sample gene amp_del log2_ratio chrom gene_start gene_end consequence 1173_N5V NOXA1 DEL -1.72256 chr9 137423349 137434406 DEL 1173_N5V ENTPD8 DEL -1.59831 chr9 137434363 137441449 DEL 1173_N5V NSMF DEL -1.40406 chr9 137447572 137459334 DEL 1173_N5V FAM21B DEL -3.0817 chr10 50078125 50132945 DEL 1173_N5V ASAH2 DEL -1.63071 chr10 50182777 50248610 DEL 1173_N5V SGMS1 DEL -1.4067 chr10 50305599 50623983 DEL 1173_N5V KDM4E DEL -1.45774 chr11 95025257 95027596 DEL 1173_N5V ENDOD1 DEL -1.4057 chr11 95089809 95132645 DEL 1173_N5V SESN3 DEL -1.60785 chr11 95165539 95231197 DEL 1173_N5V TRPC6 DEL -1.58345 chr11 101451563 101583928 DEL 1173_N5V METTL25 DEL -1.43522 chr12 82358496 82479236 DEL 1173_N5V MEOX1 DEL -1.47769 chr17 43640387 43661954 DEL 1173_N5V SOST DEL -1.48598 chr17 43753730 43758788 DEL 1173_N5V DUSP3 DEL -1.41965 chr17 43766120 43778988 DEL 1173_N5V C17orf105 DEL -1.5788 chr17 43780434 43787612 DEL 1173_N5V MPP3 DEL -1.48582 chr17 43801442 43833170 DEL 1173_N5V MN1 DEL -1.41645 chr22 27748276 27801498 DEL 1173_N5V PITPNB DEL -1.55285 chr22 27851668 27919268 DEL 1173_N5V MGAT3 DEL -1.54721 chr22 39457343 39492194 DEL 1173_N5V MIEF1 DEL -1.73296 chr22 39502352 39518132 DEL 1173_N5V ATF4 DEL -1.55271 chr22 39520563 39522683 DEL 1173_N5V RPS19BP1 DEL -1.80242 chr22 39529092 39532855 DEL 1173_N5V CACNA1I DEL -1.51094 chr22 39570752 39689737 DEL 1173_N5V ENTHD1 DEL -1.61421 chr22 39743043 39893790 DEL 1173_N5V GRAP2 DEL -1.5714 chr22 39901081 39973721 DEL 1173_N5V FAM83F DEL -1.52139 chr22 39994948 40043529 DEL 1173_N5V TNRC6B DEL -1.49435 chr22 40177924 40335807 DEL 1173_N5V ADSL DEL -1.66259 chr22 40346502 40367004 DEL 1173_N5V SGSM3 DEL -1.50729 chr22 40370610 40410289 DEL 1173_N5V MKL1 DEL -1.5304 chr22 40410280 40636685 DEL 1173_N5V MCHR1 DEL -1.55805 chr22 40678749 40682814 DEL 1173_N5V SLC25A17 DEL -1.56023 chr22 40769629 40819382 DEL 1173_N5V ST13 DEL -1.58176 chr22 40824534 40857022 DEL 1173_N5V XPNPEP3 DEL -1.55541 chr22 40857097 40932815 DEL 1173_N5V DNAJB7 DEL -1.67423 chr22 40859548 40862126 DEL