Processes

HARMONIZE_BIOMARKERS_ALTERA_EXACT:EXACT_VCF_TO_TMB_MSI
347 347
HARMONIZE_SNV_ALTERA_EXACT:TABIX_BGZIP
347 347
HARMONIZE_SNV_ALTERA_EXACT:TABIX_POST_RENAME
347 347
HARMONIZE_SNV_ALTERA_EXACT:BCFTOOLS_RENAME_CHRS
347 347
HARMONIZE_SNV_ALTERA_EXACT:PICARD_LIFTOVERVCF
347 347
HARMONIZE_SNV_ALTERA_EXACT:BCFTOOLS_NORM_POSTLIFT
347 347
HARMONIZE_SNV_ALTERA_EXACT:BCFTOOLS_SORT
347 347
HARMONIZE_SNV_ALTERA_EXACT:TABIX_FINAL
347 347
HARMONIZE:FILTER_HOTSPOT_VCF
347 347
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:CHECK_INPUT_EMPTY
347 347
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:CREATE_EMPTY_CNV_OUTPUTS
84 84
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:DEDUP_CNV_VCF
263 263
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:PRESERVE_ORIGINAL_COORDS
263 263
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:TABIX_POST_BGZIP
263 263
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:BCFTOOLS_RENAME_CHRS
263 263
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:LIFTOVER_CNV
263 263
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:CHECK_POSTLIFT_EMPTY
263 263
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:BCFTOOLS_SORT_POSTLIFT
262 261
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:ENSEMBLVEP_VEP
262 228
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:SNPEFF_SNPEFF
262 91
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:BCFTOOLS_SORT_FINAL
262 14
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:TABIX_FINAL
262 1
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:CREATE_EMPTY_VCF_WITH_INDEX
1 1
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:CNV_TO_TSV_HARMONIZED
262 1
HARMONIZE_CNV_ALTERA_EXACT:CNV_TO_TSV_POSTLIFT_EMPTY
1 1
HARMONIZE_FUSION_ALTERA_EXACT:FUSION_NORMALIZE
553 553
HARMONIZE_FUSION_ALTERA_EXACT:LIFTOVER_FUSION_TSV
553 553
HARMONIZE_SPLICE_ALTERA_EXACT:SPLICE_NORMALIZE
553 553
HARMONIZE_SPLICE_ALTERA_EXACT:LIFTOVER_FUSION_TSV
553 553
HARMONIZE_SV_ALTERA_EXACT:SV_NORMALIZE
347 347
HARMONIZE_SV_ALTERA_EXACT:SV_LIFTOVER
347 347
HARMONIZE_SUMMARY_ALTERA_EXACT:ALTERA_EXACT_CREATE_SUMMARY
472