File Info

Filename
HG01928_x_HG01952_FF_5.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG01928_x_HG01952_FF_5.features.tsv
Size
125.6 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:06 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1641723 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 366 154 212 124 1 15 1 13 0 0 212 0 0 0.8052 0.0000 0.0000 9.267 0.35 8.85 -8.49 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.1036 0.8964 0.0000
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 448 196 252 115 1 15 1 64 0 0 252 0 0 0.5867 0.0000 0.0000 12.067 0.35 8.31 -7.96 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8297 0.1651 0.0053 1 0 0.8174 0.1763 0.0063 1 0 0.7999 0.1921 0.0080
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 1 418 162 256 7 1 17 1 136 0 0 252 0 4 0.0432 0.0000 0.0156 8.529 0.57 3.21 -2.64 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8636 0.1364 2 2 0.0000 0.3981 0.6019
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.050 1 -9 2 493 149 344 71 0 17 0 61 0 0 342 0 2 0.4765 0.0000 0.0058 7.765 0.34 8.59 -8.25 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3290 0.5218 0.1492 1 1 0.3270 0.5202 0.1528 1 1 0.3242 0.5181 0.1577
chr1 3021843 CAGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 526 154 372 143 1 8 0 2 0 0 372 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 18.250 0.17 3.00 -2.83 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5888 0.4112 0.0000 0 0 0.9016 0.0984 0.0000 0 0 0.9375 0.0625 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.050 1 3 1 467 106 361 1 1 11 1 92 0 0 355 0 6 0.0094 0.0000 0.0166 8.545 0.00 3.17 -3.17 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3345 0.6655 2 2 0.0000 0.1642 0.8358 2 2 0.0000 0.1323 0.8677
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.050 1 3 2 904 168 736 5 0 8 0 155 0 0 729 0 7 0.0298 0.0000 0.0095 20.000 0.00 3.35 -3.35 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9835 0.0165 2 2 0.0000 0.3416 0.6584 2 2 0.0000 0.1166 0.8834
chr1 15933152 TAGC T 0.500000 0.050 1 -3 3 627 154 473 149 0 2 0 3 0 0 473 0 0 0.9675 0.0000 0.0000 76.000 0.30 3.00 -2.70 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2409 0.7591 0.0000 0 0 0.8417 0.1583 0.0000 0 0 0.9211 0.0789 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 340 85 255 55 0 1 0 29 0 0 255 0 0 0.6471 0.0000 0.0000 84.000 0.20 1.41 -1.21 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5919 0.3628 0.0453 1 0 0.5802 0.3708 0.0490 1 0 0.5644 0.3813 0.0543
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.050 1 1 3 1592 317 1275 197 25 22 2 71 0 0 1275 0 0 0.6215 0.0000 0.0000 12.409 1.77 1.86 -0.09 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9977 0.0023 0.0000 1 0 0.9971 0.0029 0.0000 1 0 0.9960 0.0040 0.0000
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 1 373 153 220 71 0 12 0 70 0 0 218 0 2 0.4641 0.0000 0.0091 11.750 0.15 3.16 -3.00 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2171 0.5433 0.2397 1 1 0.2191 0.5400 0.2409 1 1 0.2216 0.5359 0.2425
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 2 345 109 236 3 0 13 0 93 0 0 234 0 2 0.0275 0.0000 0.0085 7.385 0.00 2.98 -2.98 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9246 0.0754 2 2 0.0000 0.4160 0.5840 2 2 0.0000 0.2382 0.7618
chr1 44810267 CTTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 422 126 296 118 0 5 0 3 0 0 296 0 0 0.9365 0.0000 0.0000 24.200 0.09 3.00 -2.91 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1275 0.8725 0.0000 0 0 0.7131 0.2869 0.0000 0 0 0.8478 0.1522 0.0000
chr1 46533208 GCGCGGCCGCCACCCTGGCCCGGGCCCGC G 0.500000 0.050 1 -28 2 456 92 364 41 0 5 2 44 0 0 364 0 0 0.4457 0.0000 0.0000 17.400 0.95 16.75 -15.80 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1823 0.5190 0.2987 1 1 0.1850 0.5176 0.2974 1 1 0.1886 0.5158 0.2957
chr1 46815074 GAT G 0.500000 0.050 1 -2 2 274 57 217 26 0 0 0 31 0 0 216 0 1 0.4561 0.0000 0.0046 57.000 0.08 2.45 -2.37 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1755 0.5069 0.3176 1 1 0.1783 0.5063 0.3154 1 1 0.1820 0.5057 0.3124
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.050 1 6 1 591 140 451 0 0 17 0 123 0 0 451 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.235 5.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0433 0.9567 2 2 0.0000 0.0459 0.9541 2 2 0.0000 0.0498 0.9502
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 267 100 167 0 0 8 2 90 0 0 167 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.500 2.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0900 0.9100 2 2 0.0000 0.0938 0.9062 2 2 0.0000 0.0994 0.9006
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 4 699 131 568 61 0 5 1 64 0 0 568 0 0 0.4656 0.0000 0.0000 25.200 1.21 3.09 -1.88 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1880 0.5336 0.2783 1 1 0.1908 0.5311 0.2781 1 1 0.1943 0.5279 0.2778
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.050 1 3 1 170 89 81 0 0 1 0 88 0 0 81 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 88.000 3.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0985 0.9015 2 2 0.0000 0.1025 0.8975 2 2 0.0000 0.1082 0.8918
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.050 1 -6 1 482 144 338 0 0 6 1 137 0 0 330 0 8 0.0000 0.0000 0.0237 23.000 5.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0293 0.9707
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 2 414 117 297 60 1 2 3 51 0 0 293 0 4 0.5128 0.0000 0.0135 56.500 0.28 3.14 -2.85 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2719 0.5326 0.1956 1 1 0.2718 0.5301 0.1981 1 1 0.2717 0.5270 0.2013
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 219 97 122 44 0 11 1 41 0 0 121 0 1 0.4536 0.0000 0.0082 7.818 0.25 5.56 -5.31 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2486 0.5262 0.2251 1 1 0.2492 0.5243 0.2265 1 1 0.2499 0.5218 0.2283
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.050 1 18 1 1177 307 870 3 1 115 4 184 0 2 782 7 79 0.0098 0.0000 0.1011 1.681 1.33 8.87 -7.54 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3220 0.6780 2 2 0.0000 0.0193 0.9807 2 2 0.0000 0.0075 0.9925
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.050 1 -36 1 1014 194 820 0 0 39 0 155 0 0 802 0 18 0.0000 0.0000 0.0220 3.974 3.91 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0127 0.9873 2 2 0.0000 0.0138 0.9862 2 2 0.0000 0.0156 0.9844
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 240 99 141 28 7 16 5 43 0 0 141 0 0 0.2828 0.0000 0.0000 5.000 0.64 1.70 -1.05 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1100 0.4725 0.4175 1 1 0.1141 0.4744 0.4115 1 1 0.1197 0.4767 0.4035
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 229 63 166 0 0 8 0 55 0 0 144 0 22 0.0000 0.0000 0.1325 6.875 8.56 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1252 0.8748 2 2 0.0000 0.1296 0.8704 2 2 0.0000 0.1357 0.8643
chr1 152709213 G GGGCTGCTGTAGCTCTGGC 0.500000 0.050 1 18 5 229 91 138 6 0 4 1 80 0 0 138 0 0 0.0659 0.0000 0.0000 21.750 0.17 6.09 -5.92 4 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.8807 0.1193 2 1 0.0000 0.5697 0.4303
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.050 1 12 1 1161 288 873 3 2 53 3 227 0 2 830 4 37 0.0104 0.0000 0.0493 4.462 0.00 10.24 -10.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8479 0.1521 2 2 0.0000 0.0561 0.9439 2 2 0.0000 0.0143 0.9857
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.050 1 -9 1 562 256 306 115 0 14 1 126 0 0 306 0 0 0.4492 0.0000 0.0000 17.286 0.16 8.44 -8.28 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1090 0.5318 0.3593 1 1 0.1135 0.5292 0.3573 1 1 0.1195 0.5261 0.3544
chr1 154869854 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 740 247 493 12 1 41 1 192 0 0 493 0 0 0.0486 0.0000 0.0000 5.000 0.17 8.27 -8.10 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9681 0.0319 2 2 0.0000 0.4903 0.5097
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 247 103 144 52 0 2 0 49 0 0 144 0 0 0.5049 0.0000 0.0000 50.500 1.81 2.06 -0.25 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2707 0.5281 0.2012 1 1 0.2706 0.5259 0.2035 1 1 0.2704 0.5233 0.2064
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.050 1 2 4 334 79 255 0 0 0 0 79 0 0 255 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 79.000 2.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1205 0.8795 2 2 0.0000 0.1248 0.8752 2 2 0.0000 0.1308 0.8692
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 786 156 630 0 0 6 1 149 0 0 627 1 2 0.0000 0.0000 0.0048 25.000 1.46 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0209 0.9791 2 2 0.0000 0.0225 0.9775 2 2 0.0000 0.0250 0.9750
chr1 160681128 AC A 0.500000 0.050 1 -1 2 556 211 345 109 0 4 0 98 0 1 344 0 0 0.5166 0.0000 0.0029 51.750 1.38 2.22 -0.85 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3632 0.5233 0.1136 1 1 0.3607 0.5214 0.1179 1 1 0.3571 0.5190 0.1239
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.050 1 1 2 329 74 255 5 1 7 1 60 0 0 255 0 0 0.0676 0.0000 0.0000 9.429 1.20 1.18 0.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.8783 0.1217 2 1 0.0000 0.6276 0.3724
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 4 168 52 116 29 0 1 1 21 0 0 116 0 0 0.5577 0.0000 0.0000 51.000 0.28 4.24 -3.96 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3332 0.5007 0.1661 1 1 0.3303 0.5006 0.1691 1 1 0.3264 0.5005 0.1731
chr1 186307988 ACTGCTCCAACTACCCCTAAGGAGC A 0.500000 0.050 1 -24 4 1217 243 974 83 1 107 1 51 2 1 966 4 1 0.3416 0.0021 0.0082 1.271 1.64 7.71 -6.07 17 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6272 0.3403 0.0325 1 0 0.6154 0.3488 0.0357 1 0 0.5994 0.3602 0.0404
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.050 1 24 3 488 209 279 6 0 43 0 160 0 0 230 0 49 0.0287 0.0000 0.1756 3.860 0.33 13.83 -13.50 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9893 0.0107 2 2 0.0000 0.2402 0.7598 2 2 0.0000 0.0582 0.9418
chr1 206101895 GTAT G 0.500000 0.050 1 -3 2 270 113 157 54 0 5 0 54 0 0 157 0 0 0.4779 0.0000 0.0000 21.600 0.07 3.11 -3.04 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2335 0.5329 0.2335 1 1 0.2348 0.5305 0.2348 1 1 0.2363 0.5273 0.2363
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.050 1 -12 1 449 233 216 0 0 31 0 202 0 0 203 0 13 0.0000 0.0000 0.0602 6.516 11.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0057 0.9943
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 712 176 536 156 0 17 0 3 0 0 536 0 0 0.8864 0.0000 0.0000 9.353 0.80 9.67 -8.87 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2745 0.7255 0.0000 0 0 0.8634 0.1366 0.0000 0 0 0.9324 0.0676 0.0000
chr1 228424990 GAC G 0.500000 0.050 1 -2 1 421 129 292 126 0 2 0 1 0 0 292 0 0 0.9767 0.0000 0.0000 63.500 0.35 2.00 -1.65 38 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8235 0.1765 0.0000 0 0 0.9198 0.0802 0.0000 0 0 0.9339 0.0661 0.0000
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 248 139 109 62 0 5 0 72 0 0 109 0 0 0.4460 0.0000 0.0000 26.800 0.08 1.26 -1.18 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1325 0.5115 0.3560 1 1 0.1364 0.5106 0.3530 1 1 0.1418 0.5094 0.3488
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 590 162 428 0 0 22 2 138 0 0 427 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 6.364 3.59 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0280 0.9720 2 2 0.0000 0.0300 0.9700 2 2 0.0000 0.0329 0.9671
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 424 116 308 2 1 4 1 108 0 0 308 0 0 0.0172 0.0000 0.0000 27.500 0.50 2.26 -1.76 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6454 0.3546 2 2 0.0000 0.2191 0.7809 2 2 0.0000 0.1423 0.8577
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 668 157 511 0 0 7 0 150 0 0 508 0 3 0.0000 0.0000 0.0059 21.429 3.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0208 0.9792 2 2 0.0000 0.0225 0.9775 2 2 0.0000 0.0249 0.9751
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 304 77 227 35 0 0 0 42 0 0 227 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 77.000 1.49 1.29 0.20 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1638 0.5088 0.3273 1 1 0.1670 0.5081 0.3249 1 1 0.1712 0.5073 0.3215
chr1 248294830 TAA T 0.500000 0.050 1 -2 1 1167 295 872 151 0 5 0 139 0 0 870 0 2 0.5119 0.0000 0.0023 58.000 0.14 2.25 -2.11 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3210 0.5595 0.1194 1 1 0.3210 0.5550 0.1240 1 1 0.3205 0.5493 0.1302
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 696 156 540 85 0 3 1 67 0 0 538 0 2 0.5449 0.0000 0.0037 50.667 0.13 1.76 -1.63 51 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4255 0.4812 0.0933 1 1 0.4201 0.4822 0.0976 1 1 0.4127 0.4836 0.1036
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.050 1 -84 1 742 245 497 163 1 17 3 61 0 0 497 0 0 0.6653 0.0000 0.0000 13.412 0.34 3.26 -2.92 95 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9816 0.0184 0.0000 1 0 0.9783 0.0217 0.0001 1 0 0.9729 0.0270 0.0001
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 924 206 718 198 1 1 0 6 0 0 718 0 0 0.9612 0.0000 0.0000 205.000 1.59 2.00 -0.41 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0081 0.9919 0.0000 0 0 0.7032 0.2968 0.0000 0 0 0.9244 0.0756 0.0000
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.050 1 -2 1 447 132 315 90 0 4 0 38 0 0 315 0 0 0.6818 0.0000 0.0000 32.000 2.11 3.50 -1.39 68 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8441 0.1510 0.0049 1 0 0.8318 0.1623 0.0059 1 0 0.8142 0.1783 0.0075
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.050 1 2 1 613 32 581 0 0 0 0 32 0 0 574 0 7 0.0000 0.0000 0.0120 32.000 3.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2726 0.7274 2 2 0.0000 0.2765 0.7235 2 2 0.0000 0.2820 0.7180
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.050 1 -7 1 654 278 376 68 1 24 0 185 0 0 371 0 5 0.2446 0.0000 0.0133 10.583 1.19 6.57 -5.38 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0069 0.9931 1 2 0.0000 0.0084 0.9916 1 2 0.0000 0.0111 0.9889
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 764 161 603 65 0 9 0 87 0 0 600 0 3 0.4037 0.0000 0.0050 16.889 0.46 3.95 -3.49 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0467 0.3914 0.5619 1 2 0.0504 0.3976 0.5520 1 2 0.0558 0.4057 0.5384
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.050 1 9 5 479 159 320 0 1 22 0 136 0 0 304 3 13 0.0000 0.0000 0.0500 6.227 8.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0404 0.9596 2 2 0.0000 0.0190 0.9810 2 2 0.0000 0.0160 0.9840
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.050 1 -9 1 511 178 333 9 0 18 0 151 0 0 330 0 3 0.0506 0.0000 0.0090 8.889 0.33 8.37 -8.04 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9537 0.0463 2 1 0.0000 0.6146 0.3854
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.050 1 3 1 260 75 185 36 0 2 0 37 0 0 183 0 2 0.4800 0.0000 0.0108 36.500 0.11 3.00 -2.89 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2046 0.5202 0.2752 1 1 0.2066 0.5186 0.2748 1 1 0.2092 0.5167 0.2741
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.050 1 39 2 561 214 347 4 0 103 2 105 0 0 346 0 1 0.0187 0.0000 0.0029 1.088 0.50 1.47 -0.97 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9793 0.0207 2 1 0.0000 0.5119 0.4881 2 2 0.0000 0.2562 0.7438
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.050 1 39 1 561 209 352 22 4 55 5 123 0 0 352 0 0 0.1053 0.0000 0.0000 2.833 0.09 1.46 -1.36 10 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9979 0.0021
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.050 1 6 1 257 126 131 115 1 8 0 2 0 0 130 0 1 0.9127 0.0000 0.0076 14.750 0.39 6.00 -5.61 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1215 0.8785 0.0000 0 0 0.7021 0.2979 0.0000 0 0 0.8410 0.1590 0.0000
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.050 1 -6 1 588 67 521 9 1 12 0 45 1 0 520 0 0 0.1343 0.0019 0.0019 4.500 4.22 6.38 -2.16 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0194 0.4109 0.5697 2 1 0.0021 0.9405 0.0574 2 1 0.0001 0.9377 0.0621
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.050 1 -3 1 464 187 277 90 0 19 0 78 0 0 275 0 2 0.4813 0.0000 0.0072 8.842 0.42 3.15 -2.73 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3480 0.5225 0.1295 1 1 0.3457 0.5207 0.1336 1 1 0.3424 0.5185 0.1391
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.050 1 3 1 510 117 393 0 89 25 1 2 0 6 387 0 0 0.0000 0.0000 0.0153 3.833 4.00 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0972 0.9028 0.0000 0 0 0.5842 0.4158 0.0000 0 0 0.7555 0.2445 0.0000
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 1 513 117 396 2 3 20 51 41 0 0 388 6 2 0.0171 0.0000 0.0202 4.750 4.00 3.46 0.54 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.7681 0.2319 2 2 0.0000 0.3363 0.6637 2 2 0.0000 0.2123 0.7877
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.050 1 -6 1 514 120 394 4 3 58 1 54 0 0 388 0 6 0.0333 0.0000 0.0152 1.034 2.00 6.31 -4.31 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.8947 0.1053 2 1 0.0000 0.6623 0.3377
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 464 90 374 44 0 3 0 43 0 0 373 0 1 0.4889 0.0000 0.0027 29.000 0.07 3.00 -2.93 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2366 0.5269 0.2366 1 1 0.2376 0.5248 0.2376 1 1 0.2389 0.5223 0.2389
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.050 1 24 2 897 164 733 95 0 34 0 35 0 0 703 1 29 0.5793 0.0000 0.0409 3.824 0.28 11.86 -11.57 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6264 0.3420 0.0316 1 0 0.6148 0.3504 0.0348 1 0 0.5990 0.3615 0.0395
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 424 177 247 154 4 14 0 5 0 0 247 0 0 0.8701 0.0000 0.0000 11.571 0.66 3.00 -2.34 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0149 0.9851 0.0000 0 0 0.6341 0.3659 0.0000 0 0 0.8723 0.1277 0.0000
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 4 444 139 305 0 0 14 6 119 0 0 301 0 4 0.0000 0.0000 0.0131 8.929 3.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0375 0.9625 2 2 0.0000 0.0399 0.9601 2 2 0.0000 0.0434 0.9566
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -9 2 735 219 516 196 2 17 0 4 0 1 515 0 0 0.8950 0.0000 0.0019 11.882 0.43 9.00 -8.57 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1813 0.8187 0.0000 0 0 0.9047 0.0953 0.0000 0 0 0.9644 0.0356 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.050 1 6 1 596 142 454 4 0 1 0 137 0 0 440 0 14 0.0282 0.0000 0.0308 141.000 0.00 5.70 -5.70 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9388 0.0612 2 2 0.0000 0.2588 0.7412 2 2 0.0000 0.1059 0.8941
chr2 174337446 GGGCGGCGGCAGCGGC G 0.500000 0.050 1 -15 3 706 134 572 73 2 18 0 41 1 0 564 0 7 0.5448 0.0017 0.0140 6.389 0.70 12.98 -12.28 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6093 0.3529 0.0378 1 0 0.5977 0.3611 0.0412 1 0 0.5820 0.3718 0.0462
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 2 467 113 354 61 0 11 0 41 0 0 353 0 1 0.5398 0.0000 0.0028 9.273 0.28 3.24 -2.97 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4903 0.4347 0.0749 1 0 0.4820 0.4389 0.0792 1 0 0.4707 0.4442 0.0850
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.050 1 3 4 306 143 163 0 0 3 0 140 0 0 162 0 1 0.0000 0.0000 0.0061 46.667 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0280 0.9720 2 2 0.0000 0.0300 0.9700 2 2 0.0000 0.0330 0.9670
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.050 1 -2 1 336 193 143 128 0 5 0 60 1 0 142 0 0 0.6632 0.0070 0.0070 37.600 0.73 4.12 -3.38 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9223 0.0767 0.0010 1 0 0.9136 0.0851 0.0013 1 0 0.9006 0.0976 0.0018
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.050 1 3 2 657 126 531 1 0 7 0 118 0 0 524 0 7 0.0079 0.0000 0.0132 17.000 0.00 3.81 -3.81 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1805 0.8195 2 2 0.0000 0.0821 0.9179 2 2 0.0000 0.0676 0.9324
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 313 151 162 65 0 24 0 62 0 0 155 0 7 0.4305 0.0000 0.0432 5.292 3.06 5.60 -2.54 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1853 0.5357 0.2790 1 1 0.1882 0.5330 0.2789 1 1 0.1919 0.5296 0.2785
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.050 1 3 1 313 152 161 3 56 21 8 64 0 0 161 0 0 0.0197 0.0000 0.0000 6.421 0.33 2.97 -2.64 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0823 0.4516 0.4660 1 2 0.0866 0.4547 0.4587 1 1 0.0926 0.4587 0.4488
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 275 71 204 33 6 17 1 14 0 0 204 0 0 0.4648 0.0000 0.0000 2.824 0.15 0.86 -0.71 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5608 0.3819 0.0573 1 0 0.5495 0.3892 0.0613 1 0 0.5334 0.3998 0.0668
chr2 199961847 C CT 0.500000 0.050 1 1 3 174 94 80 49 0 3 0 42 0 0 79 0 1 0.5213 0.0000 0.0125 30.333 0.22 1.05 -0.82 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3109 0.5172 0.1718 1 1 0.3092 0.5159 0.1748 1 1 0.3069 0.5143 0.1788
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.050 1 3 1 243 95 148 54 0 1 0 40 0 0 148 0 0 0.5684 0.0000 0.0000 94.000 0.28 3.10 -2.82 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4214 0.4731 0.1055 1 1 0.4154 0.4749 0.1098 1 1 0.4074 0.4771 0.1155
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 2 524 149 375 0 0 22 3 124 1 0 371 0 3 0.0000 0.0027 0.0107 5.727 8.08 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1613 0.8387 2 2 0.0000 0.0735 0.9265 2 2 0.0000 0.0607 0.9393
chr2 216633573 T TGCTGCCGCC 0.500000 0.050 1 9 1 529 144 385 4 3 12 3 122 1 0 382 0 2 0.0278 0.0026 0.0078 10.833 0.50 8.17 -7.67 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.8506 0.1494 2 2 0.0000 0.4392 0.5608
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.050 1 -27 1 611 251 360 244 1 4 0 2 0 0 356 1 3 0.9721 0.0000 0.0111 61.750 0.24 14.50 -14.26 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0422 0.9578 0.0000 0 0 0.8940 0.1060 0.0000 0 0 0.9753 0.0247 0.0000
chr2 231460703 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 1 730 138 592 130 2 4 0 2 0 0 592 0 0 0.9420 0.0000 0.0000 33.500 0.38 3.00 -2.62 86 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5185 0.4815 0.0000 0 0 0.8739 0.1261 0.0000 0 0 0.9196 0.0804 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.050 1 -3 2 369 168 201 8 8 19 117 16 0 0 201 0 0 0.0476 0.0000 0.0000 7.316 1.50 1.38 0.12 4 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9761 0.0239 2 1 0.0000 0.7388 0.2612
chr2 232847517 A AG 0.500000 0.050 1 1 2 369 153 216 5 2 24 10 112 0 0 208 0 8 0.0327 0.0000 0.0370 5.250 2.00 4.51 -2.51 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9948 0.0052 2 1 0.0000 0.6122 0.3878 2 2 0.0000 0.2705 0.7295
chr2 233523368 A AT 0.500000 0.050 1 1 3 374 149 225 144 0 2 0 3 0 0 225 0 0 0.9664 0.0000 0.0000 73.500 0.14 1.00 -0.86 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2206 0.7794 0.0000 0 0 0.8249 0.1751 0.0000 0 0 0.9120 0.0880 0.0000
chr2 238329015 A AAAGGAC 0.500000 0.050 1 6 4 625 165 460 83 0 12 0 70 0 0 455 0 5 0.5030 0.0000 0.0109 12.750 0.25 5.89 -5.63 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3240 0.5292 0.1469 1 1 0.3224 0.5269 0.1507 1 1 0.3201 0.5241 0.1557
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 1062 312 750 217 0 1 0 94 0 0 749 0 1 0.6955 0.0000 0.0013 311.000 0.15 1.22 -1.08 99 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9930 0.0070 0.0000 1 0 0.9914 0.0085 0.0000 1 0 0.9888 0.0112 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.050 1 -3 1 418 139 279 48 0 37 1 53 0 0 279 0 0 0.3453 0.0000 0.0000 2.757 0.62 3.21 -2.58 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1705 0.5202 0.3093 1 1 0.1736 0.5187 0.3078 1 1 0.1776 0.5167 0.3056
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.050 1 3 1 454 108 346 51 0 3 0 54 0 0 345 0 1 0.4722 0.0000 0.0029 35.000 0.24 3.09 -2.86 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0426 0.4929 0.4645 1 1 0.0433 0.4921 0.4647 1 1 0.0441 0.4911 0.4648
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.050 1 6 2 446 87 359 0 0 2 2 83 0 0 359 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 42.500 4.86 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1058 0.8942 2 2 0.0000 0.1099 0.8901 2 2 0.0000 0.1157 0.8843
chr3 28253011 GA G 0.500000 0.050 1 -1 3 179 104 75 56 0 1 0 47 0 0 75 0 0 0.5385 0.0000 0.0000 103.000 0.09 1.11 -1.02 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3491 0.5075 0.1434 1 1 0.3460 0.5069 0.1471 1 1 0.3419 0.5061 0.1520
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 15 1 712 250 462 6 104 40 1 99 0 6 417 4 35 0.0240 0.0000 0.0974 5.250 5.17 9.58 -4.41 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0523 0.4431 0.5046 1 2 0.0563 0.4460 0.4977 1 2 0.0620 0.4499 0.4882
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.050 1 3 1 645 192 453 2 1 37 9 143 0 0 436 0 17 0.0104 0.0000 0.0375 4.189 0.00 4.93 -4.93 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6231 0.3769 2 2 0.0000 0.1014 0.8986 2 2 0.0000 0.0503 0.9497
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.050 1 6 1 645 192 453 4 1 51 1 135 0 1 435 1 16 0.0208 0.0000 0.0397 2.745 2.50 5.19 -2.69 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9357 0.0643 2 2 0.0000 0.2662 0.7338 2 2 0.0000 0.1097 0.8903
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.050 1 -2 5 417 126 291 0 0 8 0 118 0 0 289 0 2 0.0000 0.0000 0.0069 14.750 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0466 0.9534 2 2 0.0000 0.0493 0.9507 2 2 0.0000 0.0533 0.9467
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 344 162 182 0 0 1 0 161 0 0 177 0 5 0.0000 0.0000 0.0275 161.000 4.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0184 0.9816
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 541 144 397 112 0 12 0 20 0 0 396 0 1 0.7778 0.0000 0.0025 11.000 0.33 3.20 -2.87 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.050 1 -6 3 336 94 242 0 0 13 0 81 0 0 238 0 4 0.0000 0.0000 0.0165 6.231 6.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1054 0.8946 2 2 0.0000 0.1095 0.8905 2 2 0.0000 0.1153 0.8847
chr3 50118454 TGAGA T 0.500000 0.050 1 -4 1 206 74 132 42 0 25 0 7 0 0 132 0 0 0.5676 0.0000 0.0000 1.960 0.07 5.00 -4.93 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9989 0.0000 0 1 0.0266 0.9734 0.0000 0 1 0.1717 0.8283 0.0000
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.050 1 6 1 458 154 304 59 0 31 0 64 0 0 301 0 3 0.3831 0.0000 0.0099 3.968 0.14 5.16 -5.02 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1499 0.5194 0.3307 1 1 0.1536 0.5179 0.3285 1 1 0.1584 0.5160 0.3256
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.050 1 10 2 248 161 87 89 0 7 3 62 0 0 87 0 0 0.5528 0.0000 0.0000 22.000 0.08 5.84 -5.76 55 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5465 0.4026 0.0509 1 0 0.5370 0.4082 0.0548 1 0 0.5241 0.4156 0.0603
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 242 95 147 0 0 3 37 55 0 0 145 1 1 0.0000 0.0000 0.0136 30.667 3.25 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0878 0.9122 2 2 0.0000 0.0917 0.9083 2 2 0.0000 0.0972 0.9028
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 243 94 149 1 1 0 54 38 0 0 148 0 1 0.0106 0.0000 0.0067 94.000 1.00 4.03 -3.03 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.6076 0.3924 2 2 0.0000 0.2699 0.7301 2 2 0.0000 0.1897 0.8103
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.050 1 3 1 289 118 171 54 4 17 0 43 0 0 170 0 1 0.4576 0.0000 0.0058 5.941 0.17 3.02 -2.86 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4193 0.4756 0.1051 1 1 0.4135 0.4772 0.1093 1 1 0.4057 0.4792 0.1151
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.050 1 -9 3 638 181 457 165 1 9 0 6 0 0 457 0 0 0.9116 0.0000 0.0000 19.111 1.25 10.00 -8.75 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 0 0.5216 0.4784 0.0000 0 0 0.8519 0.1481 0.0000
chr3 100832332 TTTG T 0.500000 0.050 1 -3 5 249 120 129 104 2 11 0 3 0 0 129 0 0 0.8667 0.0000 0.0000 9.909 0.09 3.00 -2.91 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0971 0.9029 0.0000 0 0 0.6480 0.3520 0.0000 0 0 0.8062 0.1938 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 130 51 79 29 3 2 0 17 0 0 76 1 2 0.5686 0.0000 0.0380 23.000 0.45 1.29 -0.85 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4002 0.4752 0.1247 1 1 0.3945 0.4769 0.1285 1 1 0.3871 0.4791 0.1338
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1108 297 811 1 0 87 13 196 0 0 809 0 2 0.0034 0.0000 0.0025 2.414 0.00 3.07 -3.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0245 0.9755 2 2 0.0000 0.0106 0.9894 2 2 0.0000 0.0091 0.9909
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1112 310 802 207 12 74 12 5 0 0 802 0 0 0.6677 0.0000 0.0000 3.178 2.65 5.80 -3.15 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0147 0.9853 0.0000 0 1 0.4434 0.5566 0.0000
chr3 123700269 GTTC G 0.500000 0.050 1 -3 1 595 133 462 72 1 5 0 55 0 0 460 0 2 0.5414 0.0000 0.0043 25.600 0.44 3.04 -2.59 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4406 0.4687 0.0907 1 1 0.4343 0.4706 0.0950 1 1 0.4259 0.4731 0.1010
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.050 1 18 2 676 102 574 39 0 21 0 42 0 0 574 0 0 0.3824 0.0000 0.0000 3.857 0.54 9.19 -8.65 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2038 0.5220 0.2742 1 1 0.2059 0.5203 0.2738 1 1 0.2085 0.5182 0.2732
chr3 125055810 GGCC G 0.500000 0.050 1 -3 5 324 111 213 55 0 8 0 48 0 0 210 0 3 0.4955 0.0000 0.0141 12.875 0.60 3.38 -2.77 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2824 0.5275 0.1901 1 1 0.2819 0.5254 0.1927 1 1 0.2811 0.5228 0.1961
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 219 130 89 70 1 0 0 59 0 0 89 0 0 0.5385 0.0000 0.0000 130.000 0.43 2.44 -2.01 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3823 0.4991 0.1187 1 1 0.3782 0.4990 0.1228 1 1 0.3727 0.4989 0.1284
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 418 156 262 9 0 0 1 146 0 0 262 0 0 0.0577 0.0000 0.0000 156.000 1.00 2.16 -1.16 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9145 0.0855 2 2 0.0000 0.4541 0.5459
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 431 207 224 89 3 32 6 77 0 0 223 0 1 0.4300 0.0000 0.0045 5.645 0.19 3.17 -2.98 37 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3249 0.5329 0.1422 1 1 0.3235 0.5304 0.1462 1 1 0.3214 0.5272 0.1514
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.050 1 3 1 520 136 384 46 1 31 1 57 0 0 383 0 1 0.3382 0.0000 0.0026 3.387 0.43 3.21 -2.78 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1191 0.4908 0.3901 1 1 0.1232 0.4913 0.3855 1 1 0.1287 0.4920 0.3792
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.050 1 15 1 767 166 601 9 0 4 0 153 0 0 567 0 34 0.0542 0.0000 0.0566 40.500 0.00 10.57 -10.57 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8020 0.1980 2 2 0.0000 0.2426 0.7574
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -6 1 221 111 110 43 0 22 0 46 0 0 110 0 0 0.3874 0.0000 0.0000 4.045 0.37 6.30 -5.93 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2036 0.5246 0.2718 1 1 0.2057 0.5227 0.2716 1 1 0.2084 0.5204 0.2712
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.050 1 21 1 510 142 368 86 0 0 0 56 0 0 335 0 33 0.6056 0.0000 0.0897 142.000 0.22 13.20 -12.98 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0835 0.5313 0.3852 1 1 0.0849 0.5281 0.3870 1 1 0.0866 0.5243 0.3891
chr4 3228683 AGAG A 0.066858 0.050 1 -3 2 421 152 269 68 1 23 0 60 0 0 269 0 0 0.4474 0.0000 0.0000 5.609 0.10 2.98 -2.88 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5454 0.4385 0.0161 1 0 0.5438 0.4396 0.0166 1 0 0.5416 0.4411 0.0173
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.050 1 -12 1 599 153 446 87 0 10 0 56 0 0 443 0 3 0.5686 0.0000 0.0067 14.300 0.30 11.50 -11.20 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7540 0.2425 0.0035 1 0 0.7464 0.2498 0.0039 1 0 0.7359 0.2597 0.0044
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.050 1 -6 2 466 128 338 84 0 0 1 43 0 0 336 0 2 0.6562 0.0000 0.0059 127.000 0.10 6.30 -6.21 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8401 0.1587 0.0013 1 0 0.8316 0.1669 0.0014 1 0 0.8199 0.1784 0.0017
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 3 385 108 277 104 0 2 0 2 0 9 268 0 0 0.9630 0.0000 0.0325 53.000 0.49 3.00 -2.51 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4090 0.5910 0.0000 0 0 0.8179 0.1821 0.0000 0 0 0.8822 0.1178 0.0000
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.050 1 3 1 347 120 227 66 1 0 0 53 0 0 227 0 0 0.5500 0.0000 0.0000 120.000 0.64 3.55 -2.91 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4183 0.4793 0.1024 1 1 0.4128 0.4806 0.1067 1 1 0.4053 0.4822 0.1125
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.050 1 18 1 1576 301 1275 105 9 89 4 94 1 2 1264 1 7 0.3488 0.0008 0.0086 2.391 1.40 7.90 -6.50 15 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3510 0.5315 0.1175 1 1 0.3491 0.5290 0.1219 1 1 0.3463 0.5259 0.1278
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.050 1 9 1 2431 556 1875 281 12 24 7 232 32 26 1674 119 24 0.5054 0.0171 0.1072 23.909 2.41 8.44 -6.03 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0583 0.6271 0.3147 1 1 0.0631 0.6173 0.3196 1 1 0.0699 0.6051 0.3250
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 2130 655 1475 2 11 117 41 484 165 31 1239 19 21 0.0031 0.1119 0.1600 4.535 2.50 8.95 -6.45 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.050 1 -3 1 149 74 75 0 0 1 0 73 0 0 74 0 1 0.0000 0.0000 0.0133 73.000 2.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1345 0.8655 2 2 0.0000 0.1388 0.8612 2 2 0.0000 0.1451 0.8549
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 641 150 491 3 0 4 0 143 0 0 487 0 4 0.0200 0.0000 0.0081 36.500 0.33 4.05 -3.72 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7682 0.2318 2 2 0.0000 0.1650 0.8350 2 2 0.0000 0.0825 0.9175
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.050 1 -18 1 230 129 101 78 0 5 0 46 0 0 101 0 0 0.6047 0.0000 0.0000 24.800 0.13 14.35 -14.22 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6539 0.3176 0.0285 1 0 0.6414 0.3271 0.0315 1 0 0.6243 0.3398 0.0360
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 4 518 240 278 2 0 36 12 190 0 1 273 1 3 0.0083 0.0000 0.0180 5.829 1.50 3.06 -1.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3768 0.6232 2 2 0.0000 0.0423 0.9577 2 2 0.0000 0.0210 0.9790
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 524 210 314 8 1 52 6 143 0 0 312 1 1 0.0381 0.0000 0.0064 3.019 1.38 3.52 -2.14 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9057 0.0943 2 2 0.0000 0.4292 0.5708
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 194 83 111 0 0 14 0 69 0 0 108 1 2 0.0000 0.0000 0.0270 4.929 4.68 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1387 0.8613 2 2 0.0000 0.1431 0.8569 2 2 0.0000 0.1494 0.8506
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.050 1 -12 4 262 110 152 95 0 13 0 2 0 0 152 0 0 0.8636 0.0000 0.0000 7.462 0.37 12.00 -11.63 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7485 0.2515 0.0000 0 0 0.9513 0.0487 0.0000 0 0 0.9707 0.0293 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 723 146 577 63 0 22 1 60 0 0 577 0 0 0.4315 0.0000 0.0000 5.636 0.05 3.20 -3.15 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2546 0.5366 0.2088 1 1 0.2552 0.5338 0.2110 1 1 0.2559 0.5304 0.2137
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.050 1 -15 4 438 61 377 0 1 41 0 19 0 0 371 1 5 0.0000 0.0000 0.0159 0.463 8.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3908 0.6092 2 2 0.0000 0.3878 0.6122 2 2 0.0000 0.3857 0.6143
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.050 1 -6 1 402 104 298 47 1 6 0 50 0 0 292 0 6 0.4519 0.0000 0.0201 16.333 0.04 5.58 -5.54 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1526 0.5130 0.3344 1 1 0.1561 0.5120 0.3319 1 1 0.1608 0.5107 0.3285
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 3 544 140 404 73 0 1 0 66 0 0 398 0 6 0.5214 0.0000 0.0149 139.000 0.07 3.15 -3.08 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2393 0.5439 0.2168 1 1 0.2406 0.5406 0.2188 1 1 0.2422 0.5364 0.2214
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 513 178 335 3 0 25 0 150 0 0 333 0 2 0.0169 0.0000 0.0060 6.120 1.00 3.49 -2.49 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7448 0.2552 2 2 0.0000 0.1487 0.8513 2 2 0.0000 0.0739 0.9261
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 219 89 130 0 0 0 0 89 0 0 128 0 2 0.0000 0.0000 0.0154 89.000 3.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0919 0.9081 2 2 0.0000 0.0958 0.9042 2 2 0.0000 0.1014 0.8986
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.050 1 2 1 246 96 150 57 0 1 0 38 0 0 146 1 3 0.5938 0.0000 0.0267 95.000 0.19 4.16 -3.96 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4337 0.4674 0.0989 1 1 0.4274 0.4695 0.1031 1 1 0.4188 0.4723 0.1089
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 246 96 150 57 0 0 1 38 0 0 145 3 2 0.5938 0.0000 0.0333 95.000 0.16 4.16 -4.00 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4090 0.4806 0.1104 1 1 0.4036 0.4818 0.1146 1 1 0.3963 0.4834 0.1202
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 9 1 444 130 314 60 1 6 0 63 0 0 303 0 11 0.4615 0.0000 0.0350 20.667 0.38 8.16 -7.78 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1099 0.4928 0.3973 1 1 0.1141 0.4931 0.3927 1 1 0.1199 0.4936 0.3865
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 18 1 358 135 223 104 2 22 0 7 1 0 222 0 0 0.7704 0.0045 0.0045 5.136 0.55 15.43 -14.88 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1154 0.8846 0.0000 0 1 0.4907 0.5093 0.0000
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 642 165 477 89 1 0 0 75 0 0 476 0 1 0.5394 0.0000 0.0021 165.000 0.16 1.72 -1.56 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4032 0.4954 0.1014 1 1 0.3988 0.4954 0.1058 1 1 0.3927 0.4956 0.1117
chr5 151663455 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 233 95 138 50 1 1 0 43 0 0 136 1 1 0.5263 0.0000 0.0145 94.000 0.64 2.21 -1.57 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3155 0.5168 0.1677 1 1 0.3136 0.5156 0.1708 1 1 0.3111 0.5139 0.1749
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.050 1 -15 1 409 202 207 1 0 22 1 178 0 0 206 0 1 0.0050 0.0000 0.0048 8.524 1.00 12.69 -11.69 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0501 0.9499 2 2 0.0000 0.0227 0.9773 2 2 0.0000 0.0193 0.9807
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 211 98 113 46 0 5 0 47 0 0 113 0 0 0.4694 0.0000 0.0000 18.600 0.43 3.09 -2.65 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2243 0.5281 0.2476 1 1 0.2258 0.5260 0.2483 1 1 0.2276 0.5233 0.2491
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 1 460 117 343 57 1 6 0 53 0 0 341 0 2 0.4872 0.0000 0.0058 18.500 1.00 3.79 -2.79 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2686 0.5317 0.1997 1 1 0.2686 0.5293 0.2020 1 1 0.2686 0.5263 0.2051
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 520 226 294 108 7 45 2 64 1 0 292 0 1 0.4779 0.0034 0.0068 4.022 1.03 3.64 -2.61 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8137 0.1799 0.0064 1 0 0.8012 0.1913 0.0076 1 0 0.7835 0.2071 0.0094
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 649 107 542 95 3 7 0 2 0 0 542 0 0 0.8879 0.0000 0.0000 14.143 0.18 3.50 -3.32 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3097 0.6903 0.0000 0 0 0.7460 0.2540 0.0000 0 0 0.8323 0.1677 0.0000
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.050 1 3 5 512 117 395 48 1 12 1 55 0 0 395 0 0 0.4103 0.0000 0.0000 8.750 0.31 3.24 -2.92 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1568 0.5155 0.3277 1 1 0.1600 0.5142 0.3257 1 1 0.1644 0.5127 0.3230
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.050 1 3 1 564 144 420 4 0 28 3 109 1 0 417 0 2 0.0278 0.0024 0.0071 4.792 0.25 3.85 -3.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.8735 0.1265 2 1 0.0000 0.6290 0.3710
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.050 1 3 1 542 133 409 13 1 12 1 106 0 0 397 0 12 0.0977 0.0000 0.0293 10.083 0.85 3.92 -3.07 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9719 0.0281
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.050 1 3 2 782 146 636 1 74 57 6 8 0 0 636 0 0 0.0068 0.0000 0.0000 1.735 2.00 2.88 -0.88 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.0076 0.9924 0.0000 0 1 0.1613 0.8387 0.0000
chr6 16327663 CTGCTGCTGCTGCTGATGCTGA C 0.000280 0.050 1 -21 1 801 182 619 44 5 18 12 103 0 0 618 0 1 0.2418 0.0000 0.0016 8.722 4.02 8.06 -4.04 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0314 0.9630 0.0056 1 1 0.0360 0.9591 0.0050 1 1 0.0429 0.9529 0.0043
chr6 16327684 A ATGC 0.101269 0.050 1 3 1 791 167 624 0 92 63 3 9 0 0 623 1 0 0.0000 0.0000 0.0016 1.613 2.56 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0333 0.9667 0.0000 0 1 0.4711 0.5289 0.0000
chr6 18143680 A AT 0.500000 0.050 1 1 3 140 60 80 31 1 0 0 28 0 0 80 0 0 0.5167 0.0000 0.0000 60.000 0.32 1.11 -0.78 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2903 0.5135 0.1961 1 1 0.2892 0.5125 0.1983 1 1 0.2876 0.5112 0.2012
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.050 1 2 1 618 129 489 57 0 3 0 69 0 1 487 0 1 0.4419 0.0000 0.0041 42.000 0.09 2.32 -2.23 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2759 0.6432 0.0810 1 1 0.2832 0.6375 0.0793 1 1 0.2929 0.6299 0.0771
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 344 106 238 3 0 1 1 101 0 0 238 0 0 0.0283 0.0000 0.0000 105.000 0.00 1.14 -1.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9096 0.0904 2 2 0.0000 0.3740 0.6260 2 2 0.0000 0.2090 0.7910
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 11 1 476 138 338 5 0 2 0 131 0 0 336 0 2 0.0362 0.0000 0.0059 68.000 1.40 10.79 -9.39 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.5148 0.4852 2 2 0.0000 0.2091 0.7909
chr6 31954663 TGTCTCGATCCCG T 0.500000 0.050 1 -12 1 780 191 589 174 1 11 0 5 0 0 589 0 0 0.9110 0.0000 0.0000 16.273 0.33 12.40 -12.07 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0227 0.9773 0.0000 0 0 0.7258 0.2742 0.0000 0 0 0.9116 0.0884 0.0000
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 378 84 294 6 0 4 0 74 0 0 291 0 3 0.0714 0.0000 0.0102 20.000 1.00 3.74 -2.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.8916 0.1084 2 1 0.0000 0.5947 0.4053
chr6 32530180 C CAG 0.500000 0.050 1 2 1 219 122 97 1 89 10 11 11 1 1 95 0 0 0.0082 0.0103 0.0206 2.556 4.00 6.18 -2.18 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1275 0.8715 0.0009 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.0311 0.9689 0.0000
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 651 309 342 176 8 36 0 89 0 0 342 0 0 0.5696 0.0000 0.0000 7.556 6.48 7.88 -1.39 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9772 0.0227 0.0001 1 0 0.9733 0.0266 0.0001 1 0 0.9672 0.0326 0.0002
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 651 296 355 184 6 20 1 85 0 0 355 0 0 0.6216 0.0000 0.0000 13.750 7.32 8.02 -0.70 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9835 0.0165 0.0000 1 0 0.9805 0.0195 0.0001 1 0 0.9756 0.0243 0.0001
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.050 1 2 2 124 56 68 0 1 0 1 54 0 0 64 1 3 0.0000 0.0000 0.0588 55.000 9.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2033 0.7967 2 2 0.0000 0.2060 0.7940 2 2 0.0000 0.2105 0.7895
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.050 1 6 5 483 180 303 153 1 23 0 3 1 1 300 1 0 0.8500 0.0033 0.0099 6.783 0.55 4.67 -4.12 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1163 0.8837 0.0000 0 0 0.7829 0.2171 0.0000 0 0 0.9075 0.0925 0.0000
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.050 1 1 2 466 142 324 64 0 8 2 68 0 0 321 0 3 0.4507 0.0000 0.0093 16.750 0.36 1.29 -0.93 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1433 0.5194 0.3374 1 1 0.1471 0.5179 0.3351 1 1 0.1521 0.5160 0.3319
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 461 129 332 0 0 6 1 122 0 0 328 0 4 0.0000 0.0000 0.0120 20.500 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0394 0.9606 2 2 0.0000 0.0418 0.9582 2 2 0.0000 0.0455 0.9545
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 316 148 168 76 1 15 0 56 0 0 163 0 5 0.5135 0.0000 0.0298 8.867 0.24 5.79 -5.55 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4388 0.4710 0.0902 1 1 0.4327 0.4728 0.0946 1 1 0.4245 0.4751 0.1005
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 720 130 590 52 0 22 0 56 0 0 590 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 4.909 0.27 4.23 -3.96 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1899 0.5281 0.2820 1 1 0.1925 0.5260 0.2816 1 1 0.1959 0.5233 0.2808
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 15 2 526 168 358 84 10 73 0 1 0 0 357 0 1 0.5000 0.0000 0.0028 1.306 7.60 15.00 -7.40 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2902 0.7098 0.0000 0 0 0.7286 0.2714 0.0000 0 0 0.8197 0.1803 0.0000
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.050 1 -15 2 526 177 349 62 0 57 1 57 0 0 344 0 5 0.3503 0.0000 0.0143 2.088 0.58 13.72 -13.14 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2220 0.5378 0.2402 1 1 0.2237 0.5350 0.2414 1 1 0.2259 0.5314 0.2427
chr6 84174775 T TTCCTGTTGTTTCTTTAGTTCTTCCAACTTATTTTCTAGTTCTTTC 0.500000 0.050 1 45 5 287 102 185 38 0 17 1 46 0 0 185 0 0 0.3725 0.0000 0.0000 5.000 0.11 0.65 -0.55 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1450 0.5020 0.3530 1 1 0.1486 0.5018 0.3496 1 1 0.1534 0.5016 0.3450
chr6 84186595 TTTC T 0.500000 0.050 1 -3 1 392 86 306 47 0 1 1 37 0 0 306 0 0 0.5465 0.0000 0.0000 84.000 0.17 3.14 -2.96 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3559 0.5008 0.1433 1 1 0.3524 0.5007 0.1469 1 1 0.3476 0.5006 0.1518
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 2 147 68 79 36 0 6 2 24 0 0 78 0 1 0.5294 0.0000 0.0127 10.333 0.19 3.17 -2.97 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3589 0.4948 0.1463 1 1 0.3551 0.4952 0.1498 1 1 0.3499 0.4956 0.1545
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.050 1 3 2 707 153 554 0 0 6 2 145 0 0 550 0 4 0.0000 0.0000 0.0072 24.500 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0219 0.9781 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0261 0.9739
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.050 1 2 1 710 154 556 147 0 1 0 6 0 0 555 1 0 0.9545 0.0000 0.0018 153.000 0.18 4.67 -4.48 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.2706 0.7294 0.0000 0 0 0.7195 0.2805 0.0000
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 405 129 276 126 0 1 0 2 0 0 276 0 0 0.9767 0.0000 0.0000 128.000 0.13 1.00 -0.87 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4839 0.5161 0.0000 0 0 0.8552 0.1448 0.0000 0 0 0.9070 0.0930 0.0000
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 2 891 247 644 118 1 24 0 104 0 0 642 0 2 0.4777 0.0000 0.0031 9.292 0.14 2.99 -2.85 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3756 0.5204 0.1040 1 1 0.3728 0.5186 0.1085 1 1 0.3689 0.5165 0.1146
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.050 1 -18 1 612 214 398 5 0 42 0 167 0 0 379 0 19 0.0234 0.0000 0.0477 4.195 0.00 15.09 -15.09 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9698 0.0302 2 2 0.0000 0.2210 0.7790 2 2 0.0000 0.0684 0.9316
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.050 1 -3 5 408 120 288 0 0 4 0 116 0 0 285 0 3 0.0000 0.0000 0.0104 29.000 5.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0477 0.9523 2 2 0.0000 0.0505 0.9495 2 2 0.0000 0.0546 0.9454
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.050 1 -3 1 241 82 159 34 0 2 0 46 0 0 159 0 0 0.4146 0.0000 0.0000 40.000 6.71 9.85 -3.14 6 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1210 0.4828 0.3962 1 1 0.1250 0.4840 0.3911 1 1 0.1304 0.4854 0.3842
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.050 1 -8 2 241 71 170 0 0 8 0 63 0 0 170 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.875 10.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1701 0.8299 2 2 0.0000 0.1746 0.8254 2 2 0.0000 0.1809 0.8191
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 331 173 158 0 0 22 9 142 0 0 156 0 2 0.0000 0.0000 0.0127 7.190 3.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0208 0.9792 2 2 0.0000 0.0224 0.9776 2 2 0.0000 0.0248 0.9752
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 612 224 388 4 13 27 96 84 0 0 388 0 0 0.0179 0.0000 0.0000 8.667 3.25 6.99 -3.74 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9568 0.0432 2 1 0.0000 0.6250 0.3750
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 612 209 403 95 9 12 32 61 0 0 403 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 17.545 3.65 7.87 -4.22 55 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3723 0.5158 0.1119 1 1 0.3693 0.5144 0.1163 1 1 0.3650 0.5128 0.1222
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 611 208 403 94 14 18 31 51 0 0 403 0 0 0.4519 0.0000 0.0000 24.571 3.66 6.88 -3.22 56 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5624 0.3934 0.0442 1 0 0.5528 0.3993 0.0479 1 0 0.5396 0.4072 0.0532
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 2 234 90 144 11 40 5 0 34 0 0 143 0 1 0.1222 0.0000 0.0069 16.800 1.00 4.03 -3.03 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4311 0.4661 0.1029 1 1 0.4246 0.4684 0.1071 1 1 0.4160 0.4712 0.1128
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.050 1 -4 1 293 138 155 68 0 26 0 44 0 0 154 0 1 0.4928 0.0000 0.0065 4.308 0.31 4.18 -3.87 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5437 0.4004 0.0559 1 0 0.5337 0.4064 0.0599 1 0 0.5203 0.4142 0.0656
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 726 214 512 100 2 32 4 76 0 0 512 0 0 0.4673 0.0000 0.0000 5.688 0.34 2.99 -2.65 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5102 0.4313 0.0585 1 0 0.5022 0.4353 0.0626 1 0 0.4912 0.4405 0.0683
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 372 109 263 102 0 4 0 3 0 0 263 0 0 0.9358 0.0000 0.0000 35.000 0.15 3.00 -2.85 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0854 0.9146 0.0000 0 0 0.6163 0.3837 0.0000 0 0 0.7851 0.2149 0.0000
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.050 1 1 3 142 57 85 23 2 3 2 27 0 0 85 0 0 0.4035 0.0000 0.0000 17.333 0.09 2.07 -1.99 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1964 0.5112 0.2925 1 1 0.1985 0.5103 0.2912 1 1 0.2014 0.5093 0.2894
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 470 105 365 49 0 2 0 54 0 0 365 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 51.500 1.02 1.33 -0.31 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1796 0.5236 0.2968 1 1 0.1825 0.5218 0.2957 1 1 0.1862 0.5196 0.2942
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 213 66 147 0 0 1 0 65 0 0 143 0 4 0.0000 0.0000 0.0272 65.000 3.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1498 0.8502 2 2 0.0000 0.1543 0.8457 2 2 0.0000 0.1606 0.8394
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 223 102 121 55 0 5 1 41 0 0 121 0 0 0.5392 0.0000 0.0000 19.400 0.09 2.95 -2.86 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4067 0.4811 0.1123 1 1 0.4013 0.4823 0.1164 1 1 0.3941 0.4839 0.1220
chr7 56101805 T TA 0.500000 0.050 1 1 2 184 85 99 36 0 0 0 49 0 0 97 0 2 0.4235 0.0000 0.0202 85.000 0.42 1.22 -0.81 2 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0992 0.4633 0.4375 1 1 0.1034 0.4657 0.4309 1 1 0.1092 0.4688 0.4220
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.050 1 3 5 292 85 207 4 1 24 0 56 0 0 203 0 4 0.0471 0.0000 0.0193 2.500 0.00 3.05 -3.05 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9944 0.0056 2 1 0.0000 0.7920 0.2080 2 1 0.0000 0.5420 0.4580
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 350 105 245 0 0 0 0 105 0 0 245 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 105.000 1.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0665 0.9335 2 2 0.0000 0.0698 0.9302 2 2 0.0000 0.0747 0.9253
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 5 819 185 634 0 0 9 2 174 0 1 629 0 4 0.0000 0.0000 0.0079 19.556 3.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0360 0.9640 2 2 0.0000 0.0210 0.9790 2 2 0.0000 0.0186 0.9814
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.050 1 3 2 605 153 452 67 1 18 1 66 0 0 446 0 6 0.4379 0.0000 0.0133 7.500 0.39 3.59 -3.20 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1752 0.5351 0.2897 1 1 0.1783 0.5325 0.2892 1 1 0.1824 0.5292 0.2884
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.050 1 3 1 247 105 142 63 0 1 0 41 0 0 141 0 1 0.6000 0.0000 0.0070 104.000 0.46 3.02 -2.56 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5180 0.4170 0.0649 1 0 0.5087 0.4222 0.0691 1 0 0.4963 0.4288 0.0749
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.050 1 -4 1 525 195 330 96 0 12 0 87 0 0 330 0 0 0.4923 0.0000 0.0000 15.250 0.16 3.97 -3.81 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3319 0.5319 0.1363 1 1 0.3302 0.5294 0.1403 1 1 0.3279 0.5263 0.1458
chr7 100221192 A ACT 0.500000 0.050 1 2 1 326 82 244 47 0 4 1 30 0 0 244 0 0 0.5732 0.0000 0.0000 19.250 0.43 2.60 -2.17 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4568 0.4511 0.0921 1 1 0.4493 0.4543 0.0964 1 1 0.4393 0.4585 0.1022
chr7 100779516 A AGGGC 0.500000 0.050 1 4 1 250 118 132 58 0 4 0 56 0 0 132 0 0 0.4915 0.0000 0.0000 28.500 0.10 3.73 -3.63 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2562 0.5335 0.2102 1 1 0.2567 0.5310 0.2123 1 1 0.2573 0.5278 0.2149
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.050 1 -7 1 950 365 585 348 2 7 0 8 0 0 582 0 3 0.9534 0.0000 0.0051 51.143 0.20 7.25 -7.05 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7833 0.2167 0.0000 0 0 0.9866 0.0134 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 574 160 414 84 0 5 0 71 0 0 414 0 0 0.5250 0.0000 0.0000 31.000 0.68 3.08 -2.41 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3925 0.4989 0.1086 1 1 0.3884 0.4988 0.1128 1 1 0.3826 0.4987 0.1187
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 378 129 249 2 0 41 2 84 0 0 242 0 7 0.0155 0.0000 0.0281 2.146 4.00 5.46 -1.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7062 0.2938 2 2 0.0000 0.2752 0.7248 2 2 0.0000 0.1836 0.8164
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 700 153 547 74 0 12 1 66 0 0 547 0 0 0.4837 0.0000 0.0000 11.750 0.12 3.92 -3.80 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3111 0.5294 0.1596 1 1 0.3098 0.5271 0.1631 1 1 0.3080 0.5243 0.1677
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.050 1 6 1 457 229 228 1 0 38 1 189 0 0 212 0 16 0.0044 0.0000 0.0702 5.135 3.00 5.23 -2.23 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0275 0.9725 2 2 0.0000 0.0118 0.9882 2 2 0.0000 0.0102 0.9898
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 255 91 164 3 0 1 0 87 0 0 157 0 7 0.0330 0.0000 0.0427 90.000 2.00 3.06 -1.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9263 0.0737 2 2 0.0000 0.4220 0.5780 2 2 0.0000 0.2426 0.7574
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 3 842 220 622 10 172 33 0 5 0 2 620 0 0 0.0455 0.0000 0.0032 5.667 2.40 3.60 -1.20 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0288 0.9712 0.0000 0 0 0.7689 0.2311 0.0000 0 0 0.9279 0.0721 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 3 843 224 619 5 1 32 2 184 0 0 616 3 0 0.0223 0.0000 0.0048 6.000 2.00 3.02 -1.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9888 0.0112 2 2 0.0000 0.3230 0.6770 2 2 0.0000 0.0889 0.9111
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 713 189 524 166 2 6 0 15 0 0 524 0 0 0.8783 0.0000 0.0000 30.333 0.28 1.47 -1.18 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.1765 0.8235 0.0000
chr7 144050729 ACT A 0.500000 0.050 1 -2 1 609 114 495 106 0 1 0 7 0 0 495 0 0 0.9298 0.0000 0.0000 113.000 0.15 2.86 -2.71 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1134 0.8866 0.0000 0 1 0.4860 0.5140 0.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 671 133 538 5 0 2 0 126 0 0 531 1 6 0.0376 0.0000 0.0130 65.500 1.80 3.94 -2.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.5148 0.4852 2 2 0.0000 0.2092 0.7908
chr7 144667784 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 178 106 72 101 0 3 0 2 0 0 72 0 0 0.9528 0.0000 0.0000 34.333 0.11 3.00 -2.89 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3332 0.6668 0.0000 0 0 0.7612 0.2388 0.0000 0 0 0.8428 0.1572 0.0000
chr7 149788890 GGAC G 0.500000 0.050 1 -3 1 650 164 486 154 1 6 0 3 0 0 486 0 0 0.9390 0.0000 0.0000 26.167 0.33 3.00 -2.67 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2690 0.7310 0.0000 0 0 0.8601 0.1399 0.0000 0 0 0.9307 0.0693 0.0000
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.050 1 -4 3 174 63 111 30 0 3 1 29 0 0 110 0 1 0.4762 0.0000 0.0090 20.000 0.23 4.41 -4.18 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2295 0.5183 0.2522 1 1 0.2306 0.5169 0.2525 1 1 0.2320 0.5152 0.2528
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 701 159 542 65 0 1 1 92 0 0 541 0 1 0.4088 0.0000 0.0018 157.000 0.91 1.29 -0.39 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0353 0.3559 0.6088 1 2 0.0387 0.3637 0.5976 1 2 0.0435 0.3740 0.5824
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 430 114 316 107 0 1 0 6 0 0 316 0 0 0.9386 0.0000 0.0000 113.000 0.49 1.00 -0.51 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.2045 0.7955 0.0000 0 0 0.5843 0.4157 0.0000
chr7 149821443 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 599 158 441 9 1 0 0 148 0 0 438 0 3 0.0570 0.0000 0.0068 158.000 0.22 1.23 -1.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9485 0.0515 2 1 0.0000 0.5208 0.4792
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.050 1 -12 2 738 223 515 211 0 5 0 7 0 0 515 0 0 0.9462 0.0000 0.0000 43.600 0.49 13.43 -12.94 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 0 0.6291 0.3709 0.0000 0 0 0.9210 0.0790 0.0000
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 435 97 338 0 2 4 13 78 0 3 306 10 19 0.0000 0.0000 0.0947 31.000 7.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3867 0.6133 2 2 0.0000 0.2065 0.7935 2 2 0.0000 0.1415 0.8585
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 434 96 338 0 1 6 10 79 0 1 301 16 20 0.0000 0.0000 0.1095 43.500 7.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1550 0.8450 2 2 0.0000 0.0808 0.9192 2 2 0.0000 0.0676 0.9324
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 435 95 340 0 1 5 6 83 0 0 275 22 43 0.0000 0.0000 0.1912 17.800 7.72 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0333 0.9667 2 2 0.0000 0.0320 0.9680 2 2 0.0000 0.0325 0.9675
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.050 1 -1 3 296 117 179 4 0 1 0 112 0 0 179 0 0 0.0342 0.0000 0.0000 116.000 0.00 1.58 -1.58 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9758 0.0242 2 2 0.0000 0.4768 0.5232 2 2 0.0000 0.2317 0.7683
chr7 156950334 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 5 684 194 490 186 0 4 0 4 0 0 490 0 0 0.9588 0.0000 0.0000 47.500 0.66 3.50 -2.84 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1360 0.8640 0.0000 0 0 0.8716 0.1284 0.0000 0 0 0.9513 0.0487 0.0000
chr8 544658 GGGCGGC G 0.425210 0.050 1 -6 1 255 139 116 83 0 11 0 45 0 0 114 0 2 0.5971 0.0000 0.0172 11.636 0.60 6.09 -5.49 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7347 0.2501 0.0152 1 0 0.7225 0.2604 0.0171 1 0 0.7057 0.2743 0.0200
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.050 1 -3 1 321 120 201 0 0 2 1 117 0 0 201 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 59.000 2.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0582 0.9418 2 2 0.0000 0.0615 0.9385 2 2 0.0000 0.0664 0.9336
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.050 1 -6 1 565 269 296 0 0 48 0 221 0 0 296 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.604 6.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.050 1 -1 2 242 118 124 3 0 2 0 113 0 0 121 0 3 0.0254 0.0000 0.0242 58.000 0.33 3.88 -3.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9379 0.0621 2 2 0.0000 0.4820 0.5180 2 2 0.0000 0.2942 0.7058
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.050 1 -3 3 608 222 386 11 0 6 1 204 0 0 381 0 5 0.0495 0.0000 0.0130 36.000 0.09 3.29 -3.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9342 0.0658 2 2 0.0000 0.3870 0.6130
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.050 1 -27 4 672 240 432 143 0 10 0 87 0 0 430 0 2 0.5958 0.0000 0.0046 23.000 2.32 20.67 -18.34 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8412 0.1547 0.0040 1 0 0.8296 0.1655 0.0049 1 0 0.8129 0.1808 0.0063
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 529 141 388 0 1 28 7 105 0 0 383 1 4 0.0000 0.0000 0.0129 4.036 4.43 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0978 0.9022 2 2 0.0000 0.0802 0.9198 2 2 0.0000 0.0748 0.9252
chr8 143791687 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 727 120 607 54 0 10 0 56 0 0 604 0 3 0.4500 0.0000 0.0049 11.000 0.89 3.73 -2.84 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1792 0.5269 0.2938 1 1 0.1821 0.5249 0.2930 1 1 0.1859 0.5223 0.2917
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.050 1 15 1 838 169 669 71 0 29 0 69 0 0 661 0 8 0.4201 0.0000 0.0120 4.828 0.20 12.39 -12.19 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1657 0.5343 0.3000 1 1 0.1691 0.5317 0.2992 1 1 0.1736 0.5285 0.2980
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.050 1 -3 2 877 146 731 79 0 3 0 64 0 0 731 0 0 0.5411 0.0000 0.0000 47.667 0.35 3.11 -2.75 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4235 0.4804 0.0961 1 1 0.4180 0.4816 0.1004 1 1 0.4106 0.4831 0.1063
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 2 393 91 302 0 0 28 1 62 0 0 283 0 19 0.0000 0.0000 0.0629 2.250 7.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1127 0.8873 2 2 0.0000 0.1169 0.8831 2 2 0.0000 0.1229 0.8771
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.050 1 -1 3 293 86 207 44 0 2 0 40 0 0 207 0 0 0.5116 0.0000 0.0000 42.000 0.09 1.88 -1.78 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2864 0.5208 0.1928 1 1 0.2856 0.5192 0.1952 1 1 0.2844 0.5172 0.1984
chr9 34893048 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 320 110 210 57 0 1 0 52 0 0 210 0 0 0.5182 0.0000 0.0000 109.000 0.07 2.08 -2.01 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2914 0.5264 0.1821 1 1 0.2906 0.5244 0.1850 1 1 0.2894 0.5219 0.1886
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.050 1 -12 1 708 180 528 156 0 22 0 2 0 0 528 0 0 0.8667 0.0000 0.0000 7.182 0.23 6.50 -6.27 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6631 0.3369 0.0000 0 0 0.9251 0.0749 0.0000 0 0 0.9524 0.0476 0.0000
chr9 38396323 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 585 104 481 51 0 3 0 50 0 0 481 0 0 0.4904 0.0000 0.0000 33.667 0.98 1.30 -0.32 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2463 0.5305 0.2232 1 1 0.2471 0.5282 0.2247 1 1 0.2480 0.5253 0.2267
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 383 72 311 45 2 0 0 25 0 0 311 0 0 0.6250 0.0000 0.0000 72.000 0.29 1.00 -0.71 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5406 0.3980 0.0614 1 0 0.5302 0.4043 0.0655 1 0 0.5162 0.4125 0.0712
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.050 1 -15 3 466 116 350 0 0 7 0 109 0 0 341 0 9 0.0000 0.0000 0.0257 15.571 13.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0488 0.9512 2 2 0.0000 0.0517 0.9483 2 2 0.0000 0.0558 0.9442
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.050 1 12 1 604 142 462 5 0 10 0 127 0 0 449 0 13 0.0352 0.0000 0.0281 13.200 0.00 10.22 -10.22 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9904 0.0096 2 2 0.0000 0.4716 0.5284 2 2 0.0000 0.1827 0.8173
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 434 122 312 10 0 1 0 111 0 0 303 0 9 0.0820 0.0000 0.0288 121.000 0.60 3.23 -2.63 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9763 0.0237 2 1 0.0000 0.6983 0.3017
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.050 1 -3 2 287 91 196 5 0 21 6 59 0 0 193 1 2 0.0549 0.0000 0.0153 3.333 1.80 3.00 -1.20 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.8366 0.1634 2 1 0.0000 0.5545 0.4455
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.050 1 15 4 454 194 260 88 0 4 0 102 0 0 260 0 0 0.4536 0.0000 0.0000 47.500 0.32 8.75 -8.43 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0997 0.5024 0.3979 1 1 0.1041 0.5019 0.3940 1 1 0.1101 0.5014 0.3885
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 410 171 239 2 0 0 0 169 0 0 236 0 3 0.0117 0.0000 0.0126 171.000 0.00 3.22 -3.22 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2567 0.7433 2 2 0.0000 0.0519 0.9481 2 2 0.0000 0.0329 0.9671
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 2 390 101 289 0 0 23 2 76 0 0 289 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.348 5.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1219 0.8781 2 2 0.0000 0.1262 0.8738 2 2 0.0000 0.1323 0.8677
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 847 134 713 0 0 30 0 104 1 0 708 0 4 0.0000 0.0014 0.0070 3.467 5.78 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2465 0.7535 2 2 0.0000 0.1181 0.8819 2 2 0.0000 0.0971 0.9029
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.050 1 -4 1 805 187 618 180 0 3 0 4 0 0 618 0 0 0.9626 0.0000 0.0000 61.333 0.19 4.75 -4.56 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1185 0.8815 0.0000 0 0 0.8534 0.1466 0.0000 0 0 0.9439 0.0561 0.0000
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 763 174 589 168 1 2 0 3 0 0 589 0 0 0.9655 0.0000 0.0000 85.500 0.22 3.00 -2.78 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3440 0.6560 0.0000 0 0 0.8967 0.1033 0.0000 0 0 0.9495 0.0505 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.050 1 -4 1 292 136 156 0 0 4 1 131 0 0 153 0 3 0.0000 0.0000 0.0192 33.000 3.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0324 0.9676 2 2 0.0000 0.0346 0.9654 2 2 0.0000 0.0378 0.9622
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 471 102 369 0 0 22 0 80 0 0 368 0 1 0.0000 0.0000 0.0027 3.810 6.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1137 0.8863 2 2 0.0000 0.1180 0.8820 2 2 0.0000 0.1240 0.8760
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.050 1 6 1 654 140 514 132 0 3 0 5 0 1 513 0 0 0.9429 0.0000 0.0019 45.667 0.49 5.20 -4.71 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 1 0.4845 0.5155 0.0000 0 0 0.7903 0.2097 0.0000
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 463 156 307 0 0 2 1 153 0 0 301 1 5 0.0000 0.0000 0.0195 76.500 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0176 0.9824 2 2 0.0000 0.0190 0.9810 2 2 0.0000 0.0212 0.9788
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 247 89 158 50 0 7 0 32 0 0 158 0 0 0.5618 0.0000 0.0000 11.714 0.08 7.72 -7.64 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4816 0.4372 0.0812 1 0 0.4732 0.4413 0.0855 1 0 0.4621 0.4465 0.0914
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 1 517 164 353 7 3 50 1 103 0 1 349 1 2 0.0427 0.0000 0.0113 2.260 0.29 3.86 -3.58 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9857 0.0143 2 1 0.0000 0.7950 0.2050
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 189 78 111 49 0 1 0 28 0 0 109 1 1 0.6282 0.0000 0.0180 77.000 0.10 1.82 -1.72 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4992 0.4259 0.0750 1 0 0.4902 0.4306 0.0792 1 0 0.4782 0.4368 0.0850
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 1 545 181 364 67 0 26 7 81 1 0 362 0 1 0.3702 0.0027 0.0055 5.962 0.28 3.21 -2.93 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0628 0.4318 0.5054 1 2 0.0670 0.4358 0.4972 1 2 0.0728 0.4411 0.4861
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 222 126 96 10 2 26 0 88 0 0 96 0 0 0.0794 0.0000 0.0000 3.846 0.00 2.86 -2.86 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 1 0.0000 0.9119 0.0881
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.050 1 -9 1 758 193 565 188 0 3 0 2 0 0 565 0 0 0.9741 0.0000 0.0000 63.333 0.18 9.00 -8.82 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9889 0.0111 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr10 19352230 GC G 0.000697 0.050 1 -1 1 169 64 105 36 0 0 0 28 0 0 105 0 0 0.5625 0.0000 0.0000 64.000 0.14 2.46 -2.33 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5784 0.4214 0.0002 1 0 0.5761 0.4237 0.0002 1 0 0.5730 0.4268 0.0002
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.050 1 3 1 700 166 534 80 0 6 0 80 0 0 531 0 3 0.4819 0.0000 0.0056 26.667 0.12 4.14 -4.01 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2956 0.5650 0.1394 1 1 0.2995 0.5608 0.1396 1 1 0.3046 0.5555 0.1399
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.050 1 -3 1 341 86 255 56 0 26 0 4 0 0 255 0 0 0.6512 0.0000 0.0000 2.308 0.27 3.00 -2.73 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0301 0.9699 0.0000 0 0 0.5875 0.4125 0.0000 0 0 0.8175 0.1825 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.050 1 6 1 641 211 430 101 0 23 1 86 0 0 425 0 5 0.4787 0.0000 0.0116 8.174 0.18 6.58 -6.40 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3569 0.5243 0.1188 1 1 0.3556 0.5220 0.1224 1 1 0.3536 0.5191 0.1273
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.050 1 3 3 174 68 106 0 0 0 1 67 0 0 104 0 2 0.0000 0.0000 0.0189 67.000 3.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0618 0.9382 2 2 0.0000 0.0639 0.9361 2 2 0.0000 0.0668 0.9332
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.050 1 -1 1 399 142 257 1 0 12 2 127 0 0 257 0 0 0.0070 0.0000 0.0000 10.667 7.00 2.35 4.65 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1411 0.8589 2 2 0.0000 0.0649 0.9351 2 2 0.0000 0.0536 0.9464
chr10 124021236 CGG C 0.089512 0.050 1 -2 1 399 146 253 1 0 19 7 119 0 0 253 0 0 0.0068 0.0000 0.0000 9.769 7.00 2.15 4.85 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7009 0.2991 2 2 0.0000 0.4874 0.5126 2 2 0.0000 0.4342 0.5658
chr10 124984991 G GA 0.100418 0.050 1 1 1 223 61 162 48 1 6 1 5 0 0 162 0 0 0.7869 0.0000 0.0000 8.833 0.25 1.60 -1.35 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0090 0.9910 0.0000 0 1 0.4864 0.5136 0.0000 0 0 0.8018 0.1982 0.0000
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.050 1 21 2 578 106 472 58 0 8 0 40 0 0 456 0 16 0.5472 0.0000 0.0339 12.250 0.28 14.38 -14.10 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4324 0.5159 0.0517 1 1 0.4337 0.5140 0.0523 1 1 0.4353 0.5117 0.0530
chr10 127738728 G GGCC 0.003313 0.050 1 3 1 459 125 334 68 0 7 0 50 0 0 329 0 5 0.5440 0.0000 0.0150 16.857 0.34 3.44 -3.10 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6196 0.3799 0.0006 1 0 0.6164 0.3830 0.0006 1 0 0.6120 0.3874 0.0006
chr10 131311321 C CGCG 0.026812 0.050 1 3 1 435 146 289 65 4 16 2 59 0 0 287 0 2 0.4452 0.0000 0.0069 8.062 0.98 3.54 -2.56 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5211 0.4708 0.0080 1 0 0.5213 0.4705 0.0082 1 0 0.5213 0.4702 0.0085
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.050 1 -3 2 518 130 388 0 0 6 0 124 0 0 385 0 3 0.0000 0.0000 0.0077 20.667 2.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0728 0.9272 2 2 0.0000 0.0773 0.9227 2 2 0.0000 0.0838 0.9162
chr11 502129 ACTGGATGTCCAGGCT A 0.120821 0.050 1 -15 1 164 79 85 40 0 11 0 28 0 0 82 0 3 0.5063 0.0000 0.0353 6.182 0.20 13.54 -13.34 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5401 0.4294 0.0305 1 0 0.5371 0.4315 0.0314 1 0 0.5330 0.4344 0.0326
chr11 704604 GA G 0.439706 0.050 1 -1 2 254 107 147 102 0 1 0 4 0 0 147 0 0 0.9533 0.0000 0.0000 106.000 0.25 3.25 -3.00 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0240 0.9760 0.0000 0 0 0.5221 0.4779 0.0000 0 0 0.7688 0.2312 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.050 1 -30 2 771 132 639 4 0 51 0 77 0 0 639 0 0 0.0303 0.0000 0.0000 1.588 0.50 7.48 -6.98 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9881 0.0119 2 1 0.0000 0.6457 0.3543 2 2 0.0000 0.3703 0.6297
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.050 1 -30 2 764 210 554 6 0 69 5 130 0 0 554 0 0 0.0286 0.0000 0.0000 2.014 5.50 8.41 -2.91 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.5760 0.4240 2 2 0.0000 0.2015 0.7985
chr11 2884966 ACCGCGACCGGAG A 0.233793 0.050 1 -12 1 566 117 449 50 0 17 1 49 3 1 438 0 7 0.4274 0.0067 0.0245 5.882 3.08 12.55 -9.47 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3268 0.5478 0.1254 1 1 0.3298 0.5448 0.1254 1 1 0.3336 0.5410 0.1254
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 2 313 90 223 0 0 6 0 84 0 0 222 0 1 0.0000 0.0000 0.0045 14.000 2.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1054 0.8946 2 2 0.0000 0.1095 0.8905 2 2 0.0000 0.1153 0.8847
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 684 256 428 133 1 6 1 115 0 0 427 0 1 0.5195 0.0000 0.0023 41.667 0.17 1.17 -0.99 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4241 0.4970 0.0789 1 1 0.4199 0.4967 0.0833 1 1 0.4140 0.4965 0.0895
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.050 1 2 1 203 105 98 0 0 3 50 52 0 0 96 1 1 0.0000 0.0000 0.0204 26.000 2.29 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0925 0.9075 2 2 0.0000 0.0968 0.9032 2 2 0.0000 0.1030 0.8970
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.050 1 2 1 203 107 96 0 0 52 0 55 0 0 95 0 1 0.0000 0.0000 0.0104 27.500 2.40 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0982 0.9018 2 2 0.0000 0.1026 0.8974 2 2 0.0000 0.1090 0.8910
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 456 112 344 58 0 3 0 51 0 0 344 0 0 0.5179 0.0000 0.0000 36.333 0.43 2.75 -2.31 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3208 0.5186 0.1606 1 1 0.3189 0.5172 0.1639 1 1 0.3162 0.5154 0.1684
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 502 140 362 66 0 4 0 70 0 0 362 0 0 0.4714 0.0000 0.0000 34.000 1.21 1.99 -0.77 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1865 0.5366 0.2769 1 1 0.1893 0.5338 0.2769 1 1 0.1930 0.5304 0.2766
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 1 593 120 473 58 0 6 0 56 0 0 469 0 4 0.4833 0.0000 0.0085 19.000 0.17 6.23 -6.06 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2097 0.5348 0.2555 1 1 0.2118 0.5321 0.2561 1 1 0.2144 0.5289 0.2567
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 420 87 333 49 0 3 0 35 0 1 331 0 1 0.5632 0.0000 0.0060 28.000 0.02 1.46 -1.44 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4187 0.4729 0.1084 1 1 0.4127 0.4747 0.1126 1 1 0.4047 0.4771 0.1182
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.050 1 2 1 526 150 376 143 0 4 0 3 0 0 376 0 0 0.9533 0.0000 0.0000 36.500 0.20 1.33 -1.13 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2149 0.7851 0.0000 0 0 0.8210 0.1790 0.0000 0 0 0.9100 0.0900 0.0000
chr11 5489193 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 708 125 583 120 1 2 0 2 0 0 583 0 0 0.9600 0.0000 0.0000 61.000 1.27 3.00 -1.73 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4455 0.5545 0.0000 0 0 0.8384 0.1616 0.0000 0 0 0.8961 0.1039 0.0000
chr11 5489310 G GGGCT 0.500000 0.050 1 4 1 658 137 521 73 0 4 0 60 0 0 520 0 1 0.5328 0.0000 0.0019 33.250 1.41 5.08 -3.67 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3836 0.4993 0.1171 1 1 0.3795 0.4992 0.1213 1 1 0.3740 0.4991 0.1269
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.050 1 12 2 678 116 562 0 0 10 0 106 0 0 540 1 21 0.0000 0.0000 0.0391 10.600 9.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0388 0.9612 2 2 0.0000 0.0412 0.9588 2 2 0.0000 0.0448 0.9552
chr11 6641514 C CCAG 0.500000 0.050 1 3 5 560 175 385 79 4 22 1 69 1 0 378 0 6 0.4514 0.0026 0.0182 7.238 0.47 3.06 -2.59 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3360 0.5251 0.1389 1 1 0.3340 0.5232 0.1429 1 1 0.3311 0.5207 0.1482
chr11 7639816 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 3 242 116 126 60 0 6 0 50 0 0 124 0 2 0.5172 0.0000 0.0159 22.000 0.08 3.00 -2.92 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3377 0.5137 0.1486 1 1 0.3351 0.5127 0.1522 1 1 0.3317 0.5113 0.1570
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 309 168 141 3 0 21 6 138 0 0 140 0 1 0.0179 0.0000 0.0071 7.000 1.67 3.71 -2.04 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7766 0.2234 2 2 0.0000 0.1719 0.8281 2 2 0.0000 0.0862 0.9138
chr11 18106011 C CCGG 0.500000 0.050 1 3 3 333 171 162 79 2 21 1 68 0 0 160 0 2 0.4620 0.0000 0.0123 7.143 0.25 2.90 -2.64 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3527 0.5167 0.1306 1 1 0.3500 0.5154 0.1347 1 1 0.3462 0.5137 0.1401
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.050 1 -12 1 321 92 229 88 0 2 0 2 0 0 229 0 0 0.9565 0.0000 0.0000 45.000 0.24 6.00 -5.76 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2591 0.7409 0.0000 0 0 0.6973 0.3027 0.0000 0 0 0.7968 0.2032 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 747 200 547 0 0 12 0 188 0 0 542 0 5 0.0000 0.0000 0.0091 15.667 3.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0077 0.9923 2 2 0.0000 0.0085 0.9915 2 2 0.0000 0.0097 0.9903
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.050 1 2 4 694 144 550 0 0 1 0 143 0 0 546 0 4 0.0000 0.0000 0.0073 143.000 2.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0260 0.9740 2 2 0.0000 0.0287 0.9713
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 79 40 39 21 0 0 0 19 0 0 37 1 1 0.5250 0.0000 0.0513 40.000 0.05 2.11 -2.06 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2439 0.5128 0.2433 1 1 0.2444 0.5118 0.2437 1 1 0.2450 0.5106 0.2444
chr11 66315699 TGAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 690 163 527 76 1 2 0 84 0 0 522 0 5 0.4663 0.0000 0.0095 80.500 0.93 3.82 -2.89 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1147 0.5089 0.3764 1 1 0.1190 0.5081 0.3729 1 1 0.1247 0.5071 0.3681
chr11 68312746 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 139 70 69 37 0 6 2 25 0 1 66 0 2 0.5286 0.0000 0.0435 10.667 0.78 3.68 -2.90 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3544 0.4974 0.1482 1 1 0.3508 0.4976 0.1516 1 1 0.3459 0.4977 0.1563
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.050 1 21 2 666 159 507 79 1 25 3 51 0 0 483 0 24 0.4969 0.0000 0.0473 5.360 0.39 5.65 -5.25 45 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2490 0.5469 0.2042 1 1 0.2500 0.5434 0.2066 1 1 0.2513 0.5389 0.2098
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 820 229 591 0 0 4 1 224 0 0 591 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 56.250 2.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0045 0.9955
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.050 1 3 1 599 122 477 60 1 8 0 53 0 0 477 0 0 0.4918 0.0000 0.0000 14.250 0.33 3.13 -2.80 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3318 0.5162 0.1520 1 1 0.3295 0.5149 0.1556 1 1 0.3264 0.5134 0.1603
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 433 109 324 96 1 7 0 5 0 0 324 0 0 0.8807 0.0000 0.0000 14.571 0.20 2.80 -2.60 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0033 0.9967 0.0000 0 1 0.2804 0.7196 0.0000 0 0 0.6157 0.3843 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1209 347 862 0 2 73 3 269 0 0 860 0 2 0.0000 0.0000 0.0023 3.750 7.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.050 1 -15 3 707 229 478 3 1 31 2 192 1 0 476 0 1 0.0131 0.0021 0.0042 6.355 1.00 9.49 -8.49 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8575 0.1425 2 2 0.0000 0.1201 0.8799 2 2 0.0000 0.0445 0.9555
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 370 128 242 116 1 7 0 4 0 0 242 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 17.286 0.31 6.25 -5.94 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0270 0.9730 0.0000 0 0 0.5532 0.4468 0.0000 0 0 0.7888 0.2112 0.0000
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 363 131 232 3 0 14 5 109 0 0 230 0 2 0.0229 0.0000 0.0086 8.357 0.00 3.53 -3.53 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8783 0.1217 2 2 0.0000 0.2979 0.7021 2 2 0.0000 0.1590 0.8410
chr12 865189 T TC 0.592141 0.050 1 1 1 344 146 198 66 0 1 0 79 1 0 194 0 3 0.4521 0.0051 0.0202 145.000 1.26 1.68 -0.43 0 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0721 0.4522 0.4757 1 2 0.0756 0.4541 0.4703 1 2 0.0804 0.4566 0.4630
chr12 885406 TAGC T 0.001360 0.050 1 -3 1 655 134 521 78 0 3 0 53 0 0 520 0 1 0.5821 0.0000 0.0019 43.667 0.46 3.26 -2.80 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7357 0.2642 0.0001 1 0 0.7291 0.2708 0.0001 1 0 0.7201 0.2797 0.0001
chr12 1795735 C CAGG 0.000199 0.050 1 3 2 167 82 85 70 0 9 0 3 0 0 85 0 0 0.8537 0.0000 0.0000 8.111 0.41 4.00 -3.59 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9954 0.0046 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.050 1 3 1 475 150 325 114 11 23 0 2 0 0 325 0 0 0.7600 0.0000 0.0000 5.522 0.07 3.00 -2.93 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5364 0.4636 0.0000 0 0 0.8819 0.1181 0.0000 0 0 0.9252 0.0748 0.0000
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.050 1 -3 1 378 137 241 1 0 16 15 105 0 0 241 0 0 0.0073 0.0000 0.0000 7.562 0.00 3.09 -3.09 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1662 0.8338 2 2 0.0000 0.0747 0.9253 2 2 0.0000 0.0613 0.9387
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.050 1 3 1 1616 373 1243 152 0 4 1 216 0 0 1237 0 6 0.4075 0.0000 0.0048 92.250 1.26 4.17 -2.91 30 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.0653 0.9343 1 2 0.0005 0.0717 0.9278 1 2 0.0007 0.0812 0.9181
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.050 1 5 1 288 123 165 56 0 9 0 58 1 0 160 0 4 0.4553 0.0061 0.0303 12.667 0.27 4.22 -3.96 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1772 0.5283 0.2945 1 1 0.1801 0.5262 0.2937 1 1 0.1840 0.5235 0.2926
chr12 12477741 GCACGC G 0.023257 0.050 1 -5 3 635 169 466 161 0 2 0 6 0 0 466 0 0 0.9527 0.0000 0.0000 83.500 0.16 10.00 -9.84 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1185 0.8815 0.0000 0 0 0.9759 0.0241 0.0000 0 0 0.9954 0.0046 0.0000
chr12 12477747 TGGGC T 0.023236 0.050 1 -4 1 629 169 460 158 3 2 0 6 0 0 460 0 0 0.9349 0.0000 0.0000 83.500 0.17 10.00 -9.83 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1184 0.8816 0.0000 0 0 0.9759 0.0241 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.050 1 -3 1 292 146 146 64 0 13 1 68 0 0 146 0 0 0.4384 0.0000 0.0000 10.231 2.33 3.94 -1.61 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1090 0.5122 0.3788 1 1 0.1110 0.5104 0.3786 1 1 0.1136 0.5083 0.3781
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.050 1 -3 2 417 85 332 7 0 2 0 76 0 0 332 0 0 0.0824 0.0000 0.0000 41.500 0.00 3.55 -3.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9616 0.0384 2 1 0.0000 0.7685 0.2315
chr12 40406131 C CGTCAGGATG 0.058262 0.050 1 9 2 150 74 76 30 1 3 0 40 0 0 75 0 1 0.4054 0.0000 0.0132 23.667 1.33 7.50 -6.17 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3260 0.6198 0.0542 1 1 0.3318 0.6150 0.0532 1 1 0.3396 0.6087 0.0517
chr12 40449704 CT C 0.008989 0.050 1 -1 1 114 57 57 3 0 0 0 54 0 0 55 0 2 0.0526 0.0000 0.0351 57.000 0.00 1.00 -1.00 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9951 0.0049 2 1 0.0000 0.9887 0.0113
chr12 45928289 C CCTACTCTTTCCTCTGTATCAT 0.500000 0.050 1 21 1 657 104 553 53 0 18 0 33 0 0 541 0 12 0.5096 0.0000 0.0217 4.778 0.15 12.36 -12.21 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3366 0.5109 0.1526 1 1 0.3339 0.5100 0.1561 1 1 0.3303 0.5089 0.1607
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.050 1 -21 2 874 190 684 83 1 16 1 89 0 1 683 0 0 0.4368 0.0000 0.0015 10.812 0.94 11.94 -11.00 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1892 0.5508 0.2600 1 1 0.1928 0.5472 0.2601 1 1 0.1974 0.5426 0.2600
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.050 1 -18 2 1077 289 788 116 2 64 1 106 0 0 784 0 4 0.4014 0.0000 0.0051 3.484 0.27 12.82 -12.55 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4980 0.4893 0.0127 1 0 0.4997 0.4872 0.0130 1 0 0.5017 0.4848 0.0136
chr12 52848813 TCCTGCTGCTGAAGCCGCC T 0.001338 0.050 1 -18 1 491 154 337 123 3 25 0 3 0 0 336 0 1 0.7987 0.0000 0.0030 5.080 0.15 19.00 -18.85 47 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9625 0.0375 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.050 1 1 2 314 79 235 42 0 2 0 35 0 0 235 0 0 0.5316 0.0000 0.0000 38.500 0.12 1.29 -1.17 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3772 0.4937 0.1291 1 1 0.3748 0.4935 0.1317 1 1 0.3714 0.4934 0.1352
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.050 1 -1 1 376 71 305 21 11 14 3 22 0 0 305 0 0 0.2958 0.0000 0.0000 3.857 0.29 1.86 -1.58 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4315 0.4769 0.0916 1 1 0.4295 0.4774 0.0931 1 1 0.4267 0.4782 0.0952
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.050 1 -2 1 110 50 60 1 0 1 0 48 0 0 60 0 0 0.0200 0.0000 0.0000 49.000 0.00 1.90 -1.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4629 0.5371 2 2 0.0000 0.2519 0.7481 2 2 0.0000 0.2056 0.7944
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.050 1 -1 1 311 110 201 18 39 33 10 10 0 0 198 1 2 0.1636 0.0000 0.0149 1.909 1.78 2.70 -0.92 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7484 0.2401 0.0114 1 0 0.7382 0.2492 0.0126 1 0 0.7228 0.2629 0.0143
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.050 1 3 2 145 69 76 58 0 9 0 2 0 0 76 0 0 0.8406 0.0000 0.0000 6.667 0.09 3.00 -2.91 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2074 0.7926 0.0000 0 0 0.6363 0.3637 0.0000 0 0 0.7524 0.2476 0.0000
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.050 1 -3 1 931 235 696 0 0 23 5 207 0 0 696 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.591 3.36 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr12 102958393 C CGCAGCAGCAGCA 0.500000 0.050 1 12 1 404 100 304 67 1 27 0 5 0 1 302 0 1 0.6700 0.0000 0.0066 2.667 3.34 9.00 -5.66 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0905 0.9095 0.0000 0 1 0.3596 0.6404 0.0000
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 333 95 238 79 2 9 0 5 0 0 238 0 0 0.8316 0.0000 0.0000 10.750 0.44 3.40 -2.96 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.2092 0.7908 0.0000 0 0 0.5237 0.4763 0.0000
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.050 1 -30 1 1571 422 1149 210 3 93 1 115 3 9 1087 4 46 0.4976 0.0026 0.0540 3.538 0.91 21.99 -21.08 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8596 0.1382 0.0022 1 0 0.8495 0.1479 0.0027 1 0 0.8347 0.1617 0.0036
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 614 152 462 82 0 5 0 65 0 0 455 0 7 0.5395 0.0000 0.0152 29.400 0.23 8.71 -8.48 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3516 0.5176 0.1308 1 1 0.3489 0.5162 0.1348 1 1 0.3452 0.5145 0.1403
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 600 183 417 0 0 23 6 154 0 0 416 1 0 0.0000 0.0000 0.0024 6.913 4.44 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0172 0.9828 2 2 0.0000 0.0187 0.9813 2 2 0.0000 0.0208 0.9792
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 180 123 57 0 0 1 0 122 0 0 57 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 122.000 2.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0444 0.9556 2 2 0.0000 0.0470 0.9530 2 2 0.0000 0.0510 0.9490
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -6 1 221 103 118 55 0 15 0 33 0 0 116 0 2 0.5340 0.0000 0.0169 5.867 0.38 5.45 -5.07 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5108 0.4200 0.0693 1 0 0.5015 0.4250 0.0735 1 0 0.4892 0.4315 0.0793
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.050 1 -5 5 367 95 272 0 0 7 0 88 0 0 262 1 9 0.0000 0.0000 0.0368 12.571 5.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0784 0.9216 2 2 0.0000 0.0820 0.9180 2 2 0.0000 0.0872 0.9128
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.050 1 15 4 384 107 277 56 0 10 0 41 0 0 265 0 12 0.5234 0.0000 0.0433 9.700 0.12 10.88 -10.75 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2693 0.5305 0.2002 1 1 0.2693 0.5282 0.2025 1 1 0.2692 0.5253 0.2055
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 5 662 149 513 0 0 20 0 129 0 0 495 0 18 0.0000 0.0000 0.0351 6.450 7.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0260 0.9740 2 2 0.0000 0.0287 0.9713
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.050 1 3 3 243 89 154 4 0 32 1 52 1 0 151 0 2 0.0449 0.0065 0.0195 1.781 0.50 3.15 -2.65 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.8793 0.1207 2 1 0.0000 0.6329 0.3671
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 203 67 136 33 0 10 0 24 0 1 133 1 1 0.4925 0.0000 0.0221 5.700 1.18 3.83 -2.65 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3445 0.4993 0.1562 1 1 0.3412 0.4993 0.1595 1 1 0.3368 0.4993 0.1639
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.050 1 9 1 249 82 167 0 0 5 0 77 0 0 162 1 4 0.0000 0.0000 0.0299 15.400 9.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1129 0.8871 2 2 0.0000 0.1171 0.8829 2 2 0.0000 0.1231 0.8769
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 521 142 379 114 5 19 3 1 0 1 378 0 0 0.8028 0.0000 0.0026 6.421 1.31 4.00 -2.69 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1565 0.8435 0.0000 0 0 0.7021 0.2979 0.0000 0 0 0.8384 0.1616 0.0000
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 502 150 352 52 5 41 1 51 0 0 351 1 0 0.3467 0.0000 0.0028 2.725 0.48 2.88 -2.40 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2807 0.5288 0.1905 1 1 0.2803 0.5266 0.1931 1 1 0.2796 0.5239 0.1965
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.050 1 6 2 714 155 559 55 1 27 0 72 0 0 553 0 6 0.3548 0.0000 0.0107 4.923 0.38 5.54 -5.16 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0646 0.4273 0.5081 1 2 0.0689 0.4319 0.4991 1 2 0.0749 0.4380 0.4871
chr13 44574729 TCCA T 0.014416 0.050 1 -3 1 649 114 535 52 0 6 0 56 0 0 535 0 0 0.4561 0.0000 0.0000 18.000 0.12 2.96 -2.85 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4111 0.5800 0.0089 1 1 0.4153 0.5758 0.0089 1 1 0.4208 0.5704 0.0088
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.050 1 -18 4 499 157 342 100 0 8 0 49 0 1 339 0 2 0.6369 0.0000 0.0088 18.625 0.23 13.80 -13.57 56 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8342 0.1605 0.0053 1 0 0.8221 0.1716 0.0063 1 0 0.8050 0.1871 0.0080
chr13 52643320 GA G 0.014898 0.050 1 -1 1 621 147 474 143 0 2 0 2 0 0 474 0 0 0.9728 0.0000 0.0000 72.500 0.26 1.00 -0.74 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9895 0.0105 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.050 1 6 1 661 160 501 124 1 28 0 7 1 0 499 0 1 0.7750 0.0020 0.0040 4.714 1.40 7.71 -6.32 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.4473 0.5527 0.0000 0 0 0.8881 0.1119 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.050 1 3 4 544 59 485 0 0 6 0 53 0 0 479 2 4 0.0000 0.0000 0.0124 8.833 5.17 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0489 0.9511 2 2 0.0000 0.0503 0.9497 2 2 0.0000 0.0522 0.9478
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.050 1 -3 2 461 70 391 22 2 26 1 19 0 0 389 1 1 0.3143 0.0000 0.0051 1.654 2.14 6.11 -3.97 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2578 0.5134 0.2288 1 1 0.2578 0.5124 0.2298 1 1 0.2578 0.5111 0.2311
chr13 107866367 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.050 1 -12 2 658 179 479 89 0 4 0 86 0 0 479 0 0 0.4972 0.0000 0.0000 43.750 0.39 10.40 -10.00 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2578 0.5505 0.1916 1 1 0.2587 0.5467 0.1945 1 1 0.2598 0.5420 0.1983
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.050 1 -15 1 261 78 183 51 1 1 0 25 0 1 181 1 0 0.6538 0.0000 0.0109 77.000 0.63 7.64 -7.01 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6082 0.3501 0.0416 1 0 0.5961 0.3587 0.0452 1 0 0.5796 0.3700 0.0504
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 1 507 84 423 77 0 3 1 3 0 0 423 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 27.000 0.47 3.00 -2.53 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0118 0.9882 0.0000 0 1 0.3217 0.6783 0.0000 0 0 0.5911 0.4089 0.0000
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.050 1 1 2 480 112 368 95 0 6 0 11 0 0 368 0 0 0.8482 0.0000 0.0000 17.667 0.20 2.55 -2.35 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.0567 0.9433 0.0000
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.050 1 -1 4 424 112 312 51 0 5 1 55 0 0 312 0 0 0.4554 0.0000 0.0000 21.400 0.18 1.38 -1.21 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1993 0.5309 0.2698 1 1 0.2024 0.5288 0.2689 1 1 0.2064 0.5261 0.2675
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.050 1 -19 1 446 126 320 75 0 2 0 49 0 0 313 0 7 0.5952 0.0000 0.0219 62.000 0.47 16.08 -15.61 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5223 0.4182 0.0595 1 0 0.5147 0.4222 0.0631 1 0 0.5045 0.4275 0.0680
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.050 1 1 1 398 84 314 42 0 6 1 35 0 0 312 0 2 0.5000 0.0000 0.0064 13.000 0.33 1.14 -0.81 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1788 0.5398 0.2814 1 1 0.1780 0.5376 0.2844 1 1 0.1769 0.5347 0.2884
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.050 1 -6 1 607 148 459 122 0 22 0 4 0 0 458 0 1 0.8243 0.0000 0.0022 5.727 0.31 7.00 -6.69 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0240 0.9760 0.0000 0 0 0.7423 0.2577 0.0000 0 0 0.9209 0.0791 0.0000
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.050 1 2 3 512 122 390 55 0 7 0 60 0 0 387 0 3 0.4508 0.0000 0.0077 16.429 0.18 3.23 -3.05 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2611 0.5752 0.1637 1 1 0.2664 0.5717 0.1620 1 1 0.2733 0.5671 0.1596
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.050 1 3 3 531 165 366 68 2 17 1 77 0 0 361 0 5 0.4121 0.0000 0.0137 8.706 0.40 3.13 -2.73 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1817 0.5718 0.2465 1 1 0.1880 0.5692 0.2428 1 1 0.1964 0.5657 0.2378
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.050 1 3 1 505 128 377 4 5 6 2 111 0 0 370 0 7 0.0312 0.0000 0.0186 19.333 0.50 2.75 -2.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9807 0.0193 2 1 0.0000 0.5125 0.4875 2 2 0.0000 0.2423 0.7577
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.050 1 6 1 427 108 319 59 0 3 0 46 0 0 318 0 1 0.5463 0.0000 0.0031 35.000 0.22 5.74 -5.52 21 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5026 0.4381 0.0592 1 0 0.4984 0.4401 0.0615 1 0 0.4926 0.4428 0.0645
chr14 23079578 C CGTGAAT 0.153649 0.050 1 6 2 431 110 321 61 0 2 0 47 0 0 320 0 1 0.5545 0.0000 0.0031 54.000 0.21 5.64 -5.43 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5682 0.4033 0.0285 1 0 0.5640 0.4063 0.0297 1 0 0.5583 0.4103 0.0314
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.050 1 -1 1 329 119 210 2 3 17 5 92 0 0 210 0 0 0.0168 0.0000 0.0000 101.000 0.00 3.98 -3.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6626 0.3374 2 2 0.0000 0.2116 0.7884 2 2 0.0000 0.1249 0.8751
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.050 1 -2 1 328 118 210 2 0 20 1 95 0 0 210 0 0 0.0169 0.0000 0.0000 5.444 0.00 4.13 -4.13 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5584 0.4416 2 2 0.0000 0.1613 0.8387 2 2 0.0000 0.1018 0.8982
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.050 1 -3 1 306 42 264 2 0 4 20 16 0 1 261 1 1 0.0476 0.0000 0.0114 9.500 0.50 3.69 -3.19 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9477 0.0523 2 1 0.0000 0.7273 0.2727 2 1 0.0000 0.6002 0.3998
chr14 23275591 ACATCAT A 0.007529 0.050 1 -6 1 311 45 266 3 0 18 3 21 0 1 265 0 0 0.0667 0.0000 0.0038 1.529 0.33 5.90 -5.57 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2047 0.7855 0.0097 2 1 0.1334 0.8600 0.0066 2 1 0.0801 0.9142 0.0056
chr14 24001481 T TA 0.049020 0.050 1 1 2 316 116 200 62 0 2 0 52 0 0 200 0 0 0.5345 0.0000 0.0000 57.000 0.34 1.13 -0.80 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5694 0.4197 0.0109 1 0 0.5671 0.4216 0.0113 1 0 0.5640 0.4242 0.0118
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.050 1 3 1 355 109 246 9 0 20 0 80 0 0 244 0 2 0.0826 0.0000 0.0081 4.450 0.11 3.21 -3.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9931 0.0069 2 1 0.0000 0.9135 0.0865
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.050 1 24 1 252 41 211 2 0 26 1 12 0 0 205 0 6 0.0488 0.0000 0.0284 0.538 1.00 1.42 -0.42 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0019 0.9823 0.0158 2 1 0.0010 0.9115 0.0875 2 1 0.0007 0.8540 0.1453
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.050 1 6 1 653 129 524 0 0 22 1 106 0 0 510 0 14 0.0000 0.0000 0.0267 4.818 7.40 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0098 0.9902 2 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 2 0.0000 0.0114 0.9886
chr14 67198163 TGAA T 0.018726 0.050 1 -3 2 164 77 87 76 0 0 0 1 0 0 87 0 0 0.9870 0.0000 0.0000 77.000 0.11 3.00 -2.89 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9858 0.0142 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.050 1 -6 2 632 172 460 0 0 27 1 144 0 0 456 1 3 0.0000 0.0000 0.0087 5.370 6.57 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0054 0.9946 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr14 73739238 C CTGCTGCTGT 0.003076 0.050 1 9 1 763 209 554 94 1 11 1 102 0 0 554 0 0 0.4498 0.0000 0.0000 17.818 0.50 6.49 -5.99 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3456 0.6521 0.0023 1 1 0.3531 0.6446 0.0023 1 1 0.3629 0.6348 0.0023
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.050 1 -6 1 400 92 308 0 1 18 2 71 0 0 307 1 0 0.0000 0.0000 0.0032 4.056 5.85 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2073 0.7927 2 2 0.0000 0.2120 0.7880 2 2 0.0000 0.2189 0.7811
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.050 1 -3 1 402 81 321 3 35 4 9 30 0 3 318 0 0 0.0370 0.0000 0.0093 24.000 1.00 5.03 -4.03 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2437 0.5225 0.2338 1 1 0.2455 0.5209 0.2335 1 1 0.2479 0.5190 0.2332
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.050 1 -3 2 481 156 325 126 2 25 0 3 0 0 325 0 0 0.8077 0.0000 0.0000 5.200 0.46 3.00 -2.54 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0934 0.9066 0.0000 0 0 0.6354 0.3646 0.0000 0 0 0.7950 0.2050 0.0000
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.050 1 -9 1 231 99 132 92 0 2 0 5 0 0 132 0 0 0.9293 0.0000 0.0000 48.500 0.24 9.00 -8.76 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 1 0.3634 0.6366 0.0000 0 0 0.7021 0.2979 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.050 1 -9 1 218 67 151 0 0 9 0 58 0 0 145 0 6 0.0000 0.0000 0.0397 6.444 8.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2057 0.7943 2 2 0.0000 0.2110 0.7890 2 2 0.0000 0.2184 0.7816
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.050 1 -3 1 342 78 264 44 1 2 0 31 0 0 262 0 2 0.5641 0.0000 0.0076 76.000 1.00 4.23 -3.23 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5309 0.4216 0.0475 1 0 0.5265 0.4243 0.0492 1 0 0.5205 0.4280 0.0515
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.050 1 3 1 152 48 104 0 0 5 0 43 0 1 87 15 1 0.0000 0.0000 0.1635 8.600 3.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0059 0.9941 2 2 0.0000 0.0059 0.9941 2 2 0.0000 0.0059 0.9941
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.050 1 -2 2 221 70 151 66 0 1 0 3 0 0 151 0 0 0.9429 0.0000 0.0000 69.000 0.14 2.33 -2.20 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0616 0.9384 0.0000 0 0 0.5341 0.4659 0.0000 0 0 0.7270 0.2730 0.0000
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.050 1 -2 2 185 104 81 0 0 3 5 96 0 0 80 0 1 0.0000 0.0000 0.0123 33.667 2.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0392 0.9608 2 2 0.0000 0.0412 0.9588 2 2 0.0000 0.0441 0.9559
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.050 1 -3 1 634 147 487 59 3 23 2 60 0 0 482 0 5 0.4014 0.0000 0.0103 5.636 1.00 4.12 -3.12 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1020 0.5045 0.3935 1 1 0.1041 0.5031 0.3927 1 1 0.1069 0.5015 0.3916
chr15 38484605 AGGTGGTGGT A 0.136711 0.050 1 -9 2 464 191 273 157 0 31 0 3 0 2 271 0 0 0.8220 0.0000 0.0073 5.161 0.55 9.67 -9.11 71 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7203 0.2797 0.0000 0 0 0.9772 0.0228 0.0000 0 0 0.9894 0.0106 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.050 1 -2 1 446 165 281 87 0 4 0 74 0 0 281 0 0 0.5273 0.0000 0.0000 40.250 0.78 2.30 -1.52 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4771 0.4573 0.0656 1 0 0.4733 0.4582 0.0684 1 0 0.4682 0.4596 0.0722
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.050 1 5 1 433 133 300 3 0 9 0 121 0 0 290 0 10 0.0226 0.0000 0.0333 13.778 2.00 4.46 -2.46 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8987 0.1013 2 2 0.0000 0.3439 0.6561 2 2 0.0000 0.1909 0.8091
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.050 1 4 1 209 69 140 41 0 3 1 24 0 1 137 0 2 0.5942 0.0000 0.0214 22.000 0.10 6.46 -6.36 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6256 0.3585 0.0158 1 0 0.6200 0.3634 0.0166 1 0 0.6125 0.3698 0.0177
chr15 59207021 CCT C 0.000166 0.050 1 -2 3 395 94 301 89 1 1 0 3 0 0 301 0 0 0.9468 0.0000 0.0000 93.000 2.11 3.00 -0.89 59 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr15 65133406 G GCGC 0.007439 0.050 1 3 2 495 108 387 94 1 8 0 5 0 0 387 0 0 0.8704 0.0000 0.0000 12.375 0.67 2.20 -1.53 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2958 0.7042 0.0000 0 0 0.9801 0.0199 0.0000 0 0 0.9951 0.0049 0.0000
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.050 1 -3 2 165 87 78 50 0 1 0 36 0 0 77 0 1 0.5747 0.0000 0.0128 86.000 0.12 3.03 -2.91 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4262 0.4696 0.1043 1 1 0.4205 0.4713 0.1082 1 1 0.4130 0.4735 0.1134
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.050 1 -3 1 445 117 328 0 0 10 0 107 0 0 321 1 6 0.0000 0.0000 0.0213 10.700 3.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0381 0.9619 2 2 0.0000 0.0403 0.9597 2 2 0.0000 0.0435 0.9565
chr15 78765841 T TTGGGTCC 0.091861 0.050 1 7 3 408 83 325 69 0 10 0 4 0 0 325 0 0 0.8313 0.0000 0.0000 7.300 0.93 8.25 -7.32 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0757 0.9243 0.0000 0 0 0.7894 0.2106 0.0000 0 0 0.9212 0.0788 0.0000
chr15 80989720 TAGCAGC T 0.000292 0.050 1 -6 1 243 113 130 97 0 13 0 3 0 0 130 0 0 0.8584 0.0000 0.0000 7.692 0.13 6.00 -5.87 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9967 0.0033 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.050 1 -18 1 441 119 322 100 0 18 0 1 0 0 321 0 1 0.8403 0.0000 0.0031 5.611 0.28 19.00 -18.72 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6706 0.3294 0.0000 0 0 0.9302 0.0698 0.0000 0 0 0.9574 0.0426 0.0000
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.050 1 3 1 578 155 423 109 8 36 0 2 0 0 423 0 0 0.7032 0.0000 0.0000 3.400 0.31 3.00 -2.69 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8697 0.1303 0.0000 0 0 0.9774 0.0226 0.0000 0 0 0.9863 0.0137 0.0000
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.050 1 -24 2 768 168 600 3 1 33 1 130 0 0 572 0 28 0.0179 0.0000 0.0467 4.219 1.33 14.72 -13.38 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8733 0.1267 2 2 0.0000 0.2387 0.7613 2 2 0.0000 0.1082 0.8918
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.050 1 -12 2 758 187 571 16 4 18 7 142 0 0 571 0 0 0.0856 0.0000 0.0000 9.111 1.06 13.69 -12.63 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9465 0.0535
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.050 1 -6 1 383 124 259 0 0 9 0 115 0 0 255 0 4 0.0000 0.0000 0.0154 12.778 6.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.050 1 1 1 330 126 204 4 0 6 0 116 0 0 201 1 2 0.0317 0.0000 0.0147 20.000 0.00 2.04 -2.04 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9686 0.0314 2 2 0.0000 0.4151 0.5849 2 2 0.0000 0.1911 0.8089
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.050 1 -3 2 624 249 375 112 2 42 15 78 0 0 372 1 2 0.4498 0.0000 0.0080 4.905 0.11 3.18 -3.07 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6034 0.3790 0.0177 1 0 0.5993 0.3819 0.0188 1 0 0.5937 0.3860 0.0203
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.050 1 -6 2 624 253 371 123 3 109 2 16 0 0 370 0 1 0.4862 0.0000 0.0027 1.287 0.11 7.00 -6.89 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.0721 0.9279 0.0000
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.050 1 1 2 24 13 11 0 0 0 0 13 0 0 11 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 13.000 1.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0003 0.7538 0.2459 2 1 0.0004 0.7549 0.2447 2 1 0.0006 0.7565 0.2430
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.050 1 2 2 290 82 208 37 0 1 0 44 0 0 208 0 0 0.4512 0.0000 0.0000 81.000 1.24 3.05 -1.80 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2384 0.5429 0.2187 1 1 0.2425 0.5409 0.2166 1 1 0.2479 0.5382 0.2138
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.050 1 -1 1 857 172 685 98 1 2 0 71 0 0 683 0 2 0.5698 0.0000 0.0029 85.000 0.87 1.41 -0.54 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6884 0.2976 0.0140 1 0 0.6805 0.3042 0.0153 1 0 0.6696 0.3132 0.0172
chr16 1999881 G GTCC 0.177864 0.050 1 3 2 529 91 438 47 1 8 0 35 0 0 438 0 0 0.5165 0.0000 0.0000 10.375 0.53 3.91 -3.38 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5657 0.4005 0.0338 1 0 0.5608 0.4039 0.0353 1 0 0.5543 0.4085 0.0372
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 289 71 218 0 0 1 0 70 0 0 216 0 2 0.0000 0.0000 0.0092 70.000 6.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 289 71 218 0 0 1 0 70 0 0 216 0 2 0.0000 0.0000 0.0092 70.000 6.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 4751641 C CAGA 0.000001 0.050 1 3 3 90 50 40 30 0 1 0 19 0 0 40 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 49.000 0.53 3.32 -2.78 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6187 0.3813 0.0000 1 0 0.6148 0.3852 0.0000 1 0 0.6096 0.3904 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.050 1 -3 1 449 106 343 56 0 7 0 43 0 0 342 0 1 0.5283 0.0000 0.0029 14.143 0.12 3.09 -2.97 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3230 0.5209 0.1561 1 1 0.3184 0.5205 0.1611 1 1 0.3123 0.5200 0.1678
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.050 1 3 1 407 130 277 49 4 43 1 33 2 1 269 0 5 0.3769 0.0072 0.0289 2.000 1.41 4.48 -3.08 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6105 0.3650 0.0245 1 0 0.6045 0.3697 0.0258 1 0 0.5964 0.3760 0.0276
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.050 1 -42 2 228 93 135 36 0 28 0 29 0 0 131 0 4 0.3871 0.0000 0.0296 2.321 0.53 4.07 -3.54 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4804 0.4891 0.0305 1 1 0.4804 0.4888 0.0308 1 1 0.4803 0.4884 0.0313
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.050 1 -2 1 151 50 101 0 0 1 0 49 0 0 101 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 49.000 2.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr16 15873504 T TCTA 0.057892 0.050 1 3 2 124 55 69 52 0 1 0 2 0 0 69 0 0 0.9455 0.0000 0.0000 54.000 0.19 2.00 -1.81 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6971 0.3029 0.0000 0 0 0.9391 0.0609 0.0000 0 0 0.9642 0.0358 0.0000
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.050 1 -1 1 292 197 95 118 0 3 0 76 0 0 95 0 0 0.5990 0.0000 0.0000 64.667 0.37 1.29 -0.92 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8513 0.1475 0.0012 1 0 0.8432 0.1554 0.0014 1 0 0.8318 0.1665 0.0017
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.050 1 -12 1 661 215 446 104 0 14 0 97 0 1 445 0 0 0.4837 0.0000 0.0022 14.357 0.22 8.56 -8.34 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4620 0.4909 0.0471 1 1 0.4622 0.4893 0.0485 1 1 0.4622 0.4874 0.0504
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.050 1 -27 1 800 154 646 0 0 50 2 102 0 0 644 0 2 0.0000 0.0000 0.0031 2.060 12.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1295 0.8705 2 2 0.0000 0.1356 0.8644 2 2 0.0000 0.1444 0.8556
chr16 29779608 GGTCCGA G 0.002877 0.050 1 -6 3 363 114 249 103 1 6 0 4 0 0 249 0 0 0.9035 0.0000 0.0000 17.833 0.80 6.25 -5.45 65 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8735 0.1265 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr16 57813722 ATG A 0.500000 0.050 1 -2 1 328 150 178 145 0 2 1 2 0 0 177 0 1 0.9667 0.0000 0.0056 74.000 0.24 10.00 -9.76 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0720 0.9280 0.0000 0 0 0.7233 0.2767 0.0000 0 0 0.8816 0.1184 0.0000
chr16 57813725 CAGGTGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 328 156 172 152 0 1 0 3 0 0 171 0 1 0.9744 0.0000 0.0058 155.000 0.22 6.67 -6.44 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0627 0.9373 0.0000 0 0 0.7459 0.2541 0.0000 0 0 0.8963 0.1037 0.0000
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.050 1 -1 1 364 61 303 6 1 0 4 50 0 0 302 1 0 0.0984 0.0000 0.0033 57.000 3.67 1.88 1.79 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9416 0.0584 2 1 0.0000 0.7394 0.2606
chr16 60358911 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 867 205 662 100 0 11 0 94 1 0 655 4 2 0.4878 0.0015 0.0106 17.636 0.21 1.32 -1.11 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2408 0.5596 0.1996 1 1 0.2424 0.5551 0.2025 1 1 0.2444 0.5495 0.2061
chr16 66566827 T TAAATGAGATGGCGATC 0.500000 0.050 1 16 2 437 119 318 101 0 16 0 2 0 0 318 0 0 0.8487 0.0000 0.0000 6.438 0.21 16.00 -15.79 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3276 0.6724 0.0000 0 0 0.7612 0.2388 0.0000 0 0 0.8432 0.1568 0.0000
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.050 1 -3 2 587 106 481 2 0 11 0 93 0 0 481 0 0 0.0189 0.0000 0.0000 8.636 1.50 3.72 -2.22 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7140 0.2860 2 2 0.0000 0.2756 0.7244 2 2 0.0000 0.1833 0.8167
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.050 1 -2 2 231 108 123 61 0 2 1 44 0 1 120 0 2 0.5648 0.0000 0.0244 53.000 1.57 4.64 -3.06 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4320 0.4699 0.0980 1 1 0.4258 0.4719 0.1023 1 1 0.4175 0.4744 0.1081
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 407 108 299 42 4 23 2 37 0 1 295 0 3 0.3889 0.0000 0.0134 3.696 0.10 5.81 -5.72 14 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2947 0.5202 0.1851 1 1 0.2936 0.5187 0.1877 1 1 0.2920 0.5168 0.1912
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.050 1 6 1 407 108 299 46 0 27 0 35 0 1 295 0 3 0.4259 0.0000 0.0134 3.000 0.54 6.06 -5.51 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3467 0.5041 0.1491 1 1 0.3436 0.5038 0.1527 1 1 0.3393 0.5033 0.1574
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.050 1 -2 1 620 127 493 0 1 4 5 117 0 0 481 1 11 0.0000 0.0000 0.0243 30.500 7.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0360 0.9640 2 2 0.0000 0.0381 0.9619 2 2 0.0000 0.0413 0.9587
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 618 119 499 0 0 3 10 106 0 0 485 5 9 0.0000 0.0000 0.0281 38.333 7.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0365 0.9635 2 2 0.0000 0.0389 0.9611 2 2 0.0000 0.0424 0.9576
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 620 119 501 0 0 2 1 116 0 2 482 5 12 0.0000 0.0000 0.0379 58.500 7.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3213 0.6787 2 2 0.0000 0.1138 0.8862 2 2 0.0000 0.0775 0.9225
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.050 1 -6 1 684 142 542 5 0 11 0 126 0 0 539 0 3 0.0352 0.0000 0.0055 11.909 1.20 7.05 -5.85 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9927 0.0073 2 1 0.0000 0.5394 0.4606 2 2 0.0000 0.2254 0.7746
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.050 1 4 2 166 98 68 0 0 4 0 94 0 0 68 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 23.500 3.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0859 0.9141 2 2 0.0000 0.0896 0.9104 2 2 0.0000 0.0951 0.9049
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.050 1 -1 2 329 136 193 0 0 4 1 131 0 0 193 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 32.750 1.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0166 0.9834 2 2 0.0000 0.0177 0.9823 2 2 0.0000 0.0193 0.9807
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.050 1 3 1 680 203 477 93 2 36 0 72 0 0 473 0 4 0.4581 0.0000 0.0084 4.639 0.16 2.83 -2.67 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3724 0.5197 0.1080 1 1 0.3655 0.5206 0.1139 1 1 0.3562 0.5217 0.1221
chr17 7043458 GC G 0.000008 0.050 1 -1 2 491 137 354 66 1 3 0 67 0 0 354 0 0 0.4818 0.0000 0.0000 44.667 0.44 1.21 -0.77 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4591 0.5409 0.0000 1 1 0.4622 0.5378 0.0000 1 1 0.4660 0.5340 0.0000
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.050 1 -6 2 1269 391 878 290 11 78 0 12 0 1 877 0 0 0.7417 0.0000 0.0011 4.013 4.93 8.42 -3.49 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.8598 0.1402 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.050 1 -6 1 1120 340 780 261 2 68 0 9 0 0 778 1 1 0.7676 0.0000 0.0026 4.000 0.63 6.78 -6.15 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.8354 0.1646 0.0000 0 0 0.9895 0.0105 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.050 1 9 2 458 111 347 3 0 10 1 97 0 0 347 0 0 0.0270 0.0000 0.0000 10.100 0.33 7.34 -7.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9192 0.0808 2 2 0.0000 0.3981 0.6019 2 2 0.0000 0.2254 0.7746
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 487 185 302 1 0 28 10 146 0 0 300 1 1 0.0054 0.0000 0.0066 5.607 0.00 2.98 -2.98 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0871 0.9129 2 2 0.0000 0.0379 0.9621 2 2 0.0000 0.0317 0.9683
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 890 251 639 3 1 35 12 200 0 0 639 0 0 0.0120 0.0000 0.0000 6.719 0.00 4.26 -4.26 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5197 0.4803 2 2 0.0000 0.0535 0.9465 2 2 0.0000 0.0233 0.9767
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 891 252 639 2 22 20 24 184 0 0 639 0 0 0.0079 0.0000 0.0000 38.167 0.00 3.97 -3.97 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9810 0.0190 2 1 0.0000 0.6301 0.3699 2 2 0.0000 0.2755 0.7245
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.050 1 3 1 697 133 564 3 0 5 0 125 0 0 560 0 4 0.0226 0.0000 0.0071 25.600 0.00 3.85 -3.85 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8390 0.1610 2 2 0.0000 0.2355 0.7645 2 2 0.0000 0.1216 0.8784
chr17 30834937 ACAATGT A 0.500000 0.050 1 -6 1 836 158 678 150 0 4 0 4 0 0 678 0 0 0.9494 0.0000 0.0000 38.500 0.31 6.00 -5.69 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0598 0.9402 0.0000 0 0 0.7365 0.2635 0.0000 0 0 0.8918 0.1082 0.0000
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 111 65 46 3 0 0 0 62 0 0 43 1 2 0.0462 0.0000 0.0652 65.000 0.67 1.15 -0.48 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9627 0.0373 2 1 0.0000 0.5985 0.4015 2 2 0.0000 0.3909 0.6091
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.050 1 -12 1 821 225 596 194 2 25 1 3 3 1 589 2 1 0.8622 0.0050 0.0117 7.920 1.53 13.00 -11.47 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0705 0.9295 0.0000 0 0 0.8198 0.1802 0.0000 0 0 0.9414 0.0586 0.0000
chr17 41026759 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 623 179 444 157 2 14 0 6 0 0 444 0 0 0.8771 0.0000 0.0000 11.714 0.18 1.50 -1.32 97 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.4824 0.5176 0.0000 0 0 0.8297 0.1703 0.0000
chr17 41041248 GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCACAGCAGCGTGGCTGGCAGGAGCTGGTCTCACAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGAGCCGCAGGTCCCACTGGTGGAGCAGCTGGGAAATCCACAGAAGCTGGTCTGA G 0.500000 0.050 1 -138 2 760 313 447 257 0 13 0 43 0 0 447 0 0 0.8211 0.0000 0.0000 23.077 2.04 3.44 -1.40 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.050 1 1 1 406 142 264 77 3 0 0 62 0 0 263 0 1 0.5423 0.0000 0.0038 142.000 0.16 1.42 -1.26 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4505 0.4649 0.0846 1 1 0.4440 0.4670 0.0889 1 1 0.4353 0.4698 0.0949
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 356 78 278 39 0 3 0 36 0 0 278 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 25.000 0.38 2.03 -1.64 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2752 0.5202 0.2046 1 1 0.2748 0.5186 0.2066 1 1 0.2741 0.5167 0.2092
chr17 41105490 CTGCAGGACCACCTGCTGCCGCCCCAGCTGTTGTGTATCCAGCTGCTGCAGGCCCCAGTGCTGCCAGTCTGTGTGCTGCCAACCCACTTGTTCCCGCCCCAGCTGCTGTCAGACCACCTGT C 0.500000 0.050 1 -120 1 604 240 364 155 3 22 1 59 0 0 364 0 0 0.6458 0.0000 0.0000 9.818 0.61 2.75 -2.13 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9794 0.0205 0.0001 1 0 0.9758 0.0241 0.0001 1 0 0.9700 0.0299 0.0001
chr17 41105856 CTCCAGCTGCTGCCGCCCCTCTTGCTGTGAA C 0.500000 0.050 1 -30 1 585 189 396 106 0 30 0 53 0 0 387 0 9 0.5608 0.0000 0.0227 5.300 0.77 23.74 -22.96 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7741 0.2159 0.0100 1 0 0.7611 0.2273 0.0116 1 0 0.7430 0.2429 0.0141
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.050 1 15 1 475 96 379 39 2 11 0 44 1 0 372 0 6 0.4062 0.0026 0.0185 7.727 0.85 6.23 -5.38 3 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1531 0.5090 0.3379 1 1 0.1566 0.5083 0.3351 1 1 0.1612 0.5074 0.3314
chr17 41227070 ACTGCTGCCAGCC A 0.500000 0.050 1 -12 2 521 176 345 158 2 8 0 8 1 0 343 1 0 0.8977 0.0029 0.0058 21.000 1.47 13.25 -11.78 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1362 0.8638 0.0000 0 0 0.6420 0.3580 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.050 1 3 5 1375 244 1131 137 0 2 0 105 0 0 1127 1 3 0.5615 0.0000 0.0035 121.000 0.42 3.13 -2.72 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5762 0.3879 0.0358 1 0 0.5671 0.3937 0.0392 1 0 0.5544 0.4014 0.0441
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 618 179 439 72 3 27 1 76 0 0 437 0 2 0.4022 0.0000 0.0046 5.593 0.68 3.66 -2.98 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1792 0.5405 0.2804 1 1 0.1823 0.5374 0.2803 1 1 0.1863 0.5336 0.2801
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 216 86 130 72 1 8 0 5 0 0 130 0 0 0.8372 0.0000 0.0000 9.750 0.14 3.40 -3.26 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.1770 0.8230 0.0000 0 1 0.4731 0.5269 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.050 1 3 5 921 215 706 0 0 7 0 208 0 0 700 0 6 0.0000 0.0000 0.0085 29.714 3.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0046 0.9954 2 2 0.0000 0.0051 0.9949 2 2 0.0000 0.0059 0.9941
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.050 1 3 2 513 118 395 41 5 17 0 55 0 0 394 0 1 0.3475 0.0000 0.0025 5.882 0.12 3.04 -2.91 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1334 0.5005 0.3661 1 1 0.1373 0.5003 0.3624 1 1 0.1425 0.5002 0.3573
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.050 1 6 2 435 164 271 127 0 35 0 2 0 0 271 0 0 0.7744 0.0000 0.0000 3.794 0.57 6.00 -5.43 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4756 0.5244 0.0000 0 0 0.8544 0.1456 0.0000 0 0 0.9069 0.0931 0.0000
chr17 69149049 TGA T 0.500000 0.050 1 -2 2 161 57 104 29 0 2 0 26 0 0 104 0 0 0.5088 0.0000 0.0000 27.500 0.21 2.85 -2.64 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2787 0.5141 0.2072 1 1 0.2780 0.5130 0.2090 1 1 0.2770 0.5117 0.2114
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.050 1 -4 3 214 92 122 45 0 2 0 45 0 0 121 0 1 0.4891 0.0000 0.0082 45.000 1.11 3.87 -2.76 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2246 0.5275 0.2479 1 1 0.2260 0.5254 0.2486 1 1 0.2279 0.5228 0.2493
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.050 1 9 2 586 125 461 2 0 5 1 117 0 0 449 0 12 0.0160 0.0000 0.0260 24.000 1.50 7.95 -6.45 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4985 0.5015 2 2 0.0000 0.1335 0.8665 2 2 0.0000 0.0853 0.9147
chr17 75616380 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 721 174 547 60 3 61 2 48 0 1 545 1 0 0.3448 0.0000 0.0037 1.836 0.30 3.79 -3.49 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3968 0.4890 0.1141 1 1 0.3920 0.4897 0.1183 1 1 0.3855 0.4905 0.1239
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.050 1 -30 1 1978 438 1540 221 5 50 6 156 2 1 1529 1 7 0.5046 0.0013 0.0071 7.700 0.99 8.12 -7.14 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8429 0.1544 0.0027 1 0 0.8325 0.1642 0.0033 1 0 0.8175 0.1782 0.0043
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 1925 485 1440 229 1 24 0 231 2 4 1304 12 118 0.4722 0.0014 0.0944 19.208 1.31 4.55 -3.24 11 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0077 0.9923 1 2 0.0000 0.0092 0.9908 1 2 0.0000 0.0118 0.9882
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.050 1 -6 7 266 119 147 55 0 21 0 43 0 0 146 0 1 0.4622 0.0000 0.0068 4.667 0.31 5.93 -5.62 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3777 0.4950 0.1273 1 1 0.3735 0.4952 0.1313 1 1 0.3678 0.4956 0.1366
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.050 1 -3 2 549 149 400 0 0 5 0 144 0 0 393 0 7 0.0000 0.0000 0.0175 28.800 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0219 0.9781 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0261 0.9739
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.050 1 -1 7 336 84 252 47 0 7 1 29 0 0 252 0 0 0.5595 0.0000 0.0000 12.833 0.26 1.48 -1.23 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5239 0.4122 0.0639 1 0 0.5163 0.4165 0.0672 1 0 0.5063 0.4221 0.0716
chr18 13049812 GA G 0.001808 0.050 1 -1 1 349 108 241 102 0 2 0 4 0 0 240 0 1 0.9444 0.0000 0.0041 53.000 0.11 4.00 -3.89 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6779 0.3221 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr18 13049814 GCA G 0.001808 0.050 1 -2 1 347 107 240 102 0 1 0 4 0 0 238 1 1 0.9533 0.0000 0.0083 106.000 0.12 4.00 -3.88 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6442 0.3558 0.0000 0 0 0.9954 0.0046 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.050 1 3 1 153 72 81 4 0 3 0 65 0 0 80 0 1 0.0556 0.0000 0.0123 23.000 0.00 3.05 -3.05 4 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0369 0.9631 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.050 1 4 1 224 113 111 107 2 2 0 2 0 0 111 0 0 0.9469 0.0000 0.0000 55.000 0.11 5.00 -4.89 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3288 0.6712 0.0000 0 0 0.7615 0.2385 0.0000 0 0 0.8426 0.1574 0.0000
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 1 222 128 94 123 0 1 0 4 0 0 94 0 0 0.9609 0.0000 0.0000 127.000 0.13 3.75 -3.62 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0312 0.9688 0.0000 0 0 0.5895 0.4105 0.0000 0 0 0.8118 0.1882 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 258 160 98 89 0 10 0 61 0 0 98 0 0 0.5563 0.0000 0.0000 15.000 0.16 3.23 -3.07 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6008 0.3615 0.0377 1 0 0.5897 0.3691 0.0412 1 0 0.5746 0.3792 0.0462
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.050 1 -15 2 690 165 525 158 1 1 0 5 0 0 525 0 0 0.9576 0.0000 0.0000 164.000 0.32 16.40 -16.08 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0153 0.9847 0.0000 0 0 0.6415 0.3585 0.0000 0 0 0.8758 0.1242 0.0000
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 6 364 77 287 33 2 14 1 27 1 1 284 0 1 0.4286 0.0035 0.0105 4.500 1.36 4.44 -3.08 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3427 0.5013 0.1560 1 1 0.3395 0.5011 0.1593 1 1 0.3353 0.5010 0.1638
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 198 87 111 0 0 5 1 81 0 0 109 0 2 0.0000 0.0000 0.0180 16.400 3.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1078 0.8922 2 2 0.0000 0.1120 0.8880 2 2 0.0000 0.1179 0.8821
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.050 1 3 1 156 89 67 2 0 4 0 83 0 0 65 0 2 0.0225 0.0000 0.0299 21.250 0.00 3.01 -3.01 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7549 0.2451 2 2 0.0000 0.3185 0.6815 2 2 0.0000 0.2151 0.7849
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.050 1 24 3 423 174 249 10 4 8 4 148 0 2 245 2 0 0.0575 0.0000 0.0161 23.429 5.70 4.72 0.98 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9979 0.0021 2 1 0.0000 0.9300 0.0700
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.050 1 4 1 626 103 523 60 1 0 0 42 0 0 520 1 2 0.5825 0.0000 0.0057 103.000 0.33 5.19 -4.86 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5563 0.3987 0.0449 1 0 0.5501 0.4026 0.0473 1 0 0.5417 0.4078 0.0505
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.050 1 -27 1 349 71 278 39 0 3 0 29 0 0 275 0 3 0.5493 0.0000 0.0108 22.667 0.77 22.72 -21.95 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4707 0.4639 0.0653 1 0 0.4684 0.4648 0.0668 1 1 0.4653 0.4660 0.0687
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.050 1 -3 1 192 78 114 48 0 1 0 29 1 0 112 0 1 0.6154 0.0088 0.0175 77.000 0.15 4.10 -3.96 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6221 0.3490 0.0288 1 0 0.6145 0.3549 0.0306 1 0 0.6043 0.3626 0.0331
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.050 1 -3 2 228 130 98 1 1 1 0 127 0 0 98 0 0 0.0077 0.0000 0.0000 128.000 0.00 3.10 -3.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4642 0.5358 2 2 0.0000 0.2555 0.7445 2 2 0.0000 0.2135 0.7865
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.050 1 3 2 328 81 247 29 6 19 0 27 0 0 247 0 0 0.3580 0.0000 0.0000 3.263 0.38 3.41 -3.03 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5651 0.4256 0.0093 1 0 0.5626 0.4278 0.0096 1 0 0.5593 0.4308 0.0099
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.050 1 -3 4 369 128 241 0 0 16 65 47 0 1 234 4 2 0.0000 0.0000 0.0290 7.000 4.51 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0921 0.9079 2 2 0.0000 0.0823 0.9177 2 2 0.0000 0.0795 0.9205
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.050 1 -6 4 369 129 240 2 0 61 1 65 0 0 234 2 4 0.0155 0.0000 0.0250 1.340 4.50 7.57 -3.07 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9581 0.0419 2 1 0.0000 0.7770 0.2230 2 1 0.0000 0.6704 0.3296
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.050 1 -12 4 369 143 226 62 2 65 4 10 1 0 223 0 2 0.4336 0.0044 0.0133 1.172 3.71 10.60 -6.89 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 1 0.0034 0.9966 0.0000 0 1 0.1263 0.8737 0.0000
chr19 8305034 ACTC A 0.010955 0.050 1 -3 1 278 109 169 59 0 3 0 47 0 0 168 0 1 0.5413 0.0000 0.0059 35.333 0.32 3.94 -3.61 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5991 0.3987 0.0022 1 0 0.5964 0.4013 0.0023 1 0 0.5926 0.4050 0.0024
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.050 1 -12 2 511 152 359 4 0 10 0 138 0 0 352 0 7 0.0263 0.0000 0.0195 14.200 0.25 11.19 -10.94 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9774 0.0226 2 2 0.0000 0.4950 0.5050 2 2 0.0000 0.2488 0.7512
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.050 1 5 3 252 56 196 0 0 3 0 53 0 0 189 0 7 0.0000 0.0000 0.0357 17.667 5.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3198 0.6802 2 2 0.0000 0.3264 0.6736 2 2 0.0000 0.3356 0.6644
chr19 9126240 AG A 0.056196 0.050 1 -1 5 361 86 275 5 0 2 0 79 0 0 275 0 0 0.0581 0.0000 0.0000 42.000 0.20 2.11 -1.91 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9854 0.0146 2 1 0.0000 0.9421 0.0579
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.050 1 -3 1 858 315 543 15 0 40 23 237 0 0 538 0 5 0.0476 0.0000 0.0092 6.800 0.47 3.52 -3.05 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9848 0.0152 2 2 0.0000 0.4778 0.5222
chr19 13207858 C CCTG 0.039345 0.050 1 3 1 444 163 281 70 8 29 2 54 0 0 279 0 2 0.4294 0.0000 0.0071 4.621 0.27 3.04 -2.77 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6844 0.3118 0.0039 1 0 0.6787 0.3172 0.0041 1 0 0.6709 0.3246 0.0045
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.050 1 3 1 529 102 427 0 0 3 0 99 0 0 424 0 3 0.0000 0.0000 0.0070 33.000 3.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.050 1 -4 1 426 102 324 6 16 8 13 59 0 0 324 0 0 0.0588 0.0000 0.0000 12.857 0.00 4.71 -4.71 6 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0216 0.3926 0.5858 2 1 0.0038 0.9094 0.0867 2 1 0.0001 0.9929 0.0070
chr19 21383385 TAATTCATGCTGGAGAGAAACACTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAAGATTTTAAACAGTCCTCACACCTTACTAAACATAAGAC T 0.206936 0.050 1 -84 2 286 43 243 1 0 9 0 33 1 0 240 0 2 0.0233 0.0041 0.0123 3.778 0.00 2.97 -2.97 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9766 0.0234 2 1 0.0000 0.8606 0.1394 2 1 0.0000 0.7777 0.2223
chr19 23744939 CCA C 0.187747 0.050 1 -2 4 284 62 222 59 0 0 0 3 0 0 222 0 0 0.9516 0.0000 0.0000 62.000 0.24 2.33 -2.10 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1251 0.8749 0.0000 0 0 0.7144 0.2856 0.0000 0 0 0.8538 0.1462 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.050 1 -3 1 307 75 232 0 0 14 4 57 0 0 230 0 2 0.0000 0.0000 0.0086 4.286 2.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0395 0.9605 2 2 0.0000 0.0407 0.9593 2 2 0.0000 0.0424 0.9576
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.050 1 3 1 491 112 379 4 0 5 1 102 0 0 374 0 5 0.0357 0.0000 0.0132 21.400 0.00 3.22 -3.22 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9403 0.0597 2 2 0.0000 0.2597 0.7403 2 2 0.0000 0.1036 0.8964
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.050 1 -51 2 498 243 255 230 0 11 0 2 0 0 255 0 0 0.9465 0.0000 0.0000 21.091 0.13 0.00 0.13 38 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9844 0.0156 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr19 35739844 G GCTAT 0.000005 0.050 1 4 4 540 141 399 84 0 1 0 56 0 0 397 0 2 0.5957 0.0000 0.0050 140.000 0.45 3.84 -3.39 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7525 0.2475 0.0000 1 0 0.7456 0.2544 0.0000 1 0 0.7363 0.2637 0.0000
chr19 36638678 GGGA G 0.003494 0.050 1 -3 1 130 55 75 28 0 0 1 26 0 0 75 0 0 0.5091 0.0000 0.0000 55.000 0.29 2.96 -2.68 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4940 0.5045 0.0016 1 1 0.4947 0.5037 0.0016 1 1 0.4957 0.5027 0.0016
chr19 38081727 G GGCCACC 0.006142 0.050 1 6 3 659 215 444 170 2 40 0 3 0 0 444 0 0 0.7907 0.0000 0.0000 4.350 0.42 6.33 -5.91 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9891 0.0109 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.050 1 -1 2 344 138 206 62 1 4 0 71 0 0 200 1 5 0.4493 0.0000 0.0291 33.500 0.13 3.18 -3.05 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1619 0.5529 0.2852 1 1 0.1680 0.5515 0.2805 1 1 0.1762 0.5495 0.2743
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.050 1 -2 1 176 25 151 0 0 2 21 2 0 0 151 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.000 0.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1383 0.8617 2 2 0.0000 0.1396 0.8604 2 2 0.0000 0.1414 0.8586
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.050 1 2 2 176 25 151 0 0 12 12 1 0 0 151 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 1.000 1.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1505 0.8495 2 2 0.0000 0.1516 0.8484 2 2 0.0000 0.1532 0.8468
chr19 40394272 TTCC T 0.017263 0.050 1 -3 1 539 132 407 100 1 22 0 9 0 0 407 0 0 0.7576 0.0000 0.0000 5.000 0.29 3.11 -2.82 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.6302 0.3698 0.0000 0 0 0.9578 0.0422 0.0000
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.050 1 1 2 432 135 297 76 0 0 0 59 0 0 296 0 1 0.5630 0.0000 0.0034 135.000 0.12 1.78 -1.66 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5809 0.3891 0.0300 1 0 0.5758 0.3926 0.0316 1 0 0.5688 0.3974 0.0338
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.050 1 -1 2 429 123 306 120 1 0 0 2 0 0 306 0 0 0.9756 0.0000 0.0000 123.000 0.15 3.00 -2.85 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8274 0.1726 0.0000 0 0 0.9680 0.0320 0.0000 0 0 0.9805 0.0195 0.0000
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.050 1 6 2 561 195 366 0 0 39 0 156 0 0 333 0 33 0.0000 0.0000 0.0902 4.000 6.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0092 0.9908 2 2 0.0000 0.0102 0.9898 2 2 0.0000 0.0116 0.9884
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.050 1 18 1 314 86 228 28 0 21 0 37 0 0 212 0 16 0.3256 0.0000 0.0702 3.095 0.43 13.32 -12.90 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1505 0.6394 0.2100 1 1 0.1590 0.6393 0.2017 1 1 0.1707 0.6383 0.1910
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.050 1 -3 1 416 95 321 47 1 6 1 40 0 0 321 0 0 0.4947 0.0000 0.0000 14.667 0.87 3.75 -2.88 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5171 0.4508 0.0321 1 0 0.5152 0.4519 0.0329 1 0 0.5126 0.4534 0.0340
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.050 1 1 1 220 85 135 4 0 5 0 76 0 0 135 0 0 0.0471 0.0000 0.0000 16.000 0.00 1.51 -1.51 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.9103 0.0897 2 1 0.0000 0.7680 0.2320
chr19 48944491 GGA G 0.076452 0.050 1 -2 3 325 100 225 53 0 3 1 43 0 0 225 0 0 0.5300 0.0000 0.0000 32.333 0.19 2.07 -1.88 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5514 0.4300 0.0187 1 0 0.5490 0.4317 0.0193 1 0 0.5458 0.4341 0.0200
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.050 1 -3 1 844 236 608 99 2 42 9 84 0 0 599 2 7 0.4195 0.0000 0.0148 4.619 0.77 3.92 -3.15 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2596 0.5646 0.1758 1 1 0.2629 0.5599 0.1773 1 1 0.2670 0.5539 0.1790
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.050 1 3 1 869 184 685 73 3 40 4 64 0 0 684 1 0 0.3967 0.0000 0.0015 3.575 0.51 3.41 -2.90 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4023 0.5019 0.0958 1 1 0.4013 0.5005 0.0981 1 1 0.3998 0.4990 0.1012
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.050 1 -6 2 576 169 407 85 1 24 0 59 0 0 403 0 4 0.5030 0.0000 0.0098 6.042 1.29 7.42 -6.13 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6011 0.3636 0.0354 1 0 0.5926 0.3694 0.0380 1 0 0.5811 0.3771 0.0419
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.050 1 3 2 685 148 537 6 2 3 132 5 0 0 532 3 2 0.0405 0.0000 0.0093 72.000 0.17 7.60 -7.43 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8229 0.1771 2 2 0.0000 0.3530 0.6470
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.050 1 3 3 683 151 532 0 0 8 4 139 0 0 528 0 4 0.0000 0.0000 0.0075 17.750 3.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0458 0.9542 2 2 0.0000 0.0491 0.9509 2 2 0.0000 0.0541 0.9459
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.050 1 1 1 478 133 345 1 0 8 12 112 0 0 343 0 2 0.0075 0.0000 0.0058 15.500 2.00 2.68 -0.68 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1006 0.8994 2 2 0.0000 0.0442 0.9558 2 2 0.0000 0.0363 0.9637
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.050 1 -2 1 165 87 78 84 1 0 0 2 0 0 78 0 0 0.9655 0.0000 0.0000 86.000 0.21 2.00 -1.79 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1110 0.8890 0.0000 0 1 0.4508 0.5492 0.0000 0 0 0.5832 0.4168 0.0000
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.050 1 -1 2 422 134 288 68 0 8 1 57 0 0 288 0 0 0.5075 0.0000 0.0000 15.750 0.16 2.30 -2.14 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4197 0.4835 0.0967 1 1 0.4167 0.4836 0.0998 1 1 0.4124 0.4837 0.1038
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.050 1 3 1 506 123 383 54 0 4 0 65 0 0 383 0 0 0.4390 0.0000 0.0000 29.750 0.22 3.20 -2.98 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1631 0.5305 0.3064 1 1 0.1680 0.5293 0.3027 1 1 0.1745 0.5278 0.2977
chr19 54171999 GCCC G 0.005239 0.050 1 -3 1 299 110 189 61 0 3 1 45 0 0 187 0 2 0.5545 0.0000 0.0106 35.667 0.43 3.29 -2.86 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6229 0.3761 0.0009 1 0 0.6195 0.3796 0.0009 1 0 0.6147 0.3843 0.0010
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.050 1 -1 5 721 225 496 103 0 5 0 117 0 0 496 0 0 0.4578 0.0000 0.0000 44.000 0.24 1.61 -1.36 59 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0577 0.4640 0.4783 1 2 0.0605 0.4641 0.4753 1 2 0.0643 0.4645 0.4712
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.050 1 3 1 660 125 535 0 1 3 1 120 0 0 528 0 7 0.0000 0.0000 0.0131 40.667 3.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1321 0.8679 2 2 0.0000 0.0828 0.9172 2 2 0.0000 0.0721 0.9279
chr19 54912835 GGAA G 0.007162 0.050 1 -3 3 145 73 72 7 0 0 1 65 0 0 70 0 2 0.0959 0.0000 0.0278 72.000 0.57 3.32 -2.75 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9973 0.0027
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.050 1 4 2 809 189 620 168 0 20 0 1 0 0 620 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 8.450 0.23 4.00 -3.77 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.050 1 9 2 427 106 321 6 0 29 0 71 0 0 309 0 12 0.0566 0.0000 0.0374 2.655 1.33 7.83 -6.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.8771 0.1229 2 1 0.0000 0.5609 0.4391
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.050 1 -24 1 559 127 432 0 0 24 0 103 0 0 401 0 31 0.0000 0.0000 0.0718 4.292 17.69 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0056 0.9944 2 2 0.0000 0.0061 0.9939
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.050 1 3 4 704 157 547 5 0 33 5 114 0 0 527 5 15 0.0318 0.0000 0.0366 3.697 1.40 6.20 -4.80 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9961 0.0039 2 1 0.0000 0.6864 0.3136 2 2 0.0000 0.3541 0.6459
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.050 1 3 1 515 96 419 90 0 2 0 4 0 0 419 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 47.000 0.69 2.75 -2.06 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0119 0.9881 0.0000 0 1 0.3538 0.6462 0.0000 0 0 0.6273 0.3727 0.0000
chr19 56088071 C CTCG 0.023520 0.050 1 3 2 299 67 232 2 0 2 1 62 0 0 227 0 5 0.0299 0.0000 0.0216 32.500 2.00 4.06 -2.06 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9949 0.0051 2 1 0.0000 0.9672 0.0328 2 1 0.0000 0.9448 0.0552
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.050 1 3 1 142 72 70 2 0 8 0 62 0 0 68 0 2 0.0278 0.0000 0.0286 8.000 0.00 2.95 -2.95 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9191 0.0809 2 1 0.0000 0.6303 0.3697 2 2 0.0000 0.4964 0.5036
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.050 1 -2 1 375 172 203 85 0 3 0 84 0 0 203 0 0 0.4942 0.0000 0.0000 56.333 0.13 2.04 -1.91 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2085 0.5526 0.2390 1 1 0.2099 0.5487 0.2415 1 1 0.2116 0.5438 0.2447
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.050 1 2 1 388 144 244 109 0 0 3 32 0 0 243 0 1 0.7569 0.0000 0.0041 144.000 0.17 8.75 -8.58 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9504 0.0492 0.0004 1 0 0.9440 0.0554 0.0006 1 0 0.9264 0.0728 0.0008
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.050 1 -2 1 388 146 242 110 0 1 3 32 0 0 241 0 1 0.7534 0.0000 0.0041 145.000 0.15 8.75 -8.60 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9525 0.0471 0.0004 1 0 0.9463 0.0532 0.0005 1 0 0.9276 0.0717 0.0007
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.050 1 -3 4 389 149 240 106 0 2 0 41 0 0 238 0 2 0.7114 0.0000 0.0083 73.500 0.12 8.15 -8.02 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9222 0.0768 0.0010 1 0 0.9140 0.0847 0.0013 1 0 0.9021 0.0962 0.0017
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.050 1 5 1 301 151 150 82 0 11 0 58 0 0 143 0 7 0.5430 0.0000 0.0467 12.727 0.30 5.52 -5.21 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6176 0.3650 0.0174 1 0 0.6126 0.3690 0.0184 1 0 0.6057 0.3745 0.0198
chr20 3668985 ATCTGGACT A 0.038221 0.050 1 -8 1 219 74 145 69 1 0 0 4 0 0 145 0 0 0.9324 0.0000 0.0000 74.000 0.84 9.00 -8.16 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1761 0.8239 0.0000 0 0 0.9072 0.0928 0.0000 0 0 0.9682 0.0318 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.050 1 1 2 237 82 155 0 0 1 0 81 0 0 153 0 2 0.0000 0.0000 0.0129 81.000 1.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0713 0.9287 2 2 0.0000 0.0741 0.9259 2 2 0.0000 0.0781 0.9219
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.050 1 3 1 455 155 300 146 2 0 0 7 0 0 300 0 0 0.9419 0.0000 0.0000 155.000 0.22 3.29 -3.07 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1578 0.8422 0.0000 0 0 0.5736 0.4264 0.0000
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.050 1 -9 4 286 94 192 1 0 21 1 71 0 0 187 1 4 0.0106 0.0000 0.0260 3.476 4.00 9.18 -5.18 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3424 0.6576 2 2 0.0000 0.1711 0.8289 2 2 0.0000 0.1393 0.8607
chr20 35627312 C CA 0.103940 0.050 1 1 1 195 104 91 102 0 0 0 2 0 0 91 0 0 0.9808 0.0000 0.0000 104.000 0.27 1.00 -0.73 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8154 0.1846 0.0000 0 0 0.9657 0.0343 0.0000 0 0 0.9793 0.0207 0.0000
chr20 35652812 T TGGGCCA 0.001198 0.050 1 6 2 802 185 617 159 3 20 0 3 0 0 616 0 1 0.8595 0.0000 0.0016 8.200 0.25 4.33 -4.08 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9863 0.0137 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.050 1 -3 2 516 142 374 136 0 4 0 2 0 0 374 0 0 0.9577 0.0000 0.0000 34.500 0.23 3.00 -2.77 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4319 0.5681 0.0000 0 0 0.8302 0.1698 0.0000 0 0 0.8895 0.1105 0.0000
chr20 45891598 C CCTGCTG 0.000059 0.050 1 6 2 930 332 598 150 4 63 0 115 0 4 592 0 2 0.4518 0.0000 0.0100 4.270 3.37 5.79 -2.42 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8412 0.1588 0.0000 1 0 0.8342 0.1658 0.0000 1 0 0.8243 0.1757 0.0000
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.050 1 -3 2 935 337 598 124 8 49 6 150 0 0 594 0 4 0.3680 0.0000 0.0067 5.878 5.11 3.12 1.99 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0247 0.3606 0.6147 1 2 0.0272 0.3657 0.6071 1 2 0.0308 0.3727 0.5965
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.050 1 3 1 381 109 272 46 0 10 0 53 0 0 271 0 1 0.4220 0.0000 0.0037 9.900 0.24 3.23 -2.99 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2636 0.5694 0.1670 1 1 0.2686 0.5663 0.1651 1 1 0.2752 0.5622 0.1626
chr20 62064735 TGCGCCGCCGGGG T 0.002933 0.050 1 -12 1 348 70 278 29 0 6 0 35 1 0 275 0 2 0.4143 0.0036 0.0108 10.667 1.59 11.34 -9.76 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3930 0.6047 0.0023 1 1 0.3977 0.6000 0.0023 1 1 0.4038 0.5940 0.0022
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.050 1 -6 2 299 67 232 0 0 10 0 57 0 0 225 1 6 0.0000 0.0000 0.0302 5.700 6.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.050 1 -1 1 332 161 171 91 0 2 0 68 0 1 170 0 0 0.5652 0.0000 0.0058 79.500 0.13 2.10 -1.97 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3946 0.5132 0.0921 1 1 0.3850 0.5165 0.0985 1 1 0.3722 0.5204 0.1074
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.050 1 6 4 764 220 544 211 0 3 0 6 0 0 544 0 0 0.9591 0.0000 0.0000 72.333 0.23 6.00 -5.77 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0107 0.9893 0.0000 0 0 0.7608 0.2392 0.0000 0 0 0.9421 0.0579 0.0000
chr21 33552491 GTGCTGACCGGTCTATGATGTCGTCATACTCTGC G 0.000002 0.050 1 -33 3 1081 318 763 278 1 34 0 5 0 0 763 0 0 0.8742 0.0000 0.0000 8.324 0.20 27.00 -26.80 50 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.050 1 -30 1 779 208 571 93 2 23 3 87 2 0 566 0 3 0.4471 0.0035 0.0088 8.318 1.77 14.40 -12.63 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4047 0.5232 0.0721 1 1 0.4061 0.5203 0.0736 1 1 0.4078 0.5167 0.0756
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.050 1 3 2 247 133 114 67 2 7 0 57 0 0 113 0 1 0.5038 0.0000 0.0088 18.000 0.07 3.05 -2.98 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3276 0.5228 0.1496 1 1 0.3239 0.5218 0.1543 1 1 0.3190 0.5205 0.1605
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.050 1 1 2 352 49 303 0 0 5 1 43 0 0 302 0 1 0.0000 0.0000 0.0033 8.600 1.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.050 1 2 2 953 145 808 132 0 5 1 7 1 1 805 1 0 0.9103 0.0012 0.0037 28.000 0.74 2.14 -1.40 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0794 0.9206 0.0000 0 1 0.4123 0.5877 0.0000
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.050 1 -2 2 957 148 809 133 2 5 2 6 1 1 806 1 0 0.8986 0.0012 0.0037 28.200 0.71 2.50 -1.79 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1114 0.8886 0.0000 0 1 0.4736 0.5264 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.050 1 -15 2 519 92 427 6 0 7 0 79 0 0 414 0 13 0.0652 0.0000 0.0304 12.143 1.17 11.94 -10.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8295 0.1705 2 2 0.0000 0.4670 0.5330
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.050 1 -9 7 315 167 148 0 0 27 3 137 0 0 147 0 1 0.0000 0.0000 0.0068 5.185 8.23 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr21 45504511 CGGCCCCCCAGGCCCCCCA C 0.019360 0.050 1 -18 7 316 172 144 27 10 120 5 10 0 0 144 0 0 0.1570 0.0000 0.0000 2.526 1.15 15.60 -14.45 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1251 0.8749 0.0000 0 0 0.8098 0.1902 0.0000
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.050 1 3 1 495 205 290 93 3 24 2 83 0 0 286 0 4 0.4537 0.0000 0.0138 7.542 0.22 2.93 -2.71 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3948 0.5130 0.0922 1 1 0.3945 0.5108 0.0947 1 1 0.3939 0.5081 0.0979
chr22 19183486 AAGCAGGTCAT A 0.001085 0.050 1 -10 1 264 115 149 59 0 7 0 49 0 0 146 0 3 0.5130 0.0000 0.0201 15.429 0.15 9.53 -9.38 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5497 0.4500 0.0003 1 0 0.5490 0.4507 0.0003 1 0 0.5480 0.4517 0.0003
chr22 21867418 C CCCG 0.004356 0.050 1 3 1 189 94 95 72 2 16 1 3 0 0 95 0 0 0.7660 0.0000 0.0000 4.812 0.53 2.00 -1.47 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9013 0.0987 0.0000 0 0 0.9939 0.0061 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.050 1 -3 3 200 103 97 45 2 11 3 42 0 0 93 0 4 0.4369 0.0000 0.0412 8.364 0.11 3.02 -2.91 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3365 0.5390 0.1246 1 1 0.3389 0.5364 0.1247 1 1 0.3420 0.5332 0.1249
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.050 1 -21 3 430 90 340 0 0 24 0 66 0 0 320 0 20 0.0000 0.0000 0.0588 2.750 16.02 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0158 0.9842 2 2 0.0000 0.0165 0.9835 2 2 0.0000 0.0175 0.9825
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.050 1 -3 1 724 198 526 113 0 4 1 80 0 0 524 0 2 0.5707 0.0000 0.0038 48.500 0.22 3.91 -3.69 57 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6587 0.3183 0.0229 1 0 0.6487 0.3260 0.0253 1 0 0.6350 0.3362 0.0288
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.050 1 -2 3 657 237 420 226 1 6 0 4 0 0 420 0 0 0.9536 0.0000 0.0000 38.500 0.31 2.00 -1.69 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3197 0.6803 0.0000 0 0 0.9519 0.0481 0.0000 0 0 0.9822 0.0178 0.0000
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.050 1 -21 6 540 70 470 7 0 4 2 57 0 0 470 0 0 0.1000 0.0000 0.0000 16.500 1.00 13.19 -12.19 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9519 0.0481 2 1 0.0000 0.7215 0.2785
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.050 1 -42 4 322 168 154 106 0 3 0 59 0 0 144 0 10 0.6310 0.0000 0.0649 55.000 0.21 22.20 -22.00 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7706 0.2205 0.0088 1 0 0.7602 0.2298 0.0101 1 0 0.7456 0.2425 0.0119
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.050 1 9 4 352 178 174 94 0 14 0 70 0 0 157 1 16 0.5281 0.0000 0.0977 11.714 0.12 6.97 -6.85 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3861 0.5147 0.0992 1 1 0.3857 0.5126 0.1018 1 1 0.3849 0.5099 0.1053
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.050 1 -3 3 236 112 124 52 0 7 0 53 0 0 122 0 2 0.4643 0.0000 0.0161 15.000 0.08 4.55 -4.47 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2735 0.5424 0.1841 1 1 0.2764 0.5397 0.1840 1 1 0.2801 0.5362 0.1837
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.050 1 3 3 339 135 204 0 1 2 1 131 0 0 197 0 7 0.0000 0.0000 0.0343 66.500 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0202 0.9798 2 2 0.0000 0.0192 0.9808
chr22 40861830 T TA 0.018262 0.050 1 1 2 689 172 517 1 0 4 0 167 0 0 515 0 2 0.0058 0.0000 0.0039 42.000 0.00 1.17 -1.17 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7953 0.2047 2 1 0.0000 0.6187 0.3813 2 1 0.0000 0.5757 0.4243
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.050 1 -18 2 333 103 230 6 0 20 0 77 0 0 213 0 17 0.0583 0.0000 0.0739 4.150 0.17 10.84 -10.68 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9785 0.0215 2 1 0.0000 0.8913 0.1087
588 rows