File Info

Filename
HG01868_x_HG01891_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG01868_x_HG01891_FF_10.features.tsv
Size
167.3 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 964529 AGGTCCGCAGTGGGGCTGCGGGGAGGGGGGCGCG A 0.000081 0.100 1 -33 1 512 140 372 83 7 35 7 8 0 0 367 1 4 0.5929 0.0000 0.0134 3.960 5.43 2.88 2.56 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0332 0.9668 0.0000 0 0 0.9453 0.0547 0.0000
chr1 1752908 C CCCTCCT 0.500000 0.100 1 6 1 387 129 258 111 0 12 0 6 0 0 257 0 1 0.8605 0.0000 0.0039 9.750 0.50 6.00 -5.50 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1291 0.8709 0.0000 0 0 0.7096 0.2904 0.0000
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 420 134 286 68 0 29 0 37 0 0 283 0 3 0.5075 0.0000 0.0105 3.621 0.29 8.68 -8.38 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8226 0.1742 0.0032 1 0 0.8122 0.1839 0.0039 1 0 0.7972 0.1977 0.0051
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 279 116 163 58 0 1 1 56 0 0 162 0 1 0.5000 0.0000 0.0061 114.000 0.12 3.57 -3.45 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1846 0.6381 0.1773 1 1 0.1895 0.6281 0.1824 1 1 0.1958 0.6154 0.1888
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 497 99 398 81 1 13 0 4 0 0 398 0 0 0.8182 0.0000 0.0000 6.615 0.40 3.50 -3.10 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0089 0.9911 0.0000 0 1 0.4593 0.5407 0.0000 0 0 0.8041 0.1959 0.0000
chr1 12879725 C CG 0.500000 0.100 1 1 3 650 247 403 147 1 18 2 79 0 0 403 0 0 0.5951 0.0000 0.0000 12.722 1.62 2.24 -0.62 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9922 0.0078 0.0000 1 0 0.9907 0.0093 0.0000 1 0 0.9883 0.0117 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 943 177 766 152 2 8 0 15 0 0 766 0 0 0.8588 0.0000 0.0000 21.125 0.36 3.27 -2.91 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1039 0.8961 0.0000
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.100 1 3 2 270 104 166 89 0 6 0 9 0 0 165 1 0 0.8558 0.0000 0.0060 16.333 0.22 3.00 -2.78 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.1128 0.8872 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 306 56 250 10 0 2 2 42 0 0 250 0 0 0.1786 0.0000 0.0000 27.000 0.60 1.07 -0.47 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0001 0.9478 0.0521 2 1 0.0000 0.9923 0.0077 2 1 0.0000 0.9850 0.0150
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 374 153 221 10 0 12 1 130 0 0 219 0 2 0.0654 0.0000 0.0090 11.750 0.10 3.12 -3.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9821 0.0179 2 2 0.0000 0.4914 0.5086
chr1 40515335 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 1 635 129 506 70 0 2 1 56 0 0 505 0 1 0.5426 0.0000 0.0020 63.500 0.44 2.46 -2.02 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4529 0.5066 0.0405 1 1 0.4513 0.5044 0.0443 1 1 0.4483 0.5020 0.0498
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 368 99 269 8 1 8 0 82 0 0 268 0 1 0.0808 0.0000 0.0037 11.375 0.12 3.29 -3.17 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9935 0.0065 2 1 0.0000 0.8278 0.1722
chr1 46668333 G GCCT 0.500000 0.100 1 3 5 363 141 222 126 2 10 0 3 0 0 222 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 13.100 0.77 2.33 -1.56 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4713 0.5287 0.0000 0 0 0.9613 0.0387 0.0000 0 0 0.9866 0.0134 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 541 133 408 1 1 17 3 111 0 0 407 0 1 0.0075 0.0000 0.0025 6.765 1.00 6.29 -5.29 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0422 0.9578 2 2 0.0000 0.0139 0.9861 2 2 0.0000 0.0099 0.9901
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 231 71 160 38 1 5 0 27 0 0 160 0 0 0.5352 0.0000 0.0000 13.200 0.34 2.96 -2.62 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5170 0.4351 0.0479 1 0 0.5098 0.4384 0.0518 1 0 0.4998 0.4428 0.0573
chr1 53327841 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 205 101 104 82 10 3 1 5 0 0 104 0 0 0.8119 0.0000 0.0000 32.667 1.48 4.20 -2.72 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1564 0.8436 0.0000 0 0 0.6528 0.3472 0.0000
chr1 62206717 T TAACAGA 0.500000 0.100 1 6 2 430 117 313 106 0 9 0 2 0 0 312 0 1 0.9060 0.0000 0.0032 12.000 0.50 6.00 -5.50 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2201 0.7799 0.0000 0 0 0.8909 0.1091 0.0000 0 0 0.9615 0.0385 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 149 57 92 4 0 3 0 50 0 0 88 0 4 0.0702 0.0000 0.0435 18.000 0.25 3.74 -3.49 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 1 0.0000 0.8266 0.1734 2 2 0.0000 0.4867 0.5133
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 303 155 148 126 0 20 0 9 0 0 147 0 1 0.8129 0.0000 0.0068 6.750 0.24 8.11 -7.87 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0127 0.9873 0.0000 0 1 0.4246 0.5754 0.0000
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 418 128 290 65 0 5 0 58 0 0 288 0 2 0.5078 0.0000 0.0069 24.600 0.09 5.12 -5.03 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2763 0.6212 0.1025 1 1 0.2798 0.6123 0.1079 1 1 0.2839 0.6010 0.1151
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.100 1 -6 1 419 127 292 56 1 20 0 50 0 0 292 0 0 0.4409 0.0000 0.0000 5.350 0.11 5.74 -5.63 12 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3404 0.5747 0.0849 1 1 0.3413 0.5689 0.0899 1 1 0.3418 0.5616 0.0966
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 201 82 119 75 0 4 0 3 0 0 119 0 0 0.9146 0.0000 0.0000 19.500 0.21 3.00 -2.79 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0550 0.9450 0.0000 0 0 0.6346 0.3654 0.0000 0 0 0.8474 0.1526 0.0000
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 397 107 290 93 3 5 0 6 0 0 289 0 1 0.8692 0.0000 0.0034 20.200 0.31 3.50 -3.19 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0651 0.9349 0.0000 0 0 0.5398 0.4602 0.0000
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 869 203 666 175 2 19 0 7 0 0 666 0 0 0.8621 0.0000 0.0000 9.632 0.22 25.86 -25.64 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.7992 0.2008 0.0000 0 0 0.9835 0.0165 0.0000
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 630 188 442 97 6 22 0 63 0 0 441 0 1 0.5160 0.0000 0.0023 7.810 0.43 3.84 -3.41 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9058 0.0937 0.0005 1 0 0.8983 0.1011 0.0006 1 0 0.8871 0.1120 0.0009
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 114 45 69 12 20 6 1 6 0 0 69 0 0 0.2667 0.0000 0.0000 3.833 0.17 2.00 -1.83 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2961 0.6985 0.0054 0 1 0.1046 0.8933 0.0022 0 1 0.0733 0.9259 0.0008
chr1 150558695 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 622 157 465 144 0 4 0 9 0 0 465 0 0 0.9172 0.0000 0.0000 38.250 1.40 2.78 -1.38 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0854 0.9146 0.0000 0 0 0.7717 0.2283 0.0000
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.100 1 18 1 1381 383 998 137 4 145 4 93 12 5 935 5 41 0.3577 0.0120 0.0631 1.621 3.04 9.42 -6.38 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3205 0.6611 0.0184 1 1 0.3316 0.6471 0.0213 1 1 0.3447 0.6297 0.0256
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1270 279 991 150 0 34 0 95 2 0 982 0 7 0.5376 0.0020 0.0091 7.206 0.54 3.53 -2.99 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9533 0.0466 0.0000 1 0 0.9488 0.0512 0.0001 1 0 0.9418 0.0581 0.0001
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 239 95 144 12 0 12 3 68 0 0 144 0 0 0.1263 0.0000 0.0000 6.667 0.50 1.62 -1.12 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9859 0.0141
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 237 93 144 81 0 9 0 3 0 0 144 0 0 0.8710 0.0000 0.0000 9.333 0.15 18.00 -17.85 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0731 0.9269 0.0000 0 0 0.7009 0.2991 0.0000 0 0 0.8813 0.1187 0.0000
chr1 152985344 GGAGCCCTGCCACCCCAAGGTGCCT G 0.500000 0.100 1 -24 2 579 242 337 209 1 28 0 4 0 0 336 0 1 0.8636 0.0000 0.0030 7.643 0.27 19.25 -18.98 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4034 0.5966 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1139 273 866 109 2 49 1 112 7 2 832 3 22 0.3993 0.0081 0.0393 4.646 2.41 9.84 -7.43 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0110 0.5117 0.4773 1 1 0.0128 0.5052 0.4820 1 1 0.0157 0.4978 0.4865
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 534 238 296 119 0 21 0 98 0 0 296 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 10.850 0.39 8.33 -7.94 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5837 0.4078 0.0085 1 0 0.5826 0.4075 0.0100 1 0 0.5797 0.4081 0.0123
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 234 100 134 6 0 2 0 92 0 0 133 0 1 0.0600 0.0000 0.0075 49.000 1.50 1.14 0.36 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8458 0.1542 2 2 0.0000 0.3362 0.6638
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 405 96 309 0 0 1 1 94 0 0 307 0 2 0.0000 0.0000 0.0065 95.000 2.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0069 0.9931 2 2 0.0000 0.0076 0.9924 2 2 0.0000 0.0087 0.9913
chr1 158700284 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 688 191 497 184 0 0 0 7 0 0 497 0 0 0.9634 0.0000 0.0000 191.000 0.24 2.71 -2.47 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.8503 0.1497 0.0000 0 0 0.9883 0.0117 0.0000
chr1 159062696 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 222 81 141 49 2 3 3 24 0 0 139 0 2 0.6049 0.0000 0.0142 25.333 0.45 1.71 -1.26 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7398 0.2504 0.0098 1 0 0.7283 0.2603 0.0114 1 0 0.7122 0.2739 0.0139
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 840 175 665 12 0 6 0 157 0 0 661 0 4 0.0686 0.0000 0.0060 28.167 0.17 1.38 -1.21 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9911 0.0089 2 2 0.0000 0.4701 0.5299
chr1 159929653 T TGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 2 643 151 492 141 0 7 0 3 0 0 491 0 1 0.9338 0.0000 0.0020 20.571 0.33 6.67 -6.34 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1541 0.8459 0.0000 0 0 0.9418 0.0582 0.0000 0 0 0.9863 0.0137 0.0000
chr1 160681128 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 499 161 338 89 1 7 1 63 0 0 338 0 0 0.5528 0.0000 0.0000 21.714 1.25 2.32 -1.07 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7525 0.2431 0.0044 1 0 0.7439 0.2508 0.0053 1 0 0.7315 0.2618 0.0067
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 170 49 121 45 0 0 0 4 0 0 121 0 0 0.9184 0.0000 0.0000 49.000 0.11 1.25 -1.14 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.1183 0.8817 0.0000 0 1 0.4055 0.5945 0.0000
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 289 59 230 27 0 4 1 27 0 0 230 0 0 0.4576 0.0000 0.0000 13.750 0.33 1.85 -1.52 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1978 0.5658 0.2364 1 1 0.2008 0.5608 0.2383 1 1 0.2047 0.5546 0.2407
chr1 182952865 T TCCGCCG 0.500000 0.100 1 6 2 511 170 341 147 1 19 0 3 0 0 339 0 2 0.8647 0.0000 0.0059 7.947 0.22 6.00 -5.78 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0274 0.9726 0.0000 0 0 0.8878 0.1122 0.0000 0 0 0.9815 0.0185 0.0000
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 601 149 452 124 0 4 1 20 0 0 452 0 0 0.8322 0.0000 0.0000 36.250 0.81 4.90 -4.09 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 596 149 447 127 0 1 0 21 0 0 446 0 1 0.8523 0.0000 0.0022 148.000 0.76 4.76 -4.00 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 100 50 50 48 0 0 0 2 0 0 50 0 0 0.9600 0.0000 0.0000 50.000 0.23 2.00 -1.77 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1202 0.8798 0.0000 0 0 0.5669 0.4331 0.0000 0 0 0.7400 0.2600 0.0000
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 493 172 321 18 0 26 0 128 0 0 281 0 40 0.1047 0.0000 0.1246 5.615 1.72 13.38 -11.66 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9677 0.0323
chr1 205663089 GGCCGACAGCCCTTCTGCTGGCTCGGTGGGGCCCAGC G 0.500000 0.100 1 -36 5 615 135 480 21 0 3 0 111 0 0 442 0 38 0.1556 0.0000 0.0792 44.000 0.14 24.63 -24.49 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9981 0.0019
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 488 203 285 81 75 41 0 6 0 3 282 0 0 0.3990 0.0000 0.0105 3.927 0.44 3.17 -2.72 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0051 0.9949 0.0000 0 0 0.8185 0.1815 0.0000 0 0 0.9785 0.0215 0.0000
chr1 209432291 TAGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 488 205 283 88 3 38 61 15 0 0 276 6 1 0.4293 0.0000 0.0247 4.514 0.44 3.80 -3.36 38 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3211 0.6230 0.0559 1 1 0.3259 0.6134 0.0607 1 1 0.3311 0.6015 0.0674
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 488 215 273 123 2 26 0 64 0 0 265 0 8 0.5721 0.0000 0.0293 7.269 0.88 10.70 -9.83 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9732 0.0268 0.0000 1 0 0.9696 0.0304 0.0000 1 0 0.9639 0.0360 0.0001
chr1 225519331 A ATCCAGGCGTTCCTGCCGC 0.500000 0.100 1 18 1 409 113 296 24 0 63 0 26 0 0 285 0 11 0.2124 0.0000 0.0372 0.794 0.92 5.62 -4.70 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0418 0.4087 0.5496 1 2 0.0454 0.4135 0.5411 1 2 0.0507 0.4199 0.5295
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 245 97 148 54 0 2 0 41 0 0 148 0 0 0.5567 0.0000 0.0000 47.500 0.22 1.34 -1.12 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5116 0.4495 0.0389 1 0 0.5062 0.4513 0.0425 1 0 0.4984 0.4539 0.0477
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 565 137 428 9 0 12 4 112 2 0 421 2 3 0.0657 0.0047 0.0164 11.364 0.00 3.58 -3.58 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 1 0.0000 0.7718 0.2282
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 706 192 514 6 0 6 0 180 0 0 513 0 1 0.0312 0.0000 0.0019 31.000 0.17 3.08 -2.92 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9839 0.0161 2 2 0.0000 0.0659 0.9341 2 2 0.0000 0.0072 0.9928
chr1 248239401 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 649 141 508 131 0 2 0 8 0 0 508 0 0 0.9291 0.0000 0.0000 69.500 0.78 1.12 -0.35 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1225 0.8775 0.0000 0 0 0.7728 0.2272 0.0000
chr1 248361985 CTACG C 0.500000 0.100 1 -4 2 1253 303 950 293 0 3 0 7 0 0 949 0 1 0.9670 0.0000 0.0011 100.000 0.28 7.29 -7.01 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0549 0.9451 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1119 265 854 11 0 2 3 249 0 0 853 0 1 0.0415 0.0000 0.0012 131.500 2.82 1.29 1.53 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.2827 0.7173 2 2 0.0000 0.0054 0.9946
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 574 212 362 189 0 9 0 14 0 0 362 0 0 0.8915 0.0000 0.0000 22.556 1.54 4.00 -2.46 155 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0042 0.9958 0.0000 0 0 0.5465 0.4535 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 695 73 622 0 0 2 1 70 0 0 614 0 8 0.0000 0.0000 0.0129 35.500 3.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0175 0.9825 2 2 0.0000 0.0190 0.9810 2 2 0.0000 0.0212 0.9788
chr1 248442053 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 894 208 686 188 1 3 0 16 0 0 686 0 0 0.9038 0.0000 0.0000 68.333 0.63 2.38 -1.74 86 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.2536 0.7464 0.0000
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.100 1 9 1 600 110 490 90 0 16 0 4 1 0 488 0 1 0.8182 0.0020 0.0041 5.875 0.32 10.00 -9.68 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.3146 0.6854 0.0000 0 0 0.7697 0.2303 0.0000
chr1 248522528 CAA C 0.500000 0.100 1 -2 3 600 146 454 137 0 1 0 8 0 0 453 1 0 0.9384 0.0000 0.0022 145.000 0.25 3.12 -2.88 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1238 0.8762 0.0000 0 0 0.7824 0.2176 0.0000
chr1 248626807 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 1 794 214 580 201 1 4 1 7 1 0 579 0 0 0.9393 0.0017 0.0017 52.250 0.96 3.00 -2.04 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.8394 0.1606 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000
chr1 248638622 CAGAT C 0.500000 0.100 1 -4 1 444 208 236 194 0 10 0 4 0 0 236 0 0 0.9327 0.0000 0.0000 19.800 5.41 9.50 -4.09 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7307 0.2693 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 439 182 257 4 0 13 1 164 0 0 255 0 2 0.0220 0.0000 0.0078 13.000 0.75 6.99 -6.24 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5935 0.4065 2 2 0.0000 0.0166 0.9834 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 800 141 659 109 1 6 0 25 0 0 658 0 1 0.7730 0.0000 0.0015 22.500 0.32 3.56 -3.24 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 250 122 128 60 0 4 0 58 0 0 127 0 1 0.4918 0.0000 0.0078 29.500 0.18 3.78 -3.59 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2287 0.6370 0.1342 1 1 0.2344 0.6270 0.1386 1 1 0.2415 0.6142 0.1443
chr2 17781726 CAAGTT C 0.103121 0.100 1 -5 2 540 123 417 70 0 4 0 49 0 0 416 0 1 0.5691 0.0000 0.0024 29.750 0.33 5.18 -4.86 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7820 0.2163 0.0017 1 0 0.7763 0.2218 0.0020 1 0 0.7681 0.2295 0.0024
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 369 127 242 0 2 12 1 112 0 0 231 0 11 0.0000 0.0000 0.0455 9.583 10.80 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0469 0.9531 2 2 0.0000 0.0070 0.9930 2 2 0.0000 0.0037 0.9963
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.100 1 9 1 429 91 338 69 0 16 0 6 0 1 337 0 0 0.7582 0.0000 0.0030 4.688 0.52 8.17 -7.64 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.4615 0.5385 0.0000 0 0 0.9075 0.0925 0.0000
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 229 64 165 59 0 0 0 5 0 0 165 0 0 0.9219 0.0000 0.0000 64.000 0.27 2.60 -2.33 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0852 0.9148 0.0000 0 1 0.4145 0.5855 0.0000
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 343 110 233 57 0 12 0 41 0 0 231 0 2 0.5182 0.0000 0.0086 8.167 0.37 2.90 -2.53 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5326 0.4342 0.0332 1 0 0.5268 0.4367 0.0366 1 0 0.5184 0.4402 0.0414
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 434 179 255 77 0 14 1 87 0 0 254 0 1 0.4302 0.0000 0.0039 11.714 0.29 3.46 -3.17 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0390 0.5619 0.3991 1 1 0.0429 0.5558 0.4013 1 1 0.0485 0.5483 0.4032
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 444 113 331 5 48 27 1 32 0 1 329 1 0 0.0442 0.0000 0.0060 3.185 1.00 3.41 -2.41 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6926 0.2941 0.0133 1 0 0.6821 0.3026 0.0153 1 0 0.6673 0.3144 0.0183
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 446 114 332 32 7 25 13 37 0 0 331 0 1 0.2807 0.0000 0.0030 3.480 3.06 3.24 -0.18 8 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0405 0.4452 0.5144 1 2 0.0441 0.4473 0.5085 1 2 0.0494 0.4504 0.5001
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 447 116 331 39 3 56 0 18 0 0 331 0 0 0.3362 0.0000 0.0000 1.055 3.00 5.06 -2.06 7 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7990 0.1944 0.0067 1 0 0.7867 0.2054 0.0079 1 0 0.7685 0.2217 0.0098
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 447 108 339 56 0 7 0 45 0 0 338 0 1 0.5185 0.0000 0.0029 14.429 0.16 3.20 -3.04 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4234 0.5183 0.0583 1 1 0.4213 0.5160 0.0627 1 1 0.4180 0.5133 0.0688
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 967 241 726 201 0 37 0 3 1 0 719 0 6 0.8340 0.0014 0.0096 5.514 0.32 8.33 -8.01 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6240 0.3760 0.0000 0 0 0.9825 0.0175 0.0000
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.100 1 -9 1 411 165 246 145 0 16 0 4 0 0 246 0 0 0.8788 0.0000 0.0000 9.312 0.14 9.50 -9.36 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1824 0.8176 0.0000 0 0 0.9518 0.0482 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 324 121 203 58 0 14 1 48 0 0 201 1 1 0.4793 0.0000 0.0099 7.643 0.31 4.02 -3.71 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3362 0.5782 0.0856 1 1 0.3373 0.5722 0.0906 1 1 0.3381 0.5645 0.0973
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 424 134 290 0 0 25 3 106 0 0 286 1 3 0.0000 0.0000 0.0138 4.360 3.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr2 99593872 CG C 0.500000 0.100 1 -1 4 658 150 508 12 0 4 10 124 0 0 501 4 3 0.0800 0.0000 0.0138 36.500 0.42 7.52 -7.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9965 0.0035 2 1 0.0000 0.6901 0.3099
chr2 99593875 CTGAGG C 0.500000 0.100 1 -5 2 665 148 517 12 0 3 2 131 0 0 508 1 8 0.0811 0.0000 0.0174 48.333 0.42 7.63 -7.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 1 0.0000 0.6926 0.3074
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.100 1 3 4 495 139 356 130 1 2 0 6 0 0 356 0 0 0.9353 0.0000 0.0000 68.000 0.22 3.00 -2.78 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.5371 0.4629 0.0000 0 0 0.9242 0.0758 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 112 50 62 6 0 0 0 44 0 0 62 0 0 0.1200 0.0000 0.0000 50.000 0.67 3.32 -2.65 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9851 0.0149 2 1 0.0000 0.8476 0.1524
chr2 118846529 CGCCGCCGCCGCCACTGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -24 2 412 134 278 112 1 15 2 4 0 0 278 0 0 0.8358 0.0000 0.0000 7.867 1.43 12.50 -11.07 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.4256 0.5744 0.0000 0 0 0.8599 0.1401 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 544 121 423 0 0 0 0 121 0 0 411 0 12 0.0000 0.0000 0.0284 121.000 5.91 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 317 116 201 51 0 16 0 49 0 0 200 0 1 0.4397 0.0000 0.0050 6.250 0.41 6.18 -5.77 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2087 0.6202 0.1711 1 1 0.2127 0.6114 0.1758 1 1 0.2178 0.6003 0.1819
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 159 45 114 13 2 6 8 16 0 0 114 0 0 0.2889 0.0000 0.0000 4.833 1.77 1.81 -0.04 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0891 0.4710 0.4399 1 1 0.0934 0.4728 0.4338 1 1 0.0994 0.4751 0.4255
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 199 90 109 49 0 21 0 20 0 0 108 0 1 0.5444 0.0000 0.0092 3.286 0.22 10.60 -10.38 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8478 0.1489 0.0033 1 0 0.8365 0.1594 0.0040 1 0 0.8202 0.1745 0.0052
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 280 122 158 13 0 1 1 107 0 0 154 0 4 0.1066 0.0000 0.0253 121.000 0.31 2.92 -2.61 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9484 0.0516
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 661 123 538 7 0 7 1 108 0 0 531 0 7 0.0569 0.0000 0.0130 16.429 0.43 4.04 -3.61 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8410 0.1590 2 2 0.0000 0.2443 0.7557
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 297 121 176 12 2 10 42 55 0 0 174 0 2 0.0992 0.0000 0.0114 6.900 1.50 3.27 -1.77 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9832 0.0168
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 297 121 176 55 1 54 3 8 0 0 175 1 0 0.4545 0.0000 0.0057 1.204 2.85 4.38 -1.52 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.0211 0.9789 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 297 123 174 10 9 16 42 46 0 0 174 0 0 0.0813 0.0000 0.0000 4.000 1.10 3.28 -2.18 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9934 0.0066
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 228 70 158 27 6 5 6 26 0 0 158 0 0 0.3857 0.0000 0.0000 11.800 0.11 1.27 -1.16 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2289 0.5740 0.1971 1 1 0.2312 0.5685 0.2003 1 1 0.2342 0.5615 0.2043
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 224 73 151 49 7 11 1 5 0 0 151 0 0 0.6712 0.0000 0.0000 5.000 0.98 1.80 -0.82 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0561 0.9439 0.0000 0 1 0.3172 0.6828 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 291 97 194 58 1 2 0 36 0 0 193 0 1 0.5979 0.0000 0.0052 47.000 0.26 3.39 -3.13 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7217 0.2686 0.0098 1 0 0.7111 0.2775 0.0114 1 0 0.6962 0.2899 0.0139
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 529 140 389 0 0 17 2 121 0 0 386 1 2 0.0000 0.0000 0.0077 7.235 8.87 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr2 219496868 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 408 108 300 105 0 0 0 3 0 0 300 0 0 0.9722 0.0000 0.0000 108.000 0.57 1.00 -0.43 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2137 0.7863 0.0000 0 0 0.8862 0.1138 0.0000 0 0 0.9597 0.0403 0.0000
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 596 198 398 96 2 7 9 84 0 0 374 0 24 0.4848 0.0000 0.0603 26.429 0.24 15.04 -14.80 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0139 0.4778 0.5083 1 2 0.0161 0.4744 0.5095 1 2 0.0193 0.4710 0.5097
chr2 231460703 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 1 691 139 552 75 0 4 0 60 0 0 552 0 0 0.5396 0.0000 0.0000 33.750 0.63 3.38 -2.76 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5187 0.4548 0.0265 1 0 0.5153 0.4551 0.0296 1 0 0.5099 0.4561 0.0340
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 162 53 109 46 0 4 0 3 0 0 109 0 0 0.8679 0.0000 0.0000 12.250 0.57 3.00 -2.43 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0131 0.9869 0.0000 0 1 0.2898 0.7102 0.0000 0 0 0.5761 0.4239 0.0000
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 719 203 516 191 0 0 0 12 0 0 516 0 0 0.9409 0.0000 0.0000 203.000 0.50 1.08 -0.58 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0381 0.9619 0.0000 0 0 0.8277 0.1723 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 371 119 252 1 1 21 8 88 0 0 252 0 0 0.0084 0.0000 0.0000 4.850 6.00 3.17 2.83 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0708 0.9292 2 2 0.0000 0.0255 0.9745 2 2 0.0000 0.0191 0.9809
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 449 139 310 135 1 0 0 3 0 0 310 0 0 0.9712 0.0000 0.0000 139.000 0.20 2.00 -1.80 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5660 0.4340 0.0000 0 0 0.9734 0.0266 0.0000 0 0 0.9908 0.0092 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 499 125 374 0 1 3 0 121 0 0 370 0 4 0.0000 0.0000 0.0107 40.667 3.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 383 95 288 63 0 12 0 20 0 0 282 0 6 0.6632 0.0000 0.0208 6.917 1.19 11.70 -10.51 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9515 0.0483 0.0002 1 0 0.9463 0.0535 0.0002 1 0 0.9384 0.0613 0.0003
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 462 108 354 3 0 2 4 99 0 0 353 1 0 0.0278 0.0000 0.0028 52.000 0.00 4.86 -4.86 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8002 0.1998 2 2 0.0000 0.1213 0.8787 2 2 0.0000 0.0431 0.9569
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 475 142 333 132 0 4 0 6 0 0 332 0 1 0.9296 0.0000 0.0030 34.500 0.32 3.17 -2.85 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2973 0.7027 0.0000 0 0 0.8713 0.1287 0.0000
chr3 40462027 GTAC G 0.500000 0.100 1 -3 3 695 289 406 251 8 15 2 13 0 0 406 0 0 0.8685 0.0000 0.0000 19.286 6.48 2.62 3.86 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2412 0.7588 0.0000 0 0 0.9821 0.0179 0.0000
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 695 253 442 26 100 38 1 88 1 1 415 2 23 0.1028 0.0023 0.0611 5.632 3.69 10.69 -7.00 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3380 0.6340 0.0279 1 1 0.3459 0.6226 0.0315 1 1 0.3550 0.6083 0.0367
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 653 184 469 15 0 46 3 120 0 0 456 0 13 0.0815 0.0000 0.0277 2.978 4.47 5.27 -0.80 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9526 0.0474
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 654 199 455 143 9 32 2 13 0 0 455 0 0 0.7186 0.0000 0.0000 5.219 4.53 3.54 0.99 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0964 0.9036 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 532 164 368 0 0 11 0 153 0 0 366 0 2 0.0000 0.0000 0.0054 13.909 2.47 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr3 44651128 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 5 207 75 132 49 0 3 0 23 0 0 132 0 0 0.6533 0.0000 0.0000 24.000 0.16 3.57 -3.40 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8183 0.1770 0.0047 1 0 0.8066 0.1877 0.0057 1 0 0.7901 0.2027 0.0072
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 332 144 188 0 0 2 0 142 0 0 188 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 71.000 4.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 572 154 418 53 0 20 8 73 0 0 416 1 1 0.3442 0.0000 0.0048 6.700 0.30 3.40 -3.10 27 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0023 0.1684 0.8293 1 2 0.0028 0.1774 0.8197 1 2 0.0037 0.1903 0.8060
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 414 134 280 48 1 19 8 58 0 0 279 0 1 0.3582 0.0000 0.0036 6.000 0.25 3.83 -3.58 20 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0179 0.3696 0.6125 1 2 0.0203 0.3745 0.6052 1 2 0.0239 0.3815 0.5946
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 414 139 275 58 1 71 1 8 0 0 275 0 0 0.4173 0.0000 0.0000 0.971 0.36 5.88 -5.51 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.0836 0.9164 0.0000
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.100 1 6 1 457 153 304 60 0 24 1 68 0 1 296 0 7 0.3922 0.0000 0.0263 5.333 0.55 5.44 -4.89 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0257 0.4513 0.5230 1 2 0.0286 0.4518 0.5195 1 2 0.0330 0.4530 0.5140
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 459 167 292 144 1 19 0 3 0 0 290 0 2 0.8623 0.0000 0.0068 7.789 2.69 6.33 -3.65 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0236 0.9764 0.0000 0 0 0.8718 0.1282 0.0000 0 0 0.9787 0.0213 0.0000
chr3 52693748 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 732 191 541 172 0 12 0 7 0 0 541 0 0 0.9005 0.0000 0.0000 14.917 0.30 3.86 -3.55 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.7573 0.2427 0.0000 0 0 0.9792 0.0208 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 152 81 71 37 0 13 1 30 0 0 69 0 2 0.4568 0.0000 0.0282 5.231 0.08 7.60 -7.52 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2987 0.5663 0.1351 1 1 0.2992 0.5613 0.1395 1 1 0.2996 0.5550 0.1455
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 234 80 154 1 0 4 39 36 0 0 153 1 0 0.0125 0.0000 0.0065 19.000 0.00 3.22 -3.22 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1685 0.8315 2 2 0.0000 0.0644 0.9356 2 2 0.0000 0.0478 0.9522
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 233 78 155 2 0 2 32 42 0 0 154 0 1 0.0256 0.0000 0.0065 38.000 0.50 4.21 -3.71 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6692 0.3308 2 2 0.0000 0.1780 0.8220 2 2 0.0000 0.0937 0.9063
chr3 62372545 G GCCGCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 389 77 312 57 4 12 0 4 0 0 312 0 0 0.7403 0.0000 0.0000 5.417 0.60 5.75 -5.15 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0031 0.9969 0.0000 0 1 0.2294 0.7706 0.0000 0 0 0.5969 0.4031 0.0000
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 291 120 171 9 2 8 2 99 0 0 169 0 2 0.0750 0.0000 0.0117 14.000 0.67 3.11 -2.44 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 0.8818 0.1182
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 762 169 593 159 0 4 0 6 0 0 593 0 0 0.9408 0.0000 0.0000 41.250 0.97 1.00 -0.03 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 0 0.8278 0.1722 0.0000 0 0 0.9796 0.0204 0.0000
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 710 180 530 152 0 10 0 18 0 0 530 0 0 0.8444 0.0000 0.0000 17.000 0.82 9.50 -8.68 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0151 0.9849 0.0000
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 495 153 342 133 0 11 0 9 0 0 342 0 0 0.8693 0.0000 0.0000 12.909 0.39 1.00 -0.61 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0525 0.9475 0.0000 0 0 0.6668 0.3332 0.0000
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 385 111 274 95 0 13 0 3 0 0 273 1 0 0.8559 0.0000 0.0036 7.538 0.36 1.00 -0.64 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1074 0.8926 0.0000 0 0 0.7756 0.2244 0.0000 0 0 0.9186 0.0814 0.0000
chr3 107772911 TAGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 644 156 488 147 0 3 0 6 0 0 487 0 1 0.9423 0.0000 0.0020 51.000 0.14 3.33 -3.19 77 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4723 0.5277 0.0000 0 0 0.9334 0.0666 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 114 36 78 16 2 2 12 4 0 0 77 1 0 0.4444 0.0000 0.0128 16.000 0.06 1.25 -1.19 0 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3033 0.5266 0.1701 1 1 0.3021 0.5246 0.1733 1 1 0.3005 0.5221 0.1775
chr3 112534211 C CAA 0.500000 0.100 1 2 1 114 36 78 16 2 6 0 12 0 0 77 0 1 0.4444 0.0000 0.0128 5.000 0.06 2.08 -2.02 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3527 0.5108 0.1365 1 1 0.3497 0.5099 0.1404 1 1 0.3456 0.5088 0.1456
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1151 268 883 0 0 58 109 101 0 0 882 0 1 0.0000 0.0000 0.0011 3.569 3.28 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 1154 274 880 4 4 147 3 116 0 0 879 1 0 0.0146 0.0000 0.0011 0.854 0.25 8.02 -7.77 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9772 0.0228 2 2 0.0000 0.3062 0.6938 2 2 0.0000 0.0808 0.9192
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1159 283 876 99 9 50 16 109 0 0 876 0 0 0.3498 0.0000 0.0000 4.771 2.70 7.85 -5.16 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0185 0.5528 0.4287 1 1 0.0211 0.5453 0.4336 1 1 0.0251 0.5364 0.4385
chr3 119146279 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 600 182 418 92 0 13 0 77 0 0 415 0 3 0.5055 0.0000 0.0072 13.000 0.26 3.10 -2.84 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3987 0.5643 0.0369 1 1 0.4013 0.5579 0.0408 1 1 0.4036 0.5501 0.0463
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 512 148 364 92 1 2 0 53 0 0 363 0 1 0.6216 0.0000 0.0027 73.000 0.11 3.11 -3.00 68 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9203 0.0793 0.0004 1 0 0.9130 0.0865 0.0005 1 0 0.9021 0.0972 0.0008
chr3 123700269 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 660 146 514 78 0 6 0 62 0 0 513 0 1 0.5342 0.0000 0.0019 23.333 0.41 3.03 -2.62 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5118 0.4621 0.0262 1 0 0.5089 0.4619 0.0292 1 0 0.5042 0.4621 0.0336
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 755 148 607 2 2 26 1 117 0 0 606 0 1 0.0135 0.0000 0.0016 4.654 0.50 8.39 -7.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5961 0.4039 2 2 0.0000 0.0695 0.9305 2 2 0.0000 0.0249 0.9751
chr3 125055810 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 5 247 81 166 47 0 4 0 30 1 0 164 0 1 0.5802 0.0060 0.0120 19.250 0.91 3.60 -2.69 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6326 0.3456 0.0218 1 0 0.6229 0.3527 0.0244 1 0 0.6093 0.3623 0.0283
chr3 128915468 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 590 133 457 125 2 2 0 4 0 0 457 0 0 0.9398 0.0000 0.0000 65.500 0.54 1.50 -0.96 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0819 0.9181 0.0000 0 0 0.8893 0.1107 0.0000 0 0 0.9733 0.0267 0.0000
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 187 100 87 45 0 0 0 55 0 0 87 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 100.000 0.42 2.73 -2.31 31 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0586 0.5158 0.4255 1 1 0.0630 0.5137 0.4233 1 1 0.0691 0.5113 0.4197
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 363 146 217 77 1 2 0 66 0 0 217 0 0 0.5274 0.0000 0.0000 72.000 1.18 2.15 -0.97 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4297 0.5304 0.0399 1 1 0.4297 0.5265 0.0437 1 1 0.4288 0.5219 0.0493
chr3 149520808 C CTTAA 0.500000 0.100 1 4 1 219 76 143 52 0 0 0 24 0 0 142 0 1 0.6842 0.0000 0.0070 76.000 0.29 4.33 -4.04 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8295 0.1666 0.0039 1 0 0.8182 0.1771 0.0048 1 0 0.8020 0.1919 0.0061
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 413 160 253 118 2 24 0 16 0 0 253 0 0 0.7375 0.0000 0.0000 5.667 0.39 3.25 -2.86 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0116 0.9884 0.0000
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 517 114 403 49 2 18 0 45 0 0 401 0 2 0.4298 0.0000 0.0050 5.333 0.41 3.44 -3.04 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2756 0.5997 0.1248 1 1 0.2780 0.5923 0.1298 1 1 0.2807 0.5829 0.1364
chr3 195751094 GGCCGGTGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 294 103 191 98 0 3 0 2 0 0 191 0 0 0.9515 0.0000 0.0000 33.333 0.85 5.00 -4.15 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6341 0.3659 0.0000 0 0 0.9408 0.0592 0.0000 0 0 0.9699 0.0301 0.0000
chr3 195783188 TGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAGGGCTGGTGACATGAAGAGGGGTGGC T 0.500000 0.100 1 -48 2 146 49 97 16 4 3 3 23 16 4 72 3 2 0.3265 0.1649 0.2577 21.500 5.88 5.96 -0.08 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4309 0.4966 0.0725 1 1 0.4268 0.4962 0.0770 1 1 0.4210 0.4959 0.0831
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 848 193 655 0 0 18 0 175 0 1 613 1 40 0.0000 0.0000 0.0641 9.722 11.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 223 89 134 0 0 20 1 68 0 0 132 0 2 0.0000 0.0000 0.0149 3.450 6.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0262 0.9738 2 2 0.0000 0.0281 0.9719 2 2 0.0000 0.0310 0.9690
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 223 92 131 3 3 19 52 15 0 0 131 0 0 0.0326 0.0000 0.0000 3.737 1.33 8.13 -6.80 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9925 0.0075 2 1 0.0000 0.7496 0.2504 2 2 0.0000 0.4041 0.5959
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 538 130 408 76 0 2 0 52 0 0 365 1 42 0.5846 0.0000 0.1054 64.000 0.36 16.35 -15.99 26 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0046 0.3117 0.6837 1 2 0.0054 0.3134 0.6812 1 2 0.0064 0.3165 0.6771
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 414 173 241 63 2 59 0 49 0 0 237 0 4 0.3642 0.0000 0.0166 1.932 1.67 8.02 -6.35 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5648 0.4171 0.0181 1 0 0.5635 0.4167 0.0198 1 0 0.5611 0.4168 0.0222
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 557 160 397 151 0 7 0 2 1 0 396 0 0 0.9437 0.0025 0.0025 21.857 0.58 13.00 -12.42 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9973 0.0027 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.100 1 -6 2 511 146 365 139 0 0 0 7 0 0 365 0 0 0.9521 0.0000 0.0000 146.000 0.32 6.00 -5.68 77 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 0 0.9014 0.0986 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000
chr4 15003254 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 657 174 483 72 0 12 12 78 1 3 465 5 9 0.4138 0.0021 0.0373 14.727 1.07 6.51 -5.44 0 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0029 0.2277 0.7694 1 2 0.0036 0.2349 0.7615 1 2 0.0047 0.2453 0.7500
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 657 174 483 72 0 28 2 72 2 2 466 0 13 0.4138 0.0041 0.0352 5.179 1.07 7.72 -6.65 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0372 0.5488 0.4140 1 1 0.0410 0.5435 0.4156 1 1 0.0464 0.5370 0.4165
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 661 209 452 90 4 35 6 74 0 0 445 2 5 0.4306 0.0000 0.0155 5.242 1.60 7.15 -5.55 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2773 0.6562 0.0665 1 1 0.2834 0.6448 0.0718 1 1 0.2905 0.6303 0.0792
chr4 41745972 AGCTGCCGCCGCTGCC A 0.500000 0.100 1 -15 2 431 96 335 53 0 11 0 32 0 0 331 0 4 0.5521 0.0000 0.0119 7.727 1.19 10.38 -9.19 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6218 0.3568 0.0214 1 0 0.6129 0.3631 0.0240 1 0 0.6003 0.3718 0.0279
chr4 47595882 C CA 0.500000 0.100 1 1 3 199 48 151 28 0 0 0 20 0 0 151 0 0 0.5833 0.0000 0.0000 48.000 0.54 1.10 -0.56 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4255 0.4873 0.0871 1 1 0.4205 0.4879 0.0916 1 1 0.4137 0.4886 0.0977
chr4 56931051 GGAGCTGTCTCCTCCCATGGAGGTGGTCCAGAAGGAGCCTGTTCAGATA G 0.500000 0.100 1 -48 1 920 257 663 112 5 80 3 57 0 0 663 0 0 0.4358 0.0000 0.0000 2.289 0.38 2.68 -2.31 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9824 0.0176 0.0000 1 0 0.9796 0.0204 0.0000 1 0 0.9751 0.0249 0.0000
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 3 420 117 303 60 0 2 1 54 0 6 295 0 2 0.5128 0.0000 0.0264 57.500 0.72 3.89 -3.17 36 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3944 0.5482 0.0574 1 1 0.3944 0.5437 0.0619 1 1 0.3936 0.5383 0.0681
chr4 71567805 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 419 112 307 102 0 3 0 7 0 0 307 0 0 0.9107 0.0000 0.0000 36.333 0.85 1.57 -0.72 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0880 0.9120 0.0000 0 0 0.6139 0.3861 0.0000
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.100 1 3 1 344 103 241 64 0 1 0 38 0 0 241 0 0 0.6214 0.0000 0.0000 102.000 0.62 3.32 -2.69 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7959 0.1995 0.0046 1 0 0.7851 0.2093 0.0055 1 0 0.7698 0.2231 0.0071
chr4 78870928 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 520 216 304 159 8 28 0 21 0 0 304 0 0 0.7361 0.0000 0.0000 6.643 0.32 3.00 -2.68 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0045 0.9955 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2258 503 1755 178 8 157 7 153 1 2 1735 3 14 0.3539 0.0006 0.0114 2.205 1.64 8.65 -7.01 52 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2074 0.7723 0.0204 1 1 0.2217 0.7545 0.0238 1 1 0.2399 0.7311 0.0290
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3545 793 2752 423 22 45 13 290 53 48 2486 126 39 0.5334 0.0193 0.0967 17.500 2.70 8.51 -5.81 69 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9741 0.0259 0.0000 1 0 0.9742 0.0258 0.0000 1 0 0.9739 0.0261 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3271 1001 2270 62 17 168 58 696 238 47 1936 19 30 0.0619 0.1048 0.1471 4.807 2.37 8.60 -6.23 4 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 87616280 TAGCAGTGACAGCAGTGAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2625 828 1797 640 50 111 8 19 19 15 1747 8 8 0.7729 0.0106 0.0278 6.575 2.47 9.37 -6.90 186 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0887 0.9113 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 88697607 GACCAGCCGCGCTGTCAGGGTC G 0.500000 0.100 1 -21 1 569 198 371 161 1 30 0 6 0 0 367 0 4 0.8131 0.0000 0.0108 5.600 0.98 21.83 -20.86 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0720 0.9280 0.0000 0 0 0.8089 0.1911 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 198 86 112 42 0 4 0 40 0 0 112 0 0 0.4884 0.0000 0.0000 20.500 0.21 3.05 -2.84 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2424 0.5945 0.1631 1 1 0.2451 0.5875 0.1674 1 1 0.2483 0.5787 0.1731
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 727 190 537 93 0 5 0 92 0 0 535 0 2 0.4895 0.0000 0.0037 37.000 0.10 3.14 -3.04 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1291 0.7135 0.1574 1 1 0.1361 0.6991 0.1647 1 1 0.1453 0.6806 0.1741
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 509 208 301 0 0 22 8 178 0 0 297 0 4 0.0000 0.0000 0.0133 8.455 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 140398890 GCT G 0.500000 0.100 1 -2 5 178 78 100 71 1 0 0 6 0 0 100 0 0 0.9103 0.0000 0.0000 78.000 0.14 2.83 -2.69 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0576 0.9424 0.0000 0 1 0.4107 0.5893 0.0000
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 441 156 285 59 6 34 6 51 3 1 278 2 1 0.3782 0.0105 0.0246 3.588 1.58 3.02 -1.44 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3765 0.5631 0.0603 1 1 0.3774 0.5577 0.0649 1 1 0.3777 0.5510 0.0713
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 178 86 92 0 0 12 0 74 0 0 90 1 1 0.0000 0.0000 0.0217 6.167 4.61 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0204 0.9796 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 771 160 611 91 0 1 0 68 0 0 609 0 2 0.5687 0.0000 0.0033 159.000 0.25 3.18 -2.92 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6390 0.3511 0.0099 1 0 0.6332 0.3552 0.0116 1 0 0.6246 0.3613 0.0141
chr4 186236896 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 186 95 91 85 0 5 0 5 0 0 91 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 18.000 0.55 2.20 -1.65 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2593 0.7407 0.0000 0 0 0.7161 0.2839 0.0000
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.100 1 -12 4 235 96 139 89 0 5 0 2 1 0 137 0 1 0.9271 0.0072 0.0144 18.200 0.51 15.50 -14.99 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4712 0.5288 0.0000 0 0 0.9632 0.0368 0.0000 0 0 0.9880 0.0120 0.0000
chr5 14488084 TGGAGCTCCATCC T 0.001036 0.100 1 -12 1 366 110 256 102 0 1 0 7 0 0 256 0 0 0.9273 0.0000 0.0000 109.000 0.59 10.71 -10.13 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0296 0.9704 0.0000 0 0 0.9892 0.0108 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr5 16179479 T TCGG 0.500000 0.100 1 3 1 312 75 237 64 2 4 1 4 0 0 237 0 0 0.8533 0.0000 0.0000 17.750 1.14 3.00 -1.86 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.1517 0.8483 0.0000 0 0 0.5300 0.4700 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 817 193 624 70 1 24 5 93 0 0 623 0 1 0.3627 0.0000 0.0016 7.042 0.21 3.27 -3.05 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0030 0.2223 0.7747 1 2 0.0037 0.2299 0.7664 1 2 0.0048 0.2407 0.7544
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 2 328 117 211 88 3 12 2 12 1 1 208 0 1 0.7521 0.0047 0.0142 9.455 1.94 2.75 -0.81 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0086 0.9914 0.0000
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 291 27 264 0 0 14 0 13 0 1 256 2 5 0.0000 0.0000 0.0303 0.929 7.38 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4956 0.5044 2 2 0.0000 0.4330 0.5670 2 2 0.0000 0.3924 0.6076
chr5 73447067 G GGCGGCC 0.500000 0.100 1 6 1 399 83 316 67 2 10 1 3 0 0 316 0 0 0.8072 0.0000 0.0000 7.200 1.40 5.33 -3.93 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0112 0.9888 0.0000 0 1 0.3583 0.6417 0.0000 0 0 0.7045 0.2955 0.0000
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 362 95 267 83 1 5 0 6 0 0 267 0 0 0.8737 0.0000 0.0000 18.000 0.17 6.17 -6.00 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1004 0.8996 0.0000 0 0 0.5560 0.4440 0.0000
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 547 155 392 137 0 5 0 13 0 0 392 0 0 0.8839 0.0000 0.0000 30.000 0.30 2.85 -2.55 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.1550 0.8450 0.0000
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 274 72 202 59 0 9 0 4 0 0 202 0 0 0.8194 0.0000 0.0000 7.000 2.97 15.75 -12.78 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.2122 0.7878 0.0000 0 0 0.5734 0.4266 0.0000
chr5 80654905 G GCCGCAGCGC 0.500000 0.100 1 9 2 263 54 209 24 1 5 0 24 0 0 209 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 9.800 3.83 5.75 -1.92 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2424 0.5586 0.1990 1 1 0.2440 0.5542 0.2018 1 1 0.2459 0.5486 0.2054
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 261 53 208 50 0 1 0 2 0 0 208 0 0 0.9434 0.0000 0.0000 52.000 3.56 28.50 -24.94 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1305 0.8695 0.0000 0 0 0.5909 0.4091 0.0000 0 0 0.7582 0.2418 0.0000
chr5 96788614 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 232 98 134 57 0 2 0 39 0 0 134 0 0 0.5816 0.0000 0.0000 48.000 1.04 2.10 -1.07 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6385 0.3434 0.0180 1 0 0.6295 0.3501 0.0204 1 0 0.6169 0.3592 0.0240
chr5 96889375 CTCTT C 0.500000 0.100 1 -4 3 211 58 153 53 0 3 0 2 0 0 153 0 0 0.9138 0.0000 0.0000 18.333 0.36 4.00 -3.64 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1488 0.8512 0.0000 0 0 0.6266 0.3734 0.0000 0 0 0.7838 0.2162 0.0000
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 276 109 167 58 0 0 0 51 0 0 166 0 1 0.5321 0.0000 0.0060 109.000 0.33 3.08 -2.75 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3128 0.5920 0.0952 1 1 0.3147 0.5850 0.1003 1 1 0.3166 0.5762 0.1072
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 234 84 150 4 2 21 2 55 0 0 150 0 0 0.0476 0.0000 0.0000 3.000 2.00 5.02 -3.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9392 0.0608 2 1 0.0000 0.6768 0.3232
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 580 177 403 23 0 19 2 133 0 0 398 2 3 0.1299 0.0000 0.0124 8.316 1.04 3.83 -2.79 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 577 141 436 64 1 2 0 74 0 0 436 0 0 0.4539 0.0000 0.0000 69.500 0.44 1.27 -0.83 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0602 0.5811 0.3587 1 1 0.0649 0.5744 0.3607 1 1 0.0714 0.5661 0.3625
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 516 133 383 6 0 16 1 110 0 0 375 0 8 0.0451 0.0000 0.0209 7.312 0.00 5.42 -5.42 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.6094 0.3906 2 2 0.0000 0.1275 0.8725
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 303 84 219 47 1 5 0 31 0 0 206 0 13 0.5595 0.0000 0.0594 19.750 0.74 8.87 -8.13 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2721 0.5958 0.1321 1 1 0.2744 0.5887 0.1370 1 1 0.2769 0.5797 0.1434
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 205 74 131 4 0 0 0 70 0 0 131 0 0 0.0541 0.0000 0.0000 74.000 0.50 3.49 -2.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9951 0.0049 2 1 0.0000 0.6819 0.3181 2 2 0.0000 0.3038 0.6962
chr5 140549036 GGAGGAGC G 0.500000 0.100 1 -7 1 425 137 288 133 0 0 0 4 0 0 288 0 0 0.9708 0.0000 0.0000 137.000 0.26 17.00 -16.74 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1080 0.8920 0.0000 0 0 0.9156 0.0844 0.0000 0 0 0.9799 0.0201 0.0000
chr5 140549044 TGAAGGAGC T 0.500000 0.100 1 -8 1 426 135 291 131 0 0 0 4 0 0 290 1 0 0.9704 0.0000 0.0034 135.000 0.29 17.00 -16.71 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0709 0.9291 0.0000 0 0 0.8786 0.1214 0.0000 0 0 0.9718 0.0282 0.0000
chr5 141387924 CTGCCAG C 0.500000 0.100 1 -6 2 542 154 388 147 0 5 0 2 0 0 388 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 29.800 0.20 6.00 -5.80 61 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9547 0.0453 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 812 231 581 222 0 6 0 3 0 0 581 0 0 0.9610 0.0000 0.0000 37.500 0.29 1.00 -0.71 58 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9910 0.0090 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 428 115 313 6 1 11 0 97 0 0 304 0 9 0.0522 0.0000 0.0288 9.455 1.83 8.08 -6.25 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8933 0.1067 2 2 0.0000 0.3400 0.6600
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 12 1 425 125 300 42 2 30 0 51 0 0 278 0 22 0.3360 0.0000 0.0733 3.133 1.05 2.63 -1.58 0 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0026 0.1635 0.8340 1 2 0.0032 0.1730 0.8239 1 2 0.0042 0.1864 0.8094
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 15 1 425 125 300 42 2 30 0 51 0 0 278 0 22 0.3360 0.0000 0.0733 3.133 1.05 2.63 -1.58 0 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0026 0.1635 0.8340 1 2 0.0032 0.1730 0.8239 1 2 0.0042 0.1865 0.8094
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 644 139 505 76 0 0 0 63 0 0 505 0 0 0.5468 0.0000 0.0000 139.000 0.09 1.76 -1.67 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4617 0.5033 0.0351 1 1 0.4604 0.5010 0.0387 1 1 0.4577 0.4984 0.0438
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 578 143 435 135 0 0 0 8 0 0 435 0 0 0.9441 0.0000 0.0000 143.000 0.37 1.00 -0.63 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1471 0.8529 0.0000 0 0 0.8057 0.1943 0.0000
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 335 127 208 12 0 2 0 113 0 0 204 0 4 0.0945 0.0000 0.0192 62.500 2.50 4.94 -2.44 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.8833 0.1167
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 337 121 216 84 5 13 14 5 0 0 216 0 0 0.6942 0.0000 0.0000 8.308 3.79 11.60 -7.81 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0031 0.9969 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 337 105 232 0 3 0 1 101 0 0 230 0 2 0.0000 0.0000 0.0086 105.000 4.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7011 0.2989 2 2 0.0000 0.1093 0.8907 2 2 0.0000 0.0408 0.9592
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 178 66 112 31 0 2 0 33 0 0 111 0 1 0.4697 0.0000 0.0089 32.000 0.74 3.06 -2.32 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1535 0.5684 0.2782 1 1 0.1576 0.5632 0.2792 1 1 0.1630 0.5568 0.2802
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 441 103 338 5 0 7 0 91 0 0 337 0 1 0.0485 0.0000 0.0030 13.714 1.60 3.91 -2.31 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.6696 0.3304 2 2 0.0000 0.2204 0.7796
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 426 180 246 75 7 38 2 58 0 0 246 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 3.711 1.08 3.36 -2.28 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6727 0.3179 0.0094 1 0 0.6651 0.3239 0.0110 1 0 0.6541 0.3325 0.0134
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 578 95 483 42 2 10 1 40 0 0 482 0 1 0.4421 0.0000 0.0021 8.400 0.57 2.85 -2.28 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2355 0.5997 0.1649 1 1 0.2384 0.5923 0.1693 1 1 0.2421 0.5830 0.1750
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 480 122 358 8 0 10 1 103 0 0 355 2 1 0.0656 0.0000 0.0084 11.200 0.00 3.58 -3.58 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9600 0.0400 2 2 0.0000 0.4861 0.5139
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 565 136 429 53 3 30 3 47 2 1 418 0 8 0.3897 0.0047 0.0256 3.586 2.13 4.55 -2.42 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3081 0.6261 0.0658 1 1 0.3157 0.6165 0.0678 1 1 0.3252 0.6043 0.0705
chr6 17600553 GGCCCCGGGCCGGCCCACA G 0.000569 0.100 1 -18 1 300 85 215 73 0 11 0 1 0 0 214 0 1 0.8588 0.0000 0.0047 6.727 1.00 27.00 -26.00 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr6 22570117 G GGGC 0.051576 0.100 1 3 1 680 179 501 86 3 38 3 49 1 0 498 0 2 0.4804 0.0020 0.0060 3.684 0.27 3.35 -3.08 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9427 0.0572 0.0000 1 0 0.9380 0.0620 0.0001 1 0 0.9310 0.0689 0.0001
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.100 1 2 1 672 141 531 122 1 5 0 13 0 0 528 0 3 0.8652 0.0000 0.0056 27.200 0.25 2.08 -1.82 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1345 0.8655 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 630 134 496 57 0 2 0 75 0 0 475 0 21 0.4254 0.0000 0.0423 66.000 0.19 10.92 -10.73 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0010 0.1359 0.8631 1 2 0.0013 0.1471 0.8516 1 2 0.0019 0.1634 0.8347
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 390 112 278 55 0 2 0 55 0 0 278 0 0 0.4911 0.0000 0.0000 55.000 0.09 1.33 -1.24 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1842 0.6317 0.1842 1 1 0.1889 0.6221 0.1889 1 1 0.1950 0.6100 0.1950
chr6 31027337 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 1306 292 1014 134 4 28 3 123 3 7 994 2 8 0.4589 0.0030 0.0197 9.704 1.64 2.22 -0.58 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2979 0.6775 0.0246 1 1 0.3085 0.6634 0.0281 1 1 0.3212 0.6456 0.0332
chr6 31028710 GACC G 0.500000 0.100 1 -3 1 2657 575 2082 254 9 74 4 234 4 5 2031 18 24 0.4417 0.0019 0.0245 6.931 1.75 4.64 -2.88 36 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0113 0.9045 0.0841 1 1 0.0142 0.8884 0.0974 1 1 0.0187 0.8649 0.1164
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 872 240 632 220 1 10 0 9 1 1 630 0 0 0.9167 0.0016 0.0032 23.000 1.24 3.44 -2.20 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.8257 0.1743 0.0000 0 0 0.9936 0.0064 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 617 164 453 9 131 4 0 20 0 0 453 0 0 0.0549 0.0000 0.0000 39.500 0.00 1.90 -1.90 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000
chr6 31954568 CTCTCGG C 0.500000 0.100 1 -6 3 811 189 622 166 3 12 0 8 0 0 622 0 0 0.8783 0.0000 0.0000 14.667 0.90 6.62 -5.73 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4792 0.5208 0.0000 0 0 0.9552 0.0448 0.0000
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 583 221 362 137 8 40 0 36 0 0 362 0 0 0.6199 0.0000 0.0000 4.711 3.18 8.58 -5.41 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 583 212 371 166 4 8 0 34 0 0 370 0 1 0.7830 0.0000 0.0027 33.833 4.61 8.79 -4.18 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.100 1 2 2 180 79 101 50 2 0 1 26 0 0 100 1 0 0.6329 0.0000 0.0099 79.000 6.76 9.42 -2.66 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7867 0.2070 0.0063 1 0 0.7751 0.2175 0.0074 1 0 0.7587 0.2320 0.0093
chr6 33086236 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 255 65 190 25 1 2 0 37 0 0 190 0 0 0.3846 0.0000 0.0000 31.500 7.08 7.92 -0.84 21 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0557 0.4513 0.4930 1 2 0.0598 0.4537 0.4865 1 2 0.0656 0.4571 0.4774
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 476 180 296 101 0 22 0 57 0 0 286 0 10 0.5611 0.0000 0.0338 7.182 0.54 5.98 -5.44 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8628 0.1362 0.0010 1 0 0.8543 0.1443 0.0013 1 0 0.8421 0.1561 0.0018
chr6 35141212 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 216 73 143 39 0 3 0 31 0 0 143 0 0 0.5342 0.0000 0.0000 23.333 0.08 1.58 -1.50 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4031 0.5143 0.0826 1 1 0.4001 0.5128 0.0871 1 1 0.3956 0.5110 0.0934
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 384 104 280 87 0 12 0 5 0 0 279 0 1 0.8365 0.0000 0.0036 7.667 0.93 11.40 -10.47 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1148 0.8852 0.0000 0 0 0.5916 0.4084 0.0000
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 465 161 304 85 0 7 0 69 0 0 302 0 2 0.5280 0.0000 0.0066 22.000 0.36 1.55 -1.19 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4683 0.5025 0.0292 1 1 0.4677 0.4998 0.0325 1 1 0.4659 0.4968 0.0373
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 487 144 343 58 0 4 0 82 0 0 343 0 0 0.4028 0.0000 0.0000 35.000 0.55 3.20 -2.64 26 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0062 0.2674 0.7263 1 2 0.0074 0.2750 0.7176 1 2 0.0093 0.2857 0.7051
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 289 126 163 48 0 17 0 61 0 0 160 0 3 0.3810 0.0000 0.0184 6.412 0.62 6.41 -5.78 24 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0239 0.4050 0.5710 1 2 0.0268 0.4085 0.5647 1 2 0.0309 0.4135 0.5556
chr6 44265594 G GC 0.500000 0.100 1 1 4 429 101 328 90 0 9 0 2 0 1 327 0 0 0.8911 0.0000 0.0030 10.222 0.61 1.50 -0.89 34 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5580 0.4420 0.0000 0 0 0.9184 0.0816 0.0000 0 0 0.9582 0.0418 0.0000
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 557 151 406 43 0 74 3 31 0 0 385 1 20 0.2848 0.0000 0.0517 1.027 1.91 7.32 -5.42 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0463 0.4786 0.4751 1 1 0.0502 0.4787 0.4711 1 1 0.0558 0.4791 0.4651
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.100 1 -15 2 559 189 370 127 0 57 0 5 0 0 370 0 0 0.6720 0.0000 0.0000 2.316 2.42 9.60 -7.18 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0096 0.9904 0.0000 0 0 0.7349 0.2651 0.0000 0 0 0.9504 0.0496 0.0000
chr6 81752061 G GAAGTCGCCGCCGCCA 0.500000 0.100 1 15 2 545 184 361 96 1 26 1 60 0 0 361 0 0 0.5217 0.0000 0.0000 6.077 1.03 5.40 -4.37 12 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8919 0.1074 0.0007 1 0 0.8838 0.1153 0.0009 1 0 0.8719 0.1268 0.0013
chr6 83142027 AAAC A 0.500000 0.100 1 -3 4 160 64 96 55 0 3 0 6 0 0 96 0 0 0.8594 0.0000 0.0000 20.333 0.27 3.00 -2.73 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0256 0.9744 0.0000 0 1 0.2347 0.7653 0.0000
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 629 141 488 105 6 28 0 2 0 0 487 0 1 0.7447 0.0000 0.0020 4.000 1.74 3.00 -1.26 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2664 0.7336 0.0000 0 0 0.9125 0.0875 0.0000 0 0 0.9694 0.0306 0.0000
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 610 143 467 124 1 12 0 6 1 3 463 0 0 0.8671 0.0021 0.0086 10.917 0.95 5.67 -4.72 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.5231 0.4769 0.0000 0 0 0.9201 0.0799 0.0000
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 131 40 91 4 0 2 2 32 0 0 89 0 2 0.1000 0.0000 0.0220 19.000 0.00 3.09 -3.09 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9215 0.0785 2 1 0.0000 0.6947 0.3053
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 745 172 573 0 0 7 0 165 0 0 567 0 6 0.0000 0.0000 0.0105 23.571 3.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 123464887 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 382 118 264 100 5 9 0 4 0 0 264 0 0 0.8475 0.0000 0.0000 12.000 0.44 1.00 -0.56 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0322 0.9678 0.0000 0 0 0.7284 0.2716 0.0000 0 0 0.9249 0.0751 0.0000
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 371 109 262 56 0 1 1 51 0 0 260 0 2 0.5138 0.0000 0.0076 108.000 0.43 1.18 -0.75 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2230 0.6271 0.1499 1 1 0.2271 0.6178 0.1551 1 1 0.2322 0.6061 0.1617
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 912 248 664 109 0 13 1 125 0 0 660 1 3 0.4395 0.0000 0.0060 18.077 0.15 3.19 -3.05 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0083 0.4378 0.5539 1 2 0.0098 0.4353 0.5550 1 2 0.0121 0.4331 0.5548
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 204 86 118 47 0 1 0 38 0 0 117 0 1 0.5465 0.0000 0.0085 85.000 0.30 4.05 -3.75 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3869 0.5339 0.0792 1 1 0.3852 0.5309 0.0839 1 1 0.3825 0.5272 0.0903
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 705 302 403 236 1 51 0 14 0 0 402 0 1 0.7815 0.0000 0.0025 4.922 0.27 16.86 -16.59 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 0 0.8668 0.1332 0.0000
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 370 123 247 0 0 1 1 121 0 0 245 0 2 0.0000 0.0000 0.0081 122.000 5.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 202 76 126 38 0 3 0 35 0 0 125 0 1 0.5000 0.0000 0.0079 24.333 0.21 8.14 -7.93 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2481 0.5850 0.1669 1 1 0.2503 0.5787 0.1710 1 1 0.2530 0.5707 0.1763
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 316 137 179 1 0 24 10 102 0 0 175 1 3 0.0073 0.0000 0.0223 4.583 0.00 3.14 -3.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0090 0.9910 2 2 0.0000 0.0069 0.9931
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 609 142 467 62 0 24 0 56 0 0 456 0 11 0.4366 0.0000 0.0236 4.917 0.24 8.16 -7.92 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1013 0.6259 0.2729 1 1 0.1067 0.6166 0.2767 1 1 0.1140 0.6049 0.2811
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 759 266 493 89 7 23 78 69 0 0 493 0 0 0.3346 0.0000 0.0000 13.867 0.27 6.62 -6.35 49 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0005 0.1245 0.8749 1 2 0.0007 0.1315 0.8678 1 2 0.0010 0.1416 0.8574
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 759 251 508 175 8 6 24 38 0 0 508 0 0 0.6972 0.0000 0.0000 40.667 1.87 9.05 -7.18 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.5849 0.4151 0.0000
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 759 256 503 170 13 18 30 25 0 0 503 0 0 0.6641 0.0000 0.0000 20.091 1.89 7.72 -5.83 40 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0090 0.9910 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 236 61 175 0 1 1 2 57 0 0 172 0 3 0.0000 0.0000 0.0171 60.000 3.75 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1166 0.8834 2 2 0.0000 0.0875 0.9125 2 2 0.0000 0.0761 0.9239
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 264 101 163 39 0 31 2 29 0 0 160 0 3 0.3861 0.0000 0.0184 2.258 0.69 3.76 -3.07 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3215 0.5595 0.1190 1 1 0.3215 0.5549 0.1236 1 1 0.3209 0.5492 0.1298
chr7 5313028 G GGAT 0.500000 0.100 1 3 1 687 73 614 39 23 2 2 7 1 1 612 0 0 0.5342 0.0016 0.0033 27.500 1.79 2.57 -0.78 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0067 0.9933 0.0000 0 1 0.1174 0.8826 0.0000
chr7 11831843 A AGCAGCGGCAGCG 0.500000 0.100 1 12 2 231 117 114 55 0 18 0 44 0 0 107 0 7 0.4701 0.0000 0.0614 5.500 1.13 10.14 -9.01 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2692 0.6090 0.1218 1 1 0.2721 0.6010 0.1269 1 1 0.2754 0.5908 0.1338
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 211 76 135 45 0 0 0 31 0 0 135 0 0 0.5921 0.0000 0.0000 76.000 0.18 1.77 -1.60 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5595 0.4056 0.0349 1 0 0.5516 0.4101 0.0383 1 0 0.5405 0.4163 0.0432
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 660 200 460 75 0 29 5 91 0 0 460 0 0 0.3750 0.0000 0.0000 5.897 0.32 3.21 -2.89 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0098 0.3626 0.6276 1 2 0.0114 0.3659 0.6227 1 2 0.0139 0.3710 0.6151
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.100 1 3 2 422 94 328 44 0 7 1 42 0 0 326 0 2 0.4681 0.0000 0.0061 12.286 0.20 2.98 -2.77 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1813 0.6063 0.2124 1 1 0.1856 0.5984 0.2160 1 1 0.1910 0.5885 0.2205
chr7 27095697 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 876 316 560 250 8 49 1 8 1 0 558 1 0 0.7911 0.0018 0.0036 5.429 1.30 4.12 -2.82 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 0 0.9742 0.0258 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 111 39 72 18 2 6 1 12 0 0 70 2 0 0.4615 0.0000 0.0278 6.200 0.83 1.25 -0.42 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3476 0.5151 0.1373 1 1 0.3449 0.5139 0.1412 1 1 0.3411 0.5124 0.1464
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 486 141 345 73 0 0 0 68 0 0 345 0 0 0.5177 0.0000 0.0000 141.000 0.40 1.29 -0.90 51 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2629 0.6395 0.0976 1 1 0.2675 0.6294 0.1032 1 1 0.2728 0.6165 0.1107
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 211 73 138 45 0 0 0 28 0 0 136 0 2 0.6164 0.0000 0.0145 73.000 0.07 3.39 -3.33 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5867 0.3833 0.0300 1 0 0.5779 0.3889 0.0331 1 0 0.5658 0.3965 0.0377
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 216 56 160 1 0 23 3 29 0 0 159 1 0 0.0179 0.0000 0.0063 1.435 9.00 4.38 4.62 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6616 0.3384 2 2 0.0000 0.3965 0.6035 2 2 0.0000 0.3100 0.6900
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.100 1 2 1 215 57 158 1 21 3 3 29 0 0 157 0 1 0.0175 0.0000 0.0063 11.000 9.00 4.41 4.59 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0031 0.8104 0.1866 2 1 0.0020 0.7986 0.1994 2 1 0.0012 0.7511 0.2477
chr7 65954366 TTTA T 0.500000 0.100 1 -3 5 466 136 330 35 0 24 4 73 0 0 330 0 0 0.2574 0.0000 0.0000 4.667 0.06 3.12 -3.07 19 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0507 0.9490 1 2 0.0003 0.0568 0.9429 1 2 0.0005 0.0660 0.9335
chr7 74753110 ACT A 0.500000 0.100 1 -2 1 154 64 90 58 0 0 0 6 0 0 90 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 64.000 0.91 4.33 -3.42 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0296 0.9704 0.0000 0 1 0.2619 0.7381 0.0000
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 434 130 304 66 0 0 0 64 0 1 303 0 0 0.5077 0.0000 0.0033 130.000 0.12 1.73 -1.61 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2285 0.6454 0.1261 1 1 0.2333 0.6349 0.1318 1 1 0.2392 0.6216 0.1392
chr7 80661109 AAC A 0.500000 0.100 1 -2 1 136 71 65 50 0 0 0 21 0 0 65 0 0 0.7042 0.0000 0.0000 71.000 0.66 2.57 -1.91 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8598 0.1375 0.0027 1 0 0.8489 0.1478 0.0034 1 0 0.8328 0.1628 0.0044
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 905 221 684 0 0 13 0 208 0 0 674 0 10 0.0000 0.0000 0.0146 16.000 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 525 142 383 7 0 15 2 118 0 0 374 1 8 0.0493 0.0000 0.0235 8.467 0.57 3.59 -3.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7356 0.2644 2 2 0.0000 0.1476 0.8524
chr7 94663513 ACAACTC A 0.500000 0.100 1 -6 2 519 157 362 84 4 1 0 68 0 0 360 0 2 0.5350 0.0000 0.0055 152.000 0.70 5.99 -5.28 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5516 0.4303 0.0181 1 0 0.5483 0.4312 0.0205 1 0 0.5429 0.4329 0.0241
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 435 174 261 67 5 59 3 40 0 0 259 0 2 0.3851 0.0000 0.0077 1.932 1.25 4.12 -2.87 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8062 0.1902 0.0036 1 0 0.7959 0.1997 0.0044 1 0 0.7813 0.2131 0.0056
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 517 163 354 76 0 2 0 85 0 0 352 0 2 0.4663 0.0000 0.0056 80.500 0.79 3.80 -3.01 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0433 0.5733 0.3834 1 1 0.0474 0.5666 0.3860 1 1 0.0533 0.5584 0.3883
chr7 100075318 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 533 153 380 141 0 7 0 5 0 0 380 0 0 0.9216 0.0000 0.0000 20.857 0.26 1.00 -0.74 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0227 0.9773 0.0000 0 0 0.8515 0.1485 0.0000 0 0 0.9745 0.0255 0.0000
chr7 100124796 CAGGAGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 503 162 341 143 1 11 1 6 0 0 341 0 0 0.8827 0.0000 0.0000 13.636 0.13 5.33 -5.20 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.6596 0.3404 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.100 1 -7 1 546 189 357 177 1 3 0 8 0 0 357 0 0 0.9365 0.0000 0.0000 62.000 0.18 7.50 -7.32 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.5920 0.4080 0.0000 0 0 0.9708 0.0292 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 600 168 432 149 0 10 0 9 0 0 431 0 1 0.8869 0.0000 0.0023 15.800 0.58 2.89 -2.30 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0390 0.9610 0.0000 0 0 0.6926 0.3074 0.0000
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 316 75 241 2 0 24 1 48 0 0 239 0 2 0.0267 0.0000 0.0083 2.125 2.00 6.44 -4.44 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8626 0.1374 2 2 0.0000 0.3950 0.6050 2 2 0.0000 0.2316 0.7684
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 833 228 605 206 1 8 0 13 0 1 603 1 0 0.9035 0.0000 0.0033 27.500 1.28 3.85 -2.57 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0234 0.9766 0.0000 0 0 0.8200 0.1800 0.0000
chr7 124032402 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 752 210 542 168 3 23 6 10 1 0 541 0 0 0.8000 0.0018 0.0018 8.409 0.60 3.10 -2.50 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1339 0.8661 0.0000
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 753 211 542 171 3 30 0 7 1 0 541 0 0 0.8104 0.0018 0.0018 6.000 0.59 5.29 -4.70 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.7911 0.2089 0.0000 0 0 0.9827 0.0173 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 705 227 478 198 1 25 0 3 1 0 477 0 0 0.8722 0.0021 0.0021 8.080 0.27 1.00 -0.73 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9716 0.0284 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 369 195 174 169 0 14 0 12 0 0 174 0 0 0.8667 0.0000 0.0000 12.929 0.60 7.00 -6.40 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0129 0.9871 0.0000 0 0 0.6222 0.3778 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 231 72 159 0 0 2 0 70 0 0 157 0 2 0.0000 0.0000 0.0126 35.000 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0267 0.9733 2 2 0.0000 0.0295 0.9705
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 920 279 641 9 0 47 5 218 0 0 638 0 3 0.0323 0.0000 0.0047 4.915 0.78 3.16 -2.38 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 2 0.0000 0.1542 0.8458 2 2 0.0000 0.0056 0.9944
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 860 210 650 0 0 5 0 205 0 0 650 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 41.000 1.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 143727510 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 1 128 57 71 51 0 1 0 5 0 0 71 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 56.000 0.29 3.20 -2.91 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0586 0.9414 0.0000 0 1 0.3243 0.6757 0.0000
chr7 143727511 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 128 56 72 49 2 0 3 2 0 0 72 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 56.000 0.31 8.00 -7.69 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.1131 0.8869 0.0000 0 1 0.3929 0.6071 0.0000
chr7 143727518 A AACTGGCAGTTC 0.500000 0.100 1 11 1 128 51 77 45 2 0 1 3 0 0 77 0 0 0.8824 0.0000 0.0000 50.000 0.29 5.33 -5.04 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.1315 0.8685 0.0000 0 1 0.4301 0.5699 0.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 676 145 531 69 0 3 0 73 0 0 530 0 1 0.4759 0.0000 0.0019 47.333 0.25 4.08 -3.84 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0969 0.6418 0.2612 1 1 0.1025 0.6315 0.2659 1 1 0.1101 0.6184 0.2715
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.100 1 -4 1 371 225 146 209 0 6 0 10 0 0 146 0 0 0.9289 0.0000 0.0000 36.500 1.17 4.20 -3.03 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4525 0.5475 0.0000 0 0 0.9766 0.0234 0.0000
chr7 144667784 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 176 76 100 68 0 1 0 7 0 0 100 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 75.000 0.19 2.43 -2.24 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0174 0.9826 0.0000 0 1 0.2340 0.7660 0.0000
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 203 59 144 54 1 2 0 2 0 0 144 0 0 0.9153 0.0000 0.0000 28.500 0.44 5.00 -4.56 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1622 0.8378 0.0000 0 0 0.6496 0.3504 0.0000 0 0 0.7998 0.2002 0.0000
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 781 200 581 183 0 3 0 14 0 0 581 0 0 0.9150 0.0000 0.0000 65.667 0.28 1.43 -1.14 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 1 0.4754 0.5246 0.0000
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 450 115 335 101 0 1 0 13 0 0 335 0 0 0.8783 0.0000 0.0000 114.000 1.16 1.23 -0.07 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0312 0.9688 0.0000
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 679 190 489 96 0 10 0 84 1 1 481 0 6 0.5053 0.0020 0.0164 18.000 0.65 11.80 -11.15 44 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2870 0.6540 0.0589 1 1 0.2933 0.6426 0.0640 1 1 0.3006 0.6282 0.0712
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 362 79 283 0 1 4 17 57 0 3 259 8 13 0.0000 0.0000 0.0848 24.000 6.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0291 0.9709 2 2 0.0000 0.0260 0.9740 2 2 0.0000 0.0242 0.9758
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 365 78 287 0 1 6 18 53 0 0 263 12 12 0.0000 0.0000 0.0836 16.250 6.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0118 0.9882 2 2 0.0000 0.0123 0.9877 2 2 0.0000 0.0133 0.9867
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 369 76 293 0 0 8 6 62 0 0 243 24 26 0.0000 0.0000 0.1706 11.000 7.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 358 127 231 86 1 0 0 40 0 0 231 0 0 0.6772 0.0000 0.0000 127.000 0.26 1.98 -1.72 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9656 0.0343 0.0001 1 0 0.9609 0.0389 0.0001 1 0 0.9536 0.0462 0.0002
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 379 95 284 43 0 2 0 50 0 0 283 0 1 0.4526 0.0000 0.0035 46.500 0.07 3.14 -3.07 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0776 0.5436 0.3788 1 1 0.0823 0.5399 0.3778 1 1 0.0887 0.5353 0.3759
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 737 156 581 122 0 28 0 6 0 0 581 0 0 0.7821 0.0000 0.0000 4.571 0.46 6.50 -6.04 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3775 0.6225 0.0000 0 0 0.8660 0.1340 0.0000
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 264 88 176 8 0 1 0 79 0 0 176 0 0 0.0909 0.0000 0.0000 87.000 0.38 3.20 -2.83 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9915 0.0085 2 1 0.0000 0.8154 0.1846
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 557 262 295 0 0 49 0 213 0 0 295 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.347 5.66 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 356 148 208 82 0 2 0 64 0 0 204 1 3 0.5541 0.0000 0.0192 73.000 0.50 7.50 -7.00 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6036 0.3873 0.0091 1 0 0.6033 0.3865 0.0102 1 0 0.6021 0.3863 0.0117
chr8 38404506 GGTGA G 0.000044 0.100 1 -4 1 170 46 124 43 0 1 0 2 0 0 124 0 0 0.9348 0.0000 0.0000 45.000 0.35 2.00 -1.65 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 540 178 362 19 0 2 1 156 0 0 358 0 4 0.1067 0.0000 0.0110 88.000 0.16 3.28 -3.12 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9924 0.0076
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 615 188 427 130 10 43 1 4 0 1 426 0 0 0.6915 0.0000 0.0023 3.349 0.57 3.00 -2.43 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4771 0.5229 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr8 80486812 TGTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 299 88 211 48 0 3 1 36 0 0 208 0 3 0.5455 0.0000 0.0142 28.333 1.94 5.22 -3.28 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3840 0.5368 0.0792 1 1 0.3825 0.5336 0.0838 1 1 0.3800 0.5297 0.0903
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 679 207 472 107 1 8 0 91 0 0 471 0 1 0.5169 0.0000 0.0021 24.875 2.41 18.07 -15.65 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4685 0.5118 0.0197 1 1 0.4704 0.5073 0.0223 1 1 0.4716 0.5022 0.0263
chr8 123369918 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 1 337 98 239 77 5 13 1 2 0 0 239 0 0 0.7857 0.0000 0.0000 6.385 0.52 3.50 -2.98 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3570 0.6430 0.0000 0 0 0.8437 0.1563 0.0000 0 0 0.9214 0.0786 0.0000
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 248 106 142 99 0 1 0 6 0 0 141 0 1 0.9340 0.0000 0.0070 105.000 0.16 3.17 -3.01 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0753 0.9247 0.0000 0 0 0.5772 0.4228 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 412 118 294 0 0 31 3 84 0 0 290 0 4 0.0000 0.0000 0.0136 2.806 4.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0096 0.9904 2 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 2 0.0000 0.0119 0.9881
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 930 213 717 167 0 36 0 10 0 0 714 0 3 0.7840 0.0000 0.0042 5.057 0.42 12.20 -11.78 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0042 0.9958 0.0000 0 1 0.4453 0.5547 0.0000
chr8 144462367 G GGCC 0.500000 0.100 1 3 2 428 157 271 92 7 40 3 15 1 0 270 0 0 0.5860 0.0037 0.0037 3.000 1.02 4.93 -3.91 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0040 0.9960 0.0000
chr8 144464275 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 536 108 428 59 1 7 3 38 0 0 427 0 1 0.5463 0.0000 0.0023 14.286 0.36 1.45 -1.09 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6410 0.3420 0.0170 1 0 0.6322 0.3486 0.0193 1 0 0.6197 0.3576 0.0228
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 993 213 780 117 0 4 0 92 0 0 779 0 1 0.5493 0.0000 0.0013 52.250 0.33 3.32 -2.98 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6546 0.3398 0.0056 1 0 0.6508 0.3425 0.0067 1 0 0.6444 0.3471 0.0085
chr8 144846107 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 491 216 275 195 1 8 0 12 0 0 275 0 0 0.9028 0.0000 0.0000 25.875 0.24 2.75 -2.51 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0477 0.9523 0.0000 0 0 0.8586 0.1414 0.0000
chr9 116848 T TA 0.003653 0.100 1 1 1 984 238 746 224 2 6 0 6 1 0 745 0 0 0.9412 0.0013 0.0013 38.500 0.32 1.17 -0.85 122 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9826 0.0174 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr9 117363 T TC 0.002993 0.100 1 1 1 1153 228 925 197 24 5 0 2 0 0 925 0 0 0.8640 0.0000 0.0000 42.800 1.09 4.00 -2.91 55 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 630 184 446 47 1 39 10 87 0 0 445 1 0 0.2554 0.0000 0.0022 3.718 0.11 3.11 -3.01 21 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0003 0.0912 0.9085 1 2 0.0004 0.1032 0.8964 1 2 0.0006 0.1216 0.8778
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 325 95 230 32 0 26 0 37 1 0 223 0 6 0.3368 0.0043 0.0304 2.654 0.66 8.78 -8.13 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0622 0.4864 0.4514 1 1 0.0665 0.4865 0.4470 1 1 0.0725 0.4869 0.4406
chr9 34552176 C CTGGCAG 0.500000 0.100 1 6 1 407 126 281 120 0 3 0 3 0 0 281 0 0 0.9524 0.0000 0.0000 41.000 0.37 6.00 -5.63 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3655 0.6345 0.0000 0 0 0.9426 0.0574 0.0000 0 0 0.9801 0.0199 0.0000
chr9 35562396 A ATAGT 0.500000 0.100 1 4 5 678 174 504 165 0 2 0 7 1 0 503 0 0 0.9483 0.0020 0.0020 86.000 2.24 4.14 -1.91 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.6980 0.3020 0.0000 0 0 0.9724 0.0276 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 786 195 591 144 0 37 0 14 1 0 590 0 0 0.7385 0.0017 0.0017 4.270 0.43 10.50 -10.07 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1245 0.8755 0.0000
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 410 67 343 64 0 0 0 3 0 0 343 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 67.000 0.14 1.33 -1.19 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0325 0.9675 0.0000 0 0 0.5011 0.4989 0.0000 0 0 0.7651 0.2349 0.0000
chr9 66908681 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 3 372 131 241 91 0 2 0 38 0 0 241 0 0 0.6947 0.0000 0.0000 64.500 0.98 4.03 -3.05 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9807 0.0193 0.0000 1 0 0.9775 0.0225 0.0000 1 0 0.9724 0.0275 0.0001
chr9 72059357 TGAAAG T 0.500000 0.100 1 -5 1 178 59 119 53 0 3 0 3 0 0 119 0 0 0.8983 0.0000 0.0000 18.667 0.13 5.00 -4.87 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0186 0.9814 0.0000 0 1 0.3665 0.6335 0.0000 0 0 0.6562 0.3438 0.0000
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 475 138 337 129 0 3 0 6 0 0 336 0 1 0.9348 0.0000 0.0030 45.000 0.10 15.67 -15.57 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2670 0.7330 0.0000 0 0 0.8541 0.1459 0.0000
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 734 169 565 137 0 20 0 12 0 0 563 0 2 0.8107 0.0000 0.0035 7.450 0.40 10.42 -10.02 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0880 0.9120 0.0000
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 496 142 354 66 1 4 0 71 0 0 351 0 3 0.4648 0.0000 0.0085 34.500 0.29 3.18 -2.90 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0759 0.6130 0.3111 1 1 0.0810 0.6044 0.3145 1 1 0.0881 0.5936 0.3183
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 243 78 165 70 0 1 0 7 0 0 165 0 0 0.8974 0.0000 0.0000 77.000 0.10 4.57 -4.47 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0188 0.9812 0.0000 0 1 0.2505 0.7495 0.0000
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 277 83 194 1 53 24 0 5 0 1 193 0 0 0.0120 0.0000 0.0052 2.458 0.00 3.00 -3.00 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0713 0.9287 0.0000 0 1 0.3701 0.6299 0.0000
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 277 84 193 6 0 22 25 31 0 0 192 1 0 0.0714 0.0000 0.0052 2.818 2.50 3.29 -0.79 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9679 0.0321 2 1 0.0000 0.7367 0.2633
chr9 92474742 CTCATCA C 0.500000 0.100 1 -6 2 277 84 193 7 1 49 1 26 0 0 192 0 1 0.0833 0.0000 0.0052 0.708 2.14 6.27 -4.13 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0095 0.4841 0.5065 2 1 0.0052 0.7535 0.2412 2 1 0.0021 0.8865 0.1114
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 420 152 268 60 1 3 0 88 0 0 268 0 0 0.3947 0.0000 0.0000 49.667 0.30 8.76 -8.46 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0037 0.2214 0.7749 1 2 0.0045 0.2296 0.7659 1 2 0.0058 0.2413 0.7529
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 492 174 318 8 0 1 0 165 0 0 315 0 3 0.0460 0.0000 0.0094 173.000 0.12 3.27 -3.15 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.5317 0.4683 2 2 0.0000 0.0466 0.9534
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 358 92 266 75 1 9 0 7 0 0 266 0 0 0.8152 0.0000 0.0000 9.222 1.35 5.43 -4.08 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0252 0.9748 0.0000 0 1 0.3090 0.6910 0.0000
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 852 139 713 50 1 28 1 59 1 1 702 1 8 0.3597 0.0014 0.0154 4.074 1.38 6.41 -5.03 28 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0236 0.4166 0.5599 1 2 0.0264 0.4192 0.5544 1 2 0.0305 0.4232 0.5463
chr9 97854418 AGCCGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -9 1 863 150 713 66 10 20 39 15 0 1 705 1 6 0.4400 0.0000 0.0112 6.200 1.45 8.47 -7.01 34 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5059 0.4654 0.0287 1 0 0.5029 0.4652 0.0319 1 0 0.4980 0.4655 0.0366
chr9 99105255 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 192 113 79 98 2 10 0 3 1 0 78 0 0 0.8673 0.0127 0.0127 10.300 0.88 9.00 -8.12 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1794 0.8206 0.0000 0 0 0.8641 0.1359 0.0000 0 0 0.9515 0.0485 0.0000
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 513 131 382 81 1 0 0 49 0 0 381 0 1 0.6183 0.0000 0.0026 130.000 0.12 2.86 -2.73 55 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8584 0.1401 0.0016 1 0 0.8490 0.1490 0.0020 1 0 0.8354 0.1619 0.0027
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 833 205 628 125 1 1 0 78 0 0 627 0 1 0.6098 0.0000 0.0016 203.000 0.18 4.90 -4.72 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9498 0.0501 0.0001 1 0 0.9446 0.0553 0.0001 1 0 0.9367 0.0631 0.0002
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 787 181 606 93 0 0 3 85 0 0 605 0 1 0.5138 0.0000 0.0017 179.000 0.26 3.09 -2.84 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2221 0.6877 0.0901 1 1 0.2290 0.6747 0.0963 1 1 0.2375 0.6580 0.1045
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 274 97 177 0 0 8 0 89 0 0 172 0 5 0.0000 0.0000 0.0282 11.125 4.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0103 0.9897
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 430 102 328 0 0 11 1 90 0 0 328 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.273 6.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0096 0.9904 2 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 2 0.0000 0.0119 0.9881
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 530 115 415 52 0 11 2 50 0 0 413 0 2 0.4522 0.0000 0.0048 9.455 0.65 1.52 -0.87 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1578 0.6231 0.2191 1 1 0.1627 0.6142 0.2231 1 1 0.1691 0.6028 0.2281
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 561 196 365 155 4 20 4 13 1 1 363 0 0 0.7908 0.0027 0.0055 8.800 0.59 4.23 -3.64 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0443 0.9557 0.0000
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 2 562 195 367 161 1 27 2 4 1 1 365 0 0 0.8256 0.0027 0.0054 6.385 0.60 7.25 -6.65 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1726 0.8274 0.0000 0 0 0.9579 0.0421 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr9 129177693 CAGCTGGTGG C 0.500000 0.100 1 -9 1 597 120 477 94 1 22 0 3 0 0 477 0 0 0.7833 0.0000 0.0000 4.455 0.84 4.33 -3.49 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1394 0.8606 0.0000 0 0 0.8252 0.1748 0.0000 0 0 0.9362 0.0638 0.0000
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 485 148 337 0 0 3 0 145 0 0 334 0 3 0.0000 0.0000 0.0089 48.333 3.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 269 94 175 51 0 7 0 36 0 0 173 0 2 0.5426 0.0000 0.0114 12.429 0.18 7.92 -7.74 33 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5184 0.4422 0.0394 1 0 0.5124 0.4445 0.0430 1 0 0.5039 0.4478 0.0482
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 431 129 302 40 2 41 2 44 1 0 300 0 1 0.3101 0.0033 0.0066 2.146 2.20 4.07 -1.87 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1287 0.5906 0.2807 1 1 0.1335 0.5839 0.2826 1 1 0.1400 0.5753 0.2847
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 285 115 170 7 0 1 0 107 0 1 166 0 3 0.0609 0.0000 0.0235 114.000 3.00 1.50 1.50 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9027 0.0973 2 2 0.0000 0.3500 0.6500
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 285 115 170 7 0 1 0 107 0 1 166 0 3 0.0609 0.0000 0.0235 114.000 3.00 1.50 1.50 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9027 0.0973 2 2 0.0000 0.3500 0.6500
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 235 91 144 54 1 2 0 34 0 0 144 0 0 0.5934 0.0000 0.0000 44.000 0.11 1.82 -1.71 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7099 0.2787 0.0115 1 0 0.6991 0.2876 0.0132 1 0 0.6841 0.2999 0.0160
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 415 115 300 60 0 6 0 49 0 0 300 0 0 0.5217 0.0000 0.0000 18.167 0.28 1.47 -1.19 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4424 0.5076 0.0500 1 1 0.4401 0.5058 0.0541 1 1 0.4363 0.5037 0.0599
chr9 135945095 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 311 96 215 50 0 2 0 44 0 0 213 0 2 0.5208 0.0000 0.0093 47.000 0.44 3.09 -2.65 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2772 0.5973 0.1255 1 1 0.2795 0.5901 0.1304 1 1 0.2820 0.5809 0.1370
chr9 137110665 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 258 75 183 71 0 1 0 3 0 0 183 0 0 0.9467 0.0000 0.0000 74.000 0.35 1.33 -0.98 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0491 0.9509 0.0000 0 0 0.5907 0.4093 0.0000 0 0 0.8212 0.1788 0.0000
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 439 114 325 6 0 9 0 99 0 0 309 0 16 0.0526 0.0000 0.0492 11.667 1.00 12.51 -11.51 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.6558 0.3442 2 2 0.0000 0.1507 0.8493
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 844 221 623 194 2 5 0 20 0 0 619 0 4 0.8778 0.0000 0.0064 43.200 0.45 8.75 -8.30 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0538 0.9462 0.0000
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 385 101 284 87 0 0 0 14 0 0 284 0 0 0.8614 0.0000 0.0000 101.000 1.07 1.00 0.07 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 1 0.3858 0.6142 0.0000
chr10 13439173 CAG C 0.004149 0.100 1 -2 3 268 61 207 54 0 5 0 2 0 0 207 0 0 0.8852 0.0000 0.0000 11.200 0.44 2.00 -1.56 36 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9780 0.0220 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr10 15719771 TCTCC T 0.162657 0.100 1 -4 1 171 37 134 19 0 1 0 17 0 0 134 0 0 0.5135 0.0000 0.0000 36.000 0.74 4.47 -3.73 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4349 0.5083 0.0568 1 1 0.4358 0.5064 0.0578 1 1 0.4368 0.5041 0.0591
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 226 73 153 69 2 0 0 2 0 0 153 0 0 0.9452 0.0000 0.0000 73.000 0.04 4.00 -3.96 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6505 0.3495 0.0000 0 0 0.9461 0.0539 0.0000 0 0 0.9736 0.0264 0.0000
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 843 192 651 90 0 19 0 83 0 0 638 2 11 0.4688 0.0000 0.0200 10.176 0.59 5.57 -4.98 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0785 0.6823 0.2392 1 1 0.0844 0.6697 0.2459 1 1 0.0926 0.6535 0.2539
chr10 32847890 TAA T 0.041560 0.100 1 -2 1 144 66 78 61 1 2 0 2 0 0 78 0 0 0.9242 0.0000 0.0000 32.000 0.16 2.00 -1.84 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8646 0.1354 0.0000 0 0 0.9838 0.0162 0.0000 0 0 0.9923 0.0077 0.0000
chr10 44292818 AC A 0.006843 0.100 1 -1 1 423 153 270 127 5 8 0 13 0 1 268 1 0 0.8301 0.0000 0.0074 18.000 0.31 1.69 -1.39 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0416 0.9584 0.0000 0 0 0.9227 0.0773 0.0000
chr10 46309137 T TTTGTGCCACTCCTGCTGC 0.003400 0.100 1 18 4 249 89 160 77 0 11 0 1 0 0 158 0 2 0.8652 0.0000 0.0125 7.091 0.22 1.00 -0.78 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9504 0.0496 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr10 49988768 A AC 0.134835 0.100 1 1 1 573 162 411 155 0 1 0 6 0 0 411 0 0 0.9568 0.0000 0.0000 161.000 0.43 1.83 -1.40 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0293 0.9707 0.0000 0 0 0.9618 0.0382 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr10 49988921 AC A 0.048828 0.100 1 -1 1 616 210 406 115 7 4 0 84 0 0 404 1 1 0.5476 0.0000 0.0049 51.500 1.40 2.33 -0.93 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9221 0.0779 0.0000 1 0 0.9177 0.0823 0.0001 1 0 0.9111 0.0888 0.0001
chr10 50008914 CAA C 0.245598 0.100 1 -2 1 974 241 733 228 5 0 0 8 0 0 733 0 0 0.9461 0.0000 0.0000 241.000 0.25 2.00 -1.75 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0083 0.9917 0.0000 0 0 0.9858 0.0142 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr10 56358652 T TGCCTCA 0.001075 0.100 1 6 1 523 144 379 113 1 27 0 3 0 0 379 0 0 0.7847 0.0000 0.0000 4.333 0.13 6.00 -5.87 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 148 67 81 63 0 1 0 3 0 0 81 0 0 0.9403 0.0000 0.0000 66.000 1.08 6.00 -4.92 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1488 0.8512 0.0000 0 0 0.8410 0.1590 0.0000 0 0 0.9450 0.0550 0.0000
chr10 63208190 ACTAAAC A 0.035276 0.100 1 -6 1 847 191 656 99 0 5 0 87 0 0 650 0 6 0.5183 0.0000 0.0091 37.200 0.45 5.61 -5.15 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4055 0.5900 0.0044 1 1 0.4170 0.5782 0.0048 1 1 0.4311 0.5636 0.0053
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.100 1 1 1 190 70 120 64 0 4 0 2 0 0 120 0 0 0.9143 0.0000 0.0000 16.500 0.62 1.00 -0.38 0 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9749 0.0251 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 345 75 270 30 0 24 0 21 0 0 270 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 2.125 0.30 3.43 -3.13 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6022 0.3782 0.0196 1 0 0.5979 0.3813 0.0208 1 0 0.5918 0.3857 0.0225
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 445 179 266 151 5 18 0 5 1 0 265 0 0 0.8436 0.0038 0.0038 8.722 0.30 6.80 -6.50 35 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8374 0.1626 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 75782995 TC T 0.002156 0.100 1 -1 1 170 93 77 87 0 3 0 3 0 0 77 0 0 0.9355 0.0000 0.0000 30.000 0.11 1.00 -0.89 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9805 0.0195 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 217 48 169 38 1 5 0 4 0 0 169 0 0 0.7917 0.0000 0.0000 8.400 0.50 1.00 -0.50 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0102 0.9898 0.0000 0 1 0.4656 0.5344 0.0000 0 0 0.8141 0.1859 0.0000
chr10 87234508 TCTC T 0.013816 0.100 1 -3 2 512 179 333 113 4 5 1 56 0 0 332 0 1 0.6313 0.0000 0.0030 34.800 0.44 3.30 -2.86 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9932 0.0068 0.0000 1 0 0.9920 0.0080 0.0000 1 0 0.9901 0.0099 0.0000
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 470 151 319 140 2 1 0 8 0 0 319 0 0 0.9272 0.0000 0.0000 150.000 0.36 3.38 -3.01 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.9374 0.0626 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 322 82 240 6 0 5 1 70 0 0 234 0 6 0.0732 0.0000 0.0250 15.400 0.17 6.30 -6.13 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9337 0.0663 2 1 0.0000 0.5539 0.4461
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 178 58 120 7 0 0 0 51 0 0 120 0 0 0.1207 0.0000 0.0000 58.000 0.14 3.16 -3.01 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9810 0.0190 2 1 0.0000 0.7420 0.2580
chr10 124021236 C CG 0.056607 0.100 1 1 1 359 88 271 5 56 17 2 8 0 4 263 4 0 0.0568 0.0000 0.0295 1.000 9.80 1.88 7.93 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 1 0.1880 0.8120 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 359 92 267 7 9 15 1 60 0 1 266 0 0 0.0761 0.0000 0.0037 5.067 7.00 2.78 4.22 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9934 0.0066 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.9855 0.0145
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 312 108 204 59 0 1 0 48 0 0 204 0 0 0.5463 0.0000 0.0000 107.000 0.25 1.12 -0.87 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4446 0.5051 0.0502 1 1 0.4421 0.5035 0.0544 1 1 0.4381 0.5017 0.0602
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 582 129 453 12 0 7 0 110 0 0 450 0 3 0.0930 0.0000 0.0066 17.429 0.08 3.41 -3.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9457 0.0543
chr11 637361 CGCGGGGGCATCT C 0.071834 0.100 1 -12 2 272 100 172 59 0 8 0 33 0 0 168 0 4 0.5900 0.0000 0.0233 11.500 0.39 11.70 -11.31 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8362 0.1630 0.0008 1 0 0.8293 0.1697 0.0010 1 0 0.8196 0.1792 0.0012
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 235 89 146 5 0 1 1 82 0 0 146 0 0 0.0562 0.0000 0.0000 87.000 0.00 2.24 -2.24 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8058 0.1942 2 2 0.0000 0.3609 0.6391
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.100 1 1 1 358 113 245 68 0 4 0 41 0 0 244 0 1 0.6018 0.0000 0.0041 27.250 0.78 1.83 -1.05 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8680 0.1312 0.0008 1 0 0.8610 0.1380 0.0010 1 0 0.8510 0.1477 0.0012
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 991 205 786 67 1 82 0 55 0 0 786 0 0 0.3268 0.0000 0.0000 1.500 0.57 10.13 -9.56 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4560 0.5028 0.0412 1 1 0.4531 0.5017 0.0452 1 1 0.4485 0.5006 0.0510
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 854 255 599 77 0 76 1 101 0 0 599 0 0 0.3020 0.0000 0.0000 2.355 0.51 13.43 -12.92 23 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0036 0.2532 0.7433 1 2 0.0043 0.2585 0.7371 1 2 0.0055 0.2665 0.7280
chr11 2299635 T TG 0.001237 0.100 1 1 2 273 102 171 52 0 1 0 49 0 0 170 0 1 0.5098 0.0000 0.0058 101.000 1.27 1.20 0.07 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4246 0.5750 0.0004 1 1 0.4320 0.5676 0.0004 1 1 0.4412 0.5584 0.0004
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 338 99 239 0 0 6 0 93 0 0 237 0 2 0.0000 0.0000 0.0084 15.500 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0078 0.9922 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0099 0.9901
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 206 95 111 0 0 1 90 4 0 0 111 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.000 2.25 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0263 0.9737 2 2 0.0000 0.0287 0.9713 2 2 0.0000 0.0322 0.9678
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 206 95 111 0 0 4 0 91 0 0 111 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 91.000 2.32 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0084 0.9916 2 2 0.0000 0.0092 0.9908 2 2 0.0000 0.0106 0.9894
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 685 169 516 155 1 4 0 9 0 0 516 0 0 0.9172 0.0000 0.0000 41.250 0.39 3.11 -2.72 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1441 0.8559 0.0000 0 0 0.8580 0.1420 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 528 146 382 129 0 3 0 14 0 0 382 0 0 0.8836 0.0000 0.0000 47.667 0.12 1.21 -1.10 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0621 0.9379 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 708 167 541 22 0 4 0 141 0 0 528 0 13 0.1317 0.0000 0.0240 40.750 0.32 5.77 -5.45 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 524 129 395 12 0 4 1 112 0 0 394 0 1 0.0930 0.0000 0.0025 41.667 0.33 1.51 -1.18 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8997 0.1003
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.100 1 4 1 828 217 611 169 0 9 0 39 0 0 609 0 2 0.7788 0.0000 0.0033 23.111 0.33 4.64 -4.31 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 5489193 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 725 160 565 80 0 4 0 76 0 0 564 0 1 0.5000 0.0000 0.0018 39.000 1.35 4.14 -2.79 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2101 0.6740 0.1159 1 1 0.2162 0.6618 0.1220 1 1 0.2237 0.6462 0.1302
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 808 146 662 0 0 21 1 124 0 0 637 0 25 0.0000 0.0000 0.0378 5.952 9.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 246 111 135 0 0 12 2 97 0 0 134 1 0 0.0000 0.0000 0.0074 8.167 4.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0078 0.9922
chr11 12294797 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 556 123 433 8 2 37 4 72 0 0 422 0 11 0.0650 0.0000 0.0254 2.324 1.00 7.12 -6.12 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.8981 0.1019
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 12 1 556 123 433 42 2 42 3 34 0 0 422 0 11 0.3415 0.0000 0.0254 1.881 3.21 11.50 -8.29 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1333 0.5947 0.2720 1 1 0.1382 0.5876 0.2742 1 1 0.1445 0.5787 0.2767
chr11 18105983 A ACCTCCT 0.500000 0.100 1 6 2 325 153 172 74 0 17 0 62 0 0 169 0 3 0.4837 0.0000 0.0174 8.000 0.49 5.53 -5.05 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3532 0.5849 0.0619 1 1 0.3554 0.5780 0.0666 1 1 0.3573 0.5694 0.0732
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.100 1 -12 1 306 91 215 45 0 8 0 38 0 0 213 0 2 0.4945 0.0000 0.0093 10.375 0.53 10.03 -9.49 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3106 0.5742 0.1153 1 1 0.3114 0.5685 0.1201 1 1 0.3120 0.5615 0.1265
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 197 74 123 40 1 1 0 32 0 0 121 0 2 0.5405 0.0000 0.0163 73.000 0.45 6.00 -5.55 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3710 0.5361 0.0928 1 1 0.3694 0.5332 0.0975 1 1 0.3667 0.5294 0.1039
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 806 249 557 10 0 10 0 229 0 0 549 0 8 0.0402 0.0000 0.0144 23.900 0.90 3.46 -2.56 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.2331 0.7669 2 2 0.0000 0.0062 0.9938
chr11 55572959 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 361 92 269 86 2 0 0 4 1 0 267 0 1 0.9348 0.0037 0.0074 92.000 0.41 3.00 -2.59 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.2975 0.7025 0.0000 0 0 0.7533 0.2467 0.0000
chr11 56252727 T TGCTTCCTACGTTGCTG 0.500000 0.100 1 16 1 766 212 554 166 1 31 0 14 0 0 554 0 0 0.7830 0.0000 0.0000 5.839 0.20 7.86 -7.66 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.2918 0.7082 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 729 155 574 60 1 2 0 92 0 0 573 0 1 0.3871 0.0000 0.0017 76.500 0.18 2.27 -2.09 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0015 0.1512 0.8473 1 2 0.0019 0.1597 0.8384 1 2 0.0026 0.1720 0.8255
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 669 167 502 159 0 1 0 7 0 0 502 0 0 0.9521 0.0000 0.0000 166.000 0.36 1.29 -0.92 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.6209 0.3791 0.0000 0 0 0.9617 0.0383 0.0000
chr11 59457656 GC G 0.500000 0.100 1 -1 4 604 157 447 142 1 4 0 10 0 0 446 0 1 0.9045 0.0000 0.0022 38.250 0.17 1.40 -1.23 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0103 0.9897 0.0000 0 1 0.4701 0.5299 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 93 48 45 24 0 0 0 24 0 0 44 0 1 0.5000 0.0000 0.0222 48.000 0.08 2.29 -2.21 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1989 0.5586 0.2425 1 1 0.2017 0.5542 0.2441 1 1 0.2054 0.5486 0.2460
chr11 65557854 C CCAGCAG 0.500000 0.100 1 6 3 260 88 172 73 1 10 0 4 0 0 172 0 0 0.8295 0.0000 0.0000 7.800 0.89 6.00 -5.11 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 1 0.3610 0.6390 0.0000 0 0 0.7341 0.2659 0.0000
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 740 194 546 160 2 26 0 6 0 0 540 0 6 0.8247 0.0000 0.0110 6.462 0.47 6.67 -6.20 102 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0091 0.9909 0.0000 0 0 0.5397 0.4603 0.0000
chr11 71548924 TTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTGCCAGTGCAGCTGCTGCAAGCCCTACTGCTCCCAGTGCAGCTGCTGTAAGCCCTGTTGCTCCTCCTCGGGTCGTGGGTCATCCTGCTGCCAATCCAGCTGCTGCAAGCCCTGCTGCTCATCC T 0.500000 0.100 1 -144 1 590 269 321 232 3 27 0 7 0 0 321 0 0 0.8625 0.0000 0.0000 8.926 0.39 3.43 -3.04 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0272 0.9728 0.0000 0 0 0.9863 0.0137 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 924 229 695 143 0 52 0 34 0 0 683 0 12 0.6245 0.0000 0.0173 3.404 0.43 15.32 -14.90 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 1 0.3852 0.6148 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 880 251 629 0 0 1 0 250 0 0 627 1 1 0.0000 0.0000 0.0032 250.000 2.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 241 82 159 47 1 3 0 31 0 0 157 0 2 0.5732 0.0000 0.0126 26.333 0.15 14.90 -14.75 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5800 0.3903 0.0297 1 0 0.5718 0.3954 0.0328 1 0 0.5602 0.4024 0.0374
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 111 59 52 33 0 1 0 25 0 0 51 0 1 0.5593 0.0000 0.0192 58.000 0.42 2.96 -2.54 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3869 0.5164 0.0966 1 1 0.3839 0.5149 0.1011 1 1 0.3796 0.5131 0.1073
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 417 90 327 53 0 3 0 34 0 0 324 0 3 0.5889 0.0000 0.0092 29.000 0.62 4.74 -4.11 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5957 0.3793 0.0250 1 0 0.5875 0.3847 0.0278 1 0 0.5759 0.3920 0.0321
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.100 1 -1 3 546 58 488 44 0 0 0 14 0 0 488 0 0 0.7586 0.0000 0.0000 58.000 0.36 1.57 -1.21 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8752 0.1225 0.0023 1 0 0.8067 0.1907 0.0027 0 1 0.3785 0.6198 0.0017
chr11 96092039 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1166 324 842 272 3 32 2 15 1 0 841 0 0 0.8395 0.0012 0.0012 9.125 0.33 3.20 -2.87 152 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0269 0.9731 0.0000 0 0 0.9446 0.0554 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1342 358 984 0 5 65 3 285 0 0 984 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.500 7.97 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 737 213 524 100 1 41 0 71 0 0 524 0 0 0.4695 0.0000 0.0000 4.171 1.12 10.04 -8.92 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8034 0.1944 0.0022 1 0 0.7949 0.2024 0.0027 1 0 0.7827 0.2137 0.0036
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 298 113 185 69 0 1 0 43 0 0 184 0 1 0.6106 0.0000 0.0054 112.000 0.28 7.51 -7.24 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7697 0.2248 0.0054 1 0 0.7594 0.2341 0.0065 1 0 0.7448 0.2471 0.0082
chr11 124249871 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 485 137 348 124 0 2 0 11 0 0 348 0 0 0.9051 0.0000 0.0000 67.500 0.06 1.00 -0.94 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.2611 0.7389 0.0000
chr11 124396801 A AG 0.500000 0.100 1 1 2 867 205 662 108 1 11 0 85 0 0 661 0 1 0.5268 0.0000 0.0015 17.636 0.29 1.15 -0.87 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6464 0.3468 0.0069 1 0 0.6420 0.3498 0.0082 1 0 0.6351 0.3547 0.0102
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.100 1 -6 1 227 94 133 56 0 12 1 25 0 0 133 0 0 0.5957 0.0000 0.0000 6.833 0.12 4.20 -4.08 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8655 0.1322 0.0023 1 0 0.8550 0.1422 0.0028 1 0 0.8399 0.1564 0.0037
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 399 123 276 52 40 26 2 3 0 2 273 1 0 0.4228 0.0000 0.0109 3.692 0.67 3.67 -2.99 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0146 0.9854 0.0000 0 0 0.5501 0.4499 0.0000 0 0 0.8544 0.1456 0.0000
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 399 127 272 55 2 23 4 43 0 0 269 1 2 0.4331 0.0000 0.0110 4.522 0.62 3.77 -3.15 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3468 0.5706 0.0826 1 1 0.3475 0.5650 0.0875 1 1 0.3478 0.5581 0.0942
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 90 42 48 37 0 1 0 4 0 0 48 0 0 0.8810 0.0000 0.0000 41.000 0.78 2.00 -1.22 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.0828 0.9172 0.0000 0 1 0.3165 0.6835 0.0000
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 355 133 222 9 0 2 0 122 0 0 216 0 6 0.0677 0.0000 0.0270 65.500 0.11 1.96 -1.85 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9428 0.0572 2 2 0.0000 0.3074 0.6926
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 534 146 388 12 0 20 3 111 0 0 383 0 5 0.0822 0.0000 0.0129 6.250 0.08 3.12 -3.03 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9065 0.0935
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.100 1 1 1 668 152 516 72 1 2 1 76 0 0 508 0 8 0.4737 0.0000 0.0155 74.000 0.11 3.04 -2.93 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0923 0.7560 0.1516 1 1 0.1013 0.7470 0.1517 1 1 0.1139 0.7349 0.1512
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.100 1 -1 1 676 152 524 73 0 1 1 77 0 0 516 0 8 0.4803 0.0000 0.0153 151.000 0.16 3.01 -2.85 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0833 0.7527 0.1640 1 1 0.0919 0.7444 0.1637 1 1 0.1040 0.7333 0.1627
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 405 140 265 1 0 35 5 99 0 0 265 0 0 0.0071 0.0000 0.0000 3.088 0.00 3.11 -3.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0385 0.9615 2 2 0.0000 0.0138 0.9862 2 2 0.0000 0.0104 0.9896
chr12 6936716 CCAGCAA C 0.006744 0.100 1 -6 1 836 271 565 221 7 15 19 9 1 0 563 1 0 0.8155 0.0018 0.0035 16.867 4.13 8.22 -4.09 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.7786 0.2214 0.0000
chr12 8047961 A ACAG 0.000866 0.100 1 3 2 403 111 292 89 3 15 0 4 0 0 292 0 0 0.8018 0.0000 0.0000 6.400 0.29 3.00 -2.71 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9455 0.0545 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 1454 379 1075 101 1 3 0 274 0 0 1070 0 5 0.2665 0.0000 0.0047 188.000 1.35 4.08 -2.74 27 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 261 97 164 84 0 7 0 6 0 0 164 0 0 0.8660 0.0000 0.0000 12.857 0.26 5.00 -4.74 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0992 0.9008 0.0000 0 0 0.5527 0.4473 0.0000
chr12 10415650 T TAA 0.001347 0.100 1 2 4 135 60 75 53 0 1 0 6 0 0 75 0 0 0.8833 0.0000 0.0000 59.000 0.09 2.83 -2.74 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0176 0.9824 0.0000 0 0 0.9462 0.0538 0.0000 0 0 0.9952 0.0048 0.0000
chr12 10415652 TTA T 0.001349 0.100 1 -2 4 135 61 74 55 0 0 0 6 0 0 74 0 0 0.9016 0.0000 0.0000 61.000 0.13 2.83 -2.71 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0194 0.9806 0.0000 0 0 0.9510 0.0490 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000
chr12 10723069 G GGGT 0.002430 0.100 1 3 1 299 97 202 79 6 7 0 5 0 0 202 0 0 0.8144 0.0000 0.0000 15.000 0.46 3.20 -2.74 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3258 0.6742 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr12 12477741 GCACGC G 0.023257 0.100 1 -5 3 696 182 514 109 10 2 2 59 0 0 514 0 0 0.5989 0.0000 0.0000 90.000 0.30 9.17 -8.87 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9919 0.0081 0.0000 1 0 0.9906 0.0094 0.0000 1 0 0.9884 0.0116 0.0000
chr12 12477747 TGGGC T 0.023236 0.100 1 -4 1 693 178 515 107 8 2 2 59 0 0 515 0 0 0.6011 0.0000 0.0000 176.000 0.27 9.17 -8.90 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9885 0.0115 0.0000 1 0 0.9868 0.0132 0.0000 1 0 0.9841 0.0159 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 276 128 148 100 3 12 1 12 0 1 147 0 0 0.7812 0.0000 0.0068 9.667 2.19 4.17 -1.98 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0173 0.9827 0.0000
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 436 92 344 35 0 1 0 56 0 0 343 0 1 0.3804 0.0000 0.0029 91.000 0.17 4.25 -4.08 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0132 0.3051 0.6817 1 2 0.0154 0.3150 0.6696 1 2 0.0187 0.3287 0.6526
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 988 165 823 12 0 79 3 71 0 1 772 1 49 0.0727 0.0000 0.0620 1.076 1.42 3.79 -2.37 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.8585 0.1415
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 644 153 491 90 1 4 0 58 0 0 489 0 2 0.5882 0.0000 0.0041 37.250 0.16 1.26 -1.10 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8899 0.1096 0.0005 1 0 0.8835 0.1159 0.0006 1 0 0.8742 0.1249 0.0009
chr12 52073890 TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC T 0.050697 0.100 1 -23 2 333 110 223 88 0 12 0 10 0 0 221 0 2 0.8000 0.0000 0.0090 8.167 0.16 21.50 -21.34 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 1 0.3771 0.6229 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 922 223 699 126 2 19 0 76 0 0 699 0 0 0.5650 0.0000 0.0000 10.737 0.80 12.75 -11.95 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9717 0.0283 0.0000 1 0 0.9680 0.0319 0.0000 1 0 0.9624 0.0375 0.0001
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1080 276 804 22 0 62 0 192 0 0 794 0 10 0.0797 0.0000 0.0124 3.452 0.27 12.82 -12.55 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 331 93 238 56 0 0 0 37 0 0 237 0 1 0.6022 0.0000 0.0042 93.000 0.21 1.11 -0.89 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6813 0.3055 0.0131 1 0 0.6729 0.3122 0.0149 1 0 0.6610 0.3214 0.0176
chr12 55332197 GT G 0.000556 0.100 1 -1 1 517 136 381 129 0 2 0 5 0 0 381 0 0 0.9485 0.0000 0.0000 67.000 0.33 1.00 -0.67 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9515 0.0485 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 537 120 417 119 0 0 0 1 0 0 416 0 1 0.9917 0.0000 0.0024 120.000 0.26 0.00 0.26 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 56423665 T TC 0.000231 0.100 1 1 2 567 157 410 76 4 8 6 63 0 0 410 0 0 0.4841 0.0000 0.0000 74.000 0.30 4.65 -4.35 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5560 0.4439 0.0000 1 0 0.5605 0.4394 0.0000 1 0 0.5656 0.4343 0.0000
chr12 56423667 T TCC 0.000231 0.100 1 2 1 566 156 410 80 2 6 1 67 0 0 410 0 0 0.5128 0.0000 0.0000 150.000 0.38 4.55 -4.18 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6418 0.3582 0.0000 1 0 0.6429 0.3571 0.0000 1 0 0.6436 0.3564 0.0000
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 99 48 51 29 0 1 0 18 0 0 50 0 1 0.6042 0.0000 0.0196 47.000 0.21 2.11 -1.90 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3927 0.5114 0.0959 1 1 0.3857 0.5127 0.1017 1 1 0.3761 0.5142 0.1097
chr12 57225404 T TGGC 0.004341 0.100 1 3 1 558 129 429 120 3 1 0 5 0 0 429 0 0 0.9302 0.0000 0.0000 126.000 1.20 4.80 -3.60 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6411 0.3589 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 387 94 293 88 0 1 0 5 0 0 293 0 0 0.9362 0.0000 0.0000 93.000 0.99 5.00 -4.01 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 1 0.3675 0.6325 0.0000 0 0 0.8094 0.1906 0.0000
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.100 1 -1 1 246 73 173 8 12 12 24 17 0 0 170 3 0 0.1096 0.0000 0.0173 3.000 4.25 3.06 1.19 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0325 0.4144 0.5531 1 2 0.0369 0.4267 0.5365 1 2 0.0434 0.4433 0.5133
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 98 34 64 17 0 2 0 15 0 0 64 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 16.000 0.06 2.73 -2.67 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3350 0.5234 0.1416 1 1 0.3350 0.5212 0.1438 1 1 0.3348 0.5185 0.1467
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1018 297 721 0 0 31 4 262 0 0 720 0 1 0.0000 0.0000 0.0014 8.581 3.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 125 61 64 53 0 2 0 6 0 0 64 0 0 0.8689 0.0000 0.0000 29.500 0.15 1.00 -0.85 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0583 0.9417 0.0000 0 1 0.4136 0.5864 0.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 392 93 299 60 7 24 0 2 0 0 298 1 0 0.6452 0.0000 0.0033 2.875 0.28 3.00 -2.72 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2068 0.7932 0.0000 0 0 0.7199 0.2801 0.0000 0 0 0.8507 0.1493 0.0000
chr12 106247671 T TCTGCGGGTGCTG 0.500000 0.100 1 12 2 385 66 319 31 0 13 0 22 0 0 310 0 9 0.4697 0.0000 0.0282 4.077 4.03 11.14 -7.10 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2123 0.5754 0.2123 1 1 0.2151 0.5698 0.2151 1 1 0.2187 0.5627 0.2186
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 380 99 281 40 1 14 0 44 0 0 276 0 5 0.4040 0.0000 0.0178 6.071 5.65 4.36 1.29 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0783 0.5386 0.3831 1 1 0.0830 0.5353 0.3818 1 1 0.0894 0.5311 0.3795
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 494 151 343 1 2 27 18 103 0 0 340 0 3 0.0066 0.0000 0.0087 4.407 5.00 4.40 0.60 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0322 0.9678 2 2 0.0000 0.0106 0.9894 2 2 0.0000 0.0075 0.9925
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 190 93 97 37 0 0 0 56 0 0 97 0 0 0.3978 0.0000 0.0000 93.000 0.70 2.57 -1.87 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0154 0.3193 0.6653 1 2 0.0175 0.3269 0.6555 1 2 0.0208 0.3373 0.6418
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 174 84 90 7 0 12 0 65 0 0 87 0 3 0.0833 0.0000 0.0333 6.000 0.14 5.45 -5.30 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9830 0.0170 2 1 0.0000 0.7673 0.2327
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 461 137 324 73 35 20 3 6 0 3 321 0 0 0.5328 0.0000 0.0093 5.400 1.19 8.17 -6.97 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1594 0.8406 0.0000 0 0 0.7013 0.2987 0.0000
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 322 104 218 0 0 8 0 96 0 0 214 0 4 0.0000 0.0000 0.0183 12.000 5.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0077 0.9923
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 296 73 223 0 0 5 0 68 0 0 210 0 13 0.0000 0.0000 0.0583 13.600 11.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0158 0.9842 2 2 0.0000 0.0172 0.9828 2 2 0.0000 0.0193 0.9807
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 705 184 521 0 0 28 1 155 0 0 500 0 21 0.0000 0.0000 0.0403 5.571 7.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 223 82 141 25 2 24 1 30 0 0 140 0 1 0.3049 0.0000 0.0071 2.417 0.84 3.20 -2.36 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1239 0.5427 0.3334 1 1 0.1283 0.5394 0.3323 1 1 0.1342 0.5353 0.3305
chr12 124402512 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 3 223 82 141 27 0 49 0 6 0 0 140 1 0 0.3293 0.0000 0.0071 0.673 1.48 4.33 -2.85 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3348 0.6581 0.0071 0 1 0.1426 0.8540 0.0034 0 1 0.1024 0.8961 0.0014
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 163 48 115 23 4 4 1 16 0 1 114 0 0 0.4792 0.0000 0.0087 11.000 0.74 4.19 -3.45 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5094 0.4316 0.0590 1 0 0.5013 0.4355 0.0632 1 0 0.4903 0.4407 0.0689
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 204 74 130 0 0 4 0 70 0 0 126 0 4 0.0000 0.0000 0.0308 17.500 8.41 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0225 0.9775 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0268 0.9732
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 480 124 356 48 4 14 0 58 0 0 353 1 2 0.3871 0.0000 0.0084 7.786 0.56 3.71 -3.14 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0659 0.5505 0.3836 1 1 0.0705 0.5461 0.3834 1 1 0.0769 0.5407 0.3824
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 461 140 321 80 7 36 1 16 0 1 319 0 1 0.5714 0.0000 0.0062 2.861 1.56 5.62 -4.06 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.100 1 -36 5 519 163 356 123 1 38 0 1 0 0 356 0 0 0.7546 0.0000 0.0000 3.289 1.21 0.00 1.21 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9837 0.0163 0.0000 0 0 0.9941 0.0059 0.0000 0 0 0.9954 0.0046 0.0000
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 730 174 556 13 0 22 0 139 0 0 550 0 6 0.0747 0.0000 0.0108 6.909 0.23 5.67 -5.44 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.7981 0.2019
chr13 21172461 TG T 0.091820 0.100 1 -1 2 381 231 150 65 0 54 0 112 0 0 150 0 0 0.2814 0.0000 0.0000 3.278 0.23 1.15 -0.92 27 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0007 0.1973 0.8020 1 2 0.0010 0.2160 0.7830 1 2 0.0015 0.2431 0.7553
chr13 37105243 CTGT C 0.000775 0.100 1 -3 1 463 130 333 120 2 6 0 2 0 0 333 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 20.667 0.65 3.50 -2.85 54 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 612 222 390 196 3 12 0 11 0 0 390 0 0 0.8829 0.0000 0.0000 17.417 0.56 14.73 -14.17 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1596 0.8404 0.0000 0 0 0.9375 0.0625 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 603 138 465 63 1 33 0 41 1 1 456 2 5 0.4565 0.0022 0.0194 3.152 1.17 6.41 -5.24 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7429 0.2541 0.0030 1 0 0.7377 0.2589 0.0034 1 0 0.7302 0.2658 0.0040
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 122 54 68 49 0 2 0 3 0 0 68 0 0 0.9074 0.0000 0.0000 26.000 0.22 4.00 -3.78 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4042 0.5958 0.0000 0 0 0.9542 0.0458 0.0000 0 0 0.9857 0.0143 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 447 67 380 0 0 11 0 56 0 0 372 1 7 0.0000 0.0000 0.0211 5.091 4.39 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0092 0.9908 2 2 0.0000 0.0101 0.9899
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 404 81 323 42 2 33 1 3 2 3 317 0 1 0.5185 0.0062 0.0186 1.500 3.19 2.00 1.19 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0562 0.9438 0.0000 0 1 0.3112 0.6888 0.0000
chr13 107866338 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 2 745 181 564 129 12 31 1 8 0 0 563 0 1 0.7127 0.0000 0.0018 4.839 0.41 3.38 -2.96 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0479 0.9521 0.0000 0 0 0.6712 0.3288 0.0000
chr13 112067766 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 377 87 290 36 1 8 0 42 1 0 287 0 2 0.4138 0.0034 0.0103 11.286 1.42 3.48 -2.06 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0953 0.5503 0.3544 1 1 0.1001 0.5463 0.3536 1 1 0.1065 0.5413 0.3522
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 531 123 408 70 0 12 0 41 0 1 404 1 2 0.5691 0.0000 0.0098 9.250 1.17 6.54 -5.37 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7995 0.1966 0.0039 1 0 0.7891 0.2061 0.0048 1 0 0.7744 0.2195 0.0061
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 225 83 142 40 0 6 1 36 0 0 142 0 0 0.4819 0.0000 0.0000 12.667 1.20 5.56 -4.36 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2739 0.5809 0.1452 1 1 0.2755 0.5748 0.1497 1 1 0.2772 0.5672 0.1556
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 564 131 433 116 2 6 0 7 0 0 432 0 1 0.8855 0.0000 0.0023 20.833 0.55 2.71 -2.16 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0677 0.9323 0.0000 0 0 0.6437 0.3563 0.0000
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 811 185 626 117 1 1 0 66 0 0 625 0 1 0.6324 0.0000 0.0016 184.000 0.18 1.97 -1.79 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9441 0.0558 0.0001 1 0 0.9370 0.0628 0.0002 1 0 0.9261 0.0737 0.0003
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 551 136 415 7 0 9 0 120 0 0 415 0 0 0.0515 0.0000 0.0000 14.111 0.14 1.72 -1.57 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8333 0.1667 2 2 0.0000 0.2397 0.7603
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 484 137 347 92 1 3 0 41 0 0 336 0 11 0.6715 0.0000 0.0317 44.667 0.51 19.00 -18.49 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9422 0.0576 0.0002 1 0 0.9363 0.0634 0.0003 1 0 0.9274 0.0722 0.0004
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 343 68 275 0 0 8 0 60 0 0 275 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.571 1.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0214 0.9786 2 2 0.0000 0.0226 0.9774 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.100 1 2 3 689 150 539 42 0 8 1 99 0 0 535 0 4 0.2800 0.0000 0.0074 17.750 0.69 3.24 -2.55 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0194 0.9805 1 2 0.0000 0.0233 0.9767 1 2 0.0000 0.0295 0.9704
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.100 1 3 3 599 168 431 87 0 19 0 62 0 1 427 0 3 0.5179 0.0000 0.0093 7.842 0.44 3.13 -2.69 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7678 0.2292 0.0030 1 0 0.7618 0.2346 0.0036 1 0 0.7530 0.2425 0.0045
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 531 164 367 6 6 14 2 136 0 0 362 0 5 0.0366 0.0000 0.0136 10.214 0.50 2.94 -2.44 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.5785 0.4215 2 2 0.0000 0.0992 0.9008
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 447 108 339 95 1 10 0 2 0 0 339 0 0 0.8796 0.0000 0.0000 9.800 0.42 6.00 -5.58 55 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8021 0.1979 0.0000 0 0 0.9738 0.0262 0.0000 0 0 0.9870 0.0130 0.0000
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 389 96 293 0 6 8 10 72 0 1 292 0 0 0.0000 0.0000 0.0034 78.000 4.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6649 0.3351 2 2 0.0000 0.2027 0.7973 2 2 0.0000 0.0922 0.9078
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 387 97 290 0 1 14 8 74 0 1 289 0 0 0.0000 0.0000 0.0034 8.300 4.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0320 0.9680 2 2 0.0000 0.0230 0.9770 2 2 0.0000 0.0195 0.9805
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 308 53 255 21 6 10 0 16 0 0 253 0 2 0.3962 0.0000 0.0078 4.300 2.71 3.88 -1.16 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5227 0.4251 0.0522 1 0 0.5168 0.4279 0.0553 1 0 0.5086 0.4317 0.0597
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 325 60 265 18 4 5 0 33 0 0 265 0 0 0.3000 0.0000 0.0000 10.800 1.56 4.03 -2.47 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0748 0.4874 0.4378 1 1 0.0802 0.4900 0.4298 1 1 0.0877 0.4934 0.4189
chr14 24001481 T TA 0.049020 0.100 1 1 2 304 104 200 7 0 1 0 96 0 0 200 0 0 0.0673 0.0000 0.0000 103.000 0.29 1.33 -1.05 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9964 0.0036 2 1 0.0000 0.9426 0.0574
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 318 100 218 95 0 1 0 4 0 0 218 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 99.000 0.40 1.00 -0.60 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1736 0.8264 0.0000 0 0 0.9495 0.0505 0.0000 0 0 0.9888 0.0112 0.0000
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 336 93 243 39 0 19 0 35 0 0 241 0 2 0.4194 0.0000 0.0082 3.895 0.59 6.03 -5.44 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3174 0.5726 0.1100 1 1 0.3206 0.5666 0.1128 1 1 0.3245 0.5590 0.1165
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 608 116 492 0 0 21 0 95 0 0 477 0 15 0.0000 0.0000 0.0305 4.524 7.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.100 1 2 1 485 110 375 104 0 2 0 4 0 0 375 0 0 0.9455 0.0000 0.0000 54.000 0.52 2.00 -1.48 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8855 0.1145 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr14 60125677 C CTAT 0.004717 0.100 1 3 1 267 92 175 86 1 0 0 5 0 0 175 0 0 0.9348 0.0000 0.0000 92.000 0.43 3.00 -2.57 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2095 0.7905 0.0000 0 0 0.9875 0.0125 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 609 143 466 0 0 26 0 117 0 0 461 1 4 0.0000 0.0000 0.0107 4.500 7.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr14 77027304 AGCG A 0.024120 0.100 1 -3 1 437 110 327 75 8 21 1 5 0 0 327 0 0 0.6818 0.0000 0.0000 4.400 1.63 3.20 -1.57 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0321 0.9679 0.0000 0 0 0.9110 0.0890 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 452 107 345 4 30 15 8 50 2 0 341 2 0 0.0374 0.0058 0.0116 8.000 9.00 6.06 2.94 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0085 0.2528 0.7388 1 2 0.0101 0.2640 0.7259 1 2 0.0126 0.2795 0.7079
chr14 77027424 C CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGT 0.001107 0.100 1 21 1 447 106 341 25 4 9 2 66 0 0 338 1 2 0.2358 0.0000 0.0088 10.333 8.04 8.55 -0.51 13 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0085 0.9470 0.0445 1 1 0.0104 0.9502 0.0393 1 1 0.0136 0.9531 0.0333
chr14 77616457 GGCGGCT G 0.000168 0.100 1 -6 1 292 105 187 89 0 7 0 9 0 0 187 0 0 0.8476 0.0000 0.0000 14.000 0.37 5.56 -5.18 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.9722 0.0278 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 472 136 336 9 0 12 3 112 0 0 335 0 1 0.0662 0.0000 0.0030 10.250 0.00 3.17 -3.17 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9610 0.0390 2 2 0.0000 0.3924 0.6076
chr14 92931578 A AGAG 0.001196 0.100 1 3 2 620 170 450 130 1 32 3 4 0 0 450 0 0 0.7647 0.0000 0.0000 4.250 0.58 3.75 -3.17 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9711 0.0289 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 262 72 190 11 0 3 0 58 0 1 181 0 8 0.1528 0.0000 0.0474 23.000 0.45 8.02 -7.56 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9890 0.0110
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 257 67 190 1 0 10 0 56 0 0 187 0 3 0.0149 0.0000 0.0158 5.700 0.00 8.86 -8.86 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3716 0.6284 2 2 0.0000 0.1648 0.8352 2 2 0.0000 0.1232 0.8768
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 389 106 283 51 1 13 0 41 0 1 278 1 3 0.4811 0.0000 0.0177 7.154 0.92 3.80 -2.88 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4788 0.4842 0.0370 1 1 0.4791 0.4816 0.0394 1 0 0.4788 0.4786 0.0426
chr15 20534699 CCTCCTG C 0.091103 0.100 1 -6 1 380 41 339 24 0 13 0 4 3 6 313 8 9 0.5854 0.0088 0.0767 2.154 1.92 4.50 -2.58 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6891 0.3042 0.0067 1 0 0.6832 0.3095 0.0073 1 0 0.6751 0.3168 0.0081
chr15 20534957 TCTTCTCCTCCTGCCTCCACAC T 0.000122 0.100 1 -21 1 289 116 173 59 6 17 0 34 1 6 147 12 7 0.5086 0.0058 0.1503 5.765 3.66 9.94 -6.28 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7702 0.2298 0.0000 1 0 0.7658 0.2342 0.0000 1 0 0.7595 0.2405 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 275 75 200 35 0 7 0 33 0 0 200 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 9.714 1.86 4.61 -2.75 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3763 0.5523 0.0714 1 1 0.3795 0.5474 0.0731 1 1 0.3835 0.5412 0.0754
chr15 22866845 TAAGA T 0.262722 0.100 1 -4 5 282 61 221 6 0 3 1 51 0 0 220 0 1 0.0984 0.0000 0.0045 19.333 0.50 3.86 -3.36 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9916 0.0084 2 1 0.0000 0.9098 0.0902
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 283 55 228 7 1 2 0 45 0 2 210 12 4 0.1273 0.0000 0.0789 26.500 2.29 3.93 -1.65 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9293 0.0707 2 2 0.0000 0.2867 0.7133
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 755 205 550 0 1 8 3 193 0 0 522 5 23 0.0000 0.0000 0.0509 32.667 3.71 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 320 98 222 14 0 1 0 83 0 0 222 0 0 0.1429 0.0000 0.0000 97.000 0.00 1.99 -1.99 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9958 0.0042
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 253 95 158 8 0 7 4 76 0 0 158 0 0 0.0842 0.0000 0.0000 14.000 0.75 2.13 -1.38 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9947 0.0053 2 1 0.0000 0.8828 0.1172
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 622 154 468 0 0 44 2 108 0 0 465 0 3 0.0000 0.0000 0.0064 2.477 3.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr15 35084193 TCA T 0.022764 0.100 1 -2 2 452 96 356 89 1 0 1 5 0 0 356 0 0 0.9271 0.0000 0.0000 96.000 0.64 3.60 -2.96 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0079 0.9921 0.0000 0 0 0.8693 0.1307 0.0000 0 0 0.9864 0.0136 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 400 152 248 57 0 3 0 92 0 0 247 0 1 0.3750 0.0000 0.0040 49.667 1.56 1.97 -0.41 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0014 0.1503 0.8483 1 2 0.0018 0.1611 0.8372 1 2 0.0025 0.1766 0.8209
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 166 73 93 39 0 4 0 30 0 0 91 0 2 0.5342 0.0000 0.0215 17.250 0.10 3.27 -3.16 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3900 0.5229 0.0871 1 1 0.3881 0.5205 0.0914 1 1 0.3851 0.5176 0.0973
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 255 131 124 116 1 3 0 11 0 0 124 0 0 0.8855 0.0000 0.0000 42.667 0.45 3.45 -3.01 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.1488 0.8512 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 412 104 308 39 1 12 4 48 0 0 306 0 2 0.3750 0.0000 0.0065 7.667 0.87 3.56 -2.69 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0252 0.3906 0.5842 1 2 0.0277 0.3940 0.5782 1 2 0.0315 0.3988 0.5697
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 711 135 576 125 1 5 0 4 1 0 575 0 0 0.9259 0.0017 0.0017 26.000 1.90 5.25 -3.35 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8147 0.1853 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 355 132 223 62 1 0 0 69 0 0 221 0 2 0.4697 0.0000 0.0090 132.000 0.61 2.93 -2.31 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1125 0.6698 0.2177 1 1 0.1203 0.6608 0.2189 1 1 0.1310 0.6492 0.2199
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 756 181 575 7 6 96 1 71 0 0 556 0 19 0.0387 0.0000 0.0330 1.640 1.86 12.21 -10.35 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9931 0.0069 2 1 0.0000 0.7754 0.2246
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 744 184 560 5 6 21 3 149 0 0 560 0 0 0.0272 0.0000 0.0000 8.421 0.00 10.42 -10.42 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.6630 0.3370 2 2 0.0000 0.0844 0.9156
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 315 96 219 0 0 7 1 88 0 0 210 0 9 0.0000 0.0000 0.0411 12.714 7.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 314 116 198 5 0 3 0 108 0 0 198 0 0 0.0431 0.0000 0.0000 37.667 0.60 2.11 -1.51 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9959 0.0041 2 2 0.0000 0.4609 0.5391 2 2 0.0000 0.1078 0.8922
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.100 1 -3 2 527 192 335 6 0 37 133 16 0 0 320 14 1 0.0312 0.0000 0.0448 4.189 0.00 2.88 -2.88 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 2 0.0000 0.4897 0.5103 2 2 0.0000 0.0876 0.9124
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 527 195 332 10 0 39 0 146 0 0 318 0 14 0.0513 0.0000 0.0422 4.000 0.10 6.00 -5.90 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9695 0.0305 2 2 0.0000 0.3678 0.6322
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 234 80 154 56 0 17 0 7 1 0 153 0 0 0.7000 0.0065 0.0065 3.706 2.80 9.14 -6.34 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2521 0.7479 0.0000 0 0 0.8570 0.1430 0.0000
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 27 12 15 8 0 0 0 4 0 0 15 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 12.000 0.12 1.25 -1.12 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4987 0.4483 0.0531 1 0 0.4898 0.4566 0.0536 1 0 0.4827 0.4649 0.0524
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 328 91 237 47 0 0 0 44 0 0 236 0 1 0.5165 0.0000 0.0042 91.000 0.04 3.02 -2.98 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3137 0.5895 0.0969 1 1 0.3181 0.5821 0.0998 1 1 0.3235 0.5729 0.1035
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 290 99 191 92 1 1 0 5 0 0 190 0 1 0.9293 0.0000 0.0052 98.000 0.49 19.00 -18.51 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.6404 0.3596 0.0000 0 0 0.9518 0.0482 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 311 73 238 0 0 1 1 71 0 0 238 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 72.000 6.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 311 73 238 0 0 1 1 71 0 0 238 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 72.000 6.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2087923 T TCCCTGCAGTGCAGGAAAGGTAGGGCCGGGTGGGG 0.000288 0.100 1 34 1 429 89 340 44 0 43 0 2 0 0 338 0 2 0.4944 0.0000 0.0059 1.070 0.27 0.00 0.27 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8182 0.1818 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr16 2179036 C CGCG 0.006791 0.100 1 3 6 490 120 370 75 6 32 1 6 0 0 370 0 0 0.6250 0.0000 0.0000 2.806 1.91 3.50 -1.59 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0125 0.9875 0.0000 0 0 0.9243 0.0757 0.0000 0 0 0.9929 0.0071 0.0000
chr16 3356756 GT G 0.055155 0.100 1 -1 2 527 197 330 94 1 4 0 98 0 0 329 0 1 0.4772 0.0000 0.0030 48.250 0.11 1.10 -1.00 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1922 0.7830 0.0248 1 1 0.2058 0.7684 0.0258 1 1 0.2241 0.7490 0.0269
chr16 4885975 T TCCA 0.001019 0.100 1 3 2 325 102 223 92 0 4 0 6 0 0 223 0 0 0.9020 0.0000 0.0000 24.500 0.25 3.00 -2.75 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1471 0.8529 0.0000 0 0 0.9939 0.0061 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 395 103 292 3 0 5 0 95 0 0 291 0 1 0.0291 0.0000 0.0034 19.600 0.67 2.91 -2.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7883 0.2117 2 2 0.0000 0.1130 0.8870 2 2 0.0000 0.0395 0.9605
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 316 90 226 8 1 33 8 40 0 0 219 4 3 0.0889 0.0000 0.0310 1.727 1.50 7.25 -5.75 8 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9909 0.0091
chr16 11915673 C CCCGCCGCCGCCG 0.000621 0.100 1 12 1 316 90 226 26 3 33 1 27 3 1 219 0 3 0.2889 0.0133 0.0310 1.697 5.04 9.48 -4.44 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4711 0.5287 0.0002 1 1 0.4750 0.5247 0.0002 1 1 0.4799 0.5199 0.0002
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 438 148 290 92 0 45 0 11 0 0 287 0 3 0.6216 0.0000 0.0103 2.289 1.11 3.64 -2.53 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1131 0.8869 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 135 41 94 0 0 0 0 41 0 0 94 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 41.000 2.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr16 15873504 T TCTA 0.057892 0.100 1 3 2 107 45 62 40 0 1 0 4 0 0 62 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 44.000 0.10 3.00 -2.90 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0169 0.9831 0.0000 0 0 0.6292 0.3708 0.0000 0 0 0.8969 0.1031 0.0000
chr16 23068920 AGAG A 0.000823 0.100 1 -3 2 805 176 629 166 1 4 0 5 0 0 629 0 0 0.9432 0.0000 0.0000 43.000 0.49 2.80 -2.31 42 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9892 0.0108 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.100 1 -12 1 680 223 457 108 1 12 0 102 0 0 457 0 0 0.4843 0.0000 0.0000 17.500 0.22 9.58 -9.36 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3566 0.6230 0.0204 1 1 0.3679 0.6100 0.0221 1 1 0.3817 0.5937 0.0246
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 148 78 70 37 0 3 0 38 0 0 70 0 0 0.4744 0.0000 0.0000 25.000 0.16 2.08 -1.92 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1849 0.5897 0.2254 1 1 0.1887 0.5830 0.2283 1 1 0.1936 0.5746 0.2318
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 368 72 296 29 8 6 2 27 0 0 296 0 0 0.4028 0.0000 0.0000 10.500 1.31 2.15 -0.84 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3816 0.5219 0.0965 1 1 0.3789 0.5200 0.1011 1 1 0.3751 0.5176 0.1073
chr16 67842902 A ACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 27 2 890 270 620 96 1 68 6 99 0 0 620 0 0 0.3556 0.0000 0.0000 2.897 0.93 2.46 -1.54 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0642 0.6812 0.2546 1 1 0.0696 0.6684 0.2620 1 1 0.0772 0.6519 0.2709
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 896 251 645 168 31 36 1 15 0 0 645 0 0 0.6693 0.0000 0.0000 5.972 1.29 3.20 -1.91 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.3505 0.6495 0.0000
chr16 67968592 GCCCGCCGCTGTC G 0.500000 0.100 1 -12 2 260 87 173 73 0 10 1 3 0 0 173 0 0 0.8391 0.0000 0.0000 7.600 0.32 12.00 -11.68 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0368 0.9632 0.0000 0 0 0.5445 0.4555 0.0000 0 0 0.8005 0.1995 0.0000
chr16 71922608 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 312 135 177 95 1 33 0 6 0 0 177 0 0 0.7037 0.0000 0.0000 3.091 5.66 3.50 2.16 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1695 0.8305 0.0000 0 0 0.6923 0.3077 0.0000
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 312 138 174 70 0 25 0 43 0 0 174 0 0 0.5072 0.0000 0.0000 4.520 3.74 7.58 -3.84 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8037 0.1925 0.0038 1 0 0.7933 0.2021 0.0046 1 0 0.7785 0.2156 0.0060
chr16 71999722 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 261 87 174 82 0 2 0 3 0 0 174 0 0 0.9425 0.0000 0.0000 42.500 0.17 1.00 -0.83 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0776 0.9224 0.0000 0 0 0.7117 0.2883 0.0000 0 0 0.8864 0.1136 0.0000
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.100 1 -3 2 531 132 399 67 0 21 1 43 0 0 399 0 0 0.5076 0.0000 0.0000 5.286 1.04 5.09 -4.05 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7347 0.2577 0.0076 1 0 0.7246 0.2664 0.0090 1 0 0.7103 0.2786 0.0111
chr16 72788687 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 635 189 446 101 3 7 2 76 0 0 446 0 0 0.5344 0.0000 0.0000 26.000 0.49 4.11 -3.62 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7352 0.2609 0.0039 1 0 0.7280 0.2673 0.0047 1 0 0.7174 0.2765 0.0061
chr16 72788692 G GA 0.500000 0.100 1 1 7 634 188 446 94 3 2 15 74 0 0 446 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 86.500 0.43 4.14 -3.71 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3872 0.5756 0.0372 1 1 0.3905 0.5684 0.0411 1 1 0.3936 0.5597 0.0467
chr16 72797458 CTTGTTG C 0.500000 0.100 1 -6 1 716 180 536 86 1 24 2 67 0 0 534 0 2 0.4778 0.0000 0.0037 6.417 0.43 6.04 -5.61 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5235 0.4553 0.0212 1 0 0.5212 0.4549 0.0239 1 0 0.5171 0.4550 0.0279
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 195 92 103 10 0 3 0 79 0 0 99 0 4 0.1087 0.0000 0.0388 29.667 1.30 4.47 -3.17 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.9161 0.0839
chr16 85656394 CGAGCGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 501 105 396 90 1 10 0 4 0 0 395 1 0 0.8571 0.0000 0.0025 9.500 1.30 8.25 -6.95 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0104 0.9896 0.0000 0 0 0.5058 0.4942 0.0000 0 0 0.8360 0.1640 0.0000
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 388 108 280 85 0 20 0 3 0 0 278 0 2 0.7870 0.0000 0.0071 4.400 0.75 6.67 -5.91 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2539 0.7461 0.0000 0 0 0.7143 0.2857 0.0000
chr16 87604287 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 388 113 275 79 2 18 0 14 0 0 275 0 0 0.6991 0.0000 0.0000 5.278 0.56 3.00 -2.44 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0063 0.9937 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 589 114 475 0 1 3 7 103 0 0 465 1 9 0.0000 0.0000 0.0211 36.667 8.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0070 0.9930 2 2 0.0000 0.0056 0.9944
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 587 110 477 0 1 7 4 98 0 0 466 3 8 0.0000 0.0000 0.0231 14.571 8.52 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0095 0.9905 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0066 0.9934
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 589 109 480 1 0 3 3 102 0 1 464 6 9 0.0092 0.0000 0.0333 52.500 0.00 8.33 -8.33 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1079 0.8921 2 2 0.0000 0.0185 0.9815 2 2 0.0000 0.0101 0.9899
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 774 161 613 8 1 6 0 146 0 0 612 0 1 0.0497 0.0000 0.0016 25.833 0.12 7.36 -7.24 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8440 0.1560 2 2 0.0000 0.1661 0.8339
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 843 262 581 186 6 40 3 27 0 0 580 0 1 0.7099 0.0000 0.0017 5.450 0.53 3.67 -3.14 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 163 71 92 3 1 2 0 65 0 0 90 0 2 0.0423 0.0000 0.0217 34.000 0.67 3.95 -3.29 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9726 0.0274 2 1 0.0000 0.5303 0.4697 2 2 0.0000 0.2501 0.7499
chr16 89850471 C CGAG 0.500000 0.100 1 3 3 491 120 371 53 2 14 0 51 0 0 369 0 2 0.4417 0.0000 0.0054 7.571 0.23 3.12 -2.89 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2311 0.6233 0.1455 1 1 0.2350 0.6143 0.1506 1 1 0.2398 0.6029 0.1573
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.100 1 -3 1 850 196 654 181 1 8 0 6 0 0 654 0 0 0.9235 0.0000 0.0000 23.500 0.45 3.00 -2.55 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0559 0.9441 0.0000 0 0 0.9808 0.0192 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 404 147 257 18 0 5 0 124 0 0 257 0 0 0.1224 0.0000 0.0000 28.400 0.78 1.20 -0.42 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9914 0.0086
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 800 179 621 162 0 8 0 9 0 0 621 0 0 0.9050 0.0000 0.0000 21.375 0.17 3.56 -3.38 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.9697 0.0303 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 771 222 549 13 1 40 1 167 0 0 540 0 9 0.0586 0.0000 0.0164 4.550 1.23 3.26 -2.03 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9955 0.0045 2 2 0.0000 0.4368 0.5632
chr17 7846859 T TACC 0.057281 0.100 1 3 2 1236 365 871 3 128 96 18 120 0 1 858 1 11 0.0082 0.0000 0.0149 2.802 0.33 5.78 -5.44 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0362 0.8881 0.0756 1 1 0.0427 0.8797 0.0776 1 1 0.0525 0.8678 0.0797
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.100 1 -6 2 1241 384 857 152 7 84 0 141 0 0 854 0 3 0.3958 0.0000 0.0035 3.571 5.20 7.26 -2.06 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4746 0.5231 0.0023 1 1 0.4882 0.5091 0.0027 1 0 0.5044 0.4924 0.0032
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.100 1 -6 1 1017 277 740 130 0 51 1 95 0 0 733 0 7 0.4693 0.0000 0.0095 4.500 0.92 7.21 -6.29 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8081 0.1915 0.0004 1 0 0.8053 0.1942 0.0005 1 0 0.8008 0.1986 0.0007
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 579 159 420 81 1 9 0 68 0 0 419 0 1 0.5094 0.0000 0.0024 16.667 0.19 2.90 -2.71 37 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4479 0.5180 0.0341 1 1 0.4478 0.5146 0.0376 1 1 0.4465 0.5107 0.0428
chr17 16353358 A AGGCCGCGGG 0.500000 0.100 1 9 2 379 106 273 10 4 15 66 11 0 0 273 0 0 0.0943 0.0000 0.0000 6.067 1.00 11.00 -10.00 4 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9883 0.0117
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 369 99 270 2 0 7 3 87 0 0 270 0 0 0.0202 0.0000 0.0000 13.000 0.50 7.11 -6.61 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4661 0.5339 2 2 0.0000 0.0863 0.9137 2 2 0.0000 0.0440 0.9560
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 524 205 319 5 0 44 13 143 0 0 316 0 3 0.0244 0.0000 0.0094 3.659 0.00 3.21 -3.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9524 0.0476 2 2 0.0000 0.0676 0.9324 2 2 0.0000 0.0109 0.9891
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 904 247 657 14 3 30 17 183 0 0 657 0 0 0.0567 0.0000 0.0000 7.103 0.93 4.24 -3.31 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.6951 0.3049
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 906 243 663 15 23 23 22 160 0 0 663 0 0 0.0617 0.0000 0.0000 16.846 0.93 4.06 -3.12 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 779 178 601 11 0 6 0 161 0 0 595 0 6 0.0618 0.0000 0.0100 28.667 0.00 3.88 -3.88 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9663 0.0337 2 2 0.0000 0.2579 0.7421
chr17 20204736 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 2 631 124 507 63 1 1 0 59 0 0 505 0 2 0.5081 0.0000 0.0039 123.000 0.19 3.19 -3.00 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2325 0.6387 0.1287 1 1 0.2370 0.6287 0.1343 1 1 0.2425 0.6159 0.1416
chr17 35479822 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 747 176 571 164 0 4 0 8 0 0 571 0 0 0.9318 0.0000 0.0000 43.000 0.59 1.62 -1.03 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4204 0.5796 0.0000 0 0 0.9440 0.0560 0.0000
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 117 65 52 3 0 7 0 55 0 0 52 0 0 0.0462 0.0000 0.0000 8.286 0.00 1.42 -1.42 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9792 0.0208 2 1 0.0000 0.6095 0.3905 2 2 0.0000 0.3221 0.6779
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 775 172 603 83 1 31 0 57 1 3 590 0 9 0.4826 0.0017 0.0216 4.700 1.55 11.14 -9.59 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6750 0.3168 0.0082 1 0 0.6679 0.3224 0.0096 1 0 0.6576 0.3305 0.0119
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 413 109 304 21 0 0 0 88 0 0 304 0 0 0.1927 0.0000 0.0000 109.000 0.24 1.55 -1.31 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9758 0.0242 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 532 119 413 99 0 5 0 15 0 0 413 0 0 0.8319 0.0000 0.0000 22.800 0.27 1.33 -1.06 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0080 0.9920 0.0000
chr17 41140276 TGACAGCAGCTGG T 0.500000 0.100 1 -12 1 676 158 518 128 1 23 0 6 5 1 508 2 2 0.8101 0.0097 0.0193 5.870 1.28 10.17 -8.89 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0454 0.9546 0.0000 0 0 0.6350 0.3650 0.0000
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 550 130 420 99 4 14 1 12 1 0 418 0 1 0.7615 0.0024 0.0048 8.143 0.68 9.92 -9.24 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0191 0.9809 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1550 346 1204 308 2 7 0 29 1 0 1200 0 3 0.8902 0.0008 0.0033 48.429 0.43 3.17 -2.74 88 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 643 166 477 127 2 28 0 9 0 2 475 0 0 0.7651 0.0000 0.0042 4.857 0.80 3.67 -2.86 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0430 0.9570 0.0000 0 0 0.6266 0.3734 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 192 65 127 58 0 5 0 2 0 0 127 0 0 0.8923 0.0000 0.0000 12.000 0.34 3.50 -3.16 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1862 0.8138 0.0000 0 0 0.6835 0.3165 0.0000 0 0 0.8223 0.1777 0.0000
chr17 47836758 AAGGAGCTGGAGC A 0.500000 0.100 1 -12 1 660 155 505 139 0 8 0 8 0 0 505 0 0 0.8968 0.0000 0.0000 21.000 0.45 10.75 -10.30 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1666 0.8334 0.0000 0 0 0.8288 0.1712 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 881 239 642 110 0 9 0 120 0 0 636 0 6 0.4603 0.0000 0.0093 25.556 0.12 3.11 -2.99 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0179 0.5556 0.4265 1 1 0.0205 0.5478 0.4317 1 1 0.0243 0.5386 0.4371
chr17 57979243 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 407 172 235 119 6 37 4 6 0 0 235 0 0 0.6919 0.0000 0.0000 3.486 0.48 2.67 -2.19 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0646 0.9354 0.0000 0 0 0.6357 0.3643 0.0000
chr17 58155318 CCA C 0.500000 0.100 1 -2 1 705 193 512 180 1 6 0 6 0 0 512 0 0 0.9326 0.0000 0.0000 31.167 0.23 2.00 -1.77 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0164 0.9836 0.0000 0 0 0.9343 0.0657 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr17 58156083 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 340 70 270 63 0 3 0 4 0 0 270 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 22.333 0.62 1.50 -0.88 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.2485 0.7515 0.0000 0 0 0.6205 0.3795 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 405 124 281 45 1 29 0 49 0 0 274 0 7 0.3629 0.0000 0.0249 3.393 0.40 9.06 -8.66 19 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0562 0.5133 0.4305 1 1 0.0605 0.5113 0.4282 1 1 0.0665 0.5090 0.4245
chr17 58756096 G GGAACCCGAACCC 0.500000 0.100 1 12 2 405 124 281 45 2 35 0 42 0 0 274 0 7 0.3629 0.0000 0.0249 2.514 0.40 9.36 -8.96 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1454 0.6068 0.2478 1 1 0.1503 0.5989 0.2508 1 1 0.1566 0.5890 0.2544
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 338 110 228 50 0 12 0 48 0 0 228 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 8.167 0.24 7.17 -6.93 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2311 0.6133 0.1556 1 1 0.2346 0.6050 0.1604 1 1 0.2389 0.5944 0.1666
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 552 123 429 50 0 8 1 64 0 0 424 0 5 0.4065 0.0000 0.0117 14.250 0.46 8.27 -7.81 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0130 0.3321 0.6549 1 2 0.0150 0.3384 0.6466 1 2 0.0179 0.3471 0.6349
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 698 157 541 102 1 4 3 47 0 0 538 0 3 0.6497 0.0000 0.0055 38.250 0.51 2.43 -1.92 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9711 0.0289 0.0000 1 0 0.9670 0.0329 0.0001 1 0 0.9607 0.0392 0.0001
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 777 177 600 110 0 18 0 49 0 1 587 2 10 0.6215 0.0000 0.0217 8.833 0.87 17.78 -16.90 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9687 0.0313 0.0000 1 0 0.9645 0.0354 0.0001 1 0 0.9581 0.0418 0.0001
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.100 1 -27 1 836 191 645 121 0 6 0 64 0 2 619 2 22 0.6335 0.0000 0.0403 30.833 0.86 24.36 -23.50 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8567 0.1425 0.0008 1 0 0.8493 0.1497 0.0010 1 0 0.8383 0.1603 0.0014
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 2 378 116 262 101 0 2 0 13 0 0 262 0 0 0.8707 0.0000 0.0000 57.000 0.22 2.00 -1.78 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0310 0.9690 0.0000
chr17 75616380 C CAGG 0.500000 0.100 1 3 1 811 197 614 81 9 55 3 49 0 0 614 0 0 0.4112 0.0000 0.0000 2.545 0.86 3.24 -2.38 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9182 0.0813 0.0005 1 0 0.9107 0.0887 0.0006 1 0 0.8995 0.0996 0.0009
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2322 520 1802 228 9 61 6 216 4 3 1783 2 10 0.4385 0.0022 0.0105 7.550 1.51 7.04 -5.53 52 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1190 0.8661 0.0149 1 1 0.1336 0.8483 0.0181 1 1 0.1535 0.8233 0.0232
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2246 583 1663 229 4 36 3 311 6 5 1511 18 123 0.3928 0.0036 0.0914 15.139 1.70 4.64 -2.93 41 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -6 7 278 108 170 92 1 11 0 4 0 0 169 0 1 0.8519 0.0000 0.0059 8.818 0.30 6.00 -5.70 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.3366 0.6634 0.0000 0 0 0.7865 0.2135 0.0000
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 567 164 403 92 0 6 0 66 0 0 401 0 2 0.5610 0.0000 0.0050 26.333 0.38 3.18 -2.80 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7069 0.2871 0.0061 1 0 0.6993 0.2934 0.0072 1 0 0.6884 0.3026 0.0090
chr17 82060071 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 334 95 239 87 0 3 0 5 0 0 239 0 0 0.9158 0.0000 0.0000 30.667 0.44 3.20 -2.76 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2737 0.7263 0.0000 0 0 0.7340 0.2660 0.0000
chr18 48226 ATG A 0.000609 0.100 1 -2 2 1064 307 757 297 1 5 0 4 0 0 757 0 0 0.9674 0.0000 0.0000 60.400 0.62 2.00 -1.38 75 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.100 1 6 4 354 80 274 69 0 5 0 6 0 0 274 0 0 0.8625 0.0000 0.0000 15.000 0.38 5.67 -5.29 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2359 0.7641 0.0000 0 0 0.7797 0.2203 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 138 50 88 0 0 2 1 47 0 0 87 0 1 0.0000 0.0000 0.0114 24.000 3.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 197 85 112 53 0 1 0 31 0 0 112 0 0 0.6235 0.0000 0.0000 84.000 0.17 4.77 -4.60 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7184 0.2705 0.0111 1 0 0.7065 0.2806 0.0129 1 0 0.6899 0.2944 0.0157
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 143 63 80 31 0 2 0 30 0 0 80 0 0 0.4921 0.0000 0.0000 30.500 0.23 2.93 -2.71 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2346 0.5730 0.1924 1 1 0.2368 0.5676 0.1957 1 1 0.2394 0.5607 0.1999
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 220 107 113 94 0 3 0 10 0 0 113 0 0 0.8785 0.0000 0.0000 34.667 0.14 3.40 -3.26 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.1351 0.8649 0.0000
chr18 51197099 T TGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 1 353 74 279 42 0 6 0 26 0 0 275 0 4 0.5676 0.0000 0.0143 11.333 1.05 5.58 -4.53 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5104 0.4423 0.0473 1 0 0.5038 0.4451 0.0512 1 0 0.4945 0.4488 0.0567
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 273 146 127 133 0 6 0 7 0 0 127 0 0 0.9110 0.0000 0.0000 23.333 0.21 3.14 -2.93 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3081 0.6919 0.0000 0 0 0.8767 0.1233 0.0000
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 754 184 570 105 0 6 0 73 0 0 566 0 4 0.5707 0.0000 0.0070 29.667 0.30 13.70 -13.39 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7695 0.2277 0.0028 1 0 0.7618 0.2348 0.0035 1 0 0.7504 0.2450 0.0045
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 349 69 280 1 1 9 5 53 0 1 279 0 0 0.0145 0.0000 0.0036 6.667 1.00 5.15 -4.15 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8346 0.1654 2 2 0.0000 0.4059 0.5941 2 2 0.0000 0.2324 0.7676
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 175 78 97 0 0 10 0 68 0 0 97 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.800 2.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0303 0.9697 2 2 0.0000 0.0324 0.9676 2 2 0.0000 0.0356 0.9644
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 142 67 75 32 1 8 0 26 0 0 72 0 3 0.4776 0.0000 0.0400 7.375 0.22 3.00 -2.78 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3052 0.5566 0.1382 1 1 0.3052 0.5523 0.1425 1 1 0.3049 0.5470 0.1482
chr18 76496529 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 265 65 200 36 0 7 3 19 1 0 199 0 0 0.5538 0.0050 0.0050 8.286 0.44 1.74 -1.29 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6177 0.3537 0.0287 1 0 0.6072 0.3611 0.0317 1 0 0.5928 0.3710 0.0362
chr18 79715187 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 609 136 473 57 4 22 1 52 0 0 471 0 2 0.4191 0.0000 0.0042 5.182 0.58 3.08 -2.50 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3103 0.5975 0.0923 1 1 0.3125 0.5901 0.0974 1 1 0.3148 0.5808 0.1044
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 380 140 240 22 2 29 4 83 0 0 238 1 1 0.1571 0.0000 0.0083 4.360 4.27 5.16 -0.88 8 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0701 0.9299 2 1 0.0000 0.8931 0.1069 2 1 0.0000 0.9987 0.0013
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 186 65 121 60 0 2 0 3 0 0 121 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 31.500 0.28 3.67 -3.38 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0827 0.9173 0.0000 0 0 0.7306 0.2694 0.0000 0 0 0.8985 0.1015 0.0000
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 207 111 96 4 0 0 0 107 0 0 94 0 2 0.0360 0.0000 0.0208 111.000 1.00 3.07 -2.07 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9899 0.0101 2 1 0.0000 0.5158 0.4842 2 2 0.0000 0.1864 0.8136
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 290 100 190 0 0 15 47 38 0 0 186 1 3 0.0000 0.0000 0.0211 5.667 4.87 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0127 0.9873 2 2 0.0000 0.0144 0.9856
chr19 2015541 GGGCGGCGGC G 0.046318 0.100 1 -9 4 290 109 181 37 12 12 37 11 0 0 179 1 1 0.3394 0.0000 0.0110 8.083 3.35 10.55 -7.19 23 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3367 0.6425 0.0208 1 1 0.3457 0.6332 0.0211 1 1 0.3572 0.6212 0.0216
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 290 110 180 50 2 50 1 7 0 0 179 0 1 0.4545 0.0000 0.0056 1.229 3.82 11.29 -7.47 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0079 0.9921 0.0000 0 1 0.1963 0.8037 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 373 126 247 115 1 5 0 5 0 0 247 0 0 0.9127 0.0000 0.0000 24.200 0.27 3.20 -2.93 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0394 0.9606 0.0000 0 0 0.9224 0.0776 0.0000 0 0 0.9882 0.0118 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 527 155 372 136 0 9 1 9 1 0 370 0 1 0.8774 0.0027 0.0054 16.222 1.22 8.22 -7.00 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0196 0.9804 0.0000 0 0 0.6224 0.3776 0.0000
chr19 8906017 A AGGT 0.002480 0.100 1 3 1 290 72 218 65 0 1 0 6 0 0 218 0 0 0.9028 0.0000 0.0000 71.000 0.34 4.17 -3.83 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0175 0.9825 0.0000 0 0 0.9456 0.0544 0.0000 0 0 0.9950 0.0050 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 274 72 202 67 0 0 0 5 0 0 202 0 0 0.9306 0.0000 0.0000 72.000 0.30 5.20 -4.90 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.2279 0.7721 0.0000 0 0 0.6895 0.3105 0.0000
chr19 11447525 A AGAG 0.036742 0.100 1 3 1 827 245 582 161 35 40 0 9 0 1 581 0 0 0.6571 0.0000 0.0017 5.125 0.47 3.11 -2.65 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.9716 0.0284 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 827 248 579 181 2 32 1 32 0 0 577 1 1 0.7298 0.0000 0.0035 6.750 0.61 3.56 -2.95 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 373 139 234 105 0 30 0 4 0 0 232 0 2 0.7554 0.0000 0.0085 3.633 3.25 8.50 -5.25 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.4233 0.5767 0.0000 0 0 0.8887 0.1113 0.0000
chr19 14089291 ATCT A 0.000555 0.100 1 -3 1 360 76 284 65 2 1 1 7 0 0 284 0 0 0.8553 0.0000 0.0000 75.000 1.11 7.29 -6.18 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.9196 0.0804 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr19 14089300 ATCT A 0.000426 0.100 1 -3 1 358 82 276 71 1 1 1 8 0 0 276 0 0 0.8659 0.0000 0.0000 81.000 1.07 6.88 -5.80 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.8622 0.1378 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 574 111 463 0 0 6 0 105 0 0 462 0 1 0.0000 0.0000 0.0022 17.500 3.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 17286674 GTGTGTGTGTGTGTGTGTT G 0.001437 0.100 1 -18 1 409 103 306 29 17 23 9 25 0 0 306 0 0 0.2816 0.0000 0.0000 3.455 5.41 4.92 0.49 13 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6598 0.3401 0.0001 1 0 0.6571 0.3427 0.0001 1 0 0.6532 0.3466 0.0001
chr19 17286686 GTGTGTT G 0.073608 0.100 1 -6 1 407 93 314 0 0 9 4 80 0 0 314 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.375 5.39 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1467 0.8533 2 2 0.0000 0.1580 0.8420 2 2 0.0000 0.1746 0.8254
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.100 1 -4 1 407 90 317 0 0 6 3 81 0 0 317 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 16.600 5.40 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0627 0.9373 2 2 0.0000 0.0680 0.9320 2 2 0.0000 0.0761 0.9239
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 110 45 65 41 0 2 0 2 0 0 65 0 0 0.9111 0.0000 0.0000 21.500 0.88 3.00 -2.12 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2655 0.7345 0.0000 0 0 0.7783 0.2217 0.0000 0 0 0.8852 0.1148 0.0000
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 165 44 121 5 1 0 1 37 0 0 113 0 8 0.1136 0.0000 0.0661 44.000 1.60 3.08 -1.48 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9488 0.0512 2 1 0.0000 0.6183 0.3817
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 349 102 247 83 0 7 0 12 0 0 246 1 0 0.8137 0.0000 0.0040 13.571 0.37 2.58 -2.21 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.1264 0.8736 0.0000
chr19 21973984 AAAGGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGTAGGGCTTCTCTCCAGCATGAATTGCCTTATGTGTAATAAGGGTTGAGACCTTACTG A 0.003453 0.100 1 -84 1 378 64 314 0 0 31 1 32 0 2 309 1 2 0.0000 0.0000 0.0159 1.065 4.22 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9917 0.0083 2 1 0.0000 0.9906 0.0094 2 1 0.0000 0.9896 0.0104
chr19 22317080 ACCAAAGCTTTTAAGCAATCCTCACACCTTACTAGACAAAACAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTG A 0.000338 0.100 1 -82 1 173 53 120 39 0 2 0 12 1 0 119 0 0 0.7358 0.0083 0.0083 25.500 1.41 2.17 -0.76 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8932 0.1068 0.0000 1 0 0.6160 0.3840 0.0000 0 0 0.9060 0.0940 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 311 97 214 31 2 15 2 47 0 0 214 0 0 0.3196 0.0000 0.0000 5.333 0.29 3.06 -2.77 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0060 0.2653 0.7287 1 2 0.0068 0.2712 0.7220 1 2 0.0079 0.2795 0.7126
chr19 33379692 GACCTC G 0.005617 0.100 1 -5 1 461 120 341 64 0 5 1 50 0 0 340 0 1 0.5333 0.0000 0.0029 22.800 0.28 4.54 -4.26 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6538 0.3459 0.0003 1 0 0.6529 0.3468 0.0004 1 0 0.6511 0.3485 0.0004
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 505 127 378 118 1 3 0 5 0 0 378 0 0 0.9291 0.0000 0.0000 41.000 0.66 3.20 -2.54 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.3915 0.6085 0.0000 0 0 0.8182 0.1818 0.0000
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 420 164 256 117 0 17 1 29 0 0 239 0 17 0.7134 0.0000 0.0664 8.647 1.65 19.79 -18.14 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9974 0.0026 0.0000 1 0 0.9968 0.0032 0.0000 1 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 414 127 287 66 0 43 0 18 0 0 286 1 0 0.5197 0.0000 0.0035 2.154 2.64 9.44 -6.81 6 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8689 0.1311 0.0000 0 1 0.1372 0.8628 0.0000 0 1 0.0078 0.9922 0.0000
chr19 35720452 AAAG A 0.001622 0.100 1 -3 1 761 191 570 166 1 15 0 9 0 0 569 0 1 0.8691 0.0000 0.0018 11.733 0.55 3.33 -2.78 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.9840 0.0160 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 36141152 C CGGT 0.000243 0.100 1 3 2 433 152 281 81 5 5 3 58 0 1 280 0 0 0.5329 0.0000 0.0036 28.600 0.70 3.33 -2.62 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8505 0.1495 0.0000 1 0 0.8452 0.1548 0.0000 1 0 0.8376 0.1624 0.0000
chr19 37388950 C CTGTG 0.140068 0.100 1 4 5 580 130 450 67 0 2 0 61 0 0 442 0 8 0.5154 0.0000 0.0178 64.000 0.43 5.08 -4.65 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2497 0.6898 0.0605 1 1 0.2601 0.6779 0.0620 1 1 0.2736 0.6625 0.0639
chr19 37388952 AT A 0.140069 0.100 1 -1 2 582 127 455 66 0 4 0 57 0 0 447 2 6 0.5197 0.0000 0.0176 30.750 0.44 5.32 -4.88 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3417 0.6203 0.0380 1 1 0.3502 0.6102 0.0396 1 1 0.3608 0.5976 0.0416
chr19 37894973 TGGA T 0.043831 0.100 1 -3 1 709 141 568 92 0 2 0 47 0 0 565 0 3 0.6525 0.0000 0.0053 69.500 0.17 3.72 -3.55 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9684 0.0316 0.0000 1 0 0.9649 0.0351 0.0000 1 0 0.9596 0.0404 0.0000
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGGGCCGGG 0.000219 0.100 1 30 2 558 134 424 113 2 15 0 4 0 0 423 0 1 0.8433 0.0000 0.0024 7.867 1.15 9.25 -8.10 15 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9593 0.0407 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 357 135 222 132 0 0 0 3 0 1 220 1 0 0.9778 0.0000 0.0090 135.000 0.28 3.33 -3.05 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6546 0.3454 0.0000 0 0 0.9820 0.0180 0.0000 0 0 0.9941 0.0059 0.0000
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 229 42 187 0 0 2 34 6 0 0 187 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 17.500 3.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0367 0.9633 2 2 0.0000 0.0382 0.9618 2 2 0.0000 0.0404 0.9596
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 229 42 187 0 0 23 18 1 0 0 187 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.938 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0737 0.9263 2 2 0.0000 0.0756 0.9244 2 2 0.0000 0.0782 0.9218
chr19 40667960 TTGC T 0.034410 0.100 1 -3 1 426 109 317 102 1 1 0 5 0 0 317 0 0 0.9358 0.0000 0.0000 108.000 5.01 6.60 -1.59 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0741 0.9259 0.0000 0 0 0.9592 0.0408 0.0000 0 0 0.9941 0.0059 0.0000
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 410 125 285 0 0 6 2 117 0 0 284 0 1 0.0000 0.0000 0.0035 19.833 5.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr19 40667990 CTGT C 0.142266 0.100 1 -3 1 410 127 283 5 12 3 8 99 0 0 282 1 0 0.0394 0.0000 0.0035 113.000 2.60 5.22 -2.62 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9815 0.0185 2 1 0.0000 0.8233 0.1767
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 454 141 313 59 0 3 0 79 0 0 312 0 1 0.4184 0.0000 0.0032 69.000 0.07 1.99 -1.92 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0281 0.5422 0.4298 1 1 0.0322 0.5465 0.4213 1 1 0.0386 0.5522 0.4092
chr19 42225153 TGAG T 0.002643 0.100 1 -3 1 854 156 698 148 0 2 0 6 0 0 698 0 0 0.9487 0.0000 0.0000 77.000 0.50 3.00 -2.50 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5354 0.4646 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.100 1 -1 1 512 123 389 115 0 2 0 6 0 0 389 0 0 0.9350 0.0000 0.0000 60.500 0.16 2.17 -2.01 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0096 0.9904 0.0000 0 0 0.8946 0.1054 0.0000 0 0 0.9891 0.0109 0.0000
chr19 43613468 CAGCCGATCTAGAAGTCCCAACAAGGCAAGAGATCAT C 0.000510 0.100 1 -36 1 1105 332 773 278 1 44 0 9 1 0 771 0 1 0.8373 0.0013 0.0026 6.674 0.82 4.89 -4.07 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4319 0.5681 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 532 159 373 91 0 1 0 67 0 0 370 0 3 0.5723 0.0000 0.0080 158.000 0.46 3.15 -2.69 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5630 0.4219 0.0151 1 0 0.5566 0.4258 0.0176 1 0 0.5470 0.4316 0.0213
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 416 133 283 123 1 3 1 5 0 0 283 0 0 0.9248 0.0000 0.0000 65.000 0.53 2.40 -1.87 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0319 0.9681 0.0000 0 0 0.9060 0.0940 0.0000 0 0 0.9861 0.0139 0.0000
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 284 117 167 109 1 3 0 4 0 0 167 0 0 0.9316 0.0000 0.0000 37.667 0.19 2.50 -2.31 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7363 0.2637 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr19 45409231 CAAG C 0.234924 0.100 1 -3 2 495 105 390 28 0 13 1 63 0 0 388 0 2 0.2667 0.0000 0.0051 7.077 0.86 3.48 -2.62 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0015 0.1352 0.8633 1 2 0.0020 0.1486 0.8495 1 2 0.0029 0.1681 0.8291
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 596 193 403 5 0 32 1 155 0 0 377 0 26 0.0259 0.0000 0.0645 5.031 1.40 6.34 -4.94 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8719 0.1281 2 2 0.0000 0.0245 0.9755 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 310 87 223 48 0 16 0 23 0 0 214 0 9 0.5517 0.0000 0.0404 4.438 0.35 13.30 -12.95 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7442 0.2521 0.0037 1 0 0.7378 0.2580 0.0041 1 0 0.7290 0.2662 0.0048
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.100 1 -3 1 393 114 279 68 0 5 0 41 0 0 279 0 0 0.5965 0.0000 0.0000 21.800 0.96 4.59 -3.63 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8824 0.1170 0.0005 1 0 0.8756 0.1237 0.0007 1 0 0.8659 0.1332 0.0009
chr19 47802262 AGGCCTGGGTTCG A 0.000135 0.100 1 -12 1 1258 335 923 177 10 34 5 109 4 3 904 5 7 0.5284 0.0043 0.0206 10.172 1.60 10.98 -9.38 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9929 0.0071 0.0000 1 0 0.9919 0.0081 0.0000 1 0 0.9903 0.0097 0.0000
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 241 96 145 47 0 8 0 41 0 0 143 0 2 0.4896 0.0000 0.0138 11.000 0.32 1.83 -1.51 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4224 0.5365 0.0411 1 1 0.4259 0.5314 0.0427 1 1 0.4301 0.5250 0.0449
chr19 48944491 GGA G 0.076452 0.100 1 -2 3 342 114 228 61 0 4 0 49 0 0 227 0 1 0.5351 0.0000 0.0044 27.500 0.11 2.08 -1.97 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6110 0.3833 0.0057 1 0 0.6105 0.3833 0.0062 1 0 0.6092 0.3839 0.0069
chr19 49070105 TGGA T 0.101017 0.100 1 -3 1 396 129 267 123 0 0 0 6 0 0 267 0 0 0.9535 0.0000 0.0000 129.000 0.56 4.17 -3.61 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0075 0.9925 0.0000 0 0 0.8745 0.1255 0.0000 0 0 0.9867 0.0133 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 946 206 740 135 5 37 3 26 0 2 735 2 1 0.6553 0.0000 0.0068 4.568 0.94 3.96 -3.02 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.100 1 3 1 984 268 716 188 11 60 1 8 1 0 714 0 1 0.7015 0.0014 0.0028 3.450 0.49 3.88 -3.39 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6021 0.3979 0.0000 0 0 0.9842 0.0158 0.0000
chr19 49196501 TGCTGCGGGGGCC T 0.003841 0.100 1 -12 2 363 120 243 109 0 6 0 5 0 0 243 0 0 0.9083 0.0000 0.0000 19.000 0.49 12.00 -11.51 47 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5001 0.4999 0.0000 0 0 0.9966 0.0034 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 526 141 385 58 0 27 1 55 0 1 381 0 3 0.4113 0.0000 0.0104 4.185 1.28 6.44 -5.16 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2320 0.6393 0.1287 1 1 0.2384 0.6292 0.1324 1 1 0.2465 0.6164 0.1371
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 695 145 550 3 0 3 13 126 0 1 542 2 5 0.0207 0.0000 0.0145 47.333 0.00 3.12 -3.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2796 0.7204 2 2 0.0000 0.0138 0.9862 2 2 0.0000 0.0047 0.9953
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 696 150 546 0 0 12 125 13 0 0 543 2 1 0.0000 0.0000 0.0055 11.417 3.69 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0027 0.9973
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.100 1 6 2 572 132 440 107 0 14 0 11 0 0 437 0 3 0.8106 0.0000 0.0068 8.429 0.36 4.91 -4.54 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 0 0.6324 0.3676 0.0000
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 536 159 377 67 1 5 6 80 0 0 375 0 2 0.4214 0.0000 0.0053 30.800 0.24 2.89 -2.65 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0071 0.3125 0.6804 1 2 0.0082 0.3161 0.6758 1 2 0.0099 0.3215 0.6687
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 187 84 103 49 0 0 0 35 0 0 100 0 3 0.5833 0.0000 0.0291 84.000 0.57 2.29 -1.71 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3179 0.5888 0.0933 1 1 0.3135 0.5864 0.1001 1 1 0.3072 0.5832 0.1095
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 493 145 348 134 1 0 0 10 0 0 348 0 0 0.9241 0.0000 0.0000 145.000 0.25 4.60 -4.35 94 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0327 0.9673 0.0000 0 0 0.6510 0.3490 0.0000
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 566 143 423 127 0 6 0 10 0 0 423 0 0 0.8881 0.0000 0.0000 22.833 0.27 3.40 -3.13 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0209 0.9791 0.0000 0 0 0.5502 0.4498 0.0000
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 726 188 538 76 0 1 0 111 0 0 536 0 2 0.4043 0.0000 0.0037 187.000 0.14 3.42 -3.28 20 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0008 0.1380 0.8612 1 2 0.0011 0.1467 0.8522 1 2 0.0016 0.1594 0.8390
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 703 184 519 84 0 7 0 93 0 0 519 0 0 0.4565 0.0000 0.0000 35.400 0.39 2.24 -1.84 50 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0298 0.5616 0.4086 1 1 0.0325 0.5531 0.4144 1 1 0.0364 0.5427 0.4209
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 717 122 595 62 0 6 0 54 1 0 592 0 2 0.5082 0.0017 0.0050 19.333 0.21 3.17 -2.96 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3495 0.5769 0.0736 1 1 0.3516 0.5704 0.0781 1 1 0.3536 0.5621 0.0843
chr19 54912835 GGAA G 0.007162 0.100 1 -3 3 166 83 83 51 0 3 1 28 0 0 82 0 1 0.6145 0.0000 0.0120 26.667 0.08 3.36 -3.28 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8425 0.1574 0.0001 1 0 0.8357 0.1642 0.0001 1 0 0.8261 0.1738 0.0001
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 418 98 320 4 1 15 0 78 0 0 306 0 14 0.0408 0.0000 0.0437 5.533 0.25 7.22 -6.97 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.6690 0.3310 2 2 0.0000 0.2208 0.7792
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 632 141 491 0 0 27 0 114 0 0 443 0 48 0.0000 0.0000 0.0978 4.222 20.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 993 296 697 135 2 48 0 111 0 0 693 0 4 0.4561 0.0000 0.0057 5.146 0.99 3.62 -2.64 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6382 0.3582 0.0035 1 0 0.6401 0.3557 0.0042 1 0 0.6411 0.3536 0.0052
chr19 55518546 CCCA C 0.003059 0.100 1 -3 1 754 175 579 165 0 6 0 4 0 0 579 0 0 0.9429 0.0000 0.0000 28.167 0.45 2.50 -2.05 43 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9951 0.0049 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 537 102 435 53 0 4 0 45 0 0 433 0 2 0.5196 0.0000 0.0046 24.500 0.57 4.13 -3.57 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3028 0.5900 0.1071 1 1 0.3038 0.5836 0.1126 1 1 0.3046 0.5755 0.1199
chr19 55738355 G GA 0.000815 0.100 1 1 2 210 59 151 32 0 4 0 23 0 0 151 0 0 0.5424 0.0000 0.0000 13.750 1.12 1.00 0.12 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6505 0.3494 0.0001 1 0 0.6473 0.3527 0.0001 1 0 0.6427 0.3572 0.0001
chr19 56088071 C CTCG 0.023520 0.100 1 3 2 310 59 251 9 22 5 2 21 0 1 248 0 2 0.1525 0.0000 0.0120 10.600 4.67 5.57 -0.90 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5998 0.3967 0.0035 1 0 0.5981 0.3982 0.0037 1 0 0.5956 0.4005 0.0039
chr19 56088071 CTCGTCG C 0.000755 0.100 1 -6 2 311 65 246 35 3 3 2 22 0 0 245 0 1 0.5385 0.0000 0.0041 20.667 4.29 9.64 -5.35 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7269 0.2731 0.0000 1 0 0.7216 0.2783 0.0000 1 0 0.7143 0.2857 0.0001
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 140 75 65 6 0 8 0 61 0 0 60 1 4 0.0800 0.0000 0.0769 8.375 0.17 3.11 -2.95 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9797 0.0203 2 1 0.0000 0.8071 0.1929
chr19 57639970 TG T 0.349431 0.100 1 -1 1 190 80 110 77 0 0 0 3 0 0 110 0 0 0.9625 0.0000 0.0000 80.000 0.13 1.00 -0.87 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1096 0.8904 0.0000 0 0 0.7839 0.2161 0.0000 0 0 0.9203 0.0797 0.0000
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 312 120 192 110 1 2 0 7 0 0 192 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 58.500 0.15 1.86 -1.70 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1042 0.8958 0.0000 0 0 0.6570 0.3430 0.0000
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 92 60 32 10 0 2 0 48 0 0 32 0 0 0.1667 0.0000 0.0000 29.000 0.40 6.44 -6.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9937 0.0063 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.9746 0.0254
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 496 172 324 130 0 0 0 42 0 0 321 0 3 0.7558 0.0000 0.0093 172.000 0.17 8.38 -8.21 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9989 0.0011 0.0000 1 0 0.9880 0.0120 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 496 175 321 129 0 6 3 37 0 0 318 0 3 0.7371 0.0000 0.0093 28.167 0.18 8.54 -8.36 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9990 0.0010 0.0000 1 0 0.8659 0.1341 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 497 147 350 99 1 4 0 43 0 0 347 0 3 0.6735 0.0000 0.0086 35.750 0.12 8.95 -8.83 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9848 0.0152 0.0000 1 0 0.9824 0.0176 0.0000 1 0 0.9785 0.0215 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 204 84 120 37 0 2 0 45 0 0 120 0 0 0.4405 0.0000 0.0000 41.000 0.14 1.20 -1.06 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0571 0.4930 0.4500 1 1 0.0605 0.4912 0.4483 1 1 0.0652 0.4893 0.4456
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 702 198 504 9 0 4 0 185 0 0 498 0 6 0.0455 0.0000 0.0119 48.500 0.11 5.70 -5.59 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5612 0.4388 2 2 0.0000 0.0359 0.9641
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 459 162 297 0 0 1 1 160 0 0 288 0 9 0.0000 0.0000 0.0303 160.000 3.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.100 1 -9 4 207 68 139 5 1 20 0 42 0 0 137 0 2 0.0735 0.0000 0.0144 2.400 1.40 9.17 -7.77 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9710 0.0290 2 1 0.0000 0.7729 0.2271
chr20 38926679 C CGCGGCG 0.000616 0.100 1 6 3 559 171 388 81 0 30 1 59 0 0 378 0 10 0.4737 0.0000 0.0258 4.700 0.79 5.49 -4.70 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5840 0.4160 0.0000 1 0 0.5875 0.4125 0.0000 1 0 0.5912 0.4087 0.0001
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 915 265 650 11 0 37 10 207 0 0 646 1 3 0.0415 0.0000 0.0062 6.135 0.45 3.56 -3.11 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5624 0.4376 2 2 0.0000 0.0165 0.9835
chr20 45891618 TG T 0.009535 0.100 1 -1 1 921 269 652 29 24 110 15 91 0 1 651 0 0 0.1078 0.0000 0.0015 1.287 0.69 3.97 -3.28 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0002 0.2378 0.7620 1 2 0.0003 0.2755 0.7242 1 2 0.0005 0.3311 0.6685
chr20 45891620 CTG C 0.009541 0.100 1 -2 1 924 271 653 31 1 29 113 97 0 0 652 1 0 0.1144 0.0000 0.0015 5.185 0.71 4.06 -3.35 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.100 1 3 1 416 107 309 56 0 6 0 45 0 0 309 0 0 0.5234 0.0000 0.0000 16.833 0.45 3.00 -2.55 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5739 0.4075 0.0186 1 0 0.5719 0.4079 0.0202 1 0 0.5686 0.4090 0.0224
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 202 25 177 0 1 5 0 19 0 0 175 0 2 0.0000 0.0000 0.0113 3.800 7.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 288 139 149 63 0 2 0 74 0 0 149 0 0 0.4532 0.0000 0.0000 68.500 0.10 2.04 -1.95 33 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0230 0.4685 0.5085 1 2 0.0250 0.4654 0.5096 1 2 0.0280 0.4619 0.5101
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 771 198 573 90 0 2 0 106 0 0 566 0 7 0.4545 0.0000 0.0122 98.000 0.09 5.49 -5.40 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0065 0.3497 0.6439 1 2 0.0077 0.3521 0.6402 1 2 0.0096 0.3563 0.6341
chr21 33070402 CTCCTCCACT C 0.002225 0.100 1 -9 2 466 142 324 127 2 1 0 12 0 1 323 0 0 0.8944 0.0000 0.0031 141.000 0.73 8.08 -7.35 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4544 0.5456 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 705 160 545 82 3 8 3 64 0 3 537 2 3 0.5125 0.0000 0.0147 18.750 1.50 14.59 -13.09 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6299 0.3626 0.0075 1 0 0.6288 0.3627 0.0085 1 0 0.6265 0.3636 0.0099
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 263 124 139 11 0 7 0 106 0 0 137 0 2 0.0887 0.0000 0.0144 16.714 0.09 3.08 -2.98 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.8203 0.1797
chr21 41179506 G GGGGTGAGTGAGGGTGTCCAGGGTGAGGAGTGAGGGTGTCA 0.029913 0.100 1 40 1 882 232 650 106 2 113 1 10 13 11 602 13 11 0.4569 0.0200 0.0738 1.053 2.03 3.70 -1.67 32 0/1 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 300 47 253 0 0 5 1 41 0 0 253 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.400 2.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1069 176 893 80 3 4 8 81 1 0 886 1 5 0.4545 0.0011 0.0078 85.500 1.02 3.26 -2.23 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0229 0.5163 0.4608 1 1 0.0253 0.5101 0.4646 1 1 0.0288 0.5028 0.4684
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1073 176 897 80 4 2 7 83 1 0 889 2 5 0.4545 0.0011 0.0089 87.000 0.89 3.46 -2.57 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0238 0.5264 0.4498 1 1 0.0262 0.5197 0.4541 1 1 0.0298 0.5116 0.4585
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 677 143 534 16 0 19 0 108 21 12 488 3 10 0.1119 0.0393 0.0861 6.526 2.19 14.18 -11.99 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0078 0.9922 1 2 0.0000 0.0097 0.9903 1 2 0.0000 0.0130 0.9870
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 574 116 458 57 1 7 0 51 0 0 454 0 4 0.4914 0.0000 0.0087 15.571 0.91 13.65 -12.73 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2237 0.6306 0.1457 1 1 0.2272 0.6213 0.1514 1 1 0.2315 0.6095 0.1590
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 351 153 198 1 0 17 0 135 0 0 198 0 0 0.0065 0.0000 0.0000 8.000 1.00 7.35 -6.35 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 45505235 A AGGCCCCCCC 0.016294 0.100 1 9 6 355 90 265 70 1 12 0 7 0 0 265 0 0 0.7778 0.0000 0.0000 6.500 0.99 7.57 -6.59 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.5479 0.4521 0.0000 0 0 0.9548 0.0452 0.0000
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 496 187 309 69 7 36 0 75 0 0 307 0 2 0.3690 0.0000 0.0065 4.194 0.45 3.01 -2.56 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1995 0.6861 0.1144 1 1 0.2081 0.6735 0.1184 1 1 0.2192 0.6573 0.1234
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 226 125 101 111 0 8 0 6 0 0 100 1 0 0.8880 0.0000 0.0099 14.625 0.16 3.00 -2.84 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.4626 0.5374 0.0000 0 0 0.9118 0.0882 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 484 106 378 0 0 31 2 73 1 0 369 0 8 0.0000 0.0026 0.0238 2.419 13.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0183 0.9817 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0047 0.9953
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.100 1 3 1 852 217 635 98 4 49 7 59 0 0 634 0 1 0.4516 0.0000 0.0016 3.408 1.10 3.47 -2.37 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9258 0.0741 0.0002 1 0 0.9205 0.0793 0.0002 1 0 0.9127 0.0870 0.0003
chr22 29489869 AGCTAAGTCCCCAGAGAAG A 0.006299 0.100 1 -18 2 1581 444 1137 199 1 30 9 205 2 2 1112 7 14 0.4482 0.0018 0.0220 13.700 2.10 11.75 -9.65 121 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0060 0.9800 0.0140 1 1 0.0079 0.9774 0.0146 1 1 0.0112 0.9734 0.0154
chr22 36265995 AATAATT A 0.003695 0.100 1 -6 1 482 145 337 138 0 1 0 6 0 0 337 0 0 0.9517 0.0000 0.0000 144.000 0.54 5.17 -4.62 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3309 0.6691 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 413 204 209 74 0 45 0 85 0 0 206 0 3 0.3627 0.0000 0.0144 3.533 0.43 5.86 -5.43 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0567 0.6596 0.2837 1 1 0.0630 0.6539 0.2831 1 1 0.0721 0.6466 0.2813
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.100 1 -3 1 1021 351 670 23 0 10 5 313 0 0 658 1 11 0.0655 0.0000 0.0179 37.778 1.00 3.94 -2.94 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 2 0.0000 0.2783 0.7217
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 381 186 195 93 1 19 0 73 0 0 189 1 5 0.5000 0.0000 0.0308 8.737 0.16 7.27 -7.11 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5426 0.4425 0.0149 1 0 0.5434 0.4399 0.0167 1 0 0.5433 0.4372 0.0194
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 201 98 103 42 0 9 0 47 0 0 102 0 1 0.4286 0.0000 0.0097 9.889 0.19 4.49 -4.30 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1455 0.6153 0.2392 1 1 0.1523 0.6086 0.2391 1 1 0.1614 0.6001 0.2386
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 348 131 217 0 0 2 1 128 0 0 209 0 8 0.0000 0.0000 0.0369 64.000 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 937 210 727 15 0 2 1 192 1 0 696 0 30 0.0714 0.0014 0.0426 104.000 10.07 10.02 0.05 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.5738 0.4262
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.100 1 -48 1 1035 215 820 18 0 64 0 133 0 0 744 0 76 0.0837 0.0000 0.0927 2.359 1.56 16.21 -14.65 6 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9398 0.0602
783 rows