File Info

Filename
HG00136_x_HG00290_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG00136_x_HG00290_FF_10.features.tsv
Size
143.6 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1310876 CGGCTCTGGGTCACAGGT C 0.013343 0.100 1 -17 3 639 179 460 84 0 25 0 70 0 0 459 0 1 0.4693 0.0000 0.0022 6.160 0.64 11.56 -10.91 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6256 0.3738 0.0006 1 0 0.6273 0.3720 0.0007 1 0 0.6288 0.3704 0.0008
chr1 1641723 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 344 125 219 93 0 8 1 23 0 0 219 0 0 0.7440 0.0000 0.0000 14.625 0.20 9.26 -9.06 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4672 0.5328 0.0000 0 1 0.0061 0.9939 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 558 226 332 160 1 14 0 51 0 0 332 0 0 0.7080 0.0000 0.0000 15.143 0.32 8.57 -8.25 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 1 0.1452 0.8548 0.0000
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 445 133 312 62 2 11 2 56 0 1 308 0 3 0.4662 0.0000 0.0128 11.091 0.31 3.41 -3.10 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2536 0.6317 0.1147 1 1 0.2577 0.6221 0.1201 1 1 0.2626 0.6100 0.1275
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 541 169 372 81 0 22 0 66 1 0 370 0 1 0.4793 0.0027 0.0054 6.682 0.22 8.32 -8.10 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5025 0.4718 0.0257 1 0 0.5004 0.4709 0.0287 1 0 0.4966 0.4702 0.0331
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 312 138 174 11 0 0 0 127 0 0 170 0 4 0.0797 0.0000 0.0230 138.000 0.00 3.56 -3.56 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9943 0.0057 2 1 0.0000 0.6689 0.3311
chr1 2529505 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 445 126 319 111 1 11 0 3 0 0 319 0 0 0.8810 0.0000 0.0000 10.455 1.11 3.67 -2.56 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2776 0.7224 0.0000 0 0 0.9168 0.0832 0.0000 0 0 0.9710 0.0290 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 542 126 416 109 1 14 0 2 0 0 416 0 0 0.8651 0.0000 0.0000 7.929 0.32 3.00 -2.68 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7607 0.2393 0.0000 0 0 0.9664 0.0336 0.0000 0 0 0.9829 0.0171 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 1005 169 836 99 0 6 0 64 0 0 832 0 4 0.5858 0.0000 0.0048 27.167 0.16 3.44 -3.28 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8250 0.1733 0.0018 1 0 0.8163 0.1815 0.0022 1 0 0.8038 0.1932 0.0030
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.100 1 3 2 304 109 195 103 0 4 0 2 0 0 195 0 0 0.9450 0.0000 0.0000 26.250 0.34 3.00 -2.66 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6911 0.3089 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 414 87 327 64 0 2 1 20 0 0 327 0 0 0.7356 0.0000 0.0000 42.500 0.39 1.10 -0.71 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9587 0.0411 0.0002 1 0 0.9447 0.0551 0.0003 1 0 0.5783 0.4214 0.0002
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 1639 358 1281 278 4 38 1 37 0 0 1281 0 0 0.7765 0.0000 0.0000 8.342 1.61 2.05 -0.44 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 367 137 230 63 3 11 1 59 0 0 230 0 0 0.4599 0.0000 0.0000 11.455 0.35 3.19 -2.84 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2994 0.6101 0.0904 1 1 0.3024 0.6019 0.0957 1 1 0.3057 0.5915 0.1028
chr1 35738058 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 237 66 171 24 0 10 0 32 1 0 170 0 0 0.3636 0.0058 0.0058 5.600 2.00 5.59 -3.59 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0971 0.5140 0.3889 1 1 0.1016 0.5127 0.3857 1 1 0.1078 0.5111 0.3812
chr1 36178099 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 510 155 355 146 1 2 0 6 0 0 354 0 1 0.9419 0.0000 0.0028 76.500 0.45 3.00 -2.55 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4723 0.5277 0.0000 0 0 0.9334 0.0666 0.0000
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 374 98 276 49 0 10 0 39 0 0 276 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 8.800 0.29 3.10 -2.82 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4385 0.5011 0.0604 1 1 0.4352 0.5001 0.0647 1 1 0.4302 0.4991 0.0708
chr1 46815074 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 2 335 79 256 40 0 1 0 38 0 0 256 0 0 0.5063 0.0000 0.0000 78.000 0.45 2.42 -1.97 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2452 0.5898 0.1650 1 1 0.2477 0.5831 0.1692 1 1 0.2506 0.5747 0.1747
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 628 183 445 0 0 28 1 154 1 0 443 1 0 0.0000 0.0022 0.0045 5.536 5.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 215 71 144 31 0 5 0 35 0 0 144 0 0 0.4366 0.0000 0.0000 13.200 0.42 2.63 -2.21 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1366 0.5615 0.3019 1 1 0.1410 0.5568 0.3022 1 1 0.1468 0.5510 0.3022
chr1 53459700 G GCCGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 604 136 468 55 1 25 1 54 0 0 463 0 5 0.4044 0.0000 0.0107 4.440 0.33 4.70 -4.38 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1182 0.6206 0.2612 1 1 0.1235 0.6118 0.2647 1 1 0.1306 0.6006 0.2688
chr1 54610464 CCACTCCACATTCAGACCGTCATCCCCAGG C 0.500000 0.100 1 -29 1 278 120 158 73 1 5 1 40 0 0 154 0 4 0.6083 0.0000 0.0253 23.000 0.15 19.02 -18.87 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8295 0.1678 0.0026 1 0 0.8194 0.1773 0.0033 1 0 0.8050 0.1907 0.0043
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 835 213 622 101 3 37 0 72 0 1 618 0 3 0.4742 0.0000 0.0064 4.757 0.44 3.46 -3.02 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7992 0.1987 0.0021 1 0 0.7910 0.2064 0.0026 1 0 0.7791 0.2174 0.0035
chr1 55214867 G GGCC 0.500000 0.100 1 3 4 261 88 173 74 2 9 0 3 0 0 173 0 0 0.8409 0.0000 0.0000 8.778 0.70 4.33 -3.63 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0575 0.9425 0.0000 0 0 0.6452 0.3548 0.0000 0 0 0.8530 0.1470 0.0000
chr1 62209972 ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC A 0.500000 0.100 1 -30 1 562 147 415 118 1 23 0 5 0 0 414 0 1 0.8027 0.0000 0.0024 5.391 0.70 13.00 -12.30 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3905 0.6095 0.0000 0 0 0.8725 0.1275 0.0000
chr1 63323865 A ACCCTACGGCCGC 0.500000 0.100 1 12 3 572 100 472 87 0 11 0 2 2 1 465 0 4 0.8700 0.0042 0.0148 8.091 2.95 8.00 -5.05 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1298 0.8702 0.0000 0 0 0.6240 0.3760 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 168 86 82 43 0 2 0 41 0 0 82 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 42.000 0.21 3.71 -3.50 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2410 0.5969 0.1621 1 1 0.2438 0.5897 0.1665 1 1 0.2471 0.5806 0.1722
chr1 84574341 CAGCAGCGCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 426 174 252 160 0 3 0 11 0 0 252 0 0 0.9195 0.0000 0.0000 57.000 0.12 6.00 -5.88 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0237 0.9763 0.0000 0 0 0.6693 0.3307 0.0000
chr1 85132996 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 205 67 138 30 1 10 0 26 0 0 138 0 0 0.4478 0.0000 0.0000 5.600 0.17 1.12 -0.95 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3303 0.5420 0.1276 1 1 0.3292 0.5388 0.1320 1 1 0.3275 0.5348 0.1378
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 485 170 315 91 0 7 0 72 0 0 313 0 2 0.5353 0.0000 0.0063 23.286 0.20 5.31 -5.11 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5355 0.4461 0.0184 1 0 0.5332 0.4459 0.0209 1 0 0.5291 0.4463 0.0246
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 195 78 117 46 0 0 0 32 0 0 116 0 1 0.5897 0.0000 0.0085 78.000 0.11 3.34 -3.24 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5296 0.4302 0.0402 1 0 0.5227 0.4334 0.0439 1 0 0.5131 0.4378 0.0491
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 444 124 320 52 2 2 0 68 1 0 317 1 1 0.4194 0.0031 0.0094 60.500 0.35 3.41 -3.07 20 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0271 0.4416 0.5313 1 2 0.0302 0.4430 0.5268 1 2 0.0347 0.4452 0.5202
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 943 220 723 199 0 18 0 3 0 0 723 0 0 0.9045 0.0000 0.0000 11.222 0.26 1.00 -0.74 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9701 0.0299 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.100 1 -45 4 929 249 680 223 1 22 0 3 0 0 680 0 0 0.8956 0.0000 0.0000 10.318 0.30 1.33 -1.04 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9915 0.0085 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 216 87 129 39 29 14 0 5 0 0 129 0 0 0.4483 0.0000 0.0000 3.857 0.15 2.00 -1.85 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1112 0.8888 0.0000 0 1 0.4845 0.5155 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 252 82 170 4 0 9 9 60 0 0 170 0 0 0.0488 0.0000 0.0000 7.333 1.00 2.03 -1.03 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9947 0.0053 2 1 0.0000 0.6938 0.3062 2 2 0.0000 0.3197 0.6803
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 256 79 177 43 0 8 0 28 0 0 162 0 15 0.5443 0.0000 0.0847 8.875 0.09 11.71 -11.62 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1980 0.6039 0.1980 1 1 0.2019 0.5962 0.2019 1 1 0.2067 0.5865 0.2067
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 819 231 588 183 10 29 1 8 0 0 588 0 0 0.7922 0.0000 0.0000 7.179 1.65 5.12 -3.47 97 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6709 0.3291 0.0000 0 0 0.9804 0.0196 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1316 345 971 135 8 84 1 117 4 3 923 4 37 0.3913 0.0041 0.0494 3.084 2.46 10.83 -8.37 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0287 0.7371 0.2342 1 1 0.0328 0.7208 0.2465 1 1 0.0387 0.6997 0.2616
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 494 183 311 7 1 27 0 148 0 0 310 1 0 0.0383 0.0000 0.0032 5.741 0.00 7.99 -7.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.5515 0.4485 2 2 0.0000 0.0712 0.9288
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 205 82 123 5 0 3 1 73 0 0 122 0 1 0.0610 0.0000 0.0081 26.333 0.20 1.73 -1.53 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8238 0.1762 2 2 0.0000 0.3902 0.6098
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 659 173 486 0 0 2 0 171 0 0 484 0 2 0.0000 0.0000 0.0041 85.500 2.46 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1383 275 1108 0 0 8 2 265 0 0 1107 0 1 0.0000 0.0000 0.0009 33.250 1.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 158 61 97 30 0 11 1 19 0 0 97 0 0 0.4918 0.0000 0.0000 4.545 0.13 5.00 -4.87 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4822 0.4527 0.0651 1 0 0.4754 0.4553 0.0693 1 0 0.4659 0.4588 0.0753
chr1 201386873 CCCA C 0.500000 0.100 1 -3 1 621 171 450 94 1 6 1 69 0 0 445 0 5 0.5497 0.0000 0.0111 27.500 1.10 3.87 -2.77 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6043 0.3842 0.0115 1 0 0.6000 0.3867 0.0133 1 0 0.5933 0.3906 0.0161
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 676 205 471 82 0 39 1 83 0 0 447 0 24 0.4000 0.0000 0.0510 4.256 0.16 13.51 -13.35 22 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0042 0.2773 0.7185 1 2 0.0050 0.2830 0.7120 1 2 0.0064 0.2912 0.7023
chr1 207027530 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 257 112 145 110 0 1 0 1 0 0 145 0 0 0.9821 0.0000 0.0000 111.000 0.27 1.00 -0.73 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9675 0.0325 0.0000 0 0 0.9882 0.0118 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 524 259 265 208 0 32 0 19 0 0 265 0 0 0.8031 0.0000 0.0000 7.094 0.41 11.58 -11.17 110 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1105 0.8895 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 728 150 578 76 0 8 0 66 0 0 578 0 0 0.5067 0.0000 0.0000 17.750 0.70 8.24 -7.55 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3807 0.5669 0.0524 1 1 0.3822 0.5610 0.0568 1 1 0.3832 0.5538 0.0630
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 247 106 141 0 0 2 0 104 0 0 140 0 1 0.0000 0.0000 0.0071 52.000 1.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0047 0.9953 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0061 0.9939
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 608 160 448 73 0 15 2 70 0 1 443 1 3 0.4562 0.0000 0.0112 9.667 0.42 3.94 -3.52 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1268 0.6697 0.2035 1 1 0.1329 0.6578 0.2093 1 1 0.1409 0.6425 0.2166
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 515 136 379 65 0 2 0 69 0 0 378 0 1 0.4779 0.0000 0.0026 67.000 0.23 2.06 -1.83 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0994 0.6327 0.2679 1 1 0.1049 0.6230 0.2721 1 1 0.1123 0.6107 0.2770
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 704 212 492 95 0 1 0 116 0 0 486 0 6 0.4481 0.0000 0.0122 211.000 0.34 3.27 -2.93 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0034 0.2842 0.7124 1 2 0.0041 0.2887 0.7072 1 2 0.0053 0.2955 0.6991
chr1 247896050 ACTC A 0.500000 0.100 1 -3 2 657 183 474 113 0 1 0 69 0 0 470 0 4 0.6175 0.0000 0.0084 182.000 1.50 4.17 -2.67 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9134 0.0863 0.0003 1 0 0.9064 0.0932 0.0004 1 0 0.8960 0.1033 0.0007
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 746 164 582 85 0 4 0 75 0 0 582 0 0 0.5183 0.0000 0.0000 40.000 0.68 2.17 -1.49 59 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3617 0.5885 0.0498 1 1 0.3648 0.5810 0.0542 1 1 0.3677 0.5718 0.0605
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.100 1 -84 1 1072 354 718 320 2 21 0 11 0 0 718 0 0 0.9040 0.0000 0.0000 15.857 0.38 1.64 -1.26 192 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.9875 0.0125 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1147 287 860 12 0 3 1 271 0 1 857 0 2 0.0418 0.0000 0.0035 94.667 3.58 1.35 2.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.3056 0.6944 2 2 0.0000 0.0040 0.9960
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 1212 161 1051 100 1 7 0 53 0 0 1043 0 8 0.6211 0.0000 0.0076 22.000 0.24 3.77 -3.53 64 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9221 0.0776 0.0003 1 0 0.9150 0.0845 0.0004 1 0 0.9046 0.0948 0.0007
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 650 251 399 81 0 19 0 151 0 0 394 0 5 0.3227 0.0000 0.0125 12.211 1.19 6.62 -5.43 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0038 0.9962 1 2 0.0000 0.0046 0.9954 1 2 0.0000 0.0060 0.9940
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 227 112 115 100 2 4 0 6 0 0 115 0 0 0.8929 0.0000 0.0000 27.000 0.15 3.83 -3.68 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2767 0.7233 0.0000 0 0 0.8071 0.1929 0.0000
chr2 17781726 CAAGTT C 0.103121 0.100 1 -5 2 593 143 450 81 1 5 0 56 0 0 448 0 2 0.5664 0.0000 0.0044 27.400 0.22 4.98 -4.76 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8264 0.1728 0.0008 1 0 0.8206 0.1784 0.0010 1 0 0.8122 0.1866 0.0013
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 429 134 295 0 0 16 1 117 0 0 283 0 12 0.0000 0.0000 0.0407 7.375 9.23 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 429 134 295 4 7 105 1 17 0 0 284 5 6 0.0299 0.0000 0.0373 0.257 7.00 5.59 1.41 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0016 0.9395 0.0589 2 1 0.0005 0.9839 0.0156 2 1 0.0002 0.9872 0.0126
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 662 231 431 185 1 20 0 25 0 0 431 0 0 0.8009 0.0000 0.0000 10.550 0.41 8.08 -7.67 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 225 79 146 0 0 1 1 77 0 0 146 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 77.000 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0187 0.9813 2 2 0.0000 0.0202 0.9798 2 2 0.0000 0.0225 0.9775
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 563 195 368 76 1 113 0 5 0 0 368 0 0 0.3897 0.0000 0.0000 0.726 0.12 0.40 -0.28 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1857 0.8143 0.0000 0 0 0.6288 0.3712 0.0000
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 626 154 472 8 6 32 7 101 0 0 462 2 8 0.0519 0.0000 0.0212 3.812 0.38 4.60 -4.23 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9611 0.0389
chr2 73385903 T TGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 626 154 472 14 0 82 1 57 0 0 464 1 7 0.0909 0.0000 0.0169 0.878 2.57 5.68 -3.11 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9965 0.0035
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 631 173 458 137 1 28 0 7 0 0 458 0 0 0.7919 0.0000 0.0000 5.179 3.64 4.86 -1.22 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3672 0.6328 0.0000 0 0 0.9019 0.0981 0.0000
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 463 84 379 76 0 2 0 6 0 0 379 0 0 0.9048 0.0000 0.0000 41.000 0.14 3.50 -3.36 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0696 0.9304 0.0000 0 1 0.4593 0.5407 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 394 153 241 129 1 13 1 9 0 0 241 0 0 0.8431 0.0000 0.0000 10.769 1.19 3.00 -1.81 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0162 0.9838 0.0000 0 1 0.4764 0.5236 0.0000
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 643 182 461 72 1 28 1 80 0 0 455 0 6 0.3956 0.0000 0.0130 5.464 0.47 3.25 -2.78 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0280 0.5020 0.4700 1 1 0.0312 0.4992 0.4696 1 1 0.0359 0.4961 0.4680
chr2 97113750 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 374 121 253 114 0 1 0 6 0 0 253 0 0 0.9421 0.0000 0.0000 120.000 0.30 1.00 -0.70 78 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3157 0.6843 0.0000 0 0 0.8329 0.1671 0.0000
chr2 108259008 AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT A 0.500000 0.100 1 -22 1 650 207 443 187 0 12 0 8 0 0 443 0 0 0.9034 0.0000 0.0000 16.250 0.29 22.00 -21.71 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.6947 0.3053 0.0000 0 0 0.9809 0.0191 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 100 39 61 22 0 0 0 17 0 0 61 0 0 0.5641 0.0000 0.0000 39.000 0.50 3.06 -2.56 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3513 0.5183 0.1304 1 1 0.3487 0.5168 0.1345 1 1 0.3450 0.5150 0.1399
chr2 119321194 TAAAGGGATATCTACAA T 0.500000 0.100 1 -16 2 137 61 76 39 0 0 0 22 0 0 76 0 0 0.6393 0.0000 0.0000 61.000 1.23 11.77 -10.54 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6516 0.3259 0.0224 1 0 0.6406 0.3343 0.0251 1 0 0.6253 0.3456 0.0291
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 581 114 467 9 0 0 0 105 0 0 457 0 10 0.0789 0.0000 0.0214 114.000 0.00 6.12 -6.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9789 0.0211 2 1 0.0000 0.5489 0.4511
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 199 55 144 14 5 8 5 23 0 0 141 1 2 0.2545 0.0000 0.0208 5.250 0.79 1.83 -1.04 8 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0524 0.4182 0.5294 1 2 0.0563 0.4229 0.5208 1 2 0.0619 0.4290 0.5091
chr2 165176265 CATT C 0.500000 0.100 1 -3 1 316 121 195 108 0 7 0 6 0 0 195 0 0 0.8926 0.0000 0.0000 16.286 0.13 3.33 -3.20 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2701 0.7299 0.0000 0 0 0.8006 0.1994 0.0000
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 174 75 99 4 0 17 0 54 0 0 95 0 4 0.0533 0.0000 0.0404 3.625 0.25 6.43 -6.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.7918 0.2082 2 2 0.0000 0.4323 0.5677
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 255 121 134 91 0 24 0 6 0 0 134 0 0 0.7521 0.0000 0.0000 4.042 0.15 11.17 -11.01 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1369 0.8631 0.0000 0 0 0.6377 0.3623 0.0000
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 2 523 142 381 55 0 15 0 72 0 0 381 0 0 0.3873 0.0000 0.0000 8.467 0.60 3.01 -2.41 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0199 0.4007 0.5794 1 2 0.0225 0.4039 0.5736 1 2 0.0263 0.4086 0.5651
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 293 145 148 9 0 5 0 131 0 0 147 0 1 0.0621 0.0000 0.0068 28.000 0.00 3.17 -3.17 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9521 0.0479 2 2 0.0000 0.3477 0.6523
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.100 1 -2 1 599 217 382 133 1 1 0 82 0 0 381 0 1 0.6129 0.0000 0.0026 215.000 0.95 4.13 -3.18 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9637 0.0363 0.0000 1 0 0.9594 0.0405 0.0001 1 0 0.9529 0.0470 0.0001
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 687 146 541 75 0 2 0 69 0 0 539 0 2 0.5137 0.0000 0.0037 72.000 0.33 3.90 -3.57 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2378 0.6546 0.1076 1 1 0.2430 0.6436 0.1134 1 1 0.2494 0.6295 0.1212
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 315 125 190 18 2 23 72 10 0 0 190 0 0 0.1440 0.0000 0.0000 1.450 0.39 4.10 -3.71 8 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0581 0.9417 2 1 0.0001 0.5437 0.4562 2 1 0.0000 0.9762 0.0238
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 315 125 190 94 0 22 1 8 0 0 190 0 0 0.7520 0.0000 0.0000 4.636 2.57 4.25 -1.68 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0168 0.9832 0.0000 0 1 0.3133 0.6867 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 316 125 191 3 7 22 4 89 0 0 191 0 0 0.0240 0.0000 0.0000 4.500 0.00 2.87 -2.87 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8969 0.1031 2 1 0.0000 0.5096 0.4904
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 241 71 170 50 9 6 1 5 0 0 170 0 0 0.7042 0.0000 0.0000 9.333 0.36 1.80 -1.44 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0628 0.9372 0.0000 0 1 0.3447 0.6553 0.0000
chr2 199819526 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 399 76 323 24 18 13 4 17 0 1 320 1 1 0.3158 0.0000 0.0093 3.462 0.67 2.41 -1.75 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6599 0.3184 0.0217 1 0 0.6485 0.3271 0.0244 1 0 0.6329 0.3388 0.0283
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 281 100 181 51 0 0 0 49 0 0 181 0 0 0.5100 0.0000 0.0000 100.000 0.37 3.06 -2.69 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2298 0.6156 0.1546 1 1 0.2334 0.6071 0.1594 1 1 0.2378 0.5964 0.1658
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 624 161 463 0 0 26 5 130 0 0 459 0 4 0.0000 0.0000 0.0086 5.115 8.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr2 219496868 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 394 111 283 67 0 1 0 43 0 0 283 0 0 0.6036 0.0000 0.0000 110.000 1.42 1.49 -0.07 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7554 0.2382 0.0064 1 0 0.7450 0.2474 0.0076 1 0 0.7304 0.2601 0.0095
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 646 222 424 115 4 8 0 95 0 0 397 0 27 0.5180 0.0000 0.0637 26.750 0.57 16.11 -15.54 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0858 0.7570 0.1572 1 1 0.0929 0.7408 0.1663 1 1 0.1025 0.7195 0.1779
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 314 126 188 3 5 7 55 56 0 0 188 0 0 0.0238 0.0000 0.0000 18.833 5.67 3.77 1.90 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9885 0.0115 2 2 0.0000 0.4771 0.5229 2 2 0.0000 0.1444 0.8556
chr2 232847517 A AG 0.500000 0.100 1 1 2 314 114 200 3 40 20 4 47 0 0 192 0 8 0.0263 0.0000 0.0400 3.056 6.67 4.94 1.73 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0076 0.2341 0.7583 1 2 0.0090 0.2440 0.7470 1 2 0.0111 0.2578 0.7311
chr2 235852770 C CCAGG 0.500000 0.100 1 4 2 234 85 149 44 1 7 0 33 0 0 143 0 6 0.5176 0.0000 0.0403 11.143 1.14 4.58 -3.44 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3366 0.5609 0.1025 1 1 0.3365 0.5562 0.1073 1 1 0.3359 0.5503 0.1138
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 372 117 255 76 1 26 1 13 0 0 255 0 0 0.6496 0.0000 0.0000 3.500 0.37 3.23 -2.86 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0053 0.9947 0.0000
chr2 241317535 A AT 0.500000 0.100 1 1 1 201 59 142 25 21 4 1 8 0 1 141 0 0 0.4237 0.0000 0.0070 8.750 1.00 1.88 -0.88 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.0021 0.9978 0.0000 0 1 0.0396 0.9604 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 711 199 512 103 0 1 0 95 0 0 507 0 5 0.5176 0.0000 0.0098 198.000 0.39 3.68 -3.30 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0458 0.7685 0.1856 1 1 0.0479 0.7536 0.1986 1 1 0.0505 0.7337 0.2158
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 652 161 491 129 0 25 0 7 1 1 486 0 3 0.8012 0.0020 0.0102 5.440 0.79 9.14 -8.35 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0661 0.9339 0.0000 0 0 0.8013 0.1987 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 482 118 364 62 0 3 1 52 0 0 364 0 0 0.5254 0.0000 0.0000 38.333 0.55 5.04 -4.49 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3841 0.5516 0.0643 1 1 0.3840 0.5471 0.0689 1 1 0.3832 0.5416 0.0753
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 578 189 389 104 0 2 0 83 0 0 388 0 1 0.5503 0.0000 0.0026 93.500 0.31 3.36 -3.05 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5842 0.4047 0.0111 1 0 0.5816 0.4056 0.0129 1 0 0.5768 0.4076 0.0156
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 793 276 517 2 14 37 4 219 1 0 465 0 51 0.0072 0.0019 0.1006 6.405 3.00 9.76 -6.76 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9576 0.0424 2 2 0.0000 0.0464 0.9536
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 735 223 512 8 2 51 7 155 0 0 505 0 7 0.0359 0.0000 0.0137 3.373 0.38 4.94 -4.56 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8960 0.1040 2 2 0.0000 0.1422 0.8578
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 735 223 512 10 0 74 2 137 0 0 506 0 6 0.0448 0.0000 0.0117 2.041 1.20 5.19 -3.99 0 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9665 0.0335 2 2 0.0000 0.3414 0.6586
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 742 205 537 0 0 10 0 195 0 0 530 0 7 0.0000 0.0000 0.0130 19.500 2.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 46373452 TACAGTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAG T 0.500000 0.100 1 -32 1 793 216 577 203 1 8 0 4 0 0 577 0 0 0.9398 0.0000 0.0000 26.000 0.20 24.25 -24.05 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8194 0.1806 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 399 149 250 0 0 5 1 143 0 0 245 0 5 0.0000 0.0000 0.0200 28.800 3.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 628 170 458 1 0 21 8 140 0 0 456 0 2 0.0059 0.0000 0.0044 7.048 1.00 3.21 -2.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0044 0.9956 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 394 98 296 48 0 18 30 2 0 0 295 1 0 0.4898 0.0000 0.0034 4.444 0.27 4.00 -3.73 20 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5818 0.3888 0.0294 1 0 0.5735 0.3940 0.0325 1 0 0.5619 0.4010 0.0371
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 394 100 294 51 1 18 0 30 0 0 293 0 1 0.5100 0.0000 0.0034 4.556 0.29 6.77 -6.47 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7229 0.2662 0.0109 1 0 0.7118 0.2757 0.0126 1 0 0.6961 0.2886 0.0152
chr3 51970081 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 710 171 539 93 0 11 1 66 0 0 539 0 0 0.5439 0.0000 0.0000 14.455 0.35 1.44 -1.08 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7510 0.2449 0.0042 1 0 0.7426 0.2523 0.0050 1 0 0.7306 0.2630 0.0065
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.100 1 6 1 459 155 304 111 1 37 0 6 0 0 304 0 0 0.7161 0.0000 0.0000 3.189 0.21 4.50 -4.29 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3115 0.6885 0.0000 0 0 0.8297 0.1703 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 187 94 93 5 0 4 0 85 0 0 87 0 6 0.0532 0.0000 0.0645 22.500 0.20 7.15 -6.95 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.6852 0.3148 2 2 0.0000 0.2302 0.7698
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 269 91 178 44 0 2 5 40 0 0 177 0 1 0.4835 0.0000 0.0056 44.500 0.09 3.00 -2.91 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1639 0.6045 0.2317 1 1 0.1684 0.5968 0.2349 1 1 0.1742 0.5870 0.2388
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 269 93 176 45 0 5 38 5 0 0 176 0 0 0.4839 0.0000 0.0000 17.600 0.11 3.00 -2.89 9 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3298 0.5621 0.1081 1 1 0.3298 0.5573 0.1129 1 1 0.3293 0.5514 0.1194
chr3 63912684 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 3 276 71 205 40 4 10 0 17 0 0 203 0 2 0.5634 0.0000 0.0098 6.100 0.38 3.94 -3.57 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8071 0.1870 0.0059 1 0 0.7951 0.1980 0.0070 1 0 0.7776 0.2136 0.0088
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 310 130 180 59 4 10 2 55 0 0 176 0 4 0.4538 0.0000 0.0222 12.000 0.46 3.18 -2.72 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2156 0.6423 0.1421 1 1 0.2203 0.6321 0.1476 1 1 0.2262 0.6190 0.1548
chr3 94061063 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 454 120 334 68 1 7 1 43 0 0 329 0 5 0.5667 0.0000 0.0150 16.143 0.15 1.37 -1.23 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6661 0.3217 0.0123 1 0 0.6575 0.3284 0.0141 1 0 0.6453 0.3377 0.0170
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 849 240 609 88 0 15 0 137 0 0 597 0 12 0.3667 0.0000 0.0197 15.000 0.36 9.76 -9.40 34 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0149 0.9851 1 2 0.0000 0.0172 0.9828 1 2 0.0000 0.0209 0.9791
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 468 140 328 64 0 5 0 71 0 0 328 0 0 0.4571 0.0000 0.0000 27.000 0.33 1.28 -0.95 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0784 0.6078 0.3138 1 1 0.0835 0.5996 0.3169 1 1 0.0905 0.5893 0.3201
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 358 100 258 41 1 8 2 48 0 0 257 0 1 0.4100 0.0000 0.0039 11.375 0.44 1.27 -0.83 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0698 0.5268 0.4034 1 1 0.0743 0.5242 0.4015 1 1 0.0806 0.5210 0.3983
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 482 130 352 15 0 1 1 113 0 0 352 0 0 0.1154 0.0000 0.0000 129.000 0.00 1.32 -1.32 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9836 0.0164
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1184 307 877 0 1 85 113 108 0 0 877 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 2.541 3.33 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1195 310 885 108 7 66 9 120 0 0 885 0 0 0.3484 0.0000 0.0000 3.723 2.66 7.68 -5.03 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0242 0.6140 0.3618 1 1 0.0274 0.6034 0.3692 1 1 0.0321 0.5903 0.3776
chr3 125055821 G GCAT 0.500000 0.100 1 3 2 300 80 220 69 0 7 0 4 0 0 219 0 1 0.8625 0.0000 0.0045 10.429 1.57 3.25 -1.68 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1327 0.8673 0.0000 0 0 0.5347 0.4653 0.0000
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.100 1 -4 1 343 130 213 78 0 6 0 46 0 0 212 0 1 0.6000 0.0000 0.0047 20.667 0.22 4.43 -4.22 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8525 0.1457 0.0018 1 0 0.8428 0.1549 0.0023 1 0 0.8289 0.1680 0.0031
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 178 95 83 8 0 0 0 87 0 0 83 0 0 0.0842 0.0000 0.0000 95.000 0.38 2.48 -2.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9846 0.0154 2 1 0.0000 0.7128 0.2872
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 370 123 247 12 0 1 0 110 0 0 247 0 0 0.0976 0.0000 0.0000 122.000 0.00 2.12 -2.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9133 0.0867
chr3 184321978 AAGGAGAAGC A 0.500000 0.100 1 -9 1 687 152 535 121 0 26 0 5 0 0 535 0 0 0.7961 0.0000 0.0000 4.846 0.50 9.60 -9.10 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0071 0.9929 0.0000 0 0 0.6725 0.3275 0.0000 0 0 0.9348 0.0652 0.0000
chr3 184353343 C CCGG 0.500000 0.100 1 3 1 807 182 625 166 1 8 0 7 0 0 625 0 0 0.9121 0.0000 0.0000 21.625 0.58 3.71 -3.14 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.7073 0.2927 0.0000 0 0 0.9735 0.0265 0.0000
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 581 150 431 114 1 25 0 10 0 0 431 0 0 0.7600 0.0000 0.0000 5.000 0.37 3.00 -2.63 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0074 0.9926 0.0000 0 1 0.3020 0.6980 0.0000
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 535 152 383 81 0 7 1 63 0 0 382 0 1 0.5329 0.0000 0.0026 29.000 0.26 2.11 -1.85 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5192 0.4568 0.0240 1 0 0.5164 0.4568 0.0269 1 0 0.5117 0.4572 0.0311
chr3 195726146 GC G 0.500000 0.100 1 -1 4 1680 359 1321 131 0 15 1 212 0 0 1318 1 2 0.3649 0.0000 0.0023 22.933 1.48 2.36 -0.88 19 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0024 0.9976 1 2 0.0000 0.0029 0.9971 1 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr3 195781275 GGTGGATGCTGAGGAAGTGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCT G 0.500000 0.100 1 -48 2 6247 1805 4442 1290 47 183 24 261 171 192 4066 13 0 0.7147 0.0385 0.0846 9.011 3.27 4.71 -1.44 116 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 754 160 594 0 0 16 0 144 0 1 562 0 31 0.0000 0.0000 0.0539 9.000 12.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 278 127 151 45 0 19 4 59 0 0 149 0 2 0.3543 0.0000 0.0132 5.684 0.69 8.66 -7.97 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0128 0.3172 0.6701 1 2 0.0147 0.3243 0.6610 1 2 0.0176 0.3341 0.6483
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 535 113 422 16 0 0 0 97 0 0 351 2 69 0.1416 0.0000 0.1682 113.000 0.75 15.11 -14.36 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.7129 0.2871
chr4 3074927 G GCAA 0.030219 0.100 1 3 1 689 277 412 98 93 28 41 17 0 2 410 0 0 0.3538 0.0000 0.0049 18.833 5.24 6.18 -0.93 18 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 587 189 398 104 0 8 0 77 0 0 393 0 5 0.5503 0.0000 0.0126 22.625 0.47 9.21 -8.74 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6348 0.3571 0.0081 1 0 0.6304 0.3601 0.0095 1 0 0.6234 0.3648 0.0118
chr4 73837092 G GT 0.500000 0.100 1 1 2 578 146 432 135 0 4 0 7 0 0 432 0 0 0.9247 0.0000 0.0000 35.500 0.16 1.00 -0.84 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3317 0.6683 0.0000 0 0 0.8871 0.1129 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2531 548 1983 334 9 169 8 28 3 3 1967 5 5 0.6095 0.0015 0.0081 2.265 1.58 7.89 -6.31 130 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87614861 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3159 776 2383 660 9 64 7 36 4 9 2357 7 6 0.8505 0.0017 0.0109 11.590 1.29 9.89 -8.60 246 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6847 0.3153 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 4313 950 3363 476 19 59 9 387 62 76 2985 191 49 0.5011 0.0184 0.1124 16.315 2.68 8.78 -6.10 42 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0060 0.9937 0.0003 1 1 0.0088 0.9906 0.0005 1 1 0.0142 0.9848 0.0010
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3850 1091 2759 43 20 213 40 775 282 61 2363 19 34 0.0394 0.1022 0.1435 4.106 3.42 8.92 -5.50 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 87615746 CAACAGCAGT C 0.500000 0.100 1 -9 1 3741 1014 2727 334 271 93 87 229 341 55 2302 22 7 0.3294 0.1250 0.1558 12.233 4.61 14.84 -10.23 40 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615758 CAGCAGCGAT C 0.500000 0.100 1 -9 1 3711 1017 2694 644 179 125 42 27 293 76 2296 16 13 0.6332 0.1088 0.1477 8.535 4.91 13.37 -8.46 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 156 65 91 39 0 1 0 25 0 0 91 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 64.000 0.10 3.12 -3.02 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5728 0.3915 0.0357 1 0 0.5638 0.3970 0.0391 1 0 0.5515 0.4045 0.0441
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 755 194 561 176 0 7 0 11 0 0 561 0 0 0.9072 0.0000 0.0000 26.714 0.30 4.09 -3.79 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0511 0.9489 0.0000 0 0 0.8147 0.1853 0.0000
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.100 1 -18 1 227 112 115 99 0 6 0 7 0 0 115 0 0 0.8839 0.0000 0.0000 17.667 0.13 15.71 -15.58 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0754 0.9246 0.0000 0 0 0.5774 0.4226 0.0000
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 579 235 344 1 0 34 9 191 0 0 342 0 2 0.0043 0.0000 0.0058 5.912 1.00 3.09 -2.09 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 549 197 352 10 143 40 1 3 0 11 339 2 0 0.0508 0.0000 0.0369 4.132 0.80 4.00 -3.20 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6410 0.3590 0.0000 0 0 0.9835 0.0165 0.0000 0 0 0.9952 0.0048 0.0000
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 2 554 207 347 16 0 26 0 165 1 2 326 1 17 0.0773 0.0029 0.0605 6.962 1.50 9.15 -7.65 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9313 0.0687
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.100 1 5 2 320 142 178 3 0 11 0 128 0 0 169 0 9 0.0211 0.0000 0.0506 11.909 1.33 4.85 -3.52 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4218 0.5782 2 2 0.0000 0.0254 0.9746 2 2 0.0000 0.0088 0.9912
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 274 102 172 0 0 12 0 90 0 0 169 0 3 0.0000 0.0000 0.0174 7.500 5.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0095 0.9905 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr4 176184858 TTCTC T 0.500000 0.100 1 -4 3 168 71 97 38 0 3 0 30 0 0 97 0 0 0.5352 0.0000 0.0000 22.667 0.24 3.73 -3.50 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4052 0.5119 0.0830 1 1 0.4020 0.5105 0.0875 1 1 0.3973 0.5090 0.0938
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 791 136 655 0 0 2 0 134 0 0 652 0 3 0.0000 0.0000 0.0046 67.000 3.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.100 1 -12 4 249 91 158 46 0 3 0 42 0 0 154 0 4 0.5055 0.0000 0.0253 29.333 0.46 11.76 -11.31 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3334 0.6168 0.0498 1 1 0.3407 0.6085 0.0508 1 1 0.3501 0.5979 0.0520
chr5 7867364 TATA T 0.017279 0.100 1 -3 3 946 232 714 145 1 2 0 84 0 0 712 0 2 0.6250 0.0000 0.0028 115.000 0.41 3.36 -2.95 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9917 0.0083 0.0000 1 0 0.9905 0.0095 0.0000 1 0 0.9885 0.0115 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 810 195 615 145 2 31 2 15 0 0 614 0 1 0.7436 0.0000 0.0016 5.290 0.37 3.20 -2.83 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0121 0.9879 0.0000
chr5 61332354 A AGCG 0.500000 0.100 1 3 1 373 137 236 57 1 28 8 43 1 0 234 0 1 0.4161 0.0042 0.0085 4.037 1.42 3.91 -2.49 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3355 0.5799 0.0846 1 1 0.3367 0.5737 0.0896 1 1 0.3377 0.5659 0.0964
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 360 45 315 0 0 27 1 17 0 0 299 8 8 0.0000 0.0000 0.0508 0.692 6.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1548 0.8452 2 2 0.0000 0.1592 0.8408 2 2 0.0000 0.1655 0.8345
chr5 66596936 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 393 106 287 95 0 3 0 8 0 0 287 0 0 0.8962 0.0000 0.0000 34.333 1.79 3.25 -1.46 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0225 0.9775 0.0000 0 1 0.3719 0.6281 0.0000
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 434 115 319 59 0 5 0 51 0 0 319 0 0 0.5130 0.0000 0.0000 22.000 0.34 5.82 -5.48 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3627 0.5630 0.0743 1 1 0.3631 0.5579 0.0790 1 1 0.3629 0.5515 0.0856
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 546 142 404 5 0 3 0 134 0 0 399 0 5 0.0352 0.0000 0.0124 46.333 0.20 3.04 -2.84 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9825 0.0175 2 2 0.0000 0.1653 0.8347 2 2 0.0000 0.0283 0.9717
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 337 98 239 36 1 12 0 49 1 1 233 0 4 0.3673 0.0042 0.0251 7.167 1.92 20.63 -18.72 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0319 0.4156 0.5525 1 2 0.0352 0.4192 0.5456 1 2 0.0399 0.4242 0.5359
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 335 78 257 32 1 1 0 44 0 1 254 0 2 0.4103 0.0000 0.0117 77.000 2.44 23.73 -21.29 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0460 0.4507 0.5033 1 2 0.0499 0.4528 0.4974 1 2 0.0554 0.4557 0.4889
chr5 109855234 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 177 80 97 72 0 3 0 5 0 0 97 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 25.667 0.12 3.20 -3.08 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1509 0.8491 0.0000 0 0 0.5707 0.4293 0.0000
chr5 113488351 T TGCCGCTGCC 0.500000 0.100 1 9 1 260 105 155 52 4 5 2 42 0 0 155 0 0 0.4952 0.0000 0.0000 19.200 1.23 8.10 -6.86 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4492 0.4978 0.0530 1 1 0.4460 0.4968 0.0572 1 1 0.4412 0.4958 0.0630
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 1021 242 779 4 0 31 5 202 0 1 769 3 6 0.0165 0.0000 0.0128 7.033 2.00 3.55 -1.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1584 0.8416 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 435 124 311 98 0 20 0 6 1 0 310 0 0 0.7903 0.0032 0.0032 5.200 0.67 7.67 -6.99 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1911 0.8089 0.0000 0 0 0.7218 0.2782 0.0000
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 349 87 262 47 2 5 0 33 0 0 254 0 8 0.5402 0.0000 0.0305 16.400 0.47 8.79 -8.32 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3788 0.5410 0.0801 1 1 0.3776 0.5375 0.0848 1 1 0.3755 0.5332 0.0913
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 172 62 110 0 0 1 0 61 0 0 108 0 2 0.0000 0.0000 0.0182 61.000 3.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0387 0.9613 2 2 0.0000 0.0412 0.9588 2 2 0.0000 0.0449 0.9551
chr5 140042926 C CCTGCTGCTGCTGCCGCTCTCGCTG 0.500000 0.100 1 24 1 687 247 440 117 1 67 0 62 0 0 408 0 32 0.4737 0.0000 0.0727 2.687 0.41 13.40 -12.99 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6524 0.3420 0.0056 1 0 0.6487 0.3446 0.0067 1 0 0.6426 0.3490 0.0085
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 208 80 128 0 0 0 4 76 0 0 122 1 5 0.0000 0.0000 0.0469 80.000 4.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0124 0.9876 2 2 0.0000 0.0136 0.9864 2 2 0.0000 0.0153 0.9847
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 208 80 128 0 0 1 5 74 0 0 121 4 3 0.0000 0.0000 0.0547 79.000 4.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0125 0.9875 2 2 0.0000 0.0136 0.9864 2 2 0.0000 0.0153 0.9847
chr5 141573996 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 621 180 441 65 2 50 6 57 0 0 441 0 0 0.3611 0.0000 0.0000 2.600 0.48 3.95 -3.47 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2448 0.6387 0.1165 1 1 0.2492 0.6286 0.1221 1 1 0.2546 0.6159 0.1295
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 411 106 305 87 1 10 0 8 0 0 304 0 1 0.8208 0.0000 0.0033 9.600 0.30 8.00 -7.70 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0056 0.9944 0.0000 0 1 0.1815 0.8185 0.0000
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 349 126 223 78 9 29 1 9 0 0 223 0 0 0.6190 0.0000 0.0000 3.276 0.50 6.56 -6.06 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 1 0.1557 0.8443 0.0000
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 654 148 506 63 0 2 1 82 0 0 506 0 0 0.4257 0.0000 0.0000 73.000 0.40 1.72 -1.32 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0120 0.3562 0.6318 1 2 0.0138 0.3607 0.6255 1 2 0.0167 0.3671 0.6162
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 382 142 240 83 0 8 0 51 0 0 238 0 2 0.5845 0.0000 0.0083 16.750 3.00 4.94 -1.94 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8321 0.1657 0.0022 1 0 0.8225 0.1748 0.0027 1 0 0.8088 0.1876 0.0036
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 382 166 216 53 5 24 2 82 0 0 216 0 0 0.3193 0.0000 0.0000 5.917 3.62 12.77 -9.15 25 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0045 0.2347 0.7608 1 2 0.0054 0.2429 0.7516 1 2 0.0069 0.2546 0.7385
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 382 144 238 0 60 10 1 73 0 0 236 0 2 0.0000 0.0000 0.0084 13.400 4.82 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0244 0.4426 0.5330 1 2 0.0273 0.4436 0.5291 1 2 0.0316 0.4453 0.5230
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 424 120 304 60 1 4 0 55 0 0 304 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 28.750 1.07 3.95 -2.88 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3029 0.6012 0.0960 1 1 0.3053 0.5936 0.1011 1 1 0.3079 0.5840 0.1081
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 465 209 256 84 8 39 4 74 0 0 255 0 1 0.4019 0.0000 0.0039 4.333 1.08 3.59 -2.51 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4307 0.5377 0.0315 1 1 0.4322 0.5328 0.0350 1 1 0.4331 0.5269 0.0400
chr5 181155256 TTGTC T 0.500000 0.100 1 -4 3 900 234 666 31 0 12 0 191 0 0 650 0 16 0.1325 0.0000 0.0240 18.500 0.35 4.00 -3.65 19 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 502 127 375 45 1 11 1 69 0 0 375 0 0 0.3543 0.0000 0.0000 10.545 0.53 3.33 -2.80 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0062 0.2418 0.7520 1 2 0.0074 0.2505 0.7421 1 2 0.0092 0.2627 0.7280
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 646 155 491 49 5 36 11 54 4 2 476 2 7 0.3161 0.0081 0.0305 3.286 2.04 4.94 -2.90 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0749 0.6636 0.2615 1 1 0.0821 0.6588 0.2591 1 1 0.0924 0.6524 0.2551
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 596 131 465 59 4 16 0 52 1 4 456 1 3 0.4504 0.0022 0.0194 7.188 0.98 4.06 -3.07 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5876 0.3982 0.0142 1 0 0.5861 0.3982 0.0157 1 0 0.5834 0.3989 0.0177
chr6 7910637 T TCCG 0.039779 0.100 1 3 1 327 111 216 88 2 14 0 7 0 0 216 0 0 0.7928 0.0000 0.0000 6.929 0.85 4.14 -3.29 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.5566 0.4434 0.0000 0 0 0.9552 0.0448 0.0000
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1544 353 1191 109 91 124 16 13 0 2 1186 0 3 0.3088 0.0000 0.0042 1.744 1.86 4.92 -3.06 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000
chr6 16327684 A ATGC 0.101269 0.100 1 3 1 1557 401 1156 31 57 86 33 194 0 0 1154 0 2 0.0773 0.0000 0.0017 3.671 1.19 3.53 -2.34 7 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0242 0.9758
chr6 22570117 G GGGC 0.051576 0.100 1 3 1 762 161 601 72 1 24 2 62 0 0 598 0 3 0.4472 0.0000 0.0050 5.667 0.38 3.34 -2.96 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4671 0.5255 0.0074 1 1 0.4738 0.5183 0.0078 1 1 0.4818 0.5097 0.0085
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 1101 234 867 120 0 6 0 108 0 0 845 0 22 0.5128 0.0000 0.0254 38.000 0.32 11.07 -10.76 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0601 0.7686 0.1712 1 1 0.0673 0.7550 0.1776 1 1 0.0777 0.7370 0.1853
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 389 101 288 0 0 3 1 97 0 0 287 0 1 0.0000 0.0000 0.0035 32.333 1.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr6 31028873 A ACCTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAG 0.500000 0.100 1 30 2 2807 670 2137 183 14 272 16 185 18 17 1949 41 112 0.2731 0.0084 0.0880 1.463 2.58 3.69 -1.11 31 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 603 146 457 130 2 9 0 5 0 0 457 0 0 0.8904 0.0000 0.0000 15.111 0.30 2.40 -2.10 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0143 0.9857 0.0000 0 0 0.7836 0.2164 0.0000 0 0 0.9607 0.0393 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 619 153 466 79 2 1 0 71 0 0 466 0 0 0.5163 0.0000 0.0000 152.000 0.56 2.86 -2.30 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3664 0.5815 0.0521 1 1 0.3689 0.5746 0.0566 1 1 0.3711 0.5660 0.0628
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 619 153 466 140 3 1 1 8 0 0 466 0 0 0.9150 0.0000 0.0000 152.000 1.31 5.62 -4.32 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1338 0.8662 0.0000 0 0 0.8064 0.1936 0.0000
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 482 157 325 92 0 9 0 56 0 0 317 0 8 0.5860 0.0000 0.0246 16.444 0.52 11.38 -10.85 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7863 0.2106 0.0031 1 0 0.7774 0.2188 0.0037 1 0 0.7647 0.2305 0.0049
chr6 31772986 A ACAGGCTCCATGGGG 0.500000 0.100 1 14 2 451 137 314 122 1 9 0 5 1 0 312 0 1 0.8905 0.0032 0.0064 14.222 0.23 15.20 -14.97 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.4514 0.5486 0.0000 0 0 0.8972 0.1028 0.0000
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 509 155 354 80 1 16 0 58 0 0 354 0 0 0.5161 0.0000 0.0000 8.688 0.93 3.91 -2.99 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7057 0.2868 0.0075 1 0 0.6973 0.2939 0.0088 1 0 0.6852 0.3039 0.0109
chr6 32530180 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 200 89 111 2 48 9 21 9 0 1 109 1 0 0.0225 0.0000 0.0180 2.556 12.00 7.78 4.22 0 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5678 0.3913 0.0409 1 0 0.5583 0.3972 0.0445 1 0 0.5453 0.4050 0.0497
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 691 269 422 210 2 8 1 48 0 0 422 0 0 0.7807 0.0000 0.0000 32.625 7.33 7.52 -0.19 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 690 261 429 200 6 7 2 46 0 0 428 0 1 0.7663 0.0000 0.0023 36.286 7.57 7.70 -0.13 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32977921 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 521 116 405 72 0 3 0 41 0 0 403 0 2 0.6207 0.0000 0.0049 37.667 0.15 3.29 -3.14 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8322 0.1651 0.0027 1 0 0.8220 0.1747 0.0033 1 0 0.8075 0.1882 0.0043
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 411 84 327 51 0 8 0 25 0 0 315 0 12 0.6071 0.0000 0.0367 9.500 0.84 14.40 -13.56 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5461 0.4198 0.0340 1 0 0.5392 0.4233 0.0374 1 0 0.5295 0.4282 0.0423
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 880 201 679 99 82 7 0 13 0 0 679 0 0 0.4925 0.0000 0.0000 27.714 0.47 2.92 -2.45 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 0 0.6014 0.3986 0.0000
chr6 42107366 GGGTGGGGGTTCCAGCAGCAGGGGAGGT G 0.500000 0.100 1 -27 5 444 117 327 102 0 13 0 2 0 0 327 0 0 0.8718 0.0000 0.0000 8.000 1.02 28.00 -26.98 42 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6800 0.3200 0.0000 0 0 0.9510 0.0490 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 829 166 663 70 0 24 3 69 0 0 663 0 0 0.4217 0.0000 0.0000 5.875 0.51 3.39 -2.88 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1387 0.6635 0.1978 1 1 0.1446 0.6519 0.2035 1 1 0.1523 0.6371 0.2105
chr6 44002766 C CGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 486 113 373 70 1 30 0 12 1 0 372 0 0 0.6195 0.0027 0.0027 2.767 2.71 6.42 -3.70 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0147 0.9853 0.0000
chr6 44172317 T TGGCTGCC 0.500000 0.100 1 7 1 222 103 119 90 0 6 0 7 0 0 119 0 0 0.8738 0.0000 0.0000 16.167 0.28 6.57 -6.29 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0494 0.9506 0.0000 0 1 0.4687 0.5313 0.0000
chr6 45422749 AGGCGGCGGCGGCGGCTGC A 0.500000 0.100 1 -18 2 657 269 388 107 3 73 1 85 1 0 373 0 14 0.3978 0.0026 0.0387 2.685 1.41 14.75 -13.34 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3217 0.6382 0.0400 1 1 0.3285 0.6272 0.0443 1 1 0.3361 0.6134 0.0504
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 793 163 630 0 0 87 0 76 0 0 605 0 25 0.0000 0.0000 0.0397 0.874 9.01 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0074 0.9926
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 711 133 578 58 3 39 1 32 0 0 572 1 5 0.4361 0.0000 0.0104 2.474 1.48 4.38 -2.89 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7356 0.2561 0.0084 1 0 0.7250 0.2652 0.0098 1 0 0.7101 0.2778 0.0120
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 131 42 89 15 0 4 0 23 0 0 89 0 0 0.3571 0.0000 0.0000 9.500 0.27 2.91 -2.65 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0892 0.4751 0.4357 1 1 0.0936 0.4766 0.4299 1 1 0.0996 0.4785 0.4219
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 853 202 651 101 0 13 0 88 0 0 647 0 4 0.5000 0.0000 0.0061 14.538 0.25 3.10 -2.85 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3049 0.6439 0.0512 1 1 0.3111 0.6330 0.0560 1 1 0.3182 0.6192 0.0627
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 706 144 562 83 1 0 1 59 0 0 553 0 9 0.5764 0.0000 0.0160 144.000 0.43 5.51 -5.07 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4999 0.4749 0.0252 1 0 0.4981 0.4737 0.0282 1 0 0.4947 0.4727 0.0326
chr6 118491647 ATGT A 0.500000 0.100 1 -3 3 299 101 198 47 0 4 0 50 0 0 195 0 3 0.4653 0.0000 0.0152 24.250 0.21 3.04 -2.83 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0980 0.5801 0.3219 1 1 0.1030 0.5740 0.3231 1 1 0.1097 0.5663 0.3240
chr6 148343106 T TGAGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 400 178 222 80 0 18 2 78 0 0 221 0 1 0.4494 0.0000 0.0045 8.889 0.24 5.38 -5.15 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1415 0.6867 0.1718 1 1 0.1479 0.6738 0.1783 1 1 0.1563 0.6572 0.1865
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 953 252 701 215 0 12 0 25 1 0 700 0 0 0.8532 0.0014 0.0014 20.000 0.20 3.16 -2.96 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0038 0.9962 0.0000
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 591 218 373 0 0 42 0 176 0 0 351 0 22 0.0000 0.0000 0.0590 4.190 13.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 374 127 247 0 0 3 0 124 0 0 247 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 41.333 4.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 218 78 140 39 0 3 0 36 0 0 140 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 25.000 1.36 9.33 -7.97 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2704 0.5804 0.1492 1 1 0.2721 0.5744 0.1536 1 1 0.2739 0.5668 0.1594
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 218 71 147 30 0 10 0 31 0 0 146 0 1 0.4225 0.0000 0.0068 6.100 0.17 10.48 -10.32 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1727 0.5707 0.2567 1 1 0.1764 0.5654 0.2582 1 1 0.1812 0.5587 0.2600
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 340 138 202 0 0 14 10 114 0 0 192 0 10 0.0000 0.0000 0.0495 8.857 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr6 170283474 ATGT A 0.500000 0.100 1 -3 1 755 167 588 162 0 0 0 5 0 0 588 0 0 0.9701 0.0000 0.0000 167.000 0.27 3.00 -2.73 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0544 0.9456 0.0000 0 0 0.9409 0.0591 0.0000 0 0 0.9905 0.0095 0.0000
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 851 267 584 6 29 23 101 108 0 0 583 1 0 0.0225 0.0000 0.0017 11.765 5.17 8.38 -3.21 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9953 0.0047
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 275 98 177 38 0 7 0 53 0 0 175 0 2 0.3878 0.0000 0.0113 13.000 0.39 4.17 -3.78 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0212 0.3613 0.6174 1 2 0.0238 0.3674 0.6088 1 2 0.0277 0.3756 0.5967
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 261 105 156 47 2 27 0 29 0 0 156 0 0 0.4476 0.0000 0.0000 2.852 0.47 3.90 -3.43 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6973 0.2887 0.0140 1 0 0.6862 0.2978 0.0160 1 0 0.6708 0.3101 0.0191
chr7 5313034 T TGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 1 724 86 638 37 1 17 1 30 0 0 638 0 0 0.4302 0.0000 0.0000 4.312 1.76 6.70 -4.94 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3699 0.5328 0.0973 1 1 0.3680 0.5301 0.1020 1 1 0.3650 0.5267 0.1083
chr7 5313159 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 767 156 611 74 2 15 4 61 0 0 611 0 0 0.4744 0.0000 0.0000 9.333 0.46 4.08 -3.62 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4086 0.5454 0.0460 1 1 0.4091 0.5408 0.0501 1 1 0.4089 0.5352 0.0560
chr7 11831843 AGCAGCGGCAGCG A 0.500000 0.100 1 -12 2 170 83 87 48 0 3 0 32 0 0 84 0 3 0.5783 0.0000 0.0345 26.667 0.77 11.69 -10.92 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5251 0.4350 0.0399 1 0 0.5186 0.4378 0.0435 1 0 0.5094 0.4418 0.0488
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 644 200 444 9 0 29 10 152 0 0 444 0 0 0.0450 0.0000 0.0000 5.897 0.00 3.18 -3.18 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8168 0.1832 2 2 0.0000 0.1111 0.8889
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.100 1 3 2 473 124 349 70 0 8 0 46 0 0 347 0 2 0.5645 0.0000 0.0057 14.500 0.17 3.41 -3.24 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7063 0.2847 0.0090 1 0 0.6970 0.2925 0.0105 1 0 0.6837 0.3034 0.0129
chr7 20785321 AGCC A 0.500000 0.100 1 -3 2 509 113 396 41 2 25 2 43 0 1 391 2 2 0.3628 0.0000 0.0126 3.440 0.93 4.02 -3.10 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1321 0.5945 0.2734 1 1 0.1369 0.5875 0.2756 1 1 0.1434 0.5786 0.2780
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 374 102 272 58 0 4 0 40 0 0 272 0 0 0.5686 0.0000 0.0000 24.500 0.12 2.88 -2.75 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6364 0.3456 0.0179 1 0 0.6275 0.3521 0.0203 1 0 0.6151 0.3610 0.0239
chr7 27246028 A ACCTGCC 0.500000 0.100 1 6 1 393 102 291 55 0 7 0 40 0 0 286 0 5 0.5392 0.0000 0.0172 13.571 0.38 5.38 -4.99 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4256 0.5158 0.0586 1 1 0.4233 0.5137 0.0629 1 1 0.4197 0.5113 0.0690
chr7 30285725 A ACGG 0.500000 0.100 1 3 2 257 73 184 26 0 13 0 34 0 1 181 1 1 0.3562 0.0000 0.0163 4.615 2.31 4.18 -1.87 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0733 0.4881 0.4386 1 1 0.0777 0.4884 0.4340 1 1 0.0838 0.4888 0.4274
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 566 129 437 0 0 9 0 120 0 0 434 0 3 0.0000 0.0000 0.0069 13.333 1.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr7 43647511 G GCAGGC 0.500000 0.100 1 5 2 228 90 138 88 0 1 0 1 0 0 138 0 0 0.9778 0.0000 0.0000 89.000 0.20 5.00 -4.80 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9058 0.0942 0.0000 0 0 0.9655 0.0345 0.0000 0 0 0.9741 0.0259 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 227 92 135 51 0 4 0 37 0 0 135 0 0 0.5543 0.0000 0.0000 22.000 0.10 3.27 -3.17 13 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5461 0.4198 0.0340 1 0 0.5392 0.4233 0.0374 1 0 0.5295 0.4282 0.0423
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.100 1 3 5 286 94 192 72 3 13 0 6 0 0 192 0 0 0.7660 0.0000 0.0000 6.231 0.22 2.50 -2.28 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0665 0.9335 0.0000 0 1 0.4474 0.5526 0.0000
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 501 134 367 76 0 1 0 57 0 0 367 0 0 0.5672 0.0000 0.0000 133.000 0.14 1.81 -1.66 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6222 0.3634 0.0144 1 0 0.6155 0.3680 0.0165 1 0 0.6058 0.3746 0.0196
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 864 205 659 0 0 18 1 186 0 0 655 0 4 0.0000 0.0000 0.0061 10.389 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 83155517 T TGCTGAGCTGGAGGCTTAGCAGGACCAAGAG 0.500000 0.100 1 30 1 753 145 608 63 0 45 0 37 0 0 575 0 33 0.4345 0.0000 0.0543 2.222 0.22 5.14 -4.91 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0788 0.6056 0.3156 1 1 0.0839 0.5975 0.3186 1 1 0.0909 0.5874 0.3216
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 627 154 473 138 0 12 0 4 1 0 472 0 0 0.8961 0.0021 0.0021 11.833 1.26 6.50 -5.24 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1415 0.8585 0.0000 0 0 0.9361 0.0639 0.0000 0 0 0.9849 0.0151 0.0000
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 474 221 253 70 3 84 4 60 0 0 253 0 0 0.3167 0.0000 0.0000 1.631 1.54 3.70 -2.16 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3652 0.5755 0.0593 1 1 0.3669 0.5692 0.0640 1 1 0.3682 0.5614 0.0704
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 716 241 475 122 0 7 0 112 1 0 472 0 2 0.5062 0.0021 0.0063 33.429 0.33 4.00 -3.67 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2639 0.6917 0.0443 1 1 0.2729 0.6780 0.0491 1 1 0.2837 0.6604 0.0559
chr7 100359505 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 481 144 337 65 0 14 0 65 0 0 337 0 0 0.4514 0.0000 0.0000 9.286 0.23 3.18 -2.95 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1729 0.6542 0.1729 1 1 0.1784 0.6432 0.1784 1 1 0.1854 0.6292 0.1854
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 134 36 98 11 0 0 0 25 0 0 90 0 8 0.3056 0.0000 0.0816 36.000 0.91 29.40 -28.49 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0098 0.2202 0.7700 1 2 0.0110 0.2640 0.7250 1 2 0.0096 0.4788 0.5116
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 661 198 463 0 0 7 0 191 0 0 463 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 27.286 3.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 731 186 545 94 1 15 1 75 0 0 544 0 1 0.5054 0.0000 0.0018 11.400 0.18 3.97 -3.79 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5521 0.4323 0.0157 1 0 0.5496 0.4325 0.0179 1 0 0.5452 0.4335 0.0213
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 806 221 585 99 2 28 1 91 0 0 584 1 0 0.4480 0.0000 0.0017 6.857 0.70 6.44 -5.74 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2823 0.6598 0.0579 1 1 0.2890 0.6480 0.0630 1 1 0.2967 0.6331 0.0701
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 674 221 453 120 1 36 0 64 0 0 453 0 0 0.5430 0.0000 0.0000 5.139 0.30 13.95 -13.65 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9829 0.0171 0.0000 1 0 0.9801 0.0199 0.0000 1 0 0.9758 0.0242 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 401 209 192 180 1 20 0 8 0 0 192 0 0 0.8612 0.0000 0.0000 9.450 0.59 9.00 -8.41 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6268 0.3732 0.0000 0 0 0.9745 0.0255 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 271 78 193 0 0 0 0 78 0 0 191 0 2 0.0000 0.0000 0.0104 78.000 3.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0167 0.9833 2 2 0.0000 0.0181 0.9819 2 2 0.0000 0.0202 0.9798
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 1003 275 728 8 202 56 0 9 0 1 726 0 1 0.0291 0.0000 0.0027 3.893 5.75 3.00 2.75 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4755 0.5245 0.0000 0 0 0.9787 0.0213 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 1004 281 723 12 0 52 5 212 0 0 721 0 2 0.0427 0.0000 0.0028 4.404 2.25 3.17 -0.92 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8337 0.1663 2 2 0.0000 0.0471 0.9529
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1581 347 1234 15 1 21 2 308 0 0 1234 0 0 0.0432 0.0000 0.0000 15.429 0.27 1.29 -1.02 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.6735 0.3265 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 744 158 586 79 0 1 0 78 0 0 586 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 157.000 0.20 4.21 -4.00 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1745 0.6825 0.1431 1 1 0.1808 0.6698 0.1494 1 1 0.1889 0.6535 0.1577
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 811 196 615 0 0 5 0 191 0 0 614 0 1 0.0000 0.0000 0.0016 38.200 1.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 514 99 415 0 0 6 14 79 0 1 377 17 20 0.0000 0.0000 0.0916 15.500 6.61 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0032 0.9968
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 515 95 420 0 0 6 14 75 0 1 380 18 21 0.0000 0.0000 0.0952 17.000 6.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 526 93 433 0 0 8 7 78 0 0 357 31 45 0.0000 0.0000 0.1755 13.833 7.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 599 220 379 211 0 0 0 9 0 0 379 0 0 0.9591 0.0000 0.0000 220.000 0.32 1.78 -1.46 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7236 0.2764 0.0000 0 0 0.9886 0.0114 0.0000
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 396 109 287 95 0 4 0 10 0 0 287 0 0 0.8716 0.0000 0.0000 26.250 0.33 3.10 -2.77 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.1408 0.8592 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 819 184 635 10 0 25 1 148 0 0 626 0 9 0.0543 0.0000 0.0142 6.360 0.50 6.01 -5.51 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9298 0.0702 2 2 0.0000 0.1945 0.8055
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.100 1 -6 2 746 140 606 7 0 30 0 103 0 0 599 0 7 0.0500 0.0000 0.0116 3.667 0.43 5.98 -5.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8874 0.1126 2 2 0.0000 0.3232 0.6768
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 290 82 208 35 0 4 0 43 0 0 208 0 0 0.4268 0.0000 0.0000 19.500 0.23 2.86 -2.63 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0909 0.5397 0.3694 1 1 0.0960 0.5370 0.3670 1 1 0.1031 0.5337 0.3633
chr8 10622785 T TG 0.002736 0.100 1 1 2 682 162 520 149 0 5 0 8 0 0 520 0 0 0.9198 0.0000 0.0000 31.400 0.55 1.00 -0.45 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0167 0.9833 0.0000 0 0 0.9923 0.0077 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 636 265 371 0 0 44 2 219 0 0 370 0 1 0.0000 0.0000 0.0027 5.000 5.86 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 423 179 244 165 0 7 0 7 0 0 243 1 0 0.9218 0.0000 0.0041 24.571 0.56 7.71 -7.16 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 0 0.8774 0.1226 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 286 127 159 69 0 0 0 58 0 1 158 0 0 0.5433 0.0000 0.0063 127.000 0.17 2.91 -2.74 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5304 0.4466 0.0231 1 0 0.5297 0.4451 0.0252 1 0 0.5280 0.4437 0.0283
chr8 33496717 A AGAT 0.026718 0.100 1 3 5 156 53 103 21 1 15 0 16 0 0 103 0 0 0.3962 0.0000 0.0000 2.533 0.05 3.00 -2.95 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5912 0.4039 0.0049 1 0 0.5889 0.4059 0.0052 1 0 0.5858 0.4088 0.0054
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 648 201 447 102 1 4 0 94 0 0 446 0 1 0.5075 0.0000 0.0022 49.250 0.45 3.22 -2.77 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3272 0.6316 0.0412 1 1 0.3352 0.6199 0.0449 1 1 0.3448 0.6052 0.0501
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 211 74 137 40 0 0 0 34 0 0 137 0 0 0.5405 0.0000 0.0000 74.000 0.38 2.62 -2.24 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3459 0.5488 0.1053 1 1 0.3451 0.5449 0.1100 1 1 0.3435 0.5402 0.1163
chr8 97775937 C CGGCGGGCTCCAGGCGA 0.500000 0.100 1 16 1 281 89 192 37 3 14 0 35 0 0 187 0 5 0.4157 0.0000 0.0260 5.615 0.27 9.29 -9.02 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2022 0.5962 0.2016 1 1 0.2057 0.5891 0.2052 1 1 0.2102 0.5801 0.2097
chr8 100194231 A AGAC 0.500000 0.100 1 3 5 212 79 133 72 0 2 0 5 0 0 133 0 0 0.9114 0.0000 0.0000 38.500 0.19 4.00 -3.81 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1509 0.8491 0.0000 0 0 0.5707 0.4293 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 647 208 439 127 1 4 1 75 0 0 438 0 1 0.6106 0.0000 0.0023 51.000 2.69 16.41 -13.72 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9663 0.0337 0.0000 1 0 0.9622 0.0378 0.0001 1 0 0.9558 0.0441 0.0001
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 317 135 182 81 0 0 0 54 0 0 179 0 3 0.6000 0.0000 0.0165 135.000 0.33 2.98 -2.65 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7282 0.2655 0.0063 1 0 0.7194 0.2732 0.0074 1 0 0.7067 0.2840 0.0093
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 472 144 328 0 0 30 11 103 0 0 328 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.071 4.64 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0040 0.9960
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 1050 270 780 234 1 32 0 3 1 1 776 0 2 0.8667 0.0013 0.0051 7.438 0.57 15.33 -14.76 60 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7245 0.2755 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 1011 206 805 100 1 3 0 102 1 0 803 1 0 0.4854 0.0012 0.0025 67.333 0.34 3.25 -2.91 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1190 0.7304 0.1506 1 1 0.1263 0.7153 0.1584 1 1 0.1360 0.6956 0.1684
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.100 1 2 3 960 184 776 121 3 2 6 52 2 0 770 2 2 0.6576 0.0026 0.0077 181.000 0.75 4.31 -3.56 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9947 0.0053 0.0000 1 0 0.9937 0.0063 0.0000 1 0 0.9920 0.0080 0.0000
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.100 1 -2 4 962 186 776 110 13 3 3 57 1 1 769 0 5 0.5914 0.0013 0.0090 89.000 0.60 4.33 -3.73 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9910 0.0090 0.0000 1 0 0.9895 0.0105 0.0000 1 0 0.9870 0.0129 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 365 96 269 2 0 15 0 79 0 0 256 0 13 0.0208 0.0000 0.0483 5.400 0.00 8.30 -8.30 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4380 0.5620 2 2 0.0000 0.0783 0.9217 2 2 0.0000 0.0399 0.9601
chr9 34893048 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 743 220 523 210 1 1 0 8 0 0 523 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 219.000 0.21 2.00 -1.79 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.8842 0.1158 0.0000 0 0 0.9940 0.0060 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 821 198 623 92 0 40 0 66 0 0 618 0 5 0.4646 0.0000 0.0080 3.950 0.41 10.70 -10.28 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6367 0.3533 0.0099 1 0 0.6312 0.3573 0.0115 1 0 0.6227 0.3632 0.0141
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 411 67 344 26 0 0 0 41 0 0 343 0 1 0.3881 0.0000 0.0029 67.000 0.50 1.12 -0.62 26 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0260 0.3542 0.6198 1 2 0.0289 0.3613 0.6098 1 2 0.0332 0.3709 0.5959
chr9 66141076 TTAAG T 0.500000 0.100 1 -4 5 142 60 82 42 0 3 0 15 0 0 82 0 0 0.7000 0.0000 0.0000 19.000 0.19 4.07 -3.88 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8425 0.1535 0.0040 1 0 0.8276 0.1676 0.0048 1 0 0.7466 0.2477 0.0057
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 421 114 307 5 0 5 0 104 0 0 291 0 16 0.0439 0.0000 0.0521 21.800 0.00 13.68 -13.68 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9933 0.0067 2 2 0.0000 0.3385 0.6615 2 2 0.0000 0.0682 0.9318
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 753 170 583 65 0 19 0 86 0 0 578 0 5 0.3824 0.0000 0.0086 7.947 0.46 11.16 -10.70 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0043 0.2451 0.7505 1 2 0.0052 0.2527 0.7421 1 2 0.0067 0.2635 0.7298
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 481 124 357 74 1 5 0 44 0 0 353 0 4 0.5968 0.0000 0.0112 23.800 0.57 3.07 -2.50 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7954 0.2008 0.0038 1 0 0.7854 0.2100 0.0046 1 0 0.7710 0.2230 0.0059
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 238 67 171 34 0 1 0 32 0 0 170 0 1 0.5075 0.0000 0.0058 66.000 0.15 3.66 -3.51 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2306 0.5802 0.1891 1 1 0.2331 0.5742 0.1927 1 1 0.2362 0.5667 0.1972
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 313 101 212 3 44 22 0 32 0 1 208 0 3 0.0297 0.0000 0.0189 3.545 2.33 3.41 -1.07 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5136 0.4436 0.0428 1 0 0.5074 0.4461 0.0465 1 0 0.4987 0.4494 0.0519
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 313 105 208 37 4 21 1 42 0 0 207 0 1 0.3524 0.0000 0.0048 4.000 2.70 3.57 -0.87 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1436 0.5914 0.2651 1 1 0.1482 0.5846 0.2672 1 1 0.1543 0.5760 0.2697
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 473 170 303 142 2 2 0 24 0 0 303 0 0 0.8353 0.0000 0.0000 83.000 0.28 8.50 -8.22 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 564 220 344 29 0 1 0 190 0 0 336 1 7 0.1318 0.0000 0.0233 219.000 0.86 3.32 -2.46 17 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr9 96417976 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 1 380 117 263 101 1 9 0 6 0 0 262 0 1 0.8632 0.0000 0.0038 12.000 1.12 4.83 -3.71 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0878 0.9122 0.0000 0 0 0.6161 0.3839 0.0000
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 400 109 291 8 0 17 1 83 0 0 291 0 0 0.0734 0.0000 0.0000 5.353 0.75 5.36 -4.61 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9867 0.0133 2 1 0.0000 0.7398 0.2602
chr9 97854418 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 933 136 797 8 53 45 0 30 2 3 791 0 1 0.0588 0.0025 0.0075 2.023 0.88 3.60 -2.73 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9079 0.0912 0.0009 1 0 0.8992 0.0997 0.0012 1 0 0.8863 0.1121 0.0016
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 944 149 795 48 2 36 1 62 1 1 788 3 2 0.3221 0.0013 0.0088 3.083 2.65 5.82 -3.18 20 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0222 0.4040 0.5737 1 2 0.0249 0.4074 0.5677 1 2 0.0290 0.4122 0.5589
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 615 159 456 150 0 1 0 8 0 0 456 0 0 0.9434 0.0000 0.0000 158.000 0.27 2.88 -2.60 102 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2651 0.7349 0.0000 0 0 0.8954 0.1046 0.0000
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 904 201 703 194 1 2 0 4 0 0 703 0 0 0.9652 0.0000 0.0000 99.500 0.13 5.75 -5.62 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7406 0.2594 0.0000 0 0 0.9958 0.0042 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 851 201 650 192 1 2 0 6 0 0 650 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 99.500 0.21 2.67 -2.46 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0297 0.9703 0.0000 0 0 0.9627 0.0373 0.0000 0 0 0.9960 0.0040 0.0000
chr9 110048735 TCCCCCGGAGTCTCCTGGA T 0.500000 0.100 1 -18 2 198 75 123 39 0 12 0 24 0 0 120 0 3 0.5200 0.0000 0.0244 5.250 0.36 15.00 -14.64 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5170 0.4351 0.0479 1 0 0.5099 0.4383 0.0518 1 0 0.4999 0.4428 0.0573
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 320 118 202 0 0 5 0 113 0 0 202 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 22.600 4.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 520 104 416 5 1 24 0 74 0 0 416 0 0 0.0481 0.0000 0.0000 3.333 0.00 6.26 -6.26 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9243 0.0757 2 1 0.0000 0.5462 0.4538
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 633 140 493 126 0 7 0 7 0 0 493 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 19.000 0.53 6.14 -5.61 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2387 0.7613 0.0000 0 0 0.8350 0.1650 0.0000
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 577 130 447 65 0 10 1 54 0 0 447 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 12.000 0.31 1.52 -1.21 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4086 0.5368 0.0546 1 1 0.4080 0.5331 0.0589 1 1 0.4064 0.5286 0.0650
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 550 155 395 72 1 5 0 77 0 0 391 1 3 0.4645 0.0000 0.0101 30.000 0.32 3.55 -3.23 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0654 0.6152 0.3194 1 1 0.0704 0.6064 0.3232 1 1 0.0773 0.5952 0.3275
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 441 138 303 83 9 41 0 5 2 1 300 0 0 0.6014 0.0066 0.0099 2.366 1.28 3.20 -1.92 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 1 0.3625 0.6375 0.0000 0 0 0.8043 0.1957 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 326 140 186 124 0 1 0 15 0 0 186 0 0 0.8857 0.0000 0.0000 139.000 0.21 1.93 -1.72 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0266 0.9734 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 326 140 186 124 0 1 0 15 0 0 186 0 0 0.8857 0.0000 0.0000 139.000 0.21 1.93 -1.72 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0266 0.9734 0.0000
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 275 117 158 60 0 3 0 54 0 0 158 0 0 0.5128 0.0000 0.0000 38.000 0.25 1.74 -1.49 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3092 0.5967 0.0942 1 1 0.3114 0.5893 0.0993 1 1 0.3136 0.5802 0.1062
chr9 135945095 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 334 119 215 15 0 2 0 102 0 0 213 0 2 0.1261 0.0000 0.0093 58.500 1.07 3.19 -2.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9899 0.0101
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 636 174 462 79 1 20 4 70 0 1 458 1 2 0.4540 0.0000 0.0087 7.700 0.35 3.43 -3.07 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2258 0.6686 0.1057 1 1 0.2317 0.6566 0.1117 1 1 0.2389 0.6414 0.1197
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 238 121 117 6 0 43 3 69 0 0 117 0 0 0.0496 0.0000 0.0000 1.814 0.17 3.12 -2.95 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9429 0.0571 2 1 0.0000 0.5914 0.4086
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 867 189 678 172 0 9 0 8 0 0 675 0 3 0.9101 0.0000 0.0044 20.000 0.37 9.00 -8.63 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4765 0.5235 0.0000 0 0 0.9868 0.0132 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 222 93 129 56 0 2 0 35 0 0 128 0 1 0.6022 0.0000 0.0078 45.500 0.18 4.17 -3.99 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7866 0.2099 0.0035 1 0 0.7791 0.2169 0.0040 1 0 0.7684 0.2267 0.0049
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 962 221 741 114 0 34 2 71 0 0 732 0 9 0.5158 0.0000 0.0121 5.471 0.53 5.83 -5.30 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8225 0.1762 0.0014 1 0 0.8149 0.1834 0.0018 1 0 0.8037 0.1939 0.0024
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 738 154 584 89 0 3 0 62 0 0 582 0 2 0.5779 0.0000 0.0034 50.333 0.25 3.87 -3.62 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8049 0.1932 0.0020 1 0 0.7984 0.1992 0.0024 1 0 0.7890 0.2080 0.0030
chr10 27053356 CTCT C 0.017074 0.100 1 -3 1 134 66 68 58 0 4 0 4 0 0 68 0 0 0.8788 0.0000 0.0000 15.500 0.83 3.00 -2.17 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1323 0.8677 0.0000 0 0 0.9365 0.0635 0.0000 0 0 0.9866 0.0134 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 580 152 428 11 0 10 3 128 0 0 426 0 2 0.0724 0.0000 0.0047 14.200 0.09 1.20 -1.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 1 0.0000 0.7774 0.2226
chr10 49988921 AC A 0.048828 0.100 1 -1 1 765 237 528 224 0 2 0 11 0 0 527 1 0 0.9451 0.0000 0.0019 117.500 0.20 2.45 -2.25 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9145 0.0855 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 432 96 336 40 0 22 1 33 0 0 336 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 3.364 0.57 3.39 -2.82 6 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5019 0.4692 0.0289 1 0 0.5021 0.4676 0.0303 1 0 0.5020 0.4658 0.0322
chr10 80081665 C CAA 0.055364 0.100 1 2 1 236 59 177 46 3 6 1 3 0 0 177 0 0 0.7797 0.0000 0.0000 8.833 0.43 2.33 -1.90 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1210 0.8790 0.0000 0 0 0.8285 0.1715 0.0000 0 0 0.9476 0.0524 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 702 162 540 21 0 5 1 135 0 0 533 0 7 0.1296 0.0000 0.0130 31.200 0.19 5.68 -5.49 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 630 199 431 88 0 28 0 83 0 0 423 0 8 0.4422 0.0000 0.0186 6.107 0.25 6.13 -5.88 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1204 0.7039 0.1757 1 1 0.1276 0.6903 0.1821 1 1 0.1373 0.6727 0.1900
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 389 93 296 82 0 5 0 6 0 0 295 1 0 0.8817 0.0000 0.0034 17.600 0.85 8.17 -7.31 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0384 0.9616 0.0000 0 1 0.4014 0.5986 0.0000
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 356 139 217 127 0 3 0 9 0 0 217 0 0 0.9137 0.0000 0.0000 45.333 0.55 3.56 -3.00 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1173 0.8827 0.0000 0 0 0.8328 0.1672 0.0000
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 213 71 142 4 0 2 0 65 0 0 140 0 2 0.0563 0.0000 0.0141 34.500 0.00 2.91 -2.91 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9892 0.0108 2 2 0.0000 0.4877 0.5123 2 2 0.0000 0.1617 0.8383
chr10 124021236 C CGG 0.033163 0.100 1 2 1 307 63 244 11 23 19 1 9 0 4 239 1 0 0.1746 0.0000 0.0205 2.316 1.73 3.44 -1.72 7 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8400 0.1598 0.0002 1 0 0.5227 0.4772 0.0001 0 1 0.2684 0.7316 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 307 63 244 10 15 15 9 14 0 1 242 1 0 0.1587 0.0000 0.0082 2.533 1.40 2.14 -0.74 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2358 0.5521 0.2122 1 1 0.2367 0.5483 0.2151 1 1 0.2377 0.5434 0.2189
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.100 1 21 2 714 163 551 154 0 7 0 2 0 0 549 0 2 0.9448 0.0000 0.0036 22.286 0.42 12.00 -11.58 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7077 0.2923 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 432 135 297 76 0 5 0 54 0 0 295 0 2 0.5630 0.0000 0.0067 26.000 0.16 1.30 -1.14 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6471 0.3406 0.0123 1 0 0.6397 0.3462 0.0142 1 0 0.6290 0.3540 0.0170
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 227 76 151 0 0 2 0 74 0 0 151 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 37.000 1.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0285 0.9715 2 2 0.0000 0.0307 0.9693 2 2 0.0000 0.0339 0.9661
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.100 1 1 1 514 170 344 18 65 6 3 78 0 0 343 0 1 0.1059 0.0000 0.0029 16.333 0.67 1.41 -0.74 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1148 0.7441 0.1411 1 1 0.1243 0.7346 0.1411 1 1 0.1376 0.7218 0.1406
chr11 1051657 AC A 0.061644 0.100 1 -1 1 514 171 343 19 82 5 0 65 0 0 343 0 0 0.1111 0.0000 0.0000 33.000 0.63 1.88 -1.25 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8174 0.1820 0.0006 1 0 0.8121 0.1872 0.0007 1 0 0.8045 0.1946 0.0009
chr11 1186164 C CACCAGCACAACTTCTGCTTCTACA 0.095472 0.100 1 24 2 3347 730 2617 263 10 208 12 237 10 5 2515 32 55 0.3603 0.0038 0.0390 2.471 1.44 4.25 -2.80 49 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0001 0.5538 0.4460 1 1 0.0002 0.5465 0.4533 1 1 0.0004 0.5403 0.4594
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.100 1 -24 1 4042 936 3106 456 7 268 4 201 9 5 3088 2 2 0.4872 0.0029 0.0058 2.494 2.98 13.24 -10.25 48 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1051 235 816 11 0 99 0 125 0 0 816 0 0 0.0468 0.0000 0.0000 1.374 0.82 6.10 -5.29 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9950 0.0050 2 1 0.0000 0.6948 0.3052
chr11 1607861 GCAGCAGGGCTTACAGCAGCTGGACTGGGAA G 0.000004 0.100 1 -30 1 1173 256 917 159 2 42 0 53 0 0 894 1 22 0.6211 0.0000 0.0251 5.048 0.98 4.94 -3.96 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9991 0.0009 0.0000 1 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 998 289 709 46 0 96 3 144 0 0 709 0 0 0.1592 0.0000 0.0000 1.990 1.11 11.97 -10.86 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0002 0.9998 1 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 1 0.0000 0.9078 0.0922
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 359 102 257 0 0 1 1 100 0 0 254 0 3 0.0000 0.0000 0.0117 101.000 2.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 735 232 503 115 0 10 0 107 0 0 502 1 0 0.4957 0.0000 0.0020 22.200 0.34 1.38 -1.04 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2368 0.7044 0.0588 1 1 0.2454 0.6903 0.0644 1 1 0.2559 0.6721 0.0720
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 209 86 123 77 0 1 0 8 0 0 123 0 0 0.8953 0.0000 0.0000 85.000 0.04 2.00 -1.96 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0093 0.9907 0.0000 0 1 0.1979 0.8021 0.0000
chr11 4573328 T TG 0.500000 0.100 1 1 4 221 96 125 92 0 0 0 4 0 0 125 0 0 0.9583 0.0000 0.0000 96.000 0.16 1.25 -1.09 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0152 0.9848 0.0000 0 0 0.5846 0.4154 0.0000 0 0 0.8698 0.1302 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 877 218 659 110 0 6 0 102 0 0 658 0 1 0.5046 0.0000 0.0015 35.333 0.28 1.55 -1.27 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2445 0.6944 0.0611 1 1 0.2526 0.6808 0.0666 1 1 0.2624 0.6634 0.0742
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 520 145 375 55 0 5 3 82 0 0 375 0 0 0.3793 0.0000 0.0000 28.000 1.09 2.10 -1.01 29 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0022 0.1686 0.8292 1 2 0.0027 0.1775 0.8197 1 2 0.0036 0.1903 0.8061
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 1195 287 908 169 0 10 0 108 0 0 899 0 9 0.5889 0.0000 0.0099 27.700 0.21 5.78 -5.56 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9551 0.0448 0.0000 1 0 0.9509 0.0490 0.0000 1 0 0.9445 0.0554 0.0001
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 876 203 673 108 0 9 0 86 0 0 672 0 1 0.5320 0.0000 0.0015 21.556 0.11 1.77 -1.66 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6007 0.3900 0.0093 1 0 0.5978 0.3912 0.0109 1 0 0.5928 0.3938 0.0134
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.100 1 2 1 575 159 416 87 0 4 0 68 0 0 416 0 0 0.5472 0.0000 0.0000 38.750 0.25 2.15 -1.89 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5975 0.3887 0.0138 1 0 0.5926 0.3915 0.0159 1 0 0.5852 0.3958 0.0190
chr11 5489193 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 788 156 632 97 1 4 0 54 0 0 632 0 0 0.6218 0.0000 0.0000 38.000 1.33 4.24 -2.91 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9486 0.0512 0.0002 1 0 0.9428 0.0570 0.0002 1 0 0.9340 0.0656 0.0003
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 824 162 662 0 0 16 1 145 0 0 638 0 24 0.0000 0.0000 0.0363 9.062 9.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 6921357 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 683 164 519 154 0 0 0 10 0 0 519 0 0 0.9390 0.0000 0.0000 164.000 0.46 2.00 -1.54 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0498 0.9502 0.0000 0 0 0.7421 0.2579 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 343 176 167 145 2 20 0 9 0 0 167 0 0 0.8239 0.0000 0.0000 7.800 0.65 3.89 -3.24 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0963 0.9037 0.0000 0 0 0.7953 0.2047 0.0000
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 196 58 138 30 0 0 0 28 0 0 137 0 1 0.5172 0.0000 0.0072 58.000 0.73 3.21 -2.48 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2359 0.5706 0.1935 1 1 0.2380 0.5654 0.1967 1 1 0.2405 0.5587 0.2008
chr11 18615951 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 699 143 556 81 0 6 0 56 0 0 555 0 1 0.5664 0.0000 0.0018 22.833 0.47 3.55 -3.08 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7282 0.2655 0.0063 1 0 0.7194 0.2732 0.0074 1 0 0.7067 0.2840 0.0093
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 248 104 144 97 1 3 0 3 0 0 144 0 0 0.9327 0.0000 0.0000 33.333 0.15 6.00 -5.85 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1568 0.8432 0.0000 0 0 0.8444 0.1556 0.0000 0 0 0.9438 0.0562 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 841 249 592 12 0 14 0 223 0 0 586 0 6 0.0482 0.0000 0.0101 16.786 0.25 3.16 -2.91 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7921 0.2079 2 2 0.0000 0.0320 0.9680
chr11 56093801 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 839 202 637 187 0 4 0 11 0 0 637 0 0 0.9257 0.0000 0.0000 49.500 0.28 3.00 -2.72 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0872 0.9128 0.0000 0 0 0.8831 0.1169 0.0000
chr11 56093830 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 828 199 629 179 4 4 1 11 0 0 629 0 0 0.8995 0.0000 0.0000 48.250 0.28 3.09 -2.81 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0566 0.9434 0.0000 0 0 0.8334 0.1666 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 1114 264 850 0 0 3 1 260 0 0 841 0 9 0.0000 0.0000 0.0106 87.000 2.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 56577367 CCATTGAAG C 0.500000 0.100 1 -8 1 1019 242 777 224 0 4 0 14 0 0 775 0 2 0.9256 0.0000 0.0026 59.500 0.21 7.14 -6.93 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 0 0.6457 0.3543 0.0000
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 717 139 578 72 0 2 0 65 0 0 577 0 1 0.5180 0.0000 0.0017 68.500 0.47 1.37 -0.90 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2877 0.6247 0.0876 1 1 0.2916 0.6155 0.0930 1 1 0.2960 0.6038 0.1002
chr11 58403319 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 457 118 339 105 1 4 0 8 0 0 339 0 0 0.8898 0.0000 0.0000 28.500 0.77 1.12 -0.35 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0391 0.9609 0.0000 0 0 0.5040 0.4960 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 84 34 50 21 0 0 0 13 0 0 48 0 2 0.6176 0.0000 0.0400 34.000 0.29 2.23 -1.95 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3815 0.5023 0.1161 1 1 0.3776 0.5020 0.1204 1 1 0.3723 0.5016 0.1261
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 317 115 202 43 3 22 0 47 0 0 201 0 1 0.3739 0.0000 0.0050 4.227 0.72 3.28 -2.56 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1573 0.6086 0.2341 1 1 0.1620 0.6006 0.2374 1 1 0.1681 0.5905 0.2414
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 1010 191 819 9 0 31 2 149 0 0 739 0 80 0.0471 0.0000 0.0977 5.129 0.22 5.89 -5.67 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 2 0.0000 0.1247 0.8753 2 2 0.0000 0.0044 0.9956
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1177 241 936 82 4 116 2 37 0 0 907 0 29 0.3402 0.0000 0.0310 1.069 0.90 13.35 -12.45 36 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5790 0.4053 0.0157 1 0 0.5747 0.4074 0.0179 1 0 0.5679 0.4108 0.0213
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 1064 288 776 169 0 67 0 52 0 1 752 0 23 0.5868 0.0000 0.0309 3.299 0.33 13.13 -12.80 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9995 0.0005 0.0000 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 979 269 710 14 0 2 0 253 0 0 707 0 3 0.0520 0.0000 0.0042 133.500 0.21 2.20 -1.98 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8927 0.1073 2 2 0.0000 0.0311 0.9689
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 395 147 248 142 1 2 0 2 0 0 247 0 1 0.9660 0.0000 0.0040 72.500 0.31 22.00 -21.69 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6504 0.3496 0.0000 0 0 0.9811 0.0189 0.0000 0 0 0.9934 0.0066 0.0000
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 147 69 78 64 0 0 0 5 0 0 78 0 0 0.9275 0.0000 0.0000 69.000 0.30 3.20 -2.90 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1072 0.8928 0.0000 0 1 0.4748 0.5252 0.0000
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 560 134 426 63 0 6 0 65 1 0 422 0 3 0.4701 0.0023 0.0094 21.333 0.33 4.14 -3.81 15 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1125 0.6389 0.2486 1 1 0.1181 0.6289 0.2531 1 1 0.1255 0.6161 0.2584
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1366 366 1000 10 5 64 5 282 0 0 1000 0 0 0.0273 0.0000 0.0000 4.641 0.60 7.57 -6.97 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 2 0.0000 0.0881 0.9119 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr11 104954999 C CTTTT 0.500000 0.100 1 4 2 268 59 209 53 1 3 0 2 0 0 209 0 0 0.8983 0.0000 0.0000 18.667 0.08 8.50 -8.42 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1553 0.8447 0.0000 0 0 0.6381 0.3619 0.0000 0 0 0.7919 0.2081 0.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 844 276 568 128 1 43 0 104 0 0 568 0 0 0.4638 0.0000 0.0000 5.419 0.63 11.04 -10.41 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6522 0.3433 0.0046 1 0 0.6494 0.3450 0.0055 1 0 0.6445 0.3484 0.0071
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 284 116 168 75 0 2 0 39 0 0 165 0 3 0.6466 0.0000 0.0179 57.000 0.28 7.33 -7.05 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8801 0.1186 0.0013 1 0 0.8708 0.1275 0.0016 1 0 0.8573 0.1404 0.0022
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 456 152 304 137 1 10 0 4 0 0 304 0 0 0.9013 0.0000 0.0000 14.200 0.60 5.00 -4.40 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1357 0.8643 0.0000 0 0 0.9330 0.0670 0.0000 0 0 0.9842 0.0158 0.0000
chr11 125431296 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 265 123 142 59 1 19 0 44 0 0 141 1 0 0.4797 0.0000 0.0070 5.474 0.27 3.16 -2.89 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5534 0.4183 0.0282 1 0 0.5473 0.4214 0.0313 1 0 0.5384 0.4258 0.0359
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.100 1 -6 1 216 88 128 61 1 20 0 6 0 0 128 0 0 0.6932 0.0000 0.0000 3.350 0.15 6.17 -6.02 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0357 0.9643 0.0000 0 1 0.2998 0.7002 0.0000
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 443 134 309 2 60 20 2 50 0 0 307 0 2 0.0149 0.0000 0.0065 5.700 0.50 3.82 -3.32 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3728 0.5597 0.0675 1 1 0.3732 0.5547 0.0721 1 1 0.3729 0.5484 0.0786
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 444 138 306 49 10 17 2 60 0 1 305 0 0 0.3551 0.0000 0.0033 7.118 2.57 3.50 -0.93 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1379 0.6376 0.2245 1 1 0.1434 0.6276 0.2290 1 1 0.1505 0.6150 0.2345
chr12 165530 G GAGTGTAAGTCTTTGACAGCC 0.014581 0.100 1 20 1 384 100 284 47 1 17 0 35 0 0 280 0 4 0.4700 0.0000 0.0141 4.824 0.77 14.03 -13.26 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6055 0.3929 0.0016 1 0 0.6051 0.3932 0.0017 1 0 0.6041 0.3941 0.0018
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 352 126 226 62 2 1 0 61 0 0 225 0 1 0.4921 0.0000 0.0044 125.000 1.69 1.75 -0.06 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2944 0.6269 0.0787 1 1 0.3013 0.6169 0.0818 1 1 0.3099 0.6043 0.0858
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 588 148 440 56 2 32 2 56 0 0 439 0 1 0.3784 0.0000 0.0023 3.625 0.09 2.93 -2.84 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1877 0.6410 0.1713 1 1 0.1936 0.6309 0.1755 1 1 0.2011 0.6181 0.1808
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 430 144 286 47 2 25 5 65 0 0 284 0 2 0.3264 0.0000 0.0070 4.760 0.23 3.11 -2.87 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0063 0.2497 0.7440 1 2 0.0075 0.2575 0.7350 1 2 0.0092 0.2685 0.7222
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 3539 812 2727 397 2 4 1 408 0 0 2704 0 23 0.4889 0.0000 0.0084 201.750 1.96 4.12 -2.16 71 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0002 0.7640 0.2359 1 1 0.0002 0.7296 0.2701 1 1 0.0004 0.6840 0.3156
chr12 8946399 G GAAC 0.112820 0.100 1 3 3 186 50 136 43 0 5 0 2 0 0 136 0 0 0.8600 0.0000 0.0000 9.000 1.19 3.00 -1.81 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4524 0.5476 0.0000 0 0 0.8890 0.1110 0.0000 0 0 0.9461 0.0539 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 237 73 164 69 0 1 0 3 0 0 164 0 0 0.9452 0.0000 0.0000 72.000 0.32 4.00 -3.68 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0411 0.9589 0.0000 0 0 0.5599 0.4401 0.0000 0 0 0.8038 0.1962 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 320 138 182 65 1 17 3 52 0 0 182 0 0 0.4710 0.0000 0.0000 7.118 1.25 4.54 -3.29 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3186 0.6050 0.0764 1 1 0.3170 0.6003 0.0827 1 1 0.3141 0.5943 0.0916
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 457 101 356 93 0 2 0 6 0 0 356 0 0 0.9208 0.0000 0.0000 49.500 0.24 3.50 -3.26 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2104 0.7896 0.0000 0 0 0.7470 0.2530 0.0000
chr12 40483097 AAGTGACAGGGACAACTAGACTATCAGCTGG A 0.146503 0.100 1 -30 1 1822 412 1410 214 1 43 4 150 4 4 1396 3 3 0.5194 0.0028 0.0099 8.558 2.30 11.49 -9.19 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9873 0.0127 0.0000 1 0 0.9859 0.0141 0.0000 1 0 0.9837 0.0163 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 1018 248 770 117 0 16 2 113 2 0 767 0 1 0.4718 0.0026 0.0039 14.500 0.52 13.42 -12.90 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1719 0.7475 0.0806 1 1 0.1814 0.7315 0.0871 1 1 0.1937 0.7105 0.0958
chr12 52691336 TCCGCCGCCATAGCCCCCACCGCTG T 0.002176 0.100 1 -24 2 560 199 361 186 1 11 0 1 0 0 358 0 3 0.9347 0.0000 0.0083 17.091 0.57 25.00 -24.43 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 367 92 275 87 0 2 0 3 0 0 275 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 45.000 0.23 1.67 -1.44 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1387 0.8613 0.0000 0 0 0.8229 0.1771 0.0000 0 0 0.9357 0.0643 0.0000
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 450 90 360 39 9 6 9 27 0 0 360 0 0 0.4333 0.0000 0.0000 12.500 0.64 1.33 -0.69 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6094 0.3700 0.0207 1 0 0.6042 0.3733 0.0225 1 0 0.5969 0.3780 0.0251
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 142 65 77 0 0 2 0 63 0 0 75 1 1 0.0000 0.0000 0.0260 31.500 2.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0202 0.9798 2 2 0.0000 0.0216 0.9784 2 2 0.0000 0.0236 0.9764
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 354 93 261 44 0 6 0 43 0 0 260 0 1 0.4731 0.0000 0.0038 14.500 0.98 3.79 -2.81 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2343 0.6063 0.1594 1 1 0.2390 0.5984 0.1626 1 1 0.2449 0.5885 0.1666
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 141 64 77 31 0 7 0 26 0 0 77 0 0 0.4844 0.0000 0.0000 8.143 0.39 3.46 -3.07 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3929 0.5155 0.0916 1 1 0.3919 0.5131 0.0950 1 1 0.3902 0.5103 0.0995
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1033 286 747 0 0 19 4 263 0 0 744 0 3 0.0000 0.0000 0.0040 14.053 3.37 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 80444830 AGTGACAACAAAT A 0.002716 0.100 1 -12 1 227 77 150 43 0 0 0 34 0 0 149 0 1 0.5584 0.0000 0.0067 77.000 0.07 10.76 -10.69 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6003 0.3993 0.0003 1 0 0.5999 0.3997 0.0004 1 0 0.5989 0.4007 0.0004
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 151 67 84 4 1 3 1 58 0 0 84 0 0 0.0597 0.0000 0.0000 21.000 1.75 1.10 0.65 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9259 0.0741 2 1 0.0000 0.7062 0.2938
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 470 116 354 51 5 26 0 34 0 0 353 0 1 0.4397 0.0000 0.0028 3.462 0.22 3.12 -2.90 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7128 0.2762 0.0110 1 0 0.7021 0.2852 0.0127 1 0 0.6872 0.2975 0.0154
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 423 102 321 40 1 12 1 48 0 0 318 0 3 0.3922 0.0000 0.0093 7.417 0.75 7.73 -6.98 4 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0496 0.4805 0.4699 1 1 0.0536 0.4806 0.4658 1 1 0.0594 0.4810 0.4596
chr12 106247737 CCGGCGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 417 128 289 63 0 14 2 49 0 0 289 0 0 0.4922 0.0000 0.0000 8.000 1.83 8.14 -6.32 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4751 0.4843 0.0406 1 1 0.4719 0.4837 0.0444 1 1 0.4670 0.4833 0.0498
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.100 1 -30 1 1900 626 1274 526 3 81 1 15 9 16 1237 0 12 0.8403 0.0071 0.0290 6.800 1.14 16.13 -14.99 148 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1250 0.8750 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 627 177 450 0 1 22 6 148 0 0 447 1 2 0.0000 0.0000 0.0067 6.955 4.53 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 248 129 119 70 0 2 0 57 0 0 119 0 0 0.5426 0.0000 0.0000 63.500 0.27 2.49 -2.22 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4753 0.4886 0.0361 1 1 0.4729 0.4874 0.0397 1 1 0.4689 0.4863 0.0449
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 257 113 144 59 1 16 0 37 0 0 144 0 0 0.5221 0.0000 0.0000 6.000 0.22 5.92 -5.70 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7457 0.2464 0.0079 1 0 0.7349 0.2558 0.0093 1 0 0.7197 0.2688 0.0114
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 427 91 336 33 21 14 1 22 0 1 333 0 2 0.3626 0.0000 0.0089 5.143 1.30 5.50 -4.20 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8491 0.1479 0.0030 1 0 0.8381 0.1582 0.0037 1 0 0.8223 0.1728 0.0049
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 344 86 258 0 0 5 0 81 0 0 241 0 17 0.0000 0.0000 0.0659 16.200 5.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0085 0.9915
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 361 98 263 56 1 9 0 32 0 0 258 0 5 0.5714 0.0000 0.0190 9.889 0.21 13.38 -13.16 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6869 0.3001 0.0130 1 0 0.6767 0.3083 0.0150 1 0 0.6625 0.3195 0.0179
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 734 206 528 0 0 21 2 183 0 0 508 0 20 0.0000 0.0000 0.0379 8.762 8.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 243 89 154 49 9 26 0 5 0 0 154 0 0 0.5506 0.0000 0.0000 2.423 0.18 2.80 -2.62 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0812 0.9188 0.0000 0 1 0.4026 0.5974 0.0000
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 214 67 147 34 3 7 1 22 0 0 146 0 1 0.5075 0.0000 0.0068 8.571 0.74 3.36 -2.63 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5512 0.4074 0.0414 1 0 0.5427 0.4122 0.0451 1 0 0.5310 0.4187 0.0503
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 246 62 184 0 0 8 1 53 0 0 176 0 8 0.0000 0.0000 0.0435 6.750 8.77 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0407 0.9593 2 2 0.0000 0.0433 0.9567 2 2 0.0000 0.0470 0.9530
chr12 131828558 C CCGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 9 1 245 65 180 2 1 2 3 57 0 0 175 0 5 0.0308 0.0000 0.0278 31.500 0.00 8.30 -8.30 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9597 0.0403 2 2 0.0000 0.4793 0.5207 2 2 0.0000 0.2251 0.7749
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 591 167 424 18 3 51 5 90 0 0 422 0 2 0.1078 0.0000 0.0047 2.347 1.50 4.20 -2.70 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr12 132583284 GGCCTGGGCCGCGAGC G 0.500000 0.100 1 -15 1 520 129 391 72 0 3 1 53 2 0 383 0 6 0.5581 0.0051 0.0205 42.000 0.24 13.70 -13.46 0 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4937 0.4755 0.0308 1 0 0.4911 0.4748 0.0341 1 0 0.4867 0.4744 0.0389
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 800 207 593 86 1 34 1 85 0 0 591 0 2 0.4155 0.0000 0.0034 5.088 0.60 5.82 -5.22 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1365 0.7017 0.1618 1 1 0.1435 0.6880 0.1685 1 1 0.1526 0.6703 0.1771
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 558 179 379 84 0 3 0 92 0 0 375 1 3 0.4693 0.0000 0.0106 58.667 0.32 12.91 -12.59 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0415 0.5937 0.3648 1 1 0.0457 0.5861 0.3682 1 1 0.0519 0.5766 0.3716
chr13 60528441 GATA G 0.187645 0.100 1 -3 4 421 110 311 4 0 2 0 104 0 0 302 0 9 0.0364 0.0000 0.0289 54.000 0.00 3.56 -3.56 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9900 0.0100 2 1 0.0000 0.5201 0.4799 2 2 0.0000 0.1899 0.8101
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 717 108 609 0 0 17 3 88 0 0 605 0 4 0.0000 0.0000 0.0066 5.353 5.38 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr13 107866367 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 2 1154 410 744 391 2 5 0 12 0 1 743 0 0 0.9537 0.0000 0.0013 81.000 0.45 11.67 -11.22 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr13 109785969 G GGTT 0.500000 0.100 1 3 1 419 101 318 42 0 14 2 43 3 0 315 0 0 0.4158 0.0094 0.0094 6.692 2.45 4.14 -1.69 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2036 0.6086 0.1878 1 1 0.2075 0.6006 0.1919 1 1 0.2123 0.5905 0.1972
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 297 88 209 32 0 23 0 33 0 0 206 1 2 0.3636 0.0000 0.0144 2.826 0.47 11.73 -11.26 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1361 0.5640 0.2999 1 1 0.1405 0.5591 0.3003 1 1 0.1464 0.5531 0.3006
chr13 113406371 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 666 124 542 66 0 0 2 56 0 0 538 1 3 0.5323 0.0000 0.0074 124.000 0.35 3.20 -2.85 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2547 0.6330 0.1123 1 1 0.2588 0.6233 0.1179 1 1 0.2638 0.6110 0.1252
chr13 113406374 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 665 126 539 67 0 1 2 56 0 1 535 0 3 0.5317 0.0000 0.0074 125.000 0.34 3.20 -2.85 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3202 0.6003 0.0795 1 1 0.3228 0.5926 0.0846 1 1 0.3255 0.5830 0.0916
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 655 133 522 70 1 3 2 57 0 0 520 0 2 0.5263 0.0000 0.0038 43.000 0.71 3.35 -2.64 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3871 0.5577 0.0552 1 1 0.3878 0.5525 0.0597 1 1 0.3879 0.5461 0.0659
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 1471 360 1111 229 0 7 0 124 0 0 1111 0 0 0.6361 0.0000 0.0000 50.429 0.33 1.94 -1.60 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 938 260 678 95 1 31 0 133 0 0 677 0 1 0.3654 0.0000 0.0015 7.355 0.22 1.98 -1.76 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0005 0.1338 0.8657 1 2 0.0007 0.1410 0.8583 1 2 0.0010 0.1517 0.8473
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 396 98 298 1 0 6 1 90 0 0 296 0 2 0.0102 0.0000 0.0067 15.167 0.00 1.30 -1.30 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0326 0.9674 2 2 0.0000 0.0118 0.9882 2 2 0.0000 0.0089 0.9911
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.100 1 3 3 560 168 392 68 0 14 0 86 0 0 388 0 4 0.4048 0.0000 0.0102 11.000 0.16 2.87 -2.71 20 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0175 0.4639 0.5186 1 2 0.0204 0.4688 0.5108 1 2 0.0249 0.4757 0.4994
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 519 129 390 48 1 19 3 58 0 0 384 0 6 0.3721 0.0000 0.0154 5.684 0.46 2.62 -2.16 16 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0146 0.3429 0.6425 1 2 0.0166 0.3480 0.6354 1 2 0.0195 0.3552 0.6253
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 478 98 380 47 0 6 0 45 0 0 380 0 0 0.4796 0.0000 0.0000 15.333 0.28 5.16 -4.88 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3285 0.5862 0.0853 1 1 0.3331 0.5790 0.0879 1 1 0.3389 0.5700 0.0912
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 606 183 423 94 3 10 2 74 0 0 423 0 0 0.5137 0.0000 0.0000 17.100 0.24 3.38 -3.13 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7602 0.2390 0.0008 1 0 0.7572 0.2419 0.0009 1 0 0.7524 0.2464 0.0012
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 663 193 470 12 7 15 4 155 0 0 470 0 0 0.0622 0.0000 0.0000 175.000 0.42 4.02 -3.60 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.7654 0.2346
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 653 192 461 10 2 22 1 157 0 0 461 0 0 0.0521 0.0000 0.0000 7.636 1.20 4.08 -2.88 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9356 0.0644 2 2 0.0000 0.1978 0.8022
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 329 52 277 2 0 4 0 46 0 0 273 0 4 0.0385 0.0000 0.0144 12.000 0.00 3.30 -3.30 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9172 0.0828 2 1 0.0000 0.5354 0.4646 2 2 0.0000 0.3469 0.6531
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 399 101 298 7 0 34 0 60 0 0 290 0 8 0.0693 0.0000 0.0268 1.971 2.29 5.22 -2.93 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9907 0.0093 2 1 0.0000 0.8592 0.1408
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.100 1 24 1 324 84 240 36 0 45 0 3 0 1 238 0 1 0.4286 0.0000 0.0083 0.867 0.56 9.00 -8.44 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.2836 0.7164 0.0000 0 0 0.6707 0.3293 0.0000
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 672 120 552 50 0 18 1 51 0 0 538 0 14 0.4167 0.0000 0.0254 5.667 0.94 6.92 -5.98 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0060 0.3020 0.6920 1 2 0.0068 0.3056 0.6876 1 2 0.0079 0.3110 0.6811
chr14 54702332 C CCAG 0.081686 0.100 1 3 1 424 130 294 121 0 1 0 8 0 0 294 0 0 0.9308 0.0000 0.0000 129.000 0.26 3.25 -2.99 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4864 0.5136 0.0000 0 0 0.9592 0.0408 0.0000
chr14 69573086 CGCG C 0.132029 0.100 1 -3 2 658 172 486 0 8 29 127 8 0 1 477 8 0 0.0000 0.0000 0.0185 4.821 4.88 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0466 0.9534 2 2 0.0000 0.0373 0.9627 2 2 0.0000 0.0322 0.9678
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 661 175 486 0 0 33 1 141 0 0 476 1 9 0.0000 0.0000 0.0206 4.303 7.37 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 466 101 365 5 2 7 12 75 0 0 363 1 1 0.0495 0.0000 0.0055 17.000 2.20 4.73 -2.53 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9349 0.0651 2 1 0.0000 0.5476 0.4524
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 482 138 344 6 1 11 2 118 0 0 343 1 0 0.0435 0.0000 0.0029 11.455 0.00 3.39 -3.39 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.6899 0.3101 2 2 0.0000 0.1228 0.8772
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 378 108 270 9 0 1 0 98 0 0 265 0 5 0.0833 0.0000 0.0185 107.000 0.33 8.85 -8.51 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9930 0.0070 2 1 0.0000 0.7839 0.2161
chr14 100239450 GCCA G 0.045445 0.100 1 -3 2 532 167 365 131 5 25 3 3 0 0 364 1 0 0.7844 0.0000 0.0027 5.875 0.84 3.00 -2.16 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1719 0.8281 0.0000 0 0 0.9737 0.0263 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr14 100884333 C CTCT 0.265959 0.100 1 3 1 678 140 538 73 0 3 0 64 0 0 534 0 4 0.5214 0.0000 0.0074 45.667 0.73 3.20 -2.48 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3582 0.5936 0.0482 1 1 0.3646 0.5844 0.0509 1 1 0.3723 0.5730 0.0547
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 277 91 186 14 0 18 0 59 0 0 179 0 7 0.1538 0.0000 0.0376 4.056 0.14 9.05 -8.91 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9976 0.0024
chr14 104707525 ACCCCAC A 0.082909 0.100 1 -6 2 551 103 448 5 0 18 1 79 0 0 443 0 5 0.0485 0.0000 0.0112 5.312 0.40 5.58 -5.18 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9708 0.0292 2 1 0.0000 0.8188 0.1812
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 438 127 311 53 3 16 0 55 1 0 306 0 4 0.4173 0.0032 0.0161 6.938 0.34 4.02 -3.68 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2192 0.6562 0.1246 1 1 0.2271 0.6459 0.1270 1 1 0.2374 0.6327 0.1299
chr15 20534604 TCGTATCTTCTCCTCCTGCTCCCGTATCTTCTCCTCCTGCTCC T 0.091913 0.100 1 -42 1 4325 1665 2660 909 66 186 33 471 62 65 2518 8 7 0.5459 0.0233 0.0534 7.951 1.34 5.23 -3.89 125 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 348 100 248 41 3 15 3 38 0 0 248 0 0 0.4100 0.0000 0.0000 5.667 2.29 4.58 -2.29 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3829 0.5566 0.0604 1 1 0.3867 0.5508 0.0624 1 1 0.3913 0.5437 0.0650
chr15 22866845 TAAGA T 0.262722 0.100 1 -4 5 237 47 190 42 0 2 0 3 0 0 190 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 22.500 0.67 3.00 -2.33 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0296 0.9704 0.0000 0 1 0.4841 0.5159 0.0000 0 0 0.7586 0.2414 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 850 133 717 0 0 7 1 125 0 8 614 78 17 0.0000 0.0000 0.1437 18.000 3.72 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 2167 583 1584 0 1 8 8 566 1 1 1553 11 18 0.0000 0.0006 0.0196 71.500 3.94 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 476 119 357 67 0 1 0 51 0 0 355 0 2 0.5630 0.0000 0.0056 118.000 0.15 2.25 -2.11 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5694 0.4094 0.0213 1 0 0.5659 0.4106 0.0235 1 0 0.5605 0.4127 0.0268
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 219 81 138 0 1 2 47 31 0 0 135 3 0 0.0000 0.0000 0.0217 16.500 1.39 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0643 0.9357 2 2 0.0000 0.0657 0.9343 2 2 0.0000 0.0691 0.9309
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 219 82 137 0 2 32 2 46 0 0 135 0 2 0.0000 0.0000 0.0146 1.562 2.02 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5581 0.4419 2 2 0.0000 0.2451 0.7549 2 2 0.0000 0.1497 0.8503
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 728 177 551 66 0 29 2 80 1 1 547 0 2 0.3729 0.0018 0.0073 5.103 0.92 4.03 -3.10 30 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0117 0.3819 0.6064 1 2 0.0132 0.3825 0.6043 1 2 0.0154 0.3840 0.6006
chr15 33844878 TAGA T 0.150388 0.100 1 -3 3 250 81 169 53 0 4 0 24 0 0 168 0 1 0.6543 0.0000 0.0059 19.250 0.28 3.46 -3.18 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9023 0.0970 0.0006 1 0 0.8951 0.1041 0.0008 1 0 0.8847 0.1143 0.0010
chr15 34038912 CCCGCCGCCGCCT C 0.202105 0.100 1 -12 4 228 86 142 48 0 6 0 32 0 0 137 1 4 0.5581 0.0000 0.0352 13.333 0.75 11.03 -10.28 0 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6056 0.3778 0.0166 1 0 0.6021 0.3800 0.0180 1 0 0.5969 0.3832 0.0199
chr15 38484605 AGGTGGTGGT A 0.136711 0.100 1 -9 2 412 178 234 91 1 43 0 43 0 0 232 0 2 0.5112 0.0000 0.0085 3.140 0.75 8.74 -8.00 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9789 0.0211 0.0000 1 0 0.9761 0.0239 0.0000 1 0 0.9717 0.0283 0.0000
chr15 39976797 G GGACGAC 0.109463 0.100 1 6 1 337 88 249 75 0 9 0 4 0 0 249 0 0 0.8523 0.0000 0.0000 8.778 0.99 5.25 -4.26 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0490 0.9510 0.0000 0 0 0.8298 0.1702 0.0000 0 0 0.9596 0.0404 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 434 125 309 114 0 0 0 11 0 0 309 0 0 0.9120 0.0000 0.0000 125.000 1.64 2.09 -0.45 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 1 0.3038 0.6962 0.0000
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 513 167 346 93 0 11 0 63 0 0 343 0 3 0.5569 0.0000 0.0087 14.182 0.27 4.90 -4.64 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8086 0.1892 0.0021 1 0 0.8013 0.1961 0.0026 1 0 0.7908 0.2059 0.0034
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 153 81 72 43 0 3 0 35 0 0 72 0 0 0.5309 0.0000 0.0000 26.000 0.23 2.83 -2.60 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4099 0.5151 0.0750 1 1 0.4076 0.5130 0.0794 1 1 0.4041 0.5106 0.0853
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 260 143 117 72 0 1 0 70 0 0 112 0 5 0.5035 0.0000 0.0427 142.000 1.12 3.46 -2.33 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0968 0.6519 0.2514 1 1 0.1016 0.6405 0.2579 1 1 0.1080 0.6261 0.2659
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 468 110 358 11 0 8 6 85 0 0 353 0 5 0.1000 0.0000 0.0140 12.625 0.73 4.16 -3.44 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.8856 0.1144
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 403 141 262 74 0 1 1 65 0 0 260 0 2 0.5248 0.0000 0.0076 140.000 0.77 3.08 -2.31 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3755 0.5793 0.0451 1 1 0.3812 0.5708 0.0480 1 1 0.3878 0.5603 0.0518
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 1104 298 806 139 10 59 1 89 0 0 806 0 0 0.4664 0.0000 0.0000 4.086 0.39 3.12 -2.74 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9891 0.0109 0.0000 1 0 0.9875 0.0125 0.0000 1 0 0.9850 0.0150 0.0000
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 868 220 648 9 8 116 3 84 0 0 632 0 16 0.0409 0.0000 0.0247 1.719 2.56 15.68 -13.12 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9167 0.0833
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 856 221 635 1 3 17 6 194 0 0 635 0 0 0.0045 0.0000 0.0000 11.882 0.00 11.03 -11.03 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0076 0.9924 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 351 104 247 0 0 5 1 98 0 0 237 0 10 0.0000 0.0000 0.0405 24.500 7.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 354 107 247 41 0 5 0 61 0 0 247 0 0 0.3832 0.0000 0.0000 20.400 0.63 2.21 -1.58 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0121 0.3005 0.6875 1 2 0.0139 0.3081 0.6780 1 2 0.0166 0.3186 0.6648
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 530 188 342 11 0 42 1 134 0 0 334 0 8 0.0585 0.0000 0.0234 3.452 0.82 6.70 -5.88 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9952 0.0048 2 1 0.0000 0.7075 0.2925
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 40 12 28 5 0 0 0 7 0 0 28 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 12.000 0.00 1.00 -1.00 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3393 0.5421 0.1186 1 1 0.3420 0.5402 0.1178 1 1 0.3453 0.5381 0.1165
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 352 101 251 55 0 2 0 44 0 0 250 0 1 0.5446 0.0000 0.0040 49.500 0.24 3.02 -2.79 19 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5135 0.4541 0.0325 1 0 0.5119 0.4532 0.0350 1 0 0.5091 0.4525 0.0385
chr16 805517 GGCAGCT G 0.053997 0.100 1 -6 4 409 132 277 125 0 4 0 3 0 0 277 0 0 0.9470 0.0000 0.0000 32.000 0.43 4.33 -3.90 81 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9287 0.0713 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 324 112 212 108 0 2 0 2 0 0 212 0 0 0.9643 0.0000 0.0000 55.000 0.40 18.00 -17.60 58 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9671 0.0329 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 1028 191 837 91 0 4 0 96 2 0 831 0 4 0.4764 0.0024 0.0072 46.750 1.21 1.27 -0.06 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1163 0.7595 0.1242 1 1 0.1261 0.7463 0.1276 1 1 0.1396 0.7288 0.1316
chr16 1999881 G GTCC 0.177864 0.100 1 3 2 618 105 513 83 2 12 0 8 0 0 512 0 1 0.7905 0.0000 0.0019 7.750 1.00 4.12 -3.12 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0218 0.9782 0.0000 0 1 0.4699 0.5301 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 504 97 407 0 0 1 0 96 0 0 406 0 1 0.0000 0.0000 0.0025 96.000 6.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 504 97 407 0 0 1 0 96 0 0 406 0 1 0.0000 0.0000 0.0025 96.000 6.72 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 3028415 A AG 0.002468 0.100 1 1 1 806 190 616 111 0 2 0 77 0 0 616 0 0 0.5842 0.0000 0.0000 94.000 0.52 1.81 -1.28 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9202 0.0798 0.0000 1 0 0.9157 0.0843 0.0000 1 0 0.9090 0.0910 0.0000
chr16 4702106 ACTG A 0.023057 0.100 1 -3 1 305 125 180 102 0 13 0 10 0 0 180 0 0 0.8160 0.0000 0.0000 8.615 0.23 3.60 -3.37 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1413 0.8587 0.0000 0 0 0.9071 0.0929 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 439 103 336 56 1 4 0 42 0 0 335 0 1 0.5437 0.0000 0.0030 33.000 0.21 3.10 -2.88 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4536 0.4979 0.0485 1 1 0.4479 0.4989 0.0532 1 1 0.4396 0.5005 0.0599
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 421 115 306 37 1 40 3 34 5 1 293 3 4 0.3217 0.0163 0.0425 1.875 1.35 3.79 -2.44 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3320 0.6026 0.0654 1 1 0.3383 0.5949 0.0668 1 1 0.3463 0.5852 0.0685
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 189 48 141 0 0 1 0 47 0 0 140 0 1 0.0000 0.0000 0.0071 47.000 2.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr16 24572391 TAAAGAG T 0.075097 0.100 1 -6 1 585 97 488 60 0 3 0 34 0 0 488 0 0 0.6186 0.0000 0.0000 31.333 0.77 5.79 -5.03 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8844 0.1152 0.0004 1 0 0.8775 0.1220 0.0005 1 0 0.8677 0.1316 0.0006
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.100 1 -27 1 948 184 764 80 2 43 0 59 0 0 764 0 0 0.4348 0.0000 0.0000 3.279 0.96 11.76 -10.80 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7662 0.2300 0.0038 1 0 0.7593 0.2363 0.0044 1 0 0.7493 0.2452 0.0055
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.100 1 3 1 630 143 487 68 0 8 1 66 0 0 486 0 1 0.4755 0.0000 0.0021 16.875 0.40 3.29 -2.89 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2035 0.6606 0.1358 1 1 0.2104 0.6492 0.1404 1 1 0.2191 0.6346 0.1463
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 133 78 55 0 0 8 2 68 0 0 55 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.750 2.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0276 0.9724 2 2 0.0000 0.0296 0.9704 2 2 0.0000 0.0326 0.9674
chr16 51141744 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 1067 258 809 122 14 37 0 85 0 1 806 2 0 0.4729 0.0000 0.0037 5.973 0.56 3.27 -2.71 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9594 0.0406 0.0000 1 0 0.9549 0.0450 0.0001 1 0 0.9481 0.0518 0.0001
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 441 93 348 43 6 17 2 25 0 0 346 1 1 0.4624 0.0000 0.0057 4.353 0.65 2.64 -1.99 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6879 0.2968 0.0153 1 0 0.6769 0.3057 0.0174 1 0 0.6616 0.3178 0.0207
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1103 321 782 141 2 52 10 116 0 0 782 0 0 0.4393 0.0000 0.0000 5.135 0.45 3.27 -2.82 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4126 0.5731 0.0143 1 1 0.4199 0.5634 0.0166 1 1 0.4280 0.5519 0.0201
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 295 126 169 9 0 23 0 94 0 0 168 0 1 0.0714 0.0000 0.0059 4.478 2.56 7.96 -5.40 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9921 0.0079 2 1 0.0000 0.7625 0.2375
chr16 84236959 G GCCAGCTCCT 0.500000 0.100 1 9 2 718 191 527 149 0 36 0 6 0 0 526 0 1 0.7801 0.0000 0.0019 4.306 0.18 6.83 -6.65 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4972 0.5028 0.0000 0 0 0.9392 0.0608 0.0000
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 435 126 309 35 51 31 0 9 0 0 309 0 0 0.2778 0.0000 0.0000 3.167 0.57 4.89 -4.32 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0056 0.9944 0.0000 0 1 0.1755 0.8245 0.0000
chr16 87604287 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 435 126 309 86 5 31 0 4 0 0 309 0 0 0.6825 0.0000 0.0000 3.167 5.34 7.25 -1.91 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0147 0.9853 0.0000 0 0 0.5795 0.4205 0.0000 0 0 0.8677 0.1323 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 693 139 554 0 1 6 7 125 0 0 548 1 5 0.0000 0.0000 0.0108 26.200 8.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 689 135 554 0 1 5 8 121 0 0 547 2 5 0.0000 0.0000 0.0126 25.800 8.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 693 137 556 0 0 4 2 131 0 1 539 10 6 0.0000 0.0000 0.0306 44.000 8.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 766 147 619 0 0 11 0 136 0 1 611 0 7 0.0000 0.0000 0.0129 12.364 6.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 580 134 446 127 0 5 0 2 0 0 446 0 0 0.9478 0.0000 0.0000 25.800 1.20 3.50 -2.30 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8838 0.1162 0.0000 0 0 0.9854 0.0146 0.0000 0 0 0.9925 0.0075 0.0000
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.100 1 6 2 758 171 587 83 1 23 0 64 0 0 584 0 3 0.4854 0.0000 0.0051 6.435 0.31 5.47 -5.16 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5518 0.4292 0.0190 1 0 0.5482 0.4303 0.0215 1 0 0.5424 0.4324 0.0252
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 170 71 99 9 0 1 0 61 0 0 98 0 1 0.1268 0.0000 0.0101 70.000 0.22 3.69 -3.47 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.9409 0.0591
chr16 89850471 C CGAG 0.500000 0.100 1 3 3 495 138 357 65 1 8 1 63 0 0 356 0 1 0.4710 0.0000 0.0028 16.250 0.26 3.21 -2.94 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1903 0.6541 0.1556 1 1 0.1956 0.6431 0.1612 1 1 0.2024 0.6291 0.1685
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 374 122 252 61 1 4 0 56 0 0 252 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 29.500 0.31 1.36 -1.05 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2103 0.6519 0.1377 1 1 0.2118 0.6430 0.1452 1 1 0.2132 0.6315 0.1553
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 748 210 538 22 0 33 2 153 0 0 536 0 2 0.1048 0.0000 0.0037 5.364 1.00 3.04 -2.04 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9972 0.0028
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.100 1 9 2 1327 371 956 18 28 91 19 215 0 1 932 4 19 0.0485 0.0000 0.0251 3.112 6.28 6.13 0.15 6 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.100 1 -6 2 1329 412 917 306 8 81 0 17 0 0 916 0 1 0.7427 0.0000 0.0011 4.086 5.28 6.12 -0.83 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2496 0.7504 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.100 1 -6 1 1050 312 738 233 0 62 1 16 0 0 735 0 3 0.7468 0.0000 0.0041 4.310 0.98 7.06 -6.08 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.6591 0.3409 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 387 101 286 48 0 11 0 42 0 0 286 0 0 0.4752 0.0000 0.0000 8.182 0.46 8.45 -7.99 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3311 0.5681 0.1008 1 1 0.3315 0.5628 0.1057 1 1 0.3315 0.5563 0.1122
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 556 241 315 77 2 32 6 124 0 0 315 0 0 0.3195 0.0000 0.0000 6.531 0.34 3.18 -2.84 41 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0342 0.9658 1 2 0.0001 0.0383 0.9617 1 2 0.0001 0.0446 0.9553
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 940 273 667 121 3 15 27 107 0 0 666 0 1 0.4432 0.0000 0.0015 17.846 0.29 4.23 -3.94 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0802 0.7577 0.1621 1 1 0.0871 0.7414 0.1714 1 1 0.0966 0.7201 0.1834
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 941 272 669 122 15 28 11 96 0 0 668 1 0 0.4485 0.0000 0.0015 9.269 0.28 3.91 -3.63 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7603 0.2380 0.0017 1 0 0.7549 0.2430 0.0022 1 0 0.7465 0.2505 0.0030
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 830 199 631 174 0 6 0 19 0 2 627 0 2 0.8744 0.0000 0.0063 32.167 0.22 3.68 -3.47 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0070 0.9930 0.0000
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 242 59 183 0 0 19 1 39 0 0 172 0 11 0.0000 0.0000 0.0601 2.105 7.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0692 0.9308 2 2 0.0000 0.0726 0.9274 2 2 0.0000 0.0776 0.9224
chr17 30834937 ACAATGT A 0.500000 0.100 1 -6 1 807 168 639 158 0 2 0 8 0 0 639 0 0 0.9405 0.0000 0.0000 83.000 0.27 7.12 -6.86 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3483 0.6517 0.0000 0 0 0.9264 0.0736 0.0000
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 140 74 66 3 0 2 0 69 0 0 66 0 0 0.0405 0.0000 0.0000 36.000 0.00 1.42 -1.42 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9585 0.0415 2 2 0.0000 0.4368 0.5632 2 2 0.0000 0.1941 0.8059
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 873 220 653 112 1 34 2 71 2 1 639 0 11 0.5091 0.0031 0.0214 5.471 2.58 11.62 -9.04 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8085 0.1899 0.0016 1 0 0.8009 0.1971 0.0020 1 0 0.7897 0.2076 0.0027
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 520 124 396 111 1 5 0 7 0 0 396 0 0 0.8952 0.0000 0.0000 23.600 0.42 1.57 -1.15 91 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1357 0.8643 0.0000 0 0 0.7187 0.2813 0.0000
chr17 41302321 TGTACAGATGGTTG T 0.500000 0.100 1 -13 1 1148 264 884 32 0 8 1 223 0 0 856 0 28 0.1212 0.0000 0.0317 32.000 0.22 11.78 -11.57 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 620 196 424 17 0 26 0 153 0 0 406 1 17 0.0867 0.0000 0.0425 6.538 0.35 14.37 -14.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9316 0.0684
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1661 367 1294 343 0 4 0 20 0 0 1294 0 0 0.9346 0.0000 0.0000 90.750 0.35 3.35 -3.00 105 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0153 0.9847 0.0000 0 0 0.9783 0.0217 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 689 185 504 132 6 34 1 12 0 2 502 0 0 0.7135 0.0000 0.0040 4.441 1.08 5.25 -4.17 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.1770 0.8230 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 266 92 174 12 0 6 0 74 0 0 173 0 1 0.1304 0.0000 0.0057 14.333 0.00 4.28 -4.28 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9831 0.0169
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 458 109 349 88 0 17 0 4 0 0 349 0 0 0.8073 0.0000 0.0000 5.412 0.33 5.50 -5.17 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0121 0.9879 0.0000 0 0 0.5340 0.4660 0.0000 0 0 0.8459 0.1541 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 969 247 722 96 0 9 1 141 0 0 718 0 4 0.3887 0.0000 0.0055 26.444 0.20 3.13 -2.94 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0442 0.9558 1 2 0.0001 0.0487 0.9513 1 2 0.0001 0.0555 0.9444
chr17 58309246 G GTCCTCCTCT 0.500000 0.100 1 9 1 638 171 467 141 2 24 1 3 0 0 467 0 0 0.8246 0.0000 0.0000 6.042 0.57 5.00 -4.43 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5737 0.4263 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000 0 0 0.9917 0.0083 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 409 139 270 11 0 32 0 96 0 0 269 0 1 0.0791 0.0000 0.0037 3.344 0.27 5.19 -4.91 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9132 0.0868
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 578 112 466 0 0 8 0 104 0 0 455 0 11 0.0000 0.0000 0.0236 13.000 8.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr17 75616380 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 1311 294 1017 192 5 73 4 20 0 0 1017 0 0 0.6531 0.0000 0.0000 3.014 0.81 3.25 -2.44 114 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0036 0.9964 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2474 598 1876 65 9 71 16 437 0 3 1851 6 16 0.1087 0.0000 0.0133 7.400 1.46 6.27 -4.81 19 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2406 664 1742 63 0 31 9 561 0 1 1580 20 141 0.0949 0.0000 0.0930 20.290 1.78 4.57 -2.79 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9952 0.0048
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -6 7 267 114 153 6 0 14 0 94 0 0 150 0 3 0.0526 0.0000 0.0196 7.143 0.50 5.84 -5.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8239 0.1761 2 2 0.0000 0.2981 0.7019
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 1127 188 939 168 0 13 0 7 0 0 938 1 0 0.8936 0.0000 0.0011 13.462 0.89 7.00 -6.11 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.6801 0.3199 0.0000 0 0 0.9707 0.0293 0.0000
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 591 161 430 152 1 1 0 7 0 0 430 0 0 0.9441 0.0000 0.0000 160.000 0.23 3.29 -3.06 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.5466 0.4534 0.0000 0 0 0.9493 0.0507 0.0000
chr17 81647906 T TTAAC 0.500000 0.100 1 4 3 499 114 385 5 0 1 1 107 0 0 377 0 8 0.0439 0.0000 0.0208 113.000 0.20 4.24 -4.04 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9945 0.0055 2 2 0.0000 0.3846 0.6154 2 2 0.0000 0.0817 0.9183
chr17 82316265 GCAGGGAGGGCAGAGGCTGCTGGCGGGT G 0.500000 0.100 1 -27 2 568 171 397 92 0 26 0 53 0 0 385 0 12 0.5380 0.0000 0.0302 5.577 0.33 19.40 -19.07 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7681 0.2283 0.0036 1 0 0.7594 0.2362 0.0044 1 0 0.7469 0.2474 0.0057
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 343 77 266 47 1 1 1 27 0 0 266 0 0 0.6104 0.0000 0.0000 75.000 0.13 1.70 -1.58 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7505 0.2407 0.0088 1 0 0.7404 0.2495 0.0101 1 0 0.7262 0.2616 0.0121
chr18 8786007 CCGAGCCGCGCGGGAG C 0.007603 0.100 1 -15 1 270 71 199 43 1 1 0 26 0 0 193 0 6 0.6056 0.0000 0.0302 70.000 2.23 14.12 -11.88 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6915 0.3080 0.0005 1 0 0.6877 0.3118 0.0005 1 0 0.6823 0.3171 0.0006
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 218 90 128 0 0 3 0 87 0 0 123 0 5 0.0000 0.0000 0.0391 29.000 3.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 351 77 274 64 1 6 0 6 0 0 273 0 1 0.8312 0.0000 0.0036 11.833 1.17 9.00 -7.83 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0506 0.9494 0.0000 0 1 0.4838 0.5162 0.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 199 102 97 54 0 0 1 47 0 0 97 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 102.000 0.54 4.91 -4.38 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2962 0.5949 0.1088 1 1 0.2973 0.5883 0.1144 1 1 0.2982 0.5799 0.1219
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 342 154 188 71 0 9 0 74 0 0 187 0 1 0.4610 0.0000 0.0053 16.111 0.21 4.09 -3.88 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1076 0.6546 0.2378 1 1 0.1134 0.6436 0.2430 1 1 0.1212 0.6295 0.2494
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -9 2 551 149 402 62 0 6 1 80 0 0 402 0 0 0.4161 0.0000 0.0000 23.833 1.44 8.95 -7.51 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0141 0.3748 0.6110 1 2 0.0162 0.3786 0.6052 1 2 0.0193 0.3842 0.5965
chr18 54224214 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 319 64 255 48 1 11 0 4 0 0 255 0 0 0.7500 0.0000 0.0000 4.818 1.54 4.00 -2.46 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.1405 0.8595 0.0000 0 1 0.4528 0.5472 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 264 144 120 7 0 6 1 130 0 0 120 0 0 0.0486 0.0000 0.0000 23.000 0.29 3.13 -2.85 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7130 0.2870 2 2 0.0000 0.1342 0.8658
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 805 182 623 6 0 9 2 165 0 0 605 0 18 0.0330 0.0000 0.0289 19.222 0.17 13.27 -13.11 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9803 0.0197 2 2 0.0000 0.0546 0.9454 2 2 0.0000 0.0059 0.9941
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 425 71 354 30 1 9 2 29 0 1 351 1 1 0.4225 0.0000 0.0085 6.889 2.77 5.21 -2.44 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1958 0.5778 0.2265 1 1 0.1991 0.5720 0.2290 1 1 0.2033 0.5646 0.2321
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 170 65 105 0 0 6 0 59 0 0 101 0 4 0.0000 0.0000 0.0381 9.833 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0387 0.9613 2 2 0.0000 0.0412 0.9588 2 2 0.0000 0.0449 0.9551
chr18 74556356 G GTGCTGC 0.500000 0.100 1 6 1 153 83 70 69 0 7 0 7 0 0 69 0 1 0.8313 0.0000 0.0143 10.857 0.36 6.29 -5.92 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0062 0.9938 0.0000 0 1 0.1435 0.8565 0.0000
chr18 76496529 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 303 71 232 67 0 2 0 2 2 1 227 2 0 0.9437 0.0086 0.0216 34.500 0.37 0.50 -0.13 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0393 0.9607 0.0000 0 0 0.5173 0.4827 0.0000 0 0 0.7786 0.2214 0.0000
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 4 422 149 273 62 0 15 1 71 0 0 273 0 0 0.4161 0.0000 0.0000 8.933 0.87 3.80 -2.93 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0537 0.5576 0.3887 1 1 0.0581 0.5523 0.3895 1 1 0.0643 0.5459 0.3897
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 424 187 237 114 6 16 5 46 0 1 236 0 0 0.6096 0.0000 0.0042 12.000 2.40 6.54 -4.14 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9975 0.0025 0.0000 1 0 0.9969 0.0031 0.0000 1 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr19 932466 TGAG T 0.006773 0.100 1 -3 1 423 125 298 101 1 13 1 9 0 0 298 0 0 0.8080 0.0000 0.0000 8.615 0.74 3.56 -2.81 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3684 0.6316 0.0000 0 0 0.9715 0.0285 0.0000
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.100 1 4 1 598 89 509 52 0 1 0 36 0 0 506 0 3 0.5843 0.0000 0.0059 88.000 0.33 5.47 -5.15 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6126 0.3689 0.0185 1 0 0.6078 0.3719 0.0203 1 0 0.6008 0.3763 0.0229
chr19 1009186 GAGC G 0.092678 0.100 1 -3 2 528 115 413 95 2 8 1 9 0 0 413 0 0 0.8261 0.0000 0.0000 13.375 0.34 3.11 -2.77 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0294 0.9706 0.0000 0 0 0.6404 0.3596 0.0000
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.100 1 -27 1 392 92 300 57 1 5 0 29 0 0 299 0 1 0.6196 0.0000 0.0033 17.400 0.26 18.10 -17.84 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8899 0.1091 0.0010 1 0 0.8823 0.1165 0.0012 1 0 0.8712 0.1272 0.0015
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 179 70 109 62 0 5 0 3 0 0 109 0 0 0.8857 0.0000 0.0000 13.000 0.29 5.00 -4.71 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0900 0.9100 0.0000 0 0 0.7495 0.2505 0.0000 0 0 0.9069 0.0931 0.0000
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 240 140 100 78 0 1 0 61 0 1 98 0 1 0.5571 0.0000 0.0200 139.000 0.37 3.20 -2.82 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6704 0.3228 0.0068 1 0 0.6671 0.3253 0.0077 1 0 0.6619 0.3291 0.0090
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 307 95 212 0 0 14 51 30 0 0 209 2 1 0.0000 0.0000 0.0142 5.786 4.10 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0152 0.9848 2 2 0.0000 0.0166 0.9834 2 2 0.0000 0.0187 0.9813
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 307 98 209 0 2 40 3 53 0 0 207 0 2 0.0000 0.0000 0.0096 1.400 7.58 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3838 0.6162 2 2 0.0000 0.3762 0.6238 2 2 0.0000 0.3731 0.6269
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 307 105 202 39 1 53 2 10 0 0 202 0 0 0.3714 0.0000 0.0000 1.062 3.26 11.60 -8.34 25 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6537 0.3459 0.0003 0 1 0.1725 0.8274 0.0001 0 1 0.0459 0.9541 0.0000
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 800 180 620 142 7 23 1 7 0 0 620 0 0 0.7889 0.0000 0.0000 6.783 0.43 3.14 -2.71 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.8179 0.1821 0.0000 0 0 0.9866 0.0134 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 446 135 311 77 0 2 0 56 3 0 307 0 1 0.5704 0.0096 0.0129 66.500 0.99 3.18 -2.19 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8139 0.1850 0.0011 1 0 0.8080 0.1906 0.0014 1 0 0.7996 0.1987 0.0017
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 619 167 452 24 0 15 1 127 0 0 444 0 8 0.1437 0.0000 0.0177 10.133 0.58 11.06 -10.47 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 303 89 214 79 0 5 0 5 0 0 213 0 1 0.8876 0.0000 0.0047 16.800 0.34 5.40 -5.06 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1561 0.8439 0.0000 0 0 0.6765 0.3235 0.0000
chr19 11447525 A AGAG 0.036742 0.100 1 3 1 866 301 565 99 125 59 0 18 0 5 560 0 0 0.3289 0.0000 0.0088 4.051 0.61 3.28 -2.67 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0123 0.9877 0.0000 0 0 0.9459 0.0541 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 867 300 567 119 1 50 12 118 0 0 561 1 5 0.3967 0.0000 0.0106 4.980 0.97 3.94 -2.97 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0264 0.6667 0.3070 1 1 0.0303 0.6567 0.3130 1 1 0.0363 0.6443 0.3194
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 427 147 280 48 0 35 0 64 1 0 277 0 2 0.3265 0.0036 0.0107 3.200 1.31 6.84 -5.53 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0375 0.5011 0.4614 1 1 0.0420 0.5039 0.4541 1 1 0.0486 0.5077 0.4437
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 597 132 465 0 1 4 0 127 0 0 460 0 5 0.0000 0.0000 0.0108 31.750 3.44 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 16688246 CACG C 0.007764 0.100 1 -3 2 238 98 140 54 0 4 1 39 0 0 140 0 0 0.5510 0.0000 0.0000 23.500 0.30 3.49 -3.19 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7146 0.2850 0.0003 1 0 0.7108 0.2889 0.0004 1 0 0.7052 0.2944 0.0004
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.100 1 -4 1 413 80 333 10 15 15 10 30 0 0 333 0 0 0.1250 0.0000 0.0000 11.800 0.00 4.17 -4.17 10 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1139 0.6228 0.2634 1 1 0.1219 0.6218 0.2564 1 1 0.1330 0.6200 0.2470
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 100 39 61 20 0 2 0 17 0 0 61 0 0 0.5128 0.0000 0.0000 18.500 0.15 4.24 -4.09 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4407 0.4955 0.0638 1 1 0.4405 0.4942 0.0653 1 1 0.4401 0.4927 0.0672
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 894 194 700 0 3 5 6 180 0 0 659 6 35 0.0000 0.0000 0.0586 37.600 2.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 23744939 CCA C 0.187747 0.100 1 -2 4 819 190 629 171 2 7 0 10 0 0 629 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 26.143 0.40 1.70 -1.30 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3688 0.6312 0.0000 0 0 0.9690 0.0310 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 311 85 226 1 0 10 3 71 0 0 225 0 1 0.0118 0.0000 0.0044 7.500 0.00 3.20 -3.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0388 0.9612 2 2 0.0000 0.0135 0.9865 2 2 0.0000 0.0099 0.9901
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 567 143 424 8 1 5 0 129 0 0 419 0 5 0.0559 0.0000 0.0118 27.600 0.50 3.34 -2.84 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8535 0.1465 2 2 0.0000 0.1409 0.8591
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 584 273 311 238 0 29 0 6 0 0 307 0 4 0.8718 0.0000 0.0129 8.414 0.29 8.50 -8.21 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9460 0.0540 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr19 35720472 CAAG C 0.035298 0.100 1 -3 1 750 156 594 143 1 3 1 8 0 0 594 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 51.000 0.70 3.00 -2.30 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7217 0.2783 0.0000 0 0 0.9894 0.0106 0.0000
chr19 37894973 TGGA T 0.043831 0.100 1 -3 1 723 141 582 134 0 4 0 3 0 0 581 0 1 0.9504 0.0000 0.0017 34.250 0.22 4.00 -3.78 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7356 0.2644 0.0000 0 0 0.9960 0.0040 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr19 38304906 TGAA T 0.163680 0.100 1 -3 1 380 92 288 39 0 5 0 48 0 0 288 0 0 0.4239 0.0000 0.0000 17.400 0.69 3.69 -3.00 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1505 0.6737 0.1758 1 1 0.1593 0.6670 0.1737 1 1 0.1713 0.6581 0.1705
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 270 30 240 0 0 3 26 1 0 0 240 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.333 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0672 0.9328 2 2 0.0000 0.0690 0.9310 2 2 0.0000 0.0715 0.9285
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 269 30 239 0 0 18 10 2 0 0 239 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.769 2.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1057 0.8943 2 2 0.0000 0.1075 0.8925 2 2 0.0000 0.1100 0.8900
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 471 137 334 60 7 5 0 65 0 0 334 0 0 0.4380 0.0000 0.0000 25.200 0.25 5.83 -5.58 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1633 0.6541 0.1826 1 1 0.1682 0.6431 0.1887 1 1 0.1744 0.6292 0.1964
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.100 1 3 1 292 101 191 97 0 1 0 3 0 0 191 0 0 0.9604 0.0000 0.0000 100.000 0.56 3.00 -2.44 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8074 0.1926 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 372 118 254 108 0 0 0 10 0 0 253 0 1 0.9153 0.0000 0.0039 118.000 0.36 6.30 -5.94 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.1853 0.8147 0.0000
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 529 142 387 17 0 4 1 120 0 0 383 0 4 0.1197 0.0000 0.0103 34.250 0.35 3.14 -2.79 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9867 0.0133
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 518 155 363 149 0 0 0 6 0 0 363 0 0 0.9613 0.0000 0.0000 155.000 0.37 3.33 -2.96 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0198 0.9802 0.0000 0 0 0.9432 0.0568 0.0000 0 0 0.9941 0.0059 0.0000
chr19 46493759 C CCGGCCT 0.138319 0.100 1 6 4 359 98 261 10 0 21 2 65 0 0 259 0 2 0.1020 0.0000 0.0077 3.667 0.70 6.28 -5.58 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9926 0.0074
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.100 1 -3 1 483 102 381 60 1 3 1 37 0 0 381 0 0 0.5882 0.0000 0.0000 33.000 0.42 3.73 -3.31 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8406 0.1582 0.0011 1 0 0.8335 0.1652 0.0014 1 0 0.8234 0.1749 0.0017
chr19 48231760 C CTT 0.055045 0.100 1 2 1 122 29 93 11 0 0 0 18 0 0 93 0 0 0.3793 0.0000 0.0000 29.000 0.18 2.61 -2.43 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2721 0.6644 0.0635 1 1 0.2799 0.6582 0.0619 1 1 0.2902 0.6500 0.0598
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 200 89 111 39 1 10 1 38 0 0 111 0 0 0.4382 0.0000 0.0000 7.800 0.26 1.58 -1.32 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3573 0.5793 0.0634 1 1 0.3624 0.5728 0.0648 1 1 0.3687 0.5647 0.0666
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 1039 276 763 95 6 56 8 111 0 2 754 3 4 0.3442 0.0000 0.0118 3.964 0.92 3.75 -2.83 21 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0099 0.4570 0.5331 1 2 0.0117 0.4567 0.5315 1 2 0.0147 0.4574 0.5280
chr19 49428625 A AAC 0.009419 0.100 1 2 1 238 61 177 36 0 0 0 25 0 0 174 0 3 0.5902 0.0000 0.0169 61.000 0.36 8.00 -7.64 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6146 0.3842 0.0012 1 0 0.6129 0.3858 0.0013 1 0 0.6104 0.3883 0.0014
chr19 49428630 GACGC G 0.009533 0.100 1 -4 2 236 64 172 40 0 0 1 23 0 0 167 1 4 0.6250 0.0000 0.0291 64.000 0.38 8.35 -7.97 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6781 0.3212 0.0007 1 0 0.6744 0.3248 0.0008 1 0 0.6692 0.3300 0.0009
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 610 179 431 77 0 38 0 64 0 0 427 1 3 0.4302 0.0000 0.0093 3.711 1.44 7.36 -5.92 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4300 0.5331 0.0369 1 1 0.4327 0.5274 0.0399 1 1 0.4354 0.5204 0.0442
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 665 140 525 4 1 4 58 73 0 0 517 0 8 0.0286 0.0000 0.0152 34.000 1.00 3.10 -2.10 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9320 0.0680 2 2 0.0000 0.1052 0.8948 2 2 0.0000 0.0212 0.9788
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 663 147 516 0 0 11 77 59 0 0 516 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 12.273 3.03 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr19 50725314 C CGCCCA 0.002025 0.100 1 5 2 502 124 378 60 0 11 0 53 0 0 374 0 4 0.4839 0.0000 0.0106 10.273 0.50 5.11 -4.61 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4306 0.5689 0.0005 1 1 0.4385 0.5610 0.0005 1 1 0.4482 0.5513 0.0005
chr19 51354360 T TG 0.039193 0.100 1 1 2 564 142 422 74 0 6 0 62 0 0 422 0 0 0.5211 0.0000 0.0000 22.667 0.32 1.23 -0.90 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6169 0.3808 0.0023 1 0 0.6178 0.3796 0.0026 1 0 0.6183 0.3788 0.0029
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 596 191 405 96 0 7 9 79 0 0 404 1 0 0.5026 0.0000 0.0025 26.286 0.43 2.80 -2.37 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2062 0.7045 0.0893 1 1 0.2109 0.6924 0.0967 1 1 0.2163 0.6767 0.1070
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 203 89 114 52 0 1 0 36 0 0 112 0 2 0.5843 0.0000 0.0175 88.000 0.25 2.11 -1.86 40 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3909 0.5458 0.0633 1 1 0.3839 0.5469 0.0692 1 1 0.3740 0.5483 0.0776
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 497 166 331 89 0 6 0 71 0 0 331 0 0 0.5361 0.0000 0.0000 26.667 0.53 2.13 -1.60 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6197 0.3695 0.0108 1 0 0.6165 0.3711 0.0124 1 0 0.6113 0.3740 0.0147
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 568 141 427 77 0 4 0 60 0 0 423 0 4 0.5461 0.0000 0.0094 34.250 0.18 3.38 -3.20 43 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5136 0.4617 0.0247 1 0 0.5128 0.4599 0.0273 1 0 0.5109 0.4581 0.0310
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 1186 302 884 285 0 1 0 16 0 0 884 0 0 0.9437 0.0000 0.0000 301.000 0.26 2.75 -2.49 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0827 0.9173 0.0000 0 0 0.9812 0.0188 0.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 655 163 492 91 0 13 1 58 0 0 492 0 0 0.5583 0.0000 0.0000 11.538 0.34 2.95 -2.61 45 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.7856 0.2115 0.0029 1 0 0.7737 0.2227 0.0036 1 0 0.7565 0.2386 0.0049
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 441 119 322 64 1 19 0 35 0 0 316 0 6 0.5378 0.0000 0.0186 5.263 0.31 8.06 -7.74 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7579 0.2356 0.0065 1 0 0.7474 0.2449 0.0077 1 0 0.7325 0.2579 0.0096
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 669 150 519 15 1 27 0 107 0 0 495 0 24 0.1000 0.0000 0.0462 4.519 2.07 18.89 -16.82 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.8294 0.1706
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 890 244 646 118 0 24 1 101 0 0 642 0 4 0.4836 0.0000 0.0062 9.167 0.68 4.40 -3.72 78 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4309 0.5527 0.0164 1 1 0.4390 0.5427 0.0183 1 1 0.4483 0.5306 0.0211
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 580 96 484 58 0 5 0 33 0 0 484 0 0 0.6042 0.0000 0.0000 18.200 1.33 3.58 -2.25 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7742 0.2195 0.0063 1 0 0.7624 0.2300 0.0076 1 0 0.7459 0.2446 0.0095
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 165 72 93 62 0 7 0 3 0 0 93 0 0 0.8611 0.0000 0.0000 9.286 0.15 3.00 -2.85 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0612 0.9388 0.0000 0 0 0.6635 0.3365 0.0000 0 0 0.8653 0.1347 0.0000
chr19 57639970 TG T 0.349431 0.100 1 -1 1 159 78 81 76 0 0 0 2 0 0 81 0 0 0.9744 0.0000 0.0000 78.000 0.08 1.00 -0.92 46 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5146 0.4854 0.0000 0 0 0.9080 0.0920 0.0000 0 0 0.9537 0.0463 0.0000
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 334 137 197 82 0 6 1 48 0 0 196 0 1 0.5985 0.0000 0.0051 21.833 0.04 2.10 -2.07 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8453 0.1528 0.0019 1 0 0.8351 0.1625 0.0024 1 0 0.8203 0.1764 0.0032
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 117 63 54 58 0 3 0 2 0 0 54 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 20.000 0.21 6.50 -6.29 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1276 0.8724 0.0000 0 0 0.5827 0.4173 0.0000 0 0 0.7497 0.2503 0.0000
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 366 97 269 19 0 1 3 74 0 0 266 0 3 0.1959 0.0000 0.0112 96.000 0.11 8.89 -8.79 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9530 0.0470 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 366 99 267 19 1 5 4 70 0 0 264 0 3 0.1919 0.0000 0.0112 18.600 0.11 8.99 -8.88 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7759 0.2240 2 1 0.0000 0.9943 0.0057 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 367 125 242 24 0 0 0 101 0 0 236 0 6 0.1920 0.0000 0.0248 125.000 0.08 8.28 -8.19 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 372 161 211 139 0 16 0 6 0 0 211 0 0 0.8634 0.0000 0.0000 9.062 0.27 6.33 -6.06 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0124 0.9876 0.0000 0 0 0.9190 0.0810 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr20 17494075 TAA T 0.002346 0.100 1 -2 4 538 127 411 124 0 1 0 2 0 0 410 0 1 0.9764 0.0000 0.0024 126.000 0.65 2.00 -1.35 82 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9967 0.0033 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 236 90 146 0 0 4 0 86 0 0 145 0 1 0.0000 0.0000 0.0068 21.500 1.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0073 0.9927 2 2 0.0000 0.0080 0.9920 2 2 0.0000 0.0090 0.9910
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 742 199 543 98 0 4 0 97 0 0 540 0 3 0.4925 0.0000 0.0055 48.750 0.19 6.02 -5.83 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1240 0.7254 0.1505 1 1 0.1318 0.7107 0.1575 1 1 0.1421 0.6915 0.1664
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 483 148 335 0 1 1 1 145 0 0 320 0 15 0.0000 0.0000 0.0448 146.000 3.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.100 1 -9 4 237 91 146 37 0 22 0 32 0 1 144 1 0 0.4066 0.0000 0.0137 3.136 2.46 10.50 -8.04 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2786 0.5768 0.1446 1 1 0.2781 0.5718 0.1501 1 1 0.2771 0.5655 0.1574
chr20 35627312 C CA 0.103940 0.100 1 1 1 162 73 89 36 0 3 0 34 0 0 88 0 1 0.4932 0.0000 0.0112 23.333 0.47 1.15 -0.67 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3958 0.5666 0.0377 1 1 0.4007 0.5609 0.0384 1 1 0.4069 0.5537 0.0394
chr20 35652818 A AGGGCCG 0.080534 0.100 1 6 2 861 219 642 95 0 39 0 85 0 0 642 0 0 0.4338 0.0000 0.0000 4.615 0.27 5.22 -4.95 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5030 0.4909 0.0061 1 0 0.5098 0.4835 0.0066 1 0 0.5177 0.4748 0.0075
chr20 38926679 C CGCG 0.081611 0.100 1 3 3 695 193 502 89 1 23 1 79 0 0 499 0 3 0.4611 0.0000 0.0060 7.727 0.51 3.04 -2.53 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4443 0.5465 0.0092 1 1 0.4529 0.5372 0.0100 1 1 0.4631 0.5259 0.0110
chr20 44065918 C CCCG 0.103979 0.100 1 3 4 500 197 303 167 0 20 0 10 0 0 303 0 0 0.8477 0.0000 0.0000 8.850 0.18 2.80 -2.62 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4624 0.5376 0.0000 0 0 0.9790 0.0210 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 552 155 397 68 0 5 0 82 0 0 394 0 3 0.4387 0.0000 0.0076 30.000 0.44 3.34 -2.90 38 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0134 0.3879 0.5988 1 2 0.0152 0.3891 0.5957 1 2 0.0178 0.3914 0.5907
chr20 45834376 CCGAGGACGA C 0.000314 0.100 1 -9 1 524 138 386 63 1 18 1 55 0 0 382 0 4 0.4565 0.0000 0.0104 6.611 0.67 8.45 -7.79 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4427 0.5572 0.0001 1 1 0.4505 0.5494 0.0001 1 1 0.4600 0.5399 0.0001
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 962 307 655 121 2 41 6 137 0 0 655 0 0 0.3941 0.0000 0.0000 6.488 0.48 3.25 -2.77 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0065 0.4492 0.5443 1 2 0.0077 0.4433 0.5490 1 2 0.0095 0.4370 0.5535
chr20 45891618 TG T 0.009535 0.100 1 -1 1 970 295 675 146 11 122 1 15 0 0 675 0 0 0.4949 0.0000 0.0000 1.422 0.48 3.67 -3.19 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.5796 0.4204 0.0000
chr20 45891620 CTG C 0.009541 0.100 1 -2 1 973 296 677 148 2 12 118 16 0 0 677 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 14.333 0.48 3.69 -3.21 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9436 0.0564 0.0000 1 0 0.9399 0.0600 0.0000 1 0 0.9345 0.0655 0.0000
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 552 248 304 112 4 34 7 91 1 0 303 0 0 0.4516 0.0033 0.0033 6.424 0.27 3.14 -2.88 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5915 0.4010 0.0075 1 0 0.5926 0.3987 0.0087 1 0 0.5928 0.3967 0.0105
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.100 1 3 1 436 115 321 57 0 8 0 50 0 0 319 0 2 0.4957 0.0000 0.0062 13.375 0.53 3.04 -2.51 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4090 0.5474 0.0436 1 1 0.4131 0.5412 0.0458 1 1 0.4178 0.5335 0.0487
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 202 43 159 0 0 1 1 41 0 0 152 1 6 0.0000 0.0000 0.0440 42.000 6.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr20 63690337 GAGA G 0.005276 0.100 1 -3 2 851 216 635 198 2 5 0 11 0 0 635 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 41.800 1.13 4.45 -3.32 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.9709 0.0291 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr20 63861822 C CGGCCAGCTCGCTAGCTACGCGCT 0.012953 0.100 1 23 3 570 75 495 40 0 14 0 21 0 0 478 0 17 0.5333 0.0000 0.0343 4.357 1.00 13.67 -12.67 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4490 0.5470 0.0040 1 1 0.4543 0.5417 0.0041 1 1 0.4607 0.5351 0.0042
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 304 144 160 80 0 1 0 63 0 0 160 0 0 0.5556 0.0000 0.0000 143.000 0.16 2.16 -2.00 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4175 0.5466 0.0359 1 1 0.4127 0.5468 0.0404 1 1 0.4054 0.5474 0.0472
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 769 189 580 95 0 5 0 89 0 0 577 0 3 0.5026 0.0000 0.0052 36.800 0.18 5.54 -5.36 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1864 0.7067 0.1069 1 1 0.1936 0.6927 0.1137 1 1 0.2027 0.6747 0.1227
chr21 33488442 CAATTA C 0.224085 0.100 1 -5 2 638 177 461 92 0 7 0 78 0 0 459 0 2 0.5198 0.0000 0.0043 24.286 0.21 5.21 -5.00 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5158 0.4704 0.0138 1 0 0.5195 0.4653 0.0152 1 0 0.5232 0.4595 0.0173
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 797 195 602 117 1 14 2 61 2 2 597 1 0 0.6000 0.0033 0.0083 12.929 1.76 12.49 -10.73 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9900 0.0100 0.0000 1 0 0.9884 0.0116 0.0000 1 0 0.9857 0.0142 0.0000
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 249 118 131 45 0 4 0 69 0 0 131 0 0 0.3814 0.0000 0.0000 28.500 0.13 3.03 -2.90 19 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0049 0.2189 0.7762 1 2 0.0059 0.2273 0.7669 1 2 0.0073 0.2391 0.7536
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 337 46 291 0 0 5 0 41 0 0 290 0 1 0.0000 0.0000 0.0034 8.200 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 747 162 585 133 2 22 0 5 31 6 547 0 1 0.8210 0.0530 0.0650 6.619 1.78 10.00 -8.22 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0406 0.9594 0.0000 0 0 0.9730 0.0270 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 619 134 485 68 4 14 2 46 0 0 484 0 1 0.5075 0.0000 0.0021 9.077 1.12 14.50 -13.38 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6937 0.2966 0.0097 1 0 0.6839 0.3047 0.0113 1 0 0.6701 0.3160 0.0139
chr21 44637708 TGTCTGCTGTGTGCCC T 0.168959 0.100 1 -15 2 626 128 498 63 2 10 1 52 0 0 498 0 0 0.4922 0.0000 0.0000 11.700 1.06 12.90 -11.84 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5946 0.3938 0.0116 1 0 0.5935 0.3938 0.0127 1 0 0.5914 0.3943 0.0142
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 391 169 222 1 2 13 2 151 0 0 222 0 0 0.0059 0.0000 0.0000 12.917 0.00 7.74 -7.74 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 517 193 324 89 2 20 0 82 0 1 319 0 4 0.4611 0.0000 0.0154 8.650 0.94 2.78 -1.84 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3197 0.6327 0.0477 1 1 0.3278 0.6211 0.0511 1 1 0.3378 0.6064 0.0558
chr22 18609475 C CGG 0.080580 0.100 1 2 2 1510 135 1375 105 7 5 2 16 1 2 1371 0 1 0.7778 0.0007 0.0029 26.000 0.70 2.00 -1.30 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0155 0.9845 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 217 94 123 48 0 9 1 36 0 0 119 0 4 0.5106 0.0000 0.0325 9.444 0.23 3.00 -2.77 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4771 0.4853 0.0376 1 1 0.4775 0.4827 0.0397 1 1 0.4776 0.4798 0.0427
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 632 113 519 0 0 25 0 88 0 0 502 1 16 0.0000 0.0000 0.0328 3.520 16.10 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr22 27798945 T TTGCTGC 0.004832 0.100 1 6 1 1301 339 962 254 2 68 2 13 0 0 962 0 0 0.7493 0.0000 0.0000 3.956 0.97 3.85 -2.87 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9825 0.0175 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 744 210 534 99 1 2 0 108 0 0 531 0 3 0.4714 0.0000 0.0056 104.000 0.36 3.98 -3.62 65 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0475 0.6676 0.2848 1 1 0.0528 0.6567 0.2905 1 1 0.0602 0.6429 0.2969
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 703 232 471 206 1 6 0 19 0 0 471 0 0 0.8879 0.0000 0.0000 37.667 0.50 2.16 -1.66 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1110 0.8890 0.0000
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 481 245 236 18 0 43 0 184 0 0 231 0 5 0.0735 0.0000 0.0212 4.698 0.83 6.08 -5.24 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9721 0.0279
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 603 150 453 135 2 7 0 6 0 0 453 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 20.429 0.69 15.50 -14.81 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.5544 0.4456 0.0000 0 0 0.9283 0.0717 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 365 147 218 58 0 7 0 82 0 0 213 0 5 0.3946 0.0000 0.0229 23.333 0.36 3.00 -2.64 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0011 0.1359 0.8631 1 2 0.0013 0.1429 0.8558 1 2 0.0018 0.1529 0.8454
chr22 50547883 TAACCCCAGTCCC T 0.185453 0.100 1 -12 3 1007 219 788 187 6 17 0 9 0 1 787 0 0 0.8539 0.0000 0.0013 11.765 1.29 11.44 -10.15 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.8263 0.1737 0.0000 0 0 0.9939 0.0061 0.0000
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.100 1 -48 1 1045 296 749 266 3 15 0 12 2 0 741 0 6 0.8986 0.0027 0.0107 18.733 0.81 9.00 -8.19 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0135 0.9865 0.0000 0 0 0.9497 0.0503 0.0000
670 rows