File Info

Filename
HG01109_x_HG01175_FF_5.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG01109_x_HG01175_FF_5.features.tsv
Size
150.1 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 1 442 160 282 129 12 17 0 2 0 0 282 0 0 0.8063 0.0000 0.0000 8.412 0.22 4.00 -3.78 35 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5707 0.4293 0.0000 0 0 0.8949 0.1051 0.0000 0 0 0.9332 0.0668 0.0000
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 293 140 153 80 0 0 0 60 0 0 152 0 1 0.5714 0.0000 0.0065 140.000 0.41 3.87 -3.45 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4804 0.4462 0.0734 1 0 0.4729 0.4495 0.0777 1 0 0.4627 0.4537 0.0836
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 2 803 254 549 97 2 38 9 108 0 0 542 1 6 0.3819 0.0000 0.0128 5.658 0.31 3.04 -2.73 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0451 0.4111 0.5439 1 2 0.0488 0.4158 0.5353 1 2 0.0542 0.4222 0.5236
chr1 12879725 C CG 0.500000 0.050 1 1 3 634 194 440 91 3 11 0 89 0 0 440 0 0 0.4691 0.0000 0.0000 16.636 1.33 2.31 -0.98 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2795 0.5484 0.1721 1 1 0.2798 0.5448 0.1755 1 1 0.2799 0.5402 0.1799
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.050 1 3 2 951 188 763 96 2 10 1 79 1 0 757 0 5 0.5106 0.0013 0.0079 17.700 0.52 3.15 -2.63 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4022 0.4990 0.0988 1 1 0.3980 0.4988 0.1032 1 1 0.3922 0.4986 0.1092
chr1 15747032 T TG 0.500000 0.050 1 1 3 431 136 295 130 1 1 1 3 0 0 294 0 1 0.9559 0.0000 0.0034 134.000 0.15 5.00 -4.85 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0356 0.9644 0.0000 0 0 0.6115 0.3885 0.0000 0 0 0.8262 0.1738 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 363 62 301 2 0 4 2 54 0 0 301 0 0 0.0323 0.0000 0.0000 14.500 0.00 1.43 -1.43 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8613 0.1387 2 2 0.0000 0.4876 0.5124 2 2 0.0000 0.3543 0.6457
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.050 1 1 3 1958 494 1464 416 1 23 2 52 0 0 1464 0 0 0.8421 0.0000 0.0000 20.478 1.55 1.60 -0.05 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr1 25835277 GTTTCACTGAT G 0.500000 0.050 1 -10 3 755 172 583 162 0 7 0 3 0 0 582 0 1 0.9419 0.0000 0.0017 23.571 0.26 10.33 -10.07 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0792 0.9208 0.0000 0 0 0.7898 0.2102 0.0000 0 0 0.9166 0.0834 0.0000
chr1 26183819 AC A 0.500000 0.050 1 -1 1 396 82 314 61 14 5 0 2 0 0 314 0 0 0.7439 0.0000 0.0000 15.400 0.62 1.00 -0.38 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2100 0.7900 0.0000 0 0 0.6276 0.3724 0.0000 0 0 0.7421 0.2579 0.0000
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.050 1 -24 1 635 156 479 90 0 7 0 59 0 0 464 0 15 0.5769 0.0000 0.0313 21.286 0.39 18.14 -17.75 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4323 0.4789 0.0889 1 1 0.4267 0.4801 0.0932 1 1 0.4192 0.4816 0.0992
chr1 26696516 A AGGCGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 12 1 280 91 189 39 1 21 1 29 0 0 185 0 4 0.4286 0.0000 0.0212 3.286 2.08 7.79 -5.72 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3059 0.5139 0.1803 1 1 0.3042 0.5128 0.1830 1 1 0.3019 0.5115 0.1866
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 1 375 146 229 65 2 9 0 70 0 0 228 0 1 0.4452 0.0000 0.0044 15.222 0.11 3.13 -3.02 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1862 0.5372 0.2766 1 1 0.1890 0.5344 0.2766 1 1 0.1927 0.5309 0.2764
chr1 34761404 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 780 219 561 120 0 2 0 97 0 0 561 0 0 0.5479 0.0000 0.0000 108.500 0.20 2.48 -2.28 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5155 0.4314 0.0531 1 0 0.5077 0.4351 0.0571 1 0 0.4971 0.4401 0.0627
chr1 37612794 T TTGC 0.500000 0.050 1 3 3 336 145 191 67 0 15 1 62 0 0 189 0 2 0.4621 0.0000 0.0105 8.667 0.12 3.11 -2.99 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2538 0.5389 0.2073 1 1 0.2545 0.5360 0.2095 1 1 0.2554 0.5323 0.2123
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 2 383 116 267 40 0 14 0 62 0 0 267 0 0 0.3448 0.0000 0.0000 7.286 0.68 3.39 -2.71 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0605 0.4067 0.5328 1 2 0.0646 0.4124 0.5230 1 2 0.0703 0.4199 0.5098
chr1 44810267 CTTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 690 171 519 100 0 6 0 65 0 0 517 0 2 0.5848 0.0000 0.0039 27.500 0.23 3.06 -2.83 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6587 0.3161 0.0252 1 0 0.6466 0.3253 0.0281 1 0 0.6300 0.3377 0.0323
chr1 46815074 GAT G 0.500000 0.050 1 -2 2 351 87 264 42 0 0 0 45 0 0 261 0 3 0.4828 0.0000 0.0114 87.000 0.26 2.84 -2.58 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1720 0.5166 0.3113 1 1 0.1750 0.5154 0.3096 1 1 0.1790 0.5138 0.3072
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.050 1 6 1 659 171 488 0 0 24 2 145 0 0 488 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.083 5.80 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0260 0.9740 2 2 0.0000 0.0287 0.9713
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 226 82 144 33 1 9 2 37 0 0 144 0 0 0.4024 0.0000 0.0000 8.000 0.52 3.32 -2.81 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1821 0.5141 0.3038 1 1 0.1848 0.5130 0.3022 1 1 0.1883 0.5117 0.3001
chr1 52033398 CGCCCGCCACCTGAGGTCCCGCGATCGG C 0.500000 0.050 1 -27 1 740 242 498 233 0 4 0 5 0 0 497 0 1 0.9628 0.0000 0.0020 59.500 0.17 21.80 -21.63 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0195 0.9805 0.0000 0 0 0.8508 0.1492 0.0000 0 0 0.9663 0.0337 0.0000
chr1 53459700 G GCCGCCC 0.500000 0.050 1 6 2 569 140 429 55 0 24 0 61 0 0 427 0 2 0.3929 0.0000 0.0047 4.833 0.35 5.30 -4.95 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1507 0.5170 0.3323 1 1 0.1543 0.5157 0.3301 1 1 0.1591 0.5140 0.3269
chr1 62209972 ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC A 0.500000 0.050 1 -30 1 574 134 440 70 0 21 0 43 0 0 427 0 13 0.5224 0.0000 0.0295 5.381 0.37 21.51 -21.14 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4136 0.4829 0.1036 1 1 0.4082 0.4839 0.1079 1 1 0.4011 0.4852 0.1137
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.050 1 3 1 170 81 89 41 0 3 0 37 0 0 88 0 1 0.5062 0.0000 0.0112 26.000 0.32 3.89 -3.57 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2745 0.5214 0.2041 1 1 0.2741 0.5198 0.2061 1 1 0.2735 0.5177 0.2088
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.050 1 -9 2 374 144 230 10 0 27 1 106 0 0 228 0 2 0.0694 0.0000 0.0087 4.462 0.00 9.43 -9.43 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9826 0.0174 2 1 0.0000 0.7586 0.2414
chr1 84574341 CAGCAGCGCT C 0.500000 0.050 1 -9 2 374 144 230 24 1 3 1 115 0 0 230 0 0 0.1667 0.0000 0.0000 70.500 1.25 8.87 -7.62 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9201 0.0799 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.050 1 -6 1 470 156 314 71 1 9 0 75 0 0 311 0 3 0.4551 0.0000 0.0096 16.333 0.32 5.75 -5.42 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1655 0.5349 0.2996 1 1 0.1689 0.5323 0.2989 1 1 0.1734 0.5289 0.2977
chr1 100152449 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 124 53 71 30 0 0 0 23 0 0 70 0 1 0.5660 0.0000 0.0141 53.000 0.40 3.65 -3.25 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3184 0.5057 0.1759 1 1 0.3161 0.5052 0.1787 1 1 0.3130 0.5047 0.1823
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 188 83 105 42 0 4 0 37 0 0 102 0 3 0.5060 0.0000 0.0286 19.750 0.12 3.03 -2.91 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2616 0.5238 0.2146 1 1 0.2617 0.5220 0.2163 1 1 0.2617 0.5198 0.2186
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 2 443 108 335 1 0 9 0 98 0 1 328 0 6 0.0093 0.0000 0.0209 11.000 1.00 3.27 -2.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2828 0.7172 2 2 0.0000 0.1363 0.8637 2 2 0.0000 0.1115 0.8885
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.050 1 -24 3 798 179 619 115 2 20 6 36 0 0 610 4 5 0.6425 0.0000 0.0145 7.900 0.29 1.22 -0.94 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9087 0.0898 0.0015 1 0 0.8991 0.0990 0.0019 1 0 0.8850 0.1125 0.0025
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.050 1 -45 4 798 202 596 113 0 19 1 69 0 0 596 0 0 0.5594 0.0000 0.0000 9.632 0.63 2.46 -1.84 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7611 0.2280 0.0109 1 0 0.7482 0.2392 0.0126 1 0 0.7302 0.2545 0.0153
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 206 82 124 74 0 5 0 3 0 0 124 0 0 0.9024 0.0000 0.0000 15.400 1.03 23.33 -22.31 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0459 0.9541 0.0000 0 1 0.4555 0.5445 0.0000 0 0 0.6590 0.3410 0.0000
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.050 1 18 1 1816 478 1338 139 11 166 12 150 13 10 1255 9 51 0.2908 0.0097 0.0620 1.860 2.37 7.21 -4.84 19 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0062 0.2228 0.7710 1 2 0.0074 0.2325 0.7601 1 2 0.0093 0.2461 0.7446
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.050 1 -36 1 1269 267 1002 112 0 47 0 108 1 0 994 0 7 0.4195 0.0010 0.0080 4.681 0.58 4.15 -3.57 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1947 0.5680 0.2373 1 1 0.1978 0.5629 0.2393 1 1 0.2018 0.5565 0.2417
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 290 110 180 7 0 17 9 77 0 0 180 0 0 0.0636 0.0000 0.0000 5.000 2.29 2.05 0.23 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9255 0.0745 2 1 0.0000 0.6325 0.3675
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 281 98 183 47 0 15 0 36 0 0 179 0 4 0.4796 0.0000 0.0219 5.533 0.17 10.61 -10.44 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3253 0.5119 0.1628 1 1 0.3230 0.5110 0.1660 1 1 0.3199 0.5098 0.1703
chr1 152776532 C CCAGCTCTGGGGGCTGCTG 0.500000 0.050 1 18 1 868 301 567 228 0 70 0 3 0 0 565 0 2 0.7575 0.0000 0.0035 3.300 0.22 5.33 -5.11 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0819 0.9181 0.0000 0 0 0.9076 0.0924 0.0000 0 0 0.9736 0.0264 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.050 1 12 1 1215 286 929 0 1 53 7 225 1 0 871 3 54 0.0000 0.0011 0.0624 4.442 10.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.050 1 -9 1 595 258 337 129 1 23 1 104 0 0 337 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 10.174 0.42 7.33 -6.91 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5344 0.4192 0.0464 1 0 0.5263 0.4235 0.0502 1 0 0.5152 0.4292 0.0556
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 1 1464 355 1109 7 4 99 1 244 0 0 1066 2 41 0.0197 0.0000 0.0388 2.586 4.29 7.25 -2.96 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 2 0.0000 0.4699 0.5301 2 2 0.0000 0.0496 0.9504
chr1 154869854 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1365 487 878 428 2 49 0 8 0 0 878 0 0 0.8789 0.0000 0.0000 8.918 0.49 8.75 -8.26 166 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0955 0.9045 0.0000 0 0 0.9948 0.0052 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 235 88 147 41 1 2 0 44 0 0 145 0 2 0.4659 0.0000 0.0136 42.500 1.39 1.30 0.09 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1905 0.5214 0.2880 1 1 0.1930 0.5198 0.2872 1 1 0.1963 0.5178 0.2860
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.050 1 2 4 625 182 443 0 0 3 0 179 0 0 442 1 0 0.0000 0.0000 0.0023 59.667 2.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0107 0.9893 2 2 0.0000 0.0117 0.9883 2 2 0.0000 0.0132 0.9868
chr1 158777364 G GTT 0.500000 0.050 1 2 2 691 137 554 68 0 2 1 66 0 0 549 0 5 0.4964 0.0000 0.0090 67.500 0.16 2.12 -1.96 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1860 0.5378 0.2762 1 1 0.1889 0.5350 0.2762 1 1 0.1926 0.5314 0.2760
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 1274 276 998 136 1 11 1 127 0 0 995 0 3 0.4928 0.0000 0.0030 24.000 0.24 1.60 -1.36 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2836 0.5683 0.1481 1 1 0.2844 0.5632 0.1524 1 1 0.2853 0.5568 0.1579
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.050 1 3 1 150 67 83 61 0 2 0 4 0 0 83 0 0 0.9104 0.0000 0.0000 32.500 0.28 3.00 -2.72 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0067 0.9933 0.0000 0 1 0.2374 0.7626 0.0000 0 1 0.4940 0.5060 0.0000
chr1 182952865 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 591 185 406 158 2 16 0 9 0 0 406 0 0 0.8541 0.0000 0.0000 10.562 0.22 3.00 -2.78 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1125 0.8875 0.0000 0 0 0.6199 0.3801 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.050 1 -12 1 557 285 272 243 1 34 0 7 0 0 272 0 0 0.8526 0.0000 0.0000 7.382 0.61 12.57 -11.96 109 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0051 0.9949 0.0000 0 0 0.7942 0.2058 0.0000 0 0 0.9629 0.0371 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 684 134 550 77 1 6 0 50 0 0 548 0 2 0.5746 0.0000 0.0036 21.333 0.42 9.10 -8.68 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5798 0.3759 0.0443 1 0 0.5690 0.3830 0.0480 1 0 0.5544 0.3923 0.0533
chr1 235213963 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 1 177 54 123 26 1 7 0 20 0 0 123 0 0 0.4815 0.0000 0.0000 6.714 0.08 2.85 -2.77 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3319 0.5001 0.1680 1 1 0.3290 0.5000 0.1709 1 1 0.3251 0.5000 0.1749
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 241 115 126 2 0 4 0 109 0 0 126 0 0 0.0174 0.0000 0.0000 27.750 0.00 1.25 -1.25 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6211 0.3789 2 2 0.0000 0.2061 0.7939 2 2 0.0000 0.1344 0.8656
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 537 115 422 0 1 15 0 99 0 0 418 2 2 0.0000 0.0000 0.0095 6.667 3.41 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2273 0.7727 2 2 0.0000 0.1283 0.8717 2 2 0.0000 0.1080 0.8920
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 530 141 389 133 0 4 0 4 0 0 389 0 0 0.9433 0.0000 0.0000 34.250 0.70 1.50 -0.80 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0410 0.9590 0.0000 0 0 0.6486 0.3514 0.0000 0 0 0.8459 0.1541 0.0000
chr1 247531814 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 2 693 178 515 167 0 7 0 4 0 0 515 0 0 0.9382 0.0000 0.0000 24.429 0.40 3.00 -2.60 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0889 0.9111 0.0000 0 0 0.8095 0.1905 0.0000 0 0 0.9253 0.0747 0.0000
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 676 182 494 89 0 3 1 89 0 0 492 0 2 0.4890 0.0000 0.0040 59.667 1.03 3.15 -2.11 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1911 0.5524 0.2566 1 1 0.1940 0.5484 0.2575 1 1 0.1978 0.5435 0.2587
chr1 247896050 ACTC A 0.500000 0.050 1 -3 2 591 165 426 158 0 2 0 5 0 0 425 0 1 0.9576 0.0000 0.0023 81.500 0.24 3.60 -3.36 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.4724 0.5276 0.0000 0 0 0.8260 0.1740 0.0000
chr1 248294830 TAA T 0.500000 0.050 1 -2 1 1289 318 971 163 0 9 0 146 0 0 963 0 8 0.5126 0.0000 0.0082 34.333 0.23 2.21 -1.98 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3032 0.5723 0.1245 1 1 0.3039 0.5669 0.1292 1 1 0.3046 0.5600 0.1354
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 1118 272 846 256 0 2 0 14 0 0 846 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 135.000 1.73 1.00 0.73 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0461 0.9539 0.0000 0 0 0.7184 0.2816 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.050 1 2 1 893 50 843 1 0 0 2 47 0 0 838 0 5 0.0200 0.0000 0.0059 50.000 0.00 3.45 -3.45 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5658 0.4342 2 2 0.0000 0.3396 0.6604 2 2 0.0000 0.2843 0.7157
chr1 248442053 C CT 0.500000 0.050 1 1 2 1194 256 938 144 1 11 0 100 0 0 938 0 0 0.5625 0.0000 0.0000 22.273 0.50 2.49 -1.99 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7672 0.2238 0.0090 1 0 0.7549 0.2346 0.0105 1 0 0.7377 0.2494 0.0128
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.050 1 -7 1 530 183 347 28 0 10 0 145 0 0 342 0 5 0.1530 0.0000 0.0144 17.300 0.86 6.74 -5.89 18 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011
chr1 248650008 T TA 0.500000 0.050 1 1 2 860 280 580 150 0 6 0 124 0 0 580 0 0 0.5357 0.0000 0.0000 45.667 0.33 5.38 -5.05 94 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5407 0.4180 0.0414 1 0 0.5329 0.4221 0.0450 1 0 0.5222 0.4276 0.0502
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 1082 306 776 293 1 7 0 5 0 0 776 0 0 0.9575 0.0000 0.0000 42.714 0.82 4.20 -3.38 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3179 0.6821 0.0000 0 0 0.9804 0.0196 0.0000 0 0 0.9945 0.0055 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.050 1 -3 1 219 113 106 64 0 8 0 41 0 0 104 0 2 0.5664 0.0000 0.0189 13.125 0.23 3.85 -3.62 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5612 0.3885 0.0503 1 0 0.5523 0.3940 0.0537 1 0 0.5404 0.4013 0.0583
chr2 17781726 CAAGTT C 0.103121 0.050 1 -5 2 553 131 422 130 0 0 0 1 0 0 422 0 0 0.9924 0.0000 0.0000 131.000 0.16 5.00 -4.84 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9782 0.0218 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.050 1 9 5 435 135 300 0 0 23 2 110 0 0 276 0 24 0.0000 0.0000 0.0800 4.826 10.46 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0139 0.9861 2 2 0.0000 0.0149 0.9851 2 2 0.0000 0.0163 0.9837
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.050 1 18 5 435 135 300 5 4 73 2 51 0 0 276 3 21 0.0370 0.0000 0.0800 0.806 11.00 11.53 -0.53 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9772 0.0228 2 1 0.0000 0.8886 0.1114
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.050 1 -9 1 605 211 394 108 0 12 0 91 0 1 391 0 2 0.5118 0.0000 0.0076 16.583 0.39 8.52 -8.13 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5183 0.4344 0.0473 1 0 0.5141 0.4360 0.0499 1 0 0.5083 0.4383 0.0534
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.050 1 9 1 574 122 452 63 0 17 0 42 0 0 442 0 10 0.5164 0.0000 0.0221 6.562 0.41 8.36 -7.94 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5735 0.4137 0.0129 1 0 0.5708 0.4158 0.0133 1 0 0.5672 0.4188 0.0140
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.050 1 3 1 222 52 170 23 0 1 0 28 0 0 169 0 1 0.4423 0.0000 0.0059 51.000 0.13 3.25 -3.12 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1761 0.5050 0.3188 1 1 0.1789 0.5046 0.3165 1 1 0.1825 0.5042 0.3133
chr2 26453335 CAGGCGAGCATGGAGA C 0.500000 0.050 1 -15 1 282 99 183 57 0 4 0 38 0 0 179 0 4 0.5758 0.0000 0.0219 23.750 0.33 14.68 -14.35 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4344 0.4670 0.0986 1 1 0.4280 0.4692 0.1028 1 1 0.4194 0.4720 0.1086
chr2 26470685 C CCTTCTT 0.500000 0.050 1 6 3 510 168 342 71 1 16 1 79 0 0 335 0 7 0.4226 0.0000 0.0205 9.500 0.38 5.71 -5.33 29 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0952 0.4853 0.4195 1 1 0.0995 0.4861 0.4144 1 1 0.1055 0.4871 0.4074
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 1 597 150 447 76 0 17 0 57 0 0 447 0 0 0.5067 0.0000 0.0000 7.824 0.29 3.16 -2.87 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4825 0.4437 0.0737 1 0 0.4748 0.4472 0.0780 1 0 0.4644 0.4517 0.0839
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.050 1 6 1 224 87 137 76 0 9 0 2 0 0 137 0 0 0.8736 0.0000 0.0000 8.667 0.32 6.50 -6.18 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2054 0.7946 0.0000 0 0 0.6315 0.3685 0.0000 0 0 0.7462 0.2538 0.0000
chr2 68538002 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 4 343 103 240 55 0 1 0 47 0 0 240 0 0 0.5340 0.0000 0.0000 102.000 0.22 3.34 -3.12 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3357 0.5121 0.1522 1 1 0.3331 0.5111 0.1557 1 1 0.3297 0.5100 0.1604
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.050 1 -3 1 451 183 268 88 0 18 3 74 0 0 268 0 0 0.4809 0.0000 0.0000 9.000 0.59 3.23 -2.64 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3740 0.5096 0.1164 1 1 0.3706 0.5088 0.1206 1 1 0.3659 0.5077 0.1264
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.050 1 -6 1 603 148 455 1 0 36 2 109 0 0 444 0 11 0.0068 0.0000 0.0242 3.083 4.00 6.24 -2.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1930 0.8070 2 2 0.0000 0.0883 0.9117 2 2 0.0000 0.0727 0.9273
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 487 95 392 6 0 7 0 82 0 0 387 0 5 0.0632 0.0000 0.0128 12.571 0.00 2.85 -2.85 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8655 0.1345 2 1 0.0000 0.5359 0.4641
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.050 1 24 2 1004 228 776 114 1 48 2 63 1 0 738 1 36 0.5000 0.0013 0.0490 3.750 0.32 12.00 -11.68 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3920 0.5105 0.0976 1 1 0.3885 0.5094 0.1021 1 1 0.3837 0.5081 0.1082
chr2 74958681 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 1 294 94 200 49 1 6 2 36 0 0 199 0 1 0.5213 0.0000 0.0050 14.667 0.69 3.56 -2.86 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3815 0.4912 0.1273 1 1 0.3770 0.4918 0.1312 1 1 0.3710 0.4925 0.1365
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 368 141 227 57 1 10 2 71 0 0 225 1 1 0.4043 0.0000 0.0088 13.100 0.68 3.46 -2.78 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0861 0.4631 0.4508 1 1 0.0904 0.4654 0.4442 1 1 0.0963 0.4684 0.4353
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 4 618 154 464 0 0 24 6 124 1 0 458 0 5 0.0000 0.0022 0.0129 5.417 3.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1453 0.8547 2 2 0.0000 0.0652 0.9348 2 2 0.0000 0.0539 0.9461
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -9 2 810 209 601 86 2 14 1 106 0 0 601 0 0 0.4115 0.0000 0.0000 13.929 0.53 8.23 -7.69 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0712 0.4625 0.4663 1 1 0.0755 0.4645 0.4599 1 1 0.0815 0.4673 0.4512
chr2 108259008 AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT A 0.500000 0.050 1 -22 1 613 206 407 202 1 1 0 2 0 0 405 0 2 0.9806 0.0000 0.0049 205.000 0.19 22.00 -21.81 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1944 0.8056 0.0000 0 0 0.9117 0.0883 0.0000 0 0 0.9671 0.0329 0.0000
chr2 110995965 GGTTCTTCAGCGGGGTTTGGTGGCCAGAATTTATTATAAGGTAAAGATACACTGT G 0.500000 0.050 1 -54 3 176 82 94 59 0 2 0 21 0 0 90 0 4 0.7195 0.0000 0.0426 40.000 0.25 20.62 -20.36 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6909 0.2851 0.0240 1 0 0.6774 0.2959 0.0267 1 0 0.6588 0.3104 0.0308
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.050 1 -3 1 112 51 61 33 2 0 0 16 0 0 60 0 1 0.6471 0.0000 0.0164 50.000 0.27 3.12 -2.85 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4840 0.4313 0.0847 1 0 0.4752 0.4358 0.0890 1 0 0.4635 0.4417 0.0948
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.050 1 6 1 540 118 422 0 0 1 1 116 0 0 415 0 7 0.0000 0.0000 0.0166 116.000 6.47 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0424 0.9576 2 2 0.0000 0.0450 0.9550 2 2 0.0000 0.0488 0.9512
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 331 120 211 105 0 10 0 5 0 0 210 0 1 0.8750 0.0000 0.0047 11.000 0.30 5.00 -4.70 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.1982 0.8018 0.0000 0 0 0.5729 0.4271 0.0000
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 174 50 124 17 1 13 7 12 0 0 123 1 0 0.3400 0.0000 0.0081 2.385 0.65 3.75 -3.10 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2381 0.5105 0.2514 1 1 0.2388 0.5097 0.2515 1 1 0.2396 0.5087 0.2517
chr2 165176265 CATT C 0.500000 0.050 1 -3 1 289 115 174 63 0 2 0 50 0 0 174 0 0 0.5478 0.0000 0.0000 56.500 0.08 3.02 -2.94 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4026 0.4861 0.1113 1 1 0.3976 0.4869 0.1155 1 1 0.3908 0.4880 0.1212
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.050 1 6 2 192 66 126 3 0 24 2 37 0 0 120 0 6 0.0455 0.0000 0.0476 1.750 2.00 5.62 -3.62 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9774 0.0226 2 1 0.0000 0.7099 0.2901 2 1 0.0000 0.5093 0.4907
chr2 168247355 G GGCC 0.500000 0.050 1 3 4 194 60 134 28 1 10 1 20 0 0 134 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 5.000 2.36 5.35 -2.99 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3466 0.4962 0.1572 1 1 0.3432 0.4965 0.1604 1 1 0.3385 0.4968 0.1647
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.050 1 -13 3 217 80 137 42 0 13 0 25 0 0 137 0 0 0.5250 0.0000 0.0000 5.154 0.36 10.04 -9.68 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4711 0.4412 0.0877 1 0 0.4629 0.4451 0.0920 1 0 0.4521 0.4501 0.0978
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.050 1 3 4 315 141 174 60 0 4 1 76 0 0 173 0 1 0.4255 0.0000 0.0057 34.250 0.28 2.99 -2.70 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0791 0.4545 0.4664 1 2 0.0834 0.4573 0.4593 1 1 0.0893 0.4610 0.4497
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.050 1 3 2 675 135 540 126 0 2 0 7 0 0 540 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 66.500 0.25 4.71 -4.47 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1726 0.8274 0.0000 0 0 0.6033 0.3967 0.0000
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 293 118 175 19 3 11 77 8 0 0 175 0 0 0.1610 0.0000 0.0000 3.200 1.26 3.38 -2.11 11 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0110 0.2032 0.7858 1 2 0.0127 0.2154 0.7718 1 2 0.0131 0.3460 0.6409
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 293 118 175 96 3 13 3 3 0 0 175 0 0 0.8136 0.0000 0.0000 7.769 2.92 4.33 -1.42 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0550 0.9450 0.0000 0 0 0.5139 0.4861 0.0000 0 0 0.7182 0.2818 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.050 1 3 1 293 122 171 6 3 16 7 90 0 0 171 0 0 0.0492 0.0000 0.0000 6.375 0.67 3.12 -2.46 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9056 0.0944 2 1 0.0000 0.5993 0.4007
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 230 72 158 47 9 13 0 3 0 0 158 0 0 0.6528 0.0000 0.0000 3.846 0.26 1.33 -1.08 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0330 0.9670 0.0000 0 1 0.3483 0.6517 0.0000 0 0 0.5524 0.4476 0.0000
chr2 199819526 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 387 79 308 40 21 13 1 4 0 1 307 0 0 0.5063 0.0000 0.0032 3.615 1.52 2.50 -0.98 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0069 0.9931 0.0000 0 1 0.2102 0.7898 0.0000 0 1 0.4561 0.5439 0.0000
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.050 1 3 1 471 117 354 46 3 32 2 34 1 0 352 0 1 0.3932 0.0028 0.0056 2.656 1.33 4.71 -3.38 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4087 0.4782 0.1131 1 1 0.4031 0.4796 0.1172 1 1 0.3957 0.4815 0.1228
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 202 62 140 31 4 6 3 18 0 0 139 0 1 0.5000 0.0000 0.0071 8.500 0.45 1.67 -1.22 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4149 0.4691 0.1160 1 1 0.4088 0.4712 0.1200 1 1 0.4006 0.4739 0.1255
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.050 1 3 1 270 75 195 71 0 3 0 1 0 0 194 0 1 0.9467 0.0000 0.0051 24.000 0.38 3.00 -2.62 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2006 0.7994 0.0000 0 0 0.6059 0.3941 0.0000 0 0 0.7238 0.2762 0.0000
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 2 536 170 366 0 0 29 0 141 0 0 359 0 7 0.0000 0.0000 0.0191 4.862 7.70 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0254 0.9746 2 2 0.0000 0.0280 0.9720
chr2 229591816 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.050 1 -12 1 472 139 333 81 0 16 0 42 0 0 329 0 4 0.5827 0.0000 0.0120 7.688 0.28 10.83 -10.55 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6919 0.2864 0.0217 1 0 0.6788 0.2968 0.0244 1 0 0.6609 0.3109 0.0283
chr2 231460703 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 1 673 147 526 72 1 9 0 65 0 0 526 0 0 0.4898 0.0000 0.0000 15.333 0.24 3.26 -3.03 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3281 0.5231 0.1488 1 1 0.3262 0.5213 0.1525 1 1 0.3235 0.5191 0.1574
chr2 232847499 TCAGCAGCAGCAGCTGCCACAG T 0.500000 0.050 1 -21 1 333 165 168 130 4 29 0 2 0 0 168 0 0 0.7879 0.0000 0.0000 5.400 3.75 12.50 -8.75 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5408 0.4592 0.0000 0 0 0.8833 0.1167 0.0000 0 0 0.9256 0.0744 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.050 1 -3 2 332 141 191 6 1 1 5 128 0 0 189 0 2 0.0426 0.0000 0.0105 139.000 0.33 4.05 -3.71 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.6950 0.3050 2 2 0.0000 0.2920 0.7080
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 1204 295 909 138 0 1 0 156 0 0 909 0 0 0.4678 0.0000 0.0000 294.000 0.28 1.21 -0.93 56 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0719 0.5016 0.4264 1 1 0.0764 0.5009 0.4228 1 1 0.0825 0.5000 0.4174
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.050 1 -3 1 627 181 446 1 1 32 11 136 0 0 443 0 3 0.0055 0.0000 0.0067 4.594 0.00 3.36 -3.36 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1118 0.8882 2 2 0.0000 0.0490 0.9510 2 2 0.0000 0.0405 0.9595
chr2 240757423 ATCCTCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 628 185 443 3 8 158 1 15 0 0 443 0 0 0.0162 0.0000 0.0000 0.139 1.33 5.53 -4.20 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2203 0.5064 0.2734 1 1 0.2215 0.5059 0.2726 1 1 0.2231 0.5053 0.2716
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.050 1 3 1 614 169 445 0 0 1 0 168 0 0 441 0 4 0.0000 0.0000 0.0090 168.000 3.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr3 9835187 AGG A 0.001553 0.050 1 -2 2 717 185 532 93 0 1 14 77 0 0 531 0 1 0.5027 0.0000 0.0019 184.000 1.00 7.34 -6.34 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4617 0.5377 0.0006 1 1 0.4652 0.5342 0.0006 1 1 0.4695 0.5298 0.0006
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.050 1 12 2 672 169 503 81 0 16 0 72 1 0 483 2 17 0.4793 0.0020 0.0398 9.562 1.06 11.19 -10.13 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2548 0.6030 0.1421 1 1 0.2612 0.5980 0.1408 1 1 0.2696 0.5915 0.1389
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 15 1 763 260 503 2 7 42 6 203 0 1 456 0 46 0.0077 0.0000 0.0934 5.450 7.00 9.89 -2.89 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.5576 0.4424 2 2 0.0000 0.0808 0.9192
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.050 1 3 1 641 214 427 4 0 45 4 161 0 0 416 0 11 0.0187 0.0000 0.0258 3.756 0.00 3.88 -3.88 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8907 0.1093 2 2 0.0000 0.1587 0.8413 2 2 0.0000 0.0612 0.9388
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.050 1 6 1 641 214 427 4 0 131 4 75 0 0 417 0 10 0.0187 0.0000 0.0234 0.636 0.00 4.93 -4.93 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9848 0.0152 2 1 0.0000 0.5898 0.4102 2 2 0.0000 0.3197 0.6803
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.050 1 -2 5 714 236 478 0 0 15 1 220 0 0 476 0 2 0.0000 0.0000 0.0042 14.667 2.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr3 46373452 TACAGTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAG T 0.500000 0.050 1 -32 1 866 250 616 234 0 9 0 7 0 0 616 0 0 0.9360 0.0000 0.0000 26.778 0.48 14.14 -13.66 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0039 0.9961 0.0000 0 0 0.7496 0.2504 0.0000 0 0 0.9529 0.0471 0.0000
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 345 131 214 0 0 3 1 127 0 0 210 0 4 0.0000 0.0000 0.0187 42.667 4.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0348 0.9652 2 2 0.0000 0.0371 0.9629 2 2 0.0000 0.0405 0.9595
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 635 177 458 5 0 24 23 125 0 0 455 0 3 0.0282 0.0000 0.0066 6.375 0.80 3.42 -2.62 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9874 0.0126 2 2 0.0000 0.4050 0.5950 2 2 0.0000 0.1467 0.8533
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.050 1 -3 3 369 101 268 2 0 17 40 42 0 0 265 3 0 0.0198 0.0000 0.0112 4.941 0.00 3.95 -3.95 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7561 0.2439 2 2 0.0000 0.3200 0.6800 2 2 0.0000 0.2163 0.7837
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.050 1 -6 3 369 101 268 6 0 53 2 40 0 0 264 0 4 0.0594 0.0000 0.0149 0.904 0.17 5.78 -5.61 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9546 0.0454 2 1 0.0000 0.7846 0.2154
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.050 1 6 1 499 164 335 76 0 32 0 56 0 0 332 0 3 0.4634 0.0000 0.0090 4.125 0.24 5.30 -5.07 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4537 0.4618 0.0845 1 1 0.4471 0.4641 0.0888 1 1 0.4380 0.4672 0.0948
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.050 1 10 2 196 111 85 46 1 15 1 48 0 0 85 0 0 0.4144 0.0000 0.0000 6.333 0.65 7.67 -7.01 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2106 0.5277 0.2617 1 1 0.2125 0.5256 0.2619 1 1 0.2150 0.5230 0.2620
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 247 91 156 0 0 3 0 88 0 0 149 0 7 0.0000 0.0000 0.0449 29.333 3.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0839 0.9161 2 2 0.0000 0.0876 0.9124 2 2 0.0000 0.0930 0.9070
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.050 1 3 1 322 133 189 65 4 11 0 53 0 0 186 0 3 0.4887 0.0000 0.0159 12.200 0.22 3.04 -2.82 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3943 0.4925 0.1133 1 1 0.3897 0.4928 0.1175 1 1 0.3835 0.4934 0.1231
chr3 98087454 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 588 155 433 145 0 5 0 5 0 0 433 0 0 0.9355 0.0000 0.0000 30.000 0.26 3.00 -2.74 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0110 0.9890 0.0000 0 0 0.5592 0.4408 0.0000 0 0 0.8344 0.1656 0.0000
chr3 98087856 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 550 128 422 118 0 8 0 2 0 0 422 0 0 0.9219 0.0000 0.0000 15.000 0.25 2.50 -2.25 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4430 0.5570 0.0000 0 0 0.8297 0.1703 0.0000 0 0 0.8897 0.1103 0.0000
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.050 1 -9 3 732 168 564 80 0 13 0 75 0 0 550 0 14 0.4762 0.0000 0.0248 11.923 0.35 9.47 -9.12 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1375 0.5276 0.3349 1 1 0.1415 0.5255 0.3330 1 1 0.1469 0.5228 0.3303
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 486 150 336 76 1 6 0 67 0 0 336 0 0 0.5067 0.0000 0.0000 24.000 0.24 1.37 -1.14 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3515 0.5155 0.1331 1 1 0.3487 0.5142 0.1371 1 1 0.3449 0.5127 0.1424
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 303 96 207 2 0 3 2 89 0 0 207 0 0 0.0208 0.0000 0.0000 30.667 0.50 1.26 -0.76 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7153 0.2847 2 2 0.0000 0.2867 0.7133 2 2 0.0000 0.1923 0.8077
chr3 98901248 AGGCGGGGGCGGCGGCCGCGGCCCGGACTT A 0.500000 0.050 1 -29 3 216 108 108 102 0 4 0 2 0 0 108 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 26.000 0.32 14.50 -14.18 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3322 0.6678 0.0000 0 0 0.7649 0.2351 0.0000 0 0 0.8458 0.1542 0.0000
chr3 107772911 TAGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 650 164 486 153 2 4 0 5 0 0 486 0 0 0.9329 0.0000 0.0000 39.750 0.35 3.00 -2.65 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0138 0.9862 0.0000 0 0 0.6171 0.3829 0.0000 0 0 0.8643 0.1357 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 109 41 68 4 0 2 1 34 0 0 66 0 2 0.0976 0.0000 0.0294 19.500 0.00 1.26 -1.26 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.8503 0.1497 2 1 0.0000 0.6443 0.3556
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 420 122 298 118 0 0 0 4 0 0 298 0 0 0.9672 0.0000 0.0000 122.000 0.34 1.25 -0.91 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0280 0.9720 0.0000 0 0 0.5599 0.4401 0.0000 0 0 0.7929 0.2071 0.0000
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1241 335 906 1 1 94 30 209 0 0 904 0 2 0.0030 0.0000 0.0022 2.543 0.00 3.03 -3.03 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0124 0.9876 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0047 0.9953
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -6 1 1245 340 905 13 12 276 3 36 0 0 904 0 1 0.0382 0.0000 0.0011 0.195 0.46 6.00 -5.54 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1386 0.4890 0.3725 1 1 0.1423 0.4897 0.3680 1 1 0.1472 0.4907 0.3621
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1248 343 905 221 15 72 25 10 0 0 905 0 0 0.6443 0.0000 0.0000 3.814 2.52 6.70 -4.18 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.050 1 12 1 504 150 354 119 2 25 0 4 1 0 353 0 0 0.7933 0.0028 0.0028 5.000 0.26 9.25 -8.99 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0304 0.9696 0.0000 0 0 0.5833 0.4167 0.0000 0 0 0.8080 0.1920 0.0000
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.050 1 18 2 795 165 630 55 2 39 0 69 0 0 630 0 0 0.3333 0.0000 0.0000 3.205 0.53 7.88 -7.36 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1161 0.4953 0.3886 1 1 0.1203 0.4955 0.3843 1 1 0.1259 0.4957 0.3784
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.050 1 -4 1 346 113 233 61 0 1 1 50 0 0 230 0 3 0.5398 0.0000 0.0129 112.000 0.52 4.06 -3.54 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3188 0.5207 0.1605 1 1 0.3170 0.5191 0.1639 1 1 0.3145 0.5171 0.1683
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 319 106 213 7 0 5 0 94 0 0 210 0 3 0.0660 0.0000 0.0141 20.200 0.14 1.30 -1.16 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9062 0.0938 2 1 0.0000 0.5674 0.4326
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 414 157 257 65 0 21 4 67 0 0 256 0 1 0.4140 0.0000 0.0039 6.476 0.26 3.09 -2.83 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1578 0.5271 0.3151 1 1 0.1613 0.5251 0.3136 1 1 0.1659 0.5225 0.3116
chr3 184321978 AAGGAGAAGC A 0.500000 0.050 1 -9 1 712 160 552 68 0 19 1 72 0 0 549 0 3 0.4250 0.0000 0.0054 7.421 0.81 8.28 -7.47 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1482 0.5249 0.3269 1 1 0.1520 0.5230 0.3250 1 1 0.1569 0.5206 0.3225
chr3 184353343 C CCGG 0.500000 0.050 1 3 1 717 183 534 98 2 10 0 73 0 0 532 0 2 0.5355 0.0000 0.0037 17.300 0.16 3.77 -3.60 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5542 0.3989 0.0468 1 0 0.5448 0.4046 0.0506 1 0 0.5319 0.4121 0.0560
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.050 1 3 1 567 131 436 59 1 21 0 50 0 0 434 0 2 0.4504 0.0000 0.0046 5.238 0.36 2.86 -2.50 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3336 0.5151 0.1513 1 1 0.3312 0.5140 0.1548 1 1 0.3279 0.5125 0.1596
chr3 186677158 GATC G 0.500000 0.050 1 -3 1 596 154 442 135 0 15 0 4 0 0 442 0 0 0.8766 0.0000 0.0000 9.267 0.28 3.75 -3.47 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0418 0.9582 0.0000 0 0 0.6588 0.3412 0.0000 0 0 0.8519 0.1481 0.0000
chr3 193364172 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 242 119 123 115 0 2 0 2 0 0 123 0 0 0.9664 0.0000 0.0000 58.500 0.64 1.50 -0.86 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4130 0.5870 0.0000 0 0 0.8180 0.1820 0.0000 0 0 0.8823 0.1177 0.0000
chr3 195751094 GGCCGGTGCT G 0.500000 0.050 1 -9 1 270 86 184 58 0 2 0 26 0 0 182 0 2 0.6744 0.0000 0.0109 42.000 0.76 8.08 -7.32 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6428 0.3241 0.0331 1 0 0.6300 0.3336 0.0364 1 0 0.6126 0.3463 0.0411
chr3 195778895 TGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAGTGTC T 0.500000 0.050 1 -48 1 2580 903 1677 417 24 350 15 97 9 6 1514 14 134 0.4618 0.0054 0.0972 1.577 3.05 3.25 -0.20 75 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr3 195779135 TGGTGACAGGAAGAGGCGTGGTGTCACCTGTGGATACTGAGGAAAGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCCTGACCTGTGGATGCAGAGGAAGTGTC T 0.500000 0.050 1 -96 1 3365 1017 2348 556 18 284 14 145 10 3 2296 4 35 0.5467 0.0043 0.0221 2.548 2.67 4.01 -1.34 48 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 195788495 CGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGGGCT C 0.500000 0.050 1 -48 1 2518 584 1934 284 13 95 11 181 25 32 1831 4 42 0.4863 0.0129 0.0533 5.084 1.12 5.08 -3.97 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9851 0.0149 0.0000 1 0 0.9825 0.0175 0.0000 1 0 0.9783 0.0216 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.050 1 15 1 843 203 640 186 0 12 0 5 0 0 639 0 1 0.9163 0.0000 0.0016 15.917 0.40 9.00 -8.60 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 0 0.6410 0.3590 0.0000 0 0 0.9028 0.0972 0.0000
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -6 1 239 104 135 39 0 20 1 44 0 0 133 1 1 0.3750 0.0000 0.0148 4.200 0.49 9.16 -8.67 17 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1553 0.5079 0.3368 1 1 0.1587 0.5073 0.3341 1 1 0.1632 0.5065 0.3303
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -9 1 239 104 135 43 2 14 4 41 0 0 133 0 2 0.4135 0.0000 0.0148 6.429 0.58 9.24 -8.66 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2133 0.5268 0.2599 1 1 0.2151 0.5248 0.2601 1 1 0.2174 0.5223 0.2603
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.050 1 21 1 542 140 402 86 0 0 0 54 0 0 371 3 28 0.6143 0.0000 0.0771 140.000 0.44 17.19 -16.74 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1107 0.5612 0.3281 1 1 0.1113 0.5570 0.3317 1 1 0.1120 0.5516 0.3363
chr4 3074923 AGC A 0.021170 0.050 1 -2 1 661 257 404 71 17 24 142 3 1 2 400 1 0 0.2763 0.0025 0.0099 16.538 7.89 9.00 -1.11 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0686 0.8112 0.1202 1 1 0.0761 0.8113 0.1126 1 1 0.0870 0.8100 0.1030
chr4 3074926 AG A 0.010091 0.050 1 -1 1 661 257 404 69 19 154 15 0 1 1 400 2 0 0.2685 0.0025 0.0099 4.286 8.68 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8099 0.1898 0.0003 1 0 0.8018 0.1978 0.0004 1 0 0.7907 0.2088 0.0004
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.050 1 -6 2 486 140 346 136 2 0 0 2 0 0 346 0 0 0.9714 0.0000 0.0000 138.000 0.20 6.00 -5.80 82 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9491 0.0509 0.0000 0 0 0.9917 0.0083 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 2 701 201 500 101 1 25 1 73 2 0 488 1 9 0.5025 0.0040 0.0240 7.040 0.76 7.88 -7.11 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4814 0.4517 0.0670 1 0 0.4744 0.4544 0.0712 1 0 0.4649 0.4581 0.0771
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 693 217 476 108 1 35 4 69 1 0 469 0 6 0.4977 0.0021 0.0147 5.143 1.06 7.23 -6.17 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6401 0.3326 0.0273 1 0 0.6286 0.3411 0.0303 1 0 0.6128 0.3525 0.0346
chr4 15511381 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 4 317 132 185 64 2 10 0 56 0 0 185 0 0 0.4848 0.0000 0.0000 12.200 0.34 3.18 -2.83 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3580 0.5081 0.1339 1 1 0.3548 0.5074 0.1378 1 1 0.3504 0.5066 0.1430
chr4 49032652 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 268 135 133 62 0 4 0 69 0 0 133 0 0 0.4593 0.0000 0.0000 32.750 0.23 1.17 -0.95 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1583 0.5253 0.3164 1 1 0.1618 0.5234 0.3148 1 1 0.1664 0.5210 0.3126
chr4 56931051 GGAGCTGTCTCCTCCCATGGAGGTGGTCCAGAAGGAGCCTGTTCAGATA G 0.500000 0.050 1 -48 1 948 297 651 220 5 70 1 1 0 0 651 0 0 0.7407 0.0000 0.0000 3.243 0.40 5.00 -4.60 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9785 0.0215 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000 0 0 0.9925 0.0075 0.0000
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 3 405 111 294 61 0 6 0 44 0 9 283 0 2 0.5495 0.0000 0.0374 17.500 0.56 4.00 -3.44 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5553 0.3922 0.0525 1 0 0.5450 0.3986 0.0564 1 0 0.5311 0.4070 0.0619
chr4 87615164 TAGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 3616 827 2789 722 17 71 6 11 8 24 2747 6 4 0.8730 0.0029 0.0151 10.985 1.96 7.27 -5.32 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.050 1 9 1 3933 814 3119 6 12 43 24 729 61 48 2818 145 47 0.0074 0.0196 0.0965 19.000 4.17 9.34 -5.18 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 4023 899 3124 385 19 143 12 340 30 80 2772 91 151 0.4283 0.0096 0.1127 5.282 4.80 11.61 -6.81 55 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0003 0.1199 0.8798 1 2 0.0004 0.1258 0.8738 1 2 0.0006 0.1346 0.8648
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 3536 1103 2433 379 42 167 55 460 351 38 2020 9 15 0.3436 0.1443 0.1697 5.436 2.90 7.78 -4.88 17 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 88697681 TCCTCTGCCGCTG T 0.500000 0.050 1 -12 2 589 154 435 75 2 6 0 71 0 0 425 0 10 0.4870 0.0000 0.0230 24.667 1.23 9.25 -8.03 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1817 0.5427 0.2756 1 1 0.1847 0.5395 0.2758 1 1 0.1887 0.5354 0.2758
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.050 1 -3 1 155 68 87 34 0 4 0 30 0 0 87 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 16.000 0.15 3.07 -2.92 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2900 0.5147 0.1953 1 1 0.2889 0.5136 0.1975 1 1 0.2874 0.5122 0.2004
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 692 158 534 0 0 4 0 154 0 1 532 0 1 0.0000 0.0000 0.0037 38.500 3.87 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0223 0.9777 2 2 0.0000 0.0237 0.9763 2 2 0.0000 0.0260 0.9740
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 4 508 196 312 1 0 32 7 156 0 0 307 1 4 0.0051 0.0000 0.0160 5.125 0.00 2.94 -2.94 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0692 0.9308 2 2 0.0000 0.0299 0.9701 2 2 0.0000 0.0251 0.9749
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 475 182 293 9 3 50 7 113 0 1 286 4 2 0.0495 0.0000 0.0239 2.540 1.11 3.74 -2.63 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9929 0.0071 2 1 0.0000 0.8173 0.1827
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.050 1 5 2 275 125 150 54 0 5 1 65 0 0 146 0 4 0.4320 0.0000 0.0267 24.000 0.04 4.69 -4.66 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0909 0.4667 0.4423 1 1 0.0953 0.4688 0.4359 1 1 0.1012 0.4715 0.4273
chr4 154239272 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 225 90 135 57 0 1 1 31 0 0 134 0 1 0.6333 0.0000 0.0074 89.000 0.11 2.16 -2.06 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5635 0.3840 0.0525 1 0 0.5526 0.3909 0.0564 1 0 0.5380 0.4000 0.0620
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 244 103 141 0 0 22 1 80 0 0 136 0 5 0.0000 0.0000 0.0355 3.682 4.86 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1030 0.8970 2 2 0.0000 0.1071 0.8929 2 2 0.0000 0.1129 0.8871
chr4 164957227 GTCCAACAGCGGTCGC G 0.500000 0.050 1 -15 1 537 123 414 55 1 2 0 65 0 0 409 0 5 0.4472 0.0000 0.0121 60.500 0.15 13.83 -13.69 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1036 0.4828 0.4136 1 1 0.1078 0.4839 0.4083 1 1 0.1137 0.4852 0.4011
chr4 176184858 TTCTC T 0.500000 0.050 1 -4 3 147 71 76 64 0 1 0 6 0 0 76 0 0 0.9014 0.0000 0.0000 70.000 0.08 5.00 -4.92 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0810 0.9190 0.0000 0 1 0.3328 0.6672 0.0000
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 2 840 176 664 170 2 2 0 2 0 0 664 0 0 0.9659 0.0000 0.0000 87.000 0.32 3.00 -2.68 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7429 0.2571 0.0000 0 0 0.9480 0.0520 0.0000 0 0 0.9670 0.0330 0.0000
chr4 184691712 G GGTAA 0.500000 0.050 1 4 1 268 78 190 38 0 4 0 36 0 0 187 0 3 0.4872 0.0000 0.0158 18.500 0.16 3.83 -3.68 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2266 0.5232 0.2502 1 1 0.2279 0.5214 0.2506 1 1 0.2296 0.5192 0.2512
chr4 184694537 ACAGATGAAG A 0.500000 0.050 1 -9 2 273 84 189 42 0 6 0 36 0 0 186 0 3 0.5000 0.0000 0.0159 13.000 0.26 9.67 -9.40 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2742 0.5220 0.2038 1 1 0.2738 0.5203 0.2059 1 1 0.2732 0.5182 0.2085
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 764 167 597 1 0 19 6 141 0 0 593 0 4 0.0060 0.0000 0.0067 7.789 0.00 3.36 -3.36 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1028 0.8972 2 2 0.0000 0.0450 0.9550 2 2 0.0000 0.0375 0.9625
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 2 380 139 241 70 5 15 4 45 0 0 232 1 8 0.5036 0.0000 0.0373 8.200 1.73 3.29 -1.56 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4534 0.4616 0.0850 1 1 0.4467 0.4640 0.0893 1 1 0.4376 0.4671 0.0953
chr5 61332713 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 1 395 71 324 24 1 24 1 21 0 1 319 2 2 0.3380 0.0000 0.0154 1.958 3.83 6.10 -2.26 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2428 0.5158 0.2414 1 1 0.2434 0.5146 0.2420 1 1 0.2441 0.5131 0.2428
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.050 1 -15 4 359 52 307 0 0 29 2 21 0 1 303 1 2 0.0000 0.0000 0.0130 0.821 5.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5053 0.4947 2 2 0.0000 0.4491 0.5509 2 2 0.0000 0.4183 0.5817
chr5 66596939 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 386 109 277 99 0 8 0 2 1 0 276 0 0 0.9083 0.0036 0.0036 14.429 1.52 3.00 -1.48 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3159 0.6841 0.0000 0 0 0.7516 0.2484 0.0000 0 0 0.8365 0.1635 0.0000
chr5 73447067 G GGCGGCC 0.500000 0.050 1 6 1 431 96 335 44 1 15 3 33 0 0 335 0 0 0.4583 0.0000 0.0000 5.714 2.25 4.73 -2.48 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3511 0.5016 0.1473 1 1 0.3477 0.5014 0.1509 1 1 0.3432 0.5012 0.1556
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.050 1 -6 1 396 118 278 4 0 3 0 111 0 0 274 0 4 0.0339 0.0000 0.0144 38.333 0.25 5.64 -5.39 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9743 0.0257 2 2 0.0000 0.4589 0.5411 2 2 0.0000 0.2192 0.7808
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 3 532 146 386 64 0 2 0 80 0 0 384 0 2 0.4384 0.0000 0.0052 72.000 0.25 2.94 -2.69 18 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0784 0.4565 0.4650 1 1 0.0827 0.4592 0.4581 1 1 0.0887 0.4626 0.4487
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.050 1 -18 1 378 99 279 2 0 7 1 89 0 0 266 0 13 0.0202 0.0000 0.0466 13.143 2.00 17.96 -15.96 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6622 0.3378 2 2 0.0000 0.2307 0.7693 2 2 0.0000 0.1511 0.8489
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.050 1 -9 1 367 74 293 1 0 0 1 72 0 0 284 1 8 0.0135 0.0000 0.0307 73.000 4.00 23.58 -19.58 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3946 0.6054 2 2 0.0000 0.2056 0.7944 2 2 0.0000 0.1692 0.8308
chr5 93740585 TGAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 353 85 268 35 0 2 0 48 0 0 267 0 1 0.4118 0.0000 0.0037 41.500 0.80 3.17 -2.37 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1062 0.4701 0.4238 1 1 0.1103 0.4720 0.4176 1 1 0.1160 0.4746 0.4094
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 264 107 157 101 1 0 0 5 0 0 157 0 0 0.9439 0.0000 0.0000 107.000 0.23 3.00 -2.77 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 1 0.3049 0.6951 0.0000 0 0 0.6426 0.3574 0.0000
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 249 113 136 8 1 18 2 84 0 0 136 0 0 0.0708 0.0000 0.0000 5.278 1.88 4.85 -2.97 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9735 0.0265 2 1 0.0000 0.7635 0.2365
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 999 253 746 113 1 22 0 117 2 1 739 0 4 0.4466 0.0027 0.0094 10.500 0.57 3.67 -3.10 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1737 0.5673 0.2590 1 1 0.1773 0.5623 0.2604 1 1 0.1821 0.5559 0.2620
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.050 1 6 3 501 129 372 65 0 22 0 42 0 0 368 0 4 0.5039 0.0000 0.0108 4.864 0.46 5.57 -5.11 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4883 0.4371 0.0746 1 0 0.4801 0.4411 0.0788 1 0 0.4691 0.4462 0.0847
chr5 135936684 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 371 121 250 60 0 1 0 60 0 0 247 0 3 0.4959 0.0000 0.0120 120.000 0.25 1.18 -0.93 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1984 0.5348 0.2669 1 1 0.2008 0.5321 0.2671 1 1 0.2039 0.5288 0.2672
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.050 1 2 1 206 86 120 51 0 1 2 32 0 0 115 0 5 0.5930 0.0000 0.0417 85.000 0.76 3.88 -3.11 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3940 0.4858 0.1202 1 1 0.3890 0.4867 0.1242 1 1 0.3824 0.4879 0.1297
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 206 87 119 51 1 4 2 29 0 0 114 1 4 0.5862 0.0000 0.0420 20.500 0.76 4.24 -3.48 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4479 0.4577 0.0944 1 1 0.4408 0.4605 0.0987 1 1 0.4314 0.4641 0.1045
chr5 140801607 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 755 152 603 85 0 1 0 66 0 0 603 0 0 0.5592 0.0000 0.0000 151.000 0.25 1.26 -1.01 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4778 0.4492 0.0730 1 0 0.4704 0.4523 0.0773 1 0 0.4605 0.4563 0.0832
chr5 141573996 T TGGA 0.500000 0.050 1 3 2 626 167 459 111 12 42 0 2 0 0 459 0 0 0.6647 0.0000 0.0000 2.976 0.77 4.00 -3.23 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4596 0.5404 0.0000 0 0 0.8459 0.1541 0.0000 0 0 0.9012 0.0988 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 9 1 412 118 294 98 0 12 0 8 1 0 292 0 1 0.8305 0.0034 0.0068 8.833 0.23 7.62 -7.39 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0278 0.9722 0.0000 0 1 0.2756 0.7244 0.0000
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 12 1 418 160 258 56 1 37 1 65 0 0 251 1 6 0.3500 0.0000 0.0271 3.324 1.00 9.23 -8.23 0 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0897 0.4672 0.4432 1 1 0.0940 0.4692 0.4368 1 1 0.0999 0.4719 0.4282
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 15 1 418 160 258 56 2 36 1 65 0 0 251 1 6 0.3500 0.0000 0.0271 3.444 1.00 9.23 -8.23 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0963 0.4761 0.4276 1 1 0.1006 0.4776 0.4218 1 1 0.1065 0.4795 0.4140
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 662 150 512 0 0 3 0 147 0 0 511 0 1 0.0000 0.0000 0.0020 49.000 1.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0253 0.9747 2 2 0.0000 0.0280 0.9720
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 352 146 206 76 0 5 0 65 0 0 205 0 1 0.5205 0.0000 0.0049 28.200 3.46 4.86 -1.40 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3542 0.5140 0.1318 1 1 0.3514 0.5128 0.1358 1 1 0.3474 0.5114 0.1412
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.050 1 -15 1 354 135 219 47 2 18 5 63 0 0 219 0 0 0.3481 0.0000 0.0000 6.500 3.91 11.75 -7.83 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0755 0.4406 0.4839 1 2 0.0797 0.4444 0.4759 1 2 0.0856 0.4492 0.4652
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.050 1 3 1 353 119 234 0 44 9 1 65 0 0 233 0 1 0.0000 0.0000 0.0043 12.222 4.78 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0558 0.3992 0.5449 1 2 0.0598 0.4053 0.5349 1 2 0.0655 0.4132 0.5213
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 178 65 113 33 0 6 0 26 0 0 113 0 0 0.5077 0.0000 0.0000 9.833 0.15 3.31 -3.16 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3310 0.5033 0.1657 1 1 0.3282 0.5031 0.1687 1 1 0.3245 0.5027 0.1728
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 446 193 253 135 16 40 0 2 1 1 251 0 0 0.6995 0.0040 0.0079 3.923 0.86 3.50 -2.64 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6462 0.3538 0.0000 0 0 0.9207 0.0793 0.0000 0 0 0.9497 0.0503 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 670 115 555 44 1 14 0 56 0 0 553 0 2 0.3826 0.0000 0.0036 7.214 0.30 3.43 -3.13 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1120 0.4830 0.4050 1 1 0.1161 0.4841 0.3998 1 1 0.1218 0.4855 0.3927
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.050 1 3 5 489 126 363 6 0 16 0 104 0 0 359 0 4 0.0476 0.0000 0.0110 6.875 0.33 3.42 -3.09 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.7855 0.2145 2 2 0.0000 0.4002 0.5998
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.050 1 3 1 588 146 442 52 3 28 4 59 1 0 430 3 8 0.3562 0.0023 0.0271 4.500 2.00 3.81 -1.81 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1680 0.5894 0.2425 1 1 0.1754 0.5879 0.2367 1 1 0.1853 0.5856 0.2290
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.050 1 3 1 536 119 417 55 1 12 2 49 1 2 409 2 3 0.4622 0.0024 0.0192 8.917 1.33 4.06 -2.73 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4030 0.5098 0.0872 1 1 0.4033 0.5082 0.0884 1 1 0.4037 0.5063 0.0900
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.050 1 3 2 1548 371 1177 118 25 117 47 64 0 1 1160 0 16 0.3181 0.0000 0.0144 2.275 4.39 5.27 -0.88 14 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5759 0.4010 0.0231 1 0 0.5726 0.4028 0.0247 1 0 0.5677 0.4055 0.0268
chr6 22570091 G GGCGGAGAGGGCGGCGGAA 0.000638 0.050 1 18 1 704 181 523 65 1 51 0 64 0 0 523 0 0 0.3591 0.0000 0.0000 2.549 2.42 8.91 -6.49 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4850 0.5148 0.0003 1 1 0.4870 0.5127 0.0003 1 1 0.4895 0.5102 0.0003
chr6 22570117 G GGGC 0.051576 0.050 1 3 1 689 166 523 22 2 44 42 56 0 0 522 0 1 0.1325 0.0000 0.0019 2.905 0.77 3.02 -2.25 8 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0073 0.3601 0.6326 2 1 0.0002 0.9873 0.0125 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 414 113 301 57 0 5 0 51 0 0 301 0 0 0.5044 0.0000 0.0000 21.600 0.19 1.53 -1.34 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3078 0.5221 0.1701 1 1 0.3064 0.5204 0.1732 1 1 0.3044 0.5183 0.1773
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 545 144 401 78 0 9 1 56 0 0 401 0 0 0.5417 0.0000 0.0000 15.000 0.54 2.36 -1.82 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5123 0.4244 0.0633 1 0 0.5036 0.4290 0.0674 1 0 0.4919 0.4349 0.0732
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 11 1 630 188 442 98 1 4 0 85 0 0 440 0 2 0.5213 0.0000 0.0045 61.333 1.27 9.46 -8.19 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3733 0.5143 0.1124 1 1 0.3702 0.5130 0.1168 1 1 0.3659 0.5115 0.1226
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.050 1 -12 1 540 181 359 106 0 10 0 65 0 0 349 0 10 0.5856 0.0000 0.0279 17.100 0.28 11.95 -11.67 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6307 0.3398 0.0294 1 0 0.6193 0.3481 0.0325 1 0 0.6038 0.3592 0.0370
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 482 120 362 62 0 8 1 49 0 0 362 0 0 0.5167 0.0000 0.0000 13.875 0.71 3.88 -3.17 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3917 0.4911 0.1172 1 1 0.3870 0.4916 0.1213 1 1 0.3808 0.4923 0.1269
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.050 1 2 2 229 116 113 68 1 0 1 46 0 0 113 0 0 0.5862 0.0000 0.0000 115.000 6.07 9.15 -3.08 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5253 0.4134 0.0613 1 0 0.5159 0.4186 0.0654 1 0 0.5033 0.4255 0.0712
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.050 1 18 1 414 95 319 57 0 10 0 28 0 0 307 0 12 0.6000 0.0000 0.0376 8.500 0.58 13.86 -13.28 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4635 0.4502 0.0863 1 0 0.4560 0.4534 0.0905 1 1 0.4460 0.4576 0.0964
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.050 1 1 2 619 193 426 5 0 103 4 81 0 0 424 0 2 0.0259 0.0000 0.0047 0.874 0.60 1.75 -1.15 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9958 0.0042 2 1 0.0000 0.6944 0.3056 2 2 0.0000 0.3617 0.6383
chr6 40379369 C CT 0.500000 0.050 1 1 7 619 202 417 12 79 1 3 107 0 0 417 0 0 0.0594 0.0000 0.0000 125.000 0.33 1.41 -1.08 6 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0155 0.2597 0.7248 1 2 0.0176 0.2705 0.7119 1 2 0.0209 0.2851 0.6940
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 943 235 708 1 8 8 2 216 0 0 704 0 4 0.0043 0.0000 0.0056 28.375 1.00 3.18 -2.18 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9750 0.0250 2 2 0.0000 0.3487 0.6513 2 2 0.0000 0.0841 0.9159
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 318 116 202 93 0 16 0 7 0 0 201 0 1 0.8017 0.0000 0.0050 6.250 0.27 6.14 -5.87 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0453 0.9547 0.0000 0 1 0.3223 0.6777 0.0000
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 801 170 631 137 5 24 0 4 0 0 631 0 0 0.8059 0.0000 0.0000 6.000 0.55 3.50 -2.95 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0471 0.9529 0.0000 0 0 0.6850 0.3150 0.0000 0 0 0.8661 0.1339 0.0000
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 15 2 692 189 503 46 6 82 0 55 0 0 484 0 19 0.2434 0.0000 0.0378 1.293 15.67 6.85 8.82 10 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0599 0.4138 0.5263 1 2 0.0640 0.4190 0.5170 1 2 0.0697 0.4258 0.5045
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.050 1 -15 2 698 220 478 101 1 57 0 61 0 0 473 0 5 0.4591 0.0000 0.0105 2.860 4.01 13.15 -9.14 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6932 0.2871 0.0197 1 0 0.6806 0.2972 0.0222 1 0 0.6632 0.3109 0.0259
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 692 143 549 58 5 36 1 43 0 1 541 2 5 0.4056 0.0000 0.0146 2.972 1.43 4.58 -3.15 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4035 0.4860 0.1105 1 1 0.3985 0.4868 0.1147 1 1 0.3917 0.4879 0.1204
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.050 1 -6 1 1199 311 888 226 2 11 2 70 1 2 881 1 3 0.7267 0.0011 0.0079 27.091 1.74 6.06 -4.32 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9987 0.0013 0.0000 1 0 0.9983 0.0017 0.0000 1 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 2 135 53 82 27 2 3 3 18 0 0 82 0 0 0.5094 0.0000 0.0000 16.667 0.48 2.94 -2.46 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3471 0.4960 0.1570 1 1 0.3436 0.4962 0.1602 1 1 0.3389 0.4966 0.1645
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.050 1 3 2 806 179 627 1 0 6 2 170 0 0 623 0 4 0.0056 0.0000 0.0064 28.833 0.00 3.14 -3.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0576 0.9424 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0209 0.9791
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.050 1 2 1 653 150 503 80 0 4 0 66 0 0 499 0 4 0.5333 0.0000 0.0080 48.667 0.39 6.47 -6.08 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3590 0.5137 0.1273 1 1 0.3560 0.5126 0.1314 1 1 0.3519 0.5112 0.1369
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 400 130 270 72 0 2 0 56 0 0 269 1 0 0.5538 0.0000 0.0037 64.000 0.15 1.34 -1.19 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4304 0.4742 0.0954 1 1 0.4244 0.4758 0.0997 1 1 0.4165 0.4779 0.1056
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 2 954 231 723 102 0 11 0 118 0 0 720 0 3 0.4416 0.0000 0.0041 20.000 0.25 3.14 -2.89 4 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0701 0.4709 0.4590 1 1 0.0744 0.4724 0.4533 1 1 0.0804 0.4743 0.4453
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.050 1 -4 3 207 89 118 45 1 1 0 42 0 0 116 0 2 0.5056 0.0000 0.0169 88.000 0.22 3.86 -3.63 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2602 0.5262 0.2136 1 1 0.2603 0.5243 0.2154 1 1 0.2605 0.5218 0.2177
chr6 156778268 C CCAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 890 226 664 86 1 59 2 78 0 2 652 1 9 0.3805 0.0000 0.0181 2.814 1.17 5.21 -4.03 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2080 0.5536 0.2384 1 1 0.2105 0.5495 0.2400 1 1 0.2136 0.5445 0.2419
chr6 156778982 A AGGC 0.500000 0.050 1 3 2 480 168 312 69 2 35 4 58 0 0 310 0 2 0.4107 0.0000 0.0064 3.771 2.52 4.09 -1.56 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3029 0.5301 0.1670 1 1 0.3019 0.5278 0.1703 1 1 0.3004 0.5249 0.1747
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.050 1 -18 1 621 243 378 122 0 28 1 92 0 0 366 0 12 0.5021 0.0000 0.0317 7.679 0.36 15.77 -15.41 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4301 0.4898 0.0801 1 1 0.4255 0.4900 0.0845 1 1 0.4189 0.4905 0.0906
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.050 1 -3 5 417 147 270 76 1 5 0 65 0 0 270 0 0 0.5170 0.0000 0.0000 28.400 0.26 4.97 -4.71 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3814 0.5019 0.1167 1 1 0.3775 0.5016 0.1209 1 1 0.3722 0.5013 0.1266
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.050 1 -8 2 230 73 157 2 0 5 0 66 0 0 155 0 2 0.0274 0.0000 0.0127 13.600 0.00 8.12 -8.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8255 0.1745 2 2 0.0000 0.4155 0.5845 2 2 0.0000 0.2918 0.7082
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 328 130 198 0 0 18 8 104 0 0 197 0 1 0.0000 0.0000 0.0051 6.222 3.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0550 0.9450 2 2 0.0000 0.0581 0.9419 2 2 0.0000 0.0625 0.9375
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 795 255 540 6 5 14 109 121 0 0 540 0 0 0.0235 0.0000 0.0000 15.500 3.67 9.84 -6.18 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.6865 0.3135 2 2 0.0000 0.1692 0.8308
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 2 271 85 186 50 28 5 1 1 0 0 186 0 0 0.5882 0.0000 0.0000 16.000 1.02 6.00 -4.98 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4405 0.5595 0.0000 0 0 0.7042 0.2958 0.0000 0 0 0.7736 0.2264 0.0000
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.050 1 4 1 281 113 168 47 0 19 1 46 0 0 168 0 0 0.4159 0.0000 0.0000 4.947 0.53 4.22 -3.69 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2357 0.5287 0.2356 1 1 0.2368 0.5265 0.2367 1 1 0.2382 0.5238 0.2380
chr7 5313034 T TGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 1 755 89 666 57 3 24 3 2 0 0 666 0 0 0.6404 0.0000 0.0000 2.696 1.77 11.50 -9.73 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0726 0.9274 0.0000 0 1 0.3923 0.6077 0.0000 0 0 0.5662 0.4338 0.0000
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 673 226 447 184 2 24 0 16 0 0 447 0 0 0.8142 0.0000 0.0000 8.417 0.38 2.94 -2.56 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.1841 0.8159 0.0000
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.050 1 3 2 450 121 329 62 1 3 0 55 0 0 328 0 1 0.5124 0.0000 0.0030 39.000 0.18 3.27 -3.10 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3162 0.5224 0.1614 1 1 0.3145 0.5207 0.1648 1 1 0.3122 0.5185 0.1693
chr7 20785321 AGCC A 0.500000 0.050 1 -3 2 459 97 362 77 3 15 0 2 0 2 360 0 0 0.7938 0.0000 0.0055 7.455 1.48 2.00 -0.52 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2362 0.7638 0.0000 0 0 0.6692 0.3308 0.0000 0 0 0.7754 0.2246 0.0000
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 364 106 258 99 1 2 0 4 0 0 258 0 0 0.9340 0.0000 0.0000 52.000 0.12 3.00 -2.88 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0178 0.9822 0.0000 0 1 0.4489 0.5511 0.0000 0 0 0.7131 0.2869 0.0000
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.050 1 1 3 134 46 88 40 0 2 2 2 0 0 88 0 0 0.8696 0.0000 0.0000 22.000 0.97 1.00 -0.03 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0700 0.9300 0.0000 0 1 0.3367 0.6633 0.0000 0 1 0.4861 0.5139 0.0000
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 529 130 399 73 0 1 0 56 0 1 398 0 0 0.5615 0.0000 0.0025 129.000 0.36 1.05 -0.70 41 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4690 0.4518 0.0792 1 0 0.4617 0.4548 0.0835 1 1 0.4519 0.4587 0.0894
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 205 60 145 36 0 0 0 24 0 0 145 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 60.000 0.06 2.92 -2.86 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4009 0.4767 0.1224 1 1 0.3954 0.4783 0.1263 1 1 0.3880 0.4804 0.1317
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 242 104 138 56 0 2 0 46 0 1 137 0 0 0.5385 0.0000 0.0072 51.000 0.14 3.00 -2.86 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3734 0.4976 0.1290 1 1 0.3693 0.4977 0.1330 1 1 0.3639 0.4978 0.1383
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 592 143 449 2 2 67 0 72 1 1 446 1 0 0.0140 0.0022 0.0067 1.134 0.00 5.03 -5.03 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.8674 0.1326 2 1 0.0000 0.6220 0.3780
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.050 1 2 1 588 139 449 2 62 6 0 69 2 2 443 1 1 0.0144 0.0045 0.0134 12.167 0.00 5.16 -5.16 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0376 0.3441 0.6183 1 2 0.0411 0.3528 0.6061 1 2 0.0461 0.3643 0.5896
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 293 131 162 71 0 1 0 59 0 0 162 0 0 0.5420 0.0000 0.0000 130.000 2.54 1.64 0.89 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3845 0.4981 0.1174 1 1 0.3804 0.4981 0.1216 1 1 0.3747 0.4981 0.1272
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 5 882 223 659 0 0 21 3 199 0 0 652 0 7 0.0000 0.0000 0.0106 9.619 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0066 0.9934
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.050 1 3 2 618 178 440 149 1 22 0 6 0 0 439 1 0 0.8371 0.0000 0.0023 7.091 0.49 3.00 -2.51 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.2834 0.7166 0.0000 0 0 0.7331 0.2669 0.0000
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.050 1 3 1 260 93 167 46 0 4 0 43 0 0 166 0 1 0.4946 0.0000 0.0060 22.250 0.50 3.33 -2.83 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2602 0.5262 0.2135 1 1 0.2604 0.5243 0.2153 1 1 0.2606 0.5218 0.2176
chr7 99836454 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 156 69 87 37 1 0 0 31 0 0 87 0 0 0.5362 0.0000 0.0000 69.000 0.24 1.19 -0.95 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3289 0.5064 0.1647 1 1 0.3263 0.5059 0.1678 1 1 0.3228 0.5053 0.1719
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.050 1 -4 1 658 210 448 119 0 6 0 85 0 0 447 0 1 0.5667 0.0000 0.0022 34.000 0.29 4.14 -3.85 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6490 0.3262 0.0248 1 0 0.6375 0.3348 0.0277 1 0 0.6218 0.3464 0.0318
chr7 100755390 TACA T 0.500000 0.050 1 -3 1 284 94 190 84 0 8 0 2 0 0 190 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 10.750 0.24 3.00 -2.76 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2403 0.7597 0.0000 0 0 0.6761 0.3239 0.0000 0 0 0.7808 0.2192 0.0000
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.050 1 -35 1 113 26 87 5 0 0 0 21 0 0 82 0 5 0.1923 0.0000 0.0575 26.000 0.00 26.90 -26.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0110 0.9012 0.0879 2 1 0.0020 0.9219 0.0761 2 1 0.0005 0.7724 0.2271
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 597 162 435 84 0 7 0 71 0 0 434 0 1 0.5185 0.0000 0.0023 22.143 0.63 3.17 -2.54 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3785 0.5060 0.1155 1 1 0.3748 0.5054 0.1198 1 1 0.3698 0.5047 0.1255
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 375 107 268 75 2 24 0 6 0 0 268 0 0 0.7009 0.0000 0.0000 3.375 0.84 4.83 -3.99 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1073 0.8927 0.0000 0 1 0.4027 0.5973 0.0000
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 701 230 471 192 0 34 0 4 0 0 471 0 0 0.8348 0.0000 0.0000 5.765 0.45 5.00 -4.55 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1563 0.8437 0.0000 0 0 0.8885 0.1115 0.0000 0 0 0.9580 0.0420 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.050 1 -30 3 759 255 504 226 1 24 0 4 0 0 504 0 0 0.8863 0.0000 0.0000 9.583 0.35 8.75 -8.40 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3080 0.6920 0.0000 0 0 0.9494 0.0506 0.0000 0 0 0.9813 0.0187 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.050 1 -6 1 373 188 185 93 1 20 0 74 0 0 180 0 5 0.4947 0.0000 0.0270 8.400 0.51 6.88 -6.37 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4160 0.4896 0.0944 1 1 0.4111 0.4901 0.0988 1 1 0.4045 0.4907 0.1048
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 242 71 171 36 0 0 0 35 0 0 169 0 2 0.5070 0.0000 0.0117 71.000 0.06 3.06 -3.00 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2272 0.5220 0.2508 1 1 0.2284 0.5203 0.2512 1 1 0.2300 0.5182 0.2517
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 3 986 249 737 2 0 36 13 198 0 0 730 0 7 0.0080 0.0000 0.0095 5.917 0.00 3.17 -3.17 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0974 0.9026 2 2 0.0000 0.0173 0.9827 2 2 0.0000 0.0112 0.9888
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 1508 357 1151 2 0 14 0 341 0 0 1151 0 0 0.0056 0.0000 0.0000 28.583 0.00 1.69 -1.69 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 695 149 546 73 0 6 0 70 0 0 543 0 3 0.4899 0.0000 0.0055 23.833 0.99 4.23 -3.24 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2278 0.5445 0.2278 1 1 0.2294 0.5411 0.2294 1 1 0.2315 0.5369 0.2315
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 855 186 669 0 0 2 0 184 0 0 665 1 3 0.0000 0.0000 0.0060 92.000 1.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0088 0.9912 2 2 0.0000 0.0096 0.9904 2 2 0.0000 0.0109 0.9891
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 492 89 403 0 0 1 17 71 0 3 366 10 24 0.0000 0.0000 0.0918 88.000 7.39 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1789 0.8211 2 2 0.0000 0.0980 0.9020 2 2 0.0000 0.0806 0.9194
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 497 89 408 0 0 3 14 72 0 0 369 9 30 0.0000 0.0000 0.0956 82.000 7.24 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0385 0.9615 2 2 0.0000 0.0410 0.9590 2 2 0.0000 0.0447 0.9553
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 507 88 419 0 0 5 5 78 0 0 332 36 51 0.0000 0.0000 0.2076 27.333 7.72 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0148 0.9852 2 2 0.0000 0.0161 0.9839 2 2 0.0000 0.0180 0.9820
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.050 1 -1 3 585 181 404 83 1 1 0 96 0 0 404 0 0 0.4586 0.0000 0.0000 180.000 1.08 1.61 -0.53 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1126 0.5121 0.3754 1 1 0.1169 0.5110 0.3721 1 1 0.1228 0.5097 0.3676
chr8 544658 GGGCGGC G 0.425210 0.050 1 -6 1 221 106 115 52 0 11 0 43 0 0 110 0 5 0.4906 0.0000 0.0435 8.636 0.46 6.88 -6.42 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3214 0.5185 0.1601 1 1 0.3209 0.5168 0.1623 1 1 0.3201 0.5147 0.1652
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.050 1 -6 2 818 209 609 8 1 26 0 174 0 0 602 0 7 0.0383 0.0000 0.0115 7.038 0.25 5.89 -5.64 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7937 0.2063 2 2 0.0000 0.2360 0.7640
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.050 1 -6 2 831 179 652 86 0 31 0 62 0 0 643 0 9 0.4804 0.0000 0.0138 4.774 0.60 6.18 -5.57 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4347 0.4765 0.0887 1 1 0.4296 0.4776 0.0928 1 1 0.4226 0.4790 0.0985
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.050 1 -3 1 267 96 171 57 1 1 0 37 0 0 171 0 0 0.5938 0.0000 0.0000 95.000 0.28 3.05 -2.77 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5452 0.3978 0.0570 1 0 0.5359 0.4034 0.0607 1 0 0.5234 0.4107 0.0659
chr8 10608493 GCTGGGCCTCCCCTTCAGCCTC G 0.100122 0.050 1 -21 2 874 214 660 112 2 31 1 68 11 4 578 10 57 0.5234 0.0167 0.1242 5.871 0.79 16.13 -15.34 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2955 0.6390 0.0654 1 1 0.3032 0.6314 0.0654 1 1 0.3131 0.6216 0.0652
chr8 10610119 T TTTC 0.070211 0.050 1 3 1 1029 269 760 102 4 7 53 103 0 1 735 14 10 0.3792 0.0000 0.0329 30.857 3.12 5.82 -2.70 32 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0132 0.4551 0.5316 1 2 0.0161 0.4774 0.5065 1 1 0.0206 0.5066 0.4728
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.050 1 -6 1 616 250 366 0 0 38 0 212 0 0 366 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.579 5.71 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.050 1 -6 2 373 138 235 81 0 3 0 54 0 0 234 0 1 0.5870 0.0000 0.0043 45.000 0.06 7.50 -7.44 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7023 0.2845 0.0132 1 0 0.6939 0.2917 0.0144 1 0 0.6823 0.3015 0.0162
chr8 27536817 A AGTC 0.053422 0.050 1 3 1 110 51 59 18 0 1 0 32 0 0 56 0 3 0.3529 0.0000 0.0508 50.000 0.06 3.34 -3.29 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2554 0.6672 0.0774 1 1 0.2631 0.6621 0.0748 1 1 0.2734 0.6553 0.0713
chr8 30744269 CG C 0.004713 0.050 1 -1 3 329 109 220 106 0 2 0 1 0 0 220 0 0 0.9725 0.0000 0.0000 53.500 0.66 1.00 -0.34 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr8 38268064 CAACCAGGCCTGGGCACA C 0.000108 0.050 1 -17 2 368 97 271 56 0 5 0 36 0 0 269 0 2 0.5773 0.0000 0.0074 18.400 0.20 10.08 -9.89 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6846 0.3154 0.0000 1 0 0.6790 0.3210 0.0000 1 0 0.6715 0.3285 0.0000
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.050 1 -3 3 649 234 415 112 0 4 0 118 0 0 412 0 3 0.4786 0.0000 0.0072 57.500 0.29 3.39 -3.10 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1710 0.5729 0.2561 1 1 0.1764 0.5684 0.2552 1 1 0.1835 0.5628 0.2538
chr8 56441740 CTTCATGAAGCCTCCATACCTT C 0.000737 0.050 1 -21 4 504 133 371 65 0 13 0 55 0 0 358 0 13 0.4887 0.0000 0.0350 9.231 0.55 16.25 -15.70 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4226 0.5770 0.0004 1 1 0.4270 0.5726 0.0004 1 1 0.4326 0.5670 0.0004
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.050 1 -2 2 227 101 126 95 0 3 0 3 0 0 126 0 0 0.9406 0.0000 0.0000 32.667 0.38 2.33 -1.95 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0755 0.9245 0.0000 0 0 0.5841 0.4159 0.0000 0 0 0.7618 0.2382 0.0000
chr8 64581060 T TGGC 0.106611 0.050 1 3 1 590 169 421 146 6 15 0 2 3 2 415 1 0 0.8639 0.0071 0.0143 10.267 1.58 8.50 -6.92 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9156 0.0844 0.0000 0 0 0.9869 0.0131 0.0000 0 0 0.9925 0.0075 0.0000
chr8 64581450 T TAGCGGC 0.096175 0.050 1 6 2 610 175 435 151 2 18 0 4 0 0 435 0 0 0.8629 0.0000 0.0000 8.611 1.15 6.50 -5.35 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3905 0.6095 0.0000 0 0 0.9657 0.0343 0.0000 0 0 0.9881 0.0119 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.050 1 -27 4 686 218 468 31 6 17 1 163 0 0 468 0 0 0.1422 0.0000 0.0000 14.357 2.45 18.40 -15.95 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9317 0.0683 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr8 141449677 C CA 0.500000 0.050 1 1 2 315 133 182 124 0 5 0 4 0 0 182 0 0 0.9323 0.0000 0.0000 25.600 1.01 4.00 -2.99 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0329 0.9671 0.0000 0 0 0.5965 0.4035 0.0000 0 0 0.8157 0.1843 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 462 139 323 50 2 20 3 64 1 0 322 0 0 0.3597 0.0031 0.0031 6.263 2.14 4.98 -2.84 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1061 0.4834 0.4105 1 1 0.1104 0.4844 0.4052 1 1 0.1162 0.4857 0.3981
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 418 112 306 63 0 4 1 44 0 0 303 0 3 0.5625 0.0000 0.0098 27.000 3.00 3.66 -0.66 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4320 0.4704 0.0977 1 1 0.4258 0.4723 0.1019 1 1 0.4175 0.4747 0.1078
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.050 1 15 1 1058 241 817 100 0 31 0 110 0 0 807 0 10 0.4149 0.0000 0.0122 6.774 0.81 10.59 -9.78 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0655 0.4610 0.4735 1 2 0.0698 0.4630 0.4672 1 1 0.0757 0.4657 0.4586
chr9 116848 T TA 0.003653 0.050 1 1 1 680 191 489 175 1 9 0 6 0 0 489 0 0 0.9162 0.0000 0.0000 20.222 1.29 2.00 -0.71 107 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6047 0.3953 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr9 117363 T TC 0.002993 0.050 1 1 1 940 202 738 178 12 6 3 3 0 0 738 0 0 0.8812 0.0000 0.0000 37.600 0.84 4.00 -3.16 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9842 0.0158 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.050 1 -3 2 1073 356 717 241 21 76 1 17 0 0 717 0 0 0.6770 0.0000 0.0000 3.684 1.41 3.12 -1.71 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0347 0.9653 0.0000 0 0 0.8294 0.1706 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 2 353 97 256 37 0 16 0 44 0 0 248 0 8 0.3814 0.0000 0.0312 5.062 0.46 7.20 -6.75 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0991 0.4640 0.4369 1 1 0.1034 0.4664 0.4303 1 1 0.1091 0.4694 0.4214
chr9 33264401 ACTC A 0.500000 0.050 1 -3 2 457 124 333 66 1 4 0 53 0 0 329 0 4 0.5323 0.0000 0.0120 30.000 0.44 3.15 -2.71 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3578 0.5087 0.1336 1 1 0.3546 0.5080 0.1375 1 1 0.3502 0.5071 0.1428
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.050 1 -1 3 623 162 461 92 0 2 1 67 0 0 461 0 0 0.5679 0.0000 0.0000 80.000 0.30 1.90 -1.59 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5448 0.4044 0.0508 1 0 0.5354 0.4099 0.0547 1 0 0.5227 0.4172 0.0602
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.050 1 -12 1 806 213 593 94 0 28 0 91 0 0 582 0 11 0.4413 0.0000 0.0185 6.607 0.50 10.92 -10.42 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1433 0.5407 0.3160 1 1 0.1473 0.5376 0.3151 1 1 0.1526 0.5337 0.3137
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 417 73 344 34 0 0 0 39 0 0 344 0 0 0.4658 0.0000 0.0000 73.000 0.35 1.03 -0.67 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1839 0.5147 0.3014 1 1 0.1865 0.5136 0.2999 1 1 0.1899 0.5122 0.2979
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.050 1 -15 3 441 144 297 72 0 3 1 68 0 0 289 0 8 0.5000 0.0000 0.0269 47.000 0.28 13.28 -13.00 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1751 0.5379 0.2870 1 1 0.1783 0.5350 0.2867 1 1 0.1824 0.5314 0.2861
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.050 1 12 1 708 146 562 71 0 15 1 59 0 0 552 0 10 0.4863 0.0000 0.0178 8.733 0.46 11.19 -10.72 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2400 0.5427 0.2174 1 1 0.2412 0.5394 0.2193 1 1 0.2428 0.5354 0.2218
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 535 148 387 82 1 3 0 62 0 0 386 0 1 0.5541 0.0000 0.0026 48.333 0.34 3.44 -3.09 50 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4960 0.4367 0.0673 1 0 0.4880 0.4405 0.0715 1 0 0.4771 0.4455 0.0774
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 1 233 89 144 41 0 1 0 47 0 0 140 0 4 0.4607 0.0000 0.0278 88.000 0.07 3.57 -3.50 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1359 0.4987 0.3654 1 1 0.1397 0.4987 0.3615 1 1 0.1448 0.4988 0.3564
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.050 1 3 2 354 123 231 5 53 23 1 41 0 1 229 0 1 0.0407 0.0000 0.0087 4.348 0.00 2.85 -2.85 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4535 0.4568 0.0897 1 1 0.4464 0.4596 0.0940 1 1 0.4369 0.4632 0.0999
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.050 1 -3 2 354 126 228 39 8 23 4 52 0 0 227 0 1 0.3095 0.0000 0.0044 4.478 2.33 3.15 -0.82 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1348 0.5022 0.3631 1 1 0.1386 0.5019 0.3595 1 1 0.1438 0.5016 0.3546
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.050 1 15 4 478 178 300 0 0 5 0 173 0 0 300 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 34.600 9.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0127 0.9873 2 2 0.0000 0.0138 0.9862 2 2 0.0000 0.0156 0.9844
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 571 212 359 0 0 0 0 212 0 0 354 0 5 0.0000 0.0000 0.0139 212.000 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0042 0.9958 2 2 0.0000 0.0047 0.9953 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 2 384 108 276 2 0 20 0 86 0 0 276 0 0 0.0185 0.0000 0.0000 4.400 0.00 5.20 -5.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7490 0.2510 2 2 0.0000 0.3116 0.6884 2 2 0.0000 0.2099 0.7901
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 948 147 801 0 1 38 3 105 0 3 783 2 13 0.0000 0.0000 0.0225 2.789 5.83 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0657 0.9343 2 2 0.0000 0.0665 0.9335 2 2 0.0000 0.0685 0.9315
chr9 103005600 TAAGAAGGATGCA T 0.500000 0.050 1 -12 1 561 149 412 74 1 18 0 56 0 0 412 0 0 0.4966 0.0000 0.0000 7.278 0.96 8.66 -7.70 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4830 0.4432 0.0738 1 0 0.4752 0.4467 0.0781 1 0 0.4648 0.4512 0.0840
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 574 149 425 94 0 0 0 55 0 0 425 0 0 0.6309 0.0000 0.0000 149.000 0.22 2.55 -2.32 70 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7299 0.2547 0.0154 1 0 0.7167 0.2657 0.0176 1 0 0.6985 0.2806 0.0208
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.050 1 -4 1 878 201 677 115 0 2 0 84 0 0 675 0 2 0.5721 0.0000 0.0030 99.500 0.11 4.69 -4.58 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6001 0.3658 0.0341 1 0 0.5897 0.3729 0.0374 1 0 0.5755 0.3823 0.0422
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 820 185 635 103 0 3 2 77 0 0 634 0 1 0.5568 0.0000 0.0016 60.333 0.19 2.90 -2.70 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5288 0.4182 0.0529 1 0 0.5202 0.4229 0.0569 1 0 0.5085 0.4290 0.0625
chr9 110138061 G GGAAGCT 0.500000 0.050 1 6 1 694 135 559 62 0 19 0 54 0 0 550 0 9 0.4593 0.0000 0.0161 6.105 0.45 5.15 -4.70 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2197 0.5378 0.2425 1 1 0.2215 0.5350 0.2436 1 1 0.2238 0.5314 0.2449
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.050 1 -4 1 270 114 156 0 0 2 0 112 0 0 155 0 1 0.0000 0.0000 0.0064 56.000 3.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0550 0.9450 2 2 0.0000 0.0581 0.9419 2 2 0.0000 0.0625 0.9375
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 484 105 379 49 1 7 1 47 0 0 378 0 1 0.4667 0.0000 0.0026 14.000 0.47 5.64 -5.17 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2478 0.5298 0.2224 1 1 0.2485 0.5276 0.2240 1 1 0.2493 0.5247 0.2259
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 534 149 385 77 0 17 3 52 0 0 383 0 2 0.5168 0.0000 0.0052 7.765 0.47 1.19 -0.72 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5033 0.4302 0.0664 1 0 0.4949 0.4345 0.0706 1 0 0.4835 0.4400 0.0765
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 541 185 356 8 0 11 4 162 0 1 352 0 3 0.0432 0.0000 0.0112 15.818 0.50 3.46 -2.96 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7823 0.2177 2 2 0.0000 0.2717 0.7283
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 571 182 389 4 1 1 0 176 0 0 380 0 9 0.0220 0.0000 0.0231 180.000 0.00 3.20 -3.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8817 0.1183 2 2 0.0000 0.1451 0.8549 2 2 0.0000 0.0547 0.9453
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 538 145 393 66 0 11 0 68 0 0 385 0 8 0.4552 0.0000 0.0204 12.182 0.41 7.62 -7.21 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1318 0.5140 0.3542 1 1 0.1358 0.5128 0.3514 1 1 0.1412 0.5114 0.3474
chr9 130668313 G GGT 0.500000 0.050 1 2 1 294 104 190 54 1 14 0 35 0 0 190 0 0 0.5192 0.0000 0.0000 6.429 0.13 2.46 -2.33 6 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5076 0.4220 0.0704 1 0 0.4985 0.4269 0.0746 1 0 0.4863 0.4333 0.0804
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 1 423 122 301 49 5 27 2 39 0 0 300 1 0 0.4016 0.0000 0.0033 3.519 1.18 4.18 -3.00 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3932 0.4873 0.1195 1 1 0.3884 0.4881 0.1236 1 1 0.3818 0.4891 0.1290
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 288 122 166 2 0 0 1 119 0 0 163 0 3 0.0164 0.0000 0.0181 122.000 0.00 1.66 -1.66 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5398 0.4602 2 2 0.0000 0.1547 0.8453 2 2 0.0000 0.0994 0.9006
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 288 122 166 2 0 0 1 119 0 0 163 0 3 0.0164 0.0000 0.0181 122.000 0.00 1.66 -1.66 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5398 0.4602 2 2 0.0000 0.1547 0.8453 2 2 0.0000 0.0994 0.9006
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 324 136 188 70 0 3 0 63 0 0 186 1 1 0.5147 0.0000 0.0106 44.333 0.39 1.97 -1.58 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2897 0.5336 0.1767 1 1 0.2892 0.5311 0.1798 1 1 0.2884 0.5279 0.1838
chr9 136383542 C CGCTGCT 0.500000 0.050 1 6 1 678 190 488 73 4 43 1 69 0 0 483 0 5 0.3842 0.0000 0.0102 3.395 3.04 5.91 -2.87 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2502 0.5449 0.2049 1 1 0.2512 0.5415 0.2073 1 1 0.2524 0.5373 0.2104
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 1 678 198 480 94 4 31 3 66 0 1 479 0 0 0.4747 0.0000 0.0021 5.387 4.31 3.26 1.05 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6197 0.3479 0.0324 1 0 0.6084 0.3559 0.0356 1 0 0.5930 0.3667 0.0403
chr9 136984956 C CGGCCCCTCCCTGCCCCTCT 0.500000 0.050 1 19 3 436 108 328 52 0 19 1 36 0 0 321 0 7 0.4815 0.0000 0.0213 4.684 0.38 10.25 -9.87 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3370 0.5102 0.1527 1 1 0.3343 0.5094 0.1562 1 1 0.3307 0.5084 0.1609
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 241 103 138 8 1 18 1 75 0 0 138 0 0 0.0777 0.0000 0.0000 4.722 0.00 3.13 -3.13 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9839 0.0161 2 1 0.0000 0.8199 0.1801
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.050 1 -9 1 849 197 652 118 0 4 0 75 0 0 644 0 8 0.5990 0.0000 0.0123 48.250 0.35 8.71 -8.36 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8071 0.1917 0.0012 1 0 0.7994 0.1992 0.0014 1 0 0.7887 0.2096 0.0016
chr10 19352230 GC G 0.000697 0.050 1 -1 1 139 58 81 35 0 0 0 23 0 0 81 0 0 0.6034 0.0000 0.0000 58.000 1.14 2.35 -1.20 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6275 0.3724 0.0001 1 0 0.6234 0.3765 0.0001 1 0 0.6179 0.3820 0.0001
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.050 1 6 6 925 217 708 91 0 25 2 99 0 0 697 0 11 0.4194 0.0000 0.0155 7.640 0.64 5.51 -4.87 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0652 0.4539 0.4809 1 2 0.0695 0.4567 0.4738 1 2 0.0756 0.4604 0.4640
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.050 1 3 1 666 177 489 92 0 5 0 80 0 0 488 0 1 0.5198 0.0000 0.0020 34.400 0.46 4.09 -3.63 0 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4792 0.4641 0.0566 1 0 0.4770 0.4643 0.0588 1 0 0.4737 0.4646 0.0617
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.050 1 1 1 552 156 396 71 0 13 0 72 0 0 396 0 0 0.4551 0.0000 0.0000 11.000 0.37 1.33 -0.97 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2885 0.5472 0.1644 1 1 0.2910 0.5438 0.1652 1 1 0.2943 0.5395 0.1662
chr10 50008914 CAA C 0.245598 0.050 1 -2 1 981 246 735 236 2 3 0 5 0 0 735 0 0 0.9593 0.0000 0.0000 81.000 0.27 2.40 -2.13 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2597 0.7403 0.0000 0 0 0.9747 0.0253 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.050 1 -6 3 132 64 68 42 0 1 0 21 0 1 67 0 0 0.6562 0.0000 0.0147 63.000 1.36 7.05 -5.69 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6893 0.2965 0.0141 1 0 0.6811 0.3037 0.0152 1 0 0.6700 0.3134 0.0167
chr10 63208190 ACTAAAC A 0.035276 0.050 1 -6 1 862 205 657 191 0 6 0 8 1 0 655 0 1 0.9317 0.0015 0.0030 33.167 0.34 6.25 -5.91 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.8842 0.1158 0.0000 0 0 0.9897 0.0103 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.050 1 -3 1 432 113 319 43 0 29 4 37 0 0 319 0 0 0.3805 0.0000 0.0000 2.897 0.40 3.05 -2.66 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4244 0.5083 0.0673 1 1 0.4251 0.5070 0.0679 1 1 0.4258 0.5055 0.0687
chr10 77637505 A AGAG 0.003648 0.050 1 3 2 974 261 713 200 10 46 0 5 0 2 711 0 0 0.7663 0.0000 0.0028 4.674 0.78 3.60 -2.82 74 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9477 0.0523 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.050 1 6 1 674 152 522 81 0 8 0 63 0 0 517 0 5 0.5329 0.0000 0.0096 18.000 0.46 6.06 -5.61 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5149 0.4363 0.0489 1 0 0.5111 0.4379 0.0510 1 0 0.5060 0.4402 0.0539
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.050 1 6 1 702 241 461 113 0 28 0 100 0 0 453 0 8 0.4689 0.0000 0.0174 7.607 0.27 6.40 -6.13 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2996 0.5533 0.1471 1 1 0.3005 0.5490 0.1504 1 1 0.3015 0.5437 0.1548
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.050 1 6 1 410 118 292 58 1 9 0 50 1 0 289 0 2 0.4915 0.0034 0.0103 12.111 1.05 6.42 -5.37 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3473 0.5104 0.1423 1 1 0.3449 0.5094 0.1457 1 1 0.3416 0.5082 0.1502
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.050 1 18 1 488 129 359 4 0 17 2 106 0 0 331 0 28 0.0310 0.0000 0.0780 6.588 0.75 11.88 -11.13 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9706 0.0294 2 1 0.0000 0.9172 0.0828
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.050 1 -2 1 338 141 197 136 0 0 0 5 0 0 197 0 0 0.9645 0.0000 0.0000 141.000 0.92 2.20 -1.28 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0289 0.9711 0.0000 0 0 0.7746 0.2254 0.0000 0 0 0.9322 0.0678 0.0000
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.050 1 3 3 200 73 127 38 0 3 1 31 0 0 126 0 1 0.5205 0.0000 0.0079 23.333 0.03 3.35 -3.33 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1767 0.5428 0.2805 1 1 0.1754 0.5406 0.2840 1 1 0.1737 0.5378 0.2885
chr10 124021236 C CG 0.056607 0.050 1 1 1 326 82 244 8 48 15 1 10 0 3 238 3 0 0.0976 0.0000 0.0246 1.333 1.12 6.20 -5.08 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8294 0.1691 0.0015 0 1 0.3777 0.6215 0.0007 0 1 0.3277 0.6723 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.050 1 -1 1 326 84 242 8 12 15 4 45 0 0 240 0 2 0.0952 0.0000 0.0083 4.200 1.12 2.18 -1.05 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0252 0.2862 0.6886 1 2 0.0277 0.3002 0.6721 1 2 0.0255 0.4403 0.5342
chr10 124984991 G GA 0.100418 0.050 1 1 1 221 62 159 52 0 3 1 6 0 0 159 0 0 0.8387 0.0000 0.0000 19.667 0.35 1.00 -0.65 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.2439 0.7561 0.0000 0 0 0.7026 0.2974 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 396 125 271 65 1 4 0 55 0 0 271 0 0 0.5200 0.0000 0.0000 30.250 0.31 1.16 -0.86 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3727 0.5017 0.1256 1 1 0.3689 0.5015 0.1297 1 1 0.3637 0.5012 0.1351
chr10 132877923 G GTCCTTCTCTTTACTCCTCTCATTC 0.005288 0.050 1 24 2 138 20 118 7 2 4 0 7 0 0 105 0 13 0.3500 0.0000 0.1102 3.500 1.57 1.86 -0.29 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3515 0.6428 0.0058 1 1 0.3571 0.6373 0.0056 1 1 0.3644 0.6301 0.0054
chr11 704604 GA G 0.439706 0.050 1 -1 2 276 74 202 39 0 1 0 34 0 0 202 0 0 0.5270 0.0000 0.0000 73.000 0.41 1.97 -1.56 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3330 0.5075 0.1594 1 1 0.3316 0.5067 0.1618 1 1 0.3295 0.5056 0.1648
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.050 1 -30 1 1073 276 797 99 0 85 1 91 0 0 774 0 23 0.3587 0.0000 0.0289 2.235 0.89 9.36 -8.47 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2186 0.6799 0.1015 1 1 0.2274 0.6731 0.0995 1 1 0.2393 0.6640 0.0967
chr11 2884966 ACCGCGACCGGAG A 0.233793 0.050 1 -12 1 533 116 417 63 0 21 1 31 0 0 405 0 12 0.5431 0.0000 0.0288 4.524 1.84 12.06 -10.22 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6143 0.3571 0.0286 1 0 0.6072 0.3624 0.0304 1 0 0.5976 0.3694 0.0329
chr11 3640001 AGCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 525 125 400 119 0 4 0 2 0 0 400 0 0 0.9520 0.0000 0.0000 30.250 1.05 3.00 -1.95 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4328 0.5672 0.0000 0 0 0.8319 0.1681 0.0000 0 0 0.8918 0.1082 0.0000
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 2 345 114 231 0 0 2 1 111 0 0 231 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 55.500 3.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0565 0.9435 2 2 0.0000 0.0596 0.9404 2 2 0.0000 0.0641 0.9359
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 698 240 458 122 1 9 0 108 0 0 458 0 0 0.5083 0.0000 0.0000 25.667 0.20 1.40 -1.19 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4013 0.5075 0.0913 1 1 0.3977 0.5066 0.0958 1 1 0.3926 0.5055 0.1019
chr11 4546129 AATGAAGATT A 0.500000 0.050 1 -9 3 365 70 295 27 0 2 0 41 0 0 294 0 1 0.3857 0.0000 0.0034 34.000 2.04 8.10 -6.06 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1003 0.4579 0.4418 1 1 0.1045 0.4608 0.4348 1 1 0.1102 0.4644 0.4254
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.050 1 2 1 215 79 136 43 0 1 0 35 0 0 132 0 4 0.5443 0.0000 0.0294 78.000 0.12 2.09 -1.97 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2867 0.5202 0.1931 1 1 0.2859 0.5187 0.1955 1 1 0.2847 0.5167 0.1986
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 553 128 425 2 0 2 1 123 0 0 424 0 1 0.0156 0.0000 0.0024 63.000 0.50 3.77 -3.27 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5280 0.4720 2 2 0.0000 0.1483 0.8517 2 2 0.0000 0.0951 0.9049
chr11 4860474 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 984 260 724 115 0 12 0 133 0 0 723 1 0 0.4423 0.0000 0.0014 20.667 0.17 1.42 -1.25 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0691 0.4790 0.4519 1 1 0.0734 0.4798 0.4468 1 1 0.0794 0.4810 0.4396
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 939 237 702 116 0 2 0 119 0 0 701 0 1 0.4895 0.0000 0.0014 117.500 0.27 1.20 -0.93 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1743 0.5668 0.2589 1 1 0.1779 0.5618 0.2603 1 1 0.1826 0.5555 0.2618
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 496 123 373 119 0 2 0 2 0 0 373 0 0 0.9675 0.0000 0.0000 60.500 1.15 2.00 -0.85 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4401 0.5599 0.0000 0 0 0.8324 0.1676 0.0000 0 0 0.8919 0.1081 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 1 1057 244 813 3 0 7 0 234 0 0 795 0 18 0.0123 0.0000 0.0221 33.857 0.00 6.06 -6.06 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1891 0.8109 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0072 0.9928
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 781 201 580 2 0 4 0 195 0 0 580 0 0 0.0100 0.0000 0.0000 49.250 0.00 1.64 -1.64 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1602 0.8398 2 2 0.0000 0.0300 0.9700 2 2 0.0000 0.0192 0.9808
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.050 1 2 1 563 154 409 80 0 3 0 71 0 0 409 0 0 0.5195 0.0000 0.0000 50.333 0.21 2.32 -2.11 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3387 0.5221 0.1391 1 1 0.3365 0.5204 0.1430 1 1 0.3335 0.5183 0.1483
chr11 5454410 CA C 0.500000 0.050 1 -1 3 409 91 318 51 0 1 0 39 0 0 317 0 1 0.5604 0.0000 0.0031 90.000 0.88 1.54 -0.66 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3796 0.4925 0.1279 1 1 0.3752 0.4930 0.1318 1 1 0.3693 0.4936 0.1371
chr11 5489310 G GGGCT 0.500000 0.050 1 4 1 662 150 512 145 0 3 0 2 0 0 512 0 0 0.9667 0.0000 0.0000 49.000 1.42 5.00 -3.58 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5948 0.4052 0.0000 0 0 0.9038 0.0962 0.0000 0 0 0.9389 0.0611 0.0000
chr11 5516206 AGAAGGCAACCCAT A 0.500000 0.050 1 -13 1 568 133 435 70 0 6 0 57 0 0 429 1 5 0.5263 0.0000 0.0138 21.167 0.20 12.65 -12.45 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3217 0.5239 0.1544 1 1 0.3199 0.5221 0.1580 1 1 0.3175 0.5198 0.1627
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.050 1 12 2 763 129 634 0 0 14 0 115 0 0 614 0 20 0.0000 0.0000 0.0315 8.214 9.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0324 0.9676 2 2 0.0000 0.0346 0.9654 2 2 0.0000 0.0378 0.9622
chr11 6641514 C CCAG 0.500000 0.050 1 3 5 625 172 453 133 8 26 0 5 1 0 452 0 0 0.7733 0.0022 0.0022 5.615 0.21 3.00 -2.79 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0101 0.9899 0.0000 0 0 0.5409 0.4591 0.0000 0 0 0.8244 0.1756 0.0000
chr11 6891690 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 614 173 441 96 0 4 0 73 0 0 440 0 1 0.5549 0.0000 0.0023 42.250 0.34 2.14 -1.79 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5146 0.4269 0.0584 1 0 0.5063 0.4312 0.0625 1 0 0.4950 0.4367 0.0683
chr11 8921341 CAT C 0.500000 0.050 1 -2 1 171 73 98 37 0 2 0 34 0 0 98 0 0 0.5068 0.0000 0.0000 35.500 0.81 2.00 -1.19 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2760 0.5189 0.2051 1 1 0.2754 0.5175 0.2071 1 1 0.2747 0.5157 0.2096
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 251 123 128 49 1 14 2 57 0 0 127 0 1 0.3984 0.0000 0.0078 7.786 0.31 4.02 -3.71 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1345 0.5042 0.3613 1 1 0.1383 0.5038 0.3578 1 1 0.1435 0.5033 0.3531
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.050 1 -3 2 202 75 127 35 0 1 0 39 0 0 127 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 74.000 0.29 3.00 -2.71 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1941 0.5177 0.2882 1 1 0.1964 0.5164 0.2872 1 1 0.1994 0.5147 0.2859
chr11 17372490 CTT C 0.500000 0.050 1 -2 2 705 203 502 192 0 8 0 3 1 0 501 0 0 0.9458 0.0020 0.0020 24.375 1.07 3.00 -1.93 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4885 0.5115 0.0000 0 0 0.9399 0.0601 0.0000 0 0 0.9708 0.0292 0.0000
chr11 17641054 A ACAC 0.500000 0.050 1 3 2 448 131 317 70 0 3 0 58 0 0 316 0 1 0.5344 0.0000 0.0032 42.667 0.13 3.02 -2.89 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3709 0.5041 0.1250 1 1 0.3672 0.5037 0.1291 1 1 0.3623 0.5032 0.1345
chr11 18106011 C CCGG 0.500000 0.050 1 3 3 331 156 175 78 1 11 1 65 0 0 171 0 4 0.5000 0.0000 0.0229 13.182 0.29 3.31 -3.01 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3399 0.5212 0.1389 1 1 0.3376 0.5196 0.1428 1 1 0.3345 0.5175 0.1480
chr11 27362901 TTCATCCACGTCTTCCTCA T 0.500000 0.050 1 -18 1 483 163 320 84 0 9 0 70 0 0 308 0 12 0.5153 0.0000 0.0375 17.111 0.17 15.67 -15.50 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2473 0.5493 0.2034 1 1 0.2485 0.5456 0.2059 1 1 0.2499 0.5410 0.2091
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 836 254 582 129 0 6 0 119 0 0 578 0 4 0.5079 0.0000 0.0069 41.333 0.20 3.86 -3.66 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2797 0.5657 0.1545 1 1 0.2806 0.5608 0.1586 1 1 0.2814 0.5546 0.1639
chr11 49208393 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 242 97 145 54 1 2 0 40 0 0 144 0 1 0.5567 0.0000 0.0069 47.000 0.20 3.08 -2.87 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4181 0.4751 0.1068 1 1 0.4123 0.4767 0.1110 1 1 0.4045 0.4788 0.1167
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.050 1 2 4 1060 209 851 0 0 3 2 204 0 0 844 0 7 0.0000 0.0000 0.0082 68.667 2.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0047 0.9953 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0060 0.9940
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.050 1 -1 1 723 178 545 5 0 0 0 173 0 0 544 0 1 0.0281 0.0000 0.0018 178.000 0.00 1.40 -1.40 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9774 0.0226 2 2 0.0000 0.2780 0.7220 2 2 0.0000 0.0900 0.9100
chr11 59457656 GC G 0.500000 0.050 1 -1 4 605 170 435 85 0 2 2 81 0 0 433 1 1 0.5000 0.0000 0.0046 83.500 0.14 1.43 -1.29 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2295 0.5514 0.2191 1 1 0.2313 0.5475 0.2212 1 1 0.2335 0.5427 0.2238
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 80 35 45 0 0 0 0 35 0 0 44 0 1 0.0000 0.0000 0.0222 35.000 2.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2879 0.7121 2 2 0.0000 0.2916 0.7084 2 2 0.0000 0.2967 0.7033
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 251 97 154 45 0 15 0 37 0 0 153 0 1 0.4639 0.0000 0.0065 5.467 0.47 2.78 -2.32 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3261 0.5107 0.1632 1 1 0.3237 0.5098 0.1664 1 1 0.3205 0.5088 0.1706
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 5 288 110 178 45 2 11 1 51 0 0 178 0 0 0.4091 0.0000 0.0000 9.000 0.40 3.75 -3.35 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1813 0.5228 0.2959 1 1 0.1841 0.5210 0.2948 1 1 0.1878 0.5189 0.2933
chr11 68312746 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 2 212 102 110 46 2 15 0 39 0 0 109 0 1 0.4510 0.0000 0.0091 5.800 1.07 3.97 -2.91 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3386 0.5078 0.1536 1 1 0.3358 0.5072 0.1570 1 1 0.3320 0.5064 0.1616
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.050 1 21 2 864 189 675 107 1 27 2 52 0 0 638 0 37 0.5661 0.0000 0.0548 5.926 0.29 8.19 -7.90 63 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4380 0.4807 0.0813 1 1 0.4327 0.4817 0.0857 1 1 0.4254 0.4829 0.0917
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 975 260 715 127 1 4 0 128 0 0 714 0 1 0.4885 0.0000 0.0014 64.000 0.17 2.28 -2.12 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2008 0.5776 0.2217 1 1 0.2039 0.5718 0.2243 1 1 0.2079 0.5645 0.2276
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.050 1 -22 2 323 109 214 52 1 3 0 53 0 0 211 0 3 0.4771 0.0000 0.0140 35.333 0.17 14.87 -14.69 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2002 0.5305 0.2693 1 1 0.2025 0.5282 0.2693 1 1 0.2054 0.5253 0.2692
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 136 69 67 46 0 1 0 22 0 0 67 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 68.000 0.46 3.18 -2.73 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5692 0.3777 0.0531 1 0 0.5579 0.3851 0.0570 1 0 0.5428 0.3947 0.0625
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.050 1 -1 3 300 41 259 36 0 0 0 5 0 0 259 0 0 0.8780 0.0000 0.0000 41.000 0.69 1.40 -0.71 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9990 0.0000 0 1 0.0796 0.9204 0.0000 0 1 0.2701 0.7299 0.0000
chr11 96092039 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1177 332 845 166 4 25 1 136 1 0 844 0 0 0.5000 0.0012 0.0012 12.280 0.44 3.16 -2.72 98 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6312 0.3463 0.0224 1 0 0.6214 0.3534 0.0251 1 0 0.6079 0.3631 0.0291
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1338 382 956 1 13 87 12 269 0 0 956 0 0 0.0026 0.0000 0.0000 3.184 25.00 8.70 16.30 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1015 0.8985 2 2 0.0000 0.0122 0.9878 2 2 0.0000 0.0062 0.9938
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.050 1 -15 3 819 261 558 112 0 33 3 113 0 0 556 1 1 0.4291 0.0000 0.0036 6.909 0.40 10.58 -10.17 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1570 0.5592 0.2838 1 1 0.1609 0.5547 0.2843 1 1 0.1661 0.5491 0.2848
chr11 118557032 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 209 81 128 32 0 13 0 36 0 0 128 0 0 0.3951 0.0000 0.0000 5.231 0.06 3.31 -3.24 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1948 0.5159 0.2893 1 1 0.1971 0.5147 0.2882 1 1 0.2000 0.5132 0.2868
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 403 140 263 76 0 11 0 53 0 0 262 0 1 0.5429 0.0000 0.0038 11.727 0.22 5.92 -5.70 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5253 0.4150 0.0597 1 0 0.5161 0.4201 0.0637 1 0 0.5037 0.4268 0.0695
chr11 125431296 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 253 104 149 50 0 16 0 38 0 0 149 0 0 0.4808 0.0000 0.0000 5.500 0.20 3.00 -2.80 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3944 0.4852 0.1204 1 1 0.3894 0.4862 0.1244 1 1 0.3827 0.4875 0.1299
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.050 1 -6 1 242 87 155 43 0 14 0 30 0 0 155 0 0 0.4943 0.0000 0.0000 5.214 0.40 5.67 -5.27 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4121 0.4739 0.1140 1 1 0.4063 0.4757 0.1181 1 1 0.3985 0.4779 0.1236
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 422 131 291 65 4 14 0 48 0 1 287 1 2 0.4962 0.0000 0.0137 9.000 0.86 3.58 -2.72 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4756 0.4465 0.0780 1 0 0.4679 0.4498 0.0822 1 0 0.4577 0.4542 0.0882
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 422 136 286 105 12 15 0 4 0 1 283 0 2 0.7721 0.0000 0.0105 9.308 1.70 4.25 -2.55 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2540 0.7460 0.0000 0 0 0.6495 0.3505 0.0000
chr12 865189 T TC 0.592141 0.050 1 1 1 354 143 211 71 0 1 0 71 0 0 209 0 2 0.4965 0.0000 0.0095 142.000 0.97 2.27 -1.30 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1668 0.5382 0.2950 1 1 0.1687 0.5351 0.2962 1 1 0.1712 0.5313 0.2975
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.050 1 3 1 555 166 389 64 6 31 1 64 0 1 381 0 7 0.3855 0.0000 0.0206 4.355 0.17 3.12 -2.95 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2446 0.5448 0.2106 1 1 0.2468 0.5415 0.2116 1 1 0.2497 0.5374 0.2129
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.050 1 1 1 647 134 513 69 0 5 1 59 0 0 509 0 4 0.5149 0.0000 0.0078 25.800 0.30 3.00 -2.70 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4653 0.4917 0.0430 1 1 0.4655 0.4907 0.0439 1 1 0.4656 0.4894 0.0450
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.050 1 -1 1 656 136 520 74 0 0 2 60 1 0 515 0 4 0.5441 0.0019 0.0096 136.000 0.28 3.00 -2.72 26 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5158 0.4520 0.0322 1 0 0.5143 0.4526 0.0332 1 0 0.5120 0.4534 0.0346
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.050 1 -3 1 442 137 305 3 0 28 7 99 0 0 303 0 2 0.0219 0.0000 0.0066 3.893 0.00 3.17 -3.17 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8751 0.1249 2 2 0.0000 0.2914 0.7086 2 2 0.0000 0.1542 0.8458
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.050 1 3 1 4916 1172 3744 750 8 7 1 406 1 0 3723 0 20 0.6399 0.0003 0.0056 166.286 2.32 4.22 -1.90 120 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 8946399 G GAAC 0.112820 0.050 1 3 3 188 52 136 44 0 4 0 4 0 0 136 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 12.000 0.27 3.00 -2.73 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0336 0.9664 0.0000 0 0 0.6168 0.3832 0.0000 0 0 0.8363 0.1637 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.050 1 5 1 230 82 148 42 0 3 0 37 0 0 147 0 1 0.5122 0.0000 0.0068 26.333 0.14 4.70 -4.56 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2853 0.5199 0.1948 1 1 0.2844 0.5184 0.1971 1 1 0.2832 0.5165 0.2003
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.050 1 -3 1 287 130 157 59 1 11 1 58 0 0 157 0 0 0.4538 0.0000 0.0000 10.727 0.64 4.12 -3.48 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1549 0.5392 0.3060 1 1 0.1555 0.5363 0.3082 1 1 0.1563 0.5328 0.3109
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.050 1 -2 1 490 133 357 61 1 4 0 67 0 0 357 0 0 0.4586 0.0000 0.0000 32.250 0.48 2.34 -1.87 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3286 0.5780 0.0934 1 1 0.3333 0.5738 0.0929 1 1 0.3393 0.5684 0.0923
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.050 1 -3 2 410 79 331 49 0 1 0 29 0 0 329 0 2 0.6203 0.0000 0.0060 78.000 0.27 4.07 -3.80 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5374 0.4031 0.0595 1 0 0.5293 0.4079 0.0628 1 0 0.5185 0.4142 0.0673
chr12 38320688 C CT 0.000262 0.050 1 1 1 1189 270 919 131 0 12 1 126 0 0 915 0 4 0.4852 0.0000 0.0044 23.455 0.43 1.48 -1.06 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4248 0.5751 0.0001 1 1 0.4306 0.5693 0.0001 1 1 0.4378 0.5621 0.0001
chr12 40406131 C CGTCAGGATG 0.058262 0.050 1 9 2 264 125 139 63 1 6 0 55 0 0 132 0 7 0.5040 0.0000 0.0504 19.833 1.75 8.00 -6.25 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4602 0.5164 0.0234 1 1 0.4620 0.5144 0.0236 1 1 0.4642 0.5118 0.0240
chr12 40449704 CT C 0.008989 0.050 1 -1 1 129 62 67 28 0 1 0 33 0 0 66 0 1 0.4516 0.0000 0.0149 61.000 0.18 1.03 -0.85 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4031 0.5903 0.0066 1 1 0.4073 0.5862 0.0065 1 1 0.4126 0.5809 0.0064
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.050 1 -30 1 2374 1234 1140 908 58 235 24 9 6 2 1131 1 0 0.7358 0.0053 0.0079 4.197 3.48 8.56 -5.08 164 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.050 1 30 1 1602 290 1312 0 0 147 0 143 0 4 1213 0 95 0.0000 0.0000 0.0755 0.979 4.62 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0070 0.9930
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.050 1 1 1 1063 253 810 243 0 6 0 4 0 0 810 0 0 0.9605 0.0000 0.0000 41.167 0.23 1.00 -0.77 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7206 0.2794 0.0000 0 0 0.9906 0.0094 0.0000 0 0 0.9966 0.0034 0.0000
chr12 51329814 A AG 0.276619 0.050 1 1 2 237 88 149 79 1 5 0 3 0 0 149 0 0 0.8977 0.0000 0.0000 16.600 0.27 1.00 -0.73 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1352 0.8648 0.0000 0 0 0.7191 0.2809 0.0000 0 0 0.8541 0.1459 0.0000
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.050 1 -18 2 1125 300 825 135 0 64 1 100 0 0 818 0 7 0.4500 0.0000 0.0085 3.688 0.35 11.52 -11.17 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7277 0.2697 0.0025 1 0 0.7218 0.2754 0.0028 1 0 0.7135 0.2833 0.0032
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.050 1 -1 1 312 76 236 3 0 4 0 69 0 0 235 0 1 0.0395 0.0000 0.0042 18.000 0.67 1.81 -1.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9797 0.0203 2 1 0.0000 0.7495 0.2505 2 1 0.0000 0.5657 0.4343
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.050 1 1 2 352 97 255 5 0 1 0 91 0 0 252 0 3 0.0515 0.0000 0.0118 96.000 0.60 1.36 -0.76 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 1 0.0000 0.8014 0.1986 2 2 0.0000 0.4958 0.5042
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.050 1 -2 1 136 67 69 37 0 2 0 28 0 0 69 0 0 0.5522 0.0000 0.0000 32.500 0.27 2.07 -1.80 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2738 0.5268 0.1994 1 1 0.2703 0.5259 0.2037 1 1 0.2657 0.5248 0.2095
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.050 1 3 2 383 96 287 45 0 3 0 48 0 0 285 0 2 0.4688 0.0000 0.0070 31.000 0.76 3.60 -2.85 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2207 0.5332 0.2461 1 1 0.2239 0.5311 0.2450 1 1 0.2281 0.5285 0.2434
chr12 69694439 GT G 0.031623 0.050 1 -1 1 162 62 100 54 0 5 0 3 0 0 100 0 0 0.8710 0.0000 0.0000 11.400 0.30 1.67 -1.37 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4859 0.5141 0.0000 0 0 0.9404 0.0596 0.0000 0 0 0.9735 0.0265 0.0000
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.050 1 3 2 111 42 69 16 0 3 0 23 0 0 69 0 0 0.3810 0.0000 0.0000 13.000 0.12 2.70 -2.57 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2141 0.5170 0.2689 1 1 0.2176 0.5164 0.2660 1 1 0.2221 0.5157 0.2622
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.050 1 -3 1 1081 303 778 0 0 35 5 263 0 0 776 0 2 0.0000 0.0000 0.0026 7.629 3.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 80549726 CTGAAACAGGTAACTAACG C 0.056249 0.050 1 -18 2 569 202 367 172 0 28 0 2 0 0 367 0 0 0.8515 0.0000 0.0000 6.444 0.24 18.00 -17.76 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9800 0.0200 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 1 475 130 345 10 3 24 4 89 0 0 343 0 2 0.0769 0.0000 0.0058 4.417 0.10 3.11 -3.01 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.9161 0.0839
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 1 394 101 293 53 1 9 1 37 0 0 292 0 1 0.5248 0.0000 0.0034 10.222 1.23 3.70 -2.48 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4357 0.4653 0.0990 1 1 0.4292 0.4676 0.1032 1 1 0.4205 0.4705 0.1090
chr12 108623665 GAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.050 1 -30 2 1821 458 1363 389 20 39 5 5 1 0 1360 0 2 0.8493 0.0007 0.0022 10.487 0.84 9.40 -8.56 119 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0420 0.9580 0.0000 0 0 0.9865 0.0135 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 673 178 495 170 0 6 0 2 0 0 494 0 1 0.9551 0.0000 0.0020 28.667 0.28 9.00 -8.72 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3498 0.6502 0.0000 0 0 0.8992 0.1008 0.0000 0 0 0.9507 0.0493 0.0000
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 637 202 435 6 1 25 8 162 0 0 432 1 2 0.0297 0.0000 0.0069 7.040 1.00 4.48 -3.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.5302 0.4698 2 2 0.0000 0.1602 0.8398
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 210 114 96 57 1 0 1 55 0 0 96 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 114.000 0.82 3.25 -2.43 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2579 0.5333 0.2088 1 1 0.2584 0.5308 0.2108 1 1 0.2589 0.5276 0.2135
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.050 1 -5 5 341 103 238 0 0 8 0 95 0 0 232 0 6 0.0000 0.0000 0.0252 11.875 5.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0730 0.9270 2 2 0.0000 0.0765 0.9235 2 2 0.0000 0.0816 0.9184
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.050 1 15 4 311 90 221 0 0 10 0 80 0 0 209 0 12 0.0000 0.0000 0.0543 8.000 11.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0899 0.9101 2 2 0.0000 0.0937 0.9063 2 2 0.0000 0.0993 0.9007
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 5 761 197 564 0 0 24 0 173 0 0 544 0 20 0.0000 0.0000 0.0355 7.208 8.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0077 0.9923 2 2 0.0000 0.0085 0.9915 2 2 0.0000 0.0097 0.9903
chr12 124402512 G GGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 12 3 337 117 220 35 2 32 0 48 0 0 210 0 10 0.2991 0.0000 0.0455 2.656 1.77 10.00 -8.23 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0652 0.4140 0.5207 1 2 0.0694 0.4194 0.5112 1 2 0.0752 0.4263 0.4985
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 185 63 122 46 5 10 0 2 0 0 122 0 0 0.7302 0.0000 0.0000 5.300 2.33 3.50 -1.17 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1214 0.8786 0.0000 0 1 0.4806 0.5194 0.0000 0 0 0.6176 0.3824 0.0000
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.050 1 9 1 202 73 129 4 0 4 0 65 0 0 124 1 4 0.0548 0.0000 0.0388 17.250 2.50 8.69 -6.19 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9915 0.0085 2 1 0.0000 0.7200 0.2800 2 2 0.0000 0.4522 0.5478
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.050 1 6 2 702 182 520 91 2 29 0 60 0 0 518 0 2 0.5000 0.0000 0.0038 5.241 0.43 5.83 -5.40 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6433 0.3281 0.0286 1 0 0.6316 0.3368 0.0316 1 0 0.6157 0.3483 0.0360
chr13 24692528 TCGGA T 0.000417 0.050 1 -4 1 359 132 227 73 0 0 0 59 0 0 225 0 2 0.5530 0.0000 0.0088 132.000 0.14 6.46 -6.32 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6056 0.3943 0.0001 1 0 0.6031 0.3968 0.0001 1 0 0.5996 0.4003 0.0001
chr13 24692537 AC A 0.000417 0.050 1 -1 1 362 129 233 73 0 0 2 54 0 0 228 2 3 0.5659 0.0000 0.0215 129.000 0.14 6.87 -6.73 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6092 0.3907 0.0001 1 0 0.6066 0.3933 0.0001 1 0 0.6029 0.3970 0.0001
chr13 24692541 G GA 0.000417 0.050 1 1 3 365 133 232 76 0 0 1 56 0 0 227 2 3 0.5714 0.0000 0.0216 133.000 0.14 6.66 -6.52 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6302 0.3698 0.0001 1 0 0.6268 0.3731 0.0001 1 0 0.6222 0.3777 0.0001
chr13 60528441 GATA G 0.187645 0.050 1 -3 4 447 116 331 112 0 3 0 1 0 0 330 0 1 0.9655 0.0000 0.0030 37.667 0.64 3.00 -2.36 60 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7347 0.2653 0.0000 0 0 0.9474 0.0526 0.0000 0 0 0.9679 0.0321 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.050 1 6 1 639 150 489 74 2 33 0 41 0 0 481 1 7 0.4933 0.0000 0.0164 3.515 1.84 6.63 -4.80 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7295 0.2633 0.0072 1 0 0.7215 0.2706 0.0079 1 0 0.7106 0.2805 0.0089
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.050 1 3 4 622 117 505 0 1 21 0 95 0 0 498 1 6 0.0000 0.0000 0.0139 4.571 4.67 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0651 0.9349 2 2 0.0000 0.0331 0.9669 2 2 0.0000 0.0273 0.9727
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.050 1 -3 2 493 92 401 26 3 32 1 30 0 1 396 0 4 0.2826 0.0000 0.0125 1.844 2.15 5.63 -3.48 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1704 0.5074 0.3222 1 1 0.1734 0.5068 0.3198 1 1 0.1773 0.5061 0.3166
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.050 1 -15 1 271 84 187 35 0 13 0 36 0 0 187 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 5.462 1.46 7.36 -5.90 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2238 0.5212 0.2551 1 1 0.2251 0.5196 0.2553 1 1 0.2268 0.5176 0.2556
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.050 1 4 1 424 99 325 51 0 5 0 43 0 0 323 0 2 0.5152 0.0000 0.0062 18.800 0.76 4.12 -3.35 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3102 0.5185 0.1714 1 1 0.3085 0.5171 0.1744 1 1 0.3063 0.5153 0.1784
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 1 558 120 438 61 0 1 1 57 0 0 437 0 1 0.5083 0.0000 0.0023 119.000 0.61 3.23 -2.62 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2553 0.5354 0.2094 1 1 0.2558 0.5327 0.2115 1 1 0.2565 0.5294 0.2142
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.050 1 1 2 932 220 712 108 0 5 1 106 0 0 712 0 0 0.4909 0.0000 0.0000 43.000 0.48 1.93 -1.45 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1234 0.5707 0.3059 1 1 0.1245 0.5656 0.3098 1 1 0.1259 0.5592 0.3149
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.050 1 -1 4 839 235 604 114 0 23 1 97 0 0 603 0 1 0.4851 0.0000 0.0017 9.174 0.38 1.26 -0.88 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4345 0.4855 0.0800 1 1 0.4304 0.4856 0.0840 1 1 0.4248 0.4857 0.0894
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.050 1 -19 1 483 140 343 11 0 3 0 126 0 0 334 0 9 0.0786 0.0000 0.0262 45.667 0.18 17.72 -17.54 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9867 0.0133 2 1 0.0000 0.7585 0.2415
chr14 20197747 C CA 0.001620 0.050 1 1 2 375 94 281 53 0 3 1 37 0 0 281 0 0 0.5638 0.0000 0.0000 30.333 1.53 2.11 -0.58 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6525 0.3472 0.0002 1 0 0.6479 0.3518 0.0003 1 0 0.6417 0.3580 0.0003
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.050 1 1 1 391 79 312 41 0 2 0 36 0 0 309 0 3 0.5190 0.0000 0.0096 38.500 0.15 1.22 -1.08 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1599 0.5332 0.3068 1 1 0.1599 0.5311 0.3090 1 1 0.1597 0.5284 0.3119
chr14 21155337 CAGA C 0.002975 0.050 1 -3 1 494 102 392 52 0 6 0 44 0 0 388 0 4 0.5098 0.0000 0.0102 16.000 2.23 4.18 -1.95 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5176 0.4814 0.0010 1 0 0.5180 0.4809 0.0011 1 0 0.5184 0.4805 0.0011
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.050 1 3 3 596 166 430 145 1 18 0 2 0 0 430 0 0 0.8735 0.0000 0.0000 8.167 0.33 1.50 -1.17 33 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7984 0.2016 0.0000 0 0 0.9620 0.0380 0.0000 0 0 0.9764 0.0236 0.0000
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.050 1 3 1 526 151 375 129 2 16 0 4 0 0 375 0 0 0.8543 0.0000 0.0000 8.438 0.26 3.50 -3.24 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0302 0.9698 0.0000 0 0 0.5787 0.4213 0.0000 0 0 0.8040 0.1960 0.0000
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.050 1 6 1 447 108 339 43 2 9 0 54 0 0 339 0 0 0.3981 0.0000 0.0000 10.778 0.53 5.13 -4.59 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2239 0.5570 0.2191 1 1 0.2290 0.5547 0.2163 1 1 0.2359 0.5516 0.2125
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.050 1 -3 1 641 197 444 94 3 18 0 82 0 0 444 0 0 0.4772 0.0000 0.0000 9.944 0.32 3.88 -3.56 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6057 0.3852 0.0092 1 0 0.6026 0.3878 0.0097 1 0 0.5983 0.3914 0.0103
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.050 1 -1 1 680 185 495 101 8 6 66 4 0 0 495 0 0 0.5459 0.0000 0.0000 18.333 0.13 4.00 -3.87 3 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7902 0.2017 0.0081 1 0 0.7747 0.2156 0.0097 1 0 0.7527 0.2350 0.0122
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.050 1 -2 1 678 189 489 104 4 7 70 4 0 0 489 0 0 0.5503 0.0000 0.0000 29.333 0.12 4.00 -3.88 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5997 0.3675 0.0329 1 0 0.5852 0.3780 0.0368 1 0 0.5656 0.3918 0.0426
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.050 1 -3 1 327 70 257 30 5 6 1 28 0 0 256 0 1 0.4286 0.0000 0.0039 10.667 6.03 4.14 1.89 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3666 0.4980 0.1354 1 1 0.3650 0.4976 0.1374 1 1 0.3629 0.4971 0.1400
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.050 1 -3 1 347 77 270 30 7 2 34 4 0 0 268 2 0 0.3896 0.0000 0.0074 35.500 2.33 2.75 -0.42 20 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2469 0.5303 0.2227 1 1 0.2497 0.5285 0.2218 1 1 0.2534 0.5262 0.2204
chr14 23275617 TTCCTCC T 0.001309 0.050 1 -6 1 348 77 271 34 2 5 0 36 0 0 269 0 2 0.4416 0.0000 0.0074 14.200 2.59 6.28 -3.69 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4529 0.5464 0.0007 1 1 0.4555 0.5438 0.0007 1 1 0.4588 0.5405 0.0007
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.050 1 -1 1 301 88 213 43 0 3 1 41 0 0 213 0 0 0.4886 0.0000 0.0000 28.000 0.35 1.29 -0.94 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4519 0.5131 0.0350 1 1 0.4531 0.5117 0.0352 1 1 0.4546 0.5099 0.0356
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.050 1 3 1 419 121 298 51 3 16 0 51 0 0 296 0 2 0.4215 0.0000 0.0067 6.562 0.43 3.20 -2.76 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3532 0.5267 0.1200 1 1 0.3545 0.5245 0.1209 1 1 0.3562 0.5217 0.1221
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.050 1 6 1 419 121 298 54 0 56 4 7 0 0 296 0 2 0.4463 0.0000 0.0067 1.089 0.61 5.86 -5.25 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1743 0.8239 0.0017 0 1 0.0146 0.9853 0.0001 0 1 0.1262 0.8738 0.0000
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.050 1 24 1 313 69 244 18 1 39 0 11 0 0 240 0 4 0.2609 0.0000 0.0164 0.744 2.17 8.27 -6.11 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4514 0.4783 0.0703 1 1 0.4500 0.4788 0.0712 1 1 0.4482 0.4795 0.0722
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.050 1 6 1 653 134 519 0 0 28 1 105 0 0 507 0 12 0.0000 0.0000 0.0231 3.786 7.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 2 0.0000 0.0112 0.9888 2 2 0.0000 0.0121 0.9879
chr14 54702332 C CCAG 0.081686 0.050 1 3 1 425 143 282 136 0 3 0 4 0 0 282 0 0 0.9510 0.0000 0.0000 46.667 0.16 2.25 -2.09 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3346 0.6654 0.0000 0 0 0.9570 0.0430 0.0000 0 0 0.9851 0.0149 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.050 1 -6 2 724 163 561 0 0 25 1 137 0 0 551 0 10 0.0000 0.0000 0.0178 5.520 6.69 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0059 0.9941 2 2 0.0000 0.0065 0.9935
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.050 1 -6 1 443 107 336 0 0 19 3 85 0 1 333 1 1 0.0000 0.0000 0.0089 4.579 6.07 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1497 0.8503 2 2 0.0000 0.1540 0.8460 2 2 0.0000 0.1605 0.8395
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.050 1 -3 1 430 102 328 0 32 11 11 48 0 0 326 1 1 0.0000 0.0000 0.0061 17.000 5.46 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0309 0.3169 0.6523 1 2 0.0343 0.3278 0.6379 1 2 0.0393 0.3426 0.6181
chr14 92071020 C CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGT 0.000608 0.050 1 21 1 375 167 208 1 0 14 0 152 0 0 206 0 2 0.0060 0.0000 0.0096 11.769 2.00 10.29 -8.29 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9942 0.0058 2 1 0.0000 0.9861 0.0139 2 1 0.0000 0.9832 0.0168
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.050 1 -3 2 512 154 358 73 0 14 2 65 0 0 358 0 0 0.4740 0.0000 0.0000 10.000 0.45 3.11 -2.66 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2237 0.5533 0.2230 1 1 0.2228 0.5501 0.2271 1 1 0.2214 0.5460 0.2326
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.050 1 -9 1 340 106 234 98 1 5 0 2 1 0 233 0 0 0.9245 0.0043 0.0043 20.000 0.40 9.00 -8.60 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4399 0.5601 0.0000 0 0 0.8372 0.1628 0.0000 0 0 0.8967 0.1033 0.0000
chr14 100884333 C CTCT 0.265959 0.050 1 3 1 641 131 510 122 1 4 0 4 0 0 510 0 0 0.9313 0.0000 0.0000 31.750 0.56 3.75 -3.19 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0817 0.9183 0.0000 0 0 0.7985 0.2015 0.0000 0 0 0.9225 0.0775 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.050 1 -9 1 289 88 201 0 0 13 0 75 0 0 197 0 4 0.0000 0.0000 0.0199 5.769 8.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1508 0.8492 2 2 0.0000 0.1559 0.8441 2 2 0.0000 0.1632 0.8368
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.050 1 -12 2 565 116 449 41 2 16 1 56 0 0 443 0 6 0.3534 0.0000 0.0134 6.600 1.32 11.14 -9.83 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1623 0.6061 0.2316 1 1 0.1702 0.6053 0.2245 1 1 0.1810 0.6037 0.2153
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.050 1 -3 1 332 83 249 34 2 8 1 38 0 0 249 0 0 0.4096 0.0000 0.0000 9.375 1.38 4.24 -2.85 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3308 0.5422 0.1270 1 1 0.3336 0.5398 0.1266 1 1 0.3372 0.5368 0.1260
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.050 1 3 1 623 121 502 0 0 7 0 114 0 8 424 52 18 0.0000 0.0000 0.1554 16.286 3.78 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0132 0.9868 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.050 1 -1 2 1841 532 1309 0 1 9 4 518 1 0 1284 9 15 0.0000 0.0008 0.0191 58.111 3.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441436 CCTGCTCCCGCAGCTTCTT C 0.000510 0.050 1 -18 1 1194 328 866 110 21 68 9 120 1 1 849 3 12 0.3354 0.0012 0.0196 4.079 2.15 12.30 -10.15 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2729 0.7266 0.0005 1 1 0.2829 0.7166 0.0005 1 1 0.2962 0.7033 0.0005
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.050 1 -2 2 516 139 377 84 0 1 0 54 0 0 376 0 1 0.6043 0.0000 0.0027 138.000 0.15 1.74 -1.59 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6730 0.3041 0.0229 1 0 0.6625 0.3123 0.0252 1 0 0.6482 0.3233 0.0285
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.050 1 -1 2 248 84 164 27 3 3 11 40 0 1 161 1 1 0.3214 0.0000 0.0183 22.667 1.70 1.57 0.13 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1108 0.4965 0.3927 1 1 0.1170 0.5001 0.3829 1 1 0.1255 0.5045 0.3700
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.050 1 -2 2 248 87 161 30 2 43 1 11 0 1 159 0 1 0.3448 0.0000 0.0124 1.024 1.60 2.27 -0.67 8 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4343 0.4648 0.1009 1 1 0.4233 0.4700 0.1067 1 1 0.4054 0.4810 0.1135
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.050 1 -3 1 710 165 545 75 1 38 3 48 0 0 545 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 3.316 1.00 3.31 -2.31 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4453 0.4744 0.0803 1 1 0.4342 0.4797 0.0861 1 1 0.4194 0.4862 0.0943
chr15 33844878 TAGA T 0.150388 0.050 1 -3 3 247 85 162 50 0 4 0 31 0 0 162 0 0 0.5882 0.0000 0.0000 20.250 0.48 3.52 -3.04 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6515 0.3309 0.0176 1 0 0.6444 0.3368 0.0187 1 0 0.6349 0.3448 0.0203
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.050 1 -2 1 448 168 280 160 0 4 0 4 0 0 280 0 0 0.9524 0.0000 0.0000 41.000 1.17 2.00 -0.83 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1417 0.8583 0.0000 0 0 0.8780 0.1220 0.0000 0 0 0.9547 0.0453 0.0000
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.050 1 5 1 527 160 367 136 0 16 0 8 0 0 366 0 1 0.8500 0.0000 0.0027 9.000 0.36 4.12 -3.76 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1116 0.8884 0.0000 0 0 0.6219 0.3781 0.0000
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.050 1 4 1 225 87 138 43 0 2 1 41 0 0 138 0 0 0.4943 0.0000 0.0000 42.500 0.21 3.90 -3.69 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4392 0.5159 0.0448 1 1 0.4405 0.5144 0.0451 1 1 0.4421 0.5124 0.0455
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.050 1 -3 1 305 152 153 72 0 2 0 78 0 0 151 0 2 0.4737 0.0000 0.0131 75.000 0.29 3.28 -2.99 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1175 0.5111 0.3714 1 1 0.1206 0.5096 0.3698 1 1 0.1248 0.5077 0.3675
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.050 1 -3 1 486 124 362 54 0 13 3 54 0 0 361 0 1 0.4355 0.0000 0.0028 8.538 0.67 3.78 -3.11 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1544 0.5213 0.3242 1 1 0.1566 0.5194 0.3240 1 1 0.1594 0.5170 0.3236
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.050 1 -3 3 737 154 583 84 0 12 0 58 0 0 579 1 3 0.5455 0.0000 0.0069 11.833 2.30 5.31 -3.01 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7107 0.2877 0.0016 1 0 0.7046 0.2936 0.0017 1 0 0.6964 0.3017 0.0019
chr15 81332887 CTCT C 0.001806 0.050 1 -3 2 689 165 524 72 1 10 0 82 0 0 524 0 0 0.4364 0.0000 0.0000 15.400 0.53 3.45 -2.92 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3434 0.6550 0.0015 1 1 0.3506 0.6478 0.0015 1 1 0.3600 0.6385 0.0015
chr15 82043685 GGAA G 0.000016 0.050 1 -3 1 743 136 607 67 1 6 0 62 0 0 606 0 1 0.4926 0.0000 0.0016 21.500 0.22 3.29 -3.07 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5194 0.4806 0.0000 1 0 0.5201 0.4799 0.0000 1 0 0.5209 0.4791 0.0000
chr15 82045645 T TGCC 0.002204 0.050 1 3 1 490 162 328 135 1 22 1 3 1 0 327 0 0 0.8333 0.0030 0.0030 6.364 0.65 4.33 -3.68 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9606 0.0394 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.050 1 3 3 370 130 240 67 0 3 0 60 0 0 239 0 1 0.5154 0.0000 0.0042 42.333 0.39 3.90 -3.51 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4112 0.4989 0.0900 1 1 0.4104 0.4977 0.0919 1 1 0.4092 0.4964 0.0944
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.050 1 -24 2 837 227 610 96 8 99 3 21 0 1 607 0 2 0.4229 0.0000 0.0049 2.460 1.54 5.62 -4.08 16 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9002 0.0979 0.0019 1 0 0.8906 0.1071 0.0023 1 0 0.8742 0.1227 0.0031
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.050 1 -12 2 834 212 622 73 1 36 1 101 0 0 621 1 0 0.3443 0.0000 0.0016 5.029 1.58 7.64 -6.07 9 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0172 0.2942 0.6886 1 2 0.0189 0.3017 0.6794 1 2 0.0215 0.3118 0.6668
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.050 1 -6 1 358 124 234 0 0 4 1 119 0 0 229 0 5 0.0000 0.0000 0.0214 30.000 6.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.050 1 1 1 340 116 224 109 1 3 0 3 0 0 224 0 0 0.9397 0.0000 0.0000 37.667 0.82 2.00 -1.18 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1014 0.8986 0.0000 0 0 0.6533 0.3467 0.0000 0 0 0.8090 0.1910 0.0000
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.050 1 -6 2 602 227 375 179 1 41 0 6 0 0 375 0 0 0.7885 0.0000 0.0000 4.537 0.23 6.00 -5.77 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0120 0.9880 0.0000 0 0 0.7704 0.2296 0.0000 0 0 0.9455 0.0545 0.0000
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.050 1 -9 2 242 89 153 38 0 21 0 30 0 1 148 0 4 0.4270 0.0000 0.0327 3.238 2.34 9.30 -6.96 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5269 0.4635 0.0096 1 0 0.5262 0.4641 0.0097 1 0 0.5250 0.4650 0.0099
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.050 1 1 2 51 24 27 17 0 0 0 7 0 0 27 0 0 0.7083 0.0000 0.0000 24.000 0.18 1.29 -1.11 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5366 0.4164 0.0470 1 0 0.5311 0.4206 0.0483 1 0 0.5207 0.4303 0.0490
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.050 1 2 2 349 100 249 47 0 1 0 52 0 0 249 0 0 0.4700 0.0000 0.0000 99.000 0.32 3.25 -2.93 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2590 0.5461 0.1949 1 1 0.2626 0.5435 0.1939 1 1 0.2673 0.5401 0.1925
chr16 1093978 G GC 0.001284 0.050 1 1 2 382 109 273 55 0 7 1 46 0 0 272 0 1 0.5046 0.0000 0.0037 14.571 0.67 1.17 -0.50 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5544 0.4453 0.0004 1 0 0.5534 0.4462 0.0004 1 0 0.5520 0.4476 0.0004
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.050 1 -1 1 1085 208 877 99 2 3 1 103 0 0 875 0 2 0.4760 0.0000 0.0023 67.667 1.01 1.33 -0.32 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2832 0.5923 0.1244 1 1 0.2887 0.5868 0.1244 1 1 0.2959 0.5798 0.1243
chr16 1773388 CG C 0.024216 0.050 1 -1 1 414 88 326 42 0 3 0 43 1 1 324 0 0 0.4773 0.0031 0.0061 28.333 1.00 1.51 -0.51 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4745 0.5148 0.0107 1 1 0.4760 0.5133 0.0107 1 1 0.4778 0.5114 0.0108
chr16 1999881 G GTCC 0.177864 0.050 1 3 2 600 128 472 65 0 11 0 52 0 0 472 0 0 0.5078 0.0000 0.0000 10.636 0.75 4.29 -3.53 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5563 0.4105 0.0333 1 0 0.5521 0.4132 0.0347 1 0 0.5465 0.4168 0.0367
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 429 92 337 0 0 0 2 90 0 0 337 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 91.000 6.58 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 429 92 337 0 0 0 2 90 0 0 337 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 91.000 6.58 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.050 1 -3 2 293 108 185 104 1 2 0 1 0 0 185 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 53.000 0.37 4.00 -3.63 72 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9867 0.0133 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.050 1 -3 1 471 122 349 57 0 5 0 60 0 0 349 0 0 0.4672 0.0000 0.0000 23.400 0.42 3.05 -2.63 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1518 0.5248 0.3234 1 1 0.1537 0.5226 0.3237 1 1 0.1562 0.5199 0.3239
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.050 1 -42 2 1805 421 1384 171 4 124 1 121 0 1 1360 1 22 0.4062 0.0000 0.0173 2.387 1.27 4.20 -2.92 71 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7424 0.2547 0.0029 1 0 0.7365 0.2603 0.0032 1 0 0.7281 0.2682 0.0037
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.050 1 -2 1 198 54 144 0 0 0 1 53 0 0 144 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 54.000 2.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.050 1 -1 1 307 187 120 77 0 0 0 110 0 0 119 0 1 0.4118 0.0000 0.0083 187.000 0.40 1.18 -0.78 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0916 0.6737 0.2347 1 1 0.0997 0.6758 0.2245 1 1 0.1113 0.6775 0.2112
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.050 1 -12 1 717 236 481 114 1 11 0 110 0 0 481 0 0 0.4831 0.0000 0.0000 20.364 0.22 9.01 -8.79 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4162 0.5269 0.0569 1 1 0.4183 0.5235 0.0583 1 1 0.4208 0.5192 0.0600
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.050 1 -27 1 978 226 752 92 1 55 1 77 0 0 751 0 1 0.4071 0.0000 0.0013 3.109 0.99 11.78 -10.79 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4941 0.4479 0.0580 1 0 0.4902 0.4492 0.0607 1 0 0.4847 0.4510 0.0643
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.050 1 3 1 669 169 500 83 1 5 0 80 0 0 495 0 5 0.4911 0.0000 0.0100 32.800 0.51 2.98 -2.47 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2563 0.5535 0.1902 1 1 0.2590 0.5496 0.1914 1 1 0.2624 0.5447 0.1930
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 142 71 71 42 0 2 0 27 0 0 70 0 1 0.5915 0.0000 0.0141 34.500 0.26 1.81 -1.55 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4271 0.4658 0.1071 1 1 0.4207 0.4681 0.1112 1 1 0.4121 0.4711 0.1168
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.050 1 -1 1 432 82 350 48 15 9 1 9 0 0 349 1 0 0.5854 0.0000 0.0029 7.889 0.90 1.89 -0.99 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0075 0.9925 0.0000 0 1 0.1004 0.8996 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 1145 339 806 138 2 47 8 144 0 1 805 0 0 0.4071 0.0000 0.0012 6.213 0.59 3.28 -2.69 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1116 0.5532 0.3352 1 1 0.1163 0.5491 0.3347 1 1 0.1225 0.5439 0.3336
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.050 1 -6 2 292 120 172 43 0 20 1 56 0 0 172 0 0 0.3583 0.0000 0.0000 5.000 0.07 7.39 -7.32 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1052 0.4749 0.4198 1 1 0.1094 0.4766 0.4140 1 1 0.1152 0.4787 0.4062
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 145 84 61 45 0 3 0 36 0 0 59 0 2 0.5357 0.0000 0.0328 27.000 0.18 4.28 -4.10 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3261 0.5107 0.1632 1 1 0.3237 0.5098 0.1664 1 1 0.3205 0.5088 0.1706
chr16 81035884 AGGC A 0.500000 0.050 1 -3 2 275 79 196 37 1 3 2 36 0 0 196 0 0 0.4684 0.0000 0.0000 25.333 1.84 4.75 -2.91 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2410 0.5232 0.2358 1 1 0.2418 0.5214 0.2368 1 1 0.2428 0.5192 0.2380
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.050 1 -2 2 263 118 145 112 0 3 0 3 0 0 145 0 0 0.9492 0.0000 0.0000 38.333 1.55 4.33 -2.78 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1114 0.8886 0.0000 0 0 0.6811 0.3189 0.0000 0 0 0.8278 0.1722 0.0000
chr16 85656394 CGAGCGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 482 117 365 52 0 14 1 50 0 0 364 1 0 0.4444 0.0000 0.0027 7.357 1.25 6.26 -5.01 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2373 0.5318 0.2309 1 1 0.2384 0.5294 0.2322 1 1 0.2397 0.5264 0.2339
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.050 1 -2 1 708 121 587 0 0 3 4 114 0 0 575 0 12 0.0000 0.0000 0.0204 39.333 7.70 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0383 0.9617 2 2 0.0000 0.0406 0.9594 2 2 0.0000 0.0441 0.9559
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 707 117 590 0 0 4 9 104 0 1 576 2 11 0.0000 0.0000 0.0237 37.333 7.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0511 0.9489 2 2 0.0000 0.0516 0.9484 2 2 0.0000 0.0537 0.9463
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 713 118 595 0 0 1 3 114 0 3 572 8 12 0.0000 0.0000 0.0387 117.000 7.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3257 0.6743 2 2 0.0000 0.1152 0.8848 2 2 0.0000 0.0781 0.9219
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.050 1 -6 1 812 210 602 0 0 16 2 192 0 0 598 0 4 0.0000 0.0000 0.0066 12.062 6.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0086 0.9914
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 616 143 473 65 1 7 1 69 0 0 473 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 19.286 0.95 4.74 -3.79 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1885 0.5370 0.2745 1 1 0.1913 0.5342 0.2745 1 1 0.1949 0.5307 0.2744
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.050 1 6 2 789 203 586 104 0 21 1 77 0 0 580 0 6 0.5123 0.0000 0.0102 8.619 0.62 5.60 -4.98 66 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4849 0.4493 0.0658 1 0 0.4778 0.4522 0.0700 1 0 0.4681 0.4560 0.0759
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.050 1 4 2 170 72 98 38 0 3 0 31 0 0 97 0 1 0.5278 0.0000 0.0102 23.000 0.76 4.06 -3.30 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3153 0.5105 0.1742 1 1 0.3132 0.5097 0.1771 1 1 0.3104 0.5087 0.1808
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.050 1 -3 1 930 199 731 180 1 12 0 6 0 0 731 0 0 0.9045 0.0000 0.0000 15.583 0.33 2.83 -2.50 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0179 0.9821 0.0000 0 0 0.8441 0.1559 0.0000 0 0 0.9658 0.0342 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.050 1 -1 2 417 142 275 73 1 3 0 65 0 0 275 0 0 0.5141 0.0000 0.0000 46.333 0.71 1.09 -0.38 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2338 0.5595 0.2067 1 1 0.2315 0.5566 0.2119 1 1 0.2285 0.5528 0.2187
chr17 4672288 CTCT C 0.002496 0.050 1 -3 2 824 165 659 75 0 4 1 85 0 0 659 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 40.250 0.44 3.42 -2.98 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3216 0.6760 0.0024 1 1 0.3295 0.6682 0.0023 1 1 0.3398 0.6580 0.0023
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.050 1 -3 1 794 170 624 8 87 9 0 66 0 0 620 0 4 0.0471 0.0000 0.0064 20.000 2.12 4.24 -2.12 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6965 0.3029 0.0006 1 0 0.6911 0.3082 0.0007 1 0 0.6838 0.3155 0.0007
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.050 1 3 1 714 201 513 92 2 49 0 58 0 0 509 0 4 0.4577 0.0000 0.0078 3.102 0.35 3.45 -3.10 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5554 0.4001 0.0445 1 0 0.5419 0.4090 0.0491 1 0 0.5237 0.4206 0.0557
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.050 1 -6 2 1369 430 939 331 9 81 1 8 0 1 937 0 1 0.7698 0.0000 0.0021 4.309 4.85 7.12 -2.28 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0107 0.9893 0.0000 0 0 0.9865 0.0135 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.050 1 -6 1 1010 301 709 246 1 48 0 6 0 2 705 1 1 0.8173 0.0000 0.0056 5.383 0.73 7.00 -6.27 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0256 0.9744 0.0000 0 0 0.9624 0.0376 0.0000 0 0 0.9950 0.0050 0.0000
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 561 242 319 193 3 27 2 17 0 0 319 0 0 0.7975 0.0000 0.0000 7.926 0.35 3.41 -3.06 95 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0865 0.9135 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.050 1 3 1 801 168 633 14 0 4 0 150 0 0 625 1 7 0.0833 0.0000 0.0126 41.000 0.07 3.93 -3.86 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.8045 0.1955
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.050 1 18 3 248 80 168 47 0 11 1 21 0 0 163 0 5 0.5875 0.0000 0.0298 6.273 0.45 6.19 -5.74 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5122 0.4170 0.0708 1 0 0.5027 0.4222 0.0750 1 0 0.4901 0.4291 0.0808
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 109 55 54 3 0 1 0 51 0 0 54 0 0 0.0545 0.0000 0.0000 54.000 0.00 1.57 -1.57 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9735 0.0265 2 1 0.0000 0.6779 0.3221 2 2 0.0000 0.4730 0.5270
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.050 1 1 1 687 185 502 85 0 4 0 96 0 0 501 0 1 0.4595 0.0000 0.0020 45.250 0.28 1.75 -1.47 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1137 0.5139 0.3724 1 1 0.1180 0.5127 0.3692 1 1 0.1238 0.5113 0.3649
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 538 107 431 93 1 6 0 7 0 0 431 0 0 0.8692 0.0000 0.0000 16.833 0.34 2.00 -1.66 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0871 0.9129 0.0000 0 1 0.4145 0.5855 0.0000
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.050 1 15 1 623 127 496 53 4 7 2 61 3 0 482 1 10 0.4173 0.0060 0.0282 16.857 1.11 6.84 -5.72 15 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1011 0.4826 0.4163 1 1 0.1054 0.4836 0.4110 1 1 0.1113 0.4850 0.4038
chr17 41302321 TGTACAGATGGTTG T 0.500000 0.050 1 -13 1 1139 282 857 154 0 9 0 119 0 0 851 0 6 0.5461 0.0000 0.0070 30.333 0.55 11.70 -11.15 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5789 0.3882 0.0329 1 0 0.5701 0.3937 0.0362 1 0 0.5579 0.4011 0.0410
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.050 1 -15 1 658 177 481 83 0 26 1 67 0 0 467 1 13 0.4689 0.0000 0.0291 5.808 0.49 12.85 -12.36 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2363 0.5499 0.2138 1 1 0.2378 0.5462 0.2160 1 1 0.2397 0.5414 0.2188
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.050 1 3 5 1758 375 1383 358 2 5 0 10 0 0 1383 0 0 0.9547 0.0000 0.0000 74.000 0.62 3.90 -3.28 124 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.9002 0.0998 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 661 170 491 70 2 26 2 70 0 0 489 0 2 0.4118 0.0000 0.0041 5.538 0.56 3.40 -2.84 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2044 0.5430 0.2526 1 1 0.2067 0.5398 0.2535 1 1 0.2098 0.5357 0.2545
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 226 71 155 34 0 1 0 36 0 0 155 0 0 0.4789 0.0000 0.0000 70.000 0.26 4.53 -4.26 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2163 0.5201 0.2636 1 1 0.2179 0.5186 0.2635 1 1 0.2199 0.5167 0.2634
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.050 1 3 5 953 253 700 238 0 10 0 5 0 0 700 0 0 0.9407 0.0000 0.0000 24.300 0.27 2.60 -2.33 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1030 0.8970 0.0000 0 0 0.9263 0.0737 0.0000 0 0 0.9791 0.0209 0.0000
chr17 57979243 T TTGC 0.500000 0.050 1 3 1 416 195 221 68 9 48 3 67 0 0 220 1 0 0.3487 0.0000 0.0045 3.085 0.35 3.54 -3.18 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3128 0.5303 0.1568 1 1 0.3116 0.5280 0.1604 1 1 0.3097 0.5251 0.1651
chr17 58309246 G GTCCTCCTCT 0.500000 0.050 1 9 1 603 176 427 155 1 17 0 3 0 0 427 0 0 0.8807 0.0000 0.0000 9.353 0.43 5.67 -5.23 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2745 0.7255 0.0000 0 0 0.8634 0.1366 0.0000 0 0 0.9324 0.0676 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.050 1 6 2 404 142 262 113 0 26 0 3 0 0 262 0 0 0.7958 0.0000 0.0000 4.462 0.47 7.00 -6.53 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1136 0.8864 0.0000 0 0 0.6864 0.3136 0.0000 0 0 0.8312 0.1688 0.0000
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.050 1 9 1 375 136 239 65 1 10 0 60 0 0 239 0 0 0.4779 0.0000 0.0000 12.600 0.43 7.23 -6.80 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3037 0.5278 0.1686 1 1 0.3025 0.5257 0.1718 1 1 0.3009 0.5230 0.1761
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.050 1 8 2 306 75 231 38 0 10 0 27 0 0 230 0 1 0.5067 0.0000 0.0043 6.500 1.42 7.07 -5.65 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3712 0.4908 0.1381 1 1 0.3668 0.4914 0.1418 1 1 0.3611 0.4922 0.1467
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.050 1 -2 3 309 102 207 59 0 2 0 41 0 0 206 0 1 0.5784 0.0000 0.0048 50.000 0.03 2.24 -2.21 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4624 0.4515 0.0861 1 0 0.4550 0.4546 0.0904 1 1 0.4451 0.4586 0.0963
chr17 73209719 A ATGC 0.500000 0.050 1 3 1 353 140 213 73 2 17 0 48 0 0 212 0 1 0.5214 0.0000 0.0047 7.235 1.10 3.90 -2.80 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5813 0.3742 0.0445 1 0 0.5704 0.3814 0.0482 1 0 0.5557 0.3909 0.0535
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.050 1 9 2 614 121 493 0 0 9 1 111 0 0 472 0 21 0.0000 0.0000 0.0426 12.333 8.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0341 0.9659 2 2 0.0000 0.0364 0.9636 2 2 0.0000 0.0397 0.9603
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.050 1 -54 1 320 88 232 69 1 2 1 15 0 0 232 0 0 0.7841 0.0000 0.0000 42.000 0.42 8.53 -8.11 19 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.3708 0.6274 0.0018 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.0177 0.9823 0.0000
chr17 75516562 T TGGAGCC 0.500000 0.050 1 6 1 527 118 409 65 1 3 0 49 0 0 407 0 2 0.5508 0.0000 0.0049 38.333 0.69 5.86 -5.16 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4299 0.4725 0.0976 1 1 0.4239 0.4743 0.1019 1 1 0.4158 0.4765 0.1077
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.050 1 -2 2 730 225 505 116 0 4 0 105 0 0 500 0 5 0.5156 0.0000 0.0099 73.667 0.33 2.36 -2.03 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2885 0.5568 0.1546 1 1 0.2889 0.5526 0.1586 1 1 0.2890 0.5472 0.1638
chr17 75616380 C CAGG 0.500000 0.050 1 3 1 1300 280 1020 95 12 80 1 92 0 0 1018 0 2 0.3393 0.0000 0.0020 2.487 0.98 3.40 -2.42 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3656 0.5210 0.1134 1 1 0.3630 0.5192 0.1178 1 1 0.3592 0.5171 0.1237
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.050 1 -6 7 307 118 189 54 0 18 0 46 0 0 188 0 1 0.4576 0.0000 0.0053 5.556 0.52 5.59 -5.07 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3225 0.5162 0.1614 1 1 0.3204 0.5149 0.1647 1 1 0.3176 0.5134 0.1691
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.050 1 -3 2 627 177 450 82 0 1 0 94 0 0 448 0 2 0.4633 0.0000 0.0044 176.000 0.38 3.40 -3.03 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1004 0.4987 0.4009 1 1 0.1048 0.4986 0.3966 1 1 0.1108 0.4984 0.3908
chr17 82519935 CGGGCGGCGGGGCCGG C 0.500000 0.050 1 -15 1 302 79 223 32 1 17 2 27 0 0 217 1 5 0.4051 0.0000 0.0269 3.529 2.34 12.63 -10.29 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2240 0.5198 0.2562 1 1 0.2253 0.5183 0.2563 1 1 0.2270 0.5165 0.2565
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.050 1 6 4 422 106 316 95 2 7 0 2 0 0 316 0 0 0.8962 0.0000 0.0000 14.143 0.34 7.50 -7.16 57 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7196 0.2804 0.0000 0 0 0.9439 0.0561 0.0000 0 0 0.9661 0.0339 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.050 1 3 1 210 95 115 0 0 8 0 87 0 0 111 0 4 0.0000 0.0000 0.0348 10.875 3.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 31068033 T TTC 0.010769 0.050 1 2 1 418 100 318 45 0 1 0 54 0 0 317 0 1 0.4500 0.0000 0.0031 99.000 0.36 2.35 -2.00 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3446 0.6453 0.0101 1 1 0.3510 0.6391 0.0099 1 1 0.3595 0.6309 0.0096
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.050 1 4 1 208 100 108 96 0 1 0 3 0 0 108 0 0 0.9600 0.0000 0.0000 99.000 0.25 3.67 -3.42 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0652 0.9348 0.0000 0 0 0.5455 0.4545 0.0000 0 0 0.7320 0.2680 0.0000
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.050 1 -9 2 471 123 348 104 0 14 1 4 0 0 348 0 0 0.8455 0.0000 0.0000 8.308 1.68 11.00 -9.32 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0167 0.9833 0.0000 0 1 0.4397 0.5603 0.0000 0 0 0.7102 0.2898 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 250 142 108 72 0 7 0 63 0 0 108 0 0 0.5070 0.0000 0.0000 19.286 0.25 3.84 -3.59 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3422 0.5173 0.1406 1 1 0.3397 0.5159 0.1444 1 1 0.3363 0.5142 0.1495
chr18 58536020 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 5 645 147 498 138 0 4 0 5 0 0 498 0 0 0.9388 0.0000 0.0000 35.750 0.32 3.20 -2.88 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0091 0.9909 0.0000 0 0 0.5160 0.4840 0.0000 0 0 0.8100 0.1900 0.0000
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.050 1 -15 2 850 183 667 109 0 5 0 69 0 0 659 0 8 0.5956 0.0000 0.0120 35.600 0.35 11.90 -11.55 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6418 0.3311 0.0271 1 0 0.6302 0.3397 0.0301 1 0 0.6144 0.3512 0.0344
chr18 63655777 T TGCCA 0.500000 0.050 1 4 2 317 104 213 63 0 2 1 38 0 0 209 1 3 0.6058 0.0000 0.0188 51.000 0.95 5.76 -4.81 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5043 0.4262 0.0695 1 0 0.4955 0.4308 0.0737 1 0 0.4837 0.4368 0.0795
chr18 63655779 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 317 103 214 63 0 3 2 35 0 0 210 2 2 0.6117 0.0000 0.0187 33.333 0.94 5.83 -4.89 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5327 0.4070 0.0603 1 0 0.5229 0.4127 0.0644 1 0 0.5098 0.4201 0.0701
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 185 89 96 42 0 1 0 46 0 0 95 0 1 0.4719 0.0000 0.0104 88.000 0.19 3.26 -3.07 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1820 0.5196 0.2984 1 1 0.1847 0.5181 0.2971 1 1 0.1883 0.5163 0.2954
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.050 1 3 1 130 67 63 61 1 3 0 2 0 0 63 0 0 0.9104 0.0000 0.0000 21.333 0.38 3.00 -2.62 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1540 0.8460 0.0000 0 0 0.5482 0.4518 0.0000 0 0 0.6776 0.3224 0.0000
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 4 453 155 298 13 0 23 1 118 0 0 293 0 5 0.0839 0.0000 0.0168 6.000 0.46 3.83 -3.37 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9963 0.0037 2 1 0.0000 0.8632 0.1368
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.050 1 -3 2 267 139 128 76 1 0 0 62 0 0 127 0 1 0.5468 0.0000 0.0078 139.000 0.37 3.18 -2.81 4 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5433 0.4173 0.0395 1 0 0.5390 0.4197 0.0413 1 0 0.5332 0.4230 0.0438
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.050 1 3 2 379 87 292 34 3 28 1 21 0 0 292 0 0 0.3908 0.0000 0.0000 2.185 1.21 3.14 -1.94 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6553 0.3396 0.0052 1 0 0.6497 0.3449 0.0054 1 0 0.6422 0.3520 0.0058
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.050 1 -3 4 292 90 202 0 1 11 77 1 0 1 195 6 0 0.0000 0.0000 0.0347 7.000 3.00 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1650 0.8350 2 2 0.0000 0.1609 0.8391 2 2 0.0000 0.1602 0.8398
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.050 1 -6 4 292 91 201 0 0 10 3 78 0 0 194 1 6 0.0000 0.0000 0.0348 8.100 10.23 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.3917 0.6083 2 2 0.0000 0.4023 0.5977 2 2 0.0000 0.4170 0.5830
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.050 1 -12 4 292 100 192 9 2 38 3 48 0 1 188 0 3 0.0900 0.0000 0.0208 1.735 1.78 12.56 -10.78 9 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0137 0.8023 0.1840 2 1 0.0005 0.9932 0.0063 2 1 0.0000 0.9840 0.0160
chr19 2248153 T TGGAGTCCACCCTCCAGCCCCC 0.063774 0.050 1 21 2 219 45 174 35 1 7 0 2 1 0 173 0 0 0.7778 0.0057 0.0057 5.286 1.46 13.50 -12.04 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5865 0.4135 0.0000 0 0 0.9055 0.0945 0.0000 0 0 0.9441 0.0559 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.050 1 -12 2 627 151 476 4 0 11 2 134 0 0 468 0 8 0.0265 0.0000 0.0168 12.727 0.00 11.11 -11.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9780 0.0220 2 1 0.0000 0.5023 0.4977 2 2 0.0000 0.2542 0.7458
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.050 1 5 3 311 95 216 45 0 7 0 43 0 0 213 0 3 0.4737 0.0000 0.0139 12.571 0.29 5.21 -4.92 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3082 0.5319 0.1599 1 1 0.3101 0.5297 0.1602 1 1 0.3125 0.5269 0.1607
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.050 1 -3 1 857 310 547 122 3 56 15 114 0 0 546 0 1 0.3935 0.0000 0.0018 4.536 0.74 3.46 -2.72 44 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2190 0.5902 0.1908 1 1 0.2243 0.5844 0.1914 1 1 0.2312 0.5769 0.1919
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.050 1 -6 1 430 136 294 0 0 23 3 110 0 0 288 0 6 0.0000 0.0000 0.0204 5.136 10.59 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0998 0.9002 2 2 0.0000 0.1053 0.8947 2 2 0.0000 0.1134 0.8866
chr19 13207858 CCTGCTGCTGCTGCTGCTG C 0.085228 0.050 1 -18 1 430 138 292 64 0 16 0 58 0 0 282 0 10 0.4638 0.0000 0.0342 7.625 5.69 13.71 -8.02 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3784 0.5727 0.0489 1 1 0.3827 0.5685 0.0489 1 1 0.3881 0.5631 0.0487
chr19 13877367 T TGGAGCCGGTGTCAGCGCC 0.004594 0.050 1 18 1 404 115 289 56 0 12 0 47 0 0 279 0 10 0.4870 0.0000 0.0346 8.583 0.16 11.02 -10.86 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4511 0.5466 0.0023 1 1 0.4541 0.5436 0.0023 1 1 0.4580 0.5397 0.0023
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.050 1 3 1 568 116 452 0 0 6 0 110 0 0 451 0 1 0.0000 0.0000 0.0022 18.333 3.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr19 17286690 GTT G 0.132491 0.050 1 -2 1 389 71 318 0 0 5 19 47 0 0 318 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 13.000 3.53 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5556 0.4444 2 1 0.0000 0.5638 0.4362 2 1 0.0000 0.5750 0.4250
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.050 1 -3 1 117 63 54 7 0 4 1 51 0 0 52 0 2 0.1111 0.0000 0.0370 14.750 0.57 3.84 -3.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9908 0.0092 2 1 0.0000 0.9336 0.0664
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.050 1 -3 1 305 90 215 36 0 17 2 35 0 0 215 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 4.294 0.50 3.17 -2.67 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0742 0.5133 0.4126 1 1 0.0746 0.5119 0.4134 1 1 0.0752 0.5103 0.4145
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.050 1 3 1 606 136 470 60 2 5 0 69 0 0 468 0 2 0.4412 0.0000 0.0043 26.200 0.53 3.57 -3.03 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0662 0.4706 0.4632 1 1 0.0682 0.4708 0.4611 1 1 0.0709 0.4711 0.4581
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.050 1 -3 1 556 190 366 92 0 14 0 84 0 0 364 0 2 0.4842 0.0000 0.0055 12.571 0.23 3.33 -3.11 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4815 0.4899 0.0286 1 1 0.4823 0.4884 0.0293 1 1 0.4831 0.4866 0.0302
chr19 37388950 C CTGTG 0.140068 0.050 1 4 5 749 132 617 72 0 1 0 59 0 0 607 0 10 0.5455 0.0000 0.0162 131.000 0.22 4.69 -4.47 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4325 0.5151 0.0524 1 1 0.4339 0.5130 0.0531 1 1 0.4355 0.5104 0.0541
chr19 37388952 AT A 0.140069 0.050 1 -1 2 750 134 616 73 0 2 0 59 0 1 606 0 9 0.5448 0.0000 0.0162 66.000 0.29 4.69 -4.41 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4727 0.4850 0.0424 1 1 0.4726 0.4841 0.0434 1 1 0.4722 0.4831 0.0447
chr19 38304906 TGAA T 0.163680 0.050 1 -3 1 392 97 295 46 0 1 1 49 0 0 295 0 0 0.4742 0.0000 0.0000 96.000 0.17 3.73 -3.56 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3414 0.5594 0.0992 1 1 0.3451 0.5561 0.0988 1 1 0.3499 0.5520 0.0981
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.050 1 -1 2 508 157 351 76 0 4 6 71 0 0 345 1 5 0.4841 0.0000 0.0171 50.333 0.25 3.42 -3.17 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2350 0.5671 0.1979 1 1 0.2398 0.5632 0.1969 1 1 0.2461 0.5583 0.1956
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.050 1 -2 1 230 35 195 0 0 1 26 8 0 0 195 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 30.000 3.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1080 0.8920 2 2 0.0000 0.1097 0.8903 2 2 0.0000 0.1120 0.8880
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.050 1 2 2 230 34 196 0 0 17 15 2 0 0 196 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.786 1.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1397 0.8603 2 2 0.0000 0.1410 0.8590 2 2 0.0000 0.1428 0.8572
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.050 1 -6 1 433 125 308 0 0 10 0 115 0 0 308 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.500 6.13 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0436 0.9564 2 2 0.0000 0.0461 0.9539 2 2 0.0000 0.0497 0.9503
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.050 1 1 2 513 165 348 156 0 3 0 6 0 0 348 0 0 0.9455 0.0000 0.0000 54.000 0.28 2.00 -1.72 96 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0116 0.9884 0.0000 0 0 0.7735 0.2265 0.0000 0 0 0.9475 0.0525 0.0000
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.050 1 -1 1 501 113 388 109 1 1 0 2 1 0 387 0 0 0.9646 0.0026 0.0026 111.000 1.22 2.50 -1.28 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9094 0.0906 0.0000 0 0 0.9847 0.0153 0.0000 0 0 0.9908 0.0092 0.0000
chr19 44177654 G GA 0.000220 0.050 1 1 2 387 67 320 28 0 13 2 24 0 0 319 0 1 0.4179 0.0000 0.0031 4.077 1.00 1.33 -0.33 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5001 0.4998 0.0001 1 0 0.5007 0.4992 0.0001 1 0 0.5014 0.4985 0.0001
chr19 44273995 TCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTGAGGTATGTGATAAGGGCTTCAGTAAGGCCTCAAATCTTCAAGCCCATCAGAGAATC T 0.002701 0.050 1 -84 2 585 104 481 68 1 7 0 28 0 1 464 0 16 0.6538 0.0000 0.0353 13.857 0.50 3.93 -3.43 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7556 0.2442 0.0002 1 0 0.7484 0.2514 0.0002 1 0 0.7387 0.2611 0.0002
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.050 1 -1 2 481 110 371 3 0 3 1 103 0 0 365 5 1 0.0273 0.0000 0.0162 35.667 0.33 2.84 -2.51 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9796 0.0204 2 1 0.0000 0.7396 0.2604 2 1 0.0000 0.5579 0.4421
chr19 45145594 GGGAGGAAGA G 0.000119 0.050 1 -9 4 649 144 505 78 0 7 0 59 0 0 503 0 2 0.5417 0.0000 0.0040 19.571 0.29 8.83 -8.54 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6616 0.3384 0.0000 1 0 0.6572 0.3428 0.0000 1 0 0.6512 0.3487 0.0000
chr19 45409231 CAAG C 0.234924 0.050 1 -3 2 540 115 425 49 0 9 4 53 0 0 421 0 4 0.4261 0.0000 0.0094 11.778 1.29 3.55 -2.26 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2123 0.5743 0.2134 1 1 0.2185 0.5718 0.2098 1 1 0.2267 0.5684 0.2049
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.050 1 6 2 1058 339 719 9 1 74 0 255 0 0 681 0 38 0.0265 0.0000 0.0529 3.581 0.67 6.42 -5.76 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 2 0.0000 0.3207 0.6793 2 2 0.0000 0.0343 0.9657
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.050 1 18 1 375 94 281 8 0 17 0 69 0 0 242 0 39 0.0851 0.0000 0.1388 4.529 0.00 11.99 -11.99 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.9257 0.0743
chr19 47802355 TTTGGGCCTGAGA T 0.004392 0.050 1 -12 3 1489 375 1114 168 8 59 10 130 2 3 1101 2 6 0.4480 0.0018 0.0117 5.220 2.45 9.95 -7.51 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7761 0.2238 0.0001 1 0 0.7702 0.2297 0.0001 1 0 0.7620 0.2379 0.0002
chr19 48231760 C CTT 0.055045 0.050 1 2 1 130 51 79 28 0 0 0 23 0 0 79 0 0 0.5490 0.0000 0.0000 51.000 0.36 2.13 -1.77 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5222 0.4593 0.0186 1 0 0.5208 0.4603 0.0189 1 0 0.5190 0.4617 0.0193
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.050 1 1 1 222 93 129 84 0 6 0 3 0 0 129 0 0 0.9032 0.0000 0.0000 14.500 0.58 1.33 -0.75 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2392 0.7608 0.0000 0 0 0.8346 0.1654 0.0000 0 0 0.9198 0.0802 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.050 1 -3 1 1116 313 803 106 29 65 10 103 0 3 792 1 7 0.3387 0.0000 0.0137 3.815 2.77 3.57 -0.80 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4787 0.4649 0.0565 1 0 0.4752 0.4651 0.0597 1 0 0.4702 0.4656 0.0642
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.050 1 3 1 1126 288 838 207 10 58 2 11 2 0 835 1 0 0.7188 0.0024 0.0036 3.931 0.62 3.18 -2.56 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0896 0.9104 0.0000 0 0 0.7667 0.2333 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.050 1 -6 2 569 167 402 65 1 33 0 68 0 1 396 0 5 0.3892 0.0000 0.0149 4.061 0.89 6.71 -5.81 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2183 0.5521 0.2296 1 1 0.2225 0.5489 0.2286 1 1 0.2280 0.5450 0.2271
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.050 1 -18 2 619 239 380 95 1 61 0 82 0 0 380 0 0 0.3975 0.0000 0.0000 2.902 0.27 10.07 -9.80 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5807 0.4036 0.0158 1 0 0.5779 0.4056 0.0165 1 0 0.5739 0.4085 0.0176
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.050 1 3 2 744 164 580 7 0 4 143 10 0 0 576 3 1 0.0427 0.0000 0.0069 40.000 0.14 3.90 -3.76 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.6775 0.3225 2 2 0.0000 0.2277 0.7723
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.050 1 3 3 746 167 579 0 0 9 9 149 0 0 576 0 3 0.0000 0.0000 0.0052 17.444 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0328 0.9672 2 2 0.0000 0.0355 0.9645 2 2 0.0000 0.0395 0.9605
chr19 51225847 CCCGG C 0.024525 0.050 1 -4 2 583 180 403 171 2 4 0 3 0 0 401 1 1 0.9500 0.0000 0.0050 44.000 0.57 4.00 -3.43 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7995 0.2005 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.050 1 1 1 568 153 415 0 0 3 15 135 0 0 410 1 4 0.0000 0.0000 0.0120 50.000 2.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0106 0.9894 2 2 0.0000 0.0114 0.9886 2 2 0.0000 0.0127 0.9873
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.050 1 -2 1 232 101 131 96 0 2 0 3 0 0 131 0 0 0.9505 0.0000 0.0000 49.500 0.36 2.00 -1.64 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0314 0.9686 0.0000 0 1 0.3568 0.6432 0.0000 0 0 0.5578 0.4422 0.0000
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.050 1 -1 2 439 128 311 73 0 4 0 51 0 0 311 0 0 0.5703 0.0000 0.0000 31.000 0.37 2.08 -1.71 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5863 0.3724 0.0413 1 0 0.5776 0.3782 0.0442 1 0 0.5657 0.3859 0.0484
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.050 1 3 1 528 124 404 66 1 2 0 55 0 0 401 0 3 0.5323 0.0000 0.0074 61.000 0.92 3.51 -2.58 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4033 0.4918 0.1049 1 1 0.4007 0.4914 0.1079 1 1 0.3971 0.4910 0.1119
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.050 1 3 2 1026 233 793 106 1 1 0 125 0 0 790 0 3 0.4549 0.0000 0.0038 232.000 0.17 3.00 -2.83 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0789 0.4970 0.4242 1 1 0.0841 0.4983 0.4176 1 1 0.0914 0.5000 0.4085
chr19 53982545 C CCGG 0.000582 0.050 1 3 5 524 114 410 57 2 20 0 35 2 0 406 0 2 0.5000 0.0049 0.0098 4.700 1.12 3.66 -2.53 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7449 0.2551 0.0000 1 0 0.7378 0.2621 0.0000 1 0 0.7282 0.2717 0.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.050 1 -1 5 811 254 557 237 0 15 0 2 0 0 557 0 0 0.9331 0.0000 0.0000 18.385 0.80 1.00 -0.20 123 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8775 0.1225 0.0000 0 0 0.9770 0.0230 0.0000 0 0 0.9849 0.0151 0.0000
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.050 1 3 1 736 129 607 3 0 10 0 116 0 0 602 0 5 0.0233 0.0000 0.0082 11.900 0.00 3.40 -3.40 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8832 0.1168 2 2 0.0000 0.3079 0.6921 2 2 0.0000 0.1659 0.8341
chr19 54574302 GC G 0.000004 0.050 1 -1 3 1044 263 781 230 2 3 0 28 0 0 781 0 0 0.8745 0.0000 0.0000 86.333 0.97 6.79 -5.82 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3746 0.6254 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr19 54574306 C CA 0.000003 0.050 1 1 2 1043 262 781 230 2 4 0 26 0 0 781 0 0 0.8779 0.0000 0.0000 64.500 0.97 7.04 -6.06 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7533 0.2467 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.050 1 9 2 461 116 345 54 0 18 0 44 0 0 339 0 6 0.4655 0.0000 0.0174 5.444 0.37 7.89 -7.52 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2834 0.5268 0.1899 1 1 0.2828 0.5247 0.1924 1 1 0.2820 0.5222 0.1958
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.050 1 -24 1 642 152 490 0 0 28 0 124 0 0 448 0 42 0.0000 0.0000 0.0857 4.429 18.61 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.050 1 3 4 822 233 589 112 1 41 2 77 0 0 582 2 5 0.4807 0.0000 0.0119 4.683 0.98 6.21 -5.23 52 0/1 1/1 . . OK 1 0 0.6527 0.3265 0.0208 1 0 0.6446 0.3327 0.0227 1 0 0.6336 0.3410 0.0254
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.050 1 3 1 597 101 496 0 0 4 0 97 0 0 489 0 7 0.0000 0.0000 0.0141 24.250 3.44 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0591 0.9409 2 2 0.0000 0.0621 0.9379 2 2 0.0000 0.0664 0.9336
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.050 1 -2 1 346 127 219 65 0 3 0 59 0 0 219 0 0 0.5118 0.0000 0.0000 41.333 0.09 2.07 -1.98 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2733 0.5356 0.1911 1 1 0.2721 0.5332 0.1947 1 1 0.2704 0.5302 0.1993
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.050 1 -6 2 101 52 49 20 0 0 0 32 0 0 49 0 0 0.3846 0.0000 0.0000 52.000 0.00 7.31 -7.31 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0913 0.4475 0.4612 1 2 0.0944 0.4501 0.4556 1 1 0.0985 0.4534 0.4480
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.050 1 3 1 420 100 320 47 3 8 0 42 0 0 316 0 4 0.4700 0.0000 0.0125 11.375 0.85 3.62 -2.77 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4841 0.4893 0.0266 1 1 0.4844 0.4887 0.0269 1 1 0.4846 0.4880 0.0275
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.050 1 5 1 324 134 190 76 0 13 0 45 0 0 188 0 2 0.5672 0.0000 0.0105 9.308 0.36 5.76 -5.40 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7529 0.2406 0.0066 1 0 0.7443 0.2485 0.0072 1 0 0.7325 0.2593 0.0082
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.050 1 1 2 246 102 144 94 0 4 0 4 0 0 144 0 0 0.9216 0.0000 0.0000 24.500 0.41 2.00 -1.59 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0100 0.9900 0.0000 0 1 0.3046 0.6954 0.0000 0 0 0.5720 0.4280 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.050 1 -6 2 745 184 561 110 0 3 0 71 0 0 557 0 4 0.5978 0.0000 0.0071 60.333 0.25 6.25 -6.00 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6997 0.2823 0.0179 1 0 0.6881 0.2918 0.0202 1 0 0.6721 0.3045 0.0235
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.050 1 3 1 483 160 323 74 2 5 0 79 0 0 318 1 4 0.4625 0.0000 0.0155 31.000 0.43 3.25 -2.82 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0945 0.5007 0.4049 1 1 0.0971 0.4994 0.4035 1 1 0.1007 0.4978 0.4015
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.050 1 -9 4 211 80 131 33 1 20 0 26 0 0 130 0 1 0.4125 0.0000 0.0076 3.000 2.09 9.31 -7.22 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2816 0.5187 0.1997 1 1 0.2790 0.5178 0.2032 1 1 0.2755 0.5167 0.2078
chr20 35627312 C CA 0.103940 0.050 1 1 1 179 83 96 40 0 3 0 40 0 0 95 0 1 0.4819 0.0000 0.0104 26.667 0.40 1.45 -1.05 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4128 0.5343 0.0529 1 1 0.4149 0.5321 0.0529 1 1 0.4177 0.5293 0.0530
chr20 35652812 T TGGGCCA 0.001198 0.050 1 6 2 847 214 633 115 1 18 0 80 0 0 622 0 11 0.5374 0.0000 0.0174 10.833 0.37 5.29 -4.92 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7255 0.2744 0.0001 1 0 0.7199 0.2800 0.0001 1 0 0.7121 0.2878 0.0001
chr20 44065918 C CCCG 0.103979 0.050 1 3 4 493 180 313 89 0 13 1 77 0 0 312 0 1 0.4944 0.0000 0.0032 12.846 0.25 3.16 -2.91 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5335 0.4437 0.0228 1 0 0.5322 0.4442 0.0236 1 0 0.5301 0.4451 0.0248
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.050 1 -3 2 560 167 393 70 0 11 0 86 0 0 392 0 1 0.4192 0.0000 0.0025 14.182 0.61 3.43 -2.82 50 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0610 0.4348 0.5042 1 2 0.0643 0.4374 0.4983 1 2 0.0689 0.4409 0.4902
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.050 1 -3 2 1006 293 713 6 0 31 15 241 0 0 706 0 7 0.0205 0.0000 0.0098 8.452 0.17 3.15 -2.99 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9391 0.0609 2 2 0.0000 0.0514 0.9486 2 2 0.0000 0.0109 0.9891
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.050 1 -3 2 522 235 287 94 3 34 3 101 0 0 284 0 3 0.4000 0.0000 0.0105 5.853 0.26 3.05 -2.79 38 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1714 0.5691 0.2595 1 1 0.1771 0.5655 0.2573 1 1 0.1848 0.5609 0.2543
chr20 58461467 G GCAGGGC 0.000162 0.050 1 6 4 586 199 387 187 0 8 0 4 0 0 387 0 0 0.9397 0.0000 0.0000 23.875 0.22 6.00 -5.78 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.050 1 -6 2 163 28 135 0 0 1 0 27 0 0 130 0 5 0.0000 0.0000 0.0370 27.000 6.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr20 62960578 AT A 0.000110 0.050 1 -1 1 175 87 88 84 1 0 0 2 0 0 88 0 0 0.9655 0.0000 0.0000 87.000 0.14 1.00 -0.86 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.050 1 -1 1 261 135 126 0 0 2 0 133 0 0 126 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 66.500 1.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0139 0.9861 2 2 0.0000 0.0148 0.9852 2 2 0.0000 0.0162 0.9838
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.050 1 6 4 723 167 556 77 0 3 0 87 0 0 548 0 8 0.4611 0.0000 0.0144 54.667 0.21 5.55 -5.34 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0752 0.4610 0.4638 1 1 0.0794 0.4631 0.4575 1 1 0.0853 0.4659 0.4488
chr21 33488442 CAATTA C 0.224085 0.050 1 -5 2 651 199 452 97 0 6 1 95 0 0 448 0 4 0.4874 0.0000 0.0088 32.167 0.86 4.96 -4.10 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3055 0.5772 0.1173 1 1 0.3101 0.5722 0.1177 1 1 0.3159 0.5658 0.1182
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.050 1 3 2 274 132 142 59 0 6 0 67 0 0 142 0 0 0.4470 0.0000 0.0000 21.000 0.10 3.06 -2.96 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1242 0.5058 0.3700 1 1 0.1273 0.5047 0.3679 1 1 0.1315 0.5035 0.3650
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.050 1 1 2 314 56 258 0 0 2 0 54 0 0 257 1 0 0.0000 0.0000 0.0039 27.000 2.41 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.050 1 2 2 1152 182 970 0 3 6 14 159 1 0 962 1 6 0.0000 0.0010 0.0082 27.833 3.36 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1356 0.8644 2 2 0.0000 0.0292 0.9708 2 2 0.0000 0.0185 0.9815
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.050 1 -2 2 1148 180 968 0 1 12 14 153 0 1 959 2 6 0.0000 0.0000 0.0093 16.800 3.45 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0514 0.9486 2 2 0.0000 0.0210 0.9790 2 2 0.0000 0.0160 0.9840
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.050 1 -15 2 743 151 592 70 2 17 0 62 27 10 540 2 13 0.4636 0.0456 0.0878 7.824 1.73 13.98 -12.26 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7391 0.2520 0.0089 1 0 0.7304 0.2597 0.0099 1 0 0.7184 0.2702 0.0114
chr21 44579846 AGG A 0.004815 0.050 1 -2 2 763 240 523 149 1 5 3 82 0 0 518 0 5 0.6208 0.0000 0.0096 46.800 1.91 8.52 -6.61 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9345 0.0655 0.0000 1 0 0.9287 0.0713 0.0000 1 0 0.9201 0.0798 0.0000
chr21 44579850 A ACG 0.004831 0.050 1 2 1 765 235 530 147 2 2 5 79 0 0 525 0 5 0.6255 0.0000 0.0094 115.500 1.91 8.53 -6.62 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9364 0.0636 0.0000 1 0 0.9306 0.0694 0.0000 1 0 0.9222 0.0778 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.050 1 -15 2 629 114 515 61 0 14 2 37 0 0 512 0 3 0.5351 0.0000 0.0058 7.692 1.02 16.35 -15.33 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4621 0.4524 0.0855 1 1 0.4538 0.4561 0.0902 1 1 0.4427 0.4607 0.0966
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.050 1 -9 7 368 146 222 1 2 17 0 126 0 0 222 0 0 0.0068 0.0000 0.0000 7.588 0.00 7.51 -7.51 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0653 0.9347 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0049 0.9951
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.050 1 3 1 536 221 315 181 5 32 0 3 0 1 314 0 0 0.8190 0.0000 0.0032 5.875 0.34 2.00 -1.66 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6377 0.3623 0.0000 0 0 0.9665 0.0335 0.0000 0 0 0.9841 0.0159 0.0000
chr22 20858678 GCCGCCT G 0.003426 0.050 1 -6 2 447 164 283 84 0 20 1 59 0 0 283 0 0 0.5122 0.0000 0.0000 7.200 0.43 5.47 -5.05 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7323 0.2674 0.0002 1 0 0.7259 0.2738 0.0003 1 0 0.7172 0.2825 0.0003
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.050 1 -3 3 203 99 104 90 2 3 0 4 0 0 104 0 0 0.9091 0.0000 0.0000 32.000 0.17 4.00 -3.83 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0448 0.9552 0.0000 0 0 0.6790 0.3210 0.0000 0 0 0.8665 0.1335 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.050 1 -21 3 642 135 507 1 0 28 1 105 0 0 493 1 13 0.0074 0.0000 0.0276 3.821 0.00 14.34 -14.34 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0337 0.9663 2 2 0.0000 0.0139 0.9861 2 2 0.0000 0.0113 0.9887
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.050 1 -3 1 780 228 552 103 1 5 0 119 0 0 552 0 0 0.4518 0.0000 0.0000 44.600 0.29 4.02 -3.73 73 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1159 0.5369 0.3472 1 1 0.1214 0.5352 0.3434 1 1 0.1288 0.5332 0.3380
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.050 1 -2 3 632 186 446 11 0 8 0 167 0 0 439 0 7 0.0591 0.0000 0.0157 22.250 0.55 2.19 -1.64 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9574 0.0426 2 2 0.0000 0.4936 0.5064
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.050 1 -6 2 492 230 262 171 1 56 0 2 0 0 262 0 0 0.7435 0.0000 0.0000 3.107 0.69 6.50 -5.81 59 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9028 0.0972 0.0000 0 0 0.9832 0.0168 0.0000 0 0 0.9895 0.0105 0.0000
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.050 1 -21 6 657 132 525 123 3 5 0 1 0 0 525 0 0 0.9318 0.0000 0.0000 25.200 0.89 22.00 -21.11 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7858 0.2142 0.0000 0 0 0.9003 0.0997 0.0000 0 0 0.9176 0.0824 0.0000
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.050 1 -42 4 338 181 157 173 0 5 0 3 0 0 157 0 0 0.9558 0.0000 0.0000 35.200 0.40 14.00 -13.60 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5602 0.4398 0.0000 0 0 0.9547 0.0453 0.0000 0 0 0.9785 0.0215 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.050 1 9 4 393 189 204 91 0 17 0 81 0 1 198 0 5 0.4815 0.0000 0.0294 10.118 0.16 6.52 -6.35 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3696 0.5227 0.1077 1 1 0.3697 0.5202 0.1101 1 1 0.3696 0.5170 0.1134
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.050 1 3 3 345 139 206 0 0 6 0 133 0 0 203 0 3 0.0000 0.0000 0.0146 22.167 3.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0133 0.9867 2 2 0.0000 0.0142 0.9858 2 2 0.0000 0.0156 0.9844
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.050 1 -3 1 582 202 380 93 0 19 7 83 0 0 378 0 2 0.4604 0.0000 0.0053 10.167 0.12 3.35 -3.23 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3527 0.5473 0.1000 1 1 0.3553 0.5434 0.1013 1 1 0.3585 0.5386 0.1029
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.050 1 1 3 1447 357 1090 202 0 8 0 147 0 0 1080 1 9 0.5658 0.0000 0.0092 43.625 0.42 9.44 -9.02 74 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8032 0.1927 0.0040 1 0 0.7944 0.2009 0.0047 1 0 0.7820 0.2122 0.0058
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.050 1 -1 1 882 334 548 270 2 6 0 56 0 1 547 0 0 0.8084 0.0000 0.0018 54.667 0.20 2.96 -2.76 80 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
701 rows