File Info

Filename
HG02622_x_HG02630_FF_5.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG02622_x_HG02630_FF_5.features.tsv
Size
165.6 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1232289 T TGCGGCGGGCGTGGCG 0.000919 0.050 1 15 1 484 143 341 69 1 22 1 50 0 0 326 0 15 0.4825 0.0000 0.0440 5.500 1.04 14.22 -13.18 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5078 0.4919 0.0003 1 0 0.5090 0.4907 0.0003 1 0 0.5104 0.4892 0.0003
chr1 1426150 C CGGA 0.000187 0.050 1 3 1 268 77 191 36 0 5 1 35 0 0 189 0 2 0.4675 0.0000 0.0105 14.400 1.75 4.49 -2.74 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4536 0.5463 0.0001 1 1 0.4562 0.5437 0.0001 1 1 0.4595 0.5404 0.0001
chr1 1708855 TTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -6 1 668 305 363 275 0 27 0 3 0 0 363 0 0 0.9016 0.0000 0.0000 10.296 0.69 7.33 -6.65 113 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8836 0.1164 0.0000 0 0 0.9917 0.0083 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr1 2529505 C CGCG 0.500000 0.050 1 3 1 434 125 309 61 4 14 1 45 0 0 307 0 2 0.4880 0.0000 0.0065 7.929 0.69 4.02 -3.33 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4600 0.4547 0.0853 1 1 0.4528 0.4576 0.0896 1 1 0.4432 0.4613 0.0955
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 2 730 236 494 0 102 32 3 99 0 1 493 0 0 0.0000 0.0000 0.0020 6.312 3.99 0 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1726 0.5524 0.2750 1 1 0.1761 0.5484 0.2755 1 1 0.1806 0.5435 0.2760
chr1 6469126 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 733 233 500 4 0 130 4 95 0 0 500 0 0 0.0172 0.0000 0.0000 16.833 0.25 4.13 -3.88 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9393 0.0607 2 2 0.0000 0.2692 0.7308 2 2 0.0000 0.1130 0.8870
chr1 6469129 TCC T 0.500000 0.050 1 -2 2 735 237 498 108 4 22 11 92 0 0 498 0 0 0.4557 0.0000 0.0000 69.333 1.09 4.02 -2.93 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2826 0.5555 0.1619 1 1 0.2830 0.5513 0.1656 1 1 0.2834 0.5461 0.1705
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.050 1 3 1 495 107 388 1 0 20 4 82 0 0 381 0 7 0.0093 0.0000 0.0180 4.300 0.00 3.24 -3.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3309 0.6691 2 2 0.0000 0.1650 0.8350 2 2 0.0000 0.1355 0.8645
chr1 13260413 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 574 131 443 83 1 4 1 42 0 0 443 0 0 0.6336 0.0000 0.0000 31.750 0.58 1.21 -0.64 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7547 0.2322 0.0131 1 0 0.7412 0.2437 0.0150 1 0 0.7226 0.2594 0.0180
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.050 1 3 2 972 194 778 108 0 10 1 75 0 0 775 0 3 0.5567 0.0000 0.0039 18.400 0.42 3.29 -2.88 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6040 0.3617 0.0343 1 0 0.5933 0.3691 0.0376 1 0 0.5787 0.3788 0.0424
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.050 1 3 2 305 111 194 103 0 6 0 2 0 0 194 0 0 0.9279 0.0000 0.0000 17.500 0.28 3.00 -2.72 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3379 0.6621 0.0000 0 0 0.7693 0.2307 0.0000 0 0 0.8489 0.1511 0.0000
chr1 21474942 TGTCTCCCAG T 0.500000 0.050 1 -9 1 155 67 88 62 0 2 0 3 0 0 88 0 0 0.9254 0.0000 0.0000 32.500 0.48 6.33 -5.85 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0343 0.9657 0.0000 0 1 0.3835 0.6165 0.0000 0 0 0.5918 0.4082 0.0000
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.050 1 -2 3 784 200 584 59 36 7 35 63 0 0 582 0 2 0.2950 0.0000 0.0034 26.000 7.24 27.25 -20.02 21 1/1 0/1 . . OK 1 1 0.1481 0.5395 0.3124 1 1 0.1520 0.5365 0.3115 1 1 0.1572 0.5327 0.3101
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.050 1 -6 4 816 194 622 9 0 23 1 161 0 0 617 0 5 0.0464 0.0000 0.0080 7.727 0.78 15.96 -15.18 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8728 0.1272 2 2 0.0000 0.3481 0.6519
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.050 1 -24 1 671 154 517 84 0 3 0 67 0 0 498 0 19 0.5455 0.0000 0.0368 50.333 0.62 18.36 -17.74 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2026 0.5505 0.2469 1 1 0.2051 0.5467 0.2481 1 1 0.2084 0.5420 0.2496
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 1 402 177 225 98 1 13 0 65 0 0 224 0 1 0.5537 0.0000 0.0044 12.615 0.19 3.09 -2.90 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6594 0.3154 0.0252 1 0 0.6473 0.3247 0.0280 1 0 0.6306 0.3371 0.0322
chr1 35114681 GATA G 0.500000 0.050 1 -3 1 812 190 622 172 0 13 0 5 0 0 622 0 0 0.9053 0.0000 0.0000 13.615 0.37 3.80 -3.43 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0212 0.9788 0.0000 0 0 0.7115 0.2885 0.0000 0 0 0.9059 0.0941 0.0000
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 2 351 96 255 86 0 7 0 3 0 0 255 0 0 0.8958 0.0000 0.0000 12.714 0.40 3.33 -2.94 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0616 0.9384 0.0000 0 0 0.5297 0.4703 0.0000 0 0 0.7205 0.2795 0.0000
chr1 46668333 G GCCT 0.500000 0.050 1 3 5 432 183 249 155 6 18 1 3 0 0 248 0 1 0.8470 0.0000 0.0040 9.111 0.59 4.00 -3.41 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0669 0.9331 0.0000 0 0 0.7623 0.2377 0.0000 0 0 0.9059 0.0941 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.050 1 6 1 601 144 457 0 0 20 2 122 0 0 457 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.200 6.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0423 0.9577 2 2 0.0000 0.0449 0.9551 2 2 0.0000 0.0487 0.9513
chr1 50419101 CCGGCGG C 0.500000 0.050 1 -6 6 655 145 510 122 8 9 0 6 1 0 509 0 0 0.8414 0.0020 0.0020 15.111 2.31 8.33 -6.02 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.3172 0.6828 0.0000 0 0 0.7136 0.2864 0.0000
chr1 62206717 T TAACAGA 0.500000 0.050 1 6 2 425 103 322 51 0 7 0 45 0 0 313 0 9 0.4951 0.0000 0.0280 13.714 0.10 6.09 -5.99 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2007 0.5293 0.2700 1 1 0.2030 0.5271 0.2700 1 1 0.2059 0.5243 0.2698
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.050 1 6 1 285 102 183 86 1 8 1 6 0 0 183 0 0 0.8431 0.0000 0.0000 11.500 0.72 3.33 -2.61 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1226 0.8774 0.0000 0 1 0.4412 0.5588 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.050 1 3 1 134 72 62 37 0 2 0 33 0 0 61 0 1 0.5139 0.0000 0.0161 35.000 0.19 3.52 -3.33 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2759 0.5189 0.2051 1 1 0.2754 0.5175 0.2071 1 1 0.2747 0.5157 0.2096
chr1 78641091 CATGAGTAGATCT C 0.500000 0.050 1 -12 3 251 93 158 88 0 3 0 2 0 0 158 0 0 0.9462 0.0000 0.0000 30.000 0.16 12.00 -11.84 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2591 0.7409 0.0000 0 0 0.6973 0.3027 0.0000 0 0 0.7968 0.2032 0.0000
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.050 1 -9 2 380 161 219 82 0 24 0 55 0 0 215 0 4 0.5093 0.0000 0.0183 5.708 1.40 8.45 -7.05 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5362 0.4086 0.0552 1 0 0.5268 0.4140 0.0592 1 0 0.5141 0.4211 0.0648
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.050 1 -6 1 442 152 290 90 0 7 0 55 0 0 289 0 1 0.5921 0.0000 0.0034 20.714 0.12 5.36 -5.24 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6758 0.3008 0.0234 1 0 0.6632 0.3107 0.0262 1 0 0.6458 0.3239 0.0302
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.050 1 -6 1 439 154 285 82 1 23 0 48 0 0 285 0 0 0.5325 0.0000 0.0000 5.696 0.13 5.98 -5.85 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6909 0.2874 0.0217 1 0 0.6779 0.2978 0.0243 1 0 0.6600 0.3117 0.0282
chr1 92182085 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 653 130 523 56 0 2 0 72 0 0 523 0 0 0.4308 0.0000 0.0000 64.000 0.61 3.40 -2.80 26 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0907 0.4679 0.4414 1 1 0.0950 0.4699 0.4350 1 1 0.1010 0.4725 0.4265
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 2 442 132 310 75 0 5 1 51 0 0 308 1 1 0.5682 0.0000 0.0065 25.400 0.39 3.18 -2.79 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5119 0.4240 0.0641 1 0 0.5031 0.4286 0.0682 1 0 0.4913 0.4347 0.0740
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.050 1 -24 3 860 205 655 98 1 11 1 94 0 0 654 0 1 0.4780 0.0000 0.0015 17.545 0.64 16.27 -15.62 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2513 0.5569 0.1918 1 1 0.2526 0.5526 0.1948 1 1 0.2541 0.5472 0.1986
chr1 111414897 A ACAGGGGTCAGGGTCTTTTCCC 0.500000 0.050 1 21 1 847 179 668 87 0 19 1 72 0 0 661 3 4 0.4860 0.0000 0.0105 11.357 0.51 18.62 -18.12 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2882 0.5421 0.1696 1 1 0.2880 0.5390 0.1730 1 1 0.2876 0.5350 0.1775
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.050 1 3 1 602 176 426 79 5 21 2 69 1 0 424 0 1 0.4489 0.0023 0.0047 7.600 0.42 3.58 -3.16 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3849 0.5028 0.1123 1 1 0.3810 0.5024 0.1166 1 1 0.3757 0.5020 0.1223
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.050 1 -2 3 210 74 136 3 28 4 0 39 0 0 136 0 0 0.0405 0.0000 0.0000 11.750 0.00 2.36 -2.36 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1023 0.4563 0.4414 1 1 0.1065 0.4593 0.4342 1 1 0.1122 0.4631 0.4247
chr1 121095875 T TCCAGTTA 0.500000 0.050 1 7 2 480 96 384 92 0 1 0 3 0 0 384 0 0 0.9583 0.0000 0.0000 95.000 0.38 7.00 -6.62 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0703 0.9297 0.0000 0 0 0.5659 0.4341 0.0000 0 0 0.7485 0.2515 0.0000
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 197 76 121 68 0 5 0 3 0 0 121 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 14.200 0.76 6.00 -5.24 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0399 0.9601 0.0000 0 1 0.4192 0.5808 0.0000 0 0 0.6261 0.3739 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.050 1 -36 1 1204 291 913 179 3 45 4 60 0 0 912 0 1 0.6151 0.0000 0.0011 5.467 1.09 2.92 -1.82 15 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9919 0.0081 0.0000 1 0 0.9901 0.0099 0.0000 1 0 0.9871 0.0129 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 261 110 151 4 0 14 4 88 0 0 151 0 0 0.0364 0.0000 0.0000 6.571 1.25 1.18 0.07 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9826 0.0174 2 1 0.0000 0.5976 0.4024 2 2 0.0000 0.3307 0.6693
chr1 152709204 C CAGCTCTGGAGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 238 78 160 5 1 4 1 67 0 0 132 0 28 0.0641 0.0000 0.1750 18.500 0.20 9.63 -9.43 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8333 0.1667 2 2 0.0000 0.4798 0.5202
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 238 78 160 0 0 10 0 68 0 0 132 0 28 0.0000 0.0000 0.1750 6.800 9.49 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0820 0.9180 2 2 0.0000 0.0857 0.9143 2 2 0.0000 0.0910 0.9090
chr1 152761321 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 348 88 260 42 1 3 1 41 0 0 260 0 0 0.4773 0.0000 0.0000 28.333 1.10 1.15 -0.05 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2494 0.5256 0.2250 1 1 0.2499 0.5236 0.2264 1 1 0.2506 0.5212 0.2282
chr1 152985344 GGAGCCCTGCCACCCCAAGGTGCCT G 0.500000 0.050 1 -24 2 562 216 346 181 2 30 0 3 0 0 346 0 0 0.8380 0.0000 0.0000 6.200 1.08 16.33 -15.25 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4284 0.5716 0.0000 0 0 0.9248 0.0752 0.0000 0 0 0.9634 0.0366 0.0000
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.050 1 6 2 808 261 547 99 2 31 10 119 0 0 534 0 13 0.3793 0.0000 0.0238 7.600 2.06 6.76 -4.70 65 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0137 0.2666 0.7197 1 2 0.0157 0.2767 0.7076 1 2 0.0187 0.2905 0.6908
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.050 1 12 1 1285 317 968 7 1 63 3 243 1 1 913 3 50 0.0221 0.0010 0.0568 4.148 2.14 10.64 -8.50 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 2 0.0000 0.2749 0.7251 2 2 0.0000 0.0284 0.9716
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 1 1438 411 1027 12 2 110 5 282 0 0 990 0 37 0.0292 0.0000 0.0360 2.727 2.08 7.29 -5.21 0 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7909 0.2091 2 2 0.0000 0.0714 0.9286
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 180 59 121 3 0 2 0 54 0 0 120 0 1 0.0508 0.0000 0.0083 28.500 2.67 2.41 0.26 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9684 0.0316 2 1 0.0000 0.6534 0.3466 2 2 0.0000 0.4483 0.5517
chr1 156583439 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 312 91 221 48 0 6 0 37 0 0 221 0 0 0.5275 0.0000 0.0000 14.167 0.31 1.46 -1.15 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3820 0.4902 0.1278 1 1 0.3775 0.4908 0.1317 1 1 0.3714 0.4916 0.1370
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.050 1 2 4 611 173 438 0 0 3 1 169 0 0 437 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 56.333 2.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0134 0.9866 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0164 0.9836
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 1242 233 1009 99 0 6 0 128 0 0 1006 0 3 0.4249 0.0000 0.0030 37.833 0.25 1.41 -1.16 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0266 0.3432 0.6302 1 2 0.0296 0.3510 0.6194 1 2 0.0339 0.3615 0.6047
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.050 1 3 1 125 68 57 35 0 1 0 32 0 0 57 0 0 0.5147 0.0000 0.0000 67.000 0.23 4.28 -4.05 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2766 0.5177 0.2056 1 1 0.2761 0.5164 0.2076 1 1 0.2752 0.5147 0.2101
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 180 59 121 35 0 1 0 23 0 0 121 0 0 0.5932 0.0000 0.0000 58.000 0.43 1.09 -0.66 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4014 0.4761 0.1225 1 1 0.3958 0.4778 0.1265 1 1 0.3883 0.4799 0.1318
chr1 183533735 T TACA 0.500000 0.050 1 3 2 192 70 122 41 0 3 0 26 0 0 121 0 1 0.5857 0.0000 0.0082 22.333 0.22 3.15 -2.93 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4277 0.4652 0.1071 1 1 0.4212 0.4675 0.1113 1 1 0.4125 0.4706 0.1169
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 612 159 453 91 1 1 2 64 0 0 450 2 1 0.5723 0.0000 0.0066 157.000 0.82 4.78 -3.96 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5289 0.4159 0.0552 1 0 0.5200 0.4208 0.0592 1 0 0.5079 0.4272 0.0649
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.050 1 -2 3 609 160 449 93 0 0 0 67 0 0 444 0 5 0.5813 0.0000 0.0111 160.000 0.81 4.61 -3.81 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5021 0.4349 0.0629 1 0 0.4941 0.4388 0.0671 1 0 0.4833 0.4438 0.0729
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.050 1 -1 2 80 48 32 20 0 1 0 27 0 0 32 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 47.000 1.00 2.15 -1.15 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1669 0.4997 0.3334 1 1 0.1699 0.4997 0.3305 1 1 0.1738 0.4997 0.3265
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.050 1 -12 1 456 250 206 124 0 31 0 95 0 0 202 0 4 0.4960 0.0000 0.0194 7.065 0.43 11.23 -10.80 74 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5413 0.4130 0.0457 1 0 0.5328 0.4177 0.0495 1 0 0.5212 0.4239 0.0549
chr1 225519331 A ATCCAGGCGTTCCTGCCGC 0.500000 0.050 1 18 1 489 146 343 34 2 89 0 21 0 0 336 1 6 0.2329 0.0000 0.0204 0.640 0.44 8.24 -7.80 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3446 0.5001 0.1552 1 1 0.3413 0.5001 0.1586 1 1 0.3370 0.5000 0.1630
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 223 99 124 49 0 4 0 46 0 0 124 0 0 0.4949 0.0000 0.0000 23.750 0.06 1.39 -1.33 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2718 0.5262 0.2020 1 1 0.2716 0.5243 0.2042 1 1 0.2712 0.5218 0.2070
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 623 183 440 0 1 16 5 161 0 0 433 1 6 0.0000 0.0000 0.0159 10.438 3.44 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0482 0.9518 2 2 0.0000 0.0254 0.9746 2 2 0.0000 0.0220 0.9780
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 516 160 356 155 0 1 0 4 0 0 355 0 1 0.9688 0.0000 0.0028 159.000 0.36 2.00 -1.64 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0142 0.9858 0.0000 0 0 0.6158 0.3842 0.0000 0 0 0.8633 0.1367 0.0000
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 629 183 446 100 0 0 0 83 0 0 442 0 4 0.5464 0.0000 0.0090 183.000 0.17 3.00 -2.83 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3849 0.5087 0.1064 1 1 0.3814 0.5078 0.1108 1 1 0.3765 0.5068 0.1167
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 341 99 242 92 0 4 0 3 0 0 242 0 0 0.9293 0.0000 0.0000 23.750 0.91 1.00 -0.09 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0725 0.9275 0.0000 0 0 0.5671 0.4329 0.0000 0 0 0.7487 0.2513 0.0000
chr1 247934033 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 930 228 702 121 0 1 0 106 0 0 701 0 1 0.5307 0.0000 0.0014 227.000 0.17 1.16 -1.00 41 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3886 0.5140 0.0974 1 1 0.3855 0.5127 0.1019 1 1 0.3810 0.5111 0.1080
chr1 247934735 TTCTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 674 134 540 71 0 10 0 53 0 0 540 0 0 0.5299 0.0000 0.0000 12.400 0.28 3.92 -3.64 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4707 0.4499 0.0794 1 0 0.4633 0.4530 0.0837 1 1 0.4533 0.4571 0.0896
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 1094 253 841 131 0 3 0 119 0 0 841 0 0 0.5178 0.0000 0.0000 83.333 1.08 1.13 -0.04 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3565 0.5347 0.1088 1 1 0.3547 0.5319 0.1134 1 1 0.3521 0.5285 0.1195
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.050 1 -2 1 445 110 335 99 0 2 0 9 0 0 333 0 2 0.9000 0.0000 0.0060 54.000 1.12 4.78 -3.66 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0074 0.9926 0.0000 0 1 0.1527 0.8473 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.050 1 2 1 598 109 489 80 0 3 2 24 0 0 487 0 2 0.7339 0.0000 0.0041 35.333 2.31 3.12 -0.81 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8473 0.1478 0.0049 1 0 0.8349 0.1592 0.0059 1 0 0.8164 0.1760 0.0075
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.050 1 9 1 785 114 671 60 0 20 0 34 0 0 667 0 4 0.5263 0.0000 0.0060 4.700 0.43 8.68 -8.24 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5338 0.4056 0.0606 1 0 0.5239 0.4114 0.0647 1 0 0.5107 0.4189 0.0704
chr1 248522528 CAA C 0.500000 0.050 1 -2 3 537 143 394 91 0 0 0 52 0 0 394 0 0 0.6364 0.0000 0.0000 143.000 0.63 2.19 -1.57 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7313 0.2533 0.0155 1 0 0.7180 0.2644 0.0176 1 0 0.6997 0.2794 0.0209
chr1 248574594 T TGGATGAGGA 0.500000 0.050 1 9 1 472 84 388 20 0 13 0 51 0 0 381 0 7 0.2381 0.0000 0.0180 5.462 0.20 7.71 -7.51 18 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0172 0.2472 0.7356 1 2 0.0195 0.2589 0.7216 1 2 0.0227 0.2808 0.6965
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.050 1 -7 1 309 102 207 30 0 9 0 63 0 0 207 0 0 0.2941 0.0000 0.0000 10.333 1.00 6.49 -5.49 24 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0259 0.2969 0.6772 1 2 0.0288 0.3073 0.6639 1 2 0.0331 0.3212 0.6458
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.050 1 -3 1 211 98 113 56 0 6 0 36 0 0 112 0 1 0.5714 0.0000 0.0088 15.333 0.12 3.94 -3.82 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5375 0.4038 0.0588 1 0 0.5292 0.4086 0.0622 1 0 0.5180 0.4150 0.0670
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.050 1 9 5 444 158 286 0 1 21 2 134 0 0 274 0 12 0.0000 0.0000 0.0420 6.850 8.62 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0466 0.9534 2 2 0.0000 0.0219 0.9781 2 2 0.0000 0.0183 0.9817
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.050 1 18 5 444 158 286 7 10 125 2 14 0 0 275 2 9 0.0443 0.0000 0.0385 0.220 5.86 6.00 -0.14 5 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1400 0.5747 0.2853 1 1 0.1472 0.5792 0.2737 1 1 0.1396 0.6294 0.2311
chr2 24164308 GC G 0.029697 0.050 1 -1 1 175 92 83 85 0 5 0 2 0 0 83 0 0 0.9239 0.0000 0.0000 17.400 0.08 1.00 -0.92 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9149 0.0851 0.0000 0 0 0.9859 0.0141 0.0000 0 0 0.9917 0.0083 0.0000
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.050 1 9 1 564 133 431 66 1 21 0 45 0 0 424 0 7 0.4962 0.0000 0.0162 5.333 0.61 7.44 -6.84 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6245 0.3663 0.0092 1 0 0.6201 0.3702 0.0096 1 0 0.6142 0.3755 0.0103
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.050 1 3 1 198 45 153 0 0 1 0 44 0 0 151 0 2 0.0000 0.0000 0.0131 44.000 3.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2391 0.7609 2 2 0.0000 0.2434 0.7566 2 2 0.0000 0.2493 0.7507
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 1 546 128 418 59 1 13 0 55 0 0 417 0 1 0.4609 0.0000 0.0024 8.846 0.58 2.96 -2.39 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2805 0.5305 0.1889 1 1 0.2802 0.5282 0.1916 1 1 0.2796 0.5253 0.1951
chr2 37951894 CAACAA C 0.500000 0.050 1 -5 1 745 137 608 69 0 2 1 65 0 0 607 0 1 0.5036 0.0000 0.0016 67.500 0.43 4.97 -4.53 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2528 0.5402 0.2070 1 1 0.2536 0.5372 0.2092 1 1 0.2545 0.5334 0.2121
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.050 1 6 1 248 108 140 54 0 8 1 45 0 0 139 0 1 0.5000 0.0000 0.0071 12.375 0.22 6.07 -5.84 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3253 0.5152 0.1595 1 1 0.3231 0.5140 0.1628 1 1 0.3202 0.5126 0.1673
chr2 50346870 GCGCCGCCGCCGCCGC G 0.500000 0.050 1 -15 1 263 92 171 48 0 11 0 33 0 0 167 0 4 0.5217 0.0000 0.0234 7.364 0.71 14.21 -13.50 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3809 0.4907 0.1284 1 1 0.3764 0.4913 0.1323 1 1 0.3704 0.4920 0.1375
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.050 1 -3 1 457 179 278 71 2 20 2 84 0 0 278 0 0 0.3966 0.0000 0.0000 7.750 1.31 3.20 -1.89 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1087 0.4999 0.3914 1 1 0.1130 0.4997 0.3873 1 1 0.1188 0.4995 0.3817
chr2 73269451 AGCGGCGGCGGCGGCCGCG A 0.500000 0.050 1 -18 1 309 65 244 51 1 9 0 4 0 0 242 0 2 0.7846 0.0000 0.0082 6.111 1.55 21.00 -19.45 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0614 0.9386 0.0000 0 1 0.2717 0.7283 0.0000
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.050 1 -6 1 696 164 532 0 0 30 0 134 0 0 523 0 9 0.0000 0.0000 0.0169 4.467 6.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0286 0.9714 2 2 0.0000 0.0314 0.9686
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 393 87 306 2 0 2 0 83 0 0 303 0 3 0.0230 0.0000 0.0098 42.500 0.00 2.72 -2.72 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7504 0.2496 2 2 0.0000 0.3132 0.6868 2 2 0.0000 0.2111 0.7889
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.050 1 24 2 978 237 741 120 1 40 2 74 0 0 707 0 34 0.5063 0.0000 0.0459 4.900 0.38 13.08 -12.70 54 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3504 0.5339 0.1157 1 1 0.3486 0.5312 0.1202 1 1 0.3460 0.5279 0.1262
chr2 74958681 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 1 296 84 212 51 1 4 0 28 0 0 210 0 2 0.6071 0.0000 0.0094 20.000 1.27 3.82 -2.55 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5380 0.4009 0.0611 1 0 0.5278 0.4070 0.0652 1 0 0.5141 0.4150 0.0709
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.050 1 -9 1 351 110 241 50 0 13 0 47 0 0 238 0 3 0.4545 0.0000 0.0124 7.462 0.50 8.79 -8.29 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2347 0.5305 0.2347 1 1 0.2359 0.5282 0.2359 1 1 0.2373 0.5253 0.2373
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 4 588 150 438 61 1 17 5 66 0 0 435 0 3 0.4067 0.0000 0.0068 7.765 0.18 3.26 -3.08 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1180 0.5007 0.3812 1 1 0.1222 0.5005 0.3773 1 1 0.1278 0.5003 0.3719
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -9 2 721 200 521 95 2 8 0 95 0 0 520 0 1 0.4750 0.0000 0.0019 23.750 0.31 7.59 -7.28 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2274 0.5583 0.2142 1 1 0.2294 0.5540 0.2166 1 1 0.2319 0.5485 0.2196
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.050 1 6 1 542 114 428 0 0 0 0 114 0 0 417 0 11 0.0000 0.0000 0.0257 114.000 5.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0413 0.9587 2 2 0.0000 0.0438 0.9562 2 2 0.0000 0.0476 0.9524
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 310 103 207 2 0 13 0 88 0 0 204 0 3 0.0194 0.0000 0.0145 7.500 0.00 6.38 -6.38 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7298 0.2702 2 2 0.0000 0.2909 0.7091 2 2 0.0000 0.1944 0.8056
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.050 1 -1 1 727 183 544 90 1 8 0 84 0 0 544 0 0 0.4918 0.0000 0.0000 21.750 0.40 1.63 -1.23 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3020 0.5402 0.1578 1 1 0.3014 0.5372 0.1615 1 1 0.3004 0.5333 0.1663
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 170 46 124 20 9 12 2 3 0 0 122 1 1 0.4348 0.0000 0.0161 2.583 1.35 1.00 0.35 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2286 0.7438 0.0276 0 1 0.0944 0.8996 0.0060 0 1 0.2013 0.7974 0.0013
chr2 159987235 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 207 96 111 50 0 1 0 45 0 0 110 0 1 0.5208 0.0000 0.0090 95.000 0.14 2.22 -2.08 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2844 0.5244 0.1912 1 1 0.2837 0.5226 0.1937 1 1 0.2828 0.5202 0.1970
chr2 176130550 CCGCACGCGCCCCCGCAGG C 0.500000 0.050 1 -18 3 409 95 314 51 0 8 0 36 0 0 307 0 7 0.5368 0.0000 0.0223 10.875 0.27 13.75 -13.48 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3374 0.5096 0.1530 1 1 0.3347 0.5089 0.1564 1 1 0.3310 0.5079 0.1610
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.050 1 3 4 268 127 141 120 0 4 0 3 0 0 141 0 0 0.9449 0.0000 0.0000 30.750 0.17 2.33 -2.17 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1342 0.8658 0.0000 0 0 0.7227 0.2773 0.0000 0 0 0.8535 0.1465 0.0000
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.050 1 -2 1 735 317 418 140 0 6 0 171 0 0 417 0 1 0.4416 0.0000 0.0024 62.200 0.60 4.27 -3.67 64 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0247 0.3610 0.6143 1 2 0.0276 0.3675 0.6050 1 2 0.0317 0.3762 0.5920
chr2 178650214 TTTTCCTCTTCAGGAGCAA T 0.500000 0.050 1 -18 1 291 88 203 73 0 12 0 3 0 0 203 0 0 0.8295 0.0000 0.0000 6.333 0.10 18.67 -18.57 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0448 0.9552 0.0000 0 1 0.4494 0.5506 0.0000 0 0 0.6536 0.3464 0.0000
chr2 184936239 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 674 159 515 154 0 1 0 4 0 0 515 0 0 0.9686 0.0000 0.0000 158.000 0.15 3.25 -3.10 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0657 0.9343 0.0000 0 0 0.7552 0.2448 0.0000 0 0 0.9007 0.0993 0.0000
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 334 153 181 6 0 19 63 65 0 0 178 1 2 0.0392 0.0000 0.0166 4.056 0.17 3.02 -2.85 4 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.7327 0.2673 2 2 0.0000 0.3367 0.6633
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.050 1 3 1 335 154 181 7 1 12 61 73 0 0 181 0 0 0.0455 0.0000 0.0000 7.545 0.43 2.84 -2.41 7 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9096 0.0904 2 1 0.0000 0.5117 0.4883
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 216 58 158 8 4 9 2 35 0 0 158 0 0 0.1379 0.0000 0.0000 5.000 0.12 1.31 -1.19 0 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0469 0.3612 0.5919 1 1 0.0406 0.4936 0.4659 2 1 0.0108 0.8199 0.1693
chr2 196666794 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 181 77 104 51 5 8 2 11 0 0 104 0 0 0.6623 0.0000 0.0000 8.375 0.57 1.18 -0.61 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2338 0.7627 0.0035 0 1 0.0064 0.9936 0.0001 0 1 0.0477 0.9523 0.0000
chr2 202194209 CAAG C 0.500000 0.050 1 -3 2 318 142 176 70 0 7 1 64 0 0 176 0 0 0.4930 0.0000 0.0000 19.286 0.11 3.41 -3.29 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2897 0.5336 0.1767 1 1 0.2892 0.5311 0.1797 1 1 0.2884 0.5279 0.1838
chr2 202635317 AAGCAGC A 0.500000 0.050 1 -6 1 450 188 262 79 0 14 1 94 0 2 251 0 9 0.4202 0.0000 0.0420 13.308 0.77 6.82 -6.05 31 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0503 0.4124 0.5373 1 2 0.0542 0.4173 0.5284 1 2 0.0598 0.4238 0.5164
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 216 66 150 45 4 14 1 2 0 0 150 0 0 0.6818 0.0000 0.0000 3.357 0.29 1.50 -1.21 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1180 0.8820 0.0000 0 1 0.4558 0.5442 0.0000 0 0 0.5933 0.4067 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.050 1 3 1 261 89 172 43 0 1 0 45 0 0 172 0 0 0.4831 0.0000 0.0000 88.000 0.16 2.87 -2.70 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2138 0.5256 0.2606 1 1 0.2156 0.5237 0.2607 1 1 0.2179 0.5213 0.2609
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 2 561 157 404 0 0 23 0 134 0 0 395 1 8 0.0000 0.0000 0.0223 5.826 7.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0286 0.9714 2 2 0.0000 0.0314 0.9686
chr2 219182152 G GGAGGAA 0.500000 0.050 1 6 1 622 132 490 107 0 23 0 2 0 0 490 0 0 0.8106 0.0000 0.0000 4.739 1.02 6.00 -4.98 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3606 0.6394 0.0000 0 0 0.7863 0.2137 0.0000 0 0 0.8608 0.1392 0.0000
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.050 1 -27 1 626 234 392 216 3 6 0 9 0 0 391 0 1 0.9231 0.0000 0.0026 37.667 0.32 21.44 -21.12 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2170 0.7830 0.0000 0 0 0.8217 0.1783 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.050 1 -3 2 342 129 213 3 0 4 1 121 0 0 212 0 1 0.0233 0.0000 0.0047 31.250 0.00 3.84 -3.84 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8584 0.1416 2 2 0.0000 0.2631 0.7369 2 2 0.0000 0.1378 0.8622
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.050 1 3 1 159 56 103 33 0 1 0 22 0 0 103 0 0 0.5893 0.0000 0.0000 55.000 0.03 2.68 -2.65 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3878 0.4815 0.1307 1 1 0.3827 0.4828 0.1345 1 1 0.3759 0.4844 0.1396
chr2 240030012 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 1582 354 1228 332 4 14 0 4 0 0 1228 0 0 0.9379 0.0000 0.0000 24.286 0.27 1.00 -0.73 40 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8793 0.1207 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 737 159 578 76 0 1 0 82 0 0 578 0 0 0.4780 0.0000 0.0000 158.000 0.83 1.35 -0.52 68 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1647 0.5373 0.2980 1 1 0.1681 0.5345 0.2974 1 1 0.1726 0.5310 0.2964
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.050 1 -3 1 442 127 315 0 1 26 50 50 0 0 315 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.846 3.36 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0797 0.9203 2 2 0.0000 0.0831 0.9169 2 2 0.0000 0.0879 0.9121
chr2 240757423 ATCCTCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 442 127 315 2 1 71 1 52 0 0 315 0 0 0.0157 0.0000 0.0000 0.786 0.00 5.92 -5.92 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8921 0.1079 2 1 0.0000 0.5529 0.4471 2 2 0.0000 0.4113 0.5887
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.050 1 -2 1 436 102 334 2 0 2 0 98 0 0 332 1 1 0.0196 0.0000 0.0060 50.000 0.50 2.15 -1.65 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6788 0.3212 2 2 0.0000 0.2441 0.7559 2 2 0.0000 0.1606 0.8394
chr2 241317535 A AT 0.500000 0.050 1 1 1 224 55 169 26 23 2 1 3 1 1 164 2 1 0.4727 0.0059 0.0296 15.000 1.88 1.33 0.55 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.1256 0.8744 0.0000 0 1 0.3274 0.6726 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.050 1 3 1 679 200 479 0 0 2 1 197 0 0 477 0 2 0.0000 0.0000 0.0042 98.500 3.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.050 1 12 2 586 132 454 112 0 17 0 3 2 2 450 0 0 0.8485 0.0044 0.0088 6.765 0.33 12.67 -12.34 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3754 0.6246 0.0000 0 0 0.9111 0.0889 0.0000 0 0 0.9583 0.0417 0.0000
chr3 12901258 TGGC T 0.002987 0.050 1 -3 1 473 137 336 126 0 7 0 4 0 0 336 0 0 0.9197 0.0000 0.0000 18.571 0.75 3.00 -2.25 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9216 0.0784 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.050 1 -3 1 498 138 360 3 0 1 0 134 0 0 360 0 0 0.0217 0.0000 0.0000 137.000 0.00 3.32 -3.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8213 0.1787 2 2 0.0000 0.2140 0.7860 2 2 0.0000 0.1094 0.8906
chr3 40462027 GTAC G 0.500000 0.050 1 -3 3 618 258 360 32 4 4 86 132 0 1 356 0 3 0.1240 0.0000 0.0111 85.500 1.88 3.31 -1.44 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.050 1 3 1 686 240 446 96 11 57 0 76 0 0 444 0 2 0.4000 0.0000 0.0045 3.211 0.25 2.86 -2.61 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6049 0.3609 0.0343 1 0 0.5941 0.3683 0.0376 1 0 0.5795 0.3781 0.0424
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 686 242 444 175 5 51 2 9 0 0 444 0 0 0.7231 0.0000 0.0000 3.745 1.29 2.78 -1.49 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0537 0.9463 0.0000 0 0 0.5590 0.4410 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.050 1 -2 5 682 167 515 0 0 5 0 162 0 0 514 0 1 0.0000 0.0000 0.0019 32.400 2.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0163 0.9837 2 2 0.0000 0.0176 0.9824 2 2 0.0000 0.0197 0.9803
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 275 101 174 0 0 1 2 98 0 0 173 0 1 0.0000 0.0000 0.0057 100.000 5.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0730 0.9270 2 2 0.0000 0.0765 0.9235 2 2 0.0000 0.0816 0.9184
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 614 170 444 1 1 17 16 135 0 0 439 0 5 0.0059 0.0000 0.0113 8.941 1.00 3.40 -2.40 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1703 0.8297 2 2 0.0000 0.0604 0.9396 2 2 0.0000 0.0436 0.9564
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.050 1 -6 3 371 102 269 38 0 18 0 46 0 0 267 0 2 0.3725 0.0000 0.0074 4.667 0.21 5.98 -5.77 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1364 0.4969 0.3667 1 1 0.1402 0.4970 0.3628 1 1 0.1453 0.4973 0.3575
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.050 1 -6 1 457 141 316 84 1 14 0 42 0 0 314 0 2 0.5957 0.0000 0.0063 9.071 0.17 5.90 -5.74 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7542 0.2327 0.0131 1 0 0.7408 0.2442 0.0150 1 0 0.7221 0.2599 0.0180
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.050 1 10 2 192 93 99 2 0 12 1 78 0 0 97 0 2 0.0215 0.0000 0.0202 6.750 1.00 7.72 -6.72 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7733 0.2267 2 2 0.0000 0.3403 0.6597 2 2 0.0000 0.2318 0.7682
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 262 107 155 0 0 3 1 103 0 0 153 0 2 0.0000 0.0000 0.0129 34.667 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0650 0.9350 2 2 0.0000 0.0683 0.9317 2 2 0.0000 0.0731 0.9269
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.050 1 1 1 870 200 670 111 0 9 1 79 0 0 669 0 1 0.5550 0.0000 0.0015 21.111 1.46 1.39 0.07 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6179 0.3509 0.0312 1 0 0.6069 0.3587 0.0344 1 0 0.5919 0.3691 0.0390
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 438 117 321 55 0 7 0 55 0 0 321 0 0 0.4701 0.0000 0.0000 15.714 0.89 1.18 -0.29 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2323 0.5335 0.2342 1 1 0.2336 0.5310 0.2354 1 1 0.2352 0.5278 0.2370
chr3 108757146 G GGGGGATTA 0.500000 0.050 1 8 2 281 127 154 69 1 4 0 53 0 0 149 0 5 0.5433 0.0000 0.0325 30.750 0.19 6.81 -6.62 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3850 0.4975 0.1176 1 1 0.3808 0.4975 0.1217 1 1 0.3751 0.4976 0.1273
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 114 43 71 21 1 3 0 18 0 0 70 1 0 0.4884 0.0000 0.0141 13.000 0.00 1.17 -1.17 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2789 0.5100 0.2111 1 1 0.2781 0.5092 0.2127 1 1 0.2769 0.5083 0.2148
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 406 121 285 70 0 2 0 49 0 0 285 0 0 0.5785 0.0000 0.0000 59.500 0.13 1.10 -0.97 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5143 0.4212 0.0645 1 0 0.5053 0.4260 0.0686 1 0 0.4932 0.4323 0.0744
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1177 297 880 112 2 75 94 14 0 0 879 0 1 0.3771 0.0000 0.0011 2.986 0.43 2.71 -2.29 8 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2584 0.5632 0.1785 1 1 0.2596 0.5585 0.1819 1 1 0.2611 0.5525 0.1864
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -6 1 1182 305 877 115 3 86 1 100 0 0 877 0 0 0.3770 0.0000 0.0000 2.523 0.43 5.53 -5.10 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4356 0.4851 0.0793 1 1 0.4306 0.4857 0.0837 1 1 0.4237 0.4865 0.0897
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.050 1 12 1 537 163 374 66 0 14 0 83 0 0 374 0 0 0.4049 0.0000 0.0000 10.643 0.30 5.92 -5.61 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0837 0.4659 0.4503 1 1 0.0881 0.4680 0.4439 1 1 0.0941 0.4706 0.4353
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.050 1 18 2 707 126 581 51 0 31 2 42 1 0 580 0 0 0.4048 0.0017 0.0017 3.167 0.53 8.81 -8.28 29 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3334 0.5115 0.1551 1 1 0.3308 0.5106 0.1586 1 1 0.3274 0.5095 0.1631
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 190 93 97 0 0 0 0 93 0 0 97 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 93.000 2.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0879 0.9121 2 2 0.0000 0.0917 0.9083 2 2 0.0000 0.0972 0.9028
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 362 130 232 66 1 0 0 63 0 0 231 0 1 0.5077 0.0000 0.0043 129.000 1.17 2.44 -1.28 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2631 0.5374 0.1995 1 1 0.2635 0.5346 0.2019 1 1 0.2639 0.5311 0.2051
chr3 136145062 G GATGA 0.500000 0.050 1 4 1 188 96 92 92 0 2 0 2 0 0 92 0 0 0.9583 0.0000 0.0000 47.000 0.09 4.00 -3.91 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2789 0.7211 0.0000 0 0 0.7177 0.2823 0.0000 0 0 0.8118 0.1882 0.0000
chr3 158732285 T TCGGGGCCC 0.500000 0.050 1 8 1 395 79 316 44 0 5 0 30 0 0 310 0 6 0.5570 0.0000 0.0190 14.800 0.64 8.53 -7.90 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3403 0.5054 0.1543 1 1 0.3374 0.5049 0.1577 1 1 0.3334 0.5044 0.1622
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 275 102 173 58 1 1 0 42 0 0 173 0 0 0.5686 0.0000 0.0000 101.000 0.34 1.19 -0.85 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4621 0.4517 0.0863 1 1 0.4547 0.4548 0.0905 1 1 0.4448 0.4588 0.0964
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 391 154 237 70 3 23 6 52 0 0 231 0 6 0.4545 0.0000 0.0253 5.696 0.17 3.33 -3.16 52 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3406 0.5183 0.1411 1 1 0.3382 0.5168 0.1450 1 1 0.3348 0.5150 0.1501
chr3 187698970 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 347 94 253 59 0 0 2 33 0 0 251 1 1 0.6277 0.0000 0.0079 94.000 1.31 4.18 -2.88 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5368 0.4033 0.0600 1 0 0.5268 0.4092 0.0640 1 0 0.5134 0.4169 0.0697
chr3 187698974 CA C 0.500000 0.050 1 -1 3 345 95 250 60 0 1 1 33 0 0 248 1 1 0.6316 0.0000 0.0080 94.000 1.30 4.18 -2.88 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5621 0.3856 0.0523 1 0 0.5513 0.3925 0.0562 1 0 0.5369 0.4014 0.0618
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 523 148 375 80 0 3 3 62 0 0 372 0 3 0.5405 0.0000 0.0080 72.500 0.15 2.18 -2.03 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3777 0.5048 0.1175 1 1 0.3740 0.5043 0.1217 1 1 0.3689 0.5037 0.1274
chr3 195788493 GTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGCA G 0.500000 0.050 1 -96 1 2223 912 1311 650 37 57 10 158 48 20 1220 5 18 0.7127 0.0366 0.0694 15.400 2.64 4.63 -1.99 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.050 1 15 1 765 165 600 84 0 19 0 62 0 0 584 0 16 0.5091 0.0000 0.0267 7.684 0.15 11.24 -11.09 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2972 0.5386 0.1642 1 1 0.2967 0.5356 0.1677 1 1 0.2957 0.5320 0.1723
chr3 198153257 CTGGCAGCAGCAG C 0.500000 0.050 1 -12 2 348 154 194 80 42 11 1 20 0 0 191 1 2 0.5195 0.0000 0.0155 13.000 0.30 10.60 -10.30 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -6 1 348 147 201 53 1 33 1 59 0 0 196 1 4 0.3605 0.0000 0.0249 3.455 0.30 7.49 -7.19 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1261 0.5012 0.3726 1 1 0.1302 0.5010 0.3688 1 1 0.1356 0.5008 0.3636
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -9 1 348 150 198 58 2 30 40 20 0 0 194 0 4 0.3867 0.0000 0.0202 3.967 0.34 10.60 -10.26 30 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1852 0.5320 0.2828 1 1 0.1880 0.5296 0.2824 1 1 0.1917 0.5266 0.2818
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.050 1 21 1 518 136 382 79 1 1 0 55 0 0 353 2 27 0.5809 0.0000 0.0759 135.000 0.68 16.07 -15.39 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0793 0.5203 0.4004 1 1 0.0807 0.5178 0.4015 1 1 0.0825 0.5147 0.4028
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.050 1 -6 2 638 244 394 82 1 80 0 81 2 0 380 2 10 0.3361 0.0051 0.0355 2.103 3.04 7.25 -4.21 48 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2504 0.5844 0.1653 1 1 0.2559 0.5797 0.1645 1 1 0.2630 0.5737 0.1633
chr4 3074966 G GCCGCCGCCT 0.001791 0.050 1 9 2 639 229 410 105 6 12 3 103 5 3 400 1 1 0.4585 0.0122 0.0244 17.917 4.21 7.59 -3.38 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5636 0.4360 0.0003 1 0 0.5637 0.4360 0.0004 1 0 0.5634 0.4362 0.0004
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.050 1 -12 1 572 149 423 87 1 9 0 52 0 0 419 0 4 0.5839 0.0000 0.0095 15.556 1.02 11.67 -10.65 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7896 0.2079 0.0025 1 0 0.7814 0.2158 0.0028 1 0 0.7702 0.2266 0.0032
chr4 15003723 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 3 680 132 548 58 3 25 6 40 10 1 532 1 4 0.4394 0.0182 0.0292 4.200 1.43 3.88 -2.44 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5161 0.4203 0.0636 1 0 0.5071 0.4252 0.0678 1 0 0.4950 0.4315 0.0735
chr4 15687453 AAG A 0.500000 0.050 1 -2 4 1168 284 884 150 2 8 0 124 0 0 877 0 7 0.5282 0.0000 0.0079 34.500 0.20 2.10 -1.90 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4702 0.4708 0.0590 1 1 0.4648 0.4719 0.0632 1 1 0.4573 0.4736 0.0691
chr4 56314410 C CGGAGCGGAG 0.500000 0.050 1 9 1 580 121 459 0 0 13 0 108 0 0 420 0 39 0.0000 0.0000 0.0850 8.308 12.03 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0260 0.9740 2 2 0.0000 0.0287 0.9713
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.050 1 18 1 580 121 459 0 0 51 1 69 0 0 420 0 39 0.0000 0.0000 0.0850 1.458 12.91 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0456 0.9544 2 2 0.0000 0.0484 0.9516 2 2 0.0000 0.0526 0.9474
chr4 56378269 GTTC G 0.500000 0.050 1 -3 1 261 89 172 85 1 0 0 3 0 0 172 0 0 0.9551 0.0000 0.0000 89.000 0.08 3.00 -2.92 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0610 0.9390 0.0000 0 0 0.5292 0.4708 0.0000 0 0 0.7204 0.2796 0.0000
chr4 56448597 GGTACAGATAAAACAA G 0.500000 0.050 1 -15 2 346 96 250 44 1 13 0 38 0 0 242 0 8 0.4583 0.0000 0.0320 6.308 0.30 12.89 -12.60 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2223 0.5272 0.2505 1 1 0.2238 0.5252 0.2510 1 1 0.2257 0.5226 0.2517
chr4 56809985 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 179 55 124 53 0 0 0 2 0 0 124 0 0 0.9636 0.0000 0.0000 55.000 0.13 1.00 -0.87 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1283 0.8717 0.0000 0 1 0.4934 0.5066 0.0000 0 0 0.6290 0.3710 0.0000
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.050 1 3 1 765 291 474 12 115 44 20 100 0 2 472 0 0 0.0412 0.0000 0.0042 5.295 0.92 3.16 -2.24 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3944 0.5128 0.0928 1 1 0.3912 0.5115 0.0973 1 1 0.3865 0.5100 0.1035
chr4 78870928 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 766 299 467 112 11 39 11 126 0 0 464 1 2 0.3746 0.0000 0.0064 6.919 2.77 3.25 -0.48 38 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0827 0.5066 0.4107 1 1 0.0872 0.5057 0.4071 1 1 0.0934 0.5046 0.4020
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 152 63 89 32 0 2 0 29 0 0 89 0 0 0.5079 0.0000 0.0000 30.500 0.06 1.03 -0.97 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2777 0.5159 0.2064 1 1 0.2770 0.5147 0.2083 1 1 0.2761 0.5132 0.2107
chr4 87614693 CAGCAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 1990 437 1553 387 6 37 1 6 3 6 1543 1 0 0.8856 0.0019 0.0064 12.061 1.11 5.17 -4.06 127 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1885 0.8115 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr4 87614933 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.050 1 -18 1 2442 629 1813 318 8 76 15 212 88 52 1637 7 29 0.5056 0.0485 0.0971 7.293 1.49 13.09 -11.60 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr4 87615161 CGATAGCAGCAACAGCAGT C 0.500000 0.050 1 -18 1 2943 588 2355 289 14 91 10 184 5 18 2309 14 9 0.4915 0.0021 0.0195 5.500 1.56 12.36 -10.79 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9835 0.0165 0.0000 1 0 0.9807 0.0193 0.0000 1 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.050 1 9 1 3174 668 2506 12 9 27 19 601 35 32 2157 221 61 0.0180 0.0140 0.1393 25.240 3.50 9.55 -6.05 6 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9979 0.0021
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 3350 766 2584 332 7 113 6 308 22 61 2253 105 143 0.4334 0.0085 0.1281 5.918 3.89 11.19 -7.30 34 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0076 0.9924 1 2 0.0000 0.0090 0.9910 1 2 0.0000 0.0112 0.9887
chr4 87615614 T TAGCAGTGACAGCAGTGATAGCAGTGAC 0.500000 0.050 1 27 1 3347 887 2460 240 21 337 22 267 23 38 2304 36 59 0.2706 0.0093 0.0634 1.631 2.32 6.86 -4.54 24 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0012 0.1497 0.8490 1 2 0.0016 0.1578 0.8406 1 2 0.0021 0.1695 0.8284
chr4 94610228 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 122 62 60 60 0 0 0 2 0 0 60 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 62.000 0.98 3.00 -2.02 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1474 0.8526 0.0000 0 0 0.5359 0.4641 0.0000 0 0 0.6671 0.3329 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.050 1 -3 1 153 78 75 43 0 3 0 32 0 0 74 0 1 0.5513 0.0000 0.0133 25.000 0.21 3.06 -2.85 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3689 0.4938 0.1372 1 1 0.3648 0.4942 0.1410 1 1 0.3593 0.4947 0.1460
chr4 112439686 A AT 0.500000 0.050 1 1 1 201 85 116 51 0 1 0 33 0 0 116 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 84.000 0.14 1.06 -0.92 29 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4810 0.4379 0.0812 1 0 0.4727 0.4419 0.0854 1 0 0.4616 0.4471 0.0913
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 622 163 459 87 0 3 0 73 0 0 456 0 3 0.5337 0.0000 0.0065 53.333 0.17 4.07 -3.90 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3631 0.5145 0.1224 1 1 0.3601 0.5133 0.1266 1 1 0.3560 0.5118 0.1322
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.050 1 -18 1 195 105 90 59 0 9 0 37 0 0 90 0 0 0.5619 0.0000 0.0000 10.667 0.44 13.11 -12.67 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5344 0.4050 0.0607 1 0 0.5244 0.4108 0.0648 1 0 0.5111 0.4184 0.0705
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 4 497 206 291 0 0 26 14 166 0 0 286 1 4 0.0000 0.0000 0.0172 6.923 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0094 0.9906 2 2 0.0000 0.0103 0.9897 2 2 0.0000 0.0117 0.9883
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 493 210 283 2 92 41 2 73 1 2 278 0 2 0.0095 0.0035 0.0177 4.049 0.00 3.56 -3.56 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4784 0.4515 0.0701 1 0 0.4713 0.4544 0.0743 1 0 0.4617 0.4581 0.0802
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.050 1 -9 2 496 219 277 89 1 33 0 96 1 1 266 0 9 0.4064 0.0036 0.0397 5.606 3.17 9.45 -6.28 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1029 0.5083 0.3888 1 1 0.1073 0.5075 0.3852 1 1 0.1133 0.5064 0.3803
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 288 123 165 63 1 15 0 44 0 0 162 0 3 0.5122 0.0000 0.0182 7.200 0.79 5.55 -4.75 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4598 0.4546 0.0857 1 1 0.4526 0.4575 0.0900 1 1 0.4429 0.4612 0.0959
chr4 168878233 A ACCG 0.500000 0.050 1 3 2 453 109 344 96 0 9 0 4 0 0 344 0 0 0.8807 0.0000 0.0000 11.111 0.70 3.25 -2.55 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0161 0.9839 0.0000 0 1 0.4246 0.5754 0.0000 0 0 0.6931 0.3069 0.0000
chr4 177322470 G GAAT 0.500000 0.050 1 3 1 200 73 127 45 0 2 0 26 0 0 127 0 0 0.6164 0.0000 0.0000 35.500 0.27 4.73 -4.46 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4987 0.4252 0.0762 1 0 0.4896 0.4300 0.0804 1 0 0.4775 0.4362 0.0863
chr4 184694537 ACAGATGAAG A 0.500000 0.050 1 -9 2 317 88 229 59 1 2 0 26 0 0 229 0 0 0.6705 0.0000 0.0000 43.000 0.39 10.15 -9.76 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6904 0.2856 0.0239 1 0 0.6769 0.2964 0.0267 1 0 0.6584 0.3108 0.0308
chr5 733800 T TAA 0.007715 0.050 1 2 1 150 45 105 27 0 1 1 16 0 0 105 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 44.000 0.89 3.75 -2.86 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6056 0.3927 0.0018 1 0 0.6020 0.3962 0.0018 1 0 0.5972 0.4010 0.0019
chr5 733804 CAT C 0.005230 0.050 1 -2 3 150 43 107 26 0 4 1 12 0 0 106 0 1 0.6047 0.0000 0.0093 9.750 0.92 4.83 -3.91 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6304 0.3685 0.0010 1 0 0.6260 0.3730 0.0011 1 0 0.6200 0.3789 0.0011
chr5 41158762 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 273 78 195 36 0 2 0 40 0 0 193 2 0 0.4615 0.0000 0.0103 38.000 1.39 2.27 -0.89 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1770 0.5141 0.3089 1 1 0.1799 0.5130 0.3072 1 1 0.1836 0.5116 0.3048
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 766 164 602 55 0 36 3 70 0 0 599 0 3 0.3354 0.0000 0.0050 3.556 0.36 3.80 -3.44 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0641 0.4248 0.5111 1 2 0.0683 0.4294 0.5023 1 2 0.0741 0.4353 0.4906
chr5 56882152 AACC A 0.500000 0.050 1 -3 1 777 161 616 85 1 2 0 73 0 0 611 0 5 0.5280 0.0000 0.0081 79.500 0.45 3.82 -3.37 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3220 0.5312 0.1468 1 1 0.3205 0.5288 0.1506 1 1 0.3184 0.5258 0.1557
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 2 381 137 244 101 4 23 4 5 2 0 240 2 0 0.7372 0.0082 0.0164 4.783 0.99 2.80 -1.81 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1102 0.8898 0.0000 0 1 0.4267 0.5733 0.0000
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.050 1 -15 4 353 50 303 0 1 26 1 22 0 0 297 3 3 0.0000 0.0000 0.0198 0.885 6.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3409 0.6591 2 2 0.0000 0.3431 0.6569 2 2 0.0000 0.3463 0.6537
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.050 1 -6 1 328 98 230 92 1 2 0 3 0 0 229 1 0 0.9388 0.0000 0.0043 48.000 0.26 6.00 -5.74 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0666 0.9334 0.0000 0 0 0.5534 0.4466 0.0000 0 0 0.7404 0.2596 0.0000
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 3 460 116 344 0 0 3 0 113 0 0 339 0 5 0.0000 0.0000 0.0145 37.667 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0488 0.9512 2 2 0.0000 0.0517 0.9483 2 2 0.0000 0.0558 0.9442
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 265 105 160 99 0 1 0 5 0 0 160 0 0 0.9429 0.0000 0.0000 104.000 0.07 3.20 -3.13 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0034 0.9966 0.0000 0 1 0.2895 0.7105 0.0000 0 0 0.6260 0.3740 0.0000
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 934 226 708 110 1 28 1 86 1 2 703 0 2 0.4867 0.0014 0.0071 7.333 0.80 3.83 -3.03 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5560 0.4002 0.0438 1 0 0.5468 0.4056 0.0475 1 0 0.5343 0.4129 0.0528
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.050 1 -1 2 549 109 440 4 0 39 0 66 0 0 440 0 0 0.0367 0.0000 0.0000 1.795 1.50 1.18 0.32 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9928 0.0072 2 1 0.0000 0.7647 0.2353 2 1 0.0000 0.5100 0.4900
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.050 1 9 2 439 129 310 44 0 23 0 62 0 0 304 1 5 0.3411 0.0000 0.0194 4.609 0.18 7.23 -7.04 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0525 0.3916 0.5559 1 2 0.0564 0.3980 0.5456 1 2 0.0619 0.4065 0.5316
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.050 1 6 3 522 132 390 63 0 17 0 52 0 0 386 0 4 0.4773 0.0000 0.0103 6.765 0.51 5.92 -5.42 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3188 0.5216 0.1596 1 1 0.3170 0.5200 0.1630 1 1 0.3146 0.5179 0.1675
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.050 1 9 1 351 91 260 33 1 5 0 52 0 0 241 0 19 0.3626 0.0000 0.0731 17.200 1.21 8.73 -7.52 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0185 0.2624 0.7190 1 2 0.0209 0.2736 0.7055 1 2 0.0245 0.2887 0.6868
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 175 74 101 6 0 0 0 68 0 0 99 0 2 0.0811 0.0000 0.0198 74.000 0.50 3.37 -2.87 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9072 0.0928 2 1 0.0000 0.6344 0.3656
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 862 231 631 219 0 7 0 5 0 0 631 0 0 0.9481 0.0000 0.0000 32.000 0.28 1.40 -1.12 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0706 0.9294 0.0000 0 0 0.8881 0.1119 0.0000 0 0 0.9675 0.0325 0.0000
chr5 141415641 T TA 0.500000 0.050 1 1 2 806 131 675 98 11 8 0 14 2 1 669 1 2 0.7481 0.0030 0.0089 14.375 2.23 3.71 -1.48 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0309 0.9691 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 9 1 438 133 305 63 1 19 0 50 0 1 294 0 10 0.4737 0.0000 0.0361 5.947 0.30 8.50 -8.20 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2890 0.5311 0.1800 1 1 0.2884 0.5287 0.1829 1 1 0.2875 0.5258 0.1867
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 15 1 418 154 264 51 1 38 0 64 0 0 257 0 7 0.3312 0.0000 0.0265 3.053 0.76 10.80 -10.03 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0741 0.4407 0.4852 1 2 0.0784 0.4444 0.4772 1 2 0.0843 0.4492 0.4665
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.050 1 2 1 734 162 572 159 0 1 0 2 0 0 572 0 0 0.9815 0.0000 0.0000 161.000 0.65 2.00 -1.35 73 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6763 0.3237 0.0000 0 0 0.9299 0.0701 0.0000 0 0 0.9556 0.0444 0.0000
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.050 1 -2 3 742 169 573 166 0 1 0 2 0 0 573 0 0 0.9822 0.0000 0.0000 168.000 0.63 2.00 -1.37 76 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7136 0.2864 0.0000 0 0 0.9404 0.0596 0.0000 0 0 0.9622 0.0378 0.0000
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 708 160 548 6 0 5 1 148 0 0 547 0 1 0.0375 0.0000 0.0018 30.800 0.33 1.78 -1.45 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.5746 0.4254 2 2 0.0000 0.2028 0.7972
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.050 1 -1 4 538 135 403 126 0 3 0 6 0 0 403 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 44.000 0.13 1.00 -0.87 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.2911 0.7089 0.0000 0 0 0.6886 0.3114 0.0000
chr5 150903148 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 1 246 92 154 52 0 4 0 36 0 0 154 0 0 0.5652 0.0000 0.0000 22.000 0.69 3.64 -2.95 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4514 0.4558 0.0928 1 1 0.4443 0.4587 0.0971 1 1 0.4347 0.4624 0.1029
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.050 1 -15 1 361 157 204 117 3 26 5 6 0 0 204 0 0 0.7452 0.0000 0.0000 5.458 2.52 11.00 -8.48 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0506 0.9494 0.0000 0 1 0.3482 0.6518 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.050 1 3 1 361 139 222 2 61 5 0 71 0 0 222 0 0 0.0144 0.0000 0.0000 26.800 4.00 3.56 0.44 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1254 0.5042 0.3703 1 1 0.1295 0.5038 0.3667 1 1 0.1350 0.5033 0.3617
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 211 84 127 0 2 6 1 75 0 0 126 0 1 0.0000 0.0000 0.0079 13.000 3.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4458 0.5542 2 2 0.0000 0.2871 0.7129 2 2 0.0000 0.2266 0.7734
chr5 168454037 GGGA G 0.500000 0.050 1 -3 1 211 83 128 7 68 3 1 4 0 0 128 0 0 0.0843 0.0000 0.0000 26.333 1.86 6.00 -4.14 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 1 0.2264 0.7736 0.0000 0 0 0.5083 0.4917 0.0000
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 1 441 112 329 59 0 4 0 49 0 0 329 0 0 0.5268 0.0000 0.0000 27.000 1.07 3.86 -2.79 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3618 0.5036 0.1346 1 1 0.3583 0.5033 0.1385 1 1 0.3535 0.5028 0.1436
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 484 238 246 173 13 49 0 3 1 0 245 0 0 0.7269 0.0041 0.0041 3.938 1.03 4.00 -2.97 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4419 0.5581 0.0000 0 0 0.9287 0.0713 0.0000 0 0 0.9654 0.0346 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 627 107 520 40 0 18 1 48 0 0 520 0 0 0.3738 0.0000 0.0000 4.944 0.65 3.04 -2.39 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1446 0.5032 0.3522 1 1 0.1483 0.5029 0.3488 1 1 0.1531 0.5026 0.3443
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.050 1 3 5 489 135 354 2 0 28 1 104 0 0 351 0 3 0.0148 0.0000 0.0085 3.821 0.50 3.29 -2.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6189 0.3811 2 2 0.0000 0.2019 0.7981 2 2 0.0000 0.1312 0.8688
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.050 1 3 1 584 142 442 55 0 27 3 57 3 1 434 3 1 0.3873 0.0068 0.0181 4.259 1.69 4.02 -2.33 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3071 0.5676 0.1254 1 1 0.3114 0.5638 0.1248 1 1 0.3169 0.5591 0.1240
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.050 1 3 1 544 117 427 58 3 14 1 41 3 1 411 5 7 0.4957 0.0070 0.0375 7.357 1.41 4.37 -2.95 10 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5151 0.4355 0.0493 1 0 0.5114 0.4373 0.0512 1 0 0.5064 0.4398 0.0538
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.050 1 3 2 1484 354 1130 40 9 97 8 200 0 0 1124 2 4 0.1130 0.0000 0.0053 2.667 1.77 3.89 -2.12 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.2342 0.7658 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 16327684 A ATGC 0.101269 0.050 1 3 1 1474 404 1070 158 10 102 3 131 0 0 1068 1 1 0.3911 0.0000 0.0019 2.990 1.73 4.07 -2.33 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7190 0.2764 0.0046 1 0 0.7131 0.2817 0.0051 1 0 0.7050 0.2892 0.0059
chr6 27250733 TCTC T 0.001482 0.050 1 -3 1 286 106 180 58 0 1 0 47 0 0 179 0 1 0.5472 0.0000 0.0056 105.000 0.53 3.30 -2.76 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5897 0.4100 0.0003 1 0 0.5874 0.4122 0.0003 1 0 0.5843 0.4153 0.0004
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.050 1 2 1 1080 221 859 119 1 5 0 96 0 0 856 0 3 0.5385 0.0000 0.0035 43.200 0.15 2.30 -2.15 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6605 0.3323 0.0072 1 0 0.6558 0.3365 0.0078 1 0 0.6492 0.3423 0.0085
chr6 29173644 TA T 0.001133 0.050 1 -1 2 547 157 390 94 0 5 0 58 0 0 390 0 0 0.5987 0.0000 0.0000 30.400 0.28 1.05 -0.78 68 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8309 0.1690 0.0000 1 0 0.8231 0.1768 0.0000 1 0 0.8123 0.1877 0.0000
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 369 112 257 55 0 1 0 56 0 0 257 0 0 0.4911 0.0000 0.0000 111.000 0.18 1.25 -1.07 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2217 0.5335 0.2448 1 1 0.2234 0.5310 0.2456 1 1 0.2255 0.5278 0.2467
chr6 31111540 CCCCCAGCTGCCTCCTGGATACCGATTAATATTT C 0.500000 0.050 1 -33 2 528 138 390 7 0 35 2 94 0 0 390 0 0 0.0507 0.0000 0.0000 2.943 0.29 5.05 -4.77 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9094 0.0906 2 1 0.0000 0.5743 0.4257
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 572 146 426 137 0 4 0 5 0 0 426 0 0 0.9384 0.0000 0.0000 35.500 1.07 2.80 -1.73 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0103 0.9897 0.0000 0 0 0.5151 0.4849 0.0000 0 0 0.8072 0.1928 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.050 1 2 1 632 192 440 102 0 2 0 88 0 0 440 0 0 0.5312 0.0000 0.0000 95.000 0.29 2.86 -2.57 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3980 0.5024 0.0997 1 1 0.3940 0.5019 0.1041 1 1 0.3885 0.5014 0.1101
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 11 1 632 192 440 173 1 3 2 13 0 0 440 0 0 0.9010 0.0000 0.0000 94.500 1.25 4.23 -2.98 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0083 0.9917 0.0000 0 1 0.2731 0.7269 0.0000
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.050 1 -12 1 519 177 342 108 0 9 0 60 0 0 335 0 7 0.6102 0.0000 0.0205 18.667 0.26 11.20 -10.94 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7443 0.2428 0.0129 1 0 0.7313 0.2538 0.0148 1 0 0.7134 0.2689 0.0178
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 446 116 330 57 0 12 0 47 0 0 330 0 0 0.4914 0.0000 0.0000 8.667 1.14 3.85 -2.71 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3627 0.5024 0.1349 1 1 0.3591 0.5021 0.1388 1 1 0.3542 0.5018 0.1439
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 286 91 195 60 0 1 0 30 0 0 195 0 0 0.6593 0.0000 0.0000 90.000 0.28 4.10 -3.82 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6418 0.3251 0.0331 1 0 0.6291 0.3346 0.0363 1 0 0.6118 0.3472 0.0410
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 753 363 390 157 19 93 1 93 0 0 388 0 2 0.4325 0.0000 0.0051 3.046 6.98 7.70 -0.72 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9617 0.0381 0.0002 1 0 0.9562 0.0436 0.0003 1 0 0.9477 0.0519 0.0004
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 751 344 407 222 15 19 0 88 0 0 404 0 3 0.6453 0.0000 0.0074 18.941 7.82 7.92 -0.11 82 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9977 0.0023 0.0000 1 0 0.9971 0.0029 0.0000 1 0 0.9960 0.0040 0.0000
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.050 1 6 5 557 228 329 193 4 27 0 4 1 0 328 0 0 0.8465 0.0030 0.0030 7.444 0.60 5.50 -4.90 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1754 0.8246 0.0000 0 0 0.9013 0.0987 0.0000 0 0 0.9630 0.0370 0.0000
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.050 1 18 1 389 91 298 44 0 11 0 36 0 0 288 0 10 0.4835 0.0000 0.0336 7.273 0.84 13.89 -13.05 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2135 0.5262 0.2602 1 1 0.2153 0.5243 0.2604 1 1 0.2176 0.5218 0.2606
chr6 36722044 C CGGGCCCAGCGGTGCAGGA 0.500000 0.050 1 18 2 705 133 572 63 1 16 0 53 0 0 548 0 24 0.4737 0.0000 0.0420 7.312 1.00 12.13 -11.13 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1095 0.4946 0.3959 1 1 0.1137 0.4948 0.3915 1 1 0.1195 0.4951 0.3854
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.050 1 1 2 665 203 462 108 2 8 2 83 0 0 461 0 1 0.5320 0.0000 0.0022 24.250 0.31 1.41 -1.09 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5346 0.4152 0.0501 1 0 0.5260 0.4200 0.0540 1 0 0.5142 0.4262 0.0595
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 911 244 667 123 0 6 0 115 0 0 663 0 4 0.5041 0.0000 0.0060 39.667 0.49 3.42 -2.93 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2578 0.5686 0.1736 1 1 0.2593 0.5635 0.1772 1 1 0.2609 0.5570 0.1820
chr6 42236367 G GTCC 0.500000 0.050 1 3 3 316 115 201 2 1 14 1 97 0 0 199 0 2 0.0174 0.0000 0.0100 7.214 0.00 2.97 -2.97 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9053 0.0947 2 2 0.0000 0.3820 0.6180 2 2 0.0000 0.2162 0.7838
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 325 124 201 49 0 14 0 61 0 0 197 0 4 0.3952 0.0000 0.0199 7.857 0.24 6.11 -5.87 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0914 0.4637 0.4449 1 1 0.0957 0.4660 0.4383 1 1 0.1016 0.4690 0.4294
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 771 155 616 68 0 30 1 56 0 0 615 0 1 0.4387 0.0000 0.0016 4.167 0.51 3.43 -2.91 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3578 0.5091 0.1331 1 1 0.3546 0.5083 0.1370 1 1 0.3503 0.5074 0.1423
chr6 44002766 CGCGGCG C 0.500000 0.050 1 -6 1 476 93 383 38 0 17 0 38 0 0 380 0 3 0.4086 0.0000 0.0078 4.471 1.26 6.00 -4.74 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2047 0.5215 0.2738 1 1 0.2067 0.5199 0.2734 1 1 0.2094 0.5178 0.2728
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 15 2 720 196 524 42 5 100 1 48 0 0 507 0 17 0.2143 0.0000 0.0324 0.940 15.29 6.69 8.60 6 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0721 0.4331 0.4948 1 2 0.0764 0.4373 0.4864 1 2 0.0822 0.4427 0.4751
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.050 1 -15 2 730 232 498 98 0 69 0 65 0 0 494 0 4 0.4224 0.0000 0.0080 2.362 3.65 10.54 -6.89 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6092 0.3562 0.0346 1 0 0.5981 0.3639 0.0380 1 0 0.5830 0.3742 0.0428
chr6 87284874 TACTCC T 0.500000 0.050 1 -5 3 457 97 360 42 0 10 0 45 0 0 358 0 2 0.4330 0.0000 0.0056 8.700 1.05 6.11 -5.06 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1820 0.5196 0.2984 1 1 0.1847 0.5181 0.2971 1 1 0.1883 0.5163 0.2954
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 644 112 532 52 1 31 1 27 0 0 524 0 8 0.4643 0.0000 0.0150 2.613 1.96 3.78 -1.82 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4662 0.4474 0.0864 1 0 0.4585 0.4508 0.0907 1 1 0.4482 0.4552 0.0965
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.050 1 -6 1 1253 317 936 226 2 25 0 64 3 0 930 0 3 0.7129 0.0032 0.0064 12.167 1.48 6.36 -4.88 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.050 1 3 2 759 178 581 0 0 10 1 167 0 0 572 0 9 0.0000 0.0000 0.0155 16.800 3.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0115 0.9885 2 2 0.0000 0.0126 0.9874 2 2 0.0000 0.0142 0.9858
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.050 1 2 1 653 165 488 158 0 2 0 5 0 0 488 0 0 0.9576 0.0000 0.0000 81.500 0.31 6.00 -5.69 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0151 0.9849 0.0000 0 0 0.6362 0.3638 0.0000 0 0 0.8732 0.1268 0.0000
chr6 118491647 ATGT A 0.500000 0.050 1 -3 3 342 120 222 114 0 4 0 2 0 0 222 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 29.000 0.13 3.00 -2.87 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4023 0.5977 0.0000 0 0 0.8139 0.1861 0.0000 0 0 0.8797 0.1203 0.0000
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 2 922 241 681 117 0 16 1 107 0 0 680 0 1 0.4855 0.0000 0.0015 14.062 0.13 3.10 -2.97 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3101 0.5497 0.1403 1 1 0.3097 0.5459 0.1444 1 1 0.3088 0.5412 0.1500
chr6 156778052 CGCGGCGGCA C 0.500000 0.050 1 -9 2 977 206 771 107 1 12 0 86 1 0 767 0 3 0.5194 0.0013 0.0052 16.167 0.98 9.16 -8.18 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4794 0.4542 0.0663 1 0 0.4726 0.4568 0.0706 1 0 0.4634 0.4602 0.0765
chr6 156778268 C CCAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 943 270 673 94 5 78 4 89 2 1 658 1 11 0.3481 0.0030 0.0223 2.436 0.67 5.84 -5.17 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1862 0.5596 0.2542 1 1 0.1894 0.5551 0.2555 1 1 0.1935 0.5495 0.2570
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.050 1 -18 1 577 234 343 0 0 45 1 188 0 0 322 0 21 0.0000 0.0000 0.0612 4.178 16.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0051 0.9949 2 2 0.0000 0.0056 0.9944 2 2 0.0000 0.0065 0.9935
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.050 1 -3 5 414 149 265 80 0 4 0 65 0 0 265 0 0 0.5369 0.0000 0.0000 36.250 0.19 5.57 -5.38 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4230 0.4811 0.0960 1 1 0.4175 0.4821 0.1003 1 1 0.4102 0.4836 0.1062
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.050 1 -3 1 193 59 134 39 0 0 0 20 0 0 134 0 0 0.6610 0.0000 0.0000 59.000 6.82 8.60 -1.78 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5018 0.4216 0.0767 1 0 0.4925 0.4267 0.0809 1 0 0.4800 0.4332 0.0867
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.050 1 -8 2 195 50 145 5 0 3 0 42 0 0 143 0 2 0.1000 0.0000 0.0138 15.667 0.60 9.86 -9.26 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9050 0.0950 2 1 0.0000 0.6907 0.3093
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 322 141 181 0 0 16 10 115 0 0 178 0 3 0.0000 0.0000 0.0166 7.812 3.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0382 0.9618 2 2 0.0000 0.0406 0.9594 2 2 0.0000 0.0442 0.9558
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.050 1 12 3 716 151 565 64 1 34 0 52 0 0 554 0 11 0.4238 0.0000 0.0195 3.545 0.75 8.60 -7.85 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2572 0.5375 0.2053 1 1 0.2578 0.5346 0.2076 1 1 0.2584 0.5311 0.2105
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 898 373 525 7 31 68 132 135 0 0 525 0 0 0.0188 0.0000 0.0000 6.000 1.29 6.50 -5.21 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9777 0.0223
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 899 353 546 209 55 14 33 42 0 0 546 0 0 0.5921 0.0000 0.0000 25.455 3.81 13.02 -9.22 105 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 2 261 93 168 8 0 7 3 75 0 0 165 1 2 0.0860 0.0000 0.0179 12.286 0.12 4.19 -4.06 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9660 0.0340 2 1 0.0000 0.7377 0.2623
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.050 1 -4 1 226 89 137 41 0 11 0 37 0 0 137 0 0 0.4607 0.0000 0.0000 7.091 1.10 4.08 -2.98 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2875 0.5190 0.1936 1 1 0.2866 0.5175 0.1959 1 1 0.2853 0.5157 0.1990
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.050 1 -12 1 722 193 529 103 0 5 0 85 0 0 524 0 5 0.5337 0.0000 0.0095 37.600 0.20 10.89 -10.69 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3835 0.5105 0.1060 1 1 0.3801 0.5095 0.1104 1 1 0.3753 0.5083 0.1164
chr7 5312956 CGAAGAG C 0.500000 0.050 1 -6 1 767 111 656 45 1 11 0 54 0 0 656 0 0 0.4054 0.0000 0.0000 9.091 1.16 6.37 -5.21 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1524 0.5115 0.3362 1 1 0.1559 0.5106 0.3336 1 1 0.1605 0.5094 0.3300
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 679 223 456 0 1 30 15 177 0 0 455 0 1 0.0000 0.0000 0.0022 6.621 3.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0104 0.9896 2 2 0.0000 0.0107 0.9893 2 2 0.0000 0.0115 0.9885
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 361 103 258 57 0 2 0 44 0 0 257 0 1 0.5534 0.0000 0.0039 50.500 0.19 3.00 -2.81 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3911 0.4895 0.1194 1 1 0.3864 0.4902 0.1235 1 1 0.3800 0.4910 0.1290
chr7 26152597 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 323 74 249 34 0 5 0 35 0 0 249 0 0 0.4595 0.0000 0.0000 13.800 0.47 3.06 -2.59 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2278 0.5208 0.2515 1 1 0.2290 0.5192 0.2518 1 1 0.2305 0.5172 0.2522
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 468 134 334 128 0 2 0 4 0 0 334 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 66.000 0.32 1.25 -0.93 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0380 0.9620 0.0000 0 0 0.6216 0.3784 0.0000 0 0 0.8299 0.1701 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 241 112 129 103 0 4 0 5 0 0 129 0 0 0.9196 0.0000 0.0000 27.000 0.14 2.80 -2.66 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 1 0.3104 0.6896 0.0000 0 0 0.6482 0.3518 0.0000
chr7 51065234 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 581 160 421 153 0 5 0 2 0 0 421 0 0 0.9563 0.0000 0.0000 31.000 0.66 2.00 -1.34 89 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6456 0.3544 0.0000 0 0 0.9198 0.0802 0.0000 0 0 0.9491 0.0509 0.0000
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 452 141 311 61 0 0 1 79 0 0 309 0 2 0.4326 0.0000 0.0064 141.000 0.16 1.73 -1.57 33 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0637 0.4284 0.5079 1 2 0.0679 0.4327 0.4994 1 2 0.0737 0.4383 0.4880
chr7 80672793 TG T 0.500000 0.050 1 -1 3 194 83 111 46 0 1 2 34 0 0 110 0 1 0.5542 0.0000 0.0090 82.000 0.17 2.06 -1.88 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3538 0.5012 0.1449 1 1 0.3504 0.5011 0.1485 1 1 0.3457 0.5009 0.1534
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 5 836 219 617 0 0 11 1 207 0 0 607 0 10 0.0000 0.0000 0.0162 18.909 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0046 0.9954 2 2 0.0000 0.0054 0.9946
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.050 1 3 2 609 156 453 4 0 15 0 137 0 0 445 1 7 0.0256 0.0000 0.0177 9.400 0.25 3.34 -3.09 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9468 0.0532 2 2 0.0000 0.2881 0.7119 2 2 0.0000 0.1203 0.8797
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.050 1 3 1 237 91 146 49 1 1 0 40 0 0 146 0 0 0.5385 0.0000 0.0000 90.000 0.31 3.12 -2.82 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3656 0.4982 0.1362 1 1 0.3617 0.4983 0.1400 1 1 0.3566 0.4983 0.1451
chr7 93886877 CTTCT C 0.500000 0.050 1 -4 1 179 64 115 29 0 1 0 34 0 0 114 0 1 0.4531 0.0000 0.0087 63.000 0.45 4.18 -3.73 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1748 0.5087 0.3165 1 1 0.1777 0.5080 0.3143 1 1 0.1814 0.5072 0.3114
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.050 1 -4 1 672 200 472 6 0 5 0 189 0 0 469 0 3 0.0300 0.0000 0.0064 39.000 1.00 4.20 -3.20 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9931 0.0069 2 2 0.0000 0.3257 0.6743 2 2 0.0000 0.0853 0.9147
chr7 100075318 C CA 0.500000 0.050 1 1 2 560 166 394 156 0 7 0 3 0 0 394 0 0 0.9398 0.0000 0.0000 22.714 0.15 3.00 -2.85 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2934 0.7066 0.0000 0 0 0.8649 0.1351 0.0000 0 0 0.9326 0.0674 0.0000
chr7 100124796 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 571 175 396 79 1 14 3 78 0 0 396 0 0 0.4514 0.0000 0.0000 11.500 0.20 2.99 -2.78 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2127 0.5485 0.2388 1 1 0.2149 0.5449 0.2402 1 1 0.2178 0.5403 0.2420
chr7 100124796 CAGGAGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 571 177 394 84 4 83 0 6 0 0 394 0 0 0.4746 0.0000 0.0000 1.146 0.19 7.33 -7.14 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1835 0.8165 0.0000 0 0 0.5507 0.4493 0.0000
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.050 1 -35 1 121 36 85 5 0 0 0 31 0 0 77 0 8 0.1389 0.0000 0.0941 36.000 0.20 30.26 -30.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9151 0.0849 2 1 0.0000 0.7157 0.2843
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 537 151 386 81 0 4 0 66 0 0 383 0 3 0.5364 0.0000 0.0078 36.750 0.83 3.11 -2.28 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3798 0.5042 0.1160 1 1 0.3761 0.5037 0.1202 1 1 0.3709 0.5032 0.1259
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 420 121 299 35 1 39 1 45 0 0 296 0 3 0.2893 0.0000 0.0100 2.132 1.29 6.64 -5.36 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1127 0.4769 0.4104 1 1 0.1168 0.4785 0.4047 1 1 0.1224 0.4804 0.3972
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 711 157 554 73 0 10 2 72 0 1 551 1 1 0.4650 0.0000 0.0054 14.700 1.08 3.78 -2.70 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2015 0.5438 0.2548 1 1 0.2040 0.5405 0.2556 1 1 0.2072 0.5363 0.2565
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 760 227 533 111 0 17 1 98 0 0 530 0 3 0.4890 0.0000 0.0056 13.125 0.84 6.04 -5.20 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3172 0.5442 0.1386 1 1 0.3164 0.5409 0.1427 1 1 0.3151 0.5366 0.1482
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.050 1 -30 3 592 169 423 0 0 20 1 148 0 0 422 0 1 0.0000 0.0000 0.0024 7.450 15.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0224 0.9776 2 2 0.0000 0.0241 0.9759 2 2 0.0000 0.0267 0.9733
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.050 1 6 1 346 188 158 138 5 38 0 7 0 0 158 0 0 0.7340 0.0000 0.0000 3.947 4.96 4.29 0.68 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2433 0.7567 0.0000 0 0 0.6984 0.3016 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.050 1 -6 1 346 191 155 95 0 30 1 65 0 0 153 0 2 0.4974 0.0000 0.0129 5.333 0.48 10.98 -10.50 3 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5903 0.3706 0.0391 1 0 0.5797 0.3777 0.0426 1 0 0.5652 0.3871 0.0477
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.050 1 -12 1 346 195 151 104 0 25 0 66 0 0 150 0 1 0.5333 0.0000 0.0066 6.800 0.47 10.56 -10.09 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7150 0.2685 0.0166 1 0 0.7021 0.2790 0.0188 1 0 0.6845 0.2933 0.0222
chr7 137846769 T TGGCGGC 0.500000 0.050 1 6 1 379 92 287 74 0 14 0 4 0 0 287 0 0 0.8043 0.0000 0.0000 5.571 1.57 8.25 -6.68 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0093 0.9907 0.0000 0 1 0.3002 0.6998 0.0000 0 0 0.5714 0.4286 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 228 78 150 3 0 2 1 72 0 0 146 0 4 0.0385 0.0000 0.0267 38.000 0.00 3.10 -3.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9507 0.0493 2 1 0.0000 0.5261 0.4739 2 2 0.0000 0.3250 0.6750
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.050 1 19 1 187 87 100 32 0 32 1 22 0 0 98 0 2 0.3678 0.0000 0.0200 1.719 0.12 11.32 -11.19 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3314 0.5027 0.1658 1 1 0.3286 0.5025 0.1689 1 1 0.3249 0.5022 0.1729
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 3 916 266 650 104 106 53 0 3 0 0 650 0 0 0.3910 0.0000 0.0000 4.019 0.38 4.00 -3.62 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6258 0.3742 0.0000 0 0 0.9610 0.0390 0.0000 0 0 0.9809 0.0191 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 3 917 270 647 100 8 49 4 109 0 0 645 1 1 0.3704 0.0000 0.0031 4.490 0.31 3.06 -2.75 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1469 0.5516 0.3015 1 1 0.1510 0.5477 0.3013 1 1 0.1563 0.5428 0.3008
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 1459 362 1097 0 0 13 4 345 0 0 1096 1 0 0.0000 0.0000 0.0009 26.846 1.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 704 179 525 92 0 8 0 79 0 0 525 0 0 0.5140 0.0000 0.0000 21.375 1.02 4.20 -3.18 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3887 0.5038 0.1075 1 1 0.3849 0.5033 0.1118 1 1 0.3796 0.5027 0.1177
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.050 1 -4 1 862 539 323 434 0 15 0 90 0 0 322 0 1 0.8052 0.0000 0.0031 34.933 1.17 4.43 -3.27 88 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.050 1 -4 3 205 60 145 31 0 3 0 26 0 0 141 0 4 0.5167 0.0000 0.0276 19.000 0.68 5.08 -4.40 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2527 0.5183 0.2289 1 1 0.2530 0.5169 0.2301 1 1 0.2533 0.5152 0.2315
chr7 149815757 G GAGGTGGTC 0.500000 0.050 1 8 1 660 176 484 80 0 17 0 79 0 0 479 0 5 0.4545 0.0000 0.0103 9.353 0.85 7.75 -6.90 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1827 0.5450 0.2723 1 1 0.1858 0.5416 0.2726 1 1 0.1897 0.5374 0.2729
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 783 198 585 90 0 6 0 102 0 0 585 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 32.000 0.50 1.72 -1.22 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1119 0.5160 0.3720 1 1 0.1163 0.5147 0.3690 1 1 0.1222 0.5130 0.3648
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 462 125 337 122 0 2 0 1 1 0 336 0 0 0.9760 0.0030 0.0030 61.500 0.57 1.00 -0.43 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8130 0.1870 0.0000 0 0 0.9142 0.0858 0.0000 0 0 0.9294 0.0706 0.0000
chr7 149821917 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 652 162 490 158 0 1 0 3 0 1 489 0 0 0.9753 0.0000 0.0020 161.000 1.19 2.00 -0.81 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2944 0.7056 0.0000 0 0 0.8722 0.1278 0.0000 0 0 0.9369 0.0631 0.0000
chr7 151023910 GCTC G 0.500000 0.050 1 -3 1 544 157 387 150 0 5 0 2 0 0 387 0 0 0.9554 0.0000 0.0000 30.400 0.79 3.50 -2.71 28 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6249 0.3751 0.0000 0 0 0.9141 0.0859 0.0000 0 0 0.9455 0.0545 0.0000
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 464 92 372 0 0 0 17 75 0 1 357 2 12 0.0000 0.0000 0.0403 90.000 7.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0646 0.9354 2 2 0.0000 0.0677 0.9323 2 2 0.0000 0.0723 0.9277
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 467 92 375 0 1 7 9 75 0 0 357 6 12 0.0000 0.0000 0.0480 81.000 7.44 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0691 0.9309 2 2 0.0000 0.0719 0.9281 2 2 0.0000 0.0762 0.9238
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 478 90 388 0 0 9 3 78 0 1 335 21 31 0.0000 0.0000 0.1366 9.000 7.38 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0390 0.9610 2 2 0.0000 0.0411 0.9589 2 2 0.0000 0.0443 0.9557
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.050 1 -1 3 577 210 367 203 0 4 0 3 0 0 367 0 0 0.9667 0.0000 0.0000 51.500 0.28 1.00 -0.72 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5552 0.4448 0.0000 0 0 0.9528 0.0472 0.0000 0 0 0.9771 0.0229 0.0000
chr7 154968830 T TTGC 0.500000 0.050 1 3 1 1416 362 1054 304 5 41 0 12 2 0 1051 1 0 0.8398 0.0019 0.0028 7.780 0.51 4.58 -4.07 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2744 0.7256 0.0000 0 0 0.9320 0.0680 0.0000
chr7 156950334 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 5 718 195 523 98 2 12 0 83 0 0 522 0 1 0.5026 0.0000 0.0019 15.250 0.76 3.31 -2.56 42 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4270 0.4851 0.0879 1 1 0.4219 0.4858 0.0923 1 1 0.4149 0.4868 0.0983
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.050 1 -6 2 781 176 605 71 0 18 0 87 0 0 602 0 3 0.4034 0.0000 0.0050 8.778 0.34 6.25 -5.91 31 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0642 0.4371 0.4987 1 2 0.0680 0.4403 0.4917 1 2 0.0733 0.4444 0.4822
chr8 8703108 G GCAAGCC 0.002960 0.050 1 6 2 616 157 459 55 0 35 0 67 0 0 457 0 2 0.3503 0.0000 0.0044 3.486 0.56 5.58 -5.02 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2991 0.6974 0.0035 1 1 0.3071 0.6894 0.0035 1 1 0.3178 0.6789 0.0033
chr8 10608190 CTTCCTCTTCTGCCTCCTGGGACTCTATAACTTCTGACTCTGGCTGGGT C 0.002031 0.050 1 -48 3 959 248 711 117 3 23 2 103 7 3 678 12 11 0.4718 0.0098 0.0464 10.182 2.91 8.39 -5.47 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4303 0.5689 0.0008 1 1 0.4357 0.5635 0.0008 1 1 0.4425 0.5566 0.0008
chr8 10610119 T TTTC 0.070211 0.050 1 3 1 1006 306 700 246 3 15 39 3 1 0 699 0 0 0.8039 0.0014 0.0014 18.429 1.50 5.67 -4.17 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0050 0.9950 0.0000 0 1 0.4271 0.5729 0.0000 0 0 0.8840 0.1160 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.050 1 -6 1 620 277 343 0 0 45 0 232 0 0 342 1 0 0.0000 0.0000 0.0029 5.156 6.56 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr8 13567550 CAG C 0.000361 0.050 1 -2 4 582 153 429 85 0 2 0 66 0 0 428 0 1 0.5556 0.0000 0.0023 75.500 0.35 2.32 -1.97 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6690 0.3309 0.0000 1 0 0.6645 0.3354 0.0000 1 0 0.6584 0.3416 0.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.050 1 -6 2 381 152 229 82 0 4 0 66 0 0 229 0 0 0.5395 0.0000 0.0000 37.000 0.56 7.44 -6.88 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5781 0.3923 0.0296 1 0 0.5732 0.3956 0.0312 1 0 0.5665 0.4001 0.0334
chr8 56441740 CTTCATGAAGCCTCCATACCTT C 0.000737 0.050 1 -21 4 521 138 383 64 0 13 1 60 0 0 371 0 12 0.4638 0.0000 0.0313 9.615 0.70 16.32 -15.61 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3512 0.6482 0.0006 1 1 0.3580 0.6414 0.0006 1 1 0.3669 0.6325 0.0006
chr8 64581060 T TGGC 0.106611 0.050 1 3 1 563 146 417 124 2 14 1 5 4 3 408 2 0 0.8493 0.0096 0.0216 10.077 2.26 5.40 -3.14 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0293 0.9707 0.0000 0 0 0.8089 0.1911 0.0000 0 0 0.9524 0.0476 0.0000
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.050 1 3 1 592 183 409 70 5 36 3 69 0 0 409 0 0 0.3825 0.0000 0.0000 4.083 0.77 3.70 -2.92 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4620 0.5114 0.0266 1 1 0.4636 0.5093 0.0270 1 1 0.4656 0.5068 0.0276
chr8 93134802 A ATTG 0.500000 0.050 1 3 1 196 56 140 33 0 1 1 21 0 0 140 0 0 0.5893 0.0000 0.0000 54.000 0.21 3.38 -3.17 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3907 0.4802 0.1291 1 1 0.3855 0.4816 0.1329 1 1 0.3786 0.4833 0.1381
chr8 100194231 A AGAC 0.500000 0.050 1 3 5 215 72 143 41 1 2 0 28 0 0 142 0 1 0.5694 0.0000 0.0070 35.000 0.15 4.14 -4.00 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4126 0.4733 0.1141 1 1 0.4067 0.4751 0.1182 1 1 0.3988 0.4774 0.1237
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 307 100 207 97 0 0 0 3 0 0 207 0 0 0.9700 0.0000 0.0000 100.000 0.11 2.67 -2.55 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0806 0.9194 0.0000 0 0 0.5967 0.4033 0.0000 0 0 0.7705 0.2295 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.050 1 -27 4 645 231 414 135 4 18 6 68 0 0 414 0 0 0.5844 0.0000 0.0000 14.067 2.67 16.43 -13.75 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9051 0.0934 0.0014 1 0 0.8956 0.1026 0.0018 1 0 0.8815 0.1160 0.0025
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 1 331 89 242 44 0 3 0 42 0 0 242 0 0 0.4944 0.0000 0.0000 28.667 0.16 3.79 -3.63 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2609 0.5250 0.2141 1 1 0.2610 0.5231 0.2158 1 1 0.2611 0.5208 0.2181
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 267 123 144 64 0 3 0 56 0 0 138 0 6 0.5203 0.0000 0.0417 40.000 0.11 3.29 -3.18 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2542 0.5372 0.2086 1 1 0.2549 0.5344 0.2107 1 1 0.2556 0.5309 0.2135
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 470 129 341 56 1 29 3 40 0 0 338 0 3 0.4341 0.0000 0.0088 3.448 1.73 5.20 -3.47 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3797 0.4949 0.1254 1 1 0.3755 0.4951 0.1294 1 1 0.3697 0.4955 0.1348
chr8 143440216 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 1 389 149 240 111 7 25 0 6 0 0 240 0 0 0.7450 0.0000 0.0000 4.920 0.23 3.00 -2.77 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2503 0.7497 0.0000 0 0 0.6452 0.3548 0.0000
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 379 76 303 45 0 6 0 25 0 0 302 0 1 0.5921 0.0000 0.0033 11.667 2.96 5.08 -2.12 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4986 0.4252 0.0762 1 0 0.4895 0.4300 0.0804 1 0 0.4775 0.4362 0.0863
chr8 144513027 T TGGTGCA 0.500000 0.050 1 6 2 1553 355 1198 176 0 43 0 136 0 0 1181 0 17 0.4958 0.0000 0.0142 7.256 0.44 5.88 -5.43 66 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4885 0.4625 0.0490 1 0 0.4832 0.4639 0.0529 1 0 0.4756 0.4659 0.0586
chr8 144522517 T TCCCGGC 0.500000 0.050 1 6 1 537 167 370 159 1 3 0 4 0 0 370 0 0 0.9521 0.0000 0.0000 54.667 0.57 6.25 -5.68 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0767 0.9233 0.0000 0 0 0.7819 0.2181 0.0000 0 0 0.9129 0.0871 0.0000
chr8 144846107 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 1 478 216 262 201 2 10 0 3 0 0 262 0 0 0.9306 0.0000 0.0000 20.600 0.35 3.00 -2.65 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5523 0.4477 0.0000 0 0 0.9527 0.0473 0.0000 0 0 0.9770 0.0230 0.0000
chr9 116848 T TA 0.003653 0.050 1 1 1 677 199 478 102 0 8 2 87 0 0 473 0 5 0.5126 0.0000 0.0105 23.875 0.26 1.49 -1.23 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5417 0.4574 0.0009 1 0 0.5423 0.4568 0.0009 1 0 0.5427 0.4564 0.0009
chr9 117363 T TC 0.002993 0.050 1 1 1 825 136 689 68 10 8 1 49 0 0 687 0 2 0.5000 0.0000 0.0029 15.625 1.49 4.76 -3.27 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7474 0.2524 0.0002 1 0 0.7405 0.2593 0.0002 1 0 0.7311 0.2687 0.0002
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.050 1 -3 2 993 337 656 239 7 67 3 21 0 0 656 0 0 0.7092 0.0000 0.0000 4.030 0.20 3.05 -2.85 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2278 0.7722 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 2 374 108 266 0 1 22 1 84 0 0 258 0 8 0.0000 0.0000 0.0301 3.864 7.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3019 0.6981 2 2 0.0000 0.1620 0.8380 2 2 0.0000 0.1345 0.8655
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.050 1 -12 1 792 191 601 163 0 27 0 1 0 0 599 0 2 0.8534 0.0000 0.0033 6.074 0.20 12.00 -11.80 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3109 0.6891 0.0000 0 0 0.8825 0.1175 0.0000 0 0 0.9423 0.0577 0.0000
chr9 35906601 A ACCC 0.500000 0.050 1 3 2 762 253 509 29 18 20 91 95 0 0 509 0 0 0.1146 0.0000 0.0000 11.368 0.83 3.71 -2.88 13 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr9 35906602 C CCCCCACCGCCACCAT 0.500000 0.050 1 15 1 762 251 511 86 3 42 0 120 0 0 511 0 0 0.3426 0.0000 0.0000 4.976 3.70 9.58 -5.89 38 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0282 0.3435 0.6283 1 2 0.0312 0.3514 0.6173 1 2 0.0357 0.3620 0.6023
chr9 38411406 GCGGTCAT G 0.500000 0.050 1 -7 1 225 104 121 62 0 3 0 39 0 0 119 0 2 0.5962 0.0000 0.0165 33.667 0.10 8.49 -8.39 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5185 0.4164 0.0650 1 0 0.5092 0.4216 0.0692 1 0 0.4967 0.4283 0.0749
chr9 38411418 A AT 0.500000 0.050 1 1 3 225 106 119 66 0 0 0 40 0 0 116 0 3 0.6226 0.0000 0.0252 106.000 0.09 8.30 -8.21 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5447 0.3992 0.0560 1 0 0.5347 0.4053 0.0600 1 0 0.5211 0.4132 0.0657
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 308 47 261 12 0 0 0 35 0 0 260 0 1 0.2553 0.0000 0.0038 47.000 0.75 1.34 -0.59 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0535 0.3720 0.5745 1 2 0.0574 0.3807 0.5619 1 2 0.0584 0.4328 0.5088
chr9 66987534 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 1061 198 863 190 3 3 0 2 0 0 863 0 0 0.9596 0.0000 0.0000 65.000 0.48 1.00 -0.52 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8319 0.1681 0.0000 0 0 0.9685 0.0315 0.0000 0 0 0.9798 0.0202 0.0000
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.050 1 -15 3 413 134 279 76 0 1 0 57 0 0 274 0 5 0.5672 0.0000 0.0179 133.000 0.07 13.54 -13.48 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4106 0.4865 0.1029 1 1 0.4056 0.4873 0.1072 1 1 0.3987 0.4883 0.1130
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.050 1 12 1 706 145 561 68 0 15 0 62 0 0 550 0 11 0.4690 0.0000 0.0196 8.667 0.16 10.26 -10.10 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1760 0.5354 0.2886 1 1 0.1791 0.5328 0.2881 1 1 0.1832 0.5294 0.2874
chr9 77384631 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 1 433 165 268 132 1 22 1 9 0 0 268 0 0 0.8000 0.0000 0.0000 6.500 0.28 3.11 -2.83 90 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0343 0.9657 0.0000 0 1 0.3756 0.6244 0.0000
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 490 144 346 80 1 3 0 60 0 0 345 0 1 0.5556 0.0000 0.0029 47.000 0.39 3.30 -2.91 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4939 0.4376 0.0685 1 0 0.4859 0.4414 0.0727 1 0 0.4751 0.4463 0.0786
chr9 88130024 A AAGG 0.500000 0.050 1 3 1 1019 262 757 239 1 17 0 5 0 0 756 0 1 0.9122 0.0000 0.0013 14.412 0.42 3.00 -2.58 91 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0229 0.9771 0.0000 0 0 0.8712 0.1288 0.0000 0 0 0.9713 0.0287 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 1 211 72 139 0 0 2 0 70 0 0 134 0 5 0.0000 0.0000 0.0360 35.000 3.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1316 0.8684 2 2 0.0000 0.1359 0.8641 2 2 0.0000 0.1421 0.8579
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.050 1 3 2 324 95 229 28 4 23 6 34 1 0 226 0 2 0.2947 0.0044 0.0131 3.130 0.11 3.82 -3.72 8 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1464 0.4992 0.3545 1 1 0.1499 0.4992 0.3509 1 1 0.1547 0.4992 0.3461
chr9 92474742 C CTCATCA 0.500000 0.050 1 6 2 324 95 229 32 0 29 0 34 1 0 226 0 2 0.3368 0.0044 0.0131 2.276 0.66 4.41 -3.76 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2034 0.5180 0.2786 1 1 0.2054 0.5166 0.2779 1 1 0.2080 0.5149 0.2770
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.050 1 15 4 480 189 291 0 0 4 2 183 0 0 291 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 46.250 9.01 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0094 0.9906 2 2 0.0000 0.0103 0.9897 2 2 0.0000 0.0117 0.9883
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 769 297 472 188 0 4 0 105 0 0 471 0 1 0.6330 0.0000 0.0021 73.250 0.23 3.46 -3.22 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9525 0.0472 0.0003 1 0 0.9463 0.0534 0.0004 1 0 0.9367 0.0627 0.0006
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 2 378 103 275 0 0 13 2 88 0 0 275 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.846 5.61 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0940 0.9060 2 2 0.0000 0.0979 0.9021 2 2 0.0000 0.1036 0.8964
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 832 154 678 0 0 40 0 114 0 1 671 1 5 0.0000 0.0000 0.0103 2.850 6.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0743 0.9257 2 2 0.0000 0.0683 0.9317 2 2 0.0000 0.0669 0.9331
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 489 131 358 74 0 0 0 57 0 0 358 0 0 0.5649 0.0000 0.0000 131.000 0.27 2.70 -2.43 48 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4547 0.4606 0.0847 1 1 0.4480 0.4630 0.0890 1 1 0.4389 0.4662 0.0949
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.050 1 -4 1 843 183 660 102 0 2 0 79 0 0 659 0 1 0.5574 0.0000 0.0015 90.500 0.22 4.75 -4.53 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5114 0.4305 0.0581 1 0 0.5033 0.4345 0.0622 1 0 0.4924 0.4397 0.0679
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 762 181 581 84 0 3 2 92 0 0 579 1 1 0.4641 0.0000 0.0034 58.667 0.18 2.86 -2.68 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1198 0.5181 0.3621 1 1 0.1241 0.5166 0.3593 1 1 0.1298 0.5148 0.3554
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.050 1 -4 1 278 102 176 0 0 2 1 99 0 0 174 0 2 0.0000 0.0000 0.0114 50.000 4.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0713 0.9287 2 2 0.0000 0.0748 0.9252 2 2 0.0000 0.0798 0.9202
chr9 116154344 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 2 700 183 517 70 2 38 4 69 0 1 509 0 7 0.3825 0.0000 0.0155 3.789 0.84 3.70 -2.85 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1585 0.5329 0.3086 1 1 0.1621 0.5304 0.3075 1 1 0.1668 0.5273 0.3060
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 461 130 331 69 0 15 1 45 0 0 331 0 0 0.5308 0.0000 0.0000 8.214 0.64 5.69 -5.05 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5479 0.3976 0.0545 1 0 0.5378 0.4037 0.0585 1 0 0.5242 0.4117 0.0640
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.050 1 6 1 709 156 553 137 3 9 0 7 0 0 553 0 0 0.8782 0.0000 0.0000 16.111 0.57 6.29 -5.72 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2265 0.7735 0.0000 0 0 0.6790 0.3210 0.0000
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 494 113 381 97 0 8 0 8 0 0 381 0 0 0.8584 0.0000 0.0000 13.125 0.57 1.62 -1.06 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0514 0.9486 0.0000 0 1 0.3460 0.6540 0.0000
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 481 163 318 7 1 17 59 79 0 0 317 0 1 0.0429 0.0000 0.0031 8.471 0.00 3.75 -3.75 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.7932 0.2068 2 2 0.0000 0.3437 0.6563
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.050 1 -6 2 483 166 317 7 4 82 10 63 0 0 317 0 0 0.0422 0.0000 0.0000 0.975 0.00 5.90 -5.90 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9758 0.0242 2 1 0.0000 0.8265 0.1735
chr9 128825027 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 251 89 162 45 0 2 0 42 0 0 161 0 1 0.5056 0.0000 0.0062 43.500 0.29 1.21 -0.93 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2607 0.5256 0.2136 1 1 0.2609 0.5237 0.2154 1 1 0.2610 0.5213 0.2177
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 519 172 347 69 0 4 0 99 0 0 344 0 3 0.4012 0.0000 0.0086 42.000 0.32 3.31 -2.99 17 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0252 0.3171 0.6577 1 2 0.0280 0.3263 0.6457 1 2 0.0322 0.3386 0.6292
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 492 160 332 86 0 10 0 64 0 0 326 0 6 0.5375 0.0000 0.0181 15.000 0.26 7.62 -7.37 48 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4343 0.4765 0.0893 1 1 0.4286 0.4778 0.0936 1 1 0.4208 0.4796 0.0996
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 1 444 107 337 44 3 28 0 32 2 0 332 1 2 0.4112 0.0059 0.0148 2.821 1.16 3.69 -2.53 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4286 0.4675 0.1040 1 1 0.4222 0.4696 0.1082 1 1 0.4137 0.4724 0.1139
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 545 135 410 130 1 1 0 3 0 0 410 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 133.000 1.69 4.00 -2.31 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1740 0.8260 0.0000 0 0 0.7758 0.2242 0.0000 0 0 0.8845 0.1155 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 272 120 152 64 0 1 0 55 0 0 151 0 1 0.5333 0.0000 0.0066 119.000 1.52 1.47 0.04 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3319 0.5176 0.1505 1 1 0.3297 0.5162 0.1541 1 1 0.3266 0.5145 0.1589
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 272 120 152 64 0 1 0 55 0 0 151 0 1 0.5333 0.0000 0.0066 119.000 1.52 1.47 0.04 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3319 0.5176 0.1505 1 1 0.3297 0.5162 0.1541 1 1 0.3266 0.5145 0.1589
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 285 120 165 15 0 5 0 100 0 0 163 0 2 0.1250 0.0000 0.0121 23.000 0.73 2.02 -1.29 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9574 0.0426
chr9 137228812 CCT C 0.500000 0.050 1 -2 4 463 99 364 51 0 0 0 48 1 0 362 0 1 0.5152 0.0027 0.0055 99.000 0.27 2.44 -2.16 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2707 0.5281 0.2012 1 1 0.2706 0.5260 0.2035 1 1 0.2703 0.5233 0.2064
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.050 1 -15 1 457 116 341 4 0 12 2 98 1 0 332 0 8 0.0345 0.0029 0.0264 8.583 0.75 13.29 -12.54 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.6634 0.3366 2 2 0.0000 0.3256 0.6744
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 214 108 106 3 3 23 0 79 0 0 106 0 0 0.0278 0.0000 0.0000 3.864 0.33 2.92 -2.59 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.8456 0.1544 2 1 0.0000 0.5529 0.4471
chr10 5102144 T TA 0.000084 0.050 1 1 3 412 111 301 67 0 1 0 43 0 0 301 0 0 0.6036 0.0000 0.0000 110.000 0.37 1.28 -0.91 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7412 0.2588 0.0000 1 0 0.7343 0.2657 0.0000 1 0 0.7249 0.2750 0.0000
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.050 1 -9 1 748 153 595 83 0 7 0 63 0 1 590 0 4 0.5425 0.0000 0.0084 20.857 0.45 8.37 -7.92 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6431 0.3511 0.0059 1 0 0.6387 0.3551 0.0062 1 0 0.6327 0.3606 0.0067
chr10 12100187 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 127 58 69 37 0 0 0 21 0 0 69 0 0 0.6379 0.0000 0.0000 58.000 0.19 3.14 -2.95 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4590 0.4467 0.0943 1 0 0.4512 0.4503 0.0986 1 1 0.4408 0.4549 0.1043
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.050 1 6 6 890 204 686 2 0 25 1 176 0 0 666 0 20 0.0098 0.0000 0.0292 7.160 5.50 5.62 -0.12 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1607 0.8393 2 2 0.0000 0.0300 0.9700 2 2 0.0000 0.0193 0.9807
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.050 1 3 1 633 121 512 2 0 5 0 114 0 0 507 0 5 0.0165 0.0000 0.0098 23.200 2.00 3.95 -1.95 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7890 0.2110 2 2 0.0000 0.3657 0.6343 2 2 0.0000 0.2572 0.7428
chr10 26567284 CCCG C 0.002025 0.050 1 -3 5 420 104 316 39 1 26 0 38 0 0 314 1 1 0.3750 0.0000 0.0063 3.000 0.79 3.39 -2.60 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4746 0.5244 0.0010 1 1 0.4764 0.5226 0.0010 1 1 0.4787 0.5203 0.0010
chr10 27046519 CACT C 0.000055 0.050 1 -3 2 140 48 92 44 0 2 0 2 0 0 92 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 23.000 0.77 3.50 -2.73 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.050 1 -2 1 301 105 196 4 0 0 1 100 0 0 196 0 0 0.0381 0.0000 0.0000 105.000 0.25 2.10 -1.85 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9903 0.0097 2 1 0.0000 0.9709 0.0291
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.050 1 1 1 510 141 369 132 0 6 0 3 0 0 369 0 0 0.9362 0.0000 0.0000 22.500 0.44 1.00 -0.56 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3029 0.6971 0.0000 0 0 0.8729 0.1271 0.0000 0 0 0.9380 0.0620 0.0000
chr10 27414021 CG C 0.000587 0.050 1 -1 2 694 185 509 80 1 8 0 96 0 0 509 0 0 0.4324 0.0000 0.0000 22.125 0.11 1.14 -1.02 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2767 0.7226 0.0007 1 1 0.2858 0.7135 0.0007 1 1 0.2978 0.7015 0.0007
chr10 51697903 CTGTATACCTCCTCCT C 0.001304 0.050 1 -15 5 885 241 644 207 0 31 0 3 0 0 643 0 1 0.8589 0.0000 0.0016 6.774 0.24 11.00 -10.76 99 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9952 0.0048 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 53807071 A AGTT 0.002532 0.050 1 3 2 293 89 204 51 0 9 0 29 0 0 204 0 0 0.5730 0.0000 0.0000 8.889 0.24 3.17 -2.94 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7284 0.2714 0.0002 1 0 0.7215 0.2782 0.0002 1 0 0.7122 0.2875 0.0002
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.050 1 -3 1 537 140 397 65 2 3 0 70 0 0 397 0 0 0.4643 0.0000 0.0000 45.333 0.23 3.06 -2.83 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4179 0.5802 0.0019 1 1 0.4224 0.5756 0.0019 1 1 0.4283 0.5698 0.0019
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.050 1 -6 3 97 51 46 31 0 0 0 20 0 0 46 0 0 0.6078 0.0000 0.0000 51.000 0.68 6.55 -5.87 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5587 0.4074 0.0339 1 0 0.5542 0.4107 0.0351 1 0 0.5481 0.4152 0.0367
chr10 73240978 AGCGGAG A 0.006364 0.050 1 -6 3 211 116 95 113 1 0 0 2 0 0 95 0 0 0.9741 0.0000 0.0000 116.000 0.29 16.00 -15.71 65 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9906 0.0094 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr10 73240989 ACCAGTCTCT A 0.006454 0.050 1 -9 1 212 115 97 112 0 1 0 2 0 0 97 0 0 0.9739 0.0000 0.0000 114.000 0.30 16.00 -15.70 64 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9899 0.0101 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.050 1 -3 1 408 105 303 1 0 24 1 79 0 0 303 0 0 0.0095 0.0000 0.0000 3.375 0.00 3.32 -3.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7794 0.2206 2 1 0.0000 0.5838 0.4162 2 1 0.0000 0.5244 0.4756
chr10 75028901 G GGAAGAGGAA 0.002182 0.050 1 9 1 673 147 526 61 0 39 0 47 0 0 526 0 0 0.4150 0.0000 0.0000 2.769 0.75 7.06 -6.31 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6358 0.3639 0.0003 1 0 0.6319 0.3677 0.0004 1 0 0.6266 0.3730 0.0004
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.050 1 -6 2 495 191 304 79 5 23 0 84 0 0 302 0 2 0.4136 0.0000 0.0066 7.087 0.54 5.67 -5.12 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4037 0.5917 0.0046 1 1 0.4090 0.5864 0.0046 1 1 0.4157 0.5797 0.0046
chr10 75401354 T TCCG 0.000180 0.050 1 3 2 495 176 319 127 10 35 1 3 0 0 319 0 0 0.7216 0.0000 0.0000 4.059 3.62 3.00 0.62 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 75782995 TC T 0.002156 0.050 1 -1 1 185 90 95 46 0 0 0 44 0 0 95 0 0 0.5111 0.0000 0.0000 90.000 0.11 1.00 -0.89 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4963 0.5029 0.0009 1 1 0.4974 0.5017 0.0009 1 1 0.4987 0.5004 0.0009
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.050 1 1 1 194 48 146 21 3 3 5 16 0 0 145 0 1 0.4375 0.0000 0.0068 14.000 0.62 1.19 -0.57 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4663 0.4902 0.0435 1 1 0.4660 0.4901 0.0438 1 1 0.4656 0.4901 0.0443
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.050 1 6 1 600 135 465 5 0 4 1 125 0 0 456 0 9 0.0370 0.0000 0.0194 32.750 0.00 6.02 -6.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.7464 0.2536 2 2 0.0000 0.4235 0.5765
chr10 89738577 AAAG A 0.001385 0.050 1 -3 4 426 96 330 43 0 12 0 41 0 0 330 0 0 0.4479 0.0000 0.0000 7.000 1.26 4.41 -3.16 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4988 0.5007 0.0006 1 0 0.4997 0.4997 0.0006 1 0 0.5009 0.4985 0.0006
chr10 94949281 GA G 0.000392 0.050 1 -1 1 134 65 69 62 0 0 0 3 0 0 69 0 0 0.9538 0.0000 0.0000 65.000 0.15 1.00 -0.85 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9894 0.0106 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.050 1 -3 3 535 177 358 92 0 0 0 85 0 0 355 0 3 0.5198 0.0000 0.0084 177.000 0.20 3.11 -2.91 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4879 0.5068 0.0053 1 1 0.4901 0.5045 0.0054 1 1 0.4927 0.5018 0.0055
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.050 1 18 1 460 146 314 112 0 29 0 5 0 0 314 0 0 0.7671 0.0000 0.0000 4.034 0.62 18.40 -17.78 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2375 0.7625 0.0000 0 0 0.9734 0.0266 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.050 1 -2 1 360 158 202 147 0 4 0 7 0 0 201 0 1 0.9304 0.0000 0.0050 38.500 0.97 2.57 -1.61 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.3781 0.6219 0.0000 0 0 0.8545 0.1455 0.0000
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.050 1 3 3 228 84 144 38 0 3 3 40 0 0 142 0 2 0.4524 0.0000 0.0139 40.500 0.26 3.23 -2.96 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0834 0.4748 0.4419 1 1 0.0852 0.4751 0.4396 1 1 0.0877 0.4757 0.4365
chr10 115171343 CTT C 0.004437 0.050 1 -2 1 253 54 199 52 0 0 0 2 0 0 199 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 54.000 0.27 1.50 -1.23 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9697 0.0303 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr10 116471844 GGC G 0.001719 0.050 1 -2 4 142 75 67 69 1 2 0 3 0 0 67 0 0 0.9200 0.0000 0.0000 73.000 1.46 4.33 -2.87 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9613 0.0387 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr10 116471848 G GAA 0.001728 0.050 1 2 1 142 70 72 32 33 1 1 3 0 0 72 0 0 0.4571 0.0000 0.0000 39.000 0.16 4.33 -4.18 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8890 0.1110 0.0000 0 0 0.9950 0.0050 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.050 1 -1 1 345 86 259 24 4 13 8 37 0 2 254 2 1 0.2791 0.0000 0.0193 5.000 1.46 2.92 -1.46 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0813 0.4351 0.4836 1 2 0.0852 0.4389 0.4759 1 2 0.0905 0.4438 0.4657
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.050 1 21 2 630 111 519 60 0 5 0 46 0 0 502 0 17 0.5405 0.0000 0.0328 21.200 0.48 14.65 -14.17 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3649 0.5635 0.0716 1 1 0.3687 0.5598 0.0715 1 1 0.3736 0.5550 0.0714
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 370 111 259 56 0 9 0 46 0 0 259 0 0 0.5045 0.0000 0.0000 11.333 0.09 1.07 -0.98 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3620 0.5022 0.1358 1 1 0.3584 0.5020 0.1396 1 1 0.3536 0.5017 0.1447
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.050 1 -12 1 716 184 532 92 1 15 0 76 0 0 527 0 5 0.5000 0.0000 0.0094 11.267 0.36 11.37 -11.01 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5765 0.4144 0.0091 1 0 0.5746 0.4159 0.0095 1 0 0.5719 0.4180 0.0101
chr11 627108 G GAGC 0.003229 0.050 1 3 2 324 54 270 22 0 8 0 24 0 0 270 0 0 0.4074 0.0000 0.0000 5.750 1.00 3.67 -2.67 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4568 0.5413 0.0018 1 1 0.4590 0.5392 0.0018 1 1 0.4617 0.5365 0.0018
chr11 721683 CGCCAGCAGGTGCAGGGGACAGGGACGGGGCCGGCAGGTGCAGGGGACGGG C 0.000018 0.050 1 -50 2 606 167 439 126 2 38 0 1 0 0 439 0 0 0.7545 0.0000 0.0000 3.368 1.03 51.00 -49.97 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.050 1 -30 2 1005 197 808 6 1 77 0 113 0 0 808 0 0 0.0305 0.0000 0.0000 1.558 1.17 8.21 -7.05 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8444 0.1556 2 2 0.0000 0.4287 0.5713
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 2 347 101 246 0 0 3 0 98 0 0 241 1 4 0.0000 0.0000 0.0203 32.667 3.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0697 0.9303 2 2 0.0000 0.0731 0.9269 2 2 0.0000 0.0781 0.9219
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 755 263 492 248 2 5 0 8 0 0 492 0 0 0.9430 0.0000 0.0000 51.600 0.31 1.38 -1.06 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.6974 0.3026 0.0000 0 0 0.9536 0.0464 0.0000
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.050 1 2 1 216 95 121 41 0 0 3 51 0 0 120 0 1 0.4316 0.0000 0.0083 93.000 0.10 1.94 -1.84 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1113 0.4793 0.4095 1 1 0.1154 0.4806 0.4040 1 1 0.1211 0.4824 0.3966
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.050 1 2 1 216 97 119 42 1 51 1 2 0 0 119 0 0 0.4330 0.0000 0.0000 15.333 0.10 2.00 -1.90 20 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.4730 0.4386 0.0883 1 0 0.4646 0.4428 0.0926 1 0 0.4530 0.4488 0.0982
chr11 4587230 GT G 0.500000 0.050 1 -1 1 1183 283 900 278 0 2 0 3 1 0 899 0 0 0.9823 0.0011 0.0011 140.500 0.49 3.33 -2.84 108 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8942 0.1058 0.0000 0 0 0.9924 0.0076 0.0000 0 0 0.9962 0.0038 0.0000
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 616 123 493 109 0 0 0 14 0 0 493 0 0 0.8862 0.0000 0.0000 123.000 0.26 3.57 -3.31 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.0700 0.9300 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 835 199 636 2 0 4 1 192 0 0 635 0 1 0.0101 0.0000 0.0016 48.750 0.00 1.22 -1.22 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1628 0.8372 2 2 0.0000 0.0308 0.9692 2 2 0.0000 0.0197 0.9803
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 470 127 343 119 0 3 0 5 0 0 343 0 0 0.9370 0.0000 0.0000 41.333 1.25 2.00 -0.75 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0061 0.9939 0.0000 0 1 0.4028 0.5972 0.0000 0 0 0.7306 0.2694 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 1 1029 228 801 3 0 5 1 219 0 0 779 0 22 0.0132 0.0000 0.0275 44.400 0.00 5.91 -5.91 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2334 0.7666 2 2 0.0000 0.0187 0.9813 2 2 0.0000 0.0092 0.9908
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 734 183 551 5 0 8 2 168 0 0 551 0 0 0.0273 0.0000 0.0000 21.875 0.20 1.53 -1.33 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9790 0.0210 2 2 0.0000 0.2980 0.7020 2 2 0.0000 0.0983 0.9017
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.050 1 2 1 551 152 399 79 1 4 0 68 0 0 399 0 0 0.5197 0.0000 0.0000 37.000 0.13 2.09 -1.96 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3803 0.5036 0.1161 1 1 0.3765 0.5032 0.1203 1 1 0.3713 0.5027 0.1260
chr11 5454410 CA C 0.500000 0.050 1 -1 3 410 95 315 39 1 2 0 53 0 0 315 0 0 0.4105 0.0000 0.0000 46.500 0.79 1.45 -0.66 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1126 0.4800 0.4074 1 1 0.1168 0.4813 0.4020 1 1 0.1224 0.4830 0.3947
chr11 5516206 AGAAGGCAACCCAT A 0.500000 0.050 1 -13 1 579 143 436 131 0 10 0 2 0 0 436 0 0 0.9161 0.0000 0.0000 13.300 0.22 13.00 -12.78 15 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5078 0.4922 0.0000 0 0 0.8693 0.1307 0.0000 0 0 0.9166 0.0834 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.050 1 12 2 724 135 589 0 0 12 0 123 0 0 571 0 18 0.0000 0.0000 0.0306 10.250 9.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0280 0.9720 2 2 0.0000 0.0300 0.9700 2 2 0.0000 0.0329 0.9671
chr11 6795057 CAG C 0.500000 0.050 1 -2 1 718 154 564 142 1 8 0 3 0 0 564 0 0 0.9221 0.0000 0.0000 18.250 0.23 1.33 -1.11 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2153 0.7847 0.0000 0 0 0.8211 0.1789 0.0000 0 0 0.9100 0.0900 0.0000
chr11 7639816 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 3 237 94 143 87 1 3 0 3 0 0 143 0 0 0.9255 0.0000 0.0000 30.333 0.28 3.00 -2.72 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0640 0.9360 0.0000 0 0 0.5414 0.4586 0.0000 0 0 0.7299 0.2701 0.0000
chr11 8921341 CAT C 0.500000 0.050 1 -2 1 199 92 107 88 0 0 0 4 0 0 107 0 0 0.9565 0.0000 0.0000 92.000 0.39 2.00 -1.61 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0132 0.9868 0.0000 0 1 0.3774 0.6226 0.0000 0 0 0.6510 0.3490 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 285 151 134 66 1 19 2 63 0 0 131 0 3 0.4371 0.0000 0.0224 6.947 0.59 3.95 -3.36 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2178 0.5408 0.2415 1 1 0.2197 0.5377 0.2426 1 1 0.2221 0.5338 0.2440
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 3 198 94 104 89 0 1 0 4 0 0 104 0 0 0.9468 0.0000 0.0000 93.000 0.25 4.75 -4.50 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0135 0.9865 0.0000 0 1 0.3831 0.6169 0.0000 0 0 0.6563 0.3437 0.0000
chr11 34632610 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 127 65 62 32 0 0 0 33 0 0 62 0 0 0.4923 0.0000 0.0000 65.000 0.09 1.15 -1.06 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2284 0.5195 0.2521 1 1 0.2295 0.5181 0.2524 1 1 0.2310 0.5162 0.2528
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 781 255 526 6 0 9 0 240 0 0 520 0 6 0.0235 0.0000 0.0114 27.333 0.00 3.65 -3.65 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9733 0.0267 2 2 0.0000 0.1123 0.8877 2 2 0.0000 0.0247 0.9753
chr11 54603834 GGACCCCAGTGATGGGCTGGCAGTGATGGT G 0.500000 0.050 1 -29 5 405 119 286 71 1 4 0 43 0 0 279 0 7 0.5966 0.0000 0.0245 28.750 1.45 23.81 -22.36 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5274 0.4127 0.0599 1 0 0.5181 0.4180 0.0640 1 0 0.5055 0.4248 0.0697
chr11 55839334 TATCTC T 0.500000 0.050 1 -5 2 683 181 502 176 1 1 0 3 0 0 502 0 0 0.9724 0.0000 0.0000 180.000 0.77 3.67 -2.89 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3930 0.6070 0.0000 0 0 0.9139 0.0861 0.0000 0 0 0.9580 0.0420 0.0000
chr11 56252727 T TGCTTCCTACGTTGCTG 0.500000 0.050 1 16 1 774 193 581 160 0 30 0 3 0 0 581 0 0 0.8290 0.0000 0.0000 5.433 0.21 17.67 -17.46 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2950 0.7050 0.0000 0 0 0.8746 0.1254 0.0000 0 0 0.9382 0.0618 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.050 1 2 4 1005 205 800 0 0 4 0 201 0 0 791 0 9 0.0000 0.0000 0.0112 50.250 2.41 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0056 0.9944 2 2 0.0000 0.0065 0.9935
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.050 1 -1 1 627 138 489 131 1 1 0 5 0 0 489 0 0 0.9493 0.0000 0.0000 137.000 0.21 1.00 -0.79 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 1 0.4791 0.5209 0.0000 0 0 0.7866 0.2134 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 83 42 41 21 0 1 0 20 0 0 41 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 41.000 0.29 2.15 -1.86 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2559 0.5122 0.2318 1 1 0.2560 0.5113 0.2327 1 1 0.2560 0.5101 0.2339
chr11 60852693 T TGCG 0.500000 0.050 1 3 2 472 93 379 47 0 10 0 36 1 0 377 0 1 0.5054 0.0026 0.0053 8.300 0.53 3.64 -3.11 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3809 0.4907 0.1284 1 1 0.3764 0.4913 0.1323 1 1 0.3704 0.4920 0.1375
chr11 62146758 A AGCGGGAGCAGGAGCG 0.500000 0.050 1 15 1 715 191 524 5 1 42 6 137 1 1 490 0 32 0.0262 0.0019 0.0649 3.500 9.20 6.61 2.59 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.6018 0.3982 2 2 0.0000 0.1784 0.8216
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 256 86 170 30 0 16 1 39 0 0 170 0 0 0.3488 0.0000 0.0000 4.375 0.20 2.92 -2.72 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1380 0.4922 0.3698 1 1 0.1417 0.4927 0.3656 1 1 0.1467 0.4933 0.3600
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 5 297 108 189 43 2 15 0 48 0 0 189 0 0 0.3981 0.0000 0.0000 6.200 0.88 2.90 -2.01 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2022 0.5256 0.2721 1 1 0.2044 0.5237 0.2719 1 1 0.2072 0.5213 0.2715
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.050 1 21 2 936 190 746 0 0 58 2 130 0 0 684 0 62 0.0000 0.0000 0.0831 2.259 6.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0083 0.9917 2 2 0.0000 0.0095 0.9905
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.050 1 57 2 1120 227 893 51 2 124 4 46 0 1 854 1 37 0.2247 0.0000 0.0437 0.798 0.96 8.39 -7.43 25 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0236 0.2999 0.6765 1 2 0.0263 0.3099 0.6638 1 2 0.0304 0.3232 0.6464
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.050 1 -42 1 974 279 695 171 0 64 1 43 0 0 678 0 17 0.6129 0.0000 0.0245 3.344 0.27 20.77 -20.50 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9888 0.0112 0.0000 1 0 0.9864 0.0135 0.0000 1 0 0.9827 0.0173 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 934 243 691 7 0 3 1 232 0 0 691 0 0 0.0288 0.0000 0.0000 79.667 0.00 2.22 -2.22 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 2 0.0000 0.2556 0.7444 2 2 0.0000 0.0483 0.9517
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.050 1 3 1 802 172 630 81 1 23 0 67 0 0 627 0 3 0.4709 0.0000 0.0048 6.478 0.28 2.85 -2.57 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3794 0.5048 0.1158 1 1 0.3757 0.5043 0.1201 1 1 0.3706 0.5037 0.1258
chr11 73660839 A AGGTAAGTCT 0.500000 0.050 1 9 2 231 97 134 53 0 2 3 39 0 0 129 0 5 0.5464 0.0000 0.0373 47.500 0.43 9.03 -8.59 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3127 0.5187 0.1686 1 1 0.3110 0.5172 0.1717 1 1 0.3087 0.5155 0.1759
chr11 73660841 C CT 0.500000 0.050 1 1 2 232 95 137 51 2 7 2 33 0 0 132 0 5 0.5368 0.0000 0.0365 12.143 0.45 10.67 -10.22 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4099 0.4785 0.1117 1 1 0.4043 0.4799 0.1158 1 1 0.3969 0.4817 0.1214
chr11 75402313 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 319 138 181 84 0 0 0 54 0 0 181 0 0 0.6087 0.0000 0.0000 138.000 0.20 3.39 -3.19 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6294 0.3381 0.0324 1 0 0.6175 0.3468 0.0357 1 0 0.6013 0.3583 0.0403
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.050 1 -22 2 332 130 202 78 0 4 0 48 0 0 199 0 3 0.6000 0.0000 0.0149 31.500 0.17 15.35 -15.19 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5933 0.3656 0.0411 1 0 0.5821 0.3732 0.0447 1 0 0.5670 0.3832 0.0498
chr11 78210013 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 636 108 528 56 0 2 0 50 0 0 526 0 2 0.5185 0.0000 0.0038 53.000 0.39 4.58 -4.19 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2820 0.5281 0.1899 1 1 0.2815 0.5260 0.1925 1 1 0.2808 0.5233 0.1959
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1207 346 861 5 7 58 119 157 0 0 858 1 2 0.0145 0.0000 0.0035 4.862 0.60 7.62 -7.02 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 2 0.0000 0.2278 0.7722 2 2 0.0000 0.0337 0.9663
chr11 116858282 TTGCTGTTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 630 181 449 150 4 21 0 6 0 0 449 0 0 0.8287 0.0000 0.0000 8.000 0.73 2.67 -1.93 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.4426 0.5574 0.0000 0 0 0.8084 0.1916 0.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.050 1 -15 3 732 220 512 0 0 24 0 196 0 0 512 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.167 10.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0079 0.9921 2 2 0.0000 0.0090 0.9910
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.050 1 -8 2 286 127 159 69 0 3 0 55 0 0 159 0 0 0.5433 0.0000 0.0000 41.333 0.32 7.67 -7.35 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4141 0.4822 0.1037 1 1 0.4087 0.4833 0.1080 1 1 0.4015 0.4847 0.1138
chr11 119312056 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 861 182 679 95 0 2 0 85 0 0 679 0 0 0.5220 0.0000 0.0000 90.000 0.63 3.11 -2.47 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3458 0.5256 0.1286 1 1 0.3436 0.5236 0.1328 1 1 0.3406 0.5211 0.1384
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 398 135 263 0 0 7 3 125 0 0 263 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 18.000 5.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0386 0.9614 2 2 0.0000 0.0411 0.9589 2 2 0.0000 0.0447 0.9553
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.050 1 -6 1 224 90 134 40 0 13 0 37 0 0 134 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 5.923 0.17 5.65 -5.47 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2749 0.5208 0.2043 1 1 0.2745 0.5192 0.2063 1 1 0.2738 0.5172 0.2090
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 383 111 272 51 0 19 0 41 0 0 269 0 3 0.4595 0.0000 0.0110 4.842 0.94 4.29 -3.35 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3237 0.5143 0.1620 1 1 0.3215 0.5132 0.1653 1 1 0.3186 0.5118 0.1696
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 117 66 51 32 0 2 0 32 0 0 51 0 0 0.4848 0.0000 0.0000 32.000 0.22 2.12 -1.91 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2402 0.5195 0.2402 1 1 0.2410 0.5181 0.2410 1 1 0.2419 0.5162 0.2419
chr12 165530 G GAGTGTAAGTCTTTGACAGCC 0.014581 0.050 1 20 1 381 94 287 47 0 14 0 33 0 0 279 0 8 0.5000 0.0000 0.0279 5.714 0.15 8.39 -8.25 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5411 0.4545 0.0044 1 0 0.5402 0.4552 0.0045 1 0 0.5390 0.4564 0.0046
chr12 865142 T TC 0.282148 0.050 1 1 2 340 105 235 48 0 1 0 56 0 0 231 1 3 0.4571 0.0000 0.0170 104.000 0.15 1.80 -1.66 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1971 0.5574 0.2456 1 1 0.2028 0.5554 0.2418 1 1 0.2105 0.5529 0.2366
chr12 865189 T TC 0.592141 0.050 1 1 1 339 145 194 139 2 0 0 4 0 0 194 0 0 0.9586 0.0000 0.0000 145.000 1.09 1.50 -0.41 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0347 0.9653 0.0000 0 0 0.6074 0.3926 0.0000 0 0 0.8207 0.1793 0.0000
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.050 1 3 1 510 137 373 44 4 32 1 56 0 0 370 0 3 0.3212 0.0000 0.0080 3.281 0.20 3.05 -2.85 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1390 0.5090 0.3520 1 1 0.1436 0.5089 0.3474 1 1 0.1499 0.5088 0.3413
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.050 1 -3 1 424 139 285 0 0 33 5 101 0 0 283 0 2 0.0000 0.0000 0.0070 3.312 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0523 0.9477 2 2 0.0000 0.0549 0.9451 2 2 0.0000 0.0587 0.9413
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.050 1 5 1 243 86 157 0 0 8 0 78 0 0 156 0 1 0.0000 0.0000 0.0064 9.750 4.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1190 0.8810 2 2 0.0000 0.1233 0.8767 2 2 0.0000 0.1293 0.8707
chr12 10723069 G GGGT 0.002430 0.050 1 3 1 300 102 198 88 5 8 0 1 0 0 198 0 0 0.8627 0.0000 0.0000 11.750 0.39 3.00 -2.61 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.050 1 -9 1 666 170 496 82 0 20 0 68 0 0 494 0 2 0.4824 0.0000 0.0040 7.500 0.28 8.66 -8.38 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5872 0.4058 0.0070 1 0 0.5849 0.4078 0.0073 1 0 0.5817 0.4106 0.0077
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.050 1 -3 1 271 150 121 58 1 11 2 78 0 0 120 0 1 0.3867 0.0000 0.0083 12.636 2.34 3.86 -1.51 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0326 0.3583 0.6091 1 2 0.0350 0.3640 0.6010 1 2 0.0384 0.3715 0.5901
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.050 1 -2 1 505 119 386 58 0 1 3 57 0 0 385 0 1 0.4874 0.0000 0.0026 118.000 0.38 2.02 -1.64 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3587 0.5592 0.0821 1 1 0.3623 0.5557 0.0821 1 1 0.3669 0.5512 0.0819
chr12 29433780 GTTTTC G 0.000480 0.050 1 -5 1 95 49 46 28 0 0 0 21 0 0 45 0 1 0.5714 0.0000 0.0217 49.000 0.36 5.43 -5.07 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5584 0.4414 0.0001 1 0 0.5567 0.4431 0.0002 1 0 0.5545 0.4454 0.0002
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.050 1 1 1 951 240 711 228 0 5 0 7 0 0 711 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 47.000 0.57 1.00 -0.43 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 0 0.9079 0.0921 0.0000 0 0 0.9852 0.0148 0.0000
chr12 49330292 GA G 0.000352 0.050 1 -1 1 788 165 623 91 0 2 9 63 0 0 617 1 5 0.5515 0.0000 0.0096 163.000 0.73 9.76 -9.04 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6202 0.3797 0.0001 1 0 0.6175 0.3824 0.0001 1 0 0.6138 0.3861 0.0001
chr12 49330294 GCATAACTC G 0.000352 0.050 1 -8 1 794 172 622 100 0 1 1 70 0 0 610 4 8 0.5814 0.0000 0.0193 171.000 0.78 9.04 -8.26 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6535 0.3464 0.0000 1 0 0.6498 0.3501 0.0000 1 0 0.6447 0.3552 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.050 1 -21 2 938 238 700 123 0 12 1 102 0 0 698 0 2 0.5168 0.0000 0.0029 18.750 0.72 14.10 -13.37 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4679 0.4660 0.0661 1 1 0.4628 0.4672 0.0701 1 1 0.4556 0.4688 0.0756
chr12 52680016 TCCACCAAAGCCACCA T 0.002049 0.050 1 -15 2 1104 310 794 138 0 46 3 123 0 0 793 0 1 0.4452 0.0000 0.0013 5.739 0.33 10.03 -9.70 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5554 0.4442 0.0004 1 0 0.5562 0.4434 0.0004 1 0 0.5569 0.4426 0.0004
chr12 52768988 C CGCT 0.004583 0.050 1 3 2 521 148 373 5 67 20 3 53 0 0 371 1 1 0.0338 0.0000 0.0054 6.632 1.60 3.87 -2.27 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5923 0.4067 0.0009 1 0 0.5901 0.4089 0.0010 1 0 0.5870 0.4120 0.0010
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.050 1 21 2 465 105 360 54 0 21 0 30 0 0 349 0 11 0.5143 0.0000 0.0306 4.000 0.26 11.90 -11.64 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6141 0.3785 0.0074 1 0 0.6101 0.3821 0.0077 1 0 0.6048 0.3870 0.0082
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.050 1 -18 2 1127 294 833 112 1 68 1 112 0 0 828 0 5 0.3810 0.0000 0.0060 3.309 0.35 13.48 -13.13 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3532 0.6184 0.0284 1 1 0.3600 0.6116 0.0284 1 1 0.3687 0.6029 0.0284
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.050 1 -1 1 343 88 255 51 0 0 0 37 0 0 254 1 0 0.5795 0.0000 0.0039 88.000 0.41 1.70 -1.29 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5097 0.4289 0.0614 1 0 0.5045 0.4316 0.0638 1 0 0.4976 0.4352 0.0672
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.050 1 -4 2 536 113 423 110 0 0 0 3 0 0 423 0 0 0.9735 0.0000 0.0000 113.000 0.31 4.00 -3.69 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9534 0.0466 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.050 1 3 2 352 101 251 96 0 0 0 5 0 0 251 0 0 0.9505 0.0000 0.0000 101.000 1.08 4.00 -2.92 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 1 0.3575 0.6425 0.0000 0 0 0.6960 0.3040 0.0000
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.050 1 -3 1 1081 309 772 0 0 25 3 281 0 1 769 0 2 0.0000 0.0000 0.0039 11.360 3.28 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.050 1 -1 1 141 60 81 27 2 2 1 28 0 0 81 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 28.500 0.07 1.21 -1.14 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3425 0.5182 0.1393 1 1 0.3435 0.5169 0.1396 1 1 0.3448 0.5152 0.1400
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 1 465 139 326 49 8 33 0 49 0 0 323 0 3 0.3525 0.0000 0.0092 3.212 0.49 3.12 -2.63 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2943 0.5258 0.1799 1 1 0.2934 0.5238 0.1828 1 1 0.2921 0.5214 0.1866
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 1 447 120 327 0 0 15 3 102 0 0 321 0 6 0.0000 0.0000 0.0183 6.933 3.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0579 0.9421 2 2 0.0000 0.0610 0.9390 2 2 0.0000 0.0655 0.9345
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.050 1 -60 3 1773 453 1320 339 14 87 4 9 2 2 1313 1 2 0.7483 0.0015 0.0053 4.457 2.02 4.33 -2.32 101 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2111 0.7889 0.0000 0 0 0.9387 0.0613 0.0000
chr12 108623665 GAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.050 1 -30 2 1738 394 1344 169 8 39 11 167 1 1 1336 4 2 0.4289 0.0007 0.0060 8.821 0.52 4.47 -3.95 37 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1522 0.6004 0.2474 1 1 0.1568 0.5930 0.2502 1 1 0.1629 0.5836 0.2535
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 607 161 446 92 0 2 0 67 0 0 431 0 15 0.5714 0.0000 0.0336 79.500 0.27 9.16 -8.89 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3471 0.5237 0.1291 1 1 0.3449 0.5219 0.1333 1 1 0.3416 0.5195 0.1388
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 658 200 458 4 2 24 8 162 0 0 457 0 1 0.0200 0.0000 0.0022 7.333 1.25 4.20 -2.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9895 0.0105 2 2 0.0000 0.4034 0.5966 2 2 0.0000 0.1279 0.8721
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 201 102 99 0 0 4 0 98 0 0 99 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 24.500 2.52 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0783 0.9217 2 2 0.0000 0.0819 0.9181 2 2 0.0000 0.0872 0.9128
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -6 1 203 88 115 2 0 12 2 72 0 0 113 0 2 0.0227 0.0000 0.0174 6.333 0.00 5.82 -5.82 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7946 0.2054 2 2 0.0000 0.3685 0.6315 2 2 0.0000 0.2538 0.7462
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.050 1 -5 5 397 126 271 0 0 5 2 119 0 0 262 0 9 0.0000 0.0000 0.0332 24.000 5.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0367 0.9633 2 2 0.0000 0.0391 0.9609 2 2 0.0000 0.0426 0.9574
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.050 1 15 4 336 74 262 0 0 5 0 69 0 0 252 0 10 0.0000 0.0000 0.0382 13.800 11.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1205 0.8795 2 2 0.0000 0.1248 0.8752 2 2 0.0000 0.1308 0.8692
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.050 1 1 3 553 175 378 153 5 12 1 4 0 0 378 0 0 0.8743 0.0000 0.0000 13.583 1.82 2.00 -0.18 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0457 0.9543 0.0000 0 0 0.6979 0.3021 0.0000 0 0 0.8844 0.1156 0.0000
chr12 122995576 TGCCACCACC T 0.500000 0.050 1 -9 1 403 159 244 150 0 4 1 4 0 0 244 0 0 0.9434 0.0000 0.0000 38.750 0.27 7.50 -7.23 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0355 0.9645 0.0000 0 0 0.6598 0.3402 0.0000 0 0 0.8656 0.1344 0.0000
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 5 680 180 500 85 0 20 0 75 0 0 492 0 8 0.4722 0.0000 0.0160 8.000 0.38 8.13 -7.76 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2472 0.5499 0.2029 1 1 0.2484 0.5462 0.2054 1 1 0.2499 0.5415 0.2087
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.050 1 3 3 268 98 170 42 2 32 2 20 0 0 167 0 3 0.4286 0.0000 0.0176 2.062 0.17 2.95 -2.78 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5018 0.4229 0.0754 1 0 0.4926 0.4279 0.0796 1 0 0.4803 0.4343 0.0854
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.050 1 9 1 231 74 157 0 0 3 0 71 0 0 150 0 7 0.0000 0.0000 0.0446 23.667 8.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1232 0.8768 2 2 0.0000 0.1275 0.8725 2 2 0.0000 0.1336 0.8664
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 632 191 441 72 13 47 6 53 0 0 437 0 4 0.3770 0.0000 0.0091 3.250 0.44 3.96 -3.52 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4893 0.4411 0.0696 1 0 0.4815 0.4447 0.0738 1 0 0.4710 0.4493 0.0797
chr13 38690377 G GGGCTCT 0.000196 0.050 1 6 1 700 121 579 58 0 4 1 58 0 0 576 1 2 0.4793 0.0000 0.0052 29.250 0.31 6.10 -5.79 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4150 0.5849 0.0001 1 1 0.4195 0.5803 0.0001 1 1 0.4253 0.5745 0.0001
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.050 1 5 1 172 60 112 27 0 2 0 31 0 0 108 0 4 0.4500 0.0000 0.0357 29.000 0.19 4.68 -4.49 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3625 0.6046 0.0329 1 1 0.3675 0.6002 0.0323 1 1 0.3740 0.5944 0.0316
chr13 46553473 C CCCA 0.000465 0.050 1 3 4 289 102 187 91 2 5 0 4 0 0 187 0 0 0.8922 0.0000 0.0000 19.400 0.58 3.75 -3.17 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9703 0.0297 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr13 51111048 C CT 0.500000 0.050 1 1 2 665 222 443 116 0 4 0 102 0 0 442 0 1 0.5225 0.0000 0.0023 54.500 0.23 1.16 -0.92 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3772 0.5184 0.1043 1 1 0.3744 0.5168 0.1088 1 1 0.3703 0.5149 0.1149
chr13 60528441 GATA G 0.187645 0.050 1 -3 4 415 99 316 48 0 4 0 47 0 0 315 0 1 0.4848 0.0000 0.0032 23.750 0.50 3.11 -2.61 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3824 0.5293 0.0883 1 1 0.3842 0.5271 0.0887 1 1 0.3864 0.5243 0.0893
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.050 1 6 1 616 148 468 56 2 30 5 55 1 1 461 0 5 0.3784 0.0021 0.0150 3.867 0.84 6.58 -5.74 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3333 0.5876 0.0791 1 1 0.3383 0.5831 0.0785 1 1 0.3449 0.5774 0.0777
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.050 1 4 1 108 52 56 3 0 3 0 46 0 0 55 0 1 0.0577 0.0000 0.0179 16.333 0.00 3.59 -3.59 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9903 0.0097 2 1 0.0000 0.9775 0.0225
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.050 1 3 4 677 107 570 0 1 20 2 84 0 1 560 1 8 0.0000 0.0000 0.0175 4.300 4.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0245 0.9755 2 2 0.0000 0.0252 0.9748 2 2 0.0000 0.0263 0.9737
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.050 1 -3 2 471 72 399 2 1 23 2 44 0 2 394 1 2 0.0278 0.0000 0.0125 2.087 0.50 5.16 -4.66 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9522 0.0478 2 1 0.0000 0.6843 0.3157 2 1 0.0000 0.5076 0.4924
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.050 1 6 1 245 72 173 65 2 3 0 2 0 0 173 0 0 0.9028 0.0000 0.0000 23.000 1.34 7.50 -6.16 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1709 0.8291 0.0000 0 0 0.5785 0.4215 0.0000 0 0 0.7032 0.2968 0.0000
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.050 1 -15 1 201 66 135 8 0 3 0 55 0 1 132 0 2 0.1212 0.0000 0.0222 21.000 0.12 9.44 -9.31 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9836 0.0164 2 1 0.0000 0.8502 0.1498
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.050 1 -15 1 201 64 137 2 0 18 1 43 0 0 135 0 2 0.0312 0.0000 0.0146 2.556 2.00 10.91 -8.91 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8912 0.1088 2 1 0.0000 0.5509 0.4491 2 2 0.0000 0.4120 0.5880
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.050 1 4 1 386 87 299 3 0 3 0 81 0 0 295 0 4 0.0345 0.0000 0.0134 28.000 0.00 3.85 -3.85 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9404 0.0596 2 2 0.0000 0.4769 0.5231 2 2 0.0000 0.2844 0.7156
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 1 534 117 417 0 0 4 0 113 0 0 413 0 4 0.0000 0.0000 0.0096 28.250 3.42 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0500 0.9500 2 2 0.0000 0.0529 0.9471 2 2 0.0000 0.0571 0.9429
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.050 1 1 2 1344 325 1019 221 0 8 0 96 0 0 1018 0 1 0.6800 0.0000 0.0010 39.625 1.24 2.57 -1.33 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9881 0.0119 0.0000 1 0 0.9854 0.0145 0.0000 1 0 0.9809 0.0190 0.0000
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.050 1 -1 4 834 222 612 1 0 26 0 195 0 0 611 0 1 0.0045 0.0000 0.0016 7.538 0.00 1.30 -1.30 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0415 0.9585 2 2 0.0000 0.0184 0.9816 2 2 0.0000 0.0157 0.9843
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.050 1 -19 1 472 134 338 85 0 2 0 47 0 0 334 0 4 0.6343 0.0000 0.0118 66.000 0.42 19.00 -18.58 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7094 0.2723 0.0183 1 0 0.6974 0.2820 0.0205 1 0 0.6810 0.2952 0.0238
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.050 1 1 1 379 89 290 49 0 4 0 36 0 0 290 0 0 0.5506 0.0000 0.0000 21.250 0.31 1.08 -0.78 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2782 0.5418 0.1799 1 1 0.2732 0.5411 0.1857 1 1 0.2665 0.5401 0.1933
chr14 20383624 TGCAGC T 0.000003 0.050 1 -5 1 626 131 495 72 0 4 0 55 0 1 484 0 10 0.5496 0.0000 0.0222 31.750 0.61 8.36 -7.75 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5515 0.4485 0.0000 1 0 0.5510 0.4490 0.0000 1 0 0.5503 0.4497 0.0000
chr14 20383633 C CATGT 0.000003 0.050 1 4 3 625 135 490 75 2 3 0 55 0 1 478 0 11 0.5556 0.0000 0.0245 44.000 0.65 8.38 -7.73 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5991 0.4009 0.0000 1 0 0.5969 0.4031 0.0000 1 0 0.5939 0.4061 0.0000
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.050 1 6 1 442 107 335 3 0 3 0 101 0 0 335 0 0 0.0280 0.0000 0.0000 34.667 0.00 5.32 -5.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9647 0.0353 2 1 0.0000 0.6140 0.3860 2 2 0.0000 0.4122 0.5878
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.050 1 -3 1 661 216 445 95 4 17 1 99 0 0 445 0 0 0.4398 0.0000 0.0000 11.588 0.65 4.21 -3.56 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4000 0.5709 0.0291 1 1 0.4046 0.5660 0.0293 1 1 0.4106 0.5598 0.0296
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.050 1 -3 1 317 50 267 18 1 5 1 25 0 0 265 0 2 0.3600 0.0000 0.0075 9.000 5.83 3.48 2.35 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1958 0.5179 0.2863 1 1 0.1999 0.5176 0.2825 1 1 0.2054 0.5171 0.2775
chr14 23275617 TTCCTCC T 0.001309 0.050 1 -6 1 337 54 283 30 0 3 1 20 0 0 282 0 1 0.5556 0.0000 0.0035 17.000 2.53 6.00 -3.47 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5835 0.4161 0.0003 1 0 0.5809 0.4187 0.0004 1 0 0.5774 0.4222 0.0004
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.050 1 -1 1 306 76 230 38 0 2 0 36 0 0 230 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 37.000 0.79 1.19 -0.40 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4652 0.5015 0.0333 1 1 0.4658 0.5006 0.0336 1 1 0.4664 0.4996 0.0340
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.050 1 3 1 374 110 264 4 0 27 2 77 0 0 260 0 4 0.0364 0.0000 0.0152 3.074 0.00 4.21 -4.21 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9956 0.0044 2 1 0.0000 0.8330 0.1670 2 1 0.0000 0.6176 0.3824
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.050 1 6 1 374 110 264 5 0 62 2 41 0 0 261 1 2 0.0455 0.0000 0.0114 0.754 0.60 4.95 -4.35 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9441 0.0559 2 1 0.0000 0.7998 0.2002
chr14 24409748 A ACAGTTTCCAAAGCACCTG 0.001352 0.050 1 18 1 762 186 576 86 1 33 1 65 0 0 549 0 27 0.4624 0.0000 0.0469 4.636 0.34 9.52 -9.19 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3730 0.6261 0.0009 1 1 0.3796 0.6195 0.0009 1 1 0.3881 0.6110 0.0009
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.050 1 6 1 673 139 534 116 1 17 0 5 0 0 533 0 1 0.8345 0.0000 0.0019 7.176 0.92 8.80 -7.88 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0638 0.9362 0.0000 0 1 0.2710 0.7290 0.0000
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.050 1 2 1 496 118 378 111 0 4 0 3 0 0 378 0 0 0.9407 0.0000 0.0000 28.500 0.90 2.00 -1.10 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9714 0.0286 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.050 1 -6 2 724 183 541 4 0 27 4 148 0 1 536 0 4 0.0219 0.0000 0.0092 5.741 1.00 6.95 -5.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7857 0.2143 2 2 0.0000 0.0754 0.9246 2 2 0.0000 0.0264 0.9736
chr14 73719350 TTAC T 0.000003 0.050 1 -3 1 271 90 181 47 0 1 0 42 0 0 181 0 0 0.5222 0.0000 0.0000 89.000 0.17 3.36 -3.19 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5370 0.4630 0.0000 1 0 0.5365 0.4635 0.0000 1 0 0.5359 0.4641 0.0000
chr14 77027418 TTGC T 0.008855 0.050 1 -3 1 471 128 343 1 1 30 55 41 0 0 337 2 4 0.0078 0.0000 0.0175 3.167 3.00 3.76 -0.76 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9917 0.0083 2 1 0.0000 0.9688 0.0312 2 1 0.0000 0.9524 0.0476
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.050 1 -6 1 471 128 343 6 3 59 5 55 0 0 337 1 5 0.0469 0.0000 0.0175 1.138 0.83 6.64 -5.80 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9856 0.0144 2 1 0.0000 0.8735 0.1265
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.050 1 -3 1 461 108 353 11 46 8 37 6 0 3 348 0 2 0.1019 0.0000 0.0142 21.667 2.45 3.17 -0.71 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5581 0.3867 0.0552 1 0 0.5485 0.3928 0.0588 1 0 0.5356 0.4007 0.0637
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.050 1 -3 2 482 147 335 0 0 21 3 123 0 0 332 0 3 0.0000 0.0000 0.0090 5.905 3.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0213 0.9787 2 2 0.0000 0.0227 0.9773 2 2 0.0000 0.0248 0.9752
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.050 1 -9 1 289 93 196 54 0 11 0 28 0 0 193 0 3 0.5806 0.0000 0.0153 7.455 0.20 8.82 -8.62 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5849 0.3687 0.0464 1 0 0.5747 0.3755 0.0498 1 0 0.5609 0.3845 0.0545
chr14 104707525 ACCCCAC A 0.082909 0.050 1 -6 2 477 93 384 35 1 22 1 34 0 0 381 0 3 0.3763 0.0000 0.0078 3.500 0.97 9.32 -8.35 33 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4055 0.5475 0.0470 1 1 0.4083 0.5449 0.0469 1 1 0.4118 0.5415 0.0467
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.050 1 -12 2 487 96 391 38 1 21 0 36 0 0 389 0 2 0.3958 0.0000 0.0051 3.750 1.00 8.36 -7.36 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4180 0.5130 0.0690 1 1 0.4189 0.5116 0.0695 1 1 0.4200 0.5099 0.0701
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.050 1 -3 2 416 111 305 0 0 18 3 90 0 0 303 0 2 0.0000 0.0000 0.0066 5.111 3.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1984 0.8016 2 2 0.0000 0.2061 0.7939 2 2 0.0000 0.2170 0.7830
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.050 1 -3 1 322 91 231 46 2 8 2 33 1 0 230 0 0 0.5055 0.0043 0.0043 10.375 2.46 3.85 -1.39 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5615 0.3989 0.0396 1 0 0.5560 0.4026 0.0414 1 0 0.5487 0.4075 0.0438
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.050 1 3 1 651 91 560 0 1 9 2 79 0 4 477 57 22 0.0000 0.0000 0.1482 9.111 4.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.050 1 -2 2 465 121 344 85 0 1 0 35 0 0 344 0 0 0.7025 0.0000 0.0000 120.000 0.13 2.00 -1.87 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8616 0.1347 0.0037 1 0 0.8509 0.1447 0.0044 1 0 0.8356 0.1588 0.0055
chr15 30614474 GCAGGACCAC G 0.001011 0.050 1 -9 1 275 74 201 68 0 4 0 2 0 0 201 0 0 0.9189 0.0000 0.0000 17.500 0.34 9.00 -8.66 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9952 0.0048 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.050 1 -1 2 210 95 115 1 0 6 55 33 0 0 114 1 0 0.0105 0.0000 0.0087 6.800 1.00 1.33 -0.33 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.5698 0.4302 2 2 0.0000 0.3527 0.6473 2 2 0.0000 0.3019 0.6981
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.050 1 -2 2 210 96 114 1 1 38 1 55 0 0 113 0 1 0.0104 0.0000 0.0088 1.568 1.00 2.05 -1.05 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7488 0.2512 2 2 0.0000 0.3420 0.6580 2 2 0.0000 0.2329 0.7671
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.050 1 -3 1 648 164 484 2 0 41 2 119 0 0 481 0 3 0.0122 0.0000 0.0062 2.976 0.50 3.96 -3.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3488 0.6512 2 2 0.0000 0.0766 0.9234 2 2 0.0000 0.0476 0.9524
chr15 34038912 C CCCGCCGCCGCCT 0.002022 0.050 1 12 4 275 96 179 36 0 15 0 45 0 0 173 0 6 0.3750 0.0000 0.0335 5.400 0.56 10.09 -9.53 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2987 0.6987 0.0027 1 1 0.3064 0.6910 0.0026 1 1 0.3166 0.6809 0.0025
chr15 35084193 TCA T 0.022764 0.050 1 -2 2 628 130 498 80 0 1 0 49 0 0 496 0 2 0.6154 0.0000 0.0040 129.000 1.45 3.06 -1.61 62 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7766 0.2224 0.0010 1 0 0.7690 0.2299 0.0011 1 0 0.7585 0.2402 0.0013
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.050 1 -2 1 420 141 279 132 1 4 0 4 0 0 279 0 0 0.9362 0.0000 0.0000 34.250 1.22 2.00 -0.78 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0772 0.9228 0.0000 0 0 0.7871 0.2129 0.0000 0 0 0.9168 0.0832 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.050 1 -3 1 452 105 347 1 0 11 1 92 0 0 341 1 5 0.0095 0.0000 0.0173 9.400 6.00 4.11 1.89 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2311 0.7689 2 2 0.0000 0.1075 0.8925 2 2 0.0000 0.0875 0.9125
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.050 1 -3 3 736 151 585 135 1 11 0 4 0 0 585 0 0 0.8940 0.0000 0.0000 12.727 1.74 5.00 -3.26 11 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6879 0.3121 0.0000 0 0 0.9898 0.0102 0.0000 0 0 0.9966 0.0034 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.050 1 3 3 371 122 249 66 1 0 1 54 0 0 248 0 1 0.5410 0.0000 0.0040 122.000 0.30 3.46 -3.16 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4819 0.4538 0.0643 1 0 0.4785 0.4550 0.0666 1 0 0.4738 0.4565 0.0697
chr15 85247041 TCCC T 0.001521 0.050 1 -3 1 211 85 126 51 1 0 0 33 0 0 121 1 4 0.6000 0.0000 0.0397 85.000 0.20 4.42 -4.23 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6418 0.3579 0.0002 1 0 0.6376 0.3622 0.0003 1 0 0.6318 0.3679 0.0003
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.050 1 3 1 1036 289 747 139 6 58 5 81 0 0 746 0 1 0.4810 0.0000 0.0013 3.931 0.38 2.98 -2.59 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9224 0.0773 0.0003 1 0 0.9157 0.0839 0.0004 1 0 0.9060 0.0934 0.0005
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.050 1 -24 2 803 190 613 2 0 32 1 155 0 0 587 0 26 0.0105 0.0000 0.0424 4.938 1.50 14.10 -12.60 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2659 0.7341 2 2 0.0000 0.0545 0.9455 2 2 0.0000 0.0349 0.9651
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.050 1 -6 1 328 92 236 0 0 5 1 86 0 0 224 0 12 0.0000 0.0000 0.0508 17.200 7.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.050 1 -9 2 239 83 156 31 0 20 0 32 0 0 148 0 8 0.3735 0.0000 0.0513 3.150 2.71 10.00 -7.29 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3540 0.6204 0.0256 1 1 0.3596 0.6153 0.0251 1 1 0.3668 0.6087 0.0245
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.050 1 1 2 28 18 10 12 0 0 0 6 0 0 10 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 18.000 0.58 1.33 -0.75 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4834 0.4538 0.0628 1 0 0.4803 0.4559 0.0639 1 0 0.4759 0.4593 0.0647
chr16 286888 C CA 0.009296 0.050 1 1 1 555 99 456 60 0 3 0 36 0 0 455 0 1 0.6061 0.0000 0.0022 32.000 0.35 1.33 -0.98 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7324 0.2669 0.0007 1 0 0.7255 0.2737 0.0008 1 0 0.7161 0.2830 0.0008
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.050 1 2 2 331 94 237 45 0 0 0 49 0 0 237 0 0 0.4787 0.0000 0.0000 94.000 1.04 3.14 -2.10 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2720 0.5425 0.1855 1 1 0.2752 0.5400 0.1848 1 1 0.2793 0.5368 0.1839
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.050 1 -17 2 267 79 188 7 0 3 0 69 0 0 185 0 3 0.0886 0.0000 0.0160 25.333 0.86 15.09 -14.23 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9946 0.0054 2 1 0.0000 0.9607 0.0393
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 432 80 352 0 0 4 2 74 0 0 352 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 18.750 6.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 432 80 352 0 0 4 2 74 0 0 352 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 18.750 6.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2179036 C CGCG 0.006791 0.050 1 3 6 528 120 408 47 3 34 1 35 3 1 403 0 1 0.3917 0.0074 0.0123 2.606 1.83 3.63 -1.80 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6668 0.3323 0.0009 1 0 0.6617 0.3374 0.0009 1 0 0.6547 0.3442 0.0010
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.050 1 -3 2 255 88 167 46 0 2 0 40 0 0 166 0 1 0.5227 0.0000 0.0060 43.000 1.15 3.05 -1.90 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5199 0.4683 0.0118 1 0 0.5194 0.4686 0.0120 1 0 0.5187 0.4691 0.0123
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.050 1 -3 1 387 101 286 38 0 2 0 61 0 0 286 0 0 0.3762 0.0000 0.0000 99.000 0.16 2.89 -2.73 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0382 0.3532 0.6086 1 2 0.0411 0.3601 0.5989 1 2 0.0451 0.3691 0.5857
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.050 1 3 1 345 114 231 61 7 41 0 5 2 0 229 0 0 0.5351 0.0087 0.0087 1.780 1.56 3.00 -1.44 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0081 0.9919 0.0000 0 1 0.4926 0.5074 0.0000 0 0 0.8026 0.1974 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.050 1 -2 1 205 61 144 26 0 0 1 34 0 0 144 0 0 0.4262 0.0000 0.0000 61.000 0.23 1.97 -1.74 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0008 0.4090 0.5902 1 2 0.0009 0.4117 0.5874 1 2 0.0009 0.4155 0.5836
chr16 18543716 GA G 0.002566 0.050 1 -1 1 350 165 185 106 3 2 1 53 0 0 185 0 0 0.6424 0.0000 0.0000 81.500 0.14 1.13 -0.99 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9251 0.0749 0.0000 1 0 0.9187 0.0813 0.0000 1 0 0.9093 0.0906 0.0000
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.050 1 -1 1 315 197 118 99 0 3 2 93 0 0 117 0 1 0.5025 0.0000 0.0085 64.667 1.10 1.10 0.00 47 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4431 0.5276 0.0292 1 1 0.4458 0.5244 0.0298 1 1 0.4492 0.5204 0.0304
chr16 23636312 AAC A 0.500000 0.050 1 -2 3 407 114 293 50 0 9 1 54 0 0 293 0 0 0.4386 0.0000 0.0000 11.667 0.38 2.35 -1.97 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1802 0.5245 0.2953 1 1 0.1830 0.5226 0.2943 1 1 0.1868 0.5203 0.2929
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.050 1 -12 1 656 249 407 127 1 13 0 108 0 0 407 0 0 0.5100 0.0000 0.0000 18.077 0.25 9.18 -8.92 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6089 0.3722 0.0189 1 0 0.6044 0.3754 0.0202 1 0 0.5981 0.3798 0.0221
chr16 28342756 G GCCTCTTGGGTTTGGGTGATTGTTCCACCTCATCCACCCTCCA 0.000004 0.050 1 42 2 430 241 189 169 8 11 5 48 0 0 189 0 0 0.7012 0.0000 0.0000 20.909 0.24 3.15 -2.91 79 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9971 0.0029 0.0000 1 0 0.9964 0.0036 0.0000 0 1 0.1815 0.8185 0.0000
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.050 1 -27 1 918 209 709 0 0 59 7 143 0 0 707 1 1 0.0000 0.0000 0.0028 2.492 11.56 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0450 0.9550 2 2 0.0000 0.0484 0.9516 2 2 0.0000 0.0535 0.9465
chr16 28593494 G GT 0.000605 0.050 1 1 3 424 112 312 54 0 3 0 55 0 0 312 0 0 0.4821 0.0000 0.0000 36.333 0.22 1.31 -1.09 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4542 0.5455 0.0003 1 1 0.4572 0.5425 0.0003 1 1 0.4609 0.5388 0.0003
chr16 30953571 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 519 130 389 123 1 3 0 3 0 0 389 0 0 0.9462 0.0000 0.0000 42.000 1.15 2.00 -0.85 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1480 0.8520 0.0000 0 0 0.7412 0.2588 0.0000 0 0 0.8643 0.1357 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 149 85 64 46 0 4 1 34 0 0 64 0 0 0.5412 0.0000 0.0000 20.250 0.22 2.15 -1.93 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3818 0.4895 0.1287 1 1 0.3772 0.4901 0.1326 1 1 0.3711 0.4910 0.1379
chr16 48143986 CTT C 0.500000 0.050 1 -2 2 200 109 91 59 0 2 0 48 0 0 91 0 0 0.5413 0.0000 0.0000 53.500 0.14 2.17 -2.03 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3759 0.4974 0.1267 1 1 0.3718 0.4975 0.1307 1 1 0.3663 0.4976 0.1360
chr16 51141744 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 2 954 247 707 199 10 36 0 2 0 0 707 0 0 0.8057 0.0000 0.0000 5.750 0.49 3.00 -2.51 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8768 0.1232 0.0000 0 0 0.9778 0.0222 0.0000 0 0 0.9857 0.0143 0.0000
chr16 67195890 A ACAGCAGCAG 0.500000 0.050 1 9 2 500 195 305 73 2 52 2 66 0 1 291 0 13 0.3744 0.0000 0.0459 2.731 0.67 6.77 -6.10 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1728 0.5397 0.2875 1 1 0.1761 0.5367 0.2872 1 1 0.1804 0.5329 0.2867
chr16 67652328 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 603 151 452 142 1 3 0 5 0 0 451 1 0 0.9404 0.0000 0.0022 49.333 0.30 3.00 -2.70 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0093 0.9907 0.0000 0 0 0.5241 0.4759 0.0000 0 0 0.8162 0.1838 0.0000
chr16 67842908 GCAGCAGCAGCAA G 0.500000 0.050 1 -12 1 1065 339 726 300 7 25 4 3 0 0 726 0 0 0.8850 0.0000 0.0000 12.708 1.63 12.00 -10.37 88 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8701 0.1299 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 1063 322 741 128 4 47 8 135 0 0 741 0 0 0.3975 0.0000 0.0000 5.851 0.24 3.54 -3.30 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1115 0.5462 0.3423 1 1 0.1161 0.5426 0.3413 1 1 0.1222 0.5381 0.3396
chr16 71933451 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 1 318 121 197 113 2 2 0 4 0 0 197 0 0 0.9339 0.0000 0.0000 59.500 0.21 3.00 -2.79 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0257 0.9743 0.0000 0 0 0.5411 0.4589 0.0000 0 0 0.7808 0.2192 0.0000
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 130 68 62 3 0 2 0 63 0 0 59 0 3 0.0441 0.0000 0.0484 33.000 0.00 3.89 -3.89 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9622 0.0378 2 1 0.0000 0.5929 0.4071 2 2 0.0000 0.3853 0.6147
chr16 72797458 C CTTG 0.500000 0.050 1 3 1 650 152 498 105 8 33 1 5 1 0 497 0 0 0.6908 0.0020 0.0020 3.576 0.31 3.20 -2.89 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 1 0.3580 0.6420 0.0000 0 0 0.6951 0.3049 0.0000
chr16 85656394 CGAGCGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 484 110 374 92 2 14 0 2 0 0 374 0 0 0.8364 0.0000 0.0000 6.857 1.05 6.00 -4.95 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2891 0.7109 0.0000 0 0 0.7276 0.2724 0.0000 0 0 0.8190 0.1810 0.0000
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.050 1 6 1 456 111 345 31 2 31 0 47 0 0 340 0 5 0.2793 0.0000 0.0145 2.581 3.29 5.60 -2.31 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0757 0.4295 0.4948 1 2 0.0799 0.4340 0.4861 1 2 0.0858 0.4398 0.4744
chr16 87604287 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 456 118 338 58 8 25 6 21 0 0 336 1 1 0.4915 0.0000 0.0059 3.720 4.47 3.05 1.42 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7178 0.2630 0.0191 1 0 0.7041 0.2743 0.0216 1 0 0.6853 0.2894 0.0252
chr16 88431998 ATGC A 0.500000 0.050 1 -3 1 823 160 663 85 0 6 0 69 1 0 659 0 3 0.5312 0.0015 0.0060 25.667 0.75 3.25 -2.49 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4045 0.4933 0.1022 1 1 0.3999 0.4935 0.1066 1 1 0.3936 0.4939 0.1125
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.050 1 -2 1 704 162 542 0 0 5 10 147 0 0 529 3 10 0.0000 0.0000 0.0240 38.500 7.47 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0144 0.9856 2 2 0.0000 0.0156 0.9844 2 2 0.0000 0.0175 0.9825
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 700 155 545 0 2 6 15 132 0 0 533 5 7 0.0000 0.0000 0.0220 24.167 7.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0216 0.9784 2 2 0.0000 0.0228 0.9772 2 2 0.0000 0.0248 0.9752
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 703 152 551 0 1 1 4 146 0 2 532 5 12 0.0000 0.0000 0.0345 151.000 7.68 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2479 0.7521 2 2 0.0000 0.0718 0.9282 2 2 0.0000 0.0444 0.9556
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.050 1 -6 1 734 136 598 3 0 2 0 131 0 0 597 0 1 0.0221 0.0000 0.0017 67.000 0.00 7.24 -7.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8254 0.1746 2 2 0.0000 0.2218 0.7782 2 2 0.0000 0.1140 0.8860
chr16 88714227 GGTGTGGGTGT G 0.500000 0.050 1 -10 1 741 137 604 2 1 21 109 4 0 0 604 0 0 0.0146 0.0000 0.0000 5.429 1.00 12.25 -11.25 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6291 0.3709 2 2 0.0000 0.2059 0.7941 2 2 0.0000 0.1334 0.8666
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.050 1 6 2 750 182 568 80 1 22 0 79 0 0 560 0 8 0.4396 0.0000 0.0141 7.273 0.29 5.49 -5.21 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1635 0.5404 0.2961 1 1 0.1671 0.5373 0.2956 1 1 0.1717 0.5335 0.2948
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.050 1 4 2 158 68 90 35 0 4 0 29 0 0 90 0 0 0.5147 0.0000 0.0000 16.000 0.83 4.03 -3.21 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3165 0.5087 0.1748 1 1 0.3143 0.5080 0.1777 1 1 0.3114 0.5072 0.1814
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.050 1 -3 1 853 205 648 108 0 16 0 81 0 0 642 1 5 0.5268 0.0000 0.0093 11.812 0.31 3.22 -2.91 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6214 0.3564 0.0222 1 0 0.6153 0.3609 0.0238 1 0 0.6068 0.3670 0.0262
chr17 4933907 ACCACCCCAGAGCCCAC A 0.138018 0.050 1 -16 1 1225 237 988 193 16 14 6 8 0 0 988 0 0 0.8143 0.0000 0.0000 19.909 5.83 2.38 3.46 21 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3790 0.6210 0.0000 0 0 0.9215 0.0785 0.0000
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.050 1 -3 1 805 157 648 5 81 6 0 65 0 0 647 0 1 0.0318 0.0000 0.0015 24.833 1.60 4.22 -2.62 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6383 0.3607 0.0010 1 0 0.6346 0.3643 0.0011 1 0 0.6296 0.3693 0.0011
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.050 1 3 1 738 214 524 76 6 49 1 82 0 0 521 0 3 0.3551 0.0000 0.0057 3.367 0.20 2.93 -2.73 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1231 0.5320 0.3449 1 1 0.1252 0.5290 0.3457 1 1 0.1281 0.5253 0.3466
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 1 593 172 421 163 0 6 0 3 0 0 421 0 0 0.9477 0.0000 0.0000 27.667 0.09 3.00 -2.91 97 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3110 0.6890 0.0000 0 0 0.8825 0.1175 0.0000 0 0 0.9423 0.0577 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.050 1 9 2 403 95 308 40 0 4 0 51 1 0 307 0 0 0.4211 0.0032 0.0032 22.750 0.57 7.31 -6.74 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1359 0.4987 0.3654 1 1 0.1397 0.4987 0.3615 1 1 0.1448 0.4988 0.3564
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 549 218 331 91 3 27 3 94 0 0 331 0 0 0.4174 0.0000 0.0000 7.074 0.14 3.11 -2.96 55 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1835 0.5541 0.2624 1 1 0.1867 0.5501 0.2633 1 1 0.1908 0.5450 0.2642
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 922 255 667 223 2 3 22 5 0 0 667 0 0 0.8745 0.0000 0.0000 77.333 0.34 5.40 -5.06 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0074 0.9926 0.0000 0 0 0.5172 0.4828 0.0000 0 0 0.8473 0.1527 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 923 251 672 216 5 25 2 3 0 0 672 0 0 0.8606 0.0000 0.0000 10.667 0.33 5.33 -5.00 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2518 0.7482 0.0000 0 0 0.9219 0.0781 0.0000 0 0 0.9729 0.0271 0.0000
chr17 18778544 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 889 311 578 301 4 1 0 5 0 0 578 0 0 0.9678 0.0000 0.0000 310.000 0.32 1.00 -0.68 201 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3848 0.6152 0.0000 0 0 0.9850 0.0150 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.050 1 3 1 742 186 556 85 1 8 0 92 0 0 555 0 1 0.4570 0.0000 0.0018 22.250 1.34 4.02 -2.68 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1532 0.5397 0.3071 1 1 0.1569 0.5367 0.3063 1 1 0.1619 0.5330 0.3051
chr17 35479822 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 819 203 616 113 0 6 1 83 0 0 616 0 0 0.5567 0.0000 0.0000 32.833 0.27 1.22 -0.94 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6012 0.3646 0.0342 1 0 0.5907 0.3718 0.0375 1 0 0.5764 0.3813 0.0423
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 136 75 61 32 0 1 0 42 0 0 60 0 1 0.4267 0.0000 0.0164 74.000 0.09 1.26 -1.17 24 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1292 0.4876 0.3832 1 1 0.1330 0.4885 0.3785 1 1 0.1382 0.4895 0.3722
chr17 41084358 GGCCCCAGTGCTGCCAGTCTGTGTGCTGCCAACCCACCTGCTGTCGCCCCACCTGCTGTGAGACGACCTGCTGCCACCCTAGGTGCTGCATCTCCAGCTGCTGCCGCCCCAGCTGCTGTATGTCCAGCTGCTGCAA G 0.500000 0.050 1 -135 1 604 274 330 147 4 45 4 74 0 0 329 1 0 0.5365 0.0000 0.0030 5.067 1.60 3.18 -1.58 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9287 0.0705 0.0008 1 0 0.9205 0.0785 0.0010 1 0 0.9083 0.0903 0.0014
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 526 123 403 53 0 6 0 64 0 0 403 0 0 0.4309 0.0000 0.0000 19.500 0.47 1.53 -1.06 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1259 0.5005 0.3736 1 1 0.1300 0.5003 0.3697 1 1 0.1354 0.5002 0.3645
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.050 1 15 1 558 117 441 2 2 10 3 100 1 1 414 1 24 0.0171 0.0023 0.0612 10.700 7.50 7.72 -0.22 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9897 0.0103 2 1 0.0000 0.5596 0.4404 2 2 0.0000 0.2470 0.7530
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.050 1 -15 1 581 182 399 83 0 33 0 66 0 0 387 0 12 0.4560 0.0000 0.0301 4.515 0.49 13.26 -12.76 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2848 0.5415 0.1737 1 1 0.2847 0.5384 0.1770 1 1 0.2843 0.5345 0.1812
chr17 44399551 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 770 168 602 81 0 9 0 78 0 0 601 0 1 0.4821 0.0000 0.0017 17.667 0.31 3.18 -2.87 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2485 0.5475 0.2040 1 1 0.2496 0.5439 0.2064 1 1 0.2510 0.5394 0.2096
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.050 1 3 5 1579 317 1262 167 0 2 0 148 1 0 1257 0 4 0.5268 0.0008 0.0040 157.500 0.26 3.28 -3.03 55 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3928 0.5265 0.0807 1 1 0.3906 0.5241 0.0853 1 1 0.3872 0.5211 0.0917
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 635 177 458 142 3 19 0 13 0 0 458 0 0 0.8023 0.0000 0.0000 8.316 0.97 2.85 -1.87 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 1 0.2050 0.7950 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 236 77 159 0 0 4 0 73 0 0 155 0 4 0.0000 0.0000 0.0252 18.250 4.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1259 0.8741 2 2 0.0000 0.1302 0.8698 2 2 0.0000 0.1364 0.8636
chr17 47836758 AAGGAGCTGGAGC A 0.500000 0.050 1 -12 1 602 132 470 64 0 7 0 61 0 0 463 0 7 0.4848 0.0000 0.0149 17.857 0.39 10.89 -10.49 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1869 0.5354 0.2777 1 1 0.1897 0.5327 0.2775 1 1 0.1934 0.5294 0.2772
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.050 1 9 2 416 106 310 1 0 14 0 91 0 0 301 0 9 0.0094 0.0000 0.0290 6.571 2.00 7.29 -5.29 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2924 0.7076 2 2 0.0000 0.1421 0.8579 2 2 0.0000 0.1166 0.8834
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.050 1 3 5 896 243 653 225 1 10 0 7 0 0 653 0 0 0.9259 0.0000 0.0000 23.300 0.23 3.43 -3.20 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 0 0.7106 0.2894 0.0000 0 0 0.9435 0.0565 0.0000
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.050 1 3 2 525 124 401 54 4 19 0 47 0 0 395 0 6 0.4355 0.0000 0.0150 5.526 0.48 2.91 -2.43 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2924 0.5267 0.1810 1 1 0.2915 0.5247 0.1838 1 1 0.2903 0.5221 0.1876
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.050 1 6 2 409 142 267 5 0 27 2 108 0 0 267 0 0 0.0352 0.0000 0.0000 4.222 0.00 5.87 -5.87 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9954 0.0046 2 1 0.0000 0.6519 0.3481 2 2 0.0000 0.3151 0.6849
chr17 65536436 ACGGGGGGTGGTG A 0.500000 0.050 1 -12 1 436 142 294 132 0 6 0 4 0 0 291 0 3 0.9296 0.0000 0.0102 22.667 0.33 12.00 -11.67 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1947 0.8053 0.0000 0 0 0.6372 0.3628 0.0000
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.050 1 9 1 389 152 237 87 1 17 0 47 0 0 237 0 0 0.5724 0.0000 0.0000 7.941 0.28 7.11 -6.83 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7530 0.2340 0.0131 1 0 0.7396 0.2454 0.0150 1 0 0.7210 0.2610 0.0180
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.050 1 8 2 285 85 200 70 1 10 0 4 2 0 198 0 0 0.8235 0.0100 0.0100 7.500 0.77 8.25 -7.48 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0091 0.9909 0.0000 0 1 0.2950 0.7050 0.0000 0 0 0.5655 0.4345 0.0000
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.050 1 -2 3 311 93 218 84 0 2 0 7 0 0 217 0 1 0.9032 0.0000 0.0046 45.500 0.18 2.14 -1.96 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0366 0.9634 0.0000 0 1 0.2771 0.7229 0.0000
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.050 1 -1 1 124 58 66 32 0 3 1 22 0 0 65 0 1 0.5517 0.0000 0.0152 18.333 0.06 1.09 -1.03 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3456 0.4979 0.1564 1 1 0.3422 0.4981 0.1597 1 1 0.3377 0.4982 0.1641
chr17 74842534 ACTGTCT A 0.500000 0.050 1 -6 5 400 104 296 98 0 4 0 2 0 0 296 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 25.000 1.37 6.00 -4.63 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3102 0.6898 0.0000 0 0 0.7467 0.2533 0.0000 0 0 0.8328 0.1672 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.050 1 9 2 566 104 462 0 1 5 1 97 0 0 442 0 20 0.0000 0.0000 0.0433 19.600 7.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1092 0.8908 2 2 0.0000 0.0824 0.9176 2 2 0.0000 0.0748 0.9252
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.050 1 -54 1 293 97 196 70 3 4 1 19 0 0 196 0 0 0.7216 0.0000 0.0000 23.000 1.20 4.84 -3.64 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8546 0.1408 0.0046 1 0 0.7627 0.2322 0.0050 0 1 0.0192 0.9806 0.0001
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 1221 291 930 146 1 11 1 132 0 1 921 0 8 0.5017 0.0000 0.0097 25.455 0.50 2.44 -1.94 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2815 0.5739 0.1446 1 1 0.2827 0.5684 0.1490 1 1 0.2838 0.5614 0.1547
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 1388 317 1071 186 1 24 1 105 2 1 1050 0 18 0.5868 0.0019 0.0196 12.208 0.85 16.18 -15.33 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8984 0.1003 0.0013 1 0 0.8890 0.1094 0.0017 1 0 0.8752 0.1225 0.0023
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.050 1 -27 1 1445 270 1175 185 1 9 0 75 1 2 1137 1 34 0.6852 0.0009 0.0323 32.500 0.92 20.61 -19.69 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9407 0.0589 0.0004 1 0 0.9336 0.0659 0.0006 1 0 0.9228 0.0763 0.0009
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.050 1 -2 2 622 193 429 183 2 3 0 5 0 0 429 0 0 0.9482 0.0000 0.0000 63.333 0.31 2.60 -2.29 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0292 0.9708 0.0000 0 0 0.7723 0.2277 0.0000 0 0 0.9292 0.0708 0.0000
chr17 75616380 CAGGAGGAGG C 0.500000 0.050 1 -9 1 1073 275 798 208 4 53 5 5 2 0 795 1 0 0.7564 0.0025 0.0038 4.170 0.78 9.80 -9.02 102 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1333 0.8667 0.0000 0 0 0.7511 0.2489 0.0000
chr17 75896675 CCGGGGCCGGGAT C 0.500000 0.050 1 -12 4 531 157 374 135 0 19 0 3 0 0 373 1 0 0.8599 0.0000 0.0027 7.263 0.38 12.00 -11.62 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1581 0.8419 0.0000 0 0 0.7649 0.2351 0.0000 0 0 0.8809 0.1191 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.050 1 -30 1 2233 519 1714 229 15 52 14 209 4 4 1694 3 9 0.4412 0.0023 0.0117 8.788 1.48 7.61 -6.13 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3772 0.5589 0.0639 1 1 0.3777 0.5539 0.0685 1 1 0.3775 0.5476 0.0749
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 2172 542 1630 217 5 41 5 274 4 3 1451 18 154 0.4004 0.0025 0.1098 13.079 1.75 4.44 -2.69 33 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr18 13049812 GA G 0.001808 0.050 1 -1 1 335 104 231 53 1 2 1 47 0 0 230 0 1 0.5096 0.0000 0.0043 50.500 0.17 3.98 -3.81 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5350 0.4644 0.0006 1 0 0.5348 0.4646 0.0006 1 0 0.5344 0.4651 0.0006
chr18 13049814 GCA G 0.001808 0.050 1 -2 1 333 99 234 52 0 2 0 45 0 0 233 0 1 0.5253 0.0000 0.0043 97.000 0.17 4.11 -3.94 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5396 0.4599 0.0006 1 0 0.5391 0.4603 0.0006 1 0 0.5384 0.4610 0.0006
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.050 1 3 1 245 96 149 0 0 4 0 92 0 0 144 0 5 0.0000 0.0000 0.0336 23.000 3.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 1 112 58 54 53 0 2 0 3 0 0 54 0 0 0.9138 0.0000 0.0000 28.000 0.40 3.00 -2.60 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0276 0.9724 0.0000 0 1 0.3326 0.6674 0.0000 0 0 0.5388 0.4612 0.0000
chr18 54224211 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 2 313 78 235 68 2 2 0 6 0 0 235 0 0 0.8718 0.0000 0.0000 38.000 0.63 3.33 -2.70 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0928 0.9072 0.0000 0 1 0.3656 0.6344 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 248 143 105 0 0 5 1 137 0 0 105 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 27.600 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0301 0.9699 2 2 0.0000 0.0322 0.9678 2 2 0.0000 0.0353 0.9647
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.050 1 -15 2 836 203 633 196 0 4 0 3 0 0 632 0 1 0.9655 0.0000 0.0016 49.750 0.29 10.67 -10.38 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1683 0.8317 0.0000 0 0 0.8968 0.1032 0.0000 0 0 0.9613 0.0387 0.0000
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 6 412 99 313 8 0 19 5 67 0 1 308 1 3 0.0808 0.0000 0.0160 4.158 2.50 4.79 -2.29 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9755 0.0245 2 1 0.0000 0.7892 0.2108
chr18 63643565 TGAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 373 118 255 62 0 2 0 54 0 0 255 0 0 0.5254 0.0000 0.0000 58.000 0.08 2.85 -2.77 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3328 0.5164 0.1509 1 1 0.3305 0.5151 0.1544 1 1 0.3273 0.5135 0.1592
chr18 63954437 AGATGGAGATATTCATC A 0.500000 0.050 1 -16 2 114 50 64 38 0 1 0 11 0 0 60 0 4 0.7600 0.0000 0.0625 49.000 0.50 16.45 -15.95 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5595 0.3829 0.0576 1 0 0.5483 0.3901 0.0616 1 0 0.5329 0.4000 0.0671
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 174 69 105 0 0 6 0 63 0 0 105 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.500 2.87 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1701 0.8299 2 2 0.0000 0.1746 0.8254 2 2 0.0000 0.1809 0.8191
chr18 74556356 GTGC G 0.500000 0.050 1 -3 1 126 74 52 41 0 3 0 30 0 0 51 0 1 0.5541 0.0000 0.0192 23.667 0.05 3.10 -3.05 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3698 0.4926 0.1376 1 1 0.3656 0.4931 0.1413 1 1 0.3600 0.4937 0.1463
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.050 1 24 3 520 236 284 71 4 21 12 128 0 0 283 1 0 0.3008 0.0000 0.0035 11.722 1.77 4.91 -3.13 5 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0049 0.1957 0.7993 1 2 0.0062 0.2120 0.7818 1 2 0.0082 0.2350 0.7567
chr19 868206 AGCTCT A 0.000155 0.050 1 -5 2 1221 273 948 150 1 8 0 114 0 0 946 0 2 0.5495 0.0000 0.0021 33.000 0.56 4.99 -4.43 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8013 0.1987 0.0000 1 0 0.7946 0.2054 0.0000 1 0 0.7853 0.2147 0.0000
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.050 1 3 1 241 119 122 1 1 48 2 67 0 0 122 0 0 0.0084 0.0000 0.0000 7.778 1.00 2.70 -1.70 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9972 0.0028 2 1 0.0000 0.9924 0.0076 2 1 0.0000 0.9894 0.0106
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.050 1 -3 1 168 73 95 34 1 3 0 35 0 0 95 0 0 0.4658 0.0000 0.0000 23.333 0.97 4.09 -3.12 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3673 0.5214 0.1114 1 1 0.3685 0.5198 0.1117 1 1 0.3701 0.5177 0.1122
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.050 1 -3 2 261 134 127 80 1 2 0 51 0 0 127 0 0 0.5970 0.0000 0.0000 66.000 0.17 3.12 -2.94 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7364 0.2527 0.0109 1 0 0.7270 0.2610 0.0120 1 0 0.7141 0.2721 0.0138
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.050 1 3 2 346 71 275 5 0 17 8 41 0 0 272 0 3 0.0704 0.0000 0.0109 3.176 0.20 5.54 -5.34 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9954 0.0046 2 1 0.0000 0.9809 0.0191
chr19 1827021 T TGGAGGAGGTGGA 0.000087 0.050 1 12 2 346 71 275 38 2 5 1 25 0 1 271 0 3 0.5352 0.0000 0.0145 16.000 2.87 6.60 -3.73 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6242 0.3758 0.0000 1 0 0.6203 0.3797 0.0000 1 0 0.6151 0.3849 0.0000
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.050 1 -12 4 307 104 203 44 1 14 0 45 0 0 196 1 6 0.4231 0.0000 0.0345 6.357 1.27 13.11 -11.84 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2907 0.5689 0.1404 1 1 0.2954 0.5656 0.1390 1 1 0.3015 0.5613 0.1372
chr19 2253751 GGCGCGGTCTGCGCCTTCTTGC G 0.000218 0.050 1 -21 1 294 111 183 105 0 4 0 2 0 0 182 0 1 0.9459 0.0000 0.0055 26.750 0.40 21.00 -20.60 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9979 0.0021 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.050 1 3 1 902 213 689 168 3 39 0 3 1 0 688 0 0 0.7887 0.0015 0.0015 4.436 0.38 6.67 -6.29 76 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7902 0.2098 0.0000 0 0 0.9827 0.0173 0.0000 0 0 0.9918 0.0082 0.0000
chr19 7477288 C CTA 0.000494 0.050 1 2 1 279 100 179 53 0 3 1 43 0 0 179 0 0 0.5300 0.0000 0.0000 32.333 0.21 2.02 -1.82 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5808 0.4191 0.0001 1 0 0.5788 0.4211 0.0001 1 0 0.5760 0.4239 0.0001
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.050 1 -3 1 429 113 316 60 0 5 0 48 0 0 316 0 0 0.5310 0.0000 0.0000 21.600 0.43 3.00 -2.57 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5694 0.4072 0.0234 1 0 0.5658 0.4099 0.0243 1 0 0.5608 0.4135 0.0256
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.050 1 -12 2 586 147 439 78 0 9 1 59 0 0 434 0 5 0.5306 0.0000 0.0114 15.333 0.76 10.98 -10.23 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5027 0.4409 0.0564 1 0 0.4986 0.4425 0.0589 1 0 0.4930 0.4448 0.0622
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.050 1 5 3 262 69 193 0 0 4 0 65 0 0 192 0 1 0.0000 0.0000 0.0052 16.250 5.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2879 0.7121 2 2 0.0000 0.2948 0.7052 2 2 0.0000 0.3043 0.6957
chr19 13207858 CCTG C 0.175850 0.050 1 -3 1 408 136 272 1 0 21 67 47 0 0 266 5 1 0.0074 0.0000 0.0221 5.476 0.00 3.34 -3.34 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.5384 0.4616 2 2 0.0000 0.3210 0.6790 2 2 0.0000 0.2765 0.7235
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.050 1 -6 1 408 137 271 1 2 65 0 69 0 0 266 0 5 0.0073 0.0000 0.0185 1.145 0.00 5.74 -5.74 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7176 0.2824 2 2 0.0000 0.4885 0.5115 2 2 0.0000 0.4154 0.5846
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.050 1 3 1 337 102 235 55 1 3 1 42 0 0 234 0 1 0.5392 0.0000 0.0043 33.000 0.18 3.07 -2.89 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5919 0.3954 0.0127 1 0 0.5884 0.3985 0.0132 1 0 0.5836 0.4026 0.0139
chr19 14799631 CAGA C 0.002283 0.050 1 -3 1 703 135 568 131 0 2 0 2 0 0 568 0 0 0.9704 0.0000 0.0000 66.500 1.58 5.00 -3.42 53 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9978 0.0022 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.050 1 3 1 557 134 423 0 0 7 0 127 0 0 420 0 3 0.0000 0.0000 0.0071 18.143 3.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr19 17286678 GTGTGTGTGTGTGTT G 0.125300 0.050 1 -14 1 369 93 276 55 12 15 6 5 1 0 275 0 0 0.5914 0.0036 0.0036 5.615 2.55 6.60 -4.05 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0937 0.9063 0.0000 0 0 0.5396 0.4604 0.0000
chr19 18869245 T TGCC 0.049608 0.050 1 3 1 593 159 434 134 5 18 0 2 0 0 434 0 0 0.8428 0.0000 0.0000 7.833 0.75 3.00 -2.25 54 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9603 0.0397 0.0000 0 0 0.9936 0.0064 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.050 1 -3 2 641 148 493 73 0 4 0 71 0 0 490 0 3 0.4932 0.0000 0.0061 36.000 0.16 3.03 -2.86 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4028 0.5548 0.0424 1 1 0.4063 0.5510 0.0426 1 1 0.4108 0.5463 0.0429
chr19 23745033 TA T 0.001746 0.050 1 -1 3 620 152 468 76 0 3 1 72 0 0 468 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 49.667 0.11 1.29 -1.19 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4909 0.5085 0.0006 1 1 0.4929 0.5065 0.0006 1 1 0.4953 0.5040 0.0007
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.050 1 -3 1 293 80 213 3 0 11 4 62 0 0 213 0 0 0.0375 0.0000 0.0000 6.273 0.00 3.03 -3.03 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8348 0.1652 2 2 0.0000 0.2253 0.7747 2 2 0.0000 0.1113 0.8887
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.050 1 3 1 601 146 455 0 0 7 2 137 0 0 449 0 6 0.0000 0.0000 0.0132 19.857 3.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0090 0.9910 2 2 0.0000 0.0097 0.9903 2 2 0.0000 0.0107 0.9893
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.050 1 -51 2 540 261 279 227 1 20 0 13 0 0 279 0 0 0.8697 0.0000 0.0000 13.389 7.21 12.54 -5.33 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1856 0.8144 0.0000 0 0 0.9015 0.0985 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.050 1 12 2 533 202 331 42 3 42 6 109 0 0 331 0 0 0.2079 0.0000 0.0000 4.103 13.31 8.01 5.30 6 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0091 0.3605 0.6304 1 2 0.0113 0.3867 0.6020 1 2 0.0149 0.4220 0.5630
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.050 1 24 2 564 120 444 65 0 19 1 35 0 0 412 0 32 0.5417 0.0000 0.0721 5.316 0.55 14.97 -14.42 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3934 0.5756 0.0310 1 1 0.3978 0.5713 0.0310 1 1 0.4033 0.5658 0.0309
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.050 1 3 1 115 61 54 29 0 10 0 22 0 0 54 0 0 0.4754 0.0000 0.0000 5.100 0.10 3.05 -2.94 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5588 0.4327 0.0086 1 0 0.5565 0.4347 0.0088 1 0 0.5535 0.4375 0.0090
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.050 1 -1 2 448 133 315 0 0 4 4 125 0 0 307 1 7 0.0000 0.0000 0.0254 31.250 3.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0686 0.9314 2 2 0.0000 0.0731 0.9269 2 2 0.0000 0.0797 0.9203
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.050 1 -2 1 230 37 193 0 0 3 31 3 0 0 193 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 16.000 2.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1078 0.8922 2 2 0.0000 0.1095 0.8905 2 2 0.0000 0.1117 0.8883
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.050 1 2 2 230 36 194 0 0 21 13 2 0 0 194 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 1.091 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1330 0.8670 2 2 0.0000 0.1344 0.8656 2 2 0.0000 0.1364 0.8636
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.050 1 -6 1 455 119 336 0 0 8 1 110 0 0 336 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 13.750 5.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0481 0.9519 2 2 0.0000 0.0508 0.9492 2 2 0.0000 0.0546 0.9454
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.050 1 1 2 429 134 295 3 0 3 0 128 0 0 294 0 1 0.0224 0.0000 0.0034 43.667 2.00 1.71 0.29 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9530 0.0470 2 1 0.0000 0.5500 0.4500 2 2 0.0000 0.3551 0.6449
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.050 1 3 1 303 100 203 49 0 3 0 48 0 0 203 0 0 0.4900 0.0000 0.0000 32.333 0.43 4.54 -4.11 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4638 0.5182 0.0180 1 1 0.4655 0.5164 0.0181 1 1 0.4675 0.5142 0.0183
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.050 1 -1 1 528 106 422 101 0 2 0 3 0 0 422 0 0 0.9528 0.0000 0.0000 52.000 0.21 2.33 -2.13 53 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6065 0.3935 0.0000 0 0 0.9629 0.0371 0.0000 0 0 0.9833 0.0167 0.0000
chr19 43024952 TG T 0.000014 0.050 1 -1 2 450 123 327 74 0 1 0 48 0 0 327 0 0 0.6016 0.0000 0.0000 122.000 1.31 1.48 -0.17 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7570 0.2430 0.0000 1 0 0.7499 0.2501 0.0000 1 0 0.7402 0.2598 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.050 1 -6 1 334 93 241 0 0 2 0 91 0 0 233 0 8 0.0000 0.0000 0.0332 45.500 6.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1041 0.8959 2 2 0.0000 0.1088 0.8912 2 2 0.0000 0.1157 0.8843
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.050 1 -3 2 491 161 330 80 0 3 0 78 0 0 330 0 0 0.4969 0.0000 0.0000 52.667 0.28 3.04 -2.76 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1847 0.5535 0.2618 1 1 0.1854 0.5497 0.2649 1 1 0.1863 0.5450 0.2688
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.050 1 -1 2 482 117 365 59 0 4 3 51 0 0 363 1 1 0.5043 0.0000 0.0055 37.667 0.61 2.25 -1.64 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4422 0.5034 0.0545 1 1 0.4427 0.5020 0.0552 1 1 0.4433 0.5004 0.0563
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.050 1 -3 1 917 237 680 6 0 56 7 168 0 0 667 2 11 0.0253 0.0000 0.0191 3.232 1.50 3.74 -2.24 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9961 0.0039 2 2 0.0000 0.4678 0.5322 2 2 0.0000 0.1449 0.8551
chr19 49154632 T TTCCTCCTCC 0.001742 0.050 1 9 1 943 220 723 161 4 51 0 4 0 0 722 0 1 0.7318 0.0000 0.0014 3.294 0.72 6.75 -6.03 49 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9120 0.0880 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.050 1 -6 2 533 134 399 0 0 28 0 106 0 2 386 1 10 0.0000 0.0000 0.0326 3.786 6.80 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1061 0.8939 2 2 0.0000 0.1083 0.8917 2 2 0.0000 0.1127 0.8873
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.050 1 -18 2 686 264 422 183 2 71 0 8 0 0 422 0 0 0.6932 0.0000 0.0000 2.718 0.29 14.00 -13.71 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.8121 0.1879 0.0000 0 0 0.9760 0.0240 0.0000
chr19 49908948 G GTGC 0.000984 0.050 1 3 2 809 184 625 88 3 11 1 81 0 0 625 0 0 0.4783 0.0000 0.0000 15.727 0.67 3.40 -2.72 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5566 0.4432 0.0002 1 0 0.5563 0.4435 0.0002 1 0 0.5557 0.4440 0.0002
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.050 1 3 2 634 144 490 2 0 7 63 72 0 0 487 0 3 0.0139 0.0000 0.0061 22.833 0.00 3.22 -3.22 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3859 0.6141 2 2 0.0000 0.0898 0.9102 2 2 0.0000 0.0566 0.9434
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.050 1 3 3 635 146 489 2 0 9 66 69 0 0 489 0 0 0.0137 0.0000 0.0000 15.222 0.00 3.20 -3.20 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6398 0.3602 2 2 0.0000 0.2190 0.7810 2 2 0.0000 0.1456 0.8544
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.050 1 6 2 603 123 480 2 0 12 0 109 0 0 473 0 7 0.0163 0.0000 0.0146 9.250 0.50 5.18 -4.68 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9908 0.0092 2 1 0.0000 0.9433 0.0567 2 1 0.0000 0.9088 0.0912
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.050 1 1 1 565 176 389 0 0 3 11 162 0 0 384 1 4 0.0000 0.0000 0.0129 57.667 2.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0060 0.9940 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0074 0.9926
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.050 1 -2 1 187 88 99 1 0 1 0 86 0 0 99 0 0 0.0114 0.0000 0.0000 87.000 0.00 2.20 -2.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1843 0.8157 2 2 0.0000 0.0826 0.9174 2 2 0.0000 0.0664 0.9336
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.050 1 -1 2 449 130 319 69 0 6 0 55 0 0 319 0 0 0.5308 0.0000 0.0000 20.667 0.29 2.67 -2.38 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4765 0.4495 0.0740 1 0 0.4714 0.4515 0.0772 1 0 0.4644 0.4541 0.0816
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.050 1 3 1 526 119 407 66 0 5 0 48 0 0 405 0 2 0.5546 0.0000 0.0049 22.800 0.92 3.33 -2.41 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5042 0.4302 0.0656 1 0 0.4979 0.4333 0.0689 1 0 0.4893 0.4373 0.0734
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.050 1 3 2 993 225 768 0 0 6 0 219 0 0 760 0 8 0.0000 0.0000 0.0104 36.500 3.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0049 0.9951 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.050 1 -1 5 588 155 433 145 2 6 0 2 0 0 432 1 0 0.9355 0.0000 0.0023 37.250 0.66 1.00 -0.34 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3430 0.6570 0.0000 0 0 0.7805 0.2195 0.0000 0 0 0.8620 0.1380 0.0000
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.050 1 3 1 712 128 584 64 0 3 0 61 0 0 580 0 4 0.5000 0.0000 0.0068 41.667 0.98 3.70 -2.72 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2382 0.5401 0.2217 1 1 0.2402 0.5371 0.2227 1 1 0.2427 0.5333 0.2239
chr19 55014192 C CGGGA 0.000722 0.050 1 4 2 352 67 285 31 0 0 0 36 0 0 283 0 2 0.4627 0.0000 0.0070 67.000 1.71 5.50 -3.79 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3936 0.6058 0.0006 1 1 0.3984 0.6011 0.0006 1 1 0.4045 0.5950 0.0005
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.050 1 4 2 726 177 549 155 1 18 0 3 0 0 549 0 0 0.8757 0.0000 0.0000 9.353 0.28 4.00 -3.72 43 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9235 0.0765 0.0000 0 0 0.9951 0.0049 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.050 1 9 2 455 108 347 5 0 18 0 85 0 0 334 0 13 0.0463 0.0000 0.0375 5.000 0.00 7.49 -7.49 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.7166 0.2834 2 2 0.0000 0.3808 0.6192
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.050 1 -24 1 663 198 465 95 6 30 0 67 0 0 440 0 25 0.4798 0.0000 0.0538 5.857 2.41 19.34 -16.93 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0950 0.6163 0.2887 1 1 0.0943 0.6104 0.2953 1 1 0.0934 0.6027 0.3039
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.050 1 3 4 737 232 505 119 2 32 2 77 0 0 494 2 9 0.5129 0.0000 0.0218 6.219 1.06 8.48 -7.42 71 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7060 0.2802 0.0138 1 0 0.6969 0.2877 0.0153 1 0 0.6844 0.2980 0.0176
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.050 1 3 1 536 116 420 2 0 3 1 110 0 0 413 0 7 0.0172 0.0000 0.0167 37.667 2.00 3.74 -1.74 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5362 0.4638 2 2 0.0000 0.1513 0.8487 2 2 0.0000 0.0966 0.9034
chr19 55733513 TG T 0.500000 0.050 1 -1 3 439 103 336 101 0 0 0 2 0 0 336 0 0 0.9806 0.0000 0.0000 103.000 0.33 1.00 -0.67 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3283 0.6717 0.0000 0 0 0.7606 0.2394 0.0000 0 0 0.8426 0.1574 0.0000
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.050 1 -4 2 288 97 191 52 0 0 1 44 0 0 189 0 2 0.5361 0.0000 0.0105 97.000 0.33 4.45 -4.13 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4654 0.4836 0.0510 1 1 0.4648 0.4832 0.0519 1 1 0.4640 0.4829 0.0532
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.050 1 -2 1 289 119 170 54 0 1 0 64 0 0 169 0 1 0.4538 0.0000 0.0059 118.000 0.30 2.11 -1.81 0 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1074 0.4864 0.4063 1 1 0.1109 0.4867 0.4024 1 1 0.1157 0.4871 0.3972
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.050 1 -6 2 101 59 42 0 0 2 0 57 0 0 42 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 28.500 6.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1338 0.8662 2 2 0.0000 0.1371 0.8629 2 2 0.0000 0.1419 0.8581
chr20 4699448 CCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCT C 0.009335 0.050 1 -24 4 875 255 620 121 0 26 0 108 0 0 620 0 0 0.4745 0.0000 0.0000 8.808 0.40 10.33 -9.93 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5866 0.4119 0.0015 1 0 0.5857 0.4127 0.0016 1 0 0.5841 0.4141 0.0017
chr20 16367379 GAAC G 0.000055 0.050 1 -3 2 707 195 512 182 0 10 0 3 0 0 512 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 18.500 0.40 3.00 -2.60 72 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.050 1 1 2 241 108 133 60 0 5 0 43 0 0 132 0 1 0.5556 0.0000 0.0075 20.600 0.45 1.53 -1.08 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3734 0.5026 0.1239 1 1 0.3667 0.5040 0.1294 1 1 0.3577 0.5056 0.1367
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.050 1 -6 2 700 166 534 0 0 6 0 160 0 0 524 0 10 0.0000 0.0000 0.0187 26.667 6.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0167 0.9833 2 2 0.0000 0.0182 0.9818 2 2 0.0000 0.0204 0.9796
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.050 1 3 1 487 179 308 6 3 2 3 165 0 0 297 0 11 0.0335 0.0000 0.0357 86.500 0.33 3.18 -2.84 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9941 0.0059 2 2 0.0000 0.3450 0.6550 2 2 0.0000 0.0859 0.9141
chr20 35277855 AGGCTGGGGCTGG A 0.001908 0.050 1 -12 1 527 213 314 192 0 16 0 5 0 0 314 0 0 0.9014 0.0000 0.0000 12.312 0.45 11.00 -10.55 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9493 0.0507 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr20 38926679 CGCG C 0.001907 0.050 1 -3 3 721 212 509 105 2 26 2 77 0 0 506 1 2 0.4953 0.0000 0.0059 7.154 0.32 3.18 -2.86 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7333 0.2666 0.0001 1 0 0.7272 0.2726 0.0001 1 0 0.7190 0.2809 0.0001
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.050 1 -3 2 605 166 439 88 0 2 0 76 1 0 437 0 1 0.5301 0.0023 0.0046 82.000 0.35 3.37 -3.02 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3136 0.5390 0.1474 1 1 0.3102 0.5372 0.1526 1 1 0.3055 0.5348 0.1596
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.050 1 -3 2 945 312 633 140 0 34 10 128 0 0 631 0 2 0.4487 0.0000 0.0032 8.176 0.43 3.37 -2.94 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1633 0.5847 0.2520 1 1 0.1658 0.5784 0.2558 1 1 0.1689 0.5705 0.2606
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.050 1 -3 2 537 265 272 49 144 68 2 2 0 0 272 0 0 0.1849 0.0000 0.0000 3.804 2.61 3.00 -0.39 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5165 0.4835 0.0000 0 0 0.9451 0.0549 0.0000 0 0 0.9754 0.0246 0.0000
chr20 47651121 A AGC 0.002695 0.050 1 2 1 535 259 276 11 17 41 23 167 0 0 276 0 0 0.0425 0.0000 0.0000 5.175 1.18 5.44 -4.26 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr20 47651122 A AG 0.002096 0.050 1 1 2 535 262 273 13 5 58 22 164 0 0 273 0 0 0.0496 0.0000 0.0000 23.125 2.23 5.44 -3.21 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009
chr20 58854641 C CTGACGCCCCAGCCGATCCCGACTCCGGGGCGGCCCG 0.009401 0.050 1 36 4 706 144 562 102 15 22 2 3 0 0 562 0 0 0.7083 0.0000 0.0000 5.273 0.51 2.67 -2.16 34 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7404 0.2596 0.0000 0 0 0.9913 0.0087 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000
chr20 60012728 T TA 0.009952 0.050 1 1 2 214 67 147 32 1 9 1 24 0 0 147 0 0 0.4776 0.0000 0.0000 6.333 0.25 1.25 -1.00 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5765 0.4209 0.0026 1 0 0.5740 0.4233 0.0027 1 0 0.5707 0.4265 0.0028
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.050 1 -6 2 207 35 172 0 0 6 2 27 0 0 165 1 6 0.0000 0.0000 0.0407 4.833 6.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.050 1 -1 1 258 113 145 0 0 1 0 112 0 0 144 0 1 0.0000 0.0000 0.0069 112.000 2.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0228 0.9772 2 2 0.0000 0.0241 0.9759 2 2 0.0000 0.0260 0.9740
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.050 1 6 4 701 190 511 78 0 3 0 109 0 0 503 0 8 0.4105 0.0000 0.0157 62.333 0.23 5.71 -5.48 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0147 0.2619 0.7234 1 2 0.0168 0.2723 0.7109 1 2 0.0199 0.2864 0.6937
chr21 33070402 CTCCTCCACT C 0.002225 0.050 1 -9 2 438 142 296 135 1 2 0 4 0 0 296 0 0 0.9507 0.0000 0.0000 70.000 0.78 7.50 -6.72 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9527 0.0473 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.050 1 -30 1 761 207 554 104 2 33 1 67 1 2 550 0 1 0.5024 0.0018 0.0072 5.242 1.96 13.06 -11.10 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8167 0.1790 0.0043 1 0 0.8073 0.1878 0.0050 1 0 0.7940 0.2000 0.0060
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.050 1 3 2 240 126 114 62 0 7 0 57 0 0 112 0 2 0.4921 0.0000 0.0175 17.000 0.23 3.16 -2.93 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2297 0.5397 0.2306 1 1 0.2298 0.5369 0.2333 1 1 0.2298 0.5334 0.2369
chr21 41741965 GCTT G 0.000014 0.050 1 -3 2 719 150 569 71 0 17 1 61 0 0 565 0 4 0.4733 0.0000 0.0070 7.824 0.90 4.38 -3.48 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5200 0.4800 0.0000 1 0 0.5208 0.4792 0.0000 1 0 0.5216 0.4784 0.0000
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.050 1 1 2 327 60 267 0 1 12 3 44 0 0 267 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.800 2.30 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.050 1 2 2 1169 180 989 102 3 4 3 68 1 1 985 1 1 0.5667 0.0010 0.0040 58.667 0.75 3.28 -2.52 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5832 0.3804 0.0364 1 0 0.5695 0.3900 0.0405 1 0 0.5509 0.4026 0.0465
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.050 1 -2 2 1171 182 989 99 4 4 6 69 0 1 985 2 1 0.5440 0.0000 0.0040 59.333 0.73 3.30 -2.58 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4871 0.4517 0.0612 1 0 0.4763 0.4574 0.0664 1 1 0.4616 0.4647 0.0737
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.050 1 -15 2 540 102 438 48 1 10 1 42 0 0 434 0 4 0.4706 0.0000 0.0091 9.200 0.81 12.33 -11.52 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2383 0.5301 0.2316 1 1 0.2386 0.5279 0.2336 1 1 0.2388 0.5251 0.2361
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.050 1 -9 7 315 145 170 1 0 23 0 121 0 0 170 0 0 0.0069 0.0000 0.0000 5.304 0.00 7.66 -7.66 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0028 0.9972
chr21 45505235 A AGGCCCCCCC 0.016294 0.050 1 9 6 340 91 249 78 0 10 0 3 0 0 249 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 8.100 0.28 3.00 -2.72 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7624 0.2376 0.0000 0 0 0.9824 0.0176 0.0000 0 0 0.9923 0.0077 0.0000
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.050 1 3 1 544 197 347 84 3 24 0 86 0 0 343 2 2 0.4264 0.0000 0.0115 7.208 0.24 3.24 -3.01 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2674 0.5645 0.1681 1 1 0.2712 0.5602 0.1686 1 1 0.2762 0.5547 0.1691
chr21 46334557 G GTGGGATGTTCACAGTCAGTGACCACCCACCAGAACAGCA 0.014382 0.050 1 39 1 773 250 523 54 4 127 3 62 0 0 523 0 0 0.2160 0.0000 0.0000 0.945 0.13 2.26 -2.13 12 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3685 0.6205 0.0110 1 1 0.3743 0.6148 0.0109 1 1 0.3819 0.6074 0.0107
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.050 1 6 1 3298 1073 2225 626 4 36 1 406 0 0 2191 0 34 0.5834 0.0000 0.0153 28.806 0.22 5.85 -5.64 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr22 20858678 G GCCGCCT 0.004141 0.050 1 6 2 531 185 346 68 0 43 1 73 0 0 346 0 0 0.3676 0.0000 0.0000 3.279 0.32 5.38 -5.06 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3867 0.6105 0.0028 1 1 0.3923 0.6049 0.0028 1 1 0.3996 0.5976 0.0028
chr22 23617579 G GCAT 0.002056 0.050 1 3 3 218 102 116 58 2 8 0 34 0 1 115 0 0 0.5686 0.0000 0.0086 11.750 0.28 3.65 -3.37 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7692 0.2306 0.0001 1 0 0.7617 0.2382 0.0001 1 0 0.7513 0.2485 0.0001
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.050 1 -3 3 193 94 99 60 0 4 0 30 0 0 98 0 1 0.6383 0.0000 0.0101 22.500 0.20 3.33 -3.13 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7307 0.2562 0.0131 1 0 0.7207 0.2648 0.0145 1 0 0.7071 0.2765 0.0164
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.050 1 -21 3 666 132 534 0 0 32 0 100 0 0 514 1 19 0.0000 0.0000 0.0375 3.125 16.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0078 0.9922
chr22 35728842 GC G 0.001215 0.050 1 -1 1 251 94 157 90 0 2 0 2 0 0 157 0 0 0.9574 0.0000 0.0000 46.000 0.14 1.00 -0.86 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9968 0.0032 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr22 36265995 AATAATT A 0.003695 0.050 1 -6 1 469 114 355 58 1 4 0 51 0 0 352 0 3 0.5088 0.0000 0.0085 27.250 1.36 6.61 -5.25 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5233 0.4755 0.0012 1 0 0.5236 0.4751 0.0012 1 0 0.5239 0.4749 0.0013
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.050 1 -6 2 458 216 242 7 0 53 0 156 0 0 236 0 6 0.0324 0.0000 0.0248 3.075 1.00 5.58 -4.58 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8636 0.1364 2 2 0.0000 0.4708 0.5292
chr22 38087182 A AGGTCATGGG 0.001043 0.050 1 9 2 335 179 156 158 1 17 0 3 0 0 156 0 0 0.8827 0.0000 0.0000 9.529 0.24 6.33 -6.09 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.050 1 -3 3 216 116 100 104 1 6 0 5 0 0 99 0 1 0.8966 0.0000 0.0100 18.167 0.45 3.80 -3.35 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.3256 0.6744 0.0000 0 0 0.7265 0.2735 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.050 1 3 3 345 132 213 0 0 10 0 122 0 0 206 0 7 0.0000 0.0000 0.0329 12.200 2.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0160 0.9840 2 2 0.0000 0.0171 0.9829 2 2 0.0000 0.0186 0.9814
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.050 1 -3 1 478 142 336 59 1 17 4 61 0 0 333 0 3 0.4155 0.0000 0.0089 7.353 0.63 3.13 -2.50 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2495 0.5725 0.1780 1 1 0.2548 0.5690 0.1763 1 1 0.2617 0.5644 0.1740
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.050 1 1 3 1205 255 950 4 0 4 1 246 0 0 921 0 29 0.0157 0.0000 0.0305 62.750 0.00 11.15 -11.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5957 0.4043 2 2 0.0000 0.0358 0.9642 2 2 0.0000 0.0136 0.9864
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.050 1 -6 1 598 125 473 0 0 15 1 109 0 0 466 0 7 0.0000 0.0000 0.0148 7.333 6.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4924 0.5076 2 1 0.0000 0.5071 0.4929 2 1 0.0000 0.5273 0.4727
chr22 46364133 CGTGCGCGAGGAT C 0.000801 0.050 1 -12 1 436 116 320 68 0 4 0 44 0 0 317 0 3 0.5862 0.0000 0.0094 28.000 1.21 11.55 -10.34 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7103 0.2897 0.0001 1 0 0.7042 0.2957 0.0001 1 0 0.6959 0.3040 0.0001
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.050 1 -48 1 1004 221 783 121 3 33 1 63 0 0 735 0 48 0.5475 0.0000 0.0613 5.636 0.60 10.62 -10.02 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4896 0.4688 0.0416 1 0 0.4887 0.4679 0.0433 1 0 0.4872 0.4671 0.0457
773 rows