File Info

Filename
HG03086_x_HG03195_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG03086_x_HG03195_FF_10.features.tsv
Size
178.9 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1353305 G GC 0.001365 0.100 1 1 2 246 93 153 85 0 2 0 6 0 0 153 0 0 0.9140 0.0000 0.0000 45.500 0.42 1.00 -0.58 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0945 0.9055 0.0000 0 0 0.9888 0.0112 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 394 145 249 57 6 19 1 62 0 0 246 0 3 0.3931 0.0000 0.0120 6.579 0.35 3.11 -2.76 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1252 0.6417 0.2330 1 1 0.1308 0.6315 0.2377 1 1 0.1382 0.6185 0.2433
chr1 6469122 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 2 720 210 510 158 3 39 0 10 0 0 510 0 0 0.7524 0.0000 0.0000 4.474 0.86 4.60 -3.74 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0735 0.9265 0.0000 0 0 0.8080 0.1920 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 506 109 397 44 0 16 3 46 0 0 394 0 3 0.4037 0.0000 0.0076 5.750 0.30 3.35 -3.05 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0800 0.5498 0.3703 1 1 0.0847 0.5456 0.3696 1 1 0.0912 0.5405 0.3682
chr1 13318588 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 916 300 616 283 3 7 0 7 0 0 616 0 0 0.9433 0.0000 0.0000 41.857 0.70 1.29 -0.58 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2859 0.7141 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 932 176 756 87 0 9 1 79 0 0 753 0 3 0.4943 0.0000 0.0040 18.444 0.28 3.04 -2.76 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2240 0.6787 0.0974 1 1 0.2304 0.6662 0.1034 1 1 0.2383 0.6501 0.1116
chr1 22913752 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 440 116 324 92 6 8 0 10 0 0 322 0 2 0.7931 0.0000 0.0062 13.500 0.29 1.80 -1.51 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0499 0.9501 0.0000
chr1 26282316 TGGGTCCAGGACA T 0.500000 0.100 1 -12 1 665 147 518 81 6 10 3 47 0 1 506 2 9 0.5510 0.0000 0.0232 34.000 11.58 26.34 -14.76 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8061 0.1913 0.0027 1 0 0.7968 0.1999 0.0033 1 0 0.7835 0.2121 0.0043
chr1 26282362 GCCGGGACCGGGA G 0.500000 0.100 1 -12 4 714 161 553 34 14 15 6 92 0 0 529 1 23 0.2112 0.0000 0.0434 11.000 6.32 22.77 -16.45 26 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0031 0.9969 1 2 0.0000 0.0038 0.9962 1 2 0.0000 0.0051 0.9949
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 720 179 541 12 80 23 32 32 0 1 540 0 0 0.0670 0.0000 0.0018 6.286 11.25 25.34 -14.09 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7586 0.2368 0.0046 1 0 0.7495 0.2449 0.0055 1 0 0.7365 0.2565 0.0071
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 739 185 554 46 7 20 11 101 0 0 550 0 4 0.2486 0.0000 0.0072 8.421 2.67 16.99 -14.32 18 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0078 0.9922 1 2 0.0000 0.0093 0.9907 1 2 0.0000 0.0119 0.9881
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.100 1 -24 1 610 145 465 75 0 5 0 65 0 0 456 0 9 0.5172 0.0000 0.0194 28.000 0.28 17.98 -17.70 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1792 0.6739 0.1469 1 1 0.1852 0.6617 0.1531 1 1 0.1929 0.6461 0.1610
chr1 31429409 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 2 395 145 250 80 0 4 0 61 0 0 250 0 0 0.5517 0.0000 0.0000 35.250 0.16 2.20 -2.03 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6133 0.3725 0.0142 1 0 0.6073 0.3765 0.0163 1 0 0.5983 0.3823 0.0194
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 365 160 205 9 1 11 0 139 0 1 198 0 6 0.0563 0.0000 0.0341 13.545 0.00 2.94 -2.94 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9878 0.0122 2 1 0.0000 0.5001 0.4999
chr1 34761404 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 728 198 530 187 0 3 0 8 0 0 530 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 65.000 0.24 1.50 -1.26 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.6983 0.3017 0.0000 0 0 0.9810 0.0190 0.0000
chr1 35114681 GATA G 0.500000 0.100 1 -3 1 788 158 630 104 0 2 0 52 0 0 629 0 1 0.6582 0.0000 0.0016 78.000 0.38 3.25 -2.88 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9732 0.0268 0.0000 1 0 0.9693 0.0306 0.0001 1 0 0.9633 0.0366 0.0001
chr1 37612794 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 3 350 166 184 149 1 11 0 5 0 0 184 0 0 0.8976 0.0000 0.0000 14.091 0.12 3.00 -2.88 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0303 0.9697 0.0000 0 0 0.8974 0.1026 0.0000 0 0 0.9832 0.0168 0.0000
chr1 46815074 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 2 320 77 243 76 0 0 0 1 0 0 242 0 1 0.9870 0.0000 0.0041 77.000 0.39 3.00 -2.61 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3621 0.6379 0.0000 0 0 0.8416 0.1584 0.0000 0 0 0.9174 0.0826 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 634 164 470 0 1 28 0 135 0 0 470 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.857 5.93 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 230 85 145 40 1 9 1 34 0 1 144 0 0 0.4706 0.0000 0.0069 8.444 0.40 2.94 -2.54 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3689 0.5386 0.0924 1 1 0.3674 0.5355 0.0971 1 1 0.3650 0.5315 0.1035
chr1 54715916 AAC A 0.500000 0.100 1 -2 1 359 171 188 167 0 1 0 3 0 0 188 0 0 0.9766 0.0000 0.0000 170.000 0.16 2.33 -2.17 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8636 0.1364 0.0000 0 0 0.9942 0.0058 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 277 101 176 57 2 4 0 38 0 0 176 0 0 0.5644 0.0000 0.0000 24.000 0.53 5.76 -5.24 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7005 0.2880 0.0115 1 0 0.6903 0.2964 0.0133 1 0 0.6759 0.3081 0.0160
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 144 64 80 25 0 1 0 38 0 0 77 0 3 0.3906 0.0000 0.0375 63.000 0.40 3.74 -3.34 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0261 0.3520 0.6219 1 2 0.0290 0.3593 0.6117 1 2 0.0333 0.3690 0.5977
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 371 154 217 70 0 21 0 63 0 0 214 0 3 0.4545 0.0000 0.0138 6.333 0.07 10.62 -10.55 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2455 0.6435 0.1111 1 1 0.2502 0.6331 0.1167 1 1 0.2558 0.6199 0.1243
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 420 127 293 22 1 6 0 98 0 0 286 0 7 0.1732 0.0000 0.0239 20.000 0.05 5.38 -5.33 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 184 92 92 50 0 2 0 40 0 0 92 0 0 0.5435 0.0000 0.0000 45.000 0.14 3.00 -2.86 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4363 0.5036 0.0601 1 1 0.4332 0.5024 0.0644 1 1 0.4284 0.5011 0.0705
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 416 129 287 64 1 5 1 58 0 0 285 0 2 0.4961 0.0000 0.0070 24.600 0.33 3.41 -3.09 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2582 0.6298 0.1120 1 1 0.2622 0.6203 0.1175 1 1 0.2669 0.6083 0.1248
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.100 1 -45 4 827 220 607 114 0 22 0 84 0 0 607 0 0 0.5182 0.0000 0.0000 9.000 1.44 11.56 -10.12 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7858 0.2121 0.0021 1 0 0.7784 0.2190 0.0026 1 0 0.7675 0.2291 0.0034
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 212 85 127 4 24 11 0 46 0 0 127 0 0 0.0471 0.0000 0.0000 5.182 1.00 2.59 -1.59 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0084 0.2211 0.7706 1 2 0.0098 0.2318 0.7584 1 2 0.0120 0.2471 0.7408
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 214 83 131 36 0 15 0 32 0 0 128 0 3 0.4337 0.0000 0.0229 4.533 1.00 6.22 -5.22 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2280 0.5850 0.1870 1 1 0.2307 0.5787 0.1907 1 1 0.2340 0.5707 0.1953
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1065 244 821 106 1 39 1 97 0 0 812 0 9 0.4344 0.0000 0.0110 5.256 0.44 4.42 -3.98 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1299 0.7407 0.1294 1 1 0.1377 0.7251 0.1372 1 1 0.1479 0.7048 0.1474
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 242 71 171 10 0 9 3 49 0 0 170 0 1 0.1408 0.0000 0.0058 6.556 0.40 1.39 -0.99 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9788 0.0212
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 238 75 163 0 0 9 0 66 0 0 152 0 11 0.0000 0.0000 0.0675 7.333 12.68 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0209 0.9791 2 2 0.0000 0.0233 0.9767
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 742 211 531 171 2 27 0 11 0 1 529 0 1 0.8104 0.0000 0.0038 6.741 1.31 7.00 -5.69 119 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0163 0.9837 0.0000 0 0 0.6744 0.3256 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1194 319 875 217 4 72 2 24 9 0 859 2 5 0.6803 0.0103 0.0183 3.451 2.18 10.54 -8.36 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 1408 421 987 2 4 125 1 289 0 1 951 0 35 0.0048 0.0000 0.0365 2.387 1.50 8.14 -6.64 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 233 85 148 79 1 2 0 3 0 0 148 0 0 0.9294 0.0000 0.0000 41.000 1.92 1.67 0.26 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0761 0.9239 0.0000 0 0 0.6928 0.3072 0.0000 0 0 0.8762 0.1238 0.0000
chr1 156583439 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 341 97 244 93 0 2 0 2 0 0 244 0 0 0.9588 0.0000 0.0000 47.500 0.33 1.50 -1.17 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5793 0.4207 0.0000 0 0 0.9255 0.0745 0.0000 0 0 0.9620 0.0380 0.0000
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 549 152 397 0 0 0 1 151 0 0 397 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 151.000 2.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr1 156913391 GTTCCAGGCCCGCTCT G 0.500000 0.100 1 -15 2 613 121 492 68 0 2 0 51 0 0 484 0 8 0.5620 0.0000 0.0163 59.500 0.28 13.75 -13.47 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3709 0.5668 0.0623 1 1 0.3719 0.5611 0.0669 1 1 0.3724 0.5542 0.0734
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1136 238 898 227 2 5 0 4 0 0 897 0 1 0.9538 0.0000 0.0011 46.600 0.21 1.75 -1.54 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6505 0.3495 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.100 1 3 1 144 74 70 34 0 2 0 38 0 0 70 0 0 0.4595 0.0000 0.0000 36.000 0.03 4.00 -3.97 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1344 0.5687 0.2969 1 1 0.1389 0.5635 0.2976 1 1 0.1448 0.5570 0.2982
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 170 54 116 20 1 0 0 33 0 0 116 0 0 0.3704 0.0000 0.0000 54.000 0.15 1.09 -0.94 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0491 0.4206 0.5303 1 2 0.0530 0.4250 0.5220 1 2 0.0585 0.4307 0.5107
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 276 82 194 38 0 7 2 35 0 0 194 0 0 0.4634 0.0000 0.0000 10.714 0.61 1.23 -0.62 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2301 0.5887 0.1812 1 1 0.2329 0.5821 0.1851 1 1 0.2362 0.5738 0.1900
chr1 182474456 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 523 142 381 128 2 6 0 6 0 0 381 0 0 0.9014 0.0000 0.0000 22.667 0.37 1.17 -0.80 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.5285 0.4715 0.0000 0 0 0.9212 0.0788 0.0000
chr1 183533735 T TACA 0.500000 0.100 1 3 2 198 70 128 41 0 2 0 27 0 0 128 0 0 0.5857 0.0000 0.0000 34.000 0.44 3.04 -2.60 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5684 0.3962 0.0354 1 0 0.5598 0.4014 0.0388 1 0 0.5478 0.4084 0.0438
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 594 153 441 15 0 6 66 66 0 0 435 5 1 0.0980 0.0000 0.0136 13.667 1.33 4.53 -3.20 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9740 0.0260
chr1 201386873 CCCA C 0.500000 0.100 1 -3 1 593 151 442 12 0 6 1 132 0 0 436 0 6 0.0795 0.0000 0.0136 24.167 1.42 4.20 -2.79 6 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.7226 0.2774
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 591 153 438 15 0 0 72 66 0 0 436 1 1 0.0980 0.0000 0.0046 153.000 1.13 4.53 -3.40 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9469 0.0531
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 477 250 227 95 85 60 0 10 0 1 226 0 0 0.3800 0.0000 0.0044 3.133 0.14 3.20 -3.06 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1672 0.8328 0.0000 0 0 0.9140 0.0860 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 477 253 224 128 0 45 0 80 0 0 220 0 4 0.5059 0.0000 0.0179 4.622 0.74 10.85 -10.11 76 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9339 0.0660 0.0001 1 0 0.9280 0.0718 0.0002 1 0 0.9192 0.0805 0.0003
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 656 145 511 72 0 13 0 60 0 0 511 0 0 0.4966 0.0000 0.0000 10.154 0.72 8.97 -8.24 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4433 0.5156 0.0411 1 1 0.4422 0.5128 0.0449 1 1 0.4399 0.5096 0.0504
chr1 229342125 TCGGCCTCCGCGTCCC T 0.500000 0.100 1 -15 2 614 240 374 218 0 16 0 6 0 0 374 0 0 0.9083 0.0000 0.0000 14.000 0.40 13.33 -12.93 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0980 0.9020 0.0000 0 0 0.9890 0.0110 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr1 231337730 A ACATCGC 0.500000 0.100 1 6 1 393 95 298 84 0 7 0 4 0 0 298 0 0 0.8842 0.0000 0.0000 12.571 0.57 4.00 -3.43 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0098 0.9902 0.0000 0 1 0.4819 0.5181 0.0000 0 0 0.8176 0.1824 0.0000
chr1 234609199 A AGCT 0.500000 0.100 1 3 2 475 108 367 40 4 15 0 49 1 1 361 0 4 0.3704 0.0027 0.0163 6.200 1.82 5.20 -3.38 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0862 0.5640 0.3498 1 1 0.0911 0.5589 0.3500 1 1 0.0977 0.5526 0.3497
chr1 235213963 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 157 52 105 22 0 3 0 27 0 0 105 0 0 0.4231 0.0000 0.0000 16.333 0.05 3.19 -3.14 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1271 0.5305 0.3424 1 1 0.1313 0.5281 0.3405 1 1 0.1370 0.5252 0.3378
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 598 172 426 0 0 14 2 156 0 0 424 0 2 0.0000 0.0000 0.0047 11.286 3.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 366 88 278 53 0 0 0 35 0 0 278 0 0 0.6023 0.0000 0.0000 88.000 0.23 1.14 -0.92 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6471 0.3347 0.0183 1 0 0.6374 0.3419 0.0207 1 0 0.6240 0.3518 0.0242
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1219 295 924 136 0 2 2 155 0 0 921 0 3 0.4610 0.0000 0.0032 146.500 0.36 2.11 -1.75 20 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0048 0.4404 0.5548 1 2 0.0058 0.4355 0.5587 1 2 0.0074 0.4306 0.5620
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 528 151 377 68 0 1 1 81 0 0 377 0 0 0.4503 0.0000 0.0000 150.000 3.31 4.30 -0.99 50 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0297 0.4955 0.4748 1 1 0.0330 0.4933 0.4737 1 1 0.0378 0.4910 0.4712
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 699 50 649 0 0 2 1 47 0 0 640 0 9 0.0000 0.0000 0.0139 24.000 3.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0519 0.9481 2 2 0.0000 0.0549 0.9451 2 2 0.0000 0.0592 0.9408
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.100 1 9 1 1033 137 896 55 0 12 0 70 0 0 881 0 15 0.4015 0.0000 0.0167 10.417 0.29 8.47 -8.18 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0022 0.1685 0.8293 1 2 0.0027 0.1774 0.8199 1 2 0.0036 0.1901 0.8063
chr1 248650432 T TC 0.500000 0.100 1 1 3 1069 258 811 251 0 5 0 2 1 0 810 0 0 0.9729 0.0012 0.0012 50.600 0.46 2.00 -1.54 55 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 236 120 116 7 0 8 0 105 0 0 114 0 2 0.0583 0.0000 0.0172 14.000 0.29 3.31 -3.03 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9201 0.0799 2 2 0.0000 0.4098 0.5902
chr2 20667362 G GGGCGGC 0.021395 0.100 1 6 5 400 129 271 0 0 23 1 105 0 0 250 0 21 0.0000 0.0000 0.0775 4.818 8.78 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0687 0.9313 2 2 0.0000 0.0774 0.9226 2 2 0.0000 0.0910 0.9090
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 400 129 271 1 1 21 1 105 0 0 250 0 21 0.0078 0.0000 0.0775 5.143 5.00 8.78 -3.78 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0435 0.9565 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0032 0.9968
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 212 48 164 0 0 1 0 47 0 0 164 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 47.000 2.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0835 0.9165 2 2 0.0000 0.0873 0.9127 2 2 0.0000 0.0927 0.9073
chr2 29052032 A ACAGAGGGGTGGC 0.500000 0.100 1 12 1 265 86 179 41 0 5 0 40 0 0 178 0 1 0.4767 0.0000 0.0056 16.200 0.10 9.40 -9.30 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2004 0.5992 0.2004 1 1 0.2041 0.5919 0.2041 1 1 0.2087 0.5826 0.2087
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 555 136 419 13 0 9 1 113 0 0 414 0 5 0.0956 0.0000 0.0119 14.111 0.00 3.11 -3.11 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9289 0.0711
chr2 29070995 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 1 611 97 514 50 1 3 0 43 1 2 509 0 2 0.5155 0.0019 0.0097 31.000 0.90 3.33 -2.43 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3893 0.5394 0.0713 1 1 0.3882 0.5359 0.0759 1 1 0.3861 0.5316 0.0823
chr2 38602455 G GGCC 0.500000 0.100 1 3 2 379 154 225 74 0 10 0 70 1 1 218 0 5 0.4805 0.0044 0.0311 14.400 1.43 3.79 -2.35 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1759 0.6761 0.1481 1 1 0.1820 0.6637 0.1543 1 1 0.1898 0.6479 0.1623
chr2 39769817 ATTC A 0.500000 0.100 1 -3 3 422 106 316 99 0 5 0 2 0 0 315 1 0 0.9340 0.0000 0.0032 20.200 0.15 4.00 -3.85 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3085 0.6915 0.0000 0 0 0.8763 0.1237 0.0000 0 0 0.9508 0.0492 0.0000
chr2 43541311 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 174 65 109 59 0 1 0 5 0 0 109 0 0 0.9077 0.0000 0.0000 64.000 0.08 2.40 -2.32 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0850 0.9150 0.0000 0 1 0.4143 0.5857 0.0000
chr2 43765562 AAGC A 0.500000 0.100 1 -3 1 218 95 123 85 0 6 0 4 0 0 122 0 1 0.8947 0.0000 0.0081 14.833 0.12 3.25 -3.13 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2539 0.7461 0.0000 0 0 0.7141 0.2859 0.0000
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 502 173 329 50 1 52 1 69 0 0 327 0 2 0.2890 0.0000 0.0061 2.288 0.22 1.96 -1.74 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0106 0.3091 0.6803 1 2 0.0123 0.3161 0.6716 1 2 0.0149 0.3258 0.6593
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.100 1 6 1 245 93 152 47 0 7 1 38 0 0 148 0 4 0.5054 0.0000 0.0263 12.143 0.43 5.87 -5.44 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2906 0.5864 0.1230 1 1 0.2922 0.5799 0.1279 1 1 0.2938 0.5718 0.1344
chr2 50346870 GCGCCGCCGC G 0.500000 0.100 1 -9 1 339 125 214 58 0 23 0 44 0 0 210 0 4 0.4640 0.0000 0.0187 4.435 0.34 9.20 -8.86 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4191 0.5232 0.0577 1 1 0.4174 0.5205 0.0621 1 1 0.4144 0.5174 0.0682
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 642 91 551 21 0 9 0 61 4 1 544 0 2 0.2308 0.0073 0.0127 9.111 3.81 6.67 -2.86 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0006 0.0721 0.9273 1 2 0.0008 0.0798 0.9194 1 2 0.0011 0.0914 0.9075
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 423 178 245 89 0 9 2 78 0 0 245 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 18.667 0.65 3.22 -2.57 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3353 0.6114 0.0534 1 1 0.3395 0.6025 0.0580 1 1 0.3440 0.5914 0.0645
chr2 70984816 TGCCCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 706 159 547 147 1 3 0 8 0 0 547 0 0 0.9245 0.0000 0.0000 52.000 1.01 6.88 -5.86 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2446 0.7554 0.0000 0 0 0.8855 0.1145 0.0000
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 718 168 550 1 0 43 0 124 0 0 535 0 15 0.0060 0.0000 0.0273 2.907 9.00 6.35 2.65 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0077 0.9923 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 516 113 403 6 0 3 1 103 0 0 399 0 4 0.0531 0.0000 0.0099 36.667 0.00 3.05 -3.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7299 0.2701 2 2 0.0000 0.1994 0.8006
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 918 190 728 104 0 28 0 58 0 0 693 0 35 0.5474 0.0000 0.0481 5.786 0.14 13.33 -13.18 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3473 0.6135 0.0392 1 1 0.3527 0.6040 0.0433 1 1 0.3586 0.5921 0.0492
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 374 132 242 0 0 14 1 117 0 0 241 0 1 0.0000 0.0000 0.0041 8.429 3.41 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 647 191 456 0 0 26 8 157 0 0 451 1 4 0.0000 0.0000 0.0110 6.346 3.22 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr2 96123863 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 456 104 352 101 0 0 0 3 0 0 352 0 0 0.9712 0.0000 0.0000 104.000 0.45 1.00 -0.55 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1813 0.8187 0.0000 0 0 0.8644 0.1356 0.0000 0 0 0.9515 0.0485 0.0000
chr2 97702739 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 344 130 214 77 0 3 0 50 0 0 214 0 0 0.5923 0.0000 0.0000 42.333 0.29 1.20 -0.91 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7927 0.2035 0.0038 1 0 0.7828 0.2126 0.0046 1 0 0.7686 0.2255 0.0059
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.100 1 3 4 518 156 362 144 1 3 0 8 0 0 362 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 50.667 0.26 3.00 -2.74 90 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2173 0.7827 0.0000 0 0 0.8694 0.1306 0.0000
chr2 108308425 GA G 0.500000 0.100 1 -1 3 159 84 75 9 0 0 0 75 0 0 75 0 0 0.1071 0.0000 0.0000 84.000 0.00 1.04 -1.04 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.8942 0.1058
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 129 61 68 58 0 0 0 3 0 0 68 0 0 0.9508 0.0000 0.0000 61.000 0.14 2.00 -1.86 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0235 0.9765 0.0000 0 1 0.4226 0.5774 0.0000 0 0 0.7058 0.2942 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 508 114 394 0 0 1 0 113 0 1 382 0 11 0.0000 0.0000 0.0305 113.000 5.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0060 0.9940 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 351 122 229 99 0 8 0 15 0 0 228 0 1 0.8115 0.0000 0.0044 14.250 0.43 6.73 -6.30 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0042 0.9958 0.0000
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 764 206 558 113 0 12 0 81 0 0 557 0 1 0.5485 0.0000 0.0018 16.167 0.51 1.35 -0.83 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8044 0.1939 0.0017 1 0 0.7967 0.2011 0.0022 1 0 0.7854 0.2117 0.0029
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 175 37 138 7 2 9 4 15 0 0 138 0 0 0.1892 0.0000 0.0000 2.667 2.43 2.00 0.43 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0735 0.4331 0.4934 1 2 0.0776 0.4384 0.4840 1 2 0.0826 0.4492 0.4681
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 175 68 107 25 0 12 0 31 0 0 104 0 3 0.3676 0.0000 0.0280 4.667 1.00 6.42 -5.42 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0742 0.4838 0.4420 1 1 0.0786 0.4844 0.4370 1 1 0.0847 0.4853 0.4300
chr2 170770974 T TGCCCCC 0.500000 0.100 1 6 4 692 155 537 127 3 23 0 2 1 2 534 0 0 0.8194 0.0019 0.0056 5.909 1.16 6.00 -4.84 15 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9124 0.0876 0.0000 0 0 0.9892 0.0108 0.0000 0 0 0.9944 0.0056 0.0000
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 2 465 138 327 68 0 17 1 52 0 0 326 0 1 0.4928 0.0000 0.0031 7.118 0.75 3.06 -2.31 2 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5098 0.4589 0.0313 1 0 0.5060 0.4595 0.0346 1 0 0.5000 0.4606 0.0394
chr2 176130417 T TGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 322 78 244 37 0 14 1 26 1 0 241 1 1 0.4744 0.0041 0.0123 4.571 0.97 5.65 -4.68 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4451 0.4859 0.0690 1 1 0.4404 0.4862 0.0734 1 1 0.4337 0.4868 0.0795
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 702 145 557 79 0 4 0 62 0 0 551 1 5 0.5448 0.0000 0.0108 35.250 0.37 4.08 -3.71 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4014 0.5534 0.0451 1 1 0.4026 0.5482 0.0492 1 1 0.4031 0.5418 0.0551
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 291 121 170 8 2 11 44 56 0 0 164 0 6 0.0661 0.0000 0.0353 6.364 0.38 3.12 -2.75 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9922 0.0078 2 1 0.0000 0.7620 0.2380
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 291 121 170 48 5 60 1 7 0 0 165 3 2 0.3967 0.0000 0.0294 1.017 2.54 4.14 -1.60 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1549 0.8450 0.0001 0 1 0.0199 0.9800 0.0000 0 1 0.0107 0.9893 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 291 127 164 6 10 14 47 50 0 0 164 0 0 0.0472 0.0000 0.0000 4.846 0.00 2.90 -2.90 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.9517 0.0483
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 210 72 138 36 4 10 3 19 0 0 138 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 5.800 0.25 1.42 -1.17 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6669 0.3127 0.0204 1 0 0.6555 0.3216 0.0229 1 0 0.6398 0.3335 0.0267
chr2 202635418 A AGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 1 479 117 362 41 0 39 4 33 0 0 360 1 1 0.3504 0.0000 0.0055 2.000 1.51 7.06 -5.55 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2520 0.5898 0.1582 1 1 0.2543 0.5831 0.1626 1 1 0.2570 0.5747 0.1683
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 174 56 118 41 1 9 2 3 0 0 118 0 0 0.7321 0.0000 0.0000 5.000 0.20 1.67 -1.47 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0076 0.9924 0.0000 0 1 0.1831 0.8169 0.0000 0 1 0.4414 0.5586 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 300 94 206 39 0 3 0 52 0 0 204 0 2 0.4149 0.0000 0.0097 30.333 0.23 2.94 -2.71 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0290 0.4043 0.5667 1 2 0.0321 0.4085 0.5595 1 2 0.0366 0.4141 0.5492
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 543 153 390 1 1 22 1 128 0 0 385 2 3 0.0065 0.0000 0.0128 5.909 3.00 7.83 -4.83 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0221 0.9779 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0044 0.9956
chr2 217848163 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 1 883 214 669 166 7 36 0 5 1 0 668 0 0 0.7757 0.0015 0.0015 4.944 1.46 8.40 -6.94 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0948 0.9052 0.0000 0 0 0.9663 0.0337 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr2 229591816 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 1 445 168 277 141 0 17 0 10 0 0 277 0 0 0.8393 0.0000 0.0000 8.882 0.44 9.60 -9.16 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0265 0.9735 0.0000 0 0 0.6044 0.3956 0.0000
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 571 228 343 211 4 8 0 5 0 0 338 0 5 0.9254 0.0000 0.0146 27.375 0.54 27.00 -26.46 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5209 0.4791 0.0000 0 0 0.9821 0.0179 0.0000
chr2 232844199 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 4 566 167 399 126 3 32 0 6 0 0 399 0 0 0.7545 0.0000 0.0000 4.219 0.29 3.17 -2.87 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.5139 0.4861 0.0000 0 0 0.9175 0.0825 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 315 132 183 70 0 3 4 55 0 0 183 0 0 0.5303 0.0000 0.0000 42.000 0.54 4.09 -3.55 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4423 0.5149 0.0428 1 1 0.4410 0.5122 0.0468 1 1 0.4384 0.5092 0.0524
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 820 207 613 128 0 0 0 79 1 0 611 0 1 0.6184 0.0016 0.0033 207.000 0.51 1.27 -0.76 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9584 0.0415 0.0001 1 0 0.9538 0.0462 0.0001 1 0 0.9467 0.0532 0.0001
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 395 102 293 1 1 17 9 74 0 0 292 0 1 0.0098 0.0000 0.0034 4.941 0.00 3.11 -3.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1491 0.8509 2 2 0.0000 0.0543 0.9457 2 2 0.0000 0.0389 0.9611
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 469 130 339 61 0 1 0 68 0 0 337 0 2 0.4692 0.0000 0.0059 129.000 1.23 2.09 -0.86 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0616 0.5716 0.3668 1 1 0.0662 0.5656 0.3682 1 1 0.0727 0.5582 0.3691
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 665 171 494 0 0 5 0 166 0 0 489 0 5 0.0000 0.0000 0.0101 33.200 3.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 9917537 G GTCTGGTCTT 0.000861 0.100 1 9 1 615 154 461 136 1 8 0 9 0 0 461 0 0 0.8831 0.0000 0.0000 18.125 0.28 4.56 -4.28 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 0 0.9868 0.0132 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 620 124 496 8 0 12 1 103 0 1 462 0 33 0.0645 0.0000 0.0685 9.333 0.50 10.39 -9.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9661 0.0339 2 1 0.0000 0.5331 0.4669
chr3 27721914 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 2 491 110 381 38 3 26 36 7 0 1 379 0 1 0.3455 0.0000 0.0052 3.192 0.71 3.29 -2.58 16 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1695 0.6002 0.2304 1 1 0.1738 0.5927 0.2335 1 1 0.1794 0.5834 0.2373
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 490 100 390 45 10 3 4 38 0 0 390 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 31.667 0.98 5.26 -4.29 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4859 0.4690 0.0451 1 0 0.4813 0.4697 0.0490 1 0 0.4746 0.4709 0.0545
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 18 1 699 269 430 197 5 48 0 19 0 2 422 4 2 0.7323 0.0000 0.0186 4.702 2.99 8.58 -5.59 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0119 0.9881 0.0000
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 628 188 440 59 82 41 1 5 0 3 437 0 0 0.3138 0.0000 0.0068 3.585 0.34 3.00 -2.66 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0091 0.9909 0.0000 0 0 0.7713 0.2287 0.0000 0 0 0.9650 0.0350 0.0000
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 628 189 439 67 3 37 9 73 0 0 436 0 3 0.3545 0.0000 0.0068 4.108 0.46 3.07 -2.61 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0252 0.4780 0.4969 1 2 0.0282 0.4765 0.4953 1 2 0.0326 0.4753 0.4922
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 643 172 471 0 0 10 0 162 0 0 465 0 6 0.0000 0.0000 0.0127 16.200 2.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 372 153 219 0 0 0 1 152 0 0 217 0 2 0.0000 0.0000 0.0091 153.000 4.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr3 46709583 T TAAG 0.500000 0.100 1 3 1 572 127 445 1 108 15 0 3 0 0 445 0 0 0.0079 0.0000 0.0000 7.467 0.00 2.33 -2.33 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2544 0.7456 0.0000 0 0 0.9074 0.0926 0.0000 0 0 0.9675 0.0325 0.0000
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 574 129 445 4 0 15 12 98 0 0 443 1 1 0.0310 0.0000 0.0045 7.600 1.75 3.56 -1.81 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9431 0.0569 2 2 0.0000 0.1975 0.8025 2 2 0.0000 0.0526 0.9474
chr3 48373610 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 373 157 216 77 0 1 2 77 0 0 216 0 0 0.4904 0.0000 0.0000 156.000 0.73 1.91 -1.18 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1307 0.6786 0.1907 1 1 0.1369 0.6661 0.1970 1 1 0.1451 0.6501 0.2048
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 400 132 268 62 0 19 4 47 0 0 268 0 0 0.4697 0.0000 0.0000 5.947 0.85 4.21 -3.36 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4382 0.5123 0.0494 1 1 0.4363 0.5102 0.0536 1 1 0.4329 0.5077 0.0594
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 401 132 269 66 1 59 1 5 0 0 269 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 1.263 0.98 5.60 -4.62 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1127 0.8873 0.0000 0 1 0.4978 0.5022 0.0000
chr3 52693748 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 750 177 573 171 0 3 0 3 0 0 573 0 0 0.9661 0.0000 0.0000 58.000 0.30 3.67 -3.36 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8859 0.1141 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 181 84 97 35 0 10 0 39 0 0 96 0 1 0.4167 0.0000 0.0103 7.400 0.37 7.62 -7.24 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1185 0.5621 0.3194 1 1 0.1232 0.5574 0.3194 1 1 0.1294 0.5514 0.3191
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 233 97 136 0 0 7 40 50 0 0 135 0 1 0.0000 0.0000 0.0074 15.000 3.42 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0109 0.9891 2 2 0.0000 0.0123 0.9877
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 233 94 139 1 0 1 47 45 0 0 139 0 0 0.0106 0.0000 0.0000 93.000 1.00 3.84 -2.84 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0867 0.9133 2 2 0.0000 0.0319 0.9681 2 2 0.0000 0.0240 0.9760
chr3 63912684 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 3 297 70 227 52 4 11 0 3 0 0 227 0 0 0.7429 0.0000 0.0000 5.364 0.42 4.00 -3.58 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0219 0.9781 0.0000 0 1 0.4044 0.5956 0.0000 0 0 0.6902 0.3098 0.0000
chr3 75730470 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 269 125 144 79 1 1 0 44 0 0 143 0 1 0.6320 0.0000 0.0069 123.000 1.78 1.45 0.33 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8944 0.1047 0.0009 1 0 0.8857 0.1132 0.0012 1 0 0.8729 0.1254 0.0016
chr3 75737855 G GT 0.500000 0.100 1 1 3 911 186 725 113 1 5 2 65 3 7 715 0 0 0.6075 0.0041 0.0138 36.200 1.56 1.40 0.16 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9816 0.0183 0.0000 1 0 0.9788 0.0212 0.0000 1 0 0.9743 0.0257 0.0000
chr3 78634014 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 103 44 59 41 0 1 0 2 0 0 59 0 0 0.9318 0.0000 0.0000 43.000 0.32 3.00 -2.68 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0866 0.9134 0.0000 0 1 0.4796 0.5204 0.0000 0 0 0.6695 0.3305 0.0000
chr3 98087856 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 615 183 432 158 2 13 0 10 0 0 432 0 0 0.8634 0.0000 0.0000 13.000 0.61 2.40 -1.79 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0694 0.9306 0.0000 0 0 0.7962 0.2038 0.0000
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 853 170 683 105 1 6 1 57 0 0 681 2 0 0.6176 0.0000 0.0029 27.000 0.18 1.58 -1.40 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9563 0.0436 0.0001 1 0 0.9511 0.0488 0.0001 1 0 0.9432 0.0566 0.0002
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 746 207 539 106 0 21 0 80 0 0 534 0 5 0.5121 0.0000 0.0093 8.857 1.25 9.30 -8.05 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6053 0.3853 0.0094 1 0 0.6021 0.3869 0.0110 1 0 0.5966 0.3899 0.0135
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 476 145 331 65 0 10 0 70 0 0 331 0 0 0.4483 0.0000 0.0000 13.500 0.20 1.43 -1.23 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0995 0.6327 0.2679 1 1 0.1050 0.6230 0.2721 1 1 0.1124 0.6107 0.2770
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 344 105 239 53 0 7 0 45 0 0 238 0 1 0.5048 0.0000 0.0042 14.000 1.08 1.18 -0.10 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3480 0.5651 0.0869 1 1 0.3483 0.5599 0.0918 1 1 0.3480 0.5535 0.0984
chr3 108757146 G GGGGGATTA 0.500000 0.100 1 8 2 264 116 148 104 0 7 0 5 0 0 148 0 0 0.8966 0.0000 0.0000 15.571 0.17 8.00 -7.83 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.4677 0.5323 0.0000 0 0 0.8627 0.1373 0.0000
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 453 139 314 129 0 3 0 7 0 0 314 0 0 0.9281 0.0000 0.0000 68.000 0.62 1.57 -0.95 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2719 0.7281 0.0000 0 0 0.8567 0.1433 0.0000
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1107 288 819 20 0 74 92 102 0 0 817 0 2 0.0694 0.0000 0.0024 2.836 0.30 3.26 -2.96 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9651 0.0349
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1119 298 821 126 5 60 10 97 0 0 821 0 0 0.4228 0.0000 0.0000 3.967 2.28 7.37 -5.09 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6237 0.3710 0.0054 1 0 0.6221 0.3714 0.0064 1 0 0.6187 0.3731 0.0081
chr3 121677324 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 251 79 172 42 1 2 0 34 0 0 172 0 0 0.5316 0.0000 0.0000 38.500 0.45 3.24 -2.78 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4230 0.5059 0.0711 1 1 0.4197 0.5048 0.0755 1 1 0.4147 0.5036 0.0817
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 502 160 342 96 0 1 0 63 0 0 337 0 5 0.6000 0.0000 0.0146 159.000 0.20 3.10 -2.90 70 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7797 0.2172 0.0030 1 0 0.7712 0.2251 0.0037 1 0 0.7589 0.2363 0.0048
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 689 131 558 50 0 39 0 42 0 0 557 1 0 0.3817 0.0000 0.0018 2.359 0.56 10.74 -10.18 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3539 0.5578 0.0883 1 1 0.3537 0.5532 0.0931 1 1 0.3528 0.5475 0.0997
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 199 105 94 7 0 0 0 98 0 0 93 0 1 0.0667 0.0000 0.0106 105.000 0.29 1.70 -1.42 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9240 0.0760 2 2 0.0000 0.4219 0.5781
chr3 140956593 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 196 75 121 68 0 0 0 7 0 0 121 0 0 0.9067 0.0000 0.0000 75.000 0.69 3.29 -2.59 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0170 0.9830 0.0000 0 1 0.2327 0.7673 0.0000
chr3 149520808 C CTTAA 0.500000 0.100 1 4 1 217 81 136 45 0 0 0 36 0 0 135 0 1 0.5556 0.0000 0.0074 81.000 0.04 3.97 -3.93 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3910 0.5290 0.0800 1 1 0.3890 0.5264 0.0847 1 1 0.3858 0.5232 0.0910
chr3 169796284 TAAAGG T 0.500000 0.100 1 -5 2 265 95 170 44 1 5 0 45 0 0 170 0 0 0.4632 0.0000 0.0000 18.000 0.23 5.04 -4.82 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1953 0.6085 0.1962 1 1 0.1993 0.6005 0.2002 1 1 0.2043 0.5904 0.2052
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 291 93 198 85 0 3 0 5 0 0 198 0 0 0.9140 0.0000 0.0000 30.000 0.13 1.00 -0.87 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2566 0.7434 0.0000 0 0 0.7151 0.2849 0.0000
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 396 177 219 81 0 28 3 65 0 0 219 0 0 0.4576 0.0000 0.0000 5.321 0.22 3.28 -3.05 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4508 0.5150 0.0341 1 1 0.4505 0.5118 0.0377 1 1 0.4490 0.5082 0.0428
chr3 184059998 CA C 0.500000 0.100 1 -1 4 929 246 683 127 1 0 1 117 0 0 683 0 0 0.5163 0.0000 0.0000 246.000 0.25 1.35 -1.10 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2760 0.6858 0.0382 1 1 0.2852 0.6722 0.0426 1 1 0.2963 0.6547 0.0489
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 588 149 439 2 0 19 1 127 0 0 431 0 8 0.0134 0.0000 0.0182 6.842 0.00 3.35 -3.35 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0767 0.9233 2 2 0.0000 0.0094 0.9906 2 2 0.0000 0.0049 0.9951
chr3 184711345 A ATCCTCC 0.500000 0.100 1 6 1 588 149 439 2 0 139 2 6 0 0 432 1 6 0.0134 0.0000 0.0159 0.073 0.00 5.00 -5.00 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9570 0.0430 2 1 0.0000 0.6952 0.3048 2 1 0.0000 0.5067 0.4933
chr3 186666127 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 281 129 152 73 0 2 0 54 0 0 151 0 1 0.5659 0.0000 0.0066 63.500 0.21 1.26 -1.05 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6033 0.3797 0.0170 1 0 0.5969 0.3838 0.0193 1 0 0.5875 0.3897 0.0228
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 773 154 619 0 0 13 0 141 0 0 584 0 35 0.0000 0.0000 0.0565 10.846 11.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr3 198153257 CTGGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -9 2 275 106 169 23 2 5 61 15 0 0 167 1 1 0.2170 0.0000 0.0118 25.250 0.17 10.13 -9.96 13 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0210 0.9790 1 2 0.0001 0.0287 0.9712 1 2 0.0001 0.4255 0.5744
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 275 104 171 3 0 24 1 76 0 0 169 0 2 0.0288 0.0000 0.0117 3.333 0.67 8.45 -7.78 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9327 0.0673 2 2 0.0000 0.3185 0.6815 2 2 0.0000 0.1283 0.8717
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 275 106 169 5 0 23 30 48 0 0 167 0 2 0.0472 0.0000 0.0118 3.609 0.60 9.67 -9.07 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.7907 0.2093 2 2 0.0000 0.3382 0.6618
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 520 77 443 0 0 0 0 77 0 0 378 0 65 0.0000 0.0000 0.1467 77.000 14.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 663 255 408 91 1 70 6 87 1 0 400 4 3 0.3569 0.0025 0.0196 2.571 1.13 10.80 -9.67 27 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1300 0.7457 0.1243 1 1 0.1398 0.7320 0.1282 1 1 0.1530 0.7139 0.1330
chr4 3074923 AGC A 0.021170 0.100 1 -2 1 661 287 374 174 5 16 89 3 3 3 367 1 0 0.6063 0.0080 0.0187 31.125 3.15 13.00 -9.85 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr4 3074926 AG A 0.010091 0.100 1 -1 1 661 282 379 168 20 84 10 0 1 6 372 0 0 0.5957 0.0026 0.0185 14.077 3.21 4 0/1 0/0 . . OK 0 0 0.8492 0.1508 0.0000 0 0 0.9958 0.0042 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 808 220 588 110 0 27 0 83 2 0 574 2 10 0.5000 0.0034 0.0238 7.148 1.29 7.64 -6.35 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4784 0.5041 0.0174 1 1 0.4804 0.4997 0.0199 1 1 0.4816 0.4948 0.0236
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 811 255 556 112 3 40 3 97 0 1 540 1 14 0.4392 0.0000 0.0288 5.487 1.40 7.01 -5.61 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1355 0.7548 0.1097 1 1 0.1439 0.7387 0.1175 1 1 0.1548 0.7175 0.1277
chr4 44447936 G GCCA 0.500000 0.100 1 3 2 683 188 495 88 3 22 3 72 0 0 495 0 0 0.4681 0.0000 0.0000 7.500 1.26 4.06 -2.79 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5055 0.4727 0.0218 1 0 0.5042 0.4712 0.0246 1 0 0.5014 0.4699 0.0287
chr4 56314410 C CGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 9 1 596 123 473 4 0 14 1 104 0 0 441 0 32 0.0325 0.0000 0.0677 7.786 0.00 12.31 -12.31 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8708 0.1292 2 2 0.0000 0.0702 0.9298 2 2 0.0000 0.0166 0.9834
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 596 123 473 4 0 64 0 55 0 0 443 1 29 0.0325 0.0000 0.0634 0.922 0.00 13.91 -13.91 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9746 0.0254 2 2 0.0000 0.2959 0.7041 2 2 0.0000 0.0833 0.9167
chr4 56316659 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 3 443 114 329 104 0 3 0 7 0 0 329 0 0 0.9123 0.0000 0.0000 37.000 0.26 3.43 -3.17 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0946 0.9054 0.0000 0 0 0.6350 0.3650 0.0000
chr4 56448597 GGTACAGATAAAACAA G 0.500000 0.100 1 -15 2 352 118 234 102 0 11 1 4 0 0 234 0 0 0.8644 0.0000 0.0000 9.636 0.29 15.00 -14.71 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0185 0.9815 0.0000 0 0 0.6442 0.3558 0.0000 0 0 0.8983 0.1017 0.0000
chr4 68827423 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 406 164 242 88 0 4 0 72 0 0 242 0 0 0.5366 0.0000 0.0000 40.000 0.08 1.19 -1.11 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5156 0.4628 0.0216 1 0 0.5137 0.4619 0.0244 1 0 0.5101 0.4615 0.0284
chr4 69638978 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 426 115 311 60 0 5 0 50 0 0 311 0 0 0.5217 0.0000 0.0000 22.000 0.18 1.30 -1.12 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4148 0.5280 0.0572 1 1 0.4135 0.5250 0.0615 1 1 0.4110 0.5214 0.0676
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 3 412 113 299 68 1 1 0 43 0 3 295 0 1 0.6018 0.0000 0.0134 112.000 0.68 3.56 -2.88 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8280 0.1692 0.0028 1 0 0.8178 0.1788 0.0034 1 0 0.8032 0.1923 0.0045
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 1 791 306 485 130 7 51 3 115 0 0 476 0 9 0.4248 0.0000 0.0186 4.980 0.44 3.05 -2.61 56 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2710 0.6953 0.0338 1 1 0.2811 0.6809 0.0380 1 1 0.2933 0.6627 0.0441
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 157 70 87 37 0 0 0 33 0 0 87 0 0 0.5286 0.0000 0.0000 70.000 0.19 1.18 -0.99 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2986 0.5663 0.1351 1 1 0.2991 0.5613 0.1396 1 1 0.2995 0.5550 0.1455
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3703 797 2906 6 14 39 23 715 31 33 2594 200 48 0.0075 0.0107 0.1074 20.750 5.00 9.53 -4.53 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.1110 0.8890
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 3911 816 3095 379 14 110 7 306 20 69 2691 119 196 0.4645 0.0065 0.1305 6.413 5.84 11.31 -5.47 109 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0002 0.9998 1 2 0.0000 0.0002 0.9998 1 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr4 87615491 CAGCAGTGAT C 0.500000 0.100 1 -9 1 3804 863 2941 384 14 64 16 385 14 27 2838 29 33 0.4450 0.0048 0.0350 12.726 3.00 9.06 -6.06 88 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0008 0.9548 0.0443 1 1 0.0013 0.9424 0.0564 1 1 0.0021 0.9224 0.0755
chr4 87615611 CGATAGCAGTGACAGCAGT C 0.500000 0.100 1 -18 1 3781 1096 2685 461 38 150 30 417 45 56 2552 18 14 0.4206 0.0168 0.0495 6.582 2.56 12.39 -9.82 75 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9968 0.0032 0.0000 1 0 0.9966 0.0034 0.0000 1 0 0.9962 0.0038 0.0000
chr4 87616295 TGACAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 2758 808 1950 497 77 147 50 37 15 28 1891 11 5 0.6151 0.0077 0.0303 4.290 4.94 12.81 -7.87 155 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 100187718 GT G 0.500000 0.100 1 -1 3 373 97 276 60 0 2 1 34 0 0 274 0 2 0.6186 0.0000 0.0072 47.500 0.22 2.29 -2.08 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7468 0.2454 0.0078 1 0 0.7360 0.2548 0.0092 1 0 0.7208 0.2679 0.0113
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 656 150 506 85 0 3 0 62 0 0 506 0 0 0.5667 0.0000 0.0000 49.000 0.65 4.00 -3.35 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6987 0.2940 0.0073 1 0 0.6908 0.3006 0.0086 1 0 0.6794 0.3100 0.0107
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 525 215 310 1 0 27 13 174 0 0 303 2 5 0.0047 0.0000 0.0226 6.963 0.00 3.13 -3.13 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 2 484 193 291 88 1 27 0 77 2 1 285 0 3 0.4560 0.0069 0.0206 6.148 1.15 9.68 -8.53 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3871 0.5733 0.0396 1 1 0.3900 0.5664 0.0435 1 1 0.3927 0.5580 0.0492
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.100 1 5 2 273 122 151 64 0 4 0 54 1 0 146 1 3 0.5246 0.0066 0.0331 29.500 0.16 4.93 -4.77 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3265 0.5929 0.0806 1 1 0.3286 0.5857 0.0857 1 1 0.3307 0.5767 0.0926
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 313 131 182 102 0 23 0 6 0 0 182 0 0 0.7786 0.0000 0.0000 4.696 0.95 4.17 -3.22 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2159 0.7841 0.0000 0 0 0.7503 0.2497 0.0000
chr4 164957227 GTCCAACAGCGGTCGC G 0.500000 0.100 1 -15 1 572 151 421 139 0 5 0 7 0 0 420 0 1 0.9205 0.0000 0.0024 29.200 0.12 11.71 -11.59 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1714 0.8286 0.0000 0 0 0.8335 0.1665 0.0000
chr5 733800 T TAA 0.007715 0.100 1 2 1 125 43 82 34 0 0 2 7 0 0 82 0 0 0.7907 0.0000 0.0000 43.000 0.24 5.57 -5.34 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5553 0.4446 0.0000 0 1 0.2136 0.7864 0.0000 0 0 0.6876 0.3124 0.0000
chr5 733804 CAT C 0.005230 0.100 1 -2 3 125 44 81 35 0 1 3 5 0 0 81 0 0 0.7955 0.0000 0.0000 43.000 0.23 7.80 -7.57 3 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0300 0.9700 0.0000 0 1 0.4730 0.5270 0.0000 0 0 0.9224 0.0776 0.0000
chr5 11385089 C CGCG 0.001142 0.100 1 3 1 527 161 366 136 7 12 0 6 1 0 365 0 0 0.8447 0.0027 0.0027 12.417 1.06 3.50 -2.44 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6862 0.3138 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 721 165 556 0 0 24 9 132 0 0 551 2 3 0.0000 0.0000 0.0090 5.875 3.43 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 2 432 156 276 68 1 23 8 56 0 0 272 1 3 0.4359 0.0000 0.0145 6.238 0.82 4.05 -3.23 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1902 0.6589 0.1510 1 1 0.1957 0.6476 0.1568 1 1 0.2026 0.6332 0.1642
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 428 53 375 0 0 29 2 22 1 0 366 2 6 0.0000 0.0027 0.0240 0.828 10.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6381 0.3619 2 2 0.0000 0.3692 0.6308 2 2 0.0000 0.2870 0.7130
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 377 97 280 46 0 9 0 42 0 0 279 0 1 0.4742 0.0000 0.0036 9.778 0.24 6.14 -5.90 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2597 0.5970 0.1433 1 1 0.2622 0.5898 0.1480 1 1 0.2650 0.5807 0.1542
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 521 148 373 72 0 5 0 71 0 0 371 0 2 0.4865 0.0000 0.0054 28.600 0.18 2.97 -2.79 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1489 0.6696 0.1815 1 1 0.1549 0.6576 0.1874 1 1 0.1627 0.6423 0.1949
chr5 75611679 GGGGCTGCTGCTCC G 0.500000 0.100 1 -13 6 233 66 167 62 0 2 0 2 0 0 166 0 1 0.9394 0.0000 0.0060 32.000 0.50 7.50 -7.00 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0291 0.9709 0.0000 0 1 0.4756 0.5244 0.0000 0 0 0.7471 0.2529 0.0000
chr5 75635851 CCCAG C 0.500000 0.100 1 -4 1 296 103 193 65 0 1 1 36 0 0 193 0 0 0.6311 0.0000 0.0000 102.000 0.22 5.67 -5.45 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8288 0.1681 0.0031 1 0 0.8182 0.1779 0.0038 1 0 0.8030 0.1919 0.0050
chr5 75635856 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 296 93 203 57 0 2 0 34 0 0 203 0 0 0.6129 0.0000 0.0000 45.500 0.25 6.00 -5.75 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7464 0.2453 0.0083 1 0 0.7354 0.2549 0.0097 1 0 0.7199 0.2682 0.0119
chr5 78015515 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 155 66 89 42 0 1 0 23 0 0 89 0 0 0.6364 0.0000 0.0000 65.000 0.07 3.13 -3.06 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6937 0.2902 0.0160 1 0 0.6821 0.2996 0.0183 1 0 0.6660 0.3124 0.0216
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 375 110 265 53 3 7 0 47 0 0 260 0 5 0.4818 0.0000 0.0189 14.571 1.75 20.62 -18.86 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2630 0.6128 0.1242 1 1 0.2661 0.6045 0.1294 1 1 0.2698 0.5940 0.1363
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 357 88 269 46 0 1 0 41 0 0 265 1 3 0.5227 0.0000 0.0149 87.000 2.35 24.17 -21.82 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2205 0.6080 0.1715 1 1 0.2241 0.6000 0.1759 1 1 0.2284 0.5900 0.1816
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 245 85 160 49 1 3 0 32 0 0 157 0 3 0.5765 0.0000 0.0187 27.333 0.18 2.97 -2.79 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5752 0.3952 0.0295 1 0 0.5673 0.4000 0.0326 1 0 0.5562 0.4065 0.0372
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 948 237 711 105 1 21 3 107 1 0 705 1 4 0.4430 0.0014 0.0084 10.286 0.62 4.16 -3.54 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0558 0.6969 0.2473 1 1 0.0612 0.6831 0.2558 1 1 0.0686 0.6654 0.2660
chr5 119193899 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 159 68 91 36 0 1 1 30 0 0 91 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 66.000 0.14 3.13 -2.99 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3330 0.5492 0.1178 1 1 0.3323 0.5454 0.1224 1 1 0.3309 0.5406 0.1285
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 573 112 461 66 0 0 0 46 0 0 460 0 1 0.5893 0.0000 0.0022 112.000 0.29 1.24 -0.95 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6441 0.3410 0.0149 1 0 0.6358 0.3472 0.0170 1 0 0.6240 0.3558 0.0202
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 159 73 86 64 0 1 0 8 0 0 85 0 1 0.8767 0.0000 0.0116 72.000 0.45 3.12 -2.67 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.0647 0.9353 0.0000
chr5 139848487 CCCGGGT C 0.500000 0.100 1 -6 3 344 40 304 4 0 7 0 29 0 0 302 0 2 0.1000 0.0000 0.0066 4.714 0.25 6.00 -5.75 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9374 0.0626 2 1 0.0000 0.7431 0.2569
chr5 140858035 ACTGTG A 0.500000 0.100 1 -5 2 952 213 739 199 0 8 1 5 0 0 738 0 1 0.9343 0.0000 0.0014 25.625 0.97 5.40 -4.43 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0084 0.9916 0.0000 0 0 0.9332 0.0668 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 885 215 670 203 1 5 0 6 1 0 669 0 0 0.9442 0.0015 0.0015 42.000 0.26 1.33 -1.08 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0581 0.9419 0.0000 0 0 0.9795 0.0205 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000
chr5 141573996 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 2 621 168 453 14 62 40 1 51 0 0 452 0 1 0.0833 0.0000 0.0022 3.175 0.21 3.67 -3.45 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7266 0.2664 0.0070 1 0 0.7174 0.2744 0.0082 1 0 0.7042 0.2856 0.0102
chr5 141573996 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 621 170 451 66 5 37 5 57 0 0 451 0 0 0.3882 0.0000 0.0000 3.595 2.38 3.60 -1.22 26 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3595 0.5774 0.0630 1 1 0.3612 0.5711 0.0677 1 1 0.3625 0.5632 0.0743
chr5 141945390 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 388 121 267 109 1 6 0 5 0 0 267 0 0 0.9008 0.0000 0.0000 19.167 0.33 3.60 -3.27 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 0 0.5424 0.4576 0.0000 0 0 0.8936 0.1064 0.0000
chr5 146233607 G GCCAGGTCCAGGCCCAGGCCCGGGC 0.500000 0.100 1 24 1 173 40 133 8 0 30 0 2 0 0 130 0 3 0.2000 0.0000 0.0226 0.333 3.62 0.00 3.62 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3188 0.5054 0.1759 1 1 0.3159 0.5058 0.1783 1 1 0.3115 0.5075 0.1810
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 362 113 249 41 0 26 0 46 0 0 243 1 5 0.3628 0.0000 0.0241 3.346 0.20 7.17 -6.98 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0554 0.4959 0.4487 1 1 0.0596 0.4951 0.4453 1 1 0.0655 0.4944 0.4401
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 15 1 362 113 249 41 6 28 0 38 0 0 243 1 5 0.3628 0.0000 0.0241 3.111 0.20 7.79 -7.59 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2685 0.5948 0.1368 1 1 0.2707 0.5877 0.1416 1 1 0.2733 0.5788 0.1479
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 779 182 597 107 1 2 1 71 0 0 592 2 3 0.5879 0.0000 0.0084 90.000 0.74 3.93 -3.19 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8139 0.1844 0.0017 1 0 0.8058 0.1921 0.0022 1 0 0.7940 0.2031 0.0029
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 780 183 597 111 0 1 1 70 0 0 591 3 3 0.6066 0.0000 0.0101 182.000 0.70 4.04 -3.34 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8527 0.1463 0.0010 1 0 0.8447 0.1540 0.0013 1 0 0.8330 0.1652 0.0018
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 591 143 448 63 0 3 0 77 0 0 448 0 0 0.4406 0.0000 0.0000 70.000 0.25 1.83 -1.58 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0292 0.4773 0.4935 1 2 0.0324 0.4763 0.4912 1 2 0.0372 0.4756 0.4873
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 544 157 387 7 0 2 1 147 0 0 386 0 1 0.0446 0.0000 0.0026 77.500 0.00 1.31 -1.31 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 2 0.0000 0.4991 0.5009 2 2 0.0000 0.0605 0.9395
chr5 150656742 ACCGCCCCCGCCC A 0.500000 0.100 1 -12 2 611 134 477 51 0 22 1 60 0 0 470 0 7 0.3806 0.0000 0.0147 5.091 2.59 10.85 -8.26 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0213 0.3988 0.5798 1 2 0.0240 0.4024 0.5736 1 2 0.0279 0.4075 0.5646
chr5 150903148 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 1 261 91 170 48 1 2 0 40 0 0 169 0 1 0.5275 0.0000 0.0059 44.500 0.75 3.65 -2.90 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3828 0.5388 0.0784 1 1 0.3815 0.5354 0.0831 1 1 0.3792 0.5313 0.0895
chr5 156757714 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 295 127 168 81 1 5 0 40 0 0 163 0 5 0.6378 0.0000 0.0298 24.200 0.20 3.15 -2.95 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9110 0.0884 0.0006 1 0 0.9030 0.0962 0.0008 1 0 0.8911 0.1077 0.0012
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 381 166 215 67 2 14 6 77 0 0 215 0 0 0.4036 0.0000 0.0000 10.857 3.67 11.27 -7.60 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0308 0.5032 0.4661 1 1 0.0341 0.5005 0.4654 1 1 0.0390 0.4976 0.4634
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 379 149 230 0 52 7 0 90 0 0 228 0 2 0.0000 0.0000 0.0087 20.286 3.83 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0003 0.0697 0.9300 1 2 0.0004 0.0765 0.9231 1 2 0.0006 0.0867 0.9127
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 200 89 111 43 0 9 0 37 0 0 110 0 1 0.4831 0.0000 0.0090 8.889 0.19 2.97 -2.79 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3141 0.5693 0.1166 1 1 0.3146 0.5641 0.1213 1 1 0.3148 0.5575 0.1277
chr5 172283665 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 122 61 61 35 0 3 1 22 0 0 61 0 0 0.5738 0.0000 0.0000 19.000 0.40 3.05 -2.65 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5316 0.4210 0.0474 1 0 0.5235 0.4253 0.0512 1 0 0.5124 0.4309 0.0567
chr5 176290103 G GAGC 0.500000 0.100 1 3 2 708 171 537 148 2 15 0 6 0 1 536 0 0 0.8655 0.0000 0.0019 10.400 0.50 3.50 -3.00 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 0 0.7602 0.2398 0.0000 0 0 0.9700 0.0300 0.0000
chr5 176384091 CGT C 0.500000 0.100 1 -2 1 306 94 212 86 0 4 0 4 0 0 211 0 1 0.9149 0.0000 0.0047 22.500 0.37 2.00 -1.63 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2640 0.7360 0.0000 0 0 0.7241 0.2759 0.0000
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 403 92 311 0 0 7 0 85 0 0 311 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 12.143 3.89 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0130 0.9870 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0159 0.9841
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 488 207 281 87 6 39 7 68 0 0 281 0 0 0.4203 0.0000 0.0000 4.282 1.10 3.41 -2.31 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5669 0.4181 0.0149 1 0 0.5637 0.4192 0.0171 1 0 0.5584 0.4213 0.0204
chr5 179644808 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 368 139 229 99 0 3 0 37 0 0 228 0 1 0.7122 0.0000 0.0044 45.333 0.42 4.16 -3.74 63 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9908 0.0092 0.0000 1 0 0.9890 0.0110 0.0000 1 0 0.9859 0.0141 0.0000
chr5 181155256 TTGTC T 0.500000 0.100 1 -4 3 810 222 588 200 0 10 0 12 0 0 588 0 0 0.9009 0.0000 0.0000 21.200 0.72 4.17 -3.44 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0580 0.9420 0.0000 0 0 0.8811 0.1189 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 625 97 528 0 0 10 0 87 0 0 526 0 2 0.0000 0.0000 0.0038 8.700 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0106 0.9894 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0131 0.9869
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 504 133 371 67 2 20 0 44 0 0 369 1 1 0.5038 0.0000 0.0054 5.550 0.54 3.00 -2.46 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7157 0.2756 0.0087 1 0 0.7058 0.2840 0.0101 1 0 0.6919 0.2957 0.0125
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 595 146 449 106 5 28 1 6 6 3 439 1 0 0.7260 0.0134 0.0223 4.143 2.21 2.67 -0.46 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.4638 0.5362 0.0000 0 0 0.9322 0.0678 0.0000
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 559 130 429 94 7 23 1 5 1 2 425 1 0 0.7231 0.0023 0.0093 4.652 1.24 5.60 -4.36 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 0 0.6037 0.3963 0.0000 0 0 0.9237 0.0763 0.0000
chr6 13711236 AGGCGGGGGCGGC A 0.000517 0.100 1 -12 5 454 155 299 78 1 24 0 52 0 0 292 0 7 0.5032 0.0000 0.0234 5.458 1.17 11.40 -10.24 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7866 0.2134 0.0000 1 0 0.7823 0.2177 0.0000 1 0 0.7760 0.2240 0.0000
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1434 330 1104 104 18 103 13 92 1 1 1081 8 13 0.3152 0.0009 0.0208 2.228 5.10 5.93 -0.84 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1554 0.7878 0.0568 1 1 0.1680 0.7715 0.0605 1 1 0.1850 0.7497 0.0653
chr6 16327684 A ATGCTGCTGC 0.015710 0.100 1 9 1 1422 408 1014 112 7 92 8 189 0 0 1013 0 1 0.2745 0.0000 0.0010 3.539 4.57 5.86 -1.29 30 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.1036 0.8964 1 2 0.0000 0.1223 0.8777 1 2 0.0000 0.1520 0.8479
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 379 85 294 7 0 2 0 76 0 0 293 0 1 0.0824 0.0000 0.0034 41.500 0.14 1.29 -1.15 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9733 0.0267 2 1 0.0000 0.6798 0.3202
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 467 138 329 70 1 6 0 61 0 0 328 1 0 0.5072 0.0000 0.0030 21.833 0.54 2.67 -2.13 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3601 0.5769 0.0630 1 1 0.3617 0.5706 0.0677 1 1 0.3630 0.5627 0.0742
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 542 152 390 10 0 0 2 140 0 0 390 0 0 0.0658 0.0000 0.0000 152.000 0.70 6.97 -6.27 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9721 0.0279 2 2 0.0000 0.3841 0.6159
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 542 152 390 61 3 0 2 86 0 0 390 0 0 0.4013 0.0000 0.0000 152.000 2.02 10.03 -8.02 3 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0063 0.2816 0.7121 1 2 0.0075 0.2884 0.7041 1 2 0.0094 0.2981 0.6925
chr6 32223881 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 339 149 190 2 127 13 0 7 0 3 187 0 0 0.0134 0.0000 0.0158 10.385 1.00 4.00 -3.00 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2941 0.7059 0.0000 0 0 0.8694 0.1306 0.0000
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 525 206 319 105 1 33 0 67 0 0 317 0 2 0.5097 0.0000 0.0063 5.242 0.34 5.60 -5.25 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8894 0.1100 0.0006 1 0 0.8816 0.1176 0.0008 1 0 0.8701 0.1287 0.0011
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 389 82 307 46 0 13 0 23 0 0 302 0 5 0.5610 0.0000 0.0163 5.308 1.15 14.04 -12.89 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6643 0.3173 0.0183 1 0 0.6536 0.3256 0.0207 1 0 0.6388 0.3368 0.0243
chr6 36722044 C CGGGCCCAGCGGTGCAGGA 0.500000 0.100 1 18 2 681 143 538 79 0 23 0 41 0 0 525 0 13 0.5524 0.0000 0.0242 5.217 0.89 8.88 -7.99 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7523 0.2424 0.0053 1 0 0.7429 0.2507 0.0063 1 0 0.7295 0.2625 0.0080
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 860 221 639 93 0 3 0 125 0 0 638 0 1 0.4208 0.0000 0.0016 72.667 0.34 3.34 -3.00 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0012 0.1835 0.8153 1 2 0.0015 0.1902 0.8083 1 2 0.0021 0.2001 0.7978
chr6 42236367 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 3 333 113 220 59 1 13 0 40 0 0 216 0 4 0.5221 0.0000 0.0182 7.692 0.36 3.17 -2.82 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5800 0.3956 0.0243 1 0 0.5730 0.3998 0.0272 1 0 0.5630 0.4057 0.0314
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 323 126 197 66 0 15 1 44 0 0 191 0 6 0.5238 0.0000 0.0305 7.400 0.45 6.07 -5.61 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5395 0.4329 0.0276 1 0 0.5345 0.4349 0.0306 1 0 0.5269 0.4379 0.0351
chr6 43198673 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 2 237 80 157 71 0 3 0 6 0 0 157 0 0 0.8875 0.0000 0.0000 25.667 0.17 3.33 -3.16 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0551 0.9449 0.0000 0 1 0.4000 0.6000 0.0000
chr6 44002766 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 476 113 363 36 7 41 2 27 0 0 361 1 1 0.3186 0.0000 0.0055 1.756 2.92 4.56 -1.64 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5124 0.4414 0.0462 1 0 0.5058 0.4442 0.0500 1 0 0.4965 0.4480 0.0555
chr6 44002766 CGCGGCG C 0.500000 0.100 1 -6 1 480 118 362 82 0 34 0 2 1 0 360 1 0 0.6949 0.0028 0.0055 2.545 3.44 4.50 -1.06 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3559 0.6441 0.0000 0 0 0.8434 0.1566 0.0000 0 0 0.9214 0.0786 0.0000
chr6 44172317 T TGGCTGCC 0.500000 0.100 1 7 1 213 97 116 88 1 3 0 5 0 0 116 0 0 0.9072 0.0000 0.0000 31.000 0.12 5.80 -5.67 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.2923 0.7077 0.0000 0 0 0.7510 0.2490 0.0000
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 30 2 760 170 590 41 1 93 0 35 0 1 567 0 22 0.2412 0.0000 0.0390 0.828 0.46 3.43 -2.97 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0321 0.4293 0.5387 1 2 0.0354 0.4319 0.5327 1 2 0.0402 0.4358 0.5241
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 691 147 544 59 6 51 0 31 1 0 535 3 5 0.4014 0.0018 0.0165 1.882 1.53 4.42 -2.89 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8100 0.1862 0.0038 1 0 0.7993 0.1960 0.0046 1 0 0.7842 0.2098 0.0060
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 1051 256 795 235 2 11 0 8 0 0 795 0 0 0.9180 0.0000 0.0000 22.273 1.58 6.12 -4.54 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0034 0.9966 0.0000 0 0 0.9654 0.0346 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 634 151 483 137 0 9 0 5 0 0 483 0 0 0.9073 0.0000 0.0000 15.778 0.31 3.00 -2.69 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 0 0.8204 0.1796 0.0000 0 0 0.9689 0.0311 0.0000
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 769 161 608 0 0 13 2 146 0 0 599 0 9 0.0000 0.0000 0.0148 11.385 3.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 665 144 521 64 0 2 0 78 0 0 516 0 5 0.4444 0.0000 0.0096 71.000 0.28 5.53 -5.24 30 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0144 0.3829 0.6028 1 2 0.0165 0.3862 0.5974 1 2 0.0196 0.3911 0.5892
chr6 122781253 A ACCTCCTTCCTTCTTCTTCCCT 0.500000 0.100 1 21 1 208 48 160 24 0 10 0 14 0 0 153 0 7 0.5000 0.0000 0.0437 3.800 0.54 15.07 -14.53 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2938 0.5442 0.1621 1 1 0.2935 0.5408 0.1657 1 1 0.2929 0.5366 0.1705
chr6 136360785 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 307 81 226 44 0 4 0 33 0 0 225 0 1 0.5432 0.0000 0.0044 19.250 0.52 3.15 -2.63 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4493 0.4889 0.0619 1 1 0.4450 0.4888 0.0662 1 1 0.4389 0.4889 0.0722
chr6 151349194 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 777 160 617 90 0 2 0 68 0 0 617 0 0 0.5625 0.0000 0.0000 79.000 0.61 3.51 -2.90 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6653 0.3262 0.0085 1 0 0.6587 0.3313 0.0099 1 0 0.6489 0.3388 0.0122
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 916 235 681 12 0 11 1 211 0 0 670 0 11 0.0511 0.0000 0.0162 20.364 0.08 3.00 -2.91 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8373 0.1627 2 2 0.0000 0.0423 0.9577
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 567 200 367 11 0 46 0 143 0 0 355 0 12 0.0550 0.0000 0.0327 3.348 0.00 15.39 -15.39 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9814 0.0186 2 2 0.0000 0.3865 0.6135
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 427 168 259 107 0 4 0 57 0 0 258 0 1 0.6369 0.0000 0.0039 41.000 0.19 5.12 -4.94 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9648 0.0351 0.0001 1 0 0.9603 0.0396 0.0001 1 0 0.9534 0.0465 0.0001
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 238 89 149 70 0 10 0 9 0 0 149 0 0 0.7865 0.0000 0.0000 7.900 0.36 9.00 -8.64 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 1 0.0847 0.9153 0.0000
chr6 160992012 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 571 263 308 133 1 36 2 91 1 0 294 5 8 0.5057 0.0032 0.0455 6.306 0.49 4.42 -3.93 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7408 0.2571 0.0021 1 0 0.7358 0.2615 0.0026 1 0 0.7280 0.2685 0.0035
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 338 153 185 0 0 20 8 125 0 0 179 1 5 0.0000 0.0000 0.0324 6.650 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 790 252 538 5 1 11 127 108 0 0 538 0 0 0.0198 0.0000 0.0000 18.625 6.00 10.17 -4.17 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8708 0.1292 2 2 0.0000 0.0118 0.9882 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 258 106 152 33 1 22 1 49 0 0 151 0 1 0.3113 0.0000 0.0066 3.952 3.88 3.84 0.04 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0225 0.3581 0.6194 1 2 0.0252 0.3645 0.6102 1 2 0.0292 0.3733 0.5975
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 259 108 151 57 1 16 0 34 0 0 151 0 0 0.5278 0.0000 0.0000 5.750 3.37 3.88 -0.51 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7693 0.2241 0.0066 1 0 0.7582 0.2340 0.0078 1 0 0.7425 0.2478 0.0098
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 714 179 535 173 0 3 0 3 0 0 535 0 0 0.9665 0.0000 0.0000 58.667 0.40 12.00 -11.60 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8957 0.1043 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr7 12342095 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 151 64 87 62 0 0 0 2 0 0 87 0 0 0.9688 0.0000 0.0000 64.000 0.15 2.00 -1.85 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2181 0.7819 0.0000 0 0 0.7248 0.2752 0.0000 0 0 0.8488 0.1512 0.0000
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 231 106 125 98 1 0 0 7 0 0 125 0 0 0.9245 0.0000 0.0000 106.000 0.80 1.71 -0.92 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0760 0.9240 0.0000 0 0 0.5780 0.4220 0.0000
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 690 217 473 7 0 41 9 160 0 0 473 0 0 0.0323 0.0000 0.0000 4.293 0.14 3.33 -3.19 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 2 0.0000 0.2720 0.7280 2 2 0.0000 0.0240 0.9760
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 362 97 265 45 2 3 0 47 0 0 265 0 0 0.4639 0.0000 0.0000 31.333 0.20 3.04 -2.84 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1933 0.6132 0.1935 1 1 0.1974 0.6049 0.1976 1 1 0.2027 0.5944 0.2029
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 124 44 80 25 2 4 1 12 0 0 78 1 1 0.5682 0.0000 0.0250 9.750 0.12 1.00 -0.88 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5435 0.4057 0.0508 1 0 0.5341 0.4112 0.0547 1 0 0.5213 0.4184 0.0603
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 519 133 386 11 0 0 1 121 0 0 385 0 1 0.0827 0.0000 0.0026 133.000 0.09 1.17 -1.07 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9961 0.0039 2 1 0.0000 0.7471 0.2529
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 180 56 124 25 0 1 0 30 0 0 124 0 0 0.4464 0.0000 0.0000 55.000 0.40 3.30 -2.90 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1251 0.5378 0.3371 1 1 0.1294 0.5349 0.3357 1 1 0.1353 0.5312 0.3335
chr7 44073397 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 603 154 449 85 0 2 0 67 0 0 449 0 0 0.5519 0.0000 0.0000 76.000 0.68 1.46 -0.78 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5760 0.4077 0.0163 1 0 0.5717 0.4098 0.0185 1 0 0.5650 0.4131 0.0219
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 219 91 128 41 0 4 0 46 0 0 128 0 0 0.4505 0.0000 0.0000 21.750 0.02 3.02 -3.00 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1146 0.5765 0.3088 1 1 0.1195 0.5708 0.3098 1 1 0.1260 0.5635 0.3106
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 604 134 470 1 5 125 0 3 0 1 468 1 0 0.0075 0.0000 0.0043 0.072 16.00 2.67 13.33 1 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0279 0.9700 0.0021 0 1 0.1148 0.8839 0.0013 0 1 0.2865 0.7127 0.0008
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.100 1 3 5 268 74 194 53 3 16 0 2 0 0 194 0 0 0.7162 0.0000 0.0000 3.625 0.66 2.00 -1.34 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1720 0.8280 0.0000 0 0 0.6622 0.3378 0.0000 0 0 0.8081 0.1919 0.0000
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 301 95 206 0 0 0 0 95 0 0 206 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 95.000 2.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0078 0.9922 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0099 0.9901
chr7 80656572 TA T 0.500000 0.100 1 -1 4 215 106 109 100 0 1 0 5 0 0 108 1 0 0.9434 0.0000 0.0092 105.000 0.12 2.00 -1.88 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.2191 0.7809 0.0000 0 0 0.7403 0.2597 0.0000
chr7 80671012 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 187 92 95 57 1 0 1 33 0 0 95 0 0 0.6196 0.0000 0.0000 92.000 0.07 1.24 -1.17 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7680 0.2253 0.0067 1 0 0.7569 0.2352 0.0079 1 0 0.7412 0.2489 0.0099
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 839 211 628 0 0 10 4 197 0 0 621 0 7 0.0000 0.0000 0.0111 20.000 3.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 83155155 AGCCAGGCTGTTGAGGTGGGGGCTTTGCTGG A 0.500000 0.100 1 -30 1 808 192 616 82 4 44 2 60 0 0 616 0 0 0.4271 0.0000 0.0000 3.318 1.37 6.35 -4.98 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7185 0.2753 0.0062 1 0 0.7102 0.2824 0.0074 1 0 0.6982 0.2925 0.0093
chr7 87359354 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 203 65 138 59 1 0 0 5 0 0 138 0 0 0.9077 0.0000 0.0000 65.000 0.17 1.00 -0.83 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0895 0.9105 0.0000 0 1 0.4267 0.5733 0.0000
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 258 90 168 43 0 1 0 46 0 0 168 0 0 0.4778 0.0000 0.0000 89.000 0.28 3.00 -2.72 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1433 0.5970 0.2597 1 1 0.1480 0.5898 0.2622 1 1 0.1542 0.5807 0.2650
chr7 93104296 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 3 836 199 637 185 2 3 0 9 0 0 636 0 1 0.9296 0.0000 0.0016 65.333 0.24 2.11 -1.87 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2131 0.7869 0.0000 0 0 0.9344 0.0656 0.0000
chr7 99652770 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 190 53 137 29 0 1 0 23 0 0 136 0 1 0.5472 0.0000 0.0073 52.000 0.03 1.26 -1.23 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3388 0.5354 0.1258 1 1 0.3373 0.5326 0.1301 1 1 0.3349 0.5292 0.1359
chr7 99836454 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 188 65 123 62 0 0 0 3 0 0 123 0 0 0.9538 0.0000 0.0000 65.000 0.16 1.00 -0.84 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0294 0.9706 0.0000 0 1 0.4762 0.5238 0.0000 0 0 0.7472 0.2528 0.0000
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 216 84 132 80 0 2 0 2 1 0 131 0 0 0.9524 0.0076 0.0076 41.000 0.86 35.00 -34.14 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4169 0.5831 0.0000 0 0 0.8697 0.1303 0.0000 0 0 0.9328 0.0672 0.0000
chr7 102541185 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 775 212 563 191 4 2 0 15 0 0 563 0 0 0.9009 0.0000 0.0000 105.000 0.75 1.40 -0.65 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.4607 0.5393 0.0000
chr7 102541593 G GA 0.500000 0.100 1 1 2 1113 454 659 416 3 3 1 31 0 0 655 1 3 0.9163 0.0000 0.0061 150.333 0.23 1.84 -1.61 84 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0655 0.9345 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 539 131 408 10 0 7 0 114 0 0 407 0 1 0.0763 0.0000 0.0025 17.714 0.20 3.04 -2.84 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9926 0.0074 2 1 0.0000 0.6978 0.3022
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 513 130 383 4 0 42 1 83 0 0 375 0 8 0.0308 0.0000 0.0209 2.122 2.00 6.18 -4.18 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9857 0.0143 2 2 0.0000 0.4242 0.5758 2 2 0.0000 0.1337 0.8663
chr7 104328788 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 438 142 296 133 0 3 0 6 0 0 294 0 2 0.9366 0.0000 0.0068 46.333 1.44 10.50 -9.06 83 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1330 0.8670 0.0000 0 0 0.7891 0.2109 0.0000
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 668 156 512 68 1 15 0 72 0 0 512 0 0 0.4359 0.0000 0.0000 9.400 1.15 3.96 -2.81 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1216 0.6562 0.2222 1 1 0.1275 0.6450 0.2275 1 1 0.1352 0.6308 0.2340
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 764 209 555 172 1 22 0 14 0 1 554 0 0 0.8230 0.0000 0.0018 8.455 0.51 7.00 -6.49 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.3739 0.6261 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 614 204 410 102 0 29 0 73 0 0 409 0 1 0.5000 0.0000 0.0024 6.034 0.34 14.89 -14.55 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7696 0.2274 0.0030 1 0 0.7616 0.2347 0.0037 1 0 0.7500 0.2452 0.0048
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 354 185 169 0 0 28 3 154 0 0 163 0 6 0.0000 0.0000 0.0355 5.607 8.29 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -12 1 354 191 163 12 2 103 0 74 0 0 158 0 5 0.0628 0.0000 0.0307 0.863 1.00 10.46 -9.46 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.6363 0.3637 2 1 0.0000 0.9739 0.0261 2 1 0.0000 0.9972 0.0028
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 232 82 150 0 0 2 0 80 0 0 148 0 2 0.0000 0.0000 0.0133 40.000 3.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0184 0.9816
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.100 1 19 1 143 59 84 22 0 18 0 19 0 0 82 0 2 0.3729 0.0000 0.0238 2.278 0.09 9.11 -9.01 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2465 0.5513 0.2022 1 1 0.2478 0.5475 0.2048 1 1 0.2493 0.5426 0.2081
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 990 258 732 21 91 53 2 91 0 0 725 0 7 0.0814 0.0000 0.0096 3.942 0.67 3.42 -2.75 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3827 0.5888 0.0285 1 1 0.3879 0.5802 0.0319 1 1 0.3934 0.5696 0.0370
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 991 267 724 114 4 49 3 97 0 0 722 0 2 0.4270 0.0000 0.0028 4.449 2.58 3.26 -0.68 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4392 0.5414 0.0194 1 1 0.4432 0.5348 0.0221 1 1 0.4469 0.5270 0.0261
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1483 336 1147 0 0 16 0 320 0 0 1145 0 2 0.0000 0.0000 0.0017 20.000 1.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 144050729 ACT A 0.500000 0.100 1 -2 1 623 138 485 129 0 0 0 9 0 0 485 0 0 0.9348 0.0000 0.0000 138.000 1.06 2.78 -1.72 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0415 0.9585 0.0000 0 0 0.6186 0.3814 0.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 713 166 547 98 1 7 0 60 0 0 547 0 0 0.5904 0.0000 0.0000 22.714 0.53 3.77 -3.24 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9159 0.0837 0.0004 1 0 0.9086 0.0909 0.0005 1 0 0.8977 0.1015 0.0008
chr7 144667784 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 167 79 88 46 0 1 0 32 0 0 88 0 0 0.5823 0.0000 0.0000 78.000 0.78 2.41 -1.62 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5573 0.4080 0.0348 1 0 0.5495 0.4123 0.0382 1 0 0.5387 0.4183 0.0431
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 217 61 156 56 0 3 0 2 0 0 156 0 0 0.9180 0.0000 0.0000 19.333 0.32 4.50 -4.18 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1693 0.8307 0.0000 0 0 0.6609 0.3391 0.0000 0 0 0.8075 0.1925 0.0000
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 748 205 543 107 0 3 1 94 0 0 541 0 2 0.5220 0.0000 0.0037 67.333 0.44 1.40 -0.97 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3170 0.6394 0.0436 1 1 0.3235 0.6285 0.0480 1 1 0.3309 0.6147 0.0544
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 699 185 514 110 0 11 1 63 0 1 506 0 7 0.5946 0.0000 0.0156 15.727 0.55 11.68 -11.13 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9161 0.0836 0.0003 1 0 0.9091 0.0904 0.0004 1 0 0.8988 0.1006 0.0006
chr7 151023910 GCTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 503 137 366 81 1 6 1 48 0 0 366 0 0 0.5912 0.0000 0.0000 21.833 0.64 3.54 -2.90 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8726 0.1261 0.0013 1 0 0.8635 0.1349 0.0016 1 0 0.8502 0.1476 0.0022
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 513 99 414 0 0 2 15 82 0 6 387 9 12 0.0000 0.0000 0.0652 97.000 8.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4235 0.5765 2 2 0.0000 0.0815 0.9185 2 2 0.0000 0.0331 0.9669
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 513 97 416 0 0 6 8 83 0 0 389 11 16 0.0000 0.0000 0.0649 90.000 8.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 523 90 433 0 0 7 3 80 0 0 367 23 43 0.0000 0.0000 0.1524 13.667 8.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 552 189 363 173 1 2 0 13 0 0 363 0 0 0.9153 0.0000 0.0000 93.500 0.42 1.23 -0.81 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 0 0.5249 0.4751 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 742 159 583 76 0 20 0 63 0 0 580 0 3 0.4780 0.0000 0.0051 6.950 0.82 5.60 -4.79 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3580 0.5834 0.0586 1 1 0.3593 0.5772 0.0635 1 1 0.3601 0.5695 0.0704
chr8 10608190 CTTCCTCTTCTGCCTCCTGGGACTCTATAACTTCTGACTCTGGCTGGGT C 0.002031 0.100 1 -48 3 946 260 686 145 2 24 3 86 7 7 657 8 7 0.5577 0.0102 0.0423 9.792 2.48 11.08 -8.61 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9870 0.0130 0.0000 1 0 0.9853 0.0147 0.0000 1 0 0.9828 0.0172 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 577 241 336 0 0 41 1 199 0 0 336 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.000 5.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 13567550 CAG C 0.000361 0.100 1 -2 4 651 161 490 151 0 1 0 9 0 0 490 0 0 0.9379 0.0000 0.0000 160.000 0.32 2.11 -1.79 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0124 0.9876 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 353 156 197 82 0 5 0 69 0 0 193 0 4 0.5256 0.0000 0.0203 30.200 0.55 7.48 -6.93 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4752 0.5060 0.0188 1 1 0.4798 0.4998 0.0204 1 1 0.4850 0.4924 0.0226
chr8 64581060 T TGGC 0.106611 0.100 1 3 1 610 151 459 64 4 23 0 60 4 1 443 4 7 0.4238 0.0087 0.0349 5.522 1.64 4.75 -3.11 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3505 0.6234 0.0261 1 1 0.3599 0.6127 0.0273 1 1 0.3718 0.5993 0.0289
chr8 64581450 T TAGCGGC 0.096175 0.100 1 6 2 638 181 457 85 0 18 0 78 0 1 455 0 1 0.4696 0.0000 0.0044 9.056 1.21 5.27 -4.06 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4340 0.5537 0.0122 1 1 0.4423 0.5446 0.0131 1 1 0.4522 0.5334 0.0144
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 631 184 447 74 60 41 1 8 0 0 447 0 0 0.4022 0.0000 0.0000 3.463 1.05 2.62 -1.57 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6316 0.3684 0.0000 0 0 0.9771 0.0229 0.0000
chr8 86576034 CTTTATCTTCATTTTCTTTTTG C 0.500000 0.100 1 -21 2 502 125 377 53 0 29 0 43 0 0 376 0 1 0.4240 0.0000 0.0027 3.310 0.26 13.23 -12.97 39 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4021 0.5303 0.0675 1 1 0.4005 0.5274 0.0721 1 1 0.3978 0.5239 0.0784
chr8 90645735 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 523 131 392 109 0 16 0 6 0 0 392 0 0 0.8321 0.0000 0.0000 7.188 0.63 3.00 -2.37 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2788 0.7212 0.0000 0 0 0.8072 0.1928 0.0000
chr8 93728272 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 81 42 39 19 0 0 0 23 0 0 39 0 0 0.4524 0.0000 0.0000 42.000 0.11 3.00 -2.89 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1457 0.5323 0.3220 1 1 0.1496 0.5298 0.3206 1 1 0.1547 0.5267 0.3185
chr8 100596815 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 231 73 158 42 0 4 0 27 0 0 157 0 1 0.5753 0.0000 0.0063 17.250 0.48 1.41 -0.93 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5662 0.3985 0.0353 1 0 0.5577 0.4036 0.0387 1 0 0.5460 0.4104 0.0436
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 331 97 234 66 0 1 0 30 0 0 234 0 0 0.6804 0.0000 0.0000 96.000 0.42 2.20 -1.78 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9165 0.0828 0.0007 1 0 0.9082 0.0909 0.0010 1 0 0.8958 0.1028 0.0014
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 680 239 441 161 0 5 1 72 0 0 441 0 0 0.6736 0.0000 0.0000 46.800 2.60 16.17 -13.57 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9990 0.0010 0.0000 1 0 0.9987 0.0013 0.0000 1 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 318 109 209 43 0 3 0 63 0 0 209 0 0 0.3945 0.0000 0.0000 35.333 1.42 3.98 -2.57 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0128 0.3126 0.6747 1 2 0.0147 0.3200 0.6653 1 2 0.0176 0.3302 0.6522
chr8 116938485 AGGCGGC A 0.500000 0.100 1 -6 2 446 160 286 68 0 14 0 78 0 0 285 0 1 0.4250 0.0000 0.0035 10.429 0.31 5.44 -5.13 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0458 0.5556 0.3987 1 1 0.0499 0.5502 0.3999 1 1 0.0558 0.5437 0.4005
chr8 123369918 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 1 326 95 231 29 3 11 1 51 0 0 230 0 1 0.3053 0.0000 0.0043 7.545 0.24 3.33 -3.09 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0110 0.2692 0.7198 1 2 0.0127 0.2785 0.7088 1 2 0.0154 0.2913 0.6933
chr8 123369942 A ATCATCG 0.500000 0.100 1 6 1 326 107 219 49 47 3 2 6 0 1 218 0 0 0.4579 0.0000 0.0046 18.667 0.27 3.00 -2.73 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0891 0.9109 0.0000 0 0 0.5270 0.4730 0.0000
chr8 133238956 C CCCCTCGCTGGTGTGCGAGCGGCTGCGGGTG 0.500000 0.100 1 30 5 919 183 736 113 1 67 0 2 1 0 734 0 1 0.6175 0.0014 0.0027 1.731 0.42 2.50 -2.08 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3082 0.6918 0.0000 0 0 0.9274 0.0726 0.0000 0 0 0.9747 0.0253 0.0000
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 319 145 174 95 0 0 0 50 0 0 173 0 1 0.6552 0.0000 0.0057 145.000 0.17 3.18 -3.01 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9502 0.0496 0.0002 1 0 0.9445 0.0553 0.0002 1 0 0.9358 0.0639 0.0003
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 514 128 386 25 1 29 7 66 0 0 377 0 9 0.1953 0.0000 0.0233 3.536 2.24 4.89 -2.65 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0126 0.9874 1 2 0.0000 0.0338 0.9662 2 1 0.0000 0.7781 0.2219
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 405 104 301 36 0 5 0 63 0 0 299 0 2 0.3462 0.0000 0.0066 19.800 3.19 3.73 -0.54 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0027 0.1559 0.8414 1 2 0.0033 0.1658 0.8309 1 2 0.0044 0.1798 0.8159
chr8 143859347 CGGGCCT C 0.500000 0.100 1 -6 3 539 33 506 19 2 2 2 8 0 0 506 0 0 0.5758 0.0000 0.0000 15.500 0.00 6.00 -6.00 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5276 0.4128 0.0596 1 0 0.5180 0.4183 0.0637 1 0 0.5038 0.4270 0.0692
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 955 209 746 80 0 26 0 103 0 1 728 0 17 0.3828 0.0000 0.0241 7.320 1.06 12.02 -10.96 24 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.0975 0.9022 1 2 0.0005 0.1044 0.8951 1 2 0.0007 0.1146 0.8847
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.100 1 2 3 942 173 769 114 1 0 3 55 0 0 763 3 3 0.6590 0.0000 0.0078 173.000 0.71 3.65 -2.94 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9823 0.0177 0.0000 1 0 0.9799 0.0201 0.0000 1 0 0.9761 0.0239 0.0000
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.100 1 -2 4 940 173 767 112 4 2 3 52 0 0 760 1 6 0.6474 0.0000 0.0091 85.000 0.71 3.81 -3.09 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9864 0.0136 0.0000 1 0 0.9844 0.0156 0.0000 1 0 0.9812 0.0188 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 988 324 664 129 3 72 12 108 0 0 663 0 1 0.3981 0.0000 0.0015 3.549 0.30 3.13 -2.83 29 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4293 0.5631 0.0076 1 1 0.4413 0.5502 0.0085 1 1 0.4556 0.5346 0.0099
chr9 12775862 T TGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 2 318 78 240 30 0 17 0 31 0 0 240 0 0 0.3846 0.0000 0.0000 3.588 0.63 4.81 -4.17 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1909 0.5729 0.2362 1 1 0.1943 0.5674 0.2383 1 1 0.1985 0.5606 0.2409
chr9 34552176 C CTGGCAG 0.500000 0.100 1 6 1 492 155 337 140 1 9 0 5 0 0 337 0 0 0.9032 0.0000 0.0000 16.222 0.16 4.80 -4.64 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0192 0.9808 0.0000 0 0 0.8474 0.1526 0.0000 0 0 0.9741 0.0259 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 766 191 575 149 1 34 1 6 0 0 573 0 2 0.7801 0.0000 0.0035 4.618 0.33 12.67 -12.34 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1134 0.8866 0.0000 0 0 0.8198 0.1802 0.0000
chr9 35906602 C CCCCCACCGCCACCAT 0.500000 0.100 1 15 1 615 169 446 23 2 50 79 15 0 0 446 0 0 0.1361 0.0000 0.0000 3.000 1.17 10.73 -9.56 17 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0478 0.9522 2 1 0.0000 0.8933 0.1067 2 1 0.0000 0.9990 0.0010
chr9 37441270 CATT C 0.500000 0.100 1 -3 1 623 138 485 69 1 1 0 67 0 0 485 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 137.000 0.17 3.30 -3.12 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2241 0.6521 0.1237 1 1 0.2293 0.6412 0.1295 1 1 0.2355 0.6274 0.1371
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 454 70 384 4 0 0 1 65 0 0 384 0 0 0.0571 0.0000 0.0000 70.000 1.25 1.12 0.13 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9960 0.0040 2 1 0.0000 0.7231 0.2769 2 2 0.0000 0.3461 0.6539
chr9 72059357 TGAAAG T 0.500000 0.100 1 -5 1 186 76 110 42 0 4 0 30 0 0 108 0 2 0.5526 0.0000 0.0182 18.000 0.07 4.90 -4.83 26 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4536 0.4840 0.0625 1 1 0.4490 0.4843 0.0668 1 1 0.4424 0.4848 0.0728
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 423 105 318 0 0 2 0 103 0 0 301 0 17 0.0000 0.0000 0.0535 51.500 14.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 691 134 557 114 0 17 0 3 1 0 554 0 2 0.8507 0.0018 0.0054 6.882 0.11 13.00 -12.89 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 0 0.6035 0.3965 0.0000 0 0 0.9146 0.0854 0.0000
chr9 77384631 G GTGA 0.500000 0.100 1 3 1 440 157 283 24 67 18 0 48 0 2 280 0 1 0.1529 0.0000 0.0106 8.176 0.17 3.12 -2.96 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9513 0.0485 0.0002 1 0 0.9456 0.0541 0.0002 1 0 0.9370 0.0627 0.0003
chr9 77384631 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 441 159 282 71 3 17 6 62 0 0 280 0 2 0.4465 0.0000 0.0071 8.353 2.01 3.15 -1.13 53 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2382 0.6526 0.1091 1 1 0.2434 0.6417 0.1149 1 1 0.2496 0.6278 0.1226
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 495 139 356 129 0 0 0 10 0 0 356 0 0 0.9281 0.0000 0.0000 139.000 0.29 2.80 -2.51 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0147 0.9853 0.0000 0 1 0.4605 0.5395 0.0000
chr9 88130024 A AAGG 0.500000 0.100 1 3 1 1158 287 871 270 1 8 0 8 0 0 870 0 1 0.9408 0.0000 0.0011 34.875 0.30 3.25 -2.95 124 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 0 0.9812 0.0188 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 223 78 145 43 0 4 0 31 0 0 145 0 0 0.5513 0.0000 0.0000 18.500 0.14 4.52 -4.38 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5082 0.4447 0.0471 1 0 0.5017 0.4473 0.0510 1 0 0.4927 0.4508 0.0565
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 310 84 226 10 2 12 2 58 0 0 222 0 4 0.1190 0.0000 0.0177 6.000 0.00 2.91 -2.91 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9898 0.0102
chr9 93259450 TTGCCCCCGCAACCCACACGGCCCCCTCAACCTGTGC T 0.500000 0.100 1 -36 1 467 102 365 0 0 11 2 89 0 0 363 1 1 0.0000 0.0000 0.0055 8.182 7.57 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0096 0.9904 2 2 0.0000 0.0110 0.9890
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 475 182 293 0 0 3 0 179 0 0 293 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 59.667 9.87 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 802 328 474 132 0 2 0 194 0 0 470 0 4 0.4024 0.0000 0.0084 163.000 0.28 3.29 -3.01 26 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0143 0.9857 1 2 0.0000 0.0163 0.9837 1 2 0.0000 0.0194 0.9806
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 370 101 269 0 1 20 3 77 0 0 268 1 0 0.0000 0.0000 0.0037 4.000 5.69 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0700 0.9300 2 2 0.0000 0.0411 0.9589 2 2 0.0000 0.0336 0.9664
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 898 161 737 1 0 44 1 115 0 0 723 3 11 0.0062 0.0000 0.0190 2.659 0.00 5.67 -5.67 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0123 0.9877 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 459 101 358 0 0 1 0 100 0 0 358 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 100.000 2.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0077 0.9923
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 865 217 648 101 0 0 0 116 0 0 648 0 0 0.4654 0.0000 0.0000 217.000 0.89 4.90 -4.01 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0216 0.5550 0.4234 1 1 0.0245 0.5478 0.4277 1 1 0.0288 0.5392 0.4319
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 792 167 625 0 1 2 3 161 0 0 623 0 2 0.0000 0.0000 0.0032 82.000 3.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr9 106925601 ACAGCCACCACAGCTG A 0.500000 0.100 1 -15 2 913 243 670 221 0 19 0 3 0 0 669 0 1 0.9095 0.0000 0.0015 11.789 0.21 10.67 -10.45 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9149 0.0851 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 241 97 144 0 0 3 0 94 0 0 143 0 1 0.0000 0.0000 0.0069 31.333 4.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0078 0.9922 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0099 0.9901
chr9 113169870 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 5 431 108 323 54 0 20 0 34 0 0 323 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 4.400 0.11 3.00 -2.89 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6929 0.2939 0.0131 1 0 0.6824 0.3025 0.0151 1 0 0.6677 0.3142 0.0181
chr9 116154344 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 2 759 175 584 132 0 29 0 14 0 0 582 0 2 0.7543 0.0000 0.0034 5.034 0.55 4.00 -3.45 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0206 0.9794 0.0000
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 491 108 383 45 0 18 0 45 0 0 383 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 5.000 0.44 6.13 -5.69 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1957 0.6086 0.1957 1 1 0.1997 0.6006 0.1997 1 1 0.2048 0.5905 0.2048
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 490 111 379 61 0 13 1 36 0 1 378 0 0 0.5495 0.0000 0.0026 7.538 0.54 1.19 -0.65 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7771 0.2171 0.0058 1 0 0.7662 0.2269 0.0069 1 0 0.7507 0.2406 0.0087
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 527 188 339 69 4 28 79 8 0 0 336 3 0 0.3670 0.0000 0.0088 5.778 0.72 4.00 -3.28 1 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0180 0.4362 0.5458 1 2 0.0204 0.4367 0.5429 1 2 0.0241 0.4379 0.5380
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 2 527 191 336 76 0 31 2 82 0 0 332 1 3 0.3979 0.0000 0.0119 5.097 0.84 6.06 -5.22 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0449 0.5783 0.3769 1 1 0.0491 0.5713 0.3796 1 1 0.0551 0.5627 0.3822
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 510 180 330 82 1 5 1 91 0 0 327 0 3 0.4556 0.0000 0.0091 34.800 0.30 3.37 -3.07 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0354 0.5671 0.3975 1 1 0.0392 0.5604 0.4004 1 1 0.0446 0.5523 0.4031
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 480 146 334 60 0 14 0 72 0 0 331 0 3 0.4110 0.0000 0.0090 9.429 0.20 6.68 -6.48 36 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0265 0.4548 0.5187 1 2 0.0296 0.4551 0.5153 1 2 0.0340 0.4561 0.5099
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 457 134 323 51 4 38 0 41 0 0 320 0 3 0.3806 0.0000 0.0093 2.526 1.55 4.05 -2.50 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4566 0.4930 0.0504 1 1 0.4532 0.4923 0.0545 1 1 0.4482 0.4916 0.0603
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 590 131 459 62 0 3 0 66 0 0 457 0 2 0.4733 0.0000 0.0044 42.667 1.08 2.80 -1.72 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0897 0.6154 0.2949 1 1 0.0950 0.6068 0.2982 1 1 0.1022 0.5959 0.3019
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 304 137 167 66 0 0 0 71 0 0 166 0 1 0.4818 0.0000 0.0060 137.000 0.89 1.31 -0.42 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0878 0.6249 0.2873 1 1 0.0931 0.6157 0.2912 1 1 0.1004 0.6040 0.2956
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 304 137 167 66 0 0 0 71 0 0 166 0 1 0.4818 0.0000 0.0060 137.000 0.89 1.31 -0.42 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0878 0.6249 0.2873 1 1 0.0931 0.6157 0.2912 1 1 0.1004 0.6040 0.2956
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 299 117 182 69 1 5 0 42 0 0 181 0 1 0.5897 0.0000 0.0055 22.200 0.35 1.60 -1.25 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8009 0.1952 0.0039 1 0 0.7905 0.2047 0.0048 1 0 0.7757 0.2182 0.0061
chr9 136383542 C CGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 1 616 179 437 81 2 41 0 55 0 0 430 1 6 0.4525 0.0000 0.0160 3.366 0.65 6.25 -5.60 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6547 0.3349 0.0104 1 0 0.6478 0.3402 0.0120 1 0 0.6375 0.3478 0.0146
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 617 188 429 144 4 29 2 9 0 0 428 0 1 0.7660 0.0000 0.0023 5.483 2.51 3.00 -0.49 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 1 0.3766 0.6234 0.0000
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 520 161 359 117 3 17 4 20 1 0 358 0 0 0.7267 0.0028 0.0028 8.938 1.67 8.70 -7.03 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 206 112 94 3 3 25 1 80 0 0 94 0 0 0.0268 0.0000 0.0000 3.783 0.00 3.06 -3.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9186 0.0814 2 1 0.0000 0.5093 0.4907
chr10 3138992 CTT C 0.000027 0.100 1 -2 1 278 118 160 105 1 1 0 11 0 0 159 0 1 0.8898 0.0000 0.0063 116.000 0.90 2.18 -1.28 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9538 0.0462 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr10 3166375 T TGCACGCTAGGGAAGAGAGAGGAATG 0.004839 0.100 1 25 1 203 74 129 10 0 20 0 44 0 0 117 0 12 0.1351 0.0000 0.0930 2.700 0.00 7.50 -7.50 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 358 99 259 88 0 2 0 9 0 0 259 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 48.500 0.56 1.11 -0.55 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2963 0.7037 0.0000 0 0 0.9430 0.0570 0.0000
chr10 13439173 CAG C 0.004149 0.100 1 -2 3 274 62 212 53 1 5 0 3 0 0 212 0 0 0.8548 0.0000 0.0000 11.400 0.15 2.00 -1.85 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8287 0.1713 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr10 13657133 CCGCCCCCCG C 0.028316 0.100 1 -9 1 768 173 595 73 0 27 0 73 0 0 591 0 4 0.4220 0.0000 0.0067 5.407 0.25 7.90 -7.66 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2349 0.7500 0.0151 1 1 0.2478 0.7368 0.0155 1 1 0.2647 0.7194 0.0159
chr10 18655037 AT A 0.002315 0.100 1 -1 3 83 53 30 46 0 1 0 6 0 0 30 0 0 0.8679 0.0000 0.0000 52.000 0.11 1.17 -1.06 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0082 0.9918 0.0000 0 0 0.8805 0.1195 0.0000 0 0 0.9885 0.0115 0.0000
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 893 203 690 2 0 26 1 174 0 0 676 1 13 0.0099 0.0000 0.0203 6.808 3.50 5.61 -2.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0054 0.9946 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr10 21516554 C CTCT 0.000302 0.100 1 3 2 890 210 680 35 139 7 4 25 0 0 680 0 0 0.1667 0.0000 0.0000 32.833 1.86 2.92 -1.06 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2362 0.7638 0.0000
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 700 150 550 72 0 4 1 73 0 0 549 1 0 0.4800 0.0000 0.0018 36.500 0.47 3.96 -3.49 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1865 0.6956 0.1180 1 1 0.1957 0.6833 0.1210 1 1 0.2078 0.6675 0.1247
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 250 92 158 87 0 2 0 3 0 0 158 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 45.000 0.20 2.00 -1.80 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9008 0.0992 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 509 136 373 77 0 6 0 53 1 0 372 0 0 0.5662 0.0027 0.0027 21.667 0.40 1.17 -0.77 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8028 0.1943 0.0029 1 0 0.7948 0.2017 0.0035 1 0 0.7834 0.2121 0.0044
chr10 30027571 A ACTG 0.007813 0.100 1 3 1 873 175 698 80 3 31 0 61 0 0 694 0 4 0.4571 0.0000 0.0057 4.613 0.26 3.31 -3.05 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7372 0.2627 0.0002 1 0 0.7345 0.2653 0.0002 1 0 0.7304 0.2693 0.0002
chr10 31461077 AGAT A 0.000905 0.100 1 -3 1 170 79 91 69 0 2 0 8 0 0 91 0 0 0.8734 0.0000 0.0000 38.500 0.22 3.12 -2.91 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.8739 0.1261 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr10 44292818 AC A 0.006843 0.100 1 -1 1 413 166 247 11 0 11 0 144 0 0 245 0 2 0.0663 0.0000 0.0081 14.091 0.45 1.32 -0.86 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9928 0.0072
chr10 46309137 T TTTGTGCCACTCCTGCTGC 0.003400 0.100 1 18 4 263 84 179 30 0 12 0 42 0 0 165 0 14 0.3571 0.0000 0.0782 6.000 0.27 13.24 -12.97 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0460 0.9268 0.0272 1 1 0.0523 0.9224 0.0253 1 1 0.0616 0.9155 0.0229
chr10 51697903 CTGTATACCTCCTCCT C 0.001304 0.100 1 -15 5 797 181 616 91 0 39 0 51 0 0 607 0 9 0.5028 0.0000 0.0146 3.641 0.19 12.67 -12.48 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9114 0.0886 0.0000 1 0 0.9062 0.0938 0.0000 1 0 0.8986 0.1014 0.0000
chr10 53807071 A AGTT 0.002532 0.100 1 3 2 357 83 274 45 0 5 0 33 0 0 274 0 0 0.5422 0.0000 0.0000 15.600 0.09 3.03 -2.94 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6908 0.3090 0.0002 1 0 0.6871 0.3127 0.0002 1 0 0.6819 0.3179 0.0002
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.100 1 -3 1 573 155 418 62 0 6 0 87 0 0 416 0 2 0.4000 0.0000 0.0048 24.833 0.29 3.09 -2.80 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0310 0.9471 0.0219 1 1 0.0362 0.9430 0.0208 1 1 0.0442 0.9365 0.0193
chr10 56358652 T TGCCTCA 0.001075 0.100 1 6 1 573 129 444 56 0 18 0 55 0 0 440 0 4 0.4341 0.0000 0.0090 6.167 0.39 5.38 -4.99 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2967 0.7028 0.0006 1 1 0.3081 0.6913 0.0006 1 1 0.3229 0.6765 0.0006
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 151 69 82 64 0 0 0 5 0 0 82 0 0 0.9275 0.0000 0.0000 69.000 1.47 6.20 -4.73 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.3979 0.6021 0.0000 0 0 0.8333 0.1667 0.0000
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.100 1 1 1 201 77 124 39 0 4 0 34 0 0 124 0 0 0.5065 0.0000 0.0000 18.250 0.10 1.15 -1.04 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5315 0.4669 0.0016 1 0 0.5334 0.4649 0.0017 1 0 0.5355 0.4627 0.0018
chr10 73240978 AGCGGAG A 0.006364 0.100 1 -6 3 132 75 57 58 0 1 0 16 0 0 55 0 2 0.7733 0.0000 0.0351 74.000 0.41 14.00 -13.59 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9709 0.0291 0.0000 1 0 0.9081 0.0919 0.0000 0 1 0.2891 0.7109 0.0000
chr10 73240989 ACCAGTCTCT A 0.006454 0.100 1 -9 1 132 73 59 57 0 2 0 14 0 0 54 0 5 0.7808 0.0000 0.0847 35.500 0.44 15.71 -15.28 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9672 0.0328 0.0000 1 0 0.9554 0.0446 0.0000 1 0 0.6813 0.3186 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 357 86 271 28 0 20 2 36 0 0 271 0 0 0.3256 0.0000 0.0000 3.300 0.54 3.75 -3.21 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1472 0.6491 0.2037 1 1 0.1557 0.6448 0.1996 1 1 0.1672 0.6389 0.1939
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 455 195 260 98 2 12 3 80 0 0 259 0 1 0.5026 0.0000 0.0038 15.000 0.19 5.49 -5.29 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6613 0.3385 0.0002 1 0 0.6628 0.3370 0.0003 1 0 0.6639 0.3358 0.0003
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 199 35 164 13 1 4 0 17 0 0 164 0 0 0.3714 0.0000 0.0000 7.500 0.23 1.29 -1.06 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3335 0.5932 0.0733 1 1 0.3388 0.5886 0.0726 1 1 0.3457 0.5826 0.0718
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 657 162 495 84 0 5 0 73 0 0 489 0 6 0.5185 0.0000 0.0121 31.400 0.39 5.71 -5.32 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3393 0.6175 0.0432 1 1 0.3474 0.6066 0.0460 1 1 0.3573 0.5930 0.0497
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 502 178 324 99 0 2 1 76 0 0 321 0 3 0.5562 0.0000 0.0093 88.000 0.23 3.16 -2.93 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7291 0.2706 0.0003 1 0 0.7278 0.2719 0.0003 1 0 0.7253 0.2743 0.0004
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 375 89 286 48 0 8 0 33 1 0 282 0 3 0.5393 0.0035 0.0140 10.125 0.88 6.52 -5.64 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5363 0.4269 0.0368 1 0 0.5301 0.4297 0.0402 1 0 0.5213 0.4337 0.0451
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.100 1 18 1 439 133 306 108 0 20 0 5 0 0 301 0 5 0.8120 0.0000 0.0163 5.650 0.81 15.20 -14.39 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2545 0.7455 0.0000 0 0 0.9526 0.0474 0.0000
chr10 104057110 CGCCACCAACACCGCCACCTCCTCCACT C 0.001817 0.100 1 -27 1 299 113 186 67 1 8 0 37 0 0 178 0 8 0.5929 0.0000 0.0430 13.125 0.36 17.78 -17.43 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8486 0.1514 0.0000 1 0 0.8425 0.1574 0.0000 1 0 0.8340 0.1660 0.0000
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 362 165 197 92 1 4 0 68 0 0 195 0 2 0.5576 0.0000 0.0102 40.250 0.60 2.87 -2.27 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7701 0.2275 0.0024 1 0 0.7649 0.2322 0.0028 1 0 0.7572 0.2393 0.0035
chr10 115171343 CTT C 0.004437 0.100 1 -2 1 234 45 189 28 0 1 0 16 0 0 189 0 0 0.6222 0.0000 0.0000 44.000 0.11 2.38 -2.27 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7247 0.2750 0.0003 1 0 0.7188 0.2809 0.0003 1 0 0.7106 0.2891 0.0004
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 355 68 287 3 0 15 20 30 0 1 284 1 1 0.0441 0.0000 0.0105 2.200 0.33 1.93 -1.60 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.7718 0.2282 2 2 0.0000 0.4581 0.5419
chr10 128107489 T TGCTGGG 0.001110 0.100 1 6 1 1023 231 792 128 0 5 3 95 0 0 778 1 13 0.5541 0.0000 0.0177 45.200 0.47 6.67 -6.20 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6025 0.3975 0.0000 1 0 0.6090 0.3910 0.0000 1 0 0.6163 0.3836 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 415 114 301 62 0 3 0 49 0 0 300 0 1 0.5439 0.0000 0.0033 55.500 0.18 1.33 -1.15 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4772 0.4823 0.0406 1 1 0.4739 0.4818 0.0443 1 1 0.4687 0.4816 0.0497
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 672 150 522 70 0 8 0 72 0 0 519 0 3 0.4667 0.0000 0.0057 17.750 0.16 3.10 -2.94 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1335 0.6790 0.1875 1 1 0.1413 0.6678 0.1909 1 1 0.1517 0.6534 0.1949
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 291 107 184 91 2 3 0 11 0 0 184 0 0 0.8505 0.0000 0.0000 34.333 0.23 2.73 -2.50 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.0902 0.9098 0.0000
chr11 1051657 AC A 0.061644 0.100 1 -1 1 460 166 294 82 1 6 0 77 0 0 293 0 1 0.4940 0.0000 0.0034 26.667 1.20 2.13 -0.93 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4066 0.5834 0.0100 1 1 0.4161 0.5733 0.0106 1 1 0.4278 0.5607 0.0115
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.100 1 -24 1 2954 685 2269 510 6 157 1 11 6 3 2260 0 0 0.7445 0.0026 0.0040 3.363 1.87 15.55 -13.67 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9297 0.0703 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1066 212 854 73 2 78 0 59 0 0 854 0 0 0.3443 0.0000 0.0000 1.705 1.19 8.53 -7.33 15 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5176 0.4556 0.0268 1 0 0.5133 0.4567 0.0300 1 0 0.5066 0.4586 0.0348
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 915 249 666 24 3 74 5 143 0 0 666 0 0 0.0964 0.0000 0.0000 2.384 1.38 9.62 -8.25 12 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr11 2445250 A ACGCGCCCAT 0.000730 0.100 1 9 1 539 154 385 66 0 18 0 70 2 0 369 0 14 0.4286 0.0052 0.0416 7.556 0.82 8.06 -7.24 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0884 0.9101 0.0015 1 1 0.0983 0.9002 0.0015 1 1 0.1126 0.8859 0.0015
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 297 84 213 0 0 0 0 84 0 0 213 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 84.000 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0136 0.9864 2 2 0.0000 0.0148 0.9852 2 2 0.0000 0.0167 0.9833
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 663 222 441 209 1 7 0 5 0 0 441 0 0 0.9414 0.0000 0.0000 30.714 0.21 1.00 -0.79 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4138 0.5862 0.0000 0 0 0.9944 0.0056 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr11 4545229 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 389 105 284 57 0 0 1 47 0 0 284 0 0 0.5429 0.0000 0.0000 104.000 1.02 1.21 -0.20 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3995 0.5361 0.0645 1 1 0.3983 0.5327 0.0690 1 1 0.3962 0.5285 0.0753
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 198 82 116 49 0 1 0 32 0 0 114 0 2 0.5976 0.0000 0.0172 81.000 0.14 2.56 -2.42 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5779 0.3926 0.0295 1 0 0.5698 0.3976 0.0327 1 0 0.5584 0.4043 0.0373
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 634 164 470 152 0 6 0 6 0 0 470 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 26.333 0.15 2.67 -2.52 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 0 0.7699 0.2301 0.0000 0 0 0.9714 0.0286 0.0000
chr11 4860474 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 914 265 649 127 0 6 1 131 0 0 649 0 0 0.4792 0.0000 0.0000 43.167 0.17 1.25 -1.09 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0651 0.7600 0.1749 1 1 0.0715 0.7436 0.1848 1 1 0.0804 0.7221 0.1975
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 800 200 600 91 0 6 0 103 0 0 600 0 0 0.4550 0.0000 0.0000 32.333 0.25 1.28 -1.03 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0347 0.5906 0.3747 1 1 0.0385 0.5823 0.3792 1 1 0.0440 0.5721 0.3839
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 1012 225 787 9 0 10 0 206 0 0 772 0 15 0.0400 0.0000 0.0191 21.500 0.11 5.91 -5.80 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 2 0.0000 0.1892 0.8108 2 2 0.0000 0.0070 0.9930
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 708 163 545 4 0 3 1 155 0 0 545 0 0 0.0245 0.0000 0.0000 53.000 0.25 1.70 -1.45 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7134 0.2866 2 2 0.0000 0.0284 0.9716 2 2 0.0000 0.0067 0.9933
chr11 5200208 TAAAG T 0.500000 0.100 1 -4 2 663 145 518 131 0 9 0 5 0 0 518 0 0 0.9034 0.0000 0.0000 15.111 0.22 5.20 -4.98 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0117 0.9883 0.0000 0 0 0.7719 0.2281 0.0000 0 0 0.9588 0.0412 0.0000
chr11 5343311 CCAGCCCCAGGTCTGTGG C 0.500000 0.100 1 -17 3 548 150 398 139 1 5 0 5 0 0 397 0 1 0.9267 0.0000 0.0025 29.000 2.25 19.80 -17.55 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 0 0.6465 0.3535 0.0000 0 0 0.9499 0.0501 0.0000
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.100 1 4 1 1272 299 973 5 0 20 0 274 0 0 965 1 7 0.0167 0.0000 0.0082 13.950 0.80 4.42 -3.62 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0365 0.9635 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 5454410 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 377 87 290 6 0 2 0 79 0 0 289 0 1 0.0690 0.0000 0.0034 42.500 0.50 1.24 -0.74 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9159 0.0841 2 2 0.0000 0.4919 0.5081
chr11 6390705 TGCTGGCGCTGGCGCTGGC T 0.500000 0.100 1 -18 2 888 292 596 236 4 43 0 9 0 0 596 0 0 0.8082 0.0000 0.0000 5.767 4.50 14.33 -9.84 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.9165 0.0835 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 738 133 605 0 0 17 1 115 0 0 569 0 36 0.0000 0.0000 0.0595 6.765 9.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 270 150 120 0 0 16 2 132 0 0 119 1 0 0.0000 0.0000 0.0083 8.375 3.94 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr11 10580532 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 80 46 34 41 0 3 0 2 0 0 34 0 0 0.8913 0.0000 0.0000 14.333 0.10 3.00 -2.90 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0867 0.9133 0.0000 0 1 0.4796 0.5204 0.0000 0 0 0.6695 0.3305 0.0000
chr11 12213307 CTT C 0.500000 0.100 1 -2 2 180 92 88 87 0 2 0 3 0 0 88 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 45.000 0.21 2.00 -1.79 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0969 0.9031 0.0000 0 0 0.7597 0.2403 0.0000 0 0 0.9086 0.0914 0.0000
chr11 12294797 G GCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 9 1 582 148 434 3 4 42 1 98 0 0 426 1 7 0.0203 0.0000 0.0184 2.524 2.00 8.26 -6.26 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8809 0.1191 2 2 0.0000 0.3235 0.6765
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 12 1 582 148 434 7 0 52 0 89 0 0 426 1 7 0.0473 0.0000 0.0184 1.846 2.71 8.61 -5.89 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9297 0.0703 2 2 0.0000 0.4403 0.5597
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 770 229 541 131 0 11 0 87 0 0 537 0 4 0.5721 0.0000 0.0074 19.818 0.16 3.89 -3.72 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8984 0.1013 0.0003 1 0 0.8917 0.1079 0.0004 1 0 0.8817 0.1177 0.0006
chr11 49208393 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 267 113 154 56 0 2 0 55 0 0 154 0 0 0.4956 0.0000 0.0000 55.500 0.45 2.84 -2.39 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2023 0.6317 0.1660 1 1 0.2069 0.6221 0.1710 1 1 0.2125 0.6100 0.1775
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 1059 240 819 0 0 1 1 238 0 0 814 0 5 0.0000 0.0000 0.0061 238.000 2.58 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 59863993 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 234 94 140 57 0 0 0 37 0 0 140 0 0 0.6064 0.0000 0.0000 94.000 0.04 1.30 -1.26 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6869 0.3001 0.0130 1 0 0.6768 0.3082 0.0150 1 0 0.6626 0.3195 0.0179
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 224 83 141 66 0 13 0 4 0 0 141 0 0 0.7952 0.0000 0.0000 5.385 0.27 4.00 -3.73 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.2764 0.7236 0.0000 0 0 0.6537 0.3463 0.0000
chr11 65557854 C CCAGCAG 0.500000 0.100 1 6 3 314 83 231 37 1 19 0 26 0 0 231 0 0 0.4458 0.0000 0.0000 3.500 0.38 6.35 -5.97 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5189 0.4327 0.0483 1 0 0.5116 0.4362 0.0522 1 0 0.5014 0.4408 0.0578
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 316 117 199 92 3 19 0 3 0 0 199 0 0 0.7863 0.0000 0.0000 5.158 0.51 3.67 -3.16 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1401 0.8599 0.0000 0 0 0.8261 0.1739 0.0000 0 0 0.9365 0.0635 0.0000
chr11 68312746 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 202 87 115 38 2 10 0 37 0 0 111 0 4 0.4368 0.0000 0.0348 7.700 0.39 3.78 -3.39 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1816 0.5968 0.2216 1 1 0.1856 0.5897 0.2247 1 1 0.1908 0.5806 0.2286
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 958 169 789 0 0 33 1 135 0 0 714 0 75 0.0000 0.0000 0.0951 4.121 6.89 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1110 238 872 58 0 123 1 56 1 0 844 1 26 0.2437 0.0011 0.0321 0.935 0.90 9.54 -8.64 16 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0052 0.2516 0.7432 1 2 0.0063 0.2594 0.7343 1 2 0.0079 0.2705 0.7215
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 1094 353 741 267 1 79 0 6 0 1 738 0 2 0.7564 0.0000 0.0040 3.468 0.17 7.00 -6.83 103 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0166 0.9834 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 888 261 627 235 0 1 1 24 0 0 626 1 0 0.9004 0.0000 0.0016 260.000 0.27 2.17 -1.90 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0084 0.9916 0.0000
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 744 155 589 5 0 19 1 130 0 0 588 1 0 0.0323 0.0000 0.0017 7.158 0.60 3.38 -2.78 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9877 0.0123 2 2 0.0000 0.2193 0.7807 2 2 0.0000 0.0393 0.9607
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 316 120 196 59 0 4 0 57 0 0 192 0 4 0.4917 0.0000 0.0204 29.000 0.22 17.09 -16.87 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1454 0.6385 0.2161 1 1 0.1508 0.6285 0.2207 1 1 0.1578 0.6158 0.2264
chr11 96092039 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1017 310 707 28 0 34 4 244 0 0 707 0 0 0.0903 0.0000 0.0000 8.118 0.11 3.20 -3.10 18 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9974 0.0026
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1177 301 876 2 20 59 17 203 0 0 875 0 1 0.0066 0.0000 0.0011 3.860 1.50 10.80 -9.30 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7611 0.2389 2 2 0.0000 0.0299 0.9701 2 2 0.0000 0.0042 0.9958
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 745 239 506 1 1 40 1 196 0 0 501 1 4 0.0042 0.0000 0.0099 4.975 0.00 9.49 -9.49 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr11 118557032 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 183 60 123 26 0 7 0 27 0 0 123 0 0 0.4333 0.0000 0.0000 7.571 0.23 2.96 -2.73 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1967 0.5634 0.2399 1 1 0.1997 0.5587 0.2416 1 1 0.2035 0.5527 0.2438
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 385 128 257 59 2 10 3 54 0 0 257 0 0 0.4609 0.0000 0.0000 11.600 0.22 5.67 -5.45 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2603 0.6220 0.1176 1 1 0.2639 0.6131 0.1230 1 1 0.2681 0.6018 0.1301
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 289 88 201 81 0 1 0 6 0 0 201 0 0 0.9205 0.0000 0.0000 87.000 1.48 1.83 -0.35 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1994 0.8006 0.0000 0 0 0.7349 0.2651 0.0000
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 289 107 182 58 0 0 0 49 0 0 182 0 0 0.5421 0.0000 0.0000 107.000 1.62 1.76 -0.13 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3408 0.5767 0.0825 1 1 0.3397 0.5721 0.0882 1 1 0.3377 0.5662 0.0960
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 525 134 391 47 3 24 0 60 0 0 386 0 5 0.3507 0.0000 0.0128 4.583 0.13 3.00 -2.87 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0334 0.4608 0.5057 1 2 0.0371 0.4627 0.5002 1 2 0.0425 0.4654 0.4922
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 430 138 292 0 0 34 9 95 0 0 291 0 1 0.0000 0.0000 0.0034 3.059 3.32 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0042 0.9958 2 2 0.0000 0.0049 0.9951
chr12 8843328 AAG A 0.001621 0.100 1 -2 1 218 81 137 75 0 2 0 4 0 0 137 0 0 0.9259 0.0000 0.0000 39.500 0.35 2.50 -2.15 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7952 0.2048 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 251 85 166 0 0 4 0 81 0 0 163 0 3 0.0000 0.0000 0.0181 20.250 4.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0134 0.9866 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0165 0.9835
chr12 10723069 G GGGT 0.002430 0.100 1 3 1 301 110 191 90 5 12 0 3 0 0 191 0 0 0.8182 0.0000 0.0000 8.909 0.38 3.67 -3.29 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9856 0.0144 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.100 1 -9 1 661 194 467 74 0 41 0 79 0 0 463 0 4 0.3814 0.0000 0.0086 3.732 0.05 7.96 -7.91 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1491 0.8164 0.0345 1 1 0.1612 0.8041 0.0348 1 1 0.1777 0.7873 0.0350
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 291 152 139 9 0 10 4 129 0 0 139 0 0 0.0592 0.0000 0.0000 14.200 1.22 4.02 -2.79 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8991 0.1009 2 2 0.0000 0.1932 0.8068
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.100 1 -2 1 489 108 381 52 0 1 1 54 0 0 379 0 2 0.4815 0.0000 0.0052 106.000 0.67 2.11 -1.44 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2144 0.6895 0.0962 1 1 0.2240 0.6792 0.0968 1 1 0.2366 0.6659 0.0975
chr12 40487719 AGGACTATCAGCTGGGGTGACAGGGACAACTGGACCATCAGCTGGAATAGCAGGTACAAAT A 0.001206 0.100 1 -60 1 2588 552 2036 270 6 140 5 131 18 20 1942 4 52 0.4891 0.0088 0.0462 2.942 3.67 4.32 -0.65 16 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1489 280 1209 93 2 109 1 75 2 1 1162 1 43 0.3321 0.0017 0.0389 1.560 1.00 5.23 -4.23 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0069 0.3797 0.6133 1 2 0.0082 0.3803 0.6115 1 2 0.0102 0.3820 0.6078
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 987 219 768 102 1 3 0 113 0 0 767 0 1 0.4658 0.0000 0.0013 72.000 1.03 1.24 -0.21 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0703 0.7657 0.1641 1 1 0.0782 0.7539 0.1679 1 1 0.0896 0.7383 0.1721
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 975 212 763 104 2 14 1 91 0 0 762 0 1 0.4906 0.0000 0.0013 14.143 0.80 12.55 -11.75 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4106 0.5622 0.0272 1 1 0.4150 0.5546 0.0304 1 1 0.4196 0.5454 0.0350
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1113 279 834 199 3 64 0 13 0 0 832 0 2 0.7133 0.0000 0.0024 3.328 0.29 14.38 -14.09 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0515 0.9485 0.0000 0 0 0.9587 0.0413 0.0000
chr12 53290469 G GGT 0.000115 0.100 1 2 1 361 83 278 44 0 4 0 35 0 0 277 0 1 0.5301 0.0000 0.0036 19.750 0.09 2.23 -2.14 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5988 0.4012 0.0000 1 0 0.5986 0.4014 0.0000 1 0 0.5978 0.4021 0.0000
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 366 77 289 33 0 1 0 43 0 0 288 0 1 0.4286 0.0000 0.0035 76.000 0.21 1.30 -1.09 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0903 0.5621 0.3477 1 1 0.0967 0.5610 0.3423 1 1 0.1057 0.5595 0.3348
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 349 105 244 100 0 0 0 5 0 0 244 0 0 0.9524 0.0000 0.0000 105.000 0.10 1.00 -0.90 84 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 0 0.5146 0.4854 0.0000 0 0 0.8835 0.1165 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 507 107 400 67 0 0 0 40 0 0 397 0 3 0.6262 0.0000 0.0075 107.000 0.42 3.90 -3.48 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8622 0.1378 0.0000 1 0 0.8560 0.1440 0.0001 1 0 0.8471 0.1528 0.0001
chr12 56423649 T TTCC 0.001008 0.100 1 3 1 565 155 410 74 1 22 0 58 0 0 410 0 0 0.4774 0.0000 0.0000 6.045 0.05 3.59 -3.53 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7368 0.2632 0.0000 1 0 0.7337 0.2662 0.0000 1 0 0.7291 0.2709 0.0000
chr12 57225404 T TGGC 0.004341 0.100 1 3 1 571 152 419 141 0 4 0 7 0 0 419 0 0 0.9276 0.0000 0.0000 37.000 1.71 4.00 -2.29 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0504 0.9496 0.0000 0 0 0.9935 0.0065 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 420 119 301 48 0 0 0 71 0 0 298 0 3 0.4034 0.0000 0.0100 119.000 1.02 3.70 -2.68 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0063 0.2529 0.7408 1 2 0.0076 0.2630 0.7295 1 2 0.0096 0.2770 0.7134
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 136 59 77 33 0 4 0 22 0 0 77 0 0 0.5593 0.0000 0.0000 13.750 0.06 3.23 -3.17 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5594 0.4009 0.0397 1 0 0.5525 0.4048 0.0427 1 0 0.5432 0.4099 0.0469
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1086 302 784 0 0 23 3 276 0 0 779 0 5 0.0000 0.0000 0.0064 12.130 3.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 464 137 327 48 3 31 0 55 0 0 327 0 0 0.3504 0.0000 0.0000 3.419 0.67 4.05 -3.39 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1219 0.6090 0.2691 1 1 0.1270 0.6010 0.2720 1 1 0.1339 0.5908 0.2753
chr12 102958393 C CGCAGCAGCA 0.500000 0.100 1 9 1 464 137 327 57 40 33 0 7 0 0 327 0 0 0.4161 0.0000 0.0000 3.250 1.35 7.57 -6.22 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0643 0.9357 0.0000 0 0 0.5373 0.4627 0.0000
chr12 106247620 TGCCGCCGCC T 0.500000 0.100 1 -9 2 466 80 386 34 1 5 1 39 1 1 381 1 2 0.4250 0.0026 0.0130 15.000 3.41 9.36 -5.95 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1055 0.5573 0.3372 1 1 0.1102 0.5529 0.3369 1 1 0.1166 0.5473 0.3361
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 454 123 331 0 0 8 1 114 0 0 329 0 2 0.0000 0.0000 0.0060 14.375 4.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 1686 379 1307 169 5 82 7 116 2 0 1276 0 29 0.4459 0.0015 0.0237 3.537 0.86 5.03 -4.17 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5267 0.4690 0.0043 1 0 0.5331 0.4617 0.0052 1 0 0.5395 0.4537 0.0068
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.100 1 -30 1 1650 568 1082 459 3 95 1 10 3 13 1059 0 7 0.8081 0.0028 0.0213 5.011 1.07 16.60 -15.53 129 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9937 0.0063 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 110582934 TCGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 324 132 192 61 2 13 1 55 0 0 192 0 0 0.4621 0.0000 0.0000 9.833 0.48 3.64 -3.16 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3263 0.5902 0.0835 1 1 0.3282 0.5832 0.0885 1 1 0.3301 0.5745 0.0954
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 587 161 426 150 0 7 0 4 0 0 425 0 1 0.9317 0.0000 0.0023 22.000 0.17 9.00 -8.83 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0302 0.9698 0.0000 0 0 0.8974 0.1026 0.0000 0 0 0.9832 0.0168 0.0000
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 747 218 529 7 71 47 8 85 0 0 527 0 2 0.0321 0.0000 0.0038 3.596 2.86 4.35 -1.50 3 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0134 0.4047 0.5819 1 2 0.0154 0.4063 0.5783 1 2 0.0185 0.4091 0.5724
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 184 105 79 0 0 0 0 105 0 0 79 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 105.000 2.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0047 0.9953 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0061 0.9939
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 212 83 129 45 1 13 0 24 0 0 129 0 0 0.5422 0.0000 0.0000 5.385 0.80 5.92 -5.12 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7549 0.2358 0.0093 1 0 0.7430 0.2462 0.0108 1 0 0.7263 0.2605 0.0132
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 461 101 360 35 22 11 7 26 0 0 359 0 1 0.3465 0.0000 0.0028 7.182 1.11 4.31 -3.19 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7406 0.2503 0.0091 1 0 0.7294 0.2599 0.0107 1 0 0.7136 0.2733 0.0131
chr12 121420274 AGAT A 0.500000 0.100 1 -3 2 185 52 133 49 0 1 0 2 0 0 133 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 51.000 0.20 3.00 -2.80 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1249 0.8751 0.0000 0 0 0.5788 0.4212 0.0000 0 0 0.7492 0.2508 0.0000
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 369 112 257 0 0 5 1 106 0 0 253 0 4 0.0000 0.0000 0.0156 21.400 5.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0046 0.9954
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 307 63 244 5 0 4 0 54 0 0 231 0 13 0.0794 0.0000 0.0533 14.750 0.20 12.65 -12.45 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8784 0.1216 2 2 0.0000 0.4895 0.5105
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 603 174 429 150 2 14 1 7 0 0 429 0 0 0.8621 0.0000 0.0000 11.286 1.09 2.00 -0.91 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.4620 0.5380 0.0000 0 0 0.9323 0.0677 0.0000
chr12 122995576 TGCCACCACC T 0.500000 0.100 1 -9 1 394 160 234 138 1 10 0 11 0 0 233 0 1 0.8625 0.0000 0.0043 14.900 0.34 9.00 -8.66 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.2732 0.7268 0.0000
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 661 178 483 10 0 25 0 143 0 0 459 0 24 0.0562 0.0000 0.0497 6.120 0.20 7.78 -7.58 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9094 0.0906 2 2 0.0000 0.1564 0.8436
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 241 114 127 43 0 30 0 41 0 0 125 1 1 0.3772 0.0000 0.0157 2.800 0.33 3.46 -3.14 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1982 0.6039 0.1979 1 1 0.2021 0.5962 0.2017 1 1 0.2069 0.5865 0.2066
chr12 124402512 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 3 241 114 127 43 1 64 1 5 0 0 125 1 1 0.3772 0.0000 0.0157 0.774 0.33 5.00 -4.67 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 1 0.1028 0.8972 0.0000
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 202 62 140 33 1 5 1 22 0 0 137 0 3 0.5323 0.0000 0.0214 11.000 1.42 3.64 -2.21 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4141 0.5012 0.0848 1 1 0.4101 0.5006 0.0893 1 1 0.4045 0.5001 0.0955
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 237 73 164 0 0 3 0 70 0 0 153 0 11 0.0000 0.0000 0.0671 23.333 8.59 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0158 0.9842 2 2 0.0000 0.0172 0.9828 2 2 0.0000 0.0193 0.9807
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 705 170 535 9 12 66 6 77 0 0 530 0 5 0.0529 0.0000 0.0093 1.625 0.67 3.81 -3.14 7 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9974 0.0026
chr12 132621877 ATCTCTGCCCCT A 0.500000 0.100 1 -11 4 542 150 392 142 0 5 0 3 0 0 392 0 0 0.9467 0.0000 0.0000 29.000 0.39 4.67 -4.27 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6388 0.3612 0.0000 0 0 0.9801 0.0199 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 775 201 574 0 0 35 2 164 0 0 563 0 11 0.0000 0.0000 0.0192 4.743 6.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr13 27924562 T TGCC 0.002235 0.100 1 3 1 560 131 429 64 0 18 0 49 0 0 424 0 5 0.4885 0.0000 0.0117 6.278 0.23 3.10 -2.87 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6011 0.3988 0.0002 1 0 0.6024 0.3974 0.0002 1 0 0.6035 0.3963 0.0002
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 190 67 123 59 0 2 0 6 0 0 122 0 1 0.8806 0.0000 0.0081 32.500 0.44 5.17 -4.73 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2116 0.7884 0.0000 0 0 0.8265 0.1735 0.0000
chr13 45465068 A AGGC 0.000221 0.100 1 3 1 316 123 193 76 1 2 2 42 0 0 190 0 3 0.6179 0.0000 0.0155 60.000 0.13 2.95 -2.82 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9177 0.0823 0.0000 1 0 0.9122 0.0878 0.0000 1 0 0.9042 0.0958 0.0000
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 564 177 387 102 0 3 0 72 0 0 386 0 1 0.5763 0.0000 0.0026 58.000 0.40 13.74 -13.33 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7972 0.2005 0.0023 1 0 0.7893 0.2079 0.0028 1 0 0.7777 0.2186 0.0037
chr13 71866526 TGCC T 0.001361 0.100 1 -3 1 655 164 491 62 2 39 1 60 0 0 491 0 0 0.3780 0.0000 0.0000 3.205 1.05 3.67 -2.62 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4102 0.5895 0.0003 1 1 0.4191 0.5806 0.0004 1 1 0.4302 0.5694 0.0004
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 136 64 72 58 0 1 0 5 0 0 72 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 63.000 0.40 4.00 -3.60 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0124 0.9876 0.0000 0 0 0.7951 0.2049 0.0000 0 0 0.9673 0.0327 0.0000
chr13 77698098 T TGCC 0.001998 0.100 1 3 1 488 150 338 69 2 22 1 56 0 1 337 0 0 0.4600 0.0000 0.0030 5.773 2.84 6.38 -3.53 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7003 0.2996 0.0001 1 0 0.6983 0.3016 0.0001 1 0 0.6950 0.3049 0.0001
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 694 92 602 0 0 8 0 84 0 1 593 0 8 0.0000 0.0000 0.0150 10.500 4.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0028 0.9972
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 457 92 365 38 9 42 0 3 0 4 360 0 1 0.4130 0.0000 0.0137 1.190 3.39 6.00 -2.61 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.1389 0.8611 0.0000 0 1 0.4507 0.5493 0.0000
chr13 99970578 GGGCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 533 113 420 90 7 10 0 6 1 0 418 1 0 0.7965 0.0024 0.0048 10.000 1.69 6.17 -4.48 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1523 0.8477 0.0000 0 0 0.6686 0.3314 0.0000
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 634 135 499 61 0 18 1 55 0 0 492 1 6 0.4519 0.0000 0.0140 6.500 1.08 7.27 -6.19 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1442 0.6432 0.2127 1 1 0.1497 0.6329 0.2175 1 1 0.1568 0.6197 0.2234
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 277 87 190 31 0 7 0 49 0 0 190 0 0 0.3563 0.0000 0.0000 11.429 1.00 5.43 -4.43 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0185 0.3260 0.6556 1 2 0.0209 0.3338 0.6454 1 2 0.0245 0.3443 0.6312
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -15 1 258 81 177 14 1 6 0 60 0 0 174 1 2 0.1728 0.0000 0.0169 12.333 1.29 11.18 -9.90 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9754 0.0246 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.9977 0.0023
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 258 83 175 5 0 21 1 56 0 0 172 0 3 0.0602 0.0000 0.0171 2.952 2.20 11.68 -9.48 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9095 0.0905 2 1 0.0000 0.5701 0.4299
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.100 1 4 1 408 101 307 5 1 5 0 90 0 0 307 0 0 0.0495 0.0000 0.0000 19.000 0.80 4.26 -3.46 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.7506 0.2494 2 2 0.0000 0.2828 0.7172
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 549 104 445 0 0 4 1 99 0 0 441 0 4 0.0000 0.0000 0.0090 25.000 3.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 1195 283 912 176 0 9 0 98 0 0 912 0 0 0.6219 0.0000 0.0000 30.444 0.93 1.83 -0.89 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9937 0.0063 0.0000 1 0 0.9924 0.0076 0.0000 1 0 0.9901 0.0099 0.0000
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 780 224 556 99 0 20 0 105 0 0 556 0 0 0.4420 0.0000 0.0000 10.200 0.31 1.15 -0.84 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0787 0.7077 0.2136 1 1 0.0851 0.6940 0.2209 1 1 0.0941 0.6763 0.2296
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 497 158 339 155 0 2 0 1 0 0 337 0 2 0.9810 0.0000 0.0059 78.000 0.64 22.00 -21.36 11 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8214 0.1786 0.0000 0 0 0.9922 0.0078 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr14 20197747 C CA 0.001620 0.100 1 1 2 371 88 283 50 0 2 0 36 0 0 283 0 0 0.5682 0.0000 0.0000 43.000 1.22 1.97 -0.75 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7239 0.2760 0.0001 1 0 0.7195 0.2804 0.0001 1 0 0.7133 0.2866 0.0001
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 387 85 302 46 2 5 0 32 0 0 300 0 2 0.5412 0.0000 0.0066 16.000 0.30 1.06 -0.76 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4178 0.5211 0.0611 1 1 0.4100 0.5233 0.0667 1 1 0.3991 0.5261 0.0748
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.100 1 3 3 510 130 380 60 0 16 0 54 0 0 377 0 3 0.4615 0.0000 0.0079 7.125 0.23 3.07 -2.84 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3306 0.6005 0.0689 1 1 0.3364 0.5918 0.0717 1 1 0.3435 0.5810 0.0755
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 449 111 338 0 0 15 0 96 0 0 338 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.400 5.70 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0190 0.9810 2 2 0.0000 0.0210 0.9790 2 2 0.0000 0.0240 0.9760
chr14 23079574 A AGAACGTGAACGT 0.001238 0.100 1 12 1 449 111 338 0 0 96 1 14 0 0 338 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.149 4.07 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.9924 0.0076 2 1 0.0000 0.9929 0.0071
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 536 157 379 83 0 12 1 61 0 0 379 0 0 0.5287 0.0000 0.0000 12.083 0.63 3.74 -3.11 23 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.7864 0.2128 0.0008 1 0 0.7817 0.2173 0.0009 1 0 0.7750 0.2238 0.0012
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 298 47 251 3 0 4 4 36 0 0 250 0 1 0.0638 0.0000 0.0040 10.500 1.67 3.36 -1.69 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9939 0.0061 2 1 0.0000 0.8405 0.1595 2 1 0.0000 0.6111 0.3889
chr14 24001481 T TA 0.049020 0.100 1 1 2 283 88 195 58 0 2 0 28 0 0 195 0 0 0.6591 0.0000 0.0000 43.000 0.14 1.14 -1.00 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9241 0.0757 0.0001 1 0 0.9181 0.0818 0.0002 1 0 0.9093 0.0905 0.0002
chr14 24208137 TACG T 0.003500 0.100 1 -3 2 342 88 254 49 0 2 0 37 0 0 254 0 0 0.5568 0.0000 0.0000 43.000 0.45 3.08 -2.63 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6821 0.3177 0.0002 1 0 0.6790 0.3207 0.0002 1 0 0.6745 0.3252 0.0003
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 265 60 205 2 0 1 0 57 0 0 204 0 1 0.0333 0.0000 0.0049 59.000 0.00 1.21 -1.21 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9802 0.0198 2 1 0.0000 0.8412 0.1588 2 1 0.0000 0.7123 0.2877
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 393 99 294 7 0 19 0 73 0 0 290 0 4 0.0707 0.0000 0.0136 4.211 0.00 3.47 -3.47 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9899 0.0101 2 1 0.0000 0.8501 0.1499
chr14 24507398 AT A 0.000090 0.100 1 -1 2 188 77 111 43 1 0 0 33 0 0 110 0 1 0.5584 0.0000 0.0090 77.000 0.28 1.03 -0.75 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6450 0.3550 0.0000 1 0 0.6429 0.3571 0.0000 1 0 0.6398 0.3602 0.0000
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.100 1 24 1 307 63 244 12 0 36 0 15 0 0 239 0 5 0.1905 0.0000 0.0205 0.750 0.42 8.87 -8.45 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1894 0.6008 0.2099 1 1 0.1968 0.5982 0.2051 1 1 0.2067 0.5946 0.1987
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 703 139 564 3 0 22 1 113 0 0 553 0 11 0.0216 0.0000 0.0195 5.318 0.33 6.88 -6.55 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2183 0.7817 2 2 0.0000 0.0098 0.9902 2 2 0.0000 0.0033 0.9967
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 674 162 512 52 1 24 2 83 1 1 508 0 2 0.3210 0.0020 0.0078 5.708 0.75 6.37 -5.62 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0003 0.0903 0.9094 1 2 0.0004 0.0963 0.9033 1 2 0.0006 0.1051 0.8943
chr14 77027304 AGCG A 0.024120 0.100 1 -3 1 483 132 351 53 4 24 6 45 1 0 350 0 0 0.4015 0.0028 0.0028 5.143 1.89 4.09 -2.20 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5485 0.4485 0.0030 1 0 0.5511 0.4457 0.0032 1 0 0.5540 0.4426 0.0034
chr14 77027418 TTGC T 0.008855 0.100 1 -3 1 521 126 395 4 12 28 29 53 0 0 392 3 0 0.0317 0.0000 0.0076 3.296 0.50 4.26 -3.76 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9961 0.0039
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 522 128 394 7 1 69 8 43 0 0 391 0 3 0.0547 0.0000 0.0076 0.877 0.57 5.56 -4.99 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 0.9594 0.0406
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 487 160 327 0 0 18 1 141 0 1 326 0 0 0.0000 0.0000 0.0031 7.889 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr14 94469278 AC A 0.002528 0.100 1 -1 1 456 117 339 64 1 1 0 51 0 0 338 0 1 0.5470 0.0000 0.0029 116.000 0.36 1.10 -0.74 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6708 0.3291 0.0001 1 0 0.6693 0.3305 0.0001 1 0 0.6669 0.3329 0.0002
chr14 98717267 AG A 0.000615 0.100 1 -1 1 219 61 158 57 0 1 0 3 0 0 158 0 0 0.9344 0.0000 0.0000 60.000 0.11 1.00 -0.89 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9745 0.0255 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr14 102930656 C CGCCGGG 0.008312 0.100 1 6 2 516 108 408 55 0 10 0 43 0 0 407 0 1 0.5093 0.0000 0.0025 9.800 1.02 5.47 -4.45 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6444 0.3549 0.0006 1 0 0.6432 0.3562 0.0007 1 0 0.6410 0.3583 0.0007
chr14 103127080 T TGGC 0.001756 0.100 1 3 1 418 153 265 64 3 21 1 64 0 0 263 0 2 0.4183 0.0000 0.0075 6.600 0.91 3.72 -2.81 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3499 0.6496 0.0006 1 1 0.3609 0.6385 0.0006 1 1 0.3750 0.6244 0.0006
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 231 68 163 0 0 7 0 61 0 0 156 0 7 0.0000 0.0000 0.0429 8.714 8.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0389 0.9611 2 2 0.0000 0.0416 0.9584 2 2 0.0000 0.0456 0.9544
chr14 105399471 G GA 0.001351 0.100 1 1 3 164 61 103 58 0 0 0 3 0 0 103 0 0 0.9508 0.0000 0.0000 61.000 0.19 1.00 -0.81 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9488 0.0512 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 412 115 297 54 1 19 1 40 0 0 297 0 0 0.4696 0.0000 0.0000 5.053 0.52 3.52 -3.01 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6260 0.3582 0.0158 1 0 0.6212 0.3614 0.0174 1 0 0.6144 0.3659 0.0197
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 316 87 229 45 2 4 1 35 0 0 228 0 1 0.5172 0.0000 0.0044 20.500 1.80 4.77 -2.97 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5611 0.4156 0.0233 1 0 0.5587 0.4163 0.0250 1 0 0.5550 0.4176 0.0273
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 583 91 492 0 0 2 1 88 0 5 429 43 15 0.0000 0.0000 0.1280 44.000 4.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 1729 477 1252 0 0 11 3 463 0 0 1231 6 15 0.0000 0.0000 0.0168 42.273 3.93 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441523 TCCGCATCTTCTCCTCCTGCTC T 0.005169 0.100 1 -21 1 1054 275 779 151 0 26 2 96 3 1 752 2 21 0.5491 0.0039 0.0347 9.920 2.28 15.56 -13.28 89 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8778 0.1222 0.0000 1 0 0.8750 0.1250 0.0000 1 0 0.8704 0.1296 0.0000
chr15 31229302 C CG 0.001240 0.100 1 1 2 236 92 144 24 55 7 0 6 0 0 144 0 0 0.2609 0.0000 0.0000 4.857 2.00 3.50 -1.50 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0660 0.9340 0.0000 0 0 0.9819 0.0181 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 236 92 144 23 7 6 8 48 0 0 144 0 0 0.2500 0.0000 0.0000 13.167 1.22 1.52 -0.30 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0101 0.2746 0.7152 1 2 0.0121 0.2877 0.7003 1 2 0.0151 0.3055 0.6794
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 686 156 530 0 0 22 3 131 0 0 527 1 2 0.0000 0.0000 0.0057 6.091 3.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr15 38484605 AGGTGGTGGT A 0.136711 0.100 1 -9 2 414 164 250 90 1 37 0 36 0 1 247 1 1 0.5488 0.0000 0.0120 3.432 0.50 7.94 -7.44 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9898 0.0102 0.0000 1 0 0.9881 0.0119 0.0000 1 0 0.9853 0.0147 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 454 183 271 7 0 5 0 171 0 0 270 0 1 0.0383 0.0000 0.0037 35.600 1.43 2.12 -0.69 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 2 0.0000 0.3916 0.6084 2 2 0.0000 0.0409 0.9591
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 427 131 296 78 0 7 0 46 0 0 294 0 2 0.5954 0.0000 0.0068 17.714 0.23 5.39 -5.16 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8701 0.1286 0.0013 1 0 0.8620 0.1365 0.0016 1 0 0.8502 0.1476 0.0021
chr15 42690384 GGCA G 0.000425 0.100 1 -3 2 781 198 583 100 0 7 0 91 0 0 577 0 6 0.5051 0.0000 0.0103 27.286 0.12 3.11 -2.99 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3382 0.6617 0.0001 1 1 0.3522 0.6477 0.0001 1 1 0.3699 0.6300 0.0001
chr15 43366217 CCCT C 0.002275 0.100 1 -3 1 456 125 331 60 0 1 0 64 0 0 327 0 4 0.4800 0.0000 0.0121 124.000 0.17 2.95 -2.79 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1938 0.8041 0.0022 1 1 0.2063 0.7916 0.0022 1 1 0.2231 0.7747 0.0022
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.100 1 4 1 202 78 124 73 0 3 0 2 0 0 124 0 0 0.9359 0.0000 0.0000 25.000 0.21 4.00 -3.79 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8112 0.1888 0.0000 0 0 0.9758 0.0242 0.0000 0 0 0.9884 0.0116 0.0000
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 262 128 134 65 1 1 0 61 0 0 131 0 3 0.5078 0.0000 0.0224 127.000 0.31 3.21 -2.91 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1742 0.6578 0.1680 1 1 0.1784 0.6469 0.1747 1 1 0.1836 0.6329 0.1835
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 472 111 361 5 0 5 6 95 0 0 359 0 2 0.0450 0.0000 0.0055 21.200 0.40 3.91 -3.51 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9959 0.0041 2 2 0.0000 0.4547 0.5453 2 2 0.0000 0.1044 0.8956
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 665 122 543 67 0 3 1 51 0 0 539 1 3 0.5492 0.0000 0.0074 39.667 2.55 5.51 -2.96 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6144 0.3842 0.0014 1 0 0.6151 0.3834 0.0015 1 0 0.6154 0.3829 0.0017
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 437 93 344 56 0 12 0 25 0 0 342 0 2 0.6022 0.0000 0.0058 6.750 0.11 13.12 -13.01 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9048 0.0945 0.0007 1 0 0.8975 0.1016 0.0008 1 0 0.8870 0.1119 0.0011
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 356 131 225 125 0 1 0 5 0 0 224 0 1 0.9542 0.0000 0.0044 130.000 0.38 3.00 -2.62 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 0 0.6860 0.3140 0.0000 0 0 0.9586 0.0414 0.0000
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 1107 305 802 124 13 65 4 99 0 0 801 0 1 0.4066 0.0000 0.0012 3.677 0.40 2.93 -2.53 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8827 0.1171 0.0001 1 0 0.8786 0.1212 0.0002 1 0 0.8725 0.1273 0.0002
chr15 89333596 T TTGCTGC 0.028553 0.100 1 6 1 1107 305 802 138 0 149 6 12 0 0 801 1 0 0.4525 0.0000 0.0012 1.027 0.75 2.75 -2.00 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0117 0.9883 0.0000 0 0 0.7031 0.2969 0.0000
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 835 206 629 25 4 101 9 67 0 0 618 0 11 0.1214 0.0000 0.0175 1.661 1.56 13.64 -12.08 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.1075 0.8925 2 1 0.0000 0.9750 0.0250 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 828 190 638 17 4 21 4 144 0 0 637 0 1 0.0895 0.0000 0.0016 8.737 1.18 10.93 -9.75 7 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9917 0.0083
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 355 111 244 0 0 6 0 105 0 0 237 1 6 0.0000 0.0000 0.0287 17.500 6.64 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968530 CT C 0.000805 0.100 1 -1 1 305 103 202 53 0 1 1 48 0 0 202 0 0 0.5146 0.0000 0.0000 102.000 0.40 1.12 -0.73 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4739 0.5259 0.0002 1 1 0.4795 0.5203 0.0002 1 1 0.4863 0.5135 0.0002
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 59 27 32 22 0 0 0 5 0 0 32 0 0 0.8148 0.0000 0.0000 27.000 0.32 1.20 -0.88 10 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.1806 0.8179 0.0015 0 1 0.1276 0.8717 0.0007 0 1 0.3476 0.6522 0.0003
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 328 99 229 51 0 1 0 47 0 0 226 0 3 0.5152 0.0000 0.0131 98.000 1.14 3.17 -2.03 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2821 0.6117 0.1062 1 1 0.2877 0.6032 0.1092 1 1 0.2947 0.5924 0.1130
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 279 82 197 0 0 0 0 82 0 0 189 0 8 0.0000 0.0000 0.0406 82.000 14.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0939 0.9061 2 2 0.0000 0.1021 0.8979 2 2 0.0000 0.1144 0.8856
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 904 204 700 0 0 4 2 198 0 0 699 0 1 0.0000 0.0000 0.0014 49.750 1.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 452 91 361 0 0 2 0 89 0 0 360 0 1 0.0000 0.0000 0.0028 44.500 6.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 452 91 361 0 0 2 0 89 0 0 360 0 1 0.0000 0.0000 0.0028 44.500 6.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.100 1 -3 2 231 85 146 49 0 4 0 32 0 0 145 0 1 0.5765 0.0000 0.0068 20.250 0.55 3.31 -2.76 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7581 0.2407 0.0012 1 0 0.7523 0.2463 0.0013 1 0 0.7442 0.2542 0.0015
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 409 93 316 58 0 5 0 30 0 0 315 0 1 0.6237 0.0000 0.0032 17.600 0.36 3.00 -2.64 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7797 0.2145 0.0058 1 0 0.7667 0.2263 0.0071 1 0 0.7482 0.2427 0.0091
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 1536 379 1157 152 1 116 1 109 0 0 1136 1 20 0.4011 0.0000 0.0182 2.267 1.22 4.95 -3.73 86 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6669 0.3323 0.0007 1 0 0.6716 0.3275 0.0009 1 0 0.6762 0.3226 0.0011
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 173 50 123 0 0 3 0 47 0 0 122 0 1 0.0000 0.0000 0.0081 15.667 2.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr16 21141362 GCTT G 0.000250 0.100 1 -3 1 211 85 126 48 0 4 0 33 0 0 126 0 0 0.5647 0.0000 0.0000 20.250 0.25 2.85 -2.60 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7482 0.2518 0.0000 1 0 0.7430 0.2570 0.0000 1 0 0.7357 0.2643 0.0000
chr16 28593494 G GT 0.000605 0.100 1 1 3 504 131 373 73 0 1 2 55 0 0 373 0 0 0.5573 0.0000 0.0000 129.000 0.38 1.36 -0.98 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7251 0.2749 0.0000 1 0 0.7223 0.2777 0.0000 1 0 0.7180 0.2820 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 146 68 78 64 0 0 0 4 0 0 78 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 68.000 0.33 2.00 -1.67 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 1 0.2613 0.7387 0.0000 0 0 0.6332 0.3668 0.0000
chr16 51141732 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 992 236 756 107 5 32 5 87 1 0 751 0 4 0.4534 0.0013 0.0066 6.188 0.76 3.09 -2.33 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4702 0.5112 0.0186 1 1 0.4723 0.5065 0.0212 1 1 0.4737 0.5012 0.0250
chr16 67195890 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 479 196 283 88 0 48 1 59 0 0 278 0 5 0.4490 0.0000 0.0177 3.062 0.82 5.66 -4.84 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6935 0.2993 0.0072 1 0 0.6860 0.3055 0.0085 1 0 0.6750 0.3144 0.0106
chr16 67195890 A ACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 9 2 479 196 283 88 8 43 4 53 0 1 277 0 5 0.4490 0.0000 0.0212 3.465 0.82 5.53 -4.71 18 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8702 0.1288 0.0010 1 0 0.8616 0.1371 0.0013 1 0 0.8491 0.1491 0.0018
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1125 324 801 7 0 56 12 249 0 0 795 0 6 0.0216 0.0000 0.0075 4.786 0.43 3.37 -2.94 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8744 0.1256 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr16 69330122 AGGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 599 181 418 171 2 3 0 5 0 0 418 0 0 0.9448 0.0000 0.0000 59.333 0.42 4.00 -3.58 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0915 0.9085 0.0000 0 0 0.9650 0.0350 0.0000 0 0 0.9944 0.0056 0.0000
chr16 70973408 TG T 0.500000 0.100 1 -1 3 138 32 106 29 0 0 0 3 0 0 106 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 32.000 0.24 1.00 -0.76 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 1 0.1495 0.8505 0.0000 0 1 0.3738 0.6262 0.0000
chr16 71947527 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 1 154 89 65 85 0 0 0 4 0 0 65 0 0 0.9551 0.0000 0.0000 89.000 0.47 2.00 -1.53 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0104 0.9896 0.0000 0 1 0.4969 0.5031 0.0000 0 0 0.8260 0.1740 0.0000
chr16 71999722 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 272 72 200 36 1 1 0 34 0 0 200 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 71.000 0.33 1.09 -0.75 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2735 0.5756 0.1510 1 1 0.2748 0.5699 0.1552 1 1 0.2763 0.5628 0.1609
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 325 96 229 88 1 3 0 4 0 0 226 0 3 0.9167 0.0000 0.0131 31.000 0.19 11.75 -11.56 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0471 0.9529 0.0000 0 1 0.4565 0.5435 0.0000
chr16 81160723 GCTGCT G 0.500000 0.100 1 -5 1 246 101 145 57 0 2 0 42 0 0 143 0 2 0.5644 0.0000 0.0138 49.500 1.39 5.90 -4.52 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5048 0.4568 0.0384 1 0 0.5000 0.4580 0.0420 1 0 0.4929 0.4599 0.0472
chr16 85656376 GGAGCGC G 0.500000 0.100 1 -6 3 488 108 380 74 2 28 0 4 1 0 379 0 0 0.6852 0.0026 0.0026 2.821 1.88 6.25 -4.37 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 1 0.3953 0.6047 0.0000 0 0 0.7608 0.2392 0.0000
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 403 115 288 35 6 30 1 43 0 0 287 0 1 0.3043 0.0000 0.0035 2.833 0.09 3.63 -3.54 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1291 0.5853 0.2856 1 1 0.1339 0.5790 0.2872 1 1 0.1402 0.5709 0.2889
chr16 87604287 C CCTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 403 115 288 77 1 30 2 5 0 0 287 1 0 0.6696 0.0000 0.0035 2.767 1.81 11.20 -9.39 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1314 0.8686 0.0000 0 0 0.5422 0.4578 0.0000
chr16 88528131 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 321 117 204 110 0 4 0 3 0 0 204 0 0 0.9402 0.0000 0.0000 28.250 0.55 3.00 -2.45 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2572 0.7428 0.0000 0 0 0.9089 0.0911 0.0000 0 0 0.9681 0.0319 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 683 149 534 0 0 6 5 138 0 0 524 2 8 0.0000 0.0000 0.0187 28.400 8.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 678 141 537 0 0 8 10 123 0 0 526 3 8 0.0000 0.0000 0.0205 16.625 8.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 682 140 542 0 0 6 1 133 0 1 524 7 10 0.0000 0.0000 0.0332 22.333 8.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 796 175 621 0 0 11 2 162 0 0 620 0 1 0.0000 0.0000 0.0016 14.909 6.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr16 88715208 A ACTGT 0.500000 0.100 1 4 3 738 178 560 164 0 8 0 6 0 0 560 0 0 0.9213 0.0000 0.0000 21.250 0.37 4.67 -4.30 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 0 0.8585 0.1415 0.0000 0 0 0.9838 0.0162 0.0000
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.100 1 6 2 661 165 496 87 0 16 0 62 0 0 492 0 4 0.5273 0.0000 0.0081 9.312 0.61 5.66 -5.05 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6477 0.3422 0.0101 1 0 0.6413 0.3470 0.0117 1 0 0.6319 0.3539 0.0143
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 154 75 79 67 0 3 0 5 0 0 79 0 0 0.8933 0.0000 0.0000 24.000 0.48 3.40 -2.92 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1217 0.8783 0.0000 0 0 0.5106 0.4894 0.0000
chr17 3433106 CCTTGCAGATA C 0.003246 0.100 1 -10 2 839 167 672 100 0 11 0 56 0 0 667 0 5 0.5988 0.0000 0.0074 14.182 0.21 10.30 -10.09 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9558 0.0442 0.0000 1 0 0.9518 0.0482 0.0000 1 0 0.9459 0.0541 0.0000
chr17 4933907 ACCACCCCAGAGCCCAC A 0.138018 0.100 1 -16 1 1247 251 996 200 24 12 9 6 0 1 995 0 0 0.7968 0.0000 0.0010 25.667 6.80 2.17 4.63 12 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7167 0.2833 0.0000 0 0 0.9938 0.0062 0.0000
chr17 5141483 AATAG A 0.000611 0.100 1 -4 4 302 134 168 119 1 3 0 11 0 0 167 0 1 0.8881 0.0000 0.0060 43.667 0.33 4.27 -3.94 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6494 0.3506 0.0000 0 0 0.9960 0.0040 0.0000
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 716 147 569 74 10 7 0 56 0 0 568 1 0 0.5034 0.0000 0.0018 20.000 0.35 3.91 -3.56 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8724 0.1275 0.0000 1 0 0.8669 0.1331 0.0000 1 0 0.8588 0.1411 0.0001
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 658 168 490 54 2 36 0 76 1 1 486 0 2 0.3214 0.0020 0.0082 3.667 0.24 3.87 -3.63 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0070 0.2874 0.7057 1 2 0.0081 0.2925 0.6995 1 2 0.0098 0.2998 0.6904
chr17 7024700 C CCAGCAGCAG 0.001009 0.100 1 9 1 658 168 490 61 62 36 0 9 1 1 486 0 2 0.3631 0.0020 0.0082 3.667 0.80 6.56 -5.75 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8130 0.1870 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr17 7846859 T TACC 0.057281 0.100 1 3 2 1240 348 892 16 110 76 5 141 0 0 877 3 12 0.0460 0.0000 0.0168 3.671 0.88 3.47 -2.59 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0044 0.6588 0.3368 1 1 0.0056 0.6654 0.3290 1 1 0.0078 0.6748 0.3174
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.100 1 9 2 1240 348 892 131 115 76 6 20 0 7 879 1 5 0.3764 0.0000 0.0146 3.603 8.83 5.35 3.48 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0410 0.9590 0.0000
chr17 7846859 TACCACCACC T 0.027442 0.100 1 -9 2 1245 385 860 198 1 61 1 124 0 0 855 2 3 0.5143 0.0000 0.0058 5.295 2.73 9.36 -6.64 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9948 0.0052 0.0000 1 0 0.9940 0.0060 0.0000 1 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr17 7848540 T TCAC 0.003062 0.100 1 3 1 985 276 709 119 6 53 4 94 0 1 701 2 5 0.4312 0.0000 0.0113 4.208 0.60 3.35 -2.75 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7254 0.2745 0.0000 1 0 0.7262 0.2737 0.0000 1 0 0.7263 0.2736 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 422 92 330 72 0 10 0 10 0 0 330 0 0 0.7826 0.0000 0.0000 8.200 0.78 9.10 -8.32 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.0510 0.9490 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCCCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 18 2 422 92 330 72 0 14 1 5 0 0 330 0 0 0.7826 0.0000 0.0000 7.800 0.78 11.00 -10.22 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1039 0.8961 0.0000 0 1 0.4803 0.5197 0.0000
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 451 173 278 0 0 20 7 146 0 0 272 0 6 0.0000 0.0000 0.0216 7.650 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 931 248 683 41 2 11 184 10 0 1 679 3 0 0.1653 0.0000 0.0059 20.500 0.15 4.00 -3.85 17 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.3951 0.6049 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 932 249 683 44 8 185 2 10 0 1 681 1 0 0.1767 0.0000 0.0029 0.778 0.39 4.00 -3.61 16 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6824 0.3009 0.0167 1 0 0.6711 0.3099 0.0190 1 0 0.6554 0.3222 0.0224
chr17 18778544 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 820 249 571 245 1 0 0 3 0 0 571 0 0 0.9839 0.0000 0.0000 249.000 0.27 1.00 -0.73 187 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 724 155 569 16 0 5 1 133 0 0 558 0 11 0.1032 0.0000 0.0193 29.800 0.25 4.04 -3.79 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9623 0.0377
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 260 102 158 76 0 22 0 4 0 0 158 0 0 0.7451 0.0000 0.0000 3.636 0.50 5.75 -5.25 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.3865 0.6135 0.0000 0 0 0.7542 0.2458 0.0000
chr17 21551124 CACGAAGTACAGG C 0.500000 0.100 1 -12 2 445 145 300 20 0 2 0 123 1 1 289 0 9 0.1379 0.0033 0.0367 71.500 0.05 12.20 -12.15 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr17 21551320 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 439 125 314 12 0 6 0 107 0 0 312 0 2 0.0960 0.0000 0.0064 19.833 0.50 1.41 -0.91 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9164 0.0836
chr17 29761226 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 138 61 77 38 0 1 0 22 0 0 77 0 0 0.6230 0.0000 0.0000 60.000 0.66 1.14 -0.48 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6283 0.3454 0.0263 1 0 0.6177 0.3530 0.0293 1 0 0.6031 0.3633 0.0336
chr17 29969182 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 482 115 367 102 1 7 0 5 0 0 367 0 0 0.8870 0.0000 0.0000 15.429 0.30 3.20 -2.90 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.4553 0.5447 0.0000 0 0 0.8568 0.1432 0.0000
chr17 35745217 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 731 153 578 78 1 2 0 72 0 0 576 0 2 0.5098 0.0000 0.0035 75.000 0.14 3.22 -3.08 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2482 0.6551 0.0967 1 1 0.2536 0.6440 0.1025 1 1 0.2600 0.6298 0.1102
chr17 38352779 G GAGC 0.500000 0.100 1 3 4 641 175 466 144 7 15 1 8 0 0 466 0 0 0.8229 0.0000 0.0000 10.667 0.66 3.25 -2.59 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1833 0.8167 0.0000 0 0 0.8587 0.1413 0.0000
chr17 40819075 T TAGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 10 1 946 214 732 107 17 10 7 73 5 3 697 3 24 0.5000 0.0068 0.0478 28.000 2.63 10.22 -7.59 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6000 0.3934 0.0067 1 0 0.5990 0.3931 0.0079 1 0 0.5963 0.3938 0.0099
chr17 40819077 G GAGCTT 0.500000 0.100 1 5 2 947 213 734 138 9 8 6 52 5 3 695 2 29 0.6479 0.0068 0.0531 25.125 2.59 13.31 -10.71 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9901 0.0098 0.0000 1 0 0.9884 0.0116 0.0000 1 0 0.9857 0.0143 0.0000
chr17 40936600 T TCATGGTCC 0.500000 0.100 1 8 2 321 87 234 71 0 9 0 7 0 0 234 0 0 0.8161 0.0000 0.0000 8.667 0.28 7.71 -7.43 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0197 0.9803 0.0000 0 1 0.2597 0.7403 0.0000
chr17 41026898 G GCAGCAGCTTGGCTGACAGCAGCTGGTCTCA 0.500000 0.100 1 30 2 838 207 631 115 2 15 1 74 0 0 608 0 23 0.5556 0.0000 0.0365 12.733 0.53 1.15 -0.62 3 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5227 0.4647 0.0126 1 0 0.5235 0.4619 0.0146 1 0 0.5232 0.4592 0.0176
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 705 191 514 11 9 2 1 168 0 0 514 0 0 0.0576 0.0000 0.0000 94.000 0.09 1.93 -1.84 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9739 0.0261
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 508 128 380 0 0 5 0 123 0 0 378 0 2 0.0000 0.0000 0.0053 24.600 1.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr17 41105490 CTGCAGGACCACCTGCTGCCGCCCCAGCTGTTGTGTATCCAGCTGCTGCAGGCCCCAGTGCTGCCAGTCTGTGTGCTGCCAACCCACTTGTTCCCGCCCCAGCTGCTGTCAGACCACCTGT C 0.500000 0.100 1 -120 1 783 321 462 284 3 28 4 2 1 2 459 0 0 0.8847 0.0022 0.0065 10.321 1.37 3.50 -2.13 118 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 41105856 CTCCAGCTGCTGCCGCCCCTCTTGCTGTGAA C 0.500000 0.100 1 -30 1 752 229 523 197 0 27 1 4 3 0 518 0 2 0.8603 0.0057 0.0096 7.769 0.79 23.00 -22.21 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 0 0.9315 0.0685 0.0000 0 0 0.9948 0.0052 0.0000
chr17 41140276 TGACAGCAGCTGG T 0.500000 0.100 1 -12 1 1012 159 853 12 0 37 3 107 1 2 825 3 22 0.0755 0.0012 0.0328 3.297 1.92 10.69 -8.77 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9210 0.0790
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 508 103 405 0 0 14 2 87 0 0 388 0 17 0.0000 0.0000 0.0420 6.286 7.51 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0046 0.9954 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0060 0.9940
chr17 41238458 AGACCACCTGCTGCAG A 0.500000 0.100 1 -15 1 39 10 29 3 0 1 0 6 0 0 28 0 1 0.3000 0.0000 0.0345 9.000 3.00 13.33 -10.33 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1535 0.5073 0.3392 1 1 0.1520 0.5192 0.3288 1 1 0.1463 0.5329 0.3208
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 577 186 391 142 0 37 0 7 0 0 390 0 1 0.7634 0.0000 0.0026 4.027 0.38 13.29 -12.91 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1938 0.8062 0.0000 0 0 0.8527 0.1473 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1592 325 1267 182 1 5 0 137 0 0 1262 1 4 0.5600 0.0000 0.0039 64.000 0.43 3.23 -2.79 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8557 0.1441 0.0003 1 0 0.8510 0.1486 0.0003 1 0 0.8437 0.1558 0.0005
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 592 161 431 60 1 21 2 77 0 0 426 1 4 0.3727 0.0000 0.0116 6.619 0.55 3.95 -3.40 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0073 0.2903 0.7024 1 2 0.0086 0.2971 0.6943 1 2 0.0106 0.3067 0.6826
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 246 81 165 6 0 1 0 74 0 0 164 0 1 0.0741 0.0000 0.0061 80.000 0.00 4.43 -4.43 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9334 0.0666 2 1 0.0000 0.5525 0.4475
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 389 101 288 84 0 13 0 4 0 0 288 0 0 0.8317 0.0000 0.0000 6.769 0.12 9.00 -8.88 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.4841 0.5159 0.0000 0 0 0.8189 0.1811 0.0000
chr17 48724362 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 457 143 314 128 1 5 0 9 0 0 314 0 0 0.8951 0.0000 0.0000 27.600 0.34 1.11 -0.77 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0436 0.9564 0.0000 0 0 0.6226 0.3774 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 902 240 662 118 0 15 1 106 0 0 655 0 7 0.4917 0.0000 0.0106 15.000 0.33 3.09 -2.76 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1777 0.7426 0.0798 1 1 0.1866 0.7269 0.0864 1 1 0.1980 0.7064 0.0955
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.100 1 3 2 481 111 370 72 3 20 0 16 0 0 370 0 0 0.6486 0.0000 0.0000 4.550 0.54 3.12 -2.58 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000
chr17 57106431 GGCTTGGATAGAAATGAGGAGA G 0.500000 0.100 1 -21 3 977 215 762 97 3 27 6 82 0 0 762 0 0 0.4512 0.0000 0.0000 6.926 0.98 8.48 -7.50 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3769 0.5868 0.0363 1 1 0.3810 0.5789 0.0401 1 1 0.3852 0.5691 0.0457
chr17 57979243 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 437 202 235 69 61 64 0 8 0 0 235 0 0 0.3416 0.0000 0.0000 2.190 0.75 3.12 -2.37 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1186 0.8814 0.0000 0 0 0.7668 0.2332 0.0000
chr17 57979245 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 437 200 237 106 9 20 8 57 0 0 237 0 0 0.5300 0.0000 0.0000 9.474 0.33 4.53 -4.20 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9576 0.0423 0.0001 1 0 0.9527 0.0472 0.0001 1 0 0.9451 0.0547 0.0002
chr17 57979247 TGC T 0.500000 0.100 1 -2 1 437 201 236 114 1 16 11 59 0 0 236 0 0 0.5672 0.0000 0.0000 11.312 0.54 4.25 -3.72 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9600 0.0399 0.0001 1 0 0.9553 0.0446 0.0001 1 0 0.9480 0.0518 0.0002
chr17 58155318 CCA C 0.500000 0.100 1 -2 1 662 172 490 86 0 5 0 81 0 0 488 0 2 0.5000 0.0000 0.0041 33.400 0.31 2.17 -1.86 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2019 0.6868 0.1113 1 1 0.2085 0.6738 0.1177 1 1 0.2167 0.6572 0.1261
chr17 58156083 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 335 78 257 42 0 4 0 32 0 0 257 0 0 0.5385 0.0000 0.0000 18.500 0.40 1.81 -1.41 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4536 0.4840 0.0625 1 1 0.4489 0.4843 0.0668 1 1 0.4424 0.4848 0.0728
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 434 161 273 1 0 38 1 121 0 0 273 0 0 0.0062 0.0000 0.0000 3.237 0.00 5.12 -5.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0181 0.9819 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0051 0.9949
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 282 76 206 38 0 6 0 32 0 0 205 0 1 0.5000 0.0000 0.0049 11.667 0.55 6.56 -6.01 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3229 0.5573 0.1198 1 1 0.3227 0.5529 0.1244 1 1 0.3220 0.5474 0.1306
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.100 1 -2 3 299 76 223 44 1 1 0 30 0 0 223 0 0 0.5789 0.0000 0.0000 75.000 0.25 2.20 -1.95 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5866 0.3833 0.0300 1 0 0.5779 0.3890 0.0332 1 0 0.5657 0.3966 0.0378
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 540 103 437 44 0 8 0 51 0 0 429 0 8 0.4272 0.0000 0.0183 11.875 0.48 8.10 -7.62 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0284 0.4162 0.5554 1 2 0.0315 0.4194 0.5491 1 2 0.0360 0.4240 0.5399
chr17 75239519 G GGGT 0.500000 0.100 1 3 4 684 197 487 179 1 9 0 8 0 0 487 0 0 0.9086 0.0000 0.0000 20.889 0.53 3.00 -2.47 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6161 0.3839 0.0000 0 0 0.9734 0.0266 0.0000
chr17 75616380 CAGGAGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 1168 281 887 192 2 67 2 18 0 0 887 0 0 0.6833 0.0000 0.0000 3.179 0.62 6.33 -5.71 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0667 0.9333 0.0000
chr17 76077366 TGTCCTGGCCC T 0.500000 0.100 1 -10 3 494 147 347 85 0 7 0 55 0 0 346 0 1 0.5782 0.0000 0.0029 20.000 0.52 9.55 -9.03 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8139 0.1835 0.0026 1 0 0.8045 0.1923 0.0032 1 0 0.7909 0.2049 0.0042
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2141 470 1671 2 12 62 13 381 0 1 1649 5 16 0.0043 0.0000 0.0132 6.492 4.50 7.12 -2.62 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2104 512 1592 0 0 37 4 471 0 0 1410 15 167 0.0000 0.0000 0.1143 13.139 4.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 1110 210 900 182 4 16 0 8 0 0 900 0 0 0.8667 0.0000 0.0000 12.125 0.43 5.50 -5.07 96 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6839 0.3161 0.0000 0 0 0.9800 0.0200 0.0000
chr17 81869441 G GCAGCCCTGCGCGAAGCCC 0.500000 0.100 1 18 1 704 151 553 63 1 36 1 50 0 0 536 0 17 0.4172 0.0000 0.0307 3.167 0.70 9.94 -9.24 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1122 0.6379 0.2499 1 1 0.1178 0.6279 0.2543 1 1 0.1252 0.6152 0.2596
chr17 81907242 G GT 0.500000 0.100 1 1 3 518 131 387 121 0 4 0 6 0 0 387 0 0 0.9237 0.0000 0.0000 31.750 0.41 1.33 -0.92 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.4192 0.5808 0.0000 0 0 0.8836 0.1164 0.0000
chr17 82060071 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 363 92 271 49 0 0 0 43 0 0 271 0 0 0.5326 0.0000 0.0000 92.000 0.61 3.65 -3.04 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3293 0.5705 0.1002 1 1 0.3298 0.5651 0.1051 1 1 0.3300 0.5583 0.1117
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 321 73 248 40 1 1 2 29 0 0 248 0 0 0.5479 0.0000 0.0000 71.000 0.30 1.24 -0.94 10 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5178 0.4384 0.0438 1 0 0.5131 0.4399 0.0470 1 0 0.5064 0.4422 0.0514
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 254 110 144 0 0 7 0 103 0 0 141 1 2 0.0000 0.0000 0.0208 14.714 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 358 79 279 71 0 4 0 4 1 0 277 0 1 0.8987 0.0036 0.0072 18.750 1.31 7.75 -6.44 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.3885 0.6115 0.0000 0 0 0.8262 0.1738 0.0000
chr18 24160067 CTG C 0.002292 0.100 1 -2 4 390 87 303 41 0 1 0 45 0 0 302 0 1 0.4713 0.0000 0.0033 86.000 0.54 2.22 -1.69 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2835 0.7147 0.0018 1 1 0.2941 0.7042 0.0018 1 1 0.3079 0.6903 0.0017
chr18 36783106 G GATCC 0.000032 0.100 1 4 1 210 91 119 38 0 5 0 48 0 0 116 0 3 0.4176 0.0000 0.0252 17.200 0.13 4.40 -4.26 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1512 0.8487 0.0001 1 1 0.1622 0.8378 0.0001 1 1 0.1772 0.8227 0.0001
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 218 96 122 87 0 4 0 5 0 0 122 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 23.000 0.28 5.40 -5.12 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.2374 0.7626 0.0000 0 0 0.6951 0.3049 0.0000
chr18 45730325 AGGACAGCCCCACTATGGTTAGAGT A 0.000176 0.100 1 -24 2 469 154 315 83 0 13 0 58 0 0 304 0 11 0.5390 0.0000 0.0349 10.846 0.25 19.71 -19.45 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6552 0.3448 0.0000 1 0 0.6558 0.3441 0.0000 1 0 0.6559 0.3441 0.0000
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 125 56 69 48 0 1 0 7 0 0 69 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 55.000 0.10 3.00 -2.90 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.1031 0.8969 0.0000
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 298 141 157 120 0 10 0 11 0 0 157 0 0 0.8511 0.0000 0.0000 13.100 0.14 3.36 -3.22 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0033 0.9967 0.0000 0 1 0.2250 0.7750 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 252 148 104 0 0 7 1 140 0 0 103 0 1 0.0000 0.0000 0.0096 20.143 2.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 730 159 571 9 0 2 0 148 0 0 553 0 18 0.0566 0.0000 0.0315 78.500 0.00 14.59 -14.59 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7844 0.2156 2 2 0.0000 0.0929 0.9071
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 391 73 318 31 1 7 2 32 2 2 311 2 1 0.4247 0.0063 0.0220 9.429 2.42 5.12 -2.71 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1805 0.5842 0.2353 1 1 0.1843 0.5779 0.2378 1 1 0.1891 0.5700 0.2408
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 167 67 100 0 0 3 0 64 0 0 99 0 1 0.0000 0.0000 0.0100 21.333 3.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0351 0.9649 2 2 0.0000 0.0375 0.9625 2 2 0.0000 0.0409 0.9591
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 134 56 78 31 0 4 0 21 0 0 76 0 2 0.5536 0.0000 0.0256 13.000 0.13 2.90 -2.78 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4194 0.4947 0.0859 1 1 0.4150 0.4947 0.0903 1 1 0.4088 0.4947 0.0965
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 4 418 156 262 136 5 8 0 7 0 0 262 0 0 0.8718 0.0000 0.0000 18.500 0.38 4.43 -4.05 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3988 0.6012 0.0000 0 0 0.9129 0.0871 0.0000
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.100 1 3 1 242 109 133 10 1 84 2 12 0 0 133 0 0 0.0917 0.0000 0.0000 4.800 0.80 2.42 -1.62 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8942 0.1058 0.0001 1 0 0.7624 0.2375 0.0001 0 1 0.3733 0.6267 0.0000
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.100 1 4 1 616 115 501 112 0 0 0 3 0 1 499 0 1 0.9739 0.0000 0.0040 115.000 0.53 5.33 -4.81 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0987 0.9013 0.0000 0 0 0.9092 0.0908 0.0000 0 0 0.9789 0.0211 0.0000
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.100 1 -27 1 392 96 296 49 1 2 1 43 0 0 295 0 1 0.5104 0.0000 0.0034 46.500 0.53 19.37 -18.84 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4325 0.5248 0.0428 1 1 0.4352 0.5201 0.0448 1 1 0.4382 0.5143 0.0475
chr19 1085846 A AGGACGG 0.001288 0.100 1 6 3 288 71 217 32 0 20 0 19 0 0 212 0 5 0.4507 0.0000 0.0230 2.550 0.44 5.37 -4.93 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6264 0.3734 0.0002 1 0 0.6241 0.3758 0.0002 1 0 0.6207 0.3791 0.0002
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 161 57 104 26 0 2 0 29 0 0 103 0 1 0.4561 0.0000 0.0096 27.500 1.00 4.24 -3.24 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2370 0.6042 0.1588 1 1 0.2434 0.5985 0.1581 1 1 0.2518 0.5911 0.1571
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 254 145 109 71 0 2 0 72 0 0 107 0 2 0.4897 0.0000 0.0183 71.500 0.24 3.14 -2.90 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1981 0.6989 0.1030 1 1 0.2078 0.6866 0.1056 1 1 0.2205 0.6708 0.1087
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.100 1 3 2 385 93 292 1 1 27 2 62 0 0 292 0 0 0.0108 0.0000 0.0000 2.407 0.00 3.24 -3.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9875 0.0125 2 1 0.0000 0.9029 0.0971 2 1 0.0000 0.8163 0.1837
chr19 1827021 T TGGAGGA 0.002927 0.100 1 6 2 385 93 292 3 0 80 3 7 0 0 292 0 0 0.0323 0.0000 0.0000 0.127 2.33 2.57 -0.24 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2893 0.7063 0.0044 1 1 0.2954 0.7003 0.0042 1 1 0.3033 0.6927 0.0040
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 289 92 197 1 1 18 42 30 0 0 190 5 2 0.0109 0.0000 0.0355 4.353 3.00 3.90 -0.90 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.5289 0.4711 2 2 0.0000 0.1429 0.8571 2 2 0.0000 0.0777 0.9223
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 289 94 195 2 1 48 1 42 0 0 188 2 5 0.0213 0.0000 0.0359 1.000 5.50 12.10 -6.60 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9938 0.0062 2 1 0.0000 0.9085 0.0915 2 1 0.0000 0.7737 0.2263
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 289 97 192 38 1 19 0 39 0 0 185 0 7 0.3918 0.0000 0.0365 4.105 3.58 12.31 -8.73 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1793 0.6550 0.1657 1 1 0.1876 0.6475 0.1649 1 1 0.1988 0.6378 0.1634
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 430 126 304 117 0 2 0 7 6 0 296 0 2 0.9286 0.0197 0.0263 124.000 1.27 3.14 -1.87 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1962 0.8038 0.0000 0 0 0.9020 0.0980 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 597 145 452 10 0 7 0 128 0 0 441 0 11 0.0690 0.0000 0.0243 19.714 0.60 10.83 -10.23 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9899 0.0101 2 1 0.0000 0.6359 0.3641
chr19 8971789 GGTGTGAAGGTTAACGTCT G 0.002451 0.100 1 -18 1 381 99 282 86 1 9 0 3 0 0 282 0 0 0.8687 0.0000 0.0000 10.000 0.29 13.33 -13.04 50 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9776 0.0224 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 8979162 A AGCC 0.002510 0.100 1 3 1 574 125 449 109 1 7 0 8 0 0 449 0 0 0.8720 0.0000 0.0000 16.857 0.47 3.12 -2.66 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 0 0.9508 0.0492 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 247 70 177 60 0 5 0 5 0 0 177 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 13.000 0.32 4.00 -3.68 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.1721 0.8279 0.0000 0 0 0.6125 0.3875 0.0000
chr19 9126240 AG A 0.056196 0.100 1 -1 5 344 82 262 76 0 2 0 4 0 0 262 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 40.000 0.25 2.00 -1.75 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1021 0.8979 0.0000 0 0 0.9139 0.0861 0.0000 0 0 0.9810 0.0190 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 772 233 539 84 4 42 10 93 0 0 538 0 1 0.3605 0.0000 0.0019 4.524 0.48 3.38 -2.90 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0292 0.5783 0.3924 1 1 0.0332 0.5742 0.3926 1 1 0.0391 0.5694 0.3915
chr19 13207858 CCTG C 0.175850 0.100 1 -3 1 462 159 303 1 0 27 121 10 0 0 296 7 0 0.0063 0.0000 0.0231 5.077 1.00 3.90 -2.90 1 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0356 0.9644 2 2 0.0000 0.0132 0.9868 2 2 0.0000 0.0106 0.9894
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 462 160 302 1 0 34 1 124 0 0 295 0 7 0.0063 0.0000 0.0232 3.676 1.00 6.48 -5.48 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0253 0.9747 2 2 0.0000 0.0092 0.9908 2 2 0.0000 0.0073 0.9927
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.100 1 3 1 282 108 174 95 3 7 0 3 0 0 174 0 0 0.8796 0.0000 0.0000 14.429 0.27 3.00 -2.73 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7286 0.2714 0.0000 0 0 0.9874 0.0126 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr19 14799631 CAGA C 0.002283 0.100 1 -3 1 743 157 586 90 0 5 1 61 0 0 584 0 2 0.5732 0.0000 0.0034 30.200 1.51 5.33 -3.82 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8631 0.1369 0.0000 1 0 0.8579 0.1421 0.0000 1 0 0.8503 0.1496 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 548 117 431 0 0 3 1 113 0 0 426 0 5 0.0000 0.0000 0.0116 38.000 3.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 17286676 GTGTGTGTGTGTGTGTT G 0.018505 0.100 1 -16 1 424 97 327 13 19 22 21 22 0 0 327 0 0 0.1340 0.0000 0.0000 3.143 3.54 7.41 -3.87 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2086 0.7656 0.0259 1 1 0.2191 0.7557 0.0253 1 1 0.2332 0.7424 0.0244
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.100 1 -4 1 421 85 336 0 1 6 11 67 0 0 336 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 15.000 5.09 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1124 0.8876 2 2 0.0000 0.1169 0.8831 2 2 0.0000 0.1246 0.8754
chr19 17286690 GTT G 0.132491 0.100 1 -2 1 420 85 335 0 0 5 21 59 0 0 335 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 19.250 3.61 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1015 0.8985 2 2 0.0000 0.1093 0.8907 2 2 0.0000 0.1209 0.8791
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 776 172 604 0 0 11 3 158 0 0 556 14 34 0.0000 0.0000 0.0795 14.636 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 646 178 468 167 1 8 0 2 0 0 468 0 0 0.9382 0.0000 0.0000 21.250 0.25 3.00 -2.75 111 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 302 83 219 60 2 12 0 9 0 0 217 0 2 0.7229 0.0000 0.0091 5.917 0.22 3.33 -3.12 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0035 0.9965 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 526 213 313 57 5 47 10 94 0 0 313 0 0 0.2676 0.0000 0.0000 3.587 10.58 5.91 4.66 13 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0021 0.3287 0.6692 1 2 0.0028 0.3509 0.6463 1 2 0.0041 0.3818 0.6141
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.100 1 -3 1 535 194 341 144 7 11 2 30 0 0 341 0 0 0.7423 0.0000 0.0000 18.100 8.10 3.23 4.87 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 441 117 324 0 0 1 4 112 0 0 314 1 9 0.0000 0.0000 0.0309 114.000 3.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0042 0.9958 2 2 0.0000 0.0051 0.9949
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 211 32 179 0 0 3 26 3 0 0 179 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.667 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0620 0.9380 2 2 0.0000 0.0637 0.9363 2 2 0.0000 0.0662 0.9338
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 212 31 181 0 0 21 9 1 0 0 181 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.429 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1134 0.8866 2 2 0.0000 0.1152 0.8848 2 2 0.0000 0.1177 0.8823
chr19 40213998 GCCCTCCCCACCA G 0.000299 0.100 1 -12 1 408 139 269 72 0 7 1 59 0 0 262 0 7 0.5180 0.0000 0.0260 18.714 0.44 11.44 -11.00 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4589 0.5410 0.0000 1 1 0.4668 0.5332 0.0001 1 1 0.4763 0.5236 0.0001
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 427 111 316 0 0 10 1 100 0 0 316 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.100 5.72 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0061 0.9939
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 486 156 330 0 0 4 0 152 0 0 329 0 1 0.0000 0.0000 0.0030 38.000 1.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 351 102 249 60 1 0 0 41 0 0 248 0 1 0.5882 0.0000 0.0040 101.000 0.20 6.54 -6.34 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6864 0.3018 0.0118 1 0 0.6781 0.3084 0.0134 1 0 0.6664 0.3176 0.0160
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 486 148 338 141 1 2 0 4 0 0 338 0 0 0.9527 0.0000 0.0000 72.500 0.36 3.00 -2.64 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0993 0.9007 0.0000 0 0 0.9073 0.0927 0.0000 0 0 0.9775 0.0225 0.0000
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 446 127 319 57 0 4 3 63 0 0 318 0 1 0.4488 0.0000 0.0031 30.750 0.28 2.95 -2.67 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1250 0.7203 0.1547 1 1 0.1343 0.7116 0.1541 1 1 0.1472 0.7001 0.1527
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 315 126 189 116 0 6 0 4 0 0 189 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 20.000 1.16 2.00 -0.84 28 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7917 0.2083 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr19 45152510 C CCTG 0.000765 0.100 1 3 5 533 85 448 37 1 11 0 36 0 0 446 0 2 0.4353 0.0000 0.0045 6.727 0.78 3.33 -2.55 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4075 0.5921 0.0003 1 1 0.4144 0.5853 0.0003 1 1 0.4230 0.5767 0.0003
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 1007 351 656 148 0 63 0 140 0 0 637 1 18 0.4217 0.0000 0.0290 4.571 0.48 6.04 -5.56 54 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0289 0.7390 0.2321 1 1 0.0331 0.7229 0.2440 1 1 0.0392 0.7020 0.2588
chr19 48297459 CGCG C 0.000021 0.100 1 -3 2 663 190 473 84 1 17 1 87 0 0 470 0 3 0.4421 0.0000 0.0063 10.176 0.44 3.17 -2.73 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1885 0.8115 0.0000 1 1 0.2024 0.7976 0.0000 1 1 0.2212 0.7788 0.0000
chr19 49070105 TGGA T 0.101017 0.100 1 -3 1 349 94 255 85 0 4 0 5 0 0 255 0 0 0.9043 0.0000 0.0000 22.500 0.66 3.40 -2.74 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0100 0.9900 0.0000 0 0 0.7517 0.2483 0.0000 0 0 0.9570 0.0430 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 901 214 687 6 1 39 84 84 0 0 677 6 4 0.0280 0.0000 0.0146 4.861 2.33 4.19 -1.86 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 2 0.0000 0.2805 0.7195 2 2 0.0000 0.0283 0.9717
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.100 1 3 1 891 203 688 12 81 45 2 63 0 0 684 1 3 0.0591 0.0000 0.0058 3.356 1.08 3.32 -2.23 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7457 0.2504 0.0039 1 0 0.7398 0.2556 0.0046 1 0 0.7311 0.2632 0.0057
chr19 49154632 T TTCCTCCTCC 0.001742 0.100 1 9 1 891 203 688 90 55 46 7 5 0 1 684 2 1 0.4433 0.0000 0.0058 3.295 3.11 3.60 -0.49 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2356 0.7644 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 49154632 TTCC T 0.001916 0.100 1 -3 1 892 210 682 73 5 44 4 84 0 0 681 0 1 0.3476 0.0000 0.0015 3.773 2.67 3.36 -0.69 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1277 0.8701 0.0022 1 1 0.1398 0.8580 0.0022 1 1 0.1566 0.8411 0.0022
chr19 49196501 TGCTGCGGGGGCC T 0.003841 0.100 1 -12 2 379 116 263 104 0 5 0 7 0 0 262 0 1 0.8966 0.0000 0.0038 22.200 0.33 10.29 -9.96 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.9033 0.0967 0.0000 0 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 542 147 395 0 0 33 2 112 0 0 383 0 12 0.0000 0.0000 0.0304 3.455 7.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.100 1 -18 2 581 189 392 84 2 49 0 54 0 0 392 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 2.837 0.42 12.61 -12.19 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9140 0.0858 0.0002 1 0 0.9083 0.0914 0.0002 1 0 0.9000 0.0997 0.0003
chr19 49969702 A ATGC 0.001079 0.100 1 3 1 1089 229 860 204 1 21 0 3 0 0 860 0 0 0.8908 0.0000 0.0000 9.905 0.31 3.00 -2.69 84 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 49970457 TC T 0.000567 0.100 1 -1 1 1417 232 1185 212 1 14 0 5 0 1 1183 1 0 0.9138 0.0000 0.0017 15.500 0.38 1.00 -0.62 120 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 711 150 561 0 0 5 12 133 0 0 553 0 8 0.0000 0.0000 0.0143 29.000 3.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 712 157 555 3 0 8 128 18 0 0 555 0 0 0.0191 0.0000 0.0000 21.143 0.00 4.06 -4.06 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5272 0.4728 2 2 0.0000 0.0394 0.9606 2 2 0.0000 0.0140 0.9860
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.100 1 6 2 549 112 437 49 0 9 1 53 0 0 436 0 1 0.4375 0.0000 0.0023 11.444 0.20 5.36 -5.15 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2439 0.7456 0.0105 1 1 0.2554 0.7341 0.0105 1 1 0.2706 0.7189 0.0105
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 555 177 378 83 0 6 4 84 0 0 378 0 0 0.4689 0.0000 0.0000 28.500 0.33 2.67 -2.34 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0604 0.6463 0.2933 1 1 0.0644 0.6344 0.3012 1 1 0.0697 0.6194 0.3109
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 218 100 118 52 0 2 0 46 0 0 118 0 0 0.5200 0.0000 0.0000 49.000 0.27 2.35 -2.08 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1905 0.6432 0.1663 1 1 0.1910 0.6351 0.1739 1 1 0.1913 0.6246 0.1841
chr19 52906242 CACT C 0.001583 0.100 1 -3 1 611 139 472 70 0 1 0 68 0 0 472 0 0 0.5036 0.0000 0.0000 138.000 0.33 3.21 -2.88 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3821 0.6175 0.0004 1 1 0.3924 0.6072 0.0004 1 1 0.4054 0.5941 0.0004
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 1013 224 789 0 0 2 0 222 0 0 784 1 4 0.0000 0.0000 0.0063 111.000 3.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 655 157 498 142 0 5 0 10 0 0 498 0 0 0.9045 0.0000 0.0000 30.400 0.96 1.80 -0.84 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0141 0.9859 0.0000 0 1 0.4389 0.5611 0.0000
chr19 54251009 C CA 0.002394 0.100 1 1 1 655 152 503 100 0 5 3 44 0 0 500 2 1 0.6579 0.0000 0.0060 73.500 0.51 2.48 -1.97 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9839 0.0161 0.0000 1 0 0.9817 0.0183 0.0000 1 0 0.9782 0.0218 0.0000
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 754 162 592 78 0 6 0 78 0 1 586 0 5 0.4815 0.0000 0.0101 26.000 0.32 3.08 -2.76 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1076 0.6760 0.2164 1 1 0.1142 0.6640 0.2219 1 1 0.1229 0.6485 0.2286
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 431 114 317 43 0 20 2 49 0 0 311 0 6 0.3772 0.0000 0.0189 4.700 0.21 7.24 -7.04 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0334 0.4349 0.5317 1 2 0.0367 0.4374 0.5259 1 2 0.0416 0.4408 0.5175
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 670 148 522 0 0 28 0 120 0 0 482 0 40 0.0000 0.0000 0.0766 4.286 18.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 828 249 579 118 2 34 13 82 0 0 573 0 6 0.4739 0.0000 0.0104 6.485 1.02 4.40 -3.39 64 0/1 1/1 . . OK 1 0 0.6086 0.3856 0.0058 1 0 0.6101 0.3831 0.0068 1 0 0.6108 0.3809 0.0082
chr19 55518546 CCCA C 0.003059 0.100 1 -3 1 611 150 461 145 1 1 0 3 0 0 461 0 0 0.9667 0.0000 0.0000 148.000 0.26 3.67 -3.41 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9986 0.0014 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 554 95 459 3 0 3 0 89 1 0 449 0 9 0.0316 0.0022 0.0218 30.667 0.00 3.67 -3.67 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9768 0.0232 2 2 0.0000 0.3120 0.6880 2 2 0.0000 0.0876 0.9124
chr19 57456271 TAA T 0.000987 0.100 1 -2 2 506 137 369 85 0 0 0 52 0 0 368 0 1 0.6204 0.0000 0.0027 137.000 0.27 2.13 -1.86 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9237 0.0763 0.0000 1 0 0.9185 0.0815 0.0000 1 0 0.9110 0.0890 0.0000
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 127 69 58 31 0 7 0 31 0 0 56 0 2 0.4493 0.0000 0.0345 8.857 0.13 2.90 -2.77 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2427 0.5913 0.1660 1 1 0.2479 0.5852 0.1669 1 1 0.2545 0.5775 0.1680
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 318 105 213 97 0 0 0 8 0 0 213 0 0 0.9238 0.0000 0.0000 105.000 0.25 4.00 -3.75 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1236 0.8764 0.0000 0 0 0.7836 0.2164 0.0000
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 319 134 185 55 0 7 0 72 0 0 185 0 0 0.4104 0.0000 0.0000 18.143 0.25 2.06 -1.80 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0165 0.3760 0.6075 1 2 0.0186 0.3794 0.6020 1 2 0.0218 0.3843 0.5939
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 85 44 41 0 0 0 0 44 0 0 41 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 44.000 6.57 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0644 0.9356 2 2 0.0000 0.0672 0.9328 2 2 0.0000 0.0712 0.9288
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.100 1 3 1 471 105 366 54 1 15 0 35 1 0 363 1 1 0.5143 0.0027 0.0082 6.000 1.50 3.57 -2.07 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7915 0.2071 0.0015 1 0 0.7850 0.2133 0.0017 1 0 0.7759 0.2221 0.0020
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 585 193 392 190 0 0 0 3 0 0 392 0 0 0.9845 0.0000 0.0000 193.000 0.32 9.67 -9.35 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9709 0.0291 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 585 193 392 187 0 3 0 3 0 0 392 0 0 0.9689 0.0000 0.0000 63.333 0.32 9.67 -9.35 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9665 0.0335 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 587 172 415 161 1 4 0 6 0 0 414 0 1 0.9360 0.0000 0.0024 42.000 0.22 8.67 -8.44 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.7723 0.2277 0.0000 0 0 0.9810 0.0190 0.0000
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 321 145 176 85 0 11 0 49 0 0 174 0 2 0.5862 0.0000 0.0114 12.182 0.46 5.61 -5.15 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9281 0.0717 0.0002 1 0 0.9226 0.0772 0.0002 1 0 0.9144 0.0853 0.0003
chr20 3668985 ATCTGGACT A 0.038221 0.100 1 -8 1 240 79 161 76 0 0 0 3 0 0 161 0 0 0.9620 0.0000 0.0000 79.000 0.55 9.00 -8.45 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6061 0.3939 0.0000 0 0 0.9787 0.0213 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000
chr20 3864345 C CAAG 0.001475 0.100 1 3 2 453 149 304 138 0 4 0 7 0 0 304 0 0 0.9262 0.0000 0.0000 36.250 0.17 2.86 -2.69 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1185 0.8815 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr20 17621690 CGAG C 0.000581 0.100 1 -3 2 512 138 374 66 1 4 0 67 0 0 372 0 2 0.4783 0.0000 0.0053 33.500 0.09 3.00 -2.91 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2951 0.7046 0.0003 1 1 0.3074 0.6924 0.0003 1 1 0.3233 0.6764 0.0003
chr20 19886698 CT C 0.002304 0.100 1 -1 1 140 58 82 55 0 1 0 2 0 0 82 0 0 0.9483 0.0000 0.0000 57.000 1.24 2.00 -0.76 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9886 0.0114 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 713 197 516 13 0 7 0 177 0 0 512 0 4 0.0660 0.0000 0.0078 27.143 0.08 6.73 -6.65 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9933 0.0067 2 2 0.0000 0.4411 0.5589
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 422 140 282 8 1 0 0 131 0 0 277 0 5 0.0571 0.0000 0.0177 139.000 0.12 3.41 -3.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7912 0.2088 2 2 0.0000 0.1303 0.8697
chr20 35277779 C CGGGCTG 0.014046 0.100 1 6 1 517 183 334 61 0 60 0 62 1 0 333 0 0 0.3333 0.0030 0.0030 2.050 1.23 5.97 -4.74 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3495 0.6456 0.0049 1 1 0.3599 0.6350 0.0050 1 1 0.3731 0.6216 0.0052
chr20 38926679 CGCG C 0.001907 0.100 1 -3 3 690 184 506 91 2 15 3 73 0 1 504 0 1 0.4946 0.0000 0.0040 11.267 0.23 3.14 -2.91 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6980 0.3020 0.0000 1 0 0.6977 0.3023 0.0001 1 0 0.6965 0.3034 0.0001
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 929 303 626 134 1 41 3 124 1 0 625 0 0 0.4422 0.0016 0.0016 6.390 0.29 3.67 -3.38 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1969 0.7512 0.0519 1 1 0.2056 0.7363 0.0581 1 1 0.2163 0.7168 0.0668
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 597 286 311 130 6 30 16 104 0 0 310 0 1 0.4545 0.0000 0.0032 8.759 1.25 3.22 -1.98 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4760 0.5137 0.0102 1 1 0.4835 0.5048 0.0118 1 1 0.4917 0.4943 0.0141
chr20 53253540 AAAG A 0.000290 0.100 1 -3 4 555 136 419 123 2 3 1 7 0 0 419 0 0 0.9044 0.0000 0.0000 44.000 0.24 4.57 -4.34 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2100 0.7900 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr20 58854641 C CTGACGCCCCAGCCGATCCCGACTCCGGGGCGGCCCG 0.009401 0.100 1 36 4 719 142 577 53 11 19 5 54 1 1 574 0 1 0.3732 0.0017 0.0052 5.947 0.57 2.67 -2.10 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4824 0.5161 0.0016 1 1 0.4885 0.5099 0.0016 1 1 0.4958 0.5025 0.0018
chr20 60012728 T TA 0.009952 0.100 1 1 2 231 59 172 30 0 8 2 19 0 0 171 0 1 0.5085 0.0000 0.0058 6.375 0.43 1.53 -1.09 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6366 0.3621 0.0012 1 0 0.6336 0.3651 0.0013 1 0 0.6293 0.3693 0.0014
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 239 31 208 0 0 4 1 26 0 0 202 0 6 0.0000 0.0000 0.0288 6.750 5.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 302 156 146 0 0 1 0 155 0 0 145 0 1 0.0000 0.0000 0.0068 155.000 2.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr21 30598756 T TA 0.001158 0.100 1 1 1 250 94 156 87 0 0 0 7 0 0 156 0 0 0.9255 0.0000 0.0000 94.000 0.05 1.00 -0.95 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 0 0.9750 0.0250 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 715 186 529 0 0 2 1 183 0 0 513 0 16 0.0000 0.0000 0.0302 92.000 5.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 708 199 509 101 1 16 4 77 1 1 507 0 0 0.5075 0.0020 0.0039 12.929 1.45 15.44 -14.00 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7680 0.2301 0.0019 1 0 0.7637 0.2340 0.0023 1 0 0.7572 0.2400 0.0029
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 212 100 112 38 0 10 0 52 0 0 112 0 0 0.3800 0.0000 0.0000 9.000 0.05 3.92 -3.87 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0268 0.3924 0.5808 1 2 0.0295 0.3960 0.5745 1 2 0.0335 0.4011 0.5654
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 348 52 296 0 0 1 0 51 0 0 292 0 4 0.0000 0.0000 0.0135 51.000 2.57 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539457 CGGA C 0.002702 0.100 1 -3 1 922 257 665 132 0 17 2 106 0 0 664 0 1 0.5136 0.0000 0.0015 14.059 2.03 4.60 -2.57 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7535 0.2465 0.0000 1 0 0.7536 0.2464 0.0000 1 0 0.7527 0.2473 0.0000
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1118 188 930 0 3 13 10 162 1 0 919 2 8 0.0000 0.0011 0.0118 15.455 3.19 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1123 194 929 0 1 14 17 162 0 1 917 3 8 0.0000 0.0000 0.0129 16.000 3.23 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 652 162 490 132 2 24 0 4 24 3 462 0 1 0.8148 0.0490 0.0571 5.708 2.06 19.00 -16.94 38 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.1781 0.8219 0.0000 0 0 0.9836 0.0164 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000
chr21 44592279 G GCCT 0.000301 0.100 1 3 1 646 208 438 170 0 23 2 13 1 0 433 1 3 0.8173 0.0023 0.0114 8.409 0.99 2.77 -1.78 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0442 0.9558 0.0000 0 0 0.9877 0.0123 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 616 119 497 10 2 9 3 95 0 0 490 0 7 0.0840 0.0000 0.0141 12.000 3.90 12.01 -8.11 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.8823 0.1177
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 319 149 170 1 0 13 0 135 0 0 170 0 0 0.0067 0.0000 0.0000 10.462 0.00 7.33 -7.33 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr22 17109651 TGGAGGAAGA T 0.001153 0.100 1 -9 3 950 251 699 122 1 26 0 102 0 0 691 0 8 0.4861 0.0000 0.0114 8.654 0.44 8.99 -8.55 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5360 0.4639 0.0000 1 0 0.5451 0.4548 0.0001 1 0 0.5558 0.4441 0.0001
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.100 1 6 1 3393 1070 2323 856 5 24 1 184 0 0 2313 0 10 0.8000 0.0000 0.0043 43.583 0.26 6.09 -5.83 98 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr22 18609475 C CGG 0.080580 0.100 1 2 2 941 95 846 70 2 2 1 20 1 1 843 0 1 0.7368 0.0012 0.0035 46.500 1.01 2.05 -1.04 62 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9876 0.0124 0.0000 1 0 0.7735 0.2265 0.0000 0 1 0.0445 0.9555 0.0000
chr22 20858678 G GCCGCCT 0.004141 0.100 1 6 2 498 185 313 68 0 29 1 87 0 0 313 0 0 0.3676 0.0000 0.0000 5.345 0.54 5.23 -4.69 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0621 0.9255 0.0124 1 1 0.0703 0.9176 0.0121 1 1 0.0823 0.9061 0.0116
chr22 21030044 GGGGCCAGGGCTGGCT G 0.000265 0.100 1 -15 5 618 149 469 83 0 10 1 55 0 0 457 0 12 0.5570 0.0000 0.0256 13.800 0.51 12.56 -12.06 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6831 0.3169 0.0000 1 0 0.6825 0.3174 0.0000 1 0 0.6812 0.3188 0.0000
chr22 21867418 C CCCG 0.004356 0.100 1 3 1 216 95 121 33 1 21 1 39 1 0 120 0 0 0.3474 0.0083 0.0083 3.476 0.52 3.13 -2.61 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2992 0.6974 0.0034 1 1 0.3090 0.6876 0.0034 1 1 0.3217 0.6749 0.0033
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 189 93 96 39 1 9 0 44 0 0 96 0 0 0.4194 0.0000 0.0000 9.222 0.26 3.02 -2.77 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2112 0.6353 0.1535 1 1 0.2187 0.6274 0.1539 1 1 0.2285 0.6173 0.1542
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 683 163 520 124 0 33 0 6 0 1 517 0 2 0.7607 0.0000 0.0058 3.939 1.21 11.83 -10.62 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0142 0.9858 0.0000 0 1 0.2617 0.7383 0.0000
chr22 27798673 T TGCG 0.000703 0.100 1 3 1 1213 251 962 231 1 12 0 7 2 0 960 0 0 0.9203 0.0021 0.0021 19.917 0.66 3.14 -2.48 79 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9745 0.0255 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 778 213 565 200 0 7 0 6 0 0 565 0 0 0.9390 0.0000 0.0000 29.429 0.38 3.00 -2.62 120 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0601 0.9399 0.0000 0 0 0.9819 0.0181 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr22 30694065 A ACAGACAGGT 0.001704 0.100 1 9 1 209 55 154 27 0 0 0 28 0 0 150 0 4 0.4909 0.0000 0.0260 55.000 6.78 15.25 -8.47 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3124 0.6861 0.0014 1 1 0.3213 0.6773 0.0014 1 1 0.3329 0.6657 0.0014
chr22 31602713 CCCA C 0.001203 0.100 1 -3 1 399 156 243 86 1 6 0 63 0 0 243 0 0 0.5513 0.0000 0.0000 24.833 0.51 3.38 -2.87 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8353 0.1647 0.0000 1 0 0.8303 0.1696 0.0000 1 0 0.8232 0.1768 0.0000
chr22 36265995 AATAATT A 0.003695 0.100 1 -6 1 502 130 372 11 0 1 0 118 0 0 366 0 6 0.0846 0.0000 0.0161 129.000 1.18 6.01 -4.83 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 496 241 255 103 0 49 0 89 0 0 249 0 6 0.4274 0.0000 0.0235 3.918 0.97 6.01 -5.04 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3800 0.5957 0.0243 1 1 0.3892 0.5844 0.0264 1 1 0.4001 0.5704 0.0294
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.100 1 -3 1 910 289 621 163 0 4 7 115 0 0 617 1 3 0.5640 0.0000 0.0064 71.000 0.93 3.97 -3.04 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8499 0.1497 0.0004 1 0 0.8451 0.1544 0.0005 1 0 0.8376 0.1616 0.0007
chr22 38078443 TCGCCCCGGGCG T 0.000387 0.100 1 -11 1 413 128 285 69 0 2 0 57 0 0 282 0 3 0.5391 0.0000 0.0105 63.000 0.09 10.53 -10.44 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5644 0.4356 0.0000 1 0 0.5677 0.4323 0.0000 1 0 0.5713 0.4287 0.0000
chr22 38087182 A AGGTCATGGG 0.001043 0.100 1 9 2 360 181 179 149 0 24 0 8 0 0 179 0 0 0.8232 0.0000 0.0000 6.542 0.26 5.25 -4.99 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0350 0.9650 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 220 117 103 58 0 9 0 50 0 0 101 0 2 0.4957 0.0000 0.0194 12.000 0.57 3.70 -3.13 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3888 0.5520 0.0592 1 1 0.3915 0.5460 0.0625 1 1 0.3944 0.5387 0.0669
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 374 151 223 0 0 5 1 145 0 0 215 0 8 0.0000 0.0000 0.0359 29.200 3.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 495 180 315 80 1 21 2 76 0 0 312 0 3 0.4444 0.0000 0.0095 7.571 0.20 3.04 -2.84 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2338 0.6893 0.0768 1 1 0.2437 0.6763 0.0801 1 1 0.2563 0.6595 0.0842
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1272 291 981 164 1 3 1 122 6 1 965 0 9 0.5636 0.0061 0.0163 96.000 6.51 9.77 -3.26 66 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8928 0.1071 0.0001 1 0 0.8888 0.1110 0.0002 1 0 0.8826 0.1171 0.0003
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 809 347 462 291 0 5 0 51 0 0 462 0 0 0.8386 0.0000 0.0000 85.500 0.20 3.04 -2.84 87 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 708 158 550 76 1 17 1 63 3 0 544 1 2 0.4810 0.0055 0.0109 8.235 0.82 7.46 -6.64 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6202 0.3772 0.0027 1 0 0.6213 0.3758 0.0029 1 0 0.6219 0.3747 0.0033
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 354 91 263 46 0 14 1 30 0 0 256 0 7 0.5055 0.0000 0.0266 5.500 0.52 9.93 -9.41 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5586 0.4277 0.0137 1 0 0.5583 0.4272 0.0145 1 0 0.5574 0.4269 0.0157
837 rows