File Info

Filename
HG03391_x_HG03453_FF_5.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG03391_x_HG03453_FF_5.features.tsv
Size
163.4 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 980796 GTCC G 0.000285 0.050 1 -3 1 719 167 552 89 1 11 0 66 0 0 549 0 3 0.5329 0.0000 0.0054 14.182 0.39 3.02 -2.62 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6992 0.3008 0.0000 1 0 0.6939 0.3061 0.0000 1 0 0.6865 0.3134 0.0000
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.050 1 -9 2 506 175 331 80 0 30 1 64 0 1 327 0 3 0.4571 0.0000 0.0121 4.833 0.53 8.02 -7.49 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3936 0.4973 0.1092 1 1 0.3893 0.4973 0.1134 1 1 0.3834 0.4973 0.1192
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 318 117 201 114 0 0 0 3 0 0 200 0 1 0.9744 0.0000 0.0050 117.000 0.13 3.33 -3.20 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0251 0.9749 0.0000 0 0 0.5350 0.4650 0.0000 0 0 0.7766 0.2234 0.0000
chr1 6469122 TTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -6 2 730 262 468 14 7 35 12 194 0 0 467 0 1 0.0534 0.0000 0.0021 6.676 0.71 5.03 -4.31 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8943 0.1057
chr1 6469126 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 730 249 481 24 6 106 13 100 0 0 480 1 0 0.0964 0.0000 0.0021 33.750 0.33 4.20 -3.87 10 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9976 0.0024
chr1 6469129 TCC T 0.500000 0.050 1 -2 2 733 254 479 28 11 18 93 104 0 0 479 0 0 0.1102 0.0000 0.0000 77.667 0.43 4.18 -3.75 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.050 1 3 1 563 130 433 101 7 19 0 3 0 0 433 0 0 0.7769 0.0000 0.0000 5.789 0.28 3.33 -3.06 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1008 0.8992 0.0000 0 0 0.6572 0.3428 0.0000 0 0 0.8123 0.1877 0.0000
chr1 11650722 CGCG C 0.500000 0.050 1 -3 1 563 132 431 114 1 13 0 4 0 0 431 0 0 0.8636 0.0000 0.0000 9.154 0.35 3.75 -3.40 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0274 0.9726 0.0000 0 0 0.5435 0.4565 0.0000 0 0 0.7813 0.2187 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.050 1 3 2 1011 182 829 85 1 11 0 85 0 0 823 0 6 0.4670 0.0000 0.0072 15.545 0.18 3.02 -2.85 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1718 0.5464 0.2818 1 1 0.1752 0.5429 0.2819 1 1 0.1796 0.5385 0.2819
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.050 1 3 2 305 114 191 107 0 5 0 2 0 0 190 1 0 0.9386 0.0000 0.0052 21.800 0.22 3.00 -2.78 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2108 0.7892 0.0000 0 0 0.7001 0.2999 0.0000 0 0 0.8219 0.1781 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 246 35 211 2 0 0 1 32 0 0 211 0 0 0.0571 0.0000 0.0000 35.000 0.00 1.22 -1.22 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9172 0.0828 2 1 0.0000 0.6266 0.3734 2 2 0.0000 0.4877 0.5123
chr1 25805164 C CGAG 0.500000 0.050 1 3 1 302 160 142 74 0 12 0 74 0 0 140 0 2 0.4625 0.0000 0.0141 12.333 1.11 2.92 -1.81 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2053 0.5445 0.2502 1 1 0.2077 0.5411 0.2512 1 1 0.2107 0.5369 0.2523
chr1 26282316 TGGGTCCAGGACA T 0.500000 0.050 1 -12 1 692 159 533 87 8 12 6 46 0 0 528 0 5 0.5472 0.0000 0.0094 18.125 11.92 25.65 -13.73 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7315 0.2534 0.0152 1 0 0.7183 0.2644 0.0173 1 0 0.7001 0.2794 0.0205
chr1 26282362 GCCGGGACCGGGA G 0.500000 0.050 1 -12 4 748 176 572 42 12 31 3 88 0 0 551 0 21 0.2386 0.0000 0.0367 4.800 6.62 21.09 -14.47 28 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0033 0.1300 0.8667 1 2 0.0040 0.1407 0.8553 1 2 0.0052 0.1560 0.8389
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.050 1 -6 4 776 188 588 46 3 27 10 102 0 0 588 0 0 0.2447 0.0000 0.0000 6.913 2.96 17.18 -14.22 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0020 0.1019 0.8961 1 2 0.0025 0.1117 0.8858 1 2 0.0033 0.1259 0.8708
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.050 1 -24 1 606 163 443 160 0 3 0 0 0 0 442 0 1 0.9816 0.0000 0.0023 53.333 0.96 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9169 0.0831 0.0000 0 0 0.9639 0.0361 0.0000 0 0 0.9698 0.0302 0.0000
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 1 403 155 248 6 0 13 1 135 0 0 244 0 4 0.0387 0.0000 0.0161 10.923 0.00 2.96 -2.96 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.6334 0.3666 2 2 0.0000 0.2436 0.7564
chr1 34761404 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 790 224 566 8 0 5 1 210 0 1 565 0 0 0.0357 0.0000 0.0018 43.800 1.38 1.90 -0.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.5730 0.4270 2 2 0.0000 0.1242 0.8758
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.050 1 6 1 612 154 458 0 0 34 2 118 0 0 458 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.471 5.70 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0468 0.9532 2 2 0.0000 0.0496 0.9504 2 2 0.0000 0.0536 0.9464
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 230 85 145 73 2 4 0 6 0 0 145 0 0 0.8588 0.0000 0.0000 20.250 0.21 2.83 -2.63 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1036 0.8964 0.0000 0 1 0.3936 0.6064 0.0000
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.050 1 3 2 635 178 457 80 1 25 0 72 0 0 453 0 4 0.4494 0.0000 0.0088 6.120 0.33 3.12 -2.80 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2855 0.5403 0.1742 1 1 0.2853 0.5373 0.1774 1 1 0.2849 0.5335 0.1816
chr1 62209972 ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC A 0.500000 0.050 1 -30 1 564 134 430 74 0 16 0 44 0 0 420 0 10 0.5522 0.0000 0.0233 7.375 0.64 21.86 -21.23 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4979 0.4332 0.0689 1 0 0.4896 0.4373 0.0731 1 0 0.4784 0.4426 0.0790
chr1 63323312 CGGCCGGAGCCGG C 0.500000 0.050 1 -12 2 572 140 432 83 2 6 0 49 1 1 423 0 7 0.5929 0.0023 0.0208 22.333 0.80 10.69 -9.90 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6397 0.3303 0.0301 1 0 0.6276 0.3392 0.0332 1 0 0.6112 0.3511 0.0377
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.050 1 3 1 156 66 90 1 0 2 0 63 0 0 88 0 2 0.0152 0.0000 0.0222 32.000 0.00 3.79 -3.79 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4981 0.5019 2 2 0.0000 0.2818 0.7182 2 2 0.0000 0.2339 0.7661
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.050 1 -6 1 463 119 344 3 0 4 0 112 0 0 336 0 8 0.0252 0.0000 0.0233 28.750 0.33 5.20 -4.86 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8658 0.1342 2 2 0.0000 0.2773 0.7227 2 2 0.0000 0.1465 0.8535
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.050 1 -6 1 460 128 332 5 0 22 2 99 0 0 332 0 0 0.0391 0.0000 0.0000 4.773 0.00 5.71 -5.71 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9963 0.0037 2 1 0.0000 0.7002 0.2998 2 2 0.0000 0.3634 0.6366
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 182 93 89 1 0 2 0 90 0 0 86 0 3 0.0108 0.0000 0.0337 45.500 0.00 3.06 -3.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3301 0.6699 2 2 0.0000 0.1644 0.8356 2 2 0.0000 0.1350 0.8650
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 2 504 125 379 55 0 7 0 63 1 1 371 1 5 0.4400 0.0026 0.0211 19.667 0.36 3.25 -2.89 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1204 0.4993 0.3803 1 1 0.1245 0.4992 0.3763 1 1 0.1301 0.4991 0.3708
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.050 1 -45 4 914 225 689 13 0 23 1 188 0 0 689 0 0 0.0578 0.0000 0.0000 8.783 0.15 8.49 -8.34 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9824 0.0176 2 1 0.0000 0.5744 0.4256
chr1 116579647 GGTCGTC G 0.500000 0.050 1 -6 3 649 207 442 170 0 34 0 3 0 0 442 0 0 0.8213 0.0000 0.0000 5.088 0.34 6.67 -6.33 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3543 0.6457 0.0000 0 0 0.9009 0.0991 0.0000 0 0 0.9516 0.0484 0.0000
chr1 116961400 TGTG T 0.500000 0.050 1 -3 2 421 127 294 58 0 6 0 63 0 0 293 0 1 0.4567 0.0000 0.0034 20.167 0.24 3.17 -2.93 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1685 0.5264 0.3051 1 1 0.1718 0.5244 0.3038 1 1 0.1760 0.5219 0.3021
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.050 1 -2 3 162 65 97 3 0 4 0 58 0 0 97 0 0 0.0462 0.0000 0.0000 15.250 0.00 2.14 -2.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9687 0.0313 2 1 0.0000 0.6393 0.3607 2 2 0.0000 0.4315 0.5685
chr1 146019625 G GCCT 0.500000 0.050 1 3 2 506 117 389 97 0 17 0 3 0 0 389 0 0 0.8291 0.0000 0.0000 5.882 0.35 3.33 -2.98 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0791 0.9209 0.0000 0 0 0.5960 0.4040 0.0000 0 0 0.7704 0.2296 0.0000
chr1 146994348 ATGGAAG A 0.500000 0.050 1 -6 1 515 246 269 125 0 7 1 113 0 0 265 0 4 0.5081 0.0000 0.0149 34.143 0.21 6.37 -6.16 49 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2938 0.5592 0.1470 1 1 0.2941 0.5548 0.1511 1 1 0.2942 0.5492 0.1566
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 256 83 173 4 0 6 1 72 0 0 171 0 2 0.0482 0.0000 0.0116 12.833 1.50 6.04 -4.54 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9905 0.0095 2 1 0.0000 0.6946 0.3054 2 2 0.0000 0.4228 0.5772
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.050 1 -36 1 1278 260 1018 8 0 47 1 204 0 0 997 0 21 0.0308 0.0000 0.0206 4.532 0.62 3.70 -3.08 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 2 0.0000 0.4427 0.5573 2 2 0.0000 0.0799 0.9201
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 242 83 159 3 0 15 3 62 0 0 159 0 0 0.0361 0.0000 0.0000 4.333 0.00 1.13 -1.13 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9588 0.0412 2 1 0.0000 0.5964 0.4036 2 2 0.0000 0.3915 0.6085
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 244 73 171 0 0 8 0 65 0 0 157 0 14 0.0000 0.0000 0.0819 8.125 10.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1205 0.8795 2 2 0.0000 0.1248 0.8752 2 2 0.0000 0.1308 0.8692
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.050 1 6 2 762 211 551 93 3 26 0 89 0 0 542 1 8 0.4408 0.0000 0.0163 7.400 1.16 6.07 -4.91 61 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2048 0.5581 0.2370 1 1 0.2075 0.5538 0.2388 1 1 0.2108 0.5483 0.2409
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.050 1 12 1 1207 293 914 123 1 61 2 106 4 2 889 0 19 0.4198 0.0044 0.0274 3.850 1.33 9.75 -8.42 13 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2386 0.5757 0.1857 1 1 0.2408 0.5700 0.1892 1 1 0.2434 0.5629 0.1937
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.050 1 -9 1 547 258 289 143 0 12 0 103 0 0 289 0 0 0.5543 0.0000 0.0000 20.500 0.37 8.39 -8.02 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7177 0.2685 0.0138 1 0 0.7057 0.2785 0.0158 1 0 0.6891 0.2921 0.0188
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 1 1237 289 948 1 1 86 3 198 0 0 876 2 70 0.0035 0.0000 0.0759 2.376 6.00 10.00 -4.00 1 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0215 0.9785 2 2 0.0000 0.0044 0.9956 2 2 0.0000 0.0030 0.9970
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 231 79 152 48 0 1 1 29 0 0 151 0 1 0.6076 0.0000 0.0066 78.000 1.62 3.07 -1.44 26 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4704 0.4434 0.0862 1 0 0.4624 0.4471 0.0905 1 1 0.4518 0.4519 0.0964
chr1 156583439 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 333 78 255 40 0 3 0 35 0 0 254 1 0 0.5128 0.0000 0.0039 25.000 0.28 1.54 -1.27 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2880 0.5183 0.1937 1 1 0.2870 0.5169 0.1961 1 1 0.2857 0.5152 0.1991
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.050 1 2 4 564 133 431 0 0 1 1 131 0 0 430 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 132.000 2.75 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0340 0.9660 2 2 0.0000 0.0363 0.9637 2 2 0.0000 0.0396 0.9604
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 1121 224 897 10 0 6 0 208 0 0 895 0 2 0.0446 0.0000 0.0022 36.333 0.20 1.40 -1.20 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8150 0.1850 2 2 0.0000 0.2103 0.7897
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 4 160 54 106 32 0 5 0 17 0 0 106 0 0 0.5926 0.0000 0.0000 9.800 0.03 4.24 -4.20 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4468 0.4519 0.1014 1 1 0.4393 0.4551 0.1055 1 1 0.4294 0.4593 0.1112
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 685 139 546 7 0 3 11 118 0 0 538 5 3 0.0504 0.0000 0.0147 68.000 1.14 4.76 -3.62 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7823 0.2177 2 2 0.0000 0.3336 0.6664
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.050 1 -2 3 680 138 542 7 0 0 8 123 0 0 534 0 8 0.0507 0.0000 0.0148 137.000 1.14 4.63 -3.48 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7780 0.2220 2 2 0.0000 0.3266 0.6734
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.050 1 3 1 502 232 270 10 117 44 1 60 0 3 266 0 1 0.0431 0.0000 0.0148 4.273 1.50 3.42 -1.92 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9155 0.0833 0.0012 1 0 0.9064 0.0921 0.0015 1 0 0.8929 0.1050 0.0021
chr1 209432291 TAGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 502 234 268 69 5 41 6 113 0 0 265 0 3 0.2949 0.0000 0.0112 4.707 2.81 3.01 -0.20 45 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0069 0.1889 0.8043 1 2 0.0081 0.2001 0.7917 1 2 0.0101 0.2158 0.7741
chr1 228409077 A AC 0.500000 0.050 1 1 2 629 155 474 70 1 18 0 66 0 0 474 0 0 0.4516 0.0000 0.0000 7.556 0.36 1.33 -0.98 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2871 0.5346 0.1783 1 1 0.2866 0.5320 0.1813 1 1 0.2859 0.5287 0.1853
chr1 235213963 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 1 139 42 97 22 0 4 1 15 0 0 97 0 0 0.5238 0.0000 0.0000 9.250 0.91 2.40 -1.49 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3242 0.5000 0.1758 1 1 0.3215 0.5000 0.1785 1 1 0.3179 0.5000 0.1821
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 245 109 136 2 0 6 0 101 0 0 136 0 0 0.0183 0.0000 0.0000 17.167 0.00 1.26 -1.26 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6651 0.3349 2 2 0.0000 0.2386 0.7614 2 2 0.0000 0.1572 0.8428
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 581 155 426 4 1 10 1 139 0 0 419 1 6 0.0258 0.0000 0.0164 14.500 0.50 3.32 -2.82 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9741 0.0259 2 2 0.0000 0.3823 0.6177 2 2 0.0000 0.1498 0.8502
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 732 191 541 102 0 4 0 85 0 0 537 0 4 0.5340 0.0000 0.0074 46.750 0.98 3.28 -2.30 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3839 0.5099 0.1062 1 1 0.3805 0.5090 0.1106 1 1 0.3757 0.5078 0.1165
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 1071 267 804 134 1 2 0 130 0 0 803 1 0 0.5019 0.0000 0.0012 132.500 0.35 1.59 -1.24 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2536 0.5758 0.1706 1 1 0.2554 0.5701 0.1745 1 1 0.2575 0.5630 0.1795
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.050 1 -2 1 434 135 299 36 0 0 0 99 0 0 299 0 0 0.2667 0.0000 0.0000 135.000 2.06 4.40 -2.35 32 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0018 0.0946 0.9036 1 2 0.0022 0.1042 0.8936 1 2 0.0030 0.1181 0.8788
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.050 1 2 1 520 27 493 8 0 0 2 17 0 0 491 0 2 0.2963 0.0000 0.0041 27.000 3.00 3.29 -0.29 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1169 0.4606 0.4225 1 1 0.1207 0.4641 0.4152 1 1 0.1236 0.4764 0.4000
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.050 1 9 1 1063 142 921 40 0 17 0 85 0 0 909 0 12 0.2817 0.0000 0.0130 7.353 0.40 8.67 -8.27 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0031 0.1233 0.8735 1 2 0.0038 0.1340 0.8622 1 2 0.0050 0.1492 0.8458
chr1 248522528 CAA C 0.500000 0.050 1 -2 3 594 157 437 72 0 1 0 84 0 0 437 0 0 0.4586 0.0000 0.0000 156.000 0.26 2.15 -1.89 18 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1155 0.5060 0.3785 1 1 0.1198 0.5054 0.3748 1 1 0.1255 0.5047 0.3698
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.050 1 -7 1 625 173 452 161 1 6 0 5 0 0 452 0 0 0.9306 0.0000 0.0000 27.833 0.32 7.60 -7.28 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0165 0.9835 0.0000 0 0 0.6583 0.3417 0.0000 0 0 0.8834 0.1166 0.0000
chr1 248650008 T TA 0.500000 0.050 1 1 2 972 283 689 276 0 2 0 5 0 0 689 0 0 0.9753 0.0000 0.0000 140.500 0.41 3.80 -3.39 152 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2384 0.7616 0.0000 0 0 0.9700 0.0300 0.0000 0 0 0.9915 0.0085 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.050 1 -3 1 212 107 105 44 1 7 0 55 0 0 105 0 0 0.4112 0.0000 0.0000 14.286 0.16 2.84 -2.68 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1637 0.5208 0.3155 1 1 0.1682 0.5200 0.3119 1 1 0.1741 0.5189 0.3071
chr2 20667362 GGGC G 0.002551 0.050 1 -3 5 376 132 244 50 18 12 1 51 0 0 244 0 0 0.3788 0.0000 0.0000 10.000 11.22 3.00 8.22 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6537 0.3460 0.0003 1 0 0.6493 0.3503 0.0004 1 0 0.6434 0.3562 0.0004
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.050 1 -9 1 543 206 337 180 0 22 0 4 0 1 336 0 0 0.8738 0.0000 0.0030 8.364 0.23 7.25 -7.02 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2399 0.7601 0.0000 0 0 0.9314 0.0686 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.050 1 9 1 520 121 399 54 1 24 0 42 0 0 394 0 5 0.4463 0.0000 0.0125 4.000 0.57 7.60 -7.02 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5406 0.4432 0.0162 1 0 0.5391 0.4443 0.0166 1 0 0.5368 0.4460 0.0172
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.050 1 3 1 227 60 167 0 0 2 0 58 0 0 164 0 3 0.0000 0.0000 0.0180 29.000 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1773 0.8227 2 2 0.0000 0.1818 0.8182 2 2 0.0000 0.1881 0.8119
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 1 464 124 340 8 0 21 0 95 0 0 337 0 3 0.0645 0.0000 0.0088 4.905 1.50 3.09 -1.59 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9491 0.0509 2 1 0.0000 0.6510 0.3490
chr2 37084557 C CAGAGAGCTGTCAGGTA 0.500000 0.050 1 16 1 182 114 68 91 0 22 0 1 0 0 67 0 1 0.7982 0.0000 0.0147 4.182 0.09 16.00 -15.91 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2739 0.7261 0.0000 0 0 0.7127 0.2873 0.0000 0 0 0.8082 0.1918 0.0000
chr2 39769817 ATTC A 0.500000 0.050 1 -3 3 432 123 309 109 0 9 0 5 0 0 309 0 0 0.8862 0.0000 0.0000 12.667 0.17 3.00 -2.83 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0044 0.9956 0.0000 0 1 0.3428 0.6572 0.0000 0 0 0.6802 0.3198 0.0000
chr2 43765562 AAGC A 0.500000 0.050 1 -3 1 235 99 136 92 0 5 0 2 0 0 136 0 0 0.9293 0.0000 0.0000 18.800 0.05 3.00 -2.95 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2790 0.7210 0.0000 0 0 0.7177 0.2823 0.0000 0 0 0.8118 0.1882 0.0000
chr2 65072937 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 3 511 134 377 64 0 6 0 64 0 0 375 0 2 0.4776 0.0000 0.0053 21.333 0.33 3.45 -3.12 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2080 0.5384 0.2535 1 1 0.2102 0.5355 0.2543 1 1 0.2130 0.5319 0.2551
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 1 575 149 426 1 2 39 52 55 0 0 421 3 2 0.0067 0.0000 0.0117 2.816 0.00 3.31 -3.31 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2587 0.7413 2 2 0.0000 0.1225 0.8775 2 2 0.0000 0.0999 0.9001
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.050 1 -6 1 576 153 423 3 1 92 0 57 0 0 420 0 3 0.0196 0.0000 0.0071 0.678 0.00 6.25 -6.25 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9900 0.0100 2 1 0.0000 0.7645 0.2355 2 1 0.0000 0.5236 0.4764
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 459 105 354 41 0 7 0 57 0 0 352 0 2 0.3905 0.0000 0.0056 14.000 0.27 3.14 -2.87 17 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0804 0.4426 0.4769 1 2 0.0847 0.4463 0.4690 1 2 0.0906 0.4510 0.4583
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.050 1 -9 1 445 167 278 154 0 11 0 2 0 0 278 0 0 0.9222 0.0000 0.0000 14.182 0.31 10.50 -10.19 44 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6480 0.3520 0.0000 0 0 0.9214 0.0786 0.0000 0 0 0.9502 0.0498 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 368 145 223 68 1 11 2 63 0 0 223 0 0 0.4690 0.0000 0.0000 13.400 0.74 3.49 -2.76 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2801 0.5354 0.1845 1 1 0.2799 0.5328 0.1874 1 1 0.2795 0.5294 0.1911
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 4 546 167 379 0 0 24 7 136 0 0 371 0 8 0.0000 0.0000 0.0211 5.958 3.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0219 0.9781 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0261 0.9739
chr2 97702739 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 351 149 202 66 0 6 0 77 0 0 202 0 0 0.4430 0.0000 0.0000 23.833 0.36 1.22 -0.86 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1239 0.5084 0.3677 1 1 0.1281 0.5076 0.3643 1 1 0.1336 0.5067 0.3597
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.050 1 3 4 490 137 353 63 2 1 0 71 0 0 353 0 0 0.4599 0.0000 0.0000 136.000 0.19 3.21 -3.02 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1670 0.5306 0.3024 1 1 0.1703 0.5283 0.3014 1 1 0.1746 0.5254 0.3000
chr2 112542424 TTCCGGCGTGTACCGAGAGACTGGCG T 0.500000 0.050 1 -25 1 453 134 319 122 0 10 0 2 0 0 319 0 0 0.9104 0.0000 0.0000 12.400 0.57 12.50 -11.93 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4525 0.5475 0.0000 0 0 0.8426 0.1574 0.0000 0 0 0.8989 0.1011 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.050 1 6 1 582 121 461 0 0 0 0 121 0 0 451 0 10 0.0000 0.0000 0.0217 121.000 6.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0357 0.9643 2 2 0.0000 0.0380 0.9620 2 2 0.0000 0.0415 0.9585
chr2 130075142 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 1269 370 899 346 2 15 0 7 0 0 899 0 0 0.9351 0.0000 0.0000 23.667 0.12 2.71 -2.59 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0654 0.9346 0.0000 0 0 0.9803 0.0197 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 335 121 214 0 0 22 2 97 0 0 207 0 7 0.0000 0.0000 0.0327 4.500 6.03 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0649 0.9351 2 2 0.0000 0.0682 0.9318 2 2 0.0000 0.0731 0.9269
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.050 1 -1 1 683 186 497 174 0 8 0 4 0 0 497 0 0 0.9355 0.0000 0.0000 22.250 0.75 2.75 -2.00 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1109 0.8891 0.0000 0 0 0.8361 0.1639 0.0000 0 0 0.9363 0.0637 0.0000
chr2 151379531 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 221 59 162 18 14 11 3 13 0 0 162 0 0 0.3051 0.0000 0.0000 3.636 1.06 2.92 -1.87 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4317 0.4587 0.1096 1 1 0.4247 0.4616 0.1137 1 1 0.4155 0.4652 0.1193
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 221 59 162 18 16 13 6 6 0 0 162 0 0 0.3051 0.0000 0.0000 3.333 0.89 2.50 -1.61 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5190 0.4083 0.0727 1 0 0.5027 0.4214 0.0759 1 1 0.4258 0.5053 0.0689
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.050 1 6 2 165 57 108 14 0 19 1 23 1 0 104 0 3 0.2456 0.0093 0.0370 2.000 0.29 5.43 -5.15 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1244 0.4718 0.4039 1 1 0.1282 0.4737 0.3980 1 1 0.1335 0.4763 0.3903
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 2 491 119 372 57 0 18 0 44 0 0 372 0 0 0.4790 0.0000 0.0000 5.611 0.51 3.07 -2.56 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4055 0.4824 0.1121 1 1 0.4002 0.4835 0.1163 1 1 0.3931 0.4850 0.1219
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.050 1 -2 1 359 134 225 127 0 1 0 6 0 0 225 0 0 0.9478 0.0000 0.0000 133.000 0.63 4.50 -3.87 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.2945 0.7055 0.0000 0 0 0.6932 0.3068 0.0000
chr2 184936130 GATT G 0.500000 0.050 1 -3 2 683 170 513 84 0 0 0 86 0 0 512 0 1 0.4941 0.0000 0.0019 170.000 0.06 3.59 -3.53 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1922 0.5493 0.2585 1 1 0.1950 0.5456 0.2594 1 1 0.1987 0.5410 0.2603
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 333 142 191 8 0 21 49 64 0 0 186 0 5 0.0563 0.0000 0.0262 3.619 0.12 5.00 -4.88 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9312 0.0688 2 1 0.0000 0.5793 0.4207
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 333 142 191 50 1 29 3 59 0 0 186 0 5 0.3521 0.0000 0.0262 3.793 2.56 5.39 -2.83 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0929 0.4667 0.4404 1 1 0.0972 0.4688 0.4340 1 1 0.1031 0.4715 0.4254
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.050 1 3 1 333 138 195 8 47 25 11 47 0 0 195 0 0 0.0580 0.0000 0.0000 4.240 0.25 2.83 -2.58 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1777 0.5222 0.3001 1 1 0.1806 0.5205 0.2989 1 1 0.1844 0.5184 0.2972
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.050 1 3 1 279 98 181 50 1 5 0 42 0 0 180 0 1 0.5102 0.0000 0.0055 18.600 0.16 3.00 -2.84 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3374 0.5097 0.1530 1 1 0.3347 0.5089 0.1565 1 1 0.3310 0.5079 0.1611
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 2 532 148 384 56 0 18 1 73 0 1 382 0 1 0.3784 0.0000 0.0052 7.222 0.93 7.96 -7.03 30 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0781 0.4506 0.4713 1 2 0.0824 0.4537 0.4639 1 1 0.0883 0.4577 0.4540
chr2 217848163 G GGCTGCT 0.500000 0.050 1 6 1 910 204 706 92 3 52 0 57 0 0 701 0 5 0.4510 0.0000 0.0071 2.980 2.25 7.37 -5.12 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6560 0.3177 0.0262 1 0 0.6438 0.3270 0.0292 1 0 0.6272 0.3394 0.0334
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.050 1 -27 1 644 225 419 212 1 6 1 5 0 0 418 0 1 0.9422 0.0000 0.0024 36.333 0.56 22.00 -21.44 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 0 0.7503 0.2497 0.0000 0 0 0.9402 0.0598 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.050 1 -3 2 323 136 187 75 0 5 0 56 0 0 187 0 0 0.5515 0.0000 0.0000 26.200 0.48 4.32 -3.84 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4833 0.4430 0.0737 1 0 0.4756 0.4465 0.0780 1 0 0.4651 0.4511 0.0839
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.050 1 3 1 186 75 111 41 0 4 0 30 0 0 110 0 1 0.5467 0.0000 0.0090 17.750 0.29 3.03 -2.74 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3698 0.4926 0.1376 1 1 0.3656 0.4931 0.1413 1 1 0.3600 0.4937 0.1463
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 890 227 663 220 1 1 0 5 0 0 663 0 0 0.9692 0.0000 0.0000 226.000 0.71 1.00 -0.29 114 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0703 0.9297 0.0000 0 0 0.8922 0.1078 0.0000 0 0 0.9689 0.0311 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.050 1 -3 1 368 101 267 0 0 25 6 70 0 0 267 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.040 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1287 0.8713 2 2 0.0000 0.1331 0.8669 2 2 0.0000 0.1393 0.8607
chr2 241096075 CATT C 0.500000 0.050 1 -3 1 618 161 457 154 0 1 1 5 1 0 456 0 0 0.9565 0.0022 0.0022 160.000 0.45 7.40 -6.95 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0081 0.9919 0.0000 0 0 0.5279 0.4721 0.0000 0 0 0.8325 0.1675 0.0000
chr2 241096109 GTCATCC G 0.500000 0.050 1 -6 1 638 194 444 168 0 19 0 7 1 0 443 0 0 0.8660 0.0023 0.0023 9.211 0.58 7.00 -6.42 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.3759 0.6241 0.0000 0 0 0.8100 0.1900 0.0000
chr2 241200178 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 148 79 69 70 1 4 0 4 0 0 69 0 0 0.8861 0.0000 0.0000 25.000 0.53 1.00 -0.47 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0097 0.9903 0.0000 0 1 0.2903 0.7097 0.0000 0 0 0.5575 0.4425 0.0000
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.050 1 -2 1 481 118 363 3 0 0 0 115 0 0 362 0 1 0.0254 0.0000 0.0028 118.000 0.67 2.23 -1.56 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8784 0.1216 2 2 0.0000 0.2979 0.7021 2 2 0.0000 0.1590 0.8410
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.050 1 3 1 625 155 470 81 0 1 0 73 0 0 467 0 3 0.5226 0.0000 0.0064 154.000 0.37 3.30 -2.93 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0748 0.5903 0.3349 1 1 0.0745 0.5853 0.3402 1 1 0.0741 0.5789 0.3470
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.050 1 12 2 516 126 390 3 0 17 1 105 0 0 364 0 26 0.0238 0.0000 0.0667 6.412 0.33 10.91 -10.58 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9546 0.0454 2 1 0.0000 0.5544 0.4456 2 2 0.0000 0.3592 0.6408
chr3 12901258 TGGC T 0.002987 0.050 1 -3 1 513 126 387 84 0 6 0 36 0 0 387 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 20.000 0.49 3.89 -3.40 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9023 0.0977 0.0000 1 0 0.8950 0.1050 0.0000 1 0 0.8846 0.1154 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.050 1 6 2 430 97 333 5 0 3 5 84 0 0 333 0 0 0.0515 0.0000 0.0000 31.333 0.40 5.83 -5.43 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.7602 0.2398 2 2 0.0000 0.4340 0.5660
chr3 33093215 GTCC G 0.500000 0.050 1 -3 1 661 170 491 86 1 4 0 79 0 0 488 0 3 0.5059 0.0000 0.0061 41.500 0.29 3.14 -2.85 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2832 0.5439 0.1728 1 1 0.2832 0.5406 0.1761 1 1 0.2831 0.5365 0.1805
chr3 40462029 ACTGCTGCTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 557 193 364 79 3 22 2 87 0 0 357 0 7 0.4093 0.0000 0.0192 7.727 2.62 8.53 -5.91 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0993 0.4973 0.4034 1 1 0.1037 0.4972 0.3991 1 1 0.1097 0.4972 0.3931
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.050 1 3 1 679 231 448 83 10 46 2 90 0 0 446 0 2 0.3593 0.0000 0.0045 4.022 0.19 3.07 -2.87 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2122 0.5566 0.2313 1 1 0.2146 0.5523 0.2331 1 1 0.2176 0.5470 0.2354
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.050 1 6 1 679 231 448 94 1 125 3 8 0 0 447 0 1 0.4069 0.0000 0.0022 0.876 0.55 3.00 -2.45 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0132 0.9868 0.0000 0 1 0.1673 0.8327 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.050 1 -2 5 708 197 511 0 0 10 0 187 0 0 506 0 5 0.0000 0.0000 0.0098 18.700 2.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0079 0.9921 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0099 0.9901
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 295 124 171 0 0 5 1 118 0 0 166 0 5 0.0000 0.0000 0.0292 23.800 5.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0424 0.9576 2 2 0.0000 0.0450 0.9550 2 2 0.0000 0.0488 0.9512
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 590 142 448 0 0 18 10 114 0 0 444 0 4 0.0000 0.0000 0.0089 6.833 3.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0385 0.9615 2 2 0.0000 0.0410 0.9590 2 2 0.0000 0.0446 0.9554
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.050 1 -3 3 356 79 277 0 0 9 39 31 0 0 277 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.778 3.58 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1470 0.8530 2 2 0.0000 0.1515 0.8485 2 2 0.0000 0.1578 0.8422
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.050 1 -6 3 356 81 275 4 0 38 0 39 0 0 275 0 0 0.0494 0.0000 0.0000 1.194 0.75 5.95 -5.20 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 1 0.0000 0.8639 0.1361 2 1 0.0000 0.6645 0.3355
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.050 1 -6 1 478 163 315 79 0 21 0 63 0 0 314 0 1 0.4847 0.0000 0.0032 7.100 0.20 5.16 -4.96 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4167 0.4842 0.0991 1 1 0.4115 0.4851 0.1034 1 1 0.4044 0.4862 0.1093
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.050 1 10 2 210 121 89 0 0 10 0 111 0 0 86 0 3 0.0000 0.0000 0.0337 11.100 6.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0537 0.9463 2 2 0.0000 0.0567 0.9433 2 2 0.0000 0.0611 0.9389
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 229 76 153 0 0 5 0 71 0 0 151 0 2 0.0000 0.0000 0.0131 14.200 3.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1374 0.8626 2 2 0.0000 0.1418 0.8582 2 2 0.0000 0.1481 0.8519
chr3 73062330 C CA 0.500000 0.050 1 1 5 575 161 414 157 0 1 0 3 0 0 414 0 0 0.9752 0.0000 0.0000 160.000 0.45 1.33 -0.89 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2841 0.7159 0.0000 0 0 0.8666 0.1334 0.0000 0 0 0.9340 0.0660 0.0000
chr3 98087856 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 635 157 478 133 2 14 0 8 0 0 478 0 0 0.8471 0.0000 0.0000 10.214 0.45 1.50 -1.05 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1219 0.8781 0.0000 0 0 0.5683 0.4317 0.0000
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.050 1 -9 3 764 236 528 114 0 14 0 108 0 0 512 0 16 0.4831 0.0000 0.0303 15.857 1.25 9.27 -8.02 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1239 0.5432 0.3329 1 1 0.1283 0.5399 0.3319 1 1 0.1341 0.5357 0.3301
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 534 135 399 63 0 16 0 56 0 0 399 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 7.438 0.21 1.16 -0.95 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3188 0.5216 0.1596 1 1 0.3170 0.5200 0.1630 1 1 0.3146 0.5179 0.1675
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 346 100 246 45 0 8 0 47 0 0 246 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 11.500 0.58 1.30 -0.72 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2133 0.5268 0.2599 1 1 0.2151 0.5248 0.2601 1 1 0.2174 0.5223 0.2603
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 137 52 85 44 4 1 0 3 0 0 85 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 47.000 0.20 1.00 -0.80 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0272 0.9728 0.0000 0 1 0.3074 0.6926 0.0000 0 0 0.5078 0.4922 0.0000
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1210 323 887 3 3 89 18 210 0 0 885 0 2 0.0093 0.0000 0.0023 2.584 2.00 3.10 -1.10 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3271 0.6729 2 2 0.0000 0.0291 0.9709 2 2 0.0000 0.0140 0.9860
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1219 332 887 227 14 71 11 9 0 0 887 0 0 0.6837 0.0000 0.0000 3.725 2.62 7.44 -4.82 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.2466 0.7534 0.0000
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.050 1 12 1 533 162 371 2 0 22 1 137 0 0 371 0 0 0.0123 0.0000 0.0000 6.364 0.00 6.89 -6.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4457 0.5543 2 2 0.0000 0.1116 0.8884 2 2 0.0000 0.0711 0.9289
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.050 1 3 3 589 173 416 164 0 2 0 7 0 0 416 0 0 0.9480 0.0000 0.0000 85.500 0.16 3.14 -2.98 106 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3474 0.6526 0.0000 0 0 0.7908 0.2092 0.0000
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.050 1 18 2 763 130 633 57 0 29 0 44 0 0 632 0 1 0.4385 0.0000 0.0016 3.483 0.40 8.36 -7.96 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3911 0.4895 0.1194 1 1 0.3864 0.4902 0.1235 1 1 0.3800 0.4910 0.1290
chr3 127660520 AGAAGAG A 0.500000 0.050 1 -6 2 783 189 594 94 2 13 0 80 0 0 593 0 1 0.4974 0.0000 0.0017 13.538 0.17 5.76 -5.59 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4149 0.4909 0.0942 1 1 0.4102 0.4912 0.0986 1 1 0.4037 0.4917 0.1046
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 193 86 107 46 1 1 0 38 0 0 107 0 0 0.5349 0.0000 0.0000 85.000 0.04 2.61 -2.56 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3530 0.5020 0.1450 1 1 0.3496 0.5018 0.1486 1 1 0.3450 0.5016 0.1534
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 429 148 281 82 1 5 0 60 0 0 280 0 1 0.5541 0.0000 0.0036 28.600 0.35 2.18 -1.83 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5215 0.4192 0.0593 1 0 0.5126 0.4240 0.0634 1 0 0.5006 0.4303 0.0691
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 378 167 211 123 0 31 1 12 0 0 211 0 0 0.7365 0.0000 0.0000 4.387 0.24 3.17 -2.93 77 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 1 0.1326 0.8674 0.0000
chr3 184059998 CA C 0.500000 0.050 1 -1 4 982 251 731 239 1 1 0 10 0 0 731 0 0 0.9522 0.0000 0.0000 250.000 0.32 1.00 -0.68 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3199 0.6801 0.0000 0 0 0.8848 0.1152 0.0000
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.050 1 3 1 568 160 408 5 2 25 1 127 0 0 405 0 3 0.0312 0.0000 0.0074 5.400 0.00 3.31 -3.31 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.8032 0.1968 2 2 0.0000 0.3657 0.6343
chr3 187698970 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 408 103 305 64 1 1 2 35 0 0 304 1 0 0.6214 0.0000 0.0033 101.000 0.22 3.43 -3.21 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5959 0.3614 0.0427 1 0 0.5843 0.3694 0.0463 1 0 0.5687 0.3798 0.0515
chr3 187698974 CA C 0.500000 0.050 1 -1 3 408 101 307 66 0 0 1 34 0 0 306 1 0 0.6535 0.0000 0.0033 101.000 0.21 3.59 -3.38 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6401 0.3273 0.0326 1 0 0.6275 0.3366 0.0359 1 0 0.6105 0.3490 0.0406
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 545 182 363 169 2 6 0 5 0 0 362 0 1 0.9286 0.0000 0.0028 29.333 0.11 2.60 -2.49 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 0 0.5553 0.4447 0.0000 0 0 0.8668 0.1332 0.0000
chr3 194617730 CG C 0.500000 0.050 1 -1 4 279 63 216 59 2 0 0 2 0 0 216 0 0 0.9365 0.0000 0.0000 63.000 0.46 3.00 -2.54 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1515 0.8485 0.0000 0 0 0.5423 0.4577 0.0000 0 0 0.6724 0.3276 0.0000
chr3 195527869 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 304 102 202 63 16 18 0 5 0 3 199 0 0 0.6176 0.0000 0.0149 3.833 0.97 2.00 -1.03 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.2105 0.7895 0.0000 0 0 0.5192 0.4808 0.0000
chr3 195721040 TTTC T 0.500000 0.050 1 -3 4 249 144 105 131 0 10 0 3 0 0 105 0 0 0.9097 0.0000 0.0000 13.400 0.56 5.00 -4.44 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1679 0.8321 0.0000 0 0 0.7733 0.2267 0.0000 0 0 0.8834 0.1166 0.0000
chr3 195781111 T TGAAGAGGGGTGGTGTGTCCTGTGGATAATGAGGAAGCATTGGTGACAG 0.500000 0.050 1 48 1 3055 677 2378 399 12 141 12 113 9 12 2342 7 8 0.5894 0.0038 0.0151 3.912 2.24 5.89 -3.66 97 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 195785502 G GGAT 0.500000 0.050 1 3 1 3083 680 2403 260 6 56 10 348 150 74 2178 0 1 0.3824 0.0624 0.0936 11.327 2.30 5.92 -3.62 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9936 0.0064 0.0000 1 0 0.9923 0.0077 0.0000 1 0 0.9902 0.0098 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.050 1 15 1 889 200 689 186 0 11 0 3 0 0 688 1 0 0.9300 0.0000 0.0015 17.182 0.39 15.33 -14.94 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4293 0.5707 0.0000 0 0 0.9256 0.0744 0.0000 0 0 0.9640 0.0360 0.0000
chr3 196569036 A AGCG 0.500000 0.050 1 3 1 253 75 178 31 0 3 1 40 0 0 176 0 2 0.4133 0.0000 0.0112 24.000 1.03 3.27 -2.24 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1220 0.4814 0.3966 1 1 0.1260 0.4827 0.3914 1 1 0.1313 0.4843 0.3844
chr3 196569044 CGGCGCG C 0.500000 0.050 1 -6 2 253 87 166 77 1 6 0 3 0 0 165 0 1 0.8851 0.0000 0.0060 13.500 1.95 6.00 -4.05 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0104 0.9896 0.0000 0 1 0.3221 0.6779 0.0000 0 0 0.5955 0.4045 0.0000
chr3 198153257 CTGGCAGCAG C 0.500000 0.050 1 -9 2 313 125 188 25 2 14 67 17 0 0 186 1 1 0.2000 0.0000 0.0106 12.333 0.04 9.94 -9.90 15 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0027 0.1108 0.8865 1 2 0.0033 0.1212 0.8755 1 2 0.0032 0.3579 0.6389
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -6 1 310 125 185 1 0 33 3 88 0 0 183 0 2 0.0080 0.0000 0.0108 2.758 0.00 8.07 -8.07 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.3317 0.6683 2 2 0.0000 0.1655 0.8345 2 2 0.0000 0.1359 0.8641
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -9 1 310 125 185 3 0 31 28 63 0 0 182 1 2 0.0240 0.0000 0.0162 3.032 0.00 8.81 -8.81 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9264 0.0736 2 2 0.0000 0.4227 0.5773 2 2 0.0000 0.2432 0.7568
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.050 1 21 1 561 115 446 0 0 2 0 113 0 0 381 4 61 0.0000 0.0000 0.1457 56.500 15.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0036 0.9964 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr4 3074923 AGC A 0.021170 0.050 1 -2 1 576 233 343 198 3 6 26 0 1 3 339 0 0 0.8498 0.0029 0.0117 42.600 3.78 58 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5698 0.4302 0.0000 0 0 0.9687 0.0313 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000
chr4 3074926 AG A 0.010091 0.050 1 -1 1 576 229 347 144 56 25 4 0 2 2 343 0 0 0.6288 0.0058 0.0115 33.667 2.92 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr4 3074966 G GCCGCCGCCT 0.001791 0.050 1 9 2 574 212 362 100 2 10 6 94 0 1 358 1 2 0.4717 0.0000 0.0110 20.100 1.76 8.32 -6.56 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4465 0.5528 0.0007 1 1 0.4508 0.5485 0.0008 1 1 0.4562 0.5431 0.0008
chr4 3075022 AGCCGCCCCCGCC A 0.000900 0.050 1 -12 1 574 214 360 170 2 34 0 8 1 1 358 0 0 0.7944 0.0028 0.0056 5.294 2.11 11.50 -9.39 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1578 0.8422 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.050 1 -12 1 623 144 479 4 0 12 0 128 0 0 470 0 9 0.0278 0.0000 0.0188 11.000 0.50 11.48 -10.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 1 0.0000 0.8696 0.1304 2 1 0.0000 0.6915 0.3085
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 2 701 202 499 174 0 24 0 4 6 2 491 0 0 0.8614 0.0120 0.0160 7.417 0.91 7.75 -6.84 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1255 0.8745 0.0000 0 0 0.8608 0.1392 0.0000 0 0 0.9469 0.0531 0.0000
chr4 56314410 C CGGAGCGGAG 0.500000 0.050 1 9 1 644 153 491 139 0 12 0 2 0 0 490 0 1 0.9085 0.0000 0.0020 11.750 0.88 10.00 -9.12 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1978 0.8022 0.0000 0 0 0.8060 0.1940 0.0000 0 0 0.9018 0.0982 0.0000
chr4 56378269 GTTC G 0.500000 0.050 1 -3 1 260 85 175 81 0 1 0 3 0 0 175 0 0 0.9529 0.0000 0.0000 84.000 0.10 3.00 -2.90 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0542 0.9458 0.0000 0 1 0.4985 0.5015 0.0000 0 0 0.6957 0.3043 0.0000
chr4 56448597 GGTACAGATAAAACAA G 0.500000 0.050 1 -15 2 362 112 250 98 0 12 0 2 0 0 250 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 8.333 0.15 0.00 0.15 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3102 0.6898 0.0000 0 0 0.7467 0.2533 0.0000 0 0 0.8328 0.1672 0.0000
chr4 70409914 A AC 0.500000 0.050 1 1 2 616 251 365 235 3 9 0 4 0 0 365 0 0 0.9363 0.0000 0.0000 26.778 0.26 1.00 -0.74 95 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3882 0.6118 0.0000 0 0 0.9611 0.0389 0.0000 0 0 0.9855 0.0145 0.0000
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.050 1 3 1 613 220 393 86 80 37 12 5 0 2 391 0 0 0.3909 0.0000 0.0051 4.622 0.40 3.00 -2.60 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0078 0.9922 0.0000 0 1 0.4938 0.5062 0.0000 0 0 0.8084 0.1916 0.0000
chr4 78870928 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 614 228 386 95 2 28 5 98 0 0 384 0 2 0.4167 0.0000 0.0052 7.071 0.54 3.16 -2.63 39 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1463 0.5440 0.3097 1 1 0.1503 0.5406 0.3091 1 1 0.1556 0.5365 0.3080
chr4 78870982 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 615 193 422 137 10 41 0 5 1 0 420 1 0 0.7098 0.0024 0.0047 3.683 1.49 3.20 -1.71 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0109 0.9891 0.0000 0 0 0.5613 0.4387 0.0000 0 0 0.8364 0.1636 0.0000
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 161 76 85 1 0 2 0 73 0 0 85 0 0 0.0132 0.0000 0.0000 37.000 0.00 1.10 -1.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4472 0.5528 2 2 0.0000 0.2435 0.7565 2 2 0.0000 0.2013 0.7987
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.050 1 18 1 2288 467 1821 155 11 147 4 150 4 2 1803 3 9 0.3319 0.0022 0.0099 2.193 1.52 8.76 -7.24 49 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2554 0.5933 0.1513 1 1 0.2577 0.5864 0.1559 1 1 0.2605 0.5777 0.1618
chr4 87614693 CAGCAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 2328 494 1834 431 7 39 8 9 2 4 1826 2 0 0.8725 0.0011 0.0044 12.216 4.04 7.56 -3.51 81 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7530 0.2470 0.0000 0 0 0.9920 0.0080 0.0000
chr4 87614933 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.050 1 -18 1 2829 709 2120 350 12 94 13 240 100 73 1899 4 44 0.4937 0.0472 0.1042 6.587 1.47 11.63 -10.16 86 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr4 87615161 CGATAGCAGCAACAGCAGT C 0.500000 0.050 1 -18 1 3399 706 2693 316 24 88 17 261 6 24 2642 8 13 0.4476 0.0022 0.0189 7.600 4.73 12.44 -7.71 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8888 0.1105 0.0007 1 0 0.8807 0.1184 0.0009 1 0 0.8690 0.1297 0.0013
chr4 87615164 TAGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 3332 606 2726 56 83 63 138 266 6 24 2670 13 13 0.0924 0.0022 0.0205 8.850 2.34 5.21 -2.88 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.050 1 9 1 3670 808 2862 7 14 37 17 733 36 27 2477 209 113 0.0087 0.0126 0.1345 21.886 6.71 8.45 -1.73 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5101 0.4899
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 3905 903 3002 713 17 126 7 40 39 75 2633 127 128 0.7896 0.0130 0.1229 6.218 3.85 10.38 -6.53 109 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 88521914 TCTTA T 0.500000 0.050 1 -4 2 316 88 228 81 0 3 0 4 0 0 228 0 0 0.9205 0.0000 0.0000 28.333 0.12 3.25 -3.13 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0111 0.9889 0.0000 0 1 0.3378 0.6622 0.0000 0 0 0.6119 0.3881 0.0000
chr4 100187718 GT G 0.500000 0.050 1 -1 3 360 102 258 59 0 4 0 39 0 0 255 0 3 0.5784 0.0000 0.0116 24.500 0.15 2.21 -2.05 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4624 0.4515 0.0861 1 0 0.4550 0.4546 0.0904 1 1 0.4450 0.4587 0.0963
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.050 1 -3 1 170 69 101 3 0 2 0 64 0 0 98 0 3 0.0435 0.0000 0.0297 33.500 0.00 3.06 -3.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9612 0.0388 2 1 0.0000 0.5869 0.4131 2 2 0.0000 0.3796 0.6204
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 4 527 208 319 0 0 19 9 180 0 0 308 1 10 0.0000 0.0000 0.0345 9.947 2.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr4 140392262 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 2 306 98 208 62 0 0 0 36 0 0 206 0 2 0.6327 0.0000 0.0096 98.000 0.16 3.22 -3.06 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5608 0.3869 0.0523 1 0 0.5502 0.3936 0.0562 1 0 0.5358 0.4025 0.0617
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 491 185 306 0 147 32 0 6 0 5 298 3 0 0.0000 0.0000 0.0261 5.100 3.50 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.3585 0.6415 0.0000 0 0 0.7582 0.2418 0.0000
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.050 1 -9 2 495 194 301 6 0 19 3 166 0 1 286 1 13 0.0309 0.0000 0.0498 9.158 3.50 9.45 -5.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 2 0.0000 0.4618 0.5382 2 2 0.0000 0.1278 0.8722
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.050 1 5 2 259 122 137 53 0 4 0 65 0 0 132 0 5 0.4344 0.0000 0.0365 29.500 0.11 4.80 -4.69 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0851 0.4581 0.4568 1 1 0.0894 0.4608 0.4499 1 1 0.0953 0.4642 0.4405
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 267 105 162 86 0 13 0 6 0 0 162 0 0 0.8190 0.0000 0.0000 7.077 0.71 5.17 -4.46 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1321 0.8679 0.0000 0 1 0.4584 0.5416 0.0000
chr4 158715313 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 235 89 146 84 1 2 0 2 1 0 145 0 0 0.9438 0.0068 0.0068 43.500 0.21 1.00 -0.79 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2580 0.7420 0.0000 0 0 0.6881 0.3119 0.0000 0 0 0.7892 0.2108 0.0000
chr4 164197133 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 2 597 136 461 112 0 17 0 7 0 0 461 0 0 0.8235 0.0000 0.0000 7.000 0.38 3.29 -2.90 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1287 0.8713 0.0000 0 0 0.5209 0.4791 0.0000
chr5 733800 T TAA 0.007715 0.050 1 2 1 323 138 185 135 1 0 0 2 0 0 185 0 0 0.9783 0.0000 0.0000 138.000 0.38 7.00 -6.62 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9934 0.0066 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr5 733804 CAT C 0.005230 0.050 1 -2 3 323 136 187 131 1 2 0 2 0 0 187 0 0 0.9632 0.0000 0.0000 66.500 0.40 7.00 -6.60 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9950 0.0050 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr5 35965506 TAGA T 0.500000 0.050 1 -3 1 549 185 364 175 0 5 0 5 0 0 364 0 0 0.9459 0.0000 0.0000 36.000 0.16 3.00 -2.84 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0228 0.9772 0.0000 0 0 0.7264 0.2736 0.0000 0 0 0.9119 0.0881 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 778 180 598 74 2 27 1 76 0 0 594 0 4 0.4111 0.0000 0.0067 5.667 0.23 3.16 -2.93 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1732 0.5399 0.2868 1 1 0.1765 0.5369 0.2866 1 1 0.1808 0.5331 0.2861
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.050 1 -15 4 334 38 296 0 0 26 1 11 0 2 284 1 9 0.0000 0.0000 0.0405 0.462 6.64 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7233 0.2767 2 1 0.0000 0.5888 0.4112 2 1 0.0000 0.5124 0.4876
chr5 66596840 A AGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 451 89 362 36 0 25 0 28 0 1 357 0 4 0.4045 0.0000 0.0138 2.560 2.58 5.96 -3.38 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3028 0.5133 0.1839 1 1 0.3012 0.5123 0.1865 1 1 0.2991 0.5110 0.1899
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.050 1 -6 1 331 86 245 43 0 4 0 39 0 0 244 0 1 0.5000 0.0000 0.0041 20.500 0.19 5.51 -5.33 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2739 0.5226 0.2036 1 1 0.2735 0.5209 0.2056 1 1 0.2729 0.5187 0.2083
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 3 541 145 396 75 0 7 0 63 0 0 392 0 4 0.5172 0.0000 0.0101 19.714 0.21 3.06 -2.85 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3273 0.5243 0.1484 1 1 0.3255 0.5224 0.1521 1 1 0.3228 0.5201 0.1571
chr5 75635851 CCCAG C 0.500000 0.050 1 -4 1 255 88 167 40 0 2 0 46 0 0 167 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 43.000 0.53 5.65 -5.13 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1725 0.5154 0.3121 1 1 0.1754 0.5142 0.3103 1 1 0.1794 0.5128 0.3079
chr5 75635856 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 255 83 172 38 0 0 1 44 0 0 172 0 0 0.4578 0.0000 0.0000 83.000 0.55 5.89 -5.33 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1636 0.5108 0.3256 1 1 0.1668 0.5100 0.3233 1 1 0.1710 0.5089 0.3201
chr5 78015515 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 182 86 96 36 0 3 0 47 0 0 96 0 0 0.4186 0.0000 0.0000 27.667 0.19 2.87 -2.68 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1285 0.4901 0.3814 1 1 0.1324 0.4907 0.3769 1 1 0.1377 0.4915 0.3708
chr5 80321231 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 794 208 586 193 2 11 0 2 0 0 586 0 0 0.9279 0.0000 0.0000 17.909 0.65 1.00 -0.35 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8395 0.1605 0.0000 0 0 0.9699 0.0301 0.0000 0 0 0.9807 0.0193 0.0000
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.050 1 -18 1 292 81 211 38 0 5 1 37 0 0 210 0 1 0.4691 0.0000 0.0047 15.200 1.21 19.03 -17.82 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2257 0.5231 0.2512 1 1 0.2270 0.5214 0.2516 1 1 0.2287 0.5192 0.2521
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.050 1 -9 1 278 64 214 26 1 2 1 34 0 1 208 2 3 0.4062 0.0000 0.0280 31.000 1.85 23.09 -21.24 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1228 0.4799 0.3973 1 1 0.1268 0.4813 0.3920 1 1 0.1321 0.4830 0.3849
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 241 99 142 54 0 1 0 44 0 0 142 0 0 0.5455 0.0000 0.0000 98.000 0.19 3.00 -2.81 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3640 0.5005 0.1354 1 1 0.3603 0.5004 0.1393 1 1 0.3553 0.5003 0.1444
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.050 1 -1 2 663 139 524 73 0 4 0 62 0 0 524 0 0 0.5252 0.0000 0.0000 33.750 0.11 1.26 -1.15 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3695 0.5059 0.1245 1 1 0.3660 0.5054 0.1286 1 1 0.3612 0.5047 0.1341
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.050 1 9 2 454 119 335 4 0 13 0 102 0 0 319 0 16 0.0336 0.0000 0.0478 8.154 0.75 8.31 -7.56 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9723 0.0277 2 2 0.0000 0.4405 0.5595 2 2 0.0000 0.2071 0.7929
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 175 65 110 32 0 3 0 30 0 0 109 0 1 0.4923 0.0000 0.0091 20.667 0.06 3.37 -3.30 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2524 0.5189 0.2287 1 1 0.2527 0.5175 0.2298 1 1 0.2530 0.5157 0.2312
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.050 1 2 1 266 119 147 64 0 1 2 52 0 0 145 1 1 0.5378 0.0000 0.0136 118.000 0.11 3.81 -3.70 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3323 0.5174 0.1503 1 1 0.3300 0.5161 0.1539 1 1 0.3269 0.5144 0.1587
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 265 118 147 63 0 2 3 50 0 0 144 2 1 0.5339 0.0000 0.0204 58.000 0.11 3.94 -3.83 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3195 0.5214 0.1592 1 1 0.3177 0.5197 0.1626 1 1 0.3152 0.5177 0.1671
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 1 383 141 242 1 1 34 0 105 0 0 229 1 12 0.0071 0.0000 0.0537 3.147 3.00 8.83 -5.83 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5407 0.4593 2 2 0.0000 0.1687 0.8313 2 2 0.0000 0.1099 0.8901
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 12 1 383 141 242 2 0 34 0 105 0 0 229 1 12 0.0142 0.0000 0.0537 3.147 3.00 8.83 -5.83 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5734 0.4266 2 2 0.0000 0.1716 0.8284 2 2 0.0000 0.1105 0.8895
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 15 1 383 141 242 2 0 34 1 104 0 0 229 1 12 0.0142 0.0000 0.0537 3.147 3.00 8.75 -5.75 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5736 0.4264 2 2 0.0000 0.1717 0.8283 2 2 0.0000 0.1106 0.8894
chr5 148116440 AGTG A 0.500000 0.050 1 -3 2 191 100 91 45 0 2 0 53 0 0 91 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 49.000 0.20 3.04 -2.84 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1526 0.5109 0.3366 1 1 0.1561 0.5100 0.3339 1 1 0.1607 0.5089 0.3303
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.050 1 2 1 726 174 552 99 0 3 0 72 0 0 546 1 5 0.5690 0.0000 0.0109 85.500 0.58 3.79 -3.22 49 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4966 0.4401 0.0633 1 0 0.4890 0.4436 0.0674 1 0 0.4786 0.4482 0.0733
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.050 1 -2 3 730 175 555 101 0 0 1 73 0 0 547 1 7 0.5771 0.0000 0.0144 174.000 0.56 3.73 -3.16 49 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4762 0.4543 0.0694 1 0 0.4694 0.4570 0.0737 1 1 0.4600 0.4604 0.0796
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 675 173 502 86 0 2 0 85 0 0 501 0 1 0.4971 0.0000 0.0020 85.500 0.34 1.66 -1.32 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2238 0.5523 0.2238 1 1 0.2258 0.5484 0.2258 1 1 0.2283 0.5435 0.2283
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 368 131 237 63 0 4 1 63 0 0 235 0 2 0.4809 0.0000 0.0084 31.500 2.75 5.02 -2.27 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1997 0.5368 0.2634 1 1 0.2022 0.5341 0.2638 1 1 0.2053 0.5306 0.2641
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.050 1 -15 1 367 157 210 117 5 17 10 8 0 0 210 0 0 0.7452 0.0000 0.0000 8.750 3.70 6.88 -3.17 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.0648 0.9352 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.050 1 3 1 367 143 224 3 2 2 0 136 0 0 220 0 4 0.0210 0.0000 0.0179 70.500 0.00 3.96 -3.96 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9870 0.0130 2 2 0.0000 0.4595 0.5405 2 2 0.0000 0.1804 0.8196
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 205 94 111 5 0 5 0 84 0 0 111 0 0 0.0532 0.0000 0.0000 17.800 0.20 3.29 -3.09 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.7802 0.2198 2 2 0.0000 0.4611 0.5389
chr5 172339475 GCCGCTC G 0.500000 0.050 1 -6 1 806 193 613 163 1 23 0 6 0 0 613 0 0 0.8446 0.0000 0.0000 7.391 0.28 5.67 -5.38 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 0 0.5097 0.4903 0.0000 0 0 0.8458 0.1542 0.0000
chr5 176384091 CGT C 0.500000 0.050 1 -2 1 334 106 228 99 0 5 0 2 0 0 228 0 0 0.9340 0.0000 0.0000 20.200 0.81 2.50 -1.69 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3171 0.6829 0.0000 0 0 0.7515 0.2485 0.0000 0 0 0.8362 0.1638 0.0000
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 1 439 108 331 1 0 4 1 102 0 0 327 0 4 0.0093 0.0000 0.0121 26.000 1.00 4.08 -3.08 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2573 0.7427 2 2 0.0000 0.1223 0.8777 2 2 0.0000 0.1004 0.8996
chr5 177509601 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 366 121 245 111 0 7 0 3 0 0 245 0 0 0.9174 0.0000 0.0000 16.286 0.79 2.67 -1.87 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1120 0.8880 0.0000 0 0 0.6767 0.3233 0.0000 0 0 0.8245 0.1755 0.0000
chr5 179345240 G GGCGGCAGGA 0.500000 0.050 1 9 1 433 199 234 170 1 25 1 2 0 0 233 0 1 0.8543 0.0000 0.0043 6.960 0.98 9.00 -8.02 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1391 0.8609 0.0000 0 0 0.8345 0.1655 0.0000 0 0 0.9332 0.0668 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 624 100 524 42 0 11 0 47 0 0 523 1 0 0.4200 0.0000 0.0019 8.091 0.12 3.06 -2.94 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1720 0.5166 0.3113 1 1 0.1750 0.5154 0.3096 1 1 0.1790 0.5138 0.3072
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.050 1 3 5 527 135 392 58 1 29 2 45 0 0 389 1 2 0.4296 0.0000 0.0077 3.655 0.52 3.13 -2.62 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3480 0.5093 0.1428 1 1 0.3447 0.5086 0.1466 1 1 0.3404 0.5078 0.1518
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.050 1 3 1 532 112 420 61 1 11 0 39 0 0 410 6 4 0.5446 0.0000 0.0238 10.100 1.20 3.82 -2.62 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5401 0.4162 0.0438 1 0 0.5354 0.4189 0.0456 1 0 0.5291 0.4227 0.0482
chr6 27255285 AAAGGAGAGCCAGATT A 0.178475 0.050 1 -15 1 430 94 336 84 0 8 0 2 0 0 336 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 10.750 0.31 15.00 -14.69 46 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5928 0.4072 0.0000 0 0 0.9057 0.0943 0.0000 0 0 0.9425 0.0575 0.0000
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.050 1 2 1 862 207 655 111 0 7 0 89 0 0 655 0 0 0.5362 0.0000 0.0000 28.571 0.24 2.30 -2.06 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6767 0.3166 0.0067 1 0 0.6713 0.3215 0.0072 1 0 0.6638 0.3282 0.0080
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 419 130 289 69 0 4 0 57 0 0 289 0 0 0.5308 0.0000 0.0000 31.500 0.19 2.30 -2.11 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3855 0.4968 0.1177 1 1 0.3812 0.4969 0.1218 1 1 0.3755 0.4971 0.1274
chr6 31027337 AC A 0.500000 0.050 1 -1 2 1432 323 1109 185 4 31 1 102 7 10 1085 0 7 0.5728 0.0063 0.0216 10.069 2.01 2.51 -0.50 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9714 0.0285 0.0001 1 0 0.9670 0.0329 0.0001 1 0 0.9600 0.0398 0.0002
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 596 158 438 91 0 7 0 60 0 0 437 1 0 0.5759 0.0000 0.0023 25.167 0.40 2.12 -1.72 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6248 0.3428 0.0325 1 0 0.6131 0.3512 0.0357 1 0 0.5973 0.3623 0.0404
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.050 1 2 1 698 194 504 4 2 4 1 183 0 0 501 1 2 0.0206 0.0000 0.0060 47.500 2.75 6.54 -3.79 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9477 0.0523 2 2 0.0000 0.2300 0.7700 2 2 0.0000 0.0764 0.9236
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 11 1 698 194 504 92 1 4 3 94 0 0 501 1 2 0.4742 0.0000 0.0060 47.500 2.34 10.72 -8.39 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1558 0.5455 0.2988 1 1 0.1595 0.5421 0.2984 1 1 0.1645 0.5377 0.2977
chr6 32223881 T TAGC 0.500000 0.050 1 3 1 376 170 206 5 130 29 0 6 0 2 204 0 0 0.0294 0.0000 0.0097 5.148 0.60 2.83 -2.23 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.3502 0.6498 0.0000 0 0 0.7431 0.2569 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 247 73 174 44 0 2 0 27 0 0 174 0 0 0.6027 0.0000 0.0000 35.500 0.27 4.44 -4.17 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4700 0.4424 0.0875 1 0 0.4620 0.4462 0.0918 1 0 0.4513 0.4511 0.0976
chr6 32521966 CG C 0.500000 0.050 1 -1 2 421 191 230 169 0 7 1 14 2 1 225 0 2 0.8848 0.0087 0.0217 26.286 2.52 7.86 -5.34 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.1021 0.8979 0.0000
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.050 1 2 2 164 69 95 39 6 1 1 22 0 0 94 0 1 0.5652 0.0000 0.0105 66.000 6.77 8.91 -2.14 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5168 0.4132 0.0700 1 0 0.5071 0.4187 0.0742 1 0 0.4941 0.4259 0.0800
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.050 1 18 1 361 91 270 44 0 8 0 39 0 0 260 0 10 0.4835 0.0000 0.0370 10.375 1.09 15.33 -14.24 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1815 0.5208 0.2976 1 1 0.1843 0.5193 0.2965 1 1 0.1879 0.5173 0.2948
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 732 191 541 0 0 3 0 188 0 0 539 0 2 0.0000 0.0000 0.0037 62.667 3.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0083 0.9917 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0104 0.9896
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 301 120 181 60 0 11 0 49 0 0 179 0 2 0.5000 0.0000 0.0110 9.909 0.52 5.63 -5.12 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3474 0.5099 0.1427 1 1 0.3445 0.5091 0.1464 1 1 0.3405 0.5081 0.1514
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 858 196 662 79 2 36 2 77 0 0 662 0 0 0.4031 0.0000 0.0000 4.389 0.49 3.22 -2.73 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2494 0.5471 0.2035 1 1 0.2505 0.5436 0.2059 1 1 0.2518 0.5391 0.2091
chr6 44002766 CGCGGCG C 0.500000 0.050 1 -6 1 451 92 359 8 0 18 2 64 0 0 354 0 5 0.0870 0.0000 0.0139 4.111 4.38 6.22 -1.84 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9731 0.0269 2 1 0.0000 0.7807 0.2193
chr6 44172317 T TGGCTGCC 0.500000 0.050 1 7 1 205 99 106 1 0 6 3 89 0 0 106 0 0 0.0101 0.0000 0.0000 15.500 0.00 5.36 -5.36 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3357 0.6643 2 2 0.0000 0.1679 0.8321 2 2 0.0000 0.1378 0.8622
chr6 52403417 CCT C 0.500000 0.050 1 -2 1 750 180 570 84 0 6 0 90 0 0 567 0 3 0.4667 0.0000 0.0053 29.000 0.38 2.08 -1.70 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1368 0.5300 0.3331 1 1 0.1409 0.5277 0.3314 1 1 0.1462 0.5248 0.3289
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 15 2 641 181 460 50 0 93 1 37 0 0 443 0 17 0.2762 0.0000 0.0370 0.946 1.82 6.70 -4.88 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1805 0.5246 0.2949 1 1 0.1834 0.5227 0.2939 1 1 0.1871 0.5204 0.2925
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 30 2 641 181 460 50 0 110 3 18 0 0 444 0 16 0.2762 0.0000 0.0348 0.639 1.82 1.22 0.60 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4093 0.4777 0.1130 1 1 0.4037 0.4792 0.1171 1 1 0.3962 0.4811 0.1227
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.050 1 -15 2 646 218 428 143 2 68 1 4 0 0 426 0 2 0.6560 0.0000 0.0047 2.206 2.24 11.50 -9.26 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.2848 0.7152 0.0000 0 0 0.7188 0.2812 0.0000
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 631 115 516 48 4 31 0 32 0 0 509 0 7 0.4174 0.0000 0.0136 2.710 1.50 4.50 -3.00 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4081 0.4793 0.1127 1 1 0.4026 0.4806 0.1168 1 1 0.3952 0.4824 0.1224
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.050 1 -6 1 933 245 688 178 1 12 0 54 0 0 686 0 2 0.7265 0.0000 0.0029 21.182 1.11 6.98 -5.87 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9938 0.0062 0.0000 1 0 0.9924 0.0076 0.0000 1 0 0.9521 0.0479 0.0000
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 2 108 35 73 1 0 4 0 30 0 0 72 0 1 0.0286 0.0000 0.0137 7.750 0.00 3.00 -3.00 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7011 0.2989 2 2 0.0000 0.4760 0.5240 2 2 0.0000 0.4083 0.5917
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.050 1 3 2 753 148 605 0 0 13 0 135 0 0 592 0 13 0.0000 0.0000 0.0215 10.385 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0253 0.9747 2 2 0.0000 0.0280 0.9720
chr6 125889243 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 634 120 514 53 5 4 1 57 0 0 509 0 5 0.4417 0.0000 0.0097 29.000 0.30 3.04 -2.73 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1752 0.5282 0.2966 1 1 0.1782 0.5260 0.2957 1 1 0.1822 0.5234 0.2944
chr6 151349194 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 732 173 559 91 1 2 0 79 0 0 558 0 1 0.5260 0.0000 0.0018 85.500 0.38 3.33 -2.94 29 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3745 0.5110 0.1145 1 1 0.3712 0.5100 0.1188 1 1 0.3666 0.5088 0.1246
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 2 912 231 681 93 1 13 0 124 0 0 673 0 8 0.4026 0.0000 0.0117 16.769 0.15 3.10 -2.95 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0164 0.2824 0.7013 1 2 0.0186 0.2922 0.6892 1 2 0.0219 0.3055 0.6725
chr6 156778052 CGCGGCGGCA C 0.500000 0.050 1 -9 2 783 159 624 74 0 9 0 76 0 0 618 0 6 0.4654 0.0000 0.0096 16.667 1.23 9.67 -8.44 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1471 0.5285 0.3244 1 1 0.1509 0.5264 0.3228 1 1 0.1559 0.5236 0.3205
chr6 156778268 C CCAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 789 218 571 79 4 58 1 76 2 1 562 0 6 0.3624 0.0035 0.0158 2.724 1.32 5.20 -3.88 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2510 0.5495 0.1995 1 1 0.2520 0.5458 0.2022 1 1 0.2533 0.5411 0.2056
chr6 156778909 G GAGGAGC 0.500000 0.050 1 6 2 448 117 331 51 0 18 5 43 2 0 326 1 2 0.4359 0.0060 0.0151 5.278 3.16 7.16 -4.01 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2651 0.5293 0.2056 1 1 0.2652 0.5271 0.2077 1 1 0.2653 0.5243 0.2104
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.050 1 -18 1 623 200 423 1 0 38 0 161 0 0 393 0 30 0.0050 0.0000 0.0709 4.263 0.00 14.75 -14.75 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0402 0.9598 2 2 0.0000 0.0173 0.9827 2 2 0.0000 0.0147 0.9853
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.050 1 -3 5 386 137 249 7 0 6 0 124 0 0 247 0 2 0.0511 0.0000 0.0080 21.833 0.43 5.38 -4.95 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8274 0.1726 2 2 0.0000 0.3967 0.6033
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.050 1 -8 2 208 69 139 5 0 3 1 60 0 0 138 0 1 0.0725 0.0000 0.0072 22.000 0.00 7.23 -7.23 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.8594 0.1406 2 1 0.0000 0.5920 0.4080
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 316 138 178 1 0 18 5 114 0 0 176 0 2 0.0072 0.0000 0.0112 6.667 0.00 3.06 -3.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1957 0.8043 2 2 0.0000 0.0898 0.9102 2 2 0.0000 0.0739 0.9261
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.050 1 12 3 721 136 585 59 0 27 1 49 0 0 575 0 10 0.4338 0.0000 0.0171 4.037 0.42 7.63 -7.21 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2206 0.5360 0.2434 1 1 0.2223 0.5333 0.2444 1 1 0.2245 0.5299 0.2456
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 745 245 500 6 2 13 108 116 0 0 500 0 0 0.0245 0.0000 0.0000 16.333 3.17 8.74 -5.57 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.5448 0.4552 2 2 0.0000 0.1207 0.8793
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 745 231 514 78 18 15 27 93 0 0 514 0 0 0.3377 0.0000 0.0000 14.200 3.13 9.97 -6.84 50 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0476 0.4140 0.5384 1 2 0.0514 0.4187 0.5299 1 2 0.0568 0.4250 0.5182
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 745 233 512 75 21 34 62 41 0 0 512 0 0 0.3219 0.0000 0.0000 12.733 3.13 7.44 -4.31 53 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1319 0.5316 0.3365 1 1 0.1360 0.5292 0.3348 1 1 0.1416 0.5261 0.3323
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.050 1 4 1 304 129 175 7 0 20 0 102 0 0 171 0 4 0.0543 0.0000 0.0229 5.450 1.43 3.80 -2.38 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8870 0.1130 2 1 0.0000 0.5150 0.4850
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.050 1 -12 1 724 182 542 107 0 3 0 72 0 0 535 0 7 0.5879 0.0000 0.0129 59.667 0.36 11.12 -10.77 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5912 0.3717 0.0371 1 0 0.5808 0.3787 0.0405 1 0 0.5667 0.3878 0.0455
chr7 6484057 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 1 100 54 46 24 1 3 0 26 0 0 46 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 17.000 0.38 3.04 -2.66 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2304 0.5153 0.2544 1 1 0.2314 0.5141 0.2545 1 1 0.2327 0.5127 0.2547
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 665 205 460 0 0 44 11 150 0 0 459 0 1 0.0000 0.0000 0.0022 3.659 2.93 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0167 0.9833 2 2 0.0000 0.0181 0.9819 2 2 0.0000 0.0202 0.9798
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 371 119 252 61 0 7 0 51 0 0 251 0 1 0.5126 0.0000 0.0040 16.000 0.21 3.18 -2.96 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3470 0.5105 0.1425 1 1 0.3441 0.5097 0.1462 1 1 0.3401 0.5086 0.1512
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.050 1 1 3 136 46 90 3 1 0 3 39 0 0 89 1 0 0.0652 0.0000 0.0111 44.000 0.00 1.15 -1.15 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9801 0.0199 2 1 0.0000 0.7498 0.2502 2 1 0.0000 0.5550 0.4450
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 192 55 137 34 0 2 0 19 0 0 137 0 0 0.6182 0.0000 0.0000 26.500 0.12 3.42 -3.30 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4458 0.4531 0.1011 1 1 0.4384 0.4563 0.1053 1 1 0.4286 0.4604 0.1110
chr7 44073397 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 676 150 526 83 1 4 0 62 0 0 526 0 0 0.5533 0.0000 0.0000 36.500 0.43 1.31 -0.87 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5204 0.4202 0.0594 1 0 0.5116 0.4250 0.0635 1 0 0.4996 0.4312 0.0692
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 238 98 140 4 0 2 1 91 0 0 140 0 0 0.0408 0.0000 0.0000 48.000 0.00 2.99 -2.99 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9854 0.0146 2 1 0.0000 0.5993 0.4007 2 2 0.0000 0.3276 0.6724
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 431 94 337 0 2 48 3 41 0 0 337 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.957 4.85 0 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5833 0.4167 2 2 0.0000 0.4757 0.5243 2 2 0.0000 0.4131 0.5869
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.050 1 2 1 431 94 337 0 50 1 1 42 0 0 336 0 1 0.0000 0.0000 0.0030 45.000 4.93 0 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1098 0.4660 0.4242 1 1 0.1139 0.4683 0.4177 1 1 0.1195 0.4713 0.4092
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 535 166 369 161 0 1 0 4 0 0 369 0 0 0.9699 0.0000 0.0000 165.000 1.19 2.25 -1.06 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0784 0.9216 0.0000 0 0 0.7860 0.2140 0.0000 0 0 0.9148 0.0852 0.0000
chr7 80674137 CAATAA C 0.500000 0.050 1 -5 4 268 85 183 78 0 5 0 2 0 0 183 0 0 0.9176 0.0000 0.0000 16.000 0.08 5.00 -4.92 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2138 0.7862 0.0000 0 0 0.6429 0.3571 0.0000 0 0 0.7552 0.2448 0.0000
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 5 826 189 637 0 0 15 3 171 0 0 628 0 9 0.0000 0.0000 0.0141 11.533 3.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0109 0.9891 2 2 0.0000 0.0123 0.9877
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.050 1 3 1 282 97 185 41 0 0 0 56 0 0 183 0 2 0.4227 0.0000 0.0108 97.000 0.34 3.27 -2.93 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0862 0.4509 0.4629 1 2 0.0905 0.4540 0.4555 1 1 0.0964 0.4581 0.4455
chr7 97006061 GCAGCAGCAGCAGCAA G 0.500000 0.050 1 -15 1 439 252 187 220 1 25 0 6 1 0 186 0 0 0.8730 0.0053 0.0053 9.080 0.75 11.67 -10.92 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0147 0.9853 0.0000 0 0 0.8128 0.1872 0.0000 0 0 0.9566 0.0434 0.0000
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.050 1 -4 1 607 197 410 99 1 2 0 95 0 0 407 0 3 0.5025 0.0000 0.0073 97.000 0.13 4.01 -3.88 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2393 0.5591 0.2016 1 1 0.2409 0.5547 0.2043 1 1 0.2430 0.5491 0.2079
chr7 100114245 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 639 162 477 86 0 6 1 69 0 0 477 0 0 0.5309 0.0000 0.0000 25.833 0.21 1.39 -1.18 38 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4369 0.4749 0.0882 1 1 0.4310 0.4763 0.0926 1 1 0.4232 0.4783 0.0986
chr7 100359505 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 498 140 358 63 0 18 0 59 0 0 358 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 6.778 0.49 2.88 -2.39 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2795 0.5324 0.1882 1 1 0.2792 0.5299 0.1909 1 1 0.2787 0.5269 0.1944
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.050 1 -35 1 181 59 122 43 0 0 0 16 0 0 114 0 8 0.7288 0.0000 0.0656 59.000 0.23 20.44 -20.20 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4997 0.4240 0.0763 1 0 0.4906 0.4289 0.0806 1 0 0.4784 0.4352 0.0864
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 633 177 456 157 1 8 0 11 0 0 456 0 0 0.8870 0.0000 0.0000 21.125 0.68 3.64 -2.95 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0308 0.9692 0.0000 0 1 0.4253 0.5747 0.0000
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 386 121 265 3 0 41 3 74 0 0 257 0 8 0.0248 0.0000 0.0302 1.927 0.00 5.80 -5.80 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9397 0.0603 2 2 0.0000 0.4741 0.5259 2 2 0.0000 0.2823 0.7177
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 782 193 589 80 1 11 1 100 0 0 588 0 1 0.4145 0.0000 0.0017 16.545 1.27 3.80 -2.52 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0621 0.4399 0.4979 1 2 0.0663 0.4434 0.4903 1 2 0.0721 0.4479 0.4800
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.050 1 -30 3 688 224 464 97 1 21 1 104 0 0 462 0 2 0.4330 0.0000 0.0043 9.667 0.33 16.21 -15.88 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1329 0.5376 0.3295 1 1 0.1371 0.5347 0.3282 1 1 0.1427 0.5311 0.3263
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.050 1 -6 1 367 173 194 0 0 16 1 156 0 0 189 1 4 0.0000 0.0000 0.0258 9.812 6.74 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0167 0.9833 2 2 0.0000 0.0181 0.9819 2 2 0.0000 0.0202 0.9798
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 249 75 174 32 0 1 1 41 0 0 172 0 2 0.4267 0.0000 0.0115 74.000 0.25 3.37 -3.12 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1214 0.4817 0.3969 1 1 0.1254 0.4829 0.3917 1 1 0.1308 0.4845 0.3847
chr7 141918996 AAC A 0.500000 0.050 1 -2 3 489 110 379 103 0 2 1 4 0 0 379 0 0 0.9364 0.0000 0.0000 54.000 0.17 2.00 -1.83 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0083 0.9917 0.0000 0 1 0.3492 0.6508 0.0000 0 0 0.6626 0.3374 0.0000
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 3 973 277 696 102 124 47 0 4 0 0 696 0 0 0.3682 0.0000 0.0000 4.851 0.68 2.50 -1.82 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3012 0.6988 0.0000 0 0 0.9476 0.0524 0.0000 0 0 0.9806 0.0194 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 3 974 283 691 106 6 43 7 121 0 0 691 0 0 0.3746 0.0000 0.0000 5.581 0.68 3.12 -2.44 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0830 0.4990 0.4180 1 1 0.0875 0.4986 0.4139 1 1 0.0936 0.4982 0.4081
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 1151 287 864 0 0 12 2 273 0 0 864 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 22.917 1.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 663 135 528 63 0 3 0 69 0 0 524 0 4 0.4667 0.0000 0.0076 44.000 1.03 4.14 -3.11 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1323 0.5121 0.3556 1 1 0.1363 0.5112 0.3526 1 1 0.1416 0.5099 0.3485
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.050 1 -4 1 535 313 222 248 0 8 0 57 0 0 222 0 0 0.7923 0.0000 0.0000 38.125 1.02 4.42 -3.40 84 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9806 0.0194 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr7 149790295 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 352 96 256 38 0 2 0 56 0 0 256 0 0 0.3958 0.0000 0.0000 47.000 0.71 1.70 -0.99 14 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0807 0.4408 0.4784 1 2 0.0850 0.4447 0.4704 1 2 0.0909 0.4496 0.4596
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.050 1 -4 3 224 54 170 49 0 2 0 3 0 0 170 0 0 0.9074 0.0000 0.0000 26.000 0.80 5.33 -4.54 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0250 0.9750 0.0000 0 1 0.3111 0.6889 0.0000 0 0 0.5149 0.4851 0.0000
chr7 149814882 G GGCCCT 0.500000 0.050 1 5 1 604 125 479 56 2 14 2 51 0 0 472 0 7 0.4480 0.0000 0.0146 7.929 1.55 6.82 -5.27 10 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.2099 0.5348 0.2554 1 1 0.2119 0.5321 0.2560 1 1 0.2146 0.5288 0.2566
chr7 149815757 G GAGGTGGTC 0.500000 0.050 1 8 1 711 213 498 120 0 13 0 80 0 0 494 0 4 0.5634 0.0000 0.0080 15.385 0.87 8.29 -7.42 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6843 0.2962 0.0195 1 0 0.6723 0.3058 0.0219 1 0 0.6556 0.3188 0.0256
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 812 235 577 129 0 2 0 104 0 0 574 0 3 0.5489 0.0000 0.0052 116.500 0.93 1.42 -0.49 1 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4968 0.4468 0.0564 1 0 0.4899 0.4495 0.0605 1 0 0.4805 0.4533 0.0663
chr7 149821443 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 666 158 508 154 2 1 0 1 0 1 507 0 0 0.9747 0.0000 0.0020 157.000 0.55 1.00 -0.45 34 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9110 0.0890 0.0000 0 0 0.9609 0.0391 0.0000 0 0 0.9674 0.0326 0.0000
chr7 150331068 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 690 198 492 106 0 2 0 90 1 0 491 0 0 0.5354 0.0020 0.0020 98.000 0.15 1.83 -1.68 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4378 0.4807 0.0815 1 1 0.4325 0.4816 0.0859 1 1 0.4251 0.4829 0.0920
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.050 1 -12 2 725 207 518 123 0 2 0 82 0 0 511 0 7 0.5942 0.0000 0.0135 102.500 0.41 11.35 -10.95 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6591 0.3180 0.0229 1 0 0.6476 0.3269 0.0256 1 0 0.6317 0.3388 0.0296
chr7 151023910 GCTC G 0.500000 0.050 1 -3 1 548 134 414 128 0 3 0 3 0 1 413 0 0 0.9552 0.0000 0.0024 43.667 0.56 3.33 -2.77 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1605 0.8395 0.0000 0 0 0.7640 0.2360 0.0000 0 0 0.8780 0.1220 0.0000
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 452 84 368 0 0 1 13 70 1 2 340 13 12 0.0000 0.0027 0.0761 83.000 6.40 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2609 0.7391 2 2 0.0000 0.1305 0.8695 2 2 0.0000 0.1071 0.8929
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 454 83 371 0 1 5 11 66 0 1 341 16 13 0.0000 0.0000 0.0809 24.333 6.53 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2268 0.7732 2 2 0.0000 0.1334 0.8666 2 2 0.0000 0.1118 0.8882
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 460 82 378 0 1 6 9 66 0 0 314 24 40 0.0000 0.0000 0.1693 12.333 6.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0806 0.9194 2 2 0.0000 0.0551 0.9449 2 2 0.0000 0.0492 0.9508
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.050 1 -1 3 493 168 325 87 0 1 1 79 0 0 325 0 0 0.5179 0.0000 0.0000 167.000 0.20 1.15 -0.96 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3091 0.5362 0.1547 1 1 0.3081 0.5335 0.1584 1 1 0.3067 0.5300 0.1632
chr7 155738095 C CTGGAACAGCGAA 0.500000 0.050 1 12 5 540 138 402 127 2 6 0 3 1 0 400 0 1 0.9203 0.0025 0.0050 22.000 0.27 8.33 -8.07 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0370 0.9630 0.0000 0 0 0.6305 0.3695 0.0000 0 0 0.8361 0.1639 0.0000
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 391 101 290 44 0 4 1 52 0 0 287 0 3 0.4356 0.0000 0.0103 24.250 0.20 3.10 -2.89 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1195 0.4889 0.3916 1 1 0.1236 0.4896 0.3868 1 1 0.1291 0.4905 0.3804
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.050 1 -6 2 746 171 575 68 0 24 0 79 0 0 571 1 3 0.3977 0.0000 0.0070 6.125 0.32 6.14 -5.82 34 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0875 0.4730 0.4395 1 1 0.0914 0.4741 0.4344 1 1 0.0968 0.4756 0.4275
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.050 1 -6 2 753 168 585 136 1 24 0 7 0 0 585 0 0 0.8095 0.0000 0.0000 6.000 0.32 5.29 -4.97 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2331 0.7669 0.0000 0 0 0.6875 0.3125 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.050 1 -6 1 576 264 312 0 0 37 0 227 0 0 312 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.135 5.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.050 1 -6 2 295 106 189 0 0 1 0 105 0 0 187 0 2 0.0000 0.0000 0.0106 105.000 7.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2136 0.7864 2 2 0.0000 0.2228 0.7772 2 2 0.0000 0.2358 0.7642
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.050 1 -3 3 609 215 394 201 2 4 0 8 0 0 394 0 0 0.9349 0.0000 0.0000 52.500 0.41 4.00 -3.59 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.5355 0.4645 0.0000 0 0 0.9147 0.0853 0.0000
chr8 68331068 TCCGGCTCTCAGCGC T 0.013267 0.050 1 -14 2 379 158 221 151 2 1 0 4 0 0 221 0 0 0.9557 0.0000 0.0000 156.000 0.23 15.50 -15.27 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8356 0.1644 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.050 1 -27 4 694 225 469 123 0 5 0 97 0 0 469 0 0 0.5467 0.0000 0.0000 44.000 2.50 17.57 -15.06 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5555 0.4020 0.0425 1 0 0.5466 0.4073 0.0462 1 0 0.5344 0.4142 0.0514
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 1 303 91 212 55 1 1 0 34 0 0 212 0 0 0.6044 0.0000 0.0000 90.000 1.49 3.88 -2.39 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5357 0.4033 0.0609 1 0 0.5257 0.4093 0.0650 1 0 0.5122 0.4170 0.0707
chr8 123369918 T TTCATCA 0.500000 0.050 1 6 1 358 110 248 46 1 20 0 43 0 0 248 0 0 0.4182 0.0000 0.0000 4.500 0.89 5.60 -4.71 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2880 0.5221 0.1899 1 1 0.2872 0.5204 0.1924 1 1 0.2860 0.5183 0.1957
chr8 127416885 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 912 211 701 118 0 5 1 87 1 0 700 0 0 0.5592 0.0014 0.0014 41.200 0.42 1.25 -0.84 62 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6239 0.3470 0.0291 1 0 0.6130 0.3549 0.0322 1 0 0.5980 0.3653 0.0367
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 273 126 147 70 0 0 0 56 0 0 146 0 1 0.5556 0.0000 0.0068 126.000 0.11 3.07 -2.96 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3992 0.4904 0.1104 1 1 0.3945 0.4909 0.1146 1 1 0.3881 0.4916 0.1203
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 494 132 362 0 0 27 7 98 0 0 359 1 2 0.0000 0.0000 0.0083 3.852 4.58 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0621 0.9379 2 2 0.0000 0.0654 0.9346 2 2 0.0000 0.0701 0.9299
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.050 1 15 1 1021 198 823 86 1 41 0 70 1 1 802 0 19 0.4343 0.0012 0.0255 3.829 0.55 12.00 -11.45 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2207 0.5540 0.2252 1 1 0.2228 0.5500 0.2272 1 1 0.2255 0.5449 0.2297
chr8 144846107 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 1 528 240 288 220 3 11 0 6 0 0 288 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 20.727 0.20 3.17 -2.97 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0150 0.9850 0.0000 0 0 0.8159 0.1841 0.0000 0 0 0.9574 0.0426 0.0000
chr9 116848 T TA 0.003653 0.050 1 1 1 656 171 485 158 1 8 0 4 0 0 484 0 1 0.9240 0.0000 0.0021 20.250 0.30 1.00 -0.70 86 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8310 0.1690 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.050 1 -3 2 831 285 546 104 5 65 8 103 0 0 545 0 1 0.3649 0.0000 0.0018 3.385 0.26 3.23 -2.97 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3297 0.5937 0.0766 1 1 0.3352 0.5878 0.0769 1 1 0.3424 0.5804 0.0773
chr9 12775862 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 342 93 249 3 0 23 3 64 0 0 243 1 5 0.0323 0.0000 0.0241 3.043 0.00 5.61 -5.61 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9552 0.0448 2 1 0.0000 0.5510 0.4490 2 2 0.0000 0.3467 0.6533
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 2 342 93 249 5 23 23 1 41 0 0 243 0 6 0.0538 0.0000 0.0241 3.000 2.20 7.44 -5.24 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0719 0.4195 0.5086 1 2 0.0761 0.4246 0.4993 1 2 0.0820 0.4312 0.4868
chr9 15459864 TAAGAATAGCTACACTCACAAA T 0.500000 0.050 1 -21 2 206 82 124 42 0 3 0 37 0 0 120 0 4 0.5122 0.0000 0.0323 26.333 0.67 17.27 -16.60 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2492 0.5250 0.2258 1 1 0.2498 0.5231 0.2271 1 1 0.2504 0.5208 0.2288
chr9 25678179 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 3 485 132 353 105 4 19 0 4 0 0 353 0 0 0.7955 0.0000 0.0000 5.947 0.71 3.00 -2.29 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0222 0.9778 0.0000 0 0 0.5043 0.4957 0.0000 0 0 0.7552 0.2448 0.0000
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.050 1 -1 3 456 138 318 5 0 3 1 129 0 0 317 1 0 0.0362 0.0000 0.0031 44.667 0.20 1.75 -1.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9921 0.0079 2 1 0.0000 0.5265 0.4735 2 2 0.0000 0.2174 0.7826
chr9 35560263 TGGCCCG T 0.500000 0.050 1 -6 1 684 130 554 116 1 9 0 4 0 1 552 0 1 0.8923 0.0000 0.0036 13.444 0.44 4.50 -4.06 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 1 0.3942 0.6058 0.0000 0 0 0.7251 0.2749 0.0000
chr9 35561936 C CCCA 0.500000 0.050 1 3 1 509 143 366 75 0 10 0 58 0 0 364 0 2 0.5245 0.0000 0.0055 13.300 0.29 3.57 -3.28 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4255 0.4780 0.0965 1 1 0.4198 0.4793 0.1009 1 1 0.4122 0.4811 0.1068
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.050 1 -12 1 762 172 590 0 0 36 0 136 0 0 573 0 17 0.0000 0.0000 0.0288 3.778 10.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0208 0.9792 2 2 0.0000 0.0225 0.9775 2 2 0.0000 0.0249 0.9751
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 363 51 312 16 3 0 0 32 0 0 312 0 0 0.3137 0.0000 0.0000 51.000 2.25 1.16 1.09 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1154 0.4671 0.4175 1 1 0.1194 0.4694 0.4112 1 1 0.1248 0.4723 0.4028
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.050 1 -15 3 444 134 310 85 1 0 0 48 0 0 307 0 3 0.6343 0.0000 0.0097 134.000 0.67 14.12 -13.45 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6894 0.2889 0.0217 1 0 0.6765 0.2992 0.0243 1 0 0.6588 0.3131 0.0282
chr9 76706391 GTCCTGACACTGC G 0.500000 0.050 1 -12 1 764 176 588 93 0 4 0 79 0 0 581 0 7 0.5284 0.0000 0.0119 43.000 0.97 10.99 -10.02 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3066 0.5399 0.1535 1 1 0.3059 0.5369 0.1572 1 1 0.3047 0.5331 0.1622
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.050 1 12 1 713 158 555 75 0 22 0 61 0 0 539 0 16 0.4747 0.0000 0.0288 6.182 0.31 10.05 -9.74 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2074 0.5454 0.2472 1 1 0.2097 0.5419 0.2483 1 1 0.2127 0.5377 0.2496
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 467 132 335 60 0 4 1 67 0 0 335 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 32.000 0.43 3.09 -2.66 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1498 0.5200 0.3302 1 1 0.1534 0.5185 0.3281 1 1 0.1583 0.5166 0.3252
chr9 87919269 C CCAGCGTCATCTTGTCTCT 0.500000 0.050 1 18 3 351 148 203 45 5 15 1 82 0 0 203 0 0 0.3041 0.0000 0.0000 8.733 0.07 7.91 -7.85 17 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0259 0.3085 0.6656 1 2 0.0288 0.3183 0.6529 1 2 0.0330 0.3313 0.6356
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 1 233 73 160 1 0 0 0 72 0 0 158 0 2 0.0137 0.0000 0.0125 73.000 0.00 3.88 -3.88 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4428 0.5572 2 2 0.0000 0.2392 0.7608 2 2 0.0000 0.1975 0.8025
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.050 1 -3 2 338 98 240 72 3 15 1 7 0 0 239 1 0 0.7347 0.0000 0.0042 5.533 0.18 3.57 -3.39 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0153 0.9847 0.0000 0 1 0.1721 0.8279 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.050 1 15 4 487 189 298 1 0 3 0 185 0 0 295 1 2 0.0053 0.0000 0.0101 62.000 2.00 9.76 -7.76 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0434 0.9566 2 2 0.0000 0.0187 0.9813 2 2 0.0000 0.0158 0.9842
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 587 191 396 7 0 2 0 182 0 0 388 0 8 0.0366 0.0000 0.0202 94.500 0.29 3.08 -2.80 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 2 0.0000 0.4968 0.5032 2 2 0.0000 0.1241 0.8759
chr9 96932301 ACT A 0.500000 0.050 1 -2 1 594 167 427 107 1 3 0 56 0 0 426 0 1 0.6407 0.0000 0.0023 54.667 0.36 3.04 -2.68 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8311 0.1635 0.0054 1 0 0.8187 0.1748 0.0064 1 0 0.8012 0.1907 0.0081
chr9 96932306 TG T 0.500000 0.050 1 -1 2 594 162 432 103 0 2 0 57 0 0 431 0 1 0.6358 0.0000 0.0023 80.000 0.37 3.05 -2.68 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7845 0.2063 0.0092 1 0 0.7715 0.2178 0.0107 1 0 0.7533 0.2337 0.0131
chr9 96936443 TGAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 212 82 130 40 0 4 0 38 0 0 129 0 1 0.4878 0.0000 0.0077 19.500 0.33 3.26 -2.94 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2499 0.5238 0.2263 1 1 0.2503 0.5220 0.2276 1 1 0.2509 0.5198 0.2293
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 2 353 104 249 55 1 12 0 36 0 0 249 0 0 0.5288 0.0000 0.0000 7.667 0.80 5.83 -5.03 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5029 0.4253 0.0718 1 0 0.4940 0.4300 0.0760 1 0 0.4820 0.4361 0.0819
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 866 128 738 0 1 42 1 84 0 0 731 2 5 0.0000 0.0000 0.0095 2.024 5.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0956 0.9044 2 2 0.0000 0.0990 0.9010 2 2 0.0000 0.1040 0.8960
chr9 98012441 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 69 25 44 13 1 0 0 11 0 0 44 0 0 0.5200 0.0000 0.0000 25.000 0.31 4.09 -3.78 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2838 0.5049 0.2113 1 1 0.2826 0.5045 0.2128 1 1 0.2811 0.5041 0.2148
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 867 248 619 240 0 3 0 5 0 0 619 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 81.667 0.27 2.80 -2.53 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1072 0.8928 0.0000 0 0 0.9296 0.0704 0.0000 0 0 0.9801 0.0199 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.050 1 -4 1 267 103 164 0 0 3 1 99 0 0 164 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 33.333 3.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0747 0.9253 2 2 0.0000 0.0783 0.9217 2 2 0.0000 0.0834 0.9166
chr9 116154344 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 2 684 155 529 68 4 31 1 51 0 0 523 1 5 0.4387 0.0000 0.0113 4.067 0.94 3.51 -2.57 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4075 0.4865 0.1060 1 1 0.4024 0.4873 0.1103 1 1 0.3956 0.4883 0.1160
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 449 97 352 2 0 17 0 78 0 0 352 0 0 0.0206 0.0000 0.0000 4.706 1.00 5.85 -4.85 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7862 0.2138 2 2 0.0000 0.3571 0.6429 2 2 0.0000 0.2448 0.7552
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.050 1 6 1 614 137 477 65 2 5 0 65 0 0 469 0 8 0.4745 0.0000 0.0168 26.400 0.63 5.86 -5.23 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1661 0.5317 0.3022 1 1 0.1695 0.5293 0.3013 1 1 0.1739 0.5263 0.2999
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 525 108 417 4 0 6 6 92 0 0 415 0 2 0.0370 0.0000 0.0048 17.000 0.00 1.45 -1.45 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9801 0.0199 2 1 0.0000 0.5499 0.4501 2 2 0.0000 0.2885 0.7115
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 544 184 360 5 3 28 69 79 0 0 356 3 1 0.0272 0.0000 0.0111 5.464 0.00 3.25 -3.25 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.6145 0.3855 2 2 0.0000 0.2337 0.7663
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.050 1 -6 2 546 185 361 8 1 103 2 71 0 0 359 0 2 0.0432 0.0000 0.0055 0.802 2.00 6.28 -4.28 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9801 0.0199 2 1 0.0000 0.8241 0.1759
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 562 183 379 81 0 4 0 98 0 0 376 1 2 0.4426 0.0000 0.0079 44.750 0.11 3.34 -3.23 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0671 0.4498 0.4830 1 2 0.0714 0.4527 0.4759 1 2 0.0773 0.4565 0.4662
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 371 102 269 0 0 5 1 96 0 0 267 0 2 0.0000 0.0000 0.0074 19.400 7.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0765 0.9235 2 2 0.0000 0.0801 0.9199 2 2 0.0000 0.0853 0.9147
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 1 417 122 295 6 0 38 7 71 0 0 287 3 5 0.0492 0.0000 0.0271 2.211 0.50 4.41 -3.91 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8732 0.1268 2 1 0.0000 0.5523 0.4477
chr9 130681605 T TCGCCGC 0.500000 0.050 1 6 1 417 122 295 6 0 80 0 36 0 0 287 1 7 0.0492 0.0000 0.0271 0.560 0.50 6.47 -5.97 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9546 0.0454 2 1 0.0000 0.7837 0.2163
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 307 146 161 143 0 0 0 3 0 0 161 0 0 0.9795 0.0000 0.0000 146.000 0.68 1.67 -0.99 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2162 0.7838 0.0000 0 0 0.8212 0.1788 0.0000 0 0 0.9100 0.0900 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 307 146 161 143 0 0 0 3 0 0 161 0 0 0.9795 0.0000 0.0000 146.000 0.68 1.67 -0.99 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2162 0.7838 0.0000 0 0 0.8212 0.1788 0.0000 0 0 0.9100 0.0900 0.0000
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 274 104 170 52 1 2 0 49 0 0 169 0 1 0.5000 0.0000 0.0059 50.500 0.08 2.18 -2.11 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2682 0.5289 0.2029 1 1 0.2682 0.5267 0.2051 1 1 0.2681 0.5240 0.2080
chr9 136383542 C CGCTGCT 0.500000 0.050 1 6 1 629 167 462 67 0 33 0 67 0 0 451 0 11 0.4012 0.0000 0.0238 4.061 3.00 5.54 -2.54 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1228 0.5082 0.3689 1 1 0.1269 0.5075 0.3655 1 1 0.1325 0.5066 0.3609
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 1 629 176 453 84 2 25 1 64 0 2 450 0 1 0.4773 0.0000 0.0066 6.040 4.40 3.06 1.34 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5129 0.4263 0.0608 1 0 0.5044 0.4306 0.0650 1 0 0.4929 0.4363 0.0707
chr9 137051216 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 850 177 673 96 0 2 0 79 0 0 672 0 1 0.5424 0.0000 0.0015 87.500 0.31 3.13 -2.81 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4292 0.4826 0.0882 1 1 0.4239 0.4834 0.0926 1 1 0.4167 0.4847 0.0986
chr9 137479113 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 271 129 142 124 0 2 0 3 0 0 142 0 0 0.9612 0.0000 0.0000 63.500 0.10 1.00 -0.90 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1475 0.8525 0.0000 0 0 0.7422 0.2578 0.0000 0 0 0.8651 0.1349 0.0000
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.050 1 -15 1 457 131 326 57 1 12 1 60 0 0 324 0 2 0.4351 0.0000 0.0061 9.917 1.56 13.63 -12.07 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1780 0.5292 0.2928 1 1 0.1809 0.5270 0.2920 1 1 0.1849 0.5242 0.2909
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 210 102 108 1 24 30 2 45 0 0 107 0 1 0.0098 0.0000 0.0093 2.571 4.00 3.24 0.76 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0611 0.3976 0.5413 1 2 0.0652 0.4039 0.5309 1 2 0.0709 0.4122 0.5170
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.050 1 6 6 960 191 769 0 0 24 0 167 0 0 753 0 16 0.0000 0.0000 0.0208 6.958 5.69 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 2 0.0000 0.0115 0.9885 2 2 0.0000 0.0130 0.9870
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.050 1 3 1 745 150 595 77 0 3 0 70 0 0 591 0 4 0.5133 0.0000 0.0067 49.000 0.27 3.91 -3.64 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3758 0.5262 0.0979 1 1 0.3770 0.5236 0.0994 1 1 0.3784 0.5203 0.1012
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.050 1 -2 1 247 101 146 95 0 0 0 6 0 0 146 0 0 0.9406 0.0000 0.0000 101.000 0.13 2.50 -2.37 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0492 0.9508 0.0000 0 0 0.9414 0.0586 0.0000 0 0 0.9889 0.0111 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.050 1 1 1 522 144 378 59 0 11 0 74 0 0 376 0 2 0.4097 0.0000 0.0053 12.091 0.37 1.32 -0.95 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1279 0.5246 0.3475 1 1 0.1338 0.5251 0.3411 1 1 0.1419 0.5256 0.3325
chr10 31461077 AGAT A 0.000905 0.050 1 -3 1 164 80 84 46 0 1 0 33 0 0 81 0 3 0.5750 0.0000 0.0357 79.000 0.52 2.91 -2.39 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5970 0.4028 0.0002 1 0 0.5942 0.4056 0.0002 1 0 0.5904 0.4093 0.0002
chr10 44292818 AC A 0.006843 0.050 1 -1 1 389 169 220 152 3 8 0 6 0 0 220 0 0 0.8994 0.0000 0.0000 20.125 0.38 1.50 -1.12 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3268 0.6732 0.0000 0 0 0.9920 0.0080 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000
chr10 47502280 CG C 0.024504 0.050 1 -1 1 838 216 622 208 0 2 0 6 0 0 622 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 107.000 0.26 2.00 -1.74 104 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2986 0.7014 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000
chr10 53807071 A AGTT 0.002532 0.050 1 3 2 344 72 272 39 0 6 1 26 0 0 272 0 0 0.5417 0.0000 0.0000 11.000 0.28 3.08 -2.79 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6251 0.3744 0.0005 1 0 0.6212 0.3783 0.0005 1 0 0.6158 0.3836 0.0005
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.050 1 -3 1 577 156 421 74 0 6 0 76 0 0 421 0 0 0.4744 0.0000 0.0000 25.000 0.65 3.13 -2.48 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4310 0.5672 0.0017 1 1 0.4353 0.5630 0.0017 1 1 0.4406 0.5576 0.0017
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.050 1 -6 3 124 57 67 37 0 2 0 18 0 0 67 0 0 0.6491 0.0000 0.0000 27.500 0.78 6.61 -5.83 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6575 0.3244 0.0181 1 0 0.6499 0.3308 0.0192 1 0 0.6398 0.3394 0.0208
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.050 1 1 1 215 85 130 77 0 3 0 5 0 0 130 0 0 0.9059 0.0000 0.0000 27.333 0.29 0.80 -0.51 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2117 0.7883 0.0000 0 0 0.9667 0.0333 0.0000 0 0 0.9917 0.0083 0.0000
chr10 73240978 AGCGGAG A 0.006364 0.050 1 -6 3 122 53 69 2 0 1 0 50 0 0 66 1 2 0.0377 0.0000 0.0435 52.000 4.00 14.32 -10.32 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9938 0.0062 2 1 0.0000 0.9893 0.0107
chr10 73240989 ACCAGTCTCT A 0.006454 0.050 1 -9 1 121 53 68 2 0 0 0 51 0 0 62 0 6 0.0377 0.0000 0.0882 53.000 4.00 14.06 -10.06 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9931 0.0069 2 1 0.0000 0.9880 0.0120
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.050 1 -3 1 428 101 327 0 0 20 6 75 0 0 327 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.050 2.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4026 0.5974 2 2 0.0000 0.4125 0.5875 2 2 0.0000 0.4261 0.5739
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.050 1 -6 2 458 180 278 87 2 13 2 76 0 0 276 0 2 0.4833 0.0000 0.0072 12.769 0.21 5.43 -5.23 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5545 0.4436 0.0019 1 0 0.5542 0.4439 0.0019 1 0 0.5535 0.4445 0.0020
chr10 77637505 AGAG A 0.002012 0.050 1 -3 2 800 244 556 114 2 37 5 86 0 2 552 0 2 0.4672 0.0000 0.0072 5.595 1.04 3.55 -2.51 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7217 0.2782 0.0001 1 0 0.7162 0.2837 0.0001 1 0 0.7086 0.2913 0.0002
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.050 1 6 1 631 130 501 117 1 3 0 9 0 0 501 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 42.333 0.30 6.33 -6.03 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1160 0.8840 0.0000 0 0 0.6350 0.3650 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.050 1 6 1 628 221 407 186 2 31 0 2 0 0 406 0 1 0.8416 0.0000 0.0025 6.097 0.25 6.00 -5.75 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5113 0.4887 0.0000 0 0 0.9450 0.0550 0.0000 0 0 0.9735 0.0265 0.0000
chr10 101694600 G GCCT 0.000619 0.050 1 3 2 431 97 334 79 4 10 0 4 0 0 334 0 0 0.8144 0.0000 0.0000 8.700 1.06 3.50 -2.44 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9502 0.0498 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.050 1 18 1 497 149 348 73 0 18 0 58 0 0 330 0 18 0.4899 0.0000 0.0517 7.278 0.25 12.79 -12.55 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4110 0.5806 0.0085 1 1 0.4156 0.5759 0.0085 1 1 0.4216 0.5699 0.0085
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.050 1 -2 1 314 124 190 70 0 1 0 53 0 0 189 0 1 0.5645 0.0000 0.0053 123.000 0.57 2.75 -2.18 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5733 0.3918 0.0348 1 0 0.5678 0.3955 0.0367 1 0 0.5603 0.4005 0.0392
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.050 1 3 3 219 78 141 32 0 9 1 36 0 0 141 0 0 0.4103 0.0000 0.0000 7.667 0.09 2.97 -2.88 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0973 0.4883 0.4145 1 1 0.0988 0.4881 0.4131 1 1 0.1008 0.4880 0.4112
chr10 119029820 GCGCCCCGCT G 0.000225 0.050 1 -9 3 225 48 177 27 0 3 0 18 0 0 176 0 1 0.5625 0.0000 0.0056 15.000 1.56 10.06 -8.50 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5839 0.4160 0.0001 1 0 0.5813 0.4187 0.0001 1 0 0.5777 0.4223 0.0001
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.050 1 -1 1 376 119 257 2 1 14 7 95 0 0 256 1 0 0.0168 0.0000 0.0039 7.000 0.50 2.29 -1.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7333 0.2667 2 2 0.0000 0.2781 0.7219 2 2 0.0000 0.1687 0.8313
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 378 123 255 114 0 3 0 6 0 0 255 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 40.000 0.24 1.67 -1.43 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2346 0.7654 0.0000 0 0 0.6241 0.3759 0.0000
chr11 1051657 AC A 0.061644 0.050 1 -1 1 443 150 293 138 1 6 0 5 0 0 293 0 0 0.9200 0.0000 0.0000 24.000 0.99 2.00 -1.01 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1402 0.8598 0.0000 0 0 0.9442 0.0558 0.0000 0 0 0.9852 0.0148 0.0000
chr11 1094638 ACCAACCACCACTCCCAGCCCT A 0.029704 0.050 1 -21 2 1643 415 1228 180 17 187 6 25 13 11 1075 20 109 0.4337 0.0106 0.1246 1.215 2.52 15.96 -13.44 36 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9199 0.0800 0.0001 1 0 0.9139 0.0860 0.0001 1 0 0.9053 0.0946 0.0001
chr11 1557337 G GCTCAGGCCGCCCTCC 0.000190 0.050 1 15 1 428 108 320 53 1 7 0 47 0 0 305 0 15 0.4907 0.0000 0.0469 14.286 0.85 13.51 -12.66 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3665 0.6333 0.0002 1 1 0.3726 0.6272 0.0002 1 1 0.3806 0.6192 0.0002
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.050 1 -30 2 1161 249 912 76 2 104 0 67 0 0 911 0 1 0.3052 0.0000 0.0011 1.394 0.63 6.60 -5.97 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3293 0.5252 0.1455 1 1 0.3265 0.5236 0.1499 1 1 0.3226 0.5217 0.1557
chr11 2445250 A ACGCGCCCAT 0.000730 0.050 1 9 1 458 128 330 51 1 19 0 57 0 0 320 0 10 0.3984 0.0000 0.0303 6.000 0.57 8.53 -7.96 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2943 0.7048 0.0009 1 1 0.3024 0.6967 0.0009 1 1 0.3132 0.6859 0.0009
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 2 399 128 271 0 0 4 1 123 0 0 269 0 2 0.0000 0.0000 0.0074 31.000 2.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0403 0.9597 2 2 0.0000 0.0428 0.9572 2 2 0.0000 0.0465 0.9535
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.050 1 2 1 229 101 128 62 0 0 4 35 0 0 127 1 0 0.6139 0.0000 0.0078 97.000 0.18 2.09 -1.91 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5567 0.3898 0.0535 1 0 0.5461 0.3964 0.0575 1 0 0.5319 0.4050 0.0630
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.050 1 2 1 229 105 124 65 1 35 0 4 0 0 124 0 0 0.6190 0.0000 0.0000 34.500 0.17 2.25 -2.08 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.0807 0.9193 0.0000 0 1 0.2377 0.7623 0.0000
chr11 4860474 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 829 257 572 149 3 2 0 103 0 0 571 0 1 0.5798 0.0000 0.0017 127.500 0.26 1.14 -0.87 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7914 0.2018 0.0069 1 0 0.7793 0.2126 0.0081 1 0 0.7622 0.2277 0.0101
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 720 183 537 101 0 8 0 74 0 0 537 0 0 0.5519 0.0000 0.0000 21.875 0.21 1.11 -0.90 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5810 0.3788 0.0403 1 0 0.5707 0.3854 0.0438 1 0 0.5568 0.3943 0.0490
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 1 957 222 735 19 0 5 0 198 0 0 715 1 19 0.0856 0.0000 0.0272 43.400 0.11 6.05 -5.94 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8625 0.1375
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 704 183 521 5 0 3 0 175 0 0 521 0 0 0.0273 0.0000 0.0000 60.000 0.40 1.67 -1.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9764 0.0236 2 2 0.0000 0.2725 0.7275 2 2 0.0000 0.0880 0.9120
chr11 5343311 CCAGCCCCAGGTCTGTGG C 0.500000 0.050 1 -17 3 613 192 421 176 0 11 0 5 0 0 421 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 16.455 0.31 19.40 -19.09 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0233 0.9767 0.0000 0 0 0.7313 0.2687 0.0000 0 0 0.9138 0.0862 0.0000
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.050 1 4 1 1060 262 798 136 0 20 0 106 0 0 796 0 2 0.5191 0.0000 0.0025 12.100 0.19 4.42 -4.23 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5755 0.3884 0.0361 1 0 0.5663 0.3942 0.0395 1 0 0.5537 0.4018 0.0445
chr11 5901221 GTCATCATTGTCAGGACTTTGGTATTTGTGACTCCAT G 0.500000 0.050 1 -36 1 1182 249 933 156 0 5 0 88 0 0 915 0 18 0.6265 0.0000 0.0193 48.800 0.85 23.92 -23.07 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8067 0.1876 0.0057 1 0 0.7947 0.1984 0.0069 1 0 0.7779 0.2135 0.0086
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.050 1 12 2 818 124 694 0 0 13 0 111 0 0 669 0 25 0.0000 0.0000 0.0360 8.538 8.35 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0316 0.9684 2 2 0.0000 0.0338 0.9662 2 2 0.0000 0.0370 0.9630
chr11 6921357 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 685 176 509 90 0 1 1 84 0 0 509 0 0 0.5114 0.0000 0.0000 175.000 0.88 1.44 -0.56 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2822 0.5457 0.1721 1 1 0.2823 0.5423 0.1754 1 1 0.2822 0.5380 0.1798
chr11 7796614 AGGACGCATTC A 0.500000 0.050 1 -10 2 830 236 594 231 0 3 0 2 0 0 593 0 1 0.9788 0.0000 0.0017 77.667 0.67 10.00 -9.33 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7154 0.2846 0.0000 0 0 0.9759 0.0241 0.0000 0 0 0.9882 0.0118 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 280 121 159 0 0 13 2 106 0 0 159 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.308 3.23 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0619 0.9381 2 2 0.0000 0.0652 0.9348 2 2 0.0000 0.0699 0.9301
chr11 12294797 G GCTCCTCCTC 0.500000 0.050 1 9 1 589 120 469 6 4 42 8 60 0 0 453 0 16 0.0500 0.0000 0.0341 1.810 2.67 6.85 -4.18 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9808 0.0192 2 1 0.0000 0.7966 0.2034
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.050 1 -3 2 243 90 153 49 1 2 0 38 0 0 152 0 1 0.5444 0.0000 0.0065 43.500 0.33 3.21 -2.88 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3773 0.4930 0.1297 1 1 0.3729 0.4934 0.1336 1 1 0.3672 0.4940 0.1388
chr11 18269807 CAA C 0.500000 0.050 1 -2 2 531 213 318 204 0 5 0 4 0 0 317 0 1 0.9577 0.0000 0.0031 41.600 0.13 1.75 -1.62 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0465 0.9535 0.0000 0 0 0.8446 0.1554 0.0000 0 0 0.9540 0.0460 0.0000
chr11 31106879 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 311 138 173 135 0 1 0 2 0 0 173 0 0 0.9783 0.0000 0.0000 137.000 0.17 1.00 -0.83 45 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5422 0.4578 0.0000 0 0 0.8806 0.1194 0.0000 0 0 0.9237 0.0763 0.0000
chr11 34632610 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 133 65 68 31 0 0 0 34 0 0 67 0 1 0.4769 0.0000 0.0147 65.000 0.35 1.18 -0.82 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1951 0.5153 0.2896 1 1 0.1973 0.5141 0.2885 1 1 0.2003 0.5127 0.2871
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 877 284 593 150 0 10 0 124 0 0 589 0 4 0.5282 0.0000 0.0067 27.400 0.24 3.78 -3.54 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4854 0.4595 0.0551 1 0 0.4795 0.4613 0.0592 1 0 0.4712 0.4638 0.0650
chr11 56361197 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 511 97 414 46 0 3 1 47 0 0 414 0 0 0.4742 0.0000 0.0000 47.000 0.46 1.94 -1.48 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2166 0.5278 0.2555 1 1 0.2183 0.5257 0.2559 1 1 0.2205 0.5231 0.2564
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.050 1 2 4 927 204 723 0 0 4 1 199 0 0 718 0 5 0.0000 0.0000 0.0069 49.750 2.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0073 0.9927
chr11 59457656 GC G 0.500000 0.050 1 -1 4 575 128 447 60 0 0 0 68 0 0 447 0 0 0.4688 0.0000 0.0000 128.000 0.43 1.74 -1.30 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1497 0.5200 0.3302 1 1 0.1534 0.5185 0.3281 1 1 0.1582 0.5165 0.3252
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 84 35 49 21 0 0 0 14 0 0 49 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 35.000 0.00 2.14 -2.14 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3359 0.4960 0.1681 1 1 0.3327 0.4963 0.1710 1 1 0.3285 0.4966 0.1749
chr11 62146758 A AGCGGGAGCAGGAGCG 0.500000 0.050 1 15 1 677 203 474 135 9 54 1 4 1 0 472 0 1 0.6650 0.0021 0.0042 2.722 5.33 5.50 -0.17 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.4717 0.5283 0.0000 0 0 0.7977 0.2023 0.0000
chr11 62146777 GGAGCAGGAGCGGCGC G 0.500000 0.050 1 -15 3 677 229 448 98 10 38 2 81 0 1 447 0 0 0.4279 0.0000 0.0022 5.081 1.12 8.79 -7.67 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5485 0.4046 0.0469 1 0 0.5394 0.4099 0.0507 1 0 0.5270 0.4170 0.0561
chr11 65557854 CCAGCAGCAG C 0.500000 0.050 1 -9 3 264 80 184 34 1 5 1 39 0 0 182 1 1 0.4250 0.0000 0.0109 14.800 1.18 9.44 -8.26 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1638 0.5084 0.3278 1 1 0.1670 0.5077 0.3253 1 1 0.1712 0.5069 0.3219
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 5 280 127 153 56 7 14 2 48 0 0 153 0 0 0.4409 0.0000 0.0000 8.692 0.59 3.17 -2.58 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4070 0.4839 0.1091 1 1 0.4018 0.4849 0.1134 1 1 0.3948 0.4862 0.1191
chr11 68157814 GTCA G 0.500000 0.050 1 -3 3 479 119 360 60 2 11 1 45 0 0 354 0 6 0.5042 0.0000 0.0167 9.818 0.13 3.22 -3.09 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3598 0.5057 0.1345 1 1 0.3564 0.5052 0.1384 1 1 0.3518 0.5046 0.1436
chr11 68312746 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 2 170 78 92 35 3 9 0 31 0 0 92 0 0 0.4487 0.0000 0.0000 7.667 0.60 3.94 -3.34 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3289 0.5064 0.1647 1 1 0.3263 0.5059 0.1678 1 1 0.3228 0.5053 0.1719
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.050 1 21 2 950 174 776 0 0 51 2 121 0 0 703 1 72 0.0000 0.0000 0.0941 2.412 5.14 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0079 0.9921 2 2 0.0000 0.0090 0.9910
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.050 1 57 2 1201 260 941 7 0 142 6 105 0 0 856 0 85 0.0269 0.0000 0.0903 0.824 1.14 10.92 -9.78 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 2 0.0000 0.4586 0.5414 2 2 0.0000 0.1094 0.8906
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.050 1 -42 1 869 155 714 7 0 59 0 89 0 0 676 0 38 0.0452 0.0000 0.0532 1.627 0.14 11.22 -11.08 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8239 0.1761 2 2 0.0000 0.3910 0.6090
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 891 260 631 1 0 1 1 257 0 0 631 0 0 0.0038 0.0000 0.0000 259.000 0.00 2.60 -2.60 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0077 0.9923 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0030 0.9970
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.050 1 3 1 747 166 581 4 0 21 2 139 0 0 577 0 4 0.0241 0.0000 0.0069 6.905 1.50 3.70 -2.20 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9469 0.0531 2 2 0.0000 0.2883 0.7117 2 2 0.0000 0.1204 0.8796
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.050 1 -22 2 307 99 208 58 0 3 0 38 0 0 205 0 3 0.5859 0.0000 0.0144 32.000 0.14 15.92 -15.78 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4629 0.4509 0.0862 1 0 0.4555 0.4540 0.0905 1 1 0.4455 0.4581 0.0964
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 150 70 80 30 0 1 0 39 0 0 80 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 69.000 0.33 1.82 -1.49 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1464 0.4971 0.3565 1 1 0.1499 0.4973 0.3528 1 1 0.1547 0.4975 0.3478
chr11 89691465 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 267 92 175 54 1 5 0 32 0 0 175 0 0 0.5870 0.0000 0.0000 17.400 3.69 1.06 2.62 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5504 0.3929 0.0567 1 0 0.5399 0.3994 0.0607 1 0 0.5258 0.4079 0.0663
chr11 94380552 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 510 157 353 149 0 4 0 4 0 0 353 0 0 0.9490 0.0000 0.0000 38.250 0.30 3.00 -2.70 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0584 0.9416 0.0000 0 0 0.7317 0.2683 0.0000 0 0 0.8895 0.1105 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1200 309 891 5 5 66 3 230 0 0 891 0 0 0.0162 0.0000 0.0000 3.591 3.00 7.25 -4.25 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9381 0.0619 2 2 0.0000 0.1157 0.8843 2 2 0.0000 0.0322 0.9678
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.050 1 -15 3 882 293 589 242 1 34 1 15 0 0 589 0 0 0.8259 0.0000 0.0000 7.618 1.43 13.00 -11.57 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0094 0.9906 0.0000 0 1 0.4723 0.5277 0.0000
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.050 1 -8 2 267 93 174 50 0 5 0 38 0 0 173 0 1 0.5376 0.0000 0.0057 17.600 0.14 7.63 -7.49 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3800 0.4919 0.1281 1 1 0.3756 0.4924 0.1320 1 1 0.3696 0.4931 0.1373
chr11 124016101 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 1015 275 740 266 1 2 0 6 0 0 740 0 0 0.9673 0.0000 0.0000 136.500 0.71 4.67 -3.96 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0441 0.9559 0.0000 0 0 0.9294 0.0706 0.0000 0 0 0.9848 0.0152 0.0000
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 385 125 260 0 1 9 2 113 0 0 260 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 12.667 6.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0563 0.9437 2 2 0.0000 0.0591 0.9409 2 2 0.0000 0.0632 0.9368
chr11 125495476 CG C 0.500000 0.050 1 -1 4 460 158 302 146 1 0 0 11 0 0 302 0 0 0.9241 0.0000 0.0000 158.000 0.29 1.18 -0.89 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0239 0.9761 0.0000 0 1 0.3636 0.6364 0.0000
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.050 1 -6 1 257 87 170 38 0 9 1 39 0 0 170 0 0 0.4368 0.0000 0.0000 8.556 0.24 5.72 -5.48 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2192 0.5228 0.2580 1 1 0.2207 0.5211 0.2582 1 1 0.2227 0.5189 0.2584
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 420 134 286 64 2 18 3 47 0 0 285 0 1 0.4776 0.0000 0.0035 6.389 0.52 3.49 -2.97 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4329 0.4708 0.0963 1 1 0.4267 0.4727 0.1006 1 1 0.4185 0.4751 0.1064
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 96 45 51 25 0 0 0 20 0 0 51 0 0 0.5556 0.0000 0.0000 45.000 1.52 2.45 -0.93 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3067 0.5062 0.1871 1 1 0.3048 0.5057 0.1895 1 1 0.3022 0.5051 0.1927
chr12 865142 T TC 0.282148 0.050 1 1 2 381 118 263 49 0 3 0 66 0 0 263 0 0 0.4153 0.0000 0.0000 38.333 0.90 1.91 -1.01 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1465 0.5443 0.3092 1 1 0.1530 0.5444 0.3026 1 1 0.1618 0.5444 0.2938
chr12 865189 T TC 0.592141 0.050 1 1 1 383 137 246 62 0 3 1 71 0 0 244 0 2 0.4526 0.0000 0.0081 44.667 0.92 1.89 -0.97 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0911 0.4767 0.4323 1 1 0.0944 0.4772 0.4283 1 1 0.0990 0.4780 0.4230
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.050 1 3 1 552 153 399 13 1 22 2 115 0 0 393 0 6 0.0850 0.0000 0.0150 5.955 0.00 3.02 -3.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9247 0.0753
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.050 1 -3 1 439 135 304 6 0 30 17 82 0 0 302 0 2 0.0444 0.0000 0.0066 3.500 0.33 3.27 -2.93 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.7844 0.2156 2 2 0.0000 0.3976 0.6024
chr12 6936725 GCAA G 0.000848 0.050 1 -3 1 958 285 673 55 100 8 38 84 0 0 672 1 0 0.1930 0.0000 0.0015 45.000 0.65 4.44 -3.79 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7265 0.2734 0.0000 1 0 0.7213 0.2787 0.0001 1 0 0.7140 0.2859 0.0001
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.050 1 3 1 2578 619 1959 337 3 1 3 275 0 0 1950 0 9 0.5444 0.0000 0.0046 616.000 1.20 4.09 -2.90 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6691 0.3235 0.0074 1 0 0.6586 0.3325 0.0089 1 0 0.6436 0.3451 0.0114
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.050 1 5 1 229 84 145 2 0 4 0 78 0 0 143 0 2 0.0238 0.0000 0.0138 20.000 0.50 4.58 -4.08 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7753 0.2247 2 2 0.0000 0.3428 0.6572 2 2 0.0000 0.2336 0.7664
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.050 1 -9 1 700 197 503 164 1 28 0 4 1 0 502 0 0 0.8325 0.0020 0.0020 6.036 0.20 9.50 -9.30 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7100 0.2900 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.050 1 -3 1 276 148 128 9 0 6 2 131 0 0 127 0 1 0.0608 0.0000 0.0078 23.667 0.22 4.24 -4.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8758 0.1242 2 2 0.0000 0.3498 0.6502
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.050 1 -30 1 1936 595 1341 255 10 91 6 233 3 3 1327 3 5 0.4286 0.0022 0.0104 5.682 2.05 7.80 -5.75 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5804 0.4075 0.0121 1 0 0.5802 0.4066 0.0133 1 0 0.5791 0.4060 0.0149
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.050 1 30 1 1303 265 1038 134 2 124 0 5 3 4 1027 1 3 0.5057 0.0029 0.0106 1.129 3.37 5.40 -2.03 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1141 0.8859 0.0000 0 0 0.5617 0.4383 0.0000
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.050 1 1 1 872 179 693 16 0 3 0 160 0 0 689 0 4 0.0894 0.0000 0.0058 58.667 0.00 1.16 -1.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9658 0.0342
chr12 52317956 ACTT A 0.001740 0.050 1 -3 1 415 102 313 55 0 5 0 42 0 0 313 0 0 0.5392 0.0000 0.0000 19.400 0.31 2.95 -2.64 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6275 0.3722 0.0003 1 0 0.6238 0.3758 0.0003 1 0 0.6188 0.3809 0.0003
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.050 1 -21 2 980 228 752 108 1 28 2 89 2 0 749 1 0 0.4737 0.0027 0.0040 7.071 0.73 13.21 -12.48 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4943 0.4450 0.0608 1 0 0.4879 0.4475 0.0646 1 0 0.4791 0.4509 0.0700
chr12 52768988 C CGCT 0.004583 0.050 1 3 2 547 158 389 81 56 15 0 6 0 2 387 0 0 0.5127 0.0000 0.0051 9.533 0.44 3.67 -3.22 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2843 0.7157 0.0000 0 0 0.9918 0.0082 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.050 1 21 2 501 131 370 110 0 18 0 3 0 0 369 0 1 0.8397 0.0000 0.0027 6.278 0.14 14.00 -13.86 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3475 0.6525 0.0000 0 0 0.9598 0.0402 0.0000 0 0 0.9864 0.0136 0.0000
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.050 1 -18 2 1075 275 800 114 0 53 0 108 0 0 797 0 3 0.4145 0.0000 0.0037 4.189 0.29 13.41 -13.12 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4484 0.5347 0.0169 1 1 0.4519 0.5309 0.0172 1 1 0.4562 0.5261 0.0177
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.050 1 -1 1 330 82 248 43 0 3 0 36 0 0 248 0 0 0.5244 0.0000 0.0000 26.333 0.23 1.47 -1.24 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4280 0.4787 0.0933 1 1 0.4257 0.4790 0.0953 1 1 0.4226 0.4795 0.0980
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.050 1 1 2 336 77 259 39 0 0 0 38 0 0 259 0 0 0.5065 0.0000 0.0000 77.000 0.10 1.11 -1.00 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2959 0.5209 0.1832 1 1 0.2965 0.5192 0.1843 1 1 0.2972 0.5171 0.1857
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.050 1 -4 2 551 112 439 107 0 1 0 4 0 0 439 0 0 0.9554 0.0000 0.0000 111.000 0.14 3.25 -3.11 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7876 0.2124 0.0000 0 0 0.9940 0.0060 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr12 57225404 T TGGC 0.004341 0.050 1 3 1 617 146 471 77 2 4 1 62 0 0 467 0 4 0.5274 0.0000 0.0085 35.250 1.27 4.34 -3.07 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6030 0.3962 0.0008 1 0 0.6006 0.3985 0.0008 1 0 0.5973 0.4018 0.0009
chr12 58876497 CTGG C 0.000469 0.050 1 -3 3 214 108 106 104 1 1 0 2 0 0 106 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 107.000 0.17 3.50 -3.33 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.050 1 3 2 396 101 295 4 0 4 0 93 0 0 292 0 3 0.0396 0.0000 0.0102 24.250 0.75 3.77 -3.02 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9890 0.0110 2 1 0.0000 0.6657 0.3343 2 2 0.0000 0.3942 0.6058
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.050 1 -3 1 973 287 686 0 0 29 3 255 0 0 684 1 1 0.0000 0.0000 0.0029 8.862 3.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 1 441 114 327 65 7 36 1 5 0 0 327 0 0 0.5702 0.0000 0.0000 2.167 0.54 3.80 -3.26 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.1250 0.8750 0.0000 0 1 0.4029 0.5971 0.0000
chr12 106247620 TGCC T 0.500000 0.050 1 -3 2 407 50 357 13 2 12 2 21 1 2 352 0 2 0.2600 0.0028 0.0140 3.455 4.85 6.43 -1.58 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1693 0.4992 0.3315 1 1 0.1721 0.4993 0.3286 1 1 0.1760 0.4993 0.3247
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 1 398 94 304 0 0 8 2 84 0 0 302 0 2 0.0000 0.0000 0.0066 10.750 4.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0985 0.9015 2 2 0.0000 0.1025 0.8975 2 2 0.0000 0.1082 0.8918
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.050 1 -60 3 1878 449 1429 244 2 78 8 117 0 1 1388 0 40 0.5434 0.0000 0.0287 4.818 0.93 5.13 -4.20 64 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9443 0.0554 0.0003 1 0 0.9377 0.0619 0.0004 1 0 0.9278 0.0716 0.0006
chr12 108623665 GAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.050 1 -30 2 1844 380 1464 219 25 61 19 56 1 1 1423 18 21 0.5763 0.0007 0.0280 5.849 1.05 3.89 -2.84 67 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9945 0.0055 0.0000 1 0 0.9933 0.0067 0.0000 1 0 0.9911 0.0089 0.0000
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 204 108 96 0 0 1 0 107 0 0 96 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 107.000 3.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0634 0.9366 2 2 0.0000 0.0667 0.9333 2 2 0.0000 0.0714 0.9286
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -6 1 236 91 145 51 0 11 0 29 0 0 143 0 2 0.5604 0.0000 0.0138 7.273 0.29 5.34 -5.05 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5100 0.4194 0.0706 1 0 0.5007 0.4245 0.0748 1 0 0.4882 0.4312 0.0806
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.050 1 3 2 448 96 352 5 6 21 20 44 0 0 346 0 6 0.0521 0.0000 0.0170 3.381 3.40 4.36 -0.96 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9598 0.0402 2 1 0.0000 0.7790 0.2210
chr12 121420274 AGAT A 0.500000 0.050 1 -3 2 231 75 156 39 2 1 0 33 0 0 155 0 1 0.5200 0.0000 0.0064 74.000 0.56 3.27 -2.71 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3275 0.5083 0.1642 1 1 0.3250 0.5076 0.1674 1 1 0.3216 0.5068 0.1715
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.050 1 -5 5 335 96 239 0 0 11 0 85 0 0 227 0 12 0.0000 0.0000 0.0502 7.727 5.48 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0801 0.9199 2 2 0.0000 0.0838 0.9162 2 2 0.0000 0.0891 0.9109
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.050 1 15 4 357 88 269 0 0 12 0 76 0 0 256 0 13 0.0000 0.0000 0.0483 6.333 11.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0963 0.9037 2 2 0.0000 0.1002 0.8998 2 2 0.0000 0.1059 0.8941
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 5 746 189 557 7 0 18 1 163 0 0 537 0 20 0.0370 0.0000 0.0359 9.500 0.00 8.07 -8.07 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.5344 0.4656 2 2 0.0000 0.1408 0.8592
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.050 1 3 3 244 92 152 2 1 32 1 56 0 0 148 1 3 0.0217 0.0000 0.0263 1.875 0.00 3.84 -3.84 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9622 0.0378 2 1 0.0000 0.6178 0.3822 2 2 0.0000 0.4126 0.5874
chr12 124402512 G GGCTGCT 0.500000 0.050 1 6 3 244 92 152 3 0 65 0 24 0 0 148 0 4 0.0326 0.0000 0.0263 0.415 1.00 5.21 -4.21 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9842 0.0158 2 1 0.0000 0.7785 0.2215 2 1 0.0000 0.5964 0.4036
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 185 61 124 20 2 11 0 28 0 0 122 0 2 0.3279 0.0000 0.0161 4.545 0.60 4.18 -3.58 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1569 0.4968 0.3463 1 1 0.1601 0.4970 0.3429 1 1 0.1645 0.4973 0.3383
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.050 1 9 1 200 64 136 1 0 5 1 57 0 0 132 0 4 0.0156 0.0000 0.0294 11.800 2.00 7.67 -5.67 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5181 0.4819 2 2 0.0000 0.2971 0.7029 2 2 0.0000 0.2470 0.7530
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 523 141 382 60 0 19 1 61 0 0 380 0 2 0.4255 0.0000 0.0052 6.421 1.18 2.93 -1.75 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1886 0.5331 0.2783 1 1 0.1913 0.5306 0.2781 1 1 0.1948 0.5275 0.2777
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.050 1 -36 5 530 136 394 4 0 33 1 98 0 0 391 0 3 0.0294 0.0000 0.0076 3.219 1.25 13.05 -11.80 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9810 0.0190 2 1 0.0000 0.5357 0.4643 2 2 0.0000 0.2748 0.7252
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.050 1 6 2 771 175 596 83 2 25 0 65 0 0 588 0 8 0.4743 0.0000 0.0134 5.920 0.37 5.55 -5.18 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3818 0.5047 0.1134 1 1 0.3784 0.5040 0.1175 1 1 0.3738 0.5032 0.1230
chr13 25170698 G GCTCGGGGGGTGCCCGGGGCTT 0.001234 0.050 1 21 2 626 134 492 124 0 7 1 2 0 0 492 0 0 0.9254 0.0000 0.0000 18.000 0.92 21.00 -20.08 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr13 44574554 CTGT C 0.001798 0.050 1 -3 1 807 178 629 144 1 22 2 9 0 1 628 0 0 0.8090 0.0000 0.0016 7.000 0.24 3.00 -2.76 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0069 0.9931 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr13 46553473 C CCCA 0.000465 0.050 1 3 4 262 86 176 70 3 10 0 3 0 0 176 0 0 0.8140 0.0000 0.0000 7.600 0.36 3.67 -3.31 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9902 0.0098 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr13 52642566 CA C 0.003742 0.050 1 -1 3 611 190 421 87 0 1 0 102 0 0 421 0 0 0.4579 0.0000 0.0000 189.000 0.17 1.13 -0.96 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2724 0.7231 0.0045 1 1 0.2817 0.7139 0.0044 1 1 0.2939 0.7019 0.0043
chr13 60528441 GATA G 0.187645 0.050 1 -3 4 435 90 345 45 0 1 0 44 0 0 341 0 4 0.5000 0.0000 0.0116 89.000 0.11 3.25 -3.14 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3436 0.5496 0.1068 1 1 0.3467 0.5467 0.1065 1 1 0.3508 0.5431 0.1062
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.050 1 6 1 601 144 457 55 0 28 1 60 2 0 452 0 3 0.3819 0.0044 0.0109 4.143 1.62 6.57 -4.95 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3192 0.5955 0.0853 1 1 0.3247 0.5909 0.0844 1 1 0.3318 0.5849 0.0833
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.050 1 4 1 112 46 66 31 0 2 0 13 0 0 66 0 0 0.6739 0.0000 0.0000 22.000 0.13 4.15 -4.02 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6910 0.3063 0.0027 1 0 0.6845 0.3127 0.0028 1 0 0.6753 0.3216 0.0030
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.050 1 3 4 597 91 506 1 0 5 1 84 0 0 501 2 3 0.0110 0.0000 0.0099 17.200 4.00 4.96 -0.96 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1076 0.8924 2 2 0.0000 0.0459 0.9541 2 2 0.0000 0.0367 0.9633
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.050 1 -3 2 475 69 406 0 0 30 4 35 0 1 397 1 7 0.0000 0.0000 0.0222 1.345 4.86 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2941 0.7059 2 2 0.0000 0.2881 0.7119 2 2 0.0000 0.2848 0.7152
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.050 1 -15 1 249 80 169 13 2 4 0 61 0 0 169 0 0 0.1625 0.0000 0.0000 19.000 0.85 9.95 -9.10 11 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0083 0.2098 0.7819 2 1 0.0009 0.9241 0.0749 2 1 0.0000 0.9810 0.0190
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.050 1 -15 1 248 81 167 9 0 19 0 53 0 0 166 0 1 0.1111 0.0000 0.0060 3.263 1.67 10.81 -9.14 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9907 0.0093 2 1 0.0000 0.8858 0.1142
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.050 1 4 1 416 105 311 62 0 3 0 40 0 0 310 0 1 0.5905 0.0000 0.0032 34.000 0.84 4.10 -3.26 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5185 0.4164 0.0650 1 0 0.5092 0.4216 0.0692 1 0 0.4967 0.4283 0.0749
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 1 577 121 456 59 0 3 0 59 0 0 454 0 2 0.4876 0.0000 0.0044 39.333 0.29 3.19 -2.90 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2094 0.5354 0.2552 1 1 0.2115 0.5327 0.2558 1 1 0.2142 0.5294 0.2565
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.050 1 1 2 778 167 611 69 0 10 0 88 0 0 609 0 2 0.4132 0.0000 0.0033 15.700 0.77 1.89 -1.12 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0281 0.3596 0.6124 1 2 0.0301 0.3646 0.6054 1 2 0.0329 0.3713 0.5958
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.050 1 -1 4 701 192 509 0 0 19 0 173 0 0 507 0 2 0.0000 0.0000 0.0039 9.105 1.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0159 0.9841 2 2 0.0000 0.0179 0.9821
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.050 1 1 1 430 103 327 1 0 6 1 95 0 0 323 0 4 0.0097 0.0000 0.0122 16.000 0.00 1.29 -1.29 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1462 0.8538 2 2 0.0000 0.0660 0.9340 2 2 0.0000 0.0535 0.9465
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.050 1 -6 1 686 158 528 79 0 21 0 58 0 0 526 0 2 0.5000 0.0000 0.0038 6.524 0.65 6.43 -5.79 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6185 0.3580 0.0236 1 0 0.6122 0.3627 0.0251 1 0 0.6037 0.3691 0.0272
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.050 1 3 3 580 179 401 154 0 21 0 4 0 0 401 0 0 0.8603 0.0000 0.0000 7.524 0.23 3.00 -2.77 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1572 0.8428 0.0000 0 0 0.8910 0.1090 0.0000 0 0 0.9600 0.0400 0.0000
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.050 1 6 1 488 108 380 0 0 6 1 101 0 0 380 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 17.000 5.75 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1658 0.8342 2 2 0.0000 0.1731 0.8269 2 2 0.0000 0.1834 0.8166
chr14 23079578 C CGTGAAT 0.153649 0.050 1 6 2 486 110 376 5 1 10 3 91 0 0 376 0 0 0.0455 0.0000 0.0000 11.111 0.40 5.95 -5.55 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9571 0.0429 2 1 0.0000 0.8274 0.1726
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.050 1 -3 1 302 38 264 0 0 4 1 33 0 0 261 0 3 0.0000 0.0000 0.0114 8.500 3.58 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3960 0.6040 2 2 0.0000 0.4005 0.5995 2 2 0.0000 0.4066 0.5934
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.050 1 -1 1 298 75 223 40 0 3 0 32 0 0 222 0 1 0.5333 0.0000 0.0045 24.000 0.10 1.09 -0.99 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5306 0.4462 0.0232 1 0 0.5287 0.4476 0.0237 1 0 0.5261 0.4494 0.0244
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.050 1 6 1 417 122 295 59 0 27 0 36 1 0 293 0 1 0.4836 0.0034 0.0068 3.519 0.44 5.75 -5.31 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6242 0.3425 0.0333 1 0 0.6149 0.3493 0.0358 1 0 0.6023 0.3584 0.0393
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.050 1 6 1 685 145 540 59 0 10 1 75 0 0 535 0 5 0.4069 0.0000 0.0093 13.500 1.24 6.83 -5.59 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0158 0.3208 0.6634 1 2 0.0170 0.3267 0.6563 1 2 0.0187 0.3347 0.6467
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.050 1 -6 2 688 173 515 2 1 37 2 131 0 0 507 1 7 0.0116 0.0000 0.0155 3.649 1.00 6.92 -5.92 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3659 0.6341 2 2 0.0000 0.0464 0.9536 2 2 0.0000 0.0227 0.9773
chr14 77027418 TTGC T 0.008855 0.050 1 -3 1 436 111 325 0 1 17 43 50 0 0 324 1 0 0.0000 0.0000 0.0031 5.353 4.42 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9184 0.0816 2 1 0.0000 0.9214 0.0786 2 1 0.0000 0.9256 0.0744
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.050 1 -6 1 437 112 325 0 3 56 5 48 0 0 324 0 1 0.0000 0.0000 0.0031 1.039 6.44 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.4707 0.5293 2 2 0.0000 0.4403 0.5597 2 2 0.0000 0.4173 0.5827
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.050 1 -3 2 497 167 330 5 67 16 4 75 0 1 329 0 0 0.0299 0.0000 0.0030 9.375 4.60 3.20 1.40 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0619 0.4346 0.5034 1 2 0.0649 0.4371 0.4980 1 2 0.0690 0.4404 0.4906
chr14 92931413 AGAG A 0.000504 0.050 1 -3 2 628 151 477 70 2 12 0 67 0 0 476 0 1 0.4636 0.0000 0.0021 11.583 0.46 3.25 -2.80 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5054 0.4945 0.0002 1 0 0.5067 0.4931 0.0002 1 0 0.5083 0.4915 0.0002
chr14 94290570 CAGG C 0.000333 0.050 1 -3 1 466 120 346 56 0 3 0 61 0 0 345 0 1 0.4667 0.0000 0.0029 39.000 0.57 3.46 -2.89 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3914 0.6084 0.0002 1 1 0.3967 0.6031 0.0002 1 1 0.4036 0.5962 0.0002
chr14 94469426 TGAC T 0.001735 0.050 1 -3 2 611 149 462 87 0 5 0 57 0 0 460 0 2 0.5839 0.0000 0.0043 28.800 0.20 3.07 -2.87 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7692 0.2307 0.0001 1 0 0.7621 0.2379 0.0001 1 0 0.7523 0.2476 0.0001
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.050 1 -9 1 237 79 158 0 0 14 0 65 0 0 151 0 7 0.0000 0.0000 0.0443 4.643 8.69 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1747 0.8253 2 2 0.0000 0.1800 0.8200 2 2 0.0000 0.1875 0.8125
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.050 1 -12 2 546 104 442 74 3 20 1 6 0 0 442 0 0 0.7115 0.0000 0.0000 4.150 0.85 8.50 -7.65 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.2877 0.7123 0.0000 0 0 0.7313 0.2687 0.0000
chr14 105399471 G GA 0.001351 0.050 1 1 3 158 54 104 30 0 1 0 23 0 0 104 0 0 0.5556 0.0000 0.0000 53.000 0.63 1.13 -0.50 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5693 0.4303 0.0004 1 0 0.5672 0.4324 0.0004 1 0 0.5644 0.4352 0.0004
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.050 1 -3 2 413 124 289 52 0 24 0 48 1 1 285 0 2 0.4194 0.0035 0.0138 4.167 0.46 3.60 -3.14 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3955 0.5055 0.0990 1 1 0.3953 0.5043 0.1004 1 1 0.3949 0.5027 0.1023
chr15 20534590 ATCTCCTCCTGCTCTCGTATCTTCTCCTCCTGCTCCCGTATCT A 0.000272 0.050 1 -42 1 1913 659 1254 410 51 73 15 110 15 20 1179 7 33 0.6222 0.0120 0.0598 7.917 2.47 9.01 -6.54 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.050 1 3 1 674 136 538 1 1 4 3 127 0 2 524 7 5 0.0074 0.0000 0.0260 32.250 0.00 5.15 -5.15 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.050 1 -1 2 1383 304 1079 0 0 12 0 292 0 0 1014 22 43 0.0000 0.0000 0.0602 26.545 3.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441081 G GTCTCCTCCTCTTCCCGCATCT 0.154509 0.050 1 21 1 1152 236 916 91 1 57 4 83 1 1 913 0 1 0.3856 0.0011 0.0033 3.105 1.63 8.10 -6.47 37 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4614 0.4941 0.0444 1 1 0.4619 0.4925 0.0456 1 1 0.4623 0.4906 0.0471
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.050 1 -1 2 223 89 134 1 1 5 39 43 0 1 133 0 0 0.0112 0.0000 0.0075 9.000 0.00 1.63 -1.63 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6718 0.3282 2 2 0.0000 0.4457 0.5543 2 2 0.0000 0.3785 0.6215
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.050 1 -2 2 223 89 134 2 1 45 2 39 0 1 133 0 0 0.0225 0.0000 0.0075 1.000 0.00 2.38 -2.38 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9619 0.0381 2 1 0.0000 0.6680 0.3320 2 2 0.0000 0.4498 0.5502
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.050 1 -3 1 724 167 557 0 0 39 2 126 0 0 548 0 9 0.0000 0.0000 0.0162 3.368 4.06 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0161 0.9839 2 2 0.0000 0.0176 0.9824
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.050 1 -2 1 466 180 286 72 0 5 0 103 0 0 284 0 2 0.4000 0.0000 0.0070 35.000 1.71 2.01 -0.30 22 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0426 0.4044 0.5531 1 2 0.0471 0.4133 0.5396 1 2 0.0537 0.4250 0.5214
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.050 1 5 1 491 142 349 62 0 9 1 70 0 0 347 0 2 0.4366 0.0000 0.0057 14.778 0.32 4.56 -4.23 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1716 0.5436 0.2847 1 1 0.1769 0.5418 0.2814 1 1 0.1839 0.5393 0.2768
chr15 42685460 ACCCCATTGTGAGCTCCAG A 0.000539 0.050 1 -18 2 905 216 689 83 0 19 4 110 0 1 688 0 0 0.3843 0.0000 0.0015 10.263 1.66 6.42 -4.76 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1528 0.8457 0.0016 1 1 0.1627 0.8358 0.0015 1 1 0.1764 0.8222 0.0014
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.050 1 4 1 226 78 148 8 0 2 0 68 0 0 143 0 5 0.1026 0.0000 0.0338 38.000 0.12 5.06 -4.93 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.9679 0.0321
chr15 50529817 A AT 0.001809 0.050 1 1 1 121 58 63 54 0 1 0 3 0 0 63 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 57.000 0.72 1.67 -0.94 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9437 0.0563 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr15 65650738 AGAGGAGGAGGAAGAGCAGGAGGAAGAG A 0.000145 0.050 1 -27 2 542 138 404 108 0 24 0 6 0 0 404 0 0 0.7826 0.0000 0.0000 4.750 0.56 12.33 -11.77 36 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8534 0.1466 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.050 1 -3 2 168 95 73 55 0 4 0 36 0 0 73 0 0 0.5789 0.0000 0.0000 22.750 0.09 2.94 -2.85 17 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5091 0.4213 0.0696 1 0 0.5006 0.4259 0.0735 1 0 0.4891 0.4319 0.0790
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.050 1 -3 1 294 146 148 84 0 1 0 61 0 0 146 0 2 0.5753 0.0000 0.0135 145.000 0.79 3.30 -2.51 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4523 0.4664 0.0813 1 1 0.4438 0.4698 0.0864 1 1 0.4323 0.4742 0.0935
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.050 1 -3 1 476 101 375 0 0 15 3 83 0 0 371 0 4 0.0000 0.0000 0.0107 5.733 4.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0675 0.9325 2 2 0.0000 0.0704 0.9296 2 2 0.0000 0.0746 0.9254
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.050 1 -3 3 736 135 601 124 2 8 0 1 0 0 601 0 0 0.9185 0.0000 0.0000 15.625 1.44 7.00 -5.56 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9956 0.0044 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.050 1 -18 1 498 127 371 108 1 16 0 2 0 0 371 0 0 0.8504 0.0000 0.0000 6.938 0.31 18.50 -18.19 24 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7186 0.2814 0.0000 0 0 0.9433 0.0567 0.0000 0 0 0.9654 0.0346 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.050 1 3 3 357 142 215 76 0 4 0 62 0 0 214 0 1 0.5352 0.0000 0.0047 34.500 0.54 2.92 -2.38 40 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5052 0.4395 0.0553 1 0 0.5011 0.4412 0.0577 1 0 0.4956 0.4436 0.0609
chr15 88472272 CAG C 0.005890 0.050 1 -2 3 258 100 158 97 0 1 0 2 0 0 158 0 0 0.9700 0.0000 0.0000 99.000 0.23 2.00 -1.77 59 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9867 0.0133 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr15 89333596 T TTGCTGC 0.028553 0.050 1 6 1 953 242 711 165 0 67 0 10 0 0 710 1 0 0.6818 0.0000 0.0014 2.612 0.56 5.90 -5.34 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.7032 0.2968 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.050 1 -12 2 900 211 689 59 5 31 2 114 1 0 688 0 0 0.2796 0.0015 0.0015 5.774 1.27 7.57 -6.30 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0023 0.1232 0.8745 1 2 0.0028 0.1321 0.8651 1 2 0.0036 0.1449 0.8515
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.050 1 -6 1 339 100 239 0 0 7 0 93 0 0 228 0 11 0.0000 0.0000 0.0460 13.286 6.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.050 1 -3 2 583 224 359 94 2 44 2 82 0 0 355 1 3 0.4196 0.0000 0.0111 4.091 0.22 3.23 -3.01 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4841 0.4786 0.0374 1 0 0.4839 0.4775 0.0385 1 0 0.4835 0.4764 0.0401
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.050 1 -17 2 325 89 236 48 0 4 0 37 0 0 232 0 4 0.5393 0.0000 0.0169 21.250 0.40 15.14 -14.74 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5221 0.4522 0.0256 1 0 0.5206 0.4532 0.0263 1 0 0.5184 0.4545 0.0271
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.050 1 -1 1 1109 200 909 192 2 1 0 5 0 0 909 0 0 0.9600 0.0000 0.0000 199.000 0.86 0.80 0.06 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1280 0.8720 0.0000 0 0 0.9411 0.0589 0.0000 0 0 0.9839 0.0161 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 433 106 327 0 0 1 2 103 0 0 326 0 1 0.0000 0.0000 0.0031 105.000 7.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 433 106 327 0 0 1 2 103 0 0 326 0 1 0.0000 0.0000 0.0031 105.000 7.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.050 1 -3 2 292 105 187 101 1 1 0 2 0 0 187 0 0 0.9619 0.0000 0.0000 103.000 0.30 3.00 -2.70 67 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9305 0.0695 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.050 1 3 1 385 116 269 44 4 34 7 27 1 1 253 8 6 0.3793 0.0037 0.0595 2.412 2.45 11.26 -8.80 22 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4165 0.5131 0.0704 1 1 0.4174 0.5115 0.0711 1 1 0.4185 0.5096 0.0720
chr16 11915673 C CCCGCCGCCGCCGCCG 0.000522 0.050 1 15 1 385 116 269 51 1 33 1 30 2 1 252 1 13 0.4397 0.0074 0.0632 2.485 2.82 12.27 -9.44 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5970 0.4029 0.0001 1 0 0.5945 0.4054 0.0001 1 0 0.5909 0.4090 0.0001
chr16 11927441 G GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA 0.000747 0.050 1 42 2 1274 269 1005 53 0 153 2 61 0 0 991 1 13 0.1970 0.0000 0.0139 0.752 1.57 4.31 -2.75 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2087 0.7897 0.0016 1 1 0.2183 0.7802 0.0016 1 1 0.2312 0.7673 0.0015
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.050 1 -42 2 1288 345 943 255 4 78 0 8 1 0 941 0 1 0.7391 0.0011 0.0021 3.372 1.67 3.38 -1.70 135 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0034 0.9966 0.0000 0 0 0.9455 0.0545 0.0000 0 0 0.9952 0.0048 0.0000
chr16 11927872 ATTCTGACCTGTAGGGCCAAAGGAGGGAATGTTTTCACACATAT A 0.011371 0.050 1 -43 2 1103 192 911 133 0 1 0 58 0 0 904 0 7 0.6927 0.0000 0.0077 191.000 0.19 27.86 -27.67 111 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9572 0.0428 0.0000 1 0 0.9524 0.0475 0.0000 1 0 0.9453 0.0547 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.050 1 -2 1 142 48 94 2 0 0 0 46 0 0 94 0 0 0.0417 0.0000 0.0000 48.000 0.00 2.07 -2.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0277 0.9723 2 2 0.0000 0.0042 0.9958 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr16 18543716 GA G 0.002566 0.050 1 -1 1 228 104 124 98 0 0 0 6 0 0 124 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 104.000 0.39 1.17 -0.78 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2070 0.7930 0.0000 0 0 0.9876 0.0124 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr16 21141362 GCTT G 0.000250 0.050 1 -3 1 222 92 130 47 1 3 0 41 0 0 130 0 0 0.5109 0.0000 0.0000 29.667 0.36 3.12 -2.76 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5587 0.4412 0.0001 1 0 0.5575 0.4425 0.0001 1 0 0.5557 0.4442 0.0001
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.050 1 -1 1 297 181 116 82 0 2 0 97 1 0 114 0 1 0.4530 0.0086 0.0172 89.500 0.80 1.10 -0.30 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2357 0.6720 0.0923 1 1 0.2442 0.6655 0.0903 1 1 0.2556 0.6568 0.0877
chr16 28593494 G GT 0.000605 0.050 1 1 3 522 159 363 87 0 1 1 70 0 0 363 0 0 0.5472 0.0000 0.0000 158.000 0.30 1.24 -0.94 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6450 0.3549 0.0001 1 0 0.6414 0.3585 0.0001 1 0 0.6364 0.3636 0.0001
chr16 30698196 A AGTG 0.000373 0.050 1 3 1 721 183 538 77 1 6 1 98 0 0 538 0 0 0.4208 0.0000 0.0000 29.500 0.53 3.13 -2.60 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2228 0.7766 0.0007 1 1 0.2327 0.7667 0.0006 1 1 0.2459 0.7535 0.0006
chr16 51141744 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 2 997 260 737 114 11 47 2 86 0 0 737 0 0 0.4385 0.0000 0.0000 4.511 0.69 2.88 -2.19 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6966 0.2859 0.0175 1 0 0.6845 0.2958 0.0198 1 0 0.6677 0.3091 0.0233
chr16 57813722 ATG A 0.500000 0.050 1 -2 1 361 145 216 71 68 1 0 5 0 0 216 0 0 0.4897 0.0000 0.0000 76.000 0.10 7.80 -7.70 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0070 0.9930 0.0000 0 1 0.4487 0.5513 0.0000 0 0 0.7650 0.2350 0.0000
chr16 57813725 CAGGTGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 361 153 208 147 1 1 0 4 0 0 208 0 0 0.9608 0.0000 0.0000 152.000 0.54 9.50 -8.96 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0569 0.9431 0.0000 0 0 0.7264 0.2736 0.0000 0 0 0.8869 0.1131 0.0000
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.050 1 -1 1 428 82 346 25 9 13 4 31 0 0 345 0 1 0.3049 0.0000 0.0029 5.500 1.16 2.39 -1.23 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2008 0.5166 0.2826 1 1 0.2029 0.5154 0.2818 1 1 0.2056 0.5138 0.2806
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 976 278 698 13 0 43 12 210 0 0 694 0 4 0.0468 0.0000 0.0057 5.442 0.00 3.51 -3.51 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9575 0.0425 2 2 0.0000 0.3591 0.6409
chr16 69715020 ACACT A 0.500000 0.050 1 -4 2 127 72 55 70 0 0 0 2 0 0 55 0 0 0.9722 0.0000 0.0000 72.000 0.30 5.00 -4.70 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1819 0.8181 0.0000 0 0 0.5964 0.4036 0.0000 0 0 0.7180 0.2820 0.0000
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 107 59 48 28 0 1 0 30 0 0 48 0 0 0.4746 0.0000 0.0000 58.000 0.07 4.33 -4.26 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2179 0.5165 0.2656 1 1 0.2194 0.5152 0.2654 1 1 0.2213 0.5137 0.2650
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.050 1 -3 2 652 134 518 60 0 19 1 54 0 0 516 0 2 0.4478 0.0000 0.0039 6.053 0.67 3.81 -3.15 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2672 0.5330 0.1997 1 1 0.2674 0.5306 0.2021 1 1 0.2674 0.5274 0.2051
chr16 72797458 C CTTG 0.500000 0.050 1 3 1 725 172 553 70 2 25 1 74 0 0 552 0 1 0.4070 0.0000 0.0018 5.880 0.67 3.22 -2.54 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1860 0.5404 0.2736 1 1 0.1889 0.5374 0.2737 1 1 0.1927 0.5336 0.2738
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.050 1 -2 2 273 116 157 108 1 4 0 3 0 0 157 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 28.000 0.72 4.33 -3.61 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1039 0.8961 0.0000 0 0 0.6644 0.3356 0.0000 0 0 0.8170 0.1830 0.0000
chr16 84236959 G GCCAGCTCCT 0.500000 0.050 1 9 2 624 151 473 71 0 31 0 49 0 0 466 0 7 0.4702 0.0000 0.0148 3.871 0.42 8.18 -7.76 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4274 0.4756 0.0970 1 1 0.4216 0.4771 0.1013 1 1 0.4138 0.4790 0.1072
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.050 1 6 1 481 82 399 2 0 20 0 60 0 0 382 1 16 0.0244 0.0000 0.0426 3.100 0.00 8.33 -8.33 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7891 0.2109 2 2 0.0000 0.3626 0.6374 2 2 0.0000 0.2492 0.7508
chr16 87604287 C CCTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 15 1 481 82 399 2 27 20 1 32 0 1 382 0 16 0.0244 0.0000 0.0426 3.100 0.00 9.97 -9.97 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0754 0.4266 0.4981 1 2 0.0796 0.4313 0.4892 1 2 0.0854 0.4374 0.4772
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.050 1 -2 1 639 114 525 0 0 2 7 105 0 0 512 0 13 0.0000 0.0000 0.0248 55.500 8.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0415 0.9585 2 2 0.0000 0.0440 0.9560 2 2 0.0000 0.0478 0.9522
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 634 109 525 0 0 3 6 100 0 0 511 3 11 0.0000 0.0000 0.0267 35.000 8.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0467 0.9533 2 2 0.0000 0.0495 0.9505 2 2 0.0000 0.0536 0.9464
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 635 110 525 0 0 1 4 105 0 1 510 1 13 0.0000 0.0000 0.0286 108.000 8.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1405 0.8595 2 2 0.0000 0.0806 0.9194 2 2 0.0000 0.0688 0.9312
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.050 1 -6 1 823 185 638 72 2 6 3 102 0 0 638 0 0 0.3892 0.0000 0.0000 29.833 5.75 7.87 -2.12 28 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0293 0.3384 0.6323 1 2 0.0323 0.3468 0.6209 1 2 0.0368 0.3579 0.6052
chr16 88714227 G GGTGT 0.500000 0.050 1 4 1 815 183 632 73 3 8 2 97 0 0 631 0 1 0.3989 0.0000 0.0016 21.625 8.63 5.87 2.76 31 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0494 0.4060 0.5446 1 2 0.0532 0.4113 0.5354 1 2 0.0587 0.4183 0.5229
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.050 1 -3 1 883 257 626 103 1 45 3 105 0 0 623 1 2 0.4008 0.0000 0.0048 4.689 0.75 3.33 -2.59 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1510 0.5512 0.2978 1 1 0.1549 0.5474 0.2977 1 1 0.1602 0.5425 0.2973
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.050 1 4 2 160 71 89 40 0 2 0 29 0 0 88 0 1 0.5634 0.0000 0.0112 34.500 0.38 4.17 -3.80 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3703 0.4920 0.1377 1 1 0.3660 0.4925 0.1415 1 1 0.3604 0.4932 0.1464
chr17 3433106 CCTTGCAGATA C 0.003246 0.050 1 -10 2 1053 218 835 135 0 8 0 75 0 0 829 0 6 0.6193 0.0000 0.0072 26.250 0.21 9.13 -8.92 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9170 0.0830 0.0000 1 0 0.9105 0.0895 0.0000 1 0 0.9011 0.0989 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.050 1 -1 2 408 166 242 80 2 6 1 77 0 0 242 0 0 0.4819 0.0000 0.0000 26.667 0.31 1.18 -0.87 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1785 0.5620 0.2595 1 1 0.1785 0.5580 0.2635 1 1 0.1784 0.5530 0.2686
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.050 1 -3 1 836 161 675 69 0 6 0 86 0 1 672 0 2 0.4286 0.0000 0.0044 25.833 0.33 3.74 -3.41 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2485 0.7411 0.0104 1 1 0.2578 0.7321 0.0101 1 1 0.2702 0.7201 0.0097
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.050 1 3 1 759 199 560 10 1 45 5 138 0 1 547 0 12 0.0503 0.0000 0.0232 3.422 0.20 4.20 -4.00 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9657 0.0343 2 1 0.0000 0.5070 0.4930
chr17 7024700 C CCAGCAG 0.006500 0.050 1 6 1 759 199 560 12 1 119 2 65 0 1 549 1 9 0.0603 0.0000 0.0196 0.696 0.67 5.25 -4.58 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr17 7846859 T TACC 0.057281 0.050 1 3 2 1373 405 968 0 2 114 46 243 0 0 938 7 23 0.0000 0.0000 0.0310 2.535 6.70 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0288 0.9712 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0129 0.9871
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.050 1 9 2 1373 405 968 4 19 112 22 248 0 1 938 0 29 0.0099 0.0000 0.0310 2.616 6.25 6.71 -0.46 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9772 0.0228
chr17 12980176 G GCCAGCC 0.500000 0.050 1 6 1 309 129 180 62 0 18 0 49 0 0 175 0 5 0.4806 0.0000 0.0278 6.167 0.37 4.47 -4.10 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3328 0.5164 0.1509 1 1 0.3305 0.5151 0.1545 1 1 0.3273 0.5135 0.1592
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 1 626 172 454 111 0 6 0 55 0 0 454 0 0 0.6453 0.0000 0.0000 27.667 0.13 3.22 -3.09 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8638 0.1328 0.0034 1 0 0.8523 0.1435 0.0042 1 0 0.8357 0.1589 0.0054
chr17 16058489 TAAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 258 102 156 100 0 0 0 2 0 0 156 0 0 0.9804 0.0000 0.0000 102.000 0.33 3.00 -2.67 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3212 0.6788 0.0000 0 0 0.7559 0.2441 0.0000 0 0 0.8394 0.1606 0.0000
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 485 205 280 0 0 36 6 163 1 0 276 1 2 0.0000 0.0036 0.0143 4.667 3.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0619 0.9381 2 2 0.0000 0.0273 0.9727 2 2 0.0000 0.0230 0.9770
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 958 231 727 0 2 37 9 183 0 1 725 1 0 0.0000 0.0000 0.0028 5.081 4.39 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0565 0.9435 2 2 0.0000 0.0303 0.9697 2 2 0.0000 0.0227 0.9773
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 956 237 719 0 31 16 24 166 0 1 717 1 0 0.0000 0.0000 0.0028 24.000 4.02 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9891 0.0109 2 1 0.0000 0.8798 0.1202 2 1 0.0000 0.6196 0.3804
chr17 18673034 G GCGCCGCCGC 0.500000 0.050 1 9 3 640 188 452 72 0 41 2 73 6 1 437 0 8 0.3830 0.0133 0.0332 3.585 1.99 8.59 -6.60 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1743 0.5422 0.2836 1 1 0.1775 0.5390 0.2835 1 1 0.1818 0.5350 0.2832
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.050 1 3 1 804 170 634 81 0 9 1 79 0 0 632 0 2 0.4765 0.0000 0.0032 17.889 0.20 3.78 -3.59 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2144 0.5493 0.2363 1 1 0.2166 0.5456 0.2378 1 1 0.2194 0.5410 0.2397
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.050 1 18 3 269 99 170 1 0 22 1 75 0 0 158 0 12 0.0101 0.0000 0.0706 3.500 1.00 8.64 -7.64 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3585 0.6415 2 2 0.0000 0.1821 0.8179 2 2 0.0000 0.1496 0.8504
chr17 21551124 CACGAAGTACAGG C 0.500000 0.050 1 -12 2 425 148 277 143 0 4 0 1 0 0 277 0 0 0.9662 0.0000 0.0000 36.000 0.19 12.00 -11.81 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8772 0.1228 0.0000 0 0 0.9458 0.0542 0.0000 0 0 0.9550 0.0450 0.0000
chr17 21551320 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 420 120 300 114 0 3 0 3 0 0 300 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 39.000 0.22 1.33 -1.11 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1233 0.8767 0.0000 0 0 0.6937 0.3063 0.0000 0 0 0.8349 0.1651 0.0000
chr17 29969182 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 4 530 126 404 68 1 9 0 48 0 0 403 0 1 0.5397 0.0000 0.0025 13.000 0.22 3.15 -2.93 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4992 0.4310 0.0698 1 0 0.4907 0.4353 0.0740 1 0 0.4793 0.4409 0.0798
chr17 35930229 CTG C 0.500000 0.050 1 -2 3 311 109 202 104 0 3 0 2 0 0 202 0 0 0.9541 0.0000 0.0000 35.333 0.19 2.00 -1.81 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3436 0.6564 0.0000 0 0 0.7737 0.2263 0.0000 0 0 0.8519 0.1481 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 525 127 398 113 1 5 0 8 0 0 398 0 0 0.8898 0.0000 0.0000 24.200 0.58 2.75 -2.17 93 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0738 0.9262 0.0000 0 1 0.4392 0.5608 0.0000
chr17 41105856 CTCCAGCTGCTGCCGCCCCTCTTGCTGTGAA C 0.500000 0.050 1 -30 1 579 190 389 114 0 27 0 49 0 0 377 0 12 0.6000 0.0000 0.0308 6.037 0.57 21.80 -21.23 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8435 0.1520 0.0045 1 0 0.8315 0.1631 0.0054 1 0 0.8143 0.1788 0.0069
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.050 1 15 1 530 124 406 0 0 15 2 107 0 0 386 2 18 0.0000 0.0000 0.0493 7.200 8.80 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0376 0.9624 2 2 0.0000 0.0401 0.9599 2 2 0.0000 0.0436 0.9564
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.050 1 -15 1 690 186 504 0 0 31 0 155 0 0 481 0 23 0.0000 0.0000 0.0456 5.000 12.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0112 0.9888 2 2 0.0000 0.0123 0.9877 2 2 0.0000 0.0138 0.9862
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.050 1 3 5 1676 362 1314 354 0 3 0 5 0 0 1314 0 0 0.9779 0.0000 0.0000 119.667 0.40 3.60 -3.20 108 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6782 0.3218 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr17 45242067 T TCCG 0.500000 0.050 1 3 2 653 170 483 4 134 29 0 3 0 1 481 1 0 0.0235 0.0000 0.0041 4.862 0.00 6.00 -6.00 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1878 0.8122 0.0000 0 0 0.7964 0.2036 0.0000 0 0 0.8970 0.1030 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 655 172 483 7 0 28 2 135 0 0 479 1 3 0.0407 0.0000 0.0083 5.143 2.57 3.69 -1.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.7588 0.2412 2 2 0.0000 0.3111 0.6889
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 253 97 156 0 0 6 1 90 0 0 155 0 1 0.0000 0.0000 0.0064 15.167 4.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0899 0.9101 2 2 0.0000 0.0937 0.9063 2 2 0.0000 0.0993 0.9007
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.050 1 3 5 968 257 711 0 0 9 2 246 0 0 703 0 8 0.0000 0.0000 0.0113 27.556 2.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr17 57979225 A ATGT 0.500000 0.050 1 3 1 432 191 241 109 15 59 2 6 0 0 241 0 0 0.5707 0.0000 0.0000 9.923 0.65 2.17 -1.52 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0203 0.9797 0.0000 0 1 0.1678 0.8322 0.0000
chr17 57979243 T TTGC 0.500000 0.050 1 3 1 434 195 239 61 5 67 6 56 0 0 238 1 0 0.3128 0.0000 0.0042 1.836 0.39 3.59 -3.20 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2779 0.5338 0.1882 1 1 0.2778 0.5313 0.1909 1 1 0.2774 0.5281 0.1945
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.050 1 6 2 402 140 262 55 0 23 0 62 0 0 262 0 0 0.3929 0.0000 0.0000 5.087 0.44 5.42 -4.98 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1598 0.5210 0.3192 1 1 0.1632 0.5194 0.3174 1 1 0.1677 0.5174 0.3149
chr17 69149049 TGA T 0.500000 0.050 1 -2 2 190 60 130 27 0 2 0 31 0 0 129 0 1 0.4500 0.0000 0.0077 29.000 0.04 2.74 -2.70 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1855 0.5105 0.3041 1 1 0.1880 0.5097 0.3024 1 1 0.1913 0.5087 0.3001
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.050 1 8 2 304 93 211 85 0 5 0 3 2 0 208 0 1 0.9140 0.0095 0.0142 17.600 0.33 8.00 -7.67 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0129 0.9871 0.0000 0 1 0.3715 0.6285 0.0000 0 0 0.6454 0.3546 0.0000
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.050 1 -4 3 218 77 141 38 0 1 0 38 0 0 141 0 0 0.4935 0.0000 0.0000 76.000 0.74 4.39 -3.66 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2384 0.5232 0.2384 1 1 0.2393 0.5214 0.2393 1 1 0.2404 0.5192 0.2404
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.050 1 -1 1 128 63 65 26 0 5 0 32 0 0 65 0 0 0.4127 0.0000 0.0000 11.600 0.04 1.72 -1.68 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1755 0.5069 0.3176 1 1 0.1783 0.5063 0.3154 1 1 0.1820 0.5057 0.3123
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.050 1 9 2 629 136 493 7 0 5 0 124 0 0 484 0 9 0.0515 0.0000 0.0183 26.200 0.00 7.90 -7.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8014 0.1986 2 2 0.0000 0.3573 0.6427
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.050 1 -54 1 346 111 235 82 1 1 0 27 0 0 235 0 0 0.7387 0.0000 0.0000 110.000 0.91 3.41 -2.49 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8715 0.1251 0.0034 1 0 0.8599 0.1360 0.0042 1 0 0.8167 0.1780 0.0053
chr17 75239519 G GGGT 0.500000 0.050 1 3 4 753 201 552 104 1 9 1 86 0 0 550 0 2 0.5174 0.0000 0.0036 21.333 0.38 3.06 -2.67 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4259 0.4873 0.0868 1 1 0.4209 0.4878 0.0912 1 1 0.4141 0.4886 0.0973
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 1092 258 834 235 0 8 0 15 1 1 832 0 0 0.9109 0.0012 0.0024 31.250 0.73 2.67 -1.94 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 0 0.5286 0.4714 0.0000
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 1288 346 942 301 1 35 0 9 3 1 935 0 3 0.8699 0.0032 0.0074 8.857 0.90 18.56 -17.66 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3831 0.6169 0.0000 0 0 0.9462 0.0538 0.0000
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.050 1 -27 1 1336 310 1026 291 0 7 2 10 2 2 1020 0 2 0.9387 0.0019 0.0058 43.143 1.28 19.20 -17.92 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2379 0.7621 0.0000 0 0 0.9089 0.0911 0.0000
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.050 1 -2 2 546 182 364 103 0 3 0 76 0 0 361 0 3 0.5659 0.0000 0.0082 59.667 0.28 2.26 -1.98 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5389 0.4109 0.0502 1 0 0.5299 0.4160 0.0541 1 0 0.5178 0.4226 0.0596
chr17 75616380 C CAGG 0.500000 0.050 1 3 1 1081 240 841 151 12 73 0 4 0 2 837 1 1 0.6292 0.0000 0.0048 2.288 0.84 7.50 -6.66 101 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0159 0.9841 0.0000 0 0 0.6496 0.3504 0.0000 0 0 0.8808 0.1192 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.050 1 -30 1 2274 504 1770 9 9 70 23 393 0 2 1750 3 15 0.0179 0.0000 0.0113 6.313 1.22 6.77 -5.55 7 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.4468 0.5532 2 2 0.0000 0.0148 0.9852
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 2226 590 1636 9 0 35 5 541 0 0 1467 19 150 0.0153 0.0000 0.1033 16.324 0.22 4.43 -4.21 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0326 0.9674 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 78891339 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 889 228 661 217 1 2 0 8 0 0 661 0 0 0.9518 0.0000 0.0000 113.000 0.34 1.00 -0.66 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.5126 0.4874 0.0000 0 0 0.9053 0.0947 0.0000
chr18 47446 CCTGATATTG C 0.001071 0.050 1 -9 1 915 170 745 90 0 11 0 69 0 0 741 0 4 0.5294 0.0000 0.0054 14.455 1.44 9.42 -7.98 88 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6547 0.3452 0.0001 1 0 0.6508 0.3491 0.0001 1 0 0.6454 0.3545 0.0001
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.050 1 6 4 431 123 308 58 1 12 2 50 0 0 308 0 0 0.4715 0.0000 0.0000 9.250 6.31 5.86 0.45 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4916 0.4663 0.0420 1 0 0.4904 0.4666 0.0431 1 0 0.4885 0.4670 0.0444
chr18 11689670 CGGCCCT C 0.001376 0.050 1 -6 4 432 128 304 57 1 8 0 62 0 0 304 0 0 0.4453 0.0000 0.0000 15.000 5.23 6.02 -0.79 29 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4140 0.5851 0.0008 1 1 0.4186 0.5806 0.0008 1 1 0.4244 0.5748 0.0008
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.050 1 3 1 192 89 103 0 0 3 0 86 0 0 100 0 3 0.0000 0.0000 0.0291 28.667 3.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.050 1 -9 2 345 72 273 31 0 8 0 33 0 0 270 0 3 0.4306 0.0000 0.0110 8.000 1.13 8.85 -7.72 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3089 0.5494 0.1417 1 1 0.3124 0.5470 0.1406 1 1 0.3170 0.5439 0.1391
chr18 24160067 CTG C 0.002292 0.050 1 -2 4 457 91 366 88 0 1 0 2 0 0 366 0 0 0.9670 0.0000 0.0000 90.000 0.23 2.00 -1.77 46 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9935 0.0065 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr18 45730325 AGGACAGCCCCACTATGGTTAGAGT A 0.000176 0.050 1 -24 2 496 152 344 78 0 21 0 53 0 0 333 0 11 0.5132 0.0000 0.0320 6.238 0.12 21.15 -21.04 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6268 0.3732 0.0000 1 0 0.6236 0.3764 0.0000 1 0 0.6192 0.3807 0.0000
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 1 99 41 58 19 0 1 0 21 0 0 58 0 0 0.4634 0.0000 0.0000 40.000 0.21 3.43 -3.22 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2204 0.5110 0.2686 1 1 0.2217 0.5102 0.2681 1 1 0.2234 0.5091 0.2675
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 235 125 110 0 0 8 1 116 0 0 110 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 14.625 3.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0500 0.9500 2 2 0.0000 0.0529 0.9471 2 2 0.0000 0.0571 0.9429
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.050 1 -15 2 845 213 632 115 1 5 0 92 0 0 627 0 5 0.5399 0.0000 0.0079 41.600 0.25 12.90 -12.65 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4615 0.4680 0.0705 1 1 0.4555 0.4697 0.0748 1 1 0.4473 0.4719 0.0808
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 6 334 60 274 44 1 11 0 4 1 1 272 0 0 0.7333 0.0036 0.0073 4.455 2.68 4.25 -1.57 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 1 0.1819 0.8181 0.0000 0 1 0.4102 0.5898 0.0000
chr18 62979014 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 3 629 134 495 71 0 4 0 59 0 0 493 0 2 0.5299 0.0000 0.0040 32.500 0.39 3.36 -2.96 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3565 0.5109 0.1326 1 1 0.3534 0.5100 0.1366 1 1 0.3492 0.5089 0.1419
chr18 63655777 T TGCCA 0.500000 0.050 1 4 2 373 118 255 109 0 2 0 7 0 0 255 0 0 0.9237 0.0000 0.0000 58.000 0.14 6.43 -6.29 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1206 0.8794 0.0000 0 0 0.5029 0.4971 0.0000
chr18 63655779 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 373 114 259 107 0 0 0 7 0 0 259 0 0 0.9386 0.0000 0.0000 114.000 0.14 6.43 -6.29 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1161 0.8839 0.0000 0 1 0.4914 0.5086 0.0000
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 163 77 86 2 0 3 0 72 0 0 86 0 0 0.0260 0.0000 0.0000 24.667 0.00 3.12 -3.12 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8104 0.1896 2 2 0.0000 0.3918 0.6082 2 2 0.0000 0.2724 0.7276
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.050 1 3 1 141 76 65 45 0 3 0 28 0 0 65 0 0 0.5921 0.0000 0.0000 24.333 0.20 4.04 -3.84 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4695 0.4430 0.0874 1 0 0.4615 0.4468 0.0917 1 1 0.4509 0.4516 0.0975
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.050 1 3 1 240 105 135 1 37 15 3 49 0 0 135 0 0 0.0095 0.0000 0.0000 4.909 1.00 2.88 -1.88 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2366 0.7477 0.0157 1 1 0.2454 0.7396 0.0150 1 1 0.2572 0.7287 0.0141
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.050 1 4 1 621 133 488 75 0 1 0 57 0 0 487 0 1 0.5639 0.0000 0.0020 132.000 2.28 4.67 -2.39 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5606 0.3978 0.0415 1 0 0.5546 0.4016 0.0438 1 0 0.5464 0.4065 0.0470
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.050 1 -27 1 364 91 273 38 1 4 1 47 0 0 271 0 2 0.4176 0.0000 0.0073 21.500 2.29 17.79 -15.50 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2362 0.5734 0.1905 1 1 0.2420 0.5708 0.1873 1 1 0.2496 0.5673 0.1831
chr19 1395488 G GCGC 0.003752 0.050 1 3 1 1036 223 813 158 2 58 0 5 1 0 812 0 0 0.7085 0.0012 0.0012 2.828 0.53 2.60 -2.07 74 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8145 0.1855 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.050 1 -3 1 182 55 127 0 0 3 0 52 0 0 127 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 17.333 4.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4713 0.5287 2 2 0.0000 0.4778 0.5222 2 2 0.0000 0.4868 0.5132
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.050 1 3 2 397 83 314 2 0 20 8 53 0 0 309 1 4 0.0241 0.0000 0.0159 3.150 2.50 5.85 -3.35 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9923 0.0077 2 1 0.0000 0.9534 0.0466 2 1 0.0000 0.9225 0.0775
chr19 1827021 T TGGAGGAGGTGGA 0.000087 0.050 1 12 2 397 83 314 40 1 6 1 35 0 0 309 1 4 0.4819 0.0000 0.0159 15.400 2.70 7.20 -4.50 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4796 0.5204 0.0000 1 1 0.4813 0.5187 0.0000 1 1 0.4834 0.5165 0.0000
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.050 1 -3 4 317 112 205 1 0 14 8 89 0 0 201 0 4 0.0089 0.0000 0.0195 7.000 1.00 3.69 -2.69 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3121 0.6879 2 2 0.0000 0.1541 0.8459 2 2 0.0000 0.1269 0.8731
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.050 1 -6 4 317 117 200 2 2 101 4 8 0 0 200 0 0 0.0171 0.0000 0.0000 0.137 1.00 6.75 -5.75 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3249 0.5611 0.1139 1 1 0.3239 0.5651 0.1110 1 1 0.3164 0.5762 0.1075
chr19 7488963 G GC 0.000555 0.050 1 1 2 95 55 40 52 0 1 0 2 0 0 40 0 0 0.9455 0.0000 0.0000 54.000 0.31 4.00 -3.69 0 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9962 0.0038 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.050 1 -3 1 435 127 308 0 0 3 0 124 0 0 306 0 2 0.0000 0.0000 0.0065 41.333 3.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2378 0.7622 2 2 0.0000 0.2494 0.7506 2 2 0.0000 0.2661 0.7339
chr19 8490988 TCTC T 0.003548 0.050 1 -3 2 594 152 442 141 0 9 0 2 0 0 442 0 0 0.9276 0.0000 0.0000 15.889 1.38 3.50 -2.12 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9973 0.0027 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 8959333 C CAGT 0.000478 0.050 1 3 1 550 116 434 67 0 8 0 41 0 0 432 0 2 0.5776 0.0000 0.0046 13.500 0.48 3.54 -3.06 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7411 0.2589 0.0000 1 0 0.7342 0.2658 0.0000 1 0 0.7248 0.2751 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.050 1 5 3 292 79 213 38 0 7 0 34 0 0 211 0 2 0.4810 0.0000 0.0094 10.286 0.37 5.32 -4.96 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3517 0.5126 0.1356 1 1 0.3519 0.5114 0.1367 1 1 0.3521 0.5098 0.1382
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.050 1 -3 1 873 284 589 225 3 33 2 21 0 0 586 3 0 0.7923 0.0000 0.0051 7.606 0.37 3.10 -2.73 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0304 0.9696 0.0000
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.050 1 -6 1 408 131 277 0 0 20 0 111 0 0 271 0 6 0.0000 0.0000 0.0217 5.550 6.47 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1059 0.8941 2 2 0.0000 0.1116 0.8884 2 2 0.0000 0.1199 0.8801
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.050 1 3 1 592 124 468 0 0 8 0 116 0 0 466 0 2 0.0000 0.0000 0.0043 14.500 3.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.050 1 -4 1 375 86 289 4 2 12 21 47 0 0 289 0 0 0.0465 0.0000 0.0000 11.833 0.25 5.30 -5.05 4 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9699 0.0301 2 1 0.0000 0.8932 0.1068
chr19 17286690 GTT G 0.132491 0.050 1 -2 1 374 84 290 4 17 7 15 41 0 0 290 0 0 0.0476 0.0000 0.0000 14.200 0.25 4.49 -4.24 4 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0826 0.5569 0.3605 1 1 0.0900 0.5649 0.3451 1 1 0.1003 0.5752 0.3245
chr19 18280864 CGCGCCCCCG C 0.000645 0.050 1 -9 6 407 122 285 114 1 3 0 4 0 0 285 0 0 0.9344 0.0000 0.0000 39.333 1.18 10.25 -9.07 24 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9760 0.0240 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 18869186 T TCCGCGC 0.000008 0.050 1 6 4 604 165 439 77 0 21 1 66 1 0 432 0 6 0.4667 0.0023 0.0159 6.857 1.03 5.27 -4.25 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5210 0.4790 0.0000 1 0 0.5219 0.4781 0.0000 1 0 0.5229 0.4771 0.0000
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.050 1 1 1 638 129 509 78 2 1 1 47 0 1 481 6 21 0.6047 0.0000 0.0550 126.000 1.54 2.96 -1.42 26 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1272 0.5486 0.3243 1 1 0.1281 0.5450 0.3269 1 1 0.1293 0.5404 0.3303
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.050 1 -3 2 547 150 397 83 0 5 0 62 0 0 396 0 1 0.5533 0.0000 0.0025 29.000 0.08 3.00 -2.92 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6665 0.3247 0.0088 1 0 0.6607 0.3299 0.0094 1 0 0.6528 0.3369 0.0103
chr19 22757390 A AG 0.088391 0.050 1 1 2 1237 288 949 155 2 14 3 114 1 1 765 4 178 0.5382 0.0011 0.1939 22.833 0.81 2.25 -1.45 3 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0189 0.9811 1 2 0.0000 0.0236 0.9764 1 2 0.0000 0.0315 0.9685
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.050 1 -3 1 300 88 212 35 1 16 2 34 0 0 212 0 0 0.3977 0.0000 0.0000 4.438 0.11 2.94 -2.83 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0786 0.5202 0.4011 1 1 0.0789 0.5186 0.4024 1 1 0.0793 0.5167 0.4040
chr19 33379692 GACCTC G 0.005617 0.050 1 -5 1 518 120 398 4 0 6 3 107 0 0 397 0 1 0.0333 0.0000 0.0025 18.833 1.00 4.87 -3.87 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9940 0.0060 2 1 0.0000 0.9821 0.0179
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.050 1 3 1 596 132 464 0 0 4 0 128 0 0 458 0 6 0.0000 0.0000 0.0129 32.000 3.40 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0118 0.9882 2 2 0.0000 0.0126 0.9874 2 2 0.0000 0.0138 0.9862
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.050 1 -3 1 680 248 432 102 4 25 3 114 0 0 430 0 2 0.4113 0.0000 0.0046 11.579 4.06 3.21 0.85 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2296 0.6701 0.1003 1 1 0.2383 0.6631 0.0986 1 1 0.2498 0.6539 0.0963
chr19 38304914 AAGG A 0.000867 0.050 1 -3 1 381 99 282 98 0 0 0 1 1 0 281 0 0 0.9899 0.0035 0.0035 99.000 0.60 6.00 -5.40 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 38304940 CAAG C 0.034026 0.050 1 -3 3 386 101 285 96 1 3 0 1 0 0 284 0 1 0.9505 0.0000 0.0035 32.667 0.52 6.00 -5.48 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9257 0.0743 0.0000 0 0 0.9879 0.0121 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.050 1 3 1 130 59 71 26 1 10 1 21 0 0 71 0 0 0.4407 0.0000 0.0000 4.900 0.27 3.19 -2.92 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5338 0.4562 0.0100 1 0 0.5325 0.4574 0.0102 1 0 0.5307 0.4589 0.0104
chr19 38565185 G GCACGGCGGC 0.000654 0.050 1 9 3 481 139 342 57 0 18 1 63 0 0 336 0 6 0.4101 0.0000 0.0175 6.667 1.60 8.41 -6.82 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3123 0.6869 0.0007 1 1 0.3201 0.6791 0.0007 1 1 0.3304 0.6689 0.0007
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.050 1 -1 2 401 126 275 7 0 5 2 112 0 0 271 1 3 0.0556 0.0000 0.0145 23.800 0.14 3.10 -2.96 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9298 0.0702 2 1 0.0000 0.6450 0.3550
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.050 1 -2 1 231 29 202 0 0 4 22 3 0 0 202 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.750 3.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1300 0.8700 2 2 0.0000 0.1315 0.8685 2 2 0.0000 0.1335 0.8665
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.050 1 2 2 231 28 203 0 0 21 6 1 0 0 203 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.308 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1584 0.8416 2 2 0.0000 0.1595 0.8405 2 2 0.0000 0.1610 0.8390
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.050 1 -6 1 455 149 306 0 0 7 1 141 0 0 306 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 20.286 5.92 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0226 0.9774 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0266 0.9734
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.050 1 1 2 519 178 341 78 0 3 0 97 0 0 340 0 1 0.4382 0.0000 0.0029 58.333 0.22 1.77 -1.56 44 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1432 0.5970 0.2598 1 1 0.1508 0.5956 0.2536 1 1 0.1613 0.5935 0.2453
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.050 1 -1 1 519 109 410 57 0 1 0 51 1 1 407 0 1 0.5229 0.0024 0.0073 108.000 0.49 3.02 -2.53 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5283 0.4551 0.0166 1 0 0.5273 0.4556 0.0171 1 0 0.5259 0.4565 0.0176
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.050 1 -1 2 478 128 350 3 0 4 3 118 0 0 346 3 1 0.0234 0.0000 0.0114 41.333 0.00 2.14 -2.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9706 0.0294 2 1 0.0000 0.6629 0.3371 2 2 0.0000 0.4689 0.5311
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.050 1 6 2 862 316 546 136 0 61 0 119 0 0 522 0 24 0.4304 0.0000 0.0440 4.180 0.32 6.34 -6.02 52 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1501 0.5734 0.2765 1 1 0.1546 0.5680 0.2773 1 1 0.1606 0.5613 0.2781
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.050 1 18 1 339 108 231 82 0 21 0 5 0 0 229 0 2 0.7593 0.0000 0.0087 4.143 0.43 14.40 -13.97 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3746 0.6254 0.0000 0 0 0.8182 0.1818 0.0000
chr19 46016106 TCGTCCCGGGAGCGCTCCG T 0.003109 0.050 1 -18 1 359 91 268 46 0 4 0 41 0 0 264 0 4 0.5055 0.0000 0.0149 21.750 0.39 16.12 -15.73 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4831 0.5155 0.0014 1 1 0.4847 0.5139 0.0014 1 1 0.4867 0.5119 0.0014
chr19 46493759 C CCGGCCT 0.138319 0.050 1 6 4 373 82 291 42 1 12 1 26 0 0 290 0 1 0.5122 0.0000 0.0034 5.750 2.12 10.00 -7.88 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6126 0.3655 0.0219 1 0 0.6068 0.3703 0.0230 1 0 0.5989 0.3766 0.0245
chr19 47802317 AGATTGGGCCTGG A 0.001318 0.050 1 -12 1 1460 390 1070 301 18 58 3 10 5 0 1063 0 2 0.7718 0.0047 0.0065 5.603 2.49 9.00 -6.51 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.050 1 -3 1 1083 249 834 94 4 42 11 98 0 0 826 2 6 0.3775 0.0000 0.0096 4.881 0.51 3.56 -3.05 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0960 0.5165 0.3875 1 1 0.1016 0.5170 0.3814 1 1 0.1094 0.5176 0.3730
chr19 49154632 T TTCCTCCTCC 0.001742 0.050 1 9 1 1109 276 833 109 4 54 0 109 1 0 832 0 0 0.3949 0.0012 0.0012 4.111 0.69 6.59 -5.90 39 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4927 0.5068 0.0005 1 1 0.4955 0.5040 0.0005 1 1 0.4988 0.5006 0.0006
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.050 1 -6 2 563 131 432 0 0 31 1 99 0 0 424 0 8 0.0000 0.0000 0.0185 3.226 7.13 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1037 0.8963 2 2 0.0000 0.1088 0.8912 2 2 0.0000 0.1163 0.8837
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.050 1 -18 2 613 226 387 5 0 50 1 170 0 0 387 0 0 0.0221 0.0000 0.0000 3.520 0.00 12.84 -12.84 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 1 0.0000 0.7967 0.2033 2 1 0.0000 0.5007 0.4993
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.050 1 3 2 677 158 519 6 1 8 140 3 0 0 517 1 1 0.0380 0.0000 0.0039 29.600 0.00 2.67 -2.67 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.7371 0.2629 2 2 0.0000 0.2833 0.7167
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.050 1 3 3 676 160 516 0 0 9 5 146 0 0 515 0 1 0.0000 0.0000 0.0019 16.778 3.22 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0405 0.9595 2 2 0.0000 0.0436 0.9564 2 2 0.0000 0.0482 0.9518
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.050 1 1 1 592 156 436 75 0 5 3 73 0 0 432 1 3 0.4808 0.0000 0.0092 30.200 0.88 2.74 -1.86 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1169 0.5221 0.3609 1 1 0.1192 0.5197 0.3611 1 1 0.1221 0.5168 0.3611
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.050 1 -2 1 235 108 127 58 1 0 0 49 0 0 126 0 1 0.5370 0.0000 0.0079 107.000 0.05 2.08 -2.03 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2098 0.5600 0.2302 1 1 0.2074 0.5573 0.2353 1 1 0.2042 0.5538 0.2420
chr19 52906242 CACT C 0.001583 0.050 1 -3 1 559 144 415 71 1 1 0 71 0 0 415 0 0 0.4931 0.0000 0.0000 143.000 0.52 3.41 -2.89 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4575 0.5418 0.0007 1 1 0.4607 0.5386 0.0007 1 1 0.4647 0.5346 0.0007
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.050 1 3 2 973 243 730 114 0 2 0 127 1 0 727 0 2 0.4691 0.0014 0.0041 120.500 0.13 3.09 -2.96 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1220 0.5497 0.3283 1 1 0.1275 0.5471 0.3254 1 1 0.1350 0.5438 0.3212
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.050 1 -1 5 830 247 583 105 0 25 2 115 0 0 583 0 0 0.4251 0.0000 0.0000 9.250 0.30 1.96 -1.65 49 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0607 0.4717 0.4676 1 1 0.0635 0.4714 0.4651 1 1 0.0673 0.4712 0.4614
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.050 1 3 1 798 153 645 1 0 9 0 143 0 0 638 0 7 0.0065 0.0000 0.0109 16.000 0.00 3.35 -3.35 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1222 0.8778 2 2 0.0000 0.0541 0.9459 2 2 0.0000 0.0451 0.9549
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.050 1 4 2 830 177 653 90 0 18 1 68 0 0 648 0 5 0.5085 0.0000 0.0077 8.778 0.21 3.87 -3.66 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6364 0.3595 0.0041 1 0 0.6326 0.3631 0.0043 1 0 0.6274 0.3680 0.0046
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.050 1 9 2 454 116 338 0 0 25 0 91 0 0 318 0 20 0.0000 0.0000 0.0592 3.640 7.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0580 0.9420 2 2 0.0000 0.0611 0.9389 2 2 0.0000 0.0656 0.9344
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.050 1 -24 1 671 185 486 90 0 25 0 70 0 0 476 0 10 0.4865 0.0000 0.0206 6.400 0.27 17.33 -17.06 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1101 0.6224 0.2675 1 1 0.1088 0.6168 0.2744 1 1 0.1069 0.6095 0.2836
chr19 55518174 C CATCCCACCATGACTGCTG 0.004924 0.050 1 18 1 842 163 679 14 3 5 9 132 2 5 628 9 35 0.0859 0.0029 0.0751 51.000 3.00 12.29 -9.29 10 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.050 1 3 4 749 239 510 10 0 39 5 185 0 0 494 3 13 0.0418 0.0000 0.0314 5.103 1.10 4.82 -3.72 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9221 0.0779 2 2 0.0000 0.4137 0.5863
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.050 1 3 1 575 111 464 0 0 3 0 108 0 1 455 0 8 0.0000 0.0000 0.0194 36.000 3.78 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0568 0.9432 2 2 0.0000 0.0572 0.9428 2 2 0.0000 0.0591 0.9409
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.050 1 3 1 116 57 59 22 0 3 0 32 0 0 57 0 2 0.3860 0.0000 0.0339 18.000 0.14 3.25 -3.11 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1874 0.5302 0.2824 1 1 0.1926 0.5300 0.2773 1 1 0.1997 0.5297 0.2707
chr19 57874165 CATA C 0.001160 0.050 1 -3 2 950 247 703 116 2 10 3 116 6 8 687 0 2 0.4696 0.0085 0.0228 23.600 0.78 3.67 -2.89 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5764 0.4234 0.0002 1 0 0.5763 0.4235 0.0002 1 0 0.5758 0.4240 0.0002
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.050 1 -48 1 109 45 64 2 0 8 0 35 0 0 43 0 21 0.0444 0.0000 0.3281 4.625 1.00 7.03 -6.03 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9644 0.0356 2 1 0.0000 0.8017 0.1983 2 1 0.0000 0.6991 0.3009
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.050 1 -2 1 329 129 200 119 0 7 0 3 0 0 200 0 0 0.9225 0.0000 0.0000 17.429 0.62 2.33 -1.71 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1058 0.8942 0.0000 0 0 0.6674 0.3326 0.0000 0 0 0.8179 0.1821 0.0000
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.050 1 -6 2 102 56 46 31 0 1 0 24 0 0 46 0 0 0.5536 0.0000 0.0000 55.000 0.52 6.54 -6.03 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2705 0.5205 0.2089 1 1 0.2679 0.5197 0.2124 1 1 0.2643 0.5185 0.2171
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.050 1 3 1 457 114 343 105 2 4 1 2 1 1 341 0 0 0.9211 0.0029 0.0058 26.750 0.70 3.00 -2.30 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8753 0.1247 0.0000 0 0 0.9787 0.0213 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.050 1 2 1 474 152 322 91 0 2 0 59 0 0 318 0 4 0.5987 0.0000 0.0124 150.000 0.30 8.64 -8.35 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6520 0.3222 0.0258 1 0 0.6421 0.3298 0.0282 1 0 0.6284 0.3399 0.0317
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.050 1 -2 1 474 153 321 86 0 9 2 56 0 0 317 0 4 0.5621 0.0000 0.0125 16.000 0.29 8.71 -8.42 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6101 0.3559 0.0340 1 0 0.6011 0.3622 0.0368 1 0 0.5888 0.3705 0.0407
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.050 1 -3 4 470 140 330 81 0 1 0 58 1 0 329 0 0 0.5786 0.0030 0.0030 139.000 0.32 8.36 -8.04 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6178 0.3498 0.0324 1 0 0.6088 0.3562 0.0350 1 0 0.5966 0.3647 0.0387
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.050 1 -6 2 683 178 505 96 0 2 0 80 0 0 504 0 1 0.5393 0.0000 0.0020 88.000 0.36 6.84 -6.47 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4426 0.4754 0.0820 1 1 0.4379 0.4762 0.0859 1 1 0.4315 0.4773 0.0912
chr20 33663701 TGCGGCGGCAAGAGGC T 0.003375 0.050 1 -15 1 633 182 451 167 1 12 0 2 1 0 450 0 0 0.9176 0.0022 0.0022 14.167 0.36 15.00 -14.64 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.050 1 3 1 500 160 340 5 0 0 3 152 0 0 334 0 6 0.0312 0.0000 0.0176 160.000 0.00 3.03 -3.03 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9694 0.0306 2 2 0.0000 0.2174 0.7826 2 2 0.0000 0.0660 0.9340
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.050 1 -3 2 885 256 629 111 1 34 4 106 0 0 623 0 6 0.4336 0.0000 0.0095 6.500 0.47 3.20 -2.73 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1363 0.5548 0.3089 1 1 0.1391 0.5503 0.3106 1 1 0.1427 0.5447 0.3126
chr20 47651119 GCAA G 0.005778 0.050 1 -3 1 528 241 287 110 11 10 8 102 0 0 287 0 0 0.4564 0.0000 0.0000 23.889 0.15 3.31 -3.16 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5475 0.4513 0.0012 1 0 0.5480 0.4507 0.0013 1 0 0.5485 0.4502 0.0014
chr20 58854641 C CTGACGCCCCAGCCGATCCCGACTCCGGGGCGGCCCG 0.009401 0.050 1 36 4 682 156 526 67 4 16 7 62 0 0 526 0 0 0.4295 0.0000 0.0000 8.562 0.39 2.95 -2.56 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4857 0.5107 0.0036 1 1 0.4877 0.5087 0.0036 1 1 0.4900 0.5063 0.0037
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.050 1 -6 2 207 30 177 0 0 2 0 28 0 0 169 1 7 0.0000 0.0000 0.0452 14.000 6.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.050 1 -1 1 333 163 170 7 0 0 0 156 0 0 170 0 0 0.0429 0.0000 0.0000 163.000 0.14 1.78 -1.63 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 2 0.0000 0.4769 0.5231 2 2 0.0000 0.1134 0.8866
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.050 1 6 4 809 206 603 0 0 3 0 203 0 0 588 0 15 0.0000 0.0000 0.0249 67.667 5.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 2 0.0000 0.0044 0.9956 2 2 0.0000 0.0051 0.9949
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.050 1 1 2 295 46 249 0 0 5 0 41 0 0 249 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.200 3.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 44539457 CGGA C 0.002702 0.050 1 -3 1 880 231 649 127 1 15 0 88 0 0 647 0 2 0.5498 0.0000 0.0031 14.400 1.27 4.72 -3.45 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8332 0.1668 0.0001 1 0 0.8258 0.1741 0.0001 1 0 0.8155 0.1844 0.0001
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.050 1 2 2 1100 167 933 95 1 3 0 68 1 0 927 0 5 0.5689 0.0011 0.0064 54.667 1.78 3.28 -1.50 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4455 0.4776 0.0769 1 1 0.4360 0.4816 0.0825 1 1 0.4231 0.4866 0.0903
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.050 1 -2 2 1102 167 935 92 1 5 4 65 0 0 930 0 5 0.5509 0.0000 0.0053 32.000 1.58 3.42 -1.84 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3835 0.5126 0.1039 1 1 0.3763 0.5139 0.1098 1 1 0.3665 0.5156 0.1179
chr21 44558380 GGGCACACAGCAGACTGGCTTGCAGCAGACA G 0.000053 0.050 1 -30 1 1072 207 865 195 2 5 0 5 1 0 864 0 0 0.9420 0.0012 0.0012 40.200 0.28 18.40 -18.12 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr21 44579846 AGG A 0.004815 0.050 1 -2 2 732 242 490 148 0 7 1 86 1 0 485 2 2 0.6116 0.0020 0.0102 33.571 1.65 7.79 -6.14 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9294 0.0705 0.0000 1 0 0.9234 0.0766 0.0000 1 0 0.9146 0.0854 0.0000
chr21 44579850 A ACG 0.004831 0.050 1 2 1 735 234 501 144 1 2 4 83 1 0 495 1 4 0.6154 0.0020 0.0120 115.000 1.67 7.89 -6.22 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9150 0.0850 0.0000 1 0 0.9085 0.0915 0.0000 1 0 0.8991 0.1008 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.050 1 -15 2 677 138 539 66 2 22 2 46 0 0 537 0 2 0.4783 0.0000 0.0037 6.053 4.67 11.15 -6.49 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4675 0.4513 0.0812 1 0 0.4592 0.4550 0.0858 1 1 0.4480 0.4597 0.0923
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.050 1 -9 7 339 147 192 0 0 17 1 129 0 0 192 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.647 7.74 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.050 1 3 1 563 230 333 92 6 23 0 109 0 0 332 0 1 0.4000 0.0000 0.0030 9.000 0.51 3.19 -2.68 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1676 0.5747 0.2577 1 1 0.1737 0.5712 0.2551 1 1 0.1819 0.5665 0.2516
chr21 46302071 ATGG A 0.001115 0.050 1 -3 1 564 233 331 205 4 18 0 6 0 0 331 0 0 0.8798 0.0000 0.0000 11.944 1.82 3.00 -1.18 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9059 0.0941 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.050 1 6 1 3699 1139 2560 511 2 44 2 580 0 0 2526 0 34 0.4486 0.0000 0.0133 24.886 0.70 5.92 -5.22 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0010 0.6374 0.3617 1 1 0.0014 0.6581 0.3406 1 1 0.0021 0.6855 0.3124
chr22 20564628 CCAG C 0.002397 0.050 1 -3 1 380 154 226 66 1 25 5 57 0 0 226 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 5.160 0.29 3.04 -2.75 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5213 0.4779 0.0008 1 0 0.5219 0.4773 0.0008 1 0 0.5225 0.4767 0.0008
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.050 1 -3 3 216 114 102 67 1 4 2 40 0 0 101 0 1 0.5877 0.0000 0.0098 27.500 0.18 3.40 -3.22 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6828 0.2990 0.0182 1 0 0.6739 0.3063 0.0198 1 0 0.6618 0.3162 0.0220
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.050 1 -21 3 603 146 457 72 0 26 0 48 0 1 439 0 17 0.4932 0.0000 0.0394 4.615 0.76 15.42 -14.65 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0930 0.6050 0.3020 1 1 0.0920 0.6000 0.3080 1 1 0.0906 0.5935 0.3159
chr22 27798924 T TTGC 0.004414 0.050 1 3 1 1116 299 817 122 8 38 4 127 0 1 815 0 1 0.4080 0.0000 0.0024 6.842 0.87 3.06 -2.19 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4114 0.5866 0.0019 1 1 0.4176 0.5805 0.0020 1 1 0.4253 0.5727 0.0020
chr22 30428672 T TA 0.000840 0.050 1 1 2 296 107 189 58 0 0 0 49 0 0 189 0 0 0.5421 0.0000 0.0000 107.000 0.16 1.33 -1.17 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5776 0.4222 0.0002 1 0 0.5758 0.4240 0.0002 1 0 0.5733 0.4264 0.0002
chr22 36265995 AATAATT A 0.003695 0.050 1 -6 1 546 153 393 85 0 2 0 66 0 0 392 0 1 0.5556 0.0000 0.0025 75.500 0.64 6.05 -5.41 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6680 0.3316 0.0004 1 0 0.6635 0.3361 0.0004 1 0 0.6573 0.3422 0.0005
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.050 1 -6 2 484 220 264 177 0 41 0 2 0 0 264 0 0 0.8045 0.0000 0.0000 4.366 0.54 6.00 -5.46 49 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9133 0.0867 0.0000 0 0 0.9851 0.0149 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.050 1 -42 4 364 184 180 177 0 5 0 2 0 0 180 0 0 0.9620 0.0000 0.0000 35.800 0.45 42.00 -41.55 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8781 0.1219 0.0000 0 0 0.9784 0.0216 0.0000 0 0 0.9864 0.0136 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.050 1 9 4 424 201 223 102 1 19 0 79 0 0 217 0 6 0.5075 0.0000 0.0269 9.579 0.23 7.37 -7.14 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5338 0.4194 0.0468 1 0 0.5283 0.4221 0.0496 1 0 0.5207 0.4258 0.0535
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.050 1 -3 3 214 107 107 55 0 4 0 48 0 0 106 0 1 0.5140 0.0000 0.0093 25.750 0.65 4.42 -3.76 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3932 0.4980 0.1087 1 1 0.3919 0.4972 0.1109 1 1 0.3900 0.4963 0.1137
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.050 1 3 3 332 151 181 2 0 7 0 142 0 0 177 0 4 0.0132 0.0000 0.0221 20.571 0.00 3.02 -3.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2153 0.7847 2 2 0.0000 0.0411 0.9589 2 2 0.0000 0.0256 0.9744
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.050 1 -3 1 502 164 338 65 0 25 4 70 0 0 335 0 3 0.3963 0.0000 0.0089 5.560 0.22 3.21 -3.00 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2031 0.5801 0.2168 1 1 0.2094 0.5770 0.2136 1 1 0.2178 0.5730 0.2092
chr22 42128927 T TGGGGCGAAAGGGGCGAAA 0.000188 0.050 1 18 2 1269 311 958 171 0 49 0 91 0 0 919 1 38 0.5498 0.0000 0.0407 5.347 0.38 11.51 -11.13 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8405 0.1595 0.0000 1 0 0.8336 0.1664 0.0000 1 0 0.8239 0.1761 0.0000
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.050 1 1 3 1139 293 846 159 0 1 0 133 4 0 835 0 7 0.5427 0.0047 0.0130 292.000 7.53 10.80 -3.27 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5866 0.3879 0.0256 1 0 0.5816 0.3907 0.0277 1 0 0.5745 0.3948 0.0307
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.050 1 -1 1 831 370 461 273 1 3 0 93 0 0 461 0 0 0.7378 0.0000 0.0000 122.333 0.19 2.86 -2.67 77 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.050 1 -6 1 685 145 540 123 2 15 0 5 0 0 540 0 0 0.8483 0.0000 0.0000 8.667 2.00 7.00 -5.00 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1088 0.8912 0.0000 0 0 0.9345 0.0655 0.0000 0 0 0.9829 0.0171 0.0000
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.050 1 -18 2 346 116 230 52 0 20 0 44 0 0 224 1 5 0.4483 0.0000 0.0261 4.800 0.67 14.27 -13.60 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4467 0.5101 0.0432 1 1 0.4477 0.5086 0.0437 1 1 0.4490 0.5067 0.0443
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.050 1 -48 1 1219 395 824 337 2 53 0 3 0 2 818 0 4 0.8532 0.0000 0.0073 6.453 0.84 33.67 -32.83 125 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1814 0.8186 0.0000 0 0 0.9938 0.0062 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
763 rows