File Info

Filename
HG02622_x_HG02630_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG02622_x_HG02630_FF_10.features.tsv
Size
174.9 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1232289 T TGCGGCGGGCGTGGCG 0.000919 0.100 1 15 1 487 142 345 74 1 21 1 45 0 0 331 0 14 0.5211 0.0000 0.0406 5.762 1.07 14.44 -13.38 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6955 0.3044 0.0000 1 0 0.6939 0.3060 0.0000 1 0 0.6912 0.3088 0.0000
chr1 1426150 C CGGA 0.000187 0.100 1 3 1 265 75 190 36 0 6 1 32 0 0 189 0 1 0.4800 0.0000 0.0053 11.500 1.61 4.53 -2.92 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4655 0.5345 0.0001 1 1 0.4700 0.5300 0.0001 1 1 0.4755 0.5244 0.0001
chr1 1708855 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 659 303 356 270 0 26 0 7 0 0 356 0 0 0.8911 0.0000 0.0000 10.654 0.69 8.00 -7.31 112 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1434 0.8566 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr1 2529505 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 434 124 310 64 4 13 0 43 0 0 308 0 2 0.5161 0.0000 0.0065 8.538 0.66 4.07 -3.41 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7316 0.2607 0.0077 1 0 0.7216 0.2693 0.0090 1 0 0.7075 0.2813 0.0112
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 722 230 492 0 98 34 3 95 0 3 488 0 1 0.0000 0.0000 0.0081 5.706 4.08 0 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0979 0.7045 0.1976 1 1 0.1044 0.6906 0.2050 1 1 0.1132 0.6726 0.2142
chr1 6469126 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 725 228 497 6 2 130 4 86 0 2 495 0 0 0.0263 0.0000 0.0040 19.000 0.17 4.15 -3.98 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8585 0.1415 2 2 0.0000 0.2253 0.7747
chr1 6469129 TCC T 0.500000 0.100 1 -2 2 727 233 494 107 5 22 16 83 0 0 494 0 0 0.4592 0.0000 0.0000 66.333 1.06 4.04 -2.98 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3275 0.6328 0.0397 1 1 0.3339 0.6222 0.0439 1 1 0.3411 0.6089 0.0500
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 494 110 384 1 0 21 4 84 0 0 376 0 8 0.0091 0.0000 0.0208 4.190 0.00 3.23 -3.23 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0652 0.9348 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0178 0.9822
chr1 12847504 CT C 0.500000 0.100 1 -1 5 808 120 688 113 2 1 0 4 0 0 688 0 0 0.9417 0.0000 0.0000 119.000 1.00 1.00 0.00 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0469 0.9531 0.0000 0 0 0.8157 0.1843 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000
chr1 13260413 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 571 129 442 83 1 4 1 40 0 0 442 0 0 0.6434 0.0000 0.0000 31.250 0.60 1.23 -0.62 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9504 0.0495 0.0002 1 0 0.9444 0.0553 0.0003 1 0 0.9354 0.0642 0.0004
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 962 192 770 106 0 10 1 75 0 0 768 0 2 0.5521 0.0000 0.0026 18.200 0.31 3.20 -2.89 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7629 0.2342 0.0030 1 0 0.7553 0.2411 0.0036 1 0 0.7442 0.2511 0.0047
chr1 15935987 CGTCCCT C 0.500000 0.100 1 -6 5 725 140 585 126 0 10 0 4 0 0 585 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 14.444 0.23 5.50 -5.27 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0813 0.9187 0.0000 0 0 0.8879 0.1121 0.0000 0 0 0.9729 0.0271 0.0000
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.100 1 3 2 305 117 188 105 0 5 0 7 0 0 188 0 0 0.8974 0.0000 0.0000 22.400 0.27 2.71 -2.45 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0992 0.9008 0.0000 0 0 0.6464 0.3536 0.0000
chr1 21474942 TGTCTCCCAG T 0.500000 0.100 1 -9 1 149 65 84 60 0 2 0 3 0 0 84 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 31.500 0.50 6.33 -5.83 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0263 0.9737 0.0000 0 1 0.4508 0.5492 0.0000 0 0 0.7283 0.2717 0.0000
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 774 195 579 63 32 7 33 60 0 0 577 0 2 0.3231 0.0000 0.0035 25.286 6.63 27.40 -20.77 25 1/1 0/1 . . OK 1 1 0.1198 0.7046 0.1757 1 1 0.1265 0.6907 0.1828 1 1 0.1354 0.6727 0.1918
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 806 190 616 14 0 25 1 150 0 0 611 0 5 0.0737 0.0000 0.0081 6.833 0.86 16.17 -15.32 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8144 0.1856
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.100 1 -24 1 658 152 506 81 0 3 0 68 0 0 487 0 19 0.5329 0.0000 0.0375 49.667 0.72 18.46 -17.74 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0797 0.6585 0.2618 1 1 0.0853 0.6471 0.2676 1 1 0.0929 0.6326 0.2745
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 404 180 224 102 2 14 0 62 0 0 223 0 1 0.5667 0.0000 0.0045 11.857 0.19 3.10 -2.91 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9274 0.0724 0.0003 1 0 0.9206 0.0790 0.0004 1 0 0.9105 0.0889 0.0006
chr1 35114681 GATA G 0.500000 0.100 1 -3 1 827 195 632 173 0 13 0 9 0 0 632 0 0 0.8872 0.0000 0.0000 14.000 0.34 3.89 -3.55 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2806 0.7194 0.0000 0 0 0.9320 0.0680 0.0000
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 356 92 264 82 0 6 0 4 0 0 264 0 0 0.8913 0.0000 0.0000 14.333 0.40 3.25 -2.85 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0090 0.9910 0.0000 0 1 0.4598 0.5402 0.0000 0 0 0.8042 0.1958 0.0000
chr1 46668333 G GCCT 0.500000 0.100 1 3 5 427 182 245 149 6 17 1 9 0 0 243 0 2 0.8187 0.0000 0.0082 9.647 0.59 4.33 -3.74 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0144 0.9856 0.0000 0 0 0.5595 0.4405 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 609 144 465 0 0 18 2 124 0 0 465 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.000 6.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr1 50419101 CCGGCGG C 0.500000 0.100 1 -6 6 667 152 515 122 8 10 0 12 1 0 514 0 0 0.8026 0.0019 0.0019 14.200 2.16 7.58 -5.42 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.2071 0.7929 0.0000
chr1 62206717 T TAACAGA 0.500000 0.100 1 6 2 438 112 326 63 0 7 0 42 0 0 317 0 9 0.5625 0.0000 0.0276 15.000 0.17 6.10 -5.92 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4635 0.4936 0.0429 1 1 0.4608 0.4924 0.0468 1 1 0.4564 0.4913 0.0523
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 4 714 129 585 115 1 7 0 6 0 0 585 0 0 0.8915 0.0000 0.0000 17.429 1.05 3.00 -1.95 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.3568 0.6432 0.0000 0 0 0.8560 0.1440 0.0000
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 280 96 184 77 1 6 1 11 0 0 184 0 0 0.8021 0.0000 0.0000 14.667 0.78 3.45 -2.68 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0307 0.9693 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 137 73 64 36 0 2 0 35 0 0 63 0 1 0.4932 0.0000 0.0156 35.500 0.19 3.51 -3.32 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2063 0.5874 0.2063 1 1 0.2096 0.5809 0.2096 1 1 0.2137 0.5727 0.2137
chr1 78641091 CATGAGTAGATCT C 0.500000 0.100 1 -12 3 244 87 157 81 0 4 0 2 0 0 157 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 20.750 0.16 12.00 -11.84 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4215 0.5785 0.0000 0 0 0.8717 0.1283 0.0000 0 0 0.9338 0.0662 0.0000
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 379 162 217 82 0 25 0 55 0 0 213 0 4 0.5062 0.0000 0.0184 5.480 1.28 8.64 -7.36 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7047 0.2879 0.0074 1 0 0.6964 0.2949 0.0087 1 0 0.6845 0.3048 0.0108
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 440 153 287 90 0 7 0 56 0 0 286 0 1 0.5882 0.0000 0.0035 20.857 0.11 5.41 -5.30 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8639 0.1349 0.0012 1 0 0.8550 0.1434 0.0016 1 0 0.8420 0.1558 0.0022
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.100 1 -6 1 437 154 283 82 1 22 0 49 0 0 283 0 0 0.5325 0.0000 0.0000 6.000 0.12 6.02 -5.90 6 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8829 0.1160 0.0010 1 0 0.8741 0.1246 0.0013 1 0 0.8611 0.1370 0.0019
chr1 92182085 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 655 125 530 59 0 2 0 64 0 0 530 0 0 0.4720 0.0000 0.0000 61.500 0.51 3.39 -2.88 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1031 0.6190 0.2779 1 1 0.1085 0.6102 0.2813 1 1 0.1157 0.5991 0.2852
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 174 78 96 73 0 2 0 3 0 0 96 0 0 0.9359 0.0000 0.0000 38.000 0.07 3.00 -2.93 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0499 0.9501 0.0000 0 0 0.6111 0.3889 0.0000 0 0 0.8344 0.1656 0.0000
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 448 128 320 75 0 5 1 47 0 0 318 1 1 0.5859 0.0000 0.0063 24.600 0.39 3.17 -2.78 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7597 0.2349 0.0053 1 0 0.7499 0.2437 0.0064 1 0 0.7360 0.2560 0.0081
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 845 203 642 99 2 12 1 89 0 0 641 0 1 0.4877 0.0000 0.0016 15.833 1.10 16.00 -14.90 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3221 0.6307 0.0472 1 1 0.3278 0.6204 0.0518 1 1 0.3343 0.6075 0.0582
chr1 111414897 A ACAGGGGTCAGGGTCTTTTCCC 0.500000 0.100 1 21 1 828 175 653 86 0 18 1 70 0 0 644 3 6 0.4914 0.0000 0.0138 12.000 0.50 18.31 -17.81 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2302 0.6730 0.0968 1 1 0.2364 0.6608 0.1028 1 1 0.2439 0.6452 0.1109
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 608 175 433 81 4 21 2 67 1 0 431 0 1 0.4629 0.0023 0.0046 7.600 0.43 3.57 -3.14 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5130 0.4640 0.0230 1 0 0.5109 0.4633 0.0258 1 0 0.5071 0.4629 0.0300
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 208 73 135 5 26 4 0 38 0 0 135 0 0 0.0685 0.0000 0.0000 12.000 0.20 2.34 -2.14 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0406 0.4008 0.5586 1 2 0.0443 0.4061 0.5496 1 2 0.0495 0.4131 0.5374
chr1 121095875 T TCCAGTTA 0.500000 0.100 1 7 2 477 93 384 87 0 1 0 5 0 0 384 0 0 0.9355 0.0000 0.0000 92.000 0.39 5.60 -5.21 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2732 0.7268 0.0000 0 0 0.7335 0.2665 0.0000
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 202 79 123 67 0 5 0 7 0 0 123 0 0 0.8481 0.0000 0.0000 14.800 0.81 6.29 -5.48 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0162 0.9838 0.0000 0 1 0.2242 0.7758 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1198 287 911 176 3 41 4 63 0 0 910 0 1 0.6132 0.0000 0.0011 6.000 1.06 3.08 -2.02 12 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 265 113 152 4 0 13 4 92 0 0 152 0 0 0.0354 0.0000 0.0000 7.385 1.25 1.17 0.08 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9785 0.0215 2 2 0.0000 0.3709 0.6291 2 2 0.0000 0.1133 0.8867
chr1 152709204 C CAGCTCTGGAGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 244 79 165 4 1 4 1 69 0 0 137 0 28 0.0506 0.0000 0.1697 18.750 0.25 10.14 -9.89 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.5959 0.4041 2 2 0.0000 0.1736 0.8264
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 244 79 165 0 0 8 0 71 0 0 137 0 28 0.0000 0.0000 0.1697 8.875 9.86 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0081 0.9919
chr1 152761321 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 347 85 262 42 1 2 1 39 0 0 262 0 0 0.4941 0.0000 0.0000 41.500 0.79 1.15 -0.37 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2653 0.5894 0.1453 1 1 0.2674 0.5828 0.1498 1 1 0.2697 0.5744 0.1559
chr1 152985344 GGAGCCCTGCCACCCCAAGGTGCCT G 0.500000 0.100 1 -24 2 566 224 342 182 3 29 0 10 0 0 341 0 1 0.8125 0.0000 0.0029 6.690 1.13 15.70 -14.57 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0776 0.9224 0.0000 0 0 0.8714 0.1286 0.0000
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 800 257 543 99 2 32 10 114 0 0 531 0 12 0.3852 0.0000 0.0221 7.194 2.10 6.76 -4.66 67 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0010 0.1780 0.8211 1 2 0.0012 0.1843 0.8145 1 2 0.0017 0.1937 0.8046
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1267 312 955 9 1 65 3 234 2 1 896 3 53 0.0288 0.0021 0.0618 3.905 2.11 10.74 -8.63 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.2392 0.7608 2 2 0.0000 0.0025 0.9975
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 1404 398 1006 18 2 109 5 264 0 0 969 0 37 0.0452 0.0000 0.0368 2.667 1.44 7.27 -5.82 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9974 0.0026 2 2 0.0000 0.1159 0.8841
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 183 64 119 8 0 2 0 54 0 0 118 0 1 0.1250 0.0000 0.0084 31.000 2.62 2.41 0.22 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.9205 0.0795
chr1 156583439 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 315 92 223 52 0 6 0 34 0 0 223 0 0 0.5652 0.0000 0.0000 14.333 0.31 1.44 -1.13 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6511 0.3309 0.0181 1 0 0.6413 0.3383 0.0205 1 0 0.6276 0.3484 0.0240
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 594 167 427 0 0 3 1 163 0 0 426 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 54.333 2.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1214 231 983 93 0 6 0 132 0 0 980 0 3 0.4026 0.0000 0.0031 37.500 0.25 1.38 -1.13 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0869 0.9128 1 2 0.0003 0.0932 0.9065 1 2 0.0005 0.1025 0.8971
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.100 1 3 1 122 64 58 35 0 1 0 28 0 0 58 0 0 0.5469 0.0000 0.0000 63.000 0.23 3.96 -3.74 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3830 0.5213 0.0956 1 1 0.3803 0.5195 0.1002 1 1 0.3764 0.5172 0.1064
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 187 62 125 37 0 1 0 24 0 0 125 0 0 0.5968 0.0000 0.0000 61.000 0.41 1.08 -0.68 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5496 0.4087 0.0418 1 0 0.5411 0.4135 0.0454 1 0 0.5294 0.4199 0.0507
chr1 183533735 T TACA 0.500000 0.100 1 3 2 193 72 121 44 0 3 0 25 0 0 120 0 1 0.6111 0.0000 0.0083 23.000 0.20 3.16 -2.96 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6659 0.3153 0.0188 1 0 0.6550 0.3238 0.0212 1 0 0.6399 0.3352 0.0248
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 610 162 448 96 1 1 1 63 0 0 445 2 1 0.5926 0.0000 0.0067 160.000 0.82 4.78 -3.95 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8099 0.1879 0.0022 1 0 0.8012 0.1961 0.0027 1 0 0.7885 0.2079 0.0036
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 608 164 444 99 0 0 0 65 0 0 439 0 5 0.6037 0.0000 0.0113 164.000 0.80 4.66 -3.86 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7926 0.2049 0.0025 1 0 0.7841 0.2128 0.0031 1 0 0.7718 0.2241 0.0041
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 84 51 33 23 0 1 0 27 0 0 33 0 0 0.4510 0.0000 0.0000 50.000 1.00 2.15 -1.15 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1427 0.5420 0.3153 1 1 0.1467 0.5388 0.3144 1 1 0.1521 0.5348 0.3131
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 437 238 199 118 0 27 0 93 0 0 196 0 3 0.4958 0.0000 0.0151 7.815 0.42 11.22 -10.79 72 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6031 0.3892 0.0077 1 0 0.6011 0.3898 0.0091 1 0 0.5972 0.3916 0.0113
chr1 225519331 A ATCCAGGCGTTCCTGCCGC 0.500000 0.100 1 18 1 497 150 347 35 2 92 0 21 0 0 340 1 6 0.2333 0.0000 0.0202 0.630 0.46 8.24 -7.78 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4376 0.4898 0.0725 1 1 0.4331 0.4899 0.0770 1 1 0.4267 0.4902 0.0831
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 230 106 124 55 0 4 0 47 0 0 124 0 0 0.5189 0.0000 0.0000 25.500 0.05 1.43 -1.37 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3708 0.5533 0.0759 1 1 0.3704 0.5489 0.0807 1 1 0.3694 0.5434 0.0872
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 632 185 447 0 1 14 5 165 0 0 440 1 6 0.0000 0.0000 0.0157 12.214 3.47 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 514 154 360 147 0 1 0 6 0 0 359 0 1 0.9545 0.0000 0.0028 153.000 0.37 1.83 -1.47 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4664 0.5336 0.0000 0 0 0.9316 0.0684 0.0000
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 621 176 445 95 0 1 0 80 0 0 442 0 3 0.5398 0.0000 0.0067 175.000 0.19 3.00 -2.81 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3921 0.5715 0.0363 1 1 0.3953 0.5646 0.0402 1 1 0.3982 0.5561 0.0457
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 348 101 247 92 0 5 0 4 0 0 247 0 0 0.9109 0.0000 0.0000 19.200 0.89 1.00 -0.11 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0156 0.9844 0.0000 0 0 0.5855 0.4145 0.0000 0 0 0.8699 0.1301 0.0000
chr1 247934033 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 923 225 698 123 0 1 0 101 0 0 697 0 1 0.5467 0.0000 0.0014 224.000 0.17 1.16 -0.99 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5657 0.4255 0.0088 1 0 0.5656 0.4241 0.0103 1 0 0.5640 0.4233 0.0127
chr1 247934735 TTCTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 674 134 540 73 0 10 0 51 0 0 540 0 0 0.5448 0.0000 0.0000 12.400 0.27 3.98 -3.71 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7004 0.2907 0.0089 1 0 0.6914 0.2982 0.0104 1 0 0.6786 0.3086 0.0128
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1085 251 834 135 0 3 0 113 0 0 834 0 0 0.5378 0.0000 0.0000 82.667 0.99 1.14 -0.15 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5633 0.4295 0.0072 1 0 0.5645 0.4270 0.0085 1 0 0.5644 0.4250 0.0106
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 450 114 336 97 0 2 0 15 0 0 334 0 2 0.8509 0.0000 0.0060 56.000 1.15 4.67 -3.51 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 597 109 488 80 0 3 2 24 0 0 486 0 2 0.7339 0.0000 0.0041 35.333 2.27 3.33 -1.06 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9808 0.0192 0.0000 1 0 0.9774 0.0226 0.0000 1 0 0.9366 0.0633 0.0001
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.100 1 9 1 760 105 655 57 0 17 0 31 0 0 651 0 4 0.5429 0.0000 0.0061 5.176 0.44 8.29 -7.85 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7312 0.2595 0.0093 1 0 0.7204 0.2688 0.0109 1 0 0.7051 0.2816 0.0133
chr1 248522528 CAA C 0.500000 0.100 1 -2 3 557 149 408 97 0 0 0 52 0 0 408 0 0 0.6510 0.0000 0.0000 149.000 0.59 2.19 -1.60 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9541 0.0458 0.0001 1 0 0.9486 0.0512 0.0002 1 0 0.9403 0.0594 0.0003
chr1 248574594 T TGGATGAGGA 0.500000 0.100 1 9 1 470 86 384 24 0 14 0 48 0 0 377 0 7 0.2791 0.0000 0.0182 5.143 0.17 7.81 -7.65 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0019 0.1198 0.8783 1 2 0.0024 0.1295 0.8681 1 2 0.0032 0.1435 0.8533
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 313 102 211 31 0 9 0 62 0 0 211 0 0 0.3039 0.0000 0.0000 10.333 1.00 6.58 -5.58 25 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0019 0.1272 0.8709 1 2 0.0023 0.1368 0.8608 1 2 0.0031 0.1506 0.8462
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 1330 269 1061 249 1 6 0 13 0 0 1061 0 0 0.9257 0.0000 0.0000 43.833 0.96 3.69 -2.73 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2051 0.7949 0.0000 0 0 0.9779 0.0221 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 205 97 108 55 0 6 0 36 0 0 107 0 1 0.5670 0.0000 0.0093 15.167 0.13 4.03 -3.90 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6791 0.3072 0.0137 1 0 0.6704 0.3140 0.0155 1 0 0.6583 0.3234 0.0183
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 447 157 290 0 1 18 2 136 0 0 279 0 11 0.0000 0.0000 0.0379 8.176 8.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 447 157 290 7 9 118 4 19 0 0 280 2 8 0.0446 0.0000 0.0345 0.276 5.86 7.32 -1.46 5 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0047 0.6348 0.3605 2 1 0.0013 0.9223 0.0764 2 1 0.0003 0.9863 0.0135
chr2 24164308 GC G 0.029697 0.100 1 -1 1 174 92 82 84 0 5 0 3 0 0 82 0 0 0.9130 0.0000 0.0000 17.400 0.08 1.00 -0.92 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7549 0.2451 0.0000 0 0 0.9889 0.0111 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.100 1 9 1 563 136 427 69 1 21 0 45 0 0 421 0 6 0.5074 0.0000 0.0141 5.476 0.58 7.44 -6.86 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7724 0.2264 0.0012 1 0 0.7673 0.2313 0.0013 1 0 0.7601 0.2383 0.0016
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 198 48 150 0 0 1 0 47 0 0 148 0 2 0.0000 0.0000 0.0133 47.000 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0760 0.9240 2 2 0.0000 0.0796 0.9204 2 2 0.0000 0.0849 0.9151
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 528 123 405 53 1 14 0 55 0 0 404 0 1 0.4309 0.0000 0.0025 7.786 0.64 2.96 -2.32 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1499 0.6271 0.2230 1 1 0.1550 0.6179 0.2271 1 1 0.1617 0.6061 0.2322
chr2 37951894 CAACAA C 0.500000 0.100 1 -5 1 749 135 614 73 0 2 1 59 0 0 613 0 1 0.5407 0.0000 0.0016 66.500 0.47 4.95 -4.48 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4417 0.5175 0.0407 1 1 0.4408 0.5146 0.0446 1 1 0.4387 0.5112 0.0501
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.100 1 6 1 242 109 133 59 0 8 1 41 0 0 132 0 1 0.5413 0.0000 0.0075 12.500 0.29 6.07 -5.79 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5881 0.3883 0.0237 1 0 0.5807 0.3929 0.0264 1 0 0.5702 0.3993 0.0306
chr2 50346870 GCGCCGCCGCCGCCGC G 0.500000 0.100 1 -15 1 265 93 172 50 0 10 0 33 0 0 168 0 4 0.5376 0.0000 0.0233 8.300 0.74 14.21 -13.47 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5206 0.4398 0.0396 1 0 0.5145 0.4423 0.0432 1 0 0.5058 0.4458 0.0484
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 460 181 279 78 2 21 2 78 0 0 279 0 0 0.4309 0.0000 0.0000 7.429 1.24 3.24 -2.00 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1582 0.6848 0.1570 1 1 0.1646 0.6720 0.1634 1 1 0.1729 0.6555 0.1716
chr2 73269451 AGCGGCGGCGGCGGCCGCG A 0.500000 0.100 1 -18 1 313 67 246 50 1 10 0 6 0 0 244 0 2 0.7463 0.0000 0.0081 5.600 1.74 20.17 -18.43 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.0650 0.9350 0.0000
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 691 164 527 0 0 29 0 135 0 0 517 0 10 0.0000 0.0000 0.0190 4.655 6.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 386 89 297 6 0 2 0 81 0 0 294 0 3 0.0674 0.0000 0.0101 43.500 0.17 2.75 -2.59 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8996 0.1004 2 2 0.0000 0.4439 0.5561
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 982 233 749 119 1 37 2 74 0 0 712 0 37 0.5107 0.0000 0.0494 5.270 0.33 12.42 -12.09 51 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2323 0.7120 0.0557 1 1 0.2413 0.6975 0.0612 1 1 0.2524 0.6788 0.0688
chr2 74958681 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 1 291 83 208 51 0 3 0 29 0 0 207 0 1 0.6145 0.0000 0.0048 26.667 1.27 3.79 -2.52 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7211 0.2677 0.0112 1 0 0.7099 0.2771 0.0130 1 0 0.6942 0.2901 0.0157
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.100 1 -9 1 353 114 239 58 0 11 0 45 0 0 236 0 3 0.5088 0.0000 0.0126 9.364 0.50 8.76 -8.26 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4191 0.5232 0.0577 1 1 0.4174 0.5205 0.0621 1 1 0.4145 0.5174 0.0682
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 586 146 440 60 1 16 3 66 0 0 436 0 4 0.4110 0.0000 0.0091 8.062 0.18 3.30 -3.12 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0417 0.5204 0.4379 1 1 0.0456 0.5173 0.4371 1 1 0.0512 0.5137 0.4351
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 735 205 530 103 2 10 0 90 0 0 529 0 1 0.5024 0.0000 0.0019 19.300 0.31 7.60 -7.29 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4131 0.5591 0.0279 1 1 0.4165 0.5523 0.0312 1 1 0.4197 0.5442 0.0360
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 552 114 438 0 0 0 0 114 0 0 425 0 13 0.0000 0.0000 0.0297 114.000 5.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 303 100 203 3 0 12 0 85 0 0 200 0 3 0.0300 0.0000 0.0148 8.000 0.00 6.39 -6.39 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9019 0.0981 2 2 0.0000 0.2375 0.7625 2 2 0.0000 0.0901 0.9099
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 731 187 544 99 1 9 0 78 0 0 544 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 19.667 0.51 1.45 -0.94 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6342 0.3570 0.0088 1 0 0.6293 0.3603 0.0103 1 0 0.6219 0.3654 0.0127
chr2 131531788 ACAAGGGCAGGCCAGGTAAGGCTTGGGTGTTCCTGGGGTG A 0.500000 0.100 1 -39 1 365 140 225 110 1 26 0 3 0 0 225 0 0 0.7857 0.0000 0.0000 4.385 0.51 14.00 -13.49 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2669 0.7331 0.0000 0 0 0.9129 0.0871 0.0000 0 0 0.9695 0.0305 0.0000
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 175 49 126 20 9 13 3 4 0 0 125 1 0 0.4082 0.0000 0.0079 2.462 1.20 1.00 0.20 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2067 0.7898 0.0035 0 1 0.0866 0.9119 0.0016 0 1 0.0980 0.9014 0.0007
chr2 159987235 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 202 94 108 47 0 1 0 46 0 0 107 0 1 0.5000 0.0000 0.0093 93.000 0.13 2.24 -2.11 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1937 0.6132 0.1931 1 1 0.1978 0.6049 0.1973 1 1 0.2031 0.5944 0.2026
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 164 80 84 68 0 9 0 3 0 0 83 1 0 0.8500 0.0000 0.0119 7.889 1.57 6.00 -4.43 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0223 0.9777 0.0000 0 1 0.4365 0.5635 0.0000 0 0 0.7356 0.2644 0.0000
chr2 176130550 CCGCACGCGCCCCCGCAGG C 0.500000 0.100 1 -18 3 418 94 324 51 0 9 0 34 0 0 318 0 6 0.5426 0.0000 0.0185 9.444 0.27 14.00 -13.73 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4623 0.4855 0.0522 1 1 0.4583 0.4854 0.0563 1 1 0.4524 0.4855 0.0621
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 267 130 137 119 0 5 0 6 0 0 137 0 0 0.9154 0.0000 0.0000 25.000 0.17 4.33 -4.17 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3914 0.6086 0.0000 0 0 0.8727 0.1273 0.0000
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.100 1 -2 1 709 312 397 136 0 6 0 170 0 0 395 0 2 0.4359 0.0000 0.0050 61.200 0.52 4.24 -3.71 66 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0006 0.1959 0.8036 1 2 0.0008 0.1998 0.7994 1 2 0.0011 0.2063 0.7926
chr2 178650214 TTTTCCTCTTCAGGAGCAA T 0.500000 0.100 1 -18 1 287 87 200 69 0 14 0 4 0 0 200 0 0 0.7931 0.0000 0.0000 5.214 0.10 18.50 -18.40 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 1 0.3073 0.6927 0.0000 0 0 0.6859 0.3141 0.0000
chr2 184936239 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 683 159 524 149 0 1 0 9 0 0 524 0 0 0.9371 0.0000 0.0000 158.000 0.15 3.44 -3.29 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1052 0.8948 0.0000 0 0 0.8106 0.1894 0.0000
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 639 145 494 137 1 3 0 4 0 0 493 0 1 0.9448 0.0000 0.0020 47.000 0.28 3.50 -3.22 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0169 0.9831 0.0000 0 0 0.8273 0.1727 0.0000 0 0 0.9702 0.0298 0.0000
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 322 143 179 5 0 17 61 60 0 0 177 1 1 0.0350 0.0000 0.0112 4.125 0.20 3.02 -2.82 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9950 0.0050 2 2 0.0000 0.4133 0.5867 2 2 0.0000 0.0919 0.9081
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 322 142 180 5 0 11 55 71 0 0 180 0 0 0.0352 0.0000 0.0000 7.800 0.60 2.83 -2.23 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9947 0.0053 2 2 0.0000 0.3970 0.6030 2 2 0.0000 0.0863 0.9137
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 218 59 159 9 5 9 2 34 0 0 159 0 0 0.1525 0.0000 0.0000 5.000 0.11 1.32 -1.21 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0085 0.2106 0.7809 1 2 0.0095 0.2572 0.7334 1 2 0.0085 0.4686 0.5229
chr2 196666794 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 182 79 103 51 5 9 2 12 0 0 103 0 0 0.6456 0.0000 0.0000 7.556 0.59 1.17 -0.58 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0774 0.9226 0.0000 0 1 0.0067 0.9933 0.0000 0 1 0.0049 0.9951 0.0000
chr2 202194209 CAAG C 0.500000 0.100 1 -3 2 312 138 174 72 0 7 1 58 0 0 174 0 0 0.5217 0.0000 0.0000 18.714 0.11 3.40 -3.29 38 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4708 0.4934 0.0358 1 1 0.4688 0.4918 0.0393 1 1 0.4652 0.4903 0.0445
chr2 202635317 AAGCAGC A 0.500000 0.100 1 -6 1 450 190 260 84 0 13 1 92 0 2 250 0 8 0.4421 0.0000 0.0385 14.667 0.77 6.83 -6.05 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0205 0.4972 0.4823 1 1 0.0231 0.4938 0.4830 1 1 0.0272 0.4901 0.4827
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 1 486 116 370 75 4 34 0 3 5 2 363 0 0 0.6466 0.0135 0.0189 2.485 2.84 3.00 -0.16 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0878 0.9122 0.0000 0 0 0.7401 0.2599 0.0000 0 0 0.9000 0.1000 0.0000
chr2 205776515 TCGCA T 0.500000 0.100 1 -4 1 247 75 172 72 0 1 0 2 0 0 172 0 0 0.9600 0.0000 0.0000 74.000 0.24 5.00 -4.76 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3153 0.6847 0.0000 0 0 0.8125 0.1875 0.0000 0 0 0.9012 0.0988 0.0000
chr2 205776521 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 247 70 177 68 0 0 0 2 0 0 177 0 0 0.9714 0.0000 0.0000 70.000 0.25 5.00 -4.75 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2747 0.7253 0.0000 0 0 0.7804 0.2196 0.0000 0 0 0.8825 0.1175 0.0000
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 222 66 156 43 4 15 1 3 0 0 156 0 0 0.6515 0.0000 0.0000 3.067 0.33 1.33 -1.01 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0140 0.9860 0.0000 0 1 0.2800 0.7200 0.0000 0 0 0.5624 0.4376 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 265 93 172 43 0 1 0 49 0 0 172 0 0 0.4624 0.0000 0.0000 92.000 0.16 2.90 -2.74 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1002 0.5705 0.3293 1 1 0.1051 0.5651 0.3298 1 1 0.1117 0.5583 0.3300
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 549 150 399 0 0 25 0 125 0 0 391 1 7 0.0000 0.0000 0.0201 5.000 7.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr2 219182152 G GGAGGAA 0.500000 0.100 1 6 1 617 129 488 105 0 21 0 3 0 0 488 0 0 0.8140 0.0000 0.0000 5.143 0.96 6.33 -5.37 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2115 0.7885 0.0000 0 0 0.8860 0.1140 0.0000 0 0 0.9597 0.0403 0.0000
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 616 231 385 203 3 5 0 20 0 0 383 0 2 0.8788 0.0000 0.0052 44.800 0.34 19.85 -19.51 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0157 0.9843 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 336 134 202 8 0 4 1 121 0 0 201 0 1 0.0597 0.0000 0.0050 32.500 0.25 3.87 -3.62 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9147 0.0853 2 2 0.0000 0.3027 0.6973
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 165 59 106 36 0 1 0 22 0 0 106 0 0 0.6102 0.0000 0.0000 58.000 0.03 2.68 -2.65 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5794 0.3845 0.0361 1 0 0.5699 0.3905 0.0395 1 0 0.5569 0.3986 0.0445
chr2 240030012 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 1547 352 1195 330 3 13 0 6 0 0 1195 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 26.077 0.28 1.17 -0.88 38 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9768 0.0232 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 752 164 588 81 0 1 0 82 0 0 588 0 0 0.4939 0.0000 0.0000 163.000 0.75 1.34 -0.59 65 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1402 0.6888 0.1710 1 1 0.1467 0.6757 0.1775 1 1 0.1552 0.6590 0.1859
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 447 132 315 0 2 25 49 56 0 0 315 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.200 3.34 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0076 0.9924
chr2 240757423 ATCCTCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 447 132 315 2 1 76 1 52 0 0 315 0 0 0.0152 0.0000 0.0000 0.733 0.00 5.83 -5.83 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8955 0.1045 2 2 0.0000 0.4691 0.5309 2 2 0.0000 0.2838 0.7162
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 427 97 330 2 0 3 0 92 0 0 328 1 1 0.0206 0.0000 0.0061 31.333 0.50 2.17 -1.67 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4143 0.5857 2 2 0.0000 0.0714 0.9286 2 2 0.0000 0.0364 0.9636
chr2 241317535 A AT 0.500000 0.100 1 1 1 225 56 169 26 22 2 1 5 1 1 164 2 1 0.4643 0.0059 0.0296 16.000 1.88 1.60 0.28 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 1 0.0926 0.9074 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 676 200 476 0 0 2 1 197 0 0 474 0 2 0.0000 0.0000 0.0042 98.500 3.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 570 129 441 108 0 16 0 5 2 2 437 0 0 0.8372 0.0045 0.0091 7.062 0.32 12.60 -12.28 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0191 0.9809 0.0000 0 0 0.8505 0.1495 0.0000 0 0 0.9757 0.0243 0.0000
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 494 138 356 6 0 1 0 131 0 0 356 0 0 0.0435 0.0000 0.0000 137.000 0.17 3.33 -3.16 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 2 0.0000 0.4614 0.5386 2 2 0.0000 0.0754 0.9246
chr3 40462027 GTAC G 0.500000 0.100 1 -3 3 615 261 354 50 4 4 83 120 0 0 352 0 2 0.1916 0.0000 0.0056 88.500 2.22 3.29 -1.07 6 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0616 0.9384 2 1 0.0000 0.9994 0.0006
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 665 225 440 94 11 48 0 72 0 0 438 0 2 0.4178 0.0000 0.0045 3.688 0.27 2.88 -2.61 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8174 0.1808 0.0017 1 0 0.8091 0.1887 0.0022 1 0 0.7971 0.2000 0.0029
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 665 227 438 166 6 43 2 10 0 0 438 0 0 0.7313 0.0000 0.0000 4.279 1.28 2.80 -1.52 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0157 0.9843 0.0000 0 0 0.6587 0.3413 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 646 160 486 0 0 4 0 156 0 0 486 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 39.000 2.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 285 104 181 0 0 1 2 101 0 0 180 0 1 0.0000 0.0000 0.0055 103.000 5.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 606 168 438 1 1 17 16 133 0 0 433 0 5 0.0060 0.0000 0.0114 8.824 1.00 3.35 -2.35 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0108 0.9892 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 378 107 271 41 0 23 0 43 0 0 269 0 2 0.3832 0.0000 0.0074 3.652 0.20 6.12 -5.92 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1291 0.5854 0.2854 1 1 0.1339 0.5791 0.2870 1 1 0.1403 0.5710 0.2887
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 464 139 325 86 1 14 0 38 0 0 323 0 2 0.6187 0.0000 0.0062 8.929 0.15 6.05 -5.90 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9658 0.0342 0.0001 1 0 0.9610 0.0388 0.0001 1 0 0.9538 0.0460 0.0002
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 188 93 95 4 0 12 1 76 0 0 93 0 2 0.0430 0.0000 0.0211 6.750 0.75 7.78 -7.03 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9923 0.0077 2 1 0.0000 0.5777 0.4223 2 2 0.0000 0.2199 0.7801
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 268 106 162 0 0 2 1 103 0 0 159 0 3 0.0000 0.0000 0.0185 52.000 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 868 197 671 112 0 8 1 76 0 0 670 0 1 0.5685 0.0000 0.0015 23.500 1.46 1.37 0.10 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8532 0.1458 0.0010 1 0 0.8453 0.1535 0.0012 1 0 0.8336 0.1647 0.0017
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 437 122 315 55 0 7 0 60 0 0 315 0 0 0.4508 0.0000 0.0000 16.429 0.89 1.17 -0.28 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1047 0.6087 0.2866 1 1 0.1099 0.6006 0.2894 1 1 0.1170 0.5904 0.2926
chr3 108757146 G GGGGGATTA 0.500000 0.100 1 8 2 275 126 149 71 1 5 0 49 0 0 144 0 5 0.5635 0.0000 0.0336 24.200 0.21 6.94 -6.73 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6055 0.3774 0.0171 1 0 0.5989 0.3817 0.0194 1 0 0.5894 0.3878 0.0229
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 118 44 74 24 1 3 0 16 0 0 73 1 0 0.5455 0.0000 0.0135 13.333 0.08 1.19 -1.10 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4268 0.4825 0.0907 1 1 0.4215 0.4834 0.0951 1 1 0.4142 0.4847 0.1011
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 415 127 288 78 0 2 0 47 0 0 288 0 0 0.6142 0.0000 0.0000 62.500 0.14 1.11 -0.97 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8525 0.1457 0.0018 1 0 0.8428 0.1549 0.0023 1 0 0.8289 0.1680 0.0031
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1180 301 879 115 2 73 93 18 0 0 878 0 1 0.3821 0.0000 0.0011 3.153 0.42 2.78 -2.36 9 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1755 0.7409 0.0836 1 1 0.1843 0.7253 0.0903 1 1 0.1955 0.7050 0.0995
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 1185 309 876 118 3 88 1 99 0 0 876 0 0 0.3819 0.0000 0.0000 2.489 0.42 5.53 -5.11 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5811 0.4106 0.0084 1 0 0.5801 0.4100 0.0098 1 0 0.5776 0.4103 0.0122
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.100 1 12 1 536 169 367 73 0 14 0 82 0 0 367 0 0 0.4320 0.0000 0.0000 11.071 0.34 5.84 -5.50 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0574 0.5999 0.3427 1 1 0.0621 0.5919 0.3460 1 1 0.0687 0.5819 0.3494
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 490 145 345 140 0 3 0 2 0 0 345 0 0 0.9655 0.0000 0.0000 47.333 0.22 3.00 -2.78 106 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9365 0.0635 0.0000 0 0 0.9923 0.0077 0.0000 0 0 0.9960 0.0040 0.0000
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 711 134 577 57 0 34 2 41 1 0 576 0 0 0.4254 0.0017 0.0017 3.030 0.51 9.02 -8.52 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5507 0.4196 0.0297 1 0 0.5444 0.4228 0.0328 1 0 0.5354 0.4272 0.0375
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 190 92 98 4 0 0 0 88 0 0 98 0 0 0.0435 0.0000 0.0000 92.000 0.75 2.35 -1.60 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9875 0.0125 2 2 0.0000 0.4646 0.5354 2 2 0.0000 0.1538 0.8462
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 370 136 234 68 1 0 0 67 0 0 233 0 1 0.5000 0.0000 0.0043 135.000 1.16 2.42 -1.26 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1830 0.6608 0.1562 1 1 0.1886 0.6494 0.1620 1 1 0.1957 0.6348 0.1695
chr3 136145062 G GATGA 0.500000 0.100 1 4 1 186 95 91 90 0 2 0 3 0 0 90 0 1 0.9474 0.0000 0.0110 46.500 0.10 4.00 -3.90 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 0 0.5588 0.4412 0.0000 0 0 0.8582 0.1418 0.0000
chr3 140566154 AGAGGAG A 0.500000 0.100 1 -6 2 252 128 124 114 0 12 0 2 0 0 124 0 0 0.8906 0.0000 0.0000 9.667 0.39 6.00 -5.61 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8057 0.1943 0.0000 0 0 0.9739 0.0261 0.0000 0 0 0.9866 0.0134 0.0000
chr3 158732285 T TCGGGGCCC 0.500000 0.100 1 8 1 394 79 315 44 0 5 0 30 0 0 310 0 5 0.5570 0.0000 0.0159 14.800 0.77 8.53 -7.76 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4210 0.5083 0.0707 1 1 0.4178 0.5071 0.0752 1 1 0.4130 0.5056 0.0814
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 279 102 177 58 1 1 0 42 0 0 177 0 0 0.5686 0.0000 0.0000 101.000 0.34 1.19 -0.85 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6081 0.3709 0.0210 1 0 0.6001 0.3763 0.0236 1 0 0.5888 0.3837 0.0275
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 396 155 241 70 3 23 6 53 0 0 235 0 6 0.4516 0.0000 0.0249 5.739 0.17 3.30 -3.13 50 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3330 0.5976 0.0694 1 1 0.3357 0.5900 0.0744 1 1 0.3384 0.5804 0.0812
chr3 187698970 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 342 92 250 57 0 0 2 33 0 0 248 1 1 0.6196 0.0000 0.0080 92.000 1.16 4.18 -3.02 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6910 0.2963 0.0127 1 0 0.6808 0.3046 0.0146 1 0 0.6665 0.3160 0.0175
chr3 187698974 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 340 93 247 59 0 0 1 33 0 0 245 1 1 0.6344 0.0000 0.0081 93.000 1.15 4.18 -3.03 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7485 0.2437 0.0078 1 0 0.7376 0.2532 0.0092 1 0 0.7222 0.2664 0.0113
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 522 145 377 83 0 3 3 56 0 0 375 0 2 0.5724 0.0000 0.0053 71.000 0.12 2.16 -2.04 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6758 0.3152 0.0090 1 0 0.6683 0.3212 0.0105 1 0 0.6574 0.3298 0.0128
chr3 195721040 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 379 195 184 162 0 5 0 28 0 0 184 0 0 0.8308 0.0000 0.0000 38.000 0.63 3.32 -2.69 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195788493 GTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGCA G 0.500000 0.100 1 -96 1 2137 881 1256 632 35 54 10 150 45 19 1169 5 18 0.7174 0.0358 0.0693 15.750 2.64 4.66 -2.02 10 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 766 167 599 88 0 19 0 60 0 0 584 0 15 0.5269 0.0000 0.0250 7.789 0.16 11.12 -10.96 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4343 0.5326 0.0330 1 1 0.4353 0.5281 0.0365 1 1 0.4355 0.5228 0.0417
chr3 198153257 CTGGCAGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -12 2 346 153 193 78 41 10 1 23 0 0 190 1 2 0.5098 0.0000 0.0155 14.300 0.31 10.48 -10.17 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 346 146 200 51 1 31 1 62 0 0 195 1 4 0.3493 0.0000 0.0250 3.710 0.31 7.52 -7.20 29 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0237 0.4151 0.5612 1 2 0.0266 0.4179 0.5556 1 2 0.0307 0.4220 0.5473
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 346 149 197 56 2 28 40 23 0 0 193 0 4 0.3758 0.0000 0.0203 4.286 0.36 10.48 -10.12 32 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0611 0.5595 0.3794 1 1 0.0657 0.5543 0.3800 1 1 0.0721 0.5480 0.3799
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 495 133 362 75 1 1 0 56 0 0 331 2 29 0.5639 0.0000 0.0856 132.000 0.68 15.75 -15.07 25 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0167 0.4844 0.4989 1 2 0.0183 0.4791 0.5026 1 2 0.0206 0.4729 0.5065
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 631 237 394 79 0 75 0 83 2 0 380 2 10 0.3333 0.0051 0.0355 2.219 3.04 7.77 -4.73 45 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0599 0.6817 0.2583 1 1 0.0665 0.6740 0.2595 1 1 0.0759 0.6641 0.2600
chr4 3074966 G GCCGCCGCCT 0.001791 0.100 1 9 2 632 234 398 105 6 12 3 108 5 4 386 1 2 0.4487 0.0126 0.0302 18.333 4.21 7.67 -3.46 13 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3528 0.6470 0.0002 1 1 0.3679 0.6319 0.0002 1 1 0.3868 0.6129 0.0003
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 568 150 418 89 1 10 0 50 0 0 414 0 4 0.5933 0.0000 0.0096 14.000 0.97 11.60 -10.63 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9421 0.0578 0.0001 1 0 0.9373 0.0626 0.0001 1 0 0.9302 0.0697 0.0001
chr4 15003723 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 3 682 134 548 63 3 24 4 40 11 1 532 1 3 0.4701 0.0201 0.0292 4.500 1.38 3.88 -2.49 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8403 0.1575 0.0022 1 0 0.8305 0.1668 0.0027 1 0 0.8163 0.1800 0.0036
chr4 15004114 A AGCG 0.500000 0.100 1 3 1 446 107 339 69 4 28 4 2 3 1 333 1 1 0.6449 0.0088 0.0177 2.750 2.13 3.00 -0.87 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 1 0.2087 0.7913 0.0000 0 0 0.5735 0.4265 0.0000
chr4 15687453 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 4 1149 282 867 152 2 9 0 119 0 0 860 0 7 0.5390 0.0000 0.0081 30.333 0.21 2.12 -1.91 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6682 0.3292 0.0026 1 0 0.6670 0.3298 0.0032 1 0 0.6640 0.3317 0.0043
chr4 56314410 C CGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 9 1 580 118 462 0 0 13 0 105 0 0 425 0 37 0.0000 0.0000 0.0801 8.077 11.76 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 580 118 462 0 0 48 1 69 0 0 425 0 37 0.0000 0.0000 0.0801 1.522 12.42 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr4 56378269 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 268 96 172 90 1 0 0 5 0 0 172 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 96.000 0.08 3.00 -2.92 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.3145 0.6855 0.0000 0 0 0.7696 0.2304 0.0000
chr4 56448597 GGTACAGATAAAACAA G 0.500000 0.100 1 -15 2 344 96 248 43 1 13 0 39 0 0 240 0 8 0.4479 0.0000 0.0323 6.308 0.28 12.28 -12.00 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1393 0.5974 0.2632 1 1 0.1441 0.5902 0.2657 1 1 0.1504 0.5811 0.2685
chr4 56809985 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 179 52 127 49 0 0 0 3 0 0 127 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 52.000 0.12 1.00 -0.88 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0156 0.9844 0.0000 0 1 0.3225 0.6775 0.0000 0 0 0.6115 0.3885 0.0000
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 1 754 286 468 15 113 42 19 97 0 2 466 0 0 0.0524 0.0000 0.0043 5.500 0.73 3.16 -2.43 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5066 0.4822 0.0112 1 0 0.5091 0.4778 0.0131 1 0 0.5110 0.4731 0.0159
chr4 78870928 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 755 293 462 112 11 36 11 123 0 0 459 1 2 0.3823 0.0000 0.0065 7.441 2.69 3.27 -0.58 38 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0251 0.6433 0.3316 1 1 0.0285 0.6311 0.3405 1 1 0.0335 0.6158 0.3507
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 158 66 92 36 0 2 0 28 0 0 92 0 0 0.5455 0.0000 0.0000 32.000 0.11 1.04 -0.92 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4092 0.5069 0.0838 1 1 0.4057 0.5060 0.0883 1 1 0.4006 0.5049 0.0946
chr4 87614693 CAGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 1963 428 1535 372 6 35 1 14 3 6 1525 1 0 0.8692 0.0020 0.0065 12.613 1.12 5.93 -4.80 128 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9441 0.0559 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr4 87614933 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2407 626 1781 331 10 73 14 198 89 49 1609 7 27 0.5288 0.0500 0.0966 7.569 1.50 13.21 -11.71 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615161 CGATAGCAGCAACAGCAGT C 0.500000 0.100 1 -18 1 2898 577 2321 294 13 87 9 174 5 19 2275 13 9 0.5095 0.0022 0.0198 5.714 1.54 12.56 -11.02 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3130 649 2481 11 8 26 19 585 34 30 2140 217 60 0.0169 0.0137 0.1374 25.583 3.73 9.44 -5.72 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9608 0.0392
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 3297 754 2543 320 7 107 5 315 21 62 2218 101 141 0.4244 0.0083 0.1278 6.212 3.89 11.26 -7.37 32 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 87615614 T TAGCAGTGACAGCAGTGATAGCAGTGAC 0.500000 0.100 1 27 1 3300 871 2429 244 20 332 22 253 22 37 2276 37 57 0.2801 0.0091 0.0630 1.611 2.29 6.90 -4.61 18 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.2776 0.7224 1 2 0.0001 0.2660 0.7340 1 2 0.0001 0.2539 0.7460
chr4 94610228 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 131 67 64 65 0 0 0 2 0 0 64 0 0 0.9701 0.0000 0.0000 67.000 0.98 3.00 -2.02 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2438 0.7562 0.0000 0 0 0.7534 0.2466 0.0000 0 0 0.8665 0.1335 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 162 84 78 47 0 3 0 34 0 0 77 0 1 0.5595 0.0000 0.0128 27.000 0.19 3.06 -2.87 1 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4993 0.4544 0.0463 1 0 0.4936 0.4563 0.0501 1 0 0.4855 0.4589 0.0557
chr4 112439686 A AT 0.500000 0.100 1 1 1 199 83 116 50 0 2 0 31 0 0 116 0 0 0.6024 0.0000 0.0000 40.500 0.14 1.06 -0.92 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6776 0.3067 0.0157 1 0 0.6670 0.3151 0.0179 1 0 0.6523 0.3266 0.0212
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 605 164 441 90 0 4 0 70 0 0 438 0 3 0.5488 0.0000 0.0068 40.000 0.17 4.06 -3.89 50 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5378 0.4437 0.0185 1 0 0.5354 0.4437 0.0210 1 0 0.5310 0.4443 0.0247
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.100 1 -18 1 195 106 89 61 0 8 0 37 0 0 89 0 0 0.5755 0.0000 0.0000 12.250 0.43 13.11 -12.68 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7644 0.2290 0.0066 1 0 0.7535 0.2387 0.0078 1 0 0.7382 0.2521 0.0097
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 513 213 300 0 0 27 14 172 0 0 296 1 3 0.0000 0.0000 0.0133 6.889 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 496 209 287 2 90 43 1 73 1 2 283 0 1 0.0096 0.0035 0.0139 3.791 0.00 3.49 -3.49 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5802 0.4061 0.0137 1 0 0.5766 0.4077 0.0157 1 0 0.5708 0.4104 0.0188
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 2 499 219 280 89 1 35 0 94 0 1 269 1 9 0.4064 0.0000 0.0393 5.229 3.08 9.44 -6.36 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0286 0.5615 0.4099 1 1 0.0320 0.5546 0.4134 1 1 0.0369 0.5464 0.4167
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 288 122 166 64 1 14 0 43 0 0 163 0 3 0.5246 0.0000 0.0181 7.714 0.77 5.35 -4.58 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6461 0.3389 0.0150 1 0 0.6377 0.3452 0.0171 1 0 0.6257 0.3540 0.0203
chr4 168878233 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 444 109 335 89 0 9 0 11 0 0 335 0 0 0.8165 0.0000 0.0000 11.111 0.72 2.82 -2.10 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0606 0.9394 0.0000
chr4 177322470 G GAAT 0.500000 0.100 1 3 1 205 75 130 48 0 2 0 25 0 0 130 0 0 0.6400 0.0000 0.0000 36.500 0.29 4.72 -4.43 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7674 0.2246 0.0080 1 0 0.7555 0.2351 0.0094 1 0 0.7389 0.2495 0.0116
chr4 184694537 ACAGATGAAG A 0.500000 0.100 1 -9 2 319 93 226 66 1 2 0 24 0 0 226 0 0 0.7097 0.0000 0.0000 45.500 0.35 10.17 -9.82 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9576 0.0422 0.0002 1 0 0.9518 0.0480 0.0003 1 0 0.9199 0.0797 0.0004
chr5 733800 T TAA 0.007715 0.100 1 2 1 149 46 103 29 0 1 1 15 0 0 103 0 0 0.6304 0.0000 0.0000 45.000 0.93 3.53 -2.60 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7425 0.2570 0.0004 1 0 0.7361 0.2634 0.0005 1 0 0.7273 0.2721 0.0005
chr5 733804 CAT C 0.005230 0.100 1 -2 3 149 44 105 28 0 4 1 11 0 0 104 0 1 0.6364 0.0000 0.0095 10.000 0.96 4.64 -3.67 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7816 0.2182 0.0002 1 0 0.7742 0.2255 0.0002 1 0 0.7631 0.2366 0.0003
chr5 1295342 CCG C 0.500000 0.100 1 -2 3 736 149 587 134 1 10 0 4 0 0 587 0 0 0.8993 0.0000 0.0000 13.800 1.44 2.00 -0.56 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1209 0.8791 0.0000 0 0 0.9226 0.0774 0.0000 0 0 0.9816 0.0184 0.0000
chr5 41158762 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 279 80 199 40 0 1 0 39 0 0 197 2 0 0.5000 0.0000 0.0101 79.000 1.35 2.28 -0.93 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1896 0.5968 0.2136 1 1 0.1934 0.5896 0.2170 1 1 0.1983 0.5806 0.2211
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 770 161 609 53 0 34 4 70 0 0 605 0 4 0.3292 0.0000 0.0066 3.735 0.36 3.79 -3.43 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0053 0.2407 0.7540 1 2 0.0064 0.2492 0.7445 1 2 0.0080 0.2610 0.7309
chr5 56882152 AACC A 0.500000 0.100 1 -3 1 775 155 620 85 1 2 0 67 1 0 614 0 5 0.5484 0.0016 0.0097 76.500 0.47 3.72 -3.25 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4895 0.4852 0.0253 1 0 0.4884 0.4833 0.0283 1 0 0.4858 0.4814 0.0328
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 2 376 137 239 102 4 21 3 7 2 0 235 2 0 0.7445 0.0084 0.0167 5.381 1.05 2.86 -1.81 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0135 0.9865 0.0000 0 1 0.2883 0.7117 0.0000
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 354 45 309 0 1 22 0 22 0 0 303 3 3 0.0000 0.0000 0.0194 1.000 7.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2159 0.7841 2 2 0.0000 0.2192 0.7808 2 2 0.0000 0.2241 0.7759
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 334 104 230 89 1 4 0 10 0 0 229 1 0 0.8558 0.0000 0.0043 25.000 0.27 5.50 -5.23 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.1016 0.8984 0.0000
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 462 118 344 0 0 3 0 115 0 0 340 0 4 0.0000 0.0000 0.0116 38.333 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 264 105 159 96 0 1 0 8 0 0 158 0 1 0.9143 0.0000 0.0063 104.000 0.06 3.12 -3.06 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0083 0.9917 0.0000 0 1 0.2464 0.7536 0.0000
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 918 229 689 116 1 26 1 85 1 1 685 0 2 0.5066 0.0015 0.0058 8.120 0.69 3.84 -3.15 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8060 0.1925 0.0015 1 0 0.7987 0.1994 0.0019 1 0 0.7879 0.2096 0.0026
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 537 107 430 9 0 37 0 61 0 0 430 0 0 0.0841 0.0000 0.0000 1.892 0.78 1.20 -0.42 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.9557 0.0443
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 442 129 313 44 0 25 0 60 0 0 306 1 6 0.3411 0.0000 0.0224 4.160 0.32 7.17 -6.85 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0079 0.2609 0.7312 1 2 0.0092 0.2696 0.7212 1 2 0.0114 0.2817 0.7069
chr5 128084251 GGCGGCGGCGGCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 679 172 507 152 0 17 0 3 0 0 507 0 0 0.8837 0.0000 0.0000 9.688 1.16 8.33 -7.17 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7366 0.2634 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 520 134 386 65 0 18 0 51 0 0 382 0 4 0.4851 0.0000 0.0104 6.444 0.49 5.92 -5.43 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4041 0.5403 0.0557 1 1 0.4036 0.5363 0.0600 1 1 0.4023 0.5316 0.0662
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 347 90 257 33 1 6 0 50 0 0 238 0 19 0.3667 0.0000 0.0739 14.000 1.18 8.78 -7.60 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0009 0.0935 0.9057 1 2 0.0011 0.1019 0.8970 1 2 0.0016 0.1142 0.8842
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 175 74 101 8 0 0 0 66 0 0 99 0 2 0.1081 0.0000 0.0198 74.000 0.50 3.36 -2.86 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9941 0.0059 2 1 0.0000 0.8623 0.1377
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 847 228 619 215 0 8 0 5 0 0 619 0 0 0.9430 0.0000 0.0000 27.500 0.26 1.40 -1.14 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4820 0.5180 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr5 141415641 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 811 131 680 95 11 8 0 17 2 1 674 1 2 0.7252 0.0029 0.0088 14.375 2.04 3.41 -1.37 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 437 132 305 64 1 20 0 47 0 1 294 0 10 0.4848 0.0000 0.0361 5.550 0.31 8.45 -8.13 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3701 0.5651 0.0648 1 1 0.3709 0.5597 0.0695 1 1 0.3711 0.5529 0.0760
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 15 1 416 154 262 57 1 35 0 61 0 0 256 0 6 0.3701 0.0000 0.0229 3.400 0.68 10.79 -10.10 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0626 0.5643 0.3731 1 1 0.0672 0.5589 0.3739 1 1 0.0737 0.5521 0.3742
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 720 158 562 153 0 1 0 4 0 0 562 0 0 0.9684 0.0000 0.0000 157.000 0.65 3.50 -2.85 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2516 0.7484 0.0000 0 0 0.9672 0.0328 0.0000 0 0 0.9923 0.0077 0.0000
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 728 167 561 162 0 1 0 4 0 0 561 0 0 0.9701 0.0000 0.0000 166.000 0.62 3.50 -2.88 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3472 0.6528 0.0000 0 0 0.9788 0.0212 0.0000 0 0 0.9950 0.0050 0.0000
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 708 157 551 12 0 5 1 139 0 0 550 0 1 0.0764 0.0000 0.0018 30.200 0.33 1.79 -1.46 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.7010 0.2990
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 554 138 416 120 0 4 0 14 0 0 416 0 0 0.8696 0.0000 0.0000 33.500 0.12 1.14 -1.02 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0410 0.9590 0.0000
chr5 150903148 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 1 249 92 157 55 0 4 0 33 0 0 157 0 0 0.5978 0.0000 0.0000 22.000 0.60 3.70 -3.10 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7350 0.2557 0.0094 1 0 0.7239 0.2652 0.0109 1 0 0.7084 0.2783 0.0134
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 363 160 203 116 3 25 5 11 0 0 203 0 0 0.7250 0.0000 0.0000 5.870 2.59 11.82 -9.23 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0275 0.9725 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 363 141 222 2 59 4 1 75 0 0 222 0 0 0.0142 0.0000 0.0000 34.250 4.00 3.56 0.44 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0179 0.3917 0.5904 1 2 0.0203 0.3952 0.5845 1 2 0.0238 0.4003 0.5759
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 216 87 129 0 6 6 1 74 0 0 128 0 1 0.0000 0.0000 0.0078 13.500 3.32 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9567 0.0433 2 1 0.0000 0.6580 0.3420 2 2 0.0000 0.3328 0.6672
chr5 168454037 GGGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 216 86 130 7 67 3 1 8 0 0 130 0 0 0.0814 0.0000 0.0000 27.333 1.86 4.50 -2.64 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.1146 0.8854 0.0000
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 427 107 320 57 0 4 0 46 0 0 320 0 0 0.5327 0.0000 0.0000 25.750 1.02 3.87 -2.85 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4490 0.5002 0.0507 1 1 0.4462 0.4990 0.0548 1 1 0.4417 0.4977 0.0607
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 487 238 249 168 13 48 0 9 1 0 248 0 0 0.7059 0.0040 0.0040 4.043 1.04 3.78 -2.74 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3608 0.6392 0.0000 0 0 0.9517 0.0483 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 625 111 514 37 0 18 1 55 0 0 514 0 0 0.3333 0.0000 0.0000 5.167 0.59 3.09 -2.50 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0154 0.3193 0.6653 1 2 0.0175 0.3269 0.6555 1 2 0.0208 0.3373 0.6419
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 484 139 345 2 0 27 2 108 0 0 342 0 3 0.0144 0.0000 0.0087 4.111 0.50 3.31 -2.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2022 0.7978 2 2 0.0000 0.0278 0.9722 2 2 0.0000 0.0142 0.9858
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 576 136 440 57 0 25 3 51 3 1 432 3 1 0.4191 0.0068 0.0182 4.440 1.60 4.02 -2.42 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3609 0.5902 0.0489 1 1 0.3673 0.5818 0.0510 1 1 0.3750 0.5713 0.0537
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 539 117 422 58 2 16 1 40 3 0 407 5 7 0.4957 0.0071 0.0355 6.312 1.53 4.53 -2.99 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5464 0.4336 0.0200 1 0 0.5458 0.4325 0.0217 1 0 0.5443 0.4316 0.0241
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1467 352 1115 49 10 94 8 191 0 0 1109 2 4 0.1392 0.0000 0.0054 2.763 2.10 3.91 -1.81 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 1 0.0000 0.7109 0.2891 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 16327684 A ATGC 0.101269 0.100 1 3 1 1454 394 1060 155 10 99 3 127 0 0 1058 1 1 0.3934 0.0000 0.0019 3.010 1.88 4.06 -2.19 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8047 0.1951 0.0002 1 0 0.8038 0.1959 0.0003 1 0 0.8015 0.1981 0.0004
chr6 27250733 TCTC T 0.001482 0.100 1 -3 1 293 109 184 62 0 1 0 46 0 0 183 0 1 0.5688 0.0000 0.0054 108.000 0.50 3.28 -2.78 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7212 0.2787 0.0001 1 0 0.7178 0.2822 0.0001 1 0 0.7127 0.2872 0.0001
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.100 1 2 1 1043 213 830 118 1 5 0 89 0 0 827 0 3 0.5540 0.0000 0.0036 41.600 0.14 2.31 -2.17 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8257 0.1739 0.0003 1 0 0.8220 0.1775 0.0004 1 0 0.8164 0.1831 0.0005
chr6 29173644 TA T 0.001133 0.100 1 -1 2 548 158 390 95 0 5 0 58 0 0 390 0 0 0.6013 0.0000 0.0000 30.600 0.27 1.05 -0.78 69 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9486 0.0514 0.0000 1 0 0.9443 0.0557 0.0000 1 0 0.9379 0.0621 0.0000
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 373 113 260 54 0 1 0 58 0 0 260 0 0 0.4779 0.0000 0.0000 112.000 0.19 1.19 -1.00 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1196 0.6160 0.2644 1 1 0.1249 0.6075 0.2677 1 1 0.1319 0.5967 0.2715
chr6 31111540 CCCCCAGCTGCCTCCTGGATACCGATTAATATTT C 0.500000 0.100 1 -33 2 523 136 387 12 0 35 1 88 0 0 387 0 0 0.0882 0.0000 0.0000 2.886 0.17 5.31 -5.14 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9671 0.0329
chr6 31138080 AG A 0.500000 0.100 1 -1 4 489 134 355 128 2 1 0 3 0 0 355 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 132.000 1.13 2.67 -1.53 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4940 0.5060 0.0000 0 0 0.9643 0.0357 0.0000 0 0 0.9876 0.0124 0.0000
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 572 147 425 137 0 4 0 6 0 0 425 0 0 0.9320 0.0000 0.0000 35.750 1.07 2.67 -1.59 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.6197 0.3803 0.0000 0 0 0.9431 0.0569 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 625 189 436 94 0 2 0 93 0 0 435 0 1 0.4974 0.0000 0.0023 93.500 0.29 3.03 -2.75 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1423 0.7155 0.1422 1 1 0.1495 0.7010 0.1494 1 1 0.1589 0.6823 0.1588
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 625 189 436 167 1 3 2 16 0 0 435 0 1 0.8836 0.0000 0.0023 93.000 1.32 4.81 -3.49 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0327 0.9673 0.0000
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 528 184 344 115 0 10 0 59 0 0 337 0 7 0.6250 0.0000 0.0203 17.400 0.26 11.17 -10.91 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9635 0.0364 0.0001 1 0 0.9590 0.0409 0.0001 1 0 0.9521 0.0477 0.0001
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 433 111 322 54 0 11 0 46 0 0 322 0 0 0.4865 0.0000 0.0000 9.091 1.41 3.83 -2.42 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3728 0.5509 0.0763 1 1 0.3723 0.5467 0.0811 1 1 0.3710 0.5414 0.0876
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 284 86 198 57 0 1 0 28 0 0 198 0 0 0.6628 0.0000 0.0000 85.000 0.28 4.07 -3.79 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8514 0.1458 0.0027 1 0 0.8407 0.1559 0.0033 1 0 0.8253 0.1703 0.0044
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 756 368 388 157 19 93 0 99 0 0 386 0 2 0.4266 0.0000 0.0052 3.103 6.91 7.78 -0.87 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9975 0.0025 0.0000 1 0 0.9969 0.0031 0.0000 1 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 754 348 406 221 14 18 0 95 0 0 403 0 3 0.6351 0.0000 0.0074 21.867 7.78 7.95 -0.17 81 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 548 225 323 183 4 28 0 10 1 0 322 0 0 0.8133 0.0031 0.0031 7.036 0.62 5.50 -4.88 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2217 0.7783 0.0000 0 0 0.9373 0.0627 0.0000
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 382 92 290 44 0 11 0 37 0 0 279 0 11 0.4783 0.0000 0.0379 7.364 0.84 14.54 -13.70 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1269 0.5926 0.2805 1 1 0.1318 0.5857 0.2825 1 1 0.1383 0.5770 0.2847
chr6 36722044 C CGGGCCCAGCGGTGCAGGA 0.500000 0.100 1 18 2 721 138 583 72 1 15 0 50 0 0 559 0 24 0.5217 0.0000 0.0412 8.200 0.89 11.76 -10.87 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1479 0.6717 0.1804 1 1 0.1539 0.6597 0.1864 1 1 0.1618 0.6442 0.1940
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 657 201 456 108 2 8 2 81 0 0 455 0 1 0.5373 0.0000 0.0022 24.000 0.41 1.41 -1.00 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7148 0.2810 0.0042 1 0 0.7085 0.2864 0.0051 1 0 0.6991 0.2944 0.0065
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 867 234 633 119 0 5 0 110 0 0 629 0 4 0.5085 0.0000 0.0063 45.800 0.50 3.42 -2.91 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1926 0.7359 0.0715 1 1 0.2017 0.7205 0.0778 1 1 0.2132 0.7003 0.0865
chr6 42236367 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 3 316 115 201 4 1 15 1 94 0 0 199 0 2 0.0348 0.0000 0.0100 6.667 0.25 2.97 -2.72 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.6114 0.3886 2 2 0.0000 0.1815 0.8185
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 324 123 201 54 0 15 0 54 0 0 197 0 4 0.4390 0.0000 0.0199 7.200 0.24 6.07 -5.83 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1196 0.6160 0.2644 1 1 0.1249 0.6075 0.2676 1 1 0.1319 0.5967 0.2714
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 743 150 593 69 0 28 1 52 0 0 592 0 1 0.4600 0.0000 0.0017 4.357 0.51 3.44 -2.94 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5326 0.4402 0.0272 1 0 0.5281 0.4416 0.0303 1 0 0.5212 0.4440 0.0348
chr6 44002766 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 481 97 384 36 32 26 0 3 0 0 384 0 0 0.3711 0.0000 0.0000 2.840 1.67 2.33 -0.67 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0419 0.9581 0.0000 0 0 0.5649 0.4351 0.0000 0 0 0.8068 0.1932 0.0000
chr6 44002766 CGCGGCG C 0.500000 0.100 1 -6 1 484 99 385 43 0 20 0 36 0 0 382 0 3 0.4343 0.0000 0.0078 3.950 1.60 6.11 -4.51 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2901 0.5801 0.1297 1 1 0.2914 0.5741 0.1344 1 1 0.2928 0.5665 0.1407
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 703 195 508 41 3 100 1 50 0 0 492 0 16 0.2103 0.0000 0.0315 0.940 15.29 7.30 7.99 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0078 0.2593 0.7329 1 2 0.0091 0.2681 0.7228 1 2 0.0113 0.2802 0.7085
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.100 1 -15 2 713 229 484 97 0 70 0 62 0 0 480 0 4 0.4236 0.0000 0.0083 2.271 4.10 10.56 -6.46 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8278 0.1705 0.0018 1 0 0.8190 0.1788 0.0022 1 0 0.8063 0.1907 0.0030
chr6 87284874 TACTCC T 0.500000 0.100 1 -5 3 458 97 361 46 0 10 0 41 0 0 359 0 2 0.4742 0.0000 0.0055 8.700 1.00 6.12 -5.12 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2597 0.5970 0.1433 1 1 0.2622 0.5898 0.1480 1 1 0.2651 0.5807 0.1542
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 638 116 522 57 1 30 1 27 1 0 514 0 7 0.4914 0.0019 0.0153 2.867 2.14 3.78 -1.64 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7688 0.2247 0.0065 1 0 0.7577 0.2345 0.0077 1 0 0.7421 0.2482 0.0097
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 1229 311 918 224 2 25 0 60 3 0 912 0 3 0.7203 0.0033 0.0065 11.917 1.44 6.35 -4.91 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 764 180 584 0 0 10 1 169 0 0 575 0 9 0.0000 0.0000 0.0154 17.000 3.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 656 172 484 160 0 2 0 10 0 0 484 0 0 0.9302 0.0000 0.0000 85.000 0.32 6.50 -6.18 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0658 0.9342 0.0000 0 0 0.7936 0.2064 0.0000
chr6 118491647 ATGT A 0.500000 0.100 1 -3 3 335 118 217 109 0 4 0 5 0 0 216 0 1 0.9237 0.0000 0.0046 28.500 0.14 3.00 -2.86 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2801 0.7199 0.0000 0 0 0.8082 0.1918 0.0000
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 921 246 675 117 0 14 1 114 0 0 674 0 1 0.4756 0.0000 0.0015 16.571 0.12 3.11 -2.99 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1336 0.7572 0.1091 1 1 0.1421 0.7410 0.1169 1 1 0.1530 0.7197 0.1273
chr6 156778052 CGCGGCGGCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 965 199 766 106 1 11 0 81 1 0 763 0 2 0.5327 0.0013 0.0039 17.091 1.11 9.06 -7.95 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6968 0.2983 0.0049 1 0 0.6909 0.3032 0.0059 1 0 0.6820 0.3105 0.0075
chr6 156778268 C CCAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 938 272 666 102 5 73 4 88 2 1 651 1 11 0.3750 0.0030 0.0225 2.699 0.63 5.84 -5.21 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2250 0.7063 0.0687 1 1 0.2332 0.6922 0.0746 1 1 0.2433 0.6740 0.0826
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 574 239 335 0 0 45 1 193 0 0 313 0 22 0.0000 0.0000 0.0657 4.289 15.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 420 153 267 84 0 4 0 65 0 0 267 0 0 0.5490 0.0000 0.0000 37.250 0.25 5.48 -5.23 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6043 0.3817 0.0140 1 0 0.5990 0.3850 0.0160 1 0 0.5909 0.3900 0.0192
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 194 65 129 44 0 1 0 20 0 0 129 0 0 0.6769 0.0000 0.0000 64.000 6.14 8.60 -2.46 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7923 0.2009 0.0068 1 0 0.7801 0.2118 0.0080 1 0 0.7629 0.2270 0.0100
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 196 53 143 7 0 3 0 43 0 0 141 0 2 0.1321 0.0000 0.0140 16.667 0.43 9.65 -9.22 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9945 0.0055 2 1 0.0000 0.9096 0.0904
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 320 138 182 0 0 15 10 113 0 0 179 0 3 0.0000 0.0000 0.0165 8.200 3.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 708 145 563 63 0 32 0 50 0 0 552 0 11 0.4345 0.0000 0.0195 3.531 0.68 8.92 -8.24 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2134 0.6431 0.1435 1 1 0.2182 0.6328 0.1490 1 1 0.2241 0.6196 0.1562
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 879 372 507 7 30 65 134 136 0 0 507 0 0 0.0188 0.0000 0.0000 6.344 1.29 6.57 -5.28 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9935 0.0065
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 880 351 529 208 53 15 33 42 0 0 529 0 0 0.5926 0.0000 0.0000 23.250 3.77 12.98 -9.21 100 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1403 0.8597 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 255 93 162 11 0 8 3 71 0 0 159 1 2 0.1183 0.0000 0.0185 10.625 0.09 4.08 -3.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9654 0.0346
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 227 91 136 40 0 13 0 38 0 0 136 0 0 0.4396 0.0000 0.0000 6.000 1.18 4.08 -2.90 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2453 0.5898 0.1650 1 1 0.2477 0.5831 0.1692 1 1 0.2506 0.5747 0.1747
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 720 187 533 101 0 5 0 81 0 0 527 0 6 0.5401 0.0000 0.0113 36.400 0.21 10.69 -10.48 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4315 0.5417 0.0269 1 1 0.4339 0.5360 0.0301 1 1 0.4359 0.5293 0.0348
chr7 5312956 CGAAGAG C 0.500000 0.100 1 -6 1 760 108 652 42 0 11 0 55 0 0 652 0 0 0.3889 0.0000 0.0000 8.818 1.17 6.13 -4.96 26 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0387 0.4519 0.5094 1 2 0.0423 0.4535 0.5042 1 2 0.0475 0.4559 0.4966
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 670 218 452 0 0 29 16 173 0 0 451 0 1 0.0000 0.0000 0.0022 6.714 3.19 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 360 101 259 57 0 2 0 42 0 0 258 0 1 0.5644 0.0000 0.0039 49.500 0.19 3.00 -2.81 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5326 0.4342 0.0332 1 0 0.5268 0.4367 0.0366 1 0 0.5184 0.4402 0.0414
chr7 26152597 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 328 76 252 37 0 5 0 34 0 0 252 0 0 0.4868 0.0000 0.0000 14.200 0.43 3.06 -2.63 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2735 0.5756 0.1509 1 1 0.2749 0.5699 0.1552 1 1 0.2764 0.5628 0.1608
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 484 141 343 131 0 2 0 8 0 0 343 0 0 0.9291 0.0000 0.0000 69.500 0.32 1.12 -0.80 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1244 0.8756 0.0000 0 0 0.7739 0.2261 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 247 111 136 100 0 4 0 7 0 0 136 0 0 0.9009 0.0000 0.0000 26.750 0.14 2.86 -2.72 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0789 0.9211 0.0000 0 0 0.5891 0.4109 0.0000
chr7 51065234 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 582 158 424 150 0 5 0 3 0 0 424 0 0 0.9494 0.0000 0.0000 30.600 0.61 2.67 -2.06 88 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7316 0.2684 0.0000 0 0 0.9866 0.0134 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000
chr7 56073066 CTT C 0.500000 0.100 1 -2 1 213 103 110 97 0 3 0 3 0 0 110 0 0 0.9417 0.0000 0.0000 33.333 0.13 2.00 -1.87 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1517 0.8483 0.0000 0 0 0.8390 0.1610 0.0000 0 0 0.9417 0.0583 0.0000
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 448 142 306 60 0 0 1 81 0 0 304 0 2 0.4225 0.0000 0.0065 142.000 0.17 1.74 -1.57 34 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0062 0.2714 0.7224 1 2 0.0074 0.2787 0.7139 1 2 0.0092 0.2891 0.7017
chr7 80672793 TG T 0.500000 0.100 1 -1 3 194 81 113 49 0 1 2 29 0 0 112 0 1 0.6049 0.0000 0.0088 80.000 0.24 2.07 -1.82 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6311 0.3473 0.0216 1 0 0.6215 0.3543 0.0242 1 0 0.6081 0.3637 0.0282
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 828 216 612 0 0 10 2 204 0 0 602 0 10 0.0000 0.0000 0.0163 20.600 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 606 154 452 6 0 16 0 132 0 0 445 1 6 0.0390 0.0000 0.0155 8.625 1.67 3.35 -1.68 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 2 0.0000 0.3648 0.6352 2 2 0.0000 0.0524 0.9476
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 229 88 141 48 0 0 0 40 0 0 140 0 1 0.5455 0.0000 0.0071 88.000 0.29 3.15 -2.86 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3577 0.5530 0.0893 1 1 0.3571 0.5488 0.0941 1 1 0.3559 0.5435 0.1006
chr7 93886877 CTTCT C 0.500000 0.100 1 -4 1 182 64 118 29 0 2 0 33 0 0 117 0 1 0.4531 0.0000 0.0085 31.000 0.07 4.18 -4.11 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1225 0.5476 0.3300 1 1 0.1269 0.5439 0.3292 1 1 0.1329 0.5393 0.3277
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 656 202 454 17 0 6 0 179 0 0 451 0 3 0.0842 0.0000 0.0066 32.667 0.35 4.18 -3.83 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8889 0.1111
chr7 100075318 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 555 171 384 158 0 8 0 5 0 0 384 0 0 0.9240 0.0000 0.0000 20.375 0.16 2.20 -2.04 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0526 0.9474 0.0000 0 0 0.9306 0.0694 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr7 100124796 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 562 179 383 82 1 16 8 72 0 0 383 0 0 0.4581 0.0000 0.0000 10.188 0.20 3.06 -2.86 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2032 0.6810 0.1157 1 1 0.2096 0.6684 0.1220 1 1 0.2175 0.6522 0.1303
chr7 100124796 CAGGAGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 562 181 381 87 3 80 0 11 0 0 381 0 0 0.4807 0.0000 0.0000 1.278 0.18 6.82 -6.63 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.1095 0.8905 0.0000
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 123 39 84 8 0 0 0 31 0 0 76 0 8 0.2051 0.0000 0.0952 39.000 0.12 30.26 -30.13 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9875 0.0125 2 1 0.0000 0.9959 0.0041 2 1 0.0000 0.9617 0.0383
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 545 156 389 87 0 5 0 64 0 0 386 0 3 0.5577 0.0000 0.0077 30.200 0.64 3.11 -2.47 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6229 0.3652 0.0118 1 0 0.6173 0.3691 0.0137 1 0 0.6088 0.3747 0.0165
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 416 119 297 35 1 38 0 45 0 0 293 0 4 0.2941 0.0000 0.0135 2.162 1.71 6.91 -5.20 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0396 0.4365 0.5239 1 2 0.0433 0.4392 0.5175 1 2 0.0485 0.4430 0.5085
chr7 103989356 T TGCCGCCGCCGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 18 1 416 119 297 72 2 35 0 10 0 1 294 0 2 0.6050 0.0000 0.0101 2.400 4.21 8.00 -3.79 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0173 0.9827 0.0000
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 710 154 556 74 0 10 2 68 0 1 554 0 1 0.4805 0.0000 0.0036 14.400 1.07 3.81 -2.74 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2304 0.6570 0.1126 1 1 0.2357 0.6458 0.1185 1 1 0.2422 0.6315 0.1263
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 762 229 533 113 0 17 1 98 0 0 531 0 2 0.4934 0.0000 0.0038 13.250 0.84 6.01 -5.17 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3380 0.6266 0.0354 1 1 0.3445 0.6161 0.0394 1 1 0.3519 0.6030 0.0452
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 586 171 415 0 0 22 1 148 0 0 415 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.773 15.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 347 188 159 134 4 39 0 11 1 0 157 0 1 0.7128 0.0063 0.0126 3.821 4.90 4.64 0.27 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.2829 0.7171 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 347 192 155 97 0 31 1 63 0 0 152 0 3 0.5052 0.0000 0.0194 5.161 0.68 10.71 -10.03 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8194 0.1786 0.0020 1 0 0.8107 0.1869 0.0024 1 0 0.7980 0.1987 0.0033
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -12 1 347 198 149 107 0 30 0 61 0 0 148 0 1 0.5404 0.0000 0.0067 5.600 0.65 10.44 -9.79 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9570 0.0429 0.0001 1 0 0.9520 0.0479 0.0001 1 0 0.9442 0.0556 0.0002
chr7 137846769 T TGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 1 378 93 285 72 0 16 0 5 0 0 284 0 1 0.7742 0.0000 0.0035 4.812 1.54 7.80 -6.26 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0577 0.9423 0.0000 0 1 0.4116 0.5884 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 230 79 151 4 0 3 1 71 0 0 147 0 4 0.0506 0.0000 0.0265 25.333 0.25 3.10 -2.85 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9934 0.0066 2 1 0.0000 0.6137 0.3863 2 2 0.0000 0.2459 0.7541
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.100 1 19 1 193 89 104 35 0 31 1 22 0 0 102 0 2 0.3933 0.0000 0.0192 1.871 0.11 11.32 -11.20 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4687 0.4668 0.0645 1 1 0.4628 0.4684 0.0688 1 1 0.4547 0.4706 0.0747
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 911 263 648 104 101 53 0 5 0 0 648 0 0 0.3954 0.0000 0.0000 3.962 0.50 3.60 -3.10 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3762 0.6238 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 911 268 643 97 14 49 4 104 0 0 641 1 1 0.3619 0.0000 0.0031 4.429 0.37 3.06 -2.69 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1319 0.7449 0.1232 1 1 0.1398 0.7292 0.1310 1 1 0.1502 0.7086 0.1412
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1415 359 1056 0 0 13 4 342 0 0 1055 1 0 0.0000 0.0000 0.0009 26.615 1.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 712 180 532 89 0 7 0 84 0 0 532 0 0 0.4944 0.0000 0.0000 24.714 1.02 4.19 -3.17 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2371 0.6749 0.0880 1 1 0.2435 0.6626 0.0939 1 1 0.2513 0.6468 0.1019
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.100 1 -4 1 844 531 313 431 0 15 0 85 0 0 312 0 1 0.8117 0.0000 0.0032 34.400 1.17 4.45 -3.27 89 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 201 59 142 29 0 3 0 27 0 0 137 0 5 0.4915 0.0000 0.0352 18.667 0.62 5.07 -4.45 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1552 0.5636 0.2813 1 1 0.1592 0.5588 0.2820 1 1 0.1645 0.5528 0.2827
chr7 149815757 G GAGGTGGTC 0.500000 0.100 1 8 1 662 176 486 83 0 17 0 76 0 0 482 0 4 0.4716 0.0000 0.0082 9.353 0.83 7.80 -6.97 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2053 0.6807 0.1140 1 1 0.2117 0.6681 0.1203 1 1 0.2195 0.6519 0.1285
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 788 199 589 83 0 7 0 109 0 0 589 0 0 0.4171 0.0000 0.0000 27.429 0.52 1.67 -1.15 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0040 0.2765 0.7195 1 2 0.0049 0.2820 0.7131 1 2 0.0063 0.2902 0.7035
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 477 130 347 121 0 2 0 7 1 0 346 0 0 0.9308 0.0029 0.0029 64.000 0.55 1.14 -0.60 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2059 0.7941 0.0000 0 0 0.8070 0.1930 0.0000
chr7 149821917 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 643 163 480 154 0 2 0 7 0 1 479 0 0 0.9448 0.0000 0.0021 80.500 1.24 2.00 -0.76 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.5740 0.4260 0.0000 0 0 0.9540 0.0460 0.0000
chr7 151023910 GCTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 539 158 381 148 0 5 0 5 0 0 381 0 0 0.9367 0.0000 0.0000 30.600 0.80 3.40 -2.60 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0275 0.9725 0.0000 0 0 0.8879 0.1121 0.0000 0 0 0.9815 0.0185 0.0000
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 461 92 369 0 0 0 16 76 0 1 354 4 10 0.0000 0.0000 0.0407 90.000 7.22 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0044 0.9956 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0056 0.9944
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 464 92 372 0 1 7 8 76 0 0 354 7 11 0.0000 0.0000 0.0484 81.000 7.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0049 0.9951 2 2 0.0000 0.0054 0.9946 2 2 0.0000 0.0062 0.9938
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 475 90 385 0 0 9 3 78 0 1 331 23 30 0.0000 0.0000 0.1403 9.000 7.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 559 206 353 198 0 4 0 4 0 0 353 0 0 0.9612 0.0000 0.0000 50.500 0.29 1.00 -0.71 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7718 0.2282 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr7 154968830 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 1421 363 1058 296 5 44 0 18 2 0 1055 1 0 0.8154 0.0019 0.0028 7.205 0.52 3.94 -3.42 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 0 0.9232 0.0768 0.0000
chr7 156950334 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 5 721 188 533 101 2 12 0 73 0 0 532 0 1 0.5372 0.0000 0.0019 14.667 0.68 3.34 -2.66 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7858 0.2116 0.0025 1 0 0.7777 0.2192 0.0031 1 0 0.7659 0.2300 0.0041
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 785 182 603 70 0 18 0 94 0 0 600 0 3 0.3846 0.0000 0.0050 9.111 0.33 6.17 -5.84 30 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0031 0.2227 0.7743 1 2 0.0038 0.2298 0.7665 1 2 0.0049 0.2399 0.7552
chr8 8703108 G GCAAGCC 0.002960 0.100 1 6 2 616 161 455 64 0 39 0 58 0 0 453 0 2 0.3975 0.0000 0.0044 3.128 0.70 5.69 -4.99 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4463 0.5531 0.0006 1 1 0.4539 0.5455 0.0006 1 1 0.4632 0.5361 0.0007
chr8 10608190 CTTCCTCTTCTGCCTCCTGGGACTCTATAACTTCTGACTCTGGCTGGGT C 0.002031 0.100 1 -48 3 948 252 696 124 4 23 2 99 6 2 667 13 8 0.4921 0.0086 0.0417 10.364 2.82 8.59 -5.76 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5070 0.4929 0.0001 1 0 0.5182 0.4817 0.0001 1 0 0.5315 0.4684 0.0001
chr8 10610119 T TTTC 0.070211 0.100 1 3 1 995 307 688 241 3 14 40 9 1 0 686 0 1 0.7850 0.0015 0.0029 20.000 1.46 5.78 -4.32 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0749 0.9251 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 608 276 332 0 0 44 0 232 0 0 331 1 0 0.0000 0.0000 0.0030 5.273 6.50 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 13567550 CAG C 0.000361 0.100 1 -2 4 573 154 419 89 0 2 0 63 0 0 418 0 1 0.5779 0.0000 0.0024 76.000 0.31 2.33 -2.02 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8491 0.1509 0.0000 1 0 0.8440 0.1560 0.0000 1 0 0.8367 0.1633 0.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 368 143 225 77 0 3 0 63 0 0 225 0 0 0.5385 0.0000 0.0000 46.667 0.55 7.44 -6.90 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6115 0.3790 0.0095 1 0 0.6105 0.3790 0.0106 1 0 0.6083 0.3796 0.0121
chr8 56441740 CTTCATGAAGCCTCCATACCTT C 0.000737 0.100 1 -21 4 514 140 374 69 0 14 1 56 0 0 362 0 12 0.4929 0.0000 0.0321 9.000 0.67 17.04 -16.37 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3368 0.6630 0.0002 1 1 0.3483 0.6514 0.0003 1 1 0.3631 0.6366 0.0003
chr8 64581060 T TGGC 0.106611 0.100 1 3 1 564 145 419 118 2 14 1 10 4 3 410 2 0 0.8138 0.0095 0.0215 10.000 2.41 4.20 -1.79 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0361 0.9639 0.0000 0 0 0.7361 0.2639 0.0000
chr8 64581450 T TAGCGGC 0.096175 0.100 1 6 2 602 187 415 154 5 19 1 8 2 0 413 0 0 0.8235 0.0048 0.0048 9.111 2.14 5.38 -3.24 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.8189 0.1811 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 599 193 406 68 9 38 4 74 0 0 406 0 0 0.3523 0.0000 0.0000 4.079 0.78 3.95 -3.17 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2760 0.6979 0.0261 1 1 0.2880 0.6850 0.0270 1 1 0.3034 0.6683 0.0282
chr8 64581463 G GGCAGCA 0.003542 0.100 1 6 1 599 193 406 80 1 103 1 8 0 0 406 0 0 0.4145 0.0000 0.0000 0.890 1.52 6.50 -4.97 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6871 0.3129 0.0000 0 0 0.9835 0.0165 0.0000
chr8 93134802 A ATTG 0.500000 0.100 1 3 1 194 55 139 34 0 1 0 20 0 0 139 0 0 0.6182 0.0000 0.0000 54.000 0.24 3.40 -3.16 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5838 0.3799 0.0364 1 0 0.5739 0.3862 0.0398 1 0 0.5605 0.3947 0.0448
chr8 100194231 A AGAC 0.500000 0.100 1 3 5 216 73 143 43 1 2 0 27 0 0 142 0 1 0.5890 0.0000 0.0070 35.500 0.14 4.15 -4.01 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6154 0.3588 0.0258 1 0 0.6057 0.3656 0.0287 1 0 0.5923 0.3747 0.0330
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 311 101 210 95 0 0 0 6 0 0 210 0 0 0.9406 0.0000 0.0000 101.000 0.14 2.67 -2.53 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1632 0.8368 0.0000 0 0 0.6818 0.3182 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 642 228 414 133 4 16 5 70 0 0 414 0 0 0.5833 0.0000 0.0000 16.154 2.61 16.16 -13.55 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9883 0.0117 0.0000 1 0 0.9863 0.0137 0.0000 1 0 0.9831 0.0169 0.0000
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 328 93 235 47 0 3 0 43 0 0 235 0 0 0.5054 0.0000 0.0000 30.000 0.21 3.86 -3.65 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2821 0.5902 0.1277 1 1 0.2840 0.5835 0.1325 1 1 0.2861 0.5750 0.1390
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 264 119 145 60 0 3 0 56 0 0 139 0 6 0.5042 0.0000 0.0414 38.667 0.12 3.21 -3.10 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1445 0.6408 0.2147 1 1 0.1499 0.6306 0.2195 1 1 0.1570 0.6177 0.2253
chr8 141496488 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 315 103 212 98 0 1 0 4 0 0 212 0 0 0.9515 0.0000 0.0000 102.000 0.16 1.00 -0.84 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0203 0.9797 0.0000 0 0 0.6544 0.3456 0.0000 0 0 0.8993 0.1007 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 482 134 348 58 1 29 3 43 0 0 345 0 3 0.4328 0.0000 0.0086 3.621 1.74 5.16 -3.42 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4225 0.5216 0.0559 1 1 0.4208 0.5190 0.0602 1 1 0.4178 0.5160 0.0662
chr8 143440216 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 394 152 242 111 6 27 0 8 0 0 242 0 0 0.7303 0.0000 0.0000 4.593 0.23 3.00 -2.77 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0645 0.9355 0.0000 0 0 0.6321 0.3679 0.0000
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 371 70 301 44 1 5 0 20 0 0 300 0 1 0.6286 0.0000 0.0033 13.000 2.86 4.85 -1.99 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7905 0.2027 0.0068 1 0 0.7784 0.2135 0.0081 1 0 0.7614 0.2286 0.0100
chr8 144513027 T TGGTGCA 0.500000 0.100 1 6 2 1495 348 1147 174 0 43 0 131 0 0 1131 0 16 0.5000 0.0000 0.0139 7.093 0.45 5.87 -5.42 68 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6052 0.3921 0.0027 1 0 0.6083 0.3883 0.0034 1 0 0.6105 0.3850 0.0045
chr8 144522517 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 1 536 168 368 158 1 3 0 6 0 0 368 0 0 0.9405 0.0000 0.0000 55.000 0.58 6.50 -5.92 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0054 0.9946 0.0000 0 0 0.8258 0.1742 0.0000 0 0 0.9795 0.0205 0.0000
chr8 144846107 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 476 219 257 196 1 11 0 11 0 0 257 0 0 0.8950 0.0000 0.0000 18.909 0.36 2.82 -2.46 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1331 0.8669 0.0000 0 0 0.9240 0.0760 0.0000
chr9 116848 T TA 0.003653 0.100 1 1 1 676 193 483 105 0 6 2 80 0 0 478 0 5 0.5440 0.0000 0.0104 31.167 0.27 1.50 -1.23 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7056 0.2944 0.0001 1 0 0.7057 0.2942 0.0001 1 0 0.7051 0.2948 0.0001
chr9 117363 T TC 0.002993 0.100 1 1 1 835 138 697 69 12 8 1 48 0 0 695 0 2 0.5000 0.0000 0.0029 15.625 1.46 4.71 -3.24 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8997 0.1003 0.0000 1 0 0.8940 0.1060 0.0000 1 0 0.8858 0.1142 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 987 330 657 232 7 65 3 23 0 0 657 0 0 0.7030 0.0000 0.0000 4.077 0.18 3.04 -2.86 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0360 0.9640 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 371 105 266 0 1 22 1 81 0 0 258 0 8 0.0000 0.0000 0.0301 3.727 7.22 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0753 0.9247 2 2 0.0000 0.0307 0.9693 2 2 0.0000 0.0234 0.9766
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 793 194 599 164 0 26 0 4 0 0 596 0 3 0.8454 0.0000 0.0050 6.462 0.20 12.50 -12.30 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.6765 0.3235 0.0000 0 0 0.9697 0.0303 0.0000
chr9 35906601 A ACCC 0.500000 0.100 1 3 2 764 255 509 28 28 19 86 94 0 0 509 0 0 0.1098 0.0000 0.0000 11.722 0.86 3.68 -2.82 12 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr9 35906602 C CCCCCACCGCCACCAT 0.500000 0.100 1 15 1 764 254 510 86 3 41 2 122 0 0 510 0 0 0.3386 0.0000 0.0000 5.195 3.63 9.53 -5.90 34 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0008 0.1439 0.8554 1 2 0.0010 0.1510 0.8480 1 2 0.0014 0.1615 0.8371
chr9 38411406 GCGGTCAT G 0.500000 0.100 1 -7 1 230 103 127 65 0 3 0 35 0 0 125 0 2 0.6311 0.0000 0.0157 33.333 0.11 8.43 -8.32 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8268 0.1700 0.0032 1 0 0.8162 0.1799 0.0039 1 0 0.8010 0.1938 0.0051
chr9 38411418 A AT 0.500000 0.100 1 1 3 230 105 125 69 0 0 0 36 0 0 122 0 3 0.6571 0.0000 0.0240 105.000 0.10 8.22 -8.12 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8502 0.1476 0.0022 1 0 0.8400 0.1572 0.0028 1 0 0.8254 0.1709 0.0037
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 326 50 276 19 0 0 0 31 0 0 275 0 1 0.3800 0.0000 0.0036 50.000 0.53 1.39 -0.86 19 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0426 0.3969 0.5605 1 2 0.0463 0.4025 0.5512 1 2 0.0515 0.4100 0.5385
chr9 66987534 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 1053 195 858 184 3 3 0 5 0 0 858 0 0 0.9436 0.0000 0.0000 64.000 0.50 1.20 -0.70 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1735 0.8265 0.0000 0 0 0.9824 0.0176 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 401 128 273 72 0 0 0 56 0 0 268 0 5 0.5625 0.0000 0.0183 128.000 0.07 13.77 -13.70 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4160 0.5370 0.0470 1 1 0.4159 0.5330 0.0511 1 1 0.4149 0.5281 0.0570
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 710 147 563 67 0 16 0 64 0 0 552 0 11 0.4558 0.0000 0.0195 8.188 0.16 9.94 -9.77 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0678 0.6012 0.3310 1 1 0.0727 0.5933 0.3340 1 1 0.0795 0.5834 0.3371
chr9 77384631 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 449 169 280 133 1 22 2 11 0 0 280 0 0 0.7870 0.0000 0.0000 6.682 0.27 3.18 -2.91 91 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.1416 0.8584 0.0000
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 494 145 349 84 1 3 0 57 0 0 348 0 1 0.5793 0.0000 0.0029 47.333 0.33 3.32 -2.98 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7795 0.2168 0.0037 1 0 0.7702 0.2253 0.0045 1 0 0.7569 0.2373 0.0058
chr9 88130024 A AAGG 0.500000 0.100 1 3 1 1042 258 784 227 1 15 0 15 0 0 783 0 1 0.8798 0.0000 0.0013 16.200 0.43 3.40 -2.97 89 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 0 0.6888 0.3112 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 210 74 136 0 0 3 0 71 0 0 131 0 5 0.0000 0.0000 0.0368 23.667 3.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0203 0.9797 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 316 92 224 26 4 23 6 33 0 0 222 0 2 0.2826 0.0000 0.0089 3.000 0.12 3.76 -3.64 8 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0551 0.4619 0.4829 1 2 0.0592 0.4636 0.4772 1 2 0.0650 0.4659 0.4690
chr9 92474742 C CTCATCA 0.500000 0.100 1 6 2 316 92 224 30 0 29 0 33 0 0 222 0 2 0.3261 0.0000 0.0089 2.172 0.70 4.36 -3.66 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1192 0.5480 0.3328 1 1 0.1237 0.5443 0.3320 1 1 0.1298 0.5396 0.3306
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 473 185 288 0 0 4 2 179 0 0 288 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 45.250 8.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 743 295 448 177 0 4 0 114 0 0 447 0 1 0.6000 0.0000 0.0022 72.750 0.24 3.46 -3.23 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9825 0.0175 0.0000 1 0 0.9801 0.0199 0.0000 1 0 0.9763 0.0237 0.0000
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 368 102 266 0 0 12 2 88 0 0 266 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.417 5.59 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0101 0.9899 2 2 0.0000 0.0110 0.9890 2 2 0.0000 0.0125 0.9875
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 842 153 689 0 0 37 0 116 0 1 682 1 5 0.0000 0.0000 0.0102 3.135 6.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 482 132 350 72 0 0 0 60 0 0 350 0 0 0.5455 0.0000 0.0000 132.000 0.26 2.70 -2.44 46 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4433 0.5156 0.0411 1 1 0.4423 0.5128 0.0449 1 1 0.4399 0.5096 0.0504
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 828 176 652 99 0 2 0 75 0 0 650 0 2 0.5625 0.0000 0.0031 87.000 0.22 4.63 -4.40 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6458 0.3459 0.0082 1 0 0.6406 0.3497 0.0097 1 0 0.6326 0.3554 0.0119
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 756 182 574 81 0 4 2 95 0 0 573 0 1 0.4451 0.0000 0.0017 44.000 0.19 2.86 -2.68 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0194 0.4744 0.5062 1 2 0.0220 0.4724 0.5056 1 2 0.0258 0.4706 0.5036
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 285 105 180 0 0 3 1 101 0 0 178 0 2 0.0000 0.0000 0.0111 34.000 4.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr9 116154344 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 2 710 183 527 67 2 39 4 71 0 1 517 0 9 0.3661 0.0000 0.0190 3.667 0.85 3.55 -2.70 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0305 0.5051 0.4644 1 1 0.0339 0.5023 0.4638 1 1 0.0387 0.4992 0.4620
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 463 131 332 72 0 17 1 41 0 0 332 0 0 0.5496 0.0000 0.0000 7.125 0.64 5.80 -5.17 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8509 0.1470 0.0021 1 0 0.8410 0.1564 0.0026 1 0 0.8266 0.1699 0.0035
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 713 159 554 130 3 9 0 17 0 0 552 0 2 0.8176 0.0000 0.0036 16.444 0.60 6.18 -5.58 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0032 0.9968 0.0000
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 501 114 387 96 0 8 0 10 0 0 387 0 0 0.8421 0.0000 0.0000 13.250 0.53 1.50 -0.97 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.1494 0.8506 0.0000
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 480 164 316 15 3 17 55 74 0 0 315 0 1 0.0915 0.0000 0.0032 8.529 0.20 3.84 -3.64 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9897 0.0103
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 2 482 165 317 16 4 77 10 58 0 0 317 0 0 0.0970 0.0000 0.0000 1.093 0.94 5.98 -5.05 4 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0002 0.0439 0.9560 1 2 0.0002 0.2292 0.7706 2 1 0.0000 0.8908 0.1091
chr9 128825027 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 249 87 162 47 0 2 0 38 0 0 161 0 1 0.5402 0.0000 0.0062 42.500 0.28 1.16 -0.88 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3873 0.5336 0.0791 1 1 0.3856 0.5306 0.0837 1 1 0.3829 0.5270 0.0901
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 508 168 340 65 0 4 0 99 0 0 337 0 3 0.3869 0.0000 0.0088 41.000 0.26 3.31 -3.05 23 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0006 0.1038 0.8956 1 2 0.0008 0.1114 0.8878 1 2 0.0011 0.1226 0.8763
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 485 156 329 81 0 9 0 66 0 0 323 0 6 0.5192 0.0000 0.0182 16.333 0.26 7.53 -7.27 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3444 0.5978 0.0578 1 1 0.3475 0.5899 0.0625 1 1 0.3508 0.5801 0.0691
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 444 107 337 42 3 29 0 33 2 0 332 1 2 0.3925 0.0059 0.0148 2.690 1.19 3.82 -2.63 10 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4805 0.4686 0.0509 1 0 0.4754 0.4696 0.0549 1 1 0.4682 0.4712 0.0606
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 542 130 412 124 1 0 0 5 0 0 412 0 0 0.9538 0.0000 0.0000 129.000 1.66 4.60 -2.94 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 0 0.7159 0.2841 0.0000 0 0 0.9455 0.0545 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 267 118 149 63 0 1 0 54 0 0 148 0 1 0.5339 0.0000 0.0067 117.000 1.51 1.48 0.03 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3547 0.5726 0.0726 1 1 0.3558 0.5668 0.0775 1 1 0.3564 0.5595 0.0841
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 267 118 149 63 0 1 0 54 0 0 148 0 1 0.5339 0.0000 0.0067 117.000 1.51 1.48 0.03 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3547 0.5726 0.0726 1 1 0.3558 0.5668 0.0775 1 1 0.3564 0.5595 0.0841
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 284 116 168 18 0 5 0 93 0 0 166 0 2 0.1552 0.0000 0.0119 22.200 0.67 2.04 -1.38 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010
chr9 137228812 CCT C 0.500000 0.100 1 -2 4 458 104 354 59 0 0 0 45 1 0 352 0 1 0.5673 0.0028 0.0056 104.000 0.32 2.44 -2.12 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5257 0.4415 0.0328 1 0 0.5205 0.4434 0.0361 1 0 0.5128 0.4462 0.0410
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 458 119 339 4 0 11 2 102 1 0 330 0 8 0.0336 0.0029 0.0265 9.727 0.75 13.27 -12.52 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9956 0.0044 2 2 0.0000 0.4343 0.5657 2 2 0.0000 0.0980 0.9020
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 211 106 105 3 3 21 0 79 0 0 105 0 0 0.0283 0.0000 0.0000 4.250 0.33 3.08 -2.74 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8755 0.1245 2 2 0.0000 0.4595 0.5405
chr10 5102144 T TA 0.000084 0.100 1 1 3 414 114 300 73 0 1 0 40 0 0 300 0 0 0.6404 0.0000 0.0000 113.000 0.36 1.25 -0.89 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9380 0.0620 0.0000 1 0 0.9329 0.0671 0.0000 1 0 0.9254 0.0746 0.0000
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 763 158 605 91 0 8 0 59 0 1 600 0 4 0.5759 0.0000 0.0083 18.750 0.42 8.44 -8.02 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8869 0.1130 0.0001 1 0 0.8814 0.1184 0.0002 1 0 0.8734 0.1263 0.0002
chr10 12100187 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 135 64 71 44 0 0 0 20 0 0 71 0 0 0.6875 0.0000 0.0000 64.000 0.27 3.15 -2.88 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7923 0.2009 0.0068 1 0 0.7801 0.2118 0.0080 1 0 0.7629 0.2270 0.0100
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 232 82 150 78 0 0 0 4 0 0 150 0 0 0.9512 0.0000 0.0000 82.000 0.10 4.00 -3.90 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0304 0.9696 0.0000 0 0 0.7484 0.2516 0.0000 0 0 0.9353 0.0647 0.0000
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 879 205 674 2 0 23 1 179 0 0 655 0 19 0.0098 0.0000 0.0282 7.913 5.50 5.64 -0.14 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 635 120 515 4 0 5 0 111 0 0 511 0 4 0.0333 0.0000 0.0078 23.000 1.50 3.94 -2.44 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9833 0.0167 2 2 0.0000 0.3926 0.6074 2 2 0.0000 0.1229 0.8771
chr10 26567284 CCCG C 0.002025 0.100 1 -3 5 417 108 309 43 1 27 0 37 0 0 307 1 1 0.3981 0.0000 0.0065 3.000 0.74 3.41 -2.66 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5214 0.4782 0.0004 1 0 0.5243 0.4753 0.0004 1 0 0.5277 0.4719 0.0004
chr10 27046519 CACT C 0.000055 0.100 1 -3 2 145 49 96 42 0 2 0 5 0 0 96 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 23.500 0.81 4.00 -3.19 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6976 0.3024 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 298 108 190 13 0 0 0 95 0 0 190 0 0 0.1204 0.0000 0.0000 108.000 0.08 2.11 -2.03 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 497 136 361 127 0 5 0 4 0 0 361 0 0 0.9338 0.0000 0.0000 26.200 0.43 1.00 -0.57 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1633 0.8367 0.0000 0 0 0.9411 0.0589 0.0000 0 0 0.9862 0.0138 0.0000
chr10 27414021 CG C 0.000587 0.100 1 -1 2 685 183 502 87 1 7 0 88 0 0 502 0 0 0.4754 0.0000 0.0000 25.143 0.11 1.16 -1.04 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2959 0.7040 0.0002 1 1 0.3097 0.6901 0.0002 1 1 0.3275 0.6723 0.0002
chr10 51697903 CTGTATACCTCCTCCT C 0.001304 0.100 1 -15 5 854 230 624 192 0 32 0 6 0 0 622 0 2 0.8348 0.0000 0.0032 6.188 0.24 13.00 -12.76 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2060 0.7940 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 53807071 A AGTT 0.002532 0.100 1 3 2 295 88 207 50 0 11 0 27 0 0 207 0 0 0.5682 0.0000 0.0000 7.000 0.24 3.19 -2.95 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8698 0.1301 0.0000 1 0 0.8629 0.1370 0.0000 1 0 0.8532 0.1468 0.0000
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.100 1 -3 1 544 138 406 69 2 4 0 63 0 0 406 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 33.250 0.38 3.03 -2.65 1 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5285 0.4711 0.0004 1 0 0.5334 0.4662 0.0004 1 0 0.5391 0.4605 0.0004
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 97 51 46 30 0 0 0 21 0 0 46 0 0 0.5882 0.0000 0.0000 51.000 0.77 6.48 -5.71 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6055 0.3761 0.0183 1 0 0.6012 0.3793 0.0195 1 0 0.5952 0.3837 0.0211
chr10 67884904 GGCGGCGGCCAGGGGCTGCCCGGGT G 0.000206 0.100 1 -24 2 542 206 336 196 0 6 0 4 0 2 334 0 0 0.9515 0.0000 0.0060 33.333 0.63 25.25 -24.62 44 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 73240978 AGCGGAG A 0.006364 0.100 1 -6 3 209 117 92 113 1 0 0 3 0 0 92 0 0 0.9658 0.0000 0.0000 117.000 0.27 16.67 -16.39 61 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9851 0.0149 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr10 73240989 ACCAGTCTCT A 0.006454 0.100 1 -9 1 210 116 94 112 0 1 0 3 0 0 94 0 0 0.9655 0.0000 0.0000 115.000 0.29 16.67 -16.38 60 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9833 0.0167 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 408 104 304 1 0 21 1 81 0 0 304 0 0 0.0096 0.0000 0.0000 3.952 0.00 3.33 -3.33 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4220 0.5780 2 2 0.0000 0.1998 0.8002 2 2 0.0000 0.1553 0.8447
chr10 75028901 G GGAAGAGGAA 0.002182 0.100 1 9 1 663 143 520 61 0 39 0 43 0 0 520 0 0 0.4266 0.0000 0.0000 2.667 0.74 7.00 -6.26 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7810 0.2189 0.0000 1 0 0.7758 0.2242 0.0001 1 0 0.7683 0.2316 0.0001
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 498 198 300 92 5 23 0 78 0 0 298 0 2 0.4646 0.0000 0.0067 7.391 0.76 5.77 -5.01 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6633 0.3364 0.0002 1 0 0.6645 0.3353 0.0003 1 0 0.6651 0.3346 0.0003
chr10 75401354 T TCCG 0.000180 0.100 1 3 2 498 183 315 126 10 33 1 13 0 0 315 0 0 0.6885 0.0000 0.0000 4.594 3.46 2.77 0.69 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8100 0.1900 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr10 75782995 TC T 0.002156 0.100 1 -1 1 189 93 96 51 0 0 0 42 0 0 96 0 0 0.5484 0.0000 0.0000 93.000 0.10 1.00 -0.90 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6067 0.3931 0.0002 1 0 0.6067 0.3931 0.0002 1 0 0.6062 0.3936 0.0003
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 193 48 145 22 2 3 5 16 0 0 144 0 1 0.4583 0.0000 0.0069 14.333 0.59 1.19 -0.60 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4643 0.5025 0.0332 1 1 0.4655 0.5005 0.0339 1 1 0.4670 0.4981 0.0349
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 607 133 474 5 0 4 1 123 0 0 466 0 8 0.0376 0.0000 0.0169 32.250 0.00 6.02 -6.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 2 0.0000 0.4502 0.5498 2 2 0.0000 0.1065 0.8935
chr10 89738577 AAAG A 0.001385 0.100 1 -3 4 417 90 327 40 0 11 0 39 0 0 327 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 7.182 1.23 4.41 -3.19 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4285 0.5710 0.0005 1 1 0.4347 0.5648 0.0005 1 1 0.4425 0.5570 0.0005
chr10 94949281 GA G 0.000392 0.100 1 -1 1 132 63 69 60 0 0 0 3 0 0 69 0 0 0.9524 0.0000 0.0000 63.000 0.15 1.00 -0.85 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9861 0.0139 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 527 172 355 86 0 1 0 85 0 0 352 0 3 0.5000 0.0000 0.0085 171.000 0.14 3.08 -2.94 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2543 0.7396 0.0061 1 1 0.2682 0.7255 0.0063 1 1 0.2863 0.7071 0.0066
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.100 1 18 1 461 145 316 110 0 26 0 9 0 0 315 0 1 0.7586 0.0000 0.0032 4.577 0.64 10.44 -9.81 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2740 0.7260 0.0000 0 0 0.9568 0.0432 0.0000
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 360 159 201 139 0 4 0 16 0 0 200 0 1 0.8742 0.0000 0.0050 38.750 0.97 2.88 -1.90 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0499 0.9501 0.0000
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 221 83 138 39 0 3 3 38 0 0 136 0 2 0.4699 0.0000 0.0145 26.667 0.26 3.24 -2.98 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0693 0.5453 0.3853 1 1 0.0718 0.5403 0.3879 1 1 0.0752 0.5341 0.3907
chr10 115171343 CTT C 0.004437 0.100 1 -2 1 255 54 201 52 0 0 0 2 0 0 201 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 54.000 0.27 1.50 -1.23 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9742 0.0258 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr10 116471844 GGC G 0.001719 0.100 1 -2 4 143 77 66 69 1 2 0 5 0 0 66 0 0 0.8961 0.0000 0.0000 75.000 1.55 4.60 -3.05 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2289 0.7711 0.0000 0 0 0.9891 0.0109 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr10 116471848 G GAA 0.001728 0.100 1 2 1 143 72 71 29 36 1 1 5 0 0 71 0 0 0.4028 0.0000 0.0000 38.000 0.10 4.60 -4.50 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0426 0.9574 0.0000 0 0 0.9568 0.0432 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 330 81 249 22 5 12 8 34 0 2 245 1 1 0.2716 0.0000 0.0161 5.083 1.55 2.82 -1.28 20 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0323 0.3849 0.5828 1 2 0.0354 0.3901 0.5746 1 2 0.0398 0.3970 0.5631
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.100 1 21 2 626 110 516 60 0 5 0 45 0 0 498 0 18 0.5455 0.0000 0.0349 21.000 0.57 14.47 -13.90 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2448 0.6905 0.0647 1 1 0.2550 0.6791 0.0659 1 1 0.2683 0.6645 0.0672
chr10 131311321 C CGCG 0.026812 0.100 1 3 1 380 128 252 109 1 12 0 6 0 0 252 0 0 0.8516 0.0000 0.0000 10.545 1.51 5.83 -4.32 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0144 0.9856 0.0000 0 0 0.9315 0.0685 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 359 107 252 56 0 8 0 43 0 0 252 0 0 0.5234 0.0000 0.0000 12.375 0.09 1.05 -0.96 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5050 0.4560 0.0390 1 0 0.5000 0.4573 0.0426 1 0 0.4928 0.4594 0.0479
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.100 1 -12 1 716 177 539 86 1 15 0 75 0 0 534 0 5 0.4859 0.0000 0.0093 10.800 0.38 11.52 -11.14 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4534 0.5407 0.0059 1 1 0.4619 0.5318 0.0063 1 1 0.4722 0.5209 0.0069
chr11 627108 G GAGC 0.003229 0.100 1 3 2 325 55 270 21 0 10 0 24 0 0 270 0 0 0.3818 0.0000 0.0000 4.500 1.05 3.67 -2.62 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3664 0.6313 0.0023 1 1 0.3732 0.6246 0.0022 1 1 0.3819 0.6158 0.0022
chr11 721683 CGCCAGCAGGTGCAGGGGACAGGGACGGGGCCGGCAGGTGCAGGGGACGGG C 0.000018 0.100 1 -50 2 603 161 442 120 2 38 0 1 0 1 441 0 0 0.7453 0.0000 0.0023 3.211 1.26 51.00 -49.74 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 986 197 789 10 1 77 0 109 0 0 789 0 0 0.0508 0.0000 0.0000 1.558 0.90 7.95 -7.05 0 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.8301 0.1699
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 342 99 243 0 0 3 0 96 0 0 238 1 4 0.0000 0.0000 0.0206 32.000 3.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0074 0.9926
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 754 267 487 247 2 5 0 13 0 0 487 0 0 0.9251 0.0000 0.0000 52.400 0.30 1.23 -0.93 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2013 0.7987 0.0000 0 0 0.9770 0.0230 0.0000
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 226 102 124 41 0 0 7 54 0 0 123 0 1 0.4020 0.0000 0.0081 96.000 0.10 1.94 -1.85 21 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0165 0.3362 0.6473 1 2 0.0188 0.3430 0.6382 1 2 0.0222 0.3523 0.6255
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 226 104 122 41 1 55 1 6 0 0 122 0 0 0.3942 0.0000 0.0000 12.250 0.10 2.00 -1.90 19 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.4824 0.4580 0.0596 1 0 0.4760 0.4601 0.0639 1 0 0.4671 0.4631 0.0698
chr11 4587230 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 1172 286 886 274 0 2 0 10 1 0 885 0 0 0.9580 0.0011 0.0011 142.000 0.47 2.80 -2.33 114 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.9567 0.0433 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 610 124 486 103 0 0 0 21 0 0 486 0 0 0.8306 0.0000 0.0000 124.000 0.27 3.43 -3.16 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 818 203 615 9 0 3 1 190 0 0 614 0 1 0.0443 0.0000 0.0016 66.667 0.00 1.22 -1.22 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.4941 0.5059 2 2 0.0000 0.0281 0.9719
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 464 124 340 114 0 4 0 6 0 0 340 0 0 0.9194 0.0000 0.0000 30.000 1.22 1.83 -0.61 80 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.3368 0.6632 0.0000 0 0 0.8438 0.1562 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 1015 230 785 11 0 5 1 213 0 0 764 0 21 0.0478 0.0000 0.0268 44.800 0.27 5.92 -5.65 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.4952 0.5048 2 2 0.0000 0.0129 0.9871
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 706 173 533 9 0 8 2 154 0 0 533 0 0 0.0520 0.0000 0.0000 20.625 0.11 1.51 -1.40 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8558 0.1442 2 2 0.0000 0.1426 0.8574
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.100 1 2 1 553 155 398 85 1 4 0 65 0 0 398 0 0 0.5484 0.0000 0.0000 37.750 0.12 2.09 -1.97 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6498 0.3401 0.0101 1 0 0.6433 0.3450 0.0118 1 0 0.6336 0.3520 0.0143
chr11 5454410 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 413 93 320 38 1 2 0 52 0 0 320 0 0 0.4086 0.0000 0.0000 45.500 0.76 1.40 -0.64 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0392 0.4445 0.5163 1 2 0.0428 0.4467 0.5105 1 2 0.0480 0.4497 0.5022
chr11 5516206 AGAAGGCAACCCAT A 0.500000 0.100 1 -13 1 582 146 436 128 0 11 0 7 0 0 436 0 0 0.8767 0.0000 0.0000 12.273 0.23 9.43 -9.20 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2573 0.7427 0.0000 0 0 0.8479 0.1521 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 723 138 585 0 0 11 0 127 0 0 567 0 18 0.0000 0.0000 0.0308 11.545 9.65 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr11 6795057 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 1 716 158 558 140 1 8 0 9 0 0 558 0 0 0.8861 0.0000 0.0000 18.750 0.24 1.67 -1.42 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0734 0.9266 0.0000 0 0 0.7440 0.2560 0.0000
chr11 7639816 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 3 238 97 141 89 1 3 0 4 0 0 141 0 0 0.9175 0.0000 0.0000 31.333 0.27 3.00 -2.73 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 0 0.5585 0.4415 0.0000 0 0 0.8580 0.1420 0.0000
chr11 8921341 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 190 85 105 80 0 0 0 5 0 0 105 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 85.000 0.38 2.00 -1.62 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.2097 0.7903 0.0000 0 0 0.6622 0.3378 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 293 154 139 64 1 19 2 68 0 0 137 0 2 0.4156 0.0000 0.0144 7.105 0.50 3.87 -3.37 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0775 0.6095 0.3131 1 1 0.0826 0.6012 0.3163 1 1 0.0896 0.5907 0.3197
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 204 98 106 87 1 1 0 9 0 0 106 0 0 0.8878 0.0000 0.0000 96.000 0.26 3.78 -3.51 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 1 0.1806 0.8194 0.0000
chr11 34632610 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 131 69 62 35 0 1 0 33 0 0 62 0 0 0.5072 0.0000 0.0000 68.000 0.03 1.15 -1.12 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2524 0.5778 0.1698 1 1 0.2543 0.5720 0.1737 1 1 0.2565 0.5647 0.1788
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 765 247 518 9 0 10 0 228 0 0 513 0 5 0.0364 0.0000 0.0097 23.700 0.11 3.62 -3.51 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 2 0.0000 0.1120 0.8880 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr11 54603834 GGACCCCAGTGATGGGCTGGCAGTGATGGT G 0.500000 0.100 1 -29 5 401 118 283 72 1 5 0 40 0 0 277 0 6 0.6102 0.0000 0.0212 22.600 1.39 23.43 -22.04 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7990 0.1972 0.0038 1 0 0.7888 0.2066 0.0046 1 0 0.7743 0.2198 0.0059
chr11 55839334 TATCTC T 0.500000 0.100 1 -5 2 679 176 503 167 1 1 0 7 0 0 503 0 0 0.9489 0.0000 0.0000 175.000 0.74 4.43 -3.69 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.7189 0.2811 0.0000 0 0 0.9749 0.0251 0.0000
chr11 56252727 T TGCTTCCTACGTTGCTG 0.500000 0.100 1 16 1 775 192 583 157 0 29 0 6 0 0 583 0 0 0.8177 0.0000 0.0000 5.621 0.21 14.50 -14.29 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 0 0.8105 0.1895 0.0000 0 0 0.9774 0.0226 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 994 202 792 0 0 4 0 198 0 0 782 0 10 0.0000 0.0000 0.0126 49.500 2.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 626 134 492 124 1 2 0 7 0 0 492 0 0 0.9254 0.0000 0.0000 66.000 0.26 1.14 -0.88 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2297 0.7703 0.0000 0 0 0.8277 0.1723 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 80 40 40 21 0 1 0 18 0 0 40 0 0 0.5250 0.0000 0.0000 39.000 0.29 2.06 -1.77 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2985 0.5369 0.1647 1 1 0.2978 0.5341 0.1681 1 1 0.2968 0.5306 0.1727
chr11 60852693 T TGCG 0.500000 0.100 1 3 2 474 94 380 50 0 10 0 34 1 0 378 0 1 0.5319 0.0026 0.0053 8.400 0.34 3.68 -3.34 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6001 0.3747 0.0252 1 0 0.5916 0.3804 0.0280 1 0 0.5796 0.3881 0.0323
chr11 62146758 A AGCGGGAGCAGGAGCG 0.500000 0.100 1 15 1 713 187 526 7 1 42 7 130 1 1 493 0 31 0.0374 0.0019 0.0627 3.381 7.57 7.04 0.53 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7916 0.2084 2 2 0.0000 0.0976 0.9024
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 254 89 165 29 0 18 1 41 0 0 165 0 0 0.3258 0.0000 0.0000 3.944 0.21 2.90 -2.70 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0411 0.4212 0.5377 1 2 0.0448 0.4251 0.5301 1 2 0.0500 0.4303 0.5196
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 291 111 180 49 2 18 0 42 0 0 180 0 0 0.4414 0.0000 0.0000 5.167 0.82 3.07 -2.26 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4062 0.5255 0.0683 1 1 0.4042 0.5230 0.0728 1 1 0.4011 0.5199 0.0791
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 911 180 731 0 0 56 2 122 0 0 670 0 61 0.0000 0.0000 0.0834 2.196 6.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1103 228 875 55 2 122 3 46 0 0 837 1 37 0.2412 0.0000 0.0434 0.844 0.98 8.39 -7.41 25 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0022 0.1725 0.8253 1 2 0.0028 0.1813 0.8159 1 2 0.0037 0.1939 0.8024
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 970 282 688 180 0 64 0 38 0 0 671 0 17 0.6383 0.0000 0.0247 3.406 0.27 21.21 -20.94 80 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9970 0.0030 0.0000 0 1 0.0059 0.9941 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 920 234 686 10 0 3 1 220 0 0 686 0 0 0.0427 0.0000 0.0000 76.667 0.20 2.25 -2.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.4046 0.5954 2 2 0.0000 0.0134 0.9866
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 799 175 624 83 1 23 0 68 0 0 622 0 2 0.4743 0.0000 0.0032 6.609 0.29 2.87 -2.58 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4706 0.5001 0.0293 1 1 0.4698 0.4976 0.0326 1 1 0.4678 0.4948 0.0374
chr11 73660839 A AGGTAAGTCT 0.500000 0.100 1 9 2 232 104 128 60 0 2 3 39 0 0 123 0 5 0.5769 0.0000 0.0391 51.000 0.50 9.03 -8.53 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5052 0.4583 0.0365 1 0 0.5006 0.4593 0.0401 1 0 0.4939 0.4609 0.0452
chr11 73660841 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 233 102 131 58 2 7 2 33 0 0 126 0 5 0.5686 0.0000 0.0382 13.143 0.52 10.67 -10.15 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6857 0.3017 0.0126 1 0 0.6758 0.3097 0.0145 1 0 0.6619 0.3207 0.0174
chr11 75402313 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 314 136 178 85 0 0 0 51 0 0 178 0 0 0.6250 0.0000 0.0000 136.000 0.20 3.41 -3.21 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8809 0.1181 0.0010 1 0 0.8721 0.1266 0.0013 1 0 0.8592 0.1390 0.0019
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 330 132 198 80 0 4 0 48 0 0 195 0 3 0.6061 0.0000 0.0152 32.000 0.16 15.35 -15.19 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8212 0.1762 0.0026 1 0 0.8114 0.1854 0.0032 1 0 0.7974 0.1984 0.0043
chr11 78210013 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 644 108 536 59 0 2 0 47 0 0 534 0 2 0.5463 0.0000 0.0037 53.000 0.32 4.66 -4.34 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4170 0.5256 0.0574 1 1 0.4154 0.5228 0.0618 1 1 0.4127 0.5194 0.0679
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1229 353 876 5 6 58 118 166 0 0 873 1 2 0.0142 0.0000 0.0034 5.000 0.60 7.70 -7.10 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9483 0.0517 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 116858282 TTGCTGTTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 640 180 460 149 4 20 0 7 0 0 460 0 0 0.8278 0.0000 0.0000 8.421 0.76 3.71 -2.96 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.5359 0.4641 0.0000 0 0 0.9472 0.0528 0.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 721 216 505 0 0 23 0 193 0 0 505 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.391 10.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 284 127 157 69 0 2 0 56 0 0 157 0 0 0.5433 0.0000 0.0000 62.500 0.29 7.79 -7.50 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4776 0.4861 0.0363 1 1 0.4750 0.4851 0.0399 1 1 0.4707 0.4842 0.0451
chr11 119312056 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 858 176 682 95 0 2 0 79 0 0 682 0 0 0.5398 0.0000 0.0000 87.000 0.60 3.15 -2.55 15 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4992 0.4799 0.0209 1 0 0.4986 0.4778 0.0236 1 0 0.4967 0.4757 0.0277
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 393 129 264 0 0 7 3 119 0 0 264 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 17.143 5.91 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0027 0.9973
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.100 1 -6 1 229 94 135 45 0 14 0 35 0 0 135 0 0 0.4787 0.0000 0.0000 5.714 0.20 5.63 -5.43 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4471 0.4913 0.0616 1 1 0.4430 0.4911 0.0659 1 1 0.4372 0.4909 0.0719
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 394 115 279 56 0 19 0 40 0 0 276 0 3 0.4870 0.0000 0.0108 5.053 0.95 4.12 -3.18 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5071 0.4544 0.0385 1 0 0.5021 0.4558 0.0422 1 0 0.4947 0.4579 0.0474
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 116 65 51 31 0 2 0 32 0 0 51 0 0 0.4769 0.0000 0.0000 31.500 0.23 2.19 -1.96 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1913 0.5754 0.2333 1 1 0.1947 0.5698 0.2355 1 1 0.1990 0.5627 0.2383
chr12 165530 G GAGTGTAAGTCTTTGACAGCC 0.014581 0.100 1 20 1 383 93 290 48 0 16 0 29 0 0 282 0 8 0.5161 0.0000 0.0276 4.812 0.15 8.69 -8.54 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6583 0.3406 0.0011 1 0 0.6558 0.3430 0.0012 1 0 0.6522 0.3465 0.0013
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 346 104 242 53 0 1 0 50 0 0 239 1 2 0.5096 0.0000 0.0124 103.000 0.17 1.80 -1.63 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2755 0.6230 0.1015 1 1 0.2820 0.6139 0.1041 1 1 0.2901 0.6024 0.1075
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 345 146 199 138 2 0 0 6 0 0 199 0 0 0.9452 0.0000 0.0000 146.000 1.01 1.50 -0.49 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.5592 0.4408 0.0000 0 0 0.9290 0.0710 0.0000
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 528 139 389 40 4 32 1 62 0 0 386 0 3 0.2878 0.0000 0.0077 3.344 0.23 3.05 -2.82 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0113 0.3041 0.6846 1 2 0.0132 0.3127 0.6741 1 2 0.0161 0.3247 0.6593
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 429 140 289 0 0 34 7 99 0 0 286 0 3 0.0000 0.0000 0.0104 3.212 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 240 85 155 0 0 6 0 79 0 0 154 0 1 0.0000 0.0000 0.0065 13.167 4.71 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0178 0.9822 2 2 0.0000 0.0199 0.9801
chr12 10723069 G GGGT 0.002430 0.100 1 3 1 290 104 186 89 4 8 0 3 0 0 186 0 0 0.8558 0.0000 0.0000 12.000 0.44 3.00 -2.56 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9836 0.0164 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.100 1 -9 1 680 182 498 93 0 23 0 66 0 0 496 0 2 0.5110 0.0000 0.0040 6.913 0.27 8.65 -8.38 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8387 0.1610 0.0002 1 0 0.8338 0.1660 0.0003 1 0 0.8265 0.1731 0.0004
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 272 149 123 59 1 11 2 76 0 0 122 0 1 0.3960 0.0000 0.0081 12.545 2.24 3.84 -1.60 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0075 0.3044 0.6881 1 2 0.0086 0.3085 0.6829 1 2 0.0103 0.3146 0.6751
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.100 1 -2 1 491 112 379 54 0 1 3 54 0 0 378 0 1 0.4821 0.0000 0.0026 111.000 0.41 2.09 -1.69 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2309 0.6839 0.0853 1 1 0.2405 0.6733 0.0862 1 1 0.2530 0.6597 0.0873
chr12 29433780 GTTTTC G 0.000480 0.100 1 -5 1 95 50 45 29 0 0 0 21 0 0 44 0 1 0.5800 0.0000 0.0222 50.000 0.38 5.43 -5.05 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6090 0.3909 0.0001 1 0 0.6071 0.3928 0.0001 1 0 0.6044 0.3956 0.0001
chr12 40482547 CCAT C 0.001528 0.100 1 -3 1 1143 196 947 181 0 10 0 5 0 0 947 0 0 0.9235 0.0000 0.0000 18.600 0.54 3.20 -2.66 93 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9900 0.0100 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1476 292 1184 87 3 133 0 69 1 1 1133 1 48 0.2979 0.0008 0.0431 1.188 1.34 4.54 -3.19 13 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0032 0.2686 0.7282 1 2 0.0039 0.2735 0.7226 1 2 0.0050 0.2810 0.7140
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 937 241 696 222 0 4 0 15 0 0 696 0 0 0.9212 0.0000 0.0000 59.250 0.55 1.07 -0.51 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0285 0.9715 0.0000 0 0 0.9231 0.0769 0.0000
chr12 49330292 GA G 0.000352 0.100 1 -1 1 782 165 617 93 0 2 8 62 0 0 612 1 4 0.5636 0.0000 0.0081 163.000 0.72 9.74 -9.02 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7449 0.2551 0.0000 1 0 0.7427 0.2572 0.0000 1 0 0.7392 0.2608 0.0000
chr12 49330294 GCATAACTC G 0.000352 0.100 1 -8 1 789 172 617 102 0 1 1 68 0 0 606 4 7 0.5930 0.0000 0.0178 171.000 0.77 9.13 -8.36 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7899 0.2101 0.0000 1 0 0.7868 0.2132 0.0000 1 0 0.7821 0.2179 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 931 236 695 117 0 12 1 106 0 0 693 0 2 0.4958 0.0000 0.0029 18.583 0.74 14.35 -13.61 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2736 0.6805 0.0460 1 1 0.2825 0.6669 0.0506 1 1 0.2934 0.6496 0.0570
chr12 52680016 TCCACCAAAGCCACCA T 0.002049 0.100 1 -15 2 1110 320 790 156 0 46 2 116 0 0 789 0 1 0.4875 0.0000 0.0013 5.957 0.32 10.04 -9.72 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9110 0.0890 0.0000 1 0 0.9077 0.0923 0.0000 1 0 0.9026 0.0974 0.0000
chr12 52768988 C CGCT 0.004583 0.100 1 3 2 516 147 369 5 70 19 3 50 0 0 367 1 1 0.0340 0.0000 0.0054 7.000 1.60 3.82 -2.22 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7391 0.2607 0.0001 1 0 0.7356 0.2643 0.0001 1 0 0.7303 0.2695 0.0002
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.100 1 21 2 467 103 364 58 0 22 0 23 0 0 353 0 11 0.5631 0.0000 0.0302 3.682 0.14 10.96 -10.82 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8679 0.1318 0.0003 1 0 0.8611 0.1385 0.0004 1 0 0.8514 0.1481 0.0005
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1127 292 835 116 1 64 1 110 0 0 830 0 5 0.3973 0.0000 0.0060 3.547 0.35 13.67 -13.32 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2559 0.7342 0.0099 1 1 0.2714 0.7180 0.0106 1 1 0.2916 0.6969 0.0116
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 345 88 257 52 0 0 0 36 0 0 256 1 0 0.5909 0.0000 0.0039 88.000 0.40 1.69 -1.29 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6561 0.3293 0.0146 1 0 0.6496 0.3342 0.0162 1 0 0.6405 0.3409 0.0186
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 549 118 431 110 0 0 0 8 0 0 431 0 0 0.9322 0.0000 0.0000 118.000 0.32 4.25 -3.93 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.8933 0.1067 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 347 99 248 88 0 0 0 11 0 0 248 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 99.000 1.09 3.55 -2.45 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.0828 0.9172 0.0000
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1056 301 755 0 0 23 3 275 0 1 751 0 3 0.0000 0.0000 0.0053 12.087 3.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 142 61 81 28 2 2 1 28 0 0 81 0 0 0.4590 0.0000 0.0000 29.000 0.07 1.21 -1.14 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3279 0.5611 0.1110 1 1 0.3310 0.5562 0.1128 1 1 0.3349 0.5500 0.1151
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 472 140 332 48 8 33 0 51 0 0 329 0 3 0.3429 0.0000 0.0090 3.242 0.48 3.00 -2.52 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2225 0.6272 0.1503 1 1 0.2266 0.6179 0.1555 1 1 0.2317 0.6062 0.1621
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 426 112 314 0 0 12 3 97 0 0 308 0 6 0.0000 0.0000 0.0191 8.250 3.86 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0058 0.9942
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 1775 450 1325 332 15 84 4 15 2 2 1315 1 5 0.7378 0.0015 0.0075 4.570 1.92 4.53 -2.61 86 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.7631 0.2369 0.0000
chr12 108623665 GAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -30 2 1737 393 1344 172 8 39 12 162 1 1 1333 5 4 0.4377 0.0007 0.0082 8.795 0.59 4.15 -3.56 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0684 0.8526 0.0790 1 1 0.0768 0.8351 0.0881 1 1 0.0884 0.8108 0.1008
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 598 158 440 92 0 2 0 64 0 0 425 0 15 0.5823 0.0000 0.0341 78.000 0.25 9.05 -8.80 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4253 0.5424 0.0323 1 1 0.4270 0.5372 0.0358 1 1 0.4281 0.5309 0.0410
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 655 197 458 6 5 26 8 152 0 0 457 0 1 0.0305 0.0000 0.0022 6.577 1.33 4.18 -2.85 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9645 0.0355 2 2 0.0000 0.2898 0.7102
chr12 111598977 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 670 214 456 49 148 12 0 5 1 1 454 0 0 0.2290 0.0022 0.0044 200.000 2.33 3.00 -0.67 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2355 0.7645 0.0000 0 0 0.9854 0.0146 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr12 111598978 T TGC 0.500000 0.100 1 2 1 671 214 457 187 14 8 0 5 2 0 455 0 0 0.8738 0.0044 0.0044 25.000 3.95 3.00 0.95 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3056 0.6944 0.0000 0 0 0.9913 0.0087 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 202 103 99 0 0 4 0 99 0 0 99 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 24.750 2.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0081 0.9919
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 202 90 112 5 0 13 2 70 0 0 110 0 2 0.0556 0.0000 0.0179 5.923 0.60 5.90 -5.30 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.8359 0.1641 2 2 0.0000 0.4057 0.5943
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 404 126 278 0 0 6 2 118 0 0 269 0 9 0.0000 0.0000 0.0324 19.833 5.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 331 72 259 0 0 5 0 67 0 0 249 0 10 0.0000 0.0000 0.0386 13.400 11.13 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0209 0.9791 2 2 0.0000 0.0233 0.9767
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 543 168 375 145 5 12 1 5 0 0 375 0 0 0.8631 0.0000 0.0000 13.000 1.83 2.00 -0.17 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0050 0.9950 0.0000 0 0 0.7644 0.2356 0.0000 0 0 0.9693 0.0307 0.0000
chr12 122995576 TGCCACCACC T 0.500000 0.100 1 -9 1 407 159 248 145 0 4 1 9 0 0 248 0 0 0.9119 0.0000 0.0000 38.750 0.28 7.67 -7.39 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0489 0.9511 0.0000 0 0 0.6943 0.3057 0.0000
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 666 185 481 83 0 18 0 84 0 0 473 0 8 0.4486 0.0000 0.0166 9.278 0.36 8.17 -7.81 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0541 0.6234 0.3224 1 1 0.0589 0.6138 0.3273 1 1 0.0656 0.6017 0.3327
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 260 96 164 42 1 32 2 19 0 0 161 0 3 0.4375 0.0000 0.0183 2.000 0.12 2.95 -2.83 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6964 0.2881 0.0155 1 0 0.6848 0.2975 0.0177 1 0 0.6688 0.3103 0.0209
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 228 72 156 0 0 2 0 70 0 0 149 0 7 0.0000 0.0000 0.0449 35.000 8.61 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0209 0.9791 2 2 0.0000 0.0233 0.9767
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 615 188 427 70 13 44 6 55 0 0 423 0 4 0.3723 0.0000 0.0094 3.488 0.43 3.85 -3.43 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5261 0.4509 0.0231 1 0 0.5230 0.4511 0.0259 1 0 0.5180 0.4519 0.0300
chr13 38690377 G GGGCTCT 0.000196 0.100 1 6 1 688 121 567 61 0 4 1 55 0 0 564 1 2 0.5041 0.0000 0.0053 29.250 0.34 6.11 -5.76 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4043 0.5957 0.0001 1 1 0.4132 0.5868 0.0001 1 1 0.4243 0.5756 0.0001
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 175 64 111 32 0 2 0 30 0 0 107 0 4 0.5000 0.0000 0.0360 31.000 0.19 4.67 -4.48 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3551 0.6231 0.0217 1 1 0.3624 0.6158 0.0218 1 1 0.3718 0.6063 0.0219
chr13 46553473 C CCCA 0.000465 0.100 1 3 4 277 98 179 87 2 4 0 5 0 0 179 0 0 0.8878 0.0000 0.0000 23.500 0.61 3.60 -2.99 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7503 0.2497 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr13 51111048 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 654 219 435 116 0 4 0 99 0 0 434 0 1 0.5297 0.0000 0.0023 53.750 0.23 1.16 -0.93 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4498 0.5313 0.0189 1 1 0.4532 0.5253 0.0215 1 1 0.4563 0.5183 0.0254
chr13 60528441 GATA G 0.187645 0.100 1 -3 4 412 99 313 51 0 4 0 44 0 0 312 0 1 0.5152 0.0000 0.0032 23.750 0.47 3.09 -2.62 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4634 0.5040 0.0326 1 1 0.4656 0.5001 0.0343 1 1 0.4680 0.4954 0.0366
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 629 157 472 64 2 33 5 53 1 1 464 0 6 0.4076 0.0021 0.0169 3.697 1.05 6.55 -5.50 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3761 0.5966 0.0272 1 1 0.3841 0.5874 0.0285 1 1 0.3940 0.5758 0.0301
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 109 51 58 5 0 3 0 43 0 0 57 0 1 0.0980 0.0000 0.0172 16.000 0.00 3.56 -3.56 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9923 0.0077
chr13 77599337 G GTC 0.000205 0.100 1 2 2 196 82 114 79 1 1 0 1 0 0 114 0 0 0.9634 0.0000 0.0000 81.000 0.11 2.00 -1.89 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 688 103 585 0 1 18 2 82 0 1 576 1 7 0.0000 0.0000 0.0154 4.667 4.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 469 74 395 5 3 23 2 41 0 2 391 1 1 0.0676 0.0000 0.0101 2.174 0.60 4.85 -4.25 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9948 0.0052 2 1 0.0000 0.9367 0.0633
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 617 162 455 135 1 16 0 10 0 3 452 0 0 0.8333 0.0000 0.0066 9.125 1.48 5.80 -4.32 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0241 0.9759 0.0000 0 0 0.5815 0.4185 0.0000
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 239 71 168 64 2 3 0 2 0 0 168 0 0 0.9014 0.0000 0.0000 22.667 1.20 7.50 -6.30 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2531 0.7469 0.0000 0 0 0.7624 0.2376 0.0000 0 0 0.8719 0.1281 0.0000
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -15 1 204 66 138 7 0 3 0 56 0 1 135 0 2 0.1061 0.0000 0.0217 21.000 0.14 9.55 -9.41 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9922 0.0078 2 1 0.0000 0.8728 0.1272
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 203 64 139 2 0 18 1 43 0 0 137 0 2 0.0312 0.0000 0.0144 2.556 2.00 11.21 -9.21 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.8909 0.1091 2 2 0.0000 0.4598 0.5402 2 2 0.0000 0.2807 0.7193
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.100 1 4 1 383 87 296 5 0 3 0 79 0 0 293 0 3 0.0575 0.0000 0.0101 28.000 0.40 3.84 -3.44 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.7735 0.2265 2 2 0.0000 0.3165 0.6835
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 541 119 422 0 0 3 0 116 0 0 418 0 4 0.0000 0.0000 0.0095 38.667 3.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 1276 309 967 210 0 8 0 91 0 0 966 0 1 0.6796 0.0000 0.0010 37.625 1.29 2.54 -1.25 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 816 217 599 1 0 24 0 192 0 0 598 0 1 0.0046 0.0000 0.0017 8.042 0.00 1.31 -1.31 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 472 136 336 86 0 2 0 48 0 0 332 0 4 0.6324 0.0000 0.0119 67.000 0.41 19.04 -18.63 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8937 0.1056 0.0008 1 0 0.8858 0.1132 0.0010 1 0 0.8742 0.1244 0.0014
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 378 85 293 46 0 3 0 36 0 0 293 0 0 0.5412 0.0000 0.0000 27.333 0.33 1.08 -0.76 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3150 0.5835 0.1015 1 1 0.3111 0.5807 0.1082 1 1 0.3054 0.5771 0.1175
chr14 20383624 TGCAGC T 0.000003 0.100 1 -5 1 615 127 488 67 0 3 0 57 0 0 478 0 10 0.5276 0.0000 0.0205 41.333 0.66 8.40 -7.75 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3413 0.6587 0.0000 1 1 0.3526 0.6474 0.0000 1 1 0.3670 0.6330 0.0000
chr14 20383633 C CATGT 0.000003 0.100 1 4 3 614 131 483 70 1 3 0 57 0 1 471 0 11 0.5344 0.0000 0.0248 42.667 0.70 8.42 -7.72 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4234 0.5766 0.0000 1 1 0.4326 0.5674 0.0000 1 1 0.4439 0.5561 0.0000
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 445 109 336 5 0 4 0 100 0 0 336 0 0 0.0459 0.0000 0.0000 26.250 0.00 5.20 -5.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.7825 0.2175 2 2 0.0000 0.3336 0.6664
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 664 211 453 97 3 14 1 96 0 0 453 0 0 0.4597 0.0000 0.0000 13.929 0.64 4.22 -3.58 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3215 0.6668 0.0117 1 1 0.3347 0.6528 0.0125 1 1 0.3515 0.6351 0.0135
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 313 49 264 18 0 6 1 24 0 0 263 0 1 0.3673 0.0000 0.0038 7.167 5.50 3.50 2.00 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1217 0.5287 0.3496 1 1 0.1274 0.5282 0.3445 1 1 0.1351 0.5274 0.3374
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 331 52 279 26 2 3 18 3 0 0 277 2 0 0.5000 0.0000 0.0072 16.000 2.58 5.33 -2.76 18 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3934 0.5113 0.0953 1 1 0.3923 0.5093 0.0984 1 1 0.3905 0.5069 0.1026
chr14 23275617 TTCCTCC T 0.001309 0.100 1 -6 1 333 53 280 29 0 4 1 19 0 0 279 0 1 0.5472 0.0000 0.0036 16.333 2.62 5.89 -3.27 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6430 0.3568 0.0002 1 0 0.6399 0.3600 0.0002 1 0 0.6354 0.3644 0.0002
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 303 76 227 41 0 2 0 33 0 0 227 0 0 0.5395 0.0000 0.0000 37.000 0.73 1.18 -0.45 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5797 0.4100 0.0104 1 0 0.5785 0.4105 0.0110 1 0 0.5766 0.4115 0.0119
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 371 106 265 3 0 25 2 76 0 0 261 0 4 0.0283 0.0000 0.0151 3.240 0.00 4.09 -4.09 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9699 0.0301 2 1 0.0000 0.5210 0.4790 2 2 0.0000 0.2558 0.7442
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 371 106 265 4 0 63 2 37 0 0 262 1 2 0.0377 0.0000 0.0113 0.661 0.75 4.97 -4.22 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9381 0.0619 2 1 0.0000 0.7501 0.2499
chr14 24409748 A ACAGTTTCCAAAGCACCTG 0.001352 0.100 1 18 1 755 185 570 88 1 33 1 62 0 0 546 0 24 0.4757 0.0000 0.0421 4.606 0.33 9.60 -9.27 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3392 0.6605 0.0003 1 1 0.3523 0.6474 0.0003 1 1 0.3689 0.6308 0.0003
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 666 130 536 104 1 17 0 8 0 0 535 0 1 0.8000 0.0000 0.0019 6.647 0.99 8.62 -7.63 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.0957 0.9043 0.0000
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.100 1 2 1 494 114 380 106 0 3 0 5 0 0 380 0 0 0.9298 0.0000 0.0000 37.000 0.95 2.60 -1.65 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4805 0.5195 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 729 183 546 10 0 27 3 143 0 1 541 0 4 0.0546 0.0000 0.0092 5.741 0.40 7.06 -6.66 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8756 0.1244 2 2 0.0000 0.1082 0.8918
chr14 73719350 TTAC T 0.000003 0.100 1 -3 1 268 90 178 50 0 0 0 40 0 0 178 0 0 0.5556 0.0000 0.0000 90.000 0.10 3.38 -3.27 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6341 0.3659 0.0000 1 0 0.6330 0.3670 0.0000 1 0 0.6310 0.3690 0.0000
chr14 77027418 TTGC T 0.008855 0.100 1 -3 1 467 124 343 1 1 30 54 38 0 0 339 1 3 0.0081 0.0000 0.0117 3.033 3.00 3.71 -0.71 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9725 0.0275 2 1 0.0000 0.8731 0.1269 2 1 0.0000 0.7895 0.2105
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 467 124 343 6 3 56 5 54 0 0 339 1 3 0.0484 0.0000 0.0117 1.182 0.83 6.69 -5.85 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.9386 0.0614
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 457 104 353 11 46 7 34 6 0 2 350 0 1 0.1058 0.0000 0.0085 21.667 2.45 3.17 -0.71 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7879 0.2054 0.0067 1 0 0.7768 0.2154 0.0078 1 0 0.7611 0.2293 0.0097
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 484 154 330 0 0 21 3 130 0 0 328 0 2 0.0000 0.0000 0.0061 6.238 3.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 291 98 193 53 0 12 0 33 0 0 189 0 4 0.5408 0.0000 0.0207 7.167 0.21 8.61 -8.40 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6264 0.3533 0.0203 1 0 0.6186 0.3588 0.0226 1 0 0.6076 0.3663 0.0261
chr14 104707525 ACCCCAC A 0.082909 0.100 1 -6 2 477 89 388 34 1 20 1 33 0 0 385 0 3 0.3820 0.0000 0.0077 3.778 1.00 9.18 -8.18 32 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3192 0.6334 0.0474 1 1 0.3268 0.6255 0.0477 1 1 0.3367 0.6154 0.0479
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.100 1 -12 2 487 92 395 38 1 20 0 33 0 0 393 0 2 0.4130 0.0000 0.0051 3.789 1.03 8.33 -7.31 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4619 0.5031 0.0351 1 1 0.4637 0.4999 0.0364 1 1 0.4656 0.4961 0.0383
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 419 109 310 0 0 16 3 90 0 0 308 0 2 0.0000 0.0000 0.0065 5.750 3.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0209 0.9791 2 2 0.0000 0.0230 0.9770 2 2 0.0000 0.0263 0.9737
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 321 85 236 42 2 8 2 31 1 0 235 0 0 0.4941 0.0042 0.0042 9.625 2.36 3.84 -1.48 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6261 0.3576 0.0163 1 0 0.6213 0.3609 0.0178 1 0 0.6145 0.3657 0.0198
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 628 84 544 0 1 7 2 74 0 4 461 57 22 0.0000 0.0000 0.1526 11.000 4.14 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 456 120 336 86 0 1 0 33 0 0 336 0 0 0.7167 0.0000 0.0000 119.000 0.13 2.00 -1.87 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9852 0.0148 0.0000 1 0 0.9827 0.0173 0.0000 1 0 0.9784 0.0216 0.0000
chr15 30614474 GCAGGACCAC G 0.001011 0.100 1 -9 1 274 73 201 66 0 4 0 3 0 0 200 0 1 0.9041 0.0000 0.0050 17.250 0.35 9.00 -8.65 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7972 0.2028 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 212 97 115 1 0 7 55 34 0 0 114 1 0 0.0103 0.0000 0.0087 5.833 1.00 1.32 -0.32 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.2066 0.7934 2 2 0.0000 0.0849 0.9151 2 2 0.0000 0.0649 0.9351
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 212 98 114 1 1 40 1 55 0 0 113 0 1 0.0102 0.0000 0.0088 1.487 1.00 2.05 -1.05 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7045 0.2955 2 2 0.0000 0.2268 0.7732 2 2 0.0000 0.1218 0.8782
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 644 161 483 2 0 38 2 119 0 0 480 0 3 0.0124 0.0000 0.0062 3.211 0.50 3.96 -3.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0665 0.9335 2 2 0.0000 0.0079 0.9921 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr15 34038912 C CCCGCCGCCGCCT 0.002022 0.100 1 12 4 268 92 176 35 0 15 0 42 0 0 168 0 8 0.3804 0.0000 0.0455 5.133 0.57 10.48 -9.90 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1288 0.8661 0.0051 1 1 0.1391 0.8559 0.0049 1 1 0.1536 0.8418 0.0047
chr15 35084193 TCA T 0.022764 0.100 1 -2 2 616 124 492 79 0 1 0 44 0 0 490 0 2 0.6371 0.0000 0.0041 123.000 1.43 3.16 -1.73 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9330 0.0669 0.0000 1 0 0.9279 0.0721 0.0000 1 0 0.9203 0.0797 0.0001
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 433 146 287 130 1 4 0 11 0 0 287 0 0 0.8904 0.0000 0.0000 35.500 1.22 2.09 -0.87 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0113 0.9887 0.0000 0 1 0.4989 0.5011 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 450 103 347 4 0 11 1 87 0 0 343 1 3 0.0388 0.0000 0.0115 9.200 3.25 4.08 -0.83 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9796 0.0204 2 2 0.0000 0.3404 0.6596 2 2 0.0000 0.0976 0.9024
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 740 152 588 136 1 10 0 5 0 0 588 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 14.200 1.76 5.00 -3.24 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4423 0.5577 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 371 125 246 67 1 0 1 56 0 0 245 0 1 0.5360 0.0000 0.0041 125.000 0.30 3.48 -3.18 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4961 0.4768 0.0271 1 0 0.4971 0.4737 0.0293 1 0 0.4975 0.4701 0.0324
chr15 85247041 TCCC T 0.001521 0.100 1 -3 1 205 87 118 54 1 0 0 32 0 0 114 1 3 0.6207 0.0000 0.0339 87.000 0.19 4.41 -4.22 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8088 0.1911 0.0000 1 0 0.8027 0.1973 0.0000 1 0 0.7940 0.2059 0.0000
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 1020 289 731 137 6 57 3 86 0 0 730 0 1 0.4740 0.0000 0.0014 4.035 0.34 2.98 -2.63 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9818 0.0182 0.0000 1 0 0.9796 0.0204 0.0000 1 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 807 188 619 5 0 31 1 151 0 0 592 0 27 0.0266 0.0000 0.0436 5.065 1.20 14.13 -12.93 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9058 0.0942 2 2 0.0000 0.0348 0.9652 2 2 0.0000 0.0056 0.9944
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 329 90 239 0 0 5 1 84 0 0 227 0 12 0.0000 0.0000 0.0502 16.800 6.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 247 86 161 34 0 20 0 32 0 0 154 0 7 0.3953 0.0000 0.0435 3.300 2.47 9.28 -6.81 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2859 0.6912 0.0229 1 1 0.2954 0.6819 0.0227 1 1 0.3078 0.6697 0.0225
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 28 18 10 13 0 0 0 5 0 0 10 0 0 0.7222 0.0000 0.0000 18.000 0.54 1.20 -0.66 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5912 0.3803 0.0285 1 0 0.5636 0.4076 0.0288 1 0 0.5245 0.4489 0.0266
chr16 286888 C CA 0.009296 0.100 1 1 1 555 97 458 61 0 3 0 33 0 0 457 0 1 0.6289 0.0000 0.0022 31.333 0.34 1.36 -1.02 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9004 0.0996 0.0000 1 0 0.8941 0.1059 0.0000 1 0 0.8850 0.1149 0.0001
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 329 93 236 43 0 0 0 50 0 0 236 0 0 0.4624 0.0000 0.0000 93.000 1.05 3.16 -2.11 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1343 0.6188 0.2470 1 1 0.1413 0.6124 0.2463 1 1 0.1508 0.6042 0.2450
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 261 74 187 8 0 2 0 64 0 0 184 0 3 0.1081 0.0000 0.0160 36.000 0.88 14.73 -13.86 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9853 0.0147
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 419 73 346 0 0 4 2 67 0 0 346 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 17.000 6.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 419 73 346 0 0 4 2 67 0 0 346 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 17.000 6.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2179036 C CGCG 0.006791 0.100 1 3 6 534 126 408 48 3 39 1 35 3 1 403 0 1 0.3810 0.0074 0.0123 2.289 2.38 3.63 -1.25 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7813 0.2185 0.0002 1 0 0.7757 0.2242 0.0002 1 0 0.7677 0.2321 0.0002
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.100 1 -3 2 256 88 168 48 0 1 0 39 0 0 167 0 1 0.5455 0.0000 0.0060 87.000 1.06 3.05 -1.99 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5780 0.4176 0.0044 1 0 0.5783 0.4170 0.0047 1 0 0.5783 0.4167 0.0051
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 396 106 290 41 0 2 0 63 0 0 289 0 1 0.3868 0.0000 0.0034 104.000 0.15 2.89 -2.74 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0048 0.2115 0.7837 1 2 0.0057 0.2198 0.7745 1 2 0.0071 0.2315 0.7614
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 342 113 229 58 8 40 0 7 2 0 227 0 0 0.5133 0.0087 0.0087 1.825 1.59 3.14 -1.56 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0777 0.9223 0.0000 0 0 0.5960 0.4040 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 205 62 143 24 0 0 1 37 0 0 143 0 0 0.3871 0.0000 0.0000 62.000 0.25 1.97 -1.72 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.2535 0.7463 1 2 0.0002 0.2593 0.7405 1 2 0.0002 0.2674 0.7324
chr16 18543716 GA G 0.002566 0.100 1 -1 1 345 163 182 107 2 2 1 51 0 0 182 0 0 0.6564 0.0000 0.0000 80.500 0.14 1.14 -1.00 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9923 0.0077 0.0000 1 0 0.9910 0.0090 0.0000 1 0 0.9889 0.0111 0.0000
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.100 1 -1 1 310 189 121 94 0 3 1 91 0 0 120 0 1 0.4974 0.0000 0.0083 62.000 0.99 1.10 -0.11 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2826 0.6968 0.0206 1 1 0.2957 0.6827 0.0217 1 1 0.3124 0.6644 0.0232
chr16 23636312 AAC A 0.500000 0.100 1 -2 3 411 114 297 52 0 10 1 51 0 0 297 0 0 0.4561 0.0000 0.0000 10.400 0.37 2.37 -2.01 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1877 0.6248 0.1875 1 1 0.1922 0.6157 0.1921 1 1 0.1980 0.6042 0.1979
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.100 1 -12 1 647 239 408 127 2 13 0 97 0 0 408 0 0 0.5314 0.0000 0.0000 17.308 0.25 9.04 -8.79 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8632 0.1364 0.0003 1 0 0.8586 0.1410 0.0004 1 0 0.8517 0.1477 0.0006
chr16 28342756 G GCCTCTTGGGTTTGGGTGATTGTTCCACCTCATCCACCCTCCA 0.000004 0.100 1 42 2 410 227 183 157 8 10 5 47 0 0 183 0 0 0.6916 0.0000 0.0000 21.700 0.21 3.15 -2.94 75 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 1 0.0915 0.9085 0.0000
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.100 1 -27 1 903 205 698 0 0 58 7 140 0 0 696 1 1 0.0000 0.0000 0.0029 2.483 12.51 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr16 28593494 G GT 0.000605 0.100 1 1 3 421 110 311 52 0 4 0 54 0 0 311 0 0 0.4727 0.0000 0.0000 26.500 0.23 1.31 -1.08 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3276 0.6721 0.0003 1 1 0.3381 0.6617 0.0003 1 1 0.3515 0.6482 0.0003
chr16 30953571 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 529 136 393 122 1 3 0 10 0 0 392 0 1 0.8971 0.0000 0.0025 44.000 1.15 2.00 -0.85 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 1 0.2502 0.7498 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 146 82 64 48 0 3 1 30 0 0 64 0 0 0.5854 0.0000 0.0000 26.333 0.21 2.17 -1.96 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6325 0.3457 0.0218 1 0 0.6228 0.3528 0.0244 1 0 0.6092 0.3624 0.0284
chr16 48143986 CTT C 0.500000 0.100 1 -2 2 194 107 87 64 0 2 0 41 0 0 87 0 0 0.5981 0.0000 0.0000 52.500 0.19 2.22 -2.03 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7392 0.2531 0.0077 1 0 0.7288 0.2621 0.0091 1 0 0.7141 0.2747 0.0112
chr16 51141744 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 949 251 698 190 10 40 0 11 0 0 698 0 0 0.7570 0.0000 0.0000 5.175 0.53 3.09 -2.56 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1438 0.8562 0.0000 0 0 0.9299 0.0701 0.0000
chr16 67195890 A ACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 9 2 504 202 302 85 2 52 2 61 0 1 289 0 12 0.4208 0.0000 0.0430 2.865 0.66 6.85 -6.19 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4312 0.5351 0.0337 1 1 0.4322 0.5304 0.0373 1 1 0.4325 0.5250 0.0425
chr16 67652328 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 601 152 449 138 1 3 0 10 0 0 448 1 0 0.9079 0.0000 0.0022 49.667 0.31 3.00 -2.69 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0203 0.9797 0.0000 0 0 0.5436 0.4564 0.0000
chr16 67842908 GCAGCAGCAGCAA G 0.500000 0.100 1 -12 1 1053 339 714 293 7 27 4 8 0 0 714 0 0 0.8643 0.0000 0.0000 11.654 1.63 11.00 -9.37 81 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0169 0.9831 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1051 320 731 127 5 44 12 132 0 0 731 0 0 0.3969 0.0000 0.0000 6.250 0.24 3.55 -3.31 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0250 0.6710 0.3041 1 1 0.0284 0.6573 0.3143 1 1 0.0336 0.6400 0.3265
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 292 133 159 107 0 22 0 4 0 0 159 0 0 0.8045 0.0000 0.0000 5.045 0.15 5.25 -5.10 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0313 0.9687 0.0000 0 0 0.7476 0.2524 0.0000 0 0 0.9325 0.0675 0.0000
chr16 71933451 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 323 125 198 114 2 2 0 7 0 0 198 0 0 0.9120 0.0000 0.0000 61.500 0.19 3.00 -2.81 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1599 0.8401 0.0000 0 0 0.7570 0.2430 0.0000
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 131 69 62 4 0 2 0 63 0 0 59 0 3 0.0580 0.0000 0.0484 33.500 0.25 3.90 -3.65 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9960 0.0040 2 1 0.0000 0.7236 0.2764 2 2 0.0000 0.3463 0.6537
chr16 72797458 C CTTG 0.500000 0.100 1 3 1 637 155 482 105 9 32 1 8 1 0 481 0 0 0.6774 0.0021 0.0021 3.812 0.32 2.88 -2.55 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0530 0.9470 0.0000 0 0 0.5862 0.4138 0.0000
chr16 84463730 T TAGTGGA 0.500000 0.100 1 6 1 223 111 112 99 0 6 0 6 0 0 112 0 0 0.8919 0.0000 0.0000 17.500 0.20 6.17 -5.96 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1910 0.8090 0.0000 0 0 0.7217 0.2783 0.0000
chr16 85656394 CGAGCGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 489 108 381 93 2 11 0 2 0 0 381 0 0 0.8611 0.0000 0.0000 8.818 1.17 6.00 -4.83 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5979 0.4021 0.0000 0 0 0.9318 0.0682 0.0000 0 0 0.9653 0.0347 0.0000
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 457 114 343 36 2 31 0 45 1 0 338 0 4 0.3158 0.0029 0.0146 2.677 2.89 5.71 -2.82 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0605 0.5013 0.4382 1 1 0.0648 0.5003 0.4348 1 1 0.0709 0.4993 0.4299
chr16 87604287 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 457 120 337 61 7 25 6 21 0 1 334 1 1 0.5083 0.0000 0.0089 3.800 4.18 3.05 1.13 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9406 0.0591 0.0004 1 0 0.9336 0.0659 0.0005 1 0 0.9232 0.0761 0.0007
chr16 88431998 ATGC A 0.500000 0.100 1 -3 1 815 161 654 89 0 6 0 66 1 0 650 0 3 0.5528 0.0015 0.0061 25.833 0.78 3.26 -2.48 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6390 0.3509 0.0101 1 0 0.6332 0.3551 0.0118 1 0 0.6244 0.3613 0.0143
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 700 158 542 0 0 5 11 142 0 0 529 3 10 0.0000 0.0000 0.0240 37.500 7.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 696 152 544 0 2 6 17 127 0 0 532 5 7 0.0000 0.0000 0.0221 23.667 7.91 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 699 149 550 0 1 1 4 143 0 2 532 4 12 0.0000 0.0000 0.0327 148.000 7.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0218 0.9782 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 738 137 601 4 0 1 0 132 0 0 600 0 1 0.0292 0.0000 0.0017 136.000 0.00 7.11 -7.11 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8895 0.1105 2 2 0.0000 0.0841 0.9159 2 2 0.0000 0.0201 0.9799
chr16 88714227 GGTGTGGGTGT G 0.500000 0.100 1 -10 1 745 138 607 2 1 21 107 7 0 0 607 0 0 0.0145 0.0000 0.0000 5.476 1.00 11.43 -10.43 2 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2396 0.7604 2 2 0.0000 0.0334 0.9666 2 2 0.0000 0.0169 0.9831
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.100 1 6 2 743 183 560 81 1 24 0 77 0 0 552 0 8 0.4426 0.0000 0.0143 6.625 0.28 5.61 -5.33 37 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1121 0.6847 0.2032 1 1 0.1184 0.6719 0.2098 1 1 0.1267 0.6554 0.2179
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 160 71 89 38 0 4 0 29 0 0 89 0 0 0.5352 0.0000 0.0000 16.750 0.84 4.03 -3.19 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4336 0.4936 0.0728 1 1 0.4293 0.4935 0.0772 1 1 0.4232 0.4934 0.0834
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.100 1 -3 1 846 202 644 108 0 16 0 78 0 0 638 1 5 0.5347 0.0000 0.0093 11.625 0.32 3.28 -2.96 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7682 0.2299 0.0018 1 0 0.7641 0.2337 0.0022 1 0 0.7577 0.2395 0.0028
chr17 4933907 ACCACCCCAGAGCCCAC A 0.138018 0.100 1 -16 1 1214 234 980 190 16 14 6 8 0 0 980 0 0 0.8120 0.0000 0.0000 19.636 5.48 2.38 3.11 28 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4925 0.5075 0.0000 0 0 0.9848 0.0152 0.0000
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 787 154 633 9 79 5 0 61 0 0 632 0 1 0.0584 0.0000 0.0016 29.400 0.78 4.16 -3.39 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8040 0.1959 0.0001 1 0 0.7994 0.2005 0.0001 1 0 0.7926 0.2072 0.0001
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 726 209 517 76 6 49 1 77 0 0 514 0 3 0.3636 0.0000 0.0058 3.265 0.18 2.95 -2.76 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1199 0.6955 0.1846 1 1 0.1245 0.6824 0.1932 1 1 0.1303 0.6654 0.2043
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 586 168 418 156 0 5 0 7 0 0 418 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 32.600 0.12 3.43 -3.31 94 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.5839 0.4161 0.0000 0 0 0.9559 0.0441 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 400 92 308 40 0 5 0 47 1 0 307 0 0 0.4348 0.0032 0.0032 17.400 0.53 7.34 -6.82 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1013 0.5657 0.3330 1 1 0.1062 0.5606 0.3332 1 1 0.1127 0.5543 0.3330
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 550 218 332 87 3 27 4 97 0 0 332 0 0 0.3991 0.0000 0.0000 7.074 0.15 3.06 -2.91 53 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0369 0.5947 0.3685 1 1 0.0408 0.5862 0.3730 1 1 0.0464 0.5758 0.3777
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 920 251 669 215 1 4 21 10 0 0 669 0 0 0.8566 0.0000 0.0000 56.750 0.34 5.00 -4.66 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0302 0.9698 0.0000 0 0 0.7165 0.2835 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 921 248 673 209 5 24 2 8 0 0 673 0 0 0.8427 0.0000 0.0000 10.571 0.33 4.88 -4.54 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6568 0.3432 0.0000 0 0 0.9863 0.0137 0.0000
chr17 18778544 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 860 296 564 282 4 1 0 9 0 0 564 0 0 0.9527 0.0000 0.0000 295.000 0.32 1.00 -0.68 184 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 0 0.9911 0.0089 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 739 189 550 84 1 10 0 94 0 0 549 0 1 0.4444 0.0000 0.0018 17.900 1.32 4.10 -2.77 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0468 0.6113 0.3419 1 1 0.0512 0.6023 0.3465 1 1 0.0575 0.5910 0.3516
chr17 35479822 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 820 200 620 111 0 6 1 82 0 0 620 0 0 0.5550 0.0000 0.0000 32.333 0.32 1.22 -0.90 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7538 0.2433 0.0029 1 0 0.7468 0.2496 0.0036 1 0 0.7363 0.2590 0.0047
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 126 73 53 33 0 1 0 39 0 0 52 0 1 0.4521 0.0000 0.0189 72.000 0.09 1.26 -1.17 25 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0932 0.5336 0.3732 1 1 0.0978 0.5308 0.3714 1 1 0.1042 0.5273 0.3685
chr17 41084358 GGCCCCAGTGCTGCCAGTCTGTGTGCTGCCAACCCACCTGCTGTCGCCCCACCTGCTGTGAGACGACCTGCTGCCACCCTAGGTGCTGCATCTCCAGCTGCTGCCGCCCCAGCTGCTGTATGTCCAGCTGCTGCAA G 0.500000 0.100 1 -135 1 598 268 330 142 5 47 4 70 0 0 329 1 0 0.5299 0.0000 0.0030 4.681 1.62 3.19 -1.57 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9952 0.0048 0.0000 1 0 0.9942 0.0058 0.0000 1 0 0.9925 0.0075 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 527 127 400 56 0 5 0 66 0 0 400 0 0 0.4409 0.0000 0.0000 24.400 0.46 1.52 -1.05 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0554 0.5427 0.4019 1 1 0.0598 0.5386 0.4017 1 1 0.0659 0.5336 0.4005
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 569 116 453 2 3 9 3 99 1 1 424 1 26 0.0172 0.0022 0.0640 11.778 7.50 7.89 -0.39 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9873 0.0127 2 2 0.0000 0.2978 0.7022 2 2 0.0000 0.0593 0.9407
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 580 181 399 82 0 32 0 67 0 0 387 0 12 0.4530 0.0000 0.0301 4.656 0.50 13.51 -13.01 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2073 0.6783 0.1144 1 1 0.2136 0.6659 0.1206 1 1 0.2213 0.6499 0.1288
chr17 44399551 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 759 164 595 84 0 7 0 73 0 0 594 0 1 0.5122 0.0000 0.0017 22.429 0.32 3.19 -2.87 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3638 0.5861 0.0501 1 1 0.3667 0.5788 0.0545 1 1 0.3694 0.5698 0.0608
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1586 312 1274 168 0 2 0 142 1 0 1270 0 3 0.5385 0.0008 0.0031 155.000 0.27 3.30 -3.03 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5339 0.4615 0.0046 1 0 0.5395 0.4550 0.0056 1 0 0.5449 0.4480 0.0072
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 637 181 456 140 3 21 0 17 0 0 456 0 0 0.7735 0.0000 0.0000 7.619 0.95 2.94 -1.99 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0185 0.9815 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 234 78 156 0 0 6 0 72 0 0 152 0 4 0.0000 0.0000 0.0256 12.000 4.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0203 0.9797 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr17 47836758 AAGGAGCTGGAGC A 0.500000 0.100 1 -12 1 601 131 470 65 0 7 0 59 0 0 464 0 6 0.4962 0.0000 0.0128 17.714 0.38 11.03 -10.65 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1729 0.6542 0.1729 1 1 0.1784 0.6432 0.1784 1 1 0.1854 0.6292 0.1854
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 408 103 305 1 0 14 0 88 0 0 295 0 10 0.0097 0.0000 0.0328 6.357 0.00 7.32 -7.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0588 0.9412 2 2 0.0000 0.0213 0.9787 2 2 0.0000 0.0161 0.9839
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 901 250 651 225 1 11 0 13 0 0 651 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 21.727 0.24 3.23 -2.99 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0722 0.9278 0.0000 0 0 0.9323 0.0677 0.0000
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.100 1 3 2 515 120 395 51 4 20 0 45 0 0 389 0 6 0.4250 0.0000 0.0152 5.000 0.53 2.91 -2.38 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2660 0.6100 0.1240 1 1 0.2690 0.6019 0.1291 1 1 0.2724 0.5916 0.1360
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 398 140 258 8 0 26 2 104 0 0 257 0 1 0.0571 0.0000 0.0039 4.346 0.25 5.88 -5.62 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9600 0.0400 2 2 0.0000 0.4869 0.5131
chr17 65536436 ACGGGGGGTGGTG A 0.500000 0.100 1 -12 1 430 142 288 130 0 6 0 6 0 0 285 0 3 0.9155 0.0000 0.0104 22.667 0.31 10.17 -9.86 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0435 0.9565 0.0000 0 0 0.6299 0.3701 0.0000
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 382 152 230 90 1 16 0 45 0 0 230 0 0 0.5921 0.0000 0.0000 8.500 0.26 7.00 -6.74 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9607 0.0392 0.0001 1 0 0.9556 0.0442 0.0001 1 0 0.9479 0.0519 0.0002
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 288 82 206 65 1 9 0 7 2 0 204 0 0 0.7927 0.0097 0.0097 8.111 0.75 8.14 -7.39 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0170 0.9830 0.0000 0 1 0.2327 0.7673 0.0000
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.100 1 -2 3 325 97 228 84 0 2 0 11 0 0 227 0 1 0.8660 0.0000 0.0044 47.500 0.18 2.09 -1.91 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0259 0.9741 0.0000
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 126 59 67 34 0 3 1 21 0 0 66 0 1 0.5763 0.0000 0.0149 18.667 0.06 1.10 -1.04 14 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5000 0.4437 0.0563 1 0 0.4929 0.4467 0.0604 1 0 0.4831 0.4507 0.0662
chr17 74842534 ACTGTCT A 0.500000 0.100 1 -6 5 401 106 295 99 0 4 0 3 0 0 295 0 0 0.9340 0.0000 0.0000 25.500 1.32 6.00 -4.68 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1649 0.8351 0.0000 0 0 0.8520 0.1480 0.0000 0 0 0.9468 0.0532 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 561 109 452 0 1 4 1 103 0 0 432 0 20 0.0000 0.0000 0.0442 26.000 7.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0047 0.9953 2 2 0.0000 0.0042 0.9958
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.100 1 -54 1 299 96 203 69 3 4 1 19 0 0 203 0 0 0.7188 0.0000 0.0000 22.750 1.13 4.84 -3.71 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9343 0.0656 0.0000 0 1 0.2192 0.7808 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 1174 283 891 139 1 10 1 132 0 1 882 0 8 0.4912 0.0000 0.0101 27.300 0.49 2.39 -1.90 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0979 0.7989 0.1032 1 1 0.1065 0.7816 0.1119 1 1 0.1180 0.7584 0.1237
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 1332 305 1027 173 1 24 1 106 2 1 1006 0 18 0.5672 0.0019 0.0204 11.708 0.78 16.05 -15.27 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9522 0.0478 0.0000 1 0 0.9480 0.0519 0.0000 1 0 0.9417 0.0583 0.0001
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.100 1 -27 1 1395 262 1133 174 1 9 0 78 1 2 1098 1 31 0.6641 0.0009 0.0309 31.500 0.88 20.63 -19.75 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9888 0.0112 0.0000 1 0 0.9871 0.0129 0.0000 1 0 0.9842 0.0158 0.0000
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 2 605 190 415 175 2 4 0 9 0 0 415 0 0 0.9211 0.0000 0.0000 46.500 0.31 2.67 -2.36 83 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3219 0.6781 0.0000 0 0 0.9431 0.0569 0.0000
chr17 75616380 CAGGAGGAGG C 0.500000 0.100 1 -9 1 1063 275 788 206 3 51 5 10 1 0 786 1 0 0.7491 0.0013 0.0025 4.373 0.77 9.70 -8.93 102 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.5038 0.4962 0.0000
chr17 75896675 CCGGGGCCGGGAT C 0.500000 0.100 1 -12 4 537 156 381 132 0 17 0 7 0 0 380 0 1 0.8462 0.0000 0.0026 8.176 0.39 10.29 -9.89 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1273 0.8727 0.0000 0 0 0.7809 0.2191 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2229 527 1702 221 15 55 14 222 4 4 1678 4 12 0.4194 0.0024 0.0141 8.400 1.48 7.35 -5.88 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0208 0.8996 0.0796 1 1 0.0252 0.8834 0.0914 1 1 0.0318 0.8600 0.1081
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2168 546 1622 206 5 44 6 285 4 3 1442 18 155 0.3773 0.0025 0.1110 12.146 1.70 4.38 -2.68 26 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 13049812 GA G 0.001808 0.100 1 -1 1 324 102 222 53 1 2 1 45 0 0 221 0 1 0.5196 0.0000 0.0045 49.500 0.17 3.98 -3.81 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5603 0.4395 0.0002 1 0 0.5624 0.4373 0.0002 1 0 0.5647 0.4350 0.0003
chr18 13049814 GCA G 0.001808 0.100 1 -2 1 322 98 224 53 0 2 0 43 0 0 223 0 1 0.5408 0.0000 0.0045 96.000 0.17 4.12 -3.95 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5946 0.4052 0.0002 1 0 0.5953 0.4045 0.0002 1 0 0.5956 0.4042 0.0002
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 239 95 144 0 0 4 0 91 0 0 139 0 5 0.0000 0.0000 0.0347 22.750 3.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 116 58 58 50 0 2 0 6 0 0 58 0 0 0.8621 0.0000 0.0000 28.000 0.40 3.17 -2.77 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0200 0.9800 0.0000 0 1 0.1939 0.8061 0.0000
chr18 54224211 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 319 79 240 65 1 2 0 11 0 0 239 0 1 0.8228 0.0000 0.0042 38.500 0.66 3.45 -2.79 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0110 0.9890 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 244 141 103 0 0 5 1 135 0 0 103 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 27.200 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 832 200 632 188 0 4 0 8 0 0 631 0 1 0.9400 0.0000 0.0016 49.000 0.28 14.12 -13.84 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4519 0.5481 0.0000 0 0 0.9660 0.0340 0.0000
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 419 100 319 12 0 19 5 64 0 1 316 0 2 0.1200 0.0000 0.0094 4.211 2.75 4.72 -1.97 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9897 0.0103
chr18 63643565 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 369 112 257 63 0 2 0 47 0 0 257 0 0 0.5625 0.0000 0.0000 55.000 0.10 2.72 -2.63 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5733 0.4026 0.0240 1 0 0.5668 0.4063 0.0269 1 0 0.5574 0.4115 0.0310
chr18 63954437 AGATGGAGATATTCATC A 0.500000 0.100 1 -16 2 123 56 67 44 0 1 0 11 0 0 63 0 4 0.7857 0.0000 0.0597 55.000 0.43 16.45 -16.02 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8662 0.1310 0.0028 1 0 0.8455 0.1511 0.0034 1 0 0.6677 0.3287 0.0036
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 173 66 107 0 0 4 0 62 0 0 107 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 15.500 2.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0407 0.9593 2 2 0.0000 0.0432 0.9568 2 2 0.0000 0.0470 0.9530
chr18 74556356 GTGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 125 71 54 40 0 3 0 28 0 0 53 0 1 0.5634 0.0000 0.0185 22.667 0.05 3.11 -3.06 14 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4864 0.4586 0.0549 1 0 0.4804 0.4605 0.0590 1 0 0.4720 0.4632 0.0648
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 525 233 292 68 4 20 11 130 0 0 292 0 0 0.2918 0.0000 0.0000 12.294 1.79 4.96 -3.17 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0160 0.9840 1 2 0.0000 0.0191 0.9809 1 2 0.0000 0.0241 0.9759
chr19 868206 AGCTCT A 0.000155 0.100 1 -5 2 1209 267 942 151 1 6 0 109 0 0 940 0 2 0.5655 0.0000 0.0021 43.333 0.60 5.04 -4.43 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9402 0.0598 0.0000 1 0 0.9368 0.0632 0.0000 1 0 0.9317 0.0683 0.0000
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.100 1 3 1 243 121 122 1 1 52 2 65 0 0 122 0 0 0.0083 0.0000 0.0000 6.800 1.00 2.71 -1.71 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.9922 0.0078 2 1 0.0000 0.9870 0.0130
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.100 1 4 1 657 120 537 116 0 1 0 3 0 0 536 0 1 0.9667 0.0000 0.0019 119.000 0.41 5.33 -4.93 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1134 0.8866 0.0000 0 0 0.9210 0.0790 0.0000 0 0 0.9817 0.0183 0.0000
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.100 1 -27 1 404 118 286 114 1 2 0 1 0 0 286 0 0 0.9661 0.0000 0.0000 58.000 0.94 28.00 -27.06 24 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9927 0.0073 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 170 72 98 33 1 2 0 36 0 0 98 0 0 0.4583 0.0000 0.0000 35.000 0.97 4.03 -3.06 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2709 0.6069 0.1221 1 1 0.2770 0.6000 0.1230 1 1 0.2849 0.5912 0.1239
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 271 142 129 90 1 2 0 49 0 0 129 0 0 0.6338 0.0000 0.0000 70.000 0.17 3.12 -2.96 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9617 0.0383 0.0001 1 0 0.9574 0.0425 0.0001 1 0 0.9510 0.0489 0.0001
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.100 1 3 2 349 70 279 6 0 17 8 39 0 0 276 0 3 0.0857 0.0000 0.0108 3.118 0.17 5.44 -5.27 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9916 0.0084
chr19 1827021 T TGGAGGAGGTGGA 0.000087 0.100 1 12 2 349 70 279 38 2 5 1 24 0 1 275 0 3 0.5429 0.0000 0.0143 15.750 2.79 6.38 -3.59 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7218 0.2782 0.0000 1 0 0.7168 0.2832 0.0000 1 0 0.7099 0.2901 0.0000
chr19 2015541 G GGGC 0.004938 0.100 1 3 4 307 94 213 27 43 19 0 5 0 1 211 0 1 0.2872 0.0000 0.0094 4.167 1.00 2.80 -1.80 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0128 0.9872 0.0000 0 0 0.9248 0.0752 0.0000 0 0 0.9929 0.0071 0.0000
chr19 2015541 GGGCGGCGGC G 0.046318 0.100 1 -9 4 307 99 208 39 2 13 0 45 0 0 202 1 5 0.3939 0.0000 0.0288 6.538 1.21 12.76 -11.55 15 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1725 0.7663 0.0612 1 1 0.1831 0.7567 0.0602 1 1 0.1976 0.7437 0.0587
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 307 105 202 47 2 13 0 43 0 0 195 1 6 0.4476 0.0000 0.0347 6.923 1.34 13.09 -11.75 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2816 0.6315 0.0870 1 1 0.2890 0.6225 0.0885 1 1 0.2985 0.6111 0.0904
chr19 2253751 GGCGCGGTCTGCGCCTTCTTGC G 0.000218 0.100 1 -21 1 294 108 186 100 0 4 0 4 0 0 185 0 1 0.9259 0.0000 0.0054 26.000 0.40 21.00 -20.60 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9179 0.0821 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 904 216 688 168 3 37 1 7 1 0 687 0 0 0.7778 0.0015 0.0015 4.784 0.42 3.86 -3.44 78 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 0 0.9352 0.0648 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000
chr19 7477288 C CTA 0.000494 0.100 1 2 1 291 105 186 59 0 3 1 42 0 0 186 0 0 0.5619 0.0000 0.0000 34.000 0.22 2.02 -1.80 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7476 0.2524 0.0000 1 0 0.7431 0.2569 0.0000 1 0 0.7367 0.2633 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 430 117 313 66 0 7 0 44 0 0 313 0 0 0.5641 0.0000 0.0000 15.714 0.39 3.00 -2.61 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8186 0.1800 0.0014 1 0 0.8119 0.1864 0.0017 1 0 0.8024 0.1955 0.0020
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 583 143 440 78 0 9 1 55 0 0 434 0 6 0.5455 0.0000 0.0136 14.889 0.74 11.07 -10.33 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6326 0.3569 0.0106 1 0 0.6294 0.3587 0.0119 1 0 0.6244 0.3617 0.0139
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 256 68 188 0 0 4 0 64 0 0 186 0 2 0.0000 0.0000 0.0106 16.000 5.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0686 0.9314 2 2 0.0000 0.0730 0.9270 2 2 0.0000 0.0796 0.9204
chr19 13207858 CCTG C 0.175850 0.100 1 -3 1 413 129 284 1 0 19 69 40 0 0 278 5 1 0.0078 0.0000 0.0211 5.789 0.00 3.25 -3.25 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1095 0.8905 2 2 0.0000 0.0417 0.9583 2 2 0.0000 0.0325 0.9675
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 413 130 283 1 1 58 0 70 0 0 278 0 5 0.0077 0.0000 0.0177 1.291 0.00 5.84 -5.84 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3629 0.6371 2 2 0.0000 0.1594 0.8406 2 2 0.0000 0.1190 0.8810
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.100 1 3 1 325 99 226 57 1 2 1 38 0 0 225 0 1 0.5758 0.0000 0.0044 48.500 0.19 3.08 -2.89 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7736 0.2248 0.0015 1 0 0.7678 0.2305 0.0017 1 0 0.7594 0.2385 0.0021
chr19 14799631 CAGA C 0.002283 0.100 1 -3 1 693 128 565 123 0 2 0 3 0 0 565 0 0 0.9609 0.0000 0.0000 63.000 1.57 5.00 -3.43 49 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9966 0.0034 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 548 133 415 0 0 7 0 126 0 0 412 0 3 0.0000 0.0000 0.0072 18.000 3.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 15659373 GC G 0.000921 0.100 1 -1 1 512 195 317 179 1 10 0 5 0 0 317 0 0 0.9179 0.0000 0.0000 20.556 0.14 1.60 -1.46 11 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9939 0.0061 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 17286678 GTGTGTGTGTGTGTT G 0.125300 0.100 1 -14 1 363 91 272 51 12 15 6 7 1 0 271 0 0 0.5604 0.0037 0.0037 5.462 2.59 5.86 -3.27 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.0995 0.9005 0.0000
chr19 18869245 T TGCC 0.049608 0.100 1 3 1 591 166 425 137 5 18 0 6 0 0 425 0 0 0.8253 0.0000 0.0000 8.706 0.77 3.00 -2.23 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0424 0.9576 0.0000 0 0 0.9754 0.0246 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 618 146 472 72 0 4 0 70 0 0 470 0 2 0.4932 0.0000 0.0042 35.500 0.17 3.03 -2.86 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3016 0.6696 0.0288 1 1 0.3125 0.6576 0.0298 1 1 0.3265 0.6423 0.0312
chr19 23745033 TA T 0.001746 0.100 1 -1 3 596 147 449 76 0 3 1 67 0 0 449 0 0 0.5170 0.0000 0.0000 48.000 0.13 1.30 -1.17 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5212 0.4786 0.0002 1 0 0.5269 0.4729 0.0002 1 0 0.5336 0.4662 0.0002
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 301 79 222 5 0 11 4 59 0 0 222 0 0 0.0633 0.0000 0.0000 6.182 0.00 3.03 -3.03 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.6375 0.3625 2 2 0.0000 0.1887 0.8113
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 595 146 449 0 0 7 2 137 0 0 443 0 6 0.0000 0.0000 0.0134 19.857 3.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 540 262 278 226 1 19 0 16 0 0 277 0 1 0.8626 0.0000 0.0036 13.500 7.08 16.56 -9.48 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0056 0.9944 0.0000 0 0 0.8441 0.1559 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 532 204 328 39 3 46 5 111 0 0 328 0 0 0.1912 0.0000 0.0000 3.762 13.33 8.05 5.29 3 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0228 0.9772 1 2 0.0000 0.0283 0.9717 1 2 0.0000 0.0379 0.9621
chr19 36141122 G GGGC 0.033775 0.100 1 3 5 488 131 357 107 2 18 0 4 1 0 355 0 1 0.8168 0.0028 0.0056 6.278 1.00 4.75 -3.75 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1050 0.8950 0.0000 0 0 0.9714 0.0286 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 552 115 437 63 0 17 1 34 0 0 406 0 31 0.5478 0.0000 0.0709 5.765 0.46 15.41 -14.95 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2586 0.7131 0.0283 1 1 0.2701 0.7011 0.0288 1 1 0.2852 0.6854 0.0294
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.100 1 3 1 115 62 53 31 0 10 0 21 0 0 53 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 5.200 0.10 3.05 -2.95 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6686 0.3286 0.0028 1 0 0.6642 0.3328 0.0030 1 0 0.6582 0.3385 0.0033
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 447 136 311 0 0 4 4 128 0 0 301 0 10 0.0000 0.0000 0.0322 32.000 3.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 231 36 195 0 0 3 29 4 0 0 195 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 15.500 1.75 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0517 0.9483 2 2 0.0000 0.0533 0.9467 2 2 0.0000 0.0557 0.9443
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 231 35 196 0 0 19 14 2 0 0 196 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 1.300 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0813 0.9187 2 2 0.0000 0.0832 0.9168 2 2 0.0000 0.0858 0.9142
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 461 118 343 0 0 8 1 109 0 0 343 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 13.625 5.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0040 0.9960
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 424 131 293 5 0 3 0 123 0 0 291 0 2 0.0382 0.0000 0.0068 42.667 1.20 1.72 -0.52 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.6118 0.3882 2 2 0.0000 0.1858 0.8142
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.100 1 3 1 300 98 202 47 0 3 0 48 0 0 202 0 0 0.4796 0.0000 0.0000 31.667 0.36 4.54 -4.18 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3464 0.6355 0.0181 1 1 0.3551 0.6265 0.0184 1 1 0.3662 0.6150 0.0188
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.100 1 -1 1 524 104 420 98 0 2 0 4 0 0 420 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 51.000 0.21 2.25 -2.04 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2504 0.7496 0.0000 0 0 0.9679 0.0321 0.0000 0 0 0.9930 0.0070 0.0000
chr19 43024952 TG T 0.000014 0.100 1 -1 2 442 123 319 76 0 1 0 46 0 0 319 0 0 0.6179 0.0000 0.0000 122.000 1.29 1.50 -0.21 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9149 0.0851 0.0000 1 0 0.9093 0.0907 0.0000 1 0 0.9012 0.0988 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 330 93 237 0 0 2 0 91 0 0 229 0 8 0.0000 0.0000 0.0338 45.500 6.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0089 0.9911 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0114 0.9886
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 497 165 332 83 0 3 0 79 0 0 332 0 0 0.5030 0.0000 0.0000 54.000 0.28 3.03 -2.75 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1711 0.6951 0.1338 1 1 0.1758 0.6825 0.1417 1 1 0.1814 0.6664 0.1522
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 475 112 363 58 0 4 3 47 0 0 362 1 0 0.5179 0.0000 0.0028 36.000 0.60 2.28 -1.67 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5015 0.4786 0.0199 1 0 0.5037 0.4751 0.0212 1 0 0.5059 0.4712 0.0229
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 914 237 677 9 0 57 8 163 0 0 663 2 12 0.0380 0.0000 0.0207 3.158 1.11 3.68 -2.57 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.6992 0.3008 2 2 0.0000 0.0631 0.9369
chr19 49154632 T TTCCTCCTCC 0.001742 0.100 1 9 1 935 219 716 157 4 50 0 8 0 0 715 0 1 0.7169 0.0000 0.0014 3.360 0.73 6.88 -6.14 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 542 135 407 0 0 28 0 107 0 2 396 1 8 0.0000 0.0000 0.0270 3.821 6.66 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0080 0.9920 2 2 0.0000 0.0088 0.9912
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.100 1 -18 2 665 251 414 172 2 68 0 9 0 0 414 0 0 0.6853 0.0000 0.0000 2.691 0.29 14.44 -14.15 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7945 0.2055 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000
chr19 49908948 G GTGC 0.000984 0.100 1 3 2 796 183 613 89 3 12 1 78 0 0 613 0 0 0.4863 0.0000 0.0000 14.250 0.46 3.41 -2.95 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6082 0.3917 0.0000 1 0 0.6116 0.3884 0.0001 1 0 0.6150 0.3849 0.0001
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 638 147 491 2 0 6 63 76 0 0 488 0 3 0.0136 0.0000 0.0061 28.200 0.00 3.18 -3.18 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0513 0.9487 2 2 0.0000 0.0062 0.9938 2 2 0.0000 0.0033 0.9967
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 639 150 489 2 0 9 70 69 0 0 489 0 0 0.0133 0.0000 0.0000 15.667 0.00 3.30 -3.30 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1355 0.8645 2 2 0.0000 0.0178 0.9822 2 2 0.0000 0.0094 0.9906
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.100 1 6 2 598 119 479 6 0 13 0 100 0 0 472 0 7 0.0504 0.0000 0.0146 8.154 0.67 5.22 -4.55 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9954 0.0046 2 1 0.0000 0.9523 0.0477
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 557 173 384 0 0 2 11 160 0 0 379 1 4 0.0000 0.0000 0.0130 85.500 2.64 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 175 83 92 2 0 1 0 80 0 0 92 0 0 0.0241 0.0000 0.0000 82.000 0.00 2.21 -2.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3565 0.6435 2 2 0.0000 0.0562 0.9438 2 2 0.0000 0.0278 0.9722
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 446 132 314 72 0 7 0 53 0 0 314 0 0 0.5455 0.0000 0.0000 17.857 0.29 2.70 -2.41 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6807 0.3096 0.0098 1 0 0.6740 0.3148 0.0112 1 0 0.6645 0.3222 0.0134
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 518 115 403 66 0 4 0 45 0 0 401 0 2 0.5739 0.0000 0.0050 27.750 0.86 3.33 -2.47 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6911 0.2988 0.0101 1 0 0.6836 0.3048 0.0116 1 0 0.6729 0.3133 0.0138
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 963 216 747 0 0 4 0 212 0 0 735 0 12 0.0000 0.0000 0.0161 53.000 3.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 590 160 430 144 3 8 0 5 0 0 429 1 0 0.9000 0.0000 0.0023 30.200 0.67 1.60 -0.93 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0069 0.9931 0.0000 0 0 0.6756 0.3244 0.0000 0 0 0.9402 0.0598 0.0000
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 705 126 579 61 0 3 0 62 0 0 575 0 4 0.4841 0.0000 0.0069 41.000 1.03 3.82 -2.79 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1122 0.6329 0.2549 1 1 0.1181 0.6236 0.2583 1 1 0.1261 0.6117 0.2622
chr19 55014192 C CGGGA 0.000722 0.100 1 4 2 357 64 293 30 0 0 0 34 0 0 291 0 2 0.4688 0.0000 0.0068 64.000 1.70 5.50 -3.80 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2849 0.7144 0.0007 1 1 0.2947 0.7046 0.0007 1 1 0.3076 0.6918 0.0007
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.100 1 4 2 735 177 558 146 1 18 0 12 0 0 558 0 0 0.8249 0.0000 0.0000 9.353 0.29 4.17 -3.87 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1235 0.8765 0.0000 0 0 0.9481 0.0519 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 454 109 345 8 0 19 0 82 0 0 331 0 14 0.0734 0.0000 0.0406 4.737 0.12 7.63 -7.51 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9765 0.0235 2 1 0.0000 0.6181 0.3819
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 652 193 459 87 6 30 0 70 0 0 434 0 25 0.4508 0.0000 0.0545 5.483 2.36 19.54 -17.19 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0271 0.6675 0.3055 1 1 0.0287 0.6539 0.3173 1 1 0.0309 0.6367 0.3323
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 729 229 500 121 2 29 2 75 0 0 489 2 9 0.5284 0.0000 0.0220 6.862 1.17 8.63 -7.45 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8889 0.1107 0.0004 1 0 0.8832 0.1163 0.0005 1 0 0.8748 0.1245 0.0007
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 537 114 423 3 0 3 1 107 0 0 416 0 7 0.0263 0.0000 0.0165 37.000 2.00 3.70 -1.70 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6583 0.3417 2 2 0.0000 0.0630 0.9370 2 2 0.0000 0.0218 0.9782
chr19 55733513 TG T 0.500000 0.100 1 -1 3 442 104 338 96 0 0 0 8 0 0 338 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 104.000 0.34 1.12 -0.78 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0237 0.9763 0.0000 0 1 0.3836 0.6164 0.0000
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 298 103 195 52 0 0 1 50 0 0 193 0 2 0.5049 0.0000 0.0103 103.000 0.33 4.34 -4.01 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2945 0.6410 0.0644 1 1 0.3028 0.6315 0.0657 1 1 0.3134 0.6192 0.0674
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 299 122 177 48 0 1 0 73 0 0 176 0 1 0.3934 0.0000 0.0056 121.000 0.31 2.12 -1.81 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0036 0.1964 0.8000 1 2 0.0043 0.2050 0.7906 1 2 0.0055 0.2172 0.7773
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 102 60 42 0 0 2 0 58 0 0 42 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 29.000 6.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0326 0.9674 2 2 0.0000 0.0345 0.9655 2 2 0.0000 0.0374 0.9626
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.100 1 3 1 425 113 312 95 3 12 0 3 1 0 310 0 1 0.8407 0.0032 0.0064 8.417 0.89 3.33 -2.44 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2135 0.7865 0.0000 0 0 0.9617 0.0383 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr20 4699448 CCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCT C 0.009335 0.100 1 -24 4 866 248 618 122 0 26 0 100 0 0 618 0 0 0.4919 0.0000 0.0000 8.538 0.38 10.34 -9.96 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7469 0.2530 0.0001 1 0 0.7465 0.2534 0.0001 1 0 0.7451 0.2548 0.0001
chr20 16367379 GAAC G 0.000055 0.100 1 -3 2 687 193 494 175 0 10 0 8 0 0 494 0 0 0.9067 0.0000 0.0000 18.300 0.37 3.25 -2.88 73 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7209 0.2791 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 236 105 131 63 0 5 0 37 0 0 130 0 1 0.6000 0.0000 0.0076 20.000 0.43 1.57 -1.14 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7292 0.2626 0.0083 1 0 0.7166 0.2735 0.0099 1 0 0.6989 0.2887 0.0124
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 683 162 521 0 0 6 0 156 0 0 512 0 9 0.0000 0.0000 0.0173 26.000 6.68 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 476 175 301 12 3 2 3 155 0 0 289 0 12 0.0686 0.0000 0.0399 84.500 0.50 3.18 -2.68 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9881 0.0119 2 2 0.0000 0.3680 0.6320
chr20 35277855 AGGCTGGGGCTGG A 0.001908 0.100 1 -12 1 532 212 320 187 0 15 0 10 0 0 320 0 0 0.8821 0.0000 0.0000 13.133 0.53 12.20 -11.67 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 0 0.9930 0.0070 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr20 38926679 CGCG C 0.001907 0.100 1 -3 3 713 209 504 107 2 23 2 75 0 0 501 1 2 0.5120 0.0000 0.0060 8.087 0.36 3.19 -2.82 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8770 0.1230 0.0000 1 0 0.8724 0.1276 0.0000 1 0 0.8657 0.1343 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 613 172 441 97 0 2 0 73 1 0 439 0 1 0.5640 0.0023 0.0045 85.000 0.34 3.38 -3.04 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6409 0.3506 0.0085 1 0 0.6335 0.3564 0.0101 1 0 0.6226 0.3648 0.0126
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 943 309 634 137 0 34 10 128 0 0 632 0 2 0.4434 0.0000 0.0032 8.088 0.44 3.36 -2.92 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0585 0.7783 0.1632 1 1 0.0641 0.7610 0.1749 1 1 0.0718 0.7380 0.1902
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 542 266 276 52 139 67 2 6 0 0 276 0 0 0.1955 0.0000 0.0000 3.769 2.40 3.67 -1.26 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.8557 0.1443 0.0000 0 0 0.9901 0.0099 0.0000
chr20 47651121 A AGC 0.002695 0.100 1 2 1 540 260 280 23 16 39 22 160 0 0 280 0 0 0.0885 0.0000 0.0000 5.553 1.35 5.41 -4.06 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 47651122 A AG 0.002096 0.100 1 1 2 540 263 277 25 5 55 21 157 0 0 277 0 0 0.0951 0.0000 0.0000 23.750 1.88 5.41 -3.53 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 58854641 C CTGACGCCCCAGCCGATCCCGACTCCGGGGCGGCCCG 0.009401 0.100 1 36 4 707 143 564 100 13 23 2 5 0 0 564 0 0 0.6993 0.0000 0.0000 4.957 0.49 2.20 -1.71 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0441 0.9559 0.0000 0 0 0.9746 0.0254 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr20 60012728 T TA 0.009952 0.100 1 1 2 214 66 148 33 1 9 0 23 0 0 148 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 6.222 0.24 1.26 -1.02 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6860 0.3132 0.0008 1 0 0.6815 0.3176 0.0009 1 0 0.6754 0.3237 0.0010
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 201 33 168 0 0 6 2 25 0 0 162 1 5 0.0000 0.0000 0.0357 4.500 6.68 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 259 113 146 0 0 0 0 113 0 0 145 0 1 0.0000 0.0000 0.0068 113.000 2.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 712 193 519 77 0 2 0 114 0 0 512 0 7 0.3990 0.0000 0.0135 95.500 0.22 5.64 -5.42 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0620 0.9378 1 2 0.0002 0.0678 0.9320 1 2 0.0003 0.0764 0.9232
chr21 33070402 CTCCTCCACT C 0.002225 0.100 1 -9 2 439 138 301 126 1 2 0 9 0 0 301 0 0 0.9130 0.0000 0.0000 68.000 0.83 8.33 -7.50 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.9462 0.0538 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 761 213 548 109 3 33 1 67 1 2 544 0 1 0.5117 0.0018 0.0073 5.424 1.96 13.04 -11.08 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9681 0.0318 0.0000 1 0 0.9646 0.0354 0.0000 1 0 0.9592 0.0407 0.0001
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 243 129 114 59 0 7 0 63 0 0 112 0 2 0.4574 0.0000 0.0175 17.429 0.24 3.19 -2.95 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0754 0.5901 0.3345 1 1 0.0797 0.5824 0.3379 1 1 0.0856 0.5728 0.3416
chr21 41741965 GCTT G 0.000014 0.100 1 -3 2 693 140 553 68 0 16 0 56 0 0 549 0 4 0.4857 0.0000 0.0072 7.750 0.97 4.38 -3.40 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5412 0.4588 0.0000 1 0 0.5454 0.4546 0.0000 1 0 0.5502 0.4498 0.0000
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 332 58 274 0 1 12 3 42 0 0 274 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.600 2.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1147 174 973 98 3 4 3 66 1 1 969 1 1 0.5632 0.0010 0.0041 56.667 0.74 3.29 -2.54 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7840 0.2136 0.0024 1 0 0.7734 0.2236 0.0030 1 0 0.7581 0.2378 0.0041
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1148 175 973 94 4 4 6 67 0 1 969 2 1 0.5371 0.0000 0.0041 57.000 0.72 3.31 -2.59 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6159 0.3747 0.0094 1 0 0.6083 0.3806 0.0111 1 0 0.5970 0.3891 0.0140
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 532 99 433 47 1 9 1 41 0 0 428 0 5 0.4747 0.0000 0.0115 10.000 0.83 12.49 -11.66 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1949 0.6150 0.1900 1 1 0.1984 0.6067 0.1949 1 1 0.2028 0.5961 0.2011
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 313 141 172 1 0 22 0 118 0 0 172 0 0 0.0071 0.0000 0.0000 5.409 0.00 7.77 -7.77 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr21 45505235 A AGGCCCCCCC 0.016294 0.100 1 9 6 340 92 248 77 0 10 0 5 0 0 248 0 0 0.8370 0.0000 0.0000 8.200 0.26 5.40 -5.14 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0436 0.9564 0.0000 0 0 0.9323 0.0677 0.0000 0 0 0.9903 0.0097 0.0000
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 534 193 341 80 3 25 0 85 0 0 337 2 2 0.4145 0.0000 0.0117 6.720 0.25 3.24 -2.99 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1150 0.7090 0.1760 1 1 0.1232 0.6967 0.1801 1 1 0.1344 0.6806 0.1850
chr21 46334557 G GTGGGATGTTCACAGTCAGTGACCACCCACCAGAACAGCA 0.014382 0.100 1 39 1 774 249 525 59 4 121 3 62 0 0 525 0 0 0.2369 0.0000 0.0000 1.033 0.15 2.26 -2.11 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2957 0.6976 0.0067 1 1 0.3073 0.6858 0.0069 1 1 0.3224 0.6705 0.0070
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.100 1 6 1 3249 1052 2197 628 4 35 1 384 0 0 2164 0 33 0.5970 0.0000 0.0150 29.057 0.21 5.88 -5.66 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 20858678 G GCCGCCT 0.004141 0.100 1 6 2 526 184 342 71 0 43 1 69 0 0 342 0 0 0.3859 0.0000 0.0000 3.256 0.31 5.32 -5.01 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3632 0.6357 0.0012 1 1 0.3741 0.6247 0.0012 1 1 0.3879 0.6108 0.0013
chr22 23617579 G GCAT 0.002056 0.100 1 3 3 215 103 112 60 2 8 0 33 0 1 111 0 0 0.5825 0.0000 0.0089 11.875 0.32 3.67 -3.35 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9225 0.0775 0.0000 1 0 0.9167 0.0833 0.0000 1 0 0.9083 0.0917 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 202 95 107 66 0 4 0 25 0 0 106 0 1 0.6947 0.0000 0.0093 22.750 0.15 3.40 -3.25 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9622 0.0377 0.0001 1 0 0.9576 0.0423 0.0001 1 0 0.9499 0.0498 0.0002
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 659 129 530 0 0 32 0 97 0 0 510 1 19 0.0000 0.0000 0.0377 3.031 16.78 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr22 35728842 GC G 0.001215 0.100 1 -1 1 257 93 164 88 0 2 0 3 0 0 164 0 0 0.9462 0.0000 0.0000 45.500 0.14 1.00 -0.86 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9898 0.0102 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 36265995 AATAATT A 0.003695 0.100 1 -6 1 481 119 362 64 1 5 0 49 0 0 360 0 2 0.5378 0.0000 0.0055 22.600 1.30 6.69 -5.40 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6892 0.3107 0.0002 1 0 0.6870 0.3128 0.0002 1 0 0.6836 0.3161 0.0002
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 455 220 235 19 0 52 0 149 0 0 230 0 5 0.0864 0.0000 0.0213 3.231 0.79 5.54 -4.75 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9972 0.0028
chr22 38087182 A AGGTCATGGG 0.001043 0.100 1 9 2 325 176 149 152 1 16 0 7 0 0 149 0 0 0.8636 0.0000 0.0000 10.000 0.24 6.71 -6.48 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2909 0.7091 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 213 115 98 96 1 6 0 12 0 0 96 0 2 0.8348 0.0000 0.0204 18.000 0.46 3.67 -3.21 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0268 0.9732 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 338 134 204 0 0 10 0 124 0 0 197 0 7 0.0000 0.0000 0.0343 12.400 2.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 491 145 346 67 1 15 3 59 0 0 343 0 3 0.4621 0.0000 0.0087 8.667 0.54 3.14 -2.60 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3274 0.6145 0.0581 1 1 0.3345 0.6047 0.0608 1 1 0.3433 0.5924 0.0644
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1187 242 945 7 0 4 1 230 0 0 916 0 29 0.0289 0.0000 0.0307 59.500 0.57 11.02 -10.45 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9550 0.0450 2 2 0.0000 0.0089 0.9911 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 602 125 477 0 0 16 1 108 0 0 470 0 7 0.0000 0.0000 0.0147 6.812 6.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0474 0.9526 2 2 0.0000 0.0531 0.9469 2 2 0.0000 0.0621 0.9379
chr22 46363187 CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA C 0.006403 0.100 1 -27 3 209 95 114 75 0 19 0 1 0 0 114 0 0 0.7895 0.0000 0.0000 4.000 0.13 27.00 -26.87 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr22 46364133 CGTGCGCGAGGAT C 0.000801 0.100 1 -12 1 440 119 321 70 0 5 0 44 0 0 318 0 3 0.5882 0.0000 0.0093 22.800 1.29 11.55 -10.26 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8462 0.1538 0.0000 1 0 0.8403 0.1597 0.0000 1 0 0.8319 0.1681 0.0000
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.100 1 -48 1 1003 225 778 129 3 33 1 59 0 0 731 0 47 0.5733 0.0000 0.0604 5.758 0.76 9.68 -8.92 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7334 0.2651 0.0015 1 0 0.7322 0.2660 0.0018 1 0 0.7295 0.2682 0.0023
816 rows