File Info

Filename
HG02855_x_HG02886_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG02855_x_HG02886_FF_10.features.tsv
Size
178.0 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1708843 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 678 280 398 236 9 30 0 5 0 0 398 0 0 0.8429 0.0000 0.0000 8.414 0.83 6.20 -5.37 80 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7796 0.2204 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 307 149 158 67 0 2 0 80 0 0 158 0 0 0.4497 0.0000 0.0000 73.500 0.36 3.75 -3.39 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0348 0.5148 0.4504 1 1 0.0384 0.5117 0.4500 1 1 0.0435 0.5081 0.4484
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 760 215 545 161 4 38 0 12 0 1 543 1 0 0.7488 0.0000 0.0037 4.632 0.40 2.92 -2.51 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.4326 0.5674 0.0000
chr1 10639083 CTCGTCG C 0.500000 0.100 1 -6 2 601 119 482 96 3 14 0 6 0 0 482 0 0 0.8067 0.0000 0.0000 8.077 1.57 4.67 -3.09 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1971 0.8029 0.0000 0 0 0.7291 0.2709 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 523 103 420 40 8 21 0 34 1 0 417 0 2 0.3883 0.0024 0.0071 3.905 0.57 3.35 -2.78 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5224 0.4378 0.0399 1 0 0.5161 0.4404 0.0435 1 0 0.5071 0.4441 0.0487
chr1 11650722 CGCG C 0.500000 0.100 1 -3 1 523 109 414 80 2 19 0 8 0 0 413 0 1 0.7339 0.0000 0.0024 4.737 1.59 3.50 -1.91 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 1 0.1421 0.8579 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 935 162 773 150 0 6 0 6 0 0 771 0 2 0.9259 0.0000 0.0026 26.000 0.63 3.00 -2.37 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2639 0.7361 0.0000 0 0 0.8951 0.1049 0.0000
chr1 15410070 A AGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 388 128 260 66 0 14 0 48 0 0 260 0 0 0.5156 0.0000 0.0000 8.143 0.41 6.56 -6.15 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6156 0.3666 0.0178 1 0 0.6081 0.3717 0.0202 1 0 0.5974 0.3789 0.0238
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.100 1 3 2 286 110 176 61 0 7 0 42 0 0 174 0 2 0.5545 0.0000 0.0114 14.714 0.16 3.17 -3.00 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6042 0.3750 0.0208 1 0 0.5965 0.3801 0.0234 1 0 0.5857 0.3871 0.0272
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 324 92 232 67 0 0 0 25 0 0 232 0 0 0.7283 0.0000 0.0000 92.000 0.18 1.36 -1.18 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9532 0.0466 0.0002 1 0 0.9471 0.0526 0.0003 1 0 0.9329 0.0667 0.0005
chr1 27373179 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 293 116 177 61 0 0 0 55 0 1 175 0 1 0.5259 0.0000 0.0113 116.000 0.30 1.15 -0.85 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3025 0.6028 0.0946 1 1 0.3051 0.5951 0.0998 1 1 0.3078 0.5854 0.1068
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 414 165 249 74 5 8 0 78 0 0 249 0 0 0.4485 0.0000 0.0000 19.500 0.24 3.09 -2.85 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1703 0.6825 0.1473 1 1 0.1766 0.6698 0.1536 1 1 0.1847 0.6535 0.1618
chr1 34761404 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 687 189 498 183 0 2 0 4 0 0 498 0 0 0.9683 0.0000 0.0000 93.500 0.16 2.25 -2.09 33 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6194 0.3806 0.0000 0 0 0.9925 0.0075 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 358 107 251 93 0 10 0 4 0 0 251 0 0 0.8692 0.0000 0.0000 9.700 0.22 3.00 -2.78 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0155 0.9845 0.0000 0 0 0.5954 0.4046 0.0000 0 0 0.8750 0.1250 0.0000
chr1 46668333 G GCCT 0.500000 0.100 1 3 5 383 177 206 145 5 15 0 12 0 0 206 0 0 0.8192 0.0000 0.0000 10.800 0.86 4.42 -3.56 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0050 0.9950 0.0000 0 1 0.3955 0.6045 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 618 148 470 55 0 21 1 71 0 1 469 0 0 0.3716 0.0000 0.0021 6.000 0.95 5.83 -4.89 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0237 0.4264 0.5499 1 2 0.0265 0.4284 0.5451 1 2 0.0307 0.4315 0.5378
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 218 93 125 44 3 7 1 38 0 1 124 0 0 0.4731 0.0000 0.0080 12.143 0.14 2.87 -2.73 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4020 0.5246 0.0735 1 1 0.3998 0.5222 0.0780 1 1 0.3964 0.5193 0.0844
chr1 53459700 G GCCGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 532 133 399 52 1 33 0 47 0 0 394 0 5 0.3910 0.0000 0.0125 3.030 0.42 5.53 -5.11 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2061 0.6248 0.1691 1 1 0.2103 0.6157 0.1739 1 1 0.2157 0.6042 0.1801
chr1 63323312 CGGCCGGAGCCGG C 0.500000 0.100 1 -12 2 588 168 420 157 0 9 0 2 1 0 417 0 2 0.9345 0.0024 0.0071 17.667 0.78 12.00 -11.22 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3021 0.6979 0.0000 0 0 0.9742 0.0258 0.0000 0 0 0.9939 0.0061 0.0000
chr1 74764057 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 4 193 68 125 36 0 2 0 30 0 0 125 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 33.000 0.08 3.30 -3.22 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3534 0.5390 0.1076 1 1 0.3519 0.5359 0.1122 1 1 0.3496 0.5321 0.1184
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 255 86 169 79 0 2 0 5 0 0 169 0 0 0.9186 0.0000 0.0000 42.000 0.46 5.00 -4.54 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.2015 0.7985 0.0000 0 0 0.6513 0.3487 0.0000
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 470 206 264 168 0 30 0 8 0 0 264 0 0 0.8155 0.0000 0.0000 5.867 0.68 11.12 -10.44 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4682 0.5318 0.0000 0 0 0.9534 0.0466 0.0000
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 424 139 285 73 0 7 1 58 0 0 285 0 0 0.5252 0.0000 0.0000 18.857 0.14 6.05 -5.91 11 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.4970 0.4723 0.0308 1 0 0.4941 0.4718 0.0341 1 0 0.4894 0.4717 0.0389
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.100 1 -6 1 422 141 281 60 1 18 0 62 0 0 281 0 0 0.4255 0.0000 0.0000 6.833 0.20 5.77 -5.57 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1598 0.6453 0.1949 1 1 0.1652 0.6348 0.2000 1 1 0.1722 0.6215 0.2063
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 152 63 89 0 0 1 0 62 0 0 87 0 2 0.0000 0.0000 0.0225 62.000 3.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0369 0.9631 2 2 0.0000 0.0393 0.9607 2 2 0.0000 0.0429 0.9571
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 465 129 336 14 0 6 4 105 0 0 331 0 5 0.1085 0.0000 0.0149 20.333 0.14 3.08 -2.93 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9696 0.0304
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 833 180 653 92 1 18 1 68 0 0 653 0 0 0.5111 0.0000 0.0000 9.000 0.70 15.50 -14.80 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7024 0.2915 0.0062 1 0 0.6950 0.2976 0.0074 1 0 0.6843 0.3065 0.0092
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 194 68 126 3 0 4 0 61 0 0 125 0 1 0.0441 0.0000 0.0079 16.000 0.00 2.34 -2.34 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9707 0.0293 2 1 0.0000 0.5240 0.4760 2 2 0.0000 0.2528 0.7472
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1133 213 920 0 0 43 1 169 0 1 907 0 12 0.0000 0.0000 0.0141 3.953 3.75 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 216 71 145 19 2 14 3 33 0 0 145 0 0 0.2676 0.0000 0.0000 3.857 0.68 1.70 -1.01 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0330 0.3689 0.5981 1 2 0.0363 0.3757 0.5880 1 2 0.0410 0.3848 0.5741
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 208 67 141 0 0 14 0 53 0 0 132 0 9 0.0000 0.0000 0.0638 3.786 10.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0407 0.9593 2 2 0.0000 0.0432 0.9568 2 2 0.0000 0.0470 0.9530
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 730 226 504 188 4 23 0 11 1 0 503 0 0 0.8319 0.0020 0.0020 8.739 0.88 6.18 -5.30 126 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1102 0.8898 0.0000 0 0 0.9080 0.0920 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1168 294 874 121 5 50 4 114 4 3 853 0 14 0.4116 0.0046 0.0240 4.939 1.93 9.99 -8.06 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1199 0.7839 0.0962 1 1 0.1288 0.7669 0.1043 1 1 0.1406 0.7443 0.1151
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 1300 370 930 248 4 107 0 11 0 2 926 0 2 0.6703 0.0000 0.0043 2.449 0.92 11.55 -10.63 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2443 0.7557 0.0000 0 0 0.9819 0.0181 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 209 82 127 45 3 2 3 29 0 0 127 0 0 0.5488 0.0000 0.0000 39.000 1.67 2.14 -0.47 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6110 0.3639 0.0251 1 0 0.6018 0.3702 0.0280 1 0 0.5889 0.3789 0.0322
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 624 170 454 0 0 3 0 167 0 0 453 0 1 0.0000 0.0000 0.0022 55.667 2.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr1 158700284 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 665 157 508 151 0 1 0 5 0 0 508 0 0 0.9618 0.0000 0.0000 156.000 0.23 2.60 -2.37 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0318 0.9682 0.0000 0 0 0.9019 0.0981 0.0000 0 0 0.9840 0.0160 0.0000
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1190 233 957 0 0 4 1 228 0 0 955 0 2 0.0000 0.0000 0.0021 57.250 1.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.100 1 3 1 128 70 58 36 0 4 0 30 0 0 57 0 1 0.5143 0.0000 0.0172 16.500 0.03 4.10 -4.07 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3264 0.5524 0.1211 1 1 0.3259 0.5484 0.1257 1 1 0.3249 0.5434 0.1318
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 200 53 147 31 0 0 0 22 0 0 147 0 0 0.5849 0.0000 0.0000 53.000 0.06 1.09 -1.03 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4483 0.4765 0.0753 1 1 0.4427 0.4776 0.0797 1 1 0.4351 0.4792 0.0857
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 170 61 109 28 0 11 0 22 0 0 109 0 0 0.4590 0.0000 0.0000 4.545 0.18 4.23 -4.05 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3684 0.5195 0.1121 1 1 0.3656 0.5178 0.1165 1 1 0.3617 0.5158 0.1225
chr1 201039955 AGTAGCTCT A 0.500000 0.100 1 -8 1 780 177 603 165 1 4 0 7 0 0 601 0 2 0.9322 0.0000 0.0033 43.250 0.75 8.43 -7.68 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2156 0.7844 0.0000 0 0 0.9071 0.0929 0.0000
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 570 271 299 121 10 44 1 95 0 0 297 0 2 0.4465 0.0000 0.0067 5.159 0.26 2.87 -2.61 67 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8122 0.1866 0.0011 1 0 0.8055 0.1930 0.0014 1 0 0.7955 0.2025 0.0020
chr1 225514758 AGGAGGGGGC A 0.500000 0.100 1 -9 5 276 91 185 50 1 6 2 32 0 0 185 0 0 0.5495 0.0000 0.0000 14.000 0.26 6.81 -6.55 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6315 0.3476 0.0209 1 0 0.6221 0.3545 0.0234 1 0 0.6089 0.3638 0.0273
chr1 225519331 ATCCAGGCGTTCCTGCCGC A 0.500000 0.100 1 -18 1 456 146 310 78 0 67 0 1 0 0 310 0 0 0.5342 0.0000 0.0000 1.179 0.44 18.00 -17.56 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8524 0.1476 0.0000 0 0 0.9443 0.0557 0.0000 0 0 0.9586 0.0414 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 636 174 462 149 0 16 0 9 0 0 462 0 0 0.8563 0.0000 0.0000 9.875 0.59 6.22 -5.63 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1053 0.8947 0.0000 0 0 0.8106 0.1894 0.0000
chr1 235213963 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 173 58 115 50 0 3 1 4 0 0 115 0 0 0.8621 0.0000 0.0000 18.000 0.08 1.25 -1.17 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.1139 0.8861 0.0000 0 1 0.4056 0.5944 0.0000
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 233 113 120 41 0 5 0 67 0 0 120 0 0 0.3628 0.0000 0.0000 21.600 0.20 1.18 -0.98 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0046 0.2043 0.7911 1 2 0.0055 0.2139 0.7806 1 2 0.0070 0.2275 0.7655
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 605 157 448 0 0 8 2 147 0 0 443 0 5 0.0000 0.0000 0.0112 18.625 3.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 506 139 367 132 0 1 0 6 0 0 367 0 0 0.9496 0.0000 0.0000 138.000 0.45 2.50 -2.05 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.5530 0.4470 0.0000 0 0 0.9281 0.0719 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1037 234 803 26 1 1 0 206 0 0 799 1 3 0.1111 0.0000 0.0050 233.000 0.42 1.39 -0.97 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 418 163 255 88 0 5 0 70 0 0 255 0 0 0.5399 0.0000 0.0000 31.600 2.56 4.39 -1.83 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5691 0.4149 0.0161 1 0 0.5653 0.4164 0.0183 1 0 0.5593 0.4190 0.0217
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 500 26 474 0 0 2 1 23 0 0 472 0 2 0.0000 0.0000 0.0042 12.000 3.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2100 0.7900 2 2 0.0000 0.2144 0.7856 2 2 0.0000 0.2207 0.7793
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 1705 323 1382 255 0 12 0 56 0 0 1378 0 4 0.7895 0.0000 0.0029 25.917 0.38 2.95 -2.56 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 185 89 96 77 0 4 0 8 0 0 96 0 0 0.8652 0.0000 0.0000 21.250 0.13 4.00 -3.87 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0129 0.9871 0.0000 0 1 0.2567 0.7433 0.0000
chr2 20667362 G GGGCGGC 0.021395 0.100 1 6 5 394 132 262 0 0 15 1 116 0 0 247 1 14 0.0000 0.0000 0.0573 7.733 11.29 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0521 0.9479 2 2 0.0000 0.0592 0.9408 2 2 0.0000 0.0706 0.9294
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGC 0.009356 0.100 1 12 5 394 132 262 1 0 23 1 107 0 0 247 2 13 0.0076 0.0000 0.0573 4.696 11.00 11.63 -0.63 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.6379 0.3621 2 2 0.0000 0.3864 0.6136 2 2 0.0000 0.3300 0.6700
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 394 132 262 10 0 19 1 102 0 0 247 2 13 0.0758 0.0000 0.0573 5.895 7.70 11.75 -4.05 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.9101 0.0899
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 607 186 421 101 1 15 1 68 0 0 419 1 1 0.5430 0.0000 0.0048 11.400 0.39 9.12 -8.73 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8644 0.1348 0.0008 1 0 0.8577 0.1413 0.0010 1 0 0.8479 0.1507 0.0014
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.100 1 9 1 592 143 449 72 0 20 1 50 0 0 441 0 8 0.5035 0.0000 0.0178 6.150 0.17 7.20 -7.03 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6399 0.3569 0.0031 1 0 0.6394 0.3571 0.0035 1 0 0.6381 0.3579 0.0039
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 199 57 142 24 0 1 0 32 0 0 142 0 0 0.4211 0.0000 0.0000 56.000 0.04 3.06 -3.02 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0855 0.4971 0.4174 1 1 0.0899 0.4969 0.4131 1 1 0.0961 0.4968 0.4072
chr2 28628564 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 139 54 85 48 2 2 0 2 0 0 85 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 25.500 0.21 1.00 -0.79 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1260 0.8740 0.0000 0 0 0.5786 0.4214 0.0000 0 0 0.7491 0.2509 0.0000
chr2 29052032 A ACAGAGGGGTGGC 0.500000 0.100 1 12 1 290 97 193 87 0 6 0 4 0 0 192 0 1 0.8969 0.0000 0.0052 15.167 0.13 9.25 -9.12 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2732 0.7268 0.0000 0 0 0.7335 0.2665 0.0000
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 561 145 416 5 0 17 1 122 0 0 411 0 5 0.0345 0.0000 0.0120 7.529 0.00 3.01 -3.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9899 0.0101 2 2 0.0000 0.2555 0.7445 2 2 0.0000 0.0473 0.9527
chr2 29070995 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 1 594 100 494 92 0 4 0 4 4 0 490 0 0 0.9200 0.0081 0.0081 24.000 0.82 4.50 -3.68 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0180 0.9820 0.0000 0 0 0.6309 0.3691 0.0000 0 0 0.8900 0.1100 0.0000
chr2 42763510 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 2 714 164 550 151 2 6 0 5 1 0 549 0 0 0.9207 0.0018 0.0018 26.333 0.31 4.60 -4.29 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0369 0.9631 0.0000 0 0 0.9143 0.0857 0.0000 0 0 0.9861 0.0139 0.0000
chr2 43765562 AAGC A 0.500000 0.100 1 -3 1 213 98 115 55 1 8 0 34 0 0 115 0 0 0.5612 0.0000 0.0000 11.250 0.15 3.24 -3.09 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7325 0.2581 0.0094 1 0 0.7215 0.2675 0.0110 1 0 0.7062 0.2804 0.0134
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 588 194 394 36 0 96 0 62 0 0 393 1 0 0.1856 0.0000 0.0025 1.021 0.67 0.85 -0.19 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0039 0.1821 0.8140 1 2 0.0047 0.1921 0.8032 1 2 0.0060 0.2062 0.7878
chr2 47905586 AGGCTGCTGCTGGGGC A 0.500000 0.100 1 -15 2 521 247 274 129 0 49 3 66 0 0 263 0 11 0.5223 0.0000 0.0401 4.020 0.81 13.71 -12.91 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9594 0.0406 0.0001 1 0 0.9548 0.0451 0.0001 1 0 0.9478 0.0521 0.0001
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 700 113 587 22 0 23 1 67 4 2 578 0 3 0.1947 0.0068 0.0153 3.913 4.41 6.61 -2.20 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0437 0.9561 1 2 0.0003 0.0494 0.9504 1 2 0.0004 0.0584 0.9412
chr2 61186454 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 422 113 309 59 0 4 0 50 0 0 308 0 1 0.5221 0.0000 0.0032 36.333 0.12 3.12 -3.00 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3536 0.5687 0.0776 1 1 0.3543 0.5632 0.0825 1 1 0.3545 0.5564 0.0891
chr2 65072937 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 3 527 137 390 75 0 5 0 57 0 0 388 0 2 0.5474 0.0000 0.0051 26.400 0.20 2.98 -2.78 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5458 0.4313 0.0229 1 0 0.5415 0.4328 0.0257 1 0 0.5348 0.4354 0.0298
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 595 177 418 1 6 49 53 68 0 0 415 2 1 0.0056 0.0000 0.0072 2.551 5.00 3.63 1.37 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7510 0.2490 2 2 0.0000 0.1218 0.8782 2 2 0.0000 0.0373 0.9627
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 598 180 418 4 1 114 5 56 0 0 415 1 2 0.0222 0.0000 0.0072 0.602 4.50 6.62 -2.12 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9014 0.0986 2 1 0.0000 0.5508 0.4492
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 386 88 298 41 0 5 0 42 0 0 297 0 1 0.4659 0.0000 0.0034 16.600 0.32 3.10 -2.78 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1621 0.5969 0.2410 1 1 0.1665 0.5897 0.2438 1 1 0.1722 0.5806 0.2471
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 940 216 724 91 0 50 1 74 0 0 680 0 44 0.4213 0.0000 0.0608 3.320 0.27 13.12 -12.85 29 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0029 0.2581 0.7390 1 2 0.0035 0.2636 0.7329 1 2 0.0046 0.2718 0.7236
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.100 1 -9 1 412 134 278 81 0 11 0 42 0 0 273 0 5 0.6045 0.0000 0.0180 11.182 0.47 8.86 -8.39 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8849 0.1140 0.0010 1 0 0.8760 0.1226 0.0013 1 0 0.8631 0.1351 0.0019
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 364 127 237 66 1 8 0 52 1 0 234 0 2 0.5197 0.0042 0.0127 14.875 0.83 3.65 -2.82 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5051 0.4628 0.0321 1 0 0.5014 0.4632 0.0355 1 0 0.4957 0.4640 0.0403
chr2 85754556 ACGC A 0.500000 0.100 1 -3 4 659 161 498 143 0 14 0 4 1 1 496 0 0 0.8882 0.0020 0.0040 10.500 0.92 3.50 -2.58 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1828 0.8172 0.0000 0 0 0.9518 0.0482 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 619 153 466 0 0 19 4 130 0 0 463 0 3 0.0000 0.0000 0.0064 7.053 3.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.100 1 3 4 495 152 343 93 0 0 0 59 0 0 337 0 6 0.6118 0.0000 0.0175 152.000 0.22 3.12 -2.90 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7843 0.2126 0.0031 1 0 0.7755 0.2207 0.0037 1 0 0.7629 0.2322 0.0049
chr2 107827072 CG C 0.500000 0.100 1 -1 4 201 109 92 69 0 0 0 40 0 0 92 0 0 0.6330 0.0000 0.0000 109.000 0.68 3.27 -2.59 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8362 0.1611 0.0027 1 0 0.8259 0.1708 0.0033 1 0 0.8111 0.1845 0.0043
chr2 107848361 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 45 8 37 3 0 0 0 5 0 0 37 0 0 0.3750 0.0000 0.0000 8.000 0.00 2.00 -2.00 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1975 0.5090 0.2935 1 1 0.1975 0.5124 0.2901 1 1 0.1958 0.5172 0.2869
chr2 110995965 GGTTCTTCAGCGGGGTTTGGTGGCCAGAATTTATTATAAGGTAAAGATACACTGT G 0.500000 0.100 1 -54 3 204 115 89 111 0 2 0 2 0 0 88 0 1 0.9652 0.0000 0.0112 56.500 0.27 54.00 -53.73 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2669 0.7331 0.0000 0 0 0.9129 0.0871 0.0000 0 0 0.9696 0.0304 0.0000
chr2 118846529 CGCCGCCGCCGCCACTGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -24 2 428 117 311 60 0 11 1 45 0 0 310 1 0 0.5128 0.0000 0.0032 11.778 3.22 15.07 -11.85 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5034 0.4600 0.0367 1 0 0.4989 0.4609 0.0402 1 0 0.4923 0.4623 0.0454
chr2 118846553 G GGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 428 104 324 32 5 18 6 43 0 0 323 0 1 0.3077 0.0000 0.0031 4.778 15.06 5.91 9.16 6 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0395 0.4391 0.5214 1 2 0.0432 0.4416 0.5152 1 2 0.0484 0.4452 0.5064
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 572 142 430 0 0 1 0 141 0 0 423 0 7 0.0000 0.0000 0.0163 141.000 5.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 298 113 185 90 0 11 0 12 1 0 184 0 0 0.7965 0.0054 0.0054 9.273 0.71 6.67 -5.96 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0360 0.9640 0.0000
chr2 131363120 CTGTT C 0.500000 0.100 1 -4 1 646 95 551 64 1 0 0 30 0 0 550 0 1 0.6737 0.0000 0.0018 95.000 0.33 4.03 -3.71 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8998 0.0991 0.0011 1 0 0.8908 0.1079 0.0014 1 0 0.8775 0.1206 0.0019
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 188 55 133 27 3 6 6 13 0 0 133 0 0 0.4909 0.0000 0.0000 7.167 0.48 1.85 -1.36 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5361 0.4134 0.0505 1 0 0.5272 0.4184 0.0544 1 0 0.5152 0.4248 0.0600
chr2 151727801 ATGCTGGCTGTGCCAG A 0.500000 0.100 1 -15 1 411 119 292 101 1 12 0 5 0 0 291 0 1 0.8487 0.0000 0.0034 8.917 0.24 16.20 -15.96 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2152 0.7848 0.0000 0 0 0.7500 0.2500 0.0000
chr2 152619537 G GCCA 0.500000 0.100 1 3 1 504 137 367 18 94 13 4 8 0 0 367 0 0 0.1314 0.0000 0.0000 15.250 1.44 4.12 -2.68 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0033 0.9967 0.0000 0 1 0.1568 0.8432 0.0000
chr2 159987235 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 208 90 118 53 0 2 0 35 0 0 115 1 2 0.5889 0.0000 0.0254 88.000 0.28 2.29 -2.00 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5612 0.4084 0.0305 1 0 0.5540 0.4124 0.0337 1 0 0.5438 0.4179 0.0383
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 2 443 131 312 110 1 16 0 4 0 0 312 0 0 0.8397 0.0000 0.0000 7.188 0.40 2.50 -2.10 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0382 0.9618 0.0000 0 0 0.7835 0.2165 0.0000 0 0 0.9437 0.0563 0.0000
chr2 176130550 CCGCACGCGCCCCCGCAGG C 0.500000 0.100 1 -18 3 418 107 311 96 0 6 0 5 0 0 310 0 1 0.8972 0.0000 0.0032 16.833 1.00 18.40 -17.40 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1689 0.8311 0.0000 0 0 0.6916 0.3084 0.0000
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.100 1 -2 1 566 209 357 123 0 4 0 82 0 0 355 0 2 0.5885 0.0000 0.0056 51.250 0.42 4.10 -3.67 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8960 0.1036 0.0004 1 0 0.8889 0.1105 0.0005 1 0 0.8785 0.1207 0.0008
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 309 140 169 8 1 23 47 61 0 0 166 0 3 0.0571 0.0000 0.0178 3.273 0.00 3.08 -3.08 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9872 0.0128 2 1 0.0000 0.6736 0.3264
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 309 140 169 56 3 73 1 7 0 0 168 1 0 0.4000 0.0000 0.0059 0.930 2.59 4.43 -1.84 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 1 0.0528 0.9472 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 310 141 169 14 5 18 51 53 0 0 169 0 0 0.0993 0.0000 0.0000 4.235 0.21 2.98 -2.77 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 228 69 159 49 8 5 1 6 0 0 159 0 0 0.7101 0.0000 0.0000 14.000 0.61 1.33 -0.72 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0202 0.9798 0.0000 0 1 0.1976 0.8024 0.0000
chr2 199819526 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 336 65 271 36 16 4 3 6 0 0 270 1 0 0.5538 0.0000 0.0037 11.250 1.64 2.17 -0.53 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0065 0.9935 0.0000 0 1 0.0844 0.9156 0.0000
chr2 200571705 TAATGAACAGCTGGCTCAGATG T 0.500000 0.100 1 -21 2 834 230 604 205 0 18 0 7 0 0 602 0 2 0.8913 0.0000 0.0033 11.778 0.36 18.57 -18.22 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6586 0.3414 0.0000 0 0 0.9848 0.0152 0.0000
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 1 474 114 360 42 2 29 1 40 1 1 356 1 1 0.3684 0.0028 0.0111 2.897 1.36 4.80 -3.44 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2655 0.5947 0.1398 1 1 0.2678 0.5877 0.1445 1 1 0.2704 0.5788 0.1508
chr2 202635418 A AGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 1 474 114 360 43 4 61 0 6 2 1 356 0 1 0.3772 0.0056 0.0111 0.879 1.58 5.67 -4.09 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 1 0.0985 0.9015 0.0000
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 183 52 131 27 2 6 2 15 0 0 131 0 0 0.5192 0.0000 0.0000 7.333 1.15 1.73 -0.59 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5356 0.4129 0.0515 1 0 0.5267 0.4179 0.0554 1 0 0.5146 0.4244 0.0610
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 277 101 176 91 0 3 0 7 0 0 176 0 0 0.9010 0.0000 0.0000 32.667 0.35 3.57 -3.22 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0519 0.9481 0.0000 0 1 0.4809 0.5191 0.0000
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 605 185 420 0 0 22 2 161 0 1 412 3 4 0.0000 0.0000 0.0190 7.409 7.58 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr2 219182152 G GGAGGAA 0.500000 0.100 1 6 1 552 121 431 64 0 20 0 37 0 0 426 0 5 0.5289 0.0000 0.0116 5.050 0.31 6.30 -5.98 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7180 0.2728 0.0092 1 0 0.7079 0.2814 0.0107 1 0 0.6937 0.2932 0.0131
chr2 229591816 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 1 430 148 282 93 0 17 0 38 0 0 280 0 2 0.6284 0.0000 0.0071 7.706 0.39 11.00 -10.61 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9803 0.0197 0.0000 1 0 0.9771 0.0229 0.0000 1 0 0.9720 0.0279 0.0001
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 652 174 478 0 0 6 2 166 0 0 413 0 65 0.0000 0.0000 0.1360 28.000 16.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr2 232844199 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 4 593 198 395 84 2 33 1 78 0 0 392 0 3 0.4242 0.0000 0.0076 5.000 0.29 3.19 -2.91 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2233 0.6776 0.0991 1 1 0.2296 0.6651 0.1052 1 1 0.2374 0.6492 0.1134
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 337 140 197 72 0 3 0 65 0 0 196 0 1 0.5143 0.0000 0.0051 45.667 0.92 4.06 -3.14 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2771 0.6305 0.0924 1 1 0.2812 0.6209 0.0979 1 1 0.2860 0.6088 0.1053
chr2 233729636 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1002 220 782 186 4 19 1 10 0 0 780 2 0 0.8455 0.0000 0.0026 10.421 1.08 1.50 -0.42 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0836 0.9164 0.0000 0 0 0.8691 0.1309 0.0000
chr2 240030012 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 1517 332 1185 304 3 15 0 10 1 0 1184 0 0 0.9157 0.0008 0.0008 21.067 0.68 1.20 -0.52 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.9915 0.0085 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr2 240450682 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 588 160 428 150 1 7 0 2 0 0 428 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 21.857 0.31 1.00 -0.69 82 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9644 0.0356 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 380 105 275 1 0 19 3 82 0 0 275 0 0 0.0095 0.0000 0.0000 4.526 0.00 3.20 -3.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1071 0.8929 2 2 0.0000 0.0398 0.9602 2 2 0.0000 0.0298 0.9702
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 468 121 347 67 1 2 0 51 0 0 346 0 1 0.5537 0.0000 0.0029 59.500 1.22 2.27 -1.05 1 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5618 0.4146 0.0236 1 0 0.5562 0.4174 0.0264 1 0 0.5480 0.4215 0.0305
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 679 175 504 0 0 1 0 174 0 0 497 0 7 0.0000 0.0000 0.0139 174.000 3.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 572 126 446 51 0 24 0 51 1 0 431 0 14 0.4048 0.0022 0.0336 4.250 0.88 10.43 -9.55 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0837 0.6630 0.2532 1 1 0.0913 0.6587 0.2500 1 1 0.1021 0.6529 0.2451
chr3 12901258 TGGC T 0.002987 0.100 1 -3 1 463 126 337 66 0 4 0 56 0 0 336 0 1 0.5238 0.0000 0.0030 30.500 0.50 4.09 -3.59 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5708 0.4289 0.0003 1 0 0.5735 0.4261 0.0003 1 0 0.5765 0.4232 0.0003
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 724 232 492 86 82 53 0 11 0 0 492 0 0 0.3707 0.0000 0.0000 3.377 0.23 4.00 -3.77 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0354 0.9646 0.0000 0 0 0.7508 0.2492 0.0000
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 724 233 491 97 4 49 5 78 0 0 491 0 0 0.4163 0.0000 0.0000 3.755 0.47 3.06 -2.59 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5206 0.4625 0.0169 1 0 0.5199 0.4609 0.0193 1 0 0.5176 0.4595 0.0229
chr3 42691888 CGAG C 0.500000 0.100 1 -3 2 243 124 119 114 1 3 0 6 0 0 119 0 0 0.9194 0.0000 0.0000 40.333 0.91 3.50 -2.59 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.3441 0.6559 0.0000 0 0 0.8492 0.1508 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 653 190 463 0 0 8 1 181 0 0 460 0 3 0.0000 0.0000 0.0065 22.625 2.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 317 127 190 0 0 2 0 125 0 0 188 0 2 0.0000 0.0000 0.0105 62.500 4.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 628 151 477 4 1 17 6 123 0 0 472 0 5 0.0265 0.0000 0.0105 7.882 0.00 3.26 -3.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9605 0.0395 2 2 0.0000 0.1568 0.8432 2 2 0.0000 0.0316 0.9684
chr3 48562913 CGCG C 0.500000 0.100 1 -3 1 320 101 219 51 1 3 0 46 0 0 219 0 0 0.5050 0.0000 0.0000 32.667 0.14 3.15 -3.01 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3235 0.5778 0.0987 1 1 0.3245 0.5718 0.1036 1 1 0.3253 0.5644 0.1103
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 348 94 254 40 1 12 34 7 0 0 250 4 0 0.4255 0.0000 0.0157 6.833 0.35 3.43 -3.08 6 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1398 0.5896 0.2706 1 1 0.1445 0.5829 0.2726 1 1 0.1507 0.5745 0.2748
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 348 96 252 42 0 18 0 36 0 0 248 0 4 0.4375 0.0000 0.0159 4.333 0.71 5.81 -5.09 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2555 0.5915 0.1530 1 1 0.2578 0.5847 0.1575 1 1 0.2605 0.5761 0.1634
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 467 153 314 73 1 24 0 55 0 0 311 0 3 0.4771 0.0000 0.0096 5.375 0.34 5.49 -5.15 21 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5481 0.4289 0.0230 1 0 0.5436 0.4307 0.0258 1 0 0.5367 0.4334 0.0299
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 181 87 94 10 0 8 0 69 0 0 91 0 3 0.1149 0.0000 0.0319 9.875 0.00 7.57 -7.57 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9490 0.0510
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 232 79 153 0 0 5 7 67 0 0 152 0 1 0.0000 0.0000 0.0065 14.800 3.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0216 0.9784 2 2 0.0000 0.0233 0.9767 2 2 0.0000 0.0258 0.9742
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 232 81 151 2 0 4 66 9 0 0 151 0 0 0.0247 0.0000 0.0000 19.250 1.00 4.67 -3.67 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6869 0.3131 2 2 0.0000 0.1908 0.8092 2 2 0.0000 0.1012 0.8988
chr3 63912684 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 3 278 69 209 46 4 14 1 4 1 1 207 0 0 0.6667 0.0048 0.0096 3.929 0.67 3.75 -3.08 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.0898 0.9102 0.0000 0 1 0.3759 0.6241 0.0000
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 303 133 170 107 7 13 0 6 0 0 169 0 1 0.8045 0.0000 0.0059 9.231 0.21 3.33 -3.13 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1484 0.8516 0.0000 0 0 0.7406 0.2594 0.0000
chr3 73062330 C CA 0.500000 0.100 1 1 5 464 107 357 59 0 3 0 45 0 0 356 0 1 0.5514 0.0000 0.0028 34.667 0.34 1.38 -1.04 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5003 0.4617 0.0380 1 0 0.4958 0.4625 0.0416 1 0 0.4892 0.4640 0.0468
chr3 75730470 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 249 107 142 62 0 0 0 45 0 0 140 0 2 0.5794 0.0000 0.0141 107.000 2.32 1.33 0.99 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5485 0.4234 0.0281 1 0 0.5427 0.4261 0.0311 1 0 0.5343 0.4300 0.0357
chr3 75737855 G GT 0.500000 0.100 1 1 3 979 233 746 136 6 18 1 72 1 9 733 3 0 0.5837 0.0013 0.0174 11.833 1.84 1.79 0.05 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9966 0.0034 0.0000 1 0 0.9958 0.0042 0.0000 1 0 0.9945 0.0055 0.0000
chr3 75738710 GCA G 0.500000 0.100 1 -2 2 655 163 492 142 1 4 2 14 0 0 490 0 2 0.8712 0.0000 0.0041 39.500 0.94 8.21 -7.27 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0156 0.9844 0.0000
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 801 165 636 96 0 4 2 63 0 1 633 0 2 0.5818 0.0000 0.0047 40.250 1.32 1.40 -0.07 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8096 0.1882 0.0022 1 0 0.8008 0.1964 0.0027 1 0 0.7882 0.2082 0.0036
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 762 218 544 107 0 20 0 91 0 0 533 0 11 0.4908 0.0000 0.0202 9.900 1.40 9.23 -7.83 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2098 0.7124 0.0778 1 1 0.2179 0.6980 0.0840 1 1 0.2280 0.6795 0.0925
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 468 136 332 66 1 11 0 58 0 0 332 0 0 0.4853 0.0000 0.0000 11.364 0.35 1.12 -0.77 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3730 0.5643 0.0627 1 1 0.3738 0.5589 0.0673 1 1 0.3741 0.5521 0.0738
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 327 95 232 10 1 7 0 77 0 0 231 0 1 0.1053 0.0000 0.0043 12.429 0.60 1.14 -0.54 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9445 0.0555
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 110 34 76 26 4 1 0 3 0 0 76 0 0 0.7647 0.0000 0.0000 29.000 0.23 1.00 -0.77 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0067 0.9933 0.0000 0 1 0.1580 0.8420 0.0000 0 1 0.3861 0.6139 0.0000
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1158 308 850 93 4 76 21 114 0 1 848 0 1 0.3019 0.0000 0.0024 3.026 0.30 3.13 -2.83 29 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0004 0.1235 0.8761 1 2 0.0006 0.1302 0.8693 1 2 0.0009 0.1400 0.8592
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 1161 311 850 104 5 180 1 21 0 0 850 0 0 0.3344 0.0000 0.0000 0.727 0.32 4.81 -4.49 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr3 121677324 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 280 113 167 109 0 1 0 3 0 0 167 0 0 0.9646 0.0000 0.0000 112.000 0.31 3.00 -2.69 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2476 0.7524 0.0000 0 0 0.9046 0.0954 0.0000 0 0 0.9666 0.0334 0.0000
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 703 137 566 59 0 28 0 50 0 0 564 0 2 0.4307 0.0000 0.0035 3.893 0.39 9.54 -9.15 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3365 0.5795 0.0840 1 1 0.3377 0.5733 0.0890 1 1 0.3387 0.5656 0.0957
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.100 1 -4 1 289 108 181 102 0 2 0 4 0 0 181 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 53.000 0.11 3.00 -2.89 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0243 0.9757 0.0000 0 0 0.6975 0.3025 0.0000 0 0 0.9155 0.0845 0.0000
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 200 107 93 51 0 0 0 56 0 0 93 0 0 0.4766 0.0000 0.0000 107.000 0.57 2.27 -1.70 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1082 0.6003 0.2915 1 1 0.1133 0.5928 0.2939 1 1 0.1202 0.5833 0.2964
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 363 120 243 111 2 0 0 7 0 1 242 0 0 0.9250 0.0000 0.0041 119.000 1.34 2.71 -1.37 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1477 0.8523 0.0000 0 0 0.7380 0.2620 0.0000
chr3 134250569 A AGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 246 56 190 40 0 14 0 2 0 0 189 0 1 0.7143 0.0000 0.0053 3.000 1.52 4.00 -2.48 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.2328 0.7672 0.0000 0 0 0.5041 0.4959 0.0000
chr3 183775955 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 2 391 171 220 73 15 30 1 52 0 0 219 0 1 0.4269 0.0000 0.0045 4.700 0.18 3.12 -2.94 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8781 0.1208 0.0010 1 0 0.8694 0.1293 0.0013 1 0 0.8566 0.1416 0.0018
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 391 177 214 127 5 30 1 14 0 0 214 0 0 0.7175 0.0000 0.0000 4.900 1.32 3.00 -1.68 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0385 0.9615 0.0000
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 567 138 429 110 3 18 0 7 0 1 427 0 1 0.7971 0.0000 0.0047 6.667 0.38 2.29 -1.90 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0560 0.9440 0.0000 0 0 0.5978 0.4022 0.0000
chr3 195721040 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 322 206 116 196 2 4 0 4 0 0 116 0 0 0.9515 0.0000 0.0000 50.500 1.31 3.00 -1.69 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7687 0.2313 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr3 195786700 GTGGATGCTGAGGAAGTGTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTAGATGCTGAGGAAGGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTCACCTT G 0.500000 0.100 1 -96 1 2354 594 1760 11 6 402 23 152 0 3 1725 20 12 0.0185 0.0000 0.0199 0.460 4.73 2.41 2.31 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.5884 0.4116
chr3 195788493 GTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGCA G 0.500000 0.100 1 -96 1 2287 585 1702 316 14 58 12 185 34 21 1634 2 11 0.5402 0.0200 0.0400 9.849 4.34 4.75 -0.42 34 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 195788495 CGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGGGCT C 0.500000 0.100 1 -48 1 2228 429 1799 138 20 95 5 171 26 27 1712 9 25 0.3217 0.0145 0.0484 3.656 5.44 5.16 0.28 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0588 0.8829 0.0584 1 1 0.0672 0.8661 0.0667 1 1 0.0792 0.8422 0.0786
chr3 198153257 CTGGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -9 2 316 115 201 20 3 11 68 13 0 0 193 3 5 0.1739 0.0000 0.0398 12.750 0.15 9.31 -9.16 16 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7889 0.2111 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 315 115 200 2 0 30 3 80 0 0 192 3 5 0.0174 0.0000 0.0400 2.833 0.00 8.85 -8.85 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4483 0.5517 2 2 0.0000 0.0810 0.9190 2 2 0.0000 0.0413 0.9587
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 315 116 199 2 0 28 6 80 0 0 190 1 8 0.0172 0.0000 0.0452 3.143 0.00 8.59 -8.59 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4021 0.5979 2 2 0.0000 0.0682 0.9318 2 2 0.0000 0.0347 0.9653
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 514 107 407 0 0 2 0 105 0 0 345 0 62 0.0000 0.0000 0.1523 52.500 15.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 1394781 CGATGT C 0.001624 0.100 1 -5 2 949 191 758 91 7 25 1 67 6 1 740 4 7 0.4764 0.0079 0.0237 6.667 3.67 6.81 -3.14 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8401 0.1599 0.0000 1 0 0.8358 0.1642 0.0000 1 0 0.8295 0.1705 0.0000
chr4 3074926 AG A 0.010091 0.100 1 -1 1 620 248 372 129 9 76 32 2 2 4 366 0 0 0.5202 0.0054 0.0161 6.522 6.08 21.50 -15.42 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1234 0.8766 0.0000 0 0 0.7999 0.2001 0.0000
chr4 3074966 G GCCGCCGCCT 0.001791 0.100 1 9 2 620 209 411 4 1 6 6 192 0 2 382 7 20 0.0191 0.0000 0.0706 33.667 0.50 8.48 -7.98 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.6512 0.3488 2 2 0.0000 0.2375 0.7625
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 572 143 429 3 0 11 0 129 1 0 421 0 7 0.0210 0.0023 0.0186 12.000 0.00 12.41 -12.41 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9894 0.0106 2 1 0.0000 0.5159 0.4841 2 2 0.0000 0.1927 0.8073
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 695 202 493 165 1 28 0 8 3 0 489 0 1 0.8168 0.0061 0.0081 6.214 0.77 3.00 -2.23 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2513 0.7487 0.0000 0 0 0.9201 0.0799 0.0000
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 707 226 481 188 2 26 2 8 0 0 479 0 2 0.8319 0.0000 0.0042 7.654 1.16 6.38 -5.22 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0970 0.9030 0.0000 0 0 0.8911 0.1089 0.0000
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 545 200 345 110 0 3 0 87 0 0 344 0 1 0.5500 0.0000 0.0029 65.667 0.54 9.25 -8.72 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6213 0.3707 0.0079 1 0 0.6180 0.3727 0.0093 1 0 0.6123 0.3762 0.0115
chr4 44447936 G GCCA 0.500000 0.100 1 3 2 626 156 470 80 5 13 1 57 0 0 470 0 0 0.5128 0.0000 0.0000 11.583 1.32 3.67 -2.34 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7754 0.2207 0.0039 1 0 0.7661 0.2291 0.0047 1 0 0.7528 0.2411 0.0061
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 638 132 506 116 1 13 0 2 0 0 504 0 2 0.8788 0.0000 0.0040 9.154 1.22 19.00 -17.78 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0508 0.9492 0.0000 0 0 0.8299 0.1701 0.0000 0 0 0.9573 0.0427 0.0000
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 146 74 72 44 0 0 0 30 1 0 71 0 0 0.5946 0.0139 0.0139 74.000 0.16 1.23 -1.07 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5867 0.3833 0.0300 1 0 0.5779 0.3889 0.0332 1 0 0.5657 0.3965 0.0378
chr4 87614933 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2959 842 2117 718 12 84 6 22 95 89 1920 5 8 0.8527 0.0449 0.0931 9.171 1.54 12.59 -11.05 124 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3645 808 2837 6 14 35 23 730 37 57 2523 169 51 0.0074 0.0130 0.1107 23.061 6.67 9.93 -3.26 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 3830 801 3029 26 6 100 14 655 25 76 2642 111 175 0.0325 0.0083 0.1278 7.144 5.54 11.21 -5.67 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.100 1 -18 1 167 88 79 49 0 5 0 34 0 0 79 0 0 0.5568 0.0000 0.0000 16.600 0.10 14.62 -14.52 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5779 0.3926 0.0295 1 0 0.5698 0.3975 0.0327 1 0 0.5584 0.4043 0.0373
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 528 225 303 0 0 30 9 186 0 0 300 1 2 0.0000 0.0000 0.0099 6.500 3.10 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 495 170 325 52 75 33 1 9 0 4 321 0 0 0.3059 0.0000 0.0123 4.250 1.00 5.22 -4.22 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0250 0.9750 0.0000 0 0 0.5358 0.4642 0.0000
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 2 496 180 316 81 3 25 0 71 0 1 307 1 7 0.4500 0.0000 0.0285 6.200 1.57 9.69 -8.12 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2780 0.6463 0.0757 1 1 0.2833 0.6356 0.0811 1 1 0.2894 0.6220 0.0885
chr4 149733320 TGG T 0.500000 0.100 1 -2 1 288 102 186 89 0 3 1 9 0 0 186 0 0 0.8725 0.0000 0.0000 33.000 0.06 2.00 -1.94 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 1 0.1526 0.8474 0.0000
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 273 129 144 58 0 15 1 55 0 0 144 0 0 0.4496 0.0000 0.0000 7.600 0.88 5.18 -4.30 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2202 0.6317 0.1481 1 1 0.2246 0.6221 0.1533 1 1 0.2299 0.6100 0.1601
chr4 164957227 GTCCAACAGCGGTCGC G 0.500000 0.100 1 -15 1 535 139 396 74 0 7 0 58 0 0 389 0 7 0.5324 0.0000 0.0177 18.857 0.11 13.67 -13.56 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3586 0.5812 0.0602 1 1 0.3606 0.5745 0.0649 1 1 0.3624 0.5662 0.0714
chr4 173332110 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 153 38 115 20 1 0 0 17 0 0 115 0 0 0.5263 0.0000 0.0000 38.000 1.25 3.53 -2.28 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3252 0.5275 0.1474 1 1 0.3235 0.5254 0.1512 1 1 0.3211 0.5227 0.1562
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 797 166 631 92 0 2 0 72 0 0 627 0 4 0.5542 0.0000 0.0063 82.000 0.17 3.47 -3.30 8 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5062 0.4726 0.0212 1 0 0.5051 0.4710 0.0239 1 0 0.5024 0.4696 0.0280
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.100 1 -12 4 223 107 116 95 1 5 0 6 1 0 115 0 0 0.8879 0.0086 0.0086 25.500 0.72 12.50 -11.78 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 0 0.5948 0.4052 0.0000 0 0 0.9419 0.0581 0.0000
chr5 1295342 CCG C 0.500000 0.100 1 -2 3 725 136 589 55 1 13 1 66 0 0 587 0 2 0.4044 0.0000 0.0034 9.385 1.16 2.73 -1.56 11 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0382 0.4926 0.4692 1 1 0.0418 0.4913 0.4669 1 1 0.0471 0.4900 0.4629
chr5 11385089 C CGCG 0.001142 0.100 1 3 1 513 162 351 72 5 21 0 64 0 0 350 0 1 0.4444 0.0000 0.0028 7.316 0.75 3.39 -2.64 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6146 0.3853 0.0001 1 0 0.6164 0.3835 0.0001 1 0 0.6180 0.3819 0.0001
chr5 16179479 TCGG T 0.500000 0.100 1 -3 1 310 95 215 82 1 4 0 8 1 0 214 0 0 0.8632 0.0047 0.0047 22.750 1.43 3.00 -1.57 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0131 0.9869 0.0000 0 1 0.2575 0.7425 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 720 172 548 66 0 30 6 70 0 0 547 0 1 0.3837 0.0000 0.0018 4.733 0.23 3.16 -2.93 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0458 0.5493 0.4048 1 1 0.0500 0.5444 0.4056 1 1 0.0558 0.5384 0.4057
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 350 50 300 0 0 29 1 20 1 2 283 2 12 0.0000 0.0033 0.0567 0.724 9.40 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9483 0.0517 2 1 0.0000 0.6883 0.3117 2 2 0.0000 0.4814 0.5186
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 347 103 244 47 0 3 0 53 0 0 244 0 0 0.4563 0.0000 0.0000 33.333 0.23 5.91 -5.67 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0980 0.5801 0.3219 1 1 0.1030 0.5740 0.3231 1 1 0.1097 0.5663 0.3240
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 512 132 380 0 0 1 0 131 0 0 376 0 4 0.0000 0.0000 0.0105 131.000 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr5 75635851 CCCAG C 0.500000 0.100 1 -4 1 277 81 196 52 0 2 0 27 0 0 194 0 2 0.6420 0.0000 0.0102 39.500 0.23 5.67 -5.44 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7606 0.2315 0.0080 1 0 0.7490 0.2416 0.0093 1 0 0.7328 0.2556 0.0115
chr5 75635856 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 277 78 199 50 0 2 1 25 0 0 197 0 2 0.6410 0.0000 0.0101 37.500 0.24 6.08 -5.84 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7430 0.2474 0.0096 1 0 0.7314 0.2574 0.0112 1 0 0.7152 0.2711 0.0137
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 326 87 239 71 3 9 0 4 1 0 238 0 0 0.8161 0.0042 0.0042 8.667 3.49 28.50 -25.01 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0065 0.9935 0.0000 0 1 0.3821 0.6179 0.0000 0 0 0.7508 0.2492 0.0000
chr5 80654908 G GCAGCGCCCC 0.500000 0.100 1 9 2 313 75 238 36 1 13 0 25 1 0 236 0 1 0.4800 0.0042 0.0084 4.769 5.44 6.64 -1.20 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5143 0.4363 0.0494 1 0 0.5071 0.4396 0.0533 1 0 0.4971 0.4440 0.0589
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 314 73 241 67 0 2 0 4 0 0 241 0 0 0.9178 0.0000 0.0000 35.500 3.91 28.50 -24.59 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0042 0.9958 0.0000 0 1 0.2865 0.7135 0.0000 0 0 0.6646 0.3354 0.0000
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 269 103 166 96 0 1 0 6 0 0 166 0 0 0.9320 0.0000 0.0000 102.000 0.26 3.00 -2.74 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1689 0.8311 0.0000 0 0 0.6916 0.3084 0.0000
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 878 207 671 87 2 19 0 99 1 2 662 2 4 0.4203 0.0015 0.0134 9.842 0.59 3.55 -2.96 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0280 0.5607 0.4112 1 1 0.0313 0.5539 0.4148 1 1 0.0362 0.5457 0.4181
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 600 144 456 135 0 3 0 6 0 0 456 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 47.000 0.16 1.17 -1.01 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.5908 0.4092 0.0000 0 0 0.9373 0.0627 0.0000
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 438 141 297 109 2 23 0 7 0 0 296 0 1 0.7730 0.0000 0.0034 5.087 0.48 5.43 -4.95 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0484 0.9516 0.0000 0 0 0.5612 0.4388 0.0000
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 465 131 334 110 1 15 0 5 1 0 333 0 0 0.8397 0.0030 0.0030 7.733 0.62 4.80 -4.18 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 0 0.5671 0.4329 0.0000 0 0 0.9025 0.0975 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 156 57 99 0 0 3 0 54 0 0 95 0 4 0.0000 0.0000 0.0404 18.000 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0494 0.9506 2 2 0.0000 0.0523 0.9477 2 2 0.0000 0.0565 0.9435
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 248 92 156 86 1 0 0 5 0 0 156 0 0 0.9348 0.0000 0.0000 91.000 0.30 3.20 -2.90 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2717 0.7283 0.0000 0 0 0.7319 0.2681 0.0000
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 248 96 152 90 0 1 0 5 0 0 152 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 95.000 0.29 3.20 -2.91 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.3056 0.6944 0.0000 0 0 0.7615 0.2385 0.0000
chr5 141415641 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 797 124 673 51 9 15 9 40 0 2 669 1 1 0.4113 0.0000 0.0059 6.733 1.92 2.62 -0.70 29 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4464 0.5035 0.0501 1 1 0.4438 0.5020 0.0542 1 1 0.4396 0.5004 0.0600
chr5 141432807 ACT A 0.500000 0.100 1 -2 2 960 263 697 244 0 4 0 15 0 0 697 0 0 0.9278 0.0000 0.0000 64.750 0.39 2.53 -2.14 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0223 0.9777 0.0000 0 0 0.9015 0.0985 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 403 100 303 2 0 4 0 94 0 0 287 0 16 0.0200 0.0000 0.0528 24.000 0.00 9.69 -9.69 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2384 0.7616 2 2 0.0000 0.0334 0.9666 2 2 0.0000 0.0171 0.9829
chr5 141945390 C CCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 12 1 403 100 303 2 0 5 1 92 0 0 287 0 16 0.0200 0.0000 0.0528 19.000 0.00 9.73 -9.73 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.2456 0.7544 2 2 0.0000 0.0347 0.9653 2 2 0.0000 0.0177 0.9823
chr5 146459072 TCAGGCCCAGGCCCAGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 934 303 631 148 3 40 2 110 0 0 628 2 1 0.4884 0.0000 0.0048 6.921 0.60 9.95 -9.35 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8158 0.1834 0.0008 1 0 0.8101 0.1889 0.0010 1 0 0.8015 0.1971 0.0014
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 12 1 357 133 224 42 2 32 0 57 0 0 218 1 5 0.3158 0.0000 0.0268 3.156 3.57 8.30 -4.73 6 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0148 0.3320 0.6532 1 2 0.0169 0.3387 0.6444 1 2 0.0201 0.3480 0.6319
chr5 146878727 AGCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 357 141 216 62 5 30 4 40 0 0 216 0 0 0.4397 0.0000 0.0000 3.700 7.52 3.23 4.29 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7291 0.2629 0.0080 1 0 0.7191 0.2715 0.0094 1 0 0.7049 0.2835 0.0116
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 739 181 558 111 0 1 0 69 0 0 551 4 3 0.6133 0.0000 0.0125 180.000 0.68 4.06 -3.37 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8721 0.1272 0.0007 1 0 0.8642 0.1348 0.0010 1 0 0.8526 0.1460 0.0014
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 746 182 564 112 0 1 2 67 0 0 555 4 5 0.6154 0.0000 0.0160 181.000 0.71 4.18 -3.46 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8509 0.1481 0.0010 1 0 0.8429 0.1558 0.0013 1 0 0.8313 0.1669 0.0018
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 526 132 394 9 0 0 0 123 0 0 394 0 0 0.0682 0.0000 0.0000 132.000 0.22 1.24 -1.02 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9680 0.0320 2 2 0.0000 0.4496 0.5504
chr5 153492228 T TC 0.500000 0.100 1 1 2 120 60 60 9 0 0 0 51 0 0 59 0 1 0.1500 0.0000 0.0167 60.000 0.00 1.22 -1.22 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9626 0.0374
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 379 155 224 8 0 13 0 134 0 0 222 0 2 0.0516 0.0000 0.0089 10.923 0.25 13.49 -13.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8488 0.1512 2 2 0.0000 0.1877 0.8123
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 188 75 113 38 4 3 0 30 0 0 113 0 0 0.5067 0.0000 0.0000 23.667 0.11 3.00 -2.89 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4975 0.4515 0.0510 1 0 0.4913 0.4538 0.0550 1 0 0.4825 0.4569 0.0606
chr5 168454037 GGGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 188 71 117 38 27 2 0 4 0 0 117 0 0 0.5352 0.0000 0.0000 34.500 0.13 2.25 -2.12 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 1 0.2685 0.7315 0.0000 0 0 0.6426 0.3574 0.0000
chr5 176384091 CGT C 0.500000 0.100 1 -2 1 340 106 234 96 2 2 0 6 0 0 234 0 0 0.9057 0.0000 0.0000 51.500 0.17 2.00 -1.83 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1820 0.8180 0.0000 0 0 0.7094 0.2906 0.0000
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 437 127 310 56 0 7 0 64 0 0 310 0 0 0.4409 0.0000 0.0000 17.143 1.00 3.94 -2.94 34 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0722 0.5750 0.3527 1 1 0.0771 0.5690 0.3539 1 1 0.0837 0.5615 0.3548
chr5 179644808 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 392 140 252 95 0 1 0 44 0 0 252 0 0 0.6786 0.0000 0.0000 139.000 0.81 4.73 -3.92 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9754 0.0246 0.0000 1 0 0.9716 0.0283 0.0001 1 0 0.9658 0.0341 0.0001
chr5 181125166 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 704 168 536 141 2 9 0 16 0 0 536 0 0 0.8393 0.0000 0.0000 17.667 0.27 3.31 -3.04 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0345 0.9655 0.0000
chr5 181155256 TTGTC T 0.500000 0.100 1 -4 3 817 218 599 117 1 14 0 86 1 0 596 0 2 0.5367 0.0017 0.0050 14.571 0.35 4.05 -3.70 71 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7951 0.2032 0.0017 1 0 0.7879 0.2100 0.0021 1 0 0.7772 0.2199 0.0029
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 616 101 515 50 0 13 3 35 0 0 514 0 1 0.4950 0.0000 0.0019 6.769 0.26 3.34 -3.08 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4647 0.4829 0.0524 1 1 0.4605 0.4830 0.0565 1 1 0.4544 0.4833 0.0623
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 544 125 419 2 0 15 4 104 0 0 414 0 5 0.0160 0.0000 0.0119 7.333 0.00 3.60 -3.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2022 0.7978 2 2 0.0000 0.0274 0.9726 2 2 0.0000 0.0140 0.9860
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 575 151 424 108 4 32 4 3 2 0 421 1 0 0.7152 0.0047 0.0071 3.867 1.76 4.33 -2.57 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0296 0.9704 0.0000 0 0 0.8214 0.1786 0.0000 0 0 0.9680 0.0320 0.0000
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 533 119 414 61 2 10 1 45 0 3 403 3 5 0.5126 0.0000 0.0266 12.111 1.46 4.20 -2.74 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5664 0.4166 0.0169 1 0 0.5654 0.4161 0.0185 1 0 0.5634 0.4159 0.0207
chr6 13711474 T TGCGGCG 0.000130 0.100 1 6 1 303 89 214 39 0 12 0 38 1 1 206 1 5 0.4382 0.0047 0.0374 6.417 0.87 6.32 -5.44 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3234 0.6765 0.0001 1 1 0.3331 0.6669 0.0001 1 1 0.3456 0.6543 0.0001
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1399 374 1025 30 45 119 59 121 0 0 1021 0 4 0.0802 0.0000 0.0039 2.371 2.07 3.45 -1.38 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0003 0.9997 1 2 0.0000 0.0005 0.9995 1 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr6 16327684 A ATGC 0.101269 0.100 1 3 1 1403 381 1022 127 14 108 10 122 0 0 1021 1 0 0.3333 0.0000 0.0010 2.558 1.78 5.45 -3.67 45 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3051 0.6850 0.0099 1 1 0.3211 0.6680 0.0110 1 1 0.3413 0.6463 0.0124
chr6 18263865 C CTCG 0.000049 0.100 1 3 2 247 113 134 106 1 2 0 4 0 0 134 0 0 0.9381 0.0000 0.0000 55.500 0.33 2.50 -2.17 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr6 27255285 AAAGGAGAGCCAGATT A 0.178475 0.100 1 -15 1 480 121 359 102 0 11 0 8 0 0 357 0 2 0.8430 0.0000 0.0056 10.000 0.51 11.25 -10.74 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0175 0.9825 0.0000 0 0 0.5145 0.4855 0.0000
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.100 1 2 1 991 227 764 211 0 7 0 9 0 0 764 0 0 0.9295 0.0000 0.0000 31.429 0.32 2.22 -1.90 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.9676 0.0324 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr6 29173644 TA T 0.001133 0.100 1 -1 2 500 142 358 120 2 11 0 9 0 0 358 0 0 0.8451 0.0000 0.0000 11.909 0.21 1.33 -1.12 94 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.9658 0.0342 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr6 29657255 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 136 64 72 24 0 8 2 30 0 0 72 0 0 0.3750 0.0000 0.0000 7.000 1.50 4.73 -3.23 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0872 0.4996 0.4132 1 1 0.0917 0.4992 0.4091 1 1 0.0978 0.4989 0.4033
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 387 109 278 55 0 2 0 52 0 0 277 0 1 0.5046 0.0000 0.0036 53.500 0.31 1.50 -1.19 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2243 0.6248 0.1509 1 1 0.2283 0.6157 0.1560 1 1 0.2332 0.6042 0.1626
chr6 30602901 AGGACCCCCT A 0.500000 0.100 1 -9 5 619 163 456 100 2 4 0 57 0 0 454 0 2 0.6135 0.0000 0.0044 39.750 0.82 7.39 -6.57 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9413 0.0585 0.0002 1 0 0.9352 0.0646 0.0003 1 0 0.9260 0.0737 0.0004
chr6 30949583 CACACCATCCCCAGCAGAGCCTACAGAACATGGAGAAAGGACAGCCAATGAGAACACT C 0.500000 0.100 1 -57 2 1865 509 1356 241 16 112 5 135 1 6 1183 39 127 0.4735 0.0007 0.1276 3.495 1.54 2.05 -0.51 47 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0003 0.4104 0.5893 1 2 0.0004 0.3959 0.6036 1 2 0.0006 0.3801 0.6193
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 554 151 403 76 63 7 0 5 0 0 403 0 0 0.5033 0.0000 0.0000 13.500 0.71 2.00 -1.29 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0165 0.9835 0.0000 0 0 0.8056 0.1944 0.0000 0 0 0.9650 0.0350 0.0000
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 554 151 403 76 5 6 0 64 0 0 400 1 2 0.5033 0.0000 0.0074 24.167 0.71 2.11 -1.40 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4582 0.5083 0.0335 1 1 0.4574 0.5055 0.0370 1 1 0.4555 0.5024 0.0421
chr6 31412224 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 708 192 516 178 1 4 0 9 0 0 516 0 0 0.9271 0.0000 0.0000 47.000 0.88 2.89 -2.01 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3476 0.6524 0.0000 0 0 0.9485 0.0515 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 614 199 415 0 3 1 0 195 0 0 415 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 198.000 2.91 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 614 199 415 157 6 2 8 26 0 0 415 0 0 0.7889 0.0000 0.0000 196.000 2.45 5.31 -2.86 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 502 159 343 90 0 11 0 58 0 0 339 0 4 0.5660 0.0000 0.0117 13.455 1.26 11.22 -9.97 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7895 0.2074 0.0031 1 0 0.7805 0.2157 0.0038 1 0 0.7675 0.2276 0.0049
chr6 32223881 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 440 214 226 4 177 23 0 10 0 0 225 0 1 0.0187 0.0000 0.0044 8.682 0.75 4.00 -3.25 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0689 0.9311 0.0000 0 0 0.8565 0.1435 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 296 89 207 64 0 3 0 22 0 0 207 0 0 0.7191 0.0000 0.0000 43.000 0.25 4.27 -4.02 20 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9533 0.0465 0.0002 1 0 0.9462 0.0535 0.0003 1 0 0.8504 0.1492 0.0005
chr6 32521966 CG C 0.500000 0.100 1 -1 2 138 47 91 25 1 19 0 2 1 0 89 0 1 0.5319 0.0110 0.0220 1.474 8.56 7.00 1.56 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 1 0.1526 0.8474 0.0000 0 1 0.3786 0.6214 0.0000
chr6 32530180 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 159 57 102 1 35 10 9 2 0 0 101 0 1 0.0175 0.0000 0.0098 1.500 11.00 9.50 1.50 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6323 0.3353 0.0325 1 0 0.6150 0.3495 0.0354 1 0 0.5689 0.3931 0.0380
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 726 295 431 177 6 52 1 59 0 0 430 0 1 0.6000 0.0000 0.0023 4.725 7.90 8.05 -0.15 55 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.6333 0.3667 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 724 292 432 207 8 18 1 58 0 0 431 0 1 0.7089 0.0000 0.0023 17.062 8.32 8.22 0.09 73 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 1 0.0202 0.9798 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGA 0.500000 0.100 1 18 1 374 79 295 40 0 8 0 31 0 0 279 1 15 0.5063 0.0000 0.0542 8.875 0.97 14.61 -13.64 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0903 0.5512 0.3585 1 1 0.0951 0.5471 0.3579 1 1 0.1016 0.5419 0.3565
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 374 79 295 37 0 11 0 31 0 0 279 1 15 0.4684 0.0000 0.0542 6.182 1.03 14.61 -13.59 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0610 0.4963 0.4426 1 1 0.0654 0.4957 0.4389 1 1 0.0714 0.4951 0.4335
chr6 36722044 C CGGGCCCAGCGGTGCAGGA 0.500000 0.100 1 18 2 674 132 542 72 0 32 0 28 0 0 522 0 20 0.5455 0.0000 0.0369 3.125 0.83 12.79 -11.95 6 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.7449 0.2487 0.0064 1 0 0.7351 0.2573 0.0076 1 0 0.7211 0.2694 0.0095
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 840 226 614 11 0 9 1 205 0 0 611 1 2 0.0487 0.0000 0.0049 24.111 0.09 3.13 -3.04 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7822 0.2178 2 2 0.0000 0.0441 0.9559
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 337 119 218 13 0 14 0 92 0 0 218 0 0 0.1092 0.0000 0.0000 7.500 0.23 6.24 -6.01 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9797 0.0203
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 850 200 650 164 1 30 0 5 0 0 650 0 0 0.8200 0.0000 0.0000 5.667 0.72 3.80 -3.08 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0628 0.9372 0.0000 0 0 0.9486 0.0514 0.0000 0 0 0.9918 0.0082 0.0000
chr6 44002766 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 499 126 373 77 3 42 0 4 0 0 373 0 0 0.6111 0.0000 0.0000 2.000 2.25 3.25 -1.00 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0081 0.9919 0.0000 0 1 0.4348 0.5652 0.0000 0 0 0.7883 0.2117 0.0000
chr6 44172317 T TGGCTGCC 0.500000 0.100 1 7 1 204 92 112 35 0 1 0 56 0 0 112 0 0 0.3804 0.0000 0.0000 91.000 0.26 4.57 -4.31 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0111 0.2775 0.7115 1 2 0.0128 0.2864 0.7008 1 2 0.0155 0.2986 0.6859
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.100 1 -15 2 757 224 533 92 0 73 0 59 0 1 528 0 4 0.4107 0.0000 0.0094 2.068 1.48 11.54 -10.06 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8177 0.1801 0.0021 1 0 0.8087 0.1886 0.0027 1 0 0.7957 0.2007 0.0036
chr6 84174775 T TTCCTGTTGTTTCTTTAGTTCTTCCAACTTATTTTCTAGTTCTTTC 0.500000 0.100 1 45 5 299 80 219 63 1 8 0 8 0 0 219 0 0 0.7875 0.0000 0.0000 8.875 0.19 0.50 -0.31 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 1 0.1156 0.8844 0.0000
chr6 84186595 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 314 89 225 84 0 1 0 4 0 0 225 0 0 0.9438 0.0000 0.0000 88.000 0.10 1.75 -1.65 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.4843 0.5157 0.0000 0 0 0.8189 0.1811 0.0000
chr6 84764181 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 341 118 223 104 1 6 0 7 0 0 223 0 0 0.8814 0.0000 0.0000 18.667 0.66 2.00 -1.34 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1019 0.8981 0.0000 0 0 0.6481 0.3519 0.0000
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 670 117 553 70 7 35 1 4 3 0 549 1 0 0.5983 0.0054 0.0072 2.412 1.19 2.25 -1.06 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.2113 0.7887 0.0000 0 0 0.6321 0.3679 0.0000
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 105 47 58 25 0 2 0 20 0 0 58 0 0 0.5319 0.0000 0.0000 22.500 0.08 2.75 -2.67 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3460 0.5256 0.1284 1 1 0.3438 0.5236 0.1326 1 1 0.3407 0.5211 0.1382
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 785 187 598 87 1 6 0 93 0 0 593 0 5 0.4652 0.0000 0.0084 30.167 0.25 3.14 -2.89 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0461 0.6189 0.3350 1 1 0.0506 0.6093 0.3401 1 1 0.0569 0.5974 0.3458
chr6 116437084 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 5 700 131 569 77 2 1 0 51 0 0 568 0 1 0.5878 0.0000 0.0018 130.000 0.22 3.20 -2.98 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7890 0.2072 0.0038 1 0 0.7793 0.2162 0.0046 1 0 0.7653 0.2288 0.0059
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 623 141 482 134 0 2 0 5 0 0 482 0 0 0.9504 0.0000 0.0000 69.500 0.34 7.20 -6.86 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0136 0.9864 0.0000 0 0 0.7973 0.2027 0.0000 0 0 0.9642 0.0358 0.0000
chr6 118491647 ATGT A 0.500000 0.100 1 -3 3 326 117 209 109 0 6 0 2 0 0 209 0 0 0.9316 0.0000 0.0000 18.500 0.17 3.00 -2.83 49 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7524 0.2476 0.0000 0 0 0.9649 0.0351 0.0000 0 0 0.9821 0.0179 0.0000
chr6 123464887 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 337 103 234 56 1 4 0 42 0 0 234 0 0 0.5437 0.0000 0.0000 24.750 0.48 1.12 -0.64 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5558 0.4148 0.0294 1 0 0.5492 0.4182 0.0326 1 0 0.5398 0.4230 0.0372
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 323 101 222 48 0 4 0 49 0 0 222 0 0 0.4752 0.0000 0.0000 24.250 0.27 1.43 -1.16 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1732 0.6155 0.2112 1 1 0.1778 0.6071 0.2151 1 1 0.1837 0.5963 0.2200
chr6 138334829 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 780 198 582 174 0 11 0 13 0 0 582 0 0 0.8788 0.0000 0.0000 17.000 0.39 3.08 -2.69 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 0 0.5249 0.4751 0.0000
chr6 139373346 TTGCCGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 577 145 432 84 0 13 0 48 0 0 429 0 3 0.5793 0.0000 0.0069 10.154 1.00 6.12 -5.12 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8706 0.1282 0.0013 1 0 0.8615 0.1369 0.0016 1 0 0.8483 0.1495 0.0022
chr6 139373408 AGAGCCGCCGGGGGTGCTGCTGCCGCCC A 0.500000 0.100 1 -27 2 636 178 458 156 0 18 0 4 0 0 458 0 0 0.8764 0.0000 0.0000 8.889 1.37 21.00 -19.63 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2811 0.7189 0.0000 0 0 0.9716 0.0284 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr6 149942091 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 1 123 60 63 36 0 0 0 24 0 0 63 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 60.000 0.86 6.42 -5.56 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5236 0.4278 0.0485 1 0 0.5159 0.4317 0.0524 1 0 0.5053 0.4368 0.0579
chr6 149970071 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 156 72 84 42 0 2 0 28 0 0 83 0 1 0.5833 0.0000 0.0119 35.000 0.57 1.14 -0.57 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5385 0.4206 0.0409 1 0 0.5309 0.4245 0.0446 1 0 0.5204 0.4298 0.0498
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 869 205 664 0 0 13 0 192 0 0 658 0 6 0.0000 0.0000 0.0090 14.769 3.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 183 82 101 37 1 2 0 42 0 0 101 0 0 0.4512 0.0000 0.0000 40.000 0.14 4.24 -4.10 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1313 0.5782 0.2904 1 1 0.1360 0.5724 0.2916 1 1 0.1422 0.5650 0.2928
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 675 272 403 138 0 42 0 92 0 0 395 0 8 0.5074 0.0000 0.0199 5.476 0.25 15.51 -15.26 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8701 0.1295 0.0005 1 0 0.8633 0.1360 0.0006 1 0 0.8534 0.1457 0.0009
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 420 171 249 85 1 5 0 80 0 0 249 0 0 0.4971 0.0000 0.0000 33.200 0.13 5.58 -5.45 45 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2630 0.6565 0.0804 1 1 0.2687 0.6452 0.0860 1 1 0.2754 0.6309 0.0937
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 227 78 149 6 0 11 0 61 0 0 147 0 2 0.0769 0.0000 0.0134 6.091 0.00 8.25 -8.25 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9624 0.0376 2 1 0.0000 0.6887 0.3113
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 329 135 194 0 0 19 7 109 0 0 191 1 2 0.0000 0.0000 0.0155 6.105 3.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 677 167 510 129 0 34 0 4 0 0 508 0 2 0.7725 0.0000 0.0039 3.912 0.52 9.50 -8.98 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.5139 0.4861 0.0000 0 0 0.9175 0.0825 0.0000
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 752 245 507 4 3 14 111 113 0 0 507 0 0 0.0163 0.0000 0.0000 14.600 1.00 11.39 -10.39 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7092 0.2908 2 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 269 95 174 42 2 7 2 42 0 0 171 0 3 0.4421 0.0000 0.0172 12.571 0.74 4.33 -3.60 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1420 0.5989 0.2591 1 1 0.1468 0.5915 0.2617 1 1 0.1531 0.5823 0.2647
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 266 103 163 37 0 22 0 44 0 1 161 0 1 0.3592 0.0000 0.0123 3.682 3.81 3.68 0.13 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0943 0.5501 0.3556 1 1 0.0991 0.5461 0.3549 1 1 0.1056 0.5411 0.3533
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 266 104 162 49 1 19 0 35 0 0 160 0 2 0.4712 0.0000 0.0123 4.474 3.31 4.06 -0.75 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5204 0.4400 0.0396 1 0 0.5143 0.4425 0.0433 1 0 0.5056 0.4460 0.0485
chr7 4803582 C CCTGCCAGGG 0.500000 0.100 1 9 2 255 119 136 56 0 4 0 59 0 0 136 0 0 0.4706 0.0000 0.0000 28.750 0.39 7.92 -7.52 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1325 0.6272 0.2402 1 1 0.1378 0.6180 0.2442 1 1 0.1448 0.6062 0.2489
chr7 12342095 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 134 55 79 54 0 0 0 1 0 0 79 0 0 0.9818 0.0000 0.0000 55.000 0.13 2.00 -1.87 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6304 0.3696 0.0000 0 0 0.8366 0.1634 0.0000 0 0 0.8786 0.1214 0.0000
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 200 90 110 81 0 0 0 9 0 1 109 0 0 0.9000 0.0000 0.0091 90.000 0.72 1.56 -0.84 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0042 0.9958 0.0000 0 1 0.1427 0.8573 0.0000
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 626 186 440 0 0 28 5 153 0 0 440 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.643 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr7 26152597 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 365 107 258 54 0 7 1 45 0 0 254 0 4 0.5047 0.0000 0.0155 14.286 0.39 3.64 -3.26 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2708 0.6067 0.1225 1 1 0.2736 0.5988 0.1276 1 1 0.2768 0.5888 0.1344
chr7 26185767 AG A 0.500000 0.100 1 -1 4 358 64 294 37 0 4 0 23 0 0 294 0 0 0.5781 0.0000 0.0000 15.000 0.62 1.17 -0.55 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5772 0.3868 0.0360 1 0 0.5678 0.3927 0.0394 1 0 0.5550 0.4006 0.0444
chr7 27095697 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 905 294 611 225 11 46 0 12 0 1 607 0 3 0.7653 0.0000 0.0065 5.391 0.32 5.17 -4.85 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 0 0.8667 0.1333 0.0000
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 121 51 70 39 1 4 0 7 0 1 69 0 0 0.7647 0.0000 0.0143 23.000 0.62 1.14 -0.53 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 1 0.0677 0.9323 0.0000
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 469 140 329 77 0 2 0 61 0 0 328 0 1 0.5500 0.0000 0.0030 69.000 0.21 1.25 -1.04 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5141 0.4596 0.0263 1 0 0.5111 0.4596 0.0293 1 0 0.5061 0.4601 0.0338
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 196 68 128 36 0 4 0 28 0 0 125 0 3 0.5294 0.0000 0.0234 16.000 0.25 3.18 -2.93 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3264 0.5524 0.1211 1 1 0.3259 0.5484 0.1257 1 1 0.3249 0.5434 0.1318
chr7 44073397 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 675 149 526 84 0 5 0 60 0 0 526 0 0 0.5638 0.0000 0.0000 28.800 0.29 1.27 -0.98 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7241 0.2698 0.0061 1 0 0.7155 0.2772 0.0073 1 0 0.7033 0.2876 0.0091
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 213 87 126 44 0 3 1 39 0 0 124 0 2 0.5057 0.0000 0.0159 27.667 0.00 2.82 -2.82 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2443 0.5978 0.1579 1 1 0.2471 0.5906 0.1624 1 1 0.2503 0.5814 0.1682
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.100 1 3 5 268 78 190 40 2 12 1 23 0 0 189 0 1 0.5128 0.0000 0.0053 5.500 0.65 3.26 -2.61 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6467 0.3313 0.0220 1 0 0.6360 0.3393 0.0247 1 0 0.6212 0.3501 0.0286
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 282 146 136 0 0 0 1 145 0 0 136 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 145.000 1.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 775 192 583 0 0 8 2 182 0 0 578 0 5 0.0000 0.0000 0.0086 23.000 3.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 87359354 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 198 62 136 56 0 2 0 4 0 0 136 0 0 0.9032 0.0000 0.0000 30.000 0.27 1.00 -0.73 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.1892 0.8108 0.0000 0 0 0.5380 0.4620 0.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 558 152 406 68 1 14 2 67 0 0 403 0 3 0.4474 0.0000 0.0074 9.857 0.71 3.60 -2.89 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1229 0.6568 0.2204 1 1 0.1287 0.6456 0.2257 1 1 0.1364 0.6313 0.2322
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 231 81 150 8 0 6 0 67 0 0 145 0 5 0.0988 0.0000 0.0333 15.000 0.00 3.24 -3.24 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9926 0.0074 2 1 0.0000 0.8347 0.1653
chr7 99836454 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 166 73 93 70 0 0 0 3 0 0 93 0 0 0.9589 0.0000 0.0000 73.000 0.19 1.00 -0.81 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0436 0.9564 0.0000 0 0 0.5755 0.4245 0.0000 0 0 0.8134 0.1866 0.0000
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 608 189 419 102 0 3 0 84 0 0 417 0 2 0.5397 0.0000 0.0048 62.000 0.33 4.15 -3.82 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4827 0.4971 0.0202 1 1 0.4834 0.4936 0.0229 1 1 0.4832 0.4899 0.0269
chr7 100359505 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 461 132 329 64 1 14 0 53 0 0 329 0 0 0.4848 0.0000 0.0000 8.429 0.20 3.00 -2.80 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4581 0.4991 0.0428 1 1 0.4558 0.4976 0.0466 1 1 0.4518 0.4960 0.0522
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.100 1 -7 1 1767 635 1132 608 6 15 0 6 0 0 1132 0 0 0.9575 0.0000 0.0000 41.333 0.25 5.17 -4.92 50 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr7 102541185 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 694 218 476 187 6 4 0 21 0 0 476 0 0 0.8578 0.0000 0.0000 53.500 0.58 1.33 -0.75 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0163 0.9837 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 613 192 421 89 0 9 0 94 0 0 421 0 0 0.4635 0.0000 0.0000 20.333 0.17 3.03 -2.86 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0851 0.6856 0.2293 1 1 0.0911 0.6726 0.2363 1 1 0.0993 0.6560 0.2447
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 407 117 290 39 1 28 1 48 0 0 281 1 8 0.3333 0.0000 0.0310 3.179 1.38 7.00 -5.62 11 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0188 0.3512 0.6300 1 2 0.0212 0.3575 0.6213 1 2 0.0249 0.3661 0.6090
chr7 103989356 T TGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 407 117 290 39 1 29 2 46 0 0 281 1 8 0.3333 0.0000 0.0310 3.143 1.38 7.09 -5.70 11 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0208 0.3639 0.6152 1 2 0.0234 0.3697 0.6068 1 2 0.0273 0.3777 0.5950
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 719 180 539 75 0 20 0 85 0 0 539 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 8.000 1.28 3.79 -2.51 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0498 0.5885 0.3617 1 1 0.0542 0.5810 0.3647 1 1 0.0605 0.5718 0.3677
chr7 124032402 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 772 220 552 85 2 23 101 9 0 0 546 5 1 0.3864 0.0000 0.0109 8.818 0.45 5.11 -4.66 1 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0032 0.2575 0.7394 1 2 0.0039 0.2633 0.7328 1 2 0.0050 0.2719 0.7231
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 774 223 551 87 2 27 3 104 0 0 547 0 4 0.3901 0.0000 0.0073 7.760 0.49 6.42 -5.93 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0079 0.3706 0.6216 1 2 0.0092 0.3725 0.6182 1 2 0.0114 0.3760 0.6126
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 724 274 450 226 0 34 0 14 1 0 449 0 0 0.8248 0.0022 0.0022 7.059 0.36 13.71 -13.35 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0275 0.9725 0.0000 0 0 0.8840 0.1160 0.0000
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 309 138 171 106 6 24 0 2 0 1 170 0 0 0.7681 0.0000 0.0058 4.750 12.31 6.00 6.31 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7917 0.2083 0.0000 0 0 0.9716 0.0284 0.0000 0 0 0.9855 0.0145 0.0000
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -12 1 309 141 168 2 0 12 0 127 0 0 160 0 8 0.0142 0.0000 0.0476 10.750 6.00 10.94 -4.94 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0805 0.9195 2 2 0.0000 0.0098 0.9902 2 2 0.0000 0.0051 0.9949
chr7 137846769 T TGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 1 392 102 290 45 0 12 1 44 0 0 285 0 5 0.4412 0.0000 0.0172 8.182 0.76 6.00 -5.24 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1165 0.5898 0.2937 1 1 0.1215 0.5831 0.2955 1 1 0.1281 0.5746 0.2973
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 230 84 146 42 0 2 0 40 0 0 145 0 1 0.5000 0.0000 0.0068 41.000 0.19 3.05 -2.86 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2202 0.5992 0.1806 1 1 0.2235 0.5919 0.1847 1 1 0.2275 0.5826 0.1899
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.100 1 19 1 160 81 79 41 0 24 0 16 0 0 77 0 2 0.5062 0.0000 0.0253 2.375 0.15 13.25 -13.10 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7790 0.2129 0.0082 1 0 0.7666 0.2238 0.0096 1 0 0.7489 0.2393 0.0118
chr7 141918996 AAC A 0.500000 0.100 1 -2 3 491 111 380 65 0 6 0 40 0 0 377 0 3 0.5856 0.0000 0.0079 17.500 0.22 2.02 -1.81 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7161 0.2748 0.0091 1 0 0.7061 0.2832 0.0107 1 0 0.6920 0.2949 0.0131
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 926 262 664 7 199 38 1 17 0 4 660 0 0 0.0267 0.0000 0.0060 5.842 2.29 3.00 -0.71 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2990 0.7010 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 926 270 656 19 1 36 8 206 0 0 652 0 4 0.0704 0.0000 0.0061 6.500 2.58 3.12 -0.54 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8916 0.1084
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1520 381 1139 0 0 15 0 366 0 0 1137 0 2 0.0000 0.0000 0.0018 24.400 1.61 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 144050729 ACT A 0.500000 0.100 1 -2 1 604 110 494 107 0 1 0 2 0 0 494 0 0 0.9727 0.0000 0.0000 109.000 1.33 2.50 -1.17 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7329 0.2671 0.0000 0 0 0.9614 0.0386 0.0000 0 0 0.9803 0.0197 0.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 677 172 505 94 0 8 0 70 0 0 501 0 4 0.5465 0.0000 0.0079 20.500 0.93 3.86 -2.93 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6146 0.3744 0.0110 1 0 0.6099 0.3773 0.0127 1 0 0.6027 0.3819 0.0154
chr7 149474819 ACCGCTGCCGCCACCGCCGCCGCCACTG A 0.500000 0.100 1 -27 5 690 197 493 172 1 17 0 7 0 0 493 0 0 0.8731 0.0000 0.0000 10.588 0.31 20.00 -19.69 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.7663 0.2337 0.0000 0 0 0.9802 0.0198 0.0000
chr7 149783003 A AC 0.500000 0.100 1 1 2 688 165 523 152 0 7 0 6 0 0 523 0 0 0.9212 0.0000 0.0000 22.571 0.29 1.33 -1.04 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 0 0.7736 0.2264 0.0000 0 0 0.9716 0.0284 0.0000
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 206 57 149 51 0 3 0 3 0 0 148 0 1 0.8947 0.0000 0.0067 18.000 0.76 4.33 -3.57 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.1530 0.8470 0.0000 0 1 0.4769 0.5231 0.0000
chr7 149814882 G GGCCCT 0.500000 0.100 1 5 1 597 124 473 59 0 16 0 49 1 0 466 0 6 0.4758 0.0021 0.0148 6.750 1.95 6.53 -4.58 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2846 0.6097 0.1057 1 1 0.2875 0.6016 0.1110 1 1 0.2907 0.5913 0.1180
chr7 149815757 G GAGGTGGTC 0.500000 0.100 1 8 1 681 190 491 104 0 13 0 73 0 0 486 0 5 0.5474 0.0000 0.0102 13.615 0.75 8.25 -7.50 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7263 0.2695 0.0042 1 0 0.7193 0.2756 0.0051 1 0 0.7090 0.2845 0.0065
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 748 191 557 103 0 2 1 85 0 0 556 0 1 0.5393 0.0000 0.0018 94.000 0.53 1.22 -0.69 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4862 0.4942 0.0196 1 1 0.4869 0.4909 0.0222 1 1 0.4866 0.4873 0.0261
chr7 149821443 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 689 190 499 180 0 1 0 9 0 1 498 0 0 0.9474 0.0000 0.0020 189.000 0.33 1.00 -0.67 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3721 0.6279 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 729 167 562 20 0 8 0 139 0 0 556 0 6 0.1198 0.0000 0.0107 19.875 1.15 11.32 -10.17 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9969 0.0031
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 517 90 427 0 0 4 23 63 0 1 389 11 26 0.0000 0.0000 0.0890 21.500 7.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0036 0.9964 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 517 89 428 0 0 8 20 61 0 0 389 13 26 0.0000 0.0000 0.0911 15.200 7.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 530 85 445 0 0 12 3 70 0 1 367 31 46 0.0000 0.0000 0.1753 6.000 7.66 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr7 156950334 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 5 688 176 512 96 0 5 1 74 0 0 510 0 2 0.5455 0.0000 0.0039 34.000 0.40 3.42 -3.02 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5823 0.4048 0.0129 1 0 0.5788 0.4063 0.0149 1 0 0.5732 0.4089 0.0179
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 278 97 181 54 0 2 1 40 0 0 180 0 1 0.5567 0.0000 0.0055 47.500 0.24 3.00 -2.76 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5083 0.4527 0.0390 1 0 0.5040 0.4536 0.0424 1 0 0.4976 0.4551 0.0473
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 574 255 319 107 0 40 1 107 0 0 316 1 2 0.4196 0.0000 0.0094 5.513 0.29 11.23 -10.94 13 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0090 0.6601 0.3309 1 1 0.0097 0.6454 0.3449 1 1 0.0107 0.6268 0.3625
chr8 11808709 GTCCCACTCCCAC G 0.017271 0.100 1 -12 1 574 259 315 117 1 44 1 96 0 0 312 0 3 0.4517 0.0000 0.0095 5.000 0.31 11.69 -11.38 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6776 0.3221 0.0003 1 0 0.6798 0.3198 0.0004 1 0 0.6816 0.3179 0.0004
chr8 17754357 ATTG A 0.000068 0.100 1 -3 1 787 178 609 158 1 5 0 14 0 0 609 0 0 0.8876 0.0000 0.0000 34.600 0.81 3.21 -2.40 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9330 0.0670 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 418 181 237 169 0 6 0 6 0 0 237 0 0 0.9337 0.0000 0.0000 29.167 0.11 7.67 -7.56 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0345 0.9655 0.0000 0 0 0.9690 0.0310 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 221 104 117 56 1 0 0 47 0 0 117 0 0 0.5385 0.0000 0.0000 103.000 0.27 3.00 -2.73 2 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5047 0.4624 0.0329 1 0 0.5037 0.4610 0.0354 1 0 0.5016 0.4595 0.0389
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 194 77 117 48 0 0 0 29 0 0 117 0 0 0.6234 0.0000 0.0000 77.000 0.54 2.38 -1.84 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6817 0.3025 0.0158 1 0 0.6709 0.3112 0.0180 1 0 0.6558 0.3229 0.0213
chr8 64581060 T TGGC 0.106611 0.100 1 3 1 529 127 402 94 10 20 1 2 3 3 394 2 0 0.7402 0.0075 0.0199 5.526 2.24 1.50 0.74 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9133 0.0867 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr8 64581450 T TAGCGGC 0.096175 0.100 1 6 2 601 180 421 153 4 16 1 6 1 0 419 0 1 0.8500 0.0024 0.0048 10.800 1.95 5.33 -3.38 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 0 0.9301 0.0699 0.0000 0 0 0.9952 0.0048 0.0000
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 598 182 416 69 9 33 4 67 0 0 416 0 0 0.3791 0.0000 0.0000 4.485 0.78 3.45 -2.67 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4714 0.5196 0.0090 1 1 0.4780 0.5124 0.0097 1 1 0.4858 0.5037 0.0105
chr8 100194231 A AGAC 0.500000 0.100 1 3 5 196 79 117 76 0 0 0 3 0 0 117 0 0 0.9620 0.0000 0.0000 79.000 0.09 4.00 -3.91 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0576 0.9424 0.0000 0 0 0.6460 0.3540 0.0000 0 0 0.8535 0.1465 0.0000
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 326 87 239 9 0 0 0 78 0 0 236 0 3 0.1034 0.0000 0.0126 87.000 0.11 2.53 -2.41 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9960 0.0040 2 1 0.0000 0.8633 0.1367
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 685 210 475 11 0 8 0 191 0 0 474 0 1 0.0524 0.0000 0.0021 25.250 2.91 18.32 -15.42 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8928 0.1072 2 2 0.0000 0.0947 0.9053
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 288 85 203 79 1 2 0 3 0 0 203 0 0 0.9294 0.0000 0.0000 41.500 0.32 4.33 -4.02 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0697 0.9303 0.0000 0 0 0.6901 0.3099 0.0000 0 0 0.8761 0.1239 0.0000
chr8 116938485 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 2 461 163 298 76 3 31 0 53 0 0 297 0 1 0.4663 0.0000 0.0034 4.258 1.03 3.04 -2.01 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7522 0.2425 0.0053 1 0 0.7428 0.2508 0.0063 1 0 0.7294 0.2626 0.0080
chr8 123369918 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 1 323 94 229 0 2 8 16 68 0 0 229 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.500 5.46 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1116 0.8884 2 2 0.0000 0.0610 0.9390 2 2 0.0000 0.0440 0.9560
chr8 123369918 T TTCATCA 0.500000 0.100 1 6 1 323 94 229 0 3 19 4 68 0 0 229 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.056 5.68 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1331 0.8669 2 2 0.0000 0.0850 0.9150 2 2 0.0000 0.0678 0.9322
chr8 123369942 A ATCATCG 0.500000 0.100 1 6 1 322 106 216 13 14 4 7 68 0 0 216 0 0 0.1226 0.0000 0.0000 22.000 0.15 5.50 -5.35 11 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.5171 0.4829 2 1 0.0000 0.9671 0.0329 2 1 0.0000 0.9978 0.0022
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 302 143 159 81 0 1 0 61 0 0 157 0 2 0.5664 0.0000 0.0126 142.000 0.09 3.18 -3.09 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5852 0.3983 0.0165 1 0 0.5802 0.4010 0.0188 1 0 0.5726 0.4052 0.0222
chr8 140458378 T TGTGACCCTCACGGTACCCCCC 0.500000 0.100 1 21 5 443 141 302 55 0 20 0 66 0 0 300 0 2 0.3901 0.0000 0.0066 6.050 0.40 9.94 -9.54 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0365 0.4836 0.4799 1 1 0.0401 0.4828 0.4771 1 1 0.0452 0.4822 0.4726
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 477 118 359 2 0 23 10 83 0 0 357 1 1 0.0169 0.0000 0.0056 4.087 1.50 5.18 -3.68 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3835 0.6165 2 2 0.0000 0.0680 0.9320 2 2 0.0000 0.0350 0.9650
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 417 114 303 58 1 6 2 47 0 0 301 0 2 0.5088 0.0000 0.0066 17.667 2.22 3.60 -1.37 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3585 0.5649 0.0766 1 1 0.3590 0.5597 0.0814 1 1 0.3589 0.5531 0.0880
chr8 144846107 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 500 195 305 93 0 9 0 93 0 0 302 0 3 0.4769 0.0000 0.0098 20.667 0.35 3.10 -2.74 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1040 0.7075 0.1885 1 1 0.1106 0.6935 0.1959 1 1 0.1194 0.6753 0.2053
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 1010 329 681 199 10 87 1 32 0 0 681 0 0 0.6049 0.0000 0.0000 2.782 0.19 3.41 -3.22 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr9 2039793 A AGCC 0.000893 0.100 1 3 1 1002 315 687 299 3 7 0 6 0 0 687 0 0 0.9492 0.0000 0.0000 43.857 0.55 2.67 -2.12 83 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr9 12775862 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 342 88 254 32 1 22 3 30 0 0 253 0 1 0.3636 0.0000 0.0039 2.955 0.84 4.77 -3.92 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1959 0.5798 0.2243 1 1 0.1992 0.5738 0.2269 1 1 0.2035 0.5663 0.2302
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 342 88 254 35 20 26 1 6 0 0 253 0 1 0.3977 0.0000 0.0039 1.808 1.17 3.33 -2.16 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 1 0.0906 0.9094 0.0000
chr9 12775862 T TGGTGGC 0.500000 0.100 1 6 2 342 88 254 40 0 10 2 36 0 0 253 0 1 0.4545 0.0000 0.0039 9.750 0.70 4.28 -3.58 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2383 0.5923 0.1694 1 1 0.2409 0.5855 0.1736 1 1 0.2442 0.5768 0.1790
chr9 25678179 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 3 582 147 435 61 1 28 1 56 0 0 434 0 1 0.4150 0.0000 0.0023 4.250 0.26 3.38 -3.11 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2584 0.6251 0.1166 1 1 0.2621 0.6159 0.1220 1 1 0.2665 0.6043 0.1291
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 669 194 475 181 1 5 0 7 0 0 475 0 0 0.9330 0.0000 0.0000 37.800 0.43 1.43 -1.00 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 0 0.8377 0.1623 0.0000 0 0 0.9871 0.0129 0.0000
chr9 35674193 CGGAGAGGAGGATCTACCT C 0.500000 0.100 1 -18 3 461 147 314 48 0 34 0 65 0 0 314 0 0 0.3265 0.0000 0.0000 3.324 0.17 11.25 -11.08 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0205 0.3843 0.5953 1 2 0.0230 0.3887 0.5883 1 2 0.0269 0.3949 0.5783
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 751 188 563 98 0 35 0 55 0 0 557 0 6 0.5213 0.0000 0.0107 4.371 0.23 10.73 -10.49 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8992 0.1002 0.0006 1 0 0.8913 0.1079 0.0008 1 0 0.8797 0.1192 0.0011
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 264 34 230 1 0 1 0 32 0 0 230 0 0 0.0294 0.0000 0.0000 33.000 1.00 1.06 -0.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6428 0.3572 2 2 0.0000 0.3695 0.6305 2 2 0.0000 0.2867 0.7133
chr9 68303201 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 4 468 76 392 59 1 0 0 16 0 0 392 0 0 0.7763 0.0000 0.0000 76.000 0.90 2.19 -1.29 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7153 0.2846 0.0001 0 1 0.0884 0.9115 0.0000 0 1 0.0053 0.9947 0.0000
chr9 72059357 TGAAAG T 0.500000 0.100 1 -5 1 175 74 101 70 0 1 0 3 0 0 101 0 0 0.9459 0.0000 0.0000 73.000 0.24 5.00 -4.76 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0431 0.9569 0.0000 0 0 0.5749 0.4251 0.0000 0 0 0.8133 0.1867 0.0000
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 405 100 305 3 0 2 0 95 0 0 287 0 18 0.0300 0.0000 0.0590 49.000 0.33 13.89 -13.56 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7126 0.2874 2 2 0.0000 0.0795 0.9205 2 2 0.0000 0.0277 0.9723
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 665 164 501 80 0 10 0 74 0 0 495 0 6 0.4878 0.0000 0.0120 15.400 0.47 10.18 -9.70 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1566 0.6867 0.1567 1 1 0.1631 0.6738 0.1631 1 1 0.1714 0.6572 0.1714
chr9 85741905 A AGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 2 193 93 100 48 0 9 0 36 0 0 100 0 0 0.5161 0.0000 0.0000 9.333 1.08 5.06 -3.97 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4971 0.4569 0.0461 1 0 0.4915 0.4585 0.0499 1 0 0.4837 0.4609 0.0555
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 495 157 338 144 1 3 0 9 0 0 338 0 0 0.9172 0.0000 0.0000 51.333 0.21 3.22 -3.01 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0878 0.9122 0.0000 0 0 0.7788 0.2212 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 203 73 130 41 0 1 0 31 0 0 129 0 1 0.5616 0.0000 0.0077 72.000 0.20 4.77 -4.58 13 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4273 0.5010 0.0718 1 1 0.4235 0.5003 0.0762 1 1 0.4181 0.4995 0.0824
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 305 82 223 36 2 15 0 29 0 0 221 0 2 0.4390 0.0000 0.0090 4.467 0.50 3.24 -2.74 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3771 0.5287 0.0942 1 1 0.3749 0.5263 0.0988 1 1 0.3716 0.5233 0.1051
chr9 93259450 TTGCCCCCGCAACCCACACGGCCCCCTCAACCTGTGC T 0.500000 0.100 1 -36 1 451 99 352 82 0 13 0 4 0 0 352 0 0 0.8283 0.0000 0.0000 6.615 0.62 13.50 -12.88 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0090 0.9910 0.0000 0 1 0.4595 0.5405 0.0000 0 0 0.8041 0.1959 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 451 173 278 71 0 13 0 89 0 0 278 0 0 0.4104 0.0000 0.0000 12.308 1.15 8.89 -7.73 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0160 0.4170 0.5670 1 2 0.0182 0.4184 0.5634 1 2 0.0216 0.4208 0.5576
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 756 274 482 103 0 3 0 168 0 0 479 0 3 0.3759 0.0000 0.0062 90.333 0.18 3.31 -3.13 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0090 0.9910 1 2 0.0000 0.0105 0.9895 1 2 0.0000 0.0130 0.9870
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 370 100 270 1 0 23 3 73 0 0 270 0 0 0.0100 0.0000 0.0000 3.261 0.00 5.56 -5.56 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1588 0.8412 2 2 0.0000 0.0603 0.9397 2 2 0.0000 0.0448 0.9552
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 903 142 761 0 0 45 4 93 0 2 743 3 13 0.0000 0.0000 0.0237 2.111 6.32 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0262 0.9738 2 2 0.0000 0.0122 0.9878 2 2 0.0000 0.0096 0.9904
chr9 99828333 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 1 856 216 640 99 3 34 6 74 0 0 637 0 3 0.4583 0.0000 0.0047 5.324 0.74 3.23 -2.49 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5814 0.4069 0.0117 1 0 0.5785 0.4079 0.0136 1 0 0.5736 0.4099 0.0164
chr9 103005527 ATGCCAAGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -12 1 603 175 428 150 1 17 0 7 0 0 428 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 9.294 0.32 9.71 -9.39 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.5223 0.4777 0.0000 0 0 0.9445 0.0555 0.0000
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 461 121 340 8 0 0 0 113 0 0 339 0 1 0.0661 0.0000 0.0029 121.000 0.00 2.93 -2.93 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9437 0.0563 2 2 0.0000 0.4015 0.5985
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 798 172 626 13 0 1 0 158 0 0 620 0 6 0.0756 0.0000 0.0096 171.000 0.23 4.65 -4.42 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9965 0.0035 2 1 0.0000 0.5952 0.4048
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 722 170 552 13 0 2 3 152 0 0 550 0 2 0.0765 0.0000 0.0036 83.500 0.15 2.83 -2.68 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.6754 0.3246
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 269 102 167 0 1 3 0 98 0 0 166 0 1 0.0000 0.0000 0.0060 33.000 3.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0113 0.9887 2 2 0.0000 0.0116 0.9884
chr9 113169870 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 5 402 102 300 76 1 19 0 6 0 0 300 0 0 0.7451 0.0000 0.0000 4.368 0.18 3.33 -3.15 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0730 0.9270 0.0000 0 1 0.4714 0.5286 0.0000
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 449 110 339 52 0 19 0 39 0 0 339 0 0 0.4727 0.0000 0.0000 4.789 0.21 6.03 -5.81 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5195 0.4420 0.0385 1 0 0.5136 0.4443 0.0421 1 0 0.5052 0.4475 0.0473
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 624 131 493 61 1 9 0 60 0 0 482 0 11 0.4656 0.0000 0.0223 13.556 0.46 5.73 -5.27 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0606 0.5723 0.3671 1 1 0.0652 0.5663 0.3685 1 1 0.0717 0.5588 0.3695
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 547 134 413 67 0 16 1 50 0 0 413 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 7.375 0.31 1.28 -0.97 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5687 0.4082 0.0231 1 0 0.5627 0.4114 0.0259 1 0 0.5540 0.4160 0.0300
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 524 168 356 0 1 22 63 82 0 0 350 3 3 0.0000 0.0000 0.0169 6.591 3.70 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 2 525 173 352 4 4 91 8 66 0 0 349 0 3 0.0231 0.0000 0.0085 0.898 0.25 6.09 -5.84 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.8925 0.1075 2 1 0.0000 0.5691 0.4309
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 548 185 363 93 1 5 0 86 0 0 360 0 3 0.5027 0.0000 0.0083 36.000 0.19 3.17 -2.98 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2288 0.6858 0.0854 1 1 0.2357 0.6728 0.0914 1 1 0.2442 0.6562 0.0996
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 470 125 345 13 0 15 1 96 0 0 340 0 5 0.1040 0.0000 0.0145 7.333 0.31 7.68 -7.37 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9675 0.0325
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 449 135 314 7 3 39 1 85 0 0 309 0 5 0.0519 0.0000 0.0159 2.462 0.14 4.04 -3.89 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.8781 0.1219
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 285 122 163 115 0 2 0 5 0 0 163 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 60.000 0.55 2.00 -1.45 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 0 0.6044 0.3956 0.0000 0 0 0.9147 0.0853 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 285 122 163 115 0 2 0 5 0 0 163 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 60.000 0.55 2.00 -1.45 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 0 0.6044 0.3956 0.0000 0 0 0.9147 0.0853 0.0000
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 248 102 146 7 0 4 0 91 0 0 144 0 2 0.0686 0.0000 0.0137 24.500 0.43 1.79 -1.36 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9411 0.0589 2 2 0.0000 0.4907 0.5093
chr9 136341024 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 278 96 182 81 2 8 0 5 0 0 182 0 0 0.8438 0.0000 0.0000 10.875 0.90 1.80 -0.90 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2368 0.7632 0.0000 0 0 0.6936 0.3064 0.0000
chr9 136984956 C CGGCCCCTCCCTGCCCCTCT 0.500000 0.100 1 19 3 429 119 310 102 0 14 0 3 0 0 310 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 7.500 0.47 6.33 -5.86 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1871 0.8129 0.0000 0 0 0.8699 0.1301 0.0000 0 0 0.9537 0.0463 0.0000
chr9 137110665 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 330 116 214 61 0 5 1 49 0 0 214 0 0 0.5259 0.0000 0.0000 22.200 0.08 1.22 -1.14 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4448 0.5065 0.0487 1 1 0.4425 0.5047 0.0528 1 1 0.4387 0.5027 0.0586
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 485 121 364 13 0 11 2 95 0 0 346 0 18 0.1074 0.0000 0.0495 9.909 1.15 12.97 -11.81 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9410 0.0590
chr10 5102144 T TA 0.000084 0.100 1 1 3 353 96 257 93 0 0 1 2 0 0 257 0 0 0.9688 0.0000 0.0000 95.000 0.77 1.00 -0.23 61 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 786 202 584 184 1 10 0 7 0 0 584 0 0 0.9109 0.0000 0.0000 19.200 0.44 7.86 -7.42 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0430 0.9570 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 375 93 282 45 0 1 0 47 0 0 280 0 2 0.4839 0.0000 0.0071 92.000 0.31 1.23 -0.92 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2924 0.6987 0.0088 1 1 0.3029 0.6882 0.0089 1 1 0.3165 0.6746 0.0089
chr10 13439173 CAG C 0.004149 0.100 1 -2 3 300 74 226 39 1 2 0 32 0 0 225 0 1 0.5270 0.0000 0.0044 35.500 0.13 2.41 -2.28 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5753 0.4240 0.0006 1 0 0.5756 0.4237 0.0007 1 0 0.5756 0.4237 0.0007
chr10 13657133 CCGCCCCCCG C 0.028316 0.100 1 -9 1 770 206 564 170 0 34 0 2 0 0 563 0 1 0.8252 0.0000 0.0018 5.059 0.35 6.50 -6.15 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9961 0.0039 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 18655037 AT A 0.002315 0.100 1 -1 3 81 40 41 35 0 1 0 4 0 0 41 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 39.000 0.34 1.00 -0.66 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2773 0.7227 0.0000 0 0 0.9726 0.0274 0.0000 0 0 0.9945 0.0055 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 249 102 147 91 1 3 0 7 0 0 147 0 0 0.8922 0.0000 0.0000 33.000 0.33 4.29 -3.96 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1971 0.8029 0.0000 0 0 0.8061 0.1939 0.0000
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 824 180 644 0 0 20 1 159 0 0 638 0 6 0.0000 0.0000 0.0093 8.000 5.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 631 142 489 18 0 3 1 120 0 0 487 0 2 0.1268 0.0000 0.0041 46.333 0.39 3.89 -3.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 281 120 161 116 0 1 0 3 0 0 161 0 0 0.9667 0.0000 0.0000 119.000 0.27 2.00 -1.73 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9755 0.0245 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 547 146 401 72 0 9 0 65 0 0 401 0 0 0.4932 0.0000 0.0000 15.222 0.17 1.18 -1.02 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3829 0.5678 0.0494 1 1 0.3870 0.5603 0.0527 1 1 0.3917 0.5511 0.0572
chr10 46309137 T TTTGTGCCACTCCTGCTGC 0.003400 0.100 1 18 4 278 96 182 52 0 8 0 36 0 0 172 0 10 0.5417 0.0000 0.0549 11.000 0.10 13.31 -13.21 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5274 0.4721 0.0005 1 0 0.5307 0.4687 0.0006 1 0 0.5345 0.4649 0.0006
chr10 50093906 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 203 118 85 92 1 0 0 25 0 0 85 0 0 0.7797 0.0000 0.0000 118.000 0.51 3.20 -2.69 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8777 0.1223 0.0000 0 1 0.0376 0.9624 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000
chr10 53807071 A AGTT 0.002532 0.100 1 3 2 329 88 241 79 0 4 0 5 0 0 241 0 0 0.8977 0.0000 0.0000 21.000 0.28 3.20 -2.92 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2479 0.7521 0.0000 0 0 0.9900 0.0100 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.100 1 -3 1 508 135 373 123 0 6 0 6 0 0 372 1 0 0.9111 0.0000 0.0027 21.500 0.18 3.67 -3.49 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1697 0.8303 0.0000 0 0 0.9948 0.0052 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr10 56358652 T TGCCTCA 0.001075 0.100 1 6 1 571 154 417 73 0 20 0 61 0 0 413 0 4 0.4740 0.0000 0.0096 6.700 0.15 5.59 -5.44 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5287 0.4712 0.0001 1 0 0.5338 0.4661 0.0001 1 0 0.5398 0.4601 0.0001
chr10 63214835 TTCA T 0.005181 0.100 1 -3 1 660 133 527 113 1 1 0 18 0 0 527 0 0 0.8496 0.0000 0.0000 132.000 0.31 3.28 -2.97 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.3177 0.6823 0.0000
chr10 73240978 AGCGGAG A 0.006364 0.100 1 -6 3 154 92 62 61 0 2 0 29 0 0 61 0 1 0.6630 0.0000 0.0161 45.000 0.64 13.45 -12.81 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9300 0.0700 0.0000 1 0 0.9244 0.0756 0.0000 1 0 0.9161 0.0838 0.0000
chr10 73240989 ACCAGTCTCT A 0.006454 0.100 1 -9 1 154 86 68 59 0 1 0 26 0 0 63 1 4 0.6860 0.0000 0.0735 85.000 0.69 14.96 -14.27 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9112 0.0888 0.0000 1 0 0.9050 0.0949 0.0000 1 0 0.8961 0.1038 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 359 75 284 0 0 17 3 55 0 0 283 0 1 0.0000 0.0000 0.0035 3.412 3.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2036 0.7964 2 2 0.0000 0.2137 0.7863 2 2 0.0000 0.2280 0.7720
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 485 173 312 84 4 15 0 70 0 0 311 0 1 0.4855 0.0000 0.0032 10.267 0.45 5.81 -5.36 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6872 0.3126 0.0002 1 0 0.6867 0.3131 0.0003 1 0 0.6853 0.3144 0.0003
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 656 129 527 64 0 4 0 61 0 0 523 0 4 0.4961 0.0000 0.0076 31.250 0.70 5.93 -5.23 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2375 0.6631 0.0994 1 1 0.2459 0.6520 0.1021 1 1 0.2567 0.6377 0.1055
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 505 153 352 96 0 1 1 55 0 0 351 0 1 0.6275 0.0000 0.0028 152.000 0.53 3.16 -2.63 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9563 0.0437 0.0000 1 0 0.9523 0.0477 0.0000 1 0 0.9463 0.0537 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 674 227 447 180 1 33 0 13 0 0 445 0 2 0.7930 0.0000 0.0045 5.879 0.70 6.62 -5.92 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.3479 0.6521 0.0000
chr10 101136859 TGAC T 0.000066 0.100 1 -3 1 280 85 195 76 1 5 0 3 0 0 195 0 0 0.8941 0.0000 0.0000 16.000 0.25 3.00 -2.75 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 414 104 310 56 0 9 1 38 0 0 306 0 4 0.5385 0.0000 0.0129 10.556 0.39 6.13 -5.74 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5206 0.4437 0.0357 1 0 0.5156 0.4453 0.0391 1 0 0.5084 0.4476 0.0439
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.100 1 18 1 397 101 296 44 0 14 0 43 0 0 274 0 22 0.4356 0.0000 0.0743 6.214 0.80 9.81 -9.02 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0630 0.8750 0.0620 1 1 0.0707 0.8700 0.0593 1 1 0.0820 0.8624 0.0556
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 348 141 207 76 0 4 0 61 0 0 203 1 3 0.5390 0.0000 0.0193 34.250 0.88 2.95 -2.07 8 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5218 0.4603 0.0180 1 0 0.5235 0.4569 0.0196 1 0 0.5250 0.4531 0.0219
chr10 115171343 CTT C 0.004437 0.100 1 -2 1 228 43 185 2 0 0 0 41 0 0 185 0 0 0.0465 0.0000 0.0000 43.000 0.00 2.02 -2.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9959 0.0041 2 1 0.0000 0.9911 0.0089
chr10 119030082 GGGCGCTGGGGCC G 0.000710 0.100 1 -12 4 463 73 390 37 1 6 0 29 1 0 384 0 5 0.5068 0.0026 0.0154 11.167 0.92 12.72 -11.81 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5336 0.4662 0.0001 1 0 0.5356 0.4642 0.0001 1 0 0.5378 0.4620 0.0002
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 345 100 245 2 0 14 9 75 0 0 244 1 0 0.0200 0.0000 0.0041 5.500 3.50 1.85 1.65 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4753 0.5247 2 2 0.0000 0.0960 0.9040 2 2 0.0000 0.0494 0.9506
chr10 131311321 C CGCG 0.026812 0.100 1 3 1 369 139 230 50 0 20 3 66 0 0 230 0 0 0.3597 0.0000 0.0000 6.263 1.40 3.85 -2.45 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0685 0.8464 0.0851 1 1 0.0766 0.8413 0.0821 1 1 0.0884 0.8336 0.0780
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 402 122 280 111 0 8 0 3 0 0 280 0 0 0.9098 0.0000 0.0000 14.250 0.29 1.00 -0.71 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2768 0.7232 0.0000 0 0 0.9136 0.0864 0.0000 0 0 0.9696 0.0304 0.0000
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.100 1 -12 1 718 155 563 81 1 18 0 55 0 0 559 0 4 0.5226 0.0000 0.0071 8.059 0.30 11.22 -10.92 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8268 0.1728 0.0004 1 0 0.8214 0.1781 0.0005 1 0 0.8136 0.1858 0.0006
chr11 1051657 AC A 0.061644 0.100 1 -1 1 512 168 344 84 0 7 0 77 0 0 343 0 1 0.5000 0.0000 0.0029 23.000 0.31 1.90 -1.59 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4308 0.5605 0.0086 1 1 0.4396 0.5511 0.0092 1 1 0.4504 0.5396 0.0100
chr11 1094638 ACCAACCACCACTCCCAGCCCT A 0.029704 0.100 1 -21 2 1559 391 1168 112 11 182 13 73 6 6 1034 13 109 0.2864 0.0051 0.1147 1.122 2.54 14.40 -11.85 18 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.1123 0.8877 1 2 0.0000 0.1287 0.8713 1 2 0.0001 0.1543 0.8457
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1066 203 863 126 2 68 0 7 0 0 863 0 0 0.6207 0.0000 0.0000 1.985 0.59 7.43 -6.84 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2267 0.7733 0.0000 0 0 0.8247 0.1753 0.0000
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.100 1 -30 1 1003 236 767 13 0 79 3 141 0 0 731 0 36 0.0551 0.0000 0.0469 1.975 0.54 11.56 -11.02 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8747 0.1253
chr11 3638889 G GC 0.000158 0.100 1 1 2 387 106 281 63 0 3 1 39 0 0 280 0 1 0.5943 0.0000 0.0036 34.333 0.46 2.15 -1.69 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8422 0.1578 0.0000 1 0 0.8360 0.1640 0.0000 1 0 0.8272 0.1728 0.0000
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 328 107 221 0 0 1 2 104 0 0 220 0 1 0.0000 0.0000 0.0045 106.000 2.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 689 245 444 141 0 5 0 99 0 0 444 0 0 0.5755 0.0000 0.0000 60.000 0.21 1.18 -0.97 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9043 0.0955 0.0002 1 0 0.8980 0.1017 0.0003 1 0 0.8886 0.1109 0.0005
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 218 87 131 42 0 0 0 45 0 0 129 0 2 0.4828 0.0000 0.0153 87.000 0.14 2.18 -2.03 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1140 0.5789 0.3071 1 1 0.1188 0.5730 0.3082 1 1 0.1254 0.5655 0.3091
chr11 4587654 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 820 244 576 231 0 0 0 13 0 0 576 0 0 0.9467 0.0000 0.0000 244.000 0.35 2.15 -1.80 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0917 0.9083 0.0000 0 0 0.9463 0.0537 0.0000
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 583 137 446 72 0 1 0 64 0 0 442 0 4 0.5255 0.0000 0.0090 136.000 0.38 4.22 -3.84 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2424 0.6479 0.1097 1 1 0.2473 0.6373 0.1154 1 1 0.2532 0.6237 0.1230
chr11 4860474 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 878 284 594 275 0 4 0 5 0 0 594 0 0 0.9683 0.0000 0.0000 70.000 0.35 1.00 -0.65 57 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9500 0.0500 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 815 186 629 83 0 8 0 95 0 0 628 0 1 0.4462 0.0000 0.0016 22.250 0.31 1.46 -1.15 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0316 0.5521 0.4163 1 1 0.0352 0.5461 0.4187 1 1 0.0403 0.5390 0.4207
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 984 208 776 91 0 5 0 112 0 0 764 0 12 0.4375 0.0000 0.0155 40.600 0.40 5.88 -5.48 23 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0012 0.1785 0.8203 1 2 0.0015 0.1854 0.8131 1 2 0.0021 0.1955 0.8024
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 710 219 491 107 0 8 1 103 0 0 491 0 0 0.4886 0.0000 0.0000 30.143 0.30 1.69 -1.39 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1786 0.7278 0.0935 1 1 0.1869 0.7128 0.1003 1 1 0.1973 0.6932 0.1095
chr11 5200208 TAAAG T 0.500000 0.100 1 -4 2 633 167 466 158 0 5 0 4 1 0 465 0 0 0.9461 0.0021 0.0021 32.400 0.26 6.50 -6.24 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3130 0.6870 0.0000 0 0 0.9755 0.0245 0.0000 0 0 0.9942 0.0058 0.0000
chr11 5343311 CCAGCCCCAGGTCTGTGG C 0.500000 0.100 1 -17 3 511 130 381 112 1 9 0 8 0 0 380 0 1 0.8615 0.0000 0.0026 13.444 0.45 13.25 -12.80 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0191 0.9809 0.0000 0 1 0.4274 0.5726 0.0000
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.100 1 4 1 1170 280 890 250 0 15 0 15 0 0 887 0 3 0.8929 0.0000 0.0034 17.667 0.24 3.93 -3.70 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.6411 0.3589 0.0000
chr11 6390700 CCTGGTGCTGGCG C 0.500000 0.100 1 -12 3 809 236 573 76 133 15 0 12 0 0 573 0 0 0.3220 0.0000 0.0000 7.077 0.39 8.58 -8.19 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0312 0.9688 0.0000 0 0 0.7940 0.2060 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 759 157 602 0 0 19 0 138 0 0 583 0 19 0.0000 0.0000 0.0316 7.263 8.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr11 6921357 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 642 158 484 83 0 2 0 73 0 0 483 0 1 0.5253 0.0000 0.0021 78.000 1.43 1.27 0.16 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3404 0.6025 0.0572 1 1 0.3438 0.5943 0.0619 1 1 0.3475 0.5841 0.0685
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 253 105 148 0 0 11 3 91 0 0 146 2 0 0.0000 0.0000 0.0135 8.545 3.73 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0094 0.9906
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 15 1 573 123 450 21 55 40 0 7 0 4 440 1 5 0.1707 0.0000 0.0222 2.075 5.90 2.14 3.76 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0119 0.9881 0.0000
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 196 71 125 29 0 1 0 41 0 0 125 0 0 0.4085 0.0000 0.0000 70.000 0.00 3.22 -3.22 19 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0475 0.4399 0.5126 1 2 0.0514 0.4428 0.5058 1 2 0.0569 0.4468 0.4963
chr11 34632610 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 115 65 50 60 0 3 0 2 0 0 50 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 20.667 0.07 1.00 -0.93 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2051 0.7949 0.0000 0 0 0.7065 0.2935 0.0000 0 0 0.8370 0.1630 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 777 199 578 94 0 9 0 96 0 0 575 0 3 0.4724 0.0000 0.0052 21.111 0.24 3.91 -3.66 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0823 0.6960 0.2217 1 1 0.0884 0.6825 0.2291 1 1 0.0966 0.6651 0.2382
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 961 215 746 10 0 4 0 201 0 0 739 0 7 0.0465 0.0000 0.0094 52.750 0.30 2.31 -2.01 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5638 0.4362 2 2 0.0000 0.0247 0.9753
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 638 139 499 66 0 2 0 71 0 0 499 0 0 0.4748 0.0000 0.0000 68.500 0.17 1.18 -1.02 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0988 0.6350 0.2662 1 1 0.1043 0.6252 0.2705 1 1 0.1118 0.6127 0.2756
chr11 59124903 C CA 0.500000 0.100 1 1 3 728 165 563 125 12 14 1 13 0 0 562 1 0 0.7576 0.0000 0.0018 9.929 0.81 0.92 -0.12 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.0960 0.9040 0.0000
chr11 59457656 GC G 0.500000 0.100 1 -1 4 614 151 463 146 0 1 0 4 0 0 463 0 0 0.9669 0.0000 0.0000 150.000 0.31 2.25 -1.94 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1928 0.8072 0.0000 0 0 0.9542 0.0458 0.0000 0 0 0.9892 0.0108 0.0000
chr11 59478365 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 416 75 341 30 1 18 0 26 0 0 341 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 3.111 0.30 1.31 -1.01 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3307 0.5419 0.1274 1 1 0.3296 0.5386 0.1317 1 1 0.3279 0.5346 0.1375
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 77 37 40 4 0 0 0 33 0 0 40 0 0 0.1081 0.0000 0.0000 37.000 0.00 2.27 -2.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9315 0.0685 2 1 0.0000 0.7243 0.2757
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 277 106 171 53 1 17 1 34 0 0 171 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 5.235 0.19 2.97 -2.78 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6699 0.3147 0.0155 1 0 0.6598 0.3226 0.0176 1 0 0.6458 0.3334 0.0209
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 296 101 195 43 2 16 2 38 1 0 194 0 0 0.4257 0.0051 0.0051 5.250 1.35 3.24 -1.89 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3440 0.5581 0.0979 1 1 0.3438 0.5535 0.1027 1 1 0.3429 0.5478 0.1092
chr11 68050524 A AGGCCTG 0.500000 0.100 1 6 1 830 181 649 149 0 22 0 10 0 0 648 0 1 0.8232 0.0000 0.0015 7.227 0.33 6.00 -5.67 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0138 0.9862 0.0000 0 0 0.5424 0.4576 0.0000
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 794 223 571 191 1 23 0 8 0 0 567 0 4 0.8565 0.0000 0.0070 8.696 0.20 3.50 -3.30 119 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0399 0.9601 0.0000 0 0 0.8349 0.1651 0.0000
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 967 286 681 155 0 89 0 42 0 0 659 0 22 0.5420 0.0000 0.0323 2.213 0.23 17.45 -17.23 69 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9991 0.0009 0.0000 1 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 897 256 641 10 0 2 1 243 0 0 638 0 3 0.0391 0.0000 0.0047 127.000 0.60 2.20 -1.60 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 2 0.0000 0.1557 0.8443 2 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 751 177 574 5 0 8 1 163 0 0 573 0 1 0.0282 0.0000 0.0017 21.125 0.00 3.33 -3.33 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9371 0.0629 2 2 0.0000 0.0514 0.9486 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr11 75402313 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 299 123 176 116 1 1 0 5 0 0 176 0 0 0.9431 0.0000 0.0000 122.000 0.20 3.00 -2.80 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 0 0.6270 0.3730 0.0000 0 0 0.9218 0.0782 0.0000
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 318 103 215 59 0 2 1 41 0 0 212 0 3 0.5728 0.0000 0.0140 50.000 0.29 12.10 -11.81 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5338 0.4343 0.0320 1 0 0.5282 0.4366 0.0353 1 0 0.5200 0.4400 0.0401
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1292 373 919 259 7 75 2 30 0 1 918 0 0 0.6944 0.0000 0.0011 4.041 0.73 7.23 -6.50 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 802 241 561 1 0 32 4 204 0 0 558 2 1 0.0041 0.0000 0.0053 6.710 0.00 10.16 -10.16 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 296 119 177 77 0 2 0 40 0 0 175 0 2 0.6471 0.0000 0.0113 58.500 0.17 7.62 -7.46 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8988 0.1003 0.0009 1 0 0.8901 0.1087 0.0011 1 0 0.8774 0.1210 0.0016
chr11 119312056 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 957 180 777 165 0 0 0 15 0 0 777 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 180.000 0.47 3.13 -2.67 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1651 0.8349 0.0000
chr11 123906734 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 619 137 482 68 1 10 2 56 0 0 479 0 3 0.4964 0.0000 0.0062 12.600 1.35 3.38 -2.02 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3423 0.5866 0.0712 1 1 0.3442 0.5797 0.0761 1 1 0.3460 0.5712 0.0828
chr11 124249871 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 556 166 390 91 0 3 0 72 0 0 390 0 0 0.5482 0.0000 0.0000 54.333 0.20 1.12 -0.93 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5883 0.3980 0.0136 1 0 0.5842 0.4001 0.0156 1 0 0.5777 0.4036 0.0187
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 404 128 276 65 0 14 0 49 0 0 275 1 0 0.5078 0.0000 0.0036 8.143 0.26 5.45 -5.19 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5474 0.4257 0.0269 1 0 0.5420 0.4281 0.0299 1 0 0.5339 0.4317 0.0343
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 445 140 305 114 0 16 0 10 1 0 304 0 0 0.8143 0.0033 0.0033 7.750 1.24 3.30 -2.06 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0073 0.9927 0.0000 0 1 0.2992 0.7008 0.0000
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 325 111 214 67 0 1 0 43 0 0 214 0 0 0.6036 0.0000 0.0000 110.000 0.85 2.77 -1.92 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8165 0.1808 0.0028 1 0 0.8083 0.1884 0.0033 1 0 0.7968 0.1991 0.0041
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 325 149 176 132 0 3 0 14 0 0 175 0 1 0.8859 0.0000 0.0057 48.667 1.65 1.71 -0.06 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0269 0.9731 0.0000
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 570 168 402 7 1 31 2 127 0 0 397 0 5 0.0417 0.0000 0.0124 4.419 0.14 3.17 -3.03 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8872 0.1128 2 2 0.0000 0.2473 0.7527
chr12 4505348 TATC T 0.000011 0.100 1 -3 2 89 44 45 42 0 1 0 1 0 0 45 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 43.000 0.26 3.00 -2.74 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 4626804 A ACTTGTCATCTCCCAGCTTGTCATCTCCCAG 0.003167 0.100 1 30 1 579 132 447 117 0 12 0 3 0 0 444 0 3 0.8864 0.0000 0.0067 10.000 0.22 11.00 -10.78 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1651 0.8349 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 395 137 258 1 0 25 9 102 0 0 257 0 1 0.0073 0.0000 0.0039 4.480 0.00 3.40 -3.40 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0237 0.9763 2 2 0.0000 0.0085 0.9915 2 2 0.0000 0.0066 0.9934
chr12 6778354 G GGAGCCC 0.001563 0.100 1 6 2 445 203 242 98 2 28 2 73 0 0 241 1 0 0.4828 0.0000 0.0041 6.214 0.19 5.04 -4.85 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8156 0.1844 0.0000 1 0 0.8117 0.1883 0.0000 1 0 0.8059 0.1941 0.0000
chr12 6936716 CCAGCAA C 0.006744 0.100 1 -6 1 921 246 675 52 13 10 156 15 0 0 672 2 1 0.2114 0.0000 0.0044 25.667 0.40 9.40 -9.00 8 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0173 0.9827 1 2 0.0000 0.0234 0.9766 1 2 0.0000 0.0349 0.9651
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 245 82 163 9 0 6 0 67 0 0 157 0 6 0.1098 0.0000 0.0368 12.667 0.78 4.88 -4.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.9020 0.0980
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.100 1 -9 1 638 180 458 85 0 18 1 76 0 0 455 0 3 0.4722 0.0000 0.0066 9.000 0.27 8.76 -8.49 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4111 0.5830 0.0059 1 1 0.4212 0.5726 0.0063 1 1 0.4335 0.5597 0.0068
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 294 153 141 130 1 13 1 8 0 0 141 0 0 0.8497 0.0000 0.0000 10.769 1.29 3.62 -2.33 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0226 0.9774 0.0000 0 1 0.4593 0.5407 0.0000
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 410 89 321 53 0 1 0 35 0 0 320 0 1 0.5955 0.0000 0.0031 88.000 0.15 3.71 -3.56 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6676 0.3173 0.0151 1 0 0.6594 0.3237 0.0170 1 0 0.6479 0.3324 0.0198
chr12 29433780 GTTTTC G 0.000480 0.100 1 -5 1 92 48 44 46 0 0 0 2 0 0 44 0 0 0.9583 0.0000 0.0000 48.000 0.15 6.00 -5.85 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9961 0.0039 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.100 1 -30 1 1466 441 1025 352 4 73 1 11 7 0 1017 1 0 0.7982 0.0068 0.0078 5.041 0.76 8.27 -7.51 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 47751144 A ACGGGCT 0.000467 0.100 1 6 1 423 112 311 87 2 18 0 5 0 0 310 0 1 0.7768 0.0000 0.0032 5.222 1.31 7.00 -5.69 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2439 0.7561 0.0000 0 0 0.9967 0.0033 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr12 52317956 ACTT A 0.001740 0.100 1 -3 1 379 98 281 51 0 5 0 42 0 0 280 0 1 0.5204 0.0000 0.0036 18.600 0.22 2.98 -2.76 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5817 0.4181 0.0002 1 0 0.5827 0.4171 0.0002 1 0 0.5836 0.4162 0.0002
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 846 196 650 94 1 14 0 87 0 0 649 0 1 0.4796 0.0000 0.0015 13.000 0.65 11.23 -10.58 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2875 0.6516 0.0610 1 1 0.2942 0.6400 0.0658 1 1 0.3022 0.6253 0.0726
chr12 52691347 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 495 172 323 159 0 0 1 12 0 0 323 0 0 0.9244 0.0000 0.0000 172.000 0.43 1.67 -1.24 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.3515 0.6485 0.0000
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.100 1 21 2 492 127 365 59 0 29 0 39 0 0 344 0 21 0.4646 0.0000 0.0575 3.379 0.12 12.05 -11.93 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3206 0.6623 0.0171 1 1 0.3310 0.6516 0.0175 1 1 0.3442 0.6378 0.0180
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 295 77 218 67 1 2 0 7 0 0 218 0 0 0.8701 0.0000 0.0000 37.500 0.21 1.57 -1.36 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0390 0.9610 0.0000 0 1 0.4123 0.5877 0.0000
chr12 55294437 CTCTT C 0.000001 0.100 1 -4 1 372 112 260 102 0 6 0 4 0 0 260 0 0 0.9107 0.0000 0.0000 17.667 0.96 3.50 -2.54 52 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 55427118 C CT 0.003326 0.100 1 1 1 446 104 342 95 0 2 0 7 2 0 340 0 0 0.9135 0.0058 0.0058 51.000 0.44 1.14 -0.70 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 0 0.9571 0.0429 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 414 85 329 50 10 12 2 11 0 0 329 0 0 0.5882 0.0000 0.0000 5.833 0.34 1.36 -1.02 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0249 0.9751 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 514 112 402 65 0 0 0 47 0 0 401 0 1 0.5804 0.0000 0.0025 112.000 0.29 3.81 -3.52 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7548 0.2450 0.0002 1 0 0.7505 0.2493 0.0002 1 0 0.7442 0.2556 0.0002
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 152 79 73 74 0 0 0 5 0 0 73 0 0 0.9367 0.0000 0.0000 79.000 0.53 2.40 -1.87 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0998 0.9002 0.0000 0 1 0.4525 0.5475 0.0000
chr12 63150773 CCAGAGGCCA C 0.000196 0.100 1 -9 2 396 89 307 48 0 1 0 40 0 0 307 0 0 0.5393 0.0000 0.0000 88.000 1.10 7.83 -6.72 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5893 0.4107 0.0000 1 0 0.5898 0.4102 0.0000 1 0 0.5900 0.4100 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 351 106 245 59 0 1 0 46 0 0 243 0 2 0.5566 0.0000 0.0082 105.000 0.90 3.78 -2.88 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4923 0.4699 0.0378 1 0 0.4901 0.4689 0.0410 1 0 0.4865 0.4681 0.0455
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 992 286 706 0 0 38 3 245 0 0 704 0 2 0.0000 0.0000 0.0028 6.526 3.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 148 66 82 55 1 7 0 3 0 0 82 0 0 0.8333 0.0000 0.0000 8.429 0.18 1.33 -1.15 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0584 0.9416 0.0000 0 0 0.6304 0.3696 0.0000 0 0 0.8467 0.1533 0.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 431 131 300 9 3 39 2 78 0 0 297 0 3 0.0687 0.0000 0.0100 2.359 1.67 3.21 -1.54 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9746 0.0254
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 387 92 295 0 0 9 0 83 0 0 286 0 9 0.0000 0.0000 0.0305 10.375 4.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0108 0.9892 2 2 0.0000 0.0122 0.9878
chr12 110531583 GGAAA G 0.500000 0.100 1 -4 1 150 70 80 46 0 2 0 22 0 0 79 0 1 0.6571 0.0000 0.0125 34.000 0.46 4.00 -3.54 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7707 0.2212 0.0081 1 0 0.7587 0.2318 0.0095 1 0 0.7418 0.2465 0.0117
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 633 197 436 0 0 27 6 164 0 0 436 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.296 3.99 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 180 90 90 0 0 0 0 90 0 0 90 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 90.000 2.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0101 0.9899 2 2 0.0000 0.0110 0.9890 2 2 0.0000 0.0125 0.9875
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 223 92 131 41 0 12 0 39 0 0 130 0 1 0.4457 0.0000 0.0076 6.667 0.27 5.90 -5.63 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2243 0.5965 0.1792 1 1 0.2274 0.5894 0.1832 1 1 0.2312 0.5803 0.1885
chr12 120196874 TGGCAGCAGCCACAGG T 0.500000 0.100 1 -15 2 235 80 155 71 0 8 0 1 0 0 154 0 1 0.8875 0.0000 0.0065 9.000 0.28 15.00 -14.72 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3044 0.6956 0.0000 0 0 0.8048 0.1952 0.0000 0 0 0.8968 0.1032 0.0000
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 390 95 295 48 34 9 2 2 0 0 295 0 0 0.5053 0.0000 0.0000 8.333 0.92 6.50 -5.58 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2080 0.7920 0.0000 0 0 0.7374 0.2626 0.0000 0 0 0.8757 0.1243 0.0000
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 383 106 277 0 0 13 0 93 0 0 266 0 11 0.0000 0.0000 0.0397 7.154 5.43 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 320 81 239 44 0 9 0 28 0 0 234 0 5 0.5432 0.0000 0.0209 8.000 0.18 12.04 -11.85 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4776 0.4684 0.0540 1 0 0.4724 0.4696 0.0581 1 1 0.4649 0.4713 0.0638
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 587 184 403 92 0 20 5 67 0 0 403 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 8.150 1.12 2.12 -1.00 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6299 0.3596 0.0104 1 0 0.6245 0.3634 0.0121 1 0 0.6163 0.3690 0.0148
chr12 122995576 TGCCACCACC T 0.500000 0.100 1 -9 1 406 153 253 78 1 6 0 68 0 0 249 0 4 0.5098 0.0000 0.0158 24.500 0.12 7.72 -7.61 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2989 0.6265 0.0746 1 1 0.3031 0.6170 0.0799 1 1 0.3079 0.6051 0.0871
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 694 171 523 79 0 19 0 73 0 0 512 0 11 0.4620 0.0000 0.0210 8.000 0.11 8.63 -8.52 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0909 0.6640 0.2450 1 1 0.0968 0.6524 0.2509 1 1 0.1046 0.6375 0.2579
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 228 61 167 5 0 7 2 47 0 0 159 0 8 0.0820 0.0000 0.0479 7.714 0.60 8.94 -8.34 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9224 0.0776 2 1 0.0000 0.6090 0.3910
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 596 148 448 5 0 18 1 124 0 0 443 0 5 0.0338 0.0000 0.0112 7.167 1.00 3.35 -2.35 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9889 0.0111 2 2 0.0000 0.2383 0.7617 2 2 0.0000 0.0435 0.9565
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.100 1 -36 5 555 144 411 58 2 36 1 47 0 0 411 0 0 0.4028 0.0000 0.0000 2.972 0.53 11.79 -11.25 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4750 0.4824 0.0426 1 1 0.4715 0.4820 0.0465 1 1 0.4661 0.4819 0.0519
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 746 169 577 69 0 22 0 78 0 0 570 0 7 0.4083 0.0000 0.0121 6.682 0.93 6.28 -5.35 35 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0230 0.4629 0.5141 1 2 0.0259 0.4626 0.5116 1 2 0.0301 0.4627 0.5072
chr13 21172461 TG T 0.091820 0.100 1 -1 2 303 167 136 72 0 33 0 62 0 0 136 0 0 0.4311 0.0000 0.0000 4.061 0.15 1.10 -0.94 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5548 0.4374 0.0077 1 0 0.5573 0.4344 0.0084 1 0 0.5597 0.4310 0.0093
chr13 27924562 T TGCC 0.002235 0.100 1 3 1 524 121 403 101 0 16 0 4 0 0 403 0 0 0.8347 0.0000 0.0000 6.562 0.32 3.25 -2.93 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9139 0.0861 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 163 51 112 46 0 2 0 3 0 0 112 0 0 0.9020 0.0000 0.0000 24.500 0.22 5.00 -4.78 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2437 0.7563 0.0000 0 0 0.9084 0.0916 0.0000 0 0 0.9706 0.0294 0.0000
chr13 44574554 CTGT C 0.001798 0.100 1 -3 1 768 178 590 148 2 17 4 7 0 0 589 0 1 0.8315 0.0000 0.0017 9.235 0.34 2.43 -2.09 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 0 0.9875 0.0125 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr13 71866406 T TGCCGCC 0.060439 0.100 1 6 1 723 184 539 136 0 39 0 9 1 0 538 0 0 0.7391 0.0019 0.0019 3.718 0.91 4.89 -3.98 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5060 0.4940 0.0000 0 0 0.9740 0.0260 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 650 154 496 53 1 44 3 53 0 0 491 1 4 0.3442 0.0000 0.0101 2.477 1.19 6.15 -4.96 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1840 0.7211 0.0950 1 1 0.1942 0.7106 0.0951 1 1 0.2080 0.6969 0.0951
chr13 77698098 T TGCC 0.001998 0.100 1 3 1 481 139 342 108 6 15 0 10 0 0 342 0 0 0.7770 0.0000 0.0000 8.267 2.94 4.40 -1.46 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7698 0.2302 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 639 91 548 0 0 11 4 76 0 0 542 1 5 0.0000 0.0000 0.0109 7.273 5.72 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 459 66 393 15 1 31 17 2 0 4 384 5 0 0.2273 0.0000 0.0229 1.133 2.80 6.00 -3.20 5 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1269 0.5206 0.3525 1 1 0.1311 0.5189 0.3499 1 1 0.1367 0.5169 0.3464
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 623 148 475 132 3 10 1 2 0 0 474 0 1 0.8919 0.0000 0.0021 13.700 0.81 7.00 -6.19 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4818 0.5182 0.0000 0 0 0.9640 0.0360 0.0000 0 0 0.9878 0.0122 0.0000
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 258 86 172 68 2 6 1 9 0 0 172 0 0 0.7907 0.0000 0.0000 13.333 1.16 5.22 -4.06 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.0515 0.9485 0.0000
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -15 1 256 88 168 23 0 6 2 57 0 0 167 0 1 0.2614 0.0000 0.0060 13.667 0.22 10.05 -9.84 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0007 0.0752 0.9242 1 2 0.0009 0.0831 0.9160 1 2 0.0013 0.0967 0.9020
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 256 87 169 3 0 26 3 55 0 0 168 0 1 0.0345 0.0000 0.0059 2.346 2.33 10.07 -7.74 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9746 0.0254 2 1 0.0000 0.5607 0.4393 2 2 0.0000 0.2811 0.7189
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.100 1 4 1 353 90 263 81 0 1 0 8 0 0 263 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 89.000 0.27 5.12 -4.85 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0113 0.9887 0.0000 0 1 0.2307 0.7693 0.0000
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 571 132 439 0 0 9 0 123 0 0 437 0 2 0.0000 0.0000 0.0046 13.667 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 882 208 674 104 0 5 0 99 0 0 672 0 2 0.5000 0.0000 0.0030 50.750 0.75 2.03 -1.28 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0944 0.7496 0.1560 1 1 0.0989 0.7346 0.1665 1 1 0.1045 0.7148 0.1807
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 750 185 565 0 0 14 1 170 0 0 563 0 2 0.0000 0.0000 0.0035 12.214 2.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 379 97 282 15 0 4 0 78 0 0 274 0 8 0.1546 0.0000 0.0284 23.250 0.13 19.08 -18.94 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9968 0.0032
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 421 108 313 1 0 8 0 99 0 0 306 1 6 0.0093 0.0000 0.0224 12.500 0.00 1.27 -1.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0169 0.9831 2 2 0.0000 0.0062 0.9938 2 2 0.0000 0.0047 0.9953
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 459 126 333 56 0 9 1 60 0 0 333 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 13.000 0.14 5.25 -5.11 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1645 0.6643 0.1711 1 1 0.1726 0.6546 0.1728 1 1 0.1834 0.6421 0.1745
chr14 23080657 TTCA T 0.000055 0.100 1 -3 1 592 191 401 176 2 5 0 8 0 0 401 0 0 0.9215 0.0000 0.0000 37.000 0.59 3.62 -3.03 54 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7489 0.2511 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 590 198 392 160 2 22 1 13 0 0 392 0 0 0.8081 0.0000 0.0000 8.000 0.41 3.15 -2.75 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0167 0.9833 0.0000 0 0 0.8317 0.1683 0.0000
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 641 198 443 24 6 103 3 62 0 0 443 0 0 0.1212 0.0000 0.0000 1.045 0.29 4.10 -3.81 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0002 0.0479 0.9519 1 2 0.0003 0.0534 0.9463 1 2 0.0004 0.0619 0.9377
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 635 194 441 22 1 16 93 62 0 0 441 0 0 0.1134 0.0000 0.0000 6.133 0.23 4.39 -4.16 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 306 54 252 25 3 6 0 20 0 0 251 0 1 0.4630 0.0000 0.0040 8.000 2.92 3.30 -0.38 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4643 0.4674 0.0683 1 1 0.4606 0.4679 0.0715 1 1 0.4554 0.4686 0.0759
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 320 61 259 24 2 5 0 30 0 0 258 0 1 0.3934 0.0000 0.0039 11.000 1.71 3.63 -1.93 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1563 0.5664 0.2773 1 1 0.1619 0.5627 0.2755 1 1 0.1694 0.5579 0.2728
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 308 85 223 34 0 3 0 48 0 0 223 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 27.333 0.18 1.21 -1.03 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1122 0.7306 0.1571 1 1 0.1213 0.7261 0.1526 1 1 0.1341 0.7195 0.1464
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 393 106 287 43 2 19 0 42 0 0 286 0 1 0.4057 0.0000 0.0035 4.579 0.09 3.43 -3.34 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3347 0.5809 0.0844 1 1 0.3391 0.5740 0.0869 1 1 0.3445 0.5654 0.0900
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 393 106 287 45 0 54 0 7 0 0 286 0 1 0.4245 0.0000 0.0035 0.981 0.29 4.57 -4.28 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.0816 0.9184 0.0000
chr14 30919054 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 1 107 59 48 56 0 1 0 2 0 0 48 0 0 0.9492 0.0000 0.0000 58.000 0.21 3.00 -2.79 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1693 0.8307 0.0000 0 0 0.6610 0.3390 0.0000 0 0 0.8075 0.1925 0.0000
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.100 1 24 1 329 73 256 34 0 37 0 2 1 0 255 0 0 0.4658 0.0039 0.0039 0.973 0.26 1.00 -0.74 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2354 0.7646 0.0000 0 0 0.7506 0.2494 0.0000 0 0 0.8697 0.1303 0.0000
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 659 132 527 6 0 21 1 104 0 0 516 0 11 0.0455 0.0000 0.0209 5.286 1.83 6.68 -4.85 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9972 0.0028 2 2 0.0000 0.2749 0.7251 2 2 0.0000 0.0341 0.9659
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.100 1 2 1 524 109 415 101 0 2 0 6 0 0 415 0 0 0.9266 0.0000 0.0000 53.500 0.40 2.00 -1.60 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0721 0.9279 0.0000 0 0 0.9864 0.0136 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 648 174 474 0 0 27 2 145 0 0 474 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.444 6.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 483 122 361 46 2 25 1 48 0 0 359 0 2 0.3770 0.0000 0.0055 3.880 3.52 6.48 -2.96 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1728 0.6235 0.2037 1 1 0.1789 0.6150 0.2061 1 1 0.1869 0.6043 0.2088
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 507 142 365 0 0 10 0 132 0 0 363 0 2 0.0000 0.0000 0.0055 13.200 3.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 322 85 237 51 0 1 0 33 0 0 234 0 3 0.6000 0.0000 0.0127 84.000 0.31 9.00 -8.69 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6309 0.3498 0.0194 1 0 0.6238 0.3547 0.0215 1 0 0.6139 0.3615 0.0246
chr14 94469426 TGAC T 0.001735 0.100 1 -3 2 524 130 394 120 0 4 0 6 0 1 393 0 0 0.9231 0.0000 0.0025 31.500 0.14 3.17 -3.02 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3050 0.6950 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr14 102930656 C CGCCGGG 0.008312 0.100 1 6 2 523 113 410 99 1 10 0 3 0 0 410 0 0 0.8761 0.0000 0.0000 10.300 1.89 6.33 -4.44 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9612 0.0388 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 243 81 162 0 0 11 0 70 0 0 157 0 5 0.0000 0.0000 0.0309 6.364 8.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0275 0.9725 2 2 0.0000 0.0297 0.9703 2 2 0.0000 0.0329 0.9671
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 435 128 307 0 0 19 2 107 0 0 302 1 4 0.0000 0.0000 0.0163 5.737 3.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0107 0.9893
chr15 20535052 TCC T 0.033305 0.100 1 -2 1 2061 586 1475 305 20 118 33 110 23 19 1420 5 8 0.5205 0.0156 0.0373 4.171 2.22 4.53 -2.31 107 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 20535057 T TGA 0.035606 0.100 1 2 2 2062 570 1492 313 9 120 18 110 30 15 1433 4 10 0.5491 0.0201 0.0395 4.073 2.19 4.52 -2.32 103 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 334 88 246 68 1 13 1 5 0 0 246 0 0 0.7727 0.0000 0.0000 5.769 2.44 5.00 -2.56 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1604 0.8396 0.0000 0 0 0.6829 0.3171 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 790 156 634 0 0 9 2 145 0 1 591 29 13 0.0000 0.0000 0.0678 16.333 4.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 1782 487 1295 0 0 10 4 473 0 2 1226 19 48 0.0000 0.0000 0.0533 47.500 3.53 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 31229302 C CG 0.001240 0.100 1 1 2 212 86 126 3 77 2 1 3 0 3 123 0 0 0.0349 0.0000 0.0238 6.500 1.33 1.00 0.33 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9724 0.0276 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 212 86 126 3 4 2 34 43 0 0 123 2 1 0.0349 0.0000 0.0238 26.000 1.33 1.91 -0.57 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9931 0.0069 2 1 0.0000 0.8096 0.1904 2 1 0.0000 0.5168 0.4832
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 214 88 126 4 5 45 1 33 0 0 124 0 2 0.0455 0.0000 0.0159 0.955 1.00 2.24 -1.24 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0008 0.7417 0.2574 2 1 0.0003 0.9262 0.0735 2 1 0.0001 0.9244 0.0755
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 695 173 522 0 0 32 4 137 0 0 517 0 5 0.0000 0.0000 0.0096 4.406 3.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr15 33844878 TAGA T 0.150388 0.100 1 -3 3 264 94 170 88 1 2 0 3 0 0 170 0 0 0.9362 0.0000 0.0000 45.500 0.18 3.67 -3.48 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3994 0.6006 0.0000 0 0 0.9514 0.0486 0.0000 0 0 0.9840 0.0160 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 394 134 260 48 0 5 0 81 0 0 259 0 1 0.3582 0.0000 0.0038 25.800 0.92 2.05 -1.13 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0020 0.1634 0.8346 1 2 0.0025 0.1749 0.8226 1 2 0.0035 0.1913 0.8052
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 436 118 318 65 0 6 0 47 1 0 310 0 7 0.5508 0.0031 0.0252 18.667 0.57 4.38 -3.81 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5245 0.4484 0.0272 1 0 0.5228 0.4475 0.0297 1 0 0.5197 0.4470 0.0333
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.100 1 4 1 210 77 133 41 0 4 0 32 0 0 133 0 0 0.5325 0.0000 0.0000 18.250 0.22 3.81 -3.59 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5983 0.3903 0.0113 1 0 0.5961 0.3918 0.0121 1 0 0.5928 0.3940 0.0132
chr15 65611120 G GTCCGTCGGCATAAACTT 0.000467 0.100 1 17 1 251 87 164 29 0 29 0 29 0 0 157 1 6 0.3333 0.0000 0.0427 2.000 1.31 9.03 -7.72 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2746 0.7249 0.0005 1 1 0.2845 0.7150 0.0005 1 1 0.2976 0.7020 0.0005
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 167 87 80 40 0 2 0 45 0 0 80 0 0 0.4598 0.0000 0.0000 42.500 0.10 3.27 -3.17 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1230 0.5805 0.2965 1 1 0.1282 0.5747 0.2972 1 1 0.1350 0.5673 0.2977
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 253 151 102 140 0 4 0 7 0 0 102 0 0 0.9272 0.0000 0.0000 36.750 0.64 3.00 -2.36 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3056 0.6944 0.0000 0 0 0.8744 0.1256 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 469 123 346 1 0 11 1 110 0 0 340 0 6 0.0081 0.0000 0.0173 10.182 1.00 3.92 -2.92 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0163 0.9837 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0045 0.9955
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 651 116 535 5 0 11 0 100 0 0 531 0 4 0.0431 0.0000 0.0075 9.545 1.20 5.57 -4.37 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9827 0.0173 2 1 0.0000 0.8884 0.1116
chr15 81332887 CTCT C 0.001806 0.100 1 -3 2 668 139 529 67 0 5 0 67 0 0 528 0 1 0.4820 0.0000 0.0019 26.800 0.27 3.34 -3.07 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3177 0.6816 0.0007 1 1 0.3295 0.6697 0.0007 1 1 0.3447 0.6545 0.0007
chr15 83008518 C CA 0.185307 0.100 1 1 1 136 31 105 17 3 4 1 6 0 0 104 0 1 0.5484 0.0000 0.0095 6.250 0.88 2.17 -1.28 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6852 0.3000 0.0148 1 0 0.6659 0.3184 0.0158 1 0 0.6125 0.3713 0.0161
chr15 84817274 G GGGCCA 0.000443 0.100 1 5 1 439 91 348 79 0 9 0 3 0 0 348 0 0 0.8681 0.0000 0.0000 9.111 0.66 5.33 -4.68 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9938 0.0062 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 353 142 211 69 0 2 0 71 0 0 208 0 3 0.4859 0.0000 0.0142 70.000 0.12 3.51 -3.39 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1495 0.6909 0.1595 1 1 0.1581 0.6796 0.1623 1 1 0.1696 0.6649 0.1656
chr15 88472272 CAG C 0.005890 0.100 1 -2 3 248 99 149 49 0 1 0 49 0 0 146 0 3 0.4949 0.0000 0.0201 98.000 0.04 2.59 -2.55 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3093 0.6874 0.0033 1 1 0.3198 0.6768 0.0034 1 1 0.3335 0.6631 0.0034
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 866 203 663 52 5 29 4 113 0 0 663 0 0 0.2562 0.0000 0.0000 5.862 1.38 7.04 -5.65 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0088 0.9912 1 2 0.0000 0.0103 0.9897 1 2 0.0000 0.0129 0.9871
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 357 126 231 0 0 9 0 117 0 0 223 0 8 0.0000 0.0000 0.0346 13.000 6.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 337 120 217 70 0 6 0 44 0 0 217 0 0 0.5833 0.0000 0.0000 19.000 0.19 2.16 -1.97 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7795 0.2157 0.0049 1 0 0.7688 0.2253 0.0059 1 0 0.7538 0.2388 0.0075
chr15 99712504 C CCAGCAG 0.003114 0.100 1 6 2 588 215 373 86 0 57 0 72 0 2 357 0 14 0.4000 0.0000 0.0429 2.772 0.64 5.36 -4.72 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3323 0.6670 0.0008 1 1 0.3454 0.6539 0.0008 1 1 0.3620 0.6371 0.0008
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.100 1 -3 2 588 233 355 174 4 43 1 11 0 0 353 0 2 0.7468 0.0000 0.0056 4.419 2.41 3.09 -0.68 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0145 0.9855 0.0000 0 0 0.8073 0.1927 0.0000
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 273 103 170 70 1 27 0 5 2 0 167 0 1 0.6796 0.0118 0.0176 2.778 2.81 10.40 -7.59 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 0 0.6818 0.3182 0.0000 0 0 0.9606 0.0394 0.0000
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 43 22 21 10 0 0 0 12 0 0 21 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 22.000 0.50 1.08 -0.58 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3304 0.5541 0.1155 1 1 0.3338 0.5512 0.1149 1 1 0.3384 0.5474 0.1142
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 309 85 224 48 0 2 0 35 0 0 224 0 0 0.5647 0.0000 0.0000 41.500 0.94 3.06 -2.12 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6101 0.3687 0.0213 1 0 0.6044 0.3723 0.0233 1 0 0.5964 0.3774 0.0262
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 243 61 182 4 0 1 2 54 0 0 177 0 5 0.0656 0.0000 0.0275 60.000 1.00 16.83 -15.83 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9716 0.0284 2 1 0.0000 0.8731 0.1269
chr16 1093978 G GC 0.001284 0.100 1 1 2 409 121 288 74 0 8 0 39 0 0 288 0 0 0.6116 0.0000 0.0000 14.125 0.27 1.41 -1.14 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9485 0.0515 0.0000 1 0 0.9438 0.0562 0.0000 1 0 0.9369 0.0631 0.0000
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 914 206 708 195 3 1 0 7 0 0 708 0 0 0.9466 0.0000 0.0000 205.000 0.94 1.29 -0.35 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0165 0.9835 0.0000 0 0 0.9774 0.0226 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 479 100 379 0 0 2 0 98 0 0 379 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 49.000 6.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 479 100 379 0 0 2 0 98 0 0 379 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 49.000 6.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2830782 TCTC T 0.000821 0.100 1 -3 2 199 55 144 52 0 1 0 2 0 0 144 0 0 0.9455 0.0000 0.0000 54.000 0.40 3.00 -2.60 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9951 0.0049 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.100 1 -3 2 246 90 156 45 0 4 0 41 0 0 155 0 1 0.5000 0.0000 0.0064 21.500 0.49 3.46 -2.97 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4544 0.5363 0.0093 1 1 0.4594 0.5310 0.0096 1 1 0.4654 0.5245 0.0100
chr16 4740302 GC G 0.000174 0.100 1 -1 1 243 63 180 32 0 3 0 28 0 0 180 0 0 0.5079 0.0000 0.0000 20.000 0.34 1.04 -0.69 10 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5255 0.4745 0.0000 1 0 0.5272 0.4728 0.0000 1 0 0.5291 0.4708 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 394 99 295 53 0 4 0 42 0 0 293 0 2 0.5354 0.0000 0.0068 23.750 0.87 3.21 -2.35 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3368 0.5737 0.0895 1 1 0.3349 0.5697 0.0954 1 1 0.3319 0.5646 0.1035
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 378 116 262 26 4 45 4 37 1 1 257 1 2 0.2241 0.0038 0.0191 1.578 2.42 6.14 -3.71 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1161 0.6439 0.2400 1 1 0.1243 0.6408 0.2349 1 1 0.1356 0.6365 0.2279
chr16 11915673 C CCCGCCGCCG 0.001135 0.100 1 9 1 378 116 262 42 20 45 1 8 2 0 256 1 3 0.3621 0.0076 0.0229 1.556 4.74 6.50 -1.76 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1057 0.8943 0.0000 0 0 0.9226 0.0774 0.0000
chr16 11927441 G GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA 0.000747 0.100 1 42 2 1715 340 1375 143 4 189 0 4 0 1 1372 0 2 0.4206 0.0000 0.0022 0.788 1.37 4.50 -3.13 69 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8009 0.1991 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 171 52 119 0 0 0 0 52 0 0 117 0 2 0.0000 0.0000 0.0168 52.000 2.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr16 29810102 G GGCGGCA 0.001131 0.100 1 6 1 674 229 445 201 3 19 0 6 2 0 443 0 0 0.8777 0.0045 0.0045 11.053 0.47 5.50 -5.03 107 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9811 0.0189 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.100 1 3 1 650 151 499 140 0 8 0 3 0 0 499 0 0 0.9272 0.0000 0.0000 17.875 0.42 6.33 -5.91 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7040 0.2960 0.0000 0 0 0.9852 0.0148 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000
chr16 30659842 AGAG A 0.002875 0.100 1 -3 2 777 195 582 165 2 20 0 8 0 0 582 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 8.750 0.46 3.50 -3.04 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0321 0.9679 0.0000 0 0 0.9966 0.0034 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 145 73 72 38 0 3 0 32 0 0 71 0 1 0.5205 0.0000 0.0139 23.333 0.11 2.12 -2.02 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3229 0.5572 0.1199 1 1 0.3227 0.5529 0.1245 1 1 0.3220 0.5474 0.1306
chr16 57813722 ATG A 0.500000 0.100 1 -2 1 328 131 197 1 87 0 3 40 0 0 196 0 1 0.0076 0.0000 0.0051 45.000 6.00 8.62 -2.62 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6543 0.3284 0.0173 1 0 0.6447 0.3357 0.0196 1 0 0.6313 0.3457 0.0230
chr16 57813725 CAGGTGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 328 136 192 92 1 0 0 43 0 0 190 0 2 0.6765 0.0000 0.0104 136.000 1.09 7.84 -6.75 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9672 0.0327 0.0001 1 0 0.9627 0.0372 0.0001 1 0 0.9558 0.0441 0.0002
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 409 83 326 41 11 9 3 19 0 0 325 0 1 0.4940 0.0000 0.0031 8.000 0.68 1.74 -1.05 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8413 0.1551 0.0036 1 0 0.8300 0.1657 0.0044 1 0 0.8137 0.1807 0.0056
chr16 67195890 A ACAGCAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 12 2 550 235 315 168 1 59 1 6 0 0 313 1 1 0.7149 0.0000 0.0063 2.966 0.92 3.33 -2.42 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4416 0.5584 0.0000 0 0 0.9468 0.0532 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1005 297 708 7 1 65 10 214 0 0 704 0 4 0.0236 0.0000 0.0056 3.569 0.14 3.79 -3.64 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9913 0.0087 2 2 0.0000 0.0339 0.9661 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 279 127 152 50 0 16 0 61 0 0 151 0 1 0.3937 0.0000 0.0066 6.938 3.00 5.43 -2.43 2 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0432 0.4911 0.4658 1 1 0.0470 0.4902 0.4628 1 1 0.0525 0.4893 0.4582
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 135 66 69 45 0 1 0 20 0 0 68 0 1 0.6818 0.0000 0.0145 65.000 0.22 4.10 -3.88 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7907 0.2025 0.0068 1 0 0.7786 0.2134 0.0080 1 0 0.7616 0.2284 0.0100
chr16 71999722 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 270 82 188 80 0 0 0 2 0 0 188 0 0 0.9756 0.0000 0.0000 82.000 0.31 1.00 -0.69 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4111 0.5889 0.0000 0 0 0.8662 0.1338 0.0000 0 0 0.9308 0.0692 0.0000
chr16 72788664 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 589 169 420 72 2 33 54 8 0 0 416 3 1 0.4260 0.0000 0.0095 4.121 0.75 3.12 -2.38 14 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3525 0.5850 0.0625 1 1 0.3547 0.5781 0.0672 1 1 0.3566 0.5696 0.0738
chr16 72788664 TTGCTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -12 2 591 173 418 92 1 23 0 57 0 0 411 0 7 0.5318 0.0000 0.0167 6.522 0.86 11.58 -10.72 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8019 0.1956 0.0026 1 0 0.7930 0.2039 0.0032 1 0 0.7801 0.2158 0.0042
chr16 72797458 C CTTG 0.500000 0.100 1 3 1 676 159 517 69 7 32 0 51 0 0 513 0 4 0.4340 0.0000 0.0077 3.969 0.38 3.24 -2.86 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6709 0.3186 0.0105 1 0 0.6628 0.3250 0.0122 1 0 0.6513 0.3340 0.0148
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 298 90 208 77 0 8 0 5 0 0 208 0 0 0.8556 0.0000 0.0000 10.250 0.52 13.40 -12.88 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1858 0.8142 0.0000 0 0 0.6289 0.3711 0.0000
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 240 131 109 127 0 2 0 2 0 0 109 0 0 0.9695 0.0000 0.0000 64.500 0.45 4.00 -3.55 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8848 0.1152 0.0000 0 0 0.9855 0.0145 0.0000 0 0 0.9925 0.0075 0.0000
chr16 85656376 GGAGCGC G 0.500000 0.100 1 -6 3 501 133 368 76 0 16 0 41 0 0 367 0 1 0.5714 0.0000 0.0027 7.312 1.76 6.32 -4.55 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8898 0.1091 0.0011 1 0 0.8808 0.1178 0.0014 1 0 0.8677 0.1304 0.0019
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 413 106 307 38 2 31 0 35 0 0 303 0 4 0.3585 0.0000 0.0130 2.387 3.29 5.54 -2.25 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2148 0.5944 0.1908 1 1 0.2180 0.5874 0.1945 1 1 0.2221 0.5786 0.1993
chr16 87604287 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 413 112 301 41 6 24 2 39 0 0 301 0 0 0.3661 0.0000 0.0000 3.625 4.68 3.00 1.68 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3215 0.5707 0.1078 1 1 0.3220 0.5653 0.1126 1 1 0.3223 0.5586 0.1192
chr16 88528131 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 318 113 205 101 1 3 0 8 0 0 205 0 0 0.8938 0.0000 0.0000 36.667 0.24 3.00 -2.76 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0316 0.9684 0.0000 0 1 0.4539 0.5461 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 664 122 542 0 0 5 4 113 0 0 532 1 9 0.0000 0.0000 0.0185 23.400 7.73 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 661 116 545 0 0 3 4 109 0 0 536 1 8 0.0000 0.0000 0.0165 37.333 7.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 663 114 549 0 0 2 0 112 0 2 533 5 9 0.0000 0.0000 0.0291 112.000 7.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0582 0.9418 2 2 0.0000 0.0126 0.9874 2 2 0.0000 0.0072 0.9928
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 801 185 616 5 0 10 1 169 0 0 615 0 1 0.0270 0.0000 0.0016 17.500 6.80 6.96 -0.16 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9164 0.0836 2 2 0.0000 0.0385 0.9615 2 2 0.0000 0.0061 0.9939
chr16 88714227 G GGTGT 0.500000 0.100 1 4 1 793 185 608 134 1 11 2 37 0 0 606 1 1 0.7243 0.0000 0.0033 15.636 7.60 4.57 3.03 42 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.8649 0.1351 0.0000 0 1 0.0028 0.9972 0.0000
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.100 1 6 2 689 163 526 72 2 26 0 63 0 0 519 0 7 0.4417 0.0000 0.0133 5.231 0.53 5.81 -5.28 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2354 0.6537 0.1109 1 1 0.2406 0.6427 0.1167 1 1 0.2469 0.6287 0.1244
chr16 88733964 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 904 286 618 113 15 46 4 108 0 0 614 1 3 0.3951 0.0000 0.0065 5.109 0.60 2.94 -2.34 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3298 0.6411 0.0290 1 1 0.3380 0.6293 0.0327 1 1 0.3473 0.6146 0.0380
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 905 293 612 235 3 40 2 13 0 1 611 0 0 0.8020 0.0000 0.0016 6.250 1.68 2.92 -1.24 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0379 0.9621 0.0000 0 0 0.9145 0.0855 0.0000
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 155 59 96 5 0 0 0 54 0 0 94 0 2 0.0847 0.0000 0.0208 59.000 0.00 4.31 -4.31 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9260 0.0740 2 1 0.0000 0.6205 0.3795
chr17 3197642 AATCTGCTCATC A 0.000837 0.100 1 -11 3 565 148 417 77 0 12 0 59 0 0 412 0 5 0.5203 0.0000 0.0120 11.333 0.25 10.42 -10.18 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6448 0.3552 0.0000 1 0 0.6454 0.3546 0.0000 1 0 0.6454 0.3545 0.0001
chr17 4672141 ATCC A 0.002914 0.100 1 -3 1 721 153 568 75 1 9 2 66 0 0 568 0 0 0.4902 0.0000 0.0000 18.000 0.32 3.15 -2.83 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5243 0.4754 0.0003 1 0 0.5299 0.4698 0.0003 1 0 0.5363 0.4633 0.0004
chr17 5182147 CACT C 0.000174 0.100 1 -3 2 988 253 735 144 3 11 2 93 0 0 734 0 1 0.5692 0.0000 0.0014 21.909 0.81 3.24 -2.43 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9788 0.0212 0.0000 1 0 0.9766 0.0234 0.0000 1 0 0.9731 0.0269 0.0000
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 781 141 640 128 5 5 0 3 0 0 640 0 0 0.9078 0.0000 0.0000 27.200 0.42 3.67 -3.24 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9935 0.0065 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 773 180 593 68 3 32 5 72 0 0 577 1 15 0.3778 0.0000 0.0270 4.625 0.28 9.40 -9.12 4 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0050 0.2814 0.7135 1 2 0.0059 0.2858 0.7083 1 2 0.0073 0.2922 0.7005
chr17 7024700 C CCAGCAGCAGCAG 0.000310 0.100 1 12 1 773 180 593 78 0 33 0 69 0 0 577 0 16 0.4333 0.0000 0.0270 4.455 0.63 10.09 -9.46 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1869 0.8129 0.0002 1 1 0.2004 0.7994 0.0002 1 1 0.2186 0.7811 0.0002
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 391 102 289 49 0 7 0 46 0 0 288 0 1 0.4804 0.0000 0.0035 13.571 0.41 7.70 -7.29 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2326 0.6110 0.1565 1 1 0.2360 0.6028 0.1612 1 1 0.2402 0.5925 0.1674
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 513 194 319 70 2 35 4 83 0 0 319 0 0 0.3608 0.0000 0.0000 4.514 0.24 3.04 -2.79 30 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0257 0.4868 0.4876 1 2 0.0287 0.4848 0.4865 1 2 0.0332 0.4828 0.4841
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1005 281 724 248 1 5 15 12 0 0 724 0 0 0.8826 0.0000 0.0000 52.400 0.50 4.50 -4.00 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0481 0.9519 0.0000 0 0 0.8905 0.1095 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 1009 280 729 245 7 16 2 10 0 0 729 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 18.714 0.47 3.90 -3.43 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6502 0.3498 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 785 162 623 63 0 9 0 90 0 0 619 0 4 0.3889 0.0000 0.0064 17.000 0.22 3.93 -3.71 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0018 0.1664 0.8319 1 2 0.0022 0.1748 0.8229 1 2 0.0030 0.1870 0.8100
chr17 30834937 ACAATGT A 0.500000 0.100 1 -6 1 819 169 650 95 0 4 0 70 0 0 645 1 4 0.5621 0.0000 0.0077 41.250 0.36 6.61 -6.26 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6083 0.3805 0.0113 1 0 0.6039 0.3831 0.0130 1 0 0.5969 0.3873 0.0158
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 160 85 75 8 0 3 0 74 0 0 74 0 1 0.0941 0.0000 0.0133 27.333 0.12 1.31 -1.19 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9916 0.0084 2 1 0.0000 0.8166 0.1834
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 761 201 560 189 0 5 0 7 0 0 560 0 0 0.9403 0.0000 0.0000 39.200 0.34 1.57 -1.23 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 0 0.8809 0.1191 0.0000 0 0 0.9908 0.0092 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 554 121 433 113 0 4 0 4 0 0 433 0 0 0.9339 0.0000 0.0000 29.250 0.65 2.75 -2.10 81 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0432 0.9568 0.0000 0 0 0.8007 0.1993 0.0000 0 0 0.9487 0.0513 0.0000
chr17 41105856 CTCCAGCTGCTGCCGCCCCTCTTGCTGTGAA C 0.500000 0.100 1 -30 1 782 221 561 133 0 39 0 49 2 1 537 0 21 0.6018 0.0036 0.0428 4.667 0.68 22.67 -22.00 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9920 0.0080 0.0000 1 0 0.9905 0.0095 0.0000 1 0 0.9880 0.0120 0.0000
chr17 41140276 TGACAGCAGCTGG T 0.500000 0.100 1 -12 1 677 162 515 127 7 22 1 5 1 4 509 0 1 0.7840 0.0019 0.0117 6.227 1.43 10.20 -8.77 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.4310 0.5690 0.0000 0 0 0.9118 0.0882 0.0000
chr17 41149253 CG C 0.500000 0.100 1 -1 4 460 143 317 70 1 2 0 70 0 0 317 0 0 0.4895 0.0000 0.0000 70.000 0.36 1.30 -0.94 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1806 0.6651 0.1542 1 1 0.1864 0.6535 0.1601 1 1 0.1937 0.6385 0.1677
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 532 109 423 4 0 17 2 86 0 0 404 1 18 0.0367 0.0000 0.0449 5.412 0.50 9.16 -8.66 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9689 0.0311 2 2 0.0000 0.2537 0.7463 2 2 0.0000 0.0679 0.9321
chr17 41302321 TGTACAGATGGTTG T 0.500000 0.100 1 -13 1 1018 267 751 255 0 4 0 8 0 0 750 0 1 0.9551 0.0000 0.0013 65.750 0.29 13.50 -13.21 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.9590 0.0410 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 596 199 397 165 0 26 0 8 0 0 396 0 1 0.8291 0.0000 0.0025 6.654 0.36 16.00 -15.64 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2073 0.7927 0.0000 0 0 0.9029 0.0971 0.0000
chr17 41567480 C CCCACTTCCTCCACTATGACCACCT 0.500000 0.100 1 24 5 737 159 578 68 2 32 0 57 2 0 536 0 40 0.4277 0.0035 0.0727 3.969 0.79 10.19 -9.40 14 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0050 0.2757 0.7193 1 2 0.0060 0.2821 0.7119 1 2 0.0077 0.2913 0.7011
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1601 308 1293 157 0 4 1 146 0 0 1287 1 5 0.5097 0.0000 0.0046 75.750 0.37 3.42 -3.05 61 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1343 0.8075 0.0582 1 1 0.1450 0.7900 0.0650 1 1 0.1591 0.7665 0.0744
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 663 186 477 7 0 40 5 134 0 1 467 0 9 0.0376 0.0000 0.0210 3.625 0.43 3.39 -2.96 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.5454 0.4546 2 2 0.0000 0.0705 0.9295
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 211 84 127 34 1 3 0 46 0 0 124 0 3 0.4048 0.0000 0.0236 26.667 0.21 4.89 -4.69 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0333 0.4103 0.5563 1 2 0.0366 0.4144 0.5489 1 2 0.0415 0.4200 0.5385
chr17 48724362 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 473 158 315 83 0 5 0 70 0 0 314 0 1 0.5253 0.0000 0.0032 30.600 0.24 1.19 -0.94 51 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4187 0.5424 0.0388 1 1 0.4197 0.5376 0.0427 1 1 0.4199 0.5319 0.0482
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 863 224 639 0 0 12 0 212 0 0 633 0 6 0.0000 0.0000 0.0094 17.667 2.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.100 1 3 2 483 105 378 66 3 26 0 10 0 0 377 0 1 0.6286 0.0000 0.0026 3.038 0.26 2.90 -2.64 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0238 0.9762 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 435 154 281 119 0 30 0 5 0 0 281 0 0 0.7727 0.0000 0.0000 4.133 0.45 6.80 -6.35 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0064 0.9936 0.0000 0 0 0.6502 0.3498 0.0000 0 0 0.9286 0.0714 0.0000
chr17 65536436 ACGGGGGGTGGTG A 0.500000 0.100 1 -12 1 410 127 283 56 0 10 0 61 0 0 278 0 5 0.4409 0.0000 0.0177 11.700 0.46 10.48 -10.01 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0554 0.5429 0.4017 1 1 0.0598 0.5388 0.4014 1 1 0.0660 0.5337 0.4003
chr17 69149049 TGA T 0.500000 0.100 1 -2 2 181 80 101 75 0 1 0 4 0 0 101 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 79.000 0.23 2.75 -2.52 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.3749 0.6251 0.0000 0 0 0.7451 0.2549 0.0000
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 262 70 192 34 0 11 0 25 0 0 190 0 2 0.4857 0.0000 0.0104 5.364 0.62 7.92 -7.30 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3850 0.5189 0.0961 1 1 0.3821 0.5172 0.1007 1 1 0.3780 0.5151 0.1069
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.100 1 -2 3 296 69 227 37 0 0 0 32 0 0 226 0 1 0.5362 0.0000 0.0044 69.000 0.19 2.19 -2.00 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2986 0.5663 0.1351 1 1 0.2991 0.5613 0.1396 1 1 0.2995 0.5550 0.1455
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.100 1 -4 3 187 73 114 67 0 1 0 5 0 0 114 0 0 0.9178 0.0000 0.0000 72.000 0.54 4.20 -3.66 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1216 0.8784 0.0000 0 0 0.5105 0.4895 0.0000
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 122 46 76 21 0 1 0 24 0 0 75 0 1 0.4565 0.0000 0.0132 45.000 0.52 1.17 -0.64 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1442 0.5372 0.3186 1 1 0.1482 0.5343 0.3175 1 1 0.1534 0.5308 0.3158
chr17 74367718 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 229 83 146 44 0 0 1 38 0 0 146 0 0 0.5301 0.0000 0.0000 82.000 0.34 1.00 -0.66 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3204 0.5676 0.1119 1 1 0.3208 0.5625 0.1167 1 1 0.3208 0.5560 0.1232
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 584 127 457 61 1 14 1 50 0 0 447 0 10 0.4803 0.0000 0.0219 8.071 0.41 8.36 -7.95 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1987 0.6447 0.1566 1 1 0.2037 0.6343 0.1620 1 1 0.2099 0.6211 0.1690
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.100 1 -54 1 187 50 137 0 0 4 2 44 0 0 137 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.250 6.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0879 0.9121 2 2 0.0000 0.0918 0.9082 2 2 0.0000 0.0974 0.9026
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 1328 328 1000 173 2 12 7 134 0 0 997 1 2 0.5274 0.0000 0.0030 26.250 0.88 2.44 -1.56 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6922 0.3063 0.0015 1 0 0.6918 0.3063 0.0019 1 0 0.6897 0.3078 0.0026
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 1441 328 1113 185 2 32 1 108 1 0 1090 0 22 0.5640 0.0009 0.0207 9.250 0.94 17.08 -16.14 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9674 0.0325 0.0000 1 0 0.9641 0.0358 0.0000 1 0 0.9590 0.0410 0.0000
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.100 1 -27 1 1505 314 1191 210 0 7 0 97 1 2 1145 2 41 0.6688 0.0008 0.0386 51.167 0.79 22.23 -21.44 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9917 0.0083 0.0000 1 0 0.9904 0.0096 0.0000 1 0 0.9883 0.0117 0.0000
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 2 697 225 472 213 1 6 0 5 0 0 472 0 0 0.9467 0.0000 0.0000 36.500 0.22 3.00 -2.78 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4504 0.5496 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2300 506 1794 220 9 63 7 207 1 5 1774 4 10 0.4348 0.0006 0.0111 7.000 1.28 6.38 -5.09 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0930 0.8834 0.0236 1 1 0.1053 0.8666 0.0282 1 1 0.1224 0.8425 0.0351
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2224 562 1662 229 10 34 3 286 2 2 1505 12 141 0.4075 0.0012 0.0945 15.441 1.31 4.45 -3.14 29 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 82060071 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 385 119 266 66 0 1 0 52 0 0 266 0 0 0.5546 0.0000 0.0000 118.000 1.26 3.46 -2.20 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5120 0.4560 0.0319 1 0 0.5079 0.4568 0.0352 1 0 0.5016 0.4583 0.0401
chr18 5891374 GGCGGCGGCGGCC G 0.006401 0.100 1 -12 1 915 176 739 62 1 42 0 71 0 0 730 0 9 0.3523 0.0000 0.0122 3.190 2.68 12.18 -9.51 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0824 0.9021 0.0154 1 1 0.0918 0.8931 0.0151 1 1 0.1054 0.8800 0.0146
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.100 1 6 4 437 101 336 51 0 5 0 45 0 0 336 0 0 0.5050 0.0000 0.0000 19.200 0.37 5.40 -5.03 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4793 0.4958 0.0249 1 1 0.4817 0.4920 0.0262 1 1 0.4844 0.4876 0.0280
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 234 92 142 0 0 5 0 87 0 0 139 0 3 0.0000 0.0000 0.0211 17.400 3.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 360 84 276 28 1 7 1 47 0 1 271 0 4 0.3333 0.0000 0.0181 10.857 3.00 8.68 -5.68 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0258 0.4284 0.5458 1 2 0.0297 0.4395 0.5308 1 2 0.0355 0.4541 0.5104
chr18 26548258 TTCC T 0.006179 0.100 1 -3 1 760 181 579 87 2 25 0 67 0 0 578 1 0 0.4807 0.0000 0.0017 6.200 0.49 3.64 -3.15 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7833 0.2166 0.0001 1 0 0.7796 0.2203 0.0001 1 0 0.7741 0.2258 0.0001
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 115 53 62 49 0 1 0 3 0 0 61 0 1 0.9245 0.0000 0.0161 52.000 0.12 3.00 -2.88 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.1405 0.8595 0.0000 0 1 0.4528 0.5472 0.0000
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 304 146 158 82 0 1 0 63 0 0 156 0 2 0.5616 0.0000 0.0127 145.000 0.10 3.52 -3.43 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5565 0.4244 0.0191 1 0 0.5525 0.4259 0.0216 1 0 0.5463 0.4283 0.0254
chr18 54224211 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 319 77 242 69 0 5 0 3 0 0 242 0 0 0.8961 0.0000 0.0000 14.400 0.80 3.00 -2.20 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0411 0.9589 0.0000 0 0 0.5627 0.4373 0.0000 0 0 0.8058 0.1942 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 260 149 111 0 0 2 1 146 0 0 111 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 73.500 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 737 179 558 91 0 3 2 83 0 0 553 0 5 0.5084 0.0000 0.0090 58.667 0.26 13.27 -13.00 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1609 0.7074 0.1317 1 1 0.1681 0.6933 0.1386 1 1 0.1772 0.6752 0.1476
chr18 63655777 T TGCCA 0.500000 0.100 1 4 2 359 95 264 14 0 1 0 80 0 0 251 2 11 0.1474 0.0000 0.0492 94.000 0.00 5.33 -5.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9887 0.0113
chr18 63655779 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 359 94 265 15 0 2 5 72 0 0 252 4 9 0.1596 0.0000 0.0491 45.500 0.00 5.65 -5.65 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9949 0.0051
chr18 63954437 AGATGGAGATATTCATC A 0.500000 0.100 1 -16 2 125 46 79 36 0 0 0 10 0 0 76 0 3 0.7826 0.0000 0.0380 46.000 0.39 15.20 -14.81 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7867 0.2050 0.0082 1 0 0.7695 0.2209 0.0096 1 0 0.6926 0.2965 0.0109
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 164 61 103 4 0 3 2 52 0 0 101 0 2 0.0656 0.0000 0.0194 19.333 0.00 3.58 -3.58 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.8120 0.1880 2 2 0.0000 0.4629 0.5371
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.100 1 4 1 631 130 501 79 0 0 0 51 0 0 498 0 3 0.6077 0.0000 0.0060 130.000 0.51 5.22 -4.71 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8143 0.1834 0.0023 1 0 0.8069 0.1904 0.0027 1 0 0.7962 0.2003 0.0035
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.100 1 -27 1 356 62 294 5 1 5 0 51 0 0 289 0 5 0.0806 0.0000 0.0170 11.200 3.00 21.31 -18.31 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9806 0.0194 2 1 0.0000 0.8673 0.1327
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 171 70 101 0 0 4 0 66 0 0 100 0 1 0.0000 0.0000 0.0099 16.500 4.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0978 0.9022 2 2 0.0000 0.1041 0.8959 2 2 0.0000 0.1133 0.8867
chr19 1578372 GCTC G 0.001595 0.100 1 -3 3 395 166 229 81 1 13 4 67 0 0 226 1 2 0.4880 0.0000 0.0131 11.769 0.14 3.21 -3.07 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5056 0.4942 0.0002 1 0 0.5125 0.4873 0.0002 1 0 0.5206 0.4792 0.0002
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 254 146 108 79 0 2 1 64 0 0 107 0 1 0.5411 0.0000 0.0093 71.500 0.10 2.97 -2.87 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5788 0.4091 0.0121 1 0 0.5788 0.4078 0.0134 1 0 0.5779 0.4068 0.0153
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.100 1 3 2 355 85 270 31 1 25 1 27 0 0 270 0 0 0.3647 0.0000 0.0000 2.360 0.65 3.26 -2.61 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5200 0.4720 0.0081 1 0 0.5212 0.4704 0.0084 1 0 0.5225 0.4687 0.0088
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 333 122 211 0 0 24 90 8 0 0 202 8 1 0.0000 0.0000 0.0427 4.083 5.50 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0051 0.9949 2 2 0.0000 0.0059 0.9941
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 333 123 210 1 0 29 0 93 0 0 200 0 10 0.0081 0.0000 0.0476 3.481 0.00 6.74 -6.74 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2142 0.7858 2 2 0.0000 0.0874 0.9126 2 2 0.0000 0.0678 0.9322
chr19 4529242 TGAG T 0.001023 0.100 1 -3 1 270 82 188 77 0 2 0 3 0 0 188 0 0 0.9390 0.0000 0.0000 40.000 0.22 3.00 -2.78 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9843 0.0157 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 728 149 579 76 1 29 2 41 0 0 579 0 0 0.5101 0.0000 0.0000 4.103 0.30 3.20 -2.89 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9338 0.0660 0.0002 1 0 0.9282 0.0716 0.0002 1 0 0.9200 0.0797 0.0003
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 417 116 301 98 1 3 0 14 2 0 299 0 0 0.8448 0.0066 0.0066 37.667 0.95 3.00 -2.05 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1110 0.8890 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 597 161 436 89 1 10 0 61 1 0 429 0 6 0.5528 0.0023 0.0161 16.778 0.29 9.90 -9.61 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7808 0.2166 0.0026 1 0 0.7745 0.2223 0.0032 1 0 0.7654 0.2306 0.0040
chr19 8490988 TCTC T 0.003548 0.100 1 -3 2 554 138 416 67 0 4 0 67 0 0 416 0 0 0.4855 0.0000 0.0000 33.500 1.10 3.37 -2.27 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3401 0.6586 0.0012 1 1 0.3514 0.6474 0.0013 1 1 0.3657 0.6330 0.0013
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 332 84 248 72 0 5 0 7 0 0 248 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 15.800 0.36 5.00 -4.64 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0430 0.9570 0.0000 0 1 0.4394 0.5606 0.0000
chr19 10560338 ATCTTCCTCCTCC A 0.000985 0.100 1 -12 1 272 94 178 86 0 7 0 1 0 0 178 0 0 0.9149 0.0000 0.0000 12.429 0.36 12.00 -11.64 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 837 304 533 124 2 49 12 117 0 0 528 0 5 0.4079 0.0000 0.0094 5.204 0.36 3.32 -2.95 48 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0647 0.7737 0.1616 1 1 0.0720 0.7587 0.1693 1 1 0.0825 0.7389 0.1787
chr19 12076500 TCA T 0.003508 0.100 1 -2 2 1127 262 865 243 5 10 0 4 1 0 864 0 0 0.9275 0.0012 0.0012 27.778 1.16 2.00 -0.84 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 424 153 271 5 0 30 0 118 0 0 268 0 3 0.0327 0.0000 0.0111 4.100 0.20 6.42 -6.22 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.5223 0.4777 2 2 0.0000 0.1354 0.8646
chr19 13877367 T TGGAGCCGGTGTCAGCGCC 0.004594 0.100 1 18 1 387 124 263 112 0 8 0 4 0 0 262 0 1 0.9032 0.0000 0.0038 14.500 0.26 4.50 -4.24 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4934 0.5066 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr19 13877744 C CGAG 0.002385 0.100 1 3 2 368 92 276 43 2 14 0 33 0 0 276 0 0 0.4674 0.0000 0.0000 5.571 0.44 2.82 -2.38 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6908 0.3091 0.0002 1 0 0.6871 0.3127 0.0002 1 0 0.6819 0.3179 0.0002
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.100 1 3 1 292 93 199 47 0 8 0 38 0 1 197 0 1 0.5054 0.0000 0.0101 10.625 0.09 3.16 -3.07 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5860 0.4066 0.0074 1 0 0.5855 0.4066 0.0079 1 0 0.5843 0.4071 0.0086
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 552 113 439 0 0 5 1 107 0 0 436 0 3 0.0000 0.0000 0.0068 21.400 3.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 14942196 C CT 0.000424 0.100 1 1 2 528 109 419 100 0 5 0 4 0 0 419 0 0 0.9174 0.0000 0.0000 20.800 3.11 2.75 0.36 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9829 0.0171 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 17286690 GTT G 0.132491 0.100 1 -2 1 395 86 309 1 6 5 8 66 0 0 309 0 0 0.0116 0.0000 0.0000 15.000 2.00 3.83 -1.83 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9958 0.0042 2 1 0.0000 0.9140 0.0860 2 1 0.0000 0.7335 0.2665
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 119 49 70 21 0 3 0 25 0 0 70 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 15.333 0.43 3.60 -3.17 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2543 0.5981 0.1476 1 1 0.2604 0.5930 0.1466 1 1 0.2685 0.5864 0.1451
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 617 148 469 67 0 9 0 72 0 0 468 0 1 0.4527 0.0000 0.0021 15.444 0.15 2.90 -2.75 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1902 0.7502 0.0596 1 1 0.2016 0.7380 0.0604 1 1 0.2170 0.7218 0.0612
chr19 22757390 A AG 0.088391 0.100 1 1 2 1981 392 1589 197 5 15 4 171 3 0 1172 14 400 0.5026 0.0019 0.2624 26.786 1.63 2.01 -0.37 33 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 30009211 G GTGA 0.000599 0.100 1 3 1 342 99 243 11 72 12 0 4 0 3 240 0 0 0.1111 0.0000 0.0123 7.250 1.36 3.00 -1.64 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9491 0.0509 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 342 99 243 6 0 9 4 80 0 0 240 1 2 0.0606 0.0000 0.0123 10.000 2.00 2.98 -0.98 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.5845 0.4155 2 2 0.0000 0.1177 0.8823
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 597 138 459 76 0 3 1 58 0 0 457 0 2 0.5507 0.0000 0.0044 45.000 0.76 3.14 -2.37 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3509 0.5981 0.0510 1 1 0.3473 0.5960 0.0566 1 1 0.3417 0.5935 0.0648
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 456 197 259 138 0 16 0 43 0 0 240 0 19 0.7005 0.0000 0.0734 11.312 2.65 22.86 -20.21 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9983 0.0017 0.0000 1 0 0.9979 0.0021 0.0000 1 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 444 159 285 79 3 59 0 18 0 0 281 4 0 0.4969 0.0000 0.0140 1.815 5.06 4.78 0.29 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1593 0.8407 0.0000 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.100 1 -3 1 457 161 296 34 2 20 10 95 0 0 295 0 1 0.2112 0.0000 0.0034 8.750 2.09 3.17 -1.08 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0157 0.9843 1 2 0.0000 0.0200 0.9799 1 2 0.0000 0.3991 0.6009
chr19 36141122 GGGCGGCGGCGGC G 0.001299 0.100 1 -12 5 477 166 311 132 2 15 0 17 2 1 305 0 3 0.7952 0.0064 0.0193 9.933 0.98 11.82 -10.85 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.6083 0.3917 0.0000
chr19 37894973 TGGA T 0.043831 0.100 1 -3 1 636 134 502 127 2 1 0 4 0 0 502 0 0 0.9478 0.0000 0.0000 133.000 0.43 3.75 -3.32 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6827 0.3173 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 548 124 424 72 1 12 1 38 0 0 398 0 26 0.5806 0.0000 0.0613 9.333 0.74 9.05 -8.32 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5127 0.4814 0.0060 1 0 0.5175 0.4761 0.0064 1 0 0.5231 0.4699 0.0070
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.100 1 3 1 129 67 62 40 2 11 1 13 0 0 59 0 3 0.5970 0.0000 0.0484 5.091 0.17 3.08 -2.90 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8971 0.1027 0.0002 1 0 0.8898 0.1099 0.0002 1 0 0.8749 0.1248 0.0003
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 431 132 299 120 0 2 0 10 0 1 296 0 2 0.9091 0.0000 0.0100 130.000 0.40 2.90 -2.50 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.2615 0.7385 0.0000
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 228 37 191 0 0 3 32 2 0 0 191 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.333 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0487 0.9513 2 2 0.0000 0.0504 0.9496 2 2 0.0000 0.0528 0.9472
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 228 37 191 0 0 25 11 1 0 0 191 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.474 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1012 0.8988 2 2 0.0000 0.1030 0.8970 2 2 0.0000 0.1057 0.8943
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 461 128 333 0 0 9 2 117 0 1 332 0 0 0.0000 0.0000 0.0030 14.875 5.85 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 448 134 314 66 0 0 2 66 0 0 312 0 2 0.4925 0.0000 0.0064 134.000 0.12 1.74 -1.62 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1932 0.6997 0.1071 1 1 0.2029 0.6880 0.1091 1 1 0.2158 0.6728 0.1114
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 339 77 262 48 0 0 0 29 0 0 258 0 4 0.6234 0.0000 0.0153 77.000 0.21 6.55 -6.34 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6202 0.3572 0.0226 1 0 0.6124 0.3626 0.0250 1 0 0.6015 0.3699 0.0286
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 520 160 360 149 1 2 0 8 0 0 359 0 1 0.9313 0.0000 0.0028 79.000 0.20 3.12 -2.92 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0667 0.9333 0.0000 0 0 0.7221 0.2779 0.0000
chr19 44273995 TCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTGAGGTATGTGATAAGGGCTTCAGTAAGGCCTCAAATCTTCAAGCCCATCAGAGAATC T 0.002701 0.100 1 -84 2 540 73 467 15 1 9 1 47 0 0 434 0 33 0.2055 0.0000 0.0707 7.000 0.27 3.64 -3.37 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 459 134 325 0 0 6 3 125 0 0 322 1 2 0.0000 0.0000 0.0092 32.000 2.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0097 0.9903
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 241 111 130 61 0 1 0 49 0 0 130 0 0 0.5495 0.0000 0.0000 110.000 0.21 2.12 -1.91 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6533 0.3459 0.0009 1 0 0.6521 0.3470 0.0009 1 0 0.6499 0.3490 0.0010
chr19 46016106 TCGTCCCGGGAGCGCTCCG T 0.003109 0.100 1 -18 1 339 92 247 16 0 3 1 72 0 0 240 0 7 0.1739 0.0000 0.0283 29.333 0.44 16.06 -15.62 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 47681104 AGCAGCCCCC A 0.000031 0.100 1 -9 1 395 83 312 73 1 5 0 4 1 0 311 0 0 0.8795 0.0032 0.0032 15.600 0.78 9.75 -8.97 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9951 0.0049 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 48703766 AC A 0.000439 0.100 1 -1 1 619 148 471 79 0 2 0 67 0 0 470 0 1 0.5338 0.0000 0.0021 73.000 0.85 1.12 -0.27 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5912 0.4088 0.0000 1 0 0.5942 0.4058 0.0000 1 0 0.5973 0.4026 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 598 171 427 8 1 30 1 131 0 0 422 1 4 0.0468 0.0000 0.0117 4.700 0.25 6.64 -6.39 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9550 0.0450 2 2 0.0000 0.3990 0.6010
chr19 49908948 G GTGC 0.000984 0.100 1 3 2 854 227 627 118 2 14 3 90 0 0 627 0 0 0.5198 0.0000 0.0000 15.214 1.13 3.30 -2.17 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8407 0.1593 0.0000 1 0 0.8372 0.1628 0.0000 1 0 0.8319 0.1681 0.0000
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 712 154 558 2 0 4 1 147 0 0 554 0 4 0.0130 0.0000 0.0072 37.500 0.50 3.45 -2.95 2 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0662 0.9338 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr19 50454349 AT A 0.000449 0.100 1 -1 1 329 74 255 70 1 0 0 3 0 2 253 0 0 0.9459 0.0000 0.0078 74.000 1.09 2.00 -0.91 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9915 0.0085 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 532 138 394 7 0 3 8 120 0 0 385 0 9 0.0507 0.0000 0.0228 45.000 0.14 2.72 -2.57 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 2 0.0000 0.4883 0.5117 2 2 0.0000 0.0574 0.9426
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 215 97 118 51 0 3 0 43 0 0 118 0 0 0.5258 0.0000 0.0000 31.333 0.27 2.19 -1.91 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2432 0.6275 0.1293 1 1 0.2418 0.6214 0.1367 1 1 0.2396 0.6136 0.1468
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 417 135 282 68 0 2 0 65 0 0 282 0 0 0.5037 0.0000 0.0000 66.500 0.18 2.18 -2.01 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2739 0.6325 0.0936 1 1 0.2799 0.6222 0.0979 1 1 0.2872 0.6092 0.1036
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 486 122 364 63 0 6 0 53 0 0 363 0 1 0.5164 0.0000 0.0027 19.333 0.90 3.17 -2.27 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4358 0.5178 0.0464 1 1 0.4364 0.5139 0.0497 1 1 0.4364 0.5091 0.0545
chr19 52906242 CACT C 0.001583 0.100 1 -3 1 643 167 476 90 2 0 0 75 0 0 474 0 2 0.5389 0.0000 0.0042 167.000 0.51 3.39 -2.88 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6571 0.3428 0.0001 1 0 0.6584 0.3416 0.0001 1 0 0.6591 0.3408 0.0001
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 999 225 774 9 0 2 1 213 0 0 769 0 5 0.0400 0.0000 0.0065 111.000 1.11 3.30 -2.18 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 2 0.0000 0.2778 0.7222 2 2 0.0000 0.0115 0.9885
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 692 201 491 90 0 13 0 98 0 0 491 0 0 0.4478 0.0000 0.0000 14.462 0.98 1.48 -0.50 48 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0354 0.6054 0.3592 1 1 0.0385 0.5946 0.3669 1 1 0.0428 0.5812 0.3760
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 762 143 619 67 0 5 2 69 0 0 618 0 1 0.4685 0.0000 0.0016 27.400 0.72 3.23 -2.52 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1109 0.6479 0.2412 1 1 0.1170 0.6376 0.2454 1 1 0.1253 0.6245 0.2503
chr19 55014192 C CGGGA 0.000722 0.100 1 4 2 364 67 297 37 0 0 0 30 0 0 297 0 0 0.5522 0.0000 0.0000 67.000 1.41 5.17 -3.76 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5901 0.4098 0.0001 1 0 0.5896 0.4103 0.0001 1 0 0.5886 0.4113 0.0001
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 488 128 360 94 0 25 0 9 0 0 356 0 4 0.7344 0.0000 0.0111 4.120 0.24 8.11 -7.87 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0225 0.9775 0.0000
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 648 147 501 0 0 19 0 128 0 0 469 0 32 0.0000 0.0000 0.0639 6.737 20.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 55386752 A AT 0.003360 0.100 1 1 1 640 207 433 195 2 2 0 8 0 0 433 0 0 0.9420 0.0000 0.0000 102.500 0.23 1.12 -0.90 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1387 0.8613 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 55482006 G GCCGCCC 0.003351 0.100 1 6 4 576 123 453 87 2 28 1 5 0 0 453 0 0 0.7073 0.0000 0.0000 3.393 0.98 5.20 -4.22 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0681 0.9319 0.0000 0 0 0.9793 0.0207 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr19 55518174 C CATCCCACCATGACTGCTG 0.004924 0.100 1 18 1 793 194 599 19 5 9 23 138 1 3 548 5 42 0.0979 0.0017 0.0851 22.375 5.26 8.64 -3.38 15 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 718 218 500 15 1 32 12 158 0 0 488 1 11 0.0688 0.0000 0.0240 5.781 1.00 5.10 -4.10 13 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9045 0.0955
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 555 113 442 0 0 1 1 111 0 0 438 0 4 0.0000 0.0000 0.0090 112.000 3.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 124 62 62 53 0 4 0 5 0 0 62 0 0 0.8548 0.0000 0.0000 14.500 0.17 3.40 -3.23 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1301 0.8699 0.0000 0 0 0.5347 0.4653 0.0000
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 313 84 229 52 0 4 0 28 0 0 228 0 1 0.6190 0.0000 0.0044 20.000 0.19 3.75 -3.56 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8464 0.1520 0.0016 1 0 0.8385 0.1596 0.0019 1 0 0.8274 0.1703 0.0023
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 314 133 181 0 0 4 0 129 0 0 180 0 1 0.0000 0.0000 0.0055 32.250 2.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr20 187984 G GT 0.028509 0.100 1 1 1 230 81 149 44 2 3 0 32 0 0 149 0 0 0.5432 0.0000 0.0000 25.667 0.34 1.44 -1.10 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7216 0.2770 0.0014 1 0 0.7167 0.2818 0.0015 1 0 0.7097 0.2885 0.0017
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 117 60 57 22 0 1 0 37 0 0 57 0 0 0.3667 0.0000 0.0000 59.000 0.23 6.32 -6.10 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0216 0.3251 0.6533 1 2 0.0239 0.3321 0.6440 1 2 0.0273 0.3415 0.6312
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 580 181 399 172 0 2 0 7 0 0 398 0 1 0.9503 0.0000 0.0025 89.500 0.21 9.00 -8.79 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6374 0.3626 0.0000 0 0 0.9759 0.0241 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 581 184 397 172 0 5 1 6 0 0 396 0 1 0.9348 0.0000 0.0025 35.800 0.22 9.33 -9.11 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.6522 0.3478 0.0000 0 0 0.9766 0.0234 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 580 190 390 181 0 1 0 8 0 0 389 0 1 0.9526 0.0000 0.0026 189.000 0.14 8.88 -8.74 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5088 0.4912 0.0000 0 0 0.9729 0.0271 0.0000
chr20 3668985 ATCTGGACT A 0.038221 0.100 1 -8 1 219 60 159 40 0 0 0 20 0 0 158 0 1 0.6667 0.0000 0.0063 60.000 1.48 9.05 -7.58 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8236 0.1757 0.0008 1 0 0.8161 0.1830 0.0009 1 0 0.8057 0.1933 0.0010
chr20 18465360 T TTC 0.004672 0.100 1 2 4 161 49 112 18 6 15 0 10 0 0 111 0 1 0.3673 0.0000 0.0089 2.267 7.17 7.20 -0.03 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7523 0.2474 0.0003 1 0 0.7451 0.2546 0.0003 1 0 0.7331 0.2665 0.0003
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 271 122 149 112 0 3 0 7 0 0 149 0 0 0.9180 0.0000 0.0000 39.667 0.30 1.14 -0.84 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0893 0.9107 0.0000 0 0 0.6151 0.3849 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 699 181 518 12 0 5 0 164 0 0 510 0 8 0.0663 0.0000 0.0154 35.200 0.33 6.56 -6.23 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9877 0.0123 2 2 0.0000 0.3912 0.6088
chr20 33663701 TGCGGCGGCAAGAGGC T 0.003375 0.100 1 -15 1 623 200 423 182 2 8 0 8 0 0 423 0 0 0.9100 0.0000 0.0000 24.000 0.27 15.38 -15.10 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0621 0.9379 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 484 157 327 0 2 2 0 153 0 0 314 0 13 0.0000 0.0000 0.0398 76.500 3.02 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr20 34997397 CGAGGGCTGCCGCAAGCGG C 0.000009 0.100 1 -18 1 709 195 514 178 0 4 0 13 0 0 514 0 0 0.9128 0.0000 0.0000 47.750 0.30 14.08 -13.77 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 35627312 C CA 0.103940 0.100 1 1 1 135 64 71 35 0 2 1 26 0 0 70 0 1 0.5469 0.0000 0.0141 31.000 0.17 1.23 -1.06 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5592 0.4246 0.0162 1 0 0.5579 0.4251 0.0170 1 0 0.5558 0.4260 0.0182
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 977 296 681 0 0 38 15 243 0 0 677 0 4 0.0000 0.0000 0.0059 6.789 3.44 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr20 46013368 A ACAGCTGGCCCCACAGGTCCCCCCT 0.000080 0.100 1 24 4 500 119 381 49 1 43 0 26 0 0 370 0 11 0.4118 0.0000 0.0289 1.744 0.18 9.88 -9.70 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6966 0.3034 0.0000 1 0 0.6931 0.3069 0.0000 1 0 0.6881 0.3119 0.0000
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 549 268 281 193 5 41 5 24 0 0 280 1 0 0.7201 0.0000 0.0036 5.650 1.06 3.00 -1.94 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.100 1 3 1 411 114 297 101 0 9 0 4 0 0 297 0 0 0.8860 0.0000 0.0000 11.667 0.51 3.00 -2.49 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0763 0.9237 0.0000 0 0 0.8842 0.1158 0.0000 0 0 0.9729 0.0271 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 228 31 197 0 0 2 1 28 0 0 194 1 2 0.0000 0.0000 0.0152 14.000 6.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr20 62367030 GCCGCGCGCC G 0.002179 0.100 1 -9 1 182 68 114 48 0 0 1 19 0 0 112 0 2 0.7059 0.0000 0.0175 68.000 0.62 9.37 -8.74 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9031 0.0969 0.0000 1 0 0.8964 0.1036 0.0000 1 0 0.8869 0.1131 0.0000
chr20 62861177 GCCGCGC G 0.000431 0.100 1 -6 1 478 128 350 63 0 16 1 48 0 0 346 0 4 0.4922 0.0000 0.0114 7.000 1.54 6.50 -4.96 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6073 0.3927 0.0000 1 0 0.6083 0.3917 0.0000 1 0 0.6090 0.3910 0.0000
chr20 63006440 C CGCG 0.000529 0.100 1 3 1 660 187 473 173 1 9 0 4 1 1 471 0 0 0.9251 0.0021 0.0042 19.667 0.51 3.50 -2.99 47 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 300 146 154 0 0 0 0 146 0 0 152 0 2 0.0000 0.0000 0.0130 146.000 1.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 693 174 519 96 1 4 0 73 0 0 512 0 7 0.5517 0.0000 0.0135 42.500 0.35 5.67 -5.32 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5162 0.4654 0.0185 1 0 0.5150 0.4640 0.0210 1 0 0.5122 0.4630 0.0248
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 209 104 105 4 0 4 0 96 0 0 103 0 2 0.0385 0.0000 0.0190 25.000 0.00 3.49 -3.49 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9732 0.0268 2 2 0.0000 0.2816 0.7184 2 2 0.0000 0.0766 0.9234
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 331 53 278 0 0 2 1 50 0 0 276 1 1 0.0000 0.0000 0.0072 25.500 2.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1147 181 966 88 6 7 2 78 0 1 958 1 6 0.4862 0.0000 0.0083 28.833 1.09 3.44 -2.34 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2181 0.6961 0.0858 1 1 0.2226 0.6845 0.0930 1 1 0.2277 0.6694 0.1029
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1144 181 963 88 5 9 3 76 0 1 954 1 7 0.4862 0.0000 0.0093 24.571 0.95 3.51 -2.56 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2188 0.6957 0.0855 1 1 0.2233 0.6841 0.0927 1 1 0.2283 0.6691 0.1026
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 539 96 443 46 3 7 1 39 0 0 438 0 5 0.4792 0.0000 0.0113 22.000 5.04 14.10 -9.06 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2893 0.5912 0.1194 1 1 0.2904 0.5848 0.1248 1 1 0.2913 0.5766 0.1321
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 377 154 223 0 0 15 1 138 0 0 223 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.200 8.67 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 538 209 329 93 5 22 0 89 2 0 325 0 2 0.4450 0.0061 0.0122 8.500 0.19 3.21 -3.02 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3822 0.5876 0.0302 1 1 0.3896 0.5775 0.0329 1 1 0.3982 0.5650 0.0369
chr22 20858678 G GCCGCCT 0.004141 0.100 1 6 2 418 145 273 60 0 31 1 53 0 0 273 0 0 0.4138 0.0000 0.0000 3.677 0.48 5.40 -4.91 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5076 0.4917 0.0006 1 0 0.5124 0.4869 0.0007 1 0 0.5181 0.4812 0.0007
chr22 21867418 C CCCG 0.004356 0.100 1 3 1 184 82 102 41 1 6 0 34 0 0 102 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 12.667 1.20 3.18 -1.98 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6013 0.3981 0.0005 1 0 0.6008 0.3987 0.0006 1 0 0.5996 0.3998 0.0006
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 167 68 99 2 0 2 2 62 0 0 98 0 1 0.0294 0.0000 0.0101 33.000 0.00 3.11 -3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9074 0.0926 2 1 0.0000 0.5087 0.4913 2 2 0.0000 0.3277 0.6723
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 613 106 507 2 0 28 0 76 0 0 484 0 23 0.0189 0.0000 0.0454 2.786 0.00 15.74 -15.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0708 0.9292 2 2 0.0000 0.0083 0.9917 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.100 1 3 1 1172 314 858 118 11 71 7 107 1 0 854 0 3 0.3758 0.0012 0.0047 3.394 0.69 3.02 -2.32 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4682 0.5246 0.0071 1 1 0.4783 0.5137 0.0080 1 1 0.4901 0.5006 0.0094
chr22 30694065 A ACAGACAGGT 0.001704 0.100 1 9 1 187 44 143 17 0 2 0 25 0 0 141 0 2 0.3864 0.0000 0.0140 21.000 9.24 16.88 -7.64 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2293 0.7679 0.0028 1 1 0.2391 0.7582 0.0027 1 1 0.2523 0.7451 0.0026
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 445 233 212 180 1 46 0 6 0 0 212 0 0 0.7725 0.0000 0.0000 4.043 0.57 6.83 -6.27 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0487 0.9513 0.0000 0 0 0.9779 0.0221 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 347 188 159 157 0 20 0 11 0 0 157 0 2 0.8351 0.0000 0.0126 8.400 0.32 7.36 -7.04 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 1 0.4831 0.5169 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 330 137 193 0 0 8 1 128 0 0 189 0 4 0.0000 0.0000 0.0207 16.125 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 525 178 347 72 3 26 3 74 0 0 342 0 5 0.4045 0.0000 0.0144 5.808 0.14 2.95 -2.81 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1224 0.7122 0.1654 1 1 0.1312 0.7009 0.1678 1 1 0.1433 0.6862 0.1705
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1250 295 955 15 0 2 0 278 0 0 941 0 14 0.0508 0.0000 0.0147 146.500 0.60 9.46 -8.86 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9014 0.0986 2 2 0.0000 0.0243 0.9757
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 791 341 450 294 0 6 0 41 0 0 450 0 0 0.8622 0.0000 0.0000 55.833 3.37 3.07 0.30 80 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000
chr22 42144367 TAGCGTGCAGCCC T 0.000092 0.100 1 -12 3 783 298 485 161 0 21 0 116 0 0 475 0 10 0.5403 0.0000 0.0206 13.190 0.25 11.06 -10.81 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8871 0.1129 0.0000 1 0 0.8843 0.1157 0.0000 1 0 0.8799 0.1201 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 685 120 565 13 2 11 1 93 0 0 560 0 5 0.1083 0.0000 0.0088 9.818 0.92 7.23 -6.30 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr22 46537150 GGGC G 0.001229 0.100 1 -3 1 309 93 216 72 1 15 0 5 0 0 215 0 1 0.7742 0.0000 0.0046 5.200 0.93 4.60 -3.67 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0516 0.9484 0.0000 0 0 0.9813 0.0187 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr22 50248392 CAG C 0.000684 0.100 1 -2 1 905 226 679 213 0 3 0 10 0 0 679 0 0 0.9425 0.0000 0.0000 74.333 0.38 2.00 -1.62 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0166 0.9834 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 368 124 244 96 1 20 0 7 0 0 241 0 3 0.7742 0.0000 0.0123 5.200 0.27 16.00 -15.73 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0247 0.9753 0.0000 0 0 0.6025 0.3975 0.0000
832 rows