HG02760_x_HG02818_FF_5.features.tsv

File Info

Filename: HG02760_x_HG02818_FF_5.features.tsv
Full Path: s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG02760_x_HG02818_FF_5.features.tsv
Size: 168.6 KB
Workflow Run: adaptive-alpha-features-6a271fed
Published: Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

chrom	pos	ref	alt	p_pop	ff	is_indel	indel_len	hp_len	n_total	n_span	n_flank	span_strong_ref	span_weak_ref	span_mid	span_weak_alt	span_strong_alt	flank_strong_ref	flank_weak_ref	flank_mid	flank_weak_alt	flank_strong_alt	frac_span_strong_ref	frac_flank_strong_ref	frac_flank_informative	bimodality_ratio	nm_strong_ref	nm_strong_alt	nm_elevation	sr_strand_imbalance	baseline_mat_gt	baseline_fet_gt	truth_mat_gt	truth_fet_gt	status	a0.012_gm	a0.012_gf	a0.012_gf_post0	a0.012_gf_post1	a0.012_gf_post2	a0.05_gm	a0.05_gf	a0.05_gf_post0	a0.05_gf_post1	a0.05_gf_post2	a0.1_gm	a0.1_gf	a0.1_gf_post0	a0.1_gf_post1	a0.1_gf_post2
chr1	1708833	TCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTC	T	0.500000	0.050	1	-24	2	545	244	301	218	0	24	0	2	0	0	301	0	0	0.8934	0.0000	0.0000	9.167	0.39	26.00	-25.61	22	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9021	0.0979	0.0000	0	0	0.9827	0.0173	0.0000	0	0	0.9888	0.0112	0.0000
chr1	1752908	C	CCCT	0.500000	0.050	1	3	1	481	181	300	96	1	31	0	53	0	0	297	1	2	0.5304	0.0000	0.0100	4.839	0.34	3.13	-2.79	30	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7537	0.2338	0.0125	1	0	0.7405	0.2451	0.0144	1	0	0.7221	0.2606	0.0173
chr1	6469122	TTCC	T	0.500000	0.050	1	-3	2	827	263	564	15	91	47	3	107	0	0	562	0	2	0.0570	0.0000	0.0035	4.596	0.33	3.26	-2.93	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1220	0.5312	0.3469	1	1	0.1263	0.5287	0.3450	1	1	0.1321	0.5257	0.3422
chr1	11650722	C	CGCG	0.500000	0.050	1	3	1	528	113	415	0	0	18	4	91	0	1	410	0	4	0.0000	0.0000	0.0120	5.222		3.37		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1002	0.8998	2	2	0.0000	0.0991	0.9009	2	2	0.0000	0.1004	0.8996
chr1	16400810	G	GCTT	0.500000	0.050	1	3	2	279	105	174	99	0	4	0	2	0	0	174	0	0	0.9429	0.0000	0.0000	25.250	0.19	3.00	-2.81	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3157	0.6843	0.0000	0	0	0.7513	0.2487	0.0000	0	0	0.8361	0.1639	0.0000
chr1	16539275	CT	C	0.500000	0.050	1	-1	2	355	101	254	74	0	2	0	25	0	0	254	0	0	0.7327	0.0000	0.0000	49.500	0.47	1.00	-0.53	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8277	0.1658	0.0065	1	0	0.8147	0.1775	0.0077	1	0	0.7903	0.2001	0.0096
chr1	21474942	TGTCTCCCAG	T	0.500000	0.050	1	-9	1	166	71	95	48	0	0	0	23	0	0	95	0	0	0.6761	0.0000	0.0000	71.000	0.08	8.26	-8.18	18	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5820	0.3688	0.0491	1	0	0.5704	0.3766	0.0530	1	0	0.5548	0.3868	0.0584
chr1	26282374	ACC	A	0.500000	0.050	1	-2	3	758	200	558	47	51	5	29	68	0	0	558	0	0	0.2350	0.0000	0.0000	35.000	7.23	27.44	-20.21	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1753	0.5486	0.2761	1	1	0.1786	0.5449	0.2765	1	1	0.1829	0.5403	0.2767
chr1	26282386	GCCGGGA	G	0.500000	0.050	1	-6	4	783	202	581	6	0	28	1	167	0	0	576	0	5	0.0297	0.0000	0.0086	6.407	0.67	15.66	-14.99	2	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9956	0.0044	2	2	0.0000	0.4333	0.5667	2	2	0.0000	0.1273	0.8727
chr1	26364795	CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG	C	0.500000	0.050	1	-24	1	703	188	515	177	0	4	0	7	0	0	514	0	1	0.9415	0.0000	0.0019	46.000	0.53	24.14	-23.61	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0002	0.9998	0.0000	0	1	0.2733	0.7267	0.0000	0	0	0.7807	0.2193	0.0000
chr1	27373179	AG	A	0.500000	0.050	1	-1	3	277	111	166	56	0	1	0	54	0	0	166	0	0	0.5045	0.0000	0.0000	110.000	0.27	1.31	-1.05	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2569	0.5323	0.2108	1	1	0.2573	0.5299	0.2128	1	1	0.2578	0.5268	0.2154
chr1	28150032	CA	C	0.500000	0.050	1	-1	2	543	145	398	64	0	3	0	78	0	0	396	0	2	0.4414	0.0000	0.0050	47.333	0.25	1.31	-1.06	38	0/1	1/1	.	.	OK	1	1	0.0899	0.4728	0.4373	1	1	0.0943	0.4744	0.4313	1	1	0.1002	0.4766	0.4232
chr1	31433042	A	ACAG	0.500000	0.050	1	3	1	422	159	263	1	0	6	1	151	0	0	262	0	1	0.0063	0.0000	0.0038	25.500	1.00	3.05	-2.05	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0982	0.9018	2	2	0.0000	0.0429	0.9571	2	2	0.0000	0.0357	0.9643
chr1	35114681	GATA	G	0.500000	0.050	1	-3	1	989	241	748	227	1	8	0	5	0	0	748	0	0	0.9419	0.0000	0.0000	29.125	0.29	3.20	-2.91	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0813	0.9187	0.0000	0	0	0.9075	0.0925	0.0000	0	0	0.9736	0.0264	0.0000
chr1	47438996	T	TCCGCAC	0.500000	0.050	1	6	1	606	150	456	1	0	19	1	129	0	0	453	1	2	0.0067	0.0000	0.0066	6.895	0.00	6.07	-6.07	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1530	0.8470	2	2	0.0000	0.0686	0.9314	2	2	0.0000	0.0566	0.9434
chr1	53459700	G	GCCGCCC	0.500000	0.050	1	6	2	546	136	410	61	2	24	1	48	0	0	408	0	2	0.4485	0.0000	0.0049	4.625	0.23	6.81	-6.58	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3856	0.4944	0.1201	1	1	0.3812	0.4947	0.1242	1	1	0.3753	0.4951	0.1297
chr1	55039879	A	ACTG	0.500000	0.050	1	3	2	613	157	456	126	6	18	0	7	0	0	456	0	0	0.8025	0.0000	0.0000	7.722	0.22	3.14	-2.92	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	1	0.1948	0.8052	0.0000	0	0	0.6372	0.3628	0.0000
chr1	55214867	G	GGCC	0.500000	0.050	1	3	4	224	64	160	29	1	12	0	22	0	0	159	0	1	0.4531	0.0000	0.0063	4.333	0.41	3.27	-2.86	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3322	0.5015	0.1663	1	1	0.3293	0.5014	0.1693	1	1	0.3255	0.5012	0.1733
chr1	74572173	CCCT	C	0.500000	0.050	1	-3	4	791	141	650	5	1	9	2	124	0	0	648	0	2	0.0355	0.0000	0.0031	14.444	0.00	3.41	-3.41	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9940	0.0060	2	1	0.0000	0.5821	0.4179	2	2	0.0000	0.2522	0.7478
chr1	76868607	G	GCAGCAA	0.500000	0.050	1	6	1	292	88	204	39	0	10	5	34	0	0	204	0	0	0.4432	0.0000	0.0000	7.300	0.64	5.24	-4.59	5	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2539	0.5226	0.2235	1	1	0.2543	0.5209	0.2249	1	1	0.2546	0.5187	0.2266
chr1	77558660	C	CTAT	0.500000	0.050	1	3	1	176	88	88	83	0	2	0	3	1	0	87	0	0	0.9432	0.0114	0.0114	43.000	0.42	4.33	-3.91	13	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0582	0.9418	0.0000	0	0	0.5170	0.4830	0.0000	0	0	0.7107	0.2893	0.0000
chr1	84574315	C	CGCAGCGCCA	0.500000	0.050	1	9	2	387	158	229	62	1	35	0	60	0	0	215	0	14	0.3924	0.0000	0.0611	3.514	8.55	8.03	0.52	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1250	0.5070	0.3680	1	1	0.1291	0.5064	0.3646	1	1	0.1345	0.5056	0.3598
chr1	84574315	CGCAGCGCCA	C	0.500000	0.050	1	-9	2	387	178	209	89	0	27	0	62	0	0	204	0	5	0.5000	0.0000	0.0239	5.593	5.51	8.58	-3.08	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5184	0.4227	0.0589	1	0	0.5098	0.4273	0.0630	1	0	0.4981	0.4333	0.0687
chr1	86580213	TCCTACA	T	0.500000	0.050	1	-6	1	473	146	327	12	0	4	2	128	0	0	326	0	1	0.0822	0.0000	0.0031	47.000	0.00	5.71	-5.71	0	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9915	0.0085	2	1	0.0000	0.7867	0.2133
chr1	86580219	ACCTACT	A	0.500000	0.050	1	-6	1	470	150	320	4	1	24	0	121	0	0	320	0	0	0.0267	0.0000	0.0000	5.208	0.00	5.96	-5.96	2	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9714	0.0286	2	2	0.0000	0.4348	0.5652	2	2	0.0000	0.2031	0.7969
chr1	89150468	G	GT	0.500000	0.050	1	1	1	318	101	217	95	1	1	0	4	0	0	217	0	0	0.9406	0.0000	0.0000	100.000	0.22	1.00	-0.78	1	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0178	0.9822	0.0000	0	1	0.4282	0.5718	0.0000	0	0	0.6941	0.3059	0.0000
chr1	90716915	G	GGCT	0.500000	0.050	1	3	1	707	162	545	149	3	7	0	3	0	0	545	0	0	0.9198	0.0000	0.0000	22.143	0.98	3.00	-2.02	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2563	0.7437	0.0000	0	0	0.8521	0.1479	0.0000	0	0	0.9265	0.0735	0.0000
chr1	92074789	TC	T	0.500000	0.050	1	-1	1	809	246	563	122	0	3	0	121	0	0	563	0	0	0.4959	0.0000	0.0000	81.000	0.37	1.23	-0.86	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2239	0.5734	0.2028	1	1	0.2263	0.5679	0.2058	1	1	0.2294	0.5610	0.2096
chr1	92482940	G	GCTGTCTGGGGATGCGGAGGCT	0.500000	0.050	1	21	1	400	141	259	107	0	33	0	1	0	0	257	0	2	0.7589	0.0000	0.0077	3.273	0.26	21.00	-20.74	33	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0996	0.9004	0.0000	0	0	0.6544	0.3456	0.0000	0	0	0.8105	0.1895	0.0000
chr1	108922543	ACTT	A	0.500000	0.050	1	-3	2	165	80	85	40	0	4	0	36	0	0	85	0	0	0.5000	0.0000	0.0000	19.000	0.23	3.06	-2.83	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2878	0.5183	0.1938	1	1	0.2869	0.5170	0.1961	1	1	0.2856	0.5152	0.1992
chr1	109250113	A	ACGC	0.500000	0.050	1	3	2	480	134	346	5	1	7	3	118	0	0	338	0	8	0.0373	0.0000	0.0231	18.000	0.20	3.33	-3.13	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9984	0.0016	2	1	0.0000	0.6919	0.3081	2	2	0.0000	0.2960	0.7040
chr1	111414895	TCACAGGGGTCACAGACTGATGACC	T	0.500000	0.050	1	-24	1	908	202	706	146	4	22	5	25	0	0	692	4	10	0.7228	0.0000	0.0198	10.000	1.17	25.08	-23.91	14	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.9872	0.0127	0.0000	1	0	0.9845	0.0154	0.0000	0	1	0.0109	0.9891	0.0000
chr1	111414925	GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA	G	0.500000	0.050	1	-45	4	910	239	671	124	1	19	1	94	0	0	670	1	0	0.5188	0.0000	0.0015	12.111	1.67	8.98	-7.31	30	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5922	0.3734	0.0344	1	0	0.5823	0.3800	0.0377	1	0	0.5686	0.3888	0.0425
chr1	111477748	A	AG	0.500000	0.050	1	1	4	657	176	481	92	0	1	0	83	0	0	480	0	1	0.5227	0.0000	0.0021	175.000	0.20	1.08	-0.89	28	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3202	0.5346	0.1452	1	1	0.3189	0.5320	0.1491	1	1	0.3170	0.5287	0.1543
chr1	116579663	G	GTCC	0.500000	0.050	1	3	1	667	171	496	79	7	19	3	63	0	0	496	0	0	0.4620	0.0000	0.0000	7.947	0.53	3.54	-3.01	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4979	0.4360	0.0661	1	0	0.4899	0.4399	0.0703	1	0	0.4790	0.4449	0.0761
chr1	120436638	AAG	A	0.500000	0.050	1	-2	3	201	73	128	0	0	6	0	67	0	0	127	0	1	0.0000	0.0000	0.0078	11.167		2.30		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1530	0.8470	2	2	0.0000	0.1575	0.8425	2	2	0.0000	0.1638	0.8362
chr1	150226707	CTCCTCT	C	0.500000	0.050	1	-6	2	271	112	159	45	1	12	0	54	0	0	159	0	0	0.4018	0.0000	0.0000	8.250	0.78	5.96	-5.19	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1494	0.5096	0.3410	1	1	0.1529	0.5089	0.3382	1	1	0.1577	0.5079	0.3344
chr1	152107679	C	CCGGTACTGCCGGTCT	0.500000	0.050	1	15	3	1157	219	938	120	0	15	0	84	0	0	901	0	37	0.5479	0.0000	0.0394	13.600	0.33	11.27	-10.94	76	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2031	0.5728	0.2242	1	1	0.2060	0.5674	0.2266	1	1	0.2099	0.5605	0.2296
chr1	152223252	AT	A	0.500000	0.050	1	-1	1	280	92	188	56	7	14	1	14	0	0	188	0	0	0.6087	0.0000	0.0000	5.500	0.25	2.79	-2.54	10	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.6880	0.3054	0.0065	0	1	0.0186	0.9812	0.0002	0	1	0.0219	0.9781	0.0000
chr1	152709204	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	0.500000	0.050	1	18	2	233	64	169	0	0	10	0	54	0	0	147	0	22	0.0000	0.0000	0.1302	5.400		9.17		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1287	0.8713	2	2	0.0000	0.1331	0.8669	2	2	0.0000	0.1392	0.8608
chr1	152776532	C	CCAGCTCTGGGGGCTGCTG	0.500000	0.050	1	18	1	852	294	558	229	1	59	0	5	0	0	557	0	1	0.7789	0.0000	0.0018	3.966	0.12	16.20	-16.08	9	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0178	0.9822	0.0000	0	0	0.8405	0.1595	0.0000	0	0	0.9638	0.0362	0.0000
chr1	153261012	C	CGGCGGT	0.500000	0.050	1	6	2	823	227	596	12	0	29	0	186	0	1	586	1	8	0.0529	0.0000	0.0168	7.615	1.17	6.04	-4.88	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9643	0.0357	2	2	0.0000	0.4666	0.5334
chr1	153261515	A	ACTCTGGCGGCGG	0.500000	0.050	1	12	1	1281	310	971	1	2	75	6	226	0	0	904	0	67	0.0032	0.0000	0.0690	3.192	6.00	10.80	-4.80	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0130	0.9870	2	2	0.0000	0.0025	0.9975	2	2	0.0000	0.0017	0.9983
chr1	153934801	T	TG	0.500000	0.050	1	1	1	610	241	369	121	4	26	5	85	0	0	369	0	0	0.5021	0.0000	0.0000	52.500	0.31	3.78	-3.47	35	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5909	0.3740	0.0351	1	0	0.5809	0.3806	0.0385	1	0	0.5672	0.3895	0.0433
chr1	154869723	GGCT	G	0.500000	0.050	1	-3	1	1091	291	800	109	17	72	91	2	0	1	795	4	0	0.3746	0.0000	0.0063	3.070	4.34	4.00	0.34	1	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.6005	0.3668	0.0326	1	0	0.5904	0.3737	0.0359	1	0	0.5765	0.3829	0.0406
chr1	156384556	T	TC	0.500000	0.050	1	1	1	215	84	131	36	2	1	1	44	0	0	130	0	1	0.4286	0.0000	0.0076	81.000	1.56	2.25	-0.69	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1522	0.5053	0.3424	1	1	0.1557	0.5049	0.3394	1	1	0.1603	0.5044	0.3353
chr1	156595257	A	AAC	0.500000	0.050	1	2	4	499	106	393	0	0	0	2	104	0	0	392	0	1	0.0000	0.0000	0.0025	106.000		2.31		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0634	0.9366	2	2	0.0000	0.0667	0.9333	2	2	0.0000	0.0715	0.9285
chr1	159432794	G	GT	0.500000	0.050	1	1	1	1124	228	896	100	0	5	0	123	0	0	896	0	0	0.4386	0.0000	0.0000	44.600	0.30	1.52	-1.22	34	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0529	0.4331	0.5140	1	2	0.0569	0.4367	0.5064	1	2	0.0625	0.4415	0.4960
chr1	171196663	TG	T	0.500000	0.050	1	-1	1	191	66	125	63	1	1	0	1	0	0	125	0	0	0.9545	0.0000	0.0000	65.000	0.08	1.00	-0.92	35	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4954	0.5046	0.0000	0	0	0.7132	0.2868	0.0000	0	0	0.7618	0.2382	0.0000
chr1	171209118	C	CT	0.500000	0.050	1	1	2	323	83	240	35	0	8	0	40	0	0	240	0	0	0.4217	0.0000	0.0000	9.375	0.46	1.77	-1.32	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1837	0.5153	0.3010	1	1	0.1863	0.5142	0.2996	1	1	0.1897	0.5127	0.2976
chr1	201039955	AGTAGCTCT	A	0.500000	0.050	1	-8	1	877	233	644	139	0	6	0	88	0	0	640	0	4	0.5966	0.0000	0.0062	37.833	0.45	7.68	-7.23	39	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7879	0.2046	0.0076	1	0	0.7755	0.2156	0.0089	1	0	0.7582	0.2308	0.0110
chr1	201386872	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	1	624	157	467	94	1	3	2	57	0	0	459	5	3	0.5987	0.0000	0.0171	51.000	0.84	4.53	-3.69	0	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5942	0.3675	0.0383	1	0	0.5834	0.3748	0.0418	1	0	0.5687	0.3844	0.0469
chr1	201386876	ACC	A	0.500000	0.050	1	-2	3	625	157	468	97	0	0	1	59	0	0	460	0	8	0.6178	0.0000	0.0171	157.000	0.79	4.41	-3.61	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6098	0.3556	0.0346	1	0	0.5987	0.3633	0.0380	1	0	0.5836	0.3736	0.0428
chr1	209432291	T	TAGC	0.500000	0.050	1	3	1	518	241	277	118	13	44	2	64	0	0	275	0	2	0.4896	0.0000	0.0072	4.477	0.18	3.08	-2.90	76	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8974	0.1009	0.0017	1	0	0.8873	0.1105	0.0022	1	0	0.8727	0.1244	0.0030
chr1	225204248	AGTT	A	0.500000	0.050	1	-3	3	86	49	37	45	0	2	0	2	0	0	37	0	0	0.9184	0.0000	0.0000	23.500	0.24	3.00	-2.76	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1060	0.8940	0.0000	0	1	0.4438	0.5562	0.0000	0	0	0.5831	0.4169	0.0000
chr1	226737174	ACTGCCGCTG	A	0.500000	0.050	1	-9	1	713	147	566	76	0	12	1	58	0	0	563	0	3	0.5170	0.0000	0.0053	11.250	0.45	8.86	-8.41	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4107	0.4865	0.1028	1	1	0.4056	0.4872	0.1071	1	1	0.3988	0.4883	0.1130
chr1	234609199	A	AGCT	0.500000	0.050	1	3	2	484	95	389	77	3	13	0	2	2	0	387	0	0	0.8105	0.0051	0.0051	6.308	2.51	4.50	-1.99	13	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2314	0.7686	0.0000	0	0	0.6652	0.3348	0.0000	0	0	0.7725	0.2275	0.0000
chr1	235213963	TTCC	T	0.500000	0.050	1	-3	1	154	43	111	26	0	6	0	11	0	0	111	0	0	0.6047	0.0000	0.0000	6.167	0.12	2.82	-2.70	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.4497	0.4482	0.1020	1	1	0.4420	0.4518	0.1062	1	1	0.4313	0.4570	0.1117
chr1	236736599	TC	T	0.500000	0.050	1	-1	1	254	114	140	60	0	4	0	50	0	0	140	0	0	0.5263	0.0000	0.0000	27.500	0.12	1.28	-1.16	30	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3624	0.5038	0.1338	1	1	0.3589	0.5034	0.1377	1	1	0.3541	0.5030	0.1429
chr1	240092268	GGGC	G	0.500000	0.050	1	-3	5	667	170	497	1	0	15	2	152	0	0	492	1	4	0.0059	0.0000	0.0101	10.333	1.00	3.46	-2.46	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0853	0.9147	2	2	0.0000	0.0372	0.9628	2	2	0.0000	0.0311	0.9689
chr1	240207646	C	CGCCCCCTCTACCCGGAGCGGCAAT	0.500000	0.050	1	24	2	421	94	327	33	10	37	5	9	0	0	325	2	0	0.3511	0.0000	0.0061	1.500	5.48	22.78	-17.29	7	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.6041	0.3513	0.0445	1	0	0.5916	0.3602	0.0482	1	0	0.5647	0.3828	0.0525
chr1	247451959	GA	G	0.500000	0.050	1	-1	2	562	162	400	64	0	3	0	95	0	0	398	0	2	0.3951	0.0000	0.0050	53.000	1.45	1.48	-0.03	12	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0253	0.3145	0.6602	1	2	0.0281	0.3239	0.6480	1	2	0.0323	0.3364	0.6313
chr1	248362336	CA	C	0.500000	0.050	1	-1	1	1256	277	979	15	0	3	0	259	0	0	976	0	3	0.0542	0.0000	0.0031	91.333	1.60	1.21	0.39	9	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9720	0.0280	2	2	0.0000	0.3298	0.6702
chr1	248441153	CAT	C	0.500000	0.050	1	-2	1	786	260	526	120	0	3	0	137	0	1	525	0	0	0.4615	0.0000	0.0019	85.667	1.24	4.15	-2.90	94	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0839	0.5076	0.4085	1	1	0.0884	0.5066	0.4050	1	1	0.0946	0.5054	0.4000
chr1	248441258	T	TTC	0.500000	0.050	1	2	1	956	146	810	102	0	3	0	41	0	0	806	0	4	0.6986	0.0000	0.0049	47.667	1.72	4.51	-2.80	54	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8722	0.1247	0.0031	1	0	0.8609	0.1353	0.0038	1	0	0.8445	0.1505	0.0050
chr1	248638643	TCAGCACG	T	0.500000	0.050	1	-7	1	472	123	349	42	1	4	0	76	0	0	347	0	2	0.3415	0.0000	0.0057	29.750	1.17	6.88	-5.71	26	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0218	0.2849	0.6933	1	2	0.0244	0.2954	0.6802	1	2	0.0283	0.3096	0.6621
chr1	248650349	CAGA	C	0.500000	0.050	1	-3	1	613	119	494	114	0	2	0	3	0	0	494	0	0	0.9580	0.0000	0.0000	58.500	0.30	3.33	-3.04	2	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1163	0.8837	0.0000	0	0	0.6917	0.3083	0.0000	0	0	0.8345	0.1655	0.0000
chr2	3701561	GGAA	G	0.417063	0.050	1	-3	1	237	103	134	0	0	4	0	99	0	0	132	0	2	0.0000	0.0000	0.0149	24.750		3.75		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0992	0.9008	2	2	0.0000	0.1038	0.8962	2	2	0.0000	0.1105	0.8895
chr2	20667362	G	GGGCGGC	0.021395	0.050	1	6	5	419	148	271	0	0	21	0	127	0	0	257	1	13	0.0000	0.0000	0.0517	6.048		7.21		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	0.5696	0.4304	2	1	0.0000	0.5869	0.4131	2	1	0.0000	0.6103	0.3897
chr2	20667362	G	GGGCGGCGGC	0.698820	0.050	1	9	5	419	148	271	2	1	20	5	120	0	0	257	3	11	0.0135	0.0000	0.0517	6.350	7.50	7.09	0.41	2	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2320	0.7680	2	2	0.0000	0.0537	0.9463	2	2	0.0000	0.0338	0.9662
chr2	21043902	GGCAGCGCCA	G	0.306974	0.050	1	-9	1	539	170	369	90	0	21	0	59	0	0	368	0	1	0.5294	0.0000	0.0027	7.095	0.43	7.75	-7.31	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7062	0.2777	0.0161	1	0	0.6963	0.2859	0.0178	1	0	0.6827	0.2970	0.0203
chr2	25161587	C	CGCCGCTGCT	0.060759	0.050	1	9	1	490	117	373	53	0	20	1	43	0	0	371	0	2	0.4530	0.0000	0.0054	4.800	0.21	8.95	-8.75	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5339	0.4492	0.0169	1	0	0.5325	0.4501	0.0174	1	0	0.5306	0.4514	0.0179
chr2	26254257	G	GACT	0.500000	0.050	1	3	1	235	64	171	5	0	1	1	57	0	0	166	0	5	0.0781	0.0000	0.0292	63.000	1.20	3.21	-2.01	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9986	0.0014	2	1	0.0000	0.8564	0.1436	2	1	0.0000	0.5862	0.4138
chr2	29065060	C	CGCT	0.500000	0.050	1	3	1	454	106	348	51	1	15	0	39	0	0	344	1	3	0.4811	0.0000	0.0115	6.067	0.18	2.62	-2.44	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3519	0.5046	0.1435	1	1	0.3486	0.5042	0.1472	1	1	0.3442	0.5037	0.1521
chr2	39769817	ATTC	A	0.500000	0.050	1	-3	3	487	115	372	54	0	7	0	54	0	0	368	0	4	0.4696	0.0000	0.0108	15.429	0.26	3.07	-2.81	18	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1894	0.5293	0.2813	1	1	0.1920	0.5271	0.2809	1	1	0.1955	0.5243	0.2802
chr2	43765562	AAGC	A	0.500000	0.050	1	-3	1	228	101	127	52	0	5	0	44	0	0	127	0	0	0.5149	0.0000	0.0000	19.200	0.17	3.00	-2.83	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3370	0.5103	0.1528	1	1	0.3343	0.5095	0.1563	1	1	0.3307	0.5084	0.1609
chr2	46480673	G	GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA	0.500000	0.050	1	39	1	529	182	347	62	1	57	1	61	0	0	347	0	0	0.3407	0.0000	0.0000	2.175	0.37	1.69	-1.32	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2402	0.5378	0.2220	1	1	0.2414	0.5350	0.2237	1	1	0.2427	0.5314	0.2259
chr2	48755616	G	GGCTGCA	0.500000	0.050	1	6	1	213	82	131	39	0	5	2	36	0	0	130	0	1	0.4756	0.0000	0.0076	15.000	0.28	5.75	-5.47	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2462	0.5233	0.2305	1	1	0.2468	0.5216	0.2316	1	1	0.2475	0.5194	0.2331
chr2	69514621	CTGT	C	0.500000	0.050	1	-3	1	453	181	272	80	0	21	2	78	0	0	272	0	0	0.4420	0.0000	0.0000	7.571	0.39	3.26	-2.87	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2287	0.5485	0.2227	1	1	0.2305	0.5449	0.2246	1	1	0.2326	0.5403	0.2270
chr2	71149970	AAAG	A	0.500000	0.050	1	-3	5	277	92	185	84	2	4	0	2	0	0	185	0	0	0.9130	0.0000	0.0000	21.750	0.69	4.00	-3.31	26	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2490	0.7510	0.0000	0	0	0.6861	0.3139	0.0000	0	0	0.7883	0.2117	0.0000
chr2	73385903	TGGAGGA	T	0.500000	0.050	1	-6	1	613	160	453	0	1	28	1	130	0	0	441	1	11	0.0000	0.0000	0.0265	4.679		6.54		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0285	0.9715	2	2	0.0000	0.0304	0.9696	2	2	0.0000	0.0332	0.9668
chr2	73448097	TCTC	T	0.500000	0.050	1	-3	2	492	112	380	1	0	6	0	105	0	0	374	0	6	0.0089	0.0000	0.0158	17.667	0.00	2.92	-2.92	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2385	0.7615	2	2	0.0000	0.1121	0.8879	2	2	0.0000	0.0920	0.9080
chr2	74415138	A	ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC	0.500000	0.050	1	24	2	958	221	737	102	0	42	0	77	0	0	705	0	32	0.4615	0.0000	0.0434	4.262	0.30	14.29	-13.98	30	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1502	0.5496	0.3002	1	1	0.1542	0.5459	0.3000	1	1	0.1594	0.5412	0.2994
chr2	85133705	GGGC	G	0.500000	0.050	1	-3	5	371	133	238	111	1	8	0	13	1	0	236	1	0	0.8346	0.0042	0.0084	15.625	0.68	3.08	-2.39	37	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0025	0.9975	0.0000	0	1	0.0987	0.9013	0.0000
chr2	88627211	CCAG	C	0.500000	0.050	1	-3	4	548	156	392	3	0	11	5	137	0	0	391	0	1	0.0192	0.0000	0.0026	13.091	0.33	3.27	-2.94	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.7855	0.2145	2	2	0.0000	0.1793	0.8207	2	2	0.0000	0.0903	0.9097
chr2	101007870	A	AAAG	0.500000	0.050	1	3	4	551	167	384	8	0	2	1	156	0	0	381	0	3	0.0479	0.0000	0.0078	82.000	0.25	3.14	-2.89	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.8019	0.1981	2	2	0.0000	0.2973	0.7027
chr2	119437075	A	AGTGTGC	0.500000	0.050	1	6	1	626	164	462	0	0	1	1	162	0	0	452	0	10	0.0000	0.0000	0.0216	162.000		5.81		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0127	0.9873	2	2	0.0000	0.0139	0.9861	2	2	0.0000	0.0156	0.9844
chr2	130372355	AGACGGG	A	0.500000	0.050	1	-6	1	286	105	181	53	0	10	0	42	0	0	178	0	3	0.5048	0.0000	0.0166	9.500	0.66	6.21	-5.55	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3365	0.5109	0.1526	1	1	0.3339	0.5100	0.1561	1	1	0.3303	0.5089	0.1607
chr2	131492343	AC	A	0.500000	0.050	1	-1	1	697	189	508	108	1	6	0	74	1	0	505	0	2	0.5714	0.0020	0.0059	30.500	0.53	1.68	-1.15	46	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6656	0.3113	0.0231	1	0	0.6536	0.3205	0.0258	1	0	0.6372	0.3330	0.0298
chr2	132317662	ATGTAATAAC	A	0.500000	0.050	1	-9	1	998	244	754	130	0	10	0	104	0	0	744	0	10	0.5328	0.0000	0.0133	26.000	0.17	8.37	-8.20	26	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4062	0.5068	0.0870	1	1	0.4026	0.5059	0.0916	1	1	0.3975	0.5048	0.0977
chr2	132645507	T	TAAG	0.500000	0.050	1	3	1	612	166	446	83	1	8	1	73	0	0	445	0	1	0.5000	0.0000	0.0022	19.750	0.24	3.03	-2.79	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3370	0.5246	0.1384	1	1	0.3350	0.5227	0.1424	1	1	0.3321	0.5203	0.1476
chr2	151379531	T	TA	0.500000	0.050	1	1	1	201	56	145	16	27	10	0	3	1	3	140	1	0	0.2857	0.0069	0.0345	2.100	0.81	3.33	-2.52	8	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0069	0.9931	0.0000	0	1	0.1797	0.8203	0.0000	0	1	0.3973	0.6027	0.0000
chr2	151379531	TA	T	0.500000	0.050	1	-1	1	201	59	142	17	4	11	8	19	0	0	139	2	1	0.2881	0.0000	0.0211	3.727	0.71	2.37	-1.66	11	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1578	0.4955	0.3467	1	1	0.1610	0.4958	0.3432	1	1	0.1653	0.4962	0.3385
chr2	159987235	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	1	225	91	134	51	0	0	0	40	0	0	131	2	1	0.5604	0.0000	0.0224	91.000	0.16	2.10	-1.94	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3420	0.5079	0.1501	1	1	0.3391	0.5073	0.1536	1	1	0.3352	0.5065	0.1583
chr2	177629445	G	GGGA	0.500000	0.050	1	3	4	257	124	133	113	0	5	0	6	0	0	133	0	0	0.9113	0.0000	0.0000	23.800	0.10	3.50	-3.40	15	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0010	0.9990	0.0000	0	1	0.2279	0.7721	0.0000	0	0	0.6176	0.3824	0.0000
chr2	178650214	TTTTCCTCTTCAGGAGCAA	T	0.500000	0.050	1	-18	1	386	113	273	59	0	18	0	36	0	0	265	0	8	0.5221	0.0000	0.0293	5.278	0.22	15.22	-15.00	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4334	0.4683	0.0983	1	1	0.4271	0.4703	0.1026	1	1	0.4186	0.4730	0.1084
chr2	184937484	C	CACA	0.500000	0.050	1	3	2	764	149	615	81	0	7	1	60	0	0	608	0	7	0.5436	0.0000	0.0114	20.286	0.16	3.85	-3.69	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3943	0.4969	0.1088	1	1	0.3900	0.4969	0.1131	1	1	0.3841	0.4970	0.1189
chr2	186694302	A	ACAG	0.500000	0.050	1	3	2	336	137	199	0	4	16	6	111	0	0	190	1	8	0.0000	0.0000	0.0452	7.125		4.26		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0716	0.9284	2	2	0.0000	0.0705	0.9295	2	2	0.0000	0.0707	0.9293
chr2	186694302	A	ACAGCAG	0.500000	0.050	1	6	2	336	137	199	8	1	59	1	68	0	0	190	2	7	0.0584	0.0000	0.0452	1.305	2.38	5.03	-2.65	2	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9746	0.0254	2	1	0.0000	0.7750	0.2250
chr2	189805813	T	TA	0.500000	0.050	1	1	3	258	80	178	55	10	12	0	3	0	0	178	0	0	0.6875	0.0000	0.0000	4.833	0.31	1.00	-0.69	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0407	0.9593	0.0000	0	1	0.3987	0.6013	0.0000	0	0	0.6034	0.3966	0.0000
chr2	199819526	T	TA	0.500000	0.050	1	1	3	371	80	291	31	11	14	9	15	0	0	290	0	1	0.3875	0.0000	0.0034	4.385	1.94	1.67	0.27	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4611	0.4461	0.0928	1	0	0.4533	0.4497	0.0970	1	1	0.4428	0.4543	0.1028
chr2	202635418	A	AGGC	0.500000	0.050	1	3	1	456	125	331	52	0	32	3	38	2	0	328	0	1	0.4160	0.0060	0.0091	3.100	2.46	4.26	-1.80	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3852	0.4910	0.1238	1	1	0.3806	0.4916	0.1278	1	1	0.3745	0.4923	0.1332
chr2	210018165	T	TAA	0.500000	0.050	1	2	1	123	51	72	49	0	0	0	2	0	0	72	0	0	0.9608	0.0000	0.0000	51.000	0.16	2.00	-1.84	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1160	0.8840	0.0000	0	1	0.4682	0.5318	0.0000	0	0	0.6062	0.3938	0.0000
chr2	210556728	A	ATCT	0.500000	0.050	1	3	1	286	101	185	51	0	2	0	48	0	0	184	0	1	0.5050	0.0000	0.0054	49.500	0.04	3.19	-3.15	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2586	0.5293	0.2122	1	1	0.2589	0.5271	0.2140	1	1	0.2592	0.5243	0.2165
chr2	216633567	C	CGCCGCTGCT	0.500000	0.050	1	9	2	613	154	459	0	1	25	2	126	0	0	453	0	6	0.0000	0.0000	0.0131	5.120		8.29		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0400	0.9600	2	2	0.0000	0.0416	0.9584	2	2	0.0000	0.0442	0.9558
chr2	216633573	T	TGCTGCCGCC	0.500000	0.050	1	9	1	618	161	457	3	2	23	3	130	0	1	454	2	0	0.0186	0.0000	0.0066	6.900	0.00	8.10	-8.10	3	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9582	0.0418	2	2	0.0000	0.4373	0.5627	2	2	0.0000	0.2011	0.7989
chr2	219182152	G	GGAGGAA	0.500000	0.050	1	6	1	652	148	504	79	0	14	1	54	0	0	497	0	7	0.5338	0.0000	0.0139	9.571	0.29	5.93	-5.63	37	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4522	0.4636	0.0842	1	1	0.4457	0.4658	0.0885	1	1	0.4368	0.4687	0.0945
chr2	229591816	CGCTGCTGCTGCT	C	0.500000	0.050	1	-12	1	523	177	346	157	0	17	0	3	0	0	346	0	0	0.8870	0.0000	0.0000	9.412	0.29	13.00	-12.71	43	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2795	0.7205	0.0000	0	0	0.8663	0.1337	0.0000	0	0	0.9339	0.0661	0.0000
chr2	230996317	TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA	T	0.500000	0.050	1	-27	1	634	226	408	205	3	9	0	9	0	0	404	0	4	0.9071	0.0000	0.0098	24.111	0.89	16.22	-15.33	59	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0279	0.9721	0.0000	0	0	0.5390	0.4610	0.0000
chr2	231037824	A	AGGGCGGCGG	0.500000	0.050	1	9	1	469	97	372	36	3	14	4	40	0	0	370	0	2	0.3711	0.0000	0.0054	6.583	2.92	8.28	-5.36	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1598	0.5093	0.3309	1	1	0.1631	0.5086	0.3283	1	1	0.1675	0.5077	0.3249
chr2	232844199	A	AAGC	0.500000	0.050	1	3	4	594	191	403	79	0	33	0	79	0	1	401	0	1	0.4136	0.0000	0.0050	4.788	0.18	3.23	-3.05	31	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2238	0.5486	0.2276	1	1	0.2257	0.5450	0.2293	1	1	0.2281	0.5404	0.2316
chr2	232847516	CACA	C	0.500000	0.050	1	-3	2	359	126	233	62	0	0	2	62	0	0	233	0	0	0.4921	0.0000	0.0000	124.000	1.81	3.90	-2.10	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2126	0.5373	0.2501	1	1	0.2146	0.5345	0.2509	1	1	0.2172	0.5310	0.2518
chr2	240682382	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	1	1112	308	804	112	0	0	0	196	0	0	803	0	1	0.3636	0.0000	0.0012	308.000	0.79	1.14	-0.35	56	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0002	0.0418	0.9580	1	2	0.0003	0.0475	0.9522	1	2	0.0004	0.0562	0.9434
chr2	240757423	ATCC	A	0.500000	0.050	1	-3	1	424	123	301	2	0	24	4	93	0	0	301	0	0	0.0163	0.0000	0.0000	4.125	1.50	3.22	-1.72	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.6860	0.3140	2	2	0.0000	0.2568	0.7432	2	2	0.0000	0.1703	0.8297
chr2	241223950	TCA	T	0.500000	0.050	1	-2	1	482	135	347	64	0	0	0	71	0	0	345	0	2	0.4741	0.0000	0.0058	135.000	1.00	2.45	-1.45	20	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1404	0.5179	0.3418	1	1	0.1442	0.5165	0.3393	1	1	0.1494	0.5147	0.3359
chr2	241317535	A	AT	0.500000	0.050	1	1	1	268	64	204	21	26	8	4	5	0	2	201	0	1	0.3281	0.0000	0.0147	4.857	1.14	2.00	-0.86	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0085	0.9913	0.0003	0	1	0.0198	0.9802	0.0000	0	1	0.1351	0.8649	0.0000
chr3	9810375	C	CGAT	0.880171	0.050	1	3	1	586	154	432	0	0	3	0	151	0	0	429	0	3	0.0000	0.0000	0.0069	50.333		3.62		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0028	0.9972	2	2	0.0000	0.0030	0.9970	2	2	0.0000	0.0034	0.9966
chr3	12004751	C	CGCCCGCGCCGCA	0.186893	0.050	1	12	2	492	119	373	1	0	9	0	109	0	0	350	0	23	0.0084	0.0000	0.0617	12.222	0.00	11.22	-11.22	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.4455	0.5545	2	2	0.0000	0.2466	0.7534	2	2	0.0000	0.2105	0.7895
chr3	12901258	TGGC	T	0.002987	0.050	1	-3	1	533	151	382	77	2	12	0	60	0	0	381	0	1	0.5099	0.0000	0.0026	11.500	0.64	4.22	-3.58	15	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6693	0.3303	0.0003	1	0	0.6646	0.3350	0.0004	1	0	0.6583	0.3413	0.0004
chr3	27721936	G	GCGGCGC	0.500000	0.050	1	6	2	471	110	361	5	0	1	4	100	0	0	361	0	0	0.0455	0.0000	0.0000	108.000	0.80	4.76	-3.96	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9961	0.0039	2	1	0.0000	0.6848	0.3152	2	2	0.0000	0.3470	0.6530
chr3	33093215	GTCC	G	0.500000	0.050	1	-3	1	704	163	541	88	0	3	0	72	0	0	536	0	5	0.5399	0.0000	0.0092	53.333	0.17	3.43	-3.26	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3627	0.5151	0.1222	1	1	0.3597	0.5139	0.1264	1	1	0.3556	0.5123	0.1321
chr3	37998943	A	ACAC	0.500000	0.050	1	3	1	510	157	353	81	0	4	0	72	0	1	351	0	1	0.5159	0.0000	0.0057	38.250	0.27	3.08	-2.81	39	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3370	0.5236	0.1393	1	1	0.3349	0.5218	0.1432	1	1	0.3320	0.5195	0.1485
chr3	38122579	CATG	C	0.500000	0.050	1	-3	1	549	157	392	91	0	2	0	64	0	0	391	0	1	0.5796	0.0000	0.0026	77.500	0.35	3.23	-2.88	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5729	0.3833	0.0438	1	0	0.5626	0.3899	0.0475	1	0	0.5486	0.3986	0.0528
chr3	40462027	GTAC	G	0.500000	0.050	1	-3	3	616	221	395	29	9	4	173	6	0	0	390	5	0	0.1312	0.0000	0.0127	15.667	1.72	3.17	-1.44	17	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0005	0.0501	0.9494	1	2	0.0007	0.0599	0.9394	2	1	0.0000	0.9904	0.0096
chr3	42210085	C	CGGA	0.500000	0.050	1	3	1	710	228	482	11	2	42	3	170	0	0	470	0	12	0.0482	0.0000	0.0249	4.429	0.18	4.02	-3.84	3	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9835	0.0165	2	1	0.0000	0.5962	0.4038
chr3	42210085	C	CGGAGGA	0.500000	0.050	1	6	1	710	228	482	13	1	129	2	83	0	0	472	2	8	0.0570	0.0000	0.0207	0.767	0.85	5.25	-4.41	3	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9987	0.0013	2	1	0.0000	0.9365	0.0635
chr3	42210085	CGGA	C	0.500000	0.050	1	-3	1	710	242	468	196	5	38	1	2	0	0	468	0	0	0.8099	0.0000	0.0000	5.368	3.54	2.00	1.54	16	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.5723	0.4277	0.0000	0	0	0.9512	0.0488	0.0000	0	0	0.9760	0.0240	0.0000
chr3	44499299	TTC	T	0.500000	0.050	1	-2	5	651	196	455	0	0	6	1	189	0	0	453	0	2	0.0000	0.0000	0.0044	31.667		2.20		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0079	0.9921	2	2	0.0000	0.0087	0.9913	2	2	0.0000	0.0099	0.9901
chr3	46459794	C	CCTT	0.500000	0.050	1	3	1	356	130	226	0	0	4	1	125	0	0	221	0	5	0.0000	0.0000	0.0221	31.250		4.27		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0358	0.9642	2	2	0.0000	0.0381	0.9619	2	2	0.0000	0.0416	0.9584
chr3	46709583	TAAG	T	0.500000	0.050	1	-3	1	638	162	476	63	0	21	5	73	0	0	474	0	2	0.3889	0.0000	0.0042	6.714	0.59	3.41	-2.82	27	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0843	0.4644	0.4513	1	1	0.0886	0.4666	0.4448	1	1	0.0946	0.4694	0.4360
chr3	49554677	G	GGGCCCC	0.500000	0.050	1	6	3	214	74	140	34	0	11	0	29	0	0	140	0	0	0.4595	0.0000	0.0000	5.727	1.26	5.90	-4.63	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3033	0.5117	0.1850	1	1	0.3017	0.5108	0.1875	1	1	0.2995	0.5097	0.1909
chr3	51993837	TCCTTGG	T	0.500000	0.050	1	-6	1	485	128	357	3	0	26	0	99	0	0	350	0	7	0.0234	0.0000	0.0196	3.923	0.00	5.40	-5.40	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9029	0.0971	2	2	0.0000	0.3519	0.6481	2	2	0.0000	0.1937	0.8063
chr3	56557250	T	TGGGGTAAGCA	0.500000	0.050	1	10	2	187	87	100	67	0	14	0	6	0	0	100	0	0	0.7701	0.0000	0.0000	5.214	0.25	7.00	-6.75	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	1	0.0867	0.9133	0.0000	0	1	0.3490	0.6510	0.0000
chr3	56616023	A	ACTT	0.500000	0.050	1	3	1	311	106	205	0	0	3	96	7	0	0	204	1	0	0.0000	0.0000	0.0049	51.500		4.86		0	0/0	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0715	0.9285	2	2	0.0000	0.0751	0.9249	2	2	0.0000	0.0802	0.9198
chr3	56616026	T	TCTC	0.500000	0.050	1	3	2	312	107	205	0	0	0	4	103	0	0	204	0	1	0.0000	0.0000	0.0049	107.000		3.79		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0622	0.9378	2	2	0.0000	0.0655	0.9345	2	2	0.0000	0.0702	0.9298
chr3	63912697	G	GCCC	0.500000	0.050	1	3	1	270	60	210	31	1	0	1	27	0	0	209	0	1	0.5167	0.0000	0.0048	60.000	2.45	3.22	-0.77	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2794	0.5155	0.2050	1	1	0.2787	0.5144	0.2069	1	1	0.2777	0.5129	0.2094
chr3	65439885	T	TCTG	0.500000	0.050	1	3	1	290	110	180	41	3	15	2	49	0	0	179	0	1	0.3727	0.0000	0.0056	6.267	0.02	2.92	-2.89	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1570	0.5121	0.3310	1	1	0.1603	0.5111	0.3285	1	1	0.1648	0.5100	0.3252
chr3	67360748	CT	C	0.500000	0.050	1	-1	2	165	63	102	24	1	5	0	33	0	0	102	0	0	0.3810	0.0000	0.0000	11.600	0.21	2.27	-2.06	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1564	0.4986	0.3449	1	1	0.1597	0.4987	0.3416	1	1	0.1641	0.4988	0.3371
chr3	98087856	G	GA	0.500000	0.050	1	1	1	656	173	483	89	0	16	3	65	0	0	480	0	3	0.5145	0.0000	0.0062	9.812	0.26	1.15	-0.90	13	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4666	0.4574	0.0760	1	1	0.4598	0.4599	0.0803	1	1	0.4505	0.4633	0.0863
chr3	98169478	T	TG	0.500000	0.050	1	1	1	941	183	758	171	0	7	0	5	0	0	758	0	0	0.9344	0.0000	0.0000	25.143	1.02	1.40	-0.38	63	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0223	0.9777	0.0000	0	0	0.7087	0.2913	0.0000	0	0	0.9041	0.0959	0.0000
chr3	112534211	C	CA	0.500000	0.050	1	1	1	139	58	81	29	1	0	2	26	0	0	81	0	0	0.5000	0.0000	0.0000	57.000	0.59	1.69	-1.11	5	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2677	0.5160	0.2163	1	1	0.2674	0.5148	0.2179	1	1	0.2669	0.5133	0.2198
chr3	113657263	TTGC	T	0.500000	0.050	1	-3	1	1150	285	865	116	2	70	88	9	0	0	865	0	0	0.4070	0.0000	0.0000	3.101	0.27	2.78	-2.51	12	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.4772	0.4577	0.0651	1	0	0.4707	0.4600	0.0693	1	1	0.4617	0.4630	0.0752
chr3	113657263	TTGCTGCTGCTGCTGC	T	0.500000	0.050	1	-15	1	1155	300	855	144	2	49	1	104	0	0	855	0	0	0.4800	0.0000	0.0000	5.122	0.42	12.05	-11.63	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7282	0.2593	0.0125	1	0	0.7161	0.2695	0.0144	1	0	0.6994	0.2834	0.0173
chr3	125055810	GGCC	G	0.500000	0.050	1	-3	5	303	92	211	89	1	1	0	1	0	1	210	0	0	0.9674	0.0000	0.0047	91.000	0.79	3.00	-2.21	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.6585	0.3415	0.0000	0	0	0.8286	0.1714	0.0000	0	0	0.8592	0.1408	0.0000
chr3	140566154	AGAGGAG	A	0.500000	0.050	1	-6	2	263	98	165	50	1	7	0	40	0	0	165	0	0	0.5102	0.0000	0.0000	12.857	0.32	6.28	-5.96	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3799	0.4923	0.1278	1	1	0.3755	0.4928	0.1317	1	1	0.3696	0.4934	0.1370
chr3	150703735	A	ACCTCCT	0.500000	0.050	1	6	2	455	76	379	3	0	11	1	61	0	0	367	0	12	0.0395	0.0000	0.0317	5.909	1.33	5.87	-4.54	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9540	0.0460	2	1	0.0000	0.5438	0.4562	2	2	0.0000	0.3403	0.6597
chr3	179242978	CT	C	0.500000	0.050	1	-1	1	341	128	213	67	0	3	2	56	0	0	212	0	1	0.5234	0.0000	0.0047	41.333	0.07	1.36	-1.28	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3335	0.5183	0.1482	1	1	0.3312	0.5169	0.1519	1	1	0.3281	0.5151	0.1567
chr3	183775955	CGGA	C	0.500000	0.050	1	-3	2	431	165	266	6	0	23	10	126	0	0	262	0	4	0.0364	0.0000	0.0150	6.174	0.17	3.02	-2.86	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9981	0.0019	2	1	0.0000	0.6344	0.3656	2	2	0.0000	0.2444	0.7556
chr3	184711345	A	ATCC	0.500000	0.050	1	3	1	611	156	455	67	1	26	1	61	0	0	453	0	2	0.4295	0.0000	0.0044	4.962	0.45	3.33	-2.88	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2753	0.5357	0.1890	1	1	0.2752	0.5331	0.1917	1	1	0.2750	0.5297	0.1953
chr3	190388282	AG	A	0.500000	0.050	1	-1	2	491	146	345	133	0	9	0	4	1	0	344	0	0	0.9110	0.0029	0.0029	15.222	0.11	1.75	-1.64	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0428	0.9572	0.0000	0	0	0.6548	0.3452	0.0000	0	0	0.8491	0.1509	0.0000
chr3	195721040	TTTC	T	0.500000	0.050	1	-3	4	266	160	106	155	0	3	0	2	0	0	106	0	0	0.9688	0.0000	0.0000	52.333	0.94	3.50	-2.56	43	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.6559	0.3441	0.0000	0	0	0.9233	0.0767	0.0000	0	0	0.9513	0.0487	0.0000
chr3	195726146	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	4	1483	516	967	385	4	21	0	106	0	0	967	0	0	0.7461	0.0000	0.0000	23.476	1.86	2.13	-0.27	57	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	0.9999	0.0001	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr3	195778895	TGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAGTGTC	T	0.500000	0.050	1	-48	1	1674	723	951	345	24	254	16	84	2	3	916	0	30	0.4772	0.0021	0.0368	1.839	4.86	3.46	1.39	13	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr3	195779135	TGGTGACAGGAAGAGGCGTGGTGTCACCTGTGGATACTGAGGAAAGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCCTGACCTGTGGATGCAGAGGAAGTGTC	T	0.500000	0.050	1	-96	1	1824	370	1454	122	11	101	8	128	0	3	1408	2	41	0.3297	0.0000	0.0316	2.630	4.76	4.13	0.63	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	2	0.0103	0.2546	0.7351	1	2	0.0120	0.2644	0.7237	1	2	0.0145	0.2778	0.7077
chr3	195781259	CAGGGGTGGCGTGACCGGTGGATGCTGAGGAAGTGCTGGTGACAGGAAG	C	0.500000	0.050	1	-48	2	1515	534	981	243	45	65	24	157	23	36	916	3	3	0.4551	0.0234	0.0663	7.111	3.96	4.81	-0.85	19	0/1	1/1	.	.	OK	1	0	0.9986	0.0014	0.0000	1	0	0.9981	0.0019	0.0000	1	0	0.9974	0.0026	0.0000
chr3	195791241	T	TGTCTCCTGCGTAACA	0.500000	0.050	1	15	1	845	182	663	87	0	13	0	82	0	0	647	0	16	0.4780	0.0000	0.0241	13.000	0.22	11.27	-11.05	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1207	0.5212	0.3581	1	1	0.1249	0.5195	0.3556	1	1	0.1307	0.5174	0.3519
chr3	198153257	CTGGCAGCAG	C	0.500000	0.050	1	-9	2	329	116	213	87	1	14	0	14	0	0	208	1	4	0.7500	0.0000	0.0235	7.214	0.30	11.64	-11.34	35	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1311	0.8687	0.0001	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0071	0.9929	0.0000
chr4	1093539	G	GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	0.774228	0.050	1	21	1	544	111	433	0	0	1	0	110	0	0	352	3	78	0.0000	0.0000	0.1871	110.000		15.11		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0024	0.9976	2	2	0.0000	0.0026	0.9974	2	2	0.0000	0.0030	0.9970
chr4	3074966	G	GCCGCCGCCT	0.001791	0.050	1	9	2	533	195	338	98	65	11	3	18	2	1	335	0	0	0.5026	0.0059	0.0089	18.200	2.03	3.50	-1.47	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0706	0.9294	0.0000	0	0	0.9501	0.0499	0.0000
chr4	3074966	G	GCCT	0.008956	0.050	1	3	2	533	195	338	86	6	19	0	84	1	2	335	0	0	0.4410	0.0030	0.0089	9.158	1.84	4.77	-2.94	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5715	0.4267	0.0018	1	0	0.5706	0.4275	0.0019	1	0	0.5691	0.4289	0.0020
chr4	3767568	AGGGGGCGGGGCC	A	0.069055	0.050	1	-12	1	664	164	500	85	1	9	0	69	0	0	495	0	5	0.5183	0.0000	0.0100	17.222	0.67	10.90	-10.23	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5733	0.4137	0.0130	1	0	0.5710	0.4154	0.0135	1	0	0.5678	0.4179	0.0143
chr4	7042274	T	TG	0.500000	0.050	1	1	1	573	122	451	116	1	3	0	2	0	0	451	0	0	0.9508	0.0000	0.0000	39.667	0.34	1.50	-1.16	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4240	0.5760	0.0000	0	0	0.8251	0.1749	0.0000	0	0	0.8871	0.1129	0.0000
chr4	15003254	A	AGCCGCC	0.500000	0.050	1	6	2	688	186	502	97	3	13	0	73	1	0	498	0	3	0.5215	0.0020	0.0080	13.231	1.04	8.21	-7.16	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5508	0.4016	0.0475	1	0	0.5415	0.4072	0.0514	1	0	0.5287	0.4145	0.0568
chr4	15003300	C	CCCG	0.500000	0.050	1	3	1	687	210	477	105	3	26	3	73	0	0	472	0	5	0.5000	0.0000	0.0105	7.038	1.29	7.03	-5.74	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5801	0.3805	0.0394	1	0	0.5701	0.3870	0.0429	1	0	0.5564	0.3956	0.0480
chr4	15687392	TCTA	T	0.500000	0.050	1	-3	2	1052	244	808	122	2	4	2	114	0	0	805	0	3	0.5000	0.0000	0.0037	59.500	0.16	3.25	-3.09	24	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2696	0.5660	0.1644	1	1	0.2707	0.5611	0.1682	1	1	0.2718	0.5549	0.1733
chr4	38926929	CCTTAGAGCA	C	0.500000	0.050	1	-9	5	494	144	350	77	0	4	0	63	0	0	346	0	4	0.5347	0.0000	0.0114	35.000	0.05	9.40	-9.34	37	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3538	0.5146	0.1316	1	1	0.3510	0.5134	0.1356	1	1	0.3470	0.5120	0.1410
chr4	44447936	G	GCCA	0.500000	0.050	1	3	2	670	152	518	76	3	9	1	63	0	0	518	0	0	0.5000	0.0000	0.0000	17.625	1.54	3.83	-2.29	18	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4226	0.4808	0.0966	1	1	0.4171	0.4819	0.1009	1	1	0.4098	0.4834	0.1068
chr4	56378269	GTTC	G	0.500000	0.050	1	-3	1	307	112	195	12	0	6	0	94	0	0	193	0	2	0.1071	0.0000	0.0103	17.667	0.08	2.97	-2.88	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9965	0.0035	2	1	0.0000	0.8964	0.1036
chr4	71567805	TA	T	0.500000	0.050	1	-1	1	496	116	380	66	0	2	0	48	0	0	380	0	0	0.5690	0.0000	0.0000	57.000	0.65	1.73	-1.08	46	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4733	0.4469	0.0799	1	0	0.4656	0.4502	0.0841	1	0	0.4554	0.4546	0.0901
chr4	76896936	C	CGCT	0.500000	0.050	1	3	1	807	199	608	169	7	21	0	2	0	0	608	0	0	0.8492	0.0000	0.0000	8.429	1.07	3.50	-2.43	15	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7617	0.2383	0.0000	0	0	0.9526	0.0474	0.0000	0	0	0.9699	0.0301	0.0000
chr4	78870928	C	CCAG	0.500000	0.050	1	3	1	638	251	387	17	89	40	11	94	0	0	380	0	7	0.0677	0.0000	0.0181	5.000	0.18	3.07	-2.90	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2010	0.5633	0.2357	1	1	0.2038	0.5586	0.2376	1	1	0.2075	0.5526	0.2399
chr4	78870928	CCAG	C	0.500000	0.050	1	-3	1	638	265	373	107	12	35	7	104	0	0	373	0	0	0.4038	0.0000	0.0000	6.818	2.26	3.20	-0.94	27	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3347	0.5401	0.1252	1	1	0.3334	0.5370	0.1295	1	1	0.3315	0.5331	0.1354
chr4	87313944	CG	C	0.500000	0.050	1	-1	1	186	81	105	52	0	0	0	29	0	0	105	0	0	0.6420	0.0000	0.0000	81.000	0.06	1.03	-0.98	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5521	0.3911	0.0568	1	0	0.5415	0.3977	0.0608	1	0	0.5272	0.4064	0.0664
chr4	87614933	TAGCAGTGACAGCAGCAAC	T	0.500000	0.050	1	-18	1	3008	812	2196	692	14	85	4	17	103	69	2008	9	7	0.8522	0.0469	0.0856	8.744	1.62	7.24	-5.62	176	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	0.7283	0.2717	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr4	87615305	T	TAGTAGTGAC	0.500000	0.050	1	9	1	3808	816	2992	5	12	40	16	743	48	58	2680	159	47	0.0061	0.0160	0.1043	23.273	4.20	8.71	-4.51	3	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr4	87615390	AACAGCAGTG	A	0.500000	0.050	1	-9	1	3987	954	3033	740	25	154	11	24	67	91	2714	72	89	0.7757	0.0221	0.1052	5.150	4.47	10.79	-6.32	116	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr4	87616249	GCGA	G	0.500000	0.050	1	-3	1	2600	785	1815	387	54	120	63	161	31	36	1738	7	3	0.4930	0.0171	0.0424	6.183	6.72	19.34	-12.62	87	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr4	87616280	TAGCAGTGACAGCAGTGAC	T	0.500000	0.050	1	-18	1	2637	834	1803	634	71	86	11	32	16	38	1741	6	2	0.7602	0.0089	0.0344	9.113	7.78	8.72	-0.94	214	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	0.7347	0.2653	0.0000
chr4	100480004	TAAC	T	0.500000	0.050	1	-3	1	175	82	93	41	1	3	0	37	0	0	91	0	2	0.5000	0.0000	0.0215	26.333	0.05	3.16	-3.11	5	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2738	0.5220	0.2042	1	1	0.2734	0.5204	0.2062	1	1	0.2728	0.5183	0.2089
chr4	121157144	CTCTCTGCCTGTCGTCCTT	C	0.500000	0.050	1	-18	1	244	139	105	129	0	7	0	3	0	0	105	0	0	0.9281	0.0000	0.0000	18.857	0.22	6.33	-6.12	17	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1609	0.8391	0.0000	0	0	0.7645	0.2355	0.0000	0	0	0.8784	0.1216	0.0000
chr4	139730430	TCTG	T	0.500000	0.050	1	-3	4	581	259	322	0	0	33	16	210	0	0	316	0	6	0.0000	0.0000	0.0186	6.848		3.15		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0029	0.9971	2	2	0.0000	0.0033	0.9967	2	2	0.0000	0.0038	0.9962
chr4	154237107	A	AGTT	0.500000	0.050	1	3	1	640	156	484	85	0	15	1	55	0	0	483	0	1	0.5449	0.0000	0.0021	9.400	0.06	3.16	-3.10	15	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6036	0.3587	0.0377	1	0	0.5923	0.3665	0.0412	1	0	0.5770	0.3768	0.0461
chr4	154323249	TTTTG	T	0.500000	0.050	1	-4	1	320	127	193	60	0	19	0	48	0	0	193	0	0	0.4724	0.0000	0.0000	5.684	0.65	5.65	-5.00	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3897	0.4913	0.1190	1	1	0.3851	0.4918	0.1231	1	1	0.3789	0.4925	0.1286
chr4	184694537	ACAGATGAAG	A	0.500000	0.050	1	-9	2	334	95	239	88	0	3	0	4	0	0	239	0	0	0.9263	0.0000	0.0000	30.667	0.12	10.00	-9.88	46	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0132	0.9868	0.0000	0	1	0.3773	0.6227	0.0000	0	0	0.6509	0.3491	0.0000
chr5	733800	T	TAA	0.007715	0.050	1	2	1	169	65	104	64	0	0	1	0	0	0	104	0	0	0.9846	0.0000	0.0000	65.000	0.64			2	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9931	0.0069	0.0000	0	0	0.9969	0.0031	0.0000	0	0	0.9976	0.0024	0.0000
chr5	733804	CAT	C	0.005230	0.050	1	-2	3	169	66	103	64	0	1	1	0	0	0	103	0	0	0.9697	0.0000	0.0000	65.000	0.66			2	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9986	0.0014	0.0000	0	0	0.9986	0.0014	0.0000	0	0	0.9987	0.0013	0.0000
chr5	1295342	CCG	C	0.500000	0.050	1	-2	3	688	127	561	5	0	8	2	112	0	0	556	0	5	0.0394	0.0000	0.0089	14.875	0.80	2.74	-1.94	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9943	0.0057	2	1	0.0000	0.5994	0.4006	2	2	0.0000	0.2699	0.7301
chr5	16179479	T	TCGG	0.500000	0.050	1	3	1	297	80	217	31	1	10	3	35	0	0	216	0	1	0.3875	0.0000	0.0046	7.778	1.13	3.89	-2.76	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1684	0.5087	0.3229	1	1	0.1714	0.5080	0.3206	1	1	0.1754	0.5072	0.3174
chr5	56882021	TCAA	T	0.500000	0.050	1	-3	2	906	209	697	84	0	34	3	88	0	0	694	1	2	0.4019	0.0000	0.0043	5.147	0.14	3.44	-3.30	18	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1289	0.5250	0.3461	1	1	0.1330	0.5230	0.3439	1	1	0.1386	0.5206	0.3408
chr5	61332747	CCGGCCGCAACCTCGG	C	0.500000	0.050	1	-15	4	380	42	338	0	0	30	0	12	0	1	329	3	5	0.0000	0.0000	0.0266	0.414		9.42		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.5511	0.4489	2	2	0.0000	0.4868	0.5132	2	2	0.0000	0.4517	0.5483
chr5	74726021	TACTCAA	T	0.500000	0.050	1	-6	1	427	112	315	0	0	5	0	107	0	0	312	0	3	0.0000	0.0000	0.0095	21.400		5.84		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0591	0.9409	2	2	0.0000	0.0622	0.9378	2	2	0.0000	0.0668	0.9332
chr5	75195890	TTCA	T	0.500000	0.050	1	-3	3	580	164	416	0	0	4	0	160	0	0	411	0	5	0.0000	0.0000	0.0120	40.000		2.94		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0155	0.9845	2	2	0.0000	0.0168	0.9832	2	2	0.0000	0.0188	0.9812
chr5	77077779	T	TCGGCGC	0.500000	0.050	1	6	1	416	98	318	87	1	6	0	4	0	1	317	0	0	0.8878	0.0000	0.0031	15.333	0.80	6.25	-5.45	15	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0135	0.9865	0.0000	0	1	0.3830	0.6170	0.0000	0	0	0.6563	0.3437	0.0000
chr5	78015515	ACAG	A	0.500000	0.050	1	-3	2	203	91	112	88	0	1	0	2	0	0	112	0	0	0.9670	0.0000	0.0000	90.000	0.22	3.00	-2.78	8	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2592	0.7408	0.0000	0	0	0.6973	0.3027	0.0000	0	0	0.7968	0.2032	0.0000
chr5	80654880	TGCAGCGGCTGCAGCGGCC	T	0.500000	0.050	1	-18	1	308	92	216	78	4	5	1	4	0	0	214	0	2	0.8478	0.0000	0.0093	17.400	4.17	14.75	-10.58	16	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0674	0.9326	0.0000	0	1	0.3480	0.6520	0.0000
chr5	80654908	G	GCAGCGCCCC	0.500000	0.050	1	9	2	292	77	215	27	3	13	0	34	0	0	214	0	1	0.3506	0.0000	0.0047	4.923	3.96	7.68	-3.71	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1842	0.5121	0.3037	1	1	0.1868	0.5112	0.3021	1	1	0.1901	0.5100	0.2999
chr5	80654922	GCCCCCAGCT	G	0.500000	0.050	1	-9	1	290	74	216	68	0	2	0	4	0	0	215	0	1	0.9189	0.0000	0.0046	36.000	4.79	19.00	-14.21	2	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0017	0.9983	0.0000	0	1	0.1604	0.8396	0.0000	0	1	0.4438	0.5562	0.0000
chr5	114362934	T	TGCC	0.500000	0.050	1	3	1	777	189	588	161	6	20	0	2	0	0	588	0	0	0.8519	0.0000	0.0000	8.400	0.37	6.00	-5.63	9	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7181	0.2819	0.0000	0	0	0.9416	0.0584	0.0000	0	0	0.9629	0.0371	0.0000
chr5	122152940	AT	A	0.500000	0.050	1	-1	2	607	138	469	6	0	3	1	128	0	0	469	0	0	0.0435	0.0000	0.0000	45.000	0.33	1.25	-0.92	6	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9985	0.0015	2	1	0.0000	0.6934	0.3066	2	2	0.0000	0.2962	0.7038
chr5	123090276	A	ACCTCCGCCT	0.500000	0.050	1	9	2	455	111	344	9	0	23	0	79	0	0	331	1	12	0.0811	0.0000	0.0378	3.826	0.44	8.25	-7.81	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9770	0.0230	2	1	0.0000	0.7585	0.2415
chr5	127875593	A	AGCAAGAGGC	0.500000	0.050	1	9	2	254	94	160	92	0	0	0	2	0	0	158	0	2	0.9787	0.0000	0.0125	94.000	0.80	10.00	-9.20	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0146	0.9854	0.0000	0	1	0.4007	0.5993	0.0000	0	0	0.6724	0.3276	0.0000
chr5	129461622	T	TCCCGGC	0.500000	0.050	1	6	3	506	130	376	104	0	25	0	1	0	0	374	0	2	0.8000	0.0000	0.0053	4.200	0.73	0.00	0.73	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0927	0.9073	0.0000	0	0	0.6367	0.3633	0.0000	0	0	0.7987	0.2013	0.0000
chr5	135940512	AGTT	A	0.500000	0.050	1	-3	1	216	95	121	51	0	0	0	44	0	0	120	0	1	0.5368	0.0000	0.0083	95.000	0.67	3.14	-2.47	29	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3102	0.5185	0.1714	1	1	0.3085	0.5171	0.1744	1	1	0.3063	0.5153	0.1784
chr5	139848487	CCCGGGT	C	0.500000	0.050	1	-6	3	357	46	311	25	2	3	0	16	1	1	309	0	0	0.5435	0.0032	0.0064	14.333	1.60	6.69	-5.09	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4187	0.4654	0.1159	1	1	0.4123	0.4678	0.1199	1	1	0.4038	0.4709	0.1253
chr5	141095832	GAACT	G	0.500000	0.050	1	-4	2	816	150	666	86	1	3	0	60	0	0	665	0	1	0.5733	0.0000	0.0015	49.000	0.48	4.63	-4.16	30	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5747	0.3812	0.0440	1	0	0.5643	0.3880	0.0477	1	0	0.5502	0.3968	0.0530
chr5	141151301	GTTC	G	0.500000	0.050	1	-3	1	809	188	621	99	0	7	0	82	0	0	617	0	4	0.5266	0.0000	0.0064	25.857	0.29	2.98	-2.68	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3854	0.5081	0.1066	1	1	0.3818	0.5073	0.1109	1	1	0.3768	0.5063	0.1169
chr5	141393331	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	1	997	261	736	133	0	8	0	120	0	0	736	0	0	0.5096	0.0000	0.0000	31.625	0.21	1.26	-1.05	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3720	0.5273	0.1007	1	1	0.3697	0.5250	0.1053	1	1	0.3664	0.5222	0.1114
chr5	141573996	T	TGGA	0.500000	0.050	1	3	2	657	180	477	77	7	30	1	65	0	0	472	0	5	0.4278	0.0000	0.0105	5.000	0.78	2.86	-2.08	31	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3929	0.4987	0.1084	1	1	0.3887	0.4986	0.1127	1	1	0.3830	0.4985	0.1186
chr5	146878727	AGCT	A	0.500000	0.050	1	-3	1	332	104	228	1	0	17	6	80	0	0	228	0	0	0.0096	0.0000	0.0000	5.118	12.00	4.35	7.65	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.3435	0.6565	2	2	0.0000	0.1868	0.8132	2	2	0.0000	0.1551	0.8449
chr5	148116440	AGTG	A	0.500000	0.050	1	-3	2	196	96	100	47	0	9	0	40	0	0	100	0	0	0.4896	0.0000	0.0000	10.875	0.06	3.15	-3.09	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3186	0.5139	0.1675	1	1	0.3165	0.5129	0.1706	1	1	0.3138	0.5115	0.1747
chr5	148242694	G	GCT	0.500000	0.050	1	2	1	695	146	549	4	0	0	1	141	0	0	534	2	13	0.0274	0.0000	0.0273	145.000	0.00	4.03	-4.03	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9288	0.0712	2	2	0.0000	0.2297	0.7703	2	2	0.0000	0.0923	0.9077
chr5	148242696	GAT	G	0.500000	0.050	1	-2	3	699	148	551	5	0	3	0	140	0	0	533	4	14	0.0338	0.0000	0.0327	72.500	0.20	4.06	-3.86	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9848	0.0152	2	2	0.0000	0.3614	0.6386	2	2	0.0000	0.1256	0.8744
chr5	149995316	CT	C	0.500000	0.050	1	-1	2	689	177	512	72	0	2	0	103	0	0	512	0	0	0.4068	0.0000	0.0000	87.500	0.94	1.73	-0.78	2	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0295	0.3382	0.6323	1	2	0.0326	0.3466	0.6208	1	2	0.0371	0.3578	0.6051
chr5	149996157	TC	T	0.500000	0.050	1	-1	4	608	156	452	71	0	2	0	83	0	0	451	0	1	0.4551	0.0000	0.0022	77.000	0.20	1.39	-1.19	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1086	0.4989	0.3925	1	1	0.1129	0.4988	0.3883	1	1	0.1187	0.4987	0.3826
chr5	153492228	T	TC	0.500000	0.050	1	1	2	114	60	54	26	0	3	0	31	0	0	54	0	0	0.4333	0.0000	0.0000	19.000	0.04	1.10	-1.06	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1857	0.5098	0.3045	1	1	0.1882	0.5091	0.3027	1	1	0.1915	0.5082	0.3004
chr5	157052432	CTTG	C	0.500000	0.050	1	-3	1	381	130	251	2	0	3	0	125	0	0	251	0	0	0.0154	0.0000	0.0000	42.333	2.00	4.94	-2.94	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.5297	0.4703	2	2	0.0000	0.1484	0.8516	2	2	0.0000	0.0951	0.9049
chr5	157052557	C	CGTT	0.500000	0.050	1	3	1	383	138	245	0	0	0	2	136	0	0	243	0	2	0.0000	0.0000	0.0082	138.000		4.18		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0287	0.9713	2	2	0.0000	0.0308	0.9692	2	2	0.0000	0.0338	0.9662
chr5	168454024	TGGA	T	0.500000	0.050	1	-3	2	235	86	149	74	0	5	0	7	0	0	149	0	0	0.8605	0.0000	0.0000	16.200	0.36	3.71	-3.35	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0547	0.9453	0.0000	0	1	0.3043	0.6957	0.0000
chr5	177503170	AGAG	A	0.500000	0.050	1	-3	1	428	91	337	51	0	7	0	33	0	0	337	0	0	0.5604	0.0000	0.0000	12.000	0.90	4.06	-3.16	11	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4810	0.4378	0.0811	1	0	0.4728	0.4418	0.0854	1	0	0.4617	0.4470	0.0913
chr5	179345258	G	GGCA	0.500000	0.050	1	3	1	452	179	273	124	10	41	0	4	0	0	273	0	0	0.6927	0.0000	0.0000	3.366	1.07	4.00	-2.93	8	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0411	0.9589	0.0000	0	0	0.6542	0.3458	0.0000	0	0	0.8493	0.1507	0.0000
chr5	181260427	CTCT	C	0.500000	0.050	1	-3	2	640	107	533	0	0	16	1	90	0	0	531	0	2	0.0000	0.0000	0.0038	5.688		3.14		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0879	0.9121	2	2	0.0000	0.0917	0.9083	2	2	0.0000	0.0972	0.9028
chr6	1390850	G	GGGC	0.511246	0.050	1	3	5	521	124	397	89	2	30	0	3	1	0	396	0	0	0.7177	0.0025	0.0025	3.133	0.90	3.33	-2.43	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0679	0.9321	0.0000	0	0	0.5562	0.4438	0.0000	0	0	0.7409	0.2591	0.0000
chr6	1611782	A	ACGG	0.232567	0.050	1	3	1	534	105	429	44	2	12	2	45	4	1	417	4	3	0.4190	0.0093	0.0280	7.583	1.07	3.69	-2.62	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3272	0.5463	0.1265	1	1	0.3301	0.5434	0.1265	1	1	0.3339	0.5397	0.1264
chr6	16327633	G	GTGC	0.199384	0.050	1	3	2	1239	274	965	19	93	63	11	88	0	0	957	2	6	0.0693	0.0000	0.0083	3.295	2.21	4.43	-2.22	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3587	0.5575	0.0837	1	1	0.3622	0.5530	0.0848	1	1	0.3666	0.5474	0.0860
chr6	16327684	A	ATGC	0.101269	0.050	1	3	1	1232	339	893	8	112	82	21	116	0	0	890	2	1	0.0236	0.0000	0.0034	3.103	1.00	4.46	-3.46	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1457	0.6923	0.1620	1	1	0.1548	0.6876	0.1576	1	1	0.1673	0.6811	0.1516
chr6	21595035	G	GGGC	0.002798	0.050	1	3	5	617	142	475	118	2	20	0	2	0	0	475	0	0	0.8310	0.0000	0.0000	6.100	1.76	3.00	-1.24	42	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9964	0.0036	0.0000	0	0	0.9994	0.0006	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000
chr6	26183962	C	CCT	0.000001	0.050	1	2	1	561	153	408	141	0	8	0	4	0	0	408	0	0	0.9216	0.0000	0.0000	18.125	0.45	2.25	-1.80	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr6	27255285	AAAGGAGAGCCAGATT	A	0.178475	0.050	1	-15	1	517	101	416	57	0	3	0	41	0	0	408	0	8	0.5644	0.0000	0.0192	32.667	0.33	13.49	-13.15	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.4923	0.4592	0.0485	1	0	0.4903	0.4599	0.0498	1	0	0.4876	0.4609	0.0515
chr6	29173644	TA	T	0.001133	0.050	1	-1	2	562	153	409	131	2	14	0	6	0	0	409	0	0	0.8562	0.0000	0.0000	9.929	0.22	1.83	-1.61	107	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.6243	0.3757	0.0000	0	0	0.9977	0.0023	0.0000	0	0	0.9996	0.0004	0.0000
chr6	29657255	TTCC	T	0.500000	0.050	1	-3	2	165	66	99	29	0	5	0	32	0	0	99	0	0	0.4394	0.0000	0.0000	12.200	1.76	4.47	-2.71	5	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2064	0.5159	0.2777	1	1	0.2083	0.5147	0.2770	1	1	0.2107	0.5132	0.2761
chr6	30590700	G	GA	0.500000	0.050	1	1	1	417	115	302	4	0	1	0	110	0	0	300	0	2	0.0348	0.0000	0.0066	114.000	0.25	1.18	-0.93	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9754	0.0246	2	2	0.0000	0.4763	0.5237	2	2	0.0000	0.2316	0.7684
chr6	31027315	CTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAGCT	C	0.500000	0.050	1	-30	2	1495	372	1123	217	8	21	10	116	28	14	1074	5	2	0.5833	0.0249	0.0436	16.381	1.65	11.67	-10.02	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9959	0.0041	0.0000	1	0	0.9949	0.0051	0.0000	1	0	0.9932	0.0068	0.0000
chr6	31028377	TGAGACCACCACAGCCTCTACTGAAGGCTCC	T	0.500000	0.050	1	-30	1	2536	731	1805	505	19	189	8	10	72	20	1664	20	29	0.6908	0.0399	0.0781	2.886	2.05	11.70	-9.65	41	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0025	0.9975	0.0000
chr6	31111507	CCCCCAGCTGCCTCCTGGATACCGATTAATATTCCCCCAGCTGCCTCCTGGATACCGATTAATATTT	C	0.500000	0.050	1	-66	2	535	145	390	80	0	29	0	36	0	0	390	0	0	0.5517	0.0000	0.0000	4.000	0.25	2.19	-1.94	38	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7845	0.2053	0.0101	1	0	0.7711	0.2171	0.0118	1	0	0.7523	0.2334	0.0143
chr6	31117165	GCTT	G	0.500000	0.050	1	-3	1	874	229	645	217	1	2	0	9	0	0	645	0	0	0.9476	0.0000	0.0000	113.500	1.26	3.89	-2.63	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.3465	0.6535	0.0000	0	0	0.8677	0.1323	0.0000
chr6	31138723	TC	T	0.500000	0.050	1	-1	1	576	147	429	136	0	5	0	6	0	0	429	0	0	0.9252	0.0000	0.0000	28.400	0.35	2.00	-1.65	26	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0020	0.9980	0.0000	0	1	0.3474	0.6526	0.0000	0	0	0.7383	0.2617	0.0000
chr6	31412384	G	GCTGCTGCTGCT	0.500000	0.050	1	11	1	629	185	444	0	0	2	0	183	0	0	443	0	1	0.0000	0.0000	0.0023	91.500		11.18		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0097	0.9903	2	2	0.0000	0.0106	0.9894	2	2	0.0000	0.0120	0.9880
chr6	31954568	CTCTCGG	C	0.500000	0.050	1	-6	3	856	183	673	166	0	15	0	2	0	0	673	0	0	0.9071	0.0000	0.0000	11.200	0.80	6.50	-5.70	58	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7134	0.2866	0.0000	0	0	0.9404	0.0596	0.0000	0	0	0.9622	0.0378	0.0000
chr6	36721185	C	CAGGCTGCCTCCCCTGAGG	0.500000	0.050	1	18	1	393	94	299	5	0	8	0	81	0	0	271	0	28	0.0532	0.0000	0.0936	10.750	0.20	14.81	-14.61	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9956	0.0044	2	1	0.0000	0.6573	0.3427	2	2	0.0000	0.3198	0.6802
chr6	40379364	G	GC	0.500000	0.050	1	1	2	592	185	407	174	0	8	0	3	0	1	406	0	0	0.9405	0.0000	0.0025	22.125	0.30	1.33	-1.03	70	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4000	0.6000	0.0000	0	0	0.9109	0.0891	0.0000	0	0	0.9562	0.0438	0.0000
chr6	41786835	C	CCTT	0.500000	0.050	1	3	1	690	176	514	2	0	6	2	166	0	0	508	0	6	0.0114	0.0000	0.0117	28.167	0.00	3.30	-3.30	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2477	0.7523	2	2	0.0000	0.0496	0.9504	2	2	0.0000	0.0315	0.9685
chr6	42236367	G	GTCC	0.500000	0.050	1	3	3	349	136	213	100	3	30	0	3	0	0	213	0	0	0.7353	0.0000	0.0000	3.533	0.27	4.00	-3.73	24	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0916	0.9084	0.0000	0	0	0.6314	0.3686	0.0000	0	0	0.7949	0.2051	0.0000
chr6	42263500	CGGCGGAGGCGGA	C	0.500000	0.050	1	-12	2	408	149	259	83	0	15	0	51	0	0	254	0	5	0.5570	0.0000	0.0193	8.933	0.11	10.90	-10.79	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5906	0.3684	0.0409	1	0	0.5797	0.3758	0.0445	1	0	0.5648	0.3856	0.0496
chr6	43021675	CGCCGGG	C	0.500000	0.050	1	-6	1	293	88	205	0	0	16	0	72	0	0	202	0	3	0.0000	0.0000	0.0146	4.500		6.17		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1316	0.8684	2	2	0.0000	0.1359	0.8641	2	2	0.0000	0.1421	0.8579
chr6	43282987	GGAA	G	0.500000	0.050	1	-3	1	888	170	718	3	0	21	2	144	0	0	716	1	1	0.0176	0.0000	0.0028	7.000	0.00	3.34	-3.34	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.7646	0.2354	2	2	0.0000	0.1624	0.8376	2	2	0.0000	0.0811	0.9189
chr6	81752010	A	ACCGCCGAAGTCGCCG	0.500000	0.050	1	15	2	615	148	467	0	0	75	4	69	0	0	441	0	26	0.0000	0.0000	0.0557	0.960		8.65		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0767	0.9233	2	2	0.0000	0.0803	0.9197	2	2	0.0000	0.0855	0.9145
chr6	99613748	C	CCCG	0.500000	0.050	1	3	1	712	158	554	106	7	40	0	5	0	0	553	0	1	0.6709	0.0000	0.0018	2.950	1.70	4.40	-2.70	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0010	0.9990	0.0000	0	1	0.2280	0.7720	0.0000	0	0	0.6175	0.3825	0.0000
chr6	109443671	TGGA	T	0.500000	0.050	1	-3	1	636	148	488	10	0	7	0	131	0	0	475	0	13	0.0676	0.0000	0.0266	20.143	0.60	3.34	-2.74	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9580	0.0420	2	1	0.0000	0.5656	0.4344
chr6	116279302	T	TCAC	0.500000	0.050	1	3	2	801	183	618	0	0	18	3	162	0	0	610	0	8	0.0000	0.0000	0.0129	9.111		3.13		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0127	0.9873	2	2	0.0000	0.0139	0.9861	2	2	0.0000	0.0156	0.9844
chr6	116437084	TGGG	T	0.500000	0.050	1	-3	5	807	145	662	77	0	3	1	64	0	0	661	0	1	0.5310	0.0000	0.0015	47.333	0.43	3.16	-2.73	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3677	0.5084	0.1239	1	1	0.3644	0.5076	0.1280	1	1	0.3597	0.5067	0.1335
chr6	116792598	A	AGG	0.500000	0.050	1	2	1	731	144	587	83	0	2	0	59	0	0	582	0	5	0.5764	0.0000	0.0085	71.000	0.19	6.90	-6.71	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.4789	0.4480	0.0732	1	0	0.4715	0.4511	0.0774	1	0	0.4614	0.4552	0.0833
chr6	118491647	ATGT	A	0.500000	0.050	1	-3	3	322	116	206	111	0	3	0	2	0	0	206	0	0	0.9569	0.0000	0.0000	37.667	0.08	3.00	-2.92	57	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3843	0.6157	0.0000	0	0	0.8025	0.1975	0.0000	0	0	0.8719	0.1281	0.0000
chr6	135036575	C	CT	0.500000	0.050	1	1	1	415	94	321	86	0	5	0	3	0	0	320	0	1	0.9149	0.0000	0.0031	17.800	0.26	1.00	-0.74	64	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0143	0.9857	0.0000	0	1	0.3702	0.6298	0.0000	0	0	0.6413	0.3587	0.0000
chr6	136360785	GCTT	G	0.500000	0.050	1	-3	1	304	85	219	35	0	12	0	38	0	0	218	0	1	0.4118	0.0000	0.0046	6.083	0.09	3.00	-2.91	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1941	0.5177	0.2882	1	1	0.1964	0.5164	0.2872	1	1	0.1994	0.5147	0.2859
chr6	151352981	T	TGAG	0.500000	0.050	1	3	2	996	240	756	107	1	9	0	123	0	0	753	0	3	0.4458	0.0000	0.0040	25.667	0.30	3.00	-2.70	1	0/1	1/1	.	.	OK	1	1	0.0745	0.4832	0.4423	1	1	0.0789	0.4838	0.4373	1	1	0.0850	0.4847	0.4303
chr6	156778268	C	CCAG	0.500000	0.050	1	3	2	772	214	558	77	6	53	0	78	0	1	550	2	5	0.3598	0.0000	0.0143	3.038	1.87	3.17	-1.30	25	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2159	0.5510	0.2332	1	1	0.2181	0.5471	0.2348	1	1	0.2208	0.5423	0.2369
chr6	159239747	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	0.500000	0.050	1	-18	1	546	215	331	6	0	47	1	161	0	0	310	0	21	0.0279	0.0000	0.0634	3.574	0.33	16.39	-16.05	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9945	0.0055	2	2	0.0000	0.3762	0.6238	2	2	0.0000	0.1037	0.8963
chr6	159790613	GGTT	G	0.500000	0.050	1	-3	5	409	154	255	83	0	6	1	64	0	0	252	0	3	0.5390	0.0000	0.0118	24.500	0.45	5.98	-5.54	55	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4244	0.4812	0.0944	1	1	0.4190	0.4823	0.0988	1	1	0.4116	0.4837	0.1047
chr6	160139865	CTGGTAAGT	C	0.500000	0.050	1	-8	2	225	97	128	5	0	13	0	79	0	0	127	0	1	0.0515	0.0000	0.0078	6.462	0.20	8.70	-8.50	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9979	0.0021	2	1	0.0000	0.7968	0.2032	2	2	0.0000	0.4851	0.5149
chr6	161098318	CCTG	C	0.500000	0.050	1	-3	3	369	150	219	0	0	17	11	122	0	0	212	2	5	0.0000	0.0000	0.0320	7.824		3.05		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0287	0.9713	2	2	0.0000	0.0307	0.9693	2	2	0.0000	0.0337	0.9663
chr6	168308554	G	GCCCCTGCCGGCA	0.500000	0.050	1	12	3	755	172	583	77	0	33	0	62	1	0	572	0	10	0.4477	0.0017	0.0189	4.212	0.32	9.82	-9.50	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2996	0.5349	0.1655	1	1	0.2988	0.5323	0.1689	1	1	0.2977	0.5290	0.1734
chr6	170561949	GCAA	G	0.500000	0.050	1	-3	1	696	203	493	6	4	16	85	92	0	0	493	0	0	0.0296	0.0000	0.0000	8.067	6.17	12.86	-6.69	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.8632	0.1368	2	2	0.0000	0.3731	0.6269
chr7	1547017	A	AGCC	0.500000	0.050	1	3	2	286	105	181	0	1	9	2	93	0	0	175	0	6	0.0000	0.0000	0.0331	10.667		3.75		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1388	0.8612	2	2	0.0000	0.1142	0.8858	2	2	0.0000	0.1058	0.8942
chr7	2513247	A	AGATG	0.500000	0.050	1	4	1	295	102	193	8	0	21	2	71	0	0	190	0	3	0.0784	0.0000	0.0155	3.857	0.62	3.75	-3.12	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9697	0.0303	2	1	0.0000	0.7596	0.2404
chr7	4791165	CCAGCTCCACGCA	C	0.500000	0.050	1	-12	1	692	174	518	99	0	5	0	70	0	0	514	0	4	0.5690	0.0000	0.0077	33.800	0.27	11.99	-11.71	23	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5549	0.3983	0.0468	1	0	0.5453	0.4040	0.0506	1	0	0.5324	0.4116	0.0560
chr7	15686172	ATGG	A	0.500000	0.050	1	-3	1	689	200	489	0	1	26	7	166	0	0	488	0	1	0.0000	0.0000	0.0020	6.654		3.00		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0139	0.9861	2	2	0.0000	0.0149	0.9851	2	2	0.0000	0.0166	0.9834
chr7	26185767	AG	A	0.500000	0.050	1	-1	4	435	72	363	33	1	5	0	33	0	0	363	0	0	0.4583	0.0000	0.0000	13.400	0.27	1.55	-1.27	25	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2522	0.5201	0.2277	1	1	0.2525	0.5186	0.2289	1	1	0.2529	0.5167	0.2304
chr7	31658299	C	CT	0.500000	0.050	1	1	3	156	58	98	30	0	1	1	26	0	0	98	0	0	0.5172	0.0000	0.0000	57.000	0.50	1.35	-0.85	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2784	0.5146	0.2069	1	1	0.2777	0.5135	0.2088	1	1	0.2767	0.5121	0.2112
chr7	33635227	TC	T	0.500000	0.050	1	-1	1	541	150	391	82	0	0	0	68	0	0	390	0	1	0.5467	0.0000	0.0026	150.000	0.27	1.15	-0.88	56	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3935	0.4977	0.1088	1	1	0.3892	0.4977	0.1131	1	1	0.3834	0.4977	0.1189
chr7	36407740	A	ACTT	0.500000	0.050	1	3	1	202	53	149	27	0	4	0	22	0	0	147	0	2	0.5094	0.0000	0.0134	12.250	0.11	2.91	-2.80	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2795	0.5128	0.2077	1	1	0.2786	0.5119	0.2095	1	1	0.2775	0.5106	0.2118
chr7	51030870	GTCT	G	0.500000	0.050	1	-3	2	248	92	156	40	0	1	0	51	0	0	155	0	1	0.4348	0.0000	0.0064	91.000	0.72	2.96	-2.24	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1201	0.4865	0.3934	1	1	0.1241	0.4873	0.3885	1	1	0.1296	0.4885	0.3819
chr7	56073066	CTT	C	0.500000	0.050	1	-2	1	214	103	111	100	0	1	0	2	0	0	111	0	0	0.9709	0.0000	0.0000	102.000	0.07	2.50	-2.43	34	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3214	0.6786	0.0000	0	0	0.7560	0.2440	0.0000	0	0	0.8394	0.1606	0.0000
chr7	76611468	CA	C	0.500000	0.050	1	-1	1	318	96	222	67	0	0	0	29	0	0	222	0	0	0.6979	0.0000	0.0000	96.000	0.07	2.62	-2.55	33	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7315	0.2514	0.0171	1	0	0.7178	0.2628	0.0194	1	0	0.6989	0.2783	0.0228
chr7	82952172	T	TTCA	0.500000	0.050	1	3	5	939	234	705	0	0	14	1	219	0	0	694	0	11	0.0000	0.0000	0.0156	15.714		3.05		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0030	0.9970	2	2	0.0000	0.0033	0.9967	2	2	0.0000	0.0039	0.9961
chr7	91265144	A	ACCG	0.500000	0.050	1	3	2	631	164	467	80	1	21	2	60	0	0	464	0	3	0.4878	0.0000	0.0064	6.762	0.40	3.53	-3.13	28	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4422	0.4702	0.0876	1	1	0.4360	0.4720	0.0919	1	1	0.4277	0.4743	0.0979
chr7	92022864	A	AAAC	0.500000	0.050	1	3	1	273	93	180	0	0	4	0	89	0	0	175	0	5	0.0000	0.0000	0.0278	22.250		3.12		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0859	0.9141	2	2	0.0000	0.0896	0.9104	2	2	0.0000	0.0951	0.9049
chr7	97006108	A	AGCC	0.500000	0.050	1	3	1	473	197	276	67	1	69	2	58	0	0	276	0	0	0.3401	0.0000	0.0000	1.855	1.30	3.78	-2.48	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3335	0.5188	0.1477	1	1	0.3313	0.5173	0.1514	1	1	0.3282	0.5155	0.1563
chr7	99652770	T	TA	0.500000	0.050	1	1	2	223	54	169	33	0	1	0	20	0	0	168	0	1	0.6111	0.0000	0.0059	53.000	0.18	1.20	-1.02	5	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4023	0.4749	0.1228	1	1	0.3966	0.4766	0.1268	1	1	0.3891	0.4789	0.1321
chr7	99836454	TA	T	0.500000	0.050	1	-1	2	176	72	104	38	0	0	0	34	0	0	104	0	0	0.5278	0.0000	0.0000	72.000	0.45	1.15	-0.70	22	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2885	0.5171	0.1943	1	1	0.2875	0.5158	0.1966	1	1	0.2862	0.5142	0.1996
chr7	100075318	C	CA	0.500000	0.050	1	1	2	671	171	500	93	0	7	2	69	0	0	500	0	0	0.5439	0.0000	0.0000	23.429	0.29	1.19	-0.90	31	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5208	0.4219	0.0573	1	0	0.5122	0.4264	0.0614	1	0	0.5005	0.4324	0.0671
chr7	100124796	CAGGAGG	C	0.500000	0.050	1	-6	1	570	188	382	83	0	13	0	92	0	1	381	0	0	0.4415	0.0000	0.0026	13.462	0.40	5.62	-5.22	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1461	0.5352	0.3187	1	1	0.1500	0.5325	0.3175	1	1	0.1552	0.5291	0.3157
chr7	100752851	TCCACGGAAAAACCCACCATCC	T	0.500000	0.050	1	-21	1	1306	254	1052	90	5	65	4	90	5	24	1013	7	3	0.3543	0.0048	0.0371	2.846	1.83	11.64	-9.81	12	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.4634	0.4674	0.0692	1	1	0.4574	0.4691	0.0735	1	1	0.4492	0.4713	0.0794
chr7	101172640	CA	C	0.500000	0.050	1	-1	2	425	99	326	91	1	3	0	4	0	0	326	0	0	0.9192	0.0000	0.0000	32.000	1.00	1.00	0.00	47	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0154	0.9846	0.0000	0	1	0.4028	0.5972	0.0000	0	0	0.6729	0.3271	0.0000
chr7	102541185	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	2	625	181	444	153	0	2	0	26	0	0	444	0	0	0.8453	0.0000	0.0000	89.500	0.23	1.12	-0.89	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0025	0.9975	0.0000
chr7	102934552	TGAA	T	0.500000	0.050	1	-3	2	668	203	465	95	0	7	0	101	0	0	463	0	2	0.4680	0.0000	0.0043	28.000	0.32	3.15	-2.83	31	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1431	0.5413	0.3156	1	1	0.1471	0.5382	0.3147	1	1	0.1524	0.5342	0.3133
chr7	103989356	T	TGCCGCC	0.500000	0.050	1	6	1	373	101	272	1	0	26	3	71	0	0	267	0	5	0.0099	0.0000	0.0184	2.885	3.00	6.39	-3.39	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.4113	0.5887	2	2	0.0000	0.2170	0.7830	2	2	0.0000	0.1788	0.8212
chr7	122013320	GTGA	G	0.500000	0.050	1	-3	2	803	213	590	94	1	17	1	100	0	0	589	0	1	0.4413	0.0000	0.0017	11.471	1.16	3.99	-2.83	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1500	0.5444	0.3056	1	1	0.1539	0.5411	0.3050	1	1	0.1591	0.5369	0.3041
chr7	124032402	CGCT	C	0.500000	0.050	1	-3	2	780	214	566	6	2	16	101	89	0	0	558	6	2	0.0280	0.0000	0.0141	12.000	0.50	3.16	-2.66	4	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9933	0.0067	2	2	0.0000	0.3314	0.6686	2	2	0.0000	0.0863	0.9137
chr7	124032402	CGCTGCT	C	0.500000	0.050	1	-6	2	781	218	563	10	1	99	0	108	0	0	556	0	7	0.0459	0.0000	0.0124	1.227	0.30	6.09	-5.79	2	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9868	0.0132	2	1	0.0000	0.7959	0.2041
chr7	128947297	CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT	C	0.500000	0.050	1	-30	3	775	253	522	217	2	27	0	7	0	0	522	0	0	0.8577	0.0000	0.0000	8.333	0.39	13.57	-13.18	55	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0027	0.9973	0.0000	0	0	0.6734	0.3266	0.0000	0	0	0.9337	0.0663	0.0000
chr7	131556270	G	GGGCGAC	0.500000	0.050	1	6	1	351	145	206	56	2	17	0	70	0	2	198	0	6	0.3862	0.0000	0.0388	7.471	12.05	5.31	6.74	16	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0857	0.4633	0.4511	1	1	0.0900	0.4655	0.4445	1	1	0.0959	0.4685	0.4356
chr7	131556270	GGGCGAC	G	0.500000	0.050	1	-6	1	351	149	202	75	1	15	0	58	0	0	196	0	6	0.5034	0.0000	0.0297	8.933	4.87	11.84	-6.98	5	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.3801	0.5021	0.1178	1	1	0.3762	0.5018	0.1220	1	1	0.3709	0.5014	0.1276
chr7	131556270	GGGCGACGGCGAC	G	0.500000	0.050	1	-12	1	351	151	200	81	0	13	0	57	0	0	193	0	7	0.5364	0.0000	0.0350	10.615	4.53	11.81	-7.28	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4531	0.4637	0.0832	1	1	0.4466	0.4659	0.0875	1	1	0.4378	0.4687	0.0935
chr7	137928167	CTGG	C	0.500000	0.050	1	-3	1	227	80	147	0	0	1	0	79	0	0	144	0	3	0.0000	0.0000	0.0204	79.000		3.22		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1127	0.8873	2	2	0.0000	0.1169	0.8831	2	2	0.0000	0.1229	0.8771
chr7	142864293	C	CCCT	0.500000	0.050	1	3	3	914	257	657	12	120	40	1	84	0	1	652	0	4	0.0467	0.0000	0.0076	5.425	2.00	3.05	-1.05	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7623	0.2277	0.0099	1	0	0.7498	0.2386	0.0115	1	0	0.7324	0.2536	0.0140
chr7	142864293	CCCT	C	0.500000	0.050	1	-3	3	916	263	653	92	3	38	1	129	0	0	652	0	1	0.3498	0.0000	0.0015	5.921	2.68	3.13	-0.45	10	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0192	0.3011	0.6797	1	2	0.0217	0.3104	0.6679	1	2	0.0253	0.3230	0.6517
chr7	143511644	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	2	1173	311	862	0	0	16	3	292	0	1	860	0	1	0.0000	0.0000	0.0023	19.600		1.17		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0008	0.9992	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0010	0.9990
chr7	144050729	ACT	A	0.500000	0.050	1	-2	1	638	146	492	141	0	1	0	4	0	0	492	0	0	0.9658	0.0000	0.0000	145.000	0.25	2.75	-2.50	15	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0483	0.9517	0.0000	0	0	0.6913	0.3087	0.0000	0	0	0.8691	0.1309	0.0000
chr7	144129636	ACTT	A	0.500000	0.050	1	-3	2	668	153	515	11	0	9	0	133	0	0	513	0	2	0.0719	0.0000	0.0039	16.000	1.64	3.96	-2.33	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9823	0.0177	2	1	0.0000	0.7008	0.2992
chr7	144258792	GAGGCTGTGAAACAGC	G	0.500000	0.050	1	-15	3	1087	360	727	325	1	4	0	30	0	0	718	0	9	0.9028	0.0000	0.0124	89.000	0.20	14.53	-14.33	197	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0013	0.9987	0.0000
chr7	149783003	A	AC	0.500000	0.050	1	1	2	722	178	544	80	1	1	0	96	0	0	543	0	1	0.4494	0.0000	0.0018	177.000	0.16	1.30	-1.14	28	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0874	0.4820	0.4307	1	1	0.0918	0.4829	0.4253	1	1	0.0978	0.4841	0.4181
chr7	149815757	G	GAGGTGGTC	0.500000	0.050	1	8	1	757	207	550	180	0	19	0	8	0	0	549	0	1	0.8696	0.0000	0.0018	9.895	0.75	8.00	-7.25	30	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1720	0.8280	0.0000	0	0	0.7252	0.2748	0.0000
chr7	149818100	T	TA	0.500000	0.050	1	1	1	855	198	657	95	0	2	0	101	0	0	656	0	1	0.4798	0.0000	0.0015	98.000	1.02	1.54	-0.52	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1517	0.5454	0.3030	1	1	0.1555	0.5419	0.3025	1	1	0.1607	0.5376	0.3017
chr7	150372306	GCCGCCAGGGGCC	G	0.500000	0.050	1	-12	2	791	217	574	123	0	7	0	87	0	0	569	0	5	0.5668	0.0000	0.0087	30.000	0.58	11.05	-10.47	39	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6219	0.3491	0.0290	1	0	0.6112	0.3568	0.0320	1	0	0.5964	0.3670	0.0365
chr7	151023910	GCTC	G	0.500000	0.050	1	-3	1	571	155	416	146	1	6	0	2	0	0	416	0	0	0.9419	0.0000	0.0000	24.833	0.79	3.50	-2.71	2	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.6069	0.3931	0.0000	0	0	0.9080	0.0920	0.0000	0	0	0.9416	0.0584	0.0000
chr7	151051868	CAGA	C	0.500000	0.050	1	-3	1	448	99	349	57	0	2	0	40	0	0	346	0	3	0.5758	0.0000	0.0086	48.500	1.12	3.25	-2.13	35	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4199	0.4749	0.1052	1	1	0.4140	0.4766	0.1094	1	1	0.4062	0.4787	0.1151
chr7	151086813	C	CG	0.500000	0.050	1	1	2	417	82	335	0	1	1	11	69	0	0	304	9	22	0.0000	0.0000	0.0925	80.000		8.45		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0700	0.9300	2	2	0.0000	0.0716	0.9284	2	2	0.0000	0.0747	0.9253
chr7	151086821	C	CG	0.500000	0.050	1	1	1	420	82	338	0	0	3	13	66	0	1	305	12	20	0.0000	0.0000	0.0976	79.000		8.77		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0612	0.9388	2	2	0.0000	0.0635	0.9365	2	2	0.0000	0.0673	0.9327
chr7	151086832	GTCT	G	0.500000	0.050	1	-3	1	423	80	343	0	0	5	1	74	0	0	272	32	39	0.0000	0.0000	0.2070	18.750		8.34		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0265	0.9735	2	2	0.0000	0.0284	0.9716	2	2	0.0000	0.0312	0.9688
chr8	8318865	CGGGGCG	C	0.543000	0.050	1	-6	2	840	179	661	72	1	30	0	76	2	0	659	0	0	0.4022	0.0030	0.0030	4.933	1.11	6.04	-4.93	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1950	0.5442	0.2609	1	1	0.1969	0.5408	0.2623	1	1	0.1994	0.5366	0.2640
chr8	8377352	CGCCGCT	C	0.473558	0.050	1	-6	2	776	167	609	125	1	36	0	5	0	0	609	0	0	0.7485	0.0000	0.0000	3.611	0.32	6.80	-6.48	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0075	0.9925	0.0000	0	1	0.4678	0.5322	0.0000	0	0	0.7799	0.2201	0.0000
chr8	10608190	CTTCCTCTTCTGCCTCCTGGGACTCTATAACTTCTGACTCTGGCTGGGT	C	0.002031	0.050	1	-48	3	1109	325	784	138	5	32	8	142	2	5	758	7	12	0.4246	0.0026	0.0332	9.062	2.93	11.87	-8.95	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2041	0.7931	0.0029	1	1	0.2151	0.7821	0.0028	1	1	0.2299	0.7673	0.0027
chr8	10610095	C	CCTCTTCTTGCAGCCCTTCTTCTGTTTTAGTTTCCTCTAACTGCACCCT	0.000025	0.050	1	48	5	1097	309	788	83	8	76	13	129	1	2	783	0	2	0.2686	0.0013	0.0063	3.164	3.07	6.80	-3.73	15	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.0569	0.9428	0.0002	1	1	0.0637	0.9361	0.0002	1	1	0.0735	0.9263	0.0002
chr8	10610119	T	TTTC	0.070211	0.050	1	3	1	1084	338	746	140	7	26	63	102	0	1	732	1	12	0.4142	0.0000	0.0188	11.478	1.88	5.35	-3.47	36	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1752	0.7305	0.0943	1	1	0.1851	0.7226	0.0924	1	1	0.1985	0.7118	0.0897
chr8	11808709	GTCCCAC	G	0.938007	0.050	1	-6	1	539	230	309	0	0	33	2	195	0	0	307	0	2	0.0000	0.0000	0.0065	5.939		6.05		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0004	0.9996	2	2	0.0000	0.0005	0.9995	2	2	0.0000	0.0006	0.9994
chr8	22034158	GGAGGAA	G	0.000406	0.050	1	-6	1	273	80	193	69	0	5	0	6	0	0	193	0	0	0.8625	0.0000	0.0000	15.000	0.13	5.67	-5.54	31	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4378	0.5622	0.0000	0	0	0.9959	0.0041	0.0000	0	0	0.9993	0.0007	0.0000
chr8	22404715	AGCTGCT	A	0.199557	0.050	1	-6	2	376	129	247	66	0	3	0	60	0	0	243	0	4	0.5116	0.0000	0.0162	42.000	0.09	7.45	-7.36	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3894	0.5275	0.0831	1	1	0.3911	0.5250	0.0839	1	1	0.3931	0.5219	0.0850
chr8	23145733	GCTAAAATGATGA	G	0.001032	0.050	1	-12	1	328	131	197	126	0	5	0	0	0	0	196	0	1	0.9618	0.0000	0.0051	25.200	0.18			40	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9998	0.0002	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr8	33496717	A	AGAT	0.026718	0.050	1	3	5	187	81	106	63	0	14	0	4	0	0	106	0	0	0.7778	0.0000	0.0000	4.786	0.17	3.25	-3.08	25	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2065	0.7935	0.0000	0	0	0.9226	0.0774	0.0000	0	0	0.9739	0.0261	0.0000
chr8	37698415	GCGCCGCCGC	G	0.001415	0.050	1	-9	1	651	178	473	93	2	20	0	63	2	1	459	0	11	0.5225	0.0042	0.0296	7.900	0.83	8.73	-7.90	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7257	0.2742	0.0001	1	0	0.7197	0.2801	0.0001	1	0	0.7116	0.2883	0.0001
chr8	60222337	CAG	C	0.500000	0.050	1	-2	2	207	82	125	78	0	1	0	3	0	0	125	0	0	0.9512	0.0000	0.0000	81.000	0.46	2.33	-1.87	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0508	0.9492	0.0000	0	1	0.4803	0.5197	0.0000	0	0	0.6803	0.3197	0.0000
chr8	64581060	T	TGGCGGC	0.001021	0.050	1	6	1	612	163	449	138	2	18	2	3	6	0	441	1	1	0.8466	0.0134	0.0178	8.529	2.46	2.33	0.13	16	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.8110	0.1890	0.0000	0	0	0.9983	0.0017	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000
chr8	64581463	G	GGCA	0.072578	0.050	1	3	1	681	205	476	61	4	48	1	91	0	0	474	2	0	0.2976	0.0000	0.0042	3.250	0.56	3.52	-2.96	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1273	0.6977	0.1750	1	1	0.1362	0.6962	0.1676	1	1	0.1485	0.6933	0.1581
chr8	120811835	T	TACCGCC	0.500000	0.050	1	6	1	454	124	330	118	1	4	0	1	0	0	330	0	0	0.9516	0.0000	0.0000	30.000	1.01	6.00	-4.99	58	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7961	0.2039	0.0000	0	0	0.9061	0.0939	0.0000	0	0	0.9228	0.0772	0.0000
chr8	123369918	T	TTCATCA	0.500000	0.050	1	6	1	450	129	321	5	0	27	3	94	0	0	319	2	0	0.0388	0.0000	0.0062	3.778	0.00	5.18	-5.18	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9965	0.0035	2	1	0.0000	0.7091	0.2909	2	2	0.0000	0.3725	0.6275
chr8	137837732	C	CCTT	0.500000	0.050	1	3	1	263	121	142	63	0	2	0	56	0	0	140	0	2	0.5207	0.0000	0.0141	59.500	0.21	2.96	-2.76	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2923	0.5294	0.1783	1	1	0.2916	0.5271	0.1813	1	1	0.2905	0.5244	0.1852
chr8	141449677	C	CA	0.500000	0.050	1	1	2	320	120	200	115	1	2	0	2	0	0	200	0	0	0.9583	0.0000	0.0000	59.000	0.84	6.00	-5.16	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4184	0.5816	0.0000	0	0	0.8216	0.1784	0.0000	0	0	0.8847	0.1153	0.0000
chr8	143429783	ATGG	A	0.500000	0.050	1	-3	2	496	125	371	49	1	20	4	51	0	0	368	0	3	0.3920	0.0000	0.0081	5.200	2.16	5.20	-3.03	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1496	0.5126	0.3378	1	1	0.1531	0.5116	0.3352	1	1	0.1579	0.5104	0.3317
chr8	144392334	T	TGGGGGTGCAAGGTGA	0.500000	0.050	1	15	1	997	250	747	105	0	39	1	105	0	0	732	0	15	0.4200	0.0000	0.0201	5.385	1.25	10.70	-9.46	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0868	0.4993	0.4139	1	1	0.0912	0.4990	0.4098	1	1	0.0974	0.4986	0.4040
chr8	144522517	T	TCCCGGC	0.500000	0.050	1	6	1	471	132	339	76	0	6	0	50	0	0	333	0	6	0.5758	0.0000	0.0177	21.000	0.43	6.20	-5.77	38	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4969	0.4344	0.0688	1	0	0.4886	0.4384	0.0730	1	0	0.4775	0.4436	0.0788
chr9	116848	T	TA	0.003653	0.050	1	1	1	747	228	519	212	1	7	0	8	1	0	518	0	0	0.9298	0.0019	0.0019	31.571	0.27	1.12	-0.85	116	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1388	0.8612	0.0000	0	0	0.9962	0.0038	0.0000	0	0	0.9996	0.0004	0.0000
chr9	117363	T	TC	0.002993	0.050	1	1	1	977	186	791	129	32	11	6	8	0	0	791	0	0	0.6935	0.0000	0.0000	18.000	1.26	3.25	-1.99	9	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	0	0.7864	0.2136	0.0000	0	0	0.9914	0.0086	0.0000
chr9	117366	C	CCG	0.163682	0.050	1	2	3	975	186	789	144	15	13	2	12	0	0	789	0	0	0.7742	0.0000	0.0000	19.222	1.41	2.92	-1.51	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0234	0.9766	0.0000	0	0	0.5584	0.4416	0.0000
chr9	117370	GCC	G	0.163813	0.050	1	-2	4	977	196	781	6	163	12	4	11	0	0	780	0	1	0.0306	0.0000	0.0013	10.857	0.33	2.18	-1.85	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0096	0.9904	0.0000	0	1	0.4051	0.5949	0.0000
chr9	2039776	ACAG	A	0.143274	0.050	1	-3	2	825	276	549	9	0	55	18	194	0	0	548	0	1	0.0326	0.0000	0.0018	4.018	0.00	3.19	-3.19	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9281	0.0719	2	1	0.0000	0.5098	0.4902
chr9	12775862	T	TGGCGGC	0.500000	0.050	1	6	2	324	86	238	0	0	22	2	62	0	0	233	0	5	0.0000	0.0000	0.0210	2.864		5.68		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1492	0.8508	2	2	0.0000	0.1537	0.8463	2	2	0.0000	0.1601	0.8399
chr9	12775862	T	TGGCGGCGGC	0.500000	0.050	1	9	2	324	86	238	0	23	24	3	36	0	0	233	0	5	0.0000	0.0000	0.0210	1.818		5.17		0	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0001	0.9585	0.0414	2	1	0.0000	0.8020	0.1980	2	1	0.0000	0.6771	0.3229
chr9	12775862	T	TGGTGGC	0.500000	0.050	1	6	2	324	86	238	6	1	9	3	67	0	0	233	0	5	0.0698	0.0000	0.0210	9.500	0.50	5.39	-4.89	6	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9463	0.0537	2	1	0.0000	0.7032	0.2968
chr9	25678179	A	ACGC	0.500000	0.050	1	3	3	546	118	428	89	5	20	1	3	0	0	428	0	0	0.7542	0.0000	0.0000	4.900	0.90	3.00	-2.10	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0432	0.9568	0.0000	0	1	0.4836	0.5164	0.0000	0	0	0.7068	0.2932	0.0000
chr9	33575338	CA	C	0.500000	0.050	1	-1	3	462	115	347	1	0	2	0	112	0	0	347	0	0	0.0087	0.0000	0.0000	56.500	0.00	1.71	-1.71	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2327	0.7673	2	2	0.0000	0.1096	0.8904	2	2	0.0000	0.0900	0.9100
chr9	35674193	CGGAGAGGAGGATCTACCT	C	0.500000	0.050	1	-18	3	481	163	318	61	0	41	0	61	0	0	318	0	0	0.3742	0.0000	0.0000	2.976	0.34	11.18	-10.84	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2314	0.5372	0.2314	1	1	0.2328	0.5344	0.2328	1	1	0.2346	0.5309	0.2346
chr9	35811488	ACCAGGACCAGAG	A	0.500000	0.050	1	-12	1	828	219	609	100	1	45	1	72	0	0	604	0	5	0.4566	0.0000	0.0082	3.844	0.59	11.29	-10.70	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5235	0.4217	0.0549	1	0	0.5150	0.4261	0.0589	1	0	0.5034	0.4320	0.0645
chr9	35906602	C	CCCCCACCGCCACCAT	0.500000	0.050	1	15	1	802	246	556	190	3	43	0	10	0	0	556	0	0	0.7724	0.0000	0.0000	4.721	2.03	8.50	-6.47	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1297	0.8703	0.0000	0	0	0.7159	0.2841	0.0000
chr9	65283162	AG	A	0.500000	0.050	1	-1	3	438	76	362	8	1	0	1	66	0	0	361	0	1	0.1053	0.0000	0.0028	76.000	0.75	1.02	-0.27	6	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9866	0.0134	2	1	0.0000	0.8458	0.1542
chr9	76703459	GGTGACAGCCTGCAAC	G	0.500000	0.050	1	-15	3	500	141	359	72	0	2	0	67	0	0	345	0	14	0.5106	0.0000	0.0390	69.500	0.15	14.16	-14.01	26	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1389	0.5227	0.3383	1	1	0.1429	0.5210	0.3362	1	1	0.1481	0.5188	0.3331
chr9	76709219	A	ATGACTGTTGCAG	0.500000	0.050	1	12	1	717	165	552	143	0	13	0	9	0	0	552	0	0	0.8667	0.0000	0.0000	11.692	0.27	9.67	-9.40	45	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0770	0.9230	0.0000	0	0	0.5209	0.4791	0.0000
chr9	77384631	G	GTGA	0.500000	0.050	1	3	1	527	192	335	92	4	29	0	67	0	0	330	0	5	0.4792	0.0000	0.0149	5.621	0.14	2.94	-2.80	70	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5416	0.4075	0.0509	1	0	0.5324	0.4128	0.0548	1	0	0.5199	0.4198	0.0603
chr9	86322936	ATTT	A	0.500000	0.050	1	-3	2	528	134	394	65	0	2	0	67	0	0	391	0	3	0.4851	0.0000	0.0076	66.000	0.18	3.07	-2.89	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1767	0.5336	0.2897	1	1	0.1798	0.5311	0.2892	1	1	0.1838	0.5279	0.2883
chr9	87919269	C	CCAGCGTCATCTTGTCTCT	0.500000	0.050	1	18	3	350	125	225	21	1	5	2	96	0	0	225	0	0	0.1680	0.0000	0.0000	23.800	0.19	7.83	-7.64	3	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0001	0.7860	0.2139	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9962	0.0038
chr9	88647428	A	ATGG	0.500000	0.050	1	3	1	223	71	152	0	0	1	1	69	0	0	149	0	3	0.0000	0.0000	0.0197	70.000		3.80		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1374	0.8626	2	2	0.0000	0.1418	0.8582	2	2	0.0000	0.1481	0.8519
chr9	92474742	C	CTCATCA	0.500000	0.050	1	6	2	362	92	270	40	0	24	1	27	0	0	267	1	2	0.4348	0.0000	0.0111	2.833	0.93	8.15	-7.22	4	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.3613	0.4956	0.1431	1	1	0.3574	0.4959	0.1467	1	1	0.3523	0.4963	0.1515
chr9	92474742	C	CTCATCATCA	0.500000	0.050	1	9	2	362	92	270	40	1	23	1	27	0	0	267	1	2	0.4348	0.0000	0.0111	3.000	0.93	8.15	-7.22	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3757	0.4901	0.1342	1	1	0.3712	0.4908	0.1380	1	1	0.3653	0.4916	0.1431
chr9	93676722	C	CCCTGCCTCCACCACA	0.500000	0.050	1	15	4	505	179	326	2	0	1	0	176	0	0	325	0	1	0.0112	0.0000	0.0031	178.000	3.00	8.27	-5.27	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2335	0.7665	2	2	0.0000	0.0461	0.9539	2	2	0.0000	0.0293	0.9707
chr9	94318662	GAGA	G	0.500000	0.050	1	-3	2	696	264	432	157	10	3	0	94	1	1	429	0	1	0.5947	0.0023	0.0069	87.000	2.73	3.43	-0.69	37	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9317	0.0676	0.0006	1	0	0.9238	0.0753	0.0008	1	0	0.9121	0.0867	0.0012
chr9	96383603	C	CCCTCGG	0.500000	0.050	1	6	1	205	60	145	28	0	11	0	21	0	0	144	0	1	0.4667	0.0000	0.0069	4.455	0.46	6.05	-5.58	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3192	0.5044	0.1764	1	1	0.3168	0.5041	0.1791	1	1	0.3136	0.5037	0.1827
chr9	97330686	A	AGAGGAG	0.500000	0.050	1	6	2	409	102	307	0	0	20	3	79	0	0	307	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	4.100		5.66		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1137	0.8863	2	2	0.0000	0.1179	0.8821	2	2	0.0000	0.1238	0.8762
chr9	97854418	AGCCGCC	A	0.500000	0.050	1	-6	1	930	137	793	0	1	37	2	97	0	2	776	2	13	0.0000	0.0000	0.0214	2.676		6.37		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0978	0.9022	2	2	0.0000	0.0921	0.9079	2	2	0.0000	0.0897	0.9103
chr9	104598487	GT	G	0.500000	0.050	1	-1	2	515	124	391	4	0	1	0	119	0	0	391	0	0	0.0323	0.0000	0.0000	123.000	0.00	2.99	-2.99	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9713	0.0287	2	2	0.0000	0.4340	0.5660	2	2	0.0000	0.2032	0.7968
chr9	104605111	TGTTA	T	0.500000	0.050	1	-4	1	945	212	733	100	0	1	0	111	0	0	730	0	3	0.4717	0.0000	0.0041	211.000	0.93	4.71	-3.78	10	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0982	0.5097	0.3921	1	1	0.1027	0.5087	0.3886	1	1	0.1088	0.5075	0.3837
chr9	104605383	AGC	A	0.500000	0.050	1	-2	1	878	213	665	6	0	2	4	201	0	0	662	0	3	0.0282	0.0000	0.0045	104.000	0.17	2.88	-2.71	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9897	0.0103	2	2	0.0000	0.2471	0.7529	2	2	0.0000	0.0602	0.9398
chr9	110138061	G	GGAAGCT	0.500000	0.050	1	6	1	724	133	591	117	0	14	0	2	1	1	589	0	0	0.8797	0.0017	0.0034	8.500	0.23	6.00	-5.77	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4327	0.5673	0.0000	0	0	0.8319	0.1681	0.0000	0	0	0.8918	0.1082	0.0000
chr9	112453942	GATTA	G	0.500000	0.050	1	-4	1	299	108	191	0	0	2	0	106	0	0	188	0	3	0.0000	0.0000	0.0157	53.000		4.16		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0605	0.9395	2	2	0.0000	0.0637	0.9363	2	2	0.0000	0.0683	0.9317
chr9	120714264	ACGGCGG	A	0.500000	0.050	1	-6	1	424	95	329	0	0	22	0	73	0	0	329	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	3.318		6.22		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1377	0.8623	2	2	0.0000	0.1421	0.8579	2	2	0.0000	0.1483	0.8517
chr9	122093051	G	GTGGCCT	0.500000	0.050	1	6	1	686	150	536	64	0	3	0	83	0	0	532	0	4	0.4267	0.0000	0.0075	49.000	0.53	5.70	-5.17	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0549	0.4116	0.5335	1	2	0.0589	0.4168	0.5243	1	2	0.0645	0.4236	0.5119
chr9	122629491	C	CA	0.500000	0.050	1	1	1	586	125	461	64	0	11	0	50	0	0	461	0	0	0.5120	0.0000	0.0000	10.364	0.23	1.26	-1.03	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4164	0.4792	0.1044	1	1	0.4109	0.4805	0.1086	1	1	0.4034	0.4822	0.1144
chr9	128258516	GCCT	G	0.500000	0.050	1	-3	2	614	208	406	0	2	25	93	88	0	0	403	2	1	0.0000	0.0000	0.0074	7.458		3.98		0	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0125	0.9875	2	2	0.0000	0.0133	0.9867	2	2	0.0000	0.0146	0.9854
chr9	128258516	GCCTCCT	G	0.500000	0.050	1	-6	2	615	210	405	2	5	98	9	96	0	0	402	0	3	0.0095	0.0000	0.0074	1.112	2.50	5.91	-3.41	0	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9458	0.0542	2	1	0.0000	0.5622	0.4378	2	2	0.0000	0.3400	0.6600
chr9	129868385	TGAC	T	0.500000	0.050	1	-3	2	568	191	377	94	0	7	0	90	0	0	375	1	1	0.4921	0.0000	0.0053	30.667	0.37	3.32	-2.95	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2415	0.5556	0.2028	1	1	0.2430	0.5515	0.2055	1	1	0.2449	0.5462	0.2089
chr9	130265925	CGGCAGT	C	0.500000	0.050	1	-6	1	370	112	258	1	0	11	0	100	0	0	248	0	10	0.0089	0.0000	0.0388	9.182	0.00	7.12	-7.12	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2430	0.7570	2	2	0.0000	0.1145	0.8855	2	2	0.0000	0.0940	0.9060
chr9	130668313	G	GGT	0.500000	0.050	1	2	1	350	121	229	91	6	16	0	8	0	0	229	0	0	0.7521	0.0000	0.0000	6.562	0.27	2.00	-1.73	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0498	0.9502	0.0000	0	1	0.3429	0.6571	0.0000
chr9	130681605	T	TCGC	0.500000	0.050	1	3	1	428	119	309	7	1	39	4	68	1	0	303	0	5	0.0588	0.0032	0.0194	2.051	0.57	3.65	-3.08	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9804	0.0196	2	1	0.0000	0.8062	0.1938
chr9	133255669	CG	C	0.500000	0.050	1	-1	1	497	159	338	150	0	3	0	6	0	0	338	0	0	0.9434	0.0000	0.0000	52.000	1.18	1.83	-0.65	108	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0026	0.9974	0.0000	0	1	0.4260	0.5740	0.0000	0	0	0.7972	0.2028	0.0000
chr9	133257521	T	TC	0.500000	0.050	1	1	4	291	103	188	2	0	0	0	101	0	0	184	0	4	0.0194	0.0000	0.0213	103.000	1.50	1.92	-0.42	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.6492	0.3508	2	2	0.0000	0.2219	0.7781	2	2	0.0000	0.1451	0.8549
chr9	133257521	T	TC	0.500000	0.050	1	1	4	291	103	188	2	0	0	0	101	0	0	184	0	4	0.0194	0.0000	0.0213	103.000	1.50	1.92	-0.42	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.6492	0.3508	2	2	0.0000	0.2219	0.7781	2	2	0.0000	0.1451	0.8549
chr9	135549839	G	GC	0.500000	0.050	1	1	1	268	107	161	102	0	1	0	4	0	0	161	0	0	0.9533	0.0000	0.0000	106.000	0.19	1.25	-1.06	34	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0204	0.9796	0.0000	0	1	0.4643	0.5357	0.0000	0	0	0.7236	0.2764	0.0000
chr9	136341024	TC	T	0.500000	0.050	1	-1	1	255	78	177	35	0	6	0	37	0	0	177	0	0	0.4487	0.0000	0.0000	12.000	1.43	1.92	-0.49	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2160	0.5207	0.2632	1	1	0.2176	0.5192	0.2632	1	1	0.2197	0.5172	0.2631
chr9	137192572	TTCC	T	0.500000	0.050	1	-3	1	702	206	496	88	2	26	7	83	0	0	496	0	0	0.4272	0.0000	0.0000	6.923	0.41	3.31	-2.90	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2217	0.5547	0.2236	1	1	0.2238	0.5506	0.2257	1	1	0.2264	0.5454	0.2282
chr9	138023718	TGGAGAAGGAGACCAC	T	0.500000	0.050	1	-15	1	395	111	284	0	0	13	0	98	0	0	270	0	14	0.0000	0.0000	0.0493	7.538		13.05		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0563	0.9437	2	2	0.0000	0.0594	0.9406	2	2	0.0000	0.0639	0.9361
chr10	5748003	CCTGCCTCAG	C	0.046274	0.050	1	-9	1	900	201	699	106	1	12	0	82	0	0	690	0	9	0.5274	0.0000	0.0129	15.750	0.60	8.41	-7.81	0	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6190	0.3748	0.0062	1	0	0.6159	0.3775	0.0065	1	0	0.6116	0.3814	0.0070
chr10	7563115	T	TC	0.013494	0.050	1	1	1	388	118	270	115	0	0	0	3	0	0	270	0	0	0.9746	0.0000	0.0000	118.000	0.68	1.33	-0.66	63	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9098	0.0902	0.0000	0	0	0.9941	0.0059	0.0000	0	0	0.9974	0.0026	0.0000
chr10	13439173	CAG	C	0.004149	0.050	1	-2	3	309	77	232	37	0	4	0	36	0	0	229	0	3	0.4805	0.0000	0.0129	18.250	0.30	2.08	-1.79	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4502	0.5476	0.0023	1	1	0.4528	0.5449	0.0023	1	1	0.4563	0.5415	0.0023
chr10	21146411	ACACT	A	0.189476	0.050	1	-4	3	228	76	152	41	0	2	1	32	0	0	152	0	0	0.5395	0.0000	0.0000	37.000	0.24	4.12	-3.88	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4962	0.4512	0.0526	1	0	0.4936	0.4525	0.0539	1	0	0.4899	0.4544	0.0557
chr10	21516537	C	CCCTCCT	0.481720	0.050	1	6	6	974	228	746	86	1	25	3	113	1	0	739	0	6	0.3772	0.0013	0.0094	8.080	0.70	8.06	-7.36	20	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0237	0.3220	0.6543	1	2	0.0265	0.3310	0.6424	1	2	0.0307	0.3432	0.6261
chr10	21516554	C	CTCT	0.000302	0.050	1	3	2	965	236	729	97	9	11	97	22	1	0	727	0	1	0.4110	0.0014	0.0027	29.286	0.62	4.68	-4.06	15	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.4604	0.5395	0.0001	1	1	0.4642	0.5357	0.0001	1	1	0.4688	0.5311	0.0001
chr10	22209555	C	CAGA	0.259534	0.050	1	3	1	745	151	594	80	0	1	1	69	0	0	594	0	0	0.5298	0.0000	0.0000	150.000	0.24	3.87	-3.63	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.4725	0.4662	0.0613	1	0	0.4702	0.4664	0.0634	1	0	0.4669	0.4669	0.0662
chr10	27147532	TGC	T	0.011654	0.050	1	-2	1	278	104	174	101	0	0	0	3	0	0	174	0	0	0.9712	0.0000	0.0000	104.000	0.21	2.00	-1.79	9	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.8895	0.1105	0.0000	0	0	0.9928	0.0072	0.0000	0	0	0.9968	0.0032	0.0000
chr10	27413327	G	GC	0.340501	0.050	1	1	1	554	135	419	124	0	7	0	4	0	0	419	0	0	0.9185	0.0000	0.0000	18.286	0.69	1.00	-0.31	24	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0663	0.9337	0.0000	0	0	0.7432	0.2568	0.0000	0	0	0.8958	0.1042	0.0000
chr10	38055722	CCTT	C	0.000003	0.050	1	-3	4	1031	210	821	193	2	8	0	7	2	1	818	0	0	0.9190	0.0024	0.0037	25.250	1.36	4.14	-2.79	43	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9981	0.0019	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr10	44292818	AC	A	0.006843	0.050	1	-1	1	443	169	274	69	1	16	0	83	0	0	271	0	3	0.4083	0.0000	0.0109	9.562	0.30	1.72	-1.42	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2673	0.7236	0.0091	1	1	0.2763	0.7148	0.0088	1	1	0.2882	0.7033	0.0085
chr10	62217153	TAGCTTC	T	0.152769	0.050	1	-6	3	136	62	74	5	0	3	0	54	0	0	74	0	0	0.0806	0.0000	0.0000	19.667	0.00	6.65	-6.65	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9998	0.0002	2	1	0.0000	0.9764	0.0236	2	1	0.0000	0.9069	0.0931
chr10	63214835	TTCA	T	0.005181	0.050	1	-3	1	823	158	665	89	0	1	1	67	0	0	665	0	0	0.5633	0.0000	0.0000	157.000	0.38	3.00	-2.62	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6984	0.3011	0.0005	1	0	0.6930	0.3065	0.0005	1	0	0.6856	0.3138	0.0005
chr10	73130825	G	GC	0.008232	0.050	1	1	1	231	104	127	51	0	7	1	45	0	0	127	0	0	0.4904	0.0000	0.0000	13.857	0.20	1.31	-1.12	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5307	0.4666	0.0026	1	0	0.5305	0.4668	0.0027	1	0	0.5300	0.4672	0.0028
chr10	75022147	GGAA	G	0.161983	0.050	1	-3	1	441	110	331	0	0	30	2	78	0	0	331	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	2.667		3.10		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.4087	0.5913	2	2	0.0000	0.4184	0.5816	2	2	0.0000	0.4319	0.5681
chr10	75028901	G	GGAAGAGGAA	0.002182	0.050	1	9	1	717	122	595	42	0	43	0	37	0	0	595	0	0	0.3443	0.0000	0.0000	1.837	0.40	6.49	-6.08	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5367	0.4626	0.0007	1	0	0.5361	0.4632	0.0007	1	0	0.5353	0.4640	0.0007
chr10	75401342	GCCGCCT	G	0.008076	0.050	1	-6	2	517	188	329	102	2	12	0	72	0	0	327	0	2	0.5426	0.0000	0.0061	14.583	0.44	5.06	-4.61	36	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7759	0.2238	0.0003	1	0	0.7688	0.2308	0.0004	1	0	0.7591	0.2405	0.0004
chr10	80081665	C	CA	0.104724	0.050	1	1	1	248	43	205	18	2	2	1	20	0	0	205	0	0	0.4186	0.0000	0.0000	19.500	0.44	1.25	-0.81	10	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4209	0.5237	0.0554	1	1	0.4223	0.5223	0.0553	1	1	0.4241	0.5206	0.0552
chr10	80144341	G	GAGA	0.037415	0.050	1	3	2	257	80	177	45	0	3	0	32	0	0	176	0	1	0.5625	0.0000	0.0056	25.667	0.42	4.47	-4.05	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6085	0.3842	0.0072	1	0	0.6047	0.3878	0.0075	1	0	0.5995	0.3926	0.0079
chr10	89738145	C	CTAAAAG	0.255522	0.050	1	6	1	740	179	561	105	0	8	0	66	0	0	552	0	9	0.5866	0.0000	0.0160	21.375	0.40	6.05	-5.65	31	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7156	0.2718	0.0126	1	0	0.7066	0.2794	0.0140	1	0	0.6942	0.2898	0.0160
chr10	97572621	TGGC	T	0.015823	0.050	1	-3	3	595	186	409	101	0	1	0	84	0	0	401	0	8	0.5430	0.0000	0.0196	185.000	0.14	3.14	-3.00	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.5462	0.4502	0.0036	1	0	0.5463	0.4500	0.0037	1	0	0.5461	0.4500	0.0039
chr10	101010536	T	TGCTGCG	0.446080	0.050	1	6	1	690	224	466	112	0	44	0	68	0	0	461	0	5	0.5000	0.0000	0.0107	4.091	1.72	6.59	-4.87	30	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7380	0.2488	0.0132	1	0	0.7260	0.2589	0.0150	1	0	0.7095	0.2727	0.0178
chr10	103350983	A	AGGAGGC	0.474578	0.050	1	6	1	366	85	281	44	0	12	0	29	0	0	276	0	5	0.5176	0.0000	0.0178	6.083	0.80	5.52	-4.72	22	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3827	0.4887	0.1286	1	1	0.3786	0.4892	0.1322	1	1	0.3731	0.4899	0.1369
chr10	103473417	T	TGGGGGCTCAGGCACTGCG	0.015096	0.050	1	18	1	485	138	347	5	0	30	0	103	0	0	315	0	32	0.0362	0.0000	0.0922	3.600	0.60	12.65	-12.05	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9851	0.0149	2	1	0.0000	0.9427	0.0573
chr10	113679881	CTT	C	0.228152	0.050	1	-2	1	388	139	249	69	0	0	0	70	0	0	248	0	1	0.4964	0.0000	0.0040	139.000	0.65	2.71	-2.06	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3271	0.5551	0.1178	1	1	0.3304	0.5514	0.1181	1	1	0.3347	0.5468	0.1185
chr10	115171343	CTT	C	0.004437	0.050	1	-2	1	278	70	208	59	0	4	0	7	0	0	208	0	0	0.8429	0.0000	0.0000	16.500	0.08	2.00	-1.92	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0107	0.9893	0.0000	0	0	0.8997	0.1003	0.0000	0	0	0.9856	0.0144	0.0000
chr10	119030300	C	CCCG	0.001394	0.050	1	3	1	526	136	390	59	0	26	4	47	0	0	387	0	3	0.4338	0.0000	0.0077	4.192	1.32	6.04	-4.72	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5331	0.4664	0.0004	1	0	0.5331	0.4665	0.0004	1	0	0.5329	0.4667	0.0005
chr10	124021236	CG	C	0.538577	0.050	1	-1	1	411	113	298	3	51	12	14	33	0	0	298	0	0	0.0265	0.0000	0.0000	3.600	0.33	2.18	-1.85	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1841	0.5156	0.3003	1	1	0.1861	0.5143	0.2996	1	1	0.1887	0.5127	0.2986
chr10	132329982	G	GC	0.500000	0.050	1	1	1	376	100	276	43	0	5	0	52	0	0	275	0	1	0.4300	0.0000	0.0036	19.000	0.42	1.40	-0.99	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1356	0.4999	0.3644	1	1	0.1394	0.4999	0.3607	1	1	0.1445	0.4998	0.3557
chr11	608502	CGGACGCGCTCTG	C	0.049275	0.050	1	-12	1	699	165	534	146	1	16	0	2	0	0	534	0	0	0.8848	0.0000	0.0000	9.312	0.24	6.00	-5.76	8	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9674	0.0326	0.0000	0	0	0.9948	0.0052	0.0000	0	0	0.9968	0.0032	0.0000
chr11	637361	CGCGGGGGCATCT	C	0.071834	0.050	1	-12	2	303	107	196	48	0	13	0	46	0	1	190	0	5	0.4486	0.0000	0.0306	7.231	0.35	11.17	-10.82	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4099	0.5514	0.0387	1	1	0.4130	0.5483	0.0387	1	1	0.4169	0.5444	0.0387
chr11	1051776	TCCCCTGGCACCTGGGAAGCTGGGC	T	0.500000	0.050	1	-24	1	431	162	269	158	0	2	0	2	0	0	268	0	1	0.9753	0.0000	0.0037	80.000	0.62	14.00	-13.38	24	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2867	0.7133	0.0000	0	0	0.8693	0.1307	0.0000	0	0	0.9354	0.0646	0.0000
chr11	1188258	GACCAGCACAACCTCTGCTCCTACA	G	0.001194	0.050	1	-24	1	3114	766	2348	315	9	160	7	275	7	2	2292	3	44	0.4112	0.0030	0.0239	3.847	1.93	12.98	-11.05	93	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3312	0.6684	0.0003	1	1	0.3439	0.6557	0.0003	1	1	0.3601	0.6395	0.0004
chr11	1190500	CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA	C	0.141961	0.050	1	-24	1	3365	804	2561	350	12	246	4	192	10	3	2543	1	4	0.4353	0.0039	0.0070	2.262	3.01	13.34	-10.34	52	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9996	0.0004	0.0000	1	0	0.9994	0.0006	0.0000	1	0	0.9992	0.0008	0.0000
chr11	1597942	ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG	A	0.542785	0.050	1	-30	2	1124	234	890	89	1	90	2	52	0	0	890	0	0	0.3803	0.0000	0.0000	1.589	0.64	8.17	-7.53	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6802	0.2971	0.0227	1	0	0.6666	0.3079	0.0255	1	0	0.6481	0.3222	0.0297
chr11	1630355	CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA	C	0.088777	0.050	1	-30	1	1118	234	884	30	2	84	3	115	0	0	835	0	49	0.1282	0.0000	0.0554	1.795	2.57	17.20	-14.63	6	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr11	1630383	TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC	T	0.592794	0.050	1	-30	2	1055	270	785	16	0	99	4	151	0	0	784	1	0	0.0593	0.0000	0.0013	1.745	0.56	12.33	-11.77	10	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9985	0.0015	2	1	0.0000	0.8646	0.1354
chr11	3640355	A	ATGG	0.500000	0.050	1	3	2	416	123	293	0	0	3	0	120	0	0	291	0	2	0.0000	0.0000	0.0068	40.000		3.25		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0444	0.9556	2	2	0.0000	0.0470	0.9530	2	2	0.0000	0.0510	0.9490
chr11	4571476	T	TAC	0.500000	0.050	1	2	1	224	93	131	52	0	2	0	39	0	0	131	0	0	0.5591	0.0000	0.0000	45.500	0.12	2.36	-2.24	26	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4078	0.4794	0.1128	1	1	0.4024	0.4807	0.1169	1	1	0.3950	0.4825	0.1225
chr11	4587333	TGAGTATG	T	0.500000	0.050	1	-7	2	1398	331	1067	320	0	4	0	7	0	0	1066	0	1	0.9668	0.0000	0.0009	81.750	0.66	6.14	-5.48	94	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0066	0.9934	0.0000	0	0	0.9275	0.0725	0.0000	0	0	0.9910	0.0090	0.0000
chr11	4769643	CG	C	0.500000	0.050	1	-1	1	679	156	523	79	1	1	0	75	0	0	523	0	0	0.5064	0.0000	0.0000	155.000	0.16	4.31	-4.14	5	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2859	0.5397	0.1744	1	1	0.2857	0.5367	0.1776	1	1	0.2852	0.5329	0.1818
chr11	5070346	A	AC	0.500000	0.050	1	1	1	725	186	539	103	0	5	0	78	0	0	539	0	0	0.5538	0.0000	0.0000	36.200	0.35	1.18	-0.83	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5526	0.4007	0.0467	1	0	0.5433	0.4063	0.0505	1	0	0.5305	0.4136	0.0559
chr11	5178110	A	AATGCCC	0.500000	0.050	1	6	1	918	228	690	0	0	2	0	226	0	0	681	0	9	0.0000	0.0000	0.0130	113.000		5.81		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0027	0.9973	2	2	0.0000	0.0030	0.9970	2	2	0.0000	0.0036	0.9964
chr11	5178587	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	2	661	172	489	0	0	5	0	167	0	0	489	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	33.400		1.66		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0147	0.9853	2	2	0.0000	0.0160	0.9840	2	2	0.0000	0.0179	0.9821
chr11	6546665	C	CTGCCCTACTGCA	0.500000	0.050	1	12	2	832	167	665	0	0	15	0	152	0	0	638	1	26	0.0000	0.0000	0.0406	10.133		9.46		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0109	0.9891	2	2	0.0000	0.0120	0.9880	2	2	0.0000	0.0135	0.9865
chr11	6641514	CCAG	C	0.500000	0.050	1	-3	5	683	164	519	131	2	16	1	14	0	0	519	0	0	0.7988	0.0000	0.0000	9.250	1.06	3.50	-2.44	35	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0012	0.9988	0.0000	0	1	0.0847	0.9153	0.0000
chr11	9091461	GGCA	G	0.500000	0.050	1	-3	1	274	137	137	0	0	22	4	111	0	0	137	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	5.182		3.91		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0526	0.9474	2	2	0.0000	0.0556	0.9444	2	2	0.0000	0.0599	0.9401
chr11	12294797	G	GCTCCTCCTC	0.500000	0.050	1	9	1	651	153	498	65	1	51	1	35	0	0	486	0	12	0.4248	0.0000	0.0241	2.000	1.43	9.46	-8.03	15	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.4758	0.4453	0.0789	1	0	0.4681	0.4488	0.0832	1	0	0.4577	0.4532	0.0891
chr11	12294797	G	GCTCCTCCTCCTC	0.500000	0.050	1	12	1	651	153	498	65	1	51	1	35	0	0	486	0	12	0.4248	0.0000	0.0241	2.000	1.43	9.46	-8.03	15	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4758	0.4453	0.0789	1	0	0.4681	0.4488	0.0832	1	0	0.4577	0.4532	0.0891
chr11	17330930	TACA	T	0.500000	0.050	1	-3	2	210	75	135	72	0	1	0	2	0	0	135	0	0	0.9600	0.0000	0.0000	74.000	0.19	3.00	-2.81	46	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1896	0.8104	0.0000	0	0	0.6082	0.3918	0.0000	0	0	0.7276	0.2724	0.0000
chr11	20159199	TAAG	T	0.500000	0.050	1	-3	3	206	99	107	93	0	1	0	5	0	0	107	0	0	0.9394	0.0000	0.0000	98.000	0.24	5.20	-4.96	35	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0030	0.9970	0.0000	0	1	0.2601	0.7399	0.0000	0	0	0.5918	0.4082	0.0000
chr11	48264429	CCTT	C	0.500000	0.050	1	-3	1	883	250	633	121	0	11	1	117	0	0	627	0	6	0.4840	0.0000	0.0095	21.727	0.21	3.73	-3.52	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1827	0.5716	0.2457	1	1	0.1862	0.5663	0.2476	1	1	0.1907	0.5595	0.2498
chr11	49208393	TGAA	T	0.500000	0.050	1	-3	1	246	106	140	66	0	3	0	37	0	0	140	0	0	0.6226	0.0000	0.0000	34.333	0.14	3.27	-3.13	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6259	0.3385	0.0356	1	0	0.6137	0.3474	0.0390	1	0	0.5970	0.3591	0.0438
chr11	55839334	TATCTC	T	0.500000	0.050	1	-5	2	771	165	606	82	2	1	0	80	1	0	605	0	0	0.4970	0.0017	0.0017	164.000	0.22	4.62	-4.41	24	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2840	0.5427	0.1733	1	1	0.2839	0.5395	0.1766	1	1	0.2836	0.5355	0.1809
chr11	55968178	GA	G	0.500000	0.050	1	-1	2	720	176	544	168	0	5	0	3	0	0	544	0	0	0.9545	0.0000	0.0000	34.200	0.26	2.33	-2.07	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3561	0.6439	0.0000	0	0	0.8957	0.1043	0.0000	0	0	0.9486	0.0514	0.0000
chr11	56093801	GT	G	0.500000	0.050	1	-1	1	925	235	690	224	1	5	0	5	0	0	690	0	0	0.9532	0.0000	0.0000	46.000	0.19	2.00	-1.81	50	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0798	0.9202	0.0000	0	0	0.9018	0.0982	0.0000	0	0	0.9717	0.0283	0.0000
chr11	56093830	CA	C	0.500000	0.050	1	-1	1	916	237	679	221	6	5	0	5	0	0	679	0	0	0.9325	0.0000	0.0000	45.400	0.17	2.00	-1.83	45	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0795	0.9205	0.0000	0	0	0.9041	0.0959	0.0000	0	0	0.9725	0.0275	0.0000
chr11	56413160	A	ACT	0.500000	0.050	1	2	4	898	190	708	2	0	1	1	186	0	0	699	1	8	0.0105	0.0000	0.0127	189.000	0.00	2.92	-2.92	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1586	0.8414	2	2	0.0000	0.0294	0.9706	2	2	0.0000	0.0188	0.9812
chr11	60397879	ATT	A	0.500000	0.050	1	-2	1	84	45	39	24	0	0	0	21	0	0	39	0	0	0.5333	0.0000	0.0000	45.000	0.21	2.14	-1.93	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2805	0.5110	0.2085	1	1	0.2796	0.5102	0.2102	1	1	0.2784	0.5091	0.2125
chr11	71538079	A	AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG	0.500000	0.050	1	21	2	968	157	811	2	0	31	1	123	0	0	748	0	63	0.0127	0.0000	0.0777	4.065	3.50	6.67	-3.17	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1915	0.8085	2	2	0.0000	0.0364	0.9636	2	2	0.0000	0.0232	0.9768
chr11	71538486	C	CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG	0.500000	0.050	1	57	2	1179	233	946	8	1	109	4	111	0	0	883	2	61	0.0343	0.0000	0.0666	1.130	1.50	10.45	-8.95	8	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.8160	0.1840	2	2	0.0000	0.2787	0.7213
chr11	71582738	TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC	T	0.500000	0.050	1	-42	1	1004	299	705	154	0	80	0	65	0	0	686	0	19	0.5151	0.0000	0.0270	2.737	0.38	12.43	-12.05	42	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9200	0.0791	0.0009	1	0	0.9113	0.0875	0.0012	1	0	0.8984	0.0999	0.0017
chr11	72139110	CTA	C	0.500000	0.050	1	-2	1	926	240	686	5	0	5	2	228	0	0	685	0	1	0.0208	0.0000	0.0015	47.000	0.00	2.32	-2.32	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9126	0.0874	2	2	0.0000	0.0864	0.9136	2	2	0.0000	0.0246	0.9754
chr11	73309330	G	GCTC	0.500000	0.050	1	3	1	814	175	639	81	1	16	2	75	0	1	637	0	1	0.4629	0.0000	0.0031	9.938	0.44	4.04	-3.60	11	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2853	0.5413	0.1733	1	1	0.2852	0.5382	0.1766	1	1	0.2848	0.5343	0.1809
chr11	73660839	A	AGGTAAGTCT	0.500000	0.050	1	9	2	216	90	126	87	0	1	0	2	0	0	126	0	0	0.9667	0.0000	0.0000	89.000	0.15	17.50	-17.35	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2543	0.7457	0.0000	0	0	0.6921	0.3079	0.0000	0	0	0.7928	0.2072	0.0000
chr11	73660841	C	CT	0.500000	0.050	1	1	2	217	85	132	82	0	1	1	1	0	0	132	0	0	0.9647	0.0000	0.0000	83.000	0.16	12.00	-11.84	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.5784	0.4216	0.0000	0	0	0.7773	0.2227	0.0000	0	0	0.8182	0.1818	0.0000
chr11	77184725	GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT	G	0.500000	0.050	1	-22	2	260	73	187	0	0	1	0	72	0	0	184	0	3	0.0000	0.0000	0.0160	72.000		16.61		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1316	0.8684	2	2	0.0000	0.1359	0.8641	2	2	0.0000	0.1421	0.8579
chr11	89490963	T	TCTC	0.500000	0.050	1	3	1	536	128	408	120	0	5	0	3	0	0	408	0	0	0.9375	0.0000	0.0000	24.600	0.91	4.33	-3.42	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1327	0.8673	0.0000	0	0	0.7223	0.2777	0.0000	0	0	0.8534	0.1466	0.0000
chr11	96092210	TTGCTGCTGC	T	0.500000	0.050	1	-9	1	1343	356	987	280	4	60	2	10	0	0	987	0	0	0.7865	0.0000	0.0000	4.917	0.83	6.20	-5.37	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2788	0.7212	0.0000	0	0	0.9134	0.0866	0.0000
chr11	101962856	AGCT	A	0.500000	0.050	1	-3	1	855	178	677	173	1	1	0	3	0	0	677	0	0	0.9719	0.0000	0.0000	177.000	1.06	3.67	-2.61	37	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3731	0.6269	0.0000	0	0	0.9078	0.0922	0.0000	0	0	0.9550	0.0450	0.0000
chr11	117797169	CCGCACT	C	0.500000	0.050	1	-6	3	282	125	157	118	0	3	0	4	0	0	157	0	0	0.9440	0.0000	0.0000	40.667	0.29	6.00	-5.71	36	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0276	0.9724	0.0000	0	0	0.5594	0.4406	0.0000	0	0	0.7928	0.2072	0.0000
chr11	117918597	CGGGCTGGAGATGCCT	C	0.500000	0.050	1	-15	3	862	277	585	0	0	45	1	231	0	0	584	1	0	0.0000	0.0000	0.0017	5.273		9.22		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0029	0.9971	2	2	0.0000	0.0032	0.9968	2	2	0.0000	0.0038	0.9962
chr11	118535613	CAGTGTGGA	C	0.500000	0.050	1	-8	2	315	124	191	115	0	5	0	4	0	0	191	0	0	0.9274	0.0000	0.0000	23.800	0.23	8.00	-7.77	53	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0257	0.9743	0.0000	0	0	0.5411	0.4589	0.0000	0	0	0.7808	0.2192	0.0000
chr11	124543152	CAGA	C	0.500000	0.050	1	-3	1	698	137	561	130	0	4	0	3	1	1	559	0	0	0.9489	0.0018	0.0036	33.250	0.40	4.67	-4.27	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1714	0.8286	0.0000	0	0	0.7776	0.2224	0.0000	0	0	0.8858	0.1142	0.0000
chr11	124880551	CCGGAGT	C	0.500000	0.050	1	-6	1	391	126	265	0	0	14	2	110	0	0	265	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	7.929		5.68		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0565	0.9435	2	2	0.0000	0.0596	0.9404	2	2	0.0000	0.0641	0.9359
chr11	130121757	TGAAGAG	T	0.500000	0.050	1	-6	1	252	79	173	42	0	13	0	24	0	0	173	0	0	0.5316	0.0000	0.0000	5.077	0.29	5.50	-5.21	24	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4857	0.4324	0.0819	1	0	0.4770	0.4368	0.0862	1	0	0.4655	0.4425	0.0920
chr11	130901818	A	AG	0.500000	0.050	1	1	1	96	47	49	24	0	3	0	20	0	0	49	0	0	0.5106	0.0000	0.0000	22.000	1.92	1.95	-0.03	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2885	0.5095	0.2020	1	1	0.2873	0.5088	0.2039	1	1	0.2857	0.5079	0.2064
chr12	865189	T	TC	0.592141	0.050	1	1	1	339	117	222	113	0	2	0	2	0	0	222	0	0	0.9658	0.0000	0.0000	57.500	1.28	2.00	-0.72	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3153	0.6847	0.0000	0	0	0.7473	0.2527	0.0000	0	0	0.8316	0.1684	0.0000
chr12	1953157	T	TTGC	0.435834	0.050	1	3	1	522	148	374	12	0	33	2	101	0	0	369	0	5	0.0811	0.0000	0.0134	3.485	0.33	3.13	-2.80	8	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9963	0.0037	2	1	0.0000	0.8936	0.1064
chr12	6667903	TTGC	T	0.555955	0.050	1	-3	1	423	126	297	0	0	35	8	83	0	0	297	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	2.600		3.10		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0749	0.9251	2	2	0.0000	0.0781	0.9219	2	2	0.0000	0.0828	0.9172
chr12	6778354	G	GGAGCCC	0.001563	0.050	1	6	2	472	193	279	156	0	30	0	7	0	0	279	0	0	0.8083	0.0000	0.0000	5.433	0.38	5.57	-5.19	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2607	0.7393	0.0000	0	0	0.9964	0.0036	0.0000	0	0	0.9995	0.0005	0.0000
chr12	8222185	C	CACG	0.676520	0.050	1	3	1	2437	585	1852	316	0	3	0	266	0	0	1840	0	12	0.5402	0.0000	0.0065	194.000	1.21	4.09	-2.88	24	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4939	0.4820	0.0241	1	0	0.4879	0.4846	0.0275	1	1	0.4789	0.4884	0.0327
chr12	9733111	A	ATAAGT	0.503415	0.050	1	5	1	269	98	171	50	0	5	0	43	0	0	168	0	3	0.5102	0.0000	0.0175	18.600	0.14	4.81	-4.67	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2824	0.5248	0.1928	1	1	0.2818	0.5229	0.1953	1	1	0.2808	0.5206	0.1986
chr12	10723069	G	GGGT	0.002430	0.050	1	3	1	279	99	180	74	7	15	0	3	0	0	180	0	0	0.7475	0.0000	0.0000	5.600	0.39	2.33	-1.94	22	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9595	0.0405	0.0000	0	0	0.9976	0.0024	0.0000	0	0	0.9989	0.0011	0.0000
chr12	12477731	TGCACGCTGG	T	0.037387	0.050	1	-9	1	703	199	504	86	0	34	0	79	0	0	500	0	4	0.4322	0.0000	0.0079	4.853	0.12	8.33	-8.21	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4695	0.5169	0.0136	1	1	0.4718	0.5144	0.0138	1	1	0.4747	0.5113	0.0141
chr12	14567620	GGCA	G	0.679595	0.050	1	-3	1	335	165	170	147	0	11	0	7	0	0	170	0	0	0.8909	0.0000	0.0000	14.000	0.69	4.86	-4.17	17	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0002	0.9998	0.0000	0	1	0.1417	0.8583	0.0000	0	0	0.5426	0.4574	0.0000
chr12	14823483	CTA	C	0.147675	0.050	1	-2	1	499	112	387	59	0	5	0	48	0	0	387	0	0	0.5268	0.0000	0.0000	21.400	0.69	2.40	-1.70	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5451	0.4231	0.0318	1	0	0.5418	0.4252	0.0330	1	0	0.5373	0.4281	0.0346
chr12	18282464	GCCC	G	0.396371	0.050	1	-3	2	461	114	347	108	0	0	1	5	0	0	347	0	0	0.9474	0.0000	0.0000	113.000	0.36	3.60	-3.24	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0056	0.9944	0.0000	0	1	0.4026	0.5974	0.0000	0	0	0.7381	0.2619	0.0000
chr12	40483097	AAGTGACAGGGACAACTAGACTATCAGCTGG	A	0.146503	0.050	1	-30	1	1639	324	1315	278	6	34	2	4	3	1	1298	11	2	0.8580	0.0023	0.0129	8.471	2.12	12.25	-10.13	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	0	0.6172	0.3828	0.0000	0	0	0.9706	0.0294	0.0000
chr12	40490898	C	CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG	0.517853	0.050	1	30	1	1466	240	1226	4	0	105	1	130	0	1	1143	2	80	0.0167	0.0000	0.0677	1.286	1.75	4.42	-2.67	2	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.8651	0.1349	2	2	0.0000	0.0999	0.9001	2	2	0.0000	0.0322	0.9678
chr12	48203092	C	CA	0.208713	0.050	1	1	1	817	187	630	106	0	2	0	79	0	0	629	0	1	0.5668	0.0000	0.0016	92.500	0.21	1.29	-1.08	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6855	0.3007	0.0138	1	0	0.6778	0.3071	0.0151	1	0	0.6673	0.3158	0.0169
chr12	52073890	TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC	T	0.050697	0.050	1	-23	2	374	122	252	64	0	23	0	35	0	0	250	0	2	0.5246	0.0000	0.0079	4.304	0.45	17.26	-16.80	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7591	0.2381	0.0028	1	0	0.7512	0.2457	0.0031	1	0	0.7404	0.2561	0.0035
chr12	52317956	ACTT	A	0.001740	0.050	1	-3	1	355	85	270	75	2	5	0	3	0	0	270	0	0	0.8824	0.0000	0.0000	15.800	0.23	3.00	-2.77	35	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9674	0.0326	0.0000	0	0	0.9981	0.0019	0.0000	0	0	0.9992	0.0008	0.0000
chr12	52378037	G	GTA	0.000618	0.050	1	2	1	309	85	224	43	0	0	0	42	0	0	223	0	1	0.5059	0.0000	0.0045	85.000	0.26	2.10	-1.84	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4735	0.5262	0.0003	1	1	0.4754	0.5243	0.0003	1	1	0.4779	0.5218	0.0003
chr12	52675438	CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT	C	0.460720	0.050	1	-21	2	1016	249	767	3	0	26	2	218	0	0	766	0	1	0.0120	0.0000	0.0013	8.538	0.33	12.57	-12.24	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.3759	0.6241	2	2	0.0000	0.0359	0.9641	2	2	0.0000	0.0175	0.9825
chr12	52795629	ACCAAAGCCACCAGCCCCT	A	0.048305	0.050	1	-18	2	1171	296	875	120	2	60	0	114	0	0	873	0	2	0.4054	0.0000	0.0023	3.917	0.16	12.26	-12.10	24	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4798	0.5064	0.0137	1	1	0.4823	0.5035	0.0141	1	1	0.4853	0.5001	0.0146
chr12	55129802	AT	A	0.303312	0.050	1	-1	1	338	92	246	49	1	3	0	39	0	0	246	0	0	0.5326	0.0000	0.0000	29.667	0.39	1.54	-1.15	35	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4817	0.4476	0.0707	1	0	0.4775	0.4494	0.0731	1	0	0.4719	0.4518	0.0763
chr12	55320622	C	CA	0.406066	0.050	1	1	2	369	105	264	46	0	1	1	57	0	0	263	0	1	0.4381	0.0000	0.0038	104.000	0.02	1.14	-1.12	32	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1406	0.5118	0.3476	1	1	0.1456	0.5119	0.3425	1	1	0.1523	0.5121	0.3356
chr12	55551800	CTCTT	C	0.005776	0.050	1	-4	2	547	126	421	74	0	4	0	48	0	0	421	0	0	0.5873	0.0000	0.0000	30.500	0.11	4.15	-4.04	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7557	0.2440	0.0003	1	0	0.7485	0.2511	0.0004	1	0	0.7388	0.2608	0.0004
chr12	56686880	CAT	C	0.639374	0.050	1	-2	1	134	64	70	32	0	0	0	32	0	0	70	0	0	0.5000	0.0000	0.0000	64.000	0.97	2.09	-1.12	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1733	0.5195	0.3072	1	1	0.1738	0.5181	0.3081	1	1	0.1745	0.5162	0.3093
chr12	58876497	CTGG	C	0.000469	0.050	1	-3	3	203	95	108	91	0	1	0	3	0	0	108	0	0	0.9579	0.0000	0.0000	94.000	0.25	3.00	-2.75	31	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9937	0.0063	0.0000	0	0	0.9996	0.0004	0.0000	0	0	0.9998	0.0002	0.0000
chr12	64318766	A	AGTT	0.404869	0.050	1	3	2	385	109	276	47	0	2	1	59	0	0	272	0	4	0.4312	0.0000	0.0145	53.500	0.89	3.66	-2.77	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1100	0.4896	0.4005	1	1	0.1152	0.4915	0.3933	1	1	0.1224	0.4940	0.3837
chr12	70353913	TA	T	0.224313	0.050	1	-1	1	315	88	227	3	41	17	17	10	0	0	225	0	2	0.0341	0.0000	0.0088	3.000	1.33	4.10	-2.77	1	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.5345	0.4162	0.0494	1	0	0.5295	0.4194	0.0511	1	0	0.5229	0.4236	0.0535
chr12	76031157	TTGC	T	0.989485	0.050	1	-3	1	1064	296	768	1	0	32	1	262	0	0	765	0	3	0.0034	0.0000	0.0039	8.250	7.00	3.63	3.37	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr12	85029771	CA	C	0.001373	0.050	1	-1	3	352	117	235	68	0	2	0	47	0	0	234	1	0	0.5812	0.0000	0.0043	57.500	0.18	1.28	-1.10	42	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6996	0.3002	0.0001	1	0	0.6938	0.3060	0.0001	1	0	0.6860	0.3139	0.0002
chr12	102958393	C	CGCAGCAGCAGCA	0.500000	0.050	1	12	1	549	149	400	46	1	31	0	71	0	0	351	0	49	0.3087	0.0000	0.1225	3.774	0.76	0.76	0.00	16	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0007	0.0616	0.9377	1	2	0.0009	0.0692	0.9299	1	2	0.0013	0.0805	0.9182
chr12	106247711	GGGC	G	0.500000	0.050	1	-3	1	422	109	313	0	0	10	1	98	0	0	311	0	2	0.0000	0.0000	0.0064	9.900		4.35		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0730	0.9270	2	2	0.0000	0.0765	0.9235	2	2	0.0000	0.0816	0.9184
chr12	108623635	GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC	G	0.500000	0.050	1	-60	3	1989	407	1582	28	2	117	7	253	0	0	1517	0	65	0.0688	0.0000	0.0411	2.453	0.79	4.64	-3.85	14	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9467	0.0533
chr12	111363022	TGCCACCCCC	T	0.500000	0.050	1	-9	1	654	179	475	92	0	4	0	83	0	0	467	0	8	0.5140	0.0000	0.0168	43.750	0.13	8.51	-8.38	16	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2333	0.5554	0.2113	1	1	0.2351	0.5512	0.2137	1	1	0.2372	0.5460	0.2168
chr12	111598949	GGCT	G	0.500000	0.050	1	-3	1	549	153	396	0	0	22	6	125	0	0	396	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	5.955		3.61		0	0/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0356	0.9644	2	2	0.0000	0.0379	0.9621	2	2	0.0000	0.0414	0.9586
chr12	112931910	TA	T	0.500000	0.050	1	-1	1	193	105	88	0	0	0	0	105	0	0	88	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	105.000		2.34		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0665	0.9335	2	2	0.0000	0.0698	0.9302	2	2	0.0000	0.0747	0.9253
chr12	118068522	TTCCTCC	T	0.500000	0.050	1	-6	1	208	70	138	58	0	10	0	2	0	0	138	0	0	0.8286	0.0000	0.0000	6.000	1.05	6.00	-4.95	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1418	0.8582	0.0000	0	0	0.5249	0.4751	0.0000	0	0	0.6574	0.3426	0.0000
chr12	121240524	C	CTTT	0.500000	0.050	1	3	2	492	128	364	35	25	20	14	34	0	0	359	2	3	0.2734	0.0000	0.0137	4.900	1.49	4.21	-2.72	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3212	0.5176	0.1612	1	1	0.3192	0.5162	0.1645	1	1	0.3165	0.5146	0.1689
chr12	121626865	GGCCCC	G	0.500000	0.050	1	-5	5	354	110	244	0	0	9	0	101	0	0	239	0	5	0.0000	0.0000	0.0205	11.222		4.99		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0649	0.9351	2	2	0.0000	0.0682	0.9318	2	2	0.0000	0.0731	0.9269
chr12	121921491	G	GGAGGAGGAGGAGAAA	0.500000	0.050	1	15	4	337	70	267	0	0	6	0	64	0	0	257	0	10	0.0000	0.0000	0.0375	10.667		11.19		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1345	0.8655	2	2	0.0000	0.1389	0.8611	2	2	0.0000	0.1451	0.8549
chr12	122266132	G	GC	0.500000	0.050	1	1	3	451	138	313	57	0	12	5	64	0	0	313	0	0	0.4130	0.0000	0.0000	10.500	1.05	2.08	-1.03	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1243	0.5018	0.3739	1	1	0.1283	0.5016	0.3701	1	1	0.1338	0.5013	0.3649
chr12	124340175	C	CGCCGCTGCT	0.500000	0.050	1	9	5	737	181	556	0	0	24	0	157	0	0	536	0	20	0.0000	0.0000	0.0360	6.542		8.37		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0115	0.9885	2	2	0.0000	0.0126	0.9874	2	2	0.0000	0.0142	0.9858
chr12	124402512	G	GGCT	0.500000	0.050	1	3	3	234	76	158	47	6	20	0	3	0	0	158	0	0	0.6184	0.0000	0.0000	2.800	0.36	3.00	-2.64	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0277	0.9723	0.0000	0	1	0.3327	0.6673	0.0000	0	0	0.5388	0.4612	0.0000
chr12	124993835	C	CCTG	0.500000	0.050	1	3	1	197	60	137	25	3	10	1	21	0	0	136	1	0	0.4167	0.0000	0.0073	4.900	1.96	5.00	-3.04	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3111	0.5066	0.1823	1	1	0.3090	0.5061	0.1849	1	1	0.3063	0.5055	0.1882
chr12	131828553	G	GGCTGCCGCT	0.500000	0.050	1	9	1	244	85	159	0	0	4	0	81	0	0	153	0	6	0.0000	0.0000	0.0377	20.250		8.16		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1007	0.8993	2	2	0.0000	0.1048	0.8952	2	2	0.0000	0.1105	0.8895
chr12	132062523	G	GGCA	0.500000	0.050	1	3	1	680	188	492	8	6	116	4	54	0	0	485	3	4	0.0426	0.0000	0.0142	0.850	3.75	3.78	-0.03	4	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9919	0.0081	2	1	0.0000	0.8913	0.1087
chr12	132621877	ATCTCTGCCCCT	A	0.500000	0.050	1	-11	4	643	192	451	110	0	4	0	78	0	1	450	0	0	0.5729	0.0000	0.0022	47.000	0.35	10.35	-9.99	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6512	0.3235	0.0253	1	0	0.6395	0.3323	0.0282	1	0	0.6235	0.3441	0.0324
chr13	20988343	C	CGGGGCG	0.483296	0.050	1	6	2	798	198	600	147	4	40	0	7	0	0	600	0	0	0.7424	0.0000	0.0000	3.900	0.68	5.57	-4.89	41	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0005	0.9995	0.0000	0	1	0.2911	0.7089	0.0000	0	0	0.7464	0.2536	0.0000
chr13	27924562	T	TGCC	0.002235	0.050	1	3	1	572	142	430	67	2	16	0	57	0	0	429	0	1	0.4718	0.0000	0.0023	7.875	0.19	2.96	-2.77	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5951	0.4044	0.0004	1	0	0.5929	0.4067	0.0005	1	0	0.5898	0.4097	0.0005
chr13	42888298	T	TTCAGG	0.039508	0.050	1	5	1	190	62	128	25	0	2	0	35	0	0	125	0	3	0.4032	0.0000	0.0234	30.000	0.16	4.66	-4.50	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3042	0.6505	0.0453	1	1	0.3110	0.6450	0.0440	1	1	0.3200	0.6376	0.0424
chr13	48303948	CGCCGCCGCT	C	0.000995	0.050	1	-9	2	495	173	322	161	0	7	0	5	0	0	322	0	0	0.9306	0.0000	0.0000	23.714	0.54	6.80	-6.26	1	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9427	0.0573	0.0000	0	0	0.9995	0.0005	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr13	50956450	T	TA	0.033831	0.050	1	1	6	513	153	360	67	5	15	10	56	0	0	359	0	1	0.4379	0.0000	0.0028	8.733	0.21	1.20	-0.99	29	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5192	0.4707	0.0101	1	0	0.5193	0.4704	0.0103	1	0	0.5193	0.4701	0.0106
chr13	71866470	ACCGCCGCCG	A	0.000127	0.050	1	-9	2	692	161	531	78	3	8	0	72	1	0	526	0	4	0.4845	0.0019	0.0094	19.000	3.59	9.18	-5.59	32	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5234	0.4766	0.0000	1	0	0.5243	0.4757	0.0000	1	0	0.5252	0.4748	0.0000
chr13	71866526	T	TGCCGCC	0.116857	0.050	1	6	1	648	168	480	74	0	39	1	54	0	1	475	2	2	0.4405	0.0000	0.0104	3.308	5.95	6.48	-0.54	32	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6140	0.3694	0.0166	1	0	0.6092	0.3733	0.0175	1	0	0.6027	0.3786	0.0188
chr13	77599337	G	GTC	0.000205	0.050	1	2	2	239	97	142	52	0	4	0	41	0	0	139	0	3	0.5361	0.0000	0.0211	23.250	0.35	2.05	-1.70	22	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5690	0.4309	0.0001	1	0	0.5675	0.4325	0.0001	1	0	0.5653	0.4347	0.0001
chr13	77698098	T	TGCC	0.001998	0.050	1	3	1	466	140	326	115	3	16	1	5	0	0	326	0	0	0.8214	0.0000	0.0000	7.750	3.00	5.00	-2.00	31	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3896	0.6104	0.0000	0	0	0.9942	0.0058	0.0000	0	0	0.9989	0.0011	0.0000
chr13	78602188	G	GGCC	0.815212	0.050	1	3	4	562	99	463	0	0	12	0	87	0	1	450	1	11	0.0000	0.0000	0.0281	7.250		4.33		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0208	0.9792	2	2	0.0000	0.0215	0.9785	2	2	0.0000	0.0227	0.9773
chr13	99970413	TGGC	T	0.500000	0.050	1	-3	2	517	101	416	51	2	41	0	7	2	4	406	2	2	0.5050	0.0048	0.0240	1.463	2.90	8.57	-5.67	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0006	0.9994	0.0000	0	1	0.0046	0.9954	0.0000	0	1	0.0796	0.9204	0.0000
chr13	112067766	G	GGGC	0.500000	0.050	1	3	5	424	133	291	62	2	15	5	49	0	0	291	0	0	0.4662	0.0000	0.0000	9.833	1.23	3.69	-2.47	50	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3646	0.5045	0.1309	1	1	0.3611	0.5041	0.1349	1	1	0.3563	0.5035	0.1402
chr13	112068121	ATGGGCG	A	0.500000	0.050	1	-6	2	642	176	466	148	7	16	2	3	4	1	459	1	1	0.8409	0.0086	0.0150	9.938	1.43	11.00	-9.57	8	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0044	0.9956	0.0000	0	1	0.4680	0.5320	0.0000	0	0	0.8174	0.1826	0.0000
chr13	112068797	C	CGGGCGT	0.500000	0.050	1	6	1	261	107	154	49	1	11	2	44	0	0	154	0	0	0.4579	0.0000	0.0000	8.636	0.88	6.75	-5.87	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2806	0.5250	0.1944	1	1	0.2801	0.5231	0.1968	1	1	0.2793	0.5207	0.2000
chr13	112547538	ATGGGAAAGTCGCGCG	A	0.500000	0.050	1	-15	1	261	81	180	0	0	25	2	54	0	1	177	0	2	0.0000	0.0000	0.0167	2.200		10.30		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1979	0.8021	2	2	0.0000	0.2019	0.7981	2	2	0.0000	0.2075	0.7925
chr13	112547538	ATGGGAAAGTCGCGCGTGGGAAAGTCGCGCG	A	0.500000	0.050	1	-30	1	262	88	174	36	1	43	4	4	0	0	174	0	0	0.4091	0.0000	0.0000	2.688	1.58	7.50	-5.92	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0008	0.9992	0.0000	0	1	0.0714	0.9286	0.0000	0	1	0.2577	0.7423	0.0000
chr13	113325657	A	ACACT	0.500000	0.050	1	4	1	429	120	309	0	0	3	0	117	0	0	307	0	2	0.0000	0.0000	0.0065	39.000		4.38		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0477	0.9523	2	2	0.0000	0.0505	0.9495	2	2	0.0000	0.0546	0.9454
chr13	113406670	C	CAAG	0.500000	0.050	1	3	1	583	117	466	0	0	1	0	116	0	0	460	0	6	0.0000	0.0000	0.0129	116.000		3.37		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0444	0.9556	2	2	0.0000	0.0470	0.9530	2	2	0.0000	0.0510	0.9490
chr14	19868522	A	AG	0.732384	0.050	1	1	2	1160	300	860	101	0	9	0	190	0	0	858	0	2	0.3367	0.0000	0.0023	32.333	0.22	1.96	-1.75	23	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0212	0.9788	1	2	0.0001	0.0244	0.9755	1	2	0.0001	0.0295	0.9704
chr14	20002693	CT	C	0.452728	0.050	1	-1	4	736	205	531	164	0	30	0	11	0	0	531	0	0	0.8000	0.0000	0.0000	5.833	0.15	1.18	-1.04	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0446	0.9554	0.0000	0	0	0.5120	0.4880	0.0000
chr14	20060289	TCATAGATTTGCTCACTGAC	T	0.427196	0.050	1	-19	1	509	145	364	84	0	3	0	58	0	0	360	0	4	0.5793	0.0000	0.0110	47.333	0.52	18.79	-18.27	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5593	0.3933	0.0474	1	0	0.5508	0.3985	0.0507	1	0	0.5392	0.4053	0.0555
chr14	21155337	CAGA	C	0.002975	0.050	1	-3	1	555	120	435	66	1	5	0	48	0	0	432	0	3	0.5500	0.0000	0.0069	22.800	0.53	4.17	-3.64	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6532	0.3464	0.0004	1	0	0.6488	0.3507	0.0004	1	0	0.6429	0.3567	0.0005
chr14	22902046	G	GGGC	0.560337	0.050	1	3	1	554	145	409	129	2	11	0	3	0	0	409	0	0	0.8897	0.0000	0.0000	12.000	0.31	3.00	-2.69	37	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1361	0.8639	0.0000	0	0	0.7269	0.2731	0.0000	0	0	0.8553	0.1447	0.0000
chr14	23079574	A	AGAACGT	0.278634	0.050	1	6	1	504	116	388	0	0	9	2	105	0	0	386	0	2	0.0000	0.0000	0.0052	11.889		5.31		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1429	0.8571	2	2	0.0000	0.1497	0.8503	2	2	0.0000	0.1596	0.8404
chr14	23080669	TTCC	T	0.061796	0.050	1	-3	1	696	209	487	173	5	20	0	11	0	0	487	0	0	0.8278	0.0000	0.0000	9.450	0.50	3.00	-2.50	61	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.4409	0.5591	0.0000	0	0	0.9476	0.0524	0.0000
chr14	23275591	ACAT	A	0.375158	0.050	1	-3	1	399	74	325	29	4	6	2	33	0	0	322	0	3	0.3919	0.0000	0.0092	11.167	2.52	3.61	-1.09	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2350	0.5295	0.2354	1	1	0.2382	0.5279	0.2339	1	1	0.2423	0.5258	0.2319
chr14	23275617	TTCC	T	0.376038	0.050	1	-3	1	410	79	331	37	4	7	1	30	0	0	331	0	0	0.4684	0.0000	0.0000	11.833	2.49	2.93	-0.45	23	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.4233	0.4727	0.1040	1	1	0.4196	0.4736	0.1068	1	1	0.4147	0.4749	0.1104
chr14	24300643	A	AGAG	0.272949	0.050	1	3	1	436	124	312	52	1	19	0	52	0	0	309	0	3	0.4194	0.0000	0.0096	5.526	0.04	3.46	-3.42	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3135	0.5431	0.1434	1	1	0.3162	0.5403	0.1436	1	1	0.3196	0.5367	0.1437
chr14	38210558	C	CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG	0.184930	0.050	1	24	1	329	59	270	16	0	31	0	12	0	0	268	0	2	0.2712	0.0000	0.0074	0.903	1.06	5.00	-3.94	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4275	0.4929	0.0796	1	1	0.4270	0.4928	0.0801	1	1	0.4264	0.4928	0.0808
chr14	53152762	T	TGCCGCC	0.826994	0.050	1	6	1	697	138	559	65	1	16	0	56	1	0	550	0	8	0.4710	0.0018	0.0161	7.625	1.34	6.73	-5.39	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0961	0.5622	0.3416	1	1	0.0961	0.5585	0.3454	1	1	0.0960	0.5537	0.3503
chr14	58131686	ACTC	A	0.001004	0.050	1	-3	2	175	66	109	62	0	1	0	3	0	0	109	0	0	0.9394	0.0000	0.0000	65.000	0.27	3.00	-2.73	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9725	0.0275	0.0000	0	0	0.9984	0.0016	0.0000	0	0	0.9993	0.0007	0.0000
chr14	59464198	G	GCA	0.003589	0.050	1	2	1	561	135	426	131	1	1	0	2	0	0	426	0	0	0.9704	0.0000	0.0000	133.000	0.44	3.00	-2.56	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9966	0.0034	0.0000	0	0	0.9995	0.0005	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000
chr14	69573086	CGCGGCG	C	0.814084	0.050	1	-6	2	684	172	512	0	0	34	2	136	0	0	505	1	6	0.0000	0.0000	0.0137	4.029		6.58		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0059	0.9941	2	2	0.0000	0.0064	0.9936	2	2	0.0000	0.0071	0.9929
chr14	74260844	A	AGAG	0.000693	0.050	1	3	2	962	206	756	182	0	18	1	5	1	0	755	0	0	0.8835	0.0013	0.0013	10.444	0.29	2.40	-2.11	50	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9324	0.0676	0.0000	0	0	0.9996	0.0004	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr14	77027418	TTGCTGC	T	0.394255	0.050	1	-6	1	436	92	344	0	0	14	7	71	0	0	342	1	1	0.0000	0.0000	0.0058	5.357		5.94		0	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1719	0.8281	2	2	0.0000	0.1777	0.8223	2	2	0.0000	0.1859	0.8141
chr14	77027448	CTGT	C	0.435919	0.050	1	-3	1	418	93	325	7	39	10	4	33	0	0	324	1	0	0.0753	0.0000	0.0031	16.000	0.29	5.15	-4.87	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2883	0.5196	0.1921	1	1	0.2886	0.5180	0.1934	1	1	0.2889	0.5161	0.1950
chr14	77616457	GGCGGCT	G	0.000168	0.050	1	-6	1	372	125	247	64	0	11	0	50	0	0	245	0	2	0.5120	0.0000	0.0081	10.364	0.36	5.92	-5.56	34	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6110	0.3890	0.0000	1	0	0.6081	0.3919	0.0000	1	0	0.6041	0.3959	0.0000
chr14	92688192	TGGC	T	0.643421	0.050	1	-3	2	518	165	353	2	0	16	3	144	0	0	349	0	4	0.0121	0.0000	0.0113	9.312	0.00	3.20	-3.20	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2449	0.7551	2	2	0.0000	0.0484	0.9516	2	2	0.0000	0.0303	0.9697
chr14	103127080	T	TGGC	0.001756	0.050	1	3	1	425	133	292	55	2	19	4	53	0	0	291	0	1	0.4135	0.0000	0.0034	5.895	0.49	3.30	-2.81	23	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4625	0.5367	0.0008	1	1	0.4652	0.5340	0.0008	1	1	0.4686	0.5306	0.0008
chr14	104588781	TGACGGGCAG	T	0.435567	0.050	1	-9	1	293	96	197	34	0	15	0	47	1	0	192	0	4	0.3542	0.0051	0.0254	5.400	0.15	8.83	-8.68	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1099	0.4773	0.4128	1	1	0.1148	0.4796	0.4056	1	1	0.1215	0.4826	0.3960
chr14	105529712	TGCC	T	0.270735	0.050	1	-3	2	438	130	308	0	0	22	1	107	0	0	303	0	5	0.0000	0.0000	0.0162	4.909		3.86		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1356	0.8644	2	2	0.0000	0.1424	0.8576	2	2	0.0000	0.1522	0.8478
chr15	22786677	AGCG	A	0.219888	0.050	1	-3	1	332	85	247	72	1	7	2	3	0	0	247	0	0	0.8471	0.0000	0.0000	10.857	2.32	3.33	-1.01	32	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1246	0.8754	0.0000	0	0	0.7150	0.2850	0.0000	0	0	0.8550	0.1450	0.0000
chr15	23439857	G	GCAT	0.979303	0.050	1	3	1	621	131	490	0	1	5	0	125	0	4	454	23	9	0.0000	0.0000	0.0735	25.200		4.42		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0025	0.9975	2	2	0.0000	0.0012	0.9988	2	2	0.0000	0.0010	0.9990
chr15	23440394	CT	C	0.994113	0.050	1	-1	2	1401	343	1058	0	0	16	2	325	0	0	1001	13	44	0.0000	0.0000	0.0539	23.357		3.49		0	0/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr15	23441081	G	GTCTCCTCCTCTTCCCGCATCT	0.154509	0.050	1	21	1	1247	211	1036	142	3	61	1	4	5	2	1025	3	1	0.6730	0.0048	0.0106	2.459	2.08	2.75	-0.67	42	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0160	0.9840	0.0000	0	0	0.7470	0.2530	0.0000	0	0	0.9398	0.0602	0.0000
chr15	23441523	TCCGCATCTTCTCCTCCTGCTC	T	0.005169	0.050	1	-21	1	855	244	611	216	4	24	0	0	2	4	602	1	2	0.8852	0.0033	0.0147	9.083	1.49			58	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9989	0.0011	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr15	31229302	CGG	C	0.653809	0.050	1	-2	2	222	96	126	0	2	4	0	90	0	0	124	0	2	0.0000	0.0000	0.0159	23.000		2.18		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2803	0.7197	2	2	0.0000	0.1388	0.8612	2	2	0.0000	0.1010	0.8990
chr15	31484007	TGGC	T	0.683637	0.050	1	-3	1	684	177	507	3	0	28	3	143	0	0	504	0	3	0.0169	0.0000	0.0059	5.321	0.33	4.36	-4.03	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.5928	0.4072	2	2	0.0000	0.0800	0.9200	2	2	0.0000	0.0382	0.9618
chr15	34038912	C	CCCGCCGCCGCCT	0.002022	0.050	1	12	4	204	65	139	56	0	7	0	2	0	0	139	0	0	0.8615	0.0000	0.0000	8.286	0.45	7.50	-7.05	0	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9872	0.0128	0.0000	0	0	0.9981	0.0019	0.0000	0	0	0.9989	0.0011	0.0000
chr15	38484605	AGGTGGTGGT	A	0.136711	0.050	1	-9	2	420	178	242	149	2	25	0	2	0	0	242	0	0	0.8371	0.0000	0.0000	6.120	0.66	9.00	-8.34	71	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9150	0.0850	0.0000	0	0	0.9856	0.0144	0.0000	0	0	0.9911	0.0089	0.0000
chr15	40407805	GTT	G	0.332169	0.050	1	-2	1	447	158	289	146	0	6	0	6	0	0	289	0	0	0.9241	0.0000	0.0000	25.333	1.16	2.00	-0.84	32	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0044	0.9956	0.0000	0	0	0.5727	0.4273	0.0000	0	0	0.8775	0.1225	0.0000
chr15	43872814	C	CTATT	0.101358	0.050	1	4	1	216	75	141	5	0	1	0	69	0	0	141	0	0	0.0667	0.0000	0.0000	74.000	0.20	3.68	-3.48	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9998	0.0002	2	1	0.0000	0.9785	0.0215	2	1	0.0000	0.9158	0.0842
chr15	74244059	TAAG	T	0.589043	0.050	1	-3	1	275	145	130	75	1	0	0	69	0	0	128	0	2	0.5172	0.0000	0.0154	145.000	0.27	3.35	-3.08	25	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2409	0.5482	0.2109	1	1	0.2404	0.5450	0.2146	1	1	0.2397	0.5409	0.2194
chr15	78620725	ACAG	A	0.589191	0.050	1	-3	1	484	117	367	43	0	8	2	64	0	0	367	0	0	0.3675	0.0000	0.0000	13.625	0.35	4.31	-3.96	17	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0424	0.3672	0.5904	1	2	0.0455	0.3737	0.5808	1	2	0.0499	0.3822	0.5679
chr15	81332887	CTCT	C	0.001806	0.050	1	-3	2	666	157	509	92	0	5	0	60	0	0	509	0	0	0.5860	0.0000	0.0000	30.400	0.23	3.12	-2.89	20	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8012	0.1987	0.0001	1	0	0.7936	0.2063	0.0001	1	0	0.7832	0.2167	0.0001
chr15	82045645	T	TGCC	0.002204	0.050	1	3	1	395	115	280	51	1	15	1	47	0	0	280	0	0	0.4435	0.0000	0.0000	6.600	0.41	3.13	-2.72	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5212	0.4780	0.0008	1	0	0.5215	0.4777	0.0008	1	0	0.5217	0.4775	0.0008
chr15	83008518	C	CA	0.185307	0.050	1	1	1	152	38	114	14	7	6	4	7	0	0	114	0	0	0.3684	0.0000	0.0000	4.333	0.64	1.00	-0.36	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5297	0.4228	0.0475	1	0	0.5254	0.4258	0.0488	1	0	0.5195	0.4300	0.0506
chr15	84895080	C	CTTG	0.283663	0.050	1	3	3	387	131	256	68	0	2	0	61	0	0	252	0	4	0.5191	0.0000	0.0156	64.500	0.82	3.02	-2.19	30	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3690	0.5224	0.1086	1	1	0.3698	0.5201	0.1101	1	1	0.3707	0.5173	0.1120
chr15	89333596	T	TTGC	0.100121	0.050	1	3	1	919	233	686	84	10	57	1	81	0	0	686	0	0	0.3605	0.0000	0.0000	3.088	0.32	3.22	-2.90	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5546	0.4262	0.0192	1	0	0.5526	0.4273	0.0200	1	0	0.5498	0.4291	0.0211
chr15	89333596	T	TTGCTGC	0.028553	0.050	1	6	1	919	233	686	94	1	122	4	12	0	0	686	0	0	0.4034	0.0000	0.0000	0.892	0.65	3.58	-2.93	14	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0730	0.9270	0.0000	0	0	0.7288	0.2712	0.0000
chr15	89776889	GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC	G	0.425786	0.050	1	-24	2	865	192	673	5	1	45	0	141	0	1	644	0	28	0.0260	0.0000	0.0431	3.868	1.60	15.48	-13.88	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9953	0.0047	2	1	0.0000	0.5469	0.4531	2	2	0.0000	0.1928	0.8072
chr15	89776903	AGGGCAGGGGCAG	A	0.699006	0.050	1	-12	2	855	205	650	14	3	20	5	163	0	1	649	0	0	0.0683	0.0000	0.0015	9.050	1.00	13.91	-12.91	8	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9982	0.0018	2	1	0.0000	0.8269	0.1731
chr15	92655448	TTGGAGC	T	0.998005	0.050	1	-6	1	355	94	261	3	0	3	1	87	0	0	256	0	5	0.0319	0.0000	0.0192	30.333	0.33	7.03	-6.70	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0251	0.9749	2	2	0.0000	0.0015	0.9985	2	2	0.0000	0.0007	0.9993
chr15	99712504	C	CCAGCAG	0.003114	0.050	1	6	2	600	219	381	164	3	45	0	7	1	0	378	0	2	0.7489	0.0026	0.0079	3.867	1.90	4.43	-2.53	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0092	0.9908	0.0000	0	0	0.9802	0.0198	0.0000	0	0	0.9984	0.0016	0.0000
chr15	99712504	CCAG	C	0.144765	0.050	1	-3	2	600	222	378	90	3	39	6	84	0	0	377	1	0	0.4054	0.0000	0.0026	4.692	0.58	3.23	-2.65	32	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4043	0.5389	0.0568	1	1	0.4071	0.5354	0.0575	1	1	0.4104	0.5310	0.0586
chr15	101489563	GGCGCCCCCC	G	0.028834	0.050	1	-9	2	251	75	176	1	0	15	1	58	1	0	170	0	5	0.0133	0.0057	0.0341	3.933	0.00	10.53	-10.53	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9944	0.0056	2	1	0.0000	0.9636	0.0364	2	1	0.0000	0.9387	0.0613
chr15	101746837	T	TC	0.190418	0.050	1	1	2	46	21	25	5	0	0	0	16	0	0	25	0	0	0.2381	0.0000	0.0000	21.000	0.20	1.19	-0.99	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2567	0.5641	0.1791	1	1	0.2557	0.5728	0.1715	1	1	0.2364	0.6075	0.1561
chr16	400140	C	CAG	0.314665	0.050	1	2	2	362	102	260	5	0	0	0	97	0	0	259	0	1	0.0490	0.0000	0.0038	102.000	1.00	3.37	-2.37	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9985	0.0015	2	1	0.0000	0.8456	0.1544	2	1	0.0000	0.5713	0.4287
chr16	813355	AGGACGCCGGACCGACAC	A	0.089377	0.050	1	-17	2	275	83	192	0	0	2	1	80	0	0	190	0	2	0.0000	0.0000	0.0104	40.000		15.31		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.5586	0.4414	2	1	0.0000	0.5689	0.4311	2	1	0.0000	0.5829	0.4171
chr16	1093978	G	GC	0.001284	0.050	1	1	2	412	128	284	72	1	2	1	52	0	0	284	0	0	0.5625	0.0000	0.0000	63.000	0.40	1.21	-0.81	40	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6970	0.3029	0.0001	1	0	0.6914	0.3085	0.0001	1	0	0.6838	0.3161	0.0001
chr16	1256558	AG	A	0.210472	0.050	1	-1	1	1099	250	849	114	1	5	1	129	1	0	847	0	1	0.4560	0.0012	0.0024	49.000	0.82	1.29	-0.47	22	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1734	0.6231	0.2035	1	1	0.1811	0.6182	0.2008	1	1	0.1914	0.6117	0.1969
chr16	2009735	CG	C	0.999815	0.050	1	-1	6	437	113	324	0	0	0	0	113	0	0	322	0	2	0.0000	0.0000	0.0062	113.000		6.80		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr16	2009735	CG	C	0.999815	0.050	1	-1	6	437	113	324	0	0	0	0	113	0	0	322	0	2	0.0000	0.0000	0.0062	113.000		6.80		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr16	2179036	C	CGCG	0.006791	0.050	1	3	6	569	143	426	48	2	47	1	45	2	0	419	0	5	0.3357	0.0047	0.0164	2.021	1.90	4.24	-2.35	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4830	0.5141	0.0029	1	1	0.4847	0.5124	0.0029	1	1	0.4867	0.5103	0.0029
chr16	2768157	CTCT	C	0.000287	0.050	1	-3	2	404	106	298	52	46	5	0	3	0	0	298	0	0	0.4906	0.0000	0.0000	20.000	0.69	3.00	-2.31	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9964	0.0036	0.0000	0	0	0.9998	0.0002	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr16	4594388	CAGG	C	0.035758	0.050	1	-3	2	293	113	180	58	1	0	0	54	0	0	178	0	2	0.5133	0.0000	0.0111	112.000	0.29	2.96	-2.67	26	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4838	0.5026	0.0136	1	1	0.4850	0.5012	0.0138	1	1	0.4864	0.4995	0.0140
chr16	10430799	GGAC	G	0.612863	0.050	1	-3	1	474	128	346	61	1	7	1	58	0	0	345	0	1	0.4766	0.0000	0.0029	17.286	0.44	3.26	-2.82	27	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1994	0.5416	0.2591	1	1	0.1998	0.5386	0.2616	1	1	0.2002	0.5350	0.2648
chr16	11915673	C	CCCG	0.170317	0.050	1	3	1	385	133	252	38	2	60	0	33	0	2	243	3	4	0.2857	0.0000	0.0357	1.217	2.87	5.06	-2.19	18	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4239	0.5060	0.0701	1	1	0.4244	0.5048	0.0708	1	1	0.4249	0.5035	0.0716
chr16	11927441	GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA	G	0.078615	0.050	1	-42	2	1248	305	943	127	0	88	1	89	0	0	931	0	12	0.4164	0.0000	0.0127	2.466	1.26	4.48	-3.22	79	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7021	0.2928	0.0051	1	0	0.6963	0.2982	0.0055	1	0	0.6882	0.3056	0.0062
chr16	11933617	CAT	C	0.996541	0.050	1	-2	1	158	55	103	0	0	0	0	55	0	0	103	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	55.000		2.24		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0009	0.9991
chr16	18543716	GA	G	0.002566	0.050	1	-1	1	238	100	138	95	0	3	0	2	0	0	138	0	0	0.9500	0.0000	0.0000	32.333	0.07	1.00	-0.93	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9940	0.0060	0.0000	0	0	0.9991	0.0009	0.0000	0	0	0.9994	0.0006	0.0000
chr16	22008325	AG	A	0.081606	0.050	1	-1	1	294	175	119	80	0	1	0	94	1	0	118	0	0	0.4571	0.0084	0.0084	174.000	0.44	1.38	-0.95	16	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2574	0.6599	0.0827	1	1	0.2655	0.6534	0.0812	1	1	0.2762	0.6447	0.0791
chr16	28496076	TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC	T	0.319200	0.050	1	-27	1	1093	256	837	182	5	62	1	6	0	1	836	0	0	0.7109	0.0000	0.0012	3.097	0.71	7.00	-6.29	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0112	0.9888	0.0000	0	0	0.7747	0.2253	0.0000	0	0	0.9482	0.0518	0.0000
chr16	30369935	AGCCGGGGCTGGG	A	0.031031	0.050	1	-12	1	713	185	528	161	0	18	1	5	0	0	528	0	0	0.8703	0.0000	0.0000	9.278	0.54	12.80	-12.26	41	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2240	0.7760	0.0000	0	0	0.9756	0.0244	0.0000	0	0	0.9944	0.0056	0.0000
chr16	31759375	G	GA	0.500000	0.050	1	1	1	165	79	86	36	0	0	0	43	0	0	85	0	1	0.4557	0.0000	0.0116	79.000	0.22	2.14	-1.92	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1543	0.5054	0.3403	1	1	0.1577	0.5049	0.3373	1	1	0.1622	0.5044	0.3334
chr16	57949370	T	TTCC	0.500000	0.050	1	3	1	190	67	123	58	2	5	0	2	0	0	123	0	0	0.8657	0.0000	0.0000	12.400	0.22	3.50	-3.28	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1476	0.8524	0.0000	0	0	0.5360	0.4640	0.0000	0	0	0.6671	0.3329	0.0000
chr16	58543411	GA	G	0.500000	0.050	1	-1	1	471	104	367	41	14	12	7	30	0	0	366	1	0	0.3942	0.0000	0.0027	8.200	1.02	2.07	-1.04	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4487	0.4570	0.0943	1	1	0.4416	0.4599	0.0985	1	1	0.4322	0.4635	0.1043
chr16	67185440	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	1	501	139	362	130	3	5	0	1	0	0	361	1	0	0.9353	0.0000	0.0028	26.600	0.42	2.00	-1.58	58	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.5572	0.4428	0.0000	0	0	0.8769	0.1231	0.0000	0	0	0.9204	0.0796	0.0000
chr16	67195890	A	ACAGCAGCAG	0.500000	0.050	1	9	2	465	199	266	136	1	58	0	4	0	0	266	0	0	0.6834	0.0000	0.0000	2.414	0.66	7.00	-6.34	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0442	0.9558	0.0000	0	0	0.6695	0.3305	0.0000	0	0	0.8576	0.1424	0.0000
chr16	67842884	GCAGCAGCAA	G	0.500000	0.050	1	-9	1	1057	345	712	160	4	37	0	144	0	0	712	0	0	0.4638	0.0000	0.0000	8.297	0.77	7.53	-6.77	76	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4472	0.4896	0.0632	1	1	0.4430	0.4895	0.0675	1	1	0.4369	0.4896	0.0735
chr16	67842920	ACAG	A	0.500000	0.050	1	-3	2	1060	331	729	244	10	48	5	24	0	0	729	0	0	0.7372	0.0000	0.0000	5.875	3.31	4.12	-0.82	62	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0134	0.9866	0.0000
chr16	70973408	TG	T	0.500000	0.050	1	-1	3	214	66	148	57	0	2	0	7	0	0	148	0	0	0.8636	0.0000	0.0000	32.000	0.42	1.43	-1.01	27	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0371	0.9629	0.0000	0	1	0.2260	0.7740	0.0000
chr16	71922608	A	AATGCCC	0.500000	0.050	1	6	2	346	144	202	11	0	26	0	107	0	0	194	0	8	0.0764	0.0000	0.0396	4.538	2.73	5.31	-2.58	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9891	0.0109	2	1	0.0000	0.7909	0.2091
chr16	71922608	AATGCCC	A	0.500000	0.050	1	-6	2	348	154	194	129	0	21	0	4	0	0	194	0	0	0.8377	0.0000	0.0000	6.333	4.43	7.25	-2.82	25	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0361	0.9639	0.0000	0	0	0.6248	0.3752	0.0000	0	0	0.8328	0.1672	0.0000
chr16	84236959	G	GCCAGCTCCT	0.500000	0.050	1	9	2	665	177	488	137	0	32	0	8	0	0	487	0	1	0.7740	0.0000	0.0020	4.531	0.64	7.25	-6.61	27	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0671	0.9329	0.0000	0	1	0.4849	0.5151	0.0000
chr16	84495751	TCTC	T	0.500000	0.050	1	-3	2	268	107	161	102	0	4	0	1	0	0	161	0	0	0.9533	0.0000	0.0000	25.750	0.50	3.00	-2.50	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7179	0.2821	0.0000	0	0	0.8638	0.1362	0.0000	0	0	0.8883	0.1117	0.0000
chr16	87604287	C	CCTGCTGCTGCTG	0.500000	0.050	1	12	1	458	102	356	6	0	19	0	77	0	0	332	0	24	0.0588	0.0000	0.0674	4.368	12.67	9.62	3.04	4	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9993	0.0007	2	1	0.0000	0.8198	0.1802	2	2	0.0000	0.4522	0.5478
chr16	87604287	C	CCTGCTGCTGCTGCTG	0.500000	0.050	1	15	1	458	102	356	6	0	19	0	77	0	0	332	0	24	0.0588	0.0000	0.0674	4.368	12.67	9.62	3.04	4	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9993	0.0007	2	1	0.0000	0.8198	0.1802	2	2	0.0000	0.4522	0.5478
chr16	88430089	TTCCGGCCCCAGAGGTCCCAGC	T	0.500000	0.050	1	-21	2	775	165	610	155	1	4	0	5	1	0	608	0	1	0.9394	0.0016	0.0033	40.250	0.65	21.00	-20.35	39	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0029	0.9971	0.0000	0	1	0.4665	0.5335	0.0000	0	0	0.8226	0.1774	0.0000
chr16	88533287	GGA	G	0.500000	0.050	1	-2	1	748	145	603	0	1	5	8	131	0	0	594	2	7	0.0000	0.0000	0.0149	34.750		7.30		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0274	0.9726	2	2	0.0000	0.0288	0.9712	2	2	0.0000	0.0311	0.9689
chr16	88533292	CT	C	0.500000	0.050	1	-1	2	750	137	613	0	0	9	12	116	0	1	603	4	5	0.0000	0.0000	0.0163	14.111		7.60		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0397	0.9603	2	2	0.0000	0.0399	0.9601	2	2	0.0000	0.0415	0.9585
chr16	88533294	CTGG	C	0.500000	0.050	1	-3	1	748	133	615	0	0	5	0	128	1	1	598	9	6	0.0000	0.0016	0.0276	32.000		7.64		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.3338	0.6662	2	2	0.0000	0.0975	0.9025	2	2	0.0000	0.0643	0.9357
chr16	88714227	G	GGTGT	0.500000	0.050	1	4	1	837	192	645	0	0	6	3	183	0	0	640	0	5	0.0000	0.0000	0.0078	30.833		6.20		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0080	0.9920	2	2	0.0000	0.0088	0.9912	2	2	0.0000	0.0101	0.9899
chr16	88733964	GTCC	G	0.500000	0.050	1	-3	1	948	284	664	4	0	48	15	217	0	0	660	0	4	0.0141	0.0000	0.0060	4.750	0.50	3.38	-2.88	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.6474	0.3526	2	2	0.0000	0.0419	0.9581	2	2	0.0000	0.0155	0.9845
chr16	88733987	CCTG	C	0.500000	0.050	1	-3	1	924	278	646	36	4	19	199	20	0	0	646	0	0	0.1295	0.0000	0.0000	4.222	0.92	5.10	-4.18	8	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0000	0.1390	0.8610	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr16	89224802	G	GGTGA	0.500000	0.050	1	4	2	161	74	87	41	0	0	0	33	0	0	85	0	2	0.5541	0.0000	0.0230	74.000	0.41	3.94	-3.52	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3141	0.5124	0.1735	1	1	0.3121	0.5114	0.1764	1	1	0.3095	0.5102	0.1803
chr17	1728046	TGAG	T	0.225858	0.050	1	-3	1	947	204	743	181	1	11	1	10	0	0	743	0	0	0.8873	0.0000	0.0000	17.455	0.41	2.50	-2.09	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2491	0.7509	0.0000	0	0	0.8530	0.1470	0.0000
chr17	5141483	AATAG	A	0.000611	0.050	1	-4	4	387	171	216	165	0	3	0	3	0	0	216	0	0	0.9649	0.0000	0.0000	56.000	0.47	4.00	-3.53	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9987	0.0013	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr17	5183741	TATA	T	0.006994	0.050	1	-3	1	924	182	742	79	0	10	0	93	0	0	740	0	2	0.4341	0.0000	0.0027	17.200	0.52	3.29	-2.77	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2644	0.7265	0.0091	1	1	0.2736	0.7176	0.0088	1	1	0.2858	0.7057	0.0085
chr17	7024700	C	CCAG	0.654808	0.050	1	3	1	758	223	535	10	3	45	1	164	0	0	529	0	6	0.0448	0.0000	0.0112	3.956	0.20	3.17	-2.97	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9774	0.0226	2	1	0.0000	0.5183	0.4817
chr17	7846859	T	TACC	0.057281	0.050	1	3	2	1398	382	1016	11	3	99	18	251	0	0	1001	2	13	0.0288	0.0000	0.0148	2.859	0.64	5.10	-4.46	3	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9917	0.0083	2	1	0.0000	0.7418	0.2582
chr17	12980176	G	GCCAGCC	0.500000	0.050	1	6	1	325	149	176	123	0	24	0	2	0	0	176	0	0	0.8255	0.0000	0.0000	5.208	0.44	3.50	-3.06	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4619	0.5381	0.0000	0	0	0.8456	0.1544	0.0000	0	0	0.9008	0.0992	0.0000
chr17	16353372	G	GCGGAGGCCC	0.500000	0.050	1	9	2	412	112	300	57	0	2	0	53	1	0	299	0	0	0.5089	0.0033	0.0033	55.000	0.67	7.62	-6.96	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2942	0.5263	0.1795	1	1	0.2933	0.5243	0.1823	1	1	0.2920	0.5218	0.1861
chr17	17136247	CCAG	C	0.500000	0.050	1	-3	1	533	210	323	80	0	50	9	71	0	0	321	1	1	0.3810	0.0000	0.0062	3.200	0.26	3.01	-2.75	48	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2039	0.5481	0.2480	1	1	0.2064	0.5445	0.2491	1	1	0.2096	0.5400	0.2505
chr17	17793784	AGC	A	0.500000	0.050	1	-2	1	1027	293	734	254	1	2	29	7	0	1	732	1	0	0.8669	0.0000	0.0027	131.500	0.37	4.14	-3.78	88	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0002	0.9998	0.0000	0	1	0.2025	0.7975	0.0000	0	0	0.7356	0.2644	0.0000
chr17	17793787	AG	A	0.500000	0.050	1	-1	1	1026	293	733	255	2	29	0	7	1	0	731	1	0	0.8703	0.0014	0.0027	9.393	0.33	4.14	-3.81	93	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0060	0.9940	0.0000	0	0	0.8196	0.1804	0.0000	0	0	0.9703	0.0297	0.0000
chr17	18778544	AG	A	0.500000	0.050	1	-1	3	676	213	463	145	1	0	3	64	0	0	463	0	0	0.6808	0.0000	0.0000	213.000	0.16	1.06	-0.90	111	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9503	0.0493	0.0004	1	0	0.9437	0.0558	0.0005	1	0	0.9336	0.0657	0.0008
chr17	18971372	C	CGGT	0.500000	0.050	1	3	1	826	170	656	76	0	4	0	90	0	0	649	0	7	0.4471	0.0000	0.0107	41.500	0.43	3.99	-3.55	22	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0627	0.4374	0.5000	1	2	0.0668	0.4410	0.4922	1	2	0.0727	0.4458	0.4816
chr17	30834937	ACAATGT	A	0.500000	0.050	1	-6	1	1012	204	808	192	0	8	0	4	0	0	808	0	0	0.9412	0.0000	0.0000	24.500	0.39	7.00	-6.61	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1546	0.8454	0.0000	0	0	0.8873	0.1127	0.0000	0	0	0.9575	0.0425	0.0000
chr17	34929013	TCTG	T	0.500000	0.050	1	-3	1	144	74	70	37	0	3	0	34	0	0	68	0	2	0.5000	0.0000	0.0286	23.667	0.11	3.26	-3.16	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2508	0.5220	0.2272	1	1	0.2512	0.5203	0.2285	1	1	0.2517	0.5182	0.2300
chr17	35479485	TG	T	0.500000	0.050	1	-1	2	898	211	687	207	0	0	0	4	0	0	687	0	0	0.9810	0.0000	0.0000	211.000	0.34	3.25	-2.91	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2168	0.7832	0.0000	0	0	0.9197	0.0803	0.0000	0	0	0.9700	0.0300	0.0000
chr17	41060049	A	AC	0.500000	0.050	1	1	1	522	141	381	135	0	1	1	4	0	0	380	0	1	0.9574	0.0000	0.0026	140.000	0.73	2.25	-1.52	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0021	0.9979	0.0000	0	1	0.3455	0.6545	0.0000	0	0	0.7348	0.2652	0.0000
chr17	41098083	A	AT	0.500000	0.050	1	1	2	469	122	347	52	0	1	0	69	0	0	347	0	0	0.4262	0.0000	0.0000	121.000	0.12	1.52	-1.41	44	0/1	1/1	.	.	OK	1	1	0.0852	0.4575	0.4573	1	1	0.0895	0.4602	0.4503	1	1	0.0954	0.4637	0.4409
chr17	41149523	T	TGGCAGCAGCTGGGGC	0.500000	0.050	1	15	1	500	100	400	35	1	12	2	50	1	1	386	0	12	0.3500	0.0025	0.0350	7.250	1.17	8.84	-7.67	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	2	0.0427	0.3612	0.5961	1	2	0.0464	0.3692	0.5845	1	2	0.0516	0.3796	0.5688
chr17	41315500	TGCCCCCGCAGCCAGA	T	0.500000	0.050	1	-15	1	648	185	463	97	0	29	0	59	0	0	453	0	10	0.5243	0.0000	0.0216	5.379	0.24	13.03	-12.80	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5965	0.3660	0.0374	1	0	0.5857	0.3734	0.0409	1	0	0.5711	0.3830	0.0459
chr17	44903871	G	GAGT	0.500000	0.050	1	3	5	1750	378	1372	191	0	5	0	182	0	0	1369	0	3	0.5053	0.0000	0.0022	74.600	0.43	3.30	-2.87	45	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2560	0.6025	0.1415	1	1	0.2588	0.5950	0.1463	1	1	0.2620	0.5854	0.1526
chr17	45242067	TCCG	T	0.500000	0.050	1	-3	2	682	196	486	0	0	27	6	163	0	1	480	1	4	0.0000	0.0000	0.0123	6.259		3.32		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0138	0.9862	2	2	0.0000	0.0149	0.9851	2	2	0.0000	0.0165	0.9835
chr17	47361520	CAGTG	C	0.500000	0.050	1	-4	1	230	74	156	42	0	4	1	27	0	0	155	0	1	0.5676	0.0000	0.0064	17.250	0.26	3.81	-3.55	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4156	0.4718	0.1127	1	1	0.4096	0.4737	0.1167	1	1	0.4016	0.4761	0.1223
chr17	47836758	AAGGAGCTGGAGC	A	0.500000	0.050	1	-12	1	705	164	541	88	0	10	0	66	0	0	531	0	10	0.5366	0.0000	0.0185	15.400	0.38	11.21	-10.84	16	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3766	0.5084	0.1150	1	1	0.3731	0.5077	0.1192	1	1	0.3683	0.5067	0.1250
chr17	48530822	G	GGGGCGCTGT	0.500000	0.050	1	9	2	427	118	309	47	0	21	0	50	0	0	304	0	5	0.3983	0.0000	0.0162	4.619	0.09	7.92	-7.83	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1522	0.5121	0.3357	1	1	0.1557	0.5111	0.3332	1	1	0.1604	0.5100	0.3297
chr17	50375617	A	AAGC	0.500000	0.050	1	3	5	950	251	699	125	0	7	0	119	0	0	694	0	5	0.4980	0.0000	0.0072	34.857	0.14	3.03	-2.90	31	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2229	0.5752	0.2019	1	1	0.2254	0.5696	0.2050	1	1	0.2286	0.5625	0.2089
chr17	50699859	G	GTCA	0.500000	0.050	1	3	2	532	114	418	76	3	32	0	3	0	0	418	0	0	0.6667	0.0000	0.0000	2.562	0.18	3.00	-2.82	36	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0520	0.9480	0.0000	0	1	0.4871	0.5129	0.0000	0	0	0.6862	0.3138	0.0000
chr17	57979243	T	TTGC	0.500000	0.050	1	3	1	430	176	254	79	5	46	1	45	0	0	253	0	1	0.4489	0.0000	0.0039	2.826	0.75	3.22	-2.48	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7119	0.2696	0.0185	1	0	0.6986	0.2804	0.0209	1	0	0.6804	0.2950	0.0245
chr17	58756096	G	GGAACCC	0.500000	0.050	1	6	2	376	126	250	101	1	21	0	3	0	0	250	0	0	0.8016	0.0000	0.0000	5.000	0.44	3.33	-2.90	57	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0886	0.9114	0.0000	0	0	0.6252	0.3748	0.0000	0	0	0.7909	0.2091	0.0000
chr17	67959642	T	TCCTCCAGCC	0.500000	0.050	1	9	1	317	117	200	59	0	6	0	52	0	0	200	0	0	0.5043	0.0000	0.0000	18.500	0.32	7.00	-6.68	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3204	0.5192	0.1604	1	1	0.3185	0.5177	0.1637	1	1	0.3159	0.5159	0.1682
chr17	69154324	C	CACCTGGAA	0.500000	0.050	1	8	2	312	89	223	2	0	10	0	77	0	0	218	0	5	0.0225	0.0000	0.0224	7.900	0.00	7.53	-7.53	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.7688	0.2312	2	2	0.0000	0.3348	0.6652	2	2	0.0000	0.2275	0.7725
chr17	69193976	AAT	A	0.500000	0.050	1	-2	3	339	91	248	3	0	0	0	88	0	0	246	0	2	0.0330	0.0000	0.0081	91.000	1.67	2.64	-0.97	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9328	0.0672	2	2	0.0000	0.4461	0.5539	2	2	0.0000	0.2606	0.7394
chr17	74215706	GT	G	0.500000	0.050	1	-1	1	135	53	82	24	0	0	0	29	0	0	82	0	0	0.4528	0.0000	0.0000	53.000	0.08	1.24	-1.16	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1862	0.5086	0.3052	1	1	0.1886	0.5080	0.3034	1	1	0.1919	0.5071	0.3010
chr17	74367718	GC	G	0.500000	0.050	1	-1	2	274	98	176	3	0	5	0	90	0	0	176	0	0	0.0306	0.0000	0.0000	18.600	0.33	1.07	-0.73	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9315	0.0685	2	2	0.0000	0.4454	0.5546	2	2	0.0000	0.2605	0.7395
chr17	74842991	A	AGCTCCGGGG	0.500000	0.050	1	9	2	609	143	466	5	0	10	1	127	0	0	453	0	13	0.0350	0.0000	0.0279	13.300	0.00	8.27	-8.27	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9901	0.0099	2	2	0.0000	0.4654	0.5346	2	2	0.0000	0.1792	0.8208
chr17	74893497	C	CGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTA	0.500000	0.050	1	36	2	366	90	276	0	1	68	0	21	0	0	263	0	13	0.0000	0.0000	0.0471	0.324		2.90		0	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.3950	0.6050	2	2	0.0000	0.3711	0.6289	2	2	0.0000	0.3562	0.6438
chr17	74893524	GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC	G	0.500000	0.050	1	-54	1	367	118	249	86	1	7	1	23	0	0	249	0	0	0.7288	0.0000	0.0000	15.714	1.09	3.48	-2.39	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9070	0.0913	0.0018	1	0	0.7751	0.2230	0.0019	0	1	0.0056	0.9944	0.0000
chr17	76292311	CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT	C	0.500000	0.050	1	-30	1	2522	588	1934	236	17	81	14	240	0	3	1911	7	13	0.4014	0.0000	0.0119	6.385	1.05	7.09	-6.05	36	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0626	0.5734	0.3640	1	1	0.0672	0.5673	0.3654	1	1	0.0737	0.5598	0.3665
chr17	76292483	CTGA	C	0.500000	0.050	1	-3	1	2421	619	1802	242	8	37	10	322	1	3	1636	24	138	0.3910	0.0006	0.0921	16.486	1.75	4.80	-3.06	46	0/1	0/0	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0000	1.0000	1	2	0.0000	0.0001	0.9999	1	2	0.0000	0.0001	0.9999
chr17	79834118	T	TGCCGCC	0.500000	0.050	1	6	1	1066	183	883	89	2	10	2	80	0	0	883	0	0	0.4863	0.0000	0.0000	17.100	0.66	5.06	-4.40	41	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3337	0.5288	0.1375	1	1	0.3319	0.5265	0.1415	1	1	0.3294	0.5238	0.1469
chr18	47446	CCTGATATTG	C	0.001071	0.050	1	-9	1	815	204	611	128	0	8	0	68	0	0	603	0	8	0.6275	0.0000	0.0131	24.500	1.20	8.74	-7.54	116	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9106	0.0894	0.0000	1	0	0.9038	0.0962	0.0000	1	0	0.8941	0.1059	0.0000
chr18	48226	ATG	A	0.000609	0.050	1	-2	2	1521	404	1117	352	1	13	0	38	0	0	1117	0	0	0.8713	0.0000	0.0000	30.077	0.66	2.45	-1.79	34	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	0	0.8516	0.1484	0.0000
chr18	3452224	CT	C	0.390343	0.050	1	-1	7	290	76	214	32	2	1	2	39	0	0	214	0	0	0.4211	0.0000	0.0000	74.000	0.09	1.56	-1.47	10	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2092	0.5272	0.2636	1	1	0.2129	0.5258	0.2613	1	1	0.2177	0.5241	0.2582
chr18	11689670	CGGCCCT	C	0.001376	0.050	1	-6	4	441	85	356	46	0	2	0	37	0	0	356	0	0	0.5412	0.0000	0.0000	41.500	0.39	5.22	-4.82	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5845	0.4152	0.0003	1	0	0.5822	0.4175	0.0003	1	0	0.5790	0.4206	0.0004
chr18	21520797	A	ATCT	0.999706	0.050	1	3	1	188	78	110	0	0	3	0	75	0	0	110	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	25.000		3.03		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr18	24160067	CTG	C	0.002292	0.050	1	-2	4	454	95	359	87	0	2	1	5	0	0	359	0	0	0.9158	0.0000	0.0000	46.500	0.16	2.00	-1.84	53	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4460	0.5540	0.0000	0	0	0.9904	0.0096	0.0000	0	0	0.9978	0.0022	0.0000
chr18	44876705	C	CTCTT	0.547041	0.050	1	4	1	189	71	118	2	0	0	0	69	0	0	118	0	0	0.0282	0.0000	0.0000	71.000	0.00	4.72	-4.72	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.7925	0.2075	2	2	0.0000	0.3648	0.6352	2	2	0.0000	0.2498	0.7502
chr18	49879055	T	TGAG	0.500000	0.050	1	3	1	289	135	154	2	0	3	0	130	0	0	153	0	1	0.0148	0.0000	0.0065	44.000	1.00	3.59	-2.59	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.4921	0.5079	2	2	0.0000	0.1307	0.8693	2	2	0.0000	0.0834	0.9166
chr18	51196775	CGCCGCCGCG	C	0.500000	0.050	1	-9	2	450	116	334	57	2	6	1	50	0	0	334	0	0	0.4914	0.0000	0.0000	18.333	1.21	9.44	-8.23	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3329	0.5149	0.1523	1	1	0.3305	0.5137	0.1558	1	1	0.3272	0.5123	0.1605
chr18	54224211	C	CGCT	0.500000	0.050	1	3	2	294	76	218	41	0	4	0	31	0	0	213	0	5	0.5395	0.0000	0.0229	18.000	2.34	3.58	-1.24	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3028	0.5155	0.1817	1	1	0.3013	0.5143	0.1844	1	1	0.2992	0.5128	0.1879
chr18	54269587	GCGA	G	0.500000	0.050	1	-3	2	262	148	114	1	0	8	0	139	0	0	114	0	0	0.0068	0.0000	0.0000	17.500	0.00	2.96	-2.96	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1335	0.8665	2	2	0.0000	0.0595	0.9405	2	2	0.0000	0.0492	0.9508
chr18	57436244	G	GCAC	0.500000	0.050	1	3	2	724	219	505	95	3	33	1	87	0	0	502	0	3	0.4338	0.0000	0.0059	5.636	1.25	3.44	-2.18	27	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3050	0.5428	0.1522	1	1	0.3044	0.5396	0.1560	1	1	0.3034	0.5355	0.1611
chr18	58537155	ACAGTTGATGTGTCCT	A	0.500000	0.050	1	-15	2	869	192	677	95	0	6	0	91	0	0	666	0	11	0.4948	0.0000	0.0162	31.000	0.13	13.42	-13.29	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1516	0.5454	0.3030	1	1	0.1555	0.5419	0.3025	1	1	0.1606	0.5376	0.3017
chr18	62523553	C	CCCG	0.500000	0.050	1	3	6	388	70	318	1	1	14	1	53	0	0	315	3	0	0.0143	0.0000	0.0094	4.154	0.00	5.51	-5.51	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.6003	0.3997	2	2	0.0000	0.3646	0.6354	2	2	0.0000	0.3016	0.6984
chr18	62979014	ACAG	A	0.500000	0.050	1	-3	3	667	134	533	69	1	5	0	59	1	0	529	0	3	0.5149	0.0019	0.0075	25.800	0.28	3.49	-3.22	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3426	0.5167	0.1407	1	1	0.3401	0.5153	0.1446	1	1	0.3366	0.5137	0.1497
chr18	63655777	T	TGCCA	0.500000	0.050	1	4	2	369	121	248	119	0	0	0	2	0	0	247	0	1	0.9835	0.0000	0.0040	121.000	0.34	6.50	-6.16	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1298	0.8702	0.0000	0	0	0.7173	0.2827	0.0000	0	0	0.8504	0.1496	0.0000
chr18	63655779	CT	C	0.500000	0.050	1	-1	2	369	123	246	119	0	2	0	2	0	0	245	0	1	0.9675	0.0000	0.0041	60.500	0.35	6.50	-6.15	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1350	0.8650	0.0000	0	0	0.7186	0.2814	0.0000	0	0	0.8506	0.1494	0.0000
chr18	70196614	T	TCTC	0.500000	0.050	1	3	1	170	69	101	0	0	3	0	66	0	0	100	0	1	0.0000	0.0000	0.0099	22.000		3.41		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1563	0.8437	2	2	0.0000	0.1608	0.8392	2	2	0.0000	0.1672	0.8328
chr19	971949	G	GGCA	0.008030	0.050	1	3	1	263	114	149	51	3	49	0	11	0	0	149	0	0	0.4474	0.0000	0.0000	6.300	0.24	2.64	-2.40	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.3358	0.6642	0.0000	0	0	0.9252	0.0748	0.0000
chr19	1000449	G	GCGGGCGCTGTGGCTGGGC	0.000085	0.050	1	18	1	188	45	143	43	0	1	0	1	0	0	142	0	1	0.9556	0.0000	0.0070	44.000	0.35	3.00	-2.65	13	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9992	0.0008	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr19	1004897	G	GCGTT	0.284715	0.050	1	4	1	702	149	553	81	0	1	0	67	0	0	548	0	5	0.5436	0.0000	0.0090	148.000	2.23	5.15	-2.91	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4457	0.4814	0.0729	1	1	0.4439	0.4810	0.0751	1	1	0.4414	0.4805	0.0781
chr19	1009186	GAGC	G	0.092678	0.050	1	-3	2	602	127	475	107	1	13	1	5	0	0	475	0	0	0.8425	0.0000	0.0000	8.769	0.69	2.60	-1.91	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0093	0.9907	0.0000	0	0	0.7226	0.2774	0.0000	0	0	0.9338	0.0662	0.0000
chr19	1395488	G	GCGC	0.003752	0.050	1	3	1	1097	226	871	163	1	58	0	4	1	0	869	0	1	0.7212	0.0011	0.0023	2.897	1.01	5.00	-3.99	53	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.8286	0.1714	0.0000	0	0	0.9982	0.0018	0.0000	0	0	0.9995	0.0005	0.0000
chr19	1535194	GCCC	G	0.232630	0.050	1	-3	1	158	63	95	31	0	2	0	30	0	0	95	0	0	0.4921	0.0000	0.0000	30.500	0.13	4.27	-4.14	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3830	0.5118	0.1052	1	1	0.3836	0.5107	0.1057	1	1	0.3843	0.5093	0.1065
chr19	1578372	GCTC	G	0.001595	0.050	1	-3	3	333	116	217	89	1	14	1	11	0	0	217	0	0	0.7672	0.0000	0.0000	7.214	0.16	3.27	-3.12	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	0	0.7127	0.2873	0.0000	0	0	0.9858	0.0142	0.0000
chr19	2015541	GGGC	G	0.470011	0.050	1	-3	4	307	97	210	0	0	15	46	36	0	0	203	4	3	0.0000	0.0000	0.0333	5.467		4.19		0	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1080	0.8920	2	2	0.0000	0.1124	0.8876	2	2	0.0000	0.1186	0.8814
chr19	2015541	GGGCGGCGGC	G	0.046318	0.050	1	-9	4	307	103	204	38	6	12	1	46	0	0	199	0	5	0.3689	0.0000	0.0245	7.583	3.32	10.41	-7.10	18	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3487	0.6136	0.0377	1	1	0.3543	0.6085	0.0372	1	1	0.3617	0.6019	0.0364
chr19	2015541	GGGCGGCGGCGGC	G	0.199114	0.050	1	-12	4	307	110	197	49	1	12	0	48	0	0	195	0	2	0.4455	0.0000	0.0102	8.083	3.33	10.04	-6.72	27	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.3718	0.5327	0.0955	1	1	0.3738	0.5304	0.0959	1	1	0.3763	0.5274	0.0964
chr19	3539216	C	CCCCTCGGGGA	0.001517	0.050	1	10	1	292	76	216	31	0	8	0	37	0	0	210	0	6	0.4079	0.0000	0.0278	8.500	1.42	8.16	-6.74	13	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3345	0.6638	0.0017	1	1	0.3412	0.6572	0.0016	1	1	0.3499	0.6485	0.0016
chr19	4817276	A	AAGG	0.143545	0.050	1	3	1	912	189	723	76	5	28	1	79	0	0	720	0	3	0.4021	0.0000	0.0041	5.750	0.43	3.34	-2.91	24	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3596	0.5668	0.0736	1	1	0.3637	0.5624	0.0739	1	1	0.3689	0.5569	0.0742
chr19	6531137	GGCTGCT	G	0.000547	0.050	1	-6	4	208	75	133	36	0	5	1	33	0	0	130	0	3	0.4800	0.0000	0.0226	14.000	0.28	6.00	-5.72	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4652	0.5345	0.0003	1	1	0.4674	0.5324	0.0003	1	1	0.4701	0.5296	0.0003
chr19	7488963	G	GC	0.000555	0.050	1	1	2	91	42	49	18	0	0	0	24	0	0	49	0	0	0.4286	0.0000	0.0000	42.000	0.28	1.17	-0.89	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4136	0.5860	0.0004	1	1	0.4173	0.5823	0.0004	1	1	0.4222	0.5774	0.0004
chr19	8325008	GTCC	G	0.118610	0.050	1	-3	1	457	132	325	120	0	7	0	5	1	0	323	0	1	0.9091	0.0031	0.0062	17.857	1.00	3.80	-2.80	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0086	0.9914	0.0000	0	0	0.7277	0.2723	0.0000	0	0	0.9356	0.0644	0.0000
chr19	8334065	CTCGCTGTCGCCA	C	0.292264	0.050	1	-12	2	602	159	443	94	0	15	0	50	0	0	436	0	7	0.5912	0.0000	0.0158	10.286	0.44	10.98	-10.54	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7762	0.2153	0.0085	1	0	0.7658	0.2246	0.0097	1	0	0.7513	0.2373	0.0114
chr19	8490988	TCTC	T	0.003548	0.050	1	-3	2	547	151	396	138	2	2	0	9	0	0	396	0	0	0.9139	0.0000	0.0000	74.500	1.24	3.11	-1.87	30	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0039	0.9961	0.0000	0	0	0.9559	0.0441	0.0000	0	0	0.9965	0.0035	0.0000
chr19	8906017	A	AGGT	0.002480	0.050	1	3	1	351	108	243	56	0	2	0	50	0	0	242	0	1	0.5185	0.0000	0.0041	53.000	0.20	4.02	-3.82	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5280	0.4712	0.0008	1	0	0.5281	0.4711	0.0008	1	0	0.5281	0.4711	0.0008
chr19	9126022	G	GATGGT	0.319679	0.050	1	5	3	329	88	241	0	0	7	0	81	0	0	239	0	2	0.0000	0.0000	0.0083	11.571		5.37		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2086	0.7914	2	2	0.0000	0.2156	0.7844	2	2	0.0000	0.2254	0.7746
chr19	9126240	AG	A	0.056196	0.050	1	-1	5	421	118	303	116	0	0	0	2	0	0	303	0	0	0.9831	0.0000	0.0000	118.000	1.02	2.50	-1.48	26	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9229	0.0771	0.0000	0	0	0.9872	0.0128	0.0000	0	0	0.9923	0.0077	0.0000
chr19	11447525	AGAG	A	0.336648	0.050	1	-3	1	917	317	600	234	3	52	5	23	0	0	600	0	0	0.7382	0.0000	0.0000	5.077	0.41	3.61	-3.20	58	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0209	0.9791	0.0000
chr19	12943835	TGAGGATGAG	T	0.000485	0.050	1	-9	1	385	120	265	57	0	12	0	51	0	0	261	0	4	0.4750	0.0000	0.0151	9.000	0.39	8.02	-7.63	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4903	0.5095	0.0002	1	1	0.4919	0.5079	0.0002	1	1	0.4939	0.5059	0.0002
chr19	13207858	CCTG	C	0.175850	0.050	1	-3	1	409	130	279	0	0	26	51	53	0	0	278	1	0	0.0000	0.0000	0.0036	4.000		3.70		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2488	0.7512	2	2	0.0000	0.2589	0.7411	2	2	0.0000	0.2732	0.7268
chr19	13207858	CCTGCTG	C	0.308136	0.050	1	-6	1	409	131	278	0	4	71	3	53	0	0	275	1	2	0.0000	0.0000	0.0108	0.866		5.96		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.4985	0.5015	2	2	0.0000	0.4820	0.5180	2	2	0.0000	0.4684	0.5316
chr19	14583363	T	TGGA	0.065477	0.050	1	3	1	321	99	222	36	1	7	0	55	0	0	220	0	2	0.3636	0.0000	0.0090	13.143	0.19	3.00	-2.81	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2113	0.6817	0.1070	1	1	0.2199	0.6770	0.1032	1	1	0.2314	0.6704	0.0982
chr19	14942171	T	TATC	0.985769	0.050	1	3	1	662	133	529	0	0	2	0	131	0	0	520	0	9	0.0000	0.0000	0.0170	65.500		3.30		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0004	0.9996	2	2	0.0000	0.0005	0.9995	2	2	0.0000	0.0005	0.9995
chr19	17286678	GTGTGTGTGTGTGTT	G	0.125300	0.050	1	-14	1	372	71	301	24	1	8	8	30	0	0	301	0	0	0.3380	0.0000	0.0000	7.750	2.42	10.33	-7.92	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2684	0.6037	0.1278	1	1	0.2747	0.6003	0.1249	1	1	0.2831	0.5958	0.1211
chr19	17286690	GTT	G	0.132491	0.050	1	-2	1	370	69	301	17	8	1	29	14	0	0	301	0	0	0.2464	0.0000	0.0000	65.000	1.59	4.07	-2.48	9	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.2052	0.6144	0.1805	1	1	0.2127	0.6123	0.1749	1	1	0.2230	0.6093	0.1678
chr19	18606579	GAGC	G	0.207987	0.050	1	-3	1	137	49	88	24	0	1	0	24	1	0	85	0	2	0.4898	0.0114	0.0341	48.000	1.00	3.17	-2.17	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3701	0.5226	0.1073	1	1	0.3716	0.5211	0.1073	1	1	0.3734	0.5193	0.1073
chr19	21383385	TAATTCATGCTGGAGAGAAACACTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAAGATTTTAAACAGTCCTCACACCTTACTAAACATAAGAC	T	0.206936	0.050	1	-84	2	813	201	612	100	0	27	2	72	4	12	592	1	3	0.4975	0.0065	0.0327	6.444	0.45	3.00	-2.55	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8037	0.1916	0.0047	1	0	0.7944	0.2002	0.0054	1	0	0.7815	0.2121	0.0064
chr19	22757390	A	AG	0.088391	0.050	1	1	2	1327	303	1024	132	1	16	6	148	0	0	840	8	176	0.4356	0.0000	0.1797	17.750	1.06	1.73	-0.67	24	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0009	0.9991	1	2	0.0000	0.0012	0.9988	1	2	0.0000	0.0019	0.9981
chr19	30009211	GTGA	G	0.833397	0.050	1	-3	1	367	109	258	0	0	9	4	96	0	0	255	0	3	0.0000	0.0000	0.0116	11.000		3.00		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0148	0.9852	2	2	0.0000	0.0156	0.9844	2	2	0.0000	0.0167	0.9833
chr19	35267372	G	GGGA	0.741773	0.050	1	3	1	619	149	470	75	0	11	0	63	0	0	465	0	5	0.5034	0.0000	0.0106	12.545	0.49	3.10	-2.60	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1771	0.5727	0.2502	1	1	0.1758	0.5689	0.2553	1	1	0.1740	0.5640	0.2620
chr19	35511459	ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG	A	0.164843	0.050	1	-51	2	406	137	269	48	38	15	0	36	0	0	246	0	23	0.3504	0.0000	0.0855	8.714	6.25	13.14	-6.89	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7133	0.2764	0.0104	1	0	0.7052	0.2835	0.0113	1	0	0.6941	0.2932	0.0127
chr19	38304940	CAAG	C	0.034026	0.050	1	-3	3	377	86	291	46	0	7	0	33	0	0	289	1	1	0.5349	0.0000	0.0069	11.286	0.54	2.94	-2.40	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5969	0.3960	0.0071	1	0	0.5936	0.3991	0.0073	1	0	0.5890	0.4033	0.0077
chr19	38385765	A	AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG	0.053863	0.050	1	24	2	609	129	480	67	0	16	1	45	0	1	451	0	28	0.5194	0.0000	0.0604	7.062	0.72	11.62	-10.91	5	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3563	0.6065	0.0372	1	1	0.3620	0.6011	0.0369	1	1	0.3694	0.5941	0.0365
chr19	39248513	CT	C	0.306458	0.050	1	-1	2	380	104	276	55	0	3	0	46	0	0	272	0	4	0.5288	0.0000	0.0145	33.667	0.91	2.20	-1.29	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3920	0.5022	0.1058	1	1	0.3912	0.5011	0.1076	1	1	0.3901	0.4999	0.1100
chr19	39906132	AGC	A	0.783963	0.050	1	-2	1	206	30	176	0	0	2	27	1	0	0	176	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	12.500		2.00		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1226	0.8774	2	2	0.0000	0.1241	0.8759	2	2	0.0000	0.1263	0.8737
chr19	39906137	T	TGC	0.795815	0.050	1	2	2	205	30	175	0	0	21	9	0	0	0	175	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	0.333				0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1543	0.8457	2	2	0.0000	0.1555	0.8445	2	2	0.0000	0.1571	0.8429
chr19	40667987	CTGCTGT	C	0.548568	0.050	1	-6	1	471	134	337	75	2	9	0	48	0	0	337	0	0	0.5597	0.0000	0.0000	13.778	0.19	5.40	-5.21	11	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5905	0.3677	0.0418	1	0	0.5783	0.3760	0.0457	1	0	0.5618	0.3869	0.0513
chr19	41116202	G	GC	0.200742	0.050	1	1	2	534	164	370	162	0	2	0	0	0	0	370	0	0	0.9878	0.0000	0.0000	81.000	0.41			84	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9958	0.0042	0.0000	0	0	0.9954	0.0046	0.0000	0	0	0.9949	0.0051	0.0000
chr19	41577387	A	AGAC	0.041016	0.050	1	3	1	344	135	209	126	0	5	0	4	0	0	209	0	0	0.9333	0.0000	0.0000	26.000	0.75	3.25	-2.50	16	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4484	0.5516	0.0000	0	0	0.9731	0.0269	0.0000	0	0	0.9909	0.0091	0.0000
chr19	43847014	GGGAGAT	G	0.416095	0.050	1	-6	1	316	80	236	3	0	1	0	76	0	0	233	0	3	0.0375	0.0000	0.0127	79.000	0.00	6.70	-6.70	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9626	0.0374	2	1	0.0000	0.5973	0.4027	2	2	0.0000	0.3917	0.6083
chr19	44085846	TCTC	T	0.633374	0.050	1	-3	2	568	168	400	160	0	0	0	8	0	0	400	0	0	0.9524	0.0000	0.0000	168.000	0.23	3.25	-3.02	54	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.1253	0.8747	0.0000	0	0	0.5783	0.4217	0.0000
chr19	44273995	TCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTGAGGTATGTGATAAGGGCTTCAGTAAGGCCTCAAATCTTCAAGCCCATCAGAGAATC	T	0.002701	0.050	1	-84	2	630	146	484	100	1	19	0	26	0	0	461	0	23	0.6849	0.0000	0.0475	6.684	0.54	4.31	-3.77	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9160	0.0840	0.0000	1	0	0.9092	0.0908	0.0000	1	0	0.8994	0.1006	0.0000
chr19	44274642	CG	C	0.147169	0.050	1	-1	2	479	135	344	4	0	5	4	122	0	0	340	1	3	0.0296	0.0000	0.0116	32.500	0.25	2.16	-1.91	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9933	0.0067	2	1	0.0000	0.7715	0.2285	2	1	0.0000	0.5310	0.4690
chr19	44793589	A	AC	0.013876	0.050	1	1	1	299	131	168	69	0	4	0	58	0	0	167	0	1	0.5267	0.0000	0.0060	31.750	1.09	1.97	-0.88	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5785	0.4184	0.0030	1	0	0.5767	0.4201	0.0031	1	0	0.5742	0.4226	0.0033
chr19	45145565	GGACTCA	G	0.000407	0.050	1	-6	3	702	150	552	74	0	5	1	70	0	0	551	0	1	0.4933	0.0000	0.0018	28.800	0.32	6.09	-5.76	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4826	0.5173	0.0002	1	1	0.4849	0.5150	0.0002	1	1	0.4877	0.5121	0.0002
chr19	45761789	A	ATCCAGC	0.479648	0.050	1	6	2	815	274	541	109	0	65	0	100	0	0	523	0	18	0.3978	0.0000	0.0333	3.215	0.21	6.15	-5.94	47	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1388	0.5495	0.3117	1	1	0.1433	0.5459	0.3108	1	1	0.1492	0.5414	0.3094
chr19	45795880	T	TCTCCTCGCCCTCCTCCTC	0.105365	0.050	1	18	1	367	110	257	52	0	30	0	28	0	0	238	0	19	0.4727	0.0000	0.0739	2.667	0.29	14.21	-13.93	22	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4861	0.4789	0.0349	1	0	0.4857	0.4787	0.0356	1	0	0.4850	0.4785	0.0364
chr19	46493759	C	CCGGCCT	0.138319	0.050	1	6	4	379	77	302	36	0	11	0	30	0	0	298	1	3	0.4675	0.0000	0.0132	6.000	3.06	7.33	-4.28	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4393	0.5029	0.0578	1	1	0.4396	0.5020	0.0583	1	1	0.4401	0.5010	0.0590
chr19	47802317	AGATTGGGCCTGG	A	0.001318	0.050	1	-12	1	1431	365	1066	287	10	48	10	10	0	1	1064	1	0	0.7863	0.0000	0.0019	6.574	2.27	8.20	-5.93	73	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	0	0.9739	0.0261	0.0000	0	0	0.9996	0.0004	0.0000
chr19	49154632	T	TTCCTCCTCC	0.001742	0.050	1	9	1	1119	281	838	116	3	63	5	94	0	0	838	0	0	0.4128	0.0000	0.0000	3.413	0.72	7.19	-6.47	62	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6865	0.3133	0.0001	1	0	0.6821	0.3178	0.0002	1	0	0.6759	0.3239	0.0002
chr19	49652104	GCCGCTC	G	0.363480	0.050	1	-6	2	590	172	418	0	0	26	0	146	0	0	409	2	7	0.0000	0.0000	0.0215	5.615		7.16		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0343	0.9657	2	2	0.0000	0.0370	0.9630	2	2	0.0000	0.0410	0.9590
chr19	49746675	TCTGCTTCTCCTCCGGCTC	T	0.095886	0.050	1	-18	2	621	242	379	98	1	65	1	77	0	0	379	0	0	0.4050	0.0000	0.0000	2.708	0.34	12.45	-12.12	26	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6674	0.3237	0.0088	1	0	0.6618	0.3287	0.0095	1	0	0.6541	0.3355	0.0104
chr19	49969702	A	ATGC	0.001079	0.050	1	3	1	908	204	704	178	2	21	0	3	0	2	702	0	0	0.8725	0.0000	0.0028	8.667	0.42	3.00	-2.58	74	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9985	0.0015	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr19	50378565	A	ACAG	0.341817	0.050	1	3	3	702	160	542	0	0	12	2	146	0	0	535	0	7	0.0000	0.0000	0.0129	12.250		3.06		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0376	0.9624	2	2	0.0000	0.0405	0.9595	2	2	0.0000	0.0449	0.9551
chr19	51354620	C	CCCACAG	0.012921	0.050	1	6	2	639	181	458	93	0	12	0	76	0	0	454	0	4	0.5138	0.0000	0.0087	14.083	0.41	5.13	-4.72	11	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6018	0.3960	0.0022	1	0	0.5996	0.3981	0.0023	1	0	0.5965	0.4010	0.0024
chr19	51501537	G	GC	0.655856	0.050	1	1	1	511	140	371	71	0	5	7	57	0	0	371	0	0	0.5071	0.0000	0.0000	27.000	0.73	2.84	-2.11	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2357	0.5531	0.2112	1	1	0.2340	0.5502	0.2159	1	1	0.2316	0.5465	0.2220
chr19	52300416	CTG	C	0.721947	0.050	1	-2	1	247	117	130	62	0	0	0	55	0	0	129	0	1	0.5299	0.0000	0.0077	117.000	0.47	2.05	-1.59	44	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1811	0.5591	0.2598	1	1	0.1799	0.5559	0.2641	1	1	0.1784	0.5518	0.2698
chr19	52383892	TA	T	0.382581	0.050	1	-1	2	550	171	379	13	0	1	0	157	0	0	379	0	0	0.0760	0.0000	0.0000	170.000	0.15	2.57	-2.42	7	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9948	0.0052	2	1	0.0000	0.8227	0.1773
chr19	52383993	T	TCAA	0.387747	0.050	1	3	1	607	159	448	3	0	7	0	149	0	0	443	0	5	0.0189	0.0000	0.0112	21.714	0.33	3.70	-3.37	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.8143	0.1857	2	2	0.0000	0.2079	0.7921	2	2	0.0000	0.1072	0.8928
chr19	52951222	C	CACT	0.402666	0.050	1	3	2	993	258	735	7	0	1	0	250	0	0	733	0	2	0.0271	0.0000	0.0027	257.000	0.00	3.02	-3.02	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9959	0.0041	2	2	0.0000	0.2413	0.7587	2	2	0.0000	0.0454	0.9546
chr19	54250974	TG	T	0.674930	0.050	1	-1	5	739	217	522	13	0	6	1	197	0	0	519	0	3	0.0599	0.0000	0.0057	35.167	0.92	1.49	-0.57	11	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9508	0.0492	2	2	0.0000	0.3259	0.6741
chr19	54462808	G	GCCT	0.457433	0.050	1	3	1	778	156	622	1	0	5	1	149	0	0	617	0	5	0.0064	0.0000	0.0080	30.200	0.00	3.61	-3.61	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1094	0.8906	2	2	0.0000	0.0482	0.9518	2	2	0.0000	0.0402	0.9598
chr19	55048755	GCTC	G	0.000317	0.050	1	-3	1	263	62	201	25	0	4	1	32	0	0	200	0	1	0.4032	0.0000	0.0050	14.500	0.16	2.94	-2.78	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3736	0.6261	0.0003	1	1	0.3789	0.6208	0.0003	1	1	0.3858	0.6139	0.0003
chr19	55279518	A	AGCCGCCGCC	0.498757	0.050	1	9	2	474	145	329	62	0	31	1	51	0	0	320	1	8	0.4276	0.0000	0.0274	3.677	0.21	7.12	-6.91	30	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2439	0.5371	0.2190	1	1	0.2449	0.5343	0.2208	1	1	0.2461	0.5308	0.2231
chr19	55358511	GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT	G	0.867196	0.050	1	-24	1	632	118	514	0	0	21	0	97	0	0	475	0	39	0.0000	0.0000	0.0759	4.619		18.84		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0050	0.9950	2	2	0.0000	0.0053	0.9947	2	2	0.0000	0.0058	0.9942
chr19	55518249	C	CCCA	0.294252	0.050	1	3	4	911	278	633	124	1	37	7	109	0	0	627	0	6	0.4460	0.0000	0.0095	6.639	0.74	4.94	-4.19	72	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3412	0.5557	0.1031	1	1	0.3439	0.5509	0.1052	1	1	0.3471	0.5449	0.1079
chr19	55578542	C	CCCG	0.537557	0.050	1	3	1	591	116	475	0	0	0	0	116	0	0	471	0	4	0.0000	0.0000	0.0084	116.000		4.04		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0403	0.9597	2	2	0.0000	0.0427	0.9573	2	2	0.0000	0.0462	0.9538
chr19	56284206	G	GGTAA	0.001119	0.050	1	4	1	71	40	31	21	0	2	1	16	0	0	31	0	0	0.5250	0.0000	0.0000	18.500	0.38	4.62	-4.24	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5399	0.4597	0.0004	1	0	0.5387	0.4609	0.0004	1	0	0.5372	0.4624	0.0004
chr19	56814359	A	ATCT	0.007767	0.050	1	3	1	577	99	478	46	3	12	0	38	0	0	477	0	1	0.4646	0.0000	0.0021	7.250	0.22	3.08	-2.86	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5926	0.4057	0.0017	1	0	0.5899	0.4083	0.0018	1	0	0.5863	0.4119	0.0019
chr19	57456271	TAA	T	0.000987	0.050	1	-2	2	622	143	479	133	0	1	0	9	0	0	479	0	0	0.9301	0.0000	0.0000	142.000	0.26	2.11	-1.85	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0119	0.9881	0.0000	0	0	0.9851	0.0149	0.0000	0	0	0.9988	0.0012	0.0000
chr20	145514	GCAAA	G	0.152578	0.050	1	-4	2	348	104	244	53	0	1	0	50	0	0	244	0	0	0.5096	0.0000	0.0000	103.000	0.11	4.08	-3.97	33	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4371	0.5044	0.0585	1	1	0.4377	0.5031	0.0592	1	1	0.4383	0.5015	0.0602
chr20	145669	ACC	A	0.558572	0.050	1	-2	1	349	145	204	67	0	3	0	75	0	0	203	0	1	0.4621	0.0000	0.0049	47.333	0.21	2.15	-1.94	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1206	0.5078	0.3716	1	1	0.1241	0.5066	0.3693	1	1	0.1286	0.5052	0.3661
chr20	257794	CTGGTCT	C	0.606741	0.050	1	-6	2	121	71	50	49	0	0	0	22	0	0	50	0	0	0.6901	0.0000	0.0000	71.000	0.04	5.91	-5.87	15	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5444	0.3974	0.0582	1	0	0.5314	0.4057	0.0629	1	0	0.5139	0.4164	0.0697
chr20	298046	C	CCGG	0.073154	0.050	1	3	1	475	119	356	98	3	9	1	8	0	0	356	0	0	0.8235	0.0000	0.0000	12.111	0.84	3.38	-2.54	28	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	1	0.4018	0.5982	0.0000	0	0	0.8712	0.1288	0.0000
chr20	3045699	A	AGCCCC	0.132912	0.050	1	5	1	369	158	211	84	0	12	1	61	0	0	208	0	3	0.5316	0.0000	0.0142	12.083	0.38	6.11	-5.73	46	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.6441	0.3414	0.0145	1	0	0.6383	0.3463	0.0155	1	0	0.6303	0.3528	0.0169
chr20	3864345	C	CAAG	0.001475	0.050	1	3	2	491	156	335	152	0	1	0	3	0	0	335	0	0	0.9744	0.0000	0.0000	155.000	0.41	3.33	-2.92	62	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9957	0.0043	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr20	4699448	CCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCT	C	0.009335	0.050	1	-24	4	928	261	667	130	2	24	1	104	0	0	667	0	0	0.4981	0.0000	0.0000	9.833	0.48	8.77	-8.28	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7411	0.2584	0.0005	1	0	0.7353	0.2642	0.0005	1	0	0.7271	0.2723	0.0006
chr20	18465360	T	TTC	0.004672	0.050	1	2	4	181	52	129	18	5	25	0	4	0	0	129	0	0	0.3462	0.0000	0.0000	1.080	7.17	10.00	-2.83	8	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3856	0.6144	0.0000	0	0	0.9639	0.0361	0.0000	0	0	0.9884	0.0116	0.0000
chr20	21126073	C	CG	0.617502	0.050	1	1	2	227	91	136	79	1	7	0	4	0	0	136	0	0	0.8681	0.0000	0.0000	14.000	0.30	1.50	-1.20	39	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0068	0.9932	0.0000	0	1	0.2321	0.7679	0.0000	0	1	0.4827	0.5173	0.0000
chr20	25476413	GCTCCCA	G	0.449443	0.050	1	-6	2	729	196	533	95	0	3	0	98	0	0	531	0	2	0.4847	0.0000	0.0038	64.333	0.22	6.87	-6.65	31	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1890	0.5579	0.2530	1	1	0.1929	0.5538	0.2533	1	1	0.1979	0.5486	0.2535
chr20	33663701	TGCGGCGGCAAGAGGC	T	0.003375	0.050	1	-15	1	659	187	472	99	0	12	0	76	0	0	467	0	5	0.5294	0.0000	0.0106	14.583	0.38	13.39	-13.01	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6605	0.3391	0.0004	1	0	0.6565	0.3431	0.0004	1	0	0.6510	0.3486	0.0004
chr20	34077058	C	CCAG	0.656931	0.050	1	3	1	492	165	327	0	1	1	3	160	0	0	318	0	9	0.0000	0.0000	0.0275	163.000		3.52		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0080	0.9920	2	2	0.0000	0.0086	0.9914	2	2	0.0000	0.0094	0.9906
chr20	35277855	AGGCTGGGGCTGG	A	0.001908	0.050	1	-12	1	390	135	255	70	0	7	0	58	0	0	251	0	4	0.5185	0.0000	0.0157	18.286	0.16	13.52	-13.36	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5576	0.4420	0.0005	1	0	0.5568	0.4427	0.0005	1	0	0.5556	0.4439	0.0005
chr20	45311890	ACAGCGCGTCCGG	A	0.002746	0.050	1	-12	2	540	150	390	139	0	8	0	3	0	0	390	0	0	0.9267	0.0000	0.0000	17.750	0.33	13.67	-13.34	41	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9890	0.0110	0.0000	0	0	0.9993	0.0007	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000
chr20	45375515	CATT	C	0.606231	0.050	1	-3	2	632	176	456	165	0	4	0	7	0	0	456	0	0	0.9375	0.0000	0.0000	43.000	0.41	3.29	-2.88	71	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0005	0.9995	0.0000	0	1	0.2623	0.7377	0.0000	0	0	0.7158	0.2842	0.0000
chr20	45891598	CCTG	C	0.607197	0.050	1	-3	2	956	281	675	111	1	39	4	126	0	0	671	2	2	0.3950	0.0000	0.0059	6.179	0.19	3.25	-3.06	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0419	0.4162	0.5418	1	2	0.0450	0.4192	0.5358	1	2	0.0493	0.4233	0.5274
chr20	47651092	ACAG	A	0.342693	0.050	1	-3	2	595	280	315	2	4	42	14	218	0	0	313	0	2	0.0071	0.0000	0.0063	5.571	2.50	3.24	-0.74	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1599	0.8401	2	2	0.0000	0.0294	0.9706	2	2	0.0000	0.0187	0.9813
chr20	62065249	TGCCAGG	T	0.994314	0.050	1	-6	2	204	29	175	0	0	2	0	27	0	0	172	1	2	0.0000	0.0000	0.0171	13.500		7.30		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0027	0.9973	2	2	0.0000	0.0028	0.9972	2	2	0.0000	0.0028	0.9972
chr21	30541662	AG	A	0.714353	0.050	1	-1	1	296	141	155	0	0	2	0	139	0	0	155	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	69.500		2.11		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0120	0.9880	2	2	0.0000	0.0128	0.9872	2	2	0.0000	0.0141	0.9859
chr21	32631618	A	AAGTATT	0.509844	0.050	1	6	4	809	200	609	107	0	2	0	91	0	0	605	0	4	0.5350	0.0000	0.0066	99.000	0.07	5.68	-5.61	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3623	0.5227	0.1150	1	1	0.3596	0.5209	0.1195	1	1	0.3557	0.5188	0.1255
chr21	33070402	CTCCTCCACT	C	0.002225	0.050	1	-9	2	506	151	355	139	2	6	0	4	0	0	355	0	0	0.9205	0.0000	0.0000	24.000	0.85	9.00	-8.15	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9573	0.0427	0.0000	0	0	0.9990	0.0010	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000
chr21	34670163	GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA	G	0.216105	0.050	1	-30	1	825	219	606	190	2	20	0	7	4	3	598	1	0	0.8676	0.0066	0.0132	9.900	1.51	16.71	-15.20	16	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0019	0.9981	0.0000	0	0	0.7205	0.2795	0.0000	0	0	0.9575	0.0425	0.0000
chr21	39511744	G	GAGA	0.574597	0.050	1	3	2	212	111	101	59	0	6	0	46	0	0	101	0	0	0.5315	0.0000	0.0000	17.500	0.03	4.02	-3.99	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3599	0.5057	0.1344	1	1	0.3547	0.5061	0.1392	1	1	0.3478	0.5065	0.1457
chr21	41878845	C	CG	0.999218	0.050	1	1	2	280	39	241	0	1	1	1	36	0	0	239	0	2	0.0000	0.0000	0.0083	37.000		2.67		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0003	0.9997	2	2	0.0000	0.0003	0.9997	2	2	0.0000	0.0003	0.9997
chr21	44539673	A	ATG	0.649605	0.050	1	2	2	1137	182	955	89	3	3	8	79	3	1	944	2	5	0.4890	0.0031	0.0115	88.500	0.67	3.04	-2.36	25	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1794	0.5647	0.2559	1	1	0.1801	0.5603	0.2596	1	1	0.1810	0.5546	0.2644
chr21	44539674	ATC	A	0.649658	0.050	1	-2	2	1138	183	955	88	3	12	8	72	2	2	944	2	5	0.4809	0.0021	0.0115	15.545	0.66	3.32	-2.66	26	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2348	0.5656	0.1996	1	1	0.2336	0.5618	0.2046	1	1	0.2318	0.5569	0.2113
chr21	44637695	CCTGCTGTGTGCCTGT	C	0.541271	0.050	1	-15	2	562	112	450	98	6	5	0	3	0	0	449	0	1	0.8750	0.0000	0.0022	35.667	5.24	12.33	-7.09	38	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0178	0.9822	0.0000	0	1	0.4402	0.5598	0.0000	0	0	0.7042	0.2958	0.0000
chr21	45504511	CGGCCCCCCA	C	0.965477	0.050	1	-9	7	383	166	217	0	1	13	2	150	0	0	217	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	11.769		7.47		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0033	0.9967	2	2	0.0000	0.0016	0.9984	2	2	0.0000	0.0013	0.9987
chr21	45505235	A	AGGCCCCCCC	0.016294	0.050	1	9	6	400	80	320	1	0	11	1	67	0	0	320	0	0	0.0125	0.0000	0.0000	6.273	1.00	5.96	-4.96	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9824	0.0176	2	1	0.0000	0.9565	0.0435	2	1	0.0000	0.9449	0.0551
chr21	46302071	A	ATGG	0.319174	0.050	1	3	1	550	212	338	174	4	28	0	6	0	0	338	0	0	0.8208	0.0000	0.0000	6.571	0.30	4.50	-4.20	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0105	0.9895	0.0000	0	0	0.7579	0.2421	0.0000	0	0	0.9424	0.0576	0.0000
chr22	17109651	TGGAGGAAGA	T	0.001153	0.050	1	-9	3	762	211	551	114	0	17	0	80	0	0	547	0	4	0.5403	0.0000	0.0073	11.412	0.23	7.97	-7.75	26	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7755	0.2245	0.0000	1	0	0.7686	0.2313	0.0001	1	0	0.7592	0.2407	0.0001
chr22	23617579	G	GCAT	0.002056	0.050	1	3	3	243	98	145	46	3	9	0	40	0	0	143	0	2	0.4694	0.0000	0.0138	9.889	0.13	3.65	-3.52	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5576	0.4419	0.0006	1	0	0.5563	0.4431	0.0006	1	0	0.5546	0.4448	0.0006
chr22	23622095	GCAT	G	0.240155	0.050	1	-3	3	212	104	108	55	1	3	1	44	0	0	107	0	1	0.5288	0.0000	0.0093	33.667	0.29	3.36	-3.07	11	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4927	0.4490	0.0582	1	0	0.4895	0.4504	0.0601	1	0	0.4852	0.4523	0.0626
chr22	26483980	GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA	G	0.877460	0.050	1	-21	3	610	155	455	113	1	40	0	1	2	1	449	1	2	0.7290	0.0044	0.0132	2.875	1.12	21.00	-19.88	49	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0164	0.9836	0.0000	0	1	0.2254	0.7746	0.0000	0	1	0.4012	0.5988	0.0000
chr22	27798924	T	TTGC	0.004414	0.050	1	3	1	1076	293	783	109	5	35	4	140	0	0	780	0	3	0.3720	0.0000	0.0038	7.314	0.65	3.27	-2.62	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1213	0.8643	0.0143	1	1	0.1310	0.8553	0.0137	1	1	0.1446	0.8427	0.0128
chr22	29441577	TTCC	T	0.403493	0.050	1	-3	1	833	230	603	127	0	2	1	100	0	0	599	0	4	0.5522	0.0000	0.0066	113.500	0.28	3.14	-2.86	63	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5502	0.4084	0.0414	1	0	0.5435	0.4120	0.0445	1	0	0.5343	0.4168	0.0489
chr22	30428672	T	TA	0.000840	0.050	1	1	2	238	76	162	73	0	1	0	2	0	0	162	0	0	0.9605	0.0000	0.0000	75.000	0.18	1.00	-0.82	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9966	0.0034	0.0000	0	0	0.9995	0.0005	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000
chr22	35728842	GC	G	0.001215	0.050	1	-1	1	350	107	243	61	2	5	0	39	0	0	243	0	0	0.5701	0.0000	0.0000	20.400	1.00	1.28	-0.28	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7420	0.2580	0.0001	1	0	0.7350	0.2649	0.0001	1	0	0.7255	0.2744	0.0001
chr22	36191797	ACT	A	0.485373	0.050	1	-2	3	697	183	514	98	0	6	0	79	0	0	513	0	1	0.5355	0.0000	0.0019	29.500	0.45	2.43	-1.98	26	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4649	0.4611	0.0740	1	1	0.4587	0.4632	0.0781	1	1	0.4502	0.4659	0.0839
chr22	37510301	GCTCCTT	G	0.237706	0.050	1	-6	2	476	221	255	80	0	51	1	89	0	0	253	0	2	0.3620	0.0000	0.0078	3.333	0.89	6.03	-5.15	26	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2020	0.5917	0.2063	1	1	0.2086	0.5879	0.2035	1	1	0.2174	0.5828	0.1997
chr22	37568401	CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT	C	0.558599	0.050	1	-21	6	588	137	451	123	2	7	0	5	0	0	451	0	0	0.8978	0.0000	0.0000	18.429	0.76	17.60	-16.84	31	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0052	0.9948	0.0000	0	1	0.3787	0.6213	0.0000	0	0	0.7109	0.2891	0.0000
chr22	38087148	T	TTCATGGGTG	0.341262	0.050	1	9	4	388	193	195	167	1	23	0	2	0	0	195	0	0	0.8653	0.0000	0.0000	7.391	3.49	6.50	-3.01	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.8348	0.1652	0.0000	0	0	0.9697	0.0303	0.0000	0	0	0.9809	0.0191	0.0000
chr22	38087182	A	AGGTCATGGG	0.001043	0.050	1	9	2	381	190	191	76	0	16	0	98	0	0	190	0	1	0.4000	0.0000	0.0052	10.875	0.20	6.78	-6.58	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2051	0.7928	0.0021	1	1	0.2151	0.7829	0.0020	1	1	0.2285	0.7696	0.0019
chr22	39100317	TAAC	T	0.333557	0.050	1	-3	3	236	115	121	99	1	11	0	4	1	0	120	0	0	0.8609	0.0083	0.0083	9.455	0.21	3.25	-3.04	43	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0357	0.9643	0.0000	0	0	0.6252	0.3748	0.0000	0	0	0.8357	0.1643	0.0000
chr22	39381817	C	CCAA	0.707679	0.050	1	3	3	380	143	237	0	0	6	0	137	0	0	231	0	6	0.0000	0.0000	0.0253	22.833		3.28		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0112	0.9888	2	2	0.0000	0.0120	0.9880	2	2	0.0000	0.0132	0.9868
chr22	42142513	T	TC	0.297594	0.050	1	1	3	1163	245	918	10	0	2	0	233	0	0	897	0	21	0.0408	0.0000	0.0229	121.500	0.30	9.09	-8.79	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.7786	0.2214	2	2	0.0000	0.1797	0.8203
chr22	42144326	CA	C	0.011227	0.050	1	-1	1	855	375	480	260	0	6	0	109	0	0	480	0	0	0.6933	0.0000	0.0000	61.500	0.25	2.95	-2.70	88	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9991	0.0009	0.0000	1	0	0.9988	0.0012	0.0000	1	0	0.9984	0.0016	0.0000
chr22	46262985	ACGAGCG	A	0.051474	0.050	1	-6	1	704	118	586	3	0	9	2	104	0	0	578	0	8	0.0254	0.0000	0.0137	12.111	2.33	7.10	-4.76	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9929	0.0071	2	1	0.0000	0.8915	0.1085	2	1	0.0000	0.7852	0.2148
chr22	46363187	CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA	C	0.006403	0.050	1	-27	3	201	65	136	3	0	23	0	39	0	0	126	0	10	0.0462	0.0000	0.0735	1.826	0.00	15.51	-15.51	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9998	0.0002	2	1	0.0000	0.9971	0.0029	2	1	0.0000	0.9932	0.0068
chr22	50482719	AACACTCGGGCCCCCGAAG	A	0.106467	0.050	1	-18	2	387	113	274	84	2	24	1	2	0	0	274	0	0	0.7434	0.0000	0.0000	3.708	0.67	18.00	-17.33	30	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3908	0.6092	0.0000	0	0	0.9064	0.0936	0.0000	0	0	0.9562	0.0438	0.0000

787 rows