File Info

Filename
HG03492_x_HG03516_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG03492_x_HG03516_FF_10.features.tsv
Size
171.9 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:07 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1641723 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 541 207 334 179 0 12 0 16 0 0 334 0 0 0.8647 0.0000 0.0000 16.250 0.46 9.19 -8.73 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1703 0.8297 0.0000
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 300 133 167 77 0 13 0 43 0 0 167 0 0 0.5789 0.0000 0.0000 9.231 1.12 7.67 -6.56 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8888 0.1101 0.0011 1 0 0.8799 0.1188 0.0014 1 0 0.8668 0.1313 0.0019
chr1 6469126 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 876 290 586 239 3 29 0 19 0 0 586 0 0 0.8241 0.0000 0.0000 87.000 0.32 3.89 -3.57 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2192 0.7808 0.0000
chr1 6469129 TCC T 0.500000 0.100 1 -2 2 880 290 590 246 1 11 13 19 0 0 590 0 0 0.8483 0.0000 0.0000 53.000 0.36 3.89 -3.53 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0373 0.9627 0.0000
chr1 10639083 CTCGTCG C 0.500000 0.100 1 -6 2 579 111 468 69 1 9 0 32 0 0 466 0 2 0.6216 0.0000 0.0043 11.333 1.45 6.78 -5.33 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9134 0.0858 0.0007 1 0 0.9051 0.0939 0.0009 1 0 0.8928 0.1058 0.0013
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 590 140 450 117 0 19 0 4 0 0 450 0 0 0.8357 0.0000 0.0000 6.368 0.44 3.75 -3.31 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0509 0.9491 0.0000 0 0 0.8299 0.1701 0.0000 0 0 0.9573 0.0427 0.0000
chr1 11767056 GAC G 0.500000 0.100 1 -2 1 635 137 498 125 1 5 1 5 0 0 498 0 0 0.9124 0.0000 0.0000 26.200 0.74 3.40 -2.66 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0057 0.9943 0.0000 0 0 0.6400 0.3600 0.0000 0 0 0.9303 0.0697 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 1075 209 866 97 0 12 0 100 0 0 859 0 7 0.4641 0.0000 0.0081 16.417 0.85 3.26 -2.41 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0436 0.6396 0.3168 1 1 0.0481 0.6287 0.3233 1 1 0.0544 0.6149 0.3307
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 1701 312 1389 230 12 23 2 45 0 0 1389 0 0 0.7372 0.0000 0.0000 12.087 1.62 1.71 -0.09 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 26282316 TGGGTCCAGGACA T 0.500000 0.100 1 -12 1 844 185 659 133 10 7 4 31 1 1 635 13 9 0.7189 0.0015 0.0364 58.000 6.89 26.84 -19.95 105 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9991 0.0009 0.0000 1 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr1 26282362 GCCGGGACCGGGA G 0.500000 0.100 1 -12 4 895 216 679 77 26 25 7 81 2 2 664 2 9 0.3565 0.0029 0.0221 8.409 4.35 21.11 -16.76 53 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2412 0.6902 0.0686 1 1 0.2488 0.6769 0.0743 1 1 0.2580 0.6599 0.0821
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 900 209 691 70 64 10 35 30 8 2 679 1 1 0.3349 0.0116 0.0174 24.857 5.31 27.60 -22.29 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9960 0.0040 0.0000 1 0 0.9951 0.0049 0.0000 1 0 0.9936 0.0064 0.0000
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 921 250 671 63 9 41 8 129 0 0 664 0 7 0.2520 0.0000 0.0104 9.364 1.70 14.29 -12.59 39 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0087 0.9913 1 2 0.0000 0.0103 0.9897 1 2 0.0000 0.0130 0.9870
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.100 1 -24 1 663 159 504 149 0 2 0 8 0 0 503 0 1 0.9371 0.0000 0.0020 78.500 0.62 21.12 -20.51 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1052 0.8948 0.0000 0 0 0.8106 0.1894 0.0000
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 387 152 235 51 4 16 1 80 0 0 234 0 1 0.3355 0.0000 0.0043 8.500 0.14 3.12 -2.99 21 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0037 0.2116 0.7847 1 2 0.0045 0.2203 0.7752 1 2 0.0058 0.2327 0.7615
chr1 32895614 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 713 201 512 187 0 3 0 11 0 0 512 0 0 0.9303 0.0000 0.0000 66.000 0.29 1.09 -0.80 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0879 0.9121 0.0000 0 0 0.8834 0.1166 0.0000
chr1 34761404 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 765 214 551 203 0 2 0 9 0 0 551 0 0 0.9486 0.0000 0.0000 106.000 0.21 2.22 -2.01 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6400 0.3600 0.0000 0 0 0.9834 0.0166 0.0000
chr1 43222837 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 1 336 92 244 53 0 2 0 37 0 0 240 0 4 0.5761 0.0000 0.0164 45.000 0.15 3.14 -2.98 23 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4859 0.4691 0.0450 1 0 0.4813 0.4698 0.0489 1 0 0.4746 0.4710 0.0544
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 436 124 312 60 0 10 0 54 0 0 311 0 1 0.4839 0.0000 0.0032 11.400 0.25 3.04 -2.79 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2847 0.6097 0.1056 1 1 0.2876 0.6015 0.1109 1 1 0.2908 0.5912 0.1179
chr1 46402196 GTGGGAAAGGTAAGGCCAGCCAAGGCCAGCCCCTCCC G 0.500000 0.100 1 -36 1 149 74 75 50 0 21 0 3 0 0 75 0 0 0.6757 0.0000 0.0000 2.524 0.26 1.00 -0.74 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0162 0.9838 0.0000 0 1 0.3331 0.6669 0.0000 0 0 0.6229 0.3771 0.0000
chr1 46668333 G GCCT 0.500000 0.100 1 3 5 444 199 245 171 5 13 1 9 0 1 244 0 0 0.8593 0.0000 0.0041 14.154 0.91 2.89 -1.98 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1485 0.8515 0.0000 0 0 0.8990 0.1010 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 705 186 519 0 0 31 3 152 0 0 519 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.935 6.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 295 109 186 55 2 6 0 46 0 0 186 0 0 0.5046 0.0000 0.0000 17.167 0.31 3.04 -2.73 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4484 0.5007 0.0509 1 1 0.4455 0.4994 0.0550 1 1 0.4411 0.4981 0.0609
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 507 160 347 116 4 25 0 15 0 0 346 0 1 0.7250 0.0000 0.0029 5.400 0.44 3.27 -2.83 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0116 0.9884 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 192 99 93 61 0 5 0 33 0 0 92 0 1 0.6162 0.0000 0.0108 18.800 0.11 3.45 -3.34 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8170 0.1792 0.0039 1 0 0.8060 0.1893 0.0047 1 0 0.7905 0.2035 0.0060
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 367 171 196 77 0 28 0 66 0 0 195 0 1 0.4503 0.0000 0.0051 5.107 0.18 10.18 -10.00 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3785 0.5693 0.0521 1 1 0.3802 0.5633 0.0565 1 1 0.3815 0.5558 0.0628
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 564 189 375 89 1 6 1 92 0 0 368 0 7 0.4709 0.0000 0.0187 30.333 0.34 5.48 -5.14 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0445 0.6196 0.3359 1 1 0.0489 0.6100 0.3412 1 1 0.0551 0.5979 0.3470
chr1 92074789 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 811 252 559 243 0 1 0 8 0 0 558 0 1 0.9643 0.0000 0.0018 251.000 0.47 1.12 -0.66 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.9283 0.0717 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 202 83 119 10 0 2 0 71 0 0 117 0 2 0.1205 0.0000 0.0168 40.500 0.10 3.17 -3.07 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9466 0.0534
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 481 140 341 13 0 5 6 116 0 0 332 1 8 0.0929 0.0000 0.0264 26.800 0.38 3.25 -2.87 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8816 0.1184
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 767 198 569 103 6 20 2 67 0 0 568 0 1 0.5202 0.0000 0.0018 8.800 0.40 3.72 -3.32 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9087 0.0909 0.0004 1 0 0.9014 0.0981 0.0005 1 0 0.8906 0.1086 0.0008
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 186 78 108 71 0 3 0 4 0 0 108 0 0 0.9103 0.0000 0.0000 25.000 0.30 3.25 -2.95 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 1 0.3294 0.6706 0.0000 0 0 0.7065 0.2935 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1352 278 1074 141 0 36 0 101 0 0 1063 1 10 0.5072 0.0000 0.0102 6.722 0.50 3.74 -3.24 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7181 0.2796 0.0023 1 0 0.7142 0.2830 0.0028 1 0 0.7078 0.2885 0.0038
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 312 102 210 4 2 8 6 82 0 0 209 1 0 0.0392 0.0000 0.0048 11.125 1.00 1.39 -0.39 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9942 0.0058 2 1 0.0000 0.6398 0.3602 2 2 0.0000 0.2441 0.7559
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 274 94 180 38 0 15 1 40 0 0 169 0 11 0.4043 0.0000 0.0611 5.200 0.11 11.80 -11.69 8 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0357 0.4288 0.5355 1 2 0.0392 0.4318 0.5291 1 2 0.0442 0.4360 0.5199
chr1 152709213 G GGGCTGCTGTAGCTCTGGC 0.500000 0.100 1 18 5 274 104 170 43 0 5 1 55 0 0 170 0 0 0.4135 0.0000 0.0000 19.600 0.09 8.89 -8.80 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0405 0.4607 0.4987 1 2 0.0442 0.4618 0.4940 1 2 0.0495 0.4635 0.4870
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 820 212 608 170 4 26 5 7 0 0 608 0 0 0.8019 0.0000 0.0000 7.708 1.54 5.57 -4.04 82 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2025 0.7975 0.0000 0 0 0.8935 0.1065 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1311 336 975 17 1 66 5 247 0 0 915 3 57 0.0506 0.0000 0.0615 4.045 2.24 10.30 -8.06 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9361 0.0639 2 2 0.0000 0.0166 0.9834
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 596 270 326 159 0 14 0 97 0 0 326 0 0 0.5889 0.0000 0.0000 18.286 0.38 7.73 -7.35 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9852 0.0148 0.0000 1 0 0.9829 0.0171 0.0000 1 0 0.9793 0.0206 0.0000
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 1246 277 969 3 1 78 1 194 0 0 892 0 77 0.0108 0.0000 0.0795 2.571 16.00 8.36 7.64 1 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 155738163 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 268 136 132 79 0 6 0 51 0 0 131 0 1 0.5809 0.0000 0.0076 21.667 0.33 2.90 -2.57 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7896 0.2066 0.0037 1 0 0.7799 0.2156 0.0045 1 0 0.7659 0.2282 0.0059
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 246 87 159 2 0 3 0 82 0 0 158 0 1 0.0230 0.0000 0.0063 28.000 0.50 2.12 -1.62 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5355 0.4645 2 2 0.0000 0.1157 0.8843 2 2 0.0000 0.0599 0.9401
chr1 156583439 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 361 92 269 53 0 3 0 36 0 0 268 0 1 0.5761 0.0000 0.0037 29.667 0.23 1.14 -0.91 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5977 0.3777 0.0247 1 0 0.5894 0.3831 0.0275 1 0 0.5778 0.3905 0.0317
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 431 113 318 0 0 0 0 113 0 0 316 1 1 0.0000 0.0000 0.0063 113.000 2.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr1 156913391 GTTCCAGGCCCGCTCT G 0.500000 0.100 1 -15 2 658 172 486 166 0 2 0 4 0 0 485 0 1 0.9651 0.0000 0.0021 85.000 0.24 12.50 -12.26 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0659 0.9341 0.0000 0 0 0.9511 0.0489 0.0000 0 0 0.9922 0.0078 0.0000
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 860 180 680 0 0 9 0 171 0 0 677 0 3 0.0000 0.0000 0.0044 19.000 1.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 336 82 254 47 0 13 0 22 0 0 254 0 0 0.5732 0.0000 0.0000 5.308 0.34 1.18 -0.84 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8047 0.1896 0.0057 1 0 0.7928 0.2004 0.0068 1 0 0.7760 0.2154 0.0085
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 161 39 122 5 1 7 1 25 0 0 122 0 0 0.1282 0.0000 0.0000 4.429 0.00 4.56 -4.56 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0009 0.9481 0.0510 2 1 0.0004 0.9648 0.0348 2 1 0.0002 0.8799 0.1199
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 671 176 495 94 0 1 1 80 0 0 489 4 2 0.5341 0.0000 0.0121 175.000 0.86 4.91 -4.05 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2728 0.6596 0.0676 1 1 0.2790 0.6480 0.0730 1 1 0.2863 0.6332 0.0804
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 668 181 487 97 0 0 0 84 0 0 481 0 6 0.5359 0.0000 0.0123 181.000 0.87 4.80 -3.93 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2667 0.6668 0.0666 1 1 0.2733 0.6547 0.0720 1 1 0.2811 0.6394 0.0795
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 111 52 59 50 0 0 0 2 0 0 59 0 0 0.9615 0.0000 0.0000 52.000 0.14 2.00 -1.86 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1314 0.8686 0.0000 0 0 0.5913 0.4087 0.0000 0 0 0.7583 0.2417 0.0000
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 551 181 370 84 0 23 0 74 0 0 334 0 36 0.4641 0.0000 0.0973 6.870 0.38 12.70 -12.32 18 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0041 0.2812 0.7146 1 2 0.0050 0.2866 0.7084 1 2 0.0064 0.2945 0.6990
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 591 307 284 174 0 41 0 92 0 0 280 0 4 0.5668 0.0000 0.0141 6.488 0.49 11.65 -11.16 74 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9967 0.0033 0.0000 1 0 0.9960 0.0040 0.0000 1 0 0.9948 0.0052 0.0000
chr1 225519331 ATCCAGGCGTTCCTGCCGC A 0.500000 0.100 1 -18 1 485 169 316 116 0 48 1 4 0 0 315 0 1 0.6864 0.0000 0.0032 2.500 0.80 9.00 -8.20 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 0 0.5764 0.4236 0.0000 0 0 0.9070 0.0930 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 704 144 560 73 0 15 0 56 0 0 557 0 3 0.5069 0.0000 0.0054 8.600 0.78 8.86 -8.08 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4875 0.4802 0.0324 1 0 0.4849 0.4793 0.0358 1 0 0.4807 0.4786 0.0407
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 291 126 165 122 1 1 0 2 0 0 165 0 0 0.9683 0.0000 0.0000 125.000 0.21 1.00 -0.79 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8659 0.1341 0.0000 0 0 0.9824 0.0176 0.0000 0 0 0.9909 0.0091 0.0000
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 665 178 487 10 0 14 4 150 1 1 477 2 6 0.0562 0.0021 0.0205 11.714 0.90 3.73 -2.83 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9884 0.0116 2 2 0.0000 0.4373 0.5627
chr1 240207539 A ACCCCCT 0.500000 0.100 1 6 2 452 117 335 98 1 11 0 7 0 0 335 0 0 0.8376 0.0000 0.0000 9.636 0.96 6.14 -5.18 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0752 0.9248 0.0000 0 0 0.5770 0.4230 0.0000
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 765 200 565 12 0 2 0 186 0 0 562 0 3 0.0600 0.0000 0.0053 99.000 0.17 3.08 -2.91 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9657 0.0343 2 2 0.0000 0.1870 0.8130
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 440 110 330 104 0 1 0 5 0 0 330 0 0 0.9455 0.0000 0.0000 109.000 1.18 1.20 -0.02 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 1 0.4704 0.5296 0.0000 0 0 0.8631 0.1369 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1289 320 969 166 0 3 0 151 0 0 967 0 2 0.5188 0.0000 0.0021 105.667 0.36 1.34 -0.98 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2695 0.7101 0.0205 1 1 0.2822 0.6941 0.0237 1 1 0.2977 0.6738 0.0285
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 721 196 525 80 2 6 0 108 0 0 524 0 1 0.4082 0.0000 0.0019 31.500 2.46 4.54 -2.07 62 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0034 0.2548 0.7418 1 2 0.0041 0.2610 0.7349 1 2 0.0053 0.2701 0.7246
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 916 156 760 102 0 2 0 52 0 0 752 0 8 0.6538 0.0000 0.0105 77.000 1.56 3.71 -2.15 56 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9340 0.0658 0.0002 1 0 0.9275 0.0722 0.0003 1 0 0.9177 0.0818 0.0005
chr1 248626807 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 1 468 129 339 123 0 2 0 4 0 0 339 0 0 0.9535 0.0000 0.0000 63.500 0.97 2.50 -1.53 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0680 0.9320 0.0000 0 0 0.8682 0.1318 0.0000 0 0 0.9678 0.0322 0.0000
chr1 248638622 CAGAT C 0.500000 0.100 1 -4 1 386 136 250 119 0 4 0 13 0 0 250 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 33.000 4.41 10.62 -6.20 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0711 0.9289 0.0000
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 387 132 255 37 0 4 0 91 0 0 251 0 4 0.2803 0.0000 0.0157 32.000 0.81 7.19 -6.38 23 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0120 0.9880 1 2 0.0000 0.0143 0.9857 1 2 0.0000 0.0180 0.9820
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 242 121 121 56 0 10 1 54 0 0 121 0 0 0.4628 0.0000 0.0000 11.000 0.21 3.65 -3.43 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2452 0.6239 0.1309 1 1 0.2502 0.6147 0.1351 1 1 0.2565 0.6030 0.1405
chr2 11771478 AC A 0.000001 0.100 1 -1 2 324 111 213 63 0 2 0 46 0 0 213 0 0 0.5676 0.0000 0.0000 54.500 0.19 1.00 -0.81 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7596 0.2404 0.0000 1 0 0.7550 0.2450 0.0000 1 0 0.7485 0.2515 0.0000
chr2 20667362 G GGGCGGC 0.021395 0.100 1 6 5 436 131 305 0 0 26 0 105 0 0 275 0 30 0.0000 0.0000 0.0984 4.038 10.98 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0444 0.9556 2 2 0.0000 0.0507 0.9493 2 2 0.0000 0.0608 0.9392
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 436 131 305 0 2 24 0 105 0 0 275 0 30 0.0000 0.0000 0.0984 4.458 10.98 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0272 0.9728 2 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 436 131 305 7 6 66 2 50 0 1 276 2 26 0.0534 0.0000 0.0951 0.955 5.29 13.48 -8.19 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9899 0.0101
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 617 208 409 113 0 22 0 73 0 0 408 0 1 0.5433 0.0000 0.0024 8.455 0.31 8.22 -7.91 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9295 0.0703 0.0002 1 0 0.9240 0.0757 0.0002 1 0 0.9159 0.0837 0.0004
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.100 1 9 1 455 118 337 95 0 18 0 5 0 0 335 0 2 0.8051 0.0000 0.0059 5.556 0.94 9.00 -8.06 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.5075 0.4925 0.0000 0 0 0.9456 0.0544 0.0000
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 236 60 176 0 0 2 0 58 0 0 174 0 2 0.0000 0.0000 0.0114 29.000 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0449 0.9551 2 2 0.0000 0.0476 0.9524 2 2 0.0000 0.0516 0.9484
chr2 27581795 CCATCACAGTCCCTCTGAGAGAAGA C 0.500000 0.100 1 -24 1 1542 421 1121 323 19 64 5 10 16 30 1071 4 0 0.7672 0.0143 0.0446 5.524 1.52 4.00 -2.48 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.9915 0.0085 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 344 120 224 97 0 15 0 8 0 0 224 0 0 0.8083 0.0000 0.0000 7.000 0.12 3.00 -2.88 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0248 0.9752 0.0000 0 1 0.3947 0.6053 0.0000
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 621 215 406 55 0 103 2 55 0 0 404 0 2 0.2558 0.0000 0.0049 1.087 0.25 1.18 -0.93 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1190 0.6184 0.2627 1 1 0.1243 0.6097 0.2661 1 1 0.1313 0.5987 0.2700
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 621 209 412 94 3 55 0 57 0 0 412 0 0 0.4498 0.0000 0.0000 2.852 0.21 1.25 -1.03 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9266 0.0731 0.0003 1 0 0.9197 0.0799 0.0004 1 0 0.9093 0.0901 0.0006
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 750 109 641 28 1 16 1 63 5 0 633 0 3 0.2569 0.0078 0.0125 5.750 2.39 5.79 -3.40 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0013 0.1124 0.8862 1 2 0.0017 0.1215 0.8768 1 2 0.0023 0.1347 0.8630
chr2 61134190 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 257 134 123 80 0 0 0 54 0 0 123 0 0 0.5970 0.0000 0.0000 134.000 0.44 1.15 -0.71 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7698 0.2258 0.0044 1 0 0.7603 0.2344 0.0054 1 0 0.7466 0.2465 0.0068
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 570 145 425 5 18 34 7 81 0 2 418 1 4 0.0345 0.0000 0.0165 3.406 0.20 4.30 -4.10 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6653 0.3347 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr2 73385903 T TGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 570 145 425 25 0 84 1 35 0 2 419 0 4 0.1724 0.0000 0.0141 0.753 5.24 6.03 -0.79 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0335 0.3872 0.5793 1 2 0.0368 0.3929 0.5703 1 2 0.0416 0.4005 0.5579
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 574 154 420 104 1 29 0 20 1 0 416 0 3 0.6753 0.0024 0.0095 4.429 3.67 6.25 -2.58 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 539 121 418 109 0 6 0 6 0 0 418 0 0 0.9008 0.0000 0.0000 19.167 0.25 2.83 -2.59 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2802 0.7198 0.0000 0 0 0.8082 0.1918 0.0000
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 1104 298 806 225 0 57 1 15 0 0 799 1 6 0.7550 0.0000 0.0087 4.228 0.48 9.73 -9.26 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0309 0.9691 0.0000
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.100 1 -9 1 464 135 329 63 0 10 0 62 0 0 327 0 2 0.4667 0.0000 0.0061 12.500 0.54 8.37 -7.83 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1578 0.6498 0.1924 1 1 0.1633 0.6390 0.1976 1 1 0.1705 0.6254 0.2042
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 415 133 282 109 2 11 0 11 0 0 281 0 1 0.8195 0.0000 0.0035 11.091 0.82 3.18 -2.37 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0896 0.9104 0.0000
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 495 145 350 7 0 22 8 108 0 0 345 0 5 0.0483 0.0000 0.0143 5.591 0.43 3.07 -2.65 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8038 0.1962 2 2 0.0000 0.2014 0.7986
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 847 209 638 106 0 13 1 89 0 0 637 0 1 0.5072 0.0000 0.0016 15.000 0.53 7.70 -7.17 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4521 0.5257 0.0222 1 1 0.4544 0.5205 0.0251 1 1 0.4560 0.5146 0.0293
chr2 96123863 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 538 145 393 142 0 1 0 2 0 0 393 0 0 0.9793 0.0000 0.0000 144.000 0.21 1.00 -0.79 68 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9427 0.0573 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 145 70 75 65 1 0 0 4 0 0 75 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 70.000 0.28 3.00 -2.72 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.2763 0.7237 0.0000 0 0 0.6536 0.3464 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 657 166 491 71 1 1 0 93 0 0 485 0 6 0.4277 0.0000 0.0122 164.000 0.65 5.98 -5.33 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0035 0.2367 0.7598 1 2 0.0042 0.2440 0.7518 1 2 0.0055 0.2544 0.7401
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 342 117 225 93 0 16 0 8 0 0 225 0 0 0.7949 0.0000 0.0000 6.312 0.59 6.00 -5.41 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0204 0.9796 0.0000 0 1 0.3494 0.6506 0.0000
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 764 212 552 192 1 6 0 13 1 1 550 0 0 0.9057 0.0018 0.0036 34.333 0.33 1.46 -1.13 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0169 0.9831 0.0000 0 0 0.7562 0.2438 0.0000
chr2 132645460 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 646 188 458 171 0 8 0 9 0 0 458 0 0 0.9096 0.0000 0.0000 22.500 0.37 3.00 -2.63 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2608 0.7392 0.0000 0 0 0.9256 0.0744 0.0000
chr2 165176265 CATT C 0.500000 0.100 1 -3 1 262 95 167 89 1 2 0 3 0 0 167 0 0 0.9368 0.0000 0.0000 46.500 0.33 3.67 -3.34 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1110 0.8890 0.0000 0 0 0.7860 0.2140 0.0000 0 0 0.9200 0.0800 0.0000
chr2 170770974 T TGCCCCC 0.500000 0.100 1 6 4 359 87 272 42 0 17 1 27 0 0 272 0 0 0.4828 0.0000 0.0000 4.059 1.48 5.93 -4.45 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5719 0.3938 0.0342 1 0 0.5633 0.3991 0.0376 1 0 0.5513 0.4062 0.0425
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 230 99 131 5 0 24 0 70 0 0 128 0 3 0.0505 0.0000 0.0229 3.125 0.40 9.51 -9.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.8426 0.1574 2 2 0.0000 0.4175 0.5825
chr2 176130574 G GCGCACC 0.500000 0.100 1 6 1 470 100 370 81 1 12 0 6 0 0 370 0 0 0.8100 0.0000 0.0000 7.333 0.48 5.00 -4.52 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0917 0.9083 0.0000 0 0 0.5320 0.4680 0.0000
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 341 154 187 25 0 1 0 128 0 0 179 0 8 0.1623 0.0000 0.0428 153.000 0.32 3.06 -2.74 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 814 183 631 91 1 7 1 83 0 0 624 0 7 0.4973 0.0000 0.0111 25.143 0.32 4.02 -3.71 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1606 0.7092 0.1302 1 1 0.1678 0.6951 0.1371 1 1 0.1770 0.6768 0.1462
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 331 141 190 115 1 17 2 6 0 0 190 0 0 0.8156 0.0000 0.0000 7.625 2.63 6.17 -3.53 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2610 0.7390 0.0000 0 0 0.8027 0.1973 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 332 146 186 14 8 17 1 106 0 0 186 0 0 0.0959 0.0000 0.0000 7.412 0.71 3.04 -2.32 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 243 58 185 34 5 12 2 5 0 0 185 0 0 0.5862 0.0000 0.0000 3.417 0.91 1.40 -0.49 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.0112 0.9888 0.0000 0 1 0.1055 0.8945 0.0000
chr2 199819526 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 297 56 241 22 16 10 3 5 0 2 238 0 1 0.3929 0.0000 0.0124 3.100 0.64 1.60 -0.96 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0198 0.9801 0.0001 0 1 0.0094 0.9906 0.0000 0 1 0.0574 0.9426 0.0000
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 1 439 92 347 62 5 18 1 6 1 0 345 1 0 0.6739 0.0029 0.0058 4.235 1.34 4.83 -3.49 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 1 0.1621 0.8379 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 292 94 198 10 0 1 0 83 0 0 198 0 0 0.1064 0.0000 0.0000 93.000 0.20 3.06 -2.86 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.9161 0.0839
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 610 200 410 10 0 26 1 163 0 0 402 1 7 0.0500 0.0000 0.0195 6.692 0.00 7.66 -7.66 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8859 0.1141 2 2 0.0000 0.1265 0.8735
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 427 165 262 151 0 2 3 9 0 0 262 0 0 0.9152 0.0000 0.0000 80.000 0.63 2.56 -1.93 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0635 0.9365 0.0000 0 0 0.7298 0.2702 0.0000
chr2 233450046 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 341 125 216 115 0 7 0 3 0 0 216 0 0 0.9200 0.0000 0.0000 16.857 0.16 3.00 -2.84 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3088 0.6912 0.0000 0 0 0.9275 0.0725 0.0000 0 0 0.9748 0.0252 0.0000
chr2 233565576 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 212 60 152 51 1 6 0 2 0 0 152 0 0 0.8500 0.0000 0.0000 9.000 0.61 1.50 -0.89 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1500 0.8500 0.0000 0 0 0.6163 0.3837 0.0000 0 0 0.7753 0.2247 0.0000
chr2 233743541 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 473 128 345 114 0 8 0 6 0 0 345 0 0 0.8906 0.0000 0.0000 15.000 0.30 1.33 -1.04 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3407 0.6593 0.0000 0 0 0.8446 0.1554 0.0000
chr2 235852770 C CCAGG 0.500000 0.100 1 4 2 266 120 146 61 0 5 0 54 0 0 145 0 1 0.5083 0.0000 0.0068 23.000 1.26 3.93 -2.66 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3076 0.5990 0.0934 1 1 0.3099 0.5915 0.0986 1 1 0.3123 0.5821 0.1056
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 417 118 299 39 1 27 5 46 0 0 299 0 0 0.3305 0.0000 0.0000 3.370 0.49 3.41 -2.93 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0519 0.4846 0.4635 1 1 0.0560 0.4845 0.4594 1 1 0.0618 0.4847 0.4535
chr2 241094358 A ACGGAGTCAC 0.500000 0.100 1 9 2 362 159 203 147 0 6 0 6 0 0 203 0 0 0.9245 0.0000 0.0000 25.500 0.20 8.00 -7.80 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 0 0.7218 0.2782 0.0000 0 0 0.9638 0.0362 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 563 129 434 7 0 3 0 119 0 0 431 0 3 0.0543 0.0000 0.0069 42.000 0.00 3.11 -3.11 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 2 0.0000 0.3465 0.6535 2 2 0.0000 0.0316 0.9684
chr3 9917537 G GTCTGGTCTT 0.000861 0.100 1 9 1 699 166 533 151 1 6 0 8 0 0 533 0 0 0.9096 0.0000 0.0000 26.500 0.36 6.25 -5.89 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0491 0.9509 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 404 101 303 72 0 15 0 14 2 0 299 0 2 0.7129 0.0066 0.0132 5.733 0.65 10.86 -10.20 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0054 0.9946 0.0000
chr3 12901258 TGGC T 0.002987 0.100 1 -3 1 506 146 360 131 3 5 0 7 0 0 360 0 0 0.8973 0.0000 0.0000 28.000 0.44 4.14 -3.71 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0510 0.9490 0.0000 0 0 0.9936 0.0064 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr3 13570394 T TCTGGGC 0.000435 0.100 1 6 1 498 147 351 136 1 8 1 1 0 0 351 0 0 0.9252 0.0000 0.0000 17.250 0.40 6.00 -5.60 82 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 27721914 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 2 521 126 395 54 4 21 39 8 0 0 395 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 4.952 0.43 1.75 -1.32 26 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4442 0.5043 0.0514 1 1 0.4416 0.5028 0.0556 1 1 0.4374 0.5012 0.0614
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 510 118 392 63 7 2 1 45 0 0 392 0 0 0.5339 0.0000 0.0000 57.500 0.33 5.24 -4.91 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7407 0.2523 0.0070 1 0 0.7307 0.2610 0.0083 1 0 0.7165 0.2732 0.0103
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 611 171 440 158 2 2 0 9 0 0 440 0 0 0.9240 0.0000 0.0000 84.500 0.47 3.00 -2.53 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1694 0.8306 0.0000 0 0 0.8795 0.1205 0.0000
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 757 255 502 8 99 51 3 94 0 1 499 0 2 0.0314 0.0000 0.0060 4.000 0.00 3.03 -3.03 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3075 0.6475 0.0450 1 1 0.3143 0.6361 0.0496 1 1 0.3221 0.6218 0.0560
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 758 259 499 107 3 46 11 92 0 0 497 1 1 0.4131 0.0000 0.0040 4.630 2.68 3.10 -0.42 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2030 0.7194 0.0777 1 1 0.2114 0.7047 0.0840 1 1 0.2218 0.6857 0.0925
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 523 152 371 0 0 10 1 141 0 0 369 0 2 0.0000 0.0000 0.0054 14.200 2.48 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 373 146 227 0 0 5 1 140 0 0 218 1 8 0.0000 0.0000 0.0396 28.200 3.46 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 637 184 453 136 0 24 2 22 0 1 452 0 0 0.7391 0.0000 0.0022 6.667 0.49 3.59 -3.10 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr3 46717738 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 1 542 195 347 102 3 13 0 77 0 0 345 1 1 0.5231 0.0000 0.0058 14.000 0.15 3.09 -2.94 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7243 0.2715 0.0042 1 0 0.7175 0.2775 0.0051 1 0 0.7073 0.2862 0.0065
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 376 103 273 2 0 12 0 89 0 0 270 0 3 0.0194 0.0000 0.0110 7.583 0.00 6.01 -6.01 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4393 0.5607 2 2 0.0000 0.0783 0.9217 2 2 0.0000 0.0399 0.9601
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.100 1 6 1 535 172 363 89 0 37 1 45 0 1 353 0 9 0.5174 0.0000 0.0275 3.649 0.52 5.82 -5.31 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8828 0.1162 0.0009 1 0 0.8742 0.1246 0.0012 1 0 0.8617 0.1366 0.0017
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 539 187 352 152 1 27 0 7 0 0 351 0 1 0.8128 0.0000 0.0028 5.926 1.84 4.71 -2.88 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2948 0.7052 0.0000 0 0 0.9081 0.0919 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 218 110 108 97 1 10 0 2 0 0 107 1 0 0.8818 0.0000 0.0093 10.000 0.22 5.50 -5.28 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1983 0.8017 0.0000 0 0 0.8526 0.1474 0.0000 0 0 0.9453 0.0547 0.0000
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 285 99 186 0 0 5 81 13 0 0 181 1 4 0.0000 0.0000 0.0269 18.800 3.15 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0079 0.9921 2 2 0.0000 0.0090 0.9910
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 285 100 185 0 0 2 12 86 0 0 182 0 3 0.0000 0.0000 0.0162 49.000 3.91 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0060 0.9940 2 2 0.0000 0.0066 0.9934 2 2 0.0000 0.0076 0.9924
chr3 63912684 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 3 301 95 206 41 30 22 0 2 0 0 205 1 0 0.4316 0.0000 0.0049 3.476 0.88 3.00 -2.12 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0546 0.9454 0.0000 0 0 0.5809 0.4191 0.0000 0 0 0.8122 0.1878 0.0000
chr3 63912697 G GCCC 0.500000 0.100 1 3 1 307 94 213 54 0 4 0 36 0 0 212 0 1 0.5745 0.0000 0.0047 30.000 1.02 3.06 -2.04 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6138 0.3641 0.0221 1 0 0.6052 0.3700 0.0248 1 0 0.5930 0.3782 0.0288
chr3 98087856 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 675 159 516 139 1 15 0 4 0 0 516 0 0 0.8742 0.0000 0.0000 10.214 0.47 4.25 -3.78 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1766 0.8234 0.0000 0 0 0.9419 0.0581 0.0000 0 0 0.9860 0.0140 0.0000
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 889 190 699 178 0 4 0 8 0 0 699 0 0 0.9368 0.0000 0.0000 46.500 0.44 1.00 -0.56 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.5975 0.4025 0.0000 0 0 0.9710 0.0290 0.0000
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 822 207 615 110 0 12 0 85 0 0 607 0 8 0.5314 0.0000 0.0130 16.250 0.44 8.88 -8.45 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4907 0.4925 0.0169 1 0 0.4920 0.4887 0.0193 1 0 0.4924 0.4848 0.0229
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 553 157 396 79 1 5 0 72 0 0 396 0 0 0.5032 0.0000 0.0000 30.400 0.35 1.33 -0.98 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3213 0.6128 0.0659 1 1 0.3250 0.6041 0.0709 1 1 0.3290 0.5932 0.0778
chr3 100848802 AGG A 0.500000 0.100 1 -2 2 115 56 59 33 0 2 20 1 0 0 55 4 0 0.5893 0.0000 0.0678 27.000 0.76 17.00 -16.24 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4245 0.4937 0.0818 1 1 0.4201 0.4937 0.0862 1 1 0.4138 0.4938 0.0924
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 151 64 87 5 0 4 5 50 0 0 85 1 1 0.0781 0.0000 0.0230 15.000 1.00 1.32 -0.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9217 0.0783 2 1 0.0000 0.6126 0.3874
chr3 113657263 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 1420 370 1050 23 24 101 3 219 0 0 1046 0 4 0.0622 0.0000 0.0038 2.663 0.57 3.01 -2.45 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1423 380 1043 222 27 106 8 17 0 0 1043 0 0 0.5842 0.0000 0.0000 2.676 2.47 3.76 -1.30 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0163 0.9837 0.0000
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1433 388 1045 294 4 80 2 8 0 0 1045 0 0 0.7577 0.0000 0.0000 3.899 2.45 7.50 -5.05 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.9860 0.0140 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.100 1 12 1 508 169 339 136 1 23 0 9 0 0 339 0 0 0.8047 0.0000 0.0000 6.304 0.21 8.56 -8.35 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0604 0.9396 0.0000 0 0 0.7039 0.2961 0.0000
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 647 184 463 175 1 2 0 6 0 0 462 0 1 0.9511 0.0000 0.0022 91.000 0.19 3.00 -2.81 117 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.7921 0.2079 0.0000 0 0 0.9828 0.0172 0.0000
chr3 124763647 TTTGTTGAAC T 0.500000 0.100 1 -9 1 410 164 246 89 0 10 0 65 0 0 243 0 3 0.5427 0.0000 0.0122 15.400 0.12 8.80 -8.68 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6434 0.3466 0.0100 1 0 0.6373 0.3511 0.0116 1 0 0.6282 0.3576 0.0142
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.100 1 -4 1 399 134 265 74 0 8 0 52 0 0 265 0 0 0.5522 0.0000 0.0000 15.750 0.46 4.48 -4.02 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6996 0.2915 0.0088 1 0 0.6908 0.2989 0.0103 1 0 0.6781 0.3092 0.0127
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 254 123 131 119 0 0 0 4 0 0 131 0 0 0.9675 0.0000 0.0000 123.000 0.50 2.00 -1.50 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0578 0.9422 0.0000 0 0 0.8443 0.1557 0.0000 0 0 0.9612 0.0388 0.0000
chr3 136145062 G GATGA 0.500000 0.100 1 4 1 235 97 138 89 1 4 0 3 0 0 138 0 0 0.9175 0.0000 0.0000 23.000 0.13 4.67 -4.53 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1104 0.8896 0.0000 0 0 0.7850 0.2150 0.0000 0 0 0.9195 0.0805 0.0000
chr3 150703735 A ACCTCCTCCT 0.500000 0.100 1 9 2 533 107 426 81 3 19 0 4 0 0 425 0 1 0.7570 0.0000 0.0023 4.632 0.90 7.00 -6.10 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2436 0.7564 0.0000 0 0 0.7032 0.2968 0.0000
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 364 133 231 109 1 7 0 16 1 0 230 0 0 0.8195 0.0043 0.0043 18.000 0.23 1.00 -0.77 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0076 0.9924 0.0000
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 442 169 273 5 0 17 9 138 0 0 269 1 3 0.0296 0.0000 0.0147 8.941 0.00 3.29 -3.29 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9682 0.0318 2 2 0.0000 0.0985 0.9015 2 2 0.0000 0.0161 0.9839
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 602 152 450 11 1 31 1 108 0 0 447 0 3 0.0724 0.0000 0.0067 3.903 0.36 3.00 -2.64 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9053 0.0947
chr3 195785502 G GGAT 0.500000 0.100 1 3 1 355 61 294 34 2 8 1 16 23 3 268 0 0 0.5574 0.0782 0.0884 6.625 2.15 7.25 -5.10 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7854 0.2145 0.0001 0 1 0.1086 0.8914 0.0000 0 1 0.0054 0.9946 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 849 184 665 88 0 14 0 82 0 0 652 0 13 0.4783 0.0000 0.0195 12.143 0.19 11.30 -11.11 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0674 0.6624 0.2702 1 1 0.0728 0.6506 0.2765 1 1 0.0803 0.6357 0.2840
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 280 112 168 3 0 24 3 82 0 0 163 2 3 0.0268 0.0000 0.0298 3.667 0.67 7.45 -6.78 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8928 0.1072 2 2 0.0000 0.2202 0.7798 2 2 0.0000 0.0826 0.9174
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 280 113 167 3 1 23 46 40 0 0 162 1 4 0.0265 0.0000 0.0299 3.913 0.67 8.62 -7.96 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9792 0.0208 2 2 0.0000 0.4111 0.5889 2 2 0.0000 0.1339 0.8661
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 638 183 455 120 0 0 0 63 0 1 416 0 38 0.6557 0.0000 0.0857 183.000 0.42 13.75 -13.32 26 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3433 0.6334 0.0232 1 1 0.3434 0.6295 0.0270 1 1 0.3421 0.6250 0.0329
chr4 1394560 A AAGTGCCCATGTGGAGTGCC 0.000684 0.100 1 19 1 936 250 686 186 20 7 13 24 71 17 573 14 11 0.7440 0.1035 0.1647 58.000 2.08 4.50 -2.42 120 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 1395636 TCA T 0.001231 0.100 1 -2 1 1311 317 994 155 8 51 4 99 35 45 869 13 32 0.4890 0.0352 0.1258 5.367 2.43 4.22 -1.79 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9995 0.0005 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 1 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr4 3074923 AGC A 0.021170 0.100 1 -2 1 569 236 333 219 4 1 10 2 1 0 332 0 0 0.9280 0.0030 0.0030 233.000 3.39 9.00 -5.61 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3432 0.6568 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr4 3074926 AG A 0.010091 0.100 1 -1 1 569 235 334 114 107 8 5 1 1 0 333 0 0 0.4851 0.0030 0.0030 75.667 1.96 9.00 -7.04 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 6597186 CTTG C 0.000003 0.100 1 -3 2 316 111 205 107 1 2 0 1 0 0 205 0 0 0.9640 0.0000 0.0000 54.500 0.23 5.00 -4.77 33 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 7192754 C CCTG 0.001642 0.100 1 3 1 528 124 404 97 4 17 0 6 0 0 404 0 0 0.7823 0.0000 0.0000 6.235 1.19 2.33 -1.15 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1457 0.8543 0.0000 0 0 0.9937 0.0063 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 379 172 207 93 0 7 0 72 0 0 205 0 2 0.5407 0.0000 0.0097 23.571 0.34 8.40 -8.06 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5837 0.4028 0.0135 1 0 0.5800 0.4045 0.0155 1 0 0.5739 0.4075 0.0186
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 717 160 557 79 1 18 0 62 0 0 536 0 21 0.4938 0.0000 0.0377 7.833 0.68 15.97 -15.28 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1113 0.6788 0.2100 1 1 0.1175 0.6663 0.2163 1 1 0.1257 0.6503 0.2240
chr4 56448597 GGTACAGATAAAACAA G 0.500000 0.100 1 -15 2 400 134 266 118 0 9 1 6 0 0 266 0 0 0.8806 0.0000 0.0000 13.778 0.12 5.00 -4.88 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3168 0.6832 0.0000 0 0 0.8385 0.1615 0.0000
chr4 70409914 A AC 0.500000 0.100 1 1 2 625 223 402 202 1 10 0 10 0 0 402 0 0 0.9058 0.0000 0.0000 21.200 0.17 1.10 -0.93 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3844 0.6156 0.0000 0 0 0.9690 0.0310 0.0000
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 3 480 144 336 138 0 0 0 6 0 5 331 0 0 0.9583 0.0000 0.0149 144.000 0.91 4.00 -3.09 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 0 0.7055 0.2945 0.0000 0 0 0.9609 0.0391 0.0000
chr4 82918480 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 5 723 173 550 89 0 7 1 76 0 0 549 1 0 0.5145 0.0000 0.0018 23.714 0.40 2.92 -2.52 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3793 0.5779 0.0428 1 1 0.3822 0.5709 0.0469 1 1 0.3849 0.5623 0.0528
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2663 577 2086 33 5 155 8 376 1 3 2037 5 40 0.0572 0.0005 0.0235 2.745 1.85 8.99 -7.14 17 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9897 0.0103
chr4 87614933 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3351 935 2416 775 15 103 8 34 102 75 2222 8 9 0.8289 0.0422 0.0803 8.078 1.70 11.56 -9.85 149 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615161 CGATAGCAGCAACAGCAGT C 0.500000 0.100 1 -18 1 4064 901 3163 730 30 97 12 32 12 24 3120 4 3 0.8102 0.0038 0.0136 8.372 2.48 9.16 -6.67 80 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 4244 982 3262 50 21 48 21 842 48 59 2903 176 76 0.0509 0.0147 0.1101 21.279 2.50 8.65 -6.15 8 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3562 1030 2532 42 22 231 50 685 258 72 2134 36 32 0.0408 0.1019 0.1572 3.466 4.64 8.82 -4.18 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 99139119 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 259 110 149 106 1 0 0 3 0 0 149 0 0 0.9636 0.0000 0.0000 110.000 0.39 1.33 -0.95 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2312 0.7688 0.0000 0 0 0.8959 0.1041 0.0000 0 0 0.9633 0.0367 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 187 89 98 54 0 5 0 30 0 0 96 0 2 0.6067 0.0000 0.0204 16.800 0.37 3.07 -2.70 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7368 0.2538 0.0094 1 0 0.7256 0.2634 0.0110 1 0 0.7100 0.2766 0.0134
chr4 110011233 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 296 100 196 61 0 4 0 35 0 0 196 0 0 0.6100 0.0000 0.0000 24.000 0.11 1.40 -1.29 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8005 0.1949 0.0046 1 0 0.7895 0.2049 0.0056 1 0 0.7739 0.2190 0.0071
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 746 177 569 92 0 5 0 80 0 0 567 0 2 0.5198 0.0000 0.0035 34.400 0.18 3.96 -3.78 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3472 0.6050 0.0478 1 1 0.3513 0.5964 0.0523 1 1 0.3558 0.5857 0.0585
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.100 1 -18 1 249 122 127 115 0 4 1 2 0 0 127 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 29.500 0.23 9.00 -8.77 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3489 0.6511 0.0000 0 0 0.9298 0.0702 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 596 232 364 0 0 25 17 190 0 0 359 2 3 0.0000 0.0000 0.0137 8.280 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 564 191 373 72 6 43 5 65 1 0 366 5 1 0.3770 0.0027 0.0188 3.442 1.06 4.05 -2.99 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2346 0.6620 0.1035 1 1 0.2402 0.6504 0.1094 1 1 0.2470 0.6357 0.1173
chr4 146639305 T TGGCGGCGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 15 2 564 191 373 130 2 45 3 11 3 1 366 2 1 0.6806 0.0080 0.0188 3.222 2.27 5.64 -3.37 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0457 0.9543 0.0000
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.100 1 5 2 337 162 175 14 0 5 0 143 0 0 161 0 14 0.0864 0.0000 0.0800 39.250 0.21 4.90 -4.68 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.7923 0.2077
chr4 154237107 A AGTT 0.500000 0.100 1 3 1 547 151 396 130 0 10 0 11 0 0 396 0 0 0.8609 0.0000 0.0000 14.100 0.26 3.09 -2.83 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0054 0.9946 0.0000 0 1 0.3205 0.6795 0.0000
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 212 89 123 7 1 12 0 69 0 0 119 0 4 0.0787 0.0000 0.0325 6.417 0.43 5.46 -5.04 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9858 0.0142 2 1 0.0000 0.7835 0.2165
chr4 158715313 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 235 74 161 70 0 0 0 4 0 0 161 0 0 0.9459 0.0000 0.0000 74.000 0.24 1.75 -1.51 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0054 0.9946 0.0000 0 1 0.3218 0.6782 0.0000 0 0 0.6975 0.3025 0.0000
chr4 174977850 T TCAGAGTCAACCTCCTGTGATGCCTTCCCAGAGTCATCCTCAGTTGACGCCTTCC 0.500000 0.100 1 54 1 1105 261 844 74 0 118 2 67 0 0 843 0 1 0.2835 0.0000 0.0012 1.203 0.51 4.36 -3.84 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2440 0.6501 0.1059 1 1 0.2491 0.6393 0.1116 1 1 0.2551 0.6256 0.1193
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 878 152 726 19 0 2 0 131 0 0 721 0 5 0.1250 0.0000 0.0069 75.000 0.26 3.14 -2.87 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9963 0.0037
chr5 733800 T TAA 0.007715 0.100 1 2 1 196 90 106 76 0 1 0 13 0 0 106 0 0 0.8444 0.0000 0.0000 89.000 0.78 4.38 -3.61 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 0 0.5550 0.4450 0.0000
chr5 733804 CAT C 0.005230 0.100 1 -2 3 196 90 106 77 0 2 2 9 0 0 106 0 0 0.8556 0.0000 0.0000 44.000 0.75 6.33 -5.58 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0777 0.9223 0.0000 0 0 0.8785 0.1215 0.0000
chr5 1295342 CCG C 0.500000 0.100 1 -2 3 627 124 503 107 1 9 0 7 0 0 503 0 0 0.8629 0.0000 0.0000 12.778 0.85 2.86 -2.01 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1137 0.8863 0.0000 0 0 0.6791 0.3209 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 905 202 703 94 2 27 1 78 0 0 701 0 2 0.4653 0.0000 0.0028 6.731 0.38 3.65 -3.27 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4570 0.5172 0.0258 1 1 0.4580 0.5131 0.0289 1 1 0.4581 0.5084 0.0335
chr5 61332336 G GGCGGCGGCGGGGGCA 0.500000 0.100 1 15 1 446 166 280 86 2 24 3 51 0 0 275 0 5 0.5181 0.0000 0.0179 5.792 1.29 7.49 -6.20 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8153 0.1823 0.0025 1 0 0.8059 0.1910 0.0030 1 0 0.7925 0.2035 0.0040
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 402 53 349 0 0 26 1 26 0 0 346 0 3 0.0000 0.0000 0.0086 1.038 7.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1794 0.8206 2 2 0.0000 0.1838 0.8162 2 2 0.0000 0.1901 0.8099
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 394 112 282 102 0 4 0 6 0 0 281 1 0 0.9107 0.0000 0.0035 27.000 0.11 5.17 -5.06 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1994 0.8006 0.0000 0 0 0.7333 0.2667 0.0000
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 552 149 403 0 0 8 0 141 0 0 397 0 6 0.0000 0.0000 0.0149 17.625 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr5 77077779 T TCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 1 440 97 343 87 0 9 0 1 1 0 342 0 0 0.8969 0.0029 0.0029 9.778 0.83 7.00 -6.17 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9058 0.0942 0.0000 0 0 0.9655 0.0345 0.0000 0 0 0.9741 0.0259 0.0000
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 334 100 234 87 1 7 0 5 0 0 233 0 1 0.8700 0.0000 0.0043 13.143 1.20 23.40 -22.20 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1193 0.8807 0.0000 0 0 0.6019 0.3981 0.0000
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 289 110 179 104 0 0 0 6 1 0 178 0 0 0.9455 0.0056 0.0056 110.000 0.09 3.33 -3.25 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2416 0.7584 0.0000 0 0 0.7763 0.2237 0.0000
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 266 110 156 9 5 15 40 41 0 0 156 0 0 0.0818 0.0000 0.0000 6.571 0.78 4.78 -4.00 7 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9814 0.0186
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 613 183 430 86 1 24 2 70 2 0 426 0 2 0.4699 0.0047 0.0093 6.625 0.56 3.66 -3.10 8 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4890 0.4865 0.0245 1 0 0.4881 0.4844 0.0275 1 0 0.4859 0.4823 0.0318
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 702 158 544 69 1 2 0 86 0 0 544 0 0 0.4367 0.0000 0.0000 78.000 0.33 1.36 -1.03 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0218 0.4578 0.5204 1 2 0.0246 0.4574 0.5181 1 2 0.0286 0.4574 0.5140
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 481 138 343 51 0 23 0 64 0 0 337 0 6 0.3696 0.0000 0.0175 5.000 0.53 7.09 -6.56 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0147 0.3499 0.6354 1 2 0.0168 0.3554 0.6278 1 2 0.0200 0.3632 0.6168
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 560 128 432 14 1 13 0 100 0 0 426 0 6 0.1094 0.0000 0.0139 8.769 0.71 5.67 -4.96 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9827 0.0173
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 193 63 130 6 0 0 0 57 0 0 130 0 0 0.0952 0.0000 0.0000 63.000 0.67 3.35 -2.68 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9718 0.0282 2 1 0.0000 0.7474 0.2526
chr5 139848487 CCCGGGT C 0.500000 0.100 1 -6 3 342 42 300 27 1 2 0 12 0 0 300 0 0 0.6429 0.0000 0.0000 20.000 2.30 5.00 -2.70 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6492 0.3236 0.0272 1 0 0.6369 0.3330 0.0302 1 0 0.6168 0.3488 0.0344
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 273 102 171 50 0 0 0 52 0 0 169 0 2 0.4902 0.0000 0.0117 102.000 0.14 3.85 -3.71 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1225 0.6067 0.2708 1 1 0.1276 0.5988 0.2735 1 1 0.1344 0.5888 0.2767
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 273 103 170 51 0 2 0 50 0 0 168 0 2 0.4951 0.0000 0.0118 50.500 0.14 3.98 -3.84 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1681 0.6222 0.2097 1 1 0.1729 0.6133 0.2138 1 1 0.1790 0.6020 0.2190
chr5 141387924 CTGCCAG C 0.500000 0.100 1 -6 2 575 135 440 76 0 2 0 57 0 0 435 0 5 0.5630 0.0000 0.0114 66.500 0.18 5.84 -5.66 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4891 0.4805 0.0305 1 0 0.4868 0.4794 0.0338 1 0 0.4829 0.4785 0.0386
chr5 141415641 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 968 161 807 64 13 16 12 56 1 6 792 7 1 0.3975 0.0012 0.0186 8.312 1.28 2.50 -1.22 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3363 0.6016 0.0621 1 1 0.3395 0.5936 0.0669 1 1 0.3428 0.5836 0.0737
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 495 110 385 11 0 3 0 96 0 0 369 0 16 0.1000 0.0000 0.0416 35.667 0.36 7.55 -7.19 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 1 0.0000 0.8353 0.1647
chr5 146459072 TCAGGCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 1100 391 709 274 6 99 0 12 1 0 707 0 1 0.7008 0.0014 0.0028 3.031 0.55 6.50 -5.95 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5407 0.4593 0.0000 0 0 0.9948 0.0052 0.0000
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 12 1 407 151 256 51 0 40 0 60 0 0 247 0 9 0.3377 0.0000 0.0352 2.775 1.25 10.80 -9.55 17 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0173 0.3704 0.6123 1 2 0.0196 0.3752 0.6052 1 2 0.0231 0.3819 0.5950
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 15 1 407 151 256 51 0 40 0 60 0 0 247 0 9 0.3377 0.0000 0.0352 2.775 1.25 10.80 -9.55 17 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0173 0.3705 0.6123 1 2 0.0196 0.3752 0.6052 1 2 0.0231 0.3820 0.5949
chr5 146878727 AGCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 408 161 247 107 8 37 1 8 0 0 247 0 0 0.6646 0.0000 0.0000 3.351 5.23 3.50 1.73 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0216 0.9784 0.0000 0 1 0.4528 0.5472 0.0000
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 578 161 417 144 0 1 0 16 0 0 414 0 3 0.8944 0.0000 0.0072 160.000 0.79 3.81 -3.02 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0055 0.9945 0.0000
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 583 165 418 149 1 0 0 15 0 0 415 0 3 0.9030 0.0000 0.0072 165.000 0.75 4.00 -3.25 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0137 0.9863 0.0000
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 728 161 567 76 0 0 0 85 0 0 565 0 2 0.4720 0.0000 0.0035 161.000 0.26 1.94 -1.68 12 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0433 0.5733 0.3834 1 1 0.0475 0.5666 0.3860 1 1 0.0533 0.5584 0.3883
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 618 158 460 152 0 1 0 5 0 0 459 0 1 0.9620 0.0000 0.0022 157.000 0.34 1.00 -0.66 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 0 0.7714 0.2286 0.0000 0 0 0.9715 0.0285 0.0000
chr5 151663455 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 263 87 176 45 0 1 0 41 1 0 174 0 1 0.5172 0.0057 0.0114 86.000 0.42 2.22 -1.80 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2838 0.5878 0.1284 1 1 0.2855 0.5813 0.1332 1 1 0.2874 0.5730 0.1396
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 455 183 272 164 0 5 0 14 0 0 270 0 2 0.8962 0.0000 0.0074 35.600 2.82 4.93 -2.11 82 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0902 0.9098 0.0000
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 456 173 283 10 1 21 0 141 0 0 282 0 1 0.0578 0.0000 0.0035 7.238 3.90 12.72 -8.82 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9866 0.0134 2 1 0.0000 0.5093 0.4907
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 455 149 306 0 100 9 1 39 0 0 305 0 1 0.0000 0.0000 0.0033 15.444 6.90 0 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9886 0.0114 0.0000 1 0 0.9865 0.0135 0.0000 1 0 0.9830 0.0170 0.0000
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 233 88 145 78 1 5 0 4 0 0 145 0 0 0.8864 0.0000 0.0000 16.600 0.26 3.00 -2.74 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 1 0.4221 0.5779 0.0000 0 0 0.7799 0.2201 0.0000
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 450 112 338 54 0 9 0 49 0 0 336 0 2 0.4821 0.0000 0.0059 11.444 1.00 4.20 -3.20 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2477 0.6157 0.1366 1 1 0.2510 0.6072 0.1417 1 1 0.2551 0.5965 0.1484
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 515 224 291 164 14 40 1 5 1 0 290 0 0 0.7321 0.0034 0.0034 4.575 1.24 3.40 -2.16 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0515 0.9485 0.0000 0 0 0.9505 0.0495 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr5 179644808 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 366 133 233 126 0 3 0 4 0 0 233 0 0 0.9474 0.0000 0.0000 43.333 0.70 3.25 -2.55 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0782 0.9218 0.0000 0 0 0.8844 0.1156 0.0000 0 0 0.9720 0.0280 0.0000
chr5 179733341 CCGCCCGCCGCCACGGCCCCGG C 0.500000 0.100 1 -21 1 341 138 203 130 1 5 0 2 2 0 199 0 2 0.9420 0.0099 0.0197 26.400 0.59 11.00 -10.41 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1083 0.8917 0.0000 0 0 0.9152 0.0848 0.0000 0 0 0.9798 0.0202 0.0000
chr5 181125166 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 826 213 613 190 0 9 0 14 0 0 613 0 0 0.8920 0.0000 0.0000 22.667 0.31 2.86 -2.55 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0044 0.9956 0.0000 0 0 0.5584 0.4416 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 698 130 568 103 1 10 0 16 0 0 568 0 0 0.7923 0.0000 0.0000 12.000 0.48 3.50 -3.02 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0054 0.9946 0.0000
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 535 129 406 3 2 12 0 112 0 1 403 0 2 0.0233 0.0000 0.0074 9.667 2.67 3.44 -0.77 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9160 0.0840 2 2 0.0000 0.2057 0.7943 2 2 0.0000 0.0597 0.9403
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 656 166 490 116 6 38 2 4 4 3 482 1 0 0.6988 0.0082 0.0163 3.528 2.31 3.75 -1.44 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0069 0.9931 0.0000 0 0 0.8044 0.1956 0.0000 0 0 0.9760 0.0240 0.0000
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 613 155 458 79 3 20 2 51 1 1 450 2 4 0.5097 0.0022 0.0175 6.700 1.08 3.98 -2.90 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8290 0.1695 0.0015 1 0 0.8222 0.1759 0.0019 1 0 0.8124 0.1852 0.0024
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1237 277 960 7 35 86 92 57 0 0 941 6 13 0.0253 0.0000 0.0198 2.181 4.71 6.82 -2.11 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 16327663 C CTGA 0.002924 0.100 1 3 1 1233 311 922 67 72 43 27 102 0 0 916 6 0 0.2154 0.0000 0.0065 12.750 2.82 5.58 -2.76 9 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1595 0.8395 0.0010 1 1 0.1750 0.8239 0.0011 1 1 0.1962 0.8026 0.0012
chr6 22570117 G GGGC 0.051576 0.100 1 3 1 714 159 555 71 1 40 2 45 0 0 553 0 2 0.4465 0.0000 0.0036 2.975 0.25 3.24 -2.99 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8369 0.1626 0.0005 1 0 0.8308 0.1686 0.0006 1 0 0.8222 0.1771 0.0007
chr6 24697903 TC T 0.000150 0.100 1 -1 1 208 70 138 39 0 1 0 30 0 0 138 0 0 0.5571 0.0000 0.0000 69.000 0.13 1.27 -1.14 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6349 0.3650 0.0000 1 0 0.6329 0.3671 0.0000 1 0 0.6298 0.3702 0.0000
chr6 29828657 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 571 146 425 135 0 2 0 9 0 0 425 0 0 0.9247 0.0000 0.0000 72.000 0.73 2.00 -1.27 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0559 0.9441 0.0000 0 0 0.6855 0.3145 0.0000
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 433 115 318 0 0 3 0 112 0 0 317 0 1 0.0000 0.0000 0.0031 37.333 1.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr6 30986486 TAGCCACCAACTCTGAGTCCAGCACAACCTCCAGTGGGGCCAGCAC T 0.500000 0.100 1 -45 1 1524 444 1080 314 36 76 10 8 70 44 965 1 0 0.7072 0.0648 0.1065 5.014 3.01 3.50 -0.49 82 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0153 0.9847 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 704 205 499 90 2 2 0 111 0 0 499 0 0 0.4390 0.0000 0.0000 101.500 0.44 3.02 -2.57 16 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0120 0.4380 0.5500 1 2 0.0139 0.4369 0.5493 1 2 0.0168 0.4363 0.5469
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 704 205 499 173 3 2 5 22 0 0 499 0 0 0.8439 0.0000 0.0000 100.500 1.30 6.00 -4.70 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 728 206 522 133 0 14 0 59 0 0 522 0 0 0.6456 0.0000 0.0000 13.714 0.89 3.24 -2.34 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9967 0.0033 0.0000 1 0 0.9959 0.0041 0.0000 1 0 0.9945 0.0055 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 323 103 220 100 0 1 0 2 0 0 220 0 0 0.9709 0.0000 0.0000 102.000 0.20 3.00 -2.80 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6612 0.3388 0.0000 0 0 0.9462 0.0538 0.0000 0 0 0.9726 0.0274 0.0000
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 424 115 309 97 0 15 0 3 0 0 308 0 1 0.8435 0.0000 0.0032 6.667 0.87 12.33 -11.47 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0190 0.9810 0.0000 0 0 0.6424 0.3576 0.0000 0 0 0.8947 0.1053 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 567 147 420 71 0 3 0 73 0 0 419 0 1 0.4830 0.0000 0.0024 48.000 0.25 3.29 -3.03 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1206 0.6610 0.2185 1 1 0.1265 0.6495 0.2240 1 1 0.1343 0.6349 0.2308
chr6 42104971 ACTCCTC A 0.500000 0.100 1 -6 2 746 182 564 88 0 21 0 73 0 0 562 0 2 0.4835 0.0000 0.0035 7.667 0.17 7.27 -7.10 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4239 0.5413 0.0348 1 1 0.4252 0.5363 0.0385 1 1 0.4258 0.5304 0.0438
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 333 146 187 112 0 25 0 9 0 0 185 0 2 0.7671 0.0000 0.0107 4.840 0.40 9.11 -8.71 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.1645 0.8355 0.0000
chr6 43021675 CGCCGGGGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -12 1 333 150 183 132 0 14 0 4 0 0 181 0 2 0.8800 0.0000 0.0109 9.714 0.38 12.50 -12.12 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.5654 0.4346 0.0000 0 0 0.9315 0.0685 0.0000
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 699 193 506 0 0 94 1 98 0 0 474 0 32 0.0000 0.0000 0.0632 1.053 8.09 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr6 84174775 T TTCCTGTTGTTTCTTTAGTTCTTCCAACTTATTTTCTAGTTCTTTC 0.500000 0.100 1 45 5 377 122 255 47 0 18 0 57 0 0 254 0 1 0.3852 0.0000 0.0039 5.778 0.13 0.79 -0.66 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0505 0.5027 0.4468 1 1 0.0546 0.5013 0.4442 1 1 0.0604 0.4997 0.4399
chr6 84186595 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 387 109 278 49 0 5 0 55 1 0 277 0 0 0.4495 0.0036 0.0036 20.800 0.24 3.16 -2.92 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1088 0.5979 0.2932 1 1 0.1139 0.5906 0.2954 1 1 0.1208 0.5814 0.2978
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 757 159 598 114 6 34 1 4 1 0 596 0 1 0.7170 0.0017 0.0033 3.676 2.01 3.75 -1.74 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 0 0.5171 0.4829 0.0000 0 0 0.9003 0.0997 0.0000
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 648 153 495 133 2 11 0 7 0 2 493 0 0 0.8693 0.0000 0.0040 12.909 1.24 7.00 -5.76 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3605 0.6395 0.0000 0 0 0.8994 0.1006 0.0000
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 648 160 488 144 1 7 0 8 0 0 488 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 21.857 0.31 3.00 -2.69 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2181 0.7819 0.0000 0 0 0.8699 0.1301 0.0000
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 166 52 114 0 0 10 1 41 0 0 114 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.200 2.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1053 0.8947 2 2 0.0000 0.1094 0.8906 2 2 0.0000 0.1154 0.8846
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 842 188 654 92 1 5 0 90 0 0 653 0 1 0.4894 0.0000 0.0015 36.600 0.38 3.21 -2.83 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1748 0.7074 0.1177 1 1 0.1821 0.6934 0.1245 1 1 0.1913 0.6753 0.1334
chr6 116437084 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 5 829 168 661 158 0 5 0 5 0 0 661 0 0 0.9405 0.0000 0.0000 32.600 0.37 3.00 -2.63 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0448 0.9552 0.0000 0 0 0.9288 0.0712 0.0000 0 0 0.9885 0.0115 0.0000
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 777 178 599 171 0 1 0 6 0 0 599 0 0 0.9607 0.0000 0.0000 177.000 0.35 5.00 -4.65 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 0 0.8961 0.1039 0.0000 0 0 0.9884 0.0116 0.0000
chr6 148343106 T TGAGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 391 168 223 88 1 14 0 65 0 0 223 0 0 0.5238 0.0000 0.0000 11.000 0.49 5.43 -4.94 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7127 0.2812 0.0061 1 0 0.7048 0.2879 0.0073 1 0 0.6934 0.2975 0.0091
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 1067 238 829 6 0 9 3 220 0 0 822 0 7 0.0252 0.0000 0.0084 25.444 0.33 2.99 -2.66 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8341 0.1659 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr6 156778847 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 1 567 132 435 78 3 13 6 32 3 3 419 4 6 0.5909 0.0069 0.0368 9.833 2.65 4.03 -1.38 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9251 0.0745 0.0004 1 0 0.9178 0.0817 0.0005 1 0 0.9069 0.0923 0.0008
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 712 270 442 134 0 45 1 90 0 0 430 0 12 0.4963 0.0000 0.0271 5.000 0.19 15.41 -15.22 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7714 0.2269 0.0016 1 0 0.7656 0.2323 0.0021 1 0 0.7567 0.2405 0.0028
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 459 152 307 20 0 6 0 126 0 0 303 0 4 0.1316 0.0000 0.0130 24.333 0.85 4.90 -4.05 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 278 79 199 42 0 5 0 32 0 0 197 0 2 0.5316 0.0000 0.0101 14.800 0.05 9.34 -9.30 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3970 0.5217 0.0813 1 1 0.3945 0.5196 0.0859 1 1 0.3907 0.5171 0.0922
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 373 163 210 0 0 16 16 131 0 0 206 0 4 0.0000 0.0000 0.0190 9.188 3.14 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr6 168042716 GGT G 0.500000 0.100 1 -2 1 410 136 274 84 2 0 0 50 0 0 274 0 0 0.6176 0.0000 0.0000 136.000 0.20 2.08 -1.88 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9003 0.0990 0.0007 1 0 0.8920 0.1070 0.0009 1 0 0.8799 0.1188 0.0013
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 728 193 535 148 0 38 0 7 2 0 532 0 1 0.7668 0.0037 0.0056 4.079 0.45 7.14 -6.69 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2641 0.7359 0.0000 0 0 0.8952 0.1048 0.0000
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 827 287 540 13 12 10 111 141 0 0 540 0 0 0.0453 0.0000 0.0000 27.000 2.69 7.76 -5.07 9 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.7582 0.2418
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 825 275 550 91 16 18 79 71 0 0 550 0 0 0.3309 0.0000 0.0000 14.615 2.96 11.21 -8.26 43 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0098 0.4200 0.5703 1 2 0.0114 0.4192 0.5694 1 2 0.0139 0.4192 0.5668
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 825 277 548 96 19 87 68 7 0 1 547 0 0 0.3466 0.0000 0.0018 13.769 3.04 8.14 -5.10 44 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9870 0.0130 0.0000 1 0 0.9847 0.0152 0.0000 1 0 0.9811 0.0188 0.0000
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 282 119 163 49 3 26 1 40 0 3 159 0 1 0.4118 0.0000 0.0245 3.640 3.57 3.77 -0.20 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4995 0.4592 0.0413 1 0 0.4946 0.4604 0.0450 1 0 0.4873 0.4623 0.0504
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 282 120 162 53 1 21 0 45 0 0 159 0 3 0.4417 0.0000 0.0185 4.950 3.00 4.11 -1.11 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3089 0.5883 0.1028 1 1 0.3106 0.5816 0.1078 1 1 0.3122 0.5732 0.1146
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 642 167 475 150 0 7 0 10 0 0 474 0 1 0.8982 0.0000 0.0021 22.857 0.55 12.50 -11.95 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0145 0.9855 0.0000 0 0 0.5544 0.4456 0.0000
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 277 118 159 75 0 1 0 42 0 0 159 0 0 0.6356 0.0000 0.0000 117.000 0.31 1.81 -1.50 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8801 0.1186 0.0013 1 0 0.8708 0.1276 0.0016 1 0 0.8573 0.1404 0.0022
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 807 248 559 180 3 46 0 19 0 0 559 0 0 0.7258 0.0000 0.0000 4.391 0.34 3.32 -2.97 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0350 0.9650 0.0000
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.100 1 3 2 536 128 408 63 1 8 3 53 0 0 407 0 1 0.4922 0.0000 0.0025 14.875 0.59 3.04 -2.45 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3336 0.5872 0.0792 1 1 0.3354 0.5804 0.0842 1 1 0.3370 0.5719 0.0910
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 160 62 98 35 4 0 5 18 0 1 96 1 0 0.5645 0.0000 0.0204 58.000 0.31 1.17 -0.85 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6271 0.3465 0.0264 1 0 0.6166 0.3541 0.0293 1 0 0.6020 0.3643 0.0336
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 642 168 474 157 1 4 0 6 0 0 473 0 1 0.9345 0.0000 0.0021 41.000 0.17 1.67 -1.50 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.6117 0.3883 0.0000 0 0 0.9601 0.0399 0.0000
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 205 55 150 51 0 1 0 3 0 0 150 0 0 0.9273 0.0000 0.0000 54.000 0.24 3.00 -2.76 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0168 0.9832 0.0000 0 1 0.3437 0.6563 0.0000 0 0 0.6340 0.3660 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 231 105 126 43 2 6 0 54 0 0 125 0 1 0.4095 0.0000 0.0079 16.500 0.19 3.17 -2.98 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0586 0.5157 0.4257 1 1 0.0629 0.5136 0.4235 1 1 0.0690 0.5111 0.4199
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 470 142 328 133 1 2 0 6 0 0 328 0 0 0.9366 0.0000 0.0000 70.000 0.15 2.17 -2.02 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.5765 0.4235 0.0000 0 0 0.9342 0.0658 0.0000
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 941 225 716 0 0 11 0 214 0 0 704 0 12 0.0000 0.0000 0.0168 19.455 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 83155517 T TGCTGAGCTGGAGGCTTAGCAGGACCAAGAG 0.500000 0.100 1 30 1 830 124 706 13 0 43 1 67 0 0 638 1 67 0.1048 0.0000 0.0963 1.884 0.38 6.45 -6.06 5 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.8487 0.1513
chr7 87359354 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 225 63 162 58 0 2 0 3 0 0 162 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 30.500 0.40 1.33 -0.94 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0244 0.9756 0.0000 0 1 0.4273 0.5727 0.0000 0 0 0.7090 0.2910 0.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 627 164 463 76 1 29 2 56 0 0 460 0 3 0.4634 0.0000 0.0065 4.655 0.91 3.66 -2.75 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5427 0.4348 0.0225 1 0 0.5386 0.4361 0.0253 1 0 0.5324 0.4382 0.0294
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 301 91 210 46 0 7 0 38 0 0 209 0 1 0.5055 0.0000 0.0048 12.000 0.11 3.24 -3.13 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3611 0.5484 0.0904 1 1 0.3603 0.5445 0.0952 1 1 0.3587 0.5397 0.1017
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 560 257 303 86 13 86 3 69 0 0 303 0 0 0.3346 0.0000 0.0000 1.988 1.40 3.99 -2.59 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7599 0.2367 0.0035 1 0 0.7519 0.2439 0.0042 1 0 0.7402 0.2544 0.0055
chr7 99836454 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 212 86 126 78 0 0 0 8 0 0 126 0 0 0.9070 0.0000 0.0000 86.000 0.27 1.50 -1.23 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0098 0.9902 0.0000 0 1 0.2062 0.7938 0.0000
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 537 193 344 109 0 5 0 79 0 0 344 0 0 0.5648 0.0000 0.0000 37.600 0.26 4.04 -3.78 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7939 0.2041 0.0021 1 0 0.7860 0.2114 0.0026 1 0 0.7746 0.2220 0.0034
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 243 108 135 106 1 0 0 1 0 0 134 0 1 0.9815 0.0000 0.0074 108.000 0.97 35.00 -34.03 50 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7328 0.2672 0.0000 0 0 0.9614 0.0386 0.0000 0 0 0.9803 0.0197 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 603 173 430 76 0 6 0 91 0 0 429 0 1 0.4393 0.0000 0.0023 27.833 0.63 3.38 -2.75 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0212 0.4725 0.5062 1 2 0.0239 0.4710 0.5051 1 2 0.0280 0.4696 0.5024
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 437 136 301 0 1 46 4 85 0 0 290 0 11 0.0000 0.0000 0.0365 1.956 6.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0077 0.9923 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0091 0.9909
chr7 121064295 ATAGT A 0.500000 0.100 1 -4 3 214 111 103 104 0 3 0 4 0 0 103 0 0 0.9369 0.0000 0.0000 36.000 0.42 4.50 -4.08 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0269 0.9731 0.0000 0 0 0.7182 0.2818 0.0000 0 0 0.9227 0.0773 0.0000
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 823 202 621 74 0 17 1 110 0 0 619 0 2 0.3663 0.0000 0.0032 10.882 1.15 4.05 -2.90 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.0952 0.9044 1 2 0.0005 0.1023 0.8972 1 2 0.0008 0.1128 0.8865
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 676 193 483 9 0 37 1 146 0 0 482 0 1 0.0466 0.0000 0.0021 4.216 0.22 14.11 -13.89 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8994 0.1006 2 2 0.0000 0.1970 0.8030
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 458 221 237 95 1 29 1 95 0 0 228 0 9 0.4299 0.0000 0.0380 6.621 0.81 5.91 -5.09 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0509 0.6548 0.2942 1 1 0.0557 0.6432 0.3010 1 1 0.0625 0.6286 0.3089
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 458 236 222 207 1 22 0 6 0 0 222 0 0 0.8771 0.0000 0.0000 9.727 2.98 6.00 -3.02 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0610 0.9390 0.0000 0 0 0.9820 0.0180 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 264 84 180 79 0 0 0 5 0 0 180 0 0 0.9405 0.0000 0.0000 84.000 0.23 3.00 -2.77 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.2014 0.7986 0.0000 0 0 0.6512 0.3488 0.0000
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.100 1 19 1 200 99 101 69 1 26 0 3 0 0 101 0 0 0.6970 0.0000 0.0000 2.808 0.19 12.67 -12.48 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0430 0.9570 0.0000 0 0 0.5742 0.4258 0.0000 0 0 0.8128 0.1872 0.0000
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 1044 306 738 18 216 64 0 8 0 1 737 0 0 0.0588 0.0000 0.0014 3.781 2.78 3.62 -0.85 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 0 0.9626 0.0374 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 1048 309 739 11 9 56 6 227 0 0 738 1 0 0.0356 0.0000 0.0014 4.500 3.27 3.12 0.15 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.5560 0.4440
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 878 203 675 90 1 5 1 106 0 0 675 0 0 0.4433 0.0000 0.0000 39.400 0.31 1.23 -0.92 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0205 0.5142 0.4653 1 1 0.0232 0.5096 0.4671 1 1 0.0273 0.5045 0.4682
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 854 215 639 107 0 3 1 104 0 0 638 0 1 0.4977 0.0000 0.0016 70.667 0.32 4.07 -3.75 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1435 0.7388 0.1177 1 1 0.1515 0.7233 0.1252 1 1 0.1619 0.7031 0.1351
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 229 74 155 70 0 2 0 2 0 0 154 1 0 0.9459 0.0000 0.0065 36.000 0.34 4.50 -4.16 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2007 0.7993 0.0000 0 0 0.7228 0.2772 0.0000 0 0 0.8573 0.1427 0.0000
chr7 149815254 GTGCCAGCCAGGCTCTGTGGGC G 0.500000 0.100 1 -21 1 665 184 481 169 0 12 0 3 0 0 480 0 1 0.9185 0.0000 0.0021 14.333 0.48 14.00 -13.52 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4313 0.5687 0.0000 0 0 0.9850 0.0150 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000
chr7 149815757 G GAGGTGGTC 0.500000 0.100 1 8 1 839 226 613 189 0 24 0 13 0 0 610 0 3 0.8363 0.0000 0.0049 8.417 0.35 6.92 -6.57 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.2501 0.7499 0.0000
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 874 228 646 0 0 4 0 224 0 0 639 0 7 0.0000 0.0000 0.0108 56.000 1.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 512 148 364 141 1 1 0 5 0 2 362 0 0 0.9527 0.0000 0.0055 147.000 0.43 1.80 -1.37 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0232 0.9768 0.0000 0 0 0.8663 0.1337 0.0000 0 0 0.9776 0.0224 0.0000
chr7 151023910 GCTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 596 171 425 161 0 3 0 7 0 0 425 0 0 0.9415 0.0000 0.0000 56.000 0.77 3.43 -2.66 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.6430 0.3570 0.0000 0 0 0.9651 0.0349 0.0000
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 409 79 330 0 0 2 13 64 0 4 308 6 12 0.0000 0.0000 0.0667 38.500 7.19 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3735 0.6265 2 2 0.0000 0.1150 0.8850 2 2 0.0000 0.0599 0.9401
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 408 78 330 0 0 4 8 66 0 2 303 14 11 0.0000 0.0000 0.0818 23.333 7.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0338 0.9662 2 2 0.0000 0.0218 0.9782 2 2 0.0000 0.0181 0.9819
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 410 77 333 0 1 5 4 67 0 1 279 20 33 0.0000 0.0000 0.1622 14.400 6.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0062 0.9938 2 2 0.0000 0.0050 0.9950
chr7 156950334 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 5 714 196 518 176 2 4 0 14 0 0 518 0 0 0.8980 0.0000 0.0000 48.000 0.61 3.50 -2.89 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 1 0.4138 0.5862 0.0000
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 437 107 330 60 0 1 0 46 0 0 328 0 2 0.5607 0.0000 0.0061 106.000 0.28 3.13 -2.85 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4702 0.4862 0.0436 1 1 0.4669 0.4856 0.0474 1 1 0.4618 0.4852 0.0530
chr8 673457 CACCGTCCTCCTCCCTGGTGTCTTT C 0.000344 0.100 1 -24 1 702 198 504 182 3 8 0 5 0 0 504 0 0 0.9192 0.0000 0.0000 23.625 0.82 10.40 -9.58 74 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 883 207 676 7 0 30 1 169 0 0 670 0 6 0.0338 0.0000 0.0089 5.900 0.14 6.25 -6.11 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 2 0.0000 0.1809 0.8191 2 2 0.0000 0.0145 0.9855
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.100 1 -6 2 810 171 639 132 0 35 0 4 0 0 639 0 0 0.7719 0.0000 0.0000 3.886 0.52 4.75 -4.23 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1134 0.8866 0.0000 0 0 0.9198 0.0802 0.0000 0 0 0.9810 0.0190 0.0000
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 353 120 233 70 0 2 0 48 0 0 233 0 0 0.5833 0.0000 0.0000 59.000 0.41 3.08 -2.67 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7248 0.2675 0.0077 1 0 0.7158 0.2752 0.0090 1 0 0.7031 0.2858 0.0110
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 607 253 354 0 0 53 0 200 0 0 354 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.774 5.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 458 196 262 179 0 4 0 13 0 0 261 0 1 0.9133 0.0000 0.0038 48.000 0.36 7.46 -7.10 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0102 0.9898 0.0000 0 0 0.7483 0.2517 0.0000
chr8 33496717 A AGAT 0.026718 0.100 1 3 5 178 75 103 63 1 8 0 3 0 0 103 0 0 0.8400 0.0000 0.0000 8.375 0.35 4.00 -3.65 43 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5482 0.4518 0.0000 0 0 0.9734 0.0266 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 725 234 491 134 0 6 0 94 0 0 489 0 2 0.5726 0.0000 0.0041 38.000 0.40 3.34 -2.94 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8963 0.1034 0.0003 1 0 0.8905 0.1091 0.0004 1 0 0.8818 0.1176 0.0006
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 207 81 126 46 0 0 0 35 0 0 126 0 0 0.5679 0.0000 0.0000 81.000 0.91 2.46 -1.54 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4732 0.4733 0.0535 1 1 0.4683 0.4741 0.0576 1 1 0.4613 0.4753 0.0634
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 703 217 486 147 14 50 0 6 0 0 486 0 0 0.6774 0.0000 0.0000 3.340 0.59 3.17 -2.57 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0707 0.9293 0.0000 0 0 0.9852 0.0148 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr8 66634667 TCAGTACCAC T 0.000144 0.100 1 -9 4 533 167 366 156 1 8 0 2 0 0 364 0 2 0.9341 0.0000 0.0055 19.875 0.14 9.00 -8.86 82 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr8 79766258 AGGCATGT A 0.500000 0.100 1 -7 1 385 106 279 98 1 4 0 3 0 0 279 0 0 0.9245 0.0000 0.0000 25.250 0.80 6.33 -5.54 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1642 0.8358 0.0000 0 0 0.8513 0.1487 0.0000 0 0 0.9465 0.0535 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 733 254 479 128 1 1 0 124 0 0 478 0 1 0.5039 0.0000 0.0021 253.000 2.59 17.61 -15.03 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1628 0.7631 0.0740 1 1 0.1725 0.7467 0.0808 1 1 0.1848 0.7251 0.0902
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 392 119 273 110 0 2 0 7 0 0 273 0 0 0.9244 0.0000 0.0000 58.500 1.29 4.14 -2.85 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1236 0.8764 0.0000 0 0 0.6995 0.3005 0.0000
chr8 123369918 T TTCATCA 0.500000 0.100 1 6 1 385 115 270 98 0 12 1 4 1 0 269 0 0 0.8522 0.0037 0.0037 8.500 0.77 5.25 -4.48 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0174 0.9826 0.0000 0 0 0.6250 0.3750 0.0000 0 0 0.8893 0.1107 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 544 136 408 0 0 23 10 103 0 0 407 0 1 0.0000 0.0000 0.0025 4.870 4.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0040 0.9960
chr8 143440216 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 478 172 306 128 9 26 0 9 0 0 305 0 1 0.7442 0.0000 0.0033 5.840 0.27 3.11 -2.85 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0224 0.9776 0.0000 0 0 0.5640 0.4360 0.0000
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 1030 222 808 94 0 41 0 87 0 0 798 0 10 0.4234 0.0000 0.0124 4.415 0.39 11.57 -11.18 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1033 0.7096 0.1872 1 1 0.1099 0.6954 0.1947 1 1 0.1188 0.6771 0.2041
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.100 1 2 3 2042 405 1637 380 12 5 2 6 0 0 1637 0 0 0.9383 0.0000 0.0000 80.000 0.76 3.50 -2.74 64 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9965 0.0035 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.100 1 -2 4 2047 413 1634 266 124 14 2 7 0 0 1634 0 0 0.6441 0.0000 0.0000 27.333 0.54 3.14 -2.61 0 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9187 0.0813 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 760 233 527 104 2 56 5 66 0 0 527 0 0 0.4464 0.0000 0.0000 3.161 0.23 3.09 -2.86 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9194 0.0805 0.0002 1 0 0.9142 0.0856 0.0002 1 0 0.9065 0.0932 0.0003
chr9 6329010 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 351 106 245 64 0 2 0 40 0 0 245 0 0 0.6038 0.0000 0.0000 52.000 1.12 2.02 -0.90 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7592 0.2343 0.0065 1 0 0.7486 0.2437 0.0077 1 0 0.7336 0.2568 0.0096
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 424 113 311 12 0 15 1 85 1 0 299 0 11 0.1062 0.0032 0.0386 7.000 0.17 6.44 -6.27 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9751 0.0249
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 429 117 312 76 0 0 0 41 0 0 312 0 0 0.6496 0.0000 0.0000 117.000 0.29 1.61 -1.32 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8996 0.0995 0.0009 1 0 0.8910 0.1079 0.0011 1 0 0.8783 0.1201 0.0016
chr9 34893048 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 383 95 288 57 0 1 2 35 0 0 285 0 3 0.6000 0.0000 0.0104 94.000 0.18 2.23 -2.05 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6088 0.3695 0.0217 1 0 0.6006 0.3751 0.0243 1 0 0.5890 0.3827 0.0283
chr9 35657947 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 501 141 360 122 0 1 0 18 0 0 360 0 0 0.8652 0.0000 0.0000 140.000 0.43 2.72 -2.30 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0036 0.9964 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 837 212 625 172 1 30 0 9 0 0 625 0 0 0.8113 0.0000 0.0000 6.276 0.48 12.22 -11.74 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2682 0.7318 0.0000 0 0 0.9283 0.0717 0.0000
chr9 38411406 GCGGTCAT G 0.500000 0.100 1 -7 1 245 103 142 99 0 1 0 3 0 0 142 0 0 0.9612 0.0000 0.0000 102.000 0.43 6.00 -5.57 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1649 0.8351 0.0000 0 0 0.8520 0.1480 0.0000 0 0 0.9468 0.0532 0.0000
chr9 38411418 A AT 0.500000 0.100 1 1 3 244 105 139 101 0 0 0 4 0 0 139 0 0 0.9619 0.0000 0.0000 105.000 0.41 5.00 -4.59 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0235 0.9765 0.0000 0 0 0.6875 0.3125 0.0000 0 0 0.9117 0.0883 0.0000
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 468 71 397 65 0 0 0 6 0 0 397 0 0 0.9155 0.0000 0.0000 71.000 0.17 1.50 -1.33 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0416 0.9584 0.0000 0 1 0.3328 0.6672 0.0000
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 506 132 374 0 0 5 0 127 0 0 367 0 7 0.0000 0.0000 0.0187 25.400 13.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr9 76703941 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 494 143 351 131 0 4 0 8 0 0 351 0 0 0.9161 0.0000 0.0000 34.750 1.12 3.50 -2.38 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1219 0.8781 0.0000 0 0 0.7725 0.2275 0.0000
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 852 192 660 0 0 22 0 170 0 0 636 0 24 0.0000 0.0000 0.0364 7.727 10.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 77384631 G GTGA 0.500000 0.100 1 3 1 544 199 345 144 9 32 1 13 0 0 345 0 0 0.7236 0.0000 0.0000 5.355 0.32 2.85 -2.53 114 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2094 0.7906 0.0000
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 591 187 404 180 0 2 0 5 0 0 404 0 0 0.9626 0.0000 0.0000 92.500 0.21 3.00 -2.79 94 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1259 0.8741 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000 0 0 0.9960 0.0040 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 277 78 199 33 0 0 0 45 0 0 196 0 3 0.4231 0.0000 0.0151 78.000 0.21 3.47 -3.25 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0297 0.3903 0.5801 1 2 0.0328 0.3954 0.5718 1 2 0.0374 0.4023 0.5603
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 405 130 275 45 4 35 1 45 0 0 273 0 2 0.3462 0.0000 0.0073 2.714 0.47 3.47 -3.00 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2145 0.6152 0.1703 1 1 0.2183 0.6067 0.1750 1 1 0.2231 0.5960 0.1809
chr9 92474742 C CTCATCA 0.500000 0.100 1 6 2 405 130 275 48 2 72 1 7 0 0 273 2 0 0.3692 0.0000 0.0073 0.803 0.69 3.57 -2.88 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 1 0.0777 0.9223 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 507 191 316 90 1 3 1 96 0 0 316 0 0 0.4712 0.0000 0.0000 62.333 0.32 9.30 -8.98 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0730 0.6775 0.2495 1 1 0.0787 0.6649 0.2564 1 1 0.0865 0.6489 0.2647
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 595 216 379 18 0 1 0 197 0 0 373 0 6 0.0833 0.0000 0.0158 215.000 0.61 3.23 -2.62 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8458 0.1542
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 472 146 326 124 0 10 1 11 0 0 326 0 0 0.8493 0.0000 0.0000 13.500 0.69 5.00 -4.31 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 1 0.2236 0.7764 0.0000
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 1054 190 864 77 2 44 2 65 1 2 849 0 12 0.4053 0.0012 0.0174 3.295 1.52 6.03 -4.51 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2177 0.6744 0.1079 1 1 0.2239 0.6621 0.1140 1 1 0.2314 0.6464 0.1221
chr9 99105255 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 219 124 95 106 0 11 0 7 1 0 94 0 0 0.8548 0.0105 0.0105 10.273 1.05 9.29 -8.24 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1082 0.8918 0.0000 0 0 0.6681 0.3319 0.0000
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 527 130 397 0 0 0 0 130 0 0 397 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 130.000 2.78 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 918 199 719 1 0 1 0 197 0 0 717 0 2 0.0050 0.0000 0.0028 198.000 5.00 4.76 0.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 866 209 657 0 2 1 1 205 0 0 652 0 5 0.0000 0.0000 0.0076 206.000 2.96 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 104695275 G GTGAA 0.500000 0.100 1 4 2 599 157 442 149 0 1 0 7 0 0 442 0 0 0.9490 0.0000 0.0000 156.000 1.08 5.71 -4.63 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4972 0.5028 0.0000 0 0 0.9392 0.0608 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 313 129 184 0 0 1 0 128 0 0 183 0 1 0.0000 0.0000 0.0054 128.000 4.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 493 112 381 59 1 9 0 43 0 0 380 0 1 0.5268 0.0000 0.0026 11.444 0.58 6.42 -5.84 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5814 0.3945 0.0241 1 0 0.5743 0.3987 0.0270 1 0 0.5642 0.4046 0.0311
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 618 169 449 78 0 15 4 72 0 0 448 0 1 0.4615 0.0000 0.0022 10.267 0.51 1.46 -0.95 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1852 0.6778 0.1371 1 1 0.1913 0.6653 0.1433 1 1 0.1991 0.6494 0.1514
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 609 191 418 77 0 27 9 78 0 0 416 1 1 0.4031 0.0000 0.0048 6.074 0.52 3.28 -2.76 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0348 0.5458 0.4194 1 1 0.0385 0.5405 0.4210 1 1 0.0438 0.5342 0.4220
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 2 611 196 415 84 1 100 2 9 0 0 412 1 2 0.4286 0.0000 0.0072 0.969 0.50 6.11 -5.61 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0324 0.9676 0.0000
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 606 205 401 21 0 2 1 181 0 0 396 0 5 0.1024 0.0000 0.0125 101.500 0.14 3.09 -2.95 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9879 0.0121
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 472 153 319 59 10 36 2 46 2 0 315 0 2 0.3856 0.0063 0.0125 3.250 1.10 4.72 -3.62 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6839 0.3057 0.0104 1 0 0.6751 0.3128 0.0121 1 0 0.6625 0.3227 0.0147
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 315 137 178 77 0 2 2 56 0 0 178 0 0 0.5620 0.0000 0.0000 67.500 0.26 1.16 -0.90 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6207 0.3650 0.0143 1 0 0.6142 0.3695 0.0164 1 0 0.6046 0.3759 0.0195
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 315 137 178 77 0 2 2 56 0 0 178 0 0 0.5620 0.0000 0.0000 67.500 0.26 1.16 -0.90 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6207 0.3650 0.0143 1 0 0.6142 0.3695 0.0164 1 0 0.6046 0.3759 0.0195
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 260 100 160 89 0 5 0 6 0 0 160 0 0 0.8900 0.0000 0.0000 19.000 0.29 2.00 -1.71 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1282 0.8718 0.0000 0 0 0.6170 0.3830 0.0000
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 434 122 312 67 0 1 0 54 0 0 312 0 0 0.5492 0.0000 0.0000 121.000 0.28 1.13 -0.85 5 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4822 0.4812 0.0366 1 1 0.4792 0.4806 0.0402 1 1 0.4744 0.4802 0.0454
chr9 137192572 T TTCC 0.500000 0.100 1 3 1 687 179 508 91 4 37 1 46 0 0 508 0 0 0.5084 0.0000 0.0000 3.838 0.19 3.04 -2.86 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9666 0.0333 0.0001 1 0 0.9621 0.0378 0.0001 1 0 0.9551 0.0447 0.0002
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 481 129 352 8 0 14 2 105 0 0 333 1 18 0.0620 0.0000 0.0540 8.214 0.25 13.35 -13.10 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9024 0.0976 2 2 0.0000 0.2731 0.7269
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 850 197 653 104 0 8 0 85 0 0 641 0 12 0.5279 0.0000 0.0184 23.625 0.42 8.52 -8.09 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4139 0.5811 0.0050 1 1 0.4253 0.5692 0.0054 1 1 0.4393 0.5546 0.0060
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 378 107 271 104 0 1 0 2 0 0 271 0 0 0.9720 0.0000 0.0000 106.000 1.75 1.00 0.75 72 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9943 0.0057 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr10 15719771 TCTCC T 0.162657 0.100 1 -4 1 211 50 161 27 0 2 0 21 0 0 159 0 2 0.5400 0.0000 0.0124 24.000 0.78 4.38 -3.60 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4729 0.4855 0.0416 1 1 0.4730 0.4841 0.0429 1 1 0.4729 0.4825 0.0446
chr10 18655037 AT A 0.002315 0.100 1 -1 3 66 32 34 30 0 0 0 2 0 0 34 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 32.000 0.33 1.00 -0.67 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9605 0.0395 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 252 94 158 52 0 2 1 39 0 0 156 0 2 0.5532 0.0000 0.0127 46.000 0.33 4.44 -4.11 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5690 0.4127 0.0183 1 0 0.5674 0.4130 0.0197 1 0 0.5646 0.4137 0.0217
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 922 225 697 92 2 28 0 103 0 0 694 0 3 0.4089 0.0000 0.0043 7.036 0.45 5.88 -5.44 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0328 0.5919 0.3753 1 1 0.0366 0.5837 0.3797 1 1 0.0421 0.5736 0.3843
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 777 174 603 148 1 6 0 19 0 0 602 0 1 0.8506 0.0000 0.0017 28.000 0.09 2.74 -2.65 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0105 0.9895 0.0000
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 255 100 155 91 0 1 0 8 0 0 155 0 0 0.9100 0.0000 0.0000 99.000 0.25 2.50 -2.25 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6156 0.3844 0.0000 0 0 0.9764 0.0236 0.0000
chr10 27398605 C CT 0.021536 0.100 1 1 2 817 222 595 124 1 14 0 83 0 0 592 0 3 0.5586 0.0000 0.0050 14.857 0.36 1.29 -0.93 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9431 0.0569 0.0000 1 0 0.9392 0.0608 0.0000 1 0 0.9333 0.0667 0.0000
chr10 30027571 A ACTG 0.007813 0.100 1 3 1 971 206 765 166 9 26 0 5 0 0 765 0 0 0.8058 0.0000 0.0000 6.923 0.32 2.60 -2.28 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9346 0.0654 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 42593598 CAGA C 0.000282 0.100 1 -3 1 1018 222 796 111 0 5 0 106 0 0 791 1 4 0.5000 0.0000 0.0063 43.400 0.50 3.42 -2.92 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2541 0.7459 0.0001 1 1 0.2699 0.7300 0.0001 1 1 0.2907 0.7093 0.0001
chr10 47502280 CG C 0.024504 0.100 1 -1 1 812 177 635 146 2 0 0 29 0 0 634 0 1 0.8249 0.0000 0.0016 177.000 0.25 1.14 -0.89 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr10 49988768 A AC 0.134835 0.100 1 1 1 634 217 417 144 0 2 0 71 0 0 416 0 1 0.6636 0.0000 0.0024 107.500 0.14 1.90 -1.76 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9974 0.0026 0.0000 1 0 0.9968 0.0032 0.0000 1 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr10 50008914 CAA C 0.245598 0.100 1 -2 1 1213 314 899 180 1 3 0 130 0 0 894 0 5 0.5732 0.0000 0.0056 103.667 0.38 2.24 -1.86 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9385 0.0615 0.0000 1 0 0.9350 0.0650 0.0000 1 0 0.9296 0.0703 0.0001
chr10 53822891 G GTGTT 0.000319 0.100 1 4 1 527 127 400 113 0 5 0 9 0 0 400 0 0 0.8898 0.0000 0.0000 24.400 0.31 3.67 -3.36 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 0 0.9839 0.0161 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 149 64 85 61 0 0 0 3 0 0 85 0 0 0.9531 0.0000 0.0000 64.000 0.69 8.33 -7.64 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1364 0.8636 0.0000 0 0 0.8271 0.1729 0.0000 0 0 0.9398 0.0602 0.0000
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.100 1 1 1 223 90 133 81 0 5 0 4 0 0 133 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 17.000 0.20 1.00 -0.80 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5443 0.4557 0.0000 0 0 0.9901 0.0099 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 509 138 371 50 0 26 3 59 0 0 371 0 0 0.3623 0.0000 0.0000 4.308 0.54 3.10 -2.56 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1014 0.6876 0.2110 1 1 0.1097 0.6819 0.2084 1 1 0.1215 0.6742 0.2043
chr10 75028901 G GGAAGAGGAA 0.002182 0.100 1 9 1 721 122 599 79 2 31 0 10 0 0 599 0 0 0.6475 0.0000 0.0000 2.935 1.11 7.50 -6.39 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3833 0.6167 0.0000 0 0 0.9744 0.0256 0.0000
chr10 75043841 TAGA T 0.000651 0.100 1 -3 3 233 98 135 93 1 1 0 3 0 0 134 1 0 0.9490 0.0000 0.0074 97.000 0.62 5.67 -5.04 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9943 0.0057 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 504 187 317 160 2 13 0 12 0 0 317 0 0 0.8556 0.0000 0.0000 13.308 0.31 5.33 -5.02 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5301 0.4699 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 244 53 191 37 7 7 0 2 0 0 191 0 0 0.6981 0.0000 0.0000 5.571 0.68 1.00 -0.32 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4999 0.5001 0.0000 0 0 0.8996 0.1004 0.0000 0 0 0.9510 0.0490 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 763 151 612 9 0 6 0 136 0 0 597 0 15 0.0596 0.0000 0.0245 24.167 0.56 6.18 -5.63 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9573 0.0427 2 2 0.0000 0.3819 0.6181
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 609 200 409 190 1 3 0 6 0 0 409 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 65.667 0.22 3.17 -2.95 66 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6295 0.3705 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 713 270 443 222 0 38 0 10 0 0 443 0 0 0.8222 0.0000 0.0000 6.105 1.23 6.30 -5.07 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6587 0.3413 0.0000 0 0 0.9898 0.0102 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 401 98 303 9 0 5 0 84 0 0 297 0 6 0.0918 0.0000 0.0198 18.600 0.33 6.15 -5.82 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9945 0.0055 2 1 0.0000 0.8192 0.1808
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.100 1 18 1 510 160 350 131 0 22 0 7 0 0 349 0 1 0.8187 0.0000 0.0029 6.273 0.82 13.00 -12.18 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.9006 0.0994 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000
chr10 104057110 CGCCACCAACACCGCCACCTCCTCCACT C 0.001817 0.100 1 -27 1 320 126 194 111 0 12 0 3 0 0 194 0 0 0.8810 0.0000 0.0000 9.500 0.99 18.00 -17.01 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9950 0.0050 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 393 147 246 85 0 2 0 60 0 0 245 0 1 0.5782 0.0000 0.0041 72.500 1.25 2.62 -1.37 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8012 0.1968 0.0020 1 0 0.7948 0.2028 0.0024 1 0 0.7856 0.2113 0.0031
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 173 64 109 0 0 1 1 62 0 0 107 0 2 0.0000 0.0000 0.0183 63.000 3.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0138 0.9862 2 2 0.0000 0.0147 0.9853 2 2 0.0000 0.0161 0.9839
chr10 115171343 CTT C 0.004437 0.100 1 -2 1 294 73 221 67 0 1 0 5 0 0 221 0 0 0.9178 0.0000 0.0000 72.000 0.10 2.00 -1.90 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0927 0.9073 0.0000 0 0 0.9688 0.0312 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr10 121975076 C CGAGCGG 0.000097 0.100 1 6 1 343 120 223 106 0 8 0 6 1 0 222 0 0 0.8833 0.0045 0.0045 14.000 0.81 5.33 -4.52 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7955 0.2045 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 124021236 C CG 0.056607 0.100 1 1 1 409 90 319 30 26 16 10 8 1 1 309 7 1 0.3333 0.0031 0.0313 2.688 2.53 1.88 0.66 18 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9347 0.0652 0.0001 1 0 0.9280 0.0719 0.0002 1 0 0.8959 0.1039 0.0002
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 409 92 317 30 21 15 10 16 0 2 314 0 1 0.3261 0.0000 0.0095 3.933 2.43 4.06 -1.63 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7716 0.2204 0.0080 1 0 0.7591 0.2315 0.0094 1 0 0.7414 0.2470 0.0117
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.100 1 21 2 735 164 571 149 0 10 0 5 2 0 569 0 0 0.9085 0.0035 0.0035 15.400 0.38 14.60 -14.22 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1842 0.8158 0.0000 0 0 0.9844 0.0156 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 366 105 261 88 0 6 0 11 0 0 261 0 0 0.8381 0.0000 0.0000 16.500 0.22 1.18 -0.97 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0587 0.9413 0.0000
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.100 1 -12 1 781 189 592 167 0 15 0 7 1 0 591 0 0 0.8836 0.0017 0.0017 11.600 0.56 12.00 -11.44 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0174 0.9826 0.0000 0 0 0.9801 0.0199 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 255 96 159 47 0 1 1 47 0 0 159 0 0 0.4896 0.0000 0.0000 95.000 0.34 2.00 -1.66 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1963 0.6161 0.1877 1 1 0.2013 0.6077 0.1910 1 1 0.2078 0.5970 0.1952
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.100 1 1 1 381 110 271 53 0 6 0 51 0 0 269 1 1 0.4818 0.0000 0.0074 17.333 0.40 1.92 -1.53 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3245 0.6251 0.0505 1 1 0.3324 0.6159 0.0517 1 1 0.3424 0.6042 0.0534
chr11 1094638 ACCAACCACCACTCCCAGCCCT A 0.029704 0.100 1 -21 2 2026 499 1527 241 16 208 14 20 19 9 1340 29 130 0.4830 0.0124 0.1225 1.356 2.40 9.65 -7.25 95 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9990 0.0010 0.0000 1 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1247 283 964 92 1 101 1 88 0 0 963 1 0 0.3251 0.0000 0.0010 1.802 0.27 8.76 -8.49 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1790 0.7059 0.1151 1 1 0.1856 0.6922 0.1222 1 1 0.1939 0.6744 0.1317
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 1129 350 779 108 3 114 1 124 0 0 779 0 0 0.3086 0.0000 0.0000 2.061 0.73 9.10 -8.37 32 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0175 0.5573 0.4252 1 1 0.0198 0.5480 0.4322 1 1 0.0233 0.5368 0.4399
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 409 111 298 0 0 3 0 108 0 0 296 0 2 0.0000 0.0000 0.0067 36.000 2.81 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 779 259 520 147 1 6 0 105 0 0 519 0 1 0.5676 0.0000 0.0019 42.000 0.18 1.22 -1.04 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9000 0.0997 0.0002 1 0 0.8939 0.1058 0.0003 1 0 0.8847 0.1148 0.0005
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 233 90 143 38 0 0 0 52 0 0 141 0 2 0.4222 0.0000 0.0140 90.000 0.00 2.15 -2.15 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0249 0.3816 0.5935 1 2 0.0278 0.3868 0.5854 1 2 0.0320 0.3939 0.5741
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 764 199 565 186 1 3 1 8 0 0 565 0 0 0.9347 0.0000 0.0000 65.333 0.21 4.88 -4.67 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6138 0.3862 0.0000 0 0 0.9747 0.0253 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 595 166 429 69 0 4 1 92 0 0 427 0 2 0.4157 0.0000 0.0047 40.500 0.33 1.17 -0.84 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0043 0.2532 0.7425 1 2 0.0052 0.2603 0.7344 1 2 0.0067 0.2705 0.7228
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 605 163 442 88 1 5 2 67 0 0 441 0 1 0.5399 0.0000 0.0023 31.200 1.10 2.10 -1.00 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5931 0.3931 0.0138 1 0 0.5886 0.3956 0.0158 1 0 0.5815 0.3995 0.0190
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 662 146 516 64 0 4 0 78 0 0 514 0 2 0.4384 0.0000 0.0039 35.500 0.08 6.06 -5.99 26 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0223 0.4430 0.5347 1 2 0.0251 0.4436 0.5312 1 2 0.0292 0.4451 0.5257
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 498 142 356 54 0 7 0 81 0 0 355 0 1 0.3803 0.0000 0.0028 19.286 0.13 1.52 -1.39 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0031 0.1948 0.8021 1 2 0.0038 0.2037 0.7924 1 2 0.0050 0.2164 0.7786
chr11 5901221 GTCATCATTGTCAGGACTTTGGTATTTGTGACTCCAT G 0.500000 0.100 1 -36 1 999 255 744 237 0 3 0 15 0 0 744 0 0 0.9294 0.0000 0.0000 84.000 0.21 24.13 -23.93 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 0 0.8669 0.1331 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 856 156 700 0 0 14 0 142 0 0 675 0 25 0.0000 0.0000 0.0357 10.143 9.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 8921341 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 221 89 132 86 0 0 0 3 0 0 132 0 0 0.9663 0.0000 0.0000 89.000 0.41 2.33 -1.93 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0927 0.9073 0.0000 0 0 0.7506 0.2494 0.0000 0 0 0.9045 0.0955 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 304 151 153 57 0 22 2 70 0 0 151 1 1 0.3775 0.0000 0.0131 5.864 0.74 3.44 -2.71 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0211 0.4138 0.5651 1 2 0.0237 0.4163 0.5599 1 2 0.0277 0.4201 0.5522
chr11 9091461 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 304 153 151 59 4 87 1 2 0 0 149 2 0 0.3856 0.0000 0.0132 0.738 0.71 7.00 -6.29 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0131 0.9869 0.0000 0 1 0.3328 0.6672 0.0000 0 0 0.6745 0.3255 0.0000
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 12 1 718 183 535 119 1 60 0 3 0 0 535 0 0 0.6503 0.0000 0.0000 2.050 0.92 12.00 -11.08 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3621 0.6379 0.0000 0 0 0.9419 0.0581 0.0000 0 0 0.9798 0.0202 0.0000
chr11 44309737 TGCTGCGGCTGCG T 0.500000 0.100 1 -12 1 499 125 374 109 2 10 0 4 1 0 372 0 1 0.8720 0.0027 0.0053 11.400 0.85 9.50 -8.65 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0044 0.9956 0.0000 0 0 0.5650 0.4350 0.0000 0 0 0.9018 0.0982 0.0000
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 231 87 144 56 0 4 0 27 0 0 143 0 1 0.6437 0.0000 0.0069 20.750 0.11 6.04 -5.93 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8389 0.1579 0.0033 1 0 0.8279 0.1681 0.0040 1 0 0.8122 0.1827 0.0052
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 908 288 620 146 1 12 0 129 0 0 619 0 1 0.5069 0.0000 0.0016 23.000 0.16 3.81 -3.66 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4036 0.5825 0.0139 1 1 0.4117 0.5722 0.0161 1 1 0.4207 0.5598 0.0196
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 838 191 647 86 0 9 0 96 0 0 643 0 4 0.4503 0.0000 0.0062 20.222 0.36 2.22 -1.86 2 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0270 0.5392 0.4337 1 1 0.0303 0.5337 0.4360 1 1 0.0350 0.5273 0.4377
chr11 56613070 CCAGA C 0.500000 0.100 1 -4 1 1209 277 932 144 0 8 0 125 0 0 930 0 2 0.5199 0.0000 0.0021 33.625 0.24 4.08 -3.84 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4106 0.5753 0.0141 1 1 0.4182 0.5654 0.0164 1 1 0.4265 0.5537 0.0198
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 90 52 38 35 1 1 0 15 0 0 38 0 0 0.6731 0.0000 0.0000 51.000 0.09 2.07 -1.98 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7486 0.2398 0.0116 1 0 0.7357 0.2508 0.0134 1 0 0.7154 0.2684 0.0162
chr11 62146762 GGAGCAGGAGCGGCGGGAGCAGGAGCGGCGC G 0.500000 0.100 1 -30 3 696 241 455 138 3 33 0 67 1 0 433 0 21 0.5726 0.0022 0.0484 6.242 0.72 11.33 -10.60 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9706 0.0294 0.0000 1 0 0.9669 0.0331 0.0000 1 0 0.9612 0.0387 0.0001
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 294 107 187 51 0 21 2 33 0 0 186 0 1 0.4766 0.0000 0.0053 4.095 0.29 3.24 -2.95 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5748 0.3961 0.0291 1 0 0.5670 0.4008 0.0322 1 0 0.5561 0.4072 0.0368
chr11 68157814 GTCA G 0.500000 0.100 1 -3 3 493 133 360 112 0 13 0 8 0 0 360 0 0 0.8421 0.0000 0.0000 9.231 0.46 3.25 -2.79 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0510 0.9490 0.0000 0 0 0.5745 0.4255 0.0000
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 1048 221 827 114 0 27 1 79 0 0 778 0 49 0.5158 0.0000 0.0593 7.185 0.62 6.94 -6.31 70 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0201 0.5863 0.3936 1 1 0.0230 0.5768 0.4002 1 1 0.0272 0.5654 0.4074
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 1023 277 746 14 0 1 1 261 0 0 745 1 0 0.0505 0.0000 0.0013 276.000 0.07 2.31 -2.24 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8542 0.1458 2 2 0.0000 0.0224 0.9776
chr11 72240115 GGCGCCCGCC G 0.500000 0.100 1 -9 5 405 125 280 96 0 22 0 7 0 0 280 0 0 0.7680 0.0000 0.0000 4.682 0.34 9.00 -8.66 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0655 0.9345 0.0000 0 0 0.5413 0.4587 0.0000
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 869 189 680 169 1 12 0 7 0 0 680 0 0 0.8942 0.0000 0.0000 14.750 0.47 2.71 -2.25 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.7387 0.2613 0.0000 0 0 0.9772 0.0228 0.0000
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.100 1 -1 3 833 90 743 83 0 0 0 7 0 0 743 0 0 0.9222 0.0000 0.0000 90.000 0.28 1.71 -1.44 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0355 0.9645 0.0000 0 1 0.3862 0.6138 0.0000
chr11 96092039 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1356 374 982 321 5 36 0 12 0 0 982 0 0 0.8583 0.0000 0.0000 9.333 0.43 3.17 -2.73 197 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9704 0.0296 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1565 444 1121 0 4 86 7 347 0 0 1120 1 0 0.0000 0.0000 0.0009 4.081 7.76 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 101962856 AGCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 887 211 676 203 0 0 0 8 0 0 676 0 0 0.9621 0.0000 0.0000 211.000 1.13 4.12 -3.00 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.8349 0.1651 0.0000 0 0 0.9911 0.0089 0.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 963 317 646 148 2 45 2 120 0 2 643 1 0 0.4669 0.0000 0.0046 6.022 0.99 10.00 -9.01 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7027 0.2952 0.0021 1 0 0.7001 0.2973 0.0026 1 0 0.6953 0.3012 0.0035
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 309 121 188 69 1 4 1 46 0 0 186 0 2 0.5702 0.0000 0.0106 29.250 0.28 7.17 -6.90 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6848 0.3046 0.0106 1 0 0.6759 0.3118 0.0122 1 0 0.6632 0.3219 0.0149
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 433 127 306 65 0 6 1 55 0 0 305 1 0 0.5118 0.0000 0.0033 20.167 1.02 5.40 -4.38 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3563 0.5737 0.0700 1 1 0.3574 0.5677 0.0748 1 1 0.3582 0.5603 0.0815
chr11 125495476 CG C 0.500000 0.100 1 -1 4 365 100 265 89 0 1 0 10 0 0 265 0 0 0.8900 0.0000 0.0000 99.000 0.12 1.50 -1.38 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.1096 0.8904 0.0000
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.100 1 -6 1 253 85 168 67 1 11 0 6 0 0 168 0 0 0.7882 0.0000 0.0000 6.727 0.28 6.17 -5.88 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0478 0.9522 0.0000 0 1 0.3655 0.6345 0.0000
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 473 142 331 75 0 11 2 54 0 0 329 0 2 0.5282 0.0000 0.0060 11.909 0.59 4.00 -3.41 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5726 0.4077 0.0197 1 0 0.5674 0.4104 0.0222 1 0 0.5596 0.4144 0.0260
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 434 167 267 160 0 2 0 5 0 0 267 0 0 0.9581 0.0000 0.0000 82.500 0.87 1.00 -0.13 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0360 0.9640 0.0000 0 0 0.9090 0.0910 0.0000 0 0 0.9850 0.0150 0.0000
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 592 182 410 16 4 29 0 133 0 0 404 0 6 0.0879 0.0000 0.0146 5.276 0.06 3.02 -2.96 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 477 168 309 0 0 39 14 115 0 0 308 1 0 0.0000 0.0000 0.0032 3.282 3.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr12 6778354 G GGAGCCC 0.001563 0.100 1 6 2 466 216 250 179 0 31 1 5 0 0 250 0 0 0.8287 0.0000 0.0000 5.935 0.26 6.20 -5.94 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9874 0.0126 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 6936716 CCAGCAA C 0.006744 0.100 1 -6 1 1008 261 747 124 14 11 94 18 0 0 745 2 0 0.4751 0.0000 0.0027 22.273 0.61 7.61 -7.00 38 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8200 0.1800 0.0000 1 0 0.8177 0.1823 0.0000 1 0 0.8138 0.1861 0.0000
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 1622 420 1202 258 0 3 0 159 0 0 1200 0 2 0.6143 0.0000 0.0017 139.000 1.29 4.18 -2.89 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9984 0.0016 0.0000 1 0 0.9980 0.0020 0.0000 1 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 292 99 193 0 0 5 0 94 0 0 184 0 9 0.0000 0.0000 0.0466 18.800 4.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0051 0.9949 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0066 0.9934
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 342 175 167 0 0 11 3 161 0 0 167 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 14.818 4.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.100 1 -2 1 556 126 430 48 0 1 0 77 0 0 428 0 2 0.3810 0.0000 0.0047 125.000 0.69 2.38 -1.69 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0077 0.3660 0.6263 1 2 0.0095 0.3820 0.6084 1 2 0.0125 0.4038 0.5837
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 463 114 349 62 1 2 0 49 0 0 349 0 0 0.5439 0.0000 0.0000 56.000 0.37 3.82 -3.45 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5687 0.4080 0.0234 1 0 0.5644 0.4098 0.0258 1 0 0.5580 0.4126 0.0294
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1017 154 863 8 0 74 1 71 0 0 825 2 36 0.0519 0.0000 0.0440 1.081 0.50 5.10 -4.60 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9512 0.0488 2 2 0.0000 0.4361 0.5639
chr12 51329814 A AG 0.276619 0.100 1 1 2 222 88 134 43 0 2 0 43 0 0 134 0 0 0.4886 0.0000 0.0000 43.000 0.16 1.40 -1.23 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2866 0.6038 0.1096 1 1 0.2921 0.5962 0.1117 1 1 0.2991 0.5865 0.1144
chr12 52073890 TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC T 0.050697 0.100 1 -23 2 380 118 262 59 0 22 0 37 0 0 259 0 3 0.5000 0.0000 0.0115 4.364 0.42 18.78 -18.36 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7927 0.2064 0.0010 1 0 0.7866 0.2123 0.0011 1 0 0.7780 0.2207 0.0013
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 982 213 769 20 0 22 3 168 0 0 767 1 1 0.0939 0.0000 0.0026 8.636 0.15 12.80 -12.65 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9901 0.0099
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 381 74 307 39 0 3 0 32 0 0 306 0 1 0.5270 0.0000 0.0033 23.667 0.46 1.59 -1.13 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4425 0.4988 0.0587 1 1 0.4421 0.4965 0.0614 1 1 0.4412 0.4938 0.0650
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 370 88 282 54 0 0 0 34 0 0 282 0 0 0.6136 0.0000 0.0000 88.000 0.41 1.00 -0.59 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7299 0.2607 0.0095 1 0 0.7203 0.2688 0.0109 1 0 0.7069 0.2801 0.0131
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 506 115 391 39 9 19 3 45 0 0 391 0 0 0.3391 0.0000 0.0000 4.895 0.46 1.29 -0.83 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2626 0.6200 0.1174 1 1 0.2690 0.6116 0.1194 1 1 0.2772 0.6009 0.1219
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 622 146 476 137 0 1 0 8 0 0 475 0 1 0.9384 0.0000 0.0021 145.000 0.18 4.12 -3.94 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.9175 0.0825 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 93 44 49 2 0 1 0 41 0 0 49 0 0 0.0455 0.0000 0.0000 43.000 0.00 2.46 -2.46 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8559 0.1441 2 2 0.0000 0.3796 0.6204 2 2 0.0000 0.2178 0.7822
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 438 109 329 62 0 1 1 45 0 0 325 0 4 0.5688 0.0000 0.0122 108.000 0.84 3.82 -2.98 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5136 0.4541 0.0323 1 0 0.5110 0.4538 0.0352 1 0 0.5067 0.4539 0.0394
chr12 69574374 A AGTGCCC 0.000382 0.100 1 6 1 584 113 471 60 0 9 0 44 0 0 460 0 11 0.5310 0.0000 0.0234 11.556 0.17 5.18 -5.02 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4828 0.5172 0.0001 1 1 0.4887 0.5113 0.0001 1 1 0.4958 0.5042 0.0001
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.100 1 -1 1 306 100 206 6 9 25 42 18 0 0 202 4 0 0.0600 0.0000 0.0194 1.480 2.83 2.94 -0.11 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9853 0.0146 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.9972 0.0028
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1126 326 800 0 0 23 3 300 0 0 797 0 3 0.0000 0.0000 0.0037 13.174 3.28 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 79797287 TCTCTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -9 3 373 116 257 65 0 8 0 43 0 0 256 0 1 0.5603 0.0000 0.0039 13.500 0.28 8.65 -8.37 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6938 0.2954 0.0108 1 0 0.6843 0.3032 0.0125 1 0 0.6708 0.3141 0.0152
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 473 130 343 45 32 50 0 3 0 1 342 0 0 0.3462 0.0000 0.0029 1.600 0.18 3.33 -3.16 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0637 0.9363 0.0000 0 0 0.6686 0.3314 0.0000 0 0 0.8652 0.1348 0.0000
chr12 102958393 CGCAGCAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 1 482 134 348 62 0 31 0 41 0 0 345 0 3 0.4627 0.0000 0.0086 3.323 0.44 6.83 -6.39 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6263 0.3558 0.0179 1 0 0.6181 0.3616 0.0202 1 0 0.6065 0.3697 0.0238
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 403 107 296 75 3 10 0 19 0 0 296 0 0 0.7009 0.0000 0.0000 9.700 0.84 3.05 -2.21 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0811 0.9189 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 2000 551 1449 425 9 91 0 26 2 1 1441 1 4 0.7713 0.0014 0.0055 4.978 0.87 4.58 -3.71 127 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7921 0.2079 0.0000
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.100 1 -30 1 1913 548 1365 310 3 81 0 154 4 15 1275 4 67 0.5657 0.0029 0.0659 5.765 1.21 19.49 -18.28 124 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9991 0.0009 0.0000 1 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 647 189 458 111 0 3 0 75 0 0 453 0 5 0.5873 0.0000 0.0109 62.000 0.21 8.59 -8.38 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8075 0.1908 0.0017 1 0 0.7996 0.1982 0.0022 1 0 0.7882 0.2089 0.0029
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 671 202 469 0 0 24 2 176 0 0 469 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.375 4.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 197 102 95 50 0 0 0 52 0 0 95 0 0 0.4902 0.0000 0.0000 102.000 0.60 2.50 -1.90 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1537 0.6179 0.2284 1 1 0.1586 0.6093 0.2321 1 1 0.1650 0.5983 0.2367
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 372 101 271 0 0 10 0 91 0 0 261 0 10 0.0000 0.0000 0.0369 9.100 5.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0074 0.9926
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 364 99 265 50 0 10 0 39 0 0 261 0 4 0.5051 0.0000 0.0151 8.900 0.06 10.26 -10.20 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3538 0.5579 0.0883 1 1 0.3536 0.5533 0.0931 1 1 0.3528 0.5475 0.0997
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 781 190 591 9 0 20 0 161 0 0 572 0 19 0.0474 0.0000 0.0321 8.500 0.89 8.04 -7.15 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.6439 0.3561 2 2 0.0000 0.0494 0.9506
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 266 113 153 7 1 26 1 78 0 0 151 0 2 0.0619 0.0000 0.0131 3.346 1.14 3.15 -2.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9885 0.0115 2 1 0.0000 0.7688 0.2312
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 245 84 161 0 0 6 4 74 0 0 157 0 4 0.0000 0.0000 0.0248 12.833 8.85 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0152 0.9848 2 2 0.0000 0.0165 0.9835 2 2 0.0000 0.0185 0.9815
chr12 131828558 C CCGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 9 1 245 87 158 2 0 5 0 80 0 0 157 0 1 0.0230 0.0000 0.0063 16.400 3.50 8.31 -4.81 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5765 0.4235 2 2 0.0000 0.1283 0.8717 2 2 0.0000 0.0662 0.9338
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 629 182 447 154 3 22 0 3 1 0 446 0 0 0.8462 0.0022 0.0022 7.273 0.54 4.00 -3.46 42 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8004 0.1996 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 606 180 426 113 13 50 0 4 0 0 426 0 0 0.6278 0.0000 0.0000 2.600 0.63 5.25 -4.62 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0790 0.9210 0.0000 0 0 0.8848 0.1152 0.0000 0 0 0.9721 0.0279 0.0000
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.100 1 -36 5 588 159 429 106 0 43 0 10 0 0 429 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 2.698 0.77 12.40 -11.63 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 1 0.2185 0.7815 0.0000
chr12 133121909 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 381 85 296 82 0 0 0 3 0 0 296 0 0 0.9647 0.0000 0.0000 85.000 0.87 1.00 -0.13 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0785 0.9215 0.0000 0 0 0.7121 0.2879 0.0000 0 0 0.8865 0.1135 0.0000
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 814 186 628 91 0 29 0 66 0 0 622 0 6 0.4892 0.0000 0.0096 5.414 0.54 5.44 -4.90 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5965 0.3906 0.0129 1 0 0.5925 0.3927 0.0148 1 0 0.5860 0.3962 0.0178
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 202 68 134 36 1 3 0 28 0 0 131 0 3 0.5294 0.0000 0.0224 21.667 0.22 4.82 -4.60 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5511 0.4420 0.0069 1 0 0.5515 0.4413 0.0072 1 0 0.5516 0.4407 0.0077
chr13 50956450 T TA 0.033831 0.100 1 1 6 506 131 375 112 3 3 2 11 0 0 375 0 0 0.8550 0.0000 0.0000 41.667 0.71 2.45 -1.75 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0398 0.9602 0.0000 0 0 0.7967 0.2033 0.0000
chr13 60528441 GATA G 0.187645 0.100 1 -3 4 466 120 346 71 0 2 0 47 0 0 345 0 1 0.5917 0.0000 0.0029 59.000 0.27 3.34 -3.07 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8142 0.1838 0.0020 1 0 0.8072 0.1904 0.0023 1 0 0.7973 0.1998 0.0029
chr13 71866406 T TGCCGCC 0.060439 0.100 1 6 1 831 202 629 79 1 42 0 80 0 0 622 0 7 0.3911 0.0000 0.0111 3.902 1.08 6.26 -5.19 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1681 0.7909 0.0410 1 1 0.1805 0.7777 0.0418 1 1 0.1973 0.7601 0.0427
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 758 196 562 82 2 40 1 71 0 0 556 0 6 0.4184 0.0000 0.0107 3.900 0.80 6.24 -5.43 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4154 0.5683 0.0164 1 1 0.4237 0.5588 0.0175 1 1 0.4338 0.5471 0.0191
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 140 62 78 52 0 6 0 4 0 0 78 0 0 0.8387 0.0000 0.0000 9.333 0.62 5.25 -4.63 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0789 0.9211 0.0000 0 0 0.8929 0.1071 0.0000 0 0 0.9768 0.0232 0.0000
chr13 77698098 T TGCC 0.001998 0.100 1 3 1 532 151 381 128 1 15 0 7 1 0 380 0 0 0.8477 0.0026 0.0026 9.067 3.59 5.14 -1.56 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0629 0.9371 0.0000 0 0 0.9948 0.0052 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 565 92 473 1 0 9 1 81 0 0 467 2 4 0.0109 0.0000 0.0127 9.222 1.00 4.79 -3.79 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0231 0.9769 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0060 0.9940
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 483 70 413 18 2 31 2 17 0 1 406 2 4 0.2571 0.0000 0.0169 1.226 3.67 6.76 -3.10 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1296 0.5265 0.3439 1 1 0.1338 0.5244 0.3418 1 1 0.1394 0.5218 0.3388
chr13 102686054 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 474 120 354 110 1 3 0 6 0 0 354 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 39.000 0.42 1.17 -0.75 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3061 0.6939 0.0000 0 0 0.8241 0.1759 0.0000
chr13 107866367 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 2 831 212 619 125 0 3 0 84 0 0 619 0 0 0.5896 0.0000 0.0000 104.500 0.55 10.50 -9.95 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9085 0.0912 0.0003 1 0 0.9018 0.0979 0.0004 1 0 0.8917 0.1077 0.0006
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -15 1 298 93 205 3 0 5 1 84 0 0 205 0 0 0.0323 0.0000 0.0000 17.600 1.67 8.07 -6.40 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9111 0.0889 2 2 0.0000 0.2608 0.7392 2 2 0.0000 0.1009 0.8991
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 299 93 206 8 2 29 0 54 0 0 206 0 0 0.0860 0.0000 0.0000 2.207 2.50 10.69 -8.19 6 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9775 0.0225
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.100 1 4 1 400 101 299 93 0 4 0 4 0 0 299 0 0 0.9208 0.0000 0.0000 24.250 0.39 4.25 -3.86 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0155 0.9845 0.0000 0 0 0.5953 0.4047 0.0000 0 0 0.8750 0.1250 0.0000
chr13 113404036 TGAGCCCGTTCCTGAGCCCCTTTCTGGGCCTGTTCCC T 0.500000 0.100 1 -36 2 1512 419 1093 156 42 209 6 6 6 22 1062 3 0 0.3723 0.0055 0.0284 0.928 2.06 3.00 -0.94 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.6684 0.3316 0.0000 0 0 0.9838 0.0162 0.0000
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 620 166 454 149 1 8 1 7 0 0 454 0 0 0.8976 0.0000 0.0000 19.750 0.48 2.29 -1.80 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3166 0.6834 0.0000 0 0 0.9022 0.0978 0.0000
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 1260 307 953 133 1 7 0 166 0 0 948 0 5 0.4332 0.0000 0.0052 42.714 0.50 1.83 -1.33 27 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.1322 0.8676 1 2 0.0003 0.1356 0.8642 1 2 0.0004 0.1410 0.8586
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 533 151 382 122 1 14 0 14 0 0 382 0 0 0.8079 0.0000 0.0000 9.786 0.25 1.71 -1.47 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0572 0.9428 0.0000
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 516 116 400 11 0 2 0 103 0 0 385 0 15 0.0948 0.0000 0.0375 57.000 1.00 17.59 -16.59 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 1 0.0000 0.8357 0.1643
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 448 102 346 54 1 6 0 41 0 0 344 0 2 0.5294 0.0000 0.0058 15.833 0.63 1.15 -0.52 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3430 0.5784 0.0786 1 1 0.3388 0.5763 0.0849 1 1 0.3326 0.5735 0.0939
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.100 1 -6 1 741 188 553 156 0 28 0 4 0 0 553 0 0 0.8298 0.0000 0.0000 5.714 0.46 7.00 -6.54 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6105 0.3895 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.100 1 3 3 635 160 475 92 0 12 0 56 0 0 470 0 5 0.5750 0.0000 0.0105 12.333 0.32 3.18 -2.86 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8804 0.1189 0.0007 1 0 0.8736 0.1255 0.0009 1 0 0.8637 0.1351 0.0012
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 587 173 414 16 5 14 2 136 0 0 406 0 8 0.0925 0.0000 0.0193 11.923 0.44 3.15 -2.72 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9878 0.0122
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 483 109 374 55 1 5 0 48 0 0 374 0 0 0.5046 0.0000 0.0000 20.800 0.64 6.23 -5.59 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4708 0.4919 0.0373 1 1 0.4715 0.4888 0.0397 1 1 0.4718 0.4851 0.0430
chr14 23079574 A AGAACGTGAACGT 0.001238 0.100 1 12 1 483 109 374 55 3 40 0 11 0 0 374 0 0 0.5046 0.0000 0.0000 1.718 0.64 6.18 -5.55 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0429 0.9571 0.0000 0 1 0.0628 0.9372 0.0000 0 0 0.8613 0.1387 0.0000
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 403 121 282 19 5 9 6 82 0 1 281 0 0 0.1570 0.0000 0.0035 108.000 0.21 3.95 -3.74 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7651 0.2349 2 1 0.0000 0.9963 0.0037 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 402 125 277 18 0 17 2 88 0 1 276 0 0 0.1440 0.0000 0.0036 7.200 0.22 4.20 -3.98 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 361 74 287 39 0 5 0 30 0 1 286 0 0 0.5270 0.0000 0.0035 13.800 0.44 3.90 -3.46 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5204 0.4364 0.0432 1 0 0.5158 0.4379 0.0463 1 0 0.5093 0.4402 0.0505
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 336 96 240 84 0 3 0 9 0 0 240 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 31.000 0.24 1.22 -0.98 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0508 0.9492 0.0000 0 0 0.6781 0.3219 0.0000
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 440 145 295 110 1 25 0 9 1 0 293 0 1 0.7586 0.0034 0.0068 4.760 0.43 5.56 -5.13 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0120 0.9880 0.0000 0 1 0.4156 0.5844 0.0000
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 697 147 550 12 0 22 1 112 0 0 537 0 13 0.0816 0.0000 0.0236 5.905 0.25 7.45 -7.20 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9927 0.0073 2 1 0.0000 0.5028 0.4972
chr14 58364425 CAGA C 0.000003 0.100 1 -3 6 783 215 568 101 0 7 0 107 0 0 565 0 3 0.4698 0.0000 0.0053 29.714 0.38 3.36 -2.98 49 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1271 0.8729 0.0000 1 1 0.1402 0.8598 0.0000 1 1 0.1584 0.8416 0.0000
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.100 1 2 1 542 127 415 118 0 1 0 8 0 0 415 0 0 0.9291 0.0000 0.0000 126.000 0.41 2.75 -2.34 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 0 0.9528 0.0472 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr14 67198163 TGAA T 0.018726 0.100 1 -3 2 194 72 122 68 0 3 0 1 0 0 122 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 23.000 0.32 3.00 -2.68 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9945 0.0055 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 778 196 582 3 2 35 1 155 0 0 573 1 8 0.0153 0.0000 0.0155 4.543 1.00 6.66 -5.66 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2359 0.7641 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr14 73491507 CCTGCGACGGCGT C 0.000745 0.100 1 -12 4 646 156 490 151 1 0 0 4 0 0 489 0 1 0.9679 0.0000 0.0020 156.000 0.62 9.75 -9.13 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9789 0.0211 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 474 108 366 0 0 20 2 86 0 0 363 1 2 0.0000 0.0000 0.0082 4.350 6.30 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0160 0.9840 2 2 0.0000 0.0182 0.9818
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 468 100 368 2 39 9 6 44 0 1 367 0 0 0.0200 0.0000 0.0027 21.500 2.50 4.20 -1.70 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0371 0.4230 0.5398 1 2 0.0410 0.4278 0.5313 1 2 0.0465 0.4341 0.5194
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 597 206 391 176 2 13 1 14 1 0 390 0 0 0.8544 0.0026 0.0026 14.846 0.46 3.14 -2.68 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1814 0.8186 0.0000
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 261 109 152 98 1 1 0 9 0 0 152 0 0 0.8991 0.0000 0.0000 107.000 0.26 7.44 -7.19 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 1 0.3850 0.6150 0.0000
chr14 95436970 TAGA T 0.126266 0.100 1 -3 1 203 76 127 47 0 2 0 27 0 0 127 0 0 0.6184 0.0000 0.0000 37.000 0.28 2.63 -2.35 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8134 0.1843 0.0022 1 0 0.8056 0.1918 0.0026 1 0 0.7947 0.2022 0.0031
chr14 100884333 C CTCT 0.265959 0.100 1 3 1 551 123 428 57 1 4 0 61 0 0 425 0 3 0.4634 0.0000 0.0070 29.500 0.93 3.23 -2.30 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1468 0.6714 0.1818 1 1 0.1550 0.6619 0.1831 1 1 0.1661 0.6495 0.1843
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 325 83 242 29 0 12 0 42 0 0 240 0 2 0.3494 0.0000 0.0083 5.917 1.24 8.64 -7.40 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0368 0.4111 0.5521 1 2 0.0406 0.4166 0.5428 1 2 0.0461 0.4240 0.5299
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.100 1 -12 2 566 110 456 48 2 20 1 39 0 0 454 0 2 0.4364 0.0000 0.0044 4.737 2.04 10.38 -8.34 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5239 0.4548 0.0212 1 0 0.5244 0.4531 0.0225 1 0 0.5244 0.4513 0.0244
chr14 104886547 CGCAGGA C 0.081150 0.100 1 -6 1 520 118 402 65 0 0 0 53 0 0 401 0 1 0.5508 0.0000 0.0025 118.000 0.89 6.17 -5.28 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6003 0.3937 0.0060 1 0 0.6005 0.3930 0.0065 1 0 0.6001 0.3927 0.0073
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 505 164 341 138 1 17 0 8 0 1 340 0 0 0.8415 0.0000 0.0029 8.647 0.86 3.38 -2.51 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3687 0.6313 0.0000 0 0 0.9338 0.0662 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 351 100 251 87 2 7 0 4 0 0 251 0 0 0.8700 0.0000 0.0000 13.286 1.91 2.50 -0.59 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0438 0.9562 0.0000 0 0 0.8104 0.1896 0.0000 0 0 0.9534 0.0466 0.0000
chr15 23360743 AAGG A 0.036305 0.100 1 -3 1 712 170 542 95 0 4 2 69 0 0 542 0 0 0.5588 0.0000 0.0000 41.500 0.23 3.16 -2.93 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8216 0.1781 0.0003 1 0 0.8171 0.1826 0.0003 1 0 0.8104 0.1892 0.0004
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 270 49 221 0 0 5 0 44 1 0 191 22 7 0.0000 0.0045 0.1357 8.800 3.59 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0051 0.9949 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 682 190 492 0 0 5 0 185 0 0 475 8 9 0.0000 0.0000 0.0346 37.000 3.85 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441523 TCCGCATCTTCTCCTCCTGCTC T 0.005169 0.100 1 -21 1 401 115 286 104 1 3 0 7 0 2 280 0 4 0.9043 0.0000 0.0210 37.000 1.30 18.86 -17.56 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2183 0.7817 0.0000 0 0 0.9622 0.0378 0.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 443 114 329 35 0 1 0 78 0 0 329 0 0 0.3070 0.0000 0.0000 113.000 0.06 2.06 -2.01 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0003 0.0614 0.9383 1 2 0.0004 0.0689 0.9307 1 2 0.0007 0.0802 0.9192
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 244 95 149 2 2 6 49 36 0 0 149 0 0 0.0211 0.0000 0.0000 6.667 0.00 1.47 -1.47 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.8754 0.1246 2 2 0.0000 0.4108 0.5892 2 2 0.0000 0.2281 0.7719
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 244 95 149 3 2 40 4 46 0 0 149 0 0 0.0316 0.0000 0.0000 1.375 0.00 2.22 -2.22 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.8855 0.1145 2 1 0.0000 0.5495 0.4505
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 690 173 517 0 0 33 7 133 0 0 513 0 4 0.0000 0.0000 0.0077 4.242 3.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr15 38484532 ATTATGGTGGAAGAGGGGG A 0.001195 0.100 1 -18 1 549 133 416 59 0 21 0 53 0 0 405 0 11 0.4436 0.0000 0.0264 5.333 0.32 14.06 -13.73 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2495 0.7497 0.0008 1 1 0.2619 0.7373 0.0008 1 1 0.2781 0.7211 0.0008
chr15 40281980 T TGGCCGCGGG 0.001310 0.100 1 9 1 510 95 415 77 0 16 0 2 1 0 413 0 1 0.8105 0.0024 0.0048 4.938 0.88 10.00 -9.12 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9810 0.0190 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 508 186 322 0 0 4 0 182 0 0 319 0 3 0.0000 0.0000 0.0093 45.500 2.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 488 146 342 76 0 9 0 61 0 0 334 0 8 0.5205 0.0000 0.0234 15.222 0.34 4.62 -4.28 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3669 0.5819 0.0512 1 1 0.3716 0.5737 0.0547 1 1 0.3770 0.5634 0.0596
chr15 50529817 A AT 0.001809 0.100 1 1 1 144 72 72 68 0 3 0 1 0 0 72 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 23.000 0.25 2.00 -1.75 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr15 50583143 TCTA T 0.002158 0.100 1 -3 2 142 67 75 59 0 1 0 7 0 1 74 0 0 0.8806 0.0000 0.0133 66.000 0.39 2.57 -2.18 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.8429 0.1571 0.0000 0 0 0.9896 0.0104 0.0000
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 153 72 81 38 2 2 0 30 0 0 80 0 1 0.5278 0.0000 0.0123 35.000 0.61 3.23 -2.63 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4444 0.4888 0.0668 1 1 0.4405 0.4885 0.0709 1 1 0.4350 0.4883 0.0767
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 292 155 137 147 2 0 0 6 0 0 137 0 0 0.9484 0.0000 0.0000 154.000 0.61 4.17 -3.55 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 0 0.6649 0.3351 0.0000 0 0 0.9531 0.0469 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 534 133 401 64 0 16 2 51 0 0 400 0 1 0.4812 0.0000 0.0025 7.312 0.73 3.86 -3.13 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3561 0.5736 0.0703 1 1 0.3552 0.5691 0.0757 1 1 0.3533 0.5634 0.0833
chr15 82344656 T TCCTCTCCAGCTCCCGCAG 0.012568 0.100 1 18 1 676 209 467 99 2 50 0 58 0 0 466 1 0 0.4737 0.0000 0.0021 3.180 0.76 6.66 -5.90 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9671 0.0329 0.0000 1 0 0.9637 0.0363 0.0000 1 0 0.9586 0.0414 0.0000
chr15 82830889 TCCACCACCA T 0.000241 0.100 1 -9 2 578 137 441 129 1 3 0 4 0 0 441 0 0 0.9416 0.0000 0.0000 44.667 0.43 7.00 -6.57 53 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 488 103 385 70 0 11 0 22 0 0 385 0 0 0.6796 0.0000 0.0000 8.364 0.37 12.73 -12.36 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9834 0.0166 0.0000 1 0 0.9495 0.0504 0.0000 0 1 0.2596 0.7404 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 376 129 247 77 0 2 0 50 0 0 246 0 1 0.5969 0.0000 0.0040 63.500 0.57 3.24 -2.67 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8326 0.1655 0.0019 1 0 0.8250 0.1727 0.0023 1 0 0.8140 0.1830 0.0030
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 887 211 676 0 0 22 2 187 0 0 675 0 1 0.0000 0.0000 0.0015 8.591 7.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 364 107 257 0 0 4 0 103 0 0 244 0 13 0.0000 0.0000 0.0506 25.750 7.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 358 112 246 61 0 3 0 48 0 0 246 0 0 0.5446 0.0000 0.0000 36.333 0.72 2.17 -1.45 11 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4850 0.4751 0.0399 1 0 0.4809 0.4754 0.0437 1 1 0.4746 0.4762 0.0492
chr15 99712504 CCAGCAGCAGCAGCAG C 0.005699 0.100 1 -15 2 605 251 354 160 1 28 0 62 0 0 350 0 4 0.6375 0.0000 0.0113 7.964 0.34 23.16 -22.82 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr15 99712549 ACCGCAGCCCCAGCCACAACCC A 0.000157 0.100 1 -21 2 604 208 396 145 1 13 1 48 0 0 385 0 11 0.6971 0.0000 0.0278 14.923 0.23 27.56 -27.33 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 321 123 198 100 1 17 0 5 2 0 196 0 0 0.8130 0.0101 0.0101 6.235 1.66 12.40 -10.74 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0873 0.9127 0.0000 0 0 0.9657 0.0343 0.0000 0 0 0.9951 0.0049 0.0000
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 38 18 20 9 0 1 0 8 0 0 20 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 17.000 0.44 1.25 -0.81 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4151 0.5048 0.0801 1 1 0.4154 0.5038 0.0808 1 1 0.4156 0.5028 0.0816
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 391 103 288 9 0 3 0 91 0 0 288 0 0 0.0874 0.0000 0.0000 50.000 0.00 2.89 -2.89 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9969 0.0031 2 1 0.0000 0.8917 0.1083
chr16 770636 CGGGTGAGGGGGGCTGGGCTCCACCAGGGGAGCCGCCTGGGGGGACG C 0.004222 0.100 1 -46 1 490 120 370 78 4 32 1 5 0 0 369 1 0 0.6500 0.0000 0.0027 2.688 1.35 2.80 -1.45 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0644 0.9356 0.0000 0 0 0.9652 0.0348 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 338 117 221 110 0 5 0 2 0 0 220 0 1 0.9402 0.0000 0.0045 22.400 0.40 18.00 -17.60 54 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7748 0.2252 0.0000 0 0 0.9900 0.0100 0.0000 0 0 0.9967 0.0033 0.0000
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 1031 196 835 179 3 4 0 10 1 0 834 0 0 0.9133 0.0012 0.0012 47.750 0.82 1.40 -0.58 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4554 0.5446 0.0000 0 0 0.9777 0.0223 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 349 90 259 0 0 1 2 87 0 0 258 1 0 0.0000 0.0000 0.0039 88.000 7.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 349 90 259 0 0 1 2 87 0 0 258 1 0 0.0000 0.0000 0.0039 88.000 7.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 3356756 GT G 0.055155 0.100 1 -1 2 626 220 406 135 0 3 0 82 0 1 403 0 2 0.6136 0.0000 0.0074 72.333 0.33 1.45 -1.12 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9821 0.0179 0.0000 1 0 0.9799 0.0201 0.0000 1 0 0.9765 0.0235 0.0000
chr16 3390049 TGTA T 0.014072 0.100 1 -3 4 161 60 101 36 0 0 0 24 0 0 101 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 60.000 0.14 3.08 -2.94 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7064 0.2927 0.0009 1 0 0.7014 0.2976 0.0010 1 0 0.6945 0.3044 0.0011
chr16 4885975 T TCCA 0.001019 0.100 1 3 2 362 101 261 93 0 6 0 2 0 0 260 0 1 0.9208 0.0000 0.0038 15.833 0.27 6.50 -6.23 35 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9931 0.0069 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 469 123 346 60 1 5 0 57 0 0 345 0 1 0.4878 0.0000 0.0029 23.600 0.33 3.28 -2.95 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1882 0.6474 0.1644 1 1 0.1914 0.6374 0.1712 1 1 0.1953 0.6246 0.1800
chr16 11927438 ATGG A 0.003336 0.100 1 -3 1 445 129 316 76 2 1 1 49 0 0 305 3 8 0.5891 0.0000 0.0348 127.000 1.42 5.88 -4.46 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7287 0.2712 0.0001 1 0 0.7260 0.2739 0.0001 1 0 0.7220 0.2779 0.0001
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 449 167 282 106 1 46 0 14 0 0 278 0 4 0.6347 0.0000 0.0142 2.630 2.67 4.93 -2.26 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0199 0.9801 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 184 57 127 0 0 0 0 57 0 0 127 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 57.000 2.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.100 1 -1 1 324 187 137 85 0 2 0 100 0 0 137 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 92.500 0.53 1.05 -0.52 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0682 0.8133 0.1185 1 1 0.0766 0.8049 0.1186 1 1 0.0887 0.7932 0.1181
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.100 1 -27 1 1042 240 802 100 1 66 2 71 0 0 802 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 2.591 0.58 10.83 -10.25 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8276 0.1710 0.0014 1 0 0.8209 0.1773 0.0017 1 0 0.8112 0.1865 0.0023
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.100 1 3 1 738 183 555 104 0 9 0 70 0 0 554 0 1 0.5683 0.0000 0.0018 19.333 0.37 3.23 -2.86 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8690 0.1301 0.0008 1 0 0.8617 0.1372 0.0011 1 0 0.8510 0.1475 0.0015
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 156 83 73 34 1 4 0 44 0 0 72 0 1 0.4096 0.0000 0.0137 19.750 0.18 2.09 -1.91 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0616 0.4912 0.4471 1 1 0.0659 0.4910 0.4431 1 1 0.0719 0.4909 0.4372
chr16 51141744 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 1173 290 883 227 15 40 0 8 0 0 883 0 0 0.7828 0.0000 0.0000 6.250 0.59 2.62 -2.03 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0044 0.9956 0.0000 0 0 0.9725 0.0275 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr16 52439600 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 824 235 589 189 4 31 0 11 0 0 589 0 0 0.8043 0.0000 0.0000 6.516 0.33 3.00 -2.67 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1108 0.8892 0.0000 0 0 0.9084 0.0916 0.0000
chr16 67842896 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 1002 317 685 158 0 26 1 132 0 0 685 0 0 0.4984 0.0000 0.0000 11.640 0.89 5.20 -4.30 62 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6059 0.3905 0.0036 1 0 0.6076 0.3880 0.0044 1 0 0.6081 0.3862 0.0057
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1014 288 726 186 5 56 0 41 0 0 726 0 0 0.6458 0.0000 0.0000 4.143 3.04 3.54 -0.49 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 329 147 182 71 0 23 0 53 0 0 181 0 1 0.4830 0.0000 0.0055 5.391 0.37 8.21 -7.84 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5817 0.3983 0.0200 1 0 0.5758 0.4017 0.0226 1 0 0.5670 0.4066 0.0264
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 131 72 59 68 0 2 0 2 0 0 58 0 1 0.9444 0.0000 0.0169 35.000 0.57 4.00 -3.43 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0391 0.9609 0.0000 0 0 0.5504 0.4496 0.0000 0 0 0.7981 0.2019 0.0000
chr16 72787694 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 659 123 536 61 1 22 1 38 0 0 529 1 6 0.4959 0.0000 0.0131 4.591 0.93 5.58 -4.64 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5731 0.4024 0.0245 1 0 0.5665 0.4061 0.0274 1 0 0.5570 0.4114 0.0316
chr16 72797458 CTTGTTG C 0.500000 0.100 1 -6 1 784 208 576 91 0 36 0 81 0 0 569 1 6 0.4375 0.0000 0.0122 4.914 0.42 5.67 -5.25 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1910 0.6987 0.1103 1 1 0.1980 0.6851 0.1168 1 1 0.2069 0.6676 0.1255
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 229 89 140 7 0 2 2 78 0 0 137 0 3 0.0787 0.0000 0.0214 43.500 1.14 4.74 -3.60 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9648 0.0352 2 1 0.0000 0.6149 0.3851
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 475 129 346 51 0 32 1 45 0 0 340 1 5 0.3953 0.0000 0.0173 3.031 0.71 6.20 -5.49 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1715 0.6225 0.2060 1 1 0.1762 0.6136 0.2102 1 1 0.1823 0.6022 0.2155
chr16 87604287 C CCTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 475 129 346 54 35 30 3 7 0 1 340 1 4 0.4186 0.0000 0.0173 3.267 0.89 8.00 -7.11 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0139 0.9861 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 709 135 574 0 0 4 4 127 0 0 565 1 8 0.0000 0.0000 0.0157 43.667 8.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 705 130 575 0 0 4 6 120 0 0 567 1 7 0.0000 0.0000 0.0139 31.500 8.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 705 134 571 0 0 4 2 128 0 4 555 4 8 0.0000 0.0000 0.0280 130.000 8.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5109 0.4891 2 2 0.0000 0.0381 0.9619 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr16 88534246 CCCCCGCGCCCGAGTCGCCGCGGCCCGGAAGCGGAAGCGGAAGCGGCCCCGGCCTCGCCCCTGCGCGCTCGCCCGG C 0.500000 0.100 1 -75 1 641 161 480 120 2 5 2 32 1 0 466 0 13 0.7453 0.0021 0.0292 30.800 1.20 1.12 0.07 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9975 0.0025 0.0000 1 0 0.9969 0.0031 0.0000 1 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 889 184 705 10 0 8 0 166 0 0 701 0 4 0.0543 0.0000 0.0057 22.000 0.20 7.48 -7.28 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8963 0.1037 2 2 0.0000 0.1381 0.8619
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 600 149 451 84 0 2 0 63 0 0 451 0 0 0.5638 0.0000 0.0000 73.500 0.70 4.92 -4.22 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6542 0.3356 0.0102 1 0 0.6473 0.3408 0.0118 1 0 0.6373 0.3483 0.0144
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.100 1 6 2 771 194 577 166 0 19 0 9 0 0 577 0 0 0.8557 0.0000 0.0000 9.211 0.51 5.00 -4.49 84 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2156 0.7844 0.0000 0 0 0.9071 0.0929 0.0000
chr16 88733987 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 960 270 690 227 1 18 9 15 0 0 690 0 0 0.8407 0.0000 0.0000 13.500 0.48 3.80 -3.32 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.4050 0.5950 0.0000
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 158 65 93 5 0 2 0 58 0 0 92 0 1 0.0769 0.0000 0.0108 31.500 0.40 4.52 -4.12 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9150 0.0850 2 1 0.0000 0.5857 0.4143
chr16 89850471 C CGAG 0.500000 0.100 1 3 3 538 151 387 87 0 11 2 51 0 0 385 0 2 0.5762 0.0000 0.0052 12.727 0.29 3.00 -2.71 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8561 0.1425 0.0015 1 0 0.8469 0.1512 0.0019 1 0 0.8336 0.1638 0.0025
chr17 3197642 AATCTGCTCATC A 0.000837 0.100 1 -11 3 646 182 464 167 0 11 0 4 0 0 464 0 0 0.9176 0.0000 0.0000 15.545 0.32 11.50 -11.18 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 417 148 269 14 0 4 0 130 0 0 269 0 0 0.0946 0.0000 0.0000 36.000 0.29 1.42 -1.14 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8693 0.1307
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 954 192 762 101 71 11 0 9 1 0 761 0 0 0.5260 0.0013 0.0013 18.000 0.21 3.44 -3.24 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 0 0.9800 0.0200 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 773 228 545 28 2 41 2 155 0 0 537 0 8 0.1228 0.0000 0.0147 4.561 0.54 3.22 -2.68 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.100 1 -6 2 1381 450 931 201 6 92 1 150 0 0 924 0 7 0.4467 0.0000 0.0075 3.880 4.80 7.03 -2.24 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9509 0.0491 0.0000 1 0 0.9485 0.0515 0.0000 1 0 0.9446 0.0554 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.100 1 -6 1 1139 347 792 181 0 51 0 115 0 1 784 0 7 0.5216 0.0000 0.0101 6.041 0.64 6.49 -5.85 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9867 0.0133 0.0000 1 0 0.9851 0.0149 0.0000 1 0 0.9826 0.0174 0.0000
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 694 197 497 187 0 5 0 5 0 0 497 0 0 0.9492 0.0000 0.0000 38.400 0.17 3.00 -2.83 103 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1707 0.8293 0.0000 0 0 0.9823 0.0177 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 440 102 338 50 1 5 0 46 0 0 338 0 0 0.4902 0.0000 0.0000 19.400 0.40 7.80 -7.40 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3001 0.5885 0.1114 1 1 0.3017 0.5818 0.1164 1 1 0.3034 0.5735 0.1231
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 527 196 331 8 1 31 12 144 0 0 328 0 3 0.0408 0.0000 0.0091 5.323 0.50 2.99 -2.49 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7306 0.2694 2 2 0.0000 0.0950 0.9050
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1014 261 753 153 0 14 15 79 0 0 752 0 1 0.5862 0.0000 0.0013 16.857 0.65 4.54 -3.90 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9862 0.0138 0.0000 1 0 0.9841 0.0159 0.0000 1 0 0.9806 0.0194 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 1017 259 758 151 9 19 14 66 0 0 757 0 1 0.5830 0.0000 0.0013 18.308 0.66 4.17 -3.51 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9971 0.0029 0.0000 1 0 0.9964 0.0036 0.0000 1 0 0.9952 0.0048 0.0000
chr17 18673034 G GCGCCGCCGC 0.500000 0.100 1 9 3 485 149 336 100 0 41 2 6 8 3 323 0 2 0.6711 0.0238 0.0387 2.610 2.22 8.83 -6.61 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0229 0.9771 0.0000 0 1 0.4107 0.5893 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 886 203 683 9 0 5 0 189 0 0 676 0 7 0.0443 0.0000 0.0102 39.600 0.89 3.97 -3.08 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.4475 0.5525 2 2 0.0000 0.0232 0.9768
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 272 106 166 53 0 16 0 37 0 0 164 0 2 0.5000 0.0000 0.0120 5.625 0.32 5.78 -5.46 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5416 0.4246 0.0338 1 0 0.5351 0.4278 0.0371 1 0 0.5258 0.4322 0.0420
chr17 28898530 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 523 180 343 170 1 1 0 8 0 0 343 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 179.000 0.24 1.12 -0.89 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.5085 0.4915 0.0000 0 0 0.9596 0.0404 0.0000
chr17 30834937 ACAATGT A 0.500000 0.100 1 -6 1 946 191 755 106 0 5 0 80 0 0 746 0 9 0.5550 0.0000 0.0119 37.200 0.33 6.14 -5.81 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5001 0.4827 0.0172 1 0 0.5007 0.4797 0.0196 1 0 0.5001 0.4766 0.0233
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 984 272 712 140 0 40 0 92 3 3 693 2 11 0.5147 0.0042 0.0267 6.105 2.76 11.38 -8.62 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9004 0.0994 0.0002 1 0 0.8942 0.1055 0.0003 1 0 0.8850 0.1146 0.0005
chr17 41026898 G GCAGCAGCTTGGCTGACAGCAGCTGGTCTCA 0.500000 0.100 1 30 2 989 240 749 198 5 33 0 4 0 0 745 0 4 0.8250 0.0000 0.0053 6.212 0.32 1.00 -0.68 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.8338 0.1662 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 625 180 445 6 0 7 1 166 0 0 445 0 0 0.0333 0.0000 0.0000 24.714 2.67 1.52 1.15 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9916 0.0084 2 2 0.0000 0.1236 0.8764 2 2 0.0000 0.0140 0.9860
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 783 164 619 8 0 27 2 127 0 0 589 1 29 0.0488 0.0000 0.0485 5.074 0.25 9.92 -9.67 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.6435 0.3565 2 2 0.0000 0.0713 0.9287
chr17 41238458 AGACCACCTGCTGCAG A 0.500000 0.100 1 -15 1 626 151 475 111 1 14 0 25 1 0 468 0 6 0.7351 0.0021 0.0147 9.714 3.84 13.12 -9.28 65 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9773 0.0227 0.0000 0 1 0.0618 0.9382 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 687 215 472 172 0 26 0 17 0 0 471 0 1 0.8000 0.0000 0.0021 7.269 0.25 9.41 -9.16 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0396 0.9604 0.0000
chr17 41567480 C CCCACTTCCTCCACTATGACCACCT 0.500000 0.100 1 24 5 761 197 564 150 2 40 0 5 0 0 560 0 4 0.7614 0.0000 0.0071 3.925 0.53 9.40 -8.87 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1205 0.8795 0.0000 0 0 0.8320 0.1680 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1986 406 1580 383 1 5 0 17 0 0 1580 0 0 0.9433 0.0000 0.0000 80.000 0.44 3.29 -2.86 145 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7451 0.2549 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 703 212 491 165 5 32 1 9 2 0 485 1 3 0.7783 0.0041 0.0122 5.562 0.71 4.22 -3.51 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.3957 0.6043 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 227 79 148 72 0 5 0 2 0 0 148 0 0 0.9114 0.0000 0.0000 14.800 0.26 4.50 -4.24 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3153 0.6847 0.0000 0 0 0.8125 0.1875 0.0000 0 0 0.9012 0.0988 0.0000
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 445 122 323 57 0 23 1 41 0 0 319 0 4 0.4672 0.0000 0.0124 4.261 0.07 8.22 -8.15 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4549 0.4958 0.0494 1 1 0.4518 0.4948 0.0534 1 1 0.4470 0.4938 0.0592
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 1033 268 765 235 0 9 0 24 0 0 765 0 0 0.8769 0.0000 0.0000 28.778 0.30 2.71 -2.41 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0180 0.9820 0.0000
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.100 1 3 2 571 130 441 96 2 26 0 6 0 0 440 0 1 0.7385 0.0000 0.0023 4.000 0.25 2.67 -2.42 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0720 0.9280 0.0000 0 0 0.5655 0.4345 0.0000
chr17 58155318 CCA C 0.500000 0.100 1 -2 1 740 193 547 171 0 4 0 18 0 0 547 0 0 0.8860 0.0000 0.0000 47.250 0.30 2.00 -1.70 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0372 0.9628 0.0000
chr17 58156083 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 383 85 298 79 0 2 0 4 0 0 298 0 0 0.9294 0.0000 0.0000 41.500 0.94 2.25 -1.31 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 1 0.4240 0.5760 0.0000 0 0 0.7805 0.2195 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 461 157 304 109 0 36 0 12 0 0 303 0 1 0.6943 0.0000 0.0033 3.361 0.32 5.83 -5.51 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0450 0.9550 0.0000
chr17 63477132 T TGCTGCC 0.500000 0.100 1 6 1 216 66 150 57 1 5 0 3 0 0 150 0 0 0.8636 0.0000 0.0000 12.200 0.74 6.33 -5.60 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0239 0.9761 0.0000 0 1 0.4262 0.5738 0.0000 0 0 0.7087 0.2913 0.0000
chr17 64055860 A AGCT 0.500000 0.100 1 3 1 376 129 247 112 1 12 0 4 0 0 247 0 0 0.8682 0.0000 0.0000 9.750 0.21 3.50 -3.29 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0420 0.9580 0.0000 0 0 0.7999 0.2001 0.0000 0 0 0.9486 0.0514 0.0000
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 399 162 237 135 0 12 0 15 0 0 237 0 0 0.8333 0.0000 0.0000 12.500 0.36 9.07 -8.71 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0441 0.9559 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 599 160 439 72 0 12 0 76 0 0 435 0 4 0.4500 0.0000 0.0091 12.333 0.58 7.45 -6.86 10 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0658 0.6129 0.3213 1 1 0.0708 0.6042 0.3251 1 1 0.0777 0.5933 0.3291
chr17 74893497 CGGTTCCATGGGCTCCGTA C 0.500000 0.100 1 -18 2 341 89 252 36 0 45 0 8 0 0 252 0 0 0.4045 0.0000 0.0000 1.000 0.31 4.12 -3.82 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0874 0.9123 0.0004 0 1 0.0202 0.9797 0.0001 0 1 0.0354 0.9646 0.0000
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.100 1 -54 1 339 101 238 90 1 1 0 9 0 0 238 0 0 0.8911 0.0000 0.0000 100.000 0.83 1.33 -0.50 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0065 0.9935 0.0000 0 1 0.2044 0.7956 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2661 658 2003 308 10 83 8 249 2 1 1981 3 16 0.4681 0.0010 0.0110 6.843 1.34 6.90 -5.56 32 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6914 0.3085 0.0001 1 0 0.7019 0.2980 0.0001 1 0 0.7127 0.2871 0.0002
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2585 654 1931 275 8 36 4 331 6 1 1756 21 147 0.4205 0.0031 0.0906 17.543 1.85 4.40 -2.55 37 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 652 188 464 94 1 5 0 88 0 1 459 0 4 0.5000 0.0000 0.0108 36.600 0.54 3.27 -2.73 50 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2067 0.6997 0.0937 1 1 0.2140 0.6860 0.1000 1 1 0.2231 0.6684 0.1085
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.100 1 6 4 495 125 370 107 0 11 0 7 0 0 370 0 0 0.8560 0.0000 0.0000 10.364 0.49 5.86 -5.37 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.4153 0.5847 0.0000 0 0 0.9217 0.0783 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 143 73 70 0 0 5 0 68 0 0 69 0 1 0.0000 0.0000 0.0143 13.600 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 387 89 298 52 0 3 0 34 0 0 294 0 4 0.5843 0.0000 0.0134 28.667 0.54 8.79 -8.26 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6604 0.3281 0.0115 1 0 0.6552 0.3321 0.0127 1 0 0.6477 0.3379 0.0145
chr18 26548258 TTCC T 0.006179 0.100 1 -3 1 806 181 625 77 0 17 0 87 0 0 624 0 1 0.4254 0.0000 0.0016 9.647 0.79 3.44 -2.64 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1285 0.8644 0.0071 1 1 0.1406 0.8523 0.0071 1 1 0.1573 0.8356 0.0071
chr18 36133243 GGTT G 0.000016 0.100 1 -3 3 130 60 70 54 1 3 0 2 0 0 70 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 19.000 1.28 3.00 -1.72 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 232 104 128 57 1 1 0 45 0 0 128 0 0 0.5481 0.0000 0.0000 103.000 0.30 4.87 -4.57 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4760 0.4803 0.0437 1 1 0.4712 0.4810 0.0478 1 1 0.4641 0.4822 0.0537
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 156 71 85 34 0 0 0 37 0 0 85 0 0 0.4789 0.0000 0.0000 71.000 0.09 3.08 -2.99 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1509 0.5756 0.2735 1 1 0.1552 0.5699 0.2749 1 1 0.1608 0.5628 0.2764
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 285 129 156 12 0 7 1 109 0 0 153 0 3 0.0930 0.0000 0.0192 17.429 0.08 3.28 -3.19 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9019 0.0981
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -9 2 468 141 327 129 0 3 0 9 0 0 327 0 0 0.9149 0.0000 0.0000 46.000 1.70 9.78 -8.08 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0415 0.9585 0.0000 0 0 0.6185 0.3815 0.0000
chr18 51196970 T TTCCTCC 0.500000 0.100 1 6 1 490 87 403 80 2 2 0 3 0 0 403 0 0 0.9195 0.0000 0.0000 42.000 0.99 4.33 -3.35 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0766 0.9234 0.0000 0 0 0.7102 0.2898 0.0000 0 0 0.8858 0.1142 0.0000
chr18 54224214 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 349 76 273 8 0 11 0 57 0 0 271 0 2 0.1053 0.0000 0.0073 5.909 0.62 4.00 -3.38 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 1 0.0000 0.9065 0.0935
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 292 163 129 0 0 10 0 153 0 0 129 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 15.300 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 409 69 340 51 4 9 1 4 0 2 338 0 0 0.7391 0.0000 0.0059 6.444 3.16 2.25 0.91 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.1571 0.8429 0.0000 0 1 0.4946 0.5054 0.0000
chr18 62979014 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 3 740 173 567 161 1 4 0 7 0 0 566 0 1 0.9306 0.0000 0.0018 42.250 0.53 3.00 -2.47 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3949 0.6051 0.0000 0 0 0.9386 0.0614 0.0000
chr18 63655777 T TGCCA 0.500000 0.100 1 4 2 385 115 270 110 0 1 0 4 1 0 269 0 0 0.9565 0.0037 0.0037 114.000 0.25 6.25 -6.00 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0379 0.9621 0.0000 0 0 0.7833 0.2167 0.0000 0 0 0.9437 0.0563 0.0000
chr18 63655779 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 385 117 268 112 1 0 0 4 0 1 267 0 0 0.9573 0.0000 0.0037 117.000 0.26 6.25 -5.99 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0445 0.9555 0.0000 0 0 0.8074 0.1926 0.0000 0 0 0.9508 0.0492 0.0000
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 198 84 114 0 0 4 0 80 0 0 112 0 2 0.0000 0.0000 0.0175 20.000 3.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0184 0.9816
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 168 77 91 42 2 2 0 31 0 0 89 0 2 0.5455 0.0000 0.0220 37.500 0.12 3.29 -3.17 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4640 0.4782 0.0578 1 1 0.4592 0.4788 0.0620 1 1 0.4524 0.4797 0.0679
chr19 621458 G GGCAGGT 0.002400 0.100 1 6 1 713 163 550 142 0 9 0 12 1 0 549 0 0 0.8712 0.0018 0.0018 17.111 0.82 5.75 -4.93 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5976 0.4024 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.100 1 3 1 282 129 153 1 4 99 1 24 0 0 153 0 0 0.0078 0.0000 0.0000 3.000 1.00 1.62 -0.62 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7010 0.2983 0.0007 1 0 0.6956 0.3036 0.0007 1 0 0.6883 0.3109 0.0008
chr19 1009186 GAGC G 0.092678 0.100 1 -3 2 592 147 445 126 1 10 0 10 0 0 444 1 0 0.8571 0.0000 0.0022 13.700 0.52 3.30 -2.78 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0459 0.9541 0.0000 0 0 0.8025 0.1975 0.0000
chr19 1046907 GCTGCGGGACACCATGCGCGCCATGGGGCTCAGCCGCGCGGTGCT G 0.001648 0.100 1 -44 2 634 199 435 193 0 4 0 2 0 0 435 0 0 0.9698 0.0000 0.0000 48.750 0.33 22.50 -22.17 55 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 1395488 G GCGC 0.003752 0.100 1 3 1 1415 288 1127 213 3 65 0 7 0 0 1127 0 0 0.7396 0.0000 0.0000 3.415 0.51 3.00 -2.49 95 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7375 0.2625 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 216 70 146 68 0 0 0 2 0 0 146 0 0 0.9714 0.0000 0.0000 70.000 0.69 3.00 -2.31 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5535 0.4465 0.0000 0 0 0.9213 0.0787 0.0000 0 0 0.9612 0.0388 0.0000
chr19 1568011 G GCCGCCC 0.005506 0.100 1 6 2 243 59 184 26 0 12 2 19 0 0 178 4 2 0.4407 0.0000 0.0326 3.833 4.58 7.11 -2.53 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4249 0.5725 0.0025 1 1 0.4300 0.5674 0.0026 1 1 0.4364 0.5610 0.0026
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 274 148 126 74 0 1 0 73 0 0 126 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 147.000 0.14 3.26 -3.13 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2753 0.6599 0.0648 1 1 0.2845 0.6480 0.0675 1 1 0.2961 0.6330 0.0709
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.100 1 3 2 397 78 319 25 2 22 1 28 0 0 319 0 0 0.3205 0.0000 0.0000 2.545 0.64 2.86 -2.22 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3682 0.6118 0.0200 1 1 0.3747 0.6053 0.0200 1 1 0.3831 0.5969 0.0200
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 365 121 244 0 1 20 99 1 0 0 230 14 0 0.0000 0.0000 0.0574 5.050 3.00 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0112 0.9888 2 2 0.0000 0.0084 0.9916 2 2 0.0000 0.0076 0.9924
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 365 121 244 0 2 18 2 99 0 0 228 2 14 0.0000 0.0000 0.0656 5.667 10.39 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1179 0.8821 2 2 0.0000 0.0518 0.9482 2 2 0.0000 0.0410 0.9590
chr19 2015541 GGGCGGCGGC G 0.046318 0.100 1 -9 4 365 128 237 3 3 16 40 66 0 0 223 3 11 0.0234 0.0000 0.0591 7.400 1.00 12.30 -11.30 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9951 0.0049 2 1 0.0000 0.8317 0.1683 2 1 0.0000 0.5411 0.4589
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 365 136 229 8 6 54 4 64 0 0 219 0 10 0.0588 0.0000 0.0437 1.500 3.00 11.69 -8.69 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9906 0.0094
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 898 179 719 84 4 26 0 65 0 0 718 0 1 0.4693 0.0000 0.0014 5.885 0.21 3.54 -3.32 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7794 0.2190 0.0017 1 0 0.7745 0.2236 0.0020 1 0 0.7673 0.2303 0.0024
chr19 7477288 C CTA 0.000494 0.100 1 2 1 257 98 159 91 0 3 0 4 0 0 159 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 31.667 0.31 2.00 -1.69 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9666 0.0334 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 451 129 322 119 1 4 0 5 1 0 321 0 0 0.9225 0.0031 0.0031 31.000 0.88 3.00 -2.12 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0500 0.9500 0.0000 0 0 0.9382 0.0618 0.0000 0 0 0.9906 0.0094 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 559 166 393 14 0 13 2 137 0 0 385 0 8 0.0843 0.0000 0.0204 11.692 1.07 11.27 -10.20 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9398 0.0602
chr19 8971789 GGTGTGAAGGTTAACGTCT G 0.002451 0.100 1 -18 1 382 106 276 97 0 7 0 2 0 0 276 0 0 0.9151 0.0000 0.0000 14.143 0.37 10.50 -10.13 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 8979162 A AGCC 0.002510 0.100 1 3 1 633 136 497 126 0 3 0 7 0 0 497 0 0 0.9265 0.0000 0.0000 44.333 0.35 3.00 -2.65 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0411 0.9589 0.0000 0 0 0.9920 0.0080 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 298 80 218 1 0 9 0 70 0 0 206 0 12 0.0125 0.0000 0.0550 7.889 0.00 5.41 -5.41 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2311 0.7689 2 2 0.0000 0.0932 0.9068 2 2 0.0000 0.0703 0.9297
chr19 9126240 AG A 0.056196 0.100 1 -1 5 393 105 288 102 0 0 0 3 0 0 288 0 0 0.9714 0.0000 0.0000 105.000 1.13 2.00 -0.87 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7981 0.2019 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 958 319 639 12 0 55 19 233 0 0 633 4 2 0.0376 0.0000 0.0094 4.800 0.08 3.45 -3.37 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.6372 0.3628 2 2 0.0000 0.0156 0.9844
chr19 13207858 CCTG C 0.175850 0.100 1 -3 1 437 132 305 0 0 29 99 4 0 0 301 4 0 0.0000 0.0000 0.0131 3.552 3.75 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0195 0.9805 2 2 0.0000 0.0218 0.9782 2 2 0.0000 0.0253 0.9747
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 437 132 305 0 0 27 6 99 0 0 301 0 4 0.0000 0.0000 0.0131 4.038 11.38 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0096 0.9904 2 2 0.0000 0.0112 0.9888
chr19 13207858 CCTGCTGCTG C 0.002693 0.100 1 -9 1 437 132 305 3 1 21 7 100 0 0 301 0 4 0.0227 0.0000 0.0131 5.286 3.00 10.93 -7.93 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9888 0.0112 2 1 0.0000 0.9542 0.0458
chr19 13207858 CCTGCTGCTGCTGCTGCTG C 0.085228 0.100 1 -18 1 437 137 300 26 4 59 1 47 0 0 293 0 7 0.1898 0.0000 0.0233 1.328 2.77 13.11 -10.34 26 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0672 0.6916 0.2412 1 1 0.0746 0.6930 0.2324 1 1 0.0853 0.6940 0.2206
chr19 14799825 GA G 0.002726 0.100 1 -1 1 772 200 572 87 6 18 1 88 0 0 570 0 2 0.4350 0.0000 0.0035 10.000 1.86 1.92 -0.06 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3114 0.6879 0.0007 1 1 0.3252 0.6741 0.0007 1 1 0.3428 0.6564 0.0008
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 651 142 509 0 0 4 0 138 0 0 505 0 4 0.0000 0.0000 0.0079 34.500 3.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.100 1 -4 1 434 101 333 1 1 12 13 74 0 0 333 0 0 0.0099 0.0000 0.0000 14.667 11.00 4.31 6.69 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.5273 0.4727 2 2 0.0000 0.2552 0.7448 2 2 0.0000 0.1858 0.8142
chr19 17286690 GTT G 0.132491 0.100 1 -2 1 429 101 328 1 2 11 14 73 0 0 328 0 0 0.0099 0.0000 0.0000 21.750 11.00 4.14 6.86 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9452 0.0548 2 1 0.0000 0.6360 0.3640 2 2 0.0000 0.4058 0.5942
chr19 21423588 GACATAAGATAATTCATAATGGAGAAAAACCCTATAAATGTGAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTATTTTCTCAACCCCTACTAA G 0.000521 0.100 1 -84 2 323 54 269 50 0 2 0 2 0 0 265 0 4 0.9259 0.0000 0.0149 26.000 1.58 0.00 1.58 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0381 0.9619 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000
chr19 22759478 AT A 0.000086 0.100 1 -1 1 335 91 244 82 0 5 0 4 0 0 244 0 0 0.9011 0.0000 0.0000 17.200 0.26 2.25 -1.99 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9913 0.0087 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 23754908 GACA G 0.000403 0.100 1 -3 1 119 44 75 22 0 2 0 20 0 0 75 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 21.000 0.50 3.20 -2.70 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4979 0.5020 0.0001 1 1 0.4999 0.5000 0.0001 1 0 0.5023 0.4976 0.0001
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 657 154 503 15 1 6 2 130 0 1 496 0 6 0.0974 0.0000 0.0139 24.500 0.27 3.29 -3.03 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9509 0.0491
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 503 213 290 150 0 15 0 48 0 0 273 0 17 0.7042 0.0000 0.0586 13.200 1.49 17.54 -16.05 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9990 0.0010 0.0000 1 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 494 178 316 88 3 73 1 13 0 0 315 1 0 0.4944 0.0000 0.0032 1.444 2.59 5.31 -2.72 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.1721 0.8279 0.0000
chr19 37886746 TCCTTTCCTCCTCCTCCTC T 0.059111 0.100 1 -18 2 533 73 460 57 2 12 0 2 0 0 460 0 0 0.7808 0.0000 0.0000 5.083 0.67 11.00 -10.33 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7907 0.2093 0.0000 0 0 0.9730 0.0270 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000
chr19 38304906 TGAA T 0.163680 0.100 1 -3 1 423 104 319 50 1 5 0 48 0 1 317 0 1 0.4808 0.0000 0.0063 19.800 0.86 3.29 -2.43 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3886 0.5690 0.0424 1 1 0.3940 0.5620 0.0440 1 1 0.4006 0.5534 0.0461
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 627 143 484 129 0 11 0 3 0 0 483 0 1 0.9021 0.0000 0.0021 12.000 0.61 8.33 -7.72 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6343 0.3657 0.0000 0 0 0.9936 0.0064 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.100 1 3 1 167 68 99 51 1 14 0 2 0 0 99 0 0 0.7500 0.0000 0.0000 3.857 0.14 3.00 -2.86 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8439 0.1561 0.0000 0 0 0.9811 0.0189 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000
chr19 38565185 G GCACGGCGGC 0.000654 0.100 1 9 3 629 161 468 134 0 20 0 7 1 0 466 0 1 0.8323 0.0021 0.0043 7.050 0.72 7.14 -6.42 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0278 0.9722 0.0000 0 0 0.9962 0.0038 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 392 144 248 66 0 0 2 76 0 1 247 0 0 0.4583 0.0000 0.0040 142.000 0.45 2.41 -1.95 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0778 0.6451 0.2771 1 1 0.0845 0.6378 0.2776 1 1 0.0940 0.6286 0.2775
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 250 39 211 0 0 4 31 4 0 0 211 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.000 3.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0451 0.9549 2 2 0.0000 0.0468 0.9532 2 2 0.0000 0.0491 0.9509
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 250 39 211 0 0 20 18 1 0 0 211 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.588 5.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0841 0.9159 2 2 0.0000 0.0860 0.9140 2 2 0.0000 0.0886 0.9114
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 486 142 344 6 0 10 1 125 0 0 344 0 0 0.0423 0.0000 0.0000 13.100 0.00 5.96 -5.96 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 2 0.0000 0.4762 0.5238 2 2 0.0000 0.0792 0.9208
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 549 171 378 88 0 3 0 80 0 0 378 0 0 0.5146 0.0000 0.0000 56.000 0.44 1.76 -1.32 54 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4270 0.5510 0.0220 1 1 0.4339 0.5424 0.0237 1 1 0.4419 0.5319 0.0262
chr19 41851693 C CTAGAAA 0.001390 0.100 1 6 1 118 49 69 44 0 3 0 2 0 0 69 0 0 0.8980 0.0000 0.0000 15.333 0.32 6.00 -5.68 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9876 0.0124 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 293 83 210 3 0 0 0 80 0 0 203 0 7 0.0361 0.0000 0.0333 83.000 0.00 6.88 -6.88 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9291 0.0709 2 2 0.0000 0.3074 0.6926 2 2 0.0000 0.1237 0.8763
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 460 140 320 121 1 5 1 12 0 0 320 0 0 0.8643 0.0000 0.0000 26.800 0.35 3.08 -2.74 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.3382 0.6618 0.0000
chr19 45409231 CAAG C 0.234924 0.100 1 -3 2 521 106 415 46 0 14 0 46 0 0 412 0 3 0.4340 0.0000 0.0072 6.571 0.43 3.93 -3.50 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2293 0.6430 0.1276 1 1 0.2370 0.6341 0.1289 1 1 0.2470 0.6227 0.1303
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 660 253 407 38 0 55 0 160 0 0 387 0 20 0.1502 0.0000 0.0491 3.600 0.29 6.28 -5.99 18 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 48446744 TGAA T 0.043442 0.100 1 -3 1 393 117 276 108 1 6 0 2 0 0 276 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 18.500 0.19 3.00 -2.81 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9853 0.0147 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 229 107 122 58 1 6 0 42 0 0 122 0 0 0.5421 0.0000 0.0000 16.833 0.26 1.88 -1.62 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7261 0.2686 0.0054 1 0 0.7201 0.2738 0.0061 1 0 0.7116 0.2813 0.0071
chr19 49070105 TGGA T 0.101017 0.100 1 -3 1 458 124 334 119 0 2 0 3 0 0 334 0 0 0.9597 0.0000 0.0000 61.000 0.28 3.67 -3.39 73 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8298 0.1702 0.0000 0 0 0.9929 0.0071 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr19 49154632 T TTCCTCCTCC 0.001742 0.100 1 9 1 1082 256 826 191 4 55 0 6 0 0 826 0 0 0.7461 0.0000 0.0000 3.655 0.67 7.67 -7.00 71 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9507 0.0493 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 571 155 416 71 0 28 0 56 0 0 408 1 7 0.4581 0.0000 0.0192 4.536 1.08 7.62 -6.54 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3754 0.5711 0.0535 1 1 0.3793 0.5637 0.0570 1 1 0.3836 0.5546 0.0619
chr19 49969702 A ATGC 0.001079 0.100 1 3 1 490 111 379 94 0 8 0 9 0 1 378 0 0 0.8468 0.0000 0.0026 12.875 0.55 3.11 -2.56 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.8792 0.1208 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr19 49970457 TC T 0.000567 0.100 1 -1 1 514 92 422 77 1 4 0 10 0 0 422 0 0 0.8370 0.0000 0.0000 21.750 0.47 1.00 -0.53 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6784 0.3216 0.0000 0 0 0.9922 0.0078 0.0000
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 732 168 564 8 0 2 84 74 0 0 561 2 1 0.0476 0.0000 0.0053 82.500 0.25 3.36 -3.11 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.6101 0.3899 2 2 0.0000 0.0628 0.9372
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 733 169 564 1 0 14 70 84 0 0 562 0 2 0.0059 0.0000 0.0035 11.000 0.00 3.29 -3.29 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 596 143 453 66 0 3 3 71 0 0 452 0 1 0.4615 0.0000 0.0022 46.667 0.83 2.85 -2.01 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0381 0.5351 0.4268 1 1 0.0411 0.5292 0.4297 1 1 0.0453 0.5220 0.4327
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 236 118 118 0 0 4 0 114 0 0 114 0 4 0.0000 0.0000 0.0339 28.500 2.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 535 161 374 91 0 3 0 67 0 0 373 0 1 0.5652 0.0000 0.0027 52.667 0.14 1.93 -1.78 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7310 0.2643 0.0047 1 0 0.7247 0.2697 0.0056 1 0 0.7154 0.2776 0.0070
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 603 168 435 95 0 6 0 67 0 0 433 0 2 0.5655 0.0000 0.0046 27.000 0.12 3.39 -3.27 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7802 0.2170 0.0029 1 0 0.7731 0.2235 0.0035 1 0 0.7627 0.2328 0.0044
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 758 201 557 101 0 1 2 97 1 0 554 0 2 0.5025 0.0018 0.0054 200.000 0.21 2.96 -2.75 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1771 0.7253 0.0976 1 1 0.1863 0.7103 0.1034 1 1 0.1982 0.6907 0.1111
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 747 210 537 101 0 9 2 98 0 0 537 0 0 0.4810 0.0000 0.0000 22.222 0.18 1.67 -1.50 51 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0995 0.7341 0.1664 1 1 0.1046 0.7191 0.1763 1 1 0.1111 0.6995 0.1894
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 763 169 594 98 0 9 0 62 0 0 588 0 6 0.5799 0.0000 0.0101 17.778 0.78 3.21 -2.43 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8232 0.1750 0.0018 1 0 0.8149 0.1828 0.0023 1 0 0.8031 0.1939 0.0030
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 503 140 363 66 0 21 0 53 0 0 353 0 10 0.4714 0.0000 0.0275 5.667 0.80 8.00 -7.20 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2306 0.6429 0.1264 1 1 0.2353 0.6326 0.1320 1 1 0.2411 0.6195 0.1394
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 646 149 497 0 0 27 0 122 0 0 462 0 35 0.0000 0.0000 0.0704 4.519 18.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 55386752 A AT 0.003360 0.100 1 1 1 456 111 345 99 0 4 0 8 0 0 345 0 0 0.8919 0.0000 0.0000 26.750 0.25 1.25 -1.00 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.8966 0.1034 0.0000 0 0 0.9954 0.0046 0.0000
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 1097 300 797 121 1 40 2 136 0 1 791 1 4 0.4033 0.0000 0.0075 6.500 0.74 3.93 -3.20 77 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0163 0.6217 0.3620 1 1 0.0193 0.6148 0.3660 1 1 0.0238 0.6067 0.3695
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 611 119 492 0 0 3 0 116 0 0 482 0 10 0.0000 0.0000 0.0203 38.667 4.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr19 56159903 ACCCCGGCAG A 0.044059 0.100 1 -9 1 524 151 373 131 0 17 0 3 0 0 373 0 0 0.8675 0.0000 0.0000 7.882 0.70 9.00 -8.30 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9563 0.0437 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 155 80 75 41 0 6 0 33 0 0 75 0 0 0.5125 0.0000 0.0000 12.333 0.24 2.97 -2.73 7 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4893 0.4647 0.0461 1 0 0.4871 0.4641 0.0488 1 0 0.4838 0.4637 0.0525
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.100 1 -48 1 195 104 91 81 1 19 0 3 0 0 87 0 4 0.7788 0.0000 0.0440 4.941 1.28 1.00 0.28 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1317 0.8683 0.0000 0 0 0.7217 0.2783 0.0000
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 381 143 238 70 0 3 0 70 0 0 238 0 0 0.4895 0.0000 0.0000 46.667 0.07 2.26 -2.19 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1478 0.6652 0.1870 1 1 0.1529 0.6535 0.1935 1 1 0.1595 0.6386 0.2019
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 98 51 47 2 0 3 1 45 0 0 47 0 0 0.0392 0.0000 0.0000 16.000 1.00 6.71 -5.71 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8412 0.1588 2 2 0.0000 0.3540 0.6460 2 2 0.0000 0.2007 0.7993
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 511 166 345 114 0 1 2 49 0 0 342 0 3 0.6867 0.0000 0.0087 165.000 0.33 8.65 -8.32 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9905 0.0095 0.0000 1 0 0.9888 0.0112 0.0000 1 0 0.9860 0.0140 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 510 166 344 112 1 3 2 48 0 0 341 0 3 0.6747 0.0000 0.0087 54.333 0.29 8.69 -8.39 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9906 0.0094 0.0000 1 0 0.9889 0.0111 0.0000 1 0 0.9862 0.0138 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 513 172 341 103 0 2 1 66 0 0 337 0 4 0.5988 0.0000 0.0117 85.000 0.18 8.33 -8.15 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8660 0.1332 0.0009 1 0 0.8589 0.1400 0.0011 1 0 0.8486 0.1499 0.0015
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 228 102 126 47 0 1 0 54 0 0 126 0 0 0.4608 0.0000 0.0000 101.000 0.19 1.20 -1.01 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0623 0.5349 0.4028 1 1 0.0659 0.5304 0.4037 1 1 0.0708 0.5249 0.4043
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 798 203 595 119 0 3 1 80 0 0 590 0 5 0.5862 0.0000 0.0084 66.667 0.36 6.74 -6.38 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8409 0.1581 0.0010 1 0 0.8339 0.1649 0.0013 1 0 0.8235 0.1748 0.0017
chr20 33663701 TGCGGCGGCAAGAGGC T 0.003375 0.100 1 -15 1 670 218 452 199 0 12 0 7 0 0 451 0 1 0.9128 0.0000 0.0022 17.167 0.23 15.29 -15.06 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1245 0.8755 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 546 178 368 9 0 3 0 166 0 0 364 0 4 0.0506 0.0000 0.0109 58.333 0.00 3.25 -3.25 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.6087 0.3913 2 2 0.0000 0.0422 0.9578
chr20 36793328 ACCT A 0.000479 0.100 1 -3 1 467 121 346 114 0 4 0 3 0 0 346 0 0 0.9421 0.0000 0.0000 29.250 0.21 3.00 -2.79 54 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 592 172 420 91 0 4 2 75 0 0 417 1 2 0.5291 0.0000 0.0071 41.750 0.40 3.21 -2.82 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3371 0.6126 0.0503 1 1 0.3392 0.6054 0.0554 1 1 0.3408 0.5965 0.0627
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 1107 361 746 143 1 54 6 157 0 0 741 0 5 0.3961 0.0000 0.0067 5.685 0.24 3.11 -2.86 21 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0032 0.4111 0.5856 1 2 0.0039 0.4051 0.5909 1 2 0.0050 0.3989 0.5961
chr20 60012728 T TA 0.009952 0.100 1 1 2 266 73 193 58 4 2 1 8 1 0 192 0 0 0.7945 0.0052 0.0052 33.500 0.52 1.00 -0.48 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1546 0.8454 0.0000 0 0 0.8712 0.1288 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 272 54 218 0 0 3 0 51 0 0 213 1 4 0.0000 0.0000 0.0229 17.000 6.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 321 141 180 71 0 0 0 70 0 0 180 0 0 0.5035 0.0000 0.0000 141.000 0.18 2.19 -2.00 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1066 0.6748 0.2186 1 1 0.1099 0.6629 0.2272 1 1 0.1141 0.6476 0.2383
chr21 31559412 CGG C 0.000290 0.100 1 -2 2 306 89 217 80 0 2 0 7 0 0 216 0 1 0.8989 0.0000 0.0046 43.500 0.84 2.00 -1.16 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0039 0.9961 0.0000 0 0 0.9741 0.0259 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 822 222 600 196 0 7 0 19 0 0 600 0 0 0.8829 0.0000 0.0000 30.714 0.26 5.84 -5.59 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0616 0.9384 0.0000
chr21 33488442 CAATTA C 0.224085 0.100 1 -5 2 711 199 512 112 0 7 0 80 0 0 505 0 7 0.5628 0.0000 0.0137 27.429 0.32 4.91 -4.59 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7758 0.2226 0.0016 1 0 0.7717 0.2264 0.0019 1 0 0.7654 0.2321 0.0024
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 823 214 609 122 4 12 3 73 2 0 603 2 2 0.5701 0.0033 0.0099 16.583 1.58 13.93 -12.35 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9706 0.0294 0.0000 1 0 0.9674 0.0326 0.0000 1 0 0.9625 0.0375 0.0000
chr21 39452057 CAG C 0.000765 0.100 1 -2 1 285 107 178 58 3 1 1 44 0 0 176 0 2 0.5421 0.0000 0.0112 105.000 1.29 3.07 -1.78 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6983 0.3017 0.0000 1 0 0.6955 0.3044 0.0000 1 0 0.6914 0.3086 0.0000
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 252 127 125 64 0 6 0 57 0 0 125 0 0 0.5039 0.0000 0.0000 20.167 0.19 3.09 -2.90 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2941 0.6112 0.0947 1 1 0.2956 0.6038 0.1006 1 1 0.2969 0.5944 0.1087
chr21 41179506 G GGGGTGAGTGAGGGTGTCCAGGGTGAGGAGTGAGGGTGTCA 0.029913 0.100 1 40 1 1137 294 843 66 0 149 2 77 10 8 767 13 45 0.2245 0.0119 0.0902 0.973 2.32 3.01 -0.69 16 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0006 0.3311 0.6683 1 2 0.0008 0.3590 0.6402 1 2 0.0013 0.3981 0.6006
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 357 50 307 0 0 2 1 47 0 0 306 0 1 0.0000 0.0000 0.0033 24.000 2.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1406 229 1177 124 4 9 6 86 1 1 1172 1 2 0.5415 0.0008 0.0042 31.143 1.05 3.00 -1.95 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7767 0.2217 0.0016 1 0 0.7679 0.2300 0.0021 1 0 0.7549 0.2422 0.0029
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1404 231 1173 124 6 8 6 87 0 0 1170 1 2 0.5368 0.0000 0.0026 27.500 1.02 3.08 -2.06 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7394 0.2583 0.0023 1 0 0.7311 0.2660 0.0029 1 0 0.7189 0.2772 0.0039
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 895 182 713 87 1 29 2 63 30 7 668 4 4 0.4780 0.0421 0.0631 5.276 1.92 13.76 -11.84 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9834 0.0166 0.0000 1 0 0.9812 0.0188 0.0000 1 0 0.9776 0.0224 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 742 152 590 87 0 12 0 53 0 0 582 0 8 0.5724 0.0000 0.0136 12.727 2.18 12.21 -10.02 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7463 0.2488 0.0048 1 0 0.7370 0.2572 0.0058 1 0 0.7235 0.2690 0.0074
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 389 156 233 2 0 17 2 135 0 0 233 0 0 0.0128 0.0000 0.0000 8.176 1.50 7.66 -6.16 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr21 45505235 A AGGCCCCCCC 0.016294 0.100 1 9 6 411 113 298 96 2 7 0 8 0 0 298 0 0 0.8496 0.0000 0.0000 15.143 0.50 7.00 -6.50 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6160 0.3840 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 540 213 327 170 7 19 0 17 0 0 326 0 1 0.7981 0.0000 0.0031 10.211 0.29 2.88 -2.59 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0997 0.9003 0.0000
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.100 1 6 1 2329 838 1491 790 2 32 0 14 0 0 1491 0 0 0.9427 0.0000 0.0000 25.188 0.38 5.36 -4.97 52 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 19444307 AG A 0.000131 0.100 1 -1 2 308 159 149 148 0 2 0 9 0 0 149 0 0 0.9308 0.0000 0.0000 78.500 0.61 1.00 -0.39 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0357 0.9643 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 20858678 G GCCGCCT 0.004141 0.100 1 6 2 448 160 288 120 0 28 0 12 0 0 288 0 0 0.7500 0.0000 0.0000 4.714 0.48 3.83 -3.35 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2146 0.7854 0.0000 0 0 0.9735 0.0265 0.0000
chr22 20982391 CG C 0.000032 0.100 1 -1 1 348 114 234 63 2 3 0 46 0 0 234 0 0 0.5526 0.0000 0.0000 37.000 0.21 1.22 -1.01 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7892 0.2108 0.0000 1 0 0.7840 0.2160 0.0000 1 0 0.7766 0.2234 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 233 109 124 100 0 7 0 2 0 0 124 0 0 0.9174 0.0000 0.0000 14.571 0.27 3.00 -2.73 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8588 0.1412 0.0000 0 0 0.9823 0.0177 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 576 134 442 8 0 34 1 91 0 0 430 0 12 0.0597 0.0000 0.0271 2.941 0.12 13.68 -13.56 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7949 0.2051 2 2 0.0000 0.1323 0.8677
chr22 31602713 CCCA C 0.001203 0.100 1 -3 1 471 166 305 159 0 3 0 4 0 0 305 0 0 0.9578 0.0000 0.0000 54.333 0.21 3.50 -3.29 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9974 0.0026 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 35728842 GC G 0.001215 0.100 1 -1 1 295 100 195 95 0 3 0 2 0 0 194 0 1 0.9500 0.0000 0.0051 32.333 0.27 1.50 -1.23 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9929 0.0071 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 728 228 500 23 0 11 2 192 0 1 493 0 6 0.1009 0.0000 0.0140 19.636 0.52 2.26 -1.73 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9946 0.0054
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 536 277 259 203 0 61 0 13 0 1 258 0 0 0.7329 0.0000 0.0039 3.541 0.20 5.77 -5.57 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0763 0.9237 0.0000 0 0 0.9379 0.0621 0.0000
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 554 101 453 67 0 5 0 29 0 0 453 0 0 0.6634 0.0000 0.0000 19.200 0.84 11.76 -10.92 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9220 0.0774 0.0006 1 0 0.9136 0.0856 0.0008 1 0 0.9010 0.0978 0.0012
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.100 1 -3 1 1084 403 681 225 5 14 4 155 0 0 681 0 0 0.5583 0.0000 0.0000 29.923 1.28 4.04 -2.76 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9890 0.0110 0.0000 1 0 0.9876 0.0124 0.0000 1 0 0.9853 0.0147 0.0000
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 240 119 121 101 1 5 0 12 0 0 120 0 1 0.8487 0.0000 0.0083 22.800 0.20 4.25 -4.05 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0628 0.9372 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 398 139 259 0 0 3 1 135 0 0 254 0 5 0.0000 0.0000 0.0193 45.333 3.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 601 198 403 157 0 17 2 22 0 0 402 0 1 0.7929 0.0000 0.0025 10.647 0.17 3.23 -3.06 79 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1201 319 882 160 0 2 0 157 8 0 866 0 8 0.5016 0.0091 0.0181 158.500 7.73 9.01 -1.28 76 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1515 0.8136 0.0349 1 1 0.1656 0.7953 0.0390 1 1 0.1846 0.7706 0.0449
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 820 335 485 220 0 8 1 106 0 0 485 0 0 0.6567 0.0000 0.0000 40.875 0.18 2.92 -2.74 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 756 146 610 134 0 6 0 6 0 0 610 0 0 0.9178 0.0000 0.0000 23.333 1.46 6.50 -5.04 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0268 0.9732 0.0000 0 0 0.9615 0.0385 0.0000 0 0 0.9962 0.0038 0.0000
chr22 46363187 CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA C 0.006403 0.100 1 -27 3 190 73 117 46 0 22 0 5 0 0 117 0 0 0.6301 0.0000 0.0000 2.318 0.63 10.80 -10.17 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0236 0.9764 0.0000 0 0 0.8827 0.1173 0.0000 0 0 0.9832 0.0168 0.0000
chr22 46537150 GGGC G 0.001229 0.100 1 -3 1 343 102 241 81 2 16 0 3 0 0 241 0 0 0.7941 0.0000 0.0000 5.312 0.72 4.33 -3.62 55 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9862 0.0138 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 397 133 264 104 0 25 0 4 0 0 263 0 1 0.7820 0.0000 0.0038 4.320 0.22 13.50 -13.28 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0245 0.9755 0.0000 0 0 0.8806 0.1194 0.0000 0 0 0.9814 0.0186 0.0000
800 rows