File Info

Filename
HG02572_x_HG02583_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG02572_x_HG02583_FF_10.features.tsv
Size
180.0 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:08 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 964529 AGGTCCGCAGTGGGGCTGCGGGGAGGGGGGCGCG A 0.000081 0.100 1 -33 1 475 138 337 106 2 25 1 4 0 0 333 0 4 0.7681 0.0000 0.0119 4.520 3.41 27.00 -23.59 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0384 0.9616 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 308 123 185 68 0 0 0 55 0 0 184 0 1 0.5528 0.0000 0.0054 123.000 0.29 3.51 -3.21 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4523 0.5058 0.0419 1 1 0.4505 0.5038 0.0458 1 1 0.4472 0.5015 0.0513
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 753 217 536 151 10 39 0 17 0 0 536 0 0 0.6959 0.0000 0.0000 4.564 0.17 2.82 -2.65 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0425 0.9575 0.0000
chr1 8359808 GCTCCTT G 0.500000 0.100 1 -6 3 436 128 308 107 0 14 0 7 0 0 307 0 1 0.8359 0.0000 0.0032 8.143 0.40 6.00 -5.60 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0402 0.9598 0.0000 0 0 0.5144 0.4856 0.0000
chr1 10639083 CTCGTCG C 0.500000 0.100 1 -6 2 513 125 388 62 2 14 1 46 0 0 386 0 2 0.4960 0.0000 0.0052 7.929 1.74 6.61 -4.87 24 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5406 0.4310 0.0284 1 0 0.5353 0.4332 0.0315 1 0 0.5274 0.4365 0.0361
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 490 113 377 7 0 13 1 92 0 0 375 0 2 0.0619 0.0000 0.0053 7.692 1.00 3.13 -2.13 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9374 0.0626 2 2 0.0000 0.4707 0.5293
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 991 190 801 99 1 12 0 78 0 0 801 0 0 0.5211 0.0000 0.0000 14.833 0.33 3.17 -2.83 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6436 0.3482 0.0082 1 0 0.6385 0.3518 0.0097 1 0 0.6307 0.3573 0.0119
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 448 95 353 69 0 5 0 21 0 0 353 0 0 0.7263 0.0000 0.0000 18.000 0.22 1.05 -0.83 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9727 0.0272 0.0001 1 0 0.8578 0.1421 0.0001 0 1 0.1024 0.8976 0.0000
chr1 19138035 TTTCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 272 125 147 74 0 5 0 46 0 0 145 0 2 0.5920 0.0000 0.0136 24.000 0.11 5.70 -5.59 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7799 0.2156 0.0045 1 0 0.7699 0.2247 0.0054 1 0 0.7555 0.2375 0.0069
chr1 26282320 TCCAGGACAGGGACTGGGGCCGGGACCGGGACCGGGACTGGGGCCGGGA T 0.500000 0.100 1 -48 3 717 179 538 45 5 37 3 89 0 0 507 0 31 0.2514 0.0000 0.0576 4.147 5.62 16.82 -11.20 23 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0028 0.9972 1 2 0.0000 0.0035 0.9965 1 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 724 175 549 38 24 37 44 32 0 0 549 0 0 0.2171 0.0000 0.0000 4.615 7.84 28.06 -20.22 16 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0202 0.4011 0.5786 1 2 0.0228 0.4044 0.5728 1 2 0.0267 0.4091 0.5642
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 744 174 570 41 3 23 14 93 0 0 568 1 1 0.2356 0.0000 0.0035 7.150 1.20 18.09 -16.89 23 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0077 0.9923 1 2 0.0000 0.0093 0.9907 1 2 0.0000 0.0119 0.9881
chr1 27373179 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 264 94 170 53 0 2 0 39 0 0 170 0 0 0.5638 0.0000 0.0000 46.000 0.25 1.10 -0.86 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5416 0.4246 0.0338 1 0 0.5351 0.4278 0.0371 1 0 0.5258 0.4322 0.0420
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 377 151 226 14 0 17 0 120 0 0 224 0 2 0.0927 0.0000 0.0088 7.882 0.21 3.02 -2.80 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9554 0.0446
chr1 34761404 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 706 180 526 162 1 4 0 13 0 0 525 0 1 0.9000 0.0000 0.0019 43.750 0.24 2.38 -2.14 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2553 0.7447 0.0000
chr1 35114681 GATA G 0.500000 0.100 1 -3 1 830 189 641 96 0 8 0 85 0 0 640 0 1 0.5079 0.0000 0.0016 22.625 0.17 3.56 -3.40 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3390 0.6143 0.0467 1 1 0.3438 0.6051 0.0511 1 1 0.3491 0.5935 0.0574
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 630 167 463 0 0 23 5 139 0 0 460 1 2 0.0000 0.0000 0.0065 6.261 6.17 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr1 50419101 CCGGCGG C 0.500000 0.100 1 -6 6 672 147 525 70 0 21 0 56 0 1 523 0 1 0.4762 0.0000 0.0038 6.300 3.50 7.82 -4.32 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4877 0.4788 0.0336 1 0 0.4849 0.4781 0.0370 1 0 0.4803 0.4776 0.0420
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 234 94 140 81 0 6 0 7 0 0 139 1 0 0.8617 0.0000 0.0071 14.667 0.60 3.00 -2.40 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0250 0.9750 0.0000 0 1 0.3149 0.6851 0.0000
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 963 243 720 108 4 38 1 92 0 0 718 0 2 0.4444 0.0000 0.0028 5.395 0.32 3.21 -2.88 46 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4877 0.4957 0.0166 1 1 0.4894 0.4917 0.0190 1 0 0.4901 0.4873 0.0225
chr1 62209972 ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC A 0.500000 0.100 1 -30 1 559 124 435 69 0 24 0 31 1 0 420 0 14 0.5565 0.0023 0.0345 4.167 0.61 18.58 -17.97 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7680 0.2265 0.0054 1 0 0.7578 0.2357 0.0065 1 0 0.7433 0.2486 0.0082
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 4 747 152 595 136 2 8 0 6 0 0 595 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 18.000 0.97 3.00 -2.03 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 0 0.6233 0.3767 0.0000 0 0 0.9450 0.0550 0.0000
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 377 157 220 71 0 38 0 48 0 0 216 0 4 0.4522 0.0000 0.0182 3.132 1.45 10.25 -8.80 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6332 0.3521 0.0146 1 0 0.6257 0.3575 0.0167 1 0 0.6149 0.3651 0.0199
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 475 162 313 75 0 9 0 78 0 0 311 0 2 0.4630 0.0000 0.0064 17.000 0.16 5.74 -5.58 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0933 0.6552 0.2514 1 1 0.0991 0.6441 0.2568 1 1 0.1068 0.6299 0.2633
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.100 1 -6 1 475 158 317 69 0 15 0 74 0 0 317 0 0 0.4367 0.0000 0.0000 9.533 0.16 5.93 -5.77 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0970 0.6419 0.2611 1 1 0.1026 0.6316 0.2658 1 1 0.1102 0.6185 0.2713
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 168 67 101 2 0 1 0 64 0 0 99 0 2 0.0299 0.0000 0.0198 66.000 0.00 3.05 -3.05 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7466 0.2534 2 2 0.0000 0.2374 0.7626 2 2 0.0000 0.1279 0.8721
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 396 115 281 47 0 8 0 60 0 0 276 1 4 0.4087 0.0000 0.0178 13.375 0.87 3.25 -2.38 29 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0179 0.3639 0.6182 1 2 0.0203 0.3692 0.6105 1 2 0.0238 0.3766 0.5995
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 773 166 607 80 5 27 7 47 0 0 599 0 8 0.4819 0.0000 0.0132 5.000 1.15 3.47 -2.32 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6551 0.3346 0.0103 1 0 0.6481 0.3399 0.0120 1 0 0.6379 0.3475 0.0146
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.100 1 -45 4 764 193 571 113 1 13 7 59 0 1 570 0 0 0.5855 0.0000 0.0018 13.538 1.22 3.63 -2.41 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9685 0.0314 0.0000 1 0 0.9644 0.0356 0.0001 1 0 0.9580 0.0419 0.0001
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 305 108 197 54 0 13 0 41 0 0 197 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 7.308 0.19 2.49 -2.30 12 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5116 0.4495 0.0389 1 0 0.5062 0.4513 0.0425 1 0 0.4984 0.4539 0.0477
chr1 150280899 AAAT A 0.500000 0.100 1 -3 1 126 61 65 54 0 2 0 5 0 0 65 0 0 0.8852 0.0000 0.0000 29.500 0.19 3.00 -2.81 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0675 0.9325 0.0000 0 1 0.3569 0.6431 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 249 85 164 14 0 11 1 59 0 0 163 0 1 0.1647 0.0000 0.0061 6.636 0.29 1.85 -1.56 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9758 0.0242 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.9974 0.0026
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 225 75 150 0 0 13 0 62 0 0 138 0 12 0.0000 0.0000 0.0800 4.769 11.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0225 0.9775 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0268 0.9732
chr1 152759703 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 540 150 390 137 1 9 0 3 0 0 390 0 0 0.9133 0.0000 0.0000 15.556 0.52 2.00 -1.48 79 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6012 0.3988 0.0000 0 0 0.9759 0.0241 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr1 152761321 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 337 75 262 68 2 4 0 1 0 0 262 0 0 0.9067 0.0000 0.0000 17.750 0.31 1.00 -0.69 38 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7972 0.2028 0.0000 0 0 0.9194 0.0806 0.0000 0 0 0.9402 0.0598 0.0000
chr1 152776437 CAAGTGCCCCACACCG C 0.500000 0.100 1 -15 3 883 317 566 172 0 18 0 127 0 0 559 0 7 0.5426 0.0000 0.0124 16.611 0.33 12.87 -12.54 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8278 0.1718 0.0004 1 0 0.8231 0.1763 0.0006 1 0 0.8156 0.1835 0.0009
chr1 152797827 GCCCC G 0.500000 0.100 1 -4 1 668 187 481 127 4 2 0 54 0 0 475 1 5 0.6791 0.0000 0.0125 183.000 0.53 13.83 -13.31 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9951 0.0049 0.0000 1 0 0.9941 0.0059 0.0000 1 0 0.9923 0.0077 0.0000
chr1 152797835 CCAAGTGCA C 0.500000 0.100 1 -8 3 668 188 480 127 2 4 0 55 0 0 471 1 8 0.6755 0.0000 0.0187 45.750 0.43 13.16 -12.73 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9916 0.0084 0.0000 1 0 0.9900 0.0100 0.0000 1 0 0.9874 0.0126 0.0000
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 762 192 570 99 0 16 1 76 0 0 563 0 7 0.5156 0.0000 0.0123 11.000 1.05 5.91 -4.86 61 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4587 0.5171 0.0242 1 1 0.4600 0.5128 0.0272 1 1 0.4604 0.5080 0.0316
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1141 281 860 131 2 49 0 99 1 3 828 1 27 0.4662 0.0012 0.0372 4.694 2.01 11.17 -9.16 13 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2433 0.7166 0.0401 1 1 0.2536 0.7015 0.0448 1 1 0.2663 0.6821 0.0516
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 213 94 119 54 0 3 1 36 0 0 119 0 0 0.5745 0.0000 0.0000 30.333 1.98 1.94 0.04 22 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6239 0.3553 0.0208 1 0 0.6150 0.3617 0.0234 1 0 0.6024 0.3703 0.0272
chr1 156583439 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 292 89 203 9 0 3 0 77 0 0 203 0 0 0.1011 0.0000 0.0000 28.667 0.89 1.14 -0.25 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.8842 0.1158
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 765 214 551 0 0 2 0 212 0 0 550 0 1 0.0000 0.0000 0.0018 106.000 2.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1625 298 1327 131 0 7 0 160 0 0 1322 0 5 0.4396 0.0000 0.0038 41.571 0.19 1.61 -1.42 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0009 0.2268 0.7722 1 2 0.0012 0.2304 0.7684 1 2 0.0017 0.2362 0.7621
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.100 1 3 1 115 58 57 42 0 1 0 15 0 0 56 0 1 0.7241 0.0000 0.0175 57.000 0.21 4.20 -3.99 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8280 0.1673 0.0048 1 0 0.8155 0.1787 0.0057 1 0 0.7845 0.2083 0.0072
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 184 66 118 38 0 1 0 27 0 0 118 0 0 0.5758 0.0000 0.0000 65.000 0.13 1.11 -0.98 22 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4908 0.4538 0.0554 1 0 0.4844 0.4560 0.0595 1 0 0.4756 0.4591 0.0653
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 273 63 210 55 0 5 0 3 0 0 210 0 0 0.8730 0.0000 0.0000 11.600 0.62 1.00 -0.38 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0226 0.9774 0.0000 0 1 0.3941 0.6059 0.0000 0 0 0.6790 0.3210 0.0000
chr1 183533735 T TACA 0.500000 0.100 1 3 2 203 80 123 50 0 1 0 29 0 0 122 0 1 0.6250 0.0000 0.0081 79.000 0.28 3.24 -2.96 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7009 0.2858 0.0133 1 0 0.6899 0.2949 0.0153 1 0 0.6745 0.3072 0.0183
chr1 203797705 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 5 608 141 467 71 1 4 0 65 0 0 464 0 3 0.5035 0.0000 0.0064 34.250 0.48 3.23 -2.75 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2423 0.6480 0.1097 1 1 0.2473 0.6373 0.1154 1 1 0.2532 0.6238 0.1230
chr1 205849937 CTT C 0.500000 0.100 1 -2 1 295 119 176 109 0 2 0 8 0 0 176 0 0 0.9160 0.0000 0.0000 58.500 0.17 1.88 -1.71 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0443 0.9557 0.0000 0 0 0.5388 0.4612 0.0000
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 537 259 278 181 12 56 0 10 0 0 278 0 0 0.6988 0.0000 0.0000 3.625 0.26 3.10 -2.84 101 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2679 0.7321 0.0000 0 0 0.9501 0.0499 0.0000
chr1 225519331 ATCCAGGCGTTCCTGCCGC A 0.500000 0.100 1 -18 1 518 156 362 61 1 68 0 26 0 0 354 0 8 0.3910 0.0000 0.0221 1.279 0.74 9.23 -8.49 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8283 0.1684 0.0033 1 0 0.8175 0.1784 0.0041 1 0 0.8021 0.1926 0.0053
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 635 142 493 68 0 13 0 61 1 0 489 0 3 0.4789 0.0020 0.0081 9.923 0.57 8.72 -8.15 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2695 0.6305 0.1000 1 1 0.2736 0.6209 0.1055 1 1 0.2783 0.6088 0.1129
chr1 231185061 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 272 123 149 114 0 1 0 8 0 0 149 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 122.000 0.10 6.25 -6.15 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0564 0.9436 0.0000 0 0 0.5986 0.4014 0.0000
chr1 231185064 CCTGG C 0.500000 0.100 1 -4 1 272 129 143 121 0 0 0 8 0 0 143 0 0 0.9380 0.0000 0.0000 129.000 0.10 6.25 -6.15 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0777 0.9223 0.0000 0 0 0.6763 0.3237 0.0000
chr1 235213963 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 180 50 130 41 0 5 0 4 0 0 130 0 0 0.8200 0.0000 0.0000 9.000 0.44 2.75 -2.31 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.0989 0.9011 0.0000 0 1 0.3595 0.6405 0.0000
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 222 97 125 51 0 2 0 44 0 0 125 0 0 0.5258 0.0000 0.0000 47.500 0.18 1.30 -1.12 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3519 0.5603 0.0879 1 1 0.3518 0.5555 0.0927 1 1 0.3512 0.5495 0.0993
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 672 183 489 0 0 17 1 165 0 0 483 0 6 0.0000 0.0000 0.0123 10.375 3.51 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 483 148 335 72 0 5 0 71 0 0 335 0 0 0.4865 0.0000 0.0000 28.600 0.39 1.94 -1.55 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1827 0.6674 0.1499 1 1 0.1886 0.6556 0.1559 1 1 0.1959 0.6404 0.1636
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 731 245 486 121 1 5 0 118 0 0 485 0 1 0.4939 0.0000 0.0021 48.000 2.31 5.10 -2.79 89 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1563 0.7574 0.0863 1 1 0.1654 0.7412 0.0934 1 1 0.1770 0.7199 0.1031
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 867 46 821 0 0 3 1 42 0 0 816 0 5 0.0000 0.0000 0.0061 14.333 4.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0797 0.9203 2 2 0.0000 0.0834 0.9166 2 2 0.0000 0.0887 0.9113
chr1 248453288 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 1530 292 1238 282 1 4 0 5 0 0 1238 0 0 0.9658 0.0000 0.0000 72.000 0.29 2.40 -2.11 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9649 0.0351 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr1 248574594 T TGGATGAGGA 0.500000 0.100 1 9 1 449 73 376 34 0 7 0 32 0 0 375 0 1 0.4658 0.0000 0.0027 9.429 0.41 6.59 -6.18 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2306 0.5802 0.1891 1 1 0.2331 0.5742 0.1927 1 1 0.2361 0.5667 0.1972
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 374 124 250 40 0 9 0 75 0 0 248 0 2 0.3226 0.0000 0.0080 12.778 0.40 6.76 -6.36 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0006 0.0831 0.9163 1 2 0.0008 0.0909 0.9083 1 2 0.0011 0.1024 0.8965
chr1 248650008 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 912 291 621 188 0 2 0 101 0 0 621 0 0 0.6460 0.0000 0.0000 144.500 0.24 3.85 -3.61 124 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9985 0.0015 0.0000 1 0 0.9981 0.0019 0.0000 1 0 0.9975 0.0025 0.0000
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 1478 271 1207 124 0 7 0 140 0 0 1200 0 7 0.4576 0.0000 0.0058 37.714 0.83 3.39 -2.56 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0059 0.4331 0.5611 1 2 0.0070 0.4295 0.5635 1 2 0.0089 0.4262 0.5649
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 223 108 115 54 0 1 0 53 0 0 113 0 2 0.5000 0.0000 0.0174 107.000 0.24 3.89 -3.65 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1959 0.6333 0.1709 1 1 0.2017 0.6237 0.1746 1 1 0.2091 0.6116 0.1792
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 449 158 291 69 0 23 2 64 0 0 280 0 11 0.4367 0.0000 0.0378 5.870 1.10 7.92 -6.82 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0368 0.5499 0.4133 1 1 0.0395 0.5428 0.4177 1 1 0.0434 0.5340 0.4226
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.100 1 9 1 578 122 456 60 1 18 1 42 0 0 450 0 6 0.4918 0.0000 0.0132 5.778 0.30 8.26 -7.96 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6452 0.3511 0.0037 1 0 0.6436 0.3523 0.0041 1 0 0.6410 0.3545 0.0046
chr2 25161587 C CGCCGCTGCTGCCGCTGCT 0.000358 0.100 1 18 1 578 122 456 61 2 46 3 10 0 2 449 2 3 0.5000 0.0000 0.0154 1.689 0.39 5.50 -5.11 23 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9740 0.0260 0.0000 1 0 0.8355 0.1645 0.0000 0 1 0.4574 0.5426 0.0000
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 190 48 142 22 0 1 0 25 0 0 142 0 0 0.4583 0.0000 0.0000 47.000 0.18 3.00 -2.82 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1612 0.5466 0.2922 1 1 0.1649 0.5431 0.2920 1 1 0.1697 0.5387 0.2916
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 728 145 583 57 0 22 0 66 0 0 583 0 0 0.3931 0.0000 0.0000 5.591 0.39 3.08 -2.69 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0630 0.5620 0.3751 1 1 0.0676 0.5567 0.3757 1 1 0.0741 0.5502 0.3758
chr2 38868268 TCCA T 0.500000 0.100 1 -3 2 386 170 216 85 0 14 1 70 0 0 216 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 11.143 0.15 2.96 -2.80 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4684 0.5025 0.0292 1 1 0.4678 0.4997 0.0324 1 1 0.4660 0.4967 0.0372
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 461 164 297 102 1 57 0 4 0 0 297 0 0 0.6220 0.0000 0.0000 1.877 0.28 2.00 -1.72 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0258 0.9742 0.0000 0 0 0.7083 0.2917 0.0000 0 0 0.9192 0.0808 0.0000
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.100 1 6 1 207 91 116 78 0 5 0 8 0 0 115 0 1 0.8571 0.0000 0.0086 17.200 0.26 4.75 -4.49 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0034 0.9966 0.0000 0 1 0.1197 0.8803 0.0000
chr2 54255566 G GGGGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 601 57 544 24 1 22 0 10 4 1 534 1 4 0.4211 0.0074 0.0184 1.591 3.92 9.10 -5.18 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6095 0.3567 0.0338 1 0 0.5985 0.3644 0.0371 1 0 0.5834 0.3746 0.0419
chr2 65072937 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 3 663 172 491 155 1 8 0 8 0 0 491 0 0 0.9012 0.0000 0.0000 20.375 0.43 3.25 -2.82 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3249 0.6751 0.0000 0 0 0.9191 0.0809 0.0000
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 428 174 254 85 0 12 2 75 0 0 254 0 0 0.4885 0.0000 0.0000 13.333 0.40 3.41 -3.01 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3253 0.6149 0.0598 1 1 0.3294 0.6059 0.0647 1 1 0.3338 0.5947 0.0715
chr2 73385903 T TGGAGGAGGA 0.500000 0.100 1 9 1 662 158 504 60 3 36 4 55 0 4 487 0 13 0.3797 0.0000 0.0337 3.361 6.53 8.25 -1.72 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0957 0.6335 0.2709 1 1 0.1012 0.6237 0.2751 1 1 0.1086 0.6113 0.2801
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 664 174 490 72 2 35 1 64 0 0 485 1 4 0.4138 0.0000 0.0102 4.059 6.36 6.41 -0.05 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2453 0.6492 0.1054 1 1 0.2504 0.6385 0.1111 1 1 0.2564 0.6248 0.1188
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 450 106 344 43 0 5 0 58 0 0 342 0 2 0.4057 0.0000 0.0058 20.200 0.21 3.02 -2.81 21 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0209 0.3727 0.6064 1 2 0.0234 0.3780 0.5986 1 2 0.0273 0.3852 0.5875
chr2 74958681 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 1 250 75 175 66 0 5 0 4 0 0 175 0 0 0.8800 0.0000 0.0000 14.000 0.82 3.75 -2.93 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.2765 0.7235 0.0000 0 0 0.6537 0.3463 0.0000
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.100 1 -9 1 380 142 238 72 0 10 1 59 0 0 230 0 8 0.5070 0.0000 0.0336 13.200 0.39 8.86 -8.48 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2424 0.6479 0.1096 1 1 0.2474 0.6373 0.1154 1 1 0.2533 0.6237 0.1230
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 357 145 212 60 2 9 2 72 0 0 212 0 0 0.4138 0.0000 0.0000 17.000 0.73 3.29 -2.56 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0381 0.5112 0.4507 1 1 0.0419 0.5085 0.4496 1 1 0.0472 0.5055 0.4473
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 727 180 547 0 0 19 8 153 0 0 543 0 4 0.0000 0.0000 0.0073 8.421 3.24 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 750 204 546 106 2 10 0 86 0 0 546 0 0 0.5196 0.0000 0.0000 19.300 0.57 8.16 -7.60 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6213 0.3704 0.0083 1 0 0.6177 0.3726 0.0097 1 0 0.6117 0.3763 0.0120
chr2 97702739 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 491 158 333 146 1 6 0 5 0 0 333 0 0 0.9241 0.0000 0.0000 25.333 0.41 1.20 -0.79 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0302 0.9698 0.0000 0 0 0.8859 0.1141 0.0000 0 0 0.9809 0.0191 0.0000
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.100 1 3 4 532 155 377 72 0 3 1 79 0 0 374 1 2 0.4645 0.0000 0.0080 50.333 0.25 3.15 -2.90 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0465 0.5697 0.3837 1 1 0.0508 0.5634 0.3858 1 1 0.0568 0.5557 0.3875
chr2 101405989 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 149 62 87 39 0 2 0 21 0 0 87 0 0 0.6290 0.0000 0.0000 30.000 0.33 3.33 -3.00 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6761 0.3048 0.0191 1 0 0.6646 0.3139 0.0215 1 0 0.6486 0.3262 0.0252
chr2 110995965 GGTTCTTCAGCGGGGTTTGGTGGCCAGAATTTATTATAAGGTAAAGATACACTGT G 0.500000 0.100 1 -54 3 244 128 116 125 0 0 0 3 0 0 116 0 0 0.9766 0.0000 0.0000 128.000 0.57 18.33 -17.77 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4264 0.5736 0.0000 0 0 0.9547 0.0453 0.0000 0 0 0.9843 0.0157 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 102 45 57 25 0 1 0 19 0 0 57 0 0 0.5556 0.0000 0.0000 44.000 0.40 3.11 -2.71 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3740 0.5121 0.1138 1 1 0.3708 0.5111 0.1182 1 1 0.3662 0.5097 0.1240
chr2 118846529 CGCCGCCGCCGCCACTGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -24 2 429 97 332 59 0 12 0 26 0 0 331 0 1 0.6082 0.0000 0.0030 7.083 1.14 15.73 -14.60 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8857 0.1128 0.0015 1 0 0.8759 0.1222 0.0020 1 0 0.8616 0.1357 0.0027
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 529 122 407 0 0 1 2 119 0 0 401 0 6 0.0000 0.0000 0.0147 120.000 6.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 300 104 196 39 0 14 0 51 0 0 193 0 3 0.3750 0.0000 0.0153 6.429 0.28 6.47 -6.19 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0290 0.4043 0.5667 1 2 0.0321 0.4085 0.5595 1 2 0.0366 0.4141 0.5492
chr2 131363120 CTGTT C 0.500000 0.100 1 -4 1 677 91 586 89 0 0 0 2 0 0 585 0 1 0.9780 0.0000 0.0017 91.000 0.45 4.00 -3.55 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1061 0.8939 0.0000 0 0 0.7775 0.2225 0.0000 0 0 0.9163 0.0837 0.0000
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 725 192 533 171 0 10 1 10 1 0 531 1 0 0.8906 0.0019 0.0038 20.222 0.52 1.10 -0.58 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0330 0.9670 0.0000 0 0 0.7381 0.2619 0.0000
chr2 131528321 C CCTGG 0.500000 0.100 1 4 1 732 217 515 204 1 7 0 5 0 0 515 0 0 0.9401 0.0000 0.0000 29.857 0.35 4.00 -3.65 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3385 0.6615 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr2 132645507 T TAAG 0.500000 0.100 1 3 1 551 137 414 72 0 5 0 60 0 0 413 0 1 0.5255 0.0000 0.0024 26.400 0.18 3.00 -2.82 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4161 0.5370 0.0470 1 1 0.4159 0.5329 0.0511 1 1 0.4149 0.5281 0.0570
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 183 48 135 16 5 15 3 9 0 0 134 1 0 0.3333 0.0000 0.0074 1.867 0.62 1.33 -0.71 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4375 0.4695 0.0929 1 1 0.4313 0.4715 0.0973 1 1 0.4228 0.4740 0.1032
chr2 159987235 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 197 90 107 84 0 0 0 6 0 0 107 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 90.000 0.20 2.00 -1.80 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1029 0.8971 0.0000 0 0 0.5584 0.4416 0.0000
chr2 167250827 TA T 0.500000 0.100 1 -1 4 791 236 555 136 0 12 0 88 0 0 555 0 0 0.5763 0.0000 0.0000 18.667 0.35 1.30 -0.94 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9509 0.0490 0.0001 1 0 0.9460 0.0539 0.0001 1 0 0.9384 0.0614 0.0002
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 189 81 108 59 0 17 0 5 2 0 106 0 0 0.7284 0.0185 0.0185 3.765 1.07 6.00 -4.93 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0932 0.9068 0.0000 0 1 0.4382 0.5618 0.0000
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 197 75 122 8 0 16 0 51 0 0 122 0 0 0.1067 0.0000 0.0000 3.688 0.12 10.86 -10.74 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9974 0.0026 2 1 0.0000 0.9346 0.0654
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 277 108 169 7 1 18 76 6 0 1 168 0 0 0.0648 0.0000 0.0059 1.062 0.57 2.33 -1.76 7 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9940 0.0060 2 1 0.0000 0.8630 0.1370
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 276 110 166 2 3 10 3 92 0 0 166 0 0 0.0182 0.0000 0.0000 9.500 0.00 2.90 -2.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8676 0.1324 2 2 0.0000 0.2310 0.7690 2 2 0.0000 0.0881 0.9119
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 237 70 167 39 7 11 2 11 0 0 167 0 0 0.5571 0.0000 0.0000 4.727 0.05 1.09 -1.04 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7955 0.2031 0.0014 0 1 0.3305 0.6687 0.0008 0 1 0.0494 0.9505 0.0001
chr2 202194209 CAAG C 0.500000 0.100 1 -3 2 300 139 161 131 0 2 0 6 0 0 161 0 0 0.9424 0.0000 0.0000 68.500 0.23 3.50 -3.27 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.5388 0.4612 0.0000 0 0 0.9246 0.0754 0.0000
chr2 202635317 AAGCAGC A 0.500000 0.100 1 -6 1 422 159 263 137 1 16 0 5 2 0 260 0 1 0.8616 0.0076 0.0114 8.938 1.55 8.40 -6.85 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 0 0.6450 0.3550 0.0000 0 0 0.9496 0.0504 0.0000
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 1 461 104 357 49 4 24 3 24 0 0 357 0 0 0.4712 0.0000 0.0000 3.391 1.84 4.21 -2.37 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8052 0.1897 0.0051 1 0 0.7936 0.2002 0.0062 1 0 0.7773 0.2149 0.0078
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 197 73 124 23 4 17 6 23 0 0 124 0 0 0.3151 0.0000 0.0000 3.118 1.35 1.17 0.17 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1826 0.5614 0.2560 1 1 0.1859 0.5568 0.2573 1 1 0.1902 0.5510 0.2588
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 324 98 226 6 0 3 0 89 0 0 224 0 2 0.0612 0.0000 0.0088 31.667 0.17 3.00 -2.83 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8632 0.1368 2 2 0.0000 0.3624 0.6376
chr2 214780778 GTGGTGAAGAACATTCAGGCAA G 0.500000 0.100 1 -21 2 693 188 505 177 0 6 0 5 0 0 504 0 1 0.9415 0.0000 0.0020 30.333 0.49 17.20 -16.71 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0132 0.9868 0.0000 0 0 0.9207 0.0793 0.0000 0 0 0.9913 0.0087 0.0000
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 553 163 390 0 0 25 1 137 0 0 381 2 7 0.0000 0.0000 0.0231 5.480 7.69 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr2 217848163 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 1 815 181 634 137 12 22 0 10 0 0 632 0 2 0.7569 0.0000 0.0032 7.227 1.69 5.30 -3.61 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 1 0.3818 0.6182 0.0000
chr2 218383007 TCCAGCCCGA T 0.500000 0.100 1 -9 1 349 145 204 75 0 21 0 49 0 0 202 0 2 0.5172 0.0000 0.0098 5.905 0.49 7.65 -7.16 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7400 0.2537 0.0063 1 0 0.7305 0.2620 0.0075 1 0 0.7169 0.2737 0.0094
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 624 210 414 182 1 9 1 17 0 0 408 0 6 0.8667 0.0000 0.0145 22.222 0.52 14.18 -13.66 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 338 139 199 21 0 0 1 117 0 0 198 0 1 0.1511 0.0000 0.0050 138.000 1.48 3.78 -2.30 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 154 69 85 42 0 4 0 23 0 0 84 0 1 0.6087 0.0000 0.0118 16.250 0.24 3.00 -2.76 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6700 0.3111 0.0189 1 0 0.6589 0.3198 0.0213 1 0 0.6434 0.3316 0.0250
chr2 233729636 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1119 246 873 119 3 19 5 100 0 0 870 0 3 0.4837 0.0000 0.0034 11.737 0.27 1.12 -0.85 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3970 0.5802 0.0229 1 1 0.4026 0.5715 0.0259 1 1 0.4086 0.5610 0.0304
chr2 240568861 GCGCCCCCGC G 0.500000 0.100 1 -9 1 343 91 252 52 0 5 0 34 0 1 250 0 1 0.5714 0.0000 0.0079 17.200 0.92 9.62 -8.69 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6259 0.3530 0.0211 1 0 0.6167 0.3596 0.0237 1 0 0.6040 0.3685 0.0276
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 371 116 255 7 2 34 0 73 0 0 254 0 1 0.0603 0.0000 0.0039 2.382 0.57 3.62 -3.05 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9880 0.0120 2 1 0.0000 0.8033 0.1967
chr2 241096043 CTCG C 0.500000 0.100 1 -3 2 605 148 457 84 1 2 0 61 0 0 453 0 4 0.5676 0.0000 0.0088 73.000 0.25 3.16 -2.91 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6274 0.3607 0.0119 1 0 0.6214 0.3649 0.0137 1 0 0.6125 0.3709 0.0166
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 822 225 597 0 0 0 1 224 0 1 590 0 6 0.0000 0.0000 0.0117 225.000 3.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 10290077 ACT A 0.000063 0.100 1 -2 2 285 78 207 72 0 2 0 4 0 0 207 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 38.000 0.11 2.00 -1.89 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9886 0.0114 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 829 193 636 0 0 33 1 159 0 0 601 1 34 0.0000 0.0000 0.0550 4.848 10.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr3 12901258 TGGC T 0.002987 0.100 1 -3 1 466 144 322 121 8 5 0 10 0 0 322 0 0 0.8403 0.0000 0.0000 27.800 0.50 4.50 -4.00 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.8314 0.1686 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 439 121 318 60 0 2 3 56 0 0 318 0 0 0.4959 0.0000 0.0000 59.500 0.70 5.38 -4.67 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2064 0.6386 0.1549 1 1 0.2111 0.6286 0.1603 1 1 0.2170 0.6159 0.1671
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 512 157 355 146 3 3 0 5 0 0 353 0 2 0.9299 0.0000 0.0056 51.000 0.25 4.00 -3.75 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4940 0.5060 0.0000 0 0 0.9385 0.0615 0.0000
chr3 40462027 GTAC G 0.500000 0.100 1 -3 3 666 253 413 215 7 9 4 18 0 0 413 0 0 0.8498 0.0000 0.0000 26.444 4.52 3.00 1.52 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.2182 0.7818 0.0000
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 666 227 439 109 2 30 0 86 0 0 413 0 26 0.4802 0.0000 0.0592 6.567 1.02 11.05 -10.03 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1130 0.7480 0.1390 1 1 0.1207 0.7322 0.1472 1 1 0.1308 0.7114 0.1578
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 690 210 480 78 80 43 0 9 0 3 477 0 0 0.3714 0.0000 0.0063 3.884 0.29 3.00 -2.71 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1769 0.8231 0.0000 0 0 0.8847 0.1153 0.0000
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 690 211 479 88 1 41 6 75 0 0 476 2 1 0.4171 0.0000 0.0063 4.146 0.57 3.13 -2.57 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2357 0.6755 0.0888 1 1 0.2421 0.6631 0.0947 1 1 0.2499 0.6473 0.1028
chr3 42659294 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1025 222 803 112 1 5 1 103 0 1 802 0 0 0.5045 0.0000 0.0012 43.200 0.52 3.40 -2.88 64 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3073 0.6518 0.0409 1 1 0.3147 0.6400 0.0453 1 1 0.3232 0.6252 0.0515
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 891 250 641 0 0 22 3 225 0 0 636 0 5 0.0000 0.0000 0.0078 10.364 2.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 298 120 178 0 0 3 0 117 0 0 178 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 39.000 4.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr3 46709583 T TAAG 0.500000 0.100 1 3 1 598 163 435 1 126 25 1 10 0 3 432 0 0 0.0061 0.0000 0.0069 5.520 3.00 3.20 -0.20 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0095 0.9905 0.0000 0 1 0.3839 0.6161 0.0000
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 598 164 434 12 1 22 16 113 0 0 430 1 3 0.0732 0.0000 0.0092 6.455 2.92 3.35 -0.43 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.8092 0.1908
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 368 85 283 0 0 16 67 2 0 0 280 3 0 0.0000 0.0000 0.0106 4.600 4.00 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0243 0.9757 2 2 0.0000 0.0262 0.9738 2 2 0.0000 0.0290 0.9710
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 368 85 283 0 0 17 1 67 0 0 280 0 3 0.0000 0.0000 0.0106 4.000 5.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0263 0.9737 2 2 0.0000 0.0282 0.9718 2 2 0.0000 0.0311 0.9689
chr3 51993837 TCCTTGGCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -12 1 421 117 304 66 0 18 0 33 0 0 301 0 3 0.5641 0.0000 0.0099 5.500 0.09 10.09 -10.00 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8557 0.1421 0.0022 1 0 0.8455 0.1518 0.0027 1 0 0.8308 0.1656 0.0036
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 182 101 81 85 2 6 0 8 0 0 81 0 0 0.8416 0.0000 0.0000 15.833 0.22 8.00 -7.78 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0152 0.9848 0.0000 0 1 0.2864 0.7136 0.0000
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 215 89 126 0 0 6 79 4 0 0 123 3 0 0.0000 0.0000 0.0238 13.667 3.25 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0138 0.9862 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0170 0.9830
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 217 88 129 0 0 5 3 80 0 0 126 0 3 0.0000 0.0000 0.0233 16.600 3.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0124 0.9876 2 2 0.0000 0.0136 0.9864 2 2 0.0000 0.0153 0.9847
chr3 63912684 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 3 253 65 188 32 1 11 1 20 0 0 186 0 2 0.4923 0.0000 0.0106 4.909 0.81 3.55 -2.74 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4731 0.4618 0.0651 1 0 0.4668 0.4638 0.0693 1 1 0.4582 0.4665 0.0753
chr3 63912684 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 3 253 65 188 33 0 27 0 5 0 0 187 1 0 0.5077 0.0000 0.0053 1.462 0.88 6.00 -5.12 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 1 0.0197 0.9803 0.0000 0 1 0.1368 0.8632 0.0000
chr3 65439885 T TCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 308 148 160 62 1 17 0 68 1 0 156 0 3 0.4189 0.0063 0.0250 7.647 0.23 5.46 -5.23 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0760 0.6038 0.3202 1 1 0.0811 0.5959 0.3231 1 1 0.0880 0.5859 0.3261
chr3 73062330 C CA 0.500000 0.100 1 1 5 506 114 392 105 0 4 0 5 0 0 392 0 0 0.9211 0.0000 0.0000 27.500 0.63 1.00 -0.37 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.4856 0.5144 0.0000 0 0 0.8692 0.1308 0.0000
chr3 98087856 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 623 153 470 69 1 12 6 65 0 0 468 0 2 0.4510 0.0000 0.0043 11.667 0.97 1.09 -0.12 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1312 0.6603 0.2086 1 1 0.1371 0.6489 0.2141 1 1 0.1448 0.6343 0.2209
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 915 204 711 193 1 4 0 6 0 0 711 0 0 0.9461 0.0000 0.0000 50.000 0.23 2.00 -1.77 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0341 0.9659 0.0000 0 0 0.9650 0.0350 0.0000 0 0 0.9962 0.0038 0.0000
chr3 108757146 G GGGGGATTA 0.500000 0.100 1 8 2 237 96 141 85 0 8 0 3 0 0 141 0 0 0.8854 0.0000 0.0000 11.000 0.67 5.67 -5.00 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0903 0.9097 0.0000 0 0 0.7419 0.2581 0.0000 0 0 0.9003 0.0997 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 111 48 63 23 2 3 2 18 0 0 63 0 0 0.4792 0.0000 0.0000 14.333 0.13 1.06 -0.93 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3463 0.5244 0.1293 1 1 0.3441 0.5224 0.1335 1 1 0.3409 0.5200 0.1390
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 427 129 298 116 0 2 0 11 0 0 298 0 0 0.8992 0.0000 0.0000 63.500 0.13 1.18 -1.05 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.1933 0.8067 0.0000
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1088 264 824 1 0 66 92 105 0 0 822 1 1 0.0038 0.0000 0.0024 2.970 1.00 3.47 -2.47 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1103 272 831 108 4 49 1 110 0 0 829 0 2 0.3971 0.0000 0.0024 4.551 2.53 8.02 -5.49 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1091 0.7487 0.1423 1 1 0.1166 0.7328 0.1506 1 1 0.1267 0.7120 0.1613
chr3 121677324 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 262 99 163 94 0 0 0 5 0 0 163 0 0 0.9495 0.0000 0.0000 99.000 0.15 3.00 -2.85 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.3478 0.6522 0.0000 0 0 0.7945 0.2055 0.0000
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 559 174 385 90 0 2 0 82 0 0 382 0 3 0.5172 0.0000 0.0078 86.000 0.16 3.17 -3.02 62 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2355 0.6770 0.0874 1 1 0.2421 0.6646 0.0933 1 1 0.2500 0.6487 0.1014
chr3 124927858 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 3 450 128 322 73 0 2 0 53 0 0 320 0 2 0.5703 0.0000 0.0062 63.000 0.21 3.32 -3.12 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6037 0.3793 0.0170 1 0 0.5973 0.3834 0.0193 1 0 0.5879 0.3893 0.0228
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 687 137 550 96 0 33 0 8 0 0 550 0 0 0.7007 0.0000 0.0000 3.152 1.06 8.50 -7.44 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0236 0.9764 0.0000 0 1 0.3832 0.6168 0.0000
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 195 100 95 49 0 0 0 51 0 0 95 0 0 0.4900 0.0000 0.0000 100.000 0.67 2.08 -1.40 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1546 0.6156 0.2298 1 1 0.1595 0.6071 0.2334 1 1 0.1658 0.5964 0.2378
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 362 136 226 118 0 4 0 14 0 0 226 0 0 0.8676 0.0000 0.0000 33.000 1.53 1.93 -0.39 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0374 0.9626 0.0000
chr3 140566154 AGAGGAG A 0.500000 0.100 1 -6 2 240 104 136 61 0 7 0 36 0 0 135 0 1 0.5865 0.0000 0.0074 13.857 0.11 6.33 -6.22 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7644 0.2291 0.0066 1 0 0.7535 0.2387 0.0078 1 0 0.7382 0.2521 0.0097
chr3 149520808 C CTTAA 0.500000 0.100 1 4 1 229 71 158 44 0 1 0 26 0 0 155 0 3 0.6197 0.0000 0.0190 70.000 0.11 3.65 -3.54 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5889 0.3809 0.0301 1 0 0.5800 0.3867 0.0333 1 0 0.5676 0.3945 0.0379
chr3 150703735 A ACCTCCTCCT 0.500000 0.100 1 9 2 423 80 343 9 3 21 8 39 0 0 341 0 2 0.1125 0.0000 0.0058 2.800 1.67 7.00 -5.33 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9842 0.0158 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.9855 0.0145
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 264 93 171 51 0 0 0 42 0 0 171 0 0 0.5484 0.0000 0.0000 93.000 0.33 1.14 -0.81 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4063 0.5254 0.0683 1 1 0.4043 0.5229 0.0728 1 1 0.4011 0.5198 0.0791
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 352 134 218 56 0 11 6 61 0 0 218 0 0 0.4179 0.0000 0.0000 11.182 0.20 3.11 -2.92 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0483 0.5249 0.4267 1 1 0.0524 0.5218 0.4257 1 1 0.0583 0.5182 0.4235
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 591 173 418 26 0 18 2 127 0 0 410 0 8 0.1503 0.0000 0.0191 8.611 0.42 2.94 -2.52 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 185480514 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 362 96 266 55 0 2 0 39 0 0 266 0 0 0.5729 0.0000 0.0000 47.000 0.22 3.18 -2.96 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5913 0.3839 0.0248 1 0 0.5834 0.3890 0.0277 1 0 0.5723 0.3959 0.0319
chr3 195721040 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 324 179 145 167 0 5 0 7 0 0 145 0 0 0.9330 0.0000 0.0000 34.800 0.34 3.43 -3.09 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.7084 0.2916 0.0000 0 0 0.9737 0.0263 0.0000
chr3 195785502 G GGAT 0.500000 0.100 1 3 1 3281 474 2807 8 0 29 20 417 203 85 2517 2 0 0.0169 0.0723 0.1033 16.407 6.38 6.62 -0.24 6 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 786 179 607 0 0 17 0 162 0 0 572 0 35 0.0000 0.0000 0.0577 9.529 11.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 198153257 CTGGCAGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -12 2 264 112 152 64 28 5 1 14 0 0 150 0 2 0.5714 0.0000 0.0132 21.400 0.47 10.43 -9.96 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 263 108 155 37 0 28 1 42 0 0 153 1 1 0.3426 0.0000 0.0129 2.857 0.32 7.38 -7.06 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0808 0.5298 0.3894 1 1 0.0854 0.5271 0.3875 1 1 0.0918 0.5239 0.3844
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 263 108 155 44 0 21 29 14 0 0 150 2 3 0.4074 0.0000 0.0323 4.143 0.59 10.43 -9.84 16 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1314 0.5944 0.2741 1 1 0.1363 0.5874 0.2763 1 1 0.1427 0.5785 0.2787
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 533 97 436 0 0 2 1 94 0 0 369 1 66 0.0000 0.0000 0.1537 47.500 13.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 3074923 AGC A 0.021170 0.100 1 -2 1 668 252 416 56 23 22 148 3 1 5 409 1 0 0.2222 0.0024 0.0168 14.467 9.36 10.67 -1.31 28 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0001 0.1909 0.8090 1 2 0.0002 0.2179 0.7819 1 2 0.0003 0.2583 0.7414
chr4 3074926 AG A 0.010091 0.100 1 -1 1 668 252 416 59 24 87 78 4 2 7 407 0 0 0.2341 0.0048 0.0216 7.105 9.34 13.00 -3.66 29 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1359 0.8527 0.0114 1 1 0.1479 0.8407 0.0115 1 1 0.1645 0.8241 0.0115
chr4 3074945 A ACCGCCGCCG 0.064236 0.100 1 9 2 669 235 434 1 0 25 6 203 2 0 423 4 5 0.0043 0.0046 0.0253 8.320 2.00 9.63 -7.63 1 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1376 0.8624 2 2 0.0000 0.0066 0.9934 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 612 159 453 89 1 15 0 54 0 0 449 0 4 0.5597 0.0000 0.0088 9.600 0.55 11.46 -10.91 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9147 0.0851 0.0001 1 0 0.9093 0.0906 0.0002 1 0 0.9013 0.0985 0.0002
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 690 209 481 104 1 15 1 88 1 0 470 1 9 0.4976 0.0021 0.0229 13.786 1.25 7.89 -6.64 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2463 0.6889 0.0648 1 1 0.2540 0.6756 0.0704 1 1 0.2633 0.6586 0.0781
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 690 237 453 105 2 49 2 79 1 0 444 0 8 0.4430 0.0022 0.0199 3.917 1.30 7.20 -5.90 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5397 0.4469 0.0134 1 0 0.5390 0.4456 0.0154 1 0 0.5367 0.4447 0.0186
chr4 44447936 G GCCA 0.500000 0.100 1 3 2 647 176 471 74 3 14 7 78 0 0 471 0 0 0.4205 0.0000 0.0000 11.357 2.05 4.15 -2.10 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0674 0.6287 0.3038 1 1 0.0725 0.6190 0.3084 1 1 0.0796 0.6068 0.3136
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 664 158 506 140 0 10 0 8 0 0 503 0 3 0.8861 0.0000 0.0059 14.800 0.24 10.62 -10.38 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0089 0.9911 0.0000 0 1 0.4340 0.5660 0.0000
chr4 56448597 GGTACAGATAAAACAA G 0.500000 0.100 1 -15 2 351 115 236 90 0 19 0 6 0 0 236 0 0 0.7826 0.0000 0.0000 5.053 0.12 7.83 -7.71 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1309 0.8691 0.0000 0 0 0.6263 0.3737 0.0000
chr4 56931051 GGAGCTGTCTCCTCCCATGGAGGTGGTCCAGAAGGAGCCTGTTCAGATA G 0.500000 0.100 1 -48 1 960 252 708 113 2 83 5 49 0 0 708 0 0 0.4484 0.0000 0.0000 2.037 0.46 2.65 -2.19 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9897 0.0103 0.0000 1 0 0.9877 0.0123 0.0000 1 0 0.9846 0.0154 0.0000
chr4 68827423 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 422 188 234 102 0 5 2 79 0 0 234 0 0 0.5426 0.0000 0.0000 36.200 0.21 1.04 -0.83 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6238 0.3671 0.0090 1 0 0.6196 0.3699 0.0106 1 0 0.6128 0.3742 0.0130
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 1 1088 445 643 340 17 72 1 15 0 0 640 0 3 0.7640 0.0000 0.0047 5.167 0.38 3.40 -3.02 170 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1450 0.8550 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 170 75 95 70 1 2 0 2 0 0 95 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 36.000 0.26 1.00 -0.74 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3068 0.6932 0.0000 0 0 0.8044 0.1956 0.0000 0 0 0.8964 0.1036 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2677 547 2130 355 7 159 3 23 4 2 2111 5 8 0.6490 0.0019 0.0089 2.474 1.94 11.43 -9.49 145 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0035 0.9965 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 4371 1011 3360 7 19 65 19 901 34 69 3028 176 53 0.0069 0.0101 0.0988 16.351 2.71 9.43 -6.71 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 4499 1025 3474 417 16 164 8 420 31 90 3082 94 177 0.4068 0.0089 0.1128 5.286 4.64 11.31 -6.67 115 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0003 0.9997 1 2 0.0000 0.0003 0.9997 1 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr4 88008021 C CGAG 0.500000 0.100 1 3 2 487 94 393 48 0 8 0 38 0 1 391 0 1 0.5106 0.0000 0.0051 10.750 0.94 3.29 -2.35 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4345 0.5037 0.0618 1 1 0.4313 0.5026 0.0661 1 1 0.4265 0.5013 0.0722
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 683 180 503 163 0 7 0 10 0 0 503 0 0 0.9056 0.0000 0.0000 24.714 0.20 4.20 -4.00 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0754 0.9246 0.0000 0 0 0.8163 0.1837 0.0000
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.100 1 -18 1 207 109 98 96 0 8 0 5 0 0 98 0 0 0.8807 0.0000 0.0000 12.625 0.10 15.00 -14.90 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.3710 0.6290 0.0000 0 0 0.8099 0.1901 0.0000
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 484 185 299 1 0 19 7 158 0 0 296 0 3 0.0054 0.0000 0.0100 8.737 0.00 3.24 -3.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 464 166 298 18 2 36 4 106 1 0 290 3 4 0.1084 0.0034 0.0268 3.583 0.78 3.44 -2.67 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 283 105 178 0 0 16 0 89 0 0 173 0 5 0.0000 0.0000 0.0281 5.562 5.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0103 0.9897
chr4 184694537 ACAGATGAAG A 0.500000 0.100 1 -9 2 312 95 217 89 0 2 0 4 0 0 217 0 0 0.9368 0.0000 0.0000 46.500 0.46 11.00 -10.54 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0127 0.9873 0.0000 0 0 0.5464 0.4536 0.0000 0 0 0.8521 0.1479 0.0000
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.100 1 -12 4 255 108 147 53 0 4 1 50 0 0 145 0 2 0.4907 0.0000 0.0136 25.750 0.53 11.34 -10.81 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3322 0.6231 0.0447 1 1 0.3401 0.6140 0.0459 1 1 0.3502 0.6025 0.0473
chr5 733800 T TAA 0.007715 0.100 1 2 1 258 91 167 59 0 0 2 30 0 0 167 0 0 0.6484 0.0000 0.0000 91.000 1.32 5.10 -3.78 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9023 0.0977 0.0000 1 0 0.8959 0.1040 0.0000 1 0 0.8869 0.1131 0.0001
chr5 733804 CAT C 0.005230 0.100 1 -2 3 257 89 168 58 0 1 2 28 0 0 168 0 0 0.6517 0.0000 0.0000 88.000 1.36 5.46 -4.10 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9096 0.0904 0.0000 1 0 0.9033 0.0967 0.0000 1 0 0.8944 0.1056 0.0000
chr5 14488084 TGGAGCTCCATCC T 0.001036 0.100 1 -12 1 371 92 279 86 0 0 0 6 0 0 279 0 0 0.9348 0.0000 0.0000 92.000 0.31 8.17 -7.85 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1109 0.8891 0.0000 0 0 0.9917 0.0083 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr5 23527584 TGTCTGCAGGGAGTGTGGGCGGGGCTTTCGCAATAAGTCACACCTCCTCAGACACCAGAGGACACACACAGGGGAGAAGCCCTAC T 0.500000 0.100 1 -84 1 1233 344 889 143 27 45 24 105 73 23 777 15 1 0.4157 0.0821 0.1260 6.432 1.26 2.04 -0.78 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 783 180 603 95 0 22 5 58 0 0 598 1 4 0.5278 0.0000 0.0083 7.182 0.23 3.31 -3.08 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7632 0.2332 0.0036 1 0 0.7548 0.2408 0.0044 1 0 0.7427 0.2516 0.0057
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 348 57 291 0 1 32 2 22 0 1 277 4 9 0.0000 0.0000 0.0481 0.719 7.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6418 0.3582 2 2 0.0000 0.4083 0.5917 2 2 0.0000 0.3104 0.6896
chr5 66596939 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 485 176 309 153 0 10 0 13 2 1 306 0 0 0.8693 0.0065 0.0097 16.600 1.80 4.23 -2.43 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 1 0.3157 0.6843 0.0000
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 349 88 261 33 0 2 0 53 0 0 255 0 6 0.3750 0.0000 0.0230 43.000 0.30 5.30 -5.00 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0046 0.1918 0.8036 1 2 0.0056 0.2019 0.7925 1 2 0.0071 0.2162 0.7767
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 512 134 378 12 0 3 0 119 0 0 371 0 7 0.0896 0.0000 0.0185 43.667 0.08 3.10 -3.02 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.8303 0.1697
chr5 75635851 CCCAG C 0.500000 0.100 1 -4 1 330 108 222 105 0 2 0 1 0 0 221 0 1 0.9722 0.0000 0.0045 53.000 0.60 6.00 -5.40 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7123 0.2877 0.0000 0 0 0.9575 0.0425 0.0000 0 0 0.9784 0.0216 0.0000
chr5 75635856 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 329 107 222 104 1 1 0 1 0 0 221 0 1 0.9720 0.0000 0.0045 106.000 0.59 6.00 -5.41 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7165 0.2835 0.0000 0 0 0.9576 0.0424 0.0000 0 0 0.9784 0.0216 0.0000
chr5 77077768 A AGGCGTC 0.500000 0.100 1 6 3 391 114 277 93 1 13 0 7 0 0 277 0 0 0.8158 0.0000 0.0000 7.769 0.72 7.00 -6.28 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0596 0.9404 0.0000 0 0 0.5171 0.4829 0.0000
chr5 78015515 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 169 88 81 76 0 1 1 10 0 0 81 0 0 0.8636 0.0000 0.0000 86.000 0.09 3.00 -2.91 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.0516 0.9484 0.0000
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 367 91 276 70 2 5 0 14 0 0 276 0 0 0.7692 0.0000 0.0000 17.200 1.04 22.50 -21.46 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0041 0.9959 0.0000
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 365 82 283 68 0 3 0 11 0 0 282 0 1 0.8293 0.0000 0.0035 26.333 1.26 28.09 -26.83 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0121 0.9879 0.0000
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 241 94 147 42 0 2 0 50 0 0 145 0 2 0.4468 0.0000 0.0136 46.000 0.07 3.26 -3.19 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0595 0.5085 0.4320 1 1 0.0638 0.5069 0.4292 1 1 0.0699 0.5052 0.4249
chr5 112839053 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 788 167 621 96 1 3 1 66 0 0 619 0 2 0.5749 0.0000 0.0032 54.667 0.21 3.18 -2.97 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7779 0.2191 0.0030 1 0 0.7694 0.2269 0.0037 1 0 0.7572 0.2379 0.0048
chr5 113488342 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 222 79 143 34 32 5 0 8 0 0 143 0 0 0.4304 0.0000 0.0000 11.000 0.41 3.38 -2.96 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 1 0.1003 0.8997 0.0000
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 1186 268 918 121 2 30 0 115 3 1 907 1 6 0.4515 0.0033 0.0120 7.933 0.74 3.90 -3.17 43 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1832 0.7498 0.0670 1 1 0.1928 0.7339 0.0733 1 1 0.2051 0.7129 0.0820
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 639 142 497 70 0 3 0 69 0 0 497 0 0 0.4930 0.0000 0.0000 46.333 0.17 1.13 -0.96 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1852 0.6630 0.1519 1 1 0.1908 0.6514 0.1577 1 1 0.1980 0.6367 0.1653
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 523 149 374 57 0 28 1 63 0 0 368 0 6 0.3826 0.0000 0.0160 4.321 1.00 5.89 -4.89 21 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0361 0.4886 0.4753 1 1 0.0397 0.4874 0.4729 1 1 0.0449 0.4863 0.4688
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 298 75 223 63 1 6 0 5 0 0 223 0 0 0.8400 0.0000 0.0000 11.500 1.16 7.40 -6.24 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1102 0.8898 0.0000 0 1 0.4834 0.5166 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 167 61 106 7 0 0 0 54 0 0 102 0 4 0.1148 0.0000 0.0377 61.000 0.57 3.44 -2.87 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9896 0.0104 2 1 0.0000 0.8427 0.1573
chr5 139848487 CCCGGGT C 0.500000 0.100 1 -6 3 309 27 282 14 1 2 0 10 0 0 281 0 1 0.5185 0.0000 0.0035 12.500 1.43 5.80 -4.37 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3354 0.5127 0.1519 1 1 0.3329 0.5117 0.1554 1 1 0.3294 0.5105 0.1601
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 203 71 132 38 0 0 1 32 0 0 131 0 1 0.5352 0.0000 0.0076 71.000 0.08 3.66 -3.58 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2970 0.5687 0.1343 1 1 0.2977 0.5635 0.1388 1 1 0.2982 0.5570 0.1448
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 203 71 132 38 0 1 2 30 0 0 130 0 2 0.5352 0.0000 0.0152 70.000 0.08 3.87 -3.79 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2946 0.5695 0.1359 1 1 0.2954 0.5643 0.1404 1 1 0.2960 0.5577 0.1463
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 404 105 299 48 0 7 0 50 0 0 288 0 11 0.4571 0.0000 0.0368 14.000 0.35 10.40 -10.05 16 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0377 0.4665 0.4958 1 2 0.0413 0.4670 0.4917 1 2 0.0465 0.4680 0.4855
chr5 141945390 C CCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 12 1 404 105 299 48 0 7 0 50 0 0 288 0 11 0.4571 0.0000 0.0368 14.000 0.35 10.40 -10.05 16 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0377 0.4665 0.4958 1 2 0.0413 0.4670 0.4917 1 2 0.0465 0.4680 0.4855
chr5 146459072 TCAGGCCCAGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 911 297 614 148 1 51 1 96 0 0 614 0 0 0.4983 0.0000 0.0000 4.824 0.51 8.78 -8.27 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9626 0.0374 0.0000 1 0 0.9585 0.0415 0.0000 1 0 0.9522 0.0477 0.0001
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 360 132 228 38 2 25 0 67 0 0 225 0 3 0.2879 0.0000 0.0132 4.240 0.21 7.31 -7.10 6 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0021 0.1457 0.8522 1 2 0.0026 0.1552 0.8421 1 2 0.0035 0.1688 0.8276
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 12 1 360 132 228 39 1 29 0 63 0 0 225 1 2 0.2955 0.0000 0.0132 3.517 0.28 7.37 -7.08 7 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0042 0.1939 0.8019 1 2 0.0050 0.2037 0.7913 1 2 0.0064 0.2174 0.7761
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 1171 304 867 296 0 2 0 6 0 0 867 0 0 0.9737 0.0000 0.0000 151.000 0.39 4.17 -3.78 130 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8525 0.1475 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 1175 303 872 294 0 3 0 6 0 0 872 0 0 0.9703 0.0000 0.0000 100.000 0.38 4.17 -3.79 128 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8392 0.1608 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 585 165 420 75 0 7 0 83 0 0 419 0 1 0.4545 0.0000 0.0024 22.571 0.19 2.19 -2.01 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0568 0.6048 0.3384 1 1 0.0615 0.5964 0.3420 1 1 0.0682 0.5860 0.3458
chr5 153492228 T TC 0.500000 0.100 1 1 2 122 52 70 26 0 0 0 26 0 0 70 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 52.000 0.19 1.15 -0.96 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2183 0.5634 0.2183 1 1 0.2207 0.5586 0.2207 1 1 0.2237 0.5527 0.2237
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 347 137 210 122 0 4 0 11 0 0 209 0 1 0.8905 0.0000 0.0048 33.250 1.45 5.36 -3.91 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.1441 0.8559 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 349 122 227 2 44 5 0 71 0 0 225 0 2 0.0164 0.0000 0.0088 23.400 3.50 3.83 -0.33 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0026 0.1623 0.8351 1 2 0.0032 0.1719 0.8250 1 2 0.0042 0.1854 0.8104
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 199 82 117 67 4 4 0 7 0 0 117 0 0 0.8171 0.0000 0.0000 19.500 0.36 3.00 -2.64 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0197 0.9803 0.0000 0 1 0.2593 0.7407 0.0000
chr5 168454037 GGGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 198 82 116 70 7 1 0 4 0 0 116 0 0 0.8537 0.0000 0.0000 81.000 0.34 2.50 -2.16 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0069 0.9931 0.0000 0 1 0.3980 0.6020 0.0000 0 0 0.7629 0.2371 0.0000
chr5 176384091 CGT C 0.500000 0.100 1 -2 1 374 121 253 61 0 8 0 52 0 0 252 0 1 0.5041 0.0000 0.0040 14.125 0.33 2.13 -1.81 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3587 0.5678 0.0735 1 1 0.3594 0.5623 0.0783 1 1 0.3596 0.5555 0.0849
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 402 98 304 51 0 3 0 44 0 0 303 0 1 0.5204 0.0000 0.0033 31.667 1.71 4.91 -3.20 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3256 0.5753 0.0991 1 1 0.3264 0.5695 0.1040 1 1 0.3270 0.5623 0.1107
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 563 103 460 0 0 16 1 86 0 0 457 0 3 0.0000 0.0000 0.0065 5.438 2.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0101 0.9899 2 2 0.0000 0.0110 0.9890 2 2 0.0000 0.0125 0.9875
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 499 129 370 15 0 20 1 93 0 1 367 0 2 0.1163 0.0000 0.0081 5.450 0.60 3.23 -2.63 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9940 0.0060
chr6 10775442 CCTT C 0.000259 0.100 1 -3 1 206 100 106 88 0 6 0 6 0 0 106 0 0 0.8800 0.0000 0.0000 15.667 0.12 3.33 -3.21 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3563 0.6437 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr6 13615435 C CGGA 0.000044 0.100 1 3 1 421 113 308 58 0 14 0 41 0 0 305 0 3 0.5133 0.0000 0.0097 7.071 0.40 3.10 -2.70 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7083 0.2917 0.0000 1 0 0.7051 0.2949 0.0000 1 0 0.7003 0.2997 0.0000
chr6 16295186 A AC 0.000921 0.100 1 1 2 287 105 182 55 0 5 0 45 0 0 182 0 0 0.5238 0.0000 0.0000 20.000 0.29 1.22 -0.93 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6224 0.3775 0.0001 1 0 0.6221 0.3778 0.0001 1 0 0.6212 0.3787 0.0001
chr6 16327675 CTGA C 0.005412 0.100 1 -3 1 1692 443 1249 9 8 57 187 182 0 0 1239 1 9 0.0203 0.0000 0.0080 24.467 1.22 5.02 -3.80 9 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9717 0.0283 2 2 0.0000 0.1531 0.8469
chr6 16327687 C CTGA 0.001111 0.100 1 3 1 1684 435 1249 40 123 95 32 145 0 0 1247 1 1 0.0920 0.0000 0.0016 18.000 3.75 4.01 -0.26 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0011 0.9641 0.0349 1 1 0.0015 0.9660 0.0325 1 1 0.0023 0.9684 0.0294
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.100 1 2 1 1525 340 1185 182 0 6 1 151 0 0 1182 0 3 0.5353 0.0000 0.0025 55.667 0.15 2.10 -1.95 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7189 0.2808 0.0003 1 0 0.7232 0.2764 0.0004 1 0 0.7273 0.2722 0.0005
chr6 29397419 TG T 0.000417 0.100 1 -1 1 756 179 577 165 0 1 0 13 0 0 576 0 1 0.9218 0.0000 0.0017 178.000 0.75 2.54 -1.79 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7486 0.2514 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 1346 289 1057 145 0 13 0 131 0 0 1014 0 43 0.5017 0.0000 0.0407 21.231 0.25 12.05 -11.81 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0041 0.4871 0.5087 1 2 0.0052 0.4848 0.5100 1 2 0.0069 0.4833 0.5098
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 361 101 260 53 0 2 1 45 0 0 260 0 0 0.5248 0.0000 0.0000 49.500 0.11 1.56 -1.44 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3492 0.5644 0.0865 1 1 0.3494 0.5593 0.0913 1 1 0.3491 0.5529 0.0980
chr6 31027337 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 1359 319 1040 288 3 19 1 8 4 6 1030 0 0 0.9028 0.0038 0.0096 15.632 1.99 1.75 0.24 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0810 0.9190 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr6 31111540 CCCCCAGCTGCCTCCTGGATACCGATTAATATTT C 0.500000 0.100 1 -33 2 504 142 362 69 1 32 1 39 0 0 362 0 0 0.4859 0.0000 0.0000 3.438 0.20 5.41 -5.21 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8487 0.1491 0.0022 1 0 0.8386 0.1586 0.0028 1 0 0.8240 0.1723 0.0037
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 782 217 565 199 1 5 0 12 0 0 565 0 0 0.9171 0.0000 0.0000 42.200 1.28 3.50 -2.22 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0578 0.9422 0.0000 0 0 0.8806 0.1194 0.0000
chr6 31138080 AG A 0.500000 0.100 1 -1 4 459 134 325 126 0 2 0 6 0 0 325 0 0 0.9403 0.0000 0.0000 66.000 1.10 2.50 -1.40 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.4800 0.5200 0.0000 0 0 0.9062 0.0938 0.0000
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 528 140 388 125 0 7 0 8 0 1 387 0 0 0.8929 0.0000 0.0026 19.000 0.96 2.50 -1.54 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1013 0.8987 0.0000 0 0 0.7292 0.2708 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 622 183 439 0 61 2 2 118 0 0 436 2 1 0.0000 0.0000 0.0068 90.500 2.38 0 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0070 0.9930 1 2 0.0000 0.0085 0.9915 1 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr6 32223881 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 366 184 182 15 140 22 1 6 0 1 181 0 0 0.0815 0.0000 0.0055 8.100 1.13 4.00 -2.87 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 0 0.7587 0.2413 0.0000 0 0 0.9719 0.0281 0.0000
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 458 153 305 72 0 17 1 63 0 0 300 0 5 0.4706 0.0000 0.0164 8.438 0.64 5.40 -4.76 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2373 0.6504 0.1122 1 1 0.2424 0.6396 0.1180 1 1 0.2485 0.6259 0.1257
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 372 92 280 47 0 14 0 31 0 0 268 0 12 0.5109 0.0000 0.0429 5.571 0.43 15.45 -15.03 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2821 0.5902 0.1277 1 1 0.2840 0.5835 0.1325 1 1 0.2861 0.5750 0.1390
chr6 36722044 C CGGGCCCAGCGGTGCAGGA 0.500000 0.100 1 18 2 643 145 498 118 0 22 0 5 0 0 495 0 3 0.8138 0.0000 0.0060 5.591 1.05 7.80 -6.75 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0676 0.9324 0.0000 0 0 0.6437 0.3563 0.0000
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 815 239 576 125 0 10 5 99 0 0 575 0 1 0.5230 0.0000 0.0017 22.800 0.29 1.34 -1.06 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5583 0.4327 0.0089 1 0 0.5586 0.4309 0.0105 1 0 0.5576 0.4295 0.0129
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 1044 276 768 119 2 6 0 149 0 0 764 0 4 0.4312 0.0000 0.0052 44.833 0.27 3.23 -2.97 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0013 0.2389 0.7598 1 2 0.0016 0.2428 0.7556 1 2 0.0022 0.2491 0.7487
chr6 42236367 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 3 311 126 185 99 5 16 0 6 0 0 185 0 0 0.7857 0.0000 0.0000 6.875 0.07 2.83 -2.76 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2331 0.7669 0.0000 0 0 0.7679 0.2321 0.0000
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 351 125 226 9 0 21 0 95 0 0 220 1 5 0.0720 0.0000 0.0265 4.952 0.67 6.56 -5.89 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9894 0.0106 2 1 0.0000 0.7059 0.2941
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 797 172 625 84 0 21 1 66 0 0 624 0 1 0.4884 0.0000 0.0016 7.190 0.39 3.32 -2.93 26 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5224 0.4553 0.0223 1 0 0.5198 0.4551 0.0251 1 0 0.5154 0.4554 0.0292
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 816 169 647 2 0 89 0 78 0 0 616 0 31 0.0118 0.0000 0.0479 0.899 15.00 6.62 8.38 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2469 0.7531 2 2 0.0000 0.0350 0.9650 2 2 0.0000 0.0179 0.9821
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 644 135 509 64 5 25 1 40 0 0 497 1 11 0.4741 0.0000 0.0236 4.360 1.78 5.75 -3.97 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5605 0.4161 0.0235 1 0 0.5550 0.4188 0.0263 1 0 0.5469 0.4227 0.0304
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 1637 405 1232 300 2 22 1 80 2 1 1224 1 4 0.7407 0.0016 0.0065 18.143 1.37 6.40 -5.03 16 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 577 107 470 62 0 6 0 39 0 0 465 0 5 0.5794 0.0000 0.0106 16.833 0.29 3.18 -2.89 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6277 0.3546 0.0177 1 0 0.6195 0.3605 0.0201 1 0 0.6078 0.3686 0.0236
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 789 166 623 11 0 4 1 150 0 0 616 0 7 0.0663 0.0000 0.0112 40.500 0.27 3.09 -2.82 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9786 0.0214 2 2 0.0000 0.3530 0.6470
chr6 116437084 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 5 665 142 523 131 0 4 0 7 0 0 523 0 0 0.9225 0.0000 0.0000 34.500 0.36 3.14 -2.78 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2870 0.7130 0.0000 0 0 0.8658 0.1342 0.0000
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 641 151 490 140 0 1 0 10 0 0 490 0 0 0.9272 0.0000 0.0000 150.000 0.22 6.90 -6.68 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0252 0.9748 0.0000 0 0 0.5928 0.4072 0.0000
chr6 117563254 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 3 175 80 95 52 0 2 0 26 0 0 92 0 3 0.6500 0.0000 0.0316 39.000 0.02 3.15 -3.13 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7605 0.2315 0.0080 1 0 0.7490 0.2416 0.0094 1 0 0.7328 0.2556 0.0115
chr6 151349194 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 745 172 573 165 1 2 0 4 0 0 573 0 0 0.9593 0.0000 0.0000 85.000 0.30 1.75 -1.45 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3968 0.6032 0.0000 0 0 0.9826 0.0174 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 959 235 724 18 0 11 0 206 0 0 720 0 4 0.0766 0.0000 0.0055 20.364 0.17 2.91 -2.75 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.7961 0.2039
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 178 85 93 76 0 2 0 7 0 0 93 0 0 0.8941 0.0000 0.0000 41.500 0.18 4.14 -3.96 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0252 0.9748 0.0000 0 1 0.3090 0.6910 0.0000
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 614 236 378 92 0 45 0 99 0 1 367 1 9 0.3898 0.0000 0.0291 4.244 0.37 14.07 -13.70 16 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0195 0.5138 0.4667 1 1 0.0221 0.5090 0.4688 1 1 0.0261 0.5037 0.4702
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 219 85 134 0 0 5 0 80 0 0 132 0 2 0.0000 0.0000 0.0149 16.000 8.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0184 0.9816
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 344 136 208 0 0 11 13 112 0 0 198 4 6 0.0000 0.0000 0.0481 11.364 3.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 635 138 497 66 0 31 0 41 1 0 490 0 6 0.4783 0.0020 0.0141 3.452 0.89 9.98 -9.08 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6692 0.3185 0.0124 1 0 0.6603 0.3254 0.0143 1 0 0.6478 0.3350 0.0171
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 954 299 655 9 2 13 133 142 0 0 655 0 0 0.0301 0.0000 0.0000 15.333 7.44 10.11 -2.66 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 2 0.0000 0.0854 0.9146 2 2 0.0000 0.0028 0.9972
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 954 283 671 103 15 12 40 113 0 0 671 0 0 0.3640 0.0000 0.0000 22.417 3.28 11.39 -8.11 55 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0011 0.2148 0.7841 1 2 0.0014 0.2196 0.7790 1 2 0.0019 0.2270 0.7710
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 954 286 668 107 16 32 84 47 0 0 668 0 0 0.3741 0.0000 0.0000 79.000 3.29 7.49 -4.20 59 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0364 0.6727 0.2909 1 1 0.0406 0.6596 0.2998 1 1 0.0467 0.6429 0.3104
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 268 97 171 86 0 3 0 8 0 0 171 0 0 0.8866 0.0000 0.0000 31.333 0.13 4.62 -4.50 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0145 0.9855 0.0000 0 1 0.2769 0.7231 0.0000
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 261 98 163 34 0 25 1 38 0 2 160 0 1 0.3469 0.0000 0.0184 3.042 4.12 3.58 0.54 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1387 0.5767 0.2846 1 1 0.1432 0.5710 0.2858 1 1 0.1492 0.5637 0.2871
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 262 100 162 44 2 19 0 35 0 0 160 0 2 0.4400 0.0000 0.0123 4.263 3.09 4.06 -0.97 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4144 0.5147 0.0709 1 1 0.4116 0.5129 0.0754 1 1 0.4074 0.5109 0.0817
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 725 171 554 107 0 5 0 59 0 0 550 0 4 0.6257 0.0000 0.0072 33.200 0.30 11.59 -11.29 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9444 0.0555 0.0002 1 0 0.9385 0.0613 0.0002 1 0 0.9297 0.0700 0.0003
chr7 5313004 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 714 80 634 52 4 21 1 2 1 0 633 0 0 0.6500 0.0016 0.0016 2.810 1.85 4.50 -2.65 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0273 0.9727 0.0000 0 1 0.4226 0.5774 0.0000 0 0 0.7011 0.2989 0.0000
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 660 221 439 1 1 34 11 174 0 0 439 0 0 0.0045 0.0000 0.0000 5.667 0.00 3.20 -3.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0049 0.9951 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 351 113 238 65 0 5 0 43 0 0 238 0 0 0.5752 0.0000 0.0000 21.600 0.28 3.09 -2.82 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7161 0.2748 0.0091 1 0 0.7061 0.2832 0.0107 1 0 0.6921 0.2949 0.0131
chr7 26152597 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 349 106 243 51 0 13 0 42 0 0 243 0 0 0.4811 0.0000 0.0000 7.154 0.43 3.45 -3.02 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4063 0.5255 0.0682 1 1 0.4043 0.5229 0.0728 1 1 0.4011 0.5198 0.0790
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 106 45 61 39 1 1 0 4 0 0 61 0 0 0.8667 0.0000 0.0000 43.000 0.51 1.25 -0.74 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.0968 0.9032 0.0000 0 1 0.3498 0.6502 0.0000
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 530 149 381 80 0 2 0 67 0 0 381 0 0 0.5369 0.0000 0.0000 73.500 0.29 1.09 -0.80 54 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4525 0.5131 0.0344 1 1 0.4520 0.5100 0.0380 1 1 0.4503 0.5066 0.0431
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 162 53 109 50 0 1 0 2 0 0 109 0 0 0.9434 0.0000 0.0000 52.000 0.08 3.50 -3.42 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1305 0.8695 0.0000 0 0 0.5910 0.4090 0.0000 0 0 0.7582 0.2418 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 208 82 126 11 0 4 1 66 0 0 126 0 0 0.1341 0.0000 0.0000 19.500 0.18 3.33 -3.15 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9783 0.0217
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 941 199 742 89 1 14 3 92 1 0 731 4 6 0.4472 0.0013 0.0148 13.214 0.54 4.92 -4.38 55 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0301 0.5694 0.4006 1 1 0.0335 0.5621 0.4044 1 1 0.0386 0.5533 0.4081
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.100 1 2 1 934 195 739 89 4 12 3 87 1 2 730 1 5 0.4564 0.0014 0.0122 15.000 0.55 5.11 -4.56 55 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1097 0.7104 0.1799 1 1 0.1164 0.6962 0.1873 1 1 0.1254 0.6779 0.1967
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 444 124 320 64 0 1 0 59 0 0 320 0 0 0.5161 0.0000 0.0000 123.000 3.09 1.83 1.26 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2779 0.6190 0.1031 1 1 0.2813 0.6102 0.1085 1 1 0.2852 0.5991 0.1157
chr7 80664497 G GGTAA 0.500000 0.100 1 4 4 226 102 124 51 0 14 1 36 0 0 124 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 6.286 0.08 4.03 -3.95 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5462 0.4198 0.0340 1 0 0.5393 0.4233 0.0374 1 0 0.5296 0.4281 0.0423
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 872 220 652 0 0 14 0 206 0 0 648 0 4 0.0000 0.0000 0.0061 14.714 3.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 605 147 458 113 1 15 0 18 0 1 456 0 1 0.7687 0.0000 0.0044 8.800 0.97 3.00 -2.03 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 266 90 176 7 0 2 0 81 0 0 172 0 4 0.0778 0.0000 0.0227 44.000 0.14 3.37 -3.23 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9611 0.0389 2 1 0.0000 0.5910 0.4090
chr7 99836454 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 158 63 95 58 0 1 0 4 0 0 95 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 62.000 0.14 1.25 -1.11 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.2044 0.7956 0.0000 0 0 0.5617 0.4383 0.0000
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 831 254 577 240 0 7 0 7 1 0 576 0 0 0.9449 0.0017 0.0017 35.286 0.22 4.14 -3.93 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0365 0.9635 0.0000 0 0 0.9899 0.0101 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 172 63 109 49 0 0 0 14 0 0 105 0 4 0.7778 0.0000 0.0367 63.000 0.20 27.57 -27.37 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8844 0.1137 0.0019 1 0 0.8735 0.1241 0.0024 1 0 0.8340 0.1629 0.0031
chr7 102541593 G GA 0.500000 0.100 1 1 2 983 362 621 323 1 1 0 37 0 0 621 0 0 0.8923 0.0000 0.0000 361.000 0.27 1.84 -1.57 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 488 129 359 5 1 36 5 82 0 0 353 1 5 0.0388 0.0000 0.0167 2.583 4.60 6.54 -1.94 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8412 0.1588 2 2 0.0000 0.3345 0.6655
chr7 103989356 T TGCCGCCGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 15 1 488 129 359 39 37 37 2 14 0 1 353 2 3 0.3023 0.0000 0.0167 2.432 6.67 4.64 2.02 11 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8674 0.1326 0.0000 0 1 0.0922 0.9078 0.0000 0 1 0.0022 0.9978 0.0000
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 776 197 579 175 1 11 0 10 0 0 579 0 0 0.8883 0.0000 0.0000 16.909 0.64 3.80 -3.16 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1347 0.8653 0.0000 0 0 0.8926 0.1074 0.0000
chr7 124032402 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 747 200 547 90 1 22 72 15 0 0 544 3 0 0.4500 0.0000 0.0055 7.909 0.31 3.40 -3.09 14 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1823 0.7009 0.1167 1 1 0.1894 0.6872 0.1234 1 1 0.1983 0.6696 0.1321
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 748 202 546 93 0 37 0 72 0 0 543 0 3 0.4604 0.0000 0.0055 4.583 0.31 6.42 -6.10 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5680 0.4172 0.0147 1 0 0.5648 0.4183 0.0169 1 0 0.5595 0.4204 0.0201
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 624 185 439 9 0 36 0 140 0 0 439 0 0 0.0486 0.0000 0.0000 4.139 1.56 16.66 -15.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9301 0.0699 2 2 0.0000 0.2655 0.7345
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -12 1 284 131 153 0 0 18 0 113 0 0 146 0 7 0.0000 0.0000 0.0458 6.278 10.66 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 224 63 161 0 0 1 0 62 0 0 155 0 6 0.0000 0.0000 0.0373 62.000 3.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0303 0.9697 2 2 0.0000 0.0324 0.9676 2 2 0.0000 0.0356 0.9644
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 918 272 646 106 28 47 2 89 0 0 645 0 1 0.3897 0.0000 0.0015 4.787 0.51 3.07 -2.56 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9146 0.0852 0.0002 1 0 0.9083 0.0914 0.0003 1 0 0.8989 0.1007 0.0005
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 918 273 645 194 5 44 1 29 0 0 645 0 0 0.7106 0.0000 0.0000 5.205 1.62 3.28 -1.65 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 2035 467 1568 0 0 19 1 447 0 0 1565 0 3 0.0000 0.0000 0.0019 23.526 1.59 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 628 146 482 24 0 1 0 121 0 0 479 0 3 0.1644 0.0000 0.0062 145.000 0.75 3.93 -3.18 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr7 144187108 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 644 171 473 159 1 6 0 5 0 0 473 0 0 0.9298 0.0000 0.0000 27.333 0.31 1.40 -1.09 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0522 0.9478 0.0000 0 0 0.9354 0.0646 0.0000 0 0 0.9896 0.0104 0.0000
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.100 1 -4 1 729 422 307 297 1 6 0 118 0 0 306 0 1 0.7038 0.0000 0.0033 69.333 1.09 4.56 -3.47 79 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr7 149779543 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 469 115 354 106 0 2 0 7 0 0 354 0 0 0.9217 0.0000 0.0000 56.500 0.39 2.57 -2.18 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1040 0.8960 0.0000 0 0 0.6576 0.3424 0.0000
chr7 149791914 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 904 222 682 195 0 10 0 17 0 0 682 0 0 0.8784 0.0000 0.0000 21.200 0.47 1.06 -0.59 89 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1935 0.8065 0.0000
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 201 55 146 2 0 2 0 51 0 0 145 0 1 0.0364 0.0000 0.0068 26.500 0.50 4.82 -4.32 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8575 0.1425 2 2 0.0000 0.3852 0.6148 2 2 0.0000 0.2245 0.7755
chr7 149815757 G GAGGTGGTC 0.500000 0.100 1 8 1 692 214 478 186 2 14 0 12 0 0 477 0 1 0.8692 0.0000 0.0021 14.214 1.01 7.58 -6.57 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0114 0.9886 0.0000 0 0 0.6835 0.3165 0.0000
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 770 199 571 171 0 3 0 25 1 0 570 0 0 0.8593 0.0018 0.0018 65.333 0.79 1.20 -0.41 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 437 109 328 98 0 3 0 8 0 0 327 0 1 0.8991 0.0000 0.0030 35.333 1.18 1.00 0.18 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0093 0.9907 0.0000 0 1 0.2658 0.7342 0.0000
chr7 149821443 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 642 169 473 97 1 0 0 71 0 0 472 0 1 0.5740 0.0000 0.0021 169.000 0.81 1.70 -0.89 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7376 0.2582 0.0043 1 0 0.7299 0.2650 0.0052 1 0 0.7186 0.2748 0.0066
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 688 170 518 84 0 9 0 77 0 0 507 0 11 0.4941 0.0000 0.0212 17.889 0.45 11.74 -11.29 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0988 0.6829 0.2183 1 1 0.1050 0.6701 0.2249 1 1 0.1132 0.6538 0.2330
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 564 115 449 0 0 0 20 95 0 1 412 14 22 0.0000 0.0000 0.0824 115.000 7.68 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 571 113 458 0 0 2 17 94 0 0 416 17 25 0.0000 0.0000 0.0917 106.000 7.71 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 591 113 478 0 2 7 5 99 0 2 400 35 41 0.0000 0.0000 0.1632 20.600 7.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 594 187 407 105 0 1 0 81 1 0 405 1 0 0.5615 0.0025 0.0049 186.000 0.38 1.16 -0.78 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6784 0.3158 0.0058 1 0 0.6728 0.3202 0.0069 1 0 0.6643 0.3269 0.0087
chr7 154968830 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 1501 384 1117 170 3 56 1 154 1 0 1101 3 12 0.4427 0.0009 0.0143 5.857 0.53 3.26 -2.73 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1191 0.8310 0.0500 1 1 0.1302 0.8133 0.0565 1 1 0.1451 0.7892 0.0658
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 742 184 558 69 0 30 0 85 0 0 557 0 1 0.3750 0.0000 0.0018 5.133 0.78 6.09 -5.31 17 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0164 0.4151 0.5684 1 2 0.0186 0.4160 0.5653 1 2 0.0219 0.4179 0.5602
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.100 1 -6 2 698 176 522 133 3 34 0 6 0 0 522 0 0 0.7557 0.0000 0.0000 4.147 0.26 5.67 -5.41 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 0 0.6232 0.3768 0.0000 0 0 0.9452 0.0548 0.0000
chr8 10608190 CTTCCTCTTCTGCCTCCTGGGACTCTATAACTTCTGACTCTGGCTGGGT C 0.002031 0.100 1 -48 3 1017 285 732 214 8 35 2 26 6 5 704 14 3 0.7509 0.0082 0.0383 7.576 2.93 4.35 -1.42 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 585 254 331 0 0 28 0 226 0 0 331 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.071 5.76 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 335 119 216 4 0 4 0 111 0 0 211 0 5 0.0336 0.0000 0.0231 28.750 0.00 7.17 -7.17 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9875 0.0125 2 2 0.0000 0.4636 0.5364 2 2 0.0000 0.1581 0.8419
chr8 38268959 G GTCTC 0.000252 0.100 1 4 1 441 122 319 106 1 9 0 6 0 0 319 0 0 0.8689 0.0000 0.0000 12.556 0.41 5.00 -4.59 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5995 0.4005 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr8 61676164 T TTTC 0.000496 0.100 1 3 1 292 106 186 88 2 11 0 5 0 0 186 0 0 0.8302 0.0000 0.0000 8.636 0.11 3.40 -3.29 34 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7477 0.2523 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr8 68331068 TCCGGCTCTCAGCGC T 0.013267 0.100 1 -14 2 355 112 243 69 0 2 0 41 0 0 241 0 2 0.6161 0.0000 0.0082 55.000 0.36 12.54 -12.17 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8823 0.1177 0.0001 1 0 0.8761 0.1238 0.0001 1 0 0.8672 0.1327 0.0001
chr8 79766258 AGGCATGT A 0.500000 0.100 1 -7 1 338 81 257 46 0 3 0 32 0 0 255 0 2 0.5679 0.0000 0.0078 26.000 0.15 6.62 -6.47 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5015 0.4520 0.0465 1 0 0.4956 0.4540 0.0503 1 0 0.4873 0.4568 0.0559
chr8 93728272 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 95 40 55 23 0 3 0 14 0 0 55 0 0 0.5750 0.0000 0.0000 12.333 0.04 2.64 -2.60 13 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4650 0.4569 0.0781 1 1 0.4580 0.4595 0.0824 1 1 0.4486 0.4630 0.0884
chr8 97775937 C CGGCGGGCTCCAGGCGA 0.500000 0.100 1 16 1 248 90 158 77 0 7 0 6 0 0 158 0 0 0.8556 0.0000 0.0000 11.857 0.45 11.17 -10.71 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0730 0.9270 0.0000 0 1 0.4715 0.5285 0.0000
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 295 64 231 38 0 0 0 26 0 0 229 0 2 0.5938 0.0000 0.0087 64.000 0.34 2.23 -1.89 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4622 0.4742 0.0637 1 1 0.4568 0.4752 0.0679 1 1 0.4494 0.4767 0.0739
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 644 221 423 122 3 10 1 85 0 0 423 0 0 0.5520 0.0000 0.0000 21.000 2.61 20.18 -17.57 30 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8907 0.1089 0.0004 1 0 0.8836 0.1159 0.0006 1 0 0.8731 0.1261 0.0008
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 295 99 196 92 0 4 0 3 0 0 196 0 0 0.9293 0.0000 0.0000 23.750 0.35 4.00 -3.65 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1215 0.8785 0.0000 0 0 0.8023 0.1977 0.0000 0 0 0.9268 0.0732 0.0000
chr8 120811835 T TACCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 401 112 289 96 0 6 0 10 0 0 289 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 17.667 0.66 3.20 -2.54 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.1468 0.8532 0.0000
chr8 123369918 T TTCATCA 0.500000 0.100 1 6 1 344 104 240 34 0 13 0 57 0 0 240 0 0 0.3269 0.0000 0.0000 7.000 1.00 4.96 -3.96 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0077 0.2385 0.7538 1 2 0.0091 0.2482 0.7427 1 2 0.0112 0.2617 0.7271
chr8 133238956 C CCCCTCGCTGGTGTGCGAGCGGCTGCGGGTG 0.500000 0.100 1 30 5 1100 222 878 84 1 98 3 36 0 0 865 0 13 0.3784 0.0000 0.0148 1.245 0.43 2.69 -2.27 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8705 0.1282 0.0012 1 0 0.8615 0.1370 0.0016 1 0 0.8483 0.1495 0.0022
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 357 147 210 6 0 0 0 141 0 0 202 0 8 0.0408 0.0000 0.0381 147.000 0.67 3.38 -2.71 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 2 0.0000 0.2585 0.7415 2 2 0.0000 0.0329 0.9671
chr8 140458378 T TGTGACCCTCACGGTACCCCCC 0.500000 0.100 1 21 5 545 162 383 131 0 21 0 10 0 0 383 0 0 0.8086 0.0000 0.0000 6.714 0.37 6.70 -6.33 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0163 0.9837 0.0000 0 1 0.4848 0.5152 0.0000
chr8 141449677 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 252 101 151 47 0 3 0 51 0 0 149 0 2 0.4653 0.0000 0.0132 32.667 0.98 3.75 -2.77 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0980 0.5801 0.3220 1 1 0.1030 0.5739 0.3231 1 1 0.1097 0.5663 0.3240
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 443 112 331 1 0 18 5 88 0 0 325 1 5 0.0089 0.0000 0.0181 5.222 1.00 4.88 -3.88 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0560 0.9440 2 2 0.0000 0.0202 0.9798 2 2 0.0000 0.0153 0.9847
chr8 143871574 A AAAGGTGACCCTG 0.500000 0.100 1 12 4 675 153 522 136 0 13 0 4 0 0 522 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 10.769 0.49 12.50 -12.01 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1236 0.8764 0.0000 0 0 0.9265 0.0735 0.0000 0 0 0.9826 0.0174 0.0000
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 989 263 726 120 0 41 1 101 1 0 715 0 10 0.4563 0.0014 0.0152 5.390 0.88 11.04 -10.16 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2793 0.6786 0.0420 1 1 0.2879 0.6655 0.0466 1 1 0.2981 0.6487 0.0531
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.100 1 2 3 1185 199 986 179 10 3 1 6 0 0 986 0 0 0.8995 0.0000 0.0000 196.000 2.28 3.00 -0.72 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0399 0.9601 0.0000 0 0 0.9797 0.0203 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.100 1 -2 4 1184 203 981 4 183 6 4 6 0 0 980 0 1 0.0197 0.0000 0.0010 14.800 7.00 3.00 4.00 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4227 0.5773 0.0000 0 0 0.9643 0.0357 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 1242 427 815 155 4 83 163 22 0 0 815 0 0 0.3630 0.0000 0.0000 4.183 0.32 3.27 -2.96 37 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0110 0.7596 0.2294 1 1 0.0135 0.7518 0.2347 1 1 0.0177 0.7421 0.2401
chr9 12775862 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 336 92 244 5 0 18 4 65 0 0 238 0 6 0.0543 0.0000 0.0246 4.111 0.80 5.06 -4.26 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8290 0.1710 2 2 0.0000 0.3944 0.6056
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 336 92 244 5 28 20 1 38 0 0 238 0 6 0.0543 0.0000 0.0246 3.600 0.80 6.50 -5.70 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0470 0.4502 0.5028 1 2 0.0508 0.4524 0.4967 1 2 0.0564 0.4554 0.4882
chr9 20414312 ACTG A 0.500000 0.100 1 -3 1 616 188 428 74 4 30 6 74 0 0 428 0 0 0.3936 0.0000 0.0000 5.200 0.61 3.55 -2.95 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1283 0.6784 0.1933 1 1 0.1346 0.6659 0.1995 1 1 0.1428 0.6499 0.2073
chr9 25678179 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 3 572 117 455 57 2 21 0 37 0 0 452 0 3 0.4872 0.0000 0.0066 4.571 0.75 3.30 -2.54 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6589 0.3258 0.0153 1 0 0.6496 0.3330 0.0174 1 0 0.6365 0.3429 0.0206
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 881 271 610 257 0 4 1 9 0 0 610 0 0 0.9483 0.0000 0.0000 66.750 0.21 1.89 -1.68 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.9205 0.0795 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr9 35674193 CGGAGAGGAGGATCTACCT C 0.500000 0.100 1 -18 3 399 150 249 65 1 28 0 56 0 0 248 0 1 0.4333 0.0000 0.0040 4.357 0.25 11.91 -11.66 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3749 0.5621 0.0631 1 1 0.3755 0.5568 0.0677 1 1 0.3756 0.5503 0.0741
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 730 183 547 87 1 31 0 64 0 0 538 0 9 0.4754 0.0000 0.0165 4.903 0.36 10.67 -10.32 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4850 0.4895 0.0255 1 1 0.4841 0.4873 0.0286 1 1 0.4819 0.4850 0.0330
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 287 41 246 5 0 0 0 36 0 0 246 0 0 0.1220 0.0000 0.0000 41.000 0.60 1.08 -0.48 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9713 0.0287 2 1 0.0000 0.8117 0.1883
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 446 120 326 72 0 0 0 48 0 0 322 0 4 0.6000 0.0000 0.0123 120.000 0.19 13.81 -13.62 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6557 0.3318 0.0124 1 0 0.6477 0.3380 0.0143 1 0 0.6362 0.3466 0.0172
chr9 76703941 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 430 117 313 69 0 3 0 45 0 0 313 0 0 0.5897 0.0000 0.0000 38.000 0.29 3.64 -3.35 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7504 0.2432 0.0064 1 0 0.7402 0.2521 0.0076 1 0 0.7259 0.2646 0.0095
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 736 167 569 86 0 16 0 65 0 0 552 0 17 0.5150 0.0000 0.0299 9.438 0.23 10.06 -9.83 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2213 0.6786 0.1001 1 1 0.2277 0.6661 0.1062 1 1 0.2355 0.6501 0.1144
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 527 154 373 9 0 4 1 140 0 0 368 1 4 0.0584 0.0000 0.0134 37.250 0.22 3.24 -3.01 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9081 0.0919 2 2 0.0000 0.2134 0.7866
chr9 88130024 A AAGG 0.500000 0.100 1 3 1 1243 322 921 286 1 21 0 14 0 0 921 0 0 0.8882 0.0000 0.0000 14.333 0.47 3.64 -3.18 106 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3650 0.6350 0.0000 0 0 0.9930 0.0070 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 255 74 181 32 0 0 0 42 0 0 178 0 3 0.4324 0.0000 0.0166 74.000 0.25 3.79 -3.54 16 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0404 0.4278 0.5318 1 2 0.0441 0.4312 0.5248 1 2 0.0493 0.4358 0.5149
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 310 89 221 36 4 16 0 33 0 0 219 0 2 0.4045 0.0000 0.0090 4.500 0.39 3.27 -2.88 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3104 0.5655 0.1242 1 1 0.3107 0.5605 0.1288 1 1 0.3108 0.5543 0.1350
chr9 93259450 TTGCCCCCGCAACCCACACGGCCCCCTCAACCTGTGC T 0.500000 0.100 1 -36 1 439 120 319 102 1 14 0 3 0 0 319 0 0 0.8500 0.0000 0.0000 7.500 0.87 6.00 -5.13 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1941 0.8059 0.0000 0 0 0.8748 0.1252 0.0000 0 0 0.9555 0.0445 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 459 160 299 66 0 7 0 87 0 0 299 0 0 0.4125 0.0000 0.0000 21.857 0.15 8.37 -8.22 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0101 0.3422 0.6477 1 2 0.0117 0.3470 0.6413 1 2 0.0143 0.3539 0.6319
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 790 304 486 97 0 3 0 204 0 0 481 0 5 0.3191 0.0000 0.0103 100.333 0.24 3.23 -2.99 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0002 0.9998 1 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 411 113 298 45 1 11 2 54 0 0 298 0 0 0.3982 0.0000 0.0000 9.182 0.60 5.20 -4.60 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0562 0.5125 0.4313 1 1 0.0605 0.5106 0.4290 1 1 0.0665 0.5083 0.4252
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 840 138 702 3 0 42 0 93 1 0 690 2 9 0.0217 0.0014 0.0171 2.286 3.67 7.16 -3.49 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9733 0.0267 2 2 0.0000 0.2901 0.7099 2 2 0.0000 0.0804 0.9196
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 498 136 362 65 1 0 0 70 0 0 362 0 0 0.4779 0.0000 0.0000 135.000 0.22 2.73 -2.51 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1087 0.6413 0.2500 1 1 0.1143 0.6310 0.2546 1 1 0.1219 0.6181 0.2601
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 465 126 339 116 0 1 0 9 0 0 339 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 125.000 0.18 5.11 -4.93 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0221 0.9779 0.0000 0 1 0.4632 0.5368 0.0000
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 429 86 343 76 0 0 4 6 0 0 342 1 0 0.8837 0.0000 0.0029 85.000 0.11 2.67 -2.56 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.0582 0.9418 0.0000
chr9 104695275 G GTGAA 0.500000 0.100 1 4 2 544 140 404 135 0 0 0 5 0 0 402 0 2 0.9643 0.0000 0.0050 140.000 0.59 5.00 -4.41 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3295 0.6705 0.0000 0 0 0.8868 0.1132 0.0000
chr9 111484717 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 3 274 51 223 47 0 0 0 4 0 0 223 0 0 0.9216 0.0000 0.0000 51.000 0.66 3.75 -3.09 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.1289 0.8711 0.0000 0 1 0.4289 0.5711 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 264 89 175 0 0 3 0 86 0 0 173 0 2 0.0000 0.0000 0.0114 28.667 4.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0111 0.9889 2 2 0.0000 0.0122 0.9878 2 2 0.0000 0.0138 0.9862
chr9 113169870 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 5 443 106 337 4 1 19 1 81 0 0 336 0 1 0.0377 0.0000 0.0030 4.833 0.25 2.81 -2.56 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.7688 0.2312 2 2 0.0000 0.3139 0.6861
chr9 116154344 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 2 699 176 523 135 3 29 0 9 0 0 522 0 1 0.7670 0.0000 0.0019 5.069 1.12 3.33 -2.21 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0229 0.9771 0.0000 0 0 0.5692 0.4308 0.0000
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 496 120 376 48 1 20 1 50 0 0 376 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 4.950 0.52 5.32 -4.80 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1646 0.6171 0.2183 1 1 0.1694 0.6085 0.2221 1 1 0.1755 0.5977 0.2268
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 608 140 468 69 1 6 1 63 0 0 464 0 4 0.4929 0.0000 0.0085 22.333 0.38 6.03 -5.65 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2089 0.6575 0.1336 1 1 0.2142 0.6463 0.1394 1 1 0.2209 0.6320 0.1471
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 513 168 345 132 2 18 0 16 0 0 344 1 0 0.7857 0.0000 0.0029 8.278 0.48 3.56 -3.09 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0182 0.9818 0.0000
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 503 143 360 0 0 2 0 141 0 0 354 0 6 0.0000 0.0000 0.0167 70.500 3.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 618 180 438 7 0 17 0 156 0 0 427 0 11 0.0389 0.0000 0.0251 9.588 0.57 7.53 -6.96 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 2 0.0000 0.2916 0.7084 2 2 0.0000 0.0263 0.9737
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 442 146 296 49 7 40 3 47 0 1 291 0 4 0.3356 0.0000 0.0169 2.718 2.69 4.04 -1.35 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2371 0.6243 0.1386 1 1 0.2410 0.6152 0.1438 1 1 0.2456 0.6037 0.1507
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 269 113 156 70 0 0 0 43 0 0 155 0 1 0.6195 0.0000 0.0064 113.000 0.79 2.12 -1.33 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7864 0.2091 0.0045 1 0 0.7760 0.2185 0.0055 1 0 0.7613 0.2317 0.0070
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 269 113 156 70 0 0 0 43 0 0 155 0 1 0.6195 0.0000 0.0064 113.000 0.79 2.12 -1.33 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7864 0.2091 0.0045 1 0 0.7760 0.2185 0.0055 1 0 0.7613 0.2317 0.0070
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 278 106 172 19 0 3 0 84 0 0 170 0 2 0.1792 0.0000 0.0116 34.333 0.37 1.74 -1.37 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 563 178 385 77 0 34 1 66 0 0 383 0 2 0.4326 0.0000 0.0052 4.235 0.58 3.41 -2.82 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3272 0.6058 0.0670 1 1 0.3305 0.5976 0.0719 1 1 0.3339 0.5873 0.0788
chr9 136984956 C CGGCCCCTCCCTGCCCCTCT 0.500000 0.100 1 19 3 379 95 284 46 0 12 0 37 1 0 279 0 4 0.4842 0.0035 0.0176 6.917 0.28 11.11 -10.83 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3330 0.5657 0.1013 1 1 0.3332 0.5606 0.1062 1 1 0.3330 0.5543 0.1128
chr9 137087116 ACCG A 0.500000 0.100 1 -3 3 415 133 282 69 0 17 0 47 1 0 281 0 0 0.5188 0.0035 0.0035 6.824 1.46 4.32 -2.86 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7280 0.2644 0.0076 1 0 0.7182 0.2728 0.0090 1 0 0.7044 0.2845 0.0111
chr9 137228812 CCT C 0.500000 0.100 1 -2 4 438 109 329 63 0 1 0 45 0 0 329 0 0 0.5780 0.0000 0.0000 108.000 0.46 2.60 -2.14 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6255 0.3568 0.0176 1 0 0.6174 0.3626 0.0200 1 0 0.6060 0.3705 0.0235
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 192 95 97 7 28 16 0 44 0 0 96 0 1 0.0737 0.0000 0.0103 5.267 0.57 3.05 -2.47 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0645 0.4977 0.4378 1 1 0.0689 0.4970 0.4341 1 1 0.0750 0.4964 0.4286
chr9 138217086 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 1 192 95 97 34 1 55 2 3 0 0 96 0 1 0.3579 0.0000 0.0103 0.704 9.09 4.67 4.42 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.0536 0.9464 0.0000 0 1 0.2319 0.7681 0.0000
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 789 195 594 182 1 6 0 6 0 0 594 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 31.500 0.42 9.17 -8.74 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2724 0.7276 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 387 94 293 88 0 0 0 6 0 0 293 0 0 0.9362 0.0000 0.0000 94.000 0.67 1.00 -0.33 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0109 0.9891 0.0000 0 0 0.9095 0.0905 0.0000 0 0 0.9911 0.0089 0.0000
chr10 13657133 CCGCCCCCCG C 0.028316 0.100 1 -9 1 724 156 568 124 2 24 0 6 1 0 567 0 0 0.7949 0.0018 0.0018 5.458 0.30 9.17 -8.87 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0344 0.9656 0.0000 0 0 0.9702 0.0298 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000
chr10 15719771 TCTCC T 0.162657 0.100 1 -4 1 192 42 150 24 0 2 0 16 0 0 150 0 0 0.5714 0.0000 0.0000 20.000 0.83 4.38 -3.54 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5892 0.3874 0.0234 1 0 0.5847 0.3906 0.0247 1 0 0.5785 0.3949 0.0265
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 214 93 121 9 0 1 0 83 0 0 119 0 2 0.0968 0.0000 0.0165 92.000 0.11 4.11 -4.00 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.9571 0.0429
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 849 183 666 1 0 24 1 157 0 0 646 0 20 0.0055 0.0000 0.0300 6.625 27.00 5.76 21.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 680 138 542 66 0 3 0 69 0 0 540 0 2 0.4783 0.0000 0.0037 45.000 0.27 3.46 -3.19 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1591 0.6906 0.1503 1 1 0.1679 0.6795 0.1526 1 1 0.1797 0.6651 0.1553
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 343 141 202 73 0 2 0 66 0 0 202 0 0 0.5177 0.0000 0.0000 69.500 0.07 1.97 -1.90 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4994 0.4992 0.0015 1 0 0.5055 0.4929 0.0016 1 0 0.5128 0.4855 0.0017
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 513 108 405 52 0 6 0 50 0 0 405 0 0 0.4815 0.0000 0.0000 17.000 0.37 1.06 -0.69 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2943 0.6034 0.1022 1 1 0.2992 0.5952 0.1055 1 1 0.3052 0.5849 0.1099
chr10 45303617 T TA 0.034347 0.100 1 1 2 637 159 478 90 0 3 0 66 1 0 476 0 1 0.5660 0.0021 0.0042 52.000 0.30 1.09 -0.79 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8274 0.1723 0.0003 1 0 0.8226 0.1771 0.0003 1 0 0.8155 0.1841 0.0004
chr10 46309137 T TTTGTGCCACTCCTGCTGC 0.003400 0.100 1 18 4 296 93 203 39 0 11 0 43 0 0 195 0 8 0.4194 0.0000 0.0394 7.455 0.97 14.14 -13.17 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1623 0.8318 0.0060 1 1 0.1734 0.8208 0.0058 1 1 0.1886 0.8058 0.0056
chr10 53807071 A AGTT 0.002532 0.100 1 3 2 350 92 258 73 0 10 0 9 0 0 258 0 0 0.7935 0.0000 0.0000 8.200 0.77 2.33 -1.57 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5100 0.4900 0.0000 0 0 0.9768 0.0232 0.0000
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.100 1 -3 1 584 154 430 129 1 6 0 18 0 0 430 0 0 0.8377 0.0000 0.0000 24.667 0.22 3.11 -2.89 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.6113 0.3887 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 140 66 74 62 0 1 0 3 2 0 72 0 0 0.9394 0.0270 0.0270 65.000 0.71 6.00 -5.29 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1554 0.8446 0.0000 0 0 0.8475 0.1525 0.0000 0 0 0.9475 0.0525 0.0000
chr10 63214835 TTCA T 0.005181 0.100 1 -3 1 754 143 611 134 0 0 0 9 0 0 611 0 0 0.9371 0.0000 0.0000 143.000 0.78 3.00 -2.22 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.9143 0.0857 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 406 96 310 0 0 20 1 75 0 0 310 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.800 3.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0970 0.9030 2 2 0.0000 0.1041 0.8959 2 2 0.0000 0.1146 0.8854
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 410 154 256 6 0 14 1 133 0 0 252 0 4 0.0390 0.0000 0.0156 10.000 0.00 5.41 -5.41 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9869 0.0131 2 1 0.0000 0.8783 0.1217
chr10 80144341 G GAGA 0.037415 0.100 1 3 2 205 73 132 61 0 7 1 4 0 1 131 0 0 0.8356 0.0000 0.0076 9.429 0.21 4.75 -4.54 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0223 0.9777 0.0000 0 0 0.7800 0.2200 0.0000 0 0 0.9587 0.0413 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 626 132 494 12 1 4 0 115 0 0 485 0 9 0.0909 0.0000 0.0182 32.000 0.50 5.72 -5.22 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9675 0.0325
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 640 232 408 188 1 29 0 14 0 0 406 0 2 0.8103 0.0000 0.0049 7.000 1.56 7.29 -5.72 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.2928 0.7072 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 365 93 272 55 1 7 0 30 0 0 268 0 4 0.5914 0.0000 0.0147 12.286 0.42 5.87 -5.45 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7430 0.2484 0.0086 1 0 0.7323 0.2577 0.0100 1 0 0.7174 0.2704 0.0122
chr10 104057110 CGCCACCAACACCGCCACCTCCTCCACT C 0.001817 0.100 1 -27 1 311 110 201 92 0 8 0 10 0 0 197 0 4 0.8364 0.0000 0.0199 12.750 0.47 27.10 -26.63 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0179 0.9821 0.0000 0 0 0.8566 0.1434 0.0000
chr10 113588989 CCTT C 0.001011 0.100 1 -3 3 1120 248 872 235 1 7 0 5 0 0 871 0 1 0.9476 0.0000 0.0011 34.429 0.26 3.00 -2.74 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9963 0.0037 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 361 147 214 125 0 2 0 20 0 0 213 0 1 0.8503 0.0000 0.0047 72.500 0.89 2.45 -1.56 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000
chr10 119670135 A AGCG 0.000723 0.100 1 3 1 289 105 184 65 0 6 1 33 0 0 182 0 2 0.6190 0.0000 0.0109 16.500 0.31 3.30 -3.00 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9160 0.0840 0.0000 1 0 0.9101 0.0899 0.0000 1 0 0.9016 0.0984 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 380 106 274 1 3 8 13 81 0 2 271 0 1 0.0094 0.0000 0.0109 10.625 0.00 2.37 -2.37 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9777 0.0223 2 2 0.0000 0.4682 0.5318 2 2 0.0000 0.1570 0.8430
chr10 131311321 C CGCG 0.026812 0.100 1 3 1 385 125 260 57 4 17 2 45 1 0 255 0 4 0.4560 0.0038 0.0192 6.688 1.28 4.47 -3.19 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6221 0.3759 0.0020 1 0 0.6220 0.3759 0.0021 1 0 0.6212 0.3764 0.0024
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 475 141 334 10 0 8 1 122 0 0 333 0 1 0.0709 0.0000 0.0030 16.625 0.70 1.17 -0.47 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9882 0.0118 2 1 0.0000 0.5966 0.4034
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 767 162 605 74 0 10 1 77 0 0 604 0 1 0.4568 0.0000 0.0017 15.200 0.20 3.10 -2.90 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1300 0.6875 0.1825 1 1 0.1379 0.6758 0.1863 1 1 0.1485 0.6607 0.1907
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.100 1 -12 1 633 143 490 118 0 18 1 6 0 0 489 0 1 0.8252 0.0000 0.0020 6.944 0.42 10.83 -10.42 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.7399 0.2601 0.0000 0 0 0.9803 0.0197 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1052 215 837 11 0 80 1 123 0 0 837 0 0 0.0512 0.0000 0.0000 1.675 1.00 7.59 -6.59 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9953 0.0047 2 1 0.0000 0.7061 0.2939
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 961 272 689 17 0 83 3 169 0 0 688 1 0 0.0625 0.0000 0.0015 2.277 2.18 11.71 -9.53 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8954 0.1046
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 377 106 271 0 0 5 0 101 0 0 267 0 4 0.0000 0.0000 0.0148 20.200 3.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0047 0.9953 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0061 0.9939
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 729 241 488 33 0 7 0 201 0 0 488 0 0 0.1369 0.0000 0.0000 33.429 0.12 1.11 -0.99 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 236 104 132 0 0 2 8 94 0 0 131 0 1 0.0000 0.0000 0.0076 94.000 2.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0056 0.9944 2 2 0.0000 0.0062 0.9938 2 2 0.0000 0.0072 0.9928
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 236 108 128 3 2 92 3 8 0 0 128 0 0 0.0278 0.0000 0.0000 15.000 0.33 2.25 -1.92 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 0.8307 0.1693 2 2 0.0000 0.4419 0.5581
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 602 138 464 14 0 0 0 124 0 0 462 0 2 0.1014 0.0000 0.0043 138.000 0.21 4.27 -4.05 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9459 0.0541
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 1116 283 833 257 1 14 0 11 0 0 833 0 0 0.9081 0.0000 0.0000 19.143 0.24 1.09 -0.85 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7670 0.2330 0.0000 0 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 1546 354 1192 189 0 4 0 161 0 0 1186 0 6 0.5339 0.0000 0.0050 87.500 0.11 5.82 -5.71 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4333 0.5611 0.0055 1 1 0.4445 0.5487 0.0067 1 1 0.4572 0.5341 0.0086
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1041 254 787 147 0 4 0 103 0 0 787 0 0 0.5787 0.0000 0.0000 62.500 0.73 1.58 -0.85 55 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9198 0.0800 0.0001 1 0 0.9140 0.0858 0.0002 1 0 0.9053 0.0944 0.0003
chr11 5200208 TAAAG T 0.500000 0.100 1 -4 2 608 131 477 73 0 2 0 56 0 0 476 1 0 0.5573 0.0000 0.0021 64.500 0.32 4.75 -4.43 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5508 0.4262 0.0230 1 0 0.5461 0.4281 0.0258 1 0 0.5389 0.4311 0.0300
chr11 6390705 TGCTGGCGCTGGCGCTGGC T 0.500000 0.100 1 -18 2 877 262 615 207 1 42 1 11 0 0 615 0 0 0.7901 0.0000 0.0000 5.238 2.95 18.18 -15.23 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1031 0.8969 0.0000 0 0 0.9228 0.0772 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 708 131 577 0 0 14 0 117 0 0 561 0 16 0.0000 0.0000 0.0277 8.357 9.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr11 6795057 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 1 749 147 602 132 2 6 0 7 0 0 602 0 0 0.8980 0.0000 0.0000 23.333 0.12 1.71 -1.59 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3174 0.6826 0.0000 0 0 0.8810 0.1190 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 261 127 134 0 0 15 3 109 0 0 133 0 1 0.0000 0.0000 0.0075 7.467 3.65 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr11 12294797 G GCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 9 1 602 149 453 21 2 48 0 78 0 0 435 0 18 0.1409 0.0000 0.0397 2.104 6.67 8.86 -2.19 9 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9797 0.0203 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 12 1 602 149 453 22 1 55 1 70 0 0 436 0 17 0.1477 0.0000 0.0375 1.709 6.50 9.11 -2.61 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.4707 0.5293 2 1 0.0000 0.9904 0.0096 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr11 12294797 GCTCCTC G 0.500000 0.100 1 -6 1 602 172 430 107 0 44 2 19 0 0 430 0 0 0.6221 0.0000 0.0000 2.909 6.43 7.05 -0.62 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 201 73 128 36 0 2 1 34 0 0 128 0 0 0.4932 0.0000 0.0000 35.000 0.25 3.18 -2.93 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2326 0.5840 0.1833 1 1 0.2352 0.5778 0.1870 1 1 0.2383 0.5699 0.1918
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 200 110 90 98 0 0 0 12 0 0 90 0 0 0.8909 0.0000 0.0000 110.000 0.40 3.17 -2.77 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0499 0.9501 0.0000
chr11 34632610 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 110 64 46 56 0 0 0 8 0 0 46 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 64.000 0.18 1.12 -0.95 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0033 0.9967 0.0000 0 1 0.0823 0.9177 0.0000
chr11 44309737 TGCTGCGGCTGCG T 0.500000 0.100 1 -12 1 493 106 387 54 0 4 1 47 0 1 386 0 0 0.5094 0.0000 0.0026 25.250 0.50 10.49 -9.99 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3488 0.5670 0.0842 1 1 0.3492 0.5617 0.0891 1 1 0.3492 0.5551 0.0958
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 809 260 549 119 0 10 1 130 0 0 545 0 4 0.4577 0.0000 0.0073 25.000 0.13 3.22 -3.10 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0170 0.5774 0.4056 1 1 0.0196 0.5680 0.4124 1 1 0.0234 0.5568 0.4198
chr11 54603834 GGACCCCAGTGATGGGCTGGCAGTGATGGT G 0.500000 0.100 1 -29 5 482 134 348 80 1 5 0 48 0 0 341 0 7 0.5970 0.0000 0.0201 25.800 0.20 21.35 -21.15 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7680 0.2275 0.0044 1 0 0.7586 0.2361 0.0054 1 0 0.7451 0.2481 0.0068
chr11 55343758 G GCA 0.500000 0.100 1 2 2 816 197 619 181 0 3 3 10 0 2 614 1 2 0.9188 0.0000 0.0081 64.667 1.09 12.60 -11.51 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2766 0.7234 0.0000
chr11 55555134 CTCTCTGAGAACACACAGTTCTGAAG C 0.500000 0.100 1 -25 1 565 124 441 79 0 1 0 44 0 0 426 0 15 0.6371 0.0000 0.0340 123.000 0.13 21.82 -21.69 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6406 0.3472 0.0122 1 0 0.6337 0.3523 0.0140 1 0 0.6236 0.3596 0.0169
chr11 55572294 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 394 93 301 51 0 1 0 41 0 0 301 0 0 0.5484 0.0000 0.0000 92.000 1.61 2.17 -0.56 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4342 0.5060 0.0598 1 1 0.4312 0.5047 0.0641 1 1 0.4267 0.5031 0.0702
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 1404 325 1079 0 0 4 2 319 0 0 1070 0 9 0.0000 0.0000 0.0083 80.250 2.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 704 156 548 86 0 0 0 70 0 0 548 0 0 0.5513 0.0000 0.0000 156.000 0.30 1.16 -0.85 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5203 0.4579 0.0218 1 0 0.5180 0.4575 0.0246 1 0 0.5139 0.4575 0.0286
chr11 59503626 TACTC T 0.500000 0.100 1 -4 2 477 121 356 114 0 1 0 6 0 0 356 0 0 0.9421 0.0000 0.0000 120.000 0.31 4.33 -4.03 78 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3330 0.6670 0.0000 0 0 0.8430 0.1570 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 68 37 31 21 0 0 0 16 0 0 31 0 0 0.5676 0.0000 0.0000 37.000 0.10 2.06 -1.97 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3531 0.5158 0.1310 1 1 0.3503 0.5146 0.1351 1 1 0.3465 0.5130 0.1405
chr11 62146758 A AGCGGGAGCAGGAGCG 0.500000 0.100 1 15 1 660 183 477 80 3 44 2 54 0 0 464 1 12 0.4372 0.0000 0.0273 3.114 0.41 8.43 -8.01 44 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4795 0.4918 0.0287 1 1 0.4782 0.4898 0.0319 1 1 0.4756 0.4877 0.0367
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 252 96 156 46 0 17 1 32 0 0 156 0 0 0.4792 0.0000 0.0000 4.647 0.35 3.25 -2.90 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5297 0.4301 0.0402 1 0 0.5228 0.4333 0.0439 1 0 0.5132 0.4377 0.0491
chr11 62614650 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 674 146 528 70 0 1 0 75 0 0 527 0 1 0.4795 0.0000 0.0019 145.000 0.16 1.28 -1.12 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0855 0.6338 0.2807 1 1 0.0909 0.6240 0.2851 1 1 0.0983 0.6115 0.2902
chr11 63382198 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 165 60 105 38 8 3 1 10 0 0 104 0 1 0.6333 0.0000 0.0095 18.667 0.21 1.80 -1.59 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4234 0.5760 0.0006 0 1 0.0718 0.9281 0.0001 0 1 0.0155 0.9845 0.0000
chr11 65557854 CCAGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -9 3 255 81 174 41 1 7 0 32 0 0 172 0 2 0.5062 0.0000 0.0115 10.571 0.44 8.81 -8.37 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3959 0.5223 0.0818 1 1 0.3934 0.5202 0.0864 1 1 0.3896 0.5177 0.0927
chr11 65636776 ACCTCAGCCTCAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 588 123 465 65 0 14 0 44 0 0 453 0 12 0.5285 0.0000 0.0258 7.786 0.51 11.86 -11.36 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3771 0.5595 0.0633 1 1 0.3776 0.5544 0.0679 1 1 0.3775 0.5481 0.0744
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 848 195 653 109 1 30 1 54 0 0 631 0 22 0.5590 0.0000 0.0337 5.500 0.20 7.09 -6.89 81 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8393 0.1595 0.0012 1 0 0.8313 0.1672 0.0015 1 0 0.8195 0.1784 0.0021
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 982 268 714 161 0 80 0 27 0 0 687 0 27 0.6007 0.0000 0.0378 2.350 0.16 17.26 -17.10 63 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9493 0.0507 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 906 244 662 0 0 3 1 240 0 0 659 1 2 0.0000 0.0000 0.0045 80.333 2.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 710 139 571 0 0 13 1 125 0 0 569 1 1 0.0000 0.0000 0.0035 9.692 3.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 422 165 257 92 0 4 0 69 0 0 253 0 4 0.5576 0.0000 0.0156 40.250 0.26 16.20 -15.94 28 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5860 0.4004 0.0136 1 0 0.5821 0.4023 0.0156 1 0 0.5758 0.4055 0.0187
chr11 77214658 G GCCATGAGCAAACAGCGGGGCT 0.500000 0.100 1 21 1 529 124 405 96 1 20 0 7 0 0 403 0 2 0.7742 0.0000 0.0049 5.200 0.30 12.14 -11.84 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0087 0.9913 0.0000 0 1 0.2555 0.7445 0.0000
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 681 210 471 101 1 7 1 100 0 0 468 0 3 0.4810 0.0000 0.0064 29.000 0.33 4.50 -4.17 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1091 0.7293 0.1617 1 1 0.1162 0.7142 0.1696 1 1 0.1256 0.6946 0.1798
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.100 1 -1 3 919 121 798 109 1 2 0 9 0 0 798 0 0 0.9008 0.0000 0.0000 59.500 0.29 1.67 -1.37 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0166 0.9834 0.0000 0 1 0.3926 0.6074 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1314 357 957 25 3 82 9 238 1 0 954 1 1 0.0700 0.0010 0.0031 3.317 0.80 7.51 -6.71 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9961 0.0039
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 772 260 512 0 0 41 1 218 0 0 510 1 1 0.0000 0.0000 0.0039 5.450 9.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 347 117 230 59 0 5 0 53 0 0 230 0 0 0.5043 0.0000 0.0000 22.400 0.53 6.34 -5.81 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3110 0.5944 0.0947 1 1 0.3130 0.5872 0.0998 1 1 0.3151 0.5782 0.1067
chr11 125495476 CG C 0.500000 0.100 1 -1 4 788 283 505 11 0 1 0 271 0 0 505 0 0 0.0389 0.0000 0.0000 282.000 0.64 1.74 -1.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.1371 0.8629 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 445 145 300 28 43 22 3 49 0 0 297 2 1 0.1931 0.0000 0.0100 5.545 0.39 3.31 -2.91 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5759 0.4032 0.0209 1 0 0.5701 0.4064 0.0235 1 0 0.5615 0.4111 0.0274
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 445 147 298 74 8 18 2 45 0 0 294 1 3 0.5034 0.0000 0.0134 7.111 2.04 3.71 -1.67 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8546 0.1437 0.0017 1 0 0.8452 0.1527 0.0021 1 0 0.8316 0.1656 0.0028
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 166 94 72 44 0 1 0 49 0 0 72 0 0 0.4681 0.0000 0.0000 93.000 0.18 2.51 -2.33 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1127 0.5837 0.3036 1 1 0.1176 0.5774 0.3050 1 1 0.1242 0.5694 0.3063
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 357 91 266 51 0 3 0 37 0 0 265 0 1 0.5604 0.0000 0.0038 29.333 0.75 2.81 -2.07 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6157 0.3659 0.0184 1 0 0.6108 0.3691 0.0202 1 0 0.6036 0.3737 0.0227
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 358 118 240 111 0 0 0 7 1 0 239 0 0 0.9407 0.0042 0.0042 118.000 1.68 1.00 0.68 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0979 0.9021 0.0000 0 0 0.6395 0.3605 0.0000
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 518 153 365 61 4 30 3 55 0 1 361 0 3 0.3987 0.0000 0.0110 4.100 0.34 3.04 -2.69 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3023 0.6102 0.0876 1 1 0.3064 0.6014 0.0922 1 1 0.3112 0.5904 0.0984
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.100 1 1 1 567 128 439 114 0 3 0 11 0 0 439 0 0 0.8906 0.0000 0.0000 41.667 0.18 3.00 -2.82 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0161 0.9839 0.0000 0 0 0.5900 0.4100 0.0000
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.100 1 -1 1 574 129 445 116 0 2 0 11 0 0 445 0 0 0.8992 0.0000 0.0000 63.500 0.19 3.00 -2.81 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0175 0.9825 0.0000 0 0 0.6119 0.3881 0.0000
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 409 152 257 1 0 27 17 107 0 0 256 0 1 0.0066 0.0000 0.0039 4.630 3.00 3.11 -0.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0109 0.9891 2 2 0.0000 0.0044 0.9956 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr12 7715294 CTGT C 0.000299 0.100 1 -3 1 270 86 184 45 0 1 0 40 0 0 183 0 1 0.5233 0.0000 0.0054 85.000 0.27 3.10 -2.83 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4936 0.5064 0.0001 1 1 0.4977 0.5022 0.0001 1 0 0.5027 0.4972 0.0001
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 4045 928 3117 885 1 12 0 30 1 0 3115 0 1 0.9537 0.0003 0.0006 76.333 0.70 4.30 -3.60 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 239 83 156 0 0 1 2 80 0 0 151 0 5 0.0000 0.0000 0.0321 82.000 4.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0126 0.9874 2 2 0.0000 0.0143 0.9857
chr12 10723069 G GGGT 0.002430 0.100 1 3 1 295 99 196 51 5 10 0 33 0 0 195 0 1 0.5152 0.0000 0.0051 8.900 0.49 3.12 -2.63 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8497 0.1502 0.0000 1 0 0.8431 0.1568 0.0000 1 0 0.8338 0.1662 0.0000
chr12 12477731 T TGCACGCTGG 0.000440 0.100 1 9 1 648 160 488 74 0 39 0 47 0 0 479 0 9 0.4625 0.0000 0.0184 3.103 0.28 7.47 -7.18 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7588 0.2412 0.0000 1 0 0.7550 0.2450 0.0000 1 0 0.7494 0.2506 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 268 129 139 63 0 7 4 55 0 0 139 0 0 0.4884 0.0000 0.0000 17.429 0.40 4.13 -3.73 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1737 0.6608 0.1654 1 1 0.1762 0.6507 0.1731 1 1 0.1791 0.6376 0.1833
chr12 16194406 A AGAG 0.000389 0.100 1 3 2 110 60 50 31 0 3 1 25 0 0 50 0 0 0.5167 0.0000 0.0000 19.000 0.48 2.72 -2.24 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5537 0.4462 0.0001 1 0 0.5542 0.4457 0.0001 1 0 0.5546 0.4453 0.0001
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 410 88 322 41 0 1 0 46 0 0 322 0 0 0.4659 0.0000 0.0000 87.000 0.37 3.72 -3.35 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1442 0.6007 0.2551 1 1 0.1501 0.5942 0.2557 1 1 0.1581 0.5859 0.2560
chr12 40482547 CCAT C 0.001528 0.100 1 -3 1 1470 271 1199 149 0 13 0 109 0 0 1198 0 1 0.5498 0.0000 0.0008 19.846 0.36 3.61 -3.26 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9305 0.0695 0.0000 1 0 0.9269 0.0731 0.0000 1 0 0.9216 0.0784 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1778 367 1411 211 1 149 1 5 4 2 1400 3 2 0.5749 0.0028 0.0078 1.456 0.88 4.00 -3.12 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.7550 0.2450 0.0000 0 0 0.9884 0.0116 0.0000
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 1331 306 1025 288 1 9 0 8 0 0 1025 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 33.000 0.24 1.00 -0.76 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1612 0.8388 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 51329814 A AG 0.276619 0.100 1 1 2 204 70 134 62 0 2 0 6 0 0 134 0 0 0.8857 0.0000 0.0000 34.000 0.24 1.17 -0.92 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0908 0.9092 0.0000 0 0 0.5319 0.4681 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 890 211 679 17 1 20 1 172 1 2 674 0 2 0.0806 0.0015 0.0074 9.500 0.41 14.31 -13.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9866 0.0134
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 327 71 256 34 0 1 0 36 0 0 256 0 0 0.4789 0.0000 0.0000 70.000 0.12 1.50 -1.38 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2431 0.5996 0.1573 1 1 0.2486 0.5929 0.1584 1 1 0.2558 0.5845 0.1597
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 385 106 279 64 0 0 0 42 1 0 276 0 2 0.6038 0.0036 0.0108 106.000 0.34 1.07 -0.73 56 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7303 0.2619 0.0078 1 0 0.7216 0.2693 0.0090 1 0 0.7093 0.2797 0.0110
chr12 55427118 C CT 0.003326 0.100 1 1 1 451 118 333 109 0 2 0 7 0 0 333 0 0 0.9237 0.0000 0.0000 58.000 0.62 1.71 -1.09 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0142 0.9858 0.0000 0 0 0.9760 0.0240 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 417 79 338 43 15 11 1 9 0 0 338 0 0 0.5443 0.0000 0.0000 6.091 0.84 1.44 -0.61 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.0950 0.9050 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 508 114 394 55 1 2 0 56 0 0 394 0 0 0.4825 0.0000 0.0000 56.000 0.11 4.29 -4.18 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3639 0.6340 0.0021 1 1 0.3735 0.6243 0.0022 1 1 0.3858 0.6120 0.0022
chr12 56423649 T TTCC 0.001008 0.100 1 3 1 555 157 398 69 4 28 2 54 0 0 398 0 0 0.4395 0.0000 0.0000 4.500 0.29 3.48 -3.19 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7443 0.2557 0.0000 1 0 0.7408 0.2591 0.0000 1 0 0.7357 0.2643 0.0000
chr12 57225404 T TGGC 0.004341 0.100 1 3 1 575 152 423 84 0 5 0 63 1 0 419 0 3 0.5526 0.0024 0.0095 29.400 1.61 4.43 -2.82 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7573 0.2426 0.0001 1 0 0.7542 0.2457 0.0001 1 0 0.7495 0.2504 0.0001
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 351 83 268 26 0 3 0 54 0 0 266 0 2 0.3133 0.0000 0.0075 26.667 0.92 3.98 -3.06 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0032 0.1583 0.8385 1 2 0.0040 0.1697 0.8263 1 2 0.0053 0.1860 0.8087
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 127 53 74 7 0 5 0 41 0 0 74 0 0 0.1321 0.0000 0.0000 9.600 0.43 2.76 -2.33 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 1 0.0000 0.9510 0.0490
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1023 300 723 0 2 21 3 274 0 0 719 0 4 0.0000 0.0000 0.0055 13.143 3.32 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 130 68 62 53 3 5 0 7 0 0 62 0 0 0.7794 0.0000 0.0000 12.600 0.02 1.14 -1.12 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0241 0.9759 0.0000 0 1 0.2990 0.7010 0.0000
chr12 101162014 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 155 76 79 47 1 1 0 27 0 0 79 0 0 0.6184 0.0000 0.0000 75.000 0.15 1.11 -0.96 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7267 0.2620 0.0113 1 0 0.7151 0.2718 0.0131 1 0 0.6990 0.2852 0.0158
chr12 102958393 C CGCAGCAGCAGCA 0.500000 0.100 1 12 1 438 114 324 74 0 33 0 7 1 0 322 0 1 0.6491 0.0031 0.0062 2.455 0.59 9.00 -8.41 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0084 0.9916 0.0000 0 1 0.1839 0.8161 0.0000
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 428 117 311 53 2 8 2 52 0 0 309 0 2 0.4530 0.0000 0.0064 13.625 0.83 3.29 -2.46 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1668 0.6317 0.2016 1 1 0.1718 0.6221 0.2061 1 1 0.1782 0.6100 0.2118
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 1762 425 1337 241 8 77 7 92 0 0 1305 2 30 0.5671 0.0000 0.0239 4.468 0.66 4.40 -3.75 87 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.100 1 -30 1 1725 502 1223 276 5 95 0 126 2 9 1157 2 53 0.5498 0.0016 0.0540 4.253 1.02 17.94 -16.92 88 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr12 110582934 TCGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 326 129 197 104 2 18 1 4 0 0 197 0 0 0.8062 0.0000 0.0000 6.471 0.85 3.25 -2.40 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0221 0.9779 0.0000 0 0 0.6845 0.3155 0.0000 0 0 0.9139 0.0861 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 566 154 412 142 2 4 0 6 0 0 411 0 1 0.9221 0.0000 0.0024 37.500 0.19 9.00 -8.81 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4351 0.5649 0.0000 0 0 0.9238 0.0762 0.0000
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 623 163 460 1 1 25 8 128 0 0 458 2 0 0.0061 0.0000 0.0043 5.520 2.00 3.94 -1.94 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0127 0.9873 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0032 0.9968
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 255 149 106 0 0 0 0 149 0 0 106 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 149.000 2.46 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 220 95 125 84 0 7 0 4 0 0 125 0 0 0.8842 0.0000 0.0000 12.571 0.19 6.00 -5.81 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.4856 0.5144 0.0000 0 0 0.8197 0.1803 0.0000
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 346 96 250 0 0 13 0 83 0 0 242 0 8 0.0000 0.0000 0.0320 6.385 5.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0096 0.9904 2 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 2 0.0000 0.0119 0.9881
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 313 67 246 0 0 5 0 62 0 0 234 0 12 0.0000 0.0000 0.0488 12.400 11.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0225 0.9775 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0268 0.9732
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 736 247 489 223 1 16 0 7 0 0 489 0 0 0.9028 0.0000 0.0000 14.375 0.28 2.43 -2.15 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0201 0.9799 0.0000 0 0 0.9775 0.0225 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 622 146 476 65 0 9 0 72 1 0 467 0 8 0.4452 0.0021 0.0189 15.222 0.52 7.99 -7.46 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0299 0.4903 0.4798 1 1 0.0332 0.4885 0.4783 1 1 0.0380 0.4867 0.4754
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 187 75 112 7 13 31 0 24 0 0 112 0 0 0.0933 0.0000 0.0000 1.419 0.43 3.12 -2.70 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1446 0.5345 0.3210 1 1 0.1485 0.5318 0.3197 1 1 0.1537 0.5285 0.3177
chr12 124402512 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 3 187 75 112 20 0 50 0 5 0 0 112 0 0 0.2667 0.0000 0.0000 0.500 8.35 4.20 4.15 6 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4133 0.5624 0.0243 0 1 0.2578 0.7257 0.0164 0 1 0.1928 0.7981 0.0091
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 161 54 107 30 0 6 0 18 0 0 106 0 1 0.5556 0.0000 0.0093 8.000 0.93 3.39 -2.46 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5082 0.4344 0.0574 1 0 0.5004 0.4381 0.0615 1 0 0.4898 0.4430 0.0672
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 193 51 142 0 0 3 0 48 0 0 133 0 9 0.0000 0.0000 0.0634 16.000 9.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0519 0.9481 2 2 0.0000 0.0548 0.9452 2 2 0.0000 0.0592 0.9408
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 643 190 453 81 7 29 4 69 0 0 450 0 3 0.4263 0.0000 0.0066 5.517 0.42 3.22 -2.80 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3929 0.5655 0.0416 1 1 0.3952 0.5593 0.0456 1 1 0.3970 0.5516 0.0513
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 716 186 530 104 1 25 0 56 0 0 529 0 1 0.5591 0.0000 0.0019 6.440 0.65 6.88 -6.22 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9645 0.0355 0.0001 1 0 0.9599 0.0400 0.0001 1 0 0.9530 0.0469 0.0002
chr13 21172461 TG T 0.091820 0.100 1 -1 2 306 134 172 61 0 24 0 49 0 0 172 0 0 0.4552 0.0000 0.0000 4.583 0.08 1.06 -0.98 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6312 0.3629 0.0059 1 0 0.6297 0.3638 0.0065 1 0 0.6271 0.3657 0.0073
chr13 37105243 CTGT C 0.000775 0.100 1 -3 1 466 123 343 105 1 10 0 7 0 0 343 0 0 0.8537 0.0000 0.0000 11.300 0.36 3.14 -2.78 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0477 0.9523 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 194 71 123 66 0 2 0 3 0 0 123 0 0 0.9296 0.0000 0.0000 34.500 0.29 3.67 -3.38 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4751 0.5249 0.0000 0 0 0.9643 0.0357 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 656 224 432 197 1 8 1 17 1 0 430 0 1 0.8795 0.0023 0.0046 26.875 0.26 12.71 -12.44 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1184 0.8816 0.0000
chr13 60528441 GATA G 0.187645 0.100 1 -3 4 433 119 314 60 0 4 0 55 0 0 312 0 2 0.5042 0.0000 0.0064 28.750 0.08 2.91 -2.83 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3636 0.5901 0.0463 1 1 0.3700 0.5817 0.0483 1 1 0.3780 0.5712 0.0508
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 673 163 510 14 2 38 3 106 0 1 499 2 8 0.0859 0.0000 0.0216 3.237 1.79 7.32 -5.54 8 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9978 0.0022
chr13 71866526 T TGCCGCCGCC 0.000826 0.100 1 9 1 673 163 510 16 5 37 10 95 0 3 499 2 6 0.0982 0.0000 0.0216 3.543 2.50 7.11 -4.61 8 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 121 56 65 50 0 4 0 2 0 0 65 0 0 0.8929 0.0000 0.0000 13.000 0.46 4.00 -3.54 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8683 0.1317 0.0000 0 0 0.9845 0.0155 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr13 77698098 T TGCC 0.001998 0.100 1 3 1 452 125 327 102 2 16 1 4 0 1 326 0 0 0.8160 0.0000 0.0031 7.267 3.18 5.50 -2.32 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8720 0.1280 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 742 138 604 0 0 22 6 110 0 1 594 0 9 0.0000 0.0000 0.0166 5.227 5.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr13 80337414 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 787 205 582 193 0 3 0 9 0 0 582 0 0 0.9415 0.0000 0.0000 67.333 0.16 1.00 -0.84 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5175 0.4825 0.0000 0 0 0.9732 0.0268 0.0000
chr13 99606717 AGGGCGGCGCGCGGAGCTGCGGCGGC A 0.500000 0.100 1 -25 2 169 89 80 58 0 1 0 30 0 0 79 0 1 0.6517 0.0000 0.0125 88.000 0.60 17.27 -16.66 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8212 0.1749 0.0039 1 0 0.8102 0.1851 0.0047 1 0 0.7944 0.1995 0.0061
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 487 90 397 25 2 40 3 20 1 2 385 5 4 0.2778 0.0025 0.0302 1.250 1.00 7.00 -6.00 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1785 0.5704 0.2510 1 1 0.1821 0.5652 0.2527 1 1 0.1868 0.5585 0.2547
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 608 128 480 71 3 4 0 50 0 0 479 0 1 0.5547 0.0000 0.0021 30.750 1.37 6.38 -5.01 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7067 0.2847 0.0085 1 0 0.6976 0.2924 0.0100 1 0 0.6847 0.3031 0.0123
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 285 91 194 32 1 10 0 48 0 0 194 0 0 0.3516 0.0000 0.0000 8.100 1.12 6.06 -4.94 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0292 0.3877 0.5832 1 2 0.0323 0.3929 0.5748 1 2 0.0368 0.4000 0.5631
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 265 89 176 2 0 31 0 56 0 0 175 0 1 0.0225 0.0000 0.0057 1.871 5.50 9.79 -4.29 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8235 0.1765 2 2 0.0000 0.3280 0.6720 2 2 0.0000 0.1851 0.8149
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 496 105 391 7 0 3 0 95 0 0 389 0 2 0.0667 0.0000 0.0051 34.000 0.29 3.20 -2.91 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9314 0.0686 2 2 0.0000 0.4467 0.5533
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 2481 555 1926 265 0 13 1 276 0 0 1926 0 0 0.4775 0.0000 0.0000 41.615 0.69 1.55 -0.86 67 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0050 0.8547 0.1403 1 1 0.0063 0.8337 0.1600 1 1 0.0083 0.8044 0.1873
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 1158 309 849 138 0 34 1 136 0 0 849 0 0 0.4466 0.0000 0.0000 8.088 0.13 1.29 -1.16 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1243 0.7914 0.0843 1 1 0.1342 0.7741 0.0917 1 1 0.1472 0.7511 0.1016
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 488 138 350 88 0 2 0 48 0 0 345 0 5 0.6377 0.0000 0.0143 68.000 0.32 19.00 -18.68 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9015 0.0979 0.0007 1 0 0.8938 0.1053 0.0008 1 0 0.8826 0.1162 0.0012
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.100 1 -6 1 652 171 481 153 0 13 0 5 0 0 481 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 12.154 0.63 6.40 -5.77 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1271 0.8729 0.0000 0 0 0.9760 0.0240 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000
chr14 21155337 CAGA C 0.002975 0.100 1 -3 1 444 91 353 43 0 4 0 44 0 0 351 0 2 0.4725 0.0000 0.0057 21.750 1.51 4.68 -3.17 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3231 0.6751 0.0017 1 1 0.3329 0.6653 0.0018 1 1 0.3456 0.6526 0.0018
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 436 113 323 35 0 7 0 71 0 0 322 0 1 0.3097 0.0000 0.0031 15.143 0.49 5.30 -4.81 19 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0015 0.1340 0.8646 1 2 0.0019 0.1462 0.8519 1 2 0.0027 0.1639 0.8333
chr14 23079578 C CGTGAAT 0.153649 0.100 1 6 2 439 114 325 40 0 9 0 65 0 0 324 0 1 0.3509 0.0000 0.0031 13.125 0.42 5.69 -5.27 24 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0185 0.4587 0.5228 1 2 0.0218 0.4714 0.5069 1 1 0.0269 0.4881 0.4850
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 667 200 467 179 1 10 0 10 0 0 467 0 0 0.8950 0.0000 0.0000 19.000 0.42 4.00 -3.58 79 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7435 0.2565 0.0000 0 0 0.9935 0.0065 0.0000
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 304 63 241 44 7 5 1 6 0 0 241 0 0 0.6984 0.0000 0.0000 14.000 3.30 4.50 -1.20 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0293 0.9707 0.0000 0 1 0.2668 0.7332 0.0000
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 308 70 238 12 0 5 3 50 0 0 238 0 0 0.1714 0.0000 0.0000 13.000 2.42 3.94 -1.52 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9711 0.0288 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.9961 0.0039
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 297 75 222 37 0 0 0 38 0 0 222 0 0 0.4933 0.0000 0.0000 75.000 0.38 1.21 -0.83 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3520 0.6105 0.0375 1 1 0.3590 0.6031 0.0379 1 1 0.3678 0.5937 0.0385
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 402 113 289 42 1 24 5 41 0 0 285 1 3 0.3717 0.0000 0.0138 3.708 0.40 5.22 -4.81 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1474 0.6345 0.2181 1 1 0.1550 0.6276 0.2174 1 1 0.1652 0.6187 0.2162
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 402 113 289 42 1 29 0 41 0 0 285 0 4 0.3717 0.0000 0.0138 2.897 0.33 5.56 -5.23 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2126 0.6176 0.1698 1 1 0.2186 0.6096 0.1718 1 1 0.2265 0.5995 0.1740
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 618 124 494 9 0 20 1 94 0 0 483 0 11 0.0726 0.0000 0.0223 5.200 0.67 7.23 -6.57 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9365 0.0635 2 2 0.0000 0.2792 0.7208
chr14 67198163 TGAA T 0.018726 0.100 1 -3 2 212 79 133 75 0 0 0 4 0 0 133 0 0 0.9494 0.0000 0.0000 79.000 0.12 3.50 -3.38 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2482 0.7518 0.0000 0 0 0.9691 0.0309 0.0000 0 0 0.9935 0.0065 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 615 152 463 0 0 22 3 127 0 0 459 0 4 0.0000 0.0000 0.0086 5.864 7.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr14 77027304 AGCG A 0.024120 0.100 1 -3 1 446 131 315 43 4 18 3 63 0 0 315 0 0 0.3282 0.0000 0.0000 6.588 1.28 4.16 -2.88 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0693 0.8494 0.0814 1 1 0.0774 0.8444 0.0783 1 1 0.0891 0.8368 0.0741
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 442 100 342 0 0 20 2 78 0 0 340 0 2 0.0000 0.0000 0.0058 4.000 6.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0239 0.9761 2 2 0.0000 0.0259 0.9741 2 2 0.0000 0.0289 0.9711
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 428 88 340 5 30 7 33 13 0 2 338 0 0 0.0568 0.0000 0.0059 26.000 0.60 4.38 -3.78 5 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0506 0.4587 0.4907 1 2 0.0550 0.4616 0.4834 1 2 0.0613 0.4655 0.4733
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 484 147 337 0 0 13 2 132 0 0 334 1 2 0.0000 0.0000 0.0089 10.308 3.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr14 100884333 C CTCT 0.265959 0.100 1 3 1 542 114 428 102 0 4 0 8 0 0 427 0 1 0.8947 0.0000 0.0023 27.500 0.41 2.88 -2.46 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0301 0.9699 0.0000 0 0 0.5470 0.4530 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 201 44 157 0 0 5 0 39 0 0 151 0 6 0.0000 0.0000 0.0382 7.800 8.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1156 0.8844 2 2 0.0000 0.1204 0.8796 2 2 0.0000 0.1274 0.8726
chr14 104707525 ACCCCAC A 0.082909 0.100 1 -6 2 494 79 415 10 0 6 2 61 0 0 410 0 5 0.1266 0.0000 0.0120 12.000 0.50 9.44 -8.94 10 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9960 0.0040
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.100 1 -12 2 501 81 420 12 3 28 2 36 0 0 416 0 4 0.1481 0.0000 0.0095 1.889 0.83 12.00 -11.17 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0338 0.4696 0.4966 1 1 0.0386 0.4826 0.4788 1 1 0.0458 0.4999 0.4543
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 380 88 292 0 0 18 1 69 0 0 288 2 2 0.0000 0.0000 0.0137 3.889 3.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0584 0.9416 2 2 0.0000 0.0628 0.9372 2 2 0.0000 0.0692 0.9308
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 265 71 194 37 0 6 5 23 0 0 194 0 0 0.5211 0.0000 0.0000 10.833 1.49 3.91 -2.43 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5661 0.4073 0.0266 1 0 0.5626 0.4090 0.0283 1 0 0.5576 0.4116 0.0307
chr15 22786677 AGCGGCG A 0.001053 0.100 1 -6 1 265 72 193 39 1 28 0 4 0 0 193 0 0 0.5417 0.0000 0.0000 1.720 1.33 7.25 -5.92 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4865 0.5135 0.0000 0 0 0.9895 0.0105 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr15 22866845 TAAGA T 0.262722 0.100 1 -4 5 268 52 216 29 0 4 0 19 0 0 215 0 1 0.5577 0.0000 0.0046 12.000 0.17 4.37 -4.20 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5660 0.4001 0.0339 1 0 0.5610 0.4030 0.0360 1 0 0.5540 0.4071 0.0389
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 1169 208 961 0 0 8 1 199 0 2 899 44 16 0.0000 0.0000 0.0645 24.875 4.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 2698 692 2006 0 0 12 4 676 0 5 1896 34 71 0.0000 0.0000 0.0548 56.667 3.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441523 TCCGCATCTTCTCCTCCTGCTC T 0.005169 0.100 1 -21 1 1846 565 1281 493 1 68 0 3 7 3 1269 2 0 0.8726 0.0055 0.0094 7.309 1.25 15.00 -13.75 231 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 30961018 A ACCT 0.000726 0.100 1 3 2 144 52 92 20 1 12 0 19 0 0 91 0 1 0.3846 0.0000 0.0109 3.333 0.25 3.16 -2.91 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4742 0.5255 0.0003 1 1 0.4770 0.5227 0.0003 1 1 0.4805 0.5192 0.0003
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 219 79 140 1 1 6 5 66 0 0 140 0 0 0.0127 0.0000 0.0000 11.500 0.00 1.89 -1.89 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6732 0.3268 2 2 0.0000 0.3029 0.6971 2 2 0.0000 0.1920 0.8080
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 675 177 498 0 0 40 2 135 0 0 494 1 3 0.0000 0.0000 0.0080 3.425 3.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr15 34038912 C CCCGCCGCCGCCT 0.002022 0.100 1 12 4 251 91 160 40 0 9 2 40 0 0 155 0 5 0.4396 0.0000 0.0312 9.000 0.42 10.90 -10.47 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2510 0.7471 0.0019 1 1 0.2620 0.7361 0.0019 1 1 0.2766 0.7215 0.0019
chr15 35084193 TCA T 0.022764 0.100 1 -2 2 785 171 614 166 0 0 0 5 0 0 614 0 0 0.9708 0.0000 0.0000 171.000 1.09 4.20 -3.11 134 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7532 0.2468 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 436 148 288 0 0 7 0 141 0 0 287 0 1 0.0000 0.0000 0.0035 20.143 2.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 532 142 390 82 2 11 1 46 0 0 386 0 4 0.5775 0.0000 0.0103 11.909 0.48 4.20 -3.72 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8955 0.1038 0.0007 1 0 0.8880 0.1111 0.0009 1 0 0.8771 0.1216 0.0013
chr15 65611120 G GTCCGTCGGCATAAACTT 0.000467 0.100 1 17 1 387 112 275 43 0 40 0 29 1 0 267 0 7 0.3839 0.0036 0.0291 1.800 0.60 11.69 -11.09 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5987 0.4013 0.0001 1 0 0.5985 0.4015 0.0001 1 0 0.5977 0.4022 0.0001
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 163 83 80 42 0 3 0 38 0 0 79 0 1 0.5060 0.0000 0.0125 26.667 0.17 3.03 -2.86 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2788 0.5836 0.1376 1 1 0.2809 0.5772 0.1418 1 1 0.2834 0.5692 0.1475
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 288 161 127 87 1 3 0 70 0 0 127 0 0 0.5404 0.0000 0.0000 52.667 0.25 3.50 -3.25 27 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5166 0.4622 0.0213 1 0 0.5126 0.4632 0.0242 1 0 0.5062 0.4651 0.0287
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 449 104 345 7 0 15 2 80 0 0 342 0 3 0.0673 0.0000 0.0087 5.933 0.14 4.34 -4.19 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9451 0.0549 2 1 0.0000 0.5018 0.4982
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 669 117 552 99 1 7 0 10 0 0 552 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 15.714 1.16 4.90 -3.74 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1474 0.8526 0.0000 0 0 0.9115 0.0885 0.0000
chr15 82688452 CG C 0.003305 0.100 1 -1 2 632 206 426 93 0 3 0 110 0 0 426 0 0 0.4515 0.0000 0.0000 67.667 0.23 1.24 -1.01 53 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0631 0.9307 0.0062 1 1 0.0720 0.9218 0.0062 1 1 0.0850 0.9088 0.0061
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 441 112 329 63 0 15 1 33 0 0 326 0 3 0.5625 0.0000 0.0091 6.467 0.11 13.42 -13.31 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8668 0.1320 0.0012 1 0 0.8592 0.1394 0.0014 1 0 0.8484 0.1498 0.0018
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 360 136 224 75 0 3 0 58 0 0 224 0 0 0.5515 0.0000 0.0000 66.500 0.27 3.29 -3.03 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6550 0.3356 0.0095 1 0 0.6509 0.3384 0.0107 1 0 0.6448 0.3427 0.0125
chr15 88472272 CAG C 0.005890 0.100 1 -2 3 348 146 202 85 0 1 1 59 0 0 200 0 2 0.5822 0.0000 0.0099 144.000 0.27 2.66 -2.39 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8284 0.1715 0.0000 1 0 0.8234 0.1765 0.0001 1 0 0.8163 0.1837 0.0001
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 1237 320 917 130 8 76 4 102 0 0 917 0 0 0.4062 0.0000 0.0000 3.211 0.24 3.09 -2.85 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8696 0.1302 0.0002 1 0 0.8658 0.1340 0.0002 1 0 0.8599 0.1398 0.0003
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 792 185 607 14 7 95 5 64 1 0 594 0 12 0.0757 0.0016 0.0214 2.049 3.29 11.14 -7.85 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 780 190 590 5 3 17 1 164 0 1 589 0 0 0.0263 0.0000 0.0017 10.750 0.80 9.42 -8.62 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 2 0.0000 0.3442 0.6558 2 2 0.0000 0.0272 0.9728
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 355 107 248 54 0 4 0 49 0 0 245 0 3 0.5047 0.0000 0.0121 25.750 0.28 6.82 -6.54 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0010 0.6720 0.3270 1 1 0.0010 0.6615 0.3375 1 1 0.0010 0.6481 0.3509
chr15 99712504 C CCAGCAG 0.003114 0.100 1 6 2 603 235 368 159 3 59 0 14 0 0 367 0 1 0.6766 0.0000 0.0027 2.983 0.88 5.57 -4.69 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1071 0.8929 0.0000 0 0 0.9819 0.0181 0.0000
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.100 1 -3 2 603 241 362 170 1 52 3 15 0 0 362 0 0 0.7054 0.0000 0.0000 3.635 1.03 3.07 -2.04 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3001 0.6999 0.0000
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 264 91 173 68 0 18 0 5 0 1 172 0 0 0.7473 0.0000 0.0058 4.056 1.16 10.60 -9.44 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0166 0.9834 0.0000 0 0 0.8372 0.1628 0.0000 0 0 0.9748 0.0252 0.0000
chr16 286888 C CA 0.009296 0.100 1 1 1 545 124 421 119 0 2 0 3 0 0 421 0 0 0.9597 0.0000 0.0000 61.000 0.17 1.00 -0.83 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9838 0.0162 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 323 98 225 55 1 0 0 42 0 0 225 0 0 0.5612 0.0000 0.0000 98.000 0.11 3.02 -2.91 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6181 0.3642 0.0177 1 0 0.6130 0.3675 0.0195 1 0 0.6056 0.3722 0.0222
chr16 666909 TGGA T 0.000064 0.100 1 -3 2 528 115 413 59 1 1 1 53 0 0 413 0 0 0.5130 0.0000 0.0000 114.000 0.75 3.32 -2.57 11 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5089 0.4911 0.0000 1 0 0.5137 0.4863 0.0000 1 0 0.5195 0.4805 0.0000
chr16 770636 CGGGTGAGGGGGGCTGGGCTCCACCAGGGGAGCCGCCTGGGGGGACG C 0.004222 0.100 1 -46 1 954 202 752 57 3 67 1 74 1 0 749 0 2 0.2822 0.0013 0.0040 2.000 1.86 3.31 -1.45 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0938 0.8968 0.0093 1 1 0.1038 0.8870 0.0091 1 1 0.1181 0.8731 0.0089
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 247 79 168 0 0 1 0 78 0 0 159 0 9 0.0000 0.0000 0.0536 78.000 16.71 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1078 0.8922 2 2 0.0000 0.1167 0.8833 2 2 0.0000 0.1300 0.8700
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 980 214 766 112 3 4 0 95 0 1 764 0 1 0.5234 0.0000 0.0026 69.667 1.10 1.23 -0.13 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6592 0.3371 0.0036 1 0 0.6596 0.3362 0.0042 1 0 0.6589 0.3360 0.0051
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 513 105 408 0 0 0 0 105 0 0 406 1 1 0.0000 0.0000 0.0049 105.000 7.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 513 105 408 0 0 0 0 105 0 0 406 1 1 0.0000 0.0000 0.0049 105.000 7.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2768163 TTCA T 0.000974 0.100 1 -3 1 428 114 314 107 1 5 0 1 0 0 313 1 0 0.9386 0.0000 0.0032 21.600 0.79 4.00 -3.21 15 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 4885975 T TCCA 0.001019 0.100 1 3 2 330 94 236 85 1 2 0 6 0 0 236 0 0 0.9043 0.0000 0.0000 46.000 0.16 2.50 -2.34 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1127 0.8873 0.0000 0 0 0.9918 0.0082 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 413 97 316 5 1 4 0 87 0 0 312 0 4 0.0515 0.0000 0.0127 23.000 0.00 3.05 -3.05 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.6370 0.3630 2 2 0.0000 0.1883 0.8117
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 424 132 292 35 3 60 1 33 1 1 283 3 4 0.2652 0.0034 0.0308 1.183 2.94 3.91 -0.97 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3120 0.6108 0.0772 1 1 0.3185 0.6032 0.0782 1 1 0.3269 0.5936 0.0795
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 210 73 137 0 0 2 1 70 0 0 137 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 35.000 2.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr16 18543716 GA G 0.002566 0.100 1 -1 1 296 124 172 117 2 2 0 3 0 0 172 0 0 0.9435 0.0000 0.0000 61.000 0.11 1.00 -0.89 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9954 0.0046 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.100 1 -1 1 319 160 159 80 0 5 0 75 1 0 157 0 1 0.5000 0.0063 0.0126 31.000 0.44 1.07 -0.63 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4056 0.5810 0.0134 1 1 0.4146 0.5712 0.0142 1 1 0.4257 0.5589 0.0153
chr16 22534766 TTCCACCCTCAGC T 0.000774 0.100 1 -12 4 3095 230 2865 152 1 19 0 58 0 1 2813 13 38 0.6609 0.0000 0.0182 11.105 1.65 13.09 -11.43 26 1/1 0/1 . . OK 1 0 0.9572 0.0428 0.0000 1 0 0.9541 0.0459 0.0000 1 0 0.9494 0.0506 0.0000
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.100 1 -12 1 687 225 462 22 0 12 0 191 0 0 461 0 1 0.0978 0.0000 0.0022 17.750 0.73 9.24 -8.51 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018
chr16 28495952 TCTCAGGCGGGGAGGAGGCTGAGACAGC T 0.000535 0.100 1 -27 2 1009 244 765 116 2 36 2 88 0 0 754 1 10 0.4754 0.0000 0.0144 5.750 1.01 12.18 -11.17 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6508 0.3492 0.0000 1 0 0.6543 0.3457 0.0000 1 0 0.6579 0.3421 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 167 91 76 4 0 6 2 79 0 0 75 0 1 0.0440 0.0000 0.0132 14.167 0.25 2.01 -1.76 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9899 0.0101 2 1 0.0000 0.5363 0.4637 2 2 0.0000 0.1955 0.8045
chr16 49396542 ACCTTCATAAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 2 252 111 141 53 0 0 1 57 0 0 136 0 5 0.4775 0.0000 0.0355 111.000 0.34 10.98 -10.64 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0563 0.5354 0.4083 1 1 0.0606 0.5319 0.4075 1 1 0.0668 0.5275 0.4057
chr16 51141744 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 933 259 674 195 9 44 0 11 0 0 674 0 0 0.7529 0.0000 0.0000 4.864 0.48 3.55 -3.06 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1786 0.8214 0.0000 0 0 0.9445 0.0555 0.0000
chr16 60358911 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 1986 447 1539 233 4 17 1 192 4 4 1515 8 8 0.5213 0.0026 0.0156 25.235 0.60 1.52 -0.92 95 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6477 0.3517 0.0006 1 0 0.6548 0.3445 0.0008 1 0 0.6617 0.3372 0.0011
chr16 71922608 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 284 134 150 108 0 20 0 6 0 0 150 0 0 0.8060 0.0000 0.0000 5.700 2.15 5.33 -3.19 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2701 0.7299 0.0000 0 0 0.8006 0.1994 0.0000
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 188 97 91 55 0 1 0 41 0 0 91 0 0 0.5670 0.0000 0.0000 96.000 0.18 3.88 -3.70 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5371 0.4294 0.0335 1 0 0.5309 0.4322 0.0368 1 0 0.5221 0.4362 0.0417
chr16 72797458 C CTTG 0.500000 0.100 1 3 1 679 160 519 74 5 29 0 52 0 0 515 0 4 0.4625 0.0000 0.0077 4.517 0.41 3.42 -3.02 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7116 0.2810 0.0074 1 0 0.7029 0.2884 0.0087 1 0 0.6905 0.2987 0.0108
chr16 72957801 GCCGCCGCCGCAGCCA G 0.500000 0.100 1 -15 2 733 234 499 197 8 12 2 15 0 0 498 0 1 0.8419 0.0000 0.0020 24.667 1.98 8.27 -6.29 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.2065 0.7935 0.0000
chr16 81035884 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 2 266 67 199 57 2 4 0 4 0 0 199 0 0 0.8507 0.0000 0.0000 15.500 1.40 3.25 -1.85 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.2109 0.7891 0.0000 0 0 0.5715 0.4285 0.0000
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 309 113 196 59 0 6 0 48 0 0 191 0 5 0.5221 0.0000 0.0255 17.833 1.03 14.98 -13.95 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3111 0.5943 0.0946 1 1 0.3131 0.5872 0.0997 1 1 0.3152 0.5782 0.1067
chr16 84236959 G GCCAGCTCCT 0.500000 0.100 1 9 2 634 163 471 124 0 31 0 8 0 0 470 0 1 0.7607 0.0000 0.0021 4.258 0.37 7.25 -6.88 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0327 0.9673 0.0000 0 0 0.5601 0.4399 0.0000
chr16 85656376 GGAGCGC G 0.500000 0.100 1 -6 3 469 97 372 49 0 17 0 31 0 0 371 0 1 0.5052 0.0000 0.0027 4.706 1.84 6.13 -4.29 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6304 0.3479 0.0217 1 0 0.6209 0.3548 0.0243 1 0 0.6075 0.3642 0.0283
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 438 119 319 9 0 43 1 66 0 0 310 1 8 0.0756 0.0000 0.0282 1.767 2.33 5.68 -3.35 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9969 0.0031 2 1 0.0000 0.8872 0.1128
chr16 87604287 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 438 129 309 84 9 29 0 7 0 0 309 0 0 0.6512 0.0000 0.0000 3.571 4.36 3.00 1.36 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0576 0.9424 0.0000 0 0 0.5080 0.4920 0.0000
chr16 88528131 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 297 119 178 101 1 5 0 12 0 0 178 0 0 0.8487 0.0000 0.0000 28.500 0.19 3.33 -3.15 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.0611 0.9389 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 662 115 547 5 0 5 4 101 0 0 534 0 13 0.0435 0.0000 0.0238 27.500 0.60 7.99 -7.39 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9942 0.0058 2 2 0.0000 0.3724 0.6276 2 2 0.0000 0.0778 0.9222
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 659 111 548 5 0 4 9 93 0 0 533 4 11 0.0450 0.0000 0.0274 35.667 0.60 8.23 -7.63 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9939 0.0061 2 2 0.0000 0.3645 0.6355 2 2 0.0000 0.0759 0.9241
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 662 112 550 6 0 3 1 102 0 2 526 9 13 0.0536 0.0000 0.0436 36.333 0.50 8.24 -7.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9036 0.0964 2 2 0.0000 0.2943 0.7057
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 717 156 561 70 0 7 2 77 1 0 558 0 2 0.4487 0.0018 0.0053 21.143 4.01 7.05 -3.04 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0524 0.5822 0.3654 1 1 0.0569 0.5753 0.3679 1 1 0.0632 0.5666 0.3702
chr16 88714227 G GGTGT 0.500000 0.100 1 4 1 713 149 564 76 8 5 3 57 0 1 561 0 2 0.5101 0.0000 0.0053 28.600 5.61 5.72 -0.11 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6899 0.3021 0.0080 1 0 0.6821 0.3085 0.0094 1 0 0.6708 0.3176 0.0116
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 549 146 403 134 1 1 0 10 0 0 403 0 0 0.9178 0.0000 0.0000 145.000 0.94 3.10 -2.16 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0198 0.9802 0.0000 0 0 0.5331 0.4669 0.0000
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 859 236 623 92 4 29 10 101 0 0 622 0 1 0.3898 0.0000 0.0016 7.000 0.87 3.14 -2.27 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0176 0.5040 0.4784 1 1 0.0200 0.4996 0.4803 1 1 0.0238 0.4948 0.4815
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 142 68 74 5 0 2 0 61 0 0 74 0 0 0.0735 0.0000 0.0000 33.000 0.00 3.93 -3.93 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9069 0.0931 2 1 0.0000 0.5620 0.4380
chr16 89283315 CTTTCTT C 0.500000 0.100 1 -6 2 975 198 777 186 2 5 0 5 0 0 777 0 0 0.9394 0.0000 0.0000 38.400 0.35 6.60 -6.25 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1770 0.8230 0.0000 0 0 0.9830 0.0170 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.100 1 -3 1 877 207 670 165 1 10 0 31 0 0 669 0 1 0.7971 0.0000 0.0015 21.889 0.29 3.45 -3.16 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 3433106 CCTTGCAGATA C 0.003246 0.100 1 -10 2 1069 228 841 210 0 7 0 11 0 0 841 0 0 0.9211 0.0000 0.0000 31.571 0.33 9.18 -8.85 104 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.9891 0.0109 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 377 159 218 88 0 6 0 65 0 0 218 0 0 0.5535 0.0000 0.0000 25.500 0.19 1.22 -1.02 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5865 0.4003 0.0132 1 0 0.5777 0.4068 0.0155 1 0 0.5649 0.4160 0.0191
chr17 4672141 ATCC A 0.002914 0.100 1 -3 1 828 171 657 156 3 6 0 6 0 0 657 0 0 0.9123 0.0000 0.0000 27.500 0.57 3.33 -2.76 68 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6467 0.3533 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 734 204 530 83 8 48 0 65 0 0 525 0 5 0.4069 0.0000 0.0094 3.250 0.20 3.02 -2.81 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5475 0.4363 0.0162 1 0 0.5410 0.4402 0.0188 1 0 0.5313 0.4458 0.0228
chr17 7848540 T TCAC 0.003062 0.100 1 3 1 1060 309 751 152 15 50 0 92 1 0 741 2 7 0.4919 0.0013 0.0133 5.160 0.99 4.07 -3.08 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9951 0.0049 0.0000 1 0 0.9943 0.0057 0.0000 1 0 0.9930 0.0070 0.0000
chr17 7848990 CCCT C 0.000015 0.100 1 -3 4 1054 251 803 138 0 5 0 108 0 0 802 0 1 0.5498 0.0000 0.0012 49.200 1.02 3.84 -2.82 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8406 0.1594 0.0000 1 0 0.8380 0.1620 0.0000 1 0 0.8338 0.1662 0.0000
chr17 12980176 G GCCAGCC 0.500000 0.100 1 6 1 283 125 158 107 0 15 0 3 0 0 158 0 0 0.8560 0.0000 0.0000 7.333 0.19 5.00 -4.81 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2327 0.7673 0.0000 0 0 0.8960 0.1040 0.0000 0 0 0.9633 0.0367 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 394 112 282 50 0 5 0 57 0 0 281 0 1 0.4464 0.0000 0.0035 21.400 0.66 7.79 -7.13 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0747 0.5606 0.3647 1 1 0.0794 0.5556 0.3649 1 1 0.0860 0.5495 0.3645
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 494 190 304 1 0 31 10 148 0 0 300 2 2 0.0053 0.0000 0.0132 5.129 0.00 3.14 -3.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 848 250 598 125 0 20 19 86 0 0 597 1 0 0.5000 0.0000 0.0017 11.474 0.50 4.34 -3.84 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6267 0.3673 0.0060 1 0 0.6243 0.3685 0.0072 1 0 0.6198 0.3711 0.0091
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 847 247 600 121 17 22 12 75 0 0 600 0 0 0.4899 0.0000 0.0000 13.938 0.50 4.05 -3.55 71 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9518 0.0481 0.0001 1 0 0.9468 0.0531 0.0001 1 0 0.9393 0.0605 0.0002
chr17 18778544 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 808 262 546 154 3 2 1 102 0 0 546 0 0 0.5878 0.0000 0.0000 129.500 0.18 1.19 -1.01 86 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9662 0.0338 0.0000 1 0 0.9624 0.0375 0.0000 1 0 0.9566 0.0433 0.0001
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 718 155 563 88 0 4 1 62 0 0 561 0 2 0.5677 0.0000 0.0036 37.500 0.33 3.87 -3.54 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6973 0.2957 0.0070 1 0 0.6897 0.3020 0.0083 1 0 0.6786 0.3111 0.0103
chr17 29761226 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 136 65 71 31 0 1 0 33 0 0 71 0 0 0.4769 0.0000 0.0000 64.000 0.13 1.52 -1.39 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1717 0.5731 0.2552 1 1 0.1755 0.5676 0.2569 1 1 0.1804 0.5607 0.2589
chr17 34962049 TGAGGAGGAGGAG T 0.500000 0.100 1 -12 1 744 143 601 86 2 1 1 53 0 0 594 0 7 0.6014 0.0000 0.0116 142.000 0.35 10.68 -10.33 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7748 0.2215 0.0037 1 0 0.7658 0.2297 0.0045 1 0 0.7528 0.2414 0.0058
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 136 75 61 64 1 6 0 4 0 0 61 0 0 0.8533 0.0000 0.0000 11.500 0.44 1.00 -0.56 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 1 0.2666 0.7334 0.0000 0 0 0.6424 0.3576 0.0000
chr17 40818962 T TGCCGCCGTGGCCGCCGCTGGAGCTTCC 0.500000 0.100 1 27 1 928 191 737 68 4 54 4 61 0 0 729 0 8 0.3560 0.0000 0.0109 2.444 2.41 8.00 -5.59 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1488 0.6674 0.1838 1 1 0.1548 0.6556 0.1896 1 1 0.1626 0.6405 0.1970
chr17 40819089 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 924 265 659 238 5 17 2 3 5 4 646 1 3 0.8981 0.0076 0.0197 14.471 2.20 16.00 -13.80 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0643 0.9357 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr17 41041248 GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCACAGCAGCGTGGCTGGCAGGAGCTGGTCTCACAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGAGCCGCAGGTCCCACTGGTGGAGCAGCTGGGAAATCCACAGAAGCTGGTCTGA G 0.500000 0.100 1 -138 2 926 358 568 307 0 11 0 40 0 0 568 0 0 0.8575 0.0000 0.0000 31.545 1.78 2.62 -0.85 93 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 41060049 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 795 212 583 107 7 5 8 85 0 0 580 1 2 0.5047 0.0000 0.0051 204.000 1.48 2.53 -1.05 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5055 0.4797 0.0149 1 0 0.5065 0.4764 0.0171 1 0 0.5065 0.4731 0.0204
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 794 214 580 18 2 9 2 183 0 0 576 0 4 0.0841 0.0000 0.0069 22.778 0.17 2.02 -1.85 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9685 0.0315
chr17 41084358 GGCCCCAGTGCTGCCAGTCTGTGTGCTGCCAACCCACCTGCTGTCGCCCCACCTGCTGTGAGACGACCTGCTGCCACCCTAGGTGCTGCATCTCCAGCTGCTGCCGCCCCAGCTGCTGTATGTCCAGCTGCTGCAA G 0.500000 0.100 1 -135 1 599 277 322 221 7 38 1 10 2 0 320 0 0 0.7978 0.0062 0.0062 6.211 1.52 2.50 -0.98 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5582 0.4418 0.0000 0 0 0.9865 0.0135 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 491 127 364 61 0 2 0 64 0 0 364 0 0 0.4803 0.0000 0.0000 62.500 0.72 1.48 -0.76 49 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1285 0.6386 0.2329 1 1 0.1340 0.6286 0.2374 1 1 0.1413 0.6159 0.2428
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 534 112 422 0 1 8 4 99 1 0 394 1 26 0.0000 0.0024 0.0664 12.625 7.32 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0150 0.9850 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 614 186 428 152 1 23 0 10 0 0 428 0 0 0.8172 0.0000 0.0000 7.087 0.41 12.80 -12.39 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0472 0.9528 0.0000 0 0 0.7323 0.2677 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1745 321 1424 183 1 3 1 133 0 0 1421 0 3 0.5701 0.0000 0.0021 105.667 0.39 3.23 -2.84 71 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9148 0.0851 0.0001 1 0 0.9100 0.0899 0.0001 1 0 0.9026 0.0973 0.0002
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 609 166 443 17 1 17 1 130 0 1 438 1 3 0.1024 0.0000 0.0113 8.765 0.53 3.77 -3.24 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9962 0.0038
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 293 101 192 58 0 4 0 39 0 0 192 0 0 0.5743 0.0000 0.0000 24.250 0.05 4.59 -4.54 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6611 0.3236 0.0153 1 0 0.6516 0.3309 0.0174 1 0 0.6383 0.3410 0.0207
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 479 119 360 50 0 21 0 48 0 0 350 0 10 0.4202 0.0000 0.0278 4.667 0.46 7.08 -6.62 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0747 0.5606 0.3647 1 1 0.0794 0.5556 0.3649 1 1 0.0860 0.5495 0.3645
chr17 48724360 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 441 155 286 146 1 2 2 4 0 0 286 0 0 0.9419 0.0000 0.0000 76.000 0.41 2.75 -2.34 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0166 0.9834 0.0000 0 0 0.7998 0.2002 0.0000 0 0 0.9693 0.0307 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 883 227 656 7 0 4 0 216 0 0 648 0 8 0.0308 0.0000 0.0122 55.750 1.71 2.93 -1.22 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9841 0.0159 2 2 0.0000 0.0233 0.9767 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr17 55822764 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 1 144 79 65 73 0 0 0 6 0 0 64 0 1 0.9241 0.0000 0.0154 79.000 0.70 2.00 -1.30 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0218 0.9782 0.0000 0 1 0.2789 0.7211 0.0000
chr17 57106431 GGCTTGGATAGAAATGAGGAGA G 0.500000 0.100 1 -21 3 1012 237 775 184 11 31 2 9 0 0 775 0 0 0.7764 0.0000 0.0000 6.581 1.30 4.78 -3.48 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1283 0.8717 0.0000 0 0 0.9180 0.0820 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 382 118 264 0 0 24 1 93 0 0 262 0 2 0.0000 0.0000 0.0076 3.917 5.70 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0094 0.9906
chr17 58756096 G GGAACCCGAACCC 0.500000 0.100 1 12 2 382 118 264 2 3 95 4 14 0 0 262 1 1 0.0169 0.0000 0.0076 0.217 10.00 6.07 3.93 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9942 0.0058 2 1 0.0000 0.9115 0.0885 2 1 0.0000 0.7331 0.2669
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 316 72 244 56 0 5 0 11 0 0 244 0 0 0.7778 0.0000 0.0000 13.400 0.50 7.36 -6.86 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0128 0.9872 0.0000
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.100 1 -2 3 310 87 223 78 0 0 0 9 0 0 222 1 0 0.8966 0.0000 0.0045 87.000 0.27 1.89 -1.62 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.0792 0.9208 0.0000
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 139 70 69 58 1 3 0 8 0 0 69 0 0 0.8286 0.0000 0.0000 22.333 0.07 0.88 -0.81 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0039 0.9961 0.0000 0 1 0.0944 0.9056 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 546 112 434 0 0 6 0 106 0 0 417 0 17 0.0000 0.0000 0.0392 17.667 7.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.100 1 -54 1 271 78 193 56 0 5 0 17 0 0 193 0 0 0.7179 0.0000 0.0000 14.600 0.45 1.12 -0.67 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9386 0.0610 0.0004 1 0 0.7883 0.2113 0.0005 0 1 0.1437 0.8562 0.0001
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 2 881 310 571 168 0 7 0 135 0 0 566 0 5 0.5419 0.0000 0.0088 43.286 0.19 2.10 -1.91 74 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6362 0.3613 0.0025 1 0 0.6375 0.3594 0.0031 1 0 0.6375 0.3584 0.0041
chr17 76077366 TGTCCTGGCCC T 0.500000 0.100 1 -10 3 466 130 336 120 0 7 0 3 0 0 335 0 1 0.9231 0.0000 0.0030 17.571 0.57 10.00 -9.43 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0587 0.9413 0.0000 0 0 0.8500 0.1500 0.0000 0 0 0.9629 0.0371 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2287 515 1772 2 6 77 17 413 0 3 1750 4 15 0.0039 0.0000 0.0124 5.592 2.50 6.97 -4.47 2 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2180 555 1625 0 0 26 3 526 0 0 1434 25 166 0.0000 0.0000 0.1175 20.346 4.42 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 81462974 AAGGTGAGGCCCGGAC A 0.500000 0.100 1 -15 1 797 215 582 196 0 15 0 4 1 0 580 0 1 0.9116 0.0017 0.0034 13.333 0.92 12.25 -11.33 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2550 0.7450 0.0000 0 0 0.9892 0.0108 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr17 82519935 CGGGCGGCGGGGCCGG C 0.500000 0.100 1 -15 1 344 76 268 43 1 7 0 25 0 0 265 0 3 0.5658 0.0000 0.0112 9.714 2.42 13.28 -10.86 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6111 0.3623 0.0266 1 0 0.6015 0.3689 0.0295 1 0 0.5882 0.3779 0.0339
chr18 48226 ATG A 0.000609 0.100 1 -2 2 2293 592 1701 500 1 17 0 74 1 0 1700 0 0 0.8446 0.0006 0.0006 35.875 0.50 2.53 -2.02 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 286 68 218 42 0 3 0 23 0 0 218 0 0 0.6176 0.0000 0.0000 21.667 0.69 1.43 -0.74 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7364 0.2527 0.0109 1 0 0.7260 0.2616 0.0124 1 0 0.7115 0.2737 0.0148
chr18 11689670 CGGCCCT C 0.001376 0.100 1 -6 4 447 118 329 62 0 3 0 53 0 0 329 0 0 0.5254 0.0000 0.0000 38.333 0.53 5.68 -5.15 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5809 0.4190 0.0001 1 0 0.5829 0.4170 0.0001 1 0 0.5849 0.4150 0.0002
chr18 21452083 GCGATGACCTAGA G 0.000946 0.100 1 -12 2 362 106 256 2 0 1 0 103 0 0 241 0 15 0.0189 0.0000 0.0586 105.000 0.00 11.43 -11.43 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9955 0.0045 2 1 0.0000 0.9608 0.0392 2 1 0.0000 0.9255 0.0745
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 287 121 166 0 0 7 1 113 0 0 161 1 4 0.0000 0.0000 0.0301 16.286 2.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 203 82 121 51 0 1 1 29 0 0 121 0 0 0.6220 0.0000 0.0000 80.000 0.04 4.86 -4.82 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7048 0.2825 0.0127 1 0 0.6929 0.2924 0.0147 1 0 0.6763 0.3059 0.0178
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 124 56 68 29 0 0 0 27 0 0 68 0 0 0.5179 0.0000 0.0000 56.000 0.07 3.00 -2.93 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2610 0.5634 0.1756 1 1 0.2622 0.5587 0.1791 1 1 0.2636 0.5527 0.1837
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 361 169 192 81 0 5 0 83 0 0 191 1 0 0.4793 0.0000 0.0052 32.800 0.25 3.19 -2.95 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1171 0.6839 0.1990 1 1 0.1234 0.6711 0.2055 1 1 0.1318 0.6547 0.2135
chr18 54224211 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 323 68 255 34 0 5 1 28 0 0 255 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 12.400 0.38 4.00 -3.62 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3417 0.5420 0.1163 1 1 0.3404 0.5387 0.1209 1 1 0.3384 0.5346 0.1269
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 252 142 110 0 0 11 0 131 0 0 110 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.909 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 754 161 593 9 0 2 2 148 0 0 576 0 17 0.0559 0.0000 0.0287 79.500 0.22 13.34 -13.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7759 0.2241 2 2 0.0000 0.0889 0.9111
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 337 61 276 31 2 6 2 20 0 1 272 1 2 0.5082 0.0000 0.0145 9.167 2.23 4.70 -2.47 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4540 0.4760 0.0700 1 1 0.4486 0.4771 0.0744 1 1 0.4410 0.4786 0.0804
chr18 63655777 T TGCCA 0.500000 0.100 1 4 2 355 90 265 47 0 4 0 39 0 0 256 1 8 0.5222 0.0000 0.0340 21.500 0.19 6.13 -5.94 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1750 0.6133 0.2117 1 1 0.1795 0.6049 0.2156 1 1 0.1853 0.5944 0.2203
chr18 63655779 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 355 90 265 48 0 4 2 36 0 0 256 4 5 0.5333 0.0000 0.0340 21.500 0.19 6.39 -6.20 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2132 0.6130 0.1738 1 1 0.2170 0.6047 0.1783 1 1 0.2217 0.5942 0.1841
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 157 71 86 6 0 6 0 59 0 0 85 0 1 0.0845 0.0000 0.0116 10.833 0.00 2.73 -2.73 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9674 0.0326 2 1 0.0000 0.7190 0.2810
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 145 63 82 49 6 3 0 5 0 0 81 0 1 0.7778 0.0000 0.0122 20.000 0.06 3.00 -2.94 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0256 0.9744 0.0000 0 1 0.2347 0.7653 0.0000
chr18 74556356 GTGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 145 65 80 58 0 1 0 6 0 0 80 0 0 0.8923 0.0000 0.0000 64.000 0.33 3.33 -3.01 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0296 0.9704 0.0000 0 1 0.2618 0.7382 0.0000
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 530 250 280 84 3 27 4 132 0 1 279 0 0 0.3360 0.0000 0.0036 8.840 3.26 5.02 -1.76 4 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0003 0.1115 0.8882 1 2 0.0004 0.1215 0.8781 1 2 0.0006 0.1364 0.8629
chr19 621458 G GGCAGGT 0.002400 0.100 1 6 1 602 146 456 63 0 11 0 72 0 0 446 0 10 0.4315 0.0000 0.0219 12.273 0.76 5.93 -5.17 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0688 0.9240 0.0072 1 1 0.0774 0.9156 0.0070 1 1 0.0900 0.9034 0.0067
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.100 1 4 1 636 129 507 123 0 0 0 6 0 0 507 0 0 0.9535 0.0000 0.0000 129.000 0.69 5.67 -4.98 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.6629 0.3371 0.0000 0 0 0.9543 0.0457 0.0000
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.100 1 -27 1 321 70 251 42 0 2 1 25 1 0 248 0 2 0.6000 0.0040 0.0120 34.000 1.74 23.16 -21.42 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7027 0.2873 0.0100 1 0 0.6955 0.2934 0.0111 1 0 0.6856 0.3018 0.0127
chr19 1395488 G GCGC 0.003752 0.100 1 3 1 1027 197 830 141 3 45 0 8 0 0 830 0 0 0.7157 0.0000 0.0000 3.378 0.71 4.50 -3.79 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 0 0.9865 0.0135 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 143 48 95 34 0 1 0 13 0 0 95 0 0 0.7083 0.0000 0.0000 47.000 0.44 5.31 -4.87 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8268 0.1693 0.0039 1 0 0.8154 0.1801 0.0045 1 0 0.7764 0.2183 0.0053
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 227 123 104 115 0 1 0 7 0 0 104 0 0 0.9350 0.0000 0.0000 122.000 0.14 2.71 -2.58 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3870 0.6130 0.0000 0 0 0.9118 0.0882 0.0000
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.100 1 3 2 321 69 252 45 5 17 0 2 0 0 252 0 0 0.6522 0.0000 0.0000 3.059 0.64 3.50 -2.86 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8053 0.1947 0.0000 0 0 0.9755 0.0245 0.0000 0 0 0.9885 0.0115 0.0000
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 294 98 196 0 1 9 1 87 0 0 195 0 1 0.0000 0.0000 0.0051 9.778 7.43 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0676 0.9324 2 2 0.0000 0.0729 0.9271 2 2 0.0000 0.0810 0.9190
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 294 106 188 13 2 80 5 6 0 0 188 0 0 0.1226 0.0000 0.0000 0.267 0.85 16.33 -15.49 11 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6040 0.3678 0.0282 1 0 0.5961 0.3742 0.0297 1 0 0.5813 0.3873 0.0314
chr19 2934014 CAT C 0.000001 0.100 1 -2 1 658 146 512 78 0 1 2 65 0 0 512 0 0 0.5342 0.0000 0.0000 145.000 0.56 2.29 -1.73 24 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5978 0.4022 0.0000 1 0 0.6004 0.3996 0.0000 1 0 0.6031 0.3969 0.0000
chr19 3613266 G GTCGCCC 0.000354 0.100 1 6 2 326 73 253 48 0 4 0 21 0 0 252 0 1 0.6575 0.0000 0.0040 17.250 1.00 4.90 -3.90 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9032 0.0968 0.0000 1 0 0.8966 0.1034 0.0000 1 0 0.8871 0.1129 0.0000
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 812 195 617 142 7 41 0 5 0 0 617 0 0 0.7282 0.0000 0.0000 3.756 0.51 3.60 -3.09 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1509 0.8491 0.0000 0 0 0.9803 0.0197 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000
chr19 5832066 A AG 0.000937 0.100 1 1 1 904 225 679 121 0 4 0 100 0 0 679 0 0 0.5378 0.0000 0.0000 55.250 0.45 1.17 -0.72 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7304 0.2696 0.0000 1 0 0.7307 0.2693 0.0000 1 0 0.7302 0.2698 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 622 165 457 90 0 14 0 61 0 0 450 0 7 0.5455 0.0000 0.0153 10.786 0.69 11.48 -10.79 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7398 0.2563 0.0039 1 0 0.7344 0.2610 0.0046 1 0 0.7264 0.2680 0.0057
chr19 8906017 A AGGT 0.002480 0.100 1 3 1 371 131 240 66 0 4 0 61 0 0 239 0 1 0.5038 0.0000 0.0042 31.750 0.33 3.85 -3.52 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4416 0.5579 0.0005 1 1 0.4495 0.5499 0.0005 1 1 0.4593 0.5401 0.0006
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 289 65 224 7 0 9 0 49 0 0 214 0 10 0.1077 0.0000 0.0446 6.222 4.14 5.35 -1.20 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9948 0.0052 2 1 0.0000 0.9156 0.0844
chr19 10560338 ATCTTCCTCCTCC A 0.000985 0.100 1 -12 1 246 87 159 80 0 4 0 3 0 0 159 0 0 0.9195 0.0000 0.0000 20.750 0.57 8.67 -8.09 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9871 0.0129 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 13207858 CCTG C 0.175850 0.100 1 -3 1 396 123 273 0 0 19 92 12 0 0 269 4 0 0.0000 0.0000 0.0147 5.474 3.25 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0182 0.9818 2 2 0.0000 0.0203 0.9797 2 2 0.0000 0.0237 0.9763
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 396 124 272 0 0 26 2 96 0 0 268 0 4 0.0000 0.0000 0.0147 3.920 5.92 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0126 0.9874 2 2 0.0000 0.0139 0.9861 2 2 0.0000 0.0160 0.9840
chr19 13208877 G GGGT 0.007683 0.100 1 3 5 619 187 432 83 77 19 2 6 1 0 431 0 0 0.4439 0.0023 0.0023 8.842 0.83 3.83 -3.00 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 0 0.9877 0.0123 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr19 14053768 TCGG T 0.001329 0.100 1 -3 2 435 108 327 54 2 1 0 51 0 0 323 0 4 0.5000 0.0000 0.0122 107.000 0.09 3.29 -3.20 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3899 0.6097 0.0004 1 1 0.3988 0.6008 0.0004 1 1 0.4101 0.5895 0.0005
chr19 14799631 CAGA C 0.002283 0.100 1 -3 1 734 169 565 86 1 4 0 78 0 0 563 0 2 0.5089 0.0000 0.0035 41.250 1.41 5.19 -3.79 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4673 0.5324 0.0003 1 1 0.4761 0.5236 0.0003 1 1 0.4867 0.5129 0.0003
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 537 95 442 0 0 4 0 91 0 0 441 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 22.750 3.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr19 17286674 GTGTGTGTGTGTGTGTGTT G 0.001437 0.100 1 -18 1 357 79 278 29 4 16 5 25 0 0 278 0 0 0.3671 0.0000 0.0000 3.812 3.97 5.28 -1.31 3 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5048 0.4948 0.0004 1 0 0.5074 0.4922 0.0004 1 0 0.5104 0.4892 0.0004
chr19 17286690 GTT G 0.132491 0.100 1 -2 1 355 67 288 0 1 1 12 53 0 0 288 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 63.000 3.21 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.2430 0.7570 2 2 0.0000 0.2486 0.7514 2 2 0.0000 0.2587 0.7413
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 105 44 61 5 0 2 0 37 0 0 59 0 2 0.1136 0.0000 0.0328 21.000 0.60 4.30 -3.70 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9911 0.0089 2 1 0.0000 0.9342 0.0658
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 951 204 747 104 0 4 0 96 0 0 741 0 6 0.5098 0.0000 0.0080 50.000 0.21 3.11 -2.90 72 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2831 0.6987 0.0182 1 1 0.2968 0.6838 0.0194 1 1 0.3144 0.6646 0.0209
chr19 21727814 GTTTAA G 0.000004 0.100 1 -5 2 989 196 793 108 0 6 0 82 0 0 792 0 1 0.5510 0.0000 0.0013 31.667 0.18 4.88 -4.70 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8236 0.1764 0.0000 1 0 0.8200 0.1800 0.0000 1 0 0.8145 0.1855 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 293 90 203 64 0 12 1 13 0 0 203 0 0 0.7111 0.0000 0.0000 6.417 0.31 3.00 -2.69 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 576 131 445 54 0 5 0 72 0 0 443 0 2 0.4122 0.0000 0.0045 25.200 0.69 3.31 -2.62 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0049 0.2568 0.7383 1 2 0.0056 0.2622 0.7321 1 2 0.0068 0.2699 0.7233
chr19 35511476 TGCC T 0.000477 0.100 1 -3 1 582 225 357 35 104 17 8 61 0 0 357 0 0 0.1556 0.0000 0.0000 67.333 1.80 14.48 -12.68 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9922 0.0078 0.0000 1 0 0.9909 0.0091 0.0000 1 0 0.9889 0.0111 0.0000
chr19 35511483 ACTGCTGCCG A 0.000396 0.100 1 -9 2 585 231 354 47 22 7 10 145 0 0 354 0 0 0.2035 0.0000 0.0000 37.333 3.00 11.10 -8.10 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0000 0.5876 0.4124 1 1 0.0001 0.6464 0.3536 1 1 0.0001 0.7182 0.2817
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.100 1 -3 1 588 212 376 30 1 16 60 105 0 0 375 0 1 0.1415 0.0000 0.0027 12.000 3.20 10.38 -7.18 6 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 36141122 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGA 0.000083 0.100 1 18 5 511 158 353 127 2 21 0 8 2 0 347 0 4 0.8038 0.0057 0.0170 6.524 0.88 9.12 -8.24 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9594 0.0406 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 38081727 GGCCACC G 0.001020 0.100 1 -6 3 688 218 470 128 0 31 1 58 0 0 468 0 2 0.5872 0.0000 0.0043 6.000 0.37 5.62 -5.25 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9968 0.0032 0.0000 1 0 0.9961 0.0039 0.0000 1 0 0.9950 0.0050 0.0000
chr19 38304906 TGAA T 0.163680 0.100 1 -3 1 364 100 264 55 1 4 0 40 0 1 263 0 0 0.5500 0.0000 0.0038 24.000 0.93 3.35 -2.42 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7332 0.2619 0.0049 1 0 0.7271 0.2674 0.0056 1 0 0.7184 0.2751 0.0066
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 541 135 406 120 0 12 0 3 0 0 405 0 1 0.8889 0.0000 0.0025 10.250 0.41 19.67 -19.26 42 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5229 0.4771 0.0000 0 0 0.9901 0.0099 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 443 134 309 5 1 2 3 123 0 0 303 0 6 0.0373 0.0000 0.0194 64.500 0.00 3.11 -3.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9952 0.0048 2 2 0.0000 0.4248 0.5752 2 2 0.0000 0.0961 0.9039
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 224 40 184 0 0 2 35 3 0 0 184 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 17.500 4.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0409 0.9591 2 2 0.0000 0.0425 0.9575 2 2 0.0000 0.0447 0.9553
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 224 38 186 0 0 22 14 2 0 0 185 1 0 0.0000 0.0000 0.0054 1.000 0.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0777 0.9223 2 2 0.0000 0.0797 0.9203 2 2 0.0000 0.0824 0.9176
chr19 40394272 TTCC T 0.017263 0.100 1 -3 1 594 138 456 59 1 21 1 56 0 0 456 0 0 0.4275 0.0000 0.0000 5.571 0.58 3.86 -3.28 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4231 0.5727 0.0042 1 1 0.4309 0.5647 0.0044 1 1 0.4406 0.5548 0.0046
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 424 110 314 0 0 4 0 106 0 0 314 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 26.500 6.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 483 144 339 124 0 6 0 14 0 1 338 0 0 0.8611 0.0000 0.0029 23.000 0.47 2.36 -1.89 84 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.1777 0.8223 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 442 133 309 129 0 0 0 4 0 0 308 0 1 0.9699 0.0000 0.0032 133.000 0.19 6.75 -6.56 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0148 0.9852 0.0000 0 0 0.8112 0.1888 0.0000 0 0 0.9674 0.0326 0.0000
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 542 157 385 83 0 1 1 72 0 0 382 0 3 0.5287 0.0000 0.0078 155.000 0.19 3.19 -3.00 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2313 0.6728 0.0959 1 1 0.2349 0.6622 0.1029 1 1 0.2389 0.6486 0.1125
chr19 44273268 T TA 0.000227 0.100 1 1 1 510 127 383 66 1 3 0 57 0 0 380 0 3 0.5197 0.0000 0.0078 41.000 0.09 1.23 -1.14 38 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5132 0.4868 0.0000 1 0 0.5184 0.4815 0.0000 1 0 0.5246 0.4754 0.0000
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 572 135 437 56 0 3 1 75 0 0 436 0 1 0.4148 0.0000 0.0023 44.000 0.50 2.92 -2.42 6 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0323 0.5949 0.3728 1 1 0.0371 0.5992 0.3637 1 1 0.0443 0.6047 0.3510
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 265 113 152 62 0 7 0 44 0 0 152 0 0 0.5487 0.0000 0.0000 15.143 1.34 2.11 -0.77 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7771 0.2225 0.0003 1 0 0.7719 0.2277 0.0004 1 0 0.7645 0.2350 0.0004
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 1221 381 840 168 0 79 0 134 0 0 808 0 32 0.4409 0.0000 0.0381 3.823 0.24 6.12 -5.88 82 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1028 0.8335 0.0637 1 1 0.1130 0.8158 0.0711 1 1 0.1269 0.7916 0.0815
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 308 78 230 40 0 21 1 16 0 0 219 0 11 0.5128 0.0000 0.0478 2.714 0.50 14.62 -14.12 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6735 0.3192 0.0073 1 0 0.6685 0.3235 0.0080 1 0 0.6616 0.3295 0.0089
chr19 46016106 TCGTCCCGGGAGCGCTCCG T 0.003109 0.100 1 -18 1 365 95 270 89 0 3 0 3 1 0 269 0 0 0.9368 0.0037 0.0037 30.667 0.96 12.67 -11.71 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9756 0.0244 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 47379900 T TGGA 0.000410 0.100 1 3 1 246 96 150 79 2 12 0 3 0 0 149 0 1 0.8229 0.0000 0.0067 7.000 0.20 3.00 -2.80 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9543 0.0457 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 49153600 T TTCC 0.000490 0.100 1 3 1 438 92 346 50 3 5 0 34 0 0 346 0 0 0.5435 0.0000 0.0000 17.400 0.78 4.53 -3.75 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8045 0.1955 0.0000 1 0 0.7983 0.2017 0.0000 1 0 0.7896 0.2104 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 1007 238 769 94 4 50 62 28 0 2 762 3 2 0.3950 0.0000 0.0091 3.896 0.81 3.86 -3.05 24 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2756 0.6679 0.0565 1 1 0.2844 0.6548 0.0608 1 1 0.2952 0.6381 0.0667
chr19 49423273 C CCAG 0.003387 0.100 1 3 1 306 139 167 67 1 15 0 56 0 0 166 1 0 0.4820 0.0000 0.0060 8.267 0.25 2.95 -2.69 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6163 0.3834 0.0002 1 0 0.6173 0.3824 0.0003 1 0 0.6180 0.3818 0.0003
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 542 129 413 0 0 24 1 104 0 2 405 2 4 0.0000 0.0000 0.0194 4.333 6.78 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0379 0.9621 2 2 0.0000 0.0235 0.9765 2 2 0.0000 0.0191 0.9809
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.100 1 -18 2 657 230 427 111 1 52 0 66 0 0 427 0 0 0.4826 0.0000 0.0000 3.423 0.37 10.53 -10.16 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9730 0.0270 0.0000 1 0 0.9700 0.0300 0.0000 1 0 0.9653 0.0347 0.0000
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 680 139 541 4 1 6 126 2 0 0 535 5 1 0.0288 0.0000 0.0111 32.500 0.00 2.00 -2.00 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9863 0.0137 2 2 0.0000 0.2284 0.7716 2 2 0.0000 0.0423 0.9577
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 680 144 536 1 0 7 4 132 0 0 531 0 5 0.0069 0.0000 0.0093 19.571 0.00 3.20 -3.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0133 0.9867 2 2 0.0000 0.0049 0.9951 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.100 1 6 2 533 110 423 58 0 7 0 45 0 0 420 0 3 0.5273 0.0000 0.0071 14.714 0.14 5.67 -5.53 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6119 0.3870 0.0011 1 0 0.6121 0.3867 0.0012 1 0 0.6118 0.3869 0.0013
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 557 154 403 63 0 8 10 73 0 0 400 0 3 0.4091 0.0000 0.0074 18.250 0.43 2.86 -2.43 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0046 0.2544 0.7410 1 2 0.0054 0.2601 0.7345 1 2 0.0067 0.2682 0.7250
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 216 94 122 11 0 6 0 77 0 0 121 0 1 0.1170 0.0000 0.0082 14.667 0.18 2.09 -1.91 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9105 0.0895
chr19 52906242 CACT C 0.001583 0.100 1 -3 1 1022 227 795 127 1 2 0 97 0 0 791 0 4 0.5595 0.0000 0.0050 112.500 0.41 3.22 -2.81 83 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8247 0.1753 0.0000 1 0 0.8220 0.1779 0.0000 1 0 0.8177 0.1823 0.0000
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 1379 304 1075 0 0 5 1 298 0 0 1073 1 1 0.0000 0.0000 0.0019 59.800 3.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 667 169 498 3 3 20 1 142 0 0 498 0 0 0.0178 0.0000 0.0000 10.643 3.33 2.12 1.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8193 0.1807 2 2 0.0000 0.0626 0.9374 2 2 0.0000 0.0122 0.9878
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 711 150 561 87 0 6 1 56 0 0 559 0 2 0.5800 0.0000 0.0036 24.000 0.45 3.80 -3.36 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8092 0.1882 0.0026 1 0 0.8004 0.1964 0.0032 1 0 0.7878 0.2081 0.0042
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 445 108 337 44 0 21 0 43 0 0 329 1 7 0.4074 0.0000 0.0237 4.143 0.86 8.28 -7.42 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0887 0.5613 0.3501 1 1 0.0935 0.5564 0.3500 1 1 0.1002 0.5504 0.3495
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 631 134 497 0 0 19 0 115 0 1 459 0 37 0.0000 0.0000 0.0765 6.053 19.24 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr19 55483704 GCAGGAGGTGACCACAGTCCAGCTCCAGCCAGCA G 0.000002 0.100 1 -33 1 557 162 395 153 1 4 0 4 0 0 395 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 39.500 0.57 2.75 -2.18 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 55518174 C CATCCCACCATGACTGCTG 0.004924 0.100 1 18 1 847 199 648 118 4 9 16 52 0 3 624 4 17 0.5930 0.0000 0.0370 23.625 3.46 9.19 -5.73 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9247 0.0753 0.0000 1 0 0.9205 0.0795 0.0000 1 0 0.9143 0.0857 0.0000
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 807 245 562 16 0 35 9 185 0 0 553 0 9 0.0653 0.0000 0.0160 6.147 0.25 4.46 -4.21 12 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7766 0.2234
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 531 98 433 0 0 5 1 92 0 0 425 1 7 0.0000 0.0000 0.0185 18.600 3.47 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0066 0.9934
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 342 128 214 124 0 2 0 2 0 0 214 0 0 0.9688 0.0000 0.0000 63.000 0.15 4.00 -3.85 82 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9731 0.0269 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 345 119 226 54 0 3 0 62 0 0 226 0 0 0.4538 0.0000 0.0000 38.667 0.24 2.03 -1.79 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0624 0.5519 0.3857 1 1 0.0666 0.5466 0.3868 1 1 0.0723 0.5402 0.3875
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 94 46 48 24 0 2 0 20 0 0 48 0 0 0.5217 0.0000 0.0000 22.000 0.29 6.90 -6.61 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2617 0.5555 0.1827 1 1 0.2604 0.5521 0.1875 1 1 0.2585 0.5478 0.1937
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.100 1 3 1 409 100 309 56 0 4 0 40 0 0 307 1 1 0.5600 0.0000 0.0065 24.000 1.04 3.65 -2.61 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7013 0.2955 0.0032 1 0 0.6971 0.2993 0.0036 1 0 0.6912 0.3047 0.0041
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 642 206 436 196 0 2 1 7 0 0 436 0 0 0.9515 0.0000 0.0000 102.000 0.13 8.71 -8.59 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.8634 0.1366 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 642 213 429 195 3 8 1 6 0 0 429 0 0 0.9155 0.0000 0.0000 25.500 0.12 8.83 -8.72 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0128 0.9872 0.0000 0 0 0.9556 0.0444 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 646 211 435 194 2 2 0 13 0 0 435 0 0 0.9194 0.0000 0.0000 104.500 0.19 8.23 -8.05 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0299 0.9701 0.0000 0 0 0.8508 0.1492 0.0000
chr20 3785200 T TTCC 0.003046 0.100 1 3 4 517 91 426 74 1 11 0 5 0 0 426 0 0 0.8132 0.0000 0.0000 7.273 0.77 5.40 -4.63 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1850 0.8150 0.0000 0 0 0.9855 0.0145 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr20 3785245 TTCC T 0.001133 0.100 1 -3 1 521 124 397 104 3 4 0 13 0 0 397 0 0 0.8387 0.0000 0.0000 30.000 0.53 4.38 -3.86 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1521 0.8479 0.0000 0 0 0.9741 0.0259 0.0000
chr20 4699448 CCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCT C 0.009335 0.100 1 -24 4 843 265 578 231 1 21 0 12 0 0 578 0 0 0.8717 0.0000 0.0000 11.619 0.38 5.33 -4.95 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9700 0.0300 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 237 89 148 4 0 1 0 84 0 0 148 0 0 0.0449 0.0000 0.0000 88.000 0.00 1.27 -1.27 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9832 0.0168 2 2 0.0000 0.3951 0.6049 2 2 0.0000 0.1201 0.8799
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 676 206 470 101 0 6 0 99 0 0 467 0 3 0.4903 0.0000 0.0064 33.333 0.24 5.67 -5.43 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1347 0.7312 0.1341 1 1 0.1428 0.7161 0.1410 1 1 0.1535 0.6965 0.1500
chr20 31605404 GCAGCAC G 0.000501 0.100 1 -6 2 390 107 283 98 0 2 0 7 0 0 281 1 1 0.9159 0.0000 0.0071 52.500 0.65 5.71 -5.06 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.9515 0.0485 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr20 32019130 A AGGC 0.001324 0.100 1 3 5 476 87 389 71 0 13 0 3 0 0 389 0 0 0.8161 0.0000 0.0000 5.692 0.65 3.00 -2.35 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9730 0.0270 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr20 33037687 AG A 0.000600 0.100 1 -1 1 250 123 127 111 0 0 0 12 0 0 126 0 1 0.9024 0.0000 0.0079 123.000 0.12 1.42 -1.30 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2953 0.7047 0.0000 0 0 0.9886 0.0114 0.0000
chr20 33663701 TGCGGCGGCAAGAGGC T 0.003375 0.100 1 -15 1 585 174 411 90 0 13 0 71 0 0 409 0 2 0.5172 0.0000 0.0049 12.385 0.48 12.97 -12.49 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7072 0.2927 0.0001 1 0 0.7063 0.2936 0.0001 1 0 0.7042 0.2957 0.0001
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 446 155 291 0 3 1 0 151 0 0 278 0 13 0.0000 0.0000 0.0447 151.000 3.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr20 41361519 G GCTGAAGTTTCTGGGCTGTGTC 0.000578 0.100 1 21 1 720 158 562 75 0 19 0 64 0 0 562 0 0 0.4747 0.0000 0.0000 7.316 0.28 9.02 -8.74 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6006 0.3994 0.0000 1 0 0.6029 0.3971 0.0000 1 0 0.6051 0.3948 0.0000
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 950 290 660 126 0 43 13 108 0 0 656 0 4 0.4345 0.0000 0.0061 5.744 0.19 3.30 -3.11 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0987 0.7769 0.1245 1 1 0.1056 0.7602 0.1342 1 1 0.1146 0.7381 0.1473
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 562 288 274 116 5 39 103 25 0 0 273 1 0 0.4028 0.0000 0.0036 6.324 0.41 3.72 -3.31 58 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2046 0.7338 0.0616 1 1 0.2158 0.7179 0.0664 1 1 0.2300 0.6972 0.0728
chr20 47651119 GCAA G 0.005778 0.100 1 -3 1 563 283 280 115 11 12 19 126 0 0 280 0 0 0.4064 0.0000 0.0000 24.100 0.22 3.27 -3.05 45 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0558 0.9365 0.0076 1 1 0.0646 0.9276 0.0078 1 1 0.0776 0.9145 0.0080
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 215 31 184 0 0 5 0 26 0 0 176 1 7 0.0000 0.0000 0.0435 5.200 5.58 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 278 157 121 68 0 2 0 87 0 0 121 0 0 0.4331 0.0000 0.0000 77.500 0.28 2.53 -2.25 30 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0063 0.3109 0.6828 1 2 0.0073 0.3139 0.6789 1 2 0.0087 0.3185 0.6728
chr21 30598756 T TA 0.001158 0.100 1 1 1 228 111 117 58 0 2 0 51 0 0 117 0 0 0.5225 0.0000 0.0000 54.500 0.14 1.10 -0.96 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5393 0.4606 0.0002 1 0 0.5427 0.4572 0.0002 1 0 0.5465 0.4533 0.0002
chr21 31559541 AC A 0.000554 0.100 1 -1 1 633 136 497 129 1 2 0 4 0 0 497 0 0 0.9485 0.0000 0.0000 67.000 0.62 1.50 -0.88 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9948 0.0052 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 763 198 565 183 0 4 1 10 0 0 565 0 0 0.9242 0.0000 0.0000 48.500 0.30 5.50 -5.20 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0690 0.9310 0.0000 0 0 0.8544 0.1456 0.0000
chr21 33489028 ATCTTCT A 0.001520 0.100 1 -6 1 694 159 535 145 0 8 0 6 0 0 535 0 0 0.9119 0.0000 0.0000 18.875 0.35 5.33 -4.98 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6378 0.3622 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 769 211 558 108 3 21 1 78 2 1 552 2 1 0.5118 0.0036 0.0108 8.905 1.24 13.68 -12.44 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8798 0.1198 0.0004 1 0 0.8742 0.1253 0.0005 1 0 0.8659 0.1334 0.0007
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 230 106 124 14 0 5 0 87 0 0 123 0 1 0.1321 0.0000 0.0081 20.200 0.36 3.16 -2.80 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9880 0.0120
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 329 49 280 0 0 3 2 44 0 0 278 1 1 0.0000 0.0000 0.0071 15.000 2.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1000 176 824 86 1 5 3 81 0 0 819 2 3 0.4886 0.0000 0.0061 42.500 0.91 3.23 -2.33 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0980 0.6979 0.2041 1 1 0.1027 0.6843 0.2130 1 1 0.1089 0.6666 0.2245
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1005 177 828 86 2 4 7 78 0 0 823 2 3 0.4859 0.0000 0.0060 42.750 0.80 3.37 -2.57 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0924 0.6955 0.2121 1 1 0.0971 0.6818 0.2210 1 1 0.1033 0.6642 0.2325
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 561 106 455 29 2 13 0 62 0 0 452 0 3 0.2736 0.0000 0.0066 9.300 5.07 13.85 -8.79 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0011 0.1028 0.8960 1 2 0.0015 0.1114 0.8871 1 2 0.0020 0.1238 0.8742
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 338 143 195 0 0 16 1 126 0 0 195 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.938 8.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.100 1 6 1 4603 1456 3147 1215 4 36 1 200 0 0 3133 0 14 0.8345 0.0000 0.0044 39.417 0.28 6.33 -6.06 123 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 214 105 109 56 1 5 1 42 0 0 109 0 0 0.5333 0.0000 0.0000 20.000 0.32 3.00 -2.68 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6415 0.3457 0.0128 1 0 0.6370 0.3489 0.0141 1 0 0.6304 0.3536 0.0161
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 781 156 625 4 0 35 0 117 1 1 602 1 20 0.0256 0.0016 0.0368 3.457 0.25 15.45 -15.20 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9007 0.0993 2 2 0.0000 0.0315 0.9685 2 2 0.0000 0.0047 0.9953
chr22 27798924 T TTGC 0.004414 0.100 1 3 1 1470 504 966 207 10 65 9 213 1 1 963 0 1 0.4107 0.0010 0.0031 6.738 0.49 3.32 -2.83 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0729 0.9264 0.0007 1 1 0.0859 0.9133 0.0008 1 1 0.1053 0.8938 0.0009
chr22 27798944 G GC 0.000153 0.100 1 1 1 1479 494 985 260 20 199 7 8 0 0 985 0 0 0.5263 0.0000 0.0000 1.555 0.64 4.38 -3.74 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2298 0.7702 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 27798945 T TGC 0.000131 0.100 1 2 1 1477 494 983 398 70 13 3 10 0 0 983 0 0 0.8057 0.0000 0.0000 58.625 1.54 5.20 -3.66 48 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 28800510 T TGCC 0.004563 0.100 1 3 1 353 118 235 105 1 8 0 4 0 0 234 0 1 0.8898 0.0000 0.0043 13.750 1.59 3.25 -1.66 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4202 0.5798 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr22 29489138 G GAAACAA 0.000822 0.100 1 6 2 1000 227 773 196 1 17 0 13 0 0 772 0 1 0.8634 0.0000 0.0013 12.353 0.47 5.31 -4.84 116 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8845 0.1155 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr22 30428672 T TA 0.000840 0.100 1 1 2 226 70 156 67 0 0 0 3 0 0 156 0 0 0.9571 0.0000 0.0000 70.000 0.16 1.00 -0.84 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9792 0.0208 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 598 198 400 179 0 6 0 13 0 0 399 0 1 0.9040 0.0000 0.0025 32.000 0.57 2.08 -1.51 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.4409 0.5591 0.0000
chr22 36265995 AATAATT A 0.003695 0.100 1 -6 1 488 127 361 71 0 2 0 54 0 0 361 0 0 0.5591 0.0000 0.0000 62.500 0.52 6.20 -5.68 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7442 0.2557 0.0001 1 0 0.7406 0.2593 0.0001 1 0 0.7353 0.2646 0.0001
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 452 222 230 109 0 41 0 72 0 0 227 1 2 0.4910 0.0000 0.0130 4.415 0.17 5.83 -5.66 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8996 0.1000 0.0003 1 0 0.8938 0.1057 0.0004 1 0 0.8853 0.1141 0.0006
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 324 170 154 146 1 16 0 7 0 0 151 0 3 0.8588 0.0000 0.0195 9.625 0.12 9.00 -8.88 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0661 0.9339 0.0000 0 0 0.7976 0.2024 0.0000
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 221 110 111 6 0 6 0 98 0 0 109 0 2 0.0545 0.0000 0.0180 17.333 0.83 4.03 -3.20 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8895 0.1105 2 2 0.0000 0.4232 0.5768
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 296 117 179 3 0 3 0 111 0 0 174 0 5 0.0256 0.0000 0.0279 38.000 0.00 2.97 -2.97 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4677 0.5323 2 2 0.0000 0.0298 0.9702 2 2 0.0000 0.0101 0.9899
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 484 178 306 97 0 13 3 65 0 0 306 0 0 0.5449 0.0000 0.0000 12.692 0.12 3.05 -2.92 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8550 0.1441 0.0009 1 0 0.8485 0.1503 0.0011 1 0 0.8392 0.1593 0.0015
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1546 387 1159 368 1 6 0 12 6 0 1152 0 1 0.9509 0.0052 0.0060 63.500 2.76 9.58 -6.82 132 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 585 113 472 0 0 10 2 101 0 0 469 0 3 0.0000 0.0000 0.0064 10.300 7.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0766 0.9234 2 2 0.0000 0.0847 0.9153 2 2 0.0000 0.0971 0.9029
chr22 46363187 CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA C 0.006403 0.100 1 -27 3 256 119 137 58 0 27 0 34 0 0 132 0 5 0.4874 0.0000 0.0365 3.407 0.38 20.71 -20.33 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8023 0.1976 0.0001 1 0 0.7964 0.2035 0.0001 1 0 0.7880 0.2118 0.0002
chr22 46364133 CGTGCGCGAGGAT C 0.000801 0.100 1 -12 1 414 108 306 44 0 3 0 61 0 0 304 0 2 0.4074 0.0000 0.0065 35.000 1.25 11.61 -10.36 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0823 0.9149 0.0029 1 1 0.0912 0.9061 0.0027 1 1 0.1040 0.8934 0.0026
839 rows