File Info

Filename
HG02760_x_HG02818_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG02760_x_HG02818_FF_10.features.tsv
Size
178.6 KB
Workflow Run
adaptive-alpha-features-6a271fed
Published
Jun 08, 2026 1:08 PM

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1708833 TCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCTTC T 0.500000 0.100 1 -24 2 555 250 305 218 0 25 0 7 0 0 305 0 0 0.8720 0.0000 0.0000 9.000 0.42 22.43 -22.01 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0116 0.9884 0.0000 0 0 0.9688 0.0312 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 481 185 296 103 2 31 0 49 0 0 293 1 2 0.5568 0.0000 0.0101 4.968 0.25 3.00 -2.75 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9789 0.0211 0.0000 1 0 0.9756 0.0243 0.0000 1 0 0.9705 0.0294 0.0001
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 832 269 563 26 87 51 3 102 0 0 561 0 2 0.0967 0.0000 0.0036 4.275 0.19 3.27 -3.08 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1527 0.7359 0.1114 1 1 0.1607 0.7205 0.1187 1 1 0.1711 0.7005 0.1284
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 545 120 425 0 0 23 4 93 0 1 419 0 5 0.0000 0.0000 0.0141 4.174 3.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0098 0.9902
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.100 1 3 2 280 102 178 96 0 3 0 3 0 0 178 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 33.000 0.19 3.33 -3.15 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1450 0.8550 0.0000 0 0 0.8321 0.1679 0.0000 0 0 0.9389 0.0611 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 355 102 253 77 0 1 0 24 0 0 253 0 0 0.7549 0.0000 0.0000 101.000 0.45 1.00 -0.55 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9829 0.0171 0.0000 1 0 0.9470 0.0530 0.0000 0 1 0.1856 0.8144 0.0000
chr1 21474942 TGTCTCCCAG T 0.500000 0.100 1 -9 1 171 72 99 51 0 0 0 21 0 0 99 0 0 0.7083 0.0000 0.0000 72.000 0.14 8.10 -7.96 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8710 0.1267 0.0023 1 0 0.8604 0.1368 0.0028 1 0 0.8445 0.1518 0.0038
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 793 212 581 54 53 6 31 68 0 0 581 0 0 0.2547 0.0000 0.0000 37.200 6.74 27.44 -20.70 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1788 0.7122 0.1090 1 1 0.1863 0.6979 0.1158 1 1 0.1959 0.6794 0.1247
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 820 215 605 11 0 28 3 173 0 0 600 0 5 0.0512 0.0000 0.0083 6.889 0.45 15.65 -15.19 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9343 0.0657 2 2 0.0000 0.1496 0.8504
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.100 1 -24 1 698 182 516 168 0 4 0 10 0 0 514 0 2 0.9231 0.0000 0.0039 44.500 0.51 24.10 -23.59 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0123 0.9877 0.0000 0 0 0.6107 0.3893 0.0000
chr1 27373179 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 282 116 166 62 0 1 0 53 0 0 166 0 0 0.5345 0.0000 0.0000 115.000 0.29 1.32 -1.03 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3833 0.5523 0.0644 1 1 0.3833 0.5477 0.0690 1 1 0.3825 0.5421 0.0754
chr1 28150032 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 542 142 400 64 0 3 0 75 0 0 398 0 2 0.4507 0.0000 0.0050 46.333 0.30 1.32 -1.02 38 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0349 0.5058 0.4593 1 1 0.0385 0.5033 0.4582 1 1 0.0437 0.5005 0.4558
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 411 154 257 1 0 6 1 146 0 0 256 0 1 0.0065 0.0000 0.0039 24.667 1.00 3.09 -2.09 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0049 0.9951 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr1 35114681 GATA G 0.500000 0.100 1 -3 1 984 235 749 218 1 7 0 9 0 0 748 0 1 0.9277 0.0000 0.0013 32.571 0.26 3.11 -2.85 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5719 0.4281 0.0000 0 0 0.9853 0.0147 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 606 155 451 5 0 20 1 129 0 0 448 1 2 0.0323 0.0000 0.0067 6.750 0.80 6.08 -5.28 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9871 0.0129 2 2 0.0000 0.2119 0.7881 2 2 0.0000 0.0377 0.9623
chr1 53459700 G GCCGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 543 139 404 66 2 23 1 47 0 0 402 0 2 0.4748 0.0000 0.0050 5.000 0.20 6.81 -6.61 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6100 0.3721 0.0179 1 0 0.6028 0.3769 0.0203 1 0 0.5925 0.3836 0.0239
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 611 161 450 125 6 17 0 13 0 0 450 0 0 0.7764 0.0000 0.0000 8.471 0.22 3.23 -3.01 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.1206 0.8794 0.0000
chr1 55214867 G GGCC 0.500000 0.100 1 3 4 224 64 160 32 1 12 0 19 0 0 159 0 1 0.5000 0.0000 0.0063 4.333 0.41 3.26 -2.86 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5583 0.3993 0.0424 1 0 0.5491 0.4047 0.0461 1 0 0.5366 0.4120 0.0514
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 4 784 141 643 9 1 9 2 120 0 0 641 0 2 0.0638 0.0000 0.0031 14.444 0.00 3.42 -3.42 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9751 0.0249 2 2 0.0000 0.4982 0.5018
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 283 86 197 35 0 9 6 36 0 0 197 0 0 0.4070 0.0000 0.0000 7.889 0.69 5.33 -4.65 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1128 0.5561 0.3310 1 1 0.1175 0.5518 0.3307 1 1 0.1238 0.5464 0.3298
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 171 85 86 79 0 2 0 4 1 0 85 0 0 0.9294 0.0116 0.0116 41.500 0.44 4.25 -3.81 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0081 0.9919 0.0000 0 1 0.4346 0.5654 0.0000 0 0 0.7883 0.2117 0.0000
chr1 84574315 C CGCAGCGCCA 0.500000 0.100 1 9 2 390 160 230 65 2 36 0 57 0 0 216 0 14 0.4062 0.0000 0.0609 3.444 7.89 7.98 -0.09 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1112 0.6462 0.2426 1 1 0.1169 0.6357 0.2474 1 1 0.1245 0.6223 0.2532
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 390 180 210 92 0 28 0 60 0 0 205 0 5 0.5111 0.0000 0.0238 5.429 5.04 8.57 -3.52 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7681 0.2283 0.0036 1 0 0.7594 0.2362 0.0044 1 0 0.7469 0.2474 0.0057
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 473 146 327 11 0 4 2 129 0 0 326 0 1 0.0753 0.0000 0.0031 47.000 0.00 5.76 -5.76 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9939 0.0061 2 1 0.0000 0.6523 0.3477
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.100 1 -6 1 470 150 320 4 1 22 0 123 0 0 320 0 0 0.0267 0.0000 0.0000 5.773 0.00 5.97 -5.97 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9378 0.0622 2 2 0.0000 0.1438 0.8562 2 2 0.0000 0.0353 0.9647
chr1 89150468 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 320 100 220 91 1 1 0 7 0 0 220 0 0 0.9100 0.0000 0.0000 99.000 0.21 1.00 -0.79 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0561 0.9439 0.0000 0 1 0.4959 0.5041 0.0000
chr1 90716915 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 1 717 162 555 142 3 9 0 8 0 0 555 0 0 0.8765 0.0000 0.0000 17.000 0.94 3.12 -2.18 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2206 0.7794 0.0000 0 0 0.8715 0.1285 0.0000
chr1 92074789 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 805 247 558 127 0 3 0 117 0 0 558 0 0 0.5142 0.0000 0.0000 81.333 0.34 1.23 -0.89 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2783 0.6834 0.0383 1 1 0.2874 0.6699 0.0427 1 1 0.2983 0.6526 0.0491
chr1 92482940 G GCTGTCTGGGGATGCGGAGGCT 0.500000 0.100 1 21 1 388 138 250 100 0 32 0 6 0 0 248 0 2 0.7246 0.0000 0.0080 3.312 0.28 15.33 -15.05 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0289 0.9711 0.0000 0 1 0.4315 0.5685 0.0000
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 167 82 85 39 0 4 0 39 0 0 85 0 0 0.4756 0.0000 0.0000 19.500 0.23 3.05 -2.82 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2028 0.5945 0.2028 1 1 0.2063 0.5875 0.2063 1 1 0.2107 0.5786 0.2107
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 485 137 348 12 1 7 3 114 0 0 340 0 8 0.0876 0.0000 0.0230 18.429 0.08 3.28 -3.20 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9066 0.0934
chr1 111319160 A ATGCCCCTCAGGAAG 0.500000 0.100 1 14 3 489 150 339 131 1 15 0 3 1 0 338 0 0 0.8733 0.0029 0.0029 8.933 1.50 10.67 -9.16 55 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5290 0.4710 0.0000 0 0 0.9691 0.0309 0.0000 0 0 0.9893 0.0107 0.0000
chr1 111414895 TCACAGGGGTCACAGACTGATGACC T 0.500000 0.100 1 -24 1 896 203 693 146 3 22 5 27 0 0 679 4 10 0.7192 0.0000 0.0202 10.056 1.13 25.26 -24.13 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9871 0.0129 0.0000 0 1 0.0100 0.9900 0.0000
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.100 1 -45 4 903 241 662 130 1 21 1 88 0 0 661 1 0 0.5394 0.0000 0.0015 10.900 2.13 8.73 -6.60 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9062 0.0936 0.0003 1 0 0.8995 0.1001 0.0004 1 0 0.8897 0.1097 0.0006
chr1 111477748 A AG 0.500000 0.100 1 1 4 678 181 497 102 0 1 0 78 0 0 496 0 1 0.5635 0.0000 0.0020 180.000 0.24 1.09 -0.85 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6633 0.3298 0.0069 1 0 0.6578 0.3340 0.0082 1 0 0.6494 0.3403 0.0102
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 663 168 495 73 8 19 3 65 0 0 495 0 0 0.4345 0.0000 0.0000 7.737 0.63 3.60 -2.97 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4577 0.5089 0.0334 1 1 0.4570 0.5061 0.0369 1 1 0.4551 0.5029 0.0420
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 199 72 127 1 0 6 0 65 0 0 126 0 1 0.0139 0.0000 0.0079 11.000 0.00 2.31 -2.31 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2416 0.7584 2 2 0.0000 0.0969 0.9031 2 2 0.0000 0.0717 0.9283
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 275 113 162 51 1 12 0 49 0 0 162 0 0 0.4513 0.0000 0.0000 8.333 0.78 6.00 -5.22 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2435 0.6126 0.1440 1 1 0.2468 0.6043 0.1489 1 1 0.2507 0.5938 0.1554
chr1 152107679 C CCGGTACTGCCGGTCT 0.500000 0.100 1 15 3 1168 226 942 128 0 16 0 82 0 0 908 0 34 0.5664 0.0000 0.0361 13.125 0.28 11.15 -10.87 82 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3218 0.6484 0.0298 1 1 0.3302 0.6362 0.0335 1 1 0.3400 0.6210 0.0390
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 291 95 196 57 6 14 1 17 0 0 196 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 5.714 0.25 2.82 -2.58 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9198 0.0801 0.0001 0 1 0.3356 0.6643 0.0001 0 1 0.0182 0.9818 0.0000
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 238 66 172 0 0 11 0 55 0 0 151 0 21 0.0000 0.0000 0.1221 5.000 9.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0203 0.9797 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr1 152776532 C CCAGCTCTGGGGGCTGCTG 0.500000 0.100 1 18 1 860 295 565 227 1 58 0 9 0 0 561 0 4 0.7695 0.0000 0.0071 4.069 0.13 15.00 -14.87 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0787 0.9213 0.0000 0 0 0.9379 0.0621 0.0000
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 825 230 595 25 0 28 0 177 1 0 586 1 7 0.1087 0.0017 0.0151 8.080 1.32 5.94 -4.62 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1288 312 976 1 1 74 6 230 0 0 908 0 68 0.0032 0.0000 0.0697 3.292 6.00 10.70 -4.70 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 153934801 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 628 249 379 133 4 25 4 83 0 0 379 0 0 0.5341 0.0000 0.0000 54.750 0.34 3.77 -3.43 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9281 0.0717 0.0002 1 0 0.9222 0.0776 0.0002 1 0 0.9132 0.0864 0.0003
chr1 154869723 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 1097 297 800 108 17 77 87 8 0 1 795 4 0 0.3636 0.0000 0.0063 2.882 4.49 3.25 1.24 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6957 0.3006 0.0037 1 0 0.6912 0.3044 0.0045 1 0 0.6839 0.3103 0.0058
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 221 88 133 38 2 2 1 45 0 0 132 0 1 0.4318 0.0000 0.0075 42.000 1.58 2.29 -0.71 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0878 0.5464 0.3658 1 1 0.0926 0.5426 0.3648 1 1 0.0990 0.5379 0.3630
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 499 107 392 0 0 1 2 104 0 0 391 0 1 0.0000 0.0000 0.0026 106.000 2.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1113 226 887 98 0 5 0 123 0 0 887 0 0 0.4336 0.0000 0.0000 44.200 0.34 1.52 -1.18 36 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0047 0.3300 0.6653 1 2 0.0056 0.3328 0.6616 1 2 0.0072 0.3374 0.6554
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.100 1 3 1 149 70 79 65 0 4 0 1 0 0 79 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 16.500 0.08 4.00 -3.92 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7485 0.2515 0.0000 0 0 0.8986 0.1014 0.0000 0 0 0.9250 0.0750 0.0000
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 197 70 127 65 1 1 0 3 0 0 127 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 69.000 0.09 1.00 -0.91 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0359 0.9641 0.0000 0 0 0.5260 0.4740 0.0000 0 0 0.7821 0.2179 0.0000
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 322 86 236 41 0 6 0 39 0 0 236 0 0 0.4767 0.0000 0.0000 13.333 0.44 1.79 -1.36 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2439 0.5921 0.1640 1 1 0.2465 0.5852 0.1683 1 1 0.2495 0.5766 0.1739
chr1 201039955 AGTAGCTCT A 0.500000 0.100 1 -8 1 881 229 652 141 0 6 0 82 0 0 648 0 4 0.6157 0.0000 0.0061 37.167 0.45 7.66 -7.20 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9745 0.0254 0.0000 1 0 0.9712 0.0288 0.0000 1 0 0.9660 0.0340 0.0000
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 625 158 467 95 1 3 2 57 0 0 459 5 3 0.6013 0.0000 0.0171 51.333 0.84 4.53 -3.68 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7934 0.2039 0.0027 1 0 0.7847 0.2120 0.0033 1 0 0.7721 0.2236 0.0043
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 626 158 468 98 0 0 1 59 0 0 460 0 8 0.6203 0.0000 0.0171 158.000 0.80 4.41 -3.61 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8109 0.1870 0.0021 1 0 0.8023 0.1951 0.0026 1 0 0.7897 0.2068 0.0035
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 529 245 284 121 13 47 2 62 0 0 282 0 2 0.4939 0.0000 0.0070 4.213 0.20 3.13 -2.93 75 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9938 0.0062 0.0000 1 0 0.9926 0.0074 0.0000 1 0 0.9905 0.0095 0.0000
chr1 223363360 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 2 282 110 172 86 0 19 0 5 0 0 172 0 0 0.7818 0.0000 0.0000 4.789 0.12 2.40 -2.28 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2636 0.7364 0.0000 0 0 0.7240 0.2760 0.0000
chr1 225204248 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 3 88 49 39 45 0 2 0 2 0 0 39 0 0 0.9184 0.0000 0.0000 23.500 0.29 3.00 -2.71 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1042 0.8958 0.0000 0 0 0.5295 0.4705 0.0000 0 0 0.7110 0.2890 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 710 143 567 75 0 11 1 56 0 0 564 0 3 0.5245 0.0000 0.0053 12.000 0.47 8.82 -8.35 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5188 0.4547 0.0265 1 0 0.5154 0.4551 0.0295 1 0 0.5100 0.4560 0.0340
chr1 234609199 A AGCT 0.500000 0.100 1 3 2 480 97 383 74 2 15 0 6 2 0 380 0 1 0.7629 0.0052 0.0078 5.467 2.54 5.17 -2.63 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0278 0.9722 0.0000 0 1 0.3304 0.6696 0.0000
chr1 235213963 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 159 45 114 30 0 5 0 10 0 0 114 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 8.000 0.13 2.80 -2.67 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7335 0.2525 0.0139 1 0 0.6844 0.3004 0.0151 1 1 0.4883 0.4986 0.0132
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 248 111 137 56 0 4 0 51 0 0 137 0 0 0.5045 0.0000 0.0000 26.750 0.07 1.24 -1.16 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2934 0.5994 0.1072 1 1 0.2957 0.5920 0.1124 1 1 0.2982 0.5826 0.1193
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 665 166 499 1 0 14 2 149 0 0 494 1 4 0.0060 0.0000 0.0100 10.857 1.00 3.52 -2.52 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr1 240207646 C CGCCCCCTCTACCCGGAGCGGCAAT 0.500000 0.100 1 24 2 420 90 330 32 11 34 4 9 0 0 326 3 1 0.3556 0.0000 0.0121 1.606 5.66 21.78 -16.12 6 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8169 0.1776 0.0055 1 0 0.8040 0.1894 0.0066 1 0 0.7704 0.2215 0.0081
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 561 155 406 58 0 3 0 94 0 0 403 0 3 0.3742 0.0000 0.0074 50.667 1.38 1.40 -0.02 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.0822 0.9174 1 2 0.0005 0.0894 0.9100 1 2 0.0008 0.1001 0.8992
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1269 290 979 42 0 3 0 245 0 0 976 0 3 0.1448 0.0000 0.0031 95.667 1.64 1.22 0.42 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 774 262 512 120 0 3 0 139 0 1 511 0 0 0.4580 0.0000 0.0020 86.333 1.28 4.19 -2.90 96 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0126 0.5389 0.4484 1 1 0.0147 0.5310 0.4543 1 1 0.0179 0.5219 0.4602
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 938 141 797 95 0 3 0 43 0 0 794 0 3 0.6738 0.0000 0.0038 46.000 1.77 4.35 -2.58 55 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9698 0.0301 0.0001 1 0 0.9656 0.0343 0.0001 1 0 0.9590 0.0409 0.0001
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 464 121 343 45 1 4 0 71 0 0 341 0 2 0.3719 0.0000 0.0058 29.250 1.24 6.87 -5.63 23 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0038 0.1971 0.7991 1 2 0.0046 0.2065 0.7889 1 2 0.0059 0.2197 0.7743
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 648 129 519 116 0 3 0 10 0 0 519 0 0 0.8992 0.0000 0.0000 42.000 0.28 3.20 -2.92 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 1 0.3123 0.6877 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 233 105 128 0 0 4 0 101 0 0 126 0 2 0.0000 0.0000 0.0156 25.250 3.74 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0073 0.9927 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0093 0.9907
chr2 20667362 G GGGCGGC 0.021395 0.100 1 6 5 423 147 276 0 0 20 0 127 0 0 261 1 14 0.0000 0.0000 0.0543 6.350 7.30 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0322 0.9678 2 2 0.0000 0.0370 0.9630 2 2 0.0000 0.0449 0.9551
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 423 147 276 2 1 19 5 120 0 0 261 3 12 0.0136 0.0000 0.0543 6.684 7.50 7.18 0.32 2 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0271 0.9729 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 539 168 371 92 0 22 0 54 0 0 370 0 1 0.5476 0.0000 0.0027 6.636 0.41 7.61 -7.20 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9293 0.0704 0.0003 1 0 0.9233 0.0764 0.0004 1 0 0.9144 0.0851 0.0005
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.100 1 9 1 486 120 366 56 0 22 1 41 0 0 364 0 2 0.4667 0.0000 0.0055 4.409 0.18 8.95 -8.77 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6563 0.3399 0.0038 1 0 0.6539 0.3419 0.0041 1 0 0.6502 0.3452 0.0046
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 240 62 178 9 0 1 0 52 0 0 173 0 5 0.1452 0.0000 0.0281 61.000 0.67 3.23 -2.56 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.9530 0.0470
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 444 108 336 53 1 16 0 38 0 0 332 1 3 0.4907 0.0000 0.0119 5.750 0.19 2.61 -2.42 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4857 0.4699 0.0444 1 0 0.4812 0.4705 0.0482 1 0 0.4746 0.4716 0.0537
chr2 39769817 ATTC A 0.500000 0.100 1 -3 3 487 113 374 55 0 6 0 52 0 0 370 0 4 0.4867 0.0000 0.0107 17.833 0.25 3.06 -2.80 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1660 0.6317 0.2023 1 1 0.1710 0.6221 0.2069 1 1 0.1774 0.6100 0.2126
chr2 43765562 AAGC A 0.500000 0.100 1 -3 1 230 102 128 55 0 5 0 42 0 0 128 0 0 0.5392 0.0000 0.0000 19.400 0.07 3.00 -2.93 11 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5093 0.4519 0.0387 1 0 0.5041 0.4535 0.0423 1 0 0.4966 0.4559 0.0475
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 534 189 345 44 1 99 0 45 0 0 344 0 1 0.2328 0.0000 0.0029 0.909 0.34 1.82 -1.48 6 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1762 0.6086 0.2152 1 1 0.1806 0.6006 0.2189 1 1 0.1862 0.5905 0.2234
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 534 190 344 64 1 60 1 64 0 0 344 0 0 0.3368 0.0000 0.0000 2.150 0.38 1.64 -1.27 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1697 0.6538 0.1766 1 1 0.1752 0.6428 0.1820 1 1 0.1823 0.6288 0.1890
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.100 1 6 1 218 86 132 43 0 5 2 36 0 0 131 0 1 0.5000 0.0000 0.0076 15.800 0.26 5.75 -5.49 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3060 0.5728 0.1212 1 1 0.3067 0.5673 0.1260 1 1 0.3073 0.5604 0.1323
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 460 180 280 85 0 20 2 73 0 0 280 0 0 0.4722 0.0000 0.0000 7.950 0.35 3.26 -2.91 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3689 0.5829 0.0482 1 1 0.3717 0.5758 0.0525 1 1 0.3744 0.5670 0.0587
chr2 71149970 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 5 281 96 185 84 2 3 1 6 0 0 185 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 30.667 0.68 3.33 -2.65 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0497 0.9503 0.0000 0 1 0.4400 0.5600 0.0000
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 614 159 455 0 1 29 1 128 0 0 443 1 11 0.0000 0.0000 0.0264 4.448 6.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 497 112 385 1 0 6 0 105 0 0 378 0 7 0.0089 0.0000 0.0182 17.667 0.00 2.92 -2.92 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0297 0.9703 2 2 0.0000 0.0107 0.9893 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 964 217 747 105 0 40 0 72 0 0 717 0 30 0.4839 0.0000 0.0402 4.425 0.30 14.22 -13.92 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1769 0.7255 0.0976 1 1 0.1850 0.7105 0.1044 1 1 0.1952 0.6912 0.1136
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 369 135 234 105 1 8 0 21 1 0 232 1 0 0.7778 0.0043 0.0085 15.875 0.68 3.10 -2.42 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr2 85601097 CGTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 390 107 283 102 1 2 0 2 0 0 283 0 0 0.9533 0.0000 0.0000 52.500 0.37 3.00 -2.63 24 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6910 0.3090 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 552 158 394 7 0 12 5 134 0 0 392 0 2 0.0443 0.0000 0.0051 12.083 0.14 3.28 -3.14 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.6023 0.3977 2 2 0.0000 0.0875 0.9125
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 831 243 588 217 2 16 0 8 0 0 588 0 0 0.8930 0.0000 0.0000 14.188 0.44 10.38 -9.94 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.9183 0.0817 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.100 1 3 4 562 171 391 18 0 2 1 150 0 0 388 0 3 0.1053 0.0000 0.0077 84.000 0.28 3.15 -2.87 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9835 0.0165
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 623 163 460 0 0 0 1 162 0 0 450 0 10 0.0000 0.0000 0.0217 162.000 5.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 294 109 185 53 0 9 0 47 0 0 183 0 2 0.4862 0.0000 0.0108 11.111 0.66 6.38 -5.72 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2724 0.6044 0.1233 1 1 0.2750 0.5966 0.1283 1 1 0.2781 0.5869 0.1351
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 701 194 507 117 1 6 0 70 1 0 504 0 2 0.6031 0.0020 0.0059 31.333 0.53 1.71 -1.18 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9537 0.0462 0.0001 1 0 0.9486 0.0512 0.0001 1 0 0.9409 0.0589 0.0002
chr2 132317662 ATGTAATAAC A 0.500000 0.100 1 -9 1 1013 250 763 142 0 10 0 98 0 0 753 0 10 0.5680 0.0000 0.0131 26.667 0.15 8.42 -8.26 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8027 0.1963 0.0010 1 0 0.7967 0.2019 0.0013 1 0 0.7877 0.2104 0.0018
chr2 132645507 T TAAG 0.500000 0.100 1 3 1 616 166 450 84 1 6 1 74 0 0 449 0 1 0.5060 0.0000 0.0022 26.667 0.26 2.99 -2.72 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3363 0.6072 0.0565 1 1 0.3401 0.5987 0.0612 1 1 0.3442 0.5880 0.0678
chr2 151379531 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 204 53 151 15 27 8 0 3 1 3 146 1 0 0.2830 0.0066 0.0331 2.500 0.67 3.33 -2.67 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.1164 0.8836 0.0000 0 1 0.3859 0.6141 0.0000
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 204 56 148 16 4 9 8 19 0 0 145 2 1 0.2857 0.0000 0.0203 4.444 0.56 2.37 -1.81 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0769 0.4689 0.4541 1 1 0.0813 0.4706 0.4481 1 1 0.0873 0.4729 0.4397
chr2 159987235 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 224 94 130 56 0 0 0 38 0 0 127 2 1 0.5957 0.0000 0.0231 94.000 0.14 2.11 -1.96 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5714 0.4012 0.0274 1 0 0.5642 0.4054 0.0304 1 0 0.5540 0.4111 0.0348
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 264 126 138 110 0 6 0 10 0 0 138 0 0 0.8730 0.0000 0.0000 20.000 0.08 3.30 -3.22 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 1 0.2534 0.7466 0.0000
chr2 178650214 TTTTCCTCTTCAGGAGCAA T 0.500000 0.100 1 -18 1 373 106 267 56 0 14 0 36 0 0 259 0 8 0.5283 0.0000 0.0300 6.571 0.23 15.22 -14.99 12 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4792 0.4764 0.0444 1 1 0.4751 0.4766 0.0483 1 1 0.4691 0.4771 0.0538
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 756 143 613 79 0 6 1 57 0 0 606 0 7 0.5524 0.0000 0.0114 22.833 0.15 3.84 -3.69 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4829 0.4872 0.0299 1 1 0.4812 0.4856 0.0332 1 1 0.4779 0.4841 0.0380
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 327 131 196 0 4 16 7 104 0 0 187 1 8 0.0000 0.0000 0.0459 6.688 4.23 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0069 0.9931 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0069 0.9931
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 327 131 196 9 1 55 1 65 0 0 187 2 7 0.0687 0.0000 0.0459 1.364 2.44 4.98 -2.54 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9980 0.0020 2 1 0.0000 0.9150 0.0850
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 251 77 174 54 10 10 0 3 0 0 174 0 0 0.7013 0.0000 0.0000 5.700 0.31 1.00 -0.69 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0349 0.9651 0.0000 0 1 0.4918 0.5082 0.0000 0 0 0.7556 0.2444 0.0000
chr2 199819526 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 367 77 290 29 12 13 9 14 0 0 289 0 1 0.3766 0.0000 0.0034 4.154 1.59 1.71 -0.13 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6406 0.3349 0.0245 1 0 0.6296 0.3430 0.0273 1 0 0.6146 0.3539 0.0315
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 1 448 124 324 52 0 32 3 37 2 0 321 0 1 0.4194 0.0062 0.0093 3.067 2.23 4.27 -2.04 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4950 0.4625 0.0425 1 0 0.4901 0.4636 0.0463 1 0 0.4831 0.4652 0.0517
chr2 205776515 TCGCA T 0.500000 0.100 1 -4 1 258 89 169 86 0 1 0 2 0 0 169 0 0 0.9663 0.0000 0.0000 88.000 0.23 5.00 -4.77 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4846 0.5154 0.0000 0 0 0.8971 0.1029 0.0000 0 0 0.9473 0.0527 0.0000
chr2 205776521 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 258 85 173 81 0 2 0 2 0 0 173 0 0 0.9529 0.0000 0.0000 41.500 0.22 5.00 -4.78 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4236 0.5764 0.0000 0 0 0.8719 0.1281 0.0000 0 0 0.9339 0.0661 0.0000
chr2 210018165 T TAA 0.500000 0.100 1 2 1 124 53 71 48 0 0 0 5 0 0 71 0 0 0.9057 0.0000 0.0000 53.000 0.17 2.00 -1.83 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0509 0.9491 0.0000 0 1 0.2932 0.7068 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 282 106 176 50 0 2 0 54 0 0 175 0 1 0.4717 0.0000 0.0057 52.000 0.04 3.57 -3.53 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1088 0.5979 0.2932 1 1 0.1139 0.5906 0.2954 1 1 0.1208 0.5814 0.2978
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 624 157 467 0 1 23 2 131 0 0 461 0 6 0.0000 0.0000 0.0128 5.783 8.30 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr2 216633573 T TGCTGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 628 165 463 4 2 22 3 134 0 1 460 2 0 0.0242 0.0000 0.0065 7.526 0.00 8.22 -8.22 4 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9884 0.0116 2 2 0.0000 0.3055 0.6945 2 2 0.0000 0.0556 0.9444
chr2 217848163 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 1 884 195 689 154 2 34 0 5 0 0 689 0 0 0.7897 0.0000 0.0000 4.735 1.94 8.00 -6.06 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0404 0.9596 0.0000 0 0 0.9211 0.0789 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr2 219182152 G GGAGGAA 0.500000 0.100 1 6 1 663 151 512 82 0 16 1 52 0 0 506 0 6 0.5430 0.0000 0.0117 8.438 0.30 6.02 -5.71 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7048 0.2879 0.0074 1 0 0.6965 0.2948 0.0087 1 0 0.6845 0.3047 0.0108
chr2 229591816 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 1 524 176 348 155 0 15 0 6 0 0 347 1 0 0.8807 0.0000 0.0029 10.733 0.27 12.67 -12.40 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.6313 0.3687 0.0000 0 0 0.9581 0.0419 0.0000
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 643 225 418 202 3 9 0 11 0 0 411 0 7 0.8978 0.0000 0.0167 24.000 0.90 18.18 -17.28 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1674 0.8326 0.0000
chr2 231037824 A AGGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 9 1 477 101 376 42 4 14 4 37 0 0 374 0 2 0.4158 0.0000 0.0053 6.917 3.19 8.24 -5.05 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2527 0.5975 0.1498 1 1 0.2553 0.5903 0.1544 1 1 0.2584 0.5811 0.1605
chr2 232844199 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 4 592 190 402 82 0 33 0 75 0 1 400 0 1 0.4316 0.0000 0.0050 4.758 0.18 3.21 -3.03 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2881 0.6375 0.0744 1 1 0.2929 0.6274 0.0797 1 1 0.2985 0.6145 0.0870
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 363 133 230 61 0 0 2 70 0 0 230 0 0 0.4586 0.0000 0.0000 131.000 1.84 3.84 -2.01 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0494 0.5429 0.4077 1 1 0.0537 0.5385 0.4078 1 1 0.0596 0.5333 0.4071
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 180 74 106 65 0 3 0 6 0 0 106 0 0 0.8784 0.0000 0.0000 23.667 0.15 3.00 -2.85 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0414 0.9586 0.0000 0 1 0.3325 0.6675 0.0000
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 1109 299 810 102 0 0 0 197 0 0 809 0 1 0.3411 0.0000 0.0012 299.000 0.79 1.16 -0.36 54 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0006 0.9994 1 2 0.0000 0.0008 0.9992 1 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 423 122 301 2 0 27 4 89 0 0 301 0 0 0.0164 0.0000 0.0000 3.519 1.50 3.22 -1.72 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4153 0.5847 2 2 0.0000 0.0742 0.9258 2 2 0.0000 0.0380 0.9620
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 483 134 349 67 0 1 0 66 0 0 347 0 2 0.5000 0.0000 0.0057 133.000 0.91 2.52 -1.60 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1538 0.6586 0.1875 1 1 0.1596 0.6473 0.1931 1 1 0.1670 0.6330 0.2000
chr2 241317535 A AT 0.500000 0.100 1 1 1 255 63 192 20 25 9 4 5 0 2 189 0 1 0.3175 0.0000 0.0156 4.125 1.15 2.00 -0.85 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0039 0.9961 0.0000 0 1 0.0033 0.9967 0.0000 0 1 0.0460 0.9540 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 572 149 423 0 0 3 0 146 0 0 421 0 2 0.0000 0.0000 0.0047 48.667 3.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 483 120 363 5 0 9 0 106 0 0 340 0 23 0.0417 0.0000 0.0634 12.333 0.20 11.20 -11.00 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.5869 0.4131 2 2 0.0000 0.1707 0.8293
chr3 12901258 TGGC T 0.002987 0.100 1 -3 1 536 149 387 79 2 12 0 56 0 0 386 0 1 0.5302 0.0000 0.0026 11.333 0.63 4.23 -3.60 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8429 0.1570 0.0000 1 0 0.8376 0.1624 0.0000 1 0 0.8298 0.1701 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 471 114 357 10 0 1 4 99 0 0 357 0 0 0.0877 0.0000 0.0000 112.000 0.70 4.84 -4.14 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9960 0.0040 2 1 0.0000 0.8062 0.1938
chr3 33093215 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 704 168 536 98 0 2 0 68 0 0 532 0 4 0.5833 0.0000 0.0075 83.000 0.16 3.40 -3.23 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7377 0.2581 0.0043 1 0 0.7300 0.2649 0.0051 1 0 0.7187 0.2747 0.0066
chr3 37998943 A ACAC 0.500000 0.100 1 3 1 500 164 336 91 0 4 0 69 0 1 334 0 1 0.5549 0.0000 0.0060 40.000 0.26 3.07 -2.81 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6597 0.3318 0.0085 1 0 0.6534 0.3366 0.0100 1 0 0.6440 0.3437 0.0123
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 554 159 395 95 0 2 0 62 0 0 394 0 1 0.5975 0.0000 0.0025 78.500 0.37 3.24 -2.87 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8448 0.1537 0.0015 1 0 0.8359 0.1622 0.0019 1 0 0.8231 0.1743 0.0026
chr3 40462027 GTAC G 0.500000 0.100 1 -3 3 638 236 402 35 10 7 162 22 0 0 397 5 0 0.1483 0.0000 0.0124 11.333 2.46 2.95 -0.50 19 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0015 0.9984 1 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 1 0.0000 0.8475 0.1525
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 701 232 469 12 9 44 3 164 0 1 457 0 11 0.0517 0.0000 0.0256 4.273 0.17 4.03 -3.86 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9947 0.0053
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 701 232 469 21 1 128 2 80 1 0 459 2 7 0.0905 0.0021 0.0213 0.812 1.90 5.29 -3.38 11 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9803 0.0197 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 701 246 455 191 5 40 2 8 0 0 455 0 0 0.7764 0.0000 0.0000 5.150 3.52 2.88 0.65 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3076 0.6924 0.0000 0 0 0.9571 0.0429 0.0000
chr3 44242333 T TCGTCAGACC 0.500000 0.100 1 9 1 469 162 307 149 0 9 0 4 0 1 306 0 0 0.9198 0.0000 0.0033 17.000 1.10 7.75 -6.65 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2236 0.7764 0.0000 0 0 0.9620 0.0380 0.0000 0 0 0.9911 0.0089 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 637 194 443 0 0 5 1 188 0 0 442 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 37.800 2.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 350 122 228 0 0 4 1 117 0 0 223 0 5 0.0000 0.0000 0.0219 29.250 4.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr3 46709583 T TAAGAAG 0.500000 0.100 1 6 1 649 166 483 141 1 22 1 1 0 0 483 0 0 0.8494 0.0000 0.0000 6.500 2.26 6.00 -3.74 77 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9911 0.0089 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 650 169 481 64 1 19 5 80 0 0 479 0 2 0.3787 0.0000 0.0042 7.895 0.67 3.38 -2.70 28 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0086 0.3202 0.6712 1 2 0.0101 0.3258 0.6642 1 2 0.0124 0.3338 0.6538
chr3 49554677 G GGGCCCC 0.500000 0.100 1 6 3 218 73 145 34 0 12 0 27 0 0 145 0 0 0.4658 0.0000 0.0000 5.083 1.24 5.70 -4.47 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3850 0.5189 0.0961 1 1 0.3822 0.5172 0.1006 1 1 0.3780 0.5151 0.1068
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 480 129 351 8 0 25 0 96 0 0 342 0 9 0.0620 0.0000 0.0256 4.160 1.12 5.39 -4.26 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9635 0.0365 2 1 0.0000 0.5099 0.4901
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 181 87 94 65 0 13 0 9 0 0 94 0 0 0.7471 0.0000 0.0000 5.692 0.26 7.00 -6.74 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.0677 0.9323 0.0000
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 307 109 198 0 0 4 98 7 0 0 197 1 0 0.0000 0.0000 0.0051 35.000 4.86 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0056 0.9944 2 2 0.0000 0.0065 0.9935
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 308 110 198 0 0 1 4 105 0 0 197 0 1 0.0000 0.0000 0.0051 109.000 3.84 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr3 63912697 G GCCC 0.500000 0.100 1 3 1 273 59 214 31 1 0 1 26 0 0 213 0 1 0.5254 0.0000 0.0047 59.000 2.35 3.23 -0.88 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3105 0.5526 0.1369 1 1 0.3102 0.5486 0.1412 1 1 0.3096 0.5436 0.1468
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 283 104 179 39 3 14 2 46 0 0 179 0 0 0.3750 0.0000 0.0000 6.357 0.05 2.93 -2.88 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1067 0.5729 0.3204 1 1 0.1116 0.5673 0.3210 1 1 0.1182 0.5604 0.3215
chr3 67360748 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 170 69 101 30 1 5 0 33 0 0 101 0 0 0.4348 0.0000 0.0000 12.800 0.40 2.27 -1.87 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1717 0.5730 0.2553 1 1 0.1755 0.5675 0.2570 1 1 0.1804 0.5606 0.2589
chr3 98087856 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 651 172 479 94 0 15 3 60 0 0 476 0 3 0.5465 0.0000 0.0063 10.467 0.29 1.17 -0.88 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7896 0.2075 0.0029 1 0 0.7808 0.2156 0.0035 1 0 0.7682 0.2272 0.0046
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 955 186 769 170 0 7 0 9 0 0 768 0 1 0.9140 0.0000 0.0013 25.571 0.89 1.56 -0.66 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1065 0.8935 0.0000 0 0 0.8631 0.1369 0.0000
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 418 124 294 115 1 6 0 2 0 0 294 0 0 0.9274 0.0000 0.0000 19.500 0.66 1.00 -0.34 47 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8223 0.1777 0.0000 0 0 0.9752 0.0248 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 142 63 79 33 1 1 2 26 0 0 79 0 0 0.5238 0.0000 0.0000 61.000 0.42 1.69 -1.27 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3622 0.5309 0.1070 1 1 0.3601 0.5284 0.1115 1 1 0.3571 0.5253 0.1176
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1143 281 862 112 2 70 82 15 0 0 862 0 0 0.3986 0.0000 0.0000 3.043 0.27 3.00 -2.73 14 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4651 0.5166 0.0183 1 1 0.4676 0.5115 0.0209 1 1 0.4696 0.5057 0.0247
chr3 113657263 TTGCTGCTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -15 1 1149 295 854 145 2 50 1 97 0 0 854 0 0 0.4915 0.0000 0.0000 4.900 0.54 11.97 -11.42 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9513 0.0486 0.0001 1 0 0.9466 0.0533 0.0001 1 0 0.9394 0.0605 0.0001
chr3 125055810 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 5 298 93 205 88 1 1 0 3 0 1 204 0 0 0.9462 0.0000 0.0049 92.000 0.78 3.00 -2.22 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1109 0.8891 0.0000 0 0 0.7857 0.2143 0.0000 0 0 0.9198 0.0802 0.0000
chr3 140566154 AGAGGAG A 0.500000 0.100 1 -6 2 261 98 163 49 1 7 0 41 0 0 163 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 12.857 0.35 6.29 -5.95 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4093 0.5223 0.0685 1 1 0.4071 0.5199 0.0730 1 1 0.4036 0.5172 0.0793
chr3 149520808 C CTTAA 0.500000 0.100 1 4 1 250 73 177 67 0 0 0 6 0 0 177 0 0 0.9178 0.0000 0.0000 73.000 0.12 4.00 -3.88 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0456 0.9544 0.0000 0 1 0.3544 0.6456 0.0000
chr3 150703735 A ACCTCCT 0.500000 0.100 1 6 2 462 79 383 7 0 13 1 58 0 0 371 0 12 0.0886 0.0000 0.0313 5.077 0.86 5.86 -5.00 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9802 0.0198 2 1 0.0000 0.7391 0.2609
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 344 129 215 66 0 3 1 59 0 0 214 0 1 0.5116 0.0000 0.0047 42.000 0.08 1.36 -1.28 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2747 0.6235 0.1019 1 1 0.2783 0.6144 0.1073 1 1 0.2826 0.6029 0.1145
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 427 158 269 7 0 24 10 117 0 0 265 0 4 0.0443 0.0000 0.0149 5.583 0.14 3.03 -2.89 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7116 0.2884 2 2 0.0000 0.1337 0.8663
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 596 154 442 64 1 25 1 63 0 0 439 0 3 0.4156 0.0000 0.0068 5.120 0.44 3.35 -2.91 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1372 0.6507 0.2121 1 1 0.1429 0.6399 0.2172 1 1 0.1503 0.6261 0.2235
chr3 186677158 GATC G 0.500000 0.100 1 -3 1 559 145 414 134 0 7 0 4 0 0 414 0 0 0.9241 0.0000 0.0000 19.714 0.30 4.75 -4.45 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1132 0.8868 0.0000 0 0 0.9194 0.0806 0.0000 0 0 0.9808 0.0192 0.0000
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 488 146 342 128 0 9 1 8 1 0 341 0 0 0.8767 0.0029 0.0029 15.222 0.10 2.12 -2.02 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0520 0.9480 0.0000 0 0 0.6402 0.3598 0.0000
chr3 195721040 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 283 167 116 158 0 4 0 5 0 0 116 0 0 0.9461 0.0000 0.0000 40.750 0.94 3.40 -2.46 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0458 0.9542 0.0000 0 0 0.9296 0.0704 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr3 195725883 CAGAAAT C 0.500000 0.100 1 -6 1 1184 266 918 250 1 7 0 8 0 0 918 0 0 0.9398 0.0000 0.0000 37.000 1.63 8.00 -6.37 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 0 0.9823 0.0177 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr3 195726146 GC G 0.500000 0.100 1 -1 4 1501 512 989 385 4 21 0 102 0 0 989 0 0 0.7520 0.0000 0.0000 23.286 1.83 2.14 -0.31 49 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9643 0.0357 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195778895 TGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAGTGTC T 0.500000 0.100 1 -48 1 1591 682 909 335 22 232 14 79 1 3 877 0 28 0.4912 0.0011 0.0352 1.938 4.82 3.49 1.32 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9874 0.0126 0.0000
chr3 195779135 TGGTGACAGGAAGAGGCGTGGTGTCACCTGTGGATACTGAGGAAAGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCCTGACCTGTGGATGCAGAGGAAGTGTC T 0.500000 0.100 1 -96 1 1729 344 1385 114 11 96 8 115 0 3 1340 2 40 0.3314 0.0000 0.0325 2.547 4.84 4.14 0.70 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0005 0.1717 0.8277 1 2 0.0007 0.1768 0.8225 1 2 0.0010 0.1845 0.8145
chr3 195781259 CAGGGGTGGCGTGACCGGTGGATGCTGAGGAAGTGCTGGTGACAGGAAG C 0.500000 0.100 1 -48 2 1446 505 941 230 41 62 21 151 21 36 878 3 3 0.4554 0.0223 0.0670 7.083 4.04 4.81 -0.76 22 0/1 1/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 838 184 654 83 0 15 0 86 0 0 637 0 17 0.4511 0.0000 0.0260 11.267 0.22 11.09 -10.88 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0111 0.4023 0.5866 1 2 0.0129 0.4034 0.5837 1 2 0.0157 0.4056 0.5787
chr3 198153257 CTGGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -9 2 335 121 214 88 0 14 4 15 0 0 209 1 4 0.7273 0.0000 0.0234 7.643 0.30 11.53 -11.24 32 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8722 0.1278 0.0000 0 1 0.0508 0.9492 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 335 124 211 73 1 29 0 21 0 0 206 1 4 0.5887 0.0000 0.0237 3.241 0.32 10.19 -9.88 21 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9724 0.0276 0.0001 1 0 0.9679 0.0320 0.0001 1 0 0.9175 0.0824 0.0002
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 562 115 447 0 0 1 0 114 0 0 364 4 79 0.0000 0.0000 0.1857 114.000 15.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 3074966 G GCCGCCGCCT 0.001791 0.100 1 9 2 543 204 339 100 61 12 3 28 2 1 336 0 0 0.4902 0.0059 0.0088 17.273 2.13 6.11 -3.98 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0074 0.9926 0.0000
chr4 3074966 G GCCT 0.008956 0.100 1 3 2 543 204 339 89 6 19 0 90 1 2 336 0 0 0.4363 0.0029 0.0088 9.632 1.94 5.46 -3.51 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4538 0.5453 0.0009 1 1 0.4639 0.5351 0.0010 1 1 0.4762 0.5227 0.0011
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 677 167 510 86 1 9 0 71 0 0 505 0 5 0.5150 0.0000 0.0098 17.556 0.66 10.76 -10.10 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5520 0.4434 0.0046 1 0 0.5563 0.4387 0.0051 1 0 0.5609 0.4333 0.0057
chr4 7042274 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 579 129 450 119 1 3 0 6 0 0 450 0 0 0.9225 0.0000 0.0000 42.000 0.35 1.17 -0.81 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.4044 0.5956 0.0000 0 0 0.8780 0.1220 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 694 197 497 110 3 15 0 69 1 0 494 0 2 0.5584 0.0020 0.0060 12.067 1.16 8.35 -7.18 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9333 0.0665 0.0002 1 0 0.9270 0.0727 0.0003 1 0 0.9177 0.0819 0.0004
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 693 218 475 115 5 28 3 67 0 0 471 0 4 0.5275 0.0000 0.0084 6.714 1.30 7.27 -5.97 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9485 0.0514 0.0001 1 0 0.9431 0.0567 0.0001 1 0 0.9350 0.0648 0.0002
chr4 15687392 TCTA T 0.500000 0.100 1 -3 2 1043 238 805 127 2 5 2 102 0 0 802 0 3 0.5336 0.0000 0.0037 46.200 0.15 3.25 -3.11 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5784 0.4143 0.0074 1 0 0.5783 0.4130 0.0087 1 0 0.5768 0.4124 0.0109
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 485 145 340 78 0 4 0 63 0 0 336 0 4 0.5379 0.0000 0.0118 35.250 0.08 9.40 -9.32 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4029 0.5516 0.0455 1 1 0.4039 0.5465 0.0496 1 1 0.4042 0.5403 0.0555
chr4 44447936 G GCCA 0.500000 0.100 1 3 2 674 155 519 81 3 9 1 61 0 0 519 0 0 0.5226 0.0000 0.0000 18.000 1.49 3.85 -2.36 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6769 0.3143 0.0088 1 0 0.6694 0.3203 0.0103 1 0 0.6585 0.3289 0.0126
chr4 56378269 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 306 120 186 23 0 6 0 91 0 0 185 0 1 0.1917 0.0000 0.0054 19.000 0.09 3.00 -2.91 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8390 0.1610 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr4 71567805 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 509 123 386 76 0 2 0 45 0 0 386 0 0 0.6179 0.0000 0.0000 60.500 0.59 1.78 -1.19 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8548 0.1433 0.0018 1 0 0.8451 0.1526 0.0023 1 0 0.8311 0.1658 0.0031
chr4 76896936 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 796 197 599 164 7 22 0 4 0 0 599 0 0 0.8325 0.0000 0.0000 7.909 1.06 3.25 -2.19 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4557 0.5443 0.0000 0 0 0.9863 0.0137 0.0000 0 0 0.9967 0.0033 0.0000
chr4 76897475 G GCGC 0.500000 0.100 1 3 1 608 114 494 99 1 13 0 1 1 1 492 0 0 0.8684 0.0020 0.0040 7.769 0.92 6.00 -5.08 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9506 0.0494 0.0000 0 0 0.9822 0.0178 0.0000 0 0 0.9865 0.0135 0.0000
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 1 639 246 393 25 83 42 10 86 0 0 386 0 7 0.1016 0.0000 0.0178 4.619 0.32 3.08 -2.76 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2946 0.6563 0.0491 1 1 0.3016 0.6445 0.0539 1 1 0.3097 0.6297 0.0606
chr4 78870928 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 639 260 379 108 12 36 7 97 0 0 379 0 0 0.4154 0.0000 0.0000 6.441 2.08 3.24 -1.15 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4918 0.4939 0.0142 1 0 0.4940 0.4896 0.0164 1 0 0.4955 0.4848 0.0197
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 182 82 100 54 0 0 0 28 0 0 100 0 0 0.6585 0.0000 0.0000 82.000 0.06 1.04 -0.98 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8110 0.1843 0.0047 1 0 0.7996 0.1948 0.0056 1 0 0.7834 0.2094 0.0072
chr4 87614933 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3022 816 2206 677 14 89 5 31 109 71 2008 9 9 0.8297 0.0494 0.0898 8.349 1.69 9.13 -7.44 183 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3842 845 2997 5 14 42 15 769 47 61 2682 160 47 0.0059 0.0157 0.1051 23.353 5.00 8.85 -3.85 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 4053 984 3069 740 24 153 13 54 67 93 2737 78 94 0.7520 0.0218 0.1082 5.388 4.49 12.07 -7.58 114 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87616249 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 2630 788 1842 400 57 121 60 150 31 35 1766 7 3 0.5076 0.0168 0.0413 6.085 6.79 19.29 -12.50 104 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87616280 TAGCAGTGACAGCAGTGAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2673 841 1832 602 69 92 15 63 15 37 1772 6 2 0.7158 0.0082 0.0328 8.477 7.75 8.71 -0.97 214 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 172 82 90 43 1 2 0 36 0 0 88 0 2 0.5244 0.0000 0.0222 40.000 0.05 3.17 -3.12 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3377 0.5588 0.1035 1 1 0.3375 0.5542 0.1083 1 1 0.3367 0.5485 0.1147
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 716 207 509 188 1 8 0 10 0 0 509 0 0 0.9082 0.0000 0.0000 24.875 0.60 4.20 -3.60 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2302 0.7698 0.0000 0 0 0.9401 0.0599 0.0000
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.100 1 -18 1 239 133 106 122 0 6 0 5 0 0 106 0 0 0.9173 0.0000 0.0000 21.167 0.21 11.00 -10.79 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0074 0.9926 0.0000 0 0 0.6835 0.3165 0.0000 0 0 0.9377 0.0623 0.0000
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 570 261 309 0 0 33 14 214 0 0 303 0 6 0.0000 0.0000 0.0194 6.909 3.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 154237107 A AGTT 0.500000 0.100 1 3 1 623 155 468 86 0 16 1 52 0 0 467 0 1 0.5548 0.0000 0.0021 8.688 0.06 3.17 -3.11 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8566 0.1419 0.0015 1 0 0.8474 0.1507 0.0019 1 0 0.8341 0.1634 0.0026
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 315 125 190 59 0 18 0 48 0 0 190 0 0 0.4720 0.0000 0.0000 5.944 0.66 5.67 -5.01 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4446 0.5051 0.0502 1 1 0.4421 0.5035 0.0543 1 1 0.4381 0.5017 0.0602
chr4 184694537 ACAGATGAAG A 0.500000 0.100 1 -9 2 327 94 233 82 0 3 0 9 0 0 233 0 0 0.8723 0.0000 0.0000 30.333 0.12 10.56 -10.43 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 1 0.1422 0.8578 0.0000
chr5 733800 T TAA 0.007715 0.100 1 2 1 166 65 101 64 0 0 1 0 0 0 101 0 0 0.9846 0.0000 0.0000 65.000 0.62 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr5 733804 CAT C 0.005230 0.100 1 -2 3 166 66 100 64 0 1 1 0 0 0 100 0 0 0.9697 0.0000 0.0000 65.000 0.64 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr5 1295342 CCG C 0.500000 0.100 1 -2 3 682 122 560 9 0 8 2 103 0 0 555 0 5 0.0738 0.0000 0.0089 14.250 0.78 2.65 -1.87 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9834 0.0166 2 1 0.0000 0.6075 0.3925
chr5 16179479 T TCGG 0.500000 0.100 1 3 1 298 80 218 34 1 10 3 32 0 0 217 0 1 0.4250 0.0000 0.0046 7.778 1.06 3.97 -2.91 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1951 0.5858 0.2191 1 1 0.1986 0.5794 0.2220 1 1 0.2030 0.5713 0.2256
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 913 206 707 78 0 31 4 93 0 0 704 1 2 0.3786 0.0000 0.0042 5.645 0.15 3.48 -3.33 18 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0082 0.3484 0.6434 1 2 0.0097 0.3520 0.6384 1 2 0.0119 0.3575 0.6306
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 375 44 331 0 0 32 0 12 0 1 321 3 6 0.0000 0.0000 0.0302 0.387 9.42 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5122 0.4878 2 2 0.0000 0.4245 0.5755 2 2 0.0000 0.3747 0.6253
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 437 110 327 0 0 5 0 105 0 0 324 0 3 0.0000 0.0000 0.0092 21.000 5.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0053 0.9947
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 581 161 420 0 0 4 0 157 0 0 415 0 5 0.0000 0.0000 0.0119 39.250 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr5 77077779 T TCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 1 426 97 329 83 1 6 0 7 0 1 328 0 0 0.8557 0.0000 0.0030 15.167 0.67 5.43 -4.75 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0389 0.9611 0.0000 0 1 0.4090 0.5910 0.0000
chr5 78015515 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 203 91 112 85 0 1 0 5 0 0 112 0 0 0.9341 0.0000 0.0000 90.000 0.22 3.00 -2.78 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2539 0.7461 0.0000 0 0 0.7141 0.2859 0.0000
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 308 96 212 77 4 5 1 9 0 0 210 0 2 0.8021 0.0000 0.0094 18.200 4.21 13.33 -9.13 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0228 0.9772 0.0000
chr5 80654908 G GCAGCGCCCC 0.500000 0.100 1 9 2 293 78 215 27 3 14 0 34 0 0 214 0 1 0.3462 0.0000 0.0047 4.571 5.96 7.68 -1.71 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1210 0.5492 0.3298 1 1 0.1255 0.5454 0.3291 1 1 0.1315 0.5407 0.3278
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 291 73 218 65 0 2 0 6 0 0 216 0 2 0.8904 0.0000 0.0092 35.500 4.97 22.00 -17.03 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 1 0.1216 0.8784 0.0000
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 307 106 201 97 1 0 0 8 0 0 201 0 0 0.9151 0.0000 0.0000 105.000 0.06 3.00 -2.94 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0259 0.9741 0.0000 0 1 0.4049 0.5951 0.0000
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 750 183 567 154 5 21 0 3 0 0 566 0 1 0.8415 0.0000 0.0018 7.667 0.38 5.00 -4.62 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3121 0.6879 0.0000 0 0 0.9753 0.0247 0.0000 0 0 0.9942 0.0058 0.0000
chr5 119193899 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 169 78 91 70 0 0 2 6 0 0 91 0 0 0.8974 0.0000 0.0000 76.000 0.21 2.67 -2.45 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0338 0.9662 0.0000 0 1 0.3004 0.6996 0.0000
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 614 136 478 11 0 3 1 121 0 0 478 0 0 0.0809 0.0000 0.0000 44.333 0.18 1.26 -1.08 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9963 0.0037 2 1 0.0000 0.7562 0.2438
chr5 127875593 A AGCAAGAGGC 0.500000 0.100 1 9 2 255 96 159 91 0 0 0 5 0 0 157 0 2 0.9479 0.0000 0.0126 96.000 0.80 9.80 -9.00 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0518 0.9482 0.0000 0 1 0.4808 0.5192 0.0000
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 502 126 376 102 0 23 0 1 0 0 373 0 3 0.8095 0.0000 0.0080 4.478 0.75 0.00 0.75 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0243 0.9757 0.0000 0 0 0.6975 0.3025 0.0000 0 0 0.9155 0.0845 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 201 86 115 48 0 0 0 38 0 0 115 0 0 0.5581 0.0000 0.0000 86.000 0.67 3.08 -2.41 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4406 0.4987 0.0607 1 1 0.4371 0.4979 0.0650 1 1 0.4319 0.4970 0.0710
chr5 139848487 CCCGGGT C 0.500000 0.100 1 -6 3 367 50 317 28 2 3 0 17 1 1 315 0 0 0.5600 0.0032 0.0063 15.667 1.46 6.29 -4.83 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6147 0.3538 0.0315 1 0 0.6039 0.3614 0.0347 1 0 0.5890 0.3717 0.0394
chr5 141095832 GAACT G 0.500000 0.100 1 -4 2 824 155 669 95 1 3 0 56 0 0 668 0 1 0.6129 0.0000 0.0015 50.667 0.55 4.62 -4.08 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9180 0.0816 0.0004 1 0 0.9107 0.0888 0.0005 1 0 0.8998 0.0995 0.0008
chr5 141151301 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 805 183 622 99 0 7 0 77 0 0 618 0 4 0.5410 0.0000 0.0064 25.143 0.31 2.96 -2.65 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5434 0.4413 0.0153 1 0 0.5417 0.4408 0.0175 1 0 0.5382 0.4409 0.0209
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 996 254 742 133 0 8 0 113 0 0 742 0 0 0.5236 0.0000 0.0000 30.750 0.32 1.27 -0.95 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5210 0.4695 0.0095 1 0 0.5236 0.4653 0.0111 1 0 0.5253 0.4610 0.0137
chr5 141573996 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 2 658 184 474 82 7 32 1 62 0 0 470 0 4 0.4457 0.0000 0.0084 4.750 0.63 2.85 -2.22 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6682 0.3233 0.0085 1 0 0.6614 0.3286 0.0100 1 0 0.6514 0.3364 0.0122
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 391 100 291 89 0 8 1 2 0 0 291 0 0 0.8900 0.0000 0.0000 11.500 0.22 9.00 -8.78 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1438 0.8562 0.0000 0 0 0.7896 0.2104 0.0000 0 0 0.9183 0.0817 0.0000
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 12 1 330 106 224 78 4 22 0 2 0 0 224 0 0 0.7358 0.0000 0.0000 4.200 4.37 12.00 -7.63 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4501 0.5499 0.0000 0 0 0.8839 0.1161 0.0000 0 0 0.9403 0.0597 0.0000
chr5 146878727 AGCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 330 106 224 6 0 20 6 74 0 0 224 0 0 0.0566 0.0000 0.0000 4.300 4.17 4.35 -0.18 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9125 0.0875 2 2 0.0000 0.4879 0.5121
chr5 148116440 AGTG A 0.500000 0.100 1 -3 2 194 92 102 48 0 9 0 35 0 0 102 0 0 0.5217 0.0000 0.0000 10.375 0.06 3.17 -3.11 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5115 0.4456 0.0429 1 0 0.5055 0.4479 0.0466 1 0 0.4969 0.4511 0.0520
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 686 143 543 8 0 0 1 134 0 0 530 2 11 0.0559 0.0000 0.0239 142.000 0.50 4.01 -3.51 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7516 0.2484 2 2 0.0000 0.1126 0.8874
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 689 145 544 9 0 3 0 133 0 0 528 4 12 0.0621 0.0000 0.0294 71.000 0.56 4.05 -3.49 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8924 0.1076 2 2 0.0000 0.1859 0.8141
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 696 187 509 78 0 3 0 106 0 0 509 0 0 0.4171 0.0000 0.0000 61.333 1.03 1.72 -0.69 0 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0030 0.2344 0.7626 1 2 0.0036 0.2413 0.7551 1 2 0.0048 0.2513 0.7439
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 608 161 447 71 0 3 0 87 0 0 446 0 1 0.4410 0.0000 0.0022 52.667 0.18 1.38 -1.20 19 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0187 0.4388 0.5425 1 2 0.0212 0.4392 0.5396 1 2 0.0249 0.4403 0.5348
chr5 153492228 T TC 0.500000 0.100 1 1 2 113 61 52 29 0 3 0 29 0 0 52 0 0 0.4754 0.0000 0.0000 19.333 0.07 1.10 -1.03 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2147 0.5706 0.2147 1 1 0.2173 0.5653 0.2173 1 1 0.2207 0.5587 0.2207
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 379 129 250 4 0 3 0 122 0 0 250 0 0 0.0310 0.0000 0.0000 42.000 2.75 4.93 -2.18 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9353 0.0647 2 2 0.0000 0.1377 0.8623 2 2 0.0000 0.0338 0.9662
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 381 139 242 0 0 0 2 137 0 0 240 0 2 0.0000 0.0000 0.0083 139.000 4.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 236 88 148 72 0 5 0 11 0 0 148 0 0 0.8182 0.0000 0.0000 16.600 0.38 3.64 -3.26 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0275 0.9725 0.0000
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 427 93 334 56 0 8 0 29 0 0 334 0 0 0.6022 0.0000 0.0000 10.625 0.95 4.07 -3.12 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8240 0.1721 0.0039 1 0 0.8129 0.1824 0.0047 1 0 0.7969 0.1970 0.0061
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 441 173 268 120 11 37 0 5 0 0 268 0 0 0.6936 0.0000 0.0000 3.676 1.00 4.40 -3.40 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0118 0.9882 0.0000 0 0 0.7719 0.2281 0.0000 0 0 0.9588 0.0412 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 645 109 536 0 0 16 1 92 0 0 534 0 2 0.0000 0.0000 0.0037 5.812 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0078 0.9922 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0099 0.9901
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 516 123 393 84 2 28 0 9 1 0 392 0 0 0.6829 0.0025 0.0025 3.393 0.93 3.33 -2.40 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0051 0.9949 0.0000 0 1 0.1696 0.8304 0.0000
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 545 102 443 38 2 14 2 46 3 1 431 4 4 0.3725 0.0068 0.0271 6.143 1.16 3.65 -2.49 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0951 0.6249 0.2800 1 1 0.1025 0.6213 0.2762 1 1 0.1128 0.6164 0.2708
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1215 264 951 19 85 58 11 91 0 0 941 2 8 0.0720 0.0000 0.0105 3.500 2.21 4.66 -2.45 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0678 0.7512 0.1810 1 1 0.0755 0.7407 0.1838 1 1 0.0866 0.7268 0.1866
chr6 16327684 A ATGC 0.101269 0.100 1 3 1 1209 335 874 9 102 80 24 120 0 0 871 2 1 0.0269 0.0000 0.0034 3.184 0.89 4.57 -3.68 3 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0022 0.4091 0.5887 1 2 0.0029 0.4227 0.5744 1 2 0.0042 0.4418 0.5540
chr6 21595035 G GGGC 0.002798 0.100 1 3 5 630 149 481 119 2 21 1 6 0 0 481 0 0 0.7987 0.0000 0.0000 6.095 1.82 3.50 -1.68 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0347 0.9653 0.0000 0 0 0.9890 0.0110 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr6 26183962 C CCT 0.000001 0.100 1 2 1 560 153 407 136 0 9 0 8 0 0 407 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 16.000 0.45 2.12 -1.68 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9518 0.0482 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr6 27255285 AAAGGAGAGCCAGATT A 0.178475 0.100 1 -15 1 519 101 418 60 0 4 0 37 0 0 411 0 7 0.5941 0.0000 0.0167 24.250 0.12 13.73 -13.61 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7022 0.2914 0.0064 1 0 0.6969 0.2959 0.0072 1 0 0.6894 0.3023 0.0083
chr6 29173644 TA T 0.001133 0.100 1 -1 2 558 155 403 129 2 14 0 10 0 0 403 0 0 0.8323 0.0000 0.0000 10.071 0.19 1.60 -1.41 107 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9385 0.0615 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 829 169 660 161 0 6 0 2 0 0 658 0 2 0.9527 0.0000 0.0030 27.167 0.11 0.00 0.11 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5625 0.4375 0.0000 0 0 0.9911 0.0089 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr6 29657255 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 165 67 98 32 0 5 0 30 0 0 98 0 0 0.4776 0.0000 0.0000 12.400 1.69 4.43 -2.75 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2566 0.5707 0.1727 1 1 0.2582 0.5654 0.1764 1 1 0.2600 0.5587 0.1813
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 425 116 309 5 0 1 0 110 0 0 307 0 2 0.0431 0.0000 0.0065 115.000 1.00 1.20 -0.20 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9953 0.0047 2 2 0.0000 0.4311 0.5689 2 2 0.0000 0.0973 0.9027
chr6 31027315 CTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAGCT C 0.500000 0.100 1 -30 2 1489 372 1117 225 7 21 8 111 30 14 1066 5 2 0.6048 0.0269 0.0457 16.429 1.62 11.48 -9.86 31 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr6 31028377 TGAGACCACCACAGCCTCTACTGAAGGCTCC T 0.500000 0.100 1 -30 1 2536 731 1805 493 20 186 9 23 76 21 1656 22 30 0.6744 0.0421 0.0825 2.951 2.01 9.70 -7.68 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 31111507 CCCCCAGCTGCCTCCTGGATACCGATTAATATTCCCCCAGCTGCCTCCTGGATACCGATTAATATTT C 0.500000 0.100 1 -66 2 532 152 380 87 0 31 0 34 0 0 380 0 0 0.5724 0.0000 0.0000 3.903 0.31 2.18 -1.87 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9814 0.0186 0.0000 1 0 0.9783 0.0217 0.0000 1 0 0.9732 0.0268 0.0001
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 871 232 639 216 1 2 0 13 0 0 639 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 115.000 1.25 3.62 -2.37 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0473 0.9527 0.0000 0 0 0.8990 0.1010 0.0000
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 576 148 428 130 0 4 0 14 0 0 428 0 0 0.8784 0.0000 0.0000 36.000 0.31 2.21 -1.91 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0658 0.9342 0.0000
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 623 183 440 0 0 2 0 181 0 0 439 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 90.500 11.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr6 31954568 CTCTCGG C 0.500000 0.100 1 -6 3 870 187 683 167 0 16 0 4 0 0 683 0 0 0.8930 0.0000 0.0000 10.688 0.78 6.25 -5.47 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4065 0.5935 0.0000 0 0 0.9834 0.0166 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 346 118 228 113 1 1 0 3 0 0 228 0 0 0.9576 0.0000 0.0000 117.000 0.17 4.67 -4.50 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3031 0.6969 0.0000 0 0 0.9244 0.0756 0.0000 0 0 0.9736 0.0264 0.0000
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 395 95 300 7 0 9 0 79 0 0 273 0 27 0.0737 0.0000 0.0900 9.556 0.14 14.72 -14.58 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8965 0.1035 2 2 0.0000 0.3428 0.6572
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 598 181 417 165 0 8 0 8 0 1 416 0 0 0.9116 0.0000 0.0024 21.625 0.31 1.12 -0.82 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4547 0.5453 0.0000 0 0 0.9496 0.0504 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 675 168 507 6 0 6 2 154 0 0 501 0 6 0.0357 0.0000 0.0118 26.833 0.00 3.32 -3.32 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9938 0.0062 2 2 0.0000 0.1549 0.8451 2 2 0.0000 0.0179 0.9821
chr6 42236367 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 3 350 132 218 96 2 29 0 5 0 0 218 0 0 0.7273 0.0000 0.0000 3.552 0.28 3.60 -3.32 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.3949 0.6051 0.0000 0 0 0.8245 0.1755 0.0000
chr6 42263500 CGGCGGAGGCGGA C 0.500000 0.100 1 -12 2 404 154 250 90 0 15 0 49 0 0 245 0 5 0.5844 0.0000 0.0200 9.267 0.11 10.86 -10.75 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8968 0.1025 0.0007 1 0 0.8886 0.1105 0.0009 1 0 0.8765 0.1222 0.0013
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 295 88 207 0 0 14 0 74 0 0 204 0 3 0.0000 0.0000 0.0145 5.286 6.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0209 0.9791 2 2 0.0000 0.0233 0.9767
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 885 166 719 10 0 19 2 135 0 0 717 1 1 0.0602 0.0000 0.0028 7.632 0.00 3.28 -3.28 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9762 0.0238 2 2 0.0000 0.4218 0.5782
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 612 141 471 0 0 73 4 64 0 0 443 0 28 0.0000 0.0000 0.0594 0.918 9.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0083 0.9917 2 2 0.0000 0.0095 0.9905
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 721 164 557 102 6 41 0 15 0 0 556 0 1 0.6220 0.0000 0.0018 3.000 1.58 5.13 -3.55 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0065 0.9935 0.0000
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 635 153 482 24 1 7 0 121 0 0 470 0 12 0.1569 0.0000 0.0249 20.857 0.33 3.36 -3.03 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 836 201 635 0 0 16 3 182 0 0 627 0 8 0.0000 0.0000 0.0126 11.500 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr6 116437084 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 5 797 137 660 76 0 3 1 57 0 0 660 0 0 0.5547 0.0000 0.0000 44.667 0.46 3.19 -2.73 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5966 0.3865 0.0168 1 0 0.5907 0.3902 0.0191 1 0 0.5820 0.3954 0.0226
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 732 146 586 80 0 1 0 65 0 0 582 0 4 0.5479 0.0000 0.0068 145.000 0.20 6.80 -6.60 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3986 0.5564 0.0450 1 1 0.4000 0.5509 0.0491 1 1 0.4007 0.5443 0.0550
chr6 118491647 ATGT A 0.500000 0.100 1 -3 3 326 112 214 108 0 2 0 2 0 0 214 0 0 0.9643 0.0000 0.0000 55.000 0.08 3.00 -2.92 58 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7427 0.2573 0.0000 0 0 0.9632 0.0368 0.0000 0 0 0.9812 0.0188 0.0000
chr6 135036575 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 423 96 327 85 0 5 0 6 0 0 325 0 2 0.8854 0.0000 0.0061 18.200 0.26 1.00 -0.74 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0145 0.9855 0.0000 0 1 0.2705 0.7295 0.0000
chr6 136360785 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 293 78 215 34 0 12 0 32 0 0 214 0 1 0.4359 0.0000 0.0047 5.500 0.09 2.97 -2.88 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2306 0.5802 0.1891 1 1 0.2331 0.5742 0.1927 1 1 0.2362 0.5667 0.1972
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 991 244 747 109 1 10 0 124 0 0 744 0 3 0.4467 0.0000 0.0040 23.400 0.29 2.99 -2.70 3 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0155 0.5338 0.4508 1 1 0.0178 0.5269 0.4553 1 1 0.0213 0.5190 0.4597
chr6 156778268 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 2 775 216 559 83 6 54 0 73 0 0 552 2 5 0.3843 0.0000 0.0125 3.000 1.77 3.01 -1.24 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3372 0.6099 0.0530 1 1 0.3413 0.6011 0.0576 1 1 0.3458 0.5901 0.0641
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 557 222 335 12 0 46 1 163 0 0 315 0 20 0.0541 0.0000 0.0597 3.826 0.25 16.06 -15.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9731 0.0269 2 2 0.0000 0.2268 0.7732
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 412 154 258 80 0 6 1 67 0 0 255 0 3 0.5195 0.0000 0.0116 24.500 0.46 5.93 -5.46 56 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3517 0.5915 0.0567 1 1 0.3546 0.5841 0.0614 1 1 0.3573 0.5748 0.0679
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 228 97 131 9 0 14 0 74 0 0 131 0 0 0.0928 0.0000 0.0000 5.929 0.22 8.66 -8.44 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9972 0.0028 2 1 0.0000 0.8990 0.1010
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 358 147 211 0 0 16 10 121 0 0 204 2 5 0.0000 0.0000 0.0332 8.188 3.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 740 163 577 75 0 30 0 58 1 0 568 0 8 0.4601 0.0017 0.0156 4.433 0.28 9.64 -9.36 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3807 0.5669 0.0524 1 1 0.3822 0.5610 0.0568 1 1 0.3832 0.5537 0.0630
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 702 209 493 6 6 14 91 92 0 0 493 0 0 0.0287 0.0000 0.0000 9.692 6.17 12.63 -6.46 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8702 0.1298 2 2 0.0000 0.1670 0.8330
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 286 102 184 0 1 8 3 90 0 0 177 0 7 0.0000 0.0000 0.0380 11.750 3.74 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0186 0.9814 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0128 0.9872
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 308 108 200 12 0 20 2 74 0 0 197 0 3 0.1111 0.0000 0.0150 4.400 2.00 3.70 -1.70 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9794 0.0206
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 309 113 196 88 4 16 0 5 0 0 196 0 0 0.7788 0.0000 0.0000 6.062 3.16 4.60 -1.44 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.3254 0.6746 0.0000 0 0 0.7781 0.2219 0.0000
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 690 171 519 101 0 4 0 66 0 0 515 0 4 0.5906 0.0000 0.0077 41.750 0.29 12.32 -12.03 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8222 0.1761 0.0018 1 0 0.8136 0.1842 0.0022 1 0 0.8012 0.1958 0.0030
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 690 202 488 0 1 28 7 166 0 0 487 0 1 0.0000 0.0000 0.0020 6.179 3.01 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr7 26185767 AG A 0.500000 0.100 1 -1 4 437 73 364 34 1 6 0 32 0 0 364 0 0 0.4658 0.0000 0.0000 11.167 0.26 1.56 -1.30 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2775 0.5704 0.1521 1 1 0.2786 0.5651 0.1563 1 1 0.2797 0.5585 0.1618
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 159 61 98 33 0 1 1 26 0 0 98 0 0 0.5410 0.0000 0.0000 60.000 0.45 1.35 -0.89 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3591 0.5316 0.1093 1 1 0.3571 0.5291 0.1138 1 1 0.3541 0.5259 0.1199
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 549 155 394 84 0 0 0 71 0 0 393 0 1 0.5419 0.0000 0.0025 155.000 0.30 1.14 -0.84 56 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4165 0.5449 0.0386 1 1 0.4176 0.5399 0.0424 1 1 0.4181 0.5339 0.0480
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 203 54 149 28 0 4 0 22 0 0 147 0 2 0.5185 0.0000 0.0134 12.500 0.50 3.00 -2.50 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3136 0.5445 0.1419 1 1 0.3129 0.5411 0.1460 1 1 0.3117 0.5368 0.1514
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 246 96 150 48 0 1 0 47 0 0 149 0 1 0.5000 0.0000 0.0067 95.000 0.73 3.00 -2.27 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1922 0.6156 0.1922 1 1 0.1964 0.6071 0.1964 1 1 0.2018 0.5964 0.2018
chr7 56073066 CTT C 0.500000 0.100 1 -2 1 211 100 111 97 0 1 0 2 0 0 111 0 0 0.9700 0.0000 0.0000 99.000 0.07 2.50 -2.43 33 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6226 0.3774 0.0000 0 0 0.9379 0.0621 0.0000 0 0 0.9684 0.0316 0.0000
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 320 99 221 62 0 0 0 37 0 0 221 0 0 0.6263 0.0000 0.0000 99.000 0.08 2.38 -2.30 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7814 0.2131 0.0055 1 0 0.7705 0.2229 0.0066 1 0 0.7551 0.2366 0.0083
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 933 233 700 0 0 14 1 218 0 0 688 0 12 0.0000 0.0000 0.0171 15.643 3.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 616 155 461 76 1 20 2 56 0 0 457 1 3 0.4903 0.0000 0.0087 6.700 0.42 3.57 -3.15 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5244 0.4507 0.0249 1 0 0.5210 0.4512 0.0278 1 0 0.5156 0.4523 0.0321
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 279 95 184 0 0 4 0 91 0 0 178 0 6 0.0000 0.0000 0.0326 22.750 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0078 0.9922 2 2 0.0000 0.0089 0.9911
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 491 206 285 73 2 73 2 56 0 0 285 0 0 0.3544 0.0000 0.0000 1.822 1.27 3.75 -2.48 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5789 0.4021 0.0190 1 0 0.5735 0.4050 0.0215 1 0 0.5653 0.4094 0.0252
chr7 99652770 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 227 56 171 37 0 1 0 18 0 0 170 0 1 0.6607 0.0000 0.0058 55.000 0.16 1.06 -0.89 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6801 0.3007 0.0192 1 0 0.6683 0.3100 0.0216 1 0 0.6520 0.3227 0.0253
chr7 99836454 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 179 71 108 41 0 0 0 30 0 0 108 0 0 0.5775 0.0000 0.0000 71.000 0.44 1.17 -0.73 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4842 0.4611 0.0547 1 0 0.4784 0.4628 0.0588 1 0 0.4702 0.4652 0.0646
chr7 100075318 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 683 172 511 97 0 7 2 66 0 0 511 0 0 0.5640 0.0000 0.0000 23.571 0.29 1.20 -0.91 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8014 0.1962 0.0024 1 0 0.7927 0.2044 0.0030 1 0 0.7801 0.2160 0.0039
chr7 100124796 CAGGAGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 560 181 379 80 0 12 0 89 0 1 378 0 0 0.4420 0.0000 0.0026 14.083 0.35 5.60 -5.25 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0631 0.6353 0.3015 1 1 0.0682 0.6251 0.3066 1 1 0.0753 0.6123 0.3124
chr7 100752851 TCCACGGAAAAACCCACCATCC T 0.500000 0.100 1 -21 1 1304 252 1052 91 5 65 4 87 5 24 1013 7 3 0.3611 0.0048 0.0371 2.815 2.07 11.77 -9.70 13 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6294 0.3643 0.0063 1 0 0.6267 0.3658 0.0075 1 0 0.6218 0.3688 0.0094
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 218 91 127 87 1 1 0 2 0 0 127 0 0 0.9560 0.0000 0.0000 90.000 0.38 35.50 -35.12 53 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5100 0.4900 0.0000 0 0 0.9060 0.0940 0.0000 0 0 0.9520 0.0480 0.0000
chr7 101172640 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 422 94 328 84 1 3 0 6 0 0 328 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 30.333 0.98 1.00 -0.02 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1066 0.8934 0.0000 0 0 0.5694 0.4306 0.0000
chr7 102541185 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 636 188 448 161 0 2 0 25 0 0 448 0 0 0.8564 0.0000 0.0000 93.000 0.24 1.12 -0.88 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 672 204 468 90 0 6 0 108 0 0 465 0 3 0.4412 0.0000 0.0064 33.000 0.32 3.12 -2.80 30 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0092 0.3970 0.5938 1 2 0.0108 0.3977 0.5914 1 2 0.0133 0.3996 0.5871
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 379 104 275 4 0 26 3 71 0 0 270 0 5 0.0385 0.0000 0.0182 3.000 1.25 6.39 -5.14 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9923 0.0077 2 1 0.0000 0.5762 0.4238 2 2 0.0000 0.2190 0.7810
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 809 215 594 98 1 19 1 96 0 0 593 0 1 0.4558 0.0000 0.0017 10.263 1.08 3.99 -2.91 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1493 0.7234 0.1273 1 1 0.1569 0.7085 0.1346 1 1 0.1666 0.6893 0.1441
chr7 124032402 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 789 210 579 14 2 18 93 83 0 0 572 5 2 0.0667 0.0000 0.0121 10.333 0.21 3.18 -2.97 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.5974 0.4026
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 790 214 576 18 1 96 0 99 0 0 570 0 6 0.0841 0.0000 0.0104 1.255 0.17 6.03 -5.86 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 772 249 523 209 2 26 0 12 0 0 523 0 0 0.8394 0.0000 0.0000 8.538 0.40 13.25 -12.85 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0960 0.9040 0.0000 0 0 0.9263 0.0737 0.0000
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 362 150 212 66 2 16 0 66 0 2 204 0 6 0.4400 0.0000 0.0377 8.312 11.64 5.27 6.36 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1250 0.6571 0.2179 1 1 0.1309 0.6459 0.2233 1 1 0.1386 0.6316 0.2298
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 362 154 208 71 1 14 0 68 0 0 202 0 6 0.4610 0.0000 0.0288 10.000 4.80 11.47 -6.67 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1317 0.6667 0.2016 1 1 0.1377 0.6549 0.2074 1 1 0.1456 0.6398 0.2146
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -12 1 362 156 206 77 0 18 1 60 0 0 199 0 7 0.4936 0.0000 0.0340 7.667 4.45 12.03 -7.58 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3772 0.5708 0.0520 1 1 0.3790 0.5646 0.0564 1 1 0.3804 0.5570 0.0626
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 225 82 143 0 0 1 0 81 0 0 141 0 2 0.0000 0.0000 0.0140 81.000 3.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0143 0.9857 2 2 0.0000 0.0156 0.9844 2 2 0.0000 0.0175 0.9825
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 925 267 658 14 124 39 1 89 0 0 654 0 4 0.0524 0.0000 0.0061 5.846 2.00 3.07 -1.07 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9263 0.0736 0.0002 1 0 0.9204 0.0794 0.0002 1 0 0.9115 0.0881 0.0003
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 927 273 654 99 3 36 1 134 0 0 654 0 0 0.3626 0.0000 0.0000 6.583 2.67 3.12 -0.45 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0011 0.1937 0.8052 1 2 0.0015 0.1998 0.7988 1 2 0.0020 0.2088 0.7892
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1146 298 848 0 0 16 3 279 0 1 846 0 1 0.0000 0.0000 0.0024 18.733 1.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 144050729 ACT A 0.500000 0.100 1 -2 1 654 150 504 142 0 1 0 7 0 0 504 0 0 0.9467 0.0000 0.0000 149.000 0.37 3.00 -2.63 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.4109 0.5891 0.0000 0 0 0.9167 0.0833 0.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 676 154 522 18 0 9 0 127 0 0 520 0 2 0.1169 0.0000 0.0038 16.111 1.61 3.98 -2.37 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9950 0.0050
chr7 144258792 GAGGCTGTGAAACAGC G 0.500000 0.100 1 -15 3 1075 354 721 323 1 4 0 26 0 0 712 0 9 0.9124 0.0000 0.0125 87.500 0.22 14.31 -14.09 189 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000
chr7 149783003 A AC 0.500000 0.100 1 1 2 723 175 548 84 1 1 0 89 0 0 547 0 1 0.4800 0.0000 0.0018 174.000 0.15 1.30 -1.15 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0862 0.6753 0.2386 1 1 0.0921 0.6629 0.2450 1 1 0.1001 0.6471 0.2528
chr7 149815757 G GAGGTGGTC 0.500000 0.100 1 8 1 746 207 539 175 0 19 0 13 0 0 538 0 1 0.8454 0.0000 0.0019 9.895 0.75 7.69 -6.94 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.3790 0.6210 0.0000
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 855 197 658 93 0 2 0 102 0 0 657 0 1 0.4721 0.0000 0.0015 97.500 1.12 1.56 -0.44 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0448 0.6305 0.3248 1 1 0.0492 0.6201 0.3307 1 1 0.0555 0.6072 0.3373
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 800 218 582 121 0 7 0 90 0 0 576 0 6 0.5550 0.0000 0.0103 30.143 0.56 11.17 -10.60 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6699 0.3254 0.0047 1 0 0.6659 0.3285 0.0057 1 0 0.6593 0.3334 0.0072
chr7 151023910 GCTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 581 154 427 142 1 7 0 4 0 0 427 0 0 0.9221 0.0000 0.0000 21.000 0.79 3.25 -2.46 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1678 0.8322 0.0000 0 0 0.9470 0.0530 0.0000 0 0 0.9875 0.0125 0.0000
chr7 151051868 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 447 99 348 59 0 1 0 39 0 0 345 0 3 0.5960 0.0000 0.0086 98.000 1.08 3.26 -2.17 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6086 0.3704 0.0209 1 0 0.6006 0.3758 0.0235 1 0 0.5893 0.3833 0.0274
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 419 87 332 0 1 1 10 75 0 0 299 10 23 0.0000 0.0000 0.0994 85.000 8.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0036 0.9964 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 422 87 335 0 0 2 13 72 0 1 300 13 21 0.0000 0.0000 0.1045 85.000 8.75 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 424 85 339 0 0 5 0 80 0 0 268 30 41 0.0000 0.0000 0.2094 20.000 8.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 829 182 647 73 1 31 0 77 2 0 645 0 0 0.4011 0.0031 0.0031 4.839 0.82 6.05 -5.23 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1295 0.6751 0.1954 1 1 0.1352 0.6627 0.2020 1 1 0.1426 0.6469 0.2105
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.100 1 -6 2 773 163 610 117 1 38 0 7 0 0 610 0 0 0.7178 0.0000 0.0000 3.263 0.34 6.00 -5.66 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1888 0.8112 0.0000 0 0 0.7915 0.2085 0.0000
chr8 10608190 CTTCCTCTTCTGCCTCCTGGGACTCTATAACTTCTGACTCTGGCTGGGT C 0.002031 0.100 1 -48 3 1070 310 760 131 6 31 7 135 2 5 732 8 13 0.4226 0.0026 0.0368 8.903 2.85 12.38 -9.52 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0321 0.9649 0.0030 1 1 0.0385 0.9584 0.0031 1 1 0.0484 0.9485 0.0032
chr8 10610119 T TTTC 0.070211 0.100 1 3 1 1104 344 760 151 6 24 66 97 0 1 747 1 11 0.4390 0.0000 0.0171 12.857 1.99 5.32 -3.33 39 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0941 0.8807 0.0252 1 1 0.1065 0.8663 0.0272 1 1 0.1242 0.8461 0.0298
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 549 234 315 0 0 35 2 197 0 0 313 0 2 0.0000 0.0000 0.0063 5.657 5.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22034158 GGAGGAA G 0.000406 0.100 1 -6 1 264 77 187 65 0 6 0 6 0 0 187 0 0 0.8442 0.0000 0.0000 11.833 0.12 5.67 -5.54 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0984 0.9016 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 367 127 240 60 0 3 0 64 0 0 237 0 3 0.4724 0.0000 0.0125 41.333 0.10 7.45 -7.35 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1439 0.6999 0.1562 1 1 0.1530 0.6901 0.1569 1 1 0.1654 0.6772 0.1574
chr8 23145733 GCTAAAATGATGA G 0.001032 0.100 1 -12 1 331 130 201 125 0 5 0 0 0 0 199 0 2 0.9615 0.0000 0.0100 25.000 0.18 33 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr8 33496717 A AGAT 0.026718 0.100 1 3 5 185 77 108 57 0 13 0 7 0 0 108 0 0 0.7403 0.0000 0.0000 4.923 0.18 3.29 -3.11 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2670 0.7330 0.0000 0 0 0.8663 0.1337 0.0000
chr8 37698415 GCGCCGCCGC G 0.001415 0.100 1 -9 1 658 172 486 95 2 19 0 56 2 1 472 0 11 0.5523 0.0041 0.0288 8.053 0.80 8.79 -7.99 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9204 0.0796 0.0000 1 0 0.9155 0.0845 0.0000 1 0 0.9084 0.0916 0.0000
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 206 84 122 79 0 1 0 4 0 0 122 0 0 0.9405 0.0000 0.0000 83.000 0.51 2.25 -1.74 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 1 0.4227 0.5773 0.0000 0 0 0.7802 0.2198 0.0000
chr8 64581060 T TGGCGGC 0.001021 0.100 1 6 1 609 161 448 134 2 15 2 8 6 0 439 1 2 0.8323 0.0134 0.0201 10.429 2.46 5.50 -3.04 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7232 0.2768 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 699 209 490 60 4 50 1 94 0 0 488 2 0 0.2871 0.0000 0.0041 3.160 0.57 4.02 -3.45 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0085 0.5304 0.4611 1 1 0.0106 0.5457 0.4437 1 1 0.0140 0.5661 0.4200
chr8 64581463 G GGCAGCAGCAGCA 0.000141 0.100 1 12 1 699 209 490 140 5 51 1 12 0 0 488 1 1 0.6699 0.0000 0.0041 3.059 2.20 8.75 -6.55 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8229 0.1771 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr8 120811835 T TACCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 446 120 326 113 1 4 0 2 0 0 326 0 0 0.9417 0.0000 0.0000 29.000 0.99 6.00 -5.01 57 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7967 0.2033 0.0000 0 0 0.9725 0.0275 0.0000 0 0 0.9859 0.0141 0.0000
chr8 123369918 T TTCATCA 0.500000 0.100 1 6 1 469 135 334 13 0 28 3 91 0 0 332 2 0 0.0963 0.0000 0.0060 3.821 0.46 5.15 -4.69 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9753 0.0247
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 264 120 144 65 0 2 0 53 0 0 142 0 2 0.5417 0.0000 0.0139 59.000 0.20 2.96 -2.76 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4041 0.5403 0.0557 1 1 0.4036 0.5363 0.0600 1 1 0.4023 0.5316 0.0662
chr8 141449677 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 325 120 205 115 1 2 0 2 0 0 205 0 0 0.9583 0.0000 0.0000 59.000 0.86 6.00 -5.14 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8155 0.1845 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 504 132 372 49 1 23 4 55 0 0 368 0 4 0.3712 0.0000 0.0108 4.696 2.16 5.11 -2.95 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0361 0.4657 0.4982 1 2 0.0396 0.4661 0.4942 1 2 0.0447 0.4671 0.4882
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 1000 245 755 108 0 36 1 100 0 0 740 0 15 0.4408 0.0000 0.0199 5.778 1.19 10.77 -9.58 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0536 0.6951 0.2514 1 1 0.0588 0.6813 0.2599 1 1 0.0661 0.6637 0.2702
chr8 144522517 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 1 470 127 343 73 0 5 0 49 0 0 338 0 5 0.5748 0.0000 0.0146 24.400 0.48 6.14 -5.66 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6289 0.3566 0.0145 1 0 0.6217 0.3617 0.0166 1 0 0.6113 0.3689 0.0198
chr9 116848 T TA 0.003653 0.100 1 1 1 763 231 532 212 1 8 0 10 1 0 531 0 0 0.9177 0.0019 0.0019 27.875 0.26 1.10 -0.84 112 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 0 0.9967 0.0033 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr9 117363 T TC 0.002993 0.100 1 1 1 988 192 796 130 30 10 10 12 0 0 796 0 0 0.6771 0.0000 0.0000 21.375 1.25 3.50 -2.25 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4975 0.5025 0.0000
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.100 1 2 3 987 193 794 145 14 12 4 18 0 0 794 0 0 0.7513 0.0000 0.0000 22.625 1.40 2.94 -1.54 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0085 0.9915 0.0000
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.100 1 -2 4 989 201 788 6 166 12 2 15 0 0 787 0 1 0.0299 0.0000 0.0013 11.286 0.33 2.40 -2.07 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0862 0.9138 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 811 273 538 12 0 57 18 186 0 0 537 0 1 0.0440 0.0000 0.0019 3.789 0.00 3.19 -3.19 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9873 0.0127 2 2 0.0000 0.3934 0.6066
chr9 12775862 T TGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 2 320 93 227 0 0 24 3 66 0 0 222 0 5 0.0000 0.0000 0.0220 2.833 5.56 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0223 0.9777 2 2 0.0000 0.0240 0.9760 2 2 0.0000 0.0266 0.9734
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 320 93 227 0 23 26 4 40 0 0 222 0 5 0.0000 0.0000 0.0220 1.875 5.03 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9845 0.0155 2 1 0.0000 0.8749 0.1251 2 1 0.0000 0.7239 0.2761
chr9 12775862 T TGGTGGC 0.500000 0.100 1 6 2 320 93 227 7 1 12 4 69 0 0 222 0 5 0.0753 0.0000 0.0220 7.273 0.43 5.41 -4.98 7 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9913 0.0087 2 1 0.0000 0.8145 0.1855
chr9 25678179 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 3 551 119 432 88 5 20 1 5 0 0 431 0 1 0.7395 0.0000 0.0023 4.950 0.90 3.20 -2.30 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0833 0.9167 0.0000 0 0 0.5494 0.4506 0.0000
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 466 116 350 3 0 2 0 111 0 0 350 0 0 0.0259 0.0000 0.0000 57.000 0.67 1.71 -1.05 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7282 0.2718 2 2 0.0000 0.0868 0.9132 2 2 0.0000 0.0304 0.9696
chr9 35674193 CGGAGAGGAGGATCTACCT C 0.500000 0.100 1 -18 3 484 162 322 63 0 40 0 59 0 0 322 0 0 0.3889 0.0000 0.0000 3.050 0.32 11.56 -11.24 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2564 0.6276 0.1160 1 1 0.2603 0.6182 0.1215 1 1 0.2649 0.6064 0.1287
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 823 217 606 100 1 43 1 72 0 0 602 0 4 0.4608 0.0000 0.0066 4.023 0.57 11.29 -10.72 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6848 0.3091 0.0061 1 0 0.6786 0.3141 0.0073 1 0 0.6693 0.3216 0.0091
chr9 35906602 C CCCCCACCGCCACCAT 0.500000 0.100 1 15 1 800 253 547 179 3 49 2 20 0 0 547 0 0 0.7075 0.0000 0.0000 4.250 2.09 10.30 -8.21 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0082 0.9918 0.0000
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 434 77 357 11 1 0 1 64 0 0 357 0 0 0.1429 0.0000 0.0000 77.000 0.73 1.02 -0.29 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9893 0.0107
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 495 142 353 72 0 2 0 68 0 0 340 0 13 0.5070 0.0000 0.0368 70.000 0.15 13.97 -13.82 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0578 0.5978 0.3444 1 1 0.0625 0.5899 0.3475 1 1 0.0691 0.5801 0.3508
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 735 170 565 137 0 15 0 18 0 0 565 0 0 0.8059 0.0000 0.0000 10.333 0.27 9.94 -9.67 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0074 0.9926 0.0000
chr9 77384631 G GTGA 0.500000 0.100 1 3 1 532 195 337 94 5 29 0 67 0 0 332 0 5 0.4821 0.0000 0.0148 5.724 0.17 2.93 -2.76 72 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7544 0.2420 0.0036 1 0 0.7464 0.2492 0.0044 1 0 0.7349 0.2594 0.0057
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 538 132 406 66 0 1 0 65 0 0 402 0 4 0.5000 0.0000 0.0099 131.000 0.18 3.08 -2.90 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1245 0.6499 0.2256 1 1 0.1302 0.6391 0.2306 1 1 0.1378 0.6255 0.2368
chr9 87919269 C CCAGCGTCATCTTGTCTCT 0.500000 0.100 1 18 3 355 130 225 28 0 6 2 94 0 0 225 0 0 0.2154 0.0000 0.0000 20.667 0.29 7.97 -7.68 10 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0056 0.9944 1 2 0.0000 0.3426 0.6574 2 1 0.0000 0.9921 0.0079
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 221 70 151 0 0 1 1 68 0 0 148 0 3 0.0000 0.0000 0.0199 69.000 3.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0267 0.9733 2 2 0.0000 0.0295 0.9705
chr9 92474742 C CTCATCA 0.500000 0.100 1 6 2 373 97 276 41 0 24 1 31 0 0 273 1 2 0.4227 0.0000 0.0109 3.042 0.93 7.68 -6.75 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3534 0.5461 0.1006 1 1 0.3523 0.5424 0.1053 1 1 0.3505 0.5379 0.1116
chr9 92474742 C CTCATCATCA 0.500000 0.100 1 9 2 373 97 276 41 2 22 2 30 0 0 273 1 2 0.4227 0.0000 0.0109 3.409 0.93 7.73 -6.81 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4066 0.5167 0.0767 1 1 0.4038 0.5149 0.0813 1 1 0.3997 0.5128 0.0876
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 508 185 323 12 0 1 0 172 0 0 322 0 1 0.0649 0.0000 0.0031 184.000 0.75 8.38 -7.63 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9842 0.0158 2 2 0.0000 0.3331 0.6669
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 687 258 429 151 10 3 0 94 1 1 426 0 1 0.5853 0.0023 0.0070 85.000 2.68 3.39 -0.71 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9914 0.0086 0.0000 1 0 0.9898 0.0102 0.0000 1 0 0.9874 0.0126 0.0000
chr9 96383603 C CCCTCGG 0.500000 0.100 1 6 1 195 58 137 28 0 10 0 20 0 0 136 0 1 0.4828 0.0000 0.0073 4.800 0.46 6.05 -5.59 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3968 0.5042 0.0990 1 1 0.3929 0.5036 0.1035 1 1 0.3875 0.5029 0.1095
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 406 103 303 0 0 18 3 82 0 0 303 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.722 5.68 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0132 0.9868 2 2 0.0000 0.0144 0.9856 2 2 0.0000 0.0162 0.9838
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 940 132 808 0 1 36 1 94 0 2 790 2 14 0.0000 0.0000 0.0223 2.639 6.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0111 0.9889 2 2 0.0000 0.0102 0.9898 2 2 0.0000 0.0099 0.9901
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 524 122 402 5 0 1 0 116 0 0 402 0 0 0.0410 0.0000 0.0000 121.000 0.00 2.99 -2.99 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9944 0.0056 2 2 0.0000 0.3838 0.6162 2 2 0.0000 0.0816 0.9184
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 956 213 743 106 0 2 0 105 0 0 741 0 2 0.4977 0.0000 0.0027 105.500 0.89 4.70 -3.81 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1177 0.7388 0.1435 1 1 0.1252 0.7233 0.1515 1 1 0.1351 0.7031 0.1618
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 882 217 665 14 0 2 4 197 0 0 662 0 3 0.0645 0.0000 0.0045 106.000 0.21 2.88 -2.66 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9913 0.0087 2 2 0.0000 0.2899 0.7101
chr9 110138061 G GGAAGCT 0.500000 0.100 1 6 1 722 131 591 115 0 13 0 3 1 1 589 0 0 0.8779 0.0017 0.0034 9.077 0.26 6.00 -5.74 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3308 0.6692 0.0000 0 0 0.9340 0.0660 0.0000 0 0 0.9771 0.0229 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 293 106 187 0 0 2 0 104 0 0 184 0 3 0.0000 0.0000 0.0160 52.000 4.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 416 91 325 0 0 18 0 73 0 0 325 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.056 6.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0237 0.9763 2 2 0.0000 0.0255 0.9745 2 2 0.0000 0.0282 0.9718
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 680 149 531 64 1 3 0 81 0 0 527 0 4 0.4295 0.0000 0.0075 48.667 0.67 5.69 -5.02 8 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0118 0.3596 0.6286 1 2 0.0137 0.3638 0.6225 1 2 0.0165 0.3699 0.6136
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 585 124 461 63 1 11 0 49 0 0 461 0 0 0.5081 0.0000 0.0000 10.182 0.35 1.27 -0.92 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5396 0.4318 0.0286 1 0 0.5342 0.4340 0.0318 1 0 0.5264 0.4372 0.0363
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 619 203 416 0 2 23 91 87 0 0 411 2 3 0.0000 0.0000 0.0120 8.000 3.99 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 2 620 205 415 2 5 94 10 94 0 0 410 1 4 0.0098 0.0000 0.0120 1.138 2.50 5.97 -3.47 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9381 0.0619 2 2 0.0000 0.3794 0.6206 2 2 0.0000 0.1409 0.8591
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 577 191 386 94 0 7 0 90 0 0 384 1 1 0.4921 0.0000 0.0052 30.667 0.36 3.32 -2.96 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1699 0.7104 0.1197 1 1 0.1772 0.6962 0.1266 1 1 0.1865 0.6778 0.1356
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 368 112 256 1 0 11 0 100 0 0 247 0 9 0.0089 0.0000 0.0352 9.182 0.00 7.17 -7.17 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0344 0.9656 2 2 0.0000 0.0124 0.9876 2 2 0.0000 0.0095 0.9905
chr9 130668313 G GGT 0.500000 0.100 1 2 1 350 121 229 87 5 17 2 10 0 0 229 0 0 0.7190 0.0000 0.0000 6.118 0.15 2.00 -1.85 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0434 0.9566 0.0000
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 433 123 310 11 1 40 4 67 1 0 304 0 5 0.0894 0.0032 0.0194 2.075 1.45 3.66 -2.20 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9895 0.0105
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 504 156 348 147 0 3 0 6 0 0 348 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 51.000 1.19 1.83 -0.64 105 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0031 0.9969 0.0000 0 0 0.7244 0.2756 0.0000 0 0 0.9640 0.0360 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 282 101 181 4 0 0 0 97 0 0 179 0 2 0.0396 0.0000 0.0110 101.000 1.25 1.92 -0.67 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9787 0.0213 2 2 0.0000 0.3344 0.6656 2 2 0.0000 0.0964 0.9036
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 282 101 181 4 0 0 0 97 0 0 179 0 2 0.0396 0.0000 0.0110 101.000 1.25 1.92 -0.67 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9787 0.0213 2 2 0.0000 0.3344 0.6656 2 2 0.0000 0.0964 0.9036
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 269 104 165 99 0 1 0 4 0 0 165 0 0 0.9519 0.0000 0.0000 103.000 0.19 1.25 -1.06 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0231 0.9769 0.0000 0 0 0.6688 0.3312 0.0000 0 0 0.9040 0.0960 0.0000
chr9 136341024 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 260 81 179 39 0 7 0 35 0 0 179 0 0 0.4815 0.0000 0.0000 10.571 1.26 1.91 -0.66 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2953 0.5711 0.1336 1 1 0.2961 0.5657 0.1382 1 1 0.2968 0.5590 0.1442
chr9 137192572 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 699 200 499 86 1 25 7 81 0 0 499 0 0 0.4300 0.0000 0.0000 7.000 0.43 3.32 -2.89 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1347 0.7013 0.1640 1 1 0.1415 0.6875 0.1709 1 1 0.1503 0.6698 0.1798
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 402 109 293 0 0 13 0 96 0 0 280 0 13 0.0000 0.0000 0.0444 7.385 13.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0050 0.9950
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 924 199 725 104 1 12 0 82 0 0 717 0 8 0.5226 0.0000 0.0110 15.583 0.41 8.35 -7.94 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6175 0.3810 0.0015 1 0 0.6208 0.3774 0.0017 1 0 0.6243 0.3737 0.0020
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 388 115 273 107 0 0 0 8 0 0 273 0 0 0.9304 0.0000 0.0000 115.000 0.64 1.25 -0.61 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.7558 0.2442 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr10 13439173 CAG C 0.004149 0.100 1 -2 3 313 80 233 37 0 4 0 39 0 0 229 0 4 0.4625 0.0000 0.0172 19.000 0.30 2.08 -1.78 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2697 0.7266 0.0037 1 1 0.2802 0.7162 0.0037 1 1 0.2940 0.7024 0.0036
chr10 13657133 CCGCCCCCCG C 0.028316 0.100 1 -9 1 737 190 547 149 0 32 1 8 0 0 547 0 0 0.7842 0.0000 0.0000 4.938 0.36 8.38 -8.02 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.8664 0.1336 0.0000 0 0 0.9945 0.0055 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 229 83 146 48 0 2 1 32 0 0 146 0 0 0.5783 0.0000 0.0000 40.500 0.23 4.12 -3.90 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7009 0.2908 0.0084 1 0 0.6945 0.2962 0.0093 1 0 0.6857 0.3037 0.0107
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 981 230 751 82 1 25 3 119 1 0 744 0 6 0.3565 0.0013 0.0093 8.160 0.73 7.75 -7.02 18 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0677 0.9322 1 2 0.0002 0.0737 0.9261 1 2 0.0003 0.0826 0.9170
chr10 21516554 C CTCT 0.000302 0.100 1 3 2 968 234 734 93 12 10 92 27 1 0 732 0 1 0.3974 0.0014 0.0027 34.500 0.65 4.56 -3.91 13 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2626 0.7374 0.0001 1 1 0.2775 0.7224 0.0001 1 1 0.2969 0.7030 0.0001
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 735 147 588 79 0 1 1 66 0 0 588 0 0 0.5374 0.0000 0.0000 146.000 0.22 3.85 -3.63 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5351 0.4477 0.0172 1 0 0.5361 0.4450 0.0189 1 0 0.5366 0.4421 0.0214
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 274 104 170 96 0 0 0 8 0 0 170 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 104.000 0.19 2.00 -1.81 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6724 0.3276 0.0000 0 0 0.9814 0.0186 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 562 137 425 125 0 6 0 6 0 0 423 0 2 0.9124 0.0000 0.0047 21.833 0.75 1.00 -0.25 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1717 0.8283 0.0000 0 0 0.8328 0.1672 0.0000
chr10 38055722 CCTT C 0.000003 0.100 1 -3 4 1027 208 819 186 1 8 0 13 2 1 815 0 1 0.8942 0.0024 0.0049 25.000 1.37 3.54 -2.17 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 44292818 AC A 0.006843 0.100 1 -1 1 448 168 280 67 1 17 0 83 0 0 277 0 3 0.3988 0.0000 0.0107 8.882 0.31 1.73 -1.42 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0705 0.9117 0.0178 1 1 0.0793 0.9033 0.0174 1 1 0.0921 0.8911 0.0168
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 134 62 72 10 0 3 0 49 0 0 72 0 0 0.1613 0.0000 0.0000 19.667 1.20 6.71 -5.51 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9963 0.0037 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9967 0.0033
chr10 63214835 TTCA T 0.005181 0.100 1 -3 1 821 157 664 93 0 1 1 62 0 0 664 0 0 0.5924 0.0000 0.0000 156.000 0.38 2.98 -2.61 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9006 0.0994 0.0000 1 0 0.8953 0.1047 0.0000 1 0 0.8877 0.1122 0.0000
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.100 1 1 1 222 99 123 46 0 7 1 45 0 0 123 0 0 0.4646 0.0000 0.0000 13.143 0.22 1.33 -1.12 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3901 0.6068 0.0031 1 1 0.3980 0.5988 0.0032 1 1 0.4080 0.5887 0.0033
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 436 109 327 0 0 30 2 77 0 0 327 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 2.633 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0844 0.9156 2 2 0.0000 0.0910 0.9090 2 2 0.0000 0.1007 0.8993
chr10 75028901 G GGAAGAGGAA 0.002182 0.100 1 9 1 709 117 592 43 0 42 0 32 0 0 592 0 0 0.3675 0.0000 0.0000 1.786 0.42 6.47 -6.05 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6726 0.3273 0.0002 1 0 0.6694 0.3304 0.0002 1 0 0.6648 0.3350 0.0002
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 516 192 324 104 2 13 0 73 0 0 322 0 2 0.5417 0.0000 0.0062 13.692 0.43 4.86 -4.43 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8956 0.1044 0.0000 1 0 0.8908 0.1092 0.0000 1 0 0.8837 0.1163 0.0000
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 240 42 198 17 2 2 1 20 0 0 198 0 0 0.4048 0.0000 0.0000 19.000 0.47 1.35 -0.88 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3494 0.5874 0.0632 1 1 0.3545 0.5825 0.0630 1 1 0.3611 0.5761 0.0628
chr10 80144341 G GAGA 0.037415 0.100 1 3 2 260 82 178 49 0 3 0 30 0 0 177 0 1 0.5976 0.0000 0.0056 26.333 0.47 4.47 -4.00 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7940 0.2051 0.0009 1 0 0.7875 0.2115 0.0010 1 0 0.7783 0.2206 0.0012
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 742 179 563 109 0 7 0 63 0 0 554 0 9 0.6089 0.0000 0.0160 24.571 0.43 6.03 -5.60 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9229 0.0769 0.0002 1 0 0.9173 0.0824 0.0003 1 0 0.9092 0.0904 0.0004
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 590 191 399 104 0 1 0 86 0 0 391 0 8 0.5445 0.0000 0.0201 190.000 0.18 3.13 -2.95 18 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5005 0.4984 0.0011 1 0 0.5092 0.4896 0.0012 1 0 0.5196 0.4790 0.0014
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 696 224 472 118 0 40 0 66 0 0 467 0 5 0.5268 0.0000 0.0106 4.600 1.73 6.56 -4.83 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9565 0.0434 0.0001 1 0 0.9517 0.0481 0.0001 1 0 0.9445 0.0553 0.0002
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 370 83 287 44 0 11 0 28 0 0 282 0 5 0.5301 0.0000 0.0174 6.545 0.80 5.46 -4.67 20 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4913 0.4585 0.0501 1 0 0.4862 0.4599 0.0540 1 0 0.4788 0.4618 0.0594
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.100 1 18 1 472 128 344 6 0 28 0 94 0 0 315 0 29 0.0469 0.0000 0.0843 3.571 0.50 12.50 -12.00 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9881 0.0119 2 1 0.0000 0.8870 0.1130
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 386 140 246 64 0 0 0 76 0 0 244 0 2 0.4571 0.0000 0.0081 140.000 0.66 2.75 -2.09 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0619 0.6445 0.2936 1 1 0.0684 0.6403 0.2913 1 1 0.0777 0.6347 0.2876
chr10 115171343 CTT C 0.004437 0.100 1 -2 1 284 71 213 58 0 4 0 9 0 0 213 0 0 0.8169 0.0000 0.0000 16.750 0.09 2.00 -1.91 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2191 0.7809 0.0000 0 0 0.9207 0.0793 0.0000
chr10 119030300 C CCCG 0.001394 0.100 1 3 1 519 137 382 65 0 25 2 45 0 0 379 0 3 0.4745 0.0000 0.0079 4.480 1.40 6.18 -4.78 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7204 0.2795 0.0000 1 0 0.7172 0.2827 0.0001 1 0 0.7125 0.2875 0.0001
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 414 115 299 3 48 12 11 41 0 0 298 1 0 0.0261 0.0000 0.0033 4.400 0.33 2.20 -1.86 3 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0408 0.4318 0.5274 1 2 0.0443 0.4345 0.5213 1 2 0.0492 0.4381 0.5126
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 375 103 272 47 0 6 0 50 0 0 271 0 1 0.4563 0.0000 0.0037 16.167 0.53 1.42 -0.89 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1248 0.5996 0.2756 1 1 0.1298 0.5922 0.2780 1 1 0.1364 0.5829 0.2807
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 680 158 522 138 1 11 0 8 0 1 521 0 0 0.8734 0.0000 0.0019 13.364 0.17 3.38 -3.20 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2922 0.7078 0.0000 0 0 0.9089 0.0911 0.0000
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.100 1 -12 1 692 167 525 145 1 15 0 6 0 0 524 0 1 0.8683 0.0000 0.0019 10.133 0.23 10.00 -9.77 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0057 0.9943 0.0000 0 0 0.9424 0.0576 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr11 637361 CGCGGGGGCATCT C 0.071834 0.100 1 -12 2 306 108 198 51 0 12 0 45 0 1 192 0 5 0.4722 0.0000 0.0303 8.000 0.37 11.13 -10.76 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3981 0.5811 0.0208 1 1 0.4050 0.5735 0.0215 1 1 0.4136 0.5641 0.0224
chr11 1051776 TCCCCTGGCACCTGGGAAGCTGGGC T 0.500000 0.100 1 -24 1 428 159 269 152 0 2 0 5 0 0 268 0 1 0.9560 0.0000 0.0037 78.500 0.63 20.60 -19.97 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 0 0.7695 0.2305 0.0000 0 0 0.9714 0.0286 0.0000
chr11 1188258 GACCAGCACAACCTCTGCTCCTACA G 0.001194 0.100 1 -24 1 3082 761 2321 326 10 161 7 257 7 2 2267 3 42 0.4284 0.0030 0.0233 3.785 1.84 12.77 -10.93 96 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5468 0.4532 0.0000 1 0 0.5742 0.4258 0.0000 1 0 0.6061 0.3939 0.0000
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.100 1 -24 1 3319 789 2530 345 11 243 5 185 9 4 2512 1 4 0.4373 0.0036 0.0071 2.241 3.05 13.59 -10.55 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1116 231 885 92 1 87 3 48 0 0 885 0 0 0.3983 0.0000 0.0000 1.632 0.64 8.17 -7.53 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9374 0.0623 0.0003 1 0 0.9307 0.0690 0.0003 1 0 0.9205 0.0790 0.0005
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.100 1 -30 1 1120 236 884 32 2 84 3 115 0 0 835 0 49 0.1356 0.0000 0.0554 1.819 2.53 17.15 -14.62 8 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 1053 271 782 17 0 101 4 149 0 0 781 1 0 0.0627 0.0000 0.0013 1.700 0.53 12.47 -11.94 11 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9574 0.0426
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 410 117 293 0 0 3 0 114 0 0 291 0 2 0.0000 0.0000 0.0068 38.000 3.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 220 94 126 52 0 2 0 40 0 0 126 0 0 0.5532 0.0000 0.0000 46.000 0.12 2.35 -2.23 26 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4882 0.4666 0.0452 1 0 0.4834 0.4675 0.0491 1 0 0.4764 0.4690 0.0546
chr11 4587333 TGAGTATG T 0.500000 0.100 1 -7 2 1387 331 1056 311 0 4 0 16 0 0 1055 0 1 0.9396 0.0000 0.0009 81.750 0.68 5.81 -5.13 95 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0714 0.9286 0.0000 0 0 0.9849 0.0151 0.0000
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 666 157 509 82 1 1 0 73 0 0 509 0 0 0.5223 0.0000 0.0000 156.000 0.16 4.32 -4.16 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3658 0.5837 0.0504 1 1 0.3685 0.5766 0.0548 1 1 0.3711 0.5678 0.0611
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 716 186 530 97 0 5 0 84 0 0 530 0 0 0.5215 0.0000 0.0000 36.200 0.37 1.19 -0.82 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4140 0.5546 0.0315 1 1 0.4166 0.5484 0.0350 1 1 0.4188 0.5411 0.0401
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 902 221 681 0 0 2 0 219 0 0 672 0 9 0.0000 0.0000 0.0132 109.500 5.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 649 171 478 0 0 5 0 166 0 0 478 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 33.200 1.66 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 839 170 669 0 0 16 0 154 0 0 644 1 24 0.0000 0.0000 0.0374 9.625 9.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr11 6641514 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 5 668 164 504 127 2 17 1 17 0 0 504 0 0 0.7744 0.0000 0.0000 8.647 1.06 3.65 -2.58 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0050 0.9950 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 272 139 133 0 0 22 4 113 0 0 133 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.273 3.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr11 12294797 G GCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 9 1 648 157 491 68 1 53 1 34 0 0 479 0 12 0.4331 0.0000 0.0244 1.962 1.51 9.65 -8.13 18 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7121 0.2792 0.0088 1 0 0.7025 0.2872 0.0103 1 0 0.6890 0.2984 0.0126
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 12 1 648 157 491 68 1 53 1 34 0 0 479 0 12 0.4331 0.0000 0.0244 1.962 1.51 9.65 -8.13 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7121 0.2792 0.0088 1 0 0.7025 0.2872 0.0103 1 0 0.6890 0.2984 0.0126
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 212 77 135 72 0 1 0 4 0 0 135 0 0 0.9351 0.0000 0.0000 76.000 0.19 3.00 -2.81 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0054 0.9946 0.0000 0 1 0.3401 0.6599 0.0000 0 0 0.7164 0.2836 0.0000
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 204 99 105 87 0 1 0 11 0 0 105 0 0 0.8788 0.0000 0.0000 98.000 0.23 4.00 -3.77 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0553 0.9447 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 899 258 641 125 0 10 1 122 0 0 635 0 6 0.4845 0.0000 0.0094 24.800 0.20 3.80 -3.60 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0739 0.7630 0.1631 1 1 0.0806 0.7466 0.1728 1 1 0.0900 0.7249 0.1851
chr11 49208393 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 243 106 137 66 0 3 0 37 0 0 137 0 0 0.6226 0.0000 0.0000 34.333 0.18 3.27 -3.09 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8401 0.1572 0.0027 1 0 0.8297 0.1670 0.0033 1 0 0.8148 0.1809 0.0043
chr11 55839334 TATCTC T 0.500000 0.100 1 -5 2 766 164 602 86 2 1 0 75 1 0 601 0 0 0.5244 0.0017 0.0017 163.000 0.27 4.59 -4.32 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4589 0.5124 0.0286 1 1 0.4592 0.5090 0.0319 1 1 0.4583 0.5050 0.0367
chr11 55968178 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 715 172 543 162 0 5 0 5 0 0 543 0 0 0.9419 0.0000 0.0000 33.400 0.27 2.60 -2.33 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0623 0.9377 0.0000 0 0 0.9422 0.0578 0.0000 0 0 0.9906 0.0094 0.0000
chr11 56093801 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 921 231 690 216 1 5 0 9 0 0 690 0 0 0.9351 0.0000 0.0000 45.200 0.19 2.00 -1.81 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7815 0.2185 0.0000 0 0 0.9915 0.0085 0.0000
chr11 56093830 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 911 233 678 213 6 5 0 9 0 0 678 0 0 0.9142 0.0000 0.0000 44.600 0.18 2.00 -1.82 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7901 0.2099 0.0000 0 0 0.9920 0.0080 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 902 192 710 7 0 1 1 183 0 0 701 1 8 0.0365 0.0000 0.0127 191.000 0.14 2.91 -2.76 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 2 0.0000 0.1010 0.8990 2 2 0.0000 0.0076 0.9924
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 88 47 41 25 0 0 0 22 0 0 41 0 0 0.5319 0.0000 0.0000 47.000 0.20 2.14 -1.94 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2922 0.5466 0.1612 1 1 0.2920 0.5431 0.1649 1 1 0.2916 0.5387 0.1697
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 980 165 815 9 0 34 1 121 0 0 754 0 61 0.0545 0.0000 0.0748 3.853 0.78 6.77 -5.99 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.6087 0.3913 2 2 0.0000 0.0429 0.9571
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1184 236 948 14 1 109 3 109 0 0 892 2 54 0.0593 0.0000 0.0591 1.157 0.93 10.62 -9.70 12 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.8092 0.1908
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 1007 306 701 168 0 73 0 65 0 0 684 0 17 0.5490 0.0000 0.0243 3.192 0.36 12.43 -12.07 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9986 0.0014 0.0000 1 0 0.9982 0.0018 0.0000 1 0 0.9975 0.0025 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 926 240 686 12 0 5 2 221 0 0 685 0 1 0.0500 0.0000 0.0015 47.000 0.00 2.30 -2.30 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8302 0.1698 2 2 0.0000 0.0404 0.9596
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 822 178 644 90 2 14 2 70 0 1 642 0 1 0.5056 0.0000 0.0031 11.714 0.39 4.10 -3.71 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6107 0.3778 0.0115 1 0 0.6060 0.3807 0.0133 1 0 0.5988 0.3851 0.0161
chr11 73660839 A AGGTAAGTCT 0.500000 0.100 1 9 2 213 91 122 87 0 1 0 3 0 0 122 0 0 0.9560 0.0000 0.0000 90.000 0.15 15.67 -15.52 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0968 0.9032 0.0000 0 0 0.7597 0.2403 0.0000 0 0 0.9086 0.0914 0.0000
chr11 73660841 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 214 86 128 81 0 2 1 2 0 0 128 0 0 0.9419 0.0000 0.0000 41.500 0.16 12.00 -11.84 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3700 0.6300 0.0000 0 0 0.8478 0.1522 0.0000 0 0 0.9224 0.0776 0.0000
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 255 67 188 0 0 0 0 67 0 0 185 0 3 0.0000 0.0000 0.0160 67.000 17.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0274 0.9726 2 2 0.0000 0.0294 0.9706 2 2 0.0000 0.0324 0.9676
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 520 127 393 117 0 5 0 5 0 0 393 0 0 0.9213 0.0000 0.0000 24.400 0.88 4.20 -3.32 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 0 0.6272 0.3728 0.0000 0 0 0.9219 0.0781 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1376 365 1011 281 5 62 2 15 0 0 1011 0 0 0.7699 0.0000 0.0000 4.871 0.83 5.67 -4.84 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0230 0.9770 0.0000 0 0 0.9511 0.0489 0.0000
chr11 101962856 AGCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 862 186 676 173 1 1 0 11 0 0 676 0 0 0.9301 0.0000 0.0000 185.000 1.07 3.55 -2.48 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0465 0.9535 0.0000 0 0 0.7996 0.2004 0.0000
chr11 117797169 CCGCACT C 0.500000 0.100 1 -6 3 276 119 157 112 0 3 0 4 0 0 157 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 38.667 0.29 6.00 -5.71 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0398 0.9602 0.0000 0 0 0.7917 0.2083 0.0000 0 0 0.9462 0.0538 0.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 870 274 596 0 0 47 1 226 0 0 595 1 0 0.0000 0.0000 0.0017 4.935 9.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 316 122 194 112 0 4 0 6 0 0 194 0 0 0.9180 0.0000 0.0000 29.500 0.25 8.00 -7.75 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3112 0.6888 0.0000 0 0 0.8298 0.1702 0.0000
chr11 124543152 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 686 137 549 124 0 4 0 9 1 1 547 0 0 0.9051 0.0018 0.0036 33.250 0.35 3.67 -3.31 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0359 0.9641 0.0000 0 0 0.5835 0.4165 0.0000
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 384 126 258 0 0 15 2 109 0 0 258 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.333 5.69 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0046 0.9954
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.100 1 -6 1 252 81 171 46 0 13 0 22 0 0 171 0 0 0.5679 0.0000 0.0000 5.231 0.26 5.45 -5.19 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7891 0.2041 0.0068 1 0 0.7771 0.2149 0.0080 1 0 0.7602 0.2298 0.0100
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 89 46 43 23 0 3 0 20 0 0 43 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 21.500 1.74 1.95 -0.21 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2853 0.5445 0.1701 1 1 0.2853 0.5412 0.1736 1 1 0.2850 0.5369 0.1780
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 347 120 227 113 0 2 1 4 0 0 227 0 0 0.9417 0.0000 0.0000 58.500 1.27 2.25 -0.98 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0238 0.9762 0.0000 0 0 0.6910 0.3090 0.0000 0 0 0.9141 0.0859 0.0000
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 527 150 377 17 0 34 2 97 0 0 372 0 5 0.1133 0.0000 0.0133 3.412 0.24 3.08 -2.85 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9978 0.0022
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 445 137 308 0 0 37 9 91 0 0 308 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 2.703 3.09 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0049 0.9951 2 2 0.0000 0.0054 0.9946 2 2 0.0000 0.0062 0.9938
chr12 6778354 G GGAGCCC 0.001563 0.100 1 6 2 461 191 270 147 0 31 0 13 0 0 270 0 0 0.7696 0.0000 0.0000 5.161 0.39 5.46 -5.07 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4900 0.5100 0.0000 0 0 0.9948 0.0052 0.0000
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 2367 569 1798 312 0 4 0 253 0 0 1787 0 11 0.5483 0.0000 0.0061 141.250 1.19 4.08 -2.89 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6908 0.3091 0.0001 1 0 0.6971 0.3027 0.0002 1 0 0.7027 0.2971 0.0003
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 268 96 172 45 0 5 0 46 0 0 169 0 3 0.4688 0.0000 0.0174 18.200 0.11 4.67 -4.56 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1252 0.5943 0.2805 1 1 0.1301 0.5873 0.2826 1 1 0.1366 0.5784 0.2850
chr12 10723069 G GGGT 0.002430 0.100 1 3 1 286 102 184 70 6 15 0 11 0 0 184 0 0 0.6863 0.0000 0.0000 5.800 0.34 3.64 -3.29 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1384 0.8616 0.0000 0 0 0.9352 0.0648 0.0000
chr12 10723069 G GGGTGGT 0.000436 0.100 1 6 1 286 102 184 76 0 22 0 4 0 0 184 0 0 0.7451 0.0000 0.0000 3.636 0.54 4.75 -4.21 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9369 0.0631 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.100 1 -9 1 704 203 501 92 0 35 0 76 0 0 497 0 4 0.4532 0.0000 0.0080 4.800 0.11 8.29 -8.18 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5751 0.4228 0.0021 1 0 0.5794 0.4183 0.0023 1 0 0.5840 0.4134 0.0026
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 333 163 170 141 0 10 0 12 0 1 169 0 0 0.8650 0.0000 0.0059 15.300 0.67 4.58 -3.92 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.1724 0.8276 0.0000
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.100 1 -2 1 505 116 389 66 0 5 0 45 0 0 389 0 0 0.5690 0.0000 0.0000 22.200 0.70 2.40 -1.70 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7968 0.2010 0.0021 1 0 0.7902 0.2073 0.0025 1 0 0.7807 0.2162 0.0031
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 455 113 342 103 0 0 1 9 0 0 342 0 0 0.9115 0.0000 0.0000 112.000 0.34 3.56 -3.22 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0137 0.9863 0.0000 0 1 0.3597 0.6403 0.0000
chr12 40483097 AAGTGACAGGGACAACTAGACTATCAGCTGG A 0.146503 0.100 1 -30 1 1578 311 1267 267 5 32 2 5 3 1 1250 11 2 0.8585 0.0024 0.0134 8.688 2.13 15.80 -13.67 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6402 0.3598 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 799 191 608 115 0 2 0 74 0 0 607 0 1 0.6021 0.0000 0.0016 94.500 0.20 1.31 -1.11 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9425 0.0574 0.0001 1 0 0.9378 0.0620 0.0001 1 0 0.9309 0.0689 0.0002
chr12 52073890 TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC T 0.050697 0.100 1 -23 2 375 120 255 66 0 19 0 35 0 0 253 0 2 0.5500 0.0000 0.0078 5.316 0.44 17.26 -16.82 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9102 0.0897 0.0002 1 0 0.9040 0.0958 0.0002 1 0 0.8951 0.1047 0.0003
chr12 52317956 ACTT A 0.001740 0.100 1 -3 1 356 86 270 76 2 4 0 4 0 0 270 0 0 0.8837 0.0000 0.0000 20.250 0.25 2.50 -2.25 38 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8088 0.1912 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr12 52378037 G GTA 0.000618 0.100 1 2 1 315 88 227 48 0 0 0 40 0 0 226 0 1 0.5455 0.0000 0.0044 88.000 0.15 2.10 -1.95 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5638 0.4361 0.0001 1 0 0.5653 0.4346 0.0001 1 0 0.5668 0.4331 0.0001
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 1025 257 768 17 0 25 2 213 0 0 767 0 1 0.0661 0.0000 0.0013 9.240 0.59 12.37 -11.78 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.6425 0.3575
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1182 303 879 128 2 63 0 110 0 0 877 0 2 0.4224 0.0000 0.0023 3.794 0.17 12.20 -12.03 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6284 0.3706 0.0009 1 0 0.6334 0.3655 0.0011 1 0 0.6386 0.3601 0.0013
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 344 90 254 52 1 2 0 35 0 0 254 0 0 0.5778 0.0000 0.0000 44.000 0.37 1.60 -1.23 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7228 0.2684 0.0089 1 0 0.7147 0.2752 0.0101 1 0 0.7034 0.2847 0.0119
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 375 105 270 45 0 1 1 58 0 0 269 0 1 0.4286 0.0000 0.0037 104.000 0.02 1.14 -1.12 31 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0373 0.4644 0.4983 1 2 0.0413 0.4669 0.4918 1 2 0.0471 0.4704 0.4824
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 551 118 433 68 0 4 0 46 0 0 433 0 0 0.5763 0.0000 0.0000 28.500 0.12 4.15 -4.03 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8342 0.1658 0.0001 1 0 0.8283 0.1717 0.0001 1 0 0.8199 0.1800 0.0001
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 141 65 76 35 0 0 0 30 0 0 76 0 0 0.5385 0.0000 0.0000 65.000 0.89 2.10 -1.21 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2512 0.5836 0.1653 1 1 0.2503 0.5786 0.1711 1 1 0.2488 0.5723 0.1789
chr12 58876497 CTGG C 0.000469 0.100 1 -3 3 202 97 105 90 0 1 0 6 0 0 105 0 0 0.9278 0.0000 0.0000 96.000 0.24 3.00 -2.76 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2530 0.7470 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 394 114 280 47 0 3 1 63 0 0 276 0 4 0.4123 0.0000 0.0143 37.000 0.89 3.78 -2.88 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0147 0.3468 0.6385 1 2 0.0170 0.3545 0.6285 1 2 0.0205 0.3651 0.6144
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.100 1 -1 1 316 90 226 3 40 18 17 12 0 0 224 0 2 0.0333 0.0000 0.0088 2.941 1.33 3.75 -2.42 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5667 0.4042 0.0290 1 0 0.5627 0.4065 0.0308 1 0 0.5571 0.4097 0.0333
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1071 288 783 1 0 28 1 258 0 0 780 0 3 0.0035 0.0000 0.0038 9.286 7.00 3.56 3.44 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85029771 CA C 0.001373 0.100 1 -1 3 352 119 233 72 1 2 0 44 0 0 232 1 0 0.6050 0.0000 0.0043 58.500 0.15 1.30 -1.14 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8999 0.1001 0.0000 1 0 0.8940 0.1060 0.0000 1 0 0.8855 0.1145 0.0000
chr12 102958393 C CGCAGCAGCAGCA 0.500000 0.100 1 12 1 553 147 406 45 1 29 0 72 0 0 358 0 48 0.3061 0.0000 0.1182 4.034 0.78 1.15 -0.37 15 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0029 0.9971 1 2 0.0000 0.0036 0.9964 1 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 410 107 303 0 0 10 1 96 0 0 301 0 2 0.0000 0.0000 0.0066 9.700 4.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0081 0.9919
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 1971 406 1565 49 2 108 7 240 0 0 1504 0 61 0.1207 0.0000 0.0390 2.731 0.69 4.60 -3.91 23 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 663 180 483 98 0 4 0 78 0 0 475 0 8 0.5444 0.0000 0.0166 44.000 0.14 8.44 -8.29 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3856 0.5787 0.0357 1 1 0.3892 0.5713 0.0395 1 1 0.3928 0.5622 0.0450
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 564 161 403 0 0 23 8 130 0 0 403 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.000 3.56 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 190 102 88 0 0 0 0 102 0 0 88 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 102.000 2.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0070 0.9930
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 215 72 143 58 0 11 0 3 0 0 143 0 0 0.8056 0.0000 0.0000 5.545 1.00 6.00 -5.00 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0241 0.9759 0.0000 0 1 0.4286 0.5714 0.0000 0 0 0.7106 0.2894 0.0000
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 489 126 363 33 24 22 14 33 0 0 357 2 4 0.2619 0.0000 0.0165 4.273 1.55 4.24 -2.70 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2748 0.6040 0.1212 1 1 0.2775 0.5963 0.1263 1 1 0.2804 0.5866 0.1330
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 364 112 252 0 0 8 0 104 0 0 247 0 5 0.0000 0.0000 0.0198 13.000 4.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0050 0.9950
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 340 70 270 0 0 5 0 65 0 0 260 0 10 0.0000 0.0000 0.0370 13.000 11.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0214 0.9786 2 2 0.0000 0.0231 0.9769 2 2 0.0000 0.0256 0.9744
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 450 139 311 59 0 10 5 65 0 0 311 0 0 0.4245 0.0000 0.0000 12.900 1.08 2.08 -0.99 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0536 0.5467 0.3997 1 1 0.0579 0.5422 0.3999 1 1 0.0641 0.5368 0.3992
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 734 175 559 0 0 21 0 154 0 0 537 0 22 0.0000 0.0000 0.0394 7.333 8.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 242 81 161 47 6 24 0 4 0 0 161 0 0 0.5802 0.0000 0.0000 2.375 0.34 3.00 -2.66 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.1664 0.8336 0.0000 0 0 0.5010 0.4990 0.0000
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 187 55 132 20 3 10 1 21 0 0 131 1 0 0.3636 0.0000 0.0076 4.400 1.85 5.00 -3.15 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2253 0.5555 0.2192 1 1 0.2273 0.5513 0.2214 1 1 0.2298 0.5461 0.2241
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 248 82 166 0 0 4 0 78 0 0 159 0 7 0.0000 0.0000 0.0422 19.500 8.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0130 0.9870 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0159 0.9841
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 679 194 485 9 7 109 4 65 0 0 477 3 5 0.0464 0.0000 0.0165 1.066 3.78 3.78 -0.01 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9749 0.0251
chr12 132621877 ATCTCTGCCCCT A 0.500000 0.100 1 -11 4 644 193 451 113 0 4 0 76 0 1 450 0 0 0.5855 0.0000 0.0022 47.250 0.40 10.45 -10.05 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8930 0.1065 0.0005 1 0 0.8856 0.1138 0.0007 1 0 0.8746 0.1245 0.0009
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 803 194 609 142 4 37 0 11 0 0 608 0 1 0.7320 0.0000 0.0016 4.189 0.67 7.18 -6.51 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0044 0.9956 0.0000 0 1 0.3630 0.6370 0.0000
chr13 27924562 T TGCC 0.002235 0.100 1 3 1 552 139 413 66 1 16 0 56 0 0 412 0 1 0.4748 0.0000 0.0024 7.688 0.26 2.96 -2.71 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5939 0.4059 0.0002 1 0 0.5958 0.4040 0.0002 1 0 0.5975 0.4022 0.0002
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 196 65 131 25 0 2 0 38 0 0 128 0 3 0.3846 0.0000 0.0229 31.500 0.12 4.68 -4.56 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1110 0.7801 0.1089 1 1 0.1202 0.7754 0.1043 1 1 0.1332 0.7684 0.0984
chr13 48303948 CGCCGCCGCT C 0.000995 0.100 1 -9 2 484 172 312 158 0 8 0 6 0 0 312 0 0 0.9186 0.0000 0.0000 20.500 0.55 7.17 -6.62 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8360 0.1640 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr13 50956450 T TA 0.033831 0.100 1 1 6 501 145 356 62 5 15 10 53 0 0 355 0 1 0.4276 0.0000 0.0028 8.200 0.19 1.19 -1.00 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4334 0.5597 0.0069 1 1 0.4409 0.5519 0.0072 1 1 0.4502 0.5422 0.0077
chr13 71866470 ACCGCCGCCG A 0.000127 0.100 1 -9 2 702 160 542 82 4 8 0 66 1 0 537 0 4 0.5125 0.0018 0.0092 18.875 3.57 9.20 -5.62 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7101 0.2899 0.0000 1 0 0.7088 0.2912 0.0000 1 0 0.7064 0.2936 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 660 172 488 69 0 39 1 63 0 1 483 2 2 0.4012 0.0000 0.0102 3.410 5.72 6.29 -0.56 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3456 0.6240 0.0304 1 1 0.3547 0.6136 0.0317 1 1 0.3661 0.6004 0.0334
chr13 77599337 G GTC 0.000205 0.100 1 2 2 246 97 149 54 0 4 0 39 0 0 146 0 3 0.5567 0.0000 0.0201 23.250 0.33 2.05 -1.72 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6723 0.3277 0.0000 1 0 0.6700 0.3300 0.0000 1 0 0.6665 0.3335 0.0000
chr13 77698098 T TGCC 0.001998 0.100 1 3 1 458 144 314 113 3 17 2 9 0 0 314 0 0 0.7847 0.0000 0.0000 7.471 2.85 5.56 -2.71 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5890 0.4110 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 551 100 451 0 0 12 0 88 0 1 438 1 11 0.0000 0.0000 0.0288 7.333 4.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 510 100 410 51 2 40 0 7 2 4 399 2 3 0.5100 0.0049 0.0268 1.500 2.84 10.43 -7.59 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0110 0.9890 0.0000
chr13 112067766 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 422 129 293 61 2 14 5 47 0 0 293 0 0 0.4729 0.0000 0.0000 10.455 1.61 3.72 -2.12 49 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4457 0.5073 0.0469 1 1 0.4436 0.5054 0.0509 1 1 0.4401 0.5033 0.0567
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 635 174 461 143 6 15 2 8 5 1 453 1 1 0.8218 0.0108 0.0174 10.600 1.41 8.12 -6.72 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0156 0.9844 0.0000 0 0 0.5617 0.4383 0.0000
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 260 106 154 50 1 9 2 44 0 0 154 0 0 0.4717 0.0000 0.0000 10.667 0.92 6.75 -5.83 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2935 0.5911 0.1154 1 1 0.2954 0.5843 0.1204 1 1 0.2973 0.5757 0.1270
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 259 82 177 0 0 28 2 52 0 1 175 0 1 0.0000 0.0000 0.0113 1.893 10.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0638 0.9362 2 2 0.0000 0.0667 0.9333 2 2 0.0000 0.0711 0.9289
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCGTGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -30 1 260 87 173 36 1 43 4 3 0 0 173 0 0 0.4138 0.0000 0.0000 2.333 1.67 3.33 -1.67 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.0635 0.9365 0.0000 0 1 0.2794 0.7206 0.0000
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.100 1 4 1 427 120 307 0 0 3 0 117 0 0 305 0 2 0.0000 0.0000 0.0065 39.000 4.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 586 124 462 0 0 1 0 123 0 0 457 0 5 0.0000 0.0000 0.0108 123.000 3.41 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 1146 292 854 95 0 10 0 187 0 0 852 0 2 0.3253 0.0000 0.0023 28.200 0.22 1.95 -1.73 21 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0005 0.9995 1 2 0.0000 0.0006 0.9994 1 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 733 209 524 159 0 30 0 20 0 0 524 0 0 0.7608 0.0000 0.0000 5.967 0.14 1.10 -0.96 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0075 0.9925 0.0000
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 499 142 357 82 0 3 1 56 0 0 354 0 3 0.5775 0.0000 0.0084 46.333 0.51 18.73 -18.22 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7117 0.2815 0.0068 1 0 0.7044 0.2876 0.0079 1 0 0.6939 0.2963 0.0098
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 417 97 320 81 1 6 0 9 0 0 317 0 3 0.8351 0.0000 0.0094 15.000 0.35 1.67 -1.32 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0104 0.9896 0.0000
chr14 21155337 CAGA C 0.002975 0.100 1 -3 1 566 122 444 66 1 5 0 50 0 0 441 0 3 0.5410 0.0000 0.0068 23.200 0.53 4.20 -3.67 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6851 0.3147 0.0001 1 0 0.6833 0.3165 0.0001 1 0 0.6803 0.3195 0.0002
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 557 146 411 125 2 13 0 6 0 0 411 0 0 0.8562 0.0000 0.0000 10.077 0.29 3.00 -2.71 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.4258 0.5742 0.0000 0 0 0.8867 0.1133 0.0000
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 519 116 403 0 0 9 2 105 0 0 401 0 2 0.0000 0.0000 0.0050 11.889 5.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0111 0.9889 2 2 0.0000 0.0129 0.9871
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 699 213 486 170 5 20 0 18 0 0 486 0 0 0.7981 0.0000 0.0000 9.650 0.51 3.11 -2.60 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.4130 0.5870 0.0000
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 400 82 318 35 4 8 2 33 0 0 315 0 3 0.4268 0.0000 0.0094 9.125 2.69 3.67 -0.98 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2734 0.5870 0.1395 1 1 0.2773 0.5804 0.1424 1 1 0.2820 0.5720 0.1460
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 412 88 324 40 4 7 1 36 0 0 324 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 13.333 2.40 3.17 -0.77 26 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4027 0.5245 0.0729 1 1 0.4027 0.5210 0.0763 1 1 0.4022 0.5168 0.0811
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 297 73 224 68 1 1 0 3 0 0 224 0 0 0.9315 0.0000 0.0000 72.000 0.60 1.00 -0.40 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3169 0.6831 0.0000 0 0 0.9315 0.0685 0.0000 0 0 0.9778 0.0222 0.0000
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 443 128 315 47 1 22 0 58 0 0 312 0 3 0.3672 0.0000 0.0095 4.818 0.02 3.41 -3.39 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0692 0.5891 0.3418 1 1 0.0755 0.5871 0.3374 1 1 0.0844 0.5845 0.3311
chr14 30622360 A ACAG 0.001235 0.100 1 3 1 113 63 50 51 1 9 0 2 0 0 50 0 0 0.8095 0.0000 0.0000 6.000 0.41 3.50 -3.09 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9926 0.0074 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.100 1 24 1 331 58 273 16 0 31 0 11 0 0 270 0 3 0.2759 0.0000 0.0110 0.871 1.06 7.55 -6.48 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4313 0.5028 0.0658 1 1 0.4316 0.5015 0.0669 1 1 0.4319 0.4998 0.0683
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 686 133 553 64 1 16 0 52 1 0 545 0 7 0.4812 0.0018 0.0145 7.312 1.17 6.50 -5.33 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1329 0.7085 0.1586 1 1 0.1335 0.6983 0.1682 1 1 0.1340 0.6848 0.1812
chr14 58131686 ACTC A 0.001004 0.100 1 -3 2 178 65 113 60 0 1 0 4 0 0 112 0 1 0.9231 0.0000 0.0088 64.000 0.28 3.00 -2.72 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2401 0.7599 0.0000 0 0 0.9898 0.0102 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.100 1 2 1 555 133 422 125 1 1 0 6 0 0 422 0 0 0.9398 0.0000 0.0000 131.000 0.45 2.33 -1.89 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2165 0.7835 0.0000 0 0 0.9960 0.0040 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 685 176 509 0 0 33 2 141 0 0 499 1 9 0.0000 0.0000 0.0196 4.303 6.76 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr14 74260844 A AGAG 0.000693 0.100 1 3 2 954 205 749 177 0 19 1 8 1 0 747 0 1 0.8634 0.0013 0.0027 9.789 0.29 2.62 -2.33 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 440 96 344 0 0 16 8 72 0 0 343 0 1 0.0000 0.0000 0.0029 4.812 5.94 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0245 0.9755 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0298 0.9702
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 424 95 329 7 41 10 6 31 0 0 328 1 0 0.0737 0.0000 0.0030 16.200 0.43 4.81 -4.38 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3163 0.5651 0.1186 1 1 0.3178 0.5597 0.1225 1 1 0.3193 0.5530 0.1276
chr14 77616457 GGCGGCT G 0.000168 0.100 1 -6 1 373 124 249 64 0 10 0 50 0 0 247 0 2 0.5161 0.0000 0.0080 11.400 0.41 5.92 -5.51 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6503 0.3497 0.0000 1 0 0.6496 0.3504 0.0000 1 0 0.6482 0.3518 0.0000
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 516 164 352 3 0 20 3 138 0 0 349 0 3 0.0183 0.0000 0.0085 7.200 0.00 3.21 -3.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2203 0.7797 2 2 0.0000 0.0101 0.9899 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr14 103127080 T TGGC 0.001756 0.100 1 3 1 430 137 293 57 2 21 4 53 0 0 292 0 1 0.4161 0.0000 0.0034 5.429 0.70 3.30 -2.60 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4043 0.5952 0.0005 1 1 0.4129 0.5865 0.0005 1 1 0.4238 0.5757 0.0005
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 289 92 197 35 0 11 0 46 1 0 190 1 5 0.3804 0.0051 0.0355 7.364 0.14 9.00 -8.86 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0306 0.4074 0.5620 1 2 0.0341 0.4127 0.5533 1 2 0.0392 0.4198 0.5410
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 439 129 310 0 0 21 1 107 0 0 306 0 4 0.0000 0.0000 0.0129 5.143 3.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0089 0.9911 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0116 0.9884
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 331 84 247 68 1 7 2 6 0 0 247 0 0 0.8095 0.0000 0.0000 10.714 2.28 6.00 -3.72 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1242 0.8758 0.0000 0 0 0.6265 0.3735 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 598 128 470 0 1 5 0 122 0 4 437 21 8 0.0000 0.0000 0.0702 24.600 4.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 1344 333 1011 0 0 14 1 318 0 0 954 13 44 0.0000 0.0000 0.0564 26.583 3.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441081 G GTCTCCTCCTCTTCCCGCATCT 0.154509 0.100 1 21 1 1211 209 1002 141 3 59 1 5 5 2 991 3 1 0.6746 0.0050 0.0110 2.542 2.01 2.40 -0.39 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.7395 0.2605 0.0000 0 0 0.9786 0.0214 0.0000
chr15 23441523 TCCGCATCTTCTCCTCCTGCTC T 0.005169 0.100 1 -21 1 825 234 591 204 5 25 0 0 1 4 583 1 2 0.8718 0.0017 0.0135 8.280 1.56 54 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 227 100 127 1 3 5 0 91 0 0 125 0 2 0.0100 0.0000 0.0157 19.000 0.00 2.19 -2.19 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7907 0.2093 2 2 0.0000 0.1748 0.8252 2 2 0.0000 0.0581 0.9419
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 698 176 522 8 0 26 3 139 0 0 519 0 3 0.0455 0.0000 0.0057 5.769 1.00 4.45 -3.45 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.6234 0.3766 2 2 0.0000 0.0646 0.9354
chr15 34038912 C CCCGCCGCCGCCT 0.002022 0.100 1 12 4 208 65 143 53 0 7 0 5 0 0 142 0 1 0.8154 0.0000 0.0070 8.286 0.43 10.80 -10.37 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0117 0.9883 0.0000 0 0 0.9213 0.0787 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr15 38484605 AGGTGGTGGT A 0.136711 0.100 1 -9 2 414 173 241 138 1 27 0 7 0 0 241 0 0 0.7977 0.0000 0.0000 5.407 0.67 8.57 -7.90 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.7907 0.2093 0.0000 0 0 0.9836 0.0164 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 440 159 281 142 0 6 0 11 0 0 281 0 0 0.8931 0.0000 0.0000 25.500 1.18 2.00 -0.82 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0195 0.9805 0.0000 0 0 0.6294 0.3706 0.0000
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.100 1 4 1 217 74 143 8 0 1 0 65 0 0 143 0 0 0.1081 0.0000 0.0000 73.000 0.12 3.72 -3.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9847 0.0153
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 273 146 127 76 1 0 0 69 0 0 125 0 2 0.5205 0.0000 0.0157 146.000 0.33 3.35 -3.02 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2372 0.6590 0.1038 1 1 0.2410 0.6485 0.1105 1 1 0.2454 0.6352 0.1195
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 475 117 358 41 0 8 2 66 0 0 358 0 0 0.3504 0.0000 0.0000 13.625 0.37 4.38 -4.01 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0027 0.1658 0.8314 1 2 0.0033 0.1746 0.8221 1 2 0.0043 0.1870 0.8086
chr15 81332887 CTCT C 0.001806 0.100 1 -3 2 657 155 502 94 0 4 0 57 0 0 502 0 0 0.6065 0.0000 0.0000 37.750 0.23 3.11 -2.87 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9490 0.0510 0.0000 1 0 0.9447 0.0553 0.0000 1 0 0.9383 0.0617 0.0000
chr15 82045645 T TGCC 0.002204 0.100 1 3 1 387 112 275 50 1 15 1 45 0 0 275 0 0 0.4464 0.0000 0.0000 6.400 0.54 3.13 -2.59 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5111 0.4885 0.0004 1 0 0.5150 0.4846 0.0004 1 0 0.5196 0.4799 0.0004
chr15 83008518 C CA 0.185307 0.100 1 1 1 157 40 117 15 7 6 4 8 0 0 117 0 0 0.3750 0.0000 0.0000 4.667 0.60 1.00 -0.40 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6262 0.3518 0.0220 1 0 0.6197 0.3569 0.0234 1 0 0.6104 0.3642 0.0254
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 384 127 257 68 0 3 0 56 0 0 253 0 4 0.5354 0.0000 0.0156 41.333 0.87 2.95 -2.08 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4416 0.5226 0.0358 1 1 0.4445 0.5172 0.0383 1 1 0.4475 0.5107 0.0418
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 907 234 673 84 10 57 1 82 0 0 673 0 0 0.3590 0.0000 0.0000 3.105 0.31 3.22 -2.91 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5212 0.4719 0.0068 1 0 0.5269 0.4656 0.0075 1 0 0.5332 0.4583 0.0084
chr15 89333596 T TTGCTGC 0.028553 0.100 1 6 1 907 234 673 94 1 121 4 14 0 0 673 0 0 0.4017 0.0000 0.0000 0.916 0.64 3.50 -2.86 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1766 0.8234 0.0000
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 876 197 679 8 2 51 1 135 0 0 654 0 25 0.0406 0.0000 0.0368 3.718 1.50 15.56 -14.06 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8713 0.1287 2 2 0.0000 0.1606 0.8394
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 864 206 658 11 3 21 5 166 0 0 658 0 0 0.0534 0.0000 0.0000 8.619 1.09 13.67 -12.58 7 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9912 0.0088 2 2 0.0000 0.3839 0.6161
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 351 92 259 4 0 4 1 83 0 0 257 0 2 0.0435 0.0000 0.0077 22.000 0.25 7.10 -6.85 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1528 0.8472 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr15 99712504 C CCAGCAG 0.003114 0.100 1 6 2 602 216 386 155 3 46 0 12 1 0 381 0 4 0.7176 0.0026 0.0130 3.696 1.84 4.75 -2.91 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0346 0.9654 0.0000 0 0 0.9612 0.0388 0.0000
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.100 1 -3 2 602 221 381 97 2 40 6 76 0 0 380 1 0 0.4389 0.0000 0.0026 4.525 0.82 3.25 -2.43 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6286 0.3669 0.0045 1 0 0.6297 0.3653 0.0050 1 0 0.6301 0.3640 0.0059
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 260 77 183 2 0 15 1 59 1 0 178 0 4 0.0260 0.0055 0.0273 4.067 0.00 10.42 -10.42 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9713 0.0287 2 1 0.0000 0.9123 0.0877
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 44 21 23 5 0 0 0 16 0 0 23 0 0 0.2381 0.0000 0.0000 21.000 0.20 1.19 -0.99 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1334 0.5891 0.2775 1 1 0.1295 0.6226 0.2479 1 1 0.1154 0.6817 0.2029
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 369 99 270 8 0 0 0 91 0 0 269 0 1 0.0808 0.0000 0.0037 99.000 0.88 3.38 -2.51 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9910 0.0090 2 1 0.0000 0.8098 0.1902
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 278 82 196 0 0 2 1 79 0 0 194 0 2 0.0000 0.0000 0.0102 39.500 15.73 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1355 0.8645 2 2 0.0000 0.1457 0.8543 2 2 0.0000 0.1608 0.8392
chr16 1093978 G GC 0.001284 0.100 1 1 2 421 134 287 78 1 3 1 51 0 0 287 0 0 0.5821 0.0000 0.0000 43.667 0.37 1.22 -0.84 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8842 0.1158 0.0000 1 0 0.8784 0.1216 0.0000 1 0 0.8702 0.1298 0.0000
chr16 1222783 G GAT 0.500000 0.100 1 2 3 321 77 244 72 0 2 0 3 0 0 244 0 0 0.9351 0.0000 0.0000 37.500 0.49 2.33 -1.85 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0476 0.9524 0.0000 0 0 0.5992 0.4008 0.0000 0 0 0.8276 0.1724 0.0000
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 1089 246 843 115 1 5 1 124 1 0 842 0 0 0.4675 0.0012 0.0012 48.200 0.76 1.22 -0.46 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0872 0.7993 0.1134 1 1 0.0967 0.7851 0.1182 1 1 0.1099 0.7660 0.1240
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 435 114 321 0 0 1 0 113 0 0 319 0 2 0.0000 0.0000 0.0062 113.000 6.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 435 114 321 0 0 1 0 113 0 0 319 0 2 0.0000 0.0000 0.0062 113.000 6.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2179036 C CGCG 0.006791 0.100 1 3 6 566 141 425 49 2 44 1 45 2 0 418 0 5 0.3475 0.0047 0.0165 2.182 1.82 4.42 -2.61 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4305 0.5676 0.0018 1 1 0.4377 0.5604 0.0019 1 1 0.4465 0.5515 0.0020
chr16 2768157 CTCT C 0.000287 0.100 1 -3 2 409 111 298 52 47 6 0 6 0 0 298 0 0 0.4685 0.0000 0.0000 17.333 0.69 3.83 -3.14 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4185 0.5815 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.100 1 -3 2 286 106 180 52 1 0 0 53 0 0 178 0 2 0.4906 0.0000 0.0111 105.000 0.27 2.96 -2.69 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3082 0.6741 0.0177 1 1 0.3185 0.6636 0.0180 1 1 0.3317 0.6500 0.0183
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 474 130 344 63 1 6 1 59 0 0 344 0 0 0.4846 0.0000 0.0000 20.667 0.40 3.31 -2.91 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2037 0.6503 0.1460 1 1 0.2068 0.6403 0.1528 1 1 0.2105 0.6276 0.1619
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 384 132 252 43 2 56 0 31 0 2 243 3 4 0.3258 0.0000 0.0357 1.357 2.67 5.00 -2.33 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5671 0.4141 0.0189 1 0 0.5653 0.4145 0.0202 1 0 0.5625 0.4155 0.0220
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 1207 295 912 125 0 85 1 84 0 0 901 0 11 0.4237 0.0000 0.0121 2.471 1.26 4.46 -3.21 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8465 0.1532 0.0002 1 0 0.8427 0.1571 0.0003 1 0 0.8368 0.1628 0.0004
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 158 56 102 0 0 0 0 56 0 0 102 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 56.000 2.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr16 18543716 GA G 0.002566 0.100 1 -1 1 254 103 151 97 0 3 0 3 0 0 151 0 0 0.9417 0.0000 0.0000 33.333 0.07 1.33 -1.26 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9861 0.0139 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.100 1 -1 1 276 159 117 70 0 1 0 88 1 1 115 0 0 0.4403 0.0085 0.0171 158.000 0.50 1.40 -0.90 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0674 0.7885 0.1441 1 1 0.0754 0.7820 0.1426 1 1 0.0871 0.7729 0.1400
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.100 1 -27 1 1097 254 843 176 5 62 1 10 0 1 842 0 0 0.6929 0.0000 0.0012 3.065 0.67 7.70 -7.03 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2526 0.7474 0.0000 0 0 0.9494 0.0506 0.0000
chr16 30369935 AGCCGGGGCTGGG A 0.031031 0.100 1 -12 1 713 181 532 153 0 18 1 9 0 0 532 0 0 0.8453 0.0000 0.0000 9.056 0.58 12.78 -12.20 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6988 0.3012 0.0000 0 0 0.9903 0.0097 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 167 83 84 38 0 1 0 44 0 0 83 0 1 0.4578 0.0000 0.0119 82.000 0.32 2.11 -1.80 8 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0908 0.5457 0.3635 1 1 0.0955 0.5420 0.3625 1 1 0.1020 0.5374 0.3606
chr16 57949370 T TTCC 0.500000 0.100 1 3 1 192 66 126 56 2 4 0 4 0 0 126 0 0 0.8485 0.0000 0.0000 15.500 0.18 3.50 -3.32 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.2040 0.7960 0.0000 0 0 0.5615 0.4385 0.0000
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 477 107 370 43 16 14 5 29 0 0 369 1 0 0.4019 0.0000 0.0027 7.083 1.02 1.76 -0.74 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7370 0.2538 0.0093 1 0 0.7259 0.2633 0.0108 1 0 0.7103 0.2765 0.0132
chr16 60359388 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 1210 282 928 278 0 2 0 2 1 0 927 0 0 0.9858 0.0011 0.0011 140.000 1.01 2.00 -0.99 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 67185440 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 501 142 359 130 3 4 0 5 0 0 358 1 0 0.9155 0.0000 0.0028 34.250 0.42 1.60 -1.18 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.5703 0.4297 0.0000 0 0 0.9313 0.0687 0.0000
chr16 67195890 A ACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 9 2 461 195 266 125 1 59 0 10 0 0 266 0 0 0.6410 0.0000 0.0000 2.288 0.66 3.90 -3.24 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0127 0.9873 0.0000 0 1 0.4239 0.5761 0.0000
chr16 67842884 GCAGCAGCAA G 0.500000 0.100 1 -9 1 1061 344 717 166 3 37 0 138 0 0 717 0 0 0.4826 0.0000 0.0000 8.297 0.87 7.50 -6.63 76 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7043 0.2942 0.0015 1 0 0.7031 0.2950 0.0019 1 0 0.6998 0.2976 0.0026
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1065 332 733 240 10 48 4 30 0 0 733 0 0 0.7229 0.0000 0.0000 5.896 3.25 4.07 -0.81 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr16 70973408 TG T 0.500000 0.100 1 -1 3 220 67 153 58 0 2 0 7 0 0 153 0 0 0.8657 0.0000 0.0000 32.500 0.43 1.43 -1.00 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0106 0.9894 0.0000 0 1 0.1580 0.8420 0.0000
chr16 71922608 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 348 142 206 15 0 25 0 102 0 0 198 0 8 0.1056 0.0000 0.0388 4.680 3.47 5.42 -1.95 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9865 0.0135
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 350 151 199 124 0 20 0 7 0 0 199 0 0 0.8212 0.0000 0.0000 6.550 4.48 7.29 -2.80 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2210 0.7790 0.0000 0 0 0.8212 0.1788 0.0000
chr16 84236959 G GCCAGCTCCT 0.500000 0.100 1 9 2 664 180 484 132 0 35 0 13 0 0 483 0 1 0.7333 0.0000 0.0021 4.143 0.64 7.23 -6.59 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0704 0.9296 0.0000
chr16 84495751 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 269 112 157 103 0 4 0 5 0 0 157 0 0 0.9196 0.0000 0.0000 27.000 0.52 3.40 -2.88 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.4553 0.5447 0.0000 0 0 0.8568 0.1432 0.0000
chr16 87604287 C CCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 12 1 455 104 351 9 1 19 0 75 0 0 328 0 23 0.0865 0.0000 0.0655 4.474 8.44 9.72 -1.28 7 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9960 0.0040 2 1 0.0000 0.8269 0.1731
chr16 87604287 C CCTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 455 104 351 9 1 19 0 75 0 0 328 0 23 0.0865 0.0000 0.0655 4.474 8.44 9.72 -1.28 7 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9960 0.0040 2 1 0.0000 0.8269 0.1731
chr16 88430089 TTCCGGCCCCAGAGGTCCCAGC T 0.500000 0.100 1 -21 2 751 156 595 142 1 4 0 9 1 0 593 0 1 0.9103 0.0017 0.0034 38.000 0.69 17.67 -16.98 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0307 0.9693 0.0000 0 0 0.6389 0.3611 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 742 145 597 0 1 5 7 132 0 0 587 2 8 0.0000 0.0000 0.0168 34.750 7.46 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 744 138 606 0 0 8 11 119 0 1 595 4 6 0.0000 0.0000 0.0182 16.125 7.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 742 135 607 0 0 5 0 130 1 2 589 8 7 0.0000 0.0016 0.0297 32.500 7.81 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1858 0.8142 2 2 0.0000 0.0155 0.9845 2 2 0.0000 0.0060 0.9940
chr16 88714227 G GGTGT 0.500000 0.100 1 4 1 839 194 645 0 0 6 3 185 0 0 640 0 5 0.0000 0.0000 0.0078 31.167 6.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 942 277 665 10 0 47 19 201 0 0 661 0 4 0.0361 0.0000 0.0060 4.660 0.40 3.37 -2.97 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.3806 0.6194 2 2 0.0000 0.0122 0.9878
chr16 88733987 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 920 271 649 40 5 20 184 22 0 0 648 0 1 0.1476 0.0000 0.0015 4.100 0.80 4.77 -3.97 10 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0226 0.9774 2 1 0.0000 0.9939 0.0061 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 163 72 91 41 0 0 0 31 0 0 89 0 2 0.5694 0.0000 0.0220 72.000 0.41 3.94 -3.52 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3991 0.5192 0.0817 1 1 0.3964 0.5173 0.0863 1 1 0.3924 0.5150 0.0926
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.100 1 -3 1 943 203 740 176 1 12 1 13 0 0 740 0 0 0.8670 0.0000 0.0000 15.833 0.45 2.62 -2.17 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0173 0.9827 0.0000 0 0 0.7772 0.2228 0.0000
chr17 5141483 AATAG A 0.000611 0.100 1 -4 4 390 171 219 163 0 3 0 5 0 0 219 0 0 0.9532 0.0000 0.0000 56.000 0.49 4.00 -3.51 11 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9900 0.0100 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 946 192 754 93 0 11 0 88 0 0 752 0 2 0.4844 0.0000 0.0027 16.455 0.45 3.33 -2.88 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3522 0.6464 0.0014 1 1 0.3652 0.6334 0.0015 1 1 0.3815 0.6169 0.0016
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 758 222 536 10 3 45 1 163 0 0 530 0 6 0.0450 0.0000 0.0112 3.933 0.30 3.16 -2.86 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9904 0.0096 2 2 0.0000 0.3605 0.6395
chr17 7846859 T TACC 0.057281 0.100 1 3 2 1415 389 1026 11 3 101 19 255 0 0 1011 2 13 0.0283 0.0000 0.0146 2.851 0.64 5.12 -4.49 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9404 0.0596 2 2 0.0000 0.0792 0.9208
chr17 12980176 G GCCAGCC 0.500000 0.100 1 6 1 328 152 176 126 0 23 0 3 0 0 176 0 0 0.8289 0.0000 0.0000 5.609 0.43 4.67 -4.24 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4437 0.5563 0.0000 0 0 0.9570 0.0430 0.0000 0 0 0.9851 0.0149 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 409 108 301 52 0 2 0 54 1 0 299 0 1 0.4815 0.0033 0.0066 53.000 0.69 7.67 -6.97 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1509 0.6248 0.2243 1 1 0.1560 0.6157 0.2283 1 1 0.1626 0.6042 0.2332
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 530 207 323 82 0 46 9 70 0 0 321 1 1 0.3961 0.0000 0.0062 3.500 0.26 3.06 -2.80 50 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1713 0.6887 0.1400 1 1 0.1779 0.6757 0.1465 1 1 0.1862 0.6589 0.1549
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1038 290 748 247 1 2 30 10 0 1 746 1 0 0.8517 0.0000 0.0027 129.500 0.37 4.20 -3.83 87 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0172 0.9828 0.0000 0 0 0.6736 0.3264 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 1037 290 747 248 2 30 0 10 1 0 745 1 0 0.8552 0.0013 0.0027 8.931 0.33 4.20 -3.87 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.8366 0.1634 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000
chr17 18778544 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 663 208 455 144 1 0 3 60 0 0 455 0 0 0.6923 0.0000 0.0000 208.000 0.18 1.07 -0.89 110 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9984 0.0016 0.0000 1 0 0.9980 0.0020 0.0000 1 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 829 172 657 76 0 4 0 92 0 0 650 0 7 0.4419 0.0000 0.0107 42.000 0.41 4.01 -3.60 24 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0070 0.3233 0.6697 1 2 0.0083 0.3279 0.6638 1 2 0.0103 0.3348 0.6549
chr17 30834937 ACAATGT A 0.500000 0.100 1 -6 1 999 203 796 188 0 7 0 8 0 0 796 0 0 0.9261 0.0000 0.0000 28.000 0.37 6.62 -6.25 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.7051 0.2949 0.0000 0 0 0.9818 0.0182 0.0000
chr17 34929013 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 145 75 70 38 0 3 0 34 0 0 68 0 2 0.5067 0.0000 0.0286 24.000 0.11 3.26 -3.16 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2481 0.5850 0.1669 1 1 0.2503 0.5787 0.1710 1 1 0.2530 0.5707 0.1763
chr17 35479485 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 902 211 691 203 0 0 1 7 0 0 689 1 1 0.9621 0.0000 0.0029 211.000 0.35 2.86 -2.51 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6080 0.3920 0.0000 0 0 0.9800 0.0200 0.0000
chr17 41060049 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 530 135 395 122 0 1 3 9 0 0 394 0 1 0.9037 0.0000 0.0025 134.000 0.72 1.89 -1.17 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0887 0.9113 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 482 124 358 53 0 1 0 70 0 0 358 0 0 0.4274 0.0000 0.0000 123.000 0.19 1.51 -1.33 45 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0201 0.3959 0.5840 1 2 0.0226 0.3995 0.5779 1 2 0.0265 0.4046 0.5689
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 516 105 411 33 1 11 2 58 1 1 397 0 12 0.3143 0.0024 0.0341 8.455 1.24 9.21 -7.96 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0006 0.0821 0.9173 1 2 0.0008 0.0900 0.9092 1 2 0.0012 0.1016 0.8972
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 640 179 461 96 0 28 0 55 0 0 452 0 9 0.5363 0.0000 0.0195 5.393 0.28 13.64 -13.36 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8435 0.1550 0.0015 1 0 0.8347 0.1634 0.0019 1 0 0.8219 0.1755 0.0026
chr17 41567480 C CCCACTTCCTCCACTATGACCACCT 0.500000 0.100 1 24 5 807 208 599 165 0 39 0 4 1 0 595 0 3 0.7933 0.0017 0.0067 4.333 0.50 7.75 -7.25 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.6990 0.3010 0.0000 0 0 0.9725 0.0275 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1761 376 1385 198 0 3 0 175 0 0 1382 0 3 0.5266 0.0000 0.0022 124.333 0.42 3.30 -2.88 44 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3622 0.6309 0.0069 1 1 0.3763 0.6154 0.0083 1 1 0.3930 0.5964 0.0106
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 668 193 475 0 0 26 6 161 0 1 469 1 4 0.0000 0.0000 0.0126 6.423 3.37 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 227 71 156 39 0 4 1 27 0 0 154 0 2 0.5493 0.0000 0.0128 16.500 0.28 3.67 -3.38 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4374 0.4920 0.0706 1 1 0.4331 0.4919 0.0750 1 1 0.4269 0.4920 0.0811
chr17 47836758 AAGGAGCTGGAGC A 0.500000 0.100 1 -12 1 706 161 545 88 0 10 0 63 0 0 536 0 9 0.5466 0.0000 0.0165 15.100 0.36 11.16 -10.80 20 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5156 0.4628 0.0216 1 0 0.5137 0.4619 0.0243 1 0 0.5101 0.4615 0.0284
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 430 119 311 56 0 17 0 46 0 0 306 0 5 0.4706 0.0000 0.0161 6.000 0.07 7.83 -7.75 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2915 0.6003 0.1082 1 1 0.2939 0.5928 0.1133 1 1 0.2964 0.5834 0.1202
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 930 242 688 120 0 7 0 115 0 0 683 0 5 0.4959 0.0000 0.0073 33.571 0.14 3.03 -2.89 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1178 0.7644 0.1178 1 1 0.1260 0.7480 0.1260 1 1 0.1368 0.7263 0.1368
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.100 1 3 2 526 114 412 73 3 32 0 6 0 0 412 0 0 0.6404 0.0000 0.0000 2.562 0.10 3.00 -2.90 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0701 0.9299 0.0000 0 1 0.4610 0.5390 0.0000
chr17 57979243 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 437 177 260 73 5 48 3 48 0 0 259 0 1 0.4124 0.0000 0.0038 2.667 0.74 3.50 -2.76 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7779 0.2178 0.0043 1 0 0.7682 0.2267 0.0052 1 0 0.7542 0.2392 0.0066
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 374 124 250 96 1 21 0 6 0 0 250 0 0 0.7742 0.0000 0.0000 4.905 0.43 4.50 -4.07 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1760 0.8240 0.0000 0 0 0.7018 0.2982 0.0000
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 320 117 203 63 0 7 0 47 0 0 203 0 0 0.5385 0.0000 0.0000 15.714 0.33 7.26 -6.92 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5733 0.4027 0.0240 1 0 0.5668 0.4063 0.0269 1 0 0.5574 0.4115 0.0310
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 321 93 228 4 0 13 0 76 0 0 223 0 5 0.0430 0.0000 0.0219 6.154 0.00 7.76 -7.76 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9915 0.0085 2 1 0.0000 0.5531 0.4469 2 2 0.0000 0.2037 0.7963
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.100 1 -2 3 341 91 250 7 0 0 0 84 0 0 248 0 2 0.0769 0.0000 0.0080 91.000 0.71 2.65 -1.94 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9592 0.0408 2 1 0.0000 0.5792 0.4208
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 129 49 80 22 0 0 0 27 0 0 80 0 0 0.4490 0.0000 0.0000 49.000 0.09 1.26 -1.17 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1271 0.5305 0.3424 1 1 0.1314 0.5281 0.3405 1 1 0.1370 0.5251 0.3378
chr17 74367718 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 278 98 180 8 0 4 0 86 0 0 180 0 0 0.0816 0.0000 0.0000 23.500 0.25 1.07 -0.82 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9854 0.0146 2 1 0.0000 0.7226 0.2774
chr17 74842534 ACTGTCT A 0.500000 0.100 1 -6 5 491 130 361 125 1 1 0 3 0 0 361 0 0 0.9615 0.0000 0.0000 128.000 0.36 6.00 -5.64 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4375 0.5625 0.0000 0 0 0.9566 0.0434 0.0000 0 0 0.9850 0.0150 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 602 139 463 9 0 10 1 119 0 0 451 0 12 0.0647 0.0000 0.0259 12.900 0.44 8.10 -7.66 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9521 0.0479 2 2 0.0000 0.3477 0.6523
chr17 74893497 C CGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTA 0.500000 0.100 1 36 2 356 87 269 0 1 66 0 20 0 0 258 0 11 0.0000 0.0000 0.0409 0.318 2.90 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2991 0.7009 2 2 0.0000 0.2689 0.7311 2 2 0.0000 0.2499 0.7501
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.100 1 -54 1 356 113 243 84 1 7 1 20 0 0 243 0 0 0.7434 0.0000 0.0000 15.000 1.12 3.85 -2.73 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0480 0.9520 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr17 75516562 T TGGAGCC 0.500000 0.100 1 6 1 483 125 358 114 0 4 0 7 2 0 356 0 0 0.9120 0.0056 0.0056 30.250 1.59 7.57 -5.98 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1600 0.8400 0.0000 0 0 0.7570 0.2430 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2538 593 1945 223 18 82 13 257 0 3 1922 7 13 0.3761 0.0000 0.0118 6.354 1.05 6.74 -5.69 33 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0001 0.2213 0.7786 1 2 0.0001 0.2177 0.7822 1 2 0.0002 0.2151 0.7847
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2435 622 1813 230 8 37 9 338 1 3 1644 24 141 0.3698 0.0006 0.0932 17.088 1.79 4.79 -3.00 42 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 1063 187 876 99 2 8 2 76 0 0 876 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 22.125 0.67 5.07 -4.40 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6656 0.3274 0.0070 1 0 0.6599 0.3318 0.0083 1 0 0.6513 0.3384 0.0103
chr18 47446 CCTGATATTG C 0.001071 0.100 1 -9 1 812 199 613 126 0 7 0 66 0 0 605 0 8 0.6332 0.0000 0.0131 27.429 1.10 8.73 -7.62 114 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9848 0.0152 0.0000 1 0 0.9828 0.0172 0.0000 1 0 0.9797 0.0203 0.0000
chr18 48226 ATG A 0.000609 0.100 1 -2 2 1487 387 1100 338 1 13 0 35 0 0 1100 0 0 0.8734 0.0000 0.0000 28.769 0.71 2.40 -1.69 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8009 0.1991 0.0000
chr18 3452217 G GC 0.000172 0.100 1 1 1 287 78 209 32 35 7 1 3 0 0 209 0 0 0.4103 0.0000 0.0000 5.000 0.12 1.33 -1.21 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9934 0.0066 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 287 74 213 32 3 1 2 36 0 0 213 0 0 0.4324 0.0000 0.0000 72.000 0.12 1.61 -1.49 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1905 0.5931 0.2164 1 1 0.1957 0.5868 0.2175 1 1 0.2026 0.5788 0.2186
chr18 11689670 CGGCCCT C 0.001376 0.100 1 -6 4 446 82 364 46 0 3 0 33 0 0 364 0 0 0.5610 0.0000 0.0000 26.333 0.39 5.36 -4.97 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7107 0.2892 0.0001 1 0 0.7065 0.2934 0.0001 1 0 0.7005 0.2994 0.0001
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 191 80 111 0 0 3 0 77 0 0 111 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 25.667 2.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 24160067 CTG C 0.002292 0.100 1 -2 4 448 96 352 86 0 3 1 6 0 0 351 0 1 0.8958 0.0000 0.0028 31.000 0.15 2.00 -1.85 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 0 0.9221 0.0779 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 192 74 118 5 0 0 0 69 0 0 118 0 0 0.0676 0.0000 0.0000 74.000 0.00 4.67 -4.67 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.8440 0.1560 2 2 0.0000 0.4188 0.5812
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 286 135 151 8 0 3 0 124 0 0 150 0 1 0.0593 0.0000 0.0066 44.000 0.25 3.59 -3.34 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9067 0.0933 2 2 0.0000 0.2827 0.7173
chr18 51196767 CCCGCCG C 0.500000 0.100 1 -6 5 440 114 326 59 0 8 2 45 0 0 322 3 1 0.5175 0.0000 0.0123 13.125 1.31 9.71 -8.41 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3759 0.5541 0.0700 1 1 0.3758 0.5495 0.0747 1 1 0.3750 0.5438 0.0811
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -9 2 453 117 336 59 3 6 2 47 0 0 336 0 0 0.5043 0.0000 0.0000 18.500 1.37 9.38 -8.01 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4912 0.4707 0.0380 1 0 0.4874 0.4709 0.0417 1 0 0.4815 0.4716 0.0469
chr18 54224211 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 306 83 223 47 1 4 0 31 0 0 218 0 5 0.5663 0.0000 0.0224 19.750 2.09 3.58 -1.50 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5014 0.4536 0.0450 1 0 0.4957 0.4554 0.0488 1 0 0.4877 0.4580 0.0543
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 261 148 113 1 0 8 0 139 0 0 113 0 0 0.0068 0.0000 0.0000 17.500 0.00 2.97 -2.97 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0076 0.9924 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr18 57436244 G GCAC 0.500000 0.100 1 3 2 733 224 509 100 4 37 1 82 0 0 506 0 3 0.4464 0.0000 0.0059 5.027 1.25 3.44 -2.19 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5277 0.4569 0.0154 1 0 0.5270 0.4553 0.0176 1 0 0.5249 0.4541 0.0210
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 878 191 687 92 0 6 0 93 0 0 673 0 14 0.4817 0.0000 0.0204 30.833 0.12 13.80 -13.68 6 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0227 0.5331 0.4442 1 1 0.0256 0.5275 0.4469 1 1 0.0300 0.5210 0.4490
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 389 71 318 4 1 12 1 53 0 0 315 3 0 0.0563 0.0000 0.0094 4.750 2.00 5.70 -3.70 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.8471 0.1529 2 1 0.0000 0.5140 0.4860
chr18 62979014 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 3 660 137 523 72 1 5 0 59 1 0 519 0 3 0.5255 0.0019 0.0076 26.400 0.29 3.49 -3.20 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4387 0.5206 0.0407 1 1 0.4381 0.5174 0.0445 1 1 0.4362 0.5137 0.0500
chr18 63655777 T TGCCA 0.500000 0.100 1 4 2 368 120 248 115 0 0 0 5 0 0 246 0 2 0.9583 0.0000 0.0081 120.000 0.34 6.60 -6.26 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1533 0.8467 0.0000 0 0 0.7480 0.2520 0.0000
chr18 63655779 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 368 122 246 115 0 2 0 5 0 0 244 0 2 0.9426 0.0000 0.0081 60.000 0.35 6.60 -6.25 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1566 0.8434 0.0000 0 0 0.7496 0.2504 0.0000
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 169 67 102 0 0 3 0 64 0 0 101 0 1 0.0000 0.0000 0.0098 21.333 3.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0351 0.9649 2 2 0.0000 0.0375 0.9625 2 2 0.0000 0.0409 0.9591
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 141 78 63 66 4 5 0 3 0 0 63 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 14.600 0.17 3.67 -3.50 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0432 0.9568 0.0000 0 0 0.5750 0.4250 0.0000 0 0 0.8132 0.1868 0.0000
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.100 1 3 1 253 109 144 46 5 47 0 11 0 0 144 0 0 0.4220 0.0000 0.0000 5.700 0.26 2.82 -2.56 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0327 0.9673 0.0000 0 0 0.7593 0.2407 0.0000
chr19 1000449 G GCGGGCGCTGTGGCTGGGC 0.000085 0.100 1 18 1 202 52 150 49 0 1 0 2 0 0 148 0 2 0.9423 0.0000 0.0133 51.000 0.59 10.50 -9.91 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9516 0.0484 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.100 1 4 1 691 147 544 81 0 1 0 65 0 0 539 0 5 0.5510 0.0000 0.0092 146.000 2.22 5.15 -2.93 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4925 0.4853 0.0221 1 0 0.4949 0.4809 0.0242 1 0 0.4970 0.4758 0.0272
chr19 1009186 GAGC G 0.092678 0.100 1 -3 2 595 126 469 103 1 13 1 8 0 0 469 0 0 0.8175 0.0000 0.0000 8.692 0.79 3.38 -2.59 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1110 0.8890 0.0000 0 0 0.8264 0.1736 0.0000
chr19 1046907 GCTGCGGGACACCATGCGCGCCATGGGGCTCAGCCGCGCGGTGCT G 0.001648 0.100 1 -44 2 605 195 410 186 0 5 0 4 0 0 409 0 1 0.9538 0.0000 0.0024 38.000 0.73 11.00 -10.27 80 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9916 0.0084 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 1395488 G GCGC 0.003752 0.100 1 3 1 1099 224 875 155 1 61 0 7 1 0 873 0 1 0.6920 0.0011 0.0023 2.672 1.07 4.29 -3.21 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0149 0.9851 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 168 65 103 30 0 2 0 33 0 0 103 0 0 0.4615 0.0000 0.0000 31.500 0.13 4.30 -4.17 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2539 0.6066 0.1395 1 1 0.2601 0.6002 0.1397 1 1 0.2682 0.5920 0.1397
chr19 1578372 GCTC G 0.001595 0.100 1 -3 3 323 107 216 82 1 13 1 10 0 0 215 1 0 0.7664 0.0000 0.0046 7.154 0.15 3.30 -3.15 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1425 0.8575 0.0000 0 0 0.9493 0.0507 0.0000
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 311 97 214 0 0 17 45 35 0 0 206 5 3 0.0000 0.0000 0.0374 5.000 4.23 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0124 0.9876 2 2 0.0000 0.0136 0.9864 2 2 0.0000 0.0154 0.9846
chr19 2015541 GGGCGGCGGC G 0.046318 0.100 1 -9 4 311 103 208 37 6 13 1 46 0 0 202 0 6 0.3592 0.0000 0.0288 6.923 3.32 10.70 -7.37 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1688 0.7705 0.0607 1 1 0.1795 0.7607 0.0598 1 1 0.1941 0.7476 0.0584
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 311 110 201 48 1 13 0 48 0 0 198 0 3 0.4364 0.0000 0.0149 7.385 3.33 10.31 -6.98 28 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2528 0.6474 0.0998 1 1 0.2608 0.6380 0.1011 1 1 0.2712 0.6260 0.1027
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGC G 0.009541 0.100 1 -21 4 311 120 191 96 7 10 3 4 0 0 191 0 0 0.8000 0.0000 0.0000 11.000 5.52 15.75 -10.23 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 0 0.9373 0.0627 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000
chr19 2253751 GGCGCGGTCTGCGCCTTCTTGC G 0.000218 0.100 1 -21 1 323 114 209 101 1 8 0 4 1 0 208 0 0 0.8860 0.0048 0.0048 13.250 0.90 17.25 -16.35 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9918 0.0082 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 3539216 C CCCCTCGGGGA 0.001517 0.100 1 10 1 276 75 201 31 0 7 0 37 0 0 196 0 5 0.4133 0.0000 0.0249 9.714 1.42 8.16 -6.74 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1895 0.8079 0.0025 1 1 0.2004 0.7971 0.0025 1 1 0.2152 0.7825 0.0024
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 912 188 724 80 5 28 1 74 0 0 721 0 3 0.4255 0.0000 0.0041 5.714 0.61 3.32 -2.71 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4272 0.5549 0.0180 1 1 0.4348 0.5460 0.0193 1 1 0.4438 0.5351 0.0211
chr19 6531137 GGCTGCT G 0.000547 0.100 1 -6 4 202 75 127 37 0 5 1 32 0 0 124 0 3 0.4933 0.0000 0.0236 14.000 0.24 6.00 -5.76 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4356 0.5642 0.0002 1 1 0.4413 0.5585 0.0002 1 1 0.4485 0.5513 0.0002
chr19 7488963 G GC 0.000555 0.100 1 1 2 96 45 51 21 0 0 0 24 0 0 51 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 45.000 0.24 1.17 -0.93 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3731 0.6265 0.0004 1 1 0.3797 0.6199 0.0004 1 1 0.3882 0.6114 0.0004
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 448 135 313 116 0 8 0 11 1 0 311 0 1 0.8593 0.0032 0.0064 15.875 1.12 3.36 -2.24 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0072 0.9928 0.0000 0 1 0.4953 0.5047 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 594 159 435 92 0 16 0 51 0 0 428 0 7 0.5786 0.0000 0.0161 9.533 0.38 10.55 -10.17 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9047 0.0948 0.0005 1 0 0.8981 0.1013 0.0006 1 0 0.8884 0.1107 0.0008
chr19 8490988 TCTC T 0.003548 0.100 1 -3 2 552 153 399 137 2 2 0 12 0 0 399 0 0 0.8954 0.0000 0.0000 75.500 1.24 3.67 -2.43 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4497 0.5503 0.0000 0 0 0.9908 0.0092 0.0000
chr19 8906017 A AGGT 0.002480 0.100 1 3 1 344 108 236 53 0 2 0 53 0 0 235 0 1 0.4907 0.0000 0.0042 53.000 0.21 4.04 -3.83 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3480 0.6510 0.0011 1 1 0.3579 0.6410 0.0011 1 1 0.3706 0.6283 0.0011
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 326 87 239 0 0 6 0 81 0 0 237 0 2 0.0000 0.0000 0.0084 13.500 5.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0300 0.9700 2 2 0.0000 0.0326 0.9674 2 2 0.0000 0.0365 0.9635
chr19 9126240 AG A 0.056196 0.100 1 -1 5 417 117 300 112 0 0 0 5 0 0 300 0 0 0.9573 0.0000 0.0000 117.000 1.01 2.20 -1.19 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0716 0.9284 0.0000 0 0 0.9567 0.0433 0.0000 0 0 0.9936 0.0064 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 906 313 593 227 4 50 5 27 0 0 593 0 0 0.7252 0.0000 0.0000 5.240 0.44 3.52 -3.08 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr19 12943835 TGAGGATGAG T 0.000485 0.100 1 -9 1 383 122 261 61 0 12 0 49 0 0 257 0 4 0.5000 0.0000 0.0153 9.167 0.38 8.16 -7.79 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5580 0.4419 0.0001 1 0 0.5609 0.4390 0.0001 1 0 0.5641 0.4359 0.0001
chr19 13207858 CCTG C 0.175850 0.100 1 -3 1 416 130 286 0 0 24 55 51 0 0 285 1 0 0.0000 0.0000 0.0035 4.417 3.69 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0192 0.9808 2 2 0.0000 0.0215 0.9785 2 2 0.0000 0.0249 0.9751
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 416 132 284 0 4 67 3 58 0 0 281 1 2 0.0000 0.0000 0.0106 1.000 5.90 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2286 0.7714 2 2 0.0000 0.2115 0.7885 2 2 0.0000 0.1989 0.8011
chr19 13877367 T TGGAGCCGGTGTCAGCGCC 0.004594 0.100 1 18 1 373 96 277 78 0 15 0 3 0 0 277 0 0 0.8125 0.0000 0.0000 5.400 0.35 8.00 -7.65 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9362 0.0638 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.100 1 3 1 318 100 218 33 1 9 0 57 0 0 217 0 1 0.3300 0.0000 0.0046 10.111 0.21 3.04 -2.82 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0366 0.6643 0.2991 1 1 0.0421 0.6723 0.2856 1 1 0.0502 0.6818 0.2679
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 651 134 517 0 0 2 0 132 0 0 510 0 7 0.0000 0.0000 0.0135 66.000 3.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 17286678 GTGTGTGTGTGTGTT G 0.125300 0.100 1 -14 1 389 79 310 25 2 12 10 30 0 0 310 0 0 0.3165 0.0000 0.0000 5.500 2.56 9.97 -7.41 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1269 0.6697 0.2033 1 1 0.1356 0.6665 0.1979 1 1 0.1477 0.6618 0.1905
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 144 49 95 25 0 1 0 23 1 0 92 0 2 0.5102 0.0105 0.0316 48.000 0.80 3.17 -2.37 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3726 0.5471 0.0803 1 1 0.3755 0.5431 0.0815 1 1 0.3790 0.5380 0.0831
chr19 21383385 TAATTCATGCTGGAGAGAAACACTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAAGATTTTAAACAGTCCTCACACCTTACTAAACATAAGAC T 0.206936 0.100 1 -84 2 783 197 586 100 0 26 2 69 3 11 568 1 3 0.5076 0.0051 0.0307 6.577 0.48 3.03 -2.55 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9405 0.0594 0.0001 1 0 0.9357 0.0641 0.0001 1 0 0.9287 0.0711 0.0002
chr19 22757390 A AG 0.088391 0.100 1 1 2 1239 285 954 126 1 15 6 137 0 0 779 8 167 0.4421 0.0000 0.1834 17.800 1.10 1.69 -0.60 26 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 356 109 247 0 0 9 4 96 0 0 245 0 2 0.0000 0.0000 0.0081 11.000 2.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 618 148 470 75 0 11 0 62 0 0 465 0 5 0.5068 0.0000 0.0106 12.455 0.52 3.26 -2.74 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1990 0.6879 0.1131 1 1 0.2005 0.6782 0.1213 1 1 0.2018 0.6657 0.1325
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 430 146 284 60 37 14 0 35 0 0 261 0 23 0.4110 0.0000 0.0810 10.154 5.80 13.51 -7.71 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9461 0.0538 0.0001 1 0 0.9414 0.0585 0.0001 1 0 0.9342 0.0656 0.0002
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 425 119 306 57 5 50 1 6 0 0 305 1 0 0.4790 0.0000 0.0033 1.388 18.61 1.50 17.11 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1394 0.8606 0.0000 0 0 0.7376 0.2624 0.0000
chr19 38304940 CAAG C 0.034026 0.100 1 -3 3 380 88 292 52 0 7 0 29 0 0 290 1 1 0.5909 0.0000 0.0068 11.571 0.48 2.93 -2.45 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8372 0.1624 0.0005 1 0 0.8302 0.1692 0.0005 1 0 0.8205 0.1789 0.0007
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 616 129 487 68 0 16 1 44 0 1 460 0 26 0.5271 0.0000 0.0554 7.062 0.81 11.89 -11.08 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2719 0.7045 0.0236 1 1 0.2836 0.6921 0.0243 1 1 0.2989 0.6761 0.0250
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 381 109 272 51 0 3 0 55 0 0 267 1 4 0.4679 0.0000 0.0184 35.333 0.53 2.16 -1.63 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1032 0.6254 0.2714 1 1 0.1102 0.6193 0.2705 1 1 0.1199 0.6114 0.2687
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 207 31 176 0 0 2 28 1 0 0 176 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 13.500 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0613 0.9387 2 2 0.0000 0.0631 0.9369 2 2 0.0000 0.0656 0.9344
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 206 31 175 0 0 21 10 0 0 0 175 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.364 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1080 0.8920 2 2 0.0000 0.1100 0.8900 2 2 0.0000 0.1126 0.8874
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 471 135 336 72 2 9 1 51 0 0 336 0 0 0.5333 0.0000 0.0000 13.778 0.19 5.29 -5.10 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6755 0.3139 0.0106 1 0 0.6662 0.3215 0.0123 1 0 0.6529 0.3320 0.0151
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 533 163 370 160 0 2 0 1 0 0 370 0 0 0.9816 0.0000 0.0000 80.500 0.44 1.00 -0.56 86 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.100 1 3 1 342 133 209 122 0 5 0 6 0 0 209 0 0 0.9173 0.0000 0.0000 25.600 0.75 3.50 -2.75 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0186 0.9814 0.0000 0 0 0.9457 0.0543 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr19 42225153 TGAG T 0.002643 0.100 1 -3 1 934 174 760 164 1 4 0 5 0 1 759 0 0 0.9425 0.0000 0.0013 42.500 0.62 3.80 -3.18 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9637 0.0363 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 316 78 238 6 0 1 0 71 0 0 235 0 3 0.0769 0.0000 0.0126 77.000 0.50 6.77 -6.27 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9540 0.0460 2 1 0.0000 0.6454 0.3546
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 573 173 400 157 0 0 0 16 0 0 400 0 0 0.9075 0.0000 0.0000 173.000 0.22 3.25 -3.03 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0393 0.9607 0.0000
chr19 44273995 TCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTGAGGTATGTGATAAGGGCTTCAGTAAGGCCTCAAATCTTCAAGCCCATCAGAGAATC T 0.002701 0.100 1 -84 2 639 152 487 107 1 20 0 24 0 0 464 0 23 0.7039 0.0000 0.0472 6.600 0.51 4.12 -3.61 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9950 0.0050 0.0000 1 0 0.9940 0.0060 0.0000 1 0 0.9925 0.0075 0.0000
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 475 134 341 9 0 6 4 115 0 0 337 1 3 0.0672 0.0000 0.0117 25.600 0.33 2.17 -1.83 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9944 0.0056 2 1 0.0000 0.8260 0.1740
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 302 132 170 73 0 4 0 55 0 0 169 0 1 0.5530 0.0000 0.0059 32.000 0.96 1.96 -1.00 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7383 0.2614 0.0004 1 0 0.7349 0.2647 0.0004 1 0 0.7298 0.2697 0.0005
chr19 45145565 GGACTCA G 0.000407 0.100 1 -6 3 694 149 545 79 0 5 1 64 0 0 544 0 1 0.5302 0.0000 0.0018 28.600 0.37 6.08 -5.71 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6454 0.3546 0.0000 1 0 0.6461 0.3539 0.0000 1 0 0.6463 0.3537 0.0000
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 781 270 511 105 0 61 0 104 0 0 493 0 18 0.3889 0.0000 0.0352 3.426 0.22 5.88 -5.67 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0168 0.5315 0.4516 1 1 0.0193 0.5255 0.4551 1 1 0.0231 0.5186 0.4583
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 367 111 256 51 0 31 0 29 0 0 235 0 21 0.4595 0.0000 0.0820 2.581 0.35 13.10 -12.75 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3626 0.6024 0.0350 1 1 0.3699 0.5941 0.0360 1 1 0.3790 0.5837 0.0373
chr19 46493759 C CCGGCCT 0.138319 0.100 1 6 4 369 72 297 35 0 11 0 26 0 0 294 1 2 0.4861 0.0000 0.0101 5.545 3.14 7.69 -4.55 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5195 0.4551 0.0254 1 0 0.5191 0.4544 0.0265 1 0 0.5181 0.4537 0.0281
chr19 47802317 AGATTGGGCCTGG A 0.001318 0.100 1 -12 1 1456 371 1085 283 10 47 10 21 0 1 1084 0 0 0.7628 0.0000 0.0009 6.723 2.24 9.43 -7.18 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 0 0.9780 0.0220 0.0000
chr19 49070105 TGGA T 0.101017 0.100 1 -3 1 429 116 313 110 1 0 0 5 1 0 312 0 0 0.9483 0.0032 0.0032 115.000 0.27 4.00 -3.73 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0383 0.9617 0.0000 0 0 0.9206 0.0794 0.0000 0 0 0.9879 0.0121 0.0000
chr19 49154632 T TTCCTCCTCC 0.001742 0.100 1 9 1 1118 285 833 126 3 60 5 91 0 0 833 0 0 0.4421 0.0000 0.0000 3.700 0.77 7.08 -6.31 62 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9086 0.0914 0.0000 1 0 0.9045 0.0955 0.0000 1 0 0.8985 0.1015 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 592 173 419 0 0 26 0 147 0 0 410 2 7 0.0000 0.0000 0.0215 5.654 7.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.100 1 -18 2 631 247 384 94 1 68 1 83 0 0 384 0 0 0.3806 0.0000 0.0000 2.618 0.35 12.07 -11.72 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5261 0.4676 0.0063 1 0 0.5317 0.4614 0.0069 1 0 0.5380 0.4542 0.0078
chr19 49969702 A ATGC 0.001079 0.100 1 3 1 884 193 691 167 2 21 0 3 0 2 689 0 0 0.8653 0.0000 0.0029 8.143 0.38 3.00 -2.62 69 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 719 163 556 0 0 13 2 148 0 0 550 0 6 0.0000 0.0000 0.0108 11.462 3.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.100 1 6 2 642 179 463 94 0 14 0 71 0 0 460 0 3 0.5251 0.0000 0.0065 11.786 0.35 5.07 -4.72 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7585 0.2413 0.0002 1 0 0.7559 0.2439 0.0002 1 0 0.7517 0.2480 0.0003
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 515 144 371 78 0 4 7 55 0 0 371 0 0 0.5417 0.0000 0.0000 35.000 0.68 2.85 -2.18 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4599 0.5077 0.0324 1 1 0.4550 0.5085 0.0365 1 1 0.4477 0.5099 0.0424
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 250 117 133 63 0 0 0 54 0 0 132 0 1 0.5385 0.0000 0.0075 117.000 0.46 2.04 -1.58 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2255 0.6546 0.1199 1 1 0.2257 0.6467 0.1276 1 1 0.2254 0.6364 0.1381
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 548 167 381 23 0 1 0 143 0 0 381 0 0 0.1377 0.0000 0.0000 166.000 0.35 2.60 -2.25 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 610 160 450 11 0 6 0 143 0 0 445 0 5 0.0688 0.0000 0.0111 25.667 0.91 3.70 -2.79 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9916 0.0084 2 1 0.0000 0.5830 0.4170
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 964 251 713 12 0 1 0 238 0 0 711 0 2 0.0478 0.0000 0.0028 250.000 0.08 3.02 -2.94 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7657 0.2343 2 2 0.0000 0.0279 0.9721
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 741 220 521 18 0 7 1 194 0 0 518 0 3 0.0818 0.0000 0.0058 30.429 0.67 1.52 -0.85 12 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.7678 0.2322
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 786 157 629 7 0 5 1 144 0 0 625 0 4 0.0446 0.0000 0.0064 30.400 0.14 3.63 -3.49 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.5453 0.4547 2 2 0.0000 0.0713 0.9287
chr19 55048755 GCTC G 0.000317 0.100 1 -3 1 262 60 202 23 0 4 1 32 0 0 201 0 1 0.3833 0.0000 0.0050 14.000 0.17 2.94 -2.76 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2029 0.7966 0.0006 1 1 0.2133 0.7862 0.0005 1 1 0.2274 0.7721 0.0005
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 471 141 330 58 0 30 1 52 0 0 321 1 8 0.4113 0.0000 0.0273 3.700 0.22 7.31 -7.08 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1176 0.6257 0.2567 1 1 0.1230 0.6165 0.2604 1 1 0.1302 0.6049 0.2649
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 658 126 532 0 0 23 0 103 0 0 492 0 40 0.0000 0.0000 0.0752 4.478 19.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 931 278 653 130 2 38 7 101 0 0 647 0 6 0.4676 0.0000 0.0092 6.432 0.85 5.00 -4.15 80 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5610 0.4327 0.0063 1 0 0.5656 0.4272 0.0073 1 0 0.5701 0.4211 0.0088
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 587 121 466 0 0 0 0 121 0 0 461 0 5 0.0000 0.0000 0.0107 121.000 4.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr19 56284206 G GGTAA 0.001119 0.100 1 4 1 72 40 32 22 0 2 1 15 0 0 32 0 0 0.5500 0.0000 0.0000 18.500 0.36 4.67 -4.30 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6055 0.3943 0.0002 1 0 0.6032 0.3966 0.0002 1 0 0.5999 0.3999 0.0002
chr19 56814359 A ATCT 0.007767 0.100 1 3 1 571 98 473 47 3 11 0 37 0 0 472 0 1 0.4796 0.0000 0.0021 7.909 0.17 3.08 -2.91 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6787 0.3208 0.0005 1 0 0.6758 0.3237 0.0005 1 0 0.6715 0.3279 0.0006
chr19 57456271 TAA T 0.000987 0.100 1 -2 2 616 142 474 128 0 1 0 13 0 0 474 0 0 0.9014 0.0000 0.0000 141.000 0.27 2.00 -1.73 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3715 0.6285 0.0000 0 0 0.9917 0.0083 0.0000
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 350 106 244 56 0 1 0 49 0 0 244 0 0 0.5283 0.0000 0.0000 105.000 0.11 4.08 -3.97 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4922 0.4857 0.0221 1 0 0.4945 0.4821 0.0235 1 0 0.4969 0.4778 0.0253
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 351 144 207 68 0 3 0 73 0 0 206 0 1 0.4722 0.0000 0.0048 47.000 0.24 2.15 -1.92 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0746 0.6150 0.3103 1 1 0.0793 0.6058 0.3149 1 1 0.0857 0.5942 0.3202
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 122 70 52 50 0 0 0 20 0 0 52 0 0 0.7143 0.0000 0.0000 70.000 0.04 5.90 -5.86 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8423 0.1543 0.0034 1 0 0.8296 0.1662 0.0042 1 0 0.8098 0.1847 0.0056
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.100 1 3 1 473 114 359 89 3 9 0 13 0 0 358 1 0 0.7807 0.0000 0.0028 11.667 0.80 3.23 -2.43 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.1653 0.8347 0.0000
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 366 157 209 85 0 12 1 59 0 0 205 0 4 0.5414 0.0000 0.0191 12.000 0.32 6.15 -5.83 49 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7759 0.2223 0.0017 1 0 0.7710 0.2270 0.0020 1 0 0.7638 0.2337 0.0025
chr20 3864345 C CAAG 0.001475 0.100 1 3 2 478 152 326 143 0 1 0 8 0 0 326 0 0 0.9408 0.0000 0.0000 151.000 0.40 3.25 -2.85 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0184 0.9816 0.0000 0 0 0.9942 0.0058 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr20 4699448 CCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCT C 0.009335 0.100 1 -24 4 914 258 656 135 2 22 1 98 0 0 656 0 0 0.5233 0.0000 0.0000 10.682 0.51 8.29 -7.77 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9332 0.0668 0.0000 1 0 0.9294 0.0706 0.0000 1 0 0.9237 0.0763 0.0000
chr20 18465360 T TTC 0.004672 0.100 1 2 4 188 51 137 17 6 24 0 4 0 0 137 0 0 0.3333 0.0000 0.0000 1.125 7.53 10.00 -2.47 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1058 0.8942 0.0000 0 0 0.9091 0.0909 0.0000 0 0 0.9811 0.0189 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 230 94 136 79 1 7 0 7 0 0 136 0 0 0.8404 0.0000 0.0000 14.500 0.29 1.43 -1.14 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0185 0.9815 0.0000 0 1 0.2440 0.7560 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 742 203 539 95 0 3 0 105 0 0 537 0 2 0.4680 0.0000 0.0037 66.667 0.20 6.82 -6.62 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0386 0.6209 0.3404 1 1 0.0430 0.6118 0.3453 1 1 0.0492 0.6003 0.3505
chr20 33663701 TGCGGCGGCAAGAGGC T 0.003375 0.100 1 -15 1 641 179 462 102 0 12 0 65 0 0 458 0 4 0.5698 0.0000 0.0087 13.917 0.40 13.00 -12.60 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9190 0.0810 0.0000 1 0 0.9142 0.0858 0.0000 1 0 0.9071 0.0929 0.0000
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 502 162 340 0 2 1 2 157 0 0 330 0 10 0.0000 0.0000 0.0294 159.000 3.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr20 35277855 AGGCTGGGGCTGG A 0.001908 0.100 1 -12 1 391 134 257 74 0 6 0 54 0 0 253 0 4 0.5522 0.0000 0.0156 21.333 0.15 13.26 -13.11 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7184 0.2816 0.0001 1 0 0.7159 0.2841 0.0001 1 0 0.7120 0.2880 0.0001
chr20 45311890 ACAGCGCGTCCGG A 0.002746 0.100 1 -12 2 528 145 383 131 0 8 0 6 0 0 382 0 1 0.9034 0.0000 0.0026 17.125 0.34 10.83 -10.49 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0480 0.9520 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 627 175 452 162 0 2 0 11 0 0 452 0 0 0.9257 0.0000 0.0000 86.500 0.38 3.27 -2.90 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0172 0.9828 0.0000 0 0 0.5917 0.4083 0.0000
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 987 284 703 105 1 39 5 134 0 0 700 1 2 0.3697 0.0000 0.0043 6.282 0.20 3.29 -3.09 27 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.1355 0.8641 1 2 0.0006 0.1409 0.8585 1 2 0.0008 0.1490 0.8501
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 606 282 324 2 4 41 23 212 0 0 322 0 2 0.0071 0.0000 0.0062 5.756 2.50 3.25 -0.75 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr20 47651119 GCAA G 0.005778 0.100 1 -3 1 604 276 328 34 10 6 209 17 0 0 328 0 0 0.1232 0.0000 0.0000 13.000 0.26 3.00 -2.74 10 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8988 0.1012 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 202 28 174 0 0 0 0 28 0 0 170 1 3 0.0000 0.0000 0.0230 28.000 7.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 301 143 158 0 0 2 0 141 0 0 158 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 70.500 2.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 813 197 616 108 0 2 0 87 0 0 612 0 4 0.5482 0.0000 0.0065 97.500 0.06 5.70 -5.64 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4903 0.4922 0.0175 1 0 0.4912 0.4888 0.0200 1 0 0.4910 0.4852 0.0238
chr21 33070402 CTCCTCCACT C 0.002225 0.100 1 -9 2 498 150 348 135 1 6 0 8 0 0 347 0 1 0.9000 0.0000 0.0029 23.833 0.87 8.50 -7.63 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.9640 0.0360 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 827 219 608 185 2 21 0 11 4 3 600 1 0 0.8447 0.0066 0.0132 9.381 1.48 17.64 -16.16 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1578 0.8422 0.0000 0 0 0.9544 0.0456 0.0000
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 217 113 104 61 0 8 0 44 0 0 104 0 0 0.5398 0.0000 0.0000 13.125 0.07 4.05 -3.98 19 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5631 0.4108 0.0262 1 0 0.5550 0.4156 0.0294 1 0 0.5436 0.4223 0.0341
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 281 43 238 0 1 1 1 40 0 0 236 0 2 0.0000 0.0000 0.0084 41.000 2.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1151 184 967 93 2 3 8 78 2 1 957 2 5 0.5054 0.0021 0.0103 89.500 0.87 3.05 -2.18 29 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1754 0.7192 0.1054 1 1 0.1806 0.7059 0.1135 1 1 0.1870 0.6886 0.1244
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1150 185 965 91 3 12 8 71 2 1 955 2 5 0.4919 0.0021 0.0104 15.727 0.81 3.34 -2.52 29 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2833 0.6581 0.0586 1 1 0.2865 0.6490 0.0645 1 1 0.2897 0.6375 0.0729
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 570 116 454 98 5 6 0 7 0 0 452 0 2 0.8448 0.0000 0.0044 27.500 5.20 16.29 -11.08 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0105 0.9895 0.0000 0 1 0.2909 0.7091 0.0000
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 387 163 224 0 1 11 2 149 0 0 224 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 13.818 7.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr21 45505235 A AGGCCCCCCC 0.016294 0.100 1 9 6 408 85 323 6 0 11 1 67 0 0 323 0 0 0.0706 0.0000 0.0000 6.727 2.00 5.96 -3.96 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9905 0.0095
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 553 212 341 171 4 26 1 10 0 0 341 0 0 0.8066 0.0000 0.0000 7.154 0.32 3.90 -3.58 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1019 0.8981 0.0000 0 0 0.9005 0.0995 0.0000
chr22 17109651 TGGAGGAAGA T 0.001153 0.100 1 -9 3 741 211 530 115 0 17 0 79 0 0 527 0 3 0.5450 0.0000 0.0057 11.412 0.23 7.96 -7.74 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9091 0.0909 0.0000 1 0 0.9046 0.0954 0.0000 1 0 0.8980 0.1020 0.0000
chr22 23617579 G GCAT 0.002056 0.100 1 3 3 232 92 140 43 3 8 0 38 0 0 138 0 2 0.4674 0.0000 0.0143 10.500 0.19 3.68 -3.50 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5423 0.4574 0.0003 1 0 0.5445 0.4551 0.0004 1 0 0.5470 0.4527 0.0004
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 210 103 107 56 0 4 1 42 0 0 106 0 1 0.5437 0.0000 0.0093 24.750 0.29 3.43 -3.14 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5941 0.3885 0.0174 1 0 0.5910 0.3900 0.0190 1 0 0.5864 0.3924 0.0212
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 614 150 464 107 1 38 0 4 2 1 457 1 3 0.7133 0.0043 0.0151 2.947 1.17 17.00 -15.83 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0155 0.9845 0.0000 0 1 0.2132 0.7868 0.0000
chr22 27798924 T TTGC 0.004414 0.100 1 3 1 1060 280 780 103 4 38 4 131 0 0 777 0 3 0.3679 0.0000 0.0038 6.342 0.69 3.25 -2.56 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0135 0.9592 0.0273 1 1 0.0166 0.9569 0.0265 1 1 0.0216 0.9530 0.0253
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 834 234 600 131 0 2 1 100 0 0 596 0 4 0.5598 0.0000 0.0067 115.500 0.33 3.12 -2.79 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7141 0.2832 0.0027 1 0 0.7111 0.2857 0.0033 1 0 0.7058 0.2899 0.0042
chr22 30428672 T TA 0.000840 0.100 1 1 2 244 77 167 74 0 1 0 2 0 0 167 0 0 0.9610 0.0000 0.0000 76.000 0.18 1.00 -0.82 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 35728842 GC G 0.001215 0.100 1 -1 1 346 104 242 61 2 4 0 37 0 0 242 0 0 0.5865 0.0000 0.0000 25.000 0.97 1.27 -0.30 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8887 0.1113 0.0000 1 0 0.8824 0.1176 0.0000 1 0 0.8734 0.1266 0.0000
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 685 180 505 99 0 6 0 75 0 0 504 0 1 0.5500 0.0000 0.0020 29.000 0.49 2.45 -1.96 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6762 0.3171 0.0067 1 0 0.6704 0.3217 0.0079 1 0 0.6616 0.3286 0.0098
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 477 217 260 77 0 52 1 87 0 0 258 0 2 0.3548 0.0000 0.0077 3.173 0.90 5.99 -5.09 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0629 0.6790 0.2581 1 1 0.0696 0.6719 0.2585 1 1 0.0793 0.6626 0.2581
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 581 126 455 112 2 6 0 6 0 0 455 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 19.833 0.75 15.17 -14.42 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2817 0.7183 0.0000 0 0 0.8084 0.1916 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 387 193 194 164 1 23 0 5 0 0 194 0 0 0.8497 0.0000 0.0000 7.391 3.43 5.40 -1.97 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1159 0.8841 0.0000 0 0 0.9728 0.0272 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr22 38087182 A AGGTCATGGG 0.001043 0.100 1 9 2 381 190 191 79 0 17 0 94 0 0 190 0 1 0.4158 0.0000 0.0052 10.176 0.32 6.85 -6.53 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0800 0.9180 0.0020 1 1 0.0898 0.9083 0.0020 1 1 0.1039 0.8942 0.0019
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 238 118 120 98 1 11 0 8 1 0 119 0 0 0.8305 0.0083 0.0083 9.727 0.20 3.50 -3.30 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0557 0.9443 0.0000 0 0 0.6011 0.3989 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 381 145 236 0 0 6 0 139 0 0 230 0 6 0.0000 0.0000 0.0254 23.167 3.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1164 244 920 16 0 2 0 226 0 0 900 0 20 0.0656 0.0000 0.0217 121.000 0.25 9.17 -8.92 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 2 0.0000 0.3056 0.6944
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 847 367 480 255 0 6 0 106 0 0 480 0 0 0.6948 0.0000 0.0000 60.167 0.25 2.95 -2.70 75 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 696 118 578 4 0 9 2 103 0 0 569 0 9 0.0339 0.0000 0.0156 12.111 2.00 7.17 -5.17 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.8144 0.1856 2 2 0.0000 0.4873 0.5127
chr22 46363187 CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA C 0.006403 0.100 1 -27 3 203 64 139 3 0 23 0 38 0 0 129 0 10 0.0469 0.0000 0.0719 1.783 0.00 15.21 -15.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.9904 0.0096
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 381 109 272 80 2 22 1 4 0 0 271 0 1 0.7339 0.0000 0.0037 3.955 0.69 18.00 -17.31 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.4673 0.5327 0.0000 0 0 0.9062 0.0938 0.0000
833 rows