HG02330_x_HG02497_FF_10.features.tsv

File Info

Filename: HG02330_x_HG02497_FF_10.features.tsv
Full Path: s3://natera-platform-sandbox/users/tdouglas/nipt_caller/adaptive_alpha_features/6a271fed/features/HG02330_x_HG02497_FF_10.features.tsv
Size: 180.5 KB
Workflow Run: adaptive-alpha-features-6a271fed
Published: Jun 08, 2026 1:08 PM

Content

chrom	pos	ref	alt	p_pop	ff	is_indel	indel_len	hp_len	n_total	n_span	n_flank	span_strong_ref	span_weak_ref	span_mid	span_weak_alt	span_strong_alt	flank_strong_ref	flank_weak_ref	flank_mid	flank_weak_alt	flank_strong_alt	frac_span_strong_ref	frac_flank_strong_ref	frac_flank_informative	bimodality_ratio	nm_strong_ref	nm_strong_alt	nm_elevation	sr_strand_imbalance	baseline_mat_gt	baseline_fet_gt	truth_mat_gt	truth_fet_gt	status	a0.012_gm	a0.012_gf	a0.012_gf_post0	a0.012_gf_post1	a0.012_gf_post2	a0.05_gm	a0.05_gf	a0.05_gf_post0	a0.05_gf_post1	a0.05_gf_post2	a0.1_gm	a0.1_gf	a0.1_gf_post0	a0.1_gf_post1	a0.1_gf_post2
chr1	1180170	AC	A	0.000106	0.100	1	-1	2	406	97	309	51	2	4	0	40	0	0	308	0	1	0.5258	0.0000	0.0032	23.000	0.47	1.32	-0.85	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6704	0.3296	0.0000	1	0	0.6681	0.3319	0.0000	1	0	0.6645	0.3355	0.0000
chr1	1641723	TTCCTCCTCC	T	0.500000	0.100	1	-9	1	351	142	209	130	1	8	0	3	0	0	209	0	0	0.9155	0.0000	0.0000	16.750	0.50	9.67	-9.17	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.5023	0.4977	0.0000	0	0	0.9661	0.0339	0.0000	0	0	0.9882	0.0118	0.0000
chr1	1708855	TTCCTCCTCC	T	0.500000	0.100	1	-9	1	412	180	232	149	0	10	0	21	0	0	232	0	0	0.8278	0.0000	0.0000	17.000	0.74	9.14	-8.40	61	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0019	0.9981	0.0000
chr1	1752908	CCCT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	389	150	239	120	2	20	1	7	0	0	239	0	0	0.8000	0.0000	0.0000	6.500	0.33	3.14	-2.82	54	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0833	0.9167	0.0000	0	0	0.6888	0.3112	0.0000
chr1	1968667	T	TCTC	0.500000	0.100	1	3	2	291	126	165	119	0	0	0	7	0	0	164	0	1	0.9444	0.0000	0.0061	126.000	0.43	3.29	-2.86	35	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0708	0.9292	0.0000	0	0	0.6547	0.3453	0.0000
chr1	2192906	T	TTTG	0.500000	0.100	1	3	4	133	50	83	33	1	2	0	14	0	0	80	0	3	0.6600	0.0000	0.0361	24.000	0.36	2.93	-2.56	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6619	0.3153	0.0228	1	0	0.6502	0.3244	0.0255	1	0	0.6340	0.3365	0.0295
chr1	6469122	TTCC	T	0.500000	0.100	1	-3	2	813	256	557	185	2	42	0	27	0	0	557	0	0	0.7227	0.0000	0.0000	5.071	0.22	3.11	-2.89	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0003	0.9997	0.0000
chr1	11650722	C	CGCG	0.500000	0.100	1	3	1	452	91	361	35	5	7	0	44	0	0	358	0	3	0.3846	0.0000	0.0083	12.000	0.29	3.57	-3.28	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0928	0.5546	0.3525	1	1	0.0976	0.5503	0.3521	1	1	0.1041	0.5449	0.3510
chr1	11650722	CGCG	C	0.500000	0.100	1	-3	1	452	96	356	82	4	5	0	5	1	1	354	0	0	0.8542	0.0028	0.0056	18.200	1.73	3.40	-1.67	44	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0013	0.9987	0.0000	0	1	0.2828	0.7172	0.0000	0	0	0.7423	0.2577	0.0000
chr1	12879725	C	CG	0.500000	0.100	1	1	3	742	234	508	124	0	15	2	93	0	0	508	0	0	0.5299	0.0000	0.0000	14.533	0.29	2.27	-1.98	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7572	0.2406	0.0022	1	0	0.7509	0.2463	0.0028	1	0	0.7416	0.2547	0.0037
chr1	13779899	A	ACTC	0.500000	0.100	1	3	2	901	151	750	74	0	11	0	66	0	0	748	0	2	0.4901	0.0000	0.0027	12.727	0.65	3.09	-2.44	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2842	0.6293	0.0865	1	1	0.2884	0.6197	0.0919	1	1	0.2931	0.6077	0.0992
chr1	16400810	G	GCTT	0.500000	0.100	1	3	2	257	103	154	91	0	6	0	6	0	0	154	0	0	0.8835	0.0000	0.0000	16.167	0.22	4.00	-3.78	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0002	0.9998	0.0000	0	1	0.1367	0.8633	0.0000	0	0	0.6376	0.3624	0.0000
chr1	16539275	CT	C	0.500000	0.100	1	-1	2	393	51	342	8	0	1	0	42	0	0	342	0	0	0.1569	0.0000	0.0000	50.000	0.12	1.40	-1.28	6	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9975	0.0025	2	1	0.0000	0.9978	0.0022	2	1	0.0000	0.9563	0.0437
chr1	16759500	G	GC	0.500000	0.100	1	1	3	1609	316	1293	252	15	30	1	18	0	0	1293	0	0	0.7975	0.0000	0.0000	9.379	1.52	2.89	-1.37	0	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0013	0.9987	0.0000	0	0	0.6965	0.3035	0.0000
chr1	21474942	TGTCTCCCAG	T	0.500000	0.100	1	-9	1	123	53	70	6	0	0	0	47	0	0	69	0	1	0.1132	0.0000	0.0143	53.000	1.17	8.74	-7.58	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9819	0.0181	2	1	0.0000	0.8208	0.1792
chr1	26364795	CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG	C	0.500000	0.100	1	-24	1	557	132	425	86	1	2	0	43	0	0	414	0	11	0.6515	0.0000	0.0259	64.500	0.70	19.88	-19.19	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8629	0.1358	0.0013	1	0	0.8538	0.1445	0.0017	1	0	0.8406	0.1570	0.0023
chr1	27548841	AAGG	A	0.500000	0.100	1	-3	2	726	157	569	124	0	20	1	12	0	1	568	0	0	0.7898	0.0000	0.0018	6.800	0.44	2.83	-2.39	26	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0011	0.9989	0.0000	0	1	0.1342	0.8658	0.0000
chr1	30908522	GCGGCCCCGGCCCCGGCGC	G	0.500000	0.100	1	-18	2	123	61	62	37	0	6	0	18	1	0	61	0	0	0.6066	0.0161	0.0161	11.000	1.38	13.83	-12.45	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7141	0.2711	0.0148	1	0	0.7019	0.2812	0.0169	1	0	0.6848	0.2950	0.0201
chr1	31433042	A	ACAG	0.500000	0.100	1	3	1	339	126	213	66	0	7	0	53	0	0	210	0	3	0.5238	0.0000	0.0141	17.000	0.12	2.79	-2.67	24	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3973	0.5460	0.0567	1	1	0.3972	0.5417	0.0611	1	1	0.3963	0.5364	0.0673
chr1	35114681	GATA	G	0.500000	0.100	1	-3	1	818	192	626	98	0	3	0	91	0	0	624	0	2	0.5104	0.0000	0.0032	94.500	0.15	3.25	-3.10	20	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2134	0.6990	0.0877	1	1	0.2208	0.6853	0.0939	1	1	0.2299	0.6677	0.1023
chr1	45740970	CAT	C	0.500000	0.100	1	-2	1	336	94	242	91	0	2	0	1	0	0	242	0	0	0.9681	0.0000	0.0000	46.000	0.24	2.00	-1.76	57	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9160	0.0840	0.0000	0	0	0.9694	0.0306	0.0000	0	0	0.9770	0.0230	0.0000
chr1	47438996	T	TCCGCAC	0.500000	0.100	1	6	1	630	152	478	59	1	23	0	69	0	0	478	0	0	0.3882	0.0000	0.0000	5.609	1.39	5.87	-4.48	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0602	0.5655	0.3743	1	1	0.0648	0.5599	0.3753	1	1	0.0712	0.5530	0.3758
chr1	51840391	ATCT	A	0.500000	0.100	1	-3	1	266	98	168	72	2	6	0	18	0	0	168	0	0	0.7347	0.0000	0.0000	15.167	0.11	2.83	-2.72	38	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0916	0.9084	0.0000	0	1	0.0026	0.9974	0.0000	0	1	0.0004	0.9996	0.0000
chr1	52033398	CGCCCGCCACCTGAGGTCCCGCGATCGG	C	0.500000	0.100	1	-27	1	650	159	491	92	0	6	1	60	0	0	478	0	13	0.5786	0.0000	0.0265	25.500	0.16	20.68	-20.52	22	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5599	0.4243	0.0158	1	0	0.5568	0.4252	0.0180	1	0	0.5517	0.4269	0.0214
chr1	55039879	A	ACTG	0.500000	0.100	1	3	2	1028	245	783	115	2	30	3	95	0	0	781	0	2	0.4694	0.0000	0.0026	7.167	0.28	3.21	-2.93	45	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4774	0.5066	0.0160	1	1	0.4799	0.5017	0.0184	1	1	0.4818	0.4963	0.0219
chr1	55214867	G	GGCC	0.500000	0.100	1	3	4	225	87	138	70	1	9	0	7	0	0	137	0	1	0.8046	0.0000	0.0072	8.667	0.67	3.29	-2.61	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0069	0.9931	0.0000	0	1	0.1559	0.8441	0.0000
chr1	76868607	G	GCAGCAA	0.500000	0.100	1	6	1	275	94	181	75	3	7	0	9	0	0	181	0	0	0.7979	0.0000	0.0000	12.429	0.49	4.33	-3.84	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0033	0.9967	0.0000	0	1	0.1178	0.8822	0.0000
chr1	77558660	C	CTAT	0.500000	0.100	1	3	1	148	79	69	39	0	2	0	38	0	0	69	0	0	0.4937	0.0000	0.0000	38.500	0.51	3.63	-3.12	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2241	0.5921	0.1838	1	1	0.2271	0.5853	0.1877	1	1	0.2307	0.5767	0.1926
chr1	84574315	C	CGCAGCGCCA	0.500000	0.100	1	9	2	468	201	267	146	0	46	1	8	0	0	266	0	1	0.7264	0.0000	0.0037	3.370	0.69	8.00	-7.31	36	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0534	0.9466	0.0000	0	0	0.7075	0.2925	0.0000
chr1	84574315	CGCAGCGCCA	C	0.500000	0.100	1	-9	2	468	211	257	164	1	37	0	9	0	0	257	0	0	0.7773	0.0000	0.0000	4.703	0.57	9.00	-8.43	36	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2072	0.7928	0.0000	0	0	0.9029	0.0971	0.0000
chr1	86580213	TCCTACA	T	0.500000	0.100	1	-6	1	472	149	323	83	1	8	0	57	0	0	321	0	2	0.5570	0.0000	0.0062	17.625	0.20	4.86	-4.65	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7432	0.2515	0.0052	1	0	0.7343	0.2594	0.0063	1	0	0.7216	0.2705	0.0079
chr1	92074651	C	CCAT	0.500000	0.100	1	3	1	601	97	504	73	4	16	0	4	0	0	503	0	1	0.7526	0.0000	0.0020	5.062	0.99	3.75	-2.76	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0008	0.9992	0.0000	0	1	0.1857	0.8143	0.0000	0	0	0.6286	0.3714	0.0000
chr1	92182085	CCTT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	750	179	571	170	0	3	0	6	0	0	571	0	0	0.9497	0.0000	0.0000	58.667	0.46	3.17	-2.71	50	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0093	0.9907	0.0000	0	0	0.8911	0.1089	0.0000	0	0	0.9879	0.0121	0.0000
chr1	100152449	CTCT	C	0.500000	0.100	1	-3	2	137	54	83	21	0	4	0	29	0	0	82	0	1	0.3889	0.0000	0.0120	12.500	0.38	3.14	-2.76	7	0/1	1/1	.	.	OK	1	1	0.0756	0.4740	0.4504	1	1	0.0800	0.4753	0.4447	1	1	0.0861	0.4771	0.4368
chr1	108922543	ACTT	A	0.500000	0.100	1	-3	2	174	75	99	42	0	2	1	30	0	0	98	0	1	0.5600	0.0000	0.0101	36.500	0.02	3.57	-3.54	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4585	0.4804	0.0611	1	1	0.4537	0.4809	0.0653	1	1	0.4469	0.4818	0.0713
chr1	109250113	A	ACGC	0.500000	0.100	1	3	2	428	120	308	4	1	14	1	100	0	0	304	0	4	0.0333	0.0000	0.0130	7.571	0.00	3.16	-3.16	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9838	0.0162	2	2	0.0000	0.3700	0.6300	2	2	0.0000	0.1016	0.8984
chr1	111319160	A	ATGCCCCTCAGGAAG	0.500000	0.100	1	14	3	415	113	302	65	0	14	0	34	0	0	291	0	11	0.5752	0.0000	0.0364	7.071	1.31	10.35	-9.05	23	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6705	0.3168	0.0127	1	0	0.6615	0.3239	0.0146	1	0	0.6487	0.3338	0.0176
chr1	111414879	CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG	C	0.500000	0.100	1	-24	3	796	153	643	0	0	11	4	138	0	0	639	0	4	0.0000	0.0000	0.0062	12.909		10.99		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0006	0.9994	2	2	0.0000	0.0007	0.9993	2	2	0.0000	0.0008	0.9992
chr1	111414925	GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA	G	0.500000	0.100	1	-45	4	816	185	631	102	12	2	6	63	0	0	631	0	0	0.5514	0.0000	0.0000	91.000	11.88	4.00	7.88	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9411	0.0587	0.0002	1	0	0.9352	0.0646	0.0002	1	0	0.9263	0.0734	0.0003
chr1	116579663	G	GTCC	0.500000	0.100	1	3	1	624	177	447	3	10	35	15	114	0	0	447	0	0	0.0169	0.0000	0.0000	4.600	1.00	3.53	-2.53	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9527	0.0473	2	1	0.0000	0.5194	0.4806
chr1	120436638	AAG	A	0.500000	0.100	1	-2	3	324	119	205	2	43	12	0	62	0	0	205	0	0	0.0168	0.0000	0.0000	6.500	1.50	2.05	-0.55	2	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0048	0.1954	0.7998	1	2	0.0058	0.2055	0.7886	1	2	0.0074	0.2198	0.7728
chr1	150226707	CTCCTCT	C	0.500000	0.100	1	-6	2	202	84	118	67	0	5	0	12	0	0	118	0	0	0.7976	0.0000	0.0000	15.800	0.64	6.00	-5.36	39	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0115	0.9885	0.0000
chr1	152156589	GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA	G	0.500000	0.100	1	-36	1	1191	263	928	149	0	38	0	76	0	0	920	0	8	0.5665	0.0000	0.0086	5.921	0.53	4.75	-4.22	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9900	0.0100	0.0000	1	0	0.9883	0.0117	0.0000	1	0	0.9855	0.0145	0.0000
chr1	152223252	AT	A	0.500000	0.100	1	-1	1	254	96	158	1	0	14	7	74	0	0	158	0	0	0.0104	0.0000	0.0000	5.357	4.00	1.57	2.43	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1282	0.8718	2	2	0.0000	0.0496	0.9504	2	2	0.0000	0.0371	0.9629
chr1	152515515	G	GGGCTGCTGCGGCGACTCA	0.500000	0.100	1	18	4	221	79	142	53	0	23	0	3	0	0	142	0	0	0.6709	0.0000	0.0000	2.435	0.72	6.67	-5.95	15	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0186	0.9814	0.0000	0	1	0.3665	0.6335	0.0000	0	0	0.6562	0.3438	0.0000
chr1	152709204	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	0.500000	0.100	1	18	2	232	75	157	3	0	3	0	69	0	0	140	0	17	0.0400	0.0000	0.1083	24.000	0.00	10.20	-10.20	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9076	0.0924	2	2	0.0000	0.2495	0.7505	2	2	0.0000	0.0955	0.9045
chr1	152776532	C	CCAGCTCTGGGGGCTGCTG	0.500000	0.100	1	18	1	791	236	555	115	1	64	0	56	0	0	537	0	18	0.4873	0.0000	0.0324	2.688	0.41	10.43	-10.02	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9265	0.0733	0.0002	1	0	0.9200	0.0796	0.0003	1	0	0.9104	0.0891	0.0005
chr1	152985344	GGAGCCCTGCCACCCCAAGGTGCCT	G	0.500000	0.100	1	-24	2	509	225	284	189	3	24	0	9	0	0	284	0	0	0.8400	0.0000	0.0000	8.375	1.78	19.78	-18.00	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	0.5017	0.4983	0.0000	0	0	0.9718	0.0282	0.0000
chr1	153261012	C	CGGCGGT	0.500000	0.100	1	6	2	716	187	529	87	1	26	2	71	0	0	521	0	8	0.4652	0.0000	0.0151	6.667	1.44	5.69	-4.25	65	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2903	0.6419	0.0679	1	1	0.2955	0.6314	0.0731	1	1	0.3016	0.6181	0.0803
chr1	153261515	A	ACTCTGGCGGCGG	0.500000	0.100	1	12	1	1201	301	900	12	0	62	3	224	1	1	840	3	55	0.0399	0.0011	0.0667	3.885	2.42	10.46	-8.05	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.5560	0.4440	2	2	0.0000	0.0066	0.9934
chr1	153934802	CCTGCTGCTG	C	0.500000	0.100	1	-9	1	549	240	309	211	2	18	1	8	0	0	309	0	0	0.8792	0.0000	0.0000	13.812	0.43	8.50	-8.07	49	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	0	0.7381	0.2619	0.0000	0	0	0.9893	0.0107	0.0000
chr1	156384556	T	TCC	0.500000	0.100	1	2	1	215	79	136	67	1	4	0	7	0	0	136	0	0	0.8481	0.0000	0.0000	18.750	1.64	2.29	-0.64	45	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0170	0.9830	0.0000	0	1	0.2319	0.7681	0.0000
chr1	156595257	A	AAC	0.500000	0.100	1	2	4	777	228	549	0	0	4	0	224	0	0	547	0	2	0.0000	0.0000	0.0036	56.000		2.31		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr1	158563508	C	CA	0.500000	0.100	1	1	1	457	120	337	106	0	11	0	3	0	0	337	0	0	0.8833	0.0000	0.0000	9.909	0.48	2.33	-1.85	54	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2381	0.7619	0.0000	0	0	0.8919	0.1081	0.0000	0	0	0.9615	0.0385	0.0000
chr1	159432794	G	GT	0.500000	0.100	1	1	1	1745	370	1375	0	0	8	0	362	0	0	1371	0	4	0.0000	0.0000	0.0029	45.250		1.48		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr1	171193412	T	TGAC	0.500000	0.100	1	3	1	142	66	76	44	0	0	0	22	0	0	75	0	1	0.6667	0.0000	0.0132	66.000	0.16	4.09	-3.93	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7342	0.2544	0.0114	1	0	0.7222	0.2646	0.0132	1	0	0.7055	0.2785	0.0159
chr1	171196663	TG	T	0.500000	0.100	1	-1	1	174	57	117	31	0	0	0	26	0	0	117	0	0	0.5439	0.0000	0.0000	57.000	0.16	1.27	-1.11	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3356	0.5401	0.1242	1	1	0.3344	0.5370	0.1286	1	1	0.3324	0.5331	0.1345
chr1	179534757	AGAG	A	0.500000	0.100	1	-3	1	191	78	113	68	0	5	0	5	0	0	113	0	0	0.8718	0.0000	0.0000	14.600	0.35	3.20	-2.85	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0005	0.9995	0.0000	0	1	0.1271	0.8729	0.0000	0	0	0.5226	0.4774	0.0000
chr1	179534890	AAAG	A	0.500000	0.100	1	-3	4	186	60	126	25	1	8	1	25	0	0	125	0	1	0.4167	0.0000	0.0079	6.375	0.24	4.72	-4.48	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1934	0.5625	0.2441	1	1	0.1965	0.5578	0.2458	1	1	0.2004	0.5519	0.2477
chr1	209432291	T	TAGCAGC	0.500000	0.100	1	6	1	501	227	274	97	0	55	0	75	0	0	273	0	1	0.4273	0.0000	0.0036	3.185	0.90	5.79	-4.89	65	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6184	0.3714	0.0102	1	0	0.6139	0.3743	0.0119	1	0	0.6068	0.3788	0.0145
chr1	209432291	TAGC	T	0.500000	0.100	1	-3	1	501	232	269	163	9	41	0	19	0	0	269	0	0	0.7026	0.0000	0.0000	4.659	2.79	3.11	-0.32	91	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0208	0.9792	0.0000
chr1	225519331	ATCCAGGCGTTCCTGCCGC	A	0.500000	0.100	1	-18	1	479	143	336	54	0	54	0	35	0	0	332	0	4	0.3776	0.0000	0.0119	1.648	0.31	13.06	-12.74	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5667	0.4043	0.0290	1	0	0.5595	0.4085	0.0321	1	0	0.5492	0.4141	0.0366
chr1	226737174	ACTGCCGCTG	A	0.500000	0.100	1	-9	1	620	127	493	9	0	8	1	109	0	0	487	0	6	0.0709	0.0000	0.0122	14.875	0.89	8.86	-7.97	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9779	0.0221	2	1	0.0000	0.5367	0.4633
chr1	228409077	A	AC	0.500000	0.100	1	1	2	567	129	438	114	1	6	0	8	0	0	438	0	0	0.8837	0.0000	0.0000	20.333	0.36	1.12	-0.77	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0614	0.9386	0.0000	0	0	0.6126	0.3874	0.0000
chr1	236736599	TC	T	0.500000	0.100	1	-1	1	246	120	126	77	0	5	0	38	0	0	126	0	0	0.6417	0.0000	0.0000	23.000	0.17	1.08	-0.91	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9310	0.0686	0.0004	1	0	0.9237	0.0757	0.0005	1	0	0.9128	0.0864	0.0008
chr1	240092268	GGGC	G	0.500000	0.100	1	-3	5	621	168	453	0	0	18	1	149	0	0	451	1	1	0.0000	0.0000	0.0044	8.333		3.42		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0004	0.9996	2	2	0.0000	0.0005	0.9995	2	2	0.0000	0.0006	0.9994
chr1	240092723	T	TGCA	0.500000	0.100	1	3	2	722	159	563	109	9	34	0	7	0	0	563	0	0	0.6855	0.0000	0.0000	3.647	0.38	3.43	-3.05	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.1729	0.8271	0.0000	0	0	0.7733	0.2267	0.0000
chr1	247815239	AAGG	A	0.500000	0.100	1	-3	1	723	217	506	110	1	6	0	100	0	0	506	0	0	0.5069	0.0000	0.0000	35.167	1.00	3.18	-2.18	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3327	0.6297	0.0376	1	1	0.3392	0.6191	0.0417	1	1	0.3465	0.6059	0.0476
chr1	248361985	CTACG	C	0.500000	0.100	1	-4	2	1304	332	972	193	0	8	0	131	0	0	959	0	13	0.5813	0.0000	0.0134	40.500	0.34	6.65	-6.31	13	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9248	0.0751	0.0001	1	0	0.9204	0.0796	0.0001	1	0	0.9135	0.0864	0.0001
chr1	248362336	CA	C	0.500000	0.100	1	-1	1	1115	266	849	141	0	2	1	122	0	0	848	0	1	0.5301	0.0000	0.0012	132.000	2.72	1.30	1.42	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4136	0.5718	0.0147	1	1	0.4207	0.5623	0.0170	1	1	0.4285	0.5509	0.0205
chr1	248441153	CAT	C	0.500000	0.100	1	-2	1	804	303	501	283	0	9	0	11	0	0	501	0	0	0.9340	0.0000	0.0000	32.667	0.68	5.09	-4.41	205	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	0.9187	0.0813	0.0000	0	0	0.9987	0.0013	0.0000
chr1	248441258	T	TTC	0.500000	0.100	1	2	1	947	73	874	6	0	10	2	55	0	0	862	0	12	0.0822	0.0000	0.0137	6.300	3.17	2.36	0.80	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9498	0.0502	2	1	0.0000	0.6230	0.3770
chr1	248442053	C	CT	0.500000	0.100	1	1	2	1138	349	789	238	0	8	0	103	0	0	789	0	0	0.6819	0.0000	0.0000	42.625	1.49	4.31	-2.82	86	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr1	248473493	C	CCCTCCTCAT	0.500000	0.100	1	9	1	677	112	565	66	1	12	0	33	0	0	562	0	3	0.5893	0.0000	0.0053	8.333	0.53	8.42	-7.89	38	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8653	0.1328	0.0019	1	0	0.8554	0.1423	0.0023	1	0	0.8410	0.1559	0.0031
chr1	248638643	TCAGCACG	T	0.500000	0.100	1	-7	1	512	218	294	14	0	12	0	192	0	0	289	0	5	0.0642	0.0000	0.0170	17.167	1.00	6.75	-5.75	8	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9937	0.0063	2	2	0.0000	0.3604	0.6396
chr1	248650349	CAGA	C	0.500000	0.100	1	-3	1	1648	356	1292	321	0	10	0	25	0	0	1292	0	0	0.9017	0.0000	0.0000	34.600	0.41	3.76	-3.35	57	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.3852	0.6148	0.0000
chr2	1942998	TTCC	T	0.015778	0.100	1	-3	1	350	57	293	45	0	8	0	4	0	0	293	0	0	0.7895	0.0000	0.0000	6.125	0.51	3.25	-2.74	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0787	0.9213	0.0000	0	0	0.8931	0.1069	0.0000	0	0	0.9770	0.0230	0.0000
chr2	3701561	GGAA	G	0.417063	0.100	1	-3	1	243	113	130	103	0	6	0	4	0	0	130	0	0	0.9115	0.0000	0.0000	17.833	0.13	4.00	-3.87	35	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0354	0.9646	0.0000	0	0	0.7722	0.2278	0.0000	0	0	0.9408	0.0592	0.0000
chr2	20667362	G	GGGCGGCGGC	0.698820	0.100	1	9	5	437	152	285	0	1	21	2	128	0	0	273	0	12	0.0000	0.0000	0.0421	6.238		8.62		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0025	0.9975	2	2	0.0000	0.0010	0.9990	2	2	0.0000	0.0008	0.9992
chr2	20667362	G	GGGCGGCGGCGGCGGCGGC	0.159429	0.100	1	18	5	437	152	285	9	8	113	2	20	0	1	273	0	11	0.0592	0.0000	0.0421	0.309	5.89	6.40	-0.51	1	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0139	0.3465	0.6396	1	2	0.0138	0.4715	0.5147	2	1	0.0066	0.8062	0.1872
chr2	25161587	C	CGCCGCTGCT	0.060759	0.100	1	9	1	642	155	487	64	0	20	0	71	0	0	482	0	5	0.4129	0.0000	0.0103	6.750	0.48	7.45	-6.97	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1156	0.8036	0.0807	1	1	0.1260	0.7938	0.0802	1	1	0.1404	0.7803	0.0792
chr2	26254257	G	GACT	0.500000	0.100	1	3	1	217	55	162	0	0	2	0	53	0	0	161	0	1	0.0000	0.0000	0.0062	26.500		3.17		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0599	0.9401	2	2	0.0000	0.0632	0.9368	2	2	0.0000	0.0678	0.9322
chr2	26453335	CAGGCGAGCATGGAGA	C	0.500000	0.100	1	-15	1	252	109	143	75	0	5	0	29	0	0	140	0	3	0.6881	0.0000	0.0210	20.800	0.21	14.72	-14.51	57	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9544	0.0455	0.0002	1	0	0.9485	0.0512	0.0003	1	0	0.9397	0.0599	0.0004
chr2	27581795	CCATCACAGTCCCTCTGAGAGAAGA	C	0.500000	0.100	1	-24	1	1312	338	974	166	10	43	6	113	32	30	901	7	4	0.4911	0.0329	0.0749	6.698	1.57	4.58	-3.02	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9997	0.0003	0.0000	1	0	0.9996	0.0004	0.0000	1	0	0.9995	0.0005	0.0000
chr2	29065060	C	CGCT	0.500000	0.100	1	3	1	746	153	593	72	0	17	1	63	0	0	588	0	5	0.4706	0.0000	0.0084	7.941	0.26	3.16	-2.89	36	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2256	0.6548	0.1196	1	1	0.2309	0.6437	0.1254	1	1	0.2373	0.6296	0.1331
chr2	39769817	ATTC	A	0.500000	0.100	1	-3	3	446	113	333	57	0	9	1	46	0	0	331	0	2	0.5044	0.0000	0.0060	11.444	0.37	3.17	-2.81	35	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3723	0.5545	0.0732	1	1	0.3721	0.5499	0.0780	1	1	0.3713	0.5443	0.0845
chr2	50346870	GCGCCGCCGCCGCCGC	G	0.500000	0.100	1	-15	1	305	120	185	102	0	15	0	3	1	0	184	0	0	0.8500	0.0054	0.0054	7.000	1.01	15.00	-13.99	26	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1926	0.8074	0.0000	0	0	0.8739	0.1261	0.0000	0	0	0.9552	0.0448	0.0000
chr2	54255566	GGGGCCC	G	0.500000	0.100	1	-6	1	661	88	573	18	1	12	1	56	4	0	566	0	3	0.2045	0.0070	0.0122	6.909	3.22	6.45	-3.22	10	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0006	0.0694	0.9300	1	2	0.0008	0.0771	0.9222	1	2	0.0011	0.0920	0.9069
chr2	65071512	GAAC	G	0.500000	0.100	1	-3	1	716	192	524	15	0	10	0	167	0	0	520	0	4	0.0781	0.0000	0.0076	20.222	0.20	3.24	-3.04	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9994	0.0006	2	1	0.0000	0.7950	0.2050
chr2	69514621	CTGT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	457	203	254	101	2	11	0	89	0	0	251	0	3	0.4975	0.0000	0.0118	17.273	0.52	3.27	-2.74	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3404	0.6179	0.0417	1	1	0.3459	0.6082	0.0459	1	1	0.3519	0.5961	0.0520
chr2	72956998	CT	C	0.500000	0.100	1	-1	4	491	191	300	180	0	0	0	11	0	0	300	0	0	0.9424	0.0000	0.0000	191.000	0.13	1.45	-1.32	62	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0622	0.9378	0.0000	0	0	0.8425	0.1575	0.0000
chr2	73385903	TGGA	T	0.500000	0.100	1	-3	1	705	180	525	0	7	43	122	8	0	0	517	8	0	0.0000	0.0000	0.0152	3.095		2.75		0	0/0	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0098	0.9902	2	2	0.0000	0.0056	0.9944	2	2	0.0000	0.0045	0.9955
chr2	73385903	TGGAGGA	T	0.500000	0.100	1	-6	1	705	181	524	0	3	46	2	130	0	0	515	1	8	0.0000	0.0000	0.0172	2.891		6.20		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0078	0.9922	2	2	0.0000	0.0032	0.9968	2	2	0.0000	0.0026	0.9974
chr2	73448097	TCTC	T	0.500000	0.100	1	-3	2	483	105	378	12	0	6	0	87	0	0	376	0	2	0.1143	0.0000	0.0053	16.500	0.25	3.14	-2.89	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9998	0.0002	2	1	0.0000	0.9671	0.0329
chr2	74415138	A	ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC	0.500000	0.100	1	24	2	931	194	737	94	0	36	1	63	1	0	700	0	36	0.4845	0.0014	0.0502	4.389	0.56	10.92	-10.36	20	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0817	0.6981	0.2201	1	1	0.0878	0.6845	0.2277	1	1	0.0961	0.6670	0.2369
chr2	85133705	GGGC	G	0.500000	0.100	1	-3	5	389	145	244	63	2	9	2	69	0	0	243	0	1	0.4345	0.0000	0.0041	15.111	1.05	3.48	-2.43	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0768	0.6082	0.3150	1	1	0.0819	0.6000	0.3181	1	1	0.0889	0.5896	0.3214
chr2	88627211	CCAG	C	0.500000	0.100	1	-3	4	708	190	518	7	0	24	3	156	0	0	516	1	1	0.0368	0.0000	0.0039	6.917	0.29	3.29	-3.00	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9994	0.0006	2	2	0.0000	0.3568	0.6432	2	2	0.0000	0.0349	0.9651
chr2	96115238	CTCCTCCTCT	C	0.500000	0.100	1	-9	2	752	210	542	110	0	9	0	91	0	0	542	0	0	0.5238	0.0000	0.0000	22.333	0.54	8.33	-7.79	36	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5440	0.4435	0.0126	1	0	0.5433	0.4421	0.0145	1	0	0.5412	0.4413	0.0175
chr2	110995965	GGTTCTTCAGCGGGGTTTGGTGGCCAGAATTTATTATAAGGTAAAGATACACTGT	G	0.500000	0.100	1	-54	3	191	102	89	76	0	1	0	25	0	0	84	0	5	0.7451	0.0000	0.0562	101.000	0.42	26.00	-25.58	20	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9659	0.0340	0.0001	1	0	0.9610	0.0388	0.0001	1	0	0.9534	0.0464	0.0002
chr2	112074958	CAAT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	109	40	69	24	0	0	0	16	0	0	69	0	0	0.6000	0.0000	0.0000	40.000	0.42	2.62	-2.21	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4337	0.4775	0.0888	1	1	0.4280	0.4788	0.0932	1	1	0.4203	0.4805	0.0992
chr2	119437075	A	AGTGTGC	0.500000	0.100	1	6	1	566	136	430	0	0	0	1	135	0	0	419	0	11	0.0000	0.0000	0.0256	135.000		6.33		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0006	0.9994	2	2	0.0000	0.0007	0.9993	2	2	0.0000	0.0008	0.9992
chr2	130372355	AGACGGG	A	0.500000	0.100	1	-6	1	330	119	211	0	0	24	0	95	0	0	204	0	7	0.0000	0.0000	0.0332	4.130		6.47		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0057	0.9943	2	2	0.0000	0.0063	0.9937	2	2	0.0000	0.0072	0.9928
chr2	131492343	AC	A	0.500000	0.100	1	-1	1	826	241	585	118	1	9	2	111	1	1	580	0	3	0.4896	0.0017	0.0085	25.556	0.57	1.54	-0.97	26	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1861	0.7408	0.0731	1	1	0.1953	0.7251	0.0795	1	1	0.2069	0.7047	0.0883
chr2	151379531	TA	T	0.500000	0.100	1	-1	1	191	45	146	6	1	8	9	21	0	1	144	0	1	0.1333	0.0000	0.0137	3.375	1.33	1.90	-0.57	4	0/1	1/1	.	.	OK	2	1	0.0019	0.8517	0.1464	2	1	0.0007	0.9463	0.0529	2	1	0.0003	0.9231	0.0766
chr2	159987235	GC	G	0.500000	0.100	1	-1	1	240	92	148	88	1	0	0	3	0	0	147	0	1	0.9565	0.0000	0.0068	92.000	0.23	2.00	-1.77	2	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0141	0.9859	0.0000	0	0	0.5513	0.4487	0.0000	0	0	0.8530	0.1470	0.0000
chr2	165176265	CATT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	313	115	198	110	0	3	0	2	0	0	198	0	0	0.9565	0.0000	0.0000	37.333	0.17	3.00	-2.83	28	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7617	0.2383	0.0000	0	0	0.9666	0.0334	0.0000	0	0	0.9829	0.0171	0.0000
chr2	168247286	C	CGCCGGG	0.500000	0.100	1	6	2	197	85	112	46	0	17	0	22	0	0	110	0	2	0.5412	0.0000	0.0179	4.000	1.35	4.95	-3.61	0	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7512	0.2392	0.0096	1	0	0.7393	0.2496	0.0112	1	0	0.7226	0.2638	0.0136
chr2	176130574	G	GCGCACC	0.500000	0.100	1	6	1	405	83	322	34	0	8	2	39	0	0	322	0	0	0.4096	0.0000	0.0000	9.250	1.06	5.31	-4.25	0	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0952	0.5386	0.3662	1	1	0.0999	0.5354	0.3647	1	1	0.1063	0.5315	0.3622
chr2	178451007	GGC	G	0.500000	0.100	1	-2	1	918	305	613	202	2	6	0	95	0	0	613	0	0	0.6623	0.0000	0.0000	49.667	0.67	4.17	-3.50	100	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.9998	0.0002	0.0000	1	0	0.9998	0.0002	0.0000	1	0	0.9996	0.0004	0.0000
chr2	178650214	TTTTCCTCTTCAGGAGCAA	T	0.500000	0.100	1	-18	1	361	106	255	89	1	13	0	3	0	0	255	0	0	0.8396	0.0000	0.0000	7.154	0.13	18.33	-18.20	15	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1110	0.8890	0.0000	0	0	0.7860	0.2140	0.0000	0	0	0.9200	0.0800	0.0000
chr2	184937484	C	CACA	0.500000	0.100	1	3	2	712	143	569	74	0	4	0	65	0	0	563	0	6	0.5175	0.0000	0.0105	34.750	0.27	3.88	-3.61	0	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2185	0.6610	0.1205	1	1	0.2240	0.6495	0.1265	1	1	0.2308	0.6349	0.1343
chr2	186694320	G	GCAA	0.500000	0.100	1	3	1	304	122	182	61	2	16	0	43	0	0	182	0	0	0.5000	0.0000	0.0000	6.562	0.25	3.47	-3.22	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6690	0.3176	0.0134	1	0	0.6598	0.3249	0.0154	1	0	0.6467	0.3349	0.0184
chr2	189805813	T	TA	0.500000	0.100	1	1	3	216	62	154	44	6	6	0	6	0	0	154	0	0	0.7097	0.0000	0.0000	10.200	0.30	2.67	-2.37	14	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0191	0.9809	0.0000	0	1	0.1824	0.8176	0.0000
chr2	199819526	T	TA	0.500000	0.100	1	1	3	508	102	406	39	19	12	8	24	0	0	403	1	2	0.3824	0.0000	0.0074	6.167	0.85	2.17	-1.32	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7212	0.2679	0.0109	1	0	0.7102	0.2772	0.0126	1	0	0.6947	0.2901	0.0152
chr2	202635418	A	AGGC	0.500000	0.100	1	3	1	477	132	345	39	1	41	10	41	0	0	342	2	1	0.2955	0.0000	0.0087	2.342	1.33	6.00	-4.67	1	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0328	0.4205	0.5467	1	2	0.0361	0.4239	0.5400	1	2	0.0409	0.4285	0.5306
chr2	202635418	A	AGGCGGC	0.500000	0.100	1	6	1	477	132	345	40	1	42	2	47	0	0	342	1	2	0.3030	0.0000	0.0087	2.095	1.30	5.68	-4.38	0	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0496	0.4803	0.4700	1	1	0.0537	0.4805	0.4659	1	1	0.0594	0.4809	0.4597
chr2	210556728	A	ATCT	0.500000	0.100	1	3	1	315	121	194	50	1	5	0	65	0	0	194	0	0	0.4132	0.0000	0.0000	23.000	0.12	3.12	-3.00	2	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0304	0.4454	0.5242	1	2	0.0337	0.4468	0.5196	1	2	0.0384	0.4490	0.5126
chr2	216633567	C	CGCCGCTGCT	0.500000	0.100	1	9	2	554	163	391	67	1	21	0	74	0	1	389	0	1	0.4110	0.0000	0.0051	6.714	0.57	8.57	-8.00	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0838	0.6283	0.2879	1	1	0.0892	0.6188	0.2920	1	1	0.0965	0.6068	0.2967
chr2	217848163	G	GGCTGCT	0.500000	0.100	1	6	1	802	171	631	75	1	30	2	63	0	1	617	0	13	0.4386	0.0000	0.0222	4.667	2.69	6.75	-4.05	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1419	0.6792	0.1789	1	1	0.1482	0.6667	0.1851	1	1	0.1563	0.6507	0.1930
chr2	230996317	TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA	T	0.500000	0.100	1	-27	1	609	202	407	122	0	8	1	71	0	0	381	0	26	0.6040	0.0000	0.0639	24.125	0.43	16.41	-15.97	18	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6479	0.3467	0.0054	1	0	0.6447	0.3489	0.0064	1	0	0.6392	0.3527	0.0082
chr2	232847516	CACA	C	0.500000	0.100	1	-3	2	349	158	191	74	1	3	1	79	0	0	189	0	2	0.4684	0.0000	0.0105	51.667	2.74	4.19	-1.45	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0732	0.6332	0.2937	1	1	0.0784	0.6233	0.2983	1	1	0.0857	0.6107	0.3036
chr2	240757423	ATCC	A	0.500000	0.100	1	-3	1	382	102	280	0	2	22	5	73	0	0	279	0	1	0.0000	0.0000	0.0036	3.591		3.27		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0846	0.9154	2	2	0.0000	0.0550	0.9450	2	2	0.0000	0.0448	0.9552
chr2	241094358	A	ACGGAGTCAC	0.500000	0.100	1	9	2	558	244	314	134	0	19	0	91	0	0	303	0	11	0.5492	0.0000	0.0350	11.842	0.25	8.65	-8.40	38	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7883	0.2103	0.0014	1	0	0.7821	0.2161	0.0018	1	0	0.7728	0.2248	0.0024
chr2	241096075	CATT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	579	155	424	82	1	3	2	67	0	0	424	0	0	0.5290	0.0000	0.0000	50.667	0.82	7.64	-6.82	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4729	0.4976	0.0295	1	1	0.4720	0.4953	0.0328	1	1	0.4697	0.4928	0.0375
chr2	241096109	GTCATCC	G	0.500000	0.100	1	-6	1	602	170	432	80	1	8	1	80	0	0	432	0	0	0.4706	0.0000	0.0000	20.250	1.09	7.51	-6.43	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1555	0.6888	0.1558	1	1	0.1620	0.6757	0.1623	1	1	0.1704	0.6590	0.1707
chr2	241223950	TCA	T	0.500000	0.100	1	-2	1	444	122	322	61	0	0	1	60	0	0	321	0	1	0.5000	0.0000	0.0031	122.000	0.64	2.43	-1.79	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1605	0.6453	0.1942	1	1	0.1659	0.6348	0.1993	1	1	0.1729	0.6215	0.2056
chr3	9810375	C	CGAT	0.880171	0.100	1	3	1	828	236	592	0	0	5	0	231	0	0	585	0	7	0.0000	0.0000	0.0118	46.200		3.54		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr3	12004751	C	CGCCCGCGCCGCA	0.186893	0.100	1	12	2	812	203	609	101	0	26	1	75	0	0	590	1	18	0.4975	0.0000	0.0312	6.808	0.38	11.11	-10.73	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3574	0.6187	0.0239	1	1	0.3678	0.6064	0.0258	1	1	0.3805	0.5910	0.0284
chr3	27721936	G	GCGGCGC	0.500000	0.100	1	6	2	478	100	378	92	3	1	1	3	0	0	378	0	0	0.9200	0.0000	0.0000	99.000	0.86	5.33	-4.47	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0952	0.9048	0.0000	0	0	0.7680	0.2320	0.0000	0	0	0.9169	0.0831	0.0000
chr3	40462027	GTAC	G	0.500000	0.100	1	-3	3	581	226	355	113	83	11	0	19	0	2	353	0	0	0.5000	0.0000	0.0056	23.889	2.06	2.74	-0.67	25	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0531	0.9469	0.0000
chr3	40462029	ACTGCTGCTG	A	0.500000	0.100	1	-9	1	581	228	353	111	0	30	0	87	0	0	344	0	9	0.4868	0.0000	0.0255	6.600	2.55	9.08	-6.53	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4350	0.5428	0.0222	1	1	0.4384	0.5365	0.0251	1	1	0.4415	0.5291	0.0294
chr3	42210085	C	CGGA	0.500000	0.100	1	3	1	696	232	464	11	1	39	6	175	0	0	457	0	7	0.0474	0.0000	0.0151	4.949	0.00	3.02	-3.02	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9664	0.0336	2	2	0.0000	0.1931	0.8069
chr3	42210085	C	CGGAGGA	0.500000	0.100	1	6	1	696	232	464	15	0	193	5	19	0	0	458	4	2	0.0647	0.0000	0.0129	0.183	0.80	3.26	-2.46	1	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0183	0.2782	0.7035	1	2	0.0207	0.2887	0.6906	1	2	0.0242	0.3052	0.6706
chr3	44499299	TTC	T	0.500000	0.100	1	-2	5	860	231	629	0	0	11	1	219	0	0	619	0	10	0.0000	0.0000	0.0159	20.000		2.28		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr3	46459794	C	CCTT	0.500000	0.100	1	3	1	282	120	162	0	0	1	0	119	0	0	162	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	119.000		4.59		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0023	0.9977	2	2	0.0000	0.0026	0.9974	2	2	0.0000	0.0031	0.9969
chr3	46709583	TAAG	T	0.500000	0.100	1	-3	1	642	161	481	0	1	14	18	128	0	0	481	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	10.429		3.52		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0007	0.9993	2	2	0.0000	0.0008	0.9992	2	2	0.0000	0.0009	0.9991
chr3	49358240	GGCC	G	0.500000	0.100	1	-3	3	405	115	290	42	2	21	1	49	0	0	290	0	0	0.3652	0.0000	0.0000	4.476	0.33	3.73	-3.40	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0984	0.5713	0.3303	1	1	0.1033	0.5658	0.3309	1	1	0.1100	0.5589	0.3311
chr3	49358240	GGCCGCC	G	0.500000	0.100	1	-6	3	405	116	289	48	0	64	3	1	0	0	289	0	0	0.4138	0.0000	0.0000	0.806	0.40	6.00	-5.60	16	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2109	0.7891	0.0000	0	0	0.6112	0.3888	0.0000	0	0	0.7589	0.2411	0.0000
chr3	51993837	TCCTTGG	T	0.500000	0.100	1	-6	1	497	168	329	139	1	24	0	4	0	0	329	0	0	0.8274	0.0000	0.0000	6.000	0.22	6.75	-6.53	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1474	0.8526	0.0000	0	0	0.9390	0.0610	0.0000	0	0	0.9856	0.0144	0.0000
chr3	56557250	T	TGGGGTAAGCA	0.500000	0.100	1	10	2	171	91	80	8	0	7	0	76	0	0	76	0	4	0.0879	0.0000	0.0500	12.000	0.00	8.20	-8.20	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9893	0.0107	2	1	0.0000	0.7778	0.2222
chr3	56616023	A	ACTT	0.500000	0.100	1	3	1	253	94	159	0	0	3	50	41	0	0	156	1	2	0.0000	0.0000	0.0189	29.667		3.12		0	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0089	0.9911	2	2	0.0000	0.0098	0.9902	2	2	0.0000	0.0112	0.9888
chr3	56616026	T	TCTC	0.500000	0.100	1	3	2	252	98	154	1	1	2	39	55	0	0	153	0	1	0.0102	0.0000	0.0065	48.000	1.00	4.07	-3.07	1	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.3246	0.6754	2	2	0.0000	0.0688	0.9312	2	2	0.0000	0.0370	0.9630
chr3	63912697	G	GCCC	0.500000	0.100	1	3	1	270	59	211	31	0	0	1	27	0	0	211	0	0	0.5254	0.0000	0.0000	58.000	1.23	3.89	-2.66	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2882	0.5592	0.1526	1	1	0.2887	0.5547	0.1566	1	1	0.2890	0.5491	0.1619
chr3	65439885	T	TCTG	0.500000	0.100	1	3	1	332	129	203	43	11	13	4	58	0	0	197	0	6	0.3333	0.0000	0.0296	8.846	0.19	5.59	-5.40	17	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0311	0.4575	0.5114	1	2	0.0344	0.4581	0.5075	1	2	0.0392	0.4593	0.5015
chr3	65439885	T	TCTGCTG	0.500000	0.100	1	6	1	332	129	203	51	2	24	1	51	0	0	197	0	6	0.3953	0.0000	0.0296	4.478	0.65	5.88	-5.24	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1108	0.6070	0.2823	1	1	0.1160	0.5990	0.2850	1	1	0.1229	0.5890	0.2881
chr3	98169478	T	TG	0.500000	0.100	1	1	1	964	201	763	99	0	1	0	101	0	0	762	0	1	0.4925	0.0000	0.0013	200.000	1.62	1.51	0.10	39	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0997	0.7195	0.1808	1	1	0.1065	0.7048	0.1887	1	1	0.1156	0.6858	0.1986
chr3	98354747	TA	T	0.500000	0.100	1	-1	2	493	133	360	9	0	5	1	118	0	0	360	0	0	0.0677	0.0000	0.0000	25.600	0.22	1.35	-1.13	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9732	0.0268	2	2	0.0000	0.4965	0.5035
chr3	98391562	G	GA	0.500000	0.100	1	1	1	341	115	226	60	0	3	0	52	0	0	225	0	1	0.5217	0.0000	0.0044	37.333	0.23	1.21	-0.98	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3346	0.5818	0.0836	1	1	0.3360	0.5755	0.0886	1	1	0.3371	0.5675	0.0954
chr3	108757146	G	GGGGGATTA	0.500000	0.100	1	8	2	253	122	131	112	0	4	1	5	0	0	131	0	0	0.9180	0.0000	0.0000	29.500	0.61	5.20	-4.59	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0031	0.9969	0.0000	0	1	0.4878	0.5122	0.0000	0	0	0.8771	0.1229	0.0000
chr3	112534211	C	CA	0.500000	0.100	1	1	1	109	50	59	6	0	2	2	40	0	0	57	0	2	0.1200	0.0000	0.0339	24.000	0.50	1.25	-0.75	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9845	0.0155	2	1	0.0000	0.8466	0.1534
chr3	113657263	TTGC	T	0.500000	0.100	1	-3	1	1183	296	887	9	3	89	13	182	0	0	883	0	4	0.0304	0.0000	0.0045	2.303	0.11	3.11	-3.00	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.6408	0.3592	2	2	0.0000	0.0393	0.9607
chr3	122740443	G	GAGA	0.500000	0.100	1	3	3	573	154	419	142	1	4	0	7	0	0	419	0	0	0.9221	0.0000	0.0000	37.500	0.09	3.00	-2.91	86	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	1	0.4227	0.5773	0.0000	0	0	0.9202	0.0798	0.0000
chr3	124927858	AAAG	A	0.500000	0.100	1	-3	3	403	96	307	91	0	2	0	3	0	0	307	0	0	0.9479	0.0000	0.0000	47.000	0.38	3.67	-3.28	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1162	0.8838	0.0000	0	0	0.7943	0.2057	0.0000	0	0	0.9235	0.0765	0.0000
chr3	125013575	A	AGAGGAGGAGGAGGAAGAG	0.500000	0.100	1	18	2	678	128	550	58	0	26	0	44	0	0	549	0	1	0.4531	0.0000	0.0018	3.923	1.12	8.52	-7.40	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5026	0.4592	0.0382	1	0	0.4979	0.4603	0.0418	1	0	0.4911	0.4619	0.0470
chr3	126572375	CCT	C	0.500000	0.100	1	-2	4	442	122	320	113	0	1	0	8	0	0	320	0	0	0.9262	0.0000	0.0000	121.000	0.32	2.00	-1.68	37	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0555	0.9445	0.0000	0	0	0.5957	0.4043	0.0000
chr3	130096091	GC	G	0.500000	0.100	1	-1	2	168	90	78	7	0	0	0	83	0	0	78	0	0	0.0778	0.0000	0.0000	90.000	0.14	2.35	-2.21	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9643	0.0357	2	1	0.0000	0.6134	0.3866
chr3	134250569	A	AGCGGCG	0.500000	0.100	1	6	1	234	60	174	47	0	10	0	3	0	0	174	0	0	0.7833	0.0000	0.0000	5.000	1.62	6.33	-4.72	31	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0138	0.9862	0.0000	0	1	0.3001	0.6999	0.0000	0	0	0.5879	0.4121	0.0000
chr3	150703735	A	ACCTCCTCCT	0.500000	0.100	1	9	2	464	85	379	52	0	13	0	20	0	0	374	0	5	0.6118	0.0000	0.0132	5.538	2.73	8.15	-5.42	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8305	0.1657	0.0039	1	0	0.8191	0.1762	0.0047	1	0	0.8030	0.1910	0.0061
chr3	150703740	CTCCTCCTCCTCCTCCACCTCT	C	0.500000	0.100	1	-21	2	464	115	349	72	2	36	0	5	0	0	349	0	0	0.6261	0.0000	0.0000	2.167	1.90	23.00	-21.10	42	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0006	0.9994	0.0000	0	1	0.1633	0.8367	0.0000	0	0	0.5929	0.4071	0.0000
chr3	169796284	TAAAGG	T	0.500000	0.100	1	-5	2	270	108	162	100	0	3	0	5	0	0	162	0	0	0.9259	0.0000	0.0000	35.000	0.17	5.20	-5.03	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0024	0.9976	0.0000	0	1	0.4185	0.5815	0.0000	0	0	0.8380	0.1620	0.0000
chr3	179242978	CT	C	0.500000	0.100	1	-1	1	285	99	186	92	1	2	0	4	0	0	186	0	0	0.9293	0.0000	0.0000	48.500	0.22	1.00	-0.78	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0166	0.9834	0.0000	0	0	0.5981	0.4019	0.0000	0	0	0.8753	0.1247	0.0000
chr3	183775955	CGGA	C	0.500000	0.100	1	-3	2	397	160	237	130	0	18	2	10	0	0	237	0	0	0.8125	0.0000	0.0000	7.889	0.22	3.10	-2.88	68	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0020	0.9980	0.0000	0	1	0.2019	0.7981	0.0000
chr3	184711345	A	ATCC	0.500000	0.100	1	3	1	561	134	427	42	3	22	1	66	0	0	423	0	4	0.3134	0.0000	0.0094	5.091	0.86	3.09	-2.23	4	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0046	0.2111	0.7843	1	2	0.0055	0.2205	0.7740	1	2	0.0070	0.2336	0.7594
chr3	195726176	GTTAGCA	G	0.500000	0.100	1	-6	1	1044	218	826	213	0	1	0	4	0	0	825	0	1	0.9771	0.0000	0.0012	217.000	1.87	7.50	-5.63	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4537	0.5463	0.0000	0	0	0.9952	0.0048	0.0000	0	0	0.9992	0.0008	0.0000
chr3	195779135	TGGTGACAGGAAGAGGCGTGGTGTCACCTGTGGATACTGAGGAAAGGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCCTGACCTGTGGATGCAGAGGAAGTGTC	T	0.500000	0.100	1	-96	1	3224	603	2621	217	15	176	14	181	0	5	2567	5	44	0.3599	0.0000	0.0206	2.436	4.66	4.35	0.31	11	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.0202	0.8885	0.0913	1	1	0.0244	0.8718	0.1039	1	1	0.0307	0.8478	0.1214
chr3	195791241	T	TGTCTCCTGCGTAACA	0.500000	0.100	1	15	1	822	199	623	93	0	20	0	86	0	0	605	1	17	0.4673	0.0000	0.0289	8.950	0.55	10.09	-9.54	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0392	0.6135	0.3472	1	1	0.0434	0.6040	0.3526	1	1	0.0493	0.5922	0.3586
chr3	198153257	CTGGCAGCAG	C	0.500000	0.100	1	-9	2	312	117	195	21	2	10	74	10	0	0	188	2	5	0.1795	0.0000	0.0359	11.778	0.29	10.80	-10.51	11	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0000	0.4967	0.5033	2	1	0.0000	0.9911	0.0089	2	1	0.0000	0.9998	0.0002
chr3	198153259	GGCAGCA	G	0.500000	0.100	1	-6	1	312	116	196	0	0	30	2	84	0	0	190	1	5	0.0000	0.0000	0.0306	2.867		7.69		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0088	0.9912	2	2	0.0000	0.0097	0.9903	2	2	0.0000	0.0111	0.9889
chr3	198153259	GGCAGCAGCA	G	0.500000	0.100	1	-9	1	312	117	195	0	1	27	43	46	0	0	189	0	6	0.0000	0.0000	0.0308	3.296		8.91		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0573	0.9427	2	2	0.0000	0.0237	0.9763	2	2	0.0000	0.0183	0.9817
chr4	1093539	G	GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	0.774228	0.100	1	21	1	527	85	442	0	0	2	0	83	0	0	379	2	61	0.0000	0.0000	0.1425	41.500		19.64		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0002	0.9998	2	2	0.0000	0.0002	0.9998	2	2	0.0000	0.0002	0.9998
chr4	3074923	AGC	A	0.021170	0.100	1	-2	1	822	329	493	194	12	14	109	0	5	4	484	0	0	0.5897	0.0101	0.0183	22.300	5.73			18	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	0.9929	0.0071	0.0000	0	1	0.0771	0.9229	0.0000
chr4	3074926	AG	A	0.010091	0.100	1	-1	1	822	320	502	185	22	112	1	0	5	4	493	0	0	0.5781	0.0100	0.0179	2.494	6.05			3	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr4	3074927	G	GCAA	0.030219	0.100	1	3	1	822	320	502	196	53	15	40	16	0	5	496	1	0	0.6125	0.0000	0.0120	21.769	6.01	4.94	1.07	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0010	0.9990	0.0000
chr4	3074966	G	GCCGCCGCCT	0.001791	0.100	1	9	2	822	286	536	13	13	11	10	239	1	2	519	0	14	0.0455	0.0019	0.0317	27.100	3.23	7.68	-4.45	11	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr4	3074966	G	GCCT	0.008956	0.100	1	3	2	822	286	536	15	84	40	12	135	2	1	531	2	0	0.0524	0.0037	0.0093	6.639	3.27	7.78	-4.51	11	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.0011	0.6527	0.3462	1	1	0.0015	0.6780	0.3205	1	1	0.0023	0.7105	0.2872
chr4	3767568	AGGGGGCGGGGCC	A	0.069055	0.100	1	-12	1	594	137	457	74	0	8	1	54	1	0	453	0	3	0.5401	0.0022	0.0088	16.125	0.58	11.28	-10.70	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7223	0.2758	0.0018	1	0	0.7190	0.2790	0.0021	1	0	0.7139	0.2836	0.0025
chr4	13599332	A	ATGC	0.500000	0.100	1	3	2	720	145	575	68	0	5	0	72	0	0	572	1	2	0.4690	0.0000	0.0052	28.000	0.37	3.14	-2.77	26	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0771	0.6179	0.3050	1	1	0.0823	0.6091	0.3087	1	1	0.0894	0.5979	0.3128
chr4	15003254	A	AGCCGCC	0.500000	0.100	1	6	2	765	221	544	17	0	25	2	177	0	0	522	1	21	0.0769	0.0000	0.0404	8.125	1.29	8.02	-6.72	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9997	0.0003	2	1	0.0000	0.7547	0.2453
chr4	15003300	C	CCCG	0.500000	0.100	1	3	1	763	255	508	21	4	52	4	174	0	0	493	0	15	0.0824	0.0000	0.0295	3.961	1.95	7.07	-5.12	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9978	0.0022
chr4	70602628	CAGG	C	0.500000	0.100	1	-3	3	436	101	335	45	0	3	0	53	0	6	327	0	2	0.4455	0.0000	0.0239	32.667	2.64	3.55	-0.90	37	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1203	0.6058	0.2739	1	1	0.1254	0.5980	0.2766	1	1	0.1322	0.5881	0.2797
chr4	75873297	A	AC	0.500000	0.100	1	1	2	211	67	144	34	0	2	0	31	0	0	144	0	0	0.5075	0.0000	0.0000	32.500	0.79	1.42	-0.63	10	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2782	0.5684	0.1535	1	1	0.2792	0.5632	0.1576	1	1	0.2802	0.5568	0.1631
chr4	76144165	C	CTGT	0.500000	0.100	1	3	1	317	108	209	105	0	0	0	3	0	0	209	0	0	0.9722	0.0000	0.0000	108.000	0.36	3.00	-2.64	41	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2124	0.7876	0.0000	0	0	0.8860	0.1140	0.0000	0	0	0.9597	0.0403	0.0000
chr4	78870928	C	CCAG	0.500000	0.100	1	3	1	1235	508	727	65	1	78	12	352	0	0	719	0	8	0.1280	0.0000	0.0110	5.571	0.54	3.14	-2.60	39	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr4	87313944	CG	C	0.500000	0.100	1	-1	1	170	75	95	40	0	4	0	31	0	0	95	0	0	0.5333	0.0000	0.0000	17.750	0.10	1.03	-0.93	16	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4294	0.4985	0.0721	1	1	0.4254	0.4980	0.0766	1	1	0.4198	0.4975	0.0827
chr4	87614693	CAGCAGT	C	0.500000	0.100	1	-6	1	2545	485	2060	228	10	42	12	193	1	4	2036	6	13	0.4701	0.0005	0.0117	10.925	1.24	6.35	-5.11	62	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2775	0.7175	0.0050	1	1	0.2963	0.6975	0.0062	1	1	0.3197	0.6720	0.0083
chr4	87615305	T	TAGTAGTGAC	0.500000	0.100	1	9	1	4108	805	3303	10	7	44	15	729	40	51	2979	173	60	0.0124	0.0121	0.0981	18.900	5.00	9.31	-4.31	4	0/1	1/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr4	87615716	TAGTGACAGCAGCAATAGC	T	0.500000	0.100	1	-18	1	3757	1132	2625	387	49	193	49	454	319	60	2193	27	26	0.3419	0.1215	0.1646	4.862	2.90	8.69	-5.79	47	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr4	100187718	GT	G	0.500000	0.100	1	-1	3	407	122	285	111	0	5	0	6	0	0	285	0	0	0.9098	0.0000	0.0000	23.400	0.20	2.17	-1.97	55	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0005	0.9995	0.0000	0	1	0.3064	0.6936	0.0000	0	0	0.8241	0.1759	0.0000
chr4	100480004	TAAC	T	0.500000	0.100	1	-3	1	179	97	82	91	1	1	1	3	0	0	82	0	0	0.9381	0.0000	0.0000	96.000	0.11	3.00	-2.89	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0879	0.9121	0.0000	0	0	0.7497	0.2503	0.0000	0	0	0.9083	0.0917	0.0000
chr4	119026806	AAAG	A	0.500000	0.100	1	-3	2	687	203	484	185	0	14	0	4	0	0	484	0	0	0.9113	0.0000	0.0000	13.500	0.36	4.00	-3.64	69	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.6318	0.3682	0.0000	0	0	0.9932	0.0068	0.0000	0	0	0.9984	0.0016	0.0000
chr4	121157144	CTCTCTGCCTGTCGTCCTT	C	0.500000	0.100	1	-18	1	229	128	101	116	0	10	0	2	0	0	101	0	0	0.9062	0.0000	0.0000	11.800	0.20	18.00	-17.80	24	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.8127	0.1873	0.0000	0	0	0.9750	0.0250	0.0000	0	0	0.9872	0.0128	0.0000
chr4	139730430	TCTG	T	0.500000	0.100	1	-3	4	528	216	312	0	0	31	3	182	0	0	307	0	5	0.0000	0.0000	0.0160	5.968		3.08		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999
chr4	146639305	T	TGGC	0.500000	0.100	1	3	2	463	154	309	101	13	35	2	3	2	2	304	1	0	0.6558	0.0065	0.0162	3.371	1.54	3.00	-1.46	17	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0295	0.9705	0.0000	0	0	0.6930	0.3070	0.0000	0	0	0.9238	0.0762	0.0000
chr4	151279866	G	GCAGGT	0.500000	0.100	1	5	2	255	121	134	58	0	6	0	57	0	0	129	0	5	0.4793	0.0000	0.0373	19.167	0.10	4.79	-4.69	22	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1167	0.6253	0.2580	1	1	0.1221	0.6161	0.2618	1	1	0.1293	0.6045	0.2662
chr4	154323249	TTTTG	T	0.500000	0.100	1	-4	1	292	129	163	58	0	21	0	50	0	0	161	0	2	0.4496	0.0000	0.0123	5.143	0.69	5.04	-4.35	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3128	0.5920	0.0952	1	1	0.3147	0.5850	0.1003	1	1	0.3166	0.5762	0.1072
chr4	164957227	GTCCAACAGCGGTCGC	G	0.500000	0.100	1	-15	1	808	217	591	203	1	7	0	6	0	0	590	0	1	0.9355	0.0000	0.0017	34.833	0.23	15.83	-15.60	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0059	0.9941	0.0000	0	0	0.9406	0.0594	0.0000	0	0	0.9956	0.0044	0.0000
chr4	186236896	G	GT	0.500000	0.100	1	1	1	187	85	102	50	0	3	0	32	0	0	102	0	0	0.5882	0.0000	0.0000	27.333	0.26	1.94	-1.68	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6533	0.3282	0.0185	1	0	0.6433	0.3359	0.0209	1	0	0.6293	0.3463	0.0245
chr5	271742	CCCGGCCCTGGGG	C	0.122901	0.100	1	-12	4	241	103	138	53	0	7	0	43	0	0	135	0	3	0.5146	0.0000	0.0217	13.714	0.60	11.60	-11.00	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.5100	0.4721	0.0178	1	0	0.5119	0.4692	0.0189	1	0	0.5138	0.4658	0.0204
chr5	1295342	CCG	C	0.500000	0.100	1	-2	3	869	187	682	168	2	8	0	9	0	1	681	0	0	0.8984	0.0000	0.0015	22.375	1.14	2.67	-1.53	68	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2569	0.7431	0.0000	0	0	0.9241	0.0759	0.0000
chr5	1878382	T	TGGCGGC	0.000427	0.100	1	6	2	698	210	488	171	1	31	0	7	0	0	488	0	0	0.8143	0.0000	0.0000	5.774	0.63	4.14	-3.52	13	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7239	0.2761	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr5	45695870	TCGCCGC	T	0.500000	0.100	1	-6	2	300	116	184	50	3	17	0	46	0	0	181	0	3	0.4310	0.0000	0.0163	6.533	0.66	6.15	-5.49	0	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2812	0.6003	0.1185	1	1	0.2836	0.5929	0.1235	1	1	0.2863	0.5834	0.1303
chr5	55172603	ACTTCT	A	0.500000	0.100	1	-5	1	143	50	93	45	0	1	0	4	0	0	93	0	0	0.9000	0.0000	0.0000	49.000	0.02	5.00	-4.98	9	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0014	0.9986	0.0000	0	1	0.1180	0.8820	0.0000	0	1	0.4052	0.5948	0.0000
chr5	56882021	TCAA	T	0.500000	0.100	1	-3	2	757	164	593	0	0	22	3	139	0	0	586	0	7	0.0000	0.0000	0.0118	6.455		3.23		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0005	0.9995	2	2	0.0000	0.0006	0.9994	2	2	0.0000	0.0007	0.9993
chr5	61332713	G	GGGC	0.500000	0.100	1	3	1	381	68	313	39	5	18	1	5	0	0	311	0	2	0.5735	0.0000	0.0064	2.722	4.51	5.40	-0.89	25	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0004	0.9996	0.0000	0	1	0.0041	0.9959	0.0000	0	1	0.0700	0.9300	0.0000
chr5	61332747	CCGGCCGCAACCTCGG	C	0.500000	0.100	1	-15	4	352	55	297	0	0	36	1	18	0	0	286	4	7	0.0000	0.0000	0.0370	0.514		8.89		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1759	0.8241	2	2	0.0000	0.1805	0.8195	2	2	0.0000	0.1871	0.8129
chr5	74726021	TACTCAA	T	0.500000	0.100	1	-6	1	351	119	232	100	0	6	0	13	0	0	232	0	0	0.8403	0.0000	0.0000	18.833	0.24	5.69	-5.45	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0296	0.9704	0.0000
chr5	75195890	TTCA	T	0.500000	0.100	1	-3	3	527	144	383	0	0	7	0	137	0	0	380	0	3	0.0000	0.0000	0.0078	19.571		3.15		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0008	0.9992	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0011	0.9989
chr5	78015515	ACAG	A	0.500000	0.100	1	-3	2	141	73	68	40	0	2	0	31	0	0	67	0	1	0.5479	0.0000	0.0147	35.500	0.23	3.13	-2.90	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4011	0.5168	0.0821	1	1	0.3982	0.5151	0.0867	1	1	0.3940	0.5130	0.0930
chr5	80654880	TGCAGCGGCTGCAGCGGCC	T	0.500000	0.100	1	-18	1	380	108	272	50	2	5	3	48	0	0	267	0	5	0.4630	0.0000	0.0184	20.000	2.12	21.65	-19.53	22	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1258	0.6125	0.2616	1	1	0.1310	0.6042	0.2648	1	1	0.1378	0.5938	0.2684
chr5	80654905	G	GCCGCAGCGC	0.500000	0.100	1	9	2	367	95	272	65	9	20	0	1	0	1	271	0	0	0.6842	0.0000	0.0037	4.235	16.45	11.00	5.45	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.8422	0.1578	0.0000	0	0	0.9401	0.0599	0.0000	0	0	0.9554	0.0446	0.0000
chr5	80654908	GCAGCGCCCC	G	0.500000	0.100	1	-9	2	378	90	288	30	0	8	1	51	0	0	286	0	2	0.3333	0.0000	0.0069	10.125	2.00	21.78	-19.78	2	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0070	0.2210	0.7720	1	2	0.0082	0.2312	0.7606	1	2	0.0102	0.2453	0.7444
chr5	80654922	GCCCCCAGCT	G	0.500000	0.100	1	-9	1	384	89	295	35	0	0	0	54	0	0	293	0	2	0.3933	0.0000	0.0068	89.000	1.74	21.22	-19.48	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0111	0.2773	0.7116	1	2	0.0128	0.2863	0.7009	1	2	0.0155	0.2985	0.6860
chr5	96889375	CTCTT	C	0.500000	0.100	1	-4	3	194	47	147	30	0	2	0	15	0	0	147	0	0	0.6383	0.0000	0.0000	22.500	0.37	4.07	-3.70	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6192	0.3491	0.0316	1	0	0.6080	0.3571	0.0349	1	0	0.5927	0.3678	0.0395
chr5	114362934	T	TGCC	0.500000	0.100	1	3	1	1350	305	1045	243	4	39	0	19	1	4	1040	0	0	0.7967	0.0010	0.0048	6.821	0.77	3.37	-2.60	79	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0005	0.9995	0.0000	0	0	0.5092	0.4908	0.0000
chr5	122152940	AT	A	0.500000	0.100	1	-1	2	642	140	502	122	2	6	0	10	0	0	502	0	0	0.8714	0.0000	0.0000	26.800	0.48	1.50	-1.02	56	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0109	0.9891	0.0000	0	1	0.3866	0.6134	0.0000
chr5	132813630	G	GGCCGCCGCC	0.500000	0.100	1	9	1	355	74	281	11	1	0	1	61	0	0	261	0	20	0.1486	0.0000	0.0712	74.000	0.82	8.48	-7.66	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9998	0.0002	2	1	0.0000	0.9758	0.0242
chr5	140552043	A	AGT	0.500000	0.100	1	2	1	222	84	138	46	0	2	1	35	0	1	132	0	5	0.5476	0.0000	0.0435	41.000	0.11	3.91	-3.81	20	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3311	0.5665	0.1024	1	1	0.3314	0.5614	0.1072	1	1	0.3313	0.5549	0.1138
chr5	140552044	C	CG	0.500000	0.100	1	1	1	222	85	137	47	1	1	3	33	0	0	131	2	4	0.5529	0.0000	0.0438	84.000	0.11	4.00	-3.89	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3321	0.5674	0.1005	1	1	0.3324	0.5622	0.1054	1	1	0.3323	0.5557	0.1120
chr5	141432807	ACT	A	0.500000	0.100	1	-2	2	1043	253	790	123	2	8	1	119	0	0	788	0	2	0.4862	0.0000	0.0025	30.375	0.37	2.31	-1.94	19	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1518	0.7625	0.0856	1	1	0.1610	0.7461	0.0928	1	1	0.1728	0.7245	0.1026
chr5	141945390	C	CCTGCTG	0.500000	0.100	1	6	1	389	112	277	43	0	9	0	60	0	1	265	0	11	0.3839	0.0000	0.0433	11.444	3.37	7.52	-4.14	17	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0038	0.1946	0.8015	1	2	0.0047	0.2041	0.7912	1	2	0.0060	0.2175	0.7765
chr5	141945390	C	CCTGCTGCTG	0.500000	0.100	1	9	1	389	112	277	43	0	9	0	60	0	1	265	0	11	0.3839	0.0000	0.0433	11.444	3.37	7.52	-4.14	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0038	0.1948	0.8014	1	2	0.0047	0.2043	0.7911	1	2	0.0060	0.2177	0.7763
chr5	141945390	CCTG	C	0.500000	0.100	1	-3	1	390	126	264	66	5	8	2	45	0	0	262	1	1	0.5238	0.0000	0.0076	14.625	6.79	3.13	3.65	24	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7056	0.2855	0.0090	1	0	0.6963	0.2932	0.0105	1	0	0.6831	0.3041	0.0128
chr5	146233613	TCCAGGC	T	0.500000	0.100	1	-6	2	155	42	113	34	0	4	0	4	0	0	113	0	0	0.8095	0.0000	0.0000	9.500	1.06	6.25	-5.19	2	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0008	0.9992	0.0000	0	1	0.0717	0.9283	0.0000	0	1	0.2855	0.7145	0.0000
chr5	146878727	A	AGCTGCTGCT	0.500000	0.100	1	9	1	462	161	301	7	2	29	0	123	0	0	280	0	21	0.0435	0.0000	0.0698	4.552	0.43	10.05	-9.62	1	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9116	0.0884	2	2	0.0000	0.2258	0.7742
chr5	146878727	A	AGCTGCTGCTGCT	0.500000	0.100	1	12	1	462	161	301	9	0	30	1	121	0	0	280	0	21	0.0559	0.0000	0.0698	4.367	1.00	10.09	-9.09	1	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9192	0.0808	2	2	0.0000	0.2368	0.7632
chr5	148242694	G	GCT	0.500000	0.100	1	2	1	1264	292	972	167	0	1	1	123	0	0	959	2	11	0.5719	0.0000	0.0134	291.000	0.60	3.73	-3.13	61	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6970	0.3013	0.0017	1	0	0.6958	0.3021	0.0021	1	0	0.6928	0.3044	0.0028
chr5	148242696	GAT	G	0.500000	0.100	1	-2	3	1271	294	977	172	0	3	3	116	0	0	962	2	13	0.5850	0.0000	0.0154	97.000	0.58	3.91	-3.32	62	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8283	0.1712	0.0004	1	0	0.8236	0.1758	0.0006	1	0	0.8162	0.1830	0.0009
chr5	149995316	CT	C	0.500000	0.100	1	-1	2	612	141	471	5	0	4	1	131	0	0	471	0	0	0.0355	0.0000	0.0000	34.250	0.00	1.89	-1.89	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9872	0.0128	2	2	0.0000	0.2183	0.7817	2	2	0.0000	0.0392	0.9608
chr5	149996157	TC	T	0.500000	0.100	1	-1	4	560	164	396	98	0	3	0	63	0	0	395	0	1	0.5976	0.0000	0.0025	53.667	0.16	1.10	-0.93	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8670	0.1320	0.0010	1	0	0.8585	0.1402	0.0013	1	0	0.8461	0.1521	0.0018
chr5	153492228	T	TC	0.500000	0.100	1	1	2	98	52	46	27	0	0	0	25	0	0	46	0	0	0.5192	0.0000	0.0000	52.000	0.07	1.12	-1.05	11	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2639	0.5586	0.1775	1	1	0.2649	0.5542	0.1809	1	1	0.2660	0.5486	0.1854
chr5	157052432	CTTG	C	0.500000	0.100	1	-3	1	365	128	237	8	0	2	0	118	0	0	234	0	3	0.0625	0.0000	0.0127	63.000	2.12	5.01	-2.88	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9223	0.0777	2	2	0.0000	0.3236	0.6764
chr5	157052557	C	CGTT	0.500000	0.100	1	3	1	366	140	226	0	0	2	0	138	0	0	223	0	3	0.0000	0.0000	0.0133	69.000		4.26		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0008	0.9992	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0011	0.9989
chr5	168454024	TGGA	T	0.500000	0.100	1	-3	2	199	80	119	30	0	4	0	46	0	0	118	0	1	0.3750	0.0000	0.0084	19.000	0.30	2.83	-2.53	10	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0218	0.3430	0.6352	1	2	0.0244	0.3503	0.6253	1	2	0.0283	0.3601	0.6116
chr5	177503170	AGAG	A	0.500000	0.100	1	-3	1	407	99	308	45	0	3	0	51	0	0	307	0	1	0.4545	0.0000	0.0032	32.000	0.96	3.80	-2.85	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0874	0.5627	0.3499	1	1	0.0922	0.5577	0.3500	1	1	0.0988	0.5515	0.3496
chr5	179345240	G	GGCGGCAGGA	0.500000	0.100	1	9	1	474	215	259	91	0	26	2	96	1	0	246	0	12	0.4233	0.0039	0.0502	7.269	3.43	8.09	-4.67	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	2	0.0147	0.4690	0.5163	1	2	0.0169	0.4664	0.5167	1	2	0.0202	0.4640	0.5158
chr5	179345249	A	AGCG	0.500000	0.100	1	3	2	474	226	248	19	8	45	89	65	0	1	245	0	2	0.0841	0.0000	0.0121	4.444	1.53	3.89	-2.37	3	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9998	0.0002
chr5	179345258	G	GGCA	0.500000	0.100	1	3	1	474	216	258	44	59	43	54	16	0	1	257	0	0	0.2037	0.0000	0.0039	2.951	2.75	4.00	-1.25	12	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.9304	0.0694	0.0003	1	0	0.9235	0.0761	0.0004	1	0	0.9133	0.0861	0.0006
chr5	181125166	TGAG	T	0.500000	0.100	1	-3	1	693	180	513	88	2	13	3	74	0	0	512	0	1	0.4889	0.0000	0.0019	12.769	0.28	3.36	-3.08	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4086	0.5549	0.0364	1	1	0.4107	0.5491	0.0402	1	1	0.4122	0.5421	0.0456
chr5	181155256	TTGTC	T	0.500000	0.100	1	-4	3	793	179	614	86	0	4	1	88	0	0	606	0	8	0.4804	0.0000	0.0130	43.500	0.35	4.08	-3.73	36	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0420	0.6005	0.3575	1	1	0.0462	0.5919	0.3619	1	1	0.0522	0.5813	0.3665
chr5	181260427	CTCT	C	0.500000	0.100	1	-3	2	590	114	476	40	1	11	1	61	0	0	476	0	0	0.3509	0.0000	0.0000	9.364	0.20	3.00	-2.80	4	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0108	0.2886	0.7005	1	2	0.0125	0.2969	0.6906	1	2	0.0152	0.3082	0.6766
chr6	1390850	G	GGGC	0.511246	0.100	1	3	5	504	115	389	3	0	19	1	92	0	0	381	3	5	0.0261	0.0000	0.0206	5.053	0.00	3.42	-3.42	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.8135	0.1865	2	2	0.0000	0.1316	0.8684	2	2	0.0000	0.0469	0.9531
chr6	1610525	GCGCGGCGGC	G	0.000960	0.100	1	-9	2	636	139	497	68	0	15	0	56	2	0	492	0	3	0.4892	0.0040	0.0101	8.267	2.01	8.48	-6.47	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6122	0.3878	0.0001	1	0	0.6135	0.3864	0.0001	1	0	0.6147	0.3853	0.0001
chr6	1611567	G	GGGC	0.201628	0.100	1	3	1	600	142	458	61	0	26	5	50	2	2	449	0	5	0.4296	0.0044	0.0197	4.792	2.51	3.72	-1.21	27	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4060	0.5575	0.0365	1	1	0.4113	0.5502	0.0385	1	1	0.4176	0.5412	0.0412
chr6	1611782	A	ACGG	0.232567	0.100	1	3	1	545	104	441	50	3	10	1	40	2	2	432	4	1	0.4808	0.0045	0.0204	9.400	1.56	3.95	-2.39	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5846	0.3977	0.0177	1	0	0.5821	0.3986	0.0193	1	0	0.5782	0.4002	0.0215
chr6	16327633	G	GTGC	0.199384	0.100	1	3	2	1759	429	1330	36	51	122	71	149	2	2	1306	5	15	0.0839	0.0015	0.0180	2.691	2.25	3.59	-1.34	22	0/1	0/0	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0000	1.0000	1	2	0.0000	0.0000	1.0000	1	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr6	26234545	C	CTAG	0.001749	0.100	1	3	2	592	128	464	115	0	5	0	8	0	0	463	0	1	0.8984	0.0000	0.0022	24.600	0.32	3.50	-3.18	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0004	0.9996	0.0000	0	0	0.9247	0.0753	0.0000	0	0	0.9979	0.0021	0.0000
chr6	29397419	TG	T	0.000417	0.100	1	-1	1	745	157	588	83	1	3	0	70	0	0	587	0	1	0.5287	0.0000	0.0017	77.000	0.17	2.07	-1.90	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6065	0.3935	0.0000	1	0	0.6092	0.3908	0.0000	1	0	0.6120	0.3880	0.0000
chr6	29657255	TTCC	T	0.500000	0.100	1	-3	2	154	61	93	33	0	7	1	20	0	0	93	0	0	0.5410	0.0000	0.0000	7.714	1.39	4.20	-2.81	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5303	0.4206	0.0491	1	0	0.5220	0.4250	0.0530	1	0	0.5107	0.4307	0.0585
chr6	30590700	G	GA	0.500000	0.100	1	1	1	374	98	276	47	0	3	0	48	0	0	274	0	2	0.4796	0.0000	0.0072	47.500	0.19	1.33	-1.14	25	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1441	0.6082	0.2478	1	1	0.1489	0.6002	0.2508	1	1	0.1554	0.5901	0.2545
chr6	31027315	CTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAGCT	C	0.500000	0.100	1	-30	2	1297	359	938	304	7	19	5	24	26	16	893	3	0	0.8468	0.0277	0.0480	17.526	1.57	8.58	-7.02	2	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1396	0.8604	0.0000
chr6	31028377	TGAGACCACCACAGCCTCTACTGAAGGCTCC	T	0.500000	0.100	1	-30	1	2059	585	1474	268	18	145	7	147	58	12	1360	19	25	0.4581	0.0393	0.0773	3.071	2.11	7.39	-5.28	26	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr6	31117165	GCTT	G	0.500000	0.100	1	-3	1	752	181	571	82	0	4	0	95	0	0	571	0	0	0.4530	0.0000	0.0000	44.250	0.20	4.18	-3.98	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0318	0.5497	0.4185	1	1	0.0353	0.5439	0.4208	1	1	0.0404	0.5370	0.4225
chr6	31138080	AG	A	0.500000	0.100	1	-1	4	483	124	359	116	2	3	0	3	0	0	359	0	0	0.9355	0.0000	0.0000	40.333	1.28	1.33	-0.05	56	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3478	0.6522	0.0000	0	0	0.9372	0.0628	0.0000	0	0	0.9782	0.0218	0.0000
chr6	31138723	T	TC	0.500000	0.100	1	1	1	559	154	405	70	72	6	1	5	0	0	405	0	0	0.4545	0.0000	0.0000	12.667	0.26	2.80	-2.54	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0056	0.9944	0.0000	0	0	0.6665	0.3335	0.0000	0	0	0.9438	0.0562	0.0000
chr6	31138723	TC	T	0.500000	0.100	1	-1	1	559	154	405	68	6	7	0	73	0	0	403	2	0	0.4416	0.0000	0.0049	20.857	0.24	2.41	-2.18	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1372	0.6693	0.1935	1	1	0.1432	0.6574	0.1994	1	1	0.1511	0.6421	0.2067
chr6	31412384	G	GCT	0.500000	0.100	1	2	1	614	182	432	159	2	0	0	21	0	0	432	0	0	0.8736	0.0000	0.0000	181.000	0.52	5.62	-5.10	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0035	0.9965	0.0000
chr6	31412384	G	GCTGCTGCTGCT	0.500000	0.100	1	11	1	614	182	432	168	2	0	0	12	0	0	432	0	0	0.9231	0.0000	0.0000	181.000	0.62	8.00	-7.38	22	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0136	0.9864	0.0000	0	0	0.6327	0.3673	0.0000
chr6	31888048	GAGA	G	0.500000	0.100	1	-3	1	706	128	578	77	0	0	0	51	0	0	571	0	7	0.6016	0.0000	0.0121	128.000	0.27	3.29	-3.02	15	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6200	0.3657	0.0143	1	0	0.6135	0.3701	0.0164	1	0	0.6039	0.3765	0.0196
chr6	31954568	CTCTCGG	C	0.500000	0.100	1	-6	3	771	152	619	137	0	9	0	6	0	0	618	0	1	0.9013	0.0000	0.0016	15.889	0.76	6.67	-5.91	49	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0002	0.9998	0.0000	0	1	0.3519	0.6481	0.0000	0	0	0.8962	0.1038	0.0000
chr6	32521966	CG	C	0.500000	0.100	1	-1	2	106	44	62	17	1	17	3	6	0	0	62	0	0	0.3864	0.0000	0.0000	1.857	6.71	7.83	-1.13	5	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.5432	0.4006	0.0563	1	0	0.5273	0.4130	0.0596	1	0	0.4914	0.4465	0.0622
chr6	32581802	TG	T	0.500000	0.100	1	-1	1	688	270	418	187	13	32	0	38	0	0	417	0	1	0.6926	0.0000	0.0024	7.645	7.48	7.34	0.13	73	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr6	32581807	C	CT	0.500000	0.100	1	1	1	688	260	428	201	5	15	0	39	0	0	426	0	2	0.7731	0.0000	0.0047	16.333	7.98	7.38	0.59	81	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr6	34889525	G	GGGCGGC	0.500000	0.100	1	6	5	493	170	323	99	1	26	0	44	0	0	314	0	9	0.5824	0.0000	0.0279	5.538	0.42	5.00	-4.58	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9613	0.0386	0.0001	1	0	0.9564	0.0435	0.0001	1	0	0.9489	0.0509	0.0002
chr6	36721185	C	CAGGCTGCCTCCCCTGAGG	0.500000	0.100	1	18	1	386	98	288	60	0	12	0	26	0	0	272	0	16	0.6122	0.0000	0.0556	7.167	1.12	14.85	-13.73	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6321	0.3501	0.0178	1	0	0.6235	0.3563	0.0202	1	0	0.6115	0.3648	0.0237
chr6	41786835	C	CCTT	0.500000	0.100	1	3	1	1206	288	918	113	0	10	0	165	0	0	916	0	2	0.3924	0.0000	0.0022	27.800	0.31	3.17	-2.86	27	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0360	0.9639	1	2	0.0000	0.0398	0.9602	1	2	0.0001	0.0456	0.9544
chr6	42236367	G	GTCC	0.500000	0.100	1	3	3	304	102	202	13	0	17	0	72	0	0	198	0	4	0.1275	0.0000	0.0198	5.000	0.38	3.06	-2.67	5	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9906	0.0094
chr6	43021675	CGCCGGG	C	0.500000	0.100	1	-6	1	309	111	198	0	0	14	0	97	1	0	192	0	5	0.0000	0.0051	0.0303	6.929		5.81		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0465	0.9535	2	2	0.0000	0.0174	0.9826	2	2	0.0000	0.0133	0.9867
chr6	43282987	GGAA	G	0.500000	0.100	1	-3	1	756	172	584	62	1	33	0	76	0	0	584	0	0	0.3605	0.0000	0.0000	4.212	0.84	3.28	-2.44	20	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0344	0.4999	0.4657	1	1	0.0379	0.4978	0.4643	1	1	0.0430	0.4955	0.4615
chr6	44002766	CGCG	C	0.500000	0.100	1	-3	1	441	113	328	76	1	29	2	5	0	0	328	0	0	0.6726	0.0000	0.0000	2.862	2.09	2.80	-0.71	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0579	0.9421	0.0000	0	1	0.4176	0.5824	0.0000
chr6	81752010	A	ACCGCCGAAGTCGCCG	0.500000	0.100	1	15	2	867	186	681	47	9	84	2	44	0	0	659	0	22	0.2527	0.0000	0.0323	1.179	15.40	7.41	8.00	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0386	0.4903	0.4711	1	1	0.0423	0.4892	0.4685	1	1	0.0476	0.4881	0.4643
chr6	81752010	ACCGCCGAAGTCGCCG	A	0.500000	0.100	1	-15	2	887	227	660	98	0	64	0	65	0	0	652	0	8	0.4317	0.0000	0.0121	2.547	3.84	11.49	-7.66	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7167	0.2782	0.0050	1	0	0.7095	0.2845	0.0061	1	0	0.6988	0.2935	0.0077
chr6	99613748	C	CCCG	0.500000	0.100	1	3	1	669	136	533	99	4	30	0	3	2	0	531	0	0	0.7279	0.0038	0.0038	3.500	1.44	3.67	-2.22	43	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2109	0.7891	0.0000	0	0	0.8854	0.1146	0.0000	0	0	0.9595	0.0405	0.0000
chr6	109443671	TGGA	T	0.500000	0.100	1	-3	1	650	161	489	151	0	6	0	4	0	0	489	0	0	0.9379	0.0000	0.0000	25.833	0.27	3.50	-3.23	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2327	0.7673	0.0000	0	0	0.9638	0.0362	0.0000	0	0	0.9915	0.0085	0.0000
chr6	109585126	GCTT	G	0.500000	0.100	1	-3	2	140	53	87	44	0	6	0	3	0	0	87	0	0	0.8302	0.0000	0.0000	7.833	0.39	3.00	-2.61	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0118	0.9882	0.0000	0	1	0.2697	0.7303	0.0000	0	0	0.5522	0.4478	0.0000
chr6	116279302	T	TCAC	0.500000	0.100	1	3	2	786	164	622	12	0	10	0	142	0	0	617	0	5	0.0732	0.0000	0.0080	15.400	0.33	3.39	-3.06	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9957	0.0043	2	1	0.0000	0.6384	0.3616
chr6	123464887	GA	G	0.500000	0.100	1	-1	2	370	111	259	86	5	12	1	7	0	0	259	0	0	0.7748	0.0000	0.0000	8.167	0.35	2.43	-2.08	28	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0400	0.9600	0.0000	0	1	0.4186	0.5814	0.0000
chr6	138218046	A	AG	0.500000	0.100	1	1	1	358	111	247	53	0	1	0	57	0	0	246	0	1	0.4775	0.0000	0.0040	110.000	0.19	1.25	-1.06	35	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1070	0.6050	0.2881	1	1	0.1121	0.5971	0.2907	1	1	0.1191	0.5873	0.2936
chr6	151352981	T	TGAG	0.500000	0.100	1	3	2	959	225	734	0	0	13	1	211	0	0	728	0	6	0.0000	0.0000	0.0082	16.308		3.04		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr6	156778268	C	CCAG	0.500000	0.100	1	3	2	959	262	697	119	3	64	2	74	2	2	680	2	11	0.4542	0.0029	0.0244	3.078	1.00	3.26	-2.26	35	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8756	0.1238	0.0005	1	0	0.8684	0.1309	0.0007	1	0	0.8578	0.1412	0.0010
chr6	156778847	GGGCGGC	G	0.500000	0.100	1	-6	1	546	145	401	120	3	13	1	8	2	0	397	1	1	0.8276	0.0050	0.0100	10.154	1.68	7.00	-5.33	26	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0056	0.9944	0.0000	0	1	0.2970	0.7030	0.0000
chr6	159239747	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	0.500000	0.100	1	-18	1	548	191	357	14	0	37	0	140	0	0	342	0	15	0.0733	0.0000	0.0420	4.162	0.29	15.19	-14.90	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9992	0.0008	2	1	0.0000	0.8122	0.1878
chr6	159790613	GGTT	G	0.500000	0.100	1	-3	5	392	162	230	76	0	6	0	80	0	0	229	0	1	0.4691	0.0000	0.0043	26.000	0.16	4.97	-4.82	36	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0927	0.6574	0.2498	1	1	0.0985	0.6462	0.2554	1	1	0.1062	0.6318	0.2620
chr6	160139848	CATG	C	0.500000	0.100	1	-3	1	204	65	139	37	0	3	0	25	0	0	139	0	0	0.5692	0.0000	0.0000	20.667	7.08	9.32	-2.24	13	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5214	0.4302	0.0483	1	0	0.5139	0.4339	0.0522	1	0	0.5035	0.4388	0.0577
chr6	160139865	CTGGTAAGT	C	0.500000	0.100	1	-8	2	204	55	149	0	0	4	0	51	0	0	148	0	1	0.0000	0.0000	0.0067	12.750		9.18		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0659	0.9341	2	2	0.0000	0.0693	0.9307	2	2	0.0000	0.0742	0.9258
chr6	161098318	CCTG	C	0.500000	0.100	1	-3	3	329	135	194	1	0	10	12	112	0	0	191	2	1	0.0074	0.0000	0.0155	12.500	0.00	3.17	-3.17	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0140	0.9860	2	2	0.0000	0.0051	0.9949	2	2	0.0000	0.0040	0.9960
chr6	168308554	G	GCCCCTGCCGGCA	0.500000	0.100	1	12	3	677	132	545	74	1	16	0	41	0	0	536	0	9	0.5606	0.0000	0.0165	7.188	0.68	7.95	-7.28	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7538	0.2405	0.0057	1	0	0.7441	0.2492	0.0067	1	0	0.7302	0.2613	0.0085
chr6	170561949	GCAA	G	0.500000	0.100	1	-3	1	933	309	624	11	8	24	130	136	0	0	624	0	0	0.0356	0.0000	0.0000	14.077	5.36	11.49	-6.12	9	0/1	1/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9887	0.0113	2	2	0.0000	0.1833	0.8167
chr6	170561963	AGC	A	0.500000	0.100	1	-2	1	934	292	642	122	25	16	26	103	0	0	642	0	0	0.4178	0.0000	0.0000	20.769	3.25	13.67	-10.42	68	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.4269	0.5599	0.0132	1	1	0.4339	0.5508	0.0153	1	1	0.4414	0.5400	0.0186
chr6	170561966	AG	A	0.500000	0.100	1	-1	1	933	291	642	132	20	38	95	6	0	0	641	1	0	0.4536	0.0000	0.0016	14.471	3.59	7.83	-4.24	68	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.9460	0.0539	0.0001	1	0	0.9410	0.0589	0.0001	1	0	0.9334	0.0665	0.0002
chr7	2513247	A	AGATG	0.500000	0.100	1	4	1	232	89	143	34	2	16	1	36	0	2	140	0	1	0.3820	0.0000	0.0210	4.500	3.68	3.81	-0.13	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1950	0.5908	0.2142	1	1	0.1986	0.5840	0.2173	1	1	0.2032	0.5755	0.2213
chr7	2513247	AGATG	A	0.500000	0.100	1	-4	1	232	89	143	43	0	13	1	32	0	0	141	0	2	0.4831	0.0000	0.0140	5.769	3.42	4.03	-0.61	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4057	0.5172	0.0772	1	1	0.4029	0.5154	0.0817	1	1	0.3988	0.5132	0.0880
chr7	4791165	CCAGCTCCACGCA	C	0.500000	0.100	1	-12	1	742	173	569	110	0	3	0	60	0	0	561	0	8	0.6358	0.0000	0.0141	56.667	0.56	10.27	-9.70	40	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9305	0.0693	0.0002	1	0	0.9240	0.0757	0.0003	1	0	0.9144	0.0852	0.0005
chr7	7969479	G	GGGC	0.500000	0.100	1	3	1	274	46	228	33	1	7	0	5	0	1	227	0	0	0.7174	0.0000	0.0044	5.571	2.64	5.60	-2.96	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	1	0.0272	0.9728	0.0000	0	1	0.1798	0.8202	0.0000
chr7	12342095	AC	A	0.500000	0.100	1	-1	1	125	64	61	38	0	0	0	26	0	0	61	0	0	0.5938	0.0000	0.0000	64.000	0.18	2.15	-1.97	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5192	0.4327	0.0481	1	0	0.5119	0.4361	0.0520	1	0	0.5017	0.4408	0.0575
chr7	12351642	T	TA	0.500000	0.100	1	1	3	212	94	118	49	0	1	0	44	0	0	118	0	0	0.5213	0.0000	0.0000	93.000	0.67	1.70	-1.03	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3036	0.5837	0.1127	1	1	0.3050	0.5774	0.1176	1	1	0.3063	0.5694	0.1242
chr7	15686172	ATGG	A	0.500000	0.100	1	-3	1	680	193	487	99	1	19	1	73	0	0	486	0	1	0.5130	0.0000	0.0021	9.158	0.17	3.01	-2.84	11	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7117	0.2832	0.0051	1	0	0.7047	0.2892	0.0061	1	0	0.6944	0.2979	0.0077
chr7	25226950	TTAA	T	0.500000	0.100	1	-3	1	338	98	240	91	1	2	0	4	0	0	240	0	0	0.9286	0.0000	0.0000	48.000	0.25	3.25	-3.00	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0147	0.9853	0.0000	0	0	0.5830	0.4170	0.0000	0	0	0.8695	0.1305	0.0000
chr7	26152597	C	CCTG	0.500000	0.100	1	3	1	359	96	263	47	1	13	1	34	3	0	258	0	2	0.4896	0.0114	0.0190	6.308	0.70	3.00	-2.30	15	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5426	0.4225	0.0349	1	0	0.5358	0.4259	0.0383	1	0	0.5262	0.4306	0.0432
chr7	31658299	C	CT	0.500000	0.100	1	1	3	144	56	88	48	2	2	0	4	0	0	88	0	0	0.8571	0.0000	0.0000	52.000	0.85	1.00	-0.15	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0019	0.9981	0.0000	0	1	0.1407	0.8593	0.0000	0	1	0.4493	0.5507	0.0000
chr7	33635227	TC	T	0.500000	0.100	1	-1	1	549	145	404	132	0	3	0	10	0	0	404	0	0	0.9103	0.0000	0.0000	47.333	0.25	1.10	-0.85	90	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0174	0.9826	0.0000	0	1	0.4988	0.5012	0.0000
chr7	44073397	TC	T	0.500000	0.100	1	-1	2	608	105	503	58	0	0	0	47	0	0	503	0	0	0.5524	0.0000	0.0000	105.000	0.74	1.38	-0.64	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4468	0.5027	0.0505	1	1	0.4441	0.5013	0.0546	1	1	0.4399	0.4997	0.0604
chr7	51030870	GTCT	G	0.500000	0.100	1	-3	2	233	106	127	58	0	2	2	44	0	0	126	0	1	0.5472	0.0000	0.0079	52.000	0.24	3.05	-2.80	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4504	0.5000	0.0497	1	1	0.4475	0.4987	0.0537	1	1	0.4431	0.4974	0.0595
chr7	64708639	G	GA	0.500000	0.100	1	1	1	1028	222	806	2	3	108	4	105	2	2	797	2	3	0.0090	0.0025	0.0112	1.056	10.50	4.90	5.60	2	0/1	1/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9412	0.0588	2	1	0.0000	0.5345	0.4655
chr7	64708641	G	GAA	0.500000	0.100	1	2	1	1026	220	806	2	98	11	3	106	2	1	796	2	5	0.0091	0.0025	0.0124	19.000	10.50	4.85	5.65	2	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0280	0.9720	1	2	0.0001	0.0320	0.9680	1	2	0.0001	0.0381	0.9618
chr7	76611468	CA	C	0.500000	0.100	1	-1	1	371	151	220	12	0	0	0	139	0	0	219	0	1	0.0795	0.0000	0.0045	151.000	3.75	2.15	1.60	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9969	0.0031	2	1	0.0000	0.7120	0.2880
chr7	82952172	T	TTCA	0.500000	0.100	1	3	5	844	213	631	0	0	10	2	201	0	0	625	0	6	0.0000	0.0000	0.0095	20.300		3.13		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr7	91265144	A	ACCG	0.500000	0.100	1	3	2	667	168	499	18	0	27	1	122	0	0	494	0	5	0.1071	0.0000	0.0100	5.222	0.94	3.70	-2.75	8	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9952	0.0048
chr7	92022864	A	AAAC	0.500000	0.100	1	3	1	253	94	159	47	0	5	0	42	0	0	157	0	2	0.5000	0.0000	0.0126	17.800	0.36	3.17	-2.80	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2582	0.5994	0.1425	1	1	0.2607	0.5920	0.1473	1	1	0.2638	0.5827	0.1535
chr7	99836454	TA	T	0.500000	0.100	1	-1	2	128	45	83	42	0	0	0	3	0	0	83	0	0	0.9333	0.0000	0.0000	45.000	0.19	1.00	-0.81	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0108	0.9892	0.0000	0	1	0.2508	0.7492	0.0000	0	0	0.5283	0.4717	0.0000
chr7	100064888	GTAGT	G	0.500000	0.100	1	-4	1	831	256	575	128	1	5	0	122	0	0	572	0	3	0.5000	0.0000	0.0052	50.000	0.23	3.92	-3.68	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1604	0.7640	0.0756	1	1	0.1700	0.7476	0.0824	1	1	0.1823	0.7259	0.0918
chr7	102541593	G	GA	0.500000	0.100	1	1	2	662	254	408	212	5	3	0	34	0	0	408	0	0	0.8346	0.0000	0.0000	83.667	0.34	1.85	-1.51	38	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr7	102934552	TGAA	T	0.500000	0.100	1	-3	2	580	162	418	4	0	3	0	155	0	0	417	0	1	0.0247	0.0000	0.0024	53.000	0.00	3.17	-3.17	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.7187	0.2813	2	2	0.0000	0.0284	0.9716	2	2	0.0000	0.0067	0.9933
chr7	103989356	T	TGCCGCC	0.500000	0.100	1	6	1	552	144	408	0	0	37	4	103	0	0	396	0	12	0.0000	0.0000	0.0294	2.972		7.60		0	0/0	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0023	0.9977	2	2	0.0000	0.0026	0.9974	2	2	0.0000	0.0030	0.9970
chr7	103989356	T	TGCCGCCGCCGCC	0.500000	0.100	1	12	1	552	144	408	0	0	46	1	97	0	0	396	0	12	0.0000	0.0000	0.0294	2.227		7.56		0	0/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0035	0.9965	2	2	0.0000	0.0039	0.9961	2	2	0.0000	0.0046	0.9954
chr7	122013320	GTGA	G	0.500000	0.100	1	-3	2	732	179	553	80	1	14	1	83	0	0	553	0	0	0.4469	0.0000	0.0000	11.786	1.21	4.19	-2.98	18	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1135	0.6828	0.2038	1	1	0.1198	0.6700	0.2102	1	1	0.1281	0.6537	0.2182
chr7	124032402	CGCT	C	0.500000	0.100	1	-3	2	719	200	519	1	1	19	99	80	0	0	516	2	1	0.0050	0.0000	0.0058	9.316	7.00	3.27	3.73	1	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0010	0.9990	2	2	0.0000	0.0004	0.9996	2	2	0.0000	0.0003	0.9997
chr7	124032402	CGCTGCT	C	0.500000	0.100	1	-6	2	720	204	516	1	1	94	1	107	0	0	513	1	2	0.0049	0.0000	0.0058	1.172	7.00	5.87	1.13	1	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2936	0.7064	2	2	0.0000	0.0495	0.9505	2	2	0.0000	0.0254	0.9746
chr7	128947297	CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT	C	0.500000	0.100	1	-30	3	615	213	402	13	0	41	1	158	0	0	401	0	1	0.0610	0.0000	0.0025	4.195	0.08	16.21	-16.13	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9971	0.0029	2	1	0.0000	0.6410	0.3590
chr7	131556270	G	GGGCGAC	0.500000	0.100	1	6	1	346	160	186	121	5	25	0	9	0	1	183	0	2	0.7562	0.0000	0.0161	5.320	6.49	4.11	2.38	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0049	0.9951	0.0000	0	1	0.2996	0.7004	0.0000
chr7	131556270	GGGCGAC	G	0.500000	0.100	1	-6	1	346	165	181	84	0	13	2	66	0	0	175	2	4	0.5091	0.0000	0.0331	11.538	1.05	11.33	-10.29	8	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.3817	0.5722	0.0461	1	1	0.3839	0.5657	0.0503	1	1	0.3859	0.5578	0.0563
chr7	131556270	GGGCGACGGCGAC	G	0.500000	0.100	1	-12	1	346	171	175	97	0	15	0	59	0	0	169	0	6	0.5673	0.0000	0.0343	10.400	1.01	11.93	-10.92	13	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8586	0.1403	0.0012	1	0	0.8500	0.1486	0.0015	1	0	0.8374	0.1605	0.0021
chr7	137928167	CTGG	C	0.500000	0.100	1	-3	1	266	97	169	59	0	1	0	37	0	0	169	0	0	0.6082	0.0000	0.0000	96.000	0.24	3.14	-2.90	23	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7275	0.2632	0.0093	1	0	0.7169	0.2723	0.0108	1	0	0.7019	0.2849	0.0132
chr7	142864293	C	CCCT	0.500000	0.100	1	3	3	1044	268	776	94	5	44	5	120	0	0	770	0	6	0.3507	0.0000	0.0077	5.045	0.36	3.36	-3.00	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0017	0.2212	0.7771	1	2	0.0021	0.2270	0.7709	1	2	0.0029	0.2357	0.7615
chr7	143511644	GC	G	0.500000	0.100	1	-1	2	2242	589	1653	0	0	30	2	557	0	0	1651	0	2	0.0000	0.0000	0.0012	18.633		1.36		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr7	144129636	ACTT	A	0.500000	0.100	1	-3	2	732	185	547	172	0	3	0	10	0	0	546	0	1	0.9297	0.0000	0.0018	60.667	0.69	4.30	-3.61	2	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0423	0.9577	0.0000	0	0	0.7835	0.2165	0.0000
chr7	144187108	A	AG	0.500000	0.100	1	1	1	572	173	399	99	0	8	0	66	0	0	399	0	0	0.5723	0.0000	0.0000	20.625	0.22	1.27	-1.05	45	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8532	0.1455	0.0012	1	0	0.8446	0.1538	0.0016	1	0	0.8321	0.1657	0.0022
chr7	144258792	GAGGCTGTGAAACAGC	G	0.500000	0.100	1	-15	3	636	206	430	201	0	1	0	4	0	0	429	0	1	0.9757	0.0000	0.0023	205.000	0.31	12.00	-11.69	137	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2957	0.7043	0.0000	0	0	0.9911	0.0089	0.0000	0	0	0.9986	0.0014	0.0000
chr7	149783003	A	AC	0.500000	0.100	1	1	2	668	157	511	86	0	7	0	64	0	0	509	0	2	0.5478	0.0000	0.0039	21.429	0.41	1.09	-0.69	26	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6252	0.3630	0.0119	1	0	0.6194	0.3669	0.0137	1	0	0.6107	0.3728	0.0165
chr7	149787741	CG	C	0.500000	0.100	1	-1	1	618	173	445	98	0	3	1	71	0	0	444	0	1	0.5665	0.0000	0.0022	56.667	1.66	1.49	0.17	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7192	0.2759	0.0050	1	0	0.7119	0.2822	0.0059	1	0	0.7012	0.2913	0.0075
chr7	149806828	GGATA	G	0.500000	0.100	1	-4	3	227	79	148	40	0	6	0	33	0	0	146	0	2	0.5063	0.0000	0.0135	12.167	0.75	4.91	-4.16	0	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3194	0.5621	0.1185	1	1	0.3194	0.5574	0.1232	1	1	0.3191	0.5514	0.1294
chr7	149814882	G	GGCCCT	0.500000	0.100	1	5	1	597	131	466	63	4	16	0	48	0	0	461	0	5	0.4809	0.0000	0.0107	7.188	1.56	6.83	-5.28	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.5093	0.4588	0.0319	1	0	0.5054	0.4594	0.0352	1	0	0.4994	0.4606	0.0400
chr7	149815757	G	GAGGTGGTC	0.500000	0.100	1	8	1	671	216	455	119	0	15	0	82	0	0	450	0	5	0.5509	0.0000	0.0110	13.400	0.81	7.76	-6.95	41	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8117	0.1869	0.0014	1	0	0.8042	0.1940	0.0018	1	0	0.7933	0.2042	0.0025
chr7	149818100	T	TA	0.500000	0.100	1	1	1	791	210	581	92	0	3	0	115	0	0	579	0	2	0.4381	0.0000	0.0034	69.000	0.88	1.29	-0.41	6	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0048	0.3172	0.6781	1	2	0.0057	0.3208	0.6734	1	2	0.0073	0.3265	0.6662
chr7	149819749	TC	T	0.500000	0.100	1	-1	2	487	141	346	122	1	4	0	14	0	0	346	0	0	0.8652	0.0000	0.0000	45.333	0.66	1.29	-0.63	24	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0002	0.9998	0.0000	0	1	0.0482	0.9518	0.0000
chr7	150372306	GCCGCCAGGGGCC	G	0.500000	0.100	1	-12	2	755	231	524	214	0	10	0	7	0	0	524	0	0	0.9264	0.0000	0.0000	22.100	0.70	10.43	-9.73	96	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0095	0.9905	0.0000	0	0	0.9621	0.0379	0.0000	0	0	0.9972	0.0028	0.0000
chr7	151086813	C	CG	0.500000	0.100	1	1	2	603	107	496	0	0	5	27	75	0	1	464	11	20	0.0000	0.0000	0.0645	25.500		7.91		0	0/1	0/0	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0023	0.9977	2	2	0.0000	0.0022	0.9978	2	2	0.0000	0.0023	0.9977
chr7	151086821	C	CG	0.500000	0.100	1	1	1	606	106	500	0	0	10	17	79	0	0	467	11	22	0.0000	0.0000	0.0660	10.444		7.62		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0012	0.9988	2	2	0.0000	0.0014	0.9986	2	2	0.0000	0.0016	0.9984
chr7	151086832	GTCT	G	0.500000	0.100	1	-3	1	630	100	530	0	0	8	6	86	0	2	450	31	47	0.0000	0.0000	0.1509	13.143		7.26		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0012	0.9988	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0008	0.9992
chr8	8318865	CGGGGCG	C	0.543000	0.100	1	-6	2	727	156	571	74	0	28	1	53	0	0	570	0	1	0.4744	0.0000	0.0018	4.571	0.72	5.98	-5.26	32	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.6047	0.3787	0.0166	1	0	0.5974	0.3836	0.0190	1	0	0.5869	0.3905	0.0226
chr8	8377352	CGCCGCT	C	0.473558	0.100	1	-6	2	725	152	573	114	0	30	0	8	0	0	573	0	0	0.7500	0.0000	0.0000	4.067	0.55	6.00	-5.45	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0619	0.9381	0.0000	0	0	0.6232	0.3768	0.0000
chr8	10608190	CTTCCTCTTCTGCCTCCTGGGACTCTATAACTTCTGACTCTGGCTGGGT	C	0.002031	0.100	1	-48	3	948	227	721	90	3	35	4	95	1	8	694	9	9	0.3965	0.0014	0.0374	5.727	2.41	12.21	-9.80	14	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0692	0.9278	0.0031	1	1	0.0787	0.9182	0.0031	1	1	0.0926	0.9042	0.0031
chr8	10610119	T	TTTC	0.070211	0.100	1	3	1	1038	291	747	118	3	18	62	90	0	2	737	0	8	0.4055	0.0000	0.0134	14.062	2.14	5.89	-3.74	44	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0138	0.7739	0.2123	1	1	0.0169	0.7722	0.2109	1	1	0.0218	0.7703	0.2079
chr8	11808709	GTCCCAC	G	0.938007	0.100	1	-6	1	545	238	307	0	0	36	0	202	0	0	307	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	5.611		6.23		0	0/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr8	22404715	AGCTGCT	A	0.199557	0.100	1	-6	2	365	145	220	0	0	6	0	139	0	0	213	0	7	0.0000	0.0000	0.0318	23.167		7.11		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0023	0.9977	2	2	0.0000	0.0027	0.9973	2	2	0.0000	0.0033	0.9967
chr8	33496717	A	AGAT	0.026718	0.100	1	3	5	148	55	93	51	0	1	0	3	0	0	93	0	0	0.9273	0.0000	0.0000	54.000	0.22	3.00	-2.78	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3844	0.6156	0.0000	0	0	0.9502	0.0498	0.0000	0	0	0.9844	0.0156	0.0000
chr8	79766258	AGGCATGT	A	0.500000	0.100	1	-7	1	335	88	247	46	0	0	0	42	0	0	246	0	1	0.5227	0.0000	0.0040	88.000	0.41	7.26	-6.85	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2597	0.5970	0.1433	1	1	0.2622	0.5898	0.1480	1	1	0.2651	0.5807	0.1542
chr8	81753241	TGTGA	T	0.500000	0.100	1	-4	1	227	76	151	42	0	8	0	26	0	0	151	0	0	0.5526	0.0000	0.0000	8.500	0.07	3.85	-3.77	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6198	0.3543	0.0260	1	0	0.6097	0.3614	0.0289	1	0	0.5959	0.3709	0.0332
chr8	102560782	CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG	C	0.500000	0.100	1	-27	4	667	229	438	34	4	19	5	167	0	0	437	0	1	0.1485	0.0000	0.0023	12.875	3.35	15.69	-12.34	0	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr8	116771753	GCTT	G	0.500000	0.100	1	-3	1	302	107	195	102	0	1	0	4	0	0	195	0	0	0.9533	0.0000	0.0000	106.000	1.69	4.25	-2.56	16	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0245	0.9755	0.0000	0	0	0.6977	0.3023	0.0000	0	0	0.9155	0.0845	0.0000
chr8	123369918	T	TTCA	0.500000	0.100	1	3	1	346	93	253	11	39	15	0	28	0	0	251	1	1	0.1183	0.0000	0.0079	5.067	0.36	3.29	-2.92	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7029	0.2838	0.0133	1	0	0.6918	0.2929	0.0152	1	0	0.6763	0.3054	0.0182
chr8	123369918	TTCA	T	0.500000	0.100	1	-3	1	346	98	248	34	7	15	0	42	0	0	247	0	1	0.3469	0.0000	0.0040	5.400	2.18	2.98	-0.80	20	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1527	0.5924	0.2549	1	1	0.1572	0.5855	0.2573	1	1	0.1631	0.5768	0.2601
chr8	132948840	GGAT	G	0.500000	0.100	1	-3	1	203	97	106	59	0	0	0	38	0	0	106	0	0	0.6082	0.0000	0.0000	97.000	0.47	3.84	-3.37	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7057	0.2833	0.0110	1	0	0.6954	0.2919	0.0127	1	0	0.6809	0.3037	0.0154
chr8	137837732	C	CCTT	0.500000	0.100	1	3	1	364	163	201	18	0	1	0	144	0	0	194	0	7	0.1104	0.0000	0.0348	162.000	0.06	3.34	-3.28	10	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9859	0.0141
chr8	140458378	T	TGTGACCCTCACGGTACCCCCC	0.500000	0.100	1	21	5	570	153	417	70	0	19	0	64	0	0	416	0	1	0.4575	0.0000	0.0024	7.053	0.59	10.67	-10.09	24	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2679	0.6327	0.0994	1	1	0.2720	0.6230	0.1049	1	1	0.2769	0.6107	0.1123
chr8	143429783	ATGG	A	0.500000	0.100	1	-3	2	442	115	327	0	0	17	5	93	0	0	320	1	6	0.0000	0.0000	0.0214	5.765		4.46		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0047	0.9953	2	2	0.0000	0.0053	0.9947	2	2	0.0000	0.0061	0.9939
chr8	143567371	G	GC	0.500000	0.100	1	1	1	398	112	286	64	1	4	1	42	0	0	285	0	1	0.5714	0.0000	0.0035	26.750	2.86	3.86	-1.00	20	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6966	0.2928	0.0106	1	0	0.6870	0.3007	0.0123	1	0	0.6734	0.3117	0.0149
chr8	143569978	A	AGGCTGCGGGTCGTCCG	0.500000	0.100	1	16	1	877	149	728	88	0	2	1	58	0	0	706	0	22	0.5906	0.0000	0.0302	147.000	0.28	11.57	-11.28	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2750	0.6515	0.0735	1	1	0.2806	0.6405	0.0789	1	1	0.2872	0.6265	0.0863
chr8	143859347	CGGGCCT	C	0.500000	0.100	1	-6	3	929	43	886	20	0	5	5	13	0	0	883	0	3	0.4651	0.0000	0.0034	7.600	0.85	6.15	-5.30	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2036	0.5489	0.2475	1	1	0.2061	0.5452	0.2487	1	1	0.2094	0.5406	0.2501
chr9	117366	C	CCG	0.163682	0.100	1	2	3	981	198	783	115	1	6	10	66	0	0	779	2	2	0.5808	0.0000	0.0051	37.800	0.64	3.11	-2.46	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9164	0.0835	0.0002	1	0	0.9113	0.0885	0.0002	1	0	0.9038	0.0959	0.0003
chr9	117370	GCC	G	0.163813	0.100	1	-2	4	982	192	790	110	7	2	7	66	0	0	784	1	5	0.5729	0.0000	0.0076	94.000	0.52	3.44	-2.92	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9278	0.0721	0.0001	1	0	0.9229	0.0769	0.0002	1	0	0.9157	0.0841	0.0002
chr9	12704544	GA	G	0.500000	0.100	1	-1	3	180	85	95	43	0	4	0	38	0	0	95	0	0	0.5059	0.0000	0.0000	20.250	0.14	1.11	-0.97	27	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3141	0.5693	0.1166	1	1	0.3146	0.5641	0.1213	1	1	0.3148	0.5574	0.1277
chr9	12775862	T	TGGCGGCGGC	0.500000	0.100	1	9	2	312	91	221	35	0	25	0	31	0	0	218	0	3	0.3846	0.0000	0.0136	2.640	0.34	7.65	-7.30	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2293	0.5826	0.1881	1	1	0.2319	0.5765	0.1916	1	1	0.2351	0.5687	0.1962
chr9	20414312	ACTG	A	0.500000	0.100	1	-3	1	715	201	514	140	9	35	1	16	0	0	512	0	2	0.6965	0.0000	0.0039	4.882	1.59	3.25	-1.66	34	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0068	0.9932	0.0000
chr9	20414345	A	ACTG	0.500000	0.100	1	3	1	687	212	475	80	7	52	4	69	0	0	475	0	0	0.3774	0.0000	0.0000	3.098	0.70	2.88	-2.18	38	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4602	0.5101	0.0297	1	1	0.4601	0.5069	0.0330	1	1	0.4589	0.5033	0.0378
chr9	33575338	CA	C	0.500000	0.100	1	-1	3	879	268	611	136	0	5	0	127	0	0	610	1	0	0.5075	0.0000	0.0016	52.600	0.85	1.66	-0.82	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2219	0.7327	0.0454	1	1	0.2323	0.7171	0.0506	1	1	0.2453	0.6969	0.0579
chr9	33796692	TGAG	T	0.500000	0.100	1	-3	1	488	162	326	92	0	4	0	66	0	0	321	0	5	0.5679	0.0000	0.0153	39.500	1.42	3.21	-1.79	28	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6368	0.3533	0.0099	1	0	0.6312	0.3573	0.0115	1	0	0.6227	0.3632	0.0141
chr9	35560263	TGGCCCG	T	0.500000	0.100	1	-6	1	640	144	496	77	0	4	0	63	0	0	494	0	2	0.5347	0.0000	0.0040	35.000	0.39	6.03	-5.64	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4321	0.5279	0.0400	1	1	0.4320	0.5241	0.0439	1	1	0.4308	0.5198	0.0494
chr9	35674193	CGGAGAGGAGGATCTACCT	C	0.500000	0.100	1	-18	3	476	156	320	125	0	22	0	9	0	0	320	0	0	0.8013	0.0000	0.0000	6.091	0.22	13.44	-13.23	1	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0342	0.9658	0.0000	0	0	0.5718	0.4282	0.0000
chr9	35811488	ACCAGGACCAGAG	A	0.500000	0.100	1	-12	1	772	178	594	72	0	29	0	77	0	0	590	0	4	0.4045	0.0000	0.0067	5.138	0.28	11.21	-10.93	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0578	0.5978	0.3444	1	1	0.0625	0.5899	0.3475	1	1	0.0691	0.5801	0.3508
chr9	65283162	AG	A	0.500000	0.100	1	-1	3	390	60	330	28	0	0	0	32	0	0	330	0	0	0.4667	0.0000	0.0000	60.000	0.68	1.19	-0.51	28	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1389	0.5542	0.3069	1	1	0.1431	0.5501	0.3068	1	1	0.1488	0.5449	0.3063
chr9	76703459	GGTGACAGCCTGCAAC	G	0.500000	0.100	1	-15	3	415	106	309	0	0	1	0	105	0	0	298	0	11	0.0000	0.0000	0.0356	105.000		14.17		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0027	0.9973	2	2	0.0000	0.0030	0.9970	2	2	0.0000	0.0036	0.9964
chr9	76709219	A	ATGACTGTTGCAG	0.500000	0.100	1	12	1	714	171	543	92	0	10	0	69	0	0	531	0	12	0.5380	0.0000	0.0221	16.100	0.28	9.25	-8.96	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3726	0.5853	0.0421	1	1	0.3761	0.5777	0.0462	1	1	0.3795	0.5684	0.0521
chr9	77384631	G	GTGA	0.500000	0.100	1	3	1	501	192	309	100	6	34	0	52	0	0	309	0	0	0.5208	0.0000	0.0000	4.647	0.34	3.06	-2.72	66	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9798	0.0202	0.0000	1	0	0.9767	0.0233	0.0000	1	0	0.9717	0.0283	0.0001
chr9	86322936	ATTT	A	0.500000	0.100	1	-3	2	468	122	346	49	0	2	0	71	0	0	343	0	3	0.4016	0.0000	0.0087	60.000	0.35	3.34	-2.99	13	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0054	0.2334	0.7612	1	2	0.0064	0.2422	0.7514	1	2	0.0081	0.2546	0.7373
chr9	88130024	A	AAGG	0.500000	0.100	1	3	1	1221	314	907	174	0	12	4	124	1	0	902	0	4	0.5541	0.0011	0.0055	25.167	0.67	3.33	-2.66	28	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8888	0.1110	0.0002	1	0	0.8835	0.1162	0.0002	1	0	0.8755	0.1241	0.0004
chr9	88647428	A	ATGG	0.500000	0.100	1	3	1	247	81	166	42	0	0	1	38	0	0	165	0	1	0.5185	0.0000	0.0060	81.000	0.07	3.71	-3.64	20	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2425	0.5945	0.1630	1	1	0.2451	0.5875	0.1674	1	1	0.2483	0.5786	0.1730
chr9	92474742	C	CTCA	0.500000	0.100	1	3	2	321	83	238	49	3	21	0	10	0	0	238	0	0	0.5904	0.0000	0.0000	2.952	0.29	2.40	-2.11	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0007	0.9993	0.0000	0	1	0.0004	0.9996	0.0000	0	1	0.0201	0.9799	0.0000
chr9	93259450	TTGCCCCCGCAACCCACACGGCCCCCTCAACCTGTGC	T	0.500000	0.100	1	-36	1	485	118	367	56	1	15	0	46	0	0	367	0	0	0.4746	0.0000	0.0000	6.800	0.61	5.26	-4.65	24	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4440	0.5038	0.0522	1	1	0.4413	0.5023	0.0564	1	1	0.4370	0.5007	0.0622
chr9	93676722	C	CCCTGCCTCCACCACA	0.500000	0.100	1	15	4	411	166	245	1	0	3	0	162	0	0	245	0	0	0.0060	0.0000	0.0000	54.333	2.00	9.00	-7.00	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0024	0.9976	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0007	0.9993
chr9	94318662	GAGA	G	0.500000	0.100	1	-3	2	888	320	568	219	0	2	0	99	0	0	566	0	2	0.6844	0.0000	0.0035	159.000	0.64	3.18	-2.54	51	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9999	0.0001	0.0000	1	0	0.9999	0.0001	0.0000	1	0	0.9998	0.0002	0.0000
chr9	97330686	A	AGAGGAG	0.500000	0.100	1	6	2	387	107	280	6	0	13	1	87	0	0	280	0	0	0.0561	0.0000	0.0000	7.231	0.17	5.86	-5.70	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.8784	0.1216	2	2	0.0000	0.3932	0.6068
chr9	97854418	AGCCGCC	A	0.500000	0.100	1	-6	1	875	136	739	49	1	32	2	52	1	3	728	1	6	0.3603	0.0014	0.0149	3.219	1.69	6.52	-4.83	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0868	0.5854	0.3278	1	1	0.0918	0.5788	0.3294	1	1	0.0986	0.5706	0.3308
chr9	104598487	GT	G	0.500000	0.100	1	-1	2	508	140	368	88	0	1	0	51	0	0	368	0	0	0.6286	0.0000	0.0000	139.000	0.32	2.78	-2.47	56	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9077	0.0917	0.0006	1	0	0.8998	0.0995	0.0008	1	0	0.8880	0.1109	0.0011
chr9	104605111	TGTTA	T	0.500000	0.100	1	-4	1	924	211	713	138	0	2	0	71	0	0	711	0	2	0.6540	0.0000	0.0028	104.500	0.36	4.38	-4.02	30	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9911	0.0089	0.0000	1	0	0.9895	0.0105	0.0000	1	0	0.9868	0.0132	0.0000
chr9	104605383	AGC	A	0.500000	0.100	1	-2	1	861	219	642	117	0	4	4	94	0	0	641	0	1	0.5342	0.0000	0.0016	53.250	0.17	2.97	-2.80	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5178	0.4693	0.0129	1	0	0.5188	0.4663	0.0149	1	0	0.5187	0.4633	0.0180
chr9	110138061	G	GGAAGCT	0.500000	0.100	1	6	1	599	144	455	123	0	14	0	7	0	0	454	0	1	0.8542	0.0000	0.0022	9.286	0.21	6.00	-5.79	13	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0851	0.9149	0.0000	0	0	0.6972	0.3028	0.0000
chr9	112453942	GATTA	G	0.500000	0.100	1	-4	1	248	94	154	0	0	3	0	91	0	0	151	0	3	0.0000	0.0000	0.0195	30.333		3.84		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0082	0.9918	2	2	0.0000	0.0091	0.9909	2	2	0.0000	0.0103	0.9897
chr9	117414630	C	CGCG	0.500000	0.100	1	3	1	272	97	175	41	5	12	1	38	0	0	172	1	2	0.4227	0.0000	0.0171	7.083	1.39	3.61	-2.22	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2933	0.5834	0.1233	1	1	0.2948	0.5771	0.1281	1	1	0.2962	0.5692	0.1345
chr9	120714264	ACGGCGG	A	0.500000	0.100	1	-6	1	463	100	363	0	0	14	1	85	0	0	362	0	1	0.0000	0.0000	0.0028	6.143		5.73		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0117	0.9883	2	2	0.0000	0.0128	0.9872	2	2	0.0000	0.0145	0.9855
chr9	122093051	G	GTGGCCT	0.500000	0.100	1	6	1	669	165	504	147	3	11	0	4	0	0	503	0	1	0.8909	0.0000	0.0020	13.909	0.64	6.25	-5.61	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0302	0.9698	0.0000	0	0	0.8969	0.1031	0.0000	0	0	0.9831	0.0169	0.0000
chr9	122511106	A	AT	0.500000	0.100	1	1	1	1688	380	1308	327	5	31	0	17	0	0	1308	0	0	0.8605	0.0000	0.0000	11.161	0.57	1.18	-0.61	115	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1918	0.8082	0.0000	0	0	0.9946	0.0054	0.0000
chr9	122629491	C	CA	0.500000	0.100	1	1	1	532	123	409	60	2	8	3	50	0	0	406	0	3	0.4878	0.0000	0.0073	14.250	0.28	1.72	-1.44	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3136	0.5962	0.0902	1	1	0.3158	0.5889	0.0953	1	1	0.3180	0.5797	0.1023
chr9	127507286	GCCGCCC	G	0.500000	0.100	1	-6	1	517	158	359	84	0	5	0	69	0	0	356	0	3	0.5316	0.0000	0.0084	30.600	0.44	5.87	-5.43	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4165	0.5449	0.0386	1	1	0.4176	0.5399	0.0424	1	1	0.4181	0.5340	0.0479
chr9	128258516	GCCT	G	0.500000	0.100	1	-3	2	545	208	337	178	2	16	2	10	1	0	335	0	1	0.8558	0.0030	0.0059	11.938	0.51	3.80	-3.29	48	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0085	0.9915	0.0000	0	0	0.6110	0.3890	0.0000
chr9	129177481	GGCGGCA	G	0.500000	0.100	1	-6	1	642	185	457	167	0	14	0	4	0	0	457	0	0	0.9027	0.0000	0.0000	12.214	1.37	6.50	-5.13	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4078	0.5922	0.0000	0	0	0.9835	0.0165	0.0000	0	0	0.9961	0.0039	0.0000
chr9	129868385	TGAC	T	0.500000	0.100	1	-3	2	475	156	319	6	0	5	0	145	0	0	315	0	4	0.0385	0.0000	0.0125	30.200	0.00	3.18	-3.18	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9968	0.0032	2	2	0.0000	0.2585	0.7415	2	2	0.0000	0.0329	0.9671
chr9	130265925	CGGCAGT	C	0.500000	0.100	1	-6	1	676	217	459	89	1	20	0	107	0	0	455	0	4	0.4101	0.0000	0.0087	9.850	0.18	7.42	-7.24	61	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0092	0.3969	0.5938	1	2	0.0108	0.3977	0.5915	1	2	0.0133	0.3996	0.5872
chr9	130668313	G	GGT	0.500000	0.100	1	2	1	268	100	168	51	4	9	0	36	0	0	168	0	0	0.5100	0.0000	0.0000	10.111	0.35	1.97	-1.62	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6654	0.3189	0.0157	1	0	0.6556	0.3266	0.0179	1	0	0.6417	0.3371	0.0212
chr9	130681605	T	TCGC	0.500000	0.100	1	3	1	449	128	321	80	8	37	0	3	0	0	321	0	0	0.6250	0.0000	0.0000	2.459	1.26	3.33	-2.07	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1017	0.8983	0.0000	0	0	0.7687	0.2313	0.0000	0	0	0.9125	0.0875	0.0000
chr9	133255669	CG	C	0.500000	0.100	1	-1	1	636	166	470	159	1	2	0	4	0	0	470	0	0	0.9578	0.0000	0.0000	82.000	1.45	1.25	0.20	25	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3350	0.6650	0.0000	0	0	0.9768	0.0232	0.0000	0	0	0.9945	0.0055	0.0000
chr9	133257521	T	TC	0.500000	0.100	1	1	4	265	112	153	107	0	0	0	5	0	0	153	0	0	0.9554	0.0000	0.0000	112.000	0.97	1.00	-0.03	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0035	0.9965	0.0000	0	0	0.5060	0.4940	0.0000	0	0	0.8791	0.1209	0.0000
chr9	133257521	T	TC	0.500000	0.100	1	1	4	265	112	153	107	0	0	0	5	0	0	153	0	0	0.9554	0.0000	0.0000	112.000	0.97	1.00	-0.03	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0035	0.9965	0.0000	0	0	0.5060	0.4940	0.0000	0	0	0.8791	0.1209	0.0000
chr9	135549839	G	GC	0.500000	0.100	1	1	1	320	141	179	73	0	2	0	66	0	0	177	0	2	0.5177	0.0000	0.0112	69.500	0.14	1.70	-1.56	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2629	0.6395	0.0976	1	1	0.2675	0.6293	0.1032	1	1	0.2729	0.6164	0.1107
chr9	136341024	TC	T	0.500000	0.100	1	-1	1	212	63	149	56	1	3	0	3	0	0	148	0	1	0.8889	0.0000	0.0067	20.000	1.09	3.00	-1.91	14	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0028	0.9972	0.0000	0	1	0.1989	0.8011	0.0000	0	0	0.5511	0.4489	0.0000
chr9	136383542	CGCT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	524	163	361	134	0	15	1	13	0	0	360	0	1	0.8221	0.0000	0.0028	9.867	0.37	3.31	-2.93	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0425	0.9575	0.0000
chr9	138023718	TGGAGAAGGAGACCAC	T	0.500000	0.100	1	-15	1	428	125	303	52	2	7	1	63	0	0	298	0	5	0.4160	0.0000	0.0165	16.714	0.63	14.08	-13.44	18	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0261	0.4329	0.5410	1	2	0.0290	0.4347	0.5362	1	2	0.0334	0.4376	0.5290
chr10	7563115	T	TC	0.013494	0.100	1	1	1	371	100	271	51	0	0	0	49	0	0	268	0	3	0.5100	0.0000	0.0111	100.000	1.00	1.29	-0.29	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3482	0.6460	0.0058	1	1	0.3578	0.6363	0.0059	1	1	0.3700	0.6240	0.0061
chr10	21146411	ACACT	A	0.189476	0.100	1	-4	3	218	84	134	51	0	0	0	33	0	0	133	0	1	0.6071	0.0000	0.0075	84.000	0.04	4.55	-4.51	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7379	0.2561	0.0059	1	0	0.7309	0.2624	0.0067	1	0	0.7211	0.2711	0.0078
chr10	21516537	C	CCCTCCT	0.481720	0.100	1	6	6	893	213	680	13	0	27	0	173	0	0	668	1	11	0.0610	0.0000	0.0176	7.154	0.38	5.41	-5.03	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9899	0.0101	2	2	0.0000	0.3454	0.6546
chr10	22209555	C	CAGA	0.259534	0.100	1	3	1	668	146	522	137	0	1	0	8	0	0	521	0	1	0.9384	0.0000	0.0019	145.000	0.71	3.75	-3.04	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1556	0.8444	0.0000	0	0	0.8721	0.1279	0.0000
chr10	27147532	TGC	T	0.011654	0.100	1	-2	1	346	142	204	67	0	1	1	73	0	0	204	0	0	0.4718	0.0000	0.0000	141.000	0.09	2.27	-2.18	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1965	0.7942	0.0093	1	1	0.2092	0.7814	0.0094	1	1	0.2264	0.7642	0.0094
chr10	30027571	A	ACTG	0.007813	0.100	1	3	1	877	172	705	127	11	28	0	6	0	0	705	0	0	0.7384	0.0000	0.0000	5.143	0.42	3.33	-2.92	7	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1897	0.8103	0.0000	0	0	0.9953	0.0047	0.0000	0	0	0.9995	0.0005	0.0000
chr10	47502280	CG	C	0.024504	0.100	1	-1	1	566	143	423	112	1	1	0	29	0	0	423	0	0	0.7832	0.0000	0.0000	142.000	0.45	1.10	-0.66	50	0/1	0/0	.	.	OK	0	1	0.3861	0.6139	0.0000	0	1	0.0016	0.9984	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000
chr10	53807071	A	AGTT	0.002532	0.100	1	3	2	363	100	263	55	0	4	0	41	0	0	263	0	0	0.5500	0.0000	0.0000	24.000	0.13	2.76	-2.63	29	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7138	0.2861	0.0001	1	0	0.7101	0.2898	0.0001	1	0	0.7047	0.2951	0.0001
chr10	53822122	CGTT	C	0.003336	0.100	1	-3	1	595	155	440	83	0	1	0	71	0	0	439	0	1	0.5355	0.0000	0.0023	154.000	0.18	3.04	-2.86	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5809	0.4189	0.0002	1	0	0.5846	0.4152	0.0002	1	0	0.5887	0.4111	0.0003
chr10	62217153	TAGCTTC	T	0.152769	0.100	1	-6	3	132	51	81	36	0	0	0	15	0	0	77	1	3	0.7059	0.0000	0.0494	51.000	1.03	6.53	-5.51	22	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7736	0.2217	0.0048	1	0	0.7653	0.2293	0.0054	1	0	0.7538	0.2399	0.0063
chr10	73130825	G	GC	0.008232	0.100	1	1	1	186	72	114	39	0	5	0	28	0	0	113	0	1	0.5417	0.0000	0.0088	13.400	0.51	1.21	-0.70	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6564	0.3429	0.0008	1	0	0.6534	0.3458	0.0008	1	0	0.6491	0.3500	0.0009
chr10	73240978	AGCGGAG	A	0.006364	0.100	1	-6	3	184	98	86	94	0	1	0	3	0	0	86	0	0	0.9592	0.0000	0.0000	97.000	0.14	16.00	-15.86	50	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9561	0.0439	0.0000	0	0	0.9984	0.0016	0.0000	0	0	0.9995	0.0005	0.0000
chr10	73240989	ACCAGTCTCT	A	0.006454	0.100	1	-9	1	184	88	96	85	0	0	0	3	0	0	95	0	1	0.9659	0.0000	0.0104	88.000	0.15	16.00	-15.85	45	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.6189	0.3811	0.0000	0	0	0.9935	0.0065	0.0000	0	0	0.9986	0.0014	0.0000
chr10	75022147	GGAA	G	0.161983	0.100	1	-3	1	359	70	289	24	0	16	0	30	0	0	288	0	1	0.3429	0.0000	0.0035	3.375	0.12	3.07	-2.94	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2040	0.6381	0.1579	1	1	0.2120	0.6324	0.1556	1	1	0.2227	0.6251	0.1523
chr10	75401342	GCCGCCT	G	0.008076	0.100	1	-6	2	490	195	295	90	5	10	0	90	1	1	292	1	0	0.4615	0.0034	0.0102	18.100	0.28	5.28	-5.00	22	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3987	0.6001	0.0012	1	1	0.4105	0.5882	0.0013	1	1	0.4252	0.5734	0.0014
chr10	75782995	TC	T	0.002156	0.100	1	-1	1	190	88	102	85	0	1	0	2	0	0	102	0	0	0.9659	0.0000	0.0000	87.000	0.08	1.00	-0.92	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9976	0.0024	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr10	89738145	C	CTAAAAG	0.255522	0.100	1	6	1	707	148	559	6	0	3	0	139	0	0	549	0	10	0.0405	0.0000	0.0179	48.333	0.33	5.73	-5.39	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9989	0.0011	2	1	0.0000	0.5040	0.4960	2	2	0.0000	0.0903	0.9097
chr10	89738577	AAAG	A	0.001385	0.100	1	-3	4	489	97	392	37	0	16	0	44	0	0	391	0	1	0.3814	0.0000	0.0026	5.062	1.86	4.59	-2.73	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2317	0.7667	0.0016	1	1	0.2428	0.7557	0.0015	1	1	0.2575	0.7409	0.0015
chr10	97572621	TGGC	T	0.015823	0.100	1	-3	3	474	153	321	86	0	3	0	64	0	0	319	0	2	0.5621	0.0000	0.0062	50.000	0.43	3.03	-2.60	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7721	0.2277	0.0002	1	0	0.7685	0.2313	0.0003	1	0	0.7630	0.2366	0.0003
chr10	103350983	A	AGGAGGC	0.474578	0.100	1	6	1	350	88	262	74	0	9	0	5	1	0	261	0	0	0.8409	0.0038	0.0038	8.778	0.77	4.80	-4.03	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0008	0.9992	0.0000	0	1	0.1861	0.8139	0.0000	0	0	0.6300	0.3700	0.0000
chr10	103473417	T	TGGGGGCTCAGGCACTGCG	0.015096	0.100	1	18	1	408	138	270	63	0	19	0	56	0	0	257	0	13	0.4565	0.0000	0.0481	6.263	0.79	14.16	-13.37	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2190	0.7700	0.0110	1	1	0.2315	0.7574	0.0111	1	1	0.2482	0.7406	0.0112
chr10	104263071	AGAG	A	0.030712	0.100	1	-3	1	131	55	76	26	0	9	0	20	0	0	76	0	0	0.4727	0.0000	0.0000	5.111	0.15	3.45	-3.30	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5804	0.4140	0.0056	1	0	0.5788	0.4153	0.0058	1	0	0.5765	0.4173	0.0062
chr10	113679881	CTT	C	0.228152	0.100	1	-2	1	353	152	201	90	0	4	0	58	0	0	201	0	0	0.5921	0.0000	0.0000	37.000	0.90	2.55	-1.65	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8987	0.1009	0.0005	1	0	0.8922	0.1072	0.0006	1	0	0.8829	0.1163	0.0008
chr10	119670135	A	AGCG	0.000723	0.100	1	3	1	284	99	185	45	1	10	0	43	0	0	183	0	2	0.4545	0.0000	0.0108	8.900	0.44	3.70	-3.25	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4137	0.5860	0.0002	1	1	0.4210	0.5787	0.0003	1	1	0.4302	0.5696	0.0003
chr10	124021236	C	CG	0.056607	0.100	1	1	1	328	77	251	8	47	12	1	9	0	3	246	2	0	0.1039	0.0000	0.0199	1.636	1.62	1.78	-0.15	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0045	0.9955	0.0000	0	1	0.0065	0.9935	0.0000	0	1	0.2314	0.7686	0.0000
chr10	124021236	CG	C	0.538577	0.100	1	-1	1	328	78	250	8	11	10	3	46	0	0	248	0	2	0.1026	0.0000	0.0080	6.500	0.62	2.28	-1.66	6	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0010	0.1025	0.8965	1	2	0.0011	0.2753	0.7236	2	1	0.0005	0.7806	0.2189
chr10	125026590	A	AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG	0.127285	0.100	1	21	2	648	126	522	68	0	8	0	50	1	0	507	0	14	0.5397	0.0019	0.0287	14.750	0.65	14.74	-14.09	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4176	0.5597	0.0226	1	1	0.4243	0.5518	0.0239	1	1	0.4324	0.5420	0.0256
chr10	132330314	GAA	G	0.000450	0.100	1	-2	1	507	129	378	78	0	4	0	47	0	0	375	0	3	0.6047	0.0000	0.0079	31.250	0.32	2.28	-1.96	32	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8954	0.1046	0.0000	1	0	0.8897	0.1103	0.0000	1	0	0.8814	0.1186	0.0000
chr11	209894	ACCC	A	0.342592	0.100	1	-3	2	787	184	603	164	0	9	0	11	0	0	603	0	0	0.8913	0.0000	0.0000	19.444	0.30	2.73	-2.43	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0539	0.9461	0.0000	0	0	0.8250	0.1750	0.0000
chr11	281784	GAGA	G	0.001770	0.100	1	-3	2	461	114	347	91	1	14	0	8	0	0	347	0	0	0.7982	0.0000	0.0000	7.143	0.70	3.00	-2.30	13	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0012	0.9988	0.0000	0	0	0.9178	0.0822	0.0000	0	0	0.9965	0.0035	0.0000
chr11	608502	CGGACGCGCTCTG	C	0.049275	0.100	1	-12	1	667	167	500	86	0	18	1	62	0	0	498	0	2	0.5150	0.0000	0.0040	8.222	0.26	10.82	-10.57	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7874	0.2120	0.0006	1	0	0.7831	0.2162	0.0007	1	0	0.7767	0.2225	0.0009
chr11	704604	GA	G	0.439706	0.100	1	-1	2	265	88	177	49	0	1	0	38	0	0	177	0	0	0.5568	0.0000	0.0000	87.000	0.31	2.13	-1.83	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4981	0.4578	0.0442	1	0	0.4939	0.4585	0.0476	1	0	0.4878	0.4596	0.0526
chr11	1051657	A	AC	0.136986	0.100	1	1	1	559	179	380	80	13	6	2	78	0	0	379	1	0	0.4469	0.0000	0.0026	26.833	0.86	2.06	-1.20	30	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5017	0.4877	0.0107	1	0	0.5071	0.4813	0.0116	1	0	0.5132	0.4737	0.0131
chr11	1051657	AC	A	0.061644	0.100	1	-1	1	559	183	376	85	80	6	0	12	0	1	375	0	0	0.4645	0.0000	0.0027	29.167	0.95	2.00	-1.05	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1113	0.8887	0.0000	0	0	0.9384	0.0616	0.0000
chr11	1597942	ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG	A	0.542785	0.100	1	-30	2	993	209	784	69	1	78	0	61	0	0	784	0	0	0.3301	0.0000	0.0000	1.679	0.67	7.28	-6.61	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3409	0.5891	0.0701	1	1	0.3421	0.5826	0.0753	1	1	0.3429	0.5745	0.0825
chr11	1630355	CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA	C	0.088777	0.100	1	-30	1	1048	207	841	10	0	89	4	104	0	0	790	0	51	0.0483	0.0000	0.0606	1.326	3.70	17.91	-14.21	10	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9936	0.0064	2	1	0.0000	0.7382	0.2618
chr11	2884878	CGGGGCCGGGGCT	C	0.000415	0.100	1	-12	2	519	103	416	48	0	12	4	39	1	0	413	1	1	0.4660	0.0024	0.0072	7.333	2.02	11.23	-9.21	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4953	0.5046	0.0001	1	1	0.4997	0.5002	0.0001	1	0	0.5050	0.4949	0.0001
chr11	2884917	G	GGCCGGA	0.000033	0.100	1	6	4	538	118	420	49	4	22	1	42	0	2	414	0	4	0.4153	0.0000	0.0143	4.273	2.04	10.43	-8.39	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5674	0.4326	0.0000	1	0	0.5693	0.4307	0.0000	1	0	0.5713	0.4287	0.0000
chr11	3640355	A	ATGG	0.500000	0.100	1	3	2	339	98	241	0	0	3	0	95	0	0	239	0	2	0.0000	0.0000	0.0083	31.667		3.31		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0071	0.9929	2	2	0.0000	0.0078	0.9922	2	2	0.0000	0.0090	0.9910
chr11	4571476	T	TAC	0.500000	0.100	1	2	1	198	94	104	83	0	1	0	10	0	0	104	0	0	0.8830	0.0000	0.0000	93.000	0.18	2.00	-1.82	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0015	0.9985	0.0000	0	1	0.0840	0.9160	0.0000
chr11	4769643	CG	C	0.500000	0.100	1	-1	1	637	143	494	77	0	1	0	65	0	0	493	0	1	0.5385	0.0000	0.0020	142.000	0.21	4.46	-4.25	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4051	0.5491	0.0458	1	1	0.4059	0.5442	0.0499	1	1	0.4060	0.5382	0.0558
chr11	4860474	AG	A	0.500000	0.100	1	-1	3	1345	410	935	379	3	9	0	19	0	0	935	0	0	0.9244	0.0000	0.0000	44.333	0.23	1.21	-0.98	81	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2466	0.7534	0.0000	0	0	0.9983	0.0017	0.0000
chr11	5070346	A	AC	0.500000	0.100	1	1	1	1246	289	957	134	1	5	0	149	0	0	957	0	0	0.4637	0.0000	0.0000	56.600	0.17	2.58	-2.41	28	0/1	1/1	.	.	OK	1	1	0.0193	0.6458	0.3349	1	1	0.0222	0.6328	0.3450	1	1	0.0266	0.6166	0.3568
chr11	5151565	A	AC	0.500000	0.100	1	1	1	519	138	381	69	1	4	1	63	0	0	381	0	0	0.5000	0.0000	0.0000	33.500	1.29	2.05	-0.76	45	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2908	0.6202	0.0889	1	1	0.2944	0.6113	0.0943	1	1	0.2985	0.6000	0.1015
chr11	5178110	A	AATGCCC	0.500000	0.100	1	6	1	1633	381	1252	200	1	15	0	165	0	0	1241	0	11	0.5249	0.0000	0.0088	24.333	0.14	5.76	-5.62	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4729	0.5235	0.0036	1	1	0.4838	0.5117	0.0045	1	1	0.4960	0.4982	0.0059
chr11	5178587	GC	G	0.500000	0.100	1	-1	2	1109	284	825	131	0	10	0	143	0	0	824	0	1	0.4613	0.0000	0.0012	27.400	0.89	2.18	-1.29	39	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0238	0.6637	0.3125	1	1	0.0271	0.6503	0.3226	1	1	0.0320	0.6334	0.3346
chr11	5343311	CCAGCCCCAGGTCTGTGG	C	0.500000	0.100	1	-17	3	535	147	388	134	0	8	0	5	0	0	387	0	1	0.9116	0.0000	0.0026	17.375	0.30	17.60	-17.30	22	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0015	0.9985	0.0000	0	0	0.5755	0.4245	0.0000	0	0	0.9341	0.0659	0.0000
chr11	5403157	T	TTATC	0.500000	0.100	1	4	1	1771	385	1386	193	1	25	2	164	0	0	1379	0	7	0.5013	0.0000	0.0051	14.400	0.35	4.13	-3.79	51	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3965	0.5973	0.0061	1	1	0.4093	0.5832	0.0075	1	1	0.4242	0.5662	0.0096
chr11	5454410	CA	C	0.500000	0.100	1	-1	3	394	77	317	5	0	2	0	70	0	0	317	0	0	0.0649	0.0000	0.0000	37.500	0.20	1.29	-1.09	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9995	0.0005	2	1	0.0000	0.8610	0.1390	2	2	0.0000	0.4529	0.5471
chr11	6546665	C	CTGCCCTACTGCA	0.500000	0.100	1	12	2	772	135	637	0	0	13	0	122	0	0	617	0	20	0.0000	0.0000	0.0314	9.385		8.43		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0007	0.9993	2	2	0.0000	0.0008	0.9992	2	2	0.0000	0.0010	0.9990
chr11	6795057	CAG	C	0.500000	0.100	1	-2	1	762	159	603	141	1	8	0	9	0	0	603	0	0	0.8868	0.0000	0.0000	18.875	0.26	2.11	-1.86	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0768	0.9232	0.0000	0	0	0.7531	0.2469	0.0000
chr11	7796091	CA	C	0.500000	0.100	1	-1	1	634	170	464	90	1	2	0	77	1	0	462	0	1	0.5294	0.0022	0.0043	83.500	0.20	1.40	-1.20	38	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4430	0.5272	0.0298	1	1	0.4440	0.5228	0.0331	1	1	0.4443	0.5177	0.0380
chr11	9091461	GGCA	G	0.500000	0.100	1	-3	1	236	110	126	0	0	11	1	98	0	0	126	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	9.000		4.18		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0064	0.9936	2	2	0.0000	0.0071	0.9929	2	2	0.0000	0.0081	0.9919
chr11	12294797	G	GCTC	0.500000	0.100	1	3	1	571	162	409	59	17	47	0	39	0	0	406	0	3	0.3642	0.0000	0.0073	2.447	0.54	3.31	-2.77	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8910	0.1079	0.0010	1	0	0.8821	0.1166	0.0013	1	0	0.8690	0.1291	0.0018
chr11	20159199	TAAG	T	0.500000	0.100	1	-3	3	180	74	106	46	0	0	0	28	0	0	105	0	1	0.6216	0.0000	0.0094	74.000	0.33	3.04	-2.71	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6369	0.3412	0.0219	1	0	0.6268	0.3486	0.0246	1	0	0.6129	0.3586	0.0285
chr11	27362901	TTCATCCACGTCTTCCTCA	T	0.500000	0.100	1	-18	1	519	184	335	166	0	13	0	5	0	0	335	0	0	0.9022	0.0000	0.0000	13.154	0.34	14.60	-14.26	58	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0659	0.9341	0.0000	0	0	0.9511	0.0489	0.0000	0	0	0.9922	0.0078	0.0000
chr11	48264429	CCTT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	811	224	587	105	0	10	0	109	0	0	585	0	2	0.4688	0.0000	0.0034	21.400	0.30	3.67	-3.37	41	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0679	0.7094	0.2227	1	1	0.0738	0.6952	0.2311	1	1	0.0819	0.6767	0.2414
chr11	55839334	TATCTC	T	0.500000	0.100	1	-5	2	772	192	580	182	0	0	0	10	0	0	580	0	0	0.9479	0.0000	0.0000	192.000	0.46	4.80	-4.34	28	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1748	0.8252	0.0000	0	0	0.9180	0.0820	0.0000
chr11	56413160	A	ACT	0.500000	0.100	1	2	4	1526	323	1203	0	0	7	3	313	0	0	1186	0	17	0.0000	0.0000	0.0141	45.000		2.40		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr11	58031636	AC	A	0.500000	0.100	1	-1	1	701	169	532	88	1	2	0	78	0	0	532	0	0	0.5207	0.0000	0.0000	83.500	0.28	1.32	-1.04	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3786	0.5784	0.0430	1	1	0.3816	0.5714	0.0471	1	1	0.3843	0.5627	0.0530
chr11	58214768	TCAGATCGG	T	0.500000	0.100	1	-8	2	534	134	400	78	0	3	0	53	0	0	396	0	4	0.5821	0.0000	0.0100	43.667	1.22	8.92	-7.71	54	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6670	0.3226	0.0104	1	0	0.6593	0.3287	0.0120	1	0	0.6481	0.3373	0.0146
chr11	59457656	GC	G	0.500000	0.100	1	-1	4	606	145	461	87	0	3	0	55	0	0	460	0	1	0.6000	0.0000	0.0022	47.333	0.21	1.58	-1.37	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8422	0.1560	0.0018	1	0	0.8329	0.1648	0.0022	1	0	0.8195	0.1775	0.0030
chr11	59843948	GATTC	G	0.500000	0.100	1	-4	1	268	119	149	61	0	0	0	58	0	0	149	0	0	0.5126	0.0000	0.0000	119.000	0.16	3.90	-3.73	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2373	0.6318	0.1309	1	1	0.2415	0.6222	0.1363	1	1	0.2465	0.6101	0.1434
chr11	60397879	ATT	A	0.500000	0.100	1	-2	1	81	44	37	41	0	0	0	3	0	0	37	0	0	0.9318	0.0000	0.0000	44.000	0.24	2.00	-1.76	27	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0102	0.9898	0.0000	0	1	0.2412	0.7588	0.0000	0	0	0.5160	0.4840	0.0000
chr11	62146758	A	AGCGGGAGCAGGAGCG	0.500000	0.100	1	15	1	589	155	434	64	3	43	3	42	0	0	425	0	9	0.4129	0.0000	0.0207	2.558	0.73	6.95	-6.22	28	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.4830	0.4803	0.0367	1	0	0.4800	0.4797	0.0403	1	1	0.4751	0.4794	0.0455
chr11	62536083	T	TCTC	0.500000	0.100	1	3	1	222	69	153	54	0	10	0	5	0	0	153	0	0	0.7826	0.0000	0.0000	5.900	0.28	2.60	-2.32	24	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0002	0.9998	0.0000	0	1	0.0676	0.9324	0.0000	0	1	0.3571	0.6429	0.0000
chr11	62614650	GC	G	0.500000	0.100	1	-1	1	692	160	532	147	0	2	0	11	0	0	532	0	0	0.9187	0.0000	0.0000	79.000	0.38	1.64	-1.26	75	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0126	0.9874	0.0000	0	0	0.5189	0.4811	0.0000
chr11	65557854	CCAGCAGCAG	C	0.500000	0.100	1	-9	3	281	103	178	49	0	12	0	42	0	0	177	0	1	0.4757	0.0000	0.0056	7.583	0.71	9.60	-8.88	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3291	0.5706	0.1003	1	1	0.3296	0.5652	0.1052	1	1	0.3298	0.5583	0.1118
chr11	65570616	TCTC	T	0.500000	0.100	1	-3	2	549	166	383	157	2	1	0	6	0	0	382	0	1	0.9458	0.0000	0.0026	165.000	0.57	2.83	-2.26	23	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0006	0.9994	0.0000	0	0	0.6200	0.3800	0.0000	0	0	0.9617	0.0383	0.0000
chr11	66744819	G	GGGC	0.500000	0.100	1	3	5	234	92	142	53	5	10	1	23	0	0	142	0	0	0.5761	0.0000	0.0000	8.200	0.70	3.30	-2.61	13	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9062	0.0927	0.0011	1	0	0.8972	0.1015	0.0014	1	0	0.8836	0.1145	0.0019
chr11	68312746	C	CGCT	0.500000	0.100	1	3	2	287	112	175	52	3	12	1	44	0	0	172	0	3	0.4643	0.0000	0.0171	8.333	0.58	4.00	-3.42	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3442	0.5699	0.0859	1	1	0.3448	0.5644	0.0908	1	1	0.3450	0.5575	0.0975
chr11	71538079	A	AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG	0.500000	0.100	1	21	2	930	164	766	0	0	35	2	127	0	0	708	1	57	0.0000	0.0000	0.0757	3.686		6.36		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999
chr11	71538486	C	CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG	0.500000	0.100	1	57	2	1087	196	891	0	0	108	2	86	0	0	838	1	52	0.0000	0.0000	0.0595	0.815		11.42		0	0/0	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0008	0.9992	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0011	0.9989
chr11	71565845	CTGTGGGGGCTCCAAGGGGGGCTGTGGCTCCTGTGGGGGCTCCAAGGGGGGCTGTGGTTCT	C	0.500000	0.100	1	-60	2	1139	225	914	78	14	93	8	32	3	0	910	1	0	0.3467	0.0033	0.0044	1.396	3.23	3.38	-0.14	6	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.9817	0.0183	0.0000	1	0	0.9787	0.0213	0.0000	1	0	0.9738	0.0261	0.0001
chr11	71582738	TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC	T	0.500000	0.100	1	-42	1	1044	359	685	279	2	74	0	4	0	0	683	0	2	0.7772	0.0000	0.0029	3.838	0.20	10.75	-10.55	73	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7294	0.2706	0.0000	0	0	0.9995	0.0005	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr11	72139110	CTA	C	0.500000	0.100	1	-2	1	963	260	703	114	0	6	0	140	0	0	703	0	0	0.4385	0.0000	0.0000	42.333	0.31	2.12	-1.81	12	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0038	0.3443	0.6519	1	2	0.0046	0.3453	0.6502	1	2	0.0059	0.3476	0.6464
chr11	73309330	G	GCTC	0.500000	0.100	1	3	1	717	130	587	47	0	10	0	73	0	0	586	0	1	0.3615	0.0000	0.0017	12.000	0.60	3.27	-2.68	1	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0037	0.1969	0.7994	1	2	0.0045	0.2062	0.7893	1	2	0.0058	0.2194	0.7748
chr11	75402313	ATGG	A	0.500000	0.100	1	-3	2	294	116	178	66	0	1	0	49	1	0	177	0	0	0.5690	0.0056	0.0056	115.000	0.09	3.02	-2.93	40	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6167	0.3659	0.0174	1	0	0.6093	0.3710	0.0197	1	0	0.5986	0.3781	0.0232
chr11	77184725	GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT	G	0.500000	0.100	1	-22	2	383	122	261	0	0	2	0	120	0	0	252	0	9	0.0000	0.0000	0.0345	60.000		16.11		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0014	0.9986	2	2	0.0000	0.0016	0.9984	2	2	0.0000	0.0019	0.9981
chr11	96092210	TTGCTGCTGC	T	0.500000	0.100	1	-9	1	1215	357	858	114	4	74	4	161	0	0	856	1	1	0.3193	0.0000	0.0023	3.903	0.87	8.01	-7.14	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0001	0.0579	0.9420	1	2	0.0001	0.0626	0.9373	1	2	0.0001	0.0698	0.9301
chr11	108917907	G	GTGATGA	0.500000	0.100	1	6	1	179	74	105	31	0	9	0	34	0	0	101	0	4	0.4189	0.0000	0.0381	7.222	0.29	4.88	-4.59	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0923	0.5264	0.3813	1	1	0.0969	0.5241	0.3790	1	1	0.1032	0.5213	0.3755
chr11	115209591	A	ATGG	0.500000	0.100	1	3	2	317	152	165	63	47	34	0	8	0	0	164	0	1	0.4145	0.0000	0.0061	3.471	0.89	2.12	-1.24	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0147	0.9853	0.0000	0	1	0.3643	0.6357	0.0000
chr11	117282785	G	GCCC	0.500000	0.100	1	3	2	362	98	264	91	0	5	0	2	0	0	263	0	1	0.9286	0.0000	0.0038	18.600	0.24	3.50	-3.26	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1162	0.8838	0.0000	0	0	0.7943	0.2057	0.0000	0	0	0.9235	0.0765	0.0000
chr11	117918597	CGGGCTGGAGATGCCT	C	0.500000	0.100	1	-15	3	772	221	551	0	0	31	3	187	0	0	551	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	6.129		10.41		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999
chr11	124016101	ACTT	A	0.500000	0.100	1	-3	1	1013	277	736	261	1	6	0	9	0	0	736	0	0	0.9422	0.0000	0.0000	45.000	0.53	3.67	-3.14	33	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0013	0.9987	0.0000	0	0	0.9706	0.0294	0.0000	0	0	0.9990	0.0010	0.0000
chr11	124880551	CCGGAGT	C	0.500000	0.100	1	-6	1	391	110	281	47	0	7	0	56	0	0	281	0	0	0.4273	0.0000	0.0000	14.714	0.74	6.43	-5.68	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0665	0.5377	0.3959	1	1	0.0710	0.5342	0.3948	1	1	0.0774	0.5299	0.3927
chr11	130428222	GGCA	G	0.500000	0.100	1	-3	1	447	161	286	75	4	17	1	64	0	2	282	1	1	0.4658	0.0000	0.0140	8.412	1.29	3.53	-2.24	29	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4576	0.5088	0.0336	1	1	0.4569	0.5060	0.0371	1	1	0.4549	0.5029	0.0422
chr12	865189	T	TC	0.592141	0.100	1	1	1	301	113	188	108	0	0	0	5	0	0	188	0	0	0.9558	0.0000	0.0000	113.000	1.05	2.00	-0.95	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0026	0.9974	0.0000	0	1	0.4267	0.5733	0.0000	0	0	0.8404	0.1596	0.0000
chr12	1953157	T	TTGC	0.435834	0.100	1	3	1	510	138	372	48	7	26	2	55	0	0	372	0	0	0.3478	0.0000	0.0000	4.308	0.19	3.11	-2.92	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1715	0.6352	0.1933	1	1	0.1774	0.6256	0.1970	1	1	0.1850	0.6134	0.2016
chr12	4626799	T	TC	0.131925	0.100	1	1	1	597	142	455	134	1	4	1	2	0	0	455	0	0	0.9437	0.0000	0.0000	34.500	0.22	3.00	-2.78	46	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9418	0.0582	0.0000	0	0	0.9963	0.0037	0.0000	0	0	0.9986	0.0014	0.0000
chr12	4626803	GA	G	0.131932	0.100	1	-1	1	603	140	463	134	1	2	1	2	0	0	463	0	0	0.9571	0.0000	0.0000	69.000	0.22	3.00	-2.78	48	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9124	0.0876	0.0000	0	0	0.9958	0.0042	0.0000	0	0	0.9985	0.0015	0.0000
chr12	6667903	T	TTGC	0.006082	0.100	1	3	1	400	135	265	0	95	33	2	5	0	0	265	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	3.156		2.40		0	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0349	0.9651	0.0000	0	0	0.9551	0.0449	0.0000	0	0	0.9958	0.0042	0.0000
chr12	8222185	C	CACG	0.676520	0.100	1	3	1	4870	1161	3709	1029	6	18	0	108	0	1	3705	0	3	0.8863	0.0000	0.0011	71.312	1.41	3.96	-2.55	141	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr12	8932728	CGCAGCA	C	0.001972	0.100	1	-6	2	581	251	330	209	1	35	0	6	0	0	330	0	0	0.8327	0.0000	0.0000	6.143	0.10	6.00	-5.90	93	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9737	0.0263	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr12	9733111	A	ATAAGT	0.503415	0.100	1	5	1	237	95	142	45	0	3	1	46	0	0	139	0	3	0.4737	0.0000	0.0211	30.667	0.13	4.74	-4.61	7	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1112	0.5854	0.3035	1	1	0.1161	0.5789	0.3050	1	1	0.1227	0.5708	0.3065
chr12	14567620	GGCA	G	0.679595	0.100	1	-3	1	263	142	121	3	0	10	1	128	0	0	120	0	1	0.0211	0.0000	0.0083	13.200	0.00	4.11	-4.11	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.3290	0.6710	2	2	0.0000	0.0171	0.9829	2	2	0.0000	0.0059	0.9941
chr12	14823483	CTA	C	0.147675	0.100	1	-2	1	470	100	370	9	0	1	0	90	0	0	370	0	0	0.0900	0.0000	0.0000	99.000	0.22	2.22	-2.00	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9989	0.0011	2	1	0.0000	0.9594	0.0406
chr12	18282464	GCCC	G	0.396371	0.100	1	-3	2	412	104	308	64	0	1	0	39	0	0	308	0	0	0.6154	0.0000	0.0000	103.000	0.20	3.74	-3.54	0	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8097	0.1865	0.0037	1	0	0.8002	0.1953	0.0045	1	0	0.7868	0.2076	0.0057
chr12	40482887	AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG	A	0.182551	0.100	1	-30	1	2217	809	1408	446	16	125	4	218	2	1	1395	2	8	0.5513	0.0014	0.0092	5.590	2.58	8.72	-6.14	94	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr12	40485756	TGGTGACAGGGATAACTGGACTATCAGCTGAGGTGACAGGGACAACTGGACTATCAGCTGG	T	0.000403	0.100	1	-60	1	3151	754	2397	390	7	98	10	249	83	45	2263	5	1	0.5172	0.0346	0.0559	6.673	3.15	3.03	0.12	26	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr12	40490898	C	CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG	0.517853	0.100	1	30	1	2013	459	1554	256	4	189	0	10	3	2	1540	2	7	0.5577	0.0019	0.0090	1.429	2.95	4.70	-1.75	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0044	0.9956	0.0000	0	0	0.8155	0.1845	0.0000
chr12	48203092	C	CA	0.208713	0.100	1	1	1	1496	337	1159	37	0	5	1	294	0	0	1155	1	3	0.1098	0.0000	0.0035	66.400	0.35	1.22	-0.87	9	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr12	52073890	TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC	T	0.050697	0.100	1	-23	2	466	181	285	149	1	26	0	5	0	0	285	0	0	0.8232	0.0000	0.0000	5.962	0.21	14.00	-13.79	17	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3687	0.6313	0.0000	0	0	0.9939	0.0061	0.0000	0	0	0.9991	0.0009	0.0000
chr12	52317956	ACTT	A	0.001740	0.100	1	-3	1	329	71	258	32	0	8	0	31	0	0	257	0	1	0.4507	0.0000	0.0039	7.875	0.94	3.16	-2.22	16	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4214	0.5778	0.0007	1	1	0.4272	0.5720	0.0007	1	1	0.4345	0.5647	0.0008
chr12	52675438	CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT	C	0.460720	0.100	1	-21	2	860	181	679	8	0	22	1	150	0	1	677	0	1	0.0442	0.0000	0.0029	7.227	0.88	13.47	-12.59	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.8866	0.1134	2	2	0.0000	0.1860	0.8140
chr12	52768988	C	CGCT	0.004583	0.100	1	3	2	531	166	365	93	52	9	1	11	0	0	365	0	0	0.5602	0.0000	0.0000	17.333	0.15	3.64	-3.49	1	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	0.5894	0.4106	0.0000	0	0	0.9927	0.0073	0.0000
chr12	52790167	C	CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT	0.041809	0.100	1	21	2	470	119	351	43	1	33	0	42	0	0	336	0	15	0.3613	0.0000	0.0427	2.606	0.21	12.19	-11.98	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1284	0.7979	0.0738	1	1	0.1386	0.7893	0.0721	1	1	0.1528	0.7775	0.0697
chr12	52795629	ACCAAAGCCACCAGCCCCT	A	0.048305	0.100	1	-18	2	1062	275	787	8	0	49	2	216	0	0	777	0	10	0.0291	0.0000	0.0127	4.612	0.25	13.19	-12.94	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.5278	0.4722	2	2	0.0000	0.0498	0.9502
chr12	54403234	GGCC	G	0.000323	0.100	1	-3	1	290	80	210	73	0	1	0	6	0	0	210	0	0	0.9125	0.0000	0.0000	79.000	0.55	3.00	-2.45	17	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1711	0.8289	0.0000	0	0	0.9950	0.0050	0.0000	0	0	0.9996	0.0004	0.0000
chr12	55129802	AT	A	0.303312	0.100	1	-1	1	309	89	220	82	1	3	0	3	0	0	220	0	0	0.9213	0.0000	0.0000	28.667	0.22	1.67	-1.45	64	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1742	0.8258	0.0000	0	0	0.8571	0.1429	0.0000	0	0	0.9496	0.0504	0.0000
chr12	55320622	C	CA	0.406066	0.100	1	1	2	367	92	275	38	1	1	0	52	0	0	272	0	3	0.4130	0.0000	0.0109	91.000	0.37	1.33	-0.96	32	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0327	0.4284	0.5388	1	2	0.0364	0.4332	0.5304	1	2	0.0419	0.4395	0.5186
chr12	55427174	CA	C	0.271048	0.100	1	-1	1	407	84	323	50	11	10	2	11	0	0	323	0	0	0.5952	0.0000	0.0000	7.200	0.62	2.36	-1.74	34	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0010	0.9990	0.0000	0	1	0.0004	0.9996	0.0000	0	1	0.0261	0.9739	0.0000
chr12	57225404	T	TGGC	0.004341	0.100	1	3	1	529	121	408	62	0	0	1	58	0	1	406	0	1	0.5124	0.0000	0.0049	121.000	1.19	4.31	-3.12	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4226	0.5764	0.0010	1	1	0.4309	0.5680	0.0011	1	1	0.4413	0.5576	0.0011
chr12	64318766	A	AGTT	0.404869	0.100	1	3	2	358	103	255	1	0	2	0	100	0	0	254	0	1	0.0097	0.0000	0.0039	101.000	1.00	3.96	-2.96	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0778	0.9222	2	2	0.0000	0.0284	0.9716	2	2	0.0000	0.0215	0.9785
chr12	70353913	TA	T	0.224313	0.100	1	-1	1	213	61	152	4	5	18	18	16	0	0	151	0	1	0.0656	0.0000	0.0066	1.389	1.25	2.88	-1.62	2	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0020	0.9404	0.0577	2	1	0.0008	0.9745	0.0247	2	1	0.0004	0.9645	0.0351
chr12	76031157	TTGC	T	0.989485	0.100	1	-3	1	1114	318	796	0	0	27	3	288	0	0	795	1	0	0.0000	0.0000	0.0013	10.778		3.48		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr12	85244867	GA	G	0.286032	0.100	1	-1	1	147	69	78	35	3	6	2	23	0	0	78	0	0	0.5072	0.0000	0.0000	10.167	0.34	1.04	-0.70	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6444	0.3360	0.0195	1	0	0.6372	0.3414	0.0214	1	0	0.6273	0.3487	0.0240
chr12	102958393	C	CGCA	0.500000	0.100	1	3	1	533	159	374	11	1	30	5	112	0	0	364	1	9	0.0692	0.0000	0.0267	4.300	0.36	5.99	-5.63	5	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9983	0.0017	2	1	0.0000	0.8222	0.1778
chr12	102958393	C	CGCAGCAGCA	0.500000	0.100	1	9	1	533	159	374	12	46	30	1	70	0	2	364	0	8	0.0755	0.0000	0.0267	4.267	0.58	7.83	-7.25	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0142	0.3684	0.6174	1	2	0.0162	0.3727	0.6111	1	2	0.0194	0.3788	0.6018
chr12	106247711	GGGC	G	0.500000	0.100	1	-3	1	456	137	319	0	0	21	2	114	0	0	317	0	2	0.0000	0.0000	0.0063	5.524		3.96		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0024	0.9976	2	2	0.0000	0.0027	0.9973	2	2	0.0000	0.0032	0.9968
chr12	106977948	AAAAG	A	0.500000	0.100	1	-4	5	653	173	480	165	0	3	0	5	0	0	480	0	0	0.9538	0.0000	0.0000	56.667	0.36	4.20	-3.84	29	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0628	0.9372	0.0000	0	0	0.9487	0.0513	0.0000	0	0	0.9918	0.0082	0.0000
chr12	110582934	TCGCCGCCGC	T	0.500000	0.100	1	-9	1	278	114	164	66	1	8	0	39	0	0	163	0	1	0.5789	0.0000	0.0061	13.250	0.73	8.56	-7.84	22	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8078	0.1884	0.0038	1	0	0.7972	0.1981	0.0047	1	0	0.7821	0.2119	0.0060
chr12	111363022	TGCCACCCCC	T	0.500000	0.100	1	-9	1	563	134	429	75	0	2	0	57	0	0	422	0	7	0.5597	0.0000	0.0163	66.000	0.20	7.53	-7.33	13	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4095	0.5443	0.0463	1	1	0.4099	0.5397	0.0504	1	1	0.4095	0.5342	0.0562
chr12	111598949	GGCT	G	0.500000	0.100	1	-3	1	652	204	448	0	1	20	11	172	0	0	446	1	1	0.0000	0.0000	0.0045	9.150		4.44		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0002	0.9998
chr12	112931910	TA	T	0.500000	0.100	1	-1	1	228	115	113	0	0	1	0	114	0	0	112	0	1	0.0000	0.0000	0.0088	114.000		2.82		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0028	0.9972	2	2	0.0000	0.0032	0.9968	2	2	0.0000	0.0038	0.9962
chr12	118068522	TTCCTCC	T	0.500000	0.100	1	-6	1	199	86	113	66	2	13	0	5	0	0	113	0	0	0.7674	0.0000	0.0000	5.615	0.27	6.00	-5.73	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0005	0.9995	0.0000	0	1	0.1289	0.8711	0.0000	0	0	0.5265	0.4735	0.0000
chr12	121240524	C	CTTT	0.500000	0.100	1	3	2	424	92	332	26	19	18	3	26	0	2	327	0	3	0.2826	0.0000	0.0151	3.611	0.54	5.88	-5.35	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5465	0.4156	0.0379	1	0	0.5389	0.4197	0.0414	1	0	0.5283	0.4252	0.0465
chr12	121626865	GGCCCC	G	0.500000	0.100	1	-5	5	346	91	255	0	0	5	3	83	0	0	243	0	12	0.0000	0.0000	0.0471	17.200		5.57		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0067	0.9933	2	2	0.0000	0.0074	0.9926	2	2	0.0000	0.0085	0.9915
chr12	121921491	G	GGAGGAGGAGGAGAAA	0.500000	0.100	1	15	4	279	60	219	0	0	4	0	56	0	0	210	0	9	0.0000	0.0000	0.0411	14.000		11.04		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0351	0.9649	2	2	0.0000	0.0375	0.9625	2	2	0.0000	0.0409	0.9591
chr12	122266132	G	GC	0.500000	0.100	1	1	3	765	262	503	116	1	18	4	123	0	0	503	0	0	0.4427	0.0000	0.0000	13.500	1.78	2.16	-0.38	16	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0405	0.6880	0.2714	1	1	0.0451	0.6743	0.2806	1	1	0.0516	0.6568	0.2916
chr12	122995576	TGCCACCACC	T	0.500000	0.100	1	-9	1	367	134	233	81	0	6	0	47	0	0	233	0	0	0.6045	0.0000	0.0000	21.333	0.65	8.19	-7.54	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8849	0.1140	0.0010	1	0	0.8760	0.1226	0.0013	1	0	0.8631	0.1351	0.0019
chr12	124340175	C	CGCCGCTGCT	0.500000	0.100	1	9	5	624	153	471	0	0	24	1	128	0	0	448	0	23	0.0000	0.0000	0.0488	5.375		8.44		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0004	0.9996	2	2	0.0000	0.0005	0.9995	2	2	0.0000	0.0006	0.9994
chr12	124402512	G	GGCTGCT	0.500000	0.100	1	6	3	262	106	156	40	0	34	0	32	0	0	153	0	3	0.3774	0.0000	0.0192	2.118	0.72	5.12	-4.40	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3153	0.5639	0.1208	1	1	0.3155	0.5590	0.1255	1	1	0.3154	0.5529	0.1317
chr12	124980723	A	ACTCCTC	0.500000	0.100	1	6	1	410	128	282	60	0	20	0	48	0	0	279	0	3	0.4688	0.0000	0.0106	5.684	1.00	6.33	-5.33	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3959	0.5418	0.0623	1	1	0.3952	0.5380	0.0668	1	1	0.3937	0.5332	0.0731
chr12	131828553	G	GGCTGCCGCT	0.500000	0.100	1	9	1	193	62	131	35	0	5	0	22	0	0	127	0	4	0.5645	0.0000	0.0305	11.400	0.89	8.59	-7.71	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4399	0.4863	0.0739	1	1	0.4351	0.4867	0.0783	1	1	0.4283	0.4873	0.0844
chr12	132062523	G	GGCA	0.500000	0.100	1	3	1	577	172	405	72	10	39	4	47	0	0	400	0	5	0.4186	0.0000	0.0123	3.500	1.86	3.45	-1.59	28	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7302	0.2636	0.0062	1	0	0.7212	0.2714	0.0074	1	0	0.7084	0.2823	0.0093
chr12	132062548	A	ACAG	0.500000	0.100	1	3	2	558	198	360	28	3	69	7	91	0	0	360	0	0	0.1414	0.0000	0.0000	1.870	2.00	3.24	-1.24	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0050	0.9950	1	2	0.0000	0.0120	0.9880	2	1	0.0000	0.7545	0.2455
chr12	133121909	TA	T	0.500000	0.100	1	-1	1	351	62	289	36	1	2	0	23	0	0	288	0	1	0.5806	0.0000	0.0035	30.000	0.39	1.09	-0.70	26	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5481	0.4098	0.0422	1	0	0.5396	0.4145	0.0458	1	0	0.5280	0.4208	0.0511
chr13	20988343	C	CGGGGCG	0.483296	0.100	1	6	2	768	186	582	88	1	36	1	60	0	0	581	0	1	0.4731	0.0000	0.0017	4.139	0.40	5.77	-5.37	18	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7758	0.2206	0.0036	1	0	0.7671	0.2286	0.0043	1	0	0.7545	0.2399	0.0056
chr13	42888298	T	TTCAGG	0.039508	0.100	1	5	1	195	73	122	64	0	4	0	5	0	0	122	0	0	0.8767	0.0000	0.0000	17.250	0.27	4.20	-3.93	38	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0094	0.9906	0.0000	0	0	0.7436	0.2564	0.0000	0	0	0.9564	0.0436	0.0000
chr13	45596584	CCCAGATACTCTTCCTCCT	C	0.470699	0.100	1	-18	4	544	181	363	103	0	12	1	65	0	0	362	0	1	0.5691	0.0000	0.0028	14.000	0.55	14.51	-13.95	27	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8923	0.1071	0.0006	1	0	0.8847	0.1145	0.0008	1	0	0.8735	0.1254	0.0011
chr13	52642566	CA	C	0.003742	0.100	1	-1	3	747	236	511	225	0	0	1	10	0	0	511	0	0	0.9534	0.0000	0.0000	235.000	0.21	2.00	-1.79	133	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0048	0.9952	0.0000	0	0	0.9974	0.0026	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr13	71866526	T	TGCCGCC	0.116857	0.100	1	6	1	656	174	482	4	1	54	4	111	0	1	476	1	4	0.0230	0.0000	0.0124	2.208	0.50	6.67	-6.17	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9991	0.0009	2	1	0.0000	0.8083	0.1917	2	2	0.0000	0.3768	0.6232
chr13	72743602	G	GGTGA	0.022257	0.100	1	4	1	127	58	69	4	0	3	0	51	0	0	67	0	2	0.0690	0.0000	0.0290	18.333	0.00	4.06	-4.06	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9955	0.0045	2	1	0.0000	0.9776	0.0224
chr13	77698098	T	TGCC	0.001998	0.100	1	3	1	464	135	329	111	0	11	1	12	0	1	328	0	0	0.8222	0.0000	0.0030	11.182	3.24	5.75	-2.51	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2266	0.7734	0.0000	0	0	0.9765	0.0235	0.0000
chr13	78602188	G	GGCC	0.815212	0.100	1	3	4	772	115	657	0	0	15	2	98	0	0	653	1	3	0.0000	0.0000	0.0061	6.667		4.82		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0011	0.9989	2	2	0.0000	0.0013	0.9987	2	2	0.0000	0.0015	0.9985
chr13	99970413	TGGC	T	0.500000	0.100	1	-3	2	509	73	436	0	1	32	3	37	0	4	429	1	2	0.0000	0.0000	0.0161	1.250		3.59		0	0/1	1/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.8843	0.1157	2	1	0.0000	0.6703	0.3297	2	2	0.0000	0.4829	0.5171
chr13	112068121	ATGGGCG	A	0.500000	0.100	1	-6	2	565	148	417	77	2	15	0	54	3	0	410	1	3	0.5203	0.0072	0.0168	8.800	1.91	6.74	-4.83	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7268	0.2670	0.0063	1	0	0.7180	0.2746	0.0074	1	0	0.7054	0.2853	0.0093
chr13	112547538	ATGGGAAAGTCGCGCG	A	0.500000	0.100	1	-15	1	297	103	194	32	2	31	0	38	0	0	193	0	1	0.3107	0.0000	0.0052	2.290	0.69	9.92	-9.23	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1164	0.5569	0.3267	1	1	0.1211	0.5526	0.3264	1	1	0.1273	0.5471	0.3256
chr13	113325657	A	ACACT	0.500000	0.100	1	4	1	423	104	319	50	0	3	0	51	0	0	318	0	1	0.4808	0.0000	0.0031	33.667	0.58	4.08	-3.50	28	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1537	0.6179	0.2284	1	1	0.1586	0.6093	0.2321	1	1	0.1650	0.5983	0.2367
chr13	113406670	C	CAAG	0.500000	0.100	1	3	1	526	119	407	0	0	2	0	117	0	0	404	0	3	0.0000	0.0000	0.0074	58.500		3.15		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0022	0.9978	2	2	0.0000	0.0025	0.9975	2	2	0.0000	0.0029	0.9971
chr14	19868522	A	AG	0.732384	0.100	1	1	2	1460	323	1137	164	0	12	0	147	0	0	1136	0	1	0.5077	0.0000	0.0009	25.917	0.38	1.84	-1.45	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2151	0.7602	0.0247	1	1	0.2234	0.7476	0.0290	1	1	0.2332	0.7312	0.0356
chr14	20002693	CT	C	0.452728	0.100	1	-1	4	1223	364	859	291	5	36	1	31	0	0	859	0	0	0.7995	0.0000	0.0000	9.111	0.21	1.48	-1.27	41	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0027	0.9973	0.0000
chr14	20060289	TCATAGATTTGCTCACTGAC	T	0.427196	0.100	1	-19	1	487	136	351	86	0	1	0	49	0	0	343	0	8	0.6324	0.0000	0.0228	135.000	0.40	18.92	-18.52	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8326	0.1654	0.0020	1	0	0.8240	0.1735	0.0024	1	0	0.8117	0.1851	0.0032
chr14	20060441	AG	A	0.001037	0.100	1	-1	1	511	123	388	71	0	4	0	48	0	0	386	1	1	0.5772	0.0000	0.0052	29.750	0.24	2.73	-2.49	27	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8157	0.1843	0.0000	1	0	0.8103	0.1897	0.0000	1	0	0.8025	0.1974	0.0000
chr14	20198016	C	CA	0.700403	0.100	1	1	1	374	85	289	70	1	3	0	11	0	0	289	0	0	0.8235	0.0000	0.0000	27.333	0.33	1.18	-0.85	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0116	0.9884	0.0000
chr14	21074796	AGAGGAG	A	0.000871	0.100	1	-6	2	571	136	435	115	0	14	0	7	1	0	434	0	0	0.8456	0.0023	0.0023	8.714	0.37	6.14	-5.78	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0696	0.9304	0.0000	0	0	0.9955	0.0045	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000
chr14	21155337	CAGA	C	0.002975	0.100	1	-3	1	492	93	399	82	2	5	0	4	0	0	399	0	0	0.8817	0.0000	0.0000	17.400	0.61	4.00	-3.39	16	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.7681	0.2319	0.0000	0	0	0.9968	0.0032	0.0000	0	0	0.9993	0.0007	0.0000
chr14	22902046	G	GGGC	0.560337	0.100	1	3	1	437	117	320	62	1	12	0	42	0	0	320	0	0	0.5299	0.0000	0.0000	8.667	0.68	2.90	-2.23	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6637	0.3225	0.0138	1	0	0.6533	0.3307	0.0160	1	0	0.6388	0.3419	0.0193
chr14	23079574	A	AGAACGT	0.278634	0.100	1	6	1	420	112	308	49	0	4	1	58	0	0	308	0	0	0.4375	0.0000	0.0000	27.000	0.31	5.16	-4.85	23	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0986	0.6252	0.2763	1	1	0.1057	0.6199	0.2744	1	1	0.1156	0.6130	0.2714
chr14	23080669	TTCC	T	0.061796	0.100	1	-3	1	592	202	390	176	2	13	0	11	0	0	389	0	1	0.8713	0.0000	0.0026	14.538	0.52	4.00	-3.48	92	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2374	0.7626	0.0000	0	0	0.9747	0.0253	0.0000
chr14	23104903	CA	C	0.653704	0.100	1	-1	1	989	277	712	160	5	13	4	95	0	0	712	0	0	0.5776	0.0000	0.0000	37.286	0.46	4.04	-3.59	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9825	0.0175	0.0000	1	0	0.9797	0.0203	0.0000	1	0	0.9753	0.0247	0.0000
chr14	23104905	GCA	G	0.660524	0.100	1	-2	1	985	272	713	159	0	12	6	95	0	0	712	1	0	0.5846	0.0000	0.0014	25.400	0.46	4.18	-3.72	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9692	0.0308	0.0000	1	0	0.9652	0.0348	0.0000	1	0	0.9588	0.0412	0.0000
chr14	23275591	ACAT	A	0.375158	0.100	1	-3	1	349	46	303	12	1	3	0	30	0	0	300	0	3	0.2609	0.0000	0.0099	21.500	2.42	3.77	-1.35	6	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0228	0.3179	0.6593	1	2	0.0259	0.3298	0.6443	1	2	0.0303	0.3521	0.6176
chr14	23275617	TTCC	T	0.376038	0.100	1	-3	1	363	56	307	26	2	6	0	22	0	0	306	0	1	0.4643	0.0000	0.0033	10.000	2.23	3.91	-1.68	14	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.4102	0.5023	0.0875	1	1	0.4085	0.5008	0.0907	1	1	0.4060	0.4990	0.0950
chr14	24214060	CA	C	0.080276	0.100	1	-1	1	283	70	213	65	0	0	0	5	0	0	213	0	0	0.9286	0.0000	0.0000	70.000	0.54	1.20	-0.66	17	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0050	0.9950	0.0000	0	0	0.5920	0.4080	0.0000	0	0	0.9159	0.0841	0.0000
chr14	24300643	A	AGAG	0.272949	0.100	1	3	1	365	119	246	45	4	17	0	53	0	0	238	1	7	0.3782	0.0000	0.0325	6.000	0.56	3.19	-2.63	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0781	0.6053	0.3166	1	1	0.0847	0.6020	0.3133	1	1	0.0941	0.5977	0.3082
chr14	53152762	T	TGCCGCC	0.826994	0.100	1	6	1	627	137	490	69	0	20	1	47	0	0	482	0	8	0.5036	0.0000	0.0163	5.850	0.49	7.68	-7.19	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2324	0.6833	0.0844	1	1	0.2298	0.6780	0.0922	1	1	0.2258	0.6710	0.1032
chr14	59464198	G	GCA	0.003589	0.100	1	2	1	449	104	345	96	0	1	1	6	0	0	345	0	0	0.9231	0.0000	0.0000	103.000	0.55	2.17	-1.61	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0387	0.9613	0.0000	0	0	0.9758	0.0242	0.0000	0	0	0.9979	0.0021	0.0000
chr14	67198163	TGAA	T	0.018726	0.100	1	-3	2	174	71	103	4	0	2	0	65	0	0	99	0	4	0.0563	0.0000	0.0388	34.500	0.25	2.94	-2.69	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9916	0.0084	2	1	0.0000	0.9600	0.0400
chr14	69573086	CGCGGCG	C	0.814084	0.100	1	-6	2	651	175	476	75	4	33	2	61	0	0	473	1	2	0.4286	0.0000	0.0063	4.242	1.33	7.05	-5.72	13	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2260	0.6951	0.0789	1	1	0.2249	0.6885	0.0866	1	1	0.2226	0.6798	0.0975
chr14	77027418	TTGC	T	0.008855	0.100	1	-3	1	497	120	377	4	1	34	67	14	0	0	372	1	4	0.0333	0.0000	0.0133	2.424	0.50	6.50	-6.00	2	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9922	0.0078	2	1	0.0000	0.9631	0.0369
chr14	77027418	TTGCTGC	T	0.394255	0.100	1	-6	1	498	121	377	4	1	33	3	80	0	0	373	0	4	0.0331	0.0000	0.0106	2.656	0.50	5.26	-4.76	2	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9940	0.0060	2	1	0.0000	0.6322	0.3678	2	2	0.0000	0.2591	0.7409
chr14	77027448	CTGT	C	0.435919	0.100	1	-3	1	488	115	373	11	26	13	18	47	0	2	369	1	1	0.0957	0.0000	0.0107	22.500	1.00	4.51	-3.51	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	2	0.0026	0.1503	0.8470	1	2	0.0033	0.1610	0.8357	1	2	0.0044	0.1762	0.8194
chr14	92688192	TGGC	T	0.643421	0.100	1	-3	2	499	175	324	0	0	20	1	154	0	1	322	0	1	0.0000	0.0000	0.0062	7.750		3.15		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0002	0.9998	2	2	0.0000	0.0003	0.9997	2	2	0.0000	0.0003	0.9997
chr14	94115784	TGGCCATGGC	T	0.375227	0.100	1	-9	1	461	120	341	75	0	3	0	42	0	1	339	0	1	0.6250	0.0000	0.0059	39.000	0.44	9.19	-8.75	59	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8984	0.1008	0.0008	1	0	0.8906	0.1084	0.0011	1	0	0.8792	0.1194	0.0015
chr14	102231742	T	TGA	0.001158	0.100	1	2	2	171	91	80	54	0	0	0	37	0	0	80	0	0	0.5934	0.0000	0.0000	91.000	0.57	2.14	-1.56	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7751	0.2248	0.0000	1	0	0.7696	0.2304	0.0000	1	0	0.7618	0.2381	0.0000
chr14	103126551	GAGA	G	0.001202	0.100	1	-3	2	227	71	156	61	1	5	1	3	0	0	156	0	0	0.8592	0.0000	0.0000	13.200	0.20	3.00	-2.80	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9211	0.0789	0.0000	0	0	0.9977	0.0023	0.0000	0	0	0.9994	0.0006	0.0000
chr14	104588781	TGACGGGCAG	T	0.435567	0.100	1	-9	1	232	80	152	43	0	8	1	28	0	0	151	0	1	0.5375	0.0000	0.0066	8.875	0.12	8.25	-8.13	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5747	0.3929	0.0324	1	0	0.5675	0.3972	0.0354	1	0	0.5573	0.4030	0.0397
chr14	105529712	TGCC	T	0.270735	0.100	1	-3	2	403	112	291	11	2	17	1	81	0	0	290	0	1	0.0982	0.0000	0.0034	5.588	0.36	3.59	-3.23	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9926	0.0074
chr15	22786677	AGCG	A	0.219888	0.100	1	-3	1	313	77	236	34	1	8	0	34	0	0	236	0	0	0.4416	0.0000	0.0000	8.625	0.97	4.53	-3.56	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3481	0.5704	0.0815	1	1	0.3522	0.5647	0.0831	1	1	0.3574	0.5575	0.0851
chr15	23439857	G	GCAT	0.979303	0.100	1	3	1	1150	198	952	0	1	4	4	189	0	2	882	44	24	0.0000	0.0000	0.0735	48.000		4.40		0	0/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr15	23440394	CT	C	0.994113	0.100	1	-1	2	2550	648	1902	0	2	16	9	621	0	2	1826	19	55	0.0000	0.0000	0.0400	41.800		3.44		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr15	23441081	G	GTCTCCTCCTCTTCCCGCATCT	0.154509	0.100	1	21	1	2632	466	2166	305	12	122	5	22	4	5	2151	4	2	0.6545	0.0018	0.0069	2.857	1.89	6.00	-4.11	81	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1095	0.8905	0.0000
chr15	23441523	TCCGCATCTTCTCCTCCTGCTC	T	0.005169	0.100	1	-21	1	1725	438	1287	230	1	62	1	144	4	1	1248	3	31	0.5251	0.0031	0.0303	6.065	1.21	15.53	-14.33	104	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9756	0.0244	0.0000	1	0	0.9740	0.0260	0.0000	1	0	0.9713	0.0287	0.0000
chr15	23646297	AGCCTGGCGGATCACAGGTGGG	A	0.000427	0.100	1	-21	2	1074	278	796	104	5	75	3	91	0	0	796	0	0	0.3741	0.0000	0.0000	2.667	1.29	5.97	-4.68	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6261	0.3739	0.0000	1	0	0.6300	0.3700	0.0000	1	0	0.6341	0.3659	0.0000
chr15	31229302	CG	C	0.310739	0.100	1	-1	2	201	68	133	1	0	4	31	32	0	0	132	1	0	0.0147	0.0000	0.0075	9.000	2.00	2.03	-0.03	1	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.4724	0.5276	2	2	0.0000	0.2369	0.7631	2	2	0.0000	0.1827	0.8173
chr15	31229302	CGG	C	0.653809	0.100	1	-2	2	201	69	132	1	0	36	1	31	0	0	132	0	0	0.0145	0.0000	0.0000	0.917	2.00	2.35	-0.35	1	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.5320	0.4680	2	2	0.0000	0.2688	0.7312	2	2	0.0000	0.1998	0.8002
chr15	31484007	TGGC	T	0.683637	0.100	1	-3	1	694	153	541	44	4	34	3	68	0	0	538	0	3	0.2876	0.0000	0.0055	3.500	1.18	4.26	-3.08	16	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0022	0.1669	0.8309	1	2	0.0027	0.1745	0.8228	1	2	0.0034	0.1854	0.8112
chr15	35084193	TCA	T	0.022764	0.100	1	-2	2	837	169	668	158	2	0	0	9	0	0	668	0	0	0.9349	0.0000	0.0000	167.000	0.76	3.89	-3.13	126	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	0	0.8958	0.1042	0.0000	0	0	0.9968	0.0032	0.0000
chr15	39976797	G	GGACGAC	0.109463	0.100	1	6	1	340	81	259	66	0	8	0	7	0	0	259	0	0	0.8148	0.0000	0.0000	9.125	0.52	6.00	-5.48	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1118	0.8882	0.0000	0	0	0.6889	0.3111	0.0000
chr15	40281980	T	TGGCCGCGGG	0.001310	0.100	1	9	1	445	63	382	53	0	6	0	4	0	0	382	0	0	0.8413	0.0000	0.0000	9.500	0.74	7.00	-6.26	9	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.6099	0.3901	0.0000	0	0	0.9935	0.0065	0.0000	0	0	0.9987	0.0013	0.0000
chr15	40407805	GTT	G	0.332169	0.100	1	-2	1	432	155	277	13	0	5	0	137	0	0	277	0	0	0.0839	0.0000	0.0000	30.000	1.69	2.12	-0.43	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9995	0.0005	2	1	0.0000	0.9163	0.0837
chr15	40807701	T	TGGGGC	0.358646	0.100	1	5	1	537	146	391	80	0	10	1	55	0	0	389	0	2	0.5479	0.0000	0.0051	13.600	0.15	4.64	-4.49	28	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7388	0.2560	0.0053	1	0	0.7317	0.2621	0.0062	1	0	0.7216	0.2708	0.0076
chr15	42690819	TTAA	T	0.000402	0.100	1	-3	4	876	220	656	208	1	4	0	7	1	0	655	0	0	0.9455	0.0015	0.0015	54.000	0.21	3.29	-3.07	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9509	0.0491	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr15	43872814	C	CTATT	0.101358	0.100	1	4	1	280	129	151	118	0	4	0	7	0	0	151	0	0	0.9147	0.0000	0.0000	31.250	0.44	3.43	-2.99	40	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0006	0.9994	0.0000	0	0	0.6508	0.3492	0.0000	0	0	0.9682	0.0318	0.0000
chr15	64815936	TC	T	0.001060	0.100	1	-1	1	456	155	301	142	0	5	0	8	0	0	301	0	0	0.9161	0.0000	0.0000	30.000	0.39	1.12	-0.73	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0267	0.9733	0.0000	0	0	0.9957	0.0043	0.0000	0	0	0.9998	0.0002	0.0000
chr15	70984141	GCAA	G	0.472078	0.100	1	-3	2	151	78	73	53	0	0	0	25	0	0	71	0	2	0.6795	0.0000	0.0274	78.000	0.17	3.00	-2.83	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8208	0.1749	0.0042	1	0	0.8098	0.1851	0.0051	1	0	0.7941	0.1994	0.0065
chr15	74244059	TAAG	T	0.589043	0.100	1	-3	1	249	137	112	80	0	3	1	53	0	0	110	0	2	0.5839	0.0000	0.0179	44.667	0.36	3.34	-2.98	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6896	0.3020	0.0084	1	0	0.6797	0.3103	0.0100	1	0	0.6656	0.3219	0.0125
chr15	78620725	ACAG	A	0.589191	0.100	1	-3	1	439	115	324	44	0	12	1	58	0	1	318	1	4	0.3826	0.0000	0.0185	8.583	0.66	3.60	-2.94	22	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0114	0.3057	0.6829	1	2	0.0131	0.3119	0.6750	1	2	0.0155	0.3207	0.6638
chr15	78766598	GCGC	G	0.019890	0.100	1	-3	3	670	119	551	62	0	6	0	51	0	0	549	0	2	0.5210	0.0000	0.0036	18.833	1.37	5.27	-3.90	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5752	0.4228	0.0020	1	0	0.5771	0.4208	0.0021	1	0	0.5790	0.4187	0.0023
chr15	84895080	C	CTTG	0.283663	0.100	1	3	3	339	133	206	62	0	2	1	68	0	0	203	0	3	0.4662	0.0000	0.0146	65.500	0.61	3.10	-2.49	38	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0908	0.6527	0.2565	1	1	0.0980	0.6454	0.2566	1	1	0.1081	0.6359	0.2561
chr15	88472272	CAG	C	0.005890	0.100	1	-2	3	394	145	249	79	0	1	0	65	0	0	249	0	0	0.5448	0.0000	0.0000	144.000	0.29	3.03	-2.74	35	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6626	0.3372	0.0002	1	0	0.6625	0.3372	0.0003	1	0	0.6617	0.3380	0.0003
chr15	89333596	T	TTGC	0.100121	0.100	1	3	1	1271	377	894	168	19	69	2	119	0	1	891	0	2	0.4456	0.0000	0.0034	4.435	0.43	2.94	-2.51	30	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9919	0.0081	0.0000	1	0	0.9908	0.0092	0.0000	1	0	0.9889	0.0111	0.0000
chr15	89776889	GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC	G	0.425786	0.100	1	-24	2	762	213	549	14	17	145	4	33	0	0	548	0	1	0.0657	0.0000	0.0018	0.966	1.79	6.12	-4.34	6	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0002	0.0426	0.9572	1	2	0.0003	0.0686	0.9311	2	1	0.0002	0.6203	0.3795
chr15	89776903	AGGGCAGGGGCAG	A	0.699006	0.100	1	-12	2	752	196	556	0	0	14	2	180	0	0	556	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	13.000		8.09		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0001	0.9999
chr15	92472964	AC	A	0.000463	0.100	1	-1	1	297	118	179	104	0	4	0	10	0	0	179	0	0	0.8814	0.0000	0.0000	38.000	0.35	2.20	-1.85	46	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	0	0.9015	0.0985	0.0000	0	0	0.9981	0.0019	0.0000
chr15	92655448	TTGGAGC	T	0.998005	0.100	1	-6	1	323	86	237	0	0	4	0	82	0	0	230	0	7	0.0000	0.0000	0.0295	20.500		7.16		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr15	98968530	CT	C	0.000805	0.100	1	-1	1	310	109	201	69	0	0	0	40	0	0	201	0	0	0.6330	0.0000	0.0000	109.000	0.49	1.10	-0.61	29	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9121	0.0879	0.0000	1	0	0.9062	0.0938	0.0000	1	0	0.8978	0.1022	0.0000
chr15	101489563	GGCGCCCCCC	G	0.028834	0.100	1	-9	2	243	75	168	37	0	10	1	27	0	0	166	0	2	0.4933	0.0000	0.0119	6.500	1.89	10.70	-8.81	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5818	0.4140	0.0043	1	0	0.5811	0.4144	0.0045	1	0	0.5799	0.4153	0.0048
chr16	400140	C	CAG	0.314665	0.100	1	2	2	294	72	222	69	0	1	0	2	0	1	221	0	0	0.9583	0.0000	0.0045	71.000	1.17	4.00	-2.83	27	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4745	0.5255	0.0000	0	0	0.8949	0.1051	0.0000	0	0	0.9472	0.0528	0.0000
chr16	770636	CGGGTGAGGGGGGCTGGGCTCCACCAGGGGAGCCGCCTGGGGGGACG	C	0.004222	0.100	1	-46	1	1017	194	823	125	11	50	1	7	2	0	819	2	0	0.6443	0.0024	0.0049	2.820	1.57	2.43	-0.86	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0010	0.9990	0.0000	0	0	0.9356	0.0644	0.0000	0	0	0.9980	0.0020	0.0000
chr16	805595	AG	A	0.000016	0.100	1	-1	1	382	96	286	89	0	2	0	5	0	0	286	0	0	0.9271	0.0000	0.0000	47.000	0.28	1.60	-1.32	53	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9891	0.0109	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr16	813355	AGGACGCCGGACCGACAC	A	0.089377	0.100	1	-17	2	248	73	175	44	0	1	0	28	0	0	175	0	0	0.6027	0.0000	0.0000	72.000	1.86	16.71	-14.85	30	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7552	0.2417	0.0031	1	0	0.7485	0.2480	0.0035	1	0	0.7392	0.2567	0.0040
chr16	1093978	G	GC	0.001284	0.100	1	1	2	344	101	243	88	1	6	0	6	0	0	243	0	0	0.8713	0.0000	0.0000	15.833	0.59	1.17	-0.58	46	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1167	0.8833	0.0000	0	0	0.9913	0.0087	0.0000	0	0	0.9992	0.0008	0.0000
chr16	1256558	AG	A	0.210472	0.100	1	-1	1	793	180	613	13	1	0	0	166	0	0	611	0	2	0.0722	0.0000	0.0033	180.000	0.69	1.39	-0.70	9	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9995	0.0005	2	1	0.0000	0.8859	0.1141
chr16	2009735	CG	C	0.999815	0.100	1	-1	6	570	97	473	0	0	1	1	95	0	0	470	1	2	0.0000	0.0000	0.0063	96.000		7.20		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr16	2009735	CG	C	0.999815	0.100	1	-1	6	570	97	473	0	0	1	1	95	0	0	470	1	2	0.0000	0.0000	0.0063	96.000		7.20		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr16	10430799	GGAC	G	0.612863	0.100	1	-3	1	414	112	302	51	0	4	0	57	0	0	300	0	2	0.4554	0.0000	0.0066	27.000	0.27	3.11	-2.83	21	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0540	0.5286	0.4174	1	1	0.0575	0.5243	0.4182	1	1	0.0624	0.5190	0.4186
chr16	11915673	C	CCCG	0.170317	0.100	1	3	1	398	143	255	81	6	52	1	3	3	0	251	1	0	0.5664	0.0118	0.0157	1.750	1.84	4.33	-2.49	53	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1284	0.8716	0.0000	0	0	0.8608	0.1392	0.0000	0	0	0.9623	0.0377	0.0000
chr16	11933617	CAT	C	0.996541	0.100	1	-2	1	244	62	182	35	1	1	0	25	0	0	182	0	0	0.5645	0.0000	0.0000	61.000	0.20	2.12	-1.92	5	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0061	0.7962	0.1978	1	1	0.0059	0.7858	0.2083	1	1	0.0056	0.7719	0.2225
chr16	22008325	AG	A	0.081606	0.100	1	-1	1	312	177	135	80	0	2	1	94	0	0	135	0	0	0.4520	0.0000	0.0000	87.500	0.70	1.38	-0.68	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0710	0.8058	0.1232	1	1	0.0794	0.7977	0.1229	1	1	0.0916	0.7864	0.1219
chr16	24777101	AGCAGCCACAGCC	A	0.180179	0.100	1	-12	1	662	233	429	114	0	15	2	102	0	0	429	0	0	0.4893	0.0000	0.0000	14.467	0.20	8.30	-8.10	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4319	0.5556	0.0125	1	1	0.4414	0.5448	0.0138	1	1	0.4528	0.5315	0.0157
chr16	28593494	G	GT	0.000605	0.100	1	1	3	463	127	336	70	1	2	0	54	0	0	335	0	1	0.5512	0.0000	0.0030	62.500	0.26	1.22	-0.97	8	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7245	0.2755	0.0000	1	0	0.7216	0.2784	0.0000	1	0	0.7172	0.2828	0.0000
chr16	31759375	G	GA	0.500000	0.100	1	1	1	179	82	97	75	0	3	0	4	0	0	96	0	1	0.9146	0.0000	0.0103	26.333	0.51	2.00	-1.49	35	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0008	0.9992	0.0000	0	1	0.1752	0.8248	0.0000	0	0	0.6083	0.3917	0.0000
chr16	57813722	ATG	A	0.500000	0.100	1	-2	1	293	120	173	14	58	4	2	42	0	0	168	2	3	0.1167	0.0000	0.0289	19.333	0.07	8.79	-8.71	4	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3223	0.5740	0.1038	1	1	0.3231	0.5683	0.1086	1	1	0.3238	0.5611	0.1151
chr16	57813725	CAGGTGG	C	0.500000	0.100	1	-6	1	293	124	169	79	0	2	0	43	0	0	163	1	5	0.6371	0.0000	0.0355	61.000	0.85	8.58	-7.73	31	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8415	0.1564	0.0021	1	0	0.8318	0.1656	0.0026	1	0	0.8178	0.1787	0.0035
chr16	58543411	GA	G	0.500000	0.100	1	-1	1	496	94	402	57	8	19	2	8	0	0	402	0	0	0.6064	0.0000	0.0000	3.789	1.19	1.62	-0.43	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0020	0.9980	0.0000	0	1	0.0616	0.9384	0.0000
chr16	67195890	A	ACAGCAGCAG	0.500000	0.100	1	9	2	453	196	257	143	2	45	0	6	0	0	253	0	4	0.7296	0.0000	0.0156	3.356	0.81	9.67	-8.86	51	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0324	0.9676	0.0000	0	0	0.6519	0.3481	0.0000
chr16	67842920	ACAG	A	0.500000	0.100	1	-3	2	1259	409	850	274	33	77	1	24	0	1	848	0	1	0.6699	0.0000	0.0024	4.250	2.62	3.79	-1.17	54	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1460	0.8540	0.0000
chr16	71922608	AATGCCC	A	0.500000	0.100	1	-6	2	278	133	145	72	0	18	0	43	0	0	145	0	0	0.5414	0.0000	0.0000	6.389	0.31	8.07	-7.76	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8322	0.1651	0.0027	1	0	0.8221	0.1747	0.0033	1	0	0.8075	0.1882	0.0043
chr16	71947511	CTTTG	C	0.500000	0.100	1	-4	1	172	96	76	90	0	3	0	3	0	0	76	0	0	0.9375	0.0000	0.0000	31.000	0.49	4.00	-3.51	38	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.1110	0.8890	0.0000	0	0	0.7860	0.2140	0.0000	0	0	0.9200	0.0800	0.0000
chr16	71999722	AC	A	0.500000	0.100	1	-1	2	266	88	178	46	0	1	0	41	0	0	178	0	0	0.5227	0.0000	0.0000	87.000	0.26	1.29	-1.03	24	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3088	0.5765	0.1146	1	1	0.3098	0.5707	0.1195	1	1	0.3106	0.5635	0.1260
chr16	72797458	C	CTTG	0.500000	0.100	1	3	1	628	170	458	60	4	33	11	62	0	0	452	0	6	0.3529	0.0000	0.0131	4.121	0.53	5.19	-4.66	0	0/0	0/1	.	.	OK	1	2	0.0282	0.4750	0.4969	1	2	0.0313	0.4741	0.4946	1	2	0.0360	0.4734	0.4906
chr16	72797458	C	CTTGTTG	0.500000	0.100	1	6	1	628	170	458	64	0	50	1	55	0	0	452	0	6	0.3765	0.0000	0.0131	2.429	0.75	5.91	-5.16	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2145	0.6442	0.1413	1	1	0.2193	0.6339	0.1468	1	1	0.2253	0.6207	0.1541
chr16	81035884	AGGC	A	0.500000	0.100	1	-3	2	302	92	210	33	0	9	1	49	0	0	210	0	0	0.3587	0.0000	0.0000	9.222	1.27	4.45	-3.18	21	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0216	0.3501	0.6283	1	2	0.0242	0.3569	0.6189	1	2	0.0282	0.3661	0.6057
chr16	81208543	GTT	G	0.500000	0.100	1	-2	2	217	83	134	47	0	0	0	36	0	0	133	0	1	0.5663	0.0000	0.0075	83.000	1.43	4.69	-3.27	21	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4428	0.4962	0.0610	1	1	0.4391	0.4956	0.0653	1	1	0.4337	0.4950	0.0713
chr16	84463730	T	TAGTGGA	0.500000	0.100	1	6	1	182	78	104	42	0	3	0	33	0	0	104	0	0	0.5385	0.0000	0.0000	25.000	0.40	5.36	-4.96	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4252	0.5034	0.0714	1	1	0.4216	0.5025	0.0759	1	1	0.4164	0.5015	0.0820
chr16	85656376	GGAGCGC	G	0.500000	0.100	1	-6	3	453	99	354	47	4	10	1	37	0	0	354	0	0	0.4747	0.0000	0.0000	8.700	1.17	6.59	-5.42	25	0/0	0/1	.	.	OK	1	0	0.5081	0.4499	0.0419	1	0	0.5025	0.4519	0.0457	1	0	0.4944	0.4546	0.0510
chr16	85656394	CGAGCGT	C	0.500000	0.100	1	-6	1	442	95	347	39	0	16	1	39	0	0	347	0	0	0.4105	0.0000	0.0000	4.875	1.18	6.21	-5.03	19	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.1885	0.5945	0.2170	1	1	0.1924	0.5875	0.2202	1	1	0.1972	0.5786	0.2241
chr16	85710272	GGCTGCTGCT	G	0.500000	0.100	1	-9	1	368	176	192	90	0	16	1	69	0	0	190	0	2	0.5114	0.0000	0.0104	10.000	0.30	9.16	-8.86	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5644	0.4196	0.0159	1	0	0.5610	0.4208	0.0182	1	0	0.5554	0.4230	0.0216
chr16	87604287	C	CCTGCTG	0.500000	0.100	1	6	1	413	126	287	53	0	22	0	51	0	0	282	1	4	0.4206	0.0000	0.0174	4.727	0.43	5.86	-5.43	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1393	0.6216	0.2392	1	1	0.1444	0.6127	0.2429	1	1	0.1512	0.6014	0.2474
chr16	88533287	GGA	G	0.500000	0.100	1	-2	1	629	126	503	0	0	3	7	116	0	0	493	0	10	0.0000	0.0000	0.0199	40.333		8.19		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0011	0.9989	2	2	0.0000	0.0013	0.9987	2	2	0.0000	0.0016	0.9984
chr16	88533292	CT	C	0.500000	0.100	1	-1	2	628	123	505	0	0	6	14	103	0	0	494	2	9	0.0000	0.0000	0.0218	19.500		8.00		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0014	0.9986	2	2	0.0000	0.0016	0.9984	2	2	0.0000	0.0020	0.9980
chr16	88533294	CTGG	C	0.500000	0.100	1	-3	1	628	121	507	0	0	1	3	117	0	1	486	10	10	0.0000	0.0000	0.0414	118.000		8.21		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0055	0.9945	2	2	0.0000	0.0027	0.9973	2	2	0.0000	0.0023	0.9977
chr16	88714226	AGGTGTG	A	0.500000	0.100	1	-6	1	631	108	523	2	8	9	1	88	0	0	520	0	3	0.0185	0.0000	0.0057	14.000	6.50	13.98	-7.48	2	0/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9790	0.0210	2	1	0.0000	0.7209	0.2791
chr16	88714227	G	GGTGT	0.500000	0.100	1	4	1	624	108	516	69	12	8	1	18	1	1	514	0	0	0.6389	0.0019	0.0039	12.375	15.90	4.28	11.62	37	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0060	0.9940	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0004	0.9996	0.0000
chr16	88721199	CCTT	C	0.500000	0.100	1	-3	1	522	123	399	80	1	3	0	39	0	0	398	0	1	0.6504	0.0000	0.0025	40.000	1.16	3.03	-1.86	18	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9412	0.0586	0.0003	1	0	0.9346	0.0651	0.0004	1	0	0.9246	0.0748	0.0006
chr16	88733964	GTCC	G	0.500000	0.100	1	-3	1	752	204	548	78	1	35	6	84	0	0	546	0	2	0.3824	0.0000	0.0036	4.829	0.40	4.25	-3.85	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0317	0.5392	0.4291	1	1	0.0352	0.5341	0.4307	1	1	0.0402	0.5281	0.4316
chr16	88859959	C	CGCATCCAGTCCAGGTGGGCCCTACTTTCTGTGTCT	0.500000	0.100	1	35	2	889	190	699	98	0	45	0	47	0	0	669	0	30	0.5158	0.0000	0.0429	3.222	0.56	0.70	-0.14	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6234	0.3669	0.0097	1	0	0.6188	0.3699	0.0113	1	0	0.6116	0.3746	0.0138
chr16	89224802	G	GGTGA	0.500000	0.100	1	4	2	131	69	62	33	1	2	0	33	0	0	61	0	1	0.4783	0.0000	0.0161	33.500	0.18	4.00	-3.82	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2086	0.5826	0.2088	1	1	0.2117	0.5764	0.2118	1	1	0.2156	0.5687	0.2157
chr17	1645662	G	GAGC	0.022062	0.100	1	3	1	508	228	280	201	0	22	0	5	0	0	280	0	0	0.8816	0.0000	0.0000	9.364	0.28	3.00	-2.72	89	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9491	0.0509	0.0000	0	0	0.9998	0.0002	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr17	1728046	TGAG	T	0.225858	0.100	1	-3	1	826	199	627	100	0	10	1	88	0	0	627	0	0	0.5025	0.0000	0.0000	18.900	0.46	3.47	-3.01	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4738	0.5110	0.0151	1	1	0.4798	0.5035	0.0167	1	1	0.4865	0.4946	0.0189
chr17	3240728	CAG	C	0.002492	0.100	1	-2	1	1432	475	957	446	2	8	0	19	0	0	957	0	0	0.9389	0.0000	0.0000	58.250	0.57	2.16	-1.59	226	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr17	3690982	TG	T	0.682464	0.100	1	-1	2	316	111	205	72	0	0	0	39	0	0	205	0	0	0.6486	0.0000	0.0000	111.000	0.22	1.46	-1.24	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8269	0.1705	0.0026	1	0	0.8139	0.1828	0.0033	1	0	0.7953	0.2003	0.0044
chr17	7466484	GGAA	G	0.001385	0.100	1	-3	1	839	167	672	66	0	25	2	74	0	0	672	0	0	0.3952	0.0000	0.0000	5.680	0.32	3.34	-3.02	18	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1557	0.8427	0.0016	1	1	0.1681	0.8303	0.0016	1	1	0.1850	0.8134	0.0016
chr17	7846859	TACCACC	T	0.084745	0.100	1	-6	2	1220	354	866	171	6	59	1	117	1	0	857	1	7	0.4831	0.0012	0.0104	5.000	5.47	5.96	-0.49	25	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9720	0.0280	0.0000	1	0	0.9696	0.0304	0.0000	1	0	0.9659	0.0341	0.0000
chr17	16058489	TAAC	T	0.500000	0.100	1	-3	2	231	72	159	42	0	1	0	29	0	0	157	0	2	0.5833	0.0000	0.0126	71.000	0.19	3.10	-2.91	16	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.4820	0.4635	0.0545	1	0	0.4764	0.4650	0.0586	1	0	0.4685	0.4672	0.0643
chr17	17136247	CCAG	C	0.500000	0.100	1	-3	1	497	187	310	84	0	20	4	79	0	0	310	0	0	0.4492	0.0000	0.0000	8.350	0.17	3.20	-3.04	36	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1688	0.6930	0.1382	1	1	0.1755	0.6797	0.1448	1	1	0.1840	0.6626	0.1534
chr17	17793784	AGC	A	0.500000	0.100	1	-2	1	901	238	663	3	4	35	4	192	0	0	662	0	1	0.0126	0.0000	0.0015	5.912	1.67	4.54	-2.88	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.5536	0.4464	2	2	0.0000	0.0178	0.9822	2	2	0.0000	0.0032	0.9968
chr17	17793787	AG	A	0.500000	0.100	1	-1	1	901	240	661	2	30	13	22	173	0	0	659	1	1	0.0083	0.0000	0.0030	56.000	1.50	4.10	-2.60	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9959	0.0041	2	1	0.0000	0.8013	0.1987
chr17	18778544	AG	A	0.500000	0.100	1	-1	3	1000	328	672	315	3	1	1	8	0	0	672	0	0	0.9604	0.0000	0.0000	326.000	0.23	1.00	-0.77	211	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0769	0.9231	0.0000	0	0	0.9988	0.0012	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr17	18971372	C	CGGT	0.500000	0.100	1	3	1	701	156	545	0	0	2	1	153	0	0	538	0	7	0.0000	0.0000	0.0128	77.000		3.99		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0003	0.9997	2	2	0.0000	0.0003	0.9997	2	2	0.0000	0.0004	0.9996
chr17	38352779	G	GAGC	0.500000	0.100	1	3	4	679	192	487	93	13	13	2	71	0	0	484	1	2	0.4844	0.0000	0.0062	13.692	0.90	3.28	-2.38	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7980	0.1999	0.0021	1	0	0.7899	0.2075	0.0026	1	0	0.7781	0.2184	0.0035
chr17	40701882	CA	C	0.500000	0.100	1	-1	2	142	88	54	83	0	1	0	4	0	0	54	0	0	0.9432	0.0000	0.0000	87.000	0.46	1.00	-0.54	17	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0095	0.9905	0.0000	0	1	0.4724	0.5276	0.0000	0	0	0.8117	0.1883	0.0000
chr17	40835263	CTGTT	C	0.500000	0.100	1	-4	4	443	104	339	59	0	7	0	38	0	0	337	0	2	0.5673	0.0000	0.0059	13.857	0.22	3.89	-3.67	31	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.6590	0.3257	0.0152	1	0	0.6497	0.3329	0.0174	1	0	0.6366	0.3428	0.0206
chr17	41026759	AG	A	0.500000	0.100	1	-1	1	734	195	539	100	1	17	2	75	0	0	538	0	1	0.5128	0.0000	0.0019	10.412	0.13	1.27	-1.14	66	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6618	0.3310	0.0072	1	0	0.6563	0.3353	0.0085	1	0	0.6478	0.3416	0.0105
chr17	41041248	GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCACAGCAGCGTGGCTGGCAGGAGCTGGTCTCACAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGAGCCGCAGGTCCCACTGGTGGAGCAGCTGGGAAATCCACAGAAGCTGGTCTGA	G	0.500000	0.100	1	-138	2	936	390	546	365	2	9	0	14	0	0	546	0	0	0.9359	0.0000	0.0000	42.333	1.21	3.14	-1.93	135	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	0.9685	0.0315	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr17	41060050	T	TG	0.500000	0.100	1	1	1	856	222	634	105	4	1	0	112	0	0	634	0	0	0.4730	0.0000	0.0000	221.000	0.27	1.39	-1.13	17	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0918	0.7380	0.1702	1	1	0.0987	0.7225	0.1787	1	1	0.1081	0.7023	0.1896
chr17	41098083	A	AT	0.500000	0.100	1	1	2	423	124	299	54	0	6	0	64	0	0	299	0	0	0.4355	0.0000	0.0000	19.667	0.44	1.78	-1.34	36	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0560	0.5380	0.4060	1	1	0.0604	0.5342	0.4054	1	1	0.0665	0.5297	0.4038
chr17	41105490	CTGCAGGACCACCTGCTGCCGCCCCAGCTGTTGTGTATCCAGCTGCTGCAGGCCCCAGTGCTGCCAGTCTGTGTGCTGCCAACCCACTTGTTCCCGCCCCAGCTGCTGTCAGACCACCTGT	C	0.500000	0.100	1	-120	1	752	321	431	281	3	22	0	15	0	0	431	0	0	0.8754	0.0000	0.0000	13.591	1.19	3.87	-2.68	107	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1458	0.8542	0.0000	0	0	0.9846	0.0154	0.0000
chr17	41105507	GCCGCCCCAGCTGTTGTGTATCCAGCTGCTGCAGGCCCCAGTGCTGCCAGTCTGTGTGCTGCCAACCCACTTGTTCCCGCCCCAGCTGCTGTCAGACCACCTGTTGCAGGACCACCTGCTA	G	0.500000	0.100	1	-120	1	755	326	429	273	10	24	3	16	0	0	429	0	0	0.8374	0.0000	0.0000	12.500	1.18	3.38	-2.19	95	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0086	0.9914	0.0000	0	0	0.9000	0.1000	0.0000
chr17	41105856	CTCCAGCTGCTGCCGCCCCTCTTGCTGTGAA	C	0.500000	0.100	1	-30	1	693	234	459	189	0	37	0	8	2	0	455	0	2	0.8077	0.0044	0.0087	5.324	0.70	12.25	-11.55	85	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2484	0.7516	0.0000	0	0	0.9453	0.0547	0.0000
chr17	41149523	T	TGGCAGCAGCTGGGGC	0.500000	0.100	1	15	1	523	127	396	61	1	8	2	55	0	0	383	0	13	0.4803	0.0000	0.0328	14.875	1.03	7.60	-6.57	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0725	0.5941	0.3334	1	1	0.0774	0.5868	0.3358	1	1	0.0843	0.5776	0.3381
chr17	41227070	ACTGCTGCCAGCC	A	0.500000	0.100	1	-12	2	566	183	383	108	1	13	0	61	1	0	373	0	9	0.5902	0.0026	0.0261	14.167	1.69	10.84	-9.15	40	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9178	0.0819	0.0003	1	0	0.9109	0.0887	0.0004	1	0	0.9006	0.0988	0.0006
chr17	44903871	G	GAGT	0.500000	0.100	1	3	5	1654	366	1288	204	0	4	0	158	0	0	1281	0	7	0.5574	0.0000	0.0054	90.500	0.62	3.31	-2.69	88	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7959	0.2037	0.0003	1	0	0.7938	0.2057	0.0005	1	0	0.7896	0.2097	0.0007
chr17	45242067	TCCG	T	0.500000	0.100	1	-3	2	592	172	420	73	1	27	2	69	0	1	417	0	2	0.4244	0.0000	0.0071	5.370	0.30	3.43	-3.13	1	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1923	0.6703	0.1373	1	1	0.1983	0.6583	0.1434	1	1	0.2057	0.6430	0.1513
chr17	47361520	CAGTG	C	0.500000	0.100	1	-4	1	302	91	211	48	0	6	0	37	0	0	210	0	1	0.5275	0.0000	0.0047	14.167	0.08	3.57	-3.48	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4407	0.4987	0.0607	1	1	0.4371	0.4979	0.0650	1	1	0.4319	0.4970	0.0710
chr17	47836758	AAGGAGCTGGAGC	A	0.500000	0.100	1	-12	1	673	142	531	80	0	8	0	54	0	0	515	0	16	0.5634	0.0000	0.0301	16.750	0.41	10.94	-10.53	30	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3722	0.5765	0.0513	1	1	0.3744	0.5699	0.0557	1	1	0.3763	0.5618	0.0619
chr17	50375617	A	AAGC	0.500000	0.100	1	3	5	915	266	649	105	0	9	0	152	0	0	645	0	4	0.3947	0.0000	0.0062	28.556	0.24	3.09	-2.85	21	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0439	0.9561	1	2	0.0001	0.0482	0.9518	1	2	0.0001	0.0548	0.9451
chr17	57979245	GC	G	0.500000	0.100	1	-1	2	427	189	238	171	0	10	2	6	0	0	238	0	0	0.9048	0.0000	0.0000	17.900	0.32	4.67	-4.35	47	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	0	0.5712	0.4288	0.0000	0	0	0.9641	0.0359	0.0000
chr17	57979247	TGC	T	0.500000	0.100	1	-2	1	427	189	238	165	1	7	8	8	0	0	238	0	0	0.8730	0.0000	0.0000	25.143	0.32	4.25	-3.93	39	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0852	0.9148	0.0000	0	0	0.7614	0.2386	0.0000
chr17	58156083	G	GT	0.500000	0.100	1	1	1	332	64	268	57	0	1	0	6	0	0	268	0	0	0.8906	0.0000	0.0000	63.000	0.16	1.50	-1.34	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0284	0.9716	0.0000	0	1	0.2531	0.7469	0.0000
chr17	58206040	AT	A	0.500000	0.100	1	-1	5	1279	274	1005	255	0	2	0	17	0	0	1005	0	0	0.9307	0.0000	0.0000	136.000	0.33	1.88	-1.56	77	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0047	0.9953	0.0000	0	0	0.8127	0.1873	0.0000
chr17	58756096	G	GGAACCC	0.500000	0.100	1	6	2	409	141	268	55	2	34	1	49	0	0	267	0	1	0.3901	0.0000	0.0037	3.147	0.36	6.00	-5.64	29	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3146	0.5896	0.0958	1	1	0.3163	0.5828	0.1009	1	1	0.3180	0.5743	0.1077
chr17	65536436	ACGGGGGGTGGTG	A	0.500000	0.100	1	-12	1	356	99	257	52	0	2	0	45	0	0	247	0	10	0.5253	0.0000	0.0389	48.500	0.85	10.36	-9.51	10	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1358	0.6180	0.2462	1	1	0.1409	0.6094	0.2497	1	1	0.1477	0.5984	0.2539
chr17	67825951	AGCC	A	0.500000	0.100	1	-3	2	441	92	349	44	0	11	1	36	0	0	347	0	2	0.4783	0.0000	0.0057	7.364	0.73	3.47	-2.74	24	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.3124	0.5717	0.1159	1	1	0.3131	0.5663	0.1207	1	1	0.3135	0.5594	0.1271
chr17	67959642	T	TCCTCCAGCC	0.500000	0.100	1	9	1	371	119	252	60	0	15	0	44	0	0	252	0	0	0.5042	0.0000	0.0000	6.933	0.28	6.70	-6.42	16	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5801	0.3956	0.0243	1	0	0.5731	0.3998	0.0272	1	0	0.5630	0.4056	0.0314
chr17	69154324	C	CACCTGGAA	0.500000	0.100	1	8	2	304	80	224	74	0	3	0	3	1	0	223	0	0	0.9250	0.0045	0.0045	25.667	0.62	8.00	-7.38	10	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0549	0.9451	0.0000	0	0	0.6345	0.3655	0.0000	0	0	0.8473	0.1527	0.0000
chr17	69193976	AAT	A	0.500000	0.100	1	-2	3	303	99	204	95	0	0	0	4	0	0	204	0	0	0.9596	0.0000	0.0000	99.000	0.36	2.00	-1.64	11	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0172	0.9828	0.0000	0	0	0.6193	0.3807	0.0000	0	0	0.8852	0.1148	0.0000
chr17	74215706	GT	G	0.500000	0.100	1	-1	1	115	45	70	40	0	0	0	5	0	0	70	0	0	0.8889	0.0000	0.0000	45.000	0.07	1.00	-0.93	22	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0353	0.9647	0.0000	0	1	0.2207	0.7793	0.0000
chr17	74367718	GC	G	0.500000	0.100	1	-1	2	210	63	147	60	0	1	0	2	0	0	147	0	0	0.9524	0.0000	0.0000	62.000	0.20	1.00	-0.80	8	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2025	0.7975	0.0000	0	0	0.7048	0.2952	0.0000	0	0	0.8360	0.1640	0.0000
chr17	74842991	A	AGCTCCGGGG	0.500000	0.100	1	9	2	545	114	431	46	0	13	1	54	0	0	424	0	7	0.4035	0.0000	0.0162	7.769	0.17	8.11	-7.94	8	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0241	0.4004	0.5755	1	2	0.0270	0.4042	0.5688	1	2	0.0312	0.4096	0.5592
chr17	74893497	C	CGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTA	0.500000	0.100	1	36	2	316	92	224	5	0	58	1	28	0	0	215	0	9	0.0543	0.0000	0.0402	0.569	0.00	2.36	-2.36	1	0/1	1/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9684	0.0316	2	1	0.0000	0.7965	0.2035
chr17	74893524	GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC	G	0.500000	0.100	1	-54	1	320	120	200	94	1	5	0	20	0	0	200	0	0	0.7833	0.0000	0.0000	23.000	0.97	4.10	-3.13	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0003	0.9997	0.0000
chr17	75128745	CTCA	C	0.500000	0.100	1	-3	1	468	119	349	75	0	8	1	35	0	0	347	0	2	0.6303	0.0000	0.0057	13.875	0.23	3.17	-2.94	43	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9178	0.0816	0.0006	1	0	0.9098	0.0894	0.0008	1	0	0.8980	0.1008	0.0011
chr17	75596487	CTG	C	0.500000	0.100	1	-2	2	1041	320	721	38	0	5	1	276	0	0	708	0	13	0.1187	0.0000	0.0180	63.000	0.16	2.26	-2.10	8	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000
chr17	76292311	CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT	C	0.500000	0.100	1	-30	1	2159	482	1677	224	7	58	6	187	0	4	1661	2	10	0.4647	0.0000	0.0095	7.241	1.35	6.42	-5.06	44	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5209	0.4776	0.0015	1	0	0.5330	0.4651	0.0019	1	0	0.5463	0.4511	0.0027
chr17	76292483	CTGA	C	0.500000	0.100	1	-3	1	2077	565	1512	247	4	31	5	278	3	2	1382	7	118	0.4372	0.0020	0.0860	19.000	1.95	4.65	-2.71	11	0/1	0/0	.	.	OK	1	2	0.0000	0.0000	1.0000	1	2	0.0000	0.0000	1.0000	1	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr17	81456347	CGTGGCCCACAGG	C	0.500000	0.100	1	-12	2	866	279	587	179	0	11	1	88	0	0	575	0	12	0.6416	0.0000	0.0204	24.364	0.40	11.35	-10.95	73	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9966	0.0034	0.0000	1	0	0.9959	0.0041	0.0000	1	0	0.9946	0.0054	0.0000
chr17	82362585	TC	T	0.500000	0.100	1	-1	2	492	140	352	80	0	4	0	56	0	0	352	0	0	0.5714	0.0000	0.0000	34.000	0.29	1.50	-1.21	24	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7301	0.2636	0.0063	1	0	0.7211	0.2714	0.0074	1	0	0.7083	0.2824	0.0093
chr18	3452224	CT	C	0.390343	0.100	1	-1	7	320	67	253	61	1	1	0	4	0	0	253	0	0	0.9104	0.0000	0.0000	66.000	0.74	1.00	-0.26	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0051	0.9949	0.0000	0	1	0.3285	0.6715	0.0000	0	0	0.7082	0.2918	0.0000
chr18	11689670	C	CGGCCCT	0.145960	0.100	1	6	4	396	113	283	53	1	9	0	50	0	0	283	0	0	0.4690	0.0000	0.0000	11.444	0.38	5.60	-5.22	31	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4138	0.5529	0.0333	1	1	0.4189	0.5464	0.0347	1	1	0.4250	0.5384	0.0366
chr18	13049812	GA	G	0.001808	0.100	1	-1	1	355	99	256	58	0	0	3	38	0	0	254	0	2	0.5859	0.0000	0.0078	99.000	0.40	3.79	-3.39	0	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7315	0.2685	0.0001	1	0	0.7274	0.2725	0.0001	1	0	0.7216	0.2784	0.0001
chr18	13049814	GCA	G	0.001808	0.100	1	-2	1	355	96	259	56	1	0	1	38	0	0	257	0	2	0.5833	0.0000	0.0077	96.000	0.34	3.74	-3.40	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7504	0.2496	0.0001	1	0	0.7457	0.2543	0.0001	1	0	0.7390	0.2609	0.0001
chr18	21520797	A	ATCT	0.999706	0.100	1	3	1	322	133	189	0	0	9	1	123	0	0	182	0	7	0.0000	0.0000	0.0370	13.778		3.01		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr18	24160067	CTG	C	0.002292	0.100	1	-2	4	367	79	288	39	0	1	0	39	0	0	288	0	0	0.4937	0.0000	0.0000	78.000	0.36	2.03	-1.67	27	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4046	0.5945	0.0009	1	1	0.4116	0.5875	0.0009	1	1	0.4204	0.5786	0.0010
chr18	44876705	C	CTCTT	0.547041	0.100	1	4	1	205	103	102	95	0	2	0	6	0	0	102	0	0	0.9223	0.0000	0.0000	50.500	0.11	4.33	-4.23	27	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0002	0.9998	0.0000	0	1	0.1380	0.8620	0.0000	0	0	0.6388	0.3612	0.0000
chr18	46253735	TCTG	T	0.500000	0.100	1	-3	1	114	55	59	28	0	3	0	24	0	0	58	0	1	0.5091	0.0000	0.0169	17.333	0.18	3.04	-2.86	2	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2875	0.5539	0.1586	1	1	0.2877	0.5498	0.1624	1	1	0.2878	0.5447	0.1675
chr18	48950173	CGCGCCGGCGCCCGCGGCT	C	0.500000	0.100	1	-18	2	446	121	325	111	0	4	0	6	0	0	325	0	0	0.9174	0.0000	0.0000	29.250	0.74	12.67	-11.93	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0005	0.9995	0.0000	0	1	0.3006	0.6994	0.0000	0	0	0.8228	0.1772	0.0000
chr18	49879055	T	TGAG	0.500000	0.100	1	3	1	343	160	183	68	0	9	1	82	0	0	182	0	1	0.4250	0.0000	0.0055	16.778	0.24	2.89	-2.65	14	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0226	0.4564	0.5210	1	2	0.0254	0.4562	0.5185	1	2	0.0295	0.4564	0.5141
chr18	51196775	CGCCGCCGCG	C	0.500000	0.100	1	-9	2	616	142	474	70	0	7	2	63	0	0	474	0	0	0.4930	0.0000	0.0000	19.143	1.36	9.51	-8.15	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.2762	0.6282	0.0956	1	1	0.2802	0.6188	0.1010	1	1	0.2848	0.6069	0.1084
chr18	54269587	GCGA	G	0.500000	0.100	1	-3	2	228	126	102	0	0	6	0	120	0	0	102	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	20.000		3.52		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0022	0.9978	2	2	0.0000	0.0025	0.9975	2	2	0.0000	0.0029	0.9971
chr18	58536020	AAAG	A	0.500000	0.100	1	-3	5	623	146	477	135	0	4	0	7	0	0	476	0	1	0.9247	0.0000	0.0021	35.500	0.24	3.43	-3.19	27	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1449	0.8551	0.0000	0	0	0.8048	0.1952	0.0000
chr18	58537155	ACAGTTGATGTGTCCT	A	0.500000	0.100	1	-15	2	751	167	584	21	0	8	0	138	0	0	573	0	11	0.1257	0.0000	0.0188	19.875	0.38	12.99	-12.60	9	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9981	0.0019
chr18	62523553	C	CCCG	0.500000	0.100	1	3	6	402	68	334	23	2	8	0	35	1	1	331	0	1	0.3382	0.0030	0.0090	8.571	3.96	5.71	-1.76	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0677	0.4780	0.4543	1	1	0.0720	0.4789	0.4491	1	1	0.0780	0.4801	0.4418
chr18	63655777	T	TGCCA	0.500000	0.100	1	4	2	379	127	252	122	0	1	0	4	0	0	252	0	0	0.9606	0.0000	0.0000	126.000	0.25	4.75	-4.50	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0646	0.9354	0.0000	0	0	0.8623	0.1377	0.0000	0	0	0.9662	0.0338	0.0000
chr18	63655779	CT	C	0.500000	0.100	1	-1	2	379	127	252	123	0	1	0	3	0	0	252	0	0	0.9685	0.0000	0.0000	126.000	0.25	6.00	-5.75	21	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.4037	0.5963	0.0000	0	0	0.9501	0.0499	0.0000	0	0	0.9827	0.0173	0.0000
chr18	68691277	TAA	T	0.500000	0.100	1	-2	2	74	39	35	22	0	0	0	17	0	0	35	0	0	0.5641	0.0000	0.0000	39.000	0.36	2.41	-2.05	8	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3513	0.5183	0.1304	1	1	0.3487	0.5168	0.1345	1	1	0.3450	0.5150	0.1399
chr18	70196614	T	TCTC	0.500000	0.100	1	3	1	163	75	88	0	0	6	0	69	0	0	88	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	11.500		3.39		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0288	0.9712	2	2	0.0000	0.0309	0.9691	2	2	0.0000	0.0339	0.9661
chr18	74556356	G	GTGC	0.500000	0.100	1	3	1	145	76	69	68	1	5	0	2	0	0	69	0	0	0.8947	0.0000	0.0000	14.200	0.18	3.00	-2.82	26	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2836	0.7164	0.0000	0	0	0.7887	0.2113	0.0000	0	0	0.8874	0.1126	0.0000
chr19	1004897	G	GCGTT	0.284715	0.100	1	4	1	586	128	458	117	0	1	0	10	0	0	458	0	0	0.9141	0.0000	0.0000	127.000	0.56	5.40	-4.84	9	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0202	0.9798	0.0000	0	0	0.5450	0.4550	0.0000
chr19	1535194	GCCC	G	0.232630	0.100	1	-3	1	158	57	101	33	0	0	0	24	0	0	101	0	0	0.5789	0.0000	0.0000	57.000	1.18	4.00	-2.82	7	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5691	0.4019	0.0290	1	0	0.5649	0.4043	0.0308	1	0	0.5589	0.4077	0.0334
chr19	1825928	TCTC	T	0.223001	0.100	1	-3	2	210	122	88	16	0	0	0	106	0	0	87	0	1	0.1311	0.0000	0.0114	122.000	0.12	3.12	-3.00	6	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9982	0.0018
chr19	1827021	T	TGGA	0.035075	0.100	1	3	2	339	88	251	9	1	25	4	49	0	0	251	0	0	0.1023	0.0000	0.0000	2.520	0.78	3.59	-2.81	7	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9995	0.0005	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	1	0.0000	0.9992	0.0008
chr19	2015541	G	GGGC	0.004938	0.100	1	3	4	287	100	187	0	66	32	0	2	0	5	181	1	0	0.0000	0.0000	0.0321	2.094		3.00		0	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9736	0.0264	0.0000	0	0	0.9977	0.0023	0.0000	0	0	0.9991	0.0009	0.0000
chr19	2015541	GGGC	G	0.470011	0.100	1	-3	4	287	100	187	2	0	32	61	5	0	0	178	9	0	0.0200	0.0000	0.0481	2.125	3.00	3.40	-0.40	2	0/0	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.6196	0.3804	2	2	0.0000	0.1762	0.8238	2	2	0.0000	0.0953	0.9047
chr19	2015541	GGGCGGC	G	0.145769	0.100	1	-6	4	287	100	187	3	0	33	0	64	0	0	177	1	9	0.0300	0.0000	0.0535	2.030	2.00	7.02	-5.02	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9908	0.0092	2	1	0.0000	0.7841	0.2159	2	1	0.0000	0.5314	0.4686
chr19	2253751	GGCGCGGTCTGCGCCTTCTTGC	G	0.000218	0.100	1	-21	1	254	78	176	45	0	4	0	29	0	0	171	0	5	0.5769	0.0000	0.0284	18.500	0.16	17.90	-17.74	5	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6688	0.3312	0.0000	1	0	0.6659	0.3341	0.0000	1	0	0.6618	0.3382	0.0000
chr19	4529242	TGAG	T	0.001023	0.100	1	-3	1	210	73	137	65	0	2	0	6	0	0	137	0	0	0.8904	0.0000	0.0000	35.500	0.18	3.00	-2.82	19	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0415	0.9585	0.0000	0	0	0.9768	0.0232	0.0000	0	0	0.9979	0.0021	0.0000
chr19	4544250	G	GCGCCAC	0.000589	0.100	1	6	2	298	68	230	35	0	10	0	23	0	0	224	1	5	0.5147	0.0000	0.0261	5.800	0.89	5.91	-5.03	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5788	0.4211	0.0001	1	0	0.5786	0.4213	0.0001	1	0	0.5780	0.4219	0.0001
chr19	4817276	A	AAGG	0.143545	0.100	1	3	1	761	164	597	127	5	24	0	8	0	0	596	0	1	0.7744	0.0000	0.0017	5.833	0.69	3.12	-2.44	39	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.2311	0.7689	0.0000	0	0	0.9180	0.0820	0.0000
chr19	8325008	GTCC	G	0.118610	0.100	1	-3	1	407	101	306	51	0	7	0	43	2	0	304	0	0	0.5050	0.0065	0.0065	13.429	0.20	3.12	-2.92	23	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5907	0.3983	0.0109	1	0	0.5896	0.3986	0.0118	1	0	0.5875	0.3995	0.0130
chr19	8334065	CTCGCTGTCGCCA	C	0.292264	0.100	1	-12	2	647	177	470	97	0	9	0	71	0	0	462	0	8	0.5480	0.0000	0.0170	18.667	0.75	11.15	-10.40	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6353	0.3574	0.0074	1	0	0.6337	0.3578	0.0085	1	0	0.6307	0.3592	0.0101
chr19	9126022	G	GATGGT	0.319679	0.100	1	5	3	260	57	203	25	0	5	0	27	0	0	197	0	6	0.4386	0.0000	0.0296	10.400	0.48	5.44	-4.96	15	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1314	0.5672	0.3015	1	1	0.1378	0.5647	0.2975	1	1	0.1466	0.5615	0.2919
chr19	11447525	AGAG	A	0.336648	0.100	1	-3	1	794	249	545	94	6	43	13	93	0	0	543	0	2	0.3775	0.0000	0.0037	4.767	0.57	3.28	-2.71	28	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0753	0.7215	0.2031	1	1	0.0825	0.7088	0.2086	1	1	0.0926	0.6923	0.2151
chr19	13207858	CCTG	C	0.175850	0.100	1	-3	1	408	128	280	0	1	25	99	3	0	0	273	6	1	0.0000	0.0000	0.0250	4.120		2.00		0	0/0	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.1076	0.8924	2	2	0.0000	0.0511	0.9489	2	2	0.0000	0.0411	0.9589
chr19	13207858	CCTGCTG	C	0.308136	0.100	1	-6	1	408	131	277	0	0	23	3	105	0	0	271	0	6	0.0000	0.0000	0.0217	4.696		6.17		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0067	0.9933	2	2	0.0000	0.0076	0.9924	2	2	0.0000	0.0089	0.9911
chr19	13877367	T	TGGAGCCGGTGTCAGCGCC	0.004594	0.100	1	18	1	404	106	298	91	0	8	0	7	0	0	298	0	0	0.8585	0.0000	0.0000	12.250	0.10	13.43	-13.33	43	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0039	0.9961	0.0000	0	0	0.9220	0.0780	0.0000	0	0	0.9950	0.0050	0.0000
chr19	14942171	T	TATC	0.985769	0.100	1	3	1	554	101	453	0	0	7	0	94	0	0	447	0	6	0.0000	0.0000	0.0132	15.667		3.17		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999
chr19	17286678	GTGTGTGTGTGTGTT	G	0.125300	0.100	1	-14	1	345	71	274	0	1	11	13	46	0	0	272	1	1	0.0000	0.0000	0.0073	5.364		10.09		0	0/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.3304	0.6696	2	2	0.0000	0.3271	0.6729	2	2	0.0000	0.3300	0.6700
chr19	20624371	G	GA	0.722794	0.100	1	1	1	1485	312	1173	0	1	4	7	300	0	0	1101	16	56	0.0000	0.0000	0.0614	102.333		2.70		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr19	21116968	TATA	T	0.087128	0.100	1	-3	2	993	235	758	93	1	7	1	133	0	0	756	0	2	0.3957	0.0000	0.0026	32.429	0.29	3.10	-2.81	69	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0016	0.3481	0.6504	1	2	0.0021	0.3655	0.6324	1	2	0.0031	0.3901	0.6069
chr19	21383385	TAATTCATGCTGGAGAGAAACACTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAAGATTTTAAACAGTCCTCACACCTTACTAAACATAAGAC	T	0.206936	0.100	1	-84	2	1909	529	1380	310	2	47	0	170	4	14	1355	0	7	0.5860	0.0029	0.0181	10.234	0.41	3.02	-2.61	80	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000	1	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr19	23933695	CATA	C	0.000003	0.100	1	-3	3	2107	564	1543	515	3	21	1	24	17	4	1520	1	1	0.9131	0.0110	0.0149	27.050	1.04	4.46	-3.42	93	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr19	30009211	GTGA	G	0.833397	0.100	1	-3	1	326	84	242	6	0	12	5	61	0	0	238	0	4	0.0714	0.0000	0.0165	6.000	1.17	3.36	-2.19	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9997	0.0003	2	1	0.0000	0.7827	0.2173	2	2	0.0000	0.2394	0.7606
chr19	33301825	G	GGCGGGT	0.027007	0.100	1	6	1	469	124	345	50	1	27	0	46	0	0	344	1	0	0.4032	0.0000	0.0029	3.556	0.72	4.78	-4.06	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4648	0.5291	0.0061	1	1	0.4701	0.5236	0.0063	1	1	0.4765	0.5169	0.0067
chr19	33379692	GACCTC	G	0.005617	0.100	1	-5	1	453	118	335	106	0	4	0	8	0	0	335	0	0	0.8983	0.0000	0.0000	28.500	0.23	5.25	-5.02	50	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0007	0.9993	0.0000	0	0	0.8757	0.1243	0.0000	0	0	0.9944	0.0056	0.0000
chr19	35267372	G	GGGA	0.741773	0.100	1	3	1	561	153	408	81	1	4	0	67	0	0	407	0	1	0.5294	0.0000	0.0025	37.250	0.59	3.52	-2.93	9	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.3128	0.6312	0.0560	1	1	0.3112	0.6267	0.0621	1	1	0.3082	0.6210	0.0708
chr19	35511491	C	CGCCACTGCTGCT	0.070267	0.100	1	12	2	537	224	313	79	0	52	1	92	0	0	312	1	0	0.3527	0.0000	0.0032	3.308	0.46	6.23	-5.77	1	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.0741	0.8178	0.1082	1	1	0.0828	0.8094	0.1078	1	1	0.0954	0.7978	0.1068
chr19	35511516	GCCA	G	0.098140	0.100	1	-3	1	538	211	327	170	1	11	1	28	0	0	327	0	0	0.8057	0.0000	0.0000	18.091	3.23	2.43	0.80	12	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0005	0.9995	0.0000
chr19	38304914	AAGG	A	0.000867	0.100	1	-3	1	338	84	254	76	1	1	1	5	0	0	254	0	0	0.9048	0.0000	0.0000	82.000	0.43	6.20	-5.77	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3467	0.6533	0.0000	0	0	0.9943	0.0057	0.0000	0	0	0.9993	0.0007	0.0000
chr19	38304940	CAAG	C	0.034026	0.100	1	-3	3	336	85	251	78	0	2	0	5	1	0	250	0	0	0.9176	0.0040	0.0040	41.500	0.54	6.20	-5.66	2	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0232	0.9768	0.0000	0	0	0.8774	0.1226	0.0000	0	0	0.9815	0.0185	0.0000
chr19	39248513	CT	C	0.306458	0.100	1	-1	2	470	128	342	62	0	1	3	62	0	0	337	1	4	0.4844	0.0000	0.0146	125.000	0.24	3.16	-2.92	12	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1162	0.6619	0.2219	1	1	0.1238	0.6529	0.2234	1	1	0.1341	0.6412	0.2247
chr19	39906132	AGC	A	0.783963	0.100	1	-2	1	235	38	197	0	0	2	33	3	0	0	197	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	32.000		5.00		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0434	0.9566	2	2	0.0000	0.0450	0.9550	2	2	0.0000	0.0473	0.9527
chr19	39906137	T	TGC	0.795815	0.100	1	2	2	235	37	198	0	1	21	15	0	0	0	198	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	0.833				0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0959	0.9041	2	2	0.0000	0.0972	0.9028	2	2	0.0000	0.0991	0.9009
chr19	40667987	CTGCTGT	C	0.548568	0.100	1	-6	1	478	158	320	66	0	10	1	81	1	0	319	0	0	0.4177	0.0031	0.0031	14.700	0.15	5.95	-5.80	14	0/1	0/1	.	.	OK	1	2	0.0229	0.4551	0.5221	1	2	0.0255	0.4542	0.5203	1	2	0.0294	0.4536	0.5169
chr19	41116202	G	GC	0.200742	0.100	1	1	2	464	154	310	0	0	1	0	153	0	0	308	0	2	0.0000	0.0000	0.0065	153.000		1.97		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0015	0.9985	2	2	0.0000	0.0017	0.9983	2	2	0.0000	0.0022	0.9978
chr19	43847014	GGGAGAT	G	0.416095	0.100	1	-6	1	419	101	318	11	0	0	0	90	0	0	312	0	6	0.1089	0.0000	0.0189	101.000	0.27	6.90	-6.63	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9993	0.0007	2	1	0.0000	0.9394	0.0606
chr19	44085846	TCTC	T	0.633374	0.100	1	-3	2	523	154	369	4	0	1	0	149	0	0	368	0	1	0.0260	0.0000	0.0027	153.000	0.25	3.09	-2.84	4	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.6677	0.3323	2	2	0.0000	0.0223	0.9777	2	2	0.0000	0.0052	0.9948
chr19	44273995	TCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTGAGGTATGTGATAAGGGCTTCAGTAAGGCCTCAAATCTTCAAGCCCATCAGAGAATC	T	0.002701	0.100	1	-84	2	684	193	491	177	1	12	0	3	0	1	490	0	0	0.9171	0.0000	0.0020	15.000	0.65	4.00	-3.35	17	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9998	0.0002	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr19	44274642	CG	C	0.147169	0.100	1	-1	2	546	122	424	62	1	4	3	52	0	0	420	1	3	0.5082	0.0000	0.0094	29.500	0.29	2.27	-1.98	18	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4091	0.5615	0.0294	1	1	0.4151	0.5539	0.0309	1	1	0.4224	0.5447	0.0329
chr19	44793589	A	AC	0.013876	0.100	1	1	1	224	97	127	46	0	9	0	42	0	0	127	0	0	0.4742	0.0000	0.0000	9.778	0.22	2.02	-1.81	10	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.4916	0.5054	0.0030	1	1	0.4957	0.5012	0.0031	1	0	0.5005	0.4962	0.0033
chr19	45761789	A	ATCCAGC	0.479648	0.100	1	6	2	1364	441	923	351	0	82	0	8	0	0	921	0	2	0.7959	0.0000	0.0022	4.378	0.38	3.50	-3.12	173	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0142	0.9858	0.0000	0	0	0.9991	0.0009	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr19	47802295	ATCGGGCCTGGGT	A	0.001408	0.100	1	-12	3	1411	320	1091	134	29	32	14	111	0	5	1073	8	5	0.4188	0.0000	0.0165	9.067	5.35	9.63	-4.28	40	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8155	0.1845	0.0000	1	0	0.8148	0.1852	0.0000	1	0	0.8130	0.1870	0.0000
chr19	47802317	AGATTGGGCCTGG	A	0.001318	0.100	1	-12	1	1417	316	1101	79	53	50	16	118	1	1	1096	1	2	0.2500	0.0009	0.0045	5.609	3.47	10.03	-6.57	7	0/0	0/1	.	.	OK	1	1	0.1630	0.8365	0.0004	1	1	0.1788	0.8207	0.0004	1	1	0.2004	0.7991	0.0005
chr19	49070105	TGGA	T	0.101017	0.100	1	-3	1	377	107	270	95	1	3	0	8	0	0	270	0	0	0.8879	0.0000	0.0000	34.667	0.62	3.62	-3.00	61	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1771	0.8229	0.0000	0	0	0.8468	0.1532	0.0000
chr19	49652104	GCCGCTC	G	0.363480	0.100	1	-6	2	544	138	406	0	0	27	2	109	0	1	395	0	10	0.0000	0.0000	0.0271	4.111		6.74		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0056	0.9944	2	2	0.0000	0.0059	0.9941	2	2	0.0000	0.0065	0.9935
chr19	49746675	TCTGCTTCTCCTCCGGCTC	T	0.095886	0.100	1	-18	2	576	219	357	89	0	53	1	76	0	0	357	0	0	0.4064	0.0000	0.0000	3.132	0.31	11.32	-11.00	27	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.5651	0.4293	0.0055	1	0	0.5686	0.4253	0.0061	1	0	0.5722	0.4208	0.0070
chr19	50378563	A	AAAC	0.592165	0.100	1	3	2	633	128	505	0	0	2	14	112	0	0	493	3	9	0.0000	0.0000	0.0238	62.500		3.18		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0007	0.9993	2	2	0.0000	0.0008	0.9992	2	2	0.0000	0.0009	0.9991
chr19	50378565	A	ACAG	0.341817	0.100	1	3	3	633	137	496	0	1	10	111	15	0	0	493	0	3	0.0000	0.0000	0.0060	14.111		3.73		0	0/0	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0083	0.9917	2	2	0.0000	0.0072	0.9928	2	2	0.0000	0.0071	0.9929
chr19	51354620	C	CCCACAG	0.012921	0.100	1	6	2	556	122	434	52	0	7	0	63	0	0	430	0	4	0.4262	0.0000	0.0092	16.429	0.63	5.44	-4.81	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1077	0.8648	0.0276	1	1	0.1179	0.8552	0.0269	1	1	0.1323	0.8418	0.0260
chr19	51501537	G	GC	0.655856	0.100	1	1	1	533	147	386	3	0	10	10	124	0	0	383	0	3	0.0204	0.0000	0.0078	13.700	0.00	2.83	-2.83	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2693	0.7307	2	2	0.0000	0.0135	0.9865	2	2	0.0000	0.0047	0.9953
chr19	52300416	CTG	C	0.721947	0.100	1	-2	1	186	79	107	37	0	5	0	37	0	0	106	0	1	0.4684	0.0000	0.0093	14.800	0.11	2.43	-2.32	35	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1010	0.5793	0.3197	1	1	0.1031	0.5730	0.3239	1	1	0.1058	0.5651	0.3291
chr19	52383892	TA	T	0.382581	0.100	1	-1	2	485	147	338	136	0	4	0	7	0	0	338	0	0	0.9252	0.0000	0.0000	35.750	0.36	2.00	-1.64	88	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0003	0.9997	0.0000	0	1	0.4608	0.5392	0.0000	0	0	0.9305	0.0695	0.0000
chr19	52383993	T	TCAA	0.387747	0.100	1	3	1	573	148	425	137	0	8	0	3	0	0	425	0	0	0.9257	0.0000	0.0000	17.500	0.39	3.00	-2.61	57	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.6841	0.3159	0.0000	0	0	0.9838	0.0162	0.0000	0	0	0.9944	0.0056	0.0000
chr19	52906242	CACT	C	0.001583	0.100	1	-3	1	1086	206	880	194	1	3	0	8	0	1	879	0	0	0.9417	0.0000	0.0011	67.667	0.61	3.12	-2.52	124	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.2065	0.7935	0.0000	0	0	0.9996	0.0004	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr19	52951222	C	CACT	0.402666	0.100	1	3	2	1357	282	1075	126	1	4	1	150	0	0	1073	0	2	0.4468	0.0000	0.0019	69.250	0.42	3.48	-3.06	0	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0047	0.4197	0.5756	1	2	0.0058	0.4184	0.5758	1	2	0.0075	0.4181	0.5744
chr19	54250974	TG	T	0.674930	0.100	1	-1	5	718	208	510	181	0	17	1	9	0	0	510	0	0	0.8702	0.0000	0.0000	15.917	0.25	1.56	-1.31	105	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1022	0.8978	0.0000	0	0	0.8266	0.1734	0.0000
chr19	54462808	G	GCCT	0.457433	0.100	1	3	1	689	136	553	6	0	9	1	120	0	0	548	0	5	0.0441	0.0000	0.0090	14.111	1.00	3.39	-2.39	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9992	0.0008	2	1	0.0000	0.5660	0.4340	2	2	0.0000	0.1098	0.8902
chr19	55279518	A	AGCCGCCGCC	0.498757	0.100	1	9	2	415	112	303	0	0	24	0	88	0	0	287	0	16	0.0000	0.0000	0.0528	3.667		7.44		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0050	0.9950	2	2	0.0000	0.0055	0.9945	2	2	0.0000	0.0064	0.9936
chr19	55358511	GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT	G	0.867196	0.100	1	-24	1	585	120	465	6	1	13	1	99	0	0	436	0	29	0.0500	0.0000	0.0624	8.077	2.17	16.48	-14.32	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9944	0.0056	2	2	0.0000	0.1585	0.8415	2	2	0.0000	0.0169	0.9831
chr19	55359445	TGGCTGGGGCCTTCTGGGATGGAGCAGGTAC	T	0.000533	0.100	1	-30	1	788	193	595	155	1	25	0	12	0	0	595	0	0	0.8031	0.0000	0.0000	6.720	0.44	6.42	-5.98	27	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	0.9278	0.0722	0.0000	0	0	0.9994	0.0006	0.0000
chr19	55518249	C	CCCA	0.294252	0.100	1	3	4	874	242	632	194	2	30	0	16	0	0	631	0	1	0.8017	0.0000	0.0016	7.033	0.82	8.31	-7.49	114	0/1	0/0	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0006	0.9994	0.0000	0	1	0.3669	0.6331	0.0000
chr19	55518546	CCCA	C	0.003059	0.100	1	-3	1	642	152	490	93	1	3	0	55	1	0	486	0	3	0.6118	0.0020	0.0082	49.667	0.53	3.18	-2.65	17	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9485	0.0515	0.0000	1	0	0.9442	0.0558	0.0000	1	0	0.9378	0.0622	0.0000
chr19	55578542	C	CCCG	0.537557	0.100	1	3	1	488	89	399	0	0	5	0	84	0	0	389	0	10	0.0000	0.0000	0.0251	16.800		3.87		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0071	0.9929	2	2	0.0000	0.0078	0.9922	2	2	0.0000	0.0089	0.9911
chr19	57477298	A	AGCC	0.315092	0.100	1	3	1	170	84	86	0	0	10	0	74	0	0	86	0	0	0.0000	0.0000	0.0000	7.400		3.24		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0476	0.9524	2	2	0.0000	0.0512	0.9488	2	2	0.0000	0.0565	0.9435
chr20	145514	GCAAA	G	0.152578	0.100	1	-4	2	308	108	200	101	0	4	0	3	0	0	200	0	0	0.9352	0.0000	0.0000	26.000	0.21	4.00	-3.79	49	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.5485	0.4515	0.0000	0	0	0.9725	0.0275	0.0000	0	0	0.9909	0.0091	0.0000
chr20	145669	ACC	A	0.558572	0.100	1	-2	1	308	120	188	5	0	4	0	111	0	0	186	0	2	0.0417	0.0000	0.0106	29.000	0.00	2.11	-2.11	3	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9940	0.0060	2	2	0.0000	0.3642	0.6358	2	2	0.0000	0.0752	0.9248
chr20	257794	CTGGTCT	C	0.606741	0.100	1	-6	2	96	51	45	17	0	0	0	34	0	0	45	0	0	0.3333	0.0000	0.0000	51.000	0.59	6.12	-5.53	7	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0158	0.2774	0.7068	1	2	0.0177	0.2862	0.6962	1	2	0.0205	0.2981	0.6814
chr20	298046	C	CCGG	0.073154	0.100	1	3	1	439	129	310	111	4	11	0	3	0	0	310	0	0	0.8605	0.0000	0.0000	11.800	1.02	4.00	-2.98	3	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.8456	0.1544	0.0000	0	0	0.9937	0.0063	0.0000	0	0	0.9979	0.0021	0.0000
chr20	326596	CGAGGAGCCG	C	0.000883	0.100	1	-9	1	392	85	307	76	1	6	0	2	0	0	307	0	0	0.8941	0.0000	0.0000	13.167	0.76	9.00	-8.24	0	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9985	0.0015	0.0000	0	0	0.9998	0.0002	0.0000	0	0	0.9999	0.0001	0.0000
chr20	1915303	A	AGT	0.380246	0.100	1	2	1	461	143	318	84	0	0	0	59	0	0	317	0	1	0.5874	0.0000	0.0031	143.000	0.19	8.29	-8.10	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7645	0.2315	0.0040	1	0	0.7570	0.2382	0.0048	1	0	0.7462	0.2478	0.0060
chr20	1915304	CCT	C	0.378293	0.100	1	-2	1	462	149	313	90	0	0	1	58	0	0	312	0	1	0.6040	0.0000	0.0032	149.000	0.18	8.21	-8.03	2	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.8524	0.1462	0.0014	1	0	0.8446	0.1537	0.0017	1	0	0.8332	0.1645	0.0023
chr20	1915405	CCGA	C	0.360324	0.100	1	-3	4	459	156	303	97	0	2	0	57	0	0	300	0	3	0.6218	0.0000	0.0099	77.000	0.19	8.14	-7.95	27	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9203	0.0793	0.0003	1	0	0.9139	0.0857	0.0004	1	0	0.9044	0.0949	0.0006
chr20	25476413	GCTCCCA	G	0.449443	0.100	1	-6	2	705	178	527	86	0	7	0	85	0	0	524	0	3	0.4831	0.0000	0.0057	24.429	0.24	6.80	-6.56	30	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.1349	0.7014	0.1637	1	1	0.1422	0.6878	0.1700	1	1	0.1518	0.6703	0.1778
chr20	34077058	C	CCAG	0.656931	0.100	1	3	1	418	139	279	5	1	0	1	132	0	0	271	0	8	0.0360	0.0000	0.0287	138.000	1.80	3.19	-1.39	1	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9728	0.0272	2	2	0.0000	0.1082	0.8918	2	2	0.0000	0.0169	0.9831
chr20	35627312	C	CA	0.103940	0.100	1	1	1	137	61	76	32	0	1	0	28	0	0	75	0	1	0.5246	0.0000	0.0132	60.000	0.38	1.18	-0.80	10	0/1	0/0	.	.	OK	1	1	0.4583	0.5124	0.0293	1	1	0.4606	0.5092	0.0302	1	1	0.4633	0.5054	0.0313
chr20	38246121	A	AGGG	0.000472	0.100	1	3	2	274	64	210	58	0	2	0	4	0	0	209	0	1	0.9062	0.0000	0.0048	31.000	0.64	3.00	-2.36	20	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.3779	0.6221	0.0000	0	0	0.9947	0.0053	0.0000	0	0	0.9993	0.0007	0.0000
chr20	38553961	AGAG	A	0.000109	0.100	1	-3	2	217	127	90	66	1	1	0	59	0	0	89	0	1	0.5197	0.0000	0.0111	126.000	0.17	2.98	-2.82	30	0/1	0/1	.	.	OK	1	0	0.5176	0.4823	0.0000	1	0	0.5227	0.4773	0.0000	1	0	0.5287	0.4713	0.0000
chr20	45375515	CATT	C	0.606231	0.100	1	-3	2	545	160	385	72	0	3	0	85	0	0	384	1	0	0.4500	0.0000	0.0026	52.333	0.14	3.26	-3.12	28	0/1	1/1	.	.	OK	1	2	0.0210	0.4624	0.5167	1	2	0.0233	0.4600	0.5167	1	2	0.0268	0.4576	0.5156
chr20	45891598	CCTG	C	0.607197	0.100	1	-3	2	990	313	677	0	0	42	19	252	0	0	674	0	3	0.0000	0.0000	0.0044	6.429		3.16		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000	2	2	0.0000	0.0000	1.0000
chr20	47651119	GCAA	G	0.005778	0.100	1	-3	1	520	245	275	109	90	8	4	34	0	0	275	0	0	0.4449	0.0000	0.0000	25.167	0.26	2.29	-2.04	27	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000
chr20	60012728	T	TA	0.009952	0.100	1	1	2	240	56	184	25	1	13	3	14	0	0	184	0	0	0.4464	0.0000	0.0000	3.231	0.52	1.57	-1.05	9	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6695	0.3294	0.0011	1	0	0.6650	0.3339	0.0011	1	0	0.6587	0.3400	0.0012
chr20	62065249	TGCCAGG	T	0.994314	0.100	1	-6	2	224	33	191	0	0	5	1	27	0	0	182	0	9	0.0000	0.0000	0.0471	5.600		6.04		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0009	0.9991	2	2	0.0000	0.0009	0.9991
chr21	30541662	AG	A	0.714353	0.100	1	-1	1	278	124	154	0	0	3	0	121	0	0	151	1	2	0.0000	0.0000	0.0195	40.333		2.11		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0007	0.9993	2	2	0.0000	0.0008	0.9992	2	2	0.0000	0.0010	0.9990
chr21	32631618	A	AAGTATT	0.509844	0.100	1	6	4	742	178	564	0	0	2	0	176	0	0	559	0	5	0.0000	0.0000	0.0089	88.000		5.56		0	1/1	1/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999
chr21	33070402	CTCCTCCACT	C	0.002225	0.100	1	-9	2	471	150	321	77	4	6	0	63	0	1	320	0	0	0.5133	0.0000	0.0031	24.000	0.83	7.43	-6.60	15	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7639	0.2360	0.0000	1	0	0.7605	0.2395	0.0000	1	0	0.7552	0.2447	0.0001
chr21	39511744	G	GAGA	0.574597	0.100	1	3	2	229	104	125	52	0	4	1	47	0	0	125	0	0	0.5000	0.0000	0.0000	25.000	0.06	3.15	-3.09	30	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2391	0.6156	0.1453	1	1	0.2412	0.6076	0.1512	1	1	0.2435	0.5975	0.1590
chr21	41878845	C	CG	0.999218	0.100	1	1	2	291	41	250	0	0	1	1	39	0	0	247	0	3	0.0000	0.0000	0.0120	40.000		3.21		0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999	2	2	0.0000	0.0001	0.9999
chr21	41991439	GCCT	G	0.063434	0.100	1	-3	1	916	211	705	97	0	16	0	98	0	0	703	0	2	0.4597	0.0000	0.0028	12.188	0.29	3.49	-3.20	3	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2041	0.7709	0.0251	1	1	0.2178	0.7560	0.0261	1	1	0.2361	0.7364	0.0275
chr21	44539457	CGGA	C	0.002702	0.100	1	-3	1	840	229	611	128	0	20	1	80	1	0	605	0	5	0.5590	0.0016	0.0098	10.450	1.78	4.83	-3.04	36	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9610	0.0390	0.0000	1	0	0.9577	0.0423	0.0000	1	0	0.9527	0.0473	0.0000
chr21	44551106	GAA	G	0.000038	0.100	1	-2	2	716	154	562	148	0	1	0	5	3	0	559	0	0	0.9610	0.0053	0.0053	153.000	0.85	5.60	-4.75	6	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9988	0.0012	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr21	44551109	GC	G	0.000038	0.100	1	-1	2	718	153	565	133	2	13	0	5	4	0	561	0	0	0.8693	0.0071	0.0071	28.000	0.74	5.60	-4.86	5	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9975	0.0025	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr21	44637695	CCTGCTGTGTGCCTGT	C	0.541271	0.100	1	-15	2	523	107	416	10	3	14	1	79	0	0	412	0	4	0.0935	0.0000	0.0096	7.000	1.60	14.62	-13.02	0	0/1	1/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9995	0.0005	2	1	0.0000	0.9555	0.0445
chr21	44637708	TGTCTGCTGTGTGCCC	T	0.168959	0.100	1	-15	2	535	112	423	8	2	12	5	85	0	0	423	0	0	0.0714	0.0000	0.0000	8.250	2.75	13.62	-10.87	6	0/1	0/0	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9990	0.0010	2	1	0.0000	0.9617	0.0383
chr21	45504511	CGGCCCCCCA	C	0.965477	0.100	1	-9	7	309	152	157	4	0	18	1	129	0	0	157	0	0	0.0263	0.0000	0.0000	7.882	2.25	7.91	-5.66	0	1/1	0/1	.	.	OK	2	2	0.0000	0.2453	0.7547	2	2	0.0000	0.0037	0.9963	2	2	0.0000	0.0008	0.9992
chr21	46334557	G	GTGGGATGTTCACAGTCAGTGACCACCCACCAGAACAGCA	0.014382	0.100	1	39	1	647	192	455	82	1	96	0	13	0	1	454	0	0	0.4271	0.0000	0.0022	1.000	0.30	2.69	-2.39	42	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0042	0.9958	0.0000	0	1	0.4794	0.5206	0.0000
chr22	18608233	A	ACACCTG	0.013847	0.100	1	6	1	3531	1163	2368	1076	9	36	0	42	0	0	2366	0	2	0.9252	0.0000	0.0008	31.306	0.42	5.62	-5.20	8	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000	0	0	1.0000	0.0000	0.0000
chr22	22646410	TCTC	T	0.000151	0.100	1	-3	1	569	139	430	118	1	4	1	15	1	0	427	1	1	0.8489	0.0023	0.0070	33.750	1.04	3.80	-2.76	64	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0154	0.9846	0.0000	0	0	0.9596	0.0404	0.0000
chr22	23617579	G	GCAT	0.002056	0.100	1	3	3	197	70	127	40	0	2	0	28	0	0	126	0	1	0.5714	0.0000	0.0079	34.000	0.35	3.64	-3.29	12	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.6797	0.3202	0.0002	1	0	0.6760	0.3238	0.0002	1	0	0.6709	0.3290	0.0002
chr22	23622095	GCAT	G	0.240155	0.100	1	-3	3	183	96	87	53	0	9	1	33	0	0	87	0	0	0.5521	0.0000	0.0000	9.667	0.66	3.48	-2.82	3	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.7611	0.2334	0.0056	1	0	0.7531	0.2405	0.0064	1	0	0.7420	0.2504	0.0076
chr22	26483980	GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA	G	0.877460	0.100	1	-21	3	874	184	690	75	0	61	1	47	0	0	681	2	7	0.4076	0.0000	0.0130	2.016	0.91	14.26	-13.35	49	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.2622	0.6850	0.0527	1	1	0.2566	0.6841	0.0593	1	1	0.2486	0.6825	0.0689
chr22	27798945	TTGC	T	0.002444	0.100	1	-3	1	1470	450	1020	291	19	104	3	33	0	0	1020	0	0	0.6467	0.0000	0.0000	3.298	0.72	3.06	-2.34	49	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.1631	0.8369	0.0000
chr22	36191797	ACT	A	0.485373	0.100	1	-2	3	618	197	421	163	2	11	0	21	0	0	421	0	0	0.8274	0.0000	0.0000	16.818	0.71	2.14	-1.43	51	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0044	0.9956	0.0000
chr22	36265995	AATAATT	A	0.003695	0.100	1	-6	1	493	146	347	96	0	1	0	49	0	0	343	0	4	0.6575	0.0000	0.0115	145.000	0.42	5.63	-5.22	6	0/1	0/0	.	.	OK	1	0	0.9715	0.0285	0.0000	1	0	0.9683	0.0317	0.0000	1	0	0.9634	0.0366	0.0000
chr22	37510301	GCTCCTT	G	0.237706	0.100	1	-6	2	442	240	202	90	0	59	1	90	0	0	194	0	8	0.3750	0.0000	0.0396	3.068	0.29	5.88	-5.59	26	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0928	0.7395	0.1676	1	1	0.1013	0.7276	0.1710	1	1	0.1132	0.7120	0.1748
chr22	37568401	CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT	C	0.558599	0.100	1	-21	6	563	126	437	114	3	3	0	6	1	0	436	0	0	0.9048	0.0023	0.0023	61.000	0.53	12.50	-11.97	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0005	0.9995	0.0000	0	1	0.3073	0.6927	0.0000	0	0	0.8268	0.1732	0.0000
chr22	39100317	TAAC	T	0.333557	0.100	1	-3	3	176	95	81	76	0	3	0	16	0	0	80	0	1	0.8000	0.0000	0.0123	30.667	0.46	3.50	-3.04	18	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0039	0.9961	0.0000	0	1	0.0001	0.9999	0.0000	0	1	0.0015	0.9985	0.0000
chr22	39381817	C	CCAA	0.707679	0.100	1	3	3	315	125	190	6	1	5	1	112	0	0	188	0	2	0.0480	0.0000	0.0105	24.000	0.00	3.04	-3.04	2	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	0.9996	0.0004	2	1	0.0000	0.6442	0.3558	2	2	0.0000	0.1126	0.8874
chr22	40301172	TGCA	T	0.245189	0.100	1	-3	1	470	165	305	123	2	17	1	22	0	0	305	0	0	0.7455	0.0000	0.0000	8.706	0.24	2.86	-2.63	55	0/0	0/1	.	.	OK	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0000	1.0000	0.0000	0	1	0.0005	0.9995	0.0000
chr22	42142513	T	TC	0.297594	0.100	1	1	3	1491	353	1138	25	0	2	1	325	0	0	1113	0	25	0.0708	0.0000	0.0220	175.000	0.36	10.86	-10.50	9	1/1	0/1	.	.	OK	2	1	0.0000	1.0000	0.0000	2	1	0.0000	0.9999	0.0001	2	2	0.0000	0.4651	0.5349
chr22	46262985	ACGAGCG	A	0.051474	0.100	1	-6	1	667	128	539	54	0	5	1	68	0	0	536	0	3	0.4219	0.0000	0.0056	24.600	1.26	6.91	-5.65	4	0/1	0/1	.	.	OK	1	1	0.0687	0.7993	0.1320	1	1	0.0767	0.7949	0.1284	1	1	0.0883	0.7884	0.1233
chr22	46363187	CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA	C	0.006403	0.100	1	-27	3	284	127	157	102	0	23	0	2	0	0	156	0	1	0.8031	0.0000	0.0064	4.522	0.25	27.00	-26.75	4	0/0	0/1	.	.	OK	0	0	0.9728	0.0272	0.0000	0	0	0.9990	0.0010	0.0000	0	0	0.9997	0.0003	0.0000

841 rows