File Info

Filename
HG00733_x_HG00735_FF_5.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/2d/4a68f14bb39d8230106d9132d975f6/HG00733_x_HG00735_FF_5.features.tsv
Size
139.0 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG00733_x_HG00735_FF_5)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1641723 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 306 110 196 83 0 3 1 23 0 0 196 0 0 0.7545 0.0000 0.0000 35.667 0.34 9.09 -8.75 57 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8879 0.1095 0.0026 1 0 0.8725 0.1243 0.0032 0 1 0.0826 0.9170 0.0004
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 536 210 326 144 0 19 1 46 0 0 326 0 0 0.6857 0.0000 0.0000 10.556 0.47 8.15 -7.69 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9794 0.0205 0.0001 1 0 0.9758 0.0241 0.0001 1 0 0.9658 0.0341 0.0002
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 1 451 175 276 139 11 19 0 6 0 0 276 0 0 0.7943 0.0000 0.0000 8.211 0.33 4.00 -3.67 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.4280 0.5720 0.0000 0 0 0.7976 0.2024 0.0000
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 274 112 162 54 0 1 0 57 0 0 158 0 4 0.4821 0.0000 0.0247 111.000 0.70 3.58 -2.88 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1600 0.5204 0.3196 1 1 0.1633 0.5189 0.3178 1 1 0.1678 0.5169 0.3153
chr1 3021843 CAGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 608 181 427 77 0 9 0 95 0 0 425 0 2 0.4254 0.0000 0.0047 19.111 0.34 3.20 -2.86 39 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0672 0.4470 0.4857 1 2 0.0715 0.4501 0.4784 1 2 0.0774 0.4542 0.4685
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 2 761 220 541 177 3 29 2 9 0 0 541 0 0 0.8045 0.0000 0.0000 6.586 0.27 3.22 -2.95 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0537 0.9463 0.0000 0 0 0.5593 0.4407 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.050 1 3 2 892 160 732 88 1 8 0 63 0 0 730 0 2 0.5500 0.0000 0.0027 19.000 0.40 3.16 -2.76 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5464 0.4027 0.0509 1 0 0.5368 0.4083 0.0548 1 0 0.5239 0.4157 0.0604
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 345 56 289 1 0 2 0 53 0 0 289 0 0 0.0179 0.0000 0.0000 27.000 0.00 1.17 -1.17 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5705 0.4295 2 2 0.0000 0.3450 0.6550 2 2 0.0000 0.2892 0.7108
chr1 19270780 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 682 188 494 182 0 1 0 5 1 0 493 0 0 0.9681 0.0020 0.0020 187.000 0.23 3.00 -2.77 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0282 0.9718 0.0000 0 0 0.7643 0.2357 0.0000 0 0 0.9262 0.0738 0.0000
chr1 26183819 AC A 0.500000 0.050 1 -1 1 359 82 277 34 4 13 0 31 0 0 276 0 1 0.4146 0.0000 0.0036 5.308 1.00 1.16 -0.16 26 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3112 0.5115 0.1773 1 1 0.3093 0.5106 0.1801 1 1 0.3068 0.5095 0.1837
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.050 1 -2 3 755 198 557 43 34 7 45 69 1 0 556 0 0 0.2172 0.0018 0.0018 44.000 7.65 28.32 -20.67 21 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0144 0.2561 0.7294 1 2 0.0165 0.2669 0.7166 1 2 0.0196 0.2815 0.6988
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.050 1 -6 4 770 203 567 4 0 23 5 171 0 0 564 0 3 0.0197 0.0000 0.0053 8.136 2.00 17.22 -15.22 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.8859 0.1141 2 2 0.0000 0.1518 0.8482 2 2 0.0000 0.0583 0.9417
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 1 380 159 221 16 0 5 0 138 0 0 219 0 2 0.1006 0.0000 0.0090 30.800 0.12 3.12 -2.99 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9301 0.0699
chr1 36178099 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 1 504 141 363 133 1 4 1 2 0 0 362 1 0 0.9433 0.0000 0.0028 34.250 0.26 3.00 -2.74 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2955 0.7045 0.0000 0 0 0.7939 0.2061 0.0000 0 0 0.8858 0.1142 0.0000
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 2 361 106 255 46 0 11 0 49 0 0 255 0 0 0.4340 0.0000 0.0000 8.636 0.13 3.10 -2.97 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2020 0.5263 0.2718 1 1 0.2042 0.5243 0.2716 1 1 0.2070 0.5218 0.2712
chr1 46815074 GAT G 0.500000 0.050 1 -2 2 319 69 250 61 1 0 0 7 0 0 250 0 0 0.8841 0.0000 0.0000 69.000 0.33 3.29 -2.96 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0413 0.9587 0.0000 0 1 0.2470 0.7530 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.050 1 6 1 657 181 476 1 0 25 2 153 0 1 473 1 1 0.0055 0.0000 0.0063 6.240 0.00 6.10 -6.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1185 0.8815 2 2 0.0000 0.0510 0.9490 2 2 0.0000 0.0398 0.9602
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 225 74 151 0 0 5 4 65 0 0 151 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 13.200 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1509 0.8491 2 2 0.0000 0.1554 0.8446 2 2 0.0000 0.1617 0.8383
chr1 54610464 CCACTCCACATTCAGACCGTCATCCCCAGG C 0.500000 0.050 1 -29 1 281 120 161 118 0 2 0 0 0 0 160 0 1 0.9833 0.0000 0.0062 59.000 0.32 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7920 0.2080 0.0000 0 0 0.9040 0.0960 0.0000 0 0 0.9211 0.0789 0.0000
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.050 1 3 2 781 185 596 89 4 28 2 62 0 0 592 0 4 0.4811 0.0000 0.0067 5.607 0.28 3.27 -2.99 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5598 0.3935 0.0467 1 0 0.5500 0.3996 0.0505 1 0 0.5366 0.4075 0.0559
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 4 683 145 538 81 1 8 0 55 0 0 538 0 0 0.5586 0.0000 0.0000 17.125 0.36 3.40 -3.04 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5911 0.3679 0.0410 1 0 0.5801 0.3754 0.0446 1 0 0.5652 0.3851 0.0497
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.050 1 3 1 153 72 81 1 0 3 0 68 0 0 81 0 0 0.0139 0.0000 0.0000 23.000 0.00 3.57 -3.57 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4803 0.5197 2 2 0.0000 0.2672 0.7328 2 2 0.0000 0.2213 0.7787
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.050 1 -9 2 411 174 237 73 1 27 0 73 0 0 233 0 4 0.4195 0.0000 0.0169 5.407 0.15 9.75 -9.60 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1906 0.5423 0.2672 1 1 0.1933 0.5391 0.2676 1 1 0.1970 0.5351 0.2679
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.050 1 -6 1 405 131 274 8 0 9 0 114 0 0 267 0 7 0.0611 0.0000 0.0255 13.556 0.25 4.99 -4.74 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9135 0.0865 2 1 0.0000 0.5180 0.4820
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 2 402 117 285 102 1 8 0 6 0 0 284 0 1 0.8718 0.0000 0.0035 13.625 0.57 3.33 -2.76 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1067 0.8933 0.0000 0 1 0.4692 0.5308 0.0000
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.050 1 3 1 568 153 415 80 6 9 3 55 0 0 412 0 3 0.5229 0.0000 0.0072 17.875 0.28 3.53 -3.25 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5535 0.3967 0.0498 1 0 0.5437 0.4027 0.0536 1 0 0.5304 0.4105 0.0591
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.050 1 -2 3 206 78 128 1 0 7 0 70 0 0 127 1 0 0.0128 0.0000 0.0078 10.143 0.00 2.16 -2.16 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4610 0.5390 2 2 0.0000 0.2529 0.7471 2 2 0.0000 0.2091 0.7909
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 232 102 130 50 0 12 1 39 0 0 130 0 0 0.4902 0.0000 0.0000 7.417 0.20 5.51 -5.31 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3687 0.4968 0.1345 1 1 0.3647 0.4970 0.1383 1 1 0.3594 0.4972 0.1434
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.050 1 18 1 1729 490 1239 142 9 157 12 170 8 8 1145 7 71 0.2898 0.0065 0.0759 2.083 2.08 7.74 -5.65 36 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0001 0.0320 0.9679 1 2 0.0001 0.0366 0.9633 1 2 0.0002 0.0437 0.9561
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.050 1 -36 1 1078 229 849 97 0 31 2 99 0 0 840 0 9 0.4236 0.0000 0.0106 6.355 0.62 3.89 -3.27 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1065 0.5161 0.3774 1 1 0.1109 0.5147 0.3744 1 1 0.1169 0.5130 0.3701
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 262 89 173 4 0 17 2 66 0 0 173 0 0 0.0449 0.0000 0.0000 4.118 0.50 1.50 -1.00 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9906 0.0094 2 1 0.0000 0.7263 0.2737 2 2 0.0000 0.4636 0.5364
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 241 89 152 47 1 8 0 33 0 0 136 0 16 0.5281 0.0000 0.1053 10.125 0.04 9.94 -9.90 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2237 0.5293 0.2470 1 1 0.2252 0.5271 0.2477 1 1 0.2271 0.5243 0.2486
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.050 1 6 2 716 188 528 146 4 26 4 8 0 1 527 0 0 0.7766 0.0000 0.0019 7.227 1.39 4.12 -2.73 90 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0705 0.9295 0.0000 0 1 0.4871 0.5129 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.050 1 12 1 1229 305 924 122 4 57 0 122 2 6 881 4 31 0.4000 0.0022 0.0465 4.429 1.70 10.23 -8.53 4 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0499 0.4497 0.5004 1 2 0.0538 0.4521 0.4941 1 2 0.0594 0.4552 0.4853
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.050 1 -9 1 556 233 323 131 0 19 0 83 0 0 323 0 0 0.5622 0.0000 0.0000 11.263 0.45 8.00 -7.55 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8001 0.1930 0.0069 1 0 0.7877 0.2041 0.0082 1 0 0.7702 0.2196 0.0101
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 1 1377 390 987 6 1 111 2 270 0 0 938 1 48 0.0154 0.0000 0.0496 2.505 3.67 9.22 -5.55 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8886 0.1114 2 2 0.0000 0.0257 0.9743 2 2 0.0000 0.0052 0.9948
chr1 154961829 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 576 139 437 134 1 2 0 2 0 0 437 0 0 0.9640 0.0000 0.0000 68.500 0.31 1.50 -1.19 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5367 0.4633 0.0000 0 0 0.8803 0.1197 0.0000 0 0 0.9237 0.0763 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 222 82 140 76 1 2 0 3 0 0 140 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 39.500 1.74 1.33 0.40 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0535 0.9465 0.0000 0 1 0.4764 0.5236 0.0000 0 0 0.6753 0.3247 0.0000
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.050 1 2 4 637 180 457 0 0 4 1 175 0 0 455 1 1 0.0000 0.0000 0.0044 44.000 2.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0112 0.9888 2 2 0.0000 0.0123 0.9877 2 2 0.0000 0.0139 0.9861
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 1172 254 918 0 0 6 0 248 0 0 913 0 5 0.0000 0.0000 0.0054 41.333 1.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.050 1 -1 2 95 52 43 48 0 0 0 4 0 0 43 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 52.000 0.52 5.00 -4.48 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 1 0.1846 0.8154 0.0000 0 1 0.4170 0.5830 0.0000
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.050 1 24 3 657 215 442 94 0 37 0 84 0 0 423 0 19 0.4372 0.0000 0.0430 4.811 0.18 11.39 -11.21 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1350 0.5361 0.3288 1 1 0.1392 0.5334 0.3275 1 1 0.1447 0.5299 0.3254
chr1 205663089 GGCCGACAGCCCTTCTGCTGGCTCGGTGGGGCCCAGC G 0.500000 0.050 1 -36 5 703 223 480 159 0 5 1 58 0 0 466 0 14 0.7130 0.0000 0.0292 43.600 0.29 28.16 -27.87 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9634 0.0364 0.0002 1 0 0.9580 0.0418 0.0003 1 0 0.9496 0.0500 0.0004
chr1 206101895 GTAT G 0.500000 0.050 1 -3 2 226 94 132 54 0 2 0 38 0 0 132 0 0 0.5745 0.0000 0.0000 46.000 0.07 3.00 -2.93 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4504 0.4570 0.0926 1 1 0.4433 0.4598 0.0968 1 1 0.4339 0.4634 0.1027
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.050 1 -12 1 438 224 214 0 0 26 0 198 0 0 204 0 10 0.0000 0.0000 0.0467 7.615 10.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0059 0.9941 2 2 0.0000 0.0068 0.9932
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 622 131 491 4 0 18 3 106 0 0 485 0 6 0.0305 0.0000 0.0122 6.222 0.25 8.38 -8.13 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9744 0.0256 2 2 0.0000 0.4597 0.5403 2 2 0.0000 0.2197 0.7803
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 233 108 125 101 0 2 0 5 0 0 125 0 0 0.9352 0.0000 0.0000 53.000 0.18 1.20 -1.02 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.3026 0.6974 0.0000 0 0 0.6381 0.3619 0.0000
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 592 140 452 51 1 20 3 65 0 0 448 0 4 0.3643 0.0000 0.0088 5.950 0.71 3.26 -2.56 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0705 0.4343 0.4952 1 2 0.0747 0.4384 0.4869 1 2 0.0806 0.4437 0.4757
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 623 171 452 7 0 4 0 160 0 0 448 0 4 0.0409 0.0000 0.0088 41.750 0.00 3.16 -3.16 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.6526 0.3474 2 2 0.0000 0.2092 0.7908
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 1059 259 800 8 0 3 1 247 0 0 800 0 0 0.0309 0.0000 0.0000 85.333 0.12 1.23 -1.10 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 2 0.0000 0.3149 0.6851 2 2 0.0000 0.0487 0.9513
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.050 1 -2 1 829 257 572 247 0 5 1 4 0 0 572 0 0 0.9611 0.0000 0.0000 50.200 1.17 5.75 -4.58 167 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3818 0.6182 0.0000 0 0 0.9635 0.0365 0.0000 0 0 0.9868 0.0132 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.050 1 2 1 1085 103 982 0 0 5 1 97 0 0 977 0 5 0.0000 0.0000 0.0051 19.600 2.73 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0689 0.9311 2 2 0.0000 0.0723 0.9277 2 2 0.0000 0.0772 0.9228
chr1 248473544 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 675 153 522 145 2 4 0 2 0 0 522 0 0 0.9477 0.0000 0.0000 37.250 0.28 3.00 -2.72 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6067 0.3933 0.0000 0 0 0.9079 0.0921 0.0000 0 0 0.9416 0.0584 0.0000
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.050 1 -7 1 421 171 250 0 0 13 1 157 0 0 249 0 1 0.0000 0.0000 0.0040 12.154 6.64 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0180 0.9820 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0216 0.9784
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.050 1 -3 1 234 118 116 59 0 5 0 54 0 0 113 0 3 0.5000 0.0000 0.0259 22.600 0.20 3.72 -3.52 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2961 0.5301 0.1738 1 1 0.2968 0.5277 0.1756 1 1 0.2975 0.5247 0.1778
chr2 17781726 CAAGTT C 0.103121 0.050 1 -5 2 598 151 447 145 1 2 0 3 0 0 447 0 0 0.9603 0.0000 0.0000 74.500 0.19 6.00 -5.81 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7190 0.2810 0.0000 0 0 0.9772 0.0228 0.0000 0 0 0.9895 0.0105 0.0000
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.050 1 9 5 421 149 272 2 0 12 0 135 0 0 265 0 7 0.0134 0.0000 0.0257 11.417 2.00 8.19 -6.19 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2405 0.7595 2 2 0.0000 0.0471 0.9529 2 2 0.0000 0.0293 0.9707
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.050 1 -9 1 632 219 413 107 0 26 0 86 0 0 412 0 1 0.4886 0.0000 0.0024 7.423 0.70 8.36 -7.66 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5742 0.3906 0.0352 1 0 0.5681 0.3944 0.0376 1 0 0.5597 0.3994 0.0409
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.050 1 9 1 532 117 415 60 0 21 0 36 0 0 410 0 5 0.5128 0.0000 0.0120 4.571 0.33 7.83 -7.50 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6754 0.3180 0.0067 1 0 0.6692 0.3237 0.0071 1 0 0.6609 0.3313 0.0077
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.050 1 3 1 225 68 157 0 0 1 1 66 0 0 156 0 1 0.0000 0.0000 0.0064 67.000 2.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1531 0.8469 2 2 0.0000 0.1575 0.8425 2 2 0.0000 0.1639 0.8361
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 1 583 149 434 69 0 12 1 67 0 0 433 0 1 0.4631 0.0000 0.0023 11.417 0.35 2.88 -2.53 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2297 0.5420 0.2283 1 1 0.2313 0.5388 0.2299 1 1 0.2333 0.5349 0.2319
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.050 1 39 2 556 211 345 37 0 119 0 55 1 0 343 0 1 0.1754 0.0029 0.0058 0.773 0.19 0.55 -0.36 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0807 0.4408 0.4785 1 2 0.0850 0.4446 0.4704 1 2 0.0909 0.4495 0.4596
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.050 1 6 1 258 120 138 57 0 13 1 49 0 0 137 0 1 0.4750 0.0000 0.0072 8.154 0.42 5.22 -4.80 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3123 0.5207 0.1670 1 1 0.3107 0.5192 0.1701 1 1 0.3085 0.5172 0.1744
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.050 1 -3 1 425 178 247 157 0 13 3 5 0 0 247 0 0 0.8820 0.0000 0.0000 13.500 0.54 3.20 -2.66 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0101 0.9899 0.0000 0 0 0.5480 0.4520 0.0000 0 0 0.8339 0.1661 0.0000
chr2 71574204 C CAGGCGG 0.500000 0.050 1 6 2 326 100 226 50 0 7 0 43 0 0 223 0 3 0.5000 0.0000 0.0133 13.286 0.22 5.79 -5.57 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2842 0.5244 0.1914 1 1 0.2836 0.5226 0.1939 1 1 0.2826 0.5203 0.1971
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.050 1 3 1 612 141 471 0 101 34 4 2 0 8 463 0 0 0.0000 0.0000 0.0170 3.118 3.00 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0462 0.9538 0.0000 0 1 0.4312 0.5688 0.0000 0 0 0.6850 0.3150 0.0000
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.050 1 -6 1 615 142 473 2 1 31 0 108 0 0 460 0 13 0.0141 0.0000 0.0275 3.548 3.00 6.52 -3.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5719 0.4281 2 2 0.0000 0.1702 0.8298 2 2 0.0000 0.1091 0.8909
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 443 86 357 4 0 2 0 80 0 0 356 0 1 0.0465 0.0000 0.0028 42.000 0.00 3.16 -3.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9889 0.0111 2 1 0.0000 0.6623 0.3377 2 2 0.0000 0.3881 0.6119
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.050 1 24 2 983 269 714 224 0 41 1 3 0 0 712 0 2 0.8327 0.0000 0.0028 5.561 0.24 16.33 -16.10 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0180 0.9820 0.0000 0 0 0.8238 0.1762 0.0000 0 0 0.9588 0.0412 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 421 150 271 58 0 14 3 75 0 0 270 0 1 0.3867 0.0000 0.0037 10.462 0.40 3.73 -3.34 16 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0651 0.4290 0.5060 1 2 0.0692 0.4333 0.4975 1 2 0.0750 0.4389 0.4861
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 4 564 171 393 1 1 16 6 147 0 0 388 0 5 0.0058 0.0000 0.0127 9.625 0.00 3.20 -3.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1019 0.8981 2 2 0.0000 0.0438 0.9562 2 2 0.0000 0.0358 0.9642
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -9 2 767 207 560 103 1 9 0 94 0 0 560 0 0 0.4976 0.0000 0.0000 22.000 0.56 8.40 -7.84 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3417 0.5311 0.1272 1 1 0.3399 0.5287 0.1314 1 1 0.3373 0.5256 0.1371
chr2 97113750 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 330 117 213 112 0 0 0 5 0 0 213 0 0 0.9573 0.0000 0.0000 117.000 0.20 1.20 -1.00 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 1 0.3602 0.6398 0.0000 0 0 0.6958 0.3042 0.0000
chr2 108259008 AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT A 0.500000 0.050 1 -22 1 530 167 363 95 2 3 0 67 0 0 346 0 17 0.5689 0.0000 0.0468 54.667 0.93 18.75 -17.82 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3862 0.5069 0.1069 1 1 0.3825 0.5062 0.1113 1 1 0.3775 0.5053 0.1172
chr2 112542424 TTCCGGCGTGTACCGAGAGACTGGCG T 0.500000 0.050 1 -25 1 448 115 333 98 0 15 0 2 0 0 332 0 1 0.8522 0.0000 0.0030 6.667 0.51 25.50 -24.99 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0808 0.9192 0.0000 0 0 0.6019 0.3981 0.0000 0 0 0.7746 0.2254 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.050 1 6 1 591 140 451 0 1 0 1 138 0 0 442 0 9 0.0000 0.0000 0.0200 139.000 5.80 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0251 0.9749 2 2 0.0000 0.0268 0.9732 2 2 0.0000 0.0295 0.9705
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 329 114 215 100 0 12 0 2 0 0 215 0 0 0.8772 0.0000 0.0000 8.500 0.37 6.00 -5.63 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3211 0.6789 0.0000 0 0 0.7559 0.2441 0.0000 0 0 0.8394 0.1606 0.0000
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.050 1 6 2 166 76 90 0 0 21 0 55 0 1 85 0 4 0.0000 0.0000 0.0556 2.619 5.78 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2017 0.7983 2 2 0.0000 0.2045 0.7955 2 2 0.0000 0.2090 0.7910
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.050 1 -13 3 198 87 111 42 0 20 0 25 0 0 111 0 0 0.4828 0.0000 0.0000 3.350 0.07 11.96 -11.89 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4711 0.4412 0.0877 1 0 0.4629 0.4451 0.0920 1 0 0.4521 0.4501 0.0978
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 2 522 132 390 59 0 18 0 55 0 0 390 0 0 0.4470 0.0000 0.0000 6.333 0.58 3.13 -2.55 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2809 0.5299 0.1891 1 1 0.2806 0.5277 0.1918 1 1 0.2799 0.5248 0.1952
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.050 1 3 4 271 153 118 3 0 3 0 147 0 0 117 0 1 0.0196 0.0000 0.0085 50.000 0.00 3.14 -3.14 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7636 0.2364 2 2 0.0000 0.1616 0.8384 2 2 0.0000 0.0807 0.9193
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.050 1 -2 1 511 157 354 148 1 5 0 3 0 0 354 0 0 0.9427 0.0000 0.0000 30.400 0.78 4.33 -3.56 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2413 0.7587 0.0000 0 0 0.8415 0.1585 0.0000 0 0 0.9209 0.0791 0.0000
chr2 178650214 TTTTCCTCTTCAGGAGCAA T 0.500000 0.050 1 -18 1 300 95 205 68 0 25 0 2 0 0 205 0 0 0.7158 0.0000 0.0000 2.800 0.25 18.00 -17.75 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1745 0.8255 0.0000 0 0 0.5845 0.4155 0.0000 0 0 0.7082 0.2918 0.0000
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.050 1 3 2 614 147 467 66 1 6 0 74 0 0 463 0 4 0.4490 0.0000 0.0086 23.500 0.23 4.15 -3.92 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1235 0.5088 0.3677 1 1 0.1276 0.5080 0.3644 1 1 0.1332 0.5071 0.3598
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 332 137 195 9 4 16 50 58 0 0 194 0 1 0.0657 0.0000 0.0051 4.250 0.56 2.86 -2.31 9 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9825 0.0175 2 1 0.0000 0.7949 0.2051
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.050 1 3 1 332 141 191 16 3 18 49 55 0 0 191 0 0 0.1135 0.0000 0.0000 4.111 1.00 2.82 -1.82 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9814 0.0186
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 224 73 151 28 8 12 1 24 1 0 150 0 0 0.3836 0.0066 0.0066 4.500 0.18 1.21 -1.03 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3843 0.4839 0.1318 1 1 0.3794 0.4850 0.1356 1 1 0.3729 0.4864 0.1407
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.050 1 3 1 495 116 379 50 1 29 1 35 0 0 379 0 0 0.4310 0.0000 0.0000 2.966 1.10 3.69 -2.59 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4336 0.4653 0.1011 1 1 0.4271 0.4676 0.1053 1 1 0.4184 0.4706 0.1110
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.050 1 3 1 281 97 184 2 0 2 1 92 0 0 180 0 4 0.0206 0.0000 0.0217 47.500 0.00 3.09 -3.09 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6951 0.3049 2 2 0.0000 0.2580 0.7420 2 2 0.0000 0.1705 0.8295
chr2 214780778 GTGGTGAAGAACATTCAGGCAA G 0.500000 0.050 1 -21 2 699 189 510 182 0 4 0 3 0 0 510 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 46.250 0.88 14.00 -13.12 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4212 0.5788 0.0000 0 0 0.9231 0.0769 0.0000 0 0 0.9626 0.0374 0.0000
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 2 560 150 410 0 0 25 1 124 0 0 406 0 4 0.0000 0.0000 0.0098 5.000 8.27 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0375 0.9625 2 2 0.0000 0.0399 0.9601 2 2 0.0000 0.0435 0.9565
chr2 216633573 T TGCTGCCGCC 0.500000 0.050 1 9 1 561 147 414 6 1 12 2 126 0 2 412 0 0 0.0408 0.0000 0.0048 11.167 0.50 8.13 -7.63 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.7793 0.2207 2 2 0.0000 0.3786 0.6214
chr2 219630181 C CGACTCGCTGGGGAGAAAA 0.500000 0.050 1 18 3 327 99 228 51 0 23 0 25 0 0 216 0 12 0.5152 0.0000 0.0526 3.304 0.29 9.84 -9.55 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4228 0.4713 0.1059 1 1 0.4167 0.4732 0.1101 1 1 0.4086 0.4756 0.1158
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.050 1 -27 1 584 247 337 230 1 8 0 8 0 0 336 0 1 0.9312 0.0000 0.0030 29.875 0.38 12.62 -12.24 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4222 0.5778 0.0000 0 0 0.8996 0.1004 0.0000
chr2 231037813 A AGAGGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 1 528 130 398 62 1 16 0 51 0 0 393 0 5 0.4769 0.0000 0.0126 7.125 2.68 8.04 -5.36 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3186 0.5217 0.1597 1 1 0.3168 0.5201 0.1631 1 1 0.3144 0.5180 0.1676
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.050 1 -3 2 327 124 203 70 0 2 2 50 0 0 203 0 0 0.5645 0.0000 0.0000 60.500 0.49 4.50 -4.01 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4750 0.4469 0.0781 1 0 0.4674 0.4502 0.0824 1 0 0.4571 0.4546 0.0883
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.050 1 3 1 156 54 102 34 0 4 0 16 0 0 102 0 0 0.6296 0.0000 0.0000 12.500 0.12 2.75 -2.63 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4898 0.4276 0.0826 1 0 0.4808 0.4324 0.0868 1 0 0.4688 0.4385 0.0927
chr2 235852770 C CCAGG 0.500000 0.050 1 4 2 221 98 123 46 1 2 0 49 0 0 121 0 2 0.4694 0.0000 0.0163 48.000 1.04 3.71 -2.67 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1911 0.5250 0.2839 1 1 0.1936 0.5232 0.2833 1 1 0.1969 0.5208 0.2823
chr2 240042945 G GGCCGTGGATGAAGA 0.500000 0.050 1 14 3 1051 311 740 240 3 55 1 12 0 1 739 0 0 0.7717 0.0000 0.0014 4.811 1.75 5.25 -3.50 198 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0629 0.9371 0.0000 0 0 0.7250 0.2750 0.0000
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 781 212 569 125 0 1 1 85 0 0 568 0 1 0.5896 0.0000 0.0018 211.000 1.05 1.19 -0.14 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7046 0.2789 0.0164 1 0 0.6924 0.2890 0.0187 1 0 0.6754 0.3025 0.0220
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.050 1 -3 1 398 111 287 41 2 18 2 48 0 0 287 0 0 0.3694 0.0000 0.0000 5.167 0.24 3.31 -3.07 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1609 0.5130 0.3261 1 1 0.1642 0.5120 0.3238 1 1 0.1685 0.5108 0.3207
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.050 1 3 1 655 160 495 4 0 0 0 156 1 0 487 0 7 0.0250 0.0020 0.0162 160.000 0.25 3.71 -3.46 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8862 0.1138 2 2 0.0000 0.0637 0.9363 2 2 0.0000 0.0170 0.9830
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.050 1 12 2 682 128 554 0 0 17 0 111 0 0 514 0 40 0.0000 0.0000 0.0722 6.529 10.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0887 0.9113 2 2 0.0000 0.0951 0.9049 2 2 0.0000 0.1044 0.8956
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 15 1 702 252 450 2 9 42 1 198 0 1 416 0 33 0.0079 0.0000 0.0756 5.122 12.50 8.84 3.66 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8854 0.1146 2 2 0.0000 0.2358 0.7642
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.050 1 6 1 692 221 471 76 0 61 0 84 1 0 465 0 5 0.3439 0.0021 0.0127 2.623 3.39 5.21 -1.82 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1165 0.5107 0.3728 1 1 0.1208 0.5097 0.3695 1 1 0.1265 0.5086 0.3649
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 692 227 465 94 3 53 7 70 0 0 463 1 1 0.4141 0.0000 0.0043 3.283 4.66 3.03 1.63 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4612 0.4630 0.0758 1 1 0.4547 0.4651 0.0801 1 1 0.4460 0.4679 0.0861
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.050 1 -2 5 674 177 497 0 0 9 0 168 0 0 493 0 4 0.0000 0.0000 0.0080 18.667 2.24 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0130 0.9870 2 2 0.0000 0.0142 0.9858 2 2 0.0000 0.0159 0.9841
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 319 119 200 0 0 3 1 115 0 0 196 0 4 0.0000 0.0000 0.0200 38.667 4.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0466 0.9534 2 2 0.0000 0.0493 0.9507 2 2 0.0000 0.0533 0.9467
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 638 138 500 11 1 23 9 94 0 0 496 1 3 0.0797 0.0000 0.0080 5.000 0.45 3.26 -2.80 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9950 0.0050 2 1 0.0000 0.8661 0.1339
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.050 1 -3 3 381 124 257 50 1 22 2 49 0 0 256 0 1 0.4032 0.0000 0.0039 4.636 0.32 3.65 -3.33 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2224 0.5311 0.2466 1 1 0.2239 0.5287 0.2473 1 1 0.2260 0.5258 0.2483
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.050 1 -6 3 381 128 253 57 2 66 0 3 0 0 253 0 0 0.4453 0.0000 0.0000 0.969 0.39 5.33 -4.95 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0398 0.9602 0.0000 0 1 0.4136 0.5864 0.0000 0 0 0.6194 0.3806 0.0000
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.050 1 6 1 478 134 344 1 0 21 0 112 0 0 324 0 20 0.0075 0.0000 0.0581 5.381 1.00 5.37 -4.37 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1559 0.8441 2 2 0.0000 0.0700 0.9300 2 2 0.0000 0.0577 0.9423
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.050 1 10 2 172 85 87 29 0 10 1 45 0 0 84 0 3 0.3412 0.0000 0.0345 7.500 0.14 8.11 -7.97 19 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0708 0.4183 0.5110 1 2 0.0750 0.4235 0.5016 1 2 0.0808 0.4302 0.4890
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 234 81 153 9 0 3 35 34 0 0 152 0 1 0.1111 0.0000 0.0065 26.000 0.22 3.32 -3.10 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9867 0.0133 2 1 0.0000 0.8441 0.1559
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 235 83 152 9 0 2 35 37 0 0 152 0 0 0.1084 0.0000 0.0000 40.500 0.22 3.70 -3.48 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9864 0.0136 2 1 0.0000 0.8408 0.1592
chr3 63912684 G GGCAGCA 0.500000 0.050 1 6 3 286 67 219 29 1 11 0 26 0 0 216 0 3 0.4328 0.0000 0.0137 5.600 0.41 5.85 -5.43 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2550 0.5176 0.2274 1 1 0.2552 0.5162 0.2286 1 1 0.2554 0.5146 0.2301
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.050 1 3 1 318 130 188 66 2 13 0 49 0 0 187 0 1 0.5077 0.0000 0.0053 9.000 0.20 2.96 -2.76 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4722 0.4481 0.0797 1 0 0.4646 0.4514 0.0840 1 1 0.4545 0.4556 0.0899
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.050 1 -9 3 805 241 564 116 0 14 0 111 0 0 554 0 10 0.4813 0.0000 0.0177 16.214 0.28 9.78 -9.51 44 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1650 0.5645 0.2705 1 1 0.1688 0.5596 0.2716 1 1 0.1738 0.5536 0.2726
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 456 126 330 48 1 8 0 69 0 0 330 0 0 0.3810 0.0000 0.0000 14.625 0.17 1.16 -0.99 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0684 0.4285 0.5031 1 2 0.0726 0.4329 0.4945 1 2 0.0785 0.4386 0.4829
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 311 92 219 38 0 7 0 47 0 0 218 0 1 0.4130 0.0000 0.0046 12.143 0.53 1.17 -0.64 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1365 0.4969 0.3667 1 1 0.1402 0.4970 0.3627 1 1 0.1453 0.4973 0.3574
chr3 107772911 TAGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 622 152 470 80 0 5 0 67 0 0 466 0 4 0.5263 0.0000 0.0085 29.400 0.24 3.06 -2.82 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3387 0.5221 0.1391 1 1 0.3366 0.5204 0.1430 1 1 0.3335 0.5183 0.1483
chr3 108757146 G GGGGGATTA 0.500000 0.050 1 8 2 243 105 138 55 0 8 0 42 0 0 136 0 2 0.5238 0.0000 0.0145 12.125 0.05 7.05 -6.99 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3777 0.4950 0.1273 1 1 0.3735 0.4952 0.1313 1 1 0.3678 0.4956 0.1366
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 106 38 68 5 0 0 9 24 0 0 67 0 1 0.1316 0.0000 0.0147 38.000 1.00 1.08 -0.08 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0001 0.9976 0.0023 2 1 0.0000 0.9233 0.0766 2 1 0.0000 0.7416 0.2584
chr3 113657263 T TTGC 0.500000 0.050 1 3 1 1214 333 881 13 119 104 5 92 0 0 877 1 3 0.0390 0.0000 0.0045 2.303 0.77 3.36 -2.59 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5763 0.3869 0.0368 1 0 0.5669 0.3929 0.0402 1 0 0.5541 0.4007 0.0452
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1217 341 876 105 11 96 12 117 0 0 874 0 2 0.3079 0.0000 0.0023 2.634 2.78 3.11 -0.33 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0866 0.5072 0.4062 1 1 0.0911 0.5063 0.4026 1 1 0.0972 0.5052 0.3976
chr3 121489856 CTTT C 0.500000 0.050 1 -3 2 735 175 560 166 0 4 0 5 0 0 560 0 0 0.9486 0.0000 0.0000 42.750 0.48 3.40 -2.92 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0183 0.9817 0.0000 0 0 0.6802 0.3198 0.0000 0 0 0.8929 0.1071 0.0000
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.050 1 12 1 462 137 325 108 2 24 0 3 0 0 325 0 0 0.7883 0.0000 0.0000 4.667 0.49 12.00 -11.51 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1060 0.8940 0.0000 0 0 0.6696 0.3304 0.0000 0 0 0.8204 0.1796 0.0000
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.050 1 3 3 485 143 342 138 0 2 0 3 0 0 341 0 1 0.9650 0.0000 0.0029 70.500 0.21 3.33 -3.12 104 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0452 0.9548 0.0000 0 0 0.6755 0.3245 0.0000 0 0 0.8608 0.1392 0.0000
chr3 124763647 TTTGTTGAAC T 0.500000 0.050 1 -9 1 361 142 219 77 0 2 0 63 0 0 216 0 3 0.5423 0.0000 0.0137 70.000 0.19 8.67 -8.47 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3636 0.5102 0.1262 1 1 0.3604 0.5094 0.1303 1 1 0.3559 0.5083 0.1358
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 181 85 96 0 0 0 0 85 0 0 96 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 85.000 2.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1054 0.8946 2 2 0.0000 0.1095 0.8905 2 2 0.0000 0.1153 0.8847
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 354 131 223 61 0 3 0 67 0 0 223 0 0 0.4656 0.0000 0.0000 42.667 0.20 2.12 -1.92 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1679 0.5282 0.3039 1 1 0.1711 0.5261 0.3028 1 1 0.1754 0.5234 0.3012
chr3 138946048 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 551 89 462 46 0 2 1 40 0 0 462 0 0 0.5169 0.0000 0.0000 43.500 0.72 3.35 -2.63 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2988 0.5190 0.1822 1 1 0.2975 0.5176 0.1849 1 1 0.2958 0.5157 0.1885
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 291 95 196 86 0 5 0 4 0 0 196 0 0 0.9053 0.0000 0.0000 22.500 0.22 1.00 -0.78 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0131 0.9869 0.0000 0 1 0.3639 0.6361 0.0000 0 0 0.6370 0.3630 0.0000
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 346 147 199 0 0 21 4 122 0 0 196 0 3 0.0000 0.0000 0.0151 6.000 3.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0375 0.9625 2 2 0.0000 0.0399 0.9601 2 2 0.0000 0.0434 0.9566
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.050 1 3 1 516 150 366 57 2 25 1 65 0 0 365 0 1 0.3800 0.0000 0.0027 5.000 0.16 3.43 -3.27 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1502 0.5195 0.3303 1 1 0.1538 0.5180 0.3282 1 1 0.1586 0.5161 0.3252
chr3 195729666 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 119 61 58 41 0 0 0 20 0 0 58 0 0 0.6721 0.0000 0.0000 61.000 0.46 1.15 -0.69 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5295 0.4041 0.0664 1 0 0.5193 0.4101 0.0705 1 0 0.5057 0.4180 0.0763
chr3 195781275 GGTGGATGCTGAGGAAGTGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCT G 0.500000 0.050 1 -48 2 4727 1250 3477 833 36 150 21 210 146 117 3200 10 4 0.6664 0.0420 0.0797 7.455 2.97 4.70 -1.73 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.050 1 15 1 754 169 585 84 0 11 0 74 0 0 561 2 22 0.4970 0.0000 0.0410 14.364 0.31 11.68 -11.37 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1038 0.5037 0.3925 1 1 0.1082 0.5032 0.3886 1 1 0.1141 0.5026 0.3833
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -9 1 232 98 134 49 0 13 1 35 0 0 134 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 6.538 0.65 8.80 -8.15 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4092 0.4776 0.1132 1 1 0.4036 0.4791 0.1173 1 1 0.3961 0.4810 0.1229
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.050 1 21 1 546 122 424 0 0 0 0 122 0 0 342 2 80 0.0000 0.0000 0.1934 122.000 16.49 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr4 3074923 AGC A 0.021170 0.050 1 -2 1 683 273 410 55 18 24 168 8 2 6 401 1 0 0.2015 0.0049 0.0220 11.500 8.02 8.50 -0.48 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0076 0.5350 0.4574 1 1 0.0095 0.5663 0.4241 1 1 0.0128 0.6063 0.3809
chr4 3074926 AG A 0.010091 0.050 1 -1 1 684 266 418 61 26 127 49 3 1 7 410 0 0 0.2293 0.0024 0.0191 1.968 8.11 11.00 -2.89 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7023 0.2968 0.0009 1 0 0.6965 0.3025 0.0010 1 0 0.6886 0.3103 0.0011
chr4 3074927 G GCAA 0.030219 0.050 1 3 1 684 265 419 130 74 17 29 15 0 3 412 4 0 0.4906 0.0000 0.0167 14.769 9.06 2.20 6.86 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0895 0.9105 0.0000
chr4 3074945 A ACCGCCGCCG 0.064236 0.050 1 9 2 684 248 436 7 0 45 6 190 0 2 427 5 2 0.0282 0.0000 0.0206 4.810 4.43 8.59 -4.17 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9700 0.0300 2 1 0.0000 0.7533 0.2467
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.050 1 -6 2 402 109 293 67 0 1 0 41 0 0 291 0 2 0.6147 0.0000 0.0068 108.000 0.34 6.59 -6.24 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7256 0.2700 0.0044 1 0 0.7183 0.2769 0.0048 1 0 0.7083 0.2863 0.0054
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.050 1 -9 5 570 189 381 100 0 10 0 79 0 0 378 0 3 0.5291 0.0000 0.0079 17.900 0.51 8.42 -7.91 44 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4557 0.4675 0.0769 1 1 0.4495 0.4693 0.0812 1 1 0.4411 0.4717 0.0872
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.050 1 18 1 612 138 474 125 0 11 0 2 0 0 473 0 1 0.9058 0.0000 0.0021 11.545 0.30 19.00 -18.70 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1478 0.8522 0.0000 0 0 0.7463 0.2537 0.0000 0 0 0.8678 0.1322 0.0000
chr4 56931051 GGAGCTGTCTCCTCCCATGGAGGTGGTCCAGAAGGAGCCTGTTCAGATA G 0.500000 0.050 1 -48 1 910 275 635 207 2 61 0 5 1 2 632 0 0 0.7527 0.0016 0.0047 3.475 0.23 4.60 -4.37 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0581 0.9419 0.0000 0 0 0.8685 0.1315 0.0000 0 0 0.9615 0.0385 0.0000
chr4 78870928 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 820 341 479 264 4 56 2 15 0 0 479 0 0 0.7742 0.0000 0.0000 5.089 0.26 3.40 -3.14 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0101 0.9899 0.0000 0 0 0.5405 0.4595 0.0000
chr4 80286532 G GAGC 0.500000 0.050 1 3 2 275 98 177 51 0 5 1 41 0 0 177 0 0 0.5204 0.0000 0.0000 18.600 0.22 2.88 -2.66 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3520 0.5041 0.1439 1 1 0.3487 0.5038 0.1475 1 1 0.3443 0.5033 0.1524
chr4 87318348 ATCTCT A 0.500000 0.050 1 -5 1 155 73 82 44 0 1 0 28 0 0 80 0 2 0.6027 0.0000 0.0244 72.000 0.41 4.89 -4.48 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4262 0.4670 0.1068 1 1 0.4198 0.4692 0.1109 1 1 0.4113 0.4721 0.1166
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.050 1 18 1 2176 433 1743 144 10 115 5 159 1 2 1717 2 21 0.3326 0.0006 0.0149 2.812 1.69 8.23 -6.54 50 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0272 0.3843 0.5885 1 2 0.0302 0.3895 0.5803 1 2 0.0346 0.3967 0.5688
chr4 87615164 TAGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 3275 692 2583 319 11 57 7 298 2 17 2551 5 8 0.4610 0.0008 0.0124 11.418 1.73 4.78 -3.04 25 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5012 0.4763 0.0226 1 0 0.5000 0.4746 0.0254 1 0 0.4974 0.4731 0.0295
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.050 1 9 1 3478 732 2746 9 11 43 18 651 32 41 2463 159 51 0.0123 0.0117 0.1031 17.921 8.22 9.14 -0.92 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 3024 834 2190 13 21 166 64 570 293 30 1824 25 18 0.0156 0.1338 0.1671 3.926 6.31 7.86 -1.56 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 100187718 GT G 0.500000 0.050 1 -1 3 407 105 302 56 0 5 0 44 0 0 295 1 6 0.5333 0.0000 0.0232 20.000 0.12 2.14 -2.01 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2950 0.5251 0.1799 1 1 0.2941 0.5232 0.1828 1 1 0.2927 0.5208 0.1865
chr4 112432366 GTTC G 0.500000 0.050 1 -3 2 597 137 460 131 0 4 0 2 0 0 460 0 0 0.9562 0.0000 0.0000 33.250 0.37 5.50 -5.13 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5079 0.4921 0.0000 0 0 0.8693 0.1307 0.0000 0 0 0.9166 0.0834 0.0000
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 649 151 498 72 0 6 0 73 0 0 497 0 1 0.4768 0.0000 0.0020 24.167 0.25 3.90 -3.65 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2059 0.5433 0.2509 1 1 0.2082 0.5400 0.2518 1 1 0.2112 0.5359 0.2529
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 4 520 202 318 1 0 32 6 163 0 0 311 1 6 0.0050 0.0000 0.0220 5.312 0.00 2.99 -2.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0575 0.9425 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0209 0.9791
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 468 161 307 7 2 44 3 105 0 1 297 7 2 0.0435 0.0000 0.0326 2.591 0.57 3.67 -3.10 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8888 0.1112 2 1 0.0000 0.5113 0.4887
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.050 1 5 2 246 116 130 54 0 4 0 58 0 0 123 1 6 0.4655 0.0000 0.0538 28.000 0.94 4.69 -3.75 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1264 0.5015 0.3721 1 1 0.1304 0.5013 0.3683 1 1 0.1358 0.5010 0.3631
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 237 105 132 0 0 15 0 90 0 0 129 0 3 0.0000 0.0000 0.0227 6.000 5.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0879 0.9121 2 2 0.0000 0.0917 0.9083 2 2 0.0000 0.0972 0.9028
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 2 752 162 590 0 0 4 0 158 0 0 586 0 4 0.0000 0.0000 0.0068 39.500 3.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0167 0.9833 2 2 0.0000 0.0181 0.9819 2 2 0.0000 0.0202 0.9798
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.050 1 -12 4 254 107 147 40 0 3 0 64 0 0 141 0 6 0.3738 0.0000 0.0408 34.667 0.57 11.42 -10.85 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1056 0.6070 0.2874 1 1 0.1136 0.6105 0.2758 1 1 0.1248 0.6144 0.2608
chr5 7867364 TATA T 0.017279 0.050 1 -3 3 865 179 686 173 2 2 0 2 0 0 686 0 0 0.9665 0.0000 0.0000 88.000 0.38 3.00 -2.62 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9944 0.0056 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 726 158 568 1 0 33 5 119 0 0 562 1 5 0.0063 0.0000 0.0106 3.788 1.00 3.32 -2.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1632 0.8368 2 2 0.0000 0.0735 0.9265 2 2 0.0000 0.0607 0.9393
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.050 1 -15 4 357 53 304 0 1 36 2 14 0 2 296 2 4 0.0000 0.0000 0.0263 0.472 7.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6615 0.3384 2 1 0.0000 0.5612 0.4388 2 1 0.0000 0.5036 0.4964
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.050 1 -6 1 391 107 284 48 0 4 0 55 0 0 284 0 0 0.4486 0.0000 0.0000 25.750 0.08 6.02 -5.93 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1612 0.5168 0.3220 1 1 0.1645 0.5155 0.3200 1 1 0.1689 0.5139 0.3172
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 3 508 141 367 0 0 6 0 135 0 0 360 0 7 0.0000 0.0000 0.0191 27.000 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0278 0.9722 2 2 0.0000 0.0298 0.9702 2 2 0.0000 0.0327 0.9673
chr5 80654905 G GCCGCAGCGC 0.500000 0.050 1 9 2 330 77 253 58 4 12 0 3 0 0 252 1 0 0.7532 0.0000 0.0040 5.250 1.41 5.00 -3.59 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0289 0.9711 0.0000 0 1 0.3483 0.6517 0.0000 0 0 0.5610 0.4390 0.0000
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 274 107 167 101 0 2 0 4 0 0 167 0 0 0.9439 0.0000 0.0000 52.500 0.13 3.00 -2.87 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0182 0.9818 0.0000 0 1 0.4550 0.5450 0.0000 0 0 0.7180 0.2820 0.0000
chr5 109855234 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 149 73 76 33 0 1 0 39 0 0 76 0 0 0.4521 0.0000 0.0000 72.000 0.21 3.00 -2.79 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1740 0.5111 0.3149 1 1 0.1769 0.5103 0.3129 1 1 0.1807 0.5092 0.3101
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 968 258 710 116 3 32 2 105 3 1 702 2 2 0.4496 0.0042 0.0113 7.031 0.59 3.94 -3.35 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3557 0.5319 0.1125 1 1 0.3537 0.5293 0.1169 1 1 0.3509 0.5262 0.1230
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.050 1 9 2 457 122 335 94 0 25 0 3 1 0 334 0 0 0.7705 0.0030 0.0030 3.880 0.38 9.00 -8.62 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0754 0.9246 0.0000 0 0 0.5840 0.4160 0.0000 0 0 0.7618 0.2382 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 161 53 108 0 0 0 0 53 0 0 105 0 3 0.0000 0.0000 0.0278 53.000 3.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1964 0.8036 2 2 0.0000 0.2009 0.7991 2 2 0.0000 0.2071 0.7929
chr5 138441069 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 364 141 223 130 1 7 0 3 0 0 223 0 0 0.9220 0.0000 0.0000 19.143 0.19 1.00 -0.81 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1774 0.8226 0.0000 0 0 0.7749 0.2251 0.0000 0 0 0.8837 0.1163 0.0000
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.050 1 2 1 266 105 161 53 0 0 0 52 0 0 158 0 3 0.5048 0.0000 0.0186 105.000 0.19 3.46 -3.27 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2111 0.5317 0.2572 1 1 0.2131 0.5293 0.2576 1 1 0.2156 0.5263 0.2581
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 266 105 161 53 0 2 3 47 0 0 158 3 0 0.5048 0.0000 0.0186 51.500 0.19 3.74 -3.56 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2346 0.5323 0.2331 1 1 0.2358 0.5299 0.2343 1 1 0.2373 0.5268 0.2359
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 9 1 395 108 287 1 0 12 1 94 0 0 272 1 14 0.0093 0.0000 0.0523 8.000 0.00 8.26 -8.26 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2433 0.7567 2 2 0.0000 0.1146 0.8854 2 2 0.0000 0.0941 0.9059
chr5 146459072 TCAGGCCCAGGCC T 0.500000 0.050 1 -12 1 916 278 638 11 3 58 21 185 0 1 637 0 0 0.0396 0.0000 0.0016 3.586 1.36 11.43 -10.07 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9864 0.0136 2 1 0.0000 0.5893 0.4107
chr5 146459072 TCAGGCCCAGGCCCAGGCC T 0.500000 0.050 1 -18 1 916 288 628 28 1 55 8 196 0 0 627 0 1 0.0972 0.0000 0.0016 4.365 0.89 10.77 -9.88 4 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 12 1 369 123 246 42 0 29 0 52 0 0 239 0 7 0.3415 0.0000 0.0285 3.241 0.48 8.79 -8.31 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0861 0.4515 0.4624 1 2 0.0904 0.4546 0.4550 1 1 0.0963 0.4586 0.4451
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 18 1 369 123 246 42 0 34 0 47 0 0 239 0 7 0.3415 0.0000 0.0285 2.618 0.48 8.74 -8.27 0 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1160 0.4843 0.3997 1 1 0.1201 0.4853 0.3946 1 1 0.1257 0.4866 0.3877
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.050 1 -1 4 549 162 387 153 0 5 0 4 0 0 387 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 31.400 0.16 1.25 -1.09 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0669 0.9331 0.0000 0 0 0.7518 0.2482 0.0000 0 0 0.8987 0.1013 0.0000
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 326 116 210 3 0 4 0 109 0 0 207 0 3 0.0259 0.0000 0.0143 28.000 7.33 4.69 2.65 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8888 0.1112 2 2 0.0000 0.3189 0.6811 2 2 0.0000 0.1722 0.8278
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.050 1 -15 1 329 121 208 95 3 11 4 8 0 0 208 0 0 0.7851 0.0000 0.0000 10.000 3.66 7.75 -4.09 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0116 0.9884 0.0000 0 1 0.1601 0.8399 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.050 1 3 1 327 107 220 0 1 0 0 106 0 0 219 0 1 0.0000 0.0000 0.0045 107.000 4.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2291 0.7709 2 2 0.0000 0.1197 0.8803 2 2 0.0000 0.0997 0.9003
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 194 72 122 32 0 2 0 38 0 0 121 0 1 0.4444 0.0000 0.0082 35.000 0.25 3.21 -2.96 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1645 0.5070 0.3285 1 1 0.1676 0.5065 0.3260 1 1 0.1717 0.5058 0.3225
chr5 176384091 CGT C 0.500000 0.050 1 -2 1 337 113 224 52 0 4 0 57 0 0 224 0 0 0.4602 0.0000 0.0000 27.250 0.17 2.11 -1.93 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1797 0.5257 0.2946 1 1 0.1826 0.5238 0.2937 1 1 0.1863 0.5213 0.2923
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 1 487 107 380 49 0 3 0 55 1 0 378 0 1 0.4579 0.0026 0.0053 34.667 0.98 3.91 -2.93 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1703 0.5215 0.3082 1 1 0.1734 0.5199 0.3067 1 1 0.1775 0.5178 0.3047
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 487 219 268 90 4 46 1 78 0 0 266 1 1 0.4110 0.0000 0.0075 3.761 1.22 3.41 -2.19 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3875 0.5052 0.1074 1 1 0.3837 0.5046 0.1117 1 1 0.3785 0.5039 0.1176
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 644 112 532 49 0 13 0 50 0 0 531 0 1 0.4375 0.0000 0.0019 7.615 0.20 3.20 -3.00 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2122 0.5293 0.2585 1 1 0.2141 0.5271 0.2589 1 1 0.2165 0.5243 0.2592
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.050 1 3 5 552 150 402 66 4 20 1 59 1 0 399 1 1 0.4400 0.0025 0.0075 6.400 0.71 3.71 -3.00 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3365 0.5187 0.1448 1 1 0.3340 0.5173 0.1487 1 1 0.3305 0.5156 0.1539
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.050 1 3 1 565 145 420 55 0 29 3 58 2 3 409 2 4 0.3793 0.0048 0.0262 4.000 2.02 3.90 -1.88 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2811 0.5781 0.1408 1 1 0.2862 0.5742 0.1396 1 1 0.2928 0.5692 0.1380
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.050 1 3 1 520 108 412 48 6 12 1 41 1 1 407 1 2 0.4444 0.0024 0.0121 7.917 1.50 4.34 -2.84 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5090 0.4383 0.0527 1 0 0.5054 0.4401 0.0545 1 0 0.5004 0.4426 0.0570
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.050 1 3 2 1478 389 1089 65 86 103 3 132 0 1 1084 0 4 0.1671 0.0000 0.0046 2.830 1.80 3.57 -1.77 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5255 0.4449 0.0296 1 0 0.5241 0.4445 0.0313 1 0 0.5219 0.4445 0.0336
chr6 27255285 AAAGGAGAGCCAGATT A 0.178475 0.050 1 -15 1 408 103 305 57 0 6 0 40 0 0 301 0 4 0.5534 0.0000 0.0131 16.167 0.46 12.97 -12.52 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5605 0.4059 0.0337 1 0 0.5560 0.4089 0.0351 1 0 0.5500 0.4130 0.0371
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.050 1 2 1 1128 265 863 130 1 11 0 123 0 0 861 0 2 0.4906 0.0000 0.0023 23.091 0.31 2.30 -1.99 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4644 0.5132 0.0224 1 1 0.4671 0.5099 0.0230 1 1 0.4703 0.5059 0.0239
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.050 1 16 3 1037 219 818 200 2 9 0 8 0 0 818 0 0 0.9132 0.0000 0.0000 23.333 0.19 14.12 -13.94 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.6403 0.3597 0.0000 0 0 0.9430 0.0570 0.0000
chr6 29657255 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 2 156 62 94 51 1 3 0 7 0 0 94 0 0 0.8226 0.0000 0.0000 19.333 1.00 4.14 -3.14 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0324 0.9676 0.0000 0 1 0.2041 0.7959 0.0000
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 382 124 258 7 0 3 1 113 0 0 257 0 1 0.0565 0.0000 0.0039 40.333 2.00 1.25 0.75 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8607 0.1393 2 2 0.0000 0.4600 0.5400
chr6 31028710 GACC G 0.500000 0.050 1 -3 1 2310 476 1834 213 176 60 5 22 4 5 1786 25 14 0.4475 0.0022 0.0262 7.123 1.94 5.36 -3.42 45 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 516 124 392 5 60 6 1 52 0 0 391 0 1 0.0403 0.0000 0.0026 9.667 1.20 2.40 -1.20 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2407 0.5301 0.2292 1 1 0.2417 0.5278 0.2305 1 1 0.2429 0.5249 0.2322
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 516 125 391 5 54 5 0 61 0 0 389 2 0 0.0400 0.0000 0.0051 23.800 1.20 2.25 -1.05 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1131 0.4852 0.4017 1 1 0.1173 0.4861 0.3966 1 1 0.1229 0.4873 0.3898
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.050 1 -12 1 561 199 362 181 0 15 0 3 0 0 359 0 3 0.9095 0.0000 0.0083 12.267 0.40 8.33 -7.94 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 0 0.6125 0.3875 0.0000 0 0 0.8918 0.1082 0.0000
chr6 31954625 TCGATCC T 0.500000 0.050 1 -6 1 778 184 594 96 0 10 0 78 0 0 594 0 0 0.5217 0.0000 0.0000 17.400 0.31 5.82 -5.51 40 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4578 0.4650 0.0772 1 1 0.4514 0.4670 0.0815 1 1 0.4428 0.4697 0.0875
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 459 125 334 63 1 12 0 49 0 0 333 0 1 0.5040 0.0000 0.0030 9.417 1.02 3.90 -2.88 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4160 0.4794 0.1046 1 1 0.4105 0.4807 0.1088 1 1 0.4030 0.4824 0.1146
chr6 32223881 T TAGC 0.500000 0.050 1 3 1 472 224 248 100 8 36 0 80 0 1 242 0 5 0.4464 0.0000 0.0242 5.222 0.51 3.84 -3.33 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5411 0.4104 0.0484 1 0 0.5323 0.4154 0.0523 1 0 0.5202 0.4220 0.0577
chr6 32584184 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 391 131 260 88 3 2 4 34 0 0 254 1 5 0.6718 0.0000 0.0231 63.500 10.12 9.76 0.36 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8062 0.1860 0.0077 1 0 0.7932 0.1977 0.0091 1 0 0.7748 0.2139 0.0113
chr6 32584185 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 390 134 256 87 6 1 16 24 0 0 249 2 5 0.6493 0.0000 0.0273 131.000 10.11 9.12 0.99 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8032 0.1889 0.0079 1 0 0.7901 0.2006 0.0093 1 0 0.7718 0.2167 0.0115
chr6 33086236 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 320 67 253 40 0 2 0 25 0 0 252 0 1 0.5970 0.0000 0.0040 32.500 0.07 7.72 -7.64 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4281 0.4646 0.1073 1 1 0.4216 0.4670 0.1114 1 1 0.4129 0.4701 0.1170
chr6 35141212 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 231 67 164 64 0 1 0 2 0 0 164 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 66.000 3.08 2.00 1.08 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1657 0.8343 0.0000 0 0 0.5617 0.4383 0.0000 0 0 0.6884 0.3116 0.0000
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.050 1 1 2 672 224 448 208 0 10 0 6 0 0 448 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 21.400 0.34 1.33 -1.00 106 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0123 0.9877 0.0000 0 0 0.7583 0.2417 0.0000 0 0 0.9405 0.0595 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 906 221 685 3 95 10 1 112 0 0 685 0 0 0.0136 0.0000 0.0000 21.100 1.33 3.00 -1.67 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0840 0.4885 0.4274 1 1 0.0885 0.4889 0.4226 1 1 0.0945 0.4895 0.4159
chr6 42104971 ACTCCTC A 0.500000 0.050 1 -6 2 674 151 523 69 0 19 0 63 0 0 520 1 2 0.4570 0.0000 0.0057 6.947 1.41 6.49 -5.09 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2724 0.5370 0.1906 1 1 0.2725 0.5342 0.1933 1 1 0.2725 0.5307 0.1968
chr6 42107366 GGGTGGGGGTTCCAGCAGCAGGGGAGGT G 0.500000 0.050 1 -27 5 408 91 317 52 0 10 0 29 0 1 303 1 12 0.5714 0.0000 0.0442 8.100 0.65 15.66 -15.00 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3786 0.4937 0.1276 1 1 0.3743 0.4941 0.1316 1 1 0.3686 0.4946 0.1369
chr6 43012970 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 1 371 61 310 35 0 2 0 24 0 0 310 0 0 0.5738 0.0000 0.0000 29.500 0.49 4.17 -3.68 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3869 0.4827 0.1304 1 1 0.3819 0.4839 0.1342 1 1 0.3752 0.4855 0.1393
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 331 110 221 55 0 12 0 43 0 0 217 0 4 0.5000 0.0000 0.0181 8.167 0.51 5.86 -5.35 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3357 0.5121 0.1522 1 1 0.3332 0.5111 0.1557 1 1 0.3297 0.5100 0.1604
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 15 2 709 175 534 29 5 101 0 40 0 0 509 1 24 0.1657 0.0000 0.0468 0.713 15.24 6.30 8.94 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0284 0.3089 0.6627 1 2 0.0314 0.3189 0.6497 1 2 0.0359 0.3322 0.6319
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 30 2 709 175 534 29 8 114 0 24 0 0 511 1 22 0.1657 0.0000 0.0431 0.518 15.24 1.00 14.24 7 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1173 0.4804 0.4023 1 1 0.1214 0.4817 0.3969 1 1 0.1269 0.4834 0.3897
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.050 1 -15 2 714 209 505 84 2 76 0 47 0 0 499 0 6 0.4019 0.0000 0.0119 1.750 3.49 10.64 -7.15 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6653 0.3091 0.0256 1 0 0.6528 0.3188 0.0284 1 0 0.6356 0.3317 0.0327
chr6 84174775 T TTCCTGTTGTTTCTTTAGTTCTTCCAACTTATTTTCTAGTTCTTTC 0.500000 0.050 1 45 5 316 110 206 4 0 18 0 88 0 0 206 0 0 0.0364 0.0000 0.0000 5.111 0.25 0.67 -0.42 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9868 0.0132 2 1 0.0000 0.6226 0.3774 2 2 0.0000 0.3490 0.6510
chr6 84186595 TTTC T 0.500000 0.050 1 -3 1 318 82 236 8 0 5 0 69 0 0 236 0 0 0.0976 0.0000 0.0000 15.400 0.12 3.04 -2.92 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9744 0.0256 2 1 0.0000 0.7889 0.2111
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 692 127 565 57 3 31 0 36 0 0 555 1 9 0.4488 0.0000 0.0177 3.097 2.33 3.53 -1.19 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4189 0.4765 0.1046 1 1 0.4132 0.4780 0.1088 1 1 0.4055 0.4799 0.1146
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 2 102 44 58 27 1 2 0 14 0 0 58 0 0 0.6136 0.0000 0.0000 21.000 0.19 3.29 -3.10 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4315 0.4585 0.1100 1 1 0.4245 0.4614 0.1141 1 1 0.4153 0.4650 0.1196
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.050 1 3 2 783 193 590 8 0 8 2 175 0 0 584 0 6 0.0415 0.0000 0.0102 23.125 0.12 3.19 -3.06 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.6963 0.3037 2 2 0.0000 0.1957 0.8043
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 2 879 217 662 96 1 14 0 106 0 0 659 0 3 0.4424 0.0000 0.0045 14.500 0.15 3.03 -2.88 20 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1119 0.5211 0.3670 1 1 0.1162 0.5194 0.3644 1 1 0.1222 0.5172 0.3606
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.050 1 -18 1 595 232 363 123 1 34 0 74 0 0 356 0 7 0.5302 0.0000 0.0193 5.824 0.20 14.89 -14.70 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7560 0.2331 0.0109 1 0 0.7433 0.2441 0.0126 1 0 0.7256 0.2591 0.0153
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.050 1 -3 5 357 139 218 0 0 5 0 134 0 0 214 0 4 0.0000 0.0000 0.0183 26.800 4.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0301 0.9699 2 2 0.0000 0.0322 0.9678 2 2 0.0000 0.0353 0.9647
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.050 1 -8 2 232 77 155 46 0 6 0 25 0 0 155 0 0 0.5974 0.0000 0.0000 11.833 0.13 9.16 -9.03 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5270 0.4070 0.0661 1 0 0.5170 0.4128 0.0702 1 0 0.5036 0.4204 0.0760
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 326 137 189 0 0 9 12 116 0 0 187 0 2 0.0000 0.0000 0.0106 14.222 3.06 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0366 0.9634 2 2 0.0000 0.0390 0.9610 2 2 0.0000 0.0425 0.9575
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 773 249 524 6 29 13 101 100 0 0 523 0 1 0.0241 0.0000 0.0019 19.375 4.50 5.80 -1.30 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9823 0.0177
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 773 240 533 86 9 17 92 36 0 0 533 0 0 0.3583 0.0000 0.0000 13.455 2.94 8.53 -5.59 50 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1829 0.5477 0.2694 1 1 0.1860 0.5441 0.2699 1 1 0.1900 0.5396 0.2704
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 772 242 530 84 18 88 26 26 0 0 530 0 0 0.3471 0.0000 0.0000 10.615 2.93 7.23 -4.30 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9297 0.0694 0.0009 1 0 0.9213 0.0775 0.0012 1 0 0.9088 0.0896 0.0016
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 2 280 86 194 0 1 2 1 82 0 0 185 1 8 0.0000 0.0000 0.0464 42.000 4.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1688 0.8312 2 2 0.0000 0.1390 0.8610 2 2 0.0000 0.1282 0.8718
chr7 5313004 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 1 714 75 639 28 5 16 3 23 0 1 638 0 0 0.3733 0.0000 0.0016 3.625 1.93 3.52 -1.59 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3434 0.4993 0.1573 1 1 0.3401 0.4994 0.1605 1 1 0.3357 0.4994 0.1649
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 654 203 451 9 0 35 7 152 0 0 451 0 0 0.0443 0.0000 0.0000 4.800 0.00 3.46 -3.46 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8898 0.1102 2 2 0.0000 0.3853 0.6147
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.050 1 3 2 509 126 383 113 0 8 0 5 0 0 383 0 0 0.8968 0.0000 0.0000 14.750 0.20 2.80 -2.60 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 1 0.3655 0.6345 0.0000 0 0 0.7008 0.2992 0.0000
chr7 20785321 AGCC A 0.500000 0.050 1 -3 2 526 117 409 97 2 15 0 3 2 2 405 0 0 0.8291 0.0049 0.0098 7.286 1.03 3.67 -2.64 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0920 0.9080 0.0000 0 0 0.6345 0.3655 0.0000 0 0 0.7971 0.2029 0.0000
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.050 1 1 3 129 54 75 45 4 0 0 5 0 0 75 0 0 0.8333 0.0000 0.0000 51.000 0.33 1.20 -0.87 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.1083 0.8917 0.0000 0 1 0.3358 0.6642 0.0000
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 520 122 398 62 0 3 0 57 0 0 397 0 1 0.5082 0.0000 0.0025 39.667 1.13 1.25 -0.12 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2798 0.5317 0.1884 1 1 0.2795 0.5293 0.1911 1 1 0.2790 0.5263 0.1946
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 178 44 134 21 0 1 0 22 0 0 134 0 0 0.4773 0.0000 0.0000 43.000 0.05 3.45 -3.41 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2316 0.5128 0.2556 1 1 0.2325 0.5119 0.2557 1 1 0.2337 0.5106 0.2557
chr7 43647475 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 1 226 86 140 78 0 2 0 6 0 0 140 0 0 0.9070 0.0000 0.0000 42.000 0.19 3.33 -3.14 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1107 0.8893 0.0000 0 1 0.4110 0.5890 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 202 79 123 40 0 1 0 38 0 0 123 0 0 0.5063 0.0000 0.0000 78.000 0.23 3.03 -2.80 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2622 0.5226 0.2152 1 1 0.2623 0.5209 0.2169 1 1 0.2622 0.5187 0.2190
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 434 148 286 71 0 0 1 76 0 0 286 0 0 0.4797 0.0000 0.0000 148.000 0.28 1.63 -1.35 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1658 0.5343 0.2999 1 1 0.1691 0.5317 0.2991 1 1 0.1736 0.5285 0.2979
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 5 833 219 614 0 0 11 1 207 0 0 604 0 10 0.0000 0.0000 0.0163 18.909 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0046 0.9954 2 2 0.0000 0.0054 0.9946
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.050 1 3 2 588 142 446 65 0 13 1 63 0 0 442 0 4 0.4577 0.0000 0.0090 9.846 0.83 3.68 -2.85 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1998 0.5381 0.2620 1 1 0.2023 0.5352 0.2625 1 1 0.2054 0.5316 0.2629
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 1 488 213 275 130 6 74 0 3 0 0 275 0 0 0.6103 0.0000 0.0000 1.878 1.16 3.33 -2.17 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1868 0.8132 0.0000 0 0 0.7943 0.2057 0.0000 0 0 0.8952 0.1048 0.0000
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.050 1 -4 1 664 221 443 112 1 4 0 104 0 0 441 0 2 0.5068 0.0000 0.0045 54.250 0.38 4.07 -3.69 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2985 0.5520 0.1494 1 1 0.2985 0.5481 0.1534 1 1 0.2981 0.5432 0.1587
chr7 100088992 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 4 375 180 195 83 3 14 1 79 0 0 190 1 4 0.4611 0.0000 0.0256 11.857 0.23 3.09 -2.86 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2357 0.5516 0.2127 1 1 0.2372 0.5477 0.2150 1 1 0.2392 0.5429 0.2179
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.050 1 -7 1 535 151 384 146 0 3 0 2 0 0 384 0 0 0.9669 0.0000 0.0000 49.333 0.32 7.50 -7.18 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6008 0.3992 0.0000 0 0 0.9059 0.0941 0.0000 0 0 0.9403 0.0597 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 546 158 388 69 0 7 0 82 0 0 387 0 1 0.4367 0.0000 0.0026 21.571 0.16 3.21 -3.05 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1029 0.4918 0.4053 1 1 0.1072 0.4922 0.4006 1 1 0.1131 0.4927 0.3942
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 745 174 571 157 0 11 1 5 0 0 571 0 0 0.9023 0.0000 0.0000 14.818 0.68 4.00 -3.32 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0033 0.9967 0.0000 0 1 0.4711 0.5289 0.0000 0 0 0.8235 0.1765 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.050 1 -30 3 573 174 399 0 1 20 0 153 0 0 397 1 1 0.0000 0.0000 0.0050 7.650 14.48 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0235 0.9765 2 2 0.0000 0.0247 0.9753 2 2 0.0000 0.0267 0.9733
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 232 87 145 1 0 1 0 85 0 0 141 0 4 0.0115 0.0000 0.0276 86.000 0.00 3.02 -3.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3527 0.6473 2 2 0.0000 0.1784 0.8216 2 2 0.0000 0.1466 0.8534
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 3 965 265 700 6 1 40 7 211 0 0 696 1 3 0.0226 0.0000 0.0057 5.625 0.17 3.23 -3.07 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9916 0.0084 2 2 0.0000 0.2513 0.7487 2 2 0.0000 0.0554 0.9446
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 1516 361 1155 5 0 21 0 335 0 0 1154 1 0 0.0139 0.0000 0.0009 16.190 0.20 1.60 -1.40 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4088 0.5912 2 2 0.0000 0.0070 0.9930 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 687 152 535 4 0 7 0 141 0 0 526 0 9 0.0263 0.0000 0.0168 20.714 0.00 4.07 -4.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9402 0.0598 2 2 0.0000 0.2635 0.7365 2 2 0.0000 0.1082 0.8918
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.050 1 -4 1 1257 747 510 724 0 13 0 10 0 0 510 0 0 0.9692 0.0000 0.0000 56.462 1.15 4.20 -3.05 160 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8692 0.1308 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.050 1 -4 3 211 58 153 29 0 3 0 26 0 0 152 0 1 0.5000 0.0000 0.0065 18.333 0.83 4.42 -3.60 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2659 0.5159 0.2182 1 1 0.2657 0.5147 0.2197 1 1 0.2653 0.5132 0.2216
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 750 201 549 98 0 4 0 99 0 0 546 0 3 0.4876 0.0000 0.0055 49.250 0.88 1.18 -0.30 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1787 0.5560 0.2653 1 1 0.1820 0.5518 0.2662 1 1 0.1863 0.5465 0.2672
chr7 149821443 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 656 141 515 50 2 2 1 86 0 1 511 0 3 0.3546 0.0000 0.0078 69.500 0.58 1.43 -0.85 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0181 0.2705 0.7114 1 2 0.0205 0.2812 0.6983 1 2 0.0241 0.2957 0.6802
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.050 1 -12 2 745 222 523 210 1 8 0 3 0 0 523 0 0 0.9459 0.0000 0.0000 26.750 0.67 12.00 -11.33 70 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6036 0.3964 0.0000 0 0 0.9611 0.0389 0.0000 0 0 0.9811 0.0189 0.0000
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 476 79 397 1 0 2 9 67 0 1 374 8 14 0.0127 0.0000 0.0579 38.500 4.00 7.96 -3.96 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2864 0.7136 2 2 0.0000 0.1468 0.8532 2 2 0.0000 0.1208 0.8792
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 477 79 398 0 0 4 8 67 0 0 372 12 14 0.0000 0.0000 0.0653 37.000 8.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0668 0.9332 2 2 0.0000 0.0703 0.9297 2 2 0.0000 0.0753 0.9247
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 482 78 404 0 0 6 1 71 0 1 351 20 32 0.0000 0.0000 0.1312 18.000 7.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0445 0.9555 2 2 0.0000 0.0471 0.9529 2 2 0.0000 0.0508 0.9492
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.050 1 -1 3 530 181 349 9 0 0 0 172 0 1 347 0 1 0.0497 0.0000 0.0057 181.000 0.33 1.60 -1.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8778 0.1222 2 2 0.0000 0.3483 0.6517
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 364 94 270 42 0 1 0 51 0 0 269 0 1 0.4468 0.0000 0.0037 93.000 0.19 3.08 -2.89 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1358 0.4993 0.3649 1 1 0.1396 0.4993 0.3611 1 1 0.1447 0.4993 0.3560
chr8 544658 GGGCGGC G 0.425210 0.050 1 -6 1 210 109 101 43 0 10 0 56 0 0 97 0 4 0.3945 0.0000 0.0396 9.900 0.84 6.18 -5.34 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1055 0.4798 0.4148 1 1 0.1105 0.4821 0.4074 1 1 0.1174 0.4850 0.3976
chr8 1678294 T TCAC 0.045336 0.050 1 3 1 462 135 327 124 0 6 0 5 0 0 327 0 0 0.9185 0.0000 0.0000 21.500 0.09 2.80 -2.71 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1199 0.8801 0.0000 0 0 0.9408 0.0592 0.0000 0 0 0.9847 0.0153 0.0000
chr8 7319799 TG T 0.006394 0.050 1 -1 3 199 84 115 37 0 0 0 47 0 0 115 0 0 0.4405 0.0000 0.0000 84.000 0.32 1.02 -0.70 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3514 0.6425 0.0061 1 1 0.3576 0.6365 0.0060 1 1 0.3656 0.6286 0.0058
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.050 1 -6 2 805 199 606 85 0 22 2 90 0 0 601 0 5 0.4271 0.0000 0.0083 8.045 0.62 5.99 -5.37 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1017 0.5028 0.3955 1 1 0.1056 0.5019 0.3925 1 1 0.1109 0.5009 0.3882
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.050 1 -6 2 678 110 568 43 0 19 1 47 0 0 566 0 2 0.3909 0.0000 0.0035 4.789 1.19 6.57 -5.39 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1765 0.5197 0.3038 1 1 0.1798 0.5184 0.3018 1 1 0.1842 0.5167 0.2991
chr8 9556332 CTCT C 0.000007 0.050 1 -3 2 996 229 767 127 1 12 2 87 1 0 763 0 3 0.5546 0.0013 0.0052 17.917 0.18 3.22 -3.04 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8292 0.1708 0.0000 1 0 0.8219 0.1781 0.0000 1 0 0.8117 0.1883 0.0000
chr8 10608493 GCTGGGCCTCCCCTTCAGCCTC G 0.100122 0.050 1 -21 2 834 183 651 92 0 22 2 67 8 5 591 2 45 0.5027 0.0123 0.0922 7.273 1.16 15.88 -14.72 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2553 0.6560 0.0886 1 1 0.2635 0.6490 0.0875 1 1 0.2742 0.6398 0.0860
chr8 11808709 G GTCCCACTCCCAC 0.014168 0.050 1 12 1 599 240 359 90 4 49 0 97 0 0 347 0 12 0.3750 0.0000 0.0334 3.979 6.02 8.32 -2.30 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2680 0.7157 0.0163 1 1 0.2773 0.7068 0.0159 1 1 0.2895 0.6950 0.0154
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.050 1 -6 1 599 261 338 120 0 40 1 100 1 0 337 0 0 0.4598 0.0030 0.0030 5.500 6.80 5.64 1.16 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0926 0.7187 0.1887 1 1 0.0901 0.7117 0.1983 1 1 0.0867 0.7022 0.2112
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.050 1 -6 2 367 137 230 77 0 5 1 54 0 0 226 0 4 0.5620 0.0000 0.0174 26.400 0.08 7.67 -7.59 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6026 0.3712 0.0262 1 0 0.5968 0.3755 0.0278 1 0 0.5889 0.3812 0.0299
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.050 1 -1 2 262 113 149 59 0 2 0 52 0 0 149 0 0 0.5221 0.0000 0.0000 55.500 0.25 3.15 -2.90 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4161 0.4897 0.0943 1 1 0.4144 0.4892 0.0964 1 1 0.4120 0.4887 0.0993
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.050 1 -3 3 621 210 411 201 0 3 0 6 0 0 411 0 0 0.9571 0.0000 0.0000 69.000 0.40 4.50 -4.10 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0141 0.9859 0.0000 0 0 0.8079 0.1921 0.0000 0 0 0.9558 0.0442 0.0000
chr8 97775937 C CGGCGGGCTCCAGGCGA 0.500000 0.050 1 16 1 282 90 192 43 1 13 1 32 0 0 185 0 7 0.4778 0.0000 0.0365 5.769 0.63 9.94 -9.31 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2865 0.5206 0.1929 1 1 0.2857 0.5190 0.1953 1 1 0.2845 0.5171 0.1985
chr8 100194231 A AGAC 0.500000 0.050 1 3 5 206 83 123 81 0 0 0 2 0 0 123 0 0 0.9759 0.0000 0.0000 83.000 0.19 4.50 -4.31 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2268 0.7732 0.0000 0 0 0.6597 0.3403 0.0000 0 0 0.7682 0.2318 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.050 1 -27 4 729 242 487 127 1 10 1 103 0 0 487 0 0 0.5248 0.0000 0.0000 23.200 2.59 17.51 -14.92 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5253 0.4258 0.0489 1 0 0.5174 0.4297 0.0528 1 0 0.5067 0.4350 0.0583
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 310 148 162 144 0 1 0 3 0 0 162 0 0 0.9730 0.0000 0.0000 147.000 0.24 3.00 -2.76 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2186 0.7814 0.0000 0 0 0.8246 0.1754 0.0000 0 0 0.9119 0.0881 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 500 127 373 0 1 22 13 91 0 0 369 2 2 0.0000 0.0000 0.0107 4.773 4.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2044 0.7956 2 2 0.0000 0.1165 0.8835 2 2 0.0000 0.0984 0.9016
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.050 1 15 1 1031 241 790 2 0 39 0 200 0 0 761 1 28 0.0083 0.0000 0.0367 5.179 0.00 11.47 -11.47 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0764 0.9236 2 2 0.0000 0.0133 0.9867 2 2 0.0000 0.0087 0.9913
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.050 1 2 3 1384 267 1117 203 3 4 6 51 0 0 1114 1 2 0.7603 0.0000 0.0027 65.000 1.26 3.35 -2.09 63 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9988 0.0012 0.0000 1 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.050 1 -2 4 1386 270 1116 127 77 10 5 51 0 0 1111 0 5 0.4704 0.0000 0.0045 30.714 1.18 3.29 -2.11 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9976 0.0024 0.0000 1 0 0.9970 0.0030 0.0000 1 0 0.7237 0.2763 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 2 339 101 238 0 1 21 1 78 0 0 226 0 12 0.0000 0.0000 0.0504 3.762 7.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0974 0.9026 2 2 0.0000 0.1010 0.8990 2 2 0.0000 0.1063 0.8937
chr9 25678179 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 3 578 131 447 56 2 17 0 56 0 0 446 0 1 0.4275 0.0000 0.0022 6.706 0.89 3.50 -2.61 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2445 0.5347 0.2208 1 1 0.2454 0.5321 0.2225 1 1 0.2465 0.5288 0.2247
chr9 34893048 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 722 186 536 102 0 3 2 79 0 0 532 2 2 0.5484 0.0000 0.0075 61.000 0.16 2.22 -2.06 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4398 0.4779 0.0823 1 1 0.4343 0.4790 0.0867 1 1 0.4267 0.4806 0.0927
chr9 70140212 TAAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 229 107 122 60 0 0 1 46 0 0 121 0 1 0.5607 0.0000 0.0082 106.000 0.18 3.04 -2.86 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3937 0.4894 0.1169 1 1 0.3889 0.4900 0.1211 1 1 0.3825 0.4908 0.1266
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.050 1 -15 3 417 125 292 70 0 3 0 52 0 0 282 0 10 0.5600 0.0000 0.0342 40.667 0.06 13.60 -13.54 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3294 0.5212 0.1494 1 1 0.3274 0.5196 0.1530 1 1 0.3245 0.5176 0.1579
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.050 1 12 1 725 138 587 49 0 9 0 80 0 0 579 0 8 0.3551 0.0000 0.0136 14.333 0.22 10.19 -9.96 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0155 0.2519 0.7326 1 2 0.0176 0.2630 0.7193 1 2 0.0209 0.2782 0.7009
chr9 83956213 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 340 113 227 57 0 1 0 55 0 0 227 0 0 0.5044 0.0000 0.0000 112.000 0.49 1.24 -0.75 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2565 0.5329 0.2105 1 1 0.2570 0.5305 0.2125 1 1 0.2576 0.5273 0.2151
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 458 101 357 46 0 2 0 53 0 0 353 0 4 0.4554 0.0000 0.0112 49.500 0.41 3.26 -2.85 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1270 0.4962 0.3768 1 1 0.1310 0.4964 0.3727 1 1 0.1363 0.4966 0.3671
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 1 208 56 152 28 1 1 0 26 0 0 148 1 3 0.5000 0.0000 0.0263 55.000 0.21 3.65 -3.44 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2293 0.5177 0.2530 1 1 0.2304 0.5164 0.2532 1 1 0.2318 0.5147 0.2535
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.050 1 3 2 304 79 225 2 0 19 5 53 0 0 221 2 2 0.0253 0.0000 0.0178 3.158 2.50 3.96 -1.46 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8458 0.1542 2 2 0.0000 0.4519 0.5481 2 2 0.0000 0.3225 0.6775
chr9 92474742 C CTCATCA 0.500000 0.050 1 6 2 304 79 225 2 0 51 0 26 0 0 221 1 3 0.0253 0.0000 0.0178 0.571 2.50 5.54 -3.04 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9251 0.0749 2 1 0.0000 0.6453 0.3547 2 1 0.0000 0.5065 0.4935
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.050 1 15 4 453 187 266 96 2 3 0 86 0 0 266 0 0 0.5134 0.0000 0.0000 61.333 0.31 8.60 -8.29 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3718 0.5146 0.1136 1 1 0.3688 0.5133 0.1179 1 1 0.3645 0.5118 0.1237
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 598 208 390 98 0 1 0 109 0 0 387 0 3 0.4712 0.0000 0.0077 207.000 0.39 3.34 -2.95 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0959 0.5055 0.3986 1 1 0.1003 0.5048 0.3949 1 1 0.1064 0.5039 0.3896
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 919 141 778 50 2 38 1 50 2 0 771 1 4 0.3546 0.0026 0.0090 2.684 0.96 6.12 -5.16 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2210 0.5330 0.2460 1 1 0.2227 0.5305 0.2468 1 1 0.2248 0.5274 0.2478
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 437 100 337 5 0 0 0 95 0 0 337 0 0 0.0500 0.0000 0.0000 100.000 0.20 2.73 -2.53 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.7298 0.2702 2 2 0.0000 0.3965 0.6035
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.050 1 -4 1 698 128 570 9 1 1 0 117 0 0 568 0 2 0.0703 0.0000 0.0035 127.000 0.00 5.01 -5.01 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9764 0.0236 2 1 0.0000 0.7019 0.2981
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 660 153 507 10 0 1 2 140 0 0 506 0 1 0.0654 0.0000 0.0020 152.000 0.00 2.85 -2.85 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9590 0.0410 2 1 0.0000 0.5717 0.4283
chr9 110048735 TCCCCCGGAGTCTCCTGGA T 0.500000 0.050 1 -18 2 184 72 112 41 0 4 0 27 0 0 108 0 4 0.5694 0.0000 0.0357 17.000 0.29 16.85 -16.56 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3698 0.4926 0.1376 1 1 0.3656 0.4931 0.1413 1 1 0.3600 0.4937 0.1463
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.050 1 -4 1 277 107 170 0 0 3 1 103 0 0 166 0 4 0.0000 0.0000 0.0235 34.333 4.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0621 0.9379 2 2 0.0000 0.0653 0.9347 2 2 0.0000 0.0701 0.9299
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 457 101 356 3 0 17 0 81 0 0 354 0 2 0.0297 0.0000 0.0056 4.941 0.33 6.26 -5.93 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9432 0.0568 2 2 0.0000 0.4892 0.5108 2 2 0.0000 0.2943 0.7057
chr9 122511106 A AT 0.500000 0.050 1 1 1 1238 269 969 234 3 24 0 8 0 0 969 0 0 0.8699 0.0000 0.0000 10.125 0.25 1.00 -0.75 98 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.6298 0.3702 0.0000 0 0 0.9378 0.0622 0.0000
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 527 126 401 110 0 12 0 4 0 0 401 0 0 0.8730 0.0000 0.0000 9.500 0.85 1.25 -0.40 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0255 0.9745 0.0000 0 0 0.5146 0.4854 0.0000 0 0 0.7605 0.2395 0.0000
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 580 196 384 0 0 2 1 193 0 0 378 0 6 0.0000 0.0000 0.0156 97.000 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 1 423 124 299 45 4 29 2 44 0 0 293 1 5 0.3629 0.0000 0.0201 3.276 0.82 3.55 -2.72 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2025 0.5282 0.2693 1 1 0.2047 0.5261 0.2693 1 1 0.2075 0.5234 0.2691
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 569 146 423 11 1 1 1 132 0 0 422 0 1 0.0753 0.0000 0.0024 145.000 1.18 2.31 -1.13 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9910 0.0090 2 1 0.0000 0.7788 0.2212
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 270 122 148 2 0 0 0 120 0 0 147 0 1 0.0164 0.0000 0.0068 122.000 3.00 1.20 1.80 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5530 0.4470 2 2 0.0000 0.1612 0.8388 2 2 0.0000 0.1036 0.8964
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 270 122 148 2 0 0 0 120 0 0 147 0 1 0.0164 0.0000 0.0068 122.000 3.00 1.20 1.80 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5530 0.4470 2 2 0.0000 0.1612 0.8388 2 2 0.0000 0.1036 0.8964
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 251 102 149 52 0 2 0 48 0 0 149 0 0 0.5098 0.0000 0.0000 50.000 0.27 2.27 -2.00 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2835 0.5256 0.1909 1 1 0.2829 0.5237 0.1934 1 1 0.2820 0.5213 0.1967
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 441 113 328 5 1 2 0 105 0 0 328 0 0 0.0442 0.0000 0.0000 55.500 0.20 1.36 -1.16 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.7183 0.2817 2 2 0.0000 0.3752 0.6248
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 1 596 178 418 133 1 25 0 19 1 0 415 0 2 0.7472 0.0024 0.0072 6.080 0.32 2.95 -2.63 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0103 0.9897 0.0000
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 248 129 119 88 5 29 0 7 0 0 119 0 0 0.6822 0.0000 0.0000 3.448 0.41 3.71 -3.31 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0848 0.9152 0.0000 0 1 0.4082 0.5918 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.050 1 -4 3 209 91 118 5 0 1 1 84 0 0 115 0 3 0.0549 0.0000 0.0254 90.000 0.00 4.10 -4.10 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9323 0.0677 2 1 0.0000 0.7689 0.2311
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.050 1 6 6 846 216 630 1 0 25 1 189 0 0 618 0 12 0.0046 0.0000 0.0190 7.640 19.00 5.61 13.39 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0310 0.9690 2 2 0.0000 0.0138 0.9862 2 2 0.0000 0.0119 0.9881
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.050 1 3 1 660 133 527 123 0 5 0 5 0 0 527 0 0 0.9248 0.0000 0.0000 25.600 0.19 4.00 -3.81 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0177 0.9823 0.0000 0 0 0.6776 0.3224 0.0000 0 0 0.8946 0.1054 0.0000
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.050 1 -2 1 276 123 153 119 0 0 0 4 0 0 153 0 0 0.9675 0.0000 0.0000 123.000 0.14 2.25 -2.11 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7122 0.2878 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.050 1 1 1 522 134 388 73 0 6 2 53 0 0 387 0 1 0.5448 0.0000 0.0026 21.333 0.42 1.38 -0.95 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5376 0.4109 0.0515 1 0 0.5313 0.4145 0.0543 1 0 0.5226 0.4192 0.0582
chr10 47502280 CG C 0.024504 0.050 1 -1 1 661 163 498 113 1 2 0 47 0 0 498 0 0 0.6933 0.0000 0.0000 80.500 0.35 1.45 -1.09 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9565 0.0435 0.0000 1 0 0.9515 0.0484 0.0000 1 0 0.9441 0.0558 0.0001
chr10 49988921 AC A 0.048828 0.050 1 -1 1 663 202 461 125 2 2 0 73 0 0 460 0 1 0.6188 0.0000 0.0022 99.500 0.42 2.45 -2.03 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9091 0.0906 0.0003 1 0 0.9021 0.0976 0.0003 1 0 0.8920 0.1076 0.0004
chr10 63208190 ACTAAAC A 0.035276 0.050 1 -6 1 773 181 592 171 0 6 0 4 0 0 592 0 0 0.9448 0.0000 0.0000 29.167 0.19 4.75 -4.56 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7469 0.2531 0.0000 0 0 0.9923 0.0077 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.050 1 -3 1 380 83 297 60 0 18 1 4 0 0 297 0 0 0.7229 0.0000 0.0000 3.611 0.28 3.75 -3.47 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0075 0.9925 0.0000 0 1 0.4510 0.5490 0.0000 0 0 0.7738 0.2262 0.0000
chr10 77637505 A AGAG 0.003648 0.050 1 3 2 1025 267 758 109 7 47 1 103 1 1 754 1 1 0.4082 0.0013 0.0053 4.638 1.00 3.35 -2.35 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5786 0.4208 0.0006 1 0 0.5780 0.4214 0.0007 1 0 0.5769 0.4224 0.0007
chr10 80081665 C CAA 0.055364 0.050 1 2 1 219 28 191 1 0 11 3 13 0 0 188 2 1 0.0357 0.0000 0.0157 1.889 0.00 2.38 -2.38 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0005 0.9815 0.0179 2 1 0.0005 0.9546 0.0449 2 1 0.0005 0.9407 0.0588
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.050 1 6 1 640 136 504 128 1 4 0 3 0 0 504 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 33.000 0.24 4.00 -3.76 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3584 0.6416 0.0000 0 0 0.9044 0.0956 0.0000 0 0 0.9546 0.0454 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.050 1 6 1 661 209 452 100 0 24 0 85 0 0 444 0 8 0.4785 0.0000 0.0177 7.708 1.19 6.69 -5.50 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3311 0.5354 0.1335 1 1 0.3307 0.5324 0.1369 1 1 0.3300 0.5286 0.1415
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.050 1 6 1 350 83 267 48 0 7 0 28 0 0 263 0 4 0.5783 0.0000 0.0150 10.857 0.88 5.36 -4.48 26 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4679 0.4452 0.0869 1 0 0.4606 0.4485 0.0909 1 1 0.4509 0.4527 0.0964
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.050 1 3 3 205 83 122 1 0 1 1 80 0 0 117 0 5 0.0120 0.0000 0.0410 82.000 0.00 3.17 -3.17 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1835 0.8165 2 2 0.0000 0.0821 0.9179 2 2 0.0000 0.0659 0.9341
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.050 1 -1 1 384 153 231 0 0 18 0 135 0 0 231 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.500 2.30 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0279 0.9721 2 2 0.0000 0.0298 0.9702 2 2 0.0000 0.0326 0.9674
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.050 1 21 2 695 142 553 78 0 11 1 52 0 0 538 0 15 0.5493 0.0000 0.0271 11.818 1.28 14.29 -13.01 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5319 0.4398 0.0283 1 0 0.5299 0.4408 0.0293 1 0 0.5271 0.4422 0.0307
chr10 128107489 T TGCTGGG 0.001110 0.050 1 6 1 1093 252 841 230 1 14 0 7 1 0 839 0 1 0.9127 0.0012 0.0024 18.308 0.48 4.71 -4.23 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4006 0.5994 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.050 1 -3 2 689 153 536 142 0 6 0 5 0 0 536 0 0 0.9281 0.0000 0.0000 24.500 0.31 3.00 -2.69 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0191 0.9809 0.0000 0 0 0.6931 0.3069 0.0000 0 0 0.9000 0.1000 0.0000
chr11 502129 ACTGGATGTCCAGGCT A 0.120821 0.050 1 -15 1 190 94 96 46 0 13 0 35 0 0 93 0 3 0.4894 0.0000 0.0312 6.231 0.15 13.23 -13.08 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5233 0.4441 0.0326 1 0 0.5210 0.4455 0.0335 1 0 0.5179 0.4474 0.0346
chr11 704604 GA G 0.439706 0.050 1 -1 2 263 100 163 0 0 1 1 98 0 0 163 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 99.000 2.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0955 0.9045 2 2 0.0000 0.0998 0.9002 2 2 0.0000 0.1062 0.8938
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.050 1 1 1 541 181 360 165 1 11 0 4 0 0 360 0 0 0.9116 0.0000 0.0000 15.455 0.39 1.50 -1.11 81 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4027 0.5973 0.0000 0 0 0.9637 0.0363 0.0000 0 0 0.9871 0.0129 0.0000
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.050 1 -24 1 3666 920 2746 430 12 266 8 204 4 9 2732 0 1 0.4674 0.0015 0.0051 2.425 2.67 13.35 -10.69 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.050 1 -30 2 1051 205 846 68 2 78 0 57 0 0 845 0 1 0.3317 0.0000 0.0012 1.628 0.63 7.65 -7.02 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3602 0.5091 0.1306 1 1 0.3560 0.5088 0.1351 1 1 0.3504 0.5084 0.1412
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.050 1 -30 1 942 241 701 104 4 73 1 59 1 0 680 0 20 0.4315 0.0014 0.0300 2.274 0.68 11.32 -10.64 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7489 0.2469 0.0042 1 0 0.7415 0.2539 0.0046 1 0 0.7313 0.2634 0.0052
chr11 2884966 ACCGCGACCGGAG A 0.233793 0.050 1 -12 1 527 144 383 111 1 29 0 3 0 1 380 0 2 0.7708 0.0000 0.0078 3.966 1.97 12.00 -10.03 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 0 0.6534 0.3466 0.0000 0 0 0.8847 0.1153 0.0000
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 2 355 101 254 0 0 2 0 99 0 0 253 0 1 0.0000 0.0000 0.0039 49.500 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0747 0.9253 2 2 0.0000 0.0783 0.9217 2 2 0.0000 0.0834 0.9166
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 650 221 429 8 0 8 0 205 0 0 429 0 0 0.0362 0.0000 0.0000 26.625 0.00 1.26 -1.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.5682 0.4318 2 2 0.0000 0.1251 0.8749
chr11 4546129 AATGAAGATT A 0.500000 0.050 1 -9 3 364 100 264 95 0 0 0 5 0 0 264 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 100.000 0.42 9.00 -8.58 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0031 0.9969 0.0000 0 1 0.2697 0.7303 0.0000 0 0 0.6033 0.3967 0.0000
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.050 1 2 1 234 105 129 98 0 2 0 5 0 0 129 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 51.500 0.12 2.00 -1.88 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0034 0.9966 0.0000 0 1 0.2847 0.7153 0.0000 0 0 0.6205 0.3795 0.0000
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 615 160 455 151 1 4 0 4 0 0 455 0 0 0.9437 0.0000 0.0000 39.000 0.56 3.75 -3.19 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0636 0.9364 0.0000 0 0 0.7463 0.2537 0.0000 0 0 0.8964 0.1036 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 788 211 577 9 1 3 1 197 0 0 575 0 2 0.0427 0.0000 0.0035 69.333 0.78 1.98 -1.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8307 0.1693 2 2 0.0000 0.2438 0.7562
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 456 118 338 59 0 1 1 57 0 0 338 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 117.000 1.00 2.12 -1.12 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2438 0.5354 0.2208 1 1 0.2448 0.5327 0.2225 1 1 0.2459 0.5293 0.2247
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 1 1154 271 883 118 0 9 0 144 0 0 871 0 12 0.4354 0.0000 0.0136 29.111 0.17 5.83 -5.66 26 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0161 0.2944 0.6895 1 2 0.0183 0.3036 0.6781 1 2 0.0216 0.3159 0.6624
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 826 190 636 98 0 8 0 84 0 0 636 0 0 0.5158 0.0000 0.0000 22.750 0.23 1.54 -1.30 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3999 0.5000 0.1002 1 1 0.3957 0.4997 0.1046 1 1 0.3900 0.4994 0.1106
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.050 1 4 1 1278 305 973 150 0 22 0 133 0 0 968 0 5 0.4918 0.0000 0.0051 12.864 0.23 4.28 -4.05 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3477 0.5462 0.1061 1 1 0.3467 0.5425 0.1107 1 1 0.3450 0.5380 0.1170
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.050 1 2 1 552 152 400 0 0 2 0 150 0 0 398 0 2 0.0000 0.0000 0.0050 75.000 2.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0214 0.9786 2 2 0.0000 0.0230 0.9770 2 2 0.0000 0.0255 0.9745
chr11 5788576 GA G 0.500000 0.050 1 -1 3 450 97 353 47 0 2 0 48 0 0 353 0 0 0.4845 0.0000 0.0000 47.500 0.13 2.27 -2.14 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2240 0.5287 0.2473 1 1 0.2255 0.5265 0.2480 1 1 0.2274 0.5238 0.2488
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.050 1 12 2 762 132 630 0 1 22 0 109 0 0 608 0 22 0.0000 0.0000 0.0349 5.000 8.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0647 0.9353 2 2 0.0000 0.0560 0.9440 2 2 0.0000 0.0537 0.9463
chr11 6921357 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 618 160 458 82 0 0 0 78 0 0 458 0 0 0.5125 0.0000 0.0000 160.000 0.46 1.40 -0.93 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2726 0.5439 0.1835 1 1 0.2729 0.5406 0.1866 1 1 0.2731 0.5364 0.1905
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 267 130 137 56 0 16 1 57 0 0 136 1 0 0.4308 0.0000 0.0073 7.125 0.41 3.56 -3.15 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1983 0.5321 0.2696 1 1 0.2007 0.5297 0.2696 1 1 0.2038 0.5267 0.2696
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.050 1 -3 2 191 74 117 42 0 1 0 31 0 0 117 0 0 0.5676 0.0000 0.0000 73.000 0.17 3.13 -2.96 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3837 0.4870 0.1293 1 1 0.3789 0.4879 0.1332 1 1 0.3726 0.4890 0.1384
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.050 1 -12 1 324 82 242 44 0 3 0 35 0 0 238 0 4 0.5366 0.0000 0.0165 26.333 0.18 10.31 -10.13 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2995 0.5178 0.1827 1 1 0.2982 0.5164 0.1854 1 1 0.2964 0.5147 0.1889
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 739 243 496 108 0 9 0 126 0 0 493 0 3 0.4444 0.0000 0.0060 26.000 0.18 3.67 -3.50 32 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0605 0.4567 0.4828 1 2 0.0647 0.4589 0.4764 1 2 0.0705 0.4619 0.4676
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.050 1 2 4 1058 222 836 99 0 3 0 120 0 0 832 0 4 0.4459 0.0000 0.0048 73.000 0.15 2.31 -2.16 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0457 0.4130 0.5413 1 2 0.0495 0.4177 0.5328 1 2 0.0549 0.4239 0.5212
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 92 42 50 25 0 0 0 17 0 0 50 0 0 0.5952 0.0000 0.0000 42.000 0.04 2.18 -2.14 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3483 0.4938 0.1579 1 1 0.3447 0.4942 0.1611 1 1 0.3399 0.4948 0.1654
chr11 65557854 C CCAGCAG 0.500000 0.050 1 6 3 285 92 193 37 0 17 0 38 0 0 191 1 1 0.4022 0.0000 0.0104 4.688 0.95 6.21 -5.26 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2067 0.5212 0.2721 1 1 0.2087 0.5196 0.2718 1 1 0.2112 0.5176 0.2713
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 5 314 104 210 1 1 15 5 82 0 0 208 1 1 0.0096 0.0000 0.0095 6.357 0.00 4.06 -4.06 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7054 0.2946 2 2 0.0000 0.2914 0.7086 2 2 0.0000 0.1971 0.8029
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.050 1 21 2 920 169 751 6 0 33 6 124 0 0 695 0 56 0.0355 0.0000 0.0746 4.091 0.33 6.30 -5.97 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9940 0.0060 2 2 0.0000 0.3592 0.6408 2 2 0.0000 0.0974 0.9026
chr11 71565608 C CAGAGGCTGTGGCTCCGGCTGT 0.500000 0.050 1 21 2 850 153 697 35 7 20 4 87 0 0 625 2 70 0.2288 0.0000 0.1033 6.895 1.71 4.89 -3.17 27 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 1 0.0000 0.9766 0.0234 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 925 269 656 0 0 2 0 267 0 0 655 0 1 0.0000 0.0000 0.0015 133.500 2.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.050 1 -22 2 361 172 189 163 0 6 0 3 0 0 189 0 0 0.9477 0.0000 0.0000 27.667 0.20 14.67 -14.46 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3109 0.6891 0.0000 0 0 0.8825 0.1175 0.0000 0 0 0.9423 0.0577 0.0000
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 135 59 76 28 0 0 0 31 0 0 76 0 0 0.4746 0.0000 0.0000 59.000 0.04 2.90 -2.87 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2067 0.5153 0.2780 1 1 0.2085 0.5141 0.2773 1 1 0.2110 0.5127 0.2764
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 545 165 380 157 0 6 0 2 0 0 380 0 0 0.9515 0.0000 0.0000 26.500 0.23 4.00 -3.77 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6651 0.3349 0.0000 0 0 0.9266 0.0734 0.0000 0 0 0.9535 0.0465 0.0000
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.050 1 -1 3 447 33 414 13 0 0 0 20 0 0 414 0 0 0.3939 0.0000 0.0000 33.000 0.08 1.50 -1.42 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1683 0.4954 0.3363 1 1 0.1712 0.4957 0.3331 1 1 0.1751 0.4961 0.3288
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1156 327 829 0 4 77 6 240 0 0 827 1 1 0.0000 0.0000 0.0024 3.182 7.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0104 0.9896 2 2 0.0000 0.0051 0.9949 2 2 0.0000 0.0045 0.9955
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.050 1 -15 3 791 258 533 18 0 32 0 208 0 0 533 0 0 0.0698 0.0000 0.0000 7.062 0.83 10.25 -9.42 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.8458 0.1542
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.050 1 -8 2 276 98 178 56 0 3 0 39 0 0 178 0 0 0.5714 0.0000 0.0000 31.667 0.16 7.90 -7.74 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4640 0.4497 0.0864 1 0 0.4564 0.4529 0.0907 1 1 0.4463 0.4571 0.0965
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 403 139 264 121 1 13 0 4 0 0 264 0 0 0.8705 0.0000 0.0000 9.692 0.46 4.50 -4.04 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0305 0.9695 0.0000 0 0 0.5835 0.4165 0.0000 0 0 0.8081 0.1919 0.0000
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 464 144 320 65 7 22 1 49 2 0 314 1 3 0.4514 0.0063 0.0187 5.545 1.12 4.08 -2.96 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4993 0.4322 0.0684 1 0 0.4909 0.4364 0.0727 1 0 0.4797 0.4418 0.0785
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 464 149 315 106 16 19 0 8 0 2 313 0 0 0.7114 0.0000 0.0063 7.222 1.75 3.88 -2.12 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0934 0.9066 0.0000 0 0 0.5022 0.4978 0.0000
chr12 165530 G GAGTGTAAGTCTTTGACAGCC 0.014581 0.050 1 20 1 374 90 284 37 0 22 0 31 0 0 275 0 9 0.4111 0.0000 0.0317 3.091 0.22 10.97 -10.75 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4323 0.5591 0.0086 1 1 0.4355 0.5560 0.0086 1 1 0.4395 0.5520 0.0085
chr12 865142 T TC 0.282148 0.050 1 1 2 339 120 219 6 0 1 1 112 0 0 219 0 0 0.0500 0.0000 0.0000 119.000 0.50 2.25 -1.75 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.8949 0.1051 2 1 0.0000 0.6110 0.3890
chr12 865189 T TC 0.592141 0.050 1 1 1 337 143 194 7 0 0 0 136 1 0 190 0 3 0.0490 0.0052 0.0206 143.000 0.43 2.16 -1.73 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8225 0.1775 2 2 0.0000 0.3242 0.6758
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.050 1 3 1 536 130 406 8 2 25 0 95 0 0 399 0 7 0.0615 0.0000 0.0172 4.200 0.12 3.02 -2.90 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9875 0.0125 2 1 0.0000 0.8193 0.1807
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.050 1 3 1 3455 772 2683 0 0 8 2 762 0 0 2660 0 23 0.0000 0.0000 0.0086 95.500 4.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.050 1 5 1 245 100 145 53 0 7 0 40 0 0 143 0 2 0.5300 0.0000 0.0138 13.286 0.19 4.35 -4.16 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3767 0.4946 0.1287 1 1 0.3724 0.4949 0.1327 1 1 0.3666 0.4954 0.1380
chr12 10806246 G GA 0.018640 0.050 1 1 2 561 135 426 72 0 8 2 53 0 0 426 0 0 0.5333 0.0000 0.0000 15.875 0.38 1.94 -1.57 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6615 0.3362 0.0023 1 0 0.6567 0.3408 0.0024 1 0 0.6502 0.3472 0.0026
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.050 1 -3 1 288 132 156 0 0 5 4 123 0 0 153 0 3 0.0000 0.0000 0.0192 25.400 3.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0176 0.9824 2 2 0.0000 0.0187 0.9813 2 2 0.0000 0.0205 0.9795
chr12 18282464 GCCC G 0.500000 0.050 1 -3 2 452 109 343 107 0 1 0 1 0 0 343 0 0 0.9817 0.0000 0.0000 108.000 0.20 3.00 -2.80 15 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7427 0.2573 0.0000 0 0 0.8777 0.1223 0.0000 0 0 0.8996 0.1004 0.0000
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.050 1 -30 1 2282 870 1412 420 21 163 11 255 3 2 1400 1 6 0.4828 0.0021 0.0085 4.323 3.73 8.26 -4.53 136 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.050 1 30 1 1505 283 1222 73 1 138 1 70 1 1 1172 0 48 0.2580 0.0008 0.0409 1.051 4.40 5.04 -0.65 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0097 0.2192 0.7711 1 2 0.0112 0.2301 0.7586 1 2 0.0136 0.2452 0.7412
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.050 1 -21 2 980 243 737 211 2 19 1 10 0 0 737 0 0 0.8683 0.0000 0.0000 11.789 0.59 6.30 -5.71 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1293 0.8707 0.0000 0 0 0.7659 0.2341 0.0000
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.050 1 -18 2 1066 328 738 247 0 72 0 9 1 0 736 0 1 0.7530 0.0014 0.0027 3.556 0.39 9.67 -9.28 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.9182 0.0818 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr12 53938949 C CTTA 0.021360 0.050 1 3 2 293 88 205 46 0 3 0 39 0 0 200 0 5 0.5227 0.0000 0.0244 28.333 0.30 3.23 -2.93 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4875 0.5037 0.0087 1 1 0.4886 0.5026 0.0088 1 1 0.4899 0.5012 0.0089
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.050 1 -1 1 288 58 230 29 0 0 0 29 0 0 229 0 1 0.5000 0.0000 0.0043 58.000 0.38 1.48 -1.10 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3224 0.5226 0.1550 1 1 0.3239 0.5211 0.1551 1 1 0.3257 0.5191 0.1552
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.050 1 1 2 335 76 259 41 0 0 0 35 0 0 257 1 1 0.5395 0.0000 0.0077 76.000 0.17 1.11 -0.94 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3359 0.5098 0.1543 1 1 0.3350 0.5087 0.1562 1 1 0.3338 0.5074 0.1588
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.050 1 -2 1 127 70 57 0 0 3 0 67 0 0 56 0 1 0.0000 0.0000 0.0175 22.333 2.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0925 0.9075 2 2 0.0000 0.0954 0.9046 2 2 0.0000 0.0995 0.9005
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.050 1 3 2 337 92 245 2 0 1 0 89 0 0 239 0 6 0.0217 0.0000 0.0245 91.000 1.50 3.99 -2.49 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7789 0.2211 2 2 0.0000 0.3493 0.6507 2 2 0.0000 0.2407 0.7593
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.050 1 -3 1 1037 308 729 0 0 29 3 276 0 0 726 1 2 0.0000 0.0000 0.0041 9.621 3.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.050 1 -1 1 157 78 79 60 3 7 0 8 0 0 79 0 0 0.7692 0.0000 0.0000 10.143 0.12 1.00 -0.88 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0554 0.9446 0.0000 0 1 0.3681 0.6319 0.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 1 450 115 335 42 6 40 0 27 0 0 334 0 1 0.3652 0.0000 0.0030 1.875 0.26 3.15 -2.89 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5114 0.4178 0.0709 1 0 0.5019 0.4230 0.0751 1 0 0.4894 0.4298 0.0809
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 467 143 324 68 1 16 0 58 0 0 322 0 2 0.4755 0.0000 0.0062 7.938 0.25 3.16 -2.91 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3428 0.5156 0.1415 1 1 0.3403 0.5144 0.1453 1 1 0.3367 0.5129 0.1504
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 1 448 133 315 50 3 8 1 71 0 0 315 0 0 0.3759 0.0000 0.0000 15.625 0.86 3.89 -3.03 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0737 0.4407 0.4856 1 2 0.0780 0.4444 0.4777 1 2 0.0839 0.4492 0.4670
chr12 110582934 TCGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 365 152 213 114 7 26 0 5 0 0 213 0 0 0.7500 0.0000 0.0000 4.920 0.75 3.20 -2.45 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 1 0.4110 0.5890 0.0000 0 0 0.7383 0.2617 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 593 139 454 72 0 4 0 63 0 0 447 0 7 0.5180 0.0000 0.0154 33.750 0.24 9.02 -8.78 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2515 0.5420 0.2064 1 1 0.2524 0.5389 0.2087 1 1 0.2534 0.5349 0.2117
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 653 179 474 0 0 19 7 153 0 0 473 0 1 0.0000 0.0000 0.0021 8.368 4.63 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0172 0.9828 2 2 0.0000 0.0186 0.9814 2 2 0.0000 0.0207 0.9793
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 225 93 132 0 0 2 0 91 0 0 132 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 45.500 2.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0920 0.9080 2 2 0.0000 0.0959 0.9041 2 2 0.0000 0.1015 0.8985
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.050 1 -5 5 364 120 244 0 1 6 0 113 0 0 233 0 11 0.0000 0.0000 0.0451 18.833 5.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0498 0.9502 2 2 0.0000 0.0516 0.9484 2 2 0.0000 0.0546 0.9454
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.050 1 15 4 326 84 242 0 0 7 0 77 0 0 232 0 10 0.0000 0.0000 0.0413 11.000 11.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1007 0.8993 2 2 0.0000 0.1048 0.8952 2 2 0.0000 0.1105 0.8895
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.050 1 1 3 604 186 418 159 3 18 0 6 0 0 418 0 0 0.8548 0.0000 0.0000 9.765 0.25 2.00 -1.75 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 0 0.5056 0.4944 0.0000 0 0 0.8412 0.1588 0.0000
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 5 699 179 520 1 0 24 0 154 0 0 502 0 18 0.0056 0.0000 0.0346 6.458 0.00 7.76 -7.76 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0632 0.9368 2 2 0.0000 0.0273 0.9727 2 2 0.0000 0.0230 0.9770
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.050 1 3 3 253 107 146 2 0 35 2 68 0 0 144 0 2 0.0187 0.0000 0.0137 2.057 0.50 3.03 -2.53 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8102 0.1898 2 2 0.0000 0.3918 0.6082 2 2 0.0000 0.2725 0.7275
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.050 1 9 1 224 76 148 29 0 5 0 42 0 0 144 0 4 0.3816 0.0000 0.0270 14.200 0.66 8.60 -7.94 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0873 0.4436 0.4690 1 2 0.0916 0.4473 0.4611 1 1 0.0974 0.4521 0.4505
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 593 150 443 71 6 19 0 54 0 0 440 0 3 0.4733 0.0000 0.0068 6.842 0.94 2.80 -1.85 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4999 0.4326 0.0675 1 0 0.4916 0.4367 0.0717 1 0 0.4804 0.4421 0.0775
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.050 1 6 2 733 163 570 131 1 28 0 3 0 0 570 0 0 0.8037 0.0000 0.0000 4.821 0.88 6.33 -5.46 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1811 0.8189 0.0000 0 0 0.7889 0.2111 0.0000 0 0 0.8925 0.1075 0.0000
chr13 21172461 TG T 0.091820 0.050 1 -1 2 321 158 163 74 0 30 0 54 0 0 163 0 0 0.4684 0.0000 0.0000 4.267 0.19 1.06 -0.87 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6698 0.3208 0.0094 1 0 0.6636 0.3263 0.0100 1 0 0.6553 0.3338 0.0109
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.050 1 -18 4 568 163 405 85 1 6 0 71 0 0 401 0 4 0.5215 0.0000 0.0099 26.167 0.22 12.68 -12.45 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3795 0.5067 0.1138 1 1 0.3765 0.5058 0.1177 1 1 0.3723 0.5047 0.1230
chr13 71866406 T TGCCGCC 0.060439 0.050 1 6 1 727 184 543 65 1 50 1 67 1 0 537 0 5 0.3533 0.0018 0.0110 2.660 0.97 6.51 -5.54 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3525 0.6055 0.0420 1 1 0.3582 0.6002 0.0417 1 1 0.3655 0.5933 0.0412
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.050 1 6 1 646 160 486 64 0 44 0 52 0 1 483 0 2 0.4000 0.0000 0.0062 2.636 1.19 6.29 -5.10 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5501 0.4246 0.0253 1 0 0.5473 0.4264 0.0262 1 0 0.5435 0.4290 0.0275
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.050 1 4 1 122 53 69 50 0 2 0 1 0 0 69 0 0 0.9434 0.0000 0.0000 25.500 0.54 4.00 -3.46 14 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9680 0.0320 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000 0 0 0.9901 0.0099 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.050 1 3 4 722 142 580 0 1 23 2 116 0 1 572 1 6 0.0000 0.0000 0.0138 5.130 4.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0203 0.9797 2 2 0.0000 0.0181 0.9819 2 2 0.0000 0.0172 0.9828
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.050 1 -6 2 595 138 457 75 0 16 0 47 0 0 453 2 2 0.5435 0.0000 0.0088 7.625 1.85 6.98 -5.13 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5537 0.3946 0.0517 1 0 0.5436 0.4008 0.0556 1 0 0.5299 0.4090 0.0611
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.050 1 6 1 264 92 172 50 2 6 2 32 0 0 172 0 0 0.5435 0.0000 0.0000 14.333 0.78 5.66 -4.88 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4803 0.4385 0.0812 1 0 0.4721 0.4425 0.0854 1 0 0.4611 0.4476 0.0913
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.050 1 -15 1 221 71 150 2 0 5 0 64 0 0 150 0 0 0.0282 0.0000 0.0000 13.200 4.50 8.44 -3.94 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8395 0.1605 2 2 0.0000 0.4396 0.5604 2 2 0.0000 0.3120 0.6880
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 1 593 156 437 0 0 5 0 151 0 0 434 0 3 0.0000 0.0000 0.0069 30.200 3.48 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0203 0.9797 2 2 0.0000 0.0219 0.9781 2 2 0.0000 0.0243 0.9757
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.050 1 1 2 1678 413 1265 81 0 10 0 322 0 0 1265 0 0 0.1961 0.0000 0.0000 40.300 0.11 1.91 -1.80 39 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.050 1 -1 4 874 244 630 105 0 27 1 111 0 1 629 0 0 0.4303 0.0000 0.0016 8.037 0.19 2.01 -1.82 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1759 0.5624 0.2616 1 1 0.1801 0.5580 0.2619 1 1 0.1856 0.5524 0.2620
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.050 1 -19 1 441 108 333 72 1 5 0 30 0 0 326 0 7 0.6667 0.0000 0.0210 20.600 0.25 20.03 -19.78 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7363 0.2480 0.0156 1 0 0.7239 0.2585 0.0176 1 0 0.7067 0.2727 0.0206
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.050 1 1 1 350 77 273 1 1 5 1 69 0 0 272 0 1 0.0130 0.0000 0.0037 18.000 0.00 1.19 -1.19 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6011 0.3989 2 2 0.0000 0.2124 0.7876 2 2 0.0000 0.1380 0.8620
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.050 1 -6 1 696 156 540 136 0 14 0 6 0 0 540 0 0 0.8718 0.0000 0.0000 10.143 0.50 6.00 -5.50 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 0 0.6761 0.3239 0.0000 0 0 0.9183 0.0817 0.0000
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.050 1 2 3 1106 270 836 133 0 9 0 128 0 0 832 0 4 0.4926 0.0000 0.0048 29.000 0.31 3.28 -2.97 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3393 0.5733 0.0874 1 1 0.3436 0.5676 0.0888 1 1 0.3490 0.5604 0.0906
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.050 1 3 3 538 136 402 60 0 18 0 58 0 0 401 0 1 0.4412 0.0000 0.0025 6.556 0.18 3.00 -2.82 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3499 0.5305 0.1197 1 1 0.3514 0.5280 0.1206 1 1 0.3533 0.5248 0.1219
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.050 1 3 1 529 151 378 2 8 21 1 119 0 0 372 0 6 0.0132 0.0000 0.0159 5.810 0.00 2.92 -2.92 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7146 0.2854 2 2 0.0000 0.2535 0.7465 2 2 0.0000 0.1510 0.8490
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.050 1 6 1 425 93 332 81 1 5 0 6 0 1 331 0 0 0.8710 0.0000 0.0030 17.600 0.23 5.00 -4.77 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2666 0.7334 0.0000 0 0 0.6701 0.3299 0.0000
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.050 1 -3 1 605 190 415 159 3 17 3 8 0 0 415 0 0 0.8368 0.0000 0.0000 10.118 0.16 3.38 -3.21 97 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3599 0.6401 0.0000 0 0 0.9263 0.0737 0.0000
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.050 1 -1 1 731 219 512 99 8 36 2 74 0 0 512 0 0 0.4521 0.0000 0.0000 9.100 0.38 4.00 -3.62 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4632 0.4682 0.0686 1 1 0.4530 0.4729 0.0741 1 1 0.4393 0.4790 0.0817
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.050 1 -2 1 728 216 512 100 1 24 18 73 0 0 512 0 0 0.4630 0.0000 0.0000 7.955 0.41 4.04 -3.63 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3115 0.5498 0.1387 1 1 0.3071 0.5482 0.1447 1 1 0.3011 0.5461 0.1529
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.050 1 -3 1 343 52 291 0 0 6 2 44 0 0 291 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.667 3.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3428 0.6572 2 2 0.0000 0.3480 0.6520 2 2 0.0000 0.3552 0.6448
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.050 1 -1 1 291 67 224 33 0 2 0 32 0 0 224 0 0 0.4925 0.0000 0.0000 32.500 0.36 1.19 -0.82 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4557 0.5086 0.0358 1 1 0.4565 0.5075 0.0360 1 1 0.4576 0.5062 0.0362
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.050 1 3 1 388 148 240 56 1 25 2 64 0 0 239 0 1 0.3784 0.0000 0.0042 5.125 0.38 3.53 -3.16 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2193 0.5663 0.2144 1 1 0.2248 0.5634 0.2118 1 1 0.2321 0.5596 0.2083
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.050 1 6 1 388 148 240 57 3 78 4 6 0 0 239 0 1 0.3851 0.0000 0.0042 0.844 0.42 5.67 -5.25 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0223 0.9777 0.0000 0 1 0.2014 0.7986 0.0000
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.050 1 6 1 719 139 580 0 0 26 1 112 0 0 570 0 10 0.0000 0.0000 0.0172 4.346 7.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr14 59505305 TTTC T 0.011152 0.050 1 -3 1 66 27 39 11 0 1 0 15 0 0 39 0 0 0.4074 0.0000 0.0000 26.000 0.36 2.53 -2.17 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4369 0.5558 0.0073 1 1 0.4394 0.5534 0.0072 1 1 0.4426 0.5502 0.0072
chr14 69573086 CGCG C 0.132029 0.050 1 -3 2 650 147 503 0 3 37 103 4 0 1 500 2 0 0.0000 0.0000 0.0060 2.919 3.75 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6509 0.3491 2 1 0.0000 0.5412 0.4588 2 2 0.0000 0.4867 0.5133
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.050 1 -6 2 654 149 505 0 0 37 3 109 0 0 502 1 2 0.0000 0.0000 0.0059 3.000 6.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0127 0.9873 2 2 0.0000 0.0134 0.9866 2 2 0.0000 0.0145 0.9855
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.050 1 -6 1 508 113 395 1 0 20 4 88 0 0 387 0 8 0.0088 0.0000 0.0203 4.550 1.00 6.35 -5.35 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3867 0.6133 2 2 0.0000 0.2036 0.7964 2 2 0.0000 0.1694 0.8306
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.050 1 -3 2 518 179 339 83 0 24 1 71 0 0 339 0 0 0.4637 0.0000 0.0000 6.458 0.22 3.31 -3.09 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2781 0.5506 0.1712 1 1 0.2752 0.5482 0.1766 1 1 0.2711 0.5452 0.1837
chr14 94769867 G GCGC 0.027535 0.050 1 3 2 324 89 235 37 1 8 0 43 0 0 234 0 1 0.4157 0.0000 0.0043 10.125 0.65 3.70 -3.05 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3875 0.5926 0.0199 1 1 0.3920 0.5883 0.0196 1 1 0.3980 0.5827 0.0193
chr14 103127080 T TGGC 0.001756 0.050 1 3 1 421 132 289 103 3 19 2 5 0 0 289 0 0 0.7803 0.0000 0.0000 5.895 0.51 2.40 -1.89 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3536 0.6464 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.050 1 -9 1 272 71 201 0 0 8 0 63 0 0 197 0 4 0.0000 0.0000 0.0199 7.875 8.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1936 0.8064 2 2 0.0000 0.1989 0.8011 2 2 0.0000 0.2064 0.7936
chr14 105168369 C CCAG 0.035095 0.050 1 3 1 310 84 226 72 2 8 1 1 2 2 222 0 0 0.8571 0.0088 0.0177 10.714 1.83 5.00 -3.17 40 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9688 0.0312 0.0000 0 0 0.9877 0.0123 0.0000 0 0 0.9906 0.0094 0.0000
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.050 1 -3 2 445 143 302 58 1 12 0 72 0 0 301 0 1 0.4056 0.0000 0.0033 10.917 0.41 3.42 -3.00 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1750 0.5645 0.2605 1 1 0.1813 0.5627 0.2560 1 1 0.1899 0.5603 0.2498
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.050 1 -3 1 325 85 240 72 3 6 1 3 0 0 240 0 0 0.8471 0.0000 0.0000 13.167 1.67 3.67 -2.00 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0372 0.9628 0.0000 0 0 0.6135 0.3865 0.0000 0 0 0.8295 0.1705 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.050 1 3 1 771 136 635 0 0 5 1 130 0 3 584 32 16 0.0000 0.0000 0.0803 26.200 5.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.050 1 -1 2 1725 418 1307 0 0 8 1 409 0 0 1245 16 46 0.0000 0.0000 0.0474 51.250 3.42 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441081 G GTCTCCTCCTCTTCCCGCATCT 0.154509 0.050 1 21 1 1616 278 1338 99 7 55 2 115 2 4 1327 3 2 0.3561 0.0015 0.0082 3.982 2.01 7.97 -5.96 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2392 0.6353 0.1255 1 1 0.2468 0.6288 0.1244 1 1 0.2569 0.6204 0.1227
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.050 1 -2 2 293 89 204 39 0 2 0 48 0 0 203 0 1 0.4382 0.0000 0.0049 43.500 0.08 2.04 -1.96 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1808 0.5279 0.2913 1 1 0.1854 0.5269 0.2877 1 1 0.1916 0.5257 0.2827
chr15 30610931 AAG A 0.000368 0.050 1 -2 2 395 81 314 40 1 5 1 34 0 1 312 0 1 0.4938 0.0000 0.0064 15.200 0.40 2.47 -2.07 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5497 0.4501 0.0001 1 0 0.5487 0.4512 0.0001 1 0 0.5472 0.4527 0.0001
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.050 1 -1 2 201 81 120 1 0 4 52 24 0 0 116 4 0 0.0123 0.0000 0.0333 6.250 1.00 1.42 -0.42 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.6279 0.3721 2 2 0.0000 0.4085 0.5915 2 2 0.0000 0.3525 0.6475
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.050 1 -2 2 201 83 118 1 1 28 0 53 0 0 116 0 2 0.0120 0.0000 0.0169 2.115 1.00 1.98 -0.98 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5131 0.4869 2 2 0.0000 0.2705 0.7295 2 2 0.0000 0.2083 0.7917
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.050 1 -3 1 719 175 544 71 1 35 1 67 1 0 540 0 3 0.4057 0.0018 0.0074 4.000 0.85 3.58 -2.74 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1578 0.5503 0.2919 1 1 0.1584 0.5468 0.2948 1 1 0.1591 0.5424 0.2985
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.050 1 -2 1 414 140 274 62 0 6 0 72 0 0 273 0 1 0.4429 0.0000 0.0036 22.333 1.98 2.07 -0.09 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1812 0.5513 0.2675 1 1 0.1866 0.5491 0.2642 1 1 0.1939 0.5463 0.2598
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.050 1 5 1 484 129 355 70 2 8 0 49 0 0 352 0 3 0.5426 0.0000 0.0085 15.125 0.21 4.63 -4.42 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5691 0.3863 0.0446 1 0 0.5613 0.3912 0.0474 1 0 0.5508 0.3978 0.0514
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.050 1 -3 2 158 67 91 33 0 3 0 31 0 0 91 0 0 0.4925 0.0000 0.0000 21.333 0.18 3.32 -3.14 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2786 0.5169 0.2044 1 1 0.2785 0.5156 0.2059 1 1 0.2782 0.5139 0.2078
chr15 74072270 GCCT G 0.012706 0.050 1 -3 1 537 195 342 162 0 11 0 22 0 0 340 0 2 0.8308 0.0000 0.0058 16.727 0.91 3.45 -2.55 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3360 0.6640 0.0000
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.050 1 -3 1 288 156 132 147 1 1 0 7 0 0 132 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 155.000 0.37 3.29 -2.92 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2002 0.7998 0.0000 0 0 0.6425 0.3575 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.050 1 -3 1 509 120 389 44 1 11 2 62 0 0 387 0 2 0.3667 0.0000 0.0051 9.909 1.66 3.24 -1.58 24 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0492 0.3875 0.5633 1 2 0.0525 0.3930 0.5546 1 2 0.0571 0.4002 0.5427
chr15 82344656 T TCCTCTCCAGCTCCCGCAG 0.012568 0.050 1 18 1 1245 381 864 298 1 78 0 4 0 0 864 0 0 0.7822 0.0000 0.0000 3.885 0.62 5.25 -4.63 180 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 83008518 C CA 0.185307 0.050 1 1 1 134 32 102 15 4 5 1 7 0 0 100 0 2 0.4688 0.0000 0.0196 4.600 0.87 1.14 -0.28 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5153 0.4332 0.0515 1 0 0.5115 0.4358 0.0527 1 0 0.5063 0.4393 0.0544
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.050 1 3 3 364 127 237 67 0 1 0 59 0 0 237 0 0 0.5276 0.0000 0.0000 126.000 0.76 3.64 -2.88 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4394 0.4817 0.0789 1 1 0.4376 0.4815 0.0810 1 1 0.4350 0.4812 0.0838
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.050 1 -24 2 873 225 648 27 21 145 8 24 0 2 644 0 2 0.1200 0.0000 0.0062 1.312 1.48 4.54 -3.06 13 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0639 0.4122 0.5240 1 2 0.0685 0.4189 0.5126 1 2 0.0751 0.4275 0.4974
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.050 1 -12 2 865 210 655 1 0 11 0 198 0 1 652 1 1 0.0048 0.0000 0.0046 19.900 2.00 7.58 -5.58 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0177 0.9823 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0061 0.9939
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.050 1 -6 1 348 95 253 0 0 11 0 84 0 0 245 0 8 0.0000 0.0000 0.0316 7.636 7.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.050 1 1 1 348 136 212 125 1 7 0 3 0 0 212 0 0 0.9191 0.0000 0.0000 18.429 0.38 2.00 -1.62 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1439 0.8561 0.0000 0 0 0.7365 0.2635 0.0000 0 0 0.8614 0.1386 0.0000
chr15 99105358 G GGCCGAGGGGCAGGCCCGCTGC 0.000069 0.050 1 21 3 402 82 320 40 0 20 0 22 0 0 308 0 12 0.4878 0.0000 0.0375 3.100 0.80 13.64 -12.84 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5513 0.4486 0.0000 1 0 0.5502 0.4498 0.0000 1 0 0.5486 0.4514 0.0000
chr15 99712504 C CCAGCAG 0.003114 0.050 1 6 2 580 187 393 66 2 63 0 56 1 0 384 0 8 0.3529 0.0025 0.0229 2.000 0.47 5.30 -4.83 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5124 0.4866 0.0010 1 0 0.5134 0.4856 0.0011 1 0 0.5144 0.4845 0.0011
chr16 286700 ACT A 0.005436 0.050 1 -2 1 534 118 416 57 1 2 0 58 0 0 416 0 0 0.4831 0.0000 0.0000 58.000 0.30 2.84 -2.55 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4602 0.5372 0.0026 1 1 0.4630 0.5345 0.0026 1 1 0.4664 0.5310 0.0026
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.050 1 2 2 335 101 234 45 0 0 1 55 0 0 234 0 0 0.4455 0.0000 0.0000 101.000 0.22 2.93 -2.71 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1924 0.5463 0.2613 1 1 0.1978 0.5447 0.2576 1 1 0.2049 0.5426 0.2525
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.050 1 -1 1 1018 263 755 125 1 3 0 134 1 0 751 1 2 0.4753 0.0013 0.0053 86.667 1.51 1.46 0.06 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2184 0.6254 0.1562 1 1 0.2257 0.6189 0.1554 1 1 0.2353 0.6105 0.1542
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 504 115 389 0 0 1 0 114 0 0 388 0 1 0.0000 0.0000 0.0026 114.000 6.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 504 115 389 0 0 1 0 114 0 0 388 0 1 0.0000 0.0000 0.0026 114.000 6.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2087923 TCCCTGCAGTGCAGGAAAGGTAGGGCCGGGTGGGG T 0.002312 0.050 1 -34 1 561 103 458 49 0 25 0 29 0 0 438 0 20 0.4757 0.0000 0.0437 3.120 0.35 24.93 -24.58 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4690 0.5299 0.0011 1 1 0.4713 0.5276 0.0011 1 1 0.4741 0.5248 0.0011
chr16 2798498 GGGCGCTGCTGCT G 0.076345 0.050 1 -12 4 475 182 293 168 1 10 0 3 0 0 293 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 17.200 0.67 8.67 -8.00 94 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8639 0.1361 0.0000 0 0 0.9906 0.0094 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000
chr16 5090457 CGAT C 0.000032 0.050 1 -3 1 552 133 419 128 0 3 0 2 0 0 419 0 0 0.9624 0.0000 0.0000 43.333 0.33 3.00 -2.67 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.050 1 -3 1 400 111 289 5 0 2 0 104 0 0 285 0 4 0.0450 0.0000 0.0138 54.500 0.20 3.26 -3.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9932 0.0068 2 1 0.0000 0.5537 0.4463 2 2 0.0000 0.2332 0.7668
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.050 1 -2 1 202 53 149 0 0 0 2 51 0 0 149 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 53.000 2.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr16 15873504 T TCTA 0.057892 0.050 1 3 2 115 46 69 42 1 1 0 2 0 0 69 0 0 0.9130 0.0000 0.0000 45.000 0.05 3.00 -2.95 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6473 0.3527 0.0000 0 0 0.9251 0.0749 0.0000 0 0 0.9559 0.0441 0.0000
chr16 24572391 TAAAGAG T 0.075097 0.050 1 -6 1 509 104 405 51 1 6 0 46 0 0 405 0 0 0.4904 0.0000 0.0000 16.333 0.53 5.59 -5.06 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5126 0.4644 0.0230 1 0 0.5118 0.4648 0.0235 1 0 0.5105 0.4653 0.0242
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.050 1 3 1 582 150 432 0 0 9 0 141 0 0 429 0 3 0.0000 0.0000 0.0069 15.667 3.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0382 0.9618 2 2 0.0000 0.0410 0.9590 2 2 0.0000 0.0450 0.9550
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 130 69 61 1 0 5 1 62 0 0 61 0 0 0.0145 0.0000 0.0000 12.800 1.00 1.94 -0.94 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5050 0.4950 2 2 0.0000 0.2916 0.7084 2 2 0.0000 0.2428 0.7572
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.050 1 -1 1 476 101 375 37 9 20 3 32 0 0 374 0 1 0.3663 0.0000 0.0027 3.850 0.86 1.91 -1.04 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3506 0.5014 0.1480 1 1 0.3473 0.5012 0.1515 1 1 0.3427 0.5011 0.1562
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.050 1 -6 2 287 119 168 53 1 20 0 45 0 0 168 0 0 0.4454 0.0000 0.0000 4.950 3.85 5.49 -1.64 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3500 0.5063 0.1438 1 1 0.3468 0.5058 0.1474 1 1 0.3425 0.5051 0.1523
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 129 71 58 69 0 0 0 2 0 0 58 0 0 0.9718 0.0000 0.0000 71.000 0.42 4.00 -3.58 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1782 0.8218 0.0000 0 0 0.5905 0.4095 0.0000 0 0 0.7132 0.2868 0.0000
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.050 1 -3 2 628 144 484 9 71 15 1 48 0 0 483 0 1 0.0625 0.0000 0.0021 8.533 2.22 3.29 -1.07 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5837 0.3723 0.0440 1 0 0.5727 0.3796 0.0477 1 0 0.5578 0.3892 0.0530
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.050 1 -2 2 264 122 142 115 0 2 0 5 0 0 140 0 2 0.9426 0.0000 0.0141 60.000 0.70 4.60 -3.90 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1378 0.8622 0.0000 0 0 0.5392 0.4608 0.0000
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.050 1 6 1 428 117 311 40 0 29 0 48 0 0 309 0 2 0.3419 0.0000 0.0064 3.034 0.53 5.54 -5.02 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1361 0.4981 0.3658 1 1 0.1399 0.4982 0.3619 1 1 0.1450 0.4983 0.3568
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.050 1 -2 1 682 148 534 0 1 4 9 134 0 0 523 2 9 0.0000 0.0000 0.0206 35.500 7.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0273 0.9727 2 2 0.0000 0.0278 0.9722 2 2 0.0000 0.0293 0.9707
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 681 140 541 0 0 8 10 122 0 0 532 1 8 0.0000 0.0000 0.0166 16.250 7.75 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0272 0.9728 2 2 0.0000 0.0291 0.9709 2 2 0.0000 0.0321 0.9679
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 681 140 541 0 0 4 4 132 0 3 523 6 9 0.0000 0.0000 0.0333 136.000 7.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3130 0.6870 2 2 0.0000 0.0988 0.9012 2 2 0.0000 0.0622 0.9378
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.050 1 -6 1 746 157 589 0 1 8 0 148 0 0 585 0 4 0.0000 0.0000 0.0068 18.500 6.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0250 0.9750 2 2 0.0000 0.0263 0.9737 2 2 0.0000 0.0285 0.9715
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 532 126 406 1 0 3 1 121 0 0 406 0 0 0.0079 0.0000 0.0000 41.000 0.00 4.55 -4.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1919 0.8081 2 2 0.0000 0.0878 0.9122 2 2 0.0000 0.0722 0.9278
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.050 1 4 2 154 66 88 2 0 1 0 63 0 0 87 0 1 0.0303 0.0000 0.0114 65.000 1.00 4.00 -3.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8394 0.1606 2 2 0.0000 0.4396 0.5604 2 2 0.0000 0.3120 0.6880
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.050 1 -1 2 382 137 245 53 1 4 0 79 0 0 245 0 0 0.3869 0.0000 0.0000 33.000 0.15 1.32 -1.17 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0251 0.3231 0.6518 1 2 0.0272 0.3302 0.6426 1 2 0.0303 0.3396 0.6301
chr17 4544627 AC A 0.000003 0.050 1 -1 1 787 207 580 110 0 3 0 94 0 0 579 0 1 0.5314 0.0000 0.0017 68.000 0.18 1.33 -1.15 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6213 0.3787 0.0000 1 0 0.6190 0.3810 0.0000 1 0 0.6157 0.3843 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.050 1 3 1 678 200 478 11 1 45 2 141 0 1 469 1 7 0.0550 0.0000 0.0188 3.444 0.09 3.06 -2.97 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9868 0.0132 2 1 0.0000 0.6452 0.3548
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.050 1 9 2 1275 351 924 5 11 99 16 220 0 1 885 4 34 0.0142 0.0000 0.0422 2.535 4.60 6.40 -1.80 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9974 0.0026 2 1 0.0000 0.8594 0.1406
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 504 214 290 0 0 33 12 169 0 0 283 2 5 0.0000 0.0000 0.0241 5.485 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0094 0.9906 2 2 0.0000 0.0107 0.9893
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 926 254 672 135 2 18 18 81 0 0 672 0 0 0.5315 0.0000 0.0000 13.118 0.56 4.12 -3.56 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7422 0.2461 0.0117 1 0 0.7298 0.2567 0.0135 1 0 0.7126 0.2712 0.0162
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 926 255 671 131 15 28 9 72 0 0 671 0 0 0.5137 0.0000 0.0000 11.895 0.63 3.85 -3.21 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8870 0.1110 0.0020 1 0 0.8767 0.1208 0.0025 1 0 0.8617 0.1350 0.0034
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.050 1 3 1 808 171 637 3 1 7 0 160 0 0 634 0 3 0.0175 0.0000 0.0047 23.286 0.33 4.09 -3.76 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7245 0.2755 2 2 0.0000 0.1335 0.8665 2 2 0.0000 0.0646 0.9354
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.050 1 18 3 273 75 198 0 0 18 2 55 0 0 189 0 9 0.0000 0.0000 0.0455 3.167 9.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1597 0.8403 2 2 0.0000 0.1642 0.8358 2 2 0.0000 0.1706 0.8294
chr17 30834937 ACAATGT A 0.500000 0.050 1 -6 1 805 165 640 83 0 6 1 75 0 0 635 2 3 0.5030 0.0000 0.0078 26.500 0.22 6.28 -6.06 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2482 0.5487 0.2031 1 1 0.2493 0.5450 0.2057 1 1 0.2507 0.5404 0.2089
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 108 58 50 0 0 2 0 56 0 0 49 0 1 0.0000 0.0000 0.0200 28.000 1.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1924 0.8076 2 2 0.0000 0.1969 0.8031 2 2 0.0000 0.2032 0.7968
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.050 1 -12 1 902 221 681 169 2 37 3 10 3 2 675 0 1 0.7647 0.0044 0.0088 5.353 2.45 11.00 -8.55 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0238 0.9762 0.0000 0 1 0.4180 0.5820 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 433 127 306 0 0 7 1 119 0 0 304 0 2 0.0000 0.0000 0.0065 20.000 1.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0440 0.9560 2 2 0.0000 0.0466 0.9534 2 2 0.0000 0.0505 0.9495
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.050 1 15 1 550 124 426 0 1 19 2 102 0 0 408 0 18 0.0000 0.0000 0.0423 5.474 7.95 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0524 0.9476 2 2 0.0000 0.0542 0.9458 2 2 0.0000 0.0573 0.9427
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.050 1 3 5 1644 326 1318 163 0 1 0 162 0 0 1317 0 1 0.5000 0.0000 0.0008 325.000 0.37 3.32 -2.95 59 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2009 0.5983 0.2009 1 1 0.2045 0.5910 0.2045 1 1 0.2091 0.5819 0.2091
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 620 177 443 146 1 19 2 9 0 0 443 0 0 0.8249 0.0000 0.0000 8.316 0.81 3.67 -2.86 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0244 0.9756 0.0000 0 1 0.3640 0.6360 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 232 78 154 2 0 5 0 71 0 0 152 0 2 0.0256 0.0000 0.0130 14.600 0.50 4.62 -4.12 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8066 0.1934 2 2 0.0000 0.3859 0.6141 2 2 0.0000 0.2677 0.7323
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.050 1 3 5 908 233 675 107 0 10 2 114 0 0 671 0 4 0.4592 0.0000 0.0059 22.300 0.21 3.10 -2.89 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1043 0.5214 0.3744 1 1 0.1088 0.5195 0.3717 1 1 0.1148 0.5173 0.3679
chr17 58309246 G GTCCTCCTCT 0.500000 0.050 1 9 1 614 180 434 60 1 24 1 94 0 0 434 0 0 0.3333 0.0000 0.0000 6.458 0.27 7.13 -6.86 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0237 0.3051 0.6711 1 2 0.0265 0.3148 0.6587 1 2 0.0305 0.3278 0.6416
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.050 1 6 2 394 129 265 48 0 25 0 56 0 0 264 0 1 0.3721 0.0000 0.0038 4.333 0.48 5.77 -5.29 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1476 0.5107 0.3417 1 1 0.1512 0.5099 0.3389 1 1 0.1560 0.5088 0.3352
chr17 61412509 AGGCCTCG A 0.500000 0.050 1 -7 3 537 134 403 68 0 3 0 63 1 0 398 0 4 0.5075 0.0025 0.0124 43.667 1.28 7.22 -5.94 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2525 0.5402 0.2072 1 1 0.2533 0.5372 0.2095 1 1 0.2542 0.5334 0.2124
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.050 1 9 1 348 134 214 114 0 17 0 3 0 0 214 0 0 0.8507 0.0000 0.0000 6.882 0.43 3.67 -3.24 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1162 0.8838 0.0000 0 0 0.6916 0.3084 0.0000 0 0 0.8345 0.1655 0.0000
chr17 69149049 TGA T 0.500000 0.050 1 -2 2 173 68 105 38 0 2 0 28 0 0 103 0 2 0.5588 0.0000 0.0190 33.000 0.08 2.82 -2.74 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3429 0.5017 0.1554 1 1 0.3397 0.5015 0.1588 1 1 0.3354 0.5013 0.1632
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.050 1 -4 3 222 63 159 29 1 3 0 30 0 0 158 0 1 0.4603 0.0000 0.0063 20.000 0.28 3.90 -3.62 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2287 0.5183 0.2530 1 1 0.2298 0.5169 0.2533 1 1 0.2312 0.5152 0.2536
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.050 1 9 2 577 117 460 5 0 10 0 102 0 0 443 0 17 0.0427 0.0000 0.0370 10.700 0.00 7.72 -7.72 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9943 0.0057 2 1 0.0000 0.5998 0.4002 2 2 0.0000 0.2700 0.7300
chr17 75516562 T TGGAGCC 0.500000 0.050 1 6 1 481 105 376 51 0 3 0 51 0 0 369 2 5 0.4857 0.0000 0.0186 34.000 1.63 6.00 -4.37 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1623 0.5192 0.3185 1 1 0.1656 0.5178 0.3167 1 1 0.1700 0.5159 0.3141
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 1336 319 1017 290 4 11 1 13 1 0 1016 0 0 0.9091 0.0010 0.0010 27.727 0.52 2.08 -1.56 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1800 0.8200 0.0000 0 0 0.8935 0.1065 0.0000
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 1608 413 1195 359 4 46 0 4 0 0 1194 0 1 0.8692 0.0000 0.0008 7.978 0.83 15.50 -14.67 49 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7254 0.2746 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.050 1 -27 1 1678 423 1255 412 1 6 1 3 2 0 1246 1 6 0.9740 0.0016 0.0072 69.500 1.10 29.67 -28.57 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 0 0.9645 0.0355 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.050 1 -6 7 297 112 185 53 1 10 0 48 0 0 185 0 0 0.4732 0.0000 0.0000 10.200 0.32 5.88 -5.55 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3089 0.5203 0.1708 1 1 0.3074 0.5188 0.1738 1 1 0.3053 0.5168 0.1779
chr17 79834441 C CGTG 0.500000 0.050 1 3 2 1571 403 1168 323 18 57 0 5 1 1 1166 0 0 0.8015 0.0009 0.0017 6.070 0.50 4.40 -3.90 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6164 0.3836 0.0000 0 0 0.9941 0.0059 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.050 1 -3 2 589 152 437 145 0 4 0 3 0 0 437 0 0 0.9539 0.0000 0.0000 37.000 0.20 3.00 -2.80 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2230 0.7770 0.0000 0 0 0.8281 0.1719 0.0000 0 0 0.9138 0.0862 0.0000
chr17 81647906 T TTAAC 0.500000 0.050 1 4 3 499 107 392 48 0 5 0 54 0 0 388 0 4 0.4486 0.0000 0.0102 20.400 1.17 4.02 -2.85 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1348 0.5030 0.3622 1 1 0.1386 0.5027 0.3587 1 1 0.1438 0.5023 0.3539
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.050 1 -1 7 304 67 237 44 0 1 3 19 0 0 237 0 0 0.6567 0.0000 0.0000 65.000 0.14 1.21 -1.07 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6040 0.3539 0.0421 1 0 0.5939 0.3610 0.0451 1 0 0.5803 0.3704 0.0493
chr18 11886989 AT A 0.001596 0.050 1 -1 2 397 134 263 130 0 0 0 4 0 0 263 0 0 0.9701 0.0000 0.0000 134.000 0.54 3.00 -2.46 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9622 0.0378 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.050 1 3 1 226 92 134 0 0 2 0 90 0 0 131 0 3 0.0000 0.0000 0.0224 45.000 3.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.050 1 4 1 176 67 109 0 0 0 0 67 0 0 109 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 67.000 4.75 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1330 0.8670 2 2 0.0000 0.1369 0.8631 2 2 0.0000 0.1425 0.8575
chr18 50261197 T TAAA 0.500000 0.050 1 3 1 167 58 109 54 0 2 0 2 1 0 108 0 0 0.9310 0.0092 0.0092 28.000 1.48 1.50 -0.02 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1323 0.8677 0.0000 0 0 0.5052 0.4948 0.0000 0 0 0.6400 0.3600 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 272 144 128 62 1 4 1 76 0 0 127 0 1 0.4306 0.0000 0.0078 35.000 0.18 3.58 -3.40 8 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0967 0.4803 0.4229 1 1 0.1011 0.4815 0.4175 1 1 0.1070 0.4830 0.4100
chr18 58536020 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 5 642 167 475 81 0 5 1 80 0 0 473 0 2 0.4850 0.0000 0.0042 32.400 0.65 3.25 -2.60 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2034 0.5487 0.2479 1 1 0.2059 0.5451 0.2490 1 1 0.2092 0.5405 0.2504
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.050 1 -15 2 780 186 594 98 0 6 2 80 0 0 580 0 14 0.5269 0.0000 0.0236 30.000 0.19 12.74 -12.54 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2431 0.5577 0.1991 1 1 0.2446 0.5534 0.2019 1 1 0.2465 0.5480 0.2055
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 6 375 69 306 4 2 5 10 48 0 0 302 2 2 0.0580 0.0000 0.0131 12.800 1.50 5.06 -3.56 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.8901 0.1099 2 1 0.0000 0.6406 0.3594
chr18 62523553 C CCCGCCG 0.500000 0.050 1 6 6 375 69 306 5 2 30 0 32 1 2 301 0 2 0.0725 0.0033 0.0163 1.444 3.20 7.22 -4.02 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0461 0.3783 0.5756 1 1 0.0279 0.6514 0.3208 2 1 0.0046 0.8677 0.1278
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 143 69 74 0 0 6 0 63 0 0 72 0 2 0.0000 0.0000 0.0270 10.500 3.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1631 0.8369 2 2 0.0000 0.1676 0.8324 2 2 0.0000 0.1739 0.8261
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.050 1 3 1 126 65 61 3 0 0 1 61 0 0 57 0 4 0.0462 0.0000 0.0656 65.000 0.00 2.87 -2.87 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9621 0.0379 2 1 0.0000 0.5930 0.4070 2 2 0.0000 0.3854 0.6146
chr18 76496529 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 307 86 221 76 2 5 0 3 7 1 210 3 0 0.8837 0.0317 0.0498 15.800 0.67 0.67 0.00 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0343 0.9657 0.0000 0 1 0.3973 0.6027 0.0000 0 0 0.6291 0.3709 0.0000
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 4 434 150 284 67 1 11 0 71 0 0 283 0 1 0.4467 0.0000 0.0035 12.636 0.54 3.77 -3.24 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1859 0.5378 0.2762 1 1 0.1888 0.5350 0.2762 1 1 0.1925 0.5314 0.2761
chr19 110747 G GT 0.005188 0.050 1 1 2 834 344 490 318 8 11 0 7 0 0 490 0 0 0.9244 0.0000 0.0000 30.182 0.32 1.43 -1.11 76 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9013 0.0987 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.050 1 24 3 565 280 285 23 0 22 7 228 0 0 284 0 1 0.0821 0.0000 0.0035 13.526 4.13 5.25 -1.12 11 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9843 0.0157
chr19 1009186 GAGC G 0.092678 0.050 1 -3 2 536 126 410 103 2 13 1 7 0 0 410 0 0 0.8175 0.0000 0.0000 9.417 0.39 3.43 -3.04 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.3919 0.6081 0.0000 0 0 0.8635 0.1365 0.0000
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.050 1 -3 4 318 106 212 0 0 19 7 80 0 0 210 1 1 0.0000 0.0000 0.0094 4.579 4.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1072 0.8928 2 2 0.0000 0.1116 0.8884 2 2 0.0000 0.1179 0.8821
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.050 1 -3 1 408 125 283 63 0 1 0 61 0 0 281 0 2 0.5040 0.0000 0.0071 124.000 0.41 3.10 -2.69 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4068 0.5384 0.0547 1 1 0.4094 0.5355 0.0551 1 1 0.4126 0.5319 0.0555
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.050 1 -12 2 632 181 451 87 1 12 0 81 0 0 447 0 4 0.4807 0.0000 0.0089 14.083 1.59 10.77 -9.18 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3553 0.5354 0.1093 1 1 0.3568 0.5321 0.1111 1 1 0.3586 0.5281 0.1133
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.050 1 5 3 280 80 200 43 0 7 0 30 0 0 199 0 1 0.5375 0.0000 0.0050 10.429 0.67 5.47 -4.79 23 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4920 0.4374 0.0706 1 0 0.4870 0.4399 0.0731 1 0 0.4802 0.4432 0.0766
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.050 1 -3 1 808 279 529 0 0 44 23 212 0 0 521 3 5 0.0000 0.0000 0.0151 5.341 3.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0049 0.9951 2 2 0.0000 0.0058 0.9942
chr19 11447525 AGAGGAG A 0.089394 0.050 1 -6 1 808 286 522 9 3 247 2 25 0 0 519 0 3 0.0315 0.0000 0.0057 0.160 1.78 6.52 -4.74 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3420 0.5847 0.0733 1 1 0.3466 0.5813 0.0721 1 1 0.3526 0.5769 0.0705
chr19 12954279 CCTT C 0.000671 0.050 1 -3 1 385 108 277 57 43 4 0 4 0 0 277 0 0 0.5278 0.0000 0.0000 34.667 0.63 2.25 -1.62 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9608 0.0392 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.050 1 -6 1 391 122 269 4 0 19 1 98 0 0 264 0 5 0.0328 0.0000 0.0186 5.421 0.00 6.16 -6.16 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9912 0.0088 2 1 0.0000 0.7144 0.2856 2 2 0.0000 0.4510 0.5490
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.050 1 3 1 551 117 434 0 0 1 1 115 0 0 433 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 116.000 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr19 17286684 GTGTGTGTT G 0.020051 0.050 1 -8 1 365 76 289 1 1 13 9 52 0 0 288 0 1 0.0132 0.0000 0.0035 4.846 2.00 5.87 -3.87 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.9753 0.0247 2 1 0.0000 0.9585 0.0415
chr19 17286686 GTGTGTT G 0.073608 0.050 1 -6 1 365 74 291 1 1 10 5 57 0 0 290 0 1 0.0135 0.0000 0.0034 6.400 2.00 6.25 -4.25 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9479 0.0521 2 1 0.0000 0.8694 0.1306 2 1 0.0000 0.8295 0.1705
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.050 1 -4 1 365 67 298 1 0 4 6 56 0 0 297 0 1 0.0149 0.0000 0.0034 21.000 2.00 6.29 -4.29 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8463 0.1537 2 1 0.0000 0.6833 0.3167 2 1 0.0000 0.6253 0.3747
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.050 1 -3 1 134 57 77 2 0 1 0 54 0 0 76 0 1 0.0351 0.0000 0.0130 56.000 2.50 3.54 -1.04 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9615 0.0385 2 1 0.0000 0.7886 0.2114 2 1 0.0000 0.6818 0.3182
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.050 1 1 1 819 175 644 0 0 4 6 165 0 0 602 14 28 0.0000 0.0000 0.0652 42.750 2.68 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr19 22757390 A AG 0.088391 0.050 1 1 2 2076 468 1608 227 3 21 8 209 0 0 1309 15 284 0.4850 0.0000 0.1859 21.190 0.83 2.44 -1.62 33 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 23744939 CCA C 0.187747 0.050 1 -2 4 812 189 623 173 1 12 0 3 0 0 623 0 0 0.9153 0.0000 0.0000 16.091 0.40 2.67 -2.26 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7237 0.2763 0.0000 0 0 0.9774 0.0226 0.0000 0 0 0.9894 0.0106 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.050 1 -3 1 298 67 231 1 0 10 2 54 0 0 230 1 0 0.0149 0.0000 0.0043 5.700 0.00 2.80 -2.80 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1958 0.8042 2 2 0.0000 0.0872 0.9128 2 2 0.0000 0.0688 0.9312
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.050 1 3 1 587 148 439 72 0 4 1 71 0 0 435 0 4 0.4865 0.0000 0.0091 36.000 0.39 3.20 -2.81 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0914 0.5175 0.3911 1 1 0.0930 0.5153 0.3917 1 1 0.0950 0.5126 0.3924
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.050 1 -51 2 447 199 248 131 0 25 0 43 0 0 231 0 17 0.6583 0.0000 0.0685 6.960 2.27 19.35 -17.08 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9566 0.0432 0.0002 1 0 0.9514 0.0484 0.0002 1 0 0.9436 0.0561 0.0003
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.050 1 -3 1 444 149 295 27 2 16 10 94 0 0 292 0 3 0.1812 0.0000 0.0102 10.231 0.04 3.18 -3.14 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0030 0.1933 0.8038 1 2 0.0027 0.4512 0.5461 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr19 37388950 C CTGTG 0.140068 0.050 1 4 5 641 124 517 61 0 3 0 60 0 0 507 0 10 0.4919 0.0000 0.0193 40.333 0.31 4.88 -4.57 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2836 0.6039 0.1125 1 1 0.2898 0.5992 0.1110 1 1 0.2978 0.5931 0.1091
chr19 37388952 AT A 0.140069 0.050 1 -1 2 643 125 518 63 0 5 0 57 0 0 508 1 9 0.5040 0.0000 0.0193 24.000 0.30 5.02 -4.72 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3502 0.5687 0.0811 1 1 0.3543 0.5647 0.0810 1 1 0.3596 0.5597 0.0807
chr19 37886746 TCCTTTCCTCCTCCTCCTC T 0.059111 0.050 1 -18 2 499 92 407 76 2 11 0 3 0 0 407 0 0 0.8261 0.0000 0.0000 7.364 0.49 7.00 -6.51 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4577 0.5423 0.0000 0 0 0.9361 0.0639 0.0000 0 0 0.9713 0.0287 0.0000
chr19 38304906 TGAA T 0.163680 0.050 1 -3 1 382 106 276 97 3 3 0 3 0 0 276 0 0 0.9151 0.0000 0.0000 34.000 1.80 3.33 -1.53 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3202 0.6798 0.0000 0 0 0.8900 0.1100 0.0000 0 0 0.9483 0.0517 0.0000
chr19 38304940 CAAG C 0.034026 0.050 1 -3 3 378 93 285 48 0 3 0 42 0 0 285 0 0 0.5161 0.0000 0.0000 30.000 1.56 3.79 -2.22 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5324 0.4573 0.0104 1 0 0.5315 0.4579 0.0106 1 0 0.5302 0.4589 0.0109
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.050 1 24 2 509 98 411 55 0 13 0 30 0 1 387 0 23 0.5612 0.0000 0.0584 6.538 0.56 14.43 -13.87 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4775 0.5019 0.0206 1 1 0.4785 0.5006 0.0209 1 1 0.4797 0.4990 0.0212
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.050 1 -1 2 412 129 283 65 0 0 2 62 0 0 282 0 1 0.5039 0.0000 0.0035 128.000 0.46 2.98 -2.52 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3228 0.5382 0.1390 1 1 0.3247 0.5353 0.1400 1 1 0.3272 0.5316 0.1412
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.050 1 -2 1 249 38 211 0 0 1 31 6 0 0 210 1 0 0.0000 0.0000 0.0047 35.000 2.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0975 0.9025 2 2 0.0000 0.0992 0.9008 2 2 0.0000 0.1016 0.8984
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.050 1 2 2 249 37 212 0 0 21 16 0 0 0 211 1 0 0.0000 0.0000 0.0047 0.909 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1327 0.8673 2 2 0.0000 0.1341 0.8659 2 2 0.0000 0.1360 0.8640
chr19 40667960 TTGC T 0.034410 0.050 1 -3 1 439 112 327 97 3 9 0 3 0 0 326 0 1 0.8661 0.0000 0.0031 11.444 5.54 4.67 0.87 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3380 0.6620 0.0000 0 0 0.9581 0.0419 0.0000 0 0 0.9859 0.0141 0.0000
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.050 1 -6 1 423 121 302 1 0 4 1 115 0 0 302 0 0 0.0083 0.0000 0.0000 29.000 0.00 5.50 -5.50 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1857 0.8143 2 2 0.0000 0.0843 0.9157 2 2 0.0000 0.0691 0.9309
chr19 40667990 CTGT C 0.142266 0.050 1 -3 1 423 118 305 2 11 0 3 102 0 0 305 0 0 0.0169 0.0000 0.0000 106.000 2.00 5.76 -3.76 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9588 0.0412 2 1 0.0000 0.7704 0.2296 2 1 0.0000 0.6499 0.3501
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.050 1 1 2 470 164 306 93 0 1 0 70 0 0 305 0 1 0.5671 0.0000 0.0033 163.000 0.09 1.86 -1.77 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6478 0.3337 0.0185 1 0 0.6409 0.3392 0.0199 1 0 0.6316 0.3465 0.0219
chr19 43612464 AGGGGCACACACAGCC A 0.001824 0.050 1 -15 2 582 146 436 137 1 6 0 2 0 0 436 0 0 0.9384 0.0000 0.0000 23.333 0.12 16.00 -15.88 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.050 1 -6 1 344 109 235 70 0 1 0 38 0 0 233 0 2 0.6422 0.0000 0.0085 108.000 0.33 6.45 -6.12 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6751 0.3001 0.0248 1 0 0.6636 0.3091 0.0273 1 0 0.6478 0.3212 0.0310
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.050 1 -3 2 499 135 364 13 0 2 1 119 0 0 361 0 3 0.0963 0.0000 0.0082 66.500 0.08 3.24 -3.16 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9940 0.0060 2 1 0.0000 0.7918 0.2082
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.050 1 6 2 1064 344 720 150 3 72 1 118 0 0 702 0 18 0.4360 0.0000 0.0250 3.778 0.44 6.27 -5.83 68 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4108 0.5111 0.0782 1 1 0.4080 0.5095 0.0825 1 1 0.4039 0.5076 0.0885
chr19 46493759 C CCGGCCT 0.138319 0.050 1 6 4 376 76 300 28 2 13 0 33 0 0 299 0 1 0.3684 0.0000 0.0033 4.769 1.14 7.67 -6.52 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3588 0.5540 0.0873 1 1 0.3620 0.5513 0.0867 1 1 0.3663 0.5479 0.0859
chr19 48446744 TGAA T 0.043442 0.050 1 -3 1 343 109 234 97 0 9 0 3 0 1 233 0 0 0.8899 0.0000 0.0043 11.111 0.30 3.67 -3.37 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6586 0.3414 0.0000 0 0 0.9707 0.0293 0.0000 0 0 0.9869 0.0131 0.0000
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.050 1 1 1 222 89 133 51 0 2 0 36 0 0 132 0 1 0.5730 0.0000 0.0075 43.500 0.16 2.22 -2.07 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5777 0.3912 0.0311 1 0 0.5725 0.3949 0.0325 1 0 0.5656 0.4000 0.0345
chr19 49070105 TGGA T 0.101017 0.050 1 -3 1 385 117 268 63 0 0 0 54 0 0 267 0 1 0.5385 0.0000 0.0037 117.000 0.92 4.67 -3.75 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5219 0.4515 0.0266 1 0 0.5205 0.4522 0.0273 1 0 0.5184 0.4533 0.0283
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.050 1 -6 2 565 148 417 0 0 36 1 111 0 0 407 0 10 0.0000 0.0000 0.0240 3.111 6.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0752 0.9248 2 2 0.0000 0.0796 0.9204 2 2 0.0000 0.0860 0.9140
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.050 1 3 2 716 162 554 4 1 5 147 5 0 0 550 4 0 0.0247 0.0000 0.0072 52.333 0.00 2.80 -2.80 4 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9406 0.0594 2 2 0.0000 0.2609 0.7391 2 2 0.0000 0.1040 0.8960
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.050 1 3 3 715 165 550 1 0 7 4 153 0 0 546 0 4 0.0061 0.0000 0.0073 22.571 0.00 2.99 -2.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1466 0.8534 2 2 0.0000 0.0663 0.9337 2 2 0.0000 0.0557 0.9443
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.050 1 1 1 559 155 404 74 0 8 8 65 0 0 399 0 5 0.4774 0.0000 0.0124 18.375 0.45 2.65 -2.20 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1271 0.5291 0.3437 1 1 0.1291 0.5264 0.3445 1 1 0.1317 0.5231 0.3452
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.050 1 -2 1 196 86 110 0 0 1 0 85 0 0 108 0 2 0.0000 0.0000 0.0182 85.000 2.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0414 0.9586 2 2 0.0000 0.0431 0.9569 2 2 0.0000 0.0457 0.9543
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.050 1 -1 2 450 146 304 63 0 9 0 74 0 0 304 0 0 0.4315 0.0000 0.0000 15.222 0.21 2.15 -1.94 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1630 0.5374 0.2996 1 1 0.1680 0.5358 0.2962 1 1 0.1748 0.5336 0.2916
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.050 1 3 1 540 136 404 64 1 1 0 70 0 0 400 0 4 0.4706 0.0000 0.0099 135.000 0.23 3.37 -3.14 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1798 0.5430 0.2773 1 1 0.1844 0.5407 0.2749 1 1 0.1907 0.5377 0.2716
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.050 1 3 2 1027 245 782 233 0 4 0 8 0 0 782 0 0 0.9510 0.0000 0.0000 60.250 0.18 3.62 -3.44 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.6889 0.3111 0.0000 0 0 0.9527 0.0473 0.0000
chr19 53491567 CAA C 0.009204 0.050 1 -2 1 1159 219 940 98 7 9 1 104 0 0 934 1 5 0.4475 0.0000 0.0064 26.000 0.64 2.62 -1.98 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3407 0.6525 0.0067 1 1 0.3485 0.6448 0.0067 1 1 0.3585 0.6349 0.0066
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.050 1 -1 5 558 166 392 8 0 7 1 150 0 0 392 0 0 0.0482 0.0000 0.0000 22.571 0.25 2.39 -2.14 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.7047 0.2953 2 2 0.0000 0.2008 0.7992
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.050 1 3 1 729 156 573 68 0 7 2 79 0 0 571 0 2 0.4359 0.0000 0.0035 21.286 0.29 3.44 -3.15 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1072 0.4971 0.3957 1 1 0.1120 0.4976 0.3904 1 1 0.1185 0.4983 0.3832
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.050 1 9 2 411 107 304 53 0 12 0 42 0 0 297 0 7 0.4953 0.0000 0.0230 7.917 0.26 7.95 -7.69 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2838 0.5261 0.1901 1 1 0.2832 0.5242 0.1926 1 1 0.2824 0.5217 0.1959
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.050 1 -24 1 628 125 503 0 0 17 2 106 0 0 469 0 34 0.0000 0.0000 0.0676 6.353 18.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0046 0.9954 2 2 0.0000 0.0051 0.9949
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.050 1 3 4 787 228 559 112 0 29 1 86 0 0 546 4 9 0.4912 0.0000 0.0233 7.107 0.90 7.43 -6.53 78 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4602 0.4783 0.0615 1 1 0.4584 0.4775 0.0640 1 1 0.4558 0.4768 0.0674
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.050 1 3 1 518 88 430 3 0 3 2 80 0 0 421 0 9 0.0341 0.0000 0.0209 28.000 0.33 3.80 -3.47 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9213 0.0787 2 2 0.0000 0.4041 0.5959 2 2 0.0000 0.2290 0.7710
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.050 1 3 1 133 68 65 62 0 4 0 2 0 0 65 0 0 0.9118 0.0000 0.0000 16.000 0.31 3.00 -2.69 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2834 0.7166 0.0000 0 0 0.7251 0.2749 0.0000 0 0 0.8205 0.1795 0.0000
chr19 57639970 TG T 0.349431 0.050 1 -1 1 152 73 79 40 0 0 0 33 0 0 79 0 0 0.5479 0.0000 0.0000 73.000 0.05 1.30 -1.25 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4069 0.4837 0.1094 1 1 0.4044 0.4840 0.1117 1 1 0.4010 0.4843 0.1147
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.050 1 -2 1 314 129 185 59 0 2 0 68 0 0 185 0 0 0.4574 0.0000 0.0000 63.500 0.27 2.16 -1.89 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1218 0.5029 0.3753 1 1 0.1252 0.5021 0.3727 1 1 0.1297 0.5012 0.3691
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.050 1 -6 2 97 60 37 4 0 2 0 54 0 0 37 0 0 0.0667 0.0000 0.0000 29.000 0.00 7.09 -7.09 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9913 0.0087 2 1 0.0000 0.7122 0.2878 2 2 0.0000 0.4399 0.5601
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.050 1 2 1 576 183 393 181 0 0 0 2 0 0 392 0 1 0.9891 0.0000 0.0025 183.000 0.35 6.50 -6.15 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5544 0.4456 0.0000 0 0 0.9507 0.0493 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.050 1 -2 1 576 186 390 182 1 1 0 2 0 0 389 0 1 0.9785 0.0000 0.0026 184.000 0.25 6.50 -6.25 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5535 0.4465 0.0000 0 0 0.9528 0.0472 0.0000 0 0 0.9774 0.0226 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.050 1 -3 4 577 178 399 171 2 2 1 2 0 0 399 0 0 0.9607 0.0000 0.0000 88.000 0.18 8.00 -7.82 49 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5938 0.4062 0.0000 0 0 0.9477 0.0523 0.0000 0 0 0.9741 0.0259 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.050 1 1 2 241 90 151 1 0 2 1 86 0 0 149 0 2 0.0111 0.0000 0.0132 43.500 0.00 1.22 -1.22 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2501 0.7499 2 2 0.0000 0.1184 0.8816 2 2 0.0000 0.0961 0.9039
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.050 1 -6 2 732 187 545 179 0 3 0 5 0 0 545 0 0 0.9572 0.0000 0.0000 61.333 0.25 6.80 -6.55 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0306 0.9694 0.0000 0 0 0.7821 0.2179 0.0000 0 0 0.9331 0.0669 0.0000
chr20 33677160 AGAT A 0.000012 0.050 1 -3 6 931 242 689 123 1 7 0 111 0 1 686 0 2 0.5083 0.0000 0.0044 33.571 0.25 3.07 -2.82 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5750 0.4250 0.0000 1 0 0.5748 0.4252 0.0000 1 0 0.5742 0.4258 0.0000
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.050 1 3 1 461 151 310 0 1 0 1 149 0 0 303 0 7 0.0000 0.0000 0.0226 150.000 3.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0117 0.9883 2 2 0.0000 0.0123 0.9877 2 2 0.0000 0.0134 0.9866
chr20 34757917 TTGC T 0.000222 0.050 1 -3 1 690 190 500 65 2 32 3 88 0 0 500 0 0 0.3421 0.0000 0.0000 5.032 0.28 3.09 -2.81 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2037 0.7959 0.0005 1 1 0.2135 0.7860 0.0005 1 1 0.2268 0.7727 0.0004
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.050 1 -9 4 234 67 167 25 0 23 0 19 0 0 164 1 2 0.3731 0.0000 0.0180 2.200 2.08 8.95 -6.87 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2417 0.5183 0.2401 1 1 0.2406 0.5172 0.2423 1 1 0.2391 0.5158 0.2451
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.050 1 -3 2 536 145 391 75 0 4 0 66 0 0 391 0 0 0.5172 0.0000 0.0000 35.250 0.59 3.38 -2.79 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2805 0.5422 0.1773 1 1 0.2781 0.5399 0.1820 1 1 0.2749 0.5370 0.1882
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.050 1 -3 2 919 296 623 7 0 49 10 230 0 0 618 0 5 0.0236 0.0000 0.0080 5.041 0.57 3.23 -2.66 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 2 0.0000 0.1419 0.8581 2 2 0.0000 0.0240 0.9760
chr20 47651070 TGCAGCAGCA T 0.105143 0.050 1 -9 1 572 296 276 260 7 26 0 3 0 0 276 0 0 0.8784 0.0000 0.0000 10.760 1.26 9.00 -7.74 106 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9804 0.0196 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.050 1 -3 2 572 288 284 130 6 35 9 108 0 0 284 0 0 0.4514 0.0000 0.0000 7.143 0.20 3.06 -2.86 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5210 0.4347 0.0443 1 0 0.5167 0.4362 0.0471 1 0 0.5106 0.4384 0.0510
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.050 1 3 1 425 111 314 102 0 6 0 3 0 0 314 0 0 0.9189 0.0000 0.0000 17.500 0.35 3.00 -2.65 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2530 0.7470 0.0000 0 0 0.8531 0.1469 0.0000 0 0 0.9294 0.0706 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.050 1 -6 2 208 40 168 0 0 3 0 37 0 0 165 1 2 0.0000 0.0000 0.0179 12.333 6.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.050 1 -1 1 283 149 134 59 0 1 0 89 0 0 133 1 0 0.3960 0.0000 0.0075 148.000 0.12 2.20 -2.08 29 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0137 0.2641 0.7222 1 2 0.0152 0.2725 0.7123 1 2 0.0174 0.2839 0.6987
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.050 1 6 4 709 194 515 110 0 3 0 81 1 0 508 0 6 0.5670 0.0019 0.0136 63.667 0.09 5.94 -5.85 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5343 0.4159 0.0498 1 0 0.5255 0.4207 0.0538 1 0 0.5135 0.4271 0.0594
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.050 1 3 2 229 114 115 3 0 5 0 106 0 0 114 0 1 0.0263 0.0000 0.0087 21.800 0.00 3.10 -3.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8703 0.1297 2 2 0.0000 0.2817 0.7183 2 2 0.0000 0.1480 0.8520
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.050 1 1 2 318 51 267 0 1 2 0 48 0 0 265 0 2 0.0000 0.0000 0.0075 24.500 2.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.050 1 2 2 1042 185 857 1 2 8 12 162 0 0 849 1 7 0.0054 0.0000 0.0093 35.000 1.00 3.30 -2.30 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0458 0.9542 2 2 0.0000 0.0180 0.9820 2 2 0.0000 0.0140 0.9860
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.050 1 -2 2 1044 187 857 1 2 12 19 153 0 0 849 1 7 0.0053 0.0000 0.0093 17.300 1.00 3.35 -2.35 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1027 0.8973 2 2 0.0000 0.0238 0.9762 2 2 0.0000 0.0156 0.9844
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.050 1 -15 2 608 130 478 72 1 22 0 35 13 6 451 0 8 0.5538 0.0272 0.0565 5.143 2.03 13.94 -11.92 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8831 0.1152 0.0018 1 0 0.8743 0.1236 0.0021 1 0 0.8616 0.1357 0.0026
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.050 1 -15 2 565 106 459 4 0 9 1 92 0 0 452 0 7 0.0377 0.0000 0.0153 10.778 2.75 12.42 -9.67 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9791 0.0209 2 1 0.0000 0.5100 0.4900 2 2 0.0000 0.2542 0.7458
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.050 1 -9 7 332 151 181 0 2 16 0 133 0 0 181 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.375 7.52 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.050 1 -3 3 183 85 98 49 0 8 0 28 0 0 98 0 0 0.5765 0.0000 0.0000 9.625 0.24 3.07 -2.83 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6445 0.3300 0.0255 1 0 0.6361 0.3366 0.0273 1 0 0.6248 0.3454 0.0298
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.050 1 -21 3 619 118 501 2 0 33 1 82 0 0 493 0 8 0.0169 0.0000 0.0160 2.545 0.50 14.38 -13.88 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2708 0.7292 2 2 0.0000 0.0534 0.9466 2 2 0.0000 0.0322 0.9678
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.050 1 3 1 1244 345 899 120 14 83 5 123 1 0 898 0 0 0.3478 0.0011 0.0011 3.120 0.78 3.00 -2.22 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4469 0.5114 0.0418 1 1 0.4487 0.5082 0.0431 1 1 0.4507 0.5044 0.0449
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.050 1 -3 1 695 190 505 0 0 4 1 185 0 0 503 0 2 0.0000 0.0000 0.0040 46.250 3.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0128 0.9872 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0160 0.9840
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.050 1 -2 3 598 199 399 183 3 6 0 7 0 0 399 0 0 0.9196 0.0000 0.0000 32.000 0.42 1.57 -1.16 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.4916 0.5084 0.0000 0 0 0.8711 0.1289 0.0000
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.050 1 -6 2 477 233 244 182 0 45 0 6 0 1 243 0 0 0.7811 0.0000 0.0041 4.178 0.62 6.33 -5.72 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0175 0.9825 0.0000 0 0 0.8415 0.1585 0.0000 0 0 0.9651 0.0349 0.0000
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.050 1 -21 6 499 71 428 0 0 2 1 68 0 0 428 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 34.500 11.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1224 0.8776 2 2 0.0000 0.1262 0.8738 2 2 0.0000 0.1316 0.8684
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.050 1 -3 1 871 314 557 162 1 7 2 142 0 1 550 4 2 0.5159 0.0000 0.0126 43.857 1.35 3.59 -2.25 50 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4047 0.5192 0.0760 1 1 0.4035 0.5166 0.0800 1 1 0.4013 0.5133 0.0854
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.050 1 -42 4 340 145 195 92 0 4 0 49 0 0 184 0 11 0.6345 0.0000 0.0564 35.250 0.18 21.76 -21.57 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7249 0.2611 0.0140 1 0 0.7146 0.2698 0.0155 1 0 0.7005 0.2816 0.0179
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.050 1 9 4 401 190 211 85 1 14 1 89 0 0 206 0 5 0.4474 0.0000 0.0237 12.571 0.46 7.98 -7.52 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1917 0.5665 0.2418 1 1 0.1970 0.5628 0.2402 1 1 0.2041 0.5581 0.2378
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.050 1 3 3 325 117 208 107 0 6 0 4 0 0 207 0 1 0.9145 0.0000 0.0048 18.500 0.18 2.25 -2.07 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.1702 0.8298 0.0000 0 1 0.4558 0.5442 0.0000
chr22 40861830 T TA 0.018262 0.050 1 1 2 619 123 496 119 0 2 0 2 0 0 496 0 0 0.9675 0.0000 0.0000 60.500 0.28 1.00 -0.72 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9765 0.0235 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.050 1 1 3 1902 419 1483 8 0 3 2 406 0 0 1448 2 33 0.0191 0.0000 0.0236 138.333 0.38 10.15 -9.78 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9360 0.0640 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.050 1 -18 2 395 133 262 52 0 29 0 52 0 0 253 0 9 0.3910 0.0000 0.0344 3.586 0.23 15.42 -15.19 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3035 0.6085 0.0881 1 1 0.3095 0.6037 0.0868 1 1 0.3175 0.5975 0.0851
651 rows