File Info

Filename
HG01956_x_HG01978_FF_5.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/3b/8850c7891e661dbf573ffee9d53c5d/HG01956_x_HG01978_FF_5.features.tsv
Size
166.2 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG01956_x_HG01978_FF_5)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1641723 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 1 417 166 251 140 2 16 0 8 0 0 251 0 0 0.8434 0.0000 0.0000 9.375 0.59 3.75 -3.16 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1370 0.8630 0.0000 0 0 0.6061 0.3939 0.0000
chr1 1739302 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 331 40 291 21 0 3 0 16 0 0 290 0 1 0.5250 0.0000 0.0034 12.333 0.24 3.81 -3.57 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2948 0.5067 0.1985 1 1 0.2933 0.5062 0.2005 1 1 0.2913 0.5056 0.2032
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 1 373 144 229 111 9 18 0 6 0 0 229 0 0 0.7708 0.0000 0.0000 7.000 0.24 3.33 -3.09 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2595 0.7405 0.0000 0 0 0.6560 0.3440 0.0000
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.050 1 -9 2 583 207 376 171 1 30 0 5 1 0 375 0 0 0.8261 0.0027 0.0027 5.900 0.53 7.60 -7.07 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0217 0.9783 0.0000 0 0 0.7165 0.2835 0.0000 0 0 0.9079 0.0921 0.0000
chr1 3021843 CAGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 555 175 380 167 0 4 0 4 0 0 379 0 1 0.9543 0.0000 0.0026 42.750 0.40 3.25 -2.85 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0187 0.9813 0.0000 0 0 0.6855 0.3145 0.0000 0 0 0.8952 0.1048 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.050 1 3 1 468 89 379 2 0 7 0 80 0 0 372 0 7 0.0225 0.0000 0.0185 11.714 0.00 3.44 -3.44 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7455 0.2545 2 2 0.0000 0.3079 0.6921 2 2 0.0000 0.2071 0.7929
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.050 1 3 2 988 159 829 64 0 4 0 91 0 0 828 0 1 0.4025 0.0000 0.0012 38.750 0.61 3.24 -2.63 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0376 0.3632 0.5992 1 2 0.0411 0.3707 0.5882 1 2 0.0461 0.3806 0.5733
chr1 15933152 TAGC T 0.500000 0.050 1 -3 3 652 132 520 127 0 1 0 4 0 0 520 0 0 0.9621 0.0000 0.0000 131.000 0.22 4.00 -3.78 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0344 0.9656 0.0000 0 0 0.6132 0.3868 0.0000 0 0 0.8260 0.1740 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 451 105 346 74 0 4 1 26 0 0 346 0 0 0.7048 0.0000 0.0000 25.250 0.35 1.12 -0.76 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8122 0.1800 0.0078 1 0 0.7990 0.1918 0.0092 1 0 0.7802 0.2085 0.0113
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.050 1 1 3 1311 268 1043 189 1 16 2 60 0 0 1043 0 0 0.7052 0.0000 0.0000 15.688 1.31 1.88 -0.58 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9952 0.0048 0.0000 1 0 0.9940 0.0060 0.0000 1 0 0.9904 0.0096 0.0000
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.050 1 -24 1 565 139 426 84 0 2 0 53 0 0 413 0 13 0.6043 0.0000 0.0305 68.500 0.25 19.21 -18.96 24 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4640 0.4578 0.0783 1 1 0.4571 0.4603 0.0826 1 1 0.4478 0.4636 0.0885
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 1 372 163 209 15 0 10 1 137 0 0 208 0 1 0.0920 0.0000 0.0048 15.300 0.20 3.01 -2.81 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9039 0.0961
chr1 36178099 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 1 420 112 308 108 0 1 0 3 0 0 308 0 0 0.9643 0.0000 0.0000 111.000 0.67 3.00 -2.33 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1016 0.8984 0.0000 0 0 0.6592 0.3408 0.0000 0 0 0.8137 0.1863 0.0000
chr1 44140851 GGGTCTGGTTACCAGTGGAGGTCGTCATCTGTCTCCCGTAGAA G 0.500000 0.050 1 -42 1 3401 1344 2057 1197 23 91 5 28 10 8 2031 4 4 0.8906 0.0049 0.0126 14.182 2.41 4.36 -1.95 451 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr1 46402196 GTGGGAAAGGTAAGGCCAGCCAAGGCCAGCCCCTCCC G 0.500000 0.050 1 -36 1 109 59 50 15 0 23 0 21 0 0 48 0 2 0.2542 0.0000 0.0400 1.565 0.53 13.90 -13.37 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1583 0.4925 0.3492 1 1 0.1615 0.4931 0.3455 1 1 0.1657 0.4937 0.3406
chr1 46815074 GAT G 0.500000 0.050 1 -2 2 371 86 285 82 0 1 0 3 0 0 285 0 0 0.9535 0.0000 0.0000 85.000 0.32 2.33 -2.02 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0556 0.9444 0.0000 0 0 0.5047 0.4953 0.0000 0 0 0.7007 0.2993 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.050 1 6 1 603 155 448 1 0 19 3 132 0 0 446 1 1 0.0065 0.0000 0.0045 7.105 0.00 5.42 -5.42 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1469 0.8531 2 2 0.0000 0.0655 0.9345 2 2 0.0000 0.0539 0.9461
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 228 73 155 63 0 8 0 2 0 0 155 0 0 0.8630 0.0000 0.0000 8.125 0.21 3.00 -2.79 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1573 0.8427 0.0000 0 0 0.5543 0.4457 0.0000 0 0 0.6829 0.3171 0.0000
chr1 52033398 CGCCCGCCACCTGAGGTCCCGCGATCGG C 0.500000 0.050 1 -27 1 708 189 519 118 1 2 0 68 0 0 512 0 7 0.6243 0.0000 0.0135 93.500 0.36 19.04 -18.68 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7687 0.2213 0.0099 1 0 0.7560 0.2325 0.0115 1 0 0.7381 0.2478 0.0140
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.050 1 3 2 983 224 759 116 2 33 0 73 0 0 754 0 5 0.5179 0.0000 0.0066 5.788 0.78 3.08 -2.31 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7294 0.2566 0.0140 1 0 0.7168 0.2672 0.0160 1 0 0.6993 0.2817 0.0191
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 4 707 141 566 79 0 6 0 56 0 0 565 0 1 0.5603 0.0000 0.0018 22.500 0.46 3.86 -3.40 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5237 0.4168 0.0595 1 0 0.5147 0.4218 0.0636 1 0 0.5024 0.4283 0.0693
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.050 1 3 1 168 79 89 42 1 2 0 34 0 0 86 0 3 0.5316 0.0000 0.0337 38.500 0.17 3.59 -3.42 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3133 0.5136 0.1731 1 1 0.3114 0.5126 0.1761 1 1 0.3088 0.5113 0.1799
chr1 86547161 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 136 69 67 37 0 2 0 30 0 0 66 0 1 0.5362 0.0000 0.0149 33.500 0.19 3.00 -2.81 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3157 0.5099 0.1744 1 1 0.3136 0.5092 0.1773 1 1 0.3108 0.5082 0.1810
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.050 1 -6 1 450 145 305 7 0 7 2 129 0 0 302 0 3 0.0483 0.0000 0.0098 19.571 0.00 5.29 -5.29 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.7979 0.2021 2 2 0.0000 0.3525 0.6475
chr1 87250586 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 441 189 252 106 0 2 0 81 0 0 252 0 0 0.5608 0.0000 0.0000 93.500 0.08 1.17 -1.10 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5510 0.4024 0.0465 1 0 0.5418 0.4079 0.0503 1 0 0.5292 0.4151 0.0557
chr1 89266994 T TG 0.500000 0.050 1 1 1 385 121 264 70 0 2 0 49 0 0 263 0 1 0.5785 0.0000 0.0038 59.500 0.17 1.16 -0.99 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5000 0.4308 0.0692 1 0 0.4915 0.4351 0.0734 1 0 0.4801 0.4406 0.0793
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 141 71 70 3 0 1 0 67 0 0 70 0 0 0.0423 0.0000 0.0000 70.000 0.00 3.19 -3.19 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9609 0.0391 2 1 0.0000 0.5866 0.4134 2 2 0.0000 0.3795 0.6205
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 2 452 138 314 82 0 6 1 49 0 0 309 0 5 0.5942 0.0000 0.0159 21.833 0.54 3.47 -2.93 56 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5941 0.3656 0.0403 1 0 0.5830 0.3732 0.0439 1 0 0.5680 0.3831 0.0490
chr1 111319160 A ATGCCCCTCAGGAAG 0.500000 0.050 1 14 3 397 109 288 44 1 21 0 43 0 0 282 0 6 0.4037 0.0000 0.0208 4.190 0.82 10.70 -9.88 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1916 0.5238 0.2846 1 1 0.1941 0.5220 0.2839 1 1 0.1973 0.5198 0.2829
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.050 1 -24 3 767 195 572 57 7 20 5 106 0 0 571 0 1 0.2923 0.0000 0.0017 9.053 8.98 16.65 -7.67 11 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0063 0.1771 0.8166 1 2 0.0075 0.1885 0.8041 1 2 0.0093 0.2043 0.7863
chr1 111414897 A ACAGGGGTCAGGGTCTTTTCCC 0.500000 0.050 1 21 1 750 143 607 26 4 13 1 99 0 0 584 2 21 0.1818 0.0000 0.0379 10.000 15.81 18.75 -2.94 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0001 0.0302 0.9697 2 1 0.0000 0.9980 0.0020 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.050 1 3 1 629 187 442 167 2 8 1 9 1 0 441 0 0 0.8930 0.0023 0.0023 25.571 0.53 3.11 -2.58 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0767 0.9233 0.0000 0 0 0.5838 0.4162 0.0000
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.050 1 -2 3 265 108 157 2 2 5 1 98 0 0 157 0 0 0.0185 0.0000 0.0000 20.400 1.50 2.05 -0.55 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8662 0.1338 2 2 0.0000 0.3840 0.6160 2 2 0.0000 0.2282 0.7718
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 208 81 127 68 0 11 0 2 0 0 127 0 0 0.8395 0.0000 0.0000 6.364 0.74 6.50 -5.76 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1745 0.8255 0.0000 0 0 0.5845 0.4155 0.0000 0 0 0.7082 0.2918 0.0000
chr1 152079812 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 2290 625 1665 350 1 4 1 269 0 0 1663 0 2 0.5600 0.0000 0.0012 155.250 0.24 1.29 -1.05 118 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9203 0.0793 0.0004 1 0 0.9131 0.0864 0.0005 1 0 0.9025 0.0968 0.0007
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.050 1 18 1 1770 501 1269 304 16 158 10 13 18 11 1231 5 4 0.6068 0.0142 0.0299 2.161 2.63 5.92 -3.29 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1698 0.8302 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.050 1 -36 1 1260 289 971 235 1 49 1 3 0 0 970 0 1 0.8131 0.0000 0.0010 4.878 0.50 4.33 -3.84 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3179 0.6821 0.0000 0 0 0.9527 0.0473 0.0000 0 0 0.9829 0.0171 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 269 102 167 61 14 17 1 9 0 0 167 0 0 0.5980 0.0000 0.0000 4.941 0.57 1.00 -0.43 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0146 0.9854 0.0000 0 1 0.1642 0.8358 0.0000
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 223 63 160 0 0 8 0 55 0 0 137 0 23 0.0000 0.0000 0.1437 6.875 11.87 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1232 0.8768 2 2 0.0000 0.1275 0.8725 2 2 0.0000 0.1336 0.8664
chr1 152985344 GGAGCCCTGCCACCCCAAGGTGCCT G 0.500000 0.050 1 -24 2 523 213 310 119 0 17 0 77 0 0 296 0 14 0.5587 0.0000 0.0452 11.529 0.79 13.03 -12.24 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5885 0.3756 0.0359 1 0 0.5785 0.3822 0.0393 1 0 0.5648 0.3910 0.0442
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.050 1 12 1 1067 266 801 123 1 42 1 99 6 2 766 4 23 0.4624 0.0075 0.0437 5.415 2.09 10.02 -7.93 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2621 0.5718 0.1661 1 1 0.2636 0.5664 0.1700 1 1 0.2653 0.5597 0.1751
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.050 1 -9 1 560 220 340 191 2 20 0 7 0 0 340 0 0 0.8682 0.0000 0.0000 11.111 1.40 8.43 -7.03 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.5302 0.4698 0.0000 0 0 0.8869 0.1131 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 209 85 124 78 1 2 0 4 0 0 124 0 0 0.9176 0.0000 0.0000 41.000 1.92 1.50 0.42 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0118 0.9882 0.0000 0 1 0.3299 0.6701 0.0000 0 0 0.6011 0.3989 0.0000
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.050 1 2 4 781 196 585 0 0 4 2 190 0 0 581 0 4 0.0000 0.0000 0.0068 48.000 2.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0079 0.9921 2 2 0.0000 0.0090 0.9910
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 1655 354 1301 0 0 11 0 343 0 0 1295 0 6 0.0000 0.0000 0.0046 31.182 1.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.050 1 3 1 120 66 54 36 0 1 0 29 0 0 53 0 1 0.5455 0.0000 0.0185 65.000 0.22 4.03 -3.81 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3161 0.5093 0.1746 1 1 0.3139 0.5086 0.1775 1 1 0.3111 0.5077 0.1812
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 137 48 89 26 1 1 0 20 0 0 89 0 0 0.5417 0.0000 0.0000 46.000 0.12 1.25 -1.13 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3307 0.5004 0.1689 1 1 0.3279 0.5003 0.1718 1 1 0.3240 0.5003 0.1757
chr1 175160809 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 708 144 564 5 11 3 80 45 0 0 564 0 0 0.0347 0.0000 0.0000 63.000 1.60 9.36 -7.76 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9916 0.0084 2 1 0.0000 0.8627 0.1373
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 4 153 46 107 21 0 5 0 20 0 0 107 0 0 0.4565 0.0000 0.0000 8.200 0.05 4.55 -4.50 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2559 0.5122 0.2318 1 1 0.2560 0.5113 0.2327 1 1 0.2560 0.5101 0.2339
chr1 197902774 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 293 111 182 60 0 2 0 49 0 0 182 0 0 0.5405 0.0000 0.0000 54.500 0.17 1.29 -1.12 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3754 0.4980 0.1266 1 1 0.3714 0.4981 0.1305 1 1 0.3659 0.4981 0.1359
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.050 1 -1 2 75 40 35 22 0 0 0 18 0 0 35 0 0 0.5500 0.0000 0.0000 40.000 0.41 3.17 -2.76 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2944 0.5074 0.1982 1 1 0.2929 0.5068 0.2003 1 1 0.2910 0.5061 0.2029
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.050 1 24 3 708 213 495 180 0 28 0 5 0 0 495 0 0 0.8451 0.0000 0.0000 6.607 0.23 10.00 -9.77 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0258 0.9742 0.0000 0 0 0.7502 0.2498 0.0000 0 0 0.9210 0.0790 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.050 1 -12 1 438 211 227 99 1 28 0 83 0 0 221 0 6 0.4692 0.0000 0.0264 6.536 0.32 11.49 -11.17 47 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3604 0.5210 0.1187 1 1 0.3578 0.5193 0.1230 1 1 0.3541 0.5172 0.1287
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 633 161 472 72 0 18 1 70 0 0 469 0 3 0.4472 0.0000 0.0064 7.944 0.65 8.69 -8.03 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2059 0.5433 0.2509 1 1 0.2082 0.5400 0.2518 1 1 0.2112 0.5359 0.2529
chr1 234609199 A AGCT 0.500000 0.050 1 3 2 445 105 340 42 1 15 2 45 0 0 340 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 5.933 2.81 5.20 -2.39 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1885 0.5215 0.2899 1 1 0.1911 0.5199 0.2890 1 1 0.1944 0.5179 0.2877
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 216 103 113 58 0 5 0 40 0 0 113 0 0 0.5631 0.0000 0.0000 19.600 0.12 1.12 -1.00 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4774 0.4421 0.0806 1 0 0.4694 0.4458 0.0848 1 0 0.4587 0.4506 0.0907
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 575 136 439 74 1 14 0 47 0 0 437 1 1 0.5441 0.0000 0.0046 8.714 0.78 3.32 -2.54 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5827 0.3732 0.0442 1 0 0.5717 0.3804 0.0479 1 0 0.5569 0.3900 0.0531
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 492 154 338 140 0 3 0 11 0 0 338 0 0 0.9091 0.0000 0.0000 50.333 0.28 1.45 -1.18 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0202 0.9798 0.0000 0 1 0.3257 0.6743 0.0000
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 613 180 433 164 1 1 0 14 0 0 433 0 0 0.9111 0.0000 0.0000 179.000 0.27 3.00 -2.73 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0051 0.9949 0.0000 0 1 0.2232 0.7768 0.0000
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 354 83 271 77 0 4 0 2 0 0 271 0 0 0.9277 0.0000 0.0000 26.333 1.18 1.50 -0.32 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2154 0.7846 0.0000 0 0 0.6406 0.3594 0.0000 0 0 0.7530 0.2470 0.0000
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 841 148 693 139 0 5 0 4 0 0 693 0 0 0.9392 0.0000 0.0000 28.600 0.54 1.75 -1.21 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0467 0.9533 0.0000 0 0 0.6811 0.3189 0.0000 0 0 0.8637 0.1363 0.0000
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.050 1 -84 1 916 345 571 305 6 30 0 4 0 0 571 0 0 0.8841 0.0000 0.0000 10.500 2.85 3.25 -0.40 177 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7873 0.2127 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000
chr1 248361985 CTACG C 0.500000 0.050 1 -4 2 1198 280 918 14 6 11 99 150 0 0 898 2 18 0.0500 0.0000 0.0218 87.667 0.57 6.67 -6.10 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9768 0.0232 2 2 0.0000 0.4000 0.6000
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.050 1 -2 1 602 245 357 180 0 6 0 59 0 0 357 0 0 0.7347 0.0000 0.0000 39.833 1.05 4.17 -3.12 136 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9933 0.0067 0.0000 1 0 0.9917 0.0083 0.0000 1 0 0.9888 0.0112 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.050 1 2 1 644 66 578 14 0 2 2 48 0 0 573 0 5 0.2121 0.0000 0.0087 32.000 0.43 2.62 -2.20 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0132 0.2259 0.7609 2 1 0.0053 0.7328 0.2619 2 1 0.0001 0.9743 0.0256
chr1 248442053 C CT 0.500000 0.050 1 1 2 536 131 405 26 0 1 0 104 0 0 405 0 0 0.1985 0.0000 0.0000 130.000 0.35 4.21 -3.87 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.0478 0.9517 2 1 0.0000 0.9447 0.0553 2 1 0.0000 0.9992 0.0008
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.050 1 9 1 825 130 695 64 0 21 0 45 0 0 687 0 8 0.4923 0.0000 0.0115 5.190 0.80 8.42 -7.63 26 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3736 0.5004 0.1259 1 1 0.3698 0.5003 0.1299 1 1 0.3645 0.5001 0.1353
chr1 248574594 T TGGATGAGGA 0.500000 0.050 1 9 1 321 49 272 19 0 9 0 21 0 0 268 0 4 0.3878 0.0000 0.0147 4.444 0.84 7.90 -7.06 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1770 0.5026 0.3204 1 1 0.1797 0.5024 0.3179 1 1 0.1833 0.5021 0.3146
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.050 1 -7 1 417 125 292 39 0 4 0 82 0 0 290 0 2 0.3120 0.0000 0.0068 30.250 1.05 6.52 -5.47 25 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0093 0.1990 0.7918 1 2 0.0108 0.2107 0.7785 1 2 0.0132 0.2270 0.7598
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 2708 542 2166 230 1 13 2 296 0 0 2158 0 8 0.4244 0.0000 0.0037 40.615 0.18 3.54 -3.36 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0006 0.0871 0.9123 1 2 0.0007 0.0948 0.9045 1 2 0.0011 0.1060 0.8929
chr2 1942998 TTCC T 0.015778 0.050 1 -3 1 299 64 235 54 0 7 0 3 0 0 235 0 0 0.8438 0.0000 0.0000 8.143 0.22 3.00 -2.78 24 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6450 0.3550 0.0000 0 0 0.9696 0.0304 0.0000 0 0 0.9868 0.0132 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.050 1 -3 1 225 99 126 92 1 4 0 2 0 0 126 0 0 0.9293 0.0000 0.0000 23.500 0.17 4.00 -3.83 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3556 0.6444 0.0000 0 0 0.7838 0.2162 0.0000 0 0 0.8601 0.1399 0.0000
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.050 1 9 5 387 102 285 0 0 14 0 88 0 0 268 2 15 0.0000 0.0000 0.0596 6.286 10.02 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0298 0.9702 2 2 0.0000 0.0314 0.9686 2 2 0.0000 0.0336 0.9664
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.050 1 18 5 387 102 285 4 3 51 1 43 0 0 269 3 13 0.0392 0.0000 0.0561 0.941 8.25 11.23 -2.98 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9537 0.0463 2 1 0.0000 0.8631 0.1369
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.050 1 -9 1 638 192 446 99 2 26 0 65 0 0 445 0 1 0.5156 0.0000 0.0022 6.385 0.56 7.89 -7.34 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7533 0.2363 0.0105 1 0 0.7429 0.2453 0.0118 1 0 0.7286 0.2576 0.0138
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.050 1 9 1 562 122 440 63 1 16 0 42 0 0 432 0 8 0.5164 0.0000 0.0182 6.625 0.24 7.02 -6.79 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6140 0.3761 0.0100 1 0 0.6099 0.3797 0.0104 1 0 0.6044 0.3845 0.0111
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.050 1 3 1 183 47 136 3 0 1 0 43 0 0 132 0 4 0.0638 0.0000 0.0294 46.000 0.00 3.23 -3.23 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9762 0.0238 2 1 0.0000 0.6994 0.3006 2 2 0.0000 0.4970 0.5030
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 1 752 168 584 89 1 23 1 54 0 0 582 0 2 0.5298 0.0000 0.0034 6.304 0.29 3.28 -2.99 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6638 0.3108 0.0254 1 0 0.6514 0.3204 0.0283 1 0 0.6344 0.3332 0.0325
chr2 39178722 T TA 0.500000 0.050 1 1 4 347 98 249 52 0 0 0 46 0 0 249 0 0 0.5306 0.0000 0.0000 98.000 0.29 1.24 -0.95 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3098 0.5191 0.1711 1 1 0.3082 0.5176 0.1742 1 1 0.3060 0.5158 0.1782
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.050 1 39 2 492 168 324 33 0 82 1 52 0 0 324 0 0 0.1964 0.0000 0.0000 1.049 0.06 2.06 -2.00 7 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0705 0.4206 0.5089 1 2 0.0747 0.4257 0.4997 1 2 0.0805 0.4322 0.4874
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.050 1 39 1 492 165 327 50 0 49 1 65 0 1 326 0 0 0.3030 0.0000 0.0031 2.367 0.22 2.00 -1.78 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0963 0.4709 0.4328 1 1 0.1006 0.4727 0.4267 1 1 0.1065 0.4751 0.4185
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.050 1 -3 1 401 150 251 129 1 15 2 3 0 0 251 0 0 0.8600 0.0000 0.0000 8.867 0.45 3.67 -3.22 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1332 0.8668 0.0000 0 0 0.7281 0.2719 0.0000 0 0 0.8601 0.1399 0.0000
chr2 70984816 TGCCCAA T 0.500000 0.050 1 -6 1 645 169 476 81 0 11 0 77 1 0 474 0 1 0.4793 0.0021 0.0042 14.364 0.96 6.78 -5.82 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2726 0.5439 0.1835 1 1 0.2729 0.5406 0.1865 1 1 0.2731 0.5364 0.1905
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.050 1 3 1 667 166 501 0 108 48 3 7 0 2 499 0 0 0.0000 0.0000 0.0040 2.622 4.29 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0281 0.9719 0.0000 0 1 0.2722 0.7278 0.0000
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 1 667 166 501 6 9 34 64 53 0 0 498 2 1 0.0361 0.0000 0.0060 3.647 4.50 3.30 1.20 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9295 0.0705 2 1 0.0000 0.5889 0.4111
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.050 1 -6 1 668 169 499 10 4 82 1 72 0 0 497 0 2 0.0592 0.0000 0.0040 1.076 5.30 5.99 -0.69 8 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 1 0.0000 0.9315 0.0685
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.050 1 24 2 899 168 731 19 0 38 3 108 0 0 676 0 55 0.1131 0.0000 0.0752 3.395 0.53 11.87 -11.34 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9562 0.0438
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 333 128 205 8 1 9 2 108 0 0 202 0 3 0.0625 0.0000 0.0146 13.111 2.00 3.81 -1.81 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9321 0.0679 2 1 0.0000 0.5796 0.4204
chr2 85343751 CAGAT C 0.500000 0.050 1 -4 2 843 253 590 197 1 4 1 50 0 1 589 0 0 0.7787 0.0000 0.0017 62.000 0.27 4.24 -3.97 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9982 0.0018 0.0000 0 1 0.0864 0.9136 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr2 85695371 AC A 0.500000 0.050 1 -1 3 182 49 133 31 0 0 0 18 0 0 133 0 0 0.6327 0.0000 0.0000 49.000 0.52 1.89 -1.37 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4178 0.4666 0.1156 1 1 0.4115 0.4689 0.1196 1 1 0.4031 0.4719 0.1250
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 4 737 204 533 1 0 22 6 175 0 0 525 0 8 0.0049 0.0000 0.0150 8.273 0.00 3.27 -3.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0421 0.9579 2 2 0.0000 0.0181 0.9819 2 2 0.0000 0.0154 0.9846
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.050 1 -9 2 782 240 542 115 1 15 1 108 0 0 542 0 0 0.4792 0.0000 0.0000 15.000 0.63 7.47 -6.84 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2965 0.5541 0.1495 1 1 0.2965 0.5500 0.1535 1 1 0.2963 0.5449 0.1588
chr2 96123863 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 478 123 355 60 0 0 0 63 0 0 354 0 1 0.4878 0.0000 0.0028 123.000 0.27 1.17 -0.91 48 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1879 0.5330 0.2791 1 1 0.1907 0.5305 0.2789 1 1 0.1942 0.5274 0.2784
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.050 1 3 4 438 116 322 10 0 0 0 106 0 0 318 0 4 0.0862 0.0000 0.0124 116.000 0.20 3.08 -2.88 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9814 0.0186 2 1 0.0000 0.7463 0.2537
chr2 106424136 AGGGCT A 0.500000 0.050 1 -5 1 566 124 442 121 0 0 0 3 0 0 442 0 0 0.9758 0.0000 0.0000 124.000 0.98 6.67 -5.68 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1356 0.8644 0.0000 0 0 0.7272 0.2728 0.0000 0 0 0.8564 0.1436 0.0000
chr2 106424142 A AAAGATT 0.500000 0.050 1 6 1 565 119 446 116 0 0 0 3 0 0 446 0 0 0.9748 0.0000 0.0000 119.000 0.96 6.67 -5.71 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1215 0.8785 0.0000 0 0 0.7021 0.2979 0.0000 0 0 0.8410 0.1590 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.050 1 -3 1 105 34 71 16 0 0 0 18 0 0 70 0 1 0.4706 0.0000 0.0141 34.000 0.19 2.94 -2.76 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2098 0.5079 0.2823 1 1 0.2114 0.5073 0.2812 1 1 0.2136 0.5066 0.2798
chr2 112175762 TAGA T 0.500000 0.050 1 -3 1 108 70 38 39 0 0 0 31 0 0 38 0 0 0.5571 0.0000 0.0000 70.000 0.18 3.00 -2.82 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3424 0.5023 0.1553 1 1 0.3393 0.5021 0.1586 1 1 0.3351 0.5019 0.1630
chr2 112542424 TTCCGGCGTGTACCGAGAGACTGGCG T 0.500000 0.050 1 -25 1 395 112 283 100 0 12 0 0 0 0 281 0 2 0.8929 0.0000 0.0071 8.333 0.54 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3211 0.6789 0.0000 0 0 0.7559 0.2441 0.0000 0 0 0.8394 0.1606 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.050 1 6 1 552 149 403 82 2 1 0 64 0 0 398 0 5 0.5503 0.0000 0.0124 148.000 0.22 5.70 -5.48 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4209 0.4835 0.0956 1 1 0.4157 0.4844 0.0999 1 1 0.4085 0.4856 0.1059
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 304 113 191 7 0 12 0 94 0 0 185 0 6 0.0619 0.0000 0.0314 8.417 0.14 6.22 -6.08 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9010 0.0990 2 1 0.0000 0.5508 0.4492
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.050 1 6 2 177 64 113 4 0 12 3 45 0 0 112 0 1 0.0625 0.0000 0.0088 4.167 2.25 6.29 -4.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9950 0.0050 2 1 0.0000 0.8129 0.1871 2 1 0.0000 0.5787 0.4213
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.050 1 3 4 247 110 137 107 0 1 0 2 0 0 136 0 1 0.9727 0.0000 0.0073 109.000 0.07 3.00 -2.93 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0994 0.9006 0.0000 0 0 0.6537 0.3463 0.0000 0 0 0.8100 0.1900 0.0000
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.050 1 -2 1 621 169 452 161 1 5 0 2 0 0 452 0 0 0.9527 0.0000 0.0000 32.800 0.47 4.00 -3.53 69 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6930 0.3070 0.0000 0 0 0.9346 0.0654 0.0000 0 0 0.9585 0.0415 0.0000
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 306 127 179 43 2 16 1 65 0 0 174 0 5 0.3386 0.0000 0.0279 6.812 2.67 5.62 -2.94 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0440 0.3696 0.5864 1 2 0.0477 0.3771 0.5752 1 2 0.0529 0.3870 0.5601
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.050 1 3 1 306 136 170 9 60 13 5 49 0 0 170 0 0 0.0662 0.0000 0.0000 9.833 0.00 2.90 -2.90 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3654 0.5025 0.1321 1 1 0.3618 0.5022 0.1360 1 1 0.3569 0.5019 0.1412
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 187 45 142 18 7 4 2 14 0 0 142 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 8.500 0.11 1.00 -0.89 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3479 0.4929 0.1592 1 1 0.3443 0.4934 0.1623 1 1 0.3395 0.4940 0.1665
chr2 196666794 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 190 70 120 26 3 5 4 32 0 0 119 0 1 0.3714 0.0000 0.0083 12.200 0.15 1.09 -0.94 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1580 0.5014 0.3406 1 1 0.1612 0.5013 0.3375 1 1 0.1655 0.5011 0.3333
chr2 199819526 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 424 78 346 29 11 12 5 21 0 0 344 2 0 0.3718 0.0000 0.0058 5.600 1.52 1.76 -0.24 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4084 0.4738 0.1178 1 1 0.4026 0.4756 0.1218 1 1 0.3949 0.4779 0.1273
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.050 1 3 1 384 96 288 34 1 26 2 33 0 0 286 1 1 0.3542 0.0000 0.0069 2.654 1.26 5.30 -4.04 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2185 0.5209 0.2606 1 1 0.2200 0.5193 0.2607 1 1 0.2220 0.5173 0.2607
chr2 210018165 T TAA 0.500000 0.050 1 2 1 85 38 47 26 0 0 0 12 0 0 47 0 0 0.6842 0.0000 0.0000 38.000 0.35 2.67 -2.32 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4350 0.4561 0.1090 1 1 0.4278 0.4591 0.1130 1 1 0.4183 0.4631 0.1186
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.050 1 3 1 278 80 198 1 0 0 0 79 0 0 196 0 2 0.0125 0.0000 0.0101 80.000 0.00 2.95 -2.95 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3999 0.6001 2 2 0.0000 0.2092 0.7908 2 2 0.0000 0.1722 0.8278
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 2 532 141 391 1 1 19 1 119 0 0 388 0 3 0.0071 0.0000 0.0077 6.368 0.00 8.00 -8.00 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2154 0.7846 2 2 0.0000 0.0979 0.9021 2 2 0.0000 0.0789 0.9211
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.050 1 -27 1 596 164 432 12 0 7 2 143 0 0 381 0 51 0.0732 0.0000 0.1181 22.429 0.08 15.03 -14.94 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9600 0.0400 2 2 0.0000 0.4404 0.5596
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.050 1 -3 2 293 128 165 61 0 1 9 57 0 0 164 0 1 0.4766 0.0000 0.0061 125.000 1.52 3.61 -2.09 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1818 0.5320 0.2862 1 1 0.1847 0.5296 0.2857 1 1 0.1885 0.5265 0.2849
chr2 232847517 A AG 0.500000 0.050 1 1 2 293 127 166 62 48 12 0 5 0 1 164 0 1 0.4882 0.0000 0.0120 5.917 1.52 6.00 -4.48 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1983 0.8017 0.0000 0 0 0.5746 0.4254 0.0000
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.050 1 3 1 115 38 77 19 0 3 0 16 0 0 77 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 11.667 0.26 3.81 -3.55 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2823 0.5079 0.2098 1 1 0.2812 0.5073 0.2114 1 1 0.2798 0.5066 0.2136
chr2 233822976 AGGACGGCG A 0.500000 0.050 1 -8 1 382 109 273 58 0 6 0 45 0 0 272 0 1 0.5321 0.0000 0.0037 17.167 0.43 7.53 -7.10 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3906 0.4901 0.1192 1 1 0.3859 0.4907 0.1233 1 1 0.3797 0.4915 0.1288
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 754 183 571 114 0 0 0 69 1 0 570 0 0 0.6230 0.0018 0.0018 183.000 0.61 1.16 -0.55 90 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7885 0.2031 0.0083 1 0 0.7757 0.2145 0.0098 1 0 0.7578 0.2302 0.0120
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.050 1 -3 1 414 119 295 0 0 20 10 89 0 0 295 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.950 3.30 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0765 0.9235 2 2 0.0000 0.0801 0.9199 2 2 0.0000 0.0853 0.9147
chr2 241096100 CTCA C 0.500000 0.050 1 -3 2 594 153 441 83 0 5 0 65 0 0 441 0 0 0.5425 0.0000 0.0000 29.600 0.41 3.11 -2.70 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4645 0.4571 0.0783 1 1 0.4576 0.4597 0.0827 1 1 0.4483 0.4631 0.0886
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.050 1 -2 1 492 137 355 74 0 3 0 60 0 0 352 1 2 0.5401 0.0000 0.0085 44.667 1.20 2.20 -1.00 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3691 0.5065 0.1243 1 1 0.3656 0.5059 0.1284 1 1 0.3608 0.5052 0.1340
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.050 1 3 1 802 212 590 5 0 5 0 202 0 0 576 0 14 0.0236 0.0000 0.0237 41.400 0.20 3.43 -3.23 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6754 0.3246 2 2 0.0000 0.0183 0.9817 2 2 0.0000 0.0049 0.9951
chr3 9835187 AGG A 0.001553 0.050 1 -2 2 829 186 643 180 1 1 0 4 0 0 643 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 185.000 0.26 7.75 -7.49 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9887 0.0113 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.050 1 12 2 808 183 625 90 0 20 0 73 0 0 601 0 24 0.4918 0.0000 0.0384 8.150 0.79 11.05 -10.27 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2744 0.5995 0.1260 1 1 0.2804 0.5942 0.1254 1 1 0.2883 0.5873 0.1245
chr3 13570394 T TCTGGGC 0.000435 0.050 1 6 1 380 90 290 57 1 5 0 27 0 0 289 0 1 0.6333 0.0000 0.0034 21.250 0.12 6.04 -5.91 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8020 0.1980 0.0000 1 0 0.7940 0.2060 0.0000 1 0 0.7829 0.2171 0.0000
chr3 27721914 C CGCG 0.500000 0.050 1 3 2 445 80 365 1 0 16 30 33 0 0 364 0 1 0.0125 0.0000 0.0027 4.000 0.00 3.15 -3.15 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5060 0.4940 2 2 0.0000 0.2875 0.7125 2 2 0.0000 0.2387 0.7613
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.050 1 6 2 435 80 355 10 29 2 3 36 0 0 355 0 0 0.1250 0.0000 0.0000 38.000 0.80 4.31 -3.51 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1964 0.5164 0.2872 1 1 0.1986 0.5152 0.2862 1 1 0.2015 0.5136 0.2849
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.050 1 6 1 644 219 425 166 0 47 0 6 0 0 424 0 1 0.7580 0.0000 0.0024 3.660 0.42 5.00 -4.58 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3587 0.6413 0.0000 0 0 0.7987 0.2013 0.0000
chr3 42691888 CGAG C 0.500000 0.050 1 -3 2 234 112 122 59 1 1 0 51 0 0 119 0 3 0.5268 0.0000 0.0246 111.000 0.51 3.65 -3.14 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3064 0.5240 0.1696 1 1 0.3051 0.5222 0.1727 1 1 0.3032 0.5199 0.1769
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.050 1 -2 5 866 229 637 0 0 10 0 219 0 0 633 0 4 0.0000 0.0000 0.0063 21.900 2.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0036 0.9964 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0047 0.9953
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 320 137 183 0 0 1 0 136 0 0 179 0 4 0.0000 0.0000 0.0219 136.000 4.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0287 0.9713 2 2 0.0000 0.0307 0.9693 2 2 0.0000 0.0337 0.9663
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 612 146 466 4 1 17 11 113 0 0 463 1 2 0.0274 0.0000 0.0064 7.588 0.25 3.27 -3.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9885 0.0115 2 1 0.0000 0.5270 0.4730 2 2 0.0000 0.2276 0.7724
chr3 46976753 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 304 135 169 70 0 6 0 59 0 0 169 0 0 0.5185 0.0000 0.0000 21.500 1.04 2.12 -1.08 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3709 0.5041 0.1250 1 1 0.3672 0.5037 0.1291 1 1 0.3623 0.5032 0.1345
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.050 1 -3 3 374 104 270 34 1 16 5 48 0 0 270 0 0 0.3269 0.0000 0.0000 5.500 0.88 3.62 -2.74 8 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0807 0.4386 0.4806 1 2 0.0850 0.4426 0.4724 1 2 0.0909 0.4477 0.4614
chr3 52693748 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 744 172 572 89 1 3 0 79 0 0 572 0 0 0.5174 0.0000 0.0000 56.333 0.84 4.18 -3.33 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3617 0.5163 0.1219 1 1 0.3589 0.5150 0.1261 1 1 0.3549 0.5133 0.1318
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.050 1 10 2 181 105 76 56 0 6 1 42 0 0 73 0 3 0.5333 0.0000 0.0395 16.500 0.09 7.02 -6.93 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3632 0.5018 0.1351 1 1 0.3595 0.5015 0.1389 1 1 0.3546 0.5013 0.1441
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 230 81 149 0 1 8 36 36 0 0 146 2 1 0.0000 0.0000 0.0201 8.875 3.11 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1497 0.8503 2 2 0.0000 0.1527 0.8473 2 2 0.0000 0.1573 0.8427
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 230 80 150 1 0 5 35 39 0 0 148 0 2 0.0125 0.0000 0.0133 14.800 1.00 3.87 -2.87 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4416 0.5584 2 2 0.0000 0.2392 0.7608 2 2 0.0000 0.1978 0.8022
chr3 63912697 G GCCC 0.500000 0.050 1 3 1 238 59 179 33 0 1 0 25 0 0 178 0 1 0.5593 0.0000 0.0056 58.000 1.06 3.24 -2.18 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3310 0.5033 0.1657 1 1 0.3282 0.5031 0.1687 1 1 0.3245 0.5027 0.1728
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.050 1 -9 3 827 232 595 131 1 11 0 89 0 0 583 0 12 0.5647 0.0000 0.0202 20.091 2.94 9.62 -6.68 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6169 0.3543 0.0288 1 0 0.6065 0.3616 0.0318 1 0 0.5922 0.3714 0.0363
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 467 124 343 58 0 6 0 60 0 0 343 0 0 0.4677 0.0000 0.0000 19.667 0.34 1.30 -0.96 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2097 0.5347 0.2556 1 1 0.2118 0.5321 0.2561 1 1 0.2144 0.5288 0.2567
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 366 99 267 51 0 3 1 44 0 0 265 0 2 0.5152 0.0000 0.0075 32.000 0.22 1.32 -1.10 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2839 0.5250 0.1911 1 1 0.2833 0.5231 0.1936 1 1 0.2824 0.5208 0.1969
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 111 35 76 15 1 2 5 12 0 0 76 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 16.000 0.07 1.75 -1.68 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2386 0.5095 0.2519 1 1 0.2392 0.5088 0.2520 1 1 0.2400 0.5079 0.2521
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1212 312 900 110 4 82 20 96 0 0 899 0 1 0.3526 0.0000 0.0011 2.805 0.24 3.21 -2.97 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1803 0.5665 0.2532 1 1 0.1838 0.5615 0.2547 1 1 0.1883 0.5552 0.2565
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1218 322 896 226 9 66 3 18 0 0 896 0 0 0.7019 0.0000 0.0000 3.938 1.44 7.78 -6.34 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1049 0.8951 0.0000
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.050 1 3 3 512 155 357 85 0 3 0 67 0 0 356 0 1 0.5484 0.0000 0.0028 50.667 0.06 2.94 -2.88 51 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4491 0.4673 0.0836 1 1 0.4428 0.4692 0.0880 1 1 0.4343 0.4718 0.0939
chr3 124763647 TTTGTTGAAC T 0.500000 0.050 1 -9 1 339 146 193 139 0 5 0 2 0 0 192 0 1 0.9521 0.0000 0.0052 28.200 0.32 9.00 -8.68 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1978 0.8022 0.0000 0 0 0.8060 0.1940 0.0000 0 0 0.9018 0.0982 0.0000
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.050 1 18 2 712 128 584 47 0 28 0 53 0 0 584 0 0 0.3672 0.0000 0.0000 3.571 1.98 8.53 -6.55 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1709 0.5197 0.3094 1 1 0.1740 0.5182 0.3078 1 1 0.1781 0.5163 0.3056
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 188 113 75 68 0 0 1 44 0 0 74 0 1 0.6018 0.0000 0.0133 113.000 0.62 1.86 -1.25 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5296 0.4103 0.0601 1 0 0.5201 0.4157 0.0642 1 0 0.5072 0.4228 0.0699
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 369 134 235 128 0 3 0 3 0 0 235 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 43.667 0.73 2.33 -1.61 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1621 0.8379 0.0000 0 0 0.7609 0.2391 0.0000 0 0 0.8760 0.1240 0.0000
chr3 134250569 A AGCGGCG 0.500000 0.050 1 6 1 223 48 175 27 2 4 2 13 0 0 175 0 0 0.5625 0.0000 0.0000 10.500 1.04 5.08 -4.04 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4299 0.4595 0.1106 1 1 0.4231 0.4623 0.1146 1 1 0.4140 0.4659 0.1202
chr3 149520808 C CTTAA 0.500000 0.050 1 4 1 190 61 129 39 0 0 0 22 0 0 128 0 1 0.6393 0.0000 0.0078 61.000 0.05 3.95 -3.90 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4580 0.4479 0.0941 1 1 0.4502 0.4514 0.0984 1 1 0.4400 0.4559 0.1041
chr3 150703740 CTCCTCCTCCTCCTCCACCTCT C 0.500000 0.050 1 -21 2 418 111 307 51 1 26 0 33 0 0 307 0 0 0.4595 0.0000 0.0000 3.269 0.73 8.58 -7.85 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4950 0.4294 0.0756 1 0 0.4862 0.4339 0.0799 1 0 0.4745 0.4397 0.0857
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 293 99 194 90 0 4 0 5 0 0 194 0 0 0.9091 0.0000 0.0000 23.750 0.13 1.00 -0.87 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.2483 0.7517 0.0000 0 0 0.5752 0.4248 0.0000
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 368 148 220 50 1 20 6 71 0 0 217 1 2 0.3378 0.0000 0.0136 6.400 0.66 3.11 -2.45 32 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0354 0.3469 0.6177 1 2 0.0387 0.3553 0.6060 1 2 0.0436 0.3663 0.5901
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.050 1 3 1 533 130 403 5 1 28 0 96 0 0 400 0 3 0.0385 0.0000 0.0074 3.643 0.60 3.28 -2.68 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8243 0.1757 2 2 0.0000 0.4626 0.5374
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 648 184 464 169 0 9 0 6 0 0 464 0 0 0.9185 0.0000 0.0000 19.444 0.14 2.17 -2.02 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0042 0.9958 0.0000 0 0 0.5427 0.4573 0.0000 0 0 0.8611 0.1389 0.0000
chr3 195721040 TTTC T 0.500000 0.050 1 -3 4 200 125 75 121 0 3 0 1 0 0 75 0 0 0.9680 0.0000 0.0000 40.667 0.37 3.00 -2.63 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8042 0.1958 0.0000 0 0 0.9102 0.0898 0.0000 0 0 0.9261 0.0739 0.0000
chr3 195786912 GGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTCACCTGTGGATGCTGAGGAAGGGCTA G 0.500000 0.050 1 -48 1 3644 1028 2616 578 33 245 21 151 214 92 2235 34 41 0.5623 0.0818 0.1456 3.222 2.61 4.86 -2.25 16 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195788495 CGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGGGCT C 0.500000 0.050 1 -48 1 2845 724 2121 354 22 118 9 221 49 48 1930 26 68 0.4890 0.0231 0.0901 5.128 1.51 4.96 -3.45 8 0/1 1/1 . . OK 1 0 0.9967 0.0033 0.0000 1 0 0.9959 0.0041 0.0000 1 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.050 1 15 1 740 173 567 4 0 23 0 146 0 1 535 0 31 0.0231 0.0000 0.0564 6.522 0.25 10.82 -10.57 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9703 0.0297 2 2 0.0000 0.2560 0.7440 2 2 0.0000 0.0830 0.9170
chr3 198153257 CTGGCAGCAGCAG C 0.500000 0.050 1 -12 2 251 96 155 12 2 4 2 76 0 0 154 1 0 0.1250 0.0000 0.0065 22.750 0.17 9.75 -9.58 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.9558 0.0442
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -6 1 250 96 154 1 0 15 0 80 0 0 153 1 0 0.0104 0.0000 0.0065 5.400 0.00 9.53 -9.53 1 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3996 0.6004 2 2 0.0000 0.2092 0.7908 2 2 0.0000 0.1722 0.8278
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -9 1 250 95 155 1 0 15 2 77 0 1 153 0 1 0.0105 0.0000 0.0129 5.333 0.00 9.62 -9.62 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4376 0.5624 2 2 0.0000 0.2330 0.7670 2 2 0.0000 0.1901 0.8099
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.050 1 21 1 485 82 403 12 0 0 0 70 0 0 337 0 66 0.1463 0.0000 0.1638 82.000 0.50 17.53 -17.03 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9686 0.0314 2 2 0.0000 0.4917 0.5083
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.050 1 -6 2 737 297 440 126 0 80 0 91 0 0 432 1 7 0.4242 0.0000 0.0182 2.712 7.71 8.35 -0.65 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6737 0.3108 0.0155 1 0 0.6661 0.3169 0.0170 1 0 0.6557 0.3252 0.0191
chr4 3228683 AGAG A 0.066858 0.050 1 -3 2 386 147 239 128 0 15 0 4 0 0 239 0 0 0.8707 0.0000 0.0000 8.800 0.34 2.25 -1.91 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3382 0.6618 0.0000 0 0 0.9578 0.0422 0.0000 0 0 0.9855 0.0145 0.0000
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.050 1 -6 2 465 145 320 140 0 2 0 3 0 0 320 0 0 0.9655 0.0000 0.0000 71.500 0.22 7.00 -6.78 96 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7940 0.2060 0.0000 0 0 0.9848 0.0152 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 2 661 160 501 7 1 22 5 125 0 1 482 0 18 0.0437 0.0000 0.0379 6.429 0.43 7.40 -6.97 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7692 0.2308 2 2 0.0000 0.3122 0.6878
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 667 208 459 12 2 38 11 145 0 0 449 1 9 0.0577 0.0000 0.0218 4.667 1.92 6.29 -4.37 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9865 0.0135 2 1 0.0000 0.6860 0.3140
chr4 15003704 GCCCGGACCTTCCACA G 0.500000 0.050 1 -15 1 650 115 535 109 0 2 0 4 7 3 523 1 1 0.9478 0.0131 0.0224 56.500 2.05 11.75 -9.70 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.2940 0.7060 0.0000 0 0 0.6673 0.3327 0.0000
chr4 15511381 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 4 366 155 211 135 1 15 0 4 0 0 211 0 0 0.8710 0.0000 0.0000 9.333 0.36 3.25 -2.89 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0428 0.9572 0.0000 0 0 0.6642 0.3358 0.0000 0 0 0.8548 0.1452 0.0000
chr4 56314410 C CGGAGCGGAG 0.500000 0.050 1 9 1 655 121 534 8 0 3 0 110 0 0 500 0 34 0.0661 0.0000 0.0637 39.333 1.00 11.83 -10.83 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8571 0.1429 2 2 0.0000 0.3825 0.6175
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.050 1 18 1 655 121 534 9 3 45 1 63 0 0 500 0 34 0.0744 0.0000 0.0637 1.786 2.33 12.76 -10.43 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9819 0.0181 2 1 0.0000 0.7666 0.2334
chr4 56378269 GTTC G 0.500000 0.050 1 -3 1 243 83 160 42 1 1 0 39 0 0 160 0 0 0.5060 0.0000 0.0000 81.000 0.14 3.03 -2.88 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2842 0.5205 0.1952 1 1 0.2835 0.5190 0.1975 1 1 0.2824 0.5170 0.2006
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 3 435 143 292 135 1 3 0 4 0 7 285 0 0 0.9441 0.0000 0.0240 46.667 0.70 4.25 -3.55 95 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0520 0.9480 0.0000 0 0 0.7074 0.2926 0.0000 0 0 0.8773 0.1227 0.0000
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.050 1 3 1 304 95 209 86 1 2 0 6 0 0 209 0 0 0.9053 0.0000 0.0000 46.500 0.48 3.00 -2.52 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1347 0.8653 0.0000 0 1 0.4642 0.5358 0.0000
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.050 1 3 1 1134 441 693 204 7 74 6 150 0 1 683 1 8 0.4626 0.0000 0.0144 4.932 0.79 3.09 -2.30 114 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7668 0.2265 0.0067 1 0 0.7558 0.2363 0.0079 1 0 0.7403 0.2499 0.0099
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.050 1 18 1 2322 486 1836 303 8 161 7 7 4 2 1822 4 4 0.6235 0.0022 0.0076 2.019 1.33 6.29 -4.96 95 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0951 0.9049 0.0000 0 0 0.8301 0.1699 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.050 1 9 1 3681 798 2883 26 21 45 18 688 46 51 2581 149 56 0.0326 0.0160 0.1048 19.395 3.42 10.02 -6.60 6 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 3883 768 3115 58 5 110 16 579 22 76 2725 97 195 0.0755 0.0071 0.1252 6.019 3.72 10.97 -7.25 26 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 3580 1199 2381 708 92 195 58 146 326 47 1991 10 7 0.5905 0.1369 0.1638 5.227 2.86 4.99 -2.14 108 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 88697332 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 1 526 130 396 115 4 5 0 6 0 0 396 0 0 0.8846 0.0000 0.0000 25.000 0.50 3.83 -3.33 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2543 0.7457 0.0000 0 0 0.6501 0.3499 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.050 1 -3 1 156 73 83 29 1 1 0 42 0 0 82 0 1 0.3973 0.0000 0.0120 72.000 0.10 3.02 -2.92 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1139 0.4739 0.4122 1 1 0.1180 0.4756 0.4063 1 1 0.1236 0.4779 0.3985
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 637 165 472 6 0 6 0 153 0 0 468 0 4 0.0364 0.0000 0.0085 26.500 1.17 4.07 -2.91 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.5337 0.4663 2 2 0.0000 0.1774 0.8226
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 4 498 224 274 0 1 32 10 181 0 0 270 0 4 0.0000 0.0000 0.0146 5.969 3.03 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0094 0.9906 2 2 0.0000 0.0104 0.9896
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 390 120 270 2 2 27 4 85 0 0 253 7 10 0.0167 0.0000 0.0630 3.538 2.00 4.74 -2.74 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9011 0.0989 2 2 0.0000 0.3766 0.6234 2 2 0.0000 0.2099 0.7901
chr4 146639305 T TGGCGGCGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 15 2 390 120 270 50 2 26 6 36 1 1 252 0 16 0.4167 0.0037 0.0667 3.462 3.80 6.78 -2.98 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1955 0.5297 0.2748 1 1 0.1980 0.5274 0.2746 1 1 0.2011 0.5246 0.2742
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 284 93 191 0 0 17 1 75 0 0 183 0 8 0.0000 0.0000 0.0419 4.471 5.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1073 0.8927 2 2 0.0000 0.1114 0.8886 2 2 0.0000 0.1173 0.8827
chr4 168878233 A ACCG 0.500000 0.050 1 3 2 531 139 392 64 0 10 2 63 0 0 391 1 0 0.4604 0.0000 0.0026 12.900 0.56 3.59 -3.02 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2087 0.5384 0.2529 1 1 0.2108 0.5355 0.2536 1 1 0.2136 0.5319 0.2545
chr4 173332125 TTCC T 0.500000 0.050 1 -3 1 145 48 97 24 0 4 1 19 0 0 97 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 11.000 0.29 3.21 -2.92 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2937 0.5086 0.1977 1 1 0.2923 0.5079 0.1998 1 1 0.2904 0.5071 0.2025
chr4 184694537 ACAGATGAAG A 0.500000 0.050 1 -9 2 274 78 196 45 0 5 0 28 0 0 194 0 2 0.5769 0.0000 0.0102 14.600 0.22 10.18 -9.96 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4403 0.4598 0.0999 1 1 0.4334 0.4624 0.1041 1 1 0.4242 0.4659 0.1099
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.050 1 -12 4 216 88 128 76 0 9 0 3 1 0 127 0 0 0.8636 0.0078 0.0078 8.778 0.80 12.67 -11.86 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2700 0.7300 0.0000 0 0 0.8654 0.1346 0.0000 0 0 0.9368 0.0632 0.0000
chr5 56815575 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 4 286 83 203 42 0 6 0 35 0 0 202 0 1 0.5060 0.0000 0.0049 12.833 0.83 3.49 -2.65 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3154 0.5125 0.1721 1 1 0.3134 0.5116 0.1750 1 1 0.3107 0.5104 0.1789
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 702 159 543 68 1 32 3 55 0 0 543 0 0 0.4277 0.0000 0.0000 3.969 0.19 3.38 -3.19 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3714 0.5035 0.1251 1 1 0.3677 0.5031 0.1292 1 1 0.3627 0.5027 0.1347
chr5 61332701 CGGCGGCGGCGCG C 0.500000 0.050 1 -12 2 326 49 277 19 0 13 0 17 0 0 273 1 3 0.3878 0.0000 0.0144 2.769 5.63 13.94 -8.31 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2203 0.5110 0.2687 1 1 0.2216 0.5102 0.2682 1 1 0.2233 0.5091 0.2676
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.050 1 -15 4 304 26 278 0 0 13 0 13 0 2 269 1 6 0.0000 0.0000 0.0324 1.000 10.69 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4946 0.5054 2 2 0.0000 0.4670 0.5330 2 2 0.0000 0.4474 0.5526
chr5 61332791 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 281 32 249 8 0 15 0 9 1 2 240 5 1 0.2500 0.0040 0.0361 1.133 6.00 4.11 1.89 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2026 0.5033 0.2941 1 1 0.2045 0.5030 0.2925 1 1 0.2069 0.5027 0.2904
chr5 66596939 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 376 93 283 80 0 5 0 8 3 2 278 0 0 0.8602 0.0106 0.0177 17.600 1.51 4.12 -2.61 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0372 0.9628 0.0000 0 1 0.2804 0.7196 0.0000
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.050 1 -6 1 380 113 267 60 0 4 0 49 0 0 265 0 2 0.5310 0.0000 0.0075 27.250 0.27 5.63 -5.37 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3474 0.5099 0.1427 1 1 0.3445 0.5091 0.1464 1 1 0.3405 0.5081 0.1514
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 3 478 126 352 7 0 4 0 115 0 0 347 0 5 0.0556 0.0000 0.0142 30.500 0.00 3.30 -3.30 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8475 0.1525 2 2 0.0000 0.4316 0.5684
chr5 78015515 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 138 70 68 31 0 1 0 38 0 0 68 0 0 0.4429 0.0000 0.0000 69.000 0.06 3.21 -3.15 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1646 0.5064 0.3290 1 1 0.1678 0.5059 0.3264 1 1 0.1719 0.5053 0.3229
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.050 1 -18 1 328 77 251 25 7 9 2 34 0 0 249 0 2 0.3247 0.0000 0.0080 7.444 7.28 14.74 -7.46 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1782 0.5118 0.3101 1 1 0.1809 0.5109 0.3082 1 1 0.1846 0.5097 0.3057
chr5 80654908 GCAGCGCCCC G 0.500000 0.050 1 -9 2 320 66 254 0 1 7 2 56 0 0 252 0 2 0.0000 0.0000 0.0079 8.286 15.21 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2079 0.7921 2 2 0.0000 0.2086 0.7914 2 2 0.0000 0.2112 0.7888
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.050 1 -9 1 325 66 259 1 3 2 6 54 0 0 256 0 3 0.0152 0.0000 0.0116 64.000 1.00 16.24 -15.24 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9799 0.0201 2 1 0.0000 0.7182 0.2818 2 2 0.0000 0.4848 0.5152
chr5 94653283 G GA 0.500000 0.050 1 1 2 161 70 91 31 0 5 0 34 0 0 90 1 0 0.4429 0.0000 0.0110 13.000 0.26 1.03 -0.77 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1973 0.5157 0.2871 1 1 0.1995 0.5145 0.2861 1 1 0.2023 0.5130 0.2847
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 244 100 144 61 0 1 0 38 0 0 144 0 0 0.6100 0.0000 0.0000 99.000 0.15 3.03 -2.88 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5474 0.3963 0.0563 1 0 0.5371 0.4026 0.0603 1 0 0.5233 0.4107 0.0659
chr5 113488327 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 1 216 102 114 50 0 15 1 36 0 0 114 0 0 0.4902 0.0000 0.0000 5.800 1.62 3.33 -1.71 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4092 0.4780 0.1129 1 1 0.4036 0.4794 0.1170 1 1 0.3961 0.4813 0.1226
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 216 100 116 79 4 13 1 3 0 0 115 0 1 0.7900 0.0000 0.0086 6.692 2.18 5.00 -2.82 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0090 0.9910 0.0000 0 1 0.3027 0.6973 0.0000 0 0 0.5840 0.4160 0.0000
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 1176 260 916 126 3 30 2 99 2 3 897 6 8 0.4846 0.0022 0.0207 7.931 0.73 4.05 -3.32 44 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4416 0.4856 0.0728 1 1 0.4368 0.4861 0.0772 1 1 0.4300 0.4867 0.0832
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.050 1 -1 2 534 130 404 59 0 5 0 66 0 0 404 0 0 0.4538 0.0000 0.0000 25.000 0.27 1.35 -1.08 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1590 0.5235 0.3176 1 1 0.1624 0.5217 0.3159 1 1 0.1670 0.5194 0.3136
chr5 139848487 CCCGGGT C 0.500000 0.050 1 -6 3 302 35 267 16 1 4 2 12 0 0 266 0 1 0.4571 0.0000 0.0037 7.250 2.00 6.00 -4.00 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2700 0.5083 0.2217 1 1 0.2694 0.5077 0.2229 1 1 0.2686 0.5069 0.2245
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.050 1 2 1 221 100 121 95 1 1 1 2 0 0 120 0 1 0.9500 0.0000 0.0083 99.000 0.21 5.00 -4.79 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0217 0.9783 0.0000 0 1 0.4371 0.5629 0.0000 0 0 0.6967 0.3033 0.0000
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 221 100 121 96 1 0 1 2 0 0 120 1 0 0.9600 0.0000 0.0083 100.000 0.21 5.00 -4.79 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0604 0.9396 0.0000 0 0 0.5160 0.4840 0.0000 0 0 0.7256 0.2744 0.0000
chr5 140966860 TTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -6 1 544 143 401 76 0 8 0 59 0 0 401 0 0 0.5315 0.0000 0.0000 16.875 0.24 6.41 -6.17 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4537 0.4618 0.0845 1 1 0.4471 0.4641 0.0888 1 1 0.4380 0.4672 0.0948
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 864 253 611 229 3 5 0 16 0 0 610 0 1 0.9051 0.0000 0.0016 49.600 0.28 1.31 -1.03 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 1 0.3219 0.6781 0.0000
chr5 141573996 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 608 152 456 110 4 32 3 3 0 0 456 0 0 0.7237 0.0000 0.0000 3.688 0.45 3.33 -2.89 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0054 0.9946 0.0000 0 1 0.3451 0.6549 0.0000 0 0 0.6817 0.3183 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTG 0.500000 0.050 1 6 1 378 102 276 43 0 11 1 47 0 0 272 0 4 0.4216 0.0000 0.0145 8.273 0.30 5.34 -5.04 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1446 0.5054 0.3500 1 1 0.1482 0.5049 0.3469 1 1 0.1531 0.5044 0.3425
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 9 1 378 102 276 43 4 7 1 47 0 0 272 0 4 0.4216 0.0000 0.0145 13.571 0.30 5.34 -5.04 11 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1847 0.5237 0.2916 1 1 0.1874 0.5219 0.2907 1 1 0.1909 0.5197 0.2894
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 18 1 318 110 208 77 3 23 0 7 1 0 207 0 0 0.7000 0.0048 0.0048 3.783 1.78 5.14 -3.36 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0639 0.9361 0.0000 0 1 0.3393 0.6607 0.0000
chr5 146878727 AGCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 318 110 208 47 1 20 1 41 0 1 207 0 0 0.4273 0.0000 0.0048 4.500 1.00 3.15 -2.15 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3248 0.5129 0.1623 1 1 0.3226 0.5119 0.1655 1 1 0.3195 0.5107 0.1698
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 596 126 470 121 0 2 0 3 0 0 470 0 0 0.9603 0.0000 0.0000 62.000 0.30 2.00 -1.70 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1382 0.8618 0.0000 0 0 0.7278 0.2722 0.0000 0 0 0.8565 0.1435 0.0000
chr5 150656742 ACCGCCCCCGCCC A 0.500000 0.050 1 -12 2 526 114 412 48 1 19 0 46 0 0 411 0 1 0.4211 0.0000 0.0024 4.947 5.08 11.26 -6.18 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2568 0.5282 0.2150 1 1 0.2571 0.5261 0.2168 1 1 0.2575 0.5234 0.2191
chr5 156757714 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 1 296 122 174 72 0 1 0 49 0 0 171 0 3 0.5902 0.0000 0.0172 121.000 0.14 3.04 -2.90 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4972 0.4331 0.0697 1 0 0.4889 0.4373 0.0739 1 0 0.4776 0.4426 0.0798
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 348 104 244 57 0 3 0 44 0 0 241 0 3 0.5481 0.0000 0.0123 33.667 2.88 4.93 -2.05 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3627 0.5024 0.1349 1 1 0.3591 0.5021 0.1388 1 1 0.3542 0.5018 0.1439
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.050 1 -15 1 346 153 193 119 1 9 11 13 0 0 193 0 0 0.7778 0.0000 0.0000 16.000 3.76 7.85 -4.09 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0073 0.9927 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.050 1 3 1 346 147 199 0 6 4 0 137 0 0 198 0 1 0.0000 0.0000 0.0050 35.750 3.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9813 0.0187 2 1 0.0000 0.5196 0.4804 2 2 0.0000 0.2190 0.7810
chr5 157108936 T TAGC 0.500000 0.050 1 3 1 128 62 66 35 1 5 0 21 0 0 66 0 0 0.5645 0.0000 0.0000 11.400 0.06 2.90 -2.85 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4447 0.4543 0.1009 1 1 0.4375 0.4574 0.1051 1 1 0.4278 0.4614 0.1108
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 180 66 114 0 23 6 1 36 0 0 114 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.833 3.39 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1048 0.4590 0.4362 1 1 0.1089 0.4618 0.4293 1 1 0.1146 0.4654 0.4200
chr5 168454037 GGGA G 0.500000 0.050 1 -3 1 180 67 113 6 33 2 1 25 0 0 112 0 1 0.0896 0.0000 0.0088 32.500 0.33 3.28 -2.95 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3957 0.4802 0.1242 1 1 0.3904 0.4815 0.1281 1 1 0.3833 0.4833 0.1334
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 1 436 120 316 56 1 9 0 54 0 0 314 0 2 0.4667 0.0000 0.0063 12.333 0.96 3.80 -2.83 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2444 0.5342 0.2214 1 1 0.2453 0.5316 0.2231 1 1 0.2464 0.5283 0.2252
chr5 181050253 AC A 0.500000 0.050 1 -1 2 264 66 198 63 0 1 0 2 0 0 198 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 65.000 0.11 1.50 -1.39 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1591 0.8409 0.0000 0 0 0.5548 0.4452 0.0000 0 0 0.6830 0.3170 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 600 115 485 4 0 14 0 97 0 0 485 0 0 0.0348 0.0000 0.0000 7.214 1.50 3.05 -1.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9835 0.0165 2 1 0.0000 0.5693 0.4307 2 2 0.0000 0.3018 0.6982
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.050 1 3 5 444 111 333 8 0 16 0 87 0 1 326 3 3 0.0721 0.0000 0.0210 5.938 0.00 3.48 -3.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9729 0.0271 2 1 0.0000 0.7386 0.2614
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.050 1 3 1 526 121 405 83 4 24 4 6 4 2 399 0 0 0.6860 0.0099 0.0148 4.174 2.20 3.67 -1.46 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.2156 0.7844 0.0000 0 0 0.6628 0.3372 0.0000
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.050 1 3 1 468 106 362 43 3 13 1 46 2 2 354 2 2 0.4057 0.0055 0.0221 7.750 1.14 3.78 -2.64 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3578 0.5318 0.1104 1 1 0.3596 0.5295 0.1109 1 1 0.3620 0.5265 0.1115
chr6 7727289 G GAGC 0.018903 0.050 1 3 2 547 127 420 58 2 12 1 54 0 0 420 0 0 0.4567 0.0000 0.0000 9.583 0.60 3.26 -2.66 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5194 0.4745 0.0061 1 0 0.5196 0.4742 0.0062 1 0 0.5196 0.4740 0.0064
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.050 1 3 2 1774 416 1358 37 6 130 11 232 0 0 1342 1 15 0.0889 0.0000 0.0118 2.192 1.00 3.69 -2.69 17 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 17600553 GGCCCCGGGCCGGCCCACA G 0.000569 0.050 1 -18 1 328 87 241 28 0 14 0 45 0 0 235 0 6 0.3218 0.0000 0.0249 5.214 0.96 13.00 -12.04 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2252 0.7736 0.0012 1 1 0.2342 0.7646 0.0012 1 1 0.2464 0.7525 0.0011
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.050 1 16 3 1425 305 1120 8 0 9 0 288 0 0 1066 0 54 0.0262 0.0000 0.0482 32.889 0.88 11.44 -10.57 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9954 0.0046 2 2 0.0000 0.1037 0.8963 2 2 0.0000 0.0135 0.9865
chr6 29828657 AC A 0.500000 0.050 1 -1 2 423 117 306 9 0 1 0 107 0 0 306 0 0 0.0769 0.0000 0.0000 116.000 0.44 2.13 -1.69 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9665 0.0335 2 1 0.0000 0.6849 0.3151
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 387 110 277 2 0 3 1 104 0 0 277 0 0 0.0182 0.0000 0.0000 35.667 0.00 1.27 -1.27 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6475 0.3525 2 2 0.0000 0.2217 0.7783 2 2 0.0000 0.1450 0.8550
chr6 31028873 A ACCTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAG 0.500000 0.050 1 30 2 2623 630 1993 185 13 258 15 159 18 33 1786 46 110 0.2937 0.0090 0.1039 1.403 2.37 4.00 -1.63 13 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0508 0.9491 1 2 0.0002 0.0565 0.9432 1 2 0.0004 0.0653 0.9344
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 1 839 226 613 219 1 3 0 3 0 0 613 0 0 0.9690 0.0000 0.0000 74.000 1.15 5.67 -4.52 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6538 0.3462 0.0000 0 0 0.9683 0.0317 0.0000 0 0 0.9846 0.0154 0.0000
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 499 121 378 61 54 4 0 2 0 2 376 0 0 0.5041 0.0000 0.0053 15.750 0.25 2.50 -2.25 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4007 0.5993 0.0000 0 0 0.8050 0.1950 0.0000 0 0 0.8726 0.1274 0.0000
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 499 121 378 61 2 4 0 54 0 0 376 1 1 0.5041 0.0000 0.0053 29.250 0.25 2.52 -2.27 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3167 0.5220 0.1612 1 1 0.3151 0.5204 0.1646 1 1 0.3127 0.5183 0.1690
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 11 1 572 164 408 151 1 4 2 6 0 0 408 0 0 0.9207 0.0000 0.0000 53.333 2.50 5.17 -2.66 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1935 0.8065 0.0000 0 0 0.6759 0.3241 0.0000
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.050 1 -12 1 523 169 354 153 0 7 0 9 0 0 354 0 0 0.9053 0.0000 0.0000 23.143 0.10 9.78 -9.68 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0964 0.9036 0.0000 0 0 0.5801 0.4199 0.0000
chr6 31630711 TAGG T 0.500000 0.050 1 -3 3 308 131 177 71 0 0 0 60 0 0 176 0 1 0.5420 0.0000 0.0056 131.000 0.41 3.47 -3.06 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3565 0.5109 0.1326 1 1 0.3534 0.5100 0.1366 1 1 0.3492 0.5089 0.1419
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 459 126 333 112 1 11 0 2 0 0 332 0 1 0.8889 0.0000 0.0030 10.455 0.69 3.50 -2.81 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1145 0.8855 0.0000 0 0 0.6865 0.3135 0.0000 0 0 0.8311 0.1689 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 272 66 206 36 0 2 0 28 0 0 206 0 0 0.5455 0.0000 0.0000 32.000 0.11 4.39 -4.28 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3437 0.5005 0.1558 1 1 0.3405 0.5004 0.1591 1 1 0.3361 0.5003 0.1635
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.050 1 6 5 420 143 277 53 0 19 0 71 0 0 274 0 3 0.3706 0.0000 0.0108 6.526 0.47 5.31 -4.84 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0642 0.4236 0.5122 1 2 0.0684 0.4283 0.5034 1 2 0.0742 0.4343 0.4915
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.050 1 1 2 810 227 583 214 2 8 0 3 0 0 583 0 0 0.9427 0.0000 0.0000 27.125 0.38 1.33 -0.95 136 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6508 0.3492 0.0000 0 0 0.9654 0.0346 0.0000 0 0 0.9830 0.0170 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 1170 278 892 9 118 8 0 143 0 1 887 1 3 0.0324 0.0000 0.0056 38.429 3.33 3.48 -0.15 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0564 0.4597 0.4838 1 2 0.0605 0.4616 0.4779 1 2 0.0663 0.4642 0.4695
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 315 84 231 32 0 9 1 42 0 0 228 0 3 0.3810 0.0000 0.0130 8.333 0.53 6.71 -6.18 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1067 0.4684 0.4250 1 1 0.1108 0.4705 0.4187 1 1 0.1165 0.4732 0.4103
chr6 43021695 CCGGGGCCCGACGTCCCCG C 0.500000 0.050 1 -18 4 315 102 213 94 0 5 0 3 0 0 213 0 0 0.9216 0.0000 0.0000 19.400 2.88 12.33 -9.45 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0738 0.9262 0.0000 0 0 0.5786 0.4214 0.0000 0 0 0.7578 0.2422 0.0000
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 682 160 522 133 2 22 0 3 0 1 521 0 0 0.8313 0.0000 0.0019 6.273 0.71 3.00 -2.29 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1862 0.8138 0.0000 0 0 0.7942 0.2058 0.0000 0 0 0.8952 0.1048 0.0000
chr6 44002766 C CGCG 0.500000 0.050 1 3 1 438 93 345 34 4 25 2 28 0 0 342 0 3 0.3656 0.0000 0.0087 2.720 1.79 4.75 -2.96 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3034 0.5137 0.1829 1 1 0.3018 0.5126 0.1855 1 1 0.2997 0.5113 0.1890
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 15 2 896 180 716 2 0 95 1 82 0 0 670 0 46 0.0111 0.0000 0.0642 0.895 15.00 4.55 10.45 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.5048 0.4952 2 2 0.0000 0.1364 0.8636 2 2 0.0000 0.0872 0.9128
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 30 2 896 180 716 3 0 111 2 64 0 0 672 1 43 0.0167 0.0000 0.0615 0.633 15.33 2.48 12.85 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8865 0.1135 2 2 0.0000 0.3192 0.6808 2 2 0.0000 0.1726 0.8274
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.050 1 -15 2 912 259 653 175 0 81 0 3 0 0 653 0 0 0.6757 0.0000 0.0000 2.198 2.61 10.33 -7.72 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3800 0.6200 0.0000 0 0 0.9099 0.0901 0.0000 0 0 0.9561 0.0439 0.0000
chr6 87284268 T TA 0.500000 0.050 1 1 7 513 151 362 87 0 4 1 59 0 0 362 0 0 0.5762 0.0000 0.0000 36.750 0.52 2.20 -1.69 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5890 0.3703 0.0407 1 0 0.5782 0.3776 0.0442 1 0 0.5635 0.3871 0.0494
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 661 113 548 57 3 23 1 29 0 0 539 3 6 0.5044 0.0000 0.0164 3.870 1.82 5.34 -3.52 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5310 0.4074 0.0616 1 0 0.5212 0.4131 0.0657 1 0 0.5081 0.4205 0.0714
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.050 1 -6 1 1648 415 1233 325 5 17 0 68 2 1 1221 0 9 0.7831 0.0016 0.0097 23.412 1.29 6.90 -5.61 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9986 0.0014 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 1 590 160 430 81 0 4 1 74 0 0 427 0 3 0.5062 0.0000 0.0070 39.000 0.35 2.88 -2.53 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2606 0.5457 0.1937 1 1 0.2613 0.5423 0.1964 1 1 0.2621 0.5379 0.2000
chr6 109659228 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 171 37 134 19 0 1 0 17 0 0 132 0 2 0.5135 0.0000 0.0149 36.000 1.00 4.76 -3.76 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2442 0.5116 0.2442 1 1 0.2446 0.5107 0.2446 1 1 0.2452 0.5096 0.2452
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.050 1 3 2 732 166 566 0 0 11 2 153 0 0 558 0 8 0.0000 0.0000 0.0141 14.000 3.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0163 0.9837 2 2 0.0000 0.0177 0.9823 2 2 0.0000 0.0198 0.9802
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.050 1 2 1 642 129 513 58 0 2 0 69 0 0 510 1 2 0.4496 0.0000 0.0058 63.500 0.05 6.35 -6.30 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1035 0.4842 0.4124 1 1 0.1077 0.4851 0.4072 1 1 0.1136 0.4863 0.4001
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 316 114 202 108 0 4 0 2 0 0 202 0 0 0.9474 0.0000 0.0000 27.500 0.19 1.00 -0.81 86 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3734 0.6266 0.0000 0 0 0.7911 0.2089 0.0000 0 0 0.8637 0.1363 0.0000
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 2 845 205 640 0 0 7 1 197 0 0 635 0 5 0.0000 0.0000 0.0078 28.143 3.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0060 0.9940 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0077 0.9923
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.050 1 -18 1 553 196 357 0 0 35 0 161 0 0 335 0 22 0.0000 0.0000 0.0616 4.600 14.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0108 0.9892 2 2 0.0000 0.0123 0.9877
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.050 1 -3 5 420 156 264 90 1 0 0 65 0 0 263 0 1 0.5769 0.0000 0.0038 156.000 0.41 5.26 -4.85 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5583 0.3942 0.0474 1 0 0.5485 0.4003 0.0512 1 0 0.5351 0.4082 0.0567
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.050 1 -3 1 183 61 122 29 0 3 0 29 0 0 122 0 0 0.4754 0.0000 0.0000 19.333 7.48 10.24 -2.76 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2411 0.5177 0.2411 1 1 0.2418 0.5164 0.2418 1 1 0.2427 0.5147 0.2427
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.050 1 -8 2 183 57 126 1 0 3 1 52 0 0 126 0 0 0.0175 0.0000 0.0000 18.000 0.00 9.81 -9.81 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5742 0.4258 2 2 0.0000 0.3455 0.6545 2 2 0.0000 0.2893 0.7107
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 291 130 161 3 0 15 5 107 0 0 156 3 2 0.0231 0.0000 0.0311 7.667 0.00 3.21 -3.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8755 0.1245 2 2 0.0000 0.2929 0.7071 2 2 0.0000 0.1559 0.8441
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 926 306 620 8 2 17 125 154 0 0 620 0 0 0.0261 0.0000 0.0000 12.067 7.75 10.68 -2.93 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 2 0.0000 0.4341 0.5659 2 2 0.0000 0.0627 0.9373
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 2 260 82 178 45 0 5 0 32 0 0 176 0 2 0.5488 0.0000 0.0112 15.400 0.13 4.19 -4.05 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3823 0.4888 0.1288 1 1 0.3777 0.4896 0.1327 1 1 0.3715 0.4905 0.1380
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.050 1 4 1 259 82 177 32 2 14 0 34 0 3 173 0 1 0.3902 0.0000 0.0226 5.077 3.81 3.88 -0.07 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2568 0.5208 0.2224 1 1 0.2570 0.5193 0.2238 1 1 0.2571 0.5173 0.2256
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.050 1 -4 1 259 83 176 35 4 12 0 32 0 0 173 0 3 0.4217 0.0000 0.0170 5.917 3.46 3.81 -0.36 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2880 0.5178 0.1942 1 1 0.2870 0.5164 0.1965 1 1 0.2857 0.5147 0.1996
chr7 5489915 A AG 0.500000 0.050 1 1 2 278 69 209 29 1 1 0 38 0 0 209 0 0 0.4203 0.0000 0.0000 68.000 1.17 1.34 -0.17 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1552 0.5016 0.3432 1 1 0.1586 0.5014 0.3400 1 1 0.1630 0.5012 0.3358
chr7 6484057 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 1 96 47 49 21 0 9 0 17 1 0 48 0 0 0.4468 0.0204 0.0204 4.222 0.62 3.06 -2.44 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3079 0.5043 0.1878 1 1 0.3058 0.5040 0.1901 1 1 0.3032 0.5036 0.1932
chr7 11831843 A AGCAGCG 0.500000 0.050 1 6 2 177 92 85 46 1 9 0 36 0 0 83 0 2 0.5000 0.0000 0.0235 9.111 0.98 6.28 -5.30 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3503 0.5029 0.1468 1 1 0.3470 0.5026 0.1503 1 1 0.3426 0.5023 0.1551
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 653 207 446 1 0 34 10 162 0 0 446 0 0 0.0048 0.0000 0.0000 5.088 0.00 2.98 -2.98 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0634 0.9366 2 2 0.0000 0.0274 0.9726 2 2 0.0000 0.0230 0.9770
chr7 26152597 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 291 81 210 42 1 7 0 31 0 0 210 0 0 0.5185 0.0000 0.0000 10.571 0.71 3.00 -2.29 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3961 0.4816 0.1223 1 1 0.3909 0.4829 0.1262 1 1 0.3839 0.4845 0.1316
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.050 1 1 3 123 45 78 33 2 1 1 8 0 1 77 0 0 0.7333 0.0000 0.0128 43.000 0.09 3.00 -2.91 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5322 0.4302 0.0377 0 1 0.1392 0.8505 0.0103 0 1 0.1071 0.8918 0.0011
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 202 51 151 22 0 2 0 27 0 0 150 0 1 0.4314 0.0000 0.0066 24.500 0.09 3.63 -3.54 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1764 0.5044 0.3192 1 1 0.1791 0.5041 0.3168 1 1 0.1827 0.5037 0.3136
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 215 94 121 47 0 5 0 42 0 0 121 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 17.800 0.26 2.88 -2.63 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2984 0.5196 0.1820 1 1 0.2971 0.5181 0.1847 1 1 0.2954 0.5163 0.1883
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 995 215 780 2 3 97 5 108 2 1 765 5 7 0.0093 0.0026 0.0192 1.206 7.00 5.01 1.99 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9979 0.0021 2 1 0.0000 0.8058 0.1942 2 2 0.0000 0.4482 0.5518
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.050 1 2 1 988 212 776 2 94 4 5 107 3 1 765 1 6 0.0094 0.0039 0.0142 29.500 7.00 5.07 1.93 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0031 0.1267 0.8702 1 2 0.0038 0.1374 0.8588 1 2 0.0050 0.1526 0.8424
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 372 112 260 0 0 0 1 111 0 0 258 0 2 0.0000 0.0000 0.0077 112.000 1.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0537 0.9463 2 2 0.0000 0.0567 0.9433 2 2 0.0000 0.0611 0.9389
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 5 868 202 666 0 0 12 0 190 0 0 656 0 10 0.0000 0.0000 0.0150 15.833 3.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.050 1 3 2 561 158 403 66 0 21 1 70 0 0 399 1 3 0.4177 0.0000 0.0099 6.524 0.73 3.51 -2.79 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1419 0.5202 0.3379 1 1 0.1457 0.5186 0.3356 1 1 0.1509 0.5167 0.3325
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.050 1 3 1 228 81 147 1 0 1 0 79 0 0 144 0 3 0.0123 0.0000 0.0204 80.000 9.00 3.10 5.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3939 0.6061 2 2 0.0000 0.2052 0.7948 2 2 0.0000 0.1688 0.8312
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.050 1 -35 1 157 48 109 36 0 1 0 11 0 0 106 0 3 0.7500 0.0000 0.0275 47.000 1.67 28.91 -27.24 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5464 0.3915 0.0621 1 0 0.5356 0.3983 0.0661 1 0 0.5202 0.4081 0.0717
chr7 102541185 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 490 148 342 119 4 2 0 23 0 0 342 0 0 0.8041 0.0000 0.0000 73.000 0.60 1.26 -0.66 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0037 0.9963 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 569 157 412 83 0 5 1 68 0 0 411 0 1 0.5287 0.0000 0.0024 30.400 0.63 3.03 -2.40 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3931 0.4983 0.1086 1 1 0.3889 0.4982 0.1129 1 1 0.3831 0.4981 0.1188
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 457 111 346 0 0 35 3 73 0 0 336 0 10 0.0000 0.0000 0.0289 2.375 6.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1065 0.8935 2 2 0.0000 0.1104 0.8896 2 2 0.0000 0.1161 0.8839
chr7 121064295 ATAGT A 0.500000 0.050 1 -4 3 151 84 67 45 0 1 0 38 0 0 67 0 0 0.5357 0.0000 0.0000 83.000 0.80 4.68 -3.88 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3261 0.5107 0.1632 1 1 0.3237 0.5098 0.1664 1 1 0.3205 0.5088 0.1706
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 715 185 530 162 0 17 0 6 0 0 530 0 0 0.8757 0.0000 0.0000 9.882 0.69 4.00 -3.31 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0033 0.9967 0.0000 0 1 0.4971 0.5029 0.0000 0 0 0.8394 0.1606 0.0000
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 715 212 503 186 0 22 0 4 0 0 503 0 0 0.8774 0.0000 0.0000 8.636 0.65 3.50 -2.85 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1394 0.8606 0.0000 0 0 0.8744 0.1256 0.0000 0 0 0.9523 0.0477 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.050 1 -30 3 623 198 425 99 0 31 1 67 1 0 422 0 2 0.5000 0.0024 0.0071 5.355 0.38 17.70 -17.32 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6237 0.3448 0.0315 1 0 0.6124 0.3530 0.0347 1 0 0.5968 0.3638 0.0393
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.050 1 6 1 317 158 159 116 10 24 2 6 1 1 157 0 0 0.7342 0.0063 0.0126 5.417 8.74 4.17 4.57 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1052 0.8948 0.0000 0 0 0.5208 0.4792 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.050 1 -6 1 317 160 157 6 1 19 2 132 0 0 153 1 3 0.0375 0.0000 0.0255 7.421 4.17 8.35 -4.18 6 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.7740 0.2260 2 2 0.0000 0.3276 0.6724
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.050 1 -12 1 318 167 151 13 5 85 7 57 0 0 149 0 2 0.0778 0.0000 0.0132 0.894 2.46 10.98 -8.52 9 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0223 0.2765 0.7013 1 2 0.0250 0.2875 0.6876 1 2 0.0289 0.3036 0.6676
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 213 69 144 1 0 0 0 68 0 0 141 0 3 0.0145 0.0000 0.0208 69.000 4.00 3.35 0.65 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4615 0.5385 2 2 0.0000 0.2529 0.7471 2 2 0.0000 0.2091 0.7909
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.050 1 19 1 168 69 99 28 0 18 0 23 0 0 97 0 2 0.4058 0.0000 0.0202 2.833 0.07 9.17 -9.10 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2791 0.5134 0.2075 1 1 0.2783 0.5124 0.2093 1 1 0.2772 0.5112 0.2116
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 3 870 233 637 12 9 41 4 167 0 0 631 1 5 0.0515 0.0000 0.0094 4.683 0.17 3.21 -3.04 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9710 0.0290
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 3 870 244 626 194 4 37 1 8 0 0 626 0 0 0.7951 0.0000 0.0000 5.595 2.69 3.38 -0.68 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2475 0.7525 0.0000 0 0 0.8028 0.1972 0.0000
chr7 143510991 CT C 0.500000 0.050 1 -1 3 1438 394 1044 383 1 0 0 10 0 0 1044 0 0 0.9721 0.0000 0.0000 394.000 1.26 3.00 -1.74 221 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.9425 0.0575 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 2086 504 1582 0 0 15 0 489 0 0 1581 0 1 0.0000 0.0000 0.0006 32.600 1.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 672 130 542 2 0 5 0 123 0 0 535 0 7 0.0154 0.0000 0.0129 25.000 0.50 4.03 -3.53 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4983 0.5017 2 2 0.0000 0.1335 0.8665 2 2 0.0000 0.0853 0.9147
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.050 1 -4 3 221 63 158 0 0 7 0 56 0 0 153 0 5 0.0000 0.0000 0.0316 8.000 4.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1773 0.8227 2 2 0.0000 0.1818 0.8182 2 2 0.0000 0.1881 0.8119
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 692 170 522 161 0 1 0 8 0 0 522 0 0 0.9471 0.0000 0.0000 169.000 0.71 2.12 -1.42 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2036 0.7964 0.0000 0 0 0.7087 0.2913 0.0000
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 437 125 312 122 0 1 0 2 0 0 312 0 0 0.9760 0.0000 0.0000 124.000 1.00 1.00 0.00 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4551 0.5449 0.0000 0 0 0.8422 0.1578 0.0000 0 0 0.8986 0.1014 0.0000
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.050 1 -12 2 691 202 489 115 0 3 1 83 0 0 482 0 7 0.5693 0.0000 0.0143 66.333 0.70 10.42 -9.72 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5324 0.4180 0.0496 1 0 0.5240 0.4225 0.0535 1 0 0.5125 0.4285 0.0590
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 600 85 515 0 1 3 14 67 1 0 485 10 19 0.0000 0.0019 0.0583 27.000 7.37 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.2513 0.7487 2 2 0.0000 0.1268 0.8732 2 2 0.0000 0.1036 0.8964
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 605 85 520 0 0 7 7 71 0 0 492 7 21 0.0000 0.0000 0.0538 15.600 7.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0619 0.9381 2 2 0.0000 0.0651 0.9349 2 2 0.0000 0.0699 0.9301
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 620 74 546 0 1 1 2 70 0 1 466 40 39 0.0000 0.0000 0.1465 73.000 7.64 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0583 0.9417 2 2 0.0000 0.0451 0.9549 2 2 0.0000 0.0412 0.9588
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 362 82 280 41 1 4 0 36 0 0 278 0 2 0.5000 0.0000 0.0071 19.250 0.61 3.39 -2.78 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2848 0.5199 0.1953 1 1 0.2840 0.5184 0.1976 1 1 0.2829 0.5165 0.2006
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.050 1 -6 2 772 182 590 77 1 27 0 77 1 0 588 0 1 0.4231 0.0017 0.0034 5.704 0.47 6.13 -5.66 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2153 0.5483 0.2364 1 1 0.2166 0.5447 0.2386 1 1 0.2183 0.5402 0.2414
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.050 1 -3 1 248 89 159 83 0 2 0 4 0 0 159 0 0 0.9326 0.0000 0.0000 43.500 0.16 2.50 -2.34 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0140 0.9860 0.0000 0 1 0.3917 0.6083 0.0000 0 0 0.6654 0.3346 0.0000
chr8 10610095 C CCTCTTCTTGCAGCCCTTCTATTACTTTAGTCCCCTCTAACTGCACCCT 0.000003 0.050 1 48 5 1048 299 749 32 4 15 2 246 0 0 747 0 2 0.1070 0.0000 0.0027 20.143 0.75 4.13 -3.38 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.050 1 -6 1 502 237 265 0 0 29 1 207 0 0 265 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.172 5.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.050 1 -6 2 331 120 211 78 0 1 0 41 0 0 209 0 2 0.6500 0.0000 0.0095 119.000 0.63 7.07 -6.44 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7908 0.2030 0.0062 1 0 0.7811 0.2119 0.0070 1 0 0.7676 0.2242 0.0082
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.050 1 -1 2 243 102 141 96 0 2 0 4 0 0 141 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 100.000 0.31 3.00 -2.69 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0380 0.9620 0.0000 0 0 0.6255 0.3745 0.0000 0 0 0.8353 0.1647 0.0000
chr8 38404506 GGTGA G 0.000044 0.050 1 -4 1 146 43 103 18 0 2 0 23 0 0 103 0 0 0.4186 0.0000 0.0000 20.500 0.00 3.87 -3.87 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4262 0.5738 0.0000 1 1 0.4295 0.5705 0.0000 1 1 0.4337 0.5663 0.0000
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.050 1 -3 3 550 178 372 161 0 6 0 11 0 0 372 0 0 0.9045 0.0000 0.0000 28.667 0.39 3.00 -2.61 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0528 0.9472 0.0000 0 0 0.5643 0.4357 0.0000
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.050 1 -2 2 217 97 120 95 0 1 0 1 0 0 120 0 0 0.9794 0.0000 0.0000 96.000 0.52 2.00 -1.48 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6811 0.3189 0.0000 0 0 0.8422 0.1578 0.0000 0 0 0.8705 0.1295 0.0000
chr8 61676164 T TTTC 0.000496 0.050 1 3 1 219 69 150 36 1 8 0 24 0 0 149 0 1 0.5217 0.0000 0.0067 7.625 0.06 2.88 -2.82 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6264 0.3735 0.0001 1 0 0.6224 0.3775 0.0001 1 0 0.6170 0.3829 0.0001
chr8 73009048 C CGAG 0.002257 0.050 1 3 5 306 68 238 28 2 10 1 27 0 0 238 0 0 0.4118 0.0000 0.0000 5.800 0.43 2.78 -2.35 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5066 0.4925 0.0009 1 0 0.5069 0.4921 0.0009 1 0 0.5073 0.4917 0.0010
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.050 1 -27 4 633 184 449 83 0 3 1 97 0 0 448 0 1 0.4511 0.0000 0.0022 60.333 2.69 15.21 -12.52 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0879 0.4844 0.4277 1 1 0.0923 0.4852 0.4225 1 1 0.0984 0.4862 0.4154
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 347 161 186 86 0 0 0 75 0 0 181 0 5 0.5342 0.0000 0.0269 161.000 0.21 3.07 -2.86 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2964 0.5398 0.1638 1 1 0.2959 0.5368 0.1673 1 1 0.2951 0.5330 0.1719
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 494 142 352 0 0 29 9 104 0 0 345 1 6 0.0000 0.0000 0.0199 3.897 5.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0457 0.9543 2 2 0.0000 0.0485 0.9515 2 2 0.0000 0.0525 0.9475
chr8 143859347 CGGGCCT C 0.500000 0.050 1 -6 3 1291 120 1171 94 2 8 5 11 0 0 1169 0 2 0.7833 0.0000 0.0017 14.000 0.94 5.27 -4.34 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0130 0.9870 0.0000
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.050 1 -3 2 911 189 722 180 1 6 0 2 0 0 722 0 0 0.9524 0.0000 0.0000 30.500 0.35 3.00 -2.65 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7840 0.2160 0.0000 0 0 0.9580 0.0420 0.0000 0 0 0.9733 0.0267 0.0000
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.050 1 2 3 845 145 700 65 7 2 1 70 0 0 698 1 1 0.4483 0.0000 0.0029 142.000 1.82 4.94 -3.13 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3595 0.5572 0.0833 1 1 0.3630 0.5535 0.0835 1 1 0.3675 0.5487 0.0838
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.050 1 -2 4 846 147 699 4 71 3 5 64 0 0 697 0 2 0.0272 0.0000 0.0029 35.000 4.50 5.08 -0.58 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2870 0.5904 0.1226 1 1 0.2926 0.5861 0.1213 1 1 0.2999 0.5806 0.1195
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.050 1 -3 2 1246 430 816 162 3 87 15 163 0 0 814 0 2 0.3767 0.0000 0.0025 3.943 0.19 3.24 -3.05 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1810 0.6828 0.1363 1 1 0.1901 0.6748 0.1351 1 1 0.2023 0.6644 0.1332
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 2 324 94 230 25 1 26 0 42 0 0 223 0 7 0.2660 0.0000 0.0304 2.615 0.52 8.12 -7.60 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0570 0.3893 0.5538 1 2 0.0610 0.3960 0.5430 1 2 0.0666 0.4048 0.5286
chr9 33796692 TGAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 467 158 309 146 0 6 1 5 0 0 309 0 0 0.9241 0.0000 0.0000 25.333 0.95 3.20 -2.25 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.4062 0.5938 0.0000 0 0 0.7822 0.2178 0.0000
chr9 35560263 TGGCCCG T 0.500000 0.050 1 -6 1 586 113 473 58 0 5 1 49 0 0 469 0 4 0.5133 0.0000 0.0085 21.600 0.81 6.31 -5.50 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2813 0.5293 0.1894 1 1 0.2809 0.5271 0.1920 1 1 0.2802 0.5243 0.1954
chr9 35674193 CGGAGAGGAGGATCTACCT C 0.500000 0.050 1 -18 3 405 141 264 54 0 27 0 60 0 0 264 0 0 0.3830 0.0000 0.0000 4.222 0.13 12.98 -12.85 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1694 0.5240 0.3066 1 1 0.1726 0.5221 0.3053 1 1 0.1767 0.5199 0.3034
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.050 1 -12 1 684 168 516 79 1 27 0 61 0 0 505 1 10 0.4702 0.0000 0.0213 5.222 0.39 10.41 -10.02 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3197 0.5292 0.1511 1 1 0.3183 0.5269 0.1548 1 1 0.3161 0.5241 0.1597
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.050 1 -15 3 433 129 304 65 0 0 0 64 0 0 299 0 5 0.5039 0.0000 0.0164 129.000 0.20 13.14 -12.94 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1867 0.5360 0.2773 1 1 0.1895 0.5333 0.2772 1 1 0.1932 0.5299 0.2769
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.050 1 12 1 733 136 597 63 0 11 0 62 0 0 579 0 18 0.4632 0.0000 0.0302 11.364 0.21 10.82 -10.62 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0841 0.4642 0.4517 1 1 0.0884 0.4664 0.4452 1 1 0.0944 0.4692 0.4364
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 455 101 354 1 0 4 0 96 0 0 348 0 6 0.0099 0.0000 0.0169 24.250 0.00 3.43 -3.43 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2821 0.7179 2 2 0.0000 0.1362 0.8638 2 2 0.0000 0.1117 0.8883
chr9 88130024 A AAGG 0.500000 0.050 1 3 1 1162 296 866 180 0 10 1 105 0 0 863 0 3 0.6081 0.0000 0.0035 28.600 0.49 3.10 -2.60 76 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9217 0.0775 0.0008 1 0 0.9133 0.0856 0.0010 1 0 0.9009 0.0976 0.0015
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 1 181 71 110 1 0 1 0 69 0 0 108 0 2 0.0141 0.0000 0.0182 70.000 0.00 4.19 -4.19 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4615 0.5385 2 2 0.0000 0.2529 0.7471 2 2 0.0000 0.2091 0.7909
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.050 1 3 2 293 80 213 8 2 18 0 52 0 0 209 0 4 0.1000 0.0000 0.0188 3.444 0.62 3.06 -2.43 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9948 0.0052 2 1 0.0000 0.9138 0.0862
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.050 1 -3 2 293 85 208 59 8 16 0 2 0 0 208 0 0 0.6941 0.0000 0.0000 4.600 2.29 3.00 -0.71 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1728 0.8272 0.0000 0 0 0.5809 0.4191 0.0000 0 0 0.7051 0.2949 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.050 1 15 4 391 144 247 6 1 2 1 134 0 0 246 0 1 0.0417 0.0000 0.0040 71.000 0.17 8.28 -8.12 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7852 0.2148 2 2 0.0000 0.3392 0.6608
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 849 307 542 97 0 1 1 208 0 0 540 0 2 0.3160 0.0000 0.0037 306.000 0.39 3.26 -2.87 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0103 0.9897 1 2 0.0000 0.0124 0.9876 1 2 0.0000 0.0159 0.9841
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 2 416 103 313 43 1 14 1 44 0 0 313 0 0 0.4175 0.0000 0.0000 6.357 0.35 5.86 -5.51 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2239 0.5268 0.2493 1 1 0.2254 0.5248 0.2499 1 1 0.2272 0.5222 0.2505
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 850 147 703 0 0 35 2 110 0 1 693 0 9 0.0000 0.0000 0.0142 3.200 6.49 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1232 0.8768 2 2 0.0000 0.0810 0.9190 2 2 0.0000 0.0710 0.9290
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 422 83 339 5 0 0 1 77 0 0 339 0 0 0.0602 0.0000 0.0000 83.000 0.40 2.92 -2.52 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9979 0.0021 2 1 0.0000 0.8042 0.1958 2 2 0.0000 0.4968 0.5032
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.050 1 -4 1 889 219 670 120 0 1 0 98 0 0 668 0 2 0.5479 0.0000 0.0030 218.000 0.84 4.86 -4.02 34 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4735 0.4610 0.0655 1 0 0.4672 0.4630 0.0698 1 1 0.4586 0.4657 0.0757
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 804 191 613 12 0 4 4 171 0 0 609 1 3 0.0628 0.0000 0.0065 46.250 0.42 2.92 -2.50 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9735 0.0265 2 1 0.0000 0.5439 0.4561
chr9 110138061 G GGAAGCT 0.500000 0.050 1 6 1 613 137 476 73 0 12 0 52 0 0 474 0 2 0.5328 0.0000 0.0042 10.417 0.36 5.31 -4.95 11 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4841 0.4420 0.0740 1 0 0.4762 0.4455 0.0782 1 0 0.4657 0.4502 0.0841
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.050 1 -4 1 221 88 133 0 0 1 1 86 0 0 131 0 2 0.0000 0.0000 0.0150 87.000 3.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0963 0.9037 2 2 0.0000 0.1002 0.8998 2 2 0.0000 0.1059 0.8941
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 449 111 338 49 0 16 0 46 0 0 337 0 1 0.4414 0.0000 0.0030 5.938 0.39 6.87 -6.48 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2600 0.5280 0.2120 1 1 0.2603 0.5259 0.2139 1 1 0.2605 0.5232 0.2163
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.050 1 6 1 592 127 465 116 1 4 0 6 0 1 464 0 0 0.9134 0.0000 0.0022 30.500 0.45 6.17 -5.72 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2525 0.7475 0.0000 0 0 0.6480 0.3520 0.0000
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 521 125 396 61 0 9 1 54 0 0 396 0 0 0.4880 0.0000 0.0000 12.778 0.36 1.39 -1.03 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3089 0.5237 0.1674 1 1 0.3075 0.5219 0.1706 1 1 0.3055 0.5197 0.1748
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 552 172 380 84 3 19 1 65 0 2 373 2 3 0.4884 0.0000 0.0184 8.000 1.55 3.62 -2.07 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4579 0.4628 0.0793 1 1 0.4514 0.4650 0.0836 1 1 0.4425 0.4679 0.0896
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 536 172 364 70 0 5 0 97 0 0 362 0 2 0.4070 0.0000 0.0055 33.400 0.20 3.24 -3.04 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0343 0.3556 0.6102 1 2 0.0376 0.3633 0.5991 1 2 0.0424 0.3736 0.5840
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 702 207 495 109 0 22 1 75 0 0 490 0 5 0.5266 0.0000 0.0101 8.409 0.28 8.05 -7.78 79 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5911 0.3721 0.0368 1 0 0.5808 0.3790 0.0403 1 0 0.5667 0.3881 0.0452
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 1 444 123 321 44 6 33 2 38 2 0 316 0 3 0.3577 0.0062 0.0156 2.697 1.09 4.53 -3.44 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3556 0.5031 0.1413 1 1 0.3522 0.5028 0.1450 1 1 0.3476 0.5025 0.1500
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 621 145 476 67 0 4 0 74 0 0 475 0 1 0.4621 0.0000 0.0021 35.250 1.51 2.18 -0.67 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1484 0.5243 0.3273 1 1 0.1521 0.5224 0.3255 1 1 0.1571 0.5201 0.3229
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 294 113 181 59 0 0 0 54 0 0 180 0 1 0.5221 0.0000 0.0055 113.000 0.29 1.24 -0.95 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2809 0.5299 0.1892 1 1 0.2805 0.5277 0.1918 1 1 0.2799 0.5248 0.1953
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 294 113 181 59 0 0 0 54 0 0 180 0 1 0.5221 0.0000 0.0055 113.000 0.29 1.24 -0.95 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2809 0.5299 0.1892 1 1 0.2805 0.5277 0.1918 1 1 0.2799 0.5248 0.1953
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 283 124 159 63 0 9 0 52 0 0 158 0 1 0.5081 0.0000 0.0063 12.778 0.19 1.65 -1.46 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3600 0.5060 0.1340 1 1 0.3566 0.5055 0.1379 1 1 0.3521 0.5049 0.1431
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 427 117 310 69 1 1 0 46 0 0 310 0 0 0.5897 0.0000 0.0000 115.000 0.28 1.67 -1.40 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5538 0.3935 0.0527 1 0 0.5436 0.3998 0.0566 1 0 0.5298 0.4081 0.0622
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 1 565 170 395 0 0 19 7 144 0 0 391 1 3 0.0000 0.0000 0.0101 7.947 3.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0198 0.9802 2 2 0.0000 0.0214 0.9786 2 2 0.0000 0.0238 0.9762
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.050 1 -15 1 499 146 353 64 2 17 1 62 0 0 346 0 7 0.4384 0.0000 0.0198 7.588 1.44 12.81 -11.37 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1861 0.5365 0.2774 1 1 0.1889 0.5338 0.2773 1 1 0.1926 0.5303 0.2771
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 324 149 175 75 5 31 0 38 0 0 175 0 0 0.5034 0.0000 0.0000 3.806 0.36 2.97 -2.61 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7654 0.2225 0.0121 1 0 0.7518 0.2342 0.0140 1 0 0.7330 0.2502 0.0168
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.050 1 -9 1 777 193 584 100 0 7 0 86 0 0 578 0 6 0.5181 0.0000 0.0103 26.571 0.28 8.48 -8.20 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5223 0.4662 0.0115 1 0 0.5227 0.4654 0.0119 1 0 0.5230 0.4647 0.0123
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.050 1 1 1 320 84 236 46 0 0 0 38 0 0 235 1 0 0.5476 0.0000 0.0042 84.000 0.26 1.13 -0.87 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5550 0.4413 0.0038 1 0 0.5535 0.4426 0.0039 1 0 0.5516 0.4444 0.0040
chr10 18655037 AT A 0.002315 0.050 1 -1 3 59 22 37 10 0 1 0 11 0 0 37 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 21.000 0.10 1.00 -0.90 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4801 0.5187 0.0012 1 1 0.4810 0.5177 0.0012 1 1 0.4823 0.5165 0.0012
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.050 1 -4 3 230 79 151 47 0 1 0 31 0 0 151 0 0 0.5949 0.0000 0.0000 78.000 0.30 3.84 -3.54 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6012 0.3699 0.0289 1 0 0.5949 0.3747 0.0304 1 0 0.5865 0.3810 0.0325
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.050 1 6 6 840 184 656 11 0 29 1 143 0 0 631 0 25 0.0598 0.0000 0.0381 5.345 0.36 5.53 -5.17 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9615 0.0385 2 1 0.0000 0.5194 0.4806
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.050 1 3 1 697 147 550 85 0 4 0 58 0 0 547 0 3 0.5782 0.0000 0.0055 35.750 0.27 3.98 -3.71 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6556 0.3230 0.0214 1 0 0.6474 0.3295 0.0232 1 0 0.6362 0.3381 0.0257
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.050 1 -2 1 313 128 185 79 0 2 0 47 0 0 185 0 0 0.6172 0.0000 0.0000 63.000 0.25 2.00 -1.75 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8045 0.1951 0.0004 1 0 0.7966 0.2030 0.0004 1 0 0.7857 0.2138 0.0005
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.050 1 1 1 486 132 354 5 0 5 1 121 0 0 352 0 2 0.0379 0.0000 0.0056 25.400 0.80 1.26 -0.46 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 1 0.0000 0.7151 0.2849 2 2 0.0000 0.3865 0.6135
chr10 30027571 A ACTG 0.007813 0.050 1 3 1 869 187 682 89 4 25 1 68 0 0 679 0 3 0.4759 0.0000 0.0044 6.480 0.83 3.50 -2.67 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6911 0.3081 0.0007 1 0 0.6860 0.3133 0.0008 1 0 0.6789 0.3202 0.0008
chr10 46309137 T TTTGTGCCACTCCTGCTGC 0.003400 0.050 1 18 4 305 94 211 40 0 20 1 33 0 1 191 0 19 0.4255 0.0000 0.0948 3.700 0.12 12.48 -12.36 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3267 0.6696 0.0037 1 1 0.3337 0.6626 0.0036 1 1 0.3430 0.6535 0.0035
chr10 49679733 GC G 0.000246 0.050 1 -1 3 134 84 50 40 0 1 0 43 0 0 50 0 0 0.4762 0.0000 0.0000 83.000 0.47 1.21 -0.73 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4378 0.5621 0.0001 1 1 0.4411 0.5588 0.0001 1 1 0.4453 0.5546 0.0001
chr10 49988768 A AC 0.134835 0.050 1 1 1 669 232 437 226 0 1 0 5 0 0 437 0 0 0.9741 0.0000 0.0000 231.000 0.56 1.80 -1.24 118 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3635 0.6365 0.0000 0 0 0.9837 0.0163 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000
chr10 49988921 AC A 0.048828 0.050 1 -1 1 719 206 513 117 2 5 1 81 0 0 513 0 0 0.5680 0.0000 0.0000 40.200 1.37 3.42 -2.05 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8210 0.1779 0.0011 1 0 0.8132 0.1855 0.0012 1 0 0.8023 0.1962 0.0015
chr10 50008914 CAA C 0.245598 0.050 1 -2 1 896 214 682 194 2 3 0 15 0 0 682 0 0 0.9065 0.0000 0.0000 70.333 0.16 2.20 -2.04 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0170 0.9830 0.0000 0 0 0.5615 0.4385 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.050 1 -6 3 96 49 47 30 0 0 0 19 0 0 47 0 0 0.6122 0.0000 0.0000 49.000 0.70 6.58 -5.88 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5592 0.4068 0.0340 1 0 0.5547 0.4102 0.0351 1 0 0.5486 0.4147 0.0367
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.050 1 -3 1 377 102 275 36 0 23 2 41 0 0 274 0 1 0.3529 0.0000 0.0036 3.435 0.58 3.15 -2.56 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2959 0.5780 0.1261 1 1 0.3009 0.5747 0.1244 1 1 0.3075 0.5704 0.1221
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.050 1 1 1 212 35 177 19 4 1 1 10 0 0 177 0 0 0.5429 0.0000 0.0000 30.000 0.21 1.20 -0.99 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5868 0.3907 0.0225 1 0 0.5820 0.3947 0.0233 1 0 0.5755 0.4001 0.0244
chr10 87234508 TCTC T 0.013816 0.050 1 -3 2 1028 406 622 380 13 9 0 4 0 0 622 0 0 0.9360 0.0000 0.0000 44.111 0.42 2.25 -1.83 42 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.050 1 6 1 648 134 514 80 0 4 0 50 0 0 513 0 1 0.5970 0.0000 0.0019 32.500 0.29 6.02 -5.73 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7166 0.2694 0.0140 1 0 0.7071 0.2775 0.0154 1 0 0.6940 0.2885 0.0175
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.050 1 -3 3 457 128 329 80 0 1 0 47 0 0 326 0 3 0.6250 0.0000 0.0091 127.000 0.24 3.11 -2.87 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7867 0.2126 0.0007 1 0 0.7790 0.2202 0.0007 1 0 0.7685 0.2307 0.0008
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.050 1 6 1 585 174 411 144 0 22 1 7 0 0 411 0 0 0.8276 0.0000 0.0000 6.909 1.17 7.00 -5.83 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1752 0.8248 0.0000 0 0 0.6690 0.3310 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.050 1 6 1 354 81 273 3 0 8 1 69 0 0 268 0 5 0.0370 0.0000 0.0183 9.000 0.33 6.20 -5.87 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9575 0.0425 2 1 0.0000 0.5643 0.4357 2 2 0.0000 0.3593 0.6407
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.050 1 18 1 380 127 253 56 0 19 1 51 0 0 248 0 5 0.4409 0.0000 0.0198 5.684 0.82 10.24 -9.41 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4461 0.5463 0.0075 1 1 0.4492 0.5433 0.0076 1 1 0.4530 0.5394 0.0076
chr10 104057110 CGCCACCAACACCGCCACCTCCTCCACT C 0.001817 0.050 1 -27 1 260 83 177 56 0 5 0 22 0 0 165 0 12 0.6747 0.0000 0.0678 15.600 0.43 19.77 -19.34 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7262 0.2737 0.0002 1 0 0.7195 0.2804 0.0002 1 0 0.7103 0.2895 0.0002
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.050 1 3 3 181 75 106 68 0 3 0 4 0 0 106 0 0 0.9067 0.0000 0.0000 24.000 0.47 3.50 -3.03 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0031 0.9969 0.0000 0 1 0.1239 0.8761 0.0000 0 1 0.3062 0.6938 0.0000
chr10 116471844 GGC G 0.001719 0.050 1 -2 4 134 72 62 41 2 0 2 27 0 0 62 0 0 0.5694 0.0000 0.0000 71.000 3.24 4.78 -1.53 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6514 0.3483 0.0003 1 0 0.6466 0.3531 0.0003 1 0 0.6402 0.3595 0.0003
chr10 116471848 G GAA 0.001728 0.050 1 2 1 134 71 63 2 38 3 1 27 0 0 63 0 0 0.0282 0.0000 0.0000 16.000 3.50 4.78 -1.28 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4907 0.5085 0.0008 1 1 0.4916 0.5076 0.0008 1 1 0.4927 0.5065 0.0008
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.050 1 -1 1 338 97 241 1 1 14 8 73 0 1 238 2 0 0.0103 0.0000 0.0124 5.357 0.00 2.07 -2.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8368 0.1632 2 2 0.0000 0.4035 0.5965 2 2 0.0000 0.2533 0.7467
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.050 1 21 2 615 151 464 133 0 10 0 8 1 0 462 0 1 0.8808 0.0022 0.0043 14.100 1.38 17.38 -16.00 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3142 0.6858 0.0000 0 0 0.8573 0.1427 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 508 155 353 80 0 5 0 70 0 0 353 0 0 0.5161 0.0000 0.0000 30.000 0.34 1.07 -0.73 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3524 0.5164 0.1311 1 1 0.3497 0.5151 0.1352 1 1 0.3459 0.5135 0.1406
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.050 1 -3 2 751 166 585 80 0 15 0 71 0 0 582 0 3 0.4819 0.0000 0.0051 10.067 0.33 3.15 -2.83 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3754 0.5152 0.1093 1 1 0.3751 0.5132 0.1117 1 1 0.3744 0.5107 0.1148
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.050 1 -12 1 675 152 523 84 1 9 0 58 0 0 521 0 2 0.5526 0.0000 0.0038 15.889 0.43 11.45 -11.02 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7302 0.2666 0.0032 1 0 0.7233 0.2732 0.0035 1 0 0.7138 0.2823 0.0039
chr11 637361 CGCGGGGGCATCT C 0.071834 0.050 1 -12 2 317 122 195 114 1 5 0 2 0 0 193 0 2 0.9344 0.0000 0.0103 23.400 0.51 13.00 -12.49 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2535 0.7465 0.0000 0 0 0.9383 0.0617 0.0000 0 0 0.9787 0.0213 0.0000
chr11 1094638 ACCAACCACCACTCCCAGCCCT A 0.029704 0.050 1 -21 2 1496 339 1157 104 11 141 12 71 5 3 1036 13 100 0.3068 0.0043 0.1046 1.404 2.41 12.97 -10.56 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0111 0.5816 0.4073 1 1 0.0137 0.6055 0.3808 1 1 0.0178 0.6357 0.3465
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.050 1 -30 2 1027 230 797 142 2 80 2 4 0 0 797 0 0 0.6174 0.0000 0.0000 1.863 0.72 1.25 -0.53 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0097 0.9903 0.0000 0 1 0.4837 0.5163 0.0000 0 0 0.7881 0.2119 0.0000
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.050 1 -30 1 1044 220 824 13 0 90 1 116 0 0 781 0 43 0.0591 0.0000 0.0522 1.433 1.77 9.13 -7.36 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9653 0.0347
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 2 332 85 247 0 0 1 1 83 0 0 246 0 1 0.0000 0.0000 0.0040 84.000 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1054 0.8946 2 2 0.0000 0.1095 0.8905 2 2 0.0000 0.1154 0.8846
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 660 201 459 192 0 5 0 4 0 0 459 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 39.200 0.18 1.00 -0.82 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1606 0.8394 0.0000 0 0 0.8879 0.1121 0.0000 0 0 0.9576 0.0424 0.0000
chr11 4449480 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 514 150 364 81 0 1 1 67 0 0 361 0 3 0.5400 0.0000 0.0082 149.000 0.22 3.16 -2.94 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3521 0.5170 0.1309 1 1 0.3494 0.5157 0.1350 1 1 0.3456 0.5140 0.1404
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.050 1 2 1 235 93 142 54 0 1 0 38 0 0 140 0 2 0.5806 0.0000 0.0141 92.000 1.50 2.08 -0.58 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4214 0.4731 0.1055 1 1 0.4154 0.4749 0.1098 1 1 0.4074 0.4771 0.1155
chr11 4860474 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 1306 394 912 192 1 5 1 195 0 0 912 0 0 0.4873 0.0000 0.0000 77.800 0.29 1.26 -0.98 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1646 0.6140 0.2214 1 1 0.1693 0.6057 0.2251 1 1 0.1753 0.5951 0.2296
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 428 99 329 60 0 3 0 36 0 0 329 0 0 0.6061 0.0000 0.0000 32.000 0.52 2.08 -1.57 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5618 0.3858 0.0524 1 0 0.5511 0.3926 0.0563 1 0 0.5366 0.4015 0.0618
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 1 1665 433 1232 407 0 13 0 13 0 0 1232 0 0 0.9400 0.0000 0.0000 32.308 0.20 5.31 -5.10 75 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7957 0.2043 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 1143 281 862 258 0 13 0 10 0 0 862 0 0 0.9181 0.0000 0.0000 20.615 0.16 1.50 -1.34 82 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4243 0.5757 0.0000 0 0 0.9221 0.0779 0.0000
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.050 1 4 1 1587 377 1210 174 0 16 1 186 0 0 1198 0 12 0.4615 0.0000 0.0099 22.562 1.16 4.13 -2.97 50 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0422 0.4581 0.4997 1 2 0.0459 0.4594 0.4946 1 2 0.0513 0.4614 0.4873
chr11 5454410 CA C 0.500000 0.050 1 -1 3 390 90 300 51 0 1 0 38 0 0 300 0 0 0.5667 0.0000 0.0000 89.000 0.31 1.24 -0.92 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4083 0.4788 0.1129 1 1 0.4028 0.4802 0.1170 1 1 0.3954 0.4820 0.1226
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.050 1 12 2 686 122 564 0 0 18 1 103 0 0 545 0 19 0.0000 0.0000 0.0337 5.778 9.71 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0433 0.9567 2 2 0.0000 0.0459 0.9541 2 2 0.0000 0.0498 0.9502
chr11 6641514 C CCAG 0.500000 0.050 1 3 5 573 151 422 116 3 30 0 2 1 1 420 0 0 0.7682 0.0024 0.0047 4.172 0.33 6.50 -6.17 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4499 0.5501 0.0000 0 0 0.8409 0.1591 0.0000 0 0 0.8978 0.1022 0.0000
chr11 6795057 CAG C 0.500000 0.050 1 -2 1 744 143 601 71 0 9 0 63 0 0 601 0 0 0.4965 0.0000 0.0000 14.889 0.28 2.16 -1.88 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3290 0.5218 0.1492 1 1 0.3270 0.5202 0.1528 1 1 0.3242 0.5181 0.1577
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 235 114 121 3 0 11 6 94 0 0 121 0 0 0.0263 0.0000 0.0000 9.182 1.67 3.72 -2.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9148 0.0852 2 2 0.0000 0.3852 0.6148 2 2 0.0000 0.2165 0.7835
chr11 12294797 G GCTCCTCCTC 0.500000 0.050 1 9 1 511 127 384 46 0 34 0 47 0 0 374 0 10 0.3622 0.0000 0.0260 2.735 1.28 11.09 -9.80 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1270 0.4962 0.3767 1 1 0.1310 0.4964 0.3726 1 1 0.1364 0.4966 0.3670
chr11 17372490 CTT C 0.500000 0.050 1 -2 2 957 254 703 240 1 7 0 6 0 0 703 0 0 0.9449 0.0000 0.0000 35.286 1.02 2.50 -1.48 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0237 0.9763 0.0000 0 0 0.8749 0.1251 0.0000 0 0 0.9722 0.0278 0.0000
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 3 190 94 96 52 0 1 0 41 0 0 94 0 2 0.5532 0.0000 0.0208 93.000 0.38 3.76 -3.37 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3509 0.5050 0.1441 1 1 0.3476 0.5046 0.1478 1 1 0.3433 0.5041 0.1526
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 215 94 121 88 2 1 0 3 0 0 121 0 0 0.9362 0.0000 0.0000 93.000 0.76 6.00 -5.24 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0670 0.9330 0.0000 0 0 0.5537 0.4463 0.0000 0 0 0.7393 0.2607 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 774 224 550 125 0 8 0 91 0 0 550 0 0 0.5580 0.0000 0.0000 27.000 0.31 3.55 -3.24 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6581 0.3191 0.0228 1 0 0.6466 0.3279 0.0255 1 0 0.6308 0.3397 0.0295
chr11 49208393 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 233 82 151 41 0 1 0 40 0 0 151 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 81.000 0.15 3.33 -3.18 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2495 0.5244 0.2260 1 1 0.2501 0.5226 0.2274 1 1 0.2507 0.5203 0.2291
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.050 1 2 4 1461 334 1127 0 0 9 0 325 0 0 1109 0 18 0.0000 0.0000 0.0160 36.111 2.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 82 36 46 18 0 0 0 18 0 0 46 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 36.000 0.72 2.00 -1.28 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2445 0.5110 0.2445 1 1 0.2449 0.5102 0.2449 1 1 0.2454 0.5091 0.2454
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 237 82 155 38 1 11 0 32 0 0 154 0 1 0.4634 0.0000 0.0065 6.455 0.18 3.66 -3.47 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3148 0.5112 0.1740 1 1 0.3128 0.5103 0.1769 1 1 0.3101 0.5092 0.1807
chr11 65557854 C CCAGCAG 0.500000 0.050 1 6 3 272 75 197 58 2 11 0 4 0 0 196 0 1 0.7733 0.0000 0.0051 5.818 1.17 6.50 -5.33 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.1343 0.8657 0.0000 0 1 0.3957 0.6043 0.0000
chr11 66744819 G GGGGGGC 0.500000 0.050 1 6 5 300 100 200 53 0 2 3 42 0 0 195 1 4 0.5300 0.0000 0.0250 97.000 0.79 4.83 -4.04 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2859 0.5259 0.1882 1 1 0.2853 0.5240 0.1908 1 1 0.2843 0.5215 0.1942
chr11 68050524 A AGGCCTG 0.500000 0.050 1 6 1 950 210 740 111 1 20 0 78 0 0 735 0 5 0.5286 0.0000 0.0068 9.500 0.43 6.05 -5.62 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6017 0.3641 0.0342 1 0 0.5912 0.3713 0.0375 1 0 0.5768 0.3809 0.0423
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.050 1 21 2 922 157 765 12 0 44 3 98 0 1 714 0 50 0.0764 0.0000 0.0667 2.545 0.50 5.80 -5.30 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9895 0.0105 2 1 0.0000 0.7377 0.2623
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.050 1 -42 1 939 240 699 133 2 61 0 44 0 0 678 0 21 0.5542 0.0000 0.0300 2.918 0.20 14.50 -14.30 55 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9242 0.0748 0.0009 1 0 0.9157 0.0831 0.0012 1 0 0.9029 0.0954 0.0017
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 1018 283 735 127 1 1 1 153 0 0 735 0 0 0.4488 0.0000 0.0000 281.000 0.39 2.14 -1.75 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0405 0.4179 0.5415 1 2 0.0441 0.4220 0.5339 1 2 0.0493 0.4275 0.5232
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.050 1 3 1 682 140 542 10 1 14 0 115 0 0 538 0 4 0.0714 0.0000 0.0074 9.000 0.80 3.19 -2.39 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9829 0.0171 2 1 0.0000 0.7471 0.2529
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.050 1 -22 2 374 123 251 6 0 5 0 112 0 0 241 0 10 0.0488 0.0000 0.0398 23.600 0.00 15.54 -15.54 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.7303 0.2697 2 2 0.0000 0.3328 0.6672
chr11 83255888 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 165 73 92 48 0 3 1 21 0 0 92 0 0 0.6575 0.0000 0.0000 23.333 0.46 1.57 -1.11 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5977 0.3572 0.0450 1 0 0.5857 0.3656 0.0487 1 0 0.5695 0.3765 0.0540
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 632 175 457 92 0 11 0 72 0 0 454 0 3 0.5257 0.0000 0.0066 14.909 0.23 4.40 -4.17 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4455 0.4715 0.0830 1 1 0.4395 0.4731 0.0873 1 1 0.4314 0.4753 0.0933
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1281 368 913 129 2 83 0 154 0 0 912 1 0 0.3505 0.0000 0.0011 3.422 0.95 7.40 -6.45 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0465 0.4385 0.5150 1 2 0.0503 0.4415 0.5082 1 2 0.0558 0.4455 0.4987
chr11 116858282 TTGCTGTTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 613 165 448 102 0 10 0 53 0 0 448 0 0 0.6182 0.0000 0.0000 15.500 0.21 8.83 -8.62 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8182 0.1754 0.0064 1 0 0.8055 0.1869 0.0076 1 0 0.7876 0.2029 0.0095
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.050 1 -15 3 758 246 512 1 0 44 4 197 0 0 512 0 0 0.0041 0.0000 0.0000 4.591 13.00 9.66 3.34 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0314 0.9686 2 2 0.0000 0.0135 0.9865 2 2 0.0000 0.0116 0.9884
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.050 1 -8 2 256 108 148 57 0 4 0 47 0 0 145 0 3 0.5278 0.0000 0.0203 26.000 0.23 7.89 -7.67 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3187 0.5188 0.1625 1 1 0.3169 0.5173 0.1658 1 1 0.3143 0.5155 0.1702
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 354 102 252 3 0 12 1 86 0 0 252 0 0 0.0294 0.0000 0.0000 7.500 0.00 6.06 -6.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9375 0.0625 2 2 0.0000 0.4646 0.5354 2 2 0.0000 0.2748 0.7252
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 363 107 256 45 0 21 1 40 0 0 255 0 1 0.4206 0.0000 0.0039 4.095 1.44 3.38 -1.93 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2729 0.5239 0.2033 1 1 0.2726 0.5221 0.2054 1 1 0.2721 0.5198 0.2081
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.050 1 3 1 501 132 369 8 0 17 2 105 0 0 363 0 6 0.0606 0.0000 0.0163 6.765 0.62 3.22 -2.59 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9433 0.0567 2 1 0.0000 0.6279 0.3721
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.050 1 -3 1 389 143 246 1 0 22 10 110 0 0 245 0 1 0.0070 0.0000 0.0041 5.762 0.00 3.23 -3.23 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1689 0.8311 2 2 0.0000 0.0759 0.9241 2 2 0.0000 0.0621 0.9379
chr12 6778354 G GGAGCCC 0.001563 0.050 1 6 2 378 151 227 68 3 23 2 55 0 0 224 0 3 0.4503 0.0000 0.0132 5.565 1.26 5.49 -4.23 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5978 0.4019 0.0003 1 0 0.5955 0.4042 0.0003 1 0 0.5923 0.4073 0.0003
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.050 1 3 1 4369 1049 3320 1004 4 9 0 32 0 0 3318 0 2 0.9571 0.0000 0.0006 115.444 1.27 3.94 -2.67 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8040 0.1960 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 8843328 AAG A 0.001621 0.050 1 -2 1 243 85 158 48 0 0 1 36 0 0 158 0 0 0.5647 0.0000 0.0000 85.000 0.10 2.78 -2.67 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6096 0.3901 0.0003 1 0 0.6064 0.3933 0.0003 1 0 0.6021 0.3976 0.0004
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.050 1 5 1 247 97 150 50 1 5 1 40 0 0 145 0 5 0.5155 0.0000 0.0333 18.400 0.08 4.83 -4.75 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2951 0.5225 0.1825 1 1 0.2940 0.5208 0.1853 1 1 0.2924 0.5187 0.1889
chr12 10415650 T TAA 0.001347 0.050 1 2 4 132 50 82 32 0 0 0 18 0 0 80 0 2 0.6400 0.0000 0.0244 50.000 0.12 3.06 -2.93 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6289 0.3708 0.0003 1 0 0.6247 0.3750 0.0003 1 0 0.6191 0.3807 0.0003
chr12 10415652 TTA T 0.001349 0.050 1 -2 4 133 50 83 32 0 0 0 18 0 0 81 0 2 0.6400 0.0000 0.0241 50.000 0.12 3.06 -2.93 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6290 0.3708 0.0003 1 0 0.6247 0.3750 0.0003 1 0 0.6191 0.3807 0.0003
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.050 1 -3 1 237 116 121 2 0 6 6 102 0 0 119 0 2 0.0172 0.0000 0.0165 18.333 2.00 4.29 -2.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4350 0.5650 2 2 0.0000 0.1062 0.8938 2 2 0.0000 0.0663 0.9337
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.050 1 -30 1 4914 1703 3211 547 38 303 14 801 9 12 3183 2 5 0.3212 0.0028 0.0087 4.658 3.35 8.63 -5.28 103 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0007 0.9993 1 2 0.0000 0.0009 0.9991 1 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.050 1 30 1 1902 410 1492 119 1 185 2 103 3 3 1423 0 63 0.2902 0.0020 0.0462 1.205 4.61 4.60 0.00 11 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0106 0.2530 0.7364 1 2 0.0123 0.2627 0.7250 1 2 0.0148 0.2761 0.7091
chr12 42144454 GGCCCGCGACGCCGGCGCCTCTCACGGCGCCGCGTCCGCC G 0.013087 0.050 1 -39 4 203 69 134 49 0 2 0 18 0 0 120 0 14 0.7101 0.0000 0.1045 33.500 3.57 32.61 -29.04 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6733 0.3250 0.0017 1 0 0.6678 0.3305 0.0018 1 0 0.6603 0.3378 0.0019
chr12 47751144 A ACGGGCT 0.000467 0.050 1 6 1 403 85 318 37 2 6 0 40 0 0 314 0 4 0.4353 0.0000 0.0126 13.167 1.51 6.22 -4.71 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4134 0.5863 0.0003 1 1 0.4176 0.5821 0.0003 1 1 0.4230 0.5767 0.0003
chr12 51329814 A AG 0.276619 0.050 1 1 2 170 53 117 51 0 0 0 2 0 0 117 0 0 0.9623 0.0000 0.0000 53.000 0.45 1.50 -1.05 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2738 0.7262 0.0000 0 0 0.7088 0.2912 0.0000 0 0 0.8088 0.1912 0.0000
chr12 51890755 T TGGCCCA 0.010615 0.050 1 6 1 652 193 459 150 0 38 0 5 0 0 459 0 0 0.7772 0.0000 0.0000 4.079 0.35 5.20 -4.85 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5400 0.4600 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.050 1 -21 2 893 216 677 108 1 19 3 85 0 0 677 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 10.316 0.77 13.99 -13.22 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5178 0.4279 0.0543 1 0 0.5105 0.4314 0.0581 1 0 0.5006 0.4361 0.0634
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.050 1 21 2 416 96 320 46 0 20 0 30 0 0 305 0 15 0.4792 0.0000 0.0469 3.800 0.22 10.63 -10.42 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4652 0.5164 0.0184 1 1 0.4667 0.5148 0.0185 1 1 0.4686 0.5127 0.0187
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.050 1 -18 2 1108 297 811 240 0 51 0 6 0 0 811 0 0 0.8081 0.0000 0.0000 4.824 0.36 16.50 -16.14 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3163 0.6837 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.050 1 -1 1 323 81 242 36 0 2 0 43 0 0 242 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 39.500 0.33 1.81 -1.48 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2437 0.5444 0.2119 1 1 0.2478 0.5423 0.2099 1 1 0.2532 0.5397 0.2071
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.050 1 1 2 350 94 256 87 0 3 0 4 0 0 256 0 0 0.9255 0.0000 0.0000 30.333 0.37 1.25 -0.88 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0193 0.9807 0.0000 0 1 0.4656 0.5344 0.0000 0 0 0.7279 0.2721 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.050 1 -4 2 503 104 399 6 0 1 0 97 0 0 396 0 3 0.0577 0.0000 0.0075 103.000 0.00 4.09 -4.09 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.9932 0.0068
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.050 1 -2 1 137 73 64 0 0 1 0 72 0 0 63 1 0 0.0000 0.0000 0.0156 72.000 2.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0825 0.9175 2 2 0.0000 0.0853 0.9147 2 2 0.0000 0.0893 0.9107
chr12 58876497 CTGG C 0.000469 0.050 1 -3 3 160 63 97 40 0 1 0 22 0 0 97 0 0 0.6349 0.0000 0.0000 62.000 0.40 3.18 -2.78 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6929 0.3071 0.0001 1 0 0.6867 0.3132 0.0001 1 0 0.6785 0.3214 0.0001
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.050 1 3 2 354 87 267 81 0 1 0 5 0 0 267 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 86.000 0.81 4.00 -3.19 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 1 0.2776 0.7224 0.0000 0 0 0.6151 0.3849 0.0000
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.050 1 -1 1 253 79 174 20 8 23 19 9 0 0 174 0 0 0.2532 0.0000 0.0000 1.905 3.50 2.22 1.28 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3882 0.5087 0.1031 1 1 0.3886 0.5078 0.1035 1 1 0.3891 0.5067 0.1041
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.050 1 3 2 130 46 84 44 0 0 0 2 0 0 84 0 0 0.9565 0.0000 0.0000 46.000 0.30 2.00 -1.70 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1560 0.8440 0.0000 0 0 0.5535 0.4465 0.0000 0 0 0.6849 0.3151 0.0000
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.050 1 -3 1 939 278 661 0 0 28 2 248 0 0 659 0 2 0.0000 0.0000 0.0030 8.929 3.38 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 1 425 107 318 11 2 25 1 68 0 0 312 0 6 0.1028 0.0000 0.0189 3.280 0.73 3.16 -2.43 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.9534 0.0466
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 566 143 423 119 1 16 0 7 0 0 423 0 0 0.8322 0.0000 0.0000 7.875 0.63 2.43 -1.80 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1525 0.8475 0.0000 0 0 0.5680 0.4320 0.0000
chr12 106247599 C CGGA 0.500000 0.050 1 3 2 393 61 332 49 2 9 0 1 3 3 323 2 1 0.8033 0.0090 0.0271 5.667 2.10 6.00 -3.90 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0229 0.9771 0.0000 0 1 0.2879 0.7121 0.0000 0 0 0.5046 0.4954 0.0000
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 1 382 101 281 48 2 9 0 42 0 0 279 1 1 0.4752 0.0000 0.0071 10.222 1.29 3.48 -2.18 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3103 0.5178 0.1718 1 1 0.3087 0.5165 0.1748 1 1 0.3064 0.5148 0.1788
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.050 1 -60 3 1690 318 1372 22 0 89 9 198 0 1 1308 0 63 0.0692 0.0000 0.0466 2.562 0.32 4.44 -4.12 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8613 0.1387
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 548 145 403 77 0 4 0 64 0 0 397 0 6 0.5310 0.0000 0.0149 35.250 0.40 8.66 -8.25 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3131 0.5302 0.1567 1 1 0.3118 0.5279 0.1603 1 1 0.3100 0.5250 0.1650
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 685 222 463 12 121 49 10 30 0 1 461 1 0 0.0541 0.0000 0.0043 3.562 4.75 4.07 0.68 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9707 0.0292 0.0001 1 0 0.9659 0.0339 0.0002 1 0 0.5270 0.4728 0.0002
chr12 111598963 C CTGCTGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 12 1 695 223 472 93 3 27 2 98 1 1 470 0 0 0.4170 0.0021 0.0042 8.818 2.92 10.51 -7.59 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2128 0.5599 0.2272 1 1 0.2153 0.5554 0.2293 1 1 0.2184 0.5498 0.2318
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 220 121 99 0 0 1 1 119 0 0 99 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 120.000 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0466 0.9534 2 2 0.0000 0.0493 0.9507 2 2 0.0000 0.0534 0.9466
chr12 113180950 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 262 104 158 50 2 11 1 40 0 0 154 0 4 0.4808 0.0000 0.0253 8.455 0.40 3.02 -2.62 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3239 0.5147 0.1614 1 1 0.3218 0.5136 0.1647 1 1 0.3188 0.5122 0.1690
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -6 1 194 89 105 1 0 10 0 78 0 0 102 0 3 0.0112 0.0000 0.0286 7.900 0.00 5.99 -5.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3999 0.6001 2 2 0.0000 0.2092 0.7908 2 2 0.0000 0.1722 0.8278
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.050 1 3 2 443 99 344 31 15 20 6 27 0 1 339 0 4 0.3131 0.0000 0.0145 4.000 0.55 6.30 -5.75 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3682 0.4953 0.1365 1 1 0.3642 0.4956 0.1402 1 1 0.3588 0.4960 0.1453
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.050 1 -5 5 370 112 258 0 0 6 1 105 0 0 248 0 10 0.0000 0.0000 0.0388 17.667 5.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0512 0.9488 2 2 0.0000 0.0541 0.9459 2 2 0.0000 0.0584 0.9416
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.050 1 15 4 309 80 229 12 0 7 0 61 0 0 219 0 10 0.1500 0.0000 0.0437 10.429 0.25 11.84 -11.59 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.9403 0.0597
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.050 1 1 3 683 220 463 104 2 25 9 80 0 0 462 0 1 0.4727 0.0000 0.0022 7.760 2.27 2.06 0.21 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4427 0.4772 0.0802 1 1 0.4371 0.4783 0.0845 1 1 0.4295 0.4799 0.0906
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 5 676 174 502 0 0 25 0 149 0 0 482 0 20 0.0000 0.0000 0.0398 5.960 8.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0140 0.9860 2 2 0.0000 0.0153 0.9847 2 2 0.0000 0.0171 0.9829
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.050 1 3 3 211 80 131 27 0 25 1 27 0 0 128 0 3 0.3375 0.0000 0.0229 2.200 0.19 3.30 -3.11 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1973 0.5131 0.2896 1 1 0.1994 0.5121 0.2885 1 1 0.2022 0.5109 0.2869
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 173 52 121 2 0 9 3 38 0 1 120 0 0 0.0385 0.0000 0.0083 4.667 2.00 3.53 -1.53 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9178 0.0822 2 1 0.0000 0.6176 0.3824 2 2 0.0000 0.4721 0.5279
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.050 1 9 1 207 58 149 0 0 6 0 52 0 0 142 0 7 0.0000 0.0000 0.0470 8.667 9.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1847 0.8153 2 2 0.0000 0.1892 0.8108 2 2 0.0000 0.1956 0.8044
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 727 207 520 14 9 80 9 95 0 0 518 1 1 0.0676 0.0000 0.0038 1.603 4.86 4.86 -0.01 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9898 0.0102
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 709 213 496 3 11 75 9 115 0 0 492 1 3 0.0141 0.0000 0.0081 1.863 1.00 4.63 -3.63 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9893 0.0107 2 1 0.0000 0.8064 0.1936
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.050 1 6 2 644 160 484 72 0 23 0 65 0 0 482 0 2 0.4500 0.0000 0.0041 5.957 0.44 6.03 -5.59 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2975 0.5328 0.1697 1 1 0.2970 0.5303 0.1727 1 1 0.2963 0.5271 0.1766
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.050 1 5 1 187 58 129 9 0 1 0 48 0 0 121 0 8 0.1552 0.0000 0.0620 57.000 1.78 4.75 -2.97 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9945 0.0055
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.050 1 -18 4 605 200 405 187 0 9 0 4 0 0 405 0 0 0.9350 0.0000 0.0000 21.222 0.42 14.50 -14.08 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1535 0.8465 0.0000 0 0 0.8867 0.1133 0.0000 0 0 0.9574 0.0426 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.050 1 6 1 605 150 455 59 2 48 0 41 1 1 449 1 3 0.3933 0.0022 0.0132 2.125 1.24 6.46 -5.23 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6473 0.3387 0.0141 1 0 0.6411 0.3439 0.0149 1 0 0.6329 0.3510 0.0162
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.050 1 4 1 104 53 51 23 0 5 0 25 0 0 50 1 0 0.4340 0.0000 0.0196 9.600 0.39 5.08 -4.69 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4393 0.5475 0.0132 1 1 0.4417 0.5451 0.0131 1 1 0.4449 0.5421 0.0130
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.050 1 3 4 690 118 572 0 0 22 2 94 0 0 569 2 1 0.0000 0.0000 0.0052 4.364 5.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0196 0.9804 2 2 0.0000 0.0205 0.9795 2 2 0.0000 0.0218 0.9782
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.050 1 -15 1 303 106 197 7 0 31 0 68 0 0 191 0 6 0.0660 0.0000 0.0305 2.419 0.57 9.63 -9.06 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9453 0.0547 2 1 0.0000 0.6958 0.3042
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 1 574 113 461 55 0 4 0 54 0 0 459 0 2 0.4867 0.0000 0.0043 27.250 0.36 3.30 -2.93 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2217 0.5335 0.2447 1 1 0.2234 0.5310 0.2456 1 1 0.2255 0.5278 0.2467
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.050 1 1 2 1329 298 1031 8 0 9 3 278 0 0 1026 1 4 0.0268 0.0000 0.0048 31.889 0.00 2.37 -2.37 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9915 0.0085 2 2 0.0000 0.0611 0.9389 2 2 0.0000 0.0074 0.9926
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.050 1 -1 4 1208 289 919 123 2 32 1 131 0 0 919 0 0 0.4256 0.0000 0.0000 8.031 0.19 1.16 -0.97 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1604 0.5707 0.2689 1 1 0.1650 0.5657 0.2692 1 1 0.1712 0.5594 0.2694
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.050 1 -19 1 400 114 286 5 0 3 0 106 0 0 273 0 13 0.0439 0.0000 0.0455 37.000 1.60 19.18 -17.58 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9958 0.0042 2 1 0.0000 0.6677 0.3323 2 2 0.0000 0.3315 0.6685
chr14 20060441 AG A 0.001037 0.050 1 -1 1 403 94 309 51 0 6 1 36 0 0 308 0 1 0.5426 0.0000 0.0032 14.667 0.92 2.97 -2.05 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6301 0.3697 0.0002 1 0 0.6263 0.3735 0.0002 1 0 0.6210 0.3788 0.0002
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.050 1 1 1 388 90 298 45 0 8 0 37 0 0 295 0 3 0.5000 0.0000 0.0101 10.250 0.20 1.32 -1.12 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1880 0.5438 0.2682 1 1 0.1869 0.5414 0.2717 1 1 0.1854 0.5384 0.2763
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.050 1 -6 1 626 156 470 129 0 18 0 9 0 0 470 0 0 0.8269 0.0000 0.0000 7.667 0.43 6.78 -6.35 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1914 0.8086 0.0000 0 0 0.7570 0.2430 0.0000
chr14 21155337 CAGA C 0.002975 0.050 1 -3 1 467 92 375 49 0 3 0 40 0 0 371 0 4 0.5326 0.0000 0.0107 29.667 1.22 4.10 -2.88 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5321 0.4669 0.0010 1 0 0.5318 0.4672 0.0010 1 0 0.5314 0.4676 0.0010
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.050 1 2 3 1681 448 1233 417 0 22 0 9 0 0 1233 0 0 0.9308 0.0000 0.0000 19.364 0.66 3.00 -2.34 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0510 0.9490 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.050 1 3 1 478 138 340 121 2 12 0 3 0 0 340 0 0 0.8768 0.0000 0.0000 10.417 0.35 2.67 -2.32 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1148 0.8852 0.0000 0 0 0.6866 0.3134 0.0000 0 0 0.8303 0.1697 0.0000
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.050 1 6 1 459 115 344 3 0 5 0 107 0 0 344 0 0 0.0261 0.0000 0.0000 22.000 0.00 5.31 -5.31 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9592 0.0408 2 1 0.0000 0.5784 0.4216 2 2 0.0000 0.3778 0.6222
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.050 1 -1 1 881 230 651 12 30 2 181 5 0 0 651 0 0 0.0522 0.0000 0.0000 33.000 0.33 4.20 -3.87 4 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9942 0.0058
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.050 1 -2 1 875 235 640 21 5 23 181 5 1 0 639 0 0 0.0894 0.0016 0.0016 10.947 0.81 4.20 -3.39 15 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9789 0.0211
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.050 1 -3 1 324 57 267 23 0 8 1 25 0 0 267 0 0 0.4035 0.0000 0.0000 6.125 3.09 3.20 -0.11 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2654 0.5214 0.2131 1 1 0.2675 0.5202 0.2124 1 1 0.2701 0.5185 0.2113
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.050 1 -3 1 336 55 281 23 0 3 2 27 0 0 281 0 0 0.4182 0.0000 0.0000 17.333 2.57 3.56 -0.99 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2289 0.5235 0.2476 1 1 0.2321 0.5224 0.2455 1 1 0.2363 0.5210 0.2426
chr14 24208137 TACG T 0.003500 0.050 1 -3 2 386 98 288 1 0 6 1 90 0 0 287 0 1 0.0102 0.0000 0.0035 15.333 0.00 3.07 -3.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9931 0.0069 2 1 0.0000 0.9829 0.0171 2 1 0.0000 0.9785 0.0215
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.050 1 3 1 369 101 268 79 5 12 0 5 0 0 268 0 0 0.7822 0.0000 0.0000 7.417 0.22 2.00 -1.78 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.4288 0.5712 0.0000 0 0 0.7569 0.2431 0.0000
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.050 1 24 1 270 51 219 16 1 26 1 7 0 0 218 0 1 0.3137 0.0000 0.0046 0.962 0.69 2.00 -1.31 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5113 0.4361 0.0526 1 0 0.5077 0.4385 0.0538 1 0 0.5026 0.4419 0.0555
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.050 1 6 1 637 152 485 0 1 27 0 124 0 0 472 0 13 0.0000 0.0000 0.0268 4.593 6.39 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0076 0.9924 2 2 0.0000 0.0080 0.9920 2 2 0.0000 0.0086 0.9914
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.050 1 -6 2 614 152 462 0 0 34 3 115 0 1 457 0 4 0.0000 0.0000 0.0108 3.471 7.17 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0115 0.9885 2 2 0.0000 0.0121 0.9879 2 2 0.0000 0.0130 0.9870
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.050 1 -6 1 442 119 323 51 0 22 2 44 0 0 321 0 2 0.4286 0.0000 0.0062 4.318 0.63 6.70 -6.08 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3351 0.5157 0.1491 1 1 0.3347 0.5142 0.1511 1 1 0.3340 0.5122 0.1538
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.050 1 -3 2 461 151 310 5 0 15 2 129 0 0 310 0 0 0.0331 0.0000 0.0000 9.067 0.60 3.43 -2.83 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9862 0.0138 2 2 0.0000 0.3817 0.6183 2 2 0.0000 0.1333 0.8667
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.050 1 -9 1 447 131 316 123 1 1 0 6 0 0 315 0 1 0.9389 0.0000 0.0032 130.000 0.94 7.83 -6.89 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2485 0.7515 0.0000 0 0 0.7071 0.2929 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.050 1 -9 1 238 73 165 0 0 10 0 63 0 0 159 0 6 0.0000 0.0000 0.0364 6.300 8.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1859 0.8141 2 2 0.0000 0.1912 0.8088 2 2 0.0000 0.1987 0.8013
chr14 104707525 ACCCCAC A 0.082909 0.050 1 -6 2 495 90 405 33 0 24 2 31 0 0 403 0 2 0.3667 0.0000 0.0049 2.667 1.15 5.61 -4.46 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4212 0.5350 0.0439 1 1 0.4233 0.5329 0.0438 1 1 0.4260 0.5302 0.0438
chr14 105399471 G GA 0.001351 0.050 1 1 3 156 48 108 22 0 0 0 26 0 0 108 0 0 0.4583 0.0000 0.0000 48.000 0.18 1.00 -0.82 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4355 0.5636 0.0009 1 1 0.4385 0.5606 0.0009 1 1 0.4423 0.5568 0.0009
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.050 1 -3 2 392 116 276 3 0 13 1 99 0 0 272 1 3 0.0259 0.0000 0.0145 7.923 0.67 3.59 -2.92 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9634 0.0366 2 1 0.0000 0.6061 0.3939 2 2 0.0000 0.4048 0.5952
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.050 1 -3 1 261 72 189 0 3 4 36 29 0 0 188 0 1 0.0000 0.0000 0.0053 16.250 5.28 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.4699 0.5301 2 2 0.0000 0.4713 0.5287 2 2 0.0000 0.4749 0.5251
chr15 22786677 AGCGGCG A 0.001053 0.050 1 -6 1 261 73 188 0 0 31 3 39 0 0 188 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 1.367 6.18 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.9972 0.0028 2 1 0.0000 0.9973 0.0027
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.050 1 3 1 1244 223 1021 0 0 7 2 214 0 4 942 51 24 0.0000 0.0000 0.0774 30.857 4.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.050 1 -1 2 2914 727 2187 2 2 25 6 692 0 1 2083 28 75 0.0028 0.0000 0.0476 31.818 5.50 3.38 2.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.050 1 -2 2 401 90 311 43 1 1 0 45 0 0 310 0 1 0.4778 0.0000 0.0032 89.000 0.40 2.02 -1.63 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2700 0.5325 0.1975 1 1 0.2722 0.5303 0.1976 1 1 0.2749 0.5275 0.1976
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.050 1 -2 2 188 68 120 17 4 8 3 36 0 1 116 0 3 0.2500 0.0000 0.0333 7.500 1.82 2.08 -0.26 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0426 0.3615 0.5959 1 2 0.0453 0.3679 0.5869 1 2 0.0491 0.3762 0.5747
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.050 1 -3 1 643 176 467 64 2 34 5 71 0 1 462 1 3 0.3636 0.0000 0.0107 4.176 1.30 4.06 -2.76 24 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0632 0.4504 0.4864 1 2 0.0658 0.4517 0.4824 1 2 0.0694 0.4536 0.4770
chr15 39976797 G GGACGAC 0.109463 0.050 1 6 1 318 82 236 72 0 8 0 2 0 0 236 0 0 0.8780 0.0000 0.0000 9.250 0.75 4.00 -3.25 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6554 0.3446 0.0000 0 0 0.9266 0.0734 0.0000 0 0 0.9560 0.0440 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.050 1 -2 1 442 134 308 6 0 4 0 124 0 0 306 0 2 0.0448 0.0000 0.0065 32.500 1.50 2.13 -0.63 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8316 0.1684 2 2 0.0000 0.4769 0.5231
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.050 1 5 1 440 106 334 1 0 7 0 98 0 0 332 0 2 0.0094 0.0000 0.0060 14.143 1.00 5.71 -4.71 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4249 0.5751 2 2 0.0000 0.2285 0.7715 2 2 0.0000 0.1909 0.8091
chr15 72474873 T TGGC 0.069572 0.050 1 3 2 464 183 281 143 5 30 1 4 0 0 281 0 0 0.7814 0.0000 0.0000 5.067 0.78 3.75 -2.97 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4057 0.5943 0.0000 0 0 0.9685 0.0315 0.0000 0 0 0.9894 0.0106 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.050 1 -3 1 460 116 344 43 1 9 6 57 0 0 343 0 1 0.3707 0.0000 0.0029 11.889 0.67 3.61 -2.94 17 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0534 0.3971 0.5494 1 2 0.0567 0.4022 0.5411 1 2 0.0614 0.4088 0.5298
chr15 79463264 TGAG T 0.000283 0.050 1 -3 2 284 100 184 53 1 1 0 45 0 0 184 0 0 0.5300 0.0000 0.0000 99.000 0.47 3.11 -2.64 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5802 0.4198 0.0001 1 0 0.5782 0.4217 0.0001 1 0 0.5755 0.4244 0.0001
chr15 83008518 C CA 0.185307 0.050 1 1 1 131 31 100 14 8 4 0 5 0 1 98 0 1 0.4516 0.0000 0.0200 4.750 1.07 2.20 -1.13 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5904 0.3798 0.0297 1 1 0.4797 0.4964 0.0239 0 1 0.4813 0.5109 0.0078
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.050 1 -18 1 447 102 345 83 0 18 0 1 0 0 344 0 1 0.8137 0.0000 0.0029 4.667 0.42 18.00 -17.58 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5703 0.4297 0.0000 0 0 0.8976 0.1024 0.0000 0 0 0.9374 0.0626 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.050 1 3 3 340 131 209 121 2 0 0 8 0 0 209 0 0 0.9237 0.0000 0.0000 130.000 0.17 2.62 -2.46 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2002 0.7998 0.0000 0 0 0.7108 0.2892 0.0000
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.050 1 3 1 1393 390 1003 172 10 77 2 129 0 0 1000 0 3 0.4410 0.0000 0.0030 4.039 0.25 3.28 -3.03 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8674 0.1318 0.0008 1 0 0.8599 0.1391 0.0010 1 0 0.8494 0.1494 0.0012
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.050 1 -24 2 677 185 492 80 7 77 3 18 0 1 490 0 1 0.4324 0.0000 0.0041 2.452 1.46 6.28 -4.82 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8711 0.1256 0.0034 1 0 0.8601 0.1359 0.0041 1 0 0.7750 0.2202 0.0048
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.050 1 -12 2 663 179 484 54 3 28 3 91 0 1 483 0 0 0.3017 0.0000 0.0021 5.731 1.44 6.23 -4.79 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0105 0.2335 0.7560 1 2 0.0118 0.2426 0.7456 1 2 0.0138 0.2550 0.7312
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.050 1 -6 1 316 99 217 0 0 5 0 94 0 0 211 0 6 0.0000 0.0000 0.0276 18.800 6.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.050 1 1 1 311 98 213 50 0 2 0 46 0 0 213 0 0 0.5102 0.0000 0.0000 48.000 0.20 2.17 -1.97 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2740 0.5264 0.1996 1 1 0.2733 0.5244 0.2022 1 1 0.2724 0.5220 0.2056
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.050 1 -3 2 538 205 333 72 1 35 80 17 0 0 331 2 0 0.3512 0.0000 0.0060 4.857 0.49 4.24 -3.75 22 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1892 0.6322 0.1786 1 1 0.1973 0.6285 0.1743 1 1 0.2081 0.6234 0.1685
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.050 1 -6 2 539 209 330 156 2 40 0 11 0 0 329 0 1 0.7464 0.0000 0.0030 4.333 1.84 6.27 -4.43 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0348 0.9652 0.0000 0 0 0.5301 0.4699 0.0000
chr15 99712536 AGCC A 0.004065 0.050 1 -3 1 538 208 330 82 9 8 11 98 0 0 330 0 0 0.3942 0.0000 0.0000 23.250 0.63 3.10 -2.47 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2712 0.7239 0.0049 1 1 0.2805 0.7147 0.0048 1 1 0.2927 0.7027 0.0046
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.050 1 2 2 350 108 242 53 1 1 0 53 0 0 242 0 0 0.4907 0.0000 0.0000 107.000 0.08 3.26 -3.19 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3335 0.5278 0.1387 1 1 0.3347 0.5256 0.1398 1 1 0.3362 0.5227 0.1411
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.050 1 -17 2 256 68 188 0 0 1 0 67 0 0 183 0 5 0.0000 0.0000 0.0266 67.000 16.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6247 0.3753 2 1 0.0000 0.6331 0.3669 2 1 0.0000 0.6446 0.3554
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.050 1 -1 1 842 181 661 5 0 1 1 174 0 0 660 0 1 0.0276 0.0000 0.0015 179.000 1.60 1.71 -0.11 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9934 0.0066 2 1 0.0000 0.5786 0.4214 2 2 0.0000 0.2616 0.7384
chr16 1792405 C CG 0.000218 0.050 1 1 1 600 148 452 59 1 9 0 79 0 0 451 0 1 0.3986 0.0000 0.0022 15.333 0.27 1.46 -1.18 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2371 0.7625 0.0004 1 1 0.2465 0.7531 0.0004 1 1 0.2591 0.7405 0.0003
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 574 90 484 0 0 0 2 88 0 0 482 0 2 0.0000 0.0000 0.0041 89.000 7.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 574 90 484 0 0 0 2 88 0 0 482 0 2 0.0000 0.0000 0.0041 89.000 7.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.050 1 -3 1 377 102 275 0 0 8 0 94 0 0 267 0 8 0.0000 0.0000 0.0291 11.750 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0463 0.9537 2 2 0.0000 0.0486 0.9514 2 2 0.0000 0.0519 0.9481
chr16 11927441 G GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA 0.000747 0.050 1 42 2 2035 385 1650 4 0 271 3 107 0 1 1632 0 17 0.0104 0.0000 0.0109 0.417 1.00 4.42 -3.42 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9968 0.0032
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.050 1 -42 2 2056 540 1516 264 1 137 1 137 0 0 1488 0 28 0.4889 0.0000 0.0185 2.934 2.03 4.47 -2.44 154 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9863 0.0137 0.0000 1 0 0.9841 0.0159 0.0000 1 0 0.9807 0.0193 0.0000
chr16 11927872 ATTCTGACCTGTAGGGCCAAAGGAGGGAATGTTTTCACACATAT A 0.011371 0.050 1 -43 2 1784 300 1484 198 0 0 1 101 0 0 1475 0 9 0.6600 0.0000 0.0061 300.000 0.31 29.74 -29.43 178 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9804 0.0196 0.0000 1 0 0.9776 0.0224 0.0000 1 0 0.9732 0.0268 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.050 1 -2 1 221 80 141 0 0 1 0 79 0 0 141 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 79.000 2.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.050 1 -12 1 662 218 444 122 1 13 0 82 0 0 444 0 0 0.5596 0.0000 0.0000 15.769 0.20 9.76 -9.55 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8263 0.1706 0.0032 1 0 0.8173 0.1790 0.0036 1 0 0.8048 0.1908 0.0044
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.050 1 -27 1 859 207 652 2 0 61 1 143 0 0 652 0 0 0.0097 0.0000 0.0000 2.377 4.50 12.57 -8.07 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5892 0.4108 2 2 0.0000 0.1883 0.8117 2 2 0.0000 0.1245 0.8755
chr16 31086367 G GC 0.500000 0.050 1 1 5 740 168 572 78 0 9 1 80 0 0 572 0 0 0.4643 0.0000 0.0000 17.667 0.35 2.54 -2.19 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1938 0.5457 0.2606 1 1 0.1965 0.5422 0.2613 1 1 0.2001 0.5379 0.2620
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 141 78 63 41 0 3 0 34 0 0 63 0 0 0.5256 0.0000 0.0000 25.000 0.29 2.29 -2.00 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3277 0.5082 0.1641 1 1 0.3252 0.5076 0.1672 1 1 0.3218 0.5068 0.1714
chr16 57813722 ATG A 0.500000 0.050 1 -2 1 284 121 163 59 59 1 0 2 0 0 163 0 0 0.4876 0.0000 0.0000 62.000 0.19 10.00 -9.81 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3667 0.6333 0.0000 0 0 0.7898 0.2102 0.0000 0 0 0.8625 0.1375 0.0000
chr16 57813725 CAGGTGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 284 124 160 120 0 2 0 2 0 0 160 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 61.000 0.79 10.00 -9.21 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4389 0.5611 0.0000 0 0 0.8353 0.1647 0.0000 0 0 0.8941 0.1059 0.0000
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.050 1 -1 1 505 91 414 56 12 14 1 8 0 0 413 1 0 0.6154 0.0000 0.0024 5.286 1.14 1.38 -0.23 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0152 0.9848 0.0000 0 1 0.1492 0.8508 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 1140 369 771 161 4 54 15 135 0 0 770 0 1 0.4363 0.0000 0.0013 5.796 0.47 3.28 -2.81 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3646 0.5420 0.0934 1 1 0.3633 0.5386 0.0981 1 1 0.3612 0.5344 0.1044
chr16 69715020 ACACT A 0.500000 0.050 1 -4 2 69 38 31 18 0 0 0 20 0 0 29 0 2 0.4737 0.0000 0.0645 38.000 0.00 5.55 -5.55 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1982 0.5074 0.2944 1 1 0.2003 0.5068 0.2929 1 1 0.2029 0.5061 0.2910
chr16 71922608 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 2 263 99 164 33 2 23 0 41 1 0 157 0 6 0.3333 0.0061 0.0427 3.304 6.55 5.32 1.23 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1281 0.4897 0.3821 1 1 0.1321 0.4904 0.3775 1 1 0.1373 0.4913 0.3714
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.050 1 -6 2 264 109 155 51 0 21 0 37 0 0 154 0 1 0.4679 0.0000 0.0065 4.190 4.45 5.84 -1.39 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4083 0.4788 0.1129 1 1 0.4028 0.4802 0.1170 1 1 0.3954 0.4820 0.1226
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 155 77 78 49 1 0 0 27 0 0 78 0 0 0.6364 0.0000 0.0000 76.000 0.92 4.15 -3.23 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5505 0.3917 0.0578 1 0 0.5399 0.3983 0.0618 1 0 0.5256 0.4070 0.0674
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.050 1 -3 2 612 149 463 125 3 17 0 4 0 0 463 0 0 0.8389 0.0000 0.0000 7.706 0.82 3.75 -2.93 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0352 0.9648 0.0000 0 0 0.6178 0.3822 0.0000 0 0 0.8287 0.1713 0.0000
chr16 72797458 C CTTGTTG 0.500000 0.050 1 6 1 672 161 511 78 0 37 0 46 0 0 504 0 7 0.4845 0.0000 0.0137 3.351 0.45 5.87 -5.42 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5639 0.3877 0.0484 1 0 0.5536 0.3942 0.0522 1 0 0.5396 0.4028 0.0576
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.050 1 22 2 320 93 227 49 0 7 0 37 0 0 220 0 7 0.5269 0.0000 0.0308 12.286 0.06 11.05 -10.99 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2976 0.5208 0.1815 1 1 0.2965 0.5193 0.1843 1 1 0.2948 0.5173 0.1879
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.050 1 -2 2 258 111 147 107 0 1 0 3 0 0 147 0 0 0.9640 0.0000 0.0000 110.000 0.65 4.67 -4.01 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0995 0.9005 0.0000 0 0 0.6537 0.3463 0.0000 0 0 0.8100 0.1900 0.0000
chr16 85656376 G GGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGC 0.500000 0.050 1 24 3 434 98 336 68 3 25 0 2 0 0 334 0 2 0.6939 0.0000 0.0060 2.958 3.10 12.50 -9.40 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0084 0.9916 0.0000 0 1 0.2789 0.7211 0.0000 0 0 0.5469 0.4531 0.0000
chr16 85656376 GGAGCGC G 0.500000 0.050 1 -6 3 434 101 333 45 2 20 1 33 0 0 333 0 0 0.4455 0.0000 0.0000 3.950 1.42 4.94 -3.52 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4056 0.4784 0.1159 1 1 0.4001 0.4799 0.1200 1 1 0.3928 0.4817 0.1255
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.050 1 6 1 415 114 301 47 0 24 0 43 0 0 296 0 5 0.4123 0.0000 0.0166 3.750 1.13 5.37 -4.24 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2220 0.5286 0.2494 1 1 0.2236 0.5264 0.2500 1 1 0.2255 0.5237 0.2508
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.050 1 -2 1 612 108 504 0 0 1 5 102 0 0 496 1 7 0.0000 0.0000 0.0159 106.000 7.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0526 0.9474 2 2 0.0000 0.0556 0.9444 2 2 0.0000 0.0599 0.9401
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 611 101 510 0 0 3 5 93 0 0 501 4 5 0.0000 0.0000 0.0176 32.667 8.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0628 0.9372 2 2 0.0000 0.0660 0.9340 2 2 0.0000 0.0708 0.9292
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 614 102 512 0 0 1 2 99 0 0 498 8 6 0.0000 0.0000 0.0273 100.000 8.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0526 0.9474 2 2 0.0000 0.0555 0.9445 2 2 0.0000 0.0599 0.9401
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.050 1 -6 1 735 154 581 66 0 5 3 80 0 0 578 0 3 0.4286 0.0000 0.0052 29.800 6.08 7.06 -0.99 20 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0682 0.4406 0.4913 1 2 0.0724 0.4442 0.4835 1 2 0.0783 0.4488 0.4729
chr16 88714227 G GGTAT 0.500000 0.050 1 4 1 730 151 579 71 2 5 68 5 0 0 576 3 0 0.4702 0.0000 0.0052 72.500 7.45 7.60 -0.15 33 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2168 0.5447 0.2385 1 1 0.2188 0.5413 0.2398 1 1 0.2214 0.5371 0.2415
chr16 88714227 G GGTGT 0.500000 0.050 1 4 1 730 151 579 66 3 5 4 73 0 0 576 0 3 0.4371 0.0000 0.0052 29.200 7.24 5.88 1.37 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1245 0.5108 0.3647 1 1 0.1286 0.5099 0.3615 1 1 0.1341 0.5088 0.3571
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.050 1 -3 1 767 229 538 81 1 40 5 102 0 0 536 0 2 0.3537 0.0000 0.0037 4.625 0.65 3.43 -2.78 17 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0425 0.3910 0.5665 1 2 0.0461 0.3970 0.5568 1 2 0.0514 0.4050 0.5437
chr16 88733987 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 755 217 538 99 3 11 91 13 0 0 538 0 0 0.4562 0.0000 0.0000 11.091 0.53 4.77 -4.24 7 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5621 0.3917 0.0462 1 0 0.5522 0.3978 0.0500 1 0 0.5387 0.4060 0.0553
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.050 1 4 2 126 48 78 0 0 2 0 46 0 0 78 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 23.000 3.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2391 0.7609 2 2 0.0000 0.2434 0.7566 2 2 0.0000 0.2493 0.7507
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.050 1 -3 1 944 241 703 215 4 15 0 7 0 0 703 0 0 0.8921 0.0000 0.0000 15.067 0.23 3.29 -3.06 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 0 0.8761 0.1239 0.0000 0 0 0.9797 0.0203 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.050 1 -1 2 351 134 217 126 1 2 0 5 0 0 217 0 0 0.9403 0.0000 0.0000 66.000 0.46 1.40 -0.94 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 1 0.2776 0.7224 0.0000 0 0 0.6049 0.3951 0.0000
chr17 4900004 G GC 0.000569 0.050 1 1 1 882 211 671 118 0 3 1 89 0 0 670 0 1 0.5592 0.0000 0.0015 69.333 0.31 1.17 -0.85 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7463 0.2537 0.0000 1 0 0.7402 0.2598 0.0000 1 0 0.7317 0.2683 0.0000
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.050 1 -3 1 823 161 662 1 80 4 1 75 0 0 661 0 1 0.0062 0.0000 0.0015 38.500 2.00 3.75 -1.75 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4442 0.5525 0.0033 1 1 0.4479 0.5488 0.0033 1 1 0.4525 0.5442 0.0034
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.050 1 3 1 614 147 467 55 5 34 1 52 0 0 460 0 7 0.3741 0.0000 0.0150 3.324 0.13 2.96 -2.83 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1603 0.5367 0.3030 1 1 0.1613 0.5339 0.3048 1 1 0.1625 0.5305 0.3071
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.050 1 -6 2 1239 397 842 308 10 73 0 6 0 1 841 0 0 0.7758 0.0000 0.0012 4.438 4.41 7.17 -2.76 68 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6486 0.3514 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.050 1 -6 1 1017 308 709 245 1 57 0 5 0 0 708 0 1 0.7955 0.0000 0.0014 4.464 0.88 7.00 -6.12 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1988 0.8012 0.0000 0 0 0.9862 0.0138 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.050 1 9 2 412 109 303 102 0 5 0 2 0 1 302 0 0 0.9358 0.0000 0.0033 20.800 1.05 9.00 -7.95 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3377 0.6623 0.0000 0 0 0.7692 0.2308 0.0000 0 0 0.8488 0.1512 0.0000
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 473 167 306 72 1 35 2 57 0 1 304 1 0 0.4311 0.0000 0.0065 3.743 0.21 3.00 -2.79 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4089 0.4866 0.1045 1 1 0.4039 0.4874 0.1087 1 1 0.3970 0.4884 0.1146
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 912 243 669 127 3 9 101 3 0 0 669 0 0 0.5226 0.0000 0.0000 20.429 0.56 5.00 -4.44 39 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8682 0.1288 0.0031 1 0 0.8569 0.1394 0.0038 1 0 0.8406 0.1545 0.0049
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 913 239 674 128 6 101 2 2 0 1 673 0 0 0.5356 0.0000 0.0015 1.494 0.55 4.00 -3.45 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4187 0.5813 0.0000 0 0 0.8513 0.1487 0.0000 0 0 0.9159 0.0841 0.0000
chr17 18673034 G GCGCCGCCGC 0.500000 0.050 1 9 3 990 268 722 115 4 53 0 96 9 2 696 2 13 0.4291 0.0125 0.0360 4.057 1.86 8.14 -6.27 53 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4541 0.4764 0.0696 1 1 0.4487 0.4774 0.0739 1 1 0.4413 0.4788 0.0799
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.050 1 3 1 646 146 500 0 0 6 0 140 0 0 490 0 10 0.0000 0.0000 0.0200 23.333 4.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0224 0.9776 2 2 0.0000 0.0241 0.9759 2 2 0.0000 0.0267 0.9733
chr17 29761226 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 115 50 65 24 0 2 0 24 0 0 65 0 0 0.4800 0.0000 0.0000 24.000 0.62 1.21 -0.58 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2426 0.5147 0.2427 1 1 0.2432 0.5135 0.2433 1 1 0.2439 0.5122 0.2439
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 101 62 39 58 0 0 0 4 0 0 39 0 0 0.9355 0.0000 0.0000 62.000 0.17 1.25 -1.08 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.2246 0.7754 0.0000 0 1 0.4762 0.5238 0.0000
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.050 1 -12 1 916 237 679 195 5 33 0 4 1 2 675 1 0 0.8228 0.0015 0.0059 6.581 2.66 9.25 -6.59 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0486 0.9514 0.0000 0 0 0.8355 0.1645 0.0000 0 0 0.9506 0.0494 0.0000
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.050 1 1 1 758 190 568 100 0 4 1 85 0 0 567 0 1 0.5263 0.0000 0.0018 46.500 0.58 1.53 -0.95 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3849 0.5087 0.1064 1 1 0.3814 0.5078 0.1108 1 1 0.3765 0.5068 0.1168
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 477 124 353 49 0 6 1 68 0 0 353 0 0 0.3952 0.0000 0.0000 19.667 0.53 1.50 -0.97 39 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0693 0.4302 0.5005 1 2 0.0735 0.4345 0.4920 1 2 0.0794 0.4401 0.4805
chr17 41140276 TGACAGCAGCTGG T 0.500000 0.050 1 -12 1 782 131 651 51 2 25 0 53 2 1 639 1 8 0.3893 0.0031 0.0184 4.160 1.04 10.87 -9.83 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1636 0.5226 0.3138 1 1 0.1669 0.5209 0.3122 1 1 0.1713 0.5187 0.3100
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.050 1 15 1 507 112 395 0 0 16 1 95 0 0 373 1 21 0.0000 0.0000 0.0557 5.938 8.47 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0490 0.9510 2 2 0.0000 0.0518 0.9482 2 2 0.0000 0.0560 0.9440
chr17 41238458 AGACCACCTGCTGCAG A 0.500000 0.050 1 -15 1 244 81 163 71 0 7 0 3 1 0 159 2 1 0.8765 0.0061 0.0245 10.571 4.23 8.33 -4.11 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.1721 0.8279 0.0000 0 1 0.4589 0.5411 0.0000
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.050 1 -15 1 559 176 383 73 0 33 0 70 0 0 377 0 6 0.4148 0.0000 0.0157 4.333 0.27 13.36 -13.08 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1950 0.5427 0.2623 1 1 0.1977 0.5395 0.2629 1 1 0.2011 0.5354 0.2635
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.050 1 3 5 1603 297 1306 19 0 5 0 273 0 0 1300 0 6 0.0640 0.0000 0.0046 58.400 0.47 3.26 -2.79 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 1 0.0000 0.5920 0.4080
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 600 166 434 80 1 27 0 58 0 0 433 0 1 0.4819 0.0000 0.0023 5.148 0.50 3.33 -2.83 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5226 0.4180 0.0594 1 0 0.5136 0.4229 0.0635 1 0 0.5015 0.4293 0.0692
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 297 96 201 50 0 5 0 41 0 0 200 0 1 0.5208 0.0000 0.0050 18.200 0.26 3.78 -3.52 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3378 0.5090 0.1532 1 1 0.3351 0.5083 0.1566 1 1 0.3314 0.5074 0.1612
chr17 47836758 AAGGAGCTGGAGC A 0.500000 0.050 1 -12 1 672 163 509 89 0 7 1 66 0 0 506 0 3 0.5460 0.0000 0.0059 22.143 0.46 11.00 -10.54 19 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4821 0.4474 0.0705 1 0 0.4748 0.4505 0.0747 1 0 0.4647 0.4546 0.0807
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.050 1 3 5 871 227 644 6 0 8 2 211 0 0 638 0 6 0.0264 0.0000 0.0093 27.375 0.00 3.05 -3.05 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9864 0.0136 2 2 0.0000 0.1990 0.8010 2 2 0.0000 0.0466 0.9534
chr17 57979243 T TTGC 0.500000 0.050 1 3 1 362 170 192 68 3 46 2 51 0 0 192 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 2.630 0.51 3.39 -2.88 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4674 0.4517 0.0809 1 0 0.4601 0.4547 0.0852 1 1 0.4503 0.4586 0.0911
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.050 1 6 2 378 124 254 42 0 25 2 55 0 0 254 0 0 0.3387 0.0000 0.0000 3.960 0.79 5.82 -5.03 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0989 0.4674 0.4337 1 1 0.1031 0.4695 0.4273 1 1 0.1090 0.4723 0.4188
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.050 1 9 1 339 140 199 69 0 17 0 54 0 0 199 0 0 0.4929 0.0000 0.0000 7.235 0.09 7.39 -7.30 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4284 0.4744 0.0972 1 1 0.4225 0.4759 0.1015 1 1 0.4146 0.4780 0.1074
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.050 1 8 2 274 62 212 29 1 4 0 28 0 0 211 0 1 0.4677 0.0000 0.0047 14.500 0.59 7.29 -6.70 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2530 0.5177 0.2293 1 1 0.2533 0.5164 0.2304 1 1 0.2535 0.5147 0.2318
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.050 1 -2 3 326 79 247 39 0 0 0 40 0 0 247 0 0 0.4937 0.0000 0.0000 79.000 0.18 2.20 -2.02 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2263 0.5238 0.2499 1 1 0.2276 0.5220 0.2504 1 1 0.2293 0.5198 0.2509
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.050 1 -4 3 202 69 133 67 0 0 0 2 0 0 133 0 0 0.9710 0.0000 0.0000 69.000 1.00 4.00 -3.00 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1709 0.8291 0.0000 0 0 0.5785 0.4215 0.0000 0 0 0.7032 0.2968 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.050 1 9 2 536 101 435 56 0 8 0 37 0 0 429 0 6 0.5545 0.0000 0.0138 11.625 0.55 7.35 -6.80 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4059 0.4818 0.1122 1 1 0.4006 0.4830 0.1164 1 1 0.3935 0.4845 0.1220
chr17 75516562 T TGGAGCC 0.500000 0.050 1 6 1 437 96 341 49 0 2 1 44 0 0 338 0 3 0.5104 0.0000 0.0088 47.000 0.82 6.68 -5.87 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2470 0.5293 0.2237 1 1 0.2477 0.5271 0.2252 1 1 0.2486 0.5243 0.2271
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 1871 441 1430 226 4 15 10 186 1 0 1425 0 4 0.5125 0.0007 0.0035 30.214 0.74 2.39 -1.64 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5665 0.4078 0.0257 1 0 0.5600 0.4113 0.0286 1 0 0.5508 0.4163 0.0329
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 2083 493 1590 258 3 48 2 182 2 1 1545 1 41 0.5233 0.0013 0.0283 9.250 0.79 17.41 -16.62 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6355 0.3500 0.0146 1 0 0.6279 0.3555 0.0166 1 0 0.6170 0.3632 0.0198
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.050 1 -27 1 2220 445 1775 290 0 11 0 144 0 2 1724 2 47 0.6517 0.0000 0.0287 39.455 0.75 22.52 -21.77 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9723 0.0276 0.0001 1 0 0.9682 0.0317 0.0001 1 0 0.9618 0.0381 0.0001
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.050 1 -2 2 979 291 688 149 1 8 0 133 0 0 684 0 4 0.5120 0.0000 0.0058 35.250 0.18 3.27 -3.09 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3573 0.5410 0.1017 1 1 0.3559 0.5377 0.1063 1 1 0.3537 0.5337 0.1126
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.050 1 -30 1 2236 514 1722 238 11 69 12 184 2 4 1704 4 8 0.4630 0.0012 0.0105 6.397 1.33 7.50 -6.17 82 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7443 0.2489 0.0068 1 0 0.7343 0.2577 0.0080 1 0 0.7201 0.2699 0.0100
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 2156 547 1609 250 7 31 4 255 4 3 1478 20 104 0.4570 0.0025 0.0814 17.133 1.73 4.81 -3.08 64 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0123 0.9876 1 2 0.0000 0.0146 0.9854 1 2 0.0000 0.0181 0.9819
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 1073 192 881 97 0 12 1 82 0 0 881 0 0 0.5052 0.0000 0.0000 14.917 0.47 5.24 -4.77 59 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4033 0.4977 0.0990 1 1 0.3990 0.4976 0.1034 1 1 0.3931 0.4975 0.1094
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.050 1 -3 2 516 138 378 125 0 6 0 7 0 0 377 0 1 0.9058 0.0000 0.0026 22.000 0.59 3.14 -2.55 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0945 0.9055 0.0000 0 0 0.5059 0.4941 0.0000
chr17 81647906 T TTAAC 0.500000 0.050 1 4 3 522 126 396 117 0 5 0 4 0 0 396 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 24.200 0.39 4.25 -3.86 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0270 0.9730 0.0000 0 0 0.5533 0.4467 0.0000 0 0 0.7889 0.2111 0.0000
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.050 1 6 4 361 89 272 37 0 7 1 44 0 0 272 0 0 0.4157 0.0000 0.0000 11.571 0.51 5.95 -5.44 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3056 0.5814 0.1129 1 1 0.3107 0.5779 0.1114 1 1 0.3173 0.5733 0.1094
chr18 21452083 GCGATGACCTAGA G 0.000946 0.050 1 -12 2 350 110 240 79 0 0 0 31 0 0 235 0 5 0.7182 0.0000 0.0208 110.000 0.39 10.90 -10.51 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8791 0.1208 0.0000 1 0 0.8714 0.1286 0.0000 1 0 0.8604 0.1396 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.050 1 3 1 294 129 165 0 0 8 0 121 0 0 162 0 3 0.0000 0.0000 0.0182 15.125 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.050 1 -9 2 322 71 251 62 0 5 0 4 2 0 248 0 1 0.8732 0.0080 0.0120 13.200 0.81 10.50 -9.69 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0051 0.9949 0.0000 0 1 0.3806 0.6194 0.0000 0 0 0.7211 0.2789 0.0000
chr18 24160067 CTG C 0.002292 0.050 1 -2 4 383 73 310 33 0 1 0 39 0 0 310 0 0 0.4521 0.0000 0.0000 72.000 0.21 2.23 -2.02 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4038 0.5945 0.0017 1 1 0.4081 0.5902 0.0017 1 1 0.4138 0.5846 0.0016
chr18 31760462 TC T 0.000470 0.050 1 -1 1 613 120 493 64 0 5 0 51 0 0 492 0 1 0.5333 0.0000 0.0020 23.000 0.61 1.39 -0.78 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6108 0.3891 0.0001 1 0 0.6079 0.3920 0.0001 1 0 0.6040 0.3959 0.0001
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.050 1 4 1 158 72 86 1 0 2 0 69 0 0 86 0 0 0.0139 0.0000 0.0000 35.000 0.00 5.06 -5.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4274 0.5726 2 2 0.0000 0.2275 0.7725 2 2 0.0000 0.1868 0.8132
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 1 91 40 51 14 0 1 0 25 0 0 51 0 0 0.3500 0.0000 0.0000 39.000 0.07 3.04 -2.97 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1319 0.4766 0.3914 1 1 0.1357 0.4783 0.3860 1 1 0.1407 0.4804 0.3789
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 1 345 158 187 87 0 7 0 64 0 0 187 0 0 0.5506 0.0000 0.0000 21.571 0.15 3.69 -3.54 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5335 0.4116 0.0549 1 0 0.5243 0.4168 0.0589 1 0 0.5119 0.4236 0.0645
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 218 111 107 1 0 3 0 107 0 0 107 0 0 0.0090 0.0000 0.0000 36.000 0.00 2.96 -2.96 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2555 0.7445 2 2 0.0000 0.1222 0.8778 2 2 0.0000 0.1003 0.8997
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.050 1 -15 2 730 179 551 109 0 4 0 66 0 0 542 0 9 0.6089 0.0000 0.0163 43.750 0.18 13.79 -13.60 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6663 0.3106 0.0231 1 0 0.6542 0.3200 0.0258 1 0 0.6377 0.3325 0.0298
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 6 334 66 268 30 1 11 4 20 1 0 266 1 0 0.4545 0.0037 0.0075 4.818 2.63 4.80 -2.17 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3316 0.5024 0.1660 1 1 0.3288 0.5022 0.1690 1 1 0.3250 0.5020 0.1731
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 143 54 89 0 0 2 0 52 0 0 87 0 2 0.0000 0.0000 0.0225 26.000 3.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2044 0.7956 2 2 0.0000 0.2089 0.7911 2 2 0.0000 0.2151 0.7849
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.050 1 3 1 128 63 65 30 2 3 0 28 0 0 63 0 2 0.4762 0.0000 0.0308 20.000 0.43 3.11 -2.67 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2649 0.5177 0.2174 1 1 0.2647 0.5164 0.2189 1 1 0.2644 0.5147 0.2209
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.050 1 24 3 507 238 269 61 3 33 16 125 0 1 266 1 1 0.2563 0.0000 0.0112 6.767 2.21 5.27 -3.06 21 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0013 0.1068 0.8918 1 2 0.0018 0.1198 0.8784 1 2 0.0026 0.1391 0.8583
chr19 621458 G GGCAGGT 0.002400 0.050 1 6 1 573 145 428 68 1 6 0 70 0 0 420 0 8 0.4690 0.0000 0.0187 23.167 0.94 6.23 -5.29 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3475 0.6505 0.0020 1 1 0.3545 0.6435 0.0020 1 1 0.3636 0.6345 0.0020
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.050 1 3 1 210 90 120 5 1 39 2 43 0 0 120 0 0 0.0556 0.0000 0.0000 8.167 2.80 2.79 0.01 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1792 0.7980 0.0228 1 1 0.1507 0.8319 0.0173 2 1 0.0792 0.9119 0.0089
chr19 1046907 GCTGCGGGACACCATGCGCGCCATGGGGCTCAGCCGCGCGGTGCT G 0.001648 0.050 1 -44 2 505 158 347 154 0 1 0 3 0 0 346 0 1 0.9747 0.0000 0.0029 157.000 1.03 14.67 -13.63 46 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9771 0.0229 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.050 1 -3 1 158 59 99 33 1 0 0 25 0 0 98 0 1 0.5593 0.0000 0.0101 59.000 1.55 4.12 -2.57 9 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4804 0.4536 0.0660 1 0 0.4773 0.4551 0.0676 1 0 0.4731 0.4571 0.0698
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.050 1 -3 2 219 128 91 71 0 0 0 57 0 0 91 0 0 0.5547 0.0000 0.0000 128.000 0.35 3.14 -2.79 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5479 0.4127 0.0394 1 0 0.5434 0.4154 0.0412 1 0 0.5372 0.4191 0.0437
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.050 1 3 2 357 98 259 40 6 25 1 26 0 0 258 0 1 0.4082 0.0000 0.0039 2.840 0.72 3.08 -2.35 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6737 0.3219 0.0044 1 0 0.6678 0.3276 0.0046 1 0 0.6597 0.3353 0.0050
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.050 1 -3 4 289 102 187 46 0 17 35 4 0 0 184 3 0 0.4510 0.0000 0.0160 5.000 1.30 3.50 -2.20 24 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2959 0.5203 0.1838 1 1 0.2953 0.5187 0.1860 1 1 0.2945 0.5166 0.1889
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.050 1 -6 4 289 104 185 48 0 20 0 36 0 0 181 0 4 0.4615 0.0000 0.0216 4.200 1.27 7.14 -5.87 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5114 0.4490 0.0396 1 0 0.5091 0.4502 0.0406 1 0 0.5061 0.4519 0.0420
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.050 1 -12 4 289 111 178 59 1 46 0 5 0 0 177 0 1 0.5315 0.0000 0.0056 1.413 1.36 12.20 -10.84 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2646 0.7354 0.0000 0 0 0.6696 0.3304 0.0000
chr19 2248057 TCCCCCAGCTCCTGGCGTCCAC T 0.007266 0.050 1 -21 1 243 54 189 43 0 9 1 1 0 0 189 0 0 0.7963 0.0000 0.0000 5.000 0.95 3.00 -2.05 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9476 0.0524 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr19 4529242 TGAG T 0.001023 0.050 1 -3 1 238 69 169 38 0 3 0 28 0 0 169 0 0 0.5507 0.0000 0.0000 22.000 1.00 2.82 -1.82 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6016 0.3982 0.0002 1 0 0.5985 0.4013 0.0002 1 0 0.5943 0.4054 0.0002
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.050 1 -3 1 371 114 257 69 0 1 0 44 1 0 256 0 0 0.6053 0.0039 0.0039 113.000 1.23 2.98 -1.75 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7294 0.2631 0.0075 1 0 0.7213 0.2705 0.0082 1 0 0.7103 0.2805 0.0092
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.050 1 5 3 244 63 181 5 0 5 0 53 0 0 177 0 4 0.0794 0.0000 0.0221 11.600 1.00 5.49 -4.49 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9364 0.0636 2 1 0.0000 0.7767 0.2233
chr19 10871708 A AGCG 0.007655 0.050 1 3 1 307 110 197 47 2 4 2 55 1 0 192 1 3 0.4273 0.0051 0.0254 26.500 1.79 5.58 -3.79 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3370 0.6556 0.0074 1 1 0.3439 0.6489 0.0073 1 1 0.3528 0.6401 0.0071
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.050 1 -3 1 801 275 526 109 2 43 15 106 0 0 523 0 3 0.3964 0.0000 0.0057 5.372 0.43 3.42 -2.98 47 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1470 0.5723 0.2807 1 1 0.1532 0.5689 0.2779 1 1 0.1615 0.5645 0.2740
chr19 11447525 AGAGGAG A 0.089394 0.050 1 -6 1 801 279 522 118 3 138 2 18 0 0 521 1 0 0.4229 0.0000 0.0019 1.045 0.47 6.39 -5.91 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0951 0.9049 0.0000
chr19 12430727 C CTG 0.053346 0.050 1 2 3 1376 311 1065 175 11 9 7 109 0 0 1055 3 7 0.5627 0.0000 0.0094 42.000 0.49 4.27 -3.77 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9174 0.0824 0.0002 1 0 0.9110 0.0887 0.0002 1 0 0.9018 0.0979 0.0003
chr19 12430728 CAA C 0.053324 0.050 1 -2 3 1377 318 1059 178 4 12 12 112 0 0 1052 0 7 0.5597 0.0000 0.0066 27.818 0.44 4.29 -3.85 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8925 0.1072 0.0003 1 0 0.8856 0.1140 0.0004 1 0 0.8757 0.1238 0.0005
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.050 1 -6 1 367 111 256 0 0 21 0 90 0 0 251 0 5 0.0000 0.0000 0.0195 4.286 10.46 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1700 0.8300 2 2 0.0000 0.1769 0.8231 2 2 0.0000 0.1867 0.8133
chr19 13207858 CCTGCTGCTGCTGCTGCTG C 0.085228 0.050 1 -18 1 368 115 253 58 0 18 1 38 0 0 247 0 6 0.5043 0.0000 0.0237 5.333 5.60 15.76 -10.16 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6032 0.3821 0.0147 1 0 0.5990 0.3857 0.0154 1 0 0.5932 0.3905 0.0163
chr19 14053768 TCGG T 0.001329 0.050 1 -3 2 465 118 347 56 1 4 0 57 0 0 345 0 2 0.4746 0.0000 0.0058 28.500 0.20 3.07 -2.87 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4387 0.5605 0.0007 1 1 0.4423 0.5569 0.0007 1 1 0.4469 0.5524 0.0007
chr19 14396381 GC G 0.000031 0.050 1 -1 4 473 220 253 171 0 2 0 47 0 0 253 0 0 0.7773 0.0000 0.0000 109.000 0.64 2.47 -1.83 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9972 0.0028 0.0000 1 0 0.9902 0.0098 0.0000 0 1 0.0486 0.9514 0.0000
chr19 14767068 AG A 0.000058 0.050 1 -1 1 242 41 201 20 0 0 0 21 0 0 200 0 1 0.4878 0.0000 0.0050 41.000 1.45 3.05 -1.60 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4625 0.5375 0.0000 1 1 0.4644 0.5356 0.0000 1 1 0.4669 0.5331 0.0000
chr19 14799825 GA G 0.002726 0.050 1 -1 1 802 197 605 91 2 18 0 86 0 0 605 0 0 0.4619 0.0000 0.0000 9.944 1.64 1.21 0.43 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5268 0.4724 0.0007 1 0 0.5277 0.4715 0.0008 1 0 0.5287 0.4705 0.0008
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.050 1 3 1 524 107 417 0 0 3 0 104 0 0 417 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 34.667 3.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr19 17286678 GTGTGTGTGTGTGTT G 0.125300 0.050 1 -14 1 299 73 226 28 8 9 4 24 0 0 226 0 0 0.3836 0.0000 0.0000 7.000 3.71 6.67 -2.95 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5233 0.4416 0.0351 1 0 0.5207 0.4433 0.0360 1 0 0.5172 0.4457 0.0371
chr19 17542226 CTGGCAGCACCGTT C 0.001442 0.050 1 -13 1 246 125 121 122 0 1 0 2 0 0 121 0 0 0.9760 0.0000 0.0000 124.000 0.29 13.00 -12.71 78 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9982 0.0018 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.050 1 -3 1 108 41 67 35 0 4 0 2 0 0 67 0 0 0.8537 0.0000 0.0000 9.250 1.60 3.00 -1.40 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2599 0.7401 0.0000 0 0 0.7036 0.2964 0.0000 0 0 0.8074 0.1926 0.0000
chr19 19934801 AC A 0.001341 0.050 1 -1 1 1477 312 1165 177 0 8 2 125 3 0 1153 2 7 0.5673 0.0026 0.0103 38.000 1.01 2.02 -1.01 109 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8571 0.1429 0.0000 1 0 0.8502 0.1497 0.0000 1 0 0.8406 0.1594 0.0000
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.050 1 1 1 1486 334 1152 0 0 10 2 322 0 0 1073 12 67 0.0000 0.0000 0.0686 36.000 2.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.050 1 -3 2 1004 227 777 119 0 5 0 103 0 0 772 0 5 0.5242 0.0000 0.0064 44.400 0.13 3.01 -2.88 83 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5344 0.4484 0.0172 1 0 0.5340 0.4481 0.0179 1 0 0.5332 0.4480 0.0189
chr19 23745033 TA T 0.001746 0.050 1 -1 3 975 216 759 6 0 3 1 206 0 0 758 0 1 0.0278 0.0000 0.0013 70.667 0.33 1.26 -0.93 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9947 0.0053 2 1 0.0000 0.9733 0.0267
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.050 1 -3 1 304 86 218 41 1 9 3 32 0 0 217 0 1 0.4767 0.0000 0.0046 8.444 0.20 2.69 -2.49 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1167 0.5670 0.3163 1 1 0.1156 0.5639 0.3206 1 1 0.1140 0.5598 0.3262
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.050 1 3 1 548 153 395 75 0 3 0 75 0 0 394 0 1 0.4902 0.0000 0.0025 50.000 0.65 3.36 -2.71 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1103 0.5398 0.3498 1 1 0.1114 0.5366 0.3520 1 1 0.1128 0.5326 0.3546
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.050 1 -51 2 558 248 310 225 1 18 0 4 0 0 310 0 0 0.9073 0.0000 0.0000 12.778 5.58 13.50 -7.92 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6856 0.3144 0.0000 0 0 0.9893 0.0107 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.050 1 12 2 551 198 353 60 2 54 4 78 0 0 352 0 1 0.3030 0.0000 0.0028 2.667 9.50 7.60 1.90 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1945 0.6923 0.1132 1 1 0.2034 0.6871 0.1095 1 1 0.2155 0.6798 0.1046
chr19 37388950 C CTGTG 0.140068 0.050 1 4 5 788 174 614 163 1 4 0 6 0 0 614 0 0 0.9368 0.0000 0.0000 42.250 0.17 3.83 -3.67 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0206 0.9794 0.0000 0 0 0.8635 0.1365 0.0000 0 0 0.9709 0.0291 0.0000
chr19 37388952 AT A 0.140069 0.050 1 -1 2 790 174 616 166 0 3 0 5 0 0 616 0 0 0.9540 0.0000 0.0000 57.000 0.19 4.60 -4.41 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1043 0.8957 0.0000 0 0 0.9290 0.0710 0.0000 0 0 0.9809 0.0191 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.050 1 -1 2 448 114 334 6 0 2 2 104 0 1 321 4 8 0.0526 0.0000 0.0389 55.500 1.67 3.24 -1.57 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9122 0.0878 2 1 0.0000 0.6263 0.3737
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.050 1 -2 1 233 32 201 0 0 2 27 3 0 0 201 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 12.000 5.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1198 0.8802 2 2 0.0000 0.1214 0.8786 2 2 0.0000 0.1236 0.8764
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.050 1 2 2 233 30 203 0 0 22 8 0 0 0 203 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.250 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1632 0.8367 2 2 0.0000 0.1642 0.8357 2 2 0.0001 0.1656 0.8343
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.050 1 -6 1 401 119 282 2 0 5 2 110 0 0 282 0 0 0.0168 0.0000 0.0000 22.800 1.00 5.53 -4.53 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5626 0.4374 2 2 0.0000 0.1651 0.8349 2 2 0.0000 0.1056 0.8944
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.050 1 -1 1 485 117 368 62 0 0 0 55 0 0 368 0 0 0.5299 0.0000 0.0000 117.000 0.24 3.78 -3.54 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5266 0.4568 0.0166 1 0 0.5258 0.4572 0.0170 1 0 0.5245 0.4580 0.0176
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.050 1 -6 1 438 98 340 3 0 0 1 94 0 0 329 0 11 0.0306 0.0000 0.0324 98.000 0.00 6.71 -6.71 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9288 0.0712 2 2 0.0000 0.4325 0.5675 2 2 0.0000 0.2521 0.7479
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.050 1 -3 2 515 140 375 6 0 2 0 132 0 0 370 1 4 0.0429 0.0000 0.0133 69.000 0.17 3.08 -2.92 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 1 0.0000 0.5204 0.4796 2 2 0.0000 0.1678 0.8322
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.050 1 -1 2 570 134 436 8 0 1 3 122 0 0 431 2 3 0.0597 0.0000 0.0115 132.000 0.25 2.23 -1.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9802 0.0198 2 1 0.0000 0.8355 0.1645
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.050 1 1 1 272 108 164 52 0 2 0 54 0 0 164 0 0 0.4815 0.0000 0.0000 53.000 0.08 2.15 -2.07 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4364 0.5561 0.0075 1 1 0.4398 0.5527 0.0075 1 1 0.4440 0.5485 0.0075
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.050 1 6 2 1404 457 947 204 1 81 0 171 0 0 923 0 24 0.4464 0.0000 0.0253 4.642 0.36 6.23 -5.87 82 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3067 0.5876 0.1058 1 1 0.3086 0.5808 0.1105 1 1 0.3107 0.5723 0.1170
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.050 1 18 1 319 96 223 46 0 21 0 29 0 0 211 0 12 0.4792 0.0000 0.0538 3.571 0.33 10.48 -10.16 24 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4896 0.4753 0.0352 1 0 0.4889 0.4753 0.0358 1 0 0.4879 0.4755 0.0366
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.050 1 1 1 200 90 110 80 0 6 0 4 0 1 109 0 0 0.8889 0.0000 0.0091 14.000 0.56 1.50 -0.94 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0552 0.9448 0.0000 0 0 0.7059 0.2941 0.0000 0 0 0.8800 0.1200 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.050 1 -3 1 990 288 702 204 7 52 3 22 2 3 696 1 0 0.7083 0.0028 0.0085 4.538 0.81 3.59 -2.78 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0247 0.9753 0.0000
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.050 1 3 1 1014 247 767 173 8 59 0 7 0 0 767 0 0 0.7004 0.0000 0.0000 3.186 0.37 3.57 -3.20 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 0 0.6366 0.3634 0.0000 0 0 0.9239 0.0761 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.050 1 -6 2 558 120 438 0 0 27 0 93 0 0 430 0 8 0.0000 0.0000 0.0183 3.444 6.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1212 0.8788 2 2 0.0000 0.1268 0.8732 2 2 0.0000 0.1347 0.8653
chr19 49908948 G GTGC 0.000984 0.050 1 3 2 767 192 575 106 0 12 4 70 0 0 575 0 0 0.5521 0.0000 0.0000 15.000 0.98 2.96 -1.98 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7967 0.2032 0.0000 1 0 0.7894 0.2105 0.0000 1 0 0.7793 0.2206 0.0000
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.050 1 3 2 648 156 492 4 1 4 74 73 0 0 487 2 3 0.0256 0.0000 0.0102 37.500 0.25 3.52 -3.27 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9811 0.0189 2 2 0.0000 0.3432 0.6568 2 2 0.0000 0.1184 0.8816
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.050 1 3 3 649 156 493 1 0 11 69 75 0 0 491 0 2 0.0064 0.0000 0.0041 13.182 1.00 4.08 -3.08 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2122 0.7878 2 2 0.0000 0.0995 0.9005 2 2 0.0000 0.0833 0.9167
chr19 50790456 CCTG C 0.001664 0.050 1 -3 1 471 179 292 80 1 19 2 77 0 0 292 0 0 0.4469 0.0000 0.0000 8.421 0.41 3.32 -2.91 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4751 0.5242 0.0006 1 1 0.4779 0.5215 0.0007 1 1 0.4812 0.5181 0.0007
chr19 51458362 G GGCA 0.000077 0.050 1 3 4 351 81 270 54 5 19 0 3 0 0 270 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 3.263 0.70 3.00 -2.30 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.050 1 1 1 533 144 389 4 0 3 6 131 0 0 383 0 6 0.0278 0.0000 0.0154 46.667 1.00 2.82 -1.82 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9030 0.0970 2 2 0.0000 0.1818 0.8182 2 2 0.0000 0.0701 0.9299
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.050 1 3 1 602 141 461 137 0 1 0 3 0 0 461 0 0 0.9716 0.0000 0.0000 140.000 0.15 4.00 -3.85 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2704 0.7296 0.0000 0 0 0.8620 0.1380 0.0000 0 0 0.9325 0.0675 0.0000
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.050 1 3 2 1428 300 1128 12 0 5 0 283 0 0 1120 1 7 0.0400 0.0000 0.0071 59.000 0.00 3.49 -3.49 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7744 0.2256 2 2 0.0000 0.1072 0.8928
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.050 1 -1 5 934 273 661 94 8 43 8 120 0 0 660 0 1 0.3443 0.0000 0.0015 8.444 0.28 2.62 -2.35 50 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0141 0.2821 0.7038 1 2 0.0158 0.2897 0.6945 1 2 0.0182 0.3001 0.6817
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.050 1 3 1 649 131 518 0 0 7 1 123 0 0 509 0 9 0.0000 0.0000 0.0174 17.714 3.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0401 0.9599 2 2 0.0000 0.0428 0.9572 2 2 0.0000 0.0467 0.9533
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.050 1 4 2 727 153 574 132 0 16 0 5 0 0 574 0 0 0.8627 0.0000 0.0000 8.562 0.60 4.20 -3.60 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1994 0.8006 0.0000 0 0 0.9666 0.0334 0.0000 0 0 0.9915 0.0085 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.050 1 9 2 434 108 326 0 0 27 0 81 0 0 310 0 16 0.0000 0.0000 0.0491 3.000 7.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0805 0.9195 2 2 0.0000 0.0842 0.9158 2 2 0.0000 0.0895 0.9105
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.050 1 -24 1 650 178 472 83 5 27 0 63 0 0 459 1 12 0.4663 0.0000 0.0275 6.167 2.18 19.05 -16.87 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1165 0.6245 0.2591 1 1 0.1148 0.6191 0.2662 1 1 0.1125 0.6120 0.2755
chr19 55518174 C CATCCCACCATGACTGCTG 0.004924 0.050 1 18 1 804 197 607 11 7 14 24 141 1 2 560 4 40 0.0558 0.0016 0.0774 25.000 8.18 8.71 -0.53 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.050 1 3 4 715 226 489 4 0 26 19 177 0 0 479 1 9 0.0177 0.0000 0.0204 8.522 0.25 5.23 -4.98 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9002 0.0998 2 2 0.0000 0.1746 0.8254 2 2 0.0000 0.0695 0.9305
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.050 1 3 1 534 102 432 1 0 2 1 98 0 0 428 0 4 0.0098 0.0000 0.0093 100.000 5.00 4.28 0.72 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2455 0.7545 2 2 0.0000 0.1155 0.8845 2 2 0.0000 0.0945 0.9055
chr19 56088071 C CTCG 0.023520 0.050 1 3 2 342 62 280 57 1 1 0 3 0 0 280 0 0 0.9194 0.0000 0.0000 61.000 2.49 3.67 -1.18 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5696 0.4304 0.0000 0 0 0.9587 0.0413 0.0000 0 0 0.9819 0.0181 0.0000
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.050 1 -48 1 117 58 59 30 1 15 0 12 0 0 54 0 5 0.5172 0.0000 0.0847 2.800 1.17 12.58 -11.42 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5772 0.3870 0.0358 1 0 0.5713 0.3914 0.0373 1 0 0.5635 0.3972 0.0393
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.050 1 -4 2 311 111 200 56 0 2 0 53 0 0 197 0 3 0.5045 0.0000 0.0150 54.500 0.20 3.89 -3.69 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3948 0.5342 0.0711 1 1 0.3970 0.5316 0.0715 1 1 0.3997 0.5283 0.0720
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.050 1 -2 1 314 102 212 0 0 2 2 98 0 0 211 0 1 0.0000 0.0000 0.0047 50.000 2.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0586 0.9414 2 2 0.0000 0.0615 0.9385 2 2 0.0000 0.0656 0.9344
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.050 1 -6 2 89 45 44 3 0 1 0 41 0 0 44 0 0 0.0667 0.0000 0.0000 44.000 0.00 6.24 -6.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9687 0.0313 2 1 0.0000 0.6362 0.3638 2 2 0.0000 0.4251 0.5749
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.050 1 2 1 639 194 445 187 0 1 0 6 0 0 444 0 1 0.9639 0.0000 0.0022 193.000 0.22 8.33 -8.11 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.6065 0.3935 0.0000 0 0 0.9147 0.0853 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.050 1 -2 1 639 201 438 189 0 7 0 5 0 0 437 0 1 0.9403 0.0000 0.0023 27.714 0.22 8.40 -8.18 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0106 0.9894 0.0000 0 0 0.7598 0.2402 0.0000 0 0 0.9426 0.0574 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.050 1 -3 4 643 196 447 182 0 8 0 6 0 0 447 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 23.500 0.14 8.83 -8.70 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0096 0.9904 0.0000 0 0 0.7418 0.2582 0.0000 0 0 0.9374 0.0626 0.0000
chr20 3785200 T TTCC 0.003046 0.050 1 3 4 450 83 367 38 1 6 0 38 0 0 365 0 2 0.4578 0.0000 0.0054 12.833 0.71 3.50 -2.79 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4621 0.5364 0.0016 1 1 0.4644 0.5341 0.0016 1 1 0.4673 0.5312 0.0016
chr20 4699448 CCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCT C 0.009335 0.050 1 -24 4 808 248 560 121 1 27 1 98 0 0 560 0 0 0.4879 0.0000 0.0000 8.148 0.68 6.46 -5.78 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7039 0.2955 0.0007 1 0 0.6988 0.3004 0.0007 1 0 0.6919 0.3073 0.0008
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.050 1 1 2 213 84 129 77 0 2 0 5 0 0 129 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 41.000 0.47 1.20 -0.73 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.1289 0.8711 0.0000 0 1 0.3802 0.6198 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.050 1 -6 2 669 171 498 163 0 5 0 3 0 0 498 0 0 0.9532 0.0000 0.0000 33.200 0.26 6.00 -5.74 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3559 0.6441 0.0000 0 0 0.9020 0.0980 0.0000 0 0 0.9524 0.0476 0.0000
chr20 32019232 A AGGCGGCGGC 0.000153 0.050 1 9 2 463 135 328 65 0 19 0 51 0 0 316 0 12 0.4815 0.0000 0.0366 6.105 0.34 8.08 -7.74 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4865 0.5134 0.0001 1 1 0.4885 0.5115 0.0001 1 1 0.4909 0.5091 0.0001
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.050 1 3 1 484 144 340 4 1 0 4 135 0 0 328 1 11 0.0278 0.0000 0.0353 143.000 0.25 3.56 -3.31 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9039 0.0961 2 2 0.0000 0.1731 0.8269 2 2 0.0000 0.0649 0.9351
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.050 1 -3 2 525 152 373 79 1 3 1 68 0 0 373 0 0 0.5197 0.0000 0.0000 49.333 0.25 3.28 -3.03 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3064 0.5372 0.1564 1 1 0.3031 0.5355 0.1614 1 1 0.2986 0.5332 0.1682
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.050 1 -3 2 1003 300 703 0 0 56 14 230 0 0 700 0 3 0.0000 0.0000 0.0043 4.357 3.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr20 47651119 GCAA G 0.005778 0.050 1 -3 1 508 217 291 104 0 3 4 106 0 0 291 0 0 0.4793 0.0000 0.0000 70.000 0.16 3.18 -3.02 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3773 0.6192 0.0035 1 1 0.3840 0.6125 0.0035 1 1 0.3926 0.6039 0.0035
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.050 1 3 1 376 86 290 37 0 2 1 46 0 0 286 0 4 0.4302 0.0000 0.0138 42.000 0.35 3.33 -2.97 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2001 0.5716 0.2284 1 1 0.2065 0.5699 0.2235 1 1 0.2152 0.5676 0.2172
chr20 58854444 G GGCAGCCCCT 0.000770 0.050 1 9 3 664 155 509 73 0 20 0 62 0 0 496 0 13 0.4710 0.0000 0.0255 6.750 0.59 8.50 -7.91 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4302 0.5694 0.0004 1 1 0.4345 0.5651 0.0004 1 1 0.4399 0.5597 0.0004
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.050 1 -6 2 186 41 145 0 0 5 1 35 0 0 139 0 6 0.0000 0.0000 0.0414 7.200 6.91 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.050 1 -1 1 278 128 150 4 0 2 0 122 0 0 150 0 0 0.0312 0.0000 0.0000 63.000 0.25 1.96 -1.71 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9261 0.0739 2 2 0.0000 0.2217 0.7783 2 2 0.0000 0.0867 0.9133
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.050 1 6 4 700 171 529 101 1 2 0 67 0 0 526 0 3 0.5906 0.0000 0.0057 84.500 0.17 5.85 -5.68 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6397 0.3320 0.0283 1 0 0.6278 0.3408 0.0314 1 0 0.6116 0.3526 0.0358
chr21 33070402 CTCCTCCACT C 0.002225 0.050 1 -9 2 476 153 323 68 5 3 0 77 0 0 323 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 49.667 0.57 7.84 -7.27 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4021 0.5965 0.0014 1 1 0.4074 0.5912 0.0014 1 1 0.4142 0.5845 0.0014
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.050 1 3 2 241 116 125 54 0 2 1 59 0 0 123 0 2 0.4655 0.0000 0.0160 57.000 0.24 2.88 -2.64 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1275 0.5047 0.3678 1 1 0.1305 0.5038 0.3657 1 1 0.1346 0.5027 0.3628
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.050 1 1 2 313 48 265 0 0 3 2 43 0 0 264 0 1 0.0000 0.0000 0.0038 15.000 1.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.050 1 2 2 1073 179 894 99 3 4 6 67 0 0 884 4 6 0.5531 0.0000 0.0112 86.000 1.69 3.55 -1.87 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3876 0.5133 0.0991 1 1 0.3804 0.5146 0.1049 1 1 0.3707 0.5163 0.1131
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.050 1 -2 2 1073 187 886 106 1 6 6 68 0 0 875 4 7 0.5668 0.0000 0.0124 44.750 1.64 3.54 -1.90 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4260 0.4926 0.0814 1 1 0.4174 0.4955 0.0870 1 1 0.4058 0.4992 0.0950
chr21 44579846 AGG A 0.004815 0.050 1 -2 2 700 238 462 162 0 3 2 71 0 0 458 1 3 0.6807 0.0000 0.0087 117.000 1.72 8.61 -6.88 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9814 0.0186 0.0000 1 0 0.9786 0.0214 0.0000 1 0 0.9743 0.0257 0.0000
chr21 44579850 A ACG 0.004831 0.050 1 2 1 700 235 465 161 1 3 0 70 0 0 460 0 5 0.6851 0.0000 0.0108 116.000 1.72 8.66 -6.94 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9819 0.0181 0.0000 1 0 0.9792 0.0208 0.0000 1 0 0.9750 0.0250 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.050 1 -15 2 541 125 416 62 0 20 0 43 0 0 413 0 3 0.4960 0.0000 0.0072 5.250 2.55 12.00 -9.45 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4219 0.4758 0.1023 1 1 0.4152 0.4778 0.1070 1 1 0.4061 0.4805 0.1134
chr21 45504028 TTTC T 0.000493 0.050 1 -3 1 181 55 126 25 0 1 0 29 0 0 124 0 2 0.4545 0.0000 0.0159 54.000 0.08 3.28 -3.20 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4095 0.5902 0.0004 1 1 0.4135 0.5862 0.0004 1 1 0.4187 0.5809 0.0004
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.050 1 -9 7 330 138 192 1 2 16 2 117 0 0 192 0 0 0.0072 0.0000 0.0000 7.500 1.00 8.54 -7.54 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0431 0.9569 2 2 0.0000 0.0080 0.9920 2 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.050 1 6 1 3377 1052 2325 661 1 27 1 362 0 0 2305 0 20 0.6283 0.0000 0.0086 37.963 0.36 6.02 -5.66 93 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 20366617 A ATG 0.000432 0.050 1 2 3 341 111 230 66 0 1 0 44 0 0 230 0 0 0.5946 0.0000 0.0000 110.000 0.00 2.05 -2.05 64 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7217 0.2783 0.0000 1 0 0.7152 0.2847 0.0000 1 0 0.7065 0.2934 0.0000
chr22 20566526 ACAG A 0.027879 0.050 1 -3 2 743 237 506 169 5 47 0 16 0 0 506 0 0 0.7131 0.0000 0.0000 4.043 0.23 3.00 -2.77 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0551 0.9449 0.0000 0 0 0.8551 0.1449 0.0000
chr22 23617579 G GCAT 0.002056 0.050 1 3 3 215 95 120 48 0 5 0 42 0 0 119 0 1 0.5053 0.0000 0.0083 18.000 0.08 3.86 -3.77 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5331 0.4662 0.0007 1 0 0.5328 0.4665 0.0007 1 0 0.5323 0.4670 0.0007
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.050 1 -3 3 193 91 102 85 0 4 0 2 0 0 102 0 0 0.9341 0.0000 0.0000 21.750 0.27 3.00 -2.73 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5068 0.4932 0.0000 0 0 0.8713 0.1287 0.0000 0 0 0.9203 0.0797 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.050 1 -21 3 723 123 600 0 0 37 0 86 0 0 577 1 22 0.0000 0.0000 0.0383 2.389 14.76 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0096 0.9904 2 2 0.0000 0.0103 0.9897
chr22 27798924 T TTGC 0.004414 0.050 1 3 1 1512 457 1055 189 13 64 5 186 0 0 1053 0 2 0.4136 0.0000 0.0019 6.109 0.84 3.21 -2.37 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4956 0.5035 0.0009 1 0 0.5002 0.4989 0.0009 1 0 0.5056 0.4935 0.0010
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.050 1 3 1 1506 452 1054 298 27 108 7 12 1 0 1053 0 0 0.6593 0.0009 0.0009 3.168 1.82 3.75 -1.93 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5004 0.4996 0.0000 0 0 0.9787 0.0213 0.0000
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.050 1 -3 1 757 221 536 212 0 4 0 5 0 0 536 0 0 0.9593 0.0000 0.0000 54.250 0.58 4.60 -4.02 144 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0805 0.9195 0.0000 0 0 0.9072 0.0928 0.0000 0 0 0.9738 0.0262 0.0000
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.050 1 -2 3 609 188 421 90 0 9 0 89 0 0 419 0 2 0.4787 0.0000 0.0048 19.889 0.57 2.11 -1.55 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2180 0.5551 0.2269 1 1 0.2204 0.5510 0.2286 1 1 0.2235 0.5458 0.2307
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.050 1 -21 6 563 122 441 109 2 5 0 6 0 0 441 0 0 0.8934 0.0000 0.0000 23.400 0.85 5.83 -4.98 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.1815 0.8185 0.0000 0 0 0.5485 0.4515 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.050 1 9 4 351 172 179 89 0 16 0 67 0 0 172 0 7 0.5174 0.0000 0.0391 9.750 0.33 7.85 -7.52 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5000 0.4412 0.0588 1 0 0.4953 0.4430 0.0616 1 0 0.4889 0.4455 0.0656
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.050 1 -3 3 207 96 111 41 0 3 0 52 0 0 110 0 1 0.4271 0.0000 0.0090 31.000 0.90 3.62 -2.71 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1759 0.5358 0.2884 1 1 0.1812 0.5349 0.2839 1 1 0.1884 0.5338 0.2779
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.050 1 3 3 352 133 219 0 0 4 0 129 0 0 213 1 5 0.0000 0.0000 0.0274 32.250 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0136 0.9864 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0160 0.9840
chr22 40861830 T TA 0.018262 0.050 1 1 2 594 126 468 114 0 2 0 10 0 0 468 0 0 0.9048 0.0000 0.0000 62.000 0.21 1.50 -1.29 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.5321 0.4679 0.0000 0 0 0.9528 0.0472 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.050 1 -6 1 631 115 516 12 0 6 0 97 0 0 506 0 10 0.1043 0.0000 0.0194 18.167 1.67 6.95 -5.28 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9919 0.0081
chr22 46363187 CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA C 0.006403 0.050 1 -27 3 229 89 140 4 0 23 0 62 0 0 132 0 8 0.0449 0.0000 0.0571 2.870 0.25 19.45 -19.20 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.9923 0.0077
chr22 46537150 GGGC G 0.001229 0.050 1 -3 1 261 82 179 33 3 13 0 33 0 0 178 0 1 0.4024 0.0000 0.0056 5.231 1.24 4.61 -3.36 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4961 0.5034 0.0005 1 1 0.4970 0.5025 0.0005 1 1 0.4981 0.5014 0.0005
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.050 1 -18 2 336 108 228 81 0 23 0 4 0 0 228 0 0 0.7500 0.0000 0.0000 3.696 0.27 13.50 -13.23 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0859 0.9141 0.0000 0 0 0.8105 0.1895 0.0000 0 0 0.9297 0.0703 0.0000
775 rows