File Info

Filename
HG02145_x_HG02148_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/84/1a6f924652a31a7a52ab94b9bfe5ed/HG02145_x_HG02148_FF_10.features.tsv
Size
166.9 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG02145_x_HG02148_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 410 173 237 153 1 10 0 9 0 0 237 0 0 0.8844 0.0000 0.0000 16.300 1.15 8.67 -7.52 89 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1311 0.8689 0.0000 0 0 0.8450 0.1550 0.0000
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 480 170 310 133 4 18 0 15 0 0 308 0 2 0.7824 0.0000 0.0065 8.444 0.18 2.87 -2.69 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0139 0.9861 0.0000
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 503 177 326 146 0 26 0 5 0 0 325 0 1 0.8249 0.0000 0.0031 5.808 0.49 7.60 -7.11 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 0 0.7122 0.2878 0.0000 0 0 0.9621 0.0379 0.0000
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 796 240 556 24 0 47 5 164 0 0 554 0 2 0.1000 0.0000 0.0036 4.106 0.29 3.18 -2.89 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 600 135 465 1 0 13 1 120 0 0 459 0 6 0.0074 0.0000 0.0129 9.385 0.00 3.23 -3.23 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0051 0.9949 2 2 0.0000 0.0040 0.9960
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 1084 189 895 78 1 11 0 99 0 0 891 0 4 0.4127 0.0000 0.0045 16.091 0.64 3.15 -2.51 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0057 0.3051 0.6892 1 2 0.0068 0.3101 0.6831 1 2 0.0085 0.3176 0.6739
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.100 1 3 2 295 109 186 55 0 4 0 50 0 0 184 0 2 0.5046 0.0000 0.0108 26.250 0.24 2.98 -2.74 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2462 0.6180 0.1358 1 1 0.2497 0.6094 0.1410 1 1 0.2539 0.5984 0.1477
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 440 165 275 160 1 2 0 2 0 0 275 0 0 0.9697 0.0000 0.0000 81.500 0.18 1.00 -0.82 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9780 0.0220 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 2056 422 1634 360 15 36 1 10 0 0 1634 0 0 0.8531 0.0000 0.0000 10.361 1.58 3.10 -1.52 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0377 0.9623 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr1 21474942 TGTCTCCCAG T 0.500000 0.100 1 -9 1 205 94 111 87 0 1 0 6 0 0 111 0 0 0.9255 0.0000 0.0000 93.000 0.47 10.17 -9.70 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1148 0.8852 0.0000 0 0 0.5916 0.4084 0.0000
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.100 1 -24 1 741 178 563 103 1 5 0 69 0 0 558 0 5 0.5787 0.0000 0.0089 34.600 1.14 18.17 -17.04 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8016 0.1963 0.0021 1 0 0.7934 0.2040 0.0026 1 0 0.7814 0.2151 0.0035
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 408 171 237 16 0 13 1 141 0 0 235 0 2 0.0936 0.0000 0.0084 12.154 0.25 3.06 -2.81 14 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9638 0.0362
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 376 85 291 47 0 3 0 35 0 0 291 0 0 0.5529 0.0000 0.0000 27.333 0.23 3.09 -2.85 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4993 0.4544 0.0463 1 0 0.4936 0.4563 0.0501 1 0 0.4855 0.4589 0.0557
chr1 44140851 GGGTCTGGTTACCAGTGGAGGTCGTCATCTGTCTCCCGTAGAA G 0.500000 0.100 1 -42 1 1499 529 970 477 10 23 0 19 4 1 959 0 6 0.9017 0.0041 0.0113 21.957 2.66 12.00 -9.34 193 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1145 0.8855 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 678 163 515 0 0 25 3 135 0 1 511 1 2 0.0000 0.0000 0.0078 5.480 5.62 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 239 90 149 43 0 4 0 43 0 0 149 0 0 0.4778 0.0000 0.0000 21.500 0.47 2.88 -2.42 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1981 0.6039 0.1980 1 1 0.2019 0.5962 0.2019 1 1 0.2067 0.5865 0.2067
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 479 143 336 64 2 13 1 63 1 0 334 0 1 0.4476 0.0030 0.0060 10.000 0.17 3.03 -2.86 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2090 0.6517 0.1393 1 1 0.2142 0.6408 0.1450 1 1 0.2206 0.6270 0.1524
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 4 849 173 676 157 1 8 0 7 0 0 676 0 0 0.9075 0.0000 0.0000 20.500 0.68 3.43 -2.75 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.6065 0.3935 0.0000 0 0 0.9596 0.0404 0.0000
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 313 119 194 9 1 4 5 100 0 0 194 0 0 0.0756 0.0000 0.0000 27.500 0.78 5.66 -4.88 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9903 0.0097 2 1 0.0000 0.7171 0.2829
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 163 77 86 0 0 1 0 76 0 0 84 0 2 0.0000 0.0000 0.0233 76.000 3.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0184 0.9816 2 2 0.0000 0.0199 0.9801 2 2 0.0000 0.0222 0.9778
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 332 162 170 71 1 26 0 64 0 0 165 0 5 0.4383 0.0000 0.0294 5.192 1.24 10.05 -8.81 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2176 0.6574 0.1250 1 1 0.2230 0.6462 0.1308 1 1 0.2296 0.6319 0.1385
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 514 146 368 5 0 10 1 130 0 0 364 0 4 0.0342 0.0000 0.0109 15.111 0.00 5.68 -5.68 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9861 0.0139 2 2 0.0000 0.2018 0.7982 2 2 0.0000 0.0356 0.9644
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.100 1 -6 1 514 150 364 4 0 19 1 126 0 0 364 0 0 0.0267 0.0000 0.0000 6.842 0.50 5.82 -5.32 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9170 0.0830 2 2 0.0000 0.1109 0.8891 2 2 0.0000 0.0268 0.9732
chr1 92074651 C CCAT 0.500000 0.100 1 3 1 687 115 572 51 4 13 2 45 0 0 569 0 3 0.4435 0.0000 0.0052 7.846 1.10 3.33 -2.24 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2948 0.5971 0.1081 1 1 0.2969 0.5898 0.1132 1 1 0.2992 0.5807 0.1201
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 210 78 132 46 0 3 0 29 0 0 129 0 3 0.5897 0.0000 0.0227 25.000 0.33 3.00 -2.67 10 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5573 0.4079 0.0347 1 0 0.5495 0.4123 0.0381 1 0 0.5387 0.4183 0.0430
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 484 123 361 98 1 7 1 16 0 0 359 1 1 0.7967 0.0000 0.0055 16.429 0.64 3.00 -2.36 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 767 225 542 204 1 11 0 9 0 0 542 0 0 0.9067 0.0000 0.0000 19.455 0.22 3.44 -3.22 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6658 0.3342 0.0000 0 0 0.9850 0.0150 0.0000
chr1 144429757 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 99 37 62 20 0 0 0 17 0 0 62 0 0 0.5405 0.0000 0.0000 37.000 0.25 1.12 -0.87 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3000 0.5344 0.1655 1 1 0.2992 0.5318 0.1689 1 1 0.2980 0.5285 0.1734
chr1 146994348 ATGGAAG A 0.500000 0.100 1 -6 1 153 56 97 31 0 1 0 24 0 0 94 0 3 0.5536 0.0000 0.0309 55.000 0.16 6.29 -6.13 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3086 0.5518 0.1396 1 1 0.3083 0.5478 0.1439 1 1 0.3076 0.5429 0.1495
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.100 1 18 1 1750 514 1236 277 16 178 4 39 17 5 1195 6 13 0.5389 0.0138 0.0332 1.897 2.44 5.38 -2.95 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1404 313 1091 241 0 52 0 20 3 0 1086 0 2 0.7700 0.0027 0.0046 5.019 0.25 3.20 -2.95 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0929 0.9071 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 299 105 194 38 2 15 9 41 0 0 194 0 0 0.3619 0.0000 0.0000 5.333 0.26 1.63 -1.37 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0713 0.5204 0.4083 1 1 0.0758 0.5183 0.4059 1 1 0.0821 0.5157 0.4022
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 269 80 189 0 0 9 0 71 0 0 164 0 25 0.0000 0.0000 0.1323 7.889 10.28 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0094 0.9906
chr1 152709213 G GGGCTGCTGTAGCTCTGGC 0.500000 0.100 1 18 5 268 103 165 2 0 5 2 94 0 0 165 0 0 0.0194 0.0000 0.0000 19.400 0.00 7.84 -7.84 2 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3905 0.6095 2 2 0.0000 0.0657 0.9343 2 2 0.0000 0.0335 0.9665
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 864 268 596 130 2 29 0 107 1 1 590 0 4 0.4851 0.0017 0.0101 9.192 1.41 6.12 -4.71 86 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5991 0.3951 0.0059 1 0 0.5988 0.3942 0.0070 1 0 0.5969 0.3943 0.0089
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1365 307 1058 0 0 58 5 244 0 2 998 5 53 0.0000 0.0000 0.0567 4.333 10.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 153934829 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 632 258 374 232 10 5 2 9 0 0 374 0 0 0.8992 0.0000 0.0000 251.000 0.26 4.00 -3.74 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7845 0.2155 0.0000 0 0 0.9942 0.0058 0.0000
chr1 153934830 T TGC 0.500000 0.100 1 2 1 632 259 373 242 1 5 1 10 0 0 373 0 0 0.9344 0.0000 0.0000 50.800 0.36 4.00 -3.64 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7036 0.2964 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 230 99 131 14 1 2 1 81 0 0 131 0 0 0.1414 0.0000 0.0000 48.000 1.71 2.05 -0.34 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9947 0.0053
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 414 101 313 0 0 0 1 100 0 0 310 0 3 0.0000 0.0000 0.0096 101.000 3.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr1 156913391 GTTCCAGGCCCGCTCT G 0.500000 0.100 1 -15 2 682 150 532 90 0 2 1 57 0 0 527 0 5 0.6000 0.0000 0.0094 74.000 0.38 15.11 -14.73 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7791 0.2176 0.0034 1 0 0.7701 0.2257 0.0041 1 0 0.7573 0.2373 0.0053
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 837 188 649 93 0 6 1 88 0 0 647 0 2 0.4947 0.0000 0.0031 30.333 0.16 1.53 -1.37 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1750 0.7074 0.1177 1 1 0.1823 0.6933 0.1244 1 1 0.1914 0.6752 0.1334
chr1 182952865 T TCCGCCG 0.500000 0.100 1 6 2 594 183 411 85 0 32 0 66 0 0 406 0 5 0.4645 0.0000 0.0122 4.719 0.14 5.55 -5.40 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4666 0.5040 0.0295 1 1 0.4661 0.5012 0.0327 1 1 0.4644 0.4981 0.0376
chr1 183533735 T TACA 0.500000 0.100 1 3 2 226 78 148 43 1 2 0 32 0 0 148 0 0 0.5513 0.0000 0.0000 38.000 0.81 3.09 -2.28 9 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5059 0.4472 0.0469 1 0 0.4996 0.4496 0.0508 1 0 0.4908 0.4529 0.0563
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 635 165 470 97 0 6 4 58 0 0 469 1 0 0.5879 0.0000 0.0021 39.750 0.59 4.64 -4.05 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8602 0.1387 0.0012 1 0 0.8515 0.1470 0.0015 1 0 0.8389 0.1590 0.0021
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 628 164 464 99 1 0 5 59 0 0 462 0 2 0.6037 0.0000 0.0043 162.000 0.57 4.58 -4.01 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8760 0.1232 0.0009 1 0 0.8677 0.1312 0.0011 1 0 0.8555 0.1429 0.0016
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 99 52 47 48 0 1 0 3 0 0 47 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 51.000 0.19 2.00 -1.81 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0146 0.9854 0.0000 0 1 0.3112 0.6888 0.0000 0 0 0.5998 0.4002 0.0000
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 475 191 284 150 0 30 0 11 1 0 281 0 2 0.7853 0.0035 0.0106 5.367 0.21 11.18 -10.97 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.2657 0.7343 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 695 355 340 285 4 45 0 21 0 0 338 0 2 0.8028 0.0000 0.0059 6.889 0.42 10.10 -9.67 145 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3292 0.6708 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 752 166 586 90 0 9 1 66 0 0 584 0 2 0.5422 0.0000 0.0034 17.444 0.32 9.36 -9.04 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6412 0.3488 0.0100 1 0 0.6353 0.3531 0.0116 1 0 0.6265 0.3594 0.0141
chr1 228409077 A AC 0.500000 0.100 1 1 2 719 190 529 99 0 11 3 77 0 0 529 0 0 0.5211 0.0000 0.0000 16.273 0.30 1.23 -0.93 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5832 0.4046 0.0123 1 0 0.5800 0.4059 0.0142 1 0 0.5746 0.4083 0.0171
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 280 119 161 64 0 2 0 53 0 0 160 0 1 0.5378 0.0000 0.0062 58.500 0.16 1.02 -0.86 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4062 0.5378 0.0560 1 1 0.4056 0.5341 0.0604 1 1 0.4040 0.5295 0.0665
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 663 188 475 15 1 17 2 153 0 0 469 2 4 0.0798 0.0000 0.0126 10.059 0.87 3.54 -2.67 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9155 0.0845
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 568 139 429 64 0 4 0 71 0 0 429 0 0 0.4604 0.0000 0.0000 33.750 1.09 1.11 -0.02 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0783 0.6079 0.3138 1 1 0.0835 0.5997 0.3168 1 1 0.0905 0.5894 0.3201
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 772 204 568 109 0 3 0 92 0 0 564 0 4 0.5343 0.0000 0.0070 67.000 0.33 3.01 -2.68 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3872 0.5834 0.0294 1 1 0.3919 0.5752 0.0329 1 1 0.3968 0.5652 0.0380
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 471 123 348 113 1 3 0 6 0 0 348 0 0 0.9187 0.0000 0.0000 39.667 1.71 1.67 0.04 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.3346 0.6654 0.0000 0 0 0.8428 0.1572 0.0000
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 771 169 602 96 3 2 0 68 0 0 602 0 0 0.5680 0.0000 0.0000 83.500 0.88 1.99 -1.11 68 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8243 0.1739 0.0018 1 0 0.8156 0.1821 0.0022 1 0 0.8031 0.1939 0.0030
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1184 297 887 157 0 2 0 138 0 0 887 0 0 0.5286 0.0000 0.0000 147.500 0.28 1.33 -1.05 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4318 0.5582 0.0100 1 1 0.4400 0.5482 0.0118 1 1 0.4490 0.5365 0.0146
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 486 115 371 68 0 4 0 43 1 0 370 0 0 0.5913 0.0027 0.0027 27.750 2.06 5.19 -3.13 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7880 0.2074 0.0046 1 0 0.7776 0.2169 0.0055 1 0 0.7627 0.2303 0.0070
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 604 49 555 0 0 0 2 47 0 0 550 0 5 0.0000 0.0000 0.0090 49.000 4.66 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0600 0.9400 2 2 0.0000 0.0632 0.9368 2 2 0.0000 0.0679 0.9321
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 793 331 462 109 0 18 0 204 0 0 457 0 5 0.3293 0.0000 0.0108 17.389 1.17 6.69 -5.53 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0005 0.9995 1 2 0.0000 0.0006 0.9994 1 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr1 248650008 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 635 182 453 129 0 3 0 50 0 0 453 0 0 0.7088 0.0000 0.0000 59.667 0.28 6.78 -6.50 75 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9981 0.0019 0.0000 1 0 0.9976 0.0024 0.0000 1 0 0.9967 0.0033 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 266 126 140 57 0 5 0 64 0 0 137 0 3 0.4524 0.0000 0.0214 24.200 0.26 2.94 -2.67 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0681 0.5782 0.3537 1 1 0.0735 0.5732 0.3534 1 1 0.0810 0.5669 0.3521
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 473 133 340 1 0 17 1 114 0 0 316 1 23 0.0075 0.0000 0.0706 6.765 0.00 10.11 -10.11 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 473 133 340 6 5 70 4 48 0 0 316 1 23 0.0451 0.0000 0.0706 0.826 6.50 12.08 -5.58 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9952 0.0048 2 1 0.0000 0.9270 0.0730
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 222 46 176 2 0 5 0 39 0 0 175 0 1 0.0435 0.0000 0.0057 8.200 0.00 3.44 -3.44 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9173 0.0827 2 1 0.0000 0.5329 0.4671 2 2 0.0000 0.3413 0.6587
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 346 124 222 12 0 14 0 98 0 0 220 0 2 0.0968 0.0000 0.0090 7.857 0.25 2.89 -2.64 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9453 0.0547
chr2 39178722 T TA 0.500000 0.100 1 1 4 416 148 268 81 0 1 0 66 0 0 268 0 0 0.5473 0.0000 0.0000 147.000 0.20 1.09 -0.89 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5048 0.4694 0.0258 1 0 0.5025 0.4687 0.0288 1 0 0.4985 0.4682 0.0333
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 519 161 358 59 0 92 0 10 0 0 358 0 0 0.3665 0.0000 0.0000 0.750 0.27 0.60 -0.33 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.0278 0.9722 0.0000
chr2 61186454 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 496 107 389 67 0 1 0 39 0 0 388 0 1 0.6262 0.0000 0.0026 106.000 0.12 3.10 -2.98 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8082 0.1880 0.0038 1 0 0.7976 0.1978 0.0046 1 0 0.7825 0.2115 0.0060
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 479 203 276 94 1 11 2 95 0 0 276 0 0 0.4631 0.0000 0.0000 17.364 1.12 3.28 -2.17 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1179 0.7160 0.1661 1 1 0.1248 0.7015 0.1736 1 1 0.1340 0.6828 0.1832
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 641 187 454 52 6 47 60 22 0 0 449 5 0 0.2781 0.0000 0.0110 2.915 0.10 3.36 -3.27 26 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0019 0.1622 0.8358 1 2 0.0024 0.1711 0.8265 1 2 0.0033 0.1837 0.8130
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 642 186 456 55 1 64 1 65 0 0 451 0 5 0.2957 0.0000 0.0110 1.891 0.20 6.05 -5.85 29 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0306 0.4632 0.5062 1 2 0.0339 0.4634 0.5027 1 2 0.0387 0.4641 0.4973
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 1053 221 832 98 1 54 1 67 0 0 785 0 47 0.4434 0.0000 0.0565 3.132 0.40 12.58 -12.18 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0193 0.5305 0.4503 1 1 0.0219 0.5246 0.4535 1 1 0.0259 0.5177 0.4563
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 460 174 286 23 0 12 3 136 0 0 285 0 1 0.1322 0.0000 0.0035 13.500 0.78 3.73 -2.95 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 482 133 349 0 0 23 3 107 0 0 344 1 4 0.0000 0.0000 0.0143 4.783 3.23 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 871 253 618 105 1 24 0 123 0 0 618 0 0 0.4150 0.0000 0.0000 9.500 0.57 7.82 -7.25 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0154 0.5191 0.4655 1 1 0.0177 0.5133 0.4691 1 1 0.0212 0.5066 0.4722
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.100 1 3 4 593 177 416 86 0 2 1 88 0 0 413 0 3 0.4859 0.0000 0.0072 87.500 0.38 3.24 -2.85 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0774 0.6697 0.2530 1 1 0.0830 0.6576 0.2594 1 1 0.0908 0.6422 0.2670
chr2 110995965 GGTTCTTCAGCGGGGTTTGGTGGCCAGAATTTATTATAAGGTAAAGATACACTGT G 0.500000 0.100 1 -54 3 217 108 109 85 0 4 0 19 0 0 106 0 3 0.7870 0.0000 0.0275 26.000 0.16 17.26 -17.10 17 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5099 0.4901 0.0000 0 1 0.0108 0.9892 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 148 65 83 32 0 1 0 32 0 0 82 0 1 0.4923 0.0000 0.0120 64.000 0.12 3.06 -2.94 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1902 0.5778 0.2319 1 1 0.1937 0.5720 0.2343 1 1 0.1981 0.5647 0.2372
chr2 112542424 TTCCGGCGTGTACCGAGAGACTGGCG T 0.500000 0.100 1 -25 1 511 177 334 150 0 19 0 8 0 0 334 0 0 0.8475 0.0000 0.0000 8.316 0.66 22.38 -21.71 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2639 0.7361 0.0000 0 0 0.8951 0.1049 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 614 128 486 0 0 0 0 128 0 0 476 0 10 0.0000 0.0000 0.0206 128.000 5.80 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr2 127858100 T TCGCCGCGCCG 0.500000 0.100 1 10 1 226 107 119 51 0 14 0 42 0 0 116 0 3 0.4766 0.0000 0.0252 6.643 0.49 8.98 -8.49 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3256 0.5753 0.0991 1 1 0.3264 0.5695 0.1040 1 1 0.3270 0.5623 0.1107
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 366 141 225 18 0 18 0 105 0 1 221 0 3 0.1277 0.0000 0.0178 6.833 0.17 5.97 -5.80 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 225 63 162 27 12 10 4 10 0 0 162 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 5.556 1.33 1.30 0.03 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7916 0.2006 0.0078 1 0 0.7695 0.2215 0.0091 1 0 0.6575 0.3327 0.0098
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 2 514 154 360 60 0 17 0 77 0 0 360 0 0 0.3896 0.0000 0.0000 8.059 0.57 3.19 -2.63 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0195 0.4125 0.5680 1 2 0.0221 0.4148 0.5631 1 2 0.0258 0.4184 0.5558
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 276 129 147 119 0 2 0 8 0 0 145 0 2 0.9225 0.0000 0.0136 63.500 0.18 3.00 -2.82 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0090 0.9910 0.0000 0 1 0.3444 0.6556 0.0000
chr2 178654033 G GT 0.500000 0.100 1 1 2 1431 164 1267 83 1 12 0 68 3 0 1262 0 2 0.5061 0.0024 0.0039 12.583 1.02 1.54 -0.52 37 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5400 0.4407 0.0194 1 0 0.5371 0.4410 0.0219 1 0 0.5322 0.4421 0.0257
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 768 167 601 153 1 8 0 5 0 0 601 0 0 0.9162 0.0000 0.0000 19.875 0.39 3.80 -3.41 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0369 0.9631 0.0000 0 0 0.9144 0.0856 0.0000 0 0 0.9861 0.0139 0.0000
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 327 137 190 5 0 19 55 58 0 0 190 0 0 0.0365 0.0000 0.0000 4.400 0.60 3.33 -2.73 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.5577 0.4423 2 2 0.0000 0.1495 0.8505
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 327 137 190 63 2 63 2 7 0 0 190 0 0 0.4599 0.0000 0.0000 1.200 2.87 5.57 -2.70 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.1128 0.8872 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 328 137 191 9 6 12 44 66 0 0 191 0 0 0.0657 0.0000 0.0000 6.833 0.00 2.95 -2.95 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9528 0.0472
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 252 71 181 48 9 5 0 9 0 0 181 0 0 0.6761 0.0000 0.0000 11.400 0.12 2.11 -1.99 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.0464 0.9536 0.0000
chr2 199961847 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 196 76 120 73 0 0 0 3 0 1 119 0 0 0.9605 0.0000 0.0083 76.000 0.07 1.00 -0.93 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0548 0.9452 0.0000 0 0 0.6247 0.3753 0.0000 0 0 0.8412 0.1588 0.0000
chr2 202635418 A AGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 1 499 117 382 46 1 28 0 42 0 0 381 0 1 0.3932 0.0000 0.0026 3.179 1.09 4.93 -3.84 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2796 0.5911 0.1293 1 1 0.2815 0.5843 0.1342 1 1 0.2836 0.5758 0.1406
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 273 74 199 0 0 1 0 73 0 0 194 1 4 0.0000 0.0000 0.0251 73.000 3.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0184 0.9816 2 2 0.0000 0.0199 0.9801 2 2 0.0000 0.0222 0.9778
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 600 157 443 1 0 22 2 132 0 1 436 0 6 0.0064 0.0000 0.0158 6.136 3.00 7.55 -4.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0198 0.9802 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr2 217848163 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 1 952 224 728 103 2 41 1 77 0 0 717 0 11 0.4598 0.0000 0.0151 4.463 1.37 6.60 -5.23 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4695 0.5098 0.0207 1 1 0.4710 0.5056 0.0234 1 1 0.4717 0.5008 0.0275
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 683 211 472 124 3 7 3 74 0 0 439 0 33 0.5877 0.0000 0.0699 28.571 0.19 15.42 -15.23 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4621 0.5232 0.0147 1 1 0.4662 0.5169 0.0169 1 1 0.4700 0.5097 0.0203
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 344 157 187 74 0 3 5 75 0 0 187 0 0 0.4713 0.0000 0.0000 49.667 1.84 4.12 -2.28 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0967 0.6540 0.2493 1 1 0.1024 0.6429 0.2547 1 1 0.1101 0.6288 0.2610
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 1507 334 1173 175 0 3 0 156 0 1 1170 0 2 0.5240 0.0000 0.0026 110.333 0.70 1.22 -0.52 153 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3615 0.6282 0.0103 1 1 0.3735 0.6142 0.0122 1 1 0.3877 0.5971 0.0152
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 455 121 334 13 0 26 5 77 0 0 334 0 0 0.1074 0.0000 0.0000 3.615 0.54 3.30 -2.76 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9874 0.0126
chr2 241096043 CTCG C 0.500000 0.100 1 -3 2 666 153 513 92 0 8 0 53 0 0 511 0 2 0.6013 0.0000 0.0039 18.125 0.29 3.15 -2.86 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9044 0.0950 0.0006 1 0 0.8965 0.1028 0.0008 1 0 0.8848 0.1141 0.0011
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 534 137 397 0 0 3 0 134 0 0 394 0 3 0.0000 0.0000 0.0076 44.667 3.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr3 12901258 TGGC T 0.002987 0.100 1 -3 1 498 147 351 98 0 3 0 46 0 0 351 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 48.000 0.49 4.50 -4.01 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9884 0.0116 0.0000 1 0 0.9866 0.0134 0.0000 1 0 0.9838 0.0162 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 472 132 340 56 1 3 7 65 0 1 339 0 0 0.4242 0.0000 0.0029 43.000 0.52 4.54 -4.02 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0330 0.4776 0.4894 1 2 0.0364 0.4769 0.4866 1 2 0.0414 0.4765 0.4821
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 797 308 489 135 12 31 0 130 0 0 454 0 35 0.4383 0.0000 0.0716 8.935 0.41 11.63 -11.22 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0112 0.6054 0.3834 1 1 0.0132 0.5930 0.3938 1 1 0.0163 0.5779 0.4058
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 754 238 516 165 12 44 0 17 0 0 516 0 0 0.6933 0.0000 0.0000 4.409 0.28 3.88 -3.60 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0934 0.9066 0.0000
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 754 238 516 177 0 54 1 6 0 0 516 0 0 0.7437 0.0000 0.0000 3.389 0.49 6.00 -5.51 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 0 0.8940 0.1060 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 504 135 369 0 0 9 0 126 0 0 367 1 1 0.0000 0.0000 0.0054 14.000 2.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 367 144 223 0 0 4 0 140 0 0 222 0 1 0.0000 0.0000 0.0045 35.000 4.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 639 186 453 1 0 12 17 156 0 0 450 0 3 0.0054 0.0000 0.0066 14.500 0.00 3.24 -3.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 379 97 282 0 0 16 48 33 0 0 280 2 0 0.0000 0.0000 0.0071 5.062 3.82 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0143 0.9857 2 2 0.0000 0.0156 0.9844 2 2 0.0000 0.0175 0.9825
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 379 101 278 3 1 45 2 50 0 0 276 0 2 0.0297 0.0000 0.0072 1.273 1.33 5.98 -4.65 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9914 0.0086 2 1 0.0000 0.7714 0.2286 2 2 0.0000 0.4780 0.5220
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.100 1 6 1 569 158 411 60 0 38 0 60 0 0 400 1 10 0.3797 0.0000 0.0268 3.158 0.13 5.07 -4.93 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0473 0.5346 0.4181 1 1 0.0514 0.5308 0.4178 1 1 0.0573 0.5262 0.4165
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 207 105 102 46 0 9 0 50 0 0 101 0 1 0.4381 0.0000 0.0098 10.667 0.83 7.74 -6.91 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1114 0.5885 0.3002 1 1 0.1164 0.5818 0.3018 1 1 0.1231 0.5734 0.3035
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 255 88 167 41 0 2 0 45 0 0 164 1 2 0.4659 0.0000 0.0180 43.000 0.22 3.24 -3.02 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0893 0.5531 0.3576 1 1 0.0941 0.5488 0.3571 1 1 0.1006 0.5435 0.3558
chr3 62372545 G GCCGCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 514 117 397 58 0 14 1 44 0 0 397 0 0 0.4957 0.0000 0.0000 7.286 0.95 6.52 -5.57 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5084 0.4545 0.0371 1 0 0.5035 0.4558 0.0407 1 0 0.4964 0.4578 0.0458
chr3 63912684 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 3 311 90 221 44 1 13 0 32 0 0 219 1 1 0.4889 0.0000 0.0090 5.923 0.70 3.16 -2.45 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4785 0.4684 0.0531 1 0 0.4733 0.4695 0.0572 1 1 0.4659 0.4712 0.0630
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 371 159 212 72 6 23 1 57 0 0 212 0 0 0.4528 0.0000 0.0000 5.870 0.25 2.93 -2.68 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6488 0.3395 0.0117 1 0 0.6415 0.3449 0.0136 1 0 0.6309 0.3527 0.0164
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 852 231 621 203 0 24 0 4 0 0 620 0 1 0.8788 0.0000 0.0016 8.625 0.80 10.00 -9.20 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3173 0.6827 0.0000 0 0 0.9920 0.0080 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 575 157 418 134 1 8 0 14 0 0 418 0 0 0.8535 0.0000 0.0000 18.625 0.47 1.00 -0.53 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0824 0.9176 0.0000
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 377 112 265 100 0 8 0 4 0 0 265 0 0 0.8929 0.0000 0.0000 13.000 0.24 1.25 -1.01 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0250 0.9750 0.0000 0 0 0.6809 0.3191 0.0000 0 0 0.9083 0.0917 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 113 43 70 23 0 0 2 18 0 0 70 0 0 0.5349 0.0000 0.0000 43.000 0.13 1.83 -1.70 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3001 0.5400 0.1599 1 1 0.2995 0.5370 0.1635 1 1 0.2985 0.5332 0.1683
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 447 123 324 61 1 1 0 60 0 0 324 0 0 0.4959 0.0000 0.0000 122.000 0.84 1.23 -0.40 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2147 0.6408 0.1445 1 1 0.2194 0.6306 0.1500 1 1 0.2252 0.6177 0.1571
chr3 113657263 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 1159 288 871 4 178 94 0 12 0 0 870 0 1 0.0139 0.0000 0.0011 2.256 1.25 3.00 -1.75 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 1 0.4350 0.5650 0.0000
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1162 291 871 14 1 85 91 100 0 0 870 0 1 0.0481 0.0000 0.0011 2.470 2.43 3.04 -0.61 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.5249 0.4751
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1170 310 860 124 6 71 3 106 0 0 860 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 3.338 2.54 7.46 -4.92 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5507 0.4407 0.0086 1 0 0.5518 0.4381 0.0101 1 0 0.5517 0.4359 0.0125
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 828 166 662 63 0 37 1 65 0 0 661 0 1 0.3795 0.0000 0.0015 3.459 0.48 10.35 -9.88 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1159 0.6380 0.2461 1 1 0.1215 0.6280 0.2505 1 1 0.1289 0.6153 0.2558
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.100 1 -4 1 397 161 236 85 0 6 0 70 0 0 234 0 2 0.5280 0.0000 0.0085 25.833 0.75 4.16 -3.40 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4410 0.5255 0.0336 1 1 0.4414 0.5215 0.0371 1 1 0.4408 0.5169 0.0423
chr3 126572375 CCT C 0.500000 0.100 1 -2 4 563 159 404 77 2 2 0 78 0 0 404 0 0 0.4843 0.0000 0.0000 78.500 0.18 2.22 -2.04 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1743 0.6825 0.1432 1 1 0.1807 0.6698 0.1495 1 1 0.1887 0.6535 0.1578
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 211 107 104 0 0 0 0 107 0 0 104 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 107.000 2.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 395 144 251 0 0 5 0 139 0 0 250 0 1 0.0000 0.0000 0.0040 27.800 2.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr3 150703735 A ACCTCCTCCT 0.500000 0.100 1 9 2 567 109 458 41 2 24 2 40 0 0 455 0 3 0.3761 0.0000 0.0066 3.500 0.88 7.67 -6.80 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1578 0.6001 0.2422 1 1 0.1623 0.5926 0.2450 1 1 0.1682 0.5833 0.2485
chr3 154217949 TA T 0.500000 0.100 1 -1 3 214 71 143 61 1 5 0 4 0 0 143 0 0 0.8592 0.0000 0.0000 13.000 0.18 1.00 -0.82 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0034 0.9966 0.0000 0 1 0.2393 0.7607 0.0000 0 0 0.6081 0.3919 0.0000
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 449 175 274 18 0 26 7 124 0 0 270 1 3 0.1029 0.0000 0.0146 5.731 0.17 3.32 -3.16 12 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9933 0.0067
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 630 149 481 11 0 21 2 115 0 0 477 0 4 0.0738 0.0000 0.0083 6.095 0.45 3.13 -2.68 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 1 0.0000 0.7669 0.2331
chr3 195726146 GC G 0.500000 0.100 1 -1 4 1588 420 1168 376 5 9 0 30 1 0 1167 0 0 0.8952 0.0009 0.0009 45.667 2.69 2.13 0.56 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3304 0.6696 0.0000
chr3 195751094 GGCCGGTGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 318 92 226 57 1 2 0 32 1 0 223 0 2 0.6196 0.0044 0.0133 45.000 0.98 9.34 -8.36 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7862 0.2082 0.0055 1 0 0.7751 0.2183 0.0066 1 0 0.7594 0.2323 0.0083
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 786 160 626 0 0 13 0 147 0 0 597 0 29 0.0000 0.0000 0.0463 11.308 12.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr3 198153257 CTGGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -9 2 340 152 188 32 3 8 92 17 0 0 187 1 0 0.2105 0.0000 0.0053 28.800 0.47 10.24 -9.77 22 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0033 0.9967 1 2 0.0000 0.0049 0.9951 1 2 0.0000 0.4817 0.5183
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 339 151 188 6 0 31 1 113 0 0 185 0 3 0.0397 0.0000 0.0160 3.871 0.33 7.64 -7.30 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.6344 0.3656 2 2 0.0000 0.1394 0.8606
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 339 152 187 12 3 24 54 59 0 0 185 0 2 0.0789 0.0000 0.0107 5.333 0.83 9.25 -8.42 12 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9621 0.0379
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 538 109 429 0 0 1 0 108 0 0 369 0 60 0.0000 0.0000 0.1399 108.000 16.71 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 3074966 G GCCGCCGCCT 0.001791 0.100 1 9 2 533 221 312 100 4 2 1 114 2 1 309 0 0 0.4525 0.0064 0.0096 109.000 7.21 6.64 0.57 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1284 0.8704 0.0012 1 1 0.1417 0.8570 0.0012 1 1 0.1604 0.8384 0.0013
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.100 1 -6 2 527 165 362 157 1 1 0 6 0 0 362 0 0 0.9515 0.0000 0.0000 164.000 0.19 6.00 -5.81 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0720 0.9280 0.0000 0 0 0.9856 0.0144 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr4 7192754 C CCTG 0.001642 0.100 1 3 1 547 118 429 51 2 23 0 42 1 0 426 0 2 0.4322 0.0023 0.0070 4.130 0.75 3.50 -2.75 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6244 0.3755 0.0001 1 0 0.6239 0.3759 0.0002 1 0 0.6228 0.3770 0.0002
chr4 8236322 GGAGCTGCGGCTGTGCAA G 0.500000 0.100 1 -17 1 330 135 195 127 0 2 0 6 0 0 195 0 0 0.9407 0.0000 0.0000 66.500 0.30 13.17 -12.87 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.4887 0.5113 0.0000 0 0 0.9099 0.0901 0.0000
chr4 8236343 G GGC 0.500000 0.100 1 2 2 327 125 202 116 0 5 0 4 0 0 202 0 0 0.9280 0.0000 0.0000 30.000 0.34 19.75 -19.41 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0464 0.9536 0.0000 0 0 0.8160 0.1840 0.0000 0 0 0.9535 0.0465 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 828 233 595 131 0 27 3 72 1 1 580 0 13 0.5622 0.0017 0.0252 7.630 0.93 8.19 -7.26 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9355 0.0644 0.0001 1 0 0.9298 0.0700 0.0002 1 0 0.9212 0.0785 0.0003
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 832 274 558 144 3 39 5 83 0 0 552 0 6 0.5255 0.0000 0.0108 6.000 0.89 6.31 -5.42 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9682 0.0317 0.0000 1 0 0.9645 0.0355 0.0000 1 0 0.9587 0.0413 0.0001
chr4 15003704 GCCCGGACCTTCCACA G 0.500000 0.100 1 -15 1 765 145 620 131 1 7 0 6 17 5 594 2 2 0.9034 0.0274 0.0419 19.714 1.81 12.50 -10.69 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1028 0.8972 0.0000 0 0 0.8044 0.1956 0.0000
chr4 15511381 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 4 272 129 143 113 2 9 0 5 0 0 143 0 0 0.8760 0.0000 0.0000 13.222 0.14 2.60 -2.46 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 0 0.6026 0.3974 0.0000 0 0 0.9142 0.0858 0.0000
chr4 48341960 AGTCGGGCGGCGGGCCCGG A 0.500000 0.100 1 -18 2 456 145 311 129 0 10 0 6 0 0 311 0 0 0.8897 0.0000 0.0000 13.500 0.52 15.67 -15.15 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.5136 0.4864 0.0000 0 0 0.9175 0.0825 0.0000
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 750 158 592 81 0 18 0 59 0 0 566 0 26 0.5127 0.0000 0.0439 7.778 0.27 14.92 -14.64 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1008 0.6765 0.2228 1 1 0.1069 0.6641 0.2291 1 1 0.1150 0.6482 0.2368
chr4 56378269 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 300 101 199 50 0 5 0 46 0 0 198 0 1 0.4950 0.0000 0.0050 19.200 0.20 3.17 -2.97 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2537 0.6064 0.1400 1 1 0.2566 0.5985 0.1449 1 1 0.2601 0.5886 0.1513
chr4 75873297 A AC 0.500000 0.100 1 1 2 246 74 172 38 0 8 0 28 0 0 172 0 0 0.5135 0.0000 0.0000 8.250 0.53 1.50 -0.97 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4622 0.4742 0.0637 1 1 0.4568 0.4752 0.0679 1 1 0.4494 0.4767 0.0739
chr4 76896936 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 774 161 613 80 4 12 1 64 0 0 607 0 6 0.4969 0.0000 0.0098 12.417 1.25 3.20 -1.95 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4447 0.5218 0.0335 1 1 0.4449 0.5181 0.0370 1 1 0.4440 0.5138 0.0422
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 1 507 216 291 104 3 47 3 59 0 1 289 0 1 0.4815 0.0000 0.0069 3.574 1.06 2.97 -1.91 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9519 0.0480 0.0001 1 0 0.9465 0.0534 0.0002 1 0 0.9383 0.0615 0.0003
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 4115 942 3173 111 18 46 22 745 43 49 2862 172 47 0.1178 0.0136 0.0980 20.488 3.49 9.35 -5.86 11 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3910 1230 2680 381 77 231 65 476 330 53 2234 37 26 0.3098 0.1231 0.1664 4.173 3.29 7.71 -4.42 49 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87616295 TGACAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 2912 780 2132 305 77 166 71 161 13 25 2059 21 14 0.3910 0.0061 0.0342 3.652 6.75 14.25 -7.50 83 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 177 85 92 75 0 5 0 5 0 0 92 0 0 0.8824 0.0000 0.0000 16.000 0.27 3.00 -2.73 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.1712 0.8288 0.0000 0 0 0.6060 0.3940 0.0000
chr4 104491307 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 513 91 422 37 0 21 2 31 0 0 419 0 3 0.4066 0.0000 0.0071 3.286 1.81 6.16 -4.35 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2321 0.5862 0.1818 1 1 0.2347 0.5798 0.1856 1 1 0.2379 0.5717 0.1905
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 739 206 533 91 1 4 0 110 0 0 531 0 2 0.4417 0.0000 0.0038 50.500 0.18 3.46 -3.29 37 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0107 0.4233 0.5660 1 2 0.0124 0.4228 0.5648 1 2 0.0152 0.4230 0.5618
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.100 1 -18 1 237 117 120 80 0 6 0 31 0 0 120 0 0 0.6838 0.0000 0.0000 18.500 0.19 11.97 -11.78 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9738 0.0261 0.0001 1 0 0.9698 0.0301 0.0001 1 0 0.9632 0.0367 0.0001
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 599 257 342 0 0 33 8 216 0 0 337 0 5 0.0000 0.0000 0.0146 6.788 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 587 213 374 127 15 51 2 18 4 4 366 0 0 0.5962 0.0107 0.0214 3.157 1.17 5.06 -3.88 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0077 0.9923 0.0000
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 249 116 133 1 0 13 0 102 0 0 130 1 2 0.0086 0.0000 0.0226 7.923 1.00 4.99 -3.99 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0419 0.9581 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0115 0.9885
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 989 206 783 122 1 4 0 79 0 0 781 0 2 0.5922 0.0000 0.0026 50.500 0.13 3.13 -3.00 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9217 0.0780 0.0002 1 0 0.9153 0.0844 0.0003 1 0 0.9057 0.0938 0.0005
chr5 733800 T TAA 0.007715 0.100 1 2 1 207 76 131 60 0 1 1 14 0 0 131 0 0 0.7895 0.0000 0.0000 75.000 0.37 4.14 -3.78 8 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.2474 0.7526 0.0000 0 1 0.0153 0.9847 0.0000 0 1 0.1377 0.8623 0.0000
chr5 733804 CAT C 0.005230 0.100 1 -2 3 205 75 130 60 0 3 1 11 0 0 130 0 0 0.8000 0.0000 0.0000 36.000 0.38 5.18 -4.80 12 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0174 0.9826 0.0000 0 0 0.6669 0.3331 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 856 189 667 21 1 32 5 130 0 0 662 0 5 0.1111 0.0000 0.0075 4.906 0.67 3.12 -2.45 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 439 67 372 0 0 41 2 24 0 0 368 1 3 0.0000 0.0000 0.0108 0.610 6.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1880 0.8120 2 2 0.0000 0.1921 0.8079 2 2 0.0000 0.1981 0.8019
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 421 97 324 44 0 7 1 45 0 0 324 0 0 0.4536 0.0000 0.0000 12.857 0.18 5.96 -5.77 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1593 0.6039 0.2367 1 1 0.1639 0.5963 0.2398 1 1 0.1699 0.5866 0.2436
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 579 133 446 65 0 3 0 65 0 0 444 0 2 0.4887 0.0000 0.0045 43.333 0.40 3.25 -2.85 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1399 0.6520 0.2080 1 1 0.1456 0.6411 0.2132 1 1 0.1531 0.6273 0.2196
chr5 80654908 GCAGCGCCCC G 0.500000 0.100 1 -9 2 327 95 232 53 0 11 1 30 0 0 231 0 1 0.5579 0.0000 0.0043 7.545 1.51 9.77 -8.26 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7220 0.2672 0.0108 1 0 0.7109 0.2766 0.0125 1 0 0.6954 0.2895 0.0151
chr5 109855234 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 225 104 121 98 2 2 0 2 0 0 121 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 51.000 0.15 2.00 -1.85 44 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6597 0.3403 0.0000 0 0 0.9460 0.0540 0.0000 0 0 0.9725 0.0275 0.0000
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 270 119 151 47 7 18 2 45 0 0 151 0 0 0.3950 0.0000 0.0000 5.611 1.94 5.07 -3.13 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3429 0.5689 0.0882 1 1 0.3434 0.5635 0.0931 1 1 0.3435 0.5567 0.0998
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 627 176 451 152 1 18 0 5 1 0 450 0 0 0.8636 0.0022 0.0022 8.778 0.82 3.00 -2.18 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0373 0.9627 0.0000 0 0 0.9145 0.0855 0.0000 0 0 0.9861 0.0139 0.0000
chr5 119177418 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 203 76 127 67 0 3 0 6 0 0 126 0 1 0.8816 0.0000 0.0079 24.333 0.48 3.17 -2.69 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0162 0.9838 0.0000 0 1 0.2242 0.7758 0.0000
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 682 158 524 93 0 2 1 62 0 0 524 0 0 0.5886 0.0000 0.0000 77.500 0.17 1.19 -1.02 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8213 0.1766 0.0021 1 0 0.8123 0.1851 0.0026 1 0 0.7993 0.1973 0.0034
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 167 67 100 59 0 1 0 7 0 0 100 0 0 0.8806 0.0000 0.0000 66.000 0.63 3.71 -3.09 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0109 0.9891 0.0000 0 1 0.1639 0.8361 0.0000
chr5 137753386 T TCCG 0.500000 0.100 1 3 2 773 220 553 190 1 16 3 10 0 1 552 0 0 0.8636 0.0000 0.0018 12.688 0.55 4.10 -3.55 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0491 0.9509 0.0000 0 0 0.8368 0.1632 0.0000
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 257 94 163 52 0 0 1 41 0 0 159 0 4 0.5532 0.0000 0.0245 94.000 0.23 3.71 -3.48 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3230 0.5781 0.0989 1 1 0.3240 0.5721 0.1039 1 1 0.3248 0.5646 0.1106
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 258 95 163 52 0 0 3 40 0 0 159 1 3 0.5474 0.0000 0.0245 95.000 0.23 3.67 -3.44 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3002 0.5899 0.1099 1 1 0.3019 0.5832 0.1149 1 1 0.3037 0.5747 0.1217
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 473 119 354 54 0 8 0 57 0 0 347 0 7 0.4538 0.0000 0.0198 13.875 0.31 8.05 -7.74 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0560 0.5380 0.4060 1 1 0.0604 0.5342 0.4054 1 1 0.0665 0.5297 0.4038
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 420 139 281 43 1 28 0 67 0 0 273 0 8 0.3094 0.0000 0.0285 3.964 0.30 8.79 -8.49 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0018 0.1420 0.8562 1 2 0.0023 0.1513 0.8464 1 2 0.0031 0.1646 0.8324
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 18 1 420 139 281 44 3 68 4 20 0 0 274 2 5 0.3165 0.0000 0.0249 1.045 0.43 9.85 -9.42 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5023 0.4506 0.0471 1 0 0.4962 0.4527 0.0510 1 0 0.4877 0.4558 0.0566
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 542 121 421 12 0 2 2 105 0 0 411 0 10 0.0992 0.0000 0.0238 119.000 0.75 3.83 -3.08 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.8904 0.1096
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 544 121 423 13 1 5 2 100 0 0 413 0 10 0.1074 0.0000 0.0236 23.000 0.69 4.11 -3.42 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9533 0.0467
chr5 148243107 GGGGAAGCCAGGGTTGTCTAGCCATCAA G 0.500000 0.100 1 -27 1 482 152 330 73 0 16 1 62 0 1 326 0 3 0.4803 0.0000 0.0121 8.500 0.66 18.39 -17.73 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3302 0.6006 0.0692 1 1 0.3331 0.5928 0.0741 1 1 0.3360 0.5830 0.0810
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 695 176 519 171 0 1 0 4 0 0 519 0 0 0.9716 0.0000 0.0000 175.000 0.56 1.75 -1.19 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4647 0.5353 0.0000 0 0 0.9864 0.0136 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 599 171 428 104 0 4 0 63 0 0 428 0 0 0.6082 0.0000 0.0000 41.750 0.22 1.08 -0.86 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9274 0.0723 0.0003 1 0 0.9207 0.0790 0.0004 1 0 0.9106 0.0888 0.0006
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 412 179 233 27 0 7 0 145 0 0 232 0 1 0.1508 0.0000 0.0043 24.571 3.04 4.97 -1.94 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 416 146 270 83 6 18 18 21 0 1 269 0 0 0.5685 0.0000 0.0037 7.471 3.81 10.52 -6.72 21 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9783 0.0217 0.0000 1 0 0.9748 0.0251 0.0001 1 0 0.9693 0.0306 0.0001
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 416 130 286 0 12 1 1 116 0 0 283 0 3 0.0000 0.0000 0.0105 129.000 4.51 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.8279 0.1721
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 225 94 131 0 0 6 0 88 0 0 131 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 14.667 3.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0111 0.9889 2 2 0.0000 0.0122 0.9878 2 2 0.0000 0.0138 0.9862
chr5 168529585 AGGC A 0.500000 0.100 1 -3 1 568 169 399 87 2 11 1 68 0 0 399 0 0 0.5148 0.0000 0.0000 14.364 0.91 3.32 -2.42 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6179 0.3703 0.0118 1 0 0.6126 0.3738 0.0136 1 0 0.6045 0.3790 0.0165
chr5 176384091 CGT C 0.500000 0.100 1 -2 1 332 97 235 9 49 3 0 36 0 0 232 0 3 0.0928 0.0000 0.0128 31.000 0.22 2.06 -1.83 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4798 0.4693 0.0509 1 0 0.4749 0.4702 0.0549 1 1 0.4678 0.4717 0.0606
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 467 119 348 105 1 4 0 9 1 0 346 0 1 0.8824 0.0029 0.0057 28.750 0.89 4.22 -3.34 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 1 0.2261 0.7739 0.0000
chr5 179733341 CCGCCCGCCGCCACGGCCCCGG C 0.500000 0.100 1 -21 1 404 154 250 80 0 19 0 55 1 0 231 0 18 0.5195 0.0040 0.0760 7.105 0.68 16.69 -16.02 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3186 0.6157 0.0657 1 1 0.3225 0.6068 0.0707 1 1 0.3267 0.5957 0.0776
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 665 122 543 7 0 15 1 99 0 0 542 0 1 0.0574 0.0000 0.0018 7.133 0.14 3.11 -2.97 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9176 0.0824 2 2 0.0000 0.3999 0.6001
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 563 125 438 3 0 17 5 100 0 0 432 0 6 0.0240 0.0000 0.0137 6.294 0.00 3.20 -3.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7208 0.2792 2 2 0.0000 0.0825 0.9175 2 2 0.0000 0.0288 0.9712
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 614 135 479 104 2 19 1 9 1 1 477 0 0 0.7704 0.0021 0.0042 6.105 1.26 6.11 -4.85 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0255 0.9745 0.0000 0 0 0.5495 0.4505 0.0000
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1095 247 848 73 24 64 7 79 1 0 839 2 6 0.2955 0.0012 0.0106 2.935 0.62 5.58 -4.97 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2788 0.6803 0.0409 1 1 0.2901 0.6664 0.0435 1 1 0.3045 0.6486 0.0469
chr6 16327684 A ATGC 0.101269 0.100 1 3 1 1095 282 813 95 12 67 39 69 0 0 813 0 0 0.3369 0.0000 0.0000 3.381 0.63 5.94 -5.31 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2321 0.7414 0.0265 1 1 0.2460 0.7259 0.0281 1 1 0.2643 0.7056 0.0301
chr6 21595035 G GGGC 0.002798 0.100 1 3 5 649 149 500 67 0 24 3 55 1 0 497 0 2 0.4497 0.0020 0.0060 5.391 1.42 3.58 -2.16 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5404 0.4593 0.0003 1 0 0.5445 0.4552 0.0003 1 0 0.5493 0.4504 0.0004
chr6 27255285 AAAGGAGAGCCAGATT A 0.178475 0.100 1 -15 1 487 112 375 65 0 7 0 40 0 0 372 0 3 0.5804 0.0000 0.0080 15.000 0.89 13.38 -12.48 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8089 0.1889 0.0022 1 0 0.8017 0.1957 0.0026 1 0 0.7915 0.2053 0.0032
chr6 28073396 CTT C 0.500000 0.100 1 -2 1 642 169 473 87 0 3 0 79 0 0 473 0 0 0.5148 0.0000 0.0000 55.333 0.07 2.13 -2.06 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3079 0.6290 0.0630 1 1 0.3127 0.6192 0.0681 1 1 0.3180 0.6069 0.0751
chr6 29657255 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 134 48 86 21 0 4 1 22 0 0 86 0 0 0.4375 0.0000 0.0000 11.000 1.38 3.91 -2.53 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1814 0.5489 0.2696 1 1 0.1846 0.5452 0.2702 1 1 0.1887 0.5406 0.2707
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 433 107 326 0 0 0 0 107 0 0 325 0 1 0.0000 0.0000 0.0031 107.000 1.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0053 0.9947
chr6 31027789 TAC T 0.500000 0.100 1 -2 1 1794 357 1437 205 3 15 2 132 7 9 1415 1 5 0.5742 0.0049 0.0153 24.357 2.19 3.16 -0.97 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9969 0.0031 0.0000 1 0 0.9962 0.0038 0.0000 1 0 0.9951 0.0049 0.0000
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 911 252 659 143 1 6 1 101 0 0 659 0 0 0.5675 0.0000 0.0000 41.000 1.08 3.98 -2.90 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9056 0.0942 0.0002 1 0 0.8994 0.1003 0.0003 1 0 0.8902 0.1094 0.0005
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 616 174 442 155 0 10 0 9 0 1 441 0 0 0.8908 0.0000 0.0023 16.400 0.41 2.11 -1.70 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1483 0.8517 0.0000 0 0 0.8590 0.1410 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 744 223 521 0 115 2 1 105 0 0 519 0 2 0.0000 0.0000 0.0038 110.500 2.17 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0447 0.6220 0.3333 1 1 0.0491 0.6123 0.3386 1 1 0.0554 0.6002 0.3444
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 607 207 400 181 1 19 0 6 0 0 400 0 0 0.8744 0.0000 0.0000 9.895 0.25 8.83 -8.58 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0170 0.9830 0.0000 0 0 0.9371 0.0629 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000
chr6 31954568 CTCTCGG C 0.500000 0.100 1 -6 3 937 176 761 91 1 15 0 69 0 0 759 0 2 0.5170 0.0000 0.0026 10.667 1.05 6.25 -5.19 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6324 0.3574 0.0102 1 0 0.6269 0.3612 0.0119 1 0 0.6186 0.3669 0.0145
chr6 31954663 TGTCTCGATCCCG T 0.500000 0.100 1 -12 1 968 251 717 220 2 14 0 15 1 0 715 0 1 0.8765 0.0014 0.0028 16.929 1.20 10.60 -9.40 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 0 0.6346 0.3654 0.0000
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 488 130 358 68 0 10 1 51 0 0 357 1 0 0.5231 0.0000 0.0028 12.000 1.00 4.20 -3.20 12 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5442 0.4297 0.0260 1 0 0.5392 0.4318 0.0290 1 0 0.5317 0.4349 0.0334
chr6 32129540 G GAGACTTATGAGA 0.500000 0.100 1 12 1 622 141 481 127 0 11 0 3 0 0 480 0 1 0.9007 0.0000 0.0021 11.818 0.16 8.00 -7.84 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0819 0.9181 0.0000 0 0 0.8894 0.1106 0.0000 0 0 0.9733 0.0267 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 306 97 209 62 1 1 0 33 0 0 209 0 0 0.6392 0.0000 0.0000 96.000 0.37 4.24 -3.87 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8573 0.1405 0.0022 1 0 0.8469 0.1503 0.0028 1 0 0.8321 0.1642 0.0037
chr6 32521966 CG C 0.500000 0.100 1 -1 2 329 147 182 136 2 3 1 5 0 0 182 0 0 0.9252 0.0000 0.0000 48.000 0.36 12.00 -11.64 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 0 0.7005 0.2995 0.0000 0 0 0.9520 0.0480 0.0000
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 581 211 370 102 2 30 2 75 0 0 360 0 10 0.4834 0.0000 0.0270 5.967 0.51 5.75 -5.24 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4954 0.4861 0.0185 1 0 0.4959 0.4831 0.0210 1 0 0.4952 0.4800 0.0248
chr6 35141212 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 232 67 165 62 0 3 0 2 0 0 165 0 0 0.9254 0.0000 0.0000 21.333 2.73 5.50 -2.77 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2239 0.7761 0.0000 0 0 0.7260 0.2740 0.0000 0 0 0.8491 0.1509 0.0000
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 435 104 331 61 0 11 0 32 0 0 318 0 13 0.5865 0.0000 0.0393 8.455 0.31 14.19 -13.88 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5778 0.3980 0.0242 1 0 0.5710 0.4020 0.0271 1 0 0.5611 0.4076 0.0313
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 497 184 313 172 1 4 0 7 0 0 313 0 0 0.9348 0.0000 0.0000 44.750 0.48 1.43 -0.95 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.7724 0.2276 0.0000 0 0 0.9804 0.0196 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 562 144 418 64 0 4 0 76 0 0 417 0 1 0.4444 0.0000 0.0024 46.667 0.44 3.11 -2.67 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0369 0.5142 0.4490 1 1 0.0405 0.5112 0.4482 1 1 0.0458 0.5079 0.4463
chr6 42236367 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 3 347 123 224 64 0 26 0 33 0 0 223 0 1 0.5203 0.0000 0.0045 3.731 0.27 3.00 -2.73 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8562 0.1416 0.0022 1 0 0.8459 0.1513 0.0028 1 0 0.8311 0.1652 0.0037
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 324 125 199 0 0 21 0 104 0 0 189 0 10 0.0000 0.0000 0.0503 4.952 6.53 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr6 43021695 CCGGGGCCCGACGTCCCCG C 0.500000 0.100 1 -18 4 324 143 181 133 2 4 0 4 0 0 180 0 1 0.9301 0.0000 0.0055 34.750 4.63 19.25 -14.62 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0143 0.9857 0.0000 0 0 0.8054 0.1946 0.0000 0 0 0.9659 0.0341 0.0000
chr6 44002766 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 540 137 403 13 33 44 1 46 0 3 398 1 1 0.0949 0.0000 0.0124 2.068 1.00 4.28 -3.28 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1843 0.6152 0.2006 1 1 0.1886 0.6067 0.2046 1 1 0.1942 0.5960 0.2098
chr6 44002766 CGCGGCG C 0.500000 0.100 1 -6 1 544 145 399 71 1 31 2 40 1 0 394 0 4 0.4897 0.0025 0.0125 3.645 3.04 4.75 -1.71 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8040 0.1924 0.0036 1 0 0.7937 0.2019 0.0044 1 0 0.7792 0.2152 0.0057
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 622 160 462 34 3 77 1 45 0 0 439 1 22 0.2125 0.0000 0.0498 1.065 13.50 5.00 8.50 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0017 0.1288 0.8695 1 2 0.0022 0.1382 0.8597 1 2 0.0029 0.1516 0.8455
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 30 2 622 160 462 34 5 87 1 33 0 0 439 4 19 0.2125 0.0000 0.0498 0.805 13.50 1.24 12.26 10 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0158 0.3231 0.6611 1 2 0.0179 0.3306 0.6515 1 2 0.0213 0.3408 0.6380
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.100 1 -15 2 622 194 428 92 3 55 1 43 0 0 422 0 6 0.4742 0.0000 0.0140 2.527 2.65 10.88 -8.23 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9549 0.0450 0.0001 1 0 0.9494 0.0504 0.0002 1 0 0.9412 0.0586 0.0003
chr6 84174775 T TTCCTGTTGTTTCTTTAGTTCTTCCAACTTATTTTCTAGTTCTTTC 0.500000 0.100 1 45 5 296 93 203 69 0 14 0 10 0 0 203 0 0 0.7419 0.0000 0.0000 5.643 0.20 0.40 -0.20 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0444 0.9556 0.0000
chr6 84186595 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 378 88 290 82 0 4 0 2 0 0 290 0 0 0.9318 0.0000 0.0000 21.000 0.37 3.50 -3.13 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4340 0.5660 0.0000 0 0 0.8772 0.1228 0.0000 0 0 0.9368 0.0632 0.0000
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 732 145 587 59 5 43 2 36 0 0 580 1 6 0.4069 0.0000 0.0119 2.349 1.31 5.53 -4.22 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6581 0.3278 0.0141 1 0 0.6492 0.3346 0.0162 1 0 0.6367 0.3440 0.0193
chr6 107634729 A AGCCCCCCGG 0.500000 0.100 1 9 1 535 78 457 45 1 14 0 18 0 0 453 0 4 0.5769 0.0000 0.0088 4.846 1.07 7.94 -6.88 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7712 0.2207 0.0081 1 0 0.7591 0.2314 0.0095 1 0 0.7422 0.2461 0.0117
chr6 108561444 T TCGG 0.500000 0.100 1 3 1 683 167 516 78 33 11 0 45 4 2 500 2 8 0.4671 0.0078 0.0310 15.600 1.04 4.49 -3.45 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9907 0.0093 0.0000 1 0 0.9889 0.0111 0.0000 1 0 0.9860 0.0140 0.0000
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 855 195 660 90 0 10 0 95 0 0 658 0 2 0.4615 0.0000 0.0030 18.500 0.17 3.06 -2.90 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0666 0.6668 0.2667 1 1 0.0720 0.6548 0.2733 1 1 0.0795 0.6394 0.2811
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 784 169 615 98 0 1 1 69 0 0 603 0 12 0.5799 0.0000 0.0195 167.000 0.46 6.65 -6.19 12 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4979 0.4821 0.0200 1 0 0.4977 0.4797 0.0227 1 0 0.4962 0.4772 0.0266
chr6 117563254 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 3 198 89 109 40 0 1 0 48 0 0 109 0 0 0.4494 0.0000 0.0000 88.000 0.25 2.94 -2.69 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0788 0.5363 0.3849 1 1 0.0835 0.5331 0.3834 1 1 0.0899 0.5293 0.3809
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 388 106 282 54 0 2 0 50 0 0 282 0 0 0.5094 0.0000 0.0000 52.000 0.06 1.16 -1.10 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2708 0.6067 0.1226 1 1 0.2736 0.5988 0.1277 1 1 0.2767 0.5888 0.1345
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 1032 244 788 115 0 10 0 119 0 0 787 0 1 0.4713 0.0000 0.0013 23.400 0.23 2.99 -2.76 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0705 0.7373 0.1922 1 1 0.0768 0.7218 0.2014 1 1 0.0855 0.7016 0.2130
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 211 112 99 56 1 3 0 52 0 0 97 0 2 0.5000 0.0000 0.0202 36.333 0.34 3.90 -3.56 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2428 0.6227 0.1344 1 1 0.2466 0.6138 0.1397 1 1 0.2510 0.6024 0.1466
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 683 284 399 125 1 46 0 112 0 0 386 0 13 0.4401 0.0000 0.0326 5.174 0.48 15.25 -14.77 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1246 0.7731 0.1023 1 1 0.1333 0.7564 0.1102 1 1 0.1448 0.7343 0.1209
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 527 198 329 105 0 3 0 90 0 0 329 0 0 0.5303 0.0000 0.0000 65.000 0.16 5.66 -5.49 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4488 0.5283 0.0230 1 1 0.4510 0.5231 0.0259 1 1 0.4527 0.5170 0.0302
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 242 91 151 77 0 6 0 8 0 0 151 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 14.167 0.29 10.00 -9.71 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0093 0.9907 0.0000 0 1 0.1981 0.8019 0.0000
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 241 79 162 67 0 5 0 7 0 0 161 0 1 0.8481 0.0000 0.0062 14.800 0.33 10.86 -10.53 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0057 0.9943 0.0000 0 1 0.1321 0.8679 0.0000
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 336 132 204 0 0 13 13 106 0 0 202 1 1 0.0000 0.0000 0.0098 9.154 3.19 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0028 0.9972
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 784 151 633 10 0 38 1 102 0 0 616 0 17 0.0662 0.0000 0.0269 2.974 0.80 8.85 -8.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9906 0.0094 2 1 0.0000 0.6447 0.3553
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 756 239 517 10 1 12 97 119 0 0 517 0 0 0.0418 0.0000 0.0000 24.833 3.70 9.55 -5.85 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7310 0.2690 2 2 0.0000 0.0498 0.9502
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 757 247 510 83 32 21 41 70 0 0 510 0 0 0.3360 0.0000 0.0000 11.278 3.07 12.39 -9.31 45 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1298 0.7367 0.1336 1 1 0.1374 0.7213 0.1413 1 1 0.1475 0.7012 0.1514
chr7 291345 G GAGC 0.000001 0.100 1 3 2 517 148 369 131 1 8 0 8 0 0 369 0 0 0.8851 0.0000 0.0000 17.500 0.47 2.75 -2.28 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9414 0.0586 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr7 2220958 CGG C 0.500000 0.100 1 -2 2 219 83 136 43 0 0 0 40 0 0 130 0 6 0.5181 0.0000 0.0441 83.000 0.74 2.88 -2.13 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1433 0.5970 0.2597 1 1 0.1480 0.5898 0.2622 1 1 0.1542 0.5807 0.2651
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 264 100 164 35 3 21 1 40 0 3 159 0 2 0.3500 0.0000 0.0305 3.762 3.69 4.17 -0.49 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1584 0.5943 0.2473 1 1 0.1628 0.5873 0.2499 1 1 0.1686 0.5785 0.2529
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 264 101 163 53 0 17 0 31 0 0 159 0 4 0.5248 0.0000 0.0245 4.941 3.23 4.45 -1.23 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6469 0.3348 0.0183 1 0 0.6373 0.3420 0.0207 1 0 0.6239 0.3519 0.0243
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 640 194 446 104 0 10 0 80 0 0 440 0 6 0.5361 0.0000 0.0135 18.400 0.24 11.16 -10.92 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5316 0.4534 0.0150 1 0 0.5308 0.4520 0.0172 1 0 0.5285 0.4510 0.0205
chr7 7969479 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 1 315 50 265 22 0 11 1 16 0 0 259 3 3 0.4400 0.0000 0.0226 3.545 3.45 6.12 -2.67 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2041 0.5537 0.2421 1 1 0.2067 0.5497 0.2436 1 1 0.2101 0.5446 0.2453
chr7 12342095 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 121 49 72 33 0 0 0 16 0 0 72 0 0 0.6735 0.0000 0.0000 49.000 0.24 1.94 -1.70 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6640 0.3132 0.0228 1 0 0.6521 0.3224 0.0255 1 0 0.6357 0.3348 0.0296
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 242 91 151 10 0 1 0 80 0 0 151 0 0 0.1099 0.0000 0.0000 90.000 0.40 1.73 -1.33 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.9263 0.0737
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 792 229 563 7 0 40 7 175 0 0 560 0 3 0.0306 0.0000 0.0053 4.725 0.00 3.15 -3.15 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 2 0.0000 0.1431 0.8569 2 2 0.0000 0.0111 0.9889
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 154 48 106 43 2 0 0 3 0 0 106 0 0 0.8958 0.0000 0.0000 46.000 0.47 1.67 -1.20 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0141 0.9859 0.0000 0 1 0.2824 0.7176 0.0000 0 0 0.5637 0.4363 0.0000
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 618 150 468 4 0 1 0 145 0 0 468 0 0 0.0267 0.0000 0.0000 149.000 1.25 1.26 -0.01 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8100 0.1900 2 2 0.0000 0.0478 0.9522 2 2 0.0000 0.0113 0.9887
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 220 62 158 34 0 2 0 26 0 0 157 0 1 0.5484 0.0000 0.0063 30.000 0.26 3.27 -3.00 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3850 0.5189 0.0961 1 1 0.3821 0.5172 0.1007 1 1 0.3780 0.5151 0.1069
chr7 43647475 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 237 103 134 96 0 4 0 3 0 0 134 0 0 0.9320 0.0000 0.0000 24.750 0.32 3.00 -2.68 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1450 0.8550 0.0000 0 0 0.8321 0.1679 0.0000 0 0 0.9389 0.0611 0.0000
chr7 44073397 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 730 164 566 86 0 3 0 75 0 0 566 0 0 0.5244 0.0000 0.0000 53.667 0.31 1.37 -1.06 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3856 0.5709 0.0436 1 1 0.3880 0.5643 0.0477 1 1 0.3901 0.5564 0.0536
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 255 108 147 49 0 3 0 56 0 0 147 0 0 0.4537 0.0000 0.0000 35.000 0.20 3.20 -2.99 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0854 0.5723 0.3422 1 1 0.0903 0.5667 0.3430 1 1 0.0971 0.5596 0.3434
chr7 55538631 C CAGAT 0.500000 0.100 1 4 1 74 38 36 25 0 1 0 12 0 0 35 0 1 0.6579 0.0000 0.0278 37.000 0.32 4.25 -3.93 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5476 0.4017 0.0507 1 0 0.5380 0.4074 0.0546 1 0 0.5248 0.4150 0.0602
chr7 56101805 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 193 75 118 70 1 1 0 3 0 0 118 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 73.000 0.76 1.00 -0.24 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0461 0.9539 0.0000 0 0 0.5867 0.4133 0.0000 0 0 0.8199 0.1801 0.0000
chr7 65399606 AAACAT A 0.500000 0.100 1 -5 1 321 72 249 38 0 1 0 33 5 1 242 0 1 0.5278 0.0201 0.0281 71.000 0.47 5.91 -5.44 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4492 0.4888 0.0620 1 1 0.4449 0.4887 0.0663 1 1 0.4388 0.4888 0.0724
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.100 1 3 5 259 76 183 31 1 17 1 26 0 0 183 0 0 0.4079 0.0000 0.0000 3.471 0.35 3.00 -2.65 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3376 0.5409 0.1215 1 1 0.3364 0.5378 0.1259 1 1 0.3344 0.5338 0.1318
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 452 191 261 127 0 0 0 64 0 0 261 0 0 0.6649 0.0000 0.0000 191.000 2.44 2.03 0.41 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9902 0.0098 0.0000 1 0 0.9884 0.0116 0.0000 1 0 0.9854 0.0146 0.0000
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 939 211 728 0 0 11 2 198 0 0 719 0 9 0.0000 0.0000 0.0124 18.182 3.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 706 184 522 153 2 24 0 5 0 1 520 0 1 0.8315 0.0000 0.0038 6.625 0.58 3.40 -2.82 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 0 0.8017 0.1983 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 279 105 174 66 1 1 0 37 0 0 172 0 2 0.6286 0.0000 0.0115 104.000 0.23 3.32 -3.10 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8238 0.1730 0.0032 1 0 0.8133 0.1828 0.0039 1 0 0.7982 0.1966 0.0051
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 602 251 351 85 6 87 1 72 0 0 351 0 0 0.3386 0.0000 0.0000 1.885 0.99 3.44 -2.46 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5645 0.4198 0.0157 1 0 0.5612 0.4209 0.0179 1 0 0.5557 0.4230 0.0212
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 527 160 367 85 0 4 0 71 0 0 367 0 0 0.5312 0.0000 0.0000 39.000 0.47 4.13 -3.66 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4683 0.5025 0.0292 1 1 0.4677 0.4998 0.0325 1 1 0.4659 0.4968 0.0372
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 152 53 99 14 0 1 1 37 0 0 91 0 8 0.2642 0.0000 0.0808 51.000 0.29 24.76 -24.47 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0016 0.1115 0.8869 1 2 0.0017 0.2626 0.7357 2 1 0.0007 0.7944 0.2049
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.100 1 -7 1 681 197 484 180 0 9 0 8 1 0 482 0 1 0.9137 0.0021 0.0041 20.889 0.53 5.50 -4.97 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3676 0.6324 0.0000 0 0 0.9529 0.0471 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 683 179 504 3 0 12 1 163 0 0 502 1 1 0.0168 0.0000 0.0040 13.917 0.33 3.20 -2.86 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1427 0.8573 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 427 143 284 9 1 38 0 95 0 0 277 0 7 0.0629 0.0000 0.0246 3.088 0.78 6.28 -5.51 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9931 0.0069 2 1 0.0000 0.7746 0.2254
chr7 112318220 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 114 53 61 50 0 0 0 3 0 0 61 0 0 0.9434 0.0000 0.0000 53.000 0.68 3.67 -2.99 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0164 0.9836 0.0000 0 1 0.3335 0.6665 0.0000 0 0 0.6230 0.3770 0.0000
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 833 223 610 92 0 17 3 111 0 0 609 0 1 0.4126 0.0000 0.0016 12.118 0.28 4.32 -4.03 24 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0067 0.3586 0.6347 1 2 0.0079 0.3608 0.6313 1 2 0.0099 0.3645 0.6256
chr7 124032402 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 866 276 590 127 3 29 18 99 0 0 587 3 0 0.4601 0.0000 0.0051 8.786 0.52 3.45 -2.93 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2848 0.6798 0.0354 1 1 0.2941 0.6663 0.0396 1 1 0.3051 0.6492 0.0457
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 869 280 589 137 2 118 0 23 0 0 586 0 3 0.4893 0.0000 0.0051 1.425 0.56 6.17 -5.61 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 765 280 485 232 0 31 0 17 0 0 485 0 0 0.8286 0.0000 0.0000 8.032 0.38 13.00 -12.62 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.5861 0.4139 0.0000
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 483 233 250 180 3 41 0 9 0 1 249 0 0 0.7725 0.0000 0.0040 4.683 3.83 6.67 -2.83 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4016 0.5984 0.0000 0 0 0.9588 0.0412 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 483 237 246 111 0 33 0 93 0 0 244 0 2 0.4684 0.0000 0.0081 6.182 0.87 7.15 -6.28 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4615 0.5191 0.0194 1 1 0.4640 0.5140 0.0220 1 1 0.4659 0.5082 0.0260
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 229 85 144 0 0 1 0 84 0 0 139 0 5 0.0000 0.0000 0.0347 84.000 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0102 0.9898 2 2 0.0000 0.0112 0.9888 2 2 0.0000 0.0127 0.9873
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 1013 283 730 6 114 62 2 99 0 2 725 0 3 0.0212 0.0000 0.0068 3.565 3.33 3.13 0.20 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4711 0.5132 0.0156 1 1 0.4742 0.5078 0.0180 1 1 0.4768 0.5017 0.0215
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 1015 287 728 103 5 60 1 118 0 0 726 1 1 0.3589 0.0000 0.0027 3.783 2.89 3.21 -0.32 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0277 0.6115 0.3609 1 1 0.0311 0.6013 0.3675 1 1 0.0362 0.5888 0.3750
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 789 201 588 109 2 6 0 84 0 0 588 0 0 0.5423 0.0000 0.0000 32.500 0.44 1.33 -0.89 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7336 0.2629 0.0035 1 0 0.7270 0.2688 0.0042 1 0 0.7171 0.2774 0.0055
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 844 221 623 105 0 6 0 110 0 0 622 0 1 0.4751 0.0000 0.0016 35.833 0.36 4.39 -4.03 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0678 0.7093 0.2229 1 1 0.0737 0.6950 0.2313 1 1 0.0818 0.6766 0.2416
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 878 226 652 16 0 4 1 205 0 0 646 1 5 0.0708 0.0000 0.0092 55.500 0.06 1.27 -1.21 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 2 0.0000 0.4953 0.5047
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 551 157 394 91 0 3 0 63 0 0 394 0 0 0.5796 0.0000 0.0000 51.333 0.60 1.43 -0.82 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7879 0.2090 0.0031 1 0 0.7789 0.2173 0.0038 1 0 0.7660 0.2291 0.0049
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 438 90 348 0 0 2 17 71 1 3 320 8 16 0.0000 0.0029 0.0805 88.000 7.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4336 0.5664 2 2 0.0000 0.0820 0.9180 2 2 0.0000 0.0337 0.9663
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 438 89 349 0 0 4 13 72 0 1 317 11 20 0.0000 0.0000 0.0917 78.000 7.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0149 0.9851 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0062 0.9938
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 441 88 353 0 0 5 8 75 0 0 281 30 42 0.0000 0.0000 0.2040 20.750 7.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 375 149 226 75 0 0 0 74 0 0 226 0 0 0.5034 0.0000 0.0000 149.000 0.25 1.35 -1.10 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1792 0.6739 0.1469 1 1 0.1852 0.6617 0.1531 1 1 0.1929 0.6461 0.1610
chr8 544658 GGGCGGC G 0.425210 0.100 1 -6 1 266 117 149 100 0 8 1 8 10 0 138 0 1 0.8547 0.0671 0.0738 13.500 5.39 5.38 0.01 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0199 0.9801 0.0000 0 1 0.4418 0.5582 0.0000
chr8 1678294 T TCAC 0.045336 0.100 1 3 1 477 127 350 58 0 9 0 60 0 0 348 0 2 0.4567 0.0000 0.0057 13.111 0.40 3.10 -2.70 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2557 0.7174 0.0268 1 1 0.2671 0.7057 0.0272 1 1 0.2820 0.6904 0.0276
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 835 193 642 84 0 31 1 77 0 0 639 0 3 0.4352 0.0000 0.0047 5.226 0.60 6.04 -5.44 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1888 0.6879 0.1233 1 1 0.1948 0.6751 0.1301 1 1 0.2021 0.6586 0.1392
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 285 97 188 86 0 0 0 11 0 0 187 0 1 0.8866 0.0000 0.0053 97.000 0.38 3.00 -2.62 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0341 0.9659 0.0000
chr8 10608190 CTTCCTCTTCTGCCTCCTGGGACTCTATAACTTCTGACTCTGGCTGGGT C 0.002031 0.100 1 -48 3 1056 276 780 154 3 19 4 96 5 10 744 11 10 0.5580 0.0064 0.0462 14.222 2.06 10.64 -8.57 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9740 0.0260 0.0000 1 0 0.9717 0.0283 0.0000 1 0 0.9681 0.0319 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 680 289 391 0 0 43 1 245 0 0 387 1 3 0.0000 0.0000 0.0102 6.000 8.60 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 11808709 GTCCCACTCCCAC G 0.017271 0.100 1 -12 1 680 297 383 15 4 153 4 121 0 0 379 0 4 0.0505 0.0000 0.0104 0.946 0.67 10.79 -10.13 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 389 127 262 81 0 2 0 44 0 0 260 0 2 0.6378 0.0000 0.0076 62.500 0.22 7.02 -6.80 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9331 0.0667 0.0002 1 0 0.9273 0.0724 0.0003 1 0 0.9189 0.0807 0.0004
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 292 129 163 12 0 2 0 115 0 0 163 0 0 0.0930 0.0000 0.0000 63.500 0.25 3.04 -2.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9478 0.0522
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 687 251 436 231 0 7 0 13 1 0 433 0 2 0.9203 0.0023 0.0069 34.857 0.47 3.23 -2.76 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0199 0.9801 0.0000 0 0 0.8925 0.1075 0.0000
chr8 79766258 AGGCATGT A 0.500000 0.100 1 -7 1 414 103 311 59 0 4 0 40 0 0 308 0 3 0.5728 0.0000 0.0096 24.750 0.24 7.05 -6.81 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5823 0.3933 0.0244 1 0 0.5751 0.3976 0.0273 1 0 0.5649 0.4037 0.0315
chr8 93728272 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 102 50 52 28 0 3 0 19 0 0 52 0 0 0.5600 0.0000 0.0000 15.667 0.71 2.95 -2.23 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4545 0.4691 0.0763 1 1 0.4485 0.4708 0.0807 1 1 0.4402 0.4731 0.0867
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 342 100 242 62 0 2 0 36 0 0 241 0 1 0.6200 0.0000 0.0041 49.000 0.40 2.36 -1.96 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7814 0.2131 0.0055 1 0 0.7705 0.2229 0.0066 1 0 0.7551 0.2367 0.0083
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 771 249 522 136 0 10 0 103 0 0 522 0 0 0.5462 0.0000 0.0000 23.900 0.29 18.16 -17.86 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8022 0.1967 0.0012 1 0 0.7959 0.2026 0.0015 1 0 0.7864 0.2115 0.0020
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 319 90 229 54 0 5 0 31 0 0 229 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 17.000 0.65 4.48 -3.84 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7586 0.2336 0.0078 1 0 0.7472 0.2436 0.0092 1 0 0.7312 0.2574 0.0113
chr8 123369918 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 1 384 127 257 54 4 14 17 38 0 0 257 0 0 0.4252 0.0000 0.0000 7.786 0.22 5.34 -5.12 28 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2536 0.6194 0.1270 1 1 0.2571 0.6106 0.1322 1 1 0.2613 0.5995 0.1392
chr8 123369918 T TTCATCA 0.500000 0.100 1 6 1 384 127 257 57 0 20 1 49 0 0 257 0 0 0.4488 0.0000 0.0000 5.300 0.44 6.06 -5.62 29 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3423 0.5732 0.0845 1 1 0.3431 0.5675 0.0894 1 1 0.3436 0.5603 0.0961
chr8 140458378 T TGTGACCCTCACGGTACCCCCC 0.500000 0.100 1 21 5 380 139 241 55 2 29 0 53 0 0 241 0 0 0.3957 0.0000 0.0000 3.793 0.47 9.04 -8.57 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2625 0.6148 0.1227 1 1 0.2657 0.6063 0.1279 1 1 0.2695 0.5956 0.1349
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 584 166 418 0 1 28 10 127 0 0 410 0 8 0.0000 0.0000 0.0191 4.929 4.63 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 953 194 759 97 0 35 0 62 0 0 747 1 11 0.5000 0.0000 0.0158 4.543 0.58 11.06 -10.49 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6765 0.3165 0.0069 1 0 0.6702 0.3216 0.0082 1 0 0.6608 0.3290 0.0102
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 1036 222 814 211 1 3 0 7 0 0 814 0 0 0.9505 0.0000 0.0000 72.667 0.37 2.71 -2.34 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0086 0.9914 0.0000 0 0 0.9582 0.0418 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.100 1 2 3 1155 213 942 114 5 9 6 79 0 0 940 2 0 0.5352 0.0000 0.0021 25.375 1.43 3.46 -2.03 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8897 0.1100 0.0002 1 0 0.8846 0.1151 0.0003 1 0 0.8771 0.1225 0.0004
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.100 1 -2 4 1157 216 941 26 95 8 6 81 0 0 936 0 5 0.1204 0.0000 0.0053 24.333 0.65 3.44 -2.79 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5023 0.4866 0.0111 1 0 0.5079 0.4799 0.0122 1 0 0.5142 0.4720 0.0138
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 627 199 428 18 0 52 13 116 0 0 427 0 1 0.0905 0.0000 0.0023 2.882 0.06 3.09 -3.04 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008
chr9 12775862 T TGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 2 362 89 273 32 0 23 0 34 0 0 265 1 7 0.3596 0.0000 0.0293 2.870 0.28 5.82 -5.54 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0614 0.4816 0.4569 1 1 0.0657 0.4821 0.4522 1 1 0.0717 0.4828 0.4455
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 362 89 273 32 3 21 0 33 0 0 265 2 6 0.3596 0.0000 0.0293 3.238 0.28 5.82 -5.54 16 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1053 0.5510 0.3437 1 1 0.1100 0.5470 0.3430 1 1 0.1164 0.5420 0.3416
chr9 33796692 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 419 164 255 153 1 6 0 4 0 0 254 0 1 0.9329 0.0000 0.0039 26.333 0.47 3.25 -2.78 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0369 0.9631 0.0000 0 0 0.9144 0.0856 0.0000 0 0 0.9861 0.0139 0.0000
chr9 34893048 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 357 96 261 87 1 1 0 7 0 0 261 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 95.000 0.14 2.14 -2.00 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0453 0.9547 0.0000 0 1 0.4452 0.5548 0.0000
chr9 35562396 A ATAGT 0.500000 0.100 1 4 5 777 173 604 165 1 1 0 6 0 1 603 0 0 0.9538 0.0000 0.0017 172.000 1.41 3.67 -2.25 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 0 0.8757 0.1243 0.0000 0 0 0.9860 0.0140 0.0000
chr9 38396908 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 707 157 550 89 0 2 0 66 0 0 550 0 0 0.5669 0.0000 0.0000 77.500 0.30 1.27 -0.97 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6906 0.3022 0.0072 1 0 0.6832 0.3083 0.0085 1 0 0.6724 0.3170 0.0106
chr9 65738388 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 649 150 499 137 0 10 0 3 0 0 499 0 0 0.9133 0.0000 0.0000 14.000 0.64 3.00 -2.36 109 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5783 0.4217 0.0000 0 0 0.9746 0.0254 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 470 138 332 75 0 4 0 59 0 0 324 0 8 0.5435 0.0000 0.0241 33.500 0.21 14.42 -14.21 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3310 0.6012 0.0678 1 1 0.3340 0.5933 0.0727 1 1 0.3371 0.5834 0.0795
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 866 181 685 73 0 23 0 85 0 0 669 0 16 0.4033 0.0000 0.0234 6.870 0.51 11.05 -10.54 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0030 0.2257 0.7713 1 2 0.0037 0.2331 0.7632 1 2 0.0048 0.2437 0.7515
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 541 163 378 79 0 2 1 81 0 0 376 0 2 0.4847 0.0000 0.0053 80.500 0.49 3.48 -2.99 53 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0910 0.6641 0.2450 1 1 0.0968 0.6524 0.2508 1 1 0.1046 0.6375 0.2579
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 253 86 167 36 0 4 0 46 0 0 166 0 1 0.4186 0.0000 0.0060 20.500 0.06 4.63 -4.57 20 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0532 0.4757 0.4711 1 1 0.0573 0.4763 0.4663 1 1 0.0631 0.4773 0.4596
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 381 113 268 7 5 21 0 80 0 0 268 0 0 0.0619 0.0000 0.0000 4.600 0.00 3.45 -3.45 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9782 0.0218
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 381 116 265 80 11 19 0 6 0 0 265 0 0 0.6897 0.0000 0.0000 5.389 2.67 2.67 0.01 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1389 0.8611 0.0000 0 0 0.6415 0.3585 0.0000
chr9 93259450 TTGCCCCCGCAACCCACACGGCCCCCTCAACCTGTGC T 0.500000 0.100 1 -36 1 466 98 368 43 0 18 1 36 0 1 367 0 0 0.4388 0.0000 0.0027 4.444 0.74 9.28 -8.53 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3616 0.5452 0.0933 1 1 0.3605 0.5415 0.0980 1 1 0.3586 0.5370 0.1044
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 517 204 313 10 0 3 0 191 0 0 313 0 0 0.0490 0.0000 0.0000 67.000 0.10 9.15 -9.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7517 0.2483 2 2 0.0000 0.0547 0.9453
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 776 342 434 117 0 3 0 222 0 0 426 1 7 0.3421 0.0000 0.0184 113.000 0.34 3.41 -3.07 37 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0002 0.9998 1 2 0.0000 0.0002 0.9998 1 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 435 117 318 48 0 21 1 47 0 0 317 0 1 0.4103 0.0000 0.0031 4.571 0.60 6.51 -5.91 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1687 0.6149 0.2163 1 1 0.1734 0.6065 0.2201 1 1 0.1793 0.5958 0.2249
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 1069 159 910 4 0 44 2 109 0 2 893 1 14 0.0252 0.0000 0.0187 2.614 4.50 6.41 -1.91 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9653 0.0347 2 2 0.0000 0.2084 0.7916 2 2 0.0000 0.0480 0.9520
chr9 97904745 A AGACACCAAG 0.500000 0.100 1 9 1 258 88 170 77 0 8 0 3 0 0 168 0 2 0.8750 0.0000 0.0118 10.000 0.30 9.33 -9.03 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1858 0.8142 0.0000 0 0 0.6289 0.3711 0.0000
chr9 99828333 TCAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 913 258 655 200 7 33 1 17 0 0 655 0 0 0.7752 0.0000 0.0000 6.969 0.65 3.65 -3.00 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.2109 0.7891 0.0000
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 565 146 419 87 1 0 0 58 0 0 419 0 0 0.5959 0.0000 0.0000 145.000 0.43 2.66 -2.23 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8221 0.1756 0.0022 1 0 0.8128 0.1844 0.0028 1 0 0.7994 0.1969 0.0037
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 959 207 752 130 0 0 0 77 0 0 751 0 1 0.6280 0.0000 0.0013 207.000 0.24 4.81 -4.57 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9689 0.0310 0.0000 1 0 0.9650 0.0349 0.0000 1 0 0.9590 0.0409 0.0001
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 895 214 681 123 0 2 0 89 0 0 680 1 0 0.5748 0.0000 0.0015 106.000 0.41 2.93 -2.52 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8226 0.1763 0.0012 1 0 0.8153 0.1832 0.0015 1 0 0.8045 0.1934 0.0021
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 287 105 182 0 0 5 0 100 0 0 180 0 2 0.0000 0.0000 0.0110 20.000 4.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0070 0.9930
chr9 113425365 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 537 142 395 108 4 23 0 7 0 0 395 0 0 0.7606 0.0000 0.0000 5.174 0.12 2.43 -2.31 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1351 0.8649 0.0000 0 0 0.7197 0.2803 0.0000
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 535 124 411 45 0 21 0 58 0 0 411 0 0 0.3629 0.0000 0.0000 5.150 0.38 6.00 -5.62 31 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0407 0.4685 0.4909 1 2 0.0444 0.4690 0.4866 1 2 0.0497 0.4700 0.4802
chr9 122511106 A AT 0.500000 0.100 1 1 1 731 169 562 96 0 14 0 59 0 0 559 1 2 0.5680 0.0000 0.0053 11.071 0.19 1.24 -1.05 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8693 0.1296 0.0010 1 0 0.8608 0.1379 0.0013 1 0 0.8483 0.1499 0.0018
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 606 202 404 0 0 19 95 88 0 0 402 1 1 0.0000 0.0000 0.0050 9.474 3.62 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 2 608 207 401 3 2 100 5 97 0 0 399 0 2 0.0145 0.0000 0.0050 1.073 0.00 6.45 -6.45 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9242 0.0758 2 2 0.0000 0.2764 0.7236 2 2 0.0000 0.0996 0.9004
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 604 182 422 0 0 2 1 179 0 0 418 0 4 0.0000 0.0000 0.0095 90.000 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 238 67 171 0 0 7 0 60 0 0 169 0 2 0.0000 0.0000 0.0117 8.571 7.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0417 0.9583 2 2 0.0000 0.0442 0.9558 2 2 0.0000 0.0480 0.9520
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 534 157 377 12 0 42 5 98 0 0 372 0 5 0.0764 0.0000 0.0133 2.714 2.75 3.87 -1.12 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9222 0.0778
chr9 131038976 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 1 544 172 372 152 0 8 0 12 0 0 372 0 0 0.8837 0.0000 0.0000 23.429 0.50 2.08 -1.58 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 1 0.4274 0.5726 0.0000
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 213 66 147 9 0 2 0 55 0 0 147 0 0 0.1364 0.0000 0.0000 32.000 0.78 1.80 -1.02 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.9563 0.0437
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 487 142 345 130 0 3 0 9 0 0 345 0 0 0.9155 0.0000 0.0000 46.333 0.32 1.22 -0.91 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0438 0.9562 0.0000 0 0 0.6304 0.3696 0.0000
chr9 136341024 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 275 85 190 42 0 8 1 34 0 0 190 0 0 0.4941 0.0000 0.0000 9.500 0.81 1.94 -1.13 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3751 0.5350 0.0900 1 1 0.3733 0.5320 0.0946 1 1 0.3706 0.5284 0.1010
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 501 147 354 84 1 14 0 48 0 0 351 0 3 0.5714 0.0000 0.0085 9.500 0.96 13.35 -12.39 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8809 0.1181 0.0010 1 0 0.8721 0.1266 0.0013 1 0 0.8592 0.1390 0.0019
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 273 124 149 47 32 31 0 14 0 0 149 0 0 0.3790 0.0000 0.0000 3.000 0.28 2.79 -2.51 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0058 0.9942 0.0000
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 381 99 282 50 0 2 0 47 0 0 281 0 1 0.5051 0.0000 0.0035 48.500 1.08 1.13 -0.05 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4249 0.5712 0.0039 1 1 0.4319 0.5641 0.0040 1 1 0.4405 0.5553 0.0042
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 930 213 717 10 0 27 2 174 0 0 702 0 15 0.0469 0.0000 0.0209 7.154 0.70 5.52 -4.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7485 0.2515 2 2 0.0000 0.0540 0.9460
chr10 21516768 C CGGT 0.000687 0.100 1 3 3 852 199 653 96 4 38 1 60 1 0 651 0 1 0.4824 0.0015 0.0031 4.237 0.82 3.38 -2.56 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9557 0.0443 0.0000 1 0 0.9517 0.0483 0.0000 1 0 0.9458 0.0542 0.0000
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 776 169 607 18 0 2 0 149 0 0 597 1 9 0.1065 0.0000 0.0165 83.500 0.06 3.27 -3.21 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9925 0.0075
chr10 27398605 C CT 0.021536 0.100 1 1 2 861 223 638 200 1 12 0 10 0 0 638 0 0 0.8969 0.0000 0.0000 17.583 0.45 1.10 -0.66 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.9629 0.0371 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr10 45303617 T TA 0.034347 0.100 1 1 2 702 185 517 94 0 1 0 90 0 0 516 0 1 0.5081 0.0000 0.0019 184.000 0.23 1.27 -1.03 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3419 0.6514 0.0067 1 1 0.3547 0.6382 0.0071 1 1 0.3708 0.6215 0.0077
chr10 49973015 CAG C 0.000761 0.100 1 -2 1 107 55 52 50 0 1 0 4 0 0 52 0 0 0.9091 0.0000 0.0000 54.000 0.22 3.25 -3.03 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6994 0.3006 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 134 62 72 39 0 0 0 23 0 0 71 0 1 0.6290 0.0000 0.0139 62.000 0.59 7.91 -7.32 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7285 0.2648 0.0067 1 0 0.7213 0.2713 0.0075 1 0 0.7113 0.2802 0.0086
chr10 67885122 AGGC A 0.000161 0.100 1 -3 1 597 205 392 100 2 19 1 83 1 0 389 0 2 0.4878 0.0026 0.0077 9.789 0.62 3.47 -2.85 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6812 0.3188 0.0000 1 0 0.6823 0.3177 0.0000 1 0 0.6828 0.3172 0.0000
chr10 68306803 TCTTG T 0.000227 0.100 1 -4 1 201 102 99 56 0 3 0 43 0 0 99 0 0 0.5490 0.0000 0.0000 33.000 0.09 4.12 -4.03 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6906 0.3094 0.0000 1 0 0.6878 0.3122 0.0000 1 0 0.6836 0.3164 0.0000
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.100 1 1 1 200 90 110 40 0 8 0 42 0 0 109 0 1 0.4444 0.0000 0.0091 10.250 0.28 1.07 -0.80 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3275 0.6676 0.0049 1 1 0.3368 0.6582 0.0050 1 1 0.3489 0.6461 0.0050
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 433 103 330 2 0 22 0 79 0 0 329 0 1 0.0194 0.0000 0.0030 3.682 0.50 3.43 -2.93 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8817 0.1183 2 2 0.0000 0.4445 0.5555 2 2 0.0000 0.2779 0.7221
chr10 75043841 TAGA T 0.000651 0.100 1 -3 3 237 82 155 52 0 3 0 27 0 0 155 0 0 0.6341 0.0000 0.0000 26.333 0.19 4.96 -4.77 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8899 0.1101 0.0000 1 0 0.8832 0.1168 0.0000 1 0 0.8737 0.1263 0.0000
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 246 38 208 25 0 0 3 10 0 0 207 0 1 0.6579 0.0000 0.0048 38.000 0.40 2.50 -2.10 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6933 0.2984 0.0083 1 0 0.6865 0.3045 0.0090 1 0 0.6771 0.3130 0.0099
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 775 162 613 95 0 6 0 61 0 0 608 0 5 0.5864 0.0000 0.0082 26.000 0.46 5.64 -5.18 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8561 0.1430 0.0009 1 0 0.8495 0.1493 0.0012 1 0 0.8399 0.1585 0.0015
chr10 89738577 AAAG A 0.001385 0.100 1 -3 4 523 105 418 59 0 9 1 36 0 0 418 0 0 0.5619 0.0000 0.0000 10.556 0.54 4.67 -4.12 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8529 0.1471 0.0000 1 0 0.8464 0.1536 0.0000 1 0 0.8373 0.1627 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 394 114 280 48 0 9 0 57 0 1 275 0 4 0.4211 0.0000 0.0179 11.667 0.46 5.89 -5.44 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0466 0.4994 0.4541 1 1 0.0507 0.4984 0.4509 1 1 0.0566 0.4975 0.4459
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 392 164 228 83 0 2 0 79 0 0 227 0 1 0.5061 0.0000 0.0044 81.000 0.72 2.73 -2.01 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3027 0.6479 0.0494 1 1 0.3120 0.6359 0.0521 1 1 0.3237 0.6207 0.0557
chr10 115171343 CTT C 0.004437 0.100 1 -2 1 244 50 194 29 0 1 0 20 0 0 194 0 0 0.5800 0.0000 0.0000 49.000 0.10 2.00 -1.90 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6561 0.3434 0.0005 1 0 0.6524 0.3471 0.0005 1 0 0.6472 0.3522 0.0006
chr10 118594523 A ATGACCAGCAGAGGGAGCAGGTAGG 0.500000 0.100 1 24 2 686 153 533 128 0 19 0 6 0 0 532 0 1 0.8366 0.0000 0.0019 7.053 0.31 20.00 -19.69 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2573 0.7427 0.0000 0 0 0.8479 0.1521 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 385 111 274 2 3 18 11 77 0 1 270 1 2 0.0180 0.0000 0.0146 4.556 4.00 2.48 1.52 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8943 0.1057 2 2 0.0000 0.3275 0.6725 2 2 0.0000 0.1307 0.8693
chr10 124984991 G GA 0.100418 0.100 1 1 1 195 47 148 32 1 6 0 8 0 0 148 0 0 0.6809 0.0000 0.0000 6.667 0.25 1.50 -1.25 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2471 0.7527 0.0002 0 1 0.0713 0.9287 0.0001 0 1 0.2197 0.7802 0.0000
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.100 1 21 2 772 183 589 165 2 10 0 6 0 0 587 0 2 0.9016 0.0000 0.0034 17.300 1.00 16.17 -15.17 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.8516 0.1484 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000
chr10 127738728 G GGCC 0.003313 0.100 1 3 1 447 122 325 101 2 6 0 13 0 0 325 0 0 0.8279 0.0000 0.0000 19.333 0.76 3.54 -2.78 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0478 0.9522 0.0000 0 0 0.9137 0.0863 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 324 111 213 10 0 2 0 99 0 0 212 0 1 0.0901 0.0000 0.0047 54.500 0.40 1.30 -0.90 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9964 0.0036 2 1 0.0000 0.8257 0.1743
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 652 177 475 80 0 7 2 88 0 0 473 0 2 0.4520 0.0000 0.0042 24.286 0.30 3.01 -2.71 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0549 0.6370 0.3081 1 1 0.0605 0.6295 0.3100 1 1 0.0686 0.6200 0.3114
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.100 1 -12 1 734 162 572 92 1 15 1 53 0 0 569 0 3 0.5679 0.0000 0.0052 9.800 0.82 11.06 -10.24 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9417 0.0583 0.0000 1 0 0.9370 0.0630 0.0001 1 0 0.9301 0.0699 0.0001
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 284 99 185 89 1 1 0 8 0 0 185 0 0 0.8990 0.0000 0.0000 97.000 0.27 2.88 -2.61 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0223 0.9777 0.0000 0 1 0.3710 0.6290 0.0000
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.100 1 -24 1 2292 544 1748 258 5 168 5 108 4 3 1737 2 2 0.4743 0.0023 0.0063 2.241 3.07 11.62 -8.55 12 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1249988 GCCA G 0.076028 0.100 1 -3 2 2062 445 1617 392 3 26 3 21 10 5 1601 0 1 0.8809 0.0062 0.0099 16.038 1.15 3.71 -2.57 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2262 0.7738 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1282 263 1019 103 1 85 0 74 0 0 1018 0 1 0.3916 0.0000 0.0010 2.094 0.74 7.08 -6.34 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7687 0.2284 0.0029 1 0 0.7602 0.2362 0.0036 1 0 0.7479 0.2474 0.0047
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.100 1 -30 1 1240 290 950 63 2 93 5 127 0 0 908 0 42 0.2172 0.0000 0.0442 2.097 1.94 10.57 -8.63 21 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0008 0.9992 1 2 0.0000 0.0011 0.9989 1 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 1162 345 817 48 1 121 3 172 0 0 816 1 0 0.1391 0.0000 0.0012 1.867 0.58 7.85 -7.27 6 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 1 0.0000 0.9634 0.0366 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 2884860 GGGGGCCGGGGCC G 0.024360 0.100 1 -12 1 550 144 406 117 3 19 0 5 1 1 403 0 1 0.8125 0.0025 0.0074 6.474 1.56 9.60 -8.04 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0312 0.9688 0.0000 0 0 0.9672 0.0328 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 401 125 276 0 0 6 0 119 0 0 275 0 1 0.0000 0.0000 0.0036 19.833 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 791 250 541 117 1 3 0 129 1 0 540 0 0 0.4680 0.0018 0.0018 82.333 0.31 1.29 -0.98 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0382 0.6888 0.2730 1 1 0.0426 0.6750 0.2824 1 1 0.0490 0.6573 0.2937
chr11 4450136 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 662 150 512 92 0 1 0 57 0 0 512 0 0 0.6133 0.0000 0.0000 149.000 0.32 1.84 -1.53 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8847 0.1144 0.0009 1 0 0.8762 0.1227 0.0011 1 0 0.8639 0.1346 0.0016
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 277 111 166 5 0 4 0 102 0 0 162 0 4 0.0450 0.0000 0.0241 26.750 0.40 2.15 -1.75 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.5070 0.4930 2 2 0.0000 0.1262 0.8738
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 752 160 592 103 0 3 0 54 0 0 590 0 2 0.6438 0.0000 0.0034 52.333 0.13 4.46 -4.34 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9603 0.0397 0.0001 1 0 0.9553 0.0445 0.0001 1 0 0.9478 0.0520 0.0002
chr11 4860474 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 601 167 434 97 0 2 0 68 0 0 434 0 0 0.5808 0.0000 0.0000 82.500 0.20 1.19 -1.00 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7957 0.2018 0.0025 1 0 0.7870 0.2098 0.0031 1 0 0.7746 0.2213 0.0041
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 537 128 409 69 0 2 1 56 0 0 409 0 0 0.5391 0.0000 0.0000 63.000 0.19 1.29 -1.10 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4501 0.5082 0.0417 1 1 0.4485 0.5060 0.0456 1 1 0.4455 0.5035 0.0511
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 567 146 421 134 0 6 0 6 0 0 421 0 0 0.9178 0.0000 0.0000 23.333 1.15 2.00 -0.85 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.5797 0.4203 0.0000 0 0 0.9345 0.0655 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 673 157 516 10 0 6 0 141 0 0 503 0 13 0.0637 0.0000 0.0252 25.167 0.30 6.09 -5.79 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9504 0.0496 2 2 0.0000 0.2582 0.7418
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 505 135 370 10 0 3 0 122 0 0 370 0 0 0.0741 0.0000 0.0000 44.000 0.20 1.87 -1.67 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9894 0.0106 2 1 0.0000 0.6209 0.3791
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.100 1 2 1 663 186 477 104 0 3 1 78 0 0 477 0 0 0.5591 0.0000 0.0000 61.000 0.23 2.19 -1.96 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7054 0.2897 0.0049 1 0 0.6989 0.2952 0.0059 1 0 0.6892 0.3032 0.0075
chr11 5489310 G GGGCT 0.500000 0.100 1 4 1 761 183 578 170 0 3 0 10 0 0 578 0 0 0.9290 0.0000 0.0000 60.000 1.31 5.20 -3.89 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1037 0.8963 0.0000 0 0 0.8619 0.1381 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 889 167 722 0 0 11 0 156 0 0 700 0 22 0.0000 0.0000 0.0305 14.182 10.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr11 6641514 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 5 692 195 497 152 11 22 0 10 0 0 497 0 0 0.7795 0.0000 0.0000 7.864 0.34 3.40 -3.06 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0755 0.9245 0.0000 0 0 0.8163 0.1837 0.0000
chr11 8921341 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 195 80 115 42 0 0 0 38 0 0 115 0 0 0.5250 0.0000 0.0000 80.000 0.57 2.29 -1.72 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2903 0.5783 0.1314 1 1 0.2916 0.5724 0.1360 1 1 0.2928 0.5650 0.1422
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 332 155 177 65 1 20 2 67 0 0 177 0 0 0.4194 0.0000 0.0000 6.700 0.54 4.00 -3.46 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1277 0.6509 0.2215 1 1 0.1334 0.6401 0.2265 1 1 0.1410 0.6263 0.2327
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 12 1 637 138 499 41 1 56 1 39 0 0 482 0 17 0.2971 0.0000 0.0341 1.519 2.80 8.97 -6.17 23 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0272 0.4047 0.5680 1 2 0.0303 0.4086 0.5611 1 2 0.0347 0.4141 0.5512
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 242 84 158 81 0 2 0 1 0 0 158 0 0 0.9643 0.0000 0.0000 41.000 0.35 3.00 -2.65 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8706 0.1294 0.0000 0 0 0.9517 0.0483 0.0000 0 0 0.9640 0.0360 0.0000
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 203 75 128 40 1 2 0 32 0 0 128 0 0 0.5333 0.0000 0.0000 36.500 0.93 3.41 -2.48 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4271 0.5010 0.0718 1 1 0.4234 0.5003 0.0763 1 1 0.4180 0.4996 0.0824
chr11 20363835 C CGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 384 136 248 69 1 14 1 51 0 0 243 0 5 0.5074 0.0000 0.0202 8.714 0.30 6.14 -5.83 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4682 0.4943 0.0375 1 1 0.4660 0.4928 0.0412 1 1 0.4622 0.4913 0.0465
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.100 1 -12 1 354 100 254 90 0 3 0 7 0 0 254 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 32.333 0.29 12.14 -11.85 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0494 0.9506 0.0000 0 1 0.4687 0.5313 0.0000
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 274 108 166 69 0 1 0 38 0 0 165 0 1 0.6389 0.0000 0.0060 107.000 0.35 6.11 -5.76 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8502 0.1476 0.0022 1 0 0.8400 0.1572 0.0028 1 0 0.8254 0.1709 0.0037
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 901 266 635 107 0 6 0 153 0 0 634 0 1 0.4023 0.0000 0.0016 43.333 0.37 3.26 -2.89 23 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0638 0.9361 1 2 0.0001 0.0690 0.9309 1 2 0.0002 0.0768 0.9230
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 793 174 619 0 0 5 2 167 0 0 613 0 6 0.0000 0.0000 0.0097 33.600 2.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr11 59457656 GC G 0.500000 0.100 1 -1 4 637 159 478 85 0 2 2 70 0 1 477 0 0 0.5346 0.0000 0.0021 78.500 0.80 1.59 -0.79 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4651 0.5057 0.0292 1 1 0.4648 0.5027 0.0325 1 1 0.4632 0.4995 0.0373
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 84 42 42 37 0 0 0 5 0 0 42 0 0 0.8810 0.0000 0.0000 42.000 0.43 2.00 -1.57 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0301 0.9699 0.0000 0 1 0.1957 0.8043 0.0000
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 261 93 168 46 0 15 0 32 0 0 167 0 1 0.4946 0.0000 0.0060 5.200 0.22 3.31 -3.10 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5296 0.4301 0.0402 1 0 0.5227 0.4334 0.0439 1 0 0.5131 0.4378 0.0491
chr11 68312746 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 113 42 71 25 1 6 1 9 0 0 70 0 1 0.5952 0.0000 0.0141 6.000 0.84 5.00 -4.16 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6276 0.3403 0.0321 1 0 0.6153 0.3495 0.0353 1 0 0.5935 0.3669 0.0396
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 1194 208 986 14 0 51 1 142 0 0 906 0 80 0.0673 0.0000 0.0811 3.078 0.14 6.15 -6.01 12 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9773 0.0227 2 2 0.0000 0.1371 0.8629
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1521 336 1185 11 2 180 3 140 1 0 1107 1 76 0.0327 0.0008 0.0658 0.861 2.36 9.34 -6.97 7 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9435 0.0565 2 2 0.0000 0.0949 0.9051
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 1132 325 807 193 1 83 0 48 0 0 789 0 18 0.5938 0.0000 0.0223 2.916 0.17 8.40 -8.22 81 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 855 230 625 14 0 2 0 214 0 0 622 0 3 0.0609 0.0000 0.0048 114.000 0.36 2.24 -1.88 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9831 0.0169 2 2 0.0000 0.1758 0.8242
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 269 114 155 51 0 5 0 58 0 0 152 0 3 0.4474 0.0000 0.0194 21.800 0.39 18.60 -18.21 11 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0568 0.5305 0.4126 1 1 0.0612 0.5273 0.4115 1 1 0.0673 0.5235 0.4092
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 502 142 360 70 0 3 0 69 0 0 357 0 3 0.4930 0.0000 0.0083 46.333 0.36 4.33 -3.98 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1355 0.6631 0.2014 1 1 0.1415 0.6515 0.2071 1 1 0.1492 0.6367 0.2141
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1462 425 1037 0 1 95 13 316 0 0 1034 1 2 0.0000 0.0000 0.0029 3.463 7.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 864 269 595 0 0 42 5 222 0 0 592 1 2 0.0000 0.0000 0.0050 5.381 9.71 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 311 122 189 111 0 4 0 7 0 0 188 0 1 0.9098 0.0000 0.0053 29.500 0.45 9.00 -8.55 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0487 0.9513 0.0000 0 0 0.5628 0.4372 0.0000
chr11 124249871 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 504 125 379 70 1 3 0 51 0 0 379 0 0 0.5600 0.0000 0.0000 40.667 0.19 1.16 -0.97 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6578 0.3297 0.0125 1 0 0.6496 0.3360 0.0144 1 0 0.6380 0.3448 0.0173
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 414 128 286 14 0 10 1 103 0 0 286 0 0 0.1094 0.0000 0.0000 11.700 0.36 5.95 -5.59 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9810 0.0190
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 424 126 298 41 0 17 5 63 0 1 296 0 1 0.3254 0.0000 0.0067 6.294 0.54 3.70 -3.16 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0042 0.1984 0.7974 1 2 0.0051 0.2080 0.7869 1 2 0.0065 0.2215 0.7720
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 61 29 32 3 0 1 0 25 0 0 32 0 0 0.1034 0.0000 0.0000 28.000 0.00 2.36 -2.36 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9947 0.0053 2 1 0.0000 0.8741 0.1259 2 1 0.0000 0.6705 0.3295
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 355 140 215 67 0 2 0 71 0 0 213 0 2 0.4786 0.0000 0.0093 69.000 1.12 1.97 -0.85 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0679 0.6038 0.3283 1 1 0.0722 0.5949 0.3329 1 1 0.0779 0.5838 0.3383
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 562 172 390 63 5 33 0 71 0 0 388 0 2 0.3663 0.0000 0.0051 4.212 0.27 3.03 -2.76 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1136 0.6541 0.2323 1 1 0.1200 0.6436 0.2364 1 1 0.1287 0.6302 0.2411
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.100 1 1 1 680 165 515 151 0 5 0 9 0 0 515 0 0 0.9152 0.0000 0.0000 32.000 0.24 2.44 -2.21 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4665 0.5335 0.0000 0 0 0.9690 0.0310 0.0000
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.100 1 -1 1 685 166 519 155 0 2 0 9 0 0 519 0 0 0.9337 0.0000 0.0000 82.000 0.23 2.44 -2.21 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5127 0.4873 0.0000 0 0 0.9742 0.0258 0.0000
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 438 133 305 1 0 22 13 97 0 0 302 0 3 0.0075 0.0000 0.0098 5.045 0.00 3.44 -3.44 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0227 0.9773 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0063 0.9937
chr12 6667903 TTGCTGCTGCTGC T 0.003876 0.100 1 -12 1 438 142 296 109 2 25 0 6 0 0 296 0 0 0.7676 0.0000 0.0000 4.680 3.08 9.67 -6.58 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1103 0.8897 0.0000 0 0 0.9914 0.0086 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr12 6936725 GCAA G 0.000848 0.100 1 -3 1 928 259 669 42 113 10 27 67 0 0 668 0 1 0.1622 0.0000 0.0015 26.889 0.50 4.22 -3.72 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9805 0.0195 0.0000 1 0 0.9783 0.0217 0.0000 1 0 0.9749 0.0251 0.0000
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 1455 378 1077 203 0 4 2 169 0 1 1070 0 6 0.5370 0.0000 0.0065 93.500 1.22 4.18 -2.97 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4160 0.5798 0.0042 1 1 0.4248 0.5699 0.0053 1 1 0.4343 0.5586 0.0071
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 271 113 158 69 0 3 0 41 0 0 155 0 3 0.6106 0.0000 0.0190 36.667 0.25 4.51 -4.27 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7685 0.2260 0.0055 1 0 0.7581 0.2353 0.0066 1 0 0.7434 0.2483 0.0083
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.100 1 -9 1 757 214 543 119 1 29 0 65 0 0 534 0 9 0.5561 0.0000 0.0166 6.379 0.38 8.49 -8.11 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9726 0.0274 0.0000 1 0 0.9697 0.0303 0.0000 1 0 0.9652 0.0348 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 335 165 170 71 1 11 2 80 0 0 170 0 0 0.4303 0.0000 0.0000 14.000 0.46 4.10 -3.64 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0292 0.5218 0.4490 1 1 0.0317 0.5159 0.4524 1 1 0.0354 0.5088 0.4558
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.100 1 -2 1 536 129 407 122 0 0 0 7 0 0 407 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 129.000 0.42 1.57 -1.15 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.5977 0.4023 0.0000 0 0 0.9601 0.0399 0.0000
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 462 98 364 46 0 0 0 52 0 0 362 0 2 0.4694 0.0000 0.0055 98.000 0.35 3.46 -3.11 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0982 0.5870 0.3149 1 1 0.1041 0.5818 0.3141 1 1 0.1123 0.5752 0.3125
chr12 40406131 C CGTCAGGATG 0.058262 0.100 1 9 2 157 80 77 68 1 7 0 4 0 0 76 0 1 0.8500 0.0000 0.0130 10.429 0.19 9.25 -9.06 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 0 0.7120 0.2880 0.0000 0 0 0.9489 0.0511 0.0000
chr12 40449704 CT C 0.008989 0.100 1 -1 1 132 66 66 60 0 1 0 5 0 0 66 0 0 0.9091 0.0000 0.0000 65.000 0.62 1.40 -0.78 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0345 0.9655 0.0000 0 0 0.9152 0.0848 0.0000 0 0 0.9879 0.0121 0.0000
chr12 40482547 CCAT C 0.001528 0.100 1 -3 1 989 194 795 104 0 6 0 84 0 0 794 0 1 0.5361 0.0000 0.0013 31.333 0.21 3.33 -3.12 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7221 0.2779 0.0000 1 0 0.7215 0.2784 0.0000 1 0 0.7200 0.2800 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 946 177 769 104 4 66 0 3 6 0 759 1 3 0.5876 0.0078 0.0130 1.682 1.14 5.00 -3.86 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1699 0.8301 0.0000 0 0 0.7434 0.2566 0.0000
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 585 136 449 76 0 2 0 58 1 0 448 0 0 0.5588 0.0022 0.0022 67.000 0.16 1.14 -0.98 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7253 0.2703 0.0044 1 0 0.7203 0.2746 0.0051 1 0 0.7130 0.2809 0.0061
chr12 52073890 TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC T 0.050697 0.100 1 -23 2 371 106 265 49 1 23 0 33 0 0 263 0 2 0.4623 0.0000 0.0075 3.609 0.27 15.27 -15.01 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7307 0.2672 0.0020 1 0 0.7255 0.2722 0.0023 1 0 0.7182 0.2792 0.0026
chr12 52317956 ACTT A 0.001740 0.100 1 -3 1 439 97 342 58 0 3 1 35 0 0 342 0 0 0.5979 0.0000 0.0000 31.333 0.43 2.97 -2.54 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8479 0.1521 0.0000 1 0 0.8414 0.1586 0.0000 1 0 0.8322 0.1677 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 1144 281 863 137 0 24 0 120 1 0 862 0 0 0.4875 0.0012 0.0012 10.708 0.54 12.02 -11.48 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4700 0.5187 0.0113 1 1 0.4758 0.5111 0.0132 1 1 0.4817 0.5024 0.0160
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.100 1 21 2 526 128 398 56 1 27 0 44 1 0 377 0 20 0.4375 0.0025 0.0528 3.741 0.04 10.82 -10.78 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2181 0.7506 0.0313 1 1 0.2298 0.7387 0.0315 1 1 0.2454 0.7230 0.0316
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1230 318 912 140 1 68 1 108 0 0 907 0 5 0.4403 0.0000 0.0055 3.676 0.26 13.39 -13.12 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7982 0.2016 0.0002 1 0 0.7968 0.2030 0.0002 1 0 0.7939 0.2058 0.0003
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 418 98 320 61 0 7 0 30 0 0 320 0 0 0.6224 0.0000 0.0000 13.000 0.28 1.47 -1.19 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9051 0.0940 0.0008 1 0 0.8974 0.1015 0.0011 1 0 0.8862 0.1123 0.0014
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 398 98 300 54 0 0 0 44 0 0 298 0 2 0.5510 0.0000 0.0067 98.000 0.30 1.70 -1.41 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4194 0.5219 0.0587 1 1 0.4193 0.5183 0.0624 1 1 0.4184 0.5140 0.0675
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 472 85 387 51 10 10 5 9 0 0 387 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 7.100 1.16 2.78 -1.62 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0355 0.9645 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 574 114 460 71 0 0 0 43 0 0 455 0 5 0.6228 0.0000 0.0109 114.000 0.15 4.09 -3.94 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8442 0.1557 0.0001 1 0 0.8384 0.1616 0.0001 1 0 0.8300 0.1699 0.0001
chr12 55743400 C CGCGGCGGCGGCG 0.000220 0.100 1 12 4 441 105 336 46 0 12 1 46 0 0 329 0 7 0.4381 0.0000 0.0208 7.750 0.61 9.91 -9.30 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2169 0.7828 0.0002 1 1 0.2287 0.7711 0.0002 1 1 0.2444 0.7554 0.0002
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 405 106 299 52 0 6 0 48 0 0 296 0 3 0.4906 0.0000 0.0100 16.667 1.04 3.69 -2.65 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2451 0.6181 0.1368 1 1 0.2501 0.6093 0.1406 1 1 0.2563 0.5982 0.1456
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1081 314 767 0 1 23 8 282 0 0 764 0 3 0.0000 0.0000 0.0039 12.609 5.87 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 153 72 81 57 2 7 1 5 0 0 81 0 0 0.7917 0.0000 0.0000 9.286 0.14 1.00 -0.86 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1096 0.8904 0.0000 0 0 0.5265 0.4735 0.0000
chr12 92424891 AT A 0.000308 0.100 1 -1 1 509 177 332 100 0 1 0 76 0 0 332 0 0 0.5650 0.0000 0.0000 176.000 0.31 1.34 -1.03 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8198 0.1802 0.0000 1 0 0.8159 0.1841 0.0000 1 0 0.8100 0.1900 0.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 506 144 362 9 3 26 2 104 0 0 358 0 4 0.0625 0.0000 0.0110 4.538 0.33 3.55 -3.21 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9131 0.0869
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 349 98 251 80 0 11 0 7 0 0 251 0 0 0.8163 0.0000 0.0000 7.909 0.30 2.71 -2.41 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0306 0.9694 0.0000 0 1 0.3519 0.6481 0.0000
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 475 122 353 70 2 9 1 40 0 0 353 0 0 0.5738 0.0000 0.0000 12.556 1.87 4.38 -2.50 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8585 0.1396 0.0019 1 0 0.8487 0.1490 0.0024 1 0 0.8344 0.1624 0.0032
chr12 107775724 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 474 187 287 169 0 8 0 10 0 0 287 0 0 0.9037 0.0000 0.0000 22.375 0.31 1.60 -1.29 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1031 0.8969 0.0000 0 0 0.8577 0.1423 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 594 140 454 14 0 4 0 122 0 0 444 0 10 0.1000 0.0000 0.0220 34.000 0.21 8.84 -8.63 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9296 0.0704
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 683 208 475 0 2 21 17 168 0 0 473 1 1 0.0000 0.0000 0.0042 8.714 3.60 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 159 82 77 0 0 0 0 82 0 0 77 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 82.000 2.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0184 0.9816
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 238 110 128 93 1 7 1 8 0 0 128 0 0 0.8455 0.0000 0.0000 14.714 0.26 6.38 -6.12 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0078 0.9922 0.0000 0 1 0.2317 0.7683 0.0000
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 459 109 350 34 24 24 10 17 0 0 348 0 2 0.3119 0.0000 0.0057 3.042 1.24 5.18 -3.94 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8589 0.1385 0.0025 1 0 0.8482 0.1486 0.0031 1 0 0.8329 0.1630 0.0041
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 411 145 266 0 0 13 0 132 0 0 263 0 3 0.0000 0.0000 0.0113 10.154 5.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 362 85 277 5 0 10 2 68 0 0 262 0 15 0.0588 0.0000 0.0542 7.500 2.00 12.59 -10.59 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.7462 0.2538 2 2 0.0000 0.2859 0.7141
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 449 127 322 60 0 15 1 51 0 0 322 0 0 0.4724 0.0000 0.0000 7.467 1.00 2.35 -1.35 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3653 0.5623 0.0724 1 1 0.3656 0.5572 0.0772 1 1 0.3654 0.5508 0.0838
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 777 203 574 83 1 17 0 102 0 0 568 0 6 0.4089 0.0000 0.0105 10.882 0.18 8.22 -8.03 45 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0056 0.3156 0.6788 1 2 0.0067 0.3199 0.6734 1 2 0.0084 0.3265 0.6651
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 278 106 172 69 6 28 0 3 0 0 172 0 0 0.6509 0.0000 0.0000 2.786 0.38 3.00 -2.62 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0554 0.9446 0.0000 0 0 0.6356 0.3644 0.0000 0 0 0.8478 0.1522 0.0000
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 219 66 153 52 4 8 0 2 1 1 151 0 0 0.7879 0.0065 0.0131 7.250 0.81 4.50 -3.69 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1844 0.8156 0.0000 0 0 0.6829 0.3171 0.0000 0 0 0.8221 0.1779 0.0000
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 240 79 161 0 0 6 1 72 0 0 149 1 11 0.0000 0.0000 0.0745 12.000 8.43 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0130 0.9870 2 2 0.0000 0.0142 0.9858 2 2 0.0000 0.0160 0.9840
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 731 188 543 14 7 59 6 102 0 0 539 0 4 0.0745 0.0000 0.0074 2.169 1.71 3.34 -1.63 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9971 0.0029
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 708 187 521 56 5 72 0 54 0 0 521 0 0 0.2995 0.0000 0.0000 1.614 3.04 3.52 -0.48 16 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3143 0.5942 0.0915 1 1 0.3164 0.5870 0.0966 1 1 0.3184 0.5780 0.1035
chr13 44574729 TCCA T 0.014416 0.100 1 -3 1 858 182 676 156 3 14 0 9 0 0 676 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 12.000 0.29 2.67 -2.37 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.9297 0.0703 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 589 208 381 173 0 12 0 23 0 0 380 1 0 0.8317 0.0000 0.0026 16.333 0.32 13.74 -13.42 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000
chr13 48095042 GCTCCTT G 0.000003 0.100 1 -6 2 276 143 133 94 1 10 0 38 0 0 128 0 5 0.6573 0.0000 0.0376 13.300 0.28 6.08 -5.80 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9888 0.0112 0.0000 1 0 0.9870 0.0130 0.0000 1 0 0.9842 0.0158 0.0000
chr13 49496005 GCCCAGGCGTCGCCGCCCCGGC G 0.000260 0.100 1 -21 2 132 59 73 51 1 0 0 7 0 0 73 0 0 0.8644 0.0000 0.0000 59.000 1.43 21.29 -19.85 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0094 0.9906 0.0000 0 0 0.9677 0.0323 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 741 178 563 61 1 40 1 75 3 0 554 0 6 0.3427 0.0053 0.0160 3.450 3.89 6.21 -2.33 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0560 0.7188 0.2253 1 1 0.0629 0.7155 0.2217 1 1 0.0730 0.7108 0.2162
chr13 71866566 G GGCC 0.000641 0.100 1 3 1 722 186 536 101 2 28 0 55 1 0 528 1 6 0.5430 0.0019 0.0149 5.643 3.86 4.82 -0.96 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9660 0.0340 0.0000 1 0 0.9626 0.0374 0.0000 1 0 0.9575 0.0425 0.0000
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 155 78 77 38 0 2 0 38 0 0 77 0 0 0.4872 0.0000 0.0000 38.000 0.66 3.95 -3.29 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3988 0.5921 0.0091 1 1 0.4055 0.5853 0.0092 1 1 0.4139 0.5767 0.0094
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 607 93 514 0 0 3 0 90 0 0 509 2 3 0.0000 0.0000 0.0097 30.000 4.68 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 502 88 414 6 2 33 4 43 0 1 407 1 5 0.0682 0.0000 0.0169 1.636 1.00 4.58 -3.58 0 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9896 0.0104 2 1 0.0000 0.8747 0.1253
chr13 112067748 CGGCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 2 448 129 319 113 1 5 1 9 0 0 319 0 0 0.8760 0.0000 0.0000 24.800 1.44 6.56 -5.11 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0086 0.9914 0.0000 0 1 0.3109 0.6891 0.0000
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 320 120 200 12 0 39 0 69 0 0 196 0 4 0.1000 0.0000 0.0200 2.077 1.17 9.36 -8.20 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9850 0.0150
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 575 126 449 58 0 5 1 62 0 0 449 0 0 0.4603 0.0000 0.0000 24.200 0.78 3.34 -2.56 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1038 0.6167 0.2795 1 1 0.1091 0.6081 0.2828 1 1 0.1163 0.5972 0.2866
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 524 127 397 115 1 1 0 10 0 0 396 0 1 0.9055 0.0000 0.0025 126.000 1.08 1.90 -0.82 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.0809 0.9191 0.0000
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 549 158 391 102 0 0 0 56 0 0 379 0 12 0.6456 0.0000 0.0307 158.000 0.35 19.61 -19.25 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8779 0.1213 0.0008 1 0 0.8704 0.1286 0.0010 1 0 0.8593 0.1393 0.0014
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 412 97 315 46 0 6 0 45 0 0 312 0 3 0.4742 0.0000 0.0095 15.167 0.43 1.44 -1.01 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0915 0.5904 0.3181 1 1 0.0943 0.5830 0.3227 1 1 0.0979 0.5736 0.3284
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.100 1 -6 1 732 175 557 143 0 18 0 14 0 0 557 0 0 0.8171 0.0000 0.0000 8.722 0.62 6.93 -6.31 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.3411 0.6589 0.0000
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.100 1 2 3 667 160 507 140 4 6 0 10 0 0 507 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 25.667 0.71 3.60 -2.89 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0968 0.9032 0.0000 0 0 0.8571 0.1429 0.0000
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 582 158 424 138 1 8 0 11 0 0 424 0 0 0.8734 0.0000 0.0000 18.750 0.25 2.82 -2.56 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.3644 0.6356 0.0000
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 455 119 336 14 0 4 1 100 1 0 335 0 0 0.1176 0.0030 0.0030 28.750 0.00 5.47 -5.47 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9966 0.0034
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 725 206 519 113 4 14 0 75 0 0 519 0 0 0.5485 0.0000 0.0000 13.714 0.65 3.39 -2.74 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9580 0.0420 0.0000 1 0 0.9543 0.0457 0.0000 1 0 0.9487 0.0513 0.0000
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 435 124 311 20 5 90 1 8 0 0 311 0 0 0.1613 0.0000 0.0000 0.341 0.50 3.75 -3.25 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5540 0.4000 0.0460 1 0 0.5234 0.4275 0.0491 1 1 0.4359 0.5163 0.0478
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 433 126 307 22 2 4 90 8 0 0 305 2 0 0.1746 0.0000 0.0065 8.750 0.50 3.75 -3.25 6 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0172 0.9828 1 2 0.0000 0.3807 0.6192 2 1 0.0000 0.9821 0.0179
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 366 66 300 0 0 5 1 60 0 0 299 0 1 0.0000 0.0000 0.0033 12.200 3.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0657 0.9343 2 2 0.0000 0.0698 0.9302 2 2 0.0000 0.0757 0.9243
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 452 133 319 55 3 21 0 54 0 0 317 0 2 0.4135 0.0000 0.0063 5.333 0.24 3.13 -2.89 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3100 0.6117 0.0783 1 1 0.3162 0.6027 0.0811 1 1 0.3239 0.5913 0.0848
chr14 24409748 A ACAGTTTCCAAAGCACCTG 0.001352 0.100 1 18 1 784 184 600 85 0 31 0 68 0 0 581 0 19 0.4620 0.0000 0.0317 4.935 0.38 10.43 -10.05 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2604 0.7391 0.0005 1 1 0.2744 0.7250 0.0005 1 1 0.2927 0.7067 0.0006
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 705 152 553 0 0 28 2 122 0 0 534 1 18 0.0000 0.0000 0.0344 4.769 7.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr14 60125677 C CTAT 0.004717 0.100 1 3 1 271 89 182 53 0 1 0 35 0 0 181 0 1 0.5955 0.0000 0.0055 88.000 0.36 3.09 -2.73 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7761 0.2237 0.0001 1 0 0.7705 0.2294 0.0001 1 0 0.7626 0.2373 0.0002
chr14 67198163 TGAA T 0.018726 0.100 1 -3 2 194 73 121 45 1 0 0 27 0 0 118 0 3 0.6164 0.0000 0.0248 73.000 0.13 2.85 -2.72 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7665 0.2329 0.0006 1 0 0.7605 0.2388 0.0007 1 0 0.7521 0.2471 0.0008
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 751 196 555 91 1 33 0 71 2 0 549 1 3 0.4643 0.0036 0.0108 4.939 1.33 6.77 -5.44 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3539 0.6151 0.0310 1 1 0.3493 0.6151 0.0356 1 1 0.3422 0.6153 0.0425
chr14 73593807 T TTCAA 0.190314 0.100 1 4 1 175 66 109 64 0 0 0 2 0 0 109 0 0 0.9697 0.0000 0.0000 66.000 0.16 9.00 -8.84 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5658 0.4342 0.0000 0 0 0.9252 0.0748 0.0000 0 0 0.9634 0.0366 0.0000
chr14 73593809 GCTTA G 0.190462 0.100 1 -4 1 175 68 107 65 0 1 0 2 0 0 107 0 0 0.9559 0.0000 0.0000 67.000 0.15 9.00 -8.85 31 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5781 0.4219 0.0000 0 0 0.9285 0.0715 0.0000 0 0 0.9650 0.0350 0.0000
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 535 120 415 0 2 16 1 101 0 1 411 0 3 0.0000 0.0000 0.0096 6.438 5.82 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0811 0.9189 2 2 0.0000 0.0330 0.9670 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 533 121 412 9 41 10 14 47 1 3 405 2 1 0.0744 0.0024 0.0170 25.250 0.22 4.62 -4.39 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0310 0.4304 0.5386 1 2 0.0345 0.4342 0.5313 1 2 0.0396 0.4394 0.5210
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 524 171 353 17 0 20 2 132 0 0 353 0 0 0.0994 0.0000 0.0000 7.550 0.29 3.20 -2.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9780 0.0220
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 225 87 138 76 0 4 0 7 0 0 138 0 0 0.8736 0.0000 0.0000 20.750 0.46 9.00 -8.54 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0412 0.9588 0.0000 0 1 0.4268 0.5732 0.0000
chr14 98717267 AG A 0.000615 0.100 1 -1 1 247 68 179 36 0 1 0 31 0 0 179 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 67.000 0.08 1.10 -1.01 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5414 0.4584 0.0001 1 0 0.5428 0.4570 0.0001 1 0 0.5443 0.4555 0.0001
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 334 98 236 48 0 13 0 37 0 0 232 0 4 0.4898 0.0000 0.0169 6.538 0.38 9.16 -8.79 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3903 0.5346 0.0752 1 1 0.3899 0.5308 0.0793 1 1 0.3890 0.5262 0.0849
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.100 1 -12 2 561 111 450 3 1 16 0 91 0 0 444 0 6 0.0270 0.0000 0.0133 5.938 0.00 11.22 -11.22 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9941 0.0059 2 1 0.0000 0.7277 0.2723 2 2 0.0000 0.3772 0.6228
chr14 104886547 CGCAGGA C 0.081150 0.100 1 -6 1 483 98 385 56 0 4 1 37 0 0 384 0 1 0.5714 0.0000 0.0026 23.500 0.38 5.81 -5.44 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7550 0.2427 0.0023 1 0 0.7492 0.2482 0.0026 1 0 0.7411 0.2559 0.0030
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 484 141 343 63 1 23 0 54 1 0 340 0 2 0.4468 0.0029 0.0087 5.087 0.60 3.63 -3.03 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4755 0.4935 0.0310 1 1 0.4770 0.4897 0.0333 1 1 0.4784 0.4852 0.0364
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 329 94 235 72 1 10 2 9 0 0 235 0 0 0.7660 0.0000 0.0000 8.300 1.28 4.44 -3.17 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.0999 0.9001 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 312 98 214 1 0 5 2 90 0 0 210 1 3 0.0102 0.0000 0.0187 18.600 0.00 5.03 -5.03 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 632 167 465 0 0 6 0 161 0 2 441 8 14 0.0000 0.0000 0.0516 26.833 2.57 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441081 G GTCTCCTCCTCTTCCCGCATCT 0.154509 0.100 1 21 1 290 45 245 15 0 15 1 14 1 0 243 1 0 0.3333 0.0041 0.0082 2.000 1.20 4.64 -3.44 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3954 0.5352 0.0694 1 1 0.3977 0.5324 0.0699 1 1 0.4005 0.5289 0.0705
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 267 75 192 67 0 2 0 6 0 0 192 0 0 0.8933 0.0000 0.0000 36.500 0.49 1.83 -1.34 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0738 0.9262 0.0000 0 1 0.4782 0.5218 0.0000
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 254 93 161 26 4 3 13 47 0 1 158 1 1 0.2796 0.0000 0.0186 26.333 1.69 1.94 -0.24 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0053 0.2128 0.7820 1 2 0.0065 0.2261 0.7674 1 2 0.0085 0.2448 0.7467
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 254 93 161 26 6 49 3 9 1 0 158 1 1 0.2796 0.0062 0.0186 0.894 1.69 2.00 -0.31 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6994 0.2840 0.0166 1 0 0.6758 0.3052 0.0190 1 0 0.5784 0.4013 0.0203
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 739 196 543 0 0 43 5 148 0 0 536 1 6 0.0000 0.0000 0.0129 3.558 4.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr15 32446553 TCTC T 0.007746 0.100 1 -3 2 209 120 89 87 0 5 0 28 0 0 89 0 0 0.7250 0.0000 0.0000 23.000 0.28 2.79 -2.51 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9949 0.0051 0.0000 1 0 0.9895 0.0105 0.0000 0 1 0.4333 0.5667 0.0000
chr15 34927077 ACTT A 0.000123 0.100 1 -3 1 130 56 74 33 0 1 1 21 0 0 74 0 0 0.5893 0.0000 0.0000 55.000 0.12 2.81 -2.69 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6977 0.3023 0.0000 1 0 0.6929 0.3071 0.0000 1 0 0.6864 0.3136 0.0000
chr15 40281980 T TGGCCGCGGG 0.001310 0.100 1 9 1 556 84 472 44 1 13 0 26 1 0 468 1 2 0.5238 0.0021 0.0085 5.462 1.30 7.38 -6.09 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7889 0.2111 0.0000 1 0 0.7826 0.2174 0.0000 1 0 0.7738 0.2262 0.0000
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 510 156 354 146 0 7 0 3 0 0 354 0 0 0.9359 0.0000 0.0000 21.286 0.23 5.33 -5.10 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7950 0.2050 0.0000 0 0 0.9908 0.0092 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr15 43525606 AGGT A 0.006433 0.100 1 -3 2 717 185 532 167 2 9 0 7 1 0 531 0 0 0.9027 0.0019 0.0019 19.556 0.20 2.71 -2.51 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1360 0.8640 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.100 1 4 1 220 87 133 48 0 2 0 37 0 0 129 0 4 0.5517 0.0000 0.0301 42.500 0.50 4.24 -3.74 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5295 0.4556 0.0149 1 0 0.5306 0.4536 0.0158 1 0 0.5315 0.4516 0.0169
chr15 65133406 G GCGC 0.007439 0.100 1 3 2 516 109 407 102 2 2 0 3 0 0 407 0 0 0.9358 0.0000 0.0000 53.000 0.72 5.67 -4.95 40 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9713 0.0287 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 175 90 85 40 1 0 0 49 0 0 85 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 90.000 0.05 3.24 -3.19 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0839 0.5475 0.3687 1 1 0.0888 0.5439 0.3672 1 1 0.0957 0.5395 0.3648
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 294 152 142 84 0 2 0 66 0 0 142 0 0 0.5526 0.0000 0.0000 75.000 0.19 4.05 -3.85 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5282 0.4504 0.0214 1 0 0.5234 0.4523 0.0243 1 0 0.5160 0.4553 0.0287
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 529 152 377 73 0 17 1 61 0 0 376 0 1 0.4803 0.0000 0.0027 7.941 0.64 3.56 -2.91 41 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3381 0.5951 0.0668 1 1 0.3387 0.5890 0.0722 1 1 0.3387 0.5814 0.0799
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 719 137 582 21 0 9 2 105 0 0 577 2 3 0.1533 0.0000 0.0086 14.222 1.52 5.67 -4.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr15 83982688 CAGCGAAGCCAAT C 0.000878 0.100 1 -12 1 764 166 598 100 3 4 0 59 0 0 592 0 6 0.6024 0.0000 0.0100 40.500 0.25 10.81 -10.56 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9498 0.0502 0.0000 1 0 0.9457 0.0543 0.0000 1 0 0.9396 0.0604 0.0000
chr15 88472272 CAG C 0.005890 0.100 1 -2 3 178 80 98 44 0 0 0 36 0 0 97 0 1 0.5500 0.0000 0.0102 80.000 0.11 3.44 -3.33 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5717 0.4275 0.0008 1 0 0.5724 0.4267 0.0009 1 0 0.5730 0.4260 0.0010
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 739 197 542 81 11 37 4 64 0 0 542 0 0 0.4112 0.0000 0.0000 4.324 0.35 3.23 -2.89 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8156 0.1836 0.0008 1 0 0.8105 0.1886 0.0009 1 0 0.8030 0.1958 0.0012
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 935 226 709 19 14 146 10 37 0 1 704 1 3 0.0841 0.0000 0.0071 1.273 1.47 7.16 -5.69 1 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0205 0.9794 1 2 0.0001 0.0261 0.9739 1 2 0.0001 0.3358 0.6642
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 922 218 704 1 1 15 3 198 0 1 702 0 1 0.0046 0.0000 0.0028 14.357 1.00 8.26 -7.26 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr15 92472964 AC A 0.000463 0.100 1 -1 1 332 131 201 68 0 2 0 61 0 0 200 1 0 0.5191 0.0000 0.0050 64.500 0.40 2.10 -1.70 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4946 0.5053 0.0001 1 0 0.5007 0.4992 0.0001 1 0 0.5080 0.4919 0.0001
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 380 109 271 0 0 8 0 101 0 0 264 0 7 0.0000 0.0000 0.0258 12.625 7.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.100 1 -3 2 637 230 407 167 6 34 10 13 0 1 406 0 0 0.7261 0.0000 0.0025 5.765 1.32 3.00 -1.68 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0155 0.9845 0.0000
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 637 234 403 182 1 42 0 9 1 0 402 0 0 0.7778 0.0025 0.0025 4.548 1.38 7.00 -5.62 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.5990 0.4010 0.0000 0 0 0.9810 0.0190 0.0000
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 286 97 189 35 0 34 0 28 2 1 181 0 5 0.3608 0.0106 0.0423 1.853 1.66 10.25 -8.59 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5230 0.4710 0.0059 1 0 0.5248 0.4690 0.0062 1 0 0.5267 0.4667 0.0065
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 52 24 28 8 0 0 0 16 0 0 28 0 0 0.3333 0.0000 0.0000 24.000 1.12 1.44 -0.31 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1916 0.5883 0.2200 1 1 0.1987 0.5867 0.2146 1 1 0.2079 0.5851 0.2071
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 314 111 203 69 1 1 0 40 0 0 202 0 1 0.6216 0.0000 0.0049 109.000 0.49 16.07 -15.58 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9016 0.0981 0.0003 1 0 0.8952 0.1044 0.0004 1 0 0.8861 0.1135 0.0005
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 1080 230 850 127 1 4 0 98 0 0 850 0 0 0.5522 0.0000 0.0000 56.500 0.81 1.86 -1.05 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8352 0.1642 0.0006 1 0 0.8308 0.1685 0.0007 1 0 0.8241 0.1750 0.0010
chr16 1999881 G GTCC 0.177864 0.100 1 3 2 590 101 489 43 1 6 1 50 0 0 488 0 1 0.4257 0.0000 0.0020 15.833 0.35 4.38 -4.03 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1580 0.6766 0.1654 1 1 0.1668 0.6688 0.1643 1 1 0.1788 0.6586 0.1626
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 359 96 263 0 0 3 1 92 0 0 262 1 0 0.0000 0.0000 0.0038 31.000 6.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 359 96 263 0 0 3 1 92 0 0 262 1 0 0.0000 0.0000 0.0038 31.000 6.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.100 1 -3 2 279 101 178 63 0 3 0 35 0 0 177 0 1 0.6238 0.0000 0.0056 32.667 0.19 3.14 -2.95 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8959 0.1039 0.0002 1 0 0.8895 0.1103 0.0002 1 0 0.8803 0.1194 0.0002
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 471 124 347 59 0 4 0 61 0 0 345 0 2 0.4758 0.0000 0.0058 30.000 0.32 3.20 -2.87 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0871 0.6083 0.3046 1 1 0.0912 0.5994 0.3094 1 1 0.0967 0.5883 0.3150
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 450 136 314 44 4 50 8 30 1 0 308 1 4 0.3235 0.0032 0.0191 1.720 1.66 6.80 -5.14 26 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4766 0.4940 0.0295 1 1 0.4784 0.4906 0.0310 1 1 0.4804 0.4866 0.0331
chr16 11915673 C CCCGCCG 0.014470 0.100 1 6 1 450 136 314 46 2 55 0 33 1 0 308 0 5 0.3382 0.0032 0.0191 1.473 1.74 7.82 -6.08 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6512 0.3477 0.0011 1 0 0.6491 0.3497 0.0012 1 0 0.6458 0.3528 0.0014
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 309 120 189 48 1 46 0 25 0 0 187 0 2 0.4000 0.0000 0.0106 1.609 0.21 4.08 -3.87 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8475 0.1515 0.0009 1 0 0.8401 0.1588 0.0011 1 0 0.8295 0.1691 0.0013
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 178 72 106 38 0 1 0 33 0 0 104 0 2 0.5278 0.0000 0.0189 71.000 0.13 2.03 -1.90 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0021 0.6576 0.3403 1 1 0.0021 0.6489 0.3490 1 1 0.0021 0.6376 0.3602
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.100 1 -12 1 713 246 467 127 1 10 1 107 0 0 467 0 0 0.5163 0.0000 0.0000 23.600 0.28 9.65 -9.37 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6499 0.3474 0.0027 1 0 0.6521 0.3448 0.0032 1 0 0.6537 0.3424 0.0039
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.100 1 -27 1 1188 281 907 194 7 66 0 14 2 0 905 0 0 0.6904 0.0022 0.0022 3.227 0.91 9.86 -8.94 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0177 0.9823 0.0000 0 0 0.8336 0.1664 0.0000
chr16 29810102 G GGCGGCA 0.001131 0.100 1 6 1 531 229 302 106 0 26 0 97 0 0 294 1 7 0.4629 0.0000 0.0265 7.808 0.28 5.75 -5.47 38 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2820 0.7178 0.0003 1 1 0.2973 0.7024 0.0003 1 1 0.3171 0.6826 0.0003
chr16 30036282 CAAAAT C 0.001568 0.100 1 -5 6 348 119 229 69 2 5 0 43 0 0 228 0 1 0.5798 0.0000 0.0044 22.800 0.25 4.47 -4.22 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8919 0.1081 0.0000 1 0 0.8859 0.1141 0.0000 1 0 0.8773 0.1227 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 169 87 82 46 1 2 2 36 0 0 82 0 0 0.5287 0.0000 0.0000 42.500 0.26 2.06 -1.79 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4242 0.5090 0.0668 1 1 0.4212 0.5076 0.0712 1 1 0.4166 0.5060 0.0774
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 414 77 337 34 10 10 4 19 0 0 337 0 0 0.4416 0.0000 0.0000 6.400 0.79 2.37 -1.57 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7152 0.2710 0.0139 1 0 0.7032 0.2809 0.0159 1 0 0.6866 0.2945 0.0190
chr16 67195890 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 637 258 379 172 17 61 0 8 0 1 376 0 2 0.6667 0.0000 0.0079 3.230 0.26 3.75 -3.49 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2377 0.7623 0.0000 0 0 0.9422 0.0578 0.0000
chr16 67652328 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 641 168 473 81 0 2 1 84 0 0 473 0 0 0.4821 0.0000 0.0000 83.000 0.41 3.29 -2.88 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1008 0.6765 0.2227 1 1 0.1069 0.6641 0.2290 1 1 0.1151 0.6482 0.2367
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 950 259 691 104 2 35 5 113 0 0 690 0 1 0.4015 0.0000 0.0014 6.371 0.92 3.32 -2.40 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0286 0.6107 0.3607 1 1 0.0321 0.6007 0.3672 1 1 0.0373 0.5883 0.3744
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 303 128 175 66 0 18 0 44 0 0 173 0 2 0.5156 0.0000 0.0114 6.111 0.50 5.57 -5.07 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6684 0.3189 0.0127 1 0 0.6595 0.3259 0.0146 1 0 0.6469 0.3356 0.0175
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 96 46 50 2 0 0 0 44 0 0 49 1 0 0.0435 0.0000 0.0200 46.000 0.00 4.18 -4.18 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8958 0.1042 2 2 0.0000 0.4705 0.5295 2 2 0.0000 0.2891 0.7109
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.100 1 -3 2 713 155 558 130 3 12 0 10 0 0 557 0 1 0.8387 0.0000 0.0018 11.917 0.97 3.90 -2.93 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.3536 0.6464 0.0000
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 369 122 247 64 0 8 0 50 0 0 231 0 16 0.5246 0.0000 0.0648 14.250 0.14 10.90 -10.76 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1408 0.6498 0.2094 1 1 0.1465 0.6390 0.2145 1 1 0.1539 0.6254 0.2208
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 254 116 138 67 0 3 0 46 0 0 134 1 3 0.5776 0.0000 0.0290 37.667 0.69 4.85 -4.16 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5958 0.3845 0.0197 1 0 0.5890 0.3888 0.0222 1 0 0.5792 0.3948 0.0260
chr16 85656376 GGAGCGC G 0.500000 0.100 1 -6 3 575 157 418 59 3 22 1 72 0 0 417 0 1 0.3758 0.0000 0.0024 6.045 3.05 6.06 -3.00 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0407 0.5195 0.4398 1 1 0.0446 0.5164 0.4390 1 1 0.0501 0.5128 0.4371
chr16 87604287 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 471 119 352 48 2 22 0 47 0 0 343 0 9 0.4034 0.0000 0.0256 4.409 4.04 7.11 -3.06 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0972 0.5882 0.3145 1 1 0.1023 0.5815 0.3162 1 1 0.1091 0.5731 0.3178
chr16 87604287 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 471 129 342 56 6 22 7 38 0 0 342 0 0 0.4341 0.0000 0.0000 5.095 5.59 3.13 2.46 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6008 0.3783 0.0210 1 0 0.5933 0.3831 0.0236 1 0 0.5826 0.3899 0.0275
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 730 138 592 0 1 5 10 122 0 0 579 0 13 0.0000 0.0000 0.0220 26.000 7.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 727 133 594 0 0 7 10 116 0 0 580 2 12 0.0000 0.0000 0.0236 20.500 8.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 726 132 594 0 0 3 2 127 0 0 575 6 13 0.0000 0.0000 0.0320 128.000 7.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 819 189 630 0 0 5 0 184 0 0 628 0 2 0.0000 0.0000 0.0032 36.800 7.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 187 85 102 0 0 4 0 81 0 0 101 0 1 0.0000 0.0000 0.0098 20.250 4.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0184 0.9816
chr17 1229370 GTCCCCGCGGGGAGACTCGGCCTCGGGGTCGGGGCGCCCGGGC G 0.500000 0.100 1 -42 4 555 173 382 102 0 12 1 58 2 0 380 0 0 0.5896 0.0052 0.0052 13.417 1.25 7.00 -5.75 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9510 0.0489 0.0001 1 0 0.9455 0.0544 0.0002 1 0 0.9371 0.0627 0.0003
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.100 1 -3 1 962 224 738 204 2 14 0 4 0 0 736 0 2 0.9107 0.0000 0.0027 15.000 0.33 3.00 -2.67 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1674 0.8326 0.0000 0 0 0.9941 0.0059 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 424 178 246 152 1 5 0 20 0 0 246 0 0 0.8539 0.0000 0.0000 34.600 0.31 1.40 -1.09 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0021 0.9979 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 812 254 558 102 9 47 0 96 0 1 552 0 5 0.4016 0.0000 0.0108 4.404 0.15 3.14 -2.99 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2504 0.6955 0.0541 1 1 0.2557 0.6843 0.0601 1 1 0.2615 0.6698 0.0686
chr17 7846859 T TACC 0.057281 0.100 1 3 2 1550 490 1060 17 4 121 19 329 0 1 1028 5 26 0.0347 0.0000 0.0302 3.075 1.88 5.21 -3.32 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 2 0.0000 0.0927 0.9073
chr17 8077151 TGG T 0.500000 0.100 1 -2 1 540 139 401 132 1 1 0 5 0 0 401 0 0 0.9496 0.0000 0.0000 138.000 0.30 1.80 -1.50 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0130 0.9870 0.0000 0 0 0.7891 0.2109 0.0000 0 0 0.9625 0.0375 0.0000
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 657 186 471 175 1 3 0 7 0 0 471 0 0 0.9409 0.0000 0.0000 61.000 0.21 3.14 -2.94 107 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.7919 0.2081 0.0000 0 0 0.9828 0.0172 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 480 127 353 68 1 12 1 45 0 0 353 0 0 0.5354 0.0000 0.0000 9.583 0.50 7.84 -7.34 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7299 0.2625 0.0076 1 0 0.7200 0.2710 0.0090 1 0 0.7061 0.2828 0.0111
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 625 258 367 102 3 31 5 117 0 0 362 1 4 0.3953 0.0000 0.0136 7.323 0.28 3.03 -2.74 46 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0075 0.4113 0.5812 1 2 0.0089 0.4103 0.5808 1 2 0.0111 0.4100 0.5789
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1104 305 799 260 6 8 23 8 0 0 799 0 0 0.8525 0.0000 0.0000 39.429 0.33 4.75 -4.42 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3601 0.6399 0.0000 0 0 0.9672 0.0328 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 1103 303 800 261 6 24 6 6 0 0 800 0 0 0.8614 0.0000 0.0000 12.364 0.35 4.83 -4.48 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0484 0.9516 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 810 170 640 7 0 8 1 154 0 0 637 0 3 0.0412 0.0000 0.0047 20.250 0.00 3.95 -3.95 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 2 0.0000 0.3920 0.6080 2 2 0.0000 0.0401 0.9599
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 271 117 154 92 0 22 0 3 0 0 152 0 2 0.7863 0.0000 0.0130 4.318 0.26 19.00 -18.74 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.3255 0.6745 0.0000 0 0 0.7782 0.2218 0.0000
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 145 73 72 66 0 2 0 5 0 0 72 0 0 0.9041 0.0000 0.0000 35.500 0.17 1.40 -1.23 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1168 0.8832 0.0000 0 1 0.4988 0.5012 0.0000
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 1082 305 777 245 8 44 0 8 4 0 771 0 2 0.8033 0.0051 0.0077 5.932 2.00 8.25 -6.25 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.8989 0.1011 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr17 41060049 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 569 192 377 97 14 3 6 72 0 0 377 0 0 0.5052 0.0000 0.0000 93.000 1.35 2.50 -1.15 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8475 0.1514 0.0011 1 0 0.8395 0.1591 0.0014 1 0 0.8277 0.1704 0.0019
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 569 192 377 18 0 6 1 167 0 0 377 0 0 0.0938 0.0000 0.0000 30.833 1.17 1.91 -0.74 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9675 0.0325
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 681 202 479 11 0 3 0 188 0 0 476 0 3 0.0545 0.0000 0.0063 66.333 0.73 1.37 -0.64 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8963 0.1037 2 2 0.0000 0.0985 0.9015
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 846 164 682 3 2 15 11 133 0 0 647 2 33 0.0183 0.0000 0.0513 9.733 10.33 8.09 2.24 3 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1385 0.8615 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 688 190 498 89 0 37 2 62 0 0 488 0 10 0.4684 0.0000 0.0201 4.108 0.22 13.35 -13.13 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4923 0.4836 0.0241 1 0 0.4914 0.4816 0.0270 1 0 0.4890 0.4797 0.0314
chr17 45242067 T TCCG 0.500000 0.100 1 3 2 749 233 516 21 110 40 0 62 0 2 510 1 3 0.0901 0.0000 0.0116 4.800 1.24 3.19 -1.96 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9933 0.0067 0.0000 1 0 0.9920 0.0080 0.0000 1 0 0.9897 0.0103 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 751 242 509 82 5 37 2 116 0 0 506 0 3 0.3388 0.0000 0.0059 5.514 2.49 3.53 -1.04 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0010 0.1589 0.8401 1 2 0.0013 0.1662 0.8326 1 2 0.0018 0.1767 0.8215
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 195 75 120 66 0 4 0 5 0 0 120 0 0 0.8800 0.0000 0.0000 17.750 0.12 3.60 -3.48 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1164 0.8836 0.0000 0 1 0.4984 0.5016 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 1060 296 764 158 1 6 0 131 0 0 759 0 5 0.5338 0.0000 0.0065 48.167 0.21 3.04 -2.83 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5273 0.4669 0.0057 1 0 0.5322 0.4609 0.0069 1 0 0.5367 0.4545 0.0088
chr17 57979243 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 589 260 329 102 2 62 11 83 0 0 328 1 0 0.3923 0.0000 0.0030 3.161 0.33 2.83 -2.50 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3116 0.6411 0.0473 1 1 0.3179 0.6302 0.0519 1 1 0.3251 0.6165 0.0584
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 450 142 308 110 0 27 0 5 0 0 308 0 0 0.7746 0.0000 0.0000 4.259 0.38 6.80 -6.42 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 0 0.5428 0.4572 0.0000 0 0 0.8937 0.1063 0.0000
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 378 136 242 68 0 13 0 55 0 0 242 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 9.462 0.22 7.42 -7.20 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4799 0.4836 0.0365 1 1 0.4771 0.4828 0.0401 1 1 0.4726 0.4822 0.0452
chr17 69149049 TGA T 0.500000 0.100 1 -2 2 186 71 115 69 0 1 0 1 0 0 115 0 0 0.9718 0.0000 0.0000 70.000 0.10 3.00 -2.90 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7853 0.2147 0.0000 0 0 0.9154 0.0846 0.0000 0 0 0.9374 0.0626 0.0000
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.100 1 -4 3 249 103 146 94 0 4 0 5 0 0 146 0 0 0.9126 0.0000 0.0000 24.750 0.93 4.40 -3.47 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.3478 0.6522 0.0000 0 0 0.7945 0.2055 0.0000
chr17 73209719 A ATGC 0.500000 0.100 1 3 1 401 152 249 76 3 22 0 51 0 0 246 0 3 0.5000 0.0000 0.0120 5.909 1.04 3.82 -2.78 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7517 0.2430 0.0053 1 0 0.7423 0.2514 0.0064 1 0 0.7289 0.2631 0.0081
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 157 73 84 43 0 0 0 30 0 0 84 0 0 0.5890 0.0000 0.0000 73.000 0.42 1.00 -0.58 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5362 0.4230 0.0408 1 0 0.5288 0.4268 0.0444 1 0 0.5185 0.4318 0.0497
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 651 140 511 0 2 5 0 133 0 0 499 0 12 0.0000 0.0000 0.0235 26.800 7.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr17 76072413 TACCGCCGCCGCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 651 287 364 165 0 18 2 102 0 0 352 0 12 0.5749 0.0000 0.0330 14.889 0.54 13.65 -13.11 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9431 0.0568 0.0001 1 0 0.9384 0.0615 0.0001 1 0 0.9312 0.0687 0.0001
chr17 76077366 TGTCCTGGCCC T 0.500000 0.100 1 -10 3 578 177 401 98 0 14 0 65 0 0 399 0 2 0.5537 0.0000 0.0050 11.643 0.34 9.23 -8.89 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8264 0.1719 0.0018 1 0 0.8177 0.1801 0.0022 1 0 0.8050 0.1920 0.0030
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2704 651 2053 537 16 70 3 25 2 3 2041 5 2 0.8249 0.0010 0.0058 8.200 1.18 5.96 -4.78 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0172 0.9828 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2571 659 1912 559 17 29 8 46 7 4 1725 27 149 0.8483 0.0037 0.0978 22.357 1.64 4.59 -2.95 103 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -6 7 315 145 170 123 1 16 0 5 0 0 170 0 0 0.8483 0.0000 0.0000 8.062 0.26 5.00 -4.74 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0082 0.9918 0.0000 0 0 0.7046 0.2954 0.0000 0 0 0.9431 0.0569 0.0000
chr17 79834441 CGTGGTG C 0.500000 0.100 1 -6 2 1545 479 1066 382 3 75 0 19 1 0 1064 0 1 0.7975 0.0009 0.0019 5.521 0.51 5.42 -4.92 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1262 0.8738 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000
chr17 81456347 CGTGGCCCACAGG C 0.500000 0.100 1 -12 2 263 80 183 12 0 4 1 63 0 0 178 0 5 0.1500 0.0000 0.0273 19.000 0.67 11.30 -10.63 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9873 0.0127
chr17 82316265 GCAGGGAGGGCAGAGGCTGCTGGCGGGT G 0.500000 0.100 1 -27 2 487 210 277 183 1 19 0 7 1 0 274 0 2 0.8714 0.0036 0.0108 10.000 0.26 18.00 -17.74 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4137 0.5863 0.0000 0 0 0.9606 0.0394 0.0000
chr17 82805958 CCGAAGATGACGA C 0.500000 0.100 1 -12 1 145 83 62 74 0 8 0 1 0 0 62 0 0 0.8916 0.0000 0.0000 9.375 0.26 12.00 -11.74 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8248 0.1752 0.0000 0 0 0.9328 0.0672 0.0000 0 0 0.9502 0.0498 0.0000
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 310 76 234 53 2 2 1 18 0 0 234 0 0 0.6974 0.0000 0.0000 36.500 0.40 1.11 -0.71 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9375 0.0620 0.0005 1 0 0.9253 0.0741 0.0006 1 0 0.7366 0.2627 0.0007
chr18 11689670 CGGCCCT C 0.001376 0.100 1 -6 4 504 114 390 64 0 4 1 45 0 0 390 0 0 0.5614 0.0000 0.0000 27.500 0.53 6.09 -5.56 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7775 0.2224 0.0000 1 0 0.7726 0.2274 0.0000 1 0 0.7655 0.2345 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 176 90 86 0 0 2 1 87 0 0 84 0 2 0.0000 0.0000 0.0233 44.000 3.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 423 90 333 44 2 4 0 40 0 0 329 0 4 0.4889 0.0000 0.0120 21.500 0.68 9.12 -8.44 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3544 0.5788 0.0668 1 1 0.3594 0.5719 0.0687 1 1 0.3654 0.5632 0.0713
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 139 67 72 61 0 2 0 4 0 0 72 0 0 0.9104 0.0000 0.0000 32.500 0.20 3.00 -2.80 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0031 0.9969 0.0000 0 1 0.2293 0.7707 0.0000 0 0 0.5970 0.4030 0.0000
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 222 119 103 56 0 6 0 57 0 0 102 0 1 0.4706 0.0000 0.0097 22.600 0.04 3.60 -3.56 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1542 0.6335 0.2123 1 1 0.1594 0.6238 0.2168 1 1 0.1662 0.6115 0.2223
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 273 156 117 4 0 7 0 145 0 0 117 0 0 0.0256 0.0000 0.0000 21.286 0.00 3.68 -3.68 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8173 0.1827 2 2 0.0000 0.0482 0.9518 2 2 0.0000 0.0113 0.9887
chr18 57436244 G GCAC 0.500000 0.100 1 3 2 827 217 610 118 4 27 2 66 0 0 605 1 4 0.5438 0.0000 0.0082 7.037 0.34 3.33 -2.99 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9618 0.0381 0.0001 1 0 0.9573 0.0426 0.0001 1 0 0.9504 0.0495 0.0001
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 933 207 726 113 0 4 1 89 0 0 719 0 7 0.5459 0.0000 0.0096 50.750 0.19 13.47 -13.29 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4571 0.5238 0.0191 1 1 0.4599 0.5183 0.0218 1 1 0.4622 0.5121 0.0257
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 186 75 111 0 0 4 0 71 0 0 109 0 2 0.0000 0.0000 0.0180 17.750 2.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0254 0.9746 2 2 0.0000 0.0281 0.9719
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 160 77 83 29 1 8 0 39 0 0 81 0 2 0.3766 0.0000 0.0241 8.625 0.10 2.90 -2.79 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0547 0.4610 0.4843 1 2 0.0588 0.4628 0.4785 1 2 0.0646 0.4651 0.4703
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 373 161 212 90 9 14 7 41 0 2 210 0 0 0.5590 0.0000 0.0094 11.750 3.82 5.15 -1.32 12 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9867 0.0133 0.0000 1 0 0.9846 0.0154 0.0000 1 0 0.9812 0.0187 0.0000
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.100 1 -27 1 452 106 346 59 1 2 0 44 0 0 344 0 2 0.5566 0.0000 0.0058 51.500 0.54 23.18 -22.64 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6335 0.3545 0.0120 1 0 0.6298 0.3569 0.0132 1 0 0.6243 0.3607 0.0150
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 173 73 100 69 0 2 0 2 0 0 100 0 0 0.9452 0.0000 0.0000 35.500 0.70 4.50 -3.80 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5660 0.4340 0.0000 0 0 0.9249 0.0751 0.0000 0 0 0.9630 0.0370 0.0000
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 284 164 120 149 2 0 0 13 0 0 119 1 0 0.9085 0.0000 0.0083 164.000 0.19 3.46 -3.27 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 0 0.5245 0.4755 0.0000
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 344 102 242 0 1 17 83 1 0 0 236 5 1 0.0000 0.0000 0.0248 4.941 3.00 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0127 0.9873 2 2 0.0000 0.0138 0.9862 2 2 0.0000 0.0155 0.9845
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 345 103 242 0 0 17 2 84 0 0 234 3 5 0.0000 0.0000 0.0331 5.000 9.94 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0481 0.9519 2 2 0.0000 0.0527 0.9473 2 2 0.0000 0.0598 0.9402
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 345 109 236 8 2 47 1 51 0 0 227 1 8 0.0734 0.0000 0.0381 1.348 2.00 11.90 -9.90 8 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9918 0.0082
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 916 195 721 25 0 34 3 133 0 0 719 0 2 0.1282 0.0000 0.0028 4.735 0.56 3.40 -2.84 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 5711908 CCTT C 0.000317 0.100 1 -3 1 275 100 175 56 0 0 0 44 0 0 175 0 0 0.5600 0.0000 0.0000 100.000 0.48 2.93 -2.45 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6679 0.3321 0.0000 1 0 0.6659 0.3341 0.0000 1 0 0.6628 0.3372 0.0000
chr19 5832066 A AG 0.000937 0.100 1 1 1 1040 233 807 24 0 3 0 206 0 0 806 0 1 0.1030 0.0000 0.0012 76.667 0.50 1.40 -0.90 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 436 136 300 75 1 4 0 56 0 0 299 0 1 0.5515 0.0000 0.0033 32.750 0.24 3.20 -2.96 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7418 0.2557 0.0025 1 0 0.7373 0.2598 0.0029 1 0 0.7307 0.2658 0.0034
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 610 176 434 159 2 5 1 9 0 1 433 0 0 0.9034 0.0000 0.0023 33.800 0.42 7.33 -6.91 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1704 0.8296 0.0000 0 0 0.9126 0.0874 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 290 68 222 9 0 8 0 51 0 0 214 0 8 0.1324 0.0000 0.0360 7.500 0.00 5.37 -5.37 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9751 0.0249
chr19 11447525 A AGAG 0.036742 0.100 1 3 1 950 322 628 123 29 51 1 118 0 0 626 0 2 0.3820 0.0000 0.0032 5.314 0.35 3.17 -2.82 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8459 0.1540 0.0001 1 0 0.8436 0.1564 0.0001 1 0 0.8396 0.1603 0.0001
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 951 331 620 250 5 46 3 27 0 0 619 1 0 0.7553 0.0000 0.0016 6.196 1.62 3.37 -1.75 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000
chr19 12430727 C CTG 0.053346 0.100 1 2 3 843 166 677 12 5 5 5 139 0 1 660 3 13 0.0723 0.0000 0.0251 39.750 1.50 4.27 -2.77 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9878 0.0122
chr19 12430728 CAA C 0.053324 0.100 1 -2 3 843 166 677 12 2 7 8 137 0 0 662 2 13 0.0723 0.0000 0.0222 22.286 1.25 4.30 -3.05 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9684 0.0316
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 508 189 319 0 0 27 2 160 0 0 314 0 5 0.0000 0.0000 0.0157 5.963 6.28 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr19 13877744 C CGAG 0.002385 0.100 1 3 2 359 95 264 9 0 12 1 73 0 0 260 0 4 0.0947 0.0000 0.0152 6.917 0.33 3.00 -2.67 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr19 13937965 CGGGG C 0.000007 0.100 1 -4 3 290 72 218 68 1 0 0 3 0 1 217 0 0 0.9444 0.0000 0.0046 72.000 0.13 4.33 -4.20 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.100 1 3 1 340 128 212 67 1 8 1 51 0 0 210 0 2 0.5234 0.0000 0.0094 15.000 0.07 2.98 -2.91 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6725 0.3246 0.0029 1 0 0.6704 0.3264 0.0032 1 0 0.6669 0.3294 0.0037
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 622 141 481 0 0 4 0 137 0 0 478 0 3 0.0000 0.0000 0.0062 45.667 3.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 17286678 GTGTGTGTGTGTGTT G 0.125300 0.100 1 -14 1 551 145 406 3 3 19 20 100 0 0 406 0 0 0.0207 0.0000 0.0000 7.412 3.67 10.76 -7.09 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8984 0.1016 2 2 0.0000 0.4808 0.5192
chr19 18280864 CGCGCCCCCG C 0.000645 0.100 1 -9 6 519 150 369 78 2 8 0 62 0 0 369 0 0 0.5200 0.0000 0.0000 17.625 0.76 8.31 -7.55 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7446 0.2553 0.0000 1 0 0.7416 0.2583 0.0000 1 0 0.7371 0.2629 0.0000
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 176 75 101 64 2 3 0 6 0 0 101 0 0 0.8533 0.0000 0.0000 23.667 0.52 4.33 -3.82 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1467 0.8533 0.0000 0 0 0.6643 0.3357 0.0000
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 324 113 211 0 0 9 1 103 0 0 210 0 1 0.0000 0.0000 0.0047 11.556 2.89 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0481 0.9519 2 2 0.0000 0.0533 0.9467 2 2 0.0000 0.0613 0.9387
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 339 87 252 55 1 19 0 12 0 0 251 0 1 0.6322 0.0000 0.0040 3.579 0.24 3.00 -2.76 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0436 0.9564 0.0000 0 1 0.0033 0.9966 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 605 145 460 75 0 3 1 66 0 0 456 0 4 0.5172 0.0000 0.0087 47.333 0.27 3.18 -2.92 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1311 0.6986 0.1703 1 1 0.1340 0.6866 0.1794 1 1 0.1373 0.6711 0.1916
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 570 282 288 247 2 26 0 7 0 0 284 0 4 0.8759 0.0000 0.0139 10.240 3.79 7.71 -3.92 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9085 0.0915 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr19 37894973 TGGA T 0.043831 0.100 1 -3 1 712 152 560 136 2 6 0 8 0 0 560 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 24.167 0.31 3.50 -3.19 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.8103 0.1897 0.0000 0 0 0.9904 0.0096 0.0000
chr19 38304906 TGAA T 0.163680 0.100 1 -3 1 408 95 313 80 1 5 0 9 1 0 311 0 1 0.8421 0.0032 0.0064 18.000 4.06 3.22 0.84 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0072 0.9928 0.0000 0 1 0.3083 0.6917 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 390 113 277 7 0 3 4 99 0 0 265 2 10 0.0619 0.0000 0.0433 36.333 0.14 2.61 -2.46 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9257 0.0743 2 2 0.0000 0.4339 0.5661
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 229 38 191 0 0 4 29 5 0 0 191 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.750 3.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0486 0.9514 2 2 0.0000 0.0502 0.9498 2 2 0.0000 0.0526 0.9474
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 229 37 192 0 0 21 15 1 0 0 192 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.857 12.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0853 0.9147 2 2 0.0000 0.0872 0.9128 2 2 0.0000 0.0899 0.9101
chr19 40394272 TTCC T 0.017263 0.100 1 -3 1 622 156 466 120 2 21 2 11 0 0 466 0 0 0.7692 0.0000 0.0000 6.429 0.30 4.27 -3.97 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0251 0.9749 0.0000 0 0 0.8364 0.1636 0.0000
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 480 115 365 12 0 8 0 95 0 0 365 0 0 0.1043 0.0000 0.0000 13.375 0.08 5.65 -5.57 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9477 0.0523
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 547 168 379 14 0 7 0 147 0 0 376 0 3 0.0833 0.0000 0.0079 23.000 0.71 1.79 -1.07 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9561 0.0439
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.100 1 -1 1 578 154 424 94 0 3 0 57 0 0 424 0 0 0.6104 0.0000 0.0000 50.333 2.91 2.70 0.21 56 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9457 0.0543 0.0000 1 0 0.9411 0.0588 0.0001 1 0 0.9343 0.0656 0.0001
chr19 44273995 TCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTGAGGTATGTGATAAGGGCTTCAGTAAGGCCTCAAATCTTCAAGCCCATCAGAGAATC T 0.002701 0.100 1 -84 2 718 155 563 108 0 15 0 32 0 0 538 0 25 0.6968 0.0000 0.0444 9.333 0.45 4.25 -3.80 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9858 0.0142 0.0000 1 0 0.9838 0.0162 0.0000 1 0 0.9807 0.0193 0.0000
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 472 138 334 75 0 7 1 55 0 0 333 0 1 0.5435 0.0000 0.0030 26.200 0.24 2.25 -2.01 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7170 0.2793 0.0037 1 0 0.7129 0.2829 0.0043 1 0 0.7067 0.2883 0.0051
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 291 123 168 70 0 8 0 45 0 0 168 0 0 0.5691 0.0000 0.0000 14.375 1.13 2.27 -1.14 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8698 0.1301 0.0001 1 0 0.8636 0.1363 0.0001 1 0 0.8549 0.1450 0.0001
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 618 232 386 99 0 57 1 75 0 0 373 0 13 0.4267 0.0000 0.0337 3.070 0.32 6.44 -6.12 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3425 0.6140 0.0435 1 1 0.3479 0.6044 0.0477 1 1 0.3540 0.5924 0.0536
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 354 103 251 48 0 21 0 34 0 0 234 0 17 0.4660 0.0000 0.0677 3.905 0.90 11.18 -10.28 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2736 0.6681 0.0582 1 1 0.2829 0.6583 0.0588 1 1 0.2949 0.6455 0.0595
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.100 1 -3 1 494 146 348 122 1 8 0 15 0 0 348 0 0 0.8356 0.0000 0.0000 17.250 0.78 3.87 -3.09 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1663 0.8337 0.0000
chr19 47802355 TTTGGGCCTGAGA T 0.004392 0.100 1 -12 3 1515 389 1126 276 17 75 6 15 4 6 1111 4 1 0.7095 0.0036 0.0133 4.149 3.05 7.53 -4.49 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1614 0.8386 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 226 90 136 78 1 8 0 3 0 0 136 0 0 0.8667 0.0000 0.0000 10.250 0.82 1.00 -0.18 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2690 0.7310 0.0000 0 0 0.9098 0.0902 0.0000 0 0 0.9694 0.0306 0.0000
chr19 49108236 T TCGTGAC 0.000457 0.100 1 6 1 588 161 427 134 0 21 0 6 0 0 427 0 0 0.8323 0.0000 0.0000 6.667 0.58 6.33 -5.75 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7657 0.2343 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 1128 291 837 110 7 57 10 107 0 1 826 4 6 0.3780 0.0000 0.0131 4.053 0.43 3.61 -3.18 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0501 0.7233 0.2267 1 1 0.0559 0.7099 0.2342 1 1 0.0643 0.6926 0.2431
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.100 1 3 1 1131 303 828 209 11 70 0 13 0 0 827 1 0 0.6898 0.0000 0.0012 3.329 0.36 3.15 -2.79 89 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0978 0.9022 0.0000 0 0 0.9514 0.0486 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 644 169 475 0 0 22 1 146 0 0 460 0 15 0.0000 0.0000 0.0316 6.682 6.61 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.100 1 -18 2 615 231 384 20 0 60 0 151 0 0 383 1 0 0.0866 0.0000 0.0026 2.850 0.30 12.78 -12.48 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 742 166 576 9 0 7 2 148 0 0 568 0 8 0.0542 0.0000 0.0139 22.714 0.22 3.43 -3.20 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7888 0.2112 2 2 0.0000 0.0942 0.9058
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.100 1 6 2 661 134 527 64 0 8 0 62 0 0 522 0 5 0.4776 0.0000 0.0095 15.750 0.42 4.98 -4.56 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2765 0.7170 0.0066 1 1 0.2886 0.7047 0.0067 1 1 0.3044 0.6887 0.0068
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 598 167 431 84 0 8 7 68 0 1 429 0 1 0.5030 0.0000 0.0046 19.875 0.49 2.74 -2.25 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2587 0.6612 0.0801 1 1 0.2613 0.6519 0.0868 1 1 0.2638 0.6401 0.0962
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 505 169 336 95 1 6 0 67 0 0 335 1 0 0.5621 0.0000 0.0030 27.000 0.40 2.75 -2.35 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8132 0.1848 0.0020 1 0 0.8057 0.1918 0.0025 1 0 0.7950 0.2018 0.0032
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 580 143 437 83 1 4 0 55 0 0 433 0 4 0.5804 0.0000 0.0092 34.750 0.96 3.60 -2.64 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7807 0.2158 0.0035 1 0 0.7729 0.2230 0.0042 1 0 0.7616 0.2331 0.0053
chr19 52613680 GCCACACTCATTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGGATTCTCTGATGTTGTGCAAGGTGTGAAATATGATGGAAGACCTTT G 0.063910 0.100 1 -84 2 508 145 363 132 1 6 0 6 5 2 355 0 1 0.9103 0.0138 0.0220 23.167 0.98 2.33 -1.36 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 0 0.9024 0.0976 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 736 204 532 0 0 3 0 201 0 0 530 0 2 0.0000 0.0000 0.0038 67.000 3.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 54217135 A AGAG 0.001307 0.100 1 3 2 717 301 416 197 0 2 0 102 0 0 409 1 6 0.6545 0.0000 0.0168 149.500 0.38 6.30 -5.92 93 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9991 0.0009 0.0000 1 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr19 54217137 GTTC G 0.001135 0.100 1 -3 2 719 313 406 209 1 2 0 101 0 0 397 0 9 0.6677 0.0000 0.0222 155.500 0.41 6.33 -5.92 89 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 842 221 621 0 0 31 15 175 0 0 619 0 2 0.0000 0.0000 0.0032 7.667 1.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 54251009 C CA 0.002394 0.100 1 1 1 845 230 615 185 1 0 1 43 0 0 609 3 3 0.8043 0.0000 0.0098 229.000 1.86 3.42 -1.56 47 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9495 0.0505 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 766 160 606 0 0 2 0 158 0 0 594 1 11 0.0000 0.0000 0.0198 79.000 3.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.100 1 4 2 821 177 644 151 0 19 0 7 0 0 644 0 0 0.8531 0.0000 0.0000 8.316 0.26 4.14 -3.88 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0120 0.9880 0.0000 0 0 0.9718 0.0282 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 443 115 328 50 0 9 0 56 0 0 320 0 8 0.4348 0.0000 0.0244 11.778 0.36 8.20 -7.84 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0323 0.4518 0.5159 1 2 0.0357 0.4529 0.5114 1 2 0.0405 0.4548 0.5047
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 691 169 522 96 0 19 0 54 0 0 499 0 23 0.5680 0.0000 0.0441 7.895 2.32 17.00 -14.68 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2614 0.6992 0.0395 1 1 0.2582 0.6967 0.0451 1 1 0.2531 0.6933 0.0536
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 1067 334 733 139 1 62 0 132 0 0 728 0 5 0.4162 0.0000 0.0068 4.387 1.17 3.97 -2.80 105 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1877 0.7690 0.0432 1 1 0.2010 0.7516 0.0474 1 1 0.2184 0.7285 0.0530
chr19 55518546 CCCA C 0.003059 0.100 1 -3 1 745 186 559 102 0 1 0 83 0 0 559 0 0 0.5484 0.0000 0.0000 185.000 0.43 2.99 -2.56 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7257 0.2743 0.0001 1 0 0.7248 0.2751 0.0001 1 0 0.7229 0.2770 0.0001
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 631 110 521 8 0 3 1 98 1 0 516 0 4 0.0727 0.0019 0.0096 35.667 0.75 3.43 -2.68 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9864 0.0136 2 1 0.0000 0.6519 0.3481
chr19 56088071 C CTCG 0.023520 0.100 1 3 2 378 77 301 28 35 7 0 7 0 0 301 0 0 0.3636 0.0000 0.0000 9.714 2.43 5.00 -2.57 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3614 0.6386 0.0000 0 0 0.9089 0.0911 0.0000
chr19 56088071 CTCGTCG C 0.000755 0.100 1 -6 2 380 80 300 42 1 3 0 34 0 0 295 0 5 0.5250 0.0000 0.0167 25.667 3.12 7.32 -4.20 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4982 0.5016 0.0002 1 0 0.5020 0.4978 0.0002 1 0 0.5065 0.4933 0.0002
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 151 78 73 65 0 8 0 5 0 0 73 0 0 0.8333 0.0000 0.0000 8.750 0.14 3.00 -2.86 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.2141 0.7859 0.0000 0 0 0.6729 0.3271 0.0000
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.100 1 -48 1 149 82 67 43 4 21 0 14 0 0 60 0 7 0.5244 0.0000 0.1045 2.762 1.40 3.79 -2.39 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8679 0.1305 0.0016 1 0 0.8595 0.1386 0.0019 1 0 0.8476 0.1500 0.0024
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 372 148 224 132 0 2 0 14 0 0 223 0 1 0.8919 0.0000 0.0045 73.000 0.56 2.64 -2.08 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0306 0.9694 0.0000
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 112 72 40 8 0 3 0 61 0 0 40 0 0 0.1111 0.0000 0.0000 23.000 0.00 6.74 -6.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9936 0.0064 2 1 0.0000 0.8508 0.1492
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 485 161 324 120 0 1 0 40 0 0 322 0 2 0.7453 0.0000 0.0062 160.000 0.29 9.00 -8.71 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9985 0.0015 0.0000 1 0 0.9981 0.0019 0.0000 1 0 0.9879 0.0121 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 485 164 321 121 1 1 1 40 0 0 319 0 2 0.7378 0.0000 0.0062 161.000 0.29 9.00 -8.71 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9985 0.0015 0.0000 1 0 0.9981 0.0019 0.0000 1 0 0.9912 0.0088 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 477 157 320 107 1 1 0 48 0 0 315 0 5 0.6815 0.0000 0.0156 156.000 0.18 8.44 -8.26 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9854 0.0146 0.0000 1 0 0.9831 0.0169 0.0000 1 0 0.9794 0.0206 0.0000
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 421 192 229 168 0 16 0 8 0 0 229 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 11.000 0.39 8.00 -7.61 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.8531 0.1469 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000
chr20 3290134 ACAT A 0.000002 0.100 1 -3 2 112 60 52 58 0 0 0 2 0 0 52 0 0 0.9667 0.0000 0.0000 60.000 0.07 3.00 -2.93 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 3785200 T TTCC 0.003046 0.100 1 3 4 505 92 413 51 0 6 1 34 0 0 410 0 3 0.5543 0.0000 0.0073 14.167 1.92 6.00 -4.08 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7049 0.2950 0.0002 1 0 0.7011 0.2987 0.0002 1 0 0.6958 0.3040 0.0002
chr20 3785245 TTCC T 0.001133 0.100 1 -3 1 514 102 412 59 1 2 1 39 0 0 411 0 1 0.5784 0.0000 0.0024 49.500 1.56 5.44 -3.88 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8035 0.1965 0.0000 1 0 0.7977 0.2023 0.0000 1 0 0.7895 0.2105 0.0000
chr20 5946423 CTCT C 0.007166 0.100 1 -3 3 158 74 84 66 0 3 0 5 0 0 84 0 0 0.8919 0.0000 0.0000 23.667 0.32 3.20 -2.88 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0564 0.9436 0.0000 0 0 0.9481 0.0519 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 250 100 150 91 2 2 0 5 0 0 150 0 0 0.9100 0.0000 0.0000 48.500 0.25 1.20 -0.95 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2400 0.7600 0.0000 0 0 0.6948 0.3052 0.0000
chr20 23365273 CGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGA C 0.000109 0.100 1 -21 2 737 134 603 75 0 13 1 45 0 0 596 0 7 0.5597 0.0000 0.0116 9.308 1.84 21.27 -19.43 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8254 0.1746 0.0000 1 0 0.8200 0.1800 0.0000 1 0 0.8123 0.1877 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 776 186 590 10 1 3 0 172 0 0 578 0 12 0.0538 0.0000 0.0203 60.667 0.00 6.28 -6.28 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8737 0.1263 2 2 0.0000 0.1111 0.8889
chr20 33663701 TGCGGCGGCAAGAGGC T 0.003375 0.100 1 -15 1 749 215 534 117 0 9 0 89 0 0 527 0 7 0.5442 0.0000 0.0131 22.889 0.48 13.74 -13.26 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7376 0.2624 0.0000 1 0 0.7373 0.2627 0.0000 1 0 0.7360 0.2639 0.0001
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 533 181 352 116 0 2 1 62 0 0 348 0 4 0.6409 0.0000 0.0114 89.000 0.37 4.18 -3.81 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9483 0.0516 0.0001 1 0 0.9420 0.0578 0.0002 1 0 0.9324 0.0674 0.0002
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.100 1 -9 4 245 91 154 60 1 25 0 5 1 0 153 0 0 0.6593 0.0065 0.0065 2.640 1.57 8.20 -6.63 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0738 0.9262 0.0000 0 1 0.3764 0.6236 0.0000
chr20 35627312 C CA 0.103940 0.100 1 1 1 176 78 98 44 0 2 0 32 0 0 96 0 2 0.5641 0.0000 0.0204 38.000 0.52 1.31 -0.79 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6161 0.3741 0.0098 1 0 0.6134 0.3760 0.0106 1 0 0.6095 0.3789 0.0116
chr20 35652818 A AGGGCCG 0.080534 0.100 1 6 2 855 202 653 156 0 40 0 6 0 0 653 0 0 0.7723 0.0000 0.0000 4.050 0.35 5.67 -5.32 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0500 0.9500 0.0000 0 0 0.9789 0.0211 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr20 38926679 CGCG C 0.001907 0.100 1 -3 3 676 220 456 105 2 22 3 88 0 0 454 0 2 0.4773 0.0000 0.0044 9.000 0.22 3.25 -3.03 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5991 0.4008 0.0001 1 0 0.6041 0.3958 0.0001 1 0 0.6095 0.3904 0.0001
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 1145 369 776 0 0 38 15 316 0 0 766 3 7 0.0000 0.0000 0.0129 8.711 3.23 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 683 318 365 132 3 53 6 124 0 0 365 0 0 0.4151 0.0000 0.0000 5.096 0.21 3.26 -3.05 46 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2260 0.7340 0.0400 1 1 0.2386 0.7173 0.0440 1 1 0.2548 0.6956 0.0496
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.100 1 3 1 451 104 347 5 0 9 1 89 0 0 342 0 5 0.0481 0.0000 0.0144 10.556 0.00 3.07 -3.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8614 0.1386 2 2 0.0000 0.4620 0.5380
chr20 58854641 C CTGACGCCCCAGCCGATCCCGACTCCGGGGCGGCCCG 0.009401 0.100 1 36 4 777 165 612 49 7 21 10 78 0 2 609 1 0 0.2970 0.0000 0.0049 6.619 0.43 2.31 -1.88 27 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0205 0.8917 0.0878 1 1 0.0244 0.8932 0.0825 1 1 0.0305 0.8940 0.0756
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 301 60 241 0 0 13 4 43 0 0 232 0 9 0.0000 0.0000 0.0373 3.750 6.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr20 62861177 GCCGCGC G 0.000431 0.100 1 -6 1 536 134 402 66 2 14 0 52 0 0 400 0 2 0.4925 0.0000 0.0050 8.500 1.32 6.67 -5.35 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6836 0.3164 0.0000 1 0 0.6819 0.3181 0.0000 1 0 0.6791 0.3209 0.0000
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 330 152 178 0 0 2 0 150 0 0 178 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 75.000 2.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 31559541 AC A 0.000554 0.100 1 -1 1 336 93 243 58 0 0 0 35 0 0 243 0 0 0.6237 0.0000 0.0000 93.000 0.66 2.00 -1.34 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8609 0.1391 0.0000 1 0 0.8544 0.1456 0.0000 1 0 0.8451 0.1549 0.0000
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 811 203 608 99 0 3 0 101 0 0 603 0 5 0.4877 0.0000 0.0082 66.667 0.23 5.88 -5.65 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0612 0.6835 0.2552 1 1 0.0666 0.6704 0.2630 1 1 0.0740 0.6536 0.2723
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 234 104 130 7 1 6 0 90 0 0 128 0 2 0.0673 0.0000 0.0154 16.333 0.14 3.72 -3.58 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9729 0.0271 2 1 0.0000 0.5876 0.4124
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 373 52 321 0 0 2 1 49 0 0 320 0 1 0.0000 0.0000 0.0031 25.000 2.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 41991439 GCCT G 0.063434 0.100 1 -3 1 1022 216 806 117 1 21 0 77 0 0 803 0 3 0.5417 0.0000 0.0037 9.286 0.43 3.13 -2.70 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9385 0.0615 0.0000 1 0 0.9342 0.0658 0.0000 1 0 0.9278 0.0721 0.0001
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1412 254 1158 19 4 10 15 206 1 0 1146 3 8 0.0748 0.0009 0.0104 34.143 1.58 3.21 -1.63 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8835 0.1165
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1411 260 1151 19 5 12 17 207 0 1 1140 2 8 0.0731 0.0000 0.0096 27.000 1.42 3.16 -1.74 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8075 0.1925
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 894 188 706 94 3 21 2 68 33 13 648 2 10 0.5000 0.0467 0.0822 8.300 1.39 14.38 -12.99 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9901 0.0099 0.0000 1 0 0.9886 0.0114 0.0000 1 0 0.9861 0.0139 0.0000
chr21 44579846 AGG A 0.004815 0.100 1 -2 2 934 294 640 203 1 4 3 83 0 0 631 4 5 0.6905 0.0000 0.0141 96.667 1.79 8.36 -6.57 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr21 44579850 A ACG 0.004831 0.100 1 2 1 936 290 646 201 3 3 6 77 0 0 637 1 8 0.6931 0.0000 0.0139 94.667 1.79 8.61 -6.82 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr21 44591798 G GCAGCAGACGGGCACA 0.500000 0.100 1 15 1 1223 235 988 201 4 11 0 19 57 4 909 11 7 0.8553 0.0577 0.0800 22.400 2.52 8.37 -5.85 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 732 153 579 74 2 8 1 68 0 0 573 0 6 0.4837 0.0000 0.0104 17.875 2.08 12.60 -10.52 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1615 0.6770 0.1615 1 1 0.1671 0.6646 0.1682 1 1 0.1743 0.6488 0.1769
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 414 169 245 1 2 23 0 143 0 0 245 0 0 0.0059 0.0000 0.0000 6.591 2.00 7.64 -5.64 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 588 227 361 99 1 23 0 104 0 0 357 0 4 0.4361 0.0000 0.0111 8.870 0.44 3.13 -2.69 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0814 0.7324 0.1863 1 1 0.0890 0.7193 0.1917 1 1 0.0997 0.7023 0.1980
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.100 1 6 1 3251 1036 2215 538 2 20 3 473 0 0 2178 0 37 0.5193 0.0000 0.0167 50.750 0.26 5.80 -5.55 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0780 0.9220 0.0000 1 1 0.1012 0.8988 0.0000 1 1 0.1382 0.8618 0.0000
chr22 20858678 G GCCGCCT 0.004141 0.100 1 6 2 536 189 347 76 0 38 0 75 0 0 347 0 0 0.4021 0.0000 0.0000 3.974 0.46 5.23 -4.77 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3429 0.6560 0.0012 1 1 0.3547 0.6440 0.0012 1 1 0.3699 0.6289 0.0013
chr22 21867418 C CCCG 0.004356 0.100 1 3 1 211 108 103 80 2 20 0 6 0 0 103 0 0 0.7407 0.0000 0.0000 4.400 0.78 3.00 -2.23 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0237 0.9763 0.0000 0 0 0.9585 0.0415 0.0000 0 0 0.9962 0.0038 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 597 132 465 65 0 31 0 36 0 0 453 0 12 0.4924 0.0000 0.0258 3.258 0.82 16.72 -15.91 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2577 0.6788 0.0634 1 1 0.2515 0.6779 0.0705 1 1 0.2428 0.6764 0.0808
chr22 27798924 T TTGC 0.004414 0.100 1 3 1 1054 244 810 87 5 35 6 111 0 0 810 0 0 0.3566 0.0000 0.0000 5.914 0.99 3.26 -2.27 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0292 0.9529 0.0179 1 1 0.0345 0.9480 0.0175 1 1 0.0427 0.9404 0.0168
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.100 1 3 1 1043 238 805 158 27 47 4 2 0 0 805 0 0 0.6639 0.0000 0.0000 4.349 1.87 3.00 -1.13 24 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9749 0.0251 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 815 232 583 216 0 6 0 10 0 0 583 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 37.667 1.12 4.60 -3.48 156 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6306 0.3694 0.0000 0 0 0.9885 0.0115 0.0000
chr22 31085246 GTGTCTTCC G 0.001106 0.100 1 -8 3 345 112 233 60 0 2 0 50 1 0 228 0 4 0.5357 0.0043 0.0215 110.000 0.13 7.52 -7.39 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5210 0.4788 0.0002 1 0 0.5254 0.4744 0.0002 1 0 0.5305 0.4693 0.0002
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 754 244 510 216 0 10 0 18 0 0 510 0 0 0.8852 0.0000 0.0000 23.400 0.68 2.94 -2.26 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.2667 0.7333 0.0000
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 457 214 243 96 0 41 0 77 0 0 241 0 2 0.4486 0.0000 0.0082 4.220 0.86 5.56 -4.69 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6317 0.3615 0.0067 1 0 0.6311 0.3612 0.0077 1 0 0.6292 0.3617 0.0091
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 648 153 495 144 3 2 0 4 0 0 495 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 75.000 0.49 16.50 -16.01 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1625 0.8375 0.0000 0 0 0.9449 0.0551 0.0000 0 0 0.9869 0.0131 0.0000
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.100 1 -42 4 366 175 191 161 0 2 0 12 0 0 188 1 2 0.9200 0.0000 0.0157 86.500 0.60 28.17 -27.57 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.3525 0.6475 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 443 220 223 177 0 23 0 20 0 0 223 0 0 0.8045 0.0000 0.0000 8.565 0.59 6.40 -5.81 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0269 0.9731 0.0000
chr22 38991390 TG T 0.004074 0.100 1 -1 2 489 143 346 90 0 2 0 51 0 0 345 0 1 0.6294 0.0000 0.0029 70.500 0.30 1.98 -1.68 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9555 0.0445 0.0000 1 0 0.9513 0.0487 0.0000 1 0 0.9452 0.0548 0.0000
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 230 130 100 115 0 6 0 9 0 0 100 0 0 0.8846 0.0000 0.0000 20.667 0.52 5.00 -4.48 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0412 0.9588 0.0000 0 0 0.6216 0.3784 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 381 134 247 0 0 3 1 130 0 0 238 0 9 0.0000 0.0000 0.0364 43.667 3.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 561 178 383 96 0 12 1 69 1 0 380 0 2 0.5393 0.0026 0.0078 13.833 0.17 2.93 -2.76 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7943 0.2039 0.0018 1 0 0.7886 0.2092 0.0022 1 0 0.7803 0.2169 0.0028
chr22 40861830 T TA 0.018262 0.100 1 1 2 734 187 547 162 0 1 0 24 0 0 546 0 1 0.8663 0.0000 0.0018 186.000 0.51 1.12 -0.61 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0150 0.9850 0.0000
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1136 294 842 175 1 4 2 112 1 0 832 0 9 0.5952 0.0012 0.0119 72.500 0.82 10.23 -9.42 55 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9714 0.0286 0.0000 1 0 0.9687 0.0313 0.0000 1 0 0.9644 0.0356 0.0000
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 692 285 407 229 0 7 0 49 0 0 407 0 0 0.8035 0.0000 0.0000 39.714 0.16 2.82 -2.65 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
778 rows