File Info

Filename
HG01868_x_HG01891_FF_5.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/d1/83826be5110cd515225313f989955a/HG01868_x_HG01891_FF_5.features.tsv
Size
150.0 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG01868_x_HG01891_FF_5)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 964529 AGGTCCGCAGTGGGGCTGCGGGGAGGGGGGCGCG A 0.000081 0.050 1 -33 1 488 133 355 82 6 32 7 6 0 0 350 1 4 0.6165 0.0000 0.0141 4.174 5.39 3.00 2.39 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9100 0.0900 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr1 1752908 C CCCTCCT 0.500000 0.050 1 6 1 365 123 242 108 0 12 0 3 0 0 241 0 1 0.8780 0.0000 0.0041 9.250 0.51 6.00 -5.49 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0216 0.9784 0.0000 0 1 0.4980 0.5020 0.0000 0 0 0.7507 0.2493 0.0000
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.050 1 -9 2 388 120 268 57 0 26 0 37 0 0 265 0 3 0.4750 0.0000 0.0112 3.615 0.33 8.68 -8.34 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4634 0.4503 0.0863 1 0 0.4559 0.4535 0.0906 1 1 0.4459 0.4576 0.0965
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 261 110 151 58 0 1 1 50 0 0 150 0 1 0.5273 0.0000 0.0066 108.000 0.12 3.60 -3.48 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3101 0.5219 0.1680 1 1 0.3086 0.5202 0.1711 1 1 0.3065 0.5181 0.1753
chr1 12879725 C CG 0.500000 0.050 1 1 3 624 237 387 138 1 17 2 79 0 0 387 0 0 0.5823 0.0000 0.0000 12.941 1.72 2.24 -0.52 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8692 0.1280 0.0028 1 0 0.8582 0.1384 0.0034 1 0 0.8423 0.1532 0.0045
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.050 1 3 2 909 171 738 152 2 8 0 9 0 0 738 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 20.375 0.36 3.56 -3.20 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0986 0.9014 0.0000 0 0 0.5859 0.4141 0.0000
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.050 1 3 2 261 101 160 89 0 6 0 6 0 0 160 0 0 0.8812 0.0000 0.0000 15.833 0.22 3.00 -2.78 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1404 0.8596 0.0000 0 1 0.4760 0.5240 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 284 50 234 4 0 2 2 42 0 0 234 0 0 0.0800 0.0000 0.0000 24.000 1.50 1.07 0.43 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9953 0.0047 2 1 0.0000 0.8289 0.1711 2 1 0.0000 0.6056 0.3944
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 1 360 145 215 8 0 12 1 124 0 0 213 0 2 0.0552 0.0000 0.0093 11.083 0.12 3.12 -3.00 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9012 0.0988 2 2 0.0000 0.4822 0.5178
chr1 40515335 CTG C 0.500000 0.050 1 -2 1 600 122 478 63 0 2 1 56 0 0 477 0 1 0.5164 0.0000 0.0021 60.000 0.49 2.46 -1.97 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2947 0.5287 0.1766 1 1 0.2939 0.5265 0.1796 1 1 0.2926 0.5238 0.1836
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 2 355 93 262 3 0 8 0 82 0 0 261 0 1 0.0323 0.0000 0.0038 10.625 0.00 3.29 -3.29 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9431 0.0569 2 2 0.0000 0.4891 0.5109 2 2 0.0000 0.2943 0.7057
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.050 1 6 1 513 126 387 0 1 16 3 106 0 0 386 0 1 0.0000 0.0000 0.0026 6.812 6.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0775 0.9225 2 2 0.0000 0.0771 0.9229 2 2 0.0000 0.0788 0.9212
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 216 67 149 35 1 4 0 27 0 0 149 0 0 0.5224 0.0000 0.0000 15.750 0.37 2.96 -2.59 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3578 0.4953 0.1470 1 1 0.3539 0.4956 0.1505 1 1 0.3489 0.4960 0.1552
chr1 53327841 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 195 95 100 78 10 3 0 4 0 0 100 0 0 0.8211 0.0000 0.0000 30.667 1.47 3.75 -2.28 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0148 0.9852 0.0000 0 1 0.3776 0.6224 0.0000 0 0 0.6482 0.3518 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.050 1 3 1 142 54 88 1 0 3 0 50 0 0 84 0 4 0.0185 0.0000 0.0455 17.000 0.00 3.74 -3.74 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5680 0.4320 2 2 0.0000 0.3399 0.6601 2 2 0.0000 0.2844 0.7156
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.050 1 -9 2 288 152 136 126 0 19 0 7 0 0 136 0 0 0.8289 0.0000 0.0000 7.000 0.24 9.14 -8.90 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1727 0.8273 0.0000 0 0 0.6033 0.3967 0.0000
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.050 1 -6 1 400 119 281 64 0 5 0 50 0 0 279 0 2 0.5378 0.0000 0.0071 22.800 0.09 4.98 -4.89 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3878 0.4938 0.1184 1 1 0.3834 0.4941 0.1225 1 1 0.3774 0.4945 0.1281
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.050 1 -6 1 401 118 283 56 1 19 0 42 0 0 283 0 0 0.4746 0.0000 0.0000 5.211 0.11 5.69 -5.58 12 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4344 0.4670 0.0986 1 1 0.4280 0.4692 0.1028 1 1 0.4194 0.4719 0.1086
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 2 368 98 270 88 3 5 0 2 0 0 270 0 0 0.8980 0.0000 0.0000 18.400 0.32 2.50 -2.18 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2735 0.7265 0.0000 0 0 0.7121 0.2879 0.0000 0 0 0.8077 0.1923 0.0000
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.050 1 -24 3 830 194 636 169 2 19 0 4 0 0 636 0 0 0.8711 0.0000 0.0000 9.158 0.22 25.75 -25.53 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0971 0.9029 0.0000 0 0 0.8239 0.1761 0.0000 0 0 0.9315 0.0685 0.0000
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.050 1 3 1 607 182 425 93 6 20 0 63 0 0 424 0 1 0.5110 0.0000 0.0024 8.421 0.43 3.84 -3.41 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6722 0.3046 0.0232 1 0 0.6598 0.3143 0.0260 1 0 0.6428 0.3272 0.0300
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.050 1 -2 3 99 37 62 12 18 5 1 1 0 0 62 0 0 0.3243 0.0000 0.0000 3.600 0.17 2.00 -1.83 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0829 0.9171 0.0000 0 1 0.3472 0.6528 0.0000 0 1 0.4807 0.5193 0.0000
chr1 150558695 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 589 147 442 138 0 4 0 5 0 0 442 0 0 0.9388 0.0000 0.0000 35.750 1.38 3.00 -1.62 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0096 0.9904 0.0000 0 0 0.5180 0.4820 0.0000 0 0 0.8103 0.1897 0.0000
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.050 1 18 1 1303 363 940 127 4 136 3 93 10 4 881 4 41 0.3499 0.0106 0.0628 1.647 3.04 9.42 -6.38 31 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2427 0.5823 0.1750 1 1 0.2449 0.5762 0.1789 1 1 0.2476 0.5684 0.1839
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.050 1 -36 1 1202 263 939 137 0 31 0 95 2 0 930 0 7 0.5209 0.0021 0.0096 7.484 0.58 3.53 -2.94 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6865 0.2958 0.0177 1 0 0.6748 0.3052 0.0200 1 0 0.6587 0.3178 0.0235
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 227 88 139 7 0 10 3 68 0 0 139 0 0 0.0795 0.0000 0.0000 7.500 0.86 1.62 -0.76 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9475 0.0525 2 1 0.0000 0.7105 0.2895
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 225 91 134 81 0 8 0 2 0 0 134 0 0 0.8901 0.0000 0.0000 10.375 0.15 18.00 -17.85 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2267 0.7733 0.0000 0 0 0.6597 0.3403 0.0000 0 0 0.7682 0.2318 0.0000
chr1 152985344 GGAGCCCTGCCACCCCAAGGTGCCT G 0.500000 0.050 1 -24 2 564 238 326 209 1 26 0 2 0 0 326 0 0 0.8782 0.0000 0.0000 8.154 0.27 13.50 -13.23 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8845 0.1155 0.0000 0 0 0.9791 0.0209 0.0000 0 0 0.9865 0.0135 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.050 1 12 1 1095 268 827 109 2 49 0 108 7 2 795 3 20 0.4067 0.0085 0.0387 4.542 2.41 9.92 -7.50 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1086 0.5346 0.3568 1 1 0.1131 0.5318 0.3550 1 1 0.1193 0.5284 0.3523
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.050 1 -9 1 508 228 280 110 0 20 0 98 0 0 280 0 0 0.4825 0.0000 0.0000 10.947 0.40 8.33 -7.93 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3711 0.5196 0.1094 1 1 0.3683 0.5179 0.1138 1 1 0.3644 0.5159 0.1198
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 220 96 124 2 0 2 0 92 0 0 123 0 1 0.0208 0.0000 0.0081 47.000 0.50 1.14 -0.64 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7031 0.2969 2 2 0.0000 0.2750 0.7250 2 2 0.0000 0.1837 0.8163
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.050 1 2 4 364 88 276 0 0 1 1 86 0 0 274 0 2 0.0000 0.0000 0.0072 87.000 2.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0949 0.9051 2 2 0.0000 0.0989 0.9011 2 2 0.0000 0.1045 0.8955
chr1 158700284 CAG C 0.500000 0.050 1 -2 2 654 183 471 180 0 0 0 3 0 0 471 0 0 0.9836 0.0000 0.0000 183.000 0.25 2.67 -2.42 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4093 0.5907 0.0000 0 0 0.9195 0.0805 0.0000 0 0 0.9608 0.0392 0.0000
chr1 159062696 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 208 76 132 44 2 3 3 24 0 0 130 0 2 0.5789 0.0000 0.0152 23.667 0.50 1.71 -1.21 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4668 0.4447 0.0884 1 0 0.4589 0.4484 0.0927 1 1 0.4484 0.4531 0.0985
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 762 160 602 6 0 6 0 148 0 0 599 0 3 0.0375 0.0000 0.0050 25.667 0.33 1.39 -1.05 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.5680 0.4320 2 2 0.0000 0.1990 0.8010
chr1 159929653 T TGCGGCG 0.500000 0.050 1 6 2 617 145 472 138 0 6 0 1 0 0 471 0 1 0.9517 0.0000 0.0021 23.167 0.33 6.00 -5.67 28 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5518 0.4482 0.0000 0 0 0.8877 0.1123 0.0000 0 0 0.9286 0.0714 0.0000
chr1 160681128 AC A 0.500000 0.050 1 -1 2 472 151 321 79 1 7 1 63 0 0 321 0 0 0.5232 0.0000 0.0000 20.286 1.37 2.32 -0.95 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4372 0.4728 0.0901 1 1 0.4312 0.4744 0.0944 1 1 0.4231 0.4765 0.1004
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.050 1 1 2 277 56 221 24 0 4 1 27 0 0 221 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 13.000 0.38 1.85 -1.48 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1979 0.5112 0.2909 1 1 0.2000 0.5103 0.2897 1 1 0.2027 0.5093 0.2880
chr1 182952865 T TCCGCCG 0.500000 0.050 1 6 2 489 166 323 145 1 19 0 1 0 0 322 0 1 0.8735 0.0000 0.0031 7.737 0.22 6.00 -5.78 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6008 0.3992 0.0000 0 0 0.9059 0.0941 0.0000 0 0 0.9403 0.0597 0.0000
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 564 136 428 124 0 4 0 8 0 0 428 0 0 0.9118 0.0000 0.0000 33.000 0.81 5.12 -4.32 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0937 0.9063 0.0000 0 0 0.5011 0.4989 0.0000
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.050 1 -2 3 560 136 424 127 0 1 0 8 0 0 424 0 0 0.9338 0.0000 0.0000 135.000 0.76 5.12 -4.36 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0988 0.9012 0.0000 0 0 0.5179 0.4821 0.0000
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.050 1 -1 2 96 49 47 47 0 0 0 2 0 0 47 0 0 0.9592 0.0000 0.0000 49.000 0.23 2.00 -1.77 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1116 0.8884 0.0000 0 1 0.4562 0.5438 0.0000 0 0 0.5948 0.4052 0.0000
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.050 1 24 3 462 161 301 8 0 25 0 128 0 0 261 0 40 0.0497 0.0000 0.1329 5.440 1.88 13.38 -11.51 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7682 0.2318 2 2 0.0000 0.2583 0.7417
chr1 205663089 GGCCGACAGCCCTTCTGCTGGCTCGGTGGGGCCCAGC G 0.500000 0.050 1 -36 5 586 124 462 10 0 3 0 111 0 0 424 0 38 0.0806 0.0000 0.0823 40.333 0.00 24.63 -24.63 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9527 0.0473 2 1 0.0000 0.5360 0.4640
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.050 1 3 1 468 198 270 81 73 40 0 4 0 2 268 0 0 0.4091 0.0000 0.0074 3.925 0.44 3.25 -2.81 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0679 0.9321 0.0000 0 0 0.7602 0.2398 0.0000 0 0 0.9029 0.0971 0.0000
chr1 209432291 TAGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 468 200 268 86 3 37 61 13 0 0 262 6 0 0.4300 0.0000 0.0224 4.528 0.38 3.92 -3.54 36 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3462 0.5226 0.1312 1 1 0.3439 0.5209 0.1352 1 1 0.3406 0.5186 0.1407
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.050 1 -12 1 468 205 263 114 2 25 0 64 0 0 255 0 8 0.5561 0.0000 0.0304 7.200 0.84 10.70 -9.86 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7698 0.2202 0.0100 1 0 0.7570 0.2314 0.0116 1 0 0.7391 0.2468 0.0141
chr1 225519331 A ATCCAGGCGTTCCTGCCGC 0.500000 0.050 1 18 1 385 107 278 23 0 58 0 26 0 0 267 0 11 0.2150 0.0000 0.0396 0.845 0.96 5.62 -4.66 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1076 0.4628 0.4296 1 1 0.1117 0.4653 0.4230 1 1 0.1174 0.4685 0.4141
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 233 88 145 49 0 2 0 37 0 0 145 0 0 0.5568 0.0000 0.0000 43.000 0.22 1.32 -1.10 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3948 0.4846 0.1206 1 1 0.3898 0.4857 0.1246 1 1 0.3830 0.4870 0.1300
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 543 130 413 4 0 12 4 110 1 0 407 2 3 0.0308 0.0024 0.0145 10.727 0.00 3.58 -3.58 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9939 0.0061 2 1 0.0000 0.6016 0.3984 2 2 0.0000 0.2731 0.7269
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 667 183 484 2 0 6 0 175 0 0 483 0 1 0.0109 0.0000 0.0021 29.500 0.50 3.09 -2.59 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2380 0.7620 2 2 0.0000 0.0472 0.9528 2 2 0.0000 0.0300 0.9700
chr1 248239401 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 627 136 491 131 0 2 0 3 0 0 491 0 0 0.9632 0.0000 0.0000 67.000 0.78 1.00 -0.22 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1694 0.8306 0.0000 0 0 0.7736 0.2264 0.0000 0 0 0.8835 0.1165 0.0000
chr1 248361985 CTACG C 0.500000 0.050 1 -4 2 1198 292 906 287 0 2 0 3 0 0 905 0 1 0.9829 0.0000 0.0011 145.000 0.28 7.33 -7.05 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6664 0.3336 0.0000 0 0 0.9879 0.0121 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 1075 253 822 6 0 2 3 242 0 0 821 0 1 0.0237 0.0000 0.0012 125.500 3.00 1.30 1.70 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9729 0.0271 2 2 0.0000 0.1128 0.8872 2 2 0.0000 0.0249 0.9751
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.050 1 -2 1 533 199 334 185 0 9 0 5 0 0 334 0 0 0.9296 0.0000 0.0000 21.111 1.55 3.80 -2.25 153 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0293 0.9707 0.0000 0 0 0.7727 0.2273 0.0000 0 0 0.9293 0.0707 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.050 1 2 1 643 70 573 0 0 2 1 67 0 0 565 0 8 0.0000 0.0000 0.0140 34.000 3.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1287 0.8713 2 2 0.0000 0.1331 0.8669 2 2 0.0000 0.1392 0.8608
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.050 1 9 1 565 103 462 87 0 15 0 1 1 0 460 0 1 0.8447 0.0022 0.0043 5.867 0.24 10.00 -9.76 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2591 0.7409 0.0000 0 0 0.6973 0.3027 0.0000 0 0 0.7968 0.2032 0.0000
chr1 248522528 CAA C 0.500000 0.050 1 -2 3 578 140 438 136 0 1 0 3 0 0 437 1 0 0.9714 0.0000 0.0023 139.000 0.25 4.67 -4.42 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1609 0.8391 0.0000 0 0 0.7684 0.2316 0.0000 0 0 0.8830 0.1170 0.0000
chr1 248626807 CAG C 0.500000 0.050 1 -2 1 760 204 556 196 1 4 1 2 1 0 555 0 0 0.9608 0.0018 0.0018 49.750 0.95 3.00 -2.05 28 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5628 0.4372 0.0000 0 0 0.9480 0.0520 0.0000 0 0 0.9744 0.0256 0.0000
chr1 248638622 CAGAT C 0.500000 0.050 1 -4 1 412 196 216 184 0 9 0 3 0 0 216 0 0 0.9388 0.0000 0.0000 20.778 5.57 8.67 -3.10 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4335 0.5665 0.0000 0 0 0.9265 0.0735 0.0000 0 0 0.9643 0.0357 0.0000
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.050 1 -7 1 406 172 234 2 0 12 1 157 0 0 232 0 2 0.0116 0.0000 0.0085 13.333 0.50 6.94 -6.44 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3184 0.6816 2 2 0.0000 0.0685 0.9315 2 2 0.0000 0.0434 0.9566
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 716 127 589 106 1 5 0 15 0 0 588 0 1 0.8346 0.0000 0.0017 24.400 0.33 3.40 -3.07 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0329 0.9671 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.050 1 -3 1 238 116 122 60 0 4 0 52 0 0 121 0 1 0.5172 0.0000 0.0082 28.000 0.18 3.83 -3.64 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3635 0.5064 0.1301 1 1 0.3617 0.5053 0.1330 1 1 0.3591 0.5041 0.1368
chr2 17781726 CAAGTT C 0.103121 0.050 1 -5 2 521 118 403 67 0 2 0 49 0 0 402 0 1 0.5678 0.0000 0.0025 58.000 0.30 5.18 -4.89 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6343 0.3521 0.0136 1 0 0.6289 0.3567 0.0144 1 0 0.6216 0.3629 0.0155
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.050 1 9 5 345 112 233 0 2 11 1 98 0 0 223 0 10 0.0000 0.0000 0.0429 9.182 10.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3582 0.6418 2 2 0.0000 0.0966 0.9034 2 2 0.0000 0.0616 0.9384
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.050 1 9 1 397 87 310 68 0 15 0 4 0 1 309 0 0 0.7816 0.0000 0.0032 4.800 0.53 7.75 -7.22 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1135 0.8865 0.0000 0 0 0.8542 0.1458 0.0000 0 0 0.9481 0.0519 0.0000
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 1 312 104 208 54 0 11 0 39 0 0 206 0 2 0.5192 0.0000 0.0096 8.455 0.39 2.90 -2.51 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4069 0.4806 0.1125 1 1 0.4015 0.4819 0.1167 1 1 0.3942 0.4835 0.1223
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.050 1 -6 1 690 112 578 22 1 16 0 73 4 0 574 0 0 0.1964 0.0069 0.0069 5.938 3.05 6.18 -3.13 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0084 0.1855 0.8062 1 2 0.0098 0.1974 0.7928 1 2 0.0121 0.2140 0.7739
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.050 1 -3 1 420 174 246 74 0 14 0 86 0 0 245 0 1 0.4253 0.0000 0.0041 11.429 0.28 3.49 -3.20 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1082 0.5007 0.3911 1 1 0.1125 0.5005 0.3871 1 1 0.1183 0.5002 0.3815
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.050 1 3 1 413 100 313 5 38 24 1 32 0 1 311 1 0 0.0500 0.0000 0.0064 3.167 1.00 3.41 -2.41 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3682 0.4943 0.1375 1 1 0.3641 0.4947 0.1412 1 1 0.3586 0.4952 0.1462
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 1 415 101 314 32 7 22 3 37 0 0 313 0 1 0.3168 0.0000 0.0032 3.500 3.06 3.24 -0.18 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2062 0.5215 0.2722 1 1 0.2082 0.5199 0.2719 1 1 0.2107 0.5179 0.2714
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.050 1 -6 1 416 103 313 39 3 54 0 7 0 0 313 0 0 0.3786 0.0000 0.0000 0.887 3.00 4.14 -1.14 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.0275 0.9725 0.0000 0 1 0.1745 0.8255 0.0000
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 432 100 332 53 0 6 0 41 0 0 331 0 1 0.5300 0.0000 0.0030 15.667 0.17 3.22 -3.05 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3787 0.4937 0.1276 1 1 0.3743 0.4941 0.1316 1 1 0.3686 0.4946 0.1369
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.050 1 24 2 928 236 692 199 0 35 0 2 1 0 686 0 5 0.8432 0.0014 0.0087 5.743 0.32 0.50 -0.18 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.5640 0.4360 0.0000 0 0 0.8996 0.1004 0.0000
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.050 1 -9 1 398 158 240 141 0 15 0 2 0 0 240 0 0 0.8924 0.0000 0.0000 9.533 0.13 9.00 -8.87 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5703 0.4297 0.0000 0 0 0.8949 0.1051 0.0000 0 0 0.9332 0.0668 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 310 111 199 51 0 14 1 45 0 0 198 0 1 0.4595 0.0000 0.0050 6.929 0.29 4.09 -3.79 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2802 0.5257 0.1941 1 1 0.2797 0.5238 0.1965 1 1 0.2790 0.5213 0.1997
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 4 395 122 273 0 0 22 2 98 0 0 269 1 3 0.0000 0.0000 0.0147 4.545 3.30 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0681 0.9319 2 2 0.0000 0.0715 0.9285 2 2 0.0000 0.0764 0.9236
chr2 99593872 CG C 0.500000 0.050 1 -1 4 629 144 485 6 0 4 10 124 0 0 478 4 3 0.0417 0.0000 0.0144 35.000 0.83 7.52 -6.69 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9979 0.0021 2 1 0.0000 0.6214 0.3786 2 2 0.0000 0.2353 0.7647
chr2 99593875 CTGAGG C 0.500000 0.050 1 -5 2 635 142 493 6 0 3 2 131 0 0 484 1 8 0.0423 0.0000 0.0183 46.333 0.83 7.63 -6.79 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9980 0.0020 2 1 0.0000 0.6238 0.3762 2 2 0.0000 0.2362 0.7638
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.050 1 -3 1 104 47 57 3 0 0 0 44 0 0 57 0 0 0.0638 0.0000 0.0000 47.000 1.33 3.32 -1.98 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9779 0.0221 2 1 0.0000 0.7147 0.2853 2 1 0.0000 0.5150 0.4850
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.050 1 6 1 515 110 405 0 0 0 0 110 0 0 393 0 12 0.0000 0.0000 0.0296 110.000 5.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0444 0.9556 2 2 0.0000 0.0470 0.9530 2 2 0.0000 0.0510 0.9490
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 303 108 195 47 0 15 0 46 0 0 194 0 1 0.4352 0.0000 0.0051 6.200 0.45 6.20 -5.75 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2357 0.5287 0.2357 1 1 0.2367 0.5265 0.2367 1 1 0.2381 0.5238 0.2381
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 152 44 108 13 2 6 7 16 0 0 108 0 0 0.2955 0.0000 0.0000 4.833 1.77 1.81 -0.04 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1658 0.4949 0.3393 1 1 0.1688 0.4953 0.3360 1 1 0.1727 0.4957 0.3316
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.050 1 -13 3 190 84 106 46 0 18 0 20 0 0 105 0 1 0.5476 0.0000 0.0094 3.667 0.24 10.60 -10.36 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5831 0.3677 0.0492 1 0 0.5714 0.3756 0.0531 1 0 0.5557 0.3859 0.0585
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.050 1 3 4 267 117 150 8 0 1 1 107 0 0 146 0 4 0.0684 0.0000 0.0267 116.000 0.25 2.92 -2.67 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9297 0.0703 2 1 0.0000 0.5718 0.4282
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.050 1 3 2 637 118 519 2 0 7 1 108 0 0 512 0 7 0.0169 0.0000 0.0135 15.714 1.50 4.04 -2.54 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5864 0.4136 2 2 0.0000 0.1792 0.8208 2 2 0.0000 0.1157 0.8843
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 282 118 164 12 2 10 41 53 0 0 162 0 2 0.1017 0.0000 0.0122 6.700 1.50 3.17 -1.67 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9422 0.0578
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 282 118 164 54 1 54 3 6 0 0 163 1 0 0.4576 0.0000 0.0061 1.148 2.85 3.83 -0.98 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0246 0.9754 0.0000 0 1 0.1574 0.8426 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.050 1 3 1 282 120 162 10 7 16 42 45 0 0 162 0 0 0.0833 0.0000 0.0000 3.812 1.10 3.29 -2.19 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.9406 0.0594
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 216 67 149 27 6 4 5 25 0 0 149 0 0 0.4030 0.0000 0.0000 14.250 0.11 1.24 -1.13 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2727 0.5162 0.2112 1 1 0.2722 0.5150 0.2129 1 1 0.2715 0.5134 0.2151
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 218 70 148 49 7 9 1 4 0 0 148 0 0 0.7000 0.0000 0.0000 6.000 0.98 2.00 -1.02 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0061 0.9939 0.0000 0 1 0.1911 0.8089 0.0000 0 1 0.4284 0.5716 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.050 1 3 1 265 88 177 49 1 2 0 36 0 0 176 0 1 0.5568 0.0000 0.0056 42.500 0.22 3.39 -3.16 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4045 0.4801 0.1153 1 1 0.3991 0.4815 0.1194 1 1 0.3919 0.4831 0.1250
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 2 507 137 370 0 0 17 2 118 0 0 368 1 1 0.0000 0.0000 0.0054 7.059 8.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0444 0.9556 2 2 0.0000 0.0471 0.9529 2 2 0.0000 0.0510 0.9490
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.050 1 -27 1 571 189 382 96 2 6 9 76 0 0 358 0 24 0.5079 0.0000 0.0628 29.500 0.24 15.43 -15.19 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1255 0.5323 0.3422 1 1 0.1298 0.5298 0.3405 1 1 0.1355 0.5266 0.3379
chr2 231460703 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 1 654 136 518 72 0 4 0 60 0 0 518 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 33.000 0.65 3.38 -2.73 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3841 0.4987 0.1172 1 1 0.3800 0.4986 0.1214 1 1 0.3744 0.4986 0.1270
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.050 1 3 1 154 51 103 45 0 4 0 2 0 0 103 0 0 0.8824 0.0000 0.0000 11.750 0.58 3.00 -2.42 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1060 0.8940 0.0000 0 1 0.4438 0.5562 0.0000 0 0 0.5831 0.4169 0.0000
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 669 196 473 189 0 0 0 7 0 0 473 0 0 0.9643 0.0000 0.0000 196.000 0.50 1.00 -0.50 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.4974 0.5026 0.0000 0 0 0.8733 0.1267 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.050 1 -3 1 353 113 240 1 1 20 8 83 0 0 240 0 0 0.0088 0.0000 0.0000 4.842 6.00 3.17 2.83 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3527 0.6473 2 2 0.0000 0.1779 0.8221 2 2 0.0000 0.1456 0.8544
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.050 1 -2 1 436 134 302 131 1 0 0 2 0 0 302 0 0 0.9776 0.0000 0.0000 134.000 0.21 2.00 -1.79 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5143 0.4857 0.0000 0 0 0.8721 0.1279 0.0000 0 0 0.9184 0.0816 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.050 1 3 1 454 112 342 0 1 3 0 108 0 0 338 0 4 0.0000 0.0000 0.0117 36.333 3.44 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0340 0.9660 2 2 0.0000 0.0161 0.9839 2 2 0.0000 0.0132 0.9868
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.050 1 12 2 343 84 259 63 0 12 0 9 0 0 256 0 3 0.7500 0.0000 0.0116 6.000 1.19 12.33 -11.14 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9969 0.0000 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 1 0.1857 0.8143 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.050 1 6 2 444 103 341 1 0 2 4 96 0 0 340 1 0 0.0097 0.0000 0.0029 49.500 0.00 4.86 -4.86 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2892 0.7108 2 2 0.0000 0.1403 0.8597 2 2 0.0000 0.1151 0.8849
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.050 1 -3 1 447 137 310 131 0 4 0 2 0 0 310 0 0 0.9562 0.0000 0.0000 33.250 0.32 3.00 -2.68 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5079 0.4921 0.0000 0 0 0.8693 0.1307 0.0000 0 0 0.9166 0.0834 0.0000
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 15 1 670 242 428 17 100 36 1 88 1 1 402 1 23 0.0702 0.0023 0.0607 5.694 4.06 10.69 -6.63 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2612 0.5652 0.1736 1 1 0.2625 0.5603 0.1772 1 1 0.2639 0.5542 0.1819
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.050 1 6 1 630 173 457 6 0 44 3 120 0 0 444 0 13 0.0347 0.0000 0.0284 2.909 3.50 5.27 -1.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.6529 0.3471 2 2 0.0000 0.2602 0.7398
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 631 188 443 143 9 30 0 6 0 0 443 0 0 0.7606 0.0000 0.0000 5.267 4.53 3.50 1.03 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.4359 0.5641 0.0000 0 0 0.8041 0.1959 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.050 1 -2 5 493 154 339 0 0 10 0 144 0 0 337 0 2 0.0000 0.0000 0.0059 14.400 2.49 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0293 0.9707
chr3 44651128 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 5 197 70 127 44 0 3 0 23 0 0 127 0 0 0.6286 0.0000 0.0000 22.333 0.14 3.57 -3.43 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5280 0.4058 0.0662 1 0 0.5179 0.4117 0.0703 1 0 0.5045 0.4194 0.0761
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 315 135 180 0 0 2 0 133 0 0 180 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 66.500 4.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0340 0.9660 2 2 0.0000 0.0363 0.9637 2 2 0.0000 0.0396 0.9604
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 545 148 397 53 0 19 8 68 0 0 395 1 1 0.3581 0.0000 0.0050 6.789 0.30 3.41 -3.11 27 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0486 0.3881 0.5633 1 2 0.0524 0.3946 0.5530 1 2 0.0578 0.4031 0.5390
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.050 1 -3 3 398 130 268 48 1 19 7 55 0 0 267 0 1 0.3692 0.0000 0.0037 5.789 0.25 3.82 -3.57 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1058 0.4798 0.4144 1 1 0.1100 0.4811 0.4089 1 1 0.1157 0.4828 0.4015
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.050 1 -6 3 398 135 263 58 1 68 1 7 0 0 263 0 0 0.4296 0.0000 0.0000 1.000 0.36 5.86 -5.50 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0283 0.9717 0.0000 0 1 0.2141 0.7859 0.0000
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.050 1 6 1 444 148 296 57 0 22 1 68 0 0 289 0 7 0.3851 0.0000 0.0236 5.682 0.37 5.44 -5.07 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0748 0.4455 0.4798 1 2 0.0791 0.4488 0.4721 1 2 0.0850 0.4532 0.4618
chr3 52693748 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 697 180 517 166 0 10 0 4 0 0 517 0 0 0.9222 0.0000 0.0000 17.000 0.31 4.00 -3.69 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0869 0.9131 0.0000 0 0 0.8057 0.1943 0.0000 0 0 0.9236 0.0764 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.050 1 10 2 141 77 64 35 0 13 1 28 0 0 62 0 2 0.4545 0.0000 0.0312 4.923 0.06 7.68 -7.62 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2897 0.5153 0.1950 1 1 0.2886 0.5141 0.1973 1 1 0.2871 0.5127 0.2002
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 222 77 145 1 0 4 37 35 0 0 144 1 0 0.0130 0.0000 0.0069 18.250 0.00 3.17 -3.17 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4554 0.5446 2 2 0.0000 0.2484 0.7516 2 2 0.0000 0.2054 0.7946
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 221 75 146 2 0 2 32 39 0 0 145 0 1 0.0267 0.0000 0.0068 36.500 0.50 4.21 -3.71 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8162 0.1838 2 2 0.0000 0.4018 0.5982 2 2 0.0000 0.2808 0.7192
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.050 1 3 1 279 115 164 5 2 8 2 98 0 0 162 0 2 0.0435 0.0000 0.0122 13.375 0.80 3.11 -2.31 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8865 0.1135 2 1 0.0000 0.5304 0.4696
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.050 1 1 1 727 162 565 154 0 4 0 4 0 0 565 0 0 0.9506 0.0000 0.0000 39.500 0.99 1.00 -0.01 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0695 0.9305 0.0000 0 0 0.7567 0.2433 0.0000 0 0 0.9009 0.0991 0.0000
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 472 147 325 130 0 11 0 6 0 0 325 0 0 0.8844 0.0000 0.0000 12.364 0.40 1.00 -0.60 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.3146 0.6854 0.0000 0 0 0.7096 0.2904 0.0000
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 369 106 263 92 0 12 0 2 0 0 263 0 0 0.8679 0.0000 0.0000 7.833 0.36 1.00 -0.64 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2909 0.7091 0.0000 0 0 0.7194 0.2806 0.0000 0 0 0.8122 0.1878 0.0000
chr3 107772911 TAGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 608 147 461 141 0 3 0 3 0 0 460 0 1 0.9592 0.0000 0.0022 48.000 0.15 3.00 -2.85 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0483 0.9517 0.0000 0 0 0.6913 0.3087 0.0000 0 0 0.8691 0.1309 0.0000
chr3 112534211 C CAA 0.500000 0.050 1 2 1 109 33 76 16 2 3 0 12 0 0 75 0 1 0.4848 0.0000 0.0132 10.000 0.06 2.08 -2.02 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3083 0.5021 0.1896 1 1 0.3062 0.5020 0.1919 1 1 0.3034 0.5018 0.1948
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1110 262 848 0 0 57 104 101 0 0 847 0 1 0.0000 0.0000 0.0012 3.544 3.28 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0056 0.9944 2 2 0.0000 0.0062 0.9938 2 2 0.0000 0.0071 0.9929
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -6 1 1113 268 845 4 4 146 3 111 0 0 844 1 0 0.0149 0.0000 0.0012 0.825 0.25 8.07 -7.82 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9843 0.0157 2 1 0.0000 0.5760 0.4240 2 2 0.0000 0.2998 0.7002
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1116 277 839 99 9 49 12 108 0 0 839 0 0 0.3574 0.0000 0.0000 4.766 2.70 7.84 -5.15 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1185 0.5345 0.3470 1 1 0.1229 0.5318 0.3453 1 1 0.1288 0.5284 0.3428
chr3 119146279 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 569 176 393 87 0 12 0 77 0 0 390 0 3 0.4943 0.0000 0.0076 13.667 0.26 3.10 -2.84 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3091 0.5363 0.1547 1 1 0.3081 0.5335 0.1584 1 1 0.3067 0.5301 0.1633
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.050 1 3 3 494 142 352 86 1 2 0 53 0 0 351 0 1 0.6056 0.0000 0.0028 70.000 0.12 3.11 -3.00 62 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6653 0.3093 0.0255 1 0 0.6527 0.3189 0.0283 1 0 0.6356 0.3319 0.0326
chr3 123700269 GTTC G 0.500000 0.050 1 -3 1 619 135 484 69 0 4 0 62 0 0 483 0 1 0.5111 0.0000 0.0021 32.750 0.33 3.03 -2.70 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3031 0.5294 0.1675 1 1 0.3020 0.5272 0.1707 1 1 0.3005 0.5244 0.1751
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.050 1 18 2 711 140 571 1 1 22 1 115 0 0 570 0 1 0.0071 0.0000 0.0018 5.364 0.00 8.22 -8.22 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4642 0.5358 2 2 0.0000 0.1629 0.8371 2 2 0.0000 0.1100 0.8900
chr3 125055810 GGCC G 0.500000 0.050 1 -3 5 235 79 156 45 0 4 0 30 0 0 155 0 1 0.5696 0.0000 0.0064 18.750 0.69 3.60 -2.91 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4257 0.4676 0.1066 1 1 0.4194 0.4698 0.1108 1 1 0.4109 0.4726 0.1165
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 177 95 82 43 0 0 0 52 0 0 82 0 0 0.4526 0.0000 0.0000 95.000 0.44 2.79 -2.35 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1441 0.5050 0.3509 1 1 0.1478 0.5046 0.3476 1 1 0.1526 0.5041 0.3433
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 344 137 207 68 1 2 0 66 0 0 207 0 0 0.4964 0.0000 0.0000 67.500 1.19 2.15 -0.96 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2647 0.5384 0.1969 1 1 0.2650 0.5355 0.1994 1 1 0.2654 0.5319 0.2027
chr3 149520808 C CTTAA 0.500000 0.050 1 4 1 209 72 137 48 0 0 0 24 0 0 136 0 1 0.6667 0.0000 0.0073 72.000 0.27 4.33 -4.06 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5543 0.3887 0.0570 1 0 0.5435 0.3955 0.0610 1 0 0.5290 0.4044 0.0667
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.050 1 -3 2 393 147 246 113 2 22 0 10 0 0 246 0 0 0.7687 0.0000 0.0000 5.682 0.37 3.30 -2.93 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0210 0.9790 0.0000 0 1 0.2770 0.7230 0.0000
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.050 1 3 1 496 109 387 48 1 17 0 43 0 0 385 0 2 0.4404 0.0000 0.0052 5.412 0.42 3.47 -3.05 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2846 0.5238 0.1916 1 1 0.2839 0.5220 0.1941 1 1 0.2829 0.5198 0.1973
chr3 195783188 TGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAGGGCTGGTGACATGAAGAGGGGTGGC T 0.500000 0.050 1 -48 2 73 23 50 7 2 1 2 11 8 3 35 2 2 0.3043 0.1600 0.3000 21.000 3.57 5.64 -2.06 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2919 0.5068 0.2013 1 1 0.2905 0.5063 0.2032 1 1 0.2886 0.5056 0.2058
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.050 1 15 1 809 183 626 0 0 18 0 165 0 1 585 1 39 0.0000 0.0000 0.0655 9.167 11.61 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0070 0.9930 2 2 0.0000 0.0079 0.9921
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -6 1 209 85 124 0 0 19 1 65 0 0 122 0 2 0.0000 0.0000 0.0161 3.474 6.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1532 0.8468 2 2 0.0000 0.1577 0.8423 2 2 0.0000 0.1640 0.8360
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -9 1 209 88 121 3 3 18 51 13 0 0 121 0 0 0.0341 0.0000 0.0000 3.778 1.33 7.85 -6.51 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9858 0.0142 2 1 0.0000 0.7560 0.2440 2 1 0.0000 0.5229 0.4771
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.050 1 21 1 522 128 394 76 0 2 0 50 0 0 353 1 40 0.5938 0.0000 0.1041 63.000 0.36 16.48 -16.12 26 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0364 0.4148 0.5488 1 2 0.0383 0.4171 0.5447 1 2 0.0408 0.4202 0.5389
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.050 1 -6 2 388 162 226 63 2 56 0 41 0 0 222 0 4 0.3889 0.0000 0.0177 1.893 1.67 7.05 -5.38 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6167 0.3542 0.0291 1 0 0.6093 0.3597 0.0310 1 0 0.5993 0.3670 0.0337
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.050 1 -6 2 489 140 349 137 0 0 0 3 0 0 349 0 0 0.9786 0.0000 0.0000 140.000 0.32 6.00 -5.68 79 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7814 0.2186 0.0000 0 0 0.9837 0.0163 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000
chr4 15003254 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 2 625 163 462 72 0 11 11 69 1 3 445 5 8 0.4417 0.0022 0.0368 13.818 1.07 6.72 -5.66 0 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0837 0.4729 0.4434 1 1 0.0881 0.4744 0.4375 1 1 0.0941 0.4765 0.4294
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 2 625 163 462 72 0 21 1 69 2 2 446 0 12 0.4417 0.0043 0.0346 6.762 1.07 7.72 -6.66 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1543 0.5327 0.3129 1 1 0.1580 0.5303 0.3117 1 1 0.1629 0.5271 0.3100
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 628 197 431 86 3 33 6 69 0 0 424 2 5 0.4365 0.0000 0.0162 5.258 1.45 7.26 -5.81 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3111 0.5363 0.1526 1 1 0.3101 0.5335 0.1563 1 1 0.3086 0.5301 0.1613
chr4 41745972 AGCTGCCGCCGCTGCC A 0.500000 0.050 1 -15 2 407 87 320 46 0 10 0 31 0 0 316 0 4 0.5287 0.0000 0.0125 7.700 1.15 10.13 -8.98 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3819 0.4895 0.1287 1 1 0.3773 0.4901 0.1326 1 1 0.3712 0.4910 0.1378
chr4 47595882 C CA 0.500000 0.050 1 1 3 193 45 148 25 0 0 0 20 0 0 148 0 0 0.5556 0.0000 0.0000 45.000 0.40 1.10 -0.70 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3067 0.5062 0.1871 1 1 0.3048 0.5057 0.1895 1 1 0.3022 0.5051 0.1927
chr4 56931051 GGAGCTGTCTCCTCCCATGGAGGTGGTCCAGAAGGAGCCTGTTCAGATA G 0.500000 0.050 1 -48 1 870 241 629 98 5 78 3 57 0 0 629 0 0 0.4066 0.0000 0.0000 2.162 0.35 2.68 -2.34 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7594 0.2290 0.0116 1 0 0.7463 0.2403 0.0134 1 0 0.7280 0.2558 0.0162
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 3 406 110 296 53 0 2 1 54 0 6 288 0 2 0.4818 0.0000 0.0270 54.000 0.75 3.89 -3.13 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2648 0.5329 0.2023 1 1 0.2650 0.5304 0.2045 1 1 0.2652 0.5273 0.2075
chr4 71567805 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 385 107 278 99 0 3 0 5 0 0 278 0 0 0.9252 0.0000 0.0000 34.667 0.88 1.80 -0.92 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 1 0.2917 0.7083 0.0000 0 0 0.6268 0.3732 0.0000
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.050 1 3 1 327 98 229 59 0 1 0 38 0 0 229 0 0 0.6020 0.0000 0.0000 97.000 0.63 3.32 -2.69 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5201 0.4147 0.0652 1 0 0.5107 0.4200 0.0694 1 0 0.4980 0.4269 0.0751
chr4 78870928 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 463 194 269 149 7 25 0 13 0 0 269 0 0 0.7680 0.0000 0.0000 6.680 0.34 2.77 -2.43 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0078 0.9922 0.0000 0 1 0.2496 0.7504 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.050 1 18 1 2136 490 1646 168 8 155 7 152 1 2 1626 3 14 0.3429 0.0006 0.0122 2.162 1.65 8.71 -7.06 46 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2245 0.6039 0.1717 1 1 0.2278 0.5962 0.1760 1 1 0.2318 0.5865 0.1816
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.050 1 9 1 3338 745 2593 381 20 42 12 290 47 44 2348 117 37 0.5114 0.0181 0.0945 17.718 2.70 8.51 -5.81 73 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6336 0.3607 0.0057 1 0 0.6311 0.3621 0.0068 1 0 0.6264 0.3650 0.0086
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 3068 943 2125 41 15 161 58 668 222 43 1811 19 30 0.0435 0.1045 0.1478 4.704 2.98 8.53 -5.55 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 87616280 TAGCAGTGACAGCAGTGAC T 0.500000 0.050 1 -18 1 2494 795 1699 625 50 108 7 5 18 15 1652 8 6 0.7862 0.0106 0.0277 6.476 2.52 13.80 -11.28 187 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr4 88697607 GACCAGCCGCGCTGTCAGGGTC G 0.500000 0.050 1 -21 1 535 187 348 155 1 29 0 2 0 0 347 0 1 0.8289 0.0000 0.0029 5.448 0.90 21.50 -20.60 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2745 0.7255 0.0000 0 0 0.8634 0.1366 0.0000 0 0 0.9324 0.0676 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.050 1 -3 1 191 85 106 41 0 4 0 40 0 0 106 0 0 0.4824 0.0000 0.0000 20.250 0.22 3.05 -2.83 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2495 0.5244 0.2260 1 1 0.2501 0.5226 0.2274 1 1 0.2507 0.5203 0.2291
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 696 181 515 87 0 5 0 89 0 0 513 0 2 0.4807 0.0000 0.0039 35.200 0.10 3.12 -3.02 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1813 0.5493 0.2693 1 1 0.1845 0.5456 0.2699 1 1 0.1886 0.5410 0.2704
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 4 488 194 294 0 0 19 8 167 0 0 290 0 4 0.0000 0.0000 0.0136 9.211 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0109 0.9891 2 2 0.0000 0.0119 0.9881 2 2 0.0000 0.0135 0.9865
chr4 140398890 GCT G 0.500000 0.050 1 -2 5 165 74 91 69 1 0 0 4 0 0 91 0 0 0.9324 0.0000 0.0000 74.000 0.14 3.00 -2.86 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0084 0.9916 0.0000 0 1 0.2796 0.7204 0.0000 0 0 0.5473 0.4527 0.0000
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 422 148 274 57 5 31 6 49 3 1 267 2 1 0.3851 0.0109 0.0255 3.774 1.63 3.04 -1.41 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3346 0.5172 0.1482 1 1 0.3323 0.5159 0.1519 1 1 0.3291 0.5142 0.1567
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 162 74 88 0 0 11 0 63 0 0 86 1 1 0.0000 0.0000 0.0227 5.727 4.59 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1631 0.8369 2 2 0.0000 0.1676 0.8324 2 2 0.0000 0.1739 0.8261
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 2 736 153 583 84 0 1 0 68 0 0 581 0 2 0.5490 0.0000 0.0034 152.000 0.26 3.18 -2.91 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4067 0.4914 0.1019 1 1 0.4020 0.4918 0.1062 1 1 0.3956 0.4923 0.1121
chr4 186236896 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 178 92 86 84 0 5 0 3 0 0 86 0 0 0.9130 0.0000 0.0000 17.400 0.56 2.33 -1.77 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0633 0.9367 0.0000 0 0 0.5202 0.4798 0.0000 0 0 0.7115 0.2885 0.0000
chr5 14488084 TGGAGCTCCATCC T 0.001036 0.050 1 -12 1 358 108 250 101 0 1 0 6 0 0 250 0 0 0.9352 0.0000 0.0000 107.000 0.59 10.50 -9.91 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4056 0.5944 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 789 186 603 70 1 23 5 87 0 0 602 0 1 0.3763 0.0000 0.0017 7.087 0.21 3.26 -3.05 16 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0586 0.4251 0.5162 1 2 0.0627 0.4295 0.5077 1 2 0.0685 0.4353 0.4963
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 2 309 111 198 88 3 12 2 6 1 1 196 0 0 0.7928 0.0051 0.0101 8.909 1.94 3.67 -1.72 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0837 0.9163 0.0000 0 1 0.3775 0.6225 0.0000
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.050 1 -15 4 272 24 248 0 0 13 0 11 0 1 241 2 4 0.0000 0.0000 0.0282 0.846 5.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0001 0.5438 0.4562 2 2 0.0001 0.4995 0.5005 2 2 0.0001 0.4715 0.5284
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 3 522 148 374 137 0 4 0 7 0 0 374 0 0 0.9257 0.0000 0.0000 36.000 0.30 3.00 -2.70 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2148 0.7852 0.0000 0 0 0.6644 0.3356 0.0000
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.050 1 -18 1 253 71 182 59 0 9 0 3 0 0 182 0 0 0.8310 0.0000 0.0000 6.889 2.97 11.00 -8.03 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0320 0.9680 0.0000 0 1 0.3663 0.6337 0.0000 0 0 0.5743 0.4257 0.0000
chr5 80654905 G GCCGCAGCGC 0.500000 0.050 1 9 2 242 53 189 23 1 5 0 24 0 0 189 0 0 0.4340 0.0000 0.0000 9.600 2.70 5.75 -3.05 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2426 0.5147 0.2427 1 1 0.2432 0.5135 0.2433 1 1 0.2439 0.5122 0.2440
chr5 96788614 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 221 91 130 50 0 2 0 39 0 0 130 0 0 0.5495 0.0000 0.0000 44.500 1.04 2.10 -1.06 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3800 0.4919 0.1281 1 1 0.3756 0.4924 0.1320 1 1 0.3697 0.4931 0.1373
chr5 96889375 CTCTT C 0.500000 0.050 1 -4 3 199 51 148 49 0 0 0 2 0 0 148 0 0 0.9608 0.0000 0.0000 51.000 0.39 4.00 -3.61 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1159 0.8841 0.0000 0 1 0.4682 0.5318 0.0000 0 0 0.6062 0.3938 0.0000
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 259 104 155 53 0 0 0 51 0 0 154 0 1 0.5096 0.0000 0.0065 104.000 0.36 3.08 -2.72 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2457 0.5317 0.2226 1 1 0.2465 0.5293 0.2242 1 1 0.2475 0.5263 0.2262
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 225 81 144 2 2 20 2 55 0 0 144 0 0 0.0247 0.0000 0.0000 3.050 2.00 5.02 -3.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9517 0.0483 2 1 0.0000 0.6680 0.3320 2 2 0.0000 0.4749 0.5251
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 516 160 356 15 0 17 2 126 0 0 352 2 2 0.0938 0.0000 0.0112 8.412 0.80 3.77 -2.97 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.9176 0.0824
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.050 1 -1 2 552 135 417 64 1 2 0 68 0 0 417 0 0 0.4741 0.0000 0.0000 66.500 0.44 1.28 -0.84 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1971 0.5378 0.2652 1 1 0.1996 0.5349 0.2655 1 1 0.2028 0.5314 0.2658
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.050 1 6 3 489 130 359 4 0 16 1 109 0 0 351 0 8 0.0308 0.0000 0.0223 7.125 0.00 5.45 -5.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9724 0.0276 2 2 0.0000 0.4406 0.5594 2 2 0.0000 0.2072 0.7928
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.050 1 9 1 284 76 208 39 1 5 0 31 0 0 195 0 13 0.5132 0.0000 0.0625 17.750 0.49 8.87 -8.38 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1891 0.5199 0.2909 1 1 0.1916 0.5184 0.2899 1 1 0.1949 0.5165 0.2885
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 198 68 130 2 0 0 0 66 0 0 130 0 0 0.0294 0.0000 0.0000 68.000 0.50 3.48 -2.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8326 0.1674 2 2 0.0000 0.4275 0.5725 2 2 0.0000 0.3018 0.6982
chr5 140549036 GGAGGAGC G 0.500000 0.050 1 -7 1 410 132 278 131 0 0 0 1 0 0 278 0 0 0.9924 0.0000 0.0000 132.000 0.27 17.00 -16.73 49 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8408 0.1592 0.0000 0 0 0.9284 0.0716 0.0000 0 0 0.9409 0.0591 0.0000
chr5 140549044 TGAAGGAGC T 0.500000 0.050 1 -8 1 411 130 281 129 0 0 0 1 0 0 280 1 0 0.9923 0.0000 0.0036 130.000 0.29 17.00 -16.71 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8051 0.1949 0.0000 0 0 0.9129 0.0871 0.0000 0 0 0.9301 0.0699 0.0000
chr5 141387924 CTGCCAG C 0.500000 0.050 1 -6 2 523 151 372 144 0 5 0 2 0 0 372 0 0 0.9536 0.0000 0.0000 29.200 0.21 6.00 -5.79 62 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5887 0.4113 0.0000 0 0 0.9016 0.0984 0.0000 0 0 0.9375 0.0625 0.0000
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 781 226 555 219 0 6 0 1 0 0 555 0 0 0.9690 0.0000 0.0000 36.667 0.30 1.00 -0.70 61 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9800 0.0200 0.0000 0 0 0.9913 0.0087 0.0000 0 0 0.9924 0.0076 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 9 1 412 107 305 3 1 11 0 92 0 0 296 0 9 0.0280 0.0000 0.0295 8.727 3.00 8.07 -5.07 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9786 0.0214 2 1 0.0000 0.5387 0.4613 2 2 0.0000 0.2803 0.7197
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 610 132 478 73 0 0 0 59 0 0 478 0 0 0.5530 0.0000 0.0000 132.000 0.10 1.78 -1.68 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4121 0.4847 0.1032 1 1 0.4069 0.4856 0.1075 1 1 0.3999 0.4868 0.1134
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.050 1 -1 4 555 136 419 131 0 0 0 5 0 0 419 0 0 0.9632 0.0000 0.0000 136.000 0.38 1.00 -0.62 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0081 0.9919 0.0000 0 1 0.4749 0.5251 0.0000 0 0 0.7832 0.2168 0.0000
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 322 119 203 4 0 2 0 113 0 0 199 0 4 0.0336 0.0000 0.0197 58.500 2.75 4.94 -2.19 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9730 0.0270 2 2 0.0000 0.4467 0.5533 2 2 0.0000 0.2111 0.7889
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.050 1 -15 1 324 119 205 83 5 12 14 5 0 0 205 0 0 0.6975 0.0000 0.0000 8.917 3.78 11.60 -7.82 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.0261 0.9739 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.050 1 3 1 324 104 220 0 3 0 1 100 0 0 218 0 2 0.0000 0.0000 0.0091 104.000 4.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8636 0.1364 2 2 0.0000 0.3523 0.6477 2 2 0.0000 0.2014 0.7986
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 168 60 108 31 0 2 0 27 0 0 107 0 1 0.5167 0.0000 0.0093 29.000 0.74 3.04 -2.30 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2780 0.5153 0.2067 1 1 0.2773 0.5141 0.2085 1 1 0.2764 0.5127 0.2110
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 1 424 100 324 3 0 6 0 91 0 0 323 0 1 0.0300 0.0000 0.0031 15.667 2.33 3.91 -1.58 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9224 0.0776 2 2 0.0000 0.4300 0.5700 2 2 0.0000 0.2505 0.7495
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 412 176 236 72 7 37 2 58 0 0 236 0 0 0.4091 0.0000 0.0000 3.730 1.11 3.36 -2.25 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4747 0.4494 0.0759 1 0 0.4673 0.4525 0.0802 1 0 0.4573 0.4566 0.0861
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 549 93 456 42 2 10 1 38 0 0 455 0 1 0.4516 0.0000 0.0022 8.200 0.57 2.84 -2.27 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2839 0.5211 0.1950 1 1 0.2831 0.5195 0.1973 1 1 0.2821 0.5175 0.2004
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.050 1 3 5 450 115 335 5 0 10 1 99 0 0 332 2 1 0.0435 0.0000 0.0090 10.500 0.00 3.61 -3.61 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9961 0.0039 2 1 0.0000 0.6854 0.3146 2 2 0.0000 0.3469 0.6531
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.050 1 3 1 533 130 403 47 3 30 3 47 2 1 392 0 8 0.3615 0.0050 0.0273 3.379 2.21 4.55 -2.34 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3060 0.5654 0.1286 1 1 0.3102 0.5619 0.1278 1 1 0.3158 0.5574 0.1268
chr6 22570117 G GGGC 0.051576 0.050 1 3 1 655 173 482 80 3 38 3 49 0 0 480 0 2 0.4624 0.0000 0.0041 3.526 0.21 3.35 -3.13 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7683 0.2293 0.0024 1 0 0.7605 0.2368 0.0027 1 0 0.7499 0.2471 0.0030
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.050 1 2 1 590 124 466 111 0 5 0 8 0 0 464 0 2 0.8952 0.0000 0.0043 23.800 0.26 2.12 -1.86 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1826 0.8174 0.0000 0 0 0.7999 0.2001 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.050 1 16 3 556 115 441 57 0 0 0 58 0 0 423 0 18 0.4957 0.0000 0.0408 115.000 0.19 11.05 -10.86 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1289 0.5401 0.3310 1 1 0.1355 0.5409 0.3236 1 1 0.1445 0.5417 0.3138
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 376 108 268 53 0 2 0 53 0 0 268 0 0 0.4907 0.0000 0.0000 53.000 0.09 1.34 -1.25 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2338 0.5323 0.2338 1 1 0.2351 0.5299 0.2351 1 1 0.2366 0.5268 0.2366
chr6 31027337 AC A 0.500000 0.050 1 -1 2 1248 274 974 127 4 27 3 113 3 6 955 2 8 0.4635 0.0031 0.0195 9.423 1.65 2.29 -0.65 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3922 0.5179 0.0899 1 1 0.3893 0.5162 0.0945 1 1 0.3852 0.5141 0.1007
chr6 31028710 GACC G 0.500000 0.050 1 -3 1 2549 548 2001 233 9 70 3 233 4 4 1952 17 24 0.4252 0.0020 0.0245 7.000 1.81 4.61 -2.80 31 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0285 0.4585 0.5130 1 2 0.0317 0.4588 0.5095 1 2 0.0363 0.4596 0.5041
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 1 841 231 610 215 1 10 0 5 1 1 608 0 0 0.9307 0.0016 0.0033 22.100 1.25 3.00 -1.75 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0644 0.9356 0.0000 0 0 0.8846 0.1154 0.0000 0 0 0.9667 0.0333 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.050 1 2 1 590 156 434 7 131 3 0 15 0 0 434 0 0 0.0449 0.0000 0.0000 50.333 0.00 1.60 -1.60 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.0739 0.9261 0.0000
chr6 31954568 CTCTCGG C 0.500000 0.050 1 -6 3 773 178 595 160 3 11 0 4 0 0 595 0 0 0.8989 0.0000 0.0000 15.091 0.91 6.75 -5.84 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0808 0.9192 0.0000 0 0 0.7934 0.2066 0.0000 0 0 0.9182 0.0818 0.0000
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 566 217 349 133 8 40 0 36 0 0 349 0 0 0.6129 0.0000 0.0000 4.605 3.25 8.58 -5.34 41 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9880 0.0120 0.0000 0 1 0.0093 0.9907 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 566 209 357 163 4 8 0 34 0 0 356 0 1 0.7799 0.0000 0.0028 33.333 4.70 8.79 -4.09 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.050 1 2 2 165 71 94 42 2 0 1 26 0 0 93 1 0 0.5915 0.0000 0.0106 71.000 7.10 9.42 -2.33 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4611 0.4476 0.0913 1 0 0.4534 0.4511 0.0955 1 1 0.4431 0.4556 0.1013
chr6 33086236 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 244 62 182 24 1 2 0 35 0 0 182 0 0 0.3871 0.0000 0.0000 30.000 7.17 7.91 -0.75 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1386 0.4889 0.3725 1 1 0.1422 0.4897 0.3681 1 1 0.1472 0.4907 0.3622
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.050 1 6 5 457 173 284 94 0 22 0 57 0 0 274 0 10 0.5434 0.0000 0.0352 6.864 0.54 5.98 -5.44 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5838 0.3754 0.0407 1 0 0.5733 0.3824 0.0443 1 0 0.5590 0.3915 0.0495
chr6 35141212 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 203 71 132 37 0 3 0 31 0 0 132 0 0 0.5211 0.0000 0.0000 22.667 0.05 1.58 -1.53 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3157 0.5099 0.1744 1 1 0.3136 0.5092 0.1773 1 1 0.3107 0.5082 0.1810
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.050 1 18 1 364 98 266 84 0 11 0 3 0 0 266 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 7.909 0.95 6.33 -5.38 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0582 0.9418 0.0000 0 0 0.5170 0.4830 0.0000 0 0 0.7107 0.2893 0.0000
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.050 1 1 2 435 155 280 79 0 7 0 69 0 0 278 0 2 0.5097 0.0000 0.0071 21.143 0.39 1.55 -1.16 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3256 0.5267 0.1477 1 1 0.3239 0.5247 0.1514 1 1 0.3215 0.5221 0.1564
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 442 130 312 58 0 4 0 68 0 0 312 0 0 0.4462 0.0000 0.0000 31.500 0.55 3.16 -2.61 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1331 0.5091 0.3578 1 1 0.1370 0.5083 0.3546 1 1 0.1423 0.5074 0.3503
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 273 120 153 48 0 17 0 55 0 0 150 0 3 0.4000 0.0000 0.0196 6.059 0.62 6.38 -5.76 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1348 0.5030 0.3622 1 1 0.1386 0.5027 0.3587 1 1 0.1438 0.5023 0.3539
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 15 2 530 143 387 41 0 68 3 31 0 0 368 0 19 0.2867 0.0000 0.0491 1.088 1.27 7.32 -6.05 5 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1219 0.4886 0.3895 1 1 0.1259 0.4893 0.3848 1 1 0.1313 0.4902 0.3784
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.050 1 -15 2 531 176 355 122 0 52 0 2 0 0 355 0 0 0.6932 0.0000 0.0000 2.385 2.44 8.00 -5.56 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4514 0.5486 0.0000 0 0 0.8420 0.1580 0.0000 0 0 0.8985 0.1015 0.0000
chr6 83142027 AAAC A 0.500000 0.050 1 -3 4 148 56 92 51 0 3 0 2 0 0 92 0 0 0.9107 0.0000 0.0000 17.667 0.27 3.00 -2.73 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1212 0.8788 0.0000 0 1 0.4805 0.5195 0.0000 0 0 0.6176 0.3824 0.0000
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.050 1 -6 1 532 123 409 110 0 9 0 4 1 2 406 0 0 0.8943 0.0024 0.0073 12.667 1.03 4.75 -3.72 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0251 0.9749 0.0000 0 0 0.5340 0.4660 0.0000 0 0 0.7758 0.2242 0.0000
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 2 124 38 86 2 0 2 2 32 0 0 84 0 2 0.0526 0.0000 0.0233 18.000 0.00 3.09 -3.09 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9137 0.0863 2 1 0.0000 0.6103 0.3897 2 2 0.0000 0.4703 0.5297
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.050 1 3 2 705 167 538 0 0 7 0 160 0 0 533 0 5 0.0000 0.0000 0.0093 22.857 3.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0155 0.9845 2 2 0.0000 0.0168 0.9832 2 2 0.0000 0.0188 0.9812
chr6 123464887 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 364 111 253 94 5 9 0 3 0 0 253 0 0 0.8468 0.0000 0.0000 11.222 0.47 1.00 -0.53 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0904 0.9096 0.0000 0 0 0.6084 0.3916 0.0000 0 0 0.7773 0.2227 0.0000
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 344 103 241 53 0 1 1 48 0 0 240 0 1 0.5146 0.0000 0.0041 102.000 0.45 1.19 -0.73 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2704 0.5287 0.2009 1 1 0.2703 0.5265 0.2032 1 1 0.2701 0.5238 0.2061
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 2 875 238 637 109 0 12 1 116 0 0 633 1 3 0.4580 0.0000 0.0063 18.833 0.15 3.20 -3.05 7 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1090 0.5273 0.3637 1 1 0.1134 0.5251 0.3615 1 1 0.1195 0.5223 0.3582
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.050 1 -4 3 199 86 113 47 0 1 0 38 0 0 112 0 1 0.5465 0.0000 0.0088 85.000 0.30 4.05 -3.75 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3391 0.5072 0.1537 1 1 0.3362 0.5066 0.1572 1 1 0.3324 0.5059 0.1617
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.050 1 -18 1 672 284 388 226 1 49 0 8 0 0 387 0 1 0.7958 0.0000 0.0026 4.796 0.27 14.88 -14.61 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3983 0.6017 0.0000 0 0 0.8906 0.1094 0.0000
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.050 1 -3 5 353 119 234 0 0 1 1 117 0 0 232 0 2 0.0000 0.0000 0.0085 118.000 5.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0466 0.9534 2 2 0.0000 0.0493 0.9507 2 2 0.0000 0.0534 0.9466
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.050 1 -8 2 195 74 121 38 0 3 0 33 0 0 120 0 1 0.5135 0.0000 0.0083 23.667 0.21 8.03 -7.82 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2886 0.5171 0.1943 1 1 0.2876 0.5158 0.1966 1 1 0.2862 0.5142 0.1996
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 304 129 175 1 0 20 8 100 0 0 171 1 3 0.0078 0.0000 0.0229 5.300 0.00 3.14 -3.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2357 0.7643 2 2 0.0000 0.1107 0.8893 2 2 0.0000 0.0909 0.9091
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.050 1 12 3 591 139 452 60 0 23 0 56 0 0 441 0 11 0.4317 0.0000 0.0243 5.043 0.20 8.16 -7.96 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1587 0.5241 0.3172 1 1 0.1622 0.5223 0.3156 1 1 0.1668 0.5199 0.3133
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 723 255 468 89 7 23 74 62 0 0 468 0 0 0.3490 0.0000 0.0000 13.267 0.27 6.24 -5.97 49 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0388 0.3855 0.5757 1 2 0.0423 0.3916 0.5661 1 2 0.0474 0.3998 0.5529
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 722 241 481 173 8 5 23 32 0 0 481 0 0 0.7178 0.0000 0.0000 47.000 1.86 8.66 -6.80 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9949 0.0051 0.0000 1 0 0.9937 0.0063 0.0000 0 1 0.0051 0.9949 0.0000
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 722 246 476 167 13 17 24 25 0 0 476 0 0 0.6789 0.0000 0.0000 19.364 1.87 7.72 -5.85 39 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0164 0.9836 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 2 223 56 167 0 1 1 1 53 0 0 164 0 3 0.0000 0.0000 0.0180 55.000 3.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3287 0.6713 2 2 0.0000 0.2766 0.7234 2 2 0.0000 0.2538 0.7462
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.050 1 4 1 250 96 154 37 0 29 2 28 0 0 151 0 3 0.3854 0.0000 0.0195 2.310 0.65 3.75 -3.10 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2891 0.5165 0.1944 1 1 0.2881 0.5152 0.1967 1 1 0.2867 0.5137 0.1997
chr7 11831843 A AGCAGCGGCAGCG 0.500000 0.050 1 12 2 225 113 112 51 0 18 0 44 0 0 105 0 7 0.4513 0.0000 0.0625 5.278 1.18 10.14 -8.96 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2344 0.5311 0.2344 1 1 0.2356 0.5288 0.2356 1 1 0.2371 0.5258 0.2371
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 199 70 129 39 0 0 0 31 0 0 129 0 0 0.5571 0.0000 0.0000 70.000 0.10 1.77 -1.67 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3424 0.5023 0.1553 1 1 0.3393 0.5021 0.1586 1 1 0.3351 0.5019 0.1630
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 635 194 441 75 0 29 5 85 0 0 441 0 0 0.3866 0.0000 0.0000 5.690 0.32 3.20 -2.88 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0949 0.4872 0.4178 1 1 0.0993 0.4879 0.4128 1 1 0.1053 0.4887 0.4060
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.050 1 3 2 398 89 309 39 0 7 1 42 0 0 307 0 2 0.4382 0.0000 0.0065 11.571 0.18 2.98 -2.80 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1747 0.5154 0.3099 1 1 0.1776 0.5142 0.3082 1 1 0.1814 0.5128 0.3058
chr7 27095697 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 1 831 302 529 244 8 46 1 3 1 0 527 1 0 0.8079 0.0019 0.0038 5.543 1.31 4.33 -3.02 44 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6953 0.3047 0.0000 0 0 0.9778 0.0222 0.0000 0 0 0.9903 0.0097 0.0000
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.050 1 1 3 109 39 70 18 2 6 1 12 0 0 68 2 0 0.4615 0.0000 0.0286 6.200 0.83 1.25 -0.42 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3047 0.5036 0.1917 1 1 0.3027 0.5033 0.1939 1 1 0.3002 0.5030 0.1969
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 465 133 332 65 0 0 0 68 0 0 332 0 0 0.4887 0.0000 0.0000 133.000 0.34 1.29 -0.96 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1971 0.5378 0.2651 1 1 0.1996 0.5349 0.2655 1 1 0.2029 0.5314 0.2658
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 198 68 130 42 0 0 0 26 0 0 128 0 2 0.6176 0.0000 0.0154 68.000 0.07 3.42 -3.35 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4272 0.4658 0.1070 1 1 0.4207 0.4681 0.1112 1 1 0.4121 0.4711 0.1168
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 163 45 118 1 0 23 2 19 0 0 117 1 0 0.0222 0.0000 0.0085 0.957 9.00 4.21 4.79 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7547 0.2453 2 1 0.0000 0.5510 0.4490 2 2 0.0000 0.4809 0.5191
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.050 1 2 1 162 46 116 1 21 3 2 19 0 0 115 0 1 0.0217 0.0000 0.0086 7.333 9.00 4.26 4.74 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1509 0.4868 0.3623 1 1 0.1536 0.4888 0.3576 1 1 0.1561 0.4926 0.3513
chr7 65954366 TTTA T 0.500000 0.050 1 -3 5 451 132 319 32 0 23 4 73 0 0 319 0 0 0.2424 0.0000 0.0000 4.739 0.06 3.12 -3.06 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0092 0.1956 0.7952 1 2 0.0108 0.2074 0.7818 1 2 0.0132 0.2238 0.7630
chr7 74753110 ACT A 0.500000 0.050 1 -2 1 145 60 85 55 0 0 0 5 0 0 85 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 60.000 0.93 4.00 -3.07 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.1211 0.8789 0.0000 0 1 0.3684 0.6316 0.0000
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 410 124 286 64 0 0 0 60 0 1 285 0 0 0.5161 0.0000 0.0035 124.000 0.12 1.73 -1.61 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2916 0.5306 0.1779 1 1 0.2909 0.5283 0.1809 1 1 0.2898 0.5254 0.1848
chr7 80661109 AAC A 0.500000 0.050 1 -2 1 130 67 63 46 0 0 0 21 0 0 63 0 0 0.6866 0.0000 0.0000 67.000 0.65 2.57 -1.92 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5831 0.3677 0.0492 1 0 0.5714 0.3756 0.0531 1 0 0.5557 0.3859 0.0585
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 5 859 214 645 0 0 13 0 201 0 0 635 0 10 0.0000 0.0000 0.0155 15.462 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0049 0.9951 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0063 0.9937
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.050 1 3 2 506 140 366 6 0 15 2 117 0 0 357 1 8 0.0429 0.0000 0.0246 8.333 0.50 3.60 -3.10 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.7020 0.2980 2 2 0.0000 0.3032 0.6968
chr7 94663513 ACAACTC A 0.500000 0.050 1 -6 2 495 153 342 80 4 1 0 68 0 0 340 0 2 0.5229 0.0000 0.0058 148.000 0.71 5.99 -5.27 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3966 0.4964 0.1070 1 1 0.3922 0.4965 0.1113 1 1 0.3863 0.4966 0.1171
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 1 410 161 249 61 5 52 3 40 0 0 247 0 2 0.3789 0.0000 0.0080 2.077 1.31 4.12 -2.81 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5211 0.4156 0.0633 1 0 0.5118 0.4208 0.0674 1 0 0.4993 0.4275 0.0732
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.050 1 -4 1 472 150 322 68 0 2 0 80 0 0 321 0 1 0.4533 0.0000 0.0031 74.000 0.85 3.84 -2.98 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1089 0.4971 0.3940 1 1 0.1132 0.4971 0.3897 1 1 0.1190 0.4972 0.3838
chr7 100124796 CAGGAGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 477 154 323 139 1 11 1 2 0 0 323 0 0 0.9026 0.0000 0.0000 12.909 0.13 6.00 -5.87 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5430 0.4570 0.0000 0 0 0.8851 0.1149 0.0000 0 0 0.9275 0.0725 0.0000
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.050 1 -7 1 476 163 313 155 1 3 0 4 0 0 313 0 0 0.9509 0.0000 0.0000 53.333 0.18 7.00 -6.82 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0688 0.9312 0.0000 0 0 0.7642 0.2358 0.0000 0 0 0.9049 0.0951 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 575 161 414 148 0 9 0 4 0 0 413 0 1 0.9193 0.0000 0.0024 16.889 0.54 2.50 -1.96 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0117 0.9883 0.0000 0 0 0.5771 0.4229 0.0000 0 0 0.8442 0.1558 0.0000
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 299 72 227 0 0 23 1 48 0 0 225 0 2 0.0000 0.0000 0.0088 2.130 6.44 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2162 0.7838 2 2 0.0000 0.2206 0.7794 2 2 0.0000 0.2268 0.7732
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 794 219 575 202 1 8 0 8 0 1 573 1 0 0.9224 0.0000 0.0035 26.375 1.28 4.25 -2.97 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.3869 0.6131 0.0000 0 0 0.8574 0.1426 0.0000
chr7 124032402 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 721 201 520 168 2 21 4 6 1 0 519 0 0 0.8358 0.0019 0.0019 8.950 0.60 3.00 -2.40 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0848 0.9152 0.0000 0 0 0.6018 0.3982 0.0000
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 722 201 521 171 2 24 0 4 1 0 520 0 0 0.8507 0.0019 0.0019 7.375 0.59 6.00 -5.41 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1055 0.8945 0.0000 0 0 0.8366 0.1634 0.0000 0 0 0.9369 0.0631 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.050 1 -6 1 347 185 162 164 0 14 0 7 0 0 162 0 0 0.8865 0.0000 0.0000 12.214 0.62 7.14 -6.53 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3474 0.6526 0.0000 0 0 0.7908 0.2092 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 221 68 153 0 0 1 0 67 0 0 151 0 2 0.0000 0.0000 0.0131 67.000 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1498 0.8502 2 2 0.0000 0.1543 0.8457 2 2 0.0000 0.1606 0.8394
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 3 873 269 604 6 0 44 5 214 0 0 601 0 3 0.0223 0.0000 0.0050 5.091 0.67 3.16 -2.49 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9852 0.0148 2 2 0.0000 0.1875 0.8125 2 2 0.0000 0.0436 0.9564
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 736 177 559 0 0 5 0 172 0 0 559 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 34.400 1.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0130 0.9870 2 2 0.0000 0.0142 0.9858 2 2 0.0000 0.0160 0.9840
chr7 143727510 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 1 109 51 58 47 0 1 0 3 0 0 58 0 0 0.9216 0.0000 0.0000 50.000 0.32 5.33 -5.01 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0238 0.9762 0.0000 0 1 0.3006 0.6994 0.0000 0 0 0.5030 0.4970 0.0000
chr7 143727511 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 109 50 59 45 2 0 1 2 0 0 59 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 50.000 0.33 8.00 -7.67 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0310 0.9690 0.0000 0 1 0.3100 0.6900 0.0000 0 0 0.5066 0.4934 0.0000
chr7 143727518 A AACTGGCAGTTC 0.500000 0.050 1 11 1 109 46 63 41 2 0 0 3 0 0 63 0 0 0.8913 0.0000 0.0000 45.000 0.32 5.33 -5.02 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0215 0.9785 0.0000 0 1 0.2797 0.7203 0.0000 0 1 0.4783 0.5217 0.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 646 139 507 64 0 3 0 72 0 0 506 0 1 0.4604 0.0000 0.0020 45.333 0.17 4.08 -3.91 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1404 0.5179 0.3418 1 1 0.1442 0.5165 0.3393 1 1 0.1494 0.5147 0.3359
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.050 1 -4 1 334 202 132 190 0 5 0 7 0 0 132 0 0 0.9406 0.0000 0.0000 39.400 1.19 3.86 -2.67 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.5060 0.4940 0.0000 0 0 0.8763 0.1237 0.0000
chr7 144667784 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 168 73 95 68 0 1 0 4 0 0 95 0 0 0.9315 0.0000 0.0000 72.000 0.19 2.75 -2.56 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0085 0.9915 0.0000 0 1 0.2718 0.7282 0.0000 0 0 0.5365 0.4635 0.0000
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 738 190 548 183 0 3 0 4 0 0 548 0 0 0.9632 0.0000 0.0000 62.333 0.28 2.00 -1.72 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1307 0.8693 0.0000 0 0 0.8636 0.1364 0.0000 0 0 0.9479 0.0521 0.0000
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 433 107 326 101 0 1 0 5 0 0 326 0 0 0.9439 0.0000 0.0000 106.000 1.16 1.60 -0.44 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 1 0.3009 0.6991 0.0000 0 0 0.6375 0.3625 0.0000
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.050 1 -12 2 647 185 462 93 0 10 0 82 1 1 454 0 6 0.5027 0.0022 0.0173 17.500 0.67 11.79 -11.13 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3056 0.5412 0.1532 1 1 0.3050 0.5381 0.1570 1 1 0.3039 0.5341 0.1620
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 334 72 262 0 0 4 16 52 0 3 240 8 11 0.0000 0.0000 0.0840 22.000 6.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1616 0.8384 2 2 0.0000 0.1543 0.8457 2 2 0.0000 0.1506 0.8494
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 335 71 264 0 0 6 17 48 0 0 242 12 10 0.0000 0.0000 0.0833 14.750 6.67 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1032 0.8968 2 2 0.0000 0.1073 0.8927 2 2 0.0000 0.1132 0.8868
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 339 69 270 0 0 7 6 56 0 0 225 21 24 0.0000 0.0000 0.1667 12.000 6.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0653 0.9347 2 2 0.0000 0.0686 0.9314 2 2 0.0000 0.0735 0.9265
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.050 1 -1 3 323 112 211 71 1 0 0 40 0 0 211 0 0 0.6339 0.0000 0.0000 112.000 0.11 1.98 -1.86 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6602 0.3118 0.0280 1 0 0.6474 0.3216 0.0310 1 0 0.6299 0.3347 0.0354
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 363 93 270 41 0 2 0 50 0 0 269 0 1 0.4409 0.0000 0.0037 45.500 0.07 3.14 -3.07 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1359 0.4987 0.3654 1 1 0.1397 0.4987 0.3615 1 1 0.1448 0.4988 0.3564
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.050 1 -6 2 705 146 559 117 0 26 0 3 0 0 559 0 0 0.8014 0.0000 0.0000 4.615 0.48 6.67 -6.19 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1050 0.8950 0.0000 0 0 0.6666 0.3334 0.0000 0 0 0.8179 0.1821 0.0000
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.050 1 -3 1 251 84 167 4 0 1 0 79 0 0 167 0 0 0.0476 0.0000 0.0000 83.000 0.75 3.20 -2.45 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9912 0.0088 2 1 0.0000 0.7124 0.2876 2 2 0.0000 0.4444 0.5556
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.050 1 -6 1 533 250 283 0 0 47 0 203 0 0 283 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.319 5.64 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.050 1 -6 2 342 144 198 82 0 2 0 60 0 0 194 1 3 0.5694 0.0000 0.0202 71.000 0.50 7.48 -6.98 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6059 0.3689 0.0251 1 0 0.6001 0.3732 0.0267 1 0 0.5922 0.3790 0.0288
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.050 1 -3 3 512 163 349 4 0 2 1 156 0 0 345 0 4 0.0245 0.0000 0.0115 80.500 0.00 3.28 -3.28 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9507 0.0493 2 2 0.0000 0.3072 0.6928 2 2 0.0000 0.1316 0.8684
chr8 80486812 TGTC T 0.500000 0.050 1 -3 1 290 87 203 47 0 3 1 36 0 0 200 0 3 0.5402 0.0000 0.0148 28.000 1.98 5.22 -3.24 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3248 0.5120 0.1631 1 1 0.3226 0.5111 0.1663 1 1 0.3195 0.5099 0.1706
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.050 1 -27 4 649 202 447 104 1 8 0 89 0 0 446 0 1 0.5149 0.0000 0.0022 24.250 2.39 17.84 -15.45 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4105 0.4963 0.0932 1 1 0.4061 0.4963 0.0976 1 1 0.4001 0.4963 0.1037
chr8 123369918 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 1 318 92 226 74 5 11 0 2 0 0 226 0 0 0.8043 0.0000 0.0000 7.273 0.54 3.50 -2.96 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2178 0.7822 0.0000 0 0 0.6478 0.3522 0.0000 0 0 0.7590 0.2410 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 395 115 280 0 0 30 3 82 0 0 276 0 4 0.0000 0.0000 0.0143 2.833 4.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0963 0.9037 2 2 0.0000 0.1002 0.8998 2 2 0.0000 0.1059 0.8941
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.050 1 15 1 881 202 679 163 0 34 0 5 0 0 677 0 2 0.8069 0.0000 0.0029 5.091 0.39 9.40 -9.01 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3442 0.6558 0.0000 0 0 0.7885 0.2115 0.0000
chr8 144462367 G GGCC 0.500000 0.050 1 3 2 377 134 243 84 6 35 2 7 1 0 242 0 0 0.6269 0.0041 0.0041 2.939 1.11 5.14 -4.04 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0517 0.9483 0.0000 0 1 0.3175 0.6825 0.0000
chr8 144464275 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 511 102 409 53 1 7 3 38 0 0 408 0 1 0.5196 0.0000 0.0024 13.429 0.32 1.45 -1.13 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3972 0.4852 0.1176 1 1 0.3922 0.4862 0.1217 1 1 0.3854 0.4874 0.1272
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.050 1 -3 2 942 205 737 110 0 3 0 92 0 0 736 0 1 0.5366 0.0000 0.0014 67.333 0.33 3.32 -2.99 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4363 0.4825 0.0812 1 1 0.4311 0.4833 0.0856 1 1 0.4239 0.4844 0.0917
chr8 144846107 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 1 466 203 263 190 1 8 0 4 0 0 263 0 0 0.9360 0.0000 0.0000 24.250 0.24 3.00 -2.76 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1511 0.8489 0.0000 0 0 0.8845 0.1155 0.0000 0 0 0.9564 0.0436 0.0000
chr9 116848 T TA 0.003653 0.050 1 1 1 941 225 716 214 1 6 0 4 1 0 715 0 0 0.9511 0.0014 0.0014 36.500 0.32 1.00 -0.68 116 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9904 0.0096 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.050 1 -3 2 568 165 403 47 1 35 10 72 0 0 402 1 0 0.2848 0.0000 0.0025 3.714 0.11 3.14 -3.03 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0711 0.5498 0.3791 1 1 0.0781 0.5578 0.3641 1 1 0.0880 0.5675 0.3445
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 2 306 91 215 32 0 26 0 33 0 0 209 0 6 0.3516 0.0000 0.0279 2.500 0.66 8.94 -8.28 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1644 0.5070 0.3286 1 1 0.1676 0.5065 0.3260 1 1 0.1717 0.5058 0.3225
chr9 34552176 C CTGGCAG 0.500000 0.050 1 6 1 392 123 269 118 0 3 0 2 0 0 269 0 0 0.9593 0.0000 0.0000 40.000 0.37 6.00 -5.63 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4266 0.5734 0.0000 0 0 0.8284 0.1716 0.0000 0 0 0.8895 0.1105 0.0000
chr9 35562396 A ATAGT 0.500000 0.050 1 4 5 638 162 476 158 0 2 0 2 1 0 475 0 0 0.9753 0.0021 0.0021 80.000 2.32 4.50 -2.18 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6761 0.3239 0.0000 0 0 0.9299 0.0701 0.0000 0 0 0.9556 0.0444 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.050 1 -12 1 754 186 568 144 0 35 0 7 1 0 567 0 0 0.7742 0.0018 0.0018 4.314 0.43 10.71 -10.28 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2499 0.7501 0.0000 0 0 0.7056 0.2944 0.0000
chr9 66908681 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 3 362 127 235 87 0 2 0 38 0 0 235 0 0 0.6850 0.0000 0.0000 62.500 0.93 4.03 -3.10 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8234 0.1702 0.0065 1 0 0.8105 0.1818 0.0077 1 0 0.7924 0.1980 0.0096
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.050 1 -15 3 451 134 317 129 0 3 0 2 0 0 316 0 1 0.9627 0.0000 0.0032 43.667 0.10 15.50 -15.40 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1609 0.8391 0.0000 0 0 0.7645 0.2355 0.0000 0 0 0.8784 0.1216 0.0000
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.050 1 12 1 707 161 546 137 0 19 0 5 0 0 545 0 1 0.8509 0.0000 0.0018 7.474 0.40 10.20 -9.80 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.3479 0.6521 0.0000 0 0 0.7416 0.2584 0.0000
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 475 137 338 66 1 4 0 66 0 0 335 0 3 0.4818 0.0000 0.0089 33.250 0.29 3.20 -2.91 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2060 0.5400 0.2540 1 1 0.2083 0.5370 0.2547 1 1 0.2112 0.5332 0.2556
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 1 230 75 155 70 0 1 0 4 0 0 155 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 74.000 0.10 4.25 -4.15 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0084 0.9916 0.0000 0 1 0.2799 0.7201 0.0000 0 0 0.5478 0.4522 0.0000
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.050 1 -3 2 263 79 184 1 0 22 25 31 0 0 183 1 0 0.0127 0.0000 0.0054 2.591 0.00 3.29 -3.29 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5473 0.4527 2 2 0.0000 0.3220 0.6780 2 2 0.0000 0.2688 0.7312
chr9 92474742 CTCATCA C 0.500000 0.050 1 -6 2 263 79 184 2 1 49 1 26 0 0 183 0 1 0.0253 0.0000 0.0054 0.604 0.00 6.27 -6.27 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9330 0.0670 2 1 0.0000 0.6730 0.3270 2 1 0.0000 0.5355 0.4645
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.050 1 15 4 398 142 256 60 1 3 0 78 0 0 256 0 0 0.4225 0.0000 0.0000 46.333 0.30 8.79 -8.49 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0843 0.4630 0.4528 1 1 0.0886 0.4652 0.4462 1 1 0.0946 0.4682 0.4373
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 440 150 290 3 0 0 0 147 0 0 287 0 3 0.0200 0.0000 0.0103 150.000 0.00 3.28 -3.28 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7545 0.2455 2 2 0.0000 0.1550 0.8450 2 2 0.0000 0.0772 0.9228
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 2 345 88 257 75 1 8 0 4 0 0 257 0 0 0.8523 0.0000 0.0000 10.000 1.35 6.50 -5.15 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0098 0.9902 0.0000 0 1 0.3106 0.6894 0.0000 0 0 0.5831 0.4169 0.0000
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 804 131 673 50 1 25 1 54 1 1 664 1 6 0.3817 0.0015 0.0134 4.375 1.38 6.50 -5.12 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1439 0.5118 0.3443 1 1 0.1476 0.5109 0.3415 1 1 0.1525 0.5097 0.3377
chr9 97854418 AGCCGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -9 1 815 141 674 65 8 18 37 13 0 1 668 1 4 0.4610 0.0000 0.0089 6.611 1.46 8.85 -7.38 33 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.4790 0.4450 0.0760 1 0 0.4713 0.4484 0.0802 1 0 0.4610 0.4529 0.0861
chr9 99105255 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 182 111 71 98 2 9 0 2 1 0 70 0 0 0.8829 0.0141 0.0141 11.333 0.88 9.00 -8.12 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3266 0.6734 0.0000 0 0 0.7604 0.2396 0.0000 0 0 0.8426 0.1574 0.0000
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 486 125 361 77 1 0 0 47 0 0 360 0 1 0.6160 0.0000 0.0028 124.000 0.12 2.81 -2.69 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6301 0.3368 0.0331 1 0 0.6181 0.3456 0.0364 1 0 0.6017 0.3572 0.0411
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.050 1 -4 1 808 201 607 121 1 1 0 78 0 0 606 0 1 0.6020 0.0000 0.0016 199.000 0.18 4.90 -4.72 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7561 0.2329 0.0110 1 0 0.7434 0.2439 0.0127 1 0 0.7257 0.2589 0.0154
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 763 173 590 86 0 0 2 85 0 0 589 0 1 0.4971 0.0000 0.0017 171.000 0.27 3.09 -2.83 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2079 0.5520 0.2401 1 1 0.2103 0.5481 0.2416 1 1 0.2134 0.5432 0.2434
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.050 1 -4 1 267 97 170 0 0 8 0 89 0 0 165 0 5 0.0000 0.0000 0.0294 11.125 4.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0859 0.9141 2 2 0.0000 0.0896 0.9104 2 2 0.0000 0.0951 0.9049
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 403 96 307 0 0 11 1 84 0 0 307 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.727 6.60 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1054 0.8946 2 2 0.0000 0.1095 0.8905 2 2 0.0000 0.1153 0.8847
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 508 108 400 46 0 10 2 50 0 0 398 0 2 0.4259 0.0000 0.0050 9.800 0.72 1.52 -0.80 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1556 0.5128 0.3316 1 1 0.1590 0.5118 0.3292 1 1 0.1636 0.5106 0.3259
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 531 189 342 155 4 20 1 9 1 1 340 0 0 0.8201 0.0029 0.0058 8.450 0.59 3.56 -2.96 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0635 0.9365 0.0000 0 0 0.5361 0.4639 0.0000
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 468 146 322 0 0 3 0 143 0 0 319 0 3 0.0000 0.0000 0.0093 47.667 3.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0293 0.9707
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 246 85 161 46 0 6 0 33 0 0 159 0 2 0.5412 0.0000 0.0124 13.167 0.17 7.39 -7.22 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3819 0.4895 0.1287 1 1 0.3773 0.4901 0.1326 1 1 0.3711 0.4910 0.1378
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.050 1 3 1 413 126 287 39 2 40 2 43 1 0 285 0 1 0.3095 0.0035 0.0070 2.150 2.26 4.09 -1.84 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1930 0.5221 0.2848 1 1 0.1955 0.5204 0.2841 1 1 0.1986 0.5183 0.2831
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 269 112 157 4 0 1 0 107 0 1 153 0 3 0.0357 0.0000 0.0255 111.000 1.25 1.50 -0.25 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9805 0.0195 2 1 0.0000 0.5256 0.4744 2 2 0.0000 0.2630 0.7370
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 269 112 157 4 0 1 0 107 0 1 153 0 3 0.0357 0.0000 0.0255 111.000 1.25 1.50 -0.25 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9805 0.0195 2 1 0.0000 0.5256 0.4744 2 2 0.0000 0.2630 0.7370
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 218 87 131 52 1 2 0 32 0 0 131 0 0 0.5977 0.0000 0.0000 42.000 0.08 1.84 -1.77 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5207 0.4127 0.0665 1 0 0.5111 0.4182 0.0707 1 0 0.4982 0.4253 0.0765
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 395 109 286 55 0 5 0 49 0 0 286 0 0 0.5046 0.0000 0.0000 20.800 0.31 1.47 -1.16 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3086 0.5209 0.1705 1 1 0.3071 0.5193 0.1736 1 1 0.3050 0.5173 0.1777
chr9 135945095 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 294 90 204 44 0 2 0 44 0 0 202 0 2 0.4889 0.0000 0.0098 44.000 0.45 3.09 -2.64 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2135 0.5262 0.2602 1 1 0.2153 0.5243 0.2604 1 1 0.2176 0.5218 0.2606
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.050 1 -15 1 418 109 309 3 0 9 0 97 0 0 293 0 16 0.0275 0.0000 0.0518 11.111 1.00 12.59 -11.59 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8864 0.1136 2 2 0.0000 0.3136 0.6864 2 2 0.0000 0.1688 0.8312
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.050 1 -9 1 794 211 583 194 2 5 0 10 0 0 582 0 1 0.9194 0.0000 0.0017 41.200 0.45 8.40 -7.95 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6255 0.3745 0.0000 0 0 0.9743 0.0257 0.0000
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.050 1 1 1 359 91 268 87 0 0 0 4 0 0 268 0 0 0.9560 0.0000 0.0000 91.000 1.07 1.00 0.07 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4953 0.5047 0.0000 0 0 0.9775 0.0225 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000
chr10 15719771 TCTCC T 0.162657 0.050 1 -4 1 163 35 128 18 0 1 0 16 0 0 128 0 0 0.5143 0.0000 0.0000 34.000 0.72 4.69 -3.97 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4372 0.4931 0.0697 1 1 0.4369 0.4930 0.0702 1 1 0.4363 0.4929 0.0708
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.050 1 6 6 803 182 621 86 0 16 0 80 0 0 609 1 11 0.4725 0.0000 0.0193 11.857 0.62 5.65 -5.03 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1670 0.5454 0.2876 1 1 0.1708 0.5421 0.2872 1 1 0.1757 0.5379 0.2864
chr10 44292818 AC A 0.006843 0.050 1 -1 1 400 145 255 124 5 8 0 8 0 1 253 1 0 0.8552 0.0000 0.0078 17.000 0.31 1.50 -1.19 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 0 0.9061 0.0939 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr10 49988768 A AC 0.134835 0.050 1 1 1 548 156 392 152 0 1 0 3 0 0 392 0 0 0.9744 0.0000 0.0000 155.000 0.43 2.00 -1.57 74 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6942 0.3058 0.0000 0 0 0.9736 0.0264 0.0000 0 0 0.9877 0.0123 0.0000
chr10 49988921 AC A 0.048828 0.050 1 -1 1 585 199 386 104 7 4 0 84 0 0 384 1 1 0.5226 0.0000 0.0052 48.750 1.39 2.33 -0.94 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7151 0.2817 0.0032 1 0 0.7090 0.2875 0.0035 1 0 0.7006 0.2955 0.0039
chr10 50008914 CAA C 0.245598 0.050 1 -2 1 922 229 693 220 5 0 0 4 0 0 693 0 0 0.9607 0.0000 0.0000 229.000 0.26 2.00 -1.74 70 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5633 0.4367 0.0000 0 0 0.9820 0.0180 0.0000 0 0 0.9935 0.0065 0.0000
chr10 56358652 T TGCCTCA 0.001075 0.050 1 6 1 500 139 361 110 1 26 0 2 0 0 361 0 0 0.7914 0.0000 0.0000 4.346 0.13 6.00 -5.87 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.050 1 -6 3 138 62 76 59 0 1 0 2 0 0 76 0 0 0.9516 0.0000 0.0000 61.000 1.15 6.00 -4.85 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4832 0.5168 0.0000 0 0 0.8620 0.1380 0.0000 0 0 0.9156 0.0844 0.0000
chr10 63208190 ACTAAAC A 0.035276 0.050 1 -6 1 797 178 619 87 0 4 0 87 0 0 613 0 6 0.4888 0.0000 0.0097 43.500 0.47 5.61 -5.14 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3576 0.6189 0.0235 1 1 0.3640 0.6126 0.0234 1 1 0.3722 0.6046 0.0232
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.050 1 1 1 187 69 118 64 0 4 0 1 0 0 118 0 0 0.9275 0.0000 0.0000 16.250 0.62 1.00 -0.38 0 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9918 0.0082 0.0000 0 0 0.9967 0.0033 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.050 1 -3 1 330 70 260 30 0 24 0 16 0 0 260 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 1.917 0.30 3.25 -2.95 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5952 0.3760 0.0288 1 0 0.5892 0.3807 0.0301 1 0 0.5813 0.3869 0.0318
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.050 1 -6 2 428 172 256 147 5 18 0 2 1 0 255 0 0 0.8547 0.0039 0.0039 8.333 0.31 6.00 -5.69 35 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.050 1 1 1 207 47 160 38 1 5 0 3 0 0 160 0 0 0.8085 0.0000 0.0000 8.200 0.50 1.00 -0.50 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1613 0.8387 0.0000 0 0 0.7539 0.2461 0.0000 0 0 0.8775 0.1225 0.0000
chr10 87234508 TCTC T 0.013816 0.050 1 -3 2 449 153 296 90 2 4 1 56 0 0 295 0 1 0.5882 0.0000 0.0034 37.250 0.43 3.30 -2.87 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8148 0.1848 0.0004 1 0 0.8070 0.1926 0.0004 1 0 0.7962 0.2033 0.0005
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.050 1 -3 3 454 146 308 139 2 1 0 4 0 0 308 0 0 0.9521 0.0000 0.0000 145.000 0.36 3.50 -3.14 35 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7592 0.2408 0.0000 0 0 0.9929 0.0071 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.050 1 6 1 308 79 229 3 0 5 1 70 0 0 223 0 6 0.0380 0.0000 0.0262 14.800 0.33 6.30 -5.97 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9553 0.0447 2 1 0.0000 0.5514 0.4486 2 2 0.0000 0.3477 0.6523
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.050 1 3 3 172 56 116 5 0 0 0 51 0 0 116 0 0 0.0893 0.0000 0.0000 56.000 0.20 3.16 -2.96 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.7539 0.2461 2 2 0.0000 0.4191 0.5809
chr10 124021236 C CG 0.056607 0.050 1 1 1 340 83 257 5 51 17 2 8 0 4 249 4 0 0.0602 0.0000 0.0311 1.000 9.80 1.88 7.93 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4461 0.5531 0.0007 0 1 0.0725 0.9275 0.0000 0 0 0.5107 0.4893 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.050 1 -1 1 340 87 253 7 9 15 1 55 0 1 252 0 0 0.0805 0.0000 0.0040 4.733 7.00 2.78 4.22 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0088 0.4499 0.5413 2 1 0.0008 0.9522 0.0471 2 1 0.0000 0.9313 0.0686
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 293 103 190 57 0 1 0 45 0 0 190 0 0 0.5534 0.0000 0.0000 102.000 0.26 1.11 -0.85 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3911 0.4895 0.1194 1 1 0.3863 0.4902 0.1235 1 1 0.3800 0.4910 0.1290
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.050 1 -3 2 554 122 432 5 0 7 0 110 0 0 429 0 3 0.0410 0.0000 0.0069 16.429 0.20 3.41 -3.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9974 0.0026 2 1 0.0000 0.7681 0.2319 2 2 0.0000 0.4488 0.5512
chr11 637361 CGCGGGGGCATCT C 0.071834 0.050 1 -12 2 263 97 166 56 0 8 0 33 0 0 162 0 4 0.5773 0.0000 0.0241 11.125 0.39 11.70 -11.30 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6740 0.3180 0.0080 1 0 0.6677 0.3238 0.0085 1 0 0.6591 0.3317 0.0092
chr11 704604 GA G 0.439706 0.050 1 -1 2 226 89 137 5 0 1 1 82 0 0 137 0 0 0.0562 0.0000 0.0000 87.000 0.00 2.24 -2.24 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.8227 0.1773 2 1 0.0000 0.5282 0.4718
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.050 1 1 1 329 107 222 62 0 4 0 41 0 0 221 0 1 0.5794 0.0000 0.0045 25.750 0.82 1.83 -1.01 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6615 0.3239 0.0145 1 0 0.6547 0.3298 0.0155 1 0 0.6454 0.3377 0.0169
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.050 1 -30 2 940 194 746 63 0 77 0 54 0 0 746 0 0 0.3247 0.0000 0.0000 1.519 0.44 10.30 -9.85 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3221 0.5208 0.1570 1 1 0.3193 0.5196 0.1611 1 1 0.3155 0.5180 0.1665
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.050 1 -30 2 811 243 568 75 0 71 1 96 0 0 568 0 0 0.3086 0.0000 0.0000 2.423 0.52 13.43 -12.91 23 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0438 0.3942 0.5619 1 2 0.0470 0.3989 0.5541 1 2 0.0515 0.4052 0.5433
chr11 2299635 T TG 0.001237 0.050 1 1 2 256 96 160 46 0 1 0 49 0 0 159 0 1 0.4792 0.0000 0.0063 95.000 1.43 1.20 0.23 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4213 0.5780 0.0008 1 1 0.4253 0.5739 0.0008 1 1 0.4305 0.5688 0.0008
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 2 327 94 233 0 0 6 0 88 0 0 231 0 2 0.0000 0.0000 0.0086 14.667 3.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0941 0.9059 2 2 0.0000 0.0980 0.9020 2 2 0.0000 0.1037 0.8963
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.050 1 2 1 195 91 104 0 0 1 87 3 0 0 104 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.000 2.33 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1536 0.8464 2 2 0.0000 0.1590 0.8410 2 2 0.0000 0.1667 0.8333
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.050 1 2 1 195 91 104 0 0 3 0 88 0 0 104 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 88.000 2.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0942 0.9058 2 2 0.0000 0.0981 0.9019 2 2 0.0000 0.1038 0.8962
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.050 1 -1 1 654 162 492 153 1 4 0 4 0 0 492 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 39.500 0.40 3.25 -2.85 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0667 0.9333 0.0000 0 0 0.7559 0.2441 0.0000 0 0 0.9009 0.0991 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 472 128 344 117 0 3 0 8 0 0 344 0 0 0.9141 0.0000 0.0000 41.667 0.13 1.25 -1.12 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0799 0.9201 0.0000 0 1 0.4591 0.5409 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 1 635 150 485 12 0 3 0 135 0 0 474 0 11 0.0800 0.0000 0.0227 49.000 0.33 5.80 -5.47 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9880 0.0120 2 1 0.0000 0.7229 0.2771
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 468 118 350 7 0 4 1 106 0 0 349 0 1 0.0593 0.0000 0.0029 38.000 0.29 1.52 -1.23 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8829 0.1171 2 1 0.0000 0.5063 0.4937
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.050 1 4 1 743 200 543 169 0 9 0 22 0 0 541 0 2 0.8450 0.0000 0.0037 21.222 0.33 4.32 -3.99 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0076 0.9924 0.0000
chr11 5489193 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 693 156 537 76 0 4 0 76 0 0 536 0 1 0.4872 0.0000 0.0019 38.000 1.36 4.14 -2.79 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2156 0.5463 0.2381 1 1 0.2177 0.5428 0.2395 1 1 0.2204 0.5384 0.2412
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.050 1 12 2 770 142 628 0 0 21 1 120 0 0 606 0 22 0.0000 0.0000 0.0350 5.762 9.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0286 0.9714 2 2 0.0000 0.0314 0.9686
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 231 105 126 0 0 12 2 91 0 0 125 1 0 0.0000 0.0000 0.0079 7.667 4.38 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0860 0.9140 2 2 0.0000 0.0898 0.9102 2 2 0.0000 0.0952 0.9048
chr11 12294797 G GCTC 0.500000 0.050 1 3 1 532 115 417 7 2 33 3 70 0 0 406 0 11 0.0609 0.0000 0.0264 2.485 1.14 7.16 -6.01 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9800 0.0200 2 1 0.0000 0.7886 0.2114
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.050 1 12 1 532 115 417 41 2 35 3 34 0 0 406 0 11 0.3565 0.0000 0.0264 2.229 3.29 11.50 -8.21 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1865 0.5212 0.2923 1 1 0.1891 0.5196 0.2913 1 1 0.1925 0.5176 0.2899
chr11 18105983 A ACCTCCT 0.500000 0.050 1 6 2 307 141 166 63 0 16 0 62 0 0 163 0 3 0.4468 0.0000 0.0181 7.812 0.56 5.53 -4.98 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2060 0.5375 0.2565 1 1 0.2082 0.5347 0.2571 1 1 0.2111 0.5312 0.2578
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.050 1 -12 1 288 84 204 42 0 8 0 34 0 0 202 0 2 0.5000 0.0000 0.0098 9.500 0.57 9.76 -9.19 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3137 0.5130 0.1733 1 1 0.3118 0.5120 0.1762 1 1 0.3092 0.5107 0.1801
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 190 70 120 36 1 1 0 32 0 0 118 0 2 0.5143 0.0000 0.0167 69.000 0.39 6.00 -5.61 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2758 0.5189 0.2052 1 1 0.2753 0.5175 0.2072 1 1 0.2745 0.5157 0.2097
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 768 241 527 6 0 8 0 227 0 0 520 0 7 0.0249 0.0000 0.0133 29.125 0.17 3.47 -3.30 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9803 0.0197 2 2 0.0000 0.1463 0.8537 2 2 0.0000 0.0329 0.9671
chr11 55572959 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 341 87 254 82 2 0 0 3 1 0 252 0 1 0.9425 0.0039 0.0079 87.000 0.29 3.00 -2.71 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 1 0.3628 0.6372 0.0000 0 0 0.6352 0.3648 0.0000
chr11 56252727 T TGCTTCCTACGTTGCTG 0.500000 0.050 1 16 1 728 202 526 166 1 29 0 6 0 0 526 0 0 0.8218 0.0000 0.0000 5.966 0.20 6.33 -6.13 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 0 0.5270 0.4730 0.0000 0 0 0.8545 0.1455 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.050 1 2 4 648 143 505 60 1 2 0 80 0 0 505 0 0 0.4196 0.0000 0.0000 70.500 0.18 2.26 -2.08 4 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0734 0.4462 0.4805 1 2 0.0777 0.4494 0.4729 1 2 0.0836 0.4537 0.4627
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.050 1 -1 1 640 160 480 157 0 1 0 2 0 0 480 0 0 0.9812 0.0000 0.0000 159.000 0.37 1.50 -1.13 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6667 0.3333 0.0000 0 0 0.9267 0.0733 0.0000 0 0 0.9535 0.0465 0.0000
chr11 59457656 GC G 0.500000 0.050 1 -1 4 584 153 431 142 1 4 0 6 0 0 430 0 1 0.9281 0.0000 0.0023 37.250 0.17 1.67 -1.50 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2415 0.7585 0.0000 0 0 0.6958 0.3042 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 88 46 42 23 0 0 0 23 0 0 41 0 1 0.5000 0.0000 0.0238 46.000 0.09 2.30 -2.22 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2310 0.5140 0.2550 1 1 0.2319 0.5130 0.2551 1 1 0.2332 0.5117 0.2552
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.050 1 21 2 707 189 518 160 2 25 0 2 0 0 517 0 1 0.8466 0.0000 0.0019 6.560 0.47 12.50 -12.03 102 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3055 0.6945 0.0000 0 0 0.8799 0.1201 0.0000 0 0 0.9409 0.0591 0.0000
chr11 71548924 TTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTGCCAGTGCAGCTGCTGCAAGCCCTACTGCTCCCAGTGCAGCTGCTGTAAGCCCTGTTGCTCCTCCTCGGGTCGTGGGTCATCCTGCTGCCAATCCAGCTGCTGCAAGCCCTGCTGCTCATCC T 0.500000 0.050 1 -144 1 565 258 307 226 3 25 0 4 0 0 307 0 0 0.8760 0.0000 0.0000 9.280 0.35 3.75 -3.40 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3172 0.6828 0.0000 0 0 0.9514 0.0486 0.0000 0 0 0.9820 0.0180 0.0000
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.050 1 -42 1 857 207 650 125 0 48 0 34 0 0 638 0 12 0.6039 0.0000 0.0185 3.312 0.40 15.32 -14.92 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9524 0.0472 0.0004 1 0 0.9458 0.0537 0.0005 1 0 0.9358 0.0635 0.0008
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 825 236 589 0 0 1 0 235 0 0 587 1 1 0.0000 0.0000 0.0034 235.000 2.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.050 1 -22 2 223 74 149 43 1 3 0 27 0 0 147 0 2 0.5811 0.0000 0.0134 23.667 0.16 13.85 -13.69 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4408 0.4592 0.1000 1 1 0.4338 0.4619 0.1043 1 1 0.4246 0.4654 0.1100
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 106 54 52 28 0 1 0 25 0 0 51 0 1 0.5185 0.0000 0.0192 53.000 0.50 2.96 -2.46 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2663 0.5153 0.2185 1 1 0.2660 0.5141 0.2199 1 1 0.2656 0.5127 0.2218
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 387 81 306 50 0 3 0 28 0 0 303 0 3 0.6173 0.0000 0.0098 26.000 0.66 4.68 -4.02 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4961 0.4281 0.0758 1 0 0.4872 0.4328 0.0800 1 0 0.4754 0.4387 0.0859
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.050 1 -1 3 497 50 447 36 0 0 0 14 0 0 447 0 0 0.7200 0.0000 0.0000 50.000 0.39 1.57 -1.18 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5464 0.3915 0.0621 1 0 0.5355 0.3983 0.0662 1 0 0.5201 0.4081 0.0717
chr11 96092039 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1106 312 794 266 3 31 2 10 1 0 793 0 0 0.8526 0.0013 0.0013 9.065 0.33 3.40 -3.07 148 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2958 0.7042 0.0000 0 0 0.9031 0.0969 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1268 341 927 0 4 62 3 272 0 0 927 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.508 7.85 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0180 0.9820 2 2 0.0000 0.0044 0.9956 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.050 1 -15 3 708 202 506 94 1 40 0 67 0 0 506 0 0 0.4653 0.0000 0.0000 4.025 0.99 9.93 -8.94 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5951 0.3668 0.0381 1 0 0.5843 0.3741 0.0416 1 0 0.5696 0.3838 0.0466
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.050 1 -8 2 281 101 180 57 0 1 0 43 0 0 179 0 1 0.5644 0.0000 0.0056 100.000 0.25 7.51 -7.27 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4055 0.4824 0.1121 1 1 0.4002 0.4835 0.1163 1 1 0.3931 0.4850 0.1219
chr11 124249871 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 447 124 323 120 0 1 0 3 0 0 323 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 123.000 0.06 1.00 -0.94 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1339 0.8661 0.0000 0 0 0.7226 0.2774 0.0000 0 0 0.8535 0.1465 0.0000
chr11 124396801 A AG 0.500000 0.050 1 1 2 839 201 638 105 1 10 0 85 0 0 637 0 1 0.5224 0.0000 0.0016 19.100 0.29 1.15 -0.87 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4798 0.4532 0.0670 1 0 0.4729 0.4558 0.0712 1 0 0.4635 0.4593 0.0771
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.050 1 -6 1 218 87 131 49 0 12 1 25 0 0 131 0 0 0.5632 0.0000 0.0000 6.250 0.12 4.20 -4.08 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5538 0.3893 0.0570 1 0 0.5430 0.3960 0.0610 1 0 0.5286 0.4048 0.0666
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 378 119 259 49 2 22 3 43 0 0 256 1 2 0.4118 0.0000 0.0116 4.409 0.49 3.77 -3.28 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2613 0.5289 0.2098 1 1 0.2615 0.5267 0.2118 1 1 0.2617 0.5240 0.2143
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.050 1 1 1 83 37 46 36 0 0 0 1 0 0 46 0 0 0.9730 0.0000 0.0000 37.000 0.81 2.00 -1.19 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3276 0.6724 0.0000 0 0 0.5550 0.4450 0.0000 0 0 0.6205 0.3795 0.0000
chr12 865189 T TC 0.592141 0.050 1 1 1 342 127 215 4 0 2 0 121 0 0 209 0 6 0.0315 0.0000 0.0279 62.500 0.00 1.96 -1.96 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9494 0.0506 2 2 0.0000 0.3020 0.6980 2 2 0.0000 0.1265 0.8735
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.050 1 3 1 518 141 377 9 0 20 3 109 0 0 373 0 4 0.0638 0.0000 0.0106 6.000 0.11 3.12 -3.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9693 0.0307 2 1 0.0000 0.7037 0.2963
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.050 1 1 1 633 145 488 65 1 2 1 76 0 0 480 0 8 0.4483 0.0000 0.0164 70.500 0.12 3.04 -2.92 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1806 0.6397 0.1797 1 1 0.1889 0.6363 0.1748 1 1 0.2001 0.6316 0.1684
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.050 1 -1 1 641 145 496 66 0 1 1 77 0 0 488 0 8 0.4552 0.0000 0.0161 144.000 0.18 3.01 -2.83 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1724 0.6399 0.1877 1 1 0.1807 0.6369 0.1824 1 1 0.1920 0.6326 0.1754
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.050 1 -3 1 386 135 251 1 0 33 5 96 0 0 251 0 0 0.0074 0.0000 0.0000 3.188 0.00 3.09 -3.09 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2516 0.7484 2 2 0.0000 0.1186 0.8814 2 2 0.0000 0.0966 0.9034
chr12 8047961 A ACAG 0.000866 0.050 1 3 2 386 108 278 87 3 15 0 3 0 0 278 0 0 0.8056 0.0000 0.0000 6.200 0.29 3.00 -2.71 33 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9881 0.0119 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.050 1 3 1 1242 331 911 53 1 3 0 274 0 0 906 0 5 0.1601 0.0000 0.0055 164.000 1.32 4.08 -2.76 19 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.050 1 5 1 245 94 151 84 0 6 0 4 0 0 151 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 14.667 0.26 5.00 -4.74 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0118 0.9882 0.0000 0 1 0.3513 0.6487 0.0000 0 0 0.6256 0.3744 0.0000
chr12 10723069 G GGGT 0.002430 0.050 1 3 1 285 90 195 75 6 6 0 3 0 0 195 0 0 0.8333 0.0000 0.0000 16.800 0.43 3.00 -2.57 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9599 0.0401 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr12 12477741 GCACGC G 0.023257 0.050 1 -5 3 671 176 495 103 10 2 2 59 0 0 495 0 0 0.5852 0.0000 0.0000 87.000 0.32 9.17 -8.85 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9102 0.0897 0.0001 1 0 0.9032 0.0966 0.0002 1 0 0.8932 0.1066 0.0002
chr12 12477747 TGGGC T 0.023236 0.050 1 -4 1 668 172 496 101 8 2 2 59 0 0 496 0 0 0.5872 0.0000 0.0000 170.000 0.29 9.17 -8.88 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8942 0.1056 0.0002 1 0 0.8869 0.1129 0.0002 1 0 0.8764 0.1234 0.0003
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.050 1 -3 1 258 118 140 96 3 11 1 7 0 1 139 0 0 0.8136 0.0000 0.0071 9.727 2.25 4.29 -2.04 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0264 0.9736 0.0000 0 1 0.2104 0.7896 0.0000
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.050 1 -3 2 419 90 329 34 0 1 0 55 0 0 328 0 1 0.3778 0.0000 0.0030 89.000 0.18 4.25 -4.08 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0815 0.4472 0.4713 1 2 0.0867 0.4524 0.4609 1 1 0.0939 0.4589 0.4472
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.050 1 30 1 886 147 739 5 0 74 3 65 0 1 691 1 46 0.0340 0.0000 0.0650 0.973 2.20 3.88 -1.68 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9952 0.0048 2 1 0.0000 0.6332 0.3668 2 2 0.0000 0.2949 0.7051
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.050 1 1 1 584 136 448 73 1 4 0 58 0 0 446 0 2 0.5368 0.0000 0.0045 33.000 0.14 1.26 -1.12 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5516 0.4118 0.0366 1 0 0.5473 0.4144 0.0383 1 0 0.5414 0.4180 0.0406
chr12 52073890 TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC T 0.050697 0.050 1 -23 2 312 103 209 88 0 11 0 4 0 0 207 0 2 0.8544 0.0000 0.0096 8.364 0.16 17.25 -17.09 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0095 0.9905 0.0000 0 0 0.7489 0.2511 0.0000 0 0 0.9432 0.0568 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.050 1 -21 2 886 215 671 120 2 18 0 75 0 0 671 0 0 0.5581 0.0000 0.0000 10.944 0.84 12.91 -12.06 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8070 0.1864 0.0066 1 0 0.7950 0.1972 0.0078 1 0 0.7781 0.2123 0.0097
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.050 1 -18 2 1022 259 763 7 0 60 0 192 0 0 753 0 10 0.0270 0.0000 0.0131 3.317 0.43 12.82 -12.39 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9354 0.0646 2 1 0.0000 0.6769 0.3231
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.050 1 1 2 315 89 226 52 0 0 0 37 0 0 225 0 1 0.5843 0.0000 0.0044 89.000 0.23 1.11 -0.88 46 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4735 0.4454 0.0811 1 0 0.4676 0.4480 0.0845 1 0 0.4596 0.4513 0.0891
chr12 55332197 GT G 0.000556 0.050 1 -1 1 492 130 362 125 0 2 0 3 0 0 362 0 0 0.9615 0.0000 0.0000 64.000 0.34 1.00 -0.66 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9968 0.0032 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.050 1 -4 2 509 116 393 115 0 0 0 1 0 0 393 0 0 0.9914 0.0000 0.0000 116.000 0.27 0.00 0.27 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr12 56423665 T TC 0.000231 0.050 1 1 2 546 150 396 70 3 8 6 63 0 0 396 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 70.500 0.31 4.65 -4.34 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4899 0.5101 0.0001 1 1 0.4918 0.5081 0.0001 1 1 0.4943 0.5056 0.0001
chr12 56423667 T TCC 0.000231 0.050 1 2 1 545 148 397 73 1 6 1 67 0 0 397 0 0 0.4932 0.0000 0.0000 142.000 0.40 4.55 -4.15 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5225 0.4775 0.0001 1 0 0.5232 0.4767 0.0001 1 0 0.5240 0.4759 0.0001
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.050 1 -2 1 95 45 50 26 0 1 0 18 0 0 49 0 1 0.5778 0.0000 0.0200 44.000 0.12 2.11 -2.00 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2525 0.5234 0.2241 1 1 0.2498 0.5225 0.2277 1 1 0.2462 0.5214 0.2324
chr12 57225404 T TGGC 0.004341 0.050 1 3 1 534 122 412 115 3 1 0 3 0 0 412 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 119.000 1.22 4.00 -2.78 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9707 0.0293 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.050 1 3 2 370 92 278 87 0 1 0 4 0 0 278 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 91.000 1.00 3.75 -2.75 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0188 0.9812 0.0000 0 1 0.4649 0.5351 0.0000 0 0 0.7280 0.2720 0.0000
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.050 1 -1 1 236 69 167 7 10 12 23 17 0 0 164 3 0 0.1014 0.0000 0.0180 2.667 4.14 3.06 1.08 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1285 0.5315 0.3400 1 1 0.1355 0.5351 0.3294 1 1 0.1443 0.5420 0.3137
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.050 1 3 2 92 31 61 17 0 1 0 13 0 0 61 0 0 0.5484 0.0000 0.0000 30.000 0.06 2.69 -2.63 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3560 0.4934 0.1506 1 1 0.3543 0.4935 0.1522 1 1 0.3521 0.4936 0.1543
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.050 1 -3 1 967 276 691 0 0 30 3 243 0 0 690 0 1 0.0000 0.0000 0.0014 8.200 3.28 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.050 1 -1 1 121 58 63 53 0 2 0 3 0 0 63 0 0 0.9138 0.0000 0.0000 28.000 0.15 1.00 -0.85 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0732 0.9268 0.0000 0 0 0.5583 0.4417 0.0000 0 0 0.7456 0.2544 0.0000
chr12 106247671 T TCTGCGGGTGCTG 0.500000 0.050 1 12 2 367 61 306 27 0 12 0 22 0 0 297 0 9 0.4426 0.0000 0.0294 4.083 4.26 11.14 -6.88 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1960 0.5129 0.2911 1 1 0.1982 0.5119 0.2899 1 1 0.2011 0.5107 0.2883
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 1 362 94 268 40 1 13 0 40 0 0 264 0 4 0.4255 0.0000 0.0149 6.231 5.65 4.20 1.45 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2032 0.5232 0.2736 1 1 0.2053 0.5214 0.2733 1 1 0.2080 0.5192 0.2728
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 177 88 89 37 0 0 0 51 0 0 89 0 0 0.4205 0.0000 0.0000 88.000 0.70 2.43 -1.73 15 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1059 0.4713 0.4228 1 1 0.1101 0.4732 0.4167 1 1 0.1158 0.4756 0.4086
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -6 1 165 80 85 4 0 11 0 65 0 0 82 0 3 0.0500 0.0000 0.0353 6.273 0.25 5.45 -5.20 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.7300 0.2700 2 2 0.0000 0.4642 0.5358
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.050 1 -5 5 307 100 207 0 0 8 0 92 0 0 203 0 4 0.0000 0.0000 0.0193 11.500 5.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0820 0.9180 2 2 0.0000 0.0857 0.9143 2 2 0.0000 0.0910 0.9090
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.050 1 15 4 283 72 211 0 0 5 0 67 0 0 198 0 13 0.0000 0.0000 0.0616 13.400 11.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1178 0.8822 2 2 0.0000 0.1221 0.8779 2 2 0.0000 0.1281 0.8719
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 5 682 178 504 0 0 28 1 149 0 0 483 0 21 0.0000 0.0000 0.0417 5.357 7.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0134 0.9866 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0164 0.9836
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.050 1 3 3 207 72 135 23 2 21 0 26 0 0 134 0 1 0.3194 0.0000 0.0074 2.429 0.87 2.96 -2.09 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2187 0.5146 0.2666 1 1 0.2201 0.5135 0.2663 1 1 0.2220 0.5122 0.2659
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 150 43 107 21 2 3 1 16 0 1 106 0 0 0.4884 0.0000 0.0093 13.333 0.81 4.19 -3.38 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3330 0.4982 0.1688 1 1 0.3300 0.4983 0.1717 1 1 0.3260 0.4985 0.1755
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.050 1 9 1 196 70 126 0 0 4 0 66 0 0 122 0 4 0.0000 0.0000 0.0317 16.500 8.36 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1466 0.8534 2 2 0.0000 0.1511 0.8489 2 2 0.0000 0.1574 0.8426
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 455 117 338 47 4 14 0 52 0 0 335 1 2 0.4017 0.0000 0.0089 7.286 0.53 3.73 -3.20 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1914 0.5274 0.2812 1 1 0.1940 0.5253 0.2807 1 1 0.1973 0.5227 0.2800
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 436 131 305 79 7 33 1 11 0 1 304 0 0 0.6031 0.0000 0.0033 2.939 1.56 6.45 -4.90 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.0967 0.9033 0.0000
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.050 1 -36 5 501 159 342 120 1 37 0 1 0 0 342 0 0 0.7547 0.0000 0.0000 3.297 1.24 0.00 1.24 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8041 0.1959 0.0000 0 0 0.9102 0.0898 0.0000 0 0 0.9261 0.0739 0.0000
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.050 1 6 2 699 165 534 5 0 21 0 139 0 0 528 0 6 0.0303 0.0000 0.0112 6.857 0.20 5.67 -5.47 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9899 0.0101 2 2 0.0000 0.4577 0.5423 2 2 0.0000 0.1750 0.8250
chr13 21172461 TG T 0.091820 0.050 1 -1 2 369 225 144 60 0 53 0 112 0 0 144 0 0 0.2667 0.0000 0.0000 3.245 0.25 1.15 -0.90 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0277 0.4928 0.4795 1 1 0.0322 0.5106 0.4572 1 1 0.0391 0.5333 0.4276
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.050 1 -18 4 587 219 368 196 3 12 0 8 0 0 368 0 0 0.8950 0.0000 0.0000 17.167 0.56 14.88 -14.31 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.4205 0.5795 0.0000 0 0 0.8712 0.1288 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.050 1 6 1 576 132 444 62 1 30 0 39 1 1 435 2 5 0.4697 0.0023 0.0203 3.367 0.90 6.38 -5.48 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6517 0.3348 0.0136 1 0 0.6455 0.3401 0.0144 1 0 0.6370 0.3473 0.0156
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.050 1 3 4 424 63 361 0 0 10 0 53 0 0 353 1 7 0.0000 0.0000 0.0222 5.300 4.51 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0466 0.9534 2 2 0.0000 0.0480 0.9520 2 2 0.0000 0.0499 0.9501
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.050 1 -3 2 385 77 308 42 2 31 0 2 2 3 302 0 1 0.5455 0.0065 0.0195 1.533 3.19 3.00 0.19 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0254 0.9746 0.0000 0 1 0.3142 0.6858 0.0000 0 0 0.5184 0.4816 0.0000
chr13 107866338 T TCTG 0.500000 0.050 1 3 2 686 162 524 121 10 28 0 3 0 0 523 0 1 0.7469 0.0000 0.0019 4.786 0.40 4.00 -3.60 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0415 0.9585 0.0000 0 0 0.6396 0.3604 0.0000 0 0 0.8400 0.1600 0.0000
chr13 112067766 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 5 366 85 281 34 1 8 0 42 1 0 278 0 2 0.4000 0.0036 0.0107 11.000 1.50 3.48 -1.98 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1487 0.5024 0.3489 1 1 0.1522 0.5022 0.3456 1 1 0.1569 0.5019 0.3412
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.050 1 -6 2 511 118 393 65 0 12 0 41 0 1 389 1 2 0.5508 0.0000 0.0102 8.833 1.09 6.54 -5.44 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5282 0.4107 0.0611 1 0 0.5187 0.4162 0.0651 1 0 0.5059 0.4233 0.0709
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.050 1 6 1 212 76 136 33 0 6 1 36 0 0 136 0 0 0.4342 0.0000 0.0000 11.500 1.06 5.56 -4.49 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1967 0.5169 0.2864 1 1 0.1989 0.5156 0.2855 1 1 0.2018 0.5140 0.2842
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 1 542 129 413 116 2 6 0 5 0 0 412 0 1 0.8992 0.0000 0.0024 20.500 0.55 2.60 -2.05 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2504 0.7496 0.0000 0 0 0.6455 0.3545 0.0000
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.050 1 1 2 690 158 532 108 1 1 0 48 0 0 531 0 1 0.6835 0.0000 0.0019 157.000 0.19 1.90 -1.71 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8060 0.1882 0.0059 1 0 0.7892 0.2036 0.0072 1 0 0.7653 0.2253 0.0094
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.050 1 -1 4 493 120 373 2 0 6 0 112 0 0 373 0 0 0.0167 0.0000 0.0000 19.000 0.50 1.75 -1.25 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6405 0.3595 2 2 0.0000 0.2236 0.7764 2 2 0.0000 0.1476 0.8524
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.050 1 -19 1 465 133 332 91 1 3 0 38 0 0 321 0 11 0.6842 0.0000 0.0331 43.333 0.51 18.97 -18.47 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7948 0.1967 0.0084 1 0 0.7827 0.2075 0.0098 1 0 0.7657 0.2224 0.0119
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.050 1 1 1 331 67 264 0 0 8 0 59 0 0 264 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.429 1.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0920 0.9080 2 2 0.0000 0.0942 0.9058 2 2 0.0000 0.0975 0.9025
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.050 1 2 3 597 126 471 18 0 8 1 99 0 0 467 0 4 0.1429 0.0000 0.0085 14.750 1.00 3.24 -2.24 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9957 0.0043
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.050 1 3 3 583 165 418 84 0 19 0 62 0 1 414 0 3 0.5091 0.0000 0.0096 7.684 0.44 3.13 -2.69 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5996 0.3691 0.0313 1 0 0.5927 0.3738 0.0334 1 0 0.5834 0.3802 0.0364
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.050 1 3 1 503 154 349 4 6 13 2 129 0 0 345 0 4 0.0260 0.0000 0.0115 10.308 0.75 2.90 -2.15 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9749 0.0251 2 2 0.0000 0.4478 0.5522 2 2 0.0000 0.1972 0.8028
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.050 1 -1 1 347 85 262 0 5 7 7 66 0 1 261 0 0 0.0000 0.0000 0.0038 70.000 4.09 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4508 0.5492 2 2 0.0000 0.2538 0.7462 2 2 0.0000 0.1909 0.8091
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.050 1 -2 1 345 86 259 0 0 13 6 67 0 1 258 0 0 0.0000 0.0000 0.0039 8.111 4.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0888 0.9112 2 2 0.0000 0.0893 0.9107 2 2 0.0000 0.0910 0.9090
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.050 1 -3 1 294 51 243 20 5 10 0 16 0 0 241 0 2 0.3922 0.0000 0.0082 4.100 2.70 3.88 -1.17 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4020 0.4780 0.1200 1 1 0.3988 0.4788 0.1223 1 1 0.3947 0.4799 0.1254
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.050 1 -3 1 312 58 254 18 4 5 0 31 0 0 254 0 0 0.3103 0.0000 0.0000 10.400 1.56 4.10 -2.54 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1899 0.5182 0.2919 1 1 0.1942 0.5179 0.2879 1 1 0.1999 0.5174 0.2826
chr14 24001481 T TA 0.049020 0.050 1 1 2 300 100 200 3 0 1 0 96 0 0 200 0 0 0.0300 0.0000 0.0000 99.000 0.33 1.33 -1.00 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.9308 0.0692 2 1 0.0000 0.8555 0.1445
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.050 1 -1 1 310 98 212 95 0 1 0 2 0 0 212 0 0 0.9694 0.0000 0.0000 97.000 0.40 1.00 -0.60 57 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8301 0.1699 0.0000 0 0 0.9692 0.0308 0.0000 0 0 0.9815 0.0185 0.0000
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.050 1 6 1 319 88 231 36 0 19 0 33 0 0 229 0 2 0.4091 0.0000 0.0087 3.632 0.64 6.03 -5.39 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3290 0.5175 0.1535 1 1 0.3296 0.5160 0.1544 1 1 0.3303 0.5142 0.1555
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.050 1 6 1 579 110 469 0 0 20 0 90 0 0 454 0 15 0.0000 0.0000 0.0320 4.500 7.69 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0154 0.9846 2 2 0.0000 0.0165 0.9835
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.050 1 2 1 450 103 347 98 0 2 0 3 0 0 347 0 0 0.9515 0.0000 0.0000 50.500 0.40 2.33 -1.94 0 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9608 0.0392 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.050 1 -6 2 585 134 451 0 0 25 0 109 0 0 446 1 4 0.0000 0.0000 0.0111 4.360 7.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0128 0.9872 2 2 0.0000 0.0135 0.9865 2 2 0.0000 0.0146 0.9854
chr14 77027304 AGCG A 0.024120 0.050 1 -3 1 420 105 315 72 8 20 1 4 0 0 315 0 0 0.6857 0.0000 0.0000 4.421 1.64 3.25 -1.61 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2815 0.7185 0.0000 0 0 0.9477 0.0523 0.0000 0 0 0.9828 0.0172 0.0000
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.050 1 -6 1 435 103 332 4 30 14 8 47 2 0 328 2 0 0.0388 0.0060 0.0120 8.500 9.00 6.04 2.96 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0838 0.4502 0.4660 1 2 0.0890 0.4552 0.4558 1 1 0.0963 0.4615 0.4422
chr14 77027424 C CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGT 0.001107 0.050 1 21 1 431 102 329 23 3 8 2 66 0 0 326 1 2 0.2255 0.0000 0.0091 11.375 8.17 8.55 -0.37 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0854 0.9062 0.0084 1 1 0.0932 0.8991 0.0077 1 1 0.1043 0.8888 0.0069
chr14 77616457 GGCGGCT G 0.000168 0.050 1 -6 1 265 95 170 87 0 6 0 2 0 0 170 0 0 0.9158 0.0000 0.0000 14.833 0.38 6.50 -6.12 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.050 1 -3 2 444 124 320 4 0 12 2 106 0 0 319 0 1 0.0323 0.0000 0.0031 9.250 0.00 3.15 -3.15 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9607 0.0393 2 2 0.0000 0.3533 0.6467 2 2 0.0000 0.1527 0.8473
chr14 92931578 A AGAG 0.001196 0.050 1 3 2 594 161 433 125 1 30 3 2 0 0 433 0 0 0.7764 0.0000 0.0000 4.300 0.60 3.50 -2.90 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.050 1 -9 1 231 66 165 5 0 3 0 58 0 1 156 0 8 0.0758 0.0000 0.0545 21.000 0.80 8.02 -7.22 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9090 0.0910 2 1 0.0000 0.7018 0.2982
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.050 1 -9 1 249 65 184 1 0 9 0 55 0 0 181 0 3 0.0154 0.0000 0.0163 6.222 0.00 8.85 -8.85 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6064 0.3936 2 2 0.0000 0.3768 0.6232 2 2 0.0000 0.3188 0.6812
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.050 1 -3 2 376 102 274 48 1 12 0 41 0 1 269 1 3 0.4706 0.0000 0.0182 7.500 0.98 3.80 -2.83 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4105 0.4957 0.0938 1 1 0.4096 0.4950 0.0953 1 1 0.4084 0.4942 0.0974
chr15 20534699 CCTCCTG C 0.091103 0.050 1 -6 1 201 21 180 12 0 5 0 4 0 1 167 7 5 0.5714 0.0000 0.0722 3.200 2.42 4.50 -2.08 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4065 0.5383 0.0552 1 1 0.4086 0.5366 0.0548 1 1 0.4113 0.5343 0.0543
chr15 20534957 TCTTCTCCTCCTGCCTCCACAC T 0.000122 0.050 1 -21 1 154 57 97 30 1 12 0 14 1 3 81 7 5 0.5263 0.0103 0.1649 3.750 3.90 10.21 -6.31 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5889 0.4110 0.0000 1 0 0.5862 0.4138 0.0000 1 0 0.5826 0.4174 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.050 1 -3 1 255 69 186 34 0 5 0 30 0 0 186 0 0 0.4928 0.0000 0.0000 12.800 1.91 4.73 -2.82 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4297 0.4888 0.0816 1 1 0.4288 0.4886 0.0826 1 1 0.4275 0.4884 0.0841
chr15 22866845 TAAGA T 0.262722 0.050 1 -4 5 270 57 213 2 0 3 1 51 0 0 212 0 1 0.0351 0.0000 0.0047 18.000 0.00 3.86 -3.86 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9509 0.0491 2 1 0.0000 0.7428 0.2572 2 1 0.0000 0.6236 0.3764
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.050 1 3 1 211 38 173 4 0 1 0 33 0 2 156 12 3 0.1053 0.0000 0.0983 37.000 2.50 3.55 -1.05 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9027 0.0973 2 2 0.0000 0.1409 0.8591 2 2 0.0000 0.0432 0.9568
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.050 1 -1 2 610 174 436 0 1 8 2 163 0 0 418 4 14 0.0000 0.0000 0.0413 27.500 4.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.050 1 -2 2 301 90 211 6 0 1 0 83 0 0 211 0 0 0.0667 0.0000 0.0000 89.000 0.00 1.99 -1.99 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9222 0.0778 2 1 0.0000 0.6796 0.3204
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.050 1 -1 2 238 87 151 5 0 7 3 72 0 0 151 0 0 0.0575 0.0000 0.0000 12.833 1.20 2.11 -0.91 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.9040 0.0960 2 1 0.0000 0.6985 0.3015
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.050 1 -3 1 587 143 444 0 0 42 2 99 0 0 441 0 3 0.0000 0.0000 0.0068 2.381 3.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0328 0.9672 2 2 0.0000 0.0345 0.9655 2 2 0.0000 0.0370 0.9630
chr15 35084193 TCA T 0.022764 0.050 1 -2 2 422 88 334 83 1 0 0 4 0 0 334 0 0 0.9432 0.0000 0.0000 88.000 0.59 3.00 -2.41 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3428 0.6572 0.0000 0 0 0.9593 0.0407 0.0000 0 0 0.9864 0.0136 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.050 1 -2 1 385 147 238 57 0 3 0 87 0 0 237 0 1 0.3878 0.0000 0.0042 48.000 1.56 1.99 -0.43 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0501 0.4151 0.5348 1 2 0.0550 0.4236 0.5214 1 2 0.0620 0.4346 0.5033
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.050 1 -3 2 161 71 90 37 0 4 0 30 0 0 88 0 2 0.5211 0.0000 0.0222 16.750 0.11 3.27 -3.16 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3170 0.5102 0.1729 1 1 0.3154 0.5092 0.1753 1 1 0.3133 0.5081 0.1786
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.050 1 -3 1 243 124 119 116 1 3 0 4 0 0 119 0 0 0.9355 0.0000 0.0000 40.333 0.45 3.50 -3.05 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0190 0.9810 0.0000 0 1 0.4634 0.5366 0.0000 0 0 0.7226 0.2774 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.050 1 -3 1 396 101 295 39 1 12 4 45 0 0 294 0 1 0.3861 0.0000 0.0034 7.417 0.87 3.38 -2.51 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1071 0.4781 0.4147 1 1 0.1103 0.4789 0.4109 1 1 0.1145 0.4798 0.4057
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.050 1 3 3 339 123 216 56 1 0 0 66 0 0 214 0 2 0.4553 0.0000 0.0093 123.000 0.62 2.92 -2.30 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2009 0.5629 0.2361 1 1 0.2066 0.5605 0.2329 1 1 0.2143 0.5572 0.2285
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.050 1 -24 2 719 174 545 7 6 92 1 68 0 0 527 0 18 0.0402 0.0000 0.0330 1.646 1.86 12.01 -10.16 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9823 0.0177 2 1 0.0000 0.8022 0.1978
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.050 1 -12 2 706 176 530 5 6 20 3 142 0 0 530 0 0 0.0284 0.0000 0.0000 8.500 0.00 10.39 -10.39 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7600 0.2400 2 2 0.0000 0.2692 0.7308
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.050 1 -6 1 298 92 206 0 0 7 1 84 0 0 197 0 9 0.0000 0.0000 0.0437 12.143 7.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.050 1 1 1 301 108 193 2 0 3 0 103 0 0 193 0 0 0.0185 0.0000 0.0000 35.000 1.50 2.12 -0.62 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6409 0.3591 2 2 0.0000 0.2166 0.7834 2 2 0.0000 0.1412 0.8588
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.050 1 -3 2 497 176 321 2 0 35 132 7 0 0 306 14 1 0.0114 0.0000 0.0467 4.029 0.00 2.71 -2.71 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7606 0.2394 2 2 0.0000 0.3333 0.6667 2 2 0.0000 0.2354 0.7646
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.050 1 -6 2 497 178 319 4 0 29 0 145 0 0 305 0 14 0.0225 0.0000 0.0439 5.138 0.25 5.99 -5.74 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9637 0.0363 2 2 0.0000 0.3796 0.6204 2 2 0.0000 0.1728 0.8272
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.050 1 -9 2 224 76 148 56 0 17 0 3 1 0 147 0 0 0.7368 0.0068 0.0068 3.471 2.80 10.33 -7.53 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5134 0.4866 0.0000 0 0 0.9488 0.0512 0.0000 0 0 0.9774 0.0226 0.0000
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.050 1 1 2 26 12 14 8 0 0 0 4 0 0 14 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 12.000 0.12 1.25 -1.12 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4568 0.4709 0.0723 1 1 0.4538 0.4735 0.0726 1 1 0.4571 0.4723 0.0706
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.050 1 2 2 315 86 229 47 0 0 0 39 0 0 228 0 1 0.5465 0.0000 0.0044 86.000 0.04 3.08 -3.03 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4205 0.4828 0.0966 1 1 0.4184 0.4829 0.0987 1 1 0.4154 0.4830 0.1015
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 283 67 216 0 0 1 1 65 0 0 216 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 66.000 6.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 283 67 216 0 0 1 1 65 0 0 216 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 66.000 6.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2179036 C CGCG 0.006791 0.050 1 3 6 467 117 350 74 6 31 1 5 0 0 350 0 0 0.6325 0.0000 0.0000 2.833 1.93 4.20 -2.27 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2252 0.7748 0.0000 0 0 0.9721 0.0279 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000
chr16 3356756 GT G 0.055155 0.050 1 -1 2 507 191 316 89 0 4 0 98 0 0 315 0 1 0.4660 0.0000 0.0032 46.750 0.11 1.10 -0.99 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2994 0.6536 0.0470 1 1 0.3071 0.6465 0.0464 1 1 0.3172 0.6372 0.0456
chr16 4885975 T TCCA 0.001019 0.050 1 3 2 308 97 211 89 0 4 0 4 0 0 211 0 0 0.9175 0.0000 0.0000 23.250 0.25 3.00 -2.75 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9308 0.0692 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.050 1 -3 1 375 94 281 2 0 4 0 88 0 0 280 0 1 0.0213 0.0000 0.0036 22.500 1.00 2.90 -1.90 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6378 0.3622 2 2 0.0000 0.2111 0.7889 2 2 0.0000 0.1359 0.8641
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.050 1 3 1 299 84 215 7 0 29 8 40 0 0 208 4 3 0.0833 0.0000 0.0326 1.897 1.43 7.25 -5.82 7 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9927 0.0073 2 1 0.0000 0.9464 0.0536
chr16 11915673 C CCCGCCGCCGCCG 0.000621 0.050 1 12 1 299 84 215 25 2 29 1 27 3 1 208 0 3 0.2976 0.0140 0.0326 1.862 5.16 9.48 -4.32 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4805 0.5192 0.0003 1 1 0.4819 0.5178 0.0003 1 1 0.4837 0.5160 0.0003
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.050 1 -42 2 344 124 220 81 0 35 0 8 0 0 218 0 2 0.6532 0.0000 0.0091 2.543 1.02 3.50 -2.48 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0981 0.9019 0.0000 0 0 0.6654 0.3346 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.050 1 -2 1 128 41 87 0 0 0 0 41 0 0 87 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 41.000 2.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr16 15873504 T TCTA 0.057892 0.050 1 3 2 106 45 61 40 0 1 0 4 0 0 61 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 44.000 0.10 3.00 -2.90 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0611 0.9389 0.0000 0 0 0.7512 0.2488 0.0000 0 0 0.9057 0.0943 0.0000
chr16 23068920 AGAG A 0.000823 0.050 1 -3 2 771 171 600 163 1 4 0 3 0 0 600 0 0 0.9532 0.0000 0.0000 41.750 0.50 2.33 -1.83 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.050 1 -12 1 647 207 440 93 1 11 0 102 0 0 440 0 0 0.4493 0.0000 0.0000 17.727 0.25 9.58 -9.33 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2619 0.6086 0.1295 1 1 0.2684 0.6030 0.1286 1 1 0.2769 0.5958 0.1274
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.050 1 -27 1 882 193 689 78 1 54 1 59 0 0 689 0 0 0.4041 0.0000 0.0000 2.585 0.81 11.25 -10.45 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5674 0.3908 0.0417 1 0 0.5606 0.3951 0.0443 1 0 0.5514 0.4008 0.0478
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 144 75 69 36 0 3 0 36 0 0 69 0 0 0.4800 0.0000 0.0000 24.000 0.17 2.08 -1.92 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2390 0.5220 0.2390 1 1 0.2398 0.5203 0.2399 1 1 0.2409 0.5182 0.2409
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.050 1 -1 1 348 69 279 26 8 6 2 27 0 0 279 0 0 0.3768 0.0000 0.0000 10.000 1.27 2.15 -0.88 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2900 0.5135 0.1965 1 1 0.2889 0.5125 0.1986 1 1 0.2873 0.5112 0.2015
chr16 67842902 A ACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAG 0.500000 0.050 1 27 2 833 253 580 85 1 62 6 99 0 0 580 0 0 0.3360 0.0000 0.0000 3.000 0.85 2.46 -1.62 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0768 0.4699 0.4533 1 1 0.0811 0.4716 0.4473 1 1 0.0871 0.4738 0.4391
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 838 232 606 158 31 31 1 11 0 0 606 0 0 0.6810 0.0000 0.0000 6.484 1.32 3.27 -1.96 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0344 0.9656 0.0000 0 0 0.5179 0.4821 0.0000
chr16 71922608 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 2 296 130 166 94 1 32 0 3 0 0 166 0 0 0.7231 0.0000 0.0000 3.062 5.72 4.33 1.39 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0758 0.9242 0.0000 0 0 0.5846 0.4154 0.0000 0 0 0.7621 0.2379 0.0000
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.050 1 -6 2 296 132 164 65 0 24 0 43 0 0 164 0 0 0.4924 0.0000 0.0000 4.500 3.91 7.58 -3.67 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5312 0.4085 0.0603 1 0 0.5215 0.4141 0.0644 1 0 0.5085 0.4214 0.0701
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.050 1 -3 2 507 128 379 65 0 19 1 43 0 0 379 0 0 0.5078 0.0000 0.0000 5.737 1.06 5.09 -4.03 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5177 0.4177 0.0646 1 0 0.5085 0.4228 0.0687 1 0 0.4961 0.4294 0.0745
chr16 72788687 G GCT 0.500000 0.050 1 2 1 599 177 422 90 2 7 2 76 0 0 422 0 0 0.5085 0.0000 0.0000 24.286 0.53 4.11 -3.57 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4098 0.4925 0.0977 1 1 0.4052 0.4927 0.1021 1 1 0.3988 0.4931 0.1081
chr16 72788692 G GA 0.500000 0.050 1 1 7 597 176 421 83 2 2 15 74 0 0 421 0 0 0.4716 0.0000 0.0000 80.500 0.47 4.14 -3.67 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2232 0.5507 0.2262 1 1 0.2251 0.5469 0.2281 1 1 0.2275 0.5421 0.2304
chr16 72797458 CTTGTTG C 0.500000 0.050 1 -6 1 684 176 508 83 1 23 2 67 0 0 506 0 2 0.4716 0.0000 0.0039 6.565 0.43 6.04 -5.61 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3952 0.4974 0.1074 1 1 0.3909 0.4974 0.1117 1 1 0.3851 0.4974 0.1175
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.050 1 -2 2 183 86 97 5 0 2 0 79 0 0 93 0 4 0.0581 0.0000 0.0412 42.000 1.40 4.47 -3.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.7844 0.2156 2 2 0.0000 0.4671 0.5329
chr16 85656394 CGAGCGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 481 100 381 87 1 10 0 2 0 0 380 1 0 0.8700 0.0000 0.0026 9.000 1.31 7.00 -5.69 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2290 0.7710 0.0000 0 0 0.6670 0.3330 0.0000 0 0 0.7773 0.2227 0.0000
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.050 1 6 1 367 104 263 84 0 19 0 1 0 0 261 0 2 0.8077 0.0000 0.0076 4.474 0.73 8.00 -7.27 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0583 0.9417 0.0000 0 0 0.5175 0.4825 0.0000 0 0 0.7111 0.2889 0.0000
chr16 87604287 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 367 109 258 76 2 18 0 13 0 0 258 0 0 0.6972 0.0000 0.0000 5.056 0.38 3.00 -2.62 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.0492 0.9508 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.050 1 -2 1 562 105 457 0 1 3 4 97 0 0 447 1 9 0.0000 0.0000 0.0219 33.667 8.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2074 0.7926 2 2 0.0000 0.1096 0.8904 2 2 0.0000 0.0916 0.9084
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 560 102 458 0 1 5 4 92 0 0 448 2 8 0.0000 0.0000 0.0218 19.200 8.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1257 0.8743 2 2 0.0000 0.1015 0.8985 2 2 0.0000 0.0937 0.9063
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 562 102 460 1 0 2 3 96 0 1 444 6 9 0.0098 0.0000 0.0348 49.500 0.00 8.33 -8.33 1 1/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5071 0.4929 2 2 0.0000 0.1774 0.8226 2 2 0.0000 0.1187 0.8813
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.050 1 -6 1 740 152 588 2 0 6 0 144 0 0 587 0 1 0.0132 0.0000 0.0017 24.333 0.00 7.17 -7.17 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4053 0.5947 2 2 0.0000 0.0962 0.9038 2 2 0.0000 0.0611 0.9389
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.050 1 -3 1 801 249 552 184 6 38 3 18 0 0 552 0 0 0.7390 0.0000 0.0000 5.447 0.53 3.56 -3.02 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0476 0.9524 0.0000
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.050 1 4 2 151 63 88 0 1 2 0 60 0 0 86 0 2 0.0000 0.0000 0.0227 30.000 3.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1996 0.8004 2 2 0.0000 0.2006 0.7994 2 2 0.0000 0.2033 0.7967
chr16 89850471 C CGAG 0.500000 0.050 1 3 3 468 115 353 49 2 13 0 51 0 0 351 0 2 0.4261 0.0000 0.0057 7.846 0.22 3.12 -2.89 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2153 0.5309 0.2538 1 1 0.2171 0.5286 0.2543 1 1 0.2194 0.5257 0.2549
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.050 1 -3 1 816 188 628 175 1 8 0 4 0 0 628 0 0 0.9309 0.0000 0.0000 22.500 0.43 3.00 -2.57 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2956 0.7044 0.0000 0 0 0.9479 0.0521 0.0000 0 0 0.9814 0.0186 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.050 1 -1 2 385 137 248 8 0 5 0 124 0 0 248 0 0 0.0584 0.0000 0.0000 26.400 0.88 1.20 -0.33 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8172 0.1828 2 2 0.0000 0.3162 0.6838
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.050 1 -3 1 770 170 600 160 0 7 0 3 0 0 600 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 23.286 0.17 4.33 -4.16 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9836 0.0164 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.050 1 3 1 738 212 526 12 1 36 1 162 0 0 519 0 7 0.0566 0.0000 0.0133 4.889 1.33 3.23 -1.90 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9787 0.0213 2 1 0.0000 0.5271 0.4729
chr17 7846859 T TACC 0.057281 0.050 1 3 2 1169 341 828 1 128 88 17 107 0 1 816 0 11 0.0029 0.0000 0.0145 2.875 1.00 6.01 -5.01 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3373 0.6294 0.0334 1 1 0.3446 0.6219 0.0335 1 1 0.3542 0.6123 0.0336
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.050 1 -6 2 1174 359 815 137 5 76 0 141 0 0 812 0 3 0.3816 0.0000 0.0037 3.724 5.34 7.26 -1.92 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3508 0.6084 0.0407 1 1 0.3575 0.6013 0.0412 1 1 0.3661 0.5923 0.0417
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.050 1 -6 1 969 269 700 127 0 46 1 95 0 0 693 0 7 0.4721 0.0000 0.0100 4.933 0.94 7.21 -6.27 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6861 0.3070 0.0069 1 0 0.6805 0.3120 0.0075 1 0 0.6726 0.3190 0.0084
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 1 543 149 394 71 1 9 0 68 0 0 393 0 1 0.4765 0.0000 0.0025 15.556 0.21 2.90 -2.69 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2637 0.5402 0.1961 1 1 0.2641 0.5372 0.1986 1 1 0.2646 0.5334 0.2020
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.050 1 9 2 357 97 260 1 0 7 3 86 0 0 260 0 0 0.0103 0.0000 0.0000 12.714 1.00 7.00 -6.00 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3534 0.6466 2 2 0.0000 0.1789 0.8211 2 2 0.0000 0.1470 0.8530
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 489 193 296 4 0 41 12 136 0 0 293 0 3 0.0207 0.0000 0.0101 3.707 0.00 3.21 -3.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9384 0.0616 2 2 0.0000 0.2582 0.7418 2 2 0.0000 0.1057 0.8943
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 860 237 623 8 3 30 13 183 0 0 623 0 0 0.0338 0.0000 0.0000 6.897 0.62 4.24 -3.62 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8577 0.1423 2 2 0.0000 0.2919 0.7081
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 862 233 629 9 23 19 22 160 0 0 629 0 0 0.0386 0.0000 0.0000 23.667 0.67 4.06 -3.39 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 0.9347 0.0653
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.050 1 3 1 738 168 570 6 0 5 0 157 0 0 564 0 6 0.0357 0.0000 0.0105 32.600 0.00 3.90 -3.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 2 0.0000 0.4950 0.5050 2 2 0.0000 0.1565 0.8435
chr17 20204736 TGAG T 0.500000 0.050 1 -3 2 593 115 478 55 1 0 0 59 0 0 476 0 2 0.4783 0.0000 0.0042 115.000 0.18 3.19 -3.00 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1786 0.5281 0.2933 1 1 0.1815 0.5260 0.2925 1 1 0.1854 0.5233 0.2913
chr17 35479822 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 716 167 549 158 0 3 0 6 0 0 549 0 0 0.9461 0.0000 0.0000 54.667 0.61 1.83 -1.23 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.4732 0.5268 0.0000 0 0 0.8262 0.1738 0.0000
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 111 63 48 3 0 6 0 54 0 0 48 0 0 0.0476 0.0000 0.0000 9.500 0.00 1.41 -1.41 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9715 0.0285 2 1 0.0000 0.6615 0.3385 2 2 0.0000 0.4551 0.5449
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.050 1 -12 1 726 159 567 72 0 30 0 57 1 3 554 0 9 0.4528 0.0018 0.0229 4.448 1.60 11.14 -9.54 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3576 0.5126 0.1298 1 1 0.3546 0.5115 0.1339 1 1 0.3505 0.5103 0.1393
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.050 1 1 1 380 99 281 11 0 0 0 88 0 0 281 0 0 0.1111 0.0000 0.0000 99.000 0.27 1.55 -1.27 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9943 0.0057 2 1 0.0000 0.8779 0.1221
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 508 111 397 99 0 4 0 8 0 0 397 0 0 0.8919 0.0000 0.0000 26.750 0.27 1.25 -0.98 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0525 0.9475 0.0000 0 1 0.3551 0.6449 0.0000
chr17 41140276 TGACAGCAGCTGG T 0.500000 0.050 1 -12 1 638 152 486 124 1 23 0 4 5 1 478 1 1 0.8158 0.0103 0.0165 5.609 1.27 9.25 -7.98 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.3221 0.6779 0.0000 0 0 0.7126 0.2874 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.050 1 3 5 1476 335 1141 308 2 7 0 18 1 0 1139 0 1 0.9194 0.0009 0.0018 46.857 0.43 3.11 -2.68 88 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 0 0.5974 0.4026 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 621 158 463 124 2 27 0 5 0 2 461 0 0 0.7848 0.0000 0.0043 4.778 0.81 3.60 -2.79 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0069 0.9931 0.0000 0 1 0.4466 0.5534 0.0000 0 0 0.7648 0.2352 0.0000
chr17 47836758 AAGGAGCTGGAGC A 0.500000 0.050 1 -12 1 627 149 478 137 0 8 0 4 0 0 478 0 0 0.9195 0.0000 0.0000 20.143 0.46 12.00 -11.54 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0430 0.9570 0.0000 0 0 0.6656 0.3344 0.0000 0 0 0.8557 0.1443 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.050 1 3 5 832 226 606 110 0 8 0 108 0 0 600 0 6 0.4867 0.0000 0.0099 27.250 0.12 3.09 -2.97 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1757 0.5632 0.2610 1 1 0.1793 0.5585 0.2623 1 1 0.1839 0.5525 0.2636
chr17 57979243 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 396 166 230 117 6 35 3 5 0 0 230 0 0 0.7048 0.0000 0.0000 3.571 0.49 2.60 -2.11 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2334 0.7666 0.0000 0 0 0.6274 0.3726 0.0000
chr17 58155318 CCA C 0.500000 0.050 1 -2 1 686 188 498 177 1 6 0 4 0 0 498 0 0 0.9415 0.0000 0.0000 30.333 0.23 2.00 -1.77 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1149 0.8851 0.0000 0 0 0.8481 0.1519 0.0000 0 0 0.9416 0.0584 0.0000
chr17 58156083 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 330 69 261 63 0 3 0 3 0 0 261 0 0 0.9130 0.0000 0.0000 22.000 0.62 1.33 -0.71 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0359 0.9641 0.0000 0 1 0.3902 0.6098 0.0000 0 0 0.5978 0.4022 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.050 1 6 2 383 116 267 45 1 26 0 44 0 0 260 0 7 0.3879 0.0000 0.0262 3.600 0.40 9.48 -9.08 19 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1784 0.5212 0.3003 1 1 0.1813 0.5196 0.2991 1 1 0.1850 0.5176 0.2973
chr17 58756096 G GGAACCCGAACCC 0.500000 0.050 1 12 2 383 116 267 45 1 29 0 41 0 0 260 0 7 0.3879 0.0000 0.0262 3.000 0.40 9.59 -9.19 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2100 0.5271 0.2628 1 1 0.2120 0.5251 0.2630 1 1 0.2144 0.5225 0.2631
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.050 1 9 1 327 106 221 46 0 12 0 48 0 0 221 0 0 0.4340 0.0000 0.0000 7.833 0.24 7.17 -6.93 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2129 0.5275 0.2596 1 1 0.2148 0.5254 0.2598 1 1 0.2171 0.5228 0.2601
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.050 1 9 2 523 116 407 50 0 8 1 57 0 0 403 0 4 0.4310 0.0000 0.0098 13.375 0.46 8.04 -7.58 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1205 0.4940 0.3855 1 1 0.1246 0.4943 0.3811 1 1 0.1301 0.4947 0.3752
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 616 137 479 82 1 4 3 47 0 0 476 0 3 0.5985 0.0000 0.0063 33.250 0.50 2.43 -1.93 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6321 0.3359 0.0320 1 0 0.6201 0.3447 0.0353 1 0 0.6038 0.3563 0.0399
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 688 154 534 97 0 15 0 42 0 1 524 0 9 0.6299 0.0000 0.0187 9.267 0.75 17.64 -16.89 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8034 0.1889 0.0077 1 0 0.7905 0.2005 0.0091 1 0 0.7722 0.2165 0.0112
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.050 1 -27 1 744 169 575 107 0 5 0 57 0 2 553 2 18 0.6331 0.0000 0.0383 32.800 0.93 24.61 -23.69 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6478 0.3261 0.0261 1 0 0.6361 0.3349 0.0290 1 0 0.6201 0.3466 0.0333
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.050 1 -2 2 344 105 239 97 0 1 0 7 0 0 239 0 0 0.9238 0.0000 0.0000 104.000 0.22 2.00 -1.78 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0927 0.9073 0.0000 0 1 0.4315 0.5685 0.0000
chr17 75616380 C CAGG 0.500000 0.050 1 3 1 735 174 561 70 5 47 3 49 0 0 561 0 0 0.4023 0.0000 0.0000 2.660 0.93 3.24 -2.32 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5482 0.3986 0.0533 1 0 0.5382 0.4046 0.0572 1 0 0.5248 0.4124 0.0628
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.050 1 -30 1 2211 488 1723 228 9 54 6 191 4 3 1704 2 10 0.4672 0.0023 0.0110 8.075 1.51 7.05 -5.54 52 0/1 1/1 . . OK 1 0 0.6136 0.3681 0.0184 1 0 0.6061 0.3731 0.0208 1 0 0.5954 0.3803 0.0244
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 2143 559 1584 229 4 35 3 288 6 5 1439 17 117 0.4097 0.0038 0.0915 14.914 1.70 4.65 -2.95 41 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0005 0.9995 1 2 0.0000 0.0007 0.9993 1 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.050 1 -6 7 264 104 160 92 1 10 0 1 0 0 160 0 0 0.8846 0.0000 0.0000 9.400 0.30 6.00 -5.70 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6699 0.3301 0.0000 0 0 0.8356 0.1644 0.0000 0 0 0.8650 0.1350 0.0000
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.050 1 -3 2 535 150 385 79 0 5 0 66 0 0 383 0 2 0.5267 0.0000 0.0052 29.000 0.23 3.18 -2.95 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3668 0.5096 0.1236 1 1 0.3635 0.5088 0.1277 1 1 0.3590 0.5078 0.1333
chr17 82060071 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 321 90 231 84 0 3 0 3 0 0 231 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 29.000 0.42 3.00 -2.58 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0583 0.9417 0.0000 0 0 0.5173 0.4827 0.0000 0 0 0.7109 0.2891 0.0000
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.050 1 6 4 333 71 262 64 0 5 0 2 0 0 262 0 0 0.9014 0.0000 0.0000 13.200 0.38 3.00 -2.62 28 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5280 0.4720 0.0000 0 0 0.8818 0.1182 0.0000 0 0 0.9281 0.0719 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.050 1 3 1 128 46 82 0 0 2 0 44 0 0 81 0 1 0.0000 0.0000 0.0122 22.000 3.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.050 1 4 1 188 82 106 50 0 1 0 31 0 0 106 0 0 0.6098 0.0000 0.0000 81.000 0.18 4.77 -4.59 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4679 0.4458 0.0863 1 0 0.4590 0.4500 0.0910 1 1 0.4471 0.4554 0.0975
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 1 138 61 77 29 0 2 0 30 0 0 77 0 0 0.4754 0.0000 0.0000 29.500 0.24 2.93 -2.69 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2292 0.5177 0.2531 1 1 0.2303 0.5164 0.2533 1 1 0.2317 0.5147 0.2536
chr18 51197099 T TGCCGGG 0.500000 0.050 1 6 1 342 71 271 40 0 5 0 26 0 0 267 0 4 0.5634 0.0000 0.0148 13.200 1.07 5.58 -4.50 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3703 0.4920 0.1377 1 1 0.3660 0.4925 0.1415 1 1 0.3604 0.4932 0.1464
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 264 141 123 133 0 6 0 2 0 0 123 0 0 0.9433 0.0000 0.0000 22.500 0.21 3.00 -2.79 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5206 0.4794 0.0000 0 0 0.8748 0.1252 0.0000 0 0 0.9202 0.0798 0.0000
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.050 1 -15 2 723 172 551 94 0 5 0 73 0 0 547 0 4 0.5465 0.0000 0.0073 33.400 0.26 13.70 -13.44 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4485 0.4703 0.0812 1 1 0.4425 0.4720 0.0855 1 1 0.4343 0.4742 0.0915
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 6 333 64 269 1 1 9 5 48 0 1 268 0 0 0.0156 0.0000 0.0037 6.111 1.00 5.21 -4.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8644 0.1356 2 1 0.0000 0.5562 0.4438 2 2 0.0000 0.4138 0.5862
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 167 74 93 0 0 10 0 64 0 0 93 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.400 2.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1665 0.8335 2 2 0.0000 0.1710 0.8290 2 2 0.0000 0.1774 0.8226
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.050 1 3 1 138 64 74 31 1 6 0 26 0 0 71 0 3 0.4844 0.0000 0.0405 9.667 0.19 3.00 -2.81 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2777 0.5159 0.2064 1 1 0.2770 0.5147 0.2083 1 1 0.2761 0.5132 0.2107
chr18 76496529 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 254 63 191 34 0 7 3 19 1 0 190 0 0 0.5397 0.0052 0.0052 8.000 0.44 1.74 -1.30 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4232 0.4653 0.1115 1 1 0.4168 0.4677 0.1156 1 1 0.4082 0.4707 0.1211
chr18 79715187 T TGGA 0.500000 0.050 1 3 1 576 128 448 50 4 21 1 52 0 0 446 0 2 0.3906 0.0000 0.0045 5.095 0.66 3.08 -2.42 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2233 0.5330 0.2437 1 1 0.2249 0.5305 0.2446 1 1 0.2269 0.5274 0.2457
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.050 1 24 3 353 131 222 19 2 27 4 79 0 0 220 1 1 0.1450 0.0000 0.0090 4.435 4.11 4.70 -0.59 9 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0060 0.1911 0.8029 2 1 0.0010 0.8930 0.1060 2 1 0.0000 0.9987 0.0013
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.050 1 -3 1 178 64 114 60 0 2 0 2 0 0 114 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 31.000 0.28 4.50 -4.22 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3632 0.6368 0.0000 0 0 0.7921 0.2079 0.0000 0 0 0.8686 0.1314 0.0000
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.050 1 -3 2 193 103 90 0 0 0 0 103 0 0 88 0 2 0.0000 0.0000 0.0222 103.000 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1988 0.8012 2 2 0.0000 0.2073 0.7927 2 2 0.0000 0.2195 0.7805
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.050 1 -3 4 282 97 185 0 0 15 44 38 0 0 181 1 3 0.0000 0.0000 0.0216 5.467 4.87 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1131 0.8869 2 2 0.0000 0.1175 0.8825 2 2 0.0000 0.1239 0.8761
chr19 2015541 GGGCGGCGGC G 0.046318 0.050 1 -9 4 282 106 176 37 12 12 37 8 0 0 174 1 1 0.3491 0.0000 0.0114 7.833 3.35 10.12 -6.77 23 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4722 0.5086 0.0192 1 1 0.4734 0.5072 0.0194 1 1 0.4749 0.5055 0.0196
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.050 1 -12 4 282 107 175 50 2 50 1 4 0 0 174 0 1 0.4673 0.0000 0.0057 1.167 3.82 11.00 -7.18 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 1 0.2989 0.7011 0.0000 0 0 0.6607 0.3393 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.050 1 -3 1 359 121 238 111 1 5 0 4 0 0 238 0 0 0.9174 0.0000 0.0000 23.200 0.28 3.25 -2.97 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1537 0.8463 0.0000 0 0 0.8905 0.1095 0.0000 0 0 0.9610 0.0390 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.050 1 -12 2 495 148 347 134 0 9 1 4 1 0 345 0 1 0.9054 0.0029 0.0058 15.444 1.23 9.25 -8.02 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 0 0.5648 0.4352 0.0000 0 0 0.8709 0.1291 0.0000
chr19 8906017 A AGGT 0.002480 0.050 1 3 1 283 71 212 65 0 1 0 5 0 0 212 0 0 0.9155 0.0000 0.0000 70.000 0.34 4.20 -3.86 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3706 0.6294 0.0000 0 0 0.9861 0.0139 0.0000 0 0 0.9967 0.0033 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.050 1 5 3 258 70 188 67 0 0 0 3 0 0 188 0 0 0.9571 0.0000 0.0000 70.000 0.30 5.00 -4.70 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0790 0.9210 0.0000 0 0 0.5997 0.4003 0.0000 0 0 0.7767 0.2233 0.0000
chr19 11447525 A AGAG 0.036742 0.050 1 3 1 778 229 549 161 26 36 0 6 0 1 548 0 0 0.7031 0.0000 0.0018 5.361 0.47 3.00 -2.53 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1435 0.8565 0.0000 0 0 0.9802 0.0198 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.050 1 -3 1 778 232 546 176 2 30 1 23 0 0 544 1 1 0.7586 0.0000 0.0037 6.733 0.56 3.78 -3.23 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0090 0.9910 0.0000
chr19 14089291 ATCT A 0.000555 0.050 1 -3 1 309 69 240 63 0 1 1 4 0 0 240 0 0 0.9130 0.0000 0.0000 68.000 1.13 7.25 -6.12 45 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7985 0.2015 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr19 14089300 ATCT A 0.000426 0.050 1 -3 1 309 74 235 67 0 1 1 5 0 0 235 0 0 0.9054 0.0000 0.0000 73.000 1.04 6.60 -5.56 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4809 0.5191 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.050 1 3 1 542 108 434 0 0 6 0 102 0 0 433 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 17.000 3.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr19 17286686 GTGTGTT G 0.073608 0.050 1 -6 1 395 89 306 0 0 9 3 77 0 0 306 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.875 5.21 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.6256 0.3744 2 1 0.0000 0.6351 0.3649 2 1 0.0000 0.6479 0.3521
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.050 1 -4 1 395 86 309 0 0 5 2 79 0 0 309 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 20.000 5.18 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.3925 0.6075 2 2 0.0000 0.4023 0.5977 2 2 0.0000 0.4160 0.5840
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.050 1 1 1 102 28 74 5 1 0 0 22 0 0 68 0 6 0.1786 0.0000 0.0811 28.000 1.60 2.68 -1.08 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0063 0.8340 0.1597 2 1 0.0008 0.8903 0.1088 2 1 0.0001 0.6340 0.3659
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.050 1 -3 2 300 88 212 77 0 7 0 4 0 0 211 1 0 0.8750 0.0000 0.0047 11.571 0.39 3.00 -2.61 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0292 0.9708 0.0000 0 0 0.7260 0.2740 0.0000 0 0 0.9136 0.0864 0.0000
chr19 21973984 AAAGGCTTTGCCACATTCTTTACATTTGTAGGGCTTCTCTCCAGCATGAATTGCCTTATGTGTAATAAGGGTTGAGACCTTACTG A 0.003453 0.050 1 -84 1 239 45 194 0 0 19 1 25 0 1 191 1 1 0.0000 0.0000 0.0155 1.368 4.28 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9950 0.0049 2 1 0.0000 0.9948 0.0052 2 1 0.0000 0.9945 0.0054
chr19 22317080 ACCAAAGCTTTTAAGCAATCCTCACACCTTACTAGACAAAACAATTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTGAAGAATGTG A 0.000338 0.050 1 -82 1 93 37 56 27 0 2 0 8 1 0 55 0 0 0.7297 0.0179 0.0179 17.500 1.22 1.25 -0.03 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7181 0.2818 0.0000 0 0 0.9336 0.0664 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.050 1 -3 1 293 92 201 29 2 14 2 45 0 0 201 0 0 0.3152 0.0000 0.0000 5.429 0.28 3.07 -2.79 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0250 0.3643 0.6108 1 2 0.0263 0.3691 0.6046 1 2 0.0281 0.3756 0.5963
chr19 33379692 GACCTC G 0.005617 0.050 1 -5 1 445 112 333 56 0 5 1 50 0 0 332 0 1 0.5000 0.0000 0.0030 21.200 0.27 4.54 -4.27 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5166 0.4814 0.0019 1 0 0.5171 0.4809 0.0020 1 0 0.5176 0.4804 0.0020
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.050 1 3 1 481 122 359 115 1 3 0 3 0 0 359 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 39.333 0.68 3.00 -2.32 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0458 0.9542 0.0000 0 1 0.4500 0.5500 0.0000 0 0 0.6474 0.3526 0.0000
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.050 1 -51 2 393 151 242 104 0 17 1 29 0 0 225 0 17 0.6887 0.0000 0.0702 7.882 1.23 19.79 -18.56 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9202 0.0791 0.0006 1 0 0.9129 0.0863 0.0008 1 0 0.9023 0.0967 0.0010
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.050 1 12 2 387 116 271 65 0 40 0 11 0 0 270 1 0 0.5603 0.0000 0.0037 2.111 2.65 9.45 -6.81 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0390 0.9610 0.0000 0 0 0.5045 0.4955 0.0000
chr19 35720452 AAAG A 0.001622 0.050 1 -3 1 722 181 541 160 1 14 0 6 0 0 541 0 0 0.8840 0.0000 0.0000 11.929 0.55 3.33 -2.78 88 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6641 0.3359 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 36141152 C CGGT 0.000243 0.050 1 3 2 407 143 264 72 5 5 3 58 0 1 263 0 0 0.5035 0.0000 0.0038 26.800 0.71 3.33 -2.62 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6481 0.3518 0.0000 1 0 0.6442 0.3558 0.0000 1 0 0.6387 0.3612 0.0000
chr19 37388950 C CTGTG 0.140068 0.050 1 4 5 550 125 425 62 0 2 0 61 0 0 417 0 8 0.4960 0.0000 0.0188 61.500 0.45 5.08 -4.63 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3073 0.5927 0.1000 1 1 0.3128 0.5881 0.0991 1 1 0.3199 0.5822 0.0979
chr19 37388952 AT A 0.140069 0.050 1 -1 2 553 122 431 61 0 4 0 57 0 0 423 2 6 0.5000 0.0000 0.0186 29.500 0.46 5.32 -4.86 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3574 0.5636 0.0790 1 1 0.3613 0.5599 0.0789 1 1 0.3662 0.5551 0.0787
chr19 37894973 TGGA T 0.043831 0.050 1 -3 1 675 137 538 88 0 2 0 47 0 0 535 0 3 0.6423 0.0000 0.0056 67.500 0.18 3.72 -3.54 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8402 0.1589 0.0009 1 0 0.8320 0.1670 0.0010 1 0 0.8205 0.1783 0.0012
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.050 1 -1 2 330 129 201 126 0 0 0 3 0 1 199 1 0 0.9767 0.0000 0.0100 129.000 0.26 3.33 -3.07 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2628 0.7372 0.0000 0 0 0.8587 0.1413 0.0000 0 0 0.9326 0.0674 0.0000
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.050 1 -2 1 219 39 180 0 0 2 33 4 0 0 180 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 16.000 4.75 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1006 0.8994 2 2 0.0000 0.1023 0.8977 2 2 0.0000 0.1047 0.8953
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.050 1 2 2 219 39 180 0 0 22 16 1 0 0 180 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.867 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1321 0.8679 2 2 0.0000 0.1335 0.8665 2 2 0.0000 0.1355 0.8645
chr19 40667960 TTGC T 0.034410 0.050 1 -3 1 410 105 305 99 1 1 0 4 0 0 305 0 0 0.9429 0.0000 0.0000 104.000 5.05 6.50 -1.45 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3370 0.6630 0.0000 0 0 0.9581 0.0419 0.0000 0 0 0.9859 0.0141 0.0000
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.050 1 -6 1 394 121 273 0 0 6 2 113 0 0 272 0 1 0.0000 0.0000 0.0037 19.167 5.09 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0425 0.9575 2 2 0.0000 0.0450 0.9550 2 2 0.0000 0.0486 0.9514
chr19 40667990 CTGT C 0.142266 0.050 1 -3 1 394 123 271 5 10 3 8 97 0 0 270 1 0 0.0407 0.0000 0.0037 111.000 2.60 5.19 -2.59 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9747 0.0253 2 1 0.0000 0.8759 0.1241
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.050 1 1 2 434 139 295 58 0 3 0 78 0 0 294 0 1 0.4173 0.0000 0.0034 68.000 0.07 2.00 -1.93 44 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1413 0.5828 0.2758 1 1 0.1489 0.5827 0.2685 1 1 0.1592 0.5821 0.2587
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.050 1 -1 1 493 118 375 112 0 2 0 4 0 0 375 0 0 0.9492 0.0000 0.0000 58.000 0.16 2.25 -2.09 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2885 0.7115 0.0000 0 0 0.9461 0.0539 0.0000 0 0 0.9815 0.0185 0.0000
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.050 1 -3 2 502 152 350 84 0 1 0 67 0 0 347 0 3 0.5526 0.0000 0.0086 151.000 0.26 3.15 -2.89 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3246 0.5349 0.1405 1 1 0.3200 0.5339 0.1461 1 1 0.3138 0.5326 0.1536
chr19 45409231 CAAG C 0.234924 0.050 1 -3 2 466 99 367 28 0 12 0 59 0 0 366 0 1 0.2828 0.0000 0.0027 7.250 0.86 3.46 -2.60 6 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0653 0.4616 0.4732 1 1 0.0713 0.4708 0.4578 1 1 0.0800 0.4825 0.4375
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.050 1 6 2 528 176 352 5 0 29 1 141 0 0 329 0 23 0.0284 0.0000 0.0653 5.069 1.40 6.30 -4.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9836 0.0164 2 2 0.0000 0.3434 0.6566 2 2 0.0000 0.1176 0.8824
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.050 1 18 1 293 83 210 44 0 16 0 23 0 0 201 0 9 0.5301 0.0000 0.0429 4.188 0.34 13.30 -12.96 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5836 0.3955 0.0210 1 0 0.5793 0.3989 0.0218 1 0 0.5736 0.4034 0.0229
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.050 1 -3 1 371 105 266 59 0 5 0 41 0 0 266 0 0 0.5619 0.0000 0.0000 20.000 1.00 4.59 -3.59 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6469 0.3390 0.0141 1 0 0.6408 0.3443 0.0150 1 0 0.6325 0.3514 0.0162
chr19 47802262 AGGCCTGGGTTCG A 0.000135 0.050 1 -12 1 1194 319 875 163 8 34 5 109 3 3 857 5 7 0.5110 0.0034 0.0206 9.655 1.65 10.98 -9.33 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8860 0.1140 0.0000 1 0 0.8792 0.1208 0.0000 1 0 0.8695 0.1305 0.0000
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.050 1 1 1 229 89 140 40 0 8 0 41 0 0 138 0 2 0.4494 0.0000 0.0143 10.125 0.28 1.83 -1.55 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3511 0.5474 0.1015 1 1 0.3541 0.5447 0.1012 1 1 0.3579 0.5413 0.1007
chr19 48944491 GGA G 0.076452 0.050 1 -2 3 331 109 222 56 0 4 0 49 0 0 221 0 1 0.5138 0.0000 0.0045 26.250 0.12 2.08 -1.96 18 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5097 0.4670 0.0233 1 0 0.5091 0.4671 0.0238 1 0 0.5080 0.4675 0.0245
chr19 49070105 TGGA T 0.101017 0.050 1 -3 1 383 125 258 123 0 0 0 2 0 0 258 0 0 0.9840 0.0000 0.0000 125.000 0.56 4.00 -3.44 61 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8825 0.1175 0.0000 0 0 0.9798 0.0202 0.0000 0 0 0.9878 0.0122 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.050 1 -3 1 907 198 709 135 5 36 2 20 0 2 704 2 1 0.6818 0.0000 0.0071 4.500 0.94 4.00 -3.06 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0084 0.9916 0.0000
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.050 1 3 1 942 255 687 181 10 57 1 6 1 0 685 0 1 0.7098 0.0015 0.0029 3.456 0.48 4.00 -3.52 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 0 0.5958 0.4042 0.0000 0 0 0.9208 0.0792 0.0000
chr19 49196501 TGCTGCGGGGGCC T 0.003841 0.050 1 -12 2 350 119 231 109 0 6 0 4 0 0 231 0 0 0.9160 0.0000 0.0000 18.833 0.49 12.00 -11.51 47 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8546 0.1454 0.0000 0 0 0.9962 0.0038 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.050 1 -6 2 504 135 369 58 0 24 1 52 0 1 365 0 3 0.4296 0.0000 0.0108 4.583 1.28 6.40 -5.13 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3373 0.5216 0.1411 1 1 0.3375 0.5196 0.1429 1 1 0.3377 0.5171 0.1453
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.050 1 3 2 661 137 524 0 0 2 9 126 0 0 517 2 5 0.0000 0.0000 0.0134 67.500 3.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0208 0.9792 2 2 0.0000 0.0228 0.9772
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.050 1 3 3 662 143 519 0 0 9 125 9 0 0 517 1 1 0.0000 0.0000 0.0039 14.778 3.67 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0673 0.9327 2 2 0.0000 0.0717 0.9283 2 2 0.0000 0.0782 0.9218
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.050 1 6 2 543 128 415 107 0 14 0 7 0 0 414 0 1 0.8359 0.0000 0.0024 8.143 0.36 5.14 -4.78 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 0 0.8364 0.1636 0.0000 0 0 0.9807 0.0193 0.0000
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.050 1 1 1 513 154 359 67 1 5 5 76 0 0 358 0 1 0.4351 0.0000 0.0028 29.800 0.24 2.82 -2.58 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0643 0.4477 0.4879 1 2 0.0672 0.4493 0.4835 1 2 0.0712 0.4515 0.4773
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.050 1 -2 1 181 82 99 47 0 0 0 35 0 0 96 0 3 0.5732 0.0000 0.0303 82.000 0.60 2.29 -1.69 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2163 0.5531 0.2306 1 1 0.2135 0.5509 0.2356 1 1 0.2097 0.5482 0.2421
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.050 1 -1 2 471 139 332 134 1 0 0 4 0 0 332 0 0 0.9640 0.0000 0.0000 139.000 0.25 6.75 -6.50 94 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0709 0.9291 0.0000 0 0 0.7591 0.2409 0.0000 0 0 0.9030 0.0970 0.0000
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.050 1 3 1 539 137 402 127 0 6 0 4 0 0 402 0 0 0.9270 0.0000 0.0000 21.833 0.27 3.25 -2.98 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0533 0.9467 0.0000 0 0 0.7145 0.2855 0.0000 0 0 0.8823 0.1177 0.0000
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.050 1 3 2 648 175 473 76 0 1 0 98 0 0 471 0 2 0.4343 0.0000 0.0042 174.000 0.14 3.44 -3.29 20 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0665 0.4523 0.4812 1 2 0.0715 0.4567 0.4718 1 1 0.0784 0.4625 0.4591
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.050 1 -1 5 678 178 500 84 0 7 0 87 0 0 500 0 0 0.4719 0.0000 0.0000 34.200 0.39 2.28 -1.88 50 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1183 0.5338 0.3479 1 1 0.1203 0.5307 0.3490 1 1 0.1229 0.5268 0.3503
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.050 1 3 1 683 114 569 60 0 6 0 48 1 0 566 0 2 0.5263 0.0018 0.0053 18.000 0.20 3.19 -2.99 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3985 0.4883 0.1132 1 1 0.3945 0.4886 0.1169 1 1 0.3891 0.4891 0.1218
chr19 54912835 GGAA G 0.007162 0.050 1 -3 3 160 80 80 49 0 2 1 28 0 0 79 0 1 0.6125 0.0000 0.0125 39.000 0.06 3.36 -3.30 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6970 0.3022 0.0008 1 0 0.6909 0.3083 0.0008 1 0 0.6826 0.3165 0.0009
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.050 1 9 2 394 94 300 2 1 14 0 77 0 0 286 0 14 0.0213 0.0000 0.0467 5.714 0.50 7.19 -6.69 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9220 0.0780 2 2 0.0000 0.4359 0.5641 2 2 0.0000 0.2557 0.7443
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.050 1 -24 1 596 129 467 0 0 25 0 104 0 0 421 0 46 0.0000 0.0000 0.0985 4.160 20.59 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0042 0.9958
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.050 1 3 4 938 279 659 121 1 46 0 111 0 0 655 0 4 0.4337 0.0000 0.0061 5.065 1.00 3.62 -2.62 63 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3924 0.5256 0.0819 1 1 0.3933 0.5223 0.0843 1 1 0.3942 0.5183 0.0875
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.050 1 3 1 506 95 411 53 0 4 0 38 0 0 409 0 2 0.5579 0.0000 0.0049 22.750 0.57 4.29 -3.72 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3853 0.4909 0.1239 1 1 0.3799 0.4918 0.1283 1 1 0.3726 0.4931 0.1343
chr19 55738355 G GA 0.000815 0.050 1 1 2 198 56 142 29 0 4 0 23 0 0 142 0 0 0.5179 0.0000 0.0000 13.000 1.21 1.00 0.21 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5577 0.4421 0.0003 1 0 0.5560 0.4437 0.0003 1 0 0.5538 0.4460 0.0003
chr19 56088071 C CTCG 0.023520 0.050 1 3 2 293 54 239 4 22 5 2 21 0 1 236 0 2 0.0741 0.0000 0.0126 9.600 7.50 5.57 1.93 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5007 0.4896 0.0097 1 0 0.5008 0.4895 0.0098 1 0 0.5008 0.4893 0.0099
chr19 56088071 CTCGTCG C 0.000755 0.050 1 -6 2 294 60 234 30 3 3 2 22 0 0 233 0 1 0.5000 0.0000 0.0043 19.000 4.60 9.64 -5.04 20 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5802 0.4196 0.0002 1 0 0.5777 0.4220 0.0002 1 0 0.5745 0.4253 0.0002
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.050 1 3 1 134 71 63 3 0 7 0 61 0 0 58 1 4 0.0423 0.0000 0.0794 9.143 0.33 3.11 -2.78 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9823 0.0177 2 1 0.0000 0.7605 0.2395 2 1 0.0000 0.5774 0.4226
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.050 1 -2 1 300 113 187 108 1 2 0 2 0 0 187 0 0 0.9558 0.0000 0.0000 55.000 0.16 1.00 -0.84 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3190 0.6810 0.0000 0 0 0.7527 0.2473 0.0000 0 0 0.8362 0.1638 0.0000
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.050 1 -6 2 84 53 31 3 0 2 0 48 0 0 31 0 0 0.0566 0.0000 0.0000 25.500 0.33 6.44 -6.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9629 0.0371 2 1 0.0000 0.5953 0.4047 2 2 0.0000 0.3847 0.6153
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.050 1 2 1 470 163 307 121 0 0 0 42 0 0 304 0 3 0.7423 0.0000 0.0098 163.000 0.17 8.38 -8.22 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9556 0.0441 0.0003 1 0 0.9497 0.0499 0.0004 1 0 0.9408 0.0586 0.0006
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.050 1 -2 1 470 166 304 121 0 5 3 37 0 0 301 0 3 0.7289 0.0000 0.0099 32.200 0.17 8.54 -8.37 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9599 0.0399 0.0003 1 0 0.9544 0.0453 0.0003 1 0 0.9459 0.0536 0.0005
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.050 1 -3 4 471 139 332 91 1 4 0 43 0 0 329 0 3 0.6547 0.0000 0.0090 33.750 0.10 8.95 -8.85 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8347 0.1602 0.0051 1 0 0.8237 0.1703 0.0059 1 0 0.8082 0.1845 0.0073
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.050 1 1 2 197 83 114 36 0 2 0 45 0 0 114 0 0 0.4337 0.0000 0.0000 40.500 0.14 1.20 -1.06 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1060 0.4774 0.4166 1 1 0.1088 0.4780 0.4132 1 1 0.1125 0.4789 0.4085
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.050 1 -6 2 663 184 479 2 0 3 0 179 0 0 473 0 6 0.0109 0.0000 0.0125 60.333 0.50 5.68 -5.18 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2338 0.7662 2 2 0.0000 0.0464 0.9536 2 2 0.0000 0.0296 0.9704
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.050 1 3 1 437 152 285 0 0 1 1 150 0 0 276 0 9 0.0000 0.0000 0.0316 150.000 3.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0100 0.9900 2 2 0.0000 0.0112 0.9888
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.050 1 -9 4 200 67 133 4 1 20 0 42 0 0 131 0 2 0.0597 0.0000 0.0150 2.350 1.75 9.17 -7.42 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.8417 0.1583 2 1 0.0000 0.5903 0.4097
chr20 38926679 C CGCGGCG 0.000616 0.050 1 6 3 520 158 362 70 0 28 1 59 0 0 352 0 10 0.4430 0.0000 0.0276 4.643 0.84 5.49 -4.65 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4558 0.5439 0.0003 1 1 0.4591 0.5406 0.0003 1 1 0.4632 0.5365 0.0003
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.050 1 -3 2 862 253 609 5 0 35 9 204 0 0 605 1 3 0.0198 0.0000 0.0066 6.200 0.00 3.57 -3.57 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9063 0.0937 2 2 0.0000 0.0801 0.9199 2 2 0.0000 0.0225 0.9775
chr20 45891618 TG T 0.009535 0.050 1 -1 1 870 259 611 23 23 107 15 91 0 1 610 0 0 0.0888 0.0000 0.0016 1.257 0.65 3.97 -3.31 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0176 0.7619 0.2205 1 1 0.0210 0.7799 0.1991 1 1 0.0258 0.8035 0.1706
chr20 45891620 CTG C 0.009541 0.050 1 -2 1 873 261 612 25 1 29 109 97 0 0 611 1 0 0.0958 0.0000 0.0016 4.926 0.68 4.06 -3.38 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.050 1 3 1 399 105 294 54 0 6 0 45 0 0 294 0 0 0.5143 0.0000 0.0000 16.500 0.46 3.00 -2.54 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4880 0.4544 0.0576 1 0 0.4853 0.4555 0.0593 1 0 0.4815 0.4570 0.0615
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.050 1 -6 2 192 23 169 0 1 4 0 18 0 0 167 0 2 0.0000 0.0000 0.0118 4.500 7.78 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0037 0.9963
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.050 1 -1 1 273 131 142 63 0 1 0 67 0 0 142 0 0 0.4809 0.0000 0.0000 130.000 0.10 2.03 -1.93 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1029 0.5147 0.3823 1 1 0.1046 0.5128 0.3826 1 1 0.1068 0.5105 0.3827
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.050 1 6 4 748 193 555 90 0 2 0 101 0 0 549 0 6 0.4663 0.0000 0.0108 95.500 0.09 5.55 -5.47 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0794 0.4773 0.4433 1 1 0.0837 0.4783 0.4380 1 1 0.0896 0.4797 0.4307
chr21 33070402 CTCCTCCACT C 0.002225 0.050 1 -9 2 445 134 311 127 2 1 0 4 0 1 310 0 0 0.9478 0.0000 0.0032 133.000 0.73 9.50 -8.77 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9450 0.0550 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.050 1 -30 1 667 150 517 78 2 7 3 60 0 3 509 2 3 0.5200 0.0000 0.0155 20.286 1.45 13.87 -12.42 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5586 0.4066 0.0348 1 0 0.5541 0.4094 0.0366 1 0 0.5479 0.4131 0.0390
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.050 1 3 2 251 118 133 5 0 7 0 106 0 0 131 0 2 0.0424 0.0000 0.0150 15.857 0.20 3.08 -2.88 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9942 0.0058 2 1 0.0000 0.5927 0.4073 2 2 0.0000 0.2628 0.7372
chr21 41179506 G GGGGTGAGTGAGGGTGTCCAGGGTGAGGAGTGAGGGTGTCA 0.029913 0.050 1 40 1 844 221 623 105 2 107 1 6 13 11 579 11 9 0.4751 0.0209 0.0706 1.065 2.00 5.33 -3.33 31 0/1 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1827 0.8173 0.0000
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.050 1 1 2 283 45 238 0 0 5 1 39 0 0 238 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.000 2.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.050 1 2 2 1030 170 860 80 3 4 7 76 1 0 853 1 5 0.4706 0.0012 0.0081 82.500 1.02 3.22 -2.20 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1097 0.5209 0.3694 1 1 0.1122 0.5184 0.3693 1 1 0.1156 0.5154 0.3690
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.050 1 -2 2 1034 170 864 80 4 2 7 77 1 0 856 2 5 0.4706 0.0012 0.0093 84.000 0.89 3.43 -2.54 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1117 0.5237 0.3646 1 1 0.1142 0.5211 0.3647 1 1 0.1175 0.5179 0.3646
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.050 1 -15 2 645 133 512 6 0 19 0 108 20 12 467 3 10 0.0451 0.0391 0.0879 6.000 1.33 14.18 -12.84 4 1/1 0/1 . . OK 1 2 0.0009 0.0847 0.9144 1 2 0.0012 0.0975 0.9013 2 1 0.0001 0.9676 0.0324
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.050 1 -15 2 550 113 437 57 1 7 0 48 0 0 433 0 4 0.5044 0.0000 0.0092 15.143 0.91 13.46 -12.55 19 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.2852 0.5287 0.1860 1 1 0.2838 0.5268 0.1894 1 1 0.2819 0.5243 0.1938
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.050 1 -9 7 333 141 192 1 0 16 0 124 0 0 192 0 0 0.0071 0.0000 0.0000 7.812 1.00 7.40 -6.40 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0080 0.9920 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.050 1 3 1 481 185 296 68 7 35 0 75 0 0 294 0 2 0.3676 0.0000 0.0068 4.286 0.46 3.01 -2.56 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2836 0.5541 0.1623 1 1 0.2868 0.5504 0.1628 1 1 0.2909 0.5457 0.1635
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.050 1 -3 3 220 120 100 109 0 7 0 4 0 0 99 1 0 0.9083 0.0000 0.0100 16.143 0.17 3.00 -2.83 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0491 0.9509 0.0000 0 0 0.7138 0.2862 0.0000 0 0 0.8896 0.1104 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.050 1 -21 3 450 96 354 0 0 28 2 66 0 0 347 0 7 0.0000 0.0000 0.0198 2.429 13.80 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0207 0.9793 2 2 0.0000 0.0215 0.9785 2 2 0.0000 0.0226 0.9774
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.050 1 3 1 792 198 594 83 4 45 7 59 0 0 593 0 1 0.4192 0.0000 0.0017 3.378 1.25 3.47 -2.22 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6473 0.3365 0.0163 1 0 0.6410 0.3416 0.0174 1 0 0.6323 0.3486 0.0190
chr22 29489869 AGCTAAGTCCCCAGAGAAG A 0.006299 0.050 1 -18 2 1514 422 1092 179 1 30 9 203 2 2 1067 7 14 0.4242 0.0018 0.0229 12.967 2.17 11.86 -9.69 109 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0515 0.9117 0.0368 1 1 0.0583 0.9069 0.0347 1 1 0.0684 0.8995 0.0321
chr22 36265995 AATAATT A 0.003695 0.050 1 -6 1 458 138 320 134 0 0 0 4 0 0 320 0 0 0.9710 0.0000 0.0000 138.000 0.51 4.75 -4.24 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9198 0.0802 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.050 1 -6 2 396 196 200 74 0 43 0 79 0 0 197 0 3 0.3776 0.0000 0.0150 3.558 0.43 5.92 -5.49 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2472 0.5828 0.1700 1 1 0.2528 0.5785 0.1687 1 1 0.2602 0.5731 0.1667
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.050 1 -3 1 971 330 641 12 0 9 5 304 0 0 629 1 11 0.0364 0.0000 0.0187 40.000 1.75 3.90 -2.15 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5947 0.4053 2 2 0.0000 0.0499 0.9501
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.050 1 9 4 365 182 183 91 1 19 0 71 0 0 178 1 4 0.5000 0.0000 0.0273 8.526 0.16 7.23 -7.06 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5099 0.4347 0.0553 1 0 0.5050 0.4369 0.0582 1 0 0.4981 0.4397 0.0621
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.050 1 -3 3 191 94 97 42 0 8 0 44 0 0 96 0 1 0.4468 0.0000 0.0103 10.750 0.19 4.57 -4.38 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2771 0.5363 0.1866 1 1 0.2797 0.5341 0.1862 1 1 0.2832 0.5312 0.1857
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.050 1 3 3 334 128 206 0 0 2 1 125 0 0 199 0 7 0.0000 0.0000 0.0340 62.500 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0144 0.9856 2 2 0.0000 0.0153 0.9847 2 2 0.0000 0.0168 0.9832
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.050 1 1 3 878 197 681 7 0 2 1 187 1 0 652 0 28 0.0355 0.0015 0.0426 97.500 7.71 10.06 -2.34 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.7031 0.2969 2 2 0.0000 0.2061 0.7939
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.050 1 -48 1 995 203 792 8 0 62 0 133 0 0 716 0 76 0.0394 0.0000 0.0960 2.274 3.38 16.21 -12.84 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8212 0.1788 2 2 0.0000 0.3322 0.6678
703 rows