File Info

Filename
HG00741_x_HG01106_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/11/36fed8179541388c04ec95b66bb78e/HG00741_x_HG01106_FF_10.features.tsv
Size
151.3 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG00741_x_HG01106_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1641723 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 413 164 249 127 0 12 0 25 0 0 248 0 1 0.7744 0.0000 0.0040 12.667 0.57 9.28 -8.71 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 286 130 156 68 0 12 0 50 0 0 156 0 0 0.5231 0.0000 0.0000 9.833 0.19 8.36 -8.17 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6144 0.3682 0.0173 1 0 0.6072 0.3732 0.0197 1 0 0.5967 0.3801 0.0232
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 405 155 250 25 4 14 0 112 0 0 241 0 9 0.1613 0.0000 0.0360 10.769 0.60 3.21 -2.61 13 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9946 0.0054 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 404 141 263 18 1 19 0 103 0 0 256 0 7 0.1277 0.0000 0.0266 6.421 0.22 8.82 -8.59 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 307 123 184 118 0 0 0 5 0 0 184 0 0 0.9593 0.0000 0.0000 123.000 0.33 2.60 -2.27 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0061 0.9939 0.0000 0 0 0.6388 0.3612 0.0000 0 0 0.9253 0.0747 0.0000
chr1 2498647 G GGTGGGGGCC 0.500000 0.100 1 9 1 408 113 295 51 0 15 0 47 0 0 289 0 6 0.4513 0.0000 0.0203 6.533 0.69 7.83 -7.14 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1527 0.6202 0.2270 1 1 0.1577 0.6114 0.2309 1 1 0.1642 0.6003 0.2355
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 537 99 438 78 2 17 0 2 0 1 437 0 0 0.7879 0.0000 0.0023 4.824 0.50 3.00 -2.50 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4217 0.5783 0.0000 0 0 0.8717 0.1283 0.0000 0 0 0.9338 0.0662 0.0000
chr1 12879725 C CG 0.500000 0.100 1 1 3 676 204 472 130 1 8 1 64 0 0 472 0 0 0.6373 0.0000 0.0000 24.500 0.16 2.12 -1.96 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9925 0.0075 0.0000 1 0 0.9911 0.0089 0.0000 1 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 1008 175 833 152 0 10 0 13 0 0 833 0 0 0.8686 0.0000 0.0000 16.500 0.39 3.15 -2.76 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 1 0.2753 0.7247 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 400 128 272 119 1 2 1 5 0 0 272 0 0 0.9297 0.0000 0.0000 63.000 0.08 2.20 -2.12 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.4226 0.5774 0.0000 0 0 0.8810 0.1190 0.0000
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 1314 302 1012 171 3 16 3 109 0 0 1011 0 1 0.5662 0.0000 0.0010 17.812 1.53 2.05 -0.52 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9810 0.0190 0.0000 1 0 0.9785 0.0215 0.0000 1 0 0.9745 0.0255 0.0000
chr1 19312096 G GAGACTACGCGAGACGCGGC 0.500000 0.100 1 19 3 287 98 189 72 0 19 0 7 0 0 189 0 0 0.7347 0.0000 0.0000 4.158 0.85 11.29 -10.44 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0207 0.9793 0.0000 0 1 0.2691 0.7309 0.0000
chr1 21474942 TGTCTCCCAG T 0.500000 0.100 1 -9 1 174 68 106 62 0 3 0 3 0 0 106 0 0 0.9118 0.0000 0.0000 21.667 0.55 9.33 -8.78 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0291 0.9709 0.0000 0 1 0.4756 0.5244 0.0000 0 0 0.7471 0.2529 0.0000
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 732 159 573 65 32 13 24 25 1 3 569 0 0 0.4088 0.0017 0.0070 13.000 3.42 25.76 -22.34 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9710 0.0290 0.0001 1 0 0.9668 0.0331 0.0001 1 0 0.9603 0.0395 0.0001
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 757 175 582 57 3 28 4 83 0 0 580 0 2 0.3257 0.0000 0.0034 7.300 1.37 16.65 -15.28 25 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0037 0.2214 0.7749 1 2 0.0045 0.2296 0.7659 1 2 0.0057 0.2413 0.7529
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 430 168 262 8 0 17 1 142 0 0 261 0 1 0.0476 0.0000 0.0038 9.438 0.12 2.96 -2.84 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7835 0.2165 2 2 0.0000 0.1312 0.8688
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 409 138 271 57 1 20 1 59 0 0 271 0 0 0.4130 0.0000 0.0000 5.900 0.58 3.17 -2.59 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1463 0.6362 0.2175 1 1 0.1516 0.6263 0.2220 1 1 0.1586 0.6138 0.2276
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 589 142 447 0 0 24 2 116 1 0 443 1 2 0.0000 0.0022 0.0089 4.917 5.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0188 0.9812 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0053 0.9947
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 248 94 154 7 0 5 1 81 0 0 154 0 0 0.0745 0.0000 0.0000 17.800 0.86 3.01 -2.16 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9662 0.0338 2 1 0.0000 0.6252 0.3748
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 4 768 159 609 102 2 6 2 47 0 0 609 0 0 0.6415 0.0000 0.0000 25.333 0.50 3.04 -2.54 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9824 0.0176 0.0000 1 0 0.9795 0.0205 0.0000 1 0 0.9748 0.0251 0.0000
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 286 105 181 83 4 12 1 5 3 0 178 0 0 0.7905 0.0166 0.0166 7.667 0.46 7.40 -6.94 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.2418 0.7582 0.0000 0 0 0.7109 0.2891 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 159 82 77 0 0 1 0 81 0 0 76 0 1 0.0000 0.0000 0.0130 81.000 3.57 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0184 0.9816
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 348 175 173 77 0 33 0 65 0 0 168 0 5 0.4400 0.0000 0.0289 4.303 0.08 8.85 -8.77 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3026 0.6219 0.0755 1 1 0.3066 0.6127 0.0808 1 1 0.3109 0.6011 0.0879
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 518 165 353 91 0 6 0 68 0 0 347 0 6 0.5515 0.0000 0.0170 26.500 0.18 5.26 -5.09 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5355 0.4461 0.0184 1 0 0.5332 0.4459 0.0209 1 0 0.5291 0.4463 0.0246
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 414 123 291 8 1 6 3 105 0 0 284 1 6 0.0650 0.0000 0.0241 19.500 0.75 3.26 -2.51 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9564 0.0436 2 2 0.0000 0.4532 0.5468
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 712 107 605 17 0 15 7 68 0 0 589 2 14 0.1589 0.0000 0.0264 6.133 0.18 3.22 -3.04 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9984 0.0016
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.100 1 -45 4 726 154 572 23 1 4 13 113 0 1 571 0 0 0.1494 0.0000 0.0017 36.000 0.48 3.76 -3.28 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr1 116579660 G GTCA 0.500000 0.100 1 3 1 622 176 446 162 3 5 1 5 0 0 445 0 1 0.9205 0.0000 0.0022 42.500 0.57 4.40 -3.83 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.6871 0.3129 0.0000 0 0 0.9705 0.0295 0.0000
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 262 120 142 61 0 10 1 48 0 0 141 0 1 0.5083 0.0000 0.0070 11.000 0.31 5.71 -5.40 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4403 0.5100 0.0497 1 1 0.4382 0.5080 0.0538 1 1 0.4346 0.5057 0.0597
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.100 1 18 1 1260 346 914 42 3 131 7 163 4 3 834 6 67 0.1214 0.0044 0.0875 1.643 1.38 8.53 -7.15 12 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1121 214 907 27 0 39 0 148 0 0 894 2 11 0.1262 0.0000 0.0143 4.487 0.56 4.13 -3.57 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 266 91 175 4 0 11 5 71 0 0 175 0 0 0.0440 0.0000 0.0000 6.909 0.00 1.24 -1.24 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9923 0.0077 2 1 0.0000 0.6117 0.3883 2 2 0.0000 0.2482 0.7518
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 284 96 188 0 0 15 0 81 0 0 165 0 23 0.0000 0.0000 0.1223 5.400 14.52 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 857 251 606 200 8 35 3 5 2 1 602 0 1 0.7968 0.0033 0.0066 6.235 1.38 4.40 -3.02 126 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0239 0.9761 0.0000 0 0 0.9611 0.0389 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1347 315 1032 11 1 69 8 226 0 0 974 4 54 0.0349 0.0000 0.0562 3.682 1.18 10.22 -9.04 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.1435 0.8565 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 546 236 310 110 0 22 1 103 0 0 310 0 0 0.4661 0.0000 0.0000 9.727 0.38 7.46 -7.07 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2243 0.7073 0.0684 1 1 0.2326 0.6932 0.0742 1 1 0.2428 0.6749 0.0823
chr1 154869854 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 905 298 607 161 2 52 0 83 0 0 607 0 0 0.5403 0.0000 0.0000 4.731 0.39 8.49 -8.11 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9976 0.0024 0.0000 1 0 0.9970 0.0030 0.0000 1 0 0.9960 0.0040 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 227 87 140 5 0 1 1 80 0 0 139 0 1 0.0575 0.0000 0.0071 86.000 0.00 1.36 -1.36 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.7692 0.2308 2 2 0.0000 0.3154 0.6846
chr1 156583439 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 311 74 237 44 0 4 0 26 0 0 237 0 0 0.5946 0.0000 0.0000 17.500 0.25 1.08 -0.83 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6659 0.3153 0.0188 1 0 0.6550 0.3238 0.0212 1 0 0.6399 0.3353 0.0249
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 366 94 272 0 0 1 0 93 0 0 272 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 93.000 2.61 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0095 0.9905 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 899 225 674 107 0 3 0 115 0 0 672 0 2 0.4756 0.0000 0.0030 74.000 0.47 1.56 -1.09 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0410 0.6618 0.2973 1 1 0.0454 0.6495 0.3051 1 1 0.0517 0.6339 0.3144
chr1 160240083 GCTCTTCTTCCTC G 0.500000 0.100 1 -12 1 654 162 492 74 1 25 0 62 0 0 486 0 6 0.4568 0.0000 0.0122 5.480 0.24 11.29 -11.05 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3048 0.6180 0.0771 1 1 0.3085 0.6091 0.0823 1 1 0.3126 0.5979 0.0895
chr1 168136343 A AG 0.500000 0.100 1 1 4 248 103 145 93 0 8 0 2 0 0 145 0 0 0.9029 0.0000 0.0000 11.875 0.20 1.50 -1.30 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5863 0.4137 0.0000 0 0 0.9258 0.0742 0.0000 0 0 0.9620 0.0380 0.0000
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 332 82 250 44 1 6 0 31 0 0 250 0 0 0.5366 0.0000 0.0000 12.500 0.43 1.29 -0.86 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5550 0.4091 0.0359 1 0 0.5472 0.4135 0.0394 1 0 0.5363 0.4194 0.0443
chr1 175160809 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 386 97 289 1 6 1 78 11 0 0 288 0 1 0.0103 0.0000 0.0035 18.000 1.00 7.00 -6.00 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9748 0.0252 2 1 0.0000 0.6436 0.3564 2 2 0.0000 0.3393 0.6607
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 181 76 105 65 0 5 0 6 0 0 105 0 0 0.8553 0.0000 0.0000 14.200 0.46 4.67 -4.21 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0415 0.9585 0.0000 0 1 0.3326 0.6674 0.0000
chr1 201386873 CCCA C 0.500000 0.100 1 -3 1 603 165 438 149 0 10 0 6 0 0 438 0 0 0.9030 0.0000 0.0000 15.500 0.64 4.00 -3.36 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 0 0.7417 0.2583 0.0000 0 0 0.9671 0.0329 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 514 253 261 120 0 40 0 93 0 1 256 1 3 0.4743 0.0000 0.0192 5.325 0.57 11.08 -10.51 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6465 0.3480 0.0055 1 0 0.6432 0.3502 0.0066 1 0 0.6377 0.3540 0.0084
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 722 173 549 153 1 9 0 10 0 0 549 0 0 0.8844 0.0000 0.0000 18.111 0.51 8.60 -8.09 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0492 0.9508 0.0000 0 0 0.7405 0.2595 0.0000
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 245 109 136 8 0 3 0 98 0 0 135 0 1 0.0734 0.0000 0.0074 35.333 0.12 1.45 -1.32 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9719 0.0281 2 1 0.0000 0.5795 0.4205
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 606 181 425 15 0 21 3 142 0 0 417 1 7 0.0829 0.0000 0.0188 7.619 0.20 3.37 -3.17 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9024 0.0976
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 516 147 369 136 0 4 0 7 0 0 369 0 0 0.9252 0.0000 0.0000 35.750 0.32 1.14 -0.82 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3434 0.6566 0.0000 0 0 0.8921 0.1079 0.0000
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 767 220 547 201 0 3 0 16 0 0 547 0 0 0.9136 0.0000 0.0000 72.333 0.25 3.06 -2.81 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.3739 0.6261 0.0000
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 913 153 760 141 0 1 0 11 0 0 760 0 0 0.9216 0.0000 0.0000 152.000 0.64 1.64 -1.00 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0094 0.9906 0.0000 0 1 0.4464 0.5536 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1112 250 862 220 1 5 0 24 0 0 862 0 0 0.8800 0.0000 0.0000 49.000 0.37 1.12 -0.76 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0092 0.9908 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 629 62 567 0 0 2 2 58 0 0 563 0 4 0.0000 0.0000 0.0071 29.500 2.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0372 0.9628 2 2 0.0000 0.0396 0.9604 2 2 0.0000 0.0432 0.9568
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 334 126 208 21 0 10 0 95 0 0 206 0 2 0.1667 0.0000 0.0096 11.600 0.76 6.76 -6.00 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 1179 225 954 180 0 10 0 35 0 0 950 0 4 0.8000 0.0000 0.0042 21.500 0.26 3.11 -2.85 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr2 1942998 TTCCTCC T 0.015548 0.100 1 -6 1 377 67 310 37 1 7 0 22 0 0 310 0 0 0.5522 0.0000 0.0000 8.571 0.14 5.32 -5.18 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7813 0.2182 0.0005 1 0 0.7745 0.2249 0.0006 1 0 0.7652 0.2342 0.0007
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 221 107 114 55 0 13 0 39 0 0 110 0 4 0.5140 0.0000 0.0351 7.231 0.42 3.90 -3.48 9 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5234 0.4419 0.0347 1 0 0.5194 0.4428 0.0378 1 0 0.5135 0.4443 0.0421
chr2 17781726 CAAGTT C 0.103121 0.100 1 -5 2 569 147 422 79 0 3 0 65 0 0 420 0 2 0.5374 0.0000 0.0047 48.000 0.23 5.18 -4.96 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5865 0.4073 0.0062 1 0 0.5881 0.4051 0.0069 1 0 0.5894 0.4029 0.0078
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 481 165 316 0 1 10 4 150 0 0 306 1 9 0.0000 0.0000 0.0316 15.300 8.53 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 481 165 316 9 8 112 7 29 0 1 307 4 4 0.0545 0.0000 0.0285 0.400 7.00 5.86 1.14 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0002 0.9397 0.0601 2 1 0.0000 0.9932 0.0068 2 1 0.0000 0.9977 0.0023
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 518 170 348 22 0 24 1 123 0 0 340 0 8 0.1294 0.0000 0.0230 6.083 0.18 8.88 -8.70 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 261 67 194 0 0 2 0 65 0 0 192 0 2 0.0000 0.0000 0.0103 32.500 2.86 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0318 0.9682 2 2 0.0000 0.0340 0.9660 2 2 0.0000 0.0373 0.9627
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 343 99 244 49 0 8 0 42 0 0 244 0 0 0.4949 0.0000 0.0000 11.375 0.12 2.86 -2.73 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3557 0.5555 0.0888 1 1 0.3554 0.5510 0.0936 1 1 0.3543 0.5455 0.1002
chr2 37201783 GTTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 395 149 246 83 0 3 0 63 0 0 244 0 2 0.5570 0.0000 0.0081 48.667 0.17 3.08 -2.91 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5806 0.4030 0.0164 1 0 0.5759 0.4054 0.0186 1 0 0.5688 0.4092 0.0221
chr2 47905551 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 1 489 248 241 96 8 36 3 105 0 0 239 0 2 0.3871 0.0000 0.0083 5.833 0.65 3.55 -2.91 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0721 0.7106 0.2173 1 1 0.0782 0.6963 0.2256 1 1 0.0864 0.6778 0.2358
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 693 100 593 12 2 14 0 72 3 2 585 0 3 0.1200 0.0051 0.0135 6.143 3.92 6.93 -3.01 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8547 0.1453 2 1 0.0000 0.9958 0.0042 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr2 58159793 G GTAAT 0.500000 0.100 1 4 2 519 120 399 114 1 2 0 3 0 0 399 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 59.000 0.32 4.00 -3.68 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3087 0.6913 0.0000 0 0 0.9275 0.0725 0.0000 0 0 0.9748 0.0252 0.0000
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 479 217 262 109 1 16 2 89 0 0 260 1 1 0.5023 0.0000 0.0076 12.500 0.59 3.18 -2.59 13 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4981 0.4856 0.0163 1 0 0.4991 0.4822 0.0186 1 0 0.4991 0.4787 0.0222
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 541 141 400 10 7 35 6 83 0 0 390 2 8 0.0709 0.0000 0.0250 2.943 0.50 4.53 -4.03 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9964 0.0036
chr2 73385903 T TGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 541 141 400 18 0 84 1 38 0 0 392 0 8 0.1277 0.0000 0.0200 0.687 2.00 5.76 -3.76 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0023 0.1224 0.8753 1 2 0.0028 0.1329 0.8643 1 2 0.0037 0.1651 0.8313
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 421 101 320 88 0 7 0 6 0 0 320 0 0 0.8713 0.0000 0.0000 13.429 0.10 3.00 -2.90 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1199 0.8801 0.0000 0 0 0.6033 0.3967 0.0000
chr2 74314961 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 3 114 50 64 45 0 4 0 1 0 0 64 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 11.500 0.29 3.00 -2.71 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5178 0.4822 0.0000 0 0 0.7655 0.2345 0.0000 0 0 0.8237 0.1763 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 361 140 221 57 0 13 2 68 0 0 219 0 2 0.4071 0.0000 0.0090 9.769 0.54 3.66 -3.12 19 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0269 0.4475 0.5256 1 2 0.0299 0.4484 0.5216 1 2 0.0344 0.4501 0.5155
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 447 125 322 0 0 17 4 104 0 0 320 1 1 0.0000 0.0000 0.0062 6.294 2.88 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 758 211 547 24 0 12 3 172 0 0 547 0 0 0.1137 0.0000 0.0000 16.500 0.25 7.76 -7.51 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010
chr2 99593872 CG C 0.500000 0.100 1 -1 4 703 179 524 165 0 5 2 7 0 0 523 1 0 0.9218 0.0000 0.0019 34.800 1.06 8.14 -7.08 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2436 0.7564 0.0000 0 0 0.9029 0.0971 0.0000
chr2 99593875 CTGAGG C 0.500000 0.100 1 -5 2 706 178 528 166 0 2 0 10 0 0 527 0 1 0.9326 0.0000 0.0019 88.000 1.13 5.80 -4.67 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0323 0.9677 0.0000 0 0 0.7316 0.2684 0.0000
chr2 106424136 AGGGCT A 0.500000 0.100 1 -5 1 623 128 495 118 1 1 0 8 1 0 493 1 0 0.9219 0.0020 0.0040 127.000 0.47 5.25 -4.78 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0548 0.9452 0.0000 0 0 0.6059 0.3941 0.0000
chr2 106424142 A AAAGATT 0.500000 0.100 1 6 1 616 122 494 113 1 0 0 8 0 0 492 0 2 0.9262 0.0000 0.0040 122.000 0.46 5.25 -4.79 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0070 0.9930 0.0000 0 1 0.2921 0.7079 0.0000
chr2 108259008 AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT A 0.500000 0.100 1 -22 1 542 140 402 86 0 5 0 49 0 0 390 0 12 0.6143 0.0000 0.0299 27.000 0.90 21.65 -20.76 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7396 0.2552 0.0052 1 0 0.7309 0.2629 0.0062 1 0 0.7184 0.2737 0.0079
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 144 80 64 50 0 0 0 30 0 0 64 0 0 0.6250 0.0000 0.0000 80.000 0.12 2.90 -2.78 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7009 0.2858 0.0133 1 0 0.6899 0.2949 0.0153 1 0 0.6745 0.3072 0.0183
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 533 119 414 0 0 3 2 114 0 0 405 1 8 0.0000 0.0000 0.0217 38.333 5.75 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 202 49 153 19 7 9 2 12 0 0 152 0 1 0.3878 0.0000 0.0065 4.111 1.21 2.50 -1.29 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5066 0.4308 0.0626 1 0 0.4983 0.4349 0.0668 1 0 0.4871 0.4403 0.0726
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 183 69 114 33 1 13 0 22 0 0 107 0 7 0.4783 0.0000 0.0614 4.231 0.55 5.27 -4.73 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3237 0.5499 0.1264 1 1 0.3231 0.5461 0.1308 1 1 0.3220 0.5413 0.1367
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 238 106 132 48 0 23 0 35 0 0 132 0 0 0.4528 0.0000 0.0000 3.609 0.06 11.26 -11.19 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5251 0.4350 0.0399 1 0 0.5186 0.4378 0.0435 1 0 0.5094 0.4418 0.0488
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 2 452 111 341 56 0 20 0 35 0 0 341 0 0 0.5045 0.0000 0.0000 4.550 0.25 2.86 -2.61 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7116 0.2774 0.0111 1 0 0.7009 0.2863 0.0128 1 0 0.6860 0.2985 0.0155
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 312 170 142 0 0 3 1 166 0 0 135 0 7 0.0000 0.0000 0.0493 55.667 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr2 178650214 TTTTCCTCTTCAGGAGCAA T 0.500000 0.100 1 -18 1 338 73 265 36 0 18 0 19 0 0 264 0 1 0.4932 0.0000 0.0038 3.056 0.08 16.37 -16.29 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6324 0.3411 0.0266 1 0 0.6215 0.3490 0.0295 1 0 0.6065 0.3597 0.0338
chr2 178888537 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 222 90 132 44 0 1 0 45 0 0 130 0 2 0.4889 0.0000 0.0152 89.000 0.98 3.13 -2.16 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1426 0.5994 0.2580 1 1 0.1474 0.5920 0.2606 1 1 0.1536 0.5827 0.2636
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 761 163 598 153 0 4 0 6 0 0 598 0 0 0.9387 0.0000 0.0000 39.750 0.48 4.00 -3.52 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0039 0.9961 0.0000 0 0 0.7779 0.2221 0.0000 0 0 0.9727 0.0273 0.0000
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 326 139 187 2 1 20 10 106 0 0 183 0 4 0.0144 0.0000 0.0214 5.600 0.00 4.30 -4.30 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2073 0.7927 2 2 0.0000 0.0274 0.9726 2 2 0.0000 0.0136 0.9864
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 326 139 187 8 1 75 3 52 0 0 183 2 2 0.0576 0.0000 0.0214 0.851 2.12 5.96 -3.84 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.9296 0.0704
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 327 146 181 19 42 21 57 7 0 0 181 0 0 0.1301 0.0000 0.0000 3.889 0.11 4.14 -4.04 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3907 0.5334 0.0760 1 1 0.3889 0.5304 0.0806 1 1 0.3861 0.5268 0.0870
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 264 103 161 58 0 4 0 41 0 0 159 1 1 0.5631 0.0000 0.0124 24.750 0.14 3.34 -3.20 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5643 0.4082 0.0275 1 0 0.5575 0.4119 0.0306 1 0 0.5479 0.4171 0.0350
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 620 139 481 1 0 15 5 118 0 0 474 2 5 0.0072 0.0000 0.0146 8.200 9.00 7.85 1.15 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0122 0.9878 2 2 0.0000 0.0044 0.9956 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 639 222 417 120 0 13 0 89 0 0 389 1 27 0.5405 0.0000 0.0671 16.077 0.28 15.39 -15.11 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1584 0.7539 0.0877 1 1 0.1674 0.7378 0.0948 1 1 0.1789 0.7166 0.1044
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 350 155 195 101 0 0 6 48 0 0 195 0 0 0.6516 0.0000 0.0000 149.000 0.92 4.17 -3.25 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9667 0.0332 0.0001 1 0 0.9623 0.0377 0.0001 1 0 0.9554 0.0445 0.0001
chr2 240042691 CGAAGGGCCGTGGGTGAAGAGGCATGGAT C 0.500000 0.100 1 -28 1 974 340 634 33 21 11 73 202 1 10 608 14 1 0.0971 0.0016 0.0410 30.778 2.61 3.58 -0.97 11 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 418 112 306 5 0 26 4 77 0 0 305 0 1 0.0446 0.0000 0.0033 3.308 0.40 3.18 -2.78 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.7734 0.2266 2 2 0.0000 0.3166 0.6834
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 519 122 397 0 0 0 1 121 0 0 394 0 3 0.0000 0.0000 0.0076 121.000 3.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr3 12187460 CTCTTCCTCCTCT C 0.051892 0.100 1 -12 2 284 119 165 108 2 6 0 3 0 0 165 0 0 0.9076 0.0000 0.0000 18.667 0.96 8.67 -7.70 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8627 0.1373 0.0000 0 0 0.9945 0.0055 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 494 103 391 53 1 2 0 47 0 0 391 0 0 0.5146 0.0000 0.0000 50.500 0.55 5.66 -5.11 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3460 0.5676 0.0864 1 1 0.3464 0.5622 0.0913 1 1 0.3464 0.5556 0.0980
chr3 28253011 GA G 0.500000 0.100 1 -1 3 171 86 85 58 0 0 0 28 0 0 85 0 0 0.6744 0.0000 0.0000 86.000 0.17 1.50 -1.33 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8632 0.1346 0.0023 1 0 0.8527 0.1445 0.0028 1 0 0.8377 0.1586 0.0037
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 505 147 358 77 0 4 0 66 0 0 358 0 0 0.5238 0.0000 0.0000 35.750 0.23 3.24 -3.01 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4051 0.5491 0.0458 1 1 0.4059 0.5442 0.0499 1 1 0.4060 0.5383 0.0558
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 773 295 478 4 18 50 4 219 0 0 437 1 40 0.0136 0.0000 0.0858 5.042 9.50 9.65 -0.15 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 2 0.0000 0.4294 0.5706
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 697 237 460 90 7 43 2 95 0 0 454 0 6 0.3797 0.0000 0.0130 4.512 0.23 2.86 -2.63 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0720 0.6933 0.2347 1 1 0.0779 0.6799 0.2423 1 1 0.0858 0.6626 0.2515
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 445 146 299 0 0 14 0 132 0 0 294 1 4 0.0000 0.0000 0.0167 9.429 2.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr3 46373452 TACAGTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAG T 0.500000 0.100 1 -32 1 888 236 652 134 0 7 1 94 0 0 652 0 0 0.5678 0.0000 0.0000 32.714 0.34 16.10 -15.76 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8856 0.1140 0.0004 1 0 0.8788 0.1207 0.0005 1 0 0.8687 0.1305 0.0008
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 390 183 207 0 0 4 1 178 0 0 206 0 1 0.0000 0.0000 0.0048 44.500 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 524 125 399 2 0 14 8 101 0 0 397 0 2 0.0160 0.0000 0.0050 7.929 0.00 3.30 -3.30 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2289 0.7711 2 2 0.0000 0.0319 0.9681 2 2 0.0000 0.0163 0.9837
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 339 96 243 0 0 10 0 86 0 0 242 0 1 0.0000 0.0000 0.0041 8.600 5.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0117 0.9883 2 2 0.0000 0.0128 0.9872 2 2 0.0000 0.0145 0.9855
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.100 1 6 1 506 140 366 12 0 36 1 91 1 0 348 0 17 0.0857 0.0027 0.0492 2.889 0.42 5.05 -4.64 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9550 0.0450
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 198 120 78 0 0 11 0 109 0 0 75 0 3 0.0000 0.0000 0.0385 9.909 7.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 307 110 197 98 0 1 0 11 0 0 197 0 0 0.8909 0.0000 0.0000 109.000 0.21 3.36 -3.15 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.0885 0.9115 0.0000
chr3 63912684 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 3 271 64 207 3 0 14 0 47 0 0 197 1 9 0.0469 0.0000 0.0483 3.571 0.33 6.45 -6.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9773 0.0227 2 1 0.0000 0.5854 0.4146 2 2 0.0000 0.3010 0.6990
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 304 119 185 91 6 15 0 7 0 0 184 0 1 0.7647 0.0000 0.0054 6.933 0.32 3.29 -2.97 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0256 0.9744 0.0000 0 1 0.4019 0.5981 0.0000
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 731 181 550 75 0 10 0 96 0 0 543 0 7 0.4144 0.0000 0.0127 17.100 1.25 9.31 -8.06 31 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0030 0.2291 0.7679 1 2 0.0037 0.2363 0.7600 1 2 0.0048 0.2467 0.7485
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 512 138 374 74 0 7 1 56 0 0 374 0 0 0.5362 0.0000 0.0000 18.571 0.30 1.27 -0.97 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5803 0.4005 0.0192 1 0 0.5747 0.4036 0.0217 1 0 0.5664 0.4081 0.0254
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 385 105 280 56 0 7 0 42 0 0 280 0 0 0.5333 0.0000 0.0000 14.000 0.34 1.24 -0.90 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5348 0.4319 0.0334 1 0 0.5288 0.4345 0.0367 1 0 0.5202 0.4382 0.0416
chr3 107772911 TAGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 733 186 547 109 0 5 0 72 0 0 547 0 0 0.5860 0.0000 0.0000 36.200 0.50 3.28 -2.77 55 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8891 0.1103 0.0006 1 0 0.8814 0.1179 0.0008 1 0 0.8700 0.1289 0.0011
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 129 54 75 2 1 2 1 48 0 0 74 0 1 0.0370 0.0000 0.0133 25.500 0.50 1.40 -0.90 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8969 0.1031 2 2 0.0000 0.4802 0.5198 2 2 0.0000 0.2897 0.7103
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1217 329 888 105 5 75 21 123 0 0 888 0 0 0.3191 0.0000 0.0000 3.320 0.30 3.15 -2.84 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0007 0.1648 0.8345 1 2 0.0009 0.1709 0.8282 1 2 0.0013 0.1800 0.8187
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 1222 334 888 114 5 187 1 27 0 0 888 0 0 0.3413 0.0000 0.0000 0.781 0.30 4.41 -4.11 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 121489856 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 818 192 626 112 0 5 0 75 0 0 626 0 0 0.5833 0.0000 0.0000 37.400 0.38 2.88 -2.50 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8862 0.1133 0.0006 1 0 0.8785 0.1207 0.0008 1 0 0.8673 0.1316 0.0011
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.100 1 12 1 530 181 349 75 1 16 0 89 0 0 349 0 0 0.4144 0.0000 0.0000 10.312 0.20 7.30 -7.10 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0328 0.5347 0.4325 1 1 0.0363 0.5301 0.4336 1 1 0.0414 0.5246 0.4340
chr3 124763647 TTTGTTGAAC T 0.500000 0.100 1 -9 1 339 156 183 86 1 2 0 67 1 0 178 0 4 0.5513 0.0055 0.0273 77.000 0.15 8.64 -8.49 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5385 0.4424 0.0191 1 0 0.5358 0.4426 0.0216 1 0 0.5311 0.4435 0.0254
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.100 1 -4 1 376 137 239 125 0 5 0 7 0 0 239 0 0 0.9124 0.0000 0.0000 26.400 0.22 4.14 -3.92 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2299 0.7701 0.0000 0 0 0.8282 0.1718 0.0000
chr3 126423590 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 445 139 306 128 1 1 0 9 0 0 306 0 0 0.9209 0.0000 0.0000 138.000 0.54 3.44 -2.91 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0415 0.9585 0.0000 0 0 0.6185 0.3815 0.0000
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 186 98 88 4 0 0 1 93 0 0 88 0 0 0.0408 0.0000 0.0000 98.000 0.00 1.74 -1.74 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9831 0.0169 2 2 0.0000 0.3914 0.6086 2 2 0.0000 0.1196 0.8804
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 395 143 252 0 0 4 1 138 0 0 251 0 1 0.0000 0.0000 0.0040 34.750 2.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr3 138949615 CGGCATTCGAA C 0.500000 0.100 1 -10 2 170 74 96 41 0 4 0 29 0 0 96 0 0 0.5541 0.0000 0.0000 17.500 0.34 8.03 -7.69 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5126 0.4399 0.0475 1 0 0.5058 0.4428 0.0514 1 0 0.4963 0.4468 0.0569
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 455 206 249 79 0 32 11 84 0 0 249 0 0 0.3835 0.0000 0.0000 5.406 0.38 3.11 -2.73 33 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0216 0.4844 0.4939 1 2 0.0244 0.4821 0.4935 1 2 0.0285 0.4797 0.4918
chr3 184100433 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 323 109 214 57 0 1 0 51 0 0 214 0 0 0.5229 0.0000 0.0000 108.000 0.18 1.27 -1.10 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3146 0.5896 0.0958 1 1 0.3164 0.5828 0.1008 1 1 0.3181 0.5742 0.1077
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 582 143 439 56 3 22 1 61 0 0 436 0 3 0.3916 0.0000 0.0068 5.500 0.41 3.10 -2.69 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0906 0.6071 0.3022 1 1 0.0959 0.5991 0.3051 1 1 0.1029 0.5889 0.3081
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 440 169 271 89 0 9 5 66 0 0 267 0 4 0.5266 0.0000 0.0148 17.778 0.08 2.20 -2.12 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4709 0.5021 0.0270 1 1 0.4707 0.4992 0.0302 1 1 0.4692 0.4960 0.0348
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 844 190 654 0 0 11 0 179 0 0 616 0 38 0.0000 0.0000 0.0581 16.273 11.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 198153259 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 208 97 111 38 33 24 0 2 0 0 111 0 0 0.3918 0.0000 0.0000 3.000 0.29 3.50 -3.21 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3039 0.6961 0.0000 0 0 0.8039 0.1961 0.0000 0 0 0.8962 0.1038 0.0000
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 208 95 113 45 0 19 0 31 0 0 112 0 1 0.4737 0.0000 0.0088 4.000 0.51 8.94 -8.42 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5318 0.4278 0.0404 1 0 0.5248 0.4312 0.0441 1 0 0.5149 0.4358 0.0493
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 537 114 423 0 0 1 0 113 0 0 365 4 54 0.0000 0.0000 0.1371 113.000 15.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 421 170 251 12 0 39 2 117 0 0 245 1 5 0.0706 0.0000 0.0239 3.447 5.42 6.42 -1.00 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9416 0.0584
chr4 3074927 G GCAA 0.030219 0.100 1 3 1 420 173 247 67 34 10 43 19 0 0 246 1 0 0.3873 0.0000 0.0040 18.125 7.18 3.00 4.18 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9699 0.0301 0.0000 1 0 0.9665 0.0335 0.0000 1 0 0.9614 0.0386 0.0000
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 652 179 473 162 0 10 0 7 1 0 472 0 0 0.9050 0.0021 0.0021 16.900 0.45 14.29 -13.84 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0095 0.9905 0.0000 0 0 0.9641 0.0359 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.100 1 -6 2 477 142 335 137 0 0 0 5 0 0 335 0 0 0.9648 0.0000 0.0000 142.000 0.20 6.00 -5.80 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1968 0.8032 0.0000 0 0 0.9858 0.0142 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 717 223 494 194 1 15 0 13 0 1 492 0 1 0.8700 0.0000 0.0040 13.800 0.91 8.08 -7.17 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 0 0.6287 0.3713 0.0000
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 736 258 478 209 6 28 1 14 0 1 477 0 0 0.8101 0.0000 0.0021 8.519 0.89 7.50 -6.61 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 0 0.6933 0.3067 0.0000
chr4 25748521 AGT A 0.500000 0.100 1 -2 1 282 138 144 73 0 5 0 60 0 1 142 0 1 0.5290 0.0000 0.0139 26.600 0.08 2.12 -2.03 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4573 0.5053 0.0373 1 1 0.4559 0.5030 0.0410 1 1 0.4532 0.5005 0.0463
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 333 136 197 65 0 5 0 66 1 0 196 0 0 0.4779 0.0051 0.0051 26.200 0.17 8.08 -7.91 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1717 0.6564 0.1719 1 1 0.1773 0.6453 0.1774 1 1 0.1844 0.6311 0.1846
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 646 146 500 81 1 10 0 54 0 0 478 0 22 0.5548 0.0000 0.0440 13.600 1.41 15.56 -14.15 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2703 0.6474 0.0823 1 1 0.2754 0.6367 0.0878 1 1 0.2815 0.6231 0.0954
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.100 1 3 1 312 105 207 98 1 3 0 3 0 0 207 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 33.667 0.10 2.33 -2.23 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1655 0.8345 0.0000 0 0 0.8515 0.1485 0.0000 0 0 0.9465 0.0535 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 1860 374 1486 117 4 103 5 145 1 3 1466 1 15 0.3128 0.0007 0.0135 2.683 2.09 9.04 -6.96 53 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0003 0.1251 0.8746 1 2 0.0004 0.1307 0.8690 1 2 0.0005 0.1390 0.8605
chr4 87615164 TAGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 2739 516 2223 436 17 32 1 30 8 14 2192 6 3 0.8450 0.0036 0.0139 17.179 1.97 4.97 -3.00 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4047 0.5953 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 2938 682 2256 313 19 39 16 295 39 34 2022 126 35 0.4589 0.0173 0.1037 18.471 2.88 8.37 -5.49 57 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.3819 0.6181 1 2 0.0000 0.3575 0.6425 1 2 0.0001 0.3305 0.6695
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2742 829 1913 10 13 152 42 612 198 45 1633 15 22 0.0121 0.1035 0.1464 4.376 7.20 9.24 -2.04 6 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 87616286 TGACAGCAGTGACAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2274 717 1557 360 13 325 7 12 9 24 1518 2 4 0.5021 0.0058 0.0250 1.194 2.47 9.17 -6.70 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0504 0.9496 0.0000 0 0 0.9947 0.0053 0.0000
chr4 100187718 GT G 0.500000 0.100 1 -1 3 420 120 300 49 1 2 0 68 0 0 297 0 3 0.4083 0.0000 0.0100 59.000 0.14 2.28 -2.14 33 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0106 0.3078 0.6815 1 2 0.0123 0.3149 0.6728 1 2 0.0149 0.3247 0.6603
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 198 94 104 86 0 3 0 5 0 0 104 0 0 0.9149 0.0000 0.0000 30.333 0.03 3.20 -3.17 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2634 0.7366 0.0000 0 0 0.7239 0.2761 0.0000
chr4 109869931 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 583 118 465 56 0 3 1 58 0 0 465 0 0 0.4746 0.0000 0.0000 38.333 0.38 3.57 -3.19 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1326 0.6273 0.2401 1 1 0.1379 0.6180 0.2441 1 1 0.1449 0.6062 0.2489
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 690 153 537 81 0 10 0 62 0 0 534 0 3 0.5294 0.0000 0.0056 14.300 0.44 4.00 -3.56 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5319 0.4458 0.0223 1 0 0.5287 0.4462 0.0251 1 0 0.5234 0.4474 0.0292
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 542 212 330 0 0 29 3 180 0 0 326 1 3 0.0000 0.0000 0.0121 6.310 3.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 513 174 339 10 1 45 5 113 0 0 333 0 6 0.0575 0.0000 0.0177 2.844 1.60 3.62 -2.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.7303 0.2697
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.100 1 5 2 273 139 134 121 0 10 0 8 0 0 132 0 2 0.8705 0.0000 0.0149 12.900 1.02 3.75 -2.73 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.3666 0.6334 0.0000
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 218 92 126 4 0 16 1 71 0 0 122 0 4 0.0435 0.0000 0.0317 4.750 2.00 5.07 -3.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9934 0.0066 2 1 0.0000 0.6141 0.3859 2 2 0.0000 0.2463 0.7537
chr4 174977850 T TCAGAGTCAACCTCCTGTGATGCCTTCCCAGAGTCATCCTCAGTTGACGCCTTCC 0.500000 0.100 1 54 1 829 219 610 91 1 117 0 10 0 1 609 0 0 0.4155 0.0000 0.0016 0.863 1.36 5.80 -4.44 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 1 0.1286 0.8714 0.0000
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 888 172 716 90 1 2 0 79 0 0 712 0 4 0.5233 0.0000 0.0056 85.000 0.21 3.25 -3.04 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3031 0.6363 0.0606 1 1 0.3083 0.6260 0.0656 1 1 0.3143 0.6131 0.0726
chr5 14488084 TGGAGCTCCATCC T 0.001036 0.100 1 -12 1 374 75 299 71 0 0 0 4 0 0 299 0 0 0.9467 0.0000 0.0000 75.000 0.42 15.25 -14.83 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8319 0.1681 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 766 169 597 59 1 35 4 70 0 0 595 0 2 0.3491 0.0000 0.0034 3.829 0.32 3.60 -3.28 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0227 0.4326 0.5447 1 2 0.0254 0.4341 0.5405 1 2 0.0295 0.4364 0.5340
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 361 53 308 0 0 33 2 18 0 0 302 1 5 0.0000 0.0000 0.0195 0.606 6.28 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2121 0.7879 2 2 0.0000 0.2165 0.7835 2 2 0.0000 0.2227 0.7773
chr5 66596939 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 452 104 348 92 1 3 1 7 2 0 346 0 0 0.8846 0.0057 0.0057 33.333 1.26 3.57 -2.31 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0562 0.9438 0.0000 0 0 0.5039 0.4961 0.0000
chr5 73447067 G GGCGGCC 0.500000 0.100 1 6 1 393 105 288 58 1 13 3 30 0 0 288 0 0 0.5524 0.0000 0.0000 6.923 1.64 6.27 -4.63 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8137 0.1821 0.0042 1 0 0.8026 0.1924 0.0051 1 0 0.7868 0.2067 0.0065
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 435 116 319 56 2 5 0 53 0 0 316 0 3 0.4828 0.0000 0.0094 22.200 0.04 5.96 -5.93 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2173 0.6320 0.1506 1 1 0.2217 0.6225 0.1558 1 1 0.2271 0.6103 0.1626
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 598 153 445 91 0 6 0 56 0 0 442 0 3 0.5948 0.0000 0.0067 24.500 0.32 3.30 -2.98 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8498 0.1487 0.0015 1 0 0.8408 0.1573 0.0019 1 0 0.8277 0.1697 0.0026
chr5 75635851 CCCAG C 0.500000 0.100 1 -4 1 250 104 146 47 0 4 3 50 0 0 145 0 1 0.4519 0.0000 0.0068 25.000 0.11 5.52 -5.41 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0884 0.5697 0.3419 1 1 0.0933 0.5642 0.3425 1 1 0.1000 0.5574 0.3426
chr5 75635856 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 248 92 156 43 1 0 2 46 0 0 155 1 0 0.4674 0.0000 0.0064 90.000 0.12 6.00 -5.88 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1143 0.5840 0.3017 1 1 0.1192 0.5776 0.3031 1 1 0.1258 0.5697 0.3045
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 287 91 196 68 1 13 0 9 3 2 191 0 0 0.7473 0.0153 0.0255 6.500 4.46 22.67 -18.21 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.1064 0.8936 0.0000
chr5 80654908 G GCAGCGCCCCCAGCGCCCCCAGCGCCCC 0.500000 0.100 1 27 2 279 65 214 31 1 10 1 22 0 0 207 0 7 0.4769 0.0000 0.0327 5.500 7.77 11.82 -4.04 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2572 0.5705 0.1723 1 1 0.2587 0.5652 0.1761 1 1 0.2605 0.5586 0.1809
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 277 71 206 59 1 3 0 8 0 0 206 0 0 0.8310 0.0000 0.0000 22.667 6.07 24.88 -18.81 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0039 0.9961 0.0000 0 1 0.0968 0.9032 0.0000
chr5 95436867 A AC 0.500000 0.100 1 1 2 174 84 90 41 0 3 4 36 0 0 90 0 0 0.4881 0.0000 0.0000 26.667 0.05 1.97 -1.92 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2291 0.5952 0.1757 1 1 0.2321 0.5882 0.1798 1 1 0.2357 0.5793 0.1851
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 264 98 166 57 0 1 0 40 0 0 160 0 6 0.5816 0.0000 0.0361 97.000 0.16 3.23 -3.07 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4490 0.5002 0.0507 1 1 0.4462 0.4990 0.0548 1 1 0.4417 0.4977 0.0607
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 250 113 137 42 4 20 1 46 0 0 135 0 2 0.3717 0.0000 0.0146 4.600 2.55 4.87 -2.32 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1426 0.6040 0.2534 1 1 0.1474 0.5964 0.2562 1 1 0.1538 0.5866 0.2596
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 606 169 437 24 0 16 2 127 0 1 432 0 4 0.1420 0.0000 0.0114 9.562 0.71 3.67 -2.96 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 448 117 331 86 0 25 0 6 0 0 329 0 2 0.7350 0.0000 0.0060 3.680 0.40 6.33 -5.94 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0145 0.9855 0.0000 0 1 0.2766 0.7234 0.0000
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 569 149 420 126 0 16 0 7 0 0 420 0 0 0.8456 0.0000 0.0000 8.312 0.58 6.14 -5.56 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2387 0.7613 0.0000 0 0 0.8350 0.1650 0.0000
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 336 81 255 9 0 4 1 67 0 0 236 0 19 0.1111 0.0000 0.0745 25.667 0.89 8.72 -7.83 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9945 0.0055 2 1 0.0000 0.8213 0.1787
chr5 135936684 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 386 137 249 69 0 3 0 65 0 0 249 0 0 0.5036 0.0000 0.0000 44.667 0.51 1.12 -0.62 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2471 0.6411 0.1118 1 1 0.2517 0.6309 0.1174 1 1 0.2571 0.6180 0.1249
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 224 86 138 49 0 0 0 37 0 0 137 0 1 0.5698 0.0000 0.0072 86.000 0.08 3.43 -3.35 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4667 0.4806 0.0527 1 1 0.4623 0.4809 0.0568 1 1 0.4560 0.4814 0.0626
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 194 69 125 2 0 0 2 65 0 0 122 0 3 0.0290 0.0000 0.0240 69.000 0.00 3.77 -3.77 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7061 0.2939 2 2 0.0000 0.2032 0.7968 2 2 0.0000 0.1078 0.8922
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 194 69 125 2 0 1 5 61 0 0 122 3 0 0.0290 0.0000 0.0240 68.000 0.00 3.89 -3.89 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7159 0.2841 2 2 0.0000 0.2118 0.7882 2 2 0.0000 0.1129 0.8871
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 385 113 272 55 0 12 0 46 0 0 270 0 2 0.4867 0.0000 0.0074 8.417 0.22 8.96 -8.74 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3441 0.5699 0.0859 1 1 0.3447 0.5644 0.0908 1 1 0.3449 0.5576 0.0975
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 383 138 245 4 0 34 1 99 0 0 233 0 12 0.0290 0.0000 0.0490 3.059 0.50 8.85 -8.35 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9602 0.0398 2 2 0.0000 0.2085 0.7915 2 2 0.0000 0.0538 0.9462
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 15 1 383 138 245 4 4 34 5 91 0 0 233 0 12 0.0290 0.0000 0.0490 3.029 0.50 8.81 -8.31 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8987 0.1013 2 2 0.0000 0.3547 0.6453
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 649 171 478 157 0 3 0 11 0 0 478 0 0 0.9181 0.0000 0.0000 56.000 0.29 2.09 -1.80 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0207 0.9793 0.0000 0 0 0.6374 0.3626 0.0000
chr5 153492228 T TC 0.500000 0.100 1 1 2 117 63 54 59 0 0 0 4 1 0 53 0 0 0.9365 0.0185 0.0185 63.000 0.17 1.00 -0.83 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.2216 0.7784 0.0000 0 0 0.5857 0.4143 0.0000
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 394 153 241 0 0 18 0 135 0 0 241 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.500 12.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 422 108 314 97 0 8 0 3 0 0 314 0 0 0.8981 0.0000 0.0000 12.500 0.87 4.33 -3.47 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1515 0.8485 0.0000 0 0 0.8390 0.1610 0.0000 0 0 0.9417 0.0583 0.0000
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 466 212 254 152 8 44 1 7 0 1 253 0 0 0.7170 0.0000 0.0039 3.818 0.84 3.14 -2.30 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.5170 0.4830 0.0000 0 0 0.9493 0.0507 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 646 120 526 7 1 10 0 102 0 0 525 0 1 0.0583 0.0000 0.0019 11.000 0.14 3.17 -3.02 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9660 0.0340 2 1 0.0000 0.5315 0.4685
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 543 136 407 38 2 28 5 63 4 2 395 0 6 0.2794 0.0098 0.0295 3.786 2.21 4.46 -2.25 20 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0094 0.3464 0.6442 1 2 0.0114 0.3603 0.6283 1 2 0.0146 0.3793 0.6060
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 512 102 410 44 2 16 3 37 1 1 402 2 4 0.4314 0.0024 0.0195 6.071 2.34 3.41 -1.06 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3854 0.5568 0.0578 1 1 0.3892 0.5507 0.0600 1 1 0.3938 0.5432 0.0629
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 878 189 689 64 15 45 4 61 0 1 683 1 4 0.3386 0.0000 0.0087 3.156 4.45 3.79 0.67 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5069 0.4765 0.0167 1 0 0.5100 0.4718 0.0181 1 0 0.5133 0.4665 0.0202
chr6 21595035 G GGGC 0.002798 0.100 1 3 5 664 142 522 74 0 27 2 39 0 0 520 0 2 0.5211 0.0000 0.0038 4.385 1.85 3.23 -1.38 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9287 0.0713 0.0000 1 0 0.9234 0.0766 0.0000 1 0 0.9156 0.0844 0.0000
chr6 27255285 AAAGGAGAGCCAGATT A 0.178475 0.100 1 -15 1 458 108 350 64 0 6 0 38 0 0 347 0 3 0.5926 0.0000 0.0086 17.000 0.27 13.95 -13.68 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8260 0.1721 0.0019 1 0 0.8186 0.1792 0.0022 1 0 0.8081 0.1892 0.0028
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.100 1 2 1 643 137 506 74 0 2 0 61 0 0 504 0 2 0.5401 0.0000 0.0040 67.500 0.32 2.11 -1.79 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5796 0.4147 0.0057 1 0 0.5814 0.4123 0.0062 1 0 0.5830 0.4100 0.0070
chr6 29657255 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 147 73 74 58 0 10 0 5 0 1 73 0 0 0.7945 0.0000 0.0135 6.300 1.40 4.80 -3.40 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0850 0.9150 0.0000 0 1 0.4144 0.5856 0.0000
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 359 106 253 51 0 3 0 52 0 0 251 0 2 0.4811 0.0000 0.0079 34.333 0.63 1.37 -0.74 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1367 0.6157 0.2476 1 1 0.1418 0.6072 0.2510 1 1 0.1485 0.5965 0.2551
chr6 31028710 GACC G 0.500000 0.100 1 -3 1 2265 450 1815 77 281 60 5 27 1 12 1756 28 18 0.1711 0.0006 0.0325 6.525 4.30 5.15 -0.85 17 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 31028873 A ACCTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAG 0.500000 0.100 1 30 2 2429 572 1857 49 15 224 16 268 14 23 1654 39 127 0.0857 0.0075 0.1093 1.579 3.84 3.94 -0.10 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 564 138 426 7 62 6 0 63 0 1 425 0 0 0.0507 0.0000 0.0023 14.000 0.29 2.44 -2.16 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1213 0.6178 0.2609 1 1 0.1266 0.6092 0.2642 1 1 0.1337 0.5983 0.2680
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 566 138 428 7 63 5 0 63 0 0 427 1 0 0.0507 0.0000 0.0023 26.400 0.29 2.25 -1.97 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1172 0.6183 0.2645 1 1 0.1226 0.6097 0.2678 1 1 0.1297 0.5987 0.2716
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 547 175 372 0 0 2 0 173 0 0 372 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 86.500 5.71 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 547 175 372 89 2 2 4 78 0 0 372 0 0 0.5086 0.0000 0.0000 86.500 2.34 9.76 -7.42 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3354 0.6128 0.0518 1 1 0.3397 0.6038 0.0564 1 1 0.3445 0.5926 0.0629
chr6 32521966 CG C 0.500000 0.100 1 -1 2 112 88 24 82 0 2 1 3 0 0 24 0 0 0.9318 0.0000 0.0000 43.000 6.57 7.00 -0.43 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0353 0.9647 0.0000 0 0 0.5674 0.4326 0.0000 0 0 0.8308 0.1692 0.0000
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.100 1 2 2 123 59 64 1 28 3 5 22 0 0 64 0 0 0.0169 0.0000 0.0000 9.667 9.00 9.14 -0.14 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1247 0.5185 0.3568 1 1 0.1290 0.5170 0.3540 1 1 0.1346 0.5152 0.3501
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 479 155 324 137 1 8 1 8 0 1 323 0 0 0.8839 0.0000 0.0031 18.375 0.58 1.75 -1.17 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0709 0.9291 0.0000 0 0 0.7287 0.2713 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 515 118 397 52 1 0 0 65 0 0 395 0 2 0.4407 0.0000 0.0050 118.000 0.35 3.05 -2.70 18 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0317 0.4581 0.5102 1 2 0.0350 0.4587 0.5063 1 2 0.0399 0.4599 0.5002
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 277 127 150 58 0 16 1 52 0 0 147 0 3 0.4567 0.0000 0.0200 6.938 0.26 6.06 -5.80 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2202 0.6317 0.1481 1 1 0.2246 0.6221 0.1533 1 1 0.2299 0.6100 0.1601
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 761 159 602 74 2 20 0 63 0 0 602 0 0 0.4654 0.0000 0.0000 6.950 0.59 3.30 -2.71 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4604 0.5042 0.0353 1 1 0.4592 0.5019 0.0389 1 1 0.4566 0.4993 0.0441
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 572 121 451 1 0 70 1 49 0 1 417 0 33 0.0083 0.0000 0.0754 0.729 15.00 6.16 8.84 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2202 0.7798 2 2 0.0000 0.0742 0.9258 2 2 0.0000 0.0485 0.9515
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 30 2 572 121 451 1 3 85 2 30 0 1 418 5 27 0.0083 0.0000 0.0732 0.417 15.00 1.33 13.67 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8478 0.1522 2 2 0.0000 0.4585 0.5415 2 2 0.0000 0.2569 0.7431
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 657 113 544 14 3 35 0 61 0 0 520 5 19 0.1239 0.0000 0.0441 2.294 2.07 3.84 -1.76 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 158 63 95 58 0 3 0 2 1 0 93 0 1 0.9206 0.0105 0.0211 20.000 0.26 5.00 -4.74 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0252 0.9748 0.0000 0 1 0.4387 0.5613 0.0000 0 0 0.7187 0.2813 0.0000
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 752 166 586 83 2 9 0 72 0 0 581 0 5 0.5000 0.0000 0.0085 17.444 0.40 3.44 -3.05 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3087 0.6263 0.0650 1 1 0.3132 0.6167 0.0701 1 1 0.3183 0.6046 0.0771
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 741 159 582 79 0 1 1 78 0 0 575 0 7 0.4969 0.0000 0.0120 158.000 0.19 6.51 -6.32 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0728 0.6446 0.2826 1 1 0.0782 0.6339 0.2879 1 1 0.0856 0.6205 0.2940
chr6 150865919 AGCGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 1 255 53 202 23 2 2 1 25 0 0 201 0 1 0.4340 0.0000 0.0050 25.000 1.09 5.84 -4.75 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1763 0.5574 0.2663 1 1 0.1797 0.5531 0.2672 1 1 0.1842 0.5477 0.2681
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 903 219 684 0 0 8 4 207 0 0 678 0 6 0.0000 0.0000 0.0088 26.125 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 211 101 110 57 0 1 0 43 0 0 106 0 4 0.5644 0.0000 0.0364 100.000 0.07 3.91 -3.84 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4213 0.5207 0.0580 1 1 0.4194 0.5183 0.0624 1 1 0.4162 0.5153 0.0685
chr6 157206358 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 736 191 545 92 0 12 0 87 0 0 545 0 0 0.4817 0.0000 0.0000 14.917 0.22 3.07 -2.85 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2324 0.6813 0.0863 1 1 0.2391 0.6686 0.0922 1 1 0.2473 0.6523 0.1003
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 695 303 392 137 0 37 0 129 0 0 380 0 12 0.4521 0.0000 0.0306 7.189 0.22 14.25 -14.03 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0674 0.7836 0.1490 1 1 0.0743 0.7666 0.1591 1 1 0.0837 0.7440 0.1723
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 491 177 314 78 0 5 0 94 0 0 314 0 0 0.4407 0.0000 0.0000 34.400 0.26 4.97 -4.71 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0210 0.4774 0.5015 1 2 0.0237 0.4755 0.5008 1 2 0.0278 0.4736 0.4986
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 259 108 151 57 1 5 0 45 0 0 150 0 1 0.5278 0.0000 0.0066 20.600 0.18 7.47 -7.29 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4747 0.4813 0.0440 1 1 0.4710 0.4811 0.0479 1 1 0.4654 0.4812 0.0534
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 361 168 193 0 0 21 12 135 0 0 189 0 4 0.0000 0.0000 0.0207 7.000 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 674 226 448 8 20 15 74 109 0 0 448 0 0 0.0354 0.0000 0.0000 9.857 1.75 4.27 -2.52 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9711 0.0289
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 675 222 453 84 43 19 61 15 0 0 453 0 0 0.3784 0.0000 0.0000 9.727 2.89 6.60 -3.71 46 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9906 0.0094 0.0000 1 0 0.9888 0.0112 0.0000 1 0 0.9828 0.0172 0.0000
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 675 224 451 95 45 66 6 12 0 0 451 0 0 0.4241 0.0000 0.0000 8.824 2.76 6.50 -3.74 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0787 0.9213 0.0000
chr7 1236734 GGCCCCA G 0.000012 0.100 1 -6 5 439 148 291 84 0 18 3 43 0 0 287 0 4 0.5676 0.0000 0.0137 7.588 1.45 6.91 -5.45 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9405 0.0595 0.0000 1 0 0.9357 0.0643 0.0000 1 0 0.9287 0.0713 0.0000
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 240 88 152 3 2 6 2 75 0 0 147 1 4 0.0341 0.0000 0.0329 13.500 0.67 3.83 -3.16 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9917 0.0083 2 1 0.0000 0.6508 0.3492 2 2 0.0000 0.2668 0.7332
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 256 100 156 53 0 15 0 32 0 0 155 0 1 0.5300 0.0000 0.0064 5.667 0.64 3.44 -2.80 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6950 0.2919 0.0132 1 0 0.6843 0.3006 0.0151 1 0 0.6694 0.3124 0.0181
chr7 5312992 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 664 75 589 39 4 7 15 10 0 0 588 1 0 0.5200 0.0000 0.0017 11.333 1.85 10.50 -8.65 13 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6592 0.3207 0.0201 1 0 0.6483 0.3291 0.0226 1 0 0.6332 0.3404 0.0264
chr7 5313001 GGAT G 0.500000 0.100 1 -3 1 662 68 594 29 8 9 13 9 0 0 593 1 0 0.4265 0.0000 0.0017 7.143 3.17 11.44 -8.27 9 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5828 0.3806 0.0366 1 0 0.5730 0.3869 0.0400 1 0 0.5596 0.3954 0.0450
chr7 5313031 GGAT G 0.500000 0.100 1 -3 1 669 58 611 26 4 4 14 10 0 1 607 3 0 0.4483 0.0000 0.0065 14.333 2.85 10.30 -7.45 6 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4103 0.4976 0.0920 1 1 0.4060 0.4975 0.0965 1 1 0.4000 0.4974 0.1026
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 746 212 534 150 3 43 1 15 0 0 534 0 0 0.7075 0.0000 0.0000 3.930 0.37 3.73 -3.36 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0553 0.9447 0.0000
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 380 109 271 103 0 4 0 2 0 0 271 0 0 0.9450 0.0000 0.0000 26.250 0.23 3.00 -2.77 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6911 0.3089 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr7 26152597 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 356 97 259 43 0 6 2 46 0 0 257 0 2 0.4433 0.0000 0.0077 15.167 0.53 3.33 -2.79 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0884 0.5579 0.3537 1 1 0.0932 0.5533 0.3535 1 1 0.0998 0.5476 0.3526
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 130 40 90 19 2 1 2 16 0 0 88 1 1 0.4750 0.0000 0.0222 38.000 0.16 1.25 -1.09 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2588 0.5459 0.1953 1 1 0.2595 0.5424 0.1981 1 1 0.2604 0.5381 0.2016
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 505 130 375 64 0 2 0 64 0 0 374 0 1 0.4923 0.0000 0.0027 64.000 0.39 1.52 -1.12 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1568 0.6519 0.1912 1 1 0.1624 0.6411 0.1965 1 1 0.1696 0.6272 0.2032
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 203 56 147 2 0 2 0 52 0 0 145 0 2 0.0357 0.0000 0.0136 27.000 0.00 3.35 -3.35 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8445 0.1555 2 2 0.0000 0.3618 0.6382 2 2 0.0000 0.2080 0.7920
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 239 114 125 9 0 2 1 102 0 0 123 0 2 0.0789 0.0000 0.0160 55.500 0.11 3.03 -2.92 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9871 0.0129 2 1 0.0000 0.6651 0.3349
chr7 56101805 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 171 83 88 51 0 0 0 32 0 0 88 0 0 0.6145 0.0000 0.0000 83.000 0.39 1.34 -0.95 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6756 0.3088 0.0156 1 0 0.6652 0.3170 0.0178 1 0 0.6506 0.3283 0.0211
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.100 1 3 5 345 99 246 68 8 19 0 4 0 0 246 0 0 0.6869 0.0000 0.0000 4.211 0.32 3.00 -2.68 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.3864 0.6136 0.0000 0 0 0.7541 0.2459 0.0000
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 872 201 671 0 0 16 1 184 0 0 661 1 9 0.0000 0.0000 0.0149 11.562 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 600 150 450 67 1 18 1 63 0 1 446 0 3 0.4467 0.0000 0.0089 7.333 0.90 3.81 -2.91 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1977 0.6572 0.1451 1 1 0.2031 0.6460 0.1509 1 1 0.2099 0.6317 0.1584
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 466 205 261 101 11 84 0 9 0 1 260 0 0 0.4927 0.0000 0.0038 1.440 1.30 2.89 -1.59 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0190 0.9810 0.0000 0 1 0.4262 0.5738 0.0000
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 478 158 320 79 0 8 0 71 0 0 318 0 2 0.5000 0.0000 0.0063 18.750 0.52 3.86 -3.34 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2755 0.6407 0.0839 1 1 0.2803 0.6304 0.0893 1 1 0.2859 0.6173 0.0968
chr7 100359505 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 431 129 302 104 0 14 0 11 0 0 302 0 0 0.8062 0.0000 0.0000 8.214 0.24 3.18 -2.94 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.1178 0.8822 0.0000
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 177 55 122 41 0 0 0 14 0 0 107 0 15 0.7455 0.0000 0.1230 55.000 0.15 32.50 -32.35 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5126 0.4399 0.0475 1 0 0.5058 0.4428 0.0514 1 0 0.4963 0.4468 0.0569
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.100 1 -7 1 740 257 483 199 0 3 0 55 0 0 478 0 5 0.7743 0.0000 0.0104 84.667 0.35 6.85 -6.51 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9931 0.0069 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 666 179 487 6 0 9 0 164 0 0 483 0 4 0.0335 0.0000 0.0082 18.889 0.67 3.10 -2.43 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9915 0.0085 2 2 0.0000 0.1175 0.8825 2 2 0.0000 0.0132 0.9868
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 362 90 272 27 2 23 0 38 0 0 267 0 5 0.3000 0.0000 0.0184 3.143 1.44 6.74 -5.29 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0324 0.3890 0.5785 1 2 0.0357 0.3945 0.5698 1 2 0.0405 0.4019 0.5577
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 776 209 567 93 1 16 0 99 0 0 567 0 0 0.4450 0.0000 0.0000 12.062 0.35 3.91 -3.55 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0821 0.6957 0.2222 1 1 0.0881 0.6822 0.2296 1 1 0.0964 0.6649 0.2387
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 740 202 538 107 2 27 0 66 0 0 536 0 2 0.5297 0.0000 0.0037 6.481 0.43 6.39 -5.96 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9277 0.0720 0.0002 1 0 0.9211 0.0785 0.0003 1 0 0.9113 0.0882 0.0005
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 657 214 443 124 0 23 1 66 0 0 443 0 0 0.5794 0.0000 0.0000 8.304 0.24 16.52 -16.27 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9824 0.0176 0.0000 1 0 0.9796 0.0204 0.0000 1 0 0.9752 0.0247 0.0000
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 433 223 210 83 1 34 2 103 0 0 203 1 6 0.3722 0.0000 0.0333 5.529 0.29 5.45 -5.16 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0029 0.2422 0.7549 1 2 0.0035 0.2486 0.7479 1 2 0.0046 0.2579 0.7375
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 249 87 162 14 0 1 0 72 0 0 159 0 3 0.1609 0.0000 0.0185 86.000 0.00 3.25 -3.25 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9953 0.0047
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 927 242 685 8 179 41 0 14 0 1 683 0 1 0.0331 0.0000 0.0029 4.902 3.62 2.93 0.70 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.3770 0.6230 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 933 247 686 15 2 37 7 186 0 0 685 0 1 0.0607 0.0000 0.0015 5.676 2.60 3.20 -0.60 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.7959 0.2041
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 787 191 596 0 0 9 0 182 0 0 596 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 20.222 1.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 768 179 589 169 0 6 0 4 0 0 589 0 0 0.9441 0.0000 0.0000 28.833 0.22 3.75 -3.53 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4316 0.5684 0.0000 0 0 0.9850 0.0150 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000
chr7 144667784 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 186 86 100 46 0 2 0 38 0 0 99 0 1 0.5349 0.0000 0.0100 42.000 0.13 2.66 -2.53 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3616 0.5482 0.0903 1 1 0.3607 0.5443 0.0950 1 1 0.3590 0.5394 0.1015
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 774 198 576 13 0 2 0 183 0 0 574 0 2 0.0657 0.0000 0.0035 98.000 0.77 1.30 -0.53 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9899 0.0101 2 2 0.0000 0.3450 0.6550
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 426 100 326 0 0 3 23 74 0 7 290 17 12 0.0000 0.0000 0.1104 32.000 7.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1152 0.8848 2 2 0.0000 0.0387 0.9613 2 2 0.0000 0.0210 0.9790
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 427 99 328 0 0 7 16 76 0 1 289 23 15 0.0000 0.0000 0.1189 22.000 7.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 428 95 333 0 0 10 5 80 0 2 254 23 54 0.0000 0.0000 0.2372 8.400 7.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 335 151 184 70 0 1 2 78 0 0 183 1 0 0.4636 0.0000 0.0054 150.000 0.19 1.73 -1.55 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0453 0.5602 0.3945 1 1 0.0495 0.5545 0.3960 1 1 0.0554 0.5475 0.3971
chr8 544658 GGGCGGC G 0.425210 0.100 1 -6 1 256 132 124 118 2 9 0 3 0 0 123 0 1 0.8939 0.0000 0.0081 13.556 0.63 6.00 -5.37 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0786 0.9214 0.0000 0 0 0.8856 0.1144 0.0000 0 0 0.9725 0.0275 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 776 158 618 54 1 25 1 77 0 0 616 0 2 0.3418 0.0000 0.0032 5.320 0.61 5.86 -5.25 32 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0045 0.2295 0.7660 1 2 0.0054 0.2374 0.7571 1 2 0.0069 0.2487 0.7445
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.100 1 -6 2 735 149 586 65 0 36 0 48 1 0 580 0 5 0.4362 0.0017 0.0102 3.139 0.32 5.69 -5.36 21 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4982 0.4677 0.0341 1 0 0.4951 0.4674 0.0374 1 0 0.4903 0.4675 0.0422
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 586 272 314 0 0 42 0 230 0 0 314 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.610 5.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 329 111 218 59 0 4 0 48 0 0 213 0 5 0.5315 0.0000 0.0229 26.750 0.07 7.31 -7.24 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4406 0.5260 0.0334 1 1 0.4442 0.5205 0.0353 1 1 0.4483 0.5139 0.0378
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 633 243 390 224 0 8 0 11 1 0 389 0 0 0.9218 0.0026 0.0026 29.375 0.43 3.27 -2.84 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5031 0.4969 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 177 87 90 47 0 1 0 39 0 0 90 0 0 0.5402 0.0000 0.0000 86.000 0.51 2.33 -1.82 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3869 0.5339 0.0792 1 1 0.3852 0.5309 0.0839 1 1 0.3825 0.5272 0.0903
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 569 185 384 70 5 36 5 69 0 0 382 0 2 0.3784 0.0000 0.0052 4.083 0.86 4.12 -3.26 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2814 0.6923 0.0263 1 1 0.2931 0.6797 0.0272 1 1 0.3082 0.6634 0.0284
chr8 81753241 TGTGA T 0.500000 0.100 1 -4 1 236 84 152 39 0 2 0 43 0 0 152 0 0 0.4643 0.0000 0.0000 41.000 0.36 3.84 -3.48 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1306 0.5807 0.2887 1 1 0.1353 0.5746 0.2900 1 1 0.1416 0.5670 0.2914
chr8 97775937 C CGGCGGGCTCCAGGCGA 0.500000 0.100 1 16 1 291 105 186 9 0 13 1 82 0 0 171 0 15 0.0857 0.0000 0.0806 7.077 0.56 10.01 -9.46 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9909 0.0091 2 1 0.0000 0.7362 0.2638
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 675 227 448 119 1 6 0 101 0 0 448 0 0 0.5242 0.0000 0.0000 36.833 2.54 16.24 -13.70 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5196 0.4683 0.0121 1 0 0.5209 0.4651 0.0140 1 0 0.5212 0.4619 0.0170
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 248 110 138 5 0 2 0 103 0 0 136 0 2 0.0455 0.0000 0.0145 54.000 0.00 3.19 -3.19 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9969 0.0031 2 1 0.0000 0.5198 0.4802 2 2 0.0000 0.1317 0.8683
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 478 124 354 0 0 14 11 99 0 0 351 0 3 0.0000 0.0000 0.0085 7.786 4.51 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0036 0.9964 2 2 0.0000 0.0042 0.9958
chr8 143440216 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 388 129 259 47 9 25 1 47 0 1 258 0 0 0.3643 0.0000 0.0039 4.160 1.83 3.47 -1.64 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3739 0.5522 0.0739 1 1 0.3736 0.5478 0.0786 1 1 0.3725 0.5424 0.0851
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 396 89 307 54 1 1 1 32 0 0 305 0 2 0.6067 0.0000 0.0065 87.000 3.04 3.59 -0.56 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6868 0.2996 0.0136 1 0 0.6765 0.3080 0.0156 1 0 0.6620 0.3194 0.0186
chr8 144267084 CCCCCCGCCGCCG C 0.500000 0.100 1 -12 1 462 132 330 109 0 16 0 7 1 0 328 0 1 0.8258 0.0030 0.0061 7.250 0.61 12.86 -12.25 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0464 0.9536 0.0000 0 0 0.5506 0.4494 0.0000
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 878 172 706 74 1 32 0 65 0 0 695 0 11 0.4302 0.0000 0.0156 4.344 0.84 11.74 -10.90 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1425 0.6750 0.1825 1 1 0.1487 0.6627 0.1886 1 1 0.1567 0.6470 0.1963
chr9 12775862 T TGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 2 353 88 265 0 0 24 2 62 0 0 253 0 12 0.0000 0.0000 0.0453 2.667 5.81 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0204 0.9796 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 353 88 265 0 0 24 2 62 0 0 253 0 12 0.0000 0.0000 0.0453 2.667 5.81 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0204 0.9796 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0245 0.9755
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 381 112 269 56 0 1 0 55 0 0 269 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 111.000 0.36 2.02 -1.66 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2023 0.6317 0.1660 1 1 0.2069 0.6221 0.1710 1 1 0.2125 0.6100 0.1775
chr9 33796692 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 335 137 198 122 0 5 0 10 0 0 198 0 0 0.8905 0.0000 0.0000 26.400 0.31 2.70 -2.39 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0104 0.9896 0.0000 0 1 0.3770 0.6230 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 769 208 561 152 0 34 0 22 0 0 560 0 1 0.7308 0.0000 0.0018 5.118 0.38 11.45 -11.07 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr9 35906568 G GCCACACCCCTCACCACCTCCACCACCACCACCACCCCCACCACCACCCCCA 0.500000 0.100 1 51 5 791 309 482 129 1 93 1 85 0 0 482 0 0 0.4175 0.0000 0.0000 2.301 0.98 2.33 -1.35 27 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9315 0.0683 0.0002 1 0 0.9256 0.0742 0.0002 1 0 0.9167 0.0830 0.0003
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 414 59 355 31 0 0 0 28 0 0 355 0 0 0.5254 0.0000 0.0000 59.000 0.35 1.04 -0.68 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2828 0.5611 0.1560 1 1 0.2834 0.5565 0.1600 1 1 0.2840 0.5507 0.1653
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 465 127 338 0 0 6 1 120 0 0 325 0 13 0.0000 0.0000 0.0385 20.167 14.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 755 153 602 11 0 14 1 127 0 0 575 0 27 0.0719 0.0000 0.0449 9.929 0.09 10.50 -10.41 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9815 0.0185 2 2 0.0000 0.3867 0.6133
chr9 77384631 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 486 161 325 78 0 26 3 54 0 0 325 0 0 0.4845 0.0000 0.0000 5.192 0.27 2.85 -2.58 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6671 0.3225 0.0104 1 0 0.6594 0.3286 0.0120 1 0 0.6482 0.3372 0.0146
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 523 134 389 66 0 5 0 63 0 0 385 0 4 0.4925 0.0000 0.0103 25.800 0.36 3.06 -2.70 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1548 0.6564 0.1888 1 1 0.1605 0.6453 0.1942 1 1 0.1678 0.6311 0.2011
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 203 81 122 35 0 5 0 41 0 0 120 0 2 0.4321 0.0000 0.0164 15.200 0.20 4.71 -4.51 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0809 0.5241 0.3950 1 1 0.0855 0.5218 0.3927 1 1 0.0918 0.5191 0.3891
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 337 113 224 36 2 21 4 50 0 0 224 0 0 0.3186 0.0000 0.0000 4.381 0.25 3.00 -2.75 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0247 0.3805 0.5948 1 2 0.0276 0.3858 0.5867 1 2 0.0318 0.3929 0.5753
chr9 93676716 T TACCACCCCTGCCTCC 0.500000 0.100 1 15 1 439 183 256 153 2 7 0 21 0 0 256 0 0 0.8361 0.0000 0.0000 25.000 0.25 8.29 -8.04 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0026 0.9974 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 440 189 251 161 1 7 0 20 0 0 251 0 0 0.8519 0.0000 0.0000 30.167 0.24 8.65 -8.41 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0070 0.9930 0.0000
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 462 190 272 0 0 0 0 190 0 0 270 0 2 0.0000 0.0000 0.0074 190.000 3.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 384 102 282 0 0 15 0 87 0 0 282 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.800 5.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0115 0.9885 2 2 0.0000 0.0126 0.9874 2 2 0.0000 0.0143 0.9857
chr9 97854412 TGCCGCAGCCGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 884 129 755 63 44 15 1 6 1 1 747 5 1 0.4884 0.0013 0.0106 6.083 1.51 10.17 -8.66 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0177 0.9823 0.0000 0 1 0.2873 0.7127 0.0000
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 880 117 763 35 2 32 1 47 1 0 759 1 2 0.2991 0.0013 0.0052 2.625 1.14 7.28 -6.13 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0431 0.4550 0.5019 1 2 0.0469 0.4566 0.4965 1 2 0.0523 0.4590 0.4887
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 489 131 358 22 0 1 1 107 0 0 357 1 0 0.1679 0.0000 0.0028 130.000 0.18 2.72 -2.54 16 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 807 164 643 27 0 2 0 135 0 0 641 0 2 0.1646 0.0000 0.0031 81.000 0.04 4.82 -4.79 17 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 740 178 562 17 0 1 3 157 0 0 560 0 2 0.0955 0.0000 0.0036 175.000 0.29 3.08 -2.78 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9554 0.0446
chr9 107487627 TCAGGGCTGCCTTTGCTGACGCTGATGACCGACGGGCTGCCGTACTCGCTGC T 0.500000 0.100 1 -51 1 590 107 483 73 0 5 1 28 0 0 460 1 22 0.6822 0.0000 0.0476 20.200 0.25 23.89 -23.65 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6846 0.3054 0.0100 1 0 0.6759 0.3124 0.0117 1 0 0.6636 0.3222 0.0142
chr9 110207464 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 189 90 99 50 0 2 0 38 0 0 98 0 1 0.5556 0.0000 0.0101 44.000 0.32 1.08 -0.76 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4640 0.4834 0.0526 1 1 0.4598 0.4835 0.0567 1 1 0.4537 0.4837 0.0625
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 319 135 184 0 0 3 0 132 0 0 182 0 2 0.0000 0.0000 0.0109 44.000 3.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 458 93 365 2 0 11 0 80 0 0 364 0 1 0.0215 0.0000 0.0027 7.455 0.00 6.50 -6.50 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5785 0.4215 2 2 0.0000 0.1283 0.8717 2 2 0.0000 0.0662 0.9338
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 682 143 539 24 0 9 1 109 0 0 520 0 19 0.1678 0.0000 0.0353 14.889 0.46 5.88 -5.42 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 550 188 362 74 1 20 5 88 0 0 356 1 5 0.3936 0.0000 0.0166 8.789 0.27 3.82 -3.55 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0066 0.3129 0.6805 1 2 0.0078 0.3180 0.6742 1 2 0.0097 0.3254 0.6648
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 534 186 348 0 0 7 0 179 0 0 341 1 6 0.0000 0.0000 0.0201 25.571 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 462 129 333 52 4 33 9 31 0 0 327 2 4 0.4031 0.0000 0.0180 2.909 0.94 5.68 -4.74 4 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4233 0.5181 0.0586 1 1 0.4212 0.5158 0.0629 1 1 0.4178 0.5132 0.0690
chr9 130681605 T TCGCCGC 0.500000 0.100 1 6 1 462 129 333 55 1 35 0 38 0 0 327 0 6 0.4264 0.0000 0.0180 2.686 1.71 6.37 -4.66 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4765 0.4784 0.0451 1 1 0.4725 0.4784 0.0490 1 1 0.4666 0.4788 0.0546
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 384 89 295 85 0 1 0 3 0 0 294 0 1 0.9551 0.0000 0.0034 88.000 1.41 1.00 0.41 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0109 0.9891 0.0000 0 1 0.4987 0.5013 0.0000 0 0 0.8264 0.1736 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 269 122 147 50 0 0 1 71 0 0 146 0 1 0.4098 0.0000 0.0068 121.000 1.68 1.21 0.47 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0078 0.2737 0.7185 1 2 0.0092 0.2817 0.7091 1 2 0.0114 0.2928 0.6958
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 269 122 147 50 0 0 1 71 0 0 146 0 1 0.4098 0.0000 0.0068 121.000 1.68 1.21 0.47 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0078 0.2737 0.7185 1 2 0.0092 0.2817 0.7091 1 2 0.0114 0.2928 0.6958
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 249 101 148 53 0 1 0 47 0 0 145 1 2 0.5248 0.0000 0.0203 100.000 0.11 2.11 -1.99 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2591 0.6095 0.1315 1 1 0.2621 0.6014 0.1365 1 1 0.2656 0.5912 0.1432
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 400 114 286 0 0 5 1 108 0 0 286 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 21.800 1.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0050 0.9950
chr9 136341024 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 283 79 204 70 0 5 0 4 0 0 204 0 0 0.8861 0.0000 0.0000 14.800 0.20 1.50 -1.30 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 1 0.3206 0.6794 0.0000 0 0 0.6971 0.3029 0.0000
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 560 165 395 76 4 24 6 55 0 0 393 0 2 0.4606 0.0000 0.0051 5.833 0.13 2.98 -2.85 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5532 0.4265 0.0204 1 0 0.5491 0.4280 0.0230 1 0 0.5427 0.4305 0.0268
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 508 153 355 89 0 11 0 53 0 0 349 1 5 0.5817 0.0000 0.0169 14.200 0.46 13.06 -12.60 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8311 0.1669 0.0020 1 0 0.8219 0.1756 0.0025 1 0 0.8086 0.1881 0.0033
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 194 88 106 0 55 21 0 12 0 0 106 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.190 3.92 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0095 0.9905 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.0067 0.9933 0.0000
chr9 138217086 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 1 194 88 106 54 1 29 1 3 0 0 106 0 0 0.6136 0.0000 0.0000 2.071 12.30 4.33 7.96 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0178 0.9822 0.0000 0 1 0.3586 0.6414 0.0000 0 0 0.6512 0.3488 0.0000
chr10 13439173 CAG C 0.004149 0.100 1 -2 3 317 80 237 72 2 2 0 4 0 0 236 1 0 0.9000 0.0000 0.0042 38.500 0.18 2.00 -1.82 44 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5210 0.4790 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 266 90 176 50 0 0 0 40 0 0 174 0 2 0.5556 0.0000 0.0114 90.000 0.24 4.00 -3.76 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5196 0.4555 0.0249 1 0 0.5196 0.4539 0.0264 1 0 0.5191 0.4523 0.0286
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 871 204 667 83 1 24 0 96 0 0 657 1 9 0.4069 0.0000 0.0150 7.458 0.30 5.69 -5.39 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0078 0.3569 0.6353 1 2 0.0092 0.3601 0.6307 1 2 0.0114 0.3651 0.6235
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 728 154 574 81 0 2 3 68 0 0 571 0 3 0.5260 0.0000 0.0052 76.000 0.21 3.81 -3.60 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3979 0.5680 0.0341 1 1 0.4040 0.5594 0.0366 1 1 0.4111 0.5489 0.0400
chr10 45303617 T TA 0.034347 0.100 1 1 2 621 157 464 147 0 5 0 5 0 0 464 0 0 0.9363 0.0000 0.0000 30.400 0.35 1.60 -1.25 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4396 0.5604 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr10 49988768 A AC 0.134835 0.100 1 1 1 461 144 317 14 0 1 1 128 0 0 316 0 1 0.0972 0.0000 0.0032 143.000 0.21 2.01 -1.79 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9893 0.0107
chr10 50008914 CAA C 0.245598 0.100 1 -2 1 867 220 647 11 0 3 3 203 0 0 641 0 6 0.0500 0.0000 0.0093 72.333 0.82 2.24 -1.42 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9042 0.0958 2 2 0.0000 0.1086 0.8914
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 675 147 528 134 3 4 0 6 0 0 528 0 0 0.9116 0.0000 0.0000 35.750 0.25 5.17 -4.91 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 0 0.8216 0.1784 0.0000 0 0 0.9795 0.0205 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 650 222 428 10 0 26 0 186 0 0 416 0 12 0.0450 0.0000 0.0280 7.538 1.00 6.49 -5.49 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7258 0.2742 2 2 0.0000 0.0486 0.9514
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 348 79 269 6 0 4 0 69 0 0 265 0 4 0.0759 0.0000 0.0149 18.750 0.83 5.90 -5.07 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9449 0.0551 2 1 0.0000 0.6010 0.3990
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 343 155 188 83 0 3 0 69 0 0 186 0 2 0.5355 0.0000 0.0106 50.667 0.65 2.77 -2.12 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5357 0.4496 0.0147 1 0 0.5377 0.4462 0.0161 1 0 0.5392 0.4425 0.0183
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 221 73 148 4 0 1 0 68 0 0 146 0 2 0.0548 0.0000 0.0135 72.000 0.00 3.12 -3.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9874 0.0126 2 2 0.0000 0.4504 0.5496 2 2 0.0000 0.1429 0.8571
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 389 97 292 27 2 16 16 36 0 3 285 1 3 0.2784 0.0000 0.0240 4.000 1.70 2.56 -0.85 23 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0091 0.2462 0.7447 1 2 0.0106 0.2555 0.7339 1 2 0.0129 0.2684 0.7187
chr10 125980294 TGAA T 0.024281 0.100 1 -3 2 244 105 139 49 0 11 0 45 0 0 139 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 8.545 0.35 3.00 -2.65 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4752 0.5195 0.0054 1 1 0.4799 0.5145 0.0056 1 1 0.4856 0.5085 0.0059
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 300 103 197 55 0 4 0 44 0 0 197 0 0 0.5340 0.0000 0.0000 24.750 0.35 1.16 -0.81 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4534 0.4953 0.0512 1 1 0.4502 0.4945 0.0554 1 1 0.4452 0.4936 0.0612
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 567 152 415 74 1 11 0 66 0 0 413 0 2 0.4868 0.0000 0.0048 12.727 0.30 3.11 -2.81 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3713 0.5786 0.0501 1 1 0.3760 0.5705 0.0535 1 1 0.3815 0.5604 0.0581
chr11 502129 ACTGGATGTCCAGGCT A 0.120821 0.100 1 -15 1 164 89 75 34 1 6 0 48 0 0 71 0 4 0.3820 0.0000 0.0533 13.833 0.26 12.06 -11.80 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0686 0.6511 0.2804 1 1 0.0758 0.6525 0.2717 1 1 0.0862 0.6538 0.2601
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 260 98 162 43 0 3 0 52 0 0 162 0 0 0.4388 0.0000 0.0000 31.667 0.37 2.15 -1.78 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0795 0.5506 0.3699 1 1 0.0848 0.5473 0.3680 1 1 0.0920 0.5431 0.3649
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.100 1 1 1 374 135 239 70 0 9 1 55 0 0 239 0 0 0.5185 0.0000 0.0000 15.750 0.23 1.89 -1.66 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6565 0.3375 0.0060 1 0 0.6542 0.3392 0.0067 1 0 0.6504 0.3420 0.0077
chr11 1096074 CGACACCCATCAGCACCACCACTACGGTGACCCCAACACCAACACCCACCGGCACACAGACCCCAACCCT C 0.010843 0.100 1 -69 1 1089 299 790 183 23 48 16 29 10 21 719 27 13 0.6120 0.0127 0.0899 5.085 3.02 4.34 -1.32 71 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9862 0.0138 0.0000
chr11 1186164 C CACCAGCACAACTTCTGCTTCTACA 0.095472 0.100 1 24 2 1679 407 1272 58 5 107 13 224 1 6 1222 19 24 0.1425 0.0008 0.0393 2.738 2.28 4.89 -2.62 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.100 1 -24 1 1873 382 1491 230 2 122 3 25 3 1 1486 1 0 0.6021 0.0020 0.0034 2.115 1.56 10.88 -9.32 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0204 0.9796 0.0000
chr11 1249988 GCCA G 0.076028 0.100 1 -3 2 1683 333 1350 277 6 21 1 28 6 4 1337 0 3 0.8318 0.0044 0.0096 14.762 1.22 3.54 -2.32 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0273 0.9727 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 938 202 736 60 0 77 0 65 0 0 736 0 0 0.2970 0.0000 0.0000 1.623 0.83 7.65 -6.81 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0924 0.6122 0.2954 1 1 0.0972 0.6035 0.2993 1 1 0.1038 0.5925 0.3037
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.100 1 -30 1 887 193 694 30 3 72 2 86 0 0 659 0 35 0.1554 0.0000 0.0504 1.704 3.40 12.56 -9.16 6 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0617 0.9383 2 1 0.0000 0.9843 0.0157 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 832 232 600 22 1 76 3 130 0 0 599 0 1 0.0948 0.0000 0.0017 2.040 1.18 8.31 -7.13 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr11 2884966 ACCGCGACCGGAG A 0.233793 0.100 1 -12 1 532 98 434 6 1 27 1 63 0 0 417 0 17 0.0612 0.0000 0.0392 2.593 0.50 12.94 -12.44 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9782 0.0218 2 1 0.0000 0.7918 0.2082
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 338 101 237 0 0 5 0 96 0 0 236 0 1 0.0000 0.0000 0.0042 19.200 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0078 0.9922 2 2 0.0000 0.0089 0.9911
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 697 231 466 120 0 6 0 105 0 1 465 0 0 0.5195 0.0000 0.0021 37.500 0.16 1.28 -1.12 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4313 0.5496 0.0192 1 1 0.4358 0.5424 0.0219 1 1 0.4402 0.5339 0.0259
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 242 115 127 61 0 3 0 51 0 0 125 0 2 0.5304 0.0000 0.0157 37.333 0.28 1.98 -1.70 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3587 0.5678 0.0734 1 1 0.3594 0.5623 0.0783 1 1 0.3596 0.5555 0.0849
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 718 181 537 101 1 0 1 78 0 0 536 0 1 0.5580 0.0000 0.0019 181.000 0.17 3.36 -3.19 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6392 0.3526 0.0082 1 0 0.6345 0.3559 0.0096 1 0 0.6271 0.3610 0.0118
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 544 140 404 128 0 4 0 8 0 0 404 0 0 0.9143 0.0000 0.0000 34.000 0.25 2.50 -2.25 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1085 0.8915 0.0000 0 0 0.7470 0.2530 0.0000
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 524 139 385 11 0 1 1 126 1 0 384 0 0 0.0791 0.0026 0.0026 138.000 1.27 2.28 -1.01 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.8221 0.1779
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 730 155 575 71 0 5 0 79 0 0 563 0 12 0.4581 0.0000 0.0209 30.000 0.08 5.53 -5.45 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0116 0.3744 0.6140 1 2 0.0135 0.3775 0.6090 1 2 0.0163 0.3823 0.6014
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 567 160 407 75 1 6 0 78 0 0 407 0 0 0.4688 0.0000 0.0000 25.500 0.21 1.68 -1.47 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1278 0.6748 0.1974 1 1 0.1340 0.6625 0.2035 1 1 0.1421 0.6468 0.2111
chr11 5489310 G GGGCT 0.500000 0.100 1 4 1 755 167 588 107 1 3 0 56 1 0 582 0 5 0.6407 0.0017 0.0102 54.667 1.35 5.23 -3.89 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9619 0.0380 0.0001 1 0 0.9572 0.0427 0.0001 1 0 0.9500 0.0499 0.0002
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 775 123 652 0 0 17 0 106 0 0 628 0 24 0.0000 0.0000 0.0368 6.235 8.75 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 281 137 144 63 2 12 2 58 0 0 144 0 0 0.4599 0.0000 0.0000 10.333 0.48 3.98 -3.51 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2690 0.6242 0.1067 1 1 0.2728 0.6151 0.1121 1 1 0.2771 0.6036 0.1194
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 205 80 125 41 0 0 0 39 0 0 125 0 0 0.5125 0.0000 0.0000 80.000 0.12 3.10 -2.98 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2438 0.5921 0.1640 1 1 0.2464 0.5853 0.1683 1 1 0.2495 0.5767 0.1739
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.100 1 -12 1 326 85 241 52 0 3 0 30 0 0 237 0 4 0.6118 0.0000 0.0166 27.333 0.52 11.30 -10.78 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6492 0.3325 0.0183 1 0 0.6395 0.3398 0.0207 1 0 0.6258 0.3499 0.0243
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 221 88 133 39 0 4 0 45 0 0 132 0 1 0.4432 0.0000 0.0075 21.000 0.41 6.24 -5.83 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0925 0.5510 0.3565 1 1 0.0972 0.5470 0.3558 1 1 0.1037 0.5419 0.3544
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 862 263 599 0 0 12 0 251 0 0 592 0 7 0.0000 0.0000 0.0117 20.917 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 762 155 607 0 0 0 1 154 0 0 598 0 9 0.0000 0.0000 0.0148 155.000 2.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 719 163 556 95 0 0 0 68 0 0 556 0 0 0.5828 0.0000 0.0000 163.000 0.26 1.66 -1.40 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7628 0.2335 0.0036 1 0 0.7545 0.2411 0.0044 1 0 0.7424 0.2520 0.0057
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 102 42 60 39 0 0 0 3 0 0 60 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 42.000 0.41 2.00 -1.59 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 1 0.2234 0.7766 0.0000 0 1 0.4918 0.5082 0.0000
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 253 85 168 72 0 12 0 1 0 0 168 0 0 0.8471 0.0000 0.0000 6.083 0.15 3.00 -2.85 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8097 0.1903 0.0000 0 0 0.9263 0.0737 0.0000 0 0 0.9454 0.0546 0.0000
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 290 124 166 49 2 24 1 48 0 0 166 0 0 0.3952 0.0000 0.0000 4.167 0.94 3.23 -2.29 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2315 0.6151 0.1533 1 1 0.2351 0.6067 0.1582 1 1 0.2395 0.5960 0.1646
chr11 68312746 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 123 64 59 41 3 5 0 15 0 0 58 0 1 0.6406 0.0000 0.0169 11.800 0.63 3.33 -2.70 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8537 0.1430 0.0033 1 0 0.8408 0.1551 0.0041 1 0 0.7846 0.2103 0.0050
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 703 172 531 100 1 23 3 45 0 0 506 0 25 0.5814 0.0000 0.0471 6.435 0.34 7.42 -7.08 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7753 0.2218 0.0029 1 0 0.7671 0.2293 0.0036 1 0 0.7553 0.2400 0.0046
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 769 219 550 14 0 2 1 202 0 0 549 0 1 0.0639 0.0000 0.0018 108.000 0.21 3.00 -2.78 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9912 0.0088 2 2 0.0000 0.2873 0.7127
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 762 188 574 163 1 16 1 7 1 0 573 0 0 0.8670 0.0017 0.0017 10.688 0.49 2.71 -2.22 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.5322 0.4678 0.0000 0 0 0.9546 0.0454 0.0000
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 476 120 356 99 0 6 0 15 0 0 356 0 0 0.8250 0.0000 0.0000 19.000 0.52 4.00 -3.48 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0080 0.9920 0.0000
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.100 1 -1 3 729 91 638 82 0 0 0 9 0 0 638 0 0 0.9011 0.0000 0.0000 91.000 0.20 1.78 -1.58 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0042 0.9958 0.0000 0 1 0.1424 0.8576 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1403 414 989 147 9 73 4 181 0 0 989 0 0 0.3551 0.0000 0.0000 4.562 1.00 7.29 -6.29 43 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0015 0.3279 0.6707 1 2 0.0019 0.3263 0.6719 1 2 0.0026 0.3258 0.6717
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 773 264 509 0 0 37 2 225 0 0 508 1 0 0.0000 0.0000 0.0020 6.135 9.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 431 134 297 65 6 11 0 52 0 0 294 0 3 0.4851 0.0000 0.0101 11.182 1.98 3.21 -1.23 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5468 0.4288 0.0244 1 0 0.5420 0.4307 0.0273 1 0 0.5347 0.4337 0.0315
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 431 140 291 107 17 10 0 6 0 1 290 0 0 0.7643 0.0000 0.0034 12.900 2.28 5.50 -3.22 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.4614 0.5386 0.0000 0 0 0.9006 0.0994 0.0000
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 354 112 242 45 0 1 0 66 0 0 242 0 0 0.4018 0.0000 0.0000 111.000 0.89 2.02 -1.13 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0221 0.4239 0.5539 1 2 0.0255 0.4319 0.5427 1 2 0.0305 0.4426 0.5269
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 358 146 212 50 0 1 0 95 0 0 210 0 2 0.3425 0.0000 0.0094 145.000 1.30 1.95 -0.65 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0334 0.9666 1 2 0.0001 0.0376 0.9623 1 2 0.0001 0.0441 0.9558
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 555 179 376 73 2 27 2 75 0 0 374 0 2 0.4078 0.0000 0.0053 5.630 0.36 3.03 -2.67 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1234 0.6752 0.2015 1 1 0.1302 0.6633 0.2065 1 1 0.1392 0.6480 0.2127
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.100 1 1 1 569 140 429 70 0 4 0 66 1 0 421 0 7 0.5000 0.0023 0.0186 34.000 0.33 3.05 -2.72 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2456 0.6989 0.0555 1 1 0.2565 0.6865 0.0571 1 1 0.2706 0.6704 0.0590
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.100 1 -1 1 574 142 432 72 0 2 0 68 0 0 425 0 7 0.5070 0.0000 0.0162 70.000 0.39 3.01 -2.63 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2240 0.7143 0.0617 1 1 0.2351 0.7017 0.0633 1 1 0.2496 0.6852 0.0652
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 434 127 307 0 0 23 12 92 0 0 305 0 2 0.0000 0.0000 0.0065 4.522 3.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0036 0.9964 2 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 2 0.0000 0.0046 0.9954
chr12 6936716 CCAGCAA C 0.006744 0.100 1 -6 1 777 212 565 91 9 11 28 73 0 0 563 0 2 0.4292 0.0000 0.0035 18.273 0.60 7.58 -6.97 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2316 0.7660 0.0024 1 1 0.2464 0.7510 0.0026 1 1 0.2661 0.7312 0.0027
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 1544 333 1211 251 0 2 0 80 0 0 1209 0 2 0.7538 0.0000 0.0017 165.500 1.77 4.40 -2.63 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.7598 0.2402 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 269 95 174 14 0 10 1 70 0 0 170 0 4 0.1474 0.0000 0.0230 8.500 0.00 4.74 -4.74 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9952 0.0048
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 284 138 146 62 2 8 1 65 0 0 146 0 0 0.4493 0.0000 0.0000 16.125 2.35 4.14 -1.78 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0859 0.6310 0.2831 1 1 0.0894 0.6208 0.2898 1 1 0.0941 0.6078 0.2981
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 467 96 371 54 0 2 0 40 0 0 369 0 2 0.5625 0.0000 0.0054 47.000 0.70 3.88 -3.17 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5352 0.4322 0.0326 1 0 0.5312 0.4334 0.0354 1 0 0.5252 0.4353 0.0395
chr12 40483097 AAGTGACAGGGACAACTAGACTATCAGCTGG A 0.146503 0.100 1 -30 1 831 199 632 150 2 29 2 16 5 0 625 1 1 0.7538 0.0079 0.0111 6.036 1.90 5.12 -3.23 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0394 0.9606 0.0000
chr12 40486057 AGTGACAGGGACAACTGGAATATCAACTGAAGTGACAGGGACAACTGGACCATCAGCTAGG A 0.000347 0.100 1 -60 2 448 145 303 101 8 17 2 17 1 1 284 10 7 0.6966 0.0033 0.0627 7.938 1.99 5.82 -3.83 3 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9988 0.0012 0.0000 1 0 0.9931 0.0069 0.0000 0 1 0.1678 0.8322 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 898 149 749 30 0 68 1 50 1 0 716 2 30 0.2013 0.0013 0.0441 1.191 4.30 6.18 -1.88 4 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0205 0.9795 1 2 0.0001 0.0238 0.9761 1 2 0.0001 0.0299 0.9700
chr12 51890755 T TGGCCCA 0.010615 0.100 1 6 1 680 195 485 92 0 34 0 69 0 0 479 0 6 0.4718 0.0000 0.0124 4.735 0.27 5.91 -5.64 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7015 0.2982 0.0003 1 0 0.7008 0.2989 0.0003 1 0 0.6991 0.3005 0.0003
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.100 1 21 2 524 133 391 67 0 25 0 41 0 0 368 0 23 0.5038 0.0000 0.0588 4.320 0.12 14.66 -14.54 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4003 0.5900 0.0096 1 1 0.4091 0.5809 0.0101 1 1 0.4199 0.5695 0.0107
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 338 80 258 37 0 1 0 42 0 0 258 0 0 0.4625 0.0000 0.0000 79.000 0.14 1.69 -1.56 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1772 0.6150 0.2078 1 1 0.1840 0.6083 0.2077 1 1 0.1930 0.5998 0.2072
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 392 107 285 51 0 1 0 55 0 0 284 0 1 0.4766 0.0000 0.0035 106.000 0.16 1.56 -1.41 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1331 0.6217 0.2452 1 1 0.1394 0.6136 0.2470 1 1 0.1477 0.6033 0.2490
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 424 84 340 21 5 14 7 37 0 0 338 0 2 0.2500 0.0000 0.0059 4.429 0.29 1.32 -1.04 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0329 0.4199 0.5472 1 2 0.0371 0.4296 0.5333 1 2 0.0435 0.4423 0.5143
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 126 65 61 40 1 2 0 22 0 0 61 0 0 0.6154 0.0000 0.0000 31.500 0.07 1.91 -1.83 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6190 0.3556 0.0254 1 0 0.6057 0.3656 0.0287 1 0 0.5873 0.3789 0.0338
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 402 111 291 99 0 3 0 9 0 0 291 0 0 0.8919 0.0000 0.0000 36.000 1.01 3.67 -2.66 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0140 0.9860 0.0000 0 1 0.3573 0.6427 0.0000
chr12 69694439 GT G 0.031623 0.100 1 -1 1 186 67 119 62 2 2 0 1 0 0 119 0 0 0.9254 0.0000 0.0000 32.500 0.40 1.00 -0.60 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9888 0.0112 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.100 1 -1 1 296 91 205 14 10 28 24 15 0 0 201 1 3 0.1538 0.0000 0.0195 1.500 2.71 4.13 -1.42 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0626 0.5155 0.4219 1 1 0.0687 0.5212 0.4100 1 1 0.0775 0.5284 0.3941
chr12 71676725 AGTT A 0.064476 0.100 1 -3 1 442 131 311 72 0 3 1 55 0 0 310 0 1 0.5496 0.0000 0.0032 42.667 0.08 3.36 -3.28 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6860 0.3116 0.0024 1 0 0.6837 0.3136 0.0027 1 0 0.6801 0.3168 0.0031
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 144 52 92 4 0 9 0 39 0 0 89 0 3 0.0769 0.0000 0.0326 4.778 1.00 2.79 -1.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9325 0.0675 2 1 0.0000 0.7298 0.2702
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1055 296 759 0 0 27 4 265 0 0 756 1 2 0.0000 0.0000 0.0040 9.926 3.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 80549726 CTGAAACAGGTAACTAACG C 0.056249 0.100 1 -18 2 419 133 286 111 0 15 0 7 0 0 286 0 0 0.8346 0.0000 0.0000 7.867 0.11 11.29 -11.18 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.7136 0.2864 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 141 68 73 34 2 8 0 24 0 0 73 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 7.500 0.18 1.04 -0.87 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6140 0.3617 0.0243 1 0 0.6075 0.3661 0.0263 1 0 0.5986 0.3722 0.0292
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 436 122 314 8 38 31 0 45 0 1 313 0 0 0.0656 0.0000 0.0032 2.935 0.12 3.42 -3.30 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2298 0.6068 0.1635 1 1 0.2331 0.5989 0.1680 1 1 0.2372 0.5889 0.1739
chr12 102958393 CGCA C 0.500000 0.100 1 -3 1 443 124 319 53 4 28 4 35 0 0 318 1 0 0.4274 0.0000 0.0031 3.429 2.49 3.34 -0.85 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6097 0.3687 0.0216 1 0 0.6015 0.3743 0.0242 1 0 0.5899 0.3820 0.0281
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 352 96 256 75 0 17 0 4 0 0 256 0 0 0.7812 0.0000 0.0000 4.647 0.43 3.25 -2.82 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.3746 0.6254 0.0000 0 0 0.7450 0.2550 0.0000
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 397 102 295 46 0 7 0 49 0 0 294 0 1 0.4510 0.0000 0.0034 13.571 0.37 3.63 -3.26 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1255 0.5973 0.2773 1 1 0.1304 0.5901 0.2795 1 1 0.1370 0.5809 0.2821
chr12 110582934 TCGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 332 153 179 75 3 21 4 50 0 0 178 0 1 0.4902 0.0000 0.0056 6.500 1.67 3.80 -2.13 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7035 0.2884 0.0081 1 0 0.6948 0.2957 0.0095 1 0 0.6824 0.3059 0.0117
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 536 153 383 0 0 21 9 123 0 0 380 0 3 0.0000 0.0000 0.0078 6.238 4.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 236 135 101 128 0 0 0 7 0 0 101 0 0 0.9481 0.0000 0.0000 135.000 0.62 5.00 -4.38 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2583 0.7417 0.0000 0 0 0.8482 0.1518 0.0000
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 182 71 111 35 1 12 0 23 0 0 109 0 2 0.4930 0.0000 0.0180 4.917 0.06 5.70 -5.64 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4928 0.4505 0.0567 1 0 0.4861 0.4531 0.0608 1 0 0.4769 0.4565 0.0666
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 475 132 343 71 39 19 1 2 0 0 343 0 0 0.5379 0.0000 0.0000 5.368 1.13 5.00 -3.87 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6901 0.3099 0.0000 0 0 0.9529 0.0471 0.0000 0 0 0.9770 0.0230 0.0000
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 341 103 238 0 0 11 1 91 0 0 233 0 5 0.0000 0.0000 0.0210 8.364 5.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0078 0.9922 2 2 0.0000 0.0090 0.9910
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 322 71 251 0 0 5 0 66 0 0 233 0 18 0.0000 0.0000 0.0717 13.200 11.71 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0136 0.9864 2 2 0.0000 0.0148 0.9852 2 2 0.0000 0.0167 0.9833
chr12 122200593 A AGGGGGAGAAAGACAAGAAAGG 0.500000 0.100 1 21 3 550 111 439 61 0 12 0 38 0 0 427 0 12 0.5495 0.0000 0.0273 8.250 0.28 11.03 -10.75 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4402 0.5100 0.0497 1 1 0.4381 0.5081 0.0538 1 1 0.4345 0.5058 0.0597
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 447 127 320 107 2 12 0 6 0 0 320 0 0 0.8425 0.0000 0.0000 10.273 0.25 2.33 -2.08 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.2911 0.7089 0.0000 0 0 0.8124 0.1876 0.0000
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 728 194 534 0 0 30 1 163 0 0 514 0 20 0.0000 0.0000 0.0375 5.467 8.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 221 87 134 7 0 31 4 45 0 0 130 0 4 0.0805 0.0000 0.0299 1.806 0.29 3.22 -2.94 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9919 0.0081 2 1 0.0000 0.8729 0.1271
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 171 61 110 29 2 7 1 22 0 0 110 0 0 0.4754 0.0000 0.0000 7.571 0.93 3.64 -2.71 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4257 0.4907 0.0836 1 1 0.4210 0.4910 0.0880 1 1 0.4145 0.4914 0.0942
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 200 53 147 0 0 2 0 51 0 0 138 0 9 0.0000 0.0000 0.0612 25.500 10.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0449 0.9551 2 2 0.0000 0.0476 0.9524 2 2 0.0000 0.0516 0.9484
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 529 155 374 120 5 18 1 11 0 0 374 0 0 0.7742 0.0000 0.0000 7.611 1.98 4.27 -2.29 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.2170 0.7830 0.0000
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 508 157 351 10 44 54 2 47 0 0 351 0 0 0.0637 0.0000 0.0000 1.907 3.70 2.91 0.79 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3091 0.5881 0.1028 1 1 0.3107 0.5814 0.1079 1 1 0.3123 0.5730 0.1146
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.100 1 -36 5 514 148 366 68 3 32 0 45 0 0 363 0 3 0.4595 0.0000 0.0082 3.562 0.71 9.04 -8.34 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7185 0.2734 0.0082 1 0 0.7089 0.2815 0.0096 1 0 0.6954 0.2928 0.0118
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 706 173 533 89 0 33 0 51 0 0 522 0 11 0.5145 0.0000 0.0206 4.375 0.29 5.86 -5.57 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7861 0.2107 0.0032 1 0 0.7773 0.2188 0.0039 1 0 0.7646 0.2303 0.0051
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 594 210 384 189 1 14 0 6 0 0 384 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 13.929 0.28 13.00 -12.72 79 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0284 0.9716 0.0000 0 0 0.9615 0.0385 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 577 74 503 0 0 11 0 63 0 0 498 1 4 0.0000 0.0000 0.0099 5.727 5.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0080 0.9920 2 2 0.0000 0.0087 0.9913
chr13 107866367 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 2 782 187 595 169 0 3 0 15 0 0 595 0 0 0.9037 0.0000 0.0000 61.333 0.73 8.00 -7.27 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1937 0.8063 0.0000
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 313 105 208 70 0 32 1 2 0 0 207 0 1 0.6667 0.0000 0.0048 2.281 0.61 1.50 -0.89 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0287 0.9713 0.0000 0 1 0.4870 0.5130 0.0000 0 0 0.7662 0.2338 0.0000
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 537 116 421 45 0 2 1 68 1 0 419 0 1 0.3879 0.0024 0.0048 56.500 0.82 3.22 -2.40 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0067 0.2483 0.7450 1 2 0.0079 0.2571 0.7350 1 2 0.0098 0.2694 0.7208
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 789 182 607 16 0 4 0 162 0 0 605 0 2 0.0879 0.0000 0.0033 44.500 0.44 2.01 -1.57 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7845 0.2155
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 482 138 344 60 1 9 1 67 0 0 344 0 0 0.4348 0.0000 0.0000 14.333 0.37 1.24 -0.87 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0877 0.6123 0.3000 1 1 0.0934 0.6044 0.3022 1 1 0.1011 0.5945 0.3044
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 525 167 358 161 0 4 0 2 0 0 358 0 0 0.9641 0.0000 0.0000 40.750 0.47 19.50 -19.03 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9830 0.0170 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 405 80 325 2 0 3 0 75 0 0 320 0 5 0.0250 0.0000 0.0154 25.667 0.00 1.31 -1.31 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3684 0.6316 2 2 0.0000 0.0615 0.9385 2 2 0.0000 0.0308 0.9692
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.100 1 -6 1 655 147 508 72 0 13 1 61 0 0 504 0 4 0.4898 0.0000 0.0079 10.308 0.21 5.87 -5.66 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4112 0.5576 0.0312 1 1 0.4171 0.5498 0.0331 1 1 0.4240 0.5402 0.0358
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.100 1 3 3 615 180 435 78 1 17 4 80 0 0 432 0 3 0.4333 0.0000 0.0069 9.588 0.08 3.12 -3.05 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1051 0.7080 0.1869 1 1 0.1134 0.6968 0.1898 1 1 0.1248 0.6822 0.1930
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 521 131 390 6 3 9 1 112 0 0 386 0 4 0.0458 0.0000 0.0103 13.222 0.67 2.90 -2.24 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7230 0.2770 2 2 0.0000 0.1813 0.8187
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 407 91 316 0 0 3 0 88 0 0 314 0 2 0.0000 0.0000 0.0063 29.333 5.22 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0257 0.9743 2 2 0.0000 0.0281 0.9719 2 2 0.0000 0.0318 0.9682
chr14 23079578 C CGTGAAT 0.153649 0.100 1 6 2 409 94 315 2 1 8 2 81 0 0 313 0 2 0.0213 0.0000 0.0063 14.167 0.00 5.53 -5.53 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9833 0.0167 2 1 0.0000 0.6957 0.3043 2 2 0.0000 0.4218 0.5782
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 613 199 414 178 3 9 1 8 0 1 413 0 0 0.8945 0.0000 0.0024 21.111 0.58 3.75 -3.17 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.9051 0.0949 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 386 107 279 13 5 53 0 36 0 0 278 1 0 0.1215 0.0000 0.0036 1.106 0.08 3.89 -3.81 3 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0083 0.2193 0.7724 1 2 0.0095 0.2286 0.7619 1 2 0.0114 0.2417 0.7469
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 385 106 279 16 0 7 48 35 0 0 278 1 0 0.1509 0.0000 0.0036 8.833 0.06 4.00 -3.94 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9973 0.0027
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 356 51 305 2 0 4 3 42 0 0 304 0 1 0.0392 0.0000 0.0033 15.667 4.00 3.93 0.07 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9301 0.0699 2 1 0.0000 0.5899 0.4101 2 2 0.0000 0.3982 0.6018
chr14 24001481 T TA 0.049020 0.100 1 1 2 357 127 230 83 0 0 0 44 0 0 230 0 0 0.6535 0.0000 0.0000 127.000 0.60 1.07 -0.47 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9605 0.0394 0.0000 1 0 0.9565 0.0435 0.0000 1 0 0.9503 0.0496 0.0000
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 381 114 267 7 2 21 2 82 0 1 265 0 1 0.0614 0.0000 0.0075 4.429 0.57 3.90 -3.33 7 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.9393 0.0607
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 381 114 267 8 1 68 0 37 0 1 265 0 1 0.0702 0.0000 0.0075 0.676 0.88 5.00 -4.12 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0004 0.9231 0.0765 2 1 0.0001 0.9861 0.0138 2 1 0.0000 0.9868 0.0132
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 621 129 492 60 2 11 0 56 0 0 484 0 8 0.4651 0.0000 0.0163 10.727 1.87 7.57 -5.70 4 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0464 0.6148 0.3387 1 1 0.0483 0.6052 0.3466 1 1 0.0507 0.5930 0.3563
chr14 54702332 C CCAG 0.081686 0.100 1 3 1 465 133 332 70 0 3 0 60 0 0 327 0 5 0.5263 0.0000 0.0151 43.333 0.14 3.30 -3.16 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4312 0.5546 0.0142 1 1 0.4383 0.5466 0.0150 1 1 0.4471 0.5368 0.0161
chr14 58428357 T TC 0.000628 0.100 1 1 1 257 110 147 58 0 1 0 51 0 0 146 0 1 0.5273 0.0000 0.0068 109.000 0.17 1.08 -0.91 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5146 0.4853 0.0001 1 0 0.5191 0.4808 0.0001 1 0 0.5242 0.4756 0.0001
chr14 59505305 TTTC T 0.011152 0.100 1 -3 1 72 28 44 23 0 3 0 2 0 0 44 0 0 0.8214 0.0000 0.0000 8.333 0.78 3.00 -2.22 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7707 0.2293 0.0000 0 0 0.9708 0.0292 0.0000 0 0 0.9868 0.0132 0.0000
chr14 67204765 C CT 0.023603 0.100 1 1 1 429 110 319 101 0 2 1 6 0 0 319 0 0 0.9182 0.0000 0.0000 54.000 0.25 2.50 -2.25 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.8059 0.1941 0.0000 0 0 0.9848 0.0152 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 650 160 490 0 0 27 3 130 0 0 484 0 6 0.0000 0.0000 0.0122 4.889 7.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 411 105 306 0 0 23 3 79 0 0 303 1 2 0.0000 0.0000 0.0098 3.565 5.46 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0198 0.9802 2 2 0.0000 0.0215 0.9785 2 2 0.0000 0.0242 0.9758
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 406 92 314 3 34 7 8 40 0 0 313 1 0 0.0326 0.0000 0.0032 16.200 0.33 4.72 -4.39 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0298 0.3871 0.5832 1 2 0.0332 0.3937 0.5732 1 2 0.0382 0.4025 0.5593
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 490 157 333 0 0 13 1 143 0 0 333 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.077 3.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 209 81 128 14 0 1 0 66 0 0 123 0 5 0.1728 0.0000 0.0391 80.000 0.43 8.76 -8.33 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9976 0.0024
chr14 100884333 C CTCT 0.265959 0.100 1 3 1 595 130 465 111 0 10 1 8 0 0 465 0 0 0.8538 0.0000 0.0000 11.900 0.34 3.25 -2.91 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1052 0.8948 0.0000 0 0 0.7519 0.2481 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 263 80 183 38 0 10 0 32 0 1 179 0 3 0.4750 0.0000 0.0219 7.000 0.32 8.88 -8.56 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3265 0.5595 0.1141 1 1 0.3275 0.5545 0.1180 1 1 0.3285 0.5482 0.1232
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.100 1 -12 2 501 104 397 75 3 21 0 5 1 0 394 0 2 0.7212 0.0025 0.0076 3.857 0.45 12.40 -11.95 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1361 0.8639 0.0000 0 0 0.7312 0.2688 0.0000
chr14 104886547 CGCAGGA C 0.081150 0.100 1 -6 1 456 106 350 98 0 3 0 5 0 0 350 0 0 0.9245 0.0000 0.0000 34.333 0.70 6.00 -5.30 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0243 0.9757 0.0000 0 0 0.8806 0.1194 0.0000 0 0 0.9815 0.0185 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 311 71 240 36 1 6 1 27 1 1 237 0 1 0.5070 0.0042 0.0125 10.833 2.00 4.07 -2.07 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5839 0.3928 0.0233 1 0 0.5800 0.3950 0.0250 1 0 0.5743 0.3984 0.0273
chr15 22866845 TAAGA T 0.262722 0.100 1 -4 5 295 71 224 37 0 5 0 29 0 0 224 0 0 0.5211 0.0000 0.0000 13.200 0.46 4.00 -3.54 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5205 0.4415 0.0380 1 0 0.5178 0.4420 0.0402 1 0 0.5139 0.4429 0.0432
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 194 49 145 0 0 4 0 45 0 3 121 14 7 0.0000 0.0000 0.1655 11.250 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 180 60 120 44 0 1 0 15 0 0 120 0 0 0.7333 0.0000 0.0000 59.000 0.14 2.20 -2.06 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8905 0.1078 0.0017 1 0 0.8710 0.1269 0.0021 1 0 0.6857 0.3121 0.0022
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 202 90 112 0 0 6 52 32 0 0 109 1 2 0.0000 0.0000 0.0268 7.000 2.38 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0326 0.9674 2 2 0.0000 0.0356 0.9644 2 2 0.0000 0.0400 0.9600
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 202 92 110 0 0 38 2 52 0 1 109 0 0 0.0000 0.0000 0.0091 1.459 2.38 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1735 0.8265 2 2 0.0000 0.0960 0.9040 2 2 0.0000 0.0744 0.9256
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 660 166 494 8 0 30 5 123 0 0 493 1 0 0.0482 0.0000 0.0020 4.533 0.88 3.62 -2.74 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7917 0.2083 2 2 0.0000 0.1340 0.8660
chr15 33844878 TAGA T 0.150388 0.100 1 -3 3 284 97 187 88 0 6 0 3 0 0 187 0 0 0.9072 0.0000 0.0000 15.167 0.42 4.00 -3.58 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3893 0.6107 0.0000 0 0 0.9494 0.0506 0.0000 0 0 0.9833 0.0167 0.0000
chr15 34038912 CCCGCCGCCGCCT C 0.202105 0.100 1 -12 4 263 105 158 92 0 9 0 4 0 0 158 0 0 0.8762 0.0000 0.0000 10.667 0.40 15.75 -15.35 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0558 0.9442 0.0000 0 0 0.8467 0.1533 0.0000 0 0 0.9634 0.0366 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 484 159 325 151 1 1 0 6 0 0 325 0 0 0.9497 0.0000 0.0000 157.000 1.21 2.17 -0.95 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0075 0.9925 0.0000 0 0 0.8692 0.1308 0.0000 0 0 0.9854 0.0146 0.0000
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 429 119 310 7 0 6 0 106 0 0 303 0 7 0.0588 0.0000 0.0226 18.833 0.29 4.44 -4.16 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9160 0.0840 2 2 0.0000 0.3989 0.6011
chr15 65133406 G GCGC 0.007439 0.100 1 3 2 437 86 351 38 0 9 0 39 0 0 351 0 0 0.4419 0.0000 0.0000 8.556 0.87 3.82 -2.95 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3799 0.6166 0.0035 1 1 0.3876 0.6089 0.0035 1 1 0.3973 0.5991 0.0036
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 209 119 90 112 0 3 0 4 0 0 90 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 38.667 0.16 3.00 -2.84 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0440 0.9560 0.0000 0 0 0.8080 0.1920 0.0000 0 0 0.9512 0.0488 0.0000
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 278 155 123 150 0 3 0 2 0 0 123 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 50.667 0.34 3.00 -2.66 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9449 0.0551 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 447 119 328 63 1 11 1 43 0 0 323 0 5 0.5294 0.0000 0.0152 9.818 0.46 3.53 -3.07 17 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4911 0.4725 0.0364 1 0 0.4854 0.4743 0.0403 1 0 0.4771 0.4768 0.0461
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 457 101 356 49 1 10 0 41 0 0 351 0 5 0.4851 0.0000 0.0140 9.000 0.10 13.83 -13.73 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4063 0.5493 0.0445 1 1 0.4104 0.5433 0.0462 1 1 0.4154 0.5360 0.0486
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 379 135 244 0 0 2 3 130 0 0 237 0 7 0.0000 0.0000 0.0287 66.500 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0028 0.9972
chr15 88472644 CAGGAG C 0.500000 0.100 1 -5 2 212 57 155 50 0 3 0 4 0 0 154 0 1 0.8772 0.0000 0.0065 18.000 0.06 5.00 -4.94 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0559 0.9441 0.0000 0 1 0.3137 0.6863 0.0000
chr15 89333596 T TTGCTGC 0.028553 0.100 1 6 1 720 190 530 134 0 40 2 14 0 0 530 0 0 0.7053 0.0000 0.0000 3.700 0.38 5.07 -4.69 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0067 0.9933 0.0000 0 0 0.6822 0.3178 0.0000
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 846 198 648 14 9 83 3 89 0 0 639 0 9 0.0707 0.0000 0.0139 2.184 2.36 13.92 -11.56 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9950 0.0050
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 837 188 649 0 2 21 3 162 0 0 648 1 0 0.0000 0.0000 0.0015 8.300 10.83 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 400 133 267 0 0 7 1 125 0 0 256 0 11 0.0000 0.0000 0.0412 18.000 7.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 379 136 243 128 0 1 0 7 0 0 243 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 135.000 0.23 2.00 -1.77 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2444 0.7556 0.0000 0 0 0.8379 0.1621 0.0000
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 585 211 374 22 0 43 1 145 0 0 365 1 8 0.1043 0.0000 0.0241 3.884 0.55 6.24 -5.70 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 296 84 212 8 1 0 0 75 0 0 211 0 1 0.0952 0.0000 0.0047 84.000 1.38 3.01 -1.64 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.9415 0.0585
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 287 103 184 97 1 0 0 5 2 0 182 0 0 0.9417 0.0109 0.0109 103.000 0.73 14.60 -13.87 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0242 0.9758 0.0000 0 0 0.8800 0.1200 0.0000 0 0 0.9814 0.0186 0.0000
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 813 155 658 57 0 2 0 96 0 0 658 0 0 0.3677 0.0000 0.0000 76.500 1.21 1.51 -0.30 21 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0014 0.1739 0.8248 1 2 0.0018 0.1875 0.8107 1 2 0.0026 0.2072 0.7902
chr16 1999881 G GTCC 0.177864 0.100 1 3 2 499 96 403 48 1 10 0 37 0 0 401 0 2 0.5000 0.0000 0.0050 8.600 1.23 4.22 -2.99 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5797 0.4030 0.0173 1 0 0.5776 0.4038 0.0186 1 0 0.5743 0.4053 0.0204
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 315 76 239 0 0 1 2 73 0 0 239 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 75.000 6.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 315 76 239 0 0 1 2 73 0 0 239 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 75.000 6.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 385 132 253 46 3 50 1 32 4 0 247 0 2 0.3485 0.0158 0.0237 1.620 2.28 4.91 -2.62 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7540 0.2413 0.0046 1 0 0.7470 0.2477 0.0053 1 0 0.7372 0.2566 0.0062
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 138 42 96 0 0 0 1 41 0 0 95 0 1 0.0000 0.0000 0.0104 42.000 2.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr16 24572391 TAAAGAG T 0.075097 0.100 1 -6 1 524 104 420 65 0 1 0 38 0 0 420 0 0 0.6250 0.0000 0.0000 103.000 1.09 5.92 -4.83 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8899 0.1097 0.0003 1 0 0.8833 0.1163 0.0004 1 0 0.8738 0.1256 0.0005
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.100 1 -12 1 739 270 469 245 1 10 0 14 0 0 468 0 1 0.9074 0.0000 0.0021 25.900 0.25 8.00 -7.75 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0945 0.9055 0.0000 0 0 0.9768 0.0232 0.0000
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.100 1 3 1 647 163 484 136 0 7 0 20 1 0 482 0 1 0.8344 0.0021 0.0041 22.286 0.30 2.65 -2.35 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 158 88 70 44 0 4 0 40 0 0 70 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 21.000 0.07 1.85 -1.78 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2871 0.5830 0.1299 1 1 0.2885 0.5768 0.1347 1 1 0.2901 0.5689 0.1410
chr16 50153769 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 1 471 163 308 132 1 15 0 15 1 0 307 0 0 0.8098 0.0032 0.0032 11.385 1.46 7.47 -6.00 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0420 0.9580 0.0000
chr16 50729867 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 127 68 59 40 0 1 0 27 0 0 59 0 0 0.5882 0.0000 0.0000 67.000 0.30 1.07 -0.77 6 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5429 0.4158 0.0413 1 0 0.5350 0.4201 0.0449 1 0 0.5240 0.4258 0.0502
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 835 205 630 36 1 36 5 127 0 0 629 0 1 0.1756 0.0000 0.0016 4.694 0.64 3.35 -2.71 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0073 0.9927 2 1 0.0000 0.9403 0.0597 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr16 71922626 CATGCCT C 0.500000 0.100 1 -6 3 322 134 188 122 0 8 0 4 0 0 188 0 0 0.9104 0.0000 0.0000 18.000 2.98 8.75 -5.77 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0628 0.9372 0.0000 0 0 0.8588 0.1412 0.0000 0 0 0.9653 0.0347 0.0000
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 92 54 38 27 0 2 0 25 0 0 37 0 1 0.5000 0.0000 0.0263 26.000 0.04 3.60 -3.56 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2399 0.5634 0.1967 1 1 0.2416 0.5587 0.1997 1 1 0.2438 0.5527 0.2035
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 384 110 274 94 0 8 0 8 0 0 271 0 3 0.8545 0.0000 0.0109 12.750 0.23 11.38 -11.14 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.0759 0.9241 0.0000
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 246 111 135 61 2 2 1 45 1 0 131 0 3 0.5495 0.0074 0.0296 54.500 1.59 4.62 -3.03 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5466 0.4259 0.0275 1 0 0.5411 0.4284 0.0305 1 0 0.5330 0.4320 0.0350
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 450 109 341 43 5 22 6 33 0 0 337 2 2 0.3945 0.0000 0.0117 3.955 0.63 5.15 -4.52 7 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3089 0.5795 0.1116 1 1 0.3100 0.5735 0.1165 1 1 0.3110 0.5659 0.1231
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 450 109 341 48 0 26 0 35 0 0 337 1 3 0.4404 0.0000 0.0117 3.458 0.90 5.94 -5.05 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4329 0.5043 0.0628 1 1 0.4296 0.5032 0.0672 1 1 0.4248 0.5019 0.0733
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 628 137 491 0 0 3 12 122 0 0 482 1 8 0.0000 0.0000 0.0183 44.333 8.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 627 135 492 0 0 8 12 115 0 0 481 5 6 0.0000 0.0000 0.0224 15.750 8.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 629 135 494 0 0 7 1 127 0 1 479 6 8 0.0000 0.0000 0.0304 42.667 8.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 751 148 603 10 0 7 3 128 0 0 602 0 1 0.0676 0.0000 0.0017 20.143 10.10 7.27 2.83 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9829 0.0171 2 1 0.0000 0.5037 0.4963
chr16 88714227 G GGTGT 0.500000 0.100 1 4 1 743 146 597 99 5 8 5 29 0 0 596 0 1 0.6781 0.0000 0.0017 17.125 7.62 6.86 0.75 43 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9958 0.0042 0.0000 1 0 0.9941 0.0059 0.0000 1 0 0.6053 0.3947 0.0000
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 521 125 396 78 0 0 1 46 0 0 396 0 0 0.6240 0.0000 0.0000 125.000 0.76 4.61 -3.85 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8525 0.1457 0.0018 1 0 0.8429 0.1548 0.0023 1 0 0.8289 0.1680 0.0031
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.100 1 6 2 643 170 473 138 0 24 0 8 0 0 472 0 1 0.8118 0.0000 0.0021 6.083 0.41 3.25 -2.84 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0636 0.9364 0.0000 0 0 0.7150 0.2850 0.0000
chr16 88733987 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 762 215 547 178 4 16 7 10 0 0 547 0 0 0.8279 0.0000 0.0000 11.938 0.53 3.60 -3.07 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0629 0.9371 0.0000 0 0 0.8035 0.1965 0.0000
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 144 68 76 3 0 1 0 64 0 0 75 0 1 0.0441 0.0000 0.0132 67.000 1.67 4.20 -2.54 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9663 0.0337 2 2 0.0000 0.4869 0.5131 2 2 0.0000 0.2264 0.7736
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 353 159 194 151 0 2 1 5 0 0 194 0 0 0.9497 0.0000 0.0000 78.500 0.30 1.60 -1.30 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0051 0.9949 0.0000 0 0 0.6669 0.3331 0.0000 0 0 0.9446 0.0554 0.0000
chr17 4933907 ACCACCCCAGAGCCCAC A 0.138018 0.100 1 -16 1 1288 276 1012 228 15 19 5 9 0 0 1012 0 0 0.8261 0.0000 0.0000 18.143 5.45 2.33 3.12 26 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5705 0.4295 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 725 207 518 80 6 50 2 69 0 1 512 0 5 0.3865 0.0000 0.0116 3.120 0.17 3.33 -3.16 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3020 0.6364 0.0616 1 1 0.3036 0.6289 0.0675 1 1 0.3047 0.6194 0.0759
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.100 1 9 2 1358 407 951 34 19 101 7 246 0 0 909 2 40 0.0835 0.0000 0.0442 3.010 7.65 6.51 1.14 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.100 1 -6 2 1361 469 892 336 16 79 1 37 0 0 891 0 1 0.7164 0.0000 0.0011 4.899 5.23 7.43 -2.20 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0057 0.9943 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.100 1 -6 1 1036 306 730 223 2 58 0 23 0 0 727 0 3 0.7288 0.0000 0.0041 4.333 0.84 7.87 -7.03 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0278 0.9722 0.0000
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 601 163 438 149 0 4 0 10 0 0 438 0 0 0.9141 0.0000 0.0000 39.750 0.13 3.00 -2.87 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0390 0.9610 0.0000 0 0 0.6926 0.3074 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 427 101 326 48 1 12 0 40 0 0 326 0 0 0.4752 0.0000 0.0000 7.417 0.33 7.67 -7.34 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4104 0.5206 0.0690 1 1 0.4081 0.5184 0.0735 1 1 0.4045 0.5158 0.0797
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 466 172 294 1 0 33 4 134 0 0 290 0 4 0.0058 0.0000 0.0136 4.212 0.00 3.21 -3.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0066 0.9934 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 922 253 669 117 0 23 9 104 0 0 668 1 0 0.4625 0.0000 0.0015 10.091 0.60 4.31 -3.71 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2139 0.7204 0.0657 1 1 0.2228 0.7056 0.0716 1 1 0.2337 0.6864 0.0798
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 921 247 674 109 20 14 6 98 0 1 673 0 0 0.4413 0.0000 0.0015 21.182 0.53 4.15 -3.62 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6175 0.3764 0.0061 1 0 0.6158 0.3770 0.0072 1 0 0.6121 0.3788 0.0091
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 768 155 613 73 0 5 0 77 0 0 610 0 3 0.4710 0.0000 0.0049 30.000 0.21 4.05 -3.85 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0742 0.6287 0.2971 1 1 0.0794 0.6191 0.3015 1 1 0.0866 0.6070 0.3064
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 293 112 181 82 1 25 0 4 0 0 181 0 0 0.7321 0.0000 0.0000 3.480 0.26 5.25 -4.99 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0095 0.9905 0.0000 0 1 0.4720 0.5280 0.0000 0 0 0.8117 0.1883 0.0000
chr17 29761226 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 117 59 58 33 0 1 0 25 0 0 58 0 0 0.5593 0.0000 0.0000 58.000 0.12 1.48 -1.36 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4126 0.5012 0.0862 1 1 0.4086 0.5007 0.0907 1 1 0.4030 0.5002 0.0968
chr17 35479822 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 870 192 678 177 1 3 0 11 0 0 678 0 0 0.9219 0.0000 0.0000 63.000 0.58 1.64 -1.05 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0565 0.9435 0.0000 0 0 0.8290 0.1710 0.0000
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 116 82 34 76 0 0 0 6 0 0 34 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 82.000 0.20 1.17 -0.97 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0699 0.9301 0.0000 0 1 0.4597 0.5403 0.0000
chr17 40818962 T TGCCGCCGTGGCCGCCGCTGGAGCTTCC 0.500000 0.100 1 27 1 851 162 689 67 2 42 3 48 1 0 684 0 4 0.4136 0.0015 0.0073 2.857 2.58 8.98 -6.40 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5363 0.4374 0.0262 1 0 0.5318 0.4390 0.0293 1 0 0.5249 0.4414 0.0337
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 851 235 616 170 5 50 0 10 4 3 605 2 2 0.7234 0.0065 0.0179 3.833 3.02 10.40 -7.38 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0179 0.9821 0.0000 0 0 0.7022 0.2978 0.0000
chr17 41041248 GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCACAGCAGCGTGGCTGGCAGGAGCTGGTCTCACAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGAGCCGCAGGTCCCACTGGTGGAGCAGCTGGGAAATCCACAGAAGCTGGTCTGA G 0.500000 0.100 1 -138 2 939 408 531 386 1 13 0 8 0 0 531 0 0 0.9461 0.0000 0.0000 30.308 0.70 1.00 -0.30 144 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8743 0.1257 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 414 112 302 0 1 4 1 106 0 0 301 1 0 0.0000 0.0000 0.0033 27.000 1.52 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0070 0.9930
chr17 41105856 CTCCAGCTGCTGCCGCCCCTCTTGCTGTGAA C 0.500000 0.100 1 -30 1 713 244 469 204 1 32 0 7 0 0 468 0 1 0.8361 0.0000 0.0021 6.625 0.95 18.14 -17.20 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.8482 0.1518 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 546 112 434 0 0 15 3 94 0 0 411 0 23 0.0000 0.0000 0.0530 6.400 8.41 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr17 41238458 AGACCACCTGCTGCAG A 0.500000 0.100 1 -15 1 482 124 358 82 0 10 3 29 0 0 352 0 6 0.6613 0.0000 0.0168 11.400 4.21 13.55 -9.34 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9559 0.0439 0.0002 1 0 0.9504 0.0494 0.0002 1 0 0.9419 0.0578 0.0003
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1600 314 1286 283 2 7 0 22 0 0 1286 0 0 0.9013 0.0000 0.0000 43.571 0.33 3.23 -2.90 93 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4243 0.5757 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 622 182 440 81 2 28 5 66 1 0 437 0 2 0.4451 0.0023 0.0068 5.464 0.70 3.39 -2.69 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3979 0.5596 0.0425 1 1 0.3996 0.5538 0.0466 1 1 0.4009 0.5468 0.0523
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 214 65 149 33 0 2 0 30 0 0 149 0 0 0.5077 0.0000 0.0000 31.500 0.18 4.60 -4.42 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2797 0.5660 0.1543 1 1 0.2806 0.5610 0.1584 1 1 0.2815 0.5548 0.1638
chr17 47836758 AAGGAGCTGGAGC A 0.500000 0.100 1 -12 1 688 143 545 131 1 4 0 7 0 0 545 0 0 0.9161 0.0000 0.0000 34.750 0.36 10.29 -9.93 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2973 0.7027 0.0000 0 0 0.8713 0.1287 0.0000
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 467 112 355 54 0 18 0 40 0 0 351 0 4 0.4821 0.0000 0.0113 5.222 0.19 7.55 -7.36 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4277 0.5134 0.0589 1 1 0.4253 0.5114 0.0632 1 1 0.4215 0.5092 0.0693
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 919 229 690 99 0 8 0 122 0 0 684 0 6 0.4323 0.0000 0.0087 27.625 0.28 3.06 -2.77 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0024 0.2552 0.7425 1 2 0.0029 0.2601 0.7369 1 2 0.0039 0.2677 0.7284
chr17 57979243 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 431 204 227 97 7 46 0 54 0 0 227 0 0 0.4755 0.0000 0.0000 3.391 0.65 3.35 -2.70 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9688 0.0311 0.0001 1 0 0.9646 0.0353 0.0001 1 0 0.9580 0.0418 0.0001
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 425 156 269 1 0 40 0 115 0 0 268 0 1 0.0064 0.0000 0.0037 2.900 0.00 5.26 -5.26 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0244 0.9756 2 2 0.0000 0.0088 0.9912 2 2 0.0000 0.0068 0.9932
chr17 64001113 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 2 330 96 234 83 0 5 0 8 0 0 233 0 1 0.8646 0.0000 0.0043 18.200 0.19 3.12 -2.93 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 1 0.1482 0.8518 0.0000
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 390 143 247 59 0 13 0 71 0 1 246 0 0 0.4126 0.0000 0.0040 10.000 0.49 6.89 -6.40 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0472 0.5344 0.4183 1 1 0.0513 0.5306 0.4180 1 1 0.0572 0.5260 0.4168
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 364 111 253 100 0 6 0 5 0 0 251 0 2 0.9009 0.0000 0.0079 17.500 0.77 8.00 -7.23 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0789 0.9211 0.0000 0 0 0.5891 0.4109 0.0000
chr17 74367718 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 273 104 169 97 0 0 0 7 0 0 169 0 0 0.9327 0.0000 0.0000 104.000 0.13 1.43 -1.29 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0693 0.9307 0.0000 0 0 0.5542 0.4458 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 629 126 503 0 0 7 1 118 0 0 490 0 13 0.0000 0.0000 0.0258 17.000 7.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr17 74893497 C CGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTA 0.500000 0.100 1 36 2 464 136 328 4 1 86 4 41 0 1 309 3 15 0.0294 0.0000 0.0579 0.570 0.50 3.44 -2.94 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9118 0.0882 2 1 0.0000 0.5728 0.4272
chr17 75516562 T TGGAGCC 0.500000 0.100 1 6 1 499 137 362 125 2 5 0 5 0 0 362 0 0 0.9124 0.0000 0.0000 26.000 1.12 8.00 -6.88 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0094 0.9906 0.0000 0 0 0.7324 0.2676 0.0000 0 0 0.9499 0.0501 0.0000
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 765 185 580 159 0 9 0 17 0 0 579 0 1 0.8595 0.0000 0.0017 19.556 0.59 2.76 -2.17 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0204 0.9796 0.0000
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 911 255 656 224 3 20 0 8 0 0 655 0 1 0.8784 0.0000 0.0015 11.750 0.61 15.50 -14.89 78 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.8527 0.1473 0.0000 0 0 0.9947 0.0053 0.0000
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.100 1 -27 1 947 203 744 187 1 4 1 10 0 1 735 0 8 0.9212 0.0000 0.0121 49.500 1.68 22.60 -20.92 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0629 0.9371 0.0000
chr17 75589372 GACGAGGGTCGGGGCCGCGGGAAAGCGGACGAAGGGCGGGGCCACGAGCGAGGGT G 0.500000 0.100 1 -54 4 1037 244 793 134 7 16 1 86 1 0 790 2 0 0.5492 0.0013 0.0038 14.188 3.16 3.27 -0.11 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9706 0.0294 0.0000 1 0 0.9670 0.0330 0.0000 1 0 0.9613 0.0386 0.0001
chr17 75616380 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 824 208 616 71 3 56 4 74 0 0 614 0 2 0.3413 0.0000 0.0032 2.679 0.72 3.66 -2.94 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0829 0.6411 0.2760 1 1 0.0884 0.6308 0.2808 1 1 0.0958 0.6177 0.2865
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2197 513 1684 61 11 95 16 330 1 1 1660 4 18 0.1189 0.0006 0.0143 4.309 2.26 6.40 -4.14 27 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2175 530 1645 61 4 34 2 429 2 1 1492 13 137 0.1151 0.0012 0.0930 15.000 1.77 4.38 -2.61 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -6 7 263 122 141 13 0 16 0 93 0 0 138 0 3 0.1066 0.0000 0.0213 6.625 0.15 5.80 -5.64 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9755 0.0245
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 982 171 811 152 2 11 0 6 0 0 811 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 14.364 0.49 5.83 -5.35 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 0 0.7844 0.2156 0.0000 0 0 0.9737 0.0263 0.0000
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 571 163 408 83 0 5 0 75 0 0 403 0 5 0.5092 0.0000 0.0123 31.600 0.24 3.24 -3.00 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2077 0.6799 0.1124 1 1 0.2140 0.6673 0.1187 1 1 0.2219 0.6512 0.1269
chr17 81647906 T TTAAC 0.500000 0.100 1 4 3 456 127 329 72 0 1 0 54 0 0 322 0 7 0.5669 0.0000 0.0213 126.000 0.32 4.09 -3.77 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4161 0.5369 0.0470 1 1 0.4159 0.5329 0.0511 1 1 0.4149 0.5281 0.0570
chr18 48226 ATG A 0.000609 0.100 1 -2 2 960 266 694 230 1 2 0 33 0 0 693 0 1 0.8647 0.0000 0.0014 132.000 0.43 2.85 -2.42 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0389 0.9611 0.0000
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 303 74 229 43 0 2 1 28 0 0 229 0 0 0.5811 0.0000 0.0000 35.500 0.16 1.61 -1.44 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6218 0.3544 0.0238 1 0 0.6140 0.3598 0.0262 1 0 0.6031 0.3672 0.0297
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.100 1 6 4 449 92 357 41 0 7 0 44 0 0 357 0 0 0.4457 0.0000 0.0000 12.143 0.24 5.25 -5.01 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2702 0.6462 0.0837 1 1 0.2783 0.6375 0.0842 1 1 0.2888 0.6264 0.0848
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 154 69 85 0 0 4 0 65 0 0 85 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 16.250 3.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 24014931 A AGCG 0.001821 0.100 1 3 1 274 133 141 74 3 10 1 45 0 0 139 0 2 0.5564 0.0000 0.0142 12.200 0.59 3.49 -2.89 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9078 0.0922 0.0000 1 0 0.9021 0.0979 0.0000 1 0 0.8939 0.1061 0.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 224 97 127 49 1 0 0 47 0 0 127 0 0 0.5052 0.0000 0.0000 97.000 0.41 4.55 -4.15 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2319 0.6130 0.1551 1 1 0.2345 0.6049 0.1605 1 1 0.2377 0.5947 0.1676
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 144 69 75 58 0 2 0 9 0 0 75 0 0 0.8406 0.0000 0.0000 33.500 0.12 3.00 -2.88 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.0492 0.9508 0.0000
chr18 46560316 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 517 156 361 137 0 9 0 10 0 0 361 0 0 0.8782 0.0000 0.0000 16.333 0.31 3.20 -2.89 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0218 0.9782 0.0000 0 0 0.5572 0.4428 0.0000
chr18 47098221 C CAA 0.500000 0.100 1 2 1 158 46 112 22 3 12 2 7 0 0 112 0 0 0.4783 0.0000 0.0000 2.833 0.18 2.86 -2.68 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6514 0.3208 0.0277 1 0 0.6257 0.3442 0.0301 1 0 0.5414 0.4281 0.0305
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 175 87 88 82 0 1 0 4 0 0 88 0 0 0.9425 0.0000 0.0000 86.000 0.34 3.50 -3.16 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0089 0.9911 0.0000 0 1 0.4593 0.5407 0.0000 0 0 0.8041 0.1959 0.0000
chr18 54224214 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 292 82 210 70 2 3 1 6 0 0 210 0 0 0.8537 0.0000 0.0000 26.333 1.11 3.00 -1.89 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0214 0.9786 0.0000 0 1 0.2714 0.7286 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 270 144 126 68 0 4 1 71 0 0 126 0 0 0.4722 0.0000 0.0000 34.750 0.16 2.94 -2.78 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1123 0.6492 0.2385 1 1 0.1181 0.6385 0.2434 1 1 0.1257 0.6249 0.2495
chr18 58536020 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 5 634 178 456 91 1 1 0 85 0 0 456 0 0 0.5112 0.0000 0.0000 177.000 0.30 3.19 -2.89 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2754 0.6558 0.0688 1 1 0.2814 0.6445 0.0742 1 1 0.2884 0.6300 0.0816
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 738 175 563 78 0 4 0 93 0 0 559 0 4 0.4457 0.0000 0.0071 42.750 0.15 14.10 -13.94 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0133 0.4122 0.5745 1 2 0.0153 0.4133 0.5714 1 2 0.0184 0.4154 0.5663
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 365 79 286 38 3 6 3 29 1 0 284 1 0 0.4810 0.0035 0.0070 18.000 2.42 5.24 -2.82 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4146 0.5099 0.0755 1 1 0.4114 0.5086 0.0800 1 1 0.4066 0.5071 0.0862
chr18 68691277 TAA T 0.500000 0.100 1 -2 2 95 50 45 33 0 0 0 17 0 0 45 0 0 0.6600 0.0000 0.0000 50.000 0.33 2.35 -2.02 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6389 0.3343 0.0268 1 0 0.6275 0.3427 0.0297 1 0 0.6119 0.3540 0.0341
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 200 77 123 0 0 3 0 74 0 0 121 1 1 0.0000 0.0000 0.0163 24.667 3.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0204 0.9796 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 141 72 69 32 0 1 1 38 0 0 68 0 1 0.4444 0.0000 0.0145 71.000 0.09 3.13 -3.04 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0825 0.5172 0.4003 1 1 0.0871 0.5155 0.3974 1 1 0.0934 0.5134 0.3932
chr18 76496529 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 310 80 230 67 0 6 0 7 3 3 223 0 1 0.8375 0.0130 0.0304 12.333 0.43 1.00 -0.57 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0083 0.9917 0.0000 0 1 0.1753 0.8247 0.0000
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 4 383 134 249 116 2 10 0 6 0 0 248 0 1 0.8657 0.0000 0.0040 12.400 0.36 3.50 -3.14 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1738 0.8262 0.0000 0 0 0.7744 0.2256 0.0000
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 341 147 194 90 4 15 4 34 0 0 193 0 1 0.6122 0.0000 0.0052 8.667 1.41 6.76 -5.35 28 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9900 0.0100 0.0000 1 0 0.9882 0.0118 0.0000 1 0 0.9853 0.0146 0.0000
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.100 1 4 1 588 104 484 62 1 1 0 40 0 0 478 0 6 0.5962 0.0000 0.0124 103.000 0.48 4.95 -4.47 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6863 0.3043 0.0094 1 0 0.6802 0.3091 0.0106 1 0 0.6716 0.3160 0.0125
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.100 1 -27 1 380 87 293 58 0 3 0 26 0 0 291 0 2 0.6667 0.0000 0.0068 28.000 2.28 14.69 -12.42 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9089 0.0905 0.0007 1 0 0.9017 0.0975 0.0008 1 0 0.8912 0.1077 0.0011
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 166 75 91 45 0 6 1 23 0 0 90 0 1 0.6000 0.0000 0.0110 11.500 0.96 4.70 -3.74 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7946 0.2009 0.0046 1 0 0.7857 0.2090 0.0053 1 0 0.7734 0.2202 0.0063
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 324 121 203 6 1 24 4 86 0 0 200 0 3 0.0496 0.0000 0.0148 4.042 1.33 4.73 -3.40 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9260 0.0740 2 2 0.0000 0.4825 0.5175
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 805 173 632 78 5 29 1 60 0 0 631 0 1 0.4509 0.0000 0.0016 4.966 0.19 3.15 -2.96 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7712 0.2268 0.0020 1 0 0.7662 0.2315 0.0023 1 0 0.7588 0.2383 0.0028
chr19 11447525 AGAGGAG A 0.089394 0.100 1 -6 1 779 272 507 126 0 47 0 99 0 0 498 0 9 0.4632 0.0000 0.0178 4.787 0.64 6.32 -5.68 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6396 0.3587 0.0016 1 0 0.6432 0.3548 0.0019 1 0 0.6468 0.3509 0.0023
chr19 11487787 TCGCTGC T 0.001323 0.100 1 -6 1 394 91 303 77 0 11 0 3 0 0 303 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 7.273 0.35 4.00 -3.65 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9798 0.0202 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 397 121 276 0 0 28 4 89 0 0 270 0 6 0.0000 0.0000 0.0217 3.321 15.24 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0143 0.9857 2 2 0.0000 0.0158 0.9842 2 2 0.0000 0.0182 0.9818
chr19 13207858 CCTGCTGCTGCTGCTGCTG C 0.085228 0.100 1 -18 1 397 124 273 14 0 18 0 92 0 0 265 0 8 0.1129 0.0000 0.0293 6.235 4.64 14.15 -9.51 12 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 599 118 481 0 0 5 0 113 0 0 477 0 4 0.0000 0.0000 0.0083 22.600 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 17281821 G GC 0.042830 0.100 1 1 4 416 123 293 61 2 8 1 51 0 0 292 0 1 0.4959 0.0000 0.0034 14.250 0.64 1.61 -0.97 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5836 0.4125 0.0039 1 0 0.5848 0.4110 0.0042 1 0 0.5858 0.4096 0.0046
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.100 1 -4 1 409 84 325 0 1 5 12 66 0 0 325 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 15.400 3.94 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1198 0.8802 2 2 0.0000 0.1227 0.8773 2 2 0.0000 0.1290 0.8710
chr19 17286690 GTT G 0.132491 0.100 1 -2 1 409 82 327 0 0 3 11 68 0 0 327 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 25.333 3.74 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1067 0.8933 2 2 0.0000 0.1147 0.8853 2 2 0.0000 0.1265 0.8735
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 133 39 94 0 0 1 1 37 0 0 88 1 5 0.0000 0.0000 0.0638 38.000 2.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0358 0.9642 2 2 0.0000 0.0375 0.9625 2 2 0.0000 0.0399 0.9601
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 359 115 244 72 0 6 0 37 0 0 243 0 1 0.6261 0.0000 0.0041 18.167 0.08 2.97 -2.89 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9385 0.0614 0.0001 1 0 0.9331 0.0667 0.0001 1 0 0.9252 0.0746 0.0002
chr19 21383385 TAATTCATGCTGGAGAGAAACACTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAAGATTTTAAACAGTCCTCACACCTTACTAAACATAAGAC T 0.206936 0.100 1 -84 2 400 76 324 26 0 9 2 39 1 0 320 0 3 0.3421 0.0031 0.0123 7.444 0.15 2.87 -2.72 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0549 0.5287 0.4163 1 1 0.0608 0.5344 0.4048 1 1 0.0694 0.5415 0.3891
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 335 89 246 0 0 12 5 72 0 0 243 2 1 0.0000 0.0000 0.0122 6.333 3.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 509 122 387 0 0 7 1 114 0 0 382 0 5 0.0000 0.0000 0.0129 16.286 3.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 579 232 347 91 0 47 0 94 0 0 347 0 0 0.3922 0.0000 0.0000 4.022 0.53 6.97 -6.44 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2198 0.7528 0.0274 1 1 0.2332 0.7383 0.0285 1 1 0.2508 0.7193 0.0299
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.100 1 -3 1 586 227 359 191 3 8 3 22 0 0 358 0 1 0.8414 0.0000 0.0028 27.250 3.12 3.14 -0.02 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0123 0.9877 0.0000
chr19 37894973 TGGA T 0.043831 0.100 1 -3 1 713 155 558 140 1 5 0 9 0 0 558 0 0 0.9032 0.0000 0.0000 30.000 0.14 4.11 -3.97 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6321 0.3679 0.0000 0 0 0.9844 0.0156 0.0000
chr19 38304940 CAAG C 0.034026 0.100 1 -3 3 338 98 240 86 1 7 0 4 0 0 240 0 0 0.8776 0.0000 0.0000 13.000 0.60 4.50 -3.90 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2480 0.7520 0.0000 0 0 0.9687 0.0313 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 597 169 428 144 0 22 1 2 0 0 426 0 2 0.8521 0.0000 0.0047 7.000 0.44 13.50 -13.06 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3160 0.6840 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 387 119 268 12 0 6 2 99 0 1 257 2 8 0.1008 0.0000 0.0410 22.400 0.17 3.53 -3.36 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9770 0.0230
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 227 29 198 0 0 4 19 6 0 0 198 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.000 4.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0731 0.9269 2 2 0.0000 0.0750 0.9250 2 2 0.0000 0.0775 0.9225
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 227 29 198 0 0 21 7 1 0 0 198 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.500 3.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1148 0.8852 2 2 0.0000 0.1166 0.8834 2 2 0.0000 0.1191 0.8809
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 449 118 331 17 0 4 1 96 0 0 331 0 0 0.1441 0.0000 0.0000 28.500 0.41 5.98 -5.57 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9976 0.0024
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.100 1 -1 1 442 94 348 57 0 0 0 37 0 0 347 0 1 0.6064 0.0000 0.0029 94.000 0.12 3.46 -3.34 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7942 0.2046 0.0012 1 0 0.7879 0.2108 0.0013 1 0 0.7790 0.2194 0.0016
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 360 120 240 77 0 1 0 42 0 0 239 0 1 0.6417 0.0000 0.0042 119.000 0.22 6.79 -6.56 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9034 0.0958 0.0008 1 0 0.8955 0.1035 0.0010 1 0 0.8840 0.1147 0.0014
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 547 157 390 82 0 2 0 73 0 0 386 0 4 0.5223 0.0000 0.0103 77.500 0.18 3.14 -2.95 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1938 0.6873 0.1189 1 1 0.1981 0.6754 0.1265 1 1 0.2031 0.6602 0.1367
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 434 134 300 84 0 9 0 41 0 0 298 1 1 0.6269 0.0000 0.0067 15.625 0.31 3.05 -2.74 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9638 0.0362 0.0000 1 0 0.9597 0.0402 0.0001 1 0 0.9536 0.0463 0.0001
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 665 273 392 203 0 55 0 15 0 0 390 0 2 0.7436 0.0000 0.0051 3.964 0.18 6.40 -6.22 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2759 0.7241 0.0000
chr19 46493759 C CCGGCCT 0.138319 0.100 1 6 4 322 68 254 33 0 7 0 28 0 0 254 0 0 0.4853 0.0000 0.0000 8.714 2.15 7.14 -4.99 15 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4967 0.4737 0.0296 1 0 0.4970 0.4722 0.0308 1 0 0.4970 0.4707 0.0324
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 237 110 127 100 1 5 0 4 0 0 127 0 0 0.9091 0.0000 0.0000 21.000 0.11 1.50 -1.39 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1116 0.8884 0.0000 0 0 0.9125 0.0875 0.0000 0 0 0.9797 0.0203 0.0000
chr19 48944491 GGA G 0.076452 0.100 1 -2 3 327 97 230 89 1 1 0 6 0 0 230 0 0 0.9175 0.0000 0.0000 96.000 0.18 2.00 -1.82 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.6454 0.3546 0.0000 0 0 0.9529 0.0471 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 929 254 675 97 1 46 10 100 0 1 668 2 4 0.3819 0.0000 0.0104 4.500 0.79 3.73 -2.94 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0232 0.5717 0.4051 1 1 0.0265 0.5663 0.4072 1 1 0.0316 0.5600 0.4085
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.100 1 3 1 944 220 724 164 3 40 2 11 0 0 722 1 1 0.7455 0.0000 0.0028 4.500 0.52 2.91 -2.38 78 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 1 0.4991 0.5009 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 546 173 373 74 0 36 0 63 0 0 368 0 5 0.4277 0.0000 0.0134 3.806 1.62 7.24 -5.62 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3433 0.5971 0.0597 1 1 0.3484 0.5882 0.0634 1 1 0.3544 0.5771 0.0685
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 658 162 496 1 0 8 8 145 0 0 489 1 6 0.0062 0.0000 0.0141 19.125 0.00 3.12 -3.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 658 164 494 4 0 11 142 7 0 0 493 0 1 0.0244 0.0000 0.0020 13.818 0.50 3.29 -2.79 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8952 0.1048 2 2 0.0000 0.0931 0.9069 2 2 0.0000 0.0230 0.9770
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 557 158 399 67 0 8 9 74 0 0 396 0 3 0.4241 0.0000 0.0075 18.750 0.13 3.03 -2.89 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0087 0.3360 0.6553 1 2 0.0100 0.3387 0.6512 1 2 0.0120 0.3431 0.6449
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 157 77 80 34 0 1 0 42 0 0 79 0 1 0.4416 0.0000 0.0125 76.000 0.15 2.29 -2.14 24 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0342 0.4375 0.5283 1 2 0.0364 0.4379 0.5257 1 2 0.0396 0.4387 0.5217
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 456 137 319 60 0 6 0 71 0 0 319 0 0 0.4380 0.0000 0.0000 21.833 0.27 1.93 -1.66 28 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0639 0.5855 0.3506 1 1 0.0694 0.5806 0.3499 1 1 0.0772 0.5746 0.3482
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 537 136 401 63 0 8 0 65 0 0 398 0 3 0.4632 0.0000 0.0075 16.000 0.11 3.42 -3.30 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1281 0.6532 0.2187 1 1 0.1350 0.6432 0.2218 1 1 0.1443 0.6304 0.2253
chr19 52613680 GCCACACTCATTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGGATTCTCTGATGTTGTGCAAGGTGTGAAATATGATGGAAGACCTTT G 0.063910 0.100 1 -84 2 514 179 335 154 2 8 1 14 1 0 334 0 0 0.8603 0.0030 0.0030 21.250 0.81 1.86 -1.05 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 0 0.6845 0.3155 0.0000
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 717 201 516 0 0 1 0 200 0 0 509 0 7 0.0000 0.0000 0.0136 200.000 3.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 608 148 460 0 0 9 2 137 0 0 458 0 2 0.0000 0.0000 0.0043 15.444 2.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr19 54361158 A AG 0.500000 0.100 1 1 4 297 112 185 103 0 2 0 7 0 0 185 0 0 0.9196 0.0000 0.0000 55.000 1.15 1.57 -0.43 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0929 0.9071 0.0000 0 0 0.6261 0.3739 0.0000
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 718 140 578 68 0 2 0 70 0 0 576 0 2 0.4857 0.0000 0.0035 69.000 0.32 3.80 -3.48 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1241 0.6572 0.2187 1 1 0.1304 0.6463 0.2233 1 1 0.1387 0.6323 0.2289
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 467 139 328 55 0 31 1 52 0 0 321 0 7 0.3957 0.0000 0.0213 3.484 0.31 7.27 -6.96 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1054 0.6094 0.2852 1 1 0.1106 0.6013 0.2880 1 1 0.1177 0.5911 0.2912
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 606 133 473 8 2 14 0 109 0 0 442 0 31 0.0602 0.0000 0.0655 8.500 2.00 20.35 -18.35 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8405 0.1595 2 2 0.0000 0.0915 0.9085
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 917 225 692 187 1 30 2 5 0 0 690 1 1 0.8311 0.0000 0.0029 6.500 0.93 3.80 -2.87 127 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.8431 0.1569 0.0000 0 0 0.9905 0.0095 0.0000
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 543 107 436 97 0 5 0 5 0 0 436 0 0 0.9065 0.0000 0.0000 20.400 1.13 5.40 -4.27 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.3477 0.6523 0.0000 0 0 0.7937 0.2063 0.0000
chr19 56159903 ACCCCGGCAG A 0.044059 0.100 1 -9 1 456 121 335 64 0 12 0 45 0 0 332 0 3 0.5289 0.0000 0.0090 9.083 1.41 9.31 -7.90 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7284 0.2702 0.0014 1 0 0.7244 0.2741 0.0016 1 0 0.7185 0.2797 0.0018
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 117 65 52 60 0 3 1 1 0 0 52 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 20.333 0.05 3.00 -2.95 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7855 0.2145 0.0000 0 0 0.9196 0.0804 0.0000 0 0 0.9438 0.0562 0.0000
chr19 57639970 TG T 0.349431 0.100 1 -1 1 167 78 89 6 0 0 0 72 0 0 89 0 0 0.0769 0.0000 0.0000 78.000 0.00 1.08 -1.08 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9680 0.0320 2 1 0.0000 0.7266 0.2734
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.100 1 -48 1 146 85 61 46 0 16 0 23 0 0 53 0 8 0.5412 0.0000 0.1311 4.929 1.22 6.35 -5.13 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7155 0.2768 0.0078 1 0 0.7086 0.2827 0.0087 1 0 0.6990 0.2910 0.0100
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 355 113 242 62 0 4 0 47 0 0 242 0 0 0.5487 0.0000 0.0000 27.250 0.21 3.79 -3.58 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6828 0.3109 0.0063 1 0 0.6787 0.3143 0.0070 1 0 0.6726 0.3193 0.0081
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 357 154 203 93 0 1 0 60 0 0 203 0 0 0.6039 0.0000 0.0000 153.000 0.43 2.05 -1.62 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8446 0.1539 0.0015 1 0 0.8350 0.1631 0.0020 1 0 0.8210 0.1763 0.0027
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 102 60 42 0 0 2 0 58 0 0 42 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 29.000 6.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0326 0.9674 2 2 0.0000 0.0345 0.9655 2 2 0.0000 0.0374 0.9626
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 457 153 304 108 0 1 0 44 0 0 301 0 3 0.7059 0.0000 0.0099 152.000 0.21 9.07 -8.86 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9919 0.0081 0.0000 1 0 0.9904 0.0096 0.0000 1 0 0.9878 0.0122 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 458 153 305 108 0 1 1 43 0 0 302 0 3 0.7059 0.0000 0.0098 152.000 0.21 9.05 -8.83 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9919 0.0081 0.0000 1 0 0.9904 0.0096 0.0000 1 0 0.9879 0.0121 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 457 157 300 109 0 1 0 47 0 0 297 0 3 0.6943 0.0000 0.0100 156.000 0.06 8.04 -7.98 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9903 0.0097 0.0000 1 0 0.9885 0.0115 0.0000 1 0 0.9857 0.0143 0.0000
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 283 133 150 73 0 16 0 44 0 0 148 0 2 0.5489 0.0000 0.0133 7.312 0.27 5.77 -5.50 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8749 0.1245 0.0006 1 0 0.8682 0.1311 0.0008 1 0 0.8585 0.1405 0.0010
chr20 3668985 ATCTGGACT A 0.038221 0.100 1 -8 1 262 90 172 87 0 0 0 3 0 0 172 0 0 0.9667 0.0000 0.0000 90.000 0.49 8.67 -8.17 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7294 0.2706 0.0000 0 0 0.9876 0.0124 0.0000 0 0 0.9960 0.0040 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 268 111 157 41 0 2 0 68 0 0 155 0 2 0.3694 0.0000 0.0127 54.500 0.05 1.26 -1.22 19 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0017 0.1359 0.8624 1 2 0.0021 0.1443 0.8536 1 2 0.0028 0.1562 0.8410
chr20 23365283 AGAG A 0.000954 0.100 1 -3 2 569 96 473 46 0 11 1 38 0 0 472 0 1 0.4792 0.0000 0.0021 7.727 0.37 3.61 -3.24 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5429 0.4570 0.0002 1 0 0.5451 0.4548 0.0002 1 0 0.5475 0.4523 0.0002
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 679 185 494 102 0 3 0 80 1 0 487 0 6 0.5514 0.0020 0.0142 60.667 0.39 6.05 -5.66 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5322 0.4529 0.0149 1 0 0.5323 0.4507 0.0170 1 0 0.5312 0.4487 0.0202
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 517 177 340 92 2 0 1 82 0 1 333 0 6 0.5198 0.0000 0.0206 176.000 0.66 3.00 -2.34 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1760 0.7153 0.1087 1 1 0.1810 0.7023 0.1168 1 1 0.1869 0.6854 0.1277
chr20 34988160 CAT C 0.001571 0.100 1 -2 1 575 165 410 148 0 3 1 13 0 0 410 0 0 0.8970 0.0000 0.0000 53.667 0.22 2.54 -2.32 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4728 0.5272 0.0000 0 0 0.9945 0.0055 0.0000
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.100 1 -9 4 226 77 149 26 2 19 1 29 0 0 145 1 3 0.3377 0.0000 0.0268 3.053 1.77 9.45 -7.68 20 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0863 0.5118 0.4018 1 1 0.0900 0.5098 0.4002 1 1 0.0950 0.5073 0.3977
chr20 44065918 C CCCG 0.103979 0.100 1 3 4 474 192 282 171 0 14 0 7 0 0 282 0 0 0.8906 0.0000 0.0000 12.714 0.14 2.71 -2.57 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0091 0.9909 0.0000 0 0 0.9624 0.0376 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 952 307 645 12 1 43 5 246 0 0 642 0 3 0.0391 0.0000 0.0047 6.116 0.00 3.14 -3.14 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.4816 0.5184 2 2 0.0000 0.0079 0.9921
chr20 47651070 TGCAGCAGCA T 0.105143 0.100 1 -9 1 555 278 277 166 81 18 4 9 0 0 275 0 2 0.5971 0.0000 0.0072 17.267 0.92 7.78 -6.86 78 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3970 0.6030 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr20 47651113 GCAGCAGCAA G 0.002262 0.100 1 -9 1 556 271 285 110 24 12 3 122 0 0 285 0 0 0.4059 0.0000 0.0000 23.273 0.28 7.39 -7.10 34 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4253 0.5746 0.0001 1 1 0.4396 0.5603 0.0002 1 1 0.4571 0.5427 0.0002
chr20 47651119 GCAA G 0.005778 0.100 1 -3 1 554 262 292 114 2 5 35 106 0 0 292 0 0 0.4351 0.0000 0.0000 80.667 0.67 7.25 -6.58 34 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0422 0.9470 0.0109 1 1 0.0493 0.9397 0.0110 1 1 0.0602 0.9287 0.0111
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 237 29 208 0 0 6 0 23 0 0 205 1 2 0.0000 0.0000 0.0144 3.833 8.57 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr20 62367030 GCCGCGCGCC G 0.002179 0.100 1 -9 1 206 74 132 69 0 0 0 5 0 0 132 0 0 0.9324 0.0000 0.0000 74.000 0.93 9.00 -8.07 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1869 0.8131 0.0000 0 0 0.9859 0.0141 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr20 62882074 CGCTGCTGTTGTG C 0.003967 0.100 1 -12 2 961 239 722 226 0 6 0 7 0 0 722 0 0 0.9456 0.0000 0.0000 38.833 0.25 12.29 -12.04 44 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8156 0.1844 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 62960578 AT A 0.000110 0.100 1 -1 1 180 95 85 52 0 1 0 42 0 0 85 0 0 0.5474 0.0000 0.0000 94.000 0.35 1.10 -0.75 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6295 0.3705 0.0000 1 0 0.6287 0.3713 0.0000 1 0 0.6272 0.3728 0.0000
chr20 64208063 GGAGGAA G 0.000230 0.100 1 -6 1 802 148 654 124 3 15 1 5 0 1 652 1 0 0.8378 0.0000 0.0031 8.800 0.65 5.00 -4.35 72 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8189 0.1811 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 350 157 193 5 0 1 0 151 0 0 193 0 0 0.0318 0.0000 0.0000 156.000 0.00 2.10 -2.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9227 0.0773 2 2 0.0000 0.0416 0.9584 2 2 0.0000 0.0065 0.9935
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 754 206 548 196 2 3 0 5 0 0 547 0 1 0.9515 0.0000 0.0018 67.667 0.16 7.00 -6.84 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0361 0.9639 0.0000 0 0 0.9696 0.0304 0.0000 0 0 0.9967 0.0033 0.0000
chr21 33070402 CTCCTCCACT C 0.002225 0.100 1 -9 2 427 140 287 65 1 10 0 64 0 0 287 0 0 0.4643 0.0000 0.0000 13.000 0.51 8.00 -7.49 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3911 0.6083 0.0006 1 1 0.4008 0.5986 0.0006 1 1 0.4130 0.5863 0.0006
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 330 42 288 0 0 1 0 41 0 0 287 0 1 0.0000 0.0000 0.0035 41.000 3.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1021 199 822 117 5 4 5 68 0 0 820 0 2 0.5879 0.0000 0.0024 64.000 1.02 3.26 -2.25 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9322 0.0677 0.0002 1 0 0.9251 0.0747 0.0002 1 0 0.9143 0.0853 0.0004
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1023 201 822 115 5 6 8 67 0 0 820 0 2 0.5721 0.0000 0.0024 48.250 1.00 3.31 -2.31 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9084 0.0912 0.0003 1 0 0.9002 0.0993 0.0004 1 0 0.8880 0.1113 0.0006
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 584 132 452 73 1 8 1 49 0 0 449 0 3 0.5530 0.0000 0.0066 15.500 0.68 11.24 -10.56 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6556 0.3323 0.0120 1 0 0.6470 0.3391 0.0140 1 0 0.6346 0.3485 0.0169
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 318 138 180 0 0 13 2 123 0 0 179 0 1 0.0000 0.0000 0.0056 10.333 8.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 516 217 299 104 3 36 3 71 0 0 298 0 1 0.4793 0.0000 0.0033 5.028 0.28 3.45 -3.17 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8694 0.1299 0.0007 1 0 0.8629 0.1362 0.0009 1 0 0.8533 0.1455 0.0012
chr22 23575030 AC A 0.001341 0.100 1 -1 3 149 88 61 84 0 1 0 3 0 0 61 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 87.000 0.57 1.00 -0.43 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9865 0.0135 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 509 95 414 0 0 26 1 68 0 0 395 0 19 0.0000 0.0000 0.0459 2.615 15.65 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr22 27798906 CTGCTGT C 0.030620 0.100 1 -6 1 756 175 581 95 6 11 2 61 0 0 580 1 0 0.5429 0.0000 0.0017 14.727 0.64 5.79 -5.14 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9444 0.0556 0.0000 1 0 0.9400 0.0600 0.0000 1 0 0.9334 0.0665 0.0000
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 780 211 569 187 0 6 0 18 0 0 568 0 1 0.8863 0.0000 0.0018 34.167 0.28 4.17 -3.89 113 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0613 0.9387 0.0000
chr22 30376487 CCAGCCCTGCACATCCCCACCTCGG C 0.001530 0.100 1 -24 3 650 209 441 79 3 77 1 49 0 0 420 2 19 0.3780 0.0000 0.0476 1.688 0.46 9.24 -8.79 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5866 0.4133 0.0001 1 0 0.5899 0.4099 0.0001 1 0 0.5936 0.4063 0.0001
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 691 256 435 146 3 14 0 93 0 0 435 0 0 0.5703 0.0000 0.0000 17.214 0.52 2.17 -1.65 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9751 0.0249 0.0000 1 0 0.9719 0.0281 0.0000 1 0 0.9669 0.0331 0.0000
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 472 231 241 176 0 50 0 5 0 0 241 0 0 0.7619 0.0000 0.0000 3.620 0.97 5.00 -4.03 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2744 0.7256 0.0000 0 0 0.9904 0.0096 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 592 112 480 105 2 1 0 4 0 0 480 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 110.000 0.91 16.75 -15.84 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0246 0.9754 0.0000 0 0 0.6988 0.3012 0.0000 0 0 0.9154 0.0846 0.0000
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.100 1 -42 4 345 177 168 111 0 9 0 57 0 0 157 0 11 0.6271 0.0000 0.0655 18.667 0.22 20.21 -19.99 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9529 0.0471 0.0001 1 0 0.9482 0.0517 0.0001 1 0 0.9412 0.0586 0.0002
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 400 198 202 95 0 17 1 85 0 0 191 0 11 0.4798 0.0000 0.0545 10.647 0.34 7.67 -7.33 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1537 0.7283 0.1180 1 1 0.1630 0.7138 0.1233 1 1 0.1753 0.6948 0.1299
chr22 39025104 GCTT G 0.002889 0.100 1 -3 1 476 174 302 99 0 3 0 72 0 0 301 0 1 0.5690 0.0000 0.0033 57.000 0.19 3.51 -3.32 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8495 0.1505 0.0000 1 0 0.8449 0.1551 0.0000 1 0 0.8381 0.1619 0.0000
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 232 121 111 67 0 6 0 48 0 0 110 0 1 0.5537 0.0000 0.0090 19.167 0.15 4.83 -4.68 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6853 0.3050 0.0097 1 0 0.6789 0.3101 0.0110 1 0 0.6697 0.3173 0.0130
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 385 146 239 5 0 4 1 136 0 0 234 0 5 0.0342 0.0000 0.0209 35.500 0.00 3.05 -3.05 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9522 0.0478 2 2 0.0000 0.0658 0.9342 2 2 0.0000 0.0103 0.9897
chr22 40861830 T TA 0.018262 0.100 1 1 2 703 148 555 138 0 1 0 9 0 0 555 0 0 0.9324 0.0000 0.0000 147.000 0.55 1.00 -0.45 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7871 0.2129 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1111 302 809 280 1 4 0 17 3 0 806 0 0 0.9272 0.0037 0.0037 74.500 3.81 10.94 -7.13 94 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0465 0.9535 0.0000 0 0 0.9768 0.0232 0.0000
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 659 290 369 235 1 7 1 46 0 0 369 0 0 0.8103 0.0000 0.0000 40.429 0.27 2.93 -2.67 77 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 364 118 246 57 0 25 2 34 0 0 236 0 10 0.4831 0.0000 0.0407 3.640 0.35 15.00 -14.65 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6214 0.3708 0.0077 1 0 0.6197 0.3719 0.0084 1 0 0.6168 0.3738 0.0094
706 rows