File Info

Filename
HG02657_x_HG02682_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/16/faef9ba4f1d3a76e1ba2566845eca1/HG02657_x_HG02682_FF_10.features.tsv
Size
144.9 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG02657_x_HG02682_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 493 198 295 139 1 12 0 46 0 0 295 0 0 0.7020 0.0000 0.0000 15.500 0.69 8.00 -7.31 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 1 0 0.7406 0.2594 0.0000
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 488 160 328 90 0 15 0 55 0 0 325 0 3 0.5625 0.0000 0.0091 9.667 0.58 8.49 -7.91 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8510 0.1475 0.0015 1 0 0.8420 0.1561 0.0019 1 0 0.8289 0.1686 0.0026
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 333 154 179 150 0 1 0 3 0 0 178 0 1 0.9740 0.0000 0.0056 153.000 0.81 3.33 -2.53 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2237 0.7763 0.0000 0 0 0.9621 0.0379 0.0000 0 0 0.9911 0.0089 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 587 132 455 104 1 22 0 5 0 0 454 0 1 0.7879 0.0000 0.0022 4.955 0.70 2.80 -2.10 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2408 0.7592 0.0000 0 0 0.7754 0.2246 0.0000
chr1 12879725 C CG 0.500000 0.100 1 1 3 847 265 582 246 0 12 0 7 0 0 582 0 0 0.9283 0.0000 0.0000 21.083 0.19 2.57 -2.38 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0560 0.9440 0.0000 0 0 0.9923 0.0077 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 1102 231 871 214 0 8 0 9 0 0 871 0 0 0.9264 0.0000 0.0000 27.875 0.43 3.11 -2.68 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7514 0.2486 0.0000 0 0 0.9901 0.0099 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 447 110 337 80 0 4 1 25 0 0 337 0 0 0.7273 0.0000 0.0000 26.500 0.06 1.08 -1.02 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9843 0.0157 0.0000 1 0 0.9771 0.0229 0.0000 1 0 0.5245 0.4755 0.0000
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 1005 200 805 135 2 6 0 57 0 1 804 0 0 0.6750 0.0000 0.0012 32.000 1.61 1.88 -0.27 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9982 0.0018 0.0000 1 0 0.9978 0.0022 0.0000 1 0 0.9969 0.0031 0.0000
chr1 25835277 GTTTCACTGAT G 0.500000 0.100 1 -10 3 809 192 617 180 0 4 0 8 0 0 617 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 47.000 0.21 10.38 -10.17 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6159 0.3841 0.0000 0 0 0.9734 0.0266 0.0000
chr1 26183819 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 424 98 326 41 6 6 1 44 0 0 325 0 1 0.4184 0.0000 0.0031 18.400 1.15 1.23 -0.08 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2028 0.6107 0.1865 1 1 0.2068 0.6026 0.1907 1 1 0.2117 0.5923 0.1961
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 859 213 646 49 51 12 30 71 0 0 646 0 0 0.2300 0.0000 0.0000 16.182 6.37 27.23 -20.86 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0695 0.6700 0.2605 1 1 0.0750 0.6578 0.2671 1 1 0.0826 0.6423 0.2750
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 883 212 671 11 1 22 4 174 0 0 669 0 2 0.0519 0.0000 0.0030 9.048 1.73 15.57 -13.85 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9702 0.0298 2 2 0.0000 0.2455 0.7545
chr1 26697189 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 431 95 336 45 0 8 1 41 0 0 336 0 0 0.4737 0.0000 0.0000 10.750 0.42 4.24 -3.82 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2662 0.5928 0.1411 1 1 0.2684 0.5859 0.1458 1 1 0.2709 0.5772 0.1520
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 391 162 229 10 0 17 2 133 0 0 226 0 3 0.0617 0.0000 0.0131 8.529 0.50 3.05 -2.55 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9772 0.0228 2 2 0.0000 0.4315 0.5685
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 386 96 290 40 0 9 0 47 0 0 289 0 1 0.4167 0.0000 0.0034 9.667 0.62 3.21 -2.59 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0788 0.5363 0.3849 1 1 0.0835 0.5331 0.3834 1 1 0.0899 0.5293 0.3809
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 641 181 460 0 0 37 2 142 0 0 460 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.892 6.23 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 237 99 138 46 0 4 1 48 0 0 138 0 0 0.4646 0.0000 0.0000 23.750 0.24 3.38 -3.14 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1408 0.6041 0.2551 1 1 0.1457 0.5964 0.2579 1 1 0.1521 0.5867 0.2613
chr1 53459700 G GCCGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 596 133 463 100 2 25 0 6 0 0 463 0 0 0.7519 0.0000 0.0000 4.320 0.28 3.83 -3.55 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2154 0.7846 0.0000 0 0 0.7501 0.2499 0.0000
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 499 149 350 119 6 19 0 5 0 0 349 0 1 0.7987 0.0000 0.0029 6.842 0.23 3.40 -3.17 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.4722 0.5278 0.0000 0 0 0.9044 0.0956 0.0000
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 4 799 163 636 76 0 15 1 71 0 0 636 0 0 0.4663 0.0000 0.0000 9.800 0.47 3.13 -2.65 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2407 0.6547 0.1046 1 1 0.2460 0.6436 0.1104 1 1 0.2523 0.6295 0.1182
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 174 94 80 0 0 2 0 92 0 0 78 0 2 0.0000 0.0000 0.0250 46.000 4.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0103 0.9897
chr1 84574341 CAGCAGCGCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 383 164 219 95 0 2 0 67 0 0 219 0 0 0.5793 0.0000 0.0000 81.000 0.13 7.42 -7.29 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7814 0.2156 0.0030 1 0 0.7728 0.2235 0.0037 1 0 0.7603 0.2348 0.0049
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 513 168 345 78 1 3 1 85 0 0 339 0 6 0.4643 0.0000 0.0174 55.000 0.65 5.42 -4.77 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0317 0.5388 0.4296 1 1 0.0351 0.5337 0.4311 1 1 0.0402 0.5278 0.4320
chr1 86580219 A ACCTACT 0.500000 0.100 1 6 1 510 165 345 130 0 27 0 8 0 2 339 4 0 0.7879 0.0000 0.0174 5.111 3.47 6.00 -2.53 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0251 0.9749 0.0000 0 1 0.4806 0.5194 0.0000
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 191 87 104 6 0 6 0 75 0 0 103 0 1 0.0690 0.0000 0.0096 13.500 0.50 3.04 -2.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9304 0.0696 2 1 0.0000 0.5407 0.4593
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 484 117 367 6 0 7 4 100 0 0 360 0 7 0.0513 0.0000 0.0191 15.429 0.83 3.36 -2.53 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.7033 0.2967 2 2 0.0000 0.1800 0.8200
chr1 114695466 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 252 71 181 39 0 2 0 30 0 0 181 0 0 0.5493 0.0000 0.0000 34.500 1.08 1.30 -0.22 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4315 0.4961 0.0725 1 1 0.4274 0.4957 0.0769 1 1 0.4215 0.4954 0.0831
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 287 112 175 44 0 9 2 57 0 0 175 0 0 0.3929 0.0000 0.0000 11.333 0.36 6.25 -5.88 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0293 0.4202 0.5505 1 2 0.0325 0.4233 0.5443 1 2 0.0371 0.4276 0.5353
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 309 124 185 4 2 20 8 90 0 0 185 0 0 0.0323 0.0000 0.0000 4.800 0.25 1.43 -1.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9891 0.0109 2 1 0.0000 0.5015 0.4985 2 2 0.0000 0.1623 0.8377
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 274 107 167 54 0 12 0 41 0 0 151 0 16 0.5047 0.0000 0.0958 7.917 0.28 10.61 -10.33 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1342 0.6227 0.2432 1 1 0.1394 0.6137 0.2469 1 1 0.1463 0.6023 0.2514
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1241 282 959 19 2 50 8 203 0 0 913 5 41 0.0674 0.0000 0.0480 4.694 3.37 10.64 -7.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.5709 0.4291
chr1 153934829 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 636 276 360 139 18 25 7 87 0 0 360 0 0 0.5036 0.0000 0.0000 123.000 0.17 5.51 -5.33 13 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9788 0.0212 0.0000 1 0 0.9759 0.0241 0.0000 1 0 0.9714 0.0286 0.0000
chr1 155085169 GGGGGTGGGCCCC G 0.500000 0.100 1 -12 1 521 172 349 82 0 4 1 85 0 0 346 0 3 0.4767 0.0000 0.0086 42.000 0.52 10.35 -9.83 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0701 0.6491 0.2807 1 1 0.0755 0.6382 0.2863 1 1 0.0828 0.6243 0.2928
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 236 102 134 12 0 2 0 88 0 0 133 0 1 0.1176 0.0000 0.0075 50.000 1.33 2.18 -0.85 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9664 0.0336
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 474 129 345 0 0 2 2 125 0 0 341 0 4 0.0000 0.0000 0.0116 63.500 2.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 879 162 717 0 0 6 0 156 0 0 715 0 2 0.0000 0.0000 0.0028 26.000 1.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr1 159928402 AAGGGGGCTCTGC A 0.500000 0.100 1 -12 1 508 120 388 69 0 2 0 49 0 0 384 0 4 0.5750 0.0000 0.0103 59.000 0.71 12.00 -11.29 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5596 0.4169 0.0235 1 0 0.5542 0.4195 0.0263 1 0 0.5462 0.4234 0.0304
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 344 74 270 41 0 5 0 28 0 0 270 0 0 0.5541 0.0000 0.0000 17.250 0.51 1.21 -0.70 5 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5336 0.4237 0.0427 1 0 0.5260 0.4275 0.0465 1 0 0.5156 0.4326 0.0518
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 522 174 348 87 0 27 0 60 0 0 319 0 29 0.5000 0.0000 0.0833 5.444 0.33 12.25 -11.92 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1210 0.6992 0.1798 1 1 0.1276 0.6856 0.1868 1 1 0.1363 0.6681 0.1956
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 488 243 245 10 0 38 0 195 0 0 232 0 13 0.0412 0.0000 0.0531 5.395 0.30 10.88 -10.58 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5614 0.4386 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr1 220880258 A AGCAGCAACAGCCGCC 0.500000 0.100 1 15 1 530 153 377 82 3 8 1 59 1 0 376 0 0 0.5359 0.0027 0.0027 17.875 0.45 9.53 -9.07 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7586 0.2369 0.0045 1 0 0.7497 0.2450 0.0054 1 0 0.7367 0.2564 0.0068
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 691 147 544 7 0 7 0 133 0 0 539 1 4 0.0476 0.0000 0.0092 20.000 0.86 8.56 -7.71 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.6366 0.3634 2 2 0.0000 0.0994 0.9006
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 309 136 173 11 0 3 0 122 0 0 173 0 0 0.0809 0.0000 0.0000 44.333 0.09 1.14 -1.05 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 1 0.0000 0.7551 0.2449
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 655 185 470 75 0 10 1 99 0 0 468 0 2 0.4054 0.0000 0.0043 17.500 1.03 3.26 -2.24 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0036 0.2461 0.7503 1 2 0.0043 0.2530 0.7427 1 2 0.0056 0.2629 0.7315
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 516 123 393 13 0 2 0 108 0 0 393 0 0 0.1057 0.0000 0.0000 60.500 1.31 1.23 0.08 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9567 0.0433
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 785 212 573 0 0 4 0 208 0 0 567 0 6 0.0000 0.0000 0.0105 52.000 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 400 105 295 56 1 2 1 45 1 0 294 0 0 0.5333 0.0034 0.0034 51.500 1.62 1.20 0.43 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4747 0.4813 0.0440 1 1 0.4710 0.4811 0.0479 1 1 0.4654 0.4812 0.0534
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 805 172 633 92 0 0 0 80 0 0 633 0 0 0.5349 0.0000 0.0000 172.000 0.84 1.89 -1.05 66 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3988 0.5643 0.0369 1 1 0.4014 0.5579 0.0408 1 1 0.4036 0.5501 0.0463
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.100 1 -84 1 915 291 624 174 1 28 2 86 0 0 624 0 0 0.5979 0.0000 0.0000 9.393 0.28 2.88 -2.60 86 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9987 0.0013 0.0000 1 0 0.9984 0.0016 0.0000 1 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1176 278 898 117 1 2 0 158 0 0 898 0 0 0.4209 0.0000 0.0000 138.000 3.15 1.19 1.96 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0003 0.1280 0.8717 1 2 0.0004 0.1338 0.8658 1 2 0.0006 0.1424 0.8569
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 557 169 388 105 0 3 1 60 1 0 387 0 0 0.6213 0.0026 0.0026 55.333 2.10 4.58 -2.49 87 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9501 0.0498 0.0001 1 0 0.9445 0.0553 0.0002 1 0 0.9361 0.0636 0.0003
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 699 65 634 0 0 4 3 58 0 0 626 0 8 0.0000 0.0000 0.0126 15.250 3.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0288 0.9712 2 2 0.0000 0.0309 0.9691 2 2 0.0000 0.0340 0.9660
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 749 326 423 99 1 16 0 210 0 0 417 0 6 0.3037 0.0000 0.0142 19.375 0.95 6.76 -5.81 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 850 199 651 168 2 12 0 17 0 0 651 0 0 0.8442 0.0000 0.0000 15.583 0.31 3.76 -3.46 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0650 0.9350 0.0000
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 452 123 329 0 1 13 2 107 1 0 314 0 14 0.0000 0.0030 0.0456 8.462 8.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0534 0.9466 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 583 194 389 167 0 21 0 6 0 0 388 0 1 0.8608 0.0000 0.0026 8.238 0.43 8.17 -7.74 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 0 0.8458 0.1542 0.0000 0 0 0.9882 0.0118 0.0000
chr2 24164308 GC G 0.029697 0.100 1 -1 1 200 109 91 58 0 4 0 47 0 0 91 0 0 0.5321 0.0000 0.0000 26.250 0.22 1.13 -0.90 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6316 0.3662 0.0022 1 0 0.6308 0.3668 0.0024 1 0 0.6291 0.3683 0.0026
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 250 61 189 0 0 2 0 59 0 0 184 0 5 0.0000 0.0000 0.0265 29.500 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0369 0.9631 2 2 0.0000 0.0393 0.9607 2 2 0.0000 0.0429 0.9571
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 399 113 286 90 0 15 0 8 1 0 285 0 0 0.7965 0.0035 0.0035 6.533 0.21 2.88 -2.66 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0185 0.9815 0.0000 0 1 0.3277 0.6723 0.0000
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 600 222 378 67 0 114 0 41 0 0 378 0 0 0.3018 0.0000 0.0000 0.947 0.51 0.88 -0.37 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7912 0.2042 0.0046 1 0 0.7806 0.2138 0.0055 1 0 0.7656 0.2274 0.0070
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.100 1 6 1 264 104 160 91 1 9 0 3 0 0 160 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 10.444 0.41 6.00 -5.59 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1208 0.8792 0.0000 0 0 0.8014 0.1986 0.0000 0 0 0.9264 0.0736 0.0000
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 768 119 649 29 2 18 1 69 2 1 643 0 3 0.2437 0.0031 0.0092 5.556 3.03 6.81 -3.78 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.0646 0.9350 1 2 0.0005 0.0716 0.9278 1 2 0.0008 0.0821 0.9171
chr2 65071512 GAAC G 0.500000 0.100 1 -3 1 798 220 578 206 0 5 0 9 0 0 577 0 1 0.9364 0.0000 0.0017 43.000 0.28 3.33 -3.06 118 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4115 0.5885 0.0000 0 0 0.9728 0.0272 0.0000
chr2 68538002 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 375 97 278 86 0 1 0 10 0 0 278 0 0 0.8866 0.0000 0.0000 96.000 0.19 3.00 -2.81 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.0958 0.9042 0.0000
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 513 209 304 86 0 20 5 98 0 0 304 0 0 0.4115 0.0000 0.0000 9.250 1.29 3.24 -1.95 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0205 0.4978 0.4817 1 1 0.0232 0.4944 0.4824 1 1 0.0272 0.4906 0.4822
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 575 156 419 6 56 30 0 64 0 3 413 0 3 0.0385 0.0000 0.0143 4.200 0.17 3.39 -3.22 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1318 0.6478 0.2203 1 1 0.1375 0.6372 0.2253 1 1 0.1450 0.6237 0.2313
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 580 163 417 78 0 30 1 54 0 0 413 1 3 0.4785 0.0000 0.0096 4.400 2.81 7.07 -4.27 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6269 0.3596 0.0135 1 0 0.6203 0.3642 0.0155 1 0 0.6105 0.3709 0.0186
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 487 100 387 55 0 3 0 42 0 0 387 0 0 0.5500 0.0000 0.0000 32.333 0.07 2.93 -2.86 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5094 0.4519 0.0387 1 0 0.5042 0.4535 0.0423 1 0 0.4966 0.4559 0.0475
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 513 178 335 129 1 26 0 22 0 0 335 0 0 0.7247 0.0000 0.0000 5.846 0.32 3.23 -2.91 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 835 221 614 204 1 9 0 7 0 0 614 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 23.444 0.57 9.14 -8.57 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 0 0.9416 0.0584 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr2 108259008 AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT A 0.500000 0.100 1 -22 1 515 100 415 0 0 7 0 93 0 0 392 0 23 0.0000 0.0000 0.0554 13.286 19.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr2 112542424 TTCCGGCGTGTACCGAGAGACTGGCG T 0.500000 0.100 1 -25 1 524 146 378 129 1 13 0 3 0 0 374 0 4 0.8836 0.0000 0.0106 10.231 0.47 25.33 -24.87 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2768 0.7232 0.0000 0 0 0.8600 0.1400 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 611 138 473 23 0 1 0 114 0 0 463 0 10 0.1667 0.0000 0.0211 137.000 0.17 5.98 -5.81 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 203 50 153 11 3 11 10 15 0 0 151 1 1 0.2200 0.0000 0.0131 2.727 1.18 1.53 -0.35 3 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0552 0.4105 0.5343 1 2 0.0592 0.4158 0.5250 1 2 0.0648 0.4229 0.5123
chr2 165176265 CATT C 0.500000 0.100 1 -3 1 268 85 183 45 0 2 1 37 0 0 183 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 41.500 0.16 3.08 -2.93 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3636 0.5457 0.0907 1 1 0.3626 0.5420 0.0955 1 1 0.3607 0.5374 0.1019
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 178 66 112 23 0 11 0 32 0 0 111 1 0 0.3485 0.0000 0.0089 5.000 0.83 5.69 -4.86 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0652 0.4620 0.4728 1 2 0.0694 0.4640 0.4666 1 1 0.0754 0.4666 0.4580
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 236 100 136 45 0 21 1 33 0 0 136 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 3.762 0.07 11.09 -11.02 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4755 0.4708 0.0537 1 1 0.4704 0.4718 0.0578 1 1 0.4632 0.4732 0.0636
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 2 513 141 372 4 0 12 0 125 0 0 372 0 0 0.0284 0.0000 0.0000 10.750 2.75 3.13 -0.38 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9253 0.0747 2 2 0.0000 0.1208 0.8792 2 2 0.0000 0.0294 0.9706
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 312 133 179 70 0 1 0 62 0 0 177 0 2 0.5263 0.0000 0.0112 132.000 0.10 2.95 -2.85 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2913 0.6201 0.0887 1 1 0.2949 0.6112 0.0940 1 1 0.2989 0.5999 0.1012
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.100 1 -2 1 392 181 211 85 1 7 0 88 0 0 211 0 0 0.4696 0.0000 0.0000 24.857 0.51 4.10 -3.60 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1217 0.6972 0.1811 1 1 0.1283 0.6836 0.1880 1 1 0.1370 0.6662 0.1967
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 723 161 562 97 0 8 0 56 0 0 560 0 2 0.6025 0.0000 0.0036 19.125 0.35 3.98 -3.63 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9174 0.0822 0.0004 1 0 0.9101 0.0894 0.0005 1 0 0.8992 0.1000 0.0008
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 316 125 191 3 0 12 13 97 0 0 188 0 3 0.0240 0.0000 0.0157 8.500 0.00 3.07 -3.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7305 0.2695 2 2 0.0000 0.0864 0.9136 2 2 0.0000 0.0302 0.9698
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 316 125 191 16 1 96 5 7 0 0 188 3 0 0.1280 0.0000 0.0157 0.240 2.69 4.00 -1.31 0 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2000 0.5318 0.2682 1 1 0.2023 0.5294 0.2683 1 1 0.2053 0.5263 0.2683
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 317 136 181 15 6 12 90 13 0 0 181 0 0 0.1103 0.0000 0.0000 3.364 0.00 3.00 -3.00 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9180 0.0820 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 246 83 163 54 10 13 2 4 0 0 163 0 0 0.6506 0.0000 0.0000 4.615 0.09 1.00 -0.91 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.1524 0.8476 0.0000 0 1 0.4948 0.5052 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 286 81 205 45 0 1 0 35 0 0 204 0 1 0.5556 0.0000 0.0049 80.000 0.07 3.09 -3.02 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4189 0.5108 0.0703 1 1 0.4159 0.5093 0.0748 1 1 0.4113 0.5076 0.0810
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 619 165 454 0 0 17 0 148 0 0 450 0 4 0.0000 0.0000 0.0088 8.706 7.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 678 182 496 0 0 8 8 166 0 0 426 0 70 0.0000 0.0000 0.1411 21.500 17.38 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr2 231460703 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 1 798 160 638 139 2 12 0 7 0 0 638 0 0 0.8688 0.0000 0.0000 12.250 0.32 3.71 -3.40 79 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3972 0.6028 0.0000 0 0 0.9124 0.0876 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 383 145 238 15 0 6 1 123 0 0 237 0 1 0.1034 0.0000 0.0042 23.167 0.47 4.11 -3.65 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9724 0.0276
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 184 64 120 34 0 2 0 28 0 0 119 0 1 0.5312 0.0000 0.0083 31.000 0.12 2.96 -2.85 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3300 0.5476 0.1225 1 1 0.3291 0.5439 0.1269 1 1 0.3277 0.5393 0.1329
chr2 235852770 C CCAGG 0.500000 0.100 1 4 2 259 110 149 51 1 5 0 53 0 0 147 0 2 0.4636 0.0000 0.0134 21.000 1.16 4.06 -2.90 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1358 0.6180 0.2462 1 1 0.1409 0.6094 0.2497 1 1 0.1477 0.5984 0.2539
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 759 204 555 121 0 0 0 83 0 0 552 0 3 0.5931 0.0000 0.0054 204.000 0.60 2.08 -1.49 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8526 0.1466 0.0008 1 0 0.8451 0.1538 0.0011 1 0 0.8340 0.1645 0.0015
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 401 119 282 71 1 29 4 14 0 0 282 0 0 0.5966 0.0000 0.0000 3.069 0.28 3.71 -3.43 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2150 0.7850 0.0000 0 1 0.0069 0.9931 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr3 3147456 C CTAAACT 0.000531 0.100 1 6 2 376 101 275 95 1 1 0 4 0 0 275 0 0 0.9406 0.0000 0.0000 100.000 0.68 5.25 -4.57 61 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9722 0.0278 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 579 148 431 0 0 3 3 142 0 0 426 0 5 0.0000 0.0000 0.0116 48.000 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 393 98 295 82 0 9 0 7 0 0 291 0 4 0.8367 0.0000 0.0136 9.889 0.60 12.43 -11.83 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.1665 0.8335 0.0000
chr3 12187460 CTCTTCCTCCTCT C 0.051892 0.100 1 -12 2 304 137 167 62 0 10 0 65 0 0 166 0 1 0.4526 0.0000 0.0060 12.700 1.24 11.78 -10.54 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2464 0.7238 0.0298 1 1 0.2580 0.7117 0.0303 1 1 0.2733 0.6959 0.0308
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 501 104 397 4 0 3 1 96 0 0 397 0 0 0.0385 0.0000 0.0000 33.667 0.00 5.12 -5.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9809 0.0191 2 2 0.0000 0.3580 0.6420 2 2 0.0000 0.1056 0.8944
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 775 273 502 18 4 33 4 214 0 0 463 1 38 0.0659 0.0000 0.0777 7.742 5.39 10.15 -4.77 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8587 0.1413
chr3 40462029 ACTGCTGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 775 332 443 300 1 21 1 9 1 0 442 0 0 0.9036 0.0023 0.0023 14.810 7.56 9.78 -2.21 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 780 238 542 3 10 52 3 170 0 0 534 1 7 0.0126 0.0000 0.0148 3.577 0.00 5.05 -5.05 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9896 0.0104 2 2 0.0000 0.3714 0.6286
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 780 238 542 13 1 82 0 142 0 0 536 0 6 0.0546 0.0000 0.0111 1.926 2.31 5.42 -3.11 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8351 0.1649
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 781 248 533 185 6 47 0 10 0 0 533 0 0 0.7460 0.0000 0.0000 4.277 4.58 3.00 1.58 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2451 0.7549 0.0000 0 0 0.9444 0.0556 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 555 180 375 0 0 6 0 174 0 0 371 0 4 0.0000 0.0000 0.0107 29.000 2.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 404 164 240 0 0 3 0 161 0 0 237 0 3 0.0000 0.0000 0.0125 53.667 3.24 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 658 174 484 76 0 24 8 66 0 0 482 0 2 0.4368 0.0000 0.0041 6.250 0.34 3.52 -3.17 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1623 0.6780 0.1597 1 1 0.1685 0.6656 0.1659 1 1 0.1765 0.6496 0.1739
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 366 94 272 0 0 12 78 4 0 0 270 2 0 0.0000 0.0000 0.0074 7.455 4.00 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0133 0.9867 2 2 0.0000 0.0145 0.9855 2 2 0.0000 0.0164 0.9836
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 367 95 272 0 0 14 1 80 0 0 269 0 3 0.0000 0.0000 0.0110 5.786 6.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0140 0.9860 2 2 0.0000 0.0152 0.9848 2 2 0.0000 0.0171 0.9829
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.100 1 6 1 564 190 374 73 0 42 0 75 0 2 365 0 7 0.3842 0.0000 0.0241 3.524 0.60 5.53 -4.93 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0723 0.6315 0.2962 1 1 0.0776 0.6217 0.3007 1 1 0.0848 0.6093 0.3059
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 569 206 363 167 1 32 0 6 0 0 361 0 2 0.8107 0.0000 0.0055 5.438 2.62 5.17 -2.55 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4685 0.5315 0.0000 0 0 0.9533 0.0467 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 211 109 102 35 0 10 0 64 0 0 100 0 2 0.3211 0.0000 0.0196 9.900 0.11 6.75 -6.64 19 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0019 0.1317 0.8665 1 2 0.0023 0.1412 0.8565 1 2 0.0031 0.1548 0.8421
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 289 103 186 5 0 4 48 46 0 0 180 4 2 0.0485 0.0000 0.0323 24.750 0.20 3.33 -3.13 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.5979 0.4021 2 2 0.0000 0.1714 0.8286
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 289 108 181 6 0 6 43 53 0 0 178 0 3 0.0556 0.0000 0.0166 17.000 0.17 3.49 -3.32 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8248 0.1752 2 2 0.0000 0.3000 0.7000
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 333 131 202 67 7 12 0 45 0 0 199 0 3 0.5115 0.0000 0.0149 9.917 0.42 3.20 -2.78 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7797 0.2158 0.0045 1 0 0.7696 0.2249 0.0054 1 0 0.7553 0.2377 0.0069
chr3 73062330 C CA 0.500000 0.100 1 1 5 571 136 435 7 0 3 0 126 0 0 433 0 2 0.0515 0.0000 0.0046 44.333 0.00 1.57 -1.57 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7408 0.2592 2 2 0.0000 0.1516 0.8484
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 832 225 607 107 1 11 0 106 0 0 586 0 21 0.4756 0.0000 0.0346 19.455 0.13 9.44 -9.31 11 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0116 0.4848 0.5035 1 2 0.0135 0.4803 0.5061 1 2 0.0165 0.4755 0.5080
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 522 140 382 59 0 9 0 72 0 0 382 0 0 0.4214 0.0000 0.0000 14.556 0.37 1.61 -1.24 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0358 0.4934 0.4707 1 1 0.0394 0.4919 0.4687 1 1 0.0446 0.4903 0.4651
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 407 125 282 57 0 5 3 60 0 0 279 0 3 0.4560 0.0000 0.0106 24.000 0.25 1.25 -1.00 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0645 0.5644 0.3711 1 1 0.0692 0.5590 0.3718 1 1 0.0756 0.5523 0.3720
chr3 108757146 G GGGGGATTA 0.500000 0.100 1 8 2 280 118 162 109 0 5 0 4 0 0 162 0 0 0.9237 0.0000 0.0000 22.600 0.85 8.00 -7.15 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0344 0.9656 0.0000 0 0 0.7659 0.2341 0.0000 0 0 0.9383 0.0617 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 121 49 72 25 2 0 1 21 0 0 72 0 0 0.5102 0.0000 0.0000 47.000 0.28 1.52 -1.24 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3380 0.5315 0.1305 1 1 0.3363 0.5290 0.1347 1 1 0.3337 0.5260 0.1403
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 453 153 300 82 1 0 0 70 0 0 299 1 0 0.5359 0.0000 0.0033 153.000 0.18 1.20 -1.02 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4187 0.5425 0.0388 1 1 0.4197 0.5377 0.0426 1 1 0.4199 0.5319 0.0482
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1253 295 958 0 0 74 118 103 0 0 956 1 1 0.0000 0.0000 0.0021 2.892 3.32 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1263 299 964 100 5 63 8 123 1 0 963 0 0 0.3344 0.0010 0.0010 3.730 2.73 8.11 -5.38 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0048 0.3541 0.6410 1 2 0.0058 0.3554 0.6388 1 2 0.0074 0.3581 0.6345
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.100 1 12 1 535 153 382 117 0 31 0 5 0 0 382 0 0 0.7647 0.0000 0.0000 3.935 0.36 9.80 -9.44 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 0 0.6273 0.3727 0.0000 0 0 0.9219 0.0781 0.0000
chr3 124763647 TTTGTTGAAC T 0.500000 0.100 1 -9 1 406 183 223 173 2 3 0 5 0 0 223 0 0 0.9454 0.0000 0.0000 60.000 0.30 9.00 -8.70 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1003 0.8997 0.0000 0 0 0.9682 0.0318 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.100 1 -4 1 331 118 213 65 0 2 0 51 0 0 213 0 0 0.5508 0.0000 0.0000 58.000 0.17 4.00 -3.83 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5143 0.4536 0.0321 1 0 0.5100 0.4546 0.0354 1 0 0.5035 0.4563 0.0402
chr3 129436704 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 804 241 563 198 17 16 0 10 0 0 563 0 0 0.8216 0.0000 0.0000 13.188 0.46 1.00 -0.54 102 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5253 0.4747 0.0000 0 0 0.9815 0.0185 0.0000
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 211 107 104 0 0 0 0 107 0 0 104 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 107.000 2.47 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 404 142 262 6 0 4 2 130 0 0 261 0 1 0.0423 0.0000 0.0038 34.500 1.50 2.08 -0.58 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 2 0.0000 0.4336 0.5664 2 2 0.0000 0.0687 0.9313
chr3 150703735 A ACCTCCT 0.500000 0.100 1 6 2 526 101 425 27 5 19 2 48 0 0 422 0 3 0.2673 0.0000 0.0071 4.158 1.00 5.23 -4.23 15 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0101 0.2587 0.7312 1 2 0.0117 0.2683 0.7200 1 2 0.0143 0.2814 0.7043
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 612 134 478 6 0 26 1 101 0 0 476 0 2 0.0448 0.0000 0.0042 4.154 1.17 3.15 -1.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.7676 0.2324 2 2 0.0000 0.2325 0.7675
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 472 163 309 146 0 8 0 9 0 0 309 0 0 0.8957 0.0000 0.0000 19.375 0.18 2.00 -1.82 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0937 0.9063 0.0000 0 0 0.7884 0.2116 0.0000
chr3 195779611 GTGTCGGTGACAGGAAGGGGGGTGGCGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAC G 0.500000 0.100 1 -48 2 362 73 289 36 4 12 4 17 4 4 257 7 17 0.4932 0.0138 0.1107 5.800 5.50 7.47 -1.97 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2358 0.6027 0.1615 1 1 0.2388 0.5951 0.1660 1 1 0.2426 0.5856 0.1719
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 924 194 730 82 1 20 0 91 1 0 710 0 19 0.4227 0.0014 0.0274 8.700 0.56 11.96 -11.40 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0045 0.2905 0.7050 1 2 0.0054 0.2956 0.6991 1 2 0.0069 0.3031 0.6900
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 274 128 146 45 1 39 0 43 0 0 142 3 1 0.3516 0.0000 0.0274 2.316 0.82 8.91 -8.08 23 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1700 0.6094 0.2206 1 1 0.1745 0.6014 0.2242 1 1 0.1802 0.5912 0.2286
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 274 128 146 53 1 30 4 40 0 0 142 0 4 0.4141 0.0000 0.0274 3.267 1.08 8.97 -7.90 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3199 0.5825 0.0975 1 1 0.3212 0.5762 0.1025 1 1 0.3224 0.5683 0.1093
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 606 146 460 90 0 0 0 56 0 0 420 0 40 0.6164 0.0000 0.0870 146.000 0.37 15.39 -15.03 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0310 0.6197 0.3493 1 1 0.0333 0.6079 0.3588 1 1 0.0366 0.5931 0.3704
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 478 185 293 0 0 54 0 131 0 0 282 0 11 0.0000 0.0000 0.0375 2.569 7.50 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 652 148 504 77 1 12 1 57 0 0 501 0 3 0.5203 0.0000 0.0060 11.250 1.32 11.86 -10.53 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7124 0.2857 0.0019 1 0 0.7096 0.2882 0.0021 1 0 0.7052 0.2923 0.0025
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.100 1 -6 2 484 132 352 70 0 1 1 60 0 0 350 0 2 0.5303 0.0000 0.0057 131.000 0.11 5.98 -5.87 40 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4906 0.5014 0.0080 1 0 0.4959 0.4955 0.0086 1 0 0.5022 0.4885 0.0093
chr4 15004114 A AGCG 0.500000 0.100 1 3 1 478 99 379 33 4 30 5 27 2 0 370 2 5 0.3333 0.0053 0.0237 2.310 2.33 3.67 -1.33 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2036 0.5921 0.2043 1 1 0.2071 0.5853 0.2077 1 1 0.2114 0.5766 0.2120
chr4 15511381 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 4 250 116 134 98 0 9 0 9 0 0 134 0 0 0.8448 0.0000 0.0000 11.889 0.23 3.00 -2.77 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0091 0.9909 0.0000 0 1 0.2649 0.7351 0.0000
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 412 150 262 138 0 6 0 6 0 0 261 0 1 0.9200 0.0000 0.0038 24.000 0.33 8.33 -8.00 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3634 0.6366 0.0000 0 0 0.9006 0.0994 0.0000
chr4 54100743 GCACCACCAT G 0.500000 0.100 1 -9 1 629 183 446 120 0 6 1 56 0 0 441 0 5 0.6557 0.0000 0.0112 29.500 1.23 9.45 -8.22 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9847 0.0153 0.0000 1 0 0.9822 0.0178 0.0000 1 0 0.9782 0.0218 0.0000
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 688 136 552 69 1 13 0 53 0 0 518 0 34 0.5074 0.0000 0.0616 9.462 1.23 15.77 -14.54 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0187 0.4358 0.5455 1 2 0.0212 0.4364 0.5424 1 2 0.0249 0.4378 0.5373
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 3 448 125 323 117 0 3 0 5 0 4 319 0 0 0.9360 0.0000 0.0124 40.667 1.72 2.60 -0.88 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0075 0.9925 0.0000 0 0 0.6850 0.3150 0.0000 0 0 0.9380 0.0620 0.0000
chr4 73258354 TCCGCCTCCACCG T 0.500000 0.100 1 -12 2 696 266 430 229 1 29 0 7 0 0 429 1 0 0.8609 0.0000 0.0023 8.464 0.89 11.00 -10.11 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0057 0.9943 0.0000 0 0 0.9604 0.0396 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.100 1 3 1 369 117 252 111 0 1 0 5 0 0 252 0 0 0.9487 0.0000 0.0000 116.000 0.70 3.20 -2.50 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 0 0.5551 0.4449 0.0000 0 0 0.8982 0.1018 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2358 537 1821 326 9 160 4 38 2 4 1806 4 5 0.6071 0.0011 0.0082 2.367 1.39 8.47 -7.09 86 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615164 TAGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 3560 702 2858 606 14 46 8 28 7 25 2818 7 1 0.8632 0.0024 0.0140 15.381 1.64 6.11 -4.47 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3883 879 3004 739 23 45 10 62 55 56 2689 163 41 0.8407 0.0183 0.1049 20.024 2.46 9.31 -6.85 111 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3932 1040 2892 378 37 183 36 406 267 73 2512 21 19 0.3635 0.0923 0.1314 4.695 2.03 9.40 -7.37 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 110011233 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 292 100 192 60 0 4 0 36 0 0 192 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 24.000 0.13 1.19 -1.06 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7660 0.2274 0.0066 1 0 0.7551 0.2371 0.0078 1 0 0.7396 0.2507 0.0097
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 719 160 559 14 0 8 0 138 0 0 558 0 1 0.0875 0.0000 0.0018 19.000 0.00 3.93 -3.93 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9038 0.0962
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 590 221 369 1 0 22 9 189 0 0 364 1 4 0.0045 0.0000 0.0136 9.045 1.00 3.01 -2.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 143611326 GCTCCCAGCTGTC G 0.500000 0.100 1 -12 2 213 76 137 53 0 1 0 22 0 0 136 0 1 0.6974 0.0000 0.0073 75.000 0.08 11.55 -11.47 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8688 0.1289 0.0023 1 0 0.8582 0.1389 0.0028 1 0 0.8429 0.1533 0.0038
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 536 184 352 13 2 49 6 114 1 0 345 5 1 0.0707 0.0028 0.0199 2.735 1.23 3.44 -2.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9853 0.0147
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 243 92 151 32 1 11 1 47 0 0 151 0 0 0.3478 0.0000 0.0000 7.364 0.59 5.04 -4.45 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0296 0.3902 0.5802 1 2 0.0328 0.3953 0.5719 1 2 0.0374 0.4023 0.5603
chr4 174977850 T TCAGAGTCAACCTCCTGTGATGCCTTCCCAGAGTCATCCTCAGTTGACGCCTTCC 0.500000 0.100 1 54 1 989 241 748 58 1 100 0 82 1 1 746 0 0 0.2407 0.0013 0.0027 1.424 0.66 5.48 -4.82 10 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0096 0.3235 0.6669 1 2 0.0112 0.3292 0.6595 1 2 0.0137 0.3375 0.6488
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 902 198 704 99 1 1 0 97 0 0 703 0 1 0.5000 0.0000 0.0014 197.000 0.16 3.06 -2.90 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1663 0.7215 0.1122 1 1 0.1740 0.7067 0.1193 1 1 0.1838 0.6876 0.1285
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 862 194 668 0 0 24 10 160 0 0 661 0 7 0.0000 0.0000 0.0105 7.083 3.38 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr5 59893368 CGGGGGCGGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -15 2 337 108 229 90 0 11 0 7 0 0 229 0 0 0.8333 0.0000 0.0000 8.818 1.27 13.57 -12.30 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0474 0.9526 0.0000 0 1 0.4589 0.5411 0.0000
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 2 342 117 225 52 1 19 3 42 1 0 222 0 2 0.4444 0.0044 0.0133 5.105 0.58 4.76 -4.18 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3530 0.5631 0.0839 1 1 0.3532 0.5581 0.0888 1 1 0.3528 0.5518 0.0954
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 357 45 312 0 0 28 0 17 0 0 304 2 6 0.0000 0.0000 0.0256 0.607 8.24 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2185 0.7815 2 2 0.0000 0.2230 0.7770 2 2 0.0000 0.2292 0.7708
chr5 73447202 GGCGGCGGCGGCCTGC G 0.500000 0.100 1 -15 1 475 115 360 80 0 4 0 31 1 0 353 0 6 0.6957 0.0028 0.0194 27.750 1.23 12.45 -11.23 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9563 0.0435 0.0002 1 0 0.9507 0.0490 0.0002 1 0 0.9422 0.0574 0.0003
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 400 108 292 47 0 5 0 56 0 0 290 0 2 0.4352 0.0000 0.0068 20.600 0.19 5.04 -4.84 13 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0505 0.5027 0.4468 1 1 0.0546 0.5013 0.4442 1 1 0.0604 0.4997 0.4399
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 602 159 443 146 0 7 0 6 0 0 442 0 1 0.9182 0.0000 0.0023 21.714 0.21 3.00 -2.79 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4599 0.5401 0.0000 0 0 0.9303 0.0697 0.0000
chr5 78985127 GCCCCGGCGC G 0.500000 0.100 1 -9 2 488 125 363 75 0 7 0 43 1 0 361 0 1 0.6000 0.0028 0.0055 16.857 0.48 8.70 -8.22 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8675 0.1310 0.0015 1 0 0.8580 0.1401 0.0019 1 0 0.8442 0.1532 0.0026
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 272 86 186 33 1 11 1 40 0 0 182 0 4 0.3837 0.0000 0.0215 6.818 5.36 20.27 -14.91 21 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0537 0.4708 0.4755 1 1 0.0578 0.4718 0.4704 1 1 0.0636 0.4732 0.4632
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 260 62 198 25 1 0 0 36 0 0 196 0 2 0.4032 0.0000 0.0101 62.000 6.92 24.03 -17.11 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0476 0.4313 0.5211 1 2 0.0515 0.4348 0.5137 1 2 0.0570 0.4396 0.5034
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 293 108 185 104 0 1 0 3 0 0 185 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 107.000 0.15 3.00 -2.85 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2032 0.7968 0.0000 0 0 0.8808 0.1192 0.0000 0 0 0.9578 0.0422 0.0000
chr5 109855234 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 191 81 110 38 0 4 0 39 0 0 109 0 1 0.4691 0.0000 0.0091 19.250 0.05 3.62 -3.56 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1650 0.5898 0.2452 1 1 0.1692 0.5831 0.2477 1 1 0.1747 0.5747 0.2506
chr5 113488351 T TGCCGCTGCC 0.500000 0.100 1 9 1 268 106 162 45 6 1 1 53 0 0 162 0 0 0.4245 0.0000 0.0000 100.000 1.22 7.64 -6.42 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1154 0.5994 0.2853 1 1 0.1205 0.5920 0.2876 1 1 0.1273 0.5826 0.2901
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 625 164 461 2 0 20 4 138 0 0 452 0 9 0.0122 0.0000 0.0195 7.200 0.00 3.60 -3.60 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0362 0.9638 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 653 128 525 64 0 4 0 60 0 0 525 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 31.000 0.23 1.23 -1.00 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2549 0.6298 0.1153 1 1 0.2589 0.6203 0.1208 1 1 0.2636 0.6083 0.1281
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 425 147 278 119 0 21 0 7 0 0 278 0 0 0.8095 0.0000 0.0000 6.000 0.52 8.00 -7.48 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1818 0.8182 0.0000 0 0 0.7831 0.2169 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 241 91 150 37 1 1 0 52 0 0 149 0 1 0.4066 0.0000 0.0067 89.000 0.27 3.90 -3.63 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0282 0.3972 0.5746 1 2 0.0313 0.4017 0.5670 1 2 0.0358 0.4079 0.5563
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 312 115 197 112 0 0 0 3 0 0 197 0 0 0.9739 0.0000 0.0000 115.000 0.25 4.33 -4.08 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2773 0.7227 0.0000 0 0 0.9168 0.0832 0.0000 0 0 0.9710 0.0290 0.0000
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 312 116 196 111 1 1 0 3 0 0 196 0 0 0.9569 0.0000 0.0000 115.000 0.24 4.33 -4.09 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2862 0.7138 0.0000 0 0 0.9192 0.0808 0.0000 0 0 0.9718 0.0282 0.0000
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 981 258 723 119 2 12 0 125 0 0 723 0 0 0.4612 0.0000 0.0000 20.500 0.23 1.22 -1.00 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0766 0.7559 0.1674 1 1 0.0834 0.7398 0.1768 1 1 0.0927 0.7185 0.1888
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 493 112 381 0 0 9 1 102 0 0 365 0 16 0.0000 0.0000 0.0420 11.444 8.59 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 328 118 210 88 0 24 0 6 0 0 210 0 0 0.7458 0.0000 0.0000 3.917 0.44 8.50 -8.06 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1222 0.8778 0.0000 0 0 0.6052 0.3948 0.0000
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 773 195 578 90 0 1 0 104 0 0 578 0 0 0.4615 0.0000 0.0000 194.000 0.96 1.65 -0.70 4 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0265 0.5489 0.4246 1 1 0.0297 0.5427 0.4276 1 1 0.0344 0.5354 0.4302
chr5 150657039 T TCGGCTCAAGCGTGGCAGCCTC 0.500000 0.100 1 21 2 584 174 410 57 1 29 0 87 2 0 406 0 2 0.3276 0.0049 0.0098 5.000 0.77 7.71 -6.94 35 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0026 0.1896 0.8078 1 2 0.0032 0.1982 0.7986 1 2 0.0042 0.2104 0.7854
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 446 164 282 154 0 4 0 6 0 0 280 0 2 0.9390 0.0000 0.0071 40.000 3.15 5.33 -2.18 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3046 0.6954 0.0000 0 0 0.9120 0.0880 0.0000
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 443 166 277 10 1 16 1 138 0 0 277 0 0 0.0602 0.0000 0.0000 9.312 3.50 12.50 -9.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9913 0.0087 2 1 0.0000 0.5764 0.4236
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 441 144 297 0 104 4 1 35 0 0 295 0 2 0.0000 0.0000 0.0067 35.000 6.09 0 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9941 0.0059 0.0000 1 0 0.9928 0.0072 0.0000 1 0 0.9892 0.0108 0.0000
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 222 72 150 35 0 4 0 33 0 0 150 0 0 0.4861 0.0000 0.0000 17.000 1.00 3.21 -2.21 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2524 0.5779 0.1698 1 1 0.2543 0.5720 0.1737 1 1 0.2565 0.5647 0.1788
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 504 122 382 50 1 10 0 61 0 0 378 0 4 0.4098 0.0000 0.0105 11.200 0.96 4.02 -3.06 24 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0318 0.4524 0.5158 1 2 0.0351 0.4534 0.5114 1 2 0.0400 0.4552 0.5048
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 448 198 250 86 4 36 1 71 0 0 250 0 0 0.4343 0.0000 0.0000 4.472 0.85 3.39 -2.55 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5641 0.4198 0.0161 1 0 0.5607 0.4210 0.0183 1 0 0.5550 0.4232 0.0218
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 700 121 579 5 0 13 0 103 0 0 579 0 0 0.0413 0.0000 0.0000 8.308 0.80 3.31 -2.51 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9971 0.0029 2 1 0.0000 0.5435 0.4565 2 2 0.0000 0.1430 0.8570
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 539 127 412 2 0 20 1 104 0 0 408 1 3 0.0157 0.0000 0.0097 5.350 1.00 3.36 -2.36 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2469 0.7531 2 2 0.0000 0.0349 0.9651 2 2 0.0000 0.0178 0.9822
chr6 1610525 GCGCGGCGGC G 0.000960 0.100 1 -9 2 520 132 388 70 4 12 0 46 1 0 385 0 2 0.5303 0.0026 0.0077 9.917 2.11 8.76 -6.65 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8862 0.1138 0.0000 1 0 0.8803 0.1197 0.0000 1 0 0.8719 0.1281 0.0000
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 628 155 473 73 1 22 2 57 7 1 459 1 5 0.4710 0.0148 0.0296 6.000 2.10 4.53 -2.43 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6662 0.3276 0.0062 1 0 0.6636 0.3294 0.0070 1 0 0.6592 0.3325 0.0082
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 578 124 454 67 5 13 1 38 1 2 445 2 4 0.5403 0.0022 0.0198 8.538 0.88 3.71 -2.83 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8941 0.1052 0.0007 1 0 0.8870 0.1121 0.0009 1 0 0.8768 0.1220 0.0011
chr6 16327663 C CTGA 0.002924 0.100 1 3 1 1023 225 798 122 6 2 23 72 0 1 791 6 0 0.5422 0.0000 0.0088 101.500 1.20 5.99 -4.78 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9057 0.0943 0.0000 1 0 0.9015 0.0985 0.0000 1 0 0.8952 0.1048 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 658 141 517 123 1 3 0 14 0 0 516 0 1 0.8723 0.0000 0.0019 45.667 0.31 9.36 -9.05 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0640 0.9360 0.0000
chr6 29828657 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 586 174 412 89 0 6 1 78 0 0 412 0 0 0.5115 0.0000 0.0000 27.833 0.91 1.86 -0.95 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3587 0.5938 0.0475 1 1 0.3622 0.5859 0.0518 1 1 0.3658 0.5761 0.0580
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 442 133 309 0 0 1 1 131 0 0 309 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 132.000 1.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 950 233 717 211 1 4 0 17 0 0 717 0 0 0.9056 0.0000 0.0000 57.250 1.05 4.06 -3.01 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3490 0.6510 0.0000
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 629 151 478 129 5 10 1 6 0 0 478 0 0 0.8543 0.0000 0.0000 13.900 0.49 1.33 -0.84 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 0 0.5012 0.4988 0.0000 0 0 0.9161 0.0839 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 754 216 538 101 83 4 0 28 0 0 538 0 0 0.4676 0.0000 0.0000 52.750 0.45 1.93 -1.48 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 622 198 424 122 1 9 0 66 0 0 412 0 12 0.6162 0.0000 0.0283 21.000 0.54 11.33 -10.79 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9415 0.0584 0.0001 1 0 0.9358 0.0640 0.0002 1 0 0.9273 0.0724 0.0003
chr6 31954663 TGTCTCGATCCCG T 0.500000 0.100 1 -12 1 927 252 675 216 1 22 0 13 0 0 674 0 1 0.8571 0.0000 0.0015 10.455 0.25 12.23 -11.99 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0168 0.9832 0.0000 0 0 0.8241 0.1759 0.0000
chr6 32129540 G GAGACTTATGAGA 0.500000 0.100 1 12 1 657 152 505 134 1 13 0 4 0 0 504 0 1 0.8816 0.0000 0.0020 10.615 0.61 12.00 -11.39 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0142 0.9858 0.0000 0 0 0.8043 0.1957 0.0000 0 0 0.9656 0.0344 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 304 89 215 60 0 1 0 28 0 0 215 0 0 0.6742 0.0000 0.0000 88.000 0.55 3.96 -3.41 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8843 0.1142 0.0016 1 0 0.8745 0.1236 0.0020 1 0 0.8602 0.1371 0.0027
chr6 32521966 CG C 0.500000 0.100 1 -1 2 69 36 33 20 0 2 2 12 0 0 33 0 0 0.5556 0.0000 0.0000 17.000 0.90 9.25 -8.35 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3897 0.4969 0.1134 1 1 0.3854 0.4969 0.1177 1 1 0.3795 0.4970 0.1234
chr6 32530180 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 230 104 126 17 57 7 13 10 0 0 126 0 0 0.1635 0.0000 0.0000 6.000 0.06 4.90 -4.84 7 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9366 0.0629 0.0004 1 0 0.7815 0.2181 0.0005 0 1 0.1542 0.8456 0.0001
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 750 295 455 204 11 37 1 42 1 0 452 0 2 0.6915 0.0022 0.0066 7.139 6.48 7.52 -1.04 84 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 748 292 456 227 9 14 1 41 1 0 453 0 2 0.7774 0.0022 0.0066 23.167 7.16 7.61 -0.45 101 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 569 136 433 0 6 5 0 125 0 0 429 0 4 0.0000 0.0000 0.0092 26.200 3.28 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9083 0.0917 2 2 0.0000 0.2403 0.7597 2 2 0.0000 0.0554 0.9446
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 359 144 215 113 1 26 0 4 0 0 214 0 1 0.7847 0.0000 0.0047 4.538 0.58 6.00 -5.42 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0050 0.9950 0.0000 0 0 0.5915 0.4085 0.0000 0 0 0.9107 0.0893 0.0000
chr6 43198673 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 2 252 80 172 71 0 1 0 8 0 0 171 0 1 0.8875 0.0000 0.0058 79.000 0.13 3.00 -2.87 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 1 0.0886 0.9114 0.0000
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 858 188 670 151 3 21 0 13 0 0 670 0 0 0.8032 0.0000 0.0000 7.952 0.62 3.31 -2.69 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.2967 0.7033 0.0000
chr6 44002766 CGCGGCG C 0.500000 0.100 1 -6 1 455 119 336 45 1 33 0 40 0 0 335 0 1 0.3782 0.0000 0.0030 2.606 2.24 8.65 -6.41 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3109 0.5756 0.1135 1 1 0.3117 0.5699 0.1184 1 1 0.3124 0.5627 0.1249
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 575 148 427 8 0 80 1 59 0 0 405 0 22 0.0541 0.0000 0.0515 0.850 15.25 8.17 7.08 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9884 0.0116 2 1 0.0000 0.7641 0.2359
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.100 1 -15 2 575 187 388 117 0 56 0 14 0 0 388 0 0 0.6257 0.0000 0.0000 2.339 4.39 9.07 -4.68 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0353 0.9647 0.0000
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 778 133 645 59 2 33 0 39 2 1 626 5 11 0.4436 0.0031 0.0295 3.030 1.12 3.95 -2.83 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3813 0.5556 0.0631 1 1 0.3816 0.5508 0.0677 1 1 0.3811 0.5448 0.0741
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 144 49 95 21 0 8 2 18 0 0 95 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 5.125 0.14 3.67 -3.52 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2498 0.5485 0.2017 1 1 0.2509 0.5448 0.2043 1 1 0.2522 0.5403 0.2076
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 835 174 661 0 0 9 0 165 0 0 653 0 8 0.0000 0.0000 0.0121 18.333 3.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 149749749 G GGCAGCGGCGGCGACGGCAGTAACA 0.500000 0.100 1 24 1 270 91 179 56 0 10 0 25 0 0 163 0 16 0.6154 0.0000 0.0894 8.100 0.14 12.64 -12.50 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5622 0.4091 0.0287 1 0 0.5553 0.4128 0.0318 1 0 0.5455 0.4181 0.0364
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 1002 244 758 220 0 12 0 12 0 0 757 0 1 0.9016 0.0000 0.0013 19.333 0.21 3.00 -2.79 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0545 0.9455 0.0000 0 0 0.9115 0.0885 0.0000
chr6 156778871 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 514 147 367 114 9 14 6 4 1 1 365 0 0 0.7755 0.0027 0.0054 9.846 2.59 1.50 1.09 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.3002 0.6998 0.0000 0 0 0.8170 0.1830 0.0000
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 653 236 417 0 0 35 2 199 0 0 393 0 24 0.0000 0.0000 0.0576 5.743 15.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 488 182 306 104 0 7 1 70 0 0 302 0 4 0.5714 0.0000 0.0131 25.000 0.18 4.90 -4.72 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7851 0.2124 0.0025 1 0 0.7770 0.2199 0.0031 1 0 0.7653 0.2307 0.0041
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 224 85 139 47 0 2 0 36 0 0 138 0 1 0.5529 0.0000 0.0072 41.500 4.70 10.56 -5.85 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4428 0.4962 0.0610 1 1 0.4391 0.4956 0.0653 1 1 0.4337 0.4950 0.0713
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 224 80 144 9 0 11 0 60 0 0 140 0 4 0.1125 0.0000 0.0278 6.273 0.00 9.90 -9.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.9353 0.0647
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 387 171 216 1 0 20 9 141 0 0 213 0 3 0.0058 0.0000 0.0139 7.550 3.00 3.17 -0.17 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 669 219 450 57 46 18 51 47 0 0 450 0 0 0.2603 0.0000 0.0000 12.538 1.75 9.74 -7.99 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4650 0.5095 0.0255 1 1 0.4655 0.5059 0.0286 1 1 0.4649 0.5020 0.0331
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 668 206 462 89 22 11 60 24 0 0 462 0 0 0.4320 0.0000 0.0000 20.571 3.28 14.54 -11.26 29 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8683 0.1308 0.0009 1 0 0.8600 0.1388 0.0012 1 0 0.8479 0.1505 0.0016
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 292 93 199 0 0 4 1 88 0 0 195 0 4 0.0000 0.0000 0.0201 22.250 3.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0095 0.9905 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 343 116 227 47 0 30 0 39 0 0 226 0 1 0.4052 0.0000 0.0044 2.867 0.49 3.90 -3.41 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3596 0.5506 0.0898 1 1 0.3589 0.5465 0.0945 1 1 0.3575 0.5415 0.1011
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 246 101 145 0 0 3 0 98 0 0 144 0 1 0.0000 0.0000 0.0069 32.667 1.71 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0081 0.9919
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 702 196 506 81 0 32 6 77 0 0 505 0 1 0.4133 0.0000 0.0020 5.258 0.22 3.18 -2.96 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1112 0.6815 0.2073 1 1 0.1174 0.6689 0.2137 1 1 0.1257 0.6526 0.2217
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 401 109 292 58 0 2 0 49 0 0 291 0 1 0.5321 0.0000 0.0034 53.500 0.21 3.14 -2.94 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3647 0.5606 0.0747 1 1 0.3649 0.5556 0.0795 1 1 0.3645 0.5495 0.0860
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 133 61 72 32 4 3 4 18 0 0 71 1 0 0.5246 0.0000 0.0139 18.000 0.12 1.28 -1.15 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5560 0.4021 0.0420 1 0 0.5470 0.4073 0.0456 1 0 0.5348 0.4143 0.0509
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 550 152 398 96 1 2 0 53 0 0 398 0 0 0.6316 0.0000 0.0000 75.000 0.21 1.32 -1.11 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9493 0.0506 0.0002 1 0 0.9435 0.0563 0.0002 1 0 0.9347 0.0649 0.0003
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 204 65 139 29 0 2 0 34 0 1 138 0 0 0.4462 0.0000 0.0072 31.500 0.14 3.15 -3.01 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1347 0.5570 0.3083 1 1 0.1391 0.5527 0.3082 1 1 0.1449 0.5473 0.3078
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 273 106 167 47 1 2 1 55 0 0 166 0 1 0.4434 0.0000 0.0060 104.000 0.32 3.20 -2.88 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0626 0.5327 0.4047 1 1 0.0671 0.5295 0.4034 1 1 0.0733 0.5256 0.4010
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.100 1 3 5 327 105 222 50 1 24 0 30 0 0 222 0 0 0.4762 0.0000 0.0000 3.375 0.32 3.00 -2.68 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7209 0.2678 0.0112 1 0 0.7097 0.2773 0.0130 1 0 0.6940 0.2903 0.0157
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 393 145 248 68 0 0 0 77 0 0 248 0 0 0.4690 0.0000 0.0000 145.000 0.09 1.70 -1.61 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0592 0.5883 0.3525 1 1 0.0639 0.5811 0.3550 1 1 0.0704 0.5722 0.3574
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 892 245 647 0 0 19 1 225 0 0 637 0 10 0.0000 0.0000 0.0155 11.842 3.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 660 164 496 66 0 18 1 79 0 0 494 0 2 0.4024 0.0000 0.0040 8.111 0.38 3.53 -3.15 28 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0225 0.4498 0.5277 1 2 0.0253 0.4500 0.5247 1 2 0.0294 0.4509 0.5197
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 569 215 354 122 13 74 2 4 0 0 354 0 0 0.5674 0.0000 0.0000 1.878 1.11 5.00 -3.89 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0599 0.9401 0.0000 0 0 0.8675 0.1325 0.0000 0 0 0.9708 0.0292 0.0000
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 516 151 365 75 0 4 1 71 0 0 363 0 2 0.4967 0.0000 0.0055 36.750 0.37 3.97 -3.60 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1792 0.6739 0.1469 1 1 0.1853 0.6617 0.1530 1 1 0.1929 0.6461 0.1610
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 212 89 123 60 0 0 0 29 0 0 117 0 6 0.6742 0.0000 0.0488 89.000 0.18 26.90 -26.71 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7847 0.2098 0.0055 1 0 0.7736 0.2198 0.0066 1 0 0.7580 0.2337 0.0083
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 662 197 465 90 0 9 0 98 1 0 461 0 3 0.4569 0.0022 0.0086 20.889 0.40 3.37 -2.97 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0453 0.6258 0.3289 1 1 0.0497 0.6158 0.3345 1 1 0.0560 0.6033 0.3407
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 400 126 274 3 0 35 1 87 1 0 258 0 15 0.0238 0.0036 0.0584 2.676 4.33 7.29 -2.95 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9707 0.0293 2 2 0.0000 0.2924 0.7076 2 2 0.0000 0.0823 0.9177
chr7 103989356 T TGCCGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 12 1 400 126 274 7 2 54 2 61 1 1 260 2 10 0.0556 0.0036 0.0511 1.340 3.86 7.28 -3.42 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.9252 0.0748
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 846 213 633 192 0 14 0 7 0 0 633 0 0 0.9014 0.0000 0.0000 14.214 0.67 3.86 -3.19 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0031 0.9969 0.0000 0 0 0.8945 0.1055 0.0000 0 0 0.9920 0.0080 0.0000
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 443 223 220 87 1 40 1 94 0 1 213 0 6 0.3901 0.0000 0.0318 4.550 7.34 5.87 1.47 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0349 0.5835 0.3816 1 1 0.0387 0.5757 0.3856 1 1 0.0442 0.5661 0.3897
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 443 232 211 106 0 32 0 94 0 0 209 0 2 0.4569 0.0000 0.0095 6.250 5.21 6.87 -1.66 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3188 0.6373 0.0439 1 1 0.3251 0.6265 0.0484 1 1 0.3324 0.6130 0.0547
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 249 79 170 36 0 1 1 41 0 0 167 0 3 0.4557 0.0000 0.0176 78.000 0.03 3.27 -3.24 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0704 0.5108 0.4188 1 1 0.0749 0.5094 0.4158 1 1 0.0811 0.5077 0.4113
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 1009 261 748 3 1 35 9 213 0 0 743 1 4 0.0115 0.0000 0.0067 6.400 0.00 3.11 -3.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0092 0.9908 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 863 212 651 181 2 12 0 17 0 0 650 1 0 0.8538 0.0000 0.0015 18.182 0.29 1.12 -0.83 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0748 0.9252 0.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 763 156 607 89 0 4 0 63 0 0 606 0 1 0.5705 0.0000 0.0016 38.000 0.42 4.27 -3.85 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7340 0.2609 0.0052 1 0 0.7256 0.2682 0.0062 1 0 0.7136 0.2785 0.0078
chr7 144667784 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 200 91 109 83 0 3 0 5 0 0 109 0 0 0.9121 0.0000 0.0000 29.333 0.08 2.60 -2.52 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2380 0.7620 0.0000 0 0 0.6949 0.3051 0.0000
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 876 206 670 6 0 5 0 195 0 0 665 0 5 0.0291 0.0000 0.0075 40.200 0.67 1.19 -0.53 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9566 0.0434 2 2 0.0000 0.0264 0.9736 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr7 150331050 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 828 227 601 209 0 4 0 14 0 0 601 0 0 0.9207 0.0000 0.0000 55.750 0.21 1.14 -0.93 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0117 0.9883 0.0000 0 0 0.7625 0.2375 0.0000
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 437 85 352 0 0 0 16 69 0 0 326 7 19 0.0000 0.0000 0.0739 84.000 6.94 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0044 0.9956
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 436 85 351 0 1 6 9 69 0 0 321 9 21 0.0000 0.0000 0.0855 37.500 6.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0050 0.9950
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 438 86 352 0 0 9 8 69 0 0 292 22 38 0.0000 0.0000 0.1705 9.500 6.81 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 401 145 256 0 0 1 2 142 0 0 256 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 142.000 1.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr7 157009949 A AGCGGCGGCGGCG 0.500000 0.100 1 12 5 530 63 467 8 7 21 9 18 1 0 463 0 3 0.1270 0.0021 0.0086 1.944 4.88 8.44 -3.57 6 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0335 0.3535 0.6130 1 2 0.0368 0.3613 0.6018 1 2 0.0416 0.3720 0.5864
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 429 103 326 56 0 2 0 45 0 0 324 0 2 0.5437 0.0000 0.0061 50.500 0.16 3.31 -3.15 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3958 0.5377 0.0665 1 1 0.3948 0.5342 0.0710 1 1 0.3927 0.5300 0.0774
chr8 544658 GGGCGGC G 0.425210 0.100 1 -6 1 269 118 151 110 0 4 0 4 0 0 151 0 0 0.9322 0.0000 0.0000 28.500 0.39 6.25 -5.86 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0486 0.9514 0.0000 0 0 0.8243 0.1757 0.0000 0 0 0.9561 0.0439 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 911 191 720 159 0 20 0 12 0 0 720 0 0 0.8325 0.0000 0.0000 8.550 0.57 6.58 -6.02 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.4604 0.5396 0.0000
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.100 1 -6 2 767 166 601 72 0 40 1 53 0 0 596 0 5 0.4337 0.0000 0.0083 3.125 0.33 6.60 -6.27 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4903 0.4775 0.0322 1 0 0.4881 0.4764 0.0355 1 0 0.4843 0.4754 0.0402
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 319 119 200 55 0 7 0 57 0 0 200 0 0 0.4622 0.0000 0.0000 16.000 0.36 3.00 -2.64 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1638 0.6337 0.2026 1 1 0.1695 0.6241 0.2064 1 1 0.1769 0.6120 0.2111
chr8 10610119 T TTTC 0.070211 0.100 1 3 1 1192 328 864 142 4 19 75 88 1 2 839 7 15 0.4329 0.0012 0.0289 18.846 3.70 5.97 -2.26 38 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0167 0.8471 0.1362 1 1 0.0203 0.8411 0.1386 1 1 0.0261 0.8330 0.1408
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 666 286 380 0 0 37 1 248 0 0 379 0 1 0.0000 0.0000 0.0026 6.730 6.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 652 219 433 113 0 6 0 100 0 0 433 0 0 0.5160 0.0000 0.0000 35.500 0.45 3.35 -2.90 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4325 0.5473 0.0202 1 1 0.4385 0.5389 0.0226 1 1 0.4451 0.5287 0.0262
chr8 55786336 TGAAGAA T 0.000659 0.100 1 -6 1 592 172 420 159 1 6 0 6 0 0 420 0 0 0.9244 0.0000 0.0000 27.667 0.17 5.00 -4.83 79 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8950 0.1050 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 670 196 474 139 12 37 0 8 0 0 474 0 0 0.7092 0.0000 0.0000 4.297 0.42 3.50 -3.08 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.8294 0.1706 0.0000 0 0 0.9914 0.0086 0.0000
chr8 97775937 C CGGCGGGCTCCAGGCGA 0.500000 0.100 1 16 1 310 101 209 45 0 14 1 41 0 0 199 0 10 0.4455 0.0000 0.0478 6.214 0.60 12.73 -12.13 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0874 0.5627 0.3499 1 1 0.0922 0.5578 0.3500 1 1 0.0989 0.5516 0.3496
chr8 100194231 A AGAC 0.500000 0.100 1 3 5 200 87 113 84 0 1 0 2 0 0 113 0 0 0.9655 0.0000 0.0000 86.000 0.21 4.00 -3.79 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4592 0.5408 0.0000 0 0 0.8875 0.1125 0.0000 0 0 0.9423 0.0577 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 778 265 513 250 1 8 0 6 0 0 513 0 0 0.9434 0.0000 0.0000 32.125 2.49 19.17 -16.67 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3667 0.6333 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr8 141449677 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 344 140 204 89 0 2 0 49 0 0 202 1 1 0.6357 0.0000 0.0098 69.000 1.04 4.00 -2.96 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9159 0.0836 0.0005 1 0 0.9083 0.0911 0.0006 1 0 0.8970 0.1021 0.0009
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 511 153 358 0 0 23 9 121 0 0 353 1 4 0.0000 0.0000 0.0140 5.652 4.92 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 1016 196 820 91 0 32 0 73 0 1 803 0 16 0.4643 0.0000 0.0207 5.125 0.53 12.16 -11.64 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1904 0.7002 0.1094 1 1 0.1976 0.6865 0.1160 1 1 0.2065 0.6689 0.1247
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 669 209 460 77 1 50 13 68 0 0 460 0 0 0.3684 0.0000 0.0000 3.180 0.38 3.53 -3.15 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2087 0.7260 0.0653 1 1 0.2200 0.7128 0.0672 1 1 0.2349 0.6956 0.0695
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 341 98 243 60 0 31 0 7 0 0 243 0 0 0.6122 0.0000 0.0000 2.161 0.50 7.43 -6.93 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0115 0.9885 0.0000 0 1 0.1707 0.8293 0.0000
chr9 27524366 G GTGTT 0.500000 0.100 1 4 4 336 92 244 56 0 4 0 32 0 0 239 0 5 0.6087 0.0000 0.0205 22.000 0.14 6.53 -6.39 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6653 0.3193 0.0154 1 0 0.6555 0.3269 0.0175 1 0 0.6419 0.3373 0.0208
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 392 118 274 0 0 3 0 115 0 0 274 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 38.333 1.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr9 33796692 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 452 181 271 92 1 7 1 80 0 0 270 0 1 0.5083 0.0000 0.0037 24.857 0.89 3.10 -2.21 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3697 0.5882 0.0421 1 1 0.3733 0.5805 0.0462 1 1 0.3770 0.5709 0.0521
chr9 35562396 A ATAGT 0.500000 0.100 1 4 5 751 144 607 78 0 3 0 63 0 0 606 0 1 0.5417 0.0000 0.0016 47.000 0.68 4.67 -3.99 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4844 0.4854 0.0302 1 1 0.4826 0.4839 0.0335 1 1 0.4791 0.4826 0.0383
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 842 224 618 109 0 33 0 82 0 0 608 0 10 0.4866 0.0000 0.0162 5.788 0.36 11.20 -10.84 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4930 0.4900 0.0170 1 0 0.4941 0.4865 0.0194 1 0 0.4943 0.4827 0.0230
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 468 89 379 7 0 1 0 81 0 0 377 0 2 0.0787 0.0000 0.0053 88.000 1.00 1.06 -0.06 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9645 0.0355 2 1 0.0000 0.6138 0.3862
chr9 70140212 TAAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 271 106 165 54 0 1 0 51 0 0 163 0 2 0.5094 0.0000 0.0121 105.000 0.13 3.18 -3.05 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2049 0.6271 0.1680 1 1 0.2092 0.6179 0.1729 1 1 0.2147 0.6061 0.1792
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 475 122 353 0 0 3 1 118 0 0 338 0 15 0.0000 0.0000 0.0425 39.667 12.66 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 795 152 643 0 0 15 0 137 0 0 631 0 12 0.0000 0.0000 0.0187 9.133 10.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr9 77384631 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 506 166 340 85 1 23 4 53 0 0 339 0 1 0.5120 0.0000 0.0029 6.217 0.15 3.09 -2.94 63 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7952 0.2017 0.0031 1 0 0.7859 0.2103 0.0038 1 0 0.7725 0.2225 0.0050
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 512 138 374 13 0 7 0 118 0 0 369 0 5 0.0942 0.0000 0.0134 18.714 0.15 3.28 -3.13 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9149 0.0851
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 338 112 226 5 0 23 10 74 0 0 226 0 0 0.0446 0.0000 0.0000 3.870 0.40 3.41 -3.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.7553 0.2447 2 2 0.0000 0.2959 0.7041
chr9 92474742 CTCATCA C 0.500000 0.100 1 -6 2 339 114 225 7 3 92 2 10 0 0 225 0 0 0.0614 0.0000 0.0000 0.205 0.29 6.00 -5.71 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1997 0.5220 0.2783 1 1 0.2019 0.5203 0.2778 1 1 0.2048 0.5183 0.2769
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 509 201 308 187 3 4 0 7 0 0 308 0 0 0.9303 0.0000 0.0000 49.250 0.33 13.14 -12.81 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 0 0.8845 0.1155 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 607 232 375 114 0 0 0 118 0 0 372 0 3 0.4914 0.0000 0.0080 232.000 0.18 3.28 -3.10 44 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0566 0.7169 0.2265 1 1 0.0621 0.7022 0.2357 1 1 0.0699 0.6831 0.2470
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 445 112 333 10 0 17 1 84 0 0 332 0 1 0.0893 0.0000 0.0030 5.588 0.30 5.40 -5.10 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.9022 0.0978
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 1031 152 879 3 2 54 3 90 0 4 858 2 15 0.0197 0.0000 0.0239 1.759 4.67 5.89 -1.22 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9883 0.0117 2 2 0.0000 0.4923 0.5077 2 2 0.0000 0.1486 0.8514
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 320 121 199 0 0 0 0 121 0 0 198 0 1 0.0000 0.0000 0.0050 121.000 4.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0027 0.9973
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 499 98 401 0 0 14 0 84 0 0 400 0 1 0.0000 0.0000 0.0025 6.000 6.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0130 0.9870 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0159 0.9841
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 609 143 466 10 0 13 2 118 0 0 465 0 1 0.0699 0.0000 0.0021 10.000 0.00 1.47 -1.47 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9896 0.0104 2 1 0.0000 0.6309 0.3691
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 673 209 464 0 0 7 0 202 0 0 455 0 9 0.0000 0.0000 0.0194 28.857 3.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 299 102 197 48 0 19 0 35 1 0 195 0 1 0.4706 0.0051 0.0102 4.368 0.38 7.46 -7.08 30 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5229 0.4374 0.0397 1 0 0.5165 0.4401 0.0434 1 0 0.5076 0.4438 0.0486
chr9 130681605 T TCGCCGC 0.500000 0.100 1 6 1 494 147 347 61 1 44 0 41 1 2 339 0 5 0.4150 0.0029 0.0231 2.341 2.20 6.12 -3.93 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6375 0.3465 0.0159 1 0 0.6293 0.3526 0.0182 1 0 0.6175 0.3610 0.0215
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 292 123 169 5 0 0 1 117 0 0 169 0 0 0.0407 0.0000 0.0000 123.000 0.00 2.68 -2.68 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9938 0.0062 2 2 0.0000 0.3605 0.6395 2 2 0.0000 0.0746 0.9254
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 292 123 169 5 0 0 1 117 0 0 169 0 0 0.0407 0.0000 0.0000 123.000 0.00 2.68 -2.68 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9938 0.0062 2 2 0.0000 0.3605 0.6395 2 2 0.0000 0.0746 0.9254
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 263 103 160 5 0 4 1 93 0 0 159 0 1 0.0485 0.0000 0.0063 24.750 0.20 1.86 -1.66 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9979 0.0021 2 1 0.0000 0.6353 0.3647 2 2 0.0000 0.1962 0.8038
chr9 135945095 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 328 107 221 71 0 4 0 32 0 0 220 0 1 0.6636 0.0000 0.0045 25.750 0.32 3.19 -2.86 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9280 0.0715 0.0005 1 0 0.9204 0.0789 0.0007 1 0 0.9091 0.0900 0.0010
chr9 136341024 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 311 96 215 88 0 4 0 4 0 0 215 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 23.000 0.66 2.25 -1.59 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0129 0.9871 0.0000 0 0 0.5368 0.4632 0.0000 0 0 0.8464 0.1536 0.0000
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 483 128 355 7 0 9 1 111 0 0 341 0 14 0.0547 0.0000 0.0394 13.222 0.71 12.69 -11.98 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7613 0.2387 2 2 0.0000 0.1650 0.8350
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 261 114 147 41 43 15 1 14 0 1 145 1 0 0.3596 0.0000 0.0136 6.600 0.37 3.29 -2.92 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 882 186 696 4 0 9 0 173 0 0 681 0 15 0.0215 0.0000 0.0216 19.667 0.00 8.35 -8.35 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9111 0.0889 2 2 0.0000 0.1080 0.8920 2 2 0.0000 0.0283 0.9717
chr10 7965424 GAAAGAT G 0.500000 0.100 1 -6 1 503 139 364 124 1 8 0 6 0 0 364 0 0 0.8921 0.0000 0.0000 16.375 0.31 6.00 -5.69 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.4637 0.5363 0.0000 0 0 0.9016 0.0984 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 268 111 157 101 0 5 0 5 0 0 157 0 0 0.9099 0.0000 0.0000 21.200 0.10 3.60 -3.50 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0110 0.9890 0.0000 0 0 0.7643 0.2357 0.0000 0 0 0.9588 0.0412 0.0000
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 957 194 763 15 0 21 2 156 0 0 745 0 18 0.0773 0.0000 0.0236 8.190 0.00 5.48 -5.48 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.7579 0.2421
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 742 148 594 83 0 4 0 61 0 0 593 0 1 0.5608 0.0000 0.0017 36.000 0.13 3.89 -3.75 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7416 0.2544 0.0040 1 0 0.7360 0.2593 0.0047 1 0 0.7278 0.2664 0.0058
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 618 165 453 156 0 4 0 5 0 0 453 0 0 0.9455 0.0000 0.0000 40.250 0.33 1.20 -0.87 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0865 0.9135 0.0000 0 0 0.9590 0.0410 0.0000 0 0 0.9935 0.0065 0.0000
chr10 53822780 C CCTTCTATCATCAGTGTTT 0.000071 0.100 1 18 2 445 97 348 81 2 13 0 1 1 0 346 0 1 0.8351 0.0029 0.0057 6.308 0.28 18.00 -17.72 11 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 122 52 70 4 0 0 0 48 0 0 69 0 1 0.0769 0.0000 0.0143 52.000 0.00 6.58 -6.58 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9714 0.0286 2 1 0.0000 0.8702 0.1298
chr10 73800402 CGAG C 0.000083 0.100 1 -3 3 741 232 509 216 0 4 0 12 0 0 509 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 57.000 0.23 2.83 -2.61 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 467 105 362 34 0 24 0 47 0 0 361 0 1 0.3238 0.0000 0.0028 3.375 0.18 3.06 -2.89 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0885 0.6349 0.2766 1 1 0.0961 0.6340 0.2699 1 1 0.1070 0.6325 0.2606
chr10 80081672 AAAAG A 0.045655 0.100 1 -4 10 263 59 204 47 3 5 0 4 0 0 204 0 0 0.7966 0.0000 0.0000 10.800 0.83 5.25 -4.42 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0354 0.9646 0.0000 0 0 0.7810 0.2190 0.0000 0 0 0.9474 0.0526 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 763 167 596 148 0 7 0 12 0 0 595 0 1 0.8862 0.0000 0.0017 22.857 0.41 6.42 -6.01 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 1 0.4768 0.5232 0.0000
chr10 97865640 CGGCAGCAGCAGCGGCAGT C 0.000018 0.100 1 -18 1 416 186 230 94 0 28 0 64 1 0 223 0 6 0.5054 0.0043 0.0304 5.643 0.16 13.47 -13.31 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8414 0.1586 0.0000 1 0 0.8367 0.1633 0.0000 1 0 0.8299 0.1701 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 725 229 496 109 1 26 0 93 0 0 492 0 4 0.4760 0.0000 0.0081 7.808 0.17 6.69 -6.52 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4107 0.5642 0.0251 1 1 0.4158 0.5560 0.0281 1 1 0.4213 0.5462 0.0325
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 423 91 332 0 0 9 0 82 1 0 319 3 9 0.0000 0.0030 0.0392 9.111 6.01 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0782 0.9218 2 2 0.0000 0.0285 0.9715 2 2 0.0000 0.0215 0.9785
chr10 104263071 AGAG A 0.030712 0.100 1 -3 1 136 45 91 22 0 2 0 21 0 0 91 0 0 0.4889 0.0000 0.0000 21.500 0.82 2.76 -1.94 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4588 0.5293 0.0119 1 1 0.4617 0.5262 0.0121 1 1 0.4653 0.5224 0.0123
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 214 71 143 0 0 0 1 70 0 0 141 0 2 0.0000 0.0000 0.0140 71.000 3.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0092 0.9908 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0110 0.9890
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 372 72 300 30 7 6 5 24 0 10 284 0 6 0.4167 0.0000 0.0533 10.167 1.37 2.50 -1.13 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4783 0.4689 0.0528 1 0 0.4722 0.4706 0.0572 1 1 0.4637 0.4730 0.0633
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.100 1 21 2 740 142 598 81 0 8 1 52 2 0 577 0 19 0.5704 0.0033 0.0351 16.625 0.37 13.60 -13.23 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5489 0.4424 0.0087 1 0 0.5520 0.4385 0.0095 1 0 0.5552 0.4341 0.0107
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 376 121 255 107 0 8 0 6 0 0 255 0 0 0.8843 0.0000 0.0000 14.125 0.10 1.00 -0.90 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2637 0.7363 0.0000 0 0 0.7937 0.2063 0.0000
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 658 152 506 71 0 8 0 73 0 0 505 0 1 0.4671 0.0000 0.0020 18.000 0.15 2.92 -2.76 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1635 0.6820 0.1545 1 1 0.1716 0.6701 0.1583 1 1 0.1821 0.6548 0.1631
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 294 106 188 50 0 1 0 55 0 0 188 0 0 0.4717 0.0000 0.0000 105.000 0.30 2.11 -1.81 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1247 0.6115 0.2638 1 1 0.1305 0.6038 0.2657 1 1 0.1383 0.5940 0.2677
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1126 258 868 0 0 96 1 161 0 0 868 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 1.677 8.66 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.100 1 -30 1 1215 298 917 46 5 112 2 133 0 0 871 0 46 0.1544 0.0000 0.0502 1.661 3.52 13.99 -10.47 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 1 0.0000 0.9126 0.0874 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 1140 341 799 24 2 132 9 174 0 0 798 1 0 0.0704 0.0000 0.0013 1.568 2.00 10.60 -8.60 6 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 402 128 274 0 0 4 0 124 0 0 270 0 4 0.0000 0.0000 0.0146 31.000 3.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 271 122 149 7 0 0 1 114 0 0 147 0 2 0.0574 0.0000 0.0134 122.000 0.29 2.03 -1.74 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8332 0.1668 2 2 0.0000 0.2342 0.7658
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 760 194 566 109 0 4 1 80 0 0 566 0 0 0.5619 0.0000 0.0000 63.333 0.06 4.21 -4.16 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7525 0.2444 0.0031 1 0 0.7453 0.2509 0.0038 1 0 0.7347 0.2604 0.0049
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 568 139 429 91 0 2 0 46 0 0 427 0 2 0.6547 0.0000 0.0047 68.500 0.26 2.61 -2.34 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9470 0.0528 0.0002 1 0 0.9410 0.0587 0.0003 1 0 0.9319 0.0677 0.0004
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 523 137 386 120 0 4 0 13 0 0 386 0 0 0.8759 0.0000 0.0000 33.250 1.21 2.31 -1.10 84 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0753 0.9247 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 702 147 555 34 0 2 1 110 0 0 543 0 12 0.2313 0.0000 0.0216 72.500 0.35 5.97 -5.62 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 1 0.0000 0.9293 0.0707 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 534 141 393 15 0 4 0 122 0 0 393 0 0 0.1064 0.0000 0.0000 34.250 0.27 1.58 -1.32 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9759 0.0241
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.100 1 2 1 622 153 469 73 0 1 0 79 0 0 469 0 0 0.4771 0.0000 0.0000 152.000 0.04 2.08 -2.03 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0839 0.6406 0.2755 1 1 0.0893 0.6304 0.2803 1 1 0.0968 0.6173 0.2859
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 880 154 726 0 0 14 0 140 0 0 697 0 29 0.0000 0.0000 0.0399 10.000 9.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 303 153 150 77 1 18 2 55 0 0 150 0 0 0.5033 0.0000 0.0000 7.500 0.31 4.40 -4.09 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6661 0.3235 0.0105 1 0 0.6583 0.3295 0.0121 1 0 0.6472 0.3381 0.0147
chr11 9265049 T TCCG 0.500000 0.100 1 3 5 141 72 69 33 2 10 2 25 0 0 69 0 0 0.4583 0.0000 0.0000 6.000 0.64 3.84 -3.20 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4231 0.4969 0.0800 1 1 0.4189 0.4967 0.0845 1 1 0.4129 0.4964 0.0907
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 211 76 135 70 0 0 0 6 1 0 134 0 0 0.9211 0.0074 0.0074 76.000 0.39 3.00 -2.61 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0551 0.9449 0.0000 0 1 0.4000 0.6000 0.0000
chr11 18477710 TAGG T 0.500000 0.100 1 -3 2 274 122 152 69 0 5 0 48 0 0 148 0 4 0.5656 0.0000 0.0263 23.400 0.09 3.08 -3.00 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5863 0.3936 0.0202 1 0 0.5800 0.3973 0.0227 1 0 0.5708 0.4026 0.0265
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 260 105 155 49 0 2 0 54 0 0 154 0 1 0.4667 0.0000 0.0065 51.500 0.61 6.04 -5.42 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0969 0.5849 0.3183 1 1 0.1019 0.5784 0.3197 1 1 0.1087 0.5703 0.3210
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 909 285 624 264 0 8 0 13 0 0 623 0 1 0.9263 0.0000 0.0016 34.625 0.24 3.08 -2.84 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1520 0.8480 0.0000 0 0 0.9787 0.0213 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 790 173 617 0 0 5 1 167 0 0 610 0 7 0.0000 0.0000 0.0113 33.600 2.41 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 84 37 47 28 0 0 0 9 0 0 47 0 0 0.7568 0.0000 0.0000 37.000 0.43 2.00 -1.57 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7078 0.2758 0.0164 1 0 0.6279 0.3553 0.0168 1 1 0.3940 0.5934 0.0126
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 1062 196 866 19 0 38 1 138 0 0 807 0 59 0.0969 0.0000 0.0681 4.158 0.05 5.09 -5.03 13 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9300 0.0700
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1238 227 1011 59 4 108 2 54 1 1 959 2 48 0.2599 0.0010 0.0514 1.065 0.41 11.56 -11.15 11 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0003 0.0726 0.9272 1 2 0.0004 0.0792 0.9204 1 2 0.0006 0.0890 0.9104
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 981 251 730 0 0 12 0 239 0 0 729 0 1 0.0000 0.0000 0.0014 19.917 2.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 865 194 671 83 1 17 2 91 0 0 670 1 0 0.4278 0.0000 0.0015 10.353 0.24 2.99 -2.75 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0487 0.6131 0.3382 1 1 0.0532 0.6040 0.3428 1 1 0.0595 0.5926 0.3478
chr11 74994609 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 217 87 130 46 0 3 0 38 0 0 130 0 0 0.5287 0.0000 0.0000 28.000 0.74 2.00 -1.26 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3889 0.5314 0.0797 1 1 0.3871 0.5286 0.0843 1 1 0.3841 0.5252 0.0907
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 269 95 174 66 0 2 0 27 0 0 172 0 2 0.6947 0.0000 0.0115 46.500 0.32 18.63 -18.31 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9242 0.0752 0.0006 1 0 0.9162 0.0830 0.0008 1 0 0.9044 0.0944 0.0011
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 170 95 75 90 0 0 0 5 0 0 75 0 0 0.9474 0.0000 0.0000 95.000 0.47 3.00 -2.53 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.3055 0.6945 0.0000 0 0 0.7614 0.2386 0.0000
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 459 112 347 17 0 5 0 90 0 0 347 0 0 0.1518 0.0000 0.0000 21.400 0.65 4.29 -3.64 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1372 382 990 0 2 70 4 306 0 0 990 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.544 7.36 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 107348963 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 92 50 42 37 0 3 0 10 0 0 42 0 0 0.7400 0.0000 0.0000 15.667 0.35 2.80 -2.45 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6323 0.3647 0.0030 0 1 0.2229 0.7758 0.0013 0 1 0.0515 0.9481 0.0003
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 883 268 615 126 1 43 1 97 0 1 612 0 2 0.4701 0.0000 0.0049 5.209 1.06 10.61 -9.54 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7207 0.2765 0.0028 1 0 0.7157 0.2808 0.0035 1 0 0.7079 0.2876 0.0046
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 321 135 186 78 0 2 0 55 0 0 184 0 2 0.5778 0.0000 0.0108 66.500 0.27 7.75 -7.48 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6670 0.3226 0.0104 1 0 0.6592 0.3287 0.0120 1 0 0.6481 0.3373 0.0146
chr11 118663422 CCGTGGCAGTAAATCTCACTGCAGAGA C 0.500000 0.100 1 -26 4 569 103 466 99 0 2 0 2 0 0 465 0 1 0.9612 0.0000 0.0021 50.500 0.61 14.50 -13.89 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1649 0.8351 0.0000 0 0 0.8520 0.1480 0.0000 0 0 0.9468 0.0532 0.0000
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 449 134 315 74 0 6 1 53 0 0 314 0 1 0.5522 0.0000 0.0032 21.333 0.45 6.30 -5.86 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6267 0.3588 0.0145 1 0 0.6197 0.3637 0.0166 1 0 0.6095 0.3707 0.0197
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.100 1 -6 1 263 92 171 38 2 13 1 38 0 0 171 0 0 0.4130 0.0000 0.0000 6.077 0.37 5.55 -5.18 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2215 0.5944 0.1841 1 1 0.2246 0.5874 0.1880 1 1 0.2284 0.5785 0.1930
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 426 120 306 60 1 11 4 44 0 0 302 0 4 0.5000 0.0000 0.0131 9.818 0.68 3.55 -2.86 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3779 0.5546 0.0675 1 1 0.3779 0.5499 0.0722 1 1 0.3772 0.5442 0.0786
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 408 129 279 122 0 2 0 5 0 0 279 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 63.500 1.03 1.20 -0.17 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0203 0.9797 0.0000 0 0 0.8478 0.1522 0.0000 0 0 0.9747 0.0253 0.0000
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 409 156 253 83 0 1 0 72 0 0 252 0 1 0.5321 0.0000 0.0040 155.000 0.87 2.00 -1.13 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3169 0.6197 0.0634 1 1 0.3191 0.6120 0.0689 1 1 0.3211 0.6022 0.0767
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 583 161 422 12 1 28 6 114 0 0 415 0 7 0.0745 0.0000 0.0166 4.750 0.00 3.21 -3.21 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9203 0.0797
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.100 1 1 1 660 149 511 137 0 5 0 7 0 1 510 0 0 0.9195 0.0000 0.0020 28.800 0.34 3.00 -2.66 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.7922 0.2078 0.0000 0 0 0.9836 0.0164 0.0000
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.100 1 -1 1 670 154 516 143 1 3 0 7 0 0 516 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 50.333 0.31 3.00 -2.69 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.8395 0.1605 0.0000 0 0 0.9879 0.0121 0.0000
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 452 133 319 41 2 27 6 57 0 0 319 0 0 0.3083 0.0000 0.0000 3.889 0.44 3.19 -2.75 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0108 0.2926 0.6966 1 2 0.0124 0.2998 0.6878 1 2 0.0149 0.3098 0.6753
chr12 6667903 TTGCTGCTGCTGC T 0.003876 0.100 1 -12 1 452 137 315 107 3 23 0 4 0 0 315 0 0 0.7810 0.0000 0.0000 4.957 1.81 9.00 -7.19 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9072 0.0928 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 1466 366 1100 317 2 4 0 43 0 1 1099 0 0 0.8661 0.0000 0.0009 90.250 1.69 3.79 -2.10 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 279 95 184 81 0 2 0 12 0 0 184 0 0 0.8526 0.0000 0.0000 46.500 0.09 4.33 -4.25 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0222 0.9778 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 320 142 178 0 0 9 7 126 0 0 178 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 14.778 4.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.100 1 -2 1 567 124 443 63 0 3 0 58 0 0 442 0 1 0.5081 0.0000 0.0023 40.333 0.30 2.24 -1.94 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3978 0.5711 0.0312 1 1 0.4042 0.5631 0.0327 1 1 0.4120 0.5533 0.0347
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 422 92 330 49 0 0 0 43 0 0 329 0 1 0.5326 0.0000 0.0030 92.000 0.18 3.91 -3.72 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3526 0.5615 0.0859 1 1 0.3544 0.5558 0.0898 1 1 0.3563 0.5488 0.0949
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.100 1 -30 1 1289 342 947 143 5 68 3 123 4 2 937 0 4 0.4181 0.0042 0.0106 4.091 1.69 8.85 -7.17 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6845 0.3141 0.0014 1 0 0.6872 0.3112 0.0016 1 0 0.6893 0.3086 0.0021
chr12 40483097 AAGTGACAGGGACAACTAGACTATCAGCTGG A 0.146503 0.100 1 -30 1 1103 250 853 153 1 33 0 63 0 5 845 1 2 0.6120 0.0000 0.0094 6.576 2.05 12.21 -10.16 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1072 194 878 82 0 94 1 17 2 1 861 0 14 0.4227 0.0023 0.0194 1.064 3.20 4.18 -0.98 24 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9807 0.0193 0.0000 1 0 0.9774 0.0225 0.0000 1 0 0.9714 0.0286 0.0001
chr12 42144454 GGCCCGCGACGCCGGCGCCTCTCACGGCGCCGCGTCCGCC G 0.013087 0.100 1 -39 4 278 115 163 79 0 2 0 34 0 0 149 0 14 0.6870 0.0000 0.0859 56.500 2.75 22.15 -19.40 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9196 0.0804 0.0000 1 0 0.9141 0.0859 0.0000 1 0 0.9061 0.0938 0.0000
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 706 181 525 160 0 3 0 18 0 0 525 0 0 0.8840 0.0000 0.0000 59.333 0.24 1.06 -0.82 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0797 0.9203 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 1025 248 777 126 2 20 1 99 0 0 777 0 0 0.5081 0.0000 0.0000 11.350 0.75 13.62 -12.87 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7334 0.2641 0.0025 1 0 0.7287 0.2682 0.0031 1 0 0.7213 0.2747 0.0041
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 365 83 282 44 0 2 0 37 0 0 282 0 0 0.5301 0.0000 0.0000 40.500 0.39 1.65 -1.26 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4596 0.4904 0.0500 1 1 0.4591 0.4882 0.0527 1 1 0.4579 0.4858 0.0564
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 383 100 283 11 0 0 0 89 0 0 282 0 1 0.1100 0.0000 0.0035 100.000 0.09 1.19 -1.10 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9555 0.0445
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 472 97 375 55 17 14 3 8 0 0 375 0 0 0.5670 0.0000 0.0000 5.500 0.58 1.12 -0.54 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0096 0.9904 0.0000 0 1 0.2162 0.7838 0.0000
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 106 53 53 0 0 0 0 53 0 0 53 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 53.000 2.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0365 0.9635 2 2 0.0000 0.0384 0.9616 2 2 0.0000 0.0413 0.9587
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 407 118 289 57 0 3 0 58 0 0 288 0 1 0.4831 0.0000 0.0035 38.333 1.04 3.78 -2.74 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1776 0.6428 0.1796 1 1 0.1840 0.6328 0.1832 1 1 0.1922 0.6201 0.1876
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 145 46 99 41 0 3 0 2 0 0 99 0 0 0.8913 0.0000 0.0000 14.333 0.10 3.50 -3.40 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1312 0.8688 0.0000 0 0 0.5946 0.4054 0.0000 0 0 0.7632 0.2368 0.0000
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1066 312 754 0 0 20 2 290 0 0 753 0 1 0.0000 0.0000 0.0013 14.550 3.39 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 102958393 C CGCAGCAGCA 0.500000 0.100 1 9 1 469 138 331 43 0 43 1 51 0 0 321 0 10 0.3116 0.0000 0.0302 2.209 0.72 7.10 -6.38 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0151 0.3325 0.6523 1 2 0.0173 0.3393 0.6435 1 2 0.0205 0.3486 0.6309
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 425 98 327 43 2 5 2 46 0 0 327 0 0 0.4388 0.0000 0.0000 18.600 0.72 3.70 -2.97 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1425 0.6019 0.2556 1 1 0.1473 0.5944 0.2583 1 1 0.1536 0.5849 0.2615
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 2236 577 1659 457 10 98 3 9 3 0 1650 1 5 0.7920 0.0018 0.0054 4.816 0.78 4.56 -3.77 131 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 677 194 483 185 0 4 0 5 0 0 483 0 0 0.9536 0.0000 0.0000 47.500 0.26 7.80 -7.54 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1580 0.8420 0.0000 0 0 0.9805 0.0195 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 621 169 452 0 2 24 7 136 0 0 452 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.042 4.51 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 209 101 108 48 0 1 0 52 0 0 108 0 0 0.4752 0.0000 0.0000 100.000 0.48 2.42 -1.94 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1277 0.6043 0.2680 1 1 0.1327 0.5966 0.2707 1 1 0.1394 0.5869 0.2737
chr12 113180950 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 283 114 169 54 1 8 0 51 0 0 167 0 2 0.4737 0.0000 0.0118 13.250 0.11 2.96 -2.85 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2242 0.6249 0.1509 1 1 0.2283 0.6157 0.1560 1 1 0.2332 0.6042 0.1626
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 253 93 160 81 0 9 0 3 1 0 159 0 0 0.8710 0.0063 0.0063 9.333 0.36 6.00 -5.64 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0771 0.9229 0.0000 0 0 0.7124 0.2876 0.0000 0 0 0.8869 0.1131 0.0000
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 359 103 256 0 0 9 0 94 0 0 247 0 9 0.0000 0.0000 0.0352 10.444 5.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0067 0.9933
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 366 85 281 0 0 8 1 76 0 0 266 0 15 0.0000 0.0000 0.0534 9.625 11.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0100 0.9900 2 2 0.0000 0.0114 0.9886
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 839 194 645 0 0 31 1 162 0 0 613 0 32 0.0000 0.0000 0.0496 5.258 10.03 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr12 124340175 C CGCCGCTGCTGCCCCCACCCCCGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 30 5 839 194 645 80 4 18 0 92 0 0 613 0 32 0.4124 0.0000 0.0496 9.611 7.64 10.66 -3.03 26 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0003 0.0897 0.9100 1 2 0.0004 0.0964 0.9032 1 2 0.0006 0.1062 0.8932
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 287 110 177 3 0 28 4 75 0 0 172 0 5 0.0273 0.0000 0.0282 2.893 0.00 4.39 -4.39 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9163 0.0837 2 2 0.0000 0.2708 0.7292 2 2 0.0000 0.1053 0.8947
chr12 124402512 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 3 287 110 177 3 1 61 0 45 0 0 172 1 4 0.0273 0.0000 0.0282 0.817 0.00 5.73 -5.73 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9953 0.0047 2 1 0.0000 0.8108 0.1892 2 2 0.0000 0.4955 0.5045
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 198 71 127 6 1 13 0 51 0 0 124 1 2 0.0845 0.0000 0.0236 4.462 0.50 4.00 -3.50 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9913 0.0087 2 1 0.0000 0.8670 0.1330
chr12 124993835 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 198 71 127 7 3 58 0 3 1 1 124 0 1 0.0986 0.0079 0.0236 0.222 2.29 5.33 -3.05 5 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4257 0.4791 0.0951 1 1 0.3956 0.5113 0.0931 1 1 0.3588 0.5561 0.0851
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 272 82 190 0 0 9 2 71 0 0 178 0 12 0.0000 0.0000 0.0632 8.111 8.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0130 0.9870 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0159 0.9841
chr12 131828558 C CCGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 9 1 271 94 177 3 0 5 9 77 0 0 177 0 0 0.0319 0.0000 0.0000 17.800 0.00 7.82 -7.82 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9074 0.0926 2 2 0.0000 0.2521 0.7479 2 2 0.0000 0.0969 0.9031
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 521 132 389 78 7 33 0 14 0 0 389 0 0 0.5909 0.0000 0.0000 3.000 0.28 5.00 -4.72 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0081 0.9919 0.0000
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 804 192 612 156 2 26 0 8 1 0 610 0 1 0.8125 0.0016 0.0033 6.600 0.62 6.12 -5.51 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1752 0.8248 0.0000 0 0 0.8839 0.1161 0.0000
chr13 25097025 TTAAGC T 0.000305 0.100 1 -5 1 1591 367 1224 319 0 14 24 10 0 0 1201 4 19 0.8692 0.0000 0.0188 32.091 0.31 21.90 -21.59 133 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0028 0.9972 0.0000
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 625 214 411 187 2 7 0 18 0 0 410 0 1 0.8738 0.0000 0.0024 29.429 0.27 13.17 -12.89 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0516 0.9484 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 720 177 543 73 0 44 0 60 1 1 533 1 7 0.4124 0.0018 0.0184 3.023 1.74 6.67 -4.93 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4462 0.5374 0.0165 1 1 0.4526 0.5299 0.0176 1 1 0.4602 0.5207 0.0191
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 529 64 465 0 0 7 0 57 0 0 453 2 10 0.0000 0.0000 0.0258 8.143 4.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0072 0.9928 2 2 0.0000 0.0079 0.9921
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 495 101 394 33 5 44 2 17 0 3 387 1 3 0.3267 0.0000 0.0178 1.273 2.21 5.82 -3.61 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6726 0.3084 0.0190 1 0 0.6612 0.3173 0.0215 1 0 0.6455 0.3293 0.0252
chr13 107866367 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 2 764 218 546 199 1 1 0 17 0 0 546 0 0 0.9128 0.0000 0.0000 216.000 0.36 7.35 -7.00 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2296 0.7704 0.0000
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 353 130 223 47 1 44 1 37 0 0 222 1 0 0.3615 0.0000 0.0045 1.932 0.40 10.62 -10.22 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4086 0.5205 0.0709 1 1 0.4062 0.5184 0.0754 1 1 0.4025 0.5158 0.0817
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 625 149 476 77 0 4 1 67 0 0 473 0 3 0.5168 0.0000 0.0063 36.250 0.42 3.12 -2.70 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2790 0.6361 0.0849 1 1 0.2836 0.6261 0.0903 1 1 0.2888 0.6134 0.0977
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 639 153 486 143 0 4 0 6 0 0 486 0 0 0.9346 0.0000 0.0000 37.250 0.36 1.33 -0.98 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.4402 0.5598 0.0000 0 0 0.8895 0.1105 0.0000
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 517 128 389 47 0 9 0 72 0 0 387 0 2 0.3672 0.0000 0.0051 13.222 0.28 1.26 -0.99 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0045 0.2149 0.7806 1 2 0.0054 0.2248 0.7698 1 2 0.0070 0.2385 0.7545
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 461 119 342 9 0 3 0 107 0 0 328 0 14 0.0756 0.0000 0.0409 38.667 0.67 18.45 -17.78 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9788 0.0212 2 1 0.0000 0.5494 0.4506
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 397 88 309 1 0 6 0 81 0 0 309 0 0 0.0114 0.0000 0.0000 13.667 1.00 1.27 -0.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0582 0.9418 2 2 0.0000 0.0212 0.9788 2 2 0.0000 0.0157 0.9843
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.100 1 2 3 673 158 515 88 0 4 0 66 0 0 512 0 3 0.5570 0.0000 0.0058 38.500 0.31 3.18 -2.88 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7001 0.2953 0.0046 1 0 0.6966 0.2981 0.0053 1 0 0.6911 0.3025 0.0064
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 600 154 446 10 2 14 1 127 0 0 440 0 6 0.0649 0.0000 0.0135 10.615 0.70 2.90 -2.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9840 0.0160 2 1 0.0000 0.5063 0.4937
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 578 141 437 49 0 8 1 83 0 0 437 0 0 0.3475 0.0000 0.0000 19.000 0.29 5.31 -5.03 29 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0019 0.1683 0.8298 1 2 0.0024 0.1807 0.8169 1 2 0.0034 0.1985 0.7981
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 452 142 310 66 4 22 9 41 1 0 309 0 0 0.4648 0.0032 0.0032 8.615 0.33 3.93 -3.59 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5751 0.4046 0.0204 1 0 0.5654 0.4113 0.0234 1 0 0.5517 0.4204 0.0279
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 450 143 307 65 2 12 21 43 0 1 306 0 0 0.4545 0.0000 0.0033 9.750 0.35 3.95 -3.60 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2681 0.6334 0.0985 1 1 0.2687 0.6259 0.1053 1 1 0.2688 0.6164 0.1147
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 386 82 304 2 1 5 1 73 0 0 302 0 2 0.0244 0.0000 0.0066 15.200 1.00 3.55 -2.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8013 0.1987 2 2 0.0000 0.2918 0.7082 2 2 0.0000 0.1584 0.8416
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 323 93 230 86 1 2 0 4 0 0 230 0 0 0.9247 0.0000 0.0000 45.500 0.44 1.50 -1.06 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1226 0.8774 0.0000 0 0 0.9265 0.0735 0.0000 0 0 0.9836 0.0164 0.0000
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 412 128 284 42 1 18 3 64 0 0 280 0 4 0.3281 0.0000 0.0141 6.111 0.36 5.00 -4.64 6 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0075 0.2851 0.7075 1 2 0.0091 0.2979 0.6930 1 2 0.0117 0.3157 0.6727
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 412 128 284 43 0 29 2 54 0 0 281 0 3 0.3359 0.0000 0.0106 3.464 0.42 5.52 -5.10 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0426 0.4890 0.4684 1 1 0.0472 0.4918 0.4610 1 1 0.0539 0.4956 0.4505
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 696 137 559 0 0 18 1 118 0 0 542 0 17 0.0000 0.0000 0.0304 6.611 7.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr14 67204765 C CT 0.023603 0.100 1 1 1 477 115 362 109 0 1 0 5 0 0 361 0 1 0.9478 0.0000 0.0028 114.000 0.17 3.00 -2.83 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0188 0.9812 0.0000 0 0 0.9425 0.0575 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000
chr14 69573086 CGCG C 0.132029 0.100 1 -3 2 769 173 596 0 2 43 68 60 0 2 590 1 3 0.0000 0.0000 0.0101 3.122 5.00 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0235 0.9765 2 2 0.0000 0.0225 0.9775 2 2 0.0000 0.0227 0.9773
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 771 180 591 2 6 91 3 78 0 0 586 1 4 0.0111 0.0000 0.0085 0.966 2.00 7.19 -5.19 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9396 0.0604 2 2 0.0000 0.3113 0.6887 2 2 0.0000 0.0970 0.9030
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 455 110 345 36 1 24 0 49 0 2 341 0 2 0.3273 0.0000 0.0116 3.583 2.08 5.96 -3.88 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0613 0.5135 0.4252 1 1 0.0664 0.5136 0.4201 1 1 0.0735 0.5138 0.4127
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 556 166 390 68 0 21 0 77 0 0 390 0 0 0.4096 0.0000 0.0000 6.905 0.40 3.01 -2.62 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0389 0.5426 0.4184 1 1 0.0420 0.5363 0.4216 1 1 0.0464 0.5287 0.4249
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 241 73 168 41 0 2 0 30 0 0 166 0 2 0.5616 0.0000 0.0119 35.500 0.56 9.10 -8.54 17 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4904 0.4601 0.0495 1 0 0.4870 0.4604 0.0526 1 0 0.4821 0.4609 0.0570
chr14 95436970 TAGA T 0.126266 0.100 1 -3 1 202 66 136 33 0 2 0 31 0 0 136 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 32.000 0.06 2.87 -2.81 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4198 0.5393 0.0408 1 1 0.4232 0.5350 0.0418 1 1 0.4273 0.5296 0.0430
chr14 100884333 C CTCT 0.265959 0.100 1 3 1 714 162 552 89 1 8 0 64 0 0 542 0 10 0.5494 0.0000 0.0181 19.125 0.28 2.98 -2.70 13 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6058 0.3846 0.0096 1 0 0.6051 0.3841 0.0108 1 0 0.6032 0.3842 0.0126
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 328 99 229 83 1 13 0 2 0 0 229 0 0 0.8384 0.0000 0.0000 6.615 0.20 9.00 -8.80 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5228 0.4772 0.0000 0 0 0.9106 0.0894 0.0000 0 0 0.9547 0.0453 0.0000
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.100 1 -12 2 558 120 438 86 1 24 2 7 0 0 435 0 3 0.7167 0.0000 0.0068 4.174 0.77 10.71 -9.95 82 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.1669 0.8331 0.0000
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 505 148 357 72 1 19 0 56 0 1 354 1 1 0.4865 0.0000 0.0084 6.789 0.47 3.73 -3.26 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6349 0.3543 0.0108 1 0 0.6316 0.3563 0.0121 1 0 0.6264 0.3596 0.0140
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 306 90 216 51 1 4 4 30 0 0 216 0 0 0.5667 0.0000 0.0000 21.250 1.82 4.07 -2.24 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7426 0.2511 0.0063 1 0 0.7351 0.2577 0.0071 1 0 0.7247 0.2669 0.0084
chr15 22866845 TAAGA T 0.262722 0.100 1 -4 5 336 59 277 35 0 3 0 21 0 0 276 0 1 0.5932 0.0000 0.0036 18.667 0.37 3.90 -3.53 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6572 0.3250 0.0178 1 0 0.6499 0.3307 0.0194 1 0 0.6397 0.3385 0.0218
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 304 76 228 0 1 2 2 71 0 0 215 6 7 0.0000 0.0000 0.0570 37.000 4.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 698 178 520 0 0 6 1 171 0 0 503 8 9 0.0000 0.0000 0.0327 28.667 3.26 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441081 G GTCTCCTCCTCTTCCCGCATCT 0.154509 0.100 1 21 1 520 84 436 25 2 22 3 32 0 1 434 1 0 0.2976 0.0000 0.0046 3.050 3.64 8.09 -4.45 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1787 0.6533 0.1679 1 1 0.1872 0.6477 0.1651 1 1 0.1987 0.6401 0.1612
chr15 27527620 GACA G 0.000629 0.100 1 -3 2 388 109 279 98 0 7 0 4 0 0 279 0 0 0.8991 0.0000 0.0000 14.571 0.70 3.75 -3.05 0 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9700 0.0300 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 189 58 131 0 0 1 0 57 0 0 130 0 1 0.0000 0.0000 0.0076 57.000 2.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0799 0.9201 2 2 0.0000 0.0844 0.9156 2 2 0.0000 0.0909 0.9091
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 231 110 121 0 0 5 100 5 0 0 120 1 0 0.0000 0.0000 0.0083 1.800 2.40 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0172 0.9828 2 2 0.0000 0.0191 0.9809 2 2 0.0000 0.0221 0.9779
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 231 110 121 0 0 9 5 96 0 0 120 0 1 0.0000 0.0000 0.0083 11.111 2.21 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 727 194 533 142 2 42 1 7 0 0 533 0 0 0.7320 0.0000 0.0000 3.619 0.82 3.14 -2.33 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1124 0.8876 0.0000 0 0 0.7483 0.2517 0.0000
chr15 32446553 TCTC T 0.007746 0.100 1 -3 2 146 72 74 53 0 2 0 17 0 0 74 0 0 0.7361 0.0000 0.0000 35.000 0.62 3.06 -2.44 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9606 0.0394 0.0000 1 0 0.9209 0.0791 0.0000 0 1 0.4376 0.5624 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 488 159 329 146 0 3 0 10 0 0 329 0 0 0.9182 0.0000 0.0000 52.000 1.54 2.00 -0.46 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0657 0.9343 0.0000 0 0 0.7967 0.2033 0.0000
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 465 130 335 2 0 9 2 117 0 0 327 0 8 0.0154 0.0000 0.0239 13.444 0.00 4.57 -4.57 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1905 0.8095 2 2 0.0000 0.0258 0.9742 2 2 0.0000 0.0134 0.9866
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.100 1 4 1 198 55 143 34 0 0 0 21 0 0 143 0 0 0.6182 0.0000 0.0000 55.000 0.12 6.57 -6.45 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7091 0.2849 0.0061 1 0 0.7026 0.2907 0.0067 1 0 0.6938 0.2987 0.0075
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 174 90 84 42 0 3 0 45 0 0 84 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 29.000 0.17 2.91 -2.74 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1532 0.5985 0.2483 1 1 0.1581 0.5914 0.2505 1 1 0.1646 0.5824 0.2530
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 337 181 156 169 1 5 0 6 0 0 156 0 0 0.9337 0.0000 0.0000 35.000 0.43 3.33 -2.90 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0065 0.9935 0.0000 0 0 0.8503 0.1497 0.0000 0 0 0.9826 0.0174 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 521 121 400 8 1 14 3 95 0 0 395 0 5 0.0661 0.0000 0.0125 7.571 0.62 4.13 -3.50 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9639 0.0361 2 1 0.0000 0.5009 0.4991
chr15 82809911 GGCCCGA G 0.000025 0.100 1 -6 4 433 115 318 103 0 7 0 5 0 0 318 0 0 0.8957 0.0000 0.0000 15.429 0.83 6.00 -5.17 47 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9913 0.0087 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 500 112 388 61 0 19 0 32 0 0 386 0 2 0.5446 0.0000 0.0052 4.895 0.15 15.25 -15.10 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8801 0.1189 0.0010 1 0 0.8726 0.1262 0.0012 1 0 0.8618 0.1367 0.0015
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 760 202 558 93 10 42 0 57 0 0 558 0 0 0.4604 0.0000 0.0000 3.810 0.43 3.02 -2.59 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9751 0.0249 0.0000 1 0 0.9720 0.0279 0.0000 1 0 0.9674 0.0325 0.0000
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 855 214 641 0 0 20 1 193 0 0 640 0 1 0.0000 0.0000 0.0016 9.650 8.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 383 117 266 0 0 7 0 110 0 0 255 0 11 0.0000 0.0000 0.0414 15.714 6.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 381 119 262 50 0 1 0 68 0 0 261 0 1 0.4202 0.0000 0.0038 118.000 0.60 2.15 -1.55 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0138 0.3393 0.6469 1 2 0.0158 0.3450 0.6392 1 2 0.0188 0.3530 0.6282
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 618 212 406 18 1 42 0 151 0 0 390 0 16 0.0849 0.0000 0.0394 4.024 0.17 5.99 -5.83 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9882 0.0118
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 39 19 20 3 0 0 0 16 0 0 20 0 0 0.1579 0.0000 0.0000 19.000 0.33 1.19 -0.85 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0234 0.9036 0.0730 2 1 0.0159 0.9211 0.0630 2 1 0.0113 0.8973 0.0913
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 385 109 276 65 0 0 0 44 0 0 274 0 2 0.5963 0.0000 0.0072 109.000 0.92 3.11 -2.19 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7178 0.2745 0.0076 1 0 0.7107 0.2806 0.0087 1 0 0.7006 0.2890 0.0104
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 1133 233 900 140 0 3 1 89 0 0 900 0 0 0.6009 0.0000 0.0000 76.667 0.91 1.55 -0.64 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9732 0.0268 0.0000 1 0 0.9702 0.0297 0.0000 1 0 0.9658 0.0342 0.0000
chr16 1999881 G GTCC 0.177864 0.100 1 3 2 624 129 495 106 3 16 0 4 0 0 495 0 0 0.8217 0.0000 0.0000 7.062 1.11 2.75 -1.64 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1432 0.8568 0.0000 0 0 0.9382 0.0618 0.0000 0 0 0.9860 0.0140 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 339 96 243 0 0 0 0 96 0 0 243 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 96.000 7.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 339 96 243 0 0 0 0 96 0 0 243 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 96.000 7.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2798498 GGGCGCTGCTGCT G 0.076345 0.100 1 -12 4 461 158 303 89 0 10 0 59 0 0 299 0 4 0.5633 0.0000 0.0132 14.800 0.35 11.39 -11.04 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8519 0.1477 0.0004 1 0 0.8463 0.1532 0.0005 1 0 0.8382 0.1612 0.0006
chr16 3390049 TGTA T 0.014072 0.100 1 -3 4 140 59 81 31 0 0 0 28 0 0 79 0 2 0.5254 0.0000 0.0247 59.000 0.55 3.21 -2.67 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4443 0.5505 0.0052 1 1 0.4489 0.5458 0.0053 1 1 0.4546 0.5400 0.0054
chr16 3664410 C CCGG 0.006056 0.100 1 3 3 147 40 107 26 0 0 0 14 0 0 107 0 0 0.6500 0.0000 0.0000 40.000 0.04 3.00 -2.96 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7282 0.2714 0.0004 1 0 0.7220 0.2775 0.0004 1 0 0.7134 0.2861 0.0005
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 406 86 320 0 0 4 0 82 0 0 319 0 1 0.0000 0.0000 0.0031 20.500 3.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0111 0.9889
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 440 113 327 10 1 42 8 52 0 2 318 0 7 0.0885 0.0000 0.0275 1.643 3.70 5.23 -1.53 4 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9978 0.0022
chr16 11915673 C CCCGCCG 0.014470 0.100 1 6 1 440 113 327 11 1 71 1 29 1 2 320 0 4 0.0973 0.0031 0.0214 0.612 3.73 6.69 -2.96 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0939 0.8399 0.0662 1 1 0.1024 0.8353 0.0622 1 1 0.1147 0.8282 0.0572
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 165 56 109 0 0 0 0 56 0 0 109 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 56.000 2.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.100 1 3 1 767 207 560 193 2 7 0 5 0 0 560 0 0 0.9324 0.0000 0.0000 28.429 0.31 4.20 -3.89 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3138 0.6862 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 173 90 83 46 0 5 0 39 0 0 83 0 0 0.5111 0.0000 0.0000 17.000 0.76 2.00 -1.24 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3616 0.5481 0.0903 1 1 0.3607 0.5442 0.0951 1 1 0.3590 0.5394 0.1016
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 452 93 359 37 8 8 6 34 0 0 357 2 0 0.3978 0.0000 0.0056 11.429 1.14 2.24 -1.10 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2604 0.5900 0.1496 1 1 0.2626 0.5833 0.1542 1 1 0.2651 0.5748 0.1601
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 391 178 213 144 1 29 0 4 0 0 213 0 0 0.8090 0.0000 0.0000 5.138 0.15 10.00 -9.85 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1824 0.8176 0.0000 0 0 0.9518 0.0482 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 96 52 44 27 0 0 0 25 0 0 43 0 1 0.5192 0.0000 0.0227 52.000 0.78 4.08 -3.30 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2399 0.5634 0.1967 1 1 0.2416 0.5587 0.1997 1 1 0.2438 0.5527 0.2035
chr16 71963256 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 238 108 130 59 1 0 0 48 0 0 130 0 0 0.5463 0.0000 0.0000 107.000 0.17 2.29 -2.12 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4630 0.4916 0.0455 1 1 0.4599 0.4907 0.0494 1 1 0.4551 0.4899 0.0550
chr16 72788664 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 2 741 194 547 156 1 34 0 3 1 0 545 0 1 0.8041 0.0018 0.0037 4.706 0.38 6.33 -5.95 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3061 0.6939 0.0000 0 0 0.9747 0.0253 0.0000 0 0 0.9940 0.0060 0.0000
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 383 114 269 93 0 7 1 13 0 0 267 0 2 0.8158 0.0000 0.0074 15.286 0.24 10.85 -10.61 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0033 0.9967 0.0000
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 259 102 157 59 0 1 0 42 0 0 156 0 1 0.5784 0.0000 0.0064 101.000 0.78 4.64 -3.86 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5776 0.3973 0.0251 1 0 0.5705 0.4015 0.0280 1 0 0.5605 0.4073 0.0323
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 490 127 363 49 5 29 1 43 0 0 362 0 1 0.3858 0.0000 0.0028 3.379 0.22 3.47 -3.24 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4033 0.5306 0.0662 1 1 0.4017 0.5276 0.0707 1 1 0.3990 0.5240 0.0770
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 490 127 363 55 0 66 0 6 0 0 362 0 1 0.4331 0.0000 0.0028 0.938 0.64 5.00 -4.36 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0084 0.9916 0.0000 0 1 0.1321 0.8679 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 717 147 570 0 0 4 10 133 0 0 561 1 8 0.0000 0.0000 0.0158 71.500 7.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 715 145 570 0 0 7 16 122 0 0 559 6 5 0.0000 0.0000 0.0193 19.571 7.91 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 717 143 574 0 0 4 1 138 0 0 560 4 10 0.0000 0.0000 0.0244 34.500 8.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr16 88534246 CCCCCGCGCCCGAGTCGCCGCGGCCCGGAAGCGGAAGCGGAAGCGGCCCCGGCCTCGCCCCTGCGCGCTCGCCCGG C 0.500000 0.100 1 -75 1 639 151 488 100 3 19 3 26 2 0 471 0 15 0.6623 0.0041 0.0348 7.111 2.34 1.38 0.96 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9910 0.0090 0.0000 1 0 0.9892 0.0108 0.0000 1 0 0.9863 0.0137 0.0000
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 926 199 727 100 1 6 1 91 0 0 721 0 6 0.5025 0.0000 0.0083 31.833 0.29 7.38 -7.09 48 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1825 0.7169 0.1007 1 1 0.1903 0.7023 0.1074 1 1 0.2001 0.6835 0.1164
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 728 184 544 107 0 4 0 73 0 0 544 0 0 0.5815 0.0000 0.0000 45.000 0.46 4.33 -3.87 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8566 0.1424 0.0010 1 0 0.8484 0.1503 0.0013 1 0 0.8364 0.1617 0.0018
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 149 73 76 35 0 4 0 34 0 0 76 0 0 0.4795 0.0000 0.0000 17.250 0.51 4.03 -3.52 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2293 0.5826 0.1881 1 1 0.2319 0.5765 0.1916 1 1 0.2351 0.5687 0.1962
chr16 89971820 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 747 184 563 98 0 11 0 75 0 0 562 0 1 0.5326 0.0000 0.0018 15.727 0.22 1.15 -0.92 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6480 0.3437 0.0083 1 0 0.6426 0.3477 0.0097 1 0 0.6344 0.3536 0.0120
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.100 1 -3 1 1014 251 763 108 1 10 1 131 0 0 759 1 3 0.4303 0.0000 0.0052 24.000 0.33 3.15 -2.81 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0072 0.4800 0.5128 1 2 0.0088 0.4831 0.5081 1 2 0.0114 0.4883 0.5003
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 448 157 291 11 0 5 0 141 0 0 291 0 0 0.0701 0.0000 0.0000 30.400 1.36 1.22 0.14 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9795 0.0205 2 2 0.0000 0.3633 0.6367
chr17 4933907 ACCACCCCAGAGCCCAC A 0.138018 0.100 1 -16 1 1460 288 1172 222 24 30 0 12 0 1 1171 0 0 0.7708 0.0000 0.0009 8.759 2.68 2.42 0.26 30 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8022 0.1978 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000
chr17 5183675 CTGAT C 0.000129 0.100 1 -4 1 872 205 667 105 0 5 0 95 0 1 661 0 5 0.5122 0.0000 0.0090 40.000 0.25 3.78 -3.53 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3974 0.6025 0.0000 1 1 0.4103 0.5896 0.0000 1 1 0.4264 0.5736 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 809 222 587 12 5 50 4 151 1 0 577 1 8 0.0541 0.0017 0.0170 3.420 0.00 3.01 -3.01 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9190 0.0810
chr17 7743481 C CA 0.001205 0.100 1 1 2 433 85 348 40 0 1 0 44 0 0 348 0 0 0.4706 0.0000 0.0000 84.000 0.17 1.23 -1.05 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3077 0.6914 0.0008 1 1 0.3177 0.6814 0.0008 1 1 0.3307 0.6684 0.0008
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.100 1 -6 2 1550 469 1081 190 6 92 1 180 0 0 1076 0 5 0.4051 0.0000 0.0046 4.087 4.53 7.19 -2.66 44 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2777 0.7189 0.0034 1 1 0.2986 0.6974 0.0040 1 1 0.3254 0.6697 0.0048
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.100 1 -6 1 1186 333 853 158 0 54 0 121 0 0 839 0 14 0.4745 0.0000 0.0164 5.264 0.88 6.92 -6.04 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6740 0.3252 0.0008 1 0 0.6785 0.3205 0.0009 1 0 0.6830 0.3158 0.0012
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 449 114 335 6 0 8 0 100 0 0 334 0 1 0.0526 0.0000 0.0030 13.250 0.33 8.31 -7.98 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.7931 0.2069 2 2 0.0000 0.2592 0.7408
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 594 230 364 1 0 33 26 170 0 0 361 0 3 0.0043 0.0000 0.0082 5.970 0.00 2.99 -2.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr17 17136247 CCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -6 1 594 240 354 13 10 188 2 27 0 0 354 0 0 0.0542 0.0000 0.0000 0.231 0.15 6.07 -5.92 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1784 0.5538 0.2678 1 1 0.1818 0.5498 0.2684 1 1 0.1862 0.5447 0.2691
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1126 313 813 155 4 26 7 121 0 0 812 1 0 0.4952 0.0000 0.0012 10.769 0.52 4.20 -3.68 67 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7369 0.2617 0.0014 1 0 0.7336 0.2645 0.0018 1 0 0.7280 0.2695 0.0025
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 1125 312 813 153 25 14 13 107 0 0 813 0 0 0.4904 0.0000 0.0000 29.500 0.48 3.93 -3.45 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9632 0.0368 0.0000 1 0 0.9594 0.0405 0.0000 1 0 0.9537 0.0463 0.0001
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 847 207 640 6 0 13 1 187 0 0 633 0 7 0.0290 0.0000 0.0109 14.923 0.50 3.97 -3.47 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9676 0.0324 2 2 0.0000 0.0339 0.9661 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 315 92 223 4 0 17 1 70 0 0 212 0 11 0.0435 0.0000 0.0493 4.412 0.00 7.71 -7.71 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9911 0.0089 2 1 0.0000 0.5408 0.4592 2 2 0.0000 0.1960 0.8040
chr17 35479822 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 916 224 692 217 0 2 0 5 0 0 692 0 0 0.9688 0.0000 0.0000 222.000 0.62 1.60 -0.98 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5004 0.4996 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 159 75 84 0 0 4 0 71 0 0 83 0 1 0.0000 0.0000 0.0119 17.750 1.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0267 0.9733 2 2 0.0000 0.0295 0.9705
chr17 40818859 C CCGCCGTATCCGCCGCCGGAGCTGCTGCCTG 0.500000 0.100 1 30 1 932 219 713 13 13 48 12 133 2 0 688 0 23 0.0594 0.0028 0.0351 3.617 1.92 7.12 -5.20 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 536 155 381 87 1 2 0 65 0 0 381 0 0 0.5613 0.0000 0.0000 76.500 0.23 1.46 -1.23 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6921 0.3007 0.0073 1 0 0.6846 0.3068 0.0086 1 0 0.6736 0.3157 0.0107
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 556 143 413 70 0 4 0 69 0 0 413 0 0 0.4895 0.0000 0.0000 34.750 0.14 1.26 -1.12 44 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1851 0.6630 0.1519 1 1 0.1908 0.6514 0.1577 1 1 0.1980 0.6367 0.1653
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 623 116 507 54 1 9 1 51 0 0 495 0 12 0.4655 0.0000 0.0237 13.250 1.31 8.12 -6.80 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0651 0.5590 0.3759 1 1 0.0697 0.5539 0.3763 1 1 0.0762 0.5477 0.3761
chr17 41302321 TGTACAGATGGTTG T 0.500000 0.100 1 -13 1 1231 329 902 304 0 12 0 13 0 0 902 0 0 0.9240 0.0000 0.0000 26.417 0.24 12.85 -12.61 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7928 0.2072 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 679 225 454 191 0 29 0 5 0 0 452 0 2 0.8489 0.0000 0.0044 6.759 0.37 16.00 -15.63 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 0 0.8896 0.1104 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1737 365 1372 199 0 1 0 165 0 0 1369 0 3 0.5452 0.0000 0.0022 364.000 0.43 3.30 -2.88 71 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6401 0.3585 0.0014 1 0 0.6439 0.3544 0.0018 1 0 0.6468 0.3507 0.0024
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 740 195 545 156 3 27 1 8 0 1 544 0 0 0.8000 0.0000 0.0018 6.222 0.76 3.62 -2.87 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1715 0.8285 0.0000 0 0 0.8794 0.1206 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 205 70 135 39 0 1 0 30 0 0 134 0 1 0.5571 0.0000 0.0074 69.000 0.08 4.07 -3.99 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4032 0.5143 0.0825 1 1 0.4001 0.5128 0.0871 1 1 0.3956 0.5110 0.0934
chr17 50116034 T TATC 0.500000 0.100 1 3 2 552 142 410 122 0 10 0 10 0 0 410 0 0 0.8592 0.0000 0.0000 13.200 0.11 3.70 -3.59 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0104 0.9896 0.0000 0 1 0.3781 0.6219 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 1013 274 739 138 0 10 0 126 0 0 735 0 4 0.5036 0.0000 0.0054 26.400 0.16 2.84 -2.68 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2186 0.7366 0.0448 1 1 0.2292 0.7209 0.0499 1 1 0.2424 0.7004 0.0572
chr17 58309246 G GTCCTCCTCT 0.500000 0.100 1 9 1 693 177 516 85 1 15 0 76 0 0 516 0 0 0.4802 0.0000 0.0000 10.733 0.40 7.08 -6.68 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3550 0.5941 0.0509 1 1 0.3584 0.5863 0.0554 1 1 0.3617 0.5766 0.0617
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 455 161 294 61 1 38 1 60 0 0 293 0 1 0.3789 0.0000 0.0034 3.237 0.67 5.35 -4.68 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1763 0.6475 0.1762 1 1 0.1816 0.6369 0.1815 1 1 0.1883 0.6234 0.1883
chr17 63477132 T TGCTGCC 0.500000 0.100 1 6 1 201 68 133 54 0 11 0 3 0 0 133 0 0 0.7941 0.0000 0.0000 5.182 0.78 5.00 -4.22 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0195 0.9805 0.0000 0 1 0.3782 0.6218 0.0000 0 0 0.6671 0.3329 0.0000
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 389 146 243 70 0 19 1 56 0 0 243 0 0 0.4795 0.0000 0.0000 6.632 0.37 7.73 -7.36 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4811 0.4838 0.0351 1 1 0.4785 0.4829 0.0387 1 1 0.4741 0.4821 0.0438
chr17 69149049 TGA T 0.500000 0.100 1 -2 2 178 58 120 30 0 2 0 26 0 0 119 0 1 0.5172 0.0000 0.0083 28.000 0.20 2.81 -2.61 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2844 0.5587 0.1569 1 1 0.2849 0.5543 0.1608 1 1 0.2853 0.5487 0.1660
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.100 1 -4 3 248 72 176 39 0 2 0 31 0 0 174 0 2 0.5417 0.0000 0.0114 35.000 0.64 4.23 -3.58 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3478 0.5463 0.1059 1 1 0.3468 0.5427 0.1105 1 1 0.3450 0.5381 0.1168
chr17 73751240 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 411 130 281 121 0 1 1 7 0 0 281 0 0 0.9308 0.0000 0.0000 129.000 3.69 4.43 -0.73 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0806 0.9194 0.0000 0 0 0.6795 0.3205 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 654 164 490 55 1 13 0 95 0 0 487 0 3 0.3354 0.0000 0.0061 11.615 0.56 8.24 -7.68 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0621 0.9377 1 2 0.0003 0.0684 0.9313 1 2 0.0005 0.0779 0.9217
chr17 75516562 T TGGAGCC 0.500000 0.100 1 6 1 555 134 421 65 2 6 0 61 0 0 411 0 10 0.4851 0.0000 0.0238 21.333 1.77 6.10 -4.33 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1063 0.6428 0.2509 1 1 0.1120 0.6325 0.2556 1 1 0.1195 0.6194 0.2611
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 800 167 633 86 2 5 1 73 0 1 631 0 1 0.5150 0.0000 0.0032 32.400 0.66 2.48 -1.82 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4630 0.5089 0.0281 1 1 0.4630 0.5056 0.0313 1 1 0.4620 0.5020 0.0360
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 933 240 693 148 1 20 0 71 1 0 675 0 17 0.6167 0.0014 0.0260 10.950 1.00 17.28 -16.28 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9862 0.0138 0.0000 1 0 0.9840 0.0160 0.0000 1 0 0.9805 0.0195 0.0000
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.100 1 -27 1 979 197 782 141 0 2 0 54 2 0 754 1 25 0.7157 0.0026 0.0358 195.000 1.21 20.46 -19.25 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9874 0.0126 0.0000 1 0 0.9853 0.0147 0.0000 1 0 0.9820 0.0180 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2633 615 2018 299 13 75 6 222 2 0 1999 5 12 0.4862 0.0010 0.0094 7.417 1.42 6.24 -4.82 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9650 0.0350 0.0000 1 0 0.9631 0.0369 0.0000 1 0 0.9601 0.0399 0.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2533 650 1883 273 7 52 9 309 5 7 1695 27 149 0.4200 0.0027 0.0998 11.686 1.56 4.73 -3.17 59 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -6 7 301 136 165 117 0 15 0 4 0 0 165 0 0 0.8603 0.0000 0.0000 8.067 0.38 6.00 -5.62 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0508 0.9492 0.0000 0 0 0.8299 0.1701 0.0000 0 0 0.9573 0.0427 0.0000
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 1143 203 940 95 1 19 3 85 0 0 939 1 0 0.4680 0.0000 0.0011 9.632 0.37 5.48 -5.11 39 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2677 0.6649 0.0675 1 1 0.2741 0.6530 0.0729 1 1 0.2818 0.6378 0.0804
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 736 193 543 97 0 11 0 85 0 0 540 0 3 0.5026 0.0000 0.0055 16.545 0.32 3.19 -2.87 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3126 0.6349 0.0525 1 1 0.3182 0.6245 0.0573 1 1 0.3246 0.6115 0.0640
chr17 81647906 T TTAAC 0.500000 0.100 1 4 3 505 140 365 77 0 4 1 58 0 0 362 0 3 0.5500 0.0000 0.0082 34.000 0.39 4.26 -3.87 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5142 0.4596 0.0263 1 0 0.5111 0.4596 0.0293 1 0 0.5062 0.4601 0.0338
chr17 82051639 GGGGCCGGGGCGGGGGTCC G 0.500000 0.100 1 -18 1 395 106 289 91 0 12 1 2 0 0 289 0 0 0.8585 0.0000 0.0000 8.455 1.59 9.00 -7.41 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5109 0.4891 0.0000 0 0 0.9073 0.0927 0.0000 0 0 0.9533 0.0467 0.0000
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 327 67 260 6 0 1 5 55 0 0 260 0 0 0.0896 0.0000 0.0000 62.000 1.17 1.33 -0.16 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9793 0.0207 2 1 0.0000 0.8036 0.1964
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 152 72 80 0 0 3 0 69 0 0 80 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 23.000 3.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 379 68 311 37 0 6 0 25 0 0 309 0 2 0.5441 0.0000 0.0064 10.333 0.81 8.52 -7.71 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5922 0.3850 0.0228 1 0 0.5878 0.3877 0.0245 1 0 0.5816 0.3916 0.0268
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 197 85 112 42 0 0 0 43 0 0 112 0 0 0.4941 0.0000 0.0000 85.000 0.12 4.65 -4.53 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1620 0.5993 0.2386 1 1 0.1658 0.5919 0.2423 1 1 0.1706 0.5825 0.2468
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 153 63 90 39 0 1 0 23 0 0 90 0 0 0.6190 0.0000 0.0000 62.000 0.10 3.09 -2.98 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6262 0.3476 0.0263 1 0 0.6157 0.3551 0.0292 1 0 0.6013 0.3652 0.0335
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 238 121 117 101 0 1 0 19 0 0 117 0 0 0.8347 0.0000 0.0000 120.000 0.17 3.74 -3.57 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -9 2 456 116 340 103 0 8 0 5 0 0 340 0 0 0.8879 0.0000 0.0000 13.500 1.56 8.40 -6.84 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.4553 0.5447 0.0000 0 0 0.8568 0.1432 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 293 158 135 86 1 3 1 67 1 0 134 0 0 0.5443 0.0074 0.0074 51.667 0.23 3.36 -3.13 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6207 0.3675 0.0118 1 0 0.6153 0.3711 0.0136 1 0 0.6070 0.3766 0.0164
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 846 205 641 109 0 4 1 91 0 0 625 0 16 0.5317 0.0000 0.0250 50.250 0.35 14.02 -13.67 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1416 0.7425 0.1159 1 1 0.1496 0.7269 0.1235 1 1 0.1601 0.7065 0.1335
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 363 84 279 1 0 11 5 67 0 1 278 0 0 0.0119 0.0000 0.0036 6.636 1.00 5.72 -4.72 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2120 0.7880 2 2 0.0000 0.0826 0.9174 2 2 0.0000 0.0606 0.9394
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 185 72 113 0 0 3 0 69 0 0 111 0 2 0.0000 0.0000 0.0177 23.000 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0261 0.9739 2 2 0.0000 0.0280 0.9720 2 2 0.0000 0.0309 0.9691
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 146 76 70 42 2 2 0 30 0 0 70 0 0 0.5526 0.0000 0.0000 37.000 0.05 3.03 -2.99 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5617 0.4033 0.0350 1 0 0.5536 0.4080 0.0384 1 0 0.5423 0.4144 0.0434
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 4 433 145 288 69 1 15 0 60 0 0 286 0 2 0.4759 0.0000 0.0069 8.667 0.41 3.85 -3.44 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3407 0.5894 0.0698 1 1 0.3429 0.5824 0.0747 1 1 0.3449 0.5736 0.0815
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 474 193 281 19 2 24 1 147 1 0 279 0 1 0.0984 0.0036 0.0071 8.450 3.74 5.60 -1.86 9 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr19 1009186 GAGC G 0.092678 0.100 1 -3 2 619 128 491 73 0 9 0 46 0 0 491 0 0 0.5703 0.0000 0.0000 13.222 0.48 3.11 -2.63 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8799 0.1196 0.0004 1 0 0.8735 0.1260 0.0005 1 0 0.8642 0.1351 0.0007
chr19 1395488 G GCGC 0.003752 0.100 1 3 1 1298 283 1015 199 10 64 1 9 0 0 1015 0 0 0.7032 0.0000 0.0000 3.406 0.63 5.00 -4.37 99 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0163 0.9837 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 169 59 110 4 0 1 0 54 0 0 110 0 0 0.0678 0.0000 0.0000 58.000 0.00 4.59 -4.59 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9402 0.0598 2 1 0.0000 0.7577 0.2423
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 288 144 144 95 0 1 0 48 0 0 144 0 0 0.6597 0.0000 0.0000 143.000 0.07 3.29 -3.22 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9760 0.0240 0.0000 1 0 0.9728 0.0272 0.0000 1 0 0.9679 0.0321 0.0001
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 358 117 241 0 0 13 98 6 0 0 227 14 0 0.0000 0.0000 0.0581 8.000 6.00 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0037 0.9963
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 358 118 240 0 1 18 0 99 0 0 225 1 14 0.0000 0.0000 0.0625 5.882 9.20 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1174 0.8826 2 2 0.0000 0.0517 0.9483 2 2 0.0000 0.0411 0.9589
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 617 184 433 165 0 14 0 5 0 0 431 0 2 0.8967 0.0000 0.0046 12.143 0.68 9.80 -9.12 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.8413 0.1587 0.0000 0 0 0.9878 0.0122 0.0000
chr19 9115483 TAA T 0.005195 0.100 1 -2 1 502 114 388 107 0 2 0 5 0 0 388 0 0 0.9386 0.0000 0.0000 56.000 0.51 3.00 -2.49 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4006 0.5994 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 321 92 229 49 0 7 0 36 0 0 223 0 6 0.5326 0.0000 0.0262 12.143 0.06 5.28 -5.22 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4415 0.5067 0.0518 1 1 0.4418 0.5035 0.0547 1 1 0.4416 0.4997 0.0587
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 415 116 299 35 0 29 2 50 0 0 295 0 4 0.3017 0.0000 0.0134 2.966 0.74 6.36 -5.62 23 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0235 0.3943 0.5822 1 2 0.0269 0.4033 0.5698 1 2 0.0320 0.4154 0.5526
chr19 14073386 GC G 0.000009 0.100 1 -1 1 373 97 276 77 0 4 0 16 0 1 275 0 0 0.7938 0.0000 0.0036 23.250 0.45 1.38 -0.92 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1845 0.8155 0.0000 0 0 0.9942 0.0058 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 638 130 508 0 0 6 3 121 0 0 500 1 7 0.0000 0.0000 0.0157 20.667 3.44 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 16209062 CAGG C 0.000003 0.100 1 -3 3 241 105 136 98 0 0 0 7 0 0 136 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 105.000 0.19 3.57 -3.38 50 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8960 0.1040 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 17286670 G GTT 0.003784 0.100 1 2 1 469 101 368 3 6 18 18 56 0 0 365 2 1 0.0297 0.0000 0.0082 19.250 4.67 2.54 2.13 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9982 0.0018
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 137 52 85 46 1 2 0 3 0 0 85 0 0 0.8846 0.0000 0.0000 25.000 0.65 3.00 -2.35 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0504 0.9496 0.0000 0 0 0.6197 0.3803 0.0000 0 0 0.8442 0.1558 0.0000
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 122 25 97 0 0 0 0 25 0 0 91 0 6 0.0000 0.0000 0.0619 25.000 2.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0699 0.9301 2 2 0.0000 0.0721 0.9279 2 2 0.0000 0.0752 0.9248
chr19 21383385 TAATTCATGCTGGAGAGAAACACTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAAGATTTTAAACAGTCCTCACACCTTACTAAACATAAGAC T 0.206936 0.100 1 -84 2 450 109 341 84 0 17 0 8 2 2 337 0 0 0.7706 0.0059 0.0117 5.412 0.77 3.25 -2.48 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0590 0.9410 0.0000 0 0 0.6191 0.3809 0.0000
chr19 23145949 A AT 0.003669 0.100 1 1 1 198 38 160 31 1 1 0 5 0 1 159 0 0 0.8158 0.0000 0.0063 37.000 0.81 1.40 -0.59 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0227 0.9773 0.0000 0 0 0.8734 0.1266 0.0000 0 0 0.9819 0.0181 0.0000
chr19 23754908 GACA G 0.000403 0.100 1 -3 1 99 34 65 15 0 2 0 17 0 0 65 0 0 0.4412 0.0000 0.0000 16.000 0.00 3.71 -3.71 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4119 0.5878 0.0002 1 1 0.4167 0.5831 0.0002 1 1 0.4228 0.5770 0.0002
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 346 96 250 10 0 10 3 73 0 0 248 0 2 0.1042 0.0000 0.0080 8.600 0.00 3.10 -3.10 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9942 0.0058 2 1 0.0000 0.7354 0.2646
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 655 176 479 82 2 6 4 82 0 0 475 0 4 0.4659 0.0000 0.0084 28.000 0.45 3.60 -3.15 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0402 0.6221 0.3377 1 1 0.0430 0.6107 0.3463 1 1 0.0468 0.5964 0.3568
chr19 35511519 A ACTGCTGCTG 0.059465 0.100 1 9 2 660 236 424 212 1 7 0 16 0 0 424 0 0 0.8983 0.0000 0.0000 32.714 0.20 8.25 -8.05 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0257 0.9743 0.0000 0 0 0.9441 0.0559 0.0000
chr19 35720472 CAAG C 0.035298 0.100 1 -3 1 826 175 651 166 0 2 0 7 0 0 648 0 3 0.9486 0.0000 0.0046 86.500 0.49 2.86 -2.36 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7219 0.2781 0.0000 0 0 0.9929 0.0071 0.0000
chr19 37388950 C CTGTG 0.140068 0.100 1 4 5 647 123 524 67 0 3 0 53 0 0 514 0 10 0.5447 0.0000 0.0191 40.000 0.27 4.62 -4.35 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3916 0.5795 0.0289 1 1 0.3987 0.5710 0.0303 1 1 0.4075 0.5603 0.0322
chr19 37388952 AT A 0.140069 0.100 1 -1 2 649 121 528 66 0 6 3 46 0 0 519 3 6 0.5455 0.0000 0.0170 19.167 0.27 5.07 -4.79 4 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5254 0.4600 0.0146 1 0 0.5275 0.4567 0.0157 1 0 0.5296 0.4531 0.0173
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 398 127 271 74 0 5 1 47 1 0 265 0 5 0.5827 0.0037 0.0221 24.400 0.57 3.28 -2.71 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7628 0.2329 0.0043 1 0 0.7556 0.2393 0.0050 1 0 0.7453 0.2485 0.0062
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 232 40 192 0 0 5 28 7 0 0 192 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.667 4.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0444 0.9556 2 2 0.0000 0.0460 0.9540 2 2 0.0000 0.0484 0.9516
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 232 39 193 0 0 28 8 3 0 0 193 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.450 5.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1013 0.8987 2 2 0.0000 0.1032 0.8968 2 2 0.0000 0.1058 0.8942
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 532 164 368 133 5 12 1 13 0 0 368 0 0 0.8110 0.0000 0.0000 13.364 0.08 5.00 -4.92 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0773 0.9227 0.0000
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.100 1 3 1 367 130 237 115 0 2 0 13 0 0 236 0 1 0.8846 0.0000 0.0042 64.000 0.24 4.31 -4.06 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 1 0.4370 0.5630 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 332 107 225 68 1 1 0 37 0 0 225 0 0 0.6355 0.0000 0.0000 106.000 0.22 6.54 -6.32 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8912 0.1076 0.0011 1 0 0.8827 0.1159 0.0014 1 0 0.8703 0.1278 0.0019
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 574 167 407 10 0 2 1 154 0 0 403 0 4 0.0599 0.0000 0.0098 82.500 0.00 3.15 -3.15 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8965 0.1035 2 2 0.0000 0.1366 0.8634
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 680 248 432 105 0 44 0 99 0 0 416 0 16 0.4234 0.0000 0.0370 4.636 0.37 6.00 -5.63 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0436 0.6645 0.2919 1 1 0.0483 0.6524 0.2993 1 1 0.0550 0.6371 0.3080
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 370 111 259 86 0 20 1 4 0 0 253 0 6 0.7748 0.0000 0.0232 4.550 0.24 15.25 -15.01 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.3971 0.6029 0.0000
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.100 1 -3 1 493 161 332 80 0 4 0 77 0 0 332 0 0 0.4969 0.0000 0.0000 39.250 1.07 4.31 -3.24 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3469 0.6284 0.0247 1 1 0.3569 0.6170 0.0260 1 1 0.3695 0.6027 0.0278
chr19 47802285 TGGGCCTGGGATCGGGCCTGGGTTC T 0.070835 0.100 1 -24 2 1545 408 1137 330 13 47 5 13 6 5 1121 5 0 0.8088 0.0053 0.0141 7.804 2.18 5.46 -3.28 104 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5466 0.4534 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr19 47802333 TGGGCCTGGGATC T 0.079245 0.100 1 -12 2 1530 385 1145 308 17 48 6 6 5 7 1131 2 0 0.8000 0.0044 0.0122 7.174 2.41 2.83 -0.42 36 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9565 0.0435 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 47802381 TGGGCCTGGGATC T 0.158449 0.100 1 -12 2 1533 377 1156 290 11 59 1 16 5 4 1140 6 1 0.7692 0.0043 0.0138 5.373 2.54 9.75 -7.21 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 0 0.9240 0.0760 0.0000
chr19 48446744 TGAA T 0.043442 0.100 1 -3 1 407 99 308 92 0 2 0 5 0 0 308 0 0 0.9293 0.0000 0.0000 48.500 0.24 3.20 -2.96 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0345 0.9655 0.0000 0 0 0.9140 0.0860 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 261 107 154 91 0 10 0 6 0 0 154 0 0 0.8505 0.0000 0.0000 9.700 0.20 1.50 -1.30 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.4329 0.5671 0.0000 0 0 0.8923 0.1077 0.0000
chr19 49070105 TGGA T 0.101017 0.100 1 -3 1 429 128 301 114 0 1 0 13 0 0 301 0 0 0.8906 0.0000 0.0000 127.000 0.27 3.85 -3.57 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.3506 0.6494 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 1198 318 880 104 31 56 8 119 0 0 876 0 4 0.3270 0.0000 0.0045 4.727 2.56 3.63 -1.07 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1747 0.7664 0.0589 1 1 0.1864 0.7494 0.0643 1 1 0.2015 0.7269 0.0716
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.100 1 3 1 1199 275 924 122 8 61 4 80 0 1 922 0 1 0.4436 0.0000 0.0022 3.475 0.38 3.29 -2.91 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9578 0.0421 0.0000 1 0 0.9537 0.0462 0.0001 1 0 0.9475 0.0524 0.0001
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 607 165 442 65 0 25 0 75 0 0 438 1 3 0.3939 0.0000 0.0090 5.600 0.88 6.61 -5.74 9 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0449 0.5601 0.3951 1 1 0.0497 0.5571 0.3932 1 1 0.0566 0.5537 0.3897
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.100 1 -18 2 681 271 410 127 0 68 0 76 0 0 410 0 0 0.4686 0.0000 0.0000 2.985 0.22 11.68 -11.46 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9813 0.0187 0.0000 1 0 0.9789 0.0211 0.0000 1 0 0.9753 0.0247 0.0000
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 761 152 609 0 0 2 0 150 0 0 601 0 8 0.0000 0.0000 0.0131 75.000 3.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr19 50481874 T TG 0.019409 0.100 1 1 2 290 96 194 43 0 3 3 47 0 0 194 0 0 0.4479 0.0000 0.0000 30.667 0.51 1.04 -0.53 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2436 0.7391 0.0173 1 1 0.2545 0.7282 0.0172 1 1 0.2691 0.7139 0.0171
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 588 171 417 87 2 3 5 74 0 0 415 0 2 0.5088 0.0000 0.0048 55.667 0.78 2.81 -2.03 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2231 0.6865 0.0904 1 1 0.2269 0.6755 0.0976 1 1 0.2312 0.6613 0.1076
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 208 82 126 6 0 2 0 74 0 0 123 1 2 0.0732 0.0000 0.0238 40.000 0.17 2.30 -2.13 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8301 0.1699 2 2 0.0000 0.3015 0.6985
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 482 155 327 74 0 3 0 78 0 0 327 0 0 0.4774 0.0000 0.0000 50.667 0.18 2.29 -2.12 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1344 0.6816 0.1840 1 1 0.1419 0.6697 0.1884 1 1 0.1519 0.6545 0.1937
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 535 143 392 73 2 1 0 67 0 0 391 0 1 0.5105 0.0000 0.0026 142.000 1.05 3.34 -2.29 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3566 0.5870 0.0564 1 1 0.3609 0.5788 0.0603 1 1 0.3659 0.5686 0.0656
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 739 213 526 201 0 0 0 12 0 0 525 0 1 0.9437 0.0000 0.0019 213.000 0.24 3.08 -2.84 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0320 0.9680 0.0000 0 0 0.8587 0.1413 0.0000
chr19 53258416 CAATA C 0.000164 0.100 1 -4 2 397 91 306 50 0 1 0 40 0 0 306 0 0 0.5495 0.0000 0.0000 90.000 1.24 5.40 -4.16 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6340 0.3659 0.0000 1 0 0.6329 0.3671 0.0000 1 0 0.6309 0.3690 0.0000
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 830 162 668 75 0 7 0 80 0 0 665 0 3 0.4630 0.0000 0.0045 22.143 0.61 3.29 -2.67 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0716 0.6334 0.2950 1 1 0.0772 0.6239 0.2989 1 1 0.0849 0.6120 0.3031
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.100 1 4 2 852 199 653 175 0 16 0 8 0 0 653 0 0 0.8794 0.0000 0.0000 11.438 0.17 4.50 -4.33 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 0 0.9752 0.0248 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 501 127 374 8 0 23 1 95 0 0 353 0 21 0.0630 0.0000 0.0561 4.522 0.62 7.46 -6.84 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9360 0.0640 2 2 0.0000 0.3695 0.6305
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 725 202 523 84 4 33 0 81 0 0 511 0 12 0.4158 0.0000 0.0229 5.419 2.38 18.06 -15.68 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0178 0.5938 0.3884 1 1 0.0191 0.5827 0.3982 1 1 0.0209 0.5689 0.4102
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 1066 274 792 212 3 44 1 14 0 1 790 0 1 0.7737 0.0000 0.0025 5.205 1.02 3.36 -2.33 100 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 0 0.7463 0.2537 0.0000
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 577 107 470 50 0 1 1 55 0 1 467 0 2 0.4673 0.0000 0.0064 106.000 0.44 4.40 -3.96 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0765 0.5659 0.3576 1 1 0.0810 0.5602 0.3588 1 1 0.0872 0.5531 0.3597
chr19 55579544 A ACGGCCACGGCCCCGACCACGGCCT 0.500000 0.100 1 24 2 488 125 363 93 0 26 1 5 3 1 358 0 1 0.7440 0.0083 0.0138 3.769 0.97 16.00 -15.03 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1395 0.8605 0.0000 0 0 0.6514 0.3486 0.0000
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 130 64 66 0 0 12 0 52 0 0 66 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.333 2.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1330 0.8670 2 2 0.0000 0.1394 0.8606 2 2 0.0000 0.1484 0.8516
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 372 137 235 69 0 5 0 63 0 0 233 0 2 0.5036 0.0000 0.0085 26.400 0.26 2.03 -1.77 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2216 0.6515 0.1269 1 1 0.2257 0.6411 0.1333 1 1 0.2305 0.6277 0.1417
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 107 50 57 0 0 0 0 50 0 0 56 0 1 0.0000 0.0000 0.0175 50.000 6.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0459 0.9541 2 2 0.0000 0.0483 0.9517 2 2 0.0000 0.0517 0.9483
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.100 1 3 1 505 119 386 103 2 10 0 4 1 0 385 0 0 0.8655 0.0026 0.0026 10.900 1.22 3.00 -1.78 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2795 0.7205 0.0000 0 0 0.9727 0.0273 0.0000 0 0 0.9940 0.0060 0.0000
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 484 168 316 111 1 4 0 52 0 0 315 0 1 0.6607 0.0000 0.0032 41.000 0.18 8.85 -8.67 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9896 0.0103 0.0000 1 0 0.9878 0.0122 0.0000 1 0 0.9848 0.0151 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 485 165 320 108 0 5 0 52 0 0 319 0 1 0.6545 0.0000 0.0031 32.000 0.21 8.85 -8.63 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9850 0.0150 0.0000 1 0 0.9826 0.0174 0.0000 1 0 0.9788 0.0212 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 487 161 326 100 0 3 1 57 0 0 326 0 0 0.6211 0.0000 0.0000 52.333 0.26 8.33 -8.07 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9521 0.0478 0.0001 1 0 0.9471 0.0528 0.0002 1 0 0.9395 0.0603 0.0002
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 387 164 223 143 0 17 0 4 0 0 221 0 2 0.8720 0.0000 0.0090 8.647 0.65 4.75 -4.10 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0152 0.9848 0.0000 0 0 0.9327 0.0673 0.0000 0 0 0.9931 0.0069 0.0000
chr20 3668985 ATCTGGACT A 0.038221 0.100 1 -8 1 270 93 177 90 0 1 0 2 0 0 177 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 92.000 0.98 10.00 -9.02 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9667 0.0333 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 293 126 167 63 0 1 0 62 0 0 167 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 125.000 0.21 1.29 -1.08 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1494 0.6528 0.1978 1 1 0.1533 0.6421 0.2046 1 1 0.1583 0.6284 0.2133
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 814 220 594 135 0 3 0 82 0 0 588 0 6 0.6136 0.0000 0.0101 72.333 0.17 6.45 -6.28 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9511 0.0489 0.0001 1 0 0.9463 0.0536 0.0001 1 0 0.9391 0.0608 0.0002
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 549 167 382 11 0 4 1 151 0 0 370 0 12 0.0659 0.0000 0.0314 40.750 0.00 3.12 -3.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9463 0.0537 2 2 0.0000 0.1754 0.8246
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.100 1 -9 4 250 71 179 25 0 27 1 18 0 0 178 0 1 0.3521 0.0000 0.0056 1.593 1.88 9.06 -7.18 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3122 0.5407 0.1471 1 1 0.3094 0.5385 0.1521 1 1 0.3055 0.5356 0.1588
chr20 35627312 C CA 0.103940 0.100 1 1 1 168 64 104 27 0 3 0 34 0 0 103 0 1 0.4219 0.0000 0.0096 20.333 0.26 1.26 -1.01 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2037 0.6809 0.1154 1 1 0.2128 0.6739 0.1133 1 1 0.2249 0.6646 0.1105
chr20 38926679 C CGCG 0.081611 0.100 1 3 3 657 214 443 163 7 35 0 9 0 0 443 0 0 0.7617 0.0000 0.0000 5.114 0.19 3.11 -2.92 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7906 0.2094 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000
chr20 41084518 A AGAC 0.000868 0.100 1 3 2 178 78 100 45 0 0 0 33 0 0 99 0 1 0.5769 0.0000 0.0100 78.000 0.16 3.12 -2.97 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6686 0.3313 0.0001 1 0 0.6657 0.3342 0.0001 1 0 0.6616 0.3383 0.0001
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 637 192 445 179 1 6 0 6 0 0 445 0 0 0.9323 0.0000 0.0000 31.000 0.27 3.17 -2.89 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0100 0.9900 0.0000 0 0 0.8975 0.1025 0.0000 0 0 0.9885 0.0115 0.0000
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 1061 324 737 240 2 51 0 31 0 0 736 0 1 0.7407 0.0000 0.0014 5.353 0.25 2.97 -2.72 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 621 285 336 226 7 28 1 23 0 0 336 0 0 0.7930 0.0000 0.0000 9.519 0.31 3.26 -2.95 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0342 0.9658 0.0000
chr20 57359031 TG T 0.000245 0.100 1 -1 1 183 69 114 64 0 3 1 1 0 0 114 0 0 0.9275 0.0000 0.0000 22.000 0.33 5.00 -4.67 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 186 24 162 0 0 0 0 24 0 0 160 0 2 0.0000 0.0000 0.0123 24.000 8.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 338 168 170 104 0 0 0 64 0 0 170 0 0 0.6190 0.0000 0.0000 168.000 0.29 1.98 -1.70 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8678 0.1314 0.0008 1 0 0.8569 0.1421 0.0010 1 0 0.8407 0.1577 0.0015
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 876 196 680 184 1 4 0 7 0 0 679 0 1 0.9388 0.0000 0.0015 48.000 0.27 6.00 -5.73 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6643 0.3357 0.0000 0 0 0.9782 0.0218 0.0000
chr21 33488442 CAATTA C 0.224085 0.100 1 -5 2 723 208 515 116 0 11 0 81 0 0 512 0 3 0.5577 0.0000 0.0058 17.909 0.21 5.00 -4.79 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8737 0.1259 0.0004 1 0 0.8681 0.1313 0.0006 1 0 0.8600 0.1392 0.0008
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 818 222 596 198 3 17 0 4 4 3 589 0 0 0.8919 0.0067 0.0117 12.059 1.34 9.75 -8.41 38 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9511 0.0489 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 255 107 148 0 0 4 0 103 0 0 146 0 2 0.0000 0.0000 0.0135 25.750 3.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0045 0.9955
chr21 41179506 G GGGGTGAGTGAGGGTGTCCAGGGTGAGGAGTGAGGGTGTCA 0.029913 0.100 1 40 1 1063 273 790 59 0 158 2 54 3 11 724 11 41 0.2161 0.0038 0.0835 0.722 1.56 3.11 -1.55 13 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0091 0.7083 0.2826 1 1 0.0113 0.7202 0.2684 1 1 0.0150 0.7354 0.2496
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 366 50 316 0 1 4 1 44 0 0 316 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 15.333 2.41 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1228 198 1030 28 3 7 6 154 2 0 1019 2 7 0.1414 0.0019 0.0107 47.500 0.96 3.11 -2.15 14 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1229 197 1032 27 4 8 11 147 2 0 1021 2 7 0.1371 0.0019 0.0107 37.400 0.93 3.24 -2.31 13 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 750 154 596 93 1 11 4 45 29 6 551 0 10 0.6039 0.0487 0.0755 12.909 1.73 14.07 -12.34 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9972 0.0028 0.0000 1 0 0.9965 0.0035 0.0000 1 0 0.9954 0.0045 0.0000
chr21 44637501 G GCC 0.000448 0.100 1 2 1 450 142 308 87 0 0 1 54 0 0 302 0 6 0.6127 0.0000 0.0195 142.000 1.60 7.30 -5.70 57 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8645 0.1355 0.0000 1 0 0.8592 0.1408 0.0000 1 0 0.8515 0.1485 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 617 128 489 60 1 15 2 50 0 0 486 0 3 0.4688 0.0000 0.0061 8.615 5.17 11.98 -6.81 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2943 0.6062 0.0995 1 1 0.2962 0.5987 0.1051 1 1 0.2981 0.5893 0.1127
chr21 44637708 TGTCTGCTGTGTGCCC T 0.168959 0.100 1 -15 2 632 128 504 58 4 8 5 53 0 0 504 0 0 0.4531 0.0000 0.0000 14.500 5.50 11.81 -6.31 20 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4055 0.5602 0.0343 1 1 0.4111 0.5529 0.0359 1 1 0.4178 0.5440 0.0382
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 364 163 201 1 0 18 4 140 0 0 201 0 0 0.0061 0.0000 0.0000 8.471 0.00 7.86 -7.86 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 45505226 C CGGCCCCCCA 0.000422 0.100 1 9 3 445 123 322 87 1 30 0 5 0 1 320 0 1 0.7073 0.0000 0.0062 3.100 0.64 9.00 -8.36 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2622 0.7378 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 571 207 364 172 5 24 0 6 0 0 363 0 1 0.8309 0.0000 0.0027 7.625 0.23 3.17 -2.93 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0031 0.9969 0.0000 0 0 0.8953 0.1047 0.0000 0 0 0.9923 0.0077 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 245 110 135 96 0 6 0 8 0 0 134 0 1 0.8727 0.0000 0.0074 17.333 0.14 3.12 -2.99 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0257 0.9743 0.0000 0 0 0.5086 0.4914 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 510 104 406 0 0 23 4 77 0 0 385 0 21 0.0000 0.0000 0.0517 3.478 16.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 839 213 626 122 2 8 0 81 0 0 624 0 2 0.5728 0.0000 0.0032 25.625 0.30 4.10 -3.80 78 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9262 0.0737 0.0002 1 0 0.9204 0.0793 0.0003 1 0 0.9119 0.0877 0.0004
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 796 224 572 121 0 8 0 95 0 0 571 0 1 0.5402 0.0000 0.0017 27.000 0.60 2.06 -1.47 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6760 0.3195 0.0045 1 0 0.6721 0.3225 0.0054 1 0 0.6656 0.3275 0.0069
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 675 150 525 134 1 5 0 10 0 0 525 0 0 0.8933 0.0000 0.0000 29.000 0.40 14.20 -13.80 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0157 0.9843 0.0000 0 1 0.4744 0.5256 0.0000
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.100 1 -3 1 1201 471 730 272 1 9 2 187 0 2 722 1 5 0.5775 0.0000 0.0110 51.222 1.04 3.54 -2.50 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9939 0.0061 0.0000 1 0 0.9930 0.0070 0.0000 1 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.100 1 -42 4 403 181 222 99 0 3 0 79 0 0 207 0 15 0.5470 0.0000 0.0676 59.333 0.20 17.30 -17.10 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2895 0.6615 0.0490 1 1 0.2991 0.6484 0.0525 1 1 0.3109 0.6317 0.0574
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 411 192 219 104 0 22 0 66 0 0 209 0 10 0.5417 0.0000 0.0457 7.727 0.18 8.15 -7.97 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8125 0.1859 0.0016 1 0 0.8060 0.1920 0.0020 1 0 0.7965 0.2009 0.0026
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 251 123 128 58 0 5 0 60 0 0 126 0 2 0.4715 0.0000 0.0156 23.600 0.14 4.47 -4.33 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1633 0.6561 0.1806 1 1 0.1707 0.6461 0.1831 1 1 0.1806 0.6333 0.1861
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 369 135 234 58 0 2 0 75 0 0 232 0 2 0.4296 0.0000 0.0085 66.500 0.03 3.20 -3.17 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0067 0.2922 0.7011 1 2 0.0077 0.2966 0.6957 1 2 0.0092 0.3030 0.6878
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 573 182 391 0 0 16 8 158 0 0 388 0 3 0.0000 0.0000 0.0077 10.375 3.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.100 1 -48 1 1074 265 809 246 1 9 0 9 0 0 806 0 3 0.9283 0.0000 0.0037 28.444 0.86 11.33 -10.47 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7110 0.2890 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000
676 rows