File Info

Filename
HG02922_x_HG03063_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/02/50643d3596f1a823ca763da8cd3585/HG02922_x_HG03063_FF_10.features.tsv
Size
168.4 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG02922_x_HG03063_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 426 154 272 78 1 24 1 50 0 0 270 0 2 0.5065 0.0000 0.0074 5.417 0.19 3.18 -2.99 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7725 0.2231 0.0044 1 0 0.7629 0.2318 0.0053 1 0 0.7491 0.2441 0.0068
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 810 235 575 92 3 43 5 92 0 0 572 0 3 0.3915 0.0000 0.0052 4.465 0.34 3.14 -2.80 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0808 0.6969 0.2223 1 1 0.0869 0.6833 0.2298 1 1 0.0951 0.6659 0.2390
chr1 6469126 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 816 231 585 129 4 87 0 11 0 0 585 0 0 0.5584 0.0000 0.0000 35.000 0.42 3.91 -3.49 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0366 0.9634 0.0000
chr1 6469129 TCC T 0.500000 0.100 1 -2 2 824 234 590 124 3 10 86 11 0 0 590 0 0 0.5299 0.0000 0.0000 15.889 0.41 3.91 -3.50 34 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9566 0.0433 0.0001 1 0 0.9517 0.0482 0.0001 1 0 0.9442 0.0556 0.0002
chr1 10639083 CTCGTCG C 0.500000 0.100 1 -6 2 571 124 447 104 0 15 1 4 0 0 447 0 0 0.8387 0.0000 0.0000 7.267 1.12 6.75 -5.63 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 1 0.4791 0.5209 0.0000 0 0 0.8654 0.1346 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 570 126 444 47 1 17 2 59 0 0 439 0 5 0.3730 0.0000 0.0113 6.412 0.17 3.24 -3.07 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0176 0.3646 0.6178 1 2 0.0199 0.3698 0.6103 1 2 0.0235 0.3771 0.5994
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 1000 183 817 0 0 7 0 176 0 0 809 0 8 0.0000 0.0000 0.0098 25.143 3.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr1 15410070 A AGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 404 135 269 60 0 18 2 55 0 0 264 0 5 0.4444 0.0000 0.0186 6.444 0.50 6.78 -6.28 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1453 0.6406 0.2141 1 1 0.1507 0.6304 0.2188 1 1 0.1578 0.6176 0.2246
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 249 46 203 7 0 2 1 36 0 0 202 0 1 0.1522 0.0000 0.0049 44.000 0.43 1.06 -0.63 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 1 0.0000 0.9953 0.0047 2 1 0.0000 0.9351 0.0649
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 1964 422 1542 318 20 35 1 48 0 0 1540 1 1 0.7536 0.0000 0.0013 11.182 1.60 2.17 -0.57 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 21474942 TGTCTCCCAG T 0.500000 0.100 1 -9 1 184 69 115 50 0 2 0 17 0 0 115 0 0 0.7246 0.0000 0.0000 33.500 0.10 9.47 -9.37 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9033 0.0954 0.0013 1 0 0.8873 0.1111 0.0016 1 0 0.7059 0.2922 0.0018
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 845 225 620 102 23 15 45 40 1 1 617 1 0 0.4533 0.0016 0.0048 16.417 7.08 28.82 -21.75 60 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9310 0.0688 0.0002 1 0 0.9249 0.0749 0.0002 1 0 0.9157 0.0839 0.0004
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 876 239 637 57 3 45 9 125 0 0 636 0 1 0.2385 0.0000 0.0016 5.676 1.86 17.44 -15.58 37 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0049 0.9951 1 2 0.0000 0.0060 0.9940 1 2 0.0000 0.0077 0.9923
chr1 26346647 G GCCT 0.500000 0.100 1 3 1 520 148 372 130 0 11 0 7 0 0 372 0 0 0.8784 0.0000 0.0000 12.455 1.32 3.71 -2.40 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2769 0.7231 0.0000 0 0 0.8600 0.1400 0.0000
chr1 26994059 CGCGGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 435 88 347 49 0 1 0 38 1 0 344 0 2 0.5568 0.0029 0.0086 87.000 0.78 6.24 -5.46 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4363 0.5036 0.0601 1 1 0.4332 0.5024 0.0644 1 1 0.4284 0.5011 0.0705
chr1 27549006 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 838 165 673 17 0 5 0 143 0 0 670 0 3 0.1030 0.0000 0.0045 32.000 0.71 3.41 -2.70 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9787 0.0213
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 395 168 227 5 0 17 0 146 0 0 226 0 1 0.0298 0.0000 0.0044 8.882 0.00 2.98 -2.98 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9738 0.0262 2 2 0.0000 0.1172 0.8828 2 2 0.0000 0.0194 0.9806
chr1 34761404 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 745 210 535 119 0 1 2 88 0 0 535 0 0 0.5667 0.0000 0.0000 207.000 0.27 2.33 -2.06 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7668 0.2310 0.0023 1 0 0.7600 0.2372 0.0028 1 0 0.7499 0.2463 0.0037
chr1 46547743 G GCC 0.500000 0.100 1 2 1 153 76 77 69 0 3 1 3 0 0 77 0 0 0.9079 0.0000 0.0000 24.333 1.28 2.33 -1.06 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 1 0.3420 0.6580 0.0000 0 0 0.6975 0.3025 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 599 141 458 0 1 22 1 117 0 0 457 1 0 0.0000 0.0000 0.0022 5.409 5.61 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0044 0.9956
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 656 173 483 138 1 23 0 11 0 0 482 0 1 0.7977 0.0000 0.0021 6.522 0.38 3.09 -2.71 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.2854 0.7146 0.0000
chr1 62206717 T TAACAGA 0.500000 0.100 1 6 2 415 98 317 86 0 9 0 3 0 0 316 0 1 0.8776 0.0000 0.0032 9.889 0.60 6.00 -5.40 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0109 0.9891 0.0000 0 0 0.5091 0.4909 0.0000 0 0 0.8328 0.1672 0.0000
chr1 74764057 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 4 190 70 120 32 0 10 0 28 0 0 120 0 0 0.4571 0.0000 0.0000 6.000 0.12 3.11 -2.98 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3069 0.5542 0.1389 1 1 0.3068 0.5501 0.1431 1 1 0.3063 0.5449 0.1488
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 272 82 190 66 2 7 1 6 0 0 190 0 0 0.8049 0.0000 0.0000 10.571 0.61 4.50 -3.89 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0175 0.9825 0.0000 0 1 0.2339 0.7661 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 173 84 89 51 0 2 0 31 0 0 88 0 1 0.6071 0.0000 0.0112 41.000 0.20 3.74 -3.55 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6756 0.3088 0.0156 1 0 0.6652 0.3170 0.0178 1 0 0.6506 0.3283 0.0211
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 363 146 217 0 0 25 0 121 0 0 216 0 1 0.0000 0.0000 0.0046 4.840 8.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0027 0.9973
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 495 117 378 0 0 6 0 111 0 0 372 0 6 0.0000 0.0000 0.0159 18.500 5.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr1 90716915 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 1 677 148 529 130 2 10 0 6 0 0 529 0 0 0.8784 0.0000 0.0000 13.700 0.96 4.50 -3.54 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.5496 0.4504 0.0000 0 0 0.9275 0.0725 0.0000
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 169 78 91 38 0 3 0 37 0 0 91 0 0 0.4872 0.0000 0.0000 25.000 0.16 3.19 -3.03 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2254 0.5898 0.1849 1 1 0.2283 0.5831 0.1887 1 1 0.2318 0.5747 0.1935
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 439 107 332 52 1 11 2 41 0 0 330 0 2 0.4860 0.0000 0.0060 8.636 0.33 3.20 -2.87 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3767 0.5469 0.0764 1 1 0.3759 0.5429 0.0811 1 1 0.3743 0.5380 0.0876
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 857 189 668 91 0 19 1 78 0 0 667 0 1 0.4815 0.0000 0.0015 8.947 1.33 13.04 -11.71 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3769 0.5812 0.0419 1 1 0.3801 0.5739 0.0460 1 1 0.3832 0.5650 0.0518
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.100 1 -45 4 868 228 640 205 7 11 0 5 0 0 639 1 0 0.8991 0.0000 0.0016 19.727 5.27 3.40 1.87 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3467 0.6533 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 185 69 116 7 0 1 0 61 0 0 116 0 0 0.1014 0.0000 0.0000 68.000 0.00 1.87 -1.87 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9879 0.0121 2 1 0.0000 0.8223 0.1777
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 261 87 174 25 6 15 1 40 0 0 174 0 0 0.2874 0.0000 0.0000 4.733 0.40 1.27 -0.87 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0562 0.4628 0.4811 1 2 0.0603 0.4644 0.4753 1 2 0.0661 0.4667 0.4672
chr1 152306361 C CAA 0.500000 0.100 1 2 1 273 29 244 21 0 3 0 5 0 0 244 0 0 0.7241 0.0000 0.0000 8.667 0.62 7.40 -6.78 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2507 0.7388 0.0105 0 1 0.1296 0.8648 0.0056 0 1 0.1425 0.8548 0.0027
chr1 152306363 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 273 28 245 21 0 2 2 3 0 0 245 0 0 0.7500 0.0000 0.0000 13.000 0.62 7.67 -7.05 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2401 0.7499 0.0100 0 1 0.1261 0.8685 0.0054 0 1 0.1445 0.8529 0.0026
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 256 84 172 0 0 13 0 71 0 0 150 0 22 0.0000 0.0000 0.1279 5.462 11.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0095 0.9905 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 831 247 584 201 0 30 0 16 0 0 584 0 0 0.8138 0.0000 0.0000 7.483 1.05 5.94 -4.89 141 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.3784 0.6216 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1274 347 927 240 5 80 2 20 8 2 906 4 7 0.6916 0.0086 0.0227 3.300 1.96 10.90 -8.94 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 509 222 287 17 0 17 0 188 0 0 286 0 1 0.0766 0.0000 0.0035 12.059 0.12 8.39 -8.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8505 0.1495
chr1 154558455 CCCCCCTGGGCCG C 0.500000 0.100 1 -12 8 435 128 307 60 0 8 1 59 1 0 306 0 0 0.4688 0.0033 0.0033 15.000 0.83 9.14 -8.30 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1962 0.6430 0.1608 1 1 0.2011 0.6327 0.1662 1 1 0.2073 0.6196 0.1730
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 1279 314 965 3 3 87 2 219 1 0 930 0 34 0.0096 0.0010 0.0363 2.609 7.00 6.91 0.09 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8907 0.1093 2 2 0.0000 0.0046 0.9954 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 221 92 129 48 0 1 1 42 0 0 129 0 0 0.5217 0.0000 0.0000 91.000 1.69 2.81 -1.12 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3077 0.5799 0.1123 1 1 0.3089 0.5739 0.1172 1 1 0.3099 0.5663 0.1238
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 649 168 481 0 0 4 0 164 0 0 479 0 2 0.0000 0.0000 0.0042 41.000 2.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1179 245 934 207 0 7 0 31 0 0 933 0 1 0.8449 0.0000 0.0011 34.000 0.27 1.84 -1.57 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.100 1 3 1 146 75 71 70 0 2 0 3 0 0 71 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 36.500 0.67 4.00 -3.33 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0431 0.9569 0.0000 0 0 0.5750 0.4250 0.0000 0 0 0.8133 0.1867 0.0000
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 192 61 131 60 0 0 0 1 0 0 131 0 0 0.9836 0.0000 0.0000 61.000 0.03 1.00 -0.97 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6984 0.3016 0.0000 0 0 0.8735 0.1265 0.0000 0 0 0.9064 0.0936 0.0000
chr1 175160809 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 497 125 372 14 57 4 17 33 0 1 371 0 0 0.1120 0.0000 0.0027 108.000 0.79 8.97 -8.18 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7615 0.2327 0.0058 1 0 0.7512 0.2419 0.0070 1 0 0.7366 0.2546 0.0087
chr1 183533735 T TACA 0.500000 0.100 1 3 2 243 88 155 45 0 0 0 43 0 0 153 0 2 0.5114 0.0000 0.0129 88.000 0.16 3.14 -2.98 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1957 0.6086 0.1957 1 1 0.1997 0.6006 0.1997 1 1 0.2048 0.5905 0.2048
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 659 174 485 161 0 7 0 6 0 0 485 0 0 0.9253 0.0000 0.0000 23.857 0.61 4.33 -3.72 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0065 0.9935 0.0000 0 0 0.8415 0.1585 0.0000 0 0 0.9814 0.0186 0.0000
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 656 175 481 167 1 1 0 6 0 0 481 0 0 0.9543 0.0000 0.0000 174.000 0.58 4.00 -3.42 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0085 0.9915 0.0000 0 0 0.8813 0.1187 0.0000 0 0 0.9866 0.0134 0.0000
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 69 34 35 20 0 0 0 14 0 0 35 0 0 0.5882 0.0000 0.0000 34.000 0.10 2.00 -1.90 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3834 0.4999 0.1167 1 1 0.3794 0.4997 0.1209 1 1 0.3738 0.4996 0.1266
chr1 205845546 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 266 82 184 57 0 0 0 25 0 0 184 0 0 0.6951 0.0000 0.0000 82.000 0.32 1.16 -0.84 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8872 0.1112 0.0016 1 0 0.8774 0.1206 0.0020 1 0 0.8631 0.1342 0.0027
chr1 209432291 TAGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 485 242 243 69 1 60 22 90 0 0 242 1 0 0.2851 0.0000 0.0041 3.033 0.22 2.88 -2.66 37 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0644 0.9354 1 2 0.0003 0.0705 0.9292 1 2 0.0004 0.0797 0.9199
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 485 253 232 181 0 58 0 14 0 0 231 0 1 0.7154 0.0000 0.0043 3.362 1.54 9.93 -8.39 95 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.3156 0.6844 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 664 151 513 83 0 9 0 59 0 0 509 0 4 0.5497 0.0000 0.0078 15.778 0.37 8.71 -8.34 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6319 0.3562 0.0120 1 0 0.6256 0.3606 0.0138 1 0 0.6163 0.3671 0.0167
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 234 107 127 51 0 2 0 54 0 0 127 0 0 0.4766 0.0000 0.0000 52.500 0.08 1.33 -1.25 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1367 0.6157 0.2477 1 1 0.1418 0.6072 0.2511 1 1 0.1485 0.5964 0.2551
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 599 161 438 0 0 9 1 151 0 0 434 0 4 0.0000 0.0000 0.0091 16.889 3.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 523 141 382 78 1 2 0 60 0 0 381 0 1 0.5532 0.0000 0.0026 69.500 0.32 1.20 -0.88 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5869 0.3961 0.0170 1 0 0.5816 0.3991 0.0193 1 0 0.5736 0.4036 0.0228
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 388 104 284 52 0 1 0 51 0 0 284 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 103.000 1.46 1.16 0.30 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2074 0.6225 0.1701 1 1 0.2116 0.6135 0.1749 1 1 0.2168 0.6022 0.1810
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1162 278 884 152 0 2 0 124 0 0 882 0 2 0.5468 0.0000 0.0023 138.000 0.98 1.40 -0.42 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6250 0.3714 0.0036 1 0 0.6254 0.3702 0.0044 1 0 0.6242 0.3701 0.0057
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 471 145 326 5 0 2 1 137 0 0 325 0 1 0.0345 0.0000 0.0031 71.000 2.80 5.23 -2.43 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9825 0.0175 2 2 0.0000 0.1662 0.8338 2 2 0.0000 0.0285 0.9715
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 549 45 504 0 0 0 2 43 0 0 501 0 3 0.0000 0.0000 0.0060 44.000 4.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0801 0.9199 2 2 0.0000 0.0838 0.9162 2 2 0.0000 0.0892 0.9108
chr1 248574594 T TGGATGAGGA 0.500000 0.100 1 9 1 722 124 598 103 0 19 0 2 0 0 598 0 0 0.8306 0.0000 0.0000 5.526 0.12 9.00 -8.88 35 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6910 0.3090 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 410 95 315 84 0 3 0 8 0 0 314 0 1 0.8842 0.0000 0.0032 30.667 0.95 7.12 -6.17 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 1 0.1544 0.8456 0.0000
chr1 248650432 T TC 0.500000 0.100 1 1 3 1341 371 970 288 0 10 0 73 0 0 966 0 4 0.7763 0.0000 0.0041 36.100 0.71 1.63 -0.92 56 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9945 0.0055 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 206 100 106 0 0 4 0 96 0 0 104 0 2 0.0000 0.0000 0.0189 24.000 3.86 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0094 0.9906 2 2 0.0000 0.0104 0.9896 2 2 0.0000 0.0119 0.9881
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 392 113 279 0 0 17 1 95 0 0 258 1 20 0.0000 0.0000 0.0753 5.647 10.28 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 392 113 279 4 1 66 2 40 0 0 259 3 17 0.0354 0.0000 0.0717 0.719 9.00 11.82 -2.82 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9476 0.0524 2 1 0.0000 0.7711 0.2289
chr2 24164308 GC G 0.029697 0.100 1 -1 1 201 101 100 95 0 1 0 5 0 0 100 0 0 0.9406 0.0000 0.0000 100.000 0.15 1.00 -0.85 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0605 0.9395 0.0000 0 0 0.9486 0.0514 0.0000 0 0 0.9925 0.0075 0.0000
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.100 1 9 1 548 115 433 93 0 15 0 7 0 0 432 0 1 0.8087 0.0000 0.0023 6.667 0.37 7.57 -7.21 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2433 0.7567 0.0000 0 0 0.8925 0.1075 0.0000
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 263 60 203 31 0 0 1 28 0 0 199 0 4 0.5167 0.0000 0.0197 60.000 0.65 3.18 -2.53 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1727 0.5732 0.2541 1 1 0.1764 0.5677 0.2558 1 1 0.1814 0.5608 0.2578
chr2 37084557 C CAGAGAGCTGTCAGGTA 0.500000 0.100 1 16 1 180 93 87 35 0 22 0 36 0 0 82 0 5 0.3763 0.0000 0.0575 3.227 0.14 13.00 -12.86 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1047 0.5512 0.3441 1 1 0.1094 0.5472 0.3434 1 1 0.1158 0.5422 0.3420
chr2 38602455 G GGCC 0.500000 0.100 1 3 2 387 148 239 126 0 20 0 2 0 0 238 0 1 0.8514 0.0000 0.0042 6.400 0.49 1.50 -1.01 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4394 0.5606 0.0000 0 0 0.9569 0.0431 0.0000 0 0 0.9851 0.0149 0.0000
chr2 39769817 ATTC A 0.500000 0.100 1 -3 3 457 122 335 107 0 9 0 6 0 0 335 0 0 0.8770 0.0000 0.0000 12.556 0.22 3.33 -3.11 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2604 0.7396 0.0000 0 0 0.7927 0.2073 0.0000
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 573 202 371 40 0 108 1 53 0 0 371 0 0 0.1980 0.0000 0.0000 0.870 1.25 1.13 0.12 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0337 0.4273 0.5390 1 2 0.0371 0.4303 0.5327 1 2 0.0419 0.4344 0.5236
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 573 198 375 72 3 68 1 54 0 0 375 0 0 0.3636 0.0000 0.0000 1.912 0.89 1.20 -0.31 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6461 0.3413 0.0126 1 0 0.6386 0.3469 0.0145 1 0 0.6278 0.3548 0.0174
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.100 1 6 1 214 85 129 45 0 4 0 36 0 0 126 0 3 0.5294 0.0000 0.0233 20.250 0.31 5.58 -5.27 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3367 0.5609 0.1025 1 1 0.3366 0.5561 0.1073 1 1 0.3360 0.5502 0.1138
chr2 61853885 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 3 445 162 283 156 0 5 0 1 0 0 282 0 1 0.9630 0.0000 0.0035 31.400 1.24 4.00 -2.76 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9709 0.0291 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000
chr2 65071512 GAAC G 0.500000 0.100 1 -3 1 777 188 589 103 0 8 0 77 0 0 587 0 2 0.5479 0.0000 0.0034 22.500 0.37 3.30 -2.93 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6845 0.3097 0.0059 1 0 0.6785 0.3145 0.0070 1 0 0.6694 0.3218 0.0088
chr2 65072937 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 3 568 137 431 75 1 6 0 55 0 0 430 0 1 0.5474 0.0000 0.0023 21.833 0.28 3.09 -2.81 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6471 0.3406 0.0123 1 0 0.6397 0.3462 0.0142 1 0 0.6290 0.3540 0.0170
chr2 70984816 TGCCCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 734 189 545 103 0 9 0 77 0 0 544 0 1 0.5450 0.0000 0.0018 20.000 1.15 6.78 -5.63 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7068 0.2882 0.0050 1 0 0.7002 0.2938 0.0060 1 0 0.6904 0.3020 0.0076
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 648 176 472 1 2 51 114 8 0 0 462 10 0 0.0057 0.0000 0.0212 2.460 4.00 4.62 -0.62 1 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0309 0.9691 2 2 0.0000 0.0089 0.9911 2 2 0.0000 0.0058 0.9942
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 648 178 470 1 2 53 3 119 0 0 458 2 10 0.0056 0.0000 0.0255 2.327 0.00 9.18 -9.18 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0175 0.9825 2 2 0.0000 0.0060 0.9940 2 2 0.0000 0.0045 0.9955
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 448 86 362 0 0 8 0 78 0 0 360 0 2 0.0000 0.0000 0.0055 9.750 2.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0169 0.9831 2 2 0.0000 0.0183 0.9817 2 2 0.0000 0.0205 0.9795
chr2 74958681 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 1 314 85 229 75 2 4 0 4 0 1 228 0 0 0.8824 0.0000 0.0044 20.250 0.76 4.00 -3.24 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0073 0.9927 0.0000 0 1 0.4101 0.5899 0.0000 0 0 0.7715 0.2285 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 355 134 221 106 2 14 0 12 1 0 220 0 0 0.7910 0.0045 0.0045 8.571 0.60 2.83 -2.23 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0820 0.9180 0.0000
chr2 85343751 CAGAT C 0.500000 0.100 1 -4 2 850 231 619 218 0 9 0 4 0 0 619 0 0 0.9437 0.0000 0.0000 24.667 0.83 3.50 -2.67 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9022 0.0978 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr2 85754556 ACGC A 0.500000 0.100 1 -3 4 664 175 489 94 2 20 2 57 0 0 486 1 2 0.5371 0.0000 0.0061 7.750 1.19 3.49 -2.30 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8712 0.1278 0.0010 1 0 0.8627 0.1360 0.0013 1 0 0.8502 0.1480 0.0018
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 594 163 431 0 0 26 6 131 0 0 428 0 3 0.0000 0.0000 0.0070 5.269 3.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 798 218 580 195 1 13 1 8 0 0 580 0 0 0.8945 0.0000 0.0000 15.692 0.38 7.25 -6.87 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.5780 0.4220 0.0000 0 0 0.9775 0.0225 0.0000
chr2 97702739 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 338 138 200 125 2 2 0 9 0 0 200 0 0 0.9058 0.0000 0.0000 68.000 0.17 1.11 -0.94 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0392 0.9608 0.0000 0 0 0.5980 0.4020 0.0000
chr2 108308425 GA G 0.500000 0.100 1 -1 3 171 90 81 85 0 1 0 4 0 0 81 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 89.000 0.12 2.50 -2.38 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0106 0.9894 0.0000 0 1 0.4974 0.5026 0.0000 0 0 0.8261 0.1739 0.0000
chr2 110995965 GGTTCTTCAGCGGGGTTTGGTGGCCAGAATTTATTATAAGGTAAAGATACACTGT G 0.500000 0.100 1 -54 3 212 122 90 114 1 5 0 2 0 0 90 0 0 0.9344 0.0000 0.0000 23.200 0.20 27.00 -26.80 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8039 0.1961 0.0000 0 0 0.9736 0.0264 0.0000 0 0 0.9865 0.0135 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 597 151 446 0 0 0 0 151 0 0 438 0 8 0.0000 0.0000 0.0179 151.000 5.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 326 113 213 55 0 9 0 49 0 0 211 0 2 0.4867 0.0000 0.0094 11.556 0.49 6.22 -5.73 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2691 0.6090 0.1218 1 1 0.2720 0.6010 0.1270 1 1 0.2754 0.5908 0.1338
chr2 131040094 G GAGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 572 179 393 85 2 11 0 81 1 0 391 0 1 0.4749 0.0025 0.0051 15.182 0.34 5.48 -5.14 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2528 0.6645 0.0827 1 1 0.2588 0.6528 0.0884 1 1 0.2660 0.6378 0.0962
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 761 234 527 17 0 4 0 213 0 0 525 0 2 0.0726 0.0000 0.0038 57.500 0.65 1.77 -1.12 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.6133 0.3867
chr2 131528321 C CCTGG 0.500000 0.100 1 4 1 559 142 417 80 0 5 0 57 1 0 413 1 2 0.5634 0.0024 0.0096 27.400 0.33 3.95 -3.62 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6635 0.3264 0.0101 1 0 0.6561 0.3321 0.0117 1 0 0.6454 0.3403 0.0143
chr2 132645507 T TAAG 0.500000 0.100 1 3 1 486 123 363 60 0 3 1 59 0 0 360 0 3 0.4878 0.0000 0.0083 40.000 0.22 2.88 -2.66 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1298 0.6365 0.2337 1 1 0.1353 0.6266 0.2381 1 1 0.1425 0.6141 0.2434
chr2 186694302 A ACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 9 2 342 142 200 68 0 13 4 57 0 0 195 0 5 0.4789 0.0000 0.0250 9.615 2.63 8.23 -5.60 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2266 0.6472 0.1262 1 1 0.2315 0.6366 0.1319 1 1 0.2375 0.6232 0.1394
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 341 152 189 6 55 21 1 69 0 0 189 0 0 0.0395 0.0000 0.0000 6.450 0.17 2.78 -2.62 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0255 0.4239 0.5506 1 2 0.0284 0.4263 0.5452 1 2 0.0328 0.4299 0.5373
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 243 72 171 24 8 12 4 24 0 0 171 0 0 0.3333 0.0000 0.0000 4.500 0.42 1.21 -0.79 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2922 0.5556 0.1522 1 1 0.2924 0.5514 0.1562 1 1 0.2924 0.5462 0.1614
chr2 196666794 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 175 71 104 52 2 6 3 8 0 0 104 0 0 0.7324 0.0000 0.0000 10.333 0.69 1.25 -0.56 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.0414 0.9586 0.0000
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 1 513 114 399 4 0 33 4 73 0 0 391 2 6 0.0351 0.0000 0.0201 2.531 1.00 4.12 -3.12 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9892 0.0108 2 2 0.0000 0.4947 0.5053 2 2 0.0000 0.1693 0.8307
chr2 202635418 A AGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 1 513 114 399 6 10 92 2 4 0 5 393 1 0 0.0526 0.0000 0.0150 0.184 2.83 3.25 -0.42 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5365 0.4066 0.0568 1 0 0.5116 0.4294 0.0591 1 1 0.4576 0.4840 0.0584
chr2 210315041 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 223 74 149 37 6 9 4 18 0 0 148 0 1 0.5000 0.0000 0.0067 6.556 0.57 1.44 -0.88 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7179 0.2684 0.0136 1 0 0.7059 0.2785 0.0156 1 0 0.6892 0.2921 0.0187
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 266 90 176 53 0 4 1 32 0 0 175 0 1 0.5889 0.0000 0.0057 21.500 0.17 3.44 -3.27 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6711 0.3133 0.0156 1 0 0.6609 0.3213 0.0177 1 0 0.6467 0.3322 0.0210
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 552 127 425 0 0 14 3 110 0 1 419 0 5 0.0000 0.0000 0.0141 7.929 7.44 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0045 0.9955
chr2 216633573 T TGCTGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 554 134 420 7 3 18 2 104 0 1 418 0 1 0.0522 0.0000 0.0048 6.389 1.00 7.77 -6.77 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9881 0.0119 2 1 0.0000 0.7141 0.2859
chr2 217848163 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 1 884 204 680 16 0 41 1 146 0 0 665 0 15 0.0784 0.0000 0.0221 4.075 2.25 6.58 -4.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9138 0.0862
chr2 231460727 TTCG T 0.500000 0.100 1 -3 1 663 131 532 73 1 10 0 47 0 0 532 0 0 0.5573 0.0000 0.0000 12.000 0.42 3.28 -2.85 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7945 0.2016 0.0039 1 0 0.7843 0.2109 0.0047 1 0 0.7699 0.2240 0.0061
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 376 150 226 10 0 1 0 139 0 0 226 0 0 0.0667 0.0000 0.0000 149.000 0.10 3.88 -3.78 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9760 0.0240 2 2 0.0000 0.4190 0.5810
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 183 78 105 43 0 6 0 29 0 0 105 0 0 0.5513 0.0000 0.0000 12.000 0.67 2.83 -2.15 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5640 0.4008 0.0351 1 0 0.5557 0.4057 0.0386 1 0 0.5442 0.4123 0.0435
chr2 233822976 AGGACGGCG A 0.500000 0.100 1 -8 1 424 134 290 128 0 4 0 2 0 0 290 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 32.500 0.20 10.00 -9.80 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8889 0.1111 0.0000 0 0 0.9861 0.0139 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 839 252 587 236 0 1 0 15 0 0 587 0 0 0.9365 0.0000 0.0000 251.000 0.31 1.00 -0.69 98 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0146 0.9854 0.0000 0 0 0.8572 0.1428 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 376 87 289 59 1 16 0 11 0 0 289 0 0 0.6782 0.0000 0.0000 4.438 0.44 2.64 -2.20 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0155 0.9845 0.0000
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 444 119 325 11 0 0 0 108 0 0 324 0 1 0.0924 0.0000 0.0031 119.000 0.73 2.34 -1.62 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 1 0.0000 0.8545 0.1455
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 654 159 495 0 0 2 1 156 0 0 488 0 7 0.0000 0.0000 0.0141 78.500 3.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 513 111 402 1 1 11 0 98 0 0 376 0 26 0.0090 0.0000 0.0647 9.000 12.00 12.02 -0.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0880 0.9120 2 2 0.0000 0.0321 0.9679 2 2 0.0000 0.0243 0.9757
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCAGCCCGCGCCGCA 0.034887 0.100 1 24 2 513 111 402 1 4 94 1 11 0 0 380 4 18 0.0090 0.0000 0.0547 0.163 12.00 12.00 0.00 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9950 0.0050 2 1 0.0000 0.9615 0.0385 2 1 0.0000 0.9154 0.0846
chr3 28253011 GA G 0.500000 0.100 1 -1 3 181 73 108 44 0 2 0 27 0 0 108 0 0 0.6027 0.0000 0.0000 35.500 0.05 1.15 -1.10 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6411 0.3368 0.0221 1 0 0.6308 0.3445 0.0247 1 0 0.6164 0.3549 0.0287
chr3 40462027 GTAC G 0.500000 0.100 1 -3 3 706 299 407 163 2 2 13 119 0 0 405 0 2 0.5452 0.0000 0.0049 141.500 5.63 3.13 2.51 63 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8055 0.1938 0.0007 1 0 0.8008 0.1984 0.0009 1 0 0.7932 0.2055 0.0013
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 739 247 492 101 7 36 2 101 0 2 485 0 5 0.4089 0.0000 0.0142 5.861 0.19 5.18 -4.99 3 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1556 0.7403 0.1041 1 1 0.1639 0.7247 0.1114 1 1 0.1746 0.7044 0.1210
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 739 247 492 108 0 47 0 92 2 0 485 0 5 0.4372 0.0041 0.0142 4.255 0.37 5.48 -5.11 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3704 0.5979 0.0317 1 1 0.3758 0.5889 0.0353 1 1 0.3815 0.5779 0.0406
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 642 197 445 0 0 7 0 190 0 0 444 0 1 0.0000 0.0000 0.0022 27.143 2.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 336 122 214 0 1 5 0 116 0 0 210 0 4 0.0000 0.0000 0.0187 23.200 4.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0037 0.9963
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 620 164 456 1 0 24 8 131 0 0 454 0 2 0.0061 0.0000 0.0044 5.792 1.00 3.21 -2.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0070 0.9930 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr3 47002084 T TGCAGCTGCA 0.500000 0.100 1 9 2 955 176 779 83 0 44 0 49 0 0 775 0 4 0.4716 0.0000 0.0051 3.000 1.29 8.27 -6.98 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8321 0.1657 0.0022 1 0 0.8225 0.1748 0.0027 1 0 0.8088 0.1876 0.0036
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 405 98 307 0 0 16 78 4 0 0 305 2 0 0.0000 0.0000 0.0065 5.125 4.75 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0137 0.9863 2 2 0.0000 0.0149 0.9851 2 2 0.0000 0.0168 0.9832
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 405 100 305 0 0 20 0 80 0 0 303 0 2 0.0000 0.0000 0.0066 4.000 6.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0157 0.9843 2 2 0.0000 0.0170 0.9830 2 2 0.0000 0.0190 0.9810
chr3 53290795 A ATGGCAC 0.500000 0.100 1 6 3 165 49 116 32 0 1 3 13 0 0 112 0 4 0.6531 0.0000 0.0345 48.000 2.03 6.00 -3.97 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5391 0.4133 0.0476 1 0 0.5305 0.4181 0.0514 1 0 0.5187 0.4244 0.0569
chr3 54918482 GCT G 0.500000 0.100 1 -2 1 410 141 269 135 1 1 0 4 0 0 269 0 0 0.9574 0.0000 0.0000 139.000 0.19 2.00 -1.81 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1230 0.8770 0.0000 0 0 0.9258 0.0742 0.0000 0 0 0.9824 0.0176 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 195 115 80 50 2 12 0 51 0 0 77 0 3 0.4348 0.0000 0.0375 8.583 0.02 6.57 -6.55 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1517 0.6225 0.2258 1 1 0.1567 0.6136 0.2297 1 1 0.1633 0.6022 0.2345
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 243 103 140 0 0 6 31 66 0 0 138 0 2 0.0000 0.0000 0.0143 16.167 3.70 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0085 0.9915
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 243 106 137 2 0 5 64 35 0 0 137 0 0 0.0189 0.0000 0.0000 20.200 1.00 3.80 -2.80 2 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.3888 0.6112 2 2 0.0000 0.0659 0.9341 2 2 0.0000 0.0337 0.9663
chr3 63912684 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 3 303 73 230 60 0 11 0 2 0 0 230 0 0 0.8219 0.0000 0.0000 5.636 0.67 7.50 -6.83 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2015 0.7985 0.0000 0 0 0.7062 0.2938 0.0000 0 0 0.8371 0.1629 0.0000
chr3 73062330 C CA 0.500000 0.100 1 1 5 579 136 443 81 1 4 0 50 0 0 442 0 1 0.5956 0.0000 0.0023 32.750 0.20 1.42 -1.22 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8451 0.1530 0.0019 1 0 0.8356 0.1621 0.0024 1 0 0.8218 0.1750 0.0032
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 381 117 264 101 0 8 0 8 0 0 264 0 0 0.8632 0.0000 0.0000 13.625 0.37 1.00 -0.63 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0315 0.9685 0.0000 0 1 0.4458 0.5542 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 125 55 70 8 0 1 7 39 0 0 69 1 0 0.1455 0.0000 0.0143 54.000 0.12 1.21 -1.08 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 1 0.0000 0.9461 0.0539
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 1098 289 809 0 1 67 4 217 0 0 809 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.453 6.71 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 590 168 422 89 0 4 0 75 0 0 421 1 0 0.5298 0.0000 0.0024 41.000 0.24 3.09 -2.86 57 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4345 0.5330 0.0325 1 1 0.4356 0.5285 0.0360 1 1 0.4359 0.5231 0.0411
chr3 126572375 CCT C 0.500000 0.100 1 -2 4 441 125 316 70 0 3 0 52 0 0 316 0 0 0.5600 0.0000 0.0000 40.667 0.83 1.98 -1.15 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6115 0.3714 0.0170 1 0 0.6046 0.3761 0.0193 1 0 0.5945 0.3827 0.0228
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 192 94 98 4 0 0 0 90 0 0 97 0 1 0.0426 0.0000 0.0102 94.000 0.25 2.49 -2.24 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9855 0.0145 2 2 0.0000 0.4275 0.5725 2 2 0.0000 0.1358 0.8642
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 361 116 245 62 1 2 0 51 0 0 245 0 0 0.5345 0.0000 0.0000 57.000 1.23 2.27 -1.05 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4634 0.4936 0.0430 1 1 0.4607 0.4925 0.0468 1 1 0.4563 0.4913 0.0524
chr3 133574137 CGCGGGCGCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 212 81 131 69 1 6 0 5 0 0 131 0 0 0.8519 0.0000 0.0000 12.500 0.43 9.20 -8.77 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1385 0.8615 0.0000 0 0 0.5467 0.4533 0.0000
chr3 150703735 A ACCTCCTCCT 0.500000 0.100 1 9 2 463 79 384 36 0 11 0 32 0 0 378 0 6 0.4557 0.0000 0.0156 6.182 0.53 8.50 -7.97 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1671 0.5851 0.2478 1 1 0.1712 0.5787 0.2501 1 1 0.1765 0.5707 0.2527
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 321 105 216 93 0 2 0 10 0 0 216 0 0 0.8857 0.0000 0.0000 51.500 0.17 1.10 -0.93 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.1306 0.8694 0.0000
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 427 161 266 115 2 22 3 19 0 0 266 0 0 0.7143 0.0000 0.0000 6.318 0.27 3.16 -2.89 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 592 145 447 113 5 23 0 4 0 0 446 0 1 0.7793 0.0000 0.0022 5.304 0.48 2.25 -1.77 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0061 0.9939 0.0000 0 0 0.6386 0.3614 0.0000 0 0 0.9253 0.0747 0.0000
chr3 195721040 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 396 255 141 234 1 10 0 10 0 0 141 0 0 0.9176 0.0000 0.0000 24.500 0.71 3.80 -3.09 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7488 0.2512 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000
chr3 195726176 GTTAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 1501 298 1203 268 0 3 0 27 0 0 1200 0 3 0.8993 0.0000 0.0025 98.333 1.37 6.70 -5.33 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0019 0.9981 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 779 165 614 10 0 18 0 137 0 0 579 1 34 0.0606 0.0000 0.0570 8.167 0.30 11.80 -11.50 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8877 0.1123 2 2 0.0000 0.1281 0.8719
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 226 94 132 1 0 22 3 68 0 0 129 0 3 0.0106 0.0000 0.0227 3.273 3.00 9.62 -6.62 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1588 0.8412 2 2 0.0000 0.0658 0.9342 2 2 0.0000 0.0494 0.9506
chr4 441751 CAG C 0.002391 0.100 1 -2 1 514 108 406 92 0 2 0 14 0 0 405 0 1 0.8519 0.0000 0.0025 53.000 0.72 2.07 -1.35 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 0 0.7050 0.2950 0.0000
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 565 101 464 0 0 0 0 101 0 0 377 3 84 0.0000 0.0000 0.1875 101.000 15.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 643 216 427 0 0 69 9 138 0 1 401 4 21 0.0000 0.0000 0.0609 2.103 8.12 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr4 3074923 AGC A 0.021170 0.100 1 -2 1 645 241 404 70 11 20 138 2 2 3 396 3 0 0.2905 0.0050 0.0198 18.625 7.06 5.50 1.56 16 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0043 0.6685 0.3272 1 1 0.0055 0.6862 0.3083 1 1 0.0077 0.7090 0.2833
chr4 3074926 AG A 0.010091 0.100 1 -1 1 645 236 409 74 18 137 7 0 2 4 401 2 0 0.3136 0.0049 0.0196 1.162 7.23 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6888 0.3112 0.0000 0 0 0.9321 0.0679 0.0000 0 0 0.9774 0.0226 0.0000
chr4 3074934 CAA C 0.000234 0.100 1 -2 1 645 223 422 103 98 6 15 1 1 5 413 2 1 0.4619 0.0024 0.0213 104.500 7.31 2.00 5.31 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4789 0.5211 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 3074938 AG A 0.000242 0.100 1 -1 1 645 225 420 166 35 15 6 3 3 9 404 3 1 0.7378 0.0071 0.0381 22.667 7.96 7.67 0.30 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9739 0.0261 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 590 155 435 80 0 7 0 68 0 0 428 0 7 0.5161 0.0000 0.0161 21.143 0.51 11.13 -10.62 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4120 0.5766 0.0113 1 1 0.4210 0.5670 0.0120 1 1 0.4320 0.5550 0.0130
chr4 13599332 A ATGC 0.500000 0.100 1 3 2 742 181 561 169 0 7 0 5 0 0 560 0 1 0.9337 0.0000 0.0018 24.857 0.23 2.60 -2.37 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0089 0.9911 0.0000 0 0 0.8863 0.1137 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr4 15003254 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 775 230 545 11 1 25 22 171 0 0 524 7 14 0.0478 0.0000 0.0385 8.120 1.36 7.77 -6.41 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7566 0.2434 2 2 0.0000 0.0382 0.9618
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 775 230 545 13 0 29 0 188 0 0 523 0 22 0.0565 0.0000 0.0404 7.444 1.92 7.92 -6.00 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9690 0.0310 2 2 0.0000 0.1471 0.8529
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 786 259 527 23 0 42 8 186 0 2 513 1 11 0.0888 0.0000 0.0266 5.244 1.43 7.53 -6.10 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9949 0.0051
chr4 44447936 G GCCA 0.500000 0.100 1 3 2 688 208 480 181 3 17 0 7 0 0 480 0 0 0.8702 0.0000 0.0000 11.176 1.45 3.29 -1.84 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.8497 0.1503 0.0000 0 0 0.9882 0.0118 0.0000
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 649 130 519 112 0 11 0 7 0 0 514 1 4 0.8615 0.0000 0.0096 10.818 1.04 13.71 -12.68 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.1369 0.8631 0.0000
chr4 56448597 GGTACAGATAAAACAA G 0.500000 0.100 1 -15 2 360 103 257 80 0 15 0 8 0 0 257 0 0 0.7767 0.0000 0.0000 5.867 0.09 9.38 -9.29 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0107 0.9893 0.0000 0 1 0.2222 0.7778 0.0000
chr4 56931051 GGAGCTGTCTCCTCCCATGGAGGTGGTCCAGAAGGAGCCTGTTCAGATA G 0.500000 0.100 1 -48 1 980 250 730 115 4 74 4 53 0 0 730 0 0 0.4600 0.0000 0.0000 2.351 0.47 2.64 -2.17 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9904 0.0096 0.0000 1 0 0.9886 0.0114 0.0000 1 0 0.9856 0.0144 0.0000
chr4 68098997 TATTCAGCTCGTGAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 155 57 98 41 0 5 0 11 0 0 97 0 1 0.7193 0.0000 0.0102 10.400 0.02 13.36 -13.34 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8314 0.1660 0.0026 1 0 0.5375 0.4604 0.0021 0 1 0.1195 0.8799 0.0006
chr4 68827423 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 418 182 236 168 0 7 0 7 0 0 236 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 25.000 0.12 1.14 -1.02 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.7246 0.2754 0.0000 0 0 0.9751 0.0249 0.0000
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 3 411 111 300 58 0 3 0 50 0 9 287 0 4 0.5225 0.0000 0.0433 36.000 0.86 3.54 -2.68 42 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4620 0.4962 0.0418 1 1 0.4596 0.4948 0.0456 1 1 0.4555 0.4934 0.0511
chr4 71567805 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 468 106 362 100 0 3 0 3 0 0 362 0 0 0.9434 0.0000 0.0000 34.333 0.61 1.00 -0.39 80 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1793 0.8207 0.0000 0 0 0.8592 0.1408 0.0000 0 0 0.9493 0.0507 0.0000
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.100 1 3 1 359 132 227 65 2 3 0 62 0 0 227 0 0 0.4924 0.0000 0.0000 43.000 0.52 3.53 -3.01 37 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2727 0.6259 0.1013 1 1 0.2766 0.6167 0.1068 1 1 0.2810 0.6050 0.1141
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 164 68 96 41 0 3 0 24 0 0 96 0 0 0.6029 0.0000 0.0000 21.667 0.02 1.17 -1.14 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6474 0.3303 0.0223 1 0 0.6366 0.3384 0.0249 1 0 0.6218 0.3493 0.0289
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2356 512 1844 188 4 156 8 156 0 3 1823 3 15 0.3672 0.0000 0.0114 2.331 1.37 8.10 -6.73 70 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2240 0.7596 0.0164 1 1 0.2390 0.7417 0.0194 1 1 0.2578 0.7183 0.0239
chr4 87615164 TAGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 3644 780 2864 401 14 59 11 295 4 18 2824 7 11 0.5141 0.0014 0.0140 13.278 1.57 5.28 -3.71 21 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9991 0.0009 0.0000 1 0 0.9989 0.0011 0.0000 1 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3950 848 3102 413 15 43 12 365 45 55 2795 161 46 0.4870 0.0145 0.0990 20.947 2.86 8.43 -5.57 83 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0001 0.9097 0.0902 1 1 0.0001 0.8866 0.1133 1 1 0.0002 0.8513 0.1485
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 4108 958 3150 781 24 106 6 41 42 73 2833 109 93 0.8152 0.0133 0.1006 8.096 3.23 9.93 -6.70 103 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3527 1037 2490 111 24 185 42 675 288 53 2079 31 39 0.1070 0.1157 0.1651 4.511 2.85 8.80 -5.95 3 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 192 78 114 43 0 2 0 33 0 0 114 0 0 0.5513 0.0000 0.0000 38.000 0.09 3.09 -3.00 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4514 0.4864 0.0622 1 1 0.4470 0.4865 0.0665 1 1 0.4406 0.4869 0.0725
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 676 171 505 77 0 9 0 85 0 0 502 0 3 0.4503 0.0000 0.0059 18.000 0.87 3.47 -2.60 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0431 0.5757 0.3813 1 1 0.0472 0.5688 0.3840 1 1 0.0531 0.5604 0.3865
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 538 233 305 0 0 33 10 190 0 0 301 0 4 0.0000 0.0000 0.0131 6.061 2.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 495 178 317 16 67 32 4 59 0 3 313 1 0 0.0899 0.0000 0.0126 4.710 2.06 3.83 -1.77 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6795 0.3122 0.0084 1 0 0.6721 0.3181 0.0098 1 0 0.6613 0.3267 0.0121
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 2 497 189 308 92 2 24 1 70 0 1 302 1 4 0.4868 0.0000 0.0195 6.875 3.29 9.94 -6.65 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5813 0.4054 0.0133 1 0 0.5778 0.4069 0.0153 1 0 0.5720 0.4096 0.0183
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.100 1 5 2 310 157 153 142 0 8 0 7 0 0 152 0 1 0.9045 0.0000 0.0065 18.625 0.07 5.29 -5.22 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1939 0.8061 0.0000 0 0 0.8527 0.1473 0.0000
chr4 154237107 A AGTT 0.500000 0.100 1 3 1 635 150 485 85 0 9 0 56 0 0 485 0 0 0.5667 0.0000 0.0000 15.667 0.09 3.18 -3.08 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8139 0.1835 0.0026 1 0 0.8045 0.1923 0.0032 1 0 0.7909 0.2049 0.0042
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 288 124 164 89 0 21 0 14 0 0 163 0 1 0.7177 0.0000 0.0061 4.905 0.64 5.21 -4.57 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0050 0.9950 0.0000
chr4 168878233 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 452 85 367 70 1 6 0 8 0 0 366 1 0 0.8235 0.0000 0.0027 13.000 0.41 2.38 -1.96 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 1 0.1069 0.8931 0.0000
chr4 174977850 T TCAGAGTCAACCTCCTGTGATGCCTTCCCAGAGTCATCCTCAGTTGACGCCTTCC 0.500000 0.100 1 54 1 939 212 727 93 1 111 0 7 0 0 727 0 0 0.4387 0.0000 0.0000 0.910 0.42 5.14 -4.72 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0596 0.9404 0.0000 0 0 0.5171 0.4829 0.0000
chr4 184694537 ACAGATGAAG A 0.500000 0.100 1 -9 2 328 83 245 47 0 4 0 32 0 0 243 0 2 0.5663 0.0000 0.0082 19.750 0.26 10.25 -9.99 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5274 0.4326 0.0401 1 0 0.5207 0.4356 0.0437 1 0 0.5113 0.4398 0.0489
chr5 1295342 CCG C 0.500000 0.100 1 -2 3 749 157 592 61 2 13 0 81 0 0 590 0 2 0.3885 0.0000 0.0034 11.000 0.61 3.11 -2.50 21 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0114 0.3482 0.6404 1 2 0.0131 0.3530 0.6339 1 2 0.0159 0.3599 0.6242
chr5 33527203 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 273 112 161 68 0 3 0 41 0 0 161 0 0 0.6071 0.0000 0.0000 36.333 0.40 1.07 -0.68 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8066 0.1896 0.0038 1 0 0.7961 0.1993 0.0046 1 0 0.7811 0.2129 0.0060
chr5 45695884 GCCGCCGCCA G 0.500000 0.100 1 -9 2 320 107 213 42 0 24 0 41 0 0 212 0 1 0.3925 0.0000 0.0047 3.458 1.02 7.37 -6.34 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1991 0.6016 0.1994 1 1 0.2028 0.5941 0.2031 1 1 0.2076 0.5846 0.2079
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 824 185 639 0 0 26 6 153 0 0 633 0 6 0.0000 0.0000 0.0094 6.115 3.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 2 406 153 253 122 6 21 2 2 0 0 253 0 0 0.7974 0.0000 0.0000 6.550 0.90 5.00 -4.10 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5159 0.4841 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000 0 0 0.9836 0.0164 0.0000
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 363 50 313 0 1 28 1 20 0 2 307 1 3 0.0000 0.0000 0.0192 0.750 5.20 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8230 0.1770 2 1 0.0000 0.6524 0.3476 2 1 0.0000 0.5267 0.4733
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 400 115 285 45 0 8 1 61 0 0 280 0 5 0.3913 0.0000 0.0175 13.375 0.33 5.72 -5.39 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0091 0.2792 0.7117 1 2 0.0107 0.2874 0.7019 1 2 0.0130 0.2988 0.6882
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 496 121 375 0 0 4 0 117 0 0 371 0 4 0.0000 0.0000 0.0107 29.250 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0028 0.9972
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 368 114 254 51 0 6 1 56 0 0 250 0 4 0.4474 0.0000 0.0157 18.000 1.73 19.71 -17.99 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0568 0.5305 0.4126 1 1 0.0612 0.5273 0.4115 1 1 0.0673 0.5235 0.4092
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 358 88 270 39 0 2 0 47 0 0 266 0 4 0.4432 0.0000 0.0148 43.000 2.46 24.06 -21.60 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0448 0.4623 0.4929 1 2 0.0487 0.4635 0.4879 1 2 0.0542 0.4653 0.4805
chr5 96803753 GACGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 558 167 391 90 0 6 1 70 0 0 389 1 1 0.5389 0.0000 0.0051 32.200 0.14 5.19 -5.04 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5325 0.4484 0.0191 1 0 0.5301 0.4482 0.0217 1 0 0.5260 0.4486 0.0255
chr5 96889375 CTCTT C 0.500000 0.100 1 -4 3 215 48 167 28 0 1 0 19 0 0 167 0 0 0.5833 0.0000 0.0000 47.000 0.18 3.89 -3.72 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4545 0.4691 0.0763 1 1 0.4485 0.4708 0.0807 1 1 0.4402 0.4731 0.0867
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 253 79 174 39 2 3 0 35 0 0 174 0 0 0.4937 0.0000 0.0000 25.000 0.21 3.09 -2.88 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3388 0.5535 0.1077 1 1 0.3382 0.5494 0.1124 1 1 0.3371 0.5442 0.1187
chr5 113488351 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 237 96 141 42 3 18 0 33 0 0 141 0 0 0.4375 0.0000 0.0000 4.333 1.55 4.88 -3.33 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5014 0.4513 0.0473 1 0 0.4953 0.4534 0.0512 1 0 0.4869 0.4564 0.0568
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 562 119 443 48 3 64 0 4 0 0 443 0 0 0.4034 0.0000 0.0000 0.859 0.48 1.25 -0.77 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.2173 0.7827 0.0000 0 0 0.5771 0.4229 0.0000
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 383 122 261 95 0 23 0 4 0 1 260 0 0 0.7787 0.0000 0.0038 4.304 0.44 9.25 -8.81 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0181 0.9819 0.0000 0 0 0.6311 0.3689 0.0000 0 0 0.8902 0.1098 0.0000
chr5 128084251 GGCGGCGGCGGCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 760 168 592 142 0 20 0 6 0 0 592 0 0 0.8452 0.0000 0.0000 7.789 1.01 14.50 -13.49 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 0 0.6760 0.3240 0.0000 0 0 0.9556 0.0444 0.0000
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 565 151 414 122 0 20 0 9 0 0 414 0 0 0.8079 0.0000 0.0000 6.550 0.42 6.56 -6.14 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0302 0.9698 0.0000 0 0 0.5408 0.4592 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 185 77 108 69 0 2 0 6 0 0 107 1 0 0.8961 0.0000 0.0093 37.500 0.32 3.50 -3.18 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0191 0.9809 0.0000 0 1 0.2463 0.7537 0.0000
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 271 102 169 98 0 1 0 3 0 0 169 0 0 0.9608 0.0000 0.0000 101.000 0.18 3.00 -2.82 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1600 0.8400 0.0000 0 0 0.8459 0.1541 0.0000 0 0 0.9443 0.0557 0.0000
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 271 104 167 101 0 1 0 2 0 0 167 0 0 0.9712 0.0000 0.0000 103.000 0.18 4.00 -3.82 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6724 0.3276 0.0000 0 0 0.9482 0.0518 0.0000 0 0 0.9736 0.0264 0.0000
chr5 140966860 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 570 175 395 99 1 11 1 63 0 0 395 0 0 0.5657 0.0000 0.0000 14.818 1.12 6.14 -5.02 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8856 0.1137 0.0007 1 0 0.8775 0.1216 0.0010 1 0 0.8655 0.1331 0.0014
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 932 266 666 254 1 8 0 3 0 0 666 0 0 0.9549 0.0000 0.0000 32.250 0.32 1.33 -1.01 80 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr5 141573996 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 2 641 167 474 58 7 45 1 56 0 0 471 1 2 0.3473 0.0000 0.0063 2.711 0.53 3.05 -2.52 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2768 0.6208 0.1024 1 1 0.2803 0.6119 0.1078 1 1 0.2844 0.6006 0.1150
chr5 141945390 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 406 107 299 52 0 9 0 46 0 0 296 0 3 0.4860 0.0000 0.0100 10.889 0.42 6.33 -5.90 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2461 0.6125 0.1415 1 1 0.2494 0.6042 0.1465 1 1 0.2533 0.5937 0.1530
chr5 141945390 C CCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 12 1 406 107 299 55 0 50 0 2 0 0 296 3 0 0.5140 0.0000 0.0100 1.140 0.56 10.50 -9.94 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0209 0.9791 0.0000 0 1 0.2402 0.7598 0.0000 0 1 0.4861 0.5139 0.0000
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 327 139 188 112 1 22 0 4 0 0 187 0 1 0.8058 0.0000 0.0053 5.318 0.82 3.75 -2.93 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 0 0.5847 0.4153 0.0000 0 0 0.9074 0.0926 0.0000
chr5 146878727 AGCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 327 141 186 106 2 21 1 11 0 0 186 0 0 0.7518 0.0000 0.0000 5.714 0.49 4.09 -3.60 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0791 0.9209 0.0000
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 745 176 569 92 0 0 0 84 0 0 565 2 2 0.5227 0.0000 0.0070 176.000 0.13 3.95 -3.82 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2095 0.6925 0.0981 1 1 0.2164 0.6792 0.1044 1 1 0.2251 0.6621 0.1128
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 747 185 562 100 0 2 1 82 0 0 556 3 3 0.5405 0.0000 0.0107 91.500 0.13 4.10 -3.97 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3570 0.6031 0.0399 1 1 0.3617 0.5942 0.0440 1 1 0.3668 0.5833 0.0499
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 715 183 532 9 0 5 0 169 0 0 529 0 3 0.0492 0.0000 0.0056 35.600 0.56 1.86 -1.31 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7255 0.2745 2 2 0.0000 0.0704 0.9296
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 570 154 416 145 0 5 0 4 0 0 416 0 0 0.9416 0.0000 0.0000 29.800 0.24 1.00 -0.76 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1900 0.8100 0.0000 0 0 0.9522 0.0478 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr5 150656742 ACCGCCCCCGCCC A 0.500000 0.100 1 -12 2 580 129 451 97 2 25 0 5 0 0 451 0 0 0.7519 0.0000 0.0000 4.160 1.54 10.20 -8.66 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 1 0.4058 0.5942 0.0000 0 0 0.8310 0.1690 0.0000
chr5 150903148 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 1 285 120 165 113 2 2 0 3 1 0 164 0 0 0.9417 0.0061 0.0061 59.000 0.89 5.33 -4.44 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3198 0.6802 0.0000 0 0 0.9308 0.0692 0.0000 0 0 0.9760 0.0240 0.0000
chr5 153492228 T TC 0.500000 0.100 1 1 2 120 58 62 30 0 0 0 28 0 0 62 0 0 0.5172 0.0000 0.0000 58.000 0.03 1.07 -1.04 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2596 0.5658 0.1746 1 1 0.2609 0.5609 0.1782 1 1 0.2624 0.5547 0.1829
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 381 133 248 12 0 4 0 117 0 0 246 0 2 0.0902 0.0000 0.0081 32.250 1.25 4.84 -3.59 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.8729 0.1271
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 384 141 243 9 0 0 0 132 0 0 240 0 3 0.0638 0.0000 0.0123 141.000 0.56 4.18 -3.63 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9448 0.0552 2 2 0.0000 0.3155 0.6845
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 194 77 117 35 0 4 0 38 0 0 117 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 18.250 0.06 3.03 -2.97 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1501 0.5780 0.2720 1 1 0.1544 0.5721 0.2735 1 1 0.1601 0.5648 0.2751
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 425 94 331 10 0 6 0 78 0 0 330 0 1 0.1064 0.0000 0.0030 14.667 1.20 3.82 -2.62 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.9299 0.0701
chr5 178994872 CCGCCTGCGCCAGCCA C 0.500000 0.100 1 -15 3 436 135 301 77 1 1 1 55 0 0 299 0 2 0.5704 0.0000 0.0066 134.000 0.56 12.76 -12.21 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6428 0.3450 0.0122 1 0 0.6357 0.3502 0.0141 1 0 0.6254 0.3577 0.0169
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 479 219 260 169 6 41 0 3 0 0 260 0 0 0.7717 0.0000 0.0000 4.341 0.72 6.00 -5.28 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9067 0.0933 0.0000 0 0 0.9962 0.0038 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr5 179644808 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 385 104 281 94 0 4 0 6 0 0 281 0 0 0.9038 0.0000 0.0000 25.000 0.59 3.17 -2.58 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1553 0.8447 0.0000 0 0 0.6705 0.3295 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 627 91 536 37 0 9 0 45 0 0 536 0 0 0.4066 0.0000 0.0000 9.111 0.16 3.24 -3.08 3 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0801 0.5290 0.3910 1 1 0.0847 0.5264 0.3889 1 1 0.0911 0.5232 0.3858
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 546 126 420 53 0 18 2 53 0 0 419 0 1 0.4206 0.0000 0.0024 5.944 0.64 3.53 -2.89 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1342 0.6194 0.2464 1 1 0.1393 0.6106 0.2501 1 1 0.1459 0.5995 0.2546
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1265 298 967 75 90 99 22 12 0 1 964 2 0 0.2517 0.0000 0.0031 1.614 5.13 3.42 1.72 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr6 27255285 AAAGGAGAGCCAGATT A 0.178475 0.100 1 -15 1 460 125 335 116 0 3 0 6 0 0 335 0 0 0.9280 0.0000 0.0000 40.667 0.48 12.83 -12.35 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 0 0.7183 0.2817 0.0000 0 0 0.9646 0.0354 0.0000
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.100 1 2 1 968 233 735 142 0 8 0 83 0 0 732 0 3 0.6094 0.0000 0.0041 28.125 0.15 2.08 -1.93 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9872 0.0128 0.0000 1 0 0.9855 0.0145 0.0000 1 0 0.9828 0.0172 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 865 199 666 174 1 7 0 17 0 0 662 0 4 0.8744 0.0000 0.0060 27.429 0.13 7.65 -7.52 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0171 0.9829 0.0000
chr6 29657255 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 180 80 100 62 0 10 0 8 0 0 100 0 0 0.7750 0.0000 0.0000 7.000 1.18 4.38 -3.20 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0044 0.9956 0.0000 0 1 0.1066 0.8934 0.0000
chr6 29828657 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 533 126 407 61 0 2 0 63 0 0 406 0 1 0.4841 0.0000 0.0025 62.000 0.38 1.68 -1.31 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1285 0.6386 0.2329 1 1 0.1340 0.6286 0.2374 1 1 0.1413 0.6159 0.2428
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 400 108 292 51 0 2 0 55 0 0 292 0 0 0.4722 0.0000 0.0000 53.000 0.41 1.15 -0.73 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1218 0.6090 0.2692 1 1 0.1270 0.6010 0.2721 1 1 0.1338 0.5908 0.2754
chr6 31027337 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 1292 297 995 157 12 15 2 111 5 9 981 0 0 0.5286 0.0050 0.0141 19.786 2.10 2.33 -0.23 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9897 0.0103 0.0000 1 0 0.9881 0.0119 0.0000 1 0 0.9854 0.0146 0.0000
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 803 217 586 131 0 6 0 80 0 0 586 0 0 0.6037 0.0000 0.0000 35.167 1.04 3.77 -2.74 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9653 0.0346 0.0000 1 0 0.9612 0.0388 0.0001 1 0 0.9547 0.0452 0.0001
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 660 194 466 110 71 4 2 7 0 0 465 1 0 0.5670 0.0000 0.0021 47.500 0.35 2.71 -2.37 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1904 0.8096 0.0000 0 0 0.9136 0.0864 0.0000
chr6 31954568 CTCTCGG C 0.500000 0.100 1 -6 3 892 187 705 172 1 8 0 6 0 0 705 0 0 0.9198 0.0000 0.0000 25.571 0.89 6.50 -5.61 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0111 0.9889 0.0000 0 0 0.9068 0.0932 0.0000 0 0 0.9897 0.0103 0.0000
chr6 32223881 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 438 198 240 2 87 34 0 75 0 0 234 0 6 0.0101 0.0000 0.0250 4.824 0.00 3.89 -3.89 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3004 0.6359 0.0637 1 1 0.3055 0.6257 0.0688 1 1 0.3113 0.6128 0.0759
chr6 32584184 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 346 47 299 24 1 0 7 15 0 1 277 4 17 0.5106 0.0000 0.0736 41.000 12.67 10.53 2.13 14 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0262 0.3529 0.6208 1 2 0.0292 0.3601 0.6107 1 2 0.0335 0.3698 0.5967
chr6 32584185 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 346 50 296 23 3 0 15 9 0 0 273 5 18 0.4600 0.0000 0.0777 50.000 12.87 9.89 2.98 15 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0124 0.2688 0.7188 1 2 0.0143 0.2785 0.7072 1 2 0.0172 0.2918 0.6911
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 510 181 329 156 0 20 0 5 0 0 329 0 0 0.8619 0.0000 0.0000 8.050 0.50 5.60 -5.10 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0403 0.9597 0.0000 0 0 0.9212 0.0788 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 359 72 287 0 0 12 0 60 0 0 260 0 27 0.0000 0.0000 0.0941 5.000 14.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0117 0.9883 2 2 0.0000 0.0128 0.9872 2 2 0.0000 0.0145 0.9855
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 609 180 429 105 1 6 0 68 0 0 428 0 1 0.5833 0.0000 0.0023 29.000 0.50 1.19 -0.70 57 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8911 0.1083 0.0006 1 0 0.8833 0.1159 0.0008 1 0 0.8718 0.1270 0.0011
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 824 210 614 20 0 4 1 185 0 0 613 0 1 0.0952 0.0000 0.0016 68.667 0.10 3.25 -3.15 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9767 0.0233
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 293 123 170 54 0 18 0 51 0 0 169 0 1 0.4390 0.0000 0.0059 5.833 0.54 5.90 -5.36 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2257 0.6225 0.1518 1 1 0.2296 0.6136 0.1568 1 1 0.2344 0.6022 0.1634
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 864 216 648 106 2 31 0 77 0 0 648 0 0 0.4907 0.0000 0.0000 5.968 0.42 3.30 -2.87 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8119 0.1864 0.0017 1 0 0.8038 0.1940 0.0022 1 0 0.7920 0.2050 0.0029
chr6 44002766 C CGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 517 123 394 76 3 37 1 6 0 0 393 0 1 0.6179 0.0000 0.0025 2.270 2.11 6.50 -4.39 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0221 0.9779 0.0000 0 1 0.2893 0.7107 0.0000
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 705 175 530 5 0 83 0 87 0 1 505 0 24 0.0286 0.0000 0.0472 1.108 1.20 6.97 -5.77 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 2 0.0000 0.4992 0.5008 2 2 0.0000 0.1201 0.8799
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 722 132 590 47 3 40 1 41 0 0 582 1 7 0.3561 0.0000 0.0136 2.275 1.77 4.78 -3.01 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1869 0.6197 0.1935 1 1 0.1913 0.6109 0.1978 1 1 0.1969 0.5998 0.2032
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 997 225 772 205 1 10 0 9 1 1 770 0 0 0.9111 0.0013 0.0026 21.500 1.20 7.11 -5.92 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6909 0.3091 0.0000 0 0 0.9868 0.0132 0.0000
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 627 149 478 134 0 4 0 11 0 0 478 0 0 0.8993 0.0000 0.0000 36.250 0.19 2.91 -2.72 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.3643 0.6357 0.0000
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 849 185 664 0 0 8 0 177 0 0 654 0 10 0.0000 0.0000 0.0151 22.125 3.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 736 161 575 77 0 2 0 82 0 0 562 0 13 0.4783 0.0000 0.0226 79.500 1.08 5.98 -4.90 25 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0156 0.4317 0.5527 1 2 0.0178 0.4320 0.5502 1 2 0.0212 0.4330 0.5458
chr6 123352527 A AT 0.500000 0.100 1 1 1 316 101 215 50 5 11 5 30 0 0 214 0 1 0.4950 0.0000 0.0047 8.500 0.32 1.27 -0.95 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6602 0.3231 0.0167 1 0 0.6503 0.3308 0.0189 1 0 0.6365 0.3412 0.0224
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 346 114 232 110 0 0 0 4 0 0 232 0 0 0.9649 0.0000 0.0000 114.000 0.20 1.25 -1.05 70 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0385 0.9615 0.0000 0 0 0.7767 0.2233 0.0000 0 0 0.9413 0.0587 0.0000
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 932 225 707 8 0 16 0 201 0 0 701 0 6 0.0356 0.0000 0.0085 13.062 0.00 3.20 -3.20 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 2 0.0000 0.1393 0.8607 2 2 0.0000 0.0073 0.9927
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 208 98 110 44 0 6 0 48 0 0 110 0 0 0.4490 0.0000 0.0000 15.333 0.55 4.08 -3.54 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1269 0.5926 0.2805 1 1 0.1318 0.5857 0.2825 1 1 0.1383 0.5770 0.2847
chr6 156778268 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 2 890 234 656 76 6 55 3 94 2 0 651 0 3 0.3248 0.0030 0.0076 3.236 0.95 3.12 -2.17 18 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0198 0.4861 0.4941 1 2 0.0224 0.4834 0.4942 1 2 0.0264 0.4805 0.4931
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 542 197 345 0 0 38 0 159 0 0 313 0 32 0.0000 0.0000 0.0928 4.184 14.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 449 172 277 85 0 6 0 81 0 0 276 0 1 0.4942 0.0000 0.0036 27.667 0.26 4.88 -4.62 59 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2023 0.6850 0.1127 1 1 0.2088 0.6722 0.1190 1 1 0.2169 0.6557 0.1274
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 196 80 116 48 0 4 0 28 0 0 116 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 19.000 0.75 10.96 -10.21 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7048 0.2818 0.0134 1 0 0.6936 0.2911 0.0153 1 0 0.6779 0.3037 0.0183
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 197 75 122 38 0 6 0 31 0 0 121 0 1 0.5067 0.0000 0.0082 11.500 0.05 11.06 -11.01 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3497 0.5439 0.1064 1 1 0.3485 0.5404 0.1111 1 1 0.3465 0.5361 0.1173
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 324 141 183 0 0 16 7 118 0 0 180 0 3 0.0000 0.0000 0.0164 7.750 3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 680 150 530 123 0 24 0 3 2 0 528 0 0 0.8200 0.0038 0.0038 5.250 0.56 9.33 -8.77 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4264 0.5736 0.0000 0 0 0.9547 0.0453 0.0000 0 0 0.9843 0.0157 0.0000
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 695 250 445 11 7 30 106 96 0 0 444 1 0 0.0440 0.0000 0.0022 7.722 6.64 13.22 -6.58 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9927 0.0073 2 2 0.0000 0.4567 0.5433
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 278 97 181 35 0 8 2 52 0 0 178 0 3 0.3608 0.0000 0.0166 11.125 0.97 4.15 -3.18 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0093 0.2594 0.7313 1 2 0.0109 0.2687 0.7204 1 2 0.0133 0.2815 0.7052
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 298 123 175 40 1 31 0 51 0 0 174 0 1 0.3252 0.0000 0.0057 2.968 1.23 4.18 -2.95 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0520 0.4880 0.4601 1 1 0.0561 0.4876 0.4563 1 1 0.0619 0.4875 0.4506
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 642 145 497 94 0 4 0 47 0 0 491 0 6 0.6483 0.0000 0.0121 35.250 0.26 10.64 -10.38 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9337 0.0660 0.0003 1 0 0.9270 0.0726 0.0004 1 0 0.9170 0.0824 0.0006
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 216 78 138 40 0 2 0 36 0 0 138 0 0 0.5128 0.0000 0.0000 38.000 0.68 2.08 -1.41 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2936 0.5735 0.1329 1 1 0.2946 0.5679 0.1375 1 1 0.2955 0.5610 0.1435
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 649 195 454 85 2 23 5 80 0 0 454 0 0 0.4359 0.0000 0.0000 7.478 0.34 3.11 -2.77 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1799 0.6952 0.1249 1 1 0.1867 0.6818 0.1315 1 1 0.1953 0.6645 0.1402
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.100 1 3 2 477 104 373 93 0 7 0 4 0 0 373 0 0 0.8942 0.0000 0.0000 13.857 0.13 3.50 -3.37 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0155 0.9845 0.0000 0 0 0.5954 0.4046 0.0000 0 0 0.8750 0.1250 0.0000
chr7 20658598 CA C 0.500000 0.100 1 -1 4 238 99 139 94 1 1 0 3 0 0 139 0 0 0.9495 0.0000 0.0000 98.000 0.81 3.00 -2.19 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1422 0.8578 0.0000 0 0 0.8256 0.1744 0.0000 0 0 0.9362 0.0638 0.0000
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 388 120 268 75 0 4 0 41 0 0 267 0 1 0.6250 0.0000 0.0037 29.000 0.21 3.29 -3.08 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8801 0.1186 0.0013 1 0 0.8708 0.1275 0.0016 1 0 0.8573 0.1404 0.0022
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 123 45 78 37 2 3 0 3 0 0 77 1 0 0.8222 0.0000 0.0128 13.333 0.22 1.67 -1.45 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 1 0.1828 0.8172 0.0000 0 1 0.4366 0.5634 0.0000
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 550 135 415 72 0 2 0 61 0 0 415 0 0 0.5333 0.0000 0.0000 66.500 0.33 1.10 -0.77 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4160 0.5369 0.0470 1 1 0.4159 0.5329 0.0511 1 1 0.4149 0.5281 0.0570
chr7 44073397 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 715 141 574 131 0 3 0 7 0 0 574 0 0 0.9291 0.0000 0.0000 46.000 0.31 1.00 -0.69 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2890 0.7110 0.0000 0 0 0.8662 0.1338 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 254 97 157 48 0 3 1 45 0 0 157 0 0 0.4948 0.0000 0.0000 31.333 0.17 3.24 -3.08 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2340 0.6086 0.1574 1 1 0.2373 0.6006 0.1621 1 1 0.2414 0.5905 0.1682
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 461 118 343 1 1 102 2 12 0 0 339 1 3 0.0085 0.0000 0.0117 0.149 0.00 5.00 -5.00 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0626 0.5843 0.3531 1 1 0.0546 0.6013 0.3441 2 1 0.0450 0.5978 0.3572
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.100 1 2 1 457 117 340 1 100 4 0 12 0 0 338 1 1 0.0085 0.0000 0.0059 4.667 0.00 5.08 -5.08 1 0/1 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.100 1 3 5 296 90 206 40 5 17 0 28 0 0 206 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 4.294 0.28 2.82 -2.55 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6347 0.3426 0.0227 1 0 0.6246 0.3500 0.0254 1 0 0.6106 0.3600 0.0294
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 321 140 181 0 0 1 0 139 0 0 179 0 2 0.0000 0.0000 0.0110 139.000 2.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 843 207 636 0 0 13 0 194 0 0 633 0 3 0.0000 0.0000 0.0047 14.923 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 551 140 411 68 0 12 0 60 0 0 410 0 1 0.4857 0.0000 0.0024 10.667 0.59 3.88 -3.30 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3227 0.5989 0.0784 1 1 0.3252 0.5913 0.0834 1 1 0.3278 0.5818 0.0904
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 247 85 162 39 0 3 0 43 0 0 157 0 5 0.4588 0.0000 0.0309 27.333 0.23 3.16 -2.93 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0693 0.5181 0.4126 1 1 0.0738 0.5161 0.4101 1 1 0.0800 0.5137 0.4062
chr7 99836454 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 149 53 96 31 0 1 0 21 0 0 96 0 0 0.5849 0.0000 0.0000 52.000 0.06 1.10 -1.03 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4772 0.4571 0.0657 1 0 0.4706 0.4594 0.0700 1 1 0.4615 0.4625 0.0759
chr7 100359505 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 481 123 358 101 1 13 0 8 0 0 357 0 1 0.8211 0.0000 0.0028 8.462 0.23 3.38 -3.15 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0111 0.9889 0.0000 0 1 0.3043 0.6957 0.0000
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.100 1 -7 1 986 305 681 132 0 11 0 162 0 0 672 0 9 0.4328 0.0000 0.0132 26.727 0.27 6.72 -6.45 30 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.1562 0.8435 1 2 0.0005 0.1611 0.8384 1 2 0.0007 0.1687 0.8306
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 632 181 451 166 1 3 0 11 0 0 451 0 0 0.9171 0.0000 0.0000 59.333 0.30 3.00 -2.70 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0332 0.9668 0.0000 0 0 0.7392 0.2608 0.0000
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 352 99 253 35 0 33 3 28 0 0 251 0 2 0.3535 0.0000 0.0079 1.970 1.60 6.21 -4.61 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2551 0.5769 0.1680 1 1 0.2569 0.5711 0.1720 1 1 0.2590 0.5639 0.1771
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 719 178 541 82 0 18 2 76 0 0 540 0 1 0.4607 0.0000 0.0018 8.889 1.38 4.09 -2.71 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2108 0.6769 0.1123 1 1 0.2170 0.6645 0.1185 1 1 0.2247 0.6486 0.1267
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 728 211 517 8 0 11 0 192 0 0 512 0 5 0.0379 0.0000 0.0097 18.182 1.12 6.79 -5.66 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 2 0.0000 0.2106 0.7894 2 2 0.0000 0.0118 0.9882
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 742 249 493 109 1 38 0 101 0 0 493 0 0 0.4378 0.0000 0.0000 5.553 0.29 15.24 -14.94 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2877 0.6639 0.0483 1 1 0.2951 0.6517 0.0531 1 1 0.3038 0.6363 0.0599
chr7 130367376 TG T 0.500000 0.100 1 -1 3 294 110 184 62 0 1 0 47 0 0 184 0 0 0.5636 0.0000 0.0000 109.000 0.40 1.21 -0.81 38 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5486 0.4234 0.0280 1 0 0.5428 0.4261 0.0311 1 0 0.5343 0.4300 0.0357
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 399 194 205 77 1 28 1 87 0 0 202 0 3 0.3969 0.0000 0.0146 5.893 1.64 5.85 -4.21 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0352 0.5517 0.4131 1 1 0.0389 0.5460 0.4151 1 1 0.0442 0.5392 0.4166
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -12 1 399 212 187 191 0 14 0 7 0 0 186 0 1 0.9009 0.0000 0.0053 14.143 2.91 13.43 -10.52 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.7353 0.2647 0.0000 0 0 0.9842 0.0158 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 254 90 164 44 0 1 0 45 0 0 163 0 1 0.4889 0.0000 0.0061 89.000 0.75 3.16 -2.41 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1593 0.6039 0.2368 1 1 0.1639 0.5963 0.2399 1 1 0.1698 0.5866 0.2436
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.100 1 19 1 185 84 101 36 0 21 0 27 0 0 96 0 5 0.4286 0.0000 0.0495 3.000 0.11 6.44 -6.33 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3003 0.5639 0.1359 1 1 0.3007 0.5590 0.1403 1 1 0.3009 0.5530 0.1462
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 924 245 679 90 5 41 3 106 0 0 670 0 9 0.3673 0.0000 0.0133 4.976 0.23 3.05 -2.81 10 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0069 0.3720 0.6210 1 2 0.0082 0.3734 0.6184 1 2 0.0103 0.3762 0.6135
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1146 277 869 0 0 16 0 261 0 0 869 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 16.312 1.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 143727510 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 1 175 73 102 51 1 1 2 18 0 0 99 0 3 0.6986 0.0000 0.0294 72.000 0.10 1.83 -1.74 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8572 0.1401 0.0027 1 0 0.8463 0.1503 0.0034 1 0 0.8306 0.1649 0.0044
chr7 143727511 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 175 74 101 50 3 5 5 11 0 0 98 1 2 0.6757 0.0000 0.0297 13.600 0.10 2.91 -2.81 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9167 0.0824 0.0009 1 0 0.8780 0.1208 0.0011 1 1 0.4804 0.5187 0.0009
chr7 143727518 A AACTGGCAGTTC 0.500000 0.100 1 11 1 175 60 115 41 1 6 1 11 0 0 111 0 4 0.6833 0.0000 0.0348 9.000 0.07 3.00 -2.93 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8282 0.1671 0.0048 1 0 0.8157 0.1786 0.0057 1 0 0.7839 0.2090 0.0072
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 689 158 531 84 0 4 0 70 0 0 528 0 3 0.5316 0.0000 0.0056 38.500 0.67 4.09 -3.42 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3899 0.5661 0.0440 1 1 0.3919 0.5599 0.0482 1 1 0.3936 0.5524 0.0541
chr7 144258792 GAGGCTGTGAAACAGC G 0.500000 0.100 1 -15 3 527 181 346 172 0 3 0 6 0 0 344 0 2 0.9503 0.0000 0.0058 59.333 0.27 16.00 -15.73 122 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.5156 0.4844 0.0000 0 0 0.9609 0.0391 0.0000
chr7 149815757 G GAGGTGGTC 0.500000 0.100 1 8 1 787 248 539 217 0 24 0 7 1 0 538 0 0 0.8750 0.0019 0.0019 9.333 0.61 7.71 -7.11 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0116 0.9884 0.0000 0 0 0.9688 0.0312 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 853 202 651 84 0 5 1 112 0 0 648 0 3 0.4158 0.0000 0.0046 39.400 1.06 1.32 -0.26 0 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0015 0.1836 0.8149 1 2 0.0018 0.1909 0.8073 1 2 0.0025 0.2014 0.7961
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 490 136 354 68 0 2 0 66 0 0 354 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 67.000 1.32 1.32 0.01 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2067 0.6542 0.1391 1 1 0.2120 0.6432 0.1448 1 1 0.2185 0.6292 0.1523
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 745 195 550 103 0 7 0 85 0 1 545 0 4 0.5282 0.0000 0.0091 26.857 0.52 11.60 -11.08 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4511 0.5258 0.0231 1 1 0.4532 0.5208 0.0260 1 1 0.4547 0.5150 0.0304
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 487 91 396 0 0 2 13 76 1 3 368 12 12 0.0000 0.0025 0.0707 89.000 7.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2064 0.7936 2 2 0.0000 0.0388 0.9612 2 2 0.0000 0.0197 0.9803
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 490 87 403 0 0 5 7 75 0 0 374 14 15 0.0000 0.0000 0.0720 40.500 7.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 499 85 414 0 0 5 6 74 0 0 336 35 43 0.0000 0.0000 0.1884 16.000 7.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 464 134 330 76 2 0 1 55 0 0 330 0 0 0.5672 0.0000 0.0000 134.000 0.95 1.60 -0.65 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6927 0.2986 0.0087 1 0 0.6843 0.3055 0.0101 1 0 0.6723 0.3152 0.0125
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 381 96 285 62 0 3 0 31 0 0 284 0 1 0.6458 0.0000 0.0035 31.000 0.29 2.90 -2.61 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8586 0.1392 0.0022 1 0 0.8482 0.1490 0.0028 1 0 0.8333 0.1630 0.0037
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 777 204 573 153 2 27 0 22 0 0 573 0 0 0.7500 0.0000 0.0000 6.481 0.80 5.82 -5.01 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 304 103 201 96 0 3 0 4 0 0 201 0 0 0.9320 0.0000 0.0000 33.333 0.17 2.50 -2.33 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0216 0.9784 0.0000 0 0 0.6726 0.3274 0.0000 0 0 0.9068 0.0932 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 622 261 361 0 0 34 0 227 0 0 359 0 2 0.0000 0.0000 0.0055 6.676 6.14 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 404 153 251 85 0 4 1 63 0 0 246 0 5 0.5556 0.0000 0.0199 37.250 0.28 7.30 -7.02 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6387 0.3544 0.0069 1 0 0.6373 0.3549 0.0078 1 0 0.6347 0.3562 0.0091
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 269 115 154 107 1 3 0 4 0 0 154 0 0 0.9304 0.0000 0.0000 37.000 0.14 2.75 -2.61 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0747 0.9253 0.0000 0 0 0.8739 0.1261 0.0000 0 0 0.9697 0.0303 0.0000
chr8 64581060 T TGGC 0.106611 0.100 1 3 1 632 158 474 124 7 19 2 6 2 1 468 2 1 0.7848 0.0042 0.0127 8.625 1.83 4.67 -2.84 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3600 0.6400 0.0000 0 0 0.9414 0.0586 0.0000
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 693 194 499 71 3 49 3 68 0 1 498 0 0 0.3660 0.0000 0.0020 2.939 0.45 3.31 -2.86 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3837 0.6010 0.0153 1 1 0.3929 0.5910 0.0161 1 1 0.4045 0.5784 0.0171
chr8 79766258 AGGCATGT A 0.500000 0.100 1 -7 1 400 113 287 108 0 3 0 2 0 0 287 0 0 0.9558 0.0000 0.0000 36.667 0.61 7.00 -6.39 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7426 0.2574 0.0000 0 0 0.9632 0.0368 0.0000 0 0 0.9812 0.0188 0.0000
chr8 90645735 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 525 111 414 51 0 11 1 48 0 0 413 1 0 0.4595 0.0000 0.0024 9.091 0.33 3.04 -2.71 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2165 0.6184 0.1651 1 1 0.2204 0.6098 0.1698 1 1 0.2252 0.5988 0.1760
chr8 123369942 A ATCATCG 0.500000 0.100 1 6 1 362 128 234 115 5 3 0 5 0 0 234 0 0 0.8984 0.0000 0.0000 41.000 0.30 5.80 -5.50 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 0 0.6585 0.3415 0.0000 0 0 0.9309 0.0691 0.0000
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 236 101 135 8 0 0 0 93 0 0 130 0 5 0.0792 0.0000 0.0370 101.000 0.00 3.10 -3.10 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9740 0.0260 2 1 0.0000 0.5936 0.4064
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 546 155 391 54 1 24 6 70 0 0 389 0 2 0.3484 0.0000 0.0051 5.696 2.56 4.83 -2.27 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0069 0.2714 0.7216 1 2 0.0082 0.2791 0.7127 1 2 0.0102 0.2900 0.6999
chr8 144846107 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 485 198 287 114 1 8 0 75 0 0 285 0 2 0.5758 0.0000 0.0070 23.625 0.07 3.01 -2.94 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8918 0.1077 0.0005 1 0 0.8843 0.1150 0.0007 1 0 0.8734 0.1257 0.0010
chr9 116848 T TA 0.003653 0.100 1 1 1 740 188 552 168 0 10 0 10 0 0 552 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 17.800 0.30 2.10 -1.80 98 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.9680 0.0320 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr9 117363 T TC 0.002993 0.100 1 1 1 1004 185 819 166 4 7 0 8 0 0 819 0 0 0.8973 0.0000 0.0000 25.429 0.88 3.38 -2.50 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0406 0.9594 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 850 271 579 30 2 45 15 179 0 0 577 0 2 0.1107 0.0000 0.0035 5.136 1.40 3.20 -1.80 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 337 81 256 5 0 17 0 59 0 0 243 0 13 0.0617 0.0000 0.0508 3.765 5.60 7.71 -2.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.8499 0.1501 2 2 0.0000 0.4307 0.5693
chr9 12775862 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 338 93 245 69 5 13 0 6 0 0 245 0 0 0.7419 0.0000 0.0000 6.154 6.38 5.00 1.38 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0633 0.9367 0.0000 0 1 0.4345 0.5655 0.0000
chr9 35562396 A ATAGT 0.500000 0.100 1 4 5 728 152 576 144 0 3 0 5 0 0 576 0 0 0.9474 0.0000 0.0000 49.667 1.29 4.00 -2.71 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0225 0.9775 0.0000 0 0 0.8663 0.1337 0.0000 0 0 0.9777 0.0223 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 773 186 587 0 0 26 0 160 0 0 573 0 14 0.0000 0.0000 0.0239 6.154 11.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 456 85 371 45 0 0 1 39 0 0 371 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 84.000 0.22 1.03 -0.80 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3159 0.5714 0.1126 1 1 0.3165 0.5660 0.1175 1 1 0.3169 0.5592 0.1239
chr9 72059357 TGAAAG T 0.500000 0.100 1 -5 1 153 51 102 20 0 3 0 28 1 0 100 0 1 0.3922 0.0098 0.0196 16.000 0.50 4.54 -4.04 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0867 0.4898 0.4235 1 1 0.0912 0.4901 0.4187 1 1 0.0973 0.4907 0.4121
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 409 120 289 3 0 3 0 114 0 0 284 0 5 0.0250 0.0000 0.0173 39.000 1.00 14.08 -13.08 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6444 0.3556 2 2 0.0000 0.0597 0.9403 2 2 0.0000 0.0207 0.9793
chr9 76703941 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 400 94 306 52 1 0 0 41 0 0 305 0 1 0.5532 0.0000 0.0033 94.000 0.21 3.66 -3.45 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4618 0.4876 0.0507 1 1 0.4580 0.4872 0.0548 1 1 0.4524 0.4870 0.0605
chr9 76706391 GTCCTGACACTGC G 0.500000 0.100 1 -12 1 778 187 591 178 0 1 0 8 0 0 589 0 2 0.9519 0.0000 0.0034 186.000 1.13 10.25 -9.12 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1472 0.8528 0.0000 0 0 0.9020 0.0980 0.0000
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 765 157 608 3 0 13 0 141 0 0 584 0 24 0.0191 0.0000 0.0395 11.077 0.33 9.58 -9.25 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1490 0.8510 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr9 77384631 G GTGA 0.500000 0.100 1 3 1 496 193 303 91 7 23 1 71 0 0 299 0 4 0.4715 0.0000 0.0132 7.348 0.35 3.03 -2.68 79 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6583 0.3340 0.0077 1 0 0.6526 0.3383 0.0091 1 0 0.6439 0.3448 0.0113
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 515 146 369 84 0 1 0 61 0 0 367 0 2 0.5753 0.0000 0.0054 145.000 0.19 3.03 -2.84 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6542 0.3356 0.0102 1 0 0.6473 0.3408 0.0118 1 0 0.6373 0.3483 0.0144
chr9 88130024 A AAGG 0.500000 0.100 1 3 1 1208 303 905 175 0 16 1 111 0 0 899 0 6 0.5776 0.0000 0.0066 17.938 0.37 3.05 -2.69 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9713 0.0287 0.0000 1 0 0.9681 0.0319 0.0000 1 0 0.9630 0.0369 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 219 79 140 42 0 1 0 36 0 0 139 0 1 0.5316 0.0000 0.0071 78.000 0.12 4.47 -4.35 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3158 0.5669 0.1172 1 1 0.3162 0.5618 0.1219 1 1 0.3163 0.5555 0.1283
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 326 78 248 4 0 19 1 54 0 0 248 0 0 0.0513 0.0000 0.0000 3.105 0.00 3.22 -3.22 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.8203 0.1797 2 2 0.0000 0.4767 0.5233
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 474 159 315 135 2 4 0 18 0 0 315 0 0 0.8491 0.0000 0.0000 38.750 0.25 9.06 -8.80 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0074 0.9926 0.0000
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 762 292 470 174 15 1 0 102 0 1 469 0 0 0.5959 0.0000 0.0021 291.000 3.36 3.27 0.08 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9986 0.0014 0.0000 1 0 0.9982 0.0018 0.0000 1 0 0.9975 0.0025 0.0000
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 423 113 310 0 0 12 2 99 0 0 310 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.333 5.83 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0063 0.9937 2 2 0.0000 0.0072 0.9928
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 880 125 755 0 0 29 0 96 0 3 739 3 10 0.0000 0.0000 0.0212 3.310 6.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0300 0.9700 2 2 0.0000 0.0158 0.9842 2 2 0.0000 0.0125 0.9875
chr9 97854418 AGCCGCCGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -12 1 894 146 748 24 5 104 6 7 0 2 741 2 3 0.1644 0.0000 0.0094 0.327 0.79 8.86 -8.07 10 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7454 0.2420 0.0126 1 0 0.7317 0.2539 0.0144 1 0 0.7013 0.2817 0.0170
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 493 126 367 80 0 2 0 44 0 0 367 0 0 0.6349 0.0000 0.0000 62.000 0.10 2.25 -2.15 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9055 0.0938 0.0007 1 0 0.8971 0.1019 0.0009 1 0 0.8849 0.1138 0.0013
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 1289 308 981 212 0 0 0 96 0 0 977 1 3 0.6883 0.0000 0.0041 308.000 0.16 4.79 -4.63 70 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1124 231 893 150 0 4 1 76 0 0 893 0 0 0.6494 0.0000 0.0000 56.500 0.21 2.84 -2.64 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9958 0.0042 0.0000 1 0 0.9948 0.0052 0.0000 1 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 283 98 185 0 0 1 0 97 0 0 181 0 4 0.0000 0.0000 0.0216 97.000 4.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0074 0.9926
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 526 117 409 53 0 20 0 44 0 0 409 0 0 0.4530 0.0000 0.0000 4.850 0.45 5.89 -5.43 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4021 0.5304 0.0675 1 1 0.4005 0.5274 0.0721 1 1 0.3977 0.5239 0.0784
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 555 110 445 61 0 13 1 35 0 0 444 0 1 0.5545 0.0000 0.0022 8.083 0.26 1.29 -1.02 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7602 0.2329 0.0068 1 0 0.7494 0.2425 0.0081 1 0 0.7341 0.2559 0.0101
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 589 187 402 95 2 25 3 62 0 0 400 1 1 0.5080 0.0000 0.0050 6.400 1.01 3.61 -2.60 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8152 0.1827 0.0021 1 0 0.8065 0.1910 0.0026 1 0 0.7938 0.2028 0.0034
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 477 157 320 7 0 3 0 147 0 0 313 0 7 0.0446 0.0000 0.0219 51.333 0.14 3.14 -2.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 2 0.0000 0.4401 0.5599 2 2 0.0000 0.0483 0.9517
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 398 132 266 82 0 10 0 40 0 0 264 0 2 0.6212 0.0000 0.0075 12.200 0.26 7.75 -7.49 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9345 0.0651 0.0003 1 0 0.9276 0.0720 0.0005 1 0 0.9171 0.0822 0.0007
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 448 122 326 49 4 35 1 33 0 0 326 0 0 0.4016 0.0000 0.0000 2.457 1.63 3.76 -2.12 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6793 0.3059 0.0147 1 0 0.6690 0.3142 0.0168 1 0 0.6545 0.3255 0.0200
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 213 80 133 10 0 4 1 65 0 0 133 0 0 0.1250 0.0000 0.0000 19.000 0.40 1.65 -1.25 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9610 0.0390
chr9 136341024 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 240 89 151 76 1 5 0 7 0 0 151 0 0 0.8539 0.0000 0.0000 16.800 0.80 2.29 -1.48 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0270 0.9730 0.0000 0 1 0.3210 0.6790 0.0000
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 635 192 443 163 1 16 2 10 0 0 443 0 0 0.8490 0.0000 0.0000 11.000 0.39 3.90 -3.51 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0106 0.9894 0.0000 0 0 0.5679 0.4321 0.0000
chr9 136984956 C CGGCCCCTCCCTGCCCCTCT 0.500000 0.100 1 19 3 401 104 297 83 0 16 0 5 0 0 296 0 1 0.7981 0.0000 0.0034 5.500 0.59 11.40 -10.81 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0960 0.9040 0.0000 0 0 0.5440 0.4560 0.0000
chr9 137110665 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 279 86 193 48 0 1 0 37 0 0 193 0 0 0.5581 0.0000 0.0000 85.000 0.35 1.08 -0.73 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4667 0.4797 0.0536 1 1 0.4622 0.4801 0.0577 1 1 0.4558 0.4807 0.0635
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 455 147 308 60 2 10 1 74 0 0 305 0 3 0.4082 0.0000 0.0097 13.700 1.50 11.08 -9.58 20 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0224 0.4372 0.5404 1 2 0.0252 0.4383 0.5365 1 2 0.0293 0.4402 0.5305
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 213 104 109 79 3 17 0 5 0 0 109 0 0 0.7596 0.0000 0.0000 5.118 0.61 3.20 -2.59 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.2268 0.7732 0.0000 0 0 0.6836 0.3164 0.0000
chr10 3166375 T TGCACGCTAGGGAAGAGAGAGGAATG 0.004839 0.100 1 25 1 202 53 149 21 0 5 1 26 0 0 145 0 4 0.3962 0.0000 0.0268 9.600 0.19 8.85 -8.66 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2208 0.7714 0.0078 1 1 0.2309 0.7615 0.0075 1 1 0.2445 0.7483 0.0072
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 840 191 649 101 0 7 0 83 0 0 639 0 10 0.5288 0.0000 0.0154 26.286 0.26 8.64 -8.38 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4467 0.5488 0.0044 1 1 0.4568 0.5384 0.0048 1 1 0.4689 0.5257 0.0054
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 360 95 265 60 1 1 0 33 0 0 264 0 1 0.6316 0.0000 0.0038 93.000 0.35 2.06 -1.71 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8982 0.1017 0.0001 1 0 0.8919 0.1080 0.0001 1 0 0.8828 0.1171 0.0001
chr10 13439173 CAG C 0.004149 0.100 1 -2 3 287 75 212 37 0 1 0 37 0 0 210 0 2 0.4933 0.0000 0.0094 74.000 0.11 2.11 -2.00 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3593 0.6385 0.0022 1 1 0.3676 0.6302 0.0022 1 1 0.3782 0.6196 0.0023
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 232 88 144 43 0 3 0 42 0 0 140 0 4 0.4886 0.0000 0.0278 42.500 0.14 4.00 -3.86 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2599 0.6394 0.1007 1 1 0.2677 0.6307 0.1017 1 1 0.2777 0.6196 0.1028
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 896 200 696 0 0 30 2 168 0 0 677 1 18 0.0000 0.0000 0.0273 5.633 5.66 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 754 154 600 5 0 3 0 146 0 0 594 0 6 0.0325 0.0000 0.0100 50.333 0.00 3.68 -3.68 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9880 0.0120 2 2 0.0000 0.2280 0.7720 2 2 0.0000 0.0424 0.9576
chr10 26567284 CCCG C 0.002025 0.100 1 -3 5 465 140 325 70 1 29 3 37 0 0 322 0 3 0.5000 0.0000 0.0092 3.828 0.77 3.49 -2.72 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8981 0.1019 0.0000 1 0 0.8921 0.1079 0.0000 1 0 0.8835 0.1164 0.0000
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 261 101 160 95 0 0 0 6 0 0 160 0 0 0.9406 0.0000 0.0000 101.000 0.15 2.00 -1.85 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0172 0.9828 0.0000 0 0 0.9426 0.0574 0.0000 0 0 0.9945 0.0055 0.0000
chr10 44292818 AC A 0.006843 0.100 1 -1 1 444 173 271 81 3 16 1 72 0 0 271 0 0 0.4682 0.0000 0.0000 9.812 0.53 1.28 -0.75 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5667 0.4328 0.0005 1 0 0.5710 0.4285 0.0005 1 0 0.5758 0.4236 0.0006
chr10 49988921 AC A 0.048828 0.100 1 -1 1 720 216 504 199 9 2 0 6 0 0 504 0 0 0.9213 0.0000 0.0000 107.000 1.30 2.17 -0.87 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5850 0.4150 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 53807071 A AGTT 0.002532 0.100 1 3 2 310 77 233 65 0 4 0 8 0 0 233 0 0 0.8442 0.0000 0.0000 18.250 0.38 3.25 -2.87 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6693 0.3307 0.0000 0 0 0.9819 0.0181 0.0000
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.100 1 -3 1 554 146 408 129 2 3 0 12 0 0 407 0 1 0.8836 0.0000 0.0025 47.667 0.18 3.08 -2.91 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1681 0.8319 0.0000 0 0 0.9762 0.0238 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 179 79 100 72 0 3 0 4 0 0 100 0 0 0.9114 0.0000 0.0000 25.333 1.08 6.75 -5.67 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0291 0.9709 0.0000 0 0 0.7408 0.2592 0.0000 0 0 0.9334 0.0666 0.0000
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.100 1 1 1 210 82 128 42 0 3 0 37 0 0 128 0 0 0.5122 0.0000 0.0000 26.333 0.07 1.05 -0.98 8 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5241 0.4743 0.0016 1 0 0.5266 0.4717 0.0017 1 0 0.5295 0.4688 0.0018
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 395 85 310 0 0 21 3 61 0 0 310 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 3.048 3.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1654 0.8346 2 2 0.0000 0.1747 0.8253 2 2 0.0000 0.1882 0.8118
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 473 198 275 98 3 15 1 81 0 0 274 0 1 0.4949 0.0000 0.0036 12.929 0.45 5.58 -5.13 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7009 0.2989 0.0002 1 0 0.7009 0.2989 0.0002 1 0 0.7000 0.2997 0.0002
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 740 144 596 8 0 6 0 130 0 0 590 0 6 0.0556 0.0000 0.0101 23.000 0.25 5.85 -5.60 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9424 0.0576 2 2 0.0000 0.4024 0.5976
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 514 145 369 74 0 1 0 70 0 0 369 0 0 0.5103 0.0000 0.0000 144.000 0.53 3.00 -2.47 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4180 0.5789 0.0030 1 1 0.4272 0.5696 0.0032 1 1 0.4387 0.5579 0.0034
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 383 112 271 100 0 9 0 3 0 0 270 0 1 0.8929 0.0000 0.0037 11.444 0.73 6.33 -5.60 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0243 0.9757 0.0000 0 0 0.6979 0.3021 0.0000 0 0 0.9158 0.0842 0.0000
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 351 140 211 8 0 1 1 130 0 0 210 0 1 0.0571 0.0000 0.0047 138.000 0.62 2.69 -2.07 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9588 0.0412 2 2 0.0000 0.4883 0.5117
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 198 73 125 42 0 1 0 30 0 0 123 0 2 0.5753 0.0000 0.0160 72.000 0.07 2.97 -2.90 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3040 0.5865 0.1095 1 1 0.2995 0.5840 0.1165 1 1 0.2931 0.5808 0.1261
chr10 116471844 GGC G 0.001719 0.100 1 -2 4 134 60 74 57 0 0 0 3 0 0 74 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 60.000 2.74 3.33 -0.60 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9314 0.0686 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr10 116471848 G GAA 0.001728 0.100 1 2 1 134 60 74 0 54 3 0 3 0 0 74 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 2.000 3.33 0 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8697 0.1303 0.0000 0 0 0.9951 0.0049 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 362 108 254 5 0 25 8 70 0 1 252 0 1 0.0463 0.0000 0.0079 3.000 1.80 2.99 -1.19 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.8107 0.1893 2 2 0.0000 0.3679 0.6321
chr10 128107489 T TGCTGGG 0.001110 0.100 1 6 1 1195 275 920 253 1 10 0 11 0 0 919 0 1 0.9200 0.0000 0.0011 26.500 0.60 6.91 -6.30 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 341 133 208 8 0 6 0 119 0 0 207 0 1 0.0602 0.0000 0.0048 21.167 0.38 1.15 -0.78 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9242 0.0758 2 2 0.0000 0.3326 0.6674
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 730 187 543 87 0 13 0 87 0 0 542 0 1 0.4652 0.0000 0.0018 13.385 0.18 3.23 -3.05 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1786 0.7079 0.1135 1 1 0.1876 0.6940 0.1183 1 1 0.1994 0.6762 0.1244
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.100 1 -24 1 3168 784 2384 354 11 231 10 178 1 3 2379 0 1 0.4515 0.0004 0.0021 2.393 3.19 14.36 -11.17 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1033 218 815 0 0 89 0 129 0 0 815 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 1.449 7.78 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 998 297 701 202 3 81 1 10 0 1 700 0 0 0.6801 0.0000 0.0014 2.667 0.61 5.00 -4.39 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1765 0.8235 0.0000 0 0 0.9351 0.0649 0.0000
chr11 2884966 ACCGCGACCGGAG A 0.233793 0.100 1 -12 1 542 142 400 110 1 28 0 3 1 0 399 0 0 0.7746 0.0025 0.0025 4.036 1.87 13.67 -11.79 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5553 0.4447 0.0000 0 0 0.9729 0.0271 0.0000 0 0 0.9909 0.0091 0.0000
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 380 109 271 0 0 4 0 105 0 0 269 0 2 0.0000 0.0000 0.0074 26.250 3.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr11 4545928 T TCA 0.500000 0.100 1 2 1 515 135 380 12 0 1 0 122 0 0 380 0 0 0.0889 0.0000 0.0000 134.000 0.00 2.13 -2.13 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.8558 0.1442
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 212 94 118 3 0 1 0 90 0 0 114 0 4 0.0319 0.0000 0.0339 93.000 0.00 2.20 -2.20 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8667 0.1333 2 2 0.0000 0.1822 0.8178 2 2 0.0000 0.0668 0.9332
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 660 159 501 7 0 0 0 152 0 0 501 0 0 0.0440 0.0000 0.0000 159.000 0.00 3.83 -3.83 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 2 0.0000 0.4642 0.5358 2 2 0.0000 0.0529 0.9471
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 760 179 581 0 0 7 0 172 0 0 580 0 1 0.0000 0.0000 0.0017 28.667 1.24 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 979 211 768 99 0 6 0 106 0 0 763 0 5 0.4692 0.0000 0.0065 34.167 0.21 5.58 -5.37 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0331 0.6095 0.3574 1 1 0.0369 0.5999 0.3632 1 1 0.0424 0.5880 0.3696
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 647 163 484 74 0 8 0 81 0 1 483 0 0 0.4540 0.0000 0.0021 19.375 0.27 1.62 -1.35 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0813 0.6427 0.2760 1 1 0.0868 0.6323 0.2809 1 1 0.0942 0.6191 0.2867
chr11 5343311 CCAGCCCCAGGTCTGTGG C 0.500000 0.100 1 -17 3 501 105 396 12 0 5 0 88 0 0 380 0 16 0.1143 0.0000 0.0404 20.000 0.83 15.53 -14.70 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9343 0.0657
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.100 1 4 1 1067 262 805 95 0 18 0 149 0 0 798 1 6 0.3626 0.0000 0.0087 13.556 0.33 4.33 -4.00 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0160 0.9840 1 2 0.0000 0.0183 0.9817 1 2 0.0000 0.0221 0.9779
chr11 5454410 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 416 99 317 91 1 3 0 4 0 0 317 0 0 0.9192 0.0000 0.0000 31.667 0.26 1.75 -1.49 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0149 0.9851 0.0000 0 0 0.5825 0.4175 0.0000 0 0 0.8690 0.1310 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 798 139 659 12 0 18 0 109 0 0 639 0 20 0.0863 0.0000 0.0303 6.722 0.08 8.94 -8.85 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.8087 0.1913
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 292 134 158 37 0 18 4 75 0 0 158 0 0 0.2761 0.0000 0.0000 6.389 1.22 3.51 -2.29 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0531 0.9466 1 2 0.0003 0.0593 0.9403 1 2 0.0005 0.0687 0.9308
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 207 77 130 29 0 0 0 48 0 0 130 0 0 0.3766 0.0000 0.0000 77.000 0.31 3.21 -2.90 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0158 0.3025 0.6817 1 2 0.0180 0.3112 0.6709 1 2 0.0213 0.3229 0.6558
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 180 92 88 87 0 0 0 5 0 0 88 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 92.000 0.32 3.20 -2.88 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2733 0.7267 0.0000 0 0 0.7335 0.2665 0.0000
chr11 44309737 TGCTGCGGCTGCG T 0.500000 0.100 1 -12 1 502 113 389 65 1 7 0 40 0 1 386 0 2 0.5752 0.0000 0.0077 15.143 0.69 10.97 -10.28 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7679 0.2264 0.0057 1 0 0.7574 0.2357 0.0068 1 0 0.7426 0.2488 0.0086
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 262 106 156 64 0 1 0 41 0 0 152 0 4 0.6038 0.0000 0.0256 105.000 0.12 5.49 -5.36 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6484 0.3366 0.0150 1 0 0.6398 0.3431 0.0171 1 0 0.6276 0.3520 0.0203
chr11 48217585 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 578 147 431 138 1 2 0 6 0 0 430 1 0 0.9388 0.0000 0.0023 72.500 0.39 1.67 -1.28 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.4250 0.5750 0.0000 0 0 0.9116 0.0884 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 829 242 587 6 0 6 1 229 0 0 578 0 9 0.0248 0.0000 0.0153 39.333 0.00 3.18 -3.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7600 0.2400 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr11 54603834 GGACCCCAGTGATGGGCTGGCAGTGATGGT G 0.500000 0.100 1 -29 5 442 107 335 68 0 5 0 34 1 0 328 0 6 0.6355 0.0030 0.0209 20.400 1.09 14.15 -13.06 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8362 0.1611 0.0027 1 0 0.8259 0.1708 0.0033 1 0 0.8112 0.1845 0.0043
chr11 55827503 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 851 190 661 104 1 6 0 79 0 0 659 0 2 0.5474 0.0000 0.0030 30.667 0.19 1.10 -0.91 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6797 0.3144 0.0059 1 0 0.6740 0.3190 0.0070 1 0 0.6654 0.3258 0.0088
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 1026 232 794 102 0 6 0 124 0 0 789 0 5 0.4397 0.0000 0.0063 37.667 0.26 2.35 -2.08 16 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0033 0.2984 0.6983 1 2 0.0040 0.3019 0.6941 1 2 0.0053 0.3075 0.6872
chr11 59863993 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 218 92 126 82 0 0 0 10 0 0 126 0 0 0.8913 0.0000 0.0000 92.000 0.10 1.00 -0.90 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.0804 0.9196 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 74 45 29 42 0 0 0 3 0 0 29 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 45.000 0.02 2.00 -1.98 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0107 0.9893 0.0000 0 1 0.2504 0.7496 0.0000 0 0 0.5281 0.4719 0.0000
chr11 62146758 A AGCGGGAGCAGGAGCG 0.500000 0.100 1 15 1 698 185 513 88 4 42 4 47 0 0 489 1 23 0.4757 0.0000 0.0468 3.415 1.34 6.83 -5.49 24 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5258 0.4548 0.0194 1 0 0.5238 0.4542 0.0219 1 0 0.5202 0.4541 0.0258
chr11 62146777 GGAGCAGGAGCGGCGC G 0.500000 0.100 1 -15 3 698 239 459 170 10 43 2 14 0 0 459 0 0 0.7113 0.0000 0.0000 4.659 2.29 7.00 -4.71 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1811 0.8189 0.0000
chr11 63382198 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 184 62 122 32 4 2 5 19 0 0 121 1 0 0.5161 0.0000 0.0082 28.500 0.56 1.26 -0.70 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4992 0.4448 0.0560 1 0 0.4922 0.4477 0.0601 1 0 0.4825 0.4516 0.0658
chr11 68157814 GTCA G 0.500000 0.100 1 -3 3 470 125 345 68 0 10 0 47 0 0 341 0 4 0.5440 0.0000 0.0116 11.500 0.44 3.09 -2.64 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5885 0.3912 0.0202 1 0 0.5821 0.3951 0.0228 1 0 0.5727 0.4007 0.0266
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 1027 154 873 19 0 29 3 103 0 0 795 1 77 0.1234 0.0000 0.0893 4.429 0.05 7.20 -7.15 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9616 0.0384
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1225 216 1009 12 0 107 8 89 1 0 951 1 56 0.0556 0.0010 0.0575 1.009 1.42 10.39 -8.98 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9980 0.0020 2 1 0.0000 0.7200 0.2800
chr11 71566054 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGCAATCCCTG C 0.500000 0.100 1 -30 1 1023 346 677 291 0 42 0 13 5 0 666 3 3 0.8410 0.0074 0.0162 7.238 0.52 18.69 -18.17 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0148 0.9852 0.0000 0 0 0.9444 0.0556 0.0000
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 976 267 709 132 1 69 4 61 0 0 682 0 27 0.4944 0.0000 0.0381 2.870 0.25 17.52 -17.27 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9060 0.0938 0.0003 1 0 0.8994 0.1002 0.0004 1 0 0.8897 0.1097 0.0005
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 951 282 669 22 0 2 1 257 0 0 669 0 0 0.0780 0.0000 0.0000 140.000 0.18 2.21 -2.03 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8320 0.1680
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 766 157 609 65 0 16 1 75 1 0 607 0 1 0.4140 0.0016 0.0033 8.812 0.60 3.63 -3.03 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0458 0.5492 0.4051 1 1 0.0499 0.5442 0.4059 1 1 0.0558 0.5383 0.4059
chr11 75402313 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 352 148 204 139 1 2 0 6 0 0 204 0 0 0.9392 0.0000 0.0000 72.500 0.16 2.83 -2.68 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 0 0.6455 0.3545 0.0000 0 0 0.9497 0.0503 0.0000
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 250 78 172 4 0 3 0 71 0 0 167 0 5 0.0513 0.0000 0.0291 25.000 0.25 16.30 -16.05 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9934 0.0066 2 1 0.0000 0.6135 0.3865 2 2 0.0000 0.2458 0.7542
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.100 1 -1 3 941 111 830 72 1 0 1 37 0 0 830 0 0 0.6486 0.0000 0.0000 111.000 0.57 1.11 -0.54 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9015 0.0976 0.0009 1 0 0.8928 0.1061 0.0012 1 0 0.8800 0.1184 0.0016
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1269 332 937 15 2 65 8 242 0 0 937 0 0 0.0452 0.0000 0.0000 4.109 0.53 8.01 -7.48 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9763 0.0237 2 2 0.0000 0.0916 0.9084
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 794 268 526 0 1 51 3 213 0 0 525 0 1 0.0000 0.0000 0.0019 4.320 10.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 119312056 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 985 189 796 110 0 4 0 75 0 0 796 0 0 0.5820 0.0000 0.0000 46.250 0.31 2.97 -2.66 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8656 0.1336 0.0008 1 0 0.8576 0.1413 0.0011 1 0 0.8459 0.1525 0.0015
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 363 108 255 0 0 7 1 100 0 0 255 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 14.429 5.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0074 0.9926
chr11 125495476 CG C 0.500000 0.100 1 -1 4 500 176 324 154 1 8 1 12 0 0 324 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 21.000 0.64 1.83 -1.20 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.3181 0.6819 0.0000
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.100 1 -6 1 222 80 142 40 0 11 0 29 0 0 142 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 6.273 0.55 4.97 -4.42 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4864 0.4586 0.0549 1 0 0.4804 0.4605 0.0590 1 0 0.4720 0.4632 0.0648
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 409 107 302 4 42 17 1 43 0 0 299 1 2 0.0374 0.0000 0.0099 5.294 1.75 3.30 -1.55 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1838 0.6108 0.2054 1 1 0.1881 0.6027 0.2093 1 1 0.1935 0.5924 0.2141
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 409 111 298 37 13 17 1 43 0 0 297 0 1 0.3333 0.0000 0.0034 5.529 2.84 3.56 -0.72 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3012 0.5862 0.1126 1 1 0.3027 0.5797 0.1176 1 1 0.3042 0.5715 0.1242
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 106 54 52 34 0 2 0 18 0 0 51 0 1 0.6296 0.0000 0.0192 26.000 0.53 1.83 -1.30 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6107 0.3581 0.0312 1 0 0.6001 0.3655 0.0344 1 0 0.5856 0.3753 0.0391
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 330 111 219 65 0 2 0 44 0 0 219 0 0 0.5856 0.0000 0.0000 54.500 0.60 1.20 -0.60 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7676 0.2277 0.0047 1 0 0.7599 0.2346 0.0055 1 0 0.7490 0.2444 0.0067
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 579 176 403 16 0 37 3 120 0 0 397 0 6 0.0909 0.0000 0.0149 3.757 0.06 3.17 -3.10 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9862 0.0138
chr12 6667903 T TTGC 0.006082 0.100 1 3 1 415 130 285 1 96 26 0 7 0 1 284 0 0 0.0077 0.0000 0.0035 4.000 0.00 3.29 -3.29 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 0 0.9178 0.0822 0.0000 0 0 0.9947 0.0053 0.0000
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 415 133 282 5 2 28 10 88 0 0 279 1 2 0.0376 0.0000 0.0106 3.852 2.80 3.05 -0.25 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8920 0.1080 2 2 0.0000 0.3547 0.6453
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 272 106 166 48 0 5 0 53 0 0 165 0 1 0.4528 0.0000 0.0060 20.200 0.12 5.02 -4.89 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0966 0.5816 0.3218 1 1 0.1016 0.5753 0.3231 1 1 0.1083 0.5675 0.3242
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.100 1 -9 1 688 196 492 94 0 30 0 72 0 0 488 0 4 0.4796 0.0000 0.0081 5.533 0.10 8.21 -8.11 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7129 0.2863 0.0008 1 0 0.7116 0.2875 0.0009 1 0 0.7092 0.2898 0.0011
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 308 144 164 52 0 12 0 80 0 0 163 0 1 0.3611 0.0000 0.0061 11.000 1.08 3.75 -2.67 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0013 0.1374 0.8614 1 2 0.0016 0.1448 0.8536 1 2 0.0021 0.1555 0.8424
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 455 118 337 111 0 2 0 5 0 0 337 0 0 0.9407 0.0000 0.0000 58.000 0.40 3.60 -3.20 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0065 0.9935 0.0000 0 0 0.6550 0.3450 0.0000 0 0 0.9307 0.0693 0.0000
chr12 40487719 AGGACTATCAGCTGGGGTGACAGGGACAACTGGACCATCAGCTGGAATAGCAGGTACAAAT A 0.001206 0.100 1 -60 1 2064 472 1592 271 2 106 0 93 6 12 1534 2 38 0.5742 0.0038 0.0364 3.486 1.41 3.94 -2.53 57 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 905 190 715 98 0 2 0 90 0 0 715 0 0 0.5158 0.0000 0.0000 94.000 0.20 1.12 -0.92 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4013 0.5770 0.0217 1 1 0.4098 0.5666 0.0235 1 1 0.4200 0.5538 0.0262
chr12 51329814 A AG 0.276619 0.100 1 1 2 247 83 164 77 0 2 1 3 0 0 164 0 0 0.9277 0.0000 0.0000 40.000 0.23 1.00 -0.77 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1359 0.8641 0.0000 0 0 0.8165 0.1835 0.0000 0 0 0.9345 0.0655 0.0000
chr12 52073890 TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC T 0.050697 0.100 1 -23 2 387 138 249 111 0 23 0 4 0 0 249 0 0 0.8043 0.0000 0.0000 5.000 0.14 11.50 -11.36 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4249 0.5751 0.0000 0 0 0.9854 0.0146 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr12 52317956 ACTT A 0.001740 0.100 1 -3 1 392 100 292 88 0 7 1 4 0 0 292 0 0 0.8800 0.0000 0.0000 13.286 0.16 3.75 -3.59 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5589 0.4411 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 982 275 707 229 2 19 1 24 0 0 706 0 1 0.8327 0.0000 0.0014 13.421 0.76 12.38 -11.61 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0073 0.9927 0.0000
chr12 52768988 C CGCT 0.004583 0.100 1 3 2 546 185 361 19 89 17 4 56 0 0 358 1 2 0.1027 0.0000 0.0083 9.824 0.63 4.00 -3.37 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9617 0.0383 0.0000 1 0 0.9580 0.0420 0.0000 1 0 0.9525 0.0475 0.0000
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.100 1 21 2 475 135 340 102 0 27 1 5 0 0 338 0 2 0.7556 0.0000 0.0059 3.963 0.16 13.60 -13.44 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.6228 0.3772 0.0000 0 0 0.9665 0.0335 0.0000
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 317 77 240 0 0 1 0 76 0 0 240 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 76.000 1.59 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0456 0.9544 2 2 0.0000 0.0491 0.9509 2 2 0.0000 0.0544 0.9456
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 347 94 253 51 0 0 0 43 0 0 253 0 0 0.5426 0.0000 0.0000 94.000 0.04 1.33 -1.29 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4259 0.5145 0.0596 1 1 0.4252 0.5115 0.0633 1 1 0.4237 0.5079 0.0684
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 117 51 66 2 0 0 0 49 0 0 66 0 0 0.0392 0.0000 0.0000 51.000 1.00 2.16 -1.16 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7979 0.2021 2 2 0.0000 0.2909 0.7091 2 2 0.0000 0.1588 0.8412
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 350 88 262 4 0 1 0 83 0 0 257 0 5 0.0455 0.0000 0.0191 87.000 0.50 3.77 -3.27 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9918 0.0082 2 1 0.0000 0.5619 0.4381 2 2 0.0000 0.2112 0.7888
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 124 49 75 20 0 5 0 24 0 0 73 0 2 0.4082 0.0000 0.0267 8.800 0.05 2.79 -2.74 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1479 0.5469 0.3053 1 1 0.1533 0.5446 0.3022 1 1 0.1605 0.5416 0.2979
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1094 304 790 0 0 26 1 277 0 0 790 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.692 3.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 430 123 307 13 38 31 0 41 0 0 307 0 0 0.1057 0.0000 0.0000 2.968 0.38 3.49 -3.10 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4293 0.5092 0.0615 1 1 0.4265 0.5077 0.0658 1 1 0.4222 0.5059 0.0719
chr12 102958393 CGCA C 0.500000 0.100 1 -3 1 436 125 311 51 8 28 3 35 0 0 311 0 0 0.4080 0.0000 0.0000 3.464 2.18 3.17 -0.99 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7065 0.2826 0.0109 1 0 0.6962 0.2912 0.0127 1 0 0.6817 0.3030 0.0153
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 408 117 291 0 0 7 0 110 0 0 284 0 7 0.0000 0.0000 0.0241 15.714 4.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 1904 474 1430 268 9 92 4 101 2 0 1397 0 31 0.5654 0.0014 0.0231 4.189 0.81 4.86 -4.05 74 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 108623665 GAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -30 2 1871 401 1470 246 19 62 17 57 2 0 1435 14 19 0.6135 0.0014 0.0238 5.875 0.76 3.65 -2.89 70 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.100 1 -30 1 1841 540 1301 329 2 89 0 120 5 9 1222 4 61 0.6093 0.0038 0.0607 5.067 1.00 20.44 -19.44 117 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 679 209 470 0 0 30 9 170 0 0 468 1 1 0.0000 0.0000 0.0043 5.967 3.49 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 187 109 78 0 0 2 0 107 0 0 78 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 53.500 3.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr12 113180950 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 318 124 194 66 0 14 0 44 0 0 191 0 3 0.5323 0.0000 0.0155 7.857 0.08 2.86 -2.79 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6441 0.3410 0.0149 1 0 0.6358 0.3472 0.0170 1 0 0.6240 0.3557 0.0202
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 395 87 308 26 21 12 11 17 0 0 305 1 2 0.2989 0.0000 0.0097 5.583 1.31 4.24 -2.93 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6143 0.3597 0.0260 1 0 0.6046 0.3665 0.0289 1 0 0.5912 0.3756 0.0332
chr12 121420274 AGAT A 0.500000 0.100 1 -3 2 221 79 142 48 0 0 0 31 0 0 142 0 0 0.6076 0.0000 0.0000 79.000 0.29 4.06 -3.77 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6326 0.3456 0.0218 1 0 0.6229 0.3527 0.0244 1 0 0.6093 0.3623 0.0283
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 423 121 302 0 0 12 1 108 0 0 293 0 9 0.0000 0.0000 0.0298 9.000 5.41 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0033 0.9967
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 345 75 270 6 0 9 0 60 0 0 256 0 14 0.0800 0.0000 0.0519 7.333 0.00 11.23 -11.23 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9365 0.0635 2 1 0.0000 0.5645 0.4355
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 552 149 403 120 7 10 0 12 0 0 402 0 1 0.8054 0.0000 0.0025 13.700 1.62 1.75 -0.12 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1032 0.8968 0.0000
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 727 192 535 0 0 32 0 160 0 0 513 0 22 0.0000 0.0000 0.0411 5.000 7.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr12 124402512 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 3 246 87 159 27 0 24 0 36 0 0 155 0 4 0.3103 0.0000 0.0252 2.625 0.81 5.22 -4.41 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0418 0.4175 0.5408 1 2 0.0454 0.4217 0.5329 1 2 0.0507 0.4273 0.5220
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 225 71 154 0 0 7 3 61 0 0 150 0 4 0.0000 0.0000 0.0260 9.000 7.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0305 0.9695 2 2 0.0000 0.0326 0.9674 2 2 0.0000 0.0358 0.9642
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 549 147 402 11 0 22 3 111 0 0 396 1 5 0.0748 0.0000 0.0149 5.682 0.82 4.49 -3.67 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.7767 0.2233
chr12 132062523 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 1 549 147 402 11 5 81 0 50 0 0 397 0 5 0.0748 0.0000 0.0124 0.833 0.82 5.84 -5.02 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9517 0.0483 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.9970 0.0030
chr13 37105243 CTGT C 0.000775 0.100 1 -3 1 481 132 349 71 0 2 0 59 0 0 349 0 0 0.5379 0.0000 0.0000 65.000 0.82 3.68 -2.86 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6344 0.3656 0.0000 1 0 0.6349 0.3651 0.0001 1 0 0.6349 0.3650 0.0001
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 213 87 126 81 0 4 0 2 0 0 126 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 20.750 0.04 5.00 -4.96 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9466 0.0534 0.0000 0 0 0.9940 0.0060 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000
chr13 44574569 TTGCTGC T 0.000296 0.100 1 -6 1 782 179 603 91 0 14 0 74 0 0 601 0 2 0.5084 0.0000 0.0033 12.692 0.27 5.61 -5.33 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6719 0.3280 0.0000 1 0 0.6725 0.3275 0.0000 1 0 0.6725 0.3275 0.0000
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 571 175 396 99 1 4 0 71 0 0 394 0 2 0.5657 0.0000 0.0051 42.750 0.36 12.94 -12.58 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7645 0.2322 0.0032 1 0 0.7569 0.2391 0.0039 1 0 0.7458 0.2491 0.0051
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 648 147 501 14 1 40 0 92 0 0 495 1 5 0.0952 0.0000 0.0120 2.675 1.93 5.90 -3.97 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 117 55 62 31 0 4 0 20 0 0 62 0 0 0.5636 0.0000 0.0000 12.750 0.23 4.35 -4.12 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6925 0.3057 0.0018 1 0 0.6875 0.3106 0.0019 1 0 0.6805 0.3174 0.0021
chr13 77698098 T TGCC 0.001998 0.100 1 3 1 497 145 352 77 0 12 0 56 2 0 349 1 0 0.5310 0.0057 0.0085 11.083 3.64 6.20 -2.56 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8193 0.1806 0.0000 1 0 0.8143 0.1857 0.0000 1 0 0.8070 0.1930 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 584 86 498 0 1 7 1 77 0 0 496 1 1 0.0000 0.0000 0.0040 11.286 5.43 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0293 0.9707 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0087 0.9913
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 525 95 430 17 4 44 3 27 2 1 422 1 4 0.1789 0.0047 0.0186 1.163 2.65 3.30 -0.65 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0580 0.4488 0.4931 1 2 0.0622 0.4515 0.4863 1 2 0.0680 0.4552 0.4769
chr13 112067766 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 395 112 283 91 8 9 0 4 0 0 283 0 0 0.8125 0.0000 0.0000 11.222 2.80 5.25 -2.45 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0206 0.9794 0.0000 0 0 0.6606 0.3394 0.0000 0 0 0.9017 0.0983 0.0000
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 611 139 472 122 0 13 0 4 2 1 469 0 0 0.8777 0.0042 0.0064 9.692 1.42 7.00 -5.58 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0740 0.9260 0.0000 0 0 0.8783 0.1217 0.0000 0 0 0.9704 0.0296 0.0000
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 279 85 194 74 1 7 1 2 1 0 193 0 0 0.8706 0.0052 0.0052 12.833 1.05 7.00 -5.95 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0826 0.9174 0.0000 0 0 0.6567 0.3433 0.0000 0 0 0.8525 0.1475 0.0000
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -15 1 266 88 178 52 0 4 0 32 0 0 177 0 1 0.5909 0.0000 0.0056 21.000 0.21 9.28 -9.07 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6736 0.3109 0.0156 1 0 0.6633 0.3190 0.0177 1 0 0.6489 0.3301 0.0210
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 266 91 175 44 1 19 0 27 0 0 175 0 0 0.4835 0.0000 0.0000 3.737 0.25 9.96 -9.71 8 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6559 0.3242 0.0199 1 0 0.6452 0.3324 0.0224 1 0 0.6305 0.3433 0.0262
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.100 1 4 1 390 91 299 51 0 2 0 38 0 0 298 0 1 0.5604 0.0000 0.0033 44.500 0.35 3.87 -3.52 35 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4904 0.4642 0.0454 1 0 0.4854 0.4653 0.0493 1 0 0.4782 0.4670 0.0548
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 573 118 455 0 0 6 0 112 0 0 452 0 3 0.0000 0.0000 0.0066 18.667 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 839 181 658 45 0 5 2 129 0 0 657 0 1 0.2486 0.0000 0.0015 35.200 1.58 1.76 -0.18 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0006 0.9994 1 2 0.0000 0.0008 0.9992 1 2 0.0000 0.0297 0.9703
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 743 216 527 159 1 24 0 32 0 0 527 0 0 0.7361 0.0000 0.0000 8.000 0.16 1.09 -0.93 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 497 136 361 82 0 3 0 51 0 0 358 0 3 0.6029 0.0000 0.0083 44.333 0.40 19.57 -19.17 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8231 0.1745 0.0024 1 0 0.8143 0.1827 0.0029 1 0 0.8017 0.1945 0.0038
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 370 65 305 3 0 4 0 58 0 0 303 0 2 0.0462 0.0000 0.0066 15.250 0.00 1.40 -1.40 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9355 0.0645 2 2 0.0000 0.3392 0.6608 2 2 0.0000 0.1370 0.8630
chr14 21155337 CAGA C 0.002975 0.100 1 -3 1 556 108 448 52 0 9 0 47 0 0 445 0 3 0.4815 0.0000 0.0067 11.000 1.37 4.06 -2.70 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4240 0.5752 0.0009 1 1 0.4314 0.5678 0.0009 1 1 0.4406 0.5585 0.0009
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 506 129 377 0 0 12 0 117 0 0 377 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.750 5.38 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0066 0.9934 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0088 0.9912
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 626 205 421 174 1 9 1 20 0 0 421 0 0 0.8488 0.0000 0.0000 39.200 0.28 4.20 -3.92 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0034 0.9966 0.0000
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 624 207 417 176 2 4 4 21 0 0 417 0 0 0.8502 0.0000 0.0000 49.500 0.28 4.19 -3.91 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0021 0.9979 0.0000
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 323 49 274 31 3 9 0 6 0 0 274 0 0 0.6327 0.0000 0.0000 5.000 2.61 4.33 -1.72 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.0164 0.9836 0.0000 0 1 0.1613 0.8387 0.0000
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 343 64 279 4 1 3 2 54 0 0 278 0 1 0.0625 0.0000 0.0036 20.333 1.75 3.13 -1.38 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9439 0.0561 2 1 0.0000 0.7084 0.2916
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 309 74 235 30 0 0 0 44 0 0 235 0 0 0.4054 0.0000 0.0000 74.000 0.13 1.70 -1.57 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1155 0.7228 0.1617 1 1 0.1246 0.7188 0.1566 1 1 0.1372 0.7129 0.1498
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 399 135 264 6 0 23 4 102 0 0 260 0 4 0.0444 0.0000 0.0152 4.870 0.00 4.43 -4.43 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8672 0.1328 2 2 0.0000 0.3767 0.6233
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 399 135 264 7 0 78 1 49 0 0 261 0 3 0.0519 0.0000 0.0114 0.747 0.43 6.02 -5.59 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9956 0.0044 2 1 0.0000 0.9270 0.0730
chr14 28767497 A AGCC 0.000157 0.100 1 3 1 678 152 526 126 5 14 1 6 2 4 519 1 0 0.8289 0.0038 0.0133 9.857 1.42 2.50 -1.08 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4555 0.5445 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr14 30622360 A ACAG 0.001235 0.100 1 3 1 127 80 47 66 2 9 0 3 0 0 47 0 0 0.8250 0.0000 0.0000 7.889 0.05 3.00 -2.95 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9706 0.0294 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr14 38210558 CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG C 0.001365 0.100 1 -24 1 302 73 229 52 2 17 0 2 0 0 229 0 0 0.7123 0.0000 0.0000 3.294 0.94 2.00 -1.06 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9928 0.0072 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 759 150 609 122 1 22 0 5 1 0 607 0 1 0.8133 0.0016 0.0033 5.773 1.00 6.60 -5.60 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1469 0.8531 0.0000 0 0 0.6458 0.3542 0.0000
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.100 1 2 1 490 132 358 121 0 1 0 10 0 0 358 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 131.000 0.32 1.70 -1.38 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7360 0.2640 0.0000 0 0 0.9938 0.0062 0.0000
chr14 67198163 TGAA T 0.018726 0.100 1 -3 2 132 54 78 27 0 2 0 25 0 0 77 0 1 0.5000 0.0000 0.0128 26.000 0.07 3.84 -3.77 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4520 0.5410 0.0071 1 1 0.4558 0.5370 0.0072 1 1 0.4606 0.5321 0.0073
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 654 179 475 78 1 18 3 79 1 2 471 1 0 0.4358 0.0021 0.0084 8.944 0.99 6.66 -5.67 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0513 0.6775 0.2712 1 1 0.0537 0.6646 0.2817 1 1 0.0568 0.6481 0.2951
chr14 73522300 GCTT G 0.001053 0.100 1 -3 2 468 110 358 58 0 2 0 50 0 0 356 0 2 0.5273 0.0000 0.0056 54.000 0.43 3.14 -2.71 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5135 0.4864 0.0002 1 0 0.5179 0.4819 0.0002 1 0 0.5232 0.4767 0.0002
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 501 109 392 0 0 22 2 85 0 0 390 1 1 0.0000 0.0000 0.0051 4.143 5.46 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0157 0.9843 2 2 0.0000 0.0172 0.9828 2 2 0.0000 0.0194 0.9806
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 491 96 395 2 24 8 9 53 0 2 391 2 0 0.0208 0.0000 0.0101 21.000 1.50 4.58 -3.08 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0005 0.0685 0.9310 1 2 0.0007 0.1102 0.8891 1 2 0.0006 0.4722 0.5272
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 491 158 333 5 0 23 2 128 0 0 333 0 0 0.0316 0.0000 0.0000 5.870 0.00 3.30 -3.30 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9799 0.0201 2 2 0.0000 0.1467 0.8533 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 315 100 215 92 0 0 0 8 0 0 215 0 0 0.9200 0.0000 0.0000 100.000 0.51 8.12 -7.61 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0319 0.9681 0.0000 0 1 0.4600 0.5400 0.0000
chr14 94469278 AC A 0.002528 0.100 1 -1 1 435 121 314 114 0 2 0 5 0 0 314 0 0 0.9421 0.0000 0.0000 59.500 0.25 1.00 -0.75 34 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6706 0.3294 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr14 95436970 TAGA T 0.126266 0.100 1 -3 1 177 54 123 37 0 4 0 13 0 0 123 0 0 0.6852 0.0000 0.0000 12.500 0.41 3.00 -2.59 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8791 0.1198 0.0011 1 0 0.8614 0.1373 0.0013 1 0 0.7331 0.2655 0.0014
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 237 78 159 44 1 6 1 26 0 0 157 0 2 0.5641 0.0000 0.0126 12.000 0.14 8.35 -8.21 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6541 0.3266 0.0194 1 0 0.6448 0.3336 0.0217 1 0 0.6319 0.3431 0.0250
chr14 104707525 ACCCCAC A 0.082909 0.100 1 -6 2 551 110 441 36 2 25 1 46 0 0 440 0 1 0.3273 0.0000 0.0023 3.400 0.89 7.15 -6.26 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1634 0.7299 0.1067 1 1 0.1734 0.7218 0.1048 1 1 0.1869 0.7109 0.1022
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.100 1 -12 2 555 112 443 45 3 51 2 11 0 0 443 0 0 0.4018 0.0000 0.0000 1.224 0.80 9.00 -8.20 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0763 0.9237 0.0000 0 1 0.0075 0.9925 0.0000 0 1 0.0287 0.9713 0.0000
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 420 109 311 50 0 14 0 45 0 2 306 0 3 0.4587 0.0000 0.0161 6.786 0.94 3.84 -2.90 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3686 0.5667 0.0648 1 1 0.3726 0.5600 0.0674 1 1 0.3773 0.5518 0.0709
chr15 20534590 ATCTCCTCCTGCTCTCGTATCT A 0.000423 0.100 1 -21 1 1589 614 975 481 44 46 10 33 10 6 951 0 8 0.7834 0.0103 0.0246 11.978 1.43 8.36 -6.94 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9606 0.0394 0.0000
chr15 20535052 TCC T 0.033305 0.100 1 -2 1 1643 465 1178 358 9 72 2 24 21 16 1135 5 1 0.7699 0.0178 0.0365 5.735 2.39 4.88 -2.49 154 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.9857 0.0143 0.0000
chr15 20535057 T TGA 0.035606 0.100 1 2 2 1643 451 1192 357 2 64 4 24 25 15 1148 2 2 0.7916 0.0210 0.0369 6.295 2.54 4.88 -2.34 155 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.9863 0.0137 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 795 163 632 66 3 2 2 90 0 0 624 0 8 0.4049 0.0000 0.0127 80.000 2.00 4.92 -2.92 24 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0997 0.9002 1 2 0.0001 0.1048 0.8951 1 2 0.0001 0.1122 0.8877
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 1582 354 1228 0 0 16 4 334 0 1 1128 31 68 0.0000 0.0000 0.0814 21.062 2.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 241 95 146 1 1 7 54 32 0 0 142 4 0 0.0105 0.0000 0.0274 5.667 0.00 1.94 -1.94 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.2401 0.7599 2 2 0.0000 0.0997 0.9003 2 2 0.0000 0.0751 0.9249
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 241 95 146 1 1 38 1 54 0 0 142 0 4 0.0105 0.0000 0.0274 1.500 0.00 2.30 -2.30 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4327 0.5673 2 2 0.0000 0.1598 0.8402 2 2 0.0000 0.0991 0.9009
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 651 157 494 0 0 37 2 118 0 0 491 0 3 0.0000 0.0000 0.0061 3.243 3.62 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr15 34038912 C CCCGCCGCCGCCT 0.002022 0.100 1 12 4 282 102 180 88 1 9 0 4 0 0 180 0 0 0.8627 0.0000 0.0000 10.333 0.53 9.75 -9.22 0 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8637 0.1363 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr15 38484605 AGGTGGTGGT A 0.136711 0.100 1 -9 2 429 159 270 80 0 28 0 51 1 0 266 0 3 0.5031 0.0037 0.0148 4.679 0.91 8.18 -7.26 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8655 0.1339 0.0007 1 0 0.8591 0.1401 0.0008 1 0 0.8498 0.1492 0.0010
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 467 154 313 73 0 4 1 76 0 0 312 0 1 0.4740 0.0000 0.0032 37.500 0.82 2.18 -1.36 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1338 0.6878 0.1784 1 1 0.1418 0.6762 0.1820 1 1 0.1526 0.6612 0.1863
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 509 165 344 148 0 11 1 5 0 0 344 0 0 0.8970 0.0000 0.0000 14.000 0.39 5.40 -5.01 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 0 0.8360 0.1640 0.0000 0 0 0.9807 0.0193 0.0000
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.100 1 4 1 254 92 162 86 0 3 0 3 0 0 161 0 1 0.9348 0.0000 0.0062 29.667 0.24 4.00 -3.76 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0891 0.9109 0.0000 0 0 0.9019 0.0981 0.0000 0 0 0.9779 0.0221 0.0000
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 274 145 129 80 0 1 0 64 0 0 127 0 2 0.5517 0.0000 0.0155 144.000 0.35 3.25 -2.90 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4287 0.5330 0.0383 1 1 0.4270 0.5305 0.0425 1 1 0.4237 0.5277 0.0485
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 495 119 376 11 0 15 3 90 0 0 374 0 2 0.0924 0.0000 0.0053 6.933 1.36 3.72 -2.36 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.8895 0.1105
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 696 135 561 69 0 8 0 58 0 0 554 1 6 0.5111 0.0000 0.0125 15.875 1.91 5.28 -3.36 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4324 0.5637 0.0039 1 1 0.4406 0.5553 0.0041 1 1 0.4507 0.5450 0.0043
chr15 83982688 CAGCGAAGCCAAT C 0.000878 0.100 1 -12 1 707 158 549 150 0 5 0 3 0 0 549 0 0 0.9494 0.0000 0.0000 30.600 0.13 12.00 -11.87 36 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 399 145 254 74 0 2 0 69 0 0 253 0 1 0.5103 0.0000 0.0039 71.500 0.38 3.42 -3.04 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3245 0.6174 0.0581 1 1 0.3315 0.6072 0.0613 1 1 0.3402 0.5944 0.0654
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 925 246 679 73 4 29 3 137 0 0 679 0 0 0.2967 0.0000 0.0000 7.483 1.30 6.42 -5.12 15 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0079 0.9921 1 2 0.0000 0.0092 0.9908 1 2 0.0000 0.0115 0.9885
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 360 116 244 99 0 7 0 10 0 0 242 0 2 0.8534 0.0000 0.0082 15.571 0.48 6.60 -6.12 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 41 19 22 8 0 0 0 11 0 0 22 0 0 0.4211 0.0000 0.0000 19.000 0.12 1.73 -1.60 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3076 0.5613 0.1311 1 1 0.3117 0.5585 0.1298 1 1 0.3171 0.5548 0.1281
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 261 77 184 0 0 1 0 76 0 1 180 0 3 0.0000 0.0000 0.0217 76.000 14.39 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5897 0.4103 2 2 0.0000 0.3569 0.6431 2 2 0.0000 0.2929 0.7071
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 996 200 796 101 2 1 0 96 1 0 795 0 0 0.5050 0.0013 0.0013 199.000 0.65 1.60 -0.95 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3867 0.5921 0.0212 1 1 0.3962 0.5807 0.0231 1 1 0.4076 0.5666 0.0258
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 437 105 332 0 0 1 3 101 0 0 332 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 102.000 7.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 437 105 332 0 0 1 3 101 0 0 332 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 102.000 7.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2762818 TCAC T 0.000012 0.100 1 -3 2 602 145 457 130 2 8 0 5 0 0 457 0 0 0.8966 0.0000 0.0000 17.125 0.90 3.00 -2.10 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 427 110 317 50 0 6 0 54 0 0 313 0 4 0.4545 0.0000 0.0126 17.333 0.22 3.20 -2.98 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0543 0.5262 0.4196 1 1 0.0578 0.5220 0.4202 1 1 0.0627 0.5170 0.4204
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 1309 297 1012 124 1 75 0 97 0 0 1001 0 11 0.4175 0.0000 0.0109 2.960 1.23 4.40 -3.17 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6119 0.3863 0.0018 1 0 0.6168 0.3811 0.0021 1 0 0.6220 0.3756 0.0025
chr16 11927631 AGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCAGACACTCGGGAGGTGTCTTGAGATTATCATCC A 0.000767 0.100 1 -57 2 1295 700 595 524 4 122 1 49 0 0 589 0 6 0.7486 0.0000 0.0101 4.721 1.19 0.82 0.37 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0612 0.9388 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 155 44 111 0 0 0 0 44 0 0 111 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 44.000 2.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr16 14240621 TCA T 0.003870 0.100 1 -2 1 381 97 284 87 1 4 0 5 0 0 283 0 1 0.8969 0.0000 0.0035 23.250 0.18 2.00 -1.82 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0361 0.9639 0.0000 0 0 0.9724 0.0276 0.0000 0 0 0.9975 0.0025 0.0000
chr16 15363750 GGAGCTGAGGGTGGAAGGGGAGTGAGCAGACACTCGGCAGGTGTCTTGAGATTATCATCCGCTGAGGGTA G 0.001881 0.100 1 -69 1 1657 627 1030 381 61 76 20 89 1 2 1023 4 0 0.6077 0.0010 0.0068 7.120 0.91 1.78 -0.87 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr16 18543716 GA G 0.002566 0.100 1 -1 1 345 149 196 91 2 2 0 54 0 0 196 0 0 0.6107 0.0000 0.0000 73.500 0.08 1.22 -1.15 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9586 0.0414 0.0000 1 0 0.9546 0.0454 0.0000 1 0 0.9488 0.0512 0.0000
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.100 1 -1 1 328 195 133 87 0 1 1 106 0 0 132 1 0 0.4462 0.0000 0.0075 194.000 0.31 1.30 -0.99 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0347 0.7739 0.1914 1 1 0.0403 0.7706 0.1892 1 1 0.0487 0.7659 0.1854
chr16 23068920 AGAG A 0.000823 0.100 1 -3 2 786 170 616 147 1 10 0 12 0 0 616 0 0 0.8647 0.0000 0.0000 15.900 0.32 3.00 -2.68 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8474 0.1526 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr16 23149100 A AGAGGAGGGC 0.000809 0.100 1 9 1 378 106 272 82 0 21 0 3 4 0 268 0 0 0.7736 0.0147 0.0147 4.048 0.63 6.33 -5.70 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9921 0.0079 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr16 28593494 G GT 0.000605 0.100 1 1 3 481 147 334 75 1 2 1 68 0 0 334 0 0 0.5102 0.0000 0.0000 72.500 0.13 1.26 -1.13 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4955 0.5044 0.0001 1 0 0.5023 0.4976 0.0001 1 0 0.5104 0.4895 0.0001
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.100 1 3 1 620 164 456 152 0 8 0 4 0 0 456 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 19.500 0.23 1.50 -1.27 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3222 0.6778 0.0000 0 0 0.9766 0.0234 0.0000 0 0 0.9945 0.0055 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 150 72 78 37 0 6 1 28 0 0 77 0 1 0.5139 0.0000 0.0128 10.833 0.11 2.07 -1.96 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3873 0.5213 0.0914 1 1 0.3846 0.5194 0.0960 1 1 0.3807 0.5170 0.1023
chr16 58543411 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 459 90 369 56 8 6 5 15 0 0 369 0 0 0.6222 0.0000 0.0000 13.000 1.07 1.53 -0.46 20 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9190 0.0808 0.0001 0 1 0.3784 0.6215 0.0001 0 1 0.0247 0.9753 0.0000
chr16 60358911 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 1242 296 946 258 5 9 0 24 3 5 938 0 0 0.8716 0.0032 0.0085 31.778 0.68 1.96 -1.28 112 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0986 0.9014 0.0000
chr16 67842902 ACAGCAGCAGCAGCAGCAACAG A 0.500000 0.100 1 -21 2 1151 380 771 186 22 54 28 90 0 0 771 0 0 0.4895 0.0000 0.0000 6.038 0.66 12.86 -12.20 66 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9989 0.0011 0.0000 1 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1137 336 801 138 4 51 4 139 0 0 801 0 0 0.4107 0.0000 0.0000 5.588 0.30 10.39 -10.08 46 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0899 0.8005 0.1095 1 1 0.0982 0.7832 0.1186 1 1 0.1093 0.7599 0.1308
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 115 65 50 8 0 0 0 57 0 0 49 0 1 0.1231 0.0000 0.0200 65.000 0.00 4.18 -4.18 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9964 0.0036 2 1 0.0000 0.9106 0.0894
chr16 72797458 C CTTG 0.500000 0.100 1 3 1 749 174 575 8 3 37 4 122 0 0 568 2 5 0.0460 0.0000 0.0122 3.703 0.12 3.18 -3.06 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9932 0.0068 2 1 0.0000 0.6404 0.3596
chr16 72797458 CTTGTTGTTGTTG C 0.500000 0.100 1 -12 1 755 188 567 154 0 31 0 3 0 0 566 0 1 0.8191 0.0000 0.0018 5.065 2.71 12.00 -9.29 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2610 0.7390 0.0000 0 0 0.9687 0.0313 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000
chr16 81035884 AGGC A 0.500000 0.100 1 -3 2 273 82 191 73 0 4 0 5 0 0 191 0 0 0.8902 0.0000 0.0000 19.500 0.81 4.00 -3.19 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1575 0.8425 0.0000 0 0 0.5826 0.4174 0.0000
chr16 85656394 CGAGCGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 469 102 367 84 1 16 0 1 0 0 367 0 0 0.8235 0.0000 0.0000 5.667 0.70 6.00 -5.30 44 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8817 0.1183 0.0000 0 0 0.9563 0.0437 0.0000 0 0 0.9676 0.0324 0.0000
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 392 99 293 30 3 21 2 43 0 0 291 0 2 0.3030 0.0000 0.0068 3.714 0.30 3.67 -3.37 6 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0354 0.4130 0.5516 1 2 0.0388 0.4171 0.5441 1 2 0.0438 0.4226 0.5336
chr16 87604287 C CCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 12 1 392 99 293 68 3 21 0 7 0 0 291 1 1 0.6869 0.0000 0.0068 3.714 1.96 7.57 -5.62 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 1 0.1386 0.8614 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 703 154 549 76 0 5 5 68 0 0 543 2 4 0.4935 0.0000 0.0109 37.250 0.43 8.10 -7.67 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1302 0.6763 0.1935 1 1 0.1364 0.6640 0.1997 1 1 0.1445 0.6482 0.2073
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 698 150 548 76 0 6 4 64 0 0 543 1 4 0.5067 0.0000 0.0091 24.000 0.39 8.22 -7.82 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2140 0.6655 0.1205 1 1 0.2197 0.6538 0.1265 1 1 0.2268 0.6388 0.1344
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 696 146 550 74 1 3 0 68 0 1 541 3 5 0.5068 0.0000 0.0164 71.500 0.41 8.24 -7.83 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1620 0.6772 0.1608 1 1 0.1682 0.6648 0.1670 1 1 0.1761 0.6489 0.1750
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 800 153 647 87 0 4 0 62 0 0 644 0 3 0.5686 0.0000 0.0046 37.250 0.61 7.27 -6.66 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6730 0.3185 0.0085 1 0 0.6659 0.3242 0.0099 1 0 0.6555 0.3323 0.0122
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 578 137 441 127 2 1 0 7 0 0 441 0 0 0.9270 0.0000 0.0000 135.000 0.95 3.14 -2.19 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2655 0.7345 0.0000 0 0 0.8531 0.1469 0.0000
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.100 1 6 2 770 186 584 94 0 17 0 75 0 0 579 0 5 0.5054 0.0000 0.0086 9.941 0.34 5.80 -5.46 48 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4475 0.5246 0.0279 1 1 0.4487 0.5202 0.0311 1 1 0.4490 0.5151 0.0359
chr16 88733964 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 960 259 701 114 8 43 1 93 0 0 700 1 0 0.4402 0.0000 0.0014 4.953 2.61 3.26 -0.64 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7006 0.2956 0.0038 1 0 0.6957 0.2997 0.0046 1 0 0.6880 0.3061 0.0059
chr16 88733987 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 956 257 699 136 6 16 1 98 0 0 699 0 0 0.5292 0.0000 0.0000 15.800 2.37 3.45 -1.08 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9085 0.0912 0.0002 1 0 0.9023 0.0974 0.0003 1 0 0.8930 0.1066 0.0005
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 130 53 77 30 0 1 1 21 0 0 76 0 1 0.5660 0.0000 0.0130 52.000 0.23 3.67 -3.43 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3930 0.5090 0.0980 1 1 0.3895 0.5080 0.1025 1 1 0.3845 0.5069 0.1086
chr17 3240728 CAG C 0.002492 0.100 1 -2 1 764 253 511 169 0 7 0 77 0 0 509 0 2 0.6680 0.0000 0.0039 35.143 0.28 2.77 -2.49 109 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9995 0.0005 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 1 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 825 176 649 88 66 14 0 8 0 0 649 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 13.500 0.35 3.62 -3.27 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 0 0.9814 0.0186 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 846 248 598 86 10 53 3 96 1 0 594 0 3 0.3468 0.0017 0.0067 3.679 0.20 3.14 -2.94 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0538 0.6737 0.2725 1 1 0.0578 0.6602 0.2820 1 1 0.0633 0.6429 0.2938
chr17 7743278 CT C 0.003519 0.100 1 -1 1 522 153 369 78 5 10 1 59 0 0 368 0 1 0.5098 0.0000 0.0027 14.300 0.50 1.59 -1.09 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8065 0.1934 0.0000 1 0 0.8019 0.1981 0.0000 1 0 0.7952 0.2048 0.0001
chr17 7846859 TACCACCACC T 0.027442 0.100 1 -9 2 1342 425 917 201 1 77 3 143 0 0 913 0 4 0.4729 0.0000 0.0044 4.494 3.77 9.42 -5.65 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9680 0.0320 0.0000 1 0 0.9658 0.0342 0.0000 1 0 0.9624 0.0376 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 441 116 325 51 0 13 0 52 0 0 325 0 0 0.4397 0.0000 0.0000 7.923 0.92 7.25 -6.33 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1701 0.6225 0.2074 1 1 0.1749 0.6136 0.2116 1 1 0.1810 0.6022 0.2168
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 523 207 316 0 0 28 11 168 0 0 310 3 3 0.0000 0.0000 0.0190 6.393 3.26 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 888 248 640 27 3 28 107 83 0 0 638 1 1 0.1089 0.0000 0.0031 5.167 0.48 4.40 -3.92 9 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 885 246 639 24 24 114 10 74 0 0 638 0 1 0.0976 0.0000 0.0016 1.310 0.46 4.00 -3.54 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0018 0.1467 0.8516 1 2 0.0022 0.1558 0.8420 1 2 0.0030 0.1689 0.8281
chr17 18488977 A ACGGTGC 0.500000 0.100 1 6 2 139 79 60 69 0 3 0 7 0 0 59 0 1 0.8734 0.0000 0.0167 25.333 0.30 5.14 -4.84 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0062 0.9938 0.0000 0 1 0.1435 0.8565 0.0000
chr17 18673034 G GCGCCGCCGC 0.500000 0.100 1 9 3 695 186 509 130 1 49 0 6 8 0 500 1 0 0.6989 0.0157 0.0177 2.776 1.41 9.33 -7.93 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.5666 0.4334 0.0000 0 0 0.9337 0.0663 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 803 195 608 93 0 1 0 101 0 0 608 0 0 0.4769 0.0000 0.0000 194.000 0.39 3.86 -3.47 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0577 0.6605 0.2818 1 1 0.0628 0.6487 0.2885 1 1 0.0699 0.6337 0.2963
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 295 117 178 51 1 24 0 41 0 0 171 0 7 0.4359 0.0000 0.0393 3.875 0.22 9.05 -8.83 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2740 0.6020 0.1240 1 1 0.2765 0.5945 0.1291 1 1 0.2793 0.5849 0.1358
chr17 21535325 A AT 0.500000 0.100 1 1 1 321 125 196 65 0 2 0 58 0 0 196 0 0 0.5200 0.0000 0.0000 61.500 0.31 1.09 -0.78 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3251 0.5938 0.0812 1 1 0.3272 0.5866 0.0862 1 1 0.3294 0.5775 0.0931
chr17 29761226 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 145 68 77 34 1 2 0 31 0 0 77 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 33.000 0.06 1.32 -1.26 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3019 0.5615 0.1367 1 1 0.3021 0.5568 0.1410 1 1 0.3022 0.5510 0.1469
chr17 29969182 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 576 126 450 69 0 7 0 50 0 0 449 0 1 0.5476 0.0000 0.0022 17.000 0.32 2.80 -2.48 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6123 0.3704 0.0173 1 0 0.6052 0.3752 0.0196 1 0 0.5950 0.3819 0.0231
chr17 35745217 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 730 140 590 129 0 2 0 9 0 0 589 0 1 0.9214 0.0000 0.0017 69.000 0.40 3.11 -2.71 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0147 0.9853 0.0000 0 1 0.4605 0.5395 0.0000
chr17 40818947 AGCCGCCGCTGGAACTGCCGCCGTG A 0.500000 0.100 1 -24 1 864 199 665 98 2 25 2 72 0 0 662 0 3 0.4925 0.0000 0.0045 6.880 2.03 17.50 -15.47 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6777 0.3158 0.0065 1 0 0.6716 0.3207 0.0077 1 0 0.6624 0.3279 0.0097
chr17 41026898 G GCAGCAGCTTGGCTGACAGCAGCTGGTCTCA 0.500000 0.100 1 30 2 818 197 621 105 2 15 1 74 0 0 597 0 24 0.5330 0.0000 0.0386 12.000 0.68 1.19 -0.51 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2716 0.6728 0.0556 1 1 0.2790 0.6603 0.0608 1 1 0.2878 0.6443 0.0679
chr17 41041248 GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCACAGCAGCGTGGCTGGCAGGAGCTGGTCTCACAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGAGCCGCAGGTCCCACTGGTGGAGCAGCTGGGAAATCCACAGAAGCTGGTCTGA G 0.500000 0.100 1 -138 2 850 322 528 261 0 13 2 46 0 0 528 0 0 0.8106 0.0000 0.0000 23.692 1.43 3.02 -1.59 107 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 595 151 444 11 6 4 0 130 0 0 444 0 0 0.0728 0.0000 0.0000 36.750 0.45 1.85 -1.39 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9804 0.0196
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 549 135 414 63 0 6 0 66 0 0 413 0 1 0.4667 0.0000 0.0024 21.500 0.63 1.30 -0.67 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1132 0.6367 0.2501 1 1 0.1188 0.6267 0.2545 1 1 0.1262 0.6141 0.2597
chr17 41140276 TGACAGCAGCTGG T 0.500000 0.100 1 -12 1 782 145 637 64 0 23 3 55 0 1 629 0 7 0.4414 0.0000 0.0126 5.261 1.75 11.11 -9.36 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1784 0.6533 0.1683 1 1 0.1839 0.6423 0.1738 1 1 0.1908 0.6284 0.1809
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 574 134 440 0 0 19 1 114 0 0 420 1 19 0.0000 0.0000 0.0455 6.000 9.46 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 628 209 419 169 1 33 0 6 0 0 418 0 1 0.8086 0.0000 0.0024 5.333 0.28 9.17 -8.88 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 0 0.7389 0.2611 0.0000 0 0 0.9772 0.0228 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 697 203 494 143 2 41 2 15 0 0 494 0 0 0.7044 0.0000 0.0000 3.951 0.65 4.13 -3.48 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0206 0.9794 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 239 76 163 26 0 4 0 46 0 0 163 0 0 0.3421 0.0000 0.0000 18.000 0.15 4.54 -4.39 0 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0134 0.2779 0.7087 1 2 0.0154 0.2874 0.6972 1 2 0.0184 0.3003 0.6812
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 429 113 316 87 2 17 0 7 0 0 315 0 1 0.7699 0.0000 0.0032 5.647 0.29 6.14 -5.86 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0168 0.9832 0.0000 0 1 0.3068 0.6932 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 977 258 719 12 0 12 1 233 0 0 708 0 11 0.0465 0.0000 0.0153 20.500 0.00 3.03 -3.03 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.6320 0.3680 2 2 0.0000 0.0150 0.9850
chr17 58156083 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 319 67 252 63 0 1 0 3 0 0 252 0 0 0.9403 0.0000 0.0000 66.000 0.41 1.67 -1.25 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0313 0.9687 0.0000 0 1 0.4892 0.5108 0.0000 0 0 0.7564 0.2436 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 411 139 272 6 0 28 0 105 0 0 272 0 0 0.0432 0.0000 0.0000 3.964 1.17 5.57 -4.40 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.7580 0.2420 2 2 0.0000 0.2236 0.7764
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 320 64 256 33 2 3 0 26 2 0 253 0 1 0.5156 0.0078 0.0117 20.333 0.36 7.04 -6.67 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4634 0.4723 0.0643 1 1 0.4579 0.4735 0.0686 1 1 0.4502 0.4752 0.0746
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.100 1 -2 3 324 93 231 54 0 0 0 39 0 0 231 0 0 0.5806 0.0000 0.0000 93.000 0.04 3.36 -3.32 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5667 0.4043 0.0290 1 0 0.5595 0.4085 0.0321 1 0 0.5492 0.4141 0.0366
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.100 1 -4 3 205 63 142 59 1 1 0 2 0 0 142 0 0 0.9365 0.0000 0.0000 61.000 0.69 2.50 -1.81 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2019 0.7981 0.0000 0 0 0.7036 0.2964 0.0000 0 0 0.8353 0.1647 0.0000
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 123 49 74 47 0 0 0 2 0 0 74 0 0 0.9592 0.0000 0.0000 49.000 0.06 1.00 -0.94 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1183 0.8817 0.0000 0 0 0.5560 0.4440 0.0000 0 0 0.7309 0.2691 0.0000
chr17 74367718 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 273 83 190 78 0 2 0 3 0 0 190 0 0 0.9398 0.0000 0.0000 40.500 0.33 2.00 -1.67 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0649 0.9351 0.0000 0 0 0.6695 0.3305 0.0000 0 0 0.8654 0.1346 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 564 116 448 0 0 14 0 102 0 0 429 1 18 0.0000 0.0000 0.0424 7.286 7.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0028 0.9972
chr17 75239519 G GGGT 0.500000 0.100 1 3 4 694 187 507 164 1 13 0 9 0 0 507 0 0 0.8770 0.0000 0.0000 13.385 0.36 3.11 -2.75 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2074 0.7926 0.0000 0 0 0.9030 0.0970 0.0000
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 2 552 188 364 167 0 1 0 20 0 0 364 0 0 0.8883 0.0000 0.0000 187.000 0.32 2.40 -2.08 77 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0087 0.9913 0.0000
chr17 76072446 T TGCCGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 12 1 558 229 329 112 0 49 0 68 0 0 325 0 4 0.4891 0.0000 0.0122 3.673 0.69 7.84 -7.15 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9142 0.0855 0.0003 1 0 0.9072 0.0924 0.0004 1 0 0.8968 0.1026 0.0007
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2228 483 1745 8 3 69 9 394 1 1 1719 5 19 0.0166 0.0006 0.0149 6.000 5.12 6.21 -1.08 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5412 0.4588 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2151 558 1593 0 0 35 7 516 0 0 1435 18 140 0.0000 0.0000 0.0992 14.914 4.60 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 994 177 817 156 0 9 0 12 0 0 817 0 0 0.8814 0.0000 0.0000 18.667 0.62 6.08 -5.47 78 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 1 0.4673 0.5327 0.0000
chr17 81653293 GTTCCAGGT G 0.500000 0.100 1 -8 2 284 98 186 48 0 5 0 45 0 0 186 0 0 0.4898 0.0000 0.0000 18.600 0.19 7.84 -7.66 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2567 0.6017 0.1416 1 1 0.2594 0.5942 0.1464 1 1 0.2625 0.5847 0.1528
chr17 81672586 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 422 127 295 112 0 12 0 3 0 0 295 0 0 0.8819 0.0000 0.0000 9.583 0.16 3.33 -3.17 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2772 0.7228 0.0000 0 0 0.9168 0.0832 0.0000 0 0 0.9710 0.0290 0.0000
chr18 48226 ATG A 0.000609 0.100 1 -2 2 1257 288 969 247 0 2 0 39 0 0 969 0 0 0.8576 0.0000 0.0000 143.000 1.52 2.36 -0.84 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0036 0.9964 0.0000
chr18 13049812 GA G 0.001808 0.100 1 -1 1 384 110 274 56 0 2 4 48 0 0 272 1 1 0.5091 0.0000 0.0073 53.000 0.59 4.17 -3.58 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4418 0.5578 0.0004 1 1 0.4488 0.5507 0.0005 1 1 0.4575 0.5420 0.0005
chr18 13049814 GCA G 0.001808 0.100 1 -2 1 381 108 273 56 0 1 2 49 0 0 271 1 1 0.5185 0.0000 0.0073 107.000 0.59 4.08 -3.49 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4346 0.5650 0.0005 1 1 0.4419 0.5576 0.0005 1 1 0.4510 0.5485 0.0005
chr18 21452083 GCGATGACCTAGA G 0.000946 0.100 1 -12 2 226 85 141 78 0 0 0 7 0 0 140 0 1 0.9176 0.0000 0.0071 85.000 0.21 8.86 -8.65 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.9123 0.0877 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 202 97 105 46 0 5 0 46 0 0 103 0 2 0.4742 0.0000 0.0190 18.400 0.09 3.13 -3.04 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0001 0.5653 0.4346 1 1 0.0001 0.5586 0.4413 1 1 0.0001 0.5503 0.4496
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 107 45 62 40 0 1 0 4 0 0 62 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 44.000 0.47 3.25 -2.77 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.0944 0.9056 0.0000 0 1 0.3484 0.6516 0.0000
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -9 2 529 148 381 124 0 12 0 12 0 0 381 0 0 0.8378 0.0000 0.0000 11.333 1.60 8.58 -6.98 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.1565 0.8435 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 270 150 120 0 0 3 1 146 0 0 120 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 49.000 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 860 234 626 138 0 7 0 89 0 0 620 0 6 0.5897 0.0000 0.0096 32.429 0.45 14.38 -13.93 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9186 0.0812 0.0002 1 0 0.9125 0.0872 0.0003 1 0 0.9034 0.0962 0.0004
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 410 77 333 25 1 18 0 33 1 0 332 0 0 0.3247 0.0030 0.0030 3.278 3.84 4.97 -1.13 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1092 0.5316 0.3592 1 1 0.1137 0.5290 0.3572 1 1 0.1198 0.5259 0.3543
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 149 64 85 0 0 1 0 63 0 0 84 0 1 0.0000 0.0000 0.0118 63.000 3.48 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0369 0.9631 2 2 0.0000 0.0393 0.9607 2 2 0.0000 0.0429 0.9571
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 141 75 66 39 0 3 0 33 0 0 62 0 4 0.5200 0.0000 0.0606 24.000 0.00 3.09 -3.09 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2467 0.5874 0.1659 1 1 0.2490 0.5809 0.1701 1 1 0.2518 0.5727 0.1755
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 436 192 244 59 3 14 6 110 0 2 242 0 0 0.3073 0.0000 0.0082 14.667 3.36 5.78 -2.43 23 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0612 0.9386 1 2 0.0002 0.0692 0.9306 1 2 0.0003 0.0814 0.9183
chr19 621458 G GGCAGGT 0.002400 0.100 1 6 1 724 179 545 102 0 8 0 69 1 0 539 0 5 0.5698 0.0018 0.0110 21.375 0.86 5.77 -4.91 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8814 0.1186 0.0000 1 0 0.8765 0.1234 0.0000 1 0 0.8695 0.1305 0.0000
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.100 1 3 1 248 107 141 1 47 14 2 43 0 0 140 1 0 0.0093 0.0000 0.0071 5.222 0.00 3.00 -3.00 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2479 0.7436 0.0085 1 1 0.2586 0.7331 0.0084 1 1 0.2726 0.7192 0.0082
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 170 52 118 27 1 2 0 22 0 0 117 0 1 0.5192 0.0000 0.0085 25.000 1.04 4.00 -2.96 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4661 0.4803 0.0536 1 1 0.4652 0.4793 0.0555 1 1 0.4637 0.4781 0.0581
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 289 159 130 141 0 4 0 14 0 0 130 0 0 0.8868 0.0000 0.0000 38.750 0.19 3.36 -3.17 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2901 0.7099 0.0000
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 330 97 233 1 0 8 49 39 0 0 225 7 1 0.0103 0.0000 0.0343 11.125 2.00 4.05 -2.05 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0734 0.9266 2 2 0.0000 0.0268 0.9732 2 2 0.0000 0.0203 0.9797
chr19 2015541 GGGCGGCGGC G 0.046318 0.100 1 -9 4 330 104 226 37 8 8 2 49 0 0 217 0 9 0.3558 0.0000 0.0398 13.714 3.14 10.41 -7.27 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0977 0.7992 0.1031 1 1 0.1070 0.7928 0.1002 1 1 0.1201 0.7837 0.0962
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 330 112 218 46 3 9 1 53 0 0 216 0 2 0.4107 0.0000 0.0092 11.444 3.46 9.70 -6.24 18 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1631 0.6762 0.1607 1 1 0.1719 0.6675 0.1606 1 1 0.1837 0.6562 0.1600
chr19 2917765 CAT C 0.000052 0.100 1 -2 2 1022 216 806 206 0 3 0 7 1 0 805 0 0 0.9537 0.0012 0.0012 106.500 0.56 4.00 -3.44 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9927 0.0073 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 4422718 GGAGAAGGAT G 0.000030 0.100 1 -9 3 212 76 136 45 0 6 0 25 0 0 135 0 1 0.5921 0.0000 0.0074 11.667 0.24 7.96 -7.72 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8227 0.1773 0.0000 1 0 0.8159 0.1841 0.0000 1 0 0.8063 0.1937 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 439 129 310 64 1 4 0 60 3 0 307 0 0 0.4961 0.0097 0.0097 31.250 1.44 3.23 -1.80 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5015 0.4845 0.0140 1 0 0.5052 0.4799 0.0149 1 0 0.5093 0.4744 0.0163
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 568 149 419 79 0 8 1 61 0 0 416 0 3 0.5302 0.0000 0.0072 17.625 1.19 11.30 -10.11 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5746 0.4106 0.0148 1 0 0.5736 0.4100 0.0164 1 0 0.5714 0.4098 0.0188
chr19 8971789 GGTGTGAAGGTTAACGTCT G 0.002451 0.100 1 -18 1 379 101 278 55 0 6 0 40 0 0 277 0 1 0.5446 0.0000 0.0036 15.833 0.78 16.32 -15.54 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7138 0.2861 0.0001 1 0 0.7101 0.2898 0.0001 1 0 0.7048 0.2951 0.0001
chr19 8979162 A AGCC 0.002510 0.100 1 3 1 682 142 540 65 0 4 2 71 1 0 539 0 0 0.4577 0.0019 0.0019 34.500 0.34 3.13 -2.79 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2018 0.7962 0.0020 1 1 0.2147 0.7832 0.0020 1 1 0.2320 0.7659 0.0020
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 267 73 194 0 0 5 0 68 0 0 191 0 3 0.0000 0.0000 0.0155 13.600 5.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0540 0.9460 2 2 0.0000 0.0578 0.9422 2 2 0.0000 0.0636 0.9364
chr19 9126240 AG A 0.056196 0.100 1 -1 5 360 86 274 50 0 1 0 35 0 0 274 0 0 0.5814 0.0000 0.0000 85.000 1.06 2.03 -0.97 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7318 0.2660 0.0022 1 0 0.7265 0.2710 0.0025 1 0 0.7191 0.2781 0.0029
chr19 11447525 A AGAG 0.036742 0.100 1 3 1 865 294 571 12 117 55 0 110 0 4 560 0 7 0.0408 0.0000 0.0193 4.345 0.50 3.26 -2.76 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5757 0.4234 0.0010 1 0 0.5834 0.4155 0.0011 1 0 0.5921 0.4066 0.0013
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 867 303 564 131 2 52 8 110 0 0 560 1 3 0.4323 0.0000 0.0071 4.827 2.71 3.42 -0.71 43 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3495 0.6297 0.0209 1 1 0.3606 0.6160 0.0234 1 1 0.3739 0.5990 0.0270
chr19 13207858 CCTG C 0.175850 0.100 1 -3 1 461 148 313 0 0 30 70 48 0 0 305 3 5 0.0000 0.0000 0.0256 3.933 3.46 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0076 0.9924 2 2 0.0000 0.0086 0.9914 2 2 0.0000 0.0103 0.9897
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 461 153 308 2 2 79 0 70 0 1 303 0 4 0.0131 0.0000 0.0162 0.935 1.00 8.37 -7.37 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8748 0.1252 2 2 0.0000 0.4223 0.5777 2 2 0.0000 0.2502 0.7498
chr19 13207858 CCTGCTGCTG C 0.002693 0.100 1 -9 1 461 153 308 51 6 23 14 59 0 1 302 0 5 0.3333 0.0000 0.0195 5.652 2.67 8.78 -6.11 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0629 0.9274 0.0098 1 1 0.0709 0.9197 0.0094 1 1 0.0827 0.9084 0.0089
chr19 14089291 ATCT A 0.000555 0.100 1 -3 1 561 114 447 51 52 3 1 7 0 0 447 0 0 0.4474 0.0000 0.0000 54.000 0.84 6.43 -5.59 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 0 0.9811 0.0189 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr19 14089300 ATCT A 0.000426 0.100 1 -3 1 552 116 436 98 7 3 1 7 0 0 436 0 0 0.8448 0.0000 0.0000 37.000 1.35 6.57 -5.22 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0455 0.9545 0.0000 0 0 0.9935 0.0065 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.100 1 3 1 337 101 236 50 0 7 0 44 0 0 231 0 5 0.4950 0.0000 0.0212 13.429 0.14 3.20 -3.06 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3799 0.5983 0.0218 1 1 0.3873 0.5902 0.0224 1 1 0.3967 0.5801 0.0232
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 602 106 496 0 0 4 1 101 0 0 493 0 3 0.0000 0.0000 0.0060 25.500 3.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 17286678 GTGTGTGTGTGTGTT G 0.125300 0.100 1 -14 1 431 103 328 9 4 22 19 49 0 0 328 0 0 0.0874 0.0000 0.0000 3.667 0.33 7.53 -7.20 7 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9974 0.0026
chr19 17286686 GTGTGTT G 0.073608 0.100 1 -6 1 429 96 333 9 1 14 23 49 0 0 333 0 0 0.0938 0.0000 0.0000 6.231 0.33 6.86 -6.52 7 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9952 0.0048
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 570 122 448 0 0 5 1 116 0 0 413 7 28 0.0000 0.0000 0.0781 23.400 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 549 160 389 143 0 8 0 9 0 0 389 0 0 0.8938 0.0000 0.0000 19.000 0.16 3.00 -2.84 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4773 0.5227 0.0000 0 0 0.9710 0.0290 0.0000
chr19 21973234 C CTTA 0.000740 0.100 1 3 1 1556 350 1206 300 1 19 0 30 3 6 1195 0 2 0.8571 0.0025 0.0091 17.421 1.12 4.20 -3.08 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8486 0.1514 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 327 77 250 28 0 11 2 36 0 0 250 0 0 0.3636 0.0000 0.0000 5.909 0.43 3.14 -2.71 14 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0173 0.3787 0.6039 1 2 0.0186 0.3813 0.6001 1 2 0.0203 0.3850 0.5947
chr19 33379692 GACCTC G 0.005617 0.100 1 -5 1 510 134 376 74 0 5 1 54 0 0 375 0 1 0.5522 0.0000 0.0027 25.800 0.12 4.85 -4.73 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7578 0.2421 0.0001 1 0 0.7540 0.2459 0.0001 1 0 0.7483 0.2515 0.0002
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 661 158 503 0 1 7 0 150 0 0 495 0 8 0.0000 0.0000 0.0159 21.429 3.23 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 517 213 304 146 1 26 0 40 0 0 287 0 17 0.6854 0.0000 0.0559 7.480 7.50 24.50 -17.00 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9995 0.0005 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 1 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 513 175 338 10 8 64 1 92 0 0 336 2 0 0.0571 0.0000 0.0059 1.864 1.60 10.66 -9.06 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr19 35720452 AAAG A 0.001622 0.100 1 -3 1 814 177 637 159 1 10 0 7 0 0 637 0 0 0.8983 0.0000 0.0000 16.700 0.80 3.14 -2.34 89 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2771 0.7229 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 37886681 TTTC T 0.000877 0.100 1 -3 5 551 97 454 72 0 17 0 8 0 0 454 0 0 0.7423 0.0000 0.0000 4.706 2.01 4.62 -2.61 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.8926 0.1074 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000
chr19 37886746 TCCTTTCCTCCTCCTCCTC T 0.059111 0.100 1 -18 2 542 103 439 83 2 13 1 4 0 0 439 0 0 0.8058 0.0000 0.0000 6.846 1.19 10.00 -8.81 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1082 0.8918 0.0000 0 0 0.9227 0.0773 0.0000 0 0 0.9836 0.0164 0.0000
chr19 38304914 AAGG A 0.000867 0.100 1 -3 1 393 107 286 101 1 3 0 2 0 0 286 0 0 0.9439 0.0000 0.0000 34.667 0.38 6.00 -5.62 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 38304940 CAAG C 0.034026 0.100 1 -3 3 394 100 294 93 0 4 1 2 0 0 294 0 0 0.9300 0.0000 0.0000 24.000 0.23 6.00 -5.77 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8603 0.1397 0.0000 0 0 0.9925 0.0075 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 598 143 455 109 0 26 0 8 2 0 450 1 2 0.7622 0.0044 0.0110 4.500 0.45 12.50 -12.05 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0756 0.9244 0.0000 0 0 0.8334 0.1666 0.0000
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.100 1 3 1 134 59 75 43 4 8 0 4 0 0 75 0 0 0.7288 0.0000 0.0000 6.375 0.14 3.00 -2.86 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0469 0.9531 0.0000 0 0 0.8278 0.1722 0.0000 0 0 0.9606 0.0394 0.0000
chr19 39031033 CAG C 0.000389 0.100 1 -2 1 227 81 146 77 0 1 0 3 0 0 146 0 0 0.9506 0.0000 0.0000 80.000 0.16 2.67 -2.51 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9940 0.0060 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 426 129 297 60 0 2 4 63 0 0 292 2 3 0.4651 0.0000 0.0168 62.000 0.18 3.62 -3.44 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0764 0.6229 0.3007 1 1 0.0829 0.6173 0.2998 1 1 0.0921 0.6101 0.2979
chr19 39453392 AAAG A 0.000344 0.100 1 -3 1 81 30 51 26 1 1 0 2 0 0 51 0 0 0.8667 0.0000 0.0000 29.000 1.00 3.50 -2.50 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9926 0.0074 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 212 31 181 0 0 3 24 4 0 0 180 1 0 0.0000 0.0000 0.0055 8.667 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0612 0.9388 2 2 0.0000 0.0630 0.9370 2 2 0.0000 0.0654 0.9346
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 212 31 181 0 1 21 7 2 0 0 180 1 0 0.0000 0.0000 0.0055 0.500 1.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1475 0.8525 2 2 0.0000 0.1437 0.8562 2 2 0.0000 0.1407 0.8593
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 441 127 314 0 1 11 0 115 0 0 314 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.500 5.58 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 477 161 316 95 0 1 0 65 0 0 315 0 1 0.5901 0.0000 0.0032 160.000 0.37 1.82 -1.45 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8648 0.1345 0.0007 1 0 0.8585 0.1406 0.0009 1 0 0.8495 0.1494 0.0011
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.100 1 3 1 302 103 199 97 0 2 0 4 0 0 198 0 1 0.9417 0.0000 0.0050 50.500 0.93 4.25 -3.32 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0467 0.9533 0.0000 0 0 0.9354 0.0646 0.0000 0 0 0.9905 0.0095 0.0000
chr19 42225153 TGAG T 0.002643 0.100 1 -3 1 885 170 715 98 1 1 2 68 1 0 714 0 0 0.5765 0.0014 0.0014 169.000 0.45 3.06 -2.61 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8961 0.1039 0.0000 1 0 0.8911 0.1089 0.0000 1 0 0.8838 0.1162 0.0000
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.100 1 -1 1 523 144 379 93 0 1 0 50 0 0 378 0 1 0.6458 0.0000 0.0026 143.000 3.08 2.62 0.46 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9676 0.0324 0.0000 1 0 0.9640 0.0360 0.0000 1 0 0.9586 0.0414 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 341 102 239 95 0 0 0 7 0 0 239 0 0 0.9314 0.0000 0.0000 102.000 0.19 6.86 -6.67 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0855 0.9145 0.0000 0 0 0.6120 0.3880 0.0000
chr19 44273995 TCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTGAGGTATGTGATAAGGGCTTCAGTAAGGCCTCAAATCTTCAAGCCCATCAGAGAATC T 0.002701 0.100 1 -84 2 679 204 475 187 0 15 0 2 0 0 472 0 3 0.9167 0.0000 0.0063 12.600 0.36 6.00 -5.64 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9870 0.0130 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 494 128 366 70 0 7 1 50 0 0 366 0 0 0.5469 0.0000 0.0000 24.200 0.51 2.76 -2.25 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7384 0.2581 0.0035 1 0 0.7333 0.2628 0.0039 1 0 0.7258 0.2695 0.0047
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 313 118 195 63 0 3 0 52 0 0 194 0 1 0.5339 0.0000 0.0051 38.333 1.16 1.94 -0.78 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6000 0.3989 0.0012 1 0 0.6011 0.3977 0.0013 1 0 0.6019 0.3967 0.0014
chr19 45409231 CAAG C 0.234924 0.100 1 -3 2 560 114 446 92 3 14 2 3 0 1 444 1 0 0.8070 0.0000 0.0045 7.071 1.01 7.00 -5.99 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.4208 0.5792 0.0000 0 0 0.8822 0.1178 0.0000
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 853 287 566 140 0 48 0 99 0 0 556 0 10 0.4878 0.0000 0.0177 4.979 0.23 6.13 -5.90 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7671 0.2314 0.0015 1 0 0.7620 0.2360 0.0019 1 0 0.7542 0.2432 0.0026
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 339 125 214 91 0 32 0 2 0 0 213 0 1 0.7280 0.0000 0.0047 2.906 0.23 18.00 -17.77 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5273 0.4727 0.0000 0 0 0.9704 0.0296 0.0000 0 0 0.9903 0.0097 0.0000
chr19 46016106 TCGTCCCGGGAGCGCTCCG T 0.003109 0.100 1 -18 1 361 101 260 47 0 4 0 50 0 0 255 0 5 0.4653 0.0000 0.0192 24.250 0.17 17.22 -17.05 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2141 0.7827 0.0033 1 1 0.2258 0.7709 0.0032 1 1 0.2416 0.7552 0.0032
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 254 91 163 81 0 4 0 6 0 0 163 0 0 0.8901 0.0000 0.0000 21.750 0.51 2.00 -1.49 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.3165 0.6835 0.0000 0 0 0.8361 0.1639 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 1035 263 772 115 3 45 13 87 0 1 759 4 8 0.4373 0.0000 0.0168 4.955 1.11 3.52 -2.40 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2857 0.6752 0.0391 1 1 0.2960 0.6611 0.0429 1 1 0.3087 0.6430 0.0483
chr19 49196501 TGCTGCGGGGGCC T 0.003841 0.100 1 -12 2 422 129 293 76 0 5 1 47 0 0 289 0 4 0.5891 0.0000 0.0137 24.600 0.87 11.32 -10.45 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8543 0.1456 0.0000 1 0 0.8486 0.1514 0.0000 1 0 0.8404 0.1596 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 596 166 430 0 0 37 0 129 0 0 424 1 5 0.0000 0.0000 0.0140 3.486 7.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0025 0.9975
chr19 49908948 G GTGC 0.000984 0.100 1 3 2 876 216 660 107 2 13 4 90 1 0 659 0 0 0.4954 0.0015 0.0015 15.462 1.47 3.54 -2.08 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6457 0.3543 0.0000 1 0 0.6488 0.3511 0.0000 1 0 0.6519 0.3481 0.0000
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 739 155 584 2 1 6 72 74 0 0 570 4 10 0.0129 0.0000 0.0240 24.500 0.00 3.61 -3.61 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0316 0.9684 2 2 0.0000 0.0036 0.9964 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 740 163 577 2 0 9 75 77 0 1 573 0 3 0.0123 0.0000 0.0069 17.111 0.50 3.21 -2.71 2 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.2030 0.7970 2 2 0.0000 0.0182 0.9818 2 2 0.0000 0.0075 0.9925
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.100 1 6 2 616 132 484 72 0 7 0 53 0 0 479 0 5 0.5455 0.0000 0.0103 17.857 0.18 5.62 -5.44 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6760 0.3235 0.0006 1 0 0.6748 0.3246 0.0006 1 0 0.6725 0.3268 0.0007
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 595 178 417 83 0 6 10 79 0 0 415 0 2 0.4663 0.0000 0.0048 28.667 0.22 2.75 -2.53 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0430 0.6045 0.3525 1 1 0.0464 0.5944 0.3593 1 1 0.0510 0.5817 0.3672
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 228 100 128 96 0 1 0 3 0 0 127 0 1 0.9600 0.0000 0.0078 99.000 0.18 2.00 -1.82 78 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0071 0.9929 0.0000 0 1 0.3974 0.6026 0.0000 0 0 0.7573 0.2427 0.0000
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 500 138 362 21 0 8 0 109 0 0 362 0 0 0.1522 0.0000 0.0000 16.250 0.19 1.93 -1.74 17 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 586 138 448 19 0 2 0 117 0 0 444 0 4 0.1377 0.0000 0.0089 68.000 0.11 3.36 -3.25 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 977 248 729 0 0 1 1 246 0 0 728 0 1 0.0000 0.0000 0.0014 247.000 3.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 54217135 A AGAG 0.001307 0.100 1 3 2 1027 352 675 329 1 9 0 13 0 0 674 1 0 0.9347 0.0000 0.0015 38.000 0.55 6.31 -5.76 159 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 54217137 GTTC G 0.001135 0.100 1 -3 2 1030 357 673 342 0 2 0 13 0 0 671 1 1 0.9580 0.0000 0.0030 177.500 0.54 6.31 -5.77 156 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 673 185 488 15 0 10 2 158 0 0 487 0 1 0.0811 0.0000 0.0020 17.500 0.27 1.45 -1.18 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.7427 0.2573
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 813 167 646 0 0 6 0 161 0 0 636 0 10 0.0000 0.0000 0.0155 26.833 3.58 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.100 1 4 2 800 176 624 91 0 11 0 74 0 0 622 1 1 0.5170 0.0000 0.0032 15.000 0.30 4.05 -3.76 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6534 0.3455 0.0011 1 0 0.6544 0.3444 0.0012 1 0 0.6547 0.3439 0.0014
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 469 134 335 56 0 21 0 57 0 0 326 0 9 0.4179 0.0000 0.0269 5.381 0.41 7.42 -7.01 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0556 0.5432 0.4012 1 1 0.0599 0.5391 0.4010 1 1 0.0661 0.5340 0.3998
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 646 150 496 0 0 32 1 117 0 0 460 0 36 0.0000 0.0000 0.0726 3.656 19.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 55386752 A AT 0.003360 0.100 1 1 1 574 178 396 73 0 11 0 94 0 0 396 0 0 0.4101 0.0000 0.0000 15.182 0.29 1.12 -0.83 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0514 0.9374 0.0111 1 1 0.0589 0.9303 0.0108 1 1 0.0699 0.9196 0.0104
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 992 275 717 223 1 40 0 11 1 0 714 0 2 0.8109 0.0014 0.0042 5.875 0.73 4.27 -3.55 113 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1506 0.8494 0.0000 0 0 0.9692 0.0308 0.0000
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 519 112 407 0 0 5 1 106 0 0 399 0 8 0.0000 0.0000 0.0197 21.400 4.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 118 60 58 25 0 0 0 35 0 0 57 0 1 0.4167 0.0000 0.0172 60.000 0.20 7.09 -6.89 13 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0402 0.4104 0.5493 1 2 0.0433 0.4137 0.5430 1 2 0.0476 0.4182 0.5343
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.100 1 3 1 462 103 359 43 1 12 0 47 0 0 351 0 8 0.4175 0.0000 0.0223 8.182 1.12 4.36 -3.25 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1473 0.7535 0.0992 1 1 0.1575 0.7449 0.0976 1 1 0.1715 0.7333 0.0952
chr20 4699448 CCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCT C 0.009335 0.100 1 -24 4 867 264 603 25 0 19 0 220 0 0 603 0 0 0.0947 0.0000 0.0000 12.895 0.40 8.06 -7.66 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 19886698 CT C 0.002304 0.100 1 -1 1 129 55 74 35 0 0 0 20 0 0 73 0 1 0.6364 0.0000 0.0135 55.000 0.54 2.05 -1.51 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7522 0.2477 0.0001 1 0 0.7460 0.2539 0.0001 1 0 0.7374 0.2624 0.0001
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 269 117 152 104 0 1 0 12 1 0 151 0 0 0.8889 0.0066 0.0066 116.000 0.20 1.08 -0.88 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0441 0.9559 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 715 186 529 11 0 3 1 171 0 0 523 0 6 0.0591 0.0000 0.0113 61.000 0.64 6.40 -5.77 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9537 0.0463 2 2 0.0000 0.2019 0.7981
chr20 33663701 TGCGGCGGCAAGAGGC T 0.003375 0.100 1 -15 1 695 213 482 135 0 6 0 72 0 0 475 1 6 0.6338 0.0000 0.0145 34.500 0.48 13.79 -13.31 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9895 0.0105 0.0000 1 0 0.9880 0.0120 0.0000 1 0 0.9856 0.0144 0.0000
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 494 175 319 0 0 2 2 171 0 0 304 0 15 0.0000 0.0000 0.0470 86.500 3.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr20 35277779 C CGGGCTG 0.014046 0.100 1 6 1 476 164 312 51 2 43 0 68 0 0 312 0 0 0.3110 0.0000 0.0000 2.791 0.18 5.06 -4.88 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1025 0.8663 0.0312 1 1 0.1125 0.8571 0.0304 1 1 0.1267 0.8440 0.0293
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 611 153 458 83 2 4 0 64 0 0 458 0 0 0.5425 0.0000 0.0000 37.000 0.59 3.16 -2.57 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5899 0.3954 0.0147 1 0 0.5827 0.4002 0.0171 1 0 0.5722 0.4072 0.0207
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 985 295 690 1 1 32 10 251 0 0 688 1 1 0.0034 0.0000 0.0029 8.188 0.00 3.19 -3.19 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 577 274 303 4 3 33 120 114 0 0 301 1 1 0.0146 0.0000 0.0066 6.727 0.00 3.32 -3.32 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.5604 0.4396 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr20 47651119 GCAA G 0.005778 0.100 1 -3 1 576 269 307 16 3 12 106 132 0 0 307 0 0 0.0595 0.0000 0.0000 19.125 0.12 3.23 -3.10 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011
chr20 58854641 C CTGACGCCCCAGCCGATCCCGACTCCGGGGCGGCCCG 0.009401 0.100 1 36 4 725 132 593 56 4 13 3 56 0 1 592 0 0 0.4242 0.0000 0.0017 8.846 0.68 2.59 -1.91 14 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3890 0.6082 0.0028 1 1 0.3982 0.5990 0.0029 1 1 0.4096 0.5874 0.0030
chr20 59301498 AGAGACTGTGGCTGGCCCTGGCGAG A 0.000160 0.100 1 -24 2 357 128 229 99 0 27 0 2 0 0 229 0 0 0.7734 0.0000 0.0000 3.741 0.16 24.00 -23.84 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 222 29 193 1 0 3 1 24 0 0 188 0 5 0.0345 0.0000 0.0259 8.667 7.00 8.12 -1.12 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0113 0.9887 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0025 0.9975
chr20 62367030 GCCGCGCGCC G 0.002179 0.100 1 -9 1 160 67 93 44 0 1 0 22 0 0 93 0 0 0.6567 0.0000 0.0000 66.000 0.61 9.09 -8.48 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8647 0.1353 0.0000 1 0 0.8575 0.1425 0.0000 1 0 0.8474 0.1525 0.0000
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 291 129 162 6 0 2 0 121 0 0 161 0 1 0.0465 0.0000 0.0062 63.500 0.00 2.08 -2.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9979 0.0021 2 2 0.0000 0.3484 0.6516 2 2 0.0000 0.0480 0.9520
chr21 30746991 C CGGT 0.001132 0.100 1 3 1 300 115 185 107 0 2 0 6 0 0 185 0 0 0.9304 0.0000 0.0000 56.500 0.16 3.00 -2.84 79 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2499 0.7501 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr21 31559541 AC A 0.000554 0.100 1 -1 1 414 89 325 85 1 0 0 3 0 0 325 0 0 0.9551 0.0000 0.0000 89.000 0.56 1.00 -0.44 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9947 0.0053 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 731 193 538 80 0 5 0 108 0 0 537 0 1 0.4145 0.0000 0.0019 37.600 0.31 5.34 -5.03 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0024 0.2181 0.7795 1 2 0.0030 0.2250 0.7720 1 2 0.0039 0.2351 0.7610
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 766 208 558 179 3 18 0 8 3 0 554 1 0 0.8606 0.0054 0.0072 10.556 1.70 18.38 -16.68 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.7675 0.2325 0.0000 0 0 0.9899 0.0101 0.0000
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 232 107 125 5 0 5 0 97 0 0 122 0 3 0.0467 0.0000 0.0240 20.400 0.00 3.33 -3.33 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.5071 0.4929 2 2 0.0000 0.1252 0.8748
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 378 54 324 0 0 2 0 52 0 1 322 0 1 0.0000 0.0000 0.0062 52.000 2.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1124 190 934 100 5 4 6 75 0 1 928 2 3 0.5263 0.0000 0.0064 45.250 1.28 3.23 -1.95 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4959 0.4869 0.0173 1 0 0.4927 0.4873 0.0200 1 1 0.4873 0.4885 0.0242
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1126 194 932 100 7 6 11 70 0 0 928 1 3 0.5155 0.0000 0.0043 92.000 1.21 3.36 -2.15 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5610 0.4274 0.0115 1 0 0.5558 0.4306 0.0136 1 0 0.5477 0.4354 0.0168
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 582 107 475 48 3 8 0 48 0 0 467 0 8 0.4486 0.0000 0.0168 14.000 5.46 13.08 -7.63 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1001 0.5931 0.3068 1 1 0.1048 0.5857 0.3095 1 1 0.1111 0.5765 0.3124
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 367 151 216 8 2 11 1 129 0 0 207 3 6 0.0530 0.0000 0.0417 14.000 1.12 10.89 -9.77 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5272 0.4728 2 2 0.0000 0.0232 0.9768
chr21 45505235 A AGGCCCCCCC 0.016294 0.100 1 9 6 352 82 270 45 0 6 1 30 0 0 270 0 0 0.5488 0.0000 0.0000 12.667 0.62 7.23 -6.61 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7304 0.2689 0.0008 1 0 0.7253 0.2739 0.0008 1 0 0.7181 0.2809 0.0009
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.100 1 6 1 3433 1126 2307 908 2 33 0 183 0 0 2292 0 15 0.8064 0.0000 0.0065 33.121 0.19 6.08 -5.88 116 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 212 99 113 47 0 4 1 47 0 0 110 0 3 0.4747 0.0000 0.0265 23.750 0.15 2.94 -2.79 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2057 0.6507 0.1436 1 1 0.2136 0.6417 0.1447 1 1 0.2241 0.6302 0.1457
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 602 122 480 7 0 31 0 84 0 0 459 0 21 0.0574 0.0000 0.0437 2.935 0.29 15.11 -14.82 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.5596 0.4404 2 2 0.0000 0.0710 0.9290
chr22 27798924 T TTGC 0.004414 0.100 1 3 1 1097 292 805 211 7 51 0 23 0 0 805 0 0 0.7226 0.0000 0.0000 4.918 0.61 3.04 -2.43 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.7537 0.2463 0.0000
chr22 30372245 AAGG A 0.001181 0.100 1 -3 1 335 112 223 64 0 6 0 42 0 0 223 0 0 0.5714 0.0000 0.0000 17.667 0.30 3.14 -2.85 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8402 0.1598 0.0000 1 0 0.8340 0.1659 0.0000 1 0 0.8253 0.1746 0.0000
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 675 208 467 107 0 8 0 93 0 0 463 0 4 0.5144 0.0000 0.0086 25.000 0.50 2.24 -1.74 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3235 0.6345 0.0420 1 1 0.3301 0.6236 0.0463 1 1 0.3377 0.6100 0.0524
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 547 107 440 17 0 2 0 88 0 0 440 0 0 0.1589 0.0000 0.0000 52.500 0.53 12.49 -11.96 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9983 0.0017
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 377 211 166 188 0 18 0 5 0 0 165 0 1 0.8910 0.0000 0.0060 10.722 0.18 5.80 -5.62 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0433 0.9567 0.0000 0 0 0.9749 0.0251 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 336 127 209 113 0 6 0 8 0 0 208 0 1 0.8898 0.0000 0.0048 20.167 0.19 3.00 -2.81 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 1 0.2367 0.7633 0.0000
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 520 180 340 151 0 17 3 9 0 0 340 0 0 0.8389 0.0000 0.0000 9.588 0.27 3.11 -2.84 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0174 0.9826 0.0000 0 0 0.6853 0.3147 0.0000
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1237 275 962 32 0 0 0 243 1 0 935 0 26 0.1164 0.0010 0.0281 275.000 7.97 9.79 -1.82 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 841 334 507 234 1 4 1 94 0 0 507 0 0 0.7006 0.0000 0.0000 82.250 0.13 2.82 -2.69 88 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 43946300 ACTT A 0.000569 0.100 1 -3 2 490 152 338 133 0 8 0 11 0 0 337 0 1 0.8750 0.0000 0.0030 18.000 0.62 3.45 -2.84 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7921 0.2079 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 696 146 550 61 0 12 0 73 0 0 547 0 3 0.4178 0.0000 0.0055 12.182 1.79 6.66 -4.87 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0857 0.8156 0.0987 1 1 0.0948 0.8082 0.0970 1 1 0.1078 0.7977 0.0945
chr22 46363187 CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA C 0.006403 0.100 1 -27 3 240 104 136 75 0 24 1 4 0 0 136 0 0 0.7212 0.0000 0.0000 3.292 0.17 13.50 -13.33 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4154 0.5846 0.0000 0 0 0.9860 0.0140 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.100 1 -48 1 1064 244 820 121 2 32 0 89 0 0 770 1 49 0.4959 0.0000 0.0610 6.839 0.71 18.10 -17.39 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0357 0.7599 0.2044 1 1 0.0412 0.7495 0.2093 1 1 0.0495 0.7359 0.2146
786 rows