File Info

Filename
HG02178_x_HG02257_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/47/450052b8ddf5b7f121ebbbf4edf1e4/HG02178_x_HG02257_FF_10.features.tsv
Size
159.3 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG02178_x_HG02257_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1641723 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 427 164 263 138 0 7 0 19 0 0 263 0 0 0.8415 0.0000 0.0000 26.167 0.57 8.95 -8.37 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0039 0.9961 0.0000
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 518 205 313 127 1 22 2 53 0 0 313 0 0 0.6195 0.0000 0.0000 8.318 0.65 7.62 -6.98 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9964 0.0036 0.0000 1 0 0.9956 0.0044 0.0000 1 0 0.9942 0.0058 0.0000
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 400 153 247 68 8 19 2 56 1 0 240 0 6 0.4444 0.0040 0.0283 7.053 0.26 3.23 -2.97 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4630 0.5027 0.0343 1 1 0.4618 0.5004 0.0378 1 1 0.4592 0.4978 0.0430
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 541 185 356 89 0 29 1 66 0 0 354 0 2 0.4811 0.0000 0.0056 5.345 0.28 8.62 -8.34 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6238 0.3649 0.0114 1 0 0.6183 0.3686 0.0132 1 0 0.6100 0.3741 0.0159
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 271 121 150 62 0 0 0 59 0 0 148 0 2 0.5124 0.0000 0.0133 121.000 0.27 3.31 -3.03 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1949 0.6453 0.1598 1 1 0.1999 0.6348 0.1652 1 1 0.2063 0.6215 0.1722
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 451 95 356 33 1 13 0 48 0 0 354 0 2 0.3474 0.0000 0.0056 6.308 0.18 3.29 -3.11 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0251 0.3715 0.6035 1 2 0.0280 0.3773 0.5947 1 2 0.0322 0.3853 0.5825
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 895 166 729 142 1 10 0 13 0 0 728 0 1 0.8554 0.0000 0.0014 15.600 0.54 3.23 -2.69 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1145 0.8855 0.0000
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.100 1 3 2 272 100 172 92 0 6 0 2 0 0 172 0 0 0.9200 0.0000 0.0000 15.667 0.23 3.00 -2.77 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5608 0.4392 0.0000 0 0 0.9217 0.0783 0.0000 0 0 0.9601 0.0399 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 335 57 278 10 0 2 2 43 0 0 277 0 1 0.1754 0.0000 0.0036 27.500 0.10 1.19 -1.09 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9805 0.0195 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 1 0.0000 0.9845 0.0155
chr1 21474942 TGTCTCCCAG T 0.500000 0.100 1 -9 1 198 71 127 67 0 2 0 2 0 0 127 0 0 0.9437 0.0000 0.0000 34.500 0.40 10.00 -9.60 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2630 0.7370 0.0000 0 0 0.7715 0.2285 0.0000 0 0 0.8774 0.1226 0.0000
chr1 26282316 TGGGTCCAGGACA T 0.500000 0.100 1 -12 1 798 216 582 163 2 14 3 34 6 3 564 8 1 0.7546 0.0103 0.0309 16.583 1.45 28.79 -27.34 131 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0623 0.9377 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 26282362 GCCGGGACCGGGA G 0.500000 0.100 1 -12 4 846 231 615 161 6 11 12 41 0 0 615 0 0 0.6970 0.0000 0.0000 23.889 2.79 24.59 -21.80 77 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 1 0.0285 0.9715 0.0000
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.100 1 -24 1 589 139 450 129 0 0 0 10 0 0 450 0 0 0.9281 0.0000 0.0000 139.000 0.50 22.10 -21.60 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0147 0.9853 0.0000 0 1 0.4604 0.5396 0.0000
chr1 27548841 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 768 190 578 151 2 20 2 15 0 1 577 0 0 0.7947 0.0000 0.0017 8.450 0.46 3.33 -2.88 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0314 0.9686 0.0000
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 325 136 189 113 0 13 0 10 0 0 189 0 0 0.8309 0.0000 0.0000 9.462 0.13 3.10 -2.97 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0067 0.9933 0.0000 0 1 0.2820 0.7180 0.0000
chr1 36178099 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 455 118 337 65 0 0 0 53 0 0 337 0 0 0.5508 0.0000 0.0000 118.000 0.40 3.36 -2.96 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4590 0.4985 0.0425 1 1 0.4567 0.4970 0.0464 1 1 0.4527 0.4954 0.0519
chr1 46533208 GCGCGGCCGCCACCCTGGCCCGGGCCCGC G 0.500000 0.100 1 -28 2 985 248 737 112 1 25 0 110 0 0 737 0 0 0.4516 0.0000 0.0000 8.920 0.69 15.24 -14.55 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1670 0.7408 0.0922 1 1 0.1756 0.7252 0.0992 1 1 0.1865 0.7049 0.1086
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 531 129 402 0 0 18 0 111 1 0 400 0 1 0.0000 0.0025 0.0050 6.167 5.57 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0291 0.9709 2 2 0.0000 0.0106 0.9894 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr1 50419101 CCGGCGG C 0.500000 0.100 1 -6 6 600 162 438 76 8 19 0 59 1 1 436 0 0 0.4691 0.0023 0.0046 7.778 1.87 7.98 -6.11 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7597 0.2358 0.0045 1 0 0.7506 0.2440 0.0054 1 0 0.7376 0.2555 0.0069
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 897 228 669 180 8 31 0 9 0 0 668 0 1 0.7895 0.0000 0.0015 6.355 0.36 3.33 -2.97 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2216 0.7784 0.0000 0 0 0.9373 0.0627 0.0000
chr1 62209972 ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC A 0.500000 0.100 1 -30 1 525 139 386 114 1 20 0 4 0 0 380 0 6 0.8201 0.0000 0.0155 5.950 0.92 16.25 -15.33 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0074 0.9926 0.0000 0 1 0.3023 0.6977 0.0000
chr1 67103250 TAG T 0.500000 0.100 1 -2 1 150 59 91 58 0 0 0 1 0 0 91 0 0 0.9831 0.0000 0.0000 59.000 0.48 2.00 -1.52 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6759 0.3241 0.0000 0 0 0.8620 0.1380 0.0000 0 0 0.8978 0.1022 0.0000
chr1 76868607 G GCAGCAA 0.500000 0.100 1 6 1 241 81 160 61 1 10 0 9 0 0 160 0 0 0.7531 0.0000 0.0000 7.100 0.48 4.00 -3.52 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.0591 0.9409 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 154 66 88 43 0 1 0 22 0 0 87 0 1 0.6515 0.0000 0.0114 65.000 0.37 3.68 -3.31 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7144 0.2720 0.0136 1 0 0.7026 0.2819 0.0155 1 0 0.6862 0.2952 0.0186
chr1 84574315 C CGCAGCGCCA 0.500000 0.100 1 9 2 359 146 213 110 0 32 0 4 0 0 212 0 1 0.7534 0.0000 0.0047 3.562 1.46 6.75 -5.29 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 0 0.5425 0.4575 0.0000 0 0 0.8937 0.1063 0.0000
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 359 152 207 119 0 26 0 7 0 0 207 0 0 0.7829 0.0000 0.0000 4.846 1.13 8.00 -6.87 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1812 0.8188 0.0000 0 0 0.7828 0.2172 0.0000
chr1 85132996 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 202 58 144 29 0 8 0 21 0 0 144 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 6.250 0.28 1.19 -0.91 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4213 0.4911 0.0877 1 1 0.4166 0.4913 0.0921 1 1 0.4100 0.4918 0.0982
chr1 100152449 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 120 51 69 44 0 3 0 4 0 0 69 0 0 0.8627 0.0000 0.0000 16.000 0.45 3.25 -2.80 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.1129 0.8871 0.0000 0 1 0.3936 0.6064 0.0000
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 164 74 90 66 0 4 0 4 0 0 90 0 0 0.8919 0.0000 0.0000 17.500 0.18 3.25 -3.07 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 1 0.2764 0.7236 0.0000 0 0 0.6537 0.3463 0.0000
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 393 98 295 50 1 2 2 43 0 0 294 0 1 0.5102 0.0000 0.0034 48.000 0.48 3.16 -2.68 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3015 0.5878 0.1108 1 1 0.3031 0.5812 0.1157 1 1 0.3047 0.5729 0.1224
chr1 111319160 A ATGCCCCTCAGGAAG 0.500000 0.100 1 14 3 447 131 316 116 0 8 1 6 0 0 315 0 1 0.8855 0.0000 0.0032 15.375 0.53 13.00 -12.47 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0636 0.9364 0.0000 0 0 0.6241 0.3759 0.0000
chr1 111414873 CCAGGGCTCACAGACTGATGACTCA C 0.500000 0.100 1 -24 1 889 218 671 211 1 5 0 1 0 0 670 0 1 0.9679 0.0000 0.0015 42.600 0.31 3.00 -2.69 57 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 531 170 361 151 4 9 0 6 0 0 361 0 0 0.8882 0.0000 0.0000 17.889 0.49 3.00 -2.51 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 0 0.7974 0.2026 0.0000 0 0 0.9754 0.0246 0.0000
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 297 114 183 60 48 4 0 2 0 0 183 0 0 0.5263 0.0000 0.0000 18.250 0.28 2.50 -2.22 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6771 0.3229 0.0000 0 0 0.9499 0.0501 0.0000 0 0 0.9743 0.0257 0.0000
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 219 86 133 32 0 8 0 46 0 0 130 0 3 0.3721 0.0000 0.0226 9.750 0.34 5.87 -5.53 18 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0217 0.3479 0.6305 1 2 0.0243 0.3548 0.6209 1 2 0.0283 0.3642 0.6075
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 214 71 143 5 0 11 2 53 0 0 143 0 0 0.0704 0.0000 0.0000 5.273 0.00 1.25 -1.25 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9274 0.0726 2 1 0.0000 0.6311 0.3689
chr1 152515515 G GGGCTGCTGCGGCGACTCA 0.500000 0.100 1 18 4 207 64 143 49 0 13 0 2 0 0 142 0 1 0.7656 0.0000 0.0070 3.923 1.78 19.00 -17.22 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0152 0.9848 0.0000 0 1 0.3215 0.6785 0.0000 0 0 0.6112 0.3888 0.0000
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 213 70 143 0 1 6 0 63 0 0 127 0 16 0.0000 0.0000 0.1119 10.667 10.40 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0351 0.9649 2 2 0.0000 0.0321 0.9679 2 2 0.0000 0.0313 0.9687
chr1 152709213 G GGGCTGCTGTAGCTCTGGC 0.500000 0.100 1 18 5 213 83 130 0 1 3 0 79 0 0 130 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 26.667 8.41 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0352 0.9648 2 2 0.0000 0.0322 0.9678 2 2 0.0000 0.0314 0.9686
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 668 191 477 153 3 20 0 15 0 0 475 0 2 0.8010 0.0000 0.0042 8.550 0.74 6.13 -5.39 87 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0342 0.9658 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1105 298 807 223 5 49 2 19 4 4 794 0 5 0.7483 0.0050 0.0161 5.020 1.82 7.63 -5.82 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0083 0.9917 0.0000
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 523 233 290 191 1 31 2 8 0 0 290 0 0 0.8197 0.0000 0.0000 6.700 1.58 7.12 -5.55 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4701 0.5299 0.0000 0 0 0.9682 0.0318 0.0000
chr1 153934829 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 514 217 297 112 12 33 7 53 0 0 297 0 0 0.5161 0.0000 0.0000 89.000 0.24 3.77 -3.53 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9848 0.0152 0.0000 1 0 0.9823 0.0177 0.0000 1 0 0.9783 0.0217 0.0000
chr1 153934830 T TGC 0.500000 0.100 1 2 1 515 217 298 124 10 21 8 54 0 0 298 0 0 0.5714 0.0000 0.0000 8.810 0.83 3.80 -2.97 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9940 0.0060 0.0000 1 0 0.9928 0.0072 0.0000 1 0 0.9907 0.0093 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 193 70 123 4 0 1 3 62 0 0 123 0 0 0.0571 0.0000 0.0000 69.000 1.75 1.98 -0.23 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9958 0.0042 2 1 0.0000 0.7317 0.2683 2 2 0.0000 0.3587 0.6413
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 651 171 480 0 0 4 0 167 0 0 479 0 1 0.0000 0.0000 0.0021 41.750 2.48 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1531 314 1217 5 0 11 0 298 0 0 1211 0 6 0.0159 0.0000 0.0049 27.545 0.00 1.55 -1.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 648 193 455 77 0 43 0 73 0 0 434 0 21 0.3990 0.0000 0.0462 3.488 0.26 13.81 -13.55 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0182 0.4534 0.5285 1 2 0.0206 0.4526 0.5267 1 2 0.0243 0.4524 0.5233
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 449 216 233 79 85 38 0 14 0 2 231 0 0 0.3657 0.0000 0.0086 4.632 0.14 2.79 -2.65 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2714 0.7286 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 449 219 230 107 0 32 0 80 0 0 224 0 6 0.4886 0.0000 0.0261 6.032 0.68 11.55 -10.87 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5927 0.3973 0.0100 1 0 0.5900 0.3984 0.0117 1 0 0.5852 0.4006 0.0142
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 573 134 439 122 0 3 0 9 0 0 439 0 0 0.9104 0.0000 0.0000 43.667 0.52 9.44 -8.92 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0296 0.9704 0.0000 0 0 0.5358 0.4642 0.0000
chr1 230978796 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 1 346 79 267 67 1 7 0 4 0 0 266 0 1 0.8481 0.0000 0.0037 10.143 0.43 3.00 -2.57 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1265 0.8735 0.0000 0 0 0.5212 0.4788 0.0000
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 250 108 142 52 0 0 0 56 0 0 142 0 0 0.4815 0.0000 0.0000 108.000 0.19 1.34 -1.15 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1211 0.6113 0.2676 1 1 0.1263 0.6031 0.2706 1 1 0.1332 0.5927 0.2741
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 548 169 379 125 1 22 1 20 0 0 377 0 2 0.7396 0.0000 0.0053 6.682 0.88 3.05 -2.17 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 503 121 382 6 0 1 0 114 0 0 380 0 2 0.0496 0.0000 0.0052 120.000 0.17 1.58 -1.41 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.6425 0.3575 2 2 0.0000 0.1442 0.8558
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 653 181 472 23 0 3 0 155 0 0 468 0 4 0.1271 0.0000 0.0085 59.333 0.13 3.08 -2.95 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009
chr1 247934141 GCTAT G 0.500000 0.100 1 -4 2 1399 356 1043 346 1 6 0 3 0 0 1043 0 0 0.9719 0.0000 0.0000 58.333 0.25 4.00 -3.75 88 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 608 140 468 8 0 3 0 129 0 0 466 1 1 0.0571 0.0000 0.0043 45.667 0.62 2.13 -1.51 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8776 0.1224 2 2 0.0000 0.2273 0.7727
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.100 1 -84 1 718 191 527 31 0 21 11 128 0 0 527 0 0 0.1623 0.0000 0.0000 7.952 1.74 3.59 -1.84 13 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 248361985 CTACG C 0.500000 0.100 1 -4 2 1032 240 792 17 13 12 178 20 0 0 776 4 12 0.0708 0.0000 0.0202 23.444 0.35 6.15 -5.80 9 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9594 0.0406
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 921 239 682 155 0 5 0 79 0 0 682 0 0 0.6485 0.0000 0.0000 46.800 2.17 4.32 -2.14 119 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9966 0.0034 0.0000 1 0 0.9959 0.0041 0.0000 1 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 1194 82 1112 0 0 0 3 79 0 0 1096 0 16 0.0000 0.0000 0.0144 82.000 4.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0085 0.9915
chr1 248522528 CAA C 0.500000 0.100 1 -2 3 547 139 408 127 0 6 0 6 0 0 408 0 0 0.9137 0.0000 0.0000 22.167 0.39 2.00 -1.61 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.4889 0.5111 0.0000 0 0 0.9099 0.0901 0.0000
chr1 248574594 T TGGATGAGGA 0.500000 0.100 1 9 1 631 110 521 91 1 16 0 2 0 0 521 0 0 0.8273 0.0000 0.0000 5.875 0.38 9.00 -8.62 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5607 0.4393 0.0000 0 0 0.9217 0.0783 0.0000 0 0 0.9601 0.0399 0.0000
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 596 273 323 83 0 15 1 174 0 0 323 0 0 0.3040 0.0000 0.0000 17.200 0.90 6.45 -5.55 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0008 0.9992 1 2 0.0000 0.0010 0.9990 1 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 1422 316 1106 140 0 12 0 164 0 0 1102 0 4 0.4430 0.0000 0.0036 25.333 0.54 3.73 -3.19 28 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0025 0.3600 0.6376 1 2 0.0031 0.3581 0.6388 1 2 0.0041 0.3572 0.6387
chr2 20667362 G GGGCGGC 0.021395 0.100 1 6 5 394 125 269 0 0 18 1 106 0 0 258 0 11 0.0000 0.0000 0.0409 5.944 8.16 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1005 0.8995 2 2 0.0000 0.1120 0.8880 2 2 0.0000 0.1298 0.8702
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 394 125 269 0 0 18 1 106 0 0 258 0 11 0.0000 0.0000 0.0409 5.944 8.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 630 203 427 165 1 24 0 13 0 0 427 0 0 0.8128 0.0000 0.0000 7.458 0.43 8.08 -7.65 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0087 0.9913 0.0000 0 0 0.6285 0.3715 0.0000
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 200 60 140 55 0 2 0 3 0 0 140 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 29.000 0.31 3.00 -2.69 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0205 0.9795 0.0000 0 1 0.3901 0.6099 0.0000 0 0 0.6778 0.3222 0.0000
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 705 145 560 70 0 16 0 59 0 0 558 0 2 0.4828 0.0000 0.0036 8.062 0.76 3.12 -2.36 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3668 0.5716 0.0616 1 1 0.3682 0.5656 0.0662 1 1 0.3691 0.5582 0.0727
chr2 43541311 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 137 49 88 45 0 1 0 3 0 0 88 0 0 0.9184 0.0000 0.0000 48.000 0.47 3.00 -2.53 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0124 0.9876 0.0000 0 1 0.2796 0.7204 0.0000 0 0 0.5642 0.4358 0.0000
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 588 78 510 13 3 13 2 47 5 1 502 1 1 0.1667 0.0098 0.0157 4.923 4.31 6.40 -2.10 7 1/1 0/1 . . OK 1 2 0.0027 0.1379 0.8594 1 2 0.0034 0.1481 0.8485 1 2 0.0044 0.1630 0.8326
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 424 165 259 10 0 16 1 138 0 0 258 0 1 0.0606 0.0000 0.0039 9.250 0.30 3.14 -2.84 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9749 0.0251 2 2 0.0000 0.4088 0.5912
chr2 70984816 TGCCCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 664 147 517 137 0 6 0 4 0 0 516 0 1 0.9320 0.0000 0.0019 23.500 1.15 7.25 -6.10 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0158 0.9842 0.0000 0 0 0.8204 0.1796 0.0000 0 0 0.9689 0.0311 0.0000
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 593 162 431 65 13 39 2 43 0 2 428 0 1 0.4012 0.0000 0.0070 3.184 0.45 3.16 -2.72 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8817 0.1172 0.0011 1 0 0.8726 0.1259 0.0015 1 0 0.8594 0.1386 0.0020
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 594 170 424 119 2 43 1 5 0 0 423 0 1 0.7000 0.0000 0.0024 2.930 1.45 4.20 -2.75 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2037 0.7963 0.0000 0 0 0.8031 0.1969 0.0000
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 437 73 364 61 0 5 0 7 0 0 364 0 0 0.8356 0.0000 0.0000 13.600 0.11 3.00 -2.89 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0121 0.9879 0.0000 0 1 0.1776 0.8224 0.0000
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 927 243 684 201 0 40 0 2 0 0 680 0 4 0.8272 0.0000 0.0058 5.075 0.56 12.00 -11.44 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0435 0.9565 0.0000 0 0 0.9747 0.0253 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr2 75493442 CGCTGTCGCT C 0.500000 0.100 1 -9 1 382 141 241 126 0 7 0 8 0 0 241 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 19.143 0.21 9.50 -9.29 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0976 0.9024 0.0000 0 0 0.7270 0.2730 0.0000
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 772 198 574 6 0 24 6 162 0 0 568 0 6 0.0303 0.0000 0.0105 7.250 0.33 3.27 -2.93 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9886 0.0114 2 2 0.0000 0.0909 0.9091 2 2 0.0000 0.0100 0.9900
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 680 188 492 92 1 7 3 85 0 0 492 0 0 0.4894 0.0000 0.0000 25.857 0.43 7.89 -7.46 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2318 0.6829 0.0853 1 1 0.2386 0.6701 0.0913 1 1 0.2469 0.6537 0.0994
chr2 96123863 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 495 122 373 115 0 0 0 7 0 0 373 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 122.000 0.31 1.00 -0.69 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1539 0.8461 0.0000 0 0 0.7483 0.2517 0.0000
chr2 99593872 CG C 0.500000 0.100 1 -1 4 633 150 483 15 0 1 8 126 0 0 472 6 5 0.1000 0.0000 0.0228 148.000 1.67 7.52 -5.85 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9283 0.0717
chr2 99593875 CTGAGG C 0.500000 0.100 1 -5 2 637 149 488 15 0 0 1 133 0 0 474 0 14 0.1007 0.0000 0.0287 149.000 1.67 7.12 -5.45 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9203 0.0797
chr2 108308425 GA G 0.500000 0.100 1 -1 3 146 63 83 58 0 2 0 3 0 0 83 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 30.500 0.12 1.00 -0.88 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0241 0.9759 0.0000 0 1 0.4267 0.5733 0.0000 0 0 0.7088 0.2912 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 127 53 74 51 0 1 0 1 0 0 74 0 0 0.9623 0.0000 0.0000 52.000 0.22 3.00 -2.78 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5931 0.4069 0.0000 0 0 0.8149 0.1851 0.0000 0 0 0.8621 0.1379 0.0000
chr2 112542424 TTCCGGCGTGTACCGAGAGACTGGCG T 0.500000 0.100 1 -25 1 370 87 283 43 0 9 0 35 0 0 274 0 9 0.4943 0.0000 0.0318 8.667 0.67 16.83 -16.15 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1785 0.6039 0.2176 1 1 0.1827 0.5962 0.2210 1 1 0.1882 0.5865 0.2253
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 539 130 409 0 0 2 2 126 0 0 401 0 8 0.0000 0.0000 0.0196 63.500 5.66 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 313 111 202 53 0 12 0 46 0 0 197 0 5 0.4775 0.0000 0.0248 8.250 0.57 6.28 -5.72 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2270 0.6202 0.1527 1 1 0.2309 0.6114 0.1577 1 1 0.2355 0.6003 0.1642
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 179 48 131 14 1 9 11 13 0 0 130 1 0 0.2917 0.0000 0.0076 3.333 1.14 2.00 -0.86 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0870 0.4691 0.4438 1 1 0.0914 0.4710 0.4376 1 1 0.0974 0.4734 0.4292
chr2 159987235 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 189 89 100 80 0 1 0 8 0 0 100 0 0 0.8989 0.0000 0.0000 88.000 0.20 2.00 -1.80 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0111 0.9889 0.0000 0 1 0.2245 0.7755 0.0000
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 154 62 92 44 0 16 1 1 1 0 90 0 1 0.7097 0.0109 0.0217 2.812 1.34 6.00 -4.66 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0782 0.9218 0.0000 0 1 0.4618 0.5382 0.0000 0 0 0.6624 0.3376 0.0000
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 182 80 102 33 0 29 0 18 0 0 100 0 2 0.4125 0.0000 0.0196 1.759 0.12 11.61 -11.49 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5584 0.3992 0.0424 1 0 0.5492 0.4047 0.0461 1 0 0.5367 0.4120 0.0514
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 226 93 133 12 0 3 1 77 0 0 131 0 2 0.1290 0.0000 0.0150 30.000 0.25 3.04 -2.79 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9785 0.0215
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 681 142 539 13 0 3 1 125 0 0 535 0 4 0.0915 0.0000 0.0074 46.333 0.08 4.14 -4.07 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.8846 0.1154
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 287 110 177 3 1 12 7 87 0 0 174 0 3 0.0273 0.0000 0.0169 7.583 1.33 3.17 -1.84 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8832 0.1168 2 2 0.0000 0.2034 0.7966 2 2 0.0000 0.0737 0.9263
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 287 116 171 16 1 7 84 8 0 0 171 0 0 0.1379 0.0000 0.0000 3.714 0.25 3.62 -3.38 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9926 0.0074 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9988 0.0012
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 228 69 159 45 7 11 2 4 0 0 159 0 0 0.6522 0.0000 0.0000 4.727 0.40 1.25 -0.85 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.0923 0.9077 0.0000 0 1 0.3602 0.6398 0.0000
chr2 206177196 CATAGGAATAGTTTTCAAATT C 0.500000 0.100 1 -20 1 462 115 347 104 1 2 0 8 0 0 347 0 0 0.9043 0.0000 0.0000 56.500 0.13 12.50 -12.37 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0365 0.9635 0.0000 0 1 0.4901 0.5099 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 315 93 222 88 0 1 0 4 0 0 222 0 0 0.9462 0.0000 0.0000 92.000 0.09 3.00 -2.91 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0121 0.9879 0.0000 0 0 0.5340 0.4660 0.0000 0 0 0.8459 0.1541 0.0000
chr2 214780778 GTGGTGAAGAACATTCAGGCAA G 0.500000 0.100 1 -21 2 639 151 488 82 0 1 0 68 0 0 479 0 9 0.5430 0.0000 0.0184 150.000 0.85 18.40 -17.54 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2482 0.6597 0.0921 1 1 0.2539 0.6482 0.0979 1 1 0.2606 0.6337 0.1057
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 539 136 403 0 0 23 3 110 0 0 397 1 5 0.0000 0.0000 0.0149 4.870 8.21 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr2 216633573 T TGCTGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 539 132 407 5 1 7 3 116 0 0 405 1 1 0.0379 0.0000 0.0049 20.667 0.60 7.97 -7.37 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9974 0.0026 2 2 0.0000 0.4996 0.5004 2 2 0.0000 0.1048 0.8952
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 559 183 376 109 0 7 0 67 0 0 345 0 31 0.5956 0.0000 0.0824 25.143 0.64 15.07 -14.43 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3369 0.6250 0.0381 1 1 0.3431 0.6148 0.0422 1 1 0.3500 0.6019 0.0481
chr2 231461547 C CTCATCG 0.500000 0.100 1 6 2 388 98 290 89 0 6 0 3 0 0 290 0 0 0.9082 0.0000 0.0000 15.333 0.16 6.67 -6.51 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1061 0.8939 0.0000 0 0 0.7775 0.2225 0.0000 0 0 0.9163 0.0837 0.0000
chr2 232847517 A AG 0.500000 0.100 1 1 2 344 126 218 66 3 9 3 45 0 0 212 0 6 0.5238 0.0000 0.0275 12.889 0.56 5.02 -4.46 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5329 0.4397 0.0274 1 0 0.5283 0.4412 0.0305 1 0 0.5214 0.4436 0.0350
chr2 235852770 C CCAGG 0.500000 0.100 1 4 2 204 103 101 56 0 4 0 43 0 0 99 1 1 0.5437 0.0000 0.0198 24.750 0.91 4.09 -3.18 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4514 0.4977 0.0509 1 1 0.4484 0.4966 0.0550 1 1 0.4436 0.4955 0.0609
chr2 236237820 G GGCGCCGCGGCCGCCGGGGCTGGCGTCTGGGTCT 0.500000 0.100 1 33 3 238 65 173 24 0 33 0 8 0 0 163 0 10 0.3692 0.0000 0.0578 0.970 0.83 0.50 0.33 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3759 0.5097 0.1144 1 1 0.3725 0.5088 0.1187 1 1 0.3678 0.5077 0.1245
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 710 146 564 9 0 0 0 137 0 0 563 0 1 0.0616 0.0000 0.0018 146.000 0.11 1.16 -1.05 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9360 0.0640 2 2 0.0000 0.2845 0.7155
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 334 94 240 2 0 15 5 72 0 0 240 0 0 0.0213 0.0000 0.0000 5.267 0.00 3.29 -3.29 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6299 0.3701 2 2 0.0000 0.1540 0.8460 2 2 0.0000 0.0802 0.9198
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 463 117 346 114 0 1 0 2 0 0 346 0 0 0.9744 0.0000 0.0000 116.000 0.32 2.00 -1.68 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7968 0.2032 0.0000 0 0 0.9725 0.0275 0.0000 0 0 0.9859 0.0141 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 767 194 573 98 0 4 0 92 0 0 570 0 3 0.5052 0.0000 0.0052 47.500 0.51 3.32 -2.81 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0476 0.7597 0.1927 1 1 0.0495 0.7450 0.2054 1 1 0.0520 0.7257 0.2223
chr3 9917537 G GTCTGGTCTT 0.000861 0.100 1 9 1 607 147 460 128 1 8 0 10 0 0 460 0 0 0.8707 0.0000 0.0000 17.250 0.34 8.30 -7.96 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9451 0.0549 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 741 187 554 157 1 24 0 5 2 0 551 0 1 0.8396 0.0036 0.0054 6.792 0.89 12.80 -11.91 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0239 0.9761 0.0000 0 0 0.9558 0.0442 0.0000 0 0 0.9954 0.0046 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 409 88 321 52 0 1 0 35 0 0 321 0 0 0.5909 0.0000 0.0000 87.000 0.71 5.11 -4.40 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6240 0.3546 0.0215 1 0 0.6149 0.3611 0.0241 1 0 0.6021 0.3699 0.0280
chr3 37998943 A ACAC 0.500000 0.100 1 3 1 435 157 278 92 0 5 0 60 0 0 275 0 3 0.5860 0.0000 0.0108 30.400 0.21 2.93 -2.73 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8035 0.1940 0.0026 1 0 0.7945 0.2024 0.0032 1 0 0.7815 0.2143 0.0042
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 626 186 440 20 4 31 2 129 0 0 439 0 1 0.1075 0.0000 0.0023 5.000 0.70 2.85 -2.15 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 803 200 603 0 0 12 0 188 0 0 601 0 2 0.0000 0.0000 0.0033 15.667 2.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 291 113 178 0 0 2 0 111 0 0 176 0 2 0.0000 0.0000 0.0112 55.500 4.46 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 611 149 462 2 0 11 8 128 0 0 461 0 1 0.0134 0.0000 0.0022 12.545 2.00 3.39 -1.39 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0646 0.9354 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0046 0.9954
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 353 110 243 7 0 17 1 85 0 0 239 0 4 0.0636 0.0000 0.0165 5.471 0.57 5.69 -5.12 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9506 0.0494 2 1 0.0000 0.5314 0.4686
chr3 51993837 TCCTTGGCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -12 1 418 131 287 121 0 8 0 2 0 0 287 0 0 0.9237 0.0000 0.0000 15.375 0.24 0.50 -0.26 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8508 0.1492 0.0000 0 0 0.9805 0.0195 0.0000 0 0 0.9899 0.0101 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 194 110 84 88 1 8 0 13 0 0 84 0 0 0.8000 0.0000 0.0000 12.750 0.45 7.31 -6.85 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0176 0.9824 0.0000
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 223 90 133 11 0 4 34 41 0 0 132 0 1 0.1222 0.0000 0.0075 28.667 0.18 3.39 -3.21 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9676 0.0324
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 222 89 133 11 0 1 38 39 0 0 133 0 0 0.1236 0.0000 0.0000 88.000 0.18 3.74 -3.56 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9685 0.0315
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 284 96 188 13 0 8 2 73 0 0 185 0 3 0.1354 0.0000 0.0160 11.000 0.38 3.01 -2.63 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9896 0.0104
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 92 26 66 4 0 1 1 20 0 0 65 1 0 0.1538 0.0000 0.0152 25.000 0.25 1.35 -1.10 0 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0009 0.9673 0.0318 2 1 0.0005 0.9440 0.0555 2 1 0.0003 0.8120 0.1877
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1114 272 842 0 2 66 17 187 0 0 841 0 1 0.0000 0.0000 0.0012 3.091 2.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1121 280 841 198 11 55 11 5 0 0 841 0 0 0.7071 0.0000 0.0000 4.308 2.62 6.60 -3.98 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 0 0.5661 0.4339 0.0000
chr3 119146279 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 581 169 412 93 1 14 0 61 0 0 410 0 2 0.5503 0.0000 0.0049 11.071 0.38 3.57 -3.20 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8314 0.1668 0.0018 1 0 0.8225 0.1753 0.0023 1 0 0.8096 0.1874 0.0030
chr3 121677324 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 266 88 178 84 0 0 0 4 0 0 178 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 88.000 0.31 3.00 -2.69 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.4842 0.5158 0.0000 0 0 0.8189 0.1811 0.0000
chr3 123700269 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 704 117 587 11 0 4 0 102 0 0 584 0 3 0.0940 0.0000 0.0051 28.250 0.36 3.52 -3.16 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 0.8771 0.1229
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 705 143 562 52 0 35 1 55 0 0 562 0 0 0.3636 0.0000 0.0000 3.057 0.52 8.25 -7.74 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1240 0.6127 0.2633 1 1 0.1292 0.6044 0.2664 1 1 0.1361 0.5939 0.2700
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.100 1 -4 1 287 119 168 60 0 3 0 56 0 0 168 0 0 0.5042 0.0000 0.0000 38.667 0.55 4.11 -3.56 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2612 0.6207 0.1182 1 1 0.2647 0.6118 0.1235 1 1 0.2688 0.6006 0.1306
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 145 68 77 39 0 0 0 29 0 0 77 0 0 0.5735 0.0000 0.0000 68.000 0.67 2.03 -1.37 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4600 0.4766 0.0634 1 1 0.4549 0.4775 0.0677 1 1 0.4476 0.4788 0.0736
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 360 125 235 50 0 3 0 72 0 0 235 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 40.667 0.42 2.11 -1.69 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0090 0.2887 0.7023 1 2 0.0105 0.2963 0.6932 1 2 0.0128 0.3069 0.6803
chr3 157159983 CCGTCGTGGTCGT C 0.500000 0.100 1 -12 3 279 81 198 73 0 5 0 3 0 0 198 0 0 0.9012 0.0000 0.0000 15.200 0.41 13.00 -12.59 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0499 0.9501 0.0000 0 0 0.6111 0.3889 0.0000 0 0 0.8344 0.1656 0.0000
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 269 93 176 88 0 2 0 3 0 0 176 0 0 0.9462 0.0000 0.0000 45.500 0.26 1.00 -0.74 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1059 0.8941 0.0000 0 0 0.7702 0.2298 0.0000 0 0 0.9127 0.0873 0.0000
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 474 110 364 86 2 15 0 7 0 0 364 0 0 0.7818 0.0000 0.0000 6.333 0.57 3.00 -2.43 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0449 0.9551 0.0000 0 1 0.4446 0.5554 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 750 156 594 0 0 16 0 140 0 0 569 0 25 0.0000 0.0000 0.0421 9.333 12.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 195 66 129 3 0 13 0 50 0 0 127 0 2 0.0455 0.0000 0.0155 4.077 0.33 6.62 -6.29 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9823 0.0177 2 1 0.0000 0.6450 0.3550 2 2 0.0000 0.3548 0.6452
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 195 68 127 4 1 12 43 8 0 0 127 0 0 0.0588 0.0000 0.0000 4.500 1.25 9.62 -8.38 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.8606 0.1394 2 1 0.0000 0.5480 0.4520
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 490 136 354 128 0 0 0 8 1 0 346 1 6 0.9412 0.0028 0.0226 136.000 0.16 9.88 -9.71 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0143 0.9857 0.0000
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 710 282 428 10 4 97 5 166 1 1 412 3 11 0.0355 0.0023 0.0374 1.936 2.20 6.95 -4.75 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9958 0.0042 2 1 0.0000 0.6342 0.3658
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 538 146 392 121 0 8 1 16 0 2 390 0 0 0.8288 0.0000 0.0051 17.125 1.26 10.31 -9.05 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1326 0.8674 0.0000
chr4 6861441 T TAGC 0.000083 0.100 1 3 1 727 172 555 157 0 7 0 8 0 1 554 0 0 0.9128 0.0000 0.0018 23.571 0.13 3.12 -2.99 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4169 0.5831 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 15004114 A AGCG 0.500000 0.100 1 3 1 431 104 327 41 2 27 2 32 1 1 323 1 1 0.3942 0.0031 0.0122 3.208 1.98 4.78 -2.81 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3574 0.5471 0.0955 1 1 0.3564 0.5433 0.1003 1 1 0.3547 0.5386 0.1067
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 770 268 502 258 0 5 0 5 0 0 502 0 0 0.9627 0.0000 0.0000 52.600 0.70 9.80 -9.10 104 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8847 0.1153 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr4 44447936 G GCCA 0.500000 0.100 1 3 2 588 135 453 115 4 10 1 5 0 0 453 0 0 0.8519 0.0000 0.0000 12.400 1.58 3.00 -1.42 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 0 0.5222 0.4778 0.0000 0 0 0.8972 0.1028 0.0000
chr4 56316659 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 3 361 92 269 83 0 5 0 4 1 0 268 0 0 0.9022 0.0037 0.0037 17.400 1.14 2.25 -1.11 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.4842 0.5158 0.0000 0 0 0.8189 0.1811 0.0000
chr4 56448597 GGTACAGATAAAACAA G 0.500000 0.100 1 -15 2 321 97 224 82 0 12 0 3 0 0 224 0 0 0.8454 0.0000 0.0000 7.083 0.22 10.00 -9.78 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0767 0.9233 0.0000 0 0 0.7113 0.2887 0.0000 0 0 0.8863 0.1137 0.0000
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 145 74 71 67 0 2 0 5 0 0 71 0 0 0.9054 0.0000 0.0000 36.000 0.06 1.20 -1.14 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1224 0.8776 0.0000 0 0 0.5111 0.4889 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2423 503 1920 174 7 143 8 171 2 2 1897 6 13 0.3459 0.0010 0.0120 2.539 1.41 7.67 -6.26 54 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0145 0.7521 0.2334 1 1 0.0172 0.7341 0.2487 1 1 0.0214 0.7107 0.2679
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 4024 832 3192 376 16 29 13 398 50 56 2847 194 45 0.4519 0.0157 0.1081 30.462 2.72 8.38 -5.67 28 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0008 0.9992 1 2 0.0000 0.0009 0.9991 1 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr4 87615491 CAGCAGTGAT C 0.500000 0.100 1 -9 1 4224 1014 3210 870 32 85 8 19 17 58 3085 31 19 0.8580 0.0053 0.0389 11.134 2.24 8.89 -6.65 104 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615611 CGATAGCAGTGACAGCAGT C 0.500000 0.100 1 -18 1 4264 1163 3101 866 36 217 13 31 43 54 2975 23 6 0.7446 0.0139 0.0406 4.403 2.66 11.94 -9.28 150 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 4111 1177 2934 467 28 161 48 473 299 72 2521 19 23 0.3968 0.1019 0.1408 6.234 2.11 8.87 -6.76 59 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 165 82 83 76 0 2 0 4 0 0 83 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 40.000 0.13 3.00 -2.87 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.3863 0.6137 0.0000 0 0 0.7541 0.2459 0.0000
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 597 123 474 11 0 4 0 108 0 0 468 0 6 0.0894 0.0000 0.0127 29.750 0.18 4.08 -3.90 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.8217 0.1783
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 466 179 287 0 0 15 7 157 0 1 283 0 3 0.0000 0.0000 0.0139 10.867 3.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 415 140 275 45 6 39 1 49 1 0 270 3 1 0.3214 0.0036 0.0182 2.590 1.42 3.76 -2.33 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1526 0.6223 0.2251 1 1 0.1576 0.6134 0.2290 1 1 0.1641 0.6020 0.2338
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.100 1 5 2 221 100 121 89 1 5 0 5 0 0 120 0 1 0.8900 0.0000 0.0083 19.000 0.88 5.00 -4.12 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1309 0.8691 0.0000 0 0 0.6263 0.3737 0.0000
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 287 112 175 3 0 8 1 100 0 0 171 0 4 0.0268 0.0000 0.0229 13.000 1.33 5.14 -3.81 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7885 0.2115 2 2 0.0000 0.1141 0.8859 2 2 0.0000 0.0403 0.9597
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 800 152 648 75 1 3 0 73 0 0 646 0 2 0.4934 0.0000 0.0031 49.667 0.20 3.12 -2.92 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1779 0.6761 0.1460 1 1 0.1841 0.6637 0.1522 1 1 0.1918 0.6479 0.1602
chr5 1038331 GCACCACCAC G 0.001729 0.100 1 -9 1 892 363 529 177 2 52 2 130 0 0 525 1 3 0.4876 0.0000 0.0076 6.098 1.06 9.29 -8.24 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9364 0.0636 0.0000 1 0 0.9336 0.0664 0.0000 1 0 0.9292 0.0708 0.0000
chr5 45695884 GCCGCCGCCA G 0.500000 0.100 1 -9 2 288 114 174 86 1 17 0 10 0 0 174 0 0 0.7544 0.0000 0.0000 5.706 0.99 7.50 -6.51 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.1001 0.8999 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 745 160 585 60 0 28 3 69 0 0 582 1 2 0.3750 0.0000 0.0051 4.714 0.95 3.41 -2.46 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0271 0.4577 0.5152 1 2 0.0302 0.4579 0.5119 1 2 0.0347 0.4587 0.5066
chr5 61332326 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 2 353 125 228 95 3 20 2 5 0 0 227 0 1 0.7600 0.0000 0.0044 5.526 1.45 3.00 -1.55 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0380 0.9620 0.0000 0 1 0.4441 0.5559 0.0000
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 329 53 276 0 0 34 1 18 0 1 262 5 8 0.0000 0.0000 0.0507 0.559 7.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2736 0.7264 2 2 0.0000 0.2523 0.7477 2 2 0.0000 0.2383 0.7617
chr5 72322197 TGTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 178 93 85 86 0 3 0 4 0 0 84 0 1 0.9247 0.0000 0.0118 30.000 0.10 3.25 -3.15 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2634 0.7366 0.0000 0 0 0.7239 0.2761 0.0000
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 467 145 322 67 0 8 0 70 0 0 320 0 2 0.4621 0.0000 0.0062 17.125 0.13 3.19 -3.05 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0982 0.6373 0.2645 1 1 0.1037 0.6273 0.2690 1 1 0.1112 0.6146 0.2742
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 389 79 310 42 0 5 0 32 2 2 299 0 7 0.5316 0.0065 0.0355 14.800 1.76 19.12 -17.36 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3658 0.5457 0.0885 1 1 0.3648 0.5419 0.0932 1 1 0.3630 0.5373 0.0997
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 384 79 305 40 1 1 2 35 0 1 300 0 4 0.5063 0.0000 0.0164 78.000 2.52 19.69 -17.16 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2202 0.5992 0.1806 1 1 0.2235 0.5918 0.1847 1 1 0.2275 0.5826 0.1899
chr5 109855234 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 158 71 87 39 0 3 0 29 0 0 87 0 0 0.5493 0.0000 0.0000 22.667 0.31 3.38 -3.07 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4600 0.4766 0.0634 1 1 0.4549 0.4775 0.0676 1 1 0.4476 0.4788 0.0736
chr5 112841710 T TACA 0.500000 0.100 1 3 2 645 137 508 131 0 0 0 6 0 0 508 0 0 0.9562 0.0000 0.0000 137.000 0.28 3.00 -2.72 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.5386 0.4614 0.0000 0 0 0.9246 0.0754 0.0000
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 220 94 126 28 7 16 6 37 0 0 123 0 3 0.2979 0.0000 0.0238 5.200 2.11 8.14 -6.03 16 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0518 0.4670 0.4812 1 2 0.0558 0.4682 0.4760 1 1 0.0616 0.4699 0.4685
chr5 113488351 T TGCCGCTGCC 0.500000 0.100 1 9 1 220 94 126 33 6 4 7 44 0 0 123 0 3 0.3511 0.0000 0.0238 21.250 2.09 7.39 -5.30 17 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0252 0.3799 0.5949 1 2 0.0281 0.3853 0.5867 1 2 0.0323 0.3926 0.5751
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 1124 254 870 2 0 29 3 220 0 1 853 3 13 0.0079 0.0000 0.0195 7.759 2.00 3.74 -1.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 597 129 468 71 0 2 0 56 0 0 468 0 0 0.5504 0.0000 0.0000 63.500 0.23 1.36 -1.13 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5279 0.4451 0.0270 1 0 0.5238 0.4462 0.0301 1 0 0.5174 0.4480 0.0345
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 373 118 255 52 0 19 0 47 0 0 251 0 4 0.4407 0.0000 0.0157 5.211 1.00 8.30 -7.30 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2074 0.6225 0.1701 1 1 0.2116 0.6136 0.1749 1 1 0.2168 0.6022 0.1810
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 447 119 328 57 0 14 0 48 1 0 324 0 3 0.4790 0.0030 0.0122 7.500 0.61 5.33 -4.72 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3384 0.5771 0.0845 1 1 0.3395 0.5711 0.0894 1 1 0.3402 0.5636 0.0962
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 271 70 201 38 0 2 0 30 0 0 192 0 9 0.5429 0.0000 0.0448 34.000 0.71 9.47 -8.76 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1838 0.5921 0.2241 1 1 0.1877 0.5853 0.2271 1 1 0.1926 0.5767 0.2307
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 173 65 108 59 0 0 0 6 0 0 108 0 0 0.9077 0.0000 0.0000 65.000 0.51 3.67 -3.16 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0310 0.9690 0.0000 0 1 0.2713 0.7287 0.0000
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 187 80 107 8 0 0 2 70 0 0 103 0 4 0.1000 0.0000 0.0374 80.000 0.88 4.01 -3.14 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9912 0.0088 2 1 0.0000 0.8095 0.1905
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 187 80 107 8 0 2 4 66 0 0 103 2 2 0.1000 0.0000 0.0374 39.000 0.88 4.02 -3.14 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.8240 0.1760
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 788 206 582 192 2 0 0 12 0 0 582 0 0 0.9320 0.0000 0.0000 206.000 0.32 1.17 -0.85 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0449 0.9551 0.0000 0 0 0.8480 0.1520 0.0000
chr5 141573996 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 2 551 149 402 66 0 37 0 46 0 0 401 0 1 0.4430 0.0000 0.0025 3.027 0.47 5.46 -4.99 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6498 0.3359 0.0143 1 0 0.6414 0.3422 0.0164 1 0 0.6294 0.3511 0.0195
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 379 92 287 14 0 7 0 71 0 0 275 0 12 0.1522 0.0000 0.0418 12.143 0.36 8.30 -7.94 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9930 0.0070
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 15 1 353 107 246 41 1 18 0 47 0 0 242 0 4 0.3832 0.0000 0.0163 4.944 0.56 9.40 -8.84 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0682 0.5253 0.4065 1 1 0.0727 0.5228 0.4045 1 1 0.0790 0.5197 0.4013
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 652 160 492 141 1 4 1 13 0 0 492 0 0 0.8812 0.0000 0.0000 39.000 0.35 1.77 -1.41 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1131 0.8869 0.0000
chr5 153492228 T TC 0.500000 0.100 1 1 2 99 48 51 44 0 1 0 3 0 0 51 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 47.000 0.39 1.00 -0.61 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0121 0.9879 0.0000 0 1 0.2705 0.7295 0.0000 0 0 0.5526 0.4474 0.0000
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 363 158 205 4 0 18 0 136 0 0 205 0 0 0.0253 0.0000 0.0000 7.778 2.75 12.10 -9.35 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8758 0.1242 2 2 0.0000 0.0735 0.9265 2 2 0.0000 0.0174 0.9826
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 362 140 222 0 99 6 0 35 0 0 222 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 22.333 3.89 0 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9932 0.0068 0.0000 1 0 0.9917 0.0083 0.0000 1 0 0.9794 0.0206 0.0000
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 190 73 117 37 1 6 0 29 0 0 117 0 0 0.5068 0.0000 0.0000 11.167 0.19 4.03 -3.85 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4335 0.4936 0.0728 1 1 0.4292 0.4935 0.0773 1 1 0.4232 0.4934 0.0834
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 381 90 291 19 1 4 1 65 0 0 288 0 3 0.2111 0.0000 0.0103 21.500 0.79 4.26 -3.47 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0379 0.9620 1 1 0.0000 0.5124 0.4875 2 1 0.0000 0.9795 0.0205
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 418 174 244 86 8 24 2 54 0 0 244 0 0 0.4943 0.0000 0.0000 6.208 0.65 3.30 -2.65 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9125 0.0871 0.0005 1 0 0.9048 0.0945 0.0006 1 0 0.8936 0.1055 0.0009
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 485 92 393 35 0 14 1 42 0 0 393 0 0 0.3804 0.0000 0.0000 5.571 1.00 3.40 -2.40 9 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0809 0.5241 0.3950 1 1 0.0855 0.5219 0.3926 1 1 0.0918 0.5191 0.3890
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 496 127 369 10 0 17 1 99 0 0 364 2 3 0.0787 0.0000 0.0136 6.471 2.60 3.48 -0.88 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9953 0.0047 2 1 0.0000 0.7821 0.2179
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 511 108 403 6 2 27 5 68 1 1 392 2 7 0.0556 0.0025 0.0273 2.852 2.17 4.29 -2.13 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9726 0.0274
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 479 96 383 12 1 11 1 71 1 0 367 4 11 0.1250 0.0026 0.0418 7.727 3.00 3.77 -0.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9975 0.0025
chr6 22570117 G GGGC 0.051576 0.100 1 3 1 672 154 518 106 0 41 0 7 0 0 517 0 1 0.6883 0.0000 0.0019 2.756 0.49 3.43 -2.94 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4286 0.5714 0.0000 0 0 0.9493 0.0507 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 1422 318 1104 296 1 7 0 14 0 0 1103 0 1 0.9308 0.0000 0.0009 44.429 0.24 15.14 -14.90 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4497 0.5503 0.0000 0 0 0.9967 0.0033 0.0000
chr6 29462135 GGCTGTCT G 0.001041 0.100 1 -7 1 933 289 644 143 0 5 0 141 0 0 635 0 9 0.4948 0.0000 0.0140 56.800 0.32 7.46 -7.14 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1060 0.8936 0.0004 1 1 0.1196 0.8800 0.0005 1 1 0.1389 0.8606 0.0005
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 366 112 254 58 1 2 0 51 0 0 253 0 1 0.5179 0.0000 0.0039 55.000 0.66 1.18 -0.52 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3364 0.5795 0.0840 1 1 0.3376 0.5734 0.0890 1 1 0.3386 0.5656 0.0958
chr6 31028710 GACC G 0.500000 0.100 1 -3 1 2362 512 1850 25 2 79 3 403 0 0 1803 12 35 0.0488 0.0000 0.0254 5.430 2.00 4.73 -2.73 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9858 0.0142 2 2 0.0000 0.0033 0.9967
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 578 152 426 0 132 1 1 18 0 0 424 0 2 0.0000 0.0000 0.0047 148.000 1.78 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000
chr6 31772983 T TGGACAGGCTCCATG 0.500000 0.100 1 14 1 414 126 288 112 0 5 0 9 0 0 284 0 4 0.8889 0.0000 0.0139 24.200 0.39 12.67 -12.27 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0517 0.9483 0.0000
chr6 32223881 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 325 152 173 10 109 25 0 8 0 2 171 0 0 0.0658 0.0000 0.0116 5.522 0.10 3.75 -3.65 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0820 0.9180 0.0000 0 0 0.6879 0.3121 0.0000
chr6 32519430 CTCCACTTCGAGGAACTGTT C 0.500000 0.100 1 -19 1 292 105 187 39 0 1 0 65 0 0 177 0 10 0.3714 0.0000 0.0535 104.000 6.08 15.09 -9.02 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0007 0.0897 0.9095 1 2 0.0009 0.0978 0.9012 1 2 0.0013 0.1097 0.8889
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.100 1 2 2 159 68 91 36 6 0 2 24 0 0 89 0 2 0.5294 0.0000 0.0220 66.000 7.72 9.17 -1.44 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5512 0.4100 0.0388 1 0 0.5431 0.4145 0.0424 1 0 0.5320 0.4206 0.0475
chr6 33086236 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 240 48 192 22 0 0 0 26 0 0 192 0 0 0.4583 0.0000 0.0000 48.000 4.91 7.50 -2.59 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1434 0.5396 0.3170 1 1 0.1474 0.5366 0.3160 1 1 0.1528 0.5328 0.3144
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 473 170 303 89 2 24 1 54 0 0 297 0 6 0.5235 0.0000 0.0198 6.083 0.69 4.80 -4.11 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8238 0.1742 0.0021 1 0 0.8147 0.1828 0.0026 1 0 0.8015 0.1950 0.0034
chr6 35141212 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 203 54 149 35 0 0 0 19 0 0 149 0 0 0.6481 0.0000 0.0000 54.000 3.89 1.26 2.62 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6346 0.3388 0.0266 1 0 0.6235 0.3469 0.0296 1 0 0.6083 0.3578 0.0339
chr6 36722044 C CGGGCCCAGCGGTGCAGGA 0.500000 0.100 1 18 2 617 130 487 92 2 30 1 5 1 0 482 0 4 0.7077 0.0021 0.0103 3.300 1.01 8.20 -7.19 4 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 1 0.1674 0.8326 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 1088 308 780 171 0 5 0 132 0 0 777 0 3 0.5552 0.0000 0.0038 60.600 0.27 3.29 -3.01 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7976 0.2018 0.0006 1 0 0.7935 0.2057 0.0008 1 0 0.7868 0.2120 0.0012
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 346 138 208 63 0 22 0 53 0 0 205 0 3 0.4565 0.0000 0.0144 5.273 1.13 6.25 -5.12 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3288 0.5891 0.0821 1 1 0.3307 0.5822 0.0871 1 1 0.3324 0.5736 0.0940
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 703 134 569 110 4 15 0 5 0 0 569 0 0 0.8209 0.0000 0.0000 7.933 0.59 2.60 -2.01 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0050 0.9950 0.0000 0 0 0.5917 0.4083 0.0000 0 0 0.9108 0.0892 0.0000
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 742 160 582 43 1 78 0 38 0 0 562 0 20 0.2687 0.0000 0.0344 1.038 0.58 7.61 -7.02 9 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0324 0.4332 0.5344 1 2 0.0357 0.4357 0.5286 1 2 0.0405 0.4392 0.5203
chr6 84763926 C CCGGCCCAGACGT 0.500000 0.100 1 12 1 259 67 192 39 0 8 0 20 0 0 183 0 9 0.5821 0.0000 0.0469 7.375 0.56 9.90 -9.34 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4600 0.4766 0.0634 1 1 0.4549 0.4775 0.0676 1 1 0.4476 0.4787 0.0736
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 591 152 439 142 0 6 0 4 0 0 438 0 1 0.9342 0.0000 0.0023 24.333 0.42 3.25 -2.83 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0203 0.9797 0.0000 0 0 0.8543 0.1457 0.0000 0 0 0.9754 0.0246 0.0000
chr6 110958771 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 1 236 96 140 49 1 5 1 40 0 0 138 0 2 0.5104 0.0000 0.0143 18.200 0.22 3.12 -2.90 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3538 0.5579 0.0883 1 1 0.3536 0.5532 0.0931 1 1 0.3528 0.5475 0.0997
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 714 166 548 8 0 10 0 148 0 0 537 0 11 0.0482 0.0000 0.0201 15.600 0.38 3.28 -2.91 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.6402 0.3598 2 2 0.0000 0.0704 0.9296
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 667 164 503 160 0 2 0 2 0 0 503 0 0 0.9756 0.0000 0.0000 81.000 0.54 7.00 -6.46 42 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9761 0.0239 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 362 113 249 12 0 0 0 101 0 0 247 0 2 0.1062 0.0000 0.0080 113.000 0.08 1.23 -1.14 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9365 0.0635
chr6 138773755 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 447 131 316 67 0 0 0 64 0 0 316 0 0 0.5115 0.0000 0.0000 131.000 0.22 1.14 -0.92 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2285 0.6454 0.1261 1 1 0.2333 0.6349 0.1317 1 1 0.2392 0.6216 0.1392
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 927 237 690 207 0 8 0 22 0 1 688 0 1 0.8734 0.0000 0.0029 28.625 0.28 3.09 -2.81 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0093 0.9907 0.0000
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 155 66 89 9 0 2 0 55 0 0 89 0 0 0.1364 0.0000 0.0000 32.000 0.22 4.02 -3.80 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.9572 0.0428
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 484 185 299 0 0 39 1 145 0 0 283 0 16 0.0000 0.0000 0.0535 3.744 14.75 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 382 123 259 58 0 1 0 64 0 0 254 0 5 0.4715 0.0000 0.0193 122.000 0.26 5.67 -5.41 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0477 0.5296 0.4226 1 1 0.0519 0.5262 0.4220 1 1 0.0577 0.5220 0.4202
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 196 66 130 34 0 5 0 27 0 0 128 0 2 0.5152 0.0000 0.0154 12.200 0.09 7.63 -7.54 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3300 0.5476 0.1225 1 1 0.3292 0.5439 0.1269 1 1 0.3277 0.5393 0.1329
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 314 137 177 0 0 26 13 98 0 0 172 1 4 0.0000 0.0000 0.0282 4.231 3.19 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 961 316 645 10 9 24 129 144 0 0 645 0 0 0.0316 0.0000 0.0000 12.600 2.50 5.34 -2.84 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9449 0.0551 2 2 0.0000 0.0865 0.9135
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 959 287 672 122 52 19 39 55 1 0 670 1 0 0.4251 0.0015 0.0030 15.214 3.23 8.24 -5.01 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9951 0.0049 0.0000 1 0 0.9941 0.0059 0.0000 1 0 0.9923 0.0076 0.0000
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 958 290 668 131 49 37 25 48 0 0 667 1 0 0.4517 0.0000 0.0015 12.632 3.14 7.69 -4.55 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 238 79 159 32 3 3 1 40 0 0 154 0 5 0.4051 0.0000 0.0314 25.333 0.84 4.05 -3.21 14 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0529 0.4715 0.4756 1 1 0.0570 0.4724 0.4706 1 1 0.0628 0.4738 0.4635
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 244 99 145 43 0 22 0 34 0 0 145 0 0 0.4343 0.0000 0.0000 3.500 1.51 3.88 -2.37 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4366 0.4971 0.0663 1 1 0.4328 0.4965 0.0707 1 1 0.4272 0.4960 0.0768
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 244 100 144 70 1 21 0 8 0 0 143 0 1 0.7000 0.0000 0.0069 3.762 2.27 4.75 -2.48 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 1 0.0886 0.9114 0.0000
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 778 178 600 169 1 4 0 4 0 0 600 0 0 0.9494 0.0000 0.0000 43.500 0.50 12.00 -11.50 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4436 0.5564 0.0000 0 0 0.9857 0.0143 0.0000 0 0 0.9966 0.0034 0.0000
chr7 4803582 C CCTGCCAGGG 0.500000 0.100 1 9 2 222 104 118 92 0 5 0 7 0 0 118 0 0 0.8846 0.0000 0.0000 19.800 0.77 7.29 -6.51 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0543 0.9457 0.0000 0 1 0.4929 0.5071 0.0000
chr7 5312956 CGAAGAG C 0.500000 0.100 1 -6 1 645 104 541 89 1 10 0 4 0 0 541 0 0 0.8558 0.0000 0.0000 9.400 1.24 7.75 -6.51 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 0 0.5587 0.4413 0.0000 0 0 0.8581 0.1419 0.0000
chr7 5428065 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 1363 313 1050 171 3 1 1 137 0 0 1050 0 0 0.5463 0.0000 0.0000 312.000 1.22 1.91 -0.69 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7904 0.2090 0.0006 1 0 0.7866 0.2125 0.0009 1 0 0.7804 0.2184 0.0012
chr7 11831842 GAGCAGCGGCAGCGGCAGC G 0.500000 0.100 1 -18 2 174 84 90 80 0 2 0 2 0 0 90 0 0 0.9524 0.0000 0.0000 41.000 1.29 9.50 -8.21 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4091 0.5909 0.0000 0 0 0.8660 0.1340 0.0000 0 0 0.9308 0.0692 0.0000
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 629 194 435 76 0 31 3 84 0 0 434 0 1 0.3918 0.0000 0.0023 5.258 0.47 3.12 -2.65 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0378 0.5548 0.4074 1 1 0.0416 0.5490 0.4093 1 1 0.0471 0.5421 0.4107
chr7 19117045 T TGCCGCCGCCGCCGCCCGCGCC 0.500000 0.100 1 21 1 518 117 401 57 0 30 0 30 0 0 393 0 8 0.4872 0.0000 0.0200 2.900 0.54 11.27 -10.72 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6632 0.3214 0.0153 1 0 0.6536 0.3289 0.0175 1 0 0.6401 0.3391 0.0207
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.100 1 3 2 395 90 305 57 0 3 1 29 0 0 305 0 0 0.6333 0.0000 0.0000 29.000 0.04 3.00 -2.96 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8227 0.1734 0.0039 1 0 0.8115 0.1837 0.0047 1 0 0.7957 0.1982 0.0061
chr7 20785321 AGCC A 0.500000 0.100 1 -3 2 438 99 339 76 3 14 1 5 1 2 336 0 0 0.7677 0.0029 0.0088 6.385 1.33 3.40 -2.07 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.1902 0.8098 0.0000 0 0 0.6438 0.3562 0.0000
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 307 80 227 45 0 3 0 32 0 0 226 0 1 0.5625 0.0000 0.0044 25.667 0.00 3.47 -3.47 9 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5037 0.4496 0.0467 1 0 0.4977 0.4518 0.0506 1 0 0.4891 0.4548 0.0561
chr7 29884016 GCCCCCTCCCACCCCA G 0.500000 0.100 1 -15 4 364 86 278 70 0 9 2 5 0 0 278 0 0 0.8140 0.0000 0.0000 8.444 1.71 9.80 -8.09 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0647 0.9353 0.0000 0 1 0.3898 0.6102 0.0000
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 116 47 69 26 2 1 3 15 0 0 68 1 0 0.5532 0.0000 0.0145 44.000 0.19 1.20 -1.01 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4527 0.4691 0.0782 1 1 0.4466 0.4709 0.0825 1 1 0.4383 0.4732 0.0886
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 494 132 362 125 1 2 0 4 0 0 362 0 0 0.9470 0.0000 0.0000 65.000 0.59 1.00 -0.41 95 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0818 0.9182 0.0000 0 0 0.8852 0.1148 0.0000 0 0 0.9721 0.0279 0.0000
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 179 63 116 34 1 0 0 28 0 0 115 0 1 0.5397 0.0000 0.0086 63.000 0.09 3.54 -3.45 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3552 0.5366 0.1082 1 1 0.3536 0.5337 0.1127 1 1 0.3510 0.5301 0.1189
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 199 75 124 5 0 2 0 68 0 0 122 0 2 0.0667 0.0000 0.0161 36.500 0.00 2.96 -2.96 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8614 0.1386 2 2 0.0000 0.4532 0.5468
chr7 56081643 C CG 0.500000 0.100 1 1 5 488 107 381 95 1 3 0 8 0 0 381 0 0 0.8879 0.0000 0.0000 34.333 0.40 1.38 -0.97 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0244 0.9756 0.0000 0 1 0.3863 0.6137 0.0000
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 875 201 674 6 3 182 0 10 2 1 670 1 0 0.0299 0.0030 0.0059 0.106 7.00 4.10 2.90 6 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5436 0.3986 0.0579 1 0 0.5329 0.4052 0.0618 1 0 0.5151 0.4179 0.0669
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.100 1 2 1 873 197 676 6 172 11 0 8 1 1 674 0 0 0.0305 0.0015 0.0030 1.889 7.00 3.50 3.50 6 0/1 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1428 0.8572 0.0000 0 0 0.7948 0.2052 0.0000
chr7 65954366 T TTTA 0.500000 0.100 1 3 5 251 69 182 35 0 9 1 24 0 0 181 0 1 0.5072 0.0000 0.0055 6.667 0.37 3.04 -2.67 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4428 0.4843 0.0729 1 1 0.4379 0.4848 0.0773 1 1 0.4310 0.4856 0.0834
chr7 73570587 CGTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 622 175 447 94 0 2 0 79 0 0 441 0 6 0.5371 0.0000 0.0134 86.500 0.24 3.15 -2.91 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3185 0.6280 0.0535 1 1 0.3237 0.6181 0.0582 1 1 0.3295 0.6056 0.0649
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 562 145 417 139 0 1 0 5 0 0 417 0 0 0.9586 0.0000 0.0000 144.000 0.32 1.80 -1.48 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0179 0.9821 0.0000 0 0 0.8351 0.1649 0.0000 0 0 0.9717 0.0283 0.0000
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 800 195 605 0 0 13 0 182 0 0 600 1 4 0.0000 0.0000 0.0083 14.000 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 553 136 417 64 0 12 0 60 0 2 411 1 3 0.4706 0.0000 0.0144 10.333 0.59 3.47 -2.87 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2066 0.6492 0.1442 1 1 0.2117 0.6385 0.1498 1 1 0.2180 0.6249 0.1571
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 230 84 146 83 0 0 0 1 0 0 146 0 0 0.9881 0.0000 0.0000 84.000 0.65 3.00 -2.35 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8817 0.1183 0.0000 0 0 0.9561 0.0439 0.0000 0 0 0.9673 0.0327 0.0000
chr7 99652770 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 165 42 123 39 0 1 0 2 0 0 123 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 41.000 1.10 1.00 0.10 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0801 0.9199 0.0000 0 1 0.4554 0.5446 0.0000 0 0 0.6479 0.3521 0.0000
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 738 224 514 212 3 4 0 5 0 0 513 0 1 0.9464 0.0000 0.0019 55.000 0.24 4.00 -3.76 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0849 0.9151 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr7 100075318 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 546 165 381 148 1 9 0 7 1 0 379 1 0 0.8970 0.0026 0.0052 17.222 0.26 1.00 -0.74 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4503 0.5497 0.0000 0 0 0.9287 0.0713 0.0000
chr7 100124796 CAGGAGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 640 210 430 194 0 6 0 10 0 0 430 0 0 0.9238 0.0000 0.0000 34.000 0.26 5.60 -5.34 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2773 0.7227 0.0000 0 0 0.9524 0.0476 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 537 158 379 77 1 4 0 76 0 0 376 0 3 0.4873 0.0000 0.0079 38.500 0.23 3.24 -3.00 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1424 0.6823 0.1754 1 1 0.1487 0.6696 0.1817 1 1 0.1570 0.6533 0.1897
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 433 108 325 0 1 37 1 69 0 0 310 0 15 0.0000 0.0000 0.0462 1.892 8.25 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0142 0.9858 2 2 0.0000 0.0153 0.9847 2 2 0.0000 0.0171 0.9829
chr7 103989356 T TGCCGCCGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 15 1 433 108 325 9 25 34 2 38 0 0 310 0 15 0.0833 0.0000 0.0462 2.176 7.89 8.87 -0.98 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0109 0.2735 0.7155 1 2 0.0127 0.2826 0.7047 1 2 0.0153 0.2951 0.6896
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 724 195 529 75 1 17 1 101 0 0 528 0 1 0.3846 0.0000 0.0019 10.471 0.21 3.97 -3.76 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0035 0.2469 0.7496 1 2 0.0043 0.2537 0.7420 1 2 0.0055 0.2635 0.7310
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 577 198 379 14 0 28 6 150 0 0 378 1 0 0.0707 0.0000 0.0026 6.071 0.50 15.38 -14.88 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.7974 0.2026
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 320 175 145 145 3 15 0 12 0 0 144 0 1 0.8286 0.0000 0.0069 10.667 0.48 6.25 -5.77 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.2382 0.7618 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 226 77 149 0 0 2 0 75 0 0 148 0 1 0.0000 0.0000 0.0067 37.500 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0203 0.9797 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 899 275 624 2 0 56 7 210 0 0 619 0 5 0.0073 0.0000 0.0080 3.911 1.50 3.14 -1.64 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1941 505 1436 469 2 24 0 10 0 0 1435 0 1 0.9287 0.0000 0.0007 20.042 0.32 1.40 -1.08 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4358 0.5642 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 665 146 519 82 0 6 0 58 0 0 512 0 7 0.5616 0.0000 0.0135 23.333 0.32 4.03 -3.72 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5565 0.4244 0.0191 1 0 0.5525 0.4258 0.0216 1 0 0.5463 0.4283 0.0254
chr7 144258792 GAGGCTGTGAAACAGC G 0.500000 0.100 1 -15 3 306 91 215 56 0 1 0 34 1 0 204 0 10 0.6154 0.0047 0.0512 90.000 0.23 15.18 -14.94 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5049 0.4568 0.0384 1 0 0.5000 0.4580 0.0420 1 0 0.4929 0.4599 0.0472
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.100 1 -4 1 719 423 296 407 1 6 0 9 0 0 296 0 0 0.9622 0.0000 0.0000 69.500 1.09 4.44 -3.35 113 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6886 0.3114 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 195 53 142 7 0 3 0 43 0 0 139 0 3 0.1321 0.0000 0.0211 16.667 0.57 4.40 -3.82 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9943 0.0057 2 1 0.0000 0.9056 0.0944
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 708 204 504 179 0 4 0 21 0 0 503 0 1 0.8775 0.0000 0.0020 50.000 0.91 1.05 -0.14 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0044 0.9956 0.0000
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 443 112 331 109 0 0 0 3 1 0 330 0 0 0.9732 0.0030 0.0030 112.000 1.21 1.00 0.21 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2619 0.7381 0.0000 0 0 0.9092 0.0908 0.0000 0 0 0.9681 0.0319 0.0000
chr7 149821443 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 635 171 464 13 0 4 1 153 0 0 463 0 1 0.0760 0.0000 0.0022 41.500 0.62 1.48 -0.86 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 1 0.0000 0.6953 0.3047
chr7 150331068 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 640 159 481 77 0 4 0 78 0 0 481 0 0 0.4843 0.0000 0.0000 38.750 0.23 2.00 -1.77 49 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1452 0.6805 0.1743 1 1 0.1515 0.6679 0.1806 1 1 0.1597 0.6517 0.1886
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 513 96 417 0 0 1 8 87 0 0 386 11 20 0.0000 0.0000 0.0743 95.000 7.69 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 517 95 422 0 1 2 9 83 0 1 387 16 18 0.0000 0.0000 0.0829 92.000 8.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0030 0.9970
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 527 92 435 0 1 2 2 87 0 1 358 22 54 0.0000 0.0000 0.1770 44.500 7.74 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 635 213 422 202 1 1 0 9 0 0 422 0 0 0.9484 0.0000 0.0000 212.000 0.35 1.11 -0.76 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6371 0.3629 0.0000 0 0 0.9833 0.0167 0.0000
chr7 154968830 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 1321 337 984 291 4 30 0 12 3 1 979 0 1 0.8635 0.0030 0.0051 10.233 0.67 3.17 -2.50 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7531 0.2469 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 753 166 587 12 0 17 0 137 0 0 583 0 4 0.0723 0.0000 0.0068 8.765 0.50 6.18 -5.68 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 1 0.0000 0.6654 0.3346
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.100 1 -6 2 681 147 534 5 0 33 2 107 1 0 532 0 1 0.0340 0.0019 0.0037 3.455 0.80 6.31 -5.51 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7268 0.2732 2 2 0.0000 0.1996 0.8004
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 290 98 192 43 0 0 0 55 0 0 190 0 2 0.4388 0.0000 0.0104 98.000 0.28 3.15 -2.87 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0380 0.4551 0.5069 1 2 0.0418 0.4573 0.5010 1 2 0.0473 0.4603 0.4924
chr8 10610119 T TTTC 0.070211 0.100 1 3 1 888 262 626 25 2 23 61 151 0 0 612 0 14 0.0954 0.0000 0.0224 10.889 3.24 6.03 -2.79 13 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr8 10622785 T TG 0.002736 0.100 1 1 2 661 151 510 80 0 7 0 64 0 0 510 0 0 0.5298 0.0000 0.0000 20.571 0.39 1.28 -0.89 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7061 0.2938 0.0001 1 0 0.7045 0.2954 0.0001 1 0 0.7016 0.2982 0.0001
chr8 11808709 G GTCCCACTCCCAC 0.014168 0.100 1 12 1 518 215 303 151 1 53 0 10 0 1 300 0 2 0.7023 0.0000 0.0099 3.176 6.72 9.70 -2.98 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2806 0.7194 0.0000 0 0 0.9805 0.0195 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 518 225 293 14 0 45 5 161 0 0 292 0 1 0.0622 0.0000 0.0034 4.000 7.00 6.36 0.64 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9792 0.0208 2 2 0.0000 0.1382 0.8618
chr8 11808709 GTCCCACTCCCACTCCCAC G 0.000958 0.100 1 -18 1 519 241 278 206 1 27 0 7 0 0 278 0 0 0.8548 0.0000 0.0000 7.926 4.95 14.57 -9.62 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8745 0.1255 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 316 140 176 79 1 7 0 53 0 0 175 0 1 0.5643 0.0000 0.0057 19.000 0.49 7.47 -6.98 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8452 0.1536 0.0012 1 0 0.8383 0.1602 0.0015 1 0 0.8285 0.1697 0.0019
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 219 95 124 46 0 0 1 48 0 0 124 0 0 0.4842 0.0000 0.0000 95.000 0.04 4.08 -4.04 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2054 0.6306 0.1640 1 1 0.2122 0.6221 0.1658 1 1 0.2210 0.6112 0.1678
chr8 28351708 G GGCA 0.000764 0.100 1 3 1 285 96 189 45 0 18 0 33 0 0 187 0 2 0.4688 0.0000 0.0106 4.333 0.42 3.36 -2.94 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6452 0.3548 0.0001 1 0 0.6432 0.3567 0.0001 1 0 0.6402 0.3597 0.0001
chr8 33496717 A AGAT 0.026718 0.100 1 3 5 159 61 98 47 0 9 0 5 0 0 98 0 0 0.7705 0.0000 0.0000 5.778 0.47 3.00 -2.53 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 0 0.6502 0.3498 0.0000 0 0 0.9351 0.0649 0.0000
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 551 181 370 104 0 3 0 74 0 0 367 0 3 0.5746 0.0000 0.0081 59.333 0.42 3.42 -3.00 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7856 0.2121 0.0023 1 0 0.7791 0.2182 0.0028 1 0 0.7695 0.2269 0.0036
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 208 78 130 36 0 0 0 42 0 0 130 0 0 0.4615 0.0000 0.0000 78.000 0.44 2.26 -1.82 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1042 0.5536 0.3422 1 1 0.1089 0.5494 0.3417 1 1 0.1153 0.5442 0.3405
chr8 93728272 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 92 35 57 33 0 0 0 2 0 0 57 0 0 0.9429 0.0000 0.0000 35.000 0.06 3.00 -2.94 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0594 0.9406 0.0000 0 1 0.3820 0.6180 0.0000 0 0 0.5788 0.4212 0.0000
chr8 100596815 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 238 92 146 87 0 2 0 3 0 0 146 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 45.000 0.31 1.33 -1.02 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0990 0.9010 0.0000 0 0 0.7605 0.2395 0.0000 0 0 0.9087 0.0913 0.0000
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 303 93 210 83 1 1 0 8 0 0 210 0 0 0.8925 0.0000 0.0000 91.000 0.28 2.50 -2.22 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0122 0.9878 0.0000 0 1 0.2445 0.7555 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 640 209 431 120 0 4 0 85 0 0 431 0 0 0.5742 0.0000 0.0000 51.250 0.93 18.14 -17.22 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8538 0.1453 0.0008 1 0 0.8463 0.1527 0.0011 1 0 0.8351 0.1634 0.0015
chr8 116771753 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 334 88 246 84 0 1 0 3 0 0 246 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 87.000 0.26 4.00 -3.74 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0842 0.9158 0.0000 0 0 0.7313 0.2687 0.0000 0 0 0.8957 0.1043 0.0000
chr8 116938485 AGGCGGC A 0.500000 0.100 1 -6 2 404 157 247 121 1 28 0 7 0 0 247 0 0 0.7707 0.0000 0.0000 4.607 0.60 6.14 -5.55 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1944 0.8056 0.0000 0 0 0.7972 0.2028 0.0000
chr8 120811814 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 3 403 105 298 81 3 18 0 3 0 0 298 0 0 0.7714 0.0000 0.0000 4.833 1.06 9.33 -8.27 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0928 0.9072 0.0000 0 0 0.7357 0.2643 0.0000 0 0 0.8967 0.1033 0.0000
chr8 123369942 A ATCG 0.500000 0.100 1 3 1 339 119 220 104 2 3 1 9 0 0 220 0 0 0.8739 0.0000 0.0000 38.000 0.38 2.78 -2.39 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0119 0.9881 0.0000 0 1 0.3200 0.6800 0.0000
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 400 175 225 167 0 1 0 7 0 0 225 0 0 0.9543 0.0000 0.0000 174.000 0.14 4.00 -3.86 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.7085 0.2915 0.0000 0 0 0.9737 0.0263 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 419 116 303 1 0 23 7 85 0 0 298 0 5 0.0086 0.0000 0.0165 4.043 3.00 4.60 -1.60 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0617 0.9383 2 2 0.0000 0.0223 0.9777 2 2 0.0000 0.0169 0.9831
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 885 152 733 82 0 5 0 65 0 0 733 0 0 0.5395 0.0000 0.0000 29.400 0.41 3.11 -2.69 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5565 0.4244 0.0191 1 0 0.5525 0.4258 0.0216 1 0 0.5463 0.4283 0.0254
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.100 1 2 3 1242 271 971 257 4 4 0 6 1 0 970 0 0 0.9483 0.0010 0.0010 66.750 0.75 6.17 -5.42 33 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8521 0.1479 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.100 1 -2 4 1245 275 970 225 35 8 0 7 0 0 970 0 0 0.8182 0.0000 0.0000 31.500 0.70 5.43 -4.73 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3329 0.6671 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 1124 347 777 236 8 74 1 28 0 0 776 1 0 0.6801 0.0000 0.0013 3.689 0.28 3.14 -2.86 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0081 0.9919 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 281 85 196 5 0 11 1 68 0 0 186 0 10 0.0588 0.0000 0.0510 6.727 2.20 7.09 -4.89 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.7987 0.2013 2 2 0.0000 0.3489 0.6511
chr9 25678179 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 3 509 115 394 94 1 15 0 5 0 0 393 0 1 0.8174 0.0000 0.0025 6.667 0.72 3.00 -2.28 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1621 0.8379 0.0000 0 0 0.6812 0.3188 0.0000
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 742 204 538 0 0 5 1 198 0 0 538 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 39.800 1.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 723 172 551 90 0 28 0 54 0 0 545 0 6 0.5233 0.0000 0.0109 5.143 0.43 11.22 -10.79 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8224 0.1754 0.0021 1 0 0.8132 0.1841 0.0027 1 0 0.8000 0.1964 0.0036
chr9 39357140 A AGGGCGG 0.500000 0.100 1 6 1 199 104 95 71 1 2 1 29 0 0 94 0 1 0.6827 0.0000 0.0105 51.000 0.10 6.28 -6.18 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9459 0.0539 0.0003 1 0 0.9394 0.0602 0.0004 1 0 0.9296 0.0699 0.0006
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 229 26 203 23 2 0 0 1 0 0 203 0 0 0.8846 0.0000 0.0000 26.000 0.30 1.00 -0.70 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2800 0.7200 0.0000 0 0 0.5460 0.4540 0.0000 0 0 0.6391 0.3609 0.0000
chr9 70140212 TAAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 203 80 123 54 0 0 0 26 0 0 123 0 0 0.6750 0.0000 0.0000 80.000 0.13 3.12 -2.99 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8415 0.1553 0.0033 1 0 0.8304 0.1656 0.0040 1 0 0.8146 0.1802 0.0052
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 444 134 310 72 0 2 0 60 0 0 303 0 7 0.5373 0.0000 0.0226 66.000 0.10 13.90 -13.80 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2645 0.6373 0.0982 1 1 0.2690 0.6273 0.1037 1 1 0.2742 0.6146 0.1112
chr9 76703941 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 447 129 318 119 1 3 0 6 0 0 318 0 0 0.9225 0.0000 0.0000 41.667 0.34 3.00 -2.66 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.4005 0.5995 0.0000 0 0 0.8769 0.1231 0.0000
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 662 159 503 141 0 11 0 7 0 0 502 0 1 0.8868 0.0000 0.0020 13.455 0.28 10.29 -10.00 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1861 0.8139 0.0000 0 0 0.8465 0.1535 0.0000
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 485 135 350 71 1 3 0 60 0 0 349 0 1 0.5259 0.0000 0.0029 44.000 0.25 3.35 -3.10 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4152 0.5375 0.0472 1 1 0.4151 0.5335 0.0514 1 1 0.4141 0.5286 0.0572
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 262 84 178 6 0 12 38 28 0 0 178 0 0 0.0714 0.0000 0.0000 6.000 0.17 3.29 -3.12 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9566 0.0434 2 1 0.0000 0.6570 0.3430
chr9 92474742 CTCATCA C 0.500000 0.100 1 -6 2 262 84 178 7 0 37 2 38 0 0 178 0 0 0.0833 0.0000 0.0000 1.278 0.14 6.16 -6.02 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.9956 0.0044 2 1 0.0000 0.9317 0.0683
chr9 93259450 TTGCCCCCGCAACCCACACGGCCCCCTCAACCTGTGC T 0.500000 0.100 1 -36 1 433 104 329 94 0 5 0 5 0 0 329 0 0 0.9038 0.0000 0.0000 19.800 0.89 17.00 -16.11 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.3478 0.6522 0.0000 0 0 0.7945 0.2055 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 416 178 238 73 0 5 1 99 0 0 238 0 0 0.4101 0.0000 0.0000 34.400 0.48 9.00 -8.52 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0037 0.2458 0.7506 1 2 0.0045 0.2528 0.7427 1 2 0.0058 0.2629 0.7313
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 682 245 437 48 9 2 0 186 1 1 428 0 7 0.1959 0.0023 0.0206 121.500 7.79 3.28 4.51 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0140 0.9860 2 1 0.0000 0.9991 0.0009
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 350 79 271 0 0 11 0 68 0 0 271 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.182 5.13 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0299 0.9701 2 2 0.0000 0.0320 0.9680 2 2 0.0000 0.0351 0.9649
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 792 121 671 4 0 26 2 89 0 1 663 1 6 0.0331 0.0000 0.0119 3.654 0.50 6.70 -6.20 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9829 0.0171 2 2 0.0000 0.3789 0.6211 2 2 0.0000 0.1127 0.8873
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 458 116 342 7 0 0 0 109 0 0 342 0 0 0.0603 0.0000 0.0000 116.000 0.57 2.91 -2.34 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8812 0.1188 2 2 0.0000 0.3104 0.6896
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 819 151 668 11 0 2 0 138 0 0 667 0 1 0.0728 0.0000 0.0015 74.500 0.09 4.98 -4.89 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9916 0.0084 2 1 0.0000 0.5781 0.4219
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 739 181 558 18 0 3 3 157 0 1 554 0 3 0.0994 0.0000 0.0072 58.667 0.28 2.94 -2.66 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9864 0.0136
chr9 104695275 G GTGAA 0.500000 0.100 1 4 2 505 127 378 123 0 0 0 4 0 0 378 0 0 0.9685 0.0000 0.0000 127.000 1.30 4.75 -3.45 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0678 0.9322 0.0000 0 0 0.8681 0.1319 0.0000 0 0 0.9677 0.0323 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 261 93 168 0 0 3 0 90 0 0 164 0 4 0.0000 0.0000 0.0238 30.000 4.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0103 0.9897
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 490 100 390 0 0 19 2 79 0 0 389 0 1 0.0000 0.0000 0.0026 4.263 6.10 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0151 0.9849 2 2 0.0000 0.0164 0.9836 2 2 0.0000 0.0184 0.9816
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 627 122 505 112 0 5 0 5 0 0 505 0 0 0.9180 0.0000 0.0000 23.400 0.30 6.60 -6.30 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 0 0.5671 0.4329 0.0000 0 0 0.9025 0.0975 0.0000
chr9 122093180 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 615 185 430 135 6 32 1 11 0 0 430 0 0 0.7297 0.0000 0.0000 4.781 0.30 3.18 -2.88 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.3032 0.6968 0.0000
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 477 161 316 0 0 5 0 156 0 0 313 0 3 0.0000 0.0000 0.0095 31.200 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 622 189 433 3 0 19 1 166 0 0 425 0 8 0.0159 0.0000 0.0185 8.895 1.00 7.54 -6.54 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0952 0.9048 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 447 114 333 7 3 33 5 66 0 0 330 0 3 0.0614 0.0000 0.0090 2.455 1.29 5.03 -3.74 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.9267 0.0733
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 212 84 128 40 0 0 0 44 0 0 127 0 1 0.4762 0.0000 0.0078 84.000 2.00 2.64 -0.64 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1153 0.5741 0.3106 1 1 0.1201 0.5685 0.3114 1 1 0.1265 0.5615 0.3120
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 212 84 128 40 0 0 0 44 0 0 127 0 1 0.4762 0.0000 0.0078 84.000 2.00 2.64 -0.64 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1153 0.5741 0.3106 1 1 0.1201 0.5685 0.3114 1 1 0.1265 0.5615 0.3120
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 293 100 193 43 0 4 0 53 0 0 191 0 2 0.4300 0.0000 0.0104 24.000 0.09 1.60 -1.51 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0446 0.4740 0.4814 1 2 0.0485 0.4743 0.4772 1 1 0.0540 0.4751 0.4709
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 428 122 306 59 0 1 0 62 0 0 306 0 0 0.4836 0.0000 0.0000 121.000 0.24 1.39 -1.15 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1301 0.6341 0.2358 1 1 0.1355 0.6244 0.2401 1 1 0.1427 0.6120 0.2453
chr9 135945095 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 273 81 192 74 0 3 0 4 0 0 192 0 0 0.9136 0.0000 0.0000 26.000 0.32 3.00 -2.68 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 1 0.3629 0.6371 0.0000 0 0 0.7357 0.2643 0.0000
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 569 163 406 123 3 26 1 10 0 0 406 0 0 0.7546 0.0000 0.0000 5.269 0.55 3.30 -2.75 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 1 0.2809 0.7191 0.0000
chr9 137228812 CCT C 0.500000 0.100 1 -2 4 436 85 351 78 1 0 0 6 0 0 351 0 0 0.9176 0.0000 0.0000 85.000 0.46 2.00 -1.54 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0800 0.9200 0.0000 0 1 0.4956 0.5044 0.0000
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 210 95 115 2 3 19 0 71 0 0 115 0 0 0.0211 0.0000 0.0000 4.000 0.00 3.44 -3.44 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9963 0.0037 2 1 0.0000 0.7554 0.2446 2 2 0.0000 0.3682 0.6318
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 792 168 624 93 0 8 0 67 0 0 618 0 6 0.5536 0.0000 0.0096 20.000 0.19 8.76 -8.57 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7536 0.2457 0.0007 1 0 0.7508 0.2484 0.0008 1 0 0.7462 0.2528 0.0010
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 295 71 224 64 0 0 0 7 0 0 224 0 0 0.9014 0.0000 0.0000 71.000 1.14 1.00 0.14 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.5114 0.4886 0.0000 0 0 0.9483 0.0517 0.0000
chr10 13657133 CCGCCCCCCG C 0.028316 0.100 1 -9 1 701 148 553 10 0 20 1 117 0 0 544 0 9 0.0676 0.0000 0.0163 6.400 0.30 8.29 -7.99 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9779 0.0221
chr10 15719771 TCTCC T 0.162657 0.100 1 -4 1 186 32 154 21 0 0 0 11 0 0 154 0 0 0.6562 0.0000 0.0000 32.000 0.24 5.45 -5.22 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6471 0.3356 0.0173 1 0 0.6404 0.3411 0.0185 1 0 0.6309 0.3489 0.0202
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 215 80 135 71 0 3 0 6 0 0 135 0 0 0.8875 0.0000 0.0000 25.667 0.39 4.00 -3.61 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1996 0.8004 0.0000 0 0 0.7403 0.2597 0.0000
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 801 177 624 67 2 21 0 87 0 0 616 1 7 0.3785 0.0000 0.0128 7.381 0.57 5.44 -4.87 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0041 0.2470 0.7489 1 2 0.0050 0.2545 0.7405 1 2 0.0064 0.2653 0.7283
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 650 129 521 116 0 7 0 6 0 0 521 0 0 0.8992 0.0000 0.0000 17.429 0.21 3.50 -3.29 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.6157 0.3843 0.0000 0 0 0.9450 0.0550 0.0000
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 314 142 172 139 0 1 0 2 0 0 172 0 0 0.9789 0.0000 0.0000 141.000 0.14 2.00 -1.86 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 496 111 385 94 1 5 0 11 0 0 385 0 0 0.8468 0.0000 0.0000 21.200 0.47 1.09 -0.62 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 1 0.1456 0.8544 0.0000
chr10 44292818 AC A 0.006843 0.100 1 -1 1 425 154 271 128 5 10 0 11 0 0 271 0 0 0.8312 0.0000 0.0000 14.300 0.47 2.18 -1.71 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4921 0.5079 0.0000 0 0 0.9877 0.0123 0.0000
chr10 45792308 AGCCGATCT A 0.000667 0.100 1 -8 5 173 93 80 79 0 0 0 14 0 0 80 0 0 0.8495 0.0000 0.0000 93.000 0.23 8.14 -7.92 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0254 0.9746 0.0000 0 0 0.8966 0.1034 0.0000
chr10 51697903 CTGTATACCTCCTCCT C 0.001304 0.100 1 -15 5 780 185 595 98 2 22 0 63 0 0 591 0 4 0.5297 0.0000 0.0067 7.364 0.24 12.17 -11.93 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9192 0.0808 0.0000 1 0 0.9144 0.0856 0.0000 1 0 0.9073 0.0927 0.0000
chr10 53807071 A AGTT 0.002532 0.100 1 3 2 280 78 202 70 0 5 0 3 0 0 202 0 0 0.8974 0.0000 0.0000 14.600 0.33 3.00 -2.67 40 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9467 0.0533 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.100 1 -3 1 568 182 386 175 0 3 0 4 0 0 386 0 0 0.9615 0.0000 0.0000 59.667 0.26 3.25 -2.99 43 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9968 0.0032 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 63208190 ACTAAAC A 0.035276 0.100 1 -6 1 767 182 585 97 0 9 0 76 0 0 580 0 5 0.5330 0.0000 0.0085 19.222 0.42 6.09 -5.67 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6624 0.3366 0.0010 1 0 0.6634 0.3355 0.0011 1 0 0.6638 0.3349 0.0014
chr10 63214835 TTCA T 0.005181 0.100 1 -3 1 705 137 568 133 0 0 0 4 0 0 568 0 0 0.9708 0.0000 0.0000 137.000 0.41 3.00 -2.59 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9588 0.0412 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 73240978 AGCGGAG A 0.006364 0.100 1 -6 3 123 55 68 31 0 1 0 23 0 0 68 0 0 0.5636 0.0000 0.0000 54.000 0.23 13.48 -13.25 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6072 0.3918 0.0009 1 0 0.6055 0.3936 0.0010 1 0 0.6028 0.3961 0.0011
chr10 73240989 ACCAGTCTCT A 0.006454 0.100 1 -9 1 122 54 68 33 0 1 0 20 0 0 66 0 2 0.6111 0.0000 0.0294 53.000 0.21 14.75 -14.54 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6828 0.3167 0.0005 1 0 0.6784 0.3210 0.0006 1 0 0.6724 0.3270 0.0007
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 376 89 287 26 0 22 1 40 0 0 286 0 1 0.2921 0.0000 0.0035 3.045 1.00 3.62 -2.62 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0728 0.5918 0.3354 1 1 0.0798 0.5950 0.3252 1 1 0.0898 0.5986 0.3116
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 427 168 259 145 4 9 0 10 0 1 258 0 0 0.8631 0.0000 0.0039 17.556 0.38 5.10 -4.72 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.8385 0.1615 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 202 37 165 33 1 1 0 2 0 1 163 0 1 0.8919 0.0000 0.0121 36.000 0.24 1.00 -0.76 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0683 0.9317 0.0000 0 0 0.6712 0.3288 0.0000 0 0 0.8718 0.1282 0.0000
chr10 81875718 GACCACC G 0.001436 0.100 1 -6 1 466 124 342 118 0 4 0 2 1 0 341 0 0 0.9516 0.0029 0.0029 30.000 0.75 3.50 -2.75 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 548 168 380 134 0 24 0 10 0 1 378 0 1 0.7976 0.0000 0.0053 6.000 0.29 5.90 -5.61 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0085 0.9915 0.0000 0 1 0.4269 0.5731 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 368 91 277 5 0 8 0 78 0 0 262 2 13 0.0549 0.0000 0.0542 10.375 0.60 5.85 -5.25 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.6860 0.3140 2 2 0.0000 0.2313 0.7687
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 332 129 203 122 0 1 0 6 0 0 203 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 128.000 1.11 2.67 -1.55 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 0 0.7161 0.2839 0.0000 0 0 0.9640 0.0360 0.0000
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 144 44 100 0 0 0 0 44 0 0 99 0 1 0.0000 0.0000 0.0100 44.000 2.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0371 0.9629 2 2 0.0000 0.0388 0.9612 2 2 0.0000 0.0413 0.9587
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 343 107 236 1 2 8 0 96 0 0 236 0 0 0.0093 0.0000 0.0000 12.375 0.00 2.39 -2.39 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1099 0.8901 2 2 0.0000 0.0380 0.9620 2 2 0.0000 0.0258 0.9742
chr10 128107489 T TGCTGGG 0.001110 0.100 1 6 1 1005 217 788 201 1 9 0 6 0 1 786 0 1 0.9263 0.0000 0.0025 23.000 0.52 7.33 -6.81 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8298 0.1702 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 480 151 329 141 0 4 0 6 0 0 329 0 0 0.9338 0.0000 0.0000 36.750 0.26 1.17 -0.91 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 0 0.6618 0.3382 0.0000 0 0 0.9524 0.0476 0.0000
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 734 171 563 11 0 8 1 151 0 0 556 0 7 0.0643 0.0000 0.0124 20.250 0.00 3.02 -3.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9881 0.0119 2 1 0.0000 0.5000 0.5000
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 266 86 180 5 0 2 0 79 0 0 180 0 0 0.0581 0.0000 0.0000 42.000 0.00 2.23 -2.23 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8343 0.1657 2 2 0.0000 0.4053 0.5947
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.100 1 1 1 539 165 374 9 0 6 2 148 0 0 373 0 1 0.0545 0.0000 0.0027 26.500 0.67 2.07 -1.40 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9787 0.0213 2 1 0.0000 0.5674 0.4326
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 916 179 737 6 0 73 4 96 0 0 737 0 0 0.0335 0.0000 0.0000 1.425 0.17 8.10 -7.94 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.7744 0.2256 2 2 0.0000 0.2384 0.7616
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 809 224 585 61 2 74 1 86 0 0 585 0 0 0.2723 0.0000 0.0000 2.014 0.44 11.03 -10.59 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0046 0.2481 0.7473 1 2 0.0054 0.2546 0.7399 1 2 0.0068 0.2639 0.7293
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 333 104 229 0 0 2 1 101 0 0 228 0 1 0.0000 0.0000 0.0044 50.500 2.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0067 0.9933
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 227 93 134 3 0 3 48 39 0 0 132 0 2 0.0323 0.0000 0.0149 21.000 0.00 2.33 -2.33 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9431 0.0569 2 2 0.0000 0.3597 0.6403 2 2 0.0000 0.1509 0.8491
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 227 96 131 3 1 42 0 50 0 0 131 0 0 0.0312 0.0000 0.0000 26.500 0.00 2.30 -2.30 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9569 0.0431 2 2 0.0000 0.4191 0.5809 2 2 0.0000 0.1794 0.8206
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 598 145 453 137 1 0 0 7 0 0 453 0 0 0.9448 0.0000 0.0000 144.000 0.19 4.00 -3.81 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3632 0.6368 0.0000 0 0 0.9002 0.0998 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 1163 306 857 148 0 9 1 148 1 0 853 0 3 0.4837 0.0012 0.0047 33.000 0.54 1.16 -0.62 64 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0686 0.8073 0.1242 1 1 0.0759 0.7898 0.1343 1 1 0.0860 0.7663 0.1477
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 1439 319 1120 9 0 7 1 302 0 0 1092 0 28 0.0282 0.0000 0.0250 44.571 0.67 5.91 -5.24 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9582 0.0418 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1017 267 750 13 0 9 0 245 0 0 750 0 0 0.0487 0.0000 0.0000 28.667 0.23 1.73 -1.50 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8299 0.1701 2 2 0.0000 0.0279 0.9721
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 698 130 568 0 0 14 0 116 0 0 549 0 19 0.0000 0.0000 0.0335 8.286 9.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr11 6641514 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 5 588 153 435 67 4 23 2 57 1 0 431 0 3 0.4379 0.0023 0.0092 5.652 0.30 3.30 -3.00 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3922 0.5549 0.0529 1 1 0.3929 0.5499 0.0572 1 1 0.3929 0.5437 0.0634
chr11 6891690 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 514 155 359 146 0 4 0 5 0 0 358 1 0 0.9419 0.0000 0.0028 50.333 0.27 2.40 -2.13 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0080 0.9920 0.0000 0 0 0.7719 0.2281 0.0000 0 0 0.9670 0.0330 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 249 115 134 64 0 12 2 37 0 0 134 0 0 0.5565 0.0000 0.0000 8.583 0.38 4.03 -3.65 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7782 0.2163 0.0055 1 0 0.7675 0.2260 0.0065 1 0 0.7522 0.2395 0.0082
chr11 12294797 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 524 132 392 4 43 39 3 43 0 1 390 0 1 0.0303 0.0000 0.0051 2.385 0.00 4.72 -4.72 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2086 0.6126 0.1788 1 1 0.2125 0.6043 0.1832 1 1 0.2173 0.5938 0.1888
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 15 1 524 132 392 85 1 39 1 6 0 2 390 0 0 0.6439 0.0000 0.0051 2.359 5.12 18.00 -12.88 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1038 0.8962 0.0000 0 0 0.5687 0.4313 0.0000
chr11 12294797 GCTCCTC G 0.500000 0.100 1 -6 1 524 137 387 60 0 33 0 44 0 0 386 0 1 0.4380 0.0000 0.0026 3.152 4.53 6.25 -1.72 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5531 0.4186 0.0283 1 0 0.5470 0.4217 0.0314 1 0 0.5381 0.4260 0.0359
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 212 77 135 3 0 2 0 72 0 0 133 0 2 0.0390 0.0000 0.0148 37.500 0.00 3.25 -3.25 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9476 0.0524 2 2 0.0000 0.3771 0.6229 2 2 0.0000 0.1590 0.8410
chr11 18106011 C CCGG 0.500000 0.100 1 3 3 298 146 152 76 0 11 0 59 0 0 150 0 2 0.5205 0.0000 0.0132 12.273 0.25 3.00 -2.75 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5164 0.4572 0.0264 1 0 0.5132 0.4574 0.0294 1 0 0.5080 0.4581 0.0339
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 165 84 81 77 0 2 0 5 0 0 81 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 41.000 0.42 3.00 -2.58 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1861 0.8139 0.0000 0 0 0.6290 0.3710 0.0000
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.100 1 -12 1 281 56 225 35 0 3 1 17 0 0 221 0 4 0.6250 0.0000 0.0178 17.667 0.40 10.29 -9.89 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5541 0.4039 0.0421 1 0 0.5452 0.4090 0.0458 1 0 0.5332 0.4158 0.0510
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 232 114 118 109 1 1 0 3 0 0 118 0 0 0.9561 0.0000 0.0000 112.000 0.57 6.33 -5.76 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2566 0.7434 0.0000 0 0 0.9086 0.0914 0.0000 0 0 0.9680 0.0320 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 710 213 497 11 0 10 0 192 0 0 490 0 7 0.0516 0.0000 0.0141 20.300 0.36 3.24 -2.88 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8548 0.1452 2 2 0.0000 0.0694 0.9306
chr11 55839334 TATCTC T 0.500000 0.100 1 -5 2 672 161 511 149 3 1 0 8 0 0 511 0 0 0.9255 0.0000 0.0000 158.000 0.37 4.50 -4.13 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2813 0.7187 0.0000 0 0 0.9029 0.0971 0.0000
chr11 56361197 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 466 85 381 44 0 2 0 39 0 0 381 0 0 0.5176 0.0000 0.0000 41.500 0.41 1.15 -0.74 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3123 0.5717 0.1159 1 1 0.3130 0.5663 0.1207 1 1 0.3134 0.5594 0.1271
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 1303 304 999 142 0 8 1 153 0 0 991 0 8 0.4671 0.0000 0.0080 37.000 0.20 2.41 -2.20 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0085 0.5461 0.4454 1 1 0.0101 0.5363 0.4536 1 1 0.0126 0.5249 0.4625
chr11 59124903 C CA 0.500000 0.100 1 1 3 805 197 608 152 15 16 3 11 0 0 607 1 0 0.7716 0.0000 0.0016 10.438 1.01 2.55 -1.53 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 1 0.4017 0.5983 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 78 40 38 33 0 0 0 7 0 0 38 0 0 0.8250 0.0000 0.0000 40.000 0.12 2.14 -2.02 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0384 0.9613 0.0002 0 1 0.0131 0.9868 0.0001 0 1 0.0553 0.9446 0.0000
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 279 95 184 5 2 10 1 77 0 0 184 0 0 0.0526 0.0000 0.0000 8.500 1.00 3.55 -2.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9706 0.0294 2 1 0.0000 0.6650 0.3350
chr11 68312746 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 230 99 131 81 5 7 0 6 1 0 130 0 0 0.8182 0.0076 0.0076 13.143 0.93 3.83 -2.91 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1149 0.8851 0.0000 0 0 0.5917 0.4083 0.0000
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 904 152 752 6 1 39 3 103 0 0 688 0 64 0.0395 0.0000 0.0851 2.897 0.00 5.89 -5.89 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 2 0.0000 0.2568 0.7432 2 2 0.0000 0.0226 0.9774
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1100 222 878 2 1 115 2 102 1 0 811 1 65 0.0090 0.0011 0.0763 0.904 0.00 9.10 -9.10 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1590 0.8410 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 939 239 700 0 0 4 1 234 0 0 697 0 3 0.0000 0.0000 0.0043 58.750 2.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 697 142 555 67 0 14 0 61 0 0 555 0 0 0.4718 0.0000 0.0000 9.143 0.34 3.43 -3.08 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2966 0.6131 0.0903 1 1 0.2998 0.6047 0.0955 1 1 0.3033 0.5940 0.1027
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 342 122 220 65 0 3 0 54 0 0 216 0 4 0.5328 0.0000 0.0182 39.667 0.25 15.31 -15.07 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3251 0.5938 0.0811 1 1 0.3272 0.5866 0.0862 1 1 0.3294 0.5775 0.0931
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 113 54 59 33 0 0 0 21 0 0 59 0 0 0.6111 0.0000 0.0000 54.000 0.42 2.90 -2.48 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5302 0.4207 0.0491 1 0 0.5219 0.4250 0.0530 1 0 0.5107 0.4308 0.0586
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 586 186 400 86 0 3 1 96 0 0 396 0 4 0.4624 0.0000 0.0100 60.667 0.30 4.39 -4.08 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0241 0.5225 0.4534 1 1 0.0271 0.5178 0.4551 1 1 0.0316 0.5124 0.4560
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1211 332 879 2 2 76 7 245 0 0 879 0 0 0.0060 0.0000 0.0000 3.289 5.50 8.00 -2.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 659 225 434 10 0 31 3 181 0 0 432 1 1 0.0444 0.0000 0.0046 6.226 1.90 9.89 -7.99 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7968 0.2032 2 2 0.0000 0.0692 0.9308
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 237 84 153 50 0 4 0 30 0 0 149 0 4 0.5952 0.0000 0.0261 20.000 0.24 7.70 -7.46 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6023 0.3724 0.0253 1 0 0.5936 0.3782 0.0281 1 0 0.5814 0.3862 0.0324
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 359 116 243 48 0 6 1 61 0 0 241 0 2 0.4138 0.0000 0.0082 18.333 0.73 5.80 -5.07 26 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0243 0.4073 0.5683 1 2 0.0272 0.4107 0.5621 1 2 0.0314 0.4156 0.5531
chr11 125431296 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 207 79 128 44 1 12 0 22 0 0 127 0 1 0.5570 0.0000 0.0078 5.583 0.16 3.23 -3.07 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7521 0.2382 0.0097 1 0 0.7400 0.2487 0.0113 1 0 0.7232 0.2630 0.0138
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 300 109 191 55 0 1 0 53 0 0 191 0 0 0.5046 0.0000 0.0000 108.000 0.18 1.89 -1.70 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1855 0.6334 0.1811 1 1 0.1888 0.6240 0.1872 1 1 0.1928 0.6121 0.1951
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 468 124 344 10 2 16 5 91 0 0 338 0 6 0.0806 0.0000 0.0174 6.750 0.30 3.05 -2.75 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9527 0.0473
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.100 1 1 1 568 137 431 64 0 4 0 69 0 0 428 0 3 0.4672 0.0000 0.0070 33.250 0.98 2.88 -1.90 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1493 0.7400 0.1107 1 1 0.1595 0.7292 0.1113 1 1 0.1735 0.7149 0.1117
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.100 1 -1 1 571 136 435 65 0 2 0 69 0 0 432 0 3 0.4779 0.0000 0.0069 67.000 0.97 2.87 -1.90 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1634 0.7372 0.0994 1 1 0.1738 0.7259 0.1003 1 1 0.1880 0.7109 0.1010
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 444 178 266 62 2 33 5 76 0 0 265 0 1 0.3483 0.0000 0.0038 4.531 0.50 2.91 -2.41 4 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0129 0.3674 0.6197 1 2 0.0147 0.3705 0.6148 1 2 0.0175 0.3752 0.6073
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 4006 967 3039 483 0 5 2 477 1 0 3019 0 19 0.4995 0.0003 0.0066 192.400 2.03 4.13 -2.09 69 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0006 0.9780 0.0214 1 1 0.0010 0.9701 0.0290 1 1 0.0016 0.9563 0.0421
chr12 8946399 G GAAC 0.112820 0.100 1 3 3 206 74 132 30 0 6 0 38 0 0 131 0 1 0.4054 0.0000 0.0076 11.333 0.47 2.97 -2.51 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1781 0.6871 0.1348 1 1 0.1873 0.6804 0.1324 1 1 0.1997 0.6714 0.1289
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 243 91 152 49 0 4 0 38 0 0 151 0 1 0.5385 0.0000 0.0066 21.750 0.29 4.55 -4.27 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4298 0.5072 0.0631 1 1 0.4267 0.5058 0.0675 1 1 0.4220 0.5044 0.0736
chr12 12477731 TGCACGCTGG T 0.037387 0.100 1 -9 1 603 134 469 9 0 12 0 113 0 0 458 0 11 0.0672 0.0000 0.0235 10.167 0.00 8.73 -8.73 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.9529 0.0471
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 269 128 141 11 0 9 3 105 0 0 141 0 0 0.0859 0.0000 0.0000 13.222 0.27 4.01 -3.74 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 1 0.0000 0.7439 0.2561
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 383 89 294 85 0 2 0 2 0 0 294 0 0 0.9551 0.0000 0.0000 43.500 0.24 4.00 -3.76 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5764 0.4236 0.0000 0 0 0.9267 0.0733 0.0000 0 0 0.9631 0.0369 0.0000
chr12 40406131 C CGTCAGGATG 0.058262 0.100 1 9 2 303 150 153 70 0 10 0 70 0 0 147 0 6 0.4667 0.0000 0.0392 14.000 1.64 8.27 -6.63 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1945 0.7660 0.0395 1 1 0.2066 0.7533 0.0401 1 1 0.2229 0.7364 0.0407
chr12 40449704 CT C 0.008989 0.100 1 -1 1 139 65 74 42 0 1 0 22 0 0 74 0 0 0.6462 0.0000 0.0000 64.000 0.19 1.00 -0.81 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8400 0.1598 0.0001 1 0 0.8328 0.1670 0.0002 1 0 0.8226 0.1772 0.0002
chr12 40482547 CCAT C 0.001528 0.100 1 -3 1 1586 286 1300 270 0 12 0 4 0 2 1297 1 0 0.9441 0.0000 0.0023 22.833 0.39 3.50 -3.11 154 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1802 322 1480 1 1 163 1 156 0 1 1376 3 100 0.0031 0.0000 0.0703 0.975 0.00 5.07 -5.07 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 1395 305 1090 161 0 3 0 141 0 0 1089 0 1 0.5279 0.0000 0.0009 100.667 0.29 1.18 -0.89 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5389 0.4578 0.0033 1 0 0.5484 0.4477 0.0039 1 0 0.5591 0.4361 0.0048
chr12 51329814 A AG 0.276619 0.100 1 1 2 199 67 132 33 0 3 0 31 0 0 132 0 0 0.4925 0.0000 0.0000 21.333 0.33 1.39 -1.05 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3560 0.5524 0.0916 1 1 0.3587 0.5476 0.0937 1 1 0.3619 0.5417 0.0965
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 864 222 642 193 3 20 1 5 0 0 642 0 0 0.8694 0.0000 0.0000 10.100 0.67 13.00 -12.33 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0837 0.9163 0.0000 0 0 0.9771 0.0229 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr12 52768988 C CGCT 0.004583 0.100 1 3 2 441 121 320 5 93 15 0 8 0 0 320 0 0 0.0413 0.0000 0.0000 7.000 1.20 3.62 -2.42 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.8298 0.1702 0.0000 0 0 0.9921 0.0079 0.0000
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.100 1 21 2 426 106 320 83 0 20 0 3 0 0 318 0 2 0.7830 0.0000 0.0063 4.300 0.17 14.00 -13.83 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0230 0.9770 0.0000 0 0 0.8759 0.1241 0.0000 0 0 0.9811 0.0189 0.0000
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1001 263 738 111 0 50 2 100 0 0 735 0 3 0.4221 0.0000 0.0041 4.220 0.33 12.74 -12.41 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3892 0.6055 0.0053 1 1 0.4019 0.5923 0.0057 1 1 0.4177 0.5759 0.0064
chr12 53172423 G GAACC 0.000053 0.100 1 4 2 261 84 177 76 0 3 0 5 0 0 176 0 1 0.9048 0.0000 0.0056 27.000 0.25 3.40 -3.15 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5945 0.4055 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 338 85 253 80 0 1 0 4 0 0 253 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 84.000 0.39 1.50 -1.11 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0195 0.9805 0.0000 0 0 0.6410 0.3590 0.0000 0 0 0.8957 0.1043 0.0000
chr12 55365407 AT A 0.002763 0.100 1 -1 1 637 126 511 68 0 4 0 54 0 0 510 0 1 0.5397 0.0000 0.0020 30.500 0.09 1.17 -1.08 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6642 0.3356 0.0001 1 0 0.6633 0.3366 0.0002 1 0 0.6614 0.3384 0.0002
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 403 85 318 36 4 12 3 30 0 0 318 0 0 0.4235 0.0000 0.0000 5.917 1.03 1.60 -0.57 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4763 0.4767 0.0470 1 1 0.4753 0.4753 0.0494 1 1 0.4735 0.4739 0.0526
chr12 55743400 C CGCGGCG 0.000349 0.100 1 6 4 376 106 270 84 0 20 0 2 0 0 269 0 1 0.7925 0.0000 0.0037 4.300 1.23 6.00 -4.77 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9962 0.0038 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 120 65 55 9 0 2 1 53 0 0 55 0 0 0.1385 0.0000 0.0000 31.000 0.56 2.38 -1.82 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.9301 0.0699
chr12 57225404 T TGGC 0.004341 0.100 1 3 1 577 152 425 141 2 5 0 4 1 0 424 0 0 0.9276 0.0024 0.0024 36.500 1.41 4.25 -2.84 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9787 0.0213 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 336 93 243 85 0 1 0 7 0 0 243 0 0 0.9140 0.0000 0.0000 92.000 0.95 3.71 -2.76 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0561 0.9439 0.0000 0 0 0.5043 0.4957 0.0000
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.100 1 -1 1 238 90 148 9 31 32 11 7 0 0 145 2 1 0.1000 0.0000 0.0203 1.484 4.22 2.00 2.22 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7560 0.2360 0.0080 1 0 0.7468 0.2442 0.0090 1 0 0.7339 0.2557 0.0105
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 948 282 666 0 0 20 2 260 0 0 663 0 3 0.0000 0.0000 0.0045 13.100 3.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85029771 CA C 0.001373 0.100 1 -1 3 309 96 213 92 0 1 0 3 0 0 213 0 0 0.9583 0.0000 0.0000 95.000 0.11 1.00 -0.89 38 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9903 0.0097 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 141 73 68 36 2 5 0 30 0 0 68 0 0 0.4932 0.0000 0.0000 13.600 0.08 1.07 -0.98 18 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5001 0.4560 0.0439 1 0 0.4978 0.4559 0.0463 1 0 0.4943 0.4560 0.0497
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 592 168 424 12 0 15 1 140 0 0 424 0 0 0.0714 0.0000 0.0000 10.133 0.42 3.06 -2.65 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.7038 0.2962
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 370 91 279 39 1 12 0 39 0 0 278 1 0 0.4286 0.0000 0.0036 6.583 0.95 3.85 -2.90 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1937 0.5967 0.2096 1 1 0.1975 0.5896 0.2130 1 1 0.2022 0.5805 0.2173
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 1679 471 1208 379 5 78 0 9 1 2 1201 0 4 0.8047 0.0008 0.0058 5.013 0.85 7.22 -6.38 133 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.100 1 -30 1 1605 469 1136 279 1 76 1 112 7 4 1074 3 48 0.5949 0.0062 0.0546 5.158 1.09 20.17 -19.08 81 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 552 143 409 75 1 7 0 60 0 0 400 0 9 0.5245 0.0000 0.0220 19.429 0.17 8.82 -8.64 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3044 0.6196 0.0760 1 1 0.3082 0.6106 0.0812 1 1 0.3124 0.5992 0.0884
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 620 204 416 0 1 25 16 162 0 0 415 0 1 0.0000 0.0000 0.0024 7.652 3.94 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr12 111598969 CTGCTGCTGT C 0.500000 0.100 1 -9 1 650 233 417 104 53 23 32 21 0 0 417 0 0 0.4464 0.0000 0.0000 8.950 2.39 7.10 -4.70 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 254 112 142 0 0 0 0 112 0 0 142 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 112.000 2.44 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 179 83 96 10 0 7 0 66 0 0 95 0 1 0.1205 0.0000 0.0104 10.857 0.90 5.89 -4.99 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.9595 0.0405
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 421 96 325 8 11 18 15 44 0 0 321 2 2 0.0833 0.0000 0.0123 4.111 2.38 3.75 -1.38 4 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0002 0.1221 0.8777 2 1 0.0001 0.7348 0.2651 2 1 0.0000 0.9829 0.0171
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 348 115 233 0 0 8 1 106 0 0 225 0 8 0.0000 0.0000 0.0343 13.375 5.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0038 0.9962
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 296 74 222 0 0 8 0 66 0 0 211 0 11 0.0000 0.0000 0.0495 8.250 12.67 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0209 0.9791 2 2 0.0000 0.0233 0.9767
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 673 162 511 0 0 12 0 150 0 0 490 0 21 0.0000 0.0000 0.0411 12.500 7.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 252 102 150 39 5 30 0 28 0 0 150 0 0 0.3824 0.0000 0.0000 2.400 0.64 3.25 -2.61 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6113 0.3621 0.0265 1 0 0.6017 0.3688 0.0295 1 0 0.5884 0.3777 0.0338
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 192 67 125 4 0 8 0 55 0 0 121 2 2 0.0597 0.0000 0.0320 7.375 1.75 3.62 -1.87 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9972 0.0028 2 1 0.0000 0.7901 0.2099 2 2 0.0000 0.4300 0.5700
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 184 66 118 0 0 5 0 61 0 0 113 0 5 0.0000 0.0000 0.0424 12.200 8.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0334 0.9666 2 2 0.0000 0.0357 0.9643 2 2 0.0000 0.0391 0.9609
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 489 138 351 53 3 36 1 45 0 0 351 0 0 0.3841 0.0000 0.0000 2.833 0.30 2.87 -2.56 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4233 0.5183 0.0583 1 1 0.4213 0.5160 0.0627 1 1 0.4179 0.5133 0.0688
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.100 1 -36 5 496 152 344 107 1 38 0 6 0 0 343 0 1 0.7039 0.0000 0.0029 3.000 0.47 8.67 -8.20 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1132 0.8868 0.0000 0 0 0.6788 0.3212 0.0000
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 697 144 553 72 3 22 0 47 0 0 549 0 4 0.5000 0.0000 0.0072 5.545 0.82 6.30 -5.48 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7457 0.2483 0.0060 1 0 0.7364 0.2565 0.0071 1 0 0.7231 0.2680 0.0089
chr13 71866311 A ACTGCTG 0.000243 0.100 1 6 1 721 185 536 85 0 32 2 66 0 0 530 0 6 0.4595 0.0000 0.0112 4.781 0.67 5.62 -4.95 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5724 0.4276 0.0000 1 0 0.5767 0.4233 0.0000 1 0 0.5815 0.4185 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 624 137 487 99 3 30 0 5 0 0 485 1 1 0.7226 0.0000 0.0041 3.567 1.44 9.40 -7.96 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4293 0.5707 0.0000 0 0 0.9237 0.0763 0.0000
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 119 51 68 48 0 2 0 1 0 0 67 0 1 0.9412 0.0000 0.0147 24.500 0.33 0.00 0.33 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8569 0.1431 0.0000 0 0 0.9829 0.0171 0.0000 0 0 0.9921 0.0079 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 626 108 518 0 0 12 1 95 0 0 515 0 3 0.0000 0.0000 0.0058 8.000 5.05 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 526 120 406 94 1 13 0 12 1 1 402 1 1 0.7833 0.0025 0.0099 8.231 0.87 6.92 -6.04 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0155 0.9845 0.0000
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 194 61 133 51 0 6 0 4 1 0 132 0 0 0.8361 0.0075 0.0075 9.167 1.24 6.00 -4.76 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.1606 0.8394 0.0000 0 1 0.4897 0.5103 0.0000
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -15 1 273 103 170 100 1 0 0 2 0 0 170 0 0 0.9709 0.0000 0.0000 103.000 0.43 4.50 -4.07 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6687 0.3313 0.0000 0 0 0.9485 0.0515 0.0000 0 0 0.9738 0.0262 0.0000
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 516 118 398 106 0 3 0 9 0 0 397 0 1 0.8983 0.0000 0.0025 38.333 0.53 3.00 -2.47 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 1 0.2185 0.7815 0.0000
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 1321 340 981 159 0 11 0 170 0 0 981 0 0 0.4676 0.0000 0.0000 29.909 0.32 1.86 -1.54 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0123 0.6887 0.2990 1 1 0.0142 0.6705 0.3153 1 1 0.0169 0.6473 0.3358
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 1139 326 813 9 0 39 2 276 0 0 812 0 1 0.0276 0.0000 0.0012 7.333 0.00 2.13 -2.13 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 2 0.0000 0.0147 0.9853 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 462 136 326 75 1 1 0 59 0 0 320 0 6 0.5515 0.0000 0.0184 135.000 0.44 18.54 -18.10 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4432 0.5194 0.0374 1 1 0.4441 0.5152 0.0407 1 1 0.4443 0.5101 0.0455
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 339 69 270 26 0 2 2 39 0 0 269 0 1 0.3768 0.0000 0.0037 33.500 0.54 1.82 -1.28 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0126 0.2863 0.7011 1 2 0.0141 0.2933 0.6926 1 2 0.0163 0.3028 0.6809
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.100 1 -6 1 577 151 426 125 1 19 0 6 0 0 426 0 0 0.8278 0.0000 0.0000 6.947 0.72 6.33 -5.61 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0040 0.9960 0.0000 0 0 0.7847 0.2153 0.0000 0 0 0.9747 0.0253 0.0000
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.100 1 2 3 1506 401 1105 219 0 24 0 158 0 0 1101 0 4 0.5461 0.0000 0.0036 15.708 0.16 3.23 -3.07 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9716 0.0284 0.0000 1 0 0.9693 0.0306 0.0000 1 0 0.9659 0.0341 0.0000
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 457 122 335 12 46 12 1 51 0 0 334 0 1 0.0984 0.0000 0.0030 6.400 0.50 2.73 -2.23 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0905 0.5598 0.3497 1 1 0.0948 0.5546 0.3506 1 1 0.1006 0.5481 0.3513
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 425 93 332 43 0 4 0 46 0 0 330 0 2 0.4624 0.0000 0.0060 22.250 0.33 5.35 -5.02 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1787 0.6353 0.1860 1 1 0.1861 0.6275 0.1864 1 1 0.1959 0.6175 0.1866
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 617 212 405 180 1 26 0 5 0 0 405 0 0 0.8491 0.0000 0.0000 7.154 0.66 3.20 -2.54 70 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6980 0.3020 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 869 238 631 15 15 112 5 91 0 0 630 1 0 0.0630 0.0000 0.0016 1.196 0.40 4.11 -3.71 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9828 0.0172 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 865 236 629 16 0 27 99 94 0 0 627 2 0 0.0678 0.0000 0.0032 4.560 0.50 4.18 -3.68 6 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.7212 0.2788
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 289 58 231 21 4 7 3 23 0 0 231 0 0 0.3621 0.0000 0.0000 7.143 2.90 4.00 -1.10 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2613 0.5646 0.1742 1 1 0.2645 0.5599 0.1756 1 1 0.2687 0.5539 0.1774
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 302 68 234 25 3 3 2 35 0 0 234 0 0 0.3676 0.0000 0.0000 21.667 2.40 3.51 -1.11 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1008 0.5398 0.3594 1 1 0.1066 0.5385 0.3548 1 1 0.1146 0.5369 0.3485
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 354 106 248 49 0 24 1 32 0 0 247 0 1 0.4623 0.0000 0.0040 3.417 0.39 4.72 -4.33 15 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6742 0.3130 0.0128 1 0 0.6674 0.3183 0.0142 1 0 0.6580 0.3257 0.0163
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 354 106 248 49 0 28 0 29 0 0 247 0 1 0.4623 0.0000 0.0040 2.786 0.39 5.34 -4.96 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7358 0.2550 0.0091 1 0 0.7267 0.2629 0.0104 1 0 0.7140 0.2736 0.0124
chr14 36474696 AC A 0.000235 0.100 1 -1 3 321 132 189 124 1 2 0 5 0 0 188 0 1 0.9394 0.0000 0.0053 65.000 0.64 2.40 -1.76 80 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8047 0.1953 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr14 52553246 CGCTGCAGCCTCAGGCGCCGCG C 0.000670 0.100 1 -21 1 197 57 140 51 0 1 0 5 0 0 140 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 56.000 1.02 18.20 -17.18 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2303 0.7697 0.0000 0 0 0.9893 0.0107 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 669 136 533 2 0 26 3 105 0 0 519 0 14 0.0147 0.0000 0.0263 4.115 0.00 6.70 -6.70 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0351 0.9649 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr14 59505305 TTTC T 0.011152 0.100 1 -3 1 76 34 42 24 0 7 0 3 0 0 42 0 0 0.7059 0.0000 0.0000 3.857 0.38 4.00 -3.62 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2741 0.7259 0.0000 0 0 0.9222 0.0778 0.0000 0 0 0.9760 0.0240 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 619 151 468 0 0 25 0 126 0 0 463 0 5 0.0000 0.0000 0.0107 5.040 7.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr14 77027304 A AGCGGCG 0.001242 0.100 1 6 1 394 113 281 30 3 27 8 45 0 0 281 0 0 0.2655 0.0000 0.0000 3.000 1.50 4.80 -3.30 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0899 0.9051 0.0050 1 1 0.0988 0.8964 0.0047 1 1 0.1116 0.8840 0.0044
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 399 96 303 5 22 23 7 39 0 2 296 1 4 0.0521 0.0000 0.0231 3.944 7.60 5.00 2.60 1 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0106 0.2588 0.7306 1 2 0.0125 0.2705 0.7170 1 2 0.0154 0.2865 0.6981
chr14 77027436 C CTGCTGCTGT 0.000342 0.100 1 9 1 398 87 311 26 8 4 3 46 3 2 305 1 0 0.2989 0.0096 0.0193 19.750 5.81 7.43 -1.63 18 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1677 0.8317 0.0006 1 1 0.1788 0.8206 0.0006 1 1 0.1940 0.8055 0.0006
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 395 88 307 0 5 1 40 42 0 2 300 3 2 0.0000 0.0000 0.0228 84.000 5.21 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9702 0.0298 2 1 0.0000 0.6574 0.3426 2 2 0.0000 0.3272 0.6728
chr14 92071020 C CTGCTGCTGCTGCTGT 0.000552 0.100 1 15 1 451 178 273 48 0 29 0 101 0 0 273 0 0 0.2697 0.0000 0.0000 5.138 0.29 3.87 -3.58 24 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0024 0.9495 0.0481 1 1 0.0031 0.9552 0.0417 1 1 0.0044 0.9611 0.0345
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 435 127 308 55 1 14 2 55 0 0 308 0 0 0.4331 0.0000 0.0000 8.000 0.16 3.16 -3.00 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1185 0.6282 0.2533 1 1 0.1221 0.6186 0.2592 1 1 0.1267 0.6066 0.2667
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 384 95 289 8 0 3 0 84 0 0 281 0 8 0.0842 0.0000 0.0277 30.667 0.00 9.37 -9.37 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9882 0.0118 2 1 0.0000 0.7648 0.2352
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 229 59 170 11 0 6 0 42 0 0 167 0 3 0.1864 0.0000 0.0176 8.833 0.09 8.62 -8.53 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0003 0.7952 0.2045 2 1 0.0001 0.9728 0.0272 2 1 0.0000 0.9905 0.0095
chr14 104886547 CGCAGGA C 0.081150 0.100 1 -6 1 433 89 344 85 1 1 0 2 0 0 343 0 1 0.9551 0.0000 0.0029 88.000 0.73 6.00 -5.27 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5365 0.4635 0.0000 0 0 0.9715 0.0285 0.0000 0 0 0.9908 0.0092 0.0000
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 391 111 280 88 0 18 1 4 0 0 280 0 0 0.7928 0.0000 0.0000 5.167 0.81 2.50 -1.69 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 0 0.5223 0.4777 0.0000 0 0 0.8871 0.1129 0.0000
chr15 20534699 CCTCCTG C 0.091103 0.100 1 -6 1 5136 687 4449 378 12 132 4 161 84 94 4091 141 39 0.5502 0.0189 0.0805 4.189 1.27 6.01 -4.74 186 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 263 78 185 44 1 5 2 26 0 0 185 0 0 0.5641 0.0000 0.0000 14.600 1.77 4.85 -3.07 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7405 0.2523 0.0072 1 0 0.7326 0.2592 0.0081 1 0 0.7216 0.2689 0.0095
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 895 148 747 0 0 3 8 137 0 5 655 67 20 0.0000 0.0000 0.1232 48.000 5.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 2462 659 1803 0 1 14 4 640 0 1 1759 8 35 0.0000 0.0000 0.0244 53.750 4.03 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 339 82 257 42 0 1 0 39 0 0 256 0 1 0.5122 0.0000 0.0039 81.000 0.17 2.10 -1.94 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2972 0.5829 0.1198 1 1 0.3006 0.5763 0.1231 1 1 0.3048 0.5680 0.1273
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 215 79 136 2 2 3 43 29 0 0 134 1 1 0.0253 0.0000 0.0147 11.667 2.00 2.52 -0.52 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9536 0.0464 2 1 0.0000 0.6162 0.3838 2 2 0.0000 0.3702 0.6298
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 215 80 135 2 2 33 1 42 0 0 134 0 1 0.0250 0.0000 0.0074 1.516 2.00 2.88 -0.88 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9926 0.0074 2 1 0.0000 0.7738 0.2262 2 2 0.0000 0.4421 0.5579
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 634 162 472 0 0 25 2 135 0 0 469 0 3 0.0000 0.0000 0.0064 5.480 4.17 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 456 142 314 81 0 11 1 49 0 1 309 0 4 0.5704 0.0000 0.0159 11.909 0.36 5.69 -5.34 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8370 0.1611 0.0019 1 0 0.8289 0.1687 0.0023 1 0 0.8173 0.1797 0.0030
chr15 48739002 AAC A 0.000391 0.100 1 -2 3 648 164 484 153 1 5 0 5 0 0 484 0 0 0.9329 0.0000 0.0000 31.800 0.18 2.00 -1.82 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9899 0.0101 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 62800484 G GGCTGCCAAGGTAGAGTGGGGC 0.000001 0.100 1 21 5 487 117 370 89 1 23 0 4 0 0 370 0 0 0.7607 0.0000 0.0000 4.087 0.13 21.00 -20.87 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 127 61 66 0 0 0 0 61 0 0 65 0 1 0.0000 0.0000 0.0152 61.000 3.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0453 0.9547 2 2 0.0000 0.0481 0.9519 2 2 0.0000 0.0523 0.9477
chr15 74072270 GCCT G 0.012706 0.100 1 -3 1 435 171 264 155 1 10 0 5 0 0 264 0 0 0.9064 0.0000 0.0000 16.100 0.87 3.20 -2.33 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7671 0.2329 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 211 110 101 54 0 2 0 54 0 0 100 0 1 0.4909 0.0000 0.0099 54.000 0.56 3.57 -3.02 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1364 0.6253 0.2383 1 1 0.1404 0.6160 0.2435 1 1 0.1457 0.6043 0.2501
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 414 89 325 9 0 12 3 65 0 0 324 0 1 0.1011 0.0000 0.0031 6.417 0.56 3.95 -3.40 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9969 0.0031 2 1 0.0000 0.8880 0.1120
chr15 78765841 T TTGGGTCC 0.091861 0.100 1 7 3 550 131 419 113 0 15 0 3 0 0 417 0 2 0.8626 0.0000 0.0048 7.733 0.46 6.00 -5.54 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0447 0.9553 0.0000 0 0 0.9316 0.0684 0.0000 0 0 0.9897 0.0103 0.0000
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 650 124 526 113 2 7 0 2 0 0 526 0 0 0.9113 0.0000 0.0000 16.714 1.62 5.00 -3.38 11 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9951 0.0049 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr15 79463264 TGAG T 0.000283 0.100 1 -3 2 283 93 190 85 0 2 0 6 0 0 190 0 0 0.9140 0.0000 0.0000 45.500 0.21 4.17 -3.95 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3030 0.6970 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr15 82688452 CG C 0.003305 0.100 1 -1 2 580 186 394 178 1 4 0 3 0 0 394 0 0 0.9570 0.0000 0.0000 45.500 0.26 1.00 -0.74 88 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 83982688 CAGCGAAGCCAAT C 0.000878 0.100 1 -12 1 619 157 462 151 0 3 0 3 0 0 462 0 0 0.9618 0.0000 0.0000 51.333 0.38 12.00 -11.62 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 88472272 CAG C 0.005890 0.100 1 -2 3 359 132 227 124 1 3 0 4 0 0 227 0 0 0.9394 0.0000 0.0000 43.000 0.29 2.75 -2.46 92 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9318 0.0682 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 728 185 543 27 12 71 1 74 0 0 531 0 12 0.1459 0.0000 0.0221 2.917 1.63 16.22 -14.59 11 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0069 0.9931 1 2 0.0000 0.0095 0.9905 1 2 0.0000 0.3685 0.6314
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 720 185 535 16 3 14 5 147 0 0 535 0 0 0.0865 0.0000 0.0000 13.000 1.12 11.71 -10.58 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9746 0.0254
chr15 92472964 AC A 0.000463 0.100 1 -1 1 284 125 159 119 0 2 0 4 0 0 159 0 0 0.9520 0.0000 0.0000 61.500 0.71 3.00 -2.29 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9926 0.0074 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 324 100 224 0 0 8 0 92 0 0 213 0 11 0.0000 0.0000 0.0491 11.500 6.60 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 288 93 195 61 0 0 1 31 0 0 195 0 0 0.6559 0.0000 0.0000 93.000 0.64 1.90 -1.26 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8411 0.1560 0.0029 1 0 0.8302 0.1662 0.0036 1 0 0.8146 0.1807 0.0047
chr15 99712504 C CCAGCAG 0.003114 0.100 1 6 2 466 179 287 129 2 45 1 2 0 4 283 0 0 0.7207 0.0000 0.0139 3.023 2.82 3.00 -0.18 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.100 1 -3 2 466 180 286 82 0 41 44 13 0 0 280 6 0 0.4556 0.0000 0.0210 3.390 0.37 2.92 -2.56 10 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7300 0.2671 0.0029 1 0 0.7260 0.2706 0.0034 1 0 0.7200 0.2759 0.0040
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 466 182 284 84 1 46 0 51 0 0 278 0 6 0.4615 0.0000 0.0211 3.000 0.36 6.31 -5.96 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8387 0.1597 0.0016 1 0 0.8311 0.1669 0.0020 1 0 0.8201 0.1772 0.0026
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 217 72 145 47 3 21 0 1 0 1 142 0 2 0.6528 0.0000 0.0207 2.381 2.04 9.00 -6.96 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3606 0.6394 0.0000 0 0 0.9453 0.0547 0.0000 0 0 0.9828 0.0172 0.0000
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 30 16 14 6 1 0 1 8 0 0 14 0 0 0.3750 0.0000 0.0000 15.000 0.67 2.50 -1.83 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3314 0.5486 0.1200 1 1 0.3346 0.5462 0.1192 1 1 0.3388 0.5432 0.1181
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 286 70 216 38 0 0 0 32 0 0 215 0 1 0.5429 0.0000 0.0046 70.000 0.26 3.03 -2.77 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4116 0.5183 0.0701 1 1 0.4120 0.5150 0.0729 1 1 0.4121 0.5111 0.0767
chr16 770636 CGGGTGAGGGGGGCTGGGCTCCACCAGGGGAGCCGCCTGGGGGGACG C 0.004222 0.100 1 -46 1 1013 226 787 171 5 42 0 8 0 0 787 0 0 0.7566 0.0000 0.0000 4.357 1.80 1.38 0.42 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0359 0.9641 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 275 91 184 85 0 2 0 4 0 0 184 0 0 0.9341 0.0000 0.0000 44.500 0.84 13.75 -12.91 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0965 0.9035 0.0000 0 0 0.9095 0.0905 0.0000 0 0 0.9797 0.0203 0.0000
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 821 179 642 92 1 3 0 83 0 0 641 0 1 0.5140 0.0000 0.0016 58.667 0.71 1.57 -0.86 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4381 0.5423 0.0197 1 1 0.4449 0.5337 0.0214 1 1 0.4528 0.5234 0.0238
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 541 102 439 0 0 4 1 97 0 0 438 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 24.250 6.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 541 102 439 0 0 4 1 97 0 0 438 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 24.250 6.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2179036 C CGCG 0.006791 0.100 1 3 6 520 112 408 74 7 25 0 6 2 1 405 0 0 0.6607 0.0049 0.0074 3.480 1.36 3.00 -1.64 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0172 0.9828 0.0000 0 0 0.9425 0.0575 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr16 4594388 CAGG C 0.035758 0.100 1 -3 2 233 83 150 81 0 0 0 2 0 0 150 0 0 0.9759 0.0000 0.0000 83.000 0.51 3.00 -2.49 35 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9516 0.0484 0.0000 0 0 0.9946 0.0054 0.0000 0 0 0.9974 0.0026 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 376 102 274 15 0 4 0 83 0 0 272 0 2 0.1471 0.0000 0.0073 24.500 0.00 2.96 -2.96 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9936 0.0064
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.100 1 3 1 350 99 251 60 6 30 0 3 4 0 247 0 0 0.6061 0.0159 0.0159 2.300 2.47 3.67 -1.20 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1822 0.8178 0.0000 0 0 0.8695 0.1305 0.0000 0 0 0.9554 0.0446 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 217 74 143 0 0 1 0 73 0 0 143 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 73.000 2.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.100 1 -1 1 246 138 108 82 0 1 1 54 0 0 108 0 0 0.5942 0.0000 0.0000 137.000 0.45 1.09 -0.64 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8718 0.1279 0.0004 1 0 0.8657 0.1338 0.0004 1 0 0.8570 0.1424 0.0006
chr16 23149100 A AGAGGAGGGC 0.000809 0.100 1 9 1 342 111 231 56 0 17 1 37 0 0 227 0 4 0.5045 0.0000 0.0173 5.529 0.70 6.86 -6.17 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7123 0.2877 0.0000 1 0 0.7087 0.2912 0.0000 1 0 0.7035 0.2964 0.0000
chr16 29383827 TATC T 0.000349 0.100 1 -3 2 1319 384 935 43 8 17 4 312 39 54 837 1 4 0.1120 0.0417 0.1048 22.750 2.44 3.92 -1.48 11 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0991 0.9009 1 2 0.0000 0.1303 0.8697 1 2 0.0000 0.1850 0.8150
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 144 69 75 28 2 3 0 36 0 0 75 0 0 0.4058 0.0000 0.0000 21.667 0.29 2.03 -1.74 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1053 0.5361 0.3586 1 1 0.1099 0.5332 0.3569 1 1 0.1161 0.5296 0.3543
chr16 54285216 C CCGTCCTCCT 0.500000 0.100 1 9 1 626 134 492 103 0 28 0 3 0 0 492 0 0 0.7687 0.0000 0.0000 3.786 0.55 6.67 -6.11 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1950 0.8050 0.0000 0 0 0.8755 0.1245 0.0000 0 0 0.9558 0.0442 0.0000
chr16 58734157 C CGCGGCGGCGAGGCCCGGGTGGAAG 0.500000 0.100 1 24 2 114 54 60 47 0 4 0 3 0 0 59 0 1 0.8704 0.0000 0.0167 12.500 0.21 8.00 -7.79 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.1288 0.8712 0.0000 0 1 0.4288 0.5712 0.0000
chr16 60359388 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 1729 395 1334 367 1 6 0 21 0 0 1332 0 2 0.9291 0.0000 0.0015 64.833 0.28 2.43 -2.15 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 0 0.9572 0.0428 0.0000
chr16 67195890 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 506 190 316 130 21 30 0 9 0 0 316 0 0 0.6842 0.0000 0.0000 5.333 0.23 3.11 -2.88 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1081 0.8919 0.0000 0 0 0.8154 0.1846 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1164 364 800 265 4 59 1 35 0 0 800 0 0 0.7280 0.0000 0.0000 5.259 0.62 3.74 -3.13 91 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 241 111 130 91 0 16 0 4 1 0 129 0 0 0.8198 0.0077 0.0077 5.938 2.65 6.00 -3.35 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0148 0.9852 0.0000 0 0 0.5832 0.4168 0.0000 0 0 0.8696 0.1304 0.0000
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.100 1 -3 2 566 125 441 55 2 14 1 53 0 0 439 0 2 0.4400 0.0000 0.0045 7.929 1.22 3.68 -2.46 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1997 0.6340 0.1663 1 1 0.2043 0.6243 0.1714 1 1 0.2101 0.6120 0.1779
chr16 81035884 AGGC A 0.500000 0.100 1 -3 2 267 82 185 63 1 6 1 11 0 1 184 0 0 0.7683 0.0000 0.0054 12.667 2.06 4.36 -2.30 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0110 0.9890 0.0000
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 204 90 114 17 0 2 0 71 0 0 111 0 3 0.1889 0.0000 0.0263 44.000 1.76 4.62 -2.86 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9901 0.0099 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr16 85710272 GGCTGCTGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 395 201 194 176 0 14 0 11 0 0 194 0 0 0.8756 0.0000 0.0000 13.357 0.27 9.73 -9.45 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0511 0.9489 0.0000 0 0 0.8146 0.1854 0.0000
chr16 88528131 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 288 113 175 102 1 4 0 6 0 0 175 0 0 0.9027 0.0000 0.0000 27.250 0.18 3.50 -3.32 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2236 0.7764 0.0000 0 0 0.7588 0.2412 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 591 123 468 0 0 6 6 111 0 0 461 2 5 0.0000 0.0000 0.0150 19.500 8.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 591 118 473 0 0 6 12 100 0 0 465 4 4 0.0000 0.0000 0.0169 18.667 8.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0030 0.9970
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 595 118 477 0 0 5 1 112 0 1 461 7 8 0.0000 0.0000 0.0335 28.250 8.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0037 0.9963
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 714 154 560 0 0 11 1 142 0 1 558 0 1 0.0000 0.0000 0.0036 13.000 6.74 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 139 77 62 0 0 4 0 73 0 0 62 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 18.250 4.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0254 0.9746 2 2 0.0000 0.0281 0.9719
chr16 89850471 C CGAG 0.500000 0.100 1 3 3 461 122 339 63 1 9 0 49 0 2 334 0 3 0.5164 0.0000 0.0147 12.556 0.08 2.98 -2.90 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5111 0.4568 0.0321 1 0 0.5070 0.4575 0.0354 1 0 0.5008 0.4589 0.0403
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 339 126 213 71 0 4 0 51 0 0 213 0 0 0.5635 0.0000 0.0000 30.500 0.54 1.63 -1.09 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5464 0.4313 0.0223 1 0 0.5370 0.4374 0.0256 1 0 0.5238 0.4457 0.0305
chr17 4900004 G GC 0.000569 0.100 1 1 1 820 220 600 202 0 6 0 12 0 0 600 0 0 0.9182 0.0000 0.0000 35.667 2.25 1.33 0.92 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9918 0.0082 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr17 4900042 AACCGAAG A 0.002323 0.100 1 -7 1 833 208 625 118 0 4 0 86 0 0 622 0 3 0.5673 0.0000 0.0048 51.000 0.53 7.02 -6.49 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8649 0.1351 0.0000 1 0 0.8609 0.1391 0.0000 1 0 0.8548 0.1452 0.0000
chr17 4933907 ACCACCCCAGAGCCCAC A 0.138018 0.100 1 -16 1 1161 232 929 188 17 10 9 8 0 0 929 0 0 0.8103 0.0000 0.0000 30.714 5.71 2.38 3.34 12 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0525 0.9475 0.0000 0 0 0.9106 0.0894 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 610 164 446 59 11 38 1 55 0 0 441 0 5 0.3598 0.0000 0.0112 3.405 0.64 3.16 -2.52 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2890 0.6261 0.0848 1 1 0.2895 0.6192 0.0913 1 1 0.2893 0.6104 0.1003
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.100 1 9 2 1180 331 849 7 24 88 20 192 0 1 822 1 25 0.0211 0.0000 0.0318 2.802 1.43 6.39 -4.96 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 358 91 267 81 0 4 0 6 0 0 267 0 0 0.8901 0.0000 0.0000 21.750 0.53 9.50 -8.97 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0876 0.9124 0.0000 0 0 0.5199 0.4801 0.0000
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 482 175 307 0 0 23 10 142 0 0 297 3 7 0.0000 0.0000 0.0326 6.609 3.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 876 235 641 21 4 32 7 171 0 0 641 0 0 0.0894 0.0000 0.0000 6.966 0.29 4.49 -4.21 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 873 228 645 20 28 8 28 144 0 0 645 0 0 0.0877 0.0000 0.0000 109.000 0.25 4.09 -3.84 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 663 143 520 60 0 9 0 74 0 0 516 0 4 0.4196 0.0000 0.0077 14.889 0.33 3.89 -3.56 24 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0167 0.3913 0.5920 1 2 0.0190 0.3945 0.5865 1 2 0.0224 0.3994 0.5782
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 249 67 182 33 0 11 0 23 0 0 175 0 7 0.4925 0.0000 0.0385 5.091 0.18 6.65 -6.47 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2797 0.5660 0.1543 1 1 0.2806 0.5610 0.1584 1 1 0.2815 0.5548 0.1638
chr17 35479822 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 720 160 560 8 1 0 0 151 0 0 559 0 1 0.0500 0.0000 0.0018 160.000 1.00 1.23 -0.23 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8755 0.1245 2 2 0.0000 0.1660 0.8340
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 86 50 36 6 0 0 0 44 0 0 36 0 0 0.1200 0.0000 0.0000 50.000 0.00 1.27 -1.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9850 0.0150 2 1 0.0000 0.8474 0.1526
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 855 197 658 84 5 29 4 75 8 2 632 3 13 0.4264 0.0122 0.0395 6.462 4.32 11.29 -6.97 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2003 0.7061 0.0937 1 1 0.2078 0.6921 0.1001 1 1 0.2172 0.6740 0.1088
chr17 40819075 T TAGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 10 1 854 202 652 153 10 10 13 16 7 0 640 2 3 0.7574 0.0107 0.0184 18.800 6.93 7.50 -0.57 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 40819077 G GAGCTT 0.500000 0.100 1 5 2 854 201 653 162 7 7 3 22 7 1 640 2 3 0.8060 0.0107 0.0199 27.143 6.20 10.32 -4.11 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 761 181 580 167 5 3 0 6 0 0 580 0 0 0.9227 0.0000 0.0000 59.000 0.29 1.33 -1.04 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0109 0.9891 0.0000 0 0 0.9008 0.0992 0.0000 0 0 0.9889 0.0111 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 412 113 299 5 0 5 0 103 0 0 298 0 1 0.0442 0.0000 0.0033 21.600 1.00 1.43 -0.43 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9969 0.0031 2 1 0.0000 0.5305 0.4695 2 2 0.0000 0.1371 0.8629
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 491 110 381 0 1 16 1 92 1 0 366 1 13 0.0000 0.0026 0.0394 5.875 9.92 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1365 0.8635 2 2 0.0000 0.0319 0.9681 2 2 0.0000 0.0183 0.9817
chr17 41238458 AGACCACCTGCTGCAG A 0.500000 0.100 1 -15 1 412 56 356 10 0 11 0 35 0 0 344 0 12 0.1786 0.0000 0.0337 4.091 3.30 14.49 -11.19 8 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9891 0.0109 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.9840 0.0160
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 627 170 457 129 5 21 0 15 2 1 454 0 0 0.7588 0.0044 0.0066 7.048 0.62 3.53 -2.91 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0480 0.9520 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 261 99 162 42 0 4 0 53 0 0 162 0 0 0.4242 0.0000 0.0000 23.750 0.21 4.38 -4.16 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0517 0.4904 0.4578 1 1 0.0558 0.4899 0.4542 1 1 0.0616 0.4895 0.4488
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.100 1 3 2 465 103 362 43 0 19 0 41 0 0 358 0 4 0.4175 0.0000 0.0110 4.421 0.23 3.22 -2.99 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1602 0.6016 0.2382 1 1 0.1647 0.5941 0.2412 1 1 0.1706 0.5846 0.2448
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 375 128 247 41 0 25 0 62 0 0 246 0 1 0.3203 0.0000 0.0040 4.120 0.61 5.48 -4.87 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0092 0.2709 0.7199 1 2 0.0107 0.2795 0.7097 1 2 0.0131 0.2915 0.6954
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 345 142 203 14 0 19 0 109 0 0 203 0 0 0.0986 0.0000 0.0000 6.474 0.14 6.61 -6.46 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9758 0.0242
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 527 118 409 0 0 3 1 114 0 0 393 0 16 0.0000 0.0000 0.0391 38.000 7.52 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr17 74893524 GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC G 0.500000 0.100 1 -54 1 280 94 186 65 0 5 1 23 0 0 186 0 0 0.6915 0.0000 0.0000 17.600 0.45 4.13 -3.68 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9503 0.0494 0.0003 1 0 0.9439 0.0558 0.0004 1 0 0.9191 0.0803 0.0005
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 1682 411 1271 386 1 16 0 8 0 0 1271 0 0 0.9392 0.0000 0.0000 24.688 0.73 2.00 -1.27 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9007 0.0993 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 1969 512 1457 458 5 42 0 7 1 0 1453 0 3 0.8945 0.0007 0.0027 11.143 0.79 14.86 -14.06 32 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8069 0.1931 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 2 881 260 621 251 0 4 0 5 0 0 621 0 0 0.9654 0.0000 0.0000 85.333 0.27 2.20 -1.93 111 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8458 0.1542 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr17 75616380 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 1485 343 1142 220 7 90 7 19 0 1 1140 1 0 0.6414 0.0000 0.0018 2.778 0.60 3.95 -3.34 104 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0093 0.9907 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2233 469 1764 24 5 65 13 362 1 3 1737 4 19 0.0512 0.0006 0.0153 6.123 0.79 6.39 -5.60 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5463 0.4537
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2184 564 1620 20 0 29 2 513 0 0 1450 23 147 0.0355 0.0000 0.1049 19.107 1.75 4.61 -2.86 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -6 7 267 102 165 12 0 13 0 77 0 0 164 0 1 0.1176 0.0000 0.0061 6.846 0.00 5.70 -5.70 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9805 0.0195
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 939 169 770 141 2 16 0 10 1 0 769 0 0 0.8343 0.0013 0.0013 9.500 0.77 5.40 -4.63 83 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0305 0.9695 0.0000 0 0 0.6374 0.3626 0.0000
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 558 152 406 75 0 5 0 72 0 0 402 0 4 0.4934 0.0000 0.0099 29.400 0.51 3.25 -2.74 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1460 0.6761 0.1780 1 1 0.1522 0.6637 0.1841 1 1 0.1602 0.6479 0.1919
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 280 72 208 68 0 0 0 4 0 0 208 0 0 0.9444 0.0000 0.0000 72.000 0.53 1.00 -0.47 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0069 0.9931 0.0000 0 1 0.3980 0.6020 0.0000 0 0 0.7648 0.2352 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 270 108 162 0 0 6 1 101 0 0 159 0 3 0.0000 0.0000 0.0185 17.000 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 303 71 232 33 2 3 0 33 1 0 230 0 1 0.4648 0.0043 0.0086 22.667 0.79 8.76 -7.97 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3747 0.5547 0.0706 1 1 0.3781 0.5495 0.0723 1 1 0.3822 0.5431 0.0746
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 146 67 79 0 0 4 0 63 0 0 79 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 15.750 4.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0323 0.9677 2 2 0.0000 0.0344 0.9656 2 2 0.0000 0.0375 0.9625
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 121 49 72 25 0 0 0 24 0 0 72 0 0 0.5102 0.0000 0.0000 49.000 0.16 3.00 -2.84 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2425 0.5586 0.1989 1 1 0.2441 0.5542 0.2017 1 1 0.2460 0.5486 0.2054
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 311 138 173 10 0 3 0 125 0 0 172 0 1 0.0725 0.0000 0.0058 45.000 0.20 3.78 -3.58 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9873 0.0127 2 1 0.0000 0.5754 0.4246
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -9 2 538 132 406 121 2 4 0 5 0 0 406 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 31.750 1.59 8.00 -6.41 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0079 0.9921 0.0000 0 0 0.6929 0.3071 0.0000 0 0 0.9400 0.0600 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 247 146 101 131 2 5 0 8 0 0 101 0 0 0.8973 0.0000 0.0000 28.000 0.21 3.38 -3.16 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1323 0.8677 0.0000 0 0 0.7880 0.2120 0.0000
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 747 185 562 171 0 5 0 9 0 0 562 0 0 0.9243 0.0000 0.0000 36.000 0.29 12.89 -12.60 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2608 0.7392 0.0000 0 0 0.9256 0.0744 0.0000
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 361 67 294 4 0 11 4 48 0 0 294 0 0 0.0597 0.0000 0.0000 5.091 2.25 6.27 -4.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9980 0.0020 2 1 0.0000 0.8404 0.1596 2 1 0.0000 0.5116 0.4884
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 174 80 94 0 0 7 0 73 0 0 93 0 1 0.0000 0.0000 0.0106 10.429 3.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0225 0.9775 2 2 0.0000 0.0242 0.9758 2 2 0.0000 0.0268 0.9732
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 122 55 67 3 0 3 0 49 0 0 64 0 3 0.0545 0.0000 0.0448 17.333 0.33 3.12 -2.79 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9823 0.0177 2 1 0.0000 0.6449 0.3551 2 2 0.0000 0.3548 0.6452
chr18 76496529 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 283 79 204 43 1 3 2 30 0 1 202 0 1 0.5443 0.0000 0.0098 25.333 0.23 1.63 -1.40 23 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4976 0.4536 0.0489 1 0 0.4916 0.4556 0.0528 1 0 0.4832 0.4584 0.0584
chr18 79715187 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 594 157 437 69 2 39 0 47 0 0 434 0 3 0.4395 0.0000 0.0069 3.026 0.32 2.79 -2.47 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6815 0.3079 0.0106 1 0 0.6728 0.3149 0.0123 1 0 0.6603 0.3248 0.0149
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 539 239 300 65 7 30 7 130 0 0 298 1 1 0.2720 0.0000 0.0067 7.321 2.09 5.04 -2.95 5 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0150 0.9850 1 2 0.0000 0.0180 0.9820 1 2 0.0000 0.0228 0.9772
chr19 621458 G GGCAGGT 0.002400 0.100 1 6 1 609 144 465 125 0 10 0 9 1 0 464 0 0 0.8681 0.0022 0.0022 13.400 0.60 6.22 -5.62 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.9394 0.0606 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 157 58 99 10 0 0 0 48 0 0 99 0 0 0.1724 0.0000 0.0000 58.000 1.60 4.77 -3.17 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9936 0.0063 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9948 0.0052
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 235 126 109 67 0 1 0 58 0 0 109 0 0 0.5317 0.0000 0.0000 125.000 0.15 3.12 -2.97 9 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4946 0.4816 0.0238 1 0 0.4966 0.4778 0.0256 1 0 0.4984 0.4734 0.0282
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.100 1 3 2 330 82 248 27 3 28 0 24 0 0 248 0 0 0.3293 0.0000 0.0000 1.929 0.48 3.42 -2.94 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5674 0.4262 0.0064 1 0 0.5666 0.4267 0.0067 1 0 0.5652 0.4277 0.0071
chr19 2015541 G GGGC 0.004938 0.100 1 3 4 260 78 182 2 24 17 2 33 0 2 179 0 1 0.0256 0.0000 0.0165 3.812 0.50 3.48 -2.98 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2536 0.7407 0.0057 1 1 0.2637 0.7307 0.0056 1 1 0.2772 0.7174 0.0054
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 260 79 181 34 5 14 3 23 0 0 177 3 1 0.4304 0.0000 0.0221 4.571 3.03 3.87 -0.84 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4363 0.4927 0.0710 1 1 0.4326 0.4922 0.0752 1 1 0.4273 0.4917 0.0809
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 260 81 179 40 1 36 1 3 0 1 178 0 0 0.4938 0.0000 0.0056 1.375 3.17 5.33 -2.16 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0347 0.9653 0.0000 0 0 0.5412 0.4588 0.0000 0 0 0.8085 0.1915 0.0000
chr19 3539216 C CCCCTCGGGGA 0.001517 0.100 1 10 1 611 122 489 105 0 14 0 3 0 0 489 0 0 0.8607 0.0000 0.0000 7.714 0.46 8.00 -7.54 87 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9944 0.0056 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 3810763 GC G 0.000008 0.100 1 -1 3 115 39 76 19 0 2 0 18 0 0 76 0 0 0.4872 0.0000 0.0000 18.500 0.21 1.33 -1.12 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4794 0.5206 0.0000 1 1 0.4819 0.5181 0.0000 1 1 0.4850 0.5150 0.0000
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 752 154 598 116 6 28 0 4 0 0 598 0 0 0.7532 0.0000 0.0000 4.500 0.49 3.50 -3.01 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2925 0.7075 0.0000 0 0 0.9739 0.0261 0.0000 0 0 0.9942 0.0058 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 385 115 270 101 0 7 0 7 0 0 270 0 0 0.8783 0.0000 0.0000 15.429 0.34 3.43 -3.09 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.4012 0.5988 0.0000 0 0 0.9180 0.0820 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 599 180 419 156 0 14 0 10 0 0 419 0 0 0.8667 0.0000 0.0000 12.769 0.77 10.80 -10.03 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1246 0.8754 0.0000 0 0 0.8866 0.1134 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 276 73 203 65 0 5 0 3 0 0 203 0 0 0.8904 0.0000 0.0000 13.600 0.20 5.67 -5.47 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0692 0.9308 0.0000 0 0 0.6916 0.3084 0.0000 0 0 0.8791 0.1209 0.0000
chr19 9126240 AG A 0.056196 0.100 1 -1 5 351 88 263 85 0 0 0 3 0 0 263 0 0 0.9659 0.0000 0.0000 88.000 0.33 1.33 -1.00 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6220 0.3780 0.0000 0 0 0.9797 0.0203 0.0000 0 0 0.9934 0.0066 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 810 300 510 139 2 56 15 88 1 0 507 1 1 0.4633 0.0020 0.0059 4.357 0.40 3.31 -2.91 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8838 0.1159 0.0003 1 0 0.8785 0.1211 0.0004 1 0 0.8707 0.1288 0.0006
chr19 12430727 C CTG 0.053346 0.100 1 2 3 1395 314 1081 294 1 13 0 6 0 1 1080 0 0 0.9363 0.0000 0.0009 25.083 0.50 4.50 -4.00 86 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9901 0.0099 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 12430728 CAA C 0.053324 0.100 1 -2 3 1394 315 1079 295 4 10 1 5 0 1 1078 0 0 0.9365 0.0000 0.0009 33.778 0.44 4.40 -3.96 85 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9965 0.0035 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 327 101 226 58 1 29 0 13 0 0 225 0 1 0.5743 0.0000 0.0044 2.483 0.41 6.62 -6.20 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0599 0.9401 0.0000 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 1 0.0053 0.9947 0.0000
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.100 1 3 1 257 87 170 71 0 9 0 7 0 1 168 0 1 0.8161 0.0000 0.0118 8.667 0.25 3.71 -3.46 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0943 0.9057 0.0000 0 0 0.7345 0.2655 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 507 113 394 0 0 2 0 111 0 0 390 0 4 0.0000 0.0000 0.0102 55.500 3.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 17286684 GTGTGTGTT G 0.020051 0.100 1 -8 1 385 82 303 28 11 11 12 20 0 0 303 0 0 0.3415 0.0000 0.0000 6.667 2.00 4.70 -2.70 18 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6204 0.3772 0.0024 1 0 0.6184 0.3791 0.0025 1 0 0.6154 0.3819 0.0027
chr19 18869245 T TGCC 0.049608 0.100 1 3 1 530 138 392 68 2 23 4 41 0 0 390 0 2 0.4928 0.0000 0.0051 5.000 1.26 3.44 -2.17 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8429 0.1566 0.0004 1 0 0.8367 0.1628 0.0005 1 0 0.8278 0.1715 0.0007
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 1406 301 1105 0 0 7 5 289 0 0 1033 13 59 0.0000 0.0000 0.0652 49.000 2.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 311 81 230 32 1 8 3 37 0 0 230 0 0 0.3951 0.0000 0.0000 9.125 0.41 3.14 -2.73 8 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0262 0.4497 0.5242 1 2 0.0276 0.4489 0.5235 1 2 0.0295 0.4483 0.5221
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 521 121 400 59 0 0 0 62 0 0 398 0 2 0.4876 0.0000 0.0050 121.000 0.34 3.23 -2.89 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0491 0.5707 0.3802 1 1 0.0517 0.5631 0.3852 1 1 0.0552 0.5537 0.3911
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 325 109 216 26 1 14 0 68 0 0 189 0 27 0.2385 0.0000 0.1250 6.786 8.23 15.50 -7.27 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0189 0.9811 2 1 0.0000 0.6603 0.3397 2 1 0.0000 0.9973 0.0027
chr19 35511476 TGCC T 0.000477 0.100 1 -3 1 319 92 227 1 21 21 42 7 0 0 227 0 0 0.0109 0.0000 0.0000 5.000 3.00 13.00 -10.00 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0443 0.9499 0.0058 1 1 0.0497 0.9451 0.0052 1 1 0.0561 0.9394 0.0045
chr19 35511483 ACTGCTGCCG A 0.000396 0.100 1 -9 2 321 86 235 11 8 14 21 32 0 0 226 8 1 0.1279 0.0000 0.0383 6.091 9.45 35.12 -25.67 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0078 0.9720 0.0202 1 1 0.0053 0.9850 0.0098 2 1 0.0012 0.9974 0.0014
chr19 37894973 TGGA T 0.043831 0.100 1 -3 1 646 152 494 139 1 7 0 5 0 0 494 0 0 0.9145 0.0000 0.0000 20.714 0.47 4.00 -3.53 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2903 0.7097 0.0000 0 0 0.9914 0.0086 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 584 123 461 75 0 10 0 38 1 0 435 1 24 0.6098 0.0022 0.0564 11.300 0.67 15.66 -14.99 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6334 0.3639 0.0027 1 0 0.6336 0.3634 0.0030 1 0 0.6331 0.3635 0.0034
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.100 1 3 1 122 63 59 27 1 16 0 19 0 0 59 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 2.938 0.15 3.37 -3.22 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6505 0.3461 0.0034 1 0 0.6465 0.3499 0.0036 1 0 0.6410 0.3551 0.0039
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 490 152 338 135 1 2 0 14 1 2 335 0 0 0.8882 0.0030 0.0089 75.000 0.50 1.86 -1.35 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1944 0.8056 0.0000
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 205 29 176 0 1 2 22 4 0 0 176 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.500 5.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0894 0.9106 2 2 0.0000 0.0897 0.9103 2 2 0.0000 0.0905 0.9095
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 205 28 177 0 0 16 11 1 0 0 177 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.750 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1210 0.8790 2 2 0.0000 0.1223 0.8777 2 2 0.0000 0.1240 0.8760
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 462 147 315 125 5 7 0 10 0 0 315 0 0 0.8503 0.0000 0.0000 19.286 0.17 5.40 -5.23 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0123 0.9877 0.0000 0 1 0.4153 0.5847 0.0000
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 443 133 310 123 0 0 0 10 0 0 310 0 0 0.9248 0.0000 0.0000 133.000 0.24 1.80 -1.56 93 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0428 0.9572 0.0000 0 0 0.7185 0.2815 0.0000
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.100 1 3 1 300 101 199 58 0 5 0 38 0 0 196 0 3 0.5743 0.0000 0.0151 19.200 0.38 4.55 -4.17 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7601 0.2388 0.0011 1 0 0.7547 0.2440 0.0013 1 0 0.7472 0.2513 0.0015
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 532 171 361 95 1 2 0 73 0 0 360 0 1 0.5556 0.0000 0.0028 84.500 0.54 3.04 -2.50 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5775 0.4097 0.0127 1 0 0.5712 0.4139 0.0149 1 0 0.5616 0.4201 0.0183
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 561 154 407 141 2 0 1 10 0 0 406 1 0 0.9156 0.0000 0.0025 153.000 0.23 3.00 -2.77 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0263 0.9737 0.0000 0 0 0.7442 0.2558 0.0000
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 1252 410 842 179 1 76 1 153 1 0 820 0 21 0.4366 0.0012 0.0261 4.395 0.36 6.54 -6.17 67 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1352 0.8264 0.0384 1 1 0.1476 0.8086 0.0439 1 1 0.1640 0.7842 0.0517
chr19 47802295 ATCGGGCCTGGGT A 0.001408 0.100 1 -12 3 1339 356 983 291 9 34 5 17 0 1 978 3 1 0.8174 0.0000 0.0051 10.931 3.03 10.18 -7.15 101 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0705 0.9295 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 181 65 116 34 1 6 0 24 0 0 116 0 0 0.5231 0.0000 0.0000 9.833 0.24 2.25 -2.01 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6370 0.3475 0.0155 1 0 0.6316 0.3517 0.0167 1 0 0.6242 0.3574 0.0184
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 938 237 701 168 3 42 1 23 0 1 700 0 0 0.7089 0.0000 0.0014 4.619 0.98 3.17 -2.20 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000
chr19 49196501 TGCTGCGGGGGCC T 0.003841 0.100 1 -12 2 358 114 244 105 0 4 0 5 0 0 244 0 0 0.9211 0.0000 0.0000 27.500 0.38 9.80 -9.42 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4506 0.5494 0.0000 0 0 0.9958 0.0042 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 480 122 358 55 0 21 2 44 1 1 349 2 5 0.4508 0.0028 0.0251 4.810 1.58 11.14 -9.55 9 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3348 0.5844 0.0807 1 1 0.3386 0.5770 0.0844 1 1 0.3430 0.5677 0.0894
chr19 49652104 GCCGCTCCCGCTC G 0.005187 0.100 1 -12 2 482 126 356 58 1 27 0 40 1 1 348 0 6 0.4603 0.0028 0.0225 3.667 1.57 10.93 -9.36 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7408 0.2590 0.0002 1 0 0.7367 0.2632 0.0002 1 0 0.7307 0.2691 0.0002
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.100 1 -18 2 588 235 353 163 0 61 0 11 0 0 353 0 0 0.6936 0.0000 0.0000 2.852 0.41 12.64 -12.23 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2096 0.7904 0.0000 0 0 0.9566 0.0434 0.0000
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 568 124 444 0 0 4 15 105 0 0 438 0 6 0.0000 0.0000 0.0135 30.000 3.37 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 568 130 438 2 0 7 105 16 0 0 438 0 0 0.0154 0.0000 0.0000 17.286 0.00 3.75 -3.75 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3037 0.6963 2 2 0.0000 0.0468 0.9532 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 546 154 392 65 0 5 5 79 0 0 392 0 0 0.4221 0.0000 0.0000 29.800 0.37 2.78 -2.42 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0084 0.3264 0.6652 1 2 0.0097 0.3297 0.6607 1 2 0.0116 0.3347 0.6538
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 219 101 118 10 0 1 0 90 0 0 116 0 2 0.0990 0.0000 0.0169 100.000 0.10 2.38 -2.28 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9939 0.0061 2 1 0.0000 0.7308 0.2692
chr19 52613680 GCCACACTCATTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGGATTCTCTGATGTTGTGCAAGGTGTGAAATATGATGGAAGACCTTT G 0.063910 0.100 1 -84 2 1169 339 830 214 1 12 1 111 13 5 811 1 0 0.6313 0.0157 0.0229 27.250 0.52 2.49 -1.96 38 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 52801215 CAT C 0.002645 0.100 1 -2 1 1148 226 922 116 0 1 0 109 0 0 918 0 4 0.5133 0.0000 0.0043 225.000 0.64 2.58 -1.94 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3038 0.6957 0.0004 1 1 0.3196 0.6799 0.0005 1 1 0.3399 0.6596 0.0005
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 1380 333 1047 315 4 1 0 13 0 0 1047 0 0 0.9459 0.0000 0.0000 330.000 0.22 3.00 -2.78 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9224 0.0776 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 594 175 419 121 0 7 1 46 0 0 418 1 0 0.6914 0.0000 0.0024 28.000 0.33 3.00 -2.67 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9948 0.0052 0.0000 1 0 0.9935 0.0065 0.0000 1 0 0.9914 0.0086 0.0000
chr19 54251009 C CA 0.002394 0.100 1 1 1 599 167 432 158 0 1 0 8 0 0 432 0 0 0.9461 0.0000 0.0000 166.000 0.96 2.75 -1.79 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0268 0.9732 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 642 135 507 59 0 3 0 73 0 0 505 0 2 0.4370 0.0000 0.0039 44.000 0.80 3.19 -2.40 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0260 0.4514 0.5226 1 2 0.0291 0.4528 0.5181 1 2 0.0338 0.4550 0.5112
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 409 98 311 39 0 24 0 35 0 0 303 0 8 0.3980 0.0000 0.0257 3.083 0.13 8.29 -8.16 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1310 0.5809 0.2881 1 1 0.1357 0.5748 0.2894 1 1 0.1420 0.5672 0.2908
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 594 127 467 0 0 15 0 112 0 0 434 0 33 0.0000 0.0000 0.0707 7.467 17.87 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 898 248 650 211 1 26 1 9 0 0 650 0 0 0.8508 0.0000 0.0000 8.538 0.88 4.00 -3.12 109 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.7046 0.2954 0.0000 0 0 0.9915 0.0085 0.0000
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 508 92 416 43 0 0 0 49 0 0 412 0 4 0.4674 0.0000 0.0096 92.000 0.77 3.59 -2.82 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0533 0.4971 0.4496 1 1 0.0572 0.4957 0.4471 1 1 0.0627 0.4941 0.4432
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 130 60 70 26 0 4 0 30 0 0 68 0 2 0.4333 0.0000 0.0286 14.000 0.23 3.20 -2.97 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1659 0.5834 0.2507 1 1 0.1722 0.5793 0.2485 1 1 0.1807 0.5739 0.2455
chr19 57639970 TG T 0.349431 0.100 1 -1 1 132 57 75 30 0 0 0 27 0 0 75 0 0 0.5263 0.0000 0.0000 57.000 0.17 1.22 -1.06 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3563 0.5381 0.1056 1 1 0.3573 0.5343 0.1084 1 1 0.3583 0.5297 0.1120
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.100 1 -48 1 151 69 82 35 1 12 0 21 0 0 72 0 10 0.5072 0.0000 0.1220 4.667 1.31 7.05 -5.73 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4573 0.4988 0.0439 1 1 0.4582 0.4962 0.0456 1 1 0.4591 0.4931 0.0478
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 298 105 193 95 1 0 0 9 0 0 193 0 0 0.9048 0.0000 0.0000 105.000 0.21 4.11 -3.90 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0442 0.9558 0.0000 0 0 0.6448 0.3552 0.0000
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 296 103 193 55 0 1 0 47 0 0 191 0 2 0.5340 0.0000 0.0104 102.000 0.27 2.00 -1.73 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2885 0.6004 0.1111 1 1 0.2897 0.5935 0.1168 1 1 0.2907 0.5848 0.1245
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 78 50 28 25 0 0 0 25 0 0 28 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 50.000 0.04 7.44 -7.40 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1726 0.5610 0.2664 1 1 0.1744 0.5564 0.2691 1 1 0.1767 0.5507 0.2726
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.100 1 3 1 391 96 295 48 2 8 0 38 0 1 291 0 3 0.5000 0.0000 0.0136 11.000 0.85 2.97 -2.12 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5997 0.3931 0.0071 1 0 0.5988 0.3936 0.0077 1 0 0.5970 0.3946 0.0084
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 406 146 260 102 0 0 2 42 0 0 256 0 4 0.6986 0.0000 0.0154 146.000 1.05 8.79 -7.74 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9844 0.0156 0.0000 1 0 0.9819 0.0181 0.0000 1 0 0.9779 0.0221 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 408 146 262 99 0 4 3 40 0 0 258 0 4 0.6781 0.0000 0.0153 35.500 1.01 8.68 -7.66 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9818 0.0182 0.0000 1 0 0.9790 0.0210 0.0000 1 0 0.9746 0.0254 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 413 134 279 84 0 1 0 49 0 0 277 0 2 0.6269 0.0000 0.0072 133.000 1.13 8.29 -7.15 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8962 0.1031 0.0007 1 0 0.8887 0.1104 0.0009 1 0 0.8778 0.1209 0.0013
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 249 103 146 7 1 15 0 80 0 0 133 0 13 0.0680 0.0000 0.0890 5.867 0.14 6.08 -5.93 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9948 0.0052 2 1 0.0000 0.9070 0.0930
chr20 17621690 CGAG C 0.000581 0.100 1 -3 2 515 141 374 133 0 2 0 6 0 0 373 0 1 0.9433 0.0000 0.0027 69.500 0.26 3.33 -3.07 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2095 0.7905 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 665 150 515 12 0 3 1 134 0 0 510 0 5 0.0800 0.0000 0.0097 48.667 0.17 6.16 -5.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.7535 0.2465
chr20 33663701 TGCGGCGGCAAGAGGC T 0.003375 0.100 1 -15 1 645 195 450 162 0 19 0 14 0 0 450 0 0 0.8308 0.0000 0.0000 9.263 0.48 10.71 -10.24 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2448 0.7552 0.0000 0 0 0.9897 0.0103 0.0000
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 386 117 269 6 1 3 0 107 0 0 255 0 14 0.0513 0.0000 0.0520 37.667 0.00 3.26 -3.26 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 2 0.0000 0.4885 0.5115 2 2 0.0000 0.0792 0.9208
chr20 35627312 C CA 0.103940 0.100 1 1 1 142 65 77 64 0 1 0 0 0 0 75 0 2 0.9846 0.0000 0.0260 64.000 0.27 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7319 0.2681 0.0000 0 0 0.9618 0.0382 0.0000 0 0 0.9816 0.0184 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 476 134 342 123 0 1 0 10 0 0 342 0 0 0.9179 0.0000 0.0000 133.000 0.50 3.60 -3.10 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0071 0.9929 0.0000 0 1 0.2929 0.7071 0.0000
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 932 285 647 0 0 37 10 238 0 0 642 0 5 0.0000 0.0000 0.0077 6.703 3.61 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr20 45891618 TG T 0.009535 0.100 1 -1 1 937 277 660 17 13 131 8 108 1 0 658 1 0 0.0614 0.0015 0.0030 1.103 0.24 4.18 -3.94 7 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 45891620 CTG C 0.009541 0.100 1 -2 1 936 278 658 19 0 14 131 114 1 0 656 1 0 0.0683 0.0015 0.0030 10.769 0.32 4.23 -3.91 7 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9981 0.0019
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 433 201 232 141 14 29 5 12 0 0 231 1 0 0.7015 0.0000 0.0043 6.577 1.02 2.75 -1.73 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0605 0.9395 0.0000
chr20 47651121 A AGC 0.002695 0.100 1 2 1 430 192 238 99 65 13 1 14 0 0 237 0 1 0.5156 0.0000 0.0042 9.833 0.84 4.36 -3.52 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0588 0.9412 0.0000 0 0 0.9659 0.0341 0.0000
chr20 47651122 A AG 0.002096 0.100 1 1 2 430 193 237 99 8 74 1 11 0 0 237 0 0 0.5130 0.0000 0.0000 28.750 0.65 4.64 -3.99 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0271 0.9729 0.0000 0 0 0.8056 0.1944 0.0000
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.100 1 3 1 393 112 281 53 1 8 0 50 0 0 280 0 1 0.4732 0.0000 0.0036 12.875 0.15 2.90 -2.75 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3578 0.5832 0.0590 1 1 0.3632 0.5755 0.0612 1 1 0.3698 0.5660 0.0641
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 215 23 192 0 0 2 0 21 0 0 187 0 5 0.0000 0.0000 0.0260 10.500 7.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 262 126 136 0 0 1 0 125 0 0 136 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 125.000 2.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 712 160 552 9 0 4 0 147 0 0 537 0 15 0.0563 0.0000 0.0272 39.000 0.00 5.90 -5.90 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8103 0.1897 2 2 0.0000 0.1068 0.8932
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 672 159 513 80 3 17 1 58 4 0 505 2 2 0.5031 0.0078 0.0156 8.235 2.01 16.71 -14.69 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8080 0.1902 0.0018 1 0 0.8018 0.1961 0.0021 1 0 0.7928 0.2046 0.0027
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 199 96 103 82 0 7 0 7 0 0 103 0 0 0.8542 0.0000 0.0000 12.714 0.22 3.00 -2.78 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0251 0.9749 0.0000 0 1 0.3070 0.6930 0.0000
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 268 40 228 0 0 5 1 34 0 0 227 0 1 0.0000 0.0000 0.0044 7.000 1.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1023 167 856 142 1 5 1 18 1 1 854 0 0 0.8503 0.0012 0.0023 32.400 1.13 3.17 -2.03 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0031 0.9969 0.0000
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1026 172 854 140 6 9 0 17 1 0 852 1 0 0.8140 0.0012 0.0023 20.125 1.03 3.35 -2.32 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0079 0.9921 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 582 141 441 114 0 18 0 9 0 0 441 0 0 0.8085 0.0000 0.0000 6.833 1.10 15.44 -14.35 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0171 0.9829 0.0000 0 1 0.3989 0.6011 0.0000
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 283 112 171 1 1 12 0 98 0 0 169 1 1 0.0089 0.0000 0.0117 8.333 1.00 8.27 -7.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0134 0.9866 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 476 211 265 95 4 28 0 84 0 0 264 0 1 0.4502 0.0000 0.0038 6.536 0.25 3.37 -3.12 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5171 0.4678 0.0151 1 0 0.5197 0.4633 0.0169 1 0 0.5220 0.4584 0.0196
chr22 19852234 CCTG C 0.000328 0.100 1 -3 3 446 118 328 106 1 4 0 7 0 0 328 0 0 0.8983 0.0000 0.0000 28.500 0.31 3.71 -3.40 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1108 0.8892 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 168 82 86 16 0 5 3 58 0 0 86 0 0 0.1951 0.0000 0.0000 15.400 0.50 3.17 -2.67 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0003 0.4081 0.5917 2 1 0.0000 0.9458 0.0542 2 1 0.0000 0.9970 0.0030
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 738 136 602 9 0 43 1 83 0 0 584 0 18 0.0662 0.0000 0.0299 2.163 1.33 16.02 -14.69 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9255 0.0745 2 2 0.0000 0.2420 0.7580
chr22 27798924 T TTGC 0.004414 0.100 1 3 1 1357 401 956 320 11 56 1 13 1 0 954 0 1 0.7980 0.0010 0.0021 6.089 0.68 3.31 -2.63 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 29489869 AGCTAAGTCCCCAGAGAAG A 0.006299 0.100 1 -18 2 1426 385 1041 185 6 27 13 154 2 2 1005 8 24 0.4805 0.0019 0.0346 13.148 2.21 12.77 -10.56 105 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1038 0.8951 0.0011 1 1 0.1190 0.8798 0.0012 1 1 0.1408 0.8578 0.0014
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 611 166 445 88 0 9 1 68 0 0 441 0 4 0.5301 0.0000 0.0090 17.444 0.42 2.54 -2.12 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4962 0.4799 0.0239 1 0 0.4953 0.4780 0.0268 1 0 0.4930 0.4760 0.0310
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 373 182 191 0 0 50 0 132 0 0 183 0 8 0.0000 0.0000 0.0419 2.640 6.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 446 81 365 13 0 2 0 66 0 0 365 0 0 0.1605 0.0000 0.0000 39.500 0.46 11.94 -11.48 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9926 0.0074
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.100 1 -3 1 906 319 587 143 1 12 3 160 0 0 579 2 6 0.4483 0.0000 0.0136 27.818 1.36 3.89 -2.53 23 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0042 0.4511 0.5447 1 2 0.0052 0.4464 0.5484 1 2 0.0067 0.4418 0.5514
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.100 1 -42 4 308 139 169 132 0 3 0 4 0 1 165 0 3 0.9496 0.0000 0.0237 45.333 0.25 11.00 -10.75 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4931 0.5069 0.0000 0 0 0.9396 0.0604 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 333 184 149 150 1 20 0 13 0 0 148 0 1 0.8152 0.0000 0.0067 8.200 0.29 6.85 -6.55 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2688 0.7312 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 309 114 195 2 0 3 0 109 0 0 192 0 3 0.0175 0.0000 0.0154 37.000 0.50 3.07 -2.57 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1045 0.8955 2 2 0.0000 0.0128 0.9872 2 2 0.0000 0.0065 0.9935
chr22 40301172 T TGCA 0.000280 0.100 1 3 1 418 141 277 110 9 16 0 6 0 0 277 0 0 0.7801 0.0000 0.0000 7.812 0.28 3.00 -2.72 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7146 0.2854 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1641 407 1234 236 0 6 0 165 0 0 1223 1 10 0.5799 0.0000 0.0089 66.833 0.71 9.88 -9.17 90 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9729 0.0271 0.0000 1 0 0.9708 0.0292 0.0000 1 0 0.9675 0.0325 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 619 119 500 104 1 13 0 1 0 0 498 0 2 0.8739 0.0000 0.0040 8.077 1.48 3.00 -1.52 34 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8317 0.1683 0.0000 0 0 0.9930 0.0070 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 325 110 215 91 1 15 0 3 0 0 215 0 0 0.8273 0.0000 0.0000 6.333 0.44 18.33 -17.89 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5371 0.4629 0.0000 0 0 0.9715 0.0285 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000
744 rows