File Info

Filename
HG00136_x_HG00290_FF_5.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/78/73941dbe59ad8abddbfdb776741ab3/HG00136_x_HG00290_FF_5.features.tsv
Size
135.2 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG00136_x_HG00290_FF_5)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1310876 CGGCTCTGGGTCACAGGT C 0.013343 0.050 1 -17 3 635 177 458 81 0 22 0 74 0 0 457 0 1 0.4576 0.0000 0.0022 7.045 0.69 11.68 -10.98 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5211 0.4750 0.0039 1 0 0.5218 0.4742 0.0040 1 0 0.5225 0.4734 0.0041
chr1 1641723 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 341 127 214 95 0 8 1 23 0 0 214 0 0 0.7480 0.0000 0.0000 14.875 0.21 9.26 -9.05 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9340 0.0652 0.0008 0 1 0.1152 0.8846 0.0001 0 1 0.0014 0.9986 0.0000
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -9 1 563 227 336 161 1 14 0 51 0 0 336 0 0 0.7093 0.0000 0.0000 15.214 0.33 8.67 -8.34 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9894 0.0106 0.0000 1 0 0.9871 0.0128 0.0000 1 0 0.9439 0.0561 0.0000
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 1 435 131 304 61 2 11 2 55 0 0 301 0 3 0.4656 0.0000 0.0099 10.909 0.31 3.38 -3.07 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2670 0.5347 0.1983 1 1 0.2672 0.5320 0.2007 1 1 0.2673 0.5288 0.2039
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.050 1 -9 2 554 176 378 83 0 24 0 69 0 0 377 0 1 0.4716 0.0000 0.0026 6.333 0.23 8.35 -8.12 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3930 0.4983 0.1087 1 1 0.3888 0.4982 0.1130 1 1 0.3830 0.4982 0.1188
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 313 134 179 7 0 0 0 127 0 0 175 0 4 0.0522 0.0000 0.0223 134.000 0.00 3.62 -3.62 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8091 0.1909 2 2 0.0000 0.3684 0.6316
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.050 1 3 1 553 130 423 112 1 15 0 2 0 0 423 0 0 0.8615 0.0000 0.0000 7.600 0.29 3.00 -2.71 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3957 0.6043 0.0000 0 0 0.8097 0.1903 0.0000 0 0 0.8768 0.1232 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.050 1 3 2 1006 166 840 93 0 5 0 68 0 0 836 0 4 0.5602 0.0000 0.0048 32.200 0.17 3.43 -3.25 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5021 0.4350 0.0629 1 0 0.4941 0.4388 0.0671 1 0 0.4833 0.4438 0.0729
chr1 16400810 G GCTT 0.500000 0.050 1 3 2 308 113 195 107 0 4 0 2 0 0 195 0 0 0.9469 0.0000 0.0000 27.250 0.33 3.00 -2.67 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3607 0.6393 0.0000 0 0 0.7864 0.2136 0.0000 0 0 0.8608 0.1392 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 418 86 332 67 0 2 1 16 0 0 332 0 0 0.7791 0.0000 0.0000 42.000 0.37 1.12 -0.75 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8339 0.1601 0.0059 0 1 0.2026 0.7956 0.0017 0 1 0.0107 0.9893 0.0000
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.050 1 1 3 1626 365 1261 278 3 41 1 42 0 0 1261 0 0 0.7616 0.0000 0.0000 7.854 1.58 2.31 -0.73 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 1 367 140 227 66 3 12 1 58 0 0 227 0 0 0.4714 0.0000 0.0000 10.667 0.42 3.19 -2.77 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3579 0.5094 0.1326 1 1 0.3548 0.5087 0.1366 1 1 0.3504 0.5077 0.1419
chr1 35738058 TTTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 229 66 163 22 0 11 0 33 1 0 162 0 0 0.3333 0.0061 0.0061 5.000 2.09 5.73 -3.64 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1389 0.4877 0.3734 1 1 0.1426 0.4886 0.3689 1 1 0.1474 0.4897 0.3629
chr1 36178099 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 1 499 155 344 151 1 2 0 1 0 0 344 0 0 0.9742 0.0000 0.0000 76.500 0.44 3.00 -2.56 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8996 0.1004 0.0000 0 0 0.9561 0.0439 0.0000 0 0 0.9634 0.0366 0.0000
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.050 1 -3 2 376 98 278 47 0 10 0 41 0 0 278 0 0 0.4796 0.0000 0.0000 8.800 0.30 3.10 -2.80 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3117 0.5160 0.1722 1 1 0.3100 0.5148 0.1752 1 1 0.3076 0.5133 0.1792
chr1 46815074 GAT G 0.500000 0.050 1 -2 2 338 80 258 36 0 1 0 43 0 0 258 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 79.000 0.47 2.44 -1.97 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1636 0.5094 0.3269 1 1 0.1668 0.5087 0.3245 1 1 0.1710 0.5078 0.3212
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.050 1 6 1 634 183 451 0 0 28 1 154 1 0 449 1 0 0.0000 0.0022 0.0044 5.536 5.71 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0905 0.9095 2 2 0.0000 0.0399 0.9601 2 2 0.0000 0.0333 0.9667
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 226 75 151 33 0 6 0 36 0 0 151 0 0 0.4400 0.0000 0.0000 11.500 0.39 2.64 -2.24 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2054 0.5183 0.2763 1 1 0.2073 0.5169 0.2757 1 1 0.2099 0.5152 0.2749
chr1 53459700 G GCCGCCC 0.500000 0.050 1 6 2 601 136 465 55 1 25 1 54 0 0 461 0 4 0.4044 0.0000 0.0086 4.440 0.33 4.70 -4.38 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1994 0.5323 0.2683 1 1 0.2018 0.5299 0.2683 1 1 0.2048 0.5268 0.2683
chr1 54610464 CCACTCCACATTCAGACCGTCATCCCCAGG C 0.500000 0.050 1 -29 1 283 122 161 74 1 5 1 41 0 0 157 0 4 0.6066 0.0000 0.0248 23.400 0.15 19.27 -19.12 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6213 0.3434 0.0353 1 0 0.6093 0.3520 0.0387 1 0 0.5931 0.3633 0.0435
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.050 1 3 2 838 212 626 99 3 36 0 74 0 1 622 0 3 0.4670 0.0000 0.0064 4.889 0.42 3.46 -3.04 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5661 0.3905 0.0434 1 0 0.5563 0.3966 0.0471 1 0 0.5430 0.4046 0.0524
chr1 62209972 ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC A 0.500000 0.050 1 -30 1 561 148 413 124 1 21 0 2 0 0 413 0 0 0.8378 0.0000 0.0000 6.048 0.70 31.00 -30.30 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4701 0.5299 0.0000 0 0 0.8515 0.1485 0.0000 0 0 0.9049 0.0951 0.0000
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.050 1 3 1 160 78 82 38 0 2 0 38 0 0 82 0 0 0.4872 0.0000 0.0000 38.000 0.24 3.71 -3.47 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2384 0.5232 0.2384 1 1 0.2393 0.5214 0.2393 1 1 0.2404 0.5192 0.2404
chr1 84574341 CAGCAGCGCT C 0.500000 0.050 1 -9 2 422 174 248 166 0 3 0 5 0 0 248 0 0 0.9540 0.0000 0.0000 57.000 0.14 4.00 -3.86 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0185 0.9815 0.0000 0 0 0.6806 0.3194 0.0000 0 0 0.8930 0.1070 0.0000
chr1 85132996 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 203 69 134 29 1 12 0 27 0 0 134 0 0 0.4203 0.0000 0.0000 4.667 0.21 1.11 -0.90 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2759 0.5149 0.2092 1 1 0.2753 0.5138 0.2110 1 1 0.2744 0.5124 0.2133
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.050 1 -6 1 488 170 318 89 0 8 0 73 0 0 316 0 2 0.5235 0.0000 0.0063 20.250 0.20 5.32 -5.11 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4043 0.4944 0.1013 1 1 0.3998 0.4946 0.1056 1 1 0.3936 0.4949 0.1115
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 196 81 115 45 0 0 0 36 0 0 114 0 1 0.5556 0.0000 0.0087 81.000 0.11 3.31 -3.19 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3399 0.5060 0.1541 1 1 0.3370 0.5055 0.1575 1 1 0.3331 0.5049 0.1620
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.050 1 3 2 442 128 314 59 2 2 0 65 1 0 311 1 1 0.4609 0.0032 0.0096 62.500 0.42 3.43 -3.01 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1774 0.5316 0.2910 1 1 0.1804 0.5292 0.2904 1 1 0.1844 0.5262 0.2894
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.050 1 -24 3 944 225 719 204 0 19 0 2 0 0 719 0 0 0.9067 0.0000 0.0000 10.842 0.24 1.00 -0.76 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8668 0.1332 0.0000 0 0 0.9758 0.0242 0.0000 0 0 0.9844 0.0156 0.0000
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.050 1 -45 4 935 247 688 223 1 21 0 2 0 0 688 0 0 0.9028 0.0000 0.0000 10.762 0.29 1.50 -1.21 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9151 0.0849 0.0000 0 0 0.9851 0.0149 0.0000 0 0 0.9903 0.0097 0.0000
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.050 1 -2 3 221 89 132 41 31 13 0 4 0 0 132 0 0 0.4607 0.0000 0.0000 4.231 0.15 2.00 -1.85 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0082 0.9918 0.0000 0 1 0.2733 0.7267 0.0000 0 0 0.5391 0.4609 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 250 80 170 4 0 9 9 58 0 0 170 0 0 0.0500 0.0000 0.0000 7.111 1.00 2.07 -1.07 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9910 0.0090 2 1 0.0000 0.7337 0.2663 2 2 0.0000 0.4728 0.5272
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 18 2 254 81 173 44 0 8 0 29 0 0 159 0 14 0.5432 0.0000 0.0809 9.125 0.07 11.31 -11.24 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2486 0.5262 0.2252 1 1 0.2492 0.5243 0.2266 1 1 0.2499 0.5218 0.2284
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.050 1 6 2 832 226 606 183 10 28 1 4 0 0 606 0 0 0.8097 0.0000 0.0000 7.296 1.63 6.25 -4.62 97 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1230 0.8770 0.0000 0 0 0.8654 0.1346 0.0000 0 0 0.9511 0.0489 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.050 1 12 1 1331 346 985 135 7 86 1 117 3 3 938 4 37 0.3902 0.0030 0.0477 3.012 2.31 10.79 -8.48 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1039 0.5503 0.3457 1 1 0.1086 0.5464 0.3450 1 1 0.1150 0.5415 0.3436
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.050 1 -9 1 483 177 306 1 1 26 0 149 0 0 305 1 0 0.0056 0.0000 0.0033 5.769 0.00 7.90 -7.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1166 0.8834 2 2 0.0000 0.0508 0.9492 2 2 0.0000 0.0417 0.9583
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 205 79 126 5 0 4 0 70 0 0 125 0 1 0.0633 0.0000 0.0079 18.750 0.20 1.76 -1.56 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9980 0.0020 2 1 0.0000 0.8268 0.1732 2 1 0.0000 0.5365 0.4635
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.050 1 2 4 656 165 491 0 0 2 0 163 0 0 489 0 2 0.0000 0.0000 0.0041 81.500 2.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0155 0.9845 2 2 0.0000 0.0168 0.9832 2 2 0.0000 0.0188 0.9812
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.050 1 1 1 1400 272 1128 0 0 8 2 262 0 0 1127 0 1 0.0000 0.0000 0.0009 32.875 1.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 4 160 64 96 31 0 11 1 21 0 0 96 0 0 0.4844 0.0000 0.0000 4.818 0.23 4.95 -4.73 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3614 0.4917 0.1469 1 1 0.3573 0.4922 0.1504 1 1 0.3520 0.4930 0.1551
chr1 201386873 CCCA C 0.500000 0.050 1 -3 1 623 168 455 88 1 6 1 72 0 0 450 0 5 0.5238 0.0000 0.0110 27.000 1.08 3.86 -2.78 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3618 0.5159 0.1223 1 1 0.3589 0.5146 0.1265 1 1 0.3549 0.5130 0.1321
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.050 1 24 3 679 200 479 74 0 38 1 87 0 0 453 0 26 0.3700 0.0000 0.0543 4.263 0.12 13.16 -13.04 18 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0140 0.2547 0.7313 1 2 0.0160 0.2654 0.7185 1 2 0.0191 0.2800 0.7009
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.050 1 -12 1 517 254 263 214 0 32 0 8 0 0 262 0 1 0.8425 0.0000 0.0038 6.938 0.41 12.38 -11.96 114 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3263 0.6737 0.0000 0 0 0.8573 0.1427 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.050 1 -9 1 724 146 578 69 0 8 0 69 0 0 578 0 0 0.4726 0.0000 0.0000 17.250 0.68 8.32 -7.64 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2290 0.5420 0.2290 1 1 0.2306 0.5389 0.2306 1 1 0.2325 0.5349 0.2325
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 240 104 136 0 0 2 0 102 0 0 135 0 1 0.0000 0.0000 0.0074 51.000 1.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0697 0.9303 2 2 0.0000 0.0731 0.9269 2 2 0.0000 0.0781 0.9219
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 630 168 462 77 0 17 2 72 0 1 457 1 3 0.4583 0.0000 0.0108 8.882 0.51 4.08 -3.58 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2220 0.5474 0.2306 1 1 0.2239 0.5438 0.2323 1 1 0.2263 0.5394 0.2343
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 506 131 375 66 0 2 0 63 0 0 374 0 1 0.5038 0.0000 0.0027 64.500 0.23 2.16 -1.93 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2535 0.5384 0.2081 1 1 0.2542 0.5355 0.2103 1 1 0.2551 0.5319 0.2131
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 715 215 500 104 0 1 0 110 0 0 494 0 6 0.4837 0.0000 0.0120 214.000 0.32 3.28 -2.96 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1110 0.5255 0.3635 1 1 0.1154 0.5235 0.3611 1 1 0.1214 0.5209 0.3577
chr1 247896050 ACTC A 0.500000 0.050 1 -3 2 638 177 461 105 0 1 0 71 0 0 457 0 4 0.5932 0.0000 0.0087 176.000 1.56 4.15 -2.59 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6185 0.3497 0.0318 1 0 0.6073 0.3576 0.0351 1 0 0.5921 0.3681 0.0397
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.050 1 -1 1 744 160 584 89 0 4 0 67 0 0 584 0 0 0.5563 0.0000 0.0000 39.000 0.63 2.21 -1.58 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5184 0.4227 0.0589 1 0 0.5097 0.4273 0.0630 1 0 0.4981 0.4333 0.0687
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.050 1 -84 1 1067 358 709 327 2 24 0 5 0 0 709 0 0 0.9134 0.0000 0.0000 13.917 0.38 0.20 0.18 197 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5290 0.4710 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 1140 282 858 3 0 3 1 275 0 0 856 0 2 0.0106 0.0000 0.0023 93.000 2.00 1.36 0.64 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1082 0.8918 2 2 0.0000 0.0077 0.9923 2 2 0.0000 0.0039 0.9961
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.050 1 2 1 1234 166 1068 109 1 8 0 48 0 0 1059 0 9 0.6566 0.0000 0.0084 19.750 0.25 3.88 -3.63 69 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8446 0.1509 0.0045 1 0 0.8326 0.1620 0.0054 1 0 0.8154 0.1777 0.0069
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.050 1 -7 1 658 262 396 84 0 21 0 157 0 0 391 0 5 0.3206 0.0000 0.0126 11.476 1.17 6.63 -5.46 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0004 0.0540 0.9456 1 2 0.0006 0.0608 0.9386 1 2 0.0008 0.0710 0.9281
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.050 1 -3 1 221 109 112 101 2 4 0 2 0 0 112 0 0 0.9266 0.0000 0.0000 26.250 0.17 4.00 -3.83 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4161 0.5839 0.0000 0 0 0.8232 0.1768 0.0000 0 0 0.8869 0.1131 0.0000
chr2 17781726 CAAGTT C 0.103121 0.050 1 -5 2 592 144 448 80 1 4 0 59 0 0 446 0 2 0.5556 0.0000 0.0045 34.750 0.21 4.98 -4.77 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6604 0.3289 0.0107 1 0 0.6544 0.3341 0.0115 1 0 0.6464 0.3411 0.0125
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.050 1 9 5 434 135 299 0 0 18 1 116 0 0 287 0 12 0.0000 0.0000 0.0401 6.500 9.13 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0165 0.9835 2 2 0.0000 0.0176 0.9824 2 2 0.0000 0.0192 0.9808
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.050 1 18 5 434 135 299 4 6 108 1 16 0 0 288 5 6 0.0296 0.0000 0.0368 0.231 7.00 4.81 2.19 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0249 0.9096 0.0655 2 1 0.0036 0.9803 0.0161 2 1 0.0007 0.9607 0.0386
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.050 1 -9 1 662 236 426 196 1 25 0 14 0 0 426 0 0 0.8305 0.0000 0.0000 8.440 0.40 7.71 -7.31 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0247 0.9753 0.0000 0 0 0.5828 0.4172 0.0000
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.050 1 3 1 222 78 144 0 0 1 1 76 0 0 144 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 76.000 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1268 0.8732 2 2 0.0000 0.1311 0.8689 2 2 0.0000 0.1373 0.8627
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.050 1 3 1 624 151 473 8 4 30 6 103 0 0 461 2 10 0.0530 0.0000 0.0254 4.033 0.38 4.63 -4.26 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9930 0.0070 2 1 0.0000 0.8227 0.1773
chr2 73385903 T TGGAGGA 0.500000 0.050 1 6 1 624 151 473 12 0 82 0 57 0 0 463 1 9 0.0795 0.0000 0.0211 0.852 2.00 5.68 -3.68 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.9436 0.0564
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.050 1 -6 1 629 173 456 142 1 27 0 3 0 0 456 0 0 0.8208 0.0000 0.0000 5.407 3.59 6.00 -2.41 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2157 0.7843 0.0000 0 0 0.8221 0.1779 0.0000 0 0 0.9105 0.0895 0.0000
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.050 1 -3 2 452 82 370 78 0 2 0 2 0 0 370 0 0 0.9512 0.0000 0.0000 40.000 0.13 3.50 -3.37 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2138 0.7862 0.0000 0 0 0.6429 0.3571 0.0000 0 0 0.7552 0.2448 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 5 388 152 236 131 1 11 1 8 0 0 236 0 0 0.8618 0.0000 0.0000 12.818 1.17 3.00 -1.83 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0617 0.9383 0.0000 0 1 0.4577 0.5423 0.0000
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 4 653 187 466 79 1 25 1 81 0 0 460 0 6 0.4225 0.0000 0.0129 6.440 0.44 3.21 -2.77 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1443 0.5312 0.3246 1 1 0.1482 0.5288 0.3231 1 1 0.1533 0.5258 0.3209
chr2 97113750 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 377 120 257 116 0 1 0 3 0 0 257 0 0 0.9667 0.0000 0.0000 119.000 0.29 1.00 -0.71 82 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1183 0.8817 0.0000 0 0 0.6935 0.3065 0.0000 0 0 0.8358 0.1642 0.0000
chr2 108259008 AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT A 0.500000 0.050 1 -22 1 657 209 448 197 0 11 0 1 0 0 448 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 18.000 0.27 22.00 -21.73 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9653 0.0347 0.0000 0 0 0.9851 0.0149 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.050 1 -3 1 102 41 61 22 0 0 0 19 0 0 61 0 0 0.5366 0.0000 0.0000 41.000 0.50 3.05 -2.55 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2812 0.5098 0.2090 1 1 0.2803 0.5090 0.2107 1 1 0.2790 0.5081 0.2129
chr2 119321194 TAAAGGGATATCTACAA T 0.500000 0.050 1 -16 2 131 58 73 35 0 0 0 23 0 0 73 0 0 0.6034 0.0000 0.0000 58.000 1.26 11.96 -10.70 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4014 0.4761 0.1225 1 1 0.3958 0.4777 0.1265 1 1 0.3884 0.4799 0.1318
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.050 1 6 1 583 115 468 5 0 0 0 110 0 0 459 0 9 0.0435 0.0000 0.0192 115.000 0.00 6.05 -6.05 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9943 0.0057 2 1 0.0000 0.5998 0.4002 2 2 0.0000 0.2700 0.7300
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 206 56 150 13 6 9 6 22 0 0 147 1 2 0.2321 0.0000 0.0200 4.444 0.85 1.82 -0.97 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1254 0.4740 0.4006 1 1 0.1293 0.4758 0.3949 1 1 0.1345 0.4781 0.3874
chr2 165176265 CATT C 0.500000 0.050 1 -3 1 310 121 189 111 0 7 0 3 0 0 189 0 0 0.9174 0.0000 0.0000 16.286 0.13 3.33 -3.21 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1087 0.8913 0.0000 0 0 0.6757 0.3243 0.0000 0 0 0.8243 0.1757 0.0000
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.050 1 6 2 176 76 100 4 0 17 0 55 0 0 96 0 4 0.0526 0.0000 0.0400 3.688 0.25 6.42 -6.17 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9935 0.0065 2 1 0.0000 0.7691 0.2309 2 1 0.0000 0.5149 0.4851
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.050 1 -13 3 254 119 135 92 0 23 0 4 0 0 135 0 0 0.7731 0.0000 0.0000 4.174 0.15 10.25 -10.10 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0147 0.9853 0.0000 0 1 0.4010 0.5990 0.0000 0 0 0.6725 0.3275 0.0000
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 2 536 143 393 53 0 15 0 75 0 0 393 0 0 0.3706 0.0000 0.0000 8.533 0.62 3.01 -2.39 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0597 0.4144 0.5258 1 2 0.0638 0.4196 0.5166 1 2 0.0695 0.4263 0.5042
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.050 1 3 4 288 145 143 3 0 4 0 138 0 0 142 0 1 0.0207 0.0000 0.0070 35.250 0.00 3.21 -3.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8020 0.1980 2 2 0.0000 0.1940 0.8060 2 2 0.0000 0.0982 0.9018
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.050 1 -2 1 612 226 386 137 2 1 0 86 0 0 385 0 1 0.6062 0.0000 0.0026 223.000 0.98 4.14 -3.16 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8241 0.1707 0.0051 1 0 0.8121 0.1818 0.0061 1 0 0.7951 0.1972 0.0077
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.050 1 3 2 676 143 533 75 0 2 0 66 0 0 532 0 1 0.5245 0.0000 0.0019 70.500 0.37 3.89 -3.52 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3273 0.5243 0.1484 1 1 0.3255 0.5224 0.1521 1 1 0.3228 0.5201 0.1571
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.050 1 6 2 309 123 186 97 0 20 2 4 0 0 186 0 0 0.7886 0.0000 0.0000 5.050 2.59 4.75 -2.16 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0125 0.9875 0.0000 0 1 0.3710 0.6290 0.0000 0 0 0.6524 0.3476 0.0000
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.050 1 3 1 310 123 187 3 5 21 2 92 0 0 187 0 0 0.0244 0.0000 0.0000 4.762 0.00 2.86 -2.86 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9945 0.0055 2 1 0.0000 0.7738 0.2262 2 2 0.0000 0.4770 0.5230
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 235 74 161 54 10 6 0 4 0 0 161 0 0 0.7297 0.0000 0.0000 9.667 0.33 2.00 -1.67 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0084 0.9916 0.0000 0 1 0.2506 0.7494 0.0000 0 0 0.5070 0.4930 0.0000
chr2 199819526 T TA 0.500000 0.050 1 1 3 408 81 327 26 18 14 5 18 0 1 324 1 1 0.3210 0.0000 0.0092 3.500 0.85 2.33 -1.49 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4781 0.4363 0.0856 1 0 0.4697 0.4405 0.0898 1 0 0.4585 0.4459 0.0957
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.050 1 3 1 278 97 181 49 0 1 0 47 0 0 181 0 0 0.5052 0.0000 0.0000 96.000 0.39 3.06 -2.68 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2592 0.5281 0.2127 1 1 0.2595 0.5260 0.2146 1 1 0.2598 0.5233 0.2169
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 2 620 163 457 0 0 29 5 129 0 0 453 0 4 0.0000 0.0000 0.0088 4.552 8.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0303 0.9697 2 2 0.0000 0.0324 0.9676 2 2 0.0000 0.0355 0.9645
chr2 219496868 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 393 111 282 63 0 1 1 46 0 0 282 0 0 0.5676 0.0000 0.0000 110.000 1.48 1.50 -0.02 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4470 0.4618 0.0912 1 1 0.4403 0.4642 0.0955 1 1 0.4313 0.4674 0.1013
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.050 1 -27 1 651 224 427 120 4 8 0 92 0 0 399 0 28 0.5357 0.0000 0.0656 27.000 0.54 16.30 -15.76 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2568 0.5693 0.1739 1 1 0.2583 0.5641 0.1775 1 1 0.2601 0.5576 0.1823
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.050 1 -3 2 325 132 193 3 6 7 60 56 0 0 193 0 0 0.0227 0.0000 0.0000 19.833 5.67 3.70 1.97 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9958 0.0042 2 1 0.0000 0.7393 0.2607 2 2 0.0000 0.4020 0.5980
chr2 232847517 A AG 0.500000 0.050 1 1 2 325 120 205 3 40 21 4 52 0 0 197 0 8 0.0250 0.0000 0.0390 3.211 6.67 4.90 1.76 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0386 0.3453 0.6161 1 2 0.0421 0.3540 0.6039 1 2 0.0471 0.3655 0.5874
chr2 235852770 C CCAGG 0.500000 0.050 1 4 2 229 80 149 41 1 7 0 31 0 0 143 0 6 0.5125 0.0000 0.0403 10.429 1.17 4.58 -3.41 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3003 0.5166 0.1832 1 1 0.2989 0.5153 0.1858 1 1 0.2969 0.5137 0.1893
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.050 1 -3 1 363 110 253 80 1 24 0 5 0 0 253 0 0 0.7273 0.0000 0.0000 3.583 0.35 3.00 -2.65 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.2073 0.7927 0.0000 0 0 0.5208 0.4792 0.0000
chr2 241317535 A AT 0.500000 0.050 1 1 1 207 60 147 24 23 4 1 8 0 1 146 0 0 0.4000 0.0000 0.0068 8.500 1.04 1.88 -0.83 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0165 0.9830 0.0005 0 1 0.0140 0.9859 0.0000 0 1 0.1196 0.8804 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.050 1 3 1 712 195 517 106 0 1 0 88 0 0 513 0 4 0.5436 0.0000 0.0077 194.000 0.38 3.62 -3.25 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1226 0.6520 0.2255 1 1 0.1204 0.6459 0.2337 1 1 0.1175 0.6379 0.2446
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.050 1 12 2 670 165 505 134 0 27 0 4 1 1 501 0 2 0.8121 0.0020 0.0079 5.111 0.79 12.00 -11.21 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0073 0.9927 0.0000 0 0 0.6921 0.3079 0.0000 0 0 0.9237 0.0763 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.050 1 6 2 477 120 357 63 0 3 1 53 0 0 357 0 0 0.5250 0.0000 0.0000 39.000 0.56 5.08 -4.52 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3464 0.5116 0.1420 1 1 0.3436 0.5107 0.1458 1 1 0.3397 0.5095 0.1508
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.050 1 -3 1 580 187 393 98 0 2 0 87 0 0 392 0 1 0.5241 0.0000 0.0025 92.500 0.33 3.38 -3.05 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3445 0.5274 0.1281 1 1 0.3424 0.5253 0.1323 1 1 0.3395 0.5226 0.1379
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 15 1 790 272 518 2 15 35 4 216 1 0 469 0 48 0.0074 0.0019 0.0946 6.714 3.00 9.43 -6.43 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9891 0.0109 2 2 0.0000 0.4668 0.5332
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.050 1 3 1 734 224 510 5 1 51 7 160 0 0 500 0 10 0.0223 0.0000 0.0196 3.392 0.40 4.83 -4.43 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9946 0.0054 2 2 0.0000 0.4072 0.5928 2 2 0.0000 0.1175 0.8825
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.050 1 6 1 734 224 510 6 0 71 2 145 0 0 501 0 9 0.0268 0.0000 0.0176 2.155 0.83 5.10 -4.26 0 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 1 0.0000 0.5298 0.4702 2 2 0.0000 0.1755 0.8245
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.050 1 -2 5 753 207 546 0 0 11 0 196 0 0 540 0 6 0.0000 0.0000 0.0110 17.818 2.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0062 0.9938 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0078 0.9922
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 392 146 246 0 0 6 1 139 0 0 241 0 5 0.0000 0.0000 0.0203 23.333 3.82 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0254 0.9746 2 2 0.0000 0.0272 0.9728 2 2 0.0000 0.0300 0.9700
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 636 170 466 1 0 21 9 139 0 0 464 0 2 0.0059 0.0000 0.0043 7.048 1.00 3.22 -2.22 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1053 0.8947 2 2 0.0000 0.0462 0.9538 2 2 0.0000 0.0384 0.9616
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.050 1 -6 3 386 96 290 52 1 14 0 29 0 0 289 0 1 0.5417 0.0000 0.0034 5.857 0.31 6.79 -6.49 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5516 0.3916 0.0568 1 0 0.5410 0.3983 0.0608 1 0 0.5268 0.4068 0.0664
chr3 51970081 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 711 176 535 92 0 10 1 73 0 0 535 0 0 0.5227 0.0000 0.0000 16.500 0.17 1.40 -1.22 6 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4627 0.4608 0.0766 1 1 0.4561 0.4631 0.0809 1 1 0.4471 0.4661 0.0869
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.050 1 6 1 465 155 310 113 1 37 0 4 0 0 310 0 0 0.7290 0.0000 0.0000 3.189 0.21 3.75 -3.54 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0254 0.9746 0.0000 0 0 0.5353 0.4647 0.0000 0 0 0.7766 0.2234 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.050 1 10 2 185 92 93 3 0 4 0 85 0 0 86 0 7 0.0326 0.0000 0.0753 22.000 0.00 6.96 -6.96 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9294 0.0706 2 2 0.0000 0.4339 0.5661 2 2 0.0000 0.2515 0.7485
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.050 1 3 1 269 92 177 48 0 2 3 39 0 0 176 0 1 0.5217 0.0000 0.0056 45.000 0.08 2.97 -2.89 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3001 0.5197 0.1803 1 1 0.2988 0.5182 0.1831 1 1 0.2970 0.5163 0.1867
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 2 269 94 175 49 0 5 37 3 0 0 175 0 0 0.5213 0.0000 0.0000 17.800 0.10 3.00 -2.90 9 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4030 0.4801 0.1169 1 1 0.3976 0.4814 0.1210 1 1 0.3904 0.4831 0.1265
chr3 63912684 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 3 276 69 207 36 4 11 0 18 0 0 205 0 2 0.5217 0.0000 0.0097 5.273 0.61 3.89 -3.28 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5137 0.4142 0.0722 1 0 0.5040 0.4197 0.0764 1 0 0.4910 0.4268 0.0822
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.050 1 3 1 320 134 186 61 4 13 2 54 0 0 182 0 4 0.4552 0.0000 0.0215 9.308 0.44 3.19 -2.74 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2929 0.5302 0.1769 1 1 0.2922 0.5279 0.1799 1 1 0.2911 0.5250 0.1839
chr3 94061063 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 463 119 344 63 1 8 1 46 0 0 339 0 5 0.5294 0.0000 0.0145 13.875 0.08 1.37 -1.29 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3901 0.4926 0.1173 1 1 0.3856 0.4930 0.1214 1 1 0.3795 0.4936 0.1270
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.050 1 -9 3 840 236 604 91 0 16 0 129 0 0 591 0 13 0.3856 0.0000 0.0215 13.750 0.35 9.68 -9.33 35 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0053 0.1750 0.8197 1 2 0.0063 0.1860 0.8076 1 2 0.0080 0.2014 0.7906
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.050 1 -1 2 470 136 334 65 0 5 0 66 0 0 334 0 0 0.4779 0.0000 0.0000 26.200 0.32 1.23 -0.90 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2188 0.5396 0.2416 1 1 0.2207 0.5366 0.2427 1 1 0.2231 0.5329 0.2441
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 365 103 262 44 1 8 2 48 0 0 261 0 1 0.4272 0.0000 0.0038 11.750 0.45 1.40 -0.94 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1729 0.5187 0.3084 1 1 0.1759 0.5173 0.3068 1 1 0.1799 0.5155 0.3047
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 113 44 69 4 0 3 3 34 0 0 69 0 0 0.0909 0.0000 0.0000 13.333 0.25 1.24 -0.99 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.8510 0.1490 2 1 0.0000 0.6456 0.3544
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 481 136 345 8 0 1 1 126 0 0 345 0 0 0.0588 0.0000 0.0000 135.000 0.00 1.31 -1.31 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9008 0.0992 2 2 0.0000 0.4818 0.5182
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.050 1 -3 1 1191 302 889 0 1 84 108 109 0 0 889 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 2.524 3.28 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0058 0.9942
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1201 304 897 110 6 66 8 114 0 0 897 0 0 0.3618 0.0000 0.0000 3.631 2.58 7.83 -5.25 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1595 0.5624 0.2781 1 1 0.1634 0.5577 0.2789 1 1 0.1686 0.5518 0.2796
chr3 126006425 TAACA T 0.500000 0.050 1 -4 1 334 122 212 70 0 6 0 46 0 0 211 0 1 0.5738 0.0000 0.0047 19.333 0.23 4.43 -4.21 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5426 0.4016 0.0558 1 0 0.5327 0.4075 0.0598 1 0 0.5194 0.4152 0.0654
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 168 95 73 5 0 0 0 90 0 0 73 0 0 0.0526 0.0000 0.0000 95.000 0.20 2.47 -2.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9972 0.0028 2 1 0.0000 0.7529 0.2471 2 2 0.0000 0.4253 0.5747
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.050 1 -1 1 368 120 248 6 0 1 0 113 0 0 248 0 0 0.0500 0.0000 0.0000 119.000 0.00 2.11 -2.11 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.7704 0.2296 2 2 0.0000 0.3818 0.6182
chr3 184321978 AAGGAGAAGC A 0.500000 0.050 1 -9 1 692 158 534 128 0 27 0 3 0 0 534 0 0 0.8101 0.0000 0.0000 4.852 0.51 10.00 -9.49 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1575 0.8425 0.0000 0 0 0.7601 0.2399 0.0000 0 0 0.8758 0.1242 0.0000
chr3 184353343 C CCGG 0.500000 0.050 1 3 1 816 184 632 171 1 7 0 5 0 0 632 0 0 0.9293 0.0000 0.0000 25.143 0.57 3.60 -3.03 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0211 0.9789 0.0000 0 0 0.7109 0.2891 0.0000 0 0 0.9057 0.0943 0.0000
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.050 1 3 1 575 147 428 118 1 22 0 6 0 0 428 0 0 0.8027 0.0000 0.0000 5.682 0.38 3.00 -2.62 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2551 0.7449 0.0000 0 0 0.6509 0.3491 0.0000
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 540 149 391 76 0 7 1 65 0 0 390 0 1 0.5101 0.0000 0.0026 28.400 0.28 2.11 -1.83 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3339 0.5222 0.1439 1 1 0.3318 0.5205 0.1478 1 1 0.3289 0.5183 0.1528
chr3 195726146 GC G 0.500000 0.050 1 -1 4 1731 376 1355 135 0 15 1 225 0 0 1352 1 2 0.3590 0.0000 0.0022 24.067 1.50 2.35 -0.85 17 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0291 0.9708 1 2 0.0001 0.0335 0.9664 1 2 0.0002 0.0403 0.9595
chr3 195781275 GGTGGATGCTGAGGAAGTGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCT G 0.500000 0.050 1 -48 2 6474 1871 4603 1336 49 187 26 273 175 196 4217 14 1 0.7141 0.0380 0.0839 9.104 3.25 4.89 -1.64 112 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.050 1 15 1 743 155 588 0 0 16 0 139 0 1 555 0 32 0.0000 0.0000 0.0561 8.688 12.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0207 0.9793 2 2 0.0000 0.0199 0.9801 2 2 0.0000 0.0204 0.9796
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.050 1 -9 1 283 125 158 47 0 17 4 57 0 0 156 0 2 0.3760 0.0000 0.0127 6.353 0.66 9.04 -8.38 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0918 0.4626 0.4456 1 1 0.0961 0.4650 0.4389 1 1 0.1020 0.4681 0.4299
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.050 1 21 1 530 109 421 7 0 0 1 101 0 0 347 2 72 0.0642 0.0000 0.1758 109.000 1.71 15.25 -13.53 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9969 0.0031 2 2 0.0000 0.2922 0.7078 2 2 0.0000 0.0553 0.9447
chr4 3074927 G GCAA 0.030219 0.050 1 3 1 700 280 420 102 95 25 40 18 0 2 418 0 0 0.3643 0.0000 0.0048 19.417 5.01 5.89 -0.88 18 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.3620 0.6380 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.050 1 -9 5 591 194 397 102 0 9 0 83 0 0 391 0 6 0.5258 0.0000 0.0151 20.556 0.49 9.24 -8.75 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3839 0.5099 0.1062 1 1 0.3805 0.5090 0.1106 1 1 0.3757 0.5078 0.1165
chr4 73837092 G GT 0.500000 0.050 1 1 2 574 151 423 143 0 4 0 4 0 0 423 0 0 0.9470 0.0000 0.0000 36.750 0.17 1.00 -0.83 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0521 0.9479 0.0000 0 0 0.7025 0.2975 0.0000 0 0 0.8746 0.1254 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.050 1 18 1 2529 544 1985 335 9 174 6 20 3 3 1971 5 3 0.6158 0.0015 0.0071 2.146 1.59 8.90 -7.31 131 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0547 0.9453 0.0000
chr4 87614861 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.050 1 -18 1 3162 793 2369 693 11 64 7 18 4 8 2347 7 3 0.8739 0.0017 0.0093 11.885 1.23 9.28 -8.05 257 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2850 0.7150 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.050 1 9 1 4318 953 3365 468 19 60 9 397 58 74 2990 193 50 0.4911 0.0172 0.1114 16.055 2.73 8.79 -6.06 38 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0548 0.7905 0.1548 1 1 0.0610 0.7733 0.1657 1 1 0.0698 0.7504 0.1799
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.050 1 -18 1 3818 1097 2721 29 18 213 43 794 283 61 2325 17 35 0.0264 0.1040 0.1455 4.125 3.93 8.90 -4.97 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 87615746 CAACAGCAGT C 0.500000 0.050 1 -9 1 3705 1023 2682 337 274 96 87 229 343 55 2264 16 4 0.3294 0.1279 0.1559 11.855 4.67 15.32 -10.65 41 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615758 CAGCAGCGAT C 0.500000 0.050 1 -9 1 3674 1029 2645 665 181 127 35 21 295 74 2251 14 11 0.6463 0.1115 0.1490 8.495 4.94 15.48 -10.54 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9845 0.0155 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.050 1 -3 1 160 68 92 41 0 1 0 26 0 0 92 0 0 0.6029 0.0000 0.0000 67.000 0.10 3.04 -2.94 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4423 0.4573 0.1004 1 1 0.4352 0.4602 0.1046 1 1 0.4258 0.4639 0.1103
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 756 187 569 176 0 7 0 4 0 0 569 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 25.714 0.30 4.00 -3.70 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1090 0.8910 0.0000 0 0 0.8415 0.1585 0.0000 0 0 0.9389 0.0611 0.0000
chr4 121157144 CTCTCTGCCTGTCGTCCTT C 0.500000 0.050 1 -18 1 228 110 118 101 0 6 0 3 0 0 118 0 0 0.9182 0.0000 0.0000 17.333 0.13 18.33 -18.20 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0866 0.9134 0.0000 0 0 0.6195 0.3805 0.0000 0 0 0.7869 0.2131 0.0000
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 4 582 238 344 1 0 35 9 193 0 0 342 0 2 0.0042 0.0000 0.0058 5.800 1.00 3.10 -2.10 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0293 0.9707 2 2 0.0000 0.0126 0.9874 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.050 1 3 2 549 196 353 6 148 40 0 2 0 11 340 2 0 0.0306 0.0000 0.0368 4.105 0.83 3.00 -2.17 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6722 0.3278 0.0000 0 0 0.9296 0.0704 0.0000 0 0 0.9561 0.0439 0.0000
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.050 1 -9 2 554 206 348 10 0 26 0 170 1 1 327 1 18 0.0485 0.0029 0.0603 6.923 1.10 9.16 -8.06 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9490 0.0510 2 2 0.0000 0.4356 0.5644
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.050 1 5 2 322 140 182 2 0 10 0 128 0 0 173 0 9 0.0143 0.0000 0.0495 13.000 1.50 4.86 -3.36 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4545 0.5455 2 2 0.0000 0.1148 0.8852 2 2 0.0000 0.0731 0.9269
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.050 1 -4 1 274 104 170 0 0 12 0 92 0 0 167 0 3 0.0000 0.0000 0.0176 7.667 5.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0839 0.9161 2 2 0.0000 0.0876 0.9124 2 2 0.0000 0.0930 0.9070
chr4 176184858 TTCTC T 0.500000 0.050 1 -4 3 168 71 97 37 0 3 0 31 0 0 97 0 0 0.5211 0.0000 0.0000 22.667 0.24 3.61 -3.37 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3157 0.5099 0.1744 1 1 0.3136 0.5092 0.1773 1 1 0.3108 0.5082 0.1810
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.050 1 -3 2 804 146 658 0 0 3 0 143 0 0 655 0 3 0.0000 0.0000 0.0046 47.667 3.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0248 0.9752 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0293 0.9707
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.050 1 -12 4 250 97 153 47 0 3 0 47 0 0 149 0 4 0.4845 0.0000 0.0261 31.333 0.77 11.55 -10.79 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3563 0.5672 0.0766 1 1 0.3602 0.5636 0.0762 1 1 0.3653 0.5591 0.0756
chr5 7867364 TATA T 0.017279 0.050 1 -3 3 955 238 717 140 1 2 0 95 0 0 715 0 2 0.5882 0.0000 0.0028 118.000 0.36 3.39 -3.03 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8658 0.1340 0.0002 1 0 0.8584 0.1414 0.0002 1 0 0.8480 0.1517 0.0003
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 812 198 614 150 2 33 2 11 0 0 613 0 1 0.7576 0.0000 0.0016 5.000 0.41 3.18 -2.77 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 1 0.1755 0.8245 0.0000
chr5 61332354 A AGCG 0.500000 0.050 1 3 1 373 133 240 55 1 28 8 41 1 0 238 0 1 0.4135 0.0042 0.0083 3.889 1.47 3.73 -2.26 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3206 0.5181 0.1613 1 1 0.3186 0.5167 0.1646 1 1 0.3160 0.5150 0.1690
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.050 1 -15 4 363 42 321 0 0 25 1 16 0 0 303 8 10 0.0000 0.0000 0.0561 0.708 6.62 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2955 0.7045 2 2 0.0000 0.2990 0.7010 2 2 0.0000 0.3040 0.6960
chr5 66596936 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 1 390 103 287 97 0 3 0 3 0 0 287 0 0 0.9417 0.0000 0.0000 33.333 1.73 3.00 -1.27 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0794 0.9206 0.0000 0 0 0.5962 0.4038 0.0000 0 0 0.7704 0.2296 0.0000
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.050 1 -6 1 424 117 307 59 0 5 0 53 0 0 307 0 0 0.5043 0.0000 0.0000 22.400 0.24 5.83 -5.59 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3070 0.5233 0.1696 1 1 0.3056 0.5216 0.1728 1 1 0.3037 0.5194 0.1769
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.050 1 -3 3 543 145 398 2 0 4 0 139 0 0 392 0 6 0.0138 0.0000 0.0151 35.250 0.00 3.06 -3.06 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4051 0.5949 2 2 0.0000 0.0962 0.9038 2 2 0.0000 0.0611 0.9389
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.050 1 -18 1 338 100 238 35 0 13 0 52 0 1 232 0 5 0.3500 0.0000 0.0252 6.692 1.91 20.58 -18.66 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0636 0.4097 0.5267 1 2 0.0677 0.4153 0.5170 1 2 0.0735 0.4226 0.5039
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.050 1 -9 1 337 80 257 30 1 2 0 47 0 1 254 0 2 0.3750 0.0000 0.0117 39.000 2.43 23.60 -21.16 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0860 0.4440 0.4699 1 2 0.0903 0.4477 0.4620 1 1 0.0962 0.4524 0.4514
chr5 113488351 T TGCCGCTGCC 0.500000 0.050 1 9 1 262 105 157 49 4 5 2 45 0 0 157 0 0 0.4667 0.0000 0.0000 19.200 1.31 8.18 -6.87 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2940 0.5228 0.1832 1 1 0.2930 0.5211 0.1859 1 1 0.2916 0.5189 0.1895
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 1011 243 768 4 0 33 5 201 0 1 758 3 6 0.0165 0.0000 0.0130 6.562 2.00 3.54 -1.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7961 0.2039 2 2 0.0000 0.0814 0.9186 2 2 0.0000 0.0294 0.9706
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.050 1 9 2 426 128 298 101 0 23 0 4 1 0 297 0 0 0.7891 0.0034 0.0034 4.565 0.65 7.00 -6.35 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0187 0.9813 0.0000 0 1 0.4613 0.5387 0.0000 0 0 0.7229 0.2771 0.0000
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.050 1 9 1 356 90 266 47 2 5 0 36 0 0 257 0 9 0.5222 0.0000 0.0338 17.000 0.51 8.89 -8.38 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2825 0.5241 0.1933 1 1 0.2819 0.5223 0.1958 1 1 0.2810 0.5200 0.1989
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.050 1 -3 1 173 61 112 0 0 1 0 60 0 0 110 0 2 0.0000 0.0000 0.0179 60.000 3.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1736 0.8264 2 2 0.0000 0.1781 0.8219 2 2 0.0000 0.1845 0.8155
chr5 140042926 C CCTGCTGCTGCTGCCGCTCTCGCTG 0.500000 0.050 1 24 1 694 242 452 113 1 64 0 64 0 0 415 0 37 0.4669 0.0000 0.0819 2.781 0.42 13.73 -13.31 39 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3782 0.5172 0.1046 1 1 0.3752 0.5157 0.1091 1 1 0.3710 0.5139 0.1151
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.050 1 2 1 204 74 130 0 0 0 4 70 0 0 124 1 5 0.0000 0.0000 0.0462 74.000 4.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1182 0.8818 2 2 0.0000 0.1225 0.8775 2 2 0.0000 0.1286 0.8714
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 204 74 130 0 0 1 4 69 0 0 123 4 3 0.0000 0.0000 0.0538 73.000 4.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1184 0.8816 2 2 0.0000 0.1227 0.8773 2 2 0.0000 0.1287 0.8713
chr5 141573996 TGGA T 0.500000 0.050 1 -3 2 625 179 446 59 2 50 5 63 0 0 446 0 0 0.3296 0.0000 0.0000 2.580 0.41 3.86 -3.45 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1562 0.5236 0.3202 1 1 0.1597 0.5218 0.3185 1 1 0.1644 0.5195 0.3161
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.050 1 9 1 402 103 299 91 0 10 0 2 0 0 298 0 1 0.8835 0.0000 0.0033 9.300 0.32 9.00 -8.68 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0686 0.9314 0.0000 0 0 0.5599 0.4401 0.0000 0 0 0.7439 0.2561 0.0000
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 1 352 124 228 83 5 31 1 4 0 0 228 0 0 0.6694 0.0000 0.0000 2.935 0.47 5.00 -4.53 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0120 0.9880 0.0000 0 1 0.3569 0.6431 0.0000 0 0 0.6330 0.3670 0.0000
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 662 150 512 67 0 1 1 81 0 0 512 0 0 0.4467 0.0000 0.0000 149.000 0.42 1.73 -1.31 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0958 0.4823 0.4219 1 1 0.1001 0.4833 0.4166 1 1 0.1061 0.4846 0.4093
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.050 1 -3 1 387 146 241 83 0 8 0 55 0 0 239 0 2 0.5685 0.0000 0.0083 17.250 2.78 4.95 -2.16 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5771 0.3787 0.0441 1 0 0.5665 0.3856 0.0478 1 0 0.5522 0.3947 0.0531
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.050 1 -15 1 386 161 225 55 5 24 2 75 0 0 225 0 0 0.3416 0.0000 0.0000 5.708 3.62 12.61 -9.00 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0851 0.4634 0.4515 1 1 0.0895 0.4656 0.4449 1 1 0.0954 0.4686 0.4360
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.050 1 3 1 386 140 246 0 54 10 1 75 0 0 244 0 2 0.0000 0.0000 0.0081 13.000 4.59 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0535 0.4010 0.5455 1 2 0.0575 0.4069 0.5356 1 2 0.0630 0.4145 0.5224
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 1 424 120 304 60 1 4 0 55 0 0 304 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 28.750 1.10 3.98 -2.88 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3037 0.5252 0.1712 1 1 0.3025 0.5233 0.1743 1 1 0.3007 0.5209 0.1784
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 467 206 261 84 8 38 4 72 0 0 260 0 1 0.4078 0.0000 0.0038 4.395 1.07 3.53 -2.46 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4198 0.4867 0.0935 1 1 0.4148 0.4874 0.0979 1 1 0.4079 0.4883 0.1038
chr5 181155256 TTGTC T 0.500000 0.050 1 -4 3 888 227 661 11 0 10 0 206 0 0 645 0 16 0.0485 0.0000 0.0242 21.700 0.00 4.02 -4.02 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8666 0.1334 2 2 0.0000 0.2255 0.7745
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.050 1 3 5 507 124 383 46 1 10 1 66 0 0 383 0 0 0.3710 0.0000 0.0000 11.400 0.52 3.35 -2.83 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0674 0.4253 0.5073 1 2 0.0715 0.4297 0.4987 1 2 0.0772 0.4356 0.4872
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.050 1 3 1 636 149 487 46 4 31 11 57 4 2 472 2 7 0.3087 0.0082 0.0308 3.710 2.13 4.84 -2.71 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1447 0.5816 0.2737 1 1 0.1522 0.5815 0.2664 1 1 0.1624 0.5809 0.2567
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.050 1 3 1 597 132 465 57 5 17 0 53 0 4 455 3 3 0.4318 0.0000 0.0215 6.765 1.00 4.19 -3.19 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4703 0.4683 0.0614 1 1 0.4683 0.4685 0.0632 1 1 0.4655 0.4690 0.0655
chr6 7910637 T TCCG 0.039779 0.050 1 3 1 321 111 210 88 2 16 0 5 0 0 210 0 0 0.7928 0.0000 0.0000 5.938 0.86 4.20 -3.34 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0625 0.9375 0.0000 0 0 0.8875 0.1125 0.0000 0 0 0.9702 0.0298 0.0000
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.050 1 3 2 1553 358 1195 112 99 124 17 6 0 2 1192 0 1 0.3128 0.0000 0.0025 1.760 1.90 6.50 -4.60 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 1 0.2989 0.7011 0.0000
chr6 16327684 A ATGC 0.101269 0.050 1 3 1 1568 410 1158 26 62 89 34 199 0 0 1156 0 2 0.0634 0.0000 0.0017 3.698 1.15 3.46 -2.31 6 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0077 0.9923 1 2 0.0000 0.0099 0.9901 1 2 0.0000 0.0166 0.9834
chr6 22570117 G GGGC 0.051576 0.050 1 3 1 764 167 597 70 1 29 2 65 0 0 594 0 3 0.4192 0.0000 0.0050 4.724 0.36 3.35 -3.00 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4495 0.5289 0.0216 1 1 0.4519 0.5262 0.0218 1 1 0.4550 0.5229 0.0221
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.050 1 16 3 1100 229 871 114 0 6 0 109 0 0 848 0 23 0.4978 0.0000 0.0264 37.167 0.34 11.27 -10.92 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1265 0.5792 0.2943 1 1 0.1334 0.5769 0.2897 1 1 0.1428 0.5738 0.2834
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 384 104 280 0 0 3 1 100 0 0 279 0 1 0.0000 0.0000 0.0036 33.333 1.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0715 0.9285 2 2 0.0000 0.0750 0.9250 2 2 0.0000 0.0800 0.9200
chr6 31028873 A ACCTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAG 0.500000 0.050 1 30 2 2821 664 2157 184 15 274 15 176 18 20 1965 44 110 0.2771 0.0083 0.0890 1.426 2.58 3.70 -1.12 34 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0138 0.9861 1 2 0.0000 0.0163 0.9837 1 2 0.0000 0.0202 0.9797
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.050 1 1 1 603 150 453 135 2 10 0 3 0 0 453 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 13.900 0.27 2.00 -1.73 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2032 0.7968 0.0000 0 0 0.7994 0.2006 0.0000 0 0 0.8973 0.1027 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.050 1 2 1 620 158 462 81 2 1 0 74 0 0 462 0 0 0.5127 0.0000 0.0000 157.000 0.41 2.77 -2.36 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3354 0.5247 0.1399 1 1 0.3334 0.5228 0.1439 1 1 0.3305 0.5204 0.1491
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.050 1 -12 1 493 156 337 89 0 9 0 58 0 0 329 0 8 0.5705 0.0000 0.0237 16.333 0.55 11.41 -10.86 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5325 0.4128 0.0548 1 0 0.5234 0.4179 0.0588 1 0 0.5111 0.4245 0.0644
chr6 31772986 A ACAGGCTCCATGGGG 0.500000 0.050 1 14 2 455 144 311 130 1 10 0 3 1 0 309 0 1 0.9028 0.0032 0.0064 13.400 0.19 16.00 -15.81 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0389 0.9611 0.0000 0 0 0.6420 0.3580 0.0000 0 0 0.8426 0.1574 0.0000
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 508 159 349 77 1 14 0 67 0 0 349 0 0 0.4843 0.0000 0.0000 10.357 0.91 3.91 -3.00 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3666 0.5093 0.1241 1 1 0.3633 0.5085 0.1283 1 1 0.3587 0.5075 0.1338
chr6 32530180 C CAG 0.500000 0.050 1 2 1 189 84 105 2 49 9 15 9 0 1 104 0 0 0.0238 0.0000 0.0095 2.444 12.00 7.78 4.22 0 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5012 0.4205 0.0784 1 0 0.4917 0.4256 0.0826 1 0 0.4792 0.4324 0.0884
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.050 1 -1 1 693 268 425 205 2 9 1 51 0 0 425 0 0 0.7649 0.0000 0.0000 28.778 7.39 7.51 -0.12 67 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.050 1 1 1 692 260 432 196 6 7 2 49 0 0 431 0 1 0.7538 0.0000 0.0023 36.143 7.64 7.67 -0.03 72 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9983 0.0017 0.0000 0 1 0.1056 0.8944 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32977921 TGAG T 0.500000 0.050 1 -3 1 515 114 401 68 0 3 0 43 0 0 399 0 2 0.5965 0.0000 0.0050 37.000 0.24 3.28 -3.04 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5437 0.4004 0.0559 1 0 0.5337 0.4064 0.0599 1 0 0.5203 0.4142 0.0656
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.050 1 18 1 416 80 336 47 0 7 0 26 0 0 323 0 13 0.5875 0.0000 0.0387 10.429 0.83 14.81 -13.98 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3391 0.5072 0.1537 1 1 0.3362 0.5066 0.1571 1 1 0.3324 0.5059 0.1617
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 897 212 685 111 85 7 0 9 0 1 684 0 0 0.5236 0.0000 0.0015 29.286 0.49 2.89 -2.40 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2378 0.7622 0.0000 0 0 0.7962 0.2038 0.0000
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 852 171 681 71 1 24 3 72 0 0 681 0 0 0.4152 0.0000 0.0000 6.083 0.52 3.42 -2.90 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1974 0.5423 0.2603 1 1 0.2000 0.5391 0.2609 1 1 0.2033 0.5351 0.2615
chr6 44002766 C CGCGGCG 0.500000 0.050 1 6 1 493 111 382 74 1 30 0 6 1 0 381 0 0 0.6667 0.0026 0.0026 2.700 2.69 6.33 -3.64 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1060 0.8940 0.0000 0 1 0.3995 0.6005 0.0000
chr6 45422749 AGGCGGCGGCGGCGGCTGC A 0.500000 0.050 1 -18 2 646 263 383 100 3 68 0 92 1 0 366 0 16 0.3802 0.0026 0.0444 2.868 1.56 14.61 -13.05 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1725 0.5583 0.2692 1 1 0.1761 0.5539 0.2700 1 1 0.1807 0.5484 0.2709
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.050 1 15 2 780 158 622 0 0 85 0 73 0 0 597 0 25 0.0000 0.0000 0.0402 0.859 8.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0783 0.9217 2 2 0.0000 0.0820 0.9180 2 2 0.0000 0.0872 0.9128
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 1 712 134 578 60 3 38 1 32 0 0 572 1 5 0.4478 0.0000 0.0104 2.595 1.60 4.38 -2.77 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5683 0.3817 0.0500 1 0 0.5574 0.3887 0.0538 1 0 0.5428 0.3979 0.0593
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.050 1 -3 2 123 38 85 13 0 3 0 22 0 0 85 0 0 0.3421 0.0000 0.0000 11.667 0.23 2.91 -2.68 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1494 0.4867 0.3638 1 1 0.1528 0.4877 0.3595 1 1 0.1573 0.4889 0.3538
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.050 1 3 2 848 204 644 105 0 12 0 87 0 0 640 0 4 0.5147 0.0000 0.0062 16.000 0.30 3.09 -2.79 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3965 0.5042 0.0993 1 1 0.3926 0.5036 0.1037 1 1 0.3873 0.5030 0.1098
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.050 1 2 1 714 149 565 85 1 0 1 62 0 0 556 0 9 0.5705 0.0000 0.0159 149.000 0.42 5.50 -5.08 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4068 0.4920 0.1012 1 1 0.4021 0.4924 0.1055 1 1 0.3957 0.4928 0.1114
chr6 118491647 ATGT A 0.500000 0.050 1 -3 3 301 103 198 48 0 3 0 52 0 0 195 0 3 0.4660 0.0000 0.0152 33.333 0.19 3.04 -2.85 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1612 0.5168 0.3220 1 1 0.1645 0.5155 0.3200 1 1 0.1689 0.5139 0.3172
chr6 148343106 T TGAGCCC 0.500000 0.050 1 6 2 403 181 222 79 0 18 2 82 0 0 221 0 1 0.4365 0.0000 0.0045 9.056 0.23 5.30 -5.08 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1642 0.5392 0.2966 1 1 0.1677 0.5363 0.2960 1 1 0.1723 0.5326 0.2952
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 2 953 252 701 226 0 11 0 15 1 0 700 0 0 0.8968 0.0014 0.0014 21.909 0.19 3.07 -2.88 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0119 0.9881 0.0000 0 1 0.4670 0.5330 0.0000
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.050 1 -18 1 601 219 382 0 0 42 0 177 0 0 360 1 21 0.0000 0.0000 0.0576 4.214 13.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0066 0.9934 2 2 0.0000 0.0073 0.9927 2 2 0.0000 0.0084 0.9916
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.050 1 -3 5 371 128 243 0 0 3 0 125 0 0 243 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 41.667 4.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0413 0.9587 2 2 0.0000 0.0438 0.9562 2 2 0.0000 0.0476 0.9524
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.050 1 -3 1 218 76 142 37 0 3 0 36 0 0 142 0 0 0.4868 0.0000 0.0000 24.333 0.95 9.33 -8.39 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2508 0.5220 0.2272 1 1 0.2512 0.5203 0.2284 1 1 0.2517 0.5182 0.2300
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.050 1 -8 2 218 69 149 30 0 10 0 29 0 0 148 0 1 0.4348 0.0000 0.0067 5.900 0.17 10.59 -10.42 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2408 0.5183 0.2408 1 1 0.2415 0.5169 0.2415 1 1 0.2424 0.5152 0.2424
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.050 1 -3 3 330 134 196 0 0 13 10 111 0 0 186 0 10 0.0000 0.0000 0.0510 9.308 3.14 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0352 0.9648 2 2 0.0000 0.0375 0.9625 2 2 0.0000 0.0410 0.9590
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.050 1 -3 1 860 264 596 6 33 24 98 103 0 0 595 1 0 0.0227 0.0000 0.0017 10.833 5.17 8.72 -3.55 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9914 0.0086
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 2 273 100 173 41 0 7 0 52 0 0 171 0 2 0.4100 0.0000 0.0116 13.286 0.39 4.10 -3.71 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1125 0.4806 0.4069 1 1 0.1167 0.4819 0.4015 1 1 0.1223 0.4835 0.3942
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.050 1 4 1 259 100 159 41 2 28 0 29 0 0 159 0 0 0.4100 0.0000 0.0000 2.536 0.51 3.90 -3.38 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4230 0.4682 0.1088 1 1 0.4167 0.4704 0.1129 1 1 0.4083 0.4731 0.1185
chr7 5313034 T TGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 1 713 83 630 34 1 17 1 30 0 0 630 0 0 0.4096 0.0000 0.0000 4.125 1.91 6.70 -4.79 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2862 0.5160 0.1978 1 1 0.2852 0.5148 0.2000 1 1 0.2839 0.5132 0.2028
chr7 5313159 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 757 153 604 70 2 15 4 62 0 0 604 0 0 0.4575 0.0000 0.0000 9.133 0.43 3.97 -3.54 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3023 0.5310 0.1667 1 1 0.3013 0.5286 0.1701 1 1 0.2999 0.5257 0.1744
chr7 11831843 AGCAGCGGCAGCG A 0.500000 0.050 1 -12 2 170 81 89 45 0 4 0 32 0 0 86 0 3 0.5556 0.0000 0.0337 19.250 0.98 11.69 -10.71 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3680 0.4950 0.1369 1 1 0.3640 0.4953 0.1407 1 1 0.3586 0.4957 0.1457
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 1 646 200 446 4 0 30 11 155 0 0 446 0 0 0.0200 0.0000 0.0000 5.667 0.00 3.17 -3.17 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9131 0.0869 2 2 0.0000 0.1946 0.8054 2 2 0.0000 0.0766 0.9234
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.050 1 3 2 467 124 343 69 0 7 0 48 0 0 341 0 2 0.5565 0.0000 0.0058 16.714 0.17 3.40 -3.22 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4862 0.4395 0.0743 1 0 0.4781 0.4433 0.0785 1 0 0.4673 0.4482 0.0844
chr7 20785321 AGCC A 0.500000 0.050 1 -3 2 514 114 400 40 2 25 2 45 0 1 395 2 2 0.3509 0.0000 0.0125 3.480 0.95 3.98 -3.03 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1654 0.5148 0.3198 1 1 0.1686 0.5137 0.3178 1 1 0.1728 0.5123 0.3150
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 369 105 264 58 0 3 0 44 0 0 264 0 0 0.5524 0.0000 0.0000 34.000 0.12 2.89 -2.77 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4194 0.4755 0.1051 1 1 0.4136 0.4771 0.1093 1 1 0.4058 0.4792 0.1150
chr7 27246028 A ACCTGCC 0.500000 0.050 1 6 1 396 104 292 54 0 6 0 44 0 0 287 0 5 0.5192 0.0000 0.0171 16.333 0.39 5.43 -5.04 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2957 0.5239 0.1804 1 1 0.2947 0.5221 0.1832 1 1 0.2933 0.5198 0.1869
chr7 30285725 A ACGG 0.500000 0.050 1 3 2 260 69 191 24 0 13 0 32 0 1 188 1 1 0.3478 0.0000 0.0157 4.308 2.46 4.22 -1.76 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1471 0.4939 0.3591 1 1 0.1505 0.4943 0.3552 1 1 0.1552 0.4948 0.3500
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 561 127 434 0 0 9 0 118 0 0 431 0 3 0.0000 0.0000 0.0069 13.111 1.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0455 0.9545 2 2 0.0000 0.0482 0.9518 2 2 0.0000 0.0522 0.9478
chr7 43647511 G GCAGGC 0.500000 0.050 1 5 2 239 95 144 93 0 1 0 1 0 0 144 0 0 0.9789 0.0000 0.0000 94.000 0.31 5.00 -4.69 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6699 0.3301 0.0000 0 0 0.8356 0.1644 0.0000 0 0 0.8650 0.1350 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 229 94 135 51 0 4 0 39 0 0 135 0 0 0.5426 0.0000 0.0000 22.500 0.10 3.26 -3.16 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3939 0.4859 0.1202 1 1 0.3889 0.4868 0.1243 1 1 0.3823 0.4880 0.1297
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 509 137 372 73 0 1 0 63 0 0 372 0 0 0.5328 0.0000 0.0000 136.000 0.12 1.78 -1.65 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3556 0.5121 0.1323 1 1 0.3526 0.5112 0.1363 1 1 0.3485 0.5099 0.1416
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.050 1 3 5 867 196 671 0 0 18 1 177 0 0 667 0 4 0.0000 0.0000 0.0060 9.889 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0102 0.9898 2 2 0.0000 0.0111 0.9889 2 2 0.0000 0.0126 0.9874
chr7 83155517 T TGCTGAGCTGGAGGCTTAGCAGGACCAAGAG 0.500000 0.050 1 30 1 760 145 615 59 0 48 1 37 0 0 580 0 35 0.4069 0.0000 0.0569 2.000 0.14 5.14 -5.00 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1046 0.4861 0.4093 1 1 0.1089 0.4869 0.4043 1 1 0.1147 0.4879 0.3974
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 1 466 215 251 65 4 79 4 63 0 0 251 0 0 0.3023 0.0000 0.0000 1.709 1.42 3.78 -2.36 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2522 0.5401 0.2077 1 1 0.2530 0.5370 0.2099 1 1 0.2540 0.5333 0.2128
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.050 1 -4 1 724 242 482 127 0 7 0 108 1 0 479 0 2 0.5248 0.0021 0.0062 33.571 0.31 4.19 -3.89 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4411 0.4845 0.0744 1 1 0.4361 0.4851 0.0788 1 1 0.4293 0.4859 0.0849
chr7 100359505 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 474 139 335 61 0 14 0 64 0 0 335 0 0 0.4388 0.0000 0.0000 8.929 0.33 3.23 -2.91 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1981 0.5354 0.2665 1 1 0.2005 0.5327 0.2667 1 1 0.2037 0.5294 0.2669
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.050 1 -35 1 128 34 94 7 0 0 0 27 0 0 86 0 8 0.2059 0.0000 0.0851 34.000 1.43 29.81 -28.39 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0054 0.9084 0.0862 2 1 0.0005 0.9711 0.0284 2 1 0.0001 0.8527 0.1472
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 2 659 200 459 0 0 7 0 193 0 0 459 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 27.571 3.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0077 0.9923 2 2 0.0000 0.0085 0.9915 2 2 0.0000 0.0097 0.9903
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 718 182 536 93 1 15 1 72 0 0 535 0 1 0.5110 0.0000 0.0019 11.133 0.18 4.04 -3.86 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4869 0.4455 0.0676 1 0 0.4795 0.4487 0.0718 1 0 0.4694 0.4529 0.0777
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.050 1 -6 2 808 227 581 102 2 27 1 95 0 0 580 1 0 0.4493 0.0000 0.0017 7.370 0.57 6.58 -6.01 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3023 0.5464 0.1514 1 1 0.3019 0.5429 0.1553 1 1 0.3011 0.5385 0.1604
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.050 1 -30 3 676 219 457 118 1 38 0 62 0 0 457 0 0 0.5388 0.0000 0.0000 4.763 0.26 13.90 -13.64 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8676 0.1293 0.0031 1 0 0.8563 0.1399 0.0038 1 0 0.8400 0.1550 0.0050
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 273 80 193 0 0 0 0 80 0 0 190 0 3 0.0000 0.0000 0.0155 80.000 3.29 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1102 0.8898 2 2 0.0000 0.1144 0.8856 2 2 0.0000 0.1203 0.8797
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.050 1 3 3 985 272 713 8 203 54 0 7 0 1 711 0 1 0.0294 0.0000 0.0028 4.019 5.75 3.00 2.75 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.4718 0.5282 0.0000 0 0 0.8916 0.1084 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.050 1 -3 3 986 277 709 9 0 51 7 210 0 0 707 0 2 0.0325 0.0000 0.0028 4.431 2.33 3.19 -0.85 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.6170 0.3830 2 2 0.0000 0.1248 0.8752
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 1577 348 1229 9 1 22 2 314 0 0 1229 0 0 0.0259 0.0000 0.0000 14.727 0.11 1.32 -1.20 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 2 0.0000 0.1608 0.8392 2 2 0.0000 0.0161 0.9839
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 746 163 583 80 0 1 0 82 0 0 583 0 0 0.4908 0.0000 0.0000 162.000 0.23 4.20 -3.97 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2037 0.5481 0.2482 1 1 0.2062 0.5445 0.2493 1 1 0.2094 0.5399 0.2507
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.050 1 1 1 826 196 630 0 0 6 0 190 0 0 629 0 1 0.0000 0.0000 0.0016 31.667 1.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0089 0.9911 2 2 0.0000 0.0102 0.9898
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.050 1 1 2 505 95 410 0 0 5 14 76 0 1 372 17 20 0.0000 0.0000 0.0927 18.000 6.47 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1217 0.8783 2 2 0.0000 0.0721 0.9279 2 2 0.0000 0.0621 0.9379
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.050 1 1 1 506 91 415 0 0 5 14 72 0 1 375 18 21 0.0000 0.0000 0.0964 20.500 6.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0441 0.9559 2 2 0.0000 0.0464 0.9536 2 2 0.0000 0.0499 0.9501
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 517 90 427 0 0 8 7 75 0 0 351 31 45 0.0000 0.0000 0.1780 13.333 6.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0195 0.9805 2 2 0.0000 0.0211 0.9789 2 2 0.0000 0.0234 0.9766
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.050 1 -1 3 599 222 377 217 0 0 0 5 0 0 377 0 0 0.9775 0.0000 0.0000 222.000 0.29 1.80 -1.51 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0640 0.9360 0.0000 0 0 0.8823 0.1177 0.0000 0 0 0.9659 0.0341 0.0000
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.050 1 -3 1 397 109 288 98 0 4 0 7 0 0 288 0 0 0.8991 0.0000 0.0000 26.250 0.34 3.14 -2.81 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0947 0.9053 0.0000 0 1 0.4373 0.5627 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.050 1 -6 2 831 188 643 7 0 25 1 155 0 0 634 0 9 0.0372 0.0000 0.0140 6.520 0.14 5.99 -5.84 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.6066 0.3934 2 2 0.0000 0.1785 0.8215
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.050 1 -6 2 749 139 610 6 0 25 0 108 0 0 603 0 7 0.0432 0.0000 0.0115 4.560 0.50 5.89 -5.39 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.7817 0.2183 2 2 0.0000 0.3960 0.6040
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.050 1 -3 1 292 82 210 35 0 3 0 44 0 0 210 0 0 0.4268 0.0000 0.0000 26.333 0.23 2.89 -2.66 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1620 0.5099 0.3281 1 1 0.1659 0.5095 0.3246 1 1 0.1710 0.5090 0.3200
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.050 1 -6 1 640 266 374 0 0 45 2 219 0 0 373 0 1 0.0000 0.0000 0.0027 4.889 5.84 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.050 1 -6 2 418 183 235 171 0 8 0 4 0 0 234 1 0 0.9344 0.0000 0.0043 21.875 0.53 7.75 -7.22 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2762 0.7238 0.0000 0 0 0.9440 0.0560 0.0000 0 0 0.9803 0.0197 0.0000
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.050 1 -1 2 283 129 154 71 0 0 0 58 0 1 153 0 0 0.5504 0.0000 0.0065 129.000 0.17 2.90 -2.73 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5063 0.4352 0.0585 1 0 0.5016 0.4374 0.0610 1 0 0.4951 0.4403 0.0646
chr8 33496717 A AGAT 0.026718 0.050 1 3 5 160 56 104 24 1 14 0 17 0 0 104 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 3.000 0.04 3.00 -2.96 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5745 0.4184 0.0072 1 0 0.5716 0.4211 0.0073 1 0 0.5678 0.4246 0.0076
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.050 1 -3 3 646 204 442 106 1 3 0 94 0 0 441 0 1 0.5196 0.0000 0.0023 67.000 0.43 3.27 -2.83 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4292 0.4902 0.0806 1 1 0.4267 0.4894 0.0839 1 1 0.4231 0.4886 0.0883
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.050 1 -2 2 208 70 138 36 0 0 0 34 0 0 138 0 0 0.5143 0.0000 0.0000 70.000 0.42 2.62 -2.20 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2636 0.5201 0.2163 1 1 0.2635 0.5186 0.2179 1 1 0.2633 0.5167 0.2199
chr8 97775937 C CGGCGGGCTCCAGGCGA 0.500000 0.050 1 16 1 287 90 197 40 2 14 0 34 0 0 192 0 5 0.4444 0.0000 0.0254 5.692 0.33 8.82 -8.50 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2745 0.5218 0.2037 1 1 0.2741 0.5201 0.2057 1 1 0.2735 0.5181 0.2084
chr8 100194231 A AGAC 0.500000 0.050 1 3 5 211 81 130 77 0 2 0 2 0 0 130 0 0 0.9506 0.0000 0.0000 39.500 0.19 4.00 -3.81 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2096 0.7904 0.0000 0 0 0.6372 0.3628 0.0000 0 0 0.7507 0.2493 0.0000
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.050 1 -27 4 650 207 443 124 1 3 1 78 0 0 442 0 1 0.5990 0.0000 0.0023 68.000 2.65 16.86 -14.21 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7756 0.2154 0.0091 1 0 0.7629 0.2265 0.0106 1 0 0.7452 0.2418 0.0129
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.050 1 3 1 315 134 181 77 0 0 0 57 0 0 178 0 3 0.5746 0.0000 0.0166 134.000 0.35 3.00 -2.65 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4532 0.4624 0.0844 1 1 0.4466 0.4647 0.0887 1 1 0.4376 0.4677 0.0947
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.050 1 -3 2 470 148 322 0 0 30 10 108 0 0 322 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.214 4.68 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0495 0.9505 2 2 0.0000 0.0523 0.9477 2 2 0.0000 0.0564 0.9436
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.050 1 15 1 1045 273 772 236 1 35 0 1 1 1 770 0 0 0.8645 0.0013 0.0026 6.800 0.54 16.00 -15.46 64 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9876 0.0124 0.0000 0 0 0.9947 0.0053 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.050 1 -3 2 1007 207 800 100 1 3 1 102 1 0 798 1 0 0.4831 0.0013 0.0025 67.667 0.33 3.26 -2.93 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1959 0.5610 0.2431 1 1 0.1988 0.5565 0.2447 1 1 0.2026 0.5507 0.2467
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.050 1 2 3 962 186 776 121 2 2 7 54 2 0 770 2 2 0.6505 0.0026 0.0077 183.000 0.68 4.24 -3.56 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9267 0.0728 0.0005 1 0 0.9198 0.0796 0.0006 1 0 0.9098 0.0894 0.0008
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.050 1 -2 4 965 188 777 115 7 3 4 59 1 1 770 0 5 0.6117 0.0013 0.0090 91.000 0.59 4.31 -3.71 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9102 0.0890 0.0008 1 0 0.9027 0.0964 0.0009 1 0 0.8918 0.1070 0.0012
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.050 1 9 2 377 99 278 1 0 15 0 83 0 0 265 0 13 0.0101 0.0000 0.0468 5.600 0.00 7.93 -7.93 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3136 0.6864 2 2 0.0000 0.1545 0.8455 2 2 0.0000 0.1268 0.8732
chr9 34893048 GC G 0.500000 0.050 1 -1 1 728 216 512 210 1 2 0 3 0 0 512 0 0 0.9722 0.0000 0.0000 107.000 0.20 2.00 -1.80 28 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6073 0.3927 0.0000 0 0 0.9610 0.0390 0.0000 0 0 0.9810 0.0190 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.050 1 -12 1 817 195 622 87 0 39 0 69 0 0 616 0 6 0.4462 0.0000 0.0096 4.000 0.45 10.75 -10.31 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3771 0.5078 0.1151 1 1 0.3735 0.5071 0.1194 1 1 0.3687 0.5062 0.1251
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.050 1 -1 3 410 67 343 29 0 0 0 38 0 0 342 0 1 0.4328 0.0000 0.0029 67.000 0.45 1.11 -0.66 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1379 0.4914 0.3707 1 1 0.1416 0.4920 0.3664 1 1 0.1466 0.4927 0.3607
chr9 66141076 TTAAG T 0.500000 0.050 1 -4 5 149 64 85 46 0 3 0 15 0 0 85 0 0 0.7188 0.0000 0.0000 20.333 0.17 4.27 -4.09 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6614 0.3078 0.0308 1 0 0.6474 0.3186 0.0340 1 0 0.5748 0.3901 0.0352
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.050 1 -15 3 418 111 307 1 0 5 0 105 0 0 291 0 16 0.0090 0.0000 0.0521 21.200 0.00 13.84 -13.84 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1959 0.8041 2 2 0.0000 0.0898 0.9102 2 2 0.0000 0.0739 0.9261
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.050 1 12 1 738 166 572 58 0 22 0 86 0 0 567 0 5 0.3494 0.0000 0.0087 6.545 0.47 10.86 -10.39 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0254 0.3113 0.6633 1 2 0.0282 0.3209 0.6509 1 2 0.0325 0.3336 0.6339
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.050 1 -3 2 482 123 359 72 1 5 0 45 0 0 355 0 4 0.5854 0.0000 0.0111 23.600 0.57 3.07 -2.50 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5545 0.3936 0.0519 1 0 0.5443 0.3999 0.0558 1 0 0.5306 0.4081 0.0613
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 1 237 64 173 27 0 1 0 36 0 0 172 0 1 0.4219 0.0000 0.0058 63.000 0.07 3.64 -3.56 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1382 0.4902 0.3716 1 1 0.1419 0.4908 0.3672 1 1 0.1469 0.4917 0.3614
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.050 1 3 2 310 97 213 3 40 21 0 33 0 1 209 0 3 0.0309 0.0000 0.0188 3.571 2.33 3.39 -1.06 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3343 0.5072 0.1585 1 1 0.3316 0.5066 0.1618 1 1 0.3279 0.5059 0.1662
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.050 1 -3 2 310 101 209 38 4 20 1 38 0 0 208 0 1 0.3762 0.0000 0.0048 4.050 2.71 3.55 -0.84 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2604 0.5239 0.2157 1 1 0.2606 0.5221 0.2174 1 1 0.2607 0.5198 0.2195
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.050 1 15 4 477 171 306 152 2 2 0 15 0 0 306 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 83.500 0.29 8.00 -7.71 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.1315 0.8685 0.0000
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 554 210 344 14 0 1 0 195 0 0 336 1 7 0.0667 0.0000 0.0233 209.000 1.57 3.32 -1.75 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9872 0.0128 2 1 0.0000 0.5837 0.4163
chr9 96417976 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 1 381 116 265 106 1 7 0 2 1 0 264 0 0 0.9138 0.0038 0.0038 15.571 1.08 3.00 -1.92 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3688 0.6312 0.0000 0 0 0.7919 0.2081 0.0000 0 0 0.8645 0.1355 0.0000
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.050 1 6 2 403 104 299 2 0 17 1 84 0 0 299 0 0 0.0192 0.0000 0.0000 5.059 2.50 5.30 -2.80 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7538 0.2462 2 2 0.0000 0.3171 0.6829 2 2 0.0000 0.2141 0.7859
chr9 97854418 A AGCC 0.500000 0.050 1 3 1 933 137 796 9 51 46 0 31 2 3 790 0 1 0.0657 0.0025 0.0075 1.978 1.00 3.55 -2.55 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6812 0.2937 0.0251 1 0 0.6679 0.3042 0.0279 1 0 0.6497 0.3182 0.0321
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.050 1 -6 1 944 150 794 50 2 37 1 60 1 1 787 2 3 0.3333 0.0013 0.0088 3.000 2.62 5.73 -3.11 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1138 0.4907 0.3955 1 1 0.1180 0.4912 0.3908 1 1 0.1236 0.4919 0.3845
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.050 1 -1 2 618 159 459 156 0 1 0 2 0 0 459 0 0 0.9811 0.0000 0.0000 158.000 0.26 2.00 -1.74 104 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6611 0.3389 0.0000 0 0 0.9250 0.0750 0.0000 0 0 0.9524 0.0476 0.0000
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.050 1 -4 1 907 198 709 194 1 1 0 2 0 0 709 0 0 0.9798 0.0000 0.0000 197.000 0.13 6.00 -5.87 36 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8378 0.1622 0.0000 0 0 0.9699 0.0301 0.0000 0 0 0.9808 0.0192 0.0000
chr9 110048735 TCCCCCGGAGTCTCCTGGA T 0.500000 0.050 1 -18 2 196 78 118 38 0 12 0 28 0 0 114 0 4 0.4872 0.0000 0.0339 5.500 0.39 15.43 -15.03 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3153 0.5105 0.1742 1 1 0.3132 0.5097 0.1771 1 1 0.3104 0.5087 0.1808
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.050 1 -4 1 323 120 203 0 0 5 0 115 0 0 203 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 23.000 4.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0525 0.9475 2 2 0.0000 0.0554 0.9446 2 2 0.0000 0.0597 0.9403
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.050 1 -6 1 518 108 410 4 1 24 0 79 0 0 410 0 0 0.0370 0.0000 0.0000 3.500 0.00 6.27 -6.27 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9960 0.0040 2 1 0.0000 0.7779 0.2221 2 2 0.0000 0.4790 0.5210
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.050 1 6 1 643 143 500 132 0 6 0 5 0 0 500 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 22.833 0.52 6.20 -5.68 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0078 0.9922 0.0000 0 1 0.4790 0.5210 0.0000 0 0 0.7869 0.2131 0.0000
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.050 1 1 1 582 131 451 61 0 11 1 58 0 0 451 0 0 0.4656 0.0000 0.0000 10.909 0.33 1.50 -1.17 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2572 0.5350 0.2077 1 1 0.2577 0.5324 0.2099 1 1 0.2583 0.5291 0.2126
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.050 1 -3 2 561 164 397 79 1 4 0 80 0 0 393 1 3 0.4817 0.0000 0.0101 40.000 0.29 3.44 -3.15 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1831 0.5451 0.2718 1 1 0.1861 0.5417 0.2722 1 1 0.1901 0.5375 0.2725
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 330 143 187 133 0 1 0 9 0 0 187 0 0 0.9301 0.0000 0.0000 142.000 0.22 2.00 -1.78 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0618 0.9382 0.0000 0 1 0.4623 0.5377 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.050 1 1 4 330 143 187 133 0 1 0 9 0 0 187 0 0 0.9301 0.0000 0.0000 142.000 0.22 2.00 -1.78 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0618 0.9382 0.0000 0 1 0.4623 0.5377 0.0000
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 269 114 155 54 0 3 0 57 0 0 155 0 0 0.4737 0.0000 0.0000 37.000 0.15 1.75 -1.61 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1999 0.5311 0.2690 1 1 0.2023 0.5288 0.2690 1 1 0.2053 0.5258 0.2689
chr9 135945095 GCCT G 0.500000 0.050 1 -3 2 332 116 216 8 0 3 0 105 0 0 214 0 2 0.0690 0.0000 0.0093 37.667 1.38 3.18 -1.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9372 0.0628 2 1 0.0000 0.6005 0.3995
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.050 1 -3 1 648 179 469 80 1 18 4 76 0 1 464 1 3 0.4469 0.0000 0.0107 8.944 0.49 3.45 -2.96 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2014 0.5489 0.2496 1 1 0.2040 0.5453 0.2507 1 1 0.2073 0.5406 0.2521
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 240 118 122 5 0 41 4 68 0 0 122 0 0 0.0424 0.0000 0.0000 1.878 0.20 3.10 -2.90 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9983 0.0017 2 1 0.0000 0.8277 0.1723 2 1 0.0000 0.5345 0.4655
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.050 1 -9 1 881 196 685 181 0 9 0 6 0 0 683 0 2 0.9235 0.0000 0.0029 20.778 0.37 9.00 -8.63 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0042 0.9958 0.0000 0 0 0.8954 0.1046 0.0000 0 0 0.9878 0.0122 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.050 1 -4 3 223 96 127 55 0 2 0 39 0 0 126 0 1 0.5729 0.0000 0.0079 47.000 0.16 4.15 -3.99 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5837 0.3853 0.0310 1 0 0.5782 0.3893 0.0325 1 0 0.5708 0.3946 0.0346
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.050 1 6 6 966 222 744 110 0 35 2 75 0 0 735 0 9 0.4955 0.0000 0.0121 5.314 0.52 5.84 -5.32 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5430 0.4092 0.0478 1 0 0.5345 0.4140 0.0515 1 0 0.5229 0.4203 0.0568
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.050 1 3 1 735 154 581 84 0 3 0 67 0 0 579 0 2 0.5455 0.0000 0.0034 50.333 0.24 3.90 -3.66 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5391 0.4181 0.0429 1 0 0.5345 0.4205 0.0450 1 0 0.5282 0.4239 0.0479
chr10 27053356 CTCT C 0.017074 0.050 1 -3 1 140 67 73 61 0 4 0 2 0 0 73 0 0 0.9104 0.0000 0.0000 15.750 0.82 3.00 -2.18 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9108 0.0892 0.0000 0 0 0.9855 0.0145 0.0000 0 0 0.9916 0.0084 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.050 1 1 1 577 152 425 6 0 9 3 134 0 0 423 0 2 0.0395 0.0000 0.0047 15.889 0.00 1.23 -1.23 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.7719 0.2281 2 2 0.0000 0.3901 0.6099
chr10 49988921 AC A 0.048828 0.050 1 -1 1 773 236 537 229 0 2 0 5 0 0 536 1 0 0.9703 0.0000 0.0019 117.000 0.20 2.40 -2.20 5 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6452 0.3548 0.0000 0 0 0.9947 0.0053 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.050 1 -3 1 425 94 331 38 0 20 1 35 0 0 331 0 0 0.4043 0.0000 0.0000 3.700 0.37 3.40 -3.03 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4286 0.5042 0.0672 1 1 0.4289 0.5032 0.0678 1 1 0.4293 0.5020 0.0686
chr10 80081665 C CAA 0.055364 0.050 1 2 1 233 58 175 47 3 5 1 2 0 0 175 0 0 0.8103 0.0000 0.0000 10.600 0.45 2.00 -1.55 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6138 0.3862 0.0000 0 0 0.9208 0.0792 0.0000 0 0 0.9562 0.0438 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.050 1 6 1 703 161 542 11 0 5 1 144 0 0 535 0 7 0.0683 0.0000 0.0129 31.000 0.00 5.69 -5.69 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9907 0.0093 2 1 0.0000 0.8200 0.1800
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.050 1 6 1 635 199 436 88 0 28 0 83 0 0 428 0 8 0.4422 0.0000 0.0183 6.107 0.22 6.11 -5.89 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2133 0.5557 0.2310 1 1 0.2165 0.5517 0.2319 1 1 0.2206 0.5466 0.2328
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.050 1 6 1 383 90 293 81 0 5 0 4 0 0 292 1 0 0.9000 0.0000 0.0034 17.000 0.88 6.50 -5.62 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.2289 0.7711 0.0000 0 0 0.5483 0.4517 0.0000
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.050 1 -2 1 368 144 224 134 0 3 0 7 0 0 224 0 0 0.9306 0.0000 0.0000 47.000 0.59 4.00 -3.41 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.4625 0.5375 0.0000 0 0 0.8618 0.1382 0.0000
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.050 1 3 3 214 71 143 2 0 2 0 67 0 0 142 0 1 0.0282 0.0000 0.0070 34.500 0.00 2.96 -2.96 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6438 0.3562 2 2 0.0000 0.2137 0.7863 2 2 0.0000 0.1360 0.8640
chr10 124021236 C CGG 0.033163 0.050 1 2 1 300 63 237 9 23 19 2 10 0 3 233 1 0 0.1429 0.0000 0.0169 2.316 2.11 3.30 -1.19 5 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.7178 0.2791 0.0031 1 0 0.7103 0.2864 0.0033 1 0 0.6962 0.3002 0.0036
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.050 1 -1 1 300 63 237 8 16 16 8 15 0 1 235 1 0 0.1270 0.0000 0.0084 2.438 1.75 2.07 -0.32 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2298 0.5129 0.2573 1 1 0.2301 0.5120 0.2580 1 1 0.2304 0.5108 0.2589
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.050 1 1 1 428 133 295 71 0 5 0 57 0 0 293 0 2 0.5338 0.0000 0.0068 25.600 0.17 1.28 -1.11 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3845 0.4981 0.1174 1 1 0.3804 0.4981 0.1216 1 1 0.3747 0.4981 0.1272
chr11 704604 GA G 0.439706 0.050 1 -1 2 228 74 154 0 0 1 0 73 0 0 154 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 73.000 1.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1688 0.8312 2 2 0.0000 0.1740 0.8260 2 2 0.0000 0.1813 0.8187
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.050 1 1 1 517 169 348 10 69 5 3 82 0 0 347 0 1 0.0592 0.0000 0.0029 19.000 0.60 1.39 -0.79 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1798 0.6334 0.1869 1 1 0.1879 0.6303 0.1817 1 1 0.1990 0.6261 0.1749
chr11 1051657 AC A 0.061644 0.050 1 -1 1 517 171 346 12 86 4 0 69 0 0 346 0 0 0.0702 0.0000 0.0000 41.500 0.50 1.94 -1.44 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6204 0.3705 0.0091 1 0 0.6165 0.3740 0.0095 1 0 0.6110 0.3788 0.0102
chr11 1186164 C CACCAGCACAACTTCTGCTTCTACA 0.095472 0.050 1 24 2 3366 734 2632 251 10 212 12 249 11 5 2529 30 57 0.3420 0.0042 0.0391 2.425 1.44 4.17 -2.73 53 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0036 0.3478 0.6486 1 2 0.0046 0.3673 0.6281 1 2 0.0064 0.3941 0.5994
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.050 1 -24 1 4090 944 3146 448 8 272 4 212 9 5 3127 2 3 0.4746 0.0029 0.0060 2.469 3.05 13.34 -10.29 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.050 1 -30 2 1054 235 819 9 0 94 0 132 0 0 819 0 0 0.0383 0.0000 0.0000 1.500 1.00 6.28 -5.28 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9298 0.0702 2 1 0.0000 0.5021 0.4979
chr11 1607861 GCAGCAGGGCTTACAGCAGCTGGACTGGGAA G 0.000004 0.050 1 -30 1 1163 253 910 154 2 41 0 56 1 0 883 1 25 0.6087 0.0011 0.0297 5.122 0.94 4.88 -3.93 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9677 0.0323 0.0000 1 0 0.9637 0.0363 0.0000 1 0 0.9577 0.0423 0.0000
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.050 1 -30 2 1006 283 723 35 0 97 3 148 0 0 723 0 0 0.1237 0.0000 0.0000 1.897 1.23 11.89 -10.66 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0374 0.9626 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.050 1 3 2 352 101 251 0 0 1 1 99 0 0 248 0 3 0.0000 0.0000 0.0120 100.000 2.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0697 0.9303 2 2 0.0000 0.0732 0.9268 2 2 0.0000 0.0781 0.9219
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 736 230 506 112 0 10 0 108 0 0 505 1 0 0.4870 0.0000 0.0020 22.000 0.34 1.36 -1.02 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2502 0.5643 0.1855 1 1 0.2517 0.5595 0.1888 1 1 0.2535 0.5535 0.1931
chr11 4573328 T TG 0.500000 0.050 1 1 4 224 98 126 97 0 0 0 1 0 0 126 0 0 0.9898 0.0000 0.0000 98.000 0.16 1.00 -0.84 43 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6933 0.3067 0.0000 0 0 0.8488 0.1512 0.0000 0 0 0.8758 0.1242 0.0000
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 867 219 648 112 0 6 0 101 0 0 647 0 1 0.5114 0.0000 0.0015 35.500 0.28 1.45 -1.17 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3382 0.5359 0.1259 1 1 0.3367 0.5331 0.1302 1 1 0.3344 0.5296 0.1359
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.050 1 1 1 521 147 374 58 0 5 3 81 0 0 374 0 0 0.3946 0.0000 0.0000 28.400 1.09 2.10 -1.01 32 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0441 0.3794 0.5764 1 2 0.0478 0.3863 0.5659 1 2 0.0531 0.3953 0.5516
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.050 1 6 1 1197 287 910 165 0 9 0 113 0 0 900 0 10 0.5749 0.0000 0.0110 30.889 0.18 5.80 -5.61 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7288 0.2598 0.0115 1 0 0.7171 0.2697 0.0132 1 0 0.7009 0.2832 0.0160
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.050 1 -1 2 876 206 670 106 0 10 0 90 0 0 669 0 1 0.5146 0.0000 0.0015 19.600 0.12 1.76 -1.63 36 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4100 0.4969 0.0930 1 1 0.4057 0.4968 0.0975 1 1 0.3997 0.4968 0.1035
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.050 1 2 1 570 155 415 80 0 4 0 71 0 0 415 0 0 0.5161 0.0000 0.0000 37.750 0.25 2.14 -1.89 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3387 0.5221 0.1391 1 1 0.3365 0.5204 0.1430 1 1 0.3335 0.5183 0.1483
chr11 5489193 ATCT A 0.500000 0.050 1 -3 1 794 151 643 90 1 5 0 55 0 0 643 0 0 0.5960 0.0000 0.0000 29.200 1.32 4.20 -2.88 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6980 0.2821 0.0200 1 0 0.6850 0.2925 0.0225 1 0 0.6673 0.3065 0.0262
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.050 1 12 2 816 158 658 0 0 13 1 144 0 0 635 0 23 0.0000 0.0000 0.0350 11.077 9.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0144 0.9856 2 2 0.0000 0.0156 0.9844 2 2 0.0000 0.0175 0.9825
chr11 6921357 TC T 0.500000 0.050 1 -1 1 671 164 507 157 0 0 0 7 0 0 507 0 0 0.9573 0.0000 0.0000 164.000 0.45 1.29 -0.83 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.3102 0.6898 0.0000 0 0 0.7619 0.2381 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 341 174 167 144 3 22 0 5 0 0 167 0 0 0.8276 0.0000 0.0000 6.909 0.69 4.60 -3.91 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0114 0.9886 0.0000 0 0 0.5709 0.4291 0.0000 0 0 0.8409 0.1591 0.0000
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.050 1 -3 2 198 58 140 30 0 0 0 28 0 0 139 0 1 0.5172 0.0000 0.0071 58.000 0.73 3.21 -2.48 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2531 0.5177 0.2292 1 1 0.2533 0.5164 0.2303 1 1 0.2536 0.5147 0.2317
chr11 18615951 CTCT C 0.500000 0.050 1 -3 2 703 140 563 73 0 6 0 61 0 0 562 0 1 0.5214 0.0000 0.0018 22.333 0.56 3.46 -2.90 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3695 0.5059 0.1245 1 1 0.3660 0.5054 0.1286 1 1 0.3612 0.5047 0.1341
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 254 107 147 100 1 3 0 3 0 0 147 0 0 0.9346 0.0000 0.0000 34.333 0.14 6.00 -5.86 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0862 0.9138 0.0000 0 0 0.6184 0.3816 0.0000 0 0 0.7861 0.2139 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.050 1 -3 1 857 255 602 5 0 14 0 236 0 0 596 0 6 0.0196 0.0000 0.0100 17.214 0.00 3.16 -3.16 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8882 0.1118 2 2 0.0000 0.0673 0.9327 2 2 0.0000 0.0190 0.9810
chr11 56093801 GT G 0.500000 0.050 1 -1 1 837 204 633 194 0 4 0 6 0 0 633 0 0 0.9510 0.0000 0.0000 50.000 0.26 2.83 -2.57 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0078 0.9922 0.0000 0 0 0.6871 0.3129 0.0000 0 0 0.9186 0.0814 0.0000
chr11 56093830 CA C 0.500000 0.050 1 -1 1 828 200 628 187 3 4 0 6 0 0 628 0 0 0.9350 0.0000 0.0000 49.000 0.28 2.83 -2.55 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0067 0.9933 0.0000 0 0 0.6639 0.3361 0.0000 0 0 0.9109 0.0891 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.050 1 2 4 1121 267 854 0 0 3 1 263 0 0 845 0 9 0.0000 0.0000 0.0105 88.000 2.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr11 56577367 CCATTGAAG C 0.500000 0.050 1 -8 1 1022 252 770 242 0 4 0 6 0 0 769 0 1 0.9603 0.0000 0.0013 62.000 0.21 6.67 -6.46 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 0 0.7847 0.2153 0.0000 0 0 0.9608 0.0392 0.0000
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.050 1 -1 1 710 137 573 70 0 2 0 65 0 0 572 0 1 0.5109 0.0000 0.0017 67.500 0.50 1.37 -0.87 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2769 0.5366 0.1865 1 1 0.2768 0.5339 0.1893 1 1 0.2766 0.5304 0.1930
chr11 58403319 AG A 0.500000 0.050 1 -1 2 468 116 352 107 1 4 0 4 0 0 352 0 0 0.9224 0.0000 0.0000 28.000 0.77 1.00 -0.23 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0229 0.9771 0.0000 0 1 0.5000 0.5000 0.0000 0 0 0.7511 0.2489 0.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.050 1 -2 1 85 33 52 21 0 0 0 12 0 0 50 0 2 0.6364 0.0000 0.0385 33.000 0.29 2.25 -1.96 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3359 0.4960 0.1681 1 1 0.3327 0.4963 0.1710 1 1 0.3285 0.4966 0.1749
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 5 319 113 206 47 3 19 0 44 0 0 205 0 1 0.4159 0.0000 0.0049 4.947 0.68 3.25 -2.57 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2972 0.5215 0.1814 1 1 0.2960 0.5198 0.1841 1 1 0.2944 0.5178 0.1878
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.050 1 21 2 1001 188 813 4 0 34 2 148 0 0 732 0 81 0.0213 0.0000 0.0996 4.500 0.00 6.08 -6.08 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6727 0.3273 2 2 0.0000 0.0464 0.9536 2 2 0.0000 0.0172 0.9828
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.050 1 57 2 1160 234 926 78 4 111 2 39 0 0 896 0 30 0.3333 0.0000 0.0324 1.099 0.90 13.51 -12.62 36 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3681 0.5101 0.1217 1 1 0.3648 0.5093 0.1259 1 1 0.3603 0.5082 0.1315
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.050 1 -42 1 1059 289 770 165 0 68 0 56 0 1 745 0 24 0.5709 0.0000 0.0325 3.250 0.42 12.95 -12.53 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9628 0.0370 0.0002 1 0 0.9573 0.0424 0.0003 1 0 0.9489 0.0507 0.0004
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.050 1 -2 1 973 270 703 5 0 2 0 263 0 0 700 0 3 0.0185 0.0000 0.0043 134.000 0.60 2.18 -1.58 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8124 0.1876 2 2 0.0000 0.0384 0.9616 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 569 139 430 65 0 6 0 68 1 0 426 0 3 0.4676 0.0023 0.0093 22.167 0.43 4.18 -3.75 15 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.1765 0.5342 0.2893 1 1 0.1795 0.5316 0.2888 1 1 0.1836 0.5284 0.2880
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.050 1 -9 1 1386 369 1017 5 4 67 5 288 0 0 1017 0 0 0.0136 0.0000 0.0000 4.433 1.00 7.62 -6.62 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7165 0.2835 2 2 0.0000 0.0247 0.9753 2 2 0.0000 0.0069 0.9931
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.050 1 -15 3 831 275 556 134 1 43 0 97 0 0 556 0 0 0.4873 0.0000 0.0000 5.395 0.60 11.13 -10.53 42 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6997 0.2839 0.0163 1 0 0.6878 0.2937 0.0186 1 0 0.6712 0.3069 0.0219
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.050 1 -8 2 284 111 173 69 0 2 0 40 0 0 170 0 3 0.6216 0.0000 0.0173 54.500 0.26 7.35 -7.09 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5846 0.3707 0.0447 1 0 0.5734 0.3782 0.0484 1 0 0.5584 0.3879 0.0537
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.050 1 -6 1 462 153 309 139 1 11 0 2 0 0 309 0 0 0.9085 0.0000 0.0000 12.909 0.60 6.50 -5.90 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5641 0.4359 0.0000 0 0 0.8925 0.1075 0.0000 0 0 0.9317 0.0683 0.0000
chr11 125431296 AGAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 268 122 146 58 1 17 0 46 0 0 145 1 0 0.4754 0.0000 0.0068 6.176 0.28 3.15 -2.88 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3903 0.4907 0.1190 1 1 0.3857 0.4912 0.1231 1 1 0.3794 0.4919 0.1286
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.050 1 -6 1 218 85 133 61 1 20 0 3 0 0 133 0 0 0.7176 0.0000 0.0000 3.200 0.15 6.00 -5.85 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0342 0.9658 0.0000 0 1 0.3829 0.6171 0.0000 0 0 0.5911 0.4089 0.0000
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.050 1 3 1 445 133 312 2 58 20 2 51 0 0 310 0 2 0.0150 0.0000 0.0064 5.650 0.50 3.80 -3.30 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3016 0.5255 0.1729 1 1 0.3005 0.5235 0.1760 1 1 0.2989 0.5211 0.1800
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.050 1 -3 1 446 137 309 49 11 17 2 58 0 1 308 0 0 0.3577 0.0000 0.0032 7.059 2.57 3.48 -0.91 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2379 0.5365 0.2255 1 1 0.2391 0.5338 0.2271 1 1 0.2405 0.5303 0.2291
chr12 165530 G GAGTGTAAGTCTTTGACAGCC 0.014581 0.050 1 20 1 391 98 293 46 1 16 0 35 0 0 289 0 4 0.4694 0.0000 0.0137 5.062 0.83 14.03 -13.20 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5640 0.4321 0.0039 1 0 0.5622 0.4338 0.0040 1 0 0.5598 0.4361 0.0041
chr12 865142 T TC 0.282148 0.050 1 1 2 359 125 234 57 2 1 0 65 0 0 233 0 1 0.4560 0.0000 0.0043 124.000 1.84 1.74 0.10 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2446 0.5624 0.1931 1 1 0.2493 0.5591 0.1916 1 1 0.2555 0.5549 0.1895
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.050 1 3 1 585 147 438 53 2 30 2 60 0 0 437 0 1 0.3605 0.0000 0.0023 3.900 0.11 2.90 -2.79 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1757 0.5297 0.2946 1 1 0.1796 0.5279 0.2924 1 1 0.1849 0.5256 0.2894
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.050 1 -3 1 417 138 279 47 2 25 4 60 0 0 277 0 2 0.3406 0.0000 0.0072 4.520 0.19 3.10 -2.91 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0733 0.4382 0.4885 1 2 0.0771 0.4414 0.4816 1 2 0.0822 0.4455 0.4722
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.050 1 3 1 3520 806 2714 387 2 4 2 411 0 0 2693 0 21 0.4801 0.0000 0.0077 200.250 1.97 4.12 -2.15 67 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0038 0.3009 0.6953 1 2 0.0045 0.3028 0.6926 1 2 0.0056 0.3063 0.6881
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.050 1 5 1 239 75 164 72 0 1 0 2 0 0 164 0 0 0.9600 0.0000 0.0000 74.000 0.31 5.00 -4.69 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1874 0.8126 0.0000 0 0 0.6050 0.3950 0.0000 0 0 0.7249 0.2751 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.050 1 -3 1 319 138 181 63 0 17 4 54 0 0 181 0 0 0.4565 0.0000 0.0000 7.118 1.16 4.67 -3.51 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1954 0.5520 0.2526 1 1 0.1947 0.5489 0.2564 1 1 0.1935 0.5450 0.2615
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.050 1 -3 2 455 100 355 94 0 2 0 4 0 0 355 0 0 0.9400 0.0000 0.0000 49.000 0.23 3.50 -3.27 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0231 0.9769 0.0000 0 0 0.5168 0.4832 0.0000 0 0 0.7663 0.2337 0.0000
chr12 40483097 AAGTGACAGGGACAACTAGACTATCAGCTGG A 0.146503 0.050 1 -30 1 1831 395 1436 197 1 39 4 154 4 4 1422 3 3 0.4987 0.0028 0.0097 9.103 2.21 11.28 -9.07 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8197 0.1783 0.0020 1 0 0.8123 0.1854 0.0023 1 0 0.8018 0.1954 0.0028
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.050 1 30 1 1658 325 1333 97 0 136 2 90 5 3 1263 2 60 0.2985 0.0038 0.0525 1.382 1.63 5.31 -3.68 3 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0061 0.1918 0.8021 1 2 0.0072 0.2025 0.7903 1 2 0.0090 0.2173 0.7737
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.050 1 -21 2 1011 254 757 121 0 17 1 115 2 0 754 0 1 0.4764 0.0026 0.0040 13.941 0.48 13.44 -12.96 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3015 0.5565 0.1420 1 1 0.3023 0.5520 0.1457 1 1 0.3031 0.5464 0.1505
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.050 1 -1 1 453 87 366 35 9 6 9 28 0 0 366 0 0 0.4023 0.0000 0.0000 12.000 0.71 1.43 -0.71 23 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4456 0.4721 0.0823 1 1 0.4433 0.4727 0.0841 1 1 0.4400 0.4735 0.0865
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.050 1 -2 1 141 65 76 0 0 2 0 63 0 0 74 1 1 0.0000 0.0000 0.0263 31.500 2.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0993 0.9007 2 2 0.0000 0.1022 0.8978 2 2 0.0000 0.1064 0.8936
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.050 1 3 2 354 92 262 44 0 6 0 42 0 0 261 0 1 0.4783 0.0000 0.0038 14.333 0.95 3.81 -2.85 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2946 0.5239 0.1815 1 1 0.2953 0.5220 0.1827 1 1 0.2962 0.5196 0.1842
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.050 1 3 2 147 70 77 34 0 7 0 29 0 0 77 0 0 0.4857 0.0000 0.0000 9.000 0.35 3.55 -3.20 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3627 0.4982 0.1390 1 1 0.3611 0.4978 0.1411 1 1 0.3589 0.4974 0.1438
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.050 1 -3 1 1030 278 752 0 0 20 5 253 0 0 749 0 3 0.0000 0.0000 0.0040 12.900 3.37 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 80444830 AGTGACAACAAAT A 0.002716 0.050 1 -12 1 233 73 160 39 0 0 0 34 0 0 159 0 1 0.5342 0.0000 0.0063 73.000 0.08 10.76 -10.69 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5256 0.4734 0.0010 1 0 0.5254 0.4736 0.0010 1 0 0.5251 0.4739 0.0010
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.050 1 -1 1 147 63 84 1 1 3 1 57 0 0 84 0 0 0.0159 0.0000 0.0000 19.667 7.00 1.11 5.89 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7796 0.2204 2 1 0.0000 0.5802 0.4198 2 1 0.0000 0.5093 0.4907
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.050 1 3 1 465 115 350 51 5 22 0 37 0 0 349 0 1 0.4435 0.0000 0.0029 4.227 0.22 3.03 -2.81 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4793 0.4403 0.0804 1 0 0.4712 0.4441 0.0846 1 0 0.4604 0.4491 0.0905
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.050 1 -3 1 414 103 311 43 1 13 1 45 0 0 310 0 1 0.4175 0.0000 0.0032 6.846 0.70 8.04 -7.35 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1990 0.5242 0.2768 1 1 0.2012 0.5224 0.2764 1 1 0.2041 0.5201 0.2758
chr12 106247737 CCGGCGG C 0.500000 0.050 1 -6 1 405 126 279 60 0 14 2 50 0 0 279 0 0 0.4762 0.0000 0.0000 7.857 1.60 8.12 -6.52 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3392 0.5130 0.1478 1 1 0.3366 0.5120 0.1514 1 1 0.3330 0.5107 0.1562
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.050 1 -30 1 1903 630 1273 535 3 84 1 7 9 15 1238 1 10 0.8492 0.0071 0.0275 6.566 1.15 19.57 -18.43 155 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8597 0.1403 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.050 1 -3 1 625 181 444 0 1 24 6 150 0 0 441 1 2 0.0000 0.0000 0.0068 6.458 4.57 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0212 0.9788 2 2 0.0000 0.0224 0.9776 2 2 0.0000 0.0243 0.9757
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.050 1 -1 1 256 131 125 70 0 2 0 59 0 0 125 0 0 0.5344 0.0000 0.0000 64.500 0.27 2.53 -2.25 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3709 0.5041 0.1250 1 1 0.3672 0.5037 0.1291 1 1 0.3623 0.5032 0.1345
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.050 1 -6 1 258 115 143 58 1 18 0 38 0 0 143 0 0 0.5043 0.0000 0.0000 5.333 0.21 5.92 -5.71 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5195 0.4150 0.0655 1 0 0.5101 0.4203 0.0696 1 0 0.4974 0.4272 0.0754
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.050 1 3 2 426 92 334 30 24 14 1 23 0 1 332 0 1 0.3261 0.0000 0.0060 5.214 1.37 5.39 -4.02 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6254 0.3370 0.0376 1 0 0.6128 0.3461 0.0411 1 0 0.5958 0.3581 0.0461
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.050 1 -5 5 349 87 262 0 0 6 0 81 0 0 245 0 17 0.0000 0.0000 0.0649 13.500 5.62 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0783 0.9217 2 2 0.0000 0.0819 0.9181 2 2 0.0000 0.0871 0.9129
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.050 1 15 4 372 98 274 55 1 9 0 33 0 0 269 0 5 0.5612 0.0000 0.0182 9.889 0.22 12.58 -12.36 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4784 0.4408 0.0807 1 0 0.4704 0.4447 0.0850 1 0 0.4596 0.4496 0.0909
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.050 1 9 5 739 210 529 0 0 23 2 185 0 0 508 0 21 0.0000 0.0000 0.0397 8.087 8.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0059 0.9941 2 2 0.0000 0.0068 0.9932
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.050 1 3 3 244 92 152 52 10 27 0 3 0 0 152 0 0 0.5652 0.0000 0.0000 2.407 0.19 3.00 -2.81 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0344 0.9656 0.0000 0 1 0.3836 0.6164 0.0000 0 0 0.5918 0.4082 0.0000
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.050 1 3 1 213 66 147 33 3 7 1 22 0 0 146 0 1 0.5000 0.0000 0.0068 8.429 0.73 3.36 -2.64 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4017 0.4763 0.1220 1 1 0.3961 0.4779 0.1259 1 1 0.3887 0.4800 0.1313
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.050 1 9 1 247 63 184 0 0 8 1 54 0 0 176 0 8 0.0000 0.0000 0.0435 6.875 8.41 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1701 0.8299 2 2 0.0000 0.1746 0.8254 2 2 0.0000 0.1810 0.8190
chr12 131828558 C CCGCTGCTGT 0.500000 0.050 1 9 1 246 67 179 2 1 2 2 60 0 0 174 0 5 0.0299 0.0000 0.0279 32.500 0.00 7.97 -7.97 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9545 0.0455 2 1 0.0000 0.5810 0.4190 2 2 0.0000 0.3781 0.6219
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.050 1 3 2 598 166 432 14 2 51 5 94 0 0 430 0 2 0.0843 0.0000 0.0046 2.327 1.86 4.23 -2.38 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9706 0.0294
chr12 132583284 GGCCTGGGCCGCGAGC G 0.500000 0.050 1 -15 1 518 123 395 63 0 4 1 55 2 0 387 0 6 0.5122 0.0051 0.0203 29.750 0.24 13.75 -13.51 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2662 0.5360 0.1978 1 1 0.2664 0.5333 0.2003 1 1 0.2666 0.5299 0.2035
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.050 1 6 2 805 208 597 92 1 32 1 82 0 0 595 0 2 0.4423 0.0000 0.0034 5.500 0.60 5.88 -5.28 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3259 0.5331 0.1409 1 1 0.3248 0.5305 0.1447 1 1 0.3232 0.5272 0.1497
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.050 1 -18 4 560 176 384 89 0 2 0 85 0 0 381 1 2 0.5057 0.0000 0.0078 87.000 0.30 13.09 -12.79 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2529 0.5520 0.1951 1 1 0.2545 0.5481 0.1974 1 1 0.2565 0.5431 0.2004
chr13 60528441 GATA G 0.187645 0.050 1 -3 4 419 109 310 2 0 3 0 104 0 0 301 0 9 0.0183 0.0000 0.0290 35.333 0.00 3.56 -3.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8684 0.1316 2 1 0.0000 0.5036 0.4964 2 2 0.0000 0.3775 0.6225
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.050 1 3 4 709 105 604 0 0 17 3 85 0 0 600 0 4 0.0000 0.0000 0.0066 5.176 5.36 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0219 0.9781 2 2 0.0000 0.0229 0.9771 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr13 107866367 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.050 1 -12 2 1134 407 727 393 2 5 0 7 0 1 726 0 0 0.9656 0.0000 0.0014 80.400 0.44 13.00 -12.56 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1879 0.8121 0.0000 0 0 0.9939 0.0061 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr13 109785969 G GGTT 0.500000 0.050 1 3 1 421 100 321 40 0 14 2 44 3 0 318 0 0 0.4000 0.0093 0.0093 6.615 2.55 4.11 -1.56 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2072 0.5252 0.2677 1 1 0.2092 0.5233 0.2676 1 1 0.2117 0.5209 0.2674
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.050 1 -15 1 304 92 212 33 0 25 0 34 0 0 209 1 2 0.3587 0.0000 0.0142 2.680 0.45 11.50 -11.05 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1947 0.5165 0.2888 1 1 0.1970 0.5153 0.2877 1 1 0.2000 0.5137 0.2863
chr13 113406371 GA G 0.500000 0.050 1 -1 2 666 125 541 63 0 1 2 59 0 0 536 1 4 0.5040 0.0000 0.0092 124.000 0.35 3.19 -2.84 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1990 0.5367 0.2643 1 1 0.2014 0.5340 0.2646 1 1 0.2046 0.5305 0.2649
chr13 113406374 TC T 0.500000 0.050 1 -1 2 664 126 538 64 0 1 2 59 0 1 533 0 4 0.5079 0.0000 0.0093 125.000 0.34 3.19 -2.84 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2305 0.5396 0.2299 1 1 0.2320 0.5366 0.2314 1 1 0.2339 0.5328 0.2333
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.050 1 3 1 651 132 519 70 1 3 2 56 0 0 517 0 2 0.5303 0.0000 0.0039 42.667 0.74 3.34 -2.60 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3681 0.5057 0.1262 1 1 0.3645 0.5052 0.1303 1 1 0.3597 0.5045 0.1358
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.050 1 1 2 1476 352 1124 231 0 6 0 115 0 0 1124 0 0 0.6562 0.0000 0.0000 57.667 0.32 1.93 -1.61 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9819 0.0181 0.0000 1 0 0.9782 0.0218 0.0000 1 0 0.9721 0.0278 0.0001
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.050 1 -1 4 932 264 668 105 1 30 0 128 0 0 667 0 1 0.3977 0.0000 0.0015 7.767 0.25 2.00 -1.75 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0593 0.4544 0.4862 1 2 0.0638 0.4575 0.4787 1 2 0.0701 0.4616 0.4682
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.050 1 1 1 401 101 300 1 0 5 1 94 0 0 298 0 2 0.0099 0.0000 0.0067 19.000 0.00 1.30 -1.30 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1570 0.8430 2 2 0.0000 0.0708 0.9292 2 2 0.0000 0.0573 0.9427
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.050 1 3 3 567 172 395 72 0 14 0 86 0 0 391 0 4 0.4186 0.0000 0.0101 11.286 0.18 2.84 -2.66 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1365 0.5580 0.3055 1 1 0.1432 0.5574 0.2994 1 1 0.1524 0.5565 0.2911
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.050 1 3 1 519 129 390 51 1 19 2 56 0 0 384 0 6 0.3953 0.0000 0.0154 5.684 0.43 2.68 -2.25 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1015 0.4786 0.4199 1 1 0.1051 0.4794 0.4156 1 1 0.1100 0.4804 0.4096
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.050 1 6 1 485 97 388 45 0 7 0 45 0 0 388 0 0 0.4639 0.0000 0.0000 12.857 0.29 5.24 -4.96 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3409 0.5274 0.1316 1 1 0.3424 0.5254 0.1322 1 1 0.3443 0.5228 0.1329
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.050 1 -3 1 598 183 415 91 3 12 2 75 0 0 415 0 0 0.4973 0.0000 0.0000 14.083 0.25 3.35 -3.09 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6315 0.3606 0.0079 1 0 0.6275 0.3642 0.0083 1 0 0.6219 0.3691 0.0090
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.050 1 -1 1 669 193 476 9 7 15 4 158 0 0 476 0 0 0.0466 0.0000 0.0000 175.000 0.44 3.99 -3.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9397 0.0603 2 2 0.0000 0.4571 0.5429
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.050 1 -2 1 659 191 468 7 2 22 1 159 0 0 468 0 0 0.0366 0.0000 0.0000 7.591 1.57 4.08 -2.50 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.5908 0.4092 2 2 0.0000 0.1633 0.8367
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.050 1 -3 1 332 53 279 1 0 4 0 48 0 0 275 0 4 0.0189 0.0000 0.0143 12.250 0.00 3.31 -3.31 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6971 0.3029 2 2 0.0000 0.4739 0.5261 2 2 0.0000 0.4098 0.5902
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.050 1 6 1 394 103 291 2 0 34 0 67 0 0 283 0 8 0.0194 0.0000 0.0275 2.029 2.00 5.30 -3.30 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8823 0.1177 2 1 0.0000 0.5310 0.4690 2 2 0.0000 0.3977 0.6023
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.050 1 24 1 339 87 252 39 0 45 0 3 0 1 250 0 1 0.4483 0.0000 0.0079 0.933 0.64 9.00 -8.36 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0174 0.9826 0.0000 0 1 0.4500 0.5500 0.0000 0 0 0.7223 0.2777 0.0000
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.050 1 6 1 671 122 549 51 0 19 1 51 0 0 538 0 11 0.4180 0.0000 0.0200 5.421 0.94 7.10 -6.16 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0350 0.4200 0.5450 1 2 0.0364 0.4223 0.5413 1 2 0.0383 0.4254 0.5363
chr14 54702332 C CCAG 0.081686 0.050 1 3 1 430 132 298 127 0 1 0 4 0 0 298 0 0 0.9621 0.0000 0.0000 131.000 0.27 3.00 -2.73 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2862 0.7138 0.0000 0 0 0.9469 0.0531 0.0000 0 0 0.9816 0.0184 0.0000
chr14 69573086 CGCG C 0.132029 0.050 1 -3 2 653 172 481 0 8 29 128 7 0 1 473 7 0 0.0000 0.0000 0.0166 4.821 5.14 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4065 0.5935 2 2 0.0000 0.3688 0.6312 2 2 0.0000 0.3441 0.6559
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.050 1 -6 2 656 175 481 0 0 32 1 142 0 0 472 1 8 0.0000 0.0000 0.0187 4.469 7.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0054 0.9946 2 2 0.0000 0.0060 0.9940
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.050 1 -3 1 467 101 366 3 2 6 13 77 0 0 364 1 1 0.0297 0.0000 0.0055 21.250 3.67 4.73 -1.06 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9904 0.0096 2 1 0.0000 0.7123 0.2877 2 2 0.0000 0.4386 0.5614
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.050 1 -3 2 481 143 338 4 1 13 2 123 0 0 337 1 0 0.0280 0.0000 0.0030 9.923 0.00 3.33 -3.33 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9859 0.0141 2 2 0.0000 0.4069 0.5931 2 2 0.0000 0.1476 0.8524
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.050 1 -9 1 372 109 263 7 0 1 0 101 0 0 258 0 5 0.0642 0.0000 0.0190 108.000 0.43 8.77 -8.34 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9289 0.0711 2 1 0.0000 0.6388 0.3612
chr14 100239450 GCCA G 0.045445 0.050 1 -3 2 532 175 357 138 5 26 3 3 0 0 357 0 0 0.7886 0.0000 0.0000 5.920 0.72 8.33 -7.62 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3188 0.6812 0.0000 0 0 0.9612 0.0388 0.0000 0 0 0.9888 0.0112 0.0000
chr14 100884333 C CTCT 0.265959 0.050 1 3 1 672 139 533 71 0 3 0 65 0 0 529 0 4 0.5108 0.0000 0.0075 45.333 0.75 3.09 -2.35 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3621 0.5302 0.1077 1 1 0.3636 0.5275 0.1089 1 1 0.3653 0.5241 0.1105
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.050 1 -9 1 273 87 186 7 0 17 0 63 0 0 179 0 7 0.0805 0.0000 0.0376 4.118 0.14 9.05 -8.90 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9611 0.0389 2 1 0.0000 0.7654 0.2346
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.050 1 -3 2 437 128 309 57 3 15 0 53 1 0 304 0 4 0.4453 0.0032 0.0162 7.533 0.32 3.98 -3.67 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3902 0.5108 0.0990 1 1 0.3904 0.5091 0.1005 1 1 0.3904 0.5071 0.1025
chr15 20534604 TCGTATCTTCTCCTCCTGCTCCCGTATCTTCTCCTCCTGCTCC T 0.091913 0.050 1 -42 1 4389 1683 2706 921 70 184 32 476 66 70 2555 7 8 0.5472 0.0244 0.0558 8.156 1.32 5.12 -3.80 131 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.050 1 -3 1 347 100 247 40 3 15 3 39 0 0 247 0 0 0.4000 0.0000 0.0000 5.667 2.40 4.54 -2.14 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3824 0.5193 0.0983 1 1 0.3834 0.5176 0.0990 1 1 0.3847 0.5155 0.0998
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.050 1 3 1 848 136 712 0 0 7 1 128 0 8 613 74 17 0.0000 0.0000 0.1390 18.429 3.76 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0092 0.9908 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.050 1 -1 2 2204 589 1615 0 1 9 9 570 1 1 1585 11 17 0.0000 0.0006 0.0186 64.111 3.91 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.050 1 -2 2 480 121 359 67 0 1 0 53 0 0 357 0 2 0.5537 0.0000 0.0056 120.000 0.15 2.25 -2.10 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4528 0.4644 0.0828 1 1 0.4487 0.4654 0.0859 1 1 0.4430 0.4669 0.0901
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.050 1 -1 2 210 70 140 0 1 2 39 28 0 0 137 3 0 0.0000 0.0000 0.0214 15.000 1.32 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.3446 0.6554 2 2 0.0000 0.3445 0.6555 2 2 0.0000 0.3476 0.6524
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.050 1 -2 2 210 71 139 0 2 29 0 40 0 0 137 0 2 0.0000 0.0000 0.0144 1.448 2.00 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6481 0.3519 2 2 0.0000 0.3852 0.6148 2 2 0.0000 0.2887 0.7113
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.050 1 -3 1 723 183 540 69 0 30 2 82 1 1 536 0 2 0.3770 0.0019 0.0074 5.100 0.94 4.10 -3.16 27 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0538 0.4329 0.5133 1 2 0.0564 0.4350 0.5086 1 2 0.0601 0.4378 0.5021
chr15 33844878 TAGA T 0.150388 0.050 1 -3 3 251 80 171 51 0 4 0 25 0 0 170 0 1 0.6375 0.0000 0.0058 19.000 0.25 3.44 -3.19 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7191 0.2702 0.0107 1 0 0.7104 0.2779 0.0117 1 0 0.6986 0.2884 0.0130
chr15 34038912 CCCGCCGCCGCCT C 0.202105 0.050 1 -12 4 229 88 141 49 0 6 0 33 0 0 136 1 4 0.5568 0.0000 0.0355 13.667 0.73 11.06 -10.33 1 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5310 0.4247 0.0443 1 0 0.5269 0.4271 0.0459 1 0 0.5215 0.4304 0.0481
chr15 38484605 AGGTGGTGGT A 0.136711 0.050 1 -9 2 397 169 228 85 1 39 0 44 0 0 226 0 2 0.5030 0.0000 0.0088 3.333 0.76 8.75 -7.99 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8393 0.1581 0.0025 1 0 0.8303 0.1668 0.0029 1 0 0.8177 0.1788 0.0035
chr15 39976797 G GGACGAC 0.109463 0.050 1 6 1 339 91 248 78 0 10 0 3 0 0 248 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 8.100 1.00 4.67 -3.67 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3029 0.6971 0.0000 0 0 0.8826 0.1174 0.0000 0 0 0.9454 0.0546 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.050 1 -2 1 428 122 306 115 0 0 0 7 0 0 306 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 122.000 1.65 2.14 -0.49 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2424 0.7576 0.0000 0 0 0.7015 0.2985 0.0000
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.050 1 5 1 511 170 341 90 0 12 0 68 0 0 338 0 3 0.5294 0.0000 0.0088 13.167 0.29 4.85 -4.56 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5472 0.4060 0.0468 1 0 0.5406 0.4097 0.0497 1 0 0.5316 0.4147 0.0537
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.050 1 -3 2 160 83 77 42 0 3 0 38 0 0 76 0 1 0.5060 0.0000 0.0130 26.667 0.24 2.84 -2.60 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2884 0.5199 0.1917 1 1 0.2880 0.5184 0.1936 1 1 0.2874 0.5164 0.1962
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.050 1 -3 1 262 142 120 76 0 1 0 65 0 0 115 0 5 0.5352 0.0000 0.0417 141.000 1.14 3.43 -2.29 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2529 0.5468 0.2003 1 1 0.2520 0.5438 0.2042 1 1 0.2507 0.5399 0.2094
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.050 1 -3 1 458 108 350 4 0 9 6 89 0 0 346 0 4 0.0370 0.0000 0.0114 10.889 1.00 4.17 -3.17 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9753 0.0247 2 2 0.0000 0.4679 0.5321 2 2 0.0000 0.2236 0.7764
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.050 1 3 3 396 140 256 72 0 1 1 66 0 0 254 0 2 0.5143 0.0000 0.0078 139.000 0.78 3.08 -2.30 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3673 0.5247 0.1079 1 1 0.3683 0.5223 0.1095 1 1 0.3693 0.5192 0.1115
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.050 1 3 1 1122 309 813 138 10 60 1 100 0 0 813 0 0 0.4466 0.0000 0.0000 4.186 0.39 3.10 -2.71 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8669 0.1322 0.0010 1 0 0.8590 0.1398 0.0012 1 0 0.8480 0.1506 0.0015
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.050 1 -24 2 859 218 641 8 8 115 3 84 0 1 624 0 16 0.0367 0.0000 0.0265 1.690 2.75 16.23 -13.48 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.9054 0.0946
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.050 1 -12 2 847 219 628 1 3 19 6 190 0 0 626 1 1 0.0046 0.0000 0.0032 10.421 0.00 11.36 -11.36 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1865 0.8135 2 2 0.0000 0.0243 0.9757 2 2 0.0000 0.0123 0.9877
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.050 1 -6 1 356 106 250 0 0 5 1 100 0 0 239 0 11 0.0000 0.0000 0.0440 25.000 7.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.050 1 1 1 357 106 251 42 0 5 0 59 0 0 251 0 0 0.3962 0.0000 0.0000 20.200 0.64 2.32 -1.68 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0815 0.4449 0.4736 1 2 0.0856 0.4482 0.4662 1 2 0.0912 0.4524 0.4563
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.050 1 -6 2 534 186 348 5 0 44 1 136 0 0 339 0 9 0.0269 0.0000 0.0259 3.205 0.20 6.62 -6.42 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9947 0.0053 2 1 0.0000 0.6219 0.3781 2 2 0.0000 0.2927 0.7073
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.050 1 1 2 41 12 29 4 0 0 0 8 0 0 29 0 0 0.3333 0.0000 0.0000 12.000 0.00 1.00 -1.00 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3475 0.5311 0.1214 1 1 0.3493 0.5305 0.1202 1 1 0.3505 0.5309 0.1186
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.050 1 2 2 352 103 249 55 0 2 0 46 0 0 248 0 1 0.5340 0.0000 0.0040 50.500 0.22 3.02 -2.80 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4308 0.4795 0.0897 1 1 0.4285 0.4796 0.0919 1 1 0.4252 0.4799 0.0950
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.050 1 -1 1 1048 192 856 94 0 5 0 93 2 0 850 0 4 0.4896 0.0023 0.0070 37.400 1.17 1.32 -0.15 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3357 0.5655 0.0988 1 1 0.3396 0.5609 0.0996 1 1 0.3445 0.5550 0.1005
chr16 1999881 G GTCC 0.177864 0.050 1 3 2 627 109 518 92 2 12 0 3 0 0 517 0 1 0.8440 0.0000 0.0019 8.083 0.96 3.33 -2.38 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0672 0.9328 0.0000 0 0 0.7646 0.2354 0.0000 0 0 0.9087 0.0913 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 503 97 406 0 0 1 0 96 0 0 405 0 1 0.0000 0.0000 0.0025 96.000 6.74 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.050 1 -1 6 503 97 406 0 0 1 0 96 0 0 405 0 1 0.0000 0.0000 0.0025 96.000 6.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 3028415 A AG 0.002468 0.050 1 1 1 806 192 614 109 0 2 0 81 0 0 614 0 0 0.5677 0.0000 0.0000 95.000 0.55 1.81 -1.26 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7594 0.2405 0.0001 1 0 0.7527 0.2471 0.0001 1 0 0.7437 0.2562 0.0001
chr16 4702106 ACTG A 0.023057 0.050 1 -3 1 313 135 178 109 0 16 0 10 0 0 178 0 0 0.8074 0.0000 0.0000 7.438 0.24 3.60 -3.36 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4397 0.5603 0.0000 0 0 0.9336 0.0664 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.050 1 -3 1 433 104 329 60 1 3 0 40 0 0 329 0 0 0.5769 0.0000 0.0000 50.500 0.23 3.10 -2.87 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4419 0.4667 0.0913 1 1 0.4326 0.4707 0.0967 1 1 0.4201 0.4758 0.1041
chr16 11915673 C CCCG 0.170317 0.050 1 3 1 415 113 302 36 1 39 3 34 5 1 288 3 5 0.3186 0.0166 0.0464 1.897 1.36 3.76 -2.40 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3689 0.5407 0.0904 1 1 0.3714 0.5382 0.0904 1 1 0.3746 0.5350 0.0904
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.050 1 -2 1 185 46 139 0 0 1 0 45 0 0 139 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 45.000 2.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr16 24572391 TAAAGAG T 0.075097 0.050 1 -6 1 584 101 483 60 0 4 0 37 0 0 483 0 0 0.5941 0.0000 0.0000 24.250 0.78 5.59 -4.81 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7149 0.2791 0.0060 1 0 0.7075 0.2860 0.0065 1 0 0.6975 0.2954 0.0071
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.050 1 -27 1 948 180 768 78 2 41 0 59 0 0 768 0 0 0.4333 0.0000 0.0000 3.390 0.90 12.15 -11.26 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5969 0.3680 0.0351 1 0 0.5892 0.3733 0.0375 1 0 0.5788 0.3803 0.0410
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.050 1 3 1 630 147 483 68 0 8 1 70 0 0 482 0 1 0.4626 0.0000 0.0021 17.375 0.40 3.27 -2.87 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2269 0.5475 0.2256 1 1 0.2302 0.5443 0.2255 1 1 0.2345 0.5402 0.2252
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.050 1 1 1 133 75 58 0 0 8 1 66 0 0 58 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.375 2.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1567 0.8433 2 2 0.0000 0.1612 0.8388 2 2 0.0000 0.1675 0.8325
chr16 51141744 C CGCT 0.500000 0.050 1 3 2 1071 253 818 114 11 38 0 90 0 1 815 2 0 0.4506 0.0000 0.0037 5.632 0.56 3.23 -2.67 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6551 0.3216 0.0232 1 0 0.6437 0.3303 0.0259 1 0 0.6280 0.3420 0.0300
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.050 1 -1 1 444 91 353 44 2 16 2 27 0 0 351 1 1 0.4835 0.0000 0.0057 4.625 0.70 2.63 -1.93 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4378 0.4612 0.1010 1 1 0.4310 0.4638 0.1052 1 1 0.4219 0.4672 0.1109
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.050 1 -3 2 1086 317 769 134 1 49 10 123 0 0 769 0 0 0.4227 0.0000 0.0000 5.429 0.47 3.25 -2.78 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2308 0.5797 0.1895 1 1 0.2332 0.5738 0.1930 1 1 0.2362 0.5663 0.1975
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.050 1 -6 2 283 124 159 3 0 22 0 99 0 0 158 0 1 0.0242 0.0000 0.0063 4.636 4.33 8.03 -3.70 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9154 0.0846 2 2 0.0000 0.3864 0.6136 2 2 0.0000 0.2172 0.7828
chr16 84236959 G GCCAGCTCCT 0.500000 0.050 1 9 2 717 191 526 152 0 35 0 4 0 0 526 0 0 0.7958 0.0000 0.0000 4.457 0.18 7.00 -6.82 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0627 0.9373 0.0000 0 0 0.7459 0.2541 0.0000 0 0 0.8963 0.1037 0.0000
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.050 1 -2 1 696 142 554 0 1 6 7 128 0 0 548 1 5 0.0000 0.0000 0.0108 26.800 8.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0341 0.9659 2 2 0.0000 0.0353 0.9647 2 2 0.0000 0.0375 0.9625
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.050 1 -1 2 692 138 554 0 1 5 8 124 0 0 547 2 5 0.0000 0.0000 0.0126 26.400 8.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0338 0.9662 2 2 0.0000 0.0356 0.9644 2 2 0.0000 0.0384 0.9616
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 697 140 557 0 0 4 2 134 0 1 540 10 6 0.0000 0.0000 0.0305 45.000 8.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0300 0.9700 2 2 0.0000 0.0307 0.9693 2 2 0.0000 0.0323 0.9677
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.050 1 -6 1 765 148 617 0 0 11 0 137 0 1 609 0 7 0.0000 0.0000 0.0130 12.455 6.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0299 0.9701 2 2 0.0000 0.0315 0.9685 2 2 0.0000 0.0340 0.9660
chr16 88723258 G GCCTGCT 0.500000 0.050 1 6 2 754 170 584 79 1 24 0 66 0 0 581 0 3 0.4647 0.0000 0.0051 6.083 0.33 5.52 -5.19 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3663 0.5102 0.1235 1 1 0.3630 0.5094 0.1276 1 1 0.3586 0.5083 0.1332
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.050 1 4 2 166 69 97 5 0 1 0 63 0 0 96 0 1 0.0725 0.0000 0.0103 68.000 0.40 3.70 -3.30 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.8533 0.1467 2 1 0.0000 0.5802 0.4198
chr16 89850471 C CGAG 0.500000 0.050 1 3 3 495 138 357 61 1 8 1 67 0 0 356 0 1 0.4420 0.0000 0.0028 16.250 0.26 3.19 -2.93 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1585 0.5254 0.3162 1 1 0.1620 0.5234 0.3146 1 1 0.1666 0.5210 0.3124
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.050 1 -1 2 383 123 260 63 1 4 0 55 0 0 260 0 0 0.5122 0.0000 0.0000 29.750 0.30 1.36 -1.06 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2371 0.5535 0.2094 1 1 0.2346 0.5510 0.2144 1 1 0.2312 0.5478 0.2210
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.050 1 3 1 747 216 531 20 0 35 2 159 0 0 529 0 2 0.0926 0.0000 0.0038 5.171 1.10 3.04 -1.94 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9470 0.0530
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.050 1 9 2 1325 368 957 15 27 89 20 217 0 1 933 4 19 0.0408 0.0000 0.0251 3.184 5.73 6.08 -0.35 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.050 1 -6 2 1328 409 919 312 8 78 0 11 0 0 918 0 1 0.7628 0.0000 0.0011 4.244 5.20 6.91 -1.71 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.9053 0.0947 0.0000 0 0 0.9963 0.0037 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.050 1 -6 1 1038 308 730 234 0 61 1 12 0 0 728 0 2 0.7597 0.0000 0.0027 4.333 1.09 7.25 -6.16 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1249 0.8751 0.0000 0 0 0.9050 0.0950 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.050 1 9 2 390 98 292 47 0 10 0 41 0 0 292 0 0 0.4796 0.0000 0.0000 8.800 0.47 8.59 -8.12 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3117 0.5160 0.1722 1 1 0.3100 0.5148 0.1752 1 1 0.3076 0.5133 0.1792
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.050 1 -3 1 569 245 324 81 2 35 6 121 0 0 324 0 0 0.3306 0.0000 0.0000 6.000 0.37 3.18 -2.81 45 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0098 0.2243 0.7659 1 2 0.0114 0.2353 0.7533 1 2 0.0139 0.2504 0.7356
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.050 1 -2 1 950 277 673 126 3 15 23 110 0 0 673 0 0 0.4549 0.0000 0.0000 18.538 0.30 4.25 -3.95 36 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2349 0.5745 0.1905 1 1 0.2371 0.5690 0.1939 1 1 0.2398 0.5620 0.1982
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.050 1 -1 1 951 276 675 127 14 25 12 98 0 0 675 0 0 0.4601 0.0000 0.0000 12.450 0.29 3.91 -3.62 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6214 0.3515 0.0271 1 0 0.6111 0.3588 0.0301 1 0 0.5969 0.3687 0.0344
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.050 1 3 1 828 194 634 183 0 6 0 5 0 2 632 0 0 0.9433 0.0000 0.0032 31.333 0.23 4.20 -3.97 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0290 0.9710 0.0000 0 0 0.7716 0.2284 0.0000 0 0 0.9290 0.0710 0.0000
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.050 1 18 3 248 66 182 0 0 19 1 46 0 0 171 0 11 0.0000 0.0000 0.0604 2.474 7.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1886 0.8114 2 2 0.0000 0.1931 0.8069 2 2 0.0000 0.1994 0.8006
chr17 30834937 ACAATGT A 0.500000 0.050 1 -6 1 811 165 646 159 0 2 0 4 0 0 646 0 0 0.9636 0.0000 0.0000 81.500 0.30 5.25 -4.95 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0738 0.9262 0.0000 0 0 0.7772 0.2228 0.0000 0 0 0.9109 0.0891 0.0000
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.050 1 -1 2 142 72 70 2 0 1 0 69 0 0 70 0 0 0.0278 0.0000 0.0000 71.000 0.00 1.39 -1.39 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8207 0.1793 2 2 0.0000 0.4093 0.5907 2 2 0.0000 0.2868 0.7132
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.050 1 -12 1 876 220 656 110 1 30 2 77 2 1 642 0 11 0.5000 0.0030 0.0213 6.552 2.71 11.55 -8.84 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5192 0.4273 0.0535 1 0 0.5111 0.4314 0.0575 1 0 0.5002 0.4367 0.0631
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.050 1 1 2 528 123 405 114 1 5 0 3 0 0 405 0 0 0.9268 0.0000 0.0000 23.400 0.36 1.00 -0.64 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1206 0.8794 0.0000 0 0 0.6964 0.3036 0.0000 0 0 0.8372 0.1628 0.0000
chr17 41302321 TGTACAGATGGTTG T 0.500000 0.050 1 -13 1 1129 251 878 12 0 8 1 230 0 0 850 0 28 0.0478 0.0000 0.0319 30.375 0.08 11.83 -11.74 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8357 0.1643 2 2 0.0000 0.1481 0.8519
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.050 1 -15 1 620 194 426 11 0 21 0 162 0 0 408 1 17 0.0567 0.0000 0.0423 8.238 0.36 14.38 -14.01 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9481 0.0519 2 2 0.0000 0.4431 0.5569
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.050 1 3 5 1659 375 1284 357 0 4 0 14 0 0 1284 0 0 0.9520 0.0000 0.0000 92.750 0.34 3.36 -3.02 103 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3672 0.6328 0.0000 0 0 0.9663 0.0337 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.050 1 -3 2 674 177 497 131 5 32 1 8 0 2 495 0 0 0.7401 0.0000 0.0040 4.531 1.09 6.75 -5.66 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0701 0.9299 0.0000 0 1 0.4932 0.5068 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.050 1 -4 1 268 90 178 8 0 5 0 77 0 0 177 0 1 0.0889 0.0000 0.0056 17.000 0.00 4.29 -4.29 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9683 0.0317 2 1 0.0000 0.7508 0.2492
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.050 1 9 2 463 109 354 90 0 16 0 3 0 0 354 0 0 0.8257 0.0000 0.0000 5.812 0.30 7.00 -6.70 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0671 0.9329 0.0000 0 0 0.5538 0.4462 0.0000 0 0 0.7393 0.2607 0.0000
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.050 1 3 5 965 240 725 101 0 9 1 129 0 0 723 0 2 0.4208 0.0000 0.0028 25.667 0.19 3.19 -3.01 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0288 0.3544 0.6168 1 2 0.0319 0.3617 0.6064 1 2 0.0364 0.3716 0.5921
chr17 58309246 G GTCCTCCTCT 0.500000 0.050 1 9 1 648 184 464 153 2 26 1 2 0 0 464 0 0 0.8315 0.0000 0.0000 6.000 0.56 6.00 -5.44 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6132 0.3868 0.0000 0 0 0.9119 0.0881 0.0000 0 0 0.9453 0.0547 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.050 1 6 2 411 144 267 8 0 32 0 104 0 0 266 0 1 0.0556 0.0000 0.0037 3.500 0.12 5.33 -5.20 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9401 0.0599 2 1 0.0000 0.6120 0.3880
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.050 1 9 2 579 110 469 0 0 8 0 102 0 0 460 0 9 0.0000 0.0000 0.0192 12.750 8.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0577 0.9423 2 2 0.0000 0.0608 0.9392 2 2 0.0000 0.0653 0.9347
chr17 75616380 CAGG C 0.500000 0.050 1 -3 1 1290 299 991 205 5 70 3 16 0 0 991 0 0 0.6856 0.0000 0.0000 3.257 0.80 3.50 -2.70 119 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1315 0.8685 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.050 1 -30 1 2459 584 1875 25 8 76 17 458 0 3 1848 6 18 0.0428 0.0000 0.0144 6.730 2.04 6.23 -4.19 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 2 0.0000 0.3639 0.6361
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.050 1 -3 1 2393 656 1737 27 0 30 9 590 0 0 1573 17 147 0.0412 0.0000 0.0944 20.733 2.07 4.55 -2.48 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.2879 0.7121 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.050 1 -6 7 265 110 155 1 0 14 0 95 0 0 150 0 5 0.0091 0.0000 0.0323 6.857 0.00 5.67 -5.67 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2924 0.7076 2 2 0.0000 0.1421 0.8579 2 2 0.0000 0.1166 0.8834
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.050 1 6 1 1138 194 944 177 0 15 0 2 0 0 943 1 0 0.9124 0.0000 0.0011 11.933 0.87 6.00 -5.13 75 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7466 0.2534 0.0000 0 0 0.9495 0.0505 0.0000 0 0 0.9682 0.0318 0.0000
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.050 1 -3 2 594 164 430 157 1 0 0 6 0 0 430 0 0 0.9573 0.0000 0.0000 164.000 0.24 3.33 -3.10 81 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0030 0.9970 0.0000 0 1 0.4722 0.5278 0.0000 0 0 0.8259 0.1741 0.0000
chr17 81647906 T TTAAC 0.500000 0.050 1 4 3 495 117 378 2 0 1 1 113 0 0 370 0 8 0.0171 0.0000 0.0212 116.000 0.50 4.24 -3.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5486 0.4514 2 2 0.0000 0.1580 0.8420 2 2 0.0000 0.1015 0.8985
chr17 82316265 GCAGGGAGGGCAGAGGCTGCTGGCGGGT G 0.500000 0.050 1 -27 2 575 176 399 94 0 26 0 56 0 0 387 0 12 0.5341 0.0000 0.0301 5.769 0.34 18.84 -18.50 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5698 0.3862 0.0440 1 0 0.5597 0.3926 0.0477 1 0 0.5459 0.4010 0.0530
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.050 1 -1 7 345 76 269 45 1 1 1 28 0 0 269 0 0 0.5921 0.0000 0.0000 74.000 0.11 1.71 -1.60 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5307 0.4073 0.0620 1 0 0.5229 0.4119 0.0652 1 0 0.5125 0.4178 0.0697
chr18 8786007 CCGAGCCGCGCGGGAG C 0.007603 0.050 1 -15 1 273 72 201 43 1 1 0 27 0 0 195 0 6 0.5972 0.0000 0.0299 71.000 2.21 14.15 -11.94 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6078 0.3906 0.0016 1 0 0.6045 0.3939 0.0016 1 0 0.6000 0.3983 0.0017
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.050 1 3 1 217 90 127 0 0 3 0 87 0 0 122 0 5 0.0000 0.0000 0.0394 29.000 3.86 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.050 1 -9 2 353 73 280 62 1 6 0 4 0 0 279 0 1 0.8493 0.0000 0.0036 11.167 1.19 9.00 -7.81 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 1 0.3748 0.6252 0.0000 0 0 0.7163 0.2837 0.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.050 1 4 1 198 103 95 55 0 0 1 47 0 0 95 0 0 0.5340 0.0000 0.0000 103.000 0.53 4.87 -4.35 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2963 0.5247 0.1790 1 1 0.2943 0.5231 0.1826 1 1 0.2915 0.5211 0.1874
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.050 1 3 1 334 155 179 73 0 9 0 73 0 0 178 0 1 0.4710 0.0000 0.0056 16.222 0.21 4.03 -3.82 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2165 0.5445 0.2390 1 1 0.2185 0.5411 0.2403 1 1 0.2211 0.5369 0.2420
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.050 1 -9 2 540 145 395 57 0 5 1 82 0 0 395 0 0 0.3931 0.0000 0.0000 28.000 1.40 9.01 -7.61 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0441 0.3787 0.5771 1 2 0.0478 0.3856 0.5665 1 2 0.0531 0.3947 0.5522
chr18 54224214 T TGCC 0.500000 0.050 1 3 1 321 64 257 48 1 12 0 3 0 0 257 0 0 0.7500 0.0000 0.0000 4.333 1.54 4.33 -2.79 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0250 0.9750 0.0000 0 1 0.3111 0.6889 0.0000 0 0 0.5150 0.4850 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.050 1 -3 2 260 141 119 4 0 6 1 130 0 0 119 0 0 0.0284 0.0000 0.0000 22.500 0.50 3.19 -2.69 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9620 0.0380 2 2 0.0000 0.3637 0.6363 2 2 0.0000 0.1606 0.8394
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.050 1 -15 2 809 182 627 4 0 8 2 168 0 0 607 0 20 0.0220 0.0000 0.0319 21.750 0.25 13.35 -13.10 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8519 0.1481 2 2 0.0000 0.1177 0.8823 2 2 0.0000 0.0445 0.9555
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.050 1 3 6 427 73 354 32 0 9 2 30 0 1 351 1 1 0.4384 0.0000 0.0085 7.111 2.69 5.27 -2.58 4 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.2312 0.5201 0.2486 1 1 0.2323 0.5186 0.2491 1 1 0.2337 0.5167 0.2496
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.050 1 3 1 173 65 108 0 0 4 0 61 0 0 105 0 3 0.0000 0.0000 0.0278 15.250 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1665 0.8335 2 2 0.0000 0.1710 0.8290 2 2 0.0000 0.1774 0.8226
chr18 74556356 G GTGCTGC 0.500000 0.050 1 6 1 150 81 69 69 0 6 0 6 0 0 68 0 1 0.8519 0.0000 0.0145 12.500 0.38 6.00 -5.62 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0487 0.9513 0.0000 0 1 0.2795 0.7205 0.0000
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.050 1 3 4 421 144 277 62 0 13 1 68 0 0 277 0 0 0.4306 0.0000 0.0000 10.077 0.92 3.82 -2.90 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1585 0.5254 0.3161 1 1 0.1620 0.5234 0.3146 1 1 0.1666 0.5210 0.3124
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.050 1 24 3 409 180 229 120 6 15 5 34 0 1 228 0 0 0.6667 0.0000 0.0044 12.462 2.32 6.65 -4.33 12 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9813 0.0187 0.0000 1 0 0.9781 0.0218 0.0001 0 1 0.0718 0.9282 0.0000
chr19 932466 TGAG T 0.006773 0.050 1 -3 1 426 126 300 106 1 11 1 7 0 0 300 0 0 0.8413 0.0000 0.0000 10.455 0.73 3.71 -2.99 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0052 0.9948 0.0000 0 0 0.9091 0.0909 0.0000 0 0 0.9899 0.0101 0.0000
chr19 1004897 G GCGTT 0.284715 0.050 1 4 1 596 88 508 50 0 1 0 37 0 0 505 0 3 0.5682 0.0000 0.0059 87.000 0.34 5.46 -5.12 4 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4762 0.4533 0.0705 1 0 0.4726 0.4547 0.0727 1 0 0.4677 0.4566 0.0757
chr19 1009186 GAGC G 0.092678 0.050 1 -3 2 531 116 415 101 2 8 1 4 0 0 415 0 0 0.8707 0.0000 0.0000 13.500 0.33 3.00 -2.67 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0405 0.9595 0.0000 0 0 0.8176 0.1824 0.0000 0 0 0.9477 0.0523 0.0000
chr19 1009551 GGCCCCCGCGGAGGCCCCACCACACTCT G 0.217031 0.050 1 -27 1 385 88 297 51 1 4 0 32 0 0 296 0 1 0.5795 0.0000 0.0034 21.000 0.29 17.38 -17.08 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6265 0.3470 0.0265 1 0 0.6190 0.3528 0.0282 1 0 0.6091 0.3604 0.0305
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.050 1 -3 2 241 142 99 77 0 1 0 64 0 0 98 0 1 0.5423 0.0000 0.0101 141.000 0.36 3.19 -2.82 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5172 0.4374 0.0453 1 0 0.5139 0.4389 0.0471 1 0 0.5094 0.4410 0.0496
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.050 1 -3 4 308 99 209 0 0 17 50 32 0 0 206 2 1 0.0000 0.0000 0.0144 4.824 4.19 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1169 0.8831 2 2 0.0000 0.1214 0.8786 2 2 0.0000 0.1278 0.8722
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.050 1 -6 4 308 102 206 0 2 45 3 52 0 0 204 0 2 0.0000 0.0000 0.0097 1.222 7.48 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6708 0.3292 2 1 0.0000 0.6656 0.3344 2 1 0.0000 0.6625 0.3375
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.050 1 -12 4 308 109 199 41 1 56 2 9 0 0 199 0 0 0.3761 0.0000 0.0000 1.020 3.37 11.44 -8.08 27 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6061 0.3887 0.0052 0 1 0.0618 0.9378 0.0005 0 1 0.2101 0.7899 0.0000
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.050 1 3 1 802 180 622 145 8 23 0 4 0 0 622 0 0 0.8056 0.0000 0.0000 6.826 0.46 3.00 -2.54 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2910 0.7090 0.0000 0 0 0.9473 0.0527 0.0000 0 0 0.9814 0.0186 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.050 1 -3 1 434 133 301 71 0 2 0 60 3 0 297 0 1 0.5338 0.0100 0.0133 65.500 1.08 3.17 -2.08 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5744 0.4042 0.0214 1 0 0.5710 0.4067 0.0223 1 0 0.5662 0.4102 0.0236
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.050 1 -12 2 614 162 452 12 0 15 1 134 0 0 444 0 8 0.0741 0.0000 0.0177 9.800 0.67 11.01 -10.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9954 0.0046 2 1 0.0000 0.8717 0.1283
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.050 1 5 3 303 88 215 81 0 5 0 2 0 0 214 0 1 0.9205 0.0000 0.0047 16.600 0.33 6.00 -5.67 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1087 0.8913 0.0000 0 0 0.6790 0.3210 0.0000 0 0 0.8295 0.1705 0.0000
chr19 11447525 A AGAG 0.036742 0.050 1 3 1 877 301 576 106 127 54 0 14 0 6 570 0 0 0.3522 0.0000 0.0104 4.519 0.56 3.36 -2.80 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4646 0.5354 0.0000 0 0 0.9784 0.0216 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.050 1 -3 1 878 300 578 122 2 45 11 120 0 0 571 1 6 0.4067 0.0000 0.0121 5.644 0.85 3.92 -3.07 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1399 0.5782 0.2819 1 1 0.1462 0.5744 0.2793 1 1 0.1547 0.5696 0.2757
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.050 1 -6 1 423 141 282 48 0 33 0 60 1 0 279 0 2 0.3404 0.0035 0.0106 3.273 1.27 6.87 -5.60 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1762 0.5474 0.2764 1 1 0.1820 0.5461 0.2719 1 1 0.1897 0.5444 0.2660
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.050 1 3 1 588 130 458 0 1 3 0 126 0 0 453 0 5 0.0000 0.0000 0.0109 42.000 3.48 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr19 16688246 CACG C 0.007764 0.050 1 -3 2 235 96 139 50 0 4 1 41 0 0 139 0 0 0.5208 0.0000 0.0000 23.000 0.32 3.46 -3.14 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5673 0.4307 0.0020 1 0 0.5656 0.4323 0.0021 1 0 0.5633 0.4346 0.0021
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.050 1 -4 1 421 79 342 8 15 17 11 28 0 0 342 0 0 0.1013 0.0000 0.0000 11.200 0.00 3.86 -3.86 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2417 0.5863 0.1719 1 1 0.2480 0.5840 0.1680 1 1 0.2564 0.5807 0.1628
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.050 1 -3 1 97 36 61 16 0 2 0 18 0 0 61 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 17.000 0.19 4.33 -4.15 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3606 0.5240 0.1154 1 1 0.3623 0.5227 0.1151 1 1 0.3644 0.5211 0.1146
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.050 1 1 1 875 185 690 0 2 4 5 174 0 0 648 7 35 0.0000 0.0000 0.0609 45.000 2.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr19 23744939 CCA C 0.187747 0.050 1 -2 4 813 193 620 180 2 7 0 4 0 0 620 0 0 0.9326 0.0000 0.0000 26.571 0.38 2.00 -1.62 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3820 0.6180 0.0000 0 0 0.9638 0.0362 0.0000 0 0 0.9871 0.0129 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.050 1 -3 1 313 84 229 1 0 9 3 71 0 0 229 0 0 0.0119 0.0000 0.0000 8.333 0.00 3.11 -3.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1370 0.8630 2 2 0.0000 0.0591 0.9409 2 2 0.0000 0.0469 0.9531
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.050 1 3 1 571 144 427 4 1 5 0 134 0 0 422 0 5 0.0278 0.0000 0.0117 27.800 1.00 3.34 -2.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9644 0.0356 2 2 0.0000 0.2320 0.7680 2 2 0.0000 0.0727 0.9273
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.050 1 -51 2 580 272 308 243 0 28 0 1 0 0 306 0 2 0.8934 0.0000 0.0065 8.714 0.31 0.00 0.31 51 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9448 0.0552 0.0000 0 0 0.9964 0.0036 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr19 35720472 CAAG C 0.035298 0.050 1 -3 1 760 163 597 153 1 3 1 5 0 0 597 0 0 0.9387 0.0000 0.0000 53.333 0.59 2.60 -2.01 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0799 0.9201 0.0000 0 0 0.9579 0.0421 0.0000 0 0 0.9917 0.0083 0.0000
chr19 37894973 TGGA T 0.043831 0.050 1 -3 1 724 141 583 134 0 5 0 2 0 0 583 0 0 0.9504 0.0000 0.0000 27.200 0.22 3.50 -3.28 22 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9604 0.0396 0.0000 0 0 0.9936 0.0064 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr19 38304906 TGAA T 0.163680 0.050 1 -3 1 381 90 291 39 0 5 0 46 0 0 291 0 0 0.4333 0.0000 0.0000 17.000 0.69 3.67 -2.98 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3060 0.5742 0.1198 1 1 0.3108 0.5708 0.1184 1 1 0.3169 0.5664 0.1166
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.050 1 -2 1 275 29 246 0 0 2 26 1 0 0 246 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 12.000 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1251 0.8749 2 2 0.0000 0.1266 0.8734 2 2 0.0000 0.1286 0.8714
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.050 1 2 2 274 29 245 0 0 19 8 2 0 0 245 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.571 2.50 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1544 0.8456 2 2 0.0000 0.1555 0.8445 2 2 0.0000 0.1570 0.8430
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.050 1 -6 1 469 137 332 63 8 5 0 61 0 0 332 0 0 0.4599 0.0000 0.0000 25.000 0.24 5.89 -5.65 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3056 0.5289 0.1655 1 1 0.3034 0.5271 0.1695 1 1 0.3004 0.5248 0.1748
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.050 1 3 1 300 105 195 103 0 0 0 2 0 0 195 0 0 0.9810 0.0000 0.0000 105.000 0.50 4.00 -3.50 17 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9227 0.0773 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000 0 0 0.9924 0.0076 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.050 1 -6 1 385 120 265 114 0 1 0 5 0 0 264 0 1 0.9500 0.0000 0.0038 119.000 0.35 7.20 -6.85 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.2980 0.7020 0.0000 0 0 0.6989 0.3011 0.0000
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.050 1 -3 2 526 143 383 12 0 4 1 126 0 0 379 0 4 0.0839 0.0000 0.0104 34.500 0.42 3.14 -2.73 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9858 0.0142 2 1 0.0000 0.6846 0.3154
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.050 1 -1 2 520 151 369 149 0 0 0 2 0 0 369 0 0 0.9868 0.0000 0.0000 151.000 0.36 3.00 -2.64 11 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9065 0.0935 0.0000 0 0 0.9837 0.0163 0.0000 0 0 0.9899 0.0101 0.0000
chr19 46493759 C CCGGCCT 0.138319 0.050 1 6 4 353 89 264 4 0 16 2 67 0 0 262 0 2 0.0449 0.0000 0.0076 4.562 1.75 6.33 -4.58 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9400 0.0600 2 1 0.0000 0.8342 0.1658
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.050 1 -3 1 483 101 382 59 1 3 1 37 0 0 382 0 0 0.5842 0.0000 0.0000 32.667 0.39 3.73 -3.34 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6924 0.2974 0.0102 1 0 0.6850 0.3040 0.0110 1 0 0.6750 0.3130 0.0121
chr19 48231760 C CTT 0.055045 0.050 1 2 1 117 29 88 12 0 0 0 17 0 0 88 0 0 0.4138 0.0000 0.0000 29.000 0.17 2.65 -2.48 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4001 0.5617 0.0382 1 1 0.4031 0.5591 0.0378 1 1 0.4071 0.5557 0.0372
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.050 1 1 1 207 90 117 40 1 9 1 39 0 0 117 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 8.889 0.25 1.56 -1.31 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4043 0.5167 0.0790 1 1 0.4054 0.5151 0.0795 1 1 0.4067 0.5132 0.0801
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.050 1 -3 1 1049 271 778 94 6 59 9 103 0 2 768 3 5 0.3469 0.0000 0.0129 3.684 0.84 3.79 -2.95 24 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1086 0.5329 0.3585 1 1 0.1144 0.5321 0.3535 1 1 0.1222 0.5310 0.3467
chr19 49428625 A AAC 0.009419 0.050 1 2 1 240 61 179 36 0 0 0 25 0 0 176 0 3 0.5902 0.0000 0.0168 61.000 0.36 8.00 -7.64 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5750 0.4226 0.0025 1 0 0.5726 0.4248 0.0025 1 0 0.5695 0.4279 0.0026
chr19 49428630 GACGC G 0.009533 0.050 1 -4 2 238 64 174 40 0 0 1 23 0 0 169 1 4 0.6250 0.0000 0.0287 64.000 0.38 8.35 -7.97 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6100 0.3880 0.0020 1 0 0.6065 0.3915 0.0020 1 0 0.6017 0.3962 0.0021
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.050 1 -6 2 619 182 437 85 0 36 0 61 0 0 433 1 3 0.4670 0.0000 0.0092 4.056 1.52 7.36 -5.84 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5690 0.3885 0.0425 1 0 0.5615 0.3931 0.0454 1 0 0.5512 0.3994 0.0494
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.050 1 3 2 671 141 530 5 1 3 60 72 0 0 523 0 7 0.0355 0.0000 0.0132 46.000 0.80 3.10 -2.30 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9932 0.0068 2 1 0.0000 0.5127 0.4873 2 2 0.0000 0.1886 0.8114
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.050 1 3 3 669 147 522 0 0 11 75 61 0 0 522 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 12.182 3.03 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0643 0.9357 2 2 0.0000 0.0685 0.9315 2 2 0.0000 0.0747 0.9253
chr19 50725314 C CGCCCA 0.002025 0.050 1 5 2 494 122 372 56 0 11 0 55 0 0 368 0 4 0.4590 0.0000 0.0108 10.091 0.46 5.11 -4.64 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4273 0.5715 0.0012 1 1 0.4313 0.5675 0.0012 1 1 0.4364 0.5624 0.0012
chr19 51354360 T TG 0.039193 0.050 1 1 2 563 143 420 72 0 6 0 65 0 0 420 0 0 0.5035 0.0000 0.0000 22.833 0.33 1.22 -0.88 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5288 0.4604 0.0108 1 0 0.5285 0.4604 0.0111 1 0 0.5279 0.4606 0.0115
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.050 1 1 1 583 179 404 85 0 5 9 80 0 0 403 1 0 0.4749 0.0000 0.0025 34.800 0.45 2.80 -2.35 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1180 0.5303 0.3517 1 1 0.1203 0.5274 0.3524 1 1 0.1232 0.5237 0.3530
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.050 1 -2 1 199 90 109 51 0 0 0 39 0 0 107 0 2 0.5667 0.0000 0.0183 90.000 0.25 2.05 -1.80 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2262 0.5553 0.2185 1 1 0.2230 0.5532 0.2238 1 1 0.2187 0.5505 0.2308
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.050 1 -1 2 503 166 337 91 0 6 0 69 0 0 337 0 0 0.5482 0.0000 0.0000 26.667 0.49 1.94 -1.45 63 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5766 0.3828 0.0406 1 0 0.5686 0.3878 0.0435 1 0 0.5577 0.3946 0.0477
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.050 1 3 1 572 136 436 76 0 4 0 56 0 0 432 0 4 0.5588 0.0000 0.0092 33.000 0.12 3.34 -3.22 42 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4989 0.4362 0.0649 1 0 0.4930 0.4388 0.0682 1 0 0.4850 0.4423 0.0727
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.050 1 3 2 1196 298 898 290 0 1 0 7 0 0 898 0 0 0.9732 0.0000 0.0000 297.000 0.30 2.71 -2.42 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0234 0.9766 0.0000 0 0 0.9464 0.0536 0.0000 0 0 0.9914 0.0086 0.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.050 1 -1 5 664 163 501 97 0 13 1 52 0 0 501 0 0 0.5951 0.0000 0.0000 11.538 0.35 2.92 -2.57 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6913 0.2902 0.0185 1 0 0.6748 0.3038 0.0214 1 0 0.6521 0.3221 0.0258
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.050 1 9 2 442 122 320 61 1 20 0 40 0 0 314 0 6 0.5000 0.0000 0.0187 5.100 0.33 7.97 -7.65 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4471 0.4615 0.0915 1 1 0.4403 0.4639 0.0957 1 1 0.4313 0.4671 0.1016
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.050 1 -24 1 657 142 515 6 1 25 0 110 0 0 489 0 26 0.0423 0.0000 0.0505 4.640 2.00 18.65 -16.65 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9903 0.0097 2 2 0.0000 0.2483 0.7517 2 2 0.0000 0.0569 0.9431
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.050 1 3 4 894 242 652 115 0 23 0 104 0 0 648 0 4 0.4752 0.0000 0.0061 9.522 0.70 4.13 -3.43 73 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3960 0.5213 0.0826 1 1 0.3966 0.5183 0.0850 1 1 0.3971 0.5147 0.0882
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.050 1 3 1 586 98 488 57 0 5 0 36 0 0 488 0 0 0.5816 0.0000 0.0000 18.600 1.30 3.53 -2.23 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4991 0.4281 0.0727 1 0 0.4895 0.4333 0.0773 1 0 0.4766 0.4399 0.0836
chr19 57639970 TG T 0.349431 0.050 1 -1 1 164 79 85 77 0 0 0 2 0 0 85 0 0 0.9747 0.0000 0.0000 79.000 0.08 1.00 -0.92 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3346 0.6654 0.0000 0 0 0.7679 0.2321 0.0000 0 0 0.8500 0.1500 0.0000
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.050 1 -2 1 330 130 200 74 0 6 1 49 0 0 199 0 1 0.5692 0.0000 0.0050 20.667 0.04 2.06 -2.02 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5064 0.4279 0.0657 1 0 0.4964 0.4333 0.0703 1 0 0.4830 0.4402 0.0768
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.050 1 2 1 352 94 258 12 0 1 3 78 0 0 255 0 3 0.1277 0.0000 0.0116 93.000 0.08 8.91 -8.83 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.9512 0.0488
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.050 1 -2 1 352 96 256 12 1 5 4 74 0 0 253 0 3 0.1250 0.0000 0.0117 18.000 0.08 9.00 -8.92 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9554 0.0446
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.050 1 -3 4 353 123 230 15 0 0 0 108 0 0 224 0 6 0.1220 0.0000 0.0261 123.000 0.13 8.29 -8.15 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9682 0.0318
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.050 1 5 1 376 159 217 139 0 17 0 3 0 0 217 0 0 0.8742 0.0000 0.0000 8.353 0.27 6.00 -5.73 41 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6167 0.3833 0.0000 0 0 0.9644 0.0356 0.0000 0 0 0.9836 0.0164 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.050 1 1 2 239 91 148 0 0 5 0 86 0 0 147 0 1 0.0000 0.0000 0.0068 17.200 1.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0649 0.9351 2 2 0.0000 0.0676 0.9324 2 2 0.0000 0.0715 0.9285
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.050 1 -6 2 726 190 536 86 0 3 0 101 0 0 533 0 3 0.4526 0.0000 0.0056 62.333 0.17 6.06 -5.88 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0876 0.4885 0.4239 1 1 0.0925 0.4897 0.4178 1 1 0.0992 0.4912 0.4096
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.050 1 3 1 498 154 344 0 1 1 1 151 0 0 330 0 14 0.0000 0.0000 0.0407 152.000 3.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0099 0.9901 2 2 0.0000 0.0108 0.9892
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.050 1 -9 4 243 91 152 36 0 23 0 32 0 1 149 1 1 0.3956 0.0000 0.0197 2.957 2.61 10.06 -7.45 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2320 0.5253 0.2427 1 1 0.2315 0.5236 0.2449 1 1 0.2306 0.5215 0.2478
chr20 35627312 C CA 0.103940 0.050 1 1 1 164 69 95 35 0 3 0 31 0 0 94 0 1 0.5072 0.0000 0.0105 22.000 0.46 1.13 -0.67 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4694 0.4901 0.0405 1 1 0.4693 0.4898 0.0409 1 1 0.4690 0.4894 0.0415
chr20 35652818 A AGGGCCG 0.080534 0.050 1 6 2 849 218 631 92 0 38 0 88 0 0 631 0 0 0.4220 0.0000 0.0000 4.737 0.30 5.27 -4.97 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4606 0.5122 0.0272 1 1 0.4626 0.5097 0.0277 1 1 0.4649 0.5067 0.0284
chr20 38926679 C CGCG 0.081611 0.050 1 3 3 696 189 507 82 1 23 1 82 0 0 504 0 3 0.4339 0.0000 0.0059 7.545 0.60 3.00 -2.40 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3783 0.5779 0.0438 1 1 0.3830 0.5731 0.0439 1 1 0.3891 0.5670 0.0440
chr20 44065918 C CCCG 0.103979 0.050 1 3 4 498 196 302 169 0 22 0 5 0 0 302 0 0 0.8622 0.0000 0.0000 7.909 0.18 3.00 -2.82 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1476 0.8524 0.0000 0 0 0.9518 0.0482 0.0000 0 0 0.9872 0.0128 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.050 1 -3 2 534 150 384 68 0 5 0 77 0 0 382 0 2 0.4533 0.0000 0.0052 29.000 0.44 3.35 -2.91 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0926 0.4846 0.4229 1 1 0.0958 0.4845 0.4197 1 1 0.1002 0.4845 0.4153
chr20 45834376 CCGAGGACGA C 0.000314 0.050 1 -9 1 528 138 390 59 1 19 1 58 0 0 386 0 4 0.4275 0.0000 0.0103 6.211 0.68 8.36 -7.68 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4235 0.5764 0.0002 1 1 0.4277 0.5721 0.0002 1 1 0.4332 0.5667 0.0002
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.050 1 -3 2 944 298 646 117 1 39 6 135 0 0 646 0 0 0.3926 0.0000 0.0000 6.641 0.52 3.21 -2.69 9 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0368 0.4033 0.5599 1 2 0.0397 0.4068 0.5535 1 2 0.0439 0.4116 0.5445
chr20 45891618 TG T 0.009535 0.050 1 -1 1 950 288 662 141 11 128 0 8 0 0 662 0 0 0.4896 0.0000 0.0000 1.238 0.52 4.00 -3.48 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0041 0.9959 0.0000 0 0 0.8905 0.1095 0.0000 0 0 0.9880 0.0120 0.0000
chr20 45891620 CTG C 0.009541 0.050 1 -2 1 954 289 665 143 1 13 124 8 0 0 665 0 0 0.4948 0.0000 0.0000 12.154 0.52 4.00 -3.48 5 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8280 0.1718 0.0002 1 0 0.8207 0.1791 0.0002 1 0 0.8104 0.1893 0.0003
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.050 1 -3 2 563 252 311 111 6 32 7 96 1 0 309 0 1 0.4405 0.0032 0.0064 7.032 0.35 3.19 -2.84 33 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4638 0.4729 0.0634 1 1 0.4610 0.4726 0.0663 1 1 0.4571 0.4725 0.0704
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.050 1 3 1 431 113 318 58 0 8 0 47 0 0 317 0 1 0.5133 0.0000 0.0031 13.125 0.45 3.02 -2.57 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4998 0.4467 0.0534 1 0 0.4967 0.4481 0.0552 1 0 0.4925 0.4500 0.0575
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.050 1 -6 2 190 43 147 0 0 1 1 41 0 0 141 0 6 0.0000 0.0000 0.0408 42.000 6.63 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr20 63690337 GAGA G 0.005276 0.050 1 -3 2 857 212 645 202 1 5 0 4 0 0 645 0 0 0.9528 0.0000 0.0000 41.200 1.13 5.25 -4.12 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9784 0.0216 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr20 63861822 C CGGCCAGCTCGCTAGCTACGCGCT 0.012953 0.050 1 23 3 551 74 477 38 0 15 0 21 0 0 460 0 17 0.5135 0.0000 0.0356 3.933 1.05 13.67 -12.61 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4706 0.5232 0.0062 1 1 0.4724 0.5214 0.0062 1 1 0.4745 0.5192 0.0062
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.050 1 -1 1 299 138 161 75 0 1 0 62 0 0 161 0 0 0.5435 0.0000 0.0000 137.000 0.16 2.16 -2.00 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2585 0.5627 0.1788 1 1 0.2545 0.5606 0.1849 1 1 0.2490 0.5578 0.1931
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.050 1 6 4 752 185 567 82 0 5 0 98 0 0 563 0 4 0.4432 0.0000 0.0071 36.000 0.17 5.56 -5.39 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0650 0.4464 0.4886 1 2 0.0691 0.4493 0.4815 1 2 0.0749 0.4532 0.4719
chr21 33488442 CAATTA C 0.224085 0.050 1 -5 2 643 175 468 85 0 7 0 83 0 0 466 0 2 0.4857 0.0000 0.0043 24.000 0.16 5.14 -4.98 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3478 0.5517 0.1004 1 1 0.3508 0.5479 0.1013 1 1 0.3546 0.5430 0.1024
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.050 1 -30 1 799 197 602 116 1 15 2 63 2 2 597 1 0 0.5888 0.0033 0.0083 12.133 1.88 12.71 -10.83 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9035 0.0955 0.0011 1 0 0.8954 0.1033 0.0013 1 0 0.8838 0.1145 0.0017
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.050 1 3 2 245 114 131 45 0 3 0 66 0 0 131 0 0 0.3947 0.0000 0.0000 37.000 0.13 3.03 -2.90 19 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0516 0.3924 0.5560 1 2 0.0550 0.3978 0.5472 1 2 0.0598 0.4049 0.5353
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.050 1 1 2 347 48 299 0 0 5 0 43 0 0 298 0 1 0.0000 0.0000 0.0033 8.600 2.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.050 1 -15 2 627 130 497 64 4 14 2 46 0 0 496 0 1 0.4923 0.0000 0.0020 8.769 0.95 14.48 -13.53 6 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4537 0.4594 0.0870 1 1 0.4458 0.4625 0.0916 1 1 0.4353 0.4666 0.0981
chr21 44637708 TGTCTGCTGTGTGCCC T 0.168959 0.050 1 -15 2 634 124 510 62 1 8 1 52 0 0 510 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 14.375 0.95 12.88 -11.93 2 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5195 0.4409 0.0396 1 0 0.5168 0.4423 0.0409 1 0 0.5131 0.4442 0.0427
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.050 1 -9 7 392 166 226 1 2 12 2 149 0 0 226 0 0 0.0060 0.0000 0.0000 13.909 0.00 7.63 -7.63 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0088 0.9912 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.050 1 3 1 525 196 329 88 1 20 0 87 0 1 324 0 4 0.4490 0.0000 0.0152 8.800 0.92 2.82 -1.90 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2879 0.5599 0.1522 1 1 0.2911 0.5556 0.1532 1 1 0.2953 0.5502 0.1545
chr22 18609475 C CGG 0.080580 0.050 1 2 2 1524 136 1388 104 7 5 2 18 1 2 1384 0 1 0.7647 0.0007 0.0029 26.200 0.69 2.00 -1.31 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0681 0.9319 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.050 1 -3 3 210 88 122 43 0 8 1 36 0 0 118 0 4 0.4886 0.0000 0.0328 10.000 0.26 3.00 -2.74 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3876 0.5119 0.1005 1 1 0.3881 0.5106 0.1014 1 1 0.3886 0.5089 0.1026
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.050 1 -21 3 631 116 515 0 0 25 0 91 0 0 494 2 19 0.0000 0.0000 0.0408 3.640 15.68 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0083 0.9917 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0094 0.9906
chr22 27798945 T TTGCTGC 0.004832 0.050 1 6 1 1309 352 957 274 2 68 2 6 0 0 957 0 0 0.7784 0.0000 0.0000 4.147 0.99 3.83 -2.85 46 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9127 0.0873 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.050 1 -3 1 738 212 526 94 1 2 0 115 0 0 523 0 3 0.4434 0.0000 0.0057 105.000 0.33 3.97 -3.64 64 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0696 0.4723 0.4581 1 1 0.0747 0.4753 0.4500 1 1 0.0818 0.4792 0.4390
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.050 1 -2 3 702 235 467 217 1 6 0 11 0 0 467 0 0 0.9234 0.0000 0.0000 38.167 0.50 2.18 -1.68 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1296 0.8704 0.0000 0 0 0.7689 0.2311 0.0000
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.050 1 -6 2 489 251 238 16 0 42 0 193 0 0 233 0 5 0.0637 0.0000 0.0210 4.976 0.88 6.07 -5.19 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9142 0.0858
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.050 1 -21 6 605 150 455 137 3 7 0 3 0 0 455 0 0 0.9133 0.0000 0.0000 20.429 0.68 15.33 -14.65 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1665 0.8335 0.0000 0 0 0.7709 0.2291 0.0000 0 0 0.8814 0.1186 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.050 1 3 3 355 145 210 62 0 7 0 76 0 0 205 0 5 0.4276 0.0000 0.0238 23.000 0.34 2.96 -2.62 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0358 0.3790 0.5852 1 2 0.0381 0.3835 0.5784 1 2 0.0413 0.3896 0.5692
chr22 50547883 TAACCCCAGTCCC T 0.185453 0.050 1 -12 3 1004 223 781 193 6 19 0 5 0 1 780 0 0 0.8655 0.0000 0.0013 10.632 1.28 8.80 -7.52 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1593 0.8407 0.0000 0 0 0.9552 0.0448 0.0000 0 0 0.9879 0.0121 0.0000
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.050 1 -48 1 1047 290 757 266 3 15 0 6 2 0 751 0 4 0.9172 0.0026 0.0079 18.333 0.81 9.50 -8.69 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.7935 0.2065 0.0000 0 0 0.9840 0.0160 0.0000
631 rows