File Info

Filename
HG01513_x_HG01846_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/e3/14853f61d05227e293e70af0d050cb/HG01513_x_HG01846_FF_10.features.tsv
Size
144.8 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG01513_x_HG01846_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1708855 TTCCTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 304 135 169 79 0 9 0 47 0 0 169 0 0 0.5852 0.0000 0.0000 14.000 1.08 9.13 -8.05 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8641 0.1344 0.0015 1 0 0.8547 0.1434 0.0019 1 0 0.8410 0.1564 0.0026
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 375 131 244 62 4 12 1 52 0 0 240 0 4 0.4733 0.0000 0.0164 9.917 0.39 3.38 -3.00 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3774 0.5603 0.0623 1 1 0.3780 0.5551 0.0669 1 1 0.3780 0.5487 0.0733
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 512 188 324 90 1 24 0 73 0 0 322 0 2 0.4787 0.0000 0.0062 6.792 0.29 8.88 -8.59 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4943 0.4825 0.0232 1 0 0.4935 0.4805 0.0260 1 0 0.4912 0.4785 0.0303
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 269 108 161 104 0 1 0 3 0 0 161 0 0 0.9630 0.0000 0.0000 107.000 0.37 3.67 -3.30 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2032 0.7968 0.0000 0 0 0.8808 0.1192 0.0000 0 0 0.9578 0.0422 0.0000
chr1 2498647 G GGTGGGGGCC 0.500000 0.100 1 9 1 425 125 300 109 0 8 0 8 0 0 300 0 0 0.8720 0.0000 0.0000 14.625 0.56 8.50 -7.94 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0443 0.9557 0.0000 0 0 0.5388 0.4612 0.0000
chr1 10463171 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 496 158 338 148 0 3 0 7 0 0 338 0 0 0.9367 0.0000 0.0000 51.667 0.16 1.29 -1.13 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4860 0.5140 0.0000 0 0 0.9365 0.0635 0.0000
chr1 13778626 T TGAA 0.500000 0.100 1 3 1 478 122 356 61 37 17 1 6 0 0 356 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 4.059 0.74 3.17 -2.43 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1203 0.8797 0.0000 0 0 0.6128 0.3872 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 940 161 779 4 0 8 1 148 0 0 773 0 6 0.0248 0.0000 0.0077 19.125 0.25 3.26 -3.01 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7289 0.2711 2 2 0.0000 0.0298 0.9702 2 2 0.0000 0.0070 0.9930
chr1 15747032 T TG 0.500000 0.100 1 1 3 405 112 293 75 0 2 3 32 0 0 289 0 4 0.6696 0.0000 0.0137 54.000 0.20 4.38 -4.17 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9142 0.0851 0.0007 1 0 0.9061 0.0931 0.0009 1 0 0.8940 0.1047 0.0012
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 374 83 291 57 0 0 1 25 0 0 291 0 0 0.6867 0.0000 0.0000 83.000 0.09 1.28 -1.19 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8762 0.1219 0.0019 1 0 0.8661 0.1316 0.0024 1 0 0.8514 0.1455 0.0032
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 1102 238 864 126 3 17 4 88 0 0 864 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 12.824 1.96 2.11 -0.15 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8709 0.1285 0.0006 1 0 0.8638 0.1355 0.0007 1 0 0.8532 0.1457 0.0011
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 359 135 224 8 0 16 0 111 0 0 219 0 5 0.0593 0.0000 0.0223 7.438 0.00 2.93 -2.93 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9384 0.0616 2 2 0.0000 0.3788 0.6212
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 340 110 230 92 0 11 0 7 0 0 230 0 0 0.8364 0.0000 0.0000 9.000 0.25 4.29 -4.04 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0543 0.9457 0.0000 0 1 0.4929 0.5071 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 525 157 368 0 0 30 2 125 0 0 367 0 1 0.0000 0.0000 0.0027 4.167 6.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr1 47439005 G GCACCCA 0.500000 0.100 1 6 3 521 152 369 7 4 19 4 118 0 1 367 0 1 0.0461 0.0000 0.0054 7.278 0.43 6.13 -5.70 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9881 0.0119 2 1 0.0000 0.6538 0.3462
chr1 50419101 CCGGCGG C 0.500000 0.100 1 -6 6 700 173 527 142 6 19 0 6 1 0 525 1 0 0.8208 0.0019 0.0038 8.500 2.64 5.33 -2.69 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.5324 0.4676 0.0000 0 0 0.9424 0.0576 0.0000
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 211 73 138 32 0 7 0 34 0 0 138 0 0 0.4384 0.0000 0.0000 9.429 0.53 3.47 -2.94 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1707 0.5755 0.2538 1 1 0.1746 0.5698 0.2556 1 1 0.1796 0.5627 0.2577
chr1 52033398 CGCCCGCCACCTGAGGTCCCGCGATCGG C 0.500000 0.100 1 -27 1 677 175 502 107 0 4 0 64 0 0 480 0 22 0.6114 0.0000 0.0438 42.750 0.13 21.11 -20.98 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6030 0.3876 0.0094 1 0 0.6000 0.3891 0.0110 1 0 0.5947 0.3919 0.0134
chr1 53464677 TGCCGCC T 0.500000 0.100 1 -6 2 420 190 230 172 1 13 0 4 0 0 230 0 0 0.9053 0.0000 0.0000 13.538 0.19 4.75 -4.56 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4957 0.5043 0.0000 0 0 0.9882 0.0118 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 779 218 561 106 3 34 1 74 0 0 554 0 7 0.4862 0.0000 0.0125 5.412 0.30 3.45 -3.14 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7385 0.2581 0.0035 1 0 0.7316 0.2642 0.0042 1 0 0.7214 0.2731 0.0055
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 137 68 69 6 0 0 0 62 0 0 69 0 0 0.0882 0.0000 0.0000 68.000 0.00 3.65 -3.65 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9641 0.0359 2 1 0.0000 0.6990 0.3010
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 364 152 212 124 0 26 0 2 0 0 212 0 0 0.8158 0.0000 0.0000 4.846 0.19 10.00 -9.81 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8670 0.1330 0.0000 0 0 0.9831 0.0169 0.0000 0 0 0.9913 0.0087 0.0000
chr1 85132996 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 203 64 139 56 2 3 0 3 0 0 139 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 20.333 0.46 1.00 -0.54 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0261 0.9739 0.0000 0 1 0.4315 0.5685 0.0000 0 0 0.7111 0.2889 0.0000
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 401 124 277 69 0 6 1 48 0 0 275 0 2 0.5565 0.0000 0.0072 19.667 0.29 5.58 -5.29 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6124 0.3704 0.0173 1 0 0.6053 0.3751 0.0196 1 0 0.5950 0.3819 0.0231
chr1 108922534 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 163 75 88 67 0 6 0 2 1 0 87 0 0 0.8933 0.0114 0.0114 11.500 0.21 3.00 -2.79 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2732 0.7268 0.0000 0 0 0.7802 0.2198 0.0000 0 0 0.8825 0.1175 0.0000
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 441 134 307 5 0 10 5 114 0 0 298 0 9 0.0373 0.0000 0.0293 12.000 0.20 3.54 -3.34 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9902 0.0098 2 2 0.0000 0.2604 0.7396 2 2 0.0000 0.0485 0.9515
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 205 86 119 8 34 5 0 39 0 0 118 0 1 0.0930 0.0000 0.0084 11.400 1.88 2.15 -0.28 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1172 0.5531 0.3297 1 1 0.1218 0.5491 0.3291 1 1 0.1280 0.5440 0.3280
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 207 91 116 44 0 6 0 41 0 0 116 0 0 0.4835 0.0000 0.0000 17.000 0.89 5.71 -4.82 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2683 0.5906 0.1411 1 1 0.2704 0.5838 0.1457 1 1 0.2728 0.5753 0.1519
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.100 1 18 1 1506 445 1061 253 9 135 8 40 18 5 1013 3 22 0.5685 0.0170 0.0452 2.359 2.39 3.92 -1.53 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1164 282 882 221 0 43 0 18 0 1 878 1 2 0.7837 0.0000 0.0045 5.558 0.39 4.89 -4.50 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0686 0.9314 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 248 85 163 3 0 11 9 62 0 1 162 0 0 0.0353 0.0000 0.0061 6.091 0.00 1.56 -1.56 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9752 0.0248 2 1 0.0000 0.5517 0.4483 2 2 0.0000 0.2529 0.7471
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 211 73 138 39 0 4 0 30 0 0 126 0 12 0.5342 0.0000 0.0870 17.250 0.15 12.07 -11.91 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1467 0.5875 0.2658 1 1 0.1512 0.5810 0.2678 1 1 0.1572 0.5728 0.2701
chr1 152776532 C CCAGCTCTGGGGGCTGCTG 0.500000 0.100 1 18 1 825 271 554 131 0 56 0 84 0 0 535 0 19 0.4834 0.0000 0.0343 3.839 0.47 10.40 -9.93 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7160 0.2812 0.0028 1 0 0.7114 0.2852 0.0034 1 0 0.7041 0.2914 0.0045
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1139 275 864 30 3 57 0 185 1 3 807 2 51 0.1091 0.0012 0.0660 3.825 1.73 10.50 -8.77 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 552 226 326 119 0 15 0 92 0 0 326 0 0 0.5265 0.0000 0.0000 14.067 0.76 8.22 -7.46 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7182 0.2784 0.0034 1 0 0.7126 0.2832 0.0042 1 0 0.7040 0.2906 0.0054
chr1 153934829 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 539 222 317 116 81 9 5 11 0 0 317 0 0 0.5225 0.0000 0.0000 70.667 0.34 3.82 -3.47 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 1 0.4412 0.5588 0.0000
chr1 153934830 T TGC 0.500000 0.100 1 2 1 538 222 316 194 3 14 0 11 0 0 316 0 0 0.8739 0.0000 0.0000 14.857 3.90 3.82 0.08 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1289 0.8711 0.0000 0 0 0.9213 0.0787 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 185 76 109 6 0 3 0 67 0 0 107 0 2 0.0789 0.0000 0.0183 24.333 1.17 2.07 -0.91 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9482 0.0518 2 1 0.0000 0.6202 0.3798
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 633 177 456 0 0 5 0 172 0 0 456 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 34.400 2.24 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1127 221 906 0 1 2 1 217 0 0 900 1 5 0.0000 0.0000 0.0066 109.500 1.53 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 168136343 A AG 0.500000 0.100 1 1 4 194 68 126 61 1 1 0 5 0 0 126 0 0 0.8971 0.0000 0.0000 67.000 0.51 1.00 -0.49 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0993 0.9007 0.0000 0 1 0.4519 0.5481 0.0000
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 151 53 98 29 0 7 1 16 0 0 98 0 0 0.5472 0.0000 0.0000 6.571 0.21 4.75 -4.54 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5391 0.4110 0.0499 1 0 0.5301 0.4161 0.0538 1 0 0.5179 0.4227 0.0593
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 619 229 390 173 1 40 0 15 0 0 384 0 6 0.7555 0.0000 0.0154 4.725 0.39 9.80 -9.41 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0065 0.9935 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 390 189 201 10 0 22 0 157 0 0 187 0 14 0.0529 0.0000 0.0697 7.591 1.30 11.42 -10.12 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8920 0.1080 2 2 0.0000 0.1330 0.8670
chr1 210094548 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 175 50 125 3 0 1 0 46 0 0 125 0 0 0.0600 0.0000 0.0000 49.000 0.00 2.98 -2.98 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9869 0.0131 2 1 0.0000 0.7102 0.2898 2 2 0.0000 0.4239 0.5761
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 631 138 493 78 1 7 0 52 0 0 492 0 1 0.5652 0.0000 0.0020 18.571 1.05 8.42 -7.37 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7682 0.2272 0.0046 1 0 0.7586 0.2358 0.0056 1 0 0.7449 0.2480 0.0071
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 217 101 116 4 0 5 0 92 0 0 115 0 1 0.0396 0.0000 0.0086 19.200 0.00 1.15 -1.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9832 0.0168 2 2 0.0000 0.4013 0.5987 2 2 0.0000 0.1245 0.8755
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 496 135 361 0 0 16 3 116 0 0 353 1 7 0.0000 0.0000 0.0222 7.438 3.63 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 453 105 348 3 0 1 0 101 0 0 347 0 1 0.0286 0.0000 0.0029 104.000 0.00 1.82 -1.82 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8091 0.1909 2 2 0.0000 0.1296 0.8704 2 2 0.0000 0.0463 0.9537
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 620 165 455 0 0 4 0 161 0 0 453 0 2 0.0000 0.0000 0.0044 40.250 3.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.100 1 -84 1 984 354 630 316 4 24 0 10 0 0 630 0 0 0.8927 0.0000 0.0000 13.750 0.32 4.50 -4.18 150 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 0 0.9952 0.0048 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1054 248 806 234 3 2 0 9 0 0 805 1 0 0.9435 0.0000 0.0012 123.000 0.41 2.56 -2.15 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.8696 0.1304 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 765 194 571 92 2 2 0 98 0 0 571 0 0 0.4742 0.0000 0.0000 95.000 2.46 4.30 -1.84 66 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0885 0.6996 0.2119 1 1 0.0947 0.6860 0.2193 1 1 0.1032 0.6683 0.2285
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 985 74 911 0 0 3 0 71 0 0 902 0 9 0.0000 0.0000 0.0099 23.667 3.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0166 0.9834 2 2 0.0000 0.0180 0.9820 2 2 0.0000 0.0202 0.9798
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 454 196 258 21 0 11 0 164 0 0 258 0 0 0.1071 0.0000 0.0000 16.818 1.05 6.95 -5.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9960 0.0040
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 1122 261 861 136 0 8 0 117 0 0 860 0 1 0.5211 0.0000 0.0012 31.625 0.69 3.97 -3.28 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4555 0.5317 0.0128 1 1 0.4607 0.5244 0.0149 1 1 0.4660 0.5159 0.0181
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 207 101 106 48 0 5 0 48 0 0 104 0 2 0.4752 0.0000 0.0189 19.200 0.38 3.75 -3.38 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1836 0.6211 0.1953 1 1 0.1893 0.6125 0.1982 1 1 0.1966 0.6017 0.2018
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 387 106 281 1 0 17 3 85 0 0 260 1 20 0.0094 0.0000 0.0747 5.500 0.00 10.04 -10.04 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0161 0.9839 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 542 183 359 89 0 20 0 74 0 0 357 0 2 0.4863 0.0000 0.0056 8.150 0.46 8.43 -7.97 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5189 0.4636 0.0175 1 0 0.5207 0.4599 0.0194 1 0 0.5220 0.4559 0.0221
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 187 52 135 4 0 0 1 47 0 0 133 0 2 0.0769 0.0000 0.0148 52.000 0.00 3.38 -3.38 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.8536 0.1464 2 1 0.0000 0.5355 0.4645
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 577 134 443 113 0 16 0 5 0 0 443 0 0 0.8433 0.0000 0.0000 7.375 0.45 3.00 -2.55 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0047 0.9953 0.0000 0 0 0.5795 0.4205 0.0000 0 0 0.9067 0.0933 0.0000
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 568 194 374 7 1 99 0 87 0 0 372 1 1 0.0361 0.0000 0.0053 0.960 0.00 2.14 -2.14 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9744 0.0256 2 1 0.0000 0.6514 0.3486
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGCGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 566 194 372 52 0 28 1 113 0 0 372 0 0 0.2680 0.0000 0.0000 6.148 0.17 2.03 -1.85 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0095 0.9905 1 2 0.0000 0.0113 0.9887 1 2 0.0000 0.0143 0.9857
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.100 1 6 1 200 77 123 10 1 4 1 61 0 0 117 0 6 0.1299 0.0000 0.0488 18.000 0.40 6.03 -5.63 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9752 0.0248
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 615 60 555 38 3 16 0 3 12 1 542 0 0 0.6333 0.0216 0.0234 2.688 2.47 6.33 -3.86 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0194 0.9806 0.0000 0 1 0.3760 0.6240 0.0000 0 0 0.6650 0.3350 0.0000
chr2 61186687 C CCTAT 0.500000 0.100 1 4 2 322 102 220 93 0 3 0 6 0 0 219 0 1 0.9118 0.0000 0.0045 33.000 0.48 4.33 -3.85 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0569 0.9431 0.0000 0 0 0.5050 0.4950 0.0000
chr2 68538002 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 323 97 226 51 0 2 0 44 0 0 224 0 2 0.5258 0.0000 0.0088 47.500 0.22 2.91 -2.69 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3001 0.5885 0.1114 1 1 0.3018 0.5818 0.1164 1 1 0.3035 0.5734 0.1231
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 426 179 247 76 0 16 1 86 0 0 247 0 0 0.4246 0.0000 0.0000 10.188 1.17 3.05 -1.88 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0433 0.5733 0.3834 1 1 0.0475 0.5666 0.3859 1 1 0.0533 0.5584 0.3882
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 558 152 406 102 1 40 1 8 0 0 405 0 1 0.6711 0.0000 0.0025 2.775 2.93 6.00 -3.07 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0090 0.9910 0.0000 0 1 0.2698 0.7302 0.0000
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 469 121 348 100 0 12 0 9 0 0 348 0 0 0.8264 0.0000 0.0000 9.083 0.16 2.78 -2.62 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0101 0.9899 0.0000 0 1 0.2842 0.7158 0.0000
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 918 225 693 180 0 32 0 13 1 0 685 0 7 0.8000 0.0014 0.0115 6.031 0.50 14.85 -14.35 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0171 0.9829 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 338 116 222 50 1 6 4 55 0 0 222 0 0 0.4310 0.0000 0.0000 18.333 1.50 3.13 -1.63 24 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0739 0.5622 0.3639 1 1 0.0787 0.5571 0.3642 1 1 0.0853 0.5508 0.3639
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 585 153 432 109 2 24 0 18 0 0 430 0 2 0.7124 0.0000 0.0046 5.375 0.21 3.06 -2.84 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 783 221 562 197 1 10 0 13 0 0 562 0 0 0.8914 0.0000 0.0000 21.100 0.56 7.31 -6.74 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0189 0.9811 0.0000 0 0 0.7799 0.2201 0.0000
chr2 108259008 AAAACTTGGTCAGGTGATGTTAT A 0.500000 0.100 1 -22 1 521 128 393 72 0 1 0 55 0 0 380 0 13 0.5625 0.0000 0.0331 127.000 1.14 20.09 -18.95 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2424 0.6479 0.1097 1 1 0.2473 0.6373 0.1154 1 1 0.2532 0.6238 0.1230
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 108 43 65 23 0 0 0 20 0 0 64 0 1 0.5349 0.0000 0.0154 43.000 0.74 3.25 -2.51 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2697 0.5489 0.1814 1 1 0.2702 0.5452 0.1846 1 1 0.2707 0.5406 0.1887
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 517 128 389 11 0 0 0 117 0 0 383 0 6 0.0859 0.0000 0.0154 128.000 0.18 5.54 -5.36 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9962 0.0038 2 1 0.0000 0.7487 0.2513
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 184 51 133 12 4 8 7 20 0 0 131 1 1 0.2353 0.0000 0.0150 4.375 1.67 2.05 -0.38 4 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0491 0.4020 0.5488 1 2 0.0530 0.4076 0.5393 1 2 0.0585 0.4151 0.5264
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 171 60 111 32 0 9 0 19 0 0 109 0 2 0.5333 0.0000 0.0180 5.667 1.47 6.89 -5.43 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5039 0.4392 0.0569 1 0 0.4964 0.4426 0.0610 1 0 0.4862 0.4470 0.0668
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 182 82 100 62 0 17 0 3 0 0 100 0 0 0.7561 0.0000 0.0000 3.824 0.18 4.33 -4.16 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0291 0.9709 0.0000 0 1 0.4756 0.5244 0.0000 0 0 0.7471 0.2529 0.0000
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 246 115 131 67 0 7 0 41 0 0 130 0 1 0.5826 0.0000 0.0076 15.429 0.19 3.39 -3.20 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7739 0.2207 0.0054 1 0 0.7634 0.2301 0.0065 1 0 0.7485 0.2433 0.0081
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.100 1 -2 1 468 138 330 130 0 3 0 5 0 0 330 0 0 0.9420 0.0000 0.0000 45.000 0.92 4.60 -3.68 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0112 0.9888 0.0000 0 0 0.7633 0.2367 0.0000 0 0 0.9569 0.0431 0.0000
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 279 103 176 8 0 12 79 4 0 0 176 0 0 0.0777 0.0000 0.0000 1.583 0.75 3.50 -2.75 6 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9929 0.0071 2 1 0.0000 0.8436 0.1564
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 279 113 166 0 1 14 5 93 0 0 166 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.857 2.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0509 0.9491 2 2 0.0000 0.0210 0.9790 2 2 0.0000 0.0163 0.9837
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 232 76 156 71 0 1 0 4 0 0 156 0 0 0.9342 0.0000 0.0000 75.000 0.11 2.50 -2.39 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0051 0.9949 0.0000 0 1 0.3286 0.6714 0.0000 0 0 0.7060 0.2940 0.0000
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 530 160 370 0 0 17 0 143 0 1 363 1 5 0.0000 0.0000 0.0189 8.412 7.69 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 628 202 426 112 1 6 3 80 0 0 397 0 29 0.5545 0.0000 0.0681 32.167 0.55 15.30 -14.75 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1406 0.7486 0.1108 1 1 0.1489 0.7327 0.1184 1 1 0.1596 0.7119 0.1285
chr2 231460694 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 607 122 485 65 3 6 1 47 0 1 484 0 0 0.5328 0.0000 0.0021 19.333 0.89 3.49 -2.60 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6732 0.3150 0.0118 1 0 0.6644 0.3220 0.0136 1 0 0.6519 0.3317 0.0164
chr2 231460703 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 1 605 125 480 100 6 4 1 14 0 0 480 0 0 0.8000 0.0000 0.0000 60.000 1.50 3.00 -1.50 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0120 0.9880 0.0000
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 327 130 197 7 0 5 1 117 0 0 195 0 2 0.0538 0.0000 0.0102 25.000 0.00 4.07 -4.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8115 0.1885 2 2 0.0000 0.2091 0.7909
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 133 51 82 37 0 2 0 12 0 0 81 0 1 0.7255 0.0000 0.0122 24.500 0.05 2.92 -2.86 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8025 0.1906 0.0069 1 0 0.7820 0.2099 0.0081 1 0 0.6684 0.3229 0.0088
chr2 235852770 C CCAGG 0.500000 0.100 1 4 2 231 102 129 96 0 1 0 5 0 0 128 1 0 0.9412 0.0000 0.0078 101.000 0.79 4.00 -3.21 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.3095 0.6905 0.0000 0 0 0.7723 0.2277 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 396 121 275 9 3 16 3 90 0 1 273 0 1 0.0744 0.0000 0.0073 6.500 0.00 3.19 -3.19 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.9282 0.0718
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 617 165 452 20 0 2 1 142 0 0 447 0 5 0.1212 0.0000 0.0111 81.500 0.15 3.70 -3.55 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9749 0.0251
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 594 146 448 125 1 16 0 4 1 0 446 0 1 0.8562 0.0022 0.0045 8.125 1.18 13.25 -12.07 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0403 0.9597 0.0000 0 0 0.9234 0.0766 0.0000 0 0 0.9882 0.0118 0.0000
chr3 13571198 AGAG A 0.000023 0.100 1 -3 2 689 133 556 118 1 6 0 8 0 0 556 0 0 0.8872 0.0000 0.0000 21.167 0.52 3.00 -2.48 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2627 0.7373 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 403 96 307 48 2 3 0 43 0 0 307 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 31.000 0.69 4.14 -3.45 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3537 0.5579 0.0884 1 1 0.3535 0.5533 0.0932 1 1 0.3526 0.5476 0.0998
chr3 38307655 ATTTG A 0.500000 0.100 1 -4 1 415 133 282 77 1 1 0 54 0 0 281 0 1 0.5789 0.0000 0.0035 132.000 0.38 4.17 -3.79 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7126 0.2800 0.0075 1 0 0.7037 0.2875 0.0088 1 0 0.6911 0.2980 0.0109
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 661 262 399 11 19 46 2 184 2 0 361 2 34 0.0420 0.0050 0.0952 4.696 10.55 8.97 1.58 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 648 224 424 19 0 45 3 157 0 1 420 0 3 0.0848 0.0000 0.0094 3.978 0.53 3.06 -2.54 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9901 0.0099
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 640 163 477 0 0 10 1 152 0 0 473 0 4 0.0000 0.0000 0.0084 15.200 2.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 354 142 212 0 0 1 0 141 0 0 209 1 2 0.0000 0.0000 0.0142 141.000 3.26 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 585 146 439 59 0 10 11 66 0 0 439 0 0 0.4041 0.0000 0.0000 13.600 0.66 3.09 -2.43 17 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0166 0.3877 0.5957 1 2 0.0189 0.3912 0.5899 1 2 0.0224 0.3963 0.5814
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 339 93 246 44 0 20 0 29 0 0 245 0 1 0.4731 0.0000 0.0041 3.650 0.52 5.76 -5.24 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5641 0.4013 0.0345 1 0 0.5559 0.4061 0.0379 1 0 0.5446 0.4126 0.0428
chr3 51993837 T TCCTTGG 0.500000 0.100 1 6 1 458 157 301 82 0 30 0 45 0 0 296 0 5 0.5223 0.0000 0.0166 4.233 0.63 5.00 -4.37 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8606 0.1379 0.0015 1 0 0.8513 0.1468 0.0019 1 0 0.8378 0.1596 0.0026
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 459 169 290 137 1 24 0 7 0 0 290 0 0 0.8107 0.0000 0.0000 6.042 1.72 5.29 -3.56 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3639 0.6361 0.0000 0 0 0.9006 0.0994 0.0000
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 205 100 105 46 0 12 0 42 0 0 104 0 1 0.4600 0.0000 0.0095 7.333 0.50 7.43 -6.93 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2597 0.5970 0.1433 1 1 0.2622 0.5898 0.1480 1 1 0.2651 0.5807 0.1542
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 246 92 154 33 1 7 46 5 0 0 153 1 0 0.3587 0.0000 0.0065 14.000 0.12 3.20 -3.08 7 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0266 0.3756 0.5978 1 2 0.0296 0.3813 0.5891 1 2 0.0339 0.3892 0.5769
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 246 88 158 33 0 1 5 49 0 0 157 0 1 0.3750 0.0000 0.0063 87.000 0.12 3.69 -3.57 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0101 0.2625 0.7274 1 2 0.0117 0.2719 0.7164 1 2 0.0142 0.2848 0.7010
chr3 63912684 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 3 234 46 188 39 0 4 0 3 0 0 188 0 0 0.8478 0.0000 0.0000 10.500 0.59 6.33 -5.74 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 1 0.2233 0.7767 0.0000 0 1 0.4917 0.5083 0.0000
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 318 133 185 50 50 11 4 18 1 0 184 0 0 0.3759 0.0054 0.0054 10.909 1.04 4.33 -3.29 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000
chr3 65439907 CTGCTGCTGT C 0.500000 0.100 1 -9 1 318 150 168 72 1 3 0 74 0 0 168 0 0 0.4800 0.0000 0.0000 49.000 0.82 7.88 -7.06 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1466 0.6713 0.1820 1 1 0.1527 0.6593 0.1880 1 1 0.1606 0.6439 0.1955
chr3 73062330 C CA 0.500000 0.100 1 1 5 476 122 354 8 0 5 0 109 0 0 353 0 1 0.0656 0.0000 0.0028 23.400 0.50 1.48 -0.98 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9531 0.0469 2 2 0.0000 0.4484 0.5516
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 105 43 62 5 0 4 4 30 0 0 61 0 1 0.1163 0.0000 0.0161 9.750 0.20 1.37 -1.17 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9720 0.0280 2 1 0.0000 0.8194 0.1806
chr3 113657263 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 1130 289 841 6 118 85 0 80 0 1 838 0 2 0.0208 0.0000 0.0036 2.603 0.00 3.09 -3.09 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8923 0.1073 0.0004 1 0 0.8851 0.1143 0.0006 1 0 0.8746 0.1246 0.0008
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1133 297 836 73 11 82 14 117 0 0 834 0 2 0.2458 0.0000 0.0024 2.756 2.67 3.10 -0.43 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0423 0.9576 1 2 0.0001 0.0469 0.9530 1 2 0.0001 0.0539 0.9459
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 528 184 344 111 0 2 0 71 0 0 341 0 3 0.6033 0.0000 0.0087 91.000 0.11 3.32 -3.22 67 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8871 0.1123 0.0006 1 0 0.8795 0.1198 0.0008 1 0 0.8682 0.1307 0.0011
chr3 123700269 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 805 192 613 168 2 6 0 16 0 0 613 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 31.000 0.39 3.06 -2.68 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1168 0.8832 0.0000
chr3 124763647 TTTGTTGAAC T 0.500000 0.100 1 -9 1 361 144 217 82 0 4 0 58 0 0 214 0 3 0.5694 0.0000 0.0138 35.000 0.37 8.36 -8.00 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6585 0.3313 0.0102 1 0 0.6513 0.3368 0.0119 1 0 0.6409 0.3446 0.0145
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 726 151 575 95 1 37 1 17 0 0 575 0 0 0.6291 0.0000 0.0000 3.054 0.64 7.88 -7.24 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0011 0.9989 0.0000
chr3 125055821 G GCAT 0.500000 0.100 1 3 2 241 70 171 5 0 0 0 65 0 0 168 0 3 0.0714 0.0000 0.0175 70.000 0.20 3.52 -3.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8729 0.1271 2 2 0.0000 0.4774 0.5226
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 318 115 203 8 0 4 0 103 0 0 203 0 0 0.0696 0.0000 0.0000 27.750 1.38 2.27 -0.90 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9663 0.0337 2 1 0.0000 0.5326 0.4674
chr3 168024565 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 2 299 123 176 61 1 8 0 53 0 0 175 0 1 0.4959 0.0000 0.0057 14.375 0.16 3.25 -3.08 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3567 0.5703 0.0731 1 1 0.3575 0.5646 0.0779 1 1 0.3579 0.5575 0.0845
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 390 188 202 142 2 31 0 13 0 0 201 0 1 0.7553 0.0000 0.0050 5.065 0.41 3.00 -2.59 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1194 0.8806 0.0000
chr3 184100433 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 288 95 193 57 0 1 0 37 0 0 193 0 0 0.6000 0.0000 0.0000 94.000 0.16 1.19 -1.03 35 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6868 0.3001 0.0130 1 0 0.6767 0.3083 0.0150 1 0 0.6625 0.3195 0.0179
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 566 162 404 15 0 21 1 125 0 0 401 0 3 0.0926 0.0000 0.0074 6.714 0.47 3.11 -2.65 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9667 0.0333
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 519 157 362 94 0 4 1 58 0 1 360 0 1 0.5987 0.0000 0.0055 38.250 0.27 2.09 -1.82 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8804 0.1187 0.0009 1 0 0.8720 0.1269 0.0011 1 0 0.8597 0.1387 0.0016
chr3 195778940 TGTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGCGTGACCTGTGGATGCTGAGGAAGTGTCGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTCACCTGTGGATGCTGAGGAAGTGCTGGTGACAGGAAGAGGGGTGCCGTGACCTGTGGACACTGAGGAAGC T 0.500000 0.100 1 -144 1 2146 1077 1069 610 44 120 28 275 19 12 1001 13 24 0.5664 0.0178 0.0636 8.096 4.34 5.90 -1.55 44 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 810 164 646 0 2 11 0 151 0 0 610 0 36 0.0000 0.0000 0.0557 13.818 10.66 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr3 198153257 CTGGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -9 2 285 121 164 62 0 9 41 9 0 0 160 1 3 0.5124 0.0000 0.0244 18.167 0.29 11.67 -11.38 24 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3859 0.5494 0.0648 1 1 0.3856 0.5450 0.0694 1 1 0.3845 0.5397 0.0758
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 285 120 165 43 0 26 0 51 0 0 158 2 5 0.3583 0.0000 0.0424 3.615 0.19 9.35 -9.17 11 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0293 0.4174 0.5533 1 2 0.0324 0.4206 0.5469 1 2 0.0370 0.4252 0.5378
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 285 120 165 46 0 23 6 45 0 0 159 0 6 0.3833 0.0000 0.0364 4.217 0.30 9.71 -9.41 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0508 0.5005 0.4487 1 1 0.0550 0.4992 0.4458 1 1 0.0608 0.4979 0.4414
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 558 161 397 86 0 1 0 74 0 0 363 2 32 0.5342 0.0000 0.0856 160.000 0.27 16.03 -15.76 30 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0027 0.2747 0.7225 1 2 0.0032 0.2770 0.7198 1 2 0.0040 0.2808 0.7152
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 610 240 370 2 1 75 2 160 0 0 349 1 20 0.0083 0.0000 0.0568 2.203 0.00 6.21 -6.21 2 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0258 0.9742 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr4 3074927 G GCAA 0.030219 0.100 1 3 1 609 270 339 216 26 6 9 13 2 1 336 0 0 0.8000 0.0059 0.0088 41.833 4.79 1.38 3.40 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2359 0.7641 0.0000 0 0 0.9909 0.0091 0.0000
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 557 142 415 129 0 9 0 4 1 0 413 0 1 0.9085 0.0024 0.0048 16.625 0.55 13.00 -12.45 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1353 0.8647 0.0000 0 0 0.9781 0.0219 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 620 182 438 148 1 20 1 12 0 0 437 1 0 0.8132 0.0000 0.0023 8.050 1.59 6.42 -4.83 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.2196 0.7804 0.0000
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 620 196 424 156 4 23 4 9 1 0 421 0 2 0.7959 0.0024 0.0071 7.391 1.34 6.44 -5.10 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0025 0.9975 0.0000 0 1 0.2985 0.7015 0.0000
chr4 15003704 GCCCGGACCTTCCACA G 0.500000 0.100 1 -15 1 571 115 456 106 0 4 0 5 10 1 442 0 3 0.9217 0.0219 0.0307 27.750 2.04 15.40 -13.36 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0639 0.9361 0.0000 0 0 0.6301 0.3699 0.0000
chr4 15003723 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 3 560 109 451 84 4 16 1 4 11 1 437 1 1 0.7706 0.0244 0.0310 5.750 2.64 5.25 -2.61 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2757 0.7243 0.0000 0 0 0.7569 0.2431 0.0000
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 589 189 400 177 0 1 0 11 0 0 399 0 1 0.9365 0.0000 0.0025 188.000 0.47 7.73 -7.26 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0191 0.9809 0.0000 0 0 0.7083 0.2917 0.0000
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 656 163 493 84 0 7 0 72 0 0 473 0 20 0.5153 0.0000 0.0406 22.286 1.33 14.10 -12.76 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0611 0.6404 0.2985 1 1 0.0662 0.6299 0.3039 1 1 0.0732 0.6166 0.3102
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 3 368 95 273 52 0 2 0 41 0 3 270 0 0 0.5474 0.0000 0.0110 46.500 0.77 3.73 -2.96 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5645 0.4068 0.0287 1 0 0.5575 0.4107 0.0318 1 0 0.5475 0.4161 0.0363
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2416 521 1895 160 7 154 8 192 1 5 1863 1 25 0.3071 0.0005 0.0169 2.366 2.03 9.40 -7.37 70 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0811 0.9189 1 2 0.0001 0.0848 0.9152 1 2 0.0001 0.0906 0.9093
chr4 87614861 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3018 713 2305 378 5 69 5 256 3 8 2268 7 19 0.5302 0.0013 0.0161 9.846 1.86 12.79 -10.93 162 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9986 0.0014 0.0000 1 0 0.9983 0.0017 0.0000 1 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 4012 868 3144 4 9 60 23 772 54 51 2813 163 63 0.0046 0.0172 0.1053 13.525 12.25 8.53 3.72 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3359 987 2372 13 13 210 44 707 266 49 1979 31 47 0.0132 0.1121 0.1657 3.576 3.31 8.26 -4.95 9 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 87616280 TAGCAGTGACAGCAGTGAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2637 829 1808 365 63 131 22 248 16 24 1745 12 11 0.4403 0.0088 0.0348 5.583 8.10 8.40 -0.30 65 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87616295 TGACAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 2642 783 1859 207 49 158 65 304 11 21 1802 17 8 0.2644 0.0059 0.0307 4.062 4.95 11.08 -6.13 57 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0029 0.9971 1 2 0.0000 0.0034 0.9966 1 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 156 63 93 50 0 3 0 10 0 0 93 0 0 0.7937 0.0000 0.0000 20.000 0.36 3.00 -2.64 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0182 0.9818 0.0000
chr4 109869931 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 559 113 446 65 1 7 1 39 0 0 445 1 0 0.5752 0.0000 0.0022 15.000 0.49 3.31 -2.82 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7716 0.2227 0.0056 1 0 0.7611 0.2322 0.0067 1 0 0.7461 0.2455 0.0085
chr4 110011233 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 392 118 274 111 0 1 0 6 0 0 274 0 0 0.9407 0.0000 0.0000 117.000 0.23 1.67 -1.43 77 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3054 0.6946 0.0000 0 0 0.8239 0.1761 0.0000
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 658 180 478 163 0 6 0 11 0 0 477 0 1 0.9056 0.0000 0.0021 29.000 0.42 3.82 -3.39 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0096 0.9904 0.0000 0 0 0.5519 0.4481 0.0000
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 467 200 267 0 0 20 9 171 0 0 267 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.000 3.02 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr4 143700251 T TGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 1 581 121 460 102 0 8 0 11 1 0 459 0 0 0.8430 0.0022 0.0022 14.125 0.73 6.27 -5.55 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.1128 0.8872 0.0000
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 403 146 257 5 57 34 1 49 0 4 251 1 1 0.0342 0.0000 0.0233 3.500 1.20 3.80 -2.60 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5272 0.4434 0.0293 1 0 0.5226 0.4449 0.0325 1 0 0.5157 0.4472 0.0372
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 2 404 152 252 65 1 23 0 63 1 0 245 1 5 0.4276 0.0040 0.0278 5.609 3.06 9.29 -6.22 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1398 0.6567 0.2035 1 1 0.1456 0.6455 0.2089 1 1 0.1532 0.6313 0.2156
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.100 1 5 2 207 94 113 85 1 3 0 5 0 0 112 0 1 0.9043 0.0000 0.0088 30.333 0.91 5.00 -4.09 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1093 0.8907 0.0000 0 0 0.5786 0.4214 0.0000
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 228 92 136 0 0 16 0 76 0 0 134 0 2 0.0000 0.0000 0.0147 4.750 5.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0184 0.9816 2 2 0.0000 0.0199 0.9801 2 2 0.0000 0.0222 0.9778
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 756 150 606 141 0 2 0 7 0 0 606 0 0 0.9400 0.0000 0.0000 74.000 0.35 3.29 -2.93 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3987 0.6013 0.0000 0 0 0.9129 0.0871 0.0000
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.100 1 -12 4 230 104 126 59 0 4 0 41 1 0 122 0 3 0.5673 0.0079 0.0317 25.000 0.42 12.17 -11.75 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7170 0.2788 0.0042 1 0 0.7120 0.2832 0.0047 1 0 0.7049 0.2896 0.0055
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 698 151 547 6 0 22 2 121 0 0 545 0 2 0.0397 0.0000 0.0037 5.864 0.33 3.37 -3.04 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.5360 0.4640 2 2 0.0000 0.0984 0.9016
chr5 61332354 A AGCG 0.500000 0.100 1 3 1 374 136 238 6 5 26 10 89 0 0 237 1 0 0.0441 0.0000 0.0042 4.739 1.50 3.81 -2.31 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9953 0.0047 2 1 0.0000 0.8334 0.1666
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 324 45 279 0 0 29 0 16 0 1 273 2 3 0.0000 0.0000 0.0215 0.571 9.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7319 0.2681 2 2 0.0000 0.4953 0.5047 2 2 0.0000 0.4026 0.5974
chr5 73447067 G GGCGGCC 0.500000 0.100 1 6 1 343 77 266 36 2 12 1 26 0 0 266 0 0 0.4675 0.0000 0.0000 5.333 1.39 5.35 -3.96 10 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4986 0.4479 0.0534 1 0 0.4920 0.4505 0.0575 1 0 0.4827 0.4541 0.0632
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 304 86 218 51 0 2 0 33 0 0 216 0 2 0.5930 0.0000 0.0092 42.000 0.18 5.64 -5.46 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6001 0.3747 0.0252 1 0 0.5916 0.3804 0.0280 1 0 0.5796 0.3881 0.0323
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 501 111 390 52 0 6 1 52 0 0 388 0 2 0.4685 0.0000 0.0051 17.333 0.40 3.25 -2.85 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1390 0.6189 0.2421 1 1 0.1441 0.6102 0.2456 1 1 0.1509 0.5992 0.2500
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 306 90 216 39 0 7 1 43 0 0 215 1 0 0.4333 0.0000 0.0046 11.857 1.69 19.98 -18.28 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1053 0.5632 0.3315 1 1 0.1101 0.5583 0.3315 1 1 0.1166 0.5522 0.3312
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 291 73 218 37 0 2 2 32 0 0 216 0 2 0.5068 0.0000 0.0092 35.500 2.41 26.50 -24.09 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2293 0.5868 0.1839 1 1 0.2320 0.5804 0.1876 1 1 0.2353 0.5722 0.1925
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 235 101 134 61 0 1 0 39 0 0 132 0 2 0.6040 0.0000 0.0149 100.000 0.21 3.05 -2.84 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6788 0.3084 0.0129 1 0 0.6692 0.3160 0.0148 1 0 0.6557 0.3266 0.0177
chr5 109855234 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 152 73 79 60 0 2 0 11 0 0 79 0 0 0.8219 0.0000 0.0000 35.500 0.05 3.09 -3.04 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0155 0.9845 0.0000
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 235 101 134 36 0 22 4 39 0 0 133 0 1 0.3564 0.0000 0.0075 3.591 0.31 5.05 -4.75 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0811 0.5274 0.3915 1 1 0.0858 0.5249 0.3893 1 1 0.0921 0.5219 0.3860
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 887 216 671 85 3 18 1 109 2 0 663 1 5 0.3935 0.0030 0.0119 11.000 0.82 4.20 -3.38 23 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0040 0.2923 0.7037 1 2 0.0049 0.2969 0.6982 1 2 0.0063 0.3039 0.6899
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 536 126 410 112 1 2 0 11 0 0 410 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 62.000 0.44 1.09 -0.65 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 1 0.1724 0.8276 0.0000
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 458 115 343 96 0 14 0 5 0 0 343 0 0 0.8348 0.0000 0.0000 7.214 0.65 6.00 -5.35 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.3708 0.6292 0.0000 0 0 0.8099 0.1901 0.0000
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 285 86 199 79 0 2 0 5 0 0 197 0 2 0.9186 0.0000 0.0101 42.000 0.71 9.00 -8.29 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0297 0.9703 0.0000 0 1 0.3425 0.6575 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 184 77 107 52 0 1 0 24 0 0 107 0 0 0.6753 0.0000 0.0000 76.000 0.21 3.62 -3.41 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8440 0.1527 0.0033 1 0 0.8329 0.1631 0.0040 1 0 0.8169 0.1779 0.0052
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 203 73 130 0 0 0 3 70 0 0 126 1 3 0.0000 0.0000 0.0308 72.000 3.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0195 0.9805 2 2 0.0000 0.0210 0.9790 2 2 0.0000 0.0234 0.9766
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 203 73 130 0 0 1 5 67 0 0 126 3 1 0.0000 0.0000 0.0308 72.000 4.04 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0204 0.9796 2 2 0.0000 0.0221 0.9779 2 2 0.0000 0.0245 0.9755
chr5 141375481 CA C 0.500000 0.100 1 -1 4 907 165 742 156 0 3 0 6 0 0 742 0 0 0.9455 0.0000 0.0000 54.000 0.51 1.50 -0.99 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0042 0.9958 0.0000 0 0 0.7883 0.2117 0.0000 0 0 0.9743 0.0257 0.0000
chr5 141387924 CTGCCAG C 0.500000 0.100 1 -6 2 496 135 361 78 0 1 0 56 0 0 359 0 2 0.5778 0.0000 0.0055 134.000 0.27 5.89 -5.62 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6428 0.3450 0.0122 1 0 0.6357 0.3502 0.0141 1 0 0.6254 0.3577 0.0169
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 381 99 282 0 1 7 0 91 0 0 272 0 10 0.0000 0.0000 0.0355 13.143 7.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0442 0.9558 2 2 0.0000 0.0179 0.9821 2 2 0.0000 0.0138 0.9862
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 332 132 200 54 1 30 2 45 0 0 193 0 7 0.4091 0.0000 0.0350 3.400 0.59 6.67 -6.07 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2038 0.6294 0.1668 1 1 0.2082 0.6200 0.1718 1 1 0.2138 0.6080 0.1782
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 608 134 474 63 0 1 0 70 0 0 474 0 0 0.4701 0.0000 0.0000 133.000 0.14 1.90 -1.76 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0788 0.6056 0.3156 1 1 0.0839 0.5975 0.3185 1 1 0.0909 0.5874 0.3216
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 335 140 195 0 0 12 0 128 0 0 194 0 1 0.0000 0.0000 0.0051 10.667 13.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0019 0.9981
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 204 87 117 72 1 6 0 8 0 0 117 0 0 0.8276 0.0000 0.0000 13.333 0.36 2.75 -2.39 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0076 0.9924 0.0000 0 1 0.1684 0.8316 0.0000
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 421 111 310 54 0 4 0 53 0 0 309 0 1 0.4865 0.0000 0.0032 26.750 0.93 4.02 -3.09 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1853 0.6294 0.1853 1 1 0.1900 0.6200 0.1900 1 1 0.1960 0.6081 0.1960
chr5 177509601 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 376 131 245 64 0 4 1 62 0 0 245 0 0 0.4885 0.0000 0.0000 31.750 0.91 2.74 -1.84 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1925 0.6497 0.1578 1 1 0.1977 0.6390 0.1633 1 1 0.2043 0.6253 0.1704
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 430 200 230 152 10 27 0 11 1 0 229 0 0 0.7600 0.0043 0.0043 6.407 0.91 3.64 -2.73 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0275 0.9725 0.0000 0 0 0.7008 0.2992 0.0000
chr5 179644852 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 308 113 195 107 1 0 0 5 0 0 195 0 0 0.9469 0.0000 0.0000 112.000 1.25 2.20 -0.95 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 0 0.5170 0.4830 0.0000 0 0 0.8836 0.1164 0.0000
chr5 181155256 TTGTC T 0.500000 0.100 1 -4 3 796 210 586 187 2 8 0 13 0 0 586 0 0 0.8905 0.0000 0.0000 25.250 0.42 3.77 -3.35 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0121 0.9879 0.0000 0 0 0.6960 0.3040 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 551 101 450 48 0 10 0 43 0 0 449 0 1 0.4752 0.0000 0.0022 9.100 0.29 2.91 -2.62 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2805 0.5926 0.1269 1 1 0.2825 0.5857 0.1318 1 1 0.2847 0.5770 0.1383
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 485 121 364 41 0 17 1 62 0 0 361 1 2 0.3388 0.0000 0.0082 6.118 0.66 2.98 -2.33 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0051 0.2138 0.7811 1 2 0.0061 0.2232 0.7706 1 2 0.0077 0.2364 0.7558
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1461 337 1124 24 22 90 6 195 0 0 1108 3 13 0.0712 0.0000 0.0142 2.700 1.12 4.30 -3.17 6 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 27255285 AAAGGAGAGCCAGATT A 0.178475 0.100 1 -15 1 403 101 302 92 1 4 0 4 0 0 302 0 0 0.9109 0.0000 0.0000 24.250 0.18 11.50 -11.32 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0691 0.9309 0.0000 0 0 0.8718 0.1282 0.0000 0 0 0.9699 0.0301 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 946 205 741 191 1 6 0 7 0 0 741 0 0 0.9317 0.0000 0.0000 33.167 0.23 13.71 -13.49 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0079 0.9921 0.0000 0 0 0.9557 0.0443 0.0000 0 0 0.9969 0.0031 0.0000
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 350 110 240 64 0 1 0 45 0 0 240 0 0 0.5818 0.0000 0.0000 109.000 0.28 1.42 -1.14 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6484 0.3366 0.0150 1 0 0.6398 0.3431 0.0171 1 0 0.6276 0.3520 0.0203
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 624 177 447 165 2 1 0 9 0 0 447 0 0 0.9322 0.0000 0.0000 175.000 0.35 10.44 -10.10 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2231 0.7769 0.0000 0 0 0.9106 0.0894 0.0000
chr6 31736288 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 2 127 58 69 36 0 1 0 21 0 0 68 0 1 0.6207 0.0000 0.0145 57.000 0.06 3.14 -3.09 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5794 0.3845 0.0361 1 0 0.5699 0.3905 0.0395 1 0 0.5569 0.3986 0.0445
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 454 106 348 50 0 12 0 44 0 0 345 0 3 0.4717 0.0000 0.0086 7.833 0.08 3.84 -3.76 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2534 0.6065 0.1402 1 1 0.2563 0.5986 0.1451 1 1 0.2598 0.5887 0.1515
chr6 32584184 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 451 126 325 121 0 1 0 4 0 0 320 0 5 0.9603 0.0000 0.0154 125.000 1.86 11.00 -9.14 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0290 0.9710 0.0000 0 0 0.5256 0.4744 0.0000
chr6 32584185 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 450 127 323 121 0 1 0 5 0 0 315 0 8 0.9528 0.0000 0.0248 126.000 1.86 10.20 -8.34 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0791 0.9209 0.0000
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 614 177 437 29 0 4 3 141 0 0 434 0 3 0.1638 0.0000 0.0069 43.000 0.76 1.43 -0.67 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 843 193 650 86 0 9 0 98 0 0 646 0 4 0.4456 0.0000 0.0062 20.444 0.31 3.18 -2.87 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0202 0.4971 0.4827 1 1 0.0229 0.4936 0.4835 1 1 0.0269 0.4899 0.4832
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 315 120 195 89 1 21 0 9 0 0 195 0 0 0.7417 0.0000 0.0000 4.714 0.53 5.56 -5.03 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0061 0.9939 0.0000 0 1 0.1963 0.8037 0.0000
chr6 44002766 C CGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 415 110 305 71 1 36 0 2 0 0 305 0 0 0.6455 0.0000 0.0000 2.056 2.34 0.50 1.84 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3152 0.6848 0.0000 0 0 0.8124 0.1876 0.0000 0 0 0.9011 0.0989 0.0000
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 630 142 488 29 1 68 1 43 0 1 475 0 12 0.2042 0.0000 0.0266 1.088 0.59 7.67 -7.09 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0053 0.1991 0.7956 1 2 0.0064 0.2094 0.7842 1 2 0.0081 0.2237 0.7682
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 125 50 75 42 1 2 1 4 0 0 75 0 0 0.8400 0.0000 0.0000 24.000 0.62 2.50 -1.88 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0555 0.9445 0.0000 0 1 0.2730 0.7270 0.0000
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 743 155 588 124 0 11 0 20 0 0 587 0 1 0.8000 0.0000 0.0017 13.091 0.41 3.45 -3.04 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr6 123516182 CCTTTTT C 0.500000 0.100 1 -6 4 163 77 86 68 0 7 0 2 0 0 86 0 0 0.8831 0.0000 0.0000 10.000 0.22 6.00 -5.78 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2730 0.7270 0.0000 0 0 0.7802 0.2198 0.0000 0 0 0.8825 0.1175 0.0000
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 348 102 246 94 1 1 0 6 0 0 246 0 0 0.9216 0.0000 0.0000 101.000 0.23 1.00 -0.77 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1643 0.8357 0.0000 0 0 0.6824 0.3176 0.0000
chr6 138882869 AAGGTAAATG A 0.500000 0.100 1 -9 1 164 61 103 57 0 2 0 2 0 0 103 0 0 0.9344 0.0000 0.0000 29.500 0.19 8.00 -7.81 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1765 0.8235 0.0000 0 0 0.6720 0.3280 0.0000 0 0 0.8149 0.1851 0.0000
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 871 217 654 0 0 10 0 207 0 0 648 0 6 0.0000 0.0000 0.0092 20.700 3.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 544 204 340 0 0 41 0 163 0 0 322 0 18 0.0000 0.0000 0.0529 3.976 14.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 367 128 239 58 0 2 0 68 0 0 236 0 3 0.4531 0.0000 0.0126 63.000 0.14 5.74 -5.60 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0359 0.4910 0.4731 1 1 0.0395 0.4896 0.4708 1 1 0.0447 0.4883 0.4670
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 218 80 138 39 0 12 0 29 0 0 136 0 2 0.4875 0.0000 0.0145 5.667 0.18 9.83 -9.65 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4032 0.5143 0.0825 1 1 0.4001 0.5128 0.0871 1 1 0.3956 0.5110 0.0934
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 309 141 168 0 0 21 9 111 0 0 164 0 4 0.0000 0.0000 0.0238 5.714 3.01 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr6 170561925 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 870 305 565 8 4 70 56 167 0 0 563 1 1 0.0262 0.0000 0.0035 3.243 2.75 4.45 -1.70 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.4331 0.5669 2 2 0.0000 0.0158 0.9842
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 874 293 581 25 49 20 89 110 0 0 581 0 0 0.0853 0.0000 0.0000 14.462 5.16 4.15 1.01 7 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0003 0.9997 1 2 0.0000 0.0004 0.9996 1 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 875 274 601 166 61 14 20 13 1 0 600 0 0 0.6058 0.0017 0.0017 37.600 4.86 7.23 -2.38 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0748 0.9252 0.0000
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 875 275 600 116 115 31 0 13 1 0 599 0 0 0.4218 0.0017 0.0017 9.560 3.43 7.23 -3.80 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0758 0.9242 0.0000 0 0 0.9324 0.0676 0.0000
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 260 81 179 72 0 7 0 2 0 0 179 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 10.571 0.58 2.00 -1.42 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3156 0.6844 0.0000 0 0 0.8126 0.1874 0.0000 0 0 0.9012 0.0988 0.0000
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 273 106 167 41 0 31 0 34 0 0 165 0 2 0.3868 0.0000 0.0120 2.419 0.41 3.44 -3.03 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3176 0.5645 0.1179 1 1 0.3178 0.5596 0.1226 1 1 0.3177 0.5534 0.1289
chr7 4682511 CGGGCTCCTCCGG C 0.500000 0.100 1 -12 1 362 113 249 91 1 14 0 7 0 0 249 0 0 0.8053 0.0000 0.0000 7.071 1.46 9.43 -7.97 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0551 0.9449 0.0000 0 1 0.4964 0.5036 0.0000
chr7 5313034 T TGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 1 739 73 666 29 1 11 0 32 0 0 666 0 0 0.3973 0.0000 0.0000 5.545 3.31 6.66 -3.35 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1671 0.5687 0.2643 1 1 0.1709 0.5635 0.2656 1 1 0.1759 0.5570 0.2670
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 604 176 428 75 0 27 1 73 0 0 428 0 0 0.4261 0.0000 0.0000 5.519 0.21 2.97 -2.76 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1792 0.6739 0.1469 1 1 0.1853 0.6617 0.1531 1 1 0.1929 0.6461 0.1610
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 358 101 257 59 0 3 0 39 0 0 257 0 0 0.5842 0.0000 0.0000 32.667 0.12 3.08 -2.96 19 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6829 0.3042 0.0130 1 0 0.6730 0.3121 0.0149 1 0 0.6591 0.3230 0.0178
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 125 47 78 29 1 0 2 15 0 0 78 0 0 0.6170 0.0000 0.0000 46.000 0.28 1.00 -0.72 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5711 0.3872 0.0417 1 0 0.5612 0.3935 0.0453 1 0 0.5478 0.4017 0.0505
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 475 132 343 62 1 3 0 66 0 0 343 0 0 0.4697 0.0000 0.0000 42.667 0.94 1.17 -0.23 42 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1243 0.6413 0.2344 1 1 0.1299 0.6311 0.2390 1 1 0.1372 0.6182 0.2446
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 194 52 142 48 0 2 0 2 0 0 141 0 1 0.9231 0.0000 0.0070 25.000 0.29 4.00 -3.71 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0145 0.9855 0.0000 0 1 0.3107 0.6893 0.0000 0 0 0.5996 0.4004 0.0000
chr7 43647475 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 188 65 123 5 0 3 0 57 0 0 121 0 2 0.0769 0.0000 0.0163 20.667 0.00 3.09 -3.09 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9150 0.0850 2 1 0.0000 0.5857 0.4143
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 216 85 131 80 0 2 0 3 0 0 131 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 41.500 0.19 3.67 -3.48 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0698 0.9302 0.0000 0 0 0.6903 0.3097 0.0000 0 0 0.8762 0.1238 0.0000
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 800 204 596 0 0 17 0 187 0 0 587 0 9 0.0000 0.0000 0.0151 11.000 3.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 586 164 422 8 1 28 1 126 0 0 409 0 13 0.0488 0.0000 0.0308 4.857 1.12 3.79 -2.67 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9285 0.0715 2 2 0.0000 0.2638 0.7362
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 221 75 146 8 0 2 1 64 0 0 143 0 3 0.1067 0.0000 0.0205 36.000 0.50 2.98 -2.48 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9941 0.0059 2 1 0.0000 0.8630 0.1370
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 685 214 471 93 0 3 1 117 0 0 467 0 4 0.4346 0.0000 0.0085 70.333 0.10 4.12 -4.02 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0024 0.2442 0.7534 1 2 0.0030 0.2499 0.7471 1 2 0.0039 0.2584 0.7377
chr7 100779516 A AGGGC 0.500000 0.100 1 4 1 203 77 126 69 0 2 0 6 0 0 125 0 1 0.8961 0.0000 0.0079 37.500 0.48 3.50 -3.02 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0179 0.9821 0.0000 0 1 0.2415 0.7585 0.0000
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 189 75 114 59 0 0 0 16 0 0 106 0 8 0.7867 0.0000 0.0702 75.000 0.19 17.81 -17.63 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9136 0.0855 0.0009 1 0 0.9050 0.0939 0.0011 1 0 0.8918 0.1066 0.0016
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.100 1 -7 1 605 200 405 144 0 4 0 52 0 0 404 0 1 0.7200 0.0000 0.0025 49.000 0.39 6.90 -6.51 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9994 0.0006 0.0000 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 570 164 406 0 0 5 0 159 0 0 402 0 4 0.0000 0.0000 0.0099 31.800 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 404 115 289 36 1 41 1 36 0 1 285 0 3 0.3130 0.0000 0.0138 1.825 2.17 6.42 -4.25 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1634 0.5889 0.2477 1 1 0.1676 0.5822 0.2501 1 1 0.1732 0.5739 0.2529
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 672 156 516 78 0 10 2 66 0 0 515 0 1 0.5000 0.0000 0.0019 14.600 0.18 3.79 -3.61 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3518 0.5897 0.0585 1 1 0.3545 0.5824 0.0632 1 1 0.3570 0.5733 0.0697
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 621 204 417 103 1 31 0 69 0 0 416 0 1 0.5049 0.0000 0.0024 5.581 0.43 15.03 -14.60 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8601 0.1389 0.0010 1 0 0.8518 0.1469 0.0013 1 0 0.8397 0.1585 0.0018
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 215 62 153 0 0 2 0 60 0 0 150 0 3 0.0000 0.0000 0.0196 30.000 3.30 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0387 0.9613 2 2 0.0000 0.0412 0.9588 2 2 0.0000 0.0449 0.9551
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 874 227 647 5 100 43 2 77 0 2 643 0 2 0.0220 0.0000 0.0062 4.279 2.20 3.34 -1.14 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7115 0.2840 0.0046 1 0 0.7050 0.2895 0.0055 1 0 0.6953 0.2977 0.0070
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 876 234 642 83 3 41 2 105 0 0 640 0 2 0.3547 0.0000 0.0031 4.683 2.95 3.20 -0.25 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0069 0.3456 0.6476 1 2 0.0081 0.3487 0.6432 1 2 0.0101 0.3537 0.6362
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1560 381 1179 38 0 25 3 315 0 0 1178 0 1 0.0997 0.0000 0.0008 14.200 0.32 1.28 -0.96 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 612 127 485 0 0 4 0 123 0 0 483 0 2 0.0000 0.0000 0.0041 30.750 4.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 714 215 499 125 1 1 0 88 0 0 496 0 3 0.5814 0.0000 0.0060 213.000 0.45 1.38 -0.93 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8440 0.1552 0.0009 1 0 0.8367 0.1622 0.0011 1 0 0.8259 0.1725 0.0015
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 730 214 516 192 2 8 0 12 1 0 515 0 0 0.8972 0.0019 0.0019 25.750 0.68 11.00 -10.32 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0458 0.9542 0.0000 0 0 0.8533 0.1467 0.0000
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 460 85 375 0 0 0 15 70 0 1 352 11 11 0.0000 0.0000 0.0613 85.000 7.64 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0239 0.9761 2 2 0.0000 0.0106 0.9894 2 2 0.0000 0.0084 0.9916
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 464 85 379 0 1 6 10 68 0 0 356 10 13 0.0000 0.0000 0.0607 38.000 7.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0073 0.9927
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 478 82 396 0 0 7 7 68 0 0 322 38 36 0.0000 0.0000 0.1869 10.429 7.91 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 502 159 343 105 0 0 0 54 0 0 343 0 0 0.6604 0.0000 0.0000 159.000 0.64 1.74 -1.10 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9729 0.0271 0.0000 1 0 0.9690 0.0309 0.0001 1 0 0.9630 0.0369 0.0001
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 326 85 241 40 0 3 0 42 0 0 239 0 2 0.4706 0.0000 0.0083 27.333 0.55 3.29 -2.74 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1299 0.5830 0.2871 1 1 0.1346 0.5768 0.2886 1 1 0.1409 0.5690 0.2901
chr8 544658 GGGCGGC G 0.425210 0.100 1 -6 1 230 113 117 94 1 10 0 8 0 0 116 0 1 0.8319 0.0000 0.0085 10.300 0.84 6.50 -5.66 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0108 0.9892 0.0000 0 1 0.2998 0.7002 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 754 160 594 127 1 22 0 10 0 0 594 0 0 0.7937 0.0000 0.0000 6.273 1.12 6.00 -4.88 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0118 0.9882 0.0000 0 1 0.4061 0.5939 0.0000
chr8 8377352 CGCCGCT C 0.473558 0.100 1 -6 2 691 150 541 69 1 23 0 57 1 0 539 0 1 0.4600 0.0018 0.0037 5.478 0.90 5.86 -4.96 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4819 0.4838 0.0343 1 1 0.4799 0.4824 0.0377 1 1 0.4764 0.4811 0.0425
chr8 8892929 CGGCCCCGGGGCA C 0.000156 0.100 1 -12 4 497 138 359 110 0 18 0 10 0 0 357 0 2 0.7971 0.0000 0.0056 6.667 0.71 10.50 -9.79 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8153 0.1847 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 296 128 168 71 0 4 0 53 0 0 168 0 0 0.5547 0.0000 0.0000 31.000 0.21 2.96 -2.75 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6295 0.3557 0.0148 1 0 0.6230 0.3602 0.0168 1 0 0.6135 0.3666 0.0198
chr8 11808709 G GTCCCACTCCCACTCCCAC 0.013640 0.100 1 18 1 559 226 333 94 2 45 0 85 0 0 317 0 16 0.4159 0.0000 0.0480 4.209 6.28 10.86 -4.58 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2052 0.7889 0.0059 1 1 0.2198 0.7741 0.0061 1 1 0.2392 0.7543 0.0064
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 559 253 306 107 2 37 0 107 0 1 305 0 0 0.4229 0.0000 0.0033 5.838 8.76 5.76 3.00 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0217 0.7823 0.1960 1 1 0.0229 0.7668 0.2103 1 1 0.0243 0.7463 0.2294
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 361 138 223 131 0 2 0 5 0 0 223 0 0 0.9493 0.0000 0.0000 68.000 0.51 7.40 -6.89 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0453 0.9547 0.0000 0 0 0.9314 0.0686 0.0000 0 0 0.9894 0.0106 0.0000
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 241 110 131 103 1 2 0 4 0 0 131 0 0 0.9364 0.0000 0.0000 54.000 0.27 3.75 -3.48 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0621 0.9379 0.0000 0 0 0.8508 0.1492 0.0000 0 0 0.9636 0.0364 0.0000
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 557 183 374 166 1 2 0 14 0 0 373 1 0 0.9071 0.0000 0.0027 90.500 0.54 3.64 -3.11 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.3763 0.6237 0.0000
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 204 97 107 89 0 4 0 4 0 0 107 0 0 0.9175 0.0000 0.0000 23.250 0.45 2.00 -1.55 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0127 0.9873 0.0000 0 0 0.5466 0.4534 0.0000 0 0 0.8522 0.1478 0.0000
chr8 79766258 AGGCATGT A 0.500000 0.100 1 -7 1 299 77 222 8 0 2 0 67 0 0 220 0 2 0.1039 0.0000 0.0090 37.500 0.00 7.88 -7.88 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9938 0.0062 2 1 0.0000 0.8565 0.1435
chr8 80486812 TGTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 320 86 234 40 3 2 0 41 0 0 232 0 2 0.4651 0.0000 0.0085 42.000 2.15 3.83 -1.68 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1881 0.6029 0.2089 1 1 0.1921 0.5953 0.2125 1 1 0.1973 0.5857 0.2170
chr8 97775937 C CGGCGGGCTCCAGGCGA 0.500000 0.100 1 16 1 271 97 174 44 0 19 1 33 0 0 167 0 7 0.4536 0.0000 0.0402 4.105 0.50 9.85 -9.35 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2628 0.5922 0.1449 1 1 0.2651 0.5854 0.1496 1 1 0.2676 0.5767 0.1556
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 273 85 188 57 0 0 1 27 0 0 186 0 2 0.6706 0.0000 0.0106 85.000 0.47 2.52 -2.04 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8226 0.1735 0.0039 1 0 0.8115 0.1838 0.0047 1 0 0.7957 0.1982 0.0061
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 645 232 413 142 0 6 1 83 0 0 413 0 0 0.6121 0.0000 0.0000 37.667 2.04 17.41 -15.37 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9811 0.0189 0.0000 1 0 0.9783 0.0217 0.0000 1 0 0.9739 0.0260 0.0000
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 476 133 343 0 0 18 9 106 0 0 338 0 5 0.0000 0.0000 0.0146 6.333 4.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0030 0.9970
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 381 92 289 45 1 8 1 37 0 1 284 0 4 0.4891 0.0000 0.0173 10.500 3.40 3.97 -0.57 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3069 0.5790 0.1142 1 1 0.3080 0.5730 0.1190 1 1 0.3089 0.5655 0.1256
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 958 224 734 171 1 35 0 17 0 0 733 0 1 0.7634 0.0000 0.0014 5.400 0.58 12.12 -11.54 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0389 0.9611 0.0000
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 991 204 787 99 0 2 0 103 1 0 786 0 0 0.4853 0.0013 0.0013 101.000 0.39 3.13 -2.73 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0990 0.7215 0.1795 1 1 0.1058 0.7068 0.1874 1 1 0.1149 0.6877 0.1974
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 981 325 656 218 6 73 2 26 1 0 655 0 0 0.6708 0.0015 0.0015 3.425 0.25 3.12 -2.86 74 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0052 0.9948 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 320 98 222 48 1 17 0 32 0 0 216 0 6 0.4898 0.0000 0.0270 4.765 0.35 6.38 -6.02 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4666 0.4807 0.0527 1 1 0.4622 0.4809 0.0568 1 1 0.4559 0.4814 0.0626
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 613 185 428 101 0 3 0 81 0 0 428 0 0 0.5459 0.0000 0.0000 60.667 0.25 1.73 -1.48 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5912 0.3976 0.0112 1 0 0.5879 0.3991 0.0130 1 0 0.5825 0.4017 0.0158
chr9 33796692 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 461 190 271 102 1 5 0 82 0 0 269 0 2 0.5368 0.0000 0.0074 37.000 1.36 3.07 -1.71 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5570 0.4297 0.0133 1 0 0.5552 0.4295 0.0153 1 0 0.5515 0.4301 0.0184
chr9 35562396 A ATAGT 0.500000 0.100 1 4 5 703 161 542 148 0 0 0 13 0 0 541 0 1 0.9193 0.0000 0.0018 161.000 1.26 4.00 -2.74 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1414 0.8586 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 752 177 575 142 0 28 1 6 0 0 574 0 1 0.8023 0.0000 0.0017 5.286 0.37 12.50 -12.13 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3465 0.6535 0.0000 0 0 0.8975 0.1025 0.0000
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 394 60 334 29 0 0 0 31 0 0 334 0 0 0.4833 0.0000 0.0000 60.000 0.38 1.35 -0.98 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1736 0.5683 0.2581 1 1 0.1773 0.5631 0.2596 1 1 0.1821 0.5567 0.2612
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 367 90 277 8 0 4 0 78 0 0 273 0 4 0.0889 0.0000 0.0144 21.500 0.00 14.28 -14.28 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9881 0.0119 2 1 0.0000 0.7604 0.2396
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 610 122 488 0 0 14 0 108 0 0 471 0 17 0.0000 0.0000 0.0348 7.714 9.81 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 434 120 314 7 0 3 0 110 0 0 307 0 7 0.0583 0.0000 0.0223 39.000 0.00 3.32 -3.32 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8333 0.1667 2 2 0.0000 0.2342 0.7658
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 241 96 145 89 1 1 0 5 0 0 144 0 1 0.9271 0.0000 0.0069 95.000 0.28 4.60 -4.32 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1309 0.8691 0.0000 0 0 0.6263 0.3737 0.0000
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 289 98 191 4 42 22 0 30 0 1 190 0 0 0.0408 0.0000 0.0052 3.455 0.00 3.10 -3.10 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6333 0.3446 0.0221 1 0 0.6234 0.3518 0.0247 1 0 0.6097 0.3616 0.0287
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 289 99 190 30 5 22 4 38 0 0 187 2 1 0.3030 0.0000 0.0158 3.500 2.43 3.37 -0.94 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0634 0.4944 0.4421 1 1 0.0678 0.4940 0.4382 1 1 0.0739 0.4936 0.4325
chr9 92474742 CTCATCA C 0.500000 0.100 1 -6 2 290 102 188 39 1 58 0 4 0 0 186 1 1 0.3824 0.0000 0.0106 0.786 2.31 8.50 -6.19 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0280 0.9720 0.0000 0 1 0.1896 0.8104 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 421 163 258 80 0 4 1 78 0 0 258 0 0 0.4908 0.0000 0.0000 39.750 0.19 8.95 -8.76 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1737 0.6845 0.1418 1 1 0.1801 0.6717 0.1482 1 1 0.1883 0.6552 0.1565
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 580 203 377 96 0 0 0 107 0 0 371 0 6 0.4729 0.0000 0.0159 203.000 0.41 3.36 -2.95 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0166 0.4998 0.4836 1 1 0.0190 0.4955 0.4855 1 1 0.0226 0.4908 0.4865
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 351 92 259 40 0 11 0 41 0 0 259 0 0 0.4348 0.0000 0.0000 7.364 0.12 5.51 -5.39 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1801 0.5967 0.2233 1 1 0.1841 0.5895 0.2264 1 1 0.1893 0.5805 0.2303
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 820 146 674 46 0 38 1 61 1 2 667 1 3 0.3151 0.0015 0.0104 2.816 1.52 6.90 -5.38 16 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0191 0.3742 0.6067 1 2 0.0216 0.3790 0.5994 1 2 0.0253 0.3858 0.5889
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 508 139 369 88 0 0 0 51 0 0 369 0 0 0.6331 0.0000 0.0000 139.000 0.33 2.69 -2.36 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9077 0.0917 0.0006 1 0 0.8998 0.0995 0.0008 1 0 0.8880 0.1109 0.0011
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 822 176 646 95 0 0 0 81 0 0 645 0 1 0.5398 0.0000 0.0015 176.000 0.25 4.79 -4.54 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4185 0.5497 0.0318 1 1 0.4208 0.5439 0.0353 1 1 0.4226 0.5370 0.0404
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 778 194 584 106 0 1 1 86 0 0 581 0 3 0.5464 0.0000 0.0051 193.000 0.13 2.99 -2.86 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4735 0.5066 0.0198 1 1 0.4751 0.5025 0.0225 1 1 0.4757 0.4978 0.0265
chr9 110138061 G GGAAGCT 0.500000 0.100 1 6 1 631 150 481 120 0 22 0 8 0 0 480 0 1 0.8000 0.0000 0.0021 5.818 0.35 6.25 -5.90 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0269 0.9731 0.0000 0 0 0.5116 0.4884 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 265 110 155 0 0 3 0 107 0 0 155 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 35.667 3.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0048 0.9952 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 438 99 339 40 1 17 1 40 0 0 339 0 0 0.4040 0.0000 0.0000 4.824 0.53 6.15 -5.62 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1997 0.5991 0.2012 1 1 0.2034 0.5918 0.2049 1 1 0.2080 0.5825 0.2095
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 589 121 468 61 1 6 1 52 0 0 465 0 3 0.5041 0.0000 0.0064 19.167 0.70 6.15 -5.45 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3056 0.6014 0.0930 1 1 0.3080 0.5938 0.0982 1 1 0.3106 0.5842 0.1052
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 514 126 388 14 0 15 2 95 0 0 384 1 3 0.1111 0.0000 0.0103 7.400 0.00 1.57 -1.57 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9830 0.0170
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 531 183 348 82 1 18 3 79 1 0 347 0 0 0.4481 0.0029 0.0029 9.167 0.76 3.43 -2.67 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1853 0.6889 0.1258 1 1 0.1919 0.6758 0.1323 1 1 0.2002 0.6591 0.1407
chr9 128822601 CAGTA C 0.500000 0.100 1 -4 3 443 123 320 61 1 5 0 56 0 0 319 0 1 0.4959 0.0000 0.0031 23.600 0.08 4.30 -4.22 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2812 0.6144 0.1044 1 1 0.2844 0.6059 0.1097 1 1 0.2880 0.5952 0.1168
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 486 163 323 0 0 4 0 159 0 0 319 0 4 0.0000 0.0000 0.0124 39.750 3.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 493 139 354 66 1 10 1 61 1 0 349 0 4 0.4748 0.0028 0.0141 12.800 0.20 7.54 -7.34 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2108 0.6529 0.1363 1 1 0.2160 0.6420 0.1420 1 1 0.2224 0.6280 0.1495
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 411 113 298 43 29 36 0 5 0 0 298 0 0 0.3805 0.0000 0.0000 2.139 2.63 2.60 0.03 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1497 0.8503 0.0000 0 0 0.5682 0.4318 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 276 115 161 57 0 0 0 58 0 0 161 0 0 0.4957 0.0000 0.0000 115.000 0.30 1.88 -1.58 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1639 0.6362 0.1998 1 1 0.1691 0.6264 0.2046 1 1 0.1757 0.6139 0.2105
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 276 115 161 57 0 0 0 58 0 0 161 0 0 0.4957 0.0000 0.0000 115.000 0.30 1.88 -1.58 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1639 0.6362 0.1998 1 1 0.1691 0.6264 0.2046 1 1 0.1757 0.6139 0.2105
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 300 111 189 96 2 1 0 12 0 0 188 0 1 0.8649 0.0000 0.0053 108.000 0.34 1.50 -1.16 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0272 0.9728 0.0000
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 416 98 318 42 0 4 0 52 0 0 318 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 23.500 0.69 1.27 -0.58 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0595 0.5085 0.4320 1 1 0.0638 0.5069 0.4292 1 1 0.0699 0.5052 0.4249
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 590 190 400 81 0 26 7 76 1 0 399 0 0 0.4263 0.0025 0.0025 6.308 0.52 3.30 -2.78 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1397 0.6909 0.1693 1 1 0.1463 0.6777 0.1760 1 1 0.1548 0.6608 0.1844
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 482 142 340 122 1 13 1 5 0 0 337 0 3 0.8592 0.0000 0.0088 9.846 0.46 15.20 -14.74 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0661 0.9339 0.0000 0 0 0.6470 0.3530 0.0000
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 289 130 159 32 27 32 0 39 0 0 159 0 0 0.2462 0.0000 0.0000 3.062 1.38 3.00 -1.62 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6834 0.3036 0.0129 1 0 0.6736 0.3116 0.0148 1 0 0.6597 0.3225 0.0178
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 210 83 127 45 0 0 0 38 0 0 125 0 2 0.5422 0.0000 0.0157 83.000 0.13 4.13 -4.00 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4490 0.5120 0.0390 1 1 0.4512 0.5082 0.0407 1 1 0.4535 0.5035 0.0430
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 864 202 662 88 3 18 1 92 1 0 657 0 4 0.4356 0.0015 0.0076 10.222 0.36 5.60 -5.23 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0844 0.6927 0.2229 1 1 0.0906 0.6795 0.2299 1 1 0.0991 0.6626 0.2384
chr10 27398605 C CT 0.021536 0.100 1 1 2 709 192 517 174 0 10 0 8 0 0 517 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 18.200 0.31 1.00 -0.69 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0076 0.9924 0.0000 0 0 0.9825 0.0175 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 507 158 349 87 0 7 0 64 0 0 348 0 1 0.5506 0.0000 0.0029 21.571 0.56 1.25 -0.69 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7312 0.2640 0.0048 1 0 0.7251 0.2692 0.0057 1 0 0.7162 0.2768 0.0070
chr10 49988768 A AC 0.134835 0.100 1 1 1 591 200 391 134 0 3 0 63 0 0 391 0 0 0.6700 0.0000 0.0000 65.667 0.12 1.94 -1.82 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9973 0.0027 0.0000 1 0 0.9968 0.0032 0.0000 1 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr10 50008914 CAA C 0.245598 0.100 1 -2 1 899 227 672 136 0 2 2 87 0 0 670 0 2 0.5991 0.0000 0.0030 112.500 0.27 2.28 -2.00 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9555 0.0444 0.0000 1 0 0.9516 0.0483 0.0001 1 0 0.9457 0.0542 0.0001
chr10 63208190 ACTAAAC A 0.035276 0.100 1 -6 1 801 182 619 94 1 1 0 86 0 0 615 0 4 0.5165 0.0000 0.0065 181.000 0.29 6.02 -5.74 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3878 0.6069 0.0053 1 1 0.3994 0.5949 0.0056 1 1 0.4139 0.5799 0.0061
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 381 93 288 71 1 13 0 8 0 0 288 0 0 0.7634 0.0000 0.0000 6.154 0.15 3.38 -3.22 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0364 0.9636 0.0000 0 0 0.5007 0.4993 0.0000
chr10 75028886 A AGAG 0.000059 0.100 1 3 2 707 125 582 104 0 17 0 4 0 0 582 0 0 0.8320 0.0000 0.0000 6.353 0.73 3.75 -3.02 30 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9979 0.0021 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 208 32 176 15 2 1 0 14 0 0 176 0 0 0.4688 0.0000 0.0000 29.000 0.27 2.21 -1.95 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4837 0.4828 0.0336 1 0 0.4836 0.4822 0.0342 1 0 0.4834 0.4815 0.0351
chr10 87234508 TCTC T 0.013816 0.100 1 -3 2 1043 419 624 395 10 3 0 11 0 0 624 0 0 0.9427 0.0000 0.0000 138.333 0.23 4.36 -4.13 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6121 0.3879 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 622 127 495 68 2 1 0 56 0 0 494 0 1 0.5354 0.0000 0.0020 126.000 0.50 5.95 -5.45 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5825 0.4023 0.0152 1 0 0.5810 0.4023 0.0168 1 0 0.5781 0.4028 0.0190
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 393 103 290 43 0 12 0 48 0 0 288 0 2 0.4175 0.0000 0.0069 7.583 0.93 5.94 -5.01 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0941 0.5655 0.3404 1 1 0.0992 0.5607 0.3401 1 1 0.1062 0.5547 0.3392
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 333 127 206 111 1 4 0 11 0 0 204 0 2 0.8740 0.0000 0.0097 30.500 0.71 2.45 -1.74 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.1551 0.8449 0.0000
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 182 53 129 0 0 2 0 51 0 0 128 0 1 0.0000 0.0000 0.0078 25.500 2.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0263 0.9737 2 2 0.0000 0.0277 0.9723 2 2 0.0000 0.0297 0.9703
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 349 108 241 0 3 15 0 90 0 0 241 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.133 2.14 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0325 0.9675 2 2 0.0000 0.0267 0.9733 2 2 0.0000 0.0240 0.9760
chr10 124984991 G GA 0.100418 0.100 1 1 1 211 50 161 22 0 6 5 17 0 0 161 0 0 0.4400 0.0000 0.0000 7.333 0.27 1.12 -0.84 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4205 0.5385 0.0410 1 1 0.4234 0.5351 0.0415 1 1 0.4270 0.5309 0.0421
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.100 1 21 2 620 122 498 74 0 7 0 41 0 0 477 0 21 0.6066 0.0000 0.0422 16.429 1.24 15.44 -14.20 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5906 0.4014 0.0080 1 0 0.5912 0.4000 0.0088 1 0 0.5913 0.3988 0.0099
chr10 127738728 G GGCC 0.003313 0.100 1 3 1 442 130 312 123 1 0 0 6 0 0 312 0 0 0.9462 0.0000 0.0000 129.000 0.56 3.67 -3.11 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2172 0.7828 0.0000 0 0 0.9960 0.0040 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 692 161 531 81 1 6 0 73 0 0 529 0 2 0.5031 0.0000 0.0038 25.833 0.41 3.01 -2.61 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3510 0.5996 0.0494 1 1 0.3570 0.5901 0.0529 1 1 0.3641 0.5782 0.0577
chr11 637536 GCCGCCGACCTCCT G 0.012628 0.100 1 -13 2 294 101 193 56 0 3 1 41 0 0 191 0 2 0.5545 0.0000 0.0104 32.667 0.20 12.22 -12.02 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6652 0.3340 0.0008 1 0 0.6632 0.3359 0.0009 1 0 0.6600 0.3390 0.0010
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 239 80 159 0 1 2 1 76 0 0 159 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 38.500 2.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1631 0.8369 2 2 0.0000 0.0713 0.9287 2 2 0.0000 0.0542 0.9458
chr11 1094638 ACCAACCACCACTCCCAGCCCT A 0.029704 0.100 1 -21 2 1511 348 1163 100 12 161 9 66 5 8 1035 18 97 0.2874 0.0043 0.1101 1.133 2.29 12.24 -9.95 22 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0001 0.1840 0.8160 1 2 0.0001 0.2056 0.7943 1 2 0.0002 0.2381 0.7617
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1036 221 815 77 1 94 0 49 0 0 815 0 0 0.3484 0.0000 0.0000 1.351 1.27 4.67 -3.40 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8104 0.1865 0.0031 1 0 0.7999 0.1963 0.0038 1 0 0.7849 0.2101 0.0050
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.100 1 -30 1 895 185 710 13 0 59 2 111 0 0 666 0 44 0.0703 0.0000 0.0620 2.119 2.54 10.54 -8.00 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9551 0.0449
chr11 2884884 C CGGGGCT 0.000026 0.100 1 6 2 445 97 348 77 8 5 0 7 0 1 347 0 0 0.7938 0.0000 0.0029 18.000 2.42 7.43 -5.01 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3440 0.6560 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 323 111 212 0 0 2 1 108 0 0 212 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 54.500 2.91 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0050 0.9950
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 677 216 461 8 0 7 0 201 0 0 461 0 0 0.0370 0.0000 0.0000 29.857 0.12 1.25 -1.12 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 2 0.0000 0.1768 0.8232 2 2 0.0000 0.0097 0.9903
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 196 98 98 0 0 2 46 50 0 0 97 0 1 0.0000 0.0000 0.0102 53.000 2.18 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0121 0.9879 2 2 0.0000 0.0134 0.9866 2 2 0.0000 0.0152 0.9848
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 196 100 96 2 0 49 2 47 0 0 96 0 0 0.0200 0.0000 0.0000 50.000 1.00 2.23 -1.23 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5792 0.4208 2 2 0.0000 0.1318 0.8682 2 2 0.0000 0.0691 0.9309
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 583 121 462 76 0 3 0 42 0 0 462 0 0 0.6281 0.0000 0.0000 39.333 0.46 3.12 -2.66 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8898 0.1092 0.0011 1 0 0.8808 0.1178 0.0014 1 0 0.8677 0.1304 0.0019
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 801 209 592 196 0 4 0 9 0 0 591 1 0 0.9378 0.0000 0.0017 51.250 0.15 3.44 -3.30 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5167 0.4833 0.0000 0 0 0.9734 0.0266 0.0000
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 467 135 332 17 0 7 1 110 0 0 331 0 1 0.1259 0.0000 0.0030 18.286 0.94 2.27 -1.33 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9958 0.0042
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 1041 246 795 120 0 6 1 119 0 0 783 0 12 0.4878 0.0000 0.0151 40.000 0.23 5.91 -5.67 38 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0291 0.6573 0.3136 1 1 0.0328 0.6446 0.3226 1 1 0.0382 0.6287 0.3331
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 747 184 563 85 0 6 0 93 0 0 563 0 0 0.4620 0.0000 0.0000 29.667 0.25 1.82 -1.57 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0607 0.6426 0.2966 1 1 0.0658 0.6320 0.3022 1 1 0.0729 0.6185 0.3087
chr11 5454201 T TCA 0.500000 0.100 1 2 1 535 139 396 83 0 3 1 52 0 0 395 1 0 0.5971 0.0000 0.0025 45.333 0.18 2.12 -1.93 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8216 0.1760 0.0025 1 0 0.8120 0.1850 0.0031 1 0 0.7982 0.1978 0.0040
chr11 5489310 G GGGCT 0.500000 0.100 1 4 1 657 145 512 66 0 3 0 76 0 0 503 0 9 0.4552 0.0000 0.0176 47.333 1.83 5.09 -3.26 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0139 0.3840 0.6020 1 2 0.0160 0.3872 0.5969 1 2 0.0191 0.3919 0.5890
chr11 5788576 GA G 0.500000 0.100 1 -1 3 398 80 318 42 0 2 0 36 0 0 318 0 0 0.5250 0.0000 0.0000 39.000 0.90 1.83 -0.93 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3423 0.5536 0.1042 1 1 0.3417 0.5494 0.1089 1 1 0.3405 0.5442 0.1153
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 770 125 645 0 0 16 0 109 0 0 629 0 16 0.0000 0.0000 0.0248 6.812 9.44 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr11 6641514 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 5 558 153 405 119 6 24 0 4 0 0 405 0 0 0.7778 0.0000 0.0000 5.375 0.57 3.00 -2.43 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0749 0.9251 0.0000 0 0 0.8792 0.1208 0.0000 0 0 0.9706 0.0294 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 290 123 167 106 1 12 0 4 0 0 167 0 0 0.8618 0.0000 0.0000 9.250 0.50 3.25 -2.75 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0312 0.9688 0.0000 0 0 0.7473 0.2527 0.0000 0 0 0.9324 0.0676 0.0000
chr11 12249246 GGT G 0.500000 0.100 1 -2 1 172 81 91 41 0 1 0 39 0 0 90 0 1 0.5062 0.0000 0.0110 80.000 0.17 2.10 -1.93 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2215 0.5969 0.1817 1 1 0.2247 0.5897 0.1857 1 1 0.2286 0.5806 0.1908
chr11 12294797 G GCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 9 1 549 156 393 100 2 47 0 7 0 1 392 0 0 0.6410 0.0000 0.0025 2.370 2.17 9.29 -7.12 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0911 0.9089 0.0000 0 0 0.6256 0.3744 0.0000
chr11 12294797 GCTCCTC G 0.500000 0.100 1 -6 1 549 161 388 108 1 42 0 10 0 0 388 0 0 0.6708 0.0000 0.0000 2.833 2.08 5.80 -3.72 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 1 0.2449 0.7551 0.0000
chr11 17330930 TACA T 0.500000 0.100 1 -3 2 164 64 100 55 0 2 0 7 0 0 100 0 0 0.8594 0.0000 0.0000 31.000 0.38 3.86 -3.48 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0090 0.9910 0.0000 0 1 0.1390 0.8610 0.0000
chr11 18105983 A ACCTCCT 0.500000 0.100 1 6 2 329 173 156 143 0 18 0 12 0 0 155 0 1 0.8266 0.0000 0.0064 8.611 1.44 6.08 -4.64 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.1971 0.8029 0.0000
chr11 18106011 C CCGG 0.500000 0.100 1 3 3 327 155 172 78 0 11 1 65 0 0 168 0 4 0.5032 0.0000 0.0233 13.091 1.00 3.23 -2.23 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3257 0.6079 0.0665 1 1 0.3291 0.5995 0.0714 1 1 0.3327 0.5891 0.0783
chr11 33025693 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 401 111 290 64 0 0 0 47 0 0 290 0 0 0.5766 0.0000 0.0000 111.000 0.31 1.11 -0.79 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5975 0.3820 0.0206 1 0 0.5903 0.3865 0.0231 1 0 0.5801 0.3929 0.0270
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.100 1 -12 1 296 72 224 32 0 1 0 39 0 0 221 0 3 0.4444 0.0000 0.0134 71.000 0.12 10.97 -10.85 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0625 0.4840 0.4536 1 1 0.0668 0.4843 0.4490 1 1 0.0728 0.4848 0.4424
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 194 72 122 4 0 1 0 67 0 0 119 0 3 0.0556 0.0000 0.0246 71.000 0.25 6.15 -5.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9951 0.0049 2 1 0.0000 0.6819 0.3181 2 2 0.0000 0.3038 0.6962
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 809 284 525 266 1 9 0 8 0 0 525 0 0 0.9366 0.0000 0.0000 30.556 0.16 3.12 -2.96 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0152 0.9848 0.0000 0 0 0.9920 0.0080 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr11 55819875 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 546 141 405 127 1 7 0 6 0 0 405 0 0 0.9007 0.0000 0.0000 19.000 0.37 1.17 -0.80 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.5018 0.4982 0.0000 0 0 0.9135 0.0865 0.0000
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 1031 221 810 0 0 4 0 217 0 0 799 0 11 0.0000 0.0000 0.0136 54.250 2.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 56613070 CCAGA C 0.500000 0.100 1 -4 1 1005 208 797 80 1 15 0 112 0 0 787 0 10 0.3846 0.0000 0.0125 12.867 0.19 3.98 -3.79 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0003 0.0850 0.9147 1 2 0.0004 0.0916 0.9081 1 2 0.0005 0.1013 0.8981
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 651 130 521 70 0 1 0 59 0 0 520 0 1 0.5385 0.0000 0.0019 129.000 0.33 1.54 -1.21 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3934 0.5524 0.0542 1 1 0.3939 0.5476 0.0586 1 1 0.3936 0.5417 0.0647
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 65 25 40 12 0 0 0 13 0 0 40 0 0 0.4800 0.0000 0.0000 25.000 0.08 2.00 -1.92 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2121 0.5294 0.2586 1 1 0.2140 0.5272 0.2589 1 1 0.2164 0.5244 0.2592
chr11 66052428 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 276 94 182 86 1 1 0 6 0 0 182 0 0 0.9149 0.0000 0.0000 93.000 0.69 3.00 -2.31 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1150 0.8850 0.0000 0 0 0.5918 0.4082 0.0000
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 847 171 676 77 1 25 2 66 0 0 631 0 45 0.4503 0.0000 0.0666 5.840 0.31 6.11 -5.79 51 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0008 0.1371 0.8620 1 2 0.0011 0.1447 0.8542 1 2 0.0015 0.1558 0.8426
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 878 223 655 0 0 4 0 219 0 0 654 0 1 0.0000 0.0000 0.0015 54.750 2.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 294 77 217 11 1 1 0 64 0 0 210 0 7 0.1429 0.0000 0.0323 75.000 0.18 14.14 -13.96 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9790 0.0210
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 119 53 66 39 0 0 0 14 0 0 66 0 0 0.7358 0.0000 0.0000 53.000 0.36 2.64 -2.28 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8163 0.1779 0.0058 1 0 0.8002 0.1930 0.0068 1 0 0.7205 0.2716 0.0079
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 453 132 321 71 0 5 0 56 0 0 320 0 1 0.5379 0.0000 0.0031 25.400 0.70 4.36 -3.65 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5006 0.4682 0.0312 1 0 0.4974 0.4681 0.0345 1 0 0.4923 0.4684 0.0393
chr11 89875640 GC G 0.500000 0.100 1 -1 3 641 74 567 58 0 0 0 16 0 0 567 0 0 0.7838 0.0000 0.0000 74.000 0.36 1.75 -1.39 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8564 0.1434 0.0002 0 1 0.2155 0.7844 0.0001 0 1 0.0132 0.9867 0.0000
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1231 360 871 135 10 66 4 145 0 0 870 0 1 0.3750 0.0000 0.0011 4.409 0.77 7.65 -6.88 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0526 0.7828 0.1646 1 1 0.0586 0.7658 0.1756 1 1 0.0671 0.7431 0.1898
chr11 101891348 G GT 0.500000 0.100 1 1 2 271 83 188 72 2 2 0 7 0 0 188 0 0 0.8675 0.0000 0.0000 39.500 0.33 1.29 -0.95 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0235 0.9765 0.0000 0 1 0.2894 0.7106 0.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 777 235 542 96 1 47 1 90 0 0 542 0 0 0.4085 0.0000 0.0000 4.000 0.64 10.22 -9.59 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2448 0.6804 0.0748 1 1 0.2518 0.6677 0.0805 1 1 0.2602 0.6514 0.0884
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 258 101 157 53 0 7 0 41 0 0 157 0 0 0.5248 0.0000 0.0000 13.429 0.53 7.10 -6.57 3 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4859 0.4691 0.0450 1 0 0.4813 0.4698 0.0489 1 0 0.4746 0.4710 0.0544
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 359 125 234 67 0 11 1 46 0 0 234 0 0 0.5360 0.0000 0.0000 10.364 0.51 5.61 -5.10 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6654 0.3219 0.0127 1 0 0.6566 0.3287 0.0146 1 0 0.6442 0.3382 0.0176
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 378 118 260 40 1 11 5 61 0 0 256 1 3 0.3390 0.0000 0.0154 9.727 0.85 3.97 -3.12 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0027 0.1625 0.8349 1 2 0.0033 0.1721 0.8246 1 2 0.0043 0.1858 0.8099
chr12 139085 A AGAG 0.000224 0.100 1 3 2 493 109 384 97 1 9 0 2 0 0 383 1 0 0.8899 0.0000 0.0026 11.111 1.51 3.00 -1.49 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 295 114 181 8 1 0 0 105 0 0 177 0 4 0.0702 0.0000 0.0221 113.000 0.62 2.10 -1.47 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9449 0.0551 2 2 0.0000 0.4020 0.5980
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 524 145 379 58 3 21 2 61 0 0 376 1 2 0.4000 0.0000 0.0079 5.905 0.28 3.10 -2.82 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1250 0.6406 0.2344 1 1 0.1313 0.6309 0.2378 1 1 0.1396 0.6186 0.2418
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.100 1 1 1 603 154 449 139 0 6 0 9 0 0 447 0 2 0.9026 0.0000 0.0045 24.667 0.29 2.89 -2.59 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0546 0.9454 0.0000 0 0 0.8293 0.1707 0.0000
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.100 1 -1 1 612 152 460 139 1 4 0 8 0 0 458 0 2 0.9145 0.0000 0.0043 37.000 0.31 3.25 -2.94 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1463 0.8537 0.0000 0 0 0.9056 0.0944 0.0000
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 440 152 288 4 0 26 9 113 0 0 288 0 0 0.0263 0.0000 0.0000 4.846 0.00 3.19 -3.19 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9181 0.0819 2 2 0.0000 0.1107 0.8893 2 2 0.0000 0.0266 0.9734
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 7658 1859 5799 45 0 11 12 1791 0 0 5728 0 71 0.0242 0.0000 0.0122 184.700 1.44 4.16 -2.72 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9769 0.0231 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 8946399 G GAAC 0.112820 0.100 1 3 3 190 51 139 46 1 2 0 2 0 0 139 0 0 0.9020 0.0000 0.0000 24.500 0.72 2.00 -1.28 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5045 0.4955 0.0000 0 0 0.9073 0.0927 0.0000 0 0 0.9552 0.0448 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 196 62 134 37 0 3 0 22 0 0 134 0 0 0.5968 0.0000 0.0000 19.667 0.57 4.14 -3.57 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6024 0.3663 0.0312 1 0 0.5923 0.3732 0.0344 1 0 0.5784 0.3825 0.0391
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 263 134 129 0 0 13 1 120 0 0 128 0 1 0.0000 0.0000 0.0078 9.308 4.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 371 76 295 41 0 1 0 34 0 0 295 0 0 0.5395 0.0000 0.0000 75.000 0.22 4.03 -3.81 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4266 0.5049 0.0685 1 1 0.4252 0.5028 0.0721 1 1 0.4227 0.5003 0.0770
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.100 1 -30 1 1795 671 1124 486 22 128 6 29 3 3 1117 0 1 0.7243 0.0027 0.0062 4.164 2.71 9.66 -6.95 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.9959 0.0041 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1491 264 1227 10 0 107 0 147 0 0 1136 2 89 0.0379 0.0000 0.0742 1.467 4.70 5.31 -0.61 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.2125 0.7875 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr12 48203092 C CA 0.208713 0.100 1 1 1 1020 246 774 21 0 7 0 218 0 0 772 0 2 0.0854 0.0000 0.0026 34.143 0.38 1.21 -0.83 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9841 0.0159
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 796 184 612 1 1 16 1 165 0 0 610 1 1 0.0054 0.0000 0.0033 10.500 5.00 12.42 -7.42 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0160 0.9840 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1083 271 812 209 1 54 0 7 0 0 812 0 0 0.7712 0.0000 0.0000 4.000 0.42 8.86 -8.44 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1341 0.8659 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 305 82 223 42 0 5 1 34 1 0 221 0 1 0.5122 0.0045 0.0090 15.200 0.24 1.59 -1.35 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4699 0.4818 0.0483 1 1 0.4689 0.4801 0.0510 1 1 0.4670 0.4783 0.0547
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 350 86 264 51 1 0 0 34 0 0 264 0 0 0.5930 0.0000 0.0000 86.000 0.41 1.21 -0.79 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6894 0.2973 0.0133 1 0 0.6804 0.3045 0.0151 1 0 0.6678 0.3144 0.0177
chr12 55427174 CA C 0.271048 0.100 1 -1 1 410 91 319 31 8 14 6 32 0 0 318 0 1 0.3407 0.0000 0.0031 5.143 0.68 1.19 -0.51 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2849 0.5956 0.1194 1 1 0.2902 0.5888 0.1210 1 1 0.2968 0.5801 0.1230
chr12 55743400 C CGCG 0.001333 0.100 1 3 4 372 105 267 76 7 19 0 3 0 0 267 0 0 0.7238 0.0000 0.0000 4.526 0.62 3.00 -2.38 8 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9850 0.0150 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 122 64 58 1 0 2 1 60 0 0 58 0 0 0.0156 0.0000 0.0000 31.000 0.00 2.15 -2.15 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1885 0.8115 2 2 0.0000 0.0721 0.9279 2 2 0.0000 0.0526 0.9474
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 109 42 67 1 0 6 0 35 0 0 67 0 0 0.0238 0.0000 0.0000 6.000 0.00 2.97 -2.97 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7116 0.2884 2 2 0.0000 0.4455 0.5545 2 2 0.0000 0.3562 0.6438
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 947 252 695 0 0 19 4 229 0 0 693 0 2 0.0000 0.0000 0.0029 12.263 3.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 124 56 68 48 1 3 0 4 0 0 68 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 17.667 0.08 1.00 -0.92 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 1 0.2947 0.7053 0.0000 0 0 0.6749 0.3251 0.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 451 127 324 6 0 33 3 85 0 0 319 0 5 0.0472 0.0000 0.0154 2.818 0.67 3.72 -3.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.8519 0.1481 2 2 0.0000 0.3420 0.6580
chr12 102958393 C CGCAGCAGCA 0.500000 0.100 1 9 1 451 127 324 12 65 34 6 10 0 2 320 0 2 0.0945 0.0000 0.0123 2.697 2.92 7.30 -4.38 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0032 0.9968 0.0000
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 442 103 339 89 0 4 0 10 0 0 339 0 0 0.8641 0.0000 0.0000 24.750 0.42 3.20 -2.78 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0020 0.9980 0.0000 0 1 0.1092 0.8908 0.0000
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 363 107 256 49 1 9 1 47 0 0 248 1 7 0.4579 0.0000 0.0312 10.667 0.92 4.55 -3.63 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0970 0.5863 0.3167 1 1 0.1020 0.5797 0.3182 1 1 0.1088 0.5715 0.3197
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 1789 443 1346 247 4 96 6 90 0 2 1318 1 25 0.5576 0.0000 0.0208 3.583 0.85 4.46 -3.61 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 587 166 421 151 0 5 0 10 0 0 420 0 1 0.9096 0.0000 0.0024 32.200 0.32 8.20 -7.88 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0152 0.9848 0.0000 0 0 0.5664 0.4336 0.0000
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 661 197 464 0 62 25 8 102 0 0 462 1 1 0.0000 0.0000 0.0043 4.958 3.93 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0097 0.9903 1 2 0.0000 0.0116 0.9884 1 2 0.0000 0.0173 0.9827
chr12 111598963 C CTGCTGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 12 1 666 207 459 72 1 16 16 102 0 1 457 0 1 0.3478 0.0000 0.0044 11.062 3.40 8.22 -4.81 4 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0003 0.0789 0.9208 1 2 0.0004 0.0855 0.9141 1 2 0.0006 0.0954 0.9041
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 208 98 110 54 0 0 0 44 0 0 109 0 1 0.5510 0.0000 0.0091 98.000 0.78 2.52 -1.74 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4000 0.5328 0.0672 1 1 0.3986 0.5297 0.0717 1 1 0.3961 0.5259 0.0780
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 214 101 113 16 0 8 0 77 0 0 110 0 3 0.1584 0.0000 0.0265 11.625 0.06 5.86 -5.79 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9983 0.0017
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 435 89 346 26 22 11 10 20 0 1 343 0 2 0.2921 0.0000 0.0087 6.273 1.27 4.60 -3.33 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6238 0.3522 0.0240 1 0 0.6140 0.3592 0.0268 1 0 0.6005 0.3686 0.0309
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 329 116 213 0 0 4 2 110 0 0 206 0 7 0.0000 0.0000 0.0329 27.750 5.44 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0031 0.9969
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 303 79 224 0 0 13 0 66 0 0 211 0 13 0.0000 0.0000 0.0580 5.077 12.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0175 0.9825 2 2 0.0000 0.0190 0.9810 2 2 0.0000 0.0212 0.9788
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 543 187 356 95 3 23 0 66 0 1 355 0 0 0.5080 0.0000 0.0028 7.043 0.41 2.32 -1.91 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8458 0.1528 0.0014 1 0 0.8371 0.1611 0.0018 1 0 0.8245 0.1731 0.0024
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 684 141 543 0 0 24 0 117 0 0 519 0 24 0.0000 0.0000 0.0442 4.875 7.90 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 224 88 136 10 1 29 2 46 0 0 131 0 5 0.1136 0.0000 0.0368 2.034 0.30 3.02 -2.72 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9959 0.0041 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9889 0.0111
chr12 124402512 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 3 224 88 136 15 38 30 0 5 0 2 132 0 2 0.1705 0.0000 0.0294 1.933 1.73 1.40 0.33 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0094 0.9906 0.0000 0 1 0.1437 0.8563 0.0000
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 168 64 104 34 0 7 0 23 0 0 104 0 0 0.5312 0.0000 0.0000 8.143 1.21 3.22 -2.01 12 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4995 0.4441 0.0564 1 0 0.4924 0.4471 0.0605 1 0 0.4826 0.4511 0.0663
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 188 58 130 0 0 2 0 56 0 0 121 0 9 0.0000 0.0000 0.0692 28.000 9.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0351 0.9649 2 2 0.0000 0.0375 0.9625 2 2 0.0000 0.0409 0.9591
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 554 162 392 132 3 18 0 9 1 0 391 0 0 0.8148 0.0026 0.0026 8.000 0.46 4.11 -3.65 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0579 0.9421 0.0000 0 0 0.6949 0.3051 0.0000
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 539 160 379 95 9 51 1 4 0 0 379 0 0 0.5938 0.0000 0.0000 2.140 0.29 6.00 -5.71 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0204 0.9796 0.0000 0 0 0.6656 0.3344 0.0000 0 0 0.9069 0.0931 0.0000
chr13 21172461 TG T 0.091820 0.100 1 -1 2 223 83 140 67 0 4 0 12 0 0 140 0 0 0.8072 0.0000 0.0000 19.750 0.15 1.25 -1.10 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.1038 0.8962 0.0000
chr13 41193308 C CTGT 0.000025 0.100 1 3 1 869 206 663 130 1 5 0 70 0 0 663 0 0 0.6311 0.0000 0.0000 40.000 0.28 3.21 -2.94 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9936 0.0064 0.0000 1 0 0.9925 0.0075 0.0000 1 0 0.9907 0.0093 0.0000
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 154 46 108 41 0 1 0 4 0 0 107 0 1 0.8913 0.0000 0.0093 45.000 0.78 5.50 -4.72 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.4788 0.5212 0.0000 0 0 0.8777 0.1223 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 608 154 454 111 0 36 1 6 2 0 452 0 0 0.7208 0.0044 0.0044 3.343 1.60 8.67 -7.06 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 0 0.7332 0.2668 0.0000 0 0 0.9689 0.0311 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 606 92 514 0 0 13 1 78 0 0 503 2 9 0.0000 0.0000 0.0214 6.077 4.64 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 473 91 382 25 6 34 1 25 0 2 374 2 4 0.2747 0.0000 0.0209 1.676 2.32 5.12 -2.80 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2315 0.5772 0.1913 1 1 0.2338 0.5714 0.1947 1 1 0.2368 0.5642 0.1991
chr13 99970583 C CCGG 0.500000 0.100 1 3 1 525 98 427 38 1 27 0 32 1 1 417 3 5 0.3878 0.0023 0.0234 2.630 2.39 5.69 -3.29 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2212 0.5955 0.1833 1 1 0.2244 0.5884 0.1872 1 1 0.2282 0.5795 0.1923
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 547 112 435 52 0 17 0 43 1 1 425 2 6 0.4643 0.0023 0.0230 5.588 1.10 6.74 -5.65 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2587 0.6113 0.1299 1 1 0.2618 0.6031 0.1350 1 1 0.2654 0.5928 0.1418
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 221 80 141 38 0 10 0 32 0 0 141 0 0 0.4750 0.0000 0.0000 7.000 1.47 5.94 -4.46 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3497 0.5439 0.1064 1 1 0.3485 0.5404 0.1111 1 1 0.3465 0.5361 0.1173
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -15 1 298 112 186 44 1 7 1 59 0 0 186 0 0 0.3929 0.0000 0.0000 14.857 0.39 10.66 -10.27 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0278 0.4155 0.5567 1 2 0.0309 0.4187 0.5504 1 2 0.0354 0.4233 0.5413
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 298 116 182 14 1 41 0 60 0 0 181 0 1 0.1207 0.0000 0.0055 1.829 0.79 10.28 -9.50 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.8583 0.1417 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.9981 0.0019
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 568 134 434 73 1 4 0 56 0 0 432 0 2 0.5448 0.0000 0.0046 32.500 0.49 3.14 -2.65 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5481 0.4289 0.0230 1 0 0.5436 0.4306 0.0258 1 0 0.5367 0.4334 0.0299
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 960 231 729 22 0 6 1 202 0 0 727 0 2 0.0952 0.0000 0.0027 37.333 0.09 1.91 -1.82 12 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9589 0.0411
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 806 221 585 85 0 19 0 117 0 0 584 0 1 0.3846 0.0000 0.0017 10.632 0.21 1.27 -1.06 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0014 0.1848 0.8138 1 2 0.0018 0.1926 0.8056 1 2 0.0025 0.2038 0.7937
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 439 140 299 138 1 0 0 1 0 0 299 0 0 0.9857 0.0000 0.0000 140.000 0.45 21.00 -20.55 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9943 0.0057 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 360 73 287 3 0 6 2 62 0 0 285 0 2 0.0411 0.0000 0.0070 11.000 0.00 1.11 -1.11 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9148 0.0852 2 2 0.0000 0.2768 0.7232 2 2 0.0000 0.1066 0.8934
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.100 1 -6 1 617 156 461 136 1 13 0 6 0 0 461 0 0 0.8718 0.0000 0.0000 11.000 0.71 5.67 -4.95 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0070 0.9930 0.0000 0 0 0.8634 0.1366 0.0000 0 0 0.9850 0.0150 0.0000
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.100 1 2 3 1105 290 815 14 0 12 1 263 0 0 807 0 8 0.0483 0.0000 0.0098 23.167 1.71 3.33 -1.61 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9295 0.0705 2 2 0.0000 0.0496 0.9504
chr14 22771504 T TAGC 0.274099 0.100 1 3 3 516 139 377 65 1 17 0 56 0 0 372 0 5 0.4676 0.0000 0.0133 7.176 0.20 3.16 -2.96 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3697 0.5785 0.0518 1 1 0.3749 0.5705 0.0546 1 1 0.3811 0.5605 0.0584
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 563 147 416 63 0 16 2 66 0 0 415 0 1 0.4286 0.0000 0.0024 8.125 0.24 3.00 -2.76 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0795 0.6066 0.3139 1 1 0.0841 0.5980 0.3179 1 1 0.0904 0.5871 0.3225
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 427 98 329 8 0 7 0 83 0 0 327 0 2 0.0816 0.0000 0.0061 13.000 0.12 5.87 -5.74 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9946 0.0054 2 1 0.0000 0.8767 0.1233
chr14 23079578 C CGTGAAT 0.153649 0.100 1 6 2 431 96 335 10 0 4 0 82 0 0 333 0 2 0.1042 0.0000 0.0060 23.000 0.10 5.88 -5.78 8 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9828 0.0172
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 632 179 453 155 3 9 0 12 0 0 453 0 0 0.8659 0.0000 0.0000 18.889 0.49 3.33 -2.84 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1030 0.8970 0.0000 0 0 0.9359 0.0641 0.0000
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 625 179 446 13 7 24 10 125 0 0 445 1 0 0.0726 0.0000 0.0022 37.250 0.31 3.93 -3.62 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9128 0.0872
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 621 180 441 14 0 30 5 131 0 0 440 1 0 0.0778 0.0000 0.0023 5.692 0.29 4.05 -3.77 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.8548 0.1452
chr14 23275591 ACATCAT A 0.007529 0.100 1 -6 1 300 57 243 50 0 3 1 3 0 0 243 0 0 0.8772 0.0000 0.0000 17.667 0.90 7.00 -6.10 36 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6563 0.3437 0.0000 0 0 0.9833 0.0167 0.0000 0 0 0.9950 0.0050 0.0000
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 312 60 252 51 2 3 0 4 0 0 252 0 0 0.8500 0.0000 0.0000 18.667 0.94 3.00 -2.06 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.2473 0.7527 0.0000 0 0 0.6223 0.3777 0.0000
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 627 131 496 54 0 23 0 54 0 0 488 0 8 0.4122 0.0000 0.0161 4.696 0.91 7.31 -6.41 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0210 0.4790 0.5000 1 2 0.0225 0.4753 0.5022 1 2 0.0245 0.4711 0.5044
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 595 153 442 0 0 30 2 121 0 0 437 1 4 0.0000 0.0000 0.0113 4.067 7.18 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 476 121 355 49 2 26 3 41 0 2 352 0 1 0.4050 0.0000 0.0085 3.654 0.92 4.98 -4.06 5 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4221 0.5190 0.0589 1 1 0.4219 0.5156 0.0625 1 1 0.4211 0.5115 0.0674
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 464 101 363 48 5 2 11 35 0 0 363 0 0 0.4752 0.0000 0.0000 46.000 0.73 4.77 -4.04 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4359 0.5065 0.0575 1 1 0.4343 0.5043 0.0614 1 1 0.4316 0.5017 0.0667
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 463 150 313 0 0 17 3 130 0 0 312 0 1 0.0000 0.0000 0.0032 7.824 2.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 334 99 235 55 0 2 1 41 0 0 231 0 4 0.5556 0.0000 0.0170 48.500 0.27 8.90 -8.63 43 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4594 0.4943 0.0463 1 1 0.4585 0.4919 0.0495 1 1 0.4568 0.4892 0.0540
chr14 100884333 C CTCT 0.265959 0.100 1 3 1 580 123 457 72 0 6 0 45 0 0 451 0 6 0.5854 0.0000 0.0131 19.500 0.32 3.24 -2.92 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7604 0.2353 0.0043 1 0 0.7536 0.2415 0.0050 1 0 0.7437 0.2502 0.0060
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 264 71 193 40 0 7 1 23 0 0 189 0 4 0.5634 0.0000 0.0207 9.000 0.20 9.39 -9.19 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5540 0.4080 0.0380 1 0 0.5470 0.4117 0.0413 1 0 0.5374 0.4168 0.0458
chr14 104707525 ACCCCAC A 0.082909 0.100 1 -6 2 495 107 388 45 0 22 1 39 1 0 385 0 2 0.4206 0.0026 0.0077 4.048 0.78 6.62 -5.84 43 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4435 0.5358 0.0207 1 1 0.4480 0.5305 0.0215 1 1 0.4535 0.5241 0.0225
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 454 147 307 105 5 19 0 18 0 0 307 0 0 0.7143 0.0000 0.0000 6.737 0.40 4.39 -3.99 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0052 0.9948 0.0000
chr15 20534699 CCTCCTG C 0.091103 0.100 1 -6 1 3062 490 2572 357 12 68 2 51 37 99 2347 61 28 0.7286 0.0144 0.0875 6.209 1.71 6.00 -4.29 163 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8094 0.1906 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 275 73 202 31 0 4 1 37 0 0 200 0 2 0.4247 0.0000 0.0099 17.250 1.00 3.97 -2.97 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1407 0.6232 0.2361 1 1 0.1485 0.6190 0.2326 1 1 0.1591 0.6133 0.2276
chr15 22866845 TAAGA T 0.262722 0.100 1 -4 5 233 48 185 39 0 5 0 4 0 0 185 0 0 0.8125 0.0000 0.0000 8.600 0.36 5.00 -4.64 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.2177 0.7823 0.0000 0 0 0.5883 0.4117 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 690 124 566 0 0 5 2 117 1 5 472 72 16 0.0000 0.0018 0.1661 23.800 4.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 2086 591 1495 0 0 9 4 578 0 0 1472 9 14 0.0000 0.0000 0.0154 64.556 3.87 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 547 142 405 90 2 3 0 47 0 0 404 0 1 0.6338 0.0000 0.0025 46.333 0.30 1.94 -1.64 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9609 0.0390 0.0001 1 0 0.9563 0.0436 0.0001 1 0 0.9492 0.0506 0.0002
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 215 73 142 1 0 5 17 50 0 0 139 2 1 0.0137 0.0000 0.0211 10.200 0.00 1.72 -1.72 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3802 0.6198 2 2 0.0000 0.1764 0.8236 2 2 0.0000 0.1346 0.8654
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 215 73 142 1 0 55 0 17 0 0 140 0 2 0.0137 0.0000 0.0141 0.340 0.00 2.71 -2.71 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.6948 0.3052 2 2 0.0000 0.4205 0.5795 2 2 0.0000 0.3254 0.6746
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 663 175 488 0 0 36 3 136 0 0 485 0 3 0.0000 0.0000 0.0061 3.861 3.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 402 142 260 86 0 5 0 51 0 0 258 0 2 0.6056 0.0000 0.0077 27.400 1.73 2.06 -0.33 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8984 0.1010 0.0006 1 0 0.8912 0.1080 0.0008 1 0 0.8807 0.1181 0.0011
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 462 130 332 77 0 8 1 44 0 0 330 0 2 0.5923 0.0000 0.0060 15.250 0.23 5.55 -5.31 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8712 0.1275 0.0013 1 0 0.8631 0.1353 0.0016 1 0 0.8513 0.1466 0.0021
chr15 45111496 T TC 0.001285 0.100 1 1 1 997 266 731 149 0 7 0 110 0 0 729 0 2 0.5602 0.0000 0.0027 37.000 0.82 1.60 -0.78 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9152 0.0848 0.0000 1 0 0.9116 0.0884 0.0000 1 0 0.9063 0.0937 0.0000
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 154 80 74 39 0 5 0 36 0 0 74 0 0 0.4875 0.0000 0.0000 15.000 0.21 3.08 -2.88 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2836 0.5765 0.1399 1 1 0.2853 0.5706 0.1441 1 1 0.2873 0.5632 0.1495
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 229 117 112 14 0 1 0 102 0 0 108 0 4 0.1197 0.0000 0.0357 116.000 0.29 3.36 -3.08 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9702 0.0298
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 457 129 328 5 0 17 2 105 0 0 326 1 1 0.0388 0.0000 0.0061 6.588 0.40 3.22 -2.82 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9945 0.0055 2 2 0.0000 0.3828 0.6172 2 2 0.0000 0.0804 0.9196
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 453 96 357 48 0 17 0 31 0 0 355 0 2 0.5000 0.0000 0.0056 4.647 0.27 13.10 -12.83 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7011 0.2906 0.0083 1 0 0.6948 0.2960 0.0093 1 0 0.6859 0.3035 0.0106
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 747 175 572 4 2 82 1 86 0 0 559 0 13 0.0229 0.0000 0.0227 2.275 1.75 16.93 -15.18 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9940 0.0060 2 2 0.0000 0.4196 0.5804 2 2 0.0000 0.0960 0.9040
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 738 175 563 2 3 17 3 150 0 0 563 0 0 0.0114 0.0000 0.0000 9.750 2.50 13.29 -10.79 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0708 0.9292 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 322 95 227 0 0 8 0 87 0 0 219 0 8 0.0000 0.0000 0.0352 10.875 6.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 327 114 213 65 0 2 0 47 0 0 213 0 0 0.5702 0.0000 0.0000 56.000 0.35 2.06 -1.71 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6111 0.3702 0.0187 1 0 0.6033 0.3756 0.0211 1 0 0.5920 0.3831 0.0249
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 527 202 325 73 2 37 0 90 0 0 318 2 5 0.3614 0.0000 0.0215 4.432 0.58 6.46 -5.88 21 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0146 0.4422 0.5432 1 2 0.0170 0.4462 0.5368 1 2 0.0209 0.4520 0.5271
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 30 11 19 0 0 0 0 11 0 0 19 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.000 1.36 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0009 0.7073 0.2918 2 1 0.0011 0.7094 0.2895 2 1 0.0016 0.7123 0.2862
chr16 286700 ACT A 0.005436 0.100 1 -2 1 557 140 417 76 0 3 0 61 0 0 416 0 1 0.5429 0.0000 0.0024 45.667 0.51 3.34 -2.83 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6692 0.3305 0.0002 1 0 0.6687 0.3311 0.0003 1 0 0.6673 0.3324 0.0003
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 365 105 260 58 0 0 0 47 0 0 259 0 1 0.5524 0.0000 0.0038 105.000 0.33 2.87 -2.54 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5066 0.4614 0.0320 1 0 0.5055 0.4599 0.0345 1 0 0.5035 0.4585 0.0380
chr16 805517 GGCAGCT G 0.053997 0.100 1 -6 4 403 117 286 110 0 3 0 4 0 0 285 0 1 0.9402 0.0000 0.0035 38.000 0.18 6.00 -5.82 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0664 0.9336 0.0000 0 0 0.9541 0.0459 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 345 126 219 113 2 1 0 10 0 0 219 0 0 0.8968 0.0000 0.0000 125.000 0.77 18.90 -18.13 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0700 0.9300 0.0000 0 0 0.8143 0.1857 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 429 71 358 0 0 0 4 67 0 0 357 0 1 0.0000 0.0000 0.0028 71.000 6.94 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 429 71 358 0 0 0 4 67 0 0 357 0 1 0.0000 0.0000 0.0028 71.000 6.94 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 382 100 282 42 0 7 0 51 0 1 280 0 1 0.4200 0.0000 0.0071 13.286 0.17 3.35 -3.19 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0488 0.4906 0.4606 1 1 0.0522 0.4887 0.4591 1 1 0.0568 0.4866 0.4566
chr16 10472121 ATGT A 0.009030 0.100 1 -3 1 81 38 43 19 0 2 0 17 0 0 43 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 18.000 0.16 3.12 -2.96 9 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5016 0.4953 0.0031 1 0 0.5030 0.4939 0.0031 1 0 0.5046 0.4922 0.0032
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 1644 447 1197 311 1 114 0 21 1 0 1191 0 5 0.6957 0.0008 0.0050 2.912 1.26 4.81 -3.55 193 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7224 0.2776 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 187 64 123 0 0 1 1 62 0 0 123 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 62.000 2.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr16 23148917 A AGCGGGCGGCGCGGGAGAG 0.000105 0.100 1 18 2 331 89 242 64 0 19 0 6 4 0 238 0 0 0.7191 0.0165 0.0165 3.684 1.86 15.50 -13.64 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3298 0.6702 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.100 1 -12 1 677 225 452 186 3 9 0 27 0 0 451 1 0 0.8267 0.0000 0.0022 24.000 0.24 8.63 -8.39 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.100 1 3 1 580 132 448 14 0 5 0 113 0 0 444 0 4 0.1061 0.0000 0.0089 25.400 0.07 3.16 -3.09 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9760 0.0240
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 130 71 59 6 0 3 1 61 0 0 56 0 3 0.0845 0.0000 0.0508 22.667 0.17 2.15 -1.98 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9569 0.0431 2 1 0.0000 0.6636 0.3364
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 401 82 319 14 1 8 7 52 0 0 319 0 0 0.1707 0.0000 0.0000 8.625 1.00 2.23 -1.23 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0001 0.6590 0.3409 2 1 0.0000 0.9737 0.0263 2 1 0.0000 0.9967 0.0033
chr16 60358911 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 1521 379 1142 352 3 6 0 18 7 8 1124 3 0 0.9288 0.0061 0.0158 74.400 0.44 1.17 -0.73 168 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1169 0.8831 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 309 142 167 115 0 21 1 5 0 0 167 0 0 0.8099 0.0000 0.0000 5.762 0.35 7.80 -7.45 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3520 0.6480 0.0000 0 0 0.8510 0.1490 0.0000
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 118 62 56 32 1 1 0 28 0 0 55 0 1 0.5161 0.0000 0.0179 61.000 0.75 3.79 -3.04 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3052 0.5566 0.1382 1 1 0.3052 0.5523 0.1425 1 1 0.3049 0.5470 0.1482
chr16 72787694 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 566 96 470 71 0 22 0 3 0 0 470 0 0 0.7396 0.0000 0.0000 3.364 1.66 7.00 -5.34 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0453 0.9547 0.0000 0 0 0.5871 0.4129 0.0000 0 0 0.8205 0.1795 0.0000
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 326 93 233 60 0 5 0 28 0 0 215 0 18 0.6452 0.0000 0.0773 17.600 0.15 13.25 -13.10 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5257 0.4415 0.0328 1 0 0.5205 0.4434 0.0361 1 0 0.5128 0.4462 0.0410
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 236 102 134 96 0 0 0 6 0 0 133 0 1 0.9412 0.0000 0.0075 102.000 1.08 4.50 -3.42 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0657 0.9343 0.0000 0 0 0.5417 0.4583 0.0000
chr16 85656376 GGAGCGC G 0.500000 0.100 1 -6 3 466 115 351 51 0 29 1 34 0 0 351 0 0 0.4435 0.0000 0.0000 3.071 0.88 6.85 -5.97 35 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5885 0.3845 0.0270 1 0 0.5803 0.3898 0.0300 1 0 0.5688 0.3969 0.0343
chr16 85656394 CGAGCGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 459 97 362 47 2 14 0 34 0 0 362 0 0 0.4845 0.0000 0.0000 5.929 0.83 6.50 -5.67 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5761 0.3940 0.0299 1 0 0.5680 0.3989 0.0331 1 0 0.5567 0.4056 0.0377
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 416 117 299 45 2 26 6 38 0 0 295 2 2 0.3846 0.0000 0.0134 3.500 0.33 4.79 -4.46 1 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1757 0.6132 0.2111 1 1 0.1802 0.6049 0.2149 1 1 0.1859 0.5944 0.2197
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 416 117 299 47 0 34 0 36 0 0 295 0 4 0.4017 0.0000 0.0134 2.441 0.66 5.83 -5.17 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3526 0.5545 0.0928 1 1 0.3522 0.5502 0.0976 1 1 0.3510 0.5448 0.1042
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 669 145 524 0 1 9 8 127 0 1 511 3 9 0.0000 0.0000 0.0248 16.750 7.72 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 666 138 528 0 0 6 13 119 0 0 516 3 9 0.0000 0.0000 0.0227 21.833 8.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 669 134 535 0 0 3 2 129 0 0 516 5 14 0.0000 0.0000 0.0355 65.000 8.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 800 191 609 10 0 8 1 172 0 0 605 0 4 0.0524 0.0000 0.0066 22.875 1.00 6.91 -5.91 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8590 0.1410 2 2 0.0000 0.1024 0.8976
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 566 162 404 101 1 6 0 54 1 0 401 0 2 0.6235 0.0025 0.0074 26.000 0.89 3.70 -2.81 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9600 0.0399 0.0001 1 0 0.9551 0.0448 0.0001 1 0 0.9475 0.0523 0.0002
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 140 56 84 3 0 0 1 52 0 0 84 0 0 0.0536 0.0000 0.0000 56.000 0.00 4.27 -4.27 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9814 0.0186 2 1 0.0000 0.6335 0.3665 2 2 0.0000 0.3438 0.6562
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 362 121 241 60 0 3 0 58 0 0 241 0 0 0.4959 0.0000 0.0000 39.333 0.15 1.26 -1.11 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1418 0.6532 0.2050 1 1 0.1447 0.6428 0.2124 1 1 0.1483 0.6297 0.2221
chr17 4933907 ACCACCCCAGAGCCCAC A 0.138018 0.100 1 -16 1 1253 251 1002 211 14 9 10 7 2 0 1000 0 0 0.8406 0.0020 0.0020 47.800 4.26 2.00 2.26 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4831 0.5169 0.0000 0 0 0.9867 0.0133 0.0000
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 716 198 518 16 2 32 1 147 0 0 513 0 5 0.0808 0.0000 0.0097 5.188 0.44 3.14 -2.71 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9695 0.0305
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.100 1 9 2 1162 343 819 18 21 82 17 205 1 1 802 0 15 0.0525 0.0012 0.0208 3.222 5.17 5.51 -0.35 4 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 7846859 TACC T 0.005966 0.100 1 -3 2 1165 363 802 232 33 80 4 14 0 0 802 0 0 0.6391 0.0000 0.0000 3.513 5.06 4.50 0.56 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4826 0.5174 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.100 1 -6 1 1036 315 721 244 2 51 2 16 1 0 715 1 4 0.7746 0.0014 0.0083 5.137 0.63 6.38 -5.75 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.7403 0.2597 0.0000
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 548 161 387 153 1 2 0 5 0 0 387 0 0 0.9503 0.0000 0.0000 79.500 0.20 3.00 -2.80 85 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0368 0.9632 0.0000 0 0 0.9143 0.0857 0.0000 0 0 0.9861 0.0139 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 365 96 269 37 0 9 1 49 0 1 267 1 0 0.3854 0.0000 0.0074 9.556 0.41 7.96 -7.55 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0393 0.4405 0.5202 1 2 0.0429 0.4429 0.5141 1 2 0.0481 0.4464 0.5055
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 476 198 278 0 0 25 21 152 0 0 272 3 3 0.0000 0.0000 0.0216 6.920 2.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr17 17136247 CCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -6 1 477 206 271 6 9 167 0 24 0 0 268 0 3 0.0291 0.0000 0.0111 0.187 0.00 5.58 -5.58 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0894 0.4767 0.4339 1 1 0.0938 0.4781 0.4281 1 1 0.0998 0.4799 0.4203
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1015 305 710 144 3 14 118 26 0 0 710 0 0 0.4721 0.0000 0.0000 14.385 0.49 4.04 -3.55 58 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8870 0.1126 0.0004 1 0 0.8802 0.1193 0.0005 1 0 0.8700 0.1292 0.0007
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 1016 299 717 140 11 119 3 26 0 0 716 1 0 0.4682 0.0000 0.0014 1.689 0.50 3.92 -3.42 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 783 191 592 162 1 14 0 14 0 1 591 0 0 0.8482 0.0000 0.0017 12.643 0.45 3.79 -3.34 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2625 0.7375 0.0000
chr17 19015197 A ACGGTACGGGGGTGGGGGC 0.500000 0.100 1 18 3 252 67 185 4 0 13 1 49 0 0 172 0 13 0.0597 0.0000 0.0703 4.154 0.25 6.47 -6.22 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9966 0.0034 2 1 0.0000 0.7523 0.2477 2 2 0.0000 0.3798 0.6202
chr17 30834937 ACAATGT A 0.500000 0.100 1 -6 1 813 181 632 108 0 7 0 66 0 0 629 0 3 0.5967 0.0000 0.0047 24.857 0.27 6.33 -6.06 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9089 0.0907 0.0004 1 0 0.9016 0.0979 0.0005 1 0 0.8908 0.1084 0.0008
chr17 35844706 CGGCTATGGAGGAGACCGAGGAGGT C 0.500000 0.100 1 -24 2 1025 285 740 139 5 27 3 111 2 0 738 0 0 0.4877 0.0027 0.0027 9.407 1.06 11.12 -10.05 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7779 0.2209 0.0012 1 0 0.7727 0.2258 0.0016 1 0 0.7646 0.2333 0.0022
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 794 219 575 164 2 35 0 18 3 1 570 0 1 0.7489 0.0052 0.0087 5.545 2.10 9.44 -7.35 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0196 0.9804 0.0000
chr17 41041248 GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCACAGCAGCGTGGCTGGCAGGAGCTGGTCTCACAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGAGCCGCAGGTCCCACTGGTGGAGCAGCTGGGAAATCCACAGAAGCTGGTCTGA G 0.500000 0.100 1 -138 2 991 458 533 443 2 9 0 4 0 0 533 0 0 0.9672 0.0000 0.0000 49.778 1.50 5.50 -4.00 179 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 644 165 479 84 1 1 1 78 0 0 479 0 0 0.5091 0.0000 0.0000 164.000 0.24 1.78 -1.54 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2647 0.6543 0.0810 1 1 0.2703 0.6431 0.0866 1 1 0.2769 0.6289 0.0942
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 447 111 336 57 0 0 0 54 0 0 336 0 0 0.5135 0.0000 0.0000 111.000 0.61 1.46 -0.85 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2432 0.6226 0.1342 1 1 0.2469 0.6137 0.1394 1 1 0.2514 0.6023 0.1463
chr17 41105856 CTCCAGCTGCTGCCGCCCCTCTTGCTGTGAA C 0.500000 0.100 1 -30 1 746 247 499 204 0 37 0 6 3 0 492 0 4 0.8259 0.0060 0.0140 5.676 1.16 20.67 -19.50 88 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4235 0.5765 0.0000 0 0 0.9741 0.0259 0.0000
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 505 127 378 56 0 25 1 45 0 0 364 2 12 0.4409 0.0000 0.0370 4.208 0.59 8.64 -8.06 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1296 0.6264 0.2441 1 1 0.1349 0.6172 0.2480 1 1 0.1419 0.6055 0.2526
chr17 41238458 AGACCACCTGCTGCAG A 0.500000 0.100 1 -15 1 548 169 379 151 0 17 0 1 1 0 376 0 2 0.8935 0.0026 0.0079 8.941 3.74 17.00 -13.26 77 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7492 0.2508 0.0000 0 0 0.9879 0.0121 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 590 167 423 127 2 22 5 11 0 1 422 0 0 0.7605 0.0000 0.0024 6.591 0.61 3.00 -2.39 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0194 0.9806 0.0000
chr17 45242067 TCCGCCG T 0.500000 0.100 1 -6 2 593 169 424 132 1 30 0 6 1 0 423 0 0 0.7811 0.0024 0.0024 4.600 0.70 5.17 -4.47 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 0 0.5836 0.4164 0.0000 0 0 0.9360 0.0640 0.0000
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 263 102 161 4 0 8 0 90 1 0 158 0 2 0.0392 0.0062 0.0186 11.750 0.00 4.28 -4.28 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 0.6742 0.3258 2 2 0.0000 0.2217 0.7783
chr17 48530822 G GGGGCGCTGT 0.500000 0.100 1 9 2 454 123 331 53 0 20 2 48 0 0 328 0 3 0.4309 0.0000 0.0091 5.150 0.38 7.17 -6.79 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1868 0.6271 0.1861 1 1 0.1915 0.6178 0.1907 1 1 0.1973 0.6061 0.1966
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 867 222 645 27 0 3 2 190 0 0 638 0 7 0.1216 0.0000 0.0109 73.000 0.15 2.98 -2.83 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr17 57979243 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 385 181 204 21 2 44 4 110 0 0 204 0 0 0.1160 0.0000 0.0000 3.068 0.62 3.22 -2.60 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 363 123 240 102 0 14 0 7 0 0 240 0 0 0.8293 0.0000 0.0000 7.786 0.37 6.86 -6.48 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0864 0.9136 0.0000 0 0 0.6122 0.3878 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 515 108 407 0 0 10 0 98 0 0 400 0 7 0.0000 0.0000 0.0172 9.800 7.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0047 0.9953 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0061 0.9939
chr17 74893497 CGGTTCCATGGGCTCCGTA C 0.500000 0.100 1 -18 2 336 122 214 43 0 63 1 15 1 0 211 0 2 0.3525 0.0047 0.0140 0.937 0.63 7.87 -7.24 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8278 0.1676 0.0046 1 0 0.8158 0.1786 0.0056 1 0 0.7961 0.1968 0.0071
chr17 75589372 GACGAGGGTCGGGGCCGCGGGAAAGCGGACGAAGGGCGGGGCCACGAGCGAGGGT G 0.500000 0.100 1 -54 4 1639 367 1272 315 9 27 1 15 0 1 1271 0 0 0.8583 0.0000 0.0008 12.444 0.84 10.13 -9.29 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4962 0.5038 0.0000 0 0 0.9973 0.0027 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2300 518 1782 244 12 53 6 203 3 4 1764 1 10 0.4710 0.0017 0.0101 8.642 1.26 7.96 -6.70 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7442 0.2556 0.0002 1 0 0.7477 0.2520 0.0003 1 0 0.7503 0.2493 0.0004
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2263 595 1668 256 4 37 5 293 4 2 1512 14 136 0.4303 0.0024 0.0935 15.472 1.61 4.63 -3.01 34 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -6 7 256 92 164 6 0 11 0 75 0 0 162 0 2 0.0652 0.0000 0.0122 7.364 0.50 5.76 -5.26 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9270 0.0730 2 1 0.0000 0.5286 0.4714
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 562 167 395 65 0 8 0 94 0 0 392 0 3 0.3892 0.0000 0.0076 19.875 0.38 3.37 -2.99 27 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0015 0.1563 0.8422 1 2 0.0019 0.1647 0.8335 1 2 0.0025 0.1767 0.8208
chr17 81528602 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 455 135 320 123 0 2 0 10 0 0 320 0 0 0.9111 0.0000 0.0000 66.500 0.50 1.20 -0.70 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0110 0.9890 0.0000 0 1 0.3900 0.6100 0.0000
chr18 3452224 CT C 0.390343 0.100 1 -1 7 293 58 235 5 0 0 8 45 0 0 235 0 0 0.0862 0.0000 0.0000 55.000 1.20 1.22 -0.02 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9588 0.0412 2 1 0.0000 0.7523 0.2477
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 210 90 120 0 0 5 0 85 0 0 116 0 4 0.0000 0.0000 0.0333 17.000 3.48 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 313 72 241 60 2 5 0 5 0 0 241 0 0 0.8333 0.0000 0.0000 13.400 1.33 8.40 -7.07 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2782 0.7218 0.0000 0 0 0.7452 0.2548 0.0000
chr18 31068033 T TTC 0.010769 0.100 1 2 1 328 73 255 39 0 0 0 34 0 0 255 0 0 0.5342 0.0000 0.0000 73.000 0.15 2.12 -1.96 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5305 0.4674 0.0021 1 0 0.5324 0.4653 0.0022 1 0 0.5346 0.4631 0.0024
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 178 70 108 6 0 1 0 63 0 0 108 0 0 0.0857 0.0000 0.0000 69.000 0.00 4.56 -4.56 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9549 0.0451 2 1 0.0000 0.6468 0.3532
chr18 46560255 G GGACTCCTCTGATGAGGAC 0.500000 0.100 1 18 1 562 148 414 68 0 35 0 45 0 0 400 0 14 0.4595 0.0000 0.0338 3.229 0.25 9.84 -9.59 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3709 0.5668 0.0623 1 1 0.3719 0.5611 0.0669 1 1 0.3724 0.5542 0.0734
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 287 129 158 116 0 8 0 5 0 0 158 0 0 0.8992 0.0000 0.0000 15.125 0.26 4.60 -4.34 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 0 0.6154 0.3846 0.0000 0 0 0.9183 0.0817 0.0000
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -9 2 470 112 358 52 0 7 0 53 0 0 358 0 0 0.4643 0.0000 0.0000 15.000 1.08 9.36 -8.28 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1690 0.6248 0.2061 1 1 0.1739 0.6157 0.2104 1 1 0.1801 0.6042 0.2157
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 247 140 107 82 1 4 0 53 0 0 107 0 0 0.5857 0.0000 0.0000 34.000 0.15 3.30 -3.16 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8320 0.1658 0.0022 1 0 0.8225 0.1748 0.0027 1 0 0.8087 0.1877 0.0036
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 731 160 571 92 0 7 0 61 0 0 558 0 13 0.5750 0.0000 0.0228 21.857 0.51 12.51 -12.00 26 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5630 0.4215 0.0155 1 0 0.5598 0.4225 0.0177 1 0 0.5546 0.4244 0.0210
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 317 60 257 19 2 7 3 29 0 0 256 1 0 0.3167 0.0000 0.0039 7.429 1.47 4.10 -2.63 3 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0514 0.4260 0.5225 1 2 0.0554 0.4301 0.5145 1 2 0.0610 0.4355 0.5035
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 156 65 91 0 0 3 0 62 0 0 90 0 1 0.0000 0.0000 0.0110 20.667 3.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0387 0.9613 2 2 0.0000 0.0412 0.9588 2 2 0.0000 0.0449 0.9551
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 145 70 75 33 0 7 0 30 0 0 72 0 3 0.4714 0.0000 0.0400 9.000 0.33 3.07 -2.73 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2111 0.5802 0.2087 1 1 0.2141 0.5742 0.2117 1 1 0.2178 0.5667 0.2155
chr18 76496529 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 275 70 205 53 2 6 0 9 5 0 200 0 0 0.7571 0.0244 0.0244 10.500 0.79 1.67 -0.87 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.0548 0.9452 0.0000
chr18 79715187 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 605 160 445 116 4 36 0 4 0 0 445 0 0 0.7250 0.0000 0.0000 3.417 0.24 3.00 -2.76 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0585 0.9415 0.0000 0 0 0.8491 0.1509 0.0000 0 0 0.9626 0.0374 0.0000
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 4 391 143 248 58 2 16 0 67 0 0 246 0 2 0.4056 0.0000 0.0081 7.938 1.17 3.96 -2.78 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0619 0.5692 0.3689 1 1 0.0666 0.5633 0.3701 1 1 0.0731 0.5562 0.3708
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 473 201 272 110 6 32 8 45 0 1 271 0 0 0.5473 0.0000 0.0037 6.385 2.29 6.22 -3.93 24 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9957 0.0043 0.0000 1 0 0.9948 0.0052 0.0000 1 0 0.9934 0.0066 0.0000
chr19 1009186 GAGC G 0.092678 0.100 1 -3 2 493 110 383 91 1 7 0 11 0 0 382 0 1 0.8273 0.0000 0.0026 14.714 0.57 3.18 -2.61 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.2777 0.7223 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 176 78 98 66 1 2 0 9 0 0 98 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 38.000 0.50 4.56 -4.06 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0064 0.9936 0.0000 0 1 0.2088 0.7912 0.0000
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 315 114 201 1 0 15 42 56 0 0 195 5 1 0.0088 0.0000 0.0299 6.600 2.00 4.25 -2.25 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0489 0.9511 2 2 0.0000 0.0177 0.9823 2 2 0.0000 0.0135 0.9865
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 315 116 199 3 1 64 3 45 0 0 194 0 5 0.0259 0.0000 0.0251 0.879 5.67 7.20 -1.53 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 1 0.0000 0.9348 0.0652 2 1 0.0000 0.8034 0.1966
chr19 4817276 AAGGAGGAGG A 0.000044 0.100 1 -9 1 799 172 627 88 0 18 0 66 0 0 624 0 3 0.5116 0.0000 0.0048 8.556 0.30 8.17 -7.87 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7527 0.2473 0.0000 1 0 0.7499 0.2501 0.0000 1 0 0.7457 0.2543 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 568 165 403 78 0 17 0 70 0 0 395 0 8 0.4727 0.0000 0.0199 8.706 0.42 10.59 -10.16 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2247 0.6825 0.0928 1 1 0.2337 0.6698 0.0965 1 1 0.2452 0.6535 0.1013
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 401 131 270 98 0 27 0 6 1 0 268 0 1 0.7481 0.0037 0.0074 3.852 0.67 7.17 -6.49 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1579 0.8421 0.0000 0 0 0.7584 0.2416 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 543 113 430 0 0 4 1 108 0 0 426 0 4 0.0000 0.0000 0.0093 27.250 3.47 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 17286678 GTGTGTGTGTGTGTT G 0.125300 0.100 1 -14 1 429 102 327 1 6 25 23 47 0 0 326 0 1 0.0098 0.0000 0.0031 4.688 2.00 9.06 -7.06 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9939 0.0061 2 1 0.0000 0.9440 0.0560 2 1 0.0000 0.8395 0.1605
chr19 17286682 GTGTGTGTGTT G 0.004703 0.100 1 -10 1 429 100 329 1 1 18 10 70 0 0 328 0 1 0.0100 0.0000 0.0030 8.100 2.00 8.23 -6.23 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9911 0.0089 2 1 0.0000 0.9663 0.0337 2 1 0.0000 0.9434 0.0566
chr19 17286686 GTGTGTT G 0.073608 0.100 1 -6 1 427 99 328 0 1 16 11 71 0 0 327 0 1 0.0000 0.0000 0.0030 10.000 8.15 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.4232 0.5768 2 2 0.0000 0.3563 0.6437 2 2 0.0000 0.3274 0.6726
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 121 50 71 45 0 3 0 2 0 0 71 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 15.667 1.16 7.00 -5.84 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3071 0.6929 0.0000 0 0 0.8108 0.1892 0.0000 0 0 0.9035 0.0965 0.0000
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 858 186 672 12 0 3 0 171 0 0 628 11 33 0.0645 0.0000 0.0655 61.000 2.17 2.57 -0.41 6 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5845 0.4155 2 2 0.0000 0.0124 0.9876
chr19 23744939 CCA C 0.187747 0.100 1 -2 4 700 142 558 15 0 8 0 119 0 0 554 0 4 0.1056 0.0000 0.0072 16.750 0.13 2.26 -2.13 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9941 0.0059
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 308 90 218 5 0 12 3 70 0 0 218 0 0 0.0556 0.0000 0.0000 6.417 0.00 2.86 -2.86 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 1 0.0000 0.5202 0.4798 2 2 0.0000 0.1268 0.8732
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 520 132 388 48 1 5 0 78 0 0 385 0 3 0.3636 0.0000 0.0077 25.200 0.77 3.27 -2.50 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0005 0.0940 0.9055 1 2 0.0007 0.1006 0.8987 1 2 0.0009 0.1102 0.8889
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 403 162 241 116 0 14 0 32 0 0 221 0 20 0.7160 0.0000 0.0830 10.571 1.89 14.91 -13.02 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9952 0.0048 0.0000 1 0 0.9943 0.0057 0.0000 1 0 0.9927 0.0073 0.0000
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.100 1 -3 1 403 132 271 37 2 19 2 72 0 0 271 0 0 0.2803 0.0000 0.0000 7.533 0.27 3.14 -2.87 15 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0045 0.3224 0.6732 1 2 0.0057 0.3436 0.6507 1 2 0.0079 0.3728 0.6194
chr19 37388950 C CTGTG 0.140068 0.100 1 4 5 697 123 574 72 0 3 0 48 0 0 570 0 4 0.5854 0.0000 0.0070 40.000 0.44 4.85 -4.41 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7708 0.2268 0.0024 1 0 0.7651 0.2321 0.0028 1 0 0.7569 0.2397 0.0033
chr19 37388952 AT A 0.140069 0.100 1 -1 2 700 121 579 73 0 3 0 45 0 0 575 0 4 0.6033 0.0000 0.0069 39.333 0.44 5.09 -4.65 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8347 0.1641 0.0012 1 0 0.8280 0.1706 0.0014 1 0 0.8185 0.1797 0.0018
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.100 1 3 1 126 61 65 42 6 9 0 4 0 0 65 0 0 0.6885 0.0000 0.0000 5.778 0.29 4.00 -3.71 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0487 0.9513 0.0000 0 0 0.8333 0.1667 0.0000 0 0 0.9620 0.0380 0.0000
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 218 27 191 0 0 2 23 2 0 0 191 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.000 1.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0769 0.9231 2 2 0.0000 0.0787 0.9213 2 2 0.0000 0.0813 0.9187
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 218 27 191 0 0 19 7 1 0 0 191 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.400 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1259 0.8741 2 2 0.0000 0.1275 0.8724 2 2 0.0000 0.1298 0.8702
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 451 132 319 58 4 8 0 62 0 0 319 0 0 0.4394 0.0000 0.0000 15.250 0.10 5.79 -5.69 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1487 0.6441 0.2072 1 1 0.1535 0.6337 0.2128 1 1 0.1597 0.6204 0.2198
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.100 1 3 1 306 98 208 81 0 5 1 11 0 0 208 0 0 0.8265 0.0000 0.0000 18.600 0.41 4.00 -3.59 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0061 0.9939 0.0000 0 1 0.4011 0.5989 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 366 123 243 118 0 1 0 4 0 0 243 0 0 0.9593 0.0000 0.0000 122.000 0.30 6.25 -5.95 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0733 0.9267 0.0000 0 0 0.8780 0.1220 0.0000 0 0 0.9706 0.0294 0.0000
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 527 156 371 16 0 3 0 137 0 0 368 0 3 0.1026 0.0000 0.0081 51.000 0.19 3.09 -2.91 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9493 0.0507
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 478 136 342 131 1 0 0 4 0 0 341 0 1 0.9632 0.0000 0.0029 136.000 0.38 3.50 -3.12 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0710 0.9290 0.0000 0 0 0.9532 0.0468 0.0000 0 0 0.9928 0.0072 0.0000
chr19 45409231 CAAG C 0.234924 0.100 1 -3 2 532 122 410 56 0 14 3 49 0 1 408 0 1 0.4590 0.0000 0.0049 7.714 0.79 3.37 -2.58 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3777 0.5698 0.0525 1 1 0.3826 0.5626 0.0549 1 1 0.3884 0.5536 0.0580
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 964 326 638 140 1 63 0 122 0 0 619 0 19 0.4294 0.0000 0.0298 4.175 0.51 5.84 -5.32 80 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1036 0.7995 0.0969 1 1 0.1126 0.7822 0.1052 1 1 0.1246 0.7590 0.1164
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 323 102 221 83 0 17 0 2 0 0 219 0 2 0.8137 0.0000 0.0090 5.000 0.64 11.50 -10.86 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0744 0.9256 0.0000 0 0 0.8835 0.1165 0.0000 0 0 0.9734 0.0266 0.0000
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.100 1 -3 1 460 130 330 119 0 6 0 5 0 0 330 0 0 0.9154 0.0000 0.0000 20.667 0.89 4.40 -3.51 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0474 0.9526 0.0000 0 0 0.9350 0.0650 0.0000 0 0 0.9902 0.0098 0.0000
chr19 48231760 C CTT 0.055045 0.100 1 2 1 126 39 87 22 0 3 0 14 0 0 86 0 1 0.5641 0.0000 0.0115 12.000 0.50 2.07 -1.57 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6066 0.3846 0.0088 1 0 0.6033 0.3875 0.0093 1 0 0.5986 0.3915 0.0099
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 196 83 113 74 1 6 0 2 0 0 113 0 0 0.8916 0.0000 0.0000 12.667 0.64 1.50 -0.86 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7262 0.2738 0.0000 0 0 0.9593 0.0407 0.0000 0 0 0.9800 0.0200 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 964 263 701 110 2 48 83 20 1 1 690 7 2 0.4183 0.0014 0.0157 4.479 0.91 3.55 -2.64 26 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1881 0.7371 0.0748 1 1 0.1984 0.7213 0.0802 1 1 0.2118 0.7007 0.0875
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.100 1 3 1 969 248 721 173 12 54 0 9 0 0 719 0 2 0.6976 0.0000 0.0028 3.556 0.64 3.89 -3.25 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1499 0.8501 0.0000 0 0 0.9341 0.0659 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 546 170 376 79 1 32 2 56 0 0 374 0 2 0.4647 0.0000 0.0053 4.281 1.18 6.34 -5.16 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7005 0.2923 0.0072 1 0 0.6944 0.2973 0.0083 1 0 0.6853 0.3046 0.0101
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 702 135 567 3 1 3 54 74 0 0 558 2 7 0.0222 0.0000 0.0159 43.667 0.33 3.26 -2.92 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8405 0.1595 2 2 0.0000 0.0643 0.9357 2 2 0.0000 0.0154 0.9846
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 703 143 560 1 0 11 72 59 0 0 557 0 3 0.0070 0.0000 0.0054 11.909 0.00 3.76 -3.76 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0220 0.9780 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0064 0.9936
chr19 51225847 CCCGG C 0.024525 0.100 1 -4 2 499 156 343 93 1 3 0 59 0 0 340 0 3 0.5962 0.0000 0.0087 51.000 0.41 4.03 -3.63 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9154 0.0846 0.0000 1 0 0.9102 0.0897 0.0001 1 0 0.9027 0.0972 0.0001
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 517 139 378 10 0 9 6 114 0 0 371 1 6 0.0719 0.0000 0.0185 14.444 0.00 2.95 -2.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9741 0.0259 2 2 0.0000 0.4006 0.5994
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 196 95 101 11 0 0 0 84 0 0 100 1 0 0.1158 0.0000 0.0099 95.000 0.09 2.13 -2.04 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.8793 0.1207
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 447 123 324 110 1 6 0 6 0 0 324 0 0 0.8943 0.0000 0.0000 19.500 0.21 3.00 -2.79 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.4145 0.5855 0.0000 0 0 0.8829 0.1171 0.0000
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 513 142 371 123 0 3 0 16 0 0 369 0 2 0.8662 0.0000 0.0054 46.333 0.24 3.38 -3.14 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0059 0.9941 0.0000
chr19 52384347 CACG C 0.003804 0.100 1 -3 1 683 158 525 141 2 6 0 9 0 0 525 0 0 0.8924 0.0000 0.0000 25.333 0.55 3.00 -2.45 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.9573 0.0427 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 1035 246 789 136 0 2 0 108 0 0 789 0 0 0.5528 0.0000 0.0000 122.000 0.37 3.25 -2.88 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7419 0.2562 0.0019 1 0 0.7384 0.2592 0.0024 1 0 0.7325 0.2643 0.0032
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 654 182 472 15 0 7 0 160 0 0 471 0 1 0.0824 0.0000 0.0021 25.000 0.53 1.99 -1.46 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.7435 0.2565
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 697 149 548 71 0 9 0 69 1 0 541 1 5 0.4765 0.0018 0.0128 15.556 0.62 3.19 -2.57 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1315 0.6688 0.1998 1 1 0.1380 0.6571 0.2049 1 1 0.1466 0.6421 0.2113
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 410 134 276 102 2 20 0 10 0 0 275 0 1 0.7612 0.0000 0.0036 5.650 0.34 6.40 -6.06 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.1177 0.8823 0.0000
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 597 132 465 0 1 17 1 113 0 0 436 0 29 0.0000 0.0000 0.0624 6.706 18.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 910 228 682 112 0 29 2 85 0 0 676 0 6 0.4912 0.0000 0.0088 6.828 0.91 3.99 -3.08 58 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6311 0.3631 0.0058 1 0 0.6311 0.3622 0.0068 1 0 0.6298 0.3620 0.0082
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 559 99 460 53 1 3 0 42 0 0 455 0 5 0.5354 0.0000 0.0109 31.667 1.02 4.88 -3.86 7 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3218 0.5810 0.0972 1 1 0.3222 0.5753 0.1025 1 1 0.3222 0.5680 0.1098
chr19 55912558 TGAAA T 0.015449 0.100 1 -4 2 587 127 460 75 0 4 0 48 0 0 459 0 1 0.5906 0.0000 0.0022 30.750 0.31 4.10 -3.80 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8757 0.1242 0.0001 1 0 0.8698 0.1301 0.0001 1 0 0.8612 0.1386 0.0001
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 114 57 57 30 0 8 2 17 0 0 57 0 0 0.5263 0.0000 0.0000 6.125 0.43 3.41 -2.98 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6015 0.3683 0.0302 1 0 0.5944 0.3731 0.0325 1 0 0.5846 0.3796 0.0358
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 338 139 199 64 1 1 0 73 0 0 198 0 1 0.4604 0.0000 0.0050 138.000 0.19 2.08 -1.89 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0503 0.5582 0.3914 1 1 0.0543 0.5521 0.3936 1 1 0.0599 0.5446 0.3955
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 92 55 37 25 0 3 0 27 0 0 37 0 0 0.4545 0.0000 0.0000 17.333 0.52 6.78 -6.26 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1371 0.5485 0.3144 1 1 0.1398 0.5444 0.3158 1 1 0.1433 0.5394 0.3173
chr20 298046 C CCGG 0.073154 0.100 1 3 1 422 107 315 85 1 12 0 9 1 0 311 0 3 0.7944 0.0032 0.0127 7.917 0.86 4.11 -3.25 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.2822 0.7178 0.0000
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 572 187 385 174 0 3 0 10 0 0 383 0 2 0.9305 0.0000 0.0052 61.333 0.29 8.40 -8.11 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0269 0.9731 0.0000 0 0 0.7745 0.2255 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 573 190 383 175 0 5 0 10 0 0 381 0 2 0.9211 0.0000 0.0052 37.000 0.30 8.40 -8.10 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0283 0.9717 0.0000 0 0 0.7838 0.2162 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 576 178 398 166 0 2 0 10 0 0 397 0 1 0.9326 0.0000 0.0025 88.000 0.30 8.10 -7.80 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0558 0.9442 0.0000 0 0 0.8287 0.1713 0.0000
chr20 14002371 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 162 70 92 36 0 0 0 34 0 0 92 0 0 0.5143 0.0000 0.0000 70.000 0.61 3.41 -2.80 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2510 0.5802 0.1688 1 1 0.2530 0.5743 0.1728 1 1 0.2553 0.5667 0.1780
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 238 87 151 39 0 4 0 44 0 0 150 0 1 0.4483 0.0000 0.0066 20.750 0.41 1.18 -0.77 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0743 0.5316 0.3941 1 1 0.0779 0.5277 0.3944 1 1 0.0827 0.5229 0.3943
chr20 25453456 CAG C 0.000401 0.100 1 -2 1 254 87 167 80 0 2 0 5 0 0 167 0 0 0.9195 0.0000 0.0000 42.500 0.23 2.00 -1.77 40 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6890 0.3110 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 674 164 510 62 0 6 0 96 0 0 506 0 4 0.3780 0.0000 0.0078 26.333 0.24 6.14 -5.89 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0006 0.1022 0.8972 1 2 0.0008 0.1103 0.8889 1 2 0.0011 0.1222 0.8767
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 476 161 315 78 2 5 6 70 0 0 309 0 6 0.4845 0.0000 0.0190 30.600 0.31 2.94 -2.64 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0930 0.6753 0.2317 1 1 0.0973 0.6626 0.2400 1 1 0.1030 0.6465 0.2505
chr20 34077071 CGGT C 0.001321 0.100 1 -3 2 472 165 307 149 3 7 0 6 0 0 307 0 0 0.9030 0.0000 0.0000 22.571 1.46 4.00 -2.54 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7390 0.2610 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.100 1 -9 4 198 74 124 32 2 17 0 23 0 0 122 0 2 0.4324 0.0000 0.0161 3.353 2.34 10.13 -7.79 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3894 0.5171 0.0935 1 1 0.3844 0.5168 0.0988 1 1 0.3774 0.5164 0.1062
chr20 35277855 A AGGCTGG 0.014271 0.100 1 6 1 439 149 290 121 1 22 0 5 0 0 290 0 0 0.8121 0.0000 0.0000 5.727 0.31 6.00 -5.69 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3371 0.6629 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr20 35652818 A AGGGCCG 0.080534 0.100 1 6 2 745 170 575 85 0 28 1 56 0 0 575 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 5.071 0.27 4.82 -4.55 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8819 0.1178 0.0003 1 0 0.8760 0.1236 0.0004 1 0 0.8674 0.1321 0.0005
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 507 137 370 10 0 4 0 123 0 0 369 0 1 0.0730 0.0000 0.0027 33.250 0.50 3.24 -2.74 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9824 0.0176 2 2 0.0000 0.4924 0.5076
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 933 297 636 112 1 36 8 140 0 0 636 0 0 0.3771 0.0000 0.0000 7.250 0.38 3.10 -2.72 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0005 0.1544 0.8451 1 2 0.0007 0.1593 0.8400 1 2 0.0010 0.1668 0.8322
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 556 260 296 205 7 30 1 17 0 0 296 0 0 0.7885 0.0000 0.0000 7.667 0.31 3.24 -2.92 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3916 0.6084 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 177 31 146 0 0 1 0 30 0 0 144 0 2 0.0000 0.0000 0.0137 30.000 6.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 295 147 148 72 0 2 0 73 0 0 148 0 0 0.4898 0.0000 0.0000 72.500 0.08 2.14 -2.05 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0839 0.6603 0.2558 1 1 0.0873 0.6486 0.2641 1 1 0.0917 0.6336 0.2747
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 729 189 540 113 0 5 0 71 0 0 537 0 3 0.5979 0.0000 0.0056 36.800 0.37 5.51 -5.14 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9030 0.0966 0.0004 1 0 0.8957 0.1038 0.0006 1 0 0.8848 0.1144 0.0008
chr21 33488442 CAATTA C 0.224085 0.100 1 -5 2 640 156 484 127 0 8 0 21 0 0 484 0 0 0.8141 0.0000 0.0000 18.500 0.08 4.52 -4.45 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0023 0.9977 0.0000
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 706 175 531 95 5 16 3 56 0 2 528 1 0 0.5429 0.0000 0.0056 9.938 1.83 13.62 -11.79 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9566 0.0433 0.0001 1 0 0.9523 0.0476 0.0001 1 0 0.9457 0.0541 0.0001
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 217 99 118 51 1 6 0 41 0 0 118 0 0 0.5152 0.0000 0.0000 15.500 0.29 3.15 -2.85 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4167 0.5197 0.0636 1 1 0.4128 0.5187 0.0686 1 1 0.4069 0.5175 0.0755
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 309 58 251 0 0 7 2 49 0 0 251 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.286 2.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1124 199 925 104 6 3 6 80 3 1 912 1 8 0.5226 0.0032 0.0141 64.000 0.84 3.14 -2.30 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4525 0.5288 0.0187 1 1 0.4519 0.5265 0.0216 1 1 0.4496 0.5243 0.0261
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1125 198 927 102 5 4 9 78 2 0 916 2 7 0.5152 0.0022 0.0119 62.667 0.76 3.08 -2.31 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3002 0.6545 0.0453 1 1 0.3039 0.6456 0.0506 1 1 0.3076 0.6342 0.0581
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 658 152 506 83 2 14 0 53 19 9 464 1 13 0.5461 0.0375 0.0830 9.786 1.51 13.13 -11.63 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9695 0.0305 0.0000 1 0 0.9661 0.0339 0.0000 1 0 0.9608 0.0391 0.0001
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 593 118 475 55 2 9 1 51 0 0 471 0 4 0.4661 0.0000 0.0084 12.000 0.82 12.90 -12.08 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1807 0.6353 0.1840 1 1 0.1850 0.6256 0.1894 1 1 0.1904 0.6132 0.1964
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 354 136 218 0 0 7 4 125 0 0 218 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 18.143 7.88 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 46302071 A ATGG 0.319174 0.100 1 3 1 510 202 308 9 2 27 1 163 0 0 305 0 3 0.0446 0.0000 0.0097 6.444 0.11 3.18 -3.07 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9838 0.0162 2 2 0.0000 0.4317 0.5683
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 630 146 484 65 1 31 0 49 0 0 474 1 9 0.4452 0.0000 0.0207 3.677 0.92 15.51 -14.59 41 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0945 0.7280 0.1775 1 1 0.0950 0.7170 0.1879 1 1 0.0954 0.7027 0.2019
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.100 1 3 1 1167 336 831 133 9 92 1 101 0 0 829 1 1 0.3958 0.0000 0.0024 2.652 0.84 2.98 -2.14 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9151 0.0848 0.0001 1 0 0.9108 0.0891 0.0001 1 0 0.9043 0.0955 0.0002
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 660 170 490 99 0 2 0 69 0 0 489 0 1 0.5824 0.0000 0.0020 84.000 0.47 3.97 -3.50 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8204 0.1778 0.0018 1 0 0.8129 0.1849 0.0022 1 0 0.8019 0.1952 0.0029
chr22 35658969 TA T 0.000024 0.100 1 -1 5 870 215 655 197 0 6 0 12 0 0 655 0 0 0.9163 0.0000 0.0000 34.833 0.21 1.08 -0.87 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 570 195 375 114 0 9 0 72 0 0 375 0 0 0.5846 0.0000 0.0000 20.667 0.60 2.18 -1.58 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9298 0.0700 0.0002 1 0 0.9235 0.0762 0.0003 1 0 0.9141 0.0855 0.0004
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 421 204 217 145 0 53 0 6 0 1 216 0 0 0.7108 0.0000 0.0046 2.849 0.64 9.50 -8.86 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0088 0.9912 0.0000 0 0 0.8878 0.1122 0.0000 0 0 0.9879 0.0121 0.0000
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 462 80 382 4 0 2 0 74 0 0 382 0 0 0.0500 0.0000 0.0000 39.000 0.00 9.89 -9.89 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9925 0.0075 2 1 0.0000 0.5812 0.4188 2 2 0.0000 0.2211 0.7789
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.100 1 -3 1 885 318 567 178 4 11 0 125 0 0 558 2 7 0.5597 0.0000 0.0159 30.600 1.29 3.79 -2.50 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9351 0.0648 0.0001 1 0 0.9308 0.0691 0.0001 1 0 0.9244 0.0755 0.0001
chr22 38086345 GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA G 0.313009 0.100 1 -42 4 331 124 207 24 0 4 0 96 0 0 179 0 28 0.1935 0.0000 0.1353 30.000 0.46 22.96 -22.50 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 378 176 202 10 0 13 0 153 0 0 184 0 18 0.0568 0.0000 0.0891 12.538 0.00 7.39 -7.39 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9407 0.0593 2 2 0.0000 0.2276 0.7724
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 317 107 210 50 0 3 0 54 0 0 208 0 2 0.4673 0.0000 0.0095 34.667 0.12 3.17 -3.05 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0516 0.5380 0.4104 1 1 0.0544 0.5326 0.4130 1 1 0.0581 0.5261 0.4158
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1421 378 1043 332 0 6 0 40 4 0 1037 0 2 0.8783 0.0038 0.0058 62.000 3.68 9.15 -5.47 150 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 879 357 522 301 1 7 2 46 0 0 522 0 0 0.8431 0.0000 0.0000 50.000 0.17 3.07 -2.90 147 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr22 44285538 TGGGGCCCGCTGACCCGGCCGA T 0.024129 0.100 1 -21 1 431 140 291 76 1 16 0 47 0 0 287 0 4 0.5429 0.0000 0.0137 7.688 0.49 15.55 -15.07 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8694 0.1305 0.0001 1 0 0.8635 0.1364 0.0002 1 0 0.8550 0.1448 0.0002
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 367 115 252 83 0 24 0 8 0 0 251 0 1 0.7217 0.0000 0.0040 3.792 0.30 11.62 -11.32 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0355 0.9645 0.0000 0 0 0.5948 0.4052 0.0000
chr22 50547999 GCCCCAACCCCAGCCGCATCCCCTGCCCCAGCCCCCACCTCAGCCCCAA G 0.207510 0.100 1 -48 1 1007 283 724 241 2 31 0 9 0 1 720 0 3 0.8516 0.0000 0.0055 8.400 0.71 21.78 -21.06 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6797 0.3203 0.0000 0 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr22 50739857 AC A 0.000001 0.100 1 -1 1 497 131 366 71 0 1 0 59 0 0 365 0 1 0.5420 0.0000 0.0027 130.000 0.30 1.31 -1.01 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6102 0.3898 0.0000 1 0 0.6117 0.3883 0.0000 1 0 0.6130 0.3870 0.0000
675 rows