File Info

Filename
HG03470_x_HG03486_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/4b/8416302e98b6797b110b35f1c4ee68/HG03470_x_HG03486_FF_10.features.tsv
Size
179.2 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG03470_x_HG03486_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 972109 TGGA T 0.000144 0.100 1 -3 2 495 96 399 90 0 1 0 5 0 0 398 0 1 0.9375 0.0000 0.0025 95.000 0.39 4.80 -4.41 50 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5244 0.4756 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr1 1353305 G GC 0.001365 0.100 1 1 2 283 82 201 39 0 2 0 41 0 0 199 1 1 0.4756 0.0000 0.0100 40.000 0.56 1.29 -0.73 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3100 0.6891 0.0009 1 1 0.3198 0.6792 0.0009 1 1 0.3326 0.6664 0.0009
chr1 1426150 C CGGA 0.000187 0.100 1 3 1 288 88 200 51 2 8 0 27 0 0 198 0 2 0.5795 0.0000 0.0100 10.000 1.39 4.19 -2.79 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8776 0.1224 0.0000 1 0 0.8709 0.1291 0.0000 1 0 0.8613 0.1387 0.0000
chr1 1752908 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 422 166 256 72 1 14 4 75 0 0 255 0 1 0.4337 0.0000 0.0039 10.857 0.29 3.27 -2.98 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0741 0.6286 0.2973 1 1 0.0794 0.6190 0.3016 1 1 0.0866 0.6069 0.3066
chr1 2529505 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 469 133 336 115 2 11 1 4 0 0 336 0 0 0.8647 0.0000 0.0000 11.000 1.14 3.00 -1.86 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0405 0.9595 0.0000 0 0 0.7978 0.2022 0.0000 0 0 0.9492 0.0508 0.0000
chr1 6469122 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 836 246 590 163 3 49 0 31 0 0 589 0 1 0.6626 0.0000 0.0017 4.000 0.26 3.23 -2.97 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 6469126 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 835 235 600 199 3 24 0 9 0 0 600 0 0 0.8468 0.0000 0.0000 208.000 0.30 3.78 -3.48 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4353 0.5647 0.0000 0 0 0.9641 0.0359 0.0000
chr1 6469129 TCC T 0.500000 0.100 1 -2 2 839 238 601 201 0 9 19 9 0 0 601 0 0 0.8445 0.0000 0.0000 35.000 0.36 3.78 -3.42 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0098 0.9902 0.0000 0 1 0.4284 0.5716 0.0000
chr1 8359794 T TCGCTCC 0.500000 0.100 1 6 1 499 144 355 81 0 9 0 54 0 0 355 0 0 0.5625 0.0000 0.0000 15.000 0.19 5.39 -5.20 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7864 0.2098 0.0037 1 0 0.7768 0.2186 0.0045 1 0 0.7631 0.2311 0.0058
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 552 142 410 3 66 16 1 56 0 0 408 0 2 0.0211 0.0000 0.0049 7.875 2.00 3.52 -1.52 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3940 0.5509 0.0551 1 1 0.3943 0.5462 0.0595 1 1 0.3939 0.5404 0.0657
chr1 11650722 CGCG C 0.500000 0.100 1 -3 1 552 144 408 57 6 10 0 71 0 0 408 0 0 0.3958 0.0000 0.0000 13.400 2.95 3.08 -0.14 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0682 0.5891 0.3427 1 1 0.0731 0.5820 0.3449 1 1 0.0798 0.5732 0.3470
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 1012 218 794 88 0 10 2 118 0 0 791 0 3 0.4037 0.0000 0.0038 20.800 0.39 3.29 -2.90 20 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0008 0.1492 0.8499 1 2 0.0011 0.1564 0.8425 1 2 0.0015 0.1669 0.8316
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 315 80 235 62 0 3 0 15 0 0 235 0 0 0.7750 0.0000 0.0000 25.667 0.31 1.07 -0.76 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1008 0.8992 0.0000 0 1 0.0053 0.9947 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000
chr1 26282320 TCCAGGACAGGGACTGGGGCCGGGACCGGGACCGGGACTGGGGCCGGGA T 0.500000 0.100 1 -48 3 765 230 535 73 11 50 7 89 0 0 532 0 3 0.3174 0.0000 0.0056 4.293 6.40 21.02 -14.63 41 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0209 0.4910 0.4881 1 2 0.0236 0.4881 0.4883 1 2 0.0276 0.4850 0.4873
chr1 26282374 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 772 183 589 19 76 9 15 64 0 0 585 2 2 0.1038 0.0000 0.0068 15.333 6.89 26.31 -19.42 5 1/1 0/1 . . OK 1 1 0.2131 0.6722 0.1147 1 1 0.2192 0.6601 0.1207 1 1 0.2266 0.6446 0.1288
chr1 26282386 GCCGGGA G 0.500000 0.100 1 -6 4 791 197 594 5 1 14 2 175 0 0 583 1 10 0.0254 0.0000 0.0185 18.300 1.40 13.78 -12.38 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9741 0.0259 2 2 0.0000 0.0516 0.9484 2 2 0.0000 0.0057 0.9943
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.100 1 -24 1 650 136 514 71 0 2 0 63 0 0 508 0 6 0.5221 0.0000 0.0117 67.000 0.63 20.32 -19.68 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2028 0.6609 0.1364 1 1 0.2083 0.6494 0.1423 1 1 0.2152 0.6349 0.1500
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 409 185 224 18 0 14 0 153 0 0 220 0 4 0.0973 0.0000 0.0179 12.214 0.00 3.11 -3.11 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9808 0.0192
chr1 44130707 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 2 420 116 304 106 0 7 0 3 1 0 302 0 1 0.9138 0.0033 0.0066 15.571 0.24 3.33 -3.10 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0312 0.9688 0.0000 0 0 0.7475 0.2525 0.0000 0 0 0.9325 0.0675 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 606 160 446 1 0 24 1 134 0 0 443 1 2 0.0063 0.0000 0.0067 5.667 0.00 5.49 -5.49 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0081 0.9919 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 178 84 94 40 0 2 0 42 0 0 93 0 1 0.4762 0.0000 0.0106 41.000 1.07 3.43 -2.35 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1458 0.5899 0.2643 1 1 0.1504 0.5832 0.2664 1 1 0.1564 0.5748 0.2688
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 345 178 167 134 0 36 0 8 0 0 166 0 1 0.7528 0.0000 0.0060 3.944 0.69 9.12 -8.44 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0527 0.9473 0.0000 0 0 0.6740 0.3260 0.0000
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 508 178 330 74 2 13 0 89 0 0 327 0 3 0.4157 0.0000 0.0091 12.615 0.32 5.81 -5.48 2 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0205 0.4668 0.5127 1 2 0.0232 0.4655 0.5113 1 2 0.0272 0.4645 0.5083
chr1 86580219 ACCTACT A 0.500000 0.100 1 -6 1 508 177 331 67 2 23 0 85 0 0 331 0 0 0.3785 0.0000 0.0000 6.652 0.42 6.12 -5.70 11 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0212 0.4497 0.5291 1 2 0.0239 0.4497 0.5264 1 2 0.0279 0.4504 0.5218
chr1 89150468 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 312 101 211 93 0 3 0 5 0 0 210 0 1 0.9208 0.0000 0.0047 32.667 0.11 1.00 -0.89 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1527 0.8473 0.0000 0 0 0.6620 0.3380 0.0000
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 181 85 96 41 0 1 0 43 0 0 96 0 0 0.4824 0.0000 0.0000 84.000 0.15 3.21 -3.06 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1621 0.5969 0.2410 1 1 0.1665 0.5897 0.2438 1 1 0.1722 0.5806 0.2471
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 477 149 328 125 1 13 0 10 0 0 328 0 0 0.8389 0.0000 0.0000 10.462 0.54 4.20 -3.66 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0127 0.9873 0.0000 0 1 0.4241 0.5759 0.0000
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 850 190 660 13 0 13 3 161 0 0 657 1 2 0.0684 0.0000 0.0045 13.615 1.23 14.56 -13.33 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9959 0.0041 2 1 0.0000 0.5600 0.4400
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.100 1 -45 4 852 237 615 211 12 3 2 9 0 0 615 0 0 0.8903 0.0000 0.0000 115.000 10.04 2.22 7.82 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.7803 0.2197 0.0000 0 0 0.9918 0.0082 0.0000
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 703 222 481 120 3 23 5 71 0 0 481 0 0 0.5405 0.0000 0.0000 9.000 0.46 4.14 -3.68 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9536 0.0464 0.0001 1 0 0.9485 0.0514 0.0001 1 0 0.9409 0.0590 0.0002
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 163 67 96 1 0 4 0 62 0 0 96 0 0 0.0149 0.0000 0.0000 15.750 0.00 2.08 -2.08 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2809 0.7191 2 2 0.0000 0.1159 0.8841 2 2 0.0000 0.0857 0.9143
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 246 81 165 34 0 5 0 42 0 0 164 0 1 0.4198 0.0000 0.0061 15.200 0.74 6.14 -5.41 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0711 0.5059 0.4231 1 1 0.0755 0.5048 0.4197 1 1 0.0817 0.5036 0.4147
chr1 152214519 GTGT G 0.500000 0.100 1 -3 2 4624 1190 3434 1072 10 10 1 97 8 209 3209 3 5 0.9008 0.0023 0.0655 118.000 0.57 3.54 -2.97 136 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0057 0.9943 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 321 112 209 39 5 13 3 52 0 0 209 0 0 0.3482 0.0000 0.0000 7.385 0.51 1.62 -1.10 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0504 0.4891 0.4605 1 1 0.0544 0.4887 0.4569 1 1 0.0602 0.4883 0.4515
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 265 84 181 0 0 15 0 69 0 0 163 0 18 0.0000 0.0000 0.0994 4.600 11.96 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0117 0.9883 2 2 0.0000 0.0128 0.9872 2 2 0.0000 0.0145 0.9855
chr1 153261012 C CGGCGGT 0.500000 0.100 1 6 2 791 201 590 92 0 27 3 79 1 0 580 1 8 0.4577 0.0017 0.0169 6.444 1.43 6.34 -4.91 44 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1749 0.7071 0.1180 1 1 0.1821 0.6931 0.1248 1 1 0.1913 0.6750 0.1337
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1257 296 961 18 0 47 4 227 0 2 911 4 44 0.0608 0.0000 0.0520 5.298 2.17 10.54 -8.38 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 2 0.0000 0.3031 0.6969
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 620 261 359 134 0 18 1 108 0 0 358 0 1 0.5134 0.0000 0.0028 13.500 0.44 7.58 -7.14 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6174 0.3773 0.0053 1 0 0.6164 0.3773 0.0063 1 0 0.6136 0.3783 0.0080
chr1 154869723 G GGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 1076 291 785 2 3 77 1 208 0 0 746 2 37 0.0069 0.0000 0.0497 2.779 7.50 8.22 -0.72 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1230 0.8770 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr1 156242566 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 510 139 371 126 0 3 0 10 0 0 371 0 0 0.9065 0.0000 0.0000 45.333 0.30 1.20 -0.90 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0129 0.9871 0.0000 0 1 0.4258 0.5742 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 217 76 141 43 0 2 0 31 0 0 140 0 1 0.5658 0.0000 0.0071 37.000 1.79 2.74 -0.95 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4798 0.4660 0.0543 1 0 0.4743 0.4673 0.0584 1 1 0.4666 0.4692 0.0641
chr1 156583439 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 381 112 269 65 0 4 0 43 0 0 268 0 1 0.5804 0.0000 0.0037 27.000 0.28 1.30 -1.03 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6938 0.2954 0.0108 1 0 0.6842 0.3033 0.0125 1 0 0.6707 0.3141 0.0152
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 462 108 354 0 0 1 0 107 0 0 353 0 1 0.0000 0.0000 0.0028 107.000 2.69 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0053 0.9947
chr1 158563508 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 523 134 389 78 1 8 0 47 0 0 389 0 0 0.5821 0.0000 0.0000 15.625 0.86 2.43 -1.57 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8611 0.1373 0.0016 1 0 0.8516 0.1464 0.0020 1 0 0.8378 0.1594 0.0027
chr1 158700284 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 786 185 601 176 0 0 0 9 0 0 601 0 0 0.9514 0.0000 0.0000 185.000 0.43 2.00 -1.57 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3118 0.6882 0.0000 0 0 0.9407 0.0593 0.0000
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 860 170 690 1 0 12 0 157 0 0 689 0 1 0.0059 0.0000 0.0014 13.167 3.00 1.59 1.41 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.100 1 3 1 160 69 91 43 0 1 0 25 0 0 88 0 3 0.6232 0.0000 0.0330 68.000 1.00 4.08 -3.08 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5911 0.3786 0.0302 1 0 0.5820 0.3846 0.0334 1 0 0.5694 0.3926 0.0380
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 201 64 137 38 0 0 0 26 0 0 136 0 1 0.5938 0.0000 0.0073 64.000 0.47 1.12 -0.64 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4908 0.4538 0.0554 1 0 0.4844 0.4560 0.0595 1 0 0.4756 0.4591 0.0653
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 301 69 232 61 0 3 0 5 1 0 231 0 0 0.8841 0.0043 0.0043 22.000 0.31 5.20 -4.89 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1017 0.8983 0.0000 0 1 0.4543 0.5457 0.0000
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 172 59 113 48 0 7 0 4 0 0 113 0 0 0.8136 0.0000 0.0000 7.429 0.46 4.50 -4.04 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.1346 0.8654 0.0000 0 1 0.4408 0.5592 0.0000
chr1 186304854 CAACAA C 0.500000 0.100 1 -5 2 283 105 178 98 0 1 0 6 0 0 178 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 104.000 0.87 4.17 -3.30 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1834 0.8166 0.0000 0 0 0.7119 0.2881 0.0000
chr1 186307744 CACCCCTAAGGAGCCTGCTCCAACT C 0.500000 0.100 1 -24 2 1882 562 1320 272 14 267 1 8 54 3 1261 0 2 0.4840 0.0409 0.0447 1.082 1.56 6.50 -4.94 88 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0070 0.9930 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr1 201386872 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 628 151 477 140 1 3 2 5 0 0 477 0 0 0.9272 0.0000 0.0000 49.333 0.86 4.80 -3.94 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 0 0.6525 0.3475 0.0000 0 0 0.9441 0.0559 0.0000
chr1 201386876 ACC A 0.500000 0.100 1 -2 3 625 152 473 142 1 2 2 5 0 0 472 0 1 0.9342 0.0000 0.0021 75.000 0.82 4.80 -3.98 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2194 0.7806 0.0000 0 0 0.8634 0.1366 0.0000
chr1 209432291 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 628 304 324 36 109 51 3 105 0 1 320 0 3 0.1184 0.0000 0.0123 4.961 0.14 3.02 -2.88 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8126 0.1865 0.0009 1 0 0.8067 0.1922 0.0011 1 0 0.7977 0.2008 0.0016
chr1 209432291 TAGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 628 309 319 142 10 50 8 99 0 0 318 0 1 0.4595 0.0000 0.0031 5.180 2.13 3.17 -1.04 86 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9139 0.0859 0.0002 1 0 0.9081 0.0917 0.0002 1 0 0.8994 0.1003 0.0003
chr1 214383705 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 1 879 203 676 88 0 22 0 93 0 0 672 0 4 0.4335 0.0000 0.0059 8.227 0.52 6.12 -5.60 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0546 0.6400 0.3054 1 1 0.0595 0.6294 0.3112 1 1 0.0663 0.6159 0.3178
chr1 222544020 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 431 98 333 92 0 2 0 4 0 0 332 0 1 0.9388 0.0000 0.0030 48.000 0.15 1.00 -0.85 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.3286 0.6714 0.0000 0 0 0.7790 0.2210 0.0000
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 683 141 542 69 0 8 0 64 0 0 539 0 3 0.4894 0.0000 0.0055 16.625 0.57 8.66 -8.09 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2054 0.6564 0.1382 1 1 0.2108 0.6453 0.1439 1 1 0.2174 0.6311 0.1515
chr1 234609199 A AGCT 0.500000 0.100 1 3 2 495 111 384 60 0 18 0 33 0 0 383 1 0 0.5405 0.0000 0.0026 5.167 1.98 5.52 -3.53 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8023 0.1931 0.0046 1 0 0.7912 0.2032 0.0056 1 0 0.7756 0.2174 0.0071
chr1 235213963 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 161 61 100 33 1 8 0 19 0 0 100 0 0 0.5410 0.0000 0.0000 6.625 0.18 2.89 -2.71 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6095 0.3590 0.0315 1 0 0.5990 0.3664 0.0347 1 0 0.5845 0.3761 0.0393
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 691 180 511 0 0 24 0 156 0 0 506 2 3 0.0000 0.0000 0.0098 6.500 3.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr1 240092766 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 745 142 603 104 4 27 0 7 0 0 603 0 0 0.7324 0.0000 0.0000 4.259 1.12 3.14 -2.03 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1132 0.8868 0.0000 0 0 0.6788 0.3212 0.0000
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 514 151 363 72 0 2 0 77 0 0 363 0 0 0.4768 0.0000 0.0000 74.500 0.64 1.48 -0.84 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0951 0.6485 0.2564 1 1 0.1008 0.6378 0.2614 1 1 0.1084 0.6242 0.2674
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 709 197 512 105 0 2 0 90 0 0 511 0 1 0.5330 0.0000 0.0020 97.500 0.30 3.16 -2.85 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4223 0.5514 0.0263 1 1 0.4255 0.5450 0.0295 1 1 0.4284 0.5374 0.0342
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 384 101 283 54 0 4 0 43 0 0 283 0 0 0.5347 0.0000 0.0000 24.250 0.30 1.21 -0.91 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4556 0.4929 0.0515 1 1 0.4522 0.4922 0.0556 1 1 0.4470 0.4916 0.0614
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 1185 309 876 14 0 2 1 292 0 0 876 0 0 0.0453 0.0000 0.0000 153.500 0.14 1.34 -1.20 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5651 0.4349 2 2 0.0000 0.0053 0.9947
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 504 155 349 64 0 5 0 86 0 0 349 0 0 0.4129 0.0000 0.0000 30.000 2.19 5.08 -2.89 58 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0086 0.3177 0.6737 1 2 0.0101 0.3234 0.6665 1 2 0.0124 0.3316 0.6560
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.100 1 9 1 1065 181 884 124 0 27 0 30 0 0 877 0 7 0.6851 0.0000 0.0079 5.704 0.40 8.80 -8.40 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9152 0.0848 0.0000 0 1 0.0072 0.9928 0.0000
chr1 248650432 T TC 0.500000 0.100 1 1 3 847 208 639 197 0 5 0 6 0 0 639 0 0 0.9471 0.0000 0.0000 40.600 0.57 2.67 -2.10 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0399 0.9601 0.0000 0 0 0.9701 0.0299 0.0000 0 0 0.9968 0.0032 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 241 120 121 3 0 3 1 113 0 0 119 0 2 0.0250 0.0000 0.0165 38.667 0.00 3.03 -3.03 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7492 0.2508 2 2 0.0000 0.0946 0.9054 2 2 0.0000 0.0335 0.9665
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 450 165 285 0 0 20 1 144 0 0 273 0 12 0.0000 0.0000 0.0421 7.250 8.17 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 586 226 360 197 0 22 0 7 0 0 360 0 0 0.8717 0.0000 0.0000 9.714 0.31 9.57 -9.26 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0084 0.9916 0.0000 0 0 0.9582 0.0418 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 241 61 180 0 0 2 0 59 0 0 178 0 2 0.0000 0.0000 0.0111 29.500 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0427 0.9573 2 2 0.0000 0.0454 0.9546 2 2 0.0000 0.0493 0.9507
chr2 27307769 C CG 0.500000 0.100 1 1 4 329 89 240 77 1 4 1 6 0 0 240 0 0 0.8652 0.0000 0.0000 21.000 0.51 1.00 -0.49 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0402 0.9598 0.0000 0 1 0.3661 0.6339 0.0000
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 307 100 207 12 0 11 0 77 0 0 203 0 4 0.1200 0.0000 0.0193 8.091 0.50 3.00 -2.50 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9775 0.0225
chr2 39769817 ATTC A 0.500000 0.100 1 -3 3 483 113 370 71 0 6 0 36 0 0 368 0 2 0.6283 0.0000 0.0054 17.833 0.20 2.83 -2.64 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8841 0.1146 0.0013 1 0 0.8748 0.1236 0.0016 1 0 0.8612 0.1366 0.0022
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 552 177 375 103 2 62 1 9 0 0 375 0 0 0.5819 0.0000 0.0000 1.839 0.35 1.56 -1.21 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0099 0.9901 0.0000 0 1 0.2873 0.7127 0.0000
chr2 48755616 G GGCTGCA 0.500000 0.100 1 6 1 249 104 145 47 0 12 0 45 0 0 145 0 0 0.4519 0.0000 0.0000 7.667 0.43 5.60 -5.17 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2354 0.6063 0.1583 1 1 0.2386 0.5984 0.1630 1 1 0.2425 0.5885 0.1690
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 704 67 637 47 5 9 0 6 9 2 626 0 0 0.7015 0.0141 0.0173 6.333 4.04 6.00 -1.96 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0370 0.9630 0.0000 0 1 0.3074 0.6926 0.0000
chr2 65072937 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 3 436 106 330 92 0 8 0 6 0 0 330 0 0 0.8679 0.0000 0.0000 12.250 0.13 2.67 -2.54 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1428 0.8572 0.0000 0 0 0.6488 0.3512 0.0000
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 442 175 267 75 2 17 1 80 0 0 266 0 1 0.4286 0.0000 0.0037 9.176 0.45 3.36 -2.91 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0918 0.6582 0.2499 1 1 0.0976 0.6469 0.2555 1 1 0.1054 0.6325 0.2622
chr2 72956998 CT C 0.500000 0.100 1 -1 4 213 82 131 57 0 0 0 25 0 0 131 0 0 0.6951 0.0000 0.0000 82.000 0.33 1.12 -0.79 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8872 0.1112 0.0016 1 0 0.8774 0.1206 0.0020 1 0 0.8631 0.1342 0.0027
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 608 145 463 3 1 29 56 56 0 0 456 6 1 0.0207 0.0000 0.0151 3.966 0.00 3.32 -3.32 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.8883 0.1117 2 2 0.0000 0.1312 0.8688 2 2 0.0000 0.0354 0.9646
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 609 149 460 5 2 83 1 58 0 0 453 0 7 0.0336 0.0000 0.0152 0.778 0.00 6.38 -6.38 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9302 0.0698 2 1 0.0000 0.6272 0.3728
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 495 123 372 101 0 5 0 17 0 0 371 0 1 0.8211 0.0000 0.0027 23.600 0.20 3.18 -2.98 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 970 193 777 108 0 29 0 56 0 0 754 0 23 0.5596 0.0000 0.0296 5.655 0.45 11.50 -11.05 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7778 0.2197 0.0025 1 0 0.7701 0.2268 0.0031 1 0 0.7589 0.2371 0.0040
chr2 74958681 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 1 285 70 215 62 1 1 0 6 0 0 214 0 1 0.8857 0.0000 0.0047 69.000 0.92 3.17 -2.25 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 1 0.1923 0.8077 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 417 151 266 68 1 16 3 63 0 0 263 0 3 0.4503 0.0000 0.0113 9.000 0.60 3.44 -2.84 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1612 0.6629 0.1759 1 1 0.1670 0.6514 0.1816 1 1 0.1745 0.6367 0.1889
chr2 85343751 CAGAT C 0.500000 0.100 1 -4 2 853 228 625 212 0 11 0 5 0 0 625 0 0 0.9298 0.0000 0.0000 19.727 0.35 4.20 -3.85 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4238 0.5762 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 490 149 341 0 0 23 3 123 0 0 336 1 4 0.0000 0.0000 0.0147 5.478 3.28 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr2 108308425 GA G 0.500000 0.100 1 -1 3 213 101 112 95 0 1 0 5 0 0 112 0 0 0.9406 0.0000 0.0000 100.000 0.04 1.00 -0.96 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 1 0.3600 0.6400 0.0000 0 0 0.8025 0.1975 0.0000
chr2 110995965 GGTTCTTCAGCGGGGTTTGGTGGCCAGAATTTATTATAAGGTAAAGATACACTGT G 0.500000 0.100 1 -54 3 176 83 93 54 0 2 0 27 0 0 88 0 5 0.6506 0.0000 0.0538 40.500 0.52 16.15 -15.63 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7368 0.2538 0.0094 1 0 0.7256 0.2634 0.0110 1 0 0.7100 0.2766 0.0134
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 143 66 77 36 0 2 0 28 0 0 77 0 0 0.5455 0.0000 0.0000 32.000 0.11 3.21 -3.10 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4093 0.5069 0.0838 1 1 0.4057 0.5060 0.0883 1 1 0.4006 0.5049 0.0945
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 586 144 442 0 0 0 2 142 0 0 430 0 12 0.0000 0.0000 0.0271 142.000 5.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr2 127858100 T TCGCCGCGCCG 0.500000 0.100 1 10 1 186 90 96 71 0 13 0 6 0 0 96 0 0 0.7889 0.0000 0.0000 5.923 0.32 10.50 -10.18 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0551 0.9449 0.0000 0 1 0.3999 0.6001 0.0000
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 371 114 257 0 0 19 0 95 0 0 252 0 5 0.0000 0.0000 0.0195 5.000 6.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0077 0.9923
chr2 131492343 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 747 220 527 100 1 15 0 104 1 0 525 0 1 0.4545 0.0019 0.0038 13.667 0.67 1.46 -0.79 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0985 0.7258 0.1757 1 1 0.1053 0.7109 0.1838 1 1 0.1145 0.6915 0.1940
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 195 56 139 13 3 9 16 15 0 0 138 0 1 0.2321 0.0000 0.0072 3.556 1.38 1.53 -0.15 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0429 0.3848 0.5723 1 2 0.0466 0.3912 0.5622 1 2 0.0518 0.3998 0.5484
chr2 151464366 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 818 192 626 102 0 2 0 88 0 0 625 0 1 0.5312 0.0000 0.0016 95.000 0.31 3.22 -2.90 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4028 0.5666 0.0306 1 1 0.4063 0.5596 0.0341 1 1 0.4097 0.5511 0.0392
chr2 165176265 CATT C 0.500000 0.100 1 -3 1 271 106 165 98 0 1 0 7 0 0 165 0 0 0.9245 0.0000 0.0000 105.000 0.20 3.00 -2.80 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0719 0.9281 0.0000 0 0 0.5653 0.4347 0.0000
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 322 159 163 152 0 4 0 3 0 0 163 0 0 0.9560 0.0000 0.0000 38.750 0.15 4.00 -3.85 48 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7466 0.2534 0.0000 0 0 0.9878 0.0122 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.100 1 -2 1 350 136 214 77 1 4 0 54 0 0 214 0 0 0.5662 0.0000 0.0000 33.000 0.52 4.02 -3.50 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7338 0.2599 0.0063 1 0 0.7246 0.2679 0.0075 1 0 0.7114 0.2792 0.0094
chr2 178650214 TTTTCCTCTTCAGGAGCAA T 0.500000 0.100 1 -18 1 365 106 259 50 0 19 0 37 0 0 253 0 6 0.4717 0.0000 0.0232 4.579 0.18 14.84 -14.66 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3538 0.5579 0.0883 1 1 0.3536 0.5533 0.0931 1 1 0.3528 0.5475 0.0997
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 341 150 191 6 2 21 49 72 0 0 188 0 3 0.0400 0.0000 0.0157 3.810 0.50 5.25 -4.75 4 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8634 0.1366 2 2 0.0000 0.2776 0.7224
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 341 150 191 58 1 31 1 59 0 0 188 0 3 0.3867 0.0000 0.0157 3.933 2.76 5.81 -3.05 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1156 0.6269 0.2575 1 1 0.1210 0.6176 0.2614 1 1 0.1282 0.6059 0.2659
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 341 155 186 10 50 22 14 59 0 0 186 0 0 0.0645 0.0000 0.0000 5.619 0.10 2.98 -2.88 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0231 0.4063 0.5706 1 2 0.0259 0.4096 0.5645 1 2 0.0300 0.4144 0.5556
chr2 202196839 TAGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 342 118 224 56 1 8 0 53 0 0 220 0 4 0.4746 0.0000 0.0179 13.750 0.29 3.06 -2.77 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1810 0.6361 0.1829 1 1 0.1860 0.6263 0.1878 1 1 0.1922 0.6138 0.1940
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 1 518 129 389 76 3 40 1 9 1 0 388 0 0 0.5891 0.0026 0.0026 2.256 1.74 4.78 -3.04 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.1046 0.8954 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 281 101 180 54 0 7 0 40 0 0 180 0 0 0.5347 0.0000 0.0000 13.429 0.39 3.00 -2.61 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5394 0.4270 0.0336 1 0 0.5330 0.4300 0.0370 1 0 0.5240 0.4342 0.0419
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 583 174 409 68 0 21 1 84 0 0 407 0 2 0.3908 0.0000 0.0049 7.286 0.68 7.76 -7.09 22 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0138 0.3888 0.5974 1 2 0.0159 0.3915 0.5926 1 2 0.0190 0.3958 0.5852
chr2 219182152 G GGAGGAA 0.500000 0.100 1 6 1 670 138 532 107 0 26 0 5 0 0 532 0 0 0.7754 0.0000 0.0000 4.308 0.45 7.40 -6.95 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 0 0.5052 0.4948 0.0000 0 0 0.8790 0.1210 0.0000
chr2 229591816 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 1 511 203 308 183 0 15 0 5 0 0 308 0 0 0.9015 0.0000 0.0000 12.533 0.46 12.00 -11.54 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1436 0.8564 0.0000 0 0 0.9785 0.0215 0.0000 0 0 0.9966 0.0034 0.0000
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 732 277 455 235 5 10 0 27 0 0 452 0 3 0.8484 0.0000 0.0066 26.400 0.72 17.07 -16.35 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000
chr2 231460703 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 1 707 147 560 73 0 4 1 69 0 0 559 0 1 0.4966 0.0000 0.0018 35.750 0.45 3.19 -2.74 49 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2002 0.6652 0.1346 1 1 0.2059 0.6535 0.1405 1 1 0.2130 0.6386 0.1484
chr2 232844199 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 4 625 194 431 79 1 43 2 69 2 0 426 0 3 0.4072 0.0046 0.0116 3.512 0.19 3.16 -2.97 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3192 0.6163 0.0645 1 1 0.3231 0.6074 0.0695 1 1 0.3275 0.5962 0.0764
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 423 183 240 170 1 2 6 4 0 0 240 0 0 0.9290 0.0000 0.0000 88.000 1.18 3.00 -1.82 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0384 0.9616 0.0000 0 0 0.9015 0.0985 0.0000 0 0 0.9851 0.0149 0.0000
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 157 59 98 40 0 2 0 17 0 0 97 0 1 0.6780 0.0000 0.0102 28.500 0.23 3.59 -3.36 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7616 0.2287 0.0097 1 0 0.7491 0.2395 0.0113 1 0 0.7316 0.2546 0.0138
chr2 233565576 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 209 63 146 58 0 3 0 2 0 0 146 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 20.000 0.14 1.00 -0.86 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1941 0.8059 0.0000 0 0 0.6854 0.3146 0.0000 0 0 0.8227 0.1773 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 406 97 309 7 0 19 5 66 0 0 309 0 0 0.0722 0.0000 0.0000 4.333 0.29 3.26 -2.97 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9796 0.0204 2 1 0.0000 0.7343 0.2657
chr2 241096043 CTCG C 0.500000 0.100 1 -3 2 598 138 460 66 0 3 0 69 0 0 460 0 0 0.4783 0.0000 0.0000 45.000 1.94 3.16 -1.22 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1245 0.6499 0.2256 1 1 0.1302 0.6391 0.2306 1 1 0.1378 0.6255 0.2368
chr2 241096100 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 625 166 459 92 0 4 0 70 0 0 459 0 0 0.5542 0.0000 0.0000 40.500 1.59 3.37 -1.78 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6601 0.3314 0.0085 1 0 0.6538 0.3362 0.0100 1 0 0.6445 0.3433 0.0122
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 496 153 343 134 2 2 0 15 0 0 343 0 0 0.8758 0.0000 0.0000 75.500 1.03 1.93 -0.90 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0462 0.9538 0.0000
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 515 126 389 7 0 2 0 117 0 0 388 0 1 0.0556 0.0000 0.0026 62.000 0.00 3.27 -3.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 2 0.0000 0.3930 0.6070 2 2 0.0000 0.0382 0.9618
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 411 101 310 51 0 14 1 35 0 0 298 1 11 0.5050 0.0000 0.0387 6.214 1.67 11.11 -9.45 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3916 0.5618 0.0466 1 1 0.3963 0.5552 0.0484 1 1 0.4021 0.5471 0.0508
chr3 27721914 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 2 493 126 367 54 2 19 40 11 0 0 366 0 1 0.4286 0.0000 0.0027 5.632 0.48 4.09 -3.61 2 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2766 0.6071 0.1163 1 1 0.2794 0.5992 0.1215 1 1 0.2825 0.5891 0.1284
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 481 119 362 63 9 1 4 42 0 0 362 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 118.000 0.75 5.19 -4.44 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7706 0.2241 0.0053 1 0 0.7603 0.2333 0.0063 1 0 0.7458 0.2462 0.0080
chr3 38122579 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 595 198 397 110 0 5 0 83 0 0 397 0 0 0.5556 0.0000 0.0000 38.600 0.25 3.27 -3.02 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7356 0.2609 0.0035 1 0 0.7289 0.2669 0.0042 1 0 0.7189 0.2756 0.0055
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 18 1 740 264 476 111 5 122 6 20 1 3 454 4 14 0.4205 0.0021 0.0462 1.140 3.37 4.85 -1.48 17 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9943 0.0057 0.0000 1 0 0.9931 0.0069 0.0000 1 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 724 231 493 12 75 43 2 99 0 2 490 0 1 0.0519 0.0000 0.0061 4.372 0.25 3.20 -2.95 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0303 0.5638 0.4059 1 1 0.0338 0.5570 0.4092 1 1 0.0388 0.5487 0.4124
chr3 42210085 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 724 233 491 114 3 40 6 70 0 0 489 0 2 0.4893 0.0000 0.0041 4.825 2.78 2.96 -0.18 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8995 0.1001 0.0004 1 0 0.8923 0.1071 0.0006 1 0 0.8817 0.1175 0.0008
chr3 42691888 CGAG C 0.500000 0.100 1 -3 2 278 125 153 67 1 5 0 52 0 0 153 0 0 0.5360 0.0000 0.0000 24.000 0.73 3.60 -2.86 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5619 0.4146 0.0236 1 0 0.5563 0.4174 0.0264 1 0 0.5480 0.4215 0.0305
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 512 162 350 0 0 9 0 153 0 0 342 1 7 0.0000 0.0000 0.0229 17.000 2.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 330 135 195 0 0 0 1 134 0 0 193 0 2 0.0000 0.0000 0.0103 134.000 4.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 636 158 478 0 0 23 11 124 0 0 478 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.870 3.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 408 114 294 0 0 21 49 44 0 0 293 1 0 0.0000 0.0000 0.0034 4.381 3.52 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0083 0.9917 2 2 0.0000 0.0092 0.9908 2 2 0.0000 0.0105 0.9895
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 408 116 292 5 1 62 0 48 0 0 291 0 1 0.0431 0.0000 0.0034 0.885 1.00 6.02 -5.02 3 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9768 0.0232 2 1 0.0000 0.8283 0.1717
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 504 159 345 81 0 25 0 53 0 0 343 0 2 0.5094 0.0000 0.0058 5.360 0.31 5.55 -5.24 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7681 0.2274 0.0044 1 0 0.7587 0.2360 0.0053 1 0 0.7452 0.2480 0.0068
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 187 90 97 72 1 13 0 4 0 0 97 0 0 0.8000 0.0000 0.0000 5.923 2.97 1.00 1.97 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 1 0.3524 0.6476 0.0000 0 0 0.7264 0.2736 0.0000
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 250 95 155 0 0 5 82 8 0 0 155 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 18.000 3.62 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0127 0.9873 2 2 0.0000 0.0143 0.9857
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 249 100 149 0 0 2 2 96 0 0 149 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 49.000 3.80 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0082 0.9918 2 2 0.0000 0.0093 0.9907
chr3 63912684 G GGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 3 296 80 216 29 0 11 0 40 0 0 213 0 3 0.3625 0.0000 0.0139 6.273 2.79 6.30 -3.51 11 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0369 0.4079 0.5552 1 2 0.0404 0.4124 0.5472 1 2 0.0454 0.4185 0.5360
chr3 63912710 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 1 303 87 216 79 1 1 1 5 0 0 216 0 0 0.9080 0.0000 0.0000 86.000 3.87 4.20 -0.33 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1564 0.8436 0.0000 0 0 0.5931 0.4069 0.0000
chr3 63912713 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 303 89 214 39 43 2 0 5 0 0 214 0 0 0.4382 0.0000 0.0000 87.000 1.77 4.20 -2.43 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.2238 0.7762 0.0000 0 0 0.6783 0.3217 0.0000
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 379 163 216 63 4 16 3 77 0 0 215 0 1 0.3865 0.0000 0.0046 9.188 0.35 3.10 -2.75 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0301 0.4938 0.4761 1 1 0.0334 0.4918 0.4748 1 1 0.0382 0.4897 0.4721
chr3 65439885 T TCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 379 163 216 68 3 84 1 7 0 0 215 1 0 0.4172 0.0000 0.0046 0.940 0.65 4.71 -4.07 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0086 0.9914 0.0000 0 1 0.1438 0.8562 0.0000
chr3 98169478 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 783 175 608 160 2 6 0 7 0 0 608 0 0 0.9143 0.0000 0.0000 28.000 0.80 1.00 -0.20 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.6575 0.3425 0.0000 0 0 0.9667 0.0333 0.0000
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 847 224 623 191 0 21 0 12 0 0 620 0 3 0.8527 0.0000 0.0048 9.667 1.80 9.50 -7.70 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.4114 0.5886 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 120 49 71 25 2 2 0 20 0 0 69 1 1 0.5102 0.0000 0.0282 23.000 0.24 1.40 -1.16 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3406 0.5306 0.1288 1 1 0.3387 0.5282 0.1330 1 1 0.3361 0.5253 0.1387
chr3 112827063 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 457 128 329 64 0 1 0 63 0 0 329 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 127.000 0.14 1.13 -0.99 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1924 0.6497 0.1578 1 1 0.1976 0.6390 0.1634 1 1 0.2042 0.6254 0.1705
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1290 331 959 32 1 94 18 186 0 0 956 0 3 0.0967 0.0000 0.0031 2.521 0.34 3.09 -2.74 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 586 177 409 101 0 5 0 71 0 0 405 0 4 0.5706 0.0000 0.0098 34.400 0.32 3.11 -2.80 71 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7320 0.2637 0.0042 1 0 0.7247 0.2702 0.0051 1 0 0.7139 0.2796 0.0065
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 789 158 631 75 0 34 0 49 0 0 629 0 2 0.4747 0.0000 0.0032 3.647 0.52 9.90 -9.38 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7395 0.2542 0.0063 1 0 0.7299 0.2625 0.0075 1 0 0.7164 0.2742 0.0094
chr3 126572375 CCT C 0.500000 0.100 1 -2 4 514 136 378 77 0 1 1 57 0 0 378 0 0 0.5662 0.0000 0.0000 135.000 0.26 2.58 -2.32 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6201 0.3656 0.0143 1 0 0.6135 0.3701 0.0164 1 0 0.6040 0.3765 0.0196
chr3 127660520 AGAAGAG A 0.500000 0.100 1 -6 2 726 203 523 174 2 20 0 7 0 0 522 0 1 0.8571 0.0000 0.0019 9.150 0.29 5.43 -5.14 86 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.5677 0.4323 0.0000 0 0 0.9679 0.0321 0.0000
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 221 118 103 113 0 0 0 5 0 0 103 0 0 0.9576 0.0000 0.0000 118.000 0.68 2.60 -1.92 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0049 0.9951 0.0000 0 0 0.5811 0.4189 0.0000 0 0 0.9069 0.0931 0.0000
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 421 148 273 90 1 1 0 56 0 0 269 0 4 0.6081 0.0000 0.0147 147.000 1.19 2.20 -1.01 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8353 0.1629 0.0018 1 0 0.8262 0.1715 0.0023 1 0 0.8131 0.1839 0.0030
chr3 131165503 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 185 88 97 46 0 2 0 40 0 0 97 0 0 0.5227 0.0000 0.0000 43.000 0.13 1.62 -1.49 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3348 0.5633 0.1019 1 1 0.3349 0.5584 0.1067 1 1 0.3345 0.5522 0.1133
chr3 150762661 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 4 346 70 276 39 0 11 0 20 0 0 270 0 6 0.5571 0.0000 0.0217 5.364 1.03 3.00 -1.97 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5452 0.4134 0.0414 1 0 0.5370 0.4179 0.0451 1 0 0.5258 0.4238 0.0503
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 342 119 223 8 0 3 0 108 0 0 223 0 0 0.0672 0.0000 0.0000 38.667 0.12 1.11 -0.99 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9562 0.0438 2 2 0.0000 0.4700 0.5300
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 663 166 497 19 2 34 1 110 0 0 491 0 6 0.1145 0.0000 0.0121 3.882 0.37 3.27 -2.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr3 195726176 GTTAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 1692 309 1383 268 1 5 0 35 0 0 1381 0 2 0.8673 0.0000 0.0014 60.800 1.74 6.89 -5.15 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195751094 GGCCGGTGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 312 108 204 62 1 6 0 39 1 0 199 0 4 0.5741 0.0049 0.0245 16.833 0.85 9.49 -8.63 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6918 0.2970 0.0112 1 0 0.6821 0.3049 0.0130 1 0 0.6686 0.3158 0.0157
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 859 164 695 0 0 13 0 151 0 0 655 0 40 0.0000 0.0000 0.0576 11.615 9.71 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr3 198153257 CTGGCAGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -12 2 367 158 209 36 42 3 2 75 0 0 207 1 1 0.2278 0.0000 0.0096 51.333 0.44 10.20 -9.76 20 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1174 0.6689 0.2137 1 1 0.1234 0.6570 0.2196 1 1 0.1315 0.6417 0.2268
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 367 147 220 2 0 29 0 116 0 0 216 1 3 0.0136 0.0000 0.0182 4.069 3.00 8.66 -5.66 2 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1565 0.8435 2 2 0.0000 0.0203 0.9797 2 2 0.0000 0.0104 0.9896
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 367 151 216 5 1 27 39 79 0 0 213 0 3 0.0331 0.0000 0.0139 4.556 1.20 9.82 -8.62 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9944 0.0056 2 2 0.0000 0.3761 0.6239 2 2 0.0000 0.0774 0.9226
chr4 161163 AAAGAT A 0.001991 0.100 1 -5 1 718 206 512 114 0 14 0 78 0 0 510 0 2 0.5534 0.0000 0.0039 13.714 0.18 5.85 -5.67 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9181 0.0819 0.0000 1 0 0.9136 0.0864 0.0000 1 0 0.9070 0.0930 0.0000
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 557 109 448 0 0 2 0 107 0 0 383 4 61 0.0000 0.0000 0.1451 53.500 15.51 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 1394781 CGATGT C 0.001624 0.100 1 -5 2 1516 412 1104 348 11 43 3 7 9 6 1081 6 2 0.8447 0.0082 0.0208 9.100 3.82 7.86 -4.03 102 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0120 0.9880 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 2042400 C CTG 0.002259 0.100 1 2 1 381 129 252 3 110 8 1 7 0 0 252 0 0 0.0233 0.0000 0.0000 2.400 9.33 3.29 6.05 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 0 0.9452 0.0548 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr4 2042401 C CT 0.001586 0.100 1 1 2 380 129 251 3 2 115 0 9 0 0 251 0 0 0.0233 0.0000 0.0000 7.000 9.33 2.78 6.56 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9987 0.0013
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 473 185 288 12 0 49 7 117 0 0 278 0 10 0.0649 0.0000 0.0347 2.633 3.50 7.93 -4.43 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9096 0.0904
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 597 157 440 14 0 10 0 133 0 0 437 0 3 0.0892 0.0000 0.0068 14.700 0.79 12.74 -11.96 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9932 0.0068
chr4 8227957 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 812 179 633 97 0 9 0 73 0 0 632 0 1 0.5419 0.0000 0.0016 18.889 0.38 1.38 -1.00 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6739 0.3190 0.0071 1 0 0.6677 0.3240 0.0083 1 0 0.6584 0.3312 0.0104
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 760 248 512 221 3 16 1 7 1 0 510 0 1 0.8911 0.0020 0.0039 14.500 0.87 7.71 -6.84 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.8517 0.1483 0.0000 0 0 0.9944 0.0056 0.0000
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 743 254 489 197 6 42 2 7 0 3 485 0 1 0.7756 0.0000 0.0082 5.000 1.21 7.29 -6.07 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.6426 0.3574 0.0000 0 0 0.9828 0.0172 0.0000
chr4 40432687 AGCGGCTGCGGCGGCTGCGGCC A 0.500000 0.100 1 -21 1 253 95 158 64 0 5 0 26 0 0 149 0 9 0.6737 0.0000 0.0570 18.000 0.36 19.50 -19.14 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8427 0.1546 0.0027 1 0 0.8322 0.1645 0.0033 1 0 0.8172 0.1785 0.0044
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 694 163 531 87 0 20 0 56 0 0 503 0 28 0.5337 0.0000 0.0527 7.150 0.22 15.25 -15.03 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2005 0.6889 0.1106 1 1 0.2072 0.6759 0.1170 1 1 0.2155 0.6591 0.1254
chr4 56931051 GGAGCTGTCTCCTCCCATGGAGGTGGTCCAGAAGGAGCCTGTTCAGATA G 0.500000 0.100 1 -48 1 1000 284 716 118 5 99 3 59 0 0 714 2 0 0.4155 0.0000 0.0028 1.897 0.32 2.81 -2.49 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9843 0.0157 0.0000 1 0 0.9817 0.0182 0.0000 1 0 0.9777 0.0223 0.0000
chr4 77048380 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 449 137 312 76 0 3 1 57 0 0 312 0 0 0.5547 0.0000 0.0000 44.667 0.33 1.14 -0.81 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5966 0.3865 0.0168 1 0 0.5907 0.3902 0.0191 1 0 0.5820 0.3954 0.0226
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 1 584 240 344 102 20 35 1 82 0 0 336 0 8 0.4250 0.0000 0.0233 5.829 0.68 3.12 -2.45 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7961 0.2023 0.0016 1 0 0.7891 0.2089 0.0020 1 0 0.7786 0.2187 0.0027
chr4 78870928 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 584 257 327 180 15 36 9 17 0 0 327 0 0 0.7004 0.0000 0.0000 6.086 1.56 3.47 -1.91 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0314 0.9686 0.0000
chr4 87313944 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 164 73 91 38 0 5 0 30 0 0 91 0 0 0.5205 0.0000 0.0000 13.600 0.13 1.23 -1.10 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4052 0.5119 0.0830 1 1 0.4019 0.5105 0.0875 1 1 0.3973 0.5090 0.0938
chr4 87614933 TAGCAGTGACAGCAGCAAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2976 780 2196 435 10 91 10 234 80 67 2005 10 34 0.5577 0.0364 0.0870 7.640 1.69 13.59 -11.90 89 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3867 889 2978 9 15 42 22 801 25 29 2594 242 88 0.0101 0.0084 0.1289 20.875 6.00 8.81 -2.81 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 87615491 CAGCAGTGAT C 0.500000 0.100 1 -9 1 4000 958 3042 522 18 73 13 332 9 27 2934 35 37 0.5449 0.0030 0.0355 12.543 2.21 9.25 -7.04 84 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr4 87615611 CGATAGCAGTGACAGCAGT C 0.500000 0.100 1 -18 1 3853 1194 2659 588 32 176 36 362 50 67 2520 13 9 0.4925 0.0188 0.0523 5.893 2.35 12.30 -9.95 90 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr4 87616280 TAGCAGTGACAGCAGTGAC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2788 840 1948 294 75 121 42 308 9 26 1874 17 22 0.3500 0.0046 0.0380 6.728 7.76 10.36 -2.60 112 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0400 0.9570 0.0030 1 1 0.0501 0.9458 0.0041 1 1 0.0659 0.9279 0.0062
chr4 87616295 TGACAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 2789 794 1995 171 58 123 84 358 10 29 1923 22 11 0.2154 0.0050 0.0361 5.575 5.76 10.76 -5.00 33 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 695 149 546 141 0 4 0 4 0 0 546 0 0 0.9463 0.0000 0.0000 36.250 0.15 3.75 -3.60 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1541 0.8459 0.0000 0 0 0.9418 0.0582 0.0000 0 0 0.9863 0.0137 0.0000
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 603 257 346 0 0 41 10 206 0 0 342 0 4 0.0000 0.0000 0.0116 5.268 3.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 146639305 TGGCGGCGGC T 0.500000 0.100 1 -9 2 569 217 352 97 3 30 0 87 1 0 344 0 7 0.4470 0.0028 0.0227 6.233 1.31 9.60 -8.29 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2590 0.6758 0.0651 1 1 0.2661 0.6633 0.0706 1 1 0.2746 0.6473 0.0782
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 240 100 140 62 0 12 0 26 0 0 140 0 0 0.6200 0.0000 0.0000 7.333 0.53 4.62 -4.08 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9194 0.0798 0.0007 1 0 0.9111 0.0879 0.0010 1 0 0.8988 0.0999 0.0014
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 877 182 695 96 0 4 0 82 0 0 693 0 2 0.5275 0.0000 0.0029 44.500 0.30 3.29 -2.99 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3901 0.5738 0.0361 1 1 0.3934 0.5667 0.0399 1 1 0.3965 0.5580 0.0454
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.100 1 -12 4 280 99 181 94 0 4 0 1 0 0 179 0 2 0.9495 0.0000 0.0110 23.750 0.76 14.00 -13.24 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5221 0.4779 0.0000 0 0 0.9697 0.0303 0.0000 0 0 0.9901 0.0099 0.0000
chr5 1295342 CCG C 0.500000 0.100 1 -2 3 548 128 420 109 0 10 0 9 1 0 418 0 1 0.8516 0.0024 0.0048 11.800 1.25 2.00 -0.75 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0058 0.9942 0.0000 0 1 0.2538 0.7462 0.0000
chr5 14664886 CCGGCGCGGGAGGCGGCGGCCA C 0.500000 0.100 1 -21 1 271 128 143 119 0 7 0 2 1 0 142 0 0 0.9297 0.0070 0.0070 17.286 0.49 10.50 -10.01 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8418 0.1582 0.0000 0 0 0.9794 0.0206 0.0000 0 0 0.9894 0.0106 0.0000
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 814 170 644 1 0 31 6 132 0 0 641 0 3 0.0059 0.0000 0.0047 4.484 0.00 3.36 -3.36 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0069 0.9931 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 406 62 344 0 0 43 1 18 0 0 339 2 3 0.0000 0.0000 0.0145 0.419 6.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2316 0.7684 2 2 0.0000 0.2360 0.7640 2 2 0.0000 0.2420 0.7580
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 423 103 320 47 0 3 0 53 0 0 318 0 2 0.4563 0.0000 0.0063 33.333 0.23 6.30 -6.07 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0759 0.5533 0.3708 1 1 0.0806 0.5489 0.3704 1 1 0.0872 0.5434 0.3694
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 579 150 429 0 0 3 0 147 0 0 422 0 7 0.0000 0.0000 0.0163 49.000 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr5 75635851 CCCAG C 0.500000 0.100 1 -4 1 247 108 139 103 0 1 0 4 0 0 139 0 0 0.9537 0.0000 0.0000 107.000 0.20 6.00 -5.80 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0256 0.9744 0.0000 0 0 0.7080 0.2920 0.0000 0 0 0.9192 0.0808 0.0000
chr5 75635856 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 247 102 145 98 0 0 0 4 0 0 145 0 0 0.9608 0.0000 0.0000 102.000 0.20 6.00 -5.80 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0207 0.9793 0.0000 0 0 0.6552 0.3448 0.0000 0 0 0.8994 0.1006 0.0000
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 336 105 231 86 2 8 1 8 4 1 225 1 0 0.8190 0.0173 0.0260 13.571 3.44 16.12 -12.68 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0057 0.9943 0.0000 0 1 0.1786 0.8214 0.0000
chr5 80654908 G GCAGCGCCCCCAGCGCCCC 0.500000 0.100 1 18 2 323 87 236 45 2 21 0 19 1 1 229 1 4 0.5172 0.0042 0.0297 3.143 5.02 9.11 -4.08 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8069 0.1877 0.0053 1 0 0.7952 0.1984 0.0064 1 0 0.7786 0.2133 0.0081
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 319 91 228 80 0 6 0 5 1 1 223 2 1 0.8791 0.0044 0.0219 14.167 4.04 24.60 -20.56 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0462 0.9538 0.0000 0 1 0.3932 0.6068 0.0000
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 269 96 173 91 0 1 0 4 0 0 173 0 0 0.9479 0.0000 0.0000 95.000 0.15 3.25 -3.10 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0140 0.9860 0.0000 0 0 0.5711 0.4289 0.0000 0 0 0.8640 0.1360 0.0000
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 580 150 430 83 2 17 0 48 1 0 426 0 3 0.5533 0.0023 0.0093 7.824 0.76 3.58 -2.82 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8900 0.1091 0.0009 1 0 0.8814 0.1175 0.0011 1 0 0.8689 0.1296 0.0016
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 661 142 519 69 1 2 0 70 0 0 518 0 1 0.4859 0.0000 0.0019 70.000 0.12 1.44 -1.33 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1497 0.6648 0.1855 1 1 0.1556 0.6531 0.1912 1 1 0.1633 0.6382 0.1985
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 428 122 306 54 0 24 0 44 0 0 302 0 4 0.4426 0.0000 0.0131 4.083 1.72 7.82 -6.10 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3201 0.5825 0.0974 1 1 0.3214 0.5762 0.1024 1 1 0.3225 0.5683 0.1092
chr5 132873967 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 419 125 294 117 0 1 0 7 0 0 294 0 0 0.9360 0.0000 0.0000 124.000 0.24 1.57 -1.33 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1682 0.8318 0.0000 0 0 0.7665 0.2335 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 201 60 141 27 0 1 0 32 0 0 141 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 59.000 0.48 4.00 -3.52 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1238 0.5427 0.3335 1 1 0.1282 0.5394 0.3324 1 1 0.1341 0.5353 0.3306
chr5 138467788 GCTACCTCTTACCCGTCCCCGGTTA G 0.500000 0.100 1 -24 2 806 183 623 86 0 18 1 78 0 0 623 0 0 0.4699 0.0000 0.0000 9.167 0.53 13.37 -12.84 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2862 0.6423 0.0714 1 1 0.2914 0.6318 0.0767 1 1 0.2974 0.6185 0.0840
chr5 140966860 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 619 178 441 88 0 7 0 83 0 0 441 0 0 0.4944 0.0000 0.0000 24.429 1.08 6.53 -5.45 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2387 0.6727 0.0886 1 1 0.2450 0.6605 0.0945 1 1 0.2526 0.6449 0.1025
chr5 141415641 T TA 0.500000 0.100 1 1 2 918 156 762 63 11 21 10 51 1 2 754 2 3 0.4038 0.0013 0.0105 6.000 1.98 3.08 -1.09 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4166 0.5380 0.0454 1 1 0.4167 0.5339 0.0495 1 1 0.4158 0.5289 0.0553
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 465 135 330 112 0 14 0 9 0 0 329 0 1 0.8296 0.0000 0.0030 8.643 0.38 8.33 -7.95 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.2722 0.7278 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 12 1 465 135 330 112 0 14 0 9 0 0 329 0 1 0.8296 0.0000 0.0030 8.643 0.38 8.33 -7.95 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.2722 0.7278 0.0000
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 12 1 396 142 254 47 1 23 0 71 1 1 243 0 9 0.3310 0.0039 0.0433 5.174 4.28 6.93 -2.65 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0022 0.1608 0.8370 1 2 0.0027 0.1700 0.8273 1 2 0.0036 0.1830 0.8134
chr5 146878727 AGCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 396 151 245 75 7 19 2 48 0 1 242 0 2 0.4967 0.0000 0.0122 6.947 6.01 4.00 2.01 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8446 0.1536 0.0019 1 0 0.8351 0.1626 0.0023 1 0 0.8214 0.1755 0.0031
chr5 148242694 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 547 147 400 136 0 0 0 11 0 0 398 0 2 0.9252 0.0000 0.0050 147.000 0.47 3.91 -3.44 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.1488 0.8512 0.0000
chr5 148242696 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 3 550 151 399 139 0 1 0 11 0 0 397 0 2 0.9205 0.0000 0.0050 150.000 0.45 3.91 -3.46 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.1682 0.8318 0.0000
chr5 149996157 TC T 0.500000 0.100 1 -1 4 631 158 473 84 1 5 0 68 0 0 472 0 1 0.5316 0.0000 0.0021 30.600 0.31 1.16 -0.85 18 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5225 0.4556 0.0219 1 0 0.5200 0.4553 0.0247 1 0 0.5157 0.4555 0.0288
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 428 163 265 86 0 6 0 71 0 0 264 0 1 0.5276 0.0000 0.0038 26.167 3.06 4.79 -1.73 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4660 0.5050 0.0290 1 1 0.4656 0.5021 0.0323 1 1 0.4641 0.4988 0.0371
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 426 157 269 48 5 9 3 92 0 0 268 0 1 0.3057 0.0000 0.0037 16.444 3.83 13.50 -9.67 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0557 0.9441 1 2 0.0003 0.0618 0.9380 1 2 0.0004 0.0708 0.9287
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 426 143 283 0 71 3 1 68 0 0 278 0 5 0.0000 0.0000 0.0177 46.667 4.40 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1223 0.6611 0.2165 1 1 0.1283 0.6497 0.2220 1 1 0.1361 0.6351 0.2288
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 198 70 128 2 0 7 0 61 0 0 128 0 0 0.0286 0.0000 0.0000 9.000 0.00 3.18 -3.18 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7917 0.2083 2 2 0.0000 0.2855 0.7145 2 2 0.0000 0.1576 0.8424
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 500 236 264 109 5 42 2 78 1 0 263 0 0 0.4619 0.0038 0.0038 4.595 0.84 3.56 -2.72 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8649 0.1343 0.0008 1 0 0.8572 0.1418 0.0010 1 0 0.8458 0.1528 0.0014
chr5 179644808 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 200 61 139 26 1 1 0 33 0 0 138 0 1 0.4262 0.0000 0.0072 59.000 1.08 3.91 -2.83 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0937 0.5154 0.3908 1 1 0.0983 0.5140 0.3878 1 1 0.1045 0.5122 0.3833
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 681 129 552 0 0 13 2 114 0 0 552 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.923 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0030 0.9970 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 539 136 403 60 0 20 0 56 0 0 402 1 0 0.4412 0.0000 0.0025 5.800 0.72 3.30 -2.59 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2342 0.6310 0.1348 1 1 0.2382 0.6215 0.1403 1 1 0.2430 0.6095 0.1475
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 603 129 474 9 1 15 5 99 0 4 464 2 4 0.0698 0.0000 0.0211 8.000 0.78 3.84 -3.06 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9884 0.0116
chr6 7727289 G GAGC 0.018903 0.100 1 3 2 664 140 524 98 8 19 2 13 0 0 524 0 0 0.7000 0.0000 0.0000 6.368 0.59 5.23 -4.64 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.3857 0.6143 0.0000
chr6 7727289 G GAGCAGC 0.000024 0.100 1 6 2 664 140 524 103 3 26 2 6 0 0 524 0 0 0.7357 0.0000 0.0000 4.385 0.71 7.67 -6.96 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2489 0.7511 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr6 13615435 C CGGA 0.000044 0.100 1 3 1 508 150 358 112 4 25 0 9 0 0 358 0 0 0.7467 0.0000 0.0000 4.920 0.46 3.00 -2.54 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0168 0.9832 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1078 228 850 72 18 48 6 84 1 1 839 0 9 0.3158 0.0012 0.0129 3.809 6.83 6.13 0.70 30 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1162 0.7604 0.1235 1 1 0.1260 0.7474 0.1266 1 1 0.1396 0.7302 0.1303
chr6 17291894 A AGCT 0.000307 0.100 1 3 1 385 143 242 69 1 13 0 60 0 0 242 0 0 0.4825 0.0000 0.0000 10.000 0.12 3.20 -3.08 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5874 0.4126 0.0000 1 0 0.5898 0.4102 0.0000 1 0 0.5922 0.4077 0.0000
chr6 26234545 C CTAG 0.001749 0.100 1 3 2 591 132 459 73 1 4 0 54 0 0 459 0 0 0.5530 0.0000 0.0000 32.000 0.52 3.69 -3.16 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7945 0.2054 0.0000 1 0 0.7897 0.2102 0.0000 1 0 0.7828 0.2171 0.0000
chr6 28073889 A ACC 0.080153 0.100 1 2 1 662 133 529 115 0 3 0 15 0 0 529 0 0 0.8647 0.0000 0.0000 43.333 0.20 1.87 -1.67 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1672 0.8328 0.0000
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 679 131 548 70 0 5 0 56 0 0 529 0 19 0.5344 0.0000 0.0347 25.200 0.24 11.23 -10.99 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1490 0.6935 0.1575 1 1 0.1576 0.6820 0.1604 1 1 0.1692 0.6671 0.1637
chr6 29657255 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 2 166 76 90 35 0 9 1 31 0 0 90 0 0 0.4605 0.0000 0.0000 7.444 1.11 4.39 -3.27 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2767 0.5708 0.1526 1 1 0.2778 0.5654 0.1568 1 1 0.2790 0.5588 0.1623
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 418 127 291 10 0 2 0 115 0 0 290 1 0 0.0787 0.0000 0.0034 62.500 0.20 1.48 -1.28 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9922 0.0078 2 1 0.0000 0.6870 0.3130
chr6 31027315 CTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAGCT C 0.500000 0.100 1 -30 2 1339 372 967 212 10 27 4 119 31 10 920 3 3 0.5699 0.0321 0.0486 12.630 1.38 12.09 -10.72 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr6 31111540 CCCCCAGCTGCCTCCTGGATACCGATTAATATTT C 0.500000 0.100 1 -33 2 565 166 399 111 2 51 0 2 0 0 399 0 0 0.6687 0.0000 0.0000 2.255 0.41 1.00 -0.59 15 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7890 0.2110 0.0000 0 0 0.9711 0.0289 0.0000 0 0 0.9852 0.0148 0.0000
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 517 128 389 78 0 4 0 46 0 0 388 0 1 0.6094 0.0000 0.0026 31.000 0.76 2.50 -1.74 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8524 0.1458 0.0018 1 0 0.8427 0.1550 0.0023 1 0 0.8288 0.1681 0.0031
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 643 203 440 7 82 2 4 108 0 0 439 1 0 0.0345 0.0000 0.0023 100.000 0.00 3.22 -3.22 1 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0028 0.2358 0.7614 1 2 0.0034 0.2425 0.7541 1 2 0.0045 0.2522 0.7433
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 643 203 440 160 6 3 7 27 0 0 439 1 0 0.7882 0.0000 0.0023 99.500 3.57 5.33 -1.76 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 31954568 CTCTCGG C 0.500000 0.100 1 -6 3 926 188 738 169 1 7 0 11 0 0 736 1 1 0.8989 0.0000 0.0027 25.857 1.02 7.09 -6.07 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0098 0.9902 0.0000 0 0 0.5689 0.4311 0.0000
chr6 32223881 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 465 223 242 1 181 33 1 7 0 2 240 0 0 0.0045 0.0000 0.0083 6.097 0.00 4.71 -4.71 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.8387 0.1613 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 251 87 164 58 0 0 0 29 0 0 163 0 1 0.6667 0.0000 0.0061 87.000 0.33 4.24 -3.91 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8362 0.1605 0.0033 1 0 0.8253 0.1707 0.0040 1 0 0.8097 0.1851 0.0052
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 676 279 397 146 12 52 1 68 0 0 395 0 2 0.5233 0.0000 0.0050 4.571 6.38 7.32 -0.94 68 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9992 0.0008 0.0000 1 0 0.9989 0.0011 0.0000 1 0 0.9985 0.0015 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 674 261 413 181 2 11 1 66 0 0 410 0 3 0.6935 0.0000 0.0073 31.250 7.47 7.42 0.05 81 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr6 33086236 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 319 69 250 39 0 0 0 30 0 0 250 0 0 0.5652 0.0000 0.0000 69.000 6.05 7.80 -1.75 27 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4315 0.4961 0.0725 1 1 0.4274 0.4957 0.0769 1 1 0.4215 0.4954 0.0831
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 526 174 352 87 0 18 1 68 0 0 343 0 9 0.5000 0.0000 0.0256 9.750 0.36 5.38 -5.03 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3495 0.5997 0.0509 1 1 0.3531 0.5915 0.0554 1 1 0.3569 0.5813 0.0617
chr6 36721185 C CAGGCTGCCTCCCCTGAGG 0.500000 0.100 1 18 1 404 97 307 49 0 19 0 29 0 0 295 0 12 0.5052 0.0000 0.0391 4.105 1.29 14.55 -13.27 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3829 0.5388 0.0784 1 1 0.3815 0.5354 0.0831 1 1 0.3792 0.5313 0.0895
chr6 36722044 C CGGGCCCAGCGGTGCAGGA 0.500000 0.100 1 18 2 718 153 565 86 1 23 0 43 0 0 547 0 18 0.5621 0.0000 0.0319 5.652 0.87 11.93 -11.06 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7576 0.2380 0.0044 1 0 0.7487 0.2460 0.0053 1 0 0.7360 0.2573 0.0067
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 567 153 414 140 0 2 0 11 0 0 414 0 0 0.9150 0.0000 0.0000 75.500 0.29 4.73 -4.43 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0088 0.9912 0.0000 0 1 0.4338 0.5662 0.0000
chr6 42236367 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 3 371 144 227 102 5 30 0 7 0 0 227 0 0 0.7083 0.0000 0.0000 3.800 0.18 3.00 -2.82 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1083 0.8917 0.0000 0 0 0.6681 0.3319 0.0000
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 329 119 210 8 0 13 0 98 0 0 203 0 7 0.0672 0.0000 0.0333 8.154 0.25 5.96 -5.71 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9635 0.0365 2 1 0.0000 0.5099 0.4901
chr6 43198673 TGGG T 0.500000 0.100 1 -3 2 263 86 177 84 0 1 0 1 0 0 177 0 0 0.9767 0.0000 0.0000 85.000 0.24 4.00 -3.76 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8869 0.1131 0.0000 0 0 0.9581 0.0419 0.0000 0 0 0.9688 0.0312 0.0000
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 850 199 651 165 2 27 1 4 0 0 651 0 0 0.8291 0.0000 0.0000 6.333 0.56 5.25 -4.69 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1544 0.8456 0.0000 0 0 0.9627 0.0373 0.0000 0 0 0.9932 0.0068 0.0000
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 545 135 410 61 1 63 0 10 1 1 407 0 1 0.4519 0.0024 0.0073 1.161 6.08 10.50 -4.42 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0193 0.9807 0.0000
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.100 1 -15 2 546 153 393 77 1 44 0 31 1 0 387 0 5 0.5033 0.0025 0.0153 2.535 1.88 11.65 -9.76 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9541 0.0457 0.0002 1 0 0.9484 0.0514 0.0002 1 0 0.9396 0.0600 0.0004
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 749 171 578 26 1 48 2 94 0 0 554 4 20 0.1520 0.0000 0.0415 2.617 1.69 4.86 -3.17 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 107634729 A AGCCCCCCGG 0.500000 0.100 1 9 1 499 77 422 40 0 16 1 20 0 0 418 0 4 0.5195 0.0000 0.0095 3.750 1.00 8.70 -7.70 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6028 0.3675 0.0297 1 0 0.5930 0.3742 0.0328 1 0 0.5795 0.3831 0.0374
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 692 179 513 146 0 8 0 25 0 0 509 0 4 0.8156 0.0000 0.0078 21.375 1.37 6.08 -4.71 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 660 156 504 69 0 3 0 84 0 0 499 0 5 0.4423 0.0000 0.0099 51.000 0.07 3.26 -3.19 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0117 0.3698 0.6185 1 2 0.0136 0.3733 0.6132 1 2 0.0164 0.3785 0.6051
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 837 163 674 0 0 7 0 156 0 0 662 0 12 0.0000 0.0000 0.0178 22.286 3.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 732 173 559 160 0 1 0 12 0 0 559 0 0 0.9249 0.0000 0.0000 172.000 0.24 6.75 -6.51 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0083 0.9917 0.0000 0 0 0.5156 0.4844 0.0000
chr6 117563254 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 3 208 77 131 72 0 2 0 3 0 0 131 0 0 0.9351 0.0000 0.0000 37.500 0.24 2.00 -1.76 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0476 0.9524 0.0000 0 0 0.5992 0.4008 0.0000 0 0 0.8276 0.1724 0.0000
chr6 118491647 ATGT A 0.500000 0.100 1 -3 3 344 104 240 62 0 3 0 39 0 0 239 0 1 0.5962 0.0000 0.0042 33.667 0.44 2.95 -2.51 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7218 0.2690 0.0092 1 0 0.7115 0.2777 0.0107 1 0 0.6970 0.2899 0.0131
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 411 128 283 68 0 3 0 57 0 0 283 0 0 0.5312 0.0000 0.0000 41.667 0.10 1.32 -1.21 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4248 0.5272 0.0480 1 1 0.4240 0.5239 0.0521 1 1 0.4220 0.5200 0.0580
chr6 150819774 GGTAA G 0.500000 0.100 1 -4 1 91 43 48 24 0 6 1 12 0 0 48 0 0 0.5581 0.0000 0.0000 6.167 0.12 4.00 -3.88 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5212 0.4199 0.0588 1 0 0.5123 0.4247 0.0629 1 0 0.5003 0.4310 0.0687
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 970 234 736 0 0 14 1 219 0 0 730 0 6 0.0000 0.0000 0.0082 15.714 3.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 184 81 103 46 0 3 0 32 0 0 102 0 1 0.5679 0.0000 0.0097 26.000 0.30 4.34 -4.04 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5296 0.4302 0.0402 1 0 0.5227 0.4334 0.0439 1 0 0.5131 0.4378 0.0491
chr6 156778052 CGCGGCGGCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 791 192 599 179 2 6 0 5 1 0 596 0 2 0.9323 0.0017 0.0050 31.000 1.05 9.40 -8.35 83 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 0 0.8370 0.1630 0.0000 0 0 0.9871 0.0129 0.0000
chr6 156778268 C CCAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 870 267 603 190 0 69 2 6 2 0 600 0 1 0.7116 0.0033 0.0050 2.855 0.99 5.00 -4.01 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.8256 0.1744 0.0000 0 0 0.9874 0.0126 0.0000
chr6 156779414 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 3 235 98 137 75 0 21 0 2 0 0 137 0 0 0.7653 0.0000 0.0000 3.667 1.04 3.00 -1.96 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3493 0.6507 0.0000 0 0 0.8343 0.1657 0.0000 0 0 0.9134 0.0866 0.0000
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 709 297 412 161 0 52 0 84 0 0 401 0 11 0.5421 0.0000 0.0267 4.712 0.25 15.00 -14.75 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9900 0.0100 0.0000 1 0 0.9883 0.0117 0.0000 1 0 0.9855 0.0145 0.0000
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 486 198 288 118 0 6 0 74 0 0 287 0 1 0.5960 0.0000 0.0035 32.000 0.32 4.73 -4.41 56 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9321 0.0677 0.0002 1 0 0.9259 0.0738 0.0003 1 0 0.9167 0.0829 0.0004
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 263 102 161 57 0 5 0 40 0 0 161 0 0 0.5588 0.0000 0.0000 19.400 0.18 7.78 -7.60 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6131 0.3659 0.0211 1 0 0.6047 0.3716 0.0237 1 0 0.5930 0.3794 0.0276
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 368 150 218 0 0 20 14 116 0 0 212 2 4 0.0000 0.0000 0.0275 6.500 3.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr6 168308554 G GCCCCTGCCGGCA 0.500000 0.100 1 12 3 774 178 596 143 0 31 0 4 0 0 596 0 0 0.8034 0.0000 0.0000 4.742 0.22 11.00 -10.78 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1677 0.8323 0.0000 0 0 0.9470 0.0530 0.0000 0 0 0.9875 0.0125 0.0000
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 706 233 473 2 2 9 85 135 0 0 473 0 0 0.0086 0.0000 0.0000 18.750 8.00 8.90 -0.90 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0320 0.9680 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 706 229 477 68 45 26 24 66 0 0 477 0 0 0.2969 0.0000 0.0000 9.875 3.10 13.44 -10.34 30 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.4510 0.5230 0.0259 1 1 0.4524 0.5185 0.0291 1 1 0.4531 0.5133 0.0336
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 296 119 177 10 0 34 0 75 0 0 171 0 6 0.0840 0.0000 0.0339 2.500 0.70 3.76 -3.06 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9233 0.0767
chr7 4791165 CCAGCTCCACGCA C 0.500000 0.100 1 -12 1 623 167 456 155 0 5 0 7 0 0 456 0 0 0.9281 0.0000 0.0000 32.400 0.34 12.00 -11.66 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.5716 0.4284 0.0000 0 0 0.9539 0.0461 0.0000
chr7 5313004 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 764 102 662 11 27 22 9 33 0 1 660 0 1 0.1078 0.0000 0.0030 3.636 2.82 3.85 -1.03 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1115 0.5626 0.3259 1 1 0.1163 0.5578 0.3260 1 1 0.1227 0.5518 0.3256
chr7 5390542 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 303 158 145 150 0 3 0 5 0 0 145 0 0 0.9494 0.0000 0.0000 51.667 0.15 3.40 -3.25 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0303 0.9697 0.0000 0 0 0.8974 0.1026 0.0000 0 0 0.9832 0.0168 0.0000
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 675 203 472 6 0 39 10 148 0 0 471 0 1 0.0296 0.0000 0.0021 4.205 0.17 3.21 -3.04 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9946 0.0054 2 2 0.0000 0.1744 0.8256 2 2 0.0000 0.0205 0.9795
chr7 19698487 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 5 368 131 237 62 1 11 0 57 0 0 236 0 1 0.4733 0.0000 0.0042 10.909 0.16 3.02 -2.86 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2780 0.6173 0.1047 1 1 0.2813 0.6086 0.1101 1 1 0.2851 0.5977 0.1172
chr7 26152597 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 369 118 251 98 1 13 0 6 0 0 251 0 0 0.8305 0.0000 0.0000 8.077 0.50 3.17 -2.67 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.1910 0.8090 0.0000 0 0 0.7217 0.2783 0.0000
chr7 26183722 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 205 88 117 57 0 2 0 29 0 0 117 0 0 0.6477 0.0000 0.0000 43.000 0.75 3.55 -2.80 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8376 0.1592 0.0033 1 0 0.8266 0.1694 0.0040 1 0 0.8109 0.1839 0.0052
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 154 71 83 46 4 1 3 17 0 0 83 0 0 0.6479 0.0000 0.0000 66.000 0.39 1.24 -0.84 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8680 0.1296 0.0025 1 0 0.8570 0.1399 0.0031 1 0 0.8355 0.1604 0.0041
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 567 146 421 78 0 5 0 63 0 0 421 0 0 0.5342 0.0000 0.0000 28.200 0.40 1.16 -0.76 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5118 0.4621 0.0262 1 0 0.5089 0.4619 0.0292 1 0 0.5042 0.4621 0.0337
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 221 62 159 31 0 4 0 27 0 0 159 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 14.500 0.06 3.33 -3.27 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3086 0.5518 0.1396 1 1 0.3083 0.5478 0.1438 1 1 0.3076 0.5429 0.1494
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 261 93 168 52 1 3 0 37 0 0 167 0 1 0.5591 0.0000 0.0060 30.000 0.23 3.32 -3.09 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5677 0.4029 0.0293 1 0 0.5604 0.4072 0.0324 1 0 0.5500 0.4130 0.0370
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 195 54 141 0 2 27 0 25 0 0 140 0 1 0.0000 0.0000 0.0071 1.038 4.72 0 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6984 0.3016 2 1 0.0000 0.5617 0.4383 2 2 0.0000 0.4652 0.5348
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.100 1 2 1 195 54 141 0 26 3 0 25 0 0 140 0 1 0.0000 0.0000 0.0071 9.000 4.72 0 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0680 0.4388 0.4932 1 2 0.0722 0.4434 0.4844 1 2 0.0776 0.4510 0.4714
chr7 73865132 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 554 156 398 86 0 4 3 63 0 0 398 0 0 0.5513 0.0000 0.0000 38.000 0.36 2.22 -1.86 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6308 0.3578 0.0115 1 0 0.6248 0.3620 0.0133 1 0 0.6158 0.3681 0.0160
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 397 144 253 134 0 0 0 10 0 0 253 0 0 0.9306 0.0000 0.0000 144.000 1.42 2.10 -0.68 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0190 0.9810 0.0000 0 0 0.5217 0.4783 0.0000
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 927 216 711 0 0 11 1 204 0 0 704 0 7 0.0000 0.0000 0.0098 18.636 3.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 83155155 AGCCAGGCTGTTGAGGTGGGGGCTTTGCTGG A 0.500000 0.100 1 -30 1 867 225 642 161 5 54 0 5 1 0 640 0 1 0.7156 0.0016 0.0031 3.148 1.78 9.00 -7.22 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0091 0.9909 0.0000 0 0 0.8776 0.1224 0.0000 0 0 0.9860 0.0140 0.0000
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 674 195 479 164 2 16 0 13 0 0 478 0 1 0.8410 0.0000 0.0021 11.125 0.61 4.31 -3.70 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.2818 0.7182 0.0000
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 255 100 155 51 0 1 0 48 0 0 151 0 4 0.5100 0.0000 0.0258 99.000 0.16 3.17 -3.01 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1701 0.6225 0.2074 1 1 0.1749 0.6136 0.2116 1 1 0.1810 0.6022 0.2168
chr7 99836454 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 183 71 112 34 0 0 0 37 0 0 112 0 0 0.4789 0.0000 0.0000 71.000 0.47 1.41 -0.93 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1509 0.5756 0.2735 1 1 0.1552 0.5699 0.2749 1 1 0.1608 0.5628 0.2764
chr7 100114245 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 586 136 450 126 1 4 0 5 0 0 450 0 0 0.9265 0.0000 0.0000 33.000 0.32 1.00 -0.68 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0106 0.9894 0.0000 0 0 0.7381 0.2619 0.0000 0 0 0.9507 0.0493 0.0000
chr7 100359505 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 506 146 360 66 1 12 0 67 0 0 358 0 2 0.4521 0.0000 0.0056 11.167 0.53 3.12 -2.59 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1377 0.6562 0.2061 1 1 0.1435 0.6451 0.2115 1 1 0.1510 0.6309 0.2181
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 207 81 126 62 0 0 0 19 0 0 123 0 3 0.7654 0.0000 0.0238 81.000 0.68 17.00 -16.32 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9455 0.0542 0.0003 1 0 0.9383 0.0612 0.0005 1 0 0.8882 0.1111 0.0007
chr7 102201853 G GGGCAGCGGT 0.500000 0.100 1 9 2 772 181 591 104 0 18 1 58 0 0 581 0 10 0.5746 0.0000 0.0169 9.000 0.22 8.09 -7.87 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8747 0.1245 0.0008 1 0 0.8665 0.1324 0.0011 1 0 0.8546 0.1439 0.0015
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 698 191 507 96 0 6 0 89 0 0 506 1 0 0.5026 0.0000 0.0020 30.833 0.45 3.47 -3.02 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2472 0.6778 0.0750 1 1 0.2541 0.6652 0.0807 1 1 0.2623 0.6492 0.0885
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 406 125 281 4 0 38 1 82 0 0 274 0 7 0.0320 0.0000 0.0249 2.417 1.75 5.93 -4.18 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9870 0.0130 2 2 0.0000 0.4502 0.5498 2 2 0.0000 0.1461 0.8539
chr7 103989356 T TGCCGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 12 1 406 125 281 11 1 86 3 24 0 0 277 0 4 0.0880 0.0000 0.0142 0.447 3.27 3.96 -0.69 5 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0086 0.2065 0.7849 1 2 0.0097 0.2489 0.7414 1 2 0.0084 0.4827 0.5090
chr7 120970792 AAAC A 0.500000 0.100 1 -3 1 166 61 105 38 0 1 0 22 0 0 104 0 1 0.6230 0.0000 0.0095 60.000 0.29 3.14 -2.85 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6021 0.3672 0.0308 1 0 0.5921 0.3739 0.0340 1 0 0.5785 0.3829 0.0386
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 826 193 633 164 0 15 0 14 0 0 633 0 0 0.8497 0.0000 0.0000 11.867 1.14 3.93 -2.79 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.2637 0.7363 0.0000
chr7 124032402 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 799 239 560 194 3 23 0 19 0 0 560 0 0 0.8117 0.0000 0.0000 9.391 0.63 3.63 -3.00 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0668 0.9332 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 721 231 490 129 0 35 0 67 0 0 490 0 0 0.5584 0.0000 0.0000 5.600 0.29 18.96 -18.67 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9889 0.0111 0.0000 1 0 0.9869 0.0130 0.0000 1 0 0.9838 0.0162 0.0000
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 426 210 216 102 1 18 0 89 3 0 210 0 3 0.4857 0.0139 0.0278 10.667 6.35 5.17 1.18 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4186 0.5550 0.0264 1 1 0.4220 0.5483 0.0296 1 1 0.4252 0.5404 0.0343
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 426 217 209 109 0 12 1 95 0 0 205 0 4 0.5023 0.0000 0.0191 17.000 4.36 6.77 -2.41 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2960 0.6569 0.0471 1 1 0.3031 0.6451 0.0518 1 1 0.3114 0.6301 0.0585
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 249 79 170 5 0 1 0 73 0 0 168 0 2 0.0633 0.0000 0.0118 78.000 0.00 3.21 -3.21 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8289 0.1711 2 2 0.0000 0.3941 0.6059
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.100 1 19 1 173 82 91 53 0 27 0 2 0 0 91 0 0 0.6463 0.0000 0.0000 2.037 1.13 9.50 -8.37 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1506 0.8494 0.0000 0 0 0.6297 0.3703 0.0000 0 0 0.7860 0.2140 0.0000
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 1007 276 731 119 98 48 0 11 0 1 728 0 2 0.4312 0.0000 0.0041 4.750 0.37 3.09 -2.72 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0498 0.9502 0.0000 0 0 0.9036 0.0964 0.0000
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 1010 278 732 130 2 44 1 101 0 0 730 0 2 0.4676 0.0000 0.0027 5.295 0.48 3.50 -3.02 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7086 0.2885 0.0029 1 0 0.7043 0.2922 0.0036 1 0 0.6973 0.2980 0.0047
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 726 174 552 1 0 6 0 167 0 0 551 1 0 0.0057 0.0000 0.0018 28.000 0.00 1.34 -1.34 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr7 144050729 ACT A 0.500000 0.100 1 -2 1 667 144 523 75 0 1 0 68 0 0 523 0 0 0.5208 0.0000 0.0000 143.000 0.97 3.21 -2.23 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3063 0.6172 0.0765 1 1 0.3100 0.6084 0.0816 1 1 0.3140 0.5972 0.0888
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 818 196 622 16 1 7 0 172 0 0 615 0 7 0.0816 0.0000 0.0113 27.000 0.00 4.19 -4.19 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8935 0.1065
chr7 144258792 GAGGCTGTGAAACAGC G 0.500000 0.100 1 -15 3 877 265 612 229 0 3 0 33 0 0 597 2 13 0.8642 0.0000 0.0245 87.333 0.22 14.73 -14.50 143 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr7 144318430 CTGTT C 0.500000 0.100 1 -4 1 643 368 275 349 1 11 0 7 0 0 275 0 0 0.9484 0.0000 0.0000 32.455 1.30 4.57 -3.27 135 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9073 0.0927 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr7 149779543 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 523 124 399 70 0 1 0 53 1 0 397 0 1 0.5645 0.0025 0.0050 123.000 0.50 1.58 -1.08 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5817 0.3983 0.0200 1 0 0.5758 0.4017 0.0226 1 0 0.5670 0.4066 0.0264
chr7 149791914 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 940 240 700 115 0 9 1 115 0 0 700 0 0 0.4792 0.0000 0.0000 25.667 0.24 1.31 -1.07 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1119 0.7554 0.1327 1 1 0.1197 0.7392 0.1411 1 1 0.1300 0.7180 0.1519
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 206 55 151 0 0 7 0 48 0 0 147 0 4 0.0000 0.0000 0.0265 6.857 4.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0659 0.9341 2 2 0.0000 0.0693 0.9307 2 2 0.0000 0.0742 0.9258
chr7 149814882 G GGCCCT 0.500000 0.100 1 5 1 587 118 469 99 3 11 0 5 0 1 468 0 0 0.8390 0.0000 0.0021 9.727 1.43 6.80 -5.37 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 1 0.4537 0.5463 0.0000 0 0 0.8560 0.1440 0.0000
chr7 149821443 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 738 208 530 20 0 4 0 184 0 0 527 0 3 0.0962 0.0000 0.0057 51.000 0.80 1.43 -0.63 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9769 0.0231
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 754 227 527 125 0 13 0 89 0 0 520 0 7 0.5507 0.0000 0.0133 16.462 0.59 11.19 -10.60 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7480 0.2496 0.0024 1 0 0.7421 0.2549 0.0030 1 0 0.7331 0.2630 0.0039
chr7 151066528 AGGAGGC A 0.500000 0.100 1 -6 2 438 140 298 84 0 8 2 46 0 0 296 0 2 0.6000 0.0000 0.0067 16.375 0.46 5.85 -5.38 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8852 0.1138 0.0010 1 0 0.8764 0.1223 0.0013 1 0 0.8636 0.1346 0.0018
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 403 100 303 0 0 2 16 82 0 1 286 5 11 0.0000 0.0000 0.0561 98.000 7.33 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0042 0.9958 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0050 0.9950
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 403 98 305 0 0 3 14 81 0 1 285 8 11 0.0000 0.0000 0.0656 90.000 7.57 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0036 0.9964 2 2 0.0000 0.0042 0.9958
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 403 96 307 0 0 8 6 82 0 1 248 25 33 0.0000 0.0000 0.1922 12.429 7.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 415 147 268 133 1 3 0 10 0 0 268 0 0 0.9048 0.0000 0.0000 48.000 0.23 1.10 -0.87 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0190 0.9810 0.0000 0 0 0.5220 0.4780 0.0000
chr7 154968830 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 1478 347 1131 206 5 37 1 98 1 0 1127 1 2 0.5937 0.0009 0.0035 8.351 0.48 3.52 -3.04 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 431 109 322 58 0 3 0 48 0 0 321 0 1 0.5321 0.0000 0.0031 35.333 0.22 3.17 -2.94 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3917 0.5425 0.0658 1 1 0.3909 0.5387 0.0703 1 1 0.3893 0.5340 0.0767
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 772 180 592 12 0 22 1 145 1 0 582 1 8 0.0667 0.0017 0.0169 7.182 0.50 5.86 -5.36 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.6577 0.3423
chr8 10610119 T TTTC 0.070211 0.100 1 3 1 1064 292 772 156 2 7 35 92 0 0 763 3 6 0.5342 0.0000 0.0117 51.400 1.87 5.74 -3.87 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7726 0.2271 0.0003 1 0 0.7727 0.2269 0.0003 1 0 0.7718 0.2278 0.0004
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 621 255 366 0 0 37 0 218 0 0 366 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.892 5.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 346 107 239 0 0 1 0 106 0 0 236 0 3 0.0000 0.0000 0.0126 106.000 7.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0153 0.9847 2 2 0.0000 0.0170 0.9830 2 2 0.0000 0.0198 0.9802
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 278 114 164 65 0 1 0 48 0 0 163 1 0 0.5702 0.0000 0.0061 113.000 0.48 2.98 -2.50 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6564 0.3318 0.0118 1 0 0.6510 0.3358 0.0133 1 0 0.6431 0.3415 0.0155
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 197 67 130 39 0 0 0 28 0 0 130 0 0 0.5821 0.0000 0.0000 67.000 0.85 2.50 -1.65 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4886 0.4562 0.0552 1 0 0.4824 0.4583 0.0593 1 0 0.4738 0.4611 0.0651
chr8 79766258 AGGCATGT A 0.500000 0.100 1 -7 1 375 119 256 108 1 6 0 4 0 0 256 0 0 0.9076 0.0000 0.0000 18.833 0.89 7.50 -6.61 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0344 0.9656 0.0000 0 0 0.7657 0.2343 0.0000 0 0 0.9383 0.0617 0.0000
chr8 93728272 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 100 46 54 26 0 2 0 18 0 0 53 0 1 0.5652 0.0000 0.0185 22.000 0.15 3.44 -3.29 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4007 0.4993 0.1000 1 1 0.3965 0.4991 0.1044 1 1 0.3907 0.4989 0.1104
chr8 102238611 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 319 88 231 47 2 2 0 37 0 0 231 0 0 0.5341 0.0000 0.0000 42.000 0.66 2.16 -1.50 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4847 0.4666 0.0487 1 0 0.4797 0.4677 0.0526 1 0 0.4724 0.4693 0.0583
chr8 120811814 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 3 494 151 343 116 5 24 0 6 0 0 343 0 0 0.7682 0.0000 0.0000 5.292 0.53 3.50 -2.97 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.4148 0.5852 0.0000 0 0 0.8829 0.1171 0.0000
chr8 123369918 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 1 353 108 245 2 0 12 55 39 0 0 244 1 0 0.0185 0.0000 0.0041 7.917 0.00 5.44 -5.44 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4161 0.5839 2 2 0.0000 0.0721 0.9279 2 2 0.0000 0.0367 0.9633
chr8 123369918 T TTCATCA 0.500000 0.100 1 6 1 353 108 245 37 3 24 0 44 0 0 244 0 1 0.3426 0.0000 0.0041 3.818 3.62 5.91 -2.29 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1188 0.5774 0.3039 1 1 0.1236 0.5715 0.3049 1 1 0.1300 0.5642 0.3058
chr8 123369924 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 353 114 239 11 27 10 15 51 0 0 239 0 0 0.0965 0.0000 0.0000 13.571 0.64 4.29 -3.66 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0051 0.2018 0.7932 1 2 0.0061 0.2118 0.7821 1 2 0.0077 0.2259 0.7664
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 212 97 115 5 0 0 0 92 0 0 113 0 2 0.0515 0.0000 0.0174 97.000 0.20 3.11 -2.91 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.6522 0.3478 2 2 0.0000 0.2055 0.7945
chr8 141449677 C CA 0.500000 0.100 1 1 2 334 138 196 80 0 3 0 55 0 0 196 0 0 0.5797 0.0000 0.0000 45.000 1.09 3.71 -2.62 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7505 0.2442 0.0053 1 0 0.7412 0.2525 0.0063 1 0 0.7279 0.2641 0.0080
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 507 144 363 43 0 25 5 71 0 0 359 1 3 0.2986 0.0000 0.0110 4.760 1.98 5.30 -3.32 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0006 0.0854 0.9140 1 2 0.0008 0.0932 0.9060 1 2 0.0011 0.1047 0.8942
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 454 106 348 58 1 3 0 44 0 0 347 0 1 0.5472 0.0000 0.0029 34.333 3.10 3.57 -0.46 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5277 0.4393 0.0330 1 0 0.5223 0.4413 0.0363 1 0 0.5144 0.4444 0.0412
chr9 116848 T TA 0.003653 0.100 1 1 1 815 236 579 215 1 13 0 7 0 0 578 0 1 0.9110 0.0000 0.0017 17.154 0.99 1.14 -0.15 127 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2882 0.7118 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr9 117363 T TC 0.002993 0.100 1 1 1 1058 193 865 157 24 5 0 7 0 0 865 0 0 0.8135 0.0000 0.0000 91.000 1.66 2.86 -1.19 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3986 0.6014 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr9 12775862 T TGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 2 361 104 257 0 0 20 1 83 0 2 247 0 8 0.0000 0.0000 0.0389 4.200 7.54 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1665 0.8335 2 2 0.0000 0.0552 0.9448 2 2 0.0000 0.0343 0.9657
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 361 104 257 0 1 19 1 83 1 0 247 1 8 0.0000 0.0039 0.0389 4.474 7.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3872 0.6128 2 2 0.0000 0.0734 0.9266 2 2 0.0000 0.0381 0.9619
chr9 15459864 TAAGAATAGCTACACTCACAAA T 0.500000 0.100 1 -21 2 198 80 118 73 0 2 0 5 0 0 118 0 0 0.9125 0.0000 0.0000 39.000 0.19 8.80 -8.61 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1577 0.8423 0.0000 0 0 0.5827 0.4173 0.0000
chr9 20414345 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 1 701 190 511 68 9 50 5 58 0 0 511 0 0 0.3579 0.0000 0.0000 2.780 0.79 2.79 -2.00 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4790 0.4889 0.0321 1 1 0.4772 0.4874 0.0355 1 1 0.4737 0.4859 0.0404
chr9 25678179 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 3 623 135 488 55 1 23 1 55 1 0 483 0 4 0.4074 0.0020 0.0102 4.826 0.33 7.80 -7.47 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1377 0.6316 0.2307 1 1 0.1430 0.6221 0.2349 1 1 0.1500 0.6099 0.2401
chr9 25678220 C CCGGCCGGAGCGGCCTGGCCCT 0.500000 0.100 1 21 3 579 121 458 46 0 40 1 34 0 1 442 0 15 0.3802 0.0000 0.0349 2.000 0.48 12.94 -12.46 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1402 0.6055 0.2542 1 1 0.1451 0.5977 0.2571 1 1 0.1516 0.5879 0.2605
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 319 79 240 39 0 2 0 38 0 0 240 0 0 0.4937 0.0000 0.0000 38.500 0.28 1.63 -1.35 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2241 0.5921 0.1838 1 1 0.2271 0.5853 0.1877 1 1 0.2307 0.5766 0.1926
chr9 35674193 CGGAGAGGAGGATCTACCT C 0.500000 0.100 1 -18 3 458 147 311 102 0 40 0 5 0 0 311 0 0 0.6939 0.0000 0.0000 2.675 0.39 15.20 -14.81 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0027 0.9973 0.0000 0 1 0.4432 0.5568 0.0000 0 0 0.8508 0.1492 0.0000
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 796 190 606 0 0 39 1 150 0 0 583 0 23 0.0000 0.0000 0.0380 3.846 11.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr9 37441270 CATT C 0.500000 0.100 1 -3 1 771 170 601 159 2 1 0 8 0 0 600 1 0 0.9353 0.0000 0.0017 169.000 0.40 3.00 -2.60 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1820 0.8180 0.0000 0 0 0.8859 0.1141 0.0000
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 703 133 570 95 0 1 0 37 0 0 570 0 0 0.7143 0.0000 0.0000 132.000 1.66 1.19 0.47 89 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9880 0.0120 0.0000 1 0 0.9857 0.0143 0.0000 1 0 0.9820 0.0180 0.0000
chr9 72059357 TGAAAG T 0.500000 0.100 1 -5 1 207 79 128 75 0 3 0 1 0 0 128 0 0 0.9494 0.0000 0.0000 25.333 0.19 5.00 -4.81 45 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8321 0.1679 0.0000 0 0 0.9359 0.0641 0.0000 0 0 0.9525 0.0475 0.0000
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 463 143 320 128 0 2 0 13 0 0 319 0 1 0.8951 0.0000 0.0031 70.500 0.39 14.46 -14.07 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0587 0.9413 0.0000
chr9 76706391 GTCCTGACACTGC G 0.500000 0.100 1 -12 1 740 162 578 87 2 1 0 72 0 0 574 0 4 0.5370 0.0000 0.0069 161.000 0.48 10.71 -10.23 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4320 0.5352 0.0329 1 1 0.4331 0.5305 0.0364 1 1 0.4335 0.5249 0.0415
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 747 171 576 144 1 14 0 12 0 0 574 0 2 0.8421 0.0000 0.0035 11.214 0.50 10.33 -9.83 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1239 0.8761 0.0000
chr9 77384631 G GTGA 0.500000 0.100 1 3 1 516 166 350 128 2 25 0 11 0 0 350 0 0 0.7711 0.0000 0.0000 5.640 0.35 3.09 -2.74 100 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0054 0.9946 0.0000 0 1 0.3207 0.6793 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 247 100 147 92 1 2 0 5 0 0 146 0 1 0.9200 0.0000 0.0068 49.000 0.18 4.40 -4.22 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1489 0.8511 0.0000 0 0 0.6597 0.3403 0.0000
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 355 99 256 56 10 22 0 11 0 0 255 0 1 0.5657 0.0000 0.0039 3.500 0.27 3.55 -3.28 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0110 0.9890 0.0000
chr9 93259450 TTGCCCCCGCAACCCACACGGCCCCCTCAACCTGTGC T 0.500000 0.100 1 -36 1 481 110 371 47 0 15 0 48 0 0 371 0 0 0.4273 0.0000 0.0000 6.333 0.32 6.77 -6.45 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1743 0.6133 0.2125 1 1 0.1788 0.6049 0.2163 1 1 0.1845 0.5944 0.2210
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 477 176 301 0 0 1 2 173 0 0 300 0 1 0.0000 0.0000 0.0033 175.000 10.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 592 175 417 13 0 1 3 158 0 0 416 0 1 0.0743 0.0000 0.0024 173.000 0.15 3.32 -3.16 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.6198 0.3802
chr9 96383603 C CCCTCGG 0.500000 0.100 1 6 1 188 79 109 64 0 12 0 3 0 0 108 0 1 0.8101 0.0000 0.0092 5.583 0.45 6.00 -5.55 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 1 0.2569 0.7431 0.0000 0 0 0.6314 0.3686 0.0000
chr9 96932301 ACT A 0.500000 0.100 1 -2 1 755 204 551 81 0 7 3 113 0 0 541 5 5 0.3971 0.0000 0.0181 28.000 0.07 2.80 -2.72 25 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0611 0.9388 1 2 0.0002 0.0667 0.9331 1 2 0.0003 0.0753 0.9245
chr9 96932306 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 751 197 554 78 1 2 2 114 0 0 543 5 6 0.3959 0.0000 0.0199 97.000 0.08 2.79 -2.71 28 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0443 0.9556 1 2 0.0001 0.0492 0.9507 1 2 0.0002 0.0565 0.9433
chr9 96936443 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 257 91 166 9 0 5 0 77 0 0 163 0 3 0.0989 0.0000 0.0181 17.200 0.22 3.10 -2.88 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9963 0.0037 2 1 0.0000 0.8692 0.1308
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 438 117 321 4 0 17 2 94 0 0 321 0 0 0.0342 0.0000 0.0000 5.882 0.00 5.37 -5.37 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9818 0.0182 2 2 0.0000 0.3674 0.6326 2 2 0.0000 0.1093 0.8907
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 919 137 782 0 3 27 3 104 0 1 772 1 8 0.0000 0.0000 0.0128 3.926 6.14 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0097 0.9903 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0084 0.9916
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 529 129 400 10 0 0 0 119 0 0 400 0 0 0.0775 0.0000 0.0000 129.000 1.10 2.61 -1.51 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9909 0.0091 2 1 0.0000 0.6550 0.3450
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 482 108 374 29 0 0 0 79 0 0 374 0 0 0.2685 0.0000 0.0000 108.000 0.62 4.71 -4.09 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0234 0.9766 1 2 0.0001 0.0271 0.9728 1 2 0.0001 0.0373 0.9626
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 479 105 374 8 0 5 5 87 0 0 369 1 4 0.0762 0.0000 0.0134 33.000 0.75 3.28 -2.53 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9785 0.0215 2 1 0.0000 0.6365 0.3635
chr9 104695275 G GTGAA 0.500000 0.100 1 4 2 534 123 411 82 0 1 0 40 0 0 405 0 6 0.6667 0.0000 0.0146 122.000 1.18 4.60 -3.42 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9038 0.0955 0.0007 1 0 0.8955 0.1036 0.0009 1 0 0.8833 0.1154 0.0013
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 301 126 175 0 0 1 0 125 0 0 170 0 5 0.0000 0.0000 0.0286 125.000 4.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr9 116154344 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 2 894 201 693 4 0 45 1 151 0 1 684 0 8 0.0199 0.0000 0.0130 3.467 1.75 3.77 -2.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8162 0.1838 2 2 0.0000 0.0404 0.9596 2 2 0.0000 0.0083 0.9917
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 534 134 400 0 1 21 1 111 0 0 398 0 2 0.0000 0.0000 0.0050 5.381 6.41 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0167 0.9833 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0072 0.9928
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 628 158 470 82 0 12 3 61 0 0 469 0 1 0.5190 0.0000 0.0021 12.167 0.61 1.49 -0.88 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5656 0.4162 0.0182 1 0 0.5613 0.4181 0.0207 1 0 0.5546 0.4211 0.0243
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 590 217 373 80 1 30 21 85 0 0 371 0 2 0.3687 0.0000 0.0054 6.200 0.35 3.53 -3.18 28 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0034 0.2538 0.7428 1 2 0.0042 0.2601 0.7358 1 2 0.0054 0.2693 0.7253
chr9 128258516 GCCTCCT G 0.500000 0.100 1 -6 2 592 222 370 84 7 103 6 22 0 0 370 0 0 0.3784 0.0000 0.0000 1.110 0.33 6.36 -6.03 30 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9295 0.0705 0.0000 0 1 0.0677 0.9323 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 534 160 374 0 0 4 1 155 0 0 369 0 5 0.0000 0.0000 0.0134 39.000 3.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 242 74 168 34 0 10 0 30 0 0 166 0 2 0.4595 0.0000 0.0119 6.400 0.18 7.57 -7.39 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2538 0.5755 0.1707 1 1 0.2556 0.5698 0.1746 1 1 0.2577 0.5627 0.1796
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 467 145 322 59 7 39 1 39 1 1 319 0 1 0.4069 0.0031 0.0093 2.692 0.95 3.72 -2.77 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8095 0.1868 0.0037 1 0 0.7990 0.1965 0.0045 1 0 0.7840 0.2102 0.0058
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 458 97 361 88 0 1 0 8 0 0 361 0 0 0.9072 0.0000 0.0000 96.000 1.55 1.12 0.42 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0162 0.9838 0.0000 0 1 0.2977 0.7023 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 293 124 169 113 1 1 0 9 0 0 169 0 0 0.9113 0.0000 0.0000 123.000 2.01 2.33 -0.32 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0202 0.9798 0.0000 0 1 0.4396 0.5604 0.0000
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 293 124 169 113 1 1 0 9 0 0 169 0 0 0.9113 0.0000 0.0000 123.000 2.01 2.33 -0.32 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0202 0.9798 0.0000 0 1 0.4396 0.5604 0.0000
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 237 84 153 46 0 1 0 37 0 0 152 0 1 0.5476 0.0000 0.0065 83.000 0.43 2.41 -1.97 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3890 0.5314 0.0797 1 1 0.3871 0.5286 0.0843 1 1 0.3842 0.5252 0.0907
chr9 136984956 C CGGCCCCTCCCTGCCCCTCT 0.500000 0.100 1 19 3 448 120 328 94 0 18 0 8 0 0 328 0 0 0.7833 0.0000 0.0000 5.667 0.50 7.38 -6.88 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0214 0.9786 0.0000 0 1 0.3605 0.6395 0.0000
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 500 141 359 60 1 15 4 61 0 0 351 0 8 0.4255 0.0000 0.0223 8.333 1.47 13.33 -11.86 30 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0419 0.5211 0.4370 1 1 0.0458 0.5179 0.4363 1 1 0.0514 0.5143 0.4344
chr10 3166375 T TGCACGCTAGGGAAGAGAGAGGAATG 0.004839 0.100 1 25 1 206 59 147 33 0 4 0 22 0 0 146 0 1 0.5593 0.0000 0.0068 13.750 0.15 11.32 -11.17 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6705 0.3291 0.0004 1 0 0.6666 0.3329 0.0005 1 0 0.6611 0.3384 0.0005
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 872 213 659 117 0 7 0 89 0 0 656 0 3 0.5493 0.0000 0.0046 29.429 0.33 8.24 -7.90 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8029 0.1969 0.0003 1 0 0.7999 0.1998 0.0003 1 0 0.7952 0.2043 0.0004
chr10 18655037 AT A 0.002315 0.100 1 -1 3 75 32 43 29 0 0 0 3 0 0 43 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 32.000 0.10 1.00 -0.90 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7188 0.2812 0.0000 0 0 0.9870 0.0130 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 258 118 140 111 1 1 0 5 0 0 139 0 1 0.9407 0.0000 0.0071 116.000 0.22 4.00 -3.78 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.6577 0.3423 0.0000 0 0 0.9540 0.0460 0.0000
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 903 206 697 1 0 27 0 178 0 0 682 0 15 0.0049 0.0000 0.0215 6.630 10.00 5.52 4.48 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 704 138 566 0 0 2 1 135 0 0 564 0 2 0.0000 0.0000 0.0035 68.000 3.73 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0035 0.9965
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 242 107 135 97 0 1 0 9 0 0 135 0 0 0.9065 0.0000 0.0000 106.000 0.32 2.00 -1.68 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.4264 0.5736 0.0000 0 0 0.9668 0.0332 0.0000
chr10 45303617 T TA 0.034347 0.100 1 1 2 664 128 536 77 0 2 0 49 0 0 536 0 0 0.6016 0.0000 0.0000 63.000 0.38 1.14 -0.77 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8929 0.1069 0.0001 1 0 0.8870 0.1129 0.0002 1 0 0.8784 0.1214 0.0002
chr10 49614241 AAG A 0.000146 0.100 1 -2 2 311 91 220 51 0 3 0 37 0 0 220 0 0 0.5604 0.0000 0.0000 29.333 1.51 3.38 -1.87 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7223 0.2777 0.0000 1 0 0.7181 0.2819 0.0000 1 0 0.7121 0.2879 0.0000
chr10 51698890 CCCAGGGCCAGGG C 0.000544 0.100 1 -12 1 830 173 657 153 0 18 0 2 0 0 655 0 2 0.8844 0.0000 0.0030 8.611 0.37 12.00 -11.63 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9984 0.0016 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 53822122 CGTT C 0.003336 0.100 1 -3 1 647 157 490 144 0 4 0 9 0 0 490 0 0 0.9172 0.0000 0.0000 38.250 0.33 3.67 -3.34 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.9648 0.0352 0.0000 0 0 0.9990 0.0010 0.0000
chr10 56358652 T TGCCTCA 0.001075 0.100 1 6 1 597 175 422 136 0 28 0 11 0 0 422 0 0 0.7771 0.0000 0.0000 5.250 0.24 5.45 -5.21 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8716 0.1284 0.0000 0 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 119 48 71 28 0 2 0 18 0 0 71 0 0 0.5833 0.0000 0.0000 23.000 0.54 7.50 -6.96 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6354 0.3488 0.0158 1 0 0.6299 0.3532 0.0169 1 0 0.6223 0.3592 0.0185
chr10 73130825 G GC 0.008232 0.100 1 1 1 235 108 127 92 0 11 0 5 0 0 127 0 0 0.8519 0.0000 0.0000 8.818 0.22 1.00 -0.78 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1793 0.8207 0.0000 0 0 0.9832 0.0168 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 451 110 341 0 0 20 1 89 0 0 341 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.500 3.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0500 0.9500 2 2 0.0000 0.0546 0.9454 2 2 0.0000 0.0616 0.9384
chr10 75401342 GCCGCCT G 0.008076 0.100 1 -6 2 513 212 301 174 3 25 0 10 0 0 301 0 0 0.8208 0.0000 0.0000 7.400 0.43 5.60 -5.17 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.9521 0.0479 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 765 147 618 79 0 5 0 63 0 0 613 0 5 0.5374 0.0000 0.0081 28.400 0.39 6.13 -5.73 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5083 0.4720 0.0197 1 0 0.5104 0.4680 0.0215 1 0 0.5123 0.4636 0.0241
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 492 140 352 130 0 0 0 10 0 0 351 1 0 0.9286 0.0000 0.0028 140.000 0.24 3.20 -2.96 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2598 0.7402 0.0000 0 0 0.9675 0.0325 0.0000
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.100 1 18 1 515 152 363 63 0 20 0 69 0 0 342 0 21 0.4145 0.0000 0.0579 6.600 1.03 12.86 -11.82 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0282 0.8806 0.0912 1 1 0.0331 0.8800 0.0870 1 1 0.0406 0.8780 0.0813
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 355 123 232 63 0 5 0 55 0 0 231 0 1 0.5122 0.0000 0.0043 23.600 0.75 2.73 -1.98 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4476 0.5194 0.0330 1 1 0.4508 0.5141 0.0351 1 1 0.4543 0.5077 0.0380
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 181 73 108 12 0 0 31 30 0 0 108 0 0 0.1644 0.0000 0.0000 73.000 0.58 3.23 -2.65 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9789 0.0211
chr10 115171343 CTT C 0.004437 0.100 1 -2 1 278 67 211 62 0 1 0 4 0 0 211 0 0 0.9254 0.0000 0.0000 66.000 0.37 2.00 -1.63 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4221 0.5779 0.0000 0 0 0.9860 0.0140 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 386 110 276 21 3 16 3 67 0 3 273 0 0 0.1909 0.0000 0.0109 5.688 1.00 2.33 -1.33 21 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0424 0.9574 1 2 0.0003 0.0479 0.9519 1 2 0.0004 0.0590 0.9406
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 353 126 227 64 1 7 0 54 1 0 225 0 1 0.5079 0.0044 0.0088 17.000 0.30 1.31 -1.02 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4292 0.5223 0.0485 1 1 0.4280 0.5194 0.0526 1 1 0.4255 0.5160 0.0585
chr10 132330314 GAA G 0.000450 0.100 1 -2 1 343 104 239 95 0 3 0 6 0 0 239 0 0 0.9135 0.0000 0.0000 33.667 0.24 2.00 -1.76 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3152 0.6848 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr10 132785411 GCTT G 0.000266 0.100 1 -3 1 597 154 443 79 0 9 0 66 0 0 441 1 1 0.5130 0.0000 0.0045 16.111 1.14 3.52 -2.38 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5969 0.4031 0.0000 1 0 0.5997 0.4003 0.0000 1 0 0.6025 0.3975 0.0000
chr10 132785751 C CCGG 0.000004 0.100 1 3 3 419 86 333 45 0 8 0 33 0 0 331 0 2 0.5233 0.0000 0.0060 9.750 1.33 4.00 -2.67 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6454 0.3546 0.0000 1 0 0.6434 0.3566 0.0000 1 0 0.6404 0.3596 0.0000
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 612 131 481 117 2 3 0 9 0 0 480 0 1 0.8931 0.0000 0.0021 42.667 0.37 3.22 -2.85 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0170 0.9830 0.0000 0 0 0.5007 0.4993 0.0000
chr11 281784 GAGA G 0.001770 0.100 1 -3 2 546 155 391 141 0 8 0 6 0 0 391 0 0 0.9097 0.0000 0.0000 18.375 0.42 3.00 -2.58 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5471 0.4529 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.100 1 -12 1 772 188 584 92 0 24 0 72 0 0 580 0 4 0.4894 0.0000 0.0068 6.833 0.73 11.49 -10.76 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6714 0.3272 0.0014 1 0 0.6714 0.3269 0.0016 1 0 0.6707 0.3274 0.0019
chr11 1051657 AC A 0.061644 0.100 1 -1 1 408 134 274 15 0 7 2 110 0 0 273 0 1 0.1119 0.0000 0.0036 18.000 0.40 2.12 -1.72 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9989 0.0011
chr11 1188258 GACCAGCACAACCTCTGCTCCTACA G 0.001194 0.100 1 -24 1 2665 667 1998 518 10 112 1 26 6 4 1985 1 2 0.7766 0.0030 0.0065 4.911 0.67 18.38 -17.72 96 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9530 0.0470 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr11 1190500 CCCAGCACAACCTCTGCCCCTACAA C 0.141961 0.100 1 -24 1 2232 499 1733 344 4 127 0 24 2 2 1728 1 0 0.6894 0.0012 0.0029 2.913 1.65 15.50 -13.85 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 0 0.9623 0.0377 0.0000
chr11 1249988 GCCA G 0.076028 0.100 1 -3 2 2016 415 1601 210 5 40 0 160 2 3 1576 3 17 0.5060 0.0012 0.0156 9.615 1.65 4.61 -2.95 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8761 0.1239 0.0000 1 0 0.8754 0.1246 0.0000 1 0 0.8735 0.1264 0.0001
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1085 245 840 144 1 85 1 14 0 0 840 0 0 0.5878 0.0000 0.0000 1.871 1.03 13.21 -12.19 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0598 0.9402 0.0000
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.100 1 -30 1 1160 240 920 14 0 73 3 150 0 0 871 0 49 0.0583 0.0000 0.0533 2.260 1.64 13.15 -11.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8211 0.1789
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 1063 299 764 54 2 91 0 152 0 0 763 1 0 0.1806 0.0000 0.0013 2.286 0.48 11.82 -11.34 8 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0003 0.9997 1 2 0.0000 0.0004 0.9996 1 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 370 108 262 0 0 1 2 105 0 0 259 0 3 0.0000 0.0000 0.0115 106.000 3.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr11 4450136 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 657 167 490 95 0 4 0 68 0 0 490 0 0 0.5689 0.0000 0.0000 40.750 0.39 1.65 -1.26 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7628 0.2336 0.0036 1 0 0.7545 0.2411 0.0044 1 0 0.7423 0.2520 0.0057
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 277 120 157 68 0 2 6 44 0 0 157 0 0 0.5667 0.0000 0.0000 56.000 0.06 2.18 -2.12 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6765 0.3117 0.0117 1 0 0.6675 0.3189 0.0135 1 0 0.6548 0.3289 0.0163
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 277 119 158 68 0 43 2 6 0 0 158 0 0 0.5714 0.0000 0.0000 25.333 0.06 2.00 -1.94 4 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6013 0.3985 0.0002 0 1 0.1609 0.8390 0.0001 0 1 0.0317 0.9683 0.0000
chr11 4769643 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 675 169 506 106 0 2 0 61 0 1 504 0 1 0.6272 0.0000 0.0040 167.000 0.28 3.92 -3.64 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9480 0.0519 0.0001 1 0 0.9423 0.0575 0.0002 1 0 0.9338 0.0659 0.0003
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 563 118 445 68 0 3 0 47 0 0 444 0 1 0.5763 0.0000 0.0022 38.333 0.32 1.23 -0.91 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6642 0.3232 0.0126 1 0 0.6556 0.3299 0.0145 1 0 0.6433 0.3393 0.0174
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 531 136 395 68 0 7 0 61 0 0 395 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 18.429 1.26 2.20 -0.93 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3194 0.6008 0.0798 1 1 0.3220 0.5931 0.0849 1 1 0.3247 0.5834 0.0918
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 679 158 521 69 1 3 0 85 0 0 510 0 11 0.4367 0.0000 0.0211 51.667 0.25 5.88 -5.64 25 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0043 0.2543 0.7414 1 2 0.0052 0.2613 0.7335 1 2 0.0066 0.2714 0.7220
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 485 114 371 47 0 9 0 58 0 0 371 0 0 0.4123 0.0000 0.0000 11.667 0.70 1.57 -0.87 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0505 0.5027 0.4468 1 1 0.0546 0.5013 0.4441 1 1 0.0604 0.4997 0.4399
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.100 1 4 1 839 227 612 97 1 15 1 113 0 0 610 0 2 0.4273 0.0000 0.0033 14.067 0.89 4.18 -3.29 17 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0137 0.4764 0.5099 1 2 0.0158 0.4731 0.5111 1 2 0.0190 0.4697 0.5113
chr11 5454410 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 471 140 331 13 0 0 0 127 0 0 331 0 0 0.0929 0.0000 0.0000 140.000 0.00 1.38 -1.38 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.8982 0.1018
chr11 6390705 TGCTGGCGCTGGCGCTGGC T 0.500000 0.100 1 -18 2 810 238 572 127 3 38 0 70 0 0 562 0 10 0.5336 0.0000 0.0175 5.378 4.50 13.90 -9.40 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9602 0.0398 0.0001 1 0 0.9556 0.0443 0.0001 1 0 0.9487 0.0512 0.0001
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 803 149 654 0 1 22 0 126 0 0 639 0 15 0.0000 0.0000 0.0229 5.773 8.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr11 6891690 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 647 171 476 161 0 4 0 6 0 0 476 0 0 0.9415 0.0000 0.0000 41.750 0.30 2.00 -1.70 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 0 0.8395 0.1605 0.0000 0 0 0.9813 0.0187 0.0000
chr11 6921357 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 689 168 521 163 0 1 0 4 0 0 520 0 1 0.9702 0.0000 0.0019 167.000 0.97 1.25 -0.28 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0582 0.9418 0.0000 0 0 0.9438 0.0562 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 275 126 149 0 0 26 37 63 0 0 146 3 0 0.0000 0.0000 0.0201 3.808 3.44 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0067 0.9933
chr11 9091461 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 275 127 148 4 4 76 1 42 0 0 145 0 3 0.0315 0.0000 0.0203 0.618 1.00 6.98 -5.98 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9630 0.0370 2 1 0.0000 0.8139 0.1861
chr11 10580532 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 99 56 43 31 0 7 0 18 0 0 43 0 0 0.5536 0.0000 0.0000 7.000 0.32 3.11 -2.79 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5627 0.3945 0.0428 1 0 0.5532 0.4003 0.0464 1 0 0.5403 0.4080 0.0517
chr11 12294797 G GCTCCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 12 1 642 143 499 13 2 78 1 49 1 0 486 0 12 0.0909 0.0020 0.0261 0.831 4.92 10.12 -5.20 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.8822 0.1178 2 1 0.0000 0.9938 0.0062 2 1 0.0000 0.9984 0.0016
chr11 12294797 GCTCCTC G 0.500000 0.100 1 -6 1 642 158 484 125 0 28 0 5 0 0 483 0 1 0.7911 0.0000 0.0021 4.643 6.42 5.80 0.62 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.4638 0.5362 0.0000 0 0 0.9016 0.0984 0.0000
chr11 27362901 TTCATCCACGTCTTCCTCA T 0.500000 0.100 1 -18 1 537 187 350 158 1 20 0 8 0 0 350 0 0 0.8449 0.0000 0.0000 8.350 0.46 16.12 -15.67 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3597 0.6403 0.0000 0 0 0.9296 0.0704 0.0000
chr11 34632610 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 145 71 74 48 1 1 0 21 0 0 72 0 2 0.6761 0.0000 0.0270 70.000 0.15 1.14 -1.00 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8182 0.1771 0.0047 1 0 0.8065 0.1878 0.0057 1 0 0.7900 0.2028 0.0072
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 933 310 623 166 0 8 1 135 0 0 621 0 2 0.5355 0.0000 0.0032 37.750 0.16 3.43 -3.27 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6421 0.3554 0.0025 1 0 0.6430 0.3539 0.0031 1 0 0.6425 0.3534 0.0041
chr11 49059038 C CGGGTCTATG 0.500000 0.100 1 9 2 646 198 448 94 1 36 1 66 0 0 443 1 4 0.4747 0.0000 0.0112 4.500 0.57 8.05 -7.47 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6830 0.3101 0.0069 1 0 0.6764 0.3155 0.0081 1 0 0.6665 0.3234 0.0101
chr11 54603834 GGACCCCAGTGATGGGCTGGCAGTGATGGT G 0.500000 0.100 1 -29 5 511 115 396 65 0 5 0 45 0 1 387 0 8 0.5652 0.0000 0.0227 22.000 0.26 22.16 -21.89 17 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4844 0.4788 0.0368 1 0 0.4812 0.4784 0.0404 1 1 0.4762 0.4782 0.0456
chr11 56252727 T TGCTTCCTACGTTGCTG 0.500000 0.100 1 16 1 861 213 648 93 0 42 0 78 0 0 631 0 17 0.4366 0.0000 0.0262 4.071 0.14 13.24 -13.10 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1160 0.7115 0.1725 1 1 0.1229 0.6972 0.1799 1 1 0.1319 0.6788 0.1893
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 762 175 587 0 0 3 1 171 0 0 579 0 8 0.0000 0.0000 0.0136 57.333 2.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr11 58031636 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 697 153 544 91 0 0 0 62 0 0 544 0 0 0.5948 0.0000 0.0000 153.000 0.32 1.15 -0.83 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8052 0.1922 0.0026 1 0 0.7962 0.2007 0.0032 1 0 0.7831 0.2128 0.0042
chr11 59863993 AC A 0.500000 0.100 1 -1 1 226 105 121 61 1 0 0 43 0 0 121 0 0 0.5810 0.0000 0.0000 105.000 0.43 1.28 -0.85 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6521 0.3327 0.0152 1 0 0.6432 0.3395 0.0173 1 0 0.6307 0.3488 0.0205
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 85 46 39 23 0 0 0 23 0 0 39 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 46.000 0.17 2.00 -1.83 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2219 0.5562 0.2219 1 1 0.2240 0.5519 0.2240 1 1 0.2267 0.5466 0.2267
chr11 62146758 A AGCGGGAGCAGGAGCG 0.500000 0.100 1 15 1 754 220 534 155 5 50 1 9 0 0 531 0 3 0.7045 0.0000 0.0056 3.380 0.46 6.00 -5.54 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0063 0.9937 0.0000 0 1 0.4586 0.5414 0.0000
chr11 68050524 A AGGCCTG 0.500000 0.100 1 6 1 638 154 484 130 0 14 0 10 0 0 484 0 0 0.8442 0.0000 0.0000 10.000 0.35 4.40 -4.05 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0155 0.9845 0.0000 0 1 0.4727 0.5273 0.0000
chr11 68312746 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 131 56 75 23 3 2 0 28 0 0 73 0 2 0.4107 0.0000 0.0267 27.000 0.87 4.50 -3.63 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1403 0.5493 0.3104 1 1 0.1445 0.5455 0.3100 1 1 0.1500 0.5408 0.3091
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 1068 180 888 8 0 47 2 123 0 0 812 1 75 0.0444 0.0000 0.0856 2.830 0.00 5.40 -5.40 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 2 0.0000 0.1791 0.8209 2 2 0.0000 0.0098 0.9902
chr11 71538486 C CCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCCTGCTGCTGCTCTTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTG 0.500000 0.100 1 57 2 1342 312 1030 100 3 145 2 62 2 1 981 1 45 0.3205 0.0019 0.0476 1.138 0.75 8.56 -7.81 14 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.0893 0.7292 0.1815 1 1 0.0960 0.7141 0.1899 1 1 0.1051 0.6945 0.2004
chr11 71548924 TTCAGGCTGTGGGTCATCCTGCTGCCAGTGCAGCTGCTGCAAGCCCTACTGCTCCCAGTGCAGCTGCTGTAAGCCCTGTTGCTCCTCCTCGGGTCGTGGGTCATCCTGCTGCCAATCCAGCTGCTGCAAGCCCTGCTGCTCATCC T 0.500000 0.100 1 -144 1 642 248 394 157 1 30 0 60 1 0 386 0 7 0.6331 0.0025 0.0203 7.267 0.32 3.43 -3.11 19 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9991 0.0009 0.0000 1 0 0.9988 0.0012 0.0000
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 1104 328 776 210 0 70 0 48 0 0 751 0 25 0.6402 0.0000 0.0322 3.686 0.20 14.23 -14.03 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 913 256 657 124 1 2 1 128 0 0 656 0 1 0.4844 0.0000 0.0015 127.000 0.44 2.27 -1.83 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0650 0.7548 0.1802 1 1 0.0713 0.7386 0.1900 1 1 0.0801 0.7174 0.2025
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 817 176 641 152 2 12 0 10 0 0 641 0 0 0.8636 0.0000 0.0000 13.667 0.55 2.90 -2.35 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0496 0.9504 0.0000 0 0 0.7418 0.2582 0.0000
chr11 73660839 A AGGTAAGTCT 0.500000 0.100 1 9 2 263 107 156 100 1 1 0 5 0 0 156 0 0 0.9346 0.0000 0.0000 106.000 0.37 10.00 -9.63 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0026 0.9974 0.0000 0 1 0.4306 0.5694 0.0000 0 0 0.8445 0.1555 0.0000
chr11 73660841 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 265 102 163 97 0 1 0 4 0 0 163 0 0 0.9510 0.0000 0.0000 101.000 0.38 12.50 -12.12 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0193 0.9807 0.0000 0 0 0.6436 0.3564 0.0000 0 0 0.8950 0.1050 0.0000
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 272 97 175 60 0 3 0 34 0 0 175 0 0 0.6186 0.0000 0.0000 31.333 0.15 13.12 -12.97 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8021 0.1933 0.0046 1 0 0.7910 0.2034 0.0056 1 0 0.7754 0.2175 0.0071
chr11 83255888 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 197 94 103 51 3 3 3 34 0 0 100 0 3 0.5426 0.0000 0.0291 29.333 0.24 1.62 -1.38 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5357 0.4295 0.0348 1 0 0.5294 0.4324 0.0382 1 0 0.5204 0.4364 0.0432
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1438 393 1045 18 3 66 5 301 0 0 1043 1 1 0.0458 0.0000 0.0019 5.078 0.94 7.43 -6.48 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9945 0.0055 2 2 0.0000 0.0823 0.9177
chr11 108917907 G GTGATGA 0.500000 0.100 1 6 1 207 90 117 47 0 7 0 36 0 0 116 0 1 0.5222 0.0000 0.0085 11.857 0.89 6.03 -5.13 31 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4413 0.4972 0.0614 1 1 0.4377 0.4965 0.0658 1 1 0.4323 0.4959 0.0718
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 851 279 572 1 0 37 3 238 0 0 571 1 0 0.0036 0.0000 0.0017 6.514 1.00 9.01 -8.01 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 292 119 173 61 0 5 0 53 0 0 170 0 3 0.5126 0.0000 0.0173 22.800 0.26 7.75 -7.49 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2830 0.6120 0.1050 1 1 0.2860 0.6037 0.1103 1 1 0.2894 0.5932 0.1174
chr11 118557032 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 231 84 147 48 0 7 0 29 0 0 147 0 0 0.5714 0.0000 0.0000 11.000 0.52 2.97 -2.44 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6817 0.3025 0.0158 1 0 0.6709 0.3112 0.0180 1 0 0.6558 0.3230 0.0213
chr11 124249871 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 487 132 355 120 0 3 0 9 0 0 355 0 0 0.9091 0.0000 0.0000 43.000 0.18 1.11 -0.93 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0271 0.9729 0.0000 0 0 0.5124 0.4876 0.0000
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 372 115 257 0 0 9 0 106 0 0 257 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.778 5.87 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0058 0.9942
chr11 130121757 TGAAGAG T 0.500000 0.100 1 -6 1 237 75 162 10 2 17 0 46 0 0 162 0 0 0.1333 0.0000 0.0000 3.353 1.00 5.52 -4.52 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0004 0.6853 0.3144 2 1 0.0001 0.9549 0.0451 2 1 0.0000 0.9878 0.0121
chr11 130428222 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 441 142 299 119 3 16 0 4 1 0 298 0 0 0.8380 0.0033 0.0033 7.875 1.02 3.50 -2.48 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0685 0.9315 0.0000 0 0 0.8683 0.1317 0.0000 0 0 0.9678 0.0322 0.0000
chr11 130901818 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 77 43 34 39 0 1 0 3 0 0 34 0 0 0.9070 0.0000 0.0000 42.000 0.38 2.00 -1.62 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0094 0.9906 0.0000 0 1 0.2241 0.7759 0.0000 0 1 0.4921 0.5079 0.0000
chr12 865142 T TC 0.282148 0.100 1 1 2 373 126 247 77 0 0 0 49 0 0 246 1 0 0.6111 0.0000 0.0040 126.000 0.65 1.69 -1.04 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8473 0.1512 0.0016 1 0 0.8396 0.1585 0.0019 1 0 0.8286 0.1689 0.0025
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 604 164 440 11 1 30 5 117 0 0 436 0 4 0.0671 0.0000 0.0091 4.467 0.18 3.29 -3.11 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 1 0.0000 0.8639 0.1361
chr12 4626804 A ACTTGTCATCTCCCAGCTTGTCATCTCCCAG 0.003167 0.100 1 30 1 645 139 506 119 1 15 0 4 0 0 503 0 3 0.8561 0.0000 0.0059 8.200 0.26 15.75 -15.49 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0246 0.9754 0.0000 0 0 0.9865 0.0135 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 509 188 321 70 10 45 4 59 0 0 321 0 0 0.3723 0.0000 0.0000 3.156 5.41 3.34 2.08 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5214 0.4543 0.0243 1 0 0.5171 0.4555 0.0274 1 0 0.5105 0.4576 0.0319
chr12 6936716 CCAGCAA C 0.006744 0.100 1 -6 1 972 285 687 63 10 19 172 21 0 0 682 5 0 0.2211 0.0000 0.0073 17.600 0.54 11.90 -11.37 9 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0036 0.9964 1 2 0.0000 0.0051 0.9949 1 2 0.0000 0.0083 0.9917
chr12 8843328 AAG A 0.001621 0.100 1 -2 1 245 80 165 77 0 1 0 2 0 0 165 0 0 0.9625 0.0000 0.0000 79.000 0.60 2.50 -1.90 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9973 0.0027 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 300 123 177 65 0 8 0 50 0 0 172 0 5 0.5285 0.0000 0.0282 14.375 0.11 4.64 -4.53 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4023 0.5416 0.0562 1 1 0.4018 0.5376 0.0606 1 1 0.4004 0.5328 0.0668
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 341 157 184 62 0 16 1 78 0 0 184 0 0 0.3949 0.0000 0.0000 8.812 1.18 4.28 -3.10 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0103 0.3479 0.6418 1 2 0.0117 0.3504 0.6380 1 2 0.0137 0.3542 0.6321
chr12 14823483 CTA C 0.147675 0.100 1 -2 1 548 144 404 134 1 0 0 9 0 0 404 0 0 0.9306 0.0000 0.0000 144.000 0.69 2.00 -1.31 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2524 0.7476 0.0000 0 0 0.9261 0.0739 0.0000
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.100 1 -30 1 1281 354 927 238 4 52 3 57 3 2 921 1 0 0.6723 0.0032 0.0065 5.863 1.53 8.95 -7.42 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr12 40487719 AGGACTATCAGCTGGGGTGACAGGGACAACTGGACCATCAGCTGGAATAGCAGGTACAAAT A 0.001206 0.100 1 -60 1 310 60 250 30 1 17 1 11 1 2 242 0 5 0.5000 0.0040 0.0320 2.529 4.10 3.36 0.74 6 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.8101 0.1899 0.0000 1 0 0.8027 0.1972 0.0000 1 0 0.7925 0.2074 0.0000
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1038 181 857 63 0 91 0 27 2 3 823 1 28 0.3481 0.0023 0.0397 0.989 1.62 4.26 -2.64 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4259 0.5256 0.0485 1 1 0.4245 0.5227 0.0527 1 1 0.4219 0.5193 0.0587
chr12 51807428 AGAG A 0.000201 0.100 1 -3 2 476 98 378 90 0 4 0 4 0 0 378 0 0 0.9184 0.0000 0.0000 23.500 0.18 4.50 -4.32 36 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9854 0.0146 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 52073890 TGGGGAGTTCAAGGTAAGGGTGTC T 0.050697 0.100 1 -23 2 333 105 228 56 0 18 0 31 0 0 227 0 1 0.5333 0.0000 0.0044 4.833 0.12 18.03 -17.91 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8690 0.1306 0.0004 1 0 0.8621 0.1375 0.0005 1 0 0.8522 0.1472 0.0006
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 966 233 733 0 0 36 1 196 0 0 730 0 3 0.0000 0.0000 0.0041 5.600 12.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.100 1 21 2 537 93 444 5 0 19 0 69 0 0 396 0 48 0.0538 0.0000 0.1081 3.895 0.40 11.71 -11.31 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9316 0.0684 2 1 0.0000 0.6600 0.3400
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 402 97 305 61 0 1 0 35 0 0 305 0 0 0.6289 0.0000 0.0000 96.000 0.20 1.57 -1.37 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8494 0.1484 0.0021 1 0 0.8408 0.1566 0.0026 1 0 0.8284 0.1682 0.0033
chr12 55247561 TACA T 0.000296 0.100 1 -3 2 616 167 449 93 0 3 0 71 0 0 449 0 0 0.5569 0.0000 0.0000 54.667 0.27 4.58 -4.31 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7984 0.2016 0.0000 1 0 0.7946 0.2054 0.0000 1 0 0.7889 0.2111 0.0000
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 389 106 283 103 0 0 0 3 0 0 283 0 0 0.9717 0.0000 0.0000 106.000 0.37 1.33 -0.96 77 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2664 0.7336 0.0000 0 0 0.9117 0.0883 0.0000 0 0 0.9694 0.0306 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 586 131 455 65 0 1 0 65 0 0 450 0 5 0.4962 0.0000 0.0110 130.000 0.26 4.15 -3.89 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2371 0.7591 0.0037 1 1 0.2499 0.7463 0.0038 1 1 0.2667 0.7294 0.0038
chr12 56423649 T TTCC 0.001008 0.100 1 3 1 618 159 459 68 1 17 1 72 0 0 459 0 0 0.4277 0.0000 0.0000 8.353 0.25 3.32 -3.07 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2527 0.7468 0.0006 1 1 0.2657 0.7338 0.0006 1 1 0.2828 0.7167 0.0006
chr12 57225404 T TGGC 0.004341 0.100 1 3 1 623 158 465 81 0 4 0 73 1 0 463 0 1 0.5127 0.0022 0.0043 38.500 1.05 4.23 -3.18 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5059 0.4937 0.0005 1 0 0.5127 0.4868 0.0005 1 0 0.5207 0.4787 0.0005
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 384 101 283 53 0 3 0 45 0 0 278 0 5 0.5248 0.0000 0.0177 32.667 1.04 3.80 -2.76 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2904 0.6006 0.1090 1 1 0.2943 0.5927 0.1130 1 1 0.2990 0.5826 0.1184
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 126 50 76 27 0 3 0 20 0 0 74 0 2 0.5400 0.0000 0.0263 15.667 0.37 2.70 -2.33 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4008 0.5057 0.0935 1 1 0.3992 0.5041 0.0967 1 1 0.3967 0.5022 0.1011
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 1127 319 808 0 0 31 3 285 0 0 805 0 3 0.0000 0.0000 0.0037 9.258 3.40 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 85244867 GA G 0.286032 0.100 1 -1 1 163 73 90 61 4 4 0 4 0 0 90 0 0 0.8356 0.0000 0.0000 17.250 0.25 1.00 -0.75 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0108 0.9892 0.0000 0 1 0.4779 0.5221 0.0000 0 0 0.8164 0.1836 0.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 513 158 355 4 1 37 10 106 0 0 345 1 9 0.0253 0.0000 0.0282 3.270 0.75 5.25 -4.50 4 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9896 0.0104 2 2 0.0000 0.2711 0.7289 2 2 0.0000 0.0518 0.9482
chr12 102958393 C CGCAGCA 0.500000 0.100 1 6 1 513 158 355 6 0 50 0 102 0 0 345 0 10 0.0380 0.0000 0.0282 2.298 1.50 5.74 -4.24 6 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.6889 0.3111 2 2 0.0000 0.1713 0.8287
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 408 105 303 0 1 15 2 87 0 0 299 1 3 0.0000 0.0000 0.0132 5.933 3.57 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0113 0.9887 2 2 0.0000 0.0120 0.9880 2 2 0.0000 0.0133 0.9867
chr12 110582934 TCGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 385 152 233 85 0 20 1 46 0 0 233 0 0 0.5592 0.0000 0.0000 6.600 0.76 3.61 -2.84 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9190 0.0806 0.0005 1 0 0.9113 0.0880 0.0006 1 0 0.9000 0.0991 0.0009
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 707 189 518 57 5 36 29 62 0 0 514 2 2 0.3016 0.0000 0.0077 4.286 1.70 4.40 -2.70 5 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0018 0.1650 0.8332 1 2 0.0023 0.1736 0.8241 1 2 0.0031 0.1859 0.8110
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 161 78 83 0 0 1 0 77 0 0 83 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 77.000 2.87 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0209 0.9791 2 2 0.0000 0.0233 0.9767
chr12 113180950 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 289 101 188 59 1 5 0 36 0 0 184 0 4 0.5842 0.0000 0.0213 19.200 0.29 3.08 -2.80 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6808 0.3063 0.0129 1 0 0.6710 0.3141 0.0148 1 0 0.6574 0.3248 0.0178
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 224 79 145 33 0 11 0 35 0 0 141 0 4 0.4177 0.0000 0.0276 6.182 0.36 6.71 -6.35 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1076 0.5481 0.3443 1 1 0.1123 0.5443 0.3434 1 1 0.1186 0.5396 0.3418
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 436 120 316 38 19 20 8 35 0 0 313 1 2 0.3167 0.0000 0.0095 4.800 1.89 4.23 -2.33 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4714 0.4819 0.0467 1 1 0.4675 0.4818 0.0507 1 1 0.4618 0.4819 0.0563
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 393 114 279 0 0 12 1 101 0 0 273 0 6 0.0000 0.0000 0.0215 8.417 5.27 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0053 0.9947
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 332 83 249 0 0 6 1 76 0 0 243 0 6 0.0000 0.0000 0.0241 12.833 10.78 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0143 0.9857 2 2 0.0000 0.0156 0.9844 2 2 0.0000 0.0175 0.9825
chr12 122192827 T TTGAAGAGGTTAC 0.500000 0.100 1 12 1 351 97 254 75 1 18 0 3 0 0 254 0 0 0.7732 0.0000 0.0000 4.389 0.19 8.00 -7.81 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0576 0.9424 0.0000 0 0 0.6460 0.3540 0.0000 0 0 0.8535 0.1465 0.0000
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 750 197 553 0 0 19 0 178 0 0 532 0 21 0.0000 0.0000 0.0380 9.368 7.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 273 104 169 61 7 32 0 4 0 0 169 0 0 0.5865 0.0000 0.0000 2.250 0.39 2.25 -1.86 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 1 0.2973 0.7027 0.0000 0 0 0.6755 0.3245 0.0000
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 213 70 143 27 2 13 0 28 0 0 140 0 3 0.3857 0.0000 0.0210 4.385 1.52 4.00 -2.48 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1736 0.5682 0.2582 1 1 0.1772 0.5631 0.2596 1 1 0.1820 0.5567 0.2613
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 253 70 183 0 0 8 0 62 0 0 176 0 7 0.0000 0.0000 0.0383 7.750 8.68 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0288 0.9712 2 2 0.0000 0.0309 0.9691 2 2 0.0000 0.0339 0.9661
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 693 190 503 3 5 41 11 130 0 0 500 1 2 0.0158 0.0000 0.0060 3.675 2.67 4.58 -1.92 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9918 0.0082 2 2 0.0000 0.3010 0.6990 2 2 0.0000 0.0497 0.9503
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.100 1 -36 5 556 175 381 75 0 48 1 51 0 0 381 0 0 0.4286 0.0000 0.0000 2.646 0.29 9.10 -8.80 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7185 0.2740 0.0075 1 0 0.7093 0.2818 0.0089 1 0 0.6963 0.2928 0.0110
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 768 165 603 75 2 37 1 50 0 0 598 0 5 0.4545 0.0000 0.0083 3.432 0.40 5.58 -5.18 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6729 0.3169 0.0102 1 0 0.6652 0.3230 0.0118 1 0 0.6541 0.3316 0.0143
chr13 27924562 T TGCC 0.002235 0.100 1 3 1 605 154 451 77 1 25 1 50 0 0 450 0 1 0.5000 0.0000 0.0022 5.160 0.40 2.96 -2.56 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8746 0.1254 0.0000 1 0 0.8689 0.1311 0.0000 1 0 0.8606 0.1394 0.0000
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 160 50 110 24 0 1 0 25 0 0 107 0 3 0.4800 0.0000 0.0273 49.000 0.50 4.96 -4.46 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3238 0.6468 0.0294 1 1 0.3314 0.6394 0.0292 1 1 0.3413 0.6298 0.0289
chr13 44574554 CTGTTGTTGT C 0.000005 0.100 1 -9 1 770 197 573 176 0 12 0 9 0 0 573 0 0 0.8934 0.0000 0.0000 15.417 0.58 8.44 -7.86 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7636 0.2364 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 686 236 450 215 2 12 0 7 0 1 449 0 0 0.9110 0.0000 0.0022 18.583 0.63 8.86 -8.22 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0134 0.9866 0.0000 0 0 0.9721 0.0279 0.0000 0 0 0.9980 0.0020 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 675 179 496 76 0 41 1 61 1 1 486 4 4 0.4246 0.0020 0.0202 3.366 1.58 6.10 -4.52 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4860 0.5014 0.0126 1 1 0.4912 0.4952 0.0136 1 0 0.4973 0.4878 0.0149
chr13 71866526 TGCC T 0.001361 0.100 1 -3 1 675 184 491 127 13 33 0 11 0 2 486 0 3 0.6902 0.0000 0.0102 4.719 3.16 3.45 -0.30 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2245 0.7755 0.0000 0 0 0.9887 0.0113 0.0000
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 129 67 62 0 0 7 0 60 0 0 62 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 8.571 3.92 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6735 0.3265 2 1 0.0000 0.6870 0.3130 2 1 0.0000 0.7049 0.2951
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 567 90 477 0 0 9 1 80 0 0 473 0 4 0.0000 0.0000 0.0084 9.000 5.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0036 0.9964
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 516 81 435 1 2 27 7 44 0 2 429 1 3 0.0123 0.0000 0.0138 2.038 2.00 5.05 -3.05 1 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6107 0.3893 2 2 0.0000 0.3115 0.6885 2 2 0.0000 0.2169 0.7831
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 605 156 449 72 0 23 0 61 1 0 446 0 2 0.4615 0.0022 0.0067 5.783 1.38 6.92 -5.54 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3898 0.5576 0.0525 1 1 0.3907 0.5524 0.0569 1 1 0.3910 0.5459 0.0630
chr13 112547532 ACGTGCATGGGAAAGT A 0.500000 0.100 1 -15 1 286 99 187 23 2 6 1 67 0 0 186 0 1 0.2323 0.0000 0.0053 15.167 0.57 9.60 -9.03 7 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0002 0.0397 0.9601 1 2 0.0002 0.0452 0.9545 1 2 0.0003 0.0752 0.9244
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 286 102 184 8 1 30 1 62 0 0 182 0 2 0.0784 0.0000 0.0109 2.367 1.88 9.35 -7.48 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 1 0.0000 0.9264 0.0736
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.100 1 4 1 428 108 320 10 0 6 0 92 0 0 317 0 3 0.0926 0.0000 0.0094 17.000 0.20 4.09 -3.89 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027 2 1 0.0000 0.8592 0.1408
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 571 128 443 7 0 3 0 118 0 0 440 0 3 0.0547 0.0000 0.0068 41.667 1.00 3.14 -2.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8036 0.1964 2 2 0.0000 0.2012 0.7988
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 764 189 575 52 0 9 0 128 0 0 572 0 3 0.2751 0.0000 0.0052 20.000 0.29 2.21 -1.92 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0013 0.9987 1 2 0.0000 0.0017 0.9983 1 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 516 138 378 45 1 9 0 83 0 0 378 0 0 0.3261 0.0000 0.0000 14.333 0.07 1.36 -1.29 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0007 0.0962 0.9030 1 2 0.0009 0.1047 0.8944 1 2 0.0014 0.1171 0.8816
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 505 134 371 89 0 3 0 42 0 0 364 0 7 0.6642 0.0000 0.0189 43.667 0.45 19.38 -18.93 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9386 0.0612 0.0003 1 0 0.9324 0.0673 0.0003 1 0 0.9231 0.0764 0.0005
chr14 20197747 C CA 0.001620 0.100 1 1 2 397 93 304 59 0 0 0 34 0 0 303 0 1 0.6344 0.0000 0.0033 93.000 1.64 2.21 -0.56 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8717 0.1283 0.0000 1 0 0.8652 0.1348 0.0000 1 0 0.8559 0.1441 0.0000
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 411 98 313 3 0 7 1 87 0 0 310 0 3 0.0306 0.0000 0.0096 13.000 0.00 1.37 -1.37 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7499 0.2501 2 2 0.0000 0.0988 0.9012 2 2 0.0000 0.0342 0.9658
chr14 21092002 ACCT A 0.000017 0.100 1 -3 2 573 131 442 74 0 3 1 53 1 0 441 0 0 0.5649 0.0023 0.0023 42.667 0.46 3.38 -2.92 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8099 0.1901 0.0000 1 0 0.8048 0.1952 0.0000 1 0 0.7975 0.2025 0.0000
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.100 1 -6 1 671 162 509 6 0 18 0 138 0 0 505 0 4 0.0370 0.0000 0.0079 8.000 0.33 6.30 -5.97 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.6648 0.3352 2 2 0.0000 0.1609 0.8391
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 468 115 353 40 0 9 1 65 0 0 353 0 0 0.3478 0.0000 0.0000 11.778 0.57 4.72 -4.15 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0103 0.3129 0.6768 1 2 0.0123 0.3253 0.6625 1 2 0.0155 0.3421 0.6424
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 426 136 290 71 11 5 47 2 0 0 289 1 0 0.5221 0.0000 0.0034 19.500 0.20 4.00 -3.80 11 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9211 0.0784 0.0005 1 0 0.9120 0.0873 0.0007 1 0 0.8969 0.1021 0.0010
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 427 134 293 74 1 8 49 2 0 0 292 1 0 0.5522 0.0000 0.0034 20.667 0.22 4.00 -3.78 12 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6655 0.3240 0.0105 1 0 0.6538 0.3337 0.0125 1 0 0.6373 0.3472 0.0155
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 329 73 256 26 2 10 2 33 0 0 255 0 1 0.3562 0.0000 0.0039 6.200 3.31 3.91 -0.60 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1220 0.5576 0.3204 1 1 0.1279 0.5548 0.3172 1 1 0.1359 0.5513 0.3127
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 343 70 273 26 4 1 1 38 0 0 273 0 0 0.3714 0.0000 0.0000 68.000 2.81 4.16 -1.35 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0974 0.5415 0.3611 1 1 0.1033 0.5401 0.3566 1 1 0.1113 0.5383 0.3504
chr14 23378766 C CCG 0.001327 0.100 1 2 7 556 144 412 133 1 2 0 8 0 0 412 0 0 0.9236 0.0000 0.0000 71.000 0.44 2.25 -1.81 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0133 0.9867 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 403 123 280 31 4 19 0 69 0 0 278 0 2 0.2520 0.0000 0.0071 5.474 0.29 3.10 -2.81 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0018 0.1477 0.8505 1 2 0.0023 0.1605 0.8372 1 2 0.0033 0.1789 0.8178
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 754 146 608 81 0 16 1 48 0 0 601 0 7 0.5548 0.0000 0.0115 8.600 0.63 6.27 -5.64 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5215 0.4631 0.0154 1 0 0.5083 0.4734 0.0183 1 0 0.4899 0.4873 0.0228
chr14 59464198 G GCA 0.003589 0.100 1 2 1 541 119 422 110 1 0 0 8 0 0 422 0 0 0.9244 0.0000 0.0000 119.000 0.23 2.00 -1.77 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.9340 0.0660 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr14 60125677 C CTAT 0.004717 0.100 1 3 1 276 88 188 50 0 1 0 37 0 0 186 0 2 0.5682 0.0000 0.0106 87.000 0.42 3.14 -2.72 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6566 0.3431 0.0004 1 0 0.6545 0.3451 0.0004 1 0 0.6513 0.3483 0.0004
chr14 69573086 CGCG C 0.132029 0.100 1 -3 2 730 162 568 0 2 35 64 61 0 0 564 1 3 0.0000 0.0000 0.0070 3.600 5.00 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0506 0.9494 2 2 0.0000 0.0296 0.9704 2 2 0.0000 0.0251 0.9749
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 732 171 561 9 6 83 5 68 0 0 559 1 1 0.0526 0.0000 0.0036 1.025 2.78 6.59 -3.81 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9402 0.0598
chr14 74260844 A AGAG 0.000693 0.100 1 3 2 1105 226 879 104 1 15 0 106 0 0 872 0 7 0.4602 0.0000 0.0080 15.071 0.43 3.20 -2.77 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1386 0.8609 0.0004 1 1 0.1523 0.8472 0.0005 1 1 0.1713 0.8282 0.0005
chr14 74778564 AAAG A 0.000206 0.100 1 -3 4 230 88 142 33 1 5 1 48 0 0 142 0 0 0.3750 0.0000 0.0000 16.600 0.55 3.71 -3.16 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1307 0.8688 0.0005 1 1 0.1411 0.8584 0.0005 1 1 0.1555 0.8440 0.0005
chr14 77027304 AGCGGCGGCG A 0.001248 0.100 1 -9 1 476 144 332 120 5 13 0 6 1 0 331 0 0 0.8333 0.0030 0.0030 10.077 2.13 5.33 -3.20 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4477 0.5523 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 505 112 393 0 0 22 2 88 0 0 386 1 6 0.0000 0.0000 0.0178 4.091 8.41 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0109 0.9891 2 2 0.0000 0.0120 0.9880 2 2 0.0000 0.0138 0.9862
chr14 77498757 AGAG A 0.000480 0.100 1 -3 1 197 86 111 43 0 5 0 38 0 0 110 0 1 0.5000 0.0000 0.0090 16.200 0.30 3.18 -2.88 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4984 0.5015 0.0001 1 0 0.5022 0.4977 0.0001 1 0 0.5067 0.4932 0.0001
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 520 158 362 5 0 18 2 133 0 0 362 0 0 0.0316 0.0000 0.0000 7.778 0.20 3.29 -3.09 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9768 0.0232 2 2 0.0000 0.1282 0.8718 2 2 0.0000 0.0209 0.9791
chr14 95436968 TGTA T 0.000176 0.100 1 -3 2 176 54 122 31 0 5 0 18 0 0 122 0 0 0.5741 0.0000 0.0000 9.800 0.48 3.11 -2.63 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7404 0.2596 0.0000 1 0 0.7343 0.2657 0.0000 1 0 0.7258 0.2741 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 261 81 180 0 0 11 0 70 0 0 176 0 4 0.0000 0.0000 0.0222 6.364 8.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0289 0.9711 2 2 0.0000 0.0312 0.9688 2 2 0.0000 0.0345 0.9655
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 435 125 310 0 0 18 1 106 0 0 306 0 4 0.0000 0.0000 0.0129 5.944 4.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0104 0.9896 2 2 0.0000 0.0122 0.9878
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 321 81 240 12 0 6 3 60 0 0 240 0 0 0.1481 0.0000 0.0000 12.500 1.83 4.47 -2.63 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9973 0.0027
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 242 55 187 0 1 1 0 53 0 1 171 10 5 0.0000 0.0000 0.0856 54.000 3.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0317 0.9683 2 2 0.0000 0.0054 0.9946 2 2 0.0000 0.0027 0.9973
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 607 159 448 0 0 0 3 156 0 0 429 1 18 0.0000 0.0000 0.0424 158.000 3.15 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23441523 TCCGCATCTTCTCCTCCTGCTC T 0.005169 0.100 1 -21 1 380 98 282 63 1 6 1 27 3 1 267 1 10 0.6429 0.0106 0.0532 15.333 1.52 17.11 -15.59 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9126 0.0874 0.0000 1 0 0.9067 0.0933 0.0000 1 0 0.8982 0.1017 0.0000
chr15 23646762 AGCCATCGGCTGTGCAGGTGGG A 0.000488 0.100 1 -21 2 1161 283 878 160 0 54 1 68 0 0 862 0 16 0.5654 0.0000 0.0182 4.241 0.90 15.15 -14.25 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9981 0.0019 0.0000 1 0 0.9976 0.0024 0.0000 1 0 0.9969 0.0031 0.0000
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 267 99 168 1 0 8 9 81 0 1 166 0 1 0.0101 0.0000 0.0119 10.250 12.00 1.59 10.41 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2003 0.7997 2 2 0.0000 0.0803 0.9197 2 2 0.0000 0.0597 0.9403
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 769 208 561 2 0 45 6 155 0 0 558 0 3 0.0096 0.0000 0.0053 3.622 0.50 3.43 -2.93 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0093 0.9907 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr15 34038912 CCCGCCGCCGCCT C 0.202105 0.100 1 -12 4 228 89 139 52 0 5 0 32 0 0 136 0 3 0.5843 0.0000 0.0216 16.800 0.29 10.81 -10.52 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7327 0.2609 0.0064 1 0 0.7257 0.2671 0.0072 1 0 0.7160 0.2756 0.0084
chr15 35084193 TCA T 0.022764 0.100 1 -2 2 463 96 367 92 0 1 0 3 0 0 367 0 0 0.9583 0.0000 0.0000 95.000 1.01 3.67 -2.66 56 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8564 0.1436 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr15 38484605 AGGTGGTGGT A 0.136711 0.100 1 -9 2 520 224 296 191 0 28 0 5 0 1 294 0 1 0.8527 0.0000 0.0068 7.000 0.71 9.60 -8.89 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1532 0.8468 0.0000 0 0 0.9936 0.0064 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 473 170 303 143 1 9 0 17 0 0 303 0 0 0.8412 0.0000 0.0000 20.125 1.38 2.06 -0.67 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0394 0.9606 0.0000
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 492 159 333 82 0 12 1 64 1 0 325 0 7 0.5157 0.0030 0.0240 12.250 0.18 4.72 -4.54 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4580 0.5131 0.0289 1 1 0.4604 0.5080 0.0316 1 1 0.4626 0.5019 0.0355
chr15 43872814 C CTATT 0.101358 0.100 1 4 1 227 72 155 40 0 3 0 29 0 0 153 0 2 0.5556 0.0000 0.0129 23.000 0.23 4.31 -4.09 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6006 0.3880 0.0114 1 0 0.5983 0.3896 0.0121 1 0 0.5947 0.3921 0.0132
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 160 69 91 40 0 1 0 28 0 0 90 0 1 0.5797 0.0000 0.0110 68.000 0.28 3.04 -2.76 10 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5015 0.4479 0.0507 1 0 0.4956 0.4500 0.0545 1 0 0.4873 0.4529 0.0598
chr15 72662575 C CAGGAGGAGAGGCTGCGAAAGG 0.000101 0.100 1 21 3 251 33 218 23 2 6 0 2 0 0 217 0 1 0.6970 0.0000 0.0046 4.500 0.09 10.50 -10.41 1 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9782 0.0218 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 277 153 124 11 0 3 0 139 0 1 119 0 4 0.0719 0.0000 0.0403 50.000 1.09 3.47 -2.38 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9928 0.0072 2 1 0.0000 0.5629 0.4371
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 521 131 390 1 0 12 0 118 0 0 385 0 5 0.0076 0.0000 0.0128 9.917 0.00 3.80 -3.80 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0120 0.9880 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr15 78766598 GCGC G 0.019890 0.100 1 -3 3 673 144 529 83 1 9 0 51 0 0 528 1 0 0.5764 0.0000 0.0019 15.000 1.55 5.22 -3.66 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9241 0.0759 0.0000 1 0 0.9188 0.0811 0.0000 1 0 0.9112 0.0888 0.0001
chr15 82830895 ACCACCACCG A 0.000275 0.100 1 -9 2 536 156 380 87 1 3 2 63 0 0 380 0 0 0.5577 0.0000 0.0000 50.667 0.14 8.10 -7.96 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8268 0.1732 0.0000 1 0 0.8221 0.1779 0.0000 1 0 0.8152 0.1848 0.0000
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 464 107 357 59 0 17 0 31 0 0 355 0 2 0.5514 0.0000 0.0056 5.294 0.36 15.81 -15.45 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8708 0.1280 0.0012 1 0 0.8631 0.1355 0.0014 1 0 0.8521 0.1461 0.0018
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 363 141 222 16 0 0 0 125 0 0 218 0 4 0.1135 0.0000 0.0180 141.000 0.06 2.98 -2.91 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9929 0.0071
chr15 88472272 CAG C 0.005890 0.100 1 -2 3 203 83 120 12 0 0 0 71 0 0 120 0 0 0.1446 0.0000 0.0000 83.000 0.83 3.14 -2.31 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 735 195 540 77 2 48 0 68 0 0 539 0 1 0.3949 0.0000 0.0019 3.062 0.99 3.13 -2.15 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5382 0.4538 0.0081 1 0 0.5418 0.4495 0.0088 1 0 0.5456 0.4446 0.0098
chr15 89624859 TCTC T 0.000074 0.100 1 -3 1 555 140 415 78 0 3 0 59 0 0 412 0 3 0.5571 0.0000 0.0072 45.667 1.14 3.81 -2.67 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7108 0.2892 0.0000 1 0 0.7089 0.2911 0.0000 1 0 0.7057 0.2943 0.0000
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 795 207 588 0 1 17 3 186 0 0 588 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.118 7.15 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 377 119 258 0 0 6 0 113 0 0 246 0 12 0.0000 0.0000 0.0465 18.833 7.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 356 134 222 80 0 2 0 52 0 0 222 0 0 0.5970 0.0000 0.0000 66.000 0.14 2.04 -1.90 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7986 0.1980 0.0034 1 0 0.7886 0.2073 0.0041 1 0 0.7742 0.2204 0.0054
chr15 99712504 C CCAGCAG 0.003114 0.100 1 6 2 662 253 409 112 2 51 5 83 0 0 399 1 9 0.4427 0.0000 0.0244 3.941 1.06 8.12 -7.06 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6411 0.3589 0.0001 1 0 0.6447 0.3552 0.0001 1 0 0.6483 0.3516 0.0001
chr15 99712543 G GCCA 0.000092 0.100 1 3 2 663 248 415 121 1 18 2 106 0 0 415 0 0 0.4879 0.0000 0.0000 12.778 0.93 7.27 -6.35 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5649 0.4351 0.0000 1 0 0.5727 0.4273 0.0000 1 0 0.5816 0.4184 0.0000
chr15 101489563 GGCGCCCCCC G 0.028834 0.100 1 -9 2 282 106 176 55 0 30 0 21 0 0 175 0 1 0.5189 0.0000 0.0057 2.533 2.85 9.19 -6.34 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9460 0.0540 0.0000 1 0 0.9408 0.0592 0.0001 1 0 0.9318 0.0681 0.0001
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 52 28 24 20 0 3 0 5 0 0 24 0 0 0.7143 0.0000 0.0000 8.333 0.20 1.20 -1.00 6 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.3608 0.6349 0.0043 0 1 0.2197 0.7779 0.0024 0 1 0.3487 0.6503 0.0010
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 336 91 245 56 0 1 0 34 0 0 245 0 0 0.6154 0.0000 0.0000 90.000 1.04 3.03 -1.99 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7923 0.2031 0.0046 1 0 0.7833 0.2112 0.0054 1 0 0.7707 0.2227 0.0067
chr16 770636 CGGGTGAGGGGGGCTGGGCTCCACCAGGGGAGCCGCCTGGGGGGACG C 0.004222 0.100 1 -46 1 503 119 384 42 2 28 0 47 0 0 381 0 3 0.3529 0.0000 0.0078 3.250 2.33 4.91 -2.58 4 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2563 0.7401 0.0036 1 1 0.2675 0.7289 0.0036 1 1 0.2823 0.7142 0.0035
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 254 70 184 0 0 4 0 66 0 0 175 0 9 0.0000 0.0000 0.0489 16.500 16.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1821 0.8179 2 2 0.0000 0.1939 0.8061 2 2 0.0000 0.2111 0.7889
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 1049 205 844 194 2 3 0 6 0 0 844 0 0 0.9463 0.0000 0.0000 67.333 0.88 1.67 -0.79 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1220 0.8780 0.0000 0 0 0.9913 0.0087 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 331 69 262 0 0 0 2 67 0 0 262 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 69.000 6.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 331 69 262 0 0 0 2 67 0 0 262 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 69.000 6.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 4740302 GC G 0.000174 0.100 1 -1 1 257 76 181 38 0 6 0 32 0 0 181 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 11.667 1.05 1.50 -0.45 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5625 0.4375 0.0000 1 0 0.5632 0.4368 0.0000 1 0 0.5638 0.4362 0.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 424 102 322 68 0 3 0 31 0 0 321 0 1 0.6667 0.0000 0.0031 33.000 0.51 3.68 -3.16 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8927 0.1062 0.0011 1 0 0.8824 0.1161 0.0015 1 0 0.8673 0.1306 0.0021
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 412 144 268 78 0 39 1 26 1 0 259 0 8 0.5417 0.0037 0.0336 2.692 1.53 4.38 -2.86 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9763 0.0236 0.0000 1 0 0.9732 0.0267 0.0000 1 0 0.9685 0.0315 0.0000
chr16 11927872 ATTCTGACCTGTAGGGCCAAAGGAGGGAATGTTTTCACACATAT A 0.011371 0.100 1 -43 2 315 75 240 69 0 2 0 4 0 0 239 0 1 0.9200 0.0000 0.0042 36.500 0.20 43.00 -42.80 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0418 0.9582 0.0000 0 0 0.9301 0.0699 0.0000 0 0 0.9901 0.0099 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 173 63 110 0 0 2 0 61 0 0 108 0 2 0.0000 0.0000 0.0182 30.500 2.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr16 18543716 GA G 0.002566 0.100 1 -1 1 371 168 203 96 4 6 2 60 0 0 203 0 0 0.5714 0.0000 0.0000 27.000 0.05 1.13 -1.08 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9517 0.0483 0.0000 1 0 0.9476 0.0524 0.0000 1 0 0.9415 0.0585 0.0000
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.100 1 -12 1 750 238 512 17 2 11 0 208 0 0 512 0 0 0.0714 0.0000 0.0000 20.545 0.06 9.67 -9.61 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9604 0.0396
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.100 1 -27 1 1045 227 818 93 0 61 3 70 0 0 817 0 1 0.4097 0.0000 0.0012 2.780 0.80 11.53 -10.73 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6671 0.3262 0.0068 1 0 0.6637 0.3285 0.0078 1 0 0.6582 0.3324 0.0094
chr16 29810108 AGCGGCAGCG A 0.002834 0.100 1 -9 1 523 208 315 186 1 10 0 11 0 0 315 0 0 0.8942 0.0000 0.0000 19.800 0.59 6.36 -5.78 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.9705 0.0295 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr16 29901481 G GGGT 0.401873 0.100 1 3 1 726 190 536 172 0 10 0 8 0 0 536 0 0 0.9053 0.0000 0.0000 18.000 0.25 3.12 -2.88 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6156 0.3844 0.0000 0 0 0.9737 0.0263 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 171 84 87 3 0 9 0 72 0 0 86 0 1 0.0357 0.0000 0.0115 8.333 0.67 1.97 -1.31 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9449 0.0551 2 2 0.0000 0.3833 0.6167 2 2 0.0000 0.1640 0.8360
chr16 51141744 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 2 1120 306 814 231 19 45 0 11 0 0 814 0 0 0.7549 0.0000 0.0000 5.800 0.43 3.09 -2.66 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6924 0.3076 0.0000 0 0 0.9939 0.0061 0.0000
chr16 57795086 TGCACTTCGG T 0.500000 0.100 1 -9 1 276 101 175 53 0 8 0 40 0 0 174 0 1 0.5248 0.0000 0.0057 11.625 0.51 7.80 -7.29 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4859 0.4691 0.0450 1 0 0.4813 0.4698 0.0489 1 0 0.4746 0.4710 0.0544
chr16 57813722 ATG A 0.500000 0.100 1 -2 1 323 123 200 65 6 2 1 49 0 0 195 0 5 0.5285 0.0000 0.0250 57.500 0.17 8.98 -8.81 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5147 0.4551 0.0302 1 0 0.5108 0.4558 0.0334 1 0 0.5047 0.4571 0.0381
chr16 57813725 CAGGTGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 323 121 202 71 0 0 1 49 0 0 197 0 5 0.5868 0.0000 0.0248 121.000 0.25 8.80 -8.54 43 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5557 0.4211 0.0232 1 0 0.5506 0.4234 0.0260 1 0 0.5430 0.4269 0.0301
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 400 74 326 37 11 3 3 20 0 0 325 0 1 0.5000 0.0000 0.0031 23.333 1.14 1.75 -0.61 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7609 0.2302 0.0089 1 0 0.7489 0.2407 0.0104 1 0 0.7320 0.2552 0.0128
chr16 60358911 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 1034 229 805 133 0 9 1 86 3 5 791 2 4 0.5808 0.0037 0.0174 24.444 0.35 1.26 -0.91 59 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9471 0.0528 0.0001 1 0 0.9420 0.0579 0.0001 1 0 0.9344 0.0655 0.0002
chr16 67195890 A ACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 9 2 559 232 327 176 1 52 0 3 1 0 325 0 1 0.7586 0.0031 0.0061 3.462 1.36 3.33 -1.97 24 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5472 0.4528 0.0000 0 0 0.9904 0.0096 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr16 67195890 ACAGCAGCAG A 0.500000 0.100 1 -9 2 559 254 305 188 9 43 6 8 0 0 305 0 0 0.7402 0.0000 0.0000 4.767 0.89 9.50 -8.61 34 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3768 0.6232 0.0000 0 0 0.9568 0.0432 0.0000
chr16 67652328 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 628 168 460 154 0 7 0 7 0 0 460 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 23.000 0.40 3.00 -2.60 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 0 0.5594 0.4406 0.0000 0 0 0.9517 0.0483 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 960 274 686 186 3 40 7 38 0 0 685 1 0 0.6788 0.0000 0.0015 5.850 0.39 3.61 -3.21 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0010 0.9990 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr16 72787713 GCCGCCA G 0.500000 0.100 1 -6 2 673 140 533 74 4 9 8 45 0 0 533 0 0 0.5286 0.0000 0.0000 14.000 0.91 6.98 -6.07 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7548 0.2397 0.0054 1 0 0.7452 0.2483 0.0065 1 0 0.7315 0.2603 0.0082
chr16 72797458 C CTTG 0.500000 0.100 1 3 1 778 192 586 81 7 38 2 64 0 1 581 0 4 0.4219 0.0000 0.0085 4.026 0.38 3.72 -3.34 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5871 0.3986 0.0143 1 0 0.5827 0.4008 0.0164 1 0 0.5760 0.4044 0.0196
chr16 72797458 C CTTGTTG 0.500000 0.100 1 6 1 778 192 586 87 3 88 2 12 0 1 582 2 1 0.4531 0.0000 0.0068 1.149 0.64 6.33 -5.69 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0096 0.9904 0.0000
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 264 132 132 120 0 1 0 11 0 0 130 0 2 0.9091 0.0000 0.0152 131.000 0.57 4.18 -3.62 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0745 0.9255 0.0000
chr16 85656376 GGAGCGCGAGCGC G 0.500000 0.100 1 -12 3 548 140 408 117 1 15 0 7 0 0 408 0 0 0.8357 0.0000 0.0000 8.333 1.55 10.43 -8.88 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1740 0.8260 0.0000 0 0 0.7745 0.2255 0.0000
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 441 117 324 28 9 31 2 47 0 0 319 1 4 0.2393 0.0000 0.0154 2.867 0.14 5.11 -4.96 6 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0212 0.3577 0.6211 1 2 0.0238 0.3640 0.6122 1 2 0.0277 0.3725 0.5998
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 441 117 324 36 1 38 0 42 0 0 319 0 5 0.3077 0.0000 0.0154 2.079 0.83 5.50 -4.67 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0590 0.4917 0.4492 1 1 0.0633 0.4914 0.4453 1 1 0.0693 0.4911 0.4396
chr16 87604287 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 441 123 318 78 6 29 0 10 0 0 318 0 0 0.6341 0.0000 0.0000 3.357 3.00 2.80 0.20 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.0888 0.9112 0.0000
chr16 88431998 ATGC A 0.500000 0.100 1 -3 1 905 184 721 164 1 8 0 11 0 0 721 0 0 0.8913 0.0000 0.0000 22.000 0.81 3.55 -2.73 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0301 0.9699 0.0000 0 0 0.7202 0.2798 0.0000
chr16 88528131 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 331 121 210 69 0 2 0 50 0 0 208 0 2 0.5702 0.0000 0.0095 59.500 0.20 2.90 -2.70 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5863 0.3936 0.0202 1 0 0.5800 0.3973 0.0227 1 0 0.5708 0.4027 0.0265
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 685 133 552 0 0 3 8 122 0 0 545 1 6 0.0000 0.0000 0.0127 43.000 7.45 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 685 127 558 0 0 6 13 108 0 0 550 4 4 0.0000 0.0000 0.0143 24.000 7.69 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 686 127 559 0 0 3 2 122 0 0 545 6 8 0.0000 0.0000 0.0250 124.000 7.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 814 177 637 94 0 4 0 79 0 0 635 0 2 0.5311 0.0000 0.0031 43.250 1.24 6.85 -5.60 58 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4207 0.5473 0.0320 1 1 0.4228 0.5417 0.0355 1 1 0.4244 0.5350 0.0406
chr16 88714227 G GGTGT 0.500000 0.100 1 4 1 809 174 635 144 1 8 0 21 0 0 635 0 0 0.8276 0.0000 0.0000 23.714 3.52 5.29 -1.76 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 621 157 464 94 1 6 0 56 0 0 463 0 1 0.5987 0.0000 0.0022 25.167 0.96 3.16 -2.20 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9106 0.0889 0.0005 1 0 0.9030 0.0964 0.0006 1 0 0.8917 0.1074 0.0009
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 916 255 661 185 7 40 0 23 0 0 661 0 0 0.7255 0.0000 0.0000 5.250 0.60 3.52 -2.92 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0042 0.9958 0.0000
chr16 88940199 G GGGGT 0.500000 0.100 1 4 1 250 103 147 66 0 3 0 34 0 0 144 0 3 0.6408 0.0000 0.0204 33.333 0.35 4.03 -3.68 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8402 0.1572 0.0027 1 0 0.8297 0.1670 0.0033 1 0 0.8148 0.1809 0.0043
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 180 86 94 43 0 1 0 42 0 0 94 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 85.000 0.44 3.67 -3.22 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2189 0.6016 0.1795 1 1 0.2223 0.5941 0.1837 1 1 0.2264 0.5846 0.1890
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.100 1 -3 1 900 222 678 112 0 12 0 98 0 0 676 0 2 0.5045 0.0000 0.0029 17.500 0.35 3.28 -2.93 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4674 0.5199 0.0126 1 1 0.4748 0.5111 0.0141 1 1 0.4832 0.5006 0.0162
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 830 159 671 82 0 7 0 70 0 0 668 0 3 0.5157 0.0000 0.0045 21.714 0.16 4.14 -3.98 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5308 0.4685 0.0006 1 0 0.5366 0.4628 0.0007 1 0 0.5432 0.4560 0.0008
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 735 198 537 91 6 30 2 69 0 1 535 0 1 0.4596 0.0000 0.0037 5.567 0.15 3.09 -2.93 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6559 0.3366 0.0074 1 0 0.6469 0.3442 0.0089 1 0 0.6337 0.3550 0.0113
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.100 1 9 2 1558 462 1096 10 20 139 13 280 0 1 1061 1 33 0.0216 0.0000 0.0319 2.375 3.20 6.71 -3.51 2 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018
chr17 15503228 C CCT 0.500000 0.100 1 2 2 241 28 213 17 0 0 0 11 0 0 213 0 0 0.6071 0.0000 0.0000 28.000 0.88 3.64 -2.75 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3891 0.4925 0.1184 1 1 0.3845 0.4929 0.1226 1 1 0.3784 0.4935 0.1281
chr17 15974795 CCAA C 0.500000 0.100 1 -3 1 627 180 447 91 0 9 0 80 0 0 447 0 0 0.5056 0.0000 0.0000 19.000 0.12 3.01 -2.89 53 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3748 0.5828 0.0423 1 1 0.3781 0.5755 0.0465 1 1 0.3813 0.5664 0.0524
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 561 237 324 92 1 45 4 95 0 0 322 1 1 0.3882 0.0000 0.0062 4.267 0.28 3.20 -2.92 46 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0575 0.6596 0.2829 1 1 0.0626 0.6479 0.2896 1 1 0.0697 0.6330 0.2974
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1108 292 816 163 1 10 99 19 0 0 815 1 0 0.5582 0.0000 0.0012 23.875 0.54 8.11 -7.57 47 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9966 0.0034 0.0000 1 0 0.9959 0.0041 0.0000 1 0 0.9946 0.0054 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 1106 280 826 152 6 103 10 9 0 0 826 0 0 0.5429 0.0000 0.0000 1.871 0.57 4.44 -3.87 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0986 0.9014 0.0000
chr17 18778544 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 544 172 372 163 3 1 0 5 0 0 372 0 0 0.9477 0.0000 0.0000 171.000 0.23 1.20 -0.97 93 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0670 0.9330 0.0000 0 0 0.9511 0.0489 0.0000 0 0 0.9922 0.0078 0.0000
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 810 169 641 15 0 4 0 150 0 0 636 2 3 0.0888 0.0000 0.0078 41.250 0.27 3.88 -3.61 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8915 0.1085
chr17 29761226 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 147 71 76 69 0 0 0 2 0 0 76 0 0 0.9718 0.0000 0.0000 71.000 0.33 1.00 -0.67 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2867 0.7133 0.0000 0 0 0.7891 0.2109 0.0000 0 0 0.8875 0.1125 0.0000
chr17 35193772 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 1733 369 1364 338 1 8 0 22 0 0 1364 0 0 0.9160 0.0000 0.0000 45.000 0.28 1.09 -0.81 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.9113 0.0887 0.0000
chr17 40818878 A AGCT 0.500000 0.100 1 3 2 1029 267 762 112 11 32 1 111 0 0 759 0 3 0.4195 0.0000 0.0039 7.800 1.83 3.69 -1.86 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2423 0.7071 0.0506 1 1 0.2515 0.6927 0.0558 1 1 0.2626 0.6742 0.0631
chr17 40818962 T TGCCGCCGTGGCCGCCGCTGGAGCTTCC 0.500000 0.100 1 27 1 1001 232 769 98 5 51 0 78 0 1 755 0 13 0.4224 0.0000 0.0182 3.510 2.03 9.64 -7.61 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3818 0.5848 0.0334 1 1 0.3861 0.5768 0.0371 1 1 0.3905 0.5670 0.0425
chr17 40835263 CTGTT C 0.500000 0.100 1 -4 4 483 121 362 107 0 9 0 5 0 0 362 0 0 0.8843 0.0000 0.0000 12.444 0.60 3.20 -2.60 61 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 0 0.5051 0.4949 0.0000 0 0 0.8790 0.1210 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 597 160 437 0 0 6 0 154 0 0 434 0 3 0.0000 0.0000 0.0069 25.667 1.34 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 770 153 617 0 0 22 2 129 0 0 581 2 34 0.0000 0.0000 0.0583 5.909 8.50 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr17 41567480 C CCCACTTCCTCCACTATGACCACCT 0.500000 0.100 1 24 5 783 216 567 155 1 49 3 8 0 0 561 0 6 0.7176 0.0000 0.0106 3.347 0.73 8.88 -8.15 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1091 0.8909 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1876 394 1482 231 0 6 0 157 0 0 1477 0 5 0.5863 0.0000 0.0034 64.667 0.55 3.24 -2.69 77 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9855 0.0145 0.0000 1 0 0.9837 0.0163 0.0000 1 0 0.9808 0.0192 0.0000
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 691 196 495 11 1 23 4 157 0 0 488 1 6 0.0561 0.0000 0.0141 7.522 0.91 3.45 -2.54 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9816 0.0184 2 2 0.0000 0.3483 0.6517
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 214 67 147 2 0 3 0 62 0 0 147 0 0 0.0299 0.0000 0.0000 21.333 0.50 3.95 -3.45 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7833 0.2167 2 2 0.0000 0.2755 0.7245 2 2 0.0000 0.1512 0.8488
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 1018 262 756 13 0 7 1 241 0 0 750 0 6 0.0496 0.0000 0.0079 36.429 0.15 3.01 -2.86 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8108 0.1892 2 2 0.0000 0.0244 0.9756
chr17 50699859 G GTCA 0.500000 0.100 1 3 2 490 110 380 80 3 24 0 3 0 0 380 0 0 0.7273 0.0000 0.0000 3.583 0.31 4.00 -3.69 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0806 0.9194 0.0000 0 0 0.7214 0.2786 0.0000 0 0 0.8911 0.1089 0.0000
chr17 57106431 GGCTTGGATAGAAATGAGGAGA G 0.500000 0.100 1 -21 3 995 219 776 108 2 36 4 69 0 0 775 1 0 0.4932 0.0000 0.0013 5.000 1.13 7.03 -5.90 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8823 0.1170 0.0006 1 0 0.8745 0.1246 0.0008 1 0 0.8631 0.1357 0.0012
chr17 57979225 A ATGT 0.500000 0.100 1 3 1 534 254 280 123 10 31 1 89 0 1 275 0 4 0.4843 0.0000 0.0179 8.222 2.67 2.49 0.17 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9048 0.0950 0.0003 1 0 0.8983 0.1014 0.0004 1 0 0.8886 0.1108 0.0005
chr17 57979243 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 534 276 258 88 10 69 6 103 0 0 258 0 0 0.3188 0.0000 0.0000 2.942 2.30 3.11 -0.81 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0324 0.5971 0.3705 1 1 0.0361 0.5883 0.3756 1 1 0.0415 0.5774 0.3812
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 446 154 292 61 2 34 2 55 0 0 292 0 0 0.3961 0.0000 0.0000 3.500 0.44 5.65 -5.21 17 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3090 0.6007 0.0903 1 1 0.3115 0.5931 0.0954 1 1 0.3141 0.5835 0.1025
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 395 140 255 114 0 17 0 9 0 0 255 0 0 0.8143 0.0000 0.0000 7.235 0.42 7.56 -7.13 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0201 0.9799 0.0000 0 1 0.4393 0.5607 0.0000
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 310 71 239 4 0 10 0 57 0 0 235 0 4 0.0563 0.0000 0.0167 6.100 0.25 7.79 -7.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9969 0.0031 2 1 0.0000 0.7707 0.2293 2 2 0.0000 0.4031 0.5969
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.100 1 -2 3 362 94 268 3 0 1 0 90 0 0 266 0 2 0.0319 0.0000 0.0075 93.000 0.00 2.29 -2.29 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8783 0.1217 2 2 0.0000 0.1976 0.8024 2 2 0.0000 0.0732 0.9268
chr17 74215706 GT G 0.500000 0.100 1 -1 1 134 54 80 21 0 4 0 29 0 0 79 0 1 0.3889 0.0000 0.0125 12.500 0.43 1.07 -0.64 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0756 0.4740 0.4504 1 1 0.0800 0.4753 0.4446 1 1 0.0861 0.4771 0.4368
chr17 74367718 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 311 97 214 91 0 1 0 5 0 0 214 0 0 0.9381 0.0000 0.0000 96.000 0.29 1.20 -0.91 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.3162 0.6838 0.0000 0 0 0.7701 0.2299 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 586 102 484 1 0 10 0 91 0 0 466 0 18 0.0098 0.0000 0.0372 9.200 0.00 7.67 -7.67 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0344 0.9656 2 2 0.0000 0.0124 0.9876 2 2 0.0000 0.0095 0.9905
chr17 75516562 T TGGAGCC 0.500000 0.100 1 6 1 547 118 429 63 0 4 1 50 0 0 428 0 1 0.5339 0.0000 0.0023 28.500 0.51 6.34 -5.83 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4359 0.5149 0.0492 1 1 0.4341 0.5125 0.0533 1 1 0.4310 0.5098 0.0592
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 2 316 111 205 100 0 1 0 10 0 0 204 0 1 0.9009 0.0000 0.0049 110.000 0.16 2.00 -1.84 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.0991 0.9009 0.0000
chr17 75616380 C CAGG 0.500000 0.100 1 3 1 829 194 635 120 12 53 0 9 0 0 633 0 2 0.6186 0.0000 0.0031 2.642 1.22 3.44 -2.23 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0059 0.9941 0.0000 0 1 0.3389 0.6611 0.0000
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2456 558 1898 262 6 67 10 213 2 3 1887 1 5 0.4695 0.0011 0.0058 7.269 1.48 7.70 -6.21 54 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7833 0.2165 0.0001 1 0 0.7857 0.2141 0.0002 1 0 0.7869 0.2128 0.0002
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2381 628 1753 299 9 27 10 283 2 1 1577 23 150 0.4761 0.0011 0.1004 23.840 1.57 4.51 -2.94 59 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr17 79834441 C CGTG 0.500000 0.100 1 3 2 1371 374 997 169 13 53 0 139 1 0 990 0 6 0.4519 0.0010 0.0070 6.057 0.52 3.24 -2.72 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8116 0.1880 0.0004 1 0 0.8078 0.1916 0.0006 1 0 0.8015 0.1976 0.0008
chr17 81120444 GTCCTCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 760 133 627 58 0 12 1 62 0 0 625 0 2 0.4361 0.0000 0.0032 10.083 1.12 6.40 -5.28 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0835 0.5967 0.3198 1 1 0.0886 0.5893 0.3221 1 1 0.0956 0.5800 0.3245
chr17 81869441 G GCAGCCCTGCGCGAAGCCC 0.500000 0.100 1 18 1 767 159 608 69 0 31 0 59 0 0 595 0 13 0.4340 0.0000 0.0214 4.129 0.39 11.56 -11.17 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1221 0.6566 0.2213 1 1 0.1279 0.6454 0.2267 1 1 0.1357 0.6311 0.2332
chr18 47418 T TC 0.000370 0.100 1 1 2 609 111 498 62 0 1 1 47 0 1 497 0 0 0.5586 0.0000 0.0020 110.000 0.85 1.06 -0.21 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7168 0.2832 0.0000 1 0 0.7135 0.2864 0.0000 1 0 0.7087 0.2912 0.0000
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.100 1 6 4 475 100 375 44 1 6 1 48 0 0 375 0 0 0.4400 0.0000 0.0000 15.667 0.98 6.31 -5.34 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2416 0.6671 0.0913 1 1 0.2505 0.6577 0.0918 1 1 0.2621 0.6456 0.0923
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 180 81 99 0 0 2 0 79 0 0 98 0 1 0.0000 0.0000 0.0101 39.500 3.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 373 87 286 46 0 5 0 36 0 0 281 0 5 0.5287 0.0000 0.0175 16.400 0.91 9.00 -8.09 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4351 0.5197 0.0452 1 1 0.4373 0.5155 0.0472 1 1 0.4397 0.5104 0.0499
chr18 45730325 AGGACAGCCCCACTATGGTTAGAGT A 0.000176 0.100 1 -24 2 562 176 386 150 0 19 0 7 0 0 386 0 0 0.8523 0.0000 0.0000 8.263 0.13 14.00 -13.87 16 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6751 0.3249 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 164 74 90 14 0 0 0 60 0 0 88 0 2 0.1892 0.0000 0.0222 74.000 0.07 3.38 -3.31 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9860 0.0140 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9974 0.0026
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 275 150 125 0 0 11 0 139 0 0 125 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 12.636 3.12 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0008 0.9992 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 443 91 352 5 0 9 6 71 0 0 347 3 2 0.0549 0.0000 0.0142 9.111 2.80 5.72 -2.92 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.7752 0.2248 2 2 0.0000 0.3190 0.6810
chr18 62979014 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 3 657 150 507 88 0 8 0 54 0 0 507 0 0 0.5867 0.0000 0.0000 17.750 0.34 2.93 -2.59 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8778 0.1211 0.0010 1 0 0.8690 0.1296 0.0013 1 0 0.8563 0.1419 0.0019
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 152 57 95 4 0 3 0 50 0 0 92 0 3 0.0702 0.0000 0.0316 18.000 0.00 3.82 -3.82 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9980 0.0020 2 1 0.0000 0.8336 0.1664 2 2 0.0000 0.4989 0.5011
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 165 84 81 76 0 5 0 3 0 0 81 0 0 0.9048 0.0000 0.0000 15.800 0.18 3.00 -2.82 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0578 0.9422 0.0000 0 0 0.6461 0.3539 0.0000 0 0 0.8535 0.1465 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 159 52 107 29 0 0 0 23 0 0 107 0 0 0.5577 0.0000 0.0000 52.000 1.10 4.22 -3.11 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4950 0.4593 0.0457 1 0 0.4931 0.4592 0.0476 1 0 0.4903 0.4593 0.0503
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 252 142 110 81 0 3 0 58 0 0 109 0 1 0.5704 0.0000 0.0091 46.333 0.07 3.12 -3.05 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7737 0.2235 0.0028 1 0 0.7676 0.2290 0.0033 1 0 0.7589 0.2370 0.0041
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 372 127 245 0 1 14 64 48 0 0 238 4 3 0.0000 0.0000 0.0286 8.000 3.42 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0037 0.9963
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 372 134 238 2 2 60 0 70 0 0 234 0 4 0.0149 0.0000 0.0168 1.327 1.00 6.60 -5.60 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9591 0.0409 2 1 0.0000 0.6949 0.3051 2 2 0.0000 0.4946 0.5054
chr19 2015541 GGGCGGCGGC G 0.046318 0.100 1 -9 4 372 140 232 50 14 10 51 15 0 0 230 0 2 0.3571 0.0000 0.0086 12.500 2.76 8.53 -5.77 10 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2192 0.7488 0.0320 1 1 0.2311 0.7366 0.0323 1 1 0.2469 0.7205 0.0326
chr19 2917765 CAT C 0.000052 0.100 1 -2 2 949 196 753 177 2 1 0 16 1 0 752 0 0 0.9031 0.0013 0.0013 195.000 0.75 3.06 -2.31 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8601 0.1399 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 3539216 C CCCCTCGGGGA 0.001517 0.100 1 10 1 122 55 67 50 0 3 0 2 0 0 67 0 0 0.9091 0.0000 0.0000 17.333 0.10 14.00 -13.90 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9900 0.0100 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr19 4817276 A AAGG 0.143545 0.100 1 3 1 852 167 685 122 5 32 0 8 0 1 684 0 0 0.7305 0.0000 0.0015 4.219 0.18 3.00 -2.82 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4158 0.5842 0.0000 0 0 0.9459 0.0541 0.0000
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 461 123 338 117 0 1 0 5 3 0 334 0 1 0.9512 0.0089 0.0118 122.000 0.46 3.60 -3.14 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0054 0.9946 0.0000 0 0 0.8336 0.1664 0.0000 0 0 0.9816 0.0184 0.0000
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 497 151 346 74 0 13 1 63 0 0 345 0 1 0.4901 0.0000 0.0029 11.500 0.47 11.22 -10.75 22 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4390 0.5275 0.0335 1 1 0.4424 0.5216 0.0360 1 1 0.4460 0.5144 0.0396
chr19 8490988 TCTC T 0.003548 0.100 1 -3 2 583 148 435 92 0 1 0 55 0 0 434 0 1 0.6216 0.0000 0.0023 147.000 0.58 3.18 -2.61 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9447 0.0553 0.0000 1 0 0.9402 0.0598 0.0000 1 0 0.9336 0.0664 0.0000
chr19 8971789 GGTGTGAAGGTTAACGTCT G 0.002451 0.100 1 -18 1 450 122 328 113 0 4 0 5 0 0 326 0 2 0.9262 0.0000 0.0061 29.500 0.12 20.00 -19.88 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0221 0.9779 0.0000 0 0 0.9852 0.0148 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr19 8979162 A AGCC 0.002510 0.100 1 3 1 664 155 509 136 0 6 0 13 0 0 509 0 0 0.8774 0.0000 0.0000 24.833 0.26 3.15 -2.90 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2567 0.7433 0.0000 0 0 0.9858 0.0142 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 301 70 231 36 0 5 0 29 0 0 229 0 2 0.5143 0.0000 0.0087 13.000 0.44 5.79 -5.35 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4135 0.5144 0.0721 1 1 0.4136 0.5115 0.0749 1 1 0.4133 0.5080 0.0788
chr19 11447525 A AGAG 0.036742 0.100 1 3 1 946 331 615 17 242 55 0 17 0 6 607 0 2 0.0514 0.0000 0.0130 4.964 1.59 3.29 -1.71 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0239 0.9761 0.0000 0 0 0.9807 0.0193 0.0000
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 946 336 610 33 3 52 18 230 0 0 604 2 4 0.0982 0.0000 0.0098 5.462 2.21 3.30 -1.09 11 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 457 149 308 0 0 18 1 130 0 0 305 0 3 0.0000 0.0000 0.0097 7.278 6.44 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr19 13877367 T TGGAGCCGGTGTCAGCGCC 0.004594 0.100 1 18 1 370 99 271 81 1 12 0 5 0 0 271 0 0 0.8182 0.0000 0.0000 7.167 0.31 11.80 -11.49 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1734 0.8266 0.0000 0 0 0.9844 0.0156 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr19 14583363 T TGGA 0.065477 0.100 1 3 1 329 120 209 49 2 18 2 49 0 0 208 0 1 0.4083 0.0000 0.0048 5.667 0.63 3.12 -2.49 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3298 0.6423 0.0279 1 1 0.3388 0.6328 0.0285 1 1 0.3503 0.6206 0.0291
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 653 130 523 0 0 6 0 124 0 0 518 0 5 0.0000 0.0000 0.0096 20.667 3.77 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 17286647 GGTGTGT G 0.003296 0.100 1 -6 4 464 109 355 12 11 47 7 32 0 0 349 2 4 0.1101 0.0000 0.0169 1.341 2.25 6.28 -4.03 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0759 0.9055 0.0186 1 1 0.0839 0.8987 0.0174 1 1 0.0955 0.8886 0.0159
chr19 17286688 GTGTT G 0.166715 0.100 1 -4 1 458 100 358 12 3 22 21 42 0 0 358 0 0 0.1200 0.0000 0.0000 7.500 0.58 3.10 -2.51 10 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9292 0.0707 2 1 0.0000 0.9944 0.0056 2 1 0.0000 0.9988 0.0012
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 151 63 88 30 2 4 0 27 0 0 86 0 2 0.4762 0.0000 0.0227 14.500 0.53 4.63 -4.10 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4095 0.5285 0.0620 1 1 0.4115 0.5248 0.0637 1 1 0.4138 0.5203 0.0658
chr19 21116968 TATA T 0.500000 0.100 1 -3 2 327 120 207 113 0 1 0 6 0 0 207 0 0 0.9417 0.0000 0.0000 119.000 0.12 3.17 -3.04 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.3220 0.6780 0.0000 0 0 0.8365 0.1635 0.0000
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 335 94 241 41 0 14 1 38 0 0 239 0 2 0.4362 0.0000 0.0083 5.714 0.17 2.76 -2.59 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0668 0.5992 0.3340 1 1 0.0680 0.5919 0.3401 1 1 0.0696 0.5826 0.3478
chr19 33379692 GACCTC G 0.005617 0.100 1 -5 1 541 119 422 57 0 6 0 56 0 0 421 0 1 0.4790 0.0000 0.0024 18.833 0.14 4.88 -4.73 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3617 0.6362 0.0020 1 1 0.3715 0.6264 0.0021 1 1 0.3840 0.6139 0.0022
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 579 143 436 57 0 3 0 83 0 0 433 0 3 0.3986 0.0000 0.0069 46.667 0.37 3.14 -2.78 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0010 0.1339 0.8651 1 2 0.0012 0.1407 0.8581 1 2 0.0016 0.1505 0.8479
chr19 37886681 TTTC T 0.000877 0.100 1 -3 5 549 84 465 39 2 6 1 36 0 0 465 0 0 0.4643 0.0000 0.0000 12.833 0.74 4.81 -4.06 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5085 0.4913 0.0002 1 0 0.5116 0.4882 0.0002 1 0 0.5154 0.4844 0.0002
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 416 138 278 61 0 1 4 72 0 0 270 2 6 0.4420 0.0000 0.0288 135.000 0.23 2.83 -2.60 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0153 0.4119 0.5728 1 2 0.0179 0.4186 0.5635 1 2 0.0219 0.4278 0.5502
chr19 39605304 GT G 0.000529 0.100 1 -1 1 321 141 180 135 0 3 0 3 0 0 180 0 0 0.9574 0.0000 0.0000 46.000 0.21 1.00 -0.79 39 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 248 44 204 0 0 1 40 3 0 0 204 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 38.000 8.33 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0327 0.9673 2 2 0.0000 0.0341 0.9659 2 2 0.0000 0.0361 0.9639
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 247 42 205 0 0 27 14 1 0 0 204 1 0 0.0000 0.0000 0.0049 0.550 12.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0835 0.9165 2 2 0.0000 0.0855 0.9145 2 2 0.0000 0.0882 0.9118
chr19 40394272 TTCCTCC T 0.000481 0.100 1 -6 1 642 170 472 127 3 36 0 4 0 0 472 0 0 0.7471 0.0000 0.0000 3.722 0.58 6.00 -5.42 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9957 0.0043 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 440 123 317 0 1 8 1 113 0 0 317 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 14.375 5.83 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0111 0.9889 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0058 0.9942
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 493 163 330 13 0 3 1 146 0 0 327 0 3 0.0798 0.0000 0.0091 53.333 0.15 1.88 -1.72 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9200 0.0800
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.100 1 -1 1 526 107 419 14 0 0 0 93 0 0 419 0 0 0.1308 0.0000 0.0000 107.000 0.86 2.78 -1.93 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr19 43798947 T TCCAG 0.000019 0.100 1 4 2 360 112 248 98 0 8 0 6 0 0 248 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 13.000 1.42 4.00 -2.58 46 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9268 0.0732 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 323 104 219 63 0 1 0 40 0 0 213 0 6 0.6058 0.0000 0.0274 103.000 0.51 6.78 -6.27 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6384 0.3460 0.0156 1 0 0.6315 0.3508 0.0176 1 0 0.6217 0.3577 0.0206
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 558 165 393 96 0 3 0 66 0 0 391 0 2 0.5818 0.0000 0.0051 54.000 0.20 3.12 -2.92 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7211 0.2740 0.0048 1 0 0.7111 0.2830 0.0059 1 0 0.6965 0.2958 0.0077
chr19 44273995 TCACACTGGAGAGAAACCATATAAATGTGAGGTATGTGATAAGGGCTTCAGTAAGGCCTCAAATCTTCAAGCCCATCAGAGAATC T 0.002701 0.100 1 -84 2 688 216 472 194 1 17 1 3 0 0 465 0 7 0.8981 0.0000 0.0148 11.647 0.52 3.33 -2.82 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.9914 0.0086 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 471 138 333 62 0 1 1 74 0 0 332 0 1 0.4493 0.0000 0.0030 137.000 0.32 2.85 -2.53 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0763 0.7095 0.2142 1 1 0.0841 0.7039 0.2120 1 1 0.0952 0.6964 0.2083
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 298 123 175 69 0 4 0 50 0 0 174 0 1 0.5610 0.0000 0.0057 29.750 0.33 2.02 -1.69 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7655 0.2342 0.0003 1 0 0.7611 0.2386 0.0003 1 0 0.7546 0.2450 0.0004
chr19 45409231 CAAG C 0.234924 0.100 1 -3 2 574 107 467 75 0 19 4 9 0 0 466 0 1 0.7009 0.0000 0.0021 4.632 0.89 4.33 -3.44 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0159 0.9841 0.0000
chr19 46493759 C CCGGCCT 0.138319 0.100 1 6 4 383 79 304 40 1 11 1 26 0 0 302 0 2 0.5063 0.0000 0.0066 6.182 1.90 7.38 -5.48 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6610 0.3291 0.0098 1 0 0.6560 0.3333 0.0107 1 0 0.6490 0.3390 0.0119
chr19 47271408 TGAG T 0.114402 0.100 1 -3 1 455 107 348 96 2 5 0 4 0 0 348 0 0 0.8972 0.0000 0.0000 20.400 0.90 4.75 -3.85 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1359 0.8641 0.0000 0 0 0.9359 0.0641 0.0000 0 0 0.9857 0.0143 0.0000
chr19 47379900 T TGGA 0.000410 0.100 1 3 1 262 91 171 79 3 7 0 2 0 0 171 0 0 0.8681 0.0000 0.0000 12.000 0.22 3.00 -2.78 23 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9995 0.0005 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 47802295 ATCGGGCCTGGGT A 0.001408 0.100 1 -12 3 1524 391 1133 205 19 38 12 117 2 2 1110 9 10 0.5243 0.0018 0.0203 9.600 5.68 11.41 -5.73 47 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9976 0.0024 0.0000 1 0 0.9972 0.0028 0.0000 1 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr19 47802317 A AGATTGGGCCTGG 0.000181 0.100 1 12 1 1504 378 1126 103 22 92 10 151 1 0 1115 5 5 0.2725 0.0009 0.0098 3.456 9.03 8.36 0.66 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0047 0.9931 0.0022 1 1 0.0060 0.9918 0.0021 1 1 0.0084 0.9896 0.0020
chr19 48703766 AC A 0.000439 0.100 1 -1 1 674 171 503 153 0 4 0 14 0 0 503 0 0 0.8947 0.0000 0.0000 41.750 0.55 1.14 -0.59 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.6193 0.3807 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr19 49070105 TGGA T 0.101017 0.100 1 -3 1 410 115 295 52 0 1 0 62 0 0 295 0 0 0.4522 0.0000 0.0000 114.000 0.77 3.87 -3.10 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1417 0.7427 0.1156 1 1 0.1517 0.7337 0.1146 1 1 0.1655 0.7215 0.1130
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 1042 254 788 8 4 48 174 20 0 0 779 8 1 0.0315 0.0000 0.0114 4.744 1.50 4.15 -2.65 0 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9251 0.0749 2 2 0.0000 0.1415 0.8585
chr19 49423273 C CCAG 0.003387 0.100 1 3 1 354 138 216 58 2 13 0 65 0 1 214 0 1 0.4203 0.0000 0.0093 9.615 0.24 3.22 -2.97 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2441 0.7536 0.0023 1 1 0.2566 0.7411 0.0023 1 1 0.2730 0.7246 0.0023
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 550 142 408 104 2 20 0 16 0 0 407 1 0 0.7324 0.0000 0.0025 6.100 1.52 8.81 -7.29 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0055 0.9945 0.0000
chr19 49746675 TCTGCTTCTCCTCCGGCTC T 0.095886 0.100 1 -18 2 670 252 418 100 0 65 1 86 0 0 415 2 1 0.3968 0.0000 0.0072 2.877 0.57 11.78 -11.21 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4889 0.5041 0.0070 1 0 0.4964 0.4959 0.0077 1 0 0.5052 0.4861 0.0087
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 707 153 554 4 1 7 89 52 0 0 552 1 1 0.0261 0.0000 0.0036 28.400 0.00 3.58 -3.58 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.8668 0.1332 2 2 0.0000 0.0667 0.9333 2 2 0.0000 0.0152 0.9848
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 705 155 550 0 0 8 50 97 0 0 549 0 1 0.0000 0.0000 0.0018 18.375 3.70 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr19 51354620 C CCCACAG 0.012921 0.100 1 6 2 614 139 475 116 0 14 0 9 0 0 474 0 1 0.8345 0.0000 0.0021 8.929 0.23 5.33 -5.10 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3738 0.6262 0.0000 0 0 0.9720 0.0280 0.0000
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 588 160 428 0 0 9 9 142 0 0 420 1 7 0.0000 0.0000 0.0187 16.778 2.80 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 671 193 478 0 0 0 0 193 0 1 468 0 9 0.0000 0.0000 0.0209 193.000 3.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 725 213 512 3 0 14 1 195 0 0 511 0 1 0.0141 0.0000 0.0020 16.583 2.33 1.61 0.72 3 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0143 0.9857 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 753 150 603 72 0 10 0 68 0 0 602 0 1 0.4800 0.0000 0.0017 14.000 0.36 3.85 -3.49 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2382 0.6511 0.1108 1 1 0.2439 0.6400 0.1161 1 1 0.2509 0.6260 0.1231
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 532 133 399 71 0 20 0 42 0 0 392 0 7 0.5338 0.0000 0.0175 5.650 0.31 8.40 -8.09 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7061 0.2851 0.0089 1 0 0.6968 0.2928 0.0104 1 0 0.6837 0.3036 0.0127
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 659 155 504 8 0 29 0 118 0 0 473 1 30 0.0516 0.0000 0.0615 4.345 3.38 19.53 -16.15 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 2 0.0000 0.3092 0.6908 2 2 0.0000 0.0185 0.9815
chr19 55518174 C CATCCCACCATGACTGCTG 0.004924 0.100 1 18 1 895 237 658 124 6 11 16 80 5 1 631 2 19 0.5232 0.0076 0.0410 22.100 2.20 8.86 -6.66 54 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6733 0.3267 0.0001 1 0 0.6770 0.3229 0.0001 1 0 0.6807 0.3192 0.0001
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 849 245 604 107 1 42 9 86 0 0 594 0 10 0.4367 0.0000 0.0166 5.025 1.18 4.59 -3.42 57 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2414 0.7051 0.0536 1 1 0.2525 0.6901 0.0574 1 1 0.2666 0.6708 0.0626
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 591 106 485 0 0 3 0 103 0 0 479 0 6 0.0000 0.0000 0.0124 34.333 3.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr19 55613894 C CTCCTCG 0.000276 0.100 1 6 3 428 115 313 52 2 17 0 44 0 0 312 0 1 0.4522 0.0000 0.0032 5.706 0.44 6.07 -5.63 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5951 0.4048 0.0000 1 0 0.5959 0.4041 0.0000 1 0 0.5963 0.4037 0.0000
chr19 56207177 CTG C 0.000148 0.100 1 -2 1 237 94 143 87 1 1 0 5 0 0 143 0 0 0.9255 0.0000 0.0000 93.000 0.77 2.80 -2.03 21 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8999 0.1001 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.100 1 -48 1 163 72 91 36 2 17 0 17 0 0 84 0 7 0.5000 0.0000 0.0769 3.312 1.22 8.59 -7.37 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6847 0.3038 0.0115 1 0 0.6779 0.3095 0.0126 1 0 0.6685 0.3173 0.0142
chr19 58356935 AG A 0.000153 0.100 1 -1 2 642 137 505 60 3 8 0 66 1 5 495 0 4 0.4380 0.0020 0.0198 16.000 1.93 2.55 -0.61 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3034 0.6965 0.0001 1 1 0.3156 0.6843 0.0001 1 1 0.3314 0.6685 0.0001
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 324 100 224 49 0 4 0 47 0 0 223 0 1 0.4900 0.0000 0.0045 24.000 0.20 4.04 -3.84 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3487 0.5998 0.0515 1 1 0.3554 0.5918 0.0529 1 1 0.3636 0.5817 0.0547
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 327 133 194 56 0 3 0 74 0 0 194 0 0 0.4211 0.0000 0.0000 43.333 0.04 2.00 -1.96 6 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0140 0.3575 0.6285 1 2 0.0159 0.3615 0.6226 1 2 0.0188 0.3674 0.6138
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 130 69 61 62 0 2 0 5 0 0 61 0 0 0.8986 0.0000 0.0000 33.500 0.19 6.60 -6.41 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0653 0.9347 0.0000 0 1 0.3466 0.6534 0.0000
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 507 161 346 110 0 0 0 51 0 0 345 1 0 0.6832 0.0000 0.0029 161.000 0.36 9.25 -8.89 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9888 0.0112 0.0000 1 0 0.9869 0.0131 0.0000 1 0 0.9838 0.0162 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 507 167 340 114 1 0 1 51 0 0 339 1 0 0.6826 0.0000 0.0029 166.000 0.35 9.29 -8.94 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9922 0.0078 0.0000 1 0 0.9907 0.0093 0.0000 1 0 0.9883 0.0117 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 502 175 327 127 0 1 0 47 0 0 325 0 2 0.7257 0.0000 0.0061 174.000 0.25 8.77 -8.51 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9984 0.0016 0.0000 1 0 0.9979 0.0021 0.0000 1 0 0.9972 0.0028 0.0000
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 344 150 194 84 0 16 0 50 0 0 192 0 2 0.5600 0.0000 0.0103 8.375 0.52 5.48 -4.96 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9137 0.0861 0.0002 1 0 0.9078 0.0919 0.0003 1 0 0.8992 0.1004 0.0004
chr20 3864345 C CAAG 0.001475 0.100 1 3 2 439 141 298 130 0 1 0 10 0 0 298 0 0 0.9220 0.0000 0.0000 140.000 0.25 2.70 -2.45 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.9141 0.0859 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000
chr20 19886698 CT C 0.002304 0.100 1 -1 1 165 81 84 46 1 0 0 34 0 0 84 0 0 0.5679 0.0000 0.0000 81.000 0.65 3.59 -2.94 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7084 0.2915 0.0001 1 0 0.7043 0.2956 0.0001 1 0 0.6985 0.3014 0.0002
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 233 93 140 48 0 3 0 42 0 0 140 0 0 0.5161 0.0000 0.0000 30.000 1.27 1.12 0.15 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2678 0.6006 0.1316 1 1 0.2678 0.5944 0.1378 1 1 0.2674 0.5865 0.1462
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 725 188 537 97 1 5 0 85 0 0 532 0 5 0.5160 0.0000 0.0093 36.600 0.28 6.00 -5.72 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3142 0.6355 0.0503 1 1 0.3209 0.6245 0.0547 1 1 0.3286 0.6106 0.0608
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 509 160 349 7 0 1 2 150 0 0 336 0 13 0.0437 0.0000 0.0372 158.000 1.57 3.51 -1.94 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 2 0.0000 0.1926 0.8074 2 2 0.0000 0.0154 0.9846
chr20 38926679 CGCG C 0.001907 0.100 1 -3 3 652 207 445 168 5 24 0 10 0 0 445 0 0 0.8116 0.0000 0.0000 7.625 0.27 3.30 -3.03 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 0 0.9860 0.0140 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr20 41404762 GTCT G 0.000048 0.100 1 -3 3 622 158 464 69 1 21 0 67 0 0 464 0 0 0.4367 0.0000 0.0000 6.524 0.41 3.85 -3.44 41 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4063 0.5937 0.0000 1 1 0.4159 0.5841 0.0000 1 1 0.4279 0.5721 0.0000
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 1079 363 716 274 2 46 3 38 0 0 716 0 0 0.7548 0.0000 0.0000 6.870 0.31 3.29 -2.98 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 58854641 C CTGACGCCCCAGCCGATCCCGACTCCGGGGCGGCCCG 0.009401 0.100 1 36 4 726 166 560 71 11 25 3 56 0 0 560 0 0 0.4277 0.0000 0.0000 5.400 0.62 2.25 -1.63 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8188 0.1811 0.0001 1 0 0.8137 0.1861 0.0001 1 0 0.8065 0.1934 0.0001
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 309 57 252 0 0 3 2 52 0 0 244 0 8 0.0000 0.0000 0.0317 18.000 5.69 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr21 14189118 A ACCC 0.000545 0.100 1 3 1 335 108 227 55 0 3 1 49 0 0 225 0 2 0.5093 0.0000 0.0088 35.000 0.27 2.98 -2.71 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4468 0.5531 0.0001 1 1 0.4536 0.5462 0.0001 1 1 0.4620 0.5378 0.0001
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 331 155 176 87 0 2 0 66 0 0 174 0 2 0.5613 0.0000 0.0114 76.500 0.02 2.09 -2.07 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4553 0.5184 0.0263 1 1 0.4498 0.5201 0.0301 1 1 0.4415 0.5227 0.0358
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 822 205 617 96 0 6 0 103 0 0 610 0 7 0.4683 0.0000 0.0113 33.167 0.19 5.48 -5.29 22 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0249 0.5592 0.4158 1 1 0.0280 0.5520 0.4200 1 1 0.0326 0.5434 0.4241
chr21 34670163 GGCGTAGAAGCGGGGGTCCCGGCGGGGGACA G 0.216105 0.100 1 -30 1 740 187 553 87 2 15 2 81 2 1 549 0 1 0.4652 0.0036 0.0072 11.400 1.78 14.77 -12.98 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4097 0.5665 0.0237 1 1 0.4173 0.5571 0.0257 1 1 0.4262 0.5455 0.0284
chr21 36413213 CGGA C 0.000047 0.100 1 -3 2 502 116 386 105 0 3 0 8 0 0 386 0 0 0.9052 0.0000 0.0000 37.667 0.21 3.12 -2.92 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0785 0.9215 0.0000 0 0 0.9988 0.0012 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 268 111 157 50 1 2 0 58 0 0 156 0 1 0.4505 0.0000 0.0064 54.000 0.12 3.03 -2.91 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0589 0.5353 0.4058 1 1 0.0628 0.5309 0.4063 1 1 0.0682 0.5257 0.4061
chr21 41179506 G GGGGTGAGTGAGGGTGTCCAGGGTGAGGAGTGAGGGTGTCA 0.029913 0.100 1 40 1 1174 297 877 71 5 148 0 73 6 8 807 15 41 0.2391 0.0068 0.0798 0.980 1.63 2.40 -0.76 9 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0046 0.6551 0.3404 1 1 0.0059 0.6701 0.3240 1 1 0.0081 0.6898 0.3021
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 314 52 262 0 1 2 0 49 0 0 262 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 25.000 2.43 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 41991439 GCCT G 0.063434 0.100 1 -3 1 983 201 782 106 0 13 1 81 0 0 779 0 3 0.5274 0.0000 0.0038 14.462 0.28 3.40 -3.11 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7464 0.2528 0.0008 1 0 0.7445 0.2546 0.0009 1 0 0.7411 0.2578 0.0011
chr21 44539457 CGGA C 0.002702 0.100 1 -3 1 1210 291 919 256 2 18 0 15 0 0 919 0 0 0.8797 0.0000 0.0000 15.167 1.92 4.53 -2.62 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9439 0.0561 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1447 320 1127 192 2 8 10 108 2 0 1115 3 7 0.6000 0.0018 0.0106 51.333 1.38 3.28 -1.90 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9868 0.0132 0.0000 1 0 0.9847 0.0153 0.0000 1 0 0.9813 0.0187 0.0000
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1449 325 1124 193 5 8 15 104 2 1 1110 4 7 0.5938 0.0018 0.0125 52.833 1.35 3.28 -1.93 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9889 0.0111 0.0000 1 0 0.9870 0.0130 0.0000 1 0 0.9840 0.0160 0.0000
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 841 199 642 169 3 22 1 4 14 8 618 2 0 0.8492 0.0218 0.0374 8.045 1.11 16.50 -15.39 79 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4297 0.5703 0.0000 0 0 0.9937 0.0063 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 642 141 501 70 4 19 0 48 0 0 497 0 4 0.4965 0.0000 0.0080 6.316 1.07 16.79 -15.72 22 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6690 0.3199 0.0111 1 0 0.6600 0.3271 0.0130 1 0 0.6471 0.3372 0.0158
chr21 44637708 TGTCTGCTGTGTGCCC T 0.168959 0.100 1 -15 2 657 135 522 66 0 8 2 59 0 0 522 0 0 0.4889 0.0000 0.0000 15.875 1.12 14.47 -13.35 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4096 0.5595 0.0309 1 1 0.4155 0.5519 0.0326 1 1 0.4226 0.5426 0.0348
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 368 157 211 0 1 17 3 136 0 0 209 0 2 0.0000 0.0000 0.0095 8.118 7.82 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr22 20858678 G GCCGCCT 0.004141 0.100 1 6 2 473 191 282 68 0 45 2 76 0 0 282 0 0 0.3560 0.0000 0.0000 3.222 0.82 5.16 -4.33 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1588 0.8368 0.0044 1 1 0.1713 0.8243 0.0044 1 1 0.1884 0.8073 0.0044
chr22 20858678 G GCCGCCTCCGCCT 0.001452 0.100 1 12 2 473 191 282 69 2 100 7 13 0 0 282 0 0 0.3613 0.0000 0.0000 0.889 0.86 2.92 -2.07 21 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9674 0.0326 0.0000 1 0 0.5530 0.4470 0.0000 0 1 0.1709 0.8291 0.0000
chr22 21388339 A AC 0.001328 0.100 1 1 2 1096 114 982 101 0 1 0 12 0 0 982 0 0 0.8860 0.0000 0.0000 113.000 0.58 1.00 -0.42 101 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2519 0.7481 0.0000 0 0 0.9787 0.0213 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 581 134 447 62 1 33 1 37 0 0 441 0 6 0.4627 0.0000 0.0134 3.030 1.18 17.16 -15.98 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3048 0.6438 0.0515 1 1 0.2960 0.6462 0.0578 1 1 0.2840 0.6489 0.0671
chr22 30694065 A ACAGACAGGT 0.001704 0.100 1 9 1 218 56 162 30 0 5 0 21 0 0 161 0 1 0.5357 0.0000 0.0062 10.200 8.53 15.10 -6.56 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6308 0.3690 0.0002 1 0 0.6281 0.3716 0.0002 1 0 0.6244 0.3754 0.0003
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 690 218 472 203 0 6 0 9 0 0 471 0 1 0.9312 0.0000 0.0021 35.333 0.67 1.78 -1.11 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3900 0.6100 0.0000 0 0 0.9705 0.0295 0.0000
chr22 36265995 AATAATT A 0.003695 0.100 1 -6 1 568 143 425 84 0 1 0 58 0 0 423 0 2 0.5874 0.0000 0.0047 142.000 0.67 5.86 -5.20 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8414 0.1586 0.0000 1 0 0.8362 0.1638 0.0000 1 0 0.8287 0.1713 0.0000
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 510 234 276 120 0 45 0 69 0 0 271 0 5 0.5128 0.0000 0.0181 4.200 0.44 5.71 -5.27 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9656 0.0343 0.0000 1 0 0.9620 0.0380 0.0000 1 0 0.9564 0.0435 0.0001
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 409 203 206 99 0 25 0 79 0 0 200 0 6 0.4877 0.0000 0.0291 7.120 0.21 7.49 -7.28 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5085 0.4751 0.0164 1 0 0.5111 0.4706 0.0184 1 0 0.5133 0.4655 0.0212
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 244 129 115 118 0 8 0 3 0 0 115 0 0 0.9147 0.0000 0.0000 15.125 0.63 3.00 -2.37 42 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5099 0.4901 0.0000 0 0 0.9674 0.0326 0.0000 0 0 0.9889 0.0111 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 382 128 254 0 0 5 1 122 0 0 249 0 5 0.0000 0.0000 0.0197 24.600 3.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr22 40301172 TGCA T 0.245189 0.100 1 -3 1 553 192 361 156 0 13 1 22 0 0 361 0 0 0.8125 0.0000 0.0000 13.769 0.13 3.32 -3.18 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0034 0.9966 0.0000
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1051 224 827 24 0 0 0 200 0 0 810 0 17 0.1071 0.0000 0.0206 224.000 0.79 10.06 -9.27 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9967 0.0033
chr22 42144326 CA C 0.011227 0.100 1 -1 1 649 242 407 231 1 4 0 6 0 0 407 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 79.333 0.29 2.83 -2.55 25 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9543 0.0457 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 665 142 523 53 1 11 1 76 0 0 520 1 2 0.3732 0.0000 0.0057 11.909 1.17 7.09 -5.92 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0271 0.7210 0.2518 1 1 0.0317 0.7268 0.2415 1 1 0.0388 0.7335 0.2277
chr22 46363187 CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA C 0.006403 0.100 1 -27 3 204 83 121 59 0 22 0 2 0 0 118 0 3 0.7108 0.0000 0.0248 2.773 0.22 14.00 -13.78 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0451 0.9549 0.0000 0 0 0.9352 0.0648 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 397 115 282 59 0 13 0 43 0 0 275 0 7 0.5130 0.0000 0.0248 7.846 0.46 14.09 -13.64 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5547 0.4342 0.0111 1 0 0.5557 0.4324 0.0119 1 0 0.5564 0.4306 0.0131
chr22 50603339 A AGAG 0.000143 0.100 1 3 2 405 125 280 62 2 20 0 41 0 0 279 0 1 0.4960 0.0000 0.0036 5.250 0.53 3.27 -2.74 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8403 0.1597 0.0000 1 0 0.8341 0.1658 0.0000 1 0 0.8255 0.1745 0.0000
835 rows