File Info

Filename
HG01956_x_HG01978_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/34/c502546a1c8444d31b3e2cc214895d/HG01956_x_HG01978_FF_10.features.tsv
Size
173.7 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG01956_x_HG01978_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1641723 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 430 168 262 138 2 17 0 11 0 0 261 0 1 0.8214 0.0000 0.0038 8.882 0.60 3.27 -2.67 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0031 0.9969 0.0000 0 1 0.2886 0.7114 0.0000
chr1 1739302 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 330 38 292 20 0 3 0 15 0 0 291 0 1 0.5263 0.0000 0.0034 11.667 0.25 3.80 -3.55 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3270 0.5250 0.1480 1 1 0.3252 0.5230 0.1517 1 1 0.3226 0.5206 0.1567
chr1 1752908 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 1 378 143 235 107 9 18 0 9 0 0 235 0 0 0.7483 0.0000 0.0000 6.944 0.25 3.33 -3.08 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0221 0.9779 0.0000 0 1 0.4624 0.5376 0.0000
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 591 203 388 165 1 29 0 8 1 0 387 0 0 0.8128 0.0026 0.0026 6.000 0.52 8.12 -7.60 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4559 0.5441 0.0000 0 0 0.9512 0.0488 0.0000
chr1 3021843 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 571 178 393 168 0 4 0 6 0 0 392 0 1 0.9438 0.0000 0.0025 43.500 0.40 3.17 -2.76 84 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.7187 0.2813 0.0000 0 0 0.9749 0.0251 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 481 89 392 4 0 7 0 78 0 0 385 0 7 0.0449 0.0000 0.0179 11.714 1.25 3.54 -2.29 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9896 0.0104 2 1 0.0000 0.5033 0.4967 2 2 0.0000 0.1740 0.8260
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 992 162 830 62 0 4 0 96 0 0 829 0 1 0.3827 0.0000 0.0012 39.500 0.61 3.20 -2.59 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0009 0.1195 0.8797 1 2 0.0011 0.1276 0.8713 1 2 0.0016 0.1394 0.8591
chr1 15933152 TAGC T 0.500000 0.100 1 -3 3 668 135 533 123 0 2 0 10 0 0 533 0 0 0.9111 0.0000 0.0000 66.500 0.32 3.40 -3.08 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0109 0.9891 0.0000 0 1 0.3895 0.6105 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 450 109 341 77 0 4 1 27 0 0 341 0 0 0.7064 0.0000 0.0000 26.250 0.29 1.15 -0.86 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9746 0.0254 0.0001 1 0 0.9706 0.0293 0.0001 1 0 0.9565 0.0434 0.0001
chr1 16759500 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 1320 266 1054 185 1 15 2 63 0 0 1053 0 1 0.6955 0.0000 0.0009 16.667 1.32 1.84 -0.52 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr1 26364795 CCCACCGAGCGCTGGGGTGCCCCAG C 0.500000 0.100 1 -24 1 588 140 448 87 0 3 0 50 0 0 435 0 13 0.6214 0.0000 0.0290 45.667 0.24 18.92 -18.68 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7145 0.2792 0.0063 1 0 0.7064 0.2861 0.0074 1 0 0.6947 0.2960 0.0093
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 376 165 211 25 0 10 1 129 0 0 210 0 1 0.1515 0.0000 0.0047 15.500 0.16 3.00 -2.84 11 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr1 36178099 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 429 116 313 109 0 1 0 6 0 0 313 0 0 0.9397 0.0000 0.0000 115.000 0.61 5.67 -5.06 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2801 0.7199 0.0000 0 0 0.8082 0.1918 0.0000
chr1 44140851 GGGTCTGGTTACCAGTGGAGGTCGTCATCTGTCTCCCGTAGAA G 0.500000 0.100 1 -42 1 3414 1325 2089 1171 23 91 5 35 11 8 2058 5 7 0.8838 0.0053 0.0148 13.966 2.42 5.03 -2.61 443 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr1 46402196 GTGGGAAAGGTAAGGCCAGCCAAGGCCAGCCCCTCCC G 0.500000 0.100 1 -36 1 111 59 52 16 0 22 0 21 0 0 50 0 2 0.2712 0.0000 0.0385 1.682 0.50 13.90 -13.40 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1015 0.4919 0.4066 1 1 0.1059 0.4923 0.4019 1 1 0.1118 0.4928 0.3954
chr1 46815074 GAT G 0.500000 0.100 1 -2 2 379 92 287 87 0 1 0 4 0 0 287 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 91.000 0.29 2.75 -2.46 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0115 0.9885 0.0000 0 0 0.5216 0.4784 0.0000 0 0 0.8395 0.1605 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 615 163 452 1 0 21 3 138 0 0 450 1 1 0.0061 0.0000 0.0044 6.714 0.00 5.45 -5.45 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0070 0.9930 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0020 0.9980
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 238 80 158 61 0 8 0 11 0 0 158 0 0 0.7625 0.0000 0.0000 9.000 0.20 3.00 -2.80 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0163 0.9837 0.0000
chr1 52033398 CGCCCGCCACCTGAGGTCCCGCGATCGG C 0.500000 0.100 1 -27 1 732 197 535 128 1 2 0 66 0 0 529 0 6 0.6497 0.0000 0.0112 97.500 0.37 18.80 -18.44 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9815 0.0185 0.0000 1 0 0.9787 0.0213 0.0000 1 0 0.9742 0.0258 0.0000
chr1 55039879 A ACTG 0.500000 0.100 1 3 2 996 225 771 124 2 32 0 67 0 0 766 0 5 0.5511 0.0000 0.0065 6.031 0.74 3.04 -2.30 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9756 0.0244 0.0000 1 0 0.9722 0.0278 0.0000 1 0 0.9668 0.0331 0.0001
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 4 716 142 574 80 1 5 0 56 0 0 573 0 1 0.5634 0.0000 0.0017 27.200 0.42 3.89 -3.47 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7245 0.2690 0.0065 1 0 0.7157 0.2766 0.0077 1 0 0.7031 0.2873 0.0096
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 173 82 91 41 1 2 0 38 0 0 88 0 3 0.5000 0.0000 0.0330 40.000 0.17 3.61 -3.43 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2201 0.5992 0.1807 1 1 0.2234 0.5919 0.1847 1 1 0.2274 0.5826 0.1900
chr1 86547161 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 137 69 68 40 0 2 0 27 0 0 67 0 1 0.5797 0.0000 0.0147 33.500 0.25 2.96 -2.71 22 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5148 0.4375 0.0477 1 0 0.5078 0.4406 0.0516 1 0 0.4981 0.4448 0.0571
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 457 148 309 12 1 8 2 125 0 0 306 0 3 0.0811 0.0000 0.0097 17.375 0.00 5.27 -5.27 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8837 0.1163
chr1 87250586 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 444 192 252 111 0 2 0 79 0 0 252 0 0 0.5781 0.0000 0.0000 95.000 0.07 1.15 -1.08 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8232 0.1753 0.0014 1 0 0.8153 0.1829 0.0018 1 0 0.8036 0.1939 0.0025
chr1 89266994 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 385 120 265 72 0 2 0 46 0 0 264 0 1 0.6000 0.0000 0.0038 59.000 0.17 1.17 -1.01 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7646 0.2300 0.0054 1 0 0.7545 0.2391 0.0064 1 0 0.7402 0.2517 0.0081
chr1 108922543 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 144 73 71 6 0 1 0 66 0 0 71 0 0 0.0822 0.0000 0.0000 72.000 0.33 3.18 -2.85 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9565 0.0435 2 1 0.0000 0.6565 0.3435
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 460 134 326 78 0 5 1 50 0 0 321 0 5 0.5821 0.0000 0.0153 25.600 0.51 3.46 -2.95 52 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6953 0.2962 0.0085 1 0 0.6869 0.3032 0.0100 1 0 0.6748 0.3130 0.0122
chr1 111319160 A ATGCCCCTCAGGAAG 0.500000 0.100 1 14 3 414 115 299 50 1 23 0 41 0 0 293 0 6 0.4348 0.0000 0.0201 4.000 0.74 10.83 -10.09 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2756 0.5997 0.1248 1 1 0.2780 0.5923 0.1298 1 1 0.2807 0.5829 0.1364
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 789 197 592 63 7 20 5 102 0 0 591 0 1 0.3198 0.0000 0.0017 9.158 8.22 16.78 -8.56 9 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0004 0.0883 0.9113 1 2 0.0005 0.0954 0.9041 1 2 0.0008 0.1059 0.8934
chr1 111414897 A ACAGGGGTCAGGGTCTTTTCCC 0.500000 0.100 1 21 1 772 146 626 34 4 11 1 96 0 0 604 2 20 0.2329 0.0000 0.0351 12.273 12.29 18.79 -6.50 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0014 0.9986 1 2 0.0000 0.0042 0.9958 2 1 0.0000 0.8134 0.1866
chr1 116579663 G GTCC 0.500000 0.100 1 3 1 649 191 458 165 2 8 2 14 1 0 457 0 0 0.8639 0.0022 0.0022 26.143 0.53 3.50 -2.97 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1044 0.8956 0.0000
chr1 120436638 AAG A 0.500000 0.100 1 -2 3 268 108 160 2 3 5 1 97 0 0 160 0 0 0.0185 0.0000 0.0000 20.200 1.50 2.05 -0.55 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7927 0.2073 2 2 0.0000 0.1813 0.8187 2 2 0.0000 0.0709 0.9291
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 207 81 126 67 0 11 0 3 0 0 126 0 0 0.8272 0.0000 0.0000 6.364 0.73 6.33 -5.60 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0372 0.9628 0.0000 0 0 0.5380 0.4620 0.0000 0 0 0.7901 0.2099 0.0000
chr1 152079812 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 2309 642 1667 381 1 4 1 255 0 0 1665 0 2 0.5935 0.0000 0.0012 159.500 0.24 1.31 -1.06 133 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.100 1 18 1 1806 511 1295 301 16 166 11 17 15 11 1257 5 7 0.5890 0.0116 0.0293 2.061 2.63 6.53 -3.89 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0041 0.9959 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1290 296 994 239 1 47 1 8 0 0 993 0 1 0.8074 0.0000 0.0010 5.277 0.49 3.38 -2.89 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.8938 0.1062 0.0000 0 0 0.9965 0.0035 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 275 100 175 58 12 15 1 14 0 0 175 0 0 0.5800 0.0000 0.0000 5.600 0.53 1.07 -0.54 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0008 0.9992 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0032 0.9968 0.0000
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 226 62 164 0 0 9 0 53 0 0 139 0 25 0.0000 0.0000 0.1524 5.889 11.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0184 0.9816 2 2 0.0000 0.0199 0.9801 2 2 0.0000 0.0222 0.9778
chr1 152985344 GGAGCCCTGCCACCCCAAGGTGCCT G 0.500000 0.100 1 -24 2 530 213 317 120 0 18 0 75 0 0 303 0 14 0.5634 0.0000 0.0442 10.833 0.75 12.89 -12.14 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7982 0.2002 0.0016 1 0 0.7910 0.2070 0.0020 1 0 0.7804 0.2169 0.0028
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1095 266 829 117 1 40 2 106 6 2 792 4 25 0.4398 0.0072 0.0446 5.744 2.15 9.85 -7.70 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0304 0.6791 0.2905 1 1 0.0343 0.6653 0.3003 1 1 0.0400 0.6480 0.3120
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 566 216 350 183 2 21 0 10 0 0 350 0 0 0.8472 0.0000 0.0000 10.263 1.34 8.60 -7.26 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2084 0.7916 0.0000 0 0 0.9326 0.0674 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 217 90 127 77 1 2 0 10 0 0 127 0 0 0.8556 0.0000 0.0000 43.500 1.91 1.30 0.61 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.0680 0.9320 0.0000
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 794 196 598 0 0 4 2 190 0 0 594 0 4 0.0000 0.0000 0.0067 48.000 2.28 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 1662 348 1314 0 0 12 0 336 0 0 1308 0 6 0.0000 0.0000 0.0046 28.000 1.46 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr1 171193412 T TGAC 0.500000 0.100 1 3 1 124 70 54 42 0 1 0 27 0 0 53 0 1 0.6000 0.0000 0.0185 69.000 0.26 4.04 -3.78 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5662 0.3985 0.0353 1 0 0.5577 0.4036 0.0387 1 0 0.5460 0.4104 0.0436
chr1 171196663 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 136 47 89 25 1 1 0 20 0 0 89 0 0 0.5319 0.0000 0.0000 45.000 0.12 1.25 -1.13 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3670 0.5168 0.1163 1 1 0.3641 0.5154 0.1206 1 1 0.3600 0.5136 0.1264
chr1 171209118 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 265 68 197 56 1 5 1 5 0 0 197 0 0 0.8235 0.0000 0.0000 12.400 0.38 1.00 -0.62 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0584 0.9416 0.0000 0 1 0.3307 0.6693 0.0000
chr1 175160809 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 713 148 565 5 12 3 83 45 0 0 565 0 0 0.0338 0.0000 0.0000 64.000 1.60 9.36 -7.76 3 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9333 0.0667
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 159 47 112 22 0 5 0 20 0 0 112 0 0 0.4681 0.0000 0.0000 8.400 0.05 4.50 -4.45 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2711 0.5465 0.1824 1 1 0.2715 0.5430 0.1855 1 1 0.2719 0.5386 0.1895
chr1 197902774 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 299 113 186 66 0 2 0 45 0 0 186 0 0 0.5841 0.0000 0.0000 55.500 0.17 1.31 -1.14 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6917 0.2975 0.0108 1 0 0.6823 0.3052 0.0125 1 0 0.6690 0.3159 0.0151
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 77 42 35 25 0 0 0 17 0 0 35 0 0 0.5952 0.0000 0.0000 42.000 0.48 3.24 -2.76 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4316 0.4800 0.0884 1 1 0.4261 0.4811 0.0928 1 1 0.4187 0.4825 0.0988
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 722 224 498 187 0 29 0 8 0 0 496 0 2 0.8348 0.0000 0.0040 6.724 0.25 12.25 -12.00 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2129 0.7871 0.0000 0 0 0.9344 0.0656 0.0000
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 458 221 237 97 1 31 0 92 0 0 231 0 6 0.4389 0.0000 0.0253 6.129 0.33 11.45 -11.12 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1415 0.7233 0.1351 1 1 0.1490 0.7085 0.1425 1 1 0.1586 0.6893 0.1521
chr1 226737174 ACTGCCGCTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 641 162 479 71 0 17 1 73 0 0 476 0 3 0.4383 0.0000 0.0063 8.529 0.65 8.71 -8.06 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0849 0.6361 0.2789 1 1 0.0904 0.6261 0.2835 1 1 0.0978 0.6135 0.2887
chr1 234609199 A AGCT 0.500000 0.100 1 3 2 442 105 337 44 3 16 2 40 1 0 336 0 0 0.4190 0.0030 0.0030 5.438 2.68 5.25 -2.57 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3180 0.5739 0.1081 1 1 0.3188 0.5682 0.1130 1 1 0.3193 0.5612 0.1196
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 229 107 122 60 0 6 0 41 0 0 122 0 0 0.5607 0.0000 0.0000 16.833 0.13 1.12 -0.99 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6568 0.3280 0.0152 1 0 0.6476 0.3350 0.0173 1 0 0.6347 0.3447 0.0206
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 582 136 446 73 1 14 0 48 0 0 444 1 1 0.5368 0.0000 0.0045 8.714 0.77 3.25 -2.48 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7433 0.2504 0.0063 1 0 0.7337 0.2589 0.0074 1 0 0.7199 0.2708 0.0093
chr1 247451959 GA G 0.500000 0.100 1 -1 2 503 158 345 133 0 4 0 21 0 0 345 0 0 0.8418 0.0000 0.0000 38.500 0.27 1.76 -1.49 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0009 0.9991 0.0000
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 625 181 444 155 1 0 0 25 0 0 444 0 0 0.8564 0.0000 0.0000 181.000 0.28 2.96 -2.68 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr1 247896477 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 361 89 272 82 0 4 0 3 0 0 272 0 0 0.9213 0.0000 0.0000 28.333 1.23 1.33 -0.10 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0812 0.9188 0.0000 0 0 0.7173 0.2827 0.0000 0 0 0.8888 0.1112 0.0000
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 847 150 697 136 0 5 0 9 0 0 696 0 1 0.9067 0.0000 0.0014 29.000 0.51 1.89 -1.37 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0209 0.9791 0.0000 0 0 0.5460 0.4540 0.0000
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.100 1 -84 1 941 363 578 311 6 34 0 12 0 0 578 0 0 0.8567 0.0000 0.0000 9.676 2.77 4.33 -1.56 175 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9551 0.0449 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr1 248361985 CTACG C 0.500000 0.100 1 -4 2 1238 293 945 24 5 12 106 146 0 0 923 2 20 0.0819 0.0000 0.0233 69.000 0.42 6.69 -6.28 6 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9704 0.0296
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 654 257 397 184 0 6 0 67 0 0 397 0 0 0.7160 0.0000 0.0000 41.833 1.10 4.07 -2.98 136 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 711 86 625 30 0 3 2 51 0 0 618 0 7 0.3488 0.0000 0.0112 27.667 1.07 2.61 -1.54 18 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0023 0.1370 0.8608 1 2 0.0028 0.1468 0.8504 1 2 0.0037 0.1609 0.8354
chr1 248442053 C CT 0.500000 0.100 1 1 2 617 147 470 49 0 1 0 97 0 0 470 0 0 0.3333 0.0000 0.0000 146.000 0.18 4.23 -4.04 17 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0340 0.9660 1 2 0.0001 0.0385 0.9614 1 2 0.0002 0.0455 0.9544
chr1 248473493 C CCCTCCTCAT 0.500000 0.100 1 9 1 839 135 704 72 0 20 0 43 0 0 697 0 7 0.5333 0.0000 0.0099 5.750 0.81 8.35 -7.54 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7024 0.2886 0.0090 1 0 0.6933 0.2962 0.0105 1 0 0.6803 0.3068 0.0128
chr1 248574594 T TGGATGAGGA 0.500000 0.100 1 9 1 334 50 284 20 0 11 0 19 0 0 280 0 4 0.4000 0.0000 0.0141 3.545 0.70 7.79 -7.09 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1629 0.5417 0.2953 1 1 0.1665 0.5386 0.2949 1 1 0.1712 0.5346 0.2942
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 413 127 286 38 0 4 0 85 0 0 284 0 2 0.2992 0.0000 0.0070 30.750 1.08 6.54 -5.46 26 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0279 0.9720 1 2 0.0001 0.0320 0.9679 1 2 0.0001 0.0384 0.9614
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2630 522 2108 225 1 12 2 282 0 0 2100 0 8 0.4310 0.0000 0.0038 42.417 0.19 3.54 -3.35 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0359 0.9641 1 2 0.0000 0.0381 0.9619 1 2 0.0000 0.0415 0.9585
chr2 1942998 TTCC T 0.015778 0.100 1 -3 1 306 68 238 57 0 7 0 4 0 0 238 0 0 0.8382 0.0000 0.0000 8.714 0.26 3.00 -2.74 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1360 0.8640 0.0000 0 0 0.9383 0.0617 0.0000 0 0 0.9870 0.0130 0.0000
chr2 3701561 GGAA G 0.417063 0.100 1 -3 1 232 101 131 93 1 4 0 3 0 0 131 0 0 0.9208 0.0000 0.0000 24.000 0.17 4.00 -3.83 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1749 0.8251 0.0000 0 0 0.8612 0.1388 0.0000 0 0 0.9508 0.0492 0.0000
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 393 102 291 0 0 13 0 89 0 0 273 2 16 0.0000 0.0000 0.0619 6.846 9.97 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 393 102 291 4 3 52 1 42 0 0 274 3 14 0.0392 0.0000 0.0584 0.904 8.25 11.07 -2.82 0 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9610 0.0390 2 1 0.0000 0.8215 0.1785
chr2 21043902 GGCAGCGCCA G 0.306974 0.100 1 -9 1 644 195 449 104 2 27 0 62 0 0 448 0 1 0.5333 0.0000 0.0022 6.222 0.57 7.84 -7.27 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9554 0.0445 0.0001 1 0 0.9508 0.0491 0.0001 1 0 0.9439 0.0559 0.0002
chr2 25161587 C CGCCGCTGCT 0.060759 0.100 1 9 1 569 121 448 65 0 16 0 40 0 0 440 0 8 0.5372 0.0000 0.0179 6.562 0.23 6.92 -6.69 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7430 0.2553 0.0017 1 0 0.7384 0.2597 0.0019 1 0 0.7318 0.2660 0.0022
chr2 26254257 G GACT 0.500000 0.100 1 3 1 180 46 134 3 0 1 0 42 0 0 130 0 4 0.0652 0.0000 0.0299 45.000 0.00 3.14 -3.14 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9869 0.0131 2 1 0.0000 0.7102 0.2898 2 2 0.0000 0.4239 0.5761
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 759 171 588 94 1 23 1 52 0 0 586 0 2 0.5497 0.0000 0.0034 6.435 0.30 3.29 -2.99 50 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9263 0.0733 0.0003 1 0 0.9193 0.0802 0.0004 1 0 0.9088 0.0905 0.0007
chr2 39178722 T TA 0.500000 0.100 1 1 4 355 104 251 59 0 0 0 45 0 0 251 0 0 0.5673 0.0000 0.0000 104.000 0.20 1.24 -1.04 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5280 0.4390 0.0329 1 0 0.5226 0.4411 0.0363 1 0 0.5147 0.4442 0.0411
chr2 46480669 C CAGCGGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGG 0.500000 0.100 1 39 2 496 176 320 32 0 85 1 58 0 0 320 0 0 0.1818 0.0000 0.0000 1.071 0.06 2.10 -2.04 6 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0039 0.1763 0.8198 1 2 0.0047 0.1865 0.8088 1 2 0.0061 0.2009 0.7930
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 496 172 324 51 0 50 1 70 0 1 323 0 0 0.2965 0.0000 0.0031 2.440 0.22 2.00 -1.78 11 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0142 0.3474 0.6384 1 2 0.0162 0.3530 0.6308 1 2 0.0194 0.3609 0.6198
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 418 157 261 132 1 14 2 8 0 0 261 0 0 0.8408 0.0000 0.0000 10.071 0.51 3.25 -2.74 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0921 0.9079 0.0000 0 0 0.7240 0.2760 0.0000
chr2 70984816 TGCCCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 651 168 483 83 0 11 0 74 1 0 481 0 1 0.4940 0.0021 0.0041 14.273 0.96 6.86 -5.90 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3383 0.6048 0.0568 1 1 0.3420 0.5965 0.0615 1 1 0.3458 0.5861 0.0681
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 689 172 517 2 104 45 4 17 0 2 514 0 1 0.0116 0.0000 0.0058 3.024 0.50 3.71 -3.21 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr2 73385903 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 689 173 516 20 9 32 61 51 0 0 513 2 1 0.1156 0.0000 0.0058 4.156 3.50 3.35 0.15 6 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 690 176 514 24 3 79 1 69 0 0 512 0 2 0.1364 0.0000 0.0039 1.263 4.00 5.99 -1.99 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0001 0.0382 0.9617 1 2 0.0002 0.0434 0.9564 1 2 0.0003 0.0558 0.9439
chr2 74415138 A ACGCGGAGGGGCGGGTGGCGCCGCC 0.500000 0.100 1 24 2 916 182 734 34 0 41 3 104 0 0 682 0 52 0.1868 0.0000 0.0708 3.415 0.35 11.87 -11.51 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 347 134 213 16 1 10 2 105 0 0 210 0 3 0.1194 0.0000 0.0141 12.300 1.81 3.84 -2.03 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9936 0.0064
chr2 85343751 CAGAT C 0.500000 0.100 1 -4 2 861 257 604 205 1 4 1 46 0 1 603 0 0 0.7977 0.0000 0.0017 63.000 0.35 4.24 -3.89 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr2 85695371 AC A 0.500000 0.100 1 -1 3 187 53 134 35 0 0 0 18 0 0 134 0 0 0.6604 0.0000 0.0000 53.000 0.49 1.89 -1.40 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6599 0.3174 0.0227 1 0 0.6483 0.3263 0.0254 1 0 0.6323 0.3383 0.0294
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 757 207 550 1 0 22 6 178 0 0 542 0 8 0.0048 0.0000 0.0145 8.409 0.00 3.28 -3.28 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 787 247 540 125 2 16 1 103 0 0 540 0 0 0.5061 0.0000 0.0000 14.375 0.61 7.39 -6.78 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6016 0.3918 0.0067 1 0 0.6005 0.3916 0.0079 1 0 0.5976 0.3925 0.0099
chr2 96123863 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 480 122 358 61 0 0 0 61 0 0 357 0 1 0.5000 0.0000 0.0028 122.000 0.28 1.16 -0.89 47 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1598 0.6453 0.1949 1 1 0.1652 0.6348 0.1999 1 1 0.1722 0.6215 0.2063
chr2 101007870 A AAAG 0.500000 0.100 1 3 4 444 115 329 12 0 0 0 103 0 0 325 0 4 0.1043 0.0000 0.0122 115.000 0.42 3.08 -2.66 10 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006 2 1 0.0000 0.9248 0.0752
chr2 106424136 AGGGCT A 0.500000 0.100 1 -5 1 580 127 453 119 0 0 0 8 0 0 452 1 0 0.9370 0.0000 0.0022 127.000 0.95 5.50 -4.55 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0277 0.9723 0.0000 0 0 0.5072 0.4928 0.0000
chr2 106424142 A AAAGATT 0.500000 0.100 1 6 1 579 122 457 114 0 0 0 8 0 0 456 0 1 0.9344 0.0000 0.0022 122.000 0.92 5.50 -4.58 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0201 0.9799 0.0000 0 1 0.4393 0.5607 0.0000
chr2 112074958 CAAT C 0.500000 0.100 1 -3 1 106 33 73 16 0 0 0 17 0 0 72 0 1 0.4848 0.0000 0.0137 33.000 0.19 2.94 -2.75 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1863 0.5367 0.2770 1 1 0.1891 0.5340 0.2769 1 1 0.1928 0.5305 0.2767
chr2 112175762 TAGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 110 68 42 42 0 0 0 26 0 0 42 0 0 0.6176 0.0000 0.0000 68.000 0.17 3.00 -2.83 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6198 0.3543 0.0260 1 0 0.6098 0.3613 0.0289 1 0 0.5959 0.3709 0.0332
chr2 112542424 TTCCGGCGTGTACCGAGAGACTGGCG T 0.500000 0.100 1 -25 1 405 112 293 97 0 14 0 1 0 0 289 0 4 0.8661 0.0000 0.0137 7.000 0.42 25.00 -24.58 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.3825 0.6175 0.0000 0 0 0.8173 0.1827 0.0000
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 563 154 409 80 2 1 0 71 0 0 404 0 5 0.5195 0.0000 0.0122 153.000 0.23 5.75 -5.52 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2702 0.6474 0.0823 1 1 0.2754 0.6367 0.0879 1 1 0.2815 0.6231 0.0954
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 306 113 193 12 0 12 0 89 0 0 187 0 6 0.1062 0.0000 0.0311 8.417 0.17 6.27 -6.10 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9566 0.0434
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 184 67 117 9 0 11 3 44 0 0 117 0 0 0.1343 0.0000 0.0000 4.909 1.11 6.30 -5.18 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9708 0.0292
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 253 112 141 106 0 1 0 5 0 0 140 0 1 0.9464 0.0000 0.0071 111.000 0.08 3.00 -2.92 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.2509 0.7491 0.0000 0 0 0.7846 0.2154 0.0000
chr2 178451007 GGC G 0.500000 0.100 1 -2 1 631 173 458 161 1 4 0 7 0 0 458 0 0 0.9306 0.0000 0.0000 42.250 0.53 4.00 -3.47 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 0 0.6547 0.3453 0.0000 0 0 0.9667 0.0333 0.0000
chr2 186694302 A ACAGCAG 0.500000 0.100 1 6 2 314 130 184 48 1 19 1 61 0 0 180 0 4 0.3692 0.0000 0.0217 5.737 2.69 5.66 -2.97 8 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0198 0.3813 0.5989 1 2 0.0223 0.3858 0.5919 1 2 0.0261 0.3921 0.5818
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 313 137 176 9 56 14 5 53 0 0 176 0 0 0.0657 0.0000 0.0000 9.077 0.00 2.72 -2.72 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2364 0.6242 0.1394 1 1 0.2403 0.6151 0.1446 1 1 0.2450 0.6036 0.1514
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 193 49 144 20 7 5 1 16 0 0 144 0 0 0.4082 0.0000 0.0000 7.400 0.10 1.00 -0.90 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4533 0.4665 0.0802 1 1 0.4470 0.4685 0.0846 1 1 0.4384 0.4710 0.0906
chr2 196666794 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 194 73 121 30 3 5 4 31 0 0 121 0 0 0.4110 0.0000 0.0000 12.800 0.17 1.06 -0.90 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1751 0.5761 0.2489 1 1 0.1788 0.5704 0.2508 1 1 0.1837 0.5632 0.2531
chr2 199819526 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 425 82 343 31 11 13 5 22 0 0 341 2 0 0.3780 0.0000 0.0058 5.364 1.42 1.73 -0.31 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5593 0.4027 0.0380 1 0 0.5508 0.4077 0.0415 1 0 0.5391 0.4143 0.0466
chr2 202635418 A AGGC 0.500000 0.100 1 3 1 390 95 295 36 1 24 2 32 1 1 291 1 1 0.3789 0.0034 0.0136 2.917 1.11 5.38 -4.26 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2755 0.5784 0.1461 1 1 0.2770 0.5725 0.1505 1 1 0.2785 0.5651 0.1564
chr2 210018165 T TAA 0.500000 0.100 1 2 1 82 38 44 27 0 0 0 11 0 0 44 0 0 0.7105 0.0000 0.0000 38.000 0.33 2.73 -2.39 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6512 0.3215 0.0273 1 0 0.6380 0.3318 0.0302 1 0 0.6114 0.3546 0.0341
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 273 83 190 3 0 0 0 80 0 0 188 0 2 0.0361 0.0000 0.0105 83.000 0.00 2.95 -2.95 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9233 0.0767 2 2 0.0000 0.2888 0.7112 2 2 0.0000 0.1137 0.8863
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 541 144 397 1 1 20 1 121 0 0 394 0 3 0.0069 0.0000 0.0076 6.150 0.00 8.04 -8.04 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0212 0.9788 2 2 0.0000 0.0073 0.9927 2 2 0.0000 0.0055 0.9945
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 608 170 438 23 0 7 1 139 0 0 388 0 50 0.1353 0.0000 0.1142 23.286 0.13 15.04 -14.91 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9961 0.0039
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 299 131 168 60 0 1 10 60 0 0 167 0 1 0.4580 0.0000 0.0060 128.000 1.53 3.53 -2.00 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0584 0.5605 0.3812 1 1 0.0629 0.5552 0.3819 1 1 0.0692 0.5486 0.3821
chr2 232847517 A AG 0.500000 0.100 1 1 2 299 130 169 61 50 13 0 6 0 1 167 0 1 0.4692 0.0000 0.0118 5.462 1.52 5.67 -4.14 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1059 0.8941 0.0000 0 0 0.6600 0.3400 0.0000
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 114 38 76 19 0 3 0 16 0 0 76 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 11.667 0.37 3.81 -3.44 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3016 0.5320 0.1664 1 1 0.3007 0.5296 0.1698 1 1 0.2993 0.5265 0.1742
chr2 233822976 AGGACGGCG A 0.500000 0.100 1 -8 1 394 114 280 66 0 5 0 43 0 0 279 0 1 0.5789 0.0000 0.0036 21.800 0.41 7.49 -7.08 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7142 0.2767 0.0091 1 0 0.7043 0.2851 0.0106 1 0 0.6904 0.2966 0.0130
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 821 201 620 132 0 1 0 68 2 0 618 0 0 0.6567 0.0032 0.0032 200.000 0.54 1.16 -0.62 102 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9923 0.0077 0.0000 1 0 0.9908 0.0092 0.0000 1 0 0.9883 0.0116 0.0000
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 424 123 301 0 0 21 10 92 0 0 301 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 4.857 3.35 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0055 0.9945 2 2 0.0000 0.0061 0.9939 2 2 0.0000 0.0070 0.9930
chr2 241096100 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 600 156 444 90 0 5 0 61 0 0 444 0 0 0.5769 0.0000 0.0000 30.200 0.38 3.11 -2.74 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8065 0.1909 0.0026 1 0 0.7974 0.1995 0.0032 1 0 0.7842 0.2116 0.0042
chr2 241223950 TCA T 0.500000 0.100 1 -2 1 485 135 350 75 0 3 0 57 0 0 347 1 2 0.5556 0.0000 0.0086 44.000 1.09 2.21 -1.12 9 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5188 0.4547 0.0265 1 0 0.5154 0.4550 0.0295 1 0 0.5100 0.4560 0.0340
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 809 213 596 8 0 5 0 200 0 0 582 0 14 0.0376 0.0000 0.0235 41.600 0.12 3.43 -3.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9925 0.0075 2 2 0.0000 0.0153 0.9847 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr3 9835187 AGG A 0.001553 0.100 1 -2 2 858 199 659 191 1 1 0 6 0 0 659 0 0 0.9598 0.0000 0.0000 198.000 0.24 7.83 -7.59 37 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9471 0.0529 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 12004751 C CGCCCGCGCCGCA 0.186893 0.100 1 12 2 795 182 613 90 0 20 0 72 0 0 588 0 25 0.4945 0.0000 0.0408 8.100 0.80 11.14 -10.34 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1238 0.7623 0.1139 1 1 0.1340 0.7492 0.1169 1 1 0.1479 0.7318 0.1202
chr3 13570394 T TCTGGGC 0.000435 0.100 1 6 1 402 93 309 60 1 6 0 26 0 0 308 0 1 0.6452 0.0000 0.0032 17.400 0.18 6.04 -5.86 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9517 0.0483 0.0000 1 0 0.9469 0.0531 0.0000 1 0 0.9398 0.0602 0.0000
chr3 27721914 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 2 461 83 378 1 0 17 32 33 0 0 377 0 1 0.0120 0.0000 0.0026 3.882 0.00 3.15 -3.15 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2430 0.7570 2 2 0.0000 0.0975 0.9025 2 2 0.0000 0.0721 0.9279
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 450 82 368 9 29 2 4 38 0 0 368 0 0 0.1098 0.0000 0.0000 39.000 0.89 4.39 -3.51 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0840 0.5172 0.3988 1 1 0.0886 0.5155 0.3958 1 1 0.0949 0.5135 0.3916
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 646 220 426 159 0 52 0 9 0 0 424 0 2 0.7227 0.0000 0.0047 3.231 0.36 5.33 -4.97 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0224 0.9776 0.0000 0 0 0.6573 0.3427 0.0000
chr3 42691888 CGAG C 0.500000 0.100 1 -3 2 239 114 125 63 1 1 0 49 0 0 123 0 2 0.5526 0.0000 0.0160 113.000 0.54 3.63 -3.09 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4886 0.4742 0.0373 1 0 0.4850 0.4741 0.0409 1 0 0.4796 0.4744 0.0460
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 868 233 635 0 0 10 0 223 0 0 631 0 4 0.0000 0.0000 0.0063 22.300 2.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 330 147 183 0 0 1 0 146 0 0 179 0 4 0.0000 0.0000 0.0219 146.000 4.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 624 150 474 8 1 18 11 112 0 0 471 1 2 0.0533 0.0000 0.0063 7.333 0.12 3.29 -3.16 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9590 0.0410 2 2 0.0000 0.4027 0.5973
chr3 46976753 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 317 137 180 74 0 6 0 57 0 0 180 0 0 0.5401 0.0000 0.0000 21.833 1.01 2.12 -1.11 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5749 0.4053 0.0198 1 0 0.5695 0.4082 0.0223 1 0 0.5614 0.4125 0.0261
chr3 49358240 GGCC G 0.500000 0.100 1 -3 3 379 101 278 32 1 17 6 45 0 0 278 0 0 0.3168 0.0000 0.0000 4.941 0.88 3.62 -2.75 8 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0183 0.3294 0.6524 1 2 0.0206 0.3369 0.6424 1 2 0.0242 0.3472 0.6286
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 379 103 276 37 0 59 1 6 0 0 276 0 0 0.3592 0.0000 0.0000 0.741 0.81 6.67 -5.86 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0115 0.9885 0.0000 0 1 0.1235 0.8765 0.0000
chr3 52693748 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 757 174 583 93 1 3 0 77 0 0 583 0 0 0.5345 0.0000 0.0000 57.000 0.84 4.18 -3.34 1 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5284 0.4534 0.0182 1 0 0.5267 0.4527 0.0206 1 0 0.5232 0.4524 0.0243
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 182 104 78 57 0 6 1 40 0 0 75 0 3 0.5481 0.0000 0.0385 16.333 0.09 6.88 -6.79 33 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5049 0.4567 0.0383 1 0 0.5001 0.4579 0.0420 1 0 0.4930 0.4599 0.0472
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 226 81 145 0 1 6 38 36 0 0 142 2 1 0.0000 0.0000 0.0207 12.167 3.11 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0257 0.9743 2 2 0.0000 0.0271 0.9729 2 2 0.0000 0.0293 0.9707
chr3 56616026 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 226 82 144 1 0 5 35 41 0 0 142 0 2 0.0122 0.0000 0.0139 15.200 1.00 3.95 -2.95 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1603 0.8397 2 2 0.0000 0.0613 0.9387 2 2 0.0000 0.0456 0.9544
chr3 63912697 G GCCC 0.500000 0.100 1 3 1 246 61 185 35 0 1 0 25 0 0 184 0 1 0.5738 0.0000 0.0054 60.000 1.09 3.24 -2.15 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4399 0.4863 0.0739 1 1 0.4351 0.4867 0.0783 1 1 0.4283 0.4873 0.0844
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 830 236 594 136 1 12 0 87 0 0 583 0 11 0.5763 0.0000 0.0185 18.667 2.79 9.60 -6.80 62 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8825 0.1171 0.0004 1 0 0.8758 0.1237 0.0005 1 0 0.8659 0.1334 0.0008
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 484 129 355 65 1 6 0 57 0 0 355 0 0 0.5039 0.0000 0.0000 20.500 0.31 1.32 -1.01 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3741 0.5625 0.0634 1 1 0.3748 0.5572 0.0680 1 1 0.3749 0.5507 0.0745
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 373 103 270 56 0 3 1 43 0 0 268 0 2 0.5437 0.0000 0.0074 33.333 0.23 1.30 -1.07 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4236 0.5181 0.0583 1 1 0.4215 0.5158 0.0627 1 1 0.4181 0.5132 0.0688
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 114 36 78 15 1 2 5 13 0 0 78 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 16.500 0.07 1.69 -1.63 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1965 0.5366 0.2668 1 1 0.1990 0.5339 0.2671 1 1 0.2023 0.5304 0.2673
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1220 309 911 106 2 81 26 94 0 0 910 0 1 0.3430 0.0000 0.0011 2.815 0.18 3.21 -3.03 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0260 0.6032 0.3708 1 1 0.0294 0.5934 0.3772 1 1 0.0342 0.5814 0.3844
chr3 113657263 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1226 320 906 218 9 65 2 26 0 0 906 0 0 0.6813 0.0000 0.0000 3.984 1.39 7.88 -6.50 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0010 0.9990 0.0000
chr3 122740443 G GAGA 0.500000 0.100 1 3 3 530 161 369 93 0 3 0 65 0 0 368 0 1 0.5776 0.0000 0.0027 52.667 0.05 2.94 -2.88 55 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7663 0.2300 0.0036 1 0 0.7578 0.2378 0.0044 1 0 0.7454 0.2489 0.0057
chr3 124763647 TTTGTTGAAC T 0.500000 0.100 1 -9 1 345 147 198 137 0 5 0 5 0 0 197 0 1 0.9320 0.0000 0.0051 28.400 0.32 9.00 -8.68 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.6116 0.3884 0.0000 0 0 0.9425 0.0575 0.0000
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 726 132 594 47 0 27 0 58 0 0 594 0 0 0.3561 0.0000 0.0000 3.889 1.98 8.14 -6.16 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0505 0.5027 0.4468 1 1 0.0546 0.5013 0.4441 1 1 0.0604 0.4997 0.4399
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 187 112 75 66 0 0 1 45 0 0 74 0 1 0.5893 0.0000 0.0133 112.000 0.65 1.84 -1.19 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6441 0.3410 0.0149 1 0 0.6359 0.3471 0.0170 1 0 0.6241 0.3557 0.0202
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 370 137 233 129 0 3 0 5 0 0 233 0 0 0.9416 0.0000 0.0000 44.667 0.74 2.40 -1.66 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0113 0.9887 0.0000 0 0 0.7558 0.2442 0.0000 0 0 0.9550 0.0450 0.0000
chr3 134250569 A AGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 228 51 177 30 2 4 2 13 0 0 177 0 0 0.5882 0.0000 0.0000 11.250 0.97 5.08 -4.11 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6609 0.3152 0.0240 1 0 0.6488 0.3244 0.0267 1 0 0.6320 0.3372 0.0308
chr3 149520808 C CTTAA 0.500000 0.100 1 4 1 187 61 126 41 0 0 0 20 0 0 125 0 1 0.6721 0.0000 0.0079 61.000 0.05 4.10 -4.05 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7182 0.2682 0.0136 1 0 0.7062 0.2782 0.0156 1 0 0.6895 0.2919 0.0187
chr3 150703740 CTCCTCCTCCTCCTCCACCTCT C 0.500000 0.100 1 -21 2 425 111 314 54 1 25 0 31 0 0 314 0 0 0.4865 0.0000 0.0000 3.440 0.70 8.32 -7.62 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7745 0.2189 0.0067 1 0 0.7631 0.2290 0.0079 1 0 0.7471 0.2431 0.0098
chr3 179242978 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 298 101 197 90 0 4 0 7 0 0 197 0 0 0.8911 0.0000 0.0000 24.250 0.13 1.00 -0.87 30 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0504 0.9496 0.0000 0 1 0.4706 0.5294 0.0000
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 367 144 223 49 1 18 6 70 0 0 220 1 2 0.3403 0.0000 0.0135 7.000 0.61 3.11 -2.50 31 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0027 0.1758 0.8216 1 2 0.0033 0.1850 0.8118 1 2 0.0043 0.1980 0.7977
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 555 137 418 5 1 29 0 102 0 0 414 1 3 0.0365 0.0000 0.0096 3.724 0.60 3.31 -2.71 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.7442 0.2558 2 2 0.0000 0.2138 0.7862
chr3 190388282 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 655 187 468 169 0 9 0 9 0 0 468 0 0 0.9037 0.0000 0.0000 19.778 0.14 2.11 -1.98 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2459 0.7541 0.0000 0 0 0.9192 0.0808 0.0000
chr3 195721040 TTTC T 0.500000 0.100 1 -3 4 211 132 79 127 0 3 0 2 0 0 79 0 0 0.9621 0.0000 0.0000 43.000 0.35 3.00 -2.65 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8838 0.1162 0.0000 0 0 0.9854 0.0146 0.0000 0 0 0.9925 0.0075 0.0000
chr3 195726146 GC G 0.500000 0.100 1 -1 4 1057 244 813 230 2 4 0 8 0 0 813 0 0 0.9426 0.0000 0.0000 59.750 1.43 2.62 -1.19 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0028 0.9972 0.0000 0 0 0.9561 0.0439 0.0000 0 0 0.9978 0.0022 0.0000
chr3 195786912 GGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTCACCTGTGGATGCTGAGGAAGGGCTA G 0.500000 0.100 1 -48 1 3649 1042 2607 593 33 250 20 146 207 91 2234 34 41 0.5691 0.0794 0.1431 3.189 2.61 4.83 -2.22 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr3 195788495 CGGTGACAGGAAGAGGGGTGGTGTGACCTGTGGATACTGAGGAAGGGCT C 0.500000 0.100 1 -48 1 2885 729 2156 364 23 117 9 216 50 47 1962 27 70 0.4993 0.0232 0.0900 5.224 1.56 4.96 -3.40 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 749 175 574 8 0 22 0 145 0 1 541 0 32 0.0457 0.0000 0.0575 6.955 1.00 10.69 -9.69 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.6642 0.3358 2 2 0.0000 0.0551 0.9449
chr3 198153257 CTGGCAGCAGCAG C 0.500000 0.100 1 -12 2 258 97 161 13 3 5 2 74 0 0 160 1 0 0.1340 0.0000 0.0062 22.750 0.15 9.77 -9.62 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9976 0.0024
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 257 97 160 2 0 15 0 80 0 0 159 1 0 0.0206 0.0000 0.0063 5.467 0.00 9.47 -9.47 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5782 0.4218 2 2 0.0000 0.1283 0.8717 2 2 0.0000 0.0662 0.9338
chr3 198153259 GGCAGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -9 1 257 96 161 2 0 15 3 76 0 1 159 0 1 0.0208 0.0000 0.0124 5.400 0.00 9.62 -9.62 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6484 0.3516 2 2 0.0000 0.1610 0.8390 2 2 0.0000 0.0821 0.9179
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 505 89 416 23 0 0 0 66 0 0 351 0 65 0.2584 0.0000 0.1562 89.000 0.35 17.44 -17.09 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 745 300 445 130 0 83 0 87 0 0 438 0 7 0.4333 0.0000 0.0157 2.614 7.68 8.36 -0.68 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8985 0.1013 0.0002 1 0 0.8933 0.1064 0.0003 1 0 0.8857 0.1139 0.0004
chr4 3228683 AGAG A 0.066858 0.100 1 -3 2 386 144 242 126 0 13 0 5 0 0 242 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 10.077 0.33 2.40 -2.07 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1138 0.8862 0.0000 0 0 0.9736 0.0264 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr4 4197221 GCGTTGC G 0.061581 0.100 1 -6 2 485 156 329 147 0 2 0 7 0 0 329 0 0 0.9423 0.0000 0.0000 77.000 0.24 7.29 -7.05 97 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 0 0.9317 0.0683 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 666 163 503 15 1 22 3 122 0 1 486 0 16 0.0920 0.0000 0.0338 6.619 1.07 7.48 -6.42 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9564 0.0436
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 669 208 461 19 3 35 10 141 0 0 451 1 9 0.0913 0.0000 0.0217 5.182 1.26 6.33 -5.06 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9962 0.0038
chr4 15003704 GCCCGGACCTTCCACA G 0.500000 0.100 1 -15 1 646 118 528 110 0 2 0 6 6 3 517 1 1 0.9322 0.0114 0.0208 58.000 1.86 14.33 -12.47 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0912 0.9088 0.0000 0 0 0.6800 0.3200 0.0000
chr4 15511381 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 4 368 154 214 133 1 16 0 4 0 0 214 0 0 0.8636 0.0000 0.0000 8.625 0.35 3.25 -2.90 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1130 0.8870 0.0000 0 0 0.9193 0.0807 0.0000 0 0 0.9808 0.0192 0.0000
chr4 56314410 C CGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 9 1 656 123 533 17 0 3 0 103 0 0 501 0 32 0.1382 0.0000 0.0600 40.000 0.71 11.82 -11.11 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9874 0.0126
chr4 56314410 C CGGAGCGGAGGGAGCGGAG 0.500000 0.100 1 18 1 656 123 533 18 3 41 1 60 0 0 501 0 32 0.1463 0.0000 0.0600 2.077 1.39 12.68 -11.29 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9994 0.0006
chr4 56378269 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 252 84 168 46 1 1 0 36 0 0 168 0 0 0.5476 0.0000 0.0000 82.000 0.13 3.08 -2.95 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4660 0.4793 0.0548 1 1 0.4614 0.4797 0.0589 1 1 0.4548 0.4804 0.0648
chr4 70602628 CAGG C 0.500000 0.100 1 -3 3 436 141 295 132 1 3 0 5 0 8 287 0 0 0.9362 0.0000 0.0271 46.000 0.70 4.00 -3.30 92 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0204 0.9796 0.0000 0 0 0.8545 0.1455 0.0000 0 0 0.9754 0.0246 0.0000
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.100 1 3 1 308 94 214 82 1 2 0 9 0 0 214 0 0 0.8723 0.0000 0.0000 46.000 0.50 3.33 -2.83 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 1 0.1483 0.8517 0.0000
chr4 78870928 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 1 1141 440 701 205 8 79 5 143 0 1 691 1 8 0.4659 0.0000 0.0143 4.544 0.78 3.09 -2.32 111 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9623 0.0376 0.0000 1 0 0.9591 0.0409 0.0000 1 0 0.9541 0.0458 0.0000
chr4 87614680 A ATAGCAGTGACAGCAGCAG 0.500000 0.100 1 18 1 2375 486 1889 296 7 162 8 13 4 2 1875 4 4 0.6091 0.0021 0.0074 2.006 1.30 6.31 -5.00 86 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.6079 0.3921 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 3767 813 2954 41 21 45 19 687 48 54 2640 155 57 0.0504 0.0162 0.1063 19.789 2.85 10.03 -7.18 3 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615390 AACAGCAGTG A 0.500000 0.100 1 -9 1 3975 787 3188 94 5 113 15 560 28 78 2786 102 194 0.1194 0.0088 0.1261 5.946 3.12 11.01 -7.89 30 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 3624 1213 2411 680 90 203 60 180 325 46 2021 11 8 0.5606 0.1348 0.1618 5.042 2.90 5.89 -2.99 104 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr4 88697332 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 541 128 413 110 3 5 0 10 0 0 413 0 0 0.8594 0.0000 0.0000 24.600 0.45 3.50 -3.05 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0066 0.9934 0.0000 0 1 0.2805 0.7195 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 151 70 81 27 1 1 0 41 0 0 80 0 1 0.3857 0.0000 0.0123 69.000 0.11 3.02 -2.91 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0353 0.3984 0.5663 1 2 0.0387 0.4035 0.5578 1 2 0.0436 0.4103 0.5461
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 646 168 478 9 0 6 0 153 0 0 474 0 4 0.0536 0.0000 0.0084 27.000 1.00 4.03 -3.03 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8508 0.1492 2 2 0.0000 0.1368 0.8632
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 515 233 282 0 1 34 11 187 0 0 278 0 4 0.0000 0.0000 0.0142 5.824 3.03 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 406 121 285 3 2 29 4 83 0 0 269 7 9 0.0248 0.0000 0.0561 3.250 1.33 4.80 -3.46 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9767 0.0233 2 2 0.0000 0.3386 0.6614 2 2 0.0000 0.0966 0.9034
chr4 146639305 T TGGCGGCGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 15 2 406 121 285 50 2 28 6 35 1 0 269 0 15 0.4132 0.0035 0.0561 3.179 3.70 6.97 -3.27 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1510 0.6232 0.2257 1 1 0.1561 0.6142 0.2297 1 1 0.1626 0.6028 0.2345
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 290 94 196 0 0 17 1 76 0 0 188 0 8 0.0000 0.0000 0.0408 4.529 5.17 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0128 0.9872 2 2 0.0000 0.0140 0.9860 2 2 0.0000 0.0158 0.9842
chr4 168878233 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 536 140 396 67 0 10 1 62 0 0 395 1 0 0.4786 0.0000 0.0025 13.000 0.48 3.60 -3.12 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2296 0.6450 0.1254 1 1 0.2344 0.6345 0.1310 1 1 0.2403 0.6212 0.1385
chr4 173332125 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 152 48 104 26 0 2 1 19 0 0 104 0 0 0.5417 0.0000 0.0000 23.000 0.27 3.21 -2.94 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3722 0.5145 0.1132 1 1 0.3691 0.5133 0.1176 1 1 0.3648 0.5117 0.1235
chr4 184694537 ACAGATGAAG A 0.500000 0.100 1 -9 2 291 83 208 52 0 5 0 26 0 0 206 0 2 0.6265 0.0000 0.0096 15.600 0.31 10.12 -9.81 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7795 0.2138 0.0067 1 0 0.7679 0.2242 0.0079 1 0 0.7515 0.2386 0.0099
chr5 271742 CCCGGCCCTGGGG C 0.122901 0.100 1 -12 4 223 87 136 73 0 9 0 5 1 0 135 0 0 0.8391 0.0074 0.0074 8.667 0.84 10.00 -9.16 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 0 0.5836 0.4164 0.0000 0 0 0.9127 0.0873 0.0000
chr5 56815575 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 4 299 85 214 45 0 6 0 34 0 0 213 0 1 0.5294 0.0000 0.0047 13.167 0.82 3.50 -2.68 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4471 0.4913 0.0616 1 1 0.4430 0.4911 0.0659 1 1 0.4372 0.4909 0.0719
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 715 162 553 69 1 31 3 58 0 0 553 0 0 0.4259 0.0000 0.0000 4.226 0.19 3.62 -3.43 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3669 0.5715 0.0616 1 1 0.3682 0.5655 0.0662 1 1 0.3691 0.5581 0.0727
chr5 61332701 CGGCGGCGGCGCG C 0.500000 0.100 1 -12 2 341 50 291 21 0 12 0 17 0 0 287 1 3 0.4200 0.0000 0.0137 3.167 5.24 13.94 -8.70 19 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2242 0.5513 0.2245 1 1 0.2261 0.5474 0.2265 1 1 0.2285 0.5426 0.2289
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 320 30 290 0 0 16 0 14 0 2 282 1 5 0.0000 0.0000 0.0276 0.875 10.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4534 0.5466 2 2 0.0000 0.4126 0.5874 2 2 0.0000 0.3830 0.6170
chr5 61332791 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 295 34 261 8 0 17 0 9 1 1 253 5 1 0.2353 0.0038 0.0307 1.000 6.12 4.11 2.01 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1426 0.5049 0.3525 1 1 0.1463 0.5045 0.3492 1 1 0.1512 0.5040 0.3448
chr5 66596939 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 396 98 298 75 0 5 1 17 3 2 293 0 0 0.7653 0.0101 0.0168 18.600 1.56 3.82 -2.26 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr5 74726021 TACTCAA T 0.500000 0.100 1 -6 1 390 114 276 62 0 3 0 49 0 0 275 0 1 0.5439 0.0000 0.0036 37.000 0.26 5.63 -5.37 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4657 0.4911 0.0432 1 1 0.4628 0.4902 0.0470 1 1 0.4582 0.4893 0.0525
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 481 131 350 16 0 4 0 111 0 0 345 0 5 0.1221 0.0000 0.0143 31.750 0.12 3.32 -3.20 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9904 0.0096
chr5 78015515 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 144 74 70 35 0 1 0 38 0 0 70 0 0 0.4730 0.0000 0.0000 73.000 0.31 3.21 -2.90 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1501 0.5780 0.2720 1 1 0.1544 0.5721 0.2735 1 1 0.1601 0.5648 0.2751
chr5 80654880 TGCAGCGGCTGCAGCGGCC T 0.500000 0.100 1 -18 1 341 80 261 27 7 9 2 35 0 0 258 0 3 0.3375 0.0000 0.0115 7.778 6.78 13.71 -6.94 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1107 0.5532 0.3361 1 1 0.1154 0.5491 0.3356 1 1 0.1216 0.5439 0.3344
chr5 80654908 GCAGCGCCCC G 0.500000 0.100 1 -9 2 331 68 263 1 1 6 3 57 0 0 261 0 2 0.0147 0.0000 0.0076 10.167 1.00 14.72 -13.72 1 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.3508 0.6492 2 2 0.0000 0.1475 0.8525 2 2 0.0000 0.1057 0.8943
chr5 80654922 GCCCCCAGCT G 0.500000 0.100 1 -9 1 335 68 267 2 3 2 6 55 0 0 263 1 3 0.0294 0.0000 0.0150 66.000 1.00 15.71 -14.71 2 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.8647 0.1353 2 1 0.0000 0.5042 0.4958
chr5 94653283 G GA 0.500000 0.100 1 1 2 161 71 90 33 0 4 0 34 0 0 89 1 0 0.4648 0.0000 0.0111 16.750 0.27 1.03 -0.76 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1738 0.5783 0.2480 1 1 0.1776 0.5724 0.2500 1 1 0.1826 0.5651 0.2524
chr5 98856460 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 249 104 145 65 0 1 0 38 0 0 145 0 0 0.6250 0.0000 0.0000 103.000 0.20 3.03 -2.83 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8111 0.1850 0.0038 1 0 0.8004 0.1949 0.0047 1 0 0.7852 0.2088 0.0060
chr5 113488327 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 225 101 124 53 0 12 1 35 0 0 124 0 0 0.5248 0.0000 0.0000 7.417 1.87 3.31 -1.45 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6225 0.3562 0.0213 1 0 0.6135 0.3626 0.0239 1 0 0.6009 0.3713 0.0278
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 225 101 124 75 4 14 1 7 0 0 123 0 1 0.7426 0.0000 0.0081 6.214 2.17 5.14 -2.97 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0070 0.9930 0.0000 0 1 0.1672 0.8328 0.0000
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 1200 267 933 126 3 31 2 105 2 3 913 6 9 0.4719 0.0021 0.0214 7.613 0.72 3.99 -3.27 46 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3050 0.6653 0.0297 1 1 0.3143 0.6522 0.0335 1 1 0.3252 0.6358 0.0390
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 535 127 408 60 0 5 0 62 0 0 408 0 0 0.4724 0.0000 0.0000 24.400 0.27 1.37 -1.10 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1445 0.6408 0.2148 1 1 0.1499 0.6306 0.2195 1 1 0.1570 0.6177 0.2253
chr5 123090276 A ACCTCCGCCT 0.500000 0.100 1 9 2 405 111 294 85 0 19 0 7 0 0 292 0 2 0.7658 0.0000 0.0068 4.842 1.64 8.57 -6.94 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 1 0.1609 0.8391 0.0000
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 180 59 121 51 0 2 0 6 0 0 121 0 0 0.8644 0.0000 0.0000 28.500 0.55 3.17 -2.62 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0211 0.9789 0.0000 0 1 0.2017 0.7983 0.0000
chr5 139848487 CCCGGGT C 0.500000 0.100 1 -6 3 301 35 266 17 1 4 2 11 0 0 265 0 1 0.4857 0.0000 0.0038 7.250 1.88 6.27 -4.39 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3309 0.5192 0.1499 1 1 0.3287 0.5177 0.1535 1 1 0.3257 0.5159 0.1584
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 219 100 119 89 1 1 1 8 0 0 118 0 1 0.8900 0.0000 0.0084 99.000 0.22 4.75 -4.53 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 1 0.1166 0.8834 0.0000
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 219 100 119 90 1 0 1 8 0 0 118 1 0 0.9000 0.0000 0.0084 100.000 0.22 4.75 -4.53 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 1 0.1430 0.8570 0.0000
chr5 140966860 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 566 150 416 85 0 8 0 57 0 0 416 0 0 0.5667 0.0000 0.0000 17.750 0.33 6.39 -6.06 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7974 0.1995 0.0031 1 0 0.7880 0.2082 0.0038 1 0 0.7745 0.2205 0.0049
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 868 254 614 218 3 5 0 28 0 0 613 0 1 0.8583 0.0000 0.0016 49.800 0.28 1.32 -1.04 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000
chr5 141573996 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 614 158 456 109 3 33 4 9 0 0 456 0 0 0.6899 0.0000 0.0000 3.727 0.46 3.11 -2.65 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.0776 0.9224 0.0000
chr5 141945390 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 380 105 275 40 0 12 1 52 0 0 271 0 4 0.3810 0.0000 0.0145 7.750 0.30 5.69 -5.39 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0213 0.3672 0.6115 1 2 0.0239 0.3729 0.6032 1 2 0.0278 0.3807 0.5916
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 380 105 275 40 4 8 1 52 0 0 271 0 4 0.3810 0.0000 0.0145 12.125 0.30 5.69 -5.39 10 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0405 0.4647 0.4948 1 2 0.0442 0.4655 0.4903 1 2 0.0496 0.4668 0.4836
chr5 146878727 A AGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 1 323 109 214 73 3 22 0 11 1 0 213 0 0 0.6697 0.0047 0.0047 3.955 1.78 4.91 -3.13 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0347 0.9653 0.0000
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 18 1 323 109 214 73 3 23 1 9 1 0 213 0 0 0.6697 0.0047 0.0047 3.739 1.78 6.00 -4.22 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 1 0.0894 0.9106 0.0000
chr5 146878727 AGCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 323 109 214 48 1 20 1 39 0 1 213 0 0 0.4404 0.0000 0.0047 4.450 1.35 3.13 -1.77 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4371 0.5029 0.0600 1 1 0.4339 0.5018 0.0644 1 1 0.4291 0.5005 0.0704
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 608 129 479 122 0 1 0 6 0 0 479 0 0 0.9457 0.0000 0.0000 128.000 0.31 1.83 -1.52 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.4289 0.5711 0.0000 0 0 0.8882 0.1118 0.0000
chr5 150656742 ACCGCCCCCGCCC A 0.500000 0.100 1 -12 2 529 121 408 58 1 19 0 43 0 0 407 0 1 0.4793 0.0000 0.0025 5.316 4.16 11.19 -7.03 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5505 0.4202 0.0293 1 0 0.5443 0.4233 0.0325 1 0 0.5353 0.4276 0.0371
chr5 156757714 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 300 123 177 75 0 2 0 46 0 0 174 0 3 0.6098 0.0000 0.0169 60.500 0.17 3.11 -2.94 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7760 0.2194 0.0046 1 0 0.7661 0.2284 0.0055 1 0 0.7519 0.2411 0.0070
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 355 107 248 62 0 4 0 41 0 0 246 0 2 0.5794 0.0000 0.0081 25.750 2.89 4.88 -1.99 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6527 0.3322 0.0151 1 0 0.6438 0.3390 0.0172 1 0 0.6312 0.3483 0.0205
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 353 150 203 112 0 9 11 18 0 0 202 0 1 0.7467 0.0000 0.0049 15.667 3.76 9.44 -5.69 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2497 0.7503 0.0000 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 353 144 209 0 10 4 0 130 0 0 207 0 2 0.0000 0.0000 0.0096 35.000 3.98 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9605 0.0395 2 2 0.0000 0.4168 0.5832
chr5 157108936 T TAGC 0.500000 0.100 1 3 1 130 67 63 40 2 5 0 20 0 0 63 0 0 0.5970 0.0000 0.0000 12.400 0.12 2.90 -2.77 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7581 0.2322 0.0097 1 0 0.7458 0.2429 0.0113 1 0 0.7286 0.2576 0.0138
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 180 66 114 0 23 6 1 36 0 0 114 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 9.833 3.44 0 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0338 0.3758 0.5904 1 2 0.0371 0.3823 0.5806 1 2 0.0420 0.3909 0.5672
chr5 168454037 GGGA G 0.500000 0.100 1 -3 1 180 67 113 6 33 2 1 25 0 0 112 0 1 0.0896 0.0000 0.0088 32.500 0.33 3.28 -2.95 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5100 0.4400 0.0499 1 0 0.5031 0.4430 0.0539 1 0 0.4934 0.4471 0.0595
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 435 118 317 57 1 10 0 50 0 0 315 0 2 0.4831 0.0000 0.0063 10.800 0.96 3.82 -2.86 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3128 0.5920 0.0952 1 1 0.3147 0.5850 0.1003 1 1 0.3165 0.5763 0.1072
chr5 181050253 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 268 72 196 65 0 1 0 6 0 0 196 0 0 0.9028 0.0000 0.0000 71.000 0.11 1.17 -1.06 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0418 0.9582 0.0000 0 1 0.3332 0.6668 0.0000
chr5 181260427 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 615 117 498 10 0 14 0 93 0 0 498 0 0 0.0855 0.0000 0.0000 7.357 0.90 3.04 -2.14 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.8704 0.1296
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 453 109 344 10 0 15 0 84 0 1 337 3 3 0.0917 0.0000 0.0203 6.267 0.00 3.52 -3.52 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009 2 1 0.0000 0.9308 0.0692
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 528 123 405 79 4 25 4 11 4 2 399 0 0 0.6423 0.0099 0.0148 4.042 2.03 4.64 -2.61 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.0661 0.9339 0.0000
chr6 1611782 A ACGG 0.232567 0.100 1 3 1 472 104 368 41 3 13 1 46 2 1 360 2 3 0.3942 0.0054 0.0217 7.583 1.15 3.74 -2.59 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2042 0.6536 0.1422 1 1 0.2123 0.6446 0.1431 1 1 0.2229 0.6330 0.1441
chr6 7727289 G GAGC 0.018903 0.100 1 3 2 561 131 430 62 2 14 1 52 0 0 430 0 0 0.4733 0.0000 0.0000 8.357 0.56 3.27 -2.70 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6225 0.3762 0.0013 1 0 0.6226 0.3759 0.0015 1 0 0.6222 0.3761 0.0016
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 1793 420 1373 37 7 129 12 235 0 0 1355 2 16 0.0881 0.0000 0.0131 2.248 1.03 3.58 -2.56 13 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 17600553 GGCCCCGGGCCGGCCCACA G 0.000569 0.100 1 -18 1 332 88 244 33 0 14 0 41 0 0 238 0 6 0.3750 0.0000 0.0246 5.286 0.79 12.95 -12.16 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1440 0.8546 0.0013 1 1 0.1546 0.8441 0.0013 1 1 0.1693 0.8295 0.0012
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 1411 299 1112 20 0 8 0 271 0 0 1060 0 52 0.0669 0.0000 0.0468 36.375 0.50 11.32 -10.82 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9977 0.0023 2 2 0.0000 0.1298 0.8702
chr6 29828657 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 434 121 313 16 0 1 0 104 0 0 313 0 0 0.1322 0.0000 0.0000 120.000 0.44 2.11 -1.67 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9946 0.0054
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 388 107 281 5 0 3 1 98 0 0 281 0 0 0.0467 0.0000 0.0000 34.667 0.00 1.27 -1.27 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.5919 0.4081 2 2 0.0000 0.1684 0.8316
chr6 31028873 A ACCTCTACTGAAGGCTCTGAGACCACCACAG 0.500000 0.100 1 30 2 2650 643 2007 200 13 261 14 155 18 32 1801 46 110 0.3110 0.0090 0.1026 1.431 2.29 4.05 -1.76 16 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0368 0.9632 1 2 0.0000 0.0386 0.9614 1 2 0.0000 0.0416 0.9584
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 861 228 633 217 1 3 0 7 0 0 633 0 0 0.9518 0.0000 0.0000 74.667 1.15 5.71 -4.57 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0115 0.9885 0.0000 0 0 0.9686 0.0314 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr6 31138723 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 509 125 384 61 52 4 0 8 0 2 382 0 0 0.4880 0.0000 0.0052 17.250 0.28 2.38 -2.10 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0472 0.9528 0.0000 0 0 0.5465 0.4535 0.0000
chr6 31138723 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 509 125 384 61 8 4 0 52 0 0 382 1 1 0.4880 0.0000 0.0052 30.250 0.28 2.50 -2.22 7 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5057 0.4619 0.0324 1 0 0.5019 0.4623 0.0358 1 0 0.4961 0.4632 0.0407
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 580 169 411 147 1 4 2 15 0 0 411 0 0 0.8698 0.0000 0.0000 55.000 2.46 8.00 -5.54 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0260 0.9740 0.0000
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 530 168 362 146 0 8 0 14 0 0 362 0 0 0.8690 0.0000 0.0000 20.000 0.10 11.00 -10.90 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.1300 0.8700 0.0000
chr6 31630711 TAGG T 0.500000 0.100 1 -3 3 320 140 180 82 0 0 0 58 0 0 179 0 1 0.5857 0.0000 0.0056 140.000 0.35 3.36 -3.01 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7047 0.2879 0.0074 1 0 0.6964 0.2949 0.0087 1 0 0.6845 0.3048 0.0108
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 466 129 337 113 1 11 0 4 0 0 336 0 1 0.8760 0.0000 0.0030 10.727 0.73 4.00 -3.27 21 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0050 0.9950 0.0000 0 0 0.5918 0.4082 0.0000 0 0 0.9107 0.0893 0.0000
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 277 68 209 38 0 2 0 28 0 0 209 0 0 0.5588 0.0000 0.0000 33.000 0.13 4.39 -4.26 10 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4622 0.4742 0.0637 1 1 0.4568 0.4752 0.0679 1 1 0.4494 0.4767 0.0739
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.100 1 2 2 196 89 107 85 2 1 0 1 0 0 106 1 0 0.9551 0.0000 0.0093 87.000 6.88 10.00 -3.12 13 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8867 0.1133 0.0000 0 0 0.9585 0.0415 0.0000 0 0 0.9693 0.0307 0.0000
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 432 142 290 52 0 17 0 73 0 0 285 0 5 0.3662 0.0000 0.0172 7.353 0.48 5.27 -4.79 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0045 0.2223 0.7732 1 2 0.0054 0.2311 0.7635 1 2 0.0069 0.2435 0.7496
chr6 40379364 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 811 220 591 203 2 8 0 7 0 0 591 0 0 0.9227 0.0000 0.0000 26.250 0.34 1.00 -0.66 127 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0075 0.9925 0.0000 0 0 0.9434 0.0566 0.0000 0 0 0.9957 0.0043 0.0000
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 1182 290 892 9 114 9 0 158 0 1 886 1 4 0.0310 0.0000 0.0067 35.000 3.33 3.46 -0.13 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.1138 0.8860 1 2 0.0003 0.1194 0.8803 1 2 0.0005 0.1279 0.8716
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 320 91 229 31 0 9 2 49 0 0 226 0 3 0.3407 0.0000 0.0131 9.000 0.42 8.49 -8.07 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0083 0.2394 0.7523 1 2 0.0097 0.2493 0.7409 1 2 0.0120 0.2630 0.7250
chr6 43021695 CCGGGGCCCGACGTCCCCG C 0.500000 0.100 1 -18 4 320 108 212 92 0 4 0 12 0 0 212 0 0 0.8519 0.0000 0.0000 26.000 2.88 14.17 -11.29 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0379 0.9621 0.0000
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 693 164 529 133 2 22 0 7 0 1 528 0 0 0.8110 0.0000 0.0019 6.455 0.65 3.29 -2.64 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.3406 0.6594 0.0000 0 0 0.8915 0.1085 0.0000
chr6 44002766 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 445 98 347 37 4 27 2 28 0 0 344 0 3 0.3776 0.0000 0.0086 2.630 1.97 4.75 -2.78 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4025 0.5170 0.0805 1 1 0.3997 0.5152 0.0851 1 1 0.3955 0.5131 0.0914
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 911 187 724 7 0 94 1 85 0 0 678 0 46 0.0374 0.0000 0.0635 0.989 15.14 4.29 10.85 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7027 0.2973 2 2 0.0000 0.1287 0.8713
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 30 2 911 187 724 8 0 109 2 68 0 0 680 1 43 0.0428 0.0000 0.0608 0.729 15.25 2.44 12.81 4 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9389 0.0611 2 2 0.0000 0.3812 0.6188
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.100 1 -15 2 927 265 662 177 0 80 0 8 0 0 662 0 0 0.6679 0.0000 0.0000 2.312 2.50 13.38 -10.87 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.5801 0.4199 0.0000 0 0 0.9694 0.0306 0.0000
chr6 87284268 T TA 0.500000 0.100 1 1 7 521 151 370 90 0 4 1 56 0 0 370 0 0 0.5960 0.0000 0.0000 36.750 0.58 2.20 -1.62 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8644 0.1344 0.0012 1 0 0.8555 0.1430 0.0016 1 0 0.8425 0.1553 0.0022
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 686 120 566 61 3 27 1 28 0 0 557 3 6 0.5083 0.0000 0.0159 3.407 1.87 5.43 -3.56 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8096 0.1864 0.0040 1 0 0.7988 0.1963 0.0048 1 0 0.7835 0.2103 0.0062
chr6 106973833 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 401 125 276 120 1 2 0 2 0 0 276 0 0 0.9600 0.0000 0.0000 61.000 0.35 7.00 -6.65 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8480 0.1520 0.0000 0 0 0.9802 0.0198 0.0000 0 0 0.9898 0.0102 0.0000
chr6 108561444 TCGGCGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 1660 415 1245 326 6 18 0 65 2 1 1234 0 8 0.7855 0.0016 0.0088 22.056 1.30 6.88 -5.58 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 109443671 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 1 596 164 432 87 0 4 1 72 0 0 430 0 2 0.5305 0.0000 0.0046 40.000 0.31 2.92 -2.61 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4099 0.5521 0.0380 1 1 0.4116 0.5466 0.0418 1 1 0.4128 0.5400 0.0473
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 134 48 86 41 1 4 0 2 0 0 86 0 0 0.8542 0.0000 0.0000 10.750 0.76 3.00 -2.24 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0903 0.9097 0.0000 0 1 0.4906 0.5094 0.0000 0 0 0.6789 0.3211 0.0000
chr6 109659228 CTCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 171 36 135 19 0 2 0 15 0 0 133 0 2 0.5278 0.0000 0.0148 17.000 1.00 4.87 -3.87 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2755 0.5392 0.1853 1 1 0.2755 0.5362 0.1882 1 1 0.2755 0.5325 0.1920
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 755 181 574 0 0 10 2 169 0 0 566 0 8 0.0000 0.0000 0.0139 17.000 3.73 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 116792598 A AGG 0.500000 0.100 1 2 1 669 133 536 54 0 2 0 77 0 0 531 1 4 0.4060 0.0000 0.0093 65.500 0.06 6.34 -6.28 4 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0031 0.1950 0.8018 1 2 0.0038 0.2040 0.7922 1 2 0.0050 0.2166 0.7784
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 312 115 197 109 0 4 0 2 0 0 197 0 0 0.9478 0.0000 0.0000 27.750 0.18 1.00 -0.82 87 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7583 0.2417 0.0000 0 0 0.9651 0.0349 0.0000 0 0 0.9821 0.0179 0.0000
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 850 208 642 0 0 8 1 199 0 0 636 0 6 0.0000 0.0000 0.0093 24.875 3.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 560 198 362 0 0 37 0 161 0 0 340 0 22 0.0000 0.0000 0.0608 4.351 14.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 434 161 273 94 1 1 0 65 0 0 272 0 1 0.5839 0.0000 0.0037 160.000 0.39 5.25 -4.85 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7979 0.1996 0.0026 1 0 0.7891 0.2077 0.0032 1 0 0.7764 0.2194 0.0042
chr6 160139848 CATG C 0.500000 0.100 1 -3 1 191 63 128 29 0 3 0 31 0 0 128 0 0 0.4603 0.0000 0.0000 20.000 6.79 10.00 -3.21 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1736 0.5683 0.2581 1 1 0.1773 0.5631 0.2596 1 1 0.1821 0.5567 0.2612
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 192 58 134 3 0 4 1 50 0 0 134 0 0 0.0517 0.0000 0.0000 13.500 2.67 9.84 -7.17 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9832 0.0168 2 1 0.0000 0.6564 0.3436 2 2 0.0000 0.3661 0.6339
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 293 133 160 7 0 16 6 104 0 0 155 3 2 0.0526 0.0000 0.0312 7.312 0.00 3.21 -3.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8467 0.1533 2 2 0.0000 0.2522 0.7478
chr6 167965859 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 848 211 637 193 0 13 0 5 0 0 637 0 0 0.9147 0.0000 0.0000 15.231 0.15 3.00 -2.85 79 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2185 0.7815 0.0000 0 0 0.9868 0.0132 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 942 315 627 8 2 18 127 160 0 0 627 0 0 0.0254 0.0000 0.0000 12.467 7.75 10.20 -2.45 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9981 0.0019 2 2 0.0000 0.0301 0.9699 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 942 297 645 116 29 16 34 102 0 0 645 0 0 0.3906 0.0000 0.0000 19.214 3.30 13.01 -9.71 60 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2494 0.7148 0.0358 1 1 0.2601 0.6997 0.0402 1 1 0.2731 0.6802 0.0466
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 261 84 177 45 0 5 0 34 0 0 175 0 2 0.5357 0.0000 0.0113 15.800 0.18 4.18 -4.00 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4189 0.5108 0.0703 1 1 0.4159 0.5093 0.0748 1 1 0.4113 0.5076 0.0810
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 259 81 178 33 2 13 0 33 0 2 176 0 0 0.4074 0.0000 0.0112 5.500 3.58 3.97 -0.39 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2911 0.5678 0.1411 1 1 0.2918 0.5627 0.1455 1 1 0.2924 0.5563 0.1513
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 259 81 178 37 3 11 0 30 0 0 176 0 2 0.4568 0.0000 0.0112 6.364 3.35 3.80 -0.45 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4008 0.5169 0.0823 1 1 0.3979 0.5152 0.0869 1 1 0.3937 0.5132 0.0931
chr7 5489915 A AG 0.500000 0.100 1 1 2 276 72 204 34 1 1 0 36 0 0 204 0 0 0.4722 0.0000 0.0000 71.000 1.09 1.33 -0.25 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1866 0.5849 0.2286 1 1 0.1902 0.5785 0.2312 1 1 0.1949 0.5706 0.2345
chr7 6484057 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 1 101 49 52 22 0 11 0 16 1 0 51 0 0 0.4490 0.0192 0.0192 3.455 0.59 3.06 -2.47 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4066 0.4919 0.1015 1 1 0.4019 0.4923 0.1059 1 1 0.3954 0.4928 0.1118
chr7 11831843 A AGCAGCG 0.500000 0.100 1 6 2 180 90 90 49 1 9 0 31 0 0 88 0 2 0.5444 0.0000 0.0222 8.889 0.92 6.13 -5.21 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6237 0.3539 0.0223 1 0 0.6144 0.3606 0.0250 1 0 0.6014 0.3696 0.0290
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 663 213 450 1 0 35 11 166 0 0 450 0 0 0.0047 0.0000 0.0000 5.086 0.00 2.97 -2.97 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr7 26152597 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 309 86 223 46 1 10 0 29 0 0 223 0 0 0.5349 0.0000 0.0000 7.600 0.80 3.00 -2.20 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6573 0.3238 0.0190 1 0 0.6468 0.3318 0.0214 1 0 0.6323 0.3426 0.0251
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 125 48 77 34 2 1 2 9 0 1 76 0 0 0.7083 0.0000 0.0130 45.000 0.09 2.89 -2.80 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6412 0.3552 0.0036 0 1 0.2600 0.7383 0.0018 0 1 0.0682 0.9313 0.0005
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 205 53 152 25 0 2 0 26 0 0 151 0 1 0.4717 0.0000 0.0066 25.500 0.08 3.65 -3.57 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1775 0.5586 0.2639 1 1 0.1809 0.5542 0.2649 1 1 0.1854 0.5487 0.2660
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 218 94 124 48 0 5 0 41 0 0 124 0 0 0.5106 0.0000 0.0000 17.800 0.23 2.93 -2.70 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3577 0.5530 0.0893 1 1 0.3571 0.5488 0.0941 1 1 0.3559 0.5435 0.1006
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 993 217 776 2 3 102 5 105 2 1 762 4 7 0.0092 0.0026 0.0180 1.118 7.00 5.01 1.99 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9993 0.0007 2 1 0.0000 0.8098 0.1902 2 2 0.0000 0.2902 0.7098
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.100 1 2 1 986 214 772 2 98 5 5 104 3 1 761 1 6 0.0093 0.0039 0.0142 23.000 7.00 5.08 1.92 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0252 0.9748 1 2 0.0001 0.0289 0.9711 1 2 0.0001 0.0346 0.9653
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 375 115 260 0 0 0 1 114 0 0 258 0 2 0.0000 0.0000 0.0077 115.000 2.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 872 206 666 0 0 13 0 193 0 0 656 0 10 0.0000 0.0000 0.0150 14.846 3.04 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 91265144 A ACCG 0.500000 0.100 1 3 2 576 160 416 68 0 21 1 70 0 2 410 1 3 0.4250 0.0000 0.0144 6.619 0.69 3.56 -2.87 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0982 0.6455 0.2562 1 1 0.1039 0.6350 0.2611 1 1 0.1115 0.6216 0.2669
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 234 82 152 1 0 1 0 80 0 0 149 0 3 0.0122 0.0000 0.0197 81.000 9.00 3.10 5.90 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1183 0.8817 2 2 0.0000 0.0439 0.9561 2 2 0.0000 0.0327 0.9673
chr7 100787939 GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 0.500000 0.100 1 -35 1 169 58 111 47 0 1 0 10 0 0 108 0 3 0.8103 0.0000 0.0270 57.000 1.23 28.30 -27.07 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7920 0.2070 0.0009 0 1 0.2673 0.7323 0.0004 0 1 0.0322 0.9678 0.0001
chr7 102541185 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 520 154 366 124 5 2 0 23 0 0 366 0 0 0.8052 0.0000 0.0000 76.000 0.56 1.26 -0.70 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000
chr7 102934552 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 576 159 417 83 0 5 1 70 0 0 416 0 1 0.5220 0.0000 0.0024 30.800 0.71 3.10 -2.39 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3922 0.5635 0.0443 1 1 0.3941 0.5576 0.0484 1 1 0.3955 0.5503 0.0543
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 460 113 347 0 0 34 3 76 0 0 337 0 10 0.0000 0.0000 0.0288 2.548 5.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0114 0.9886 2 2 0.0000 0.0124 0.9876 2 2 0.0000 0.0140 0.9860
chr7 121064295 ATAGT A 0.500000 0.100 1 -4 3 162 88 74 51 0 0 0 37 0 0 74 0 0 0.5795 0.0000 0.0000 88.000 0.71 4.68 -3.97 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5461 0.4198 0.0340 1 0 0.5392 0.4233 0.0374 1 0 0.5295 0.4282 0.0423
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 733 190 543 160 0 17 0 13 0 0 543 0 0 0.8421 0.0000 0.0000 10.176 0.69 4.08 -3.39 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.3591 0.6409 0.0000
chr7 124032402 CGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 728 215 513 182 0 21 0 12 0 0 513 0 0 0.8465 0.0000 0.0000 9.238 0.57 5.83 -5.26 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0256 0.9744 0.0000 0 0 0.7642 0.2358 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 637 204 433 96 0 33 1 74 1 0 430 0 2 0.4706 0.0023 0.0069 5.152 0.39 18.85 -18.47 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6057 0.3832 0.0110 1 0 0.6016 0.3856 0.0128 1 0 0.5950 0.3894 0.0155
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 329 161 168 116 9 25 2 9 1 1 166 0 0 0.7205 0.0060 0.0119 5.320 8.74 4.89 3.85 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 1 0.2838 0.7162 0.0000
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 329 163 166 10 1 19 2 131 0 0 163 0 3 0.0613 0.0000 0.0181 7.579 4.40 8.41 -4.01 10 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9923 0.0077 2 1 0.0000 0.6082 0.3918
chr7 131556270 GGGCGACGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -12 1 330 170 160 17 5 85 7 56 0 0 159 0 1 0.1000 0.0000 0.0063 0.929 3.00 11.18 -8.18 13 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0028 0.1466 0.8507 1 2 0.0034 0.1567 0.8399 1 2 0.0045 0.1712 0.8244
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 223 75 148 4 0 0 0 71 0 0 145 0 3 0.0533 0.0000 0.0203 75.000 1.25 3.31 -2.06 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9940 0.0060 2 1 0.0000 0.6371 0.3629 2 2 0.0000 0.2643 0.7357
chr7 139875656 G GTTTCTATTATGTACGATAT 0.500000 0.100 1 19 1 175 71 104 33 0 15 0 23 0 0 102 0 2 0.4648 0.0000 0.0192 3.733 0.06 9.17 -9.11 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4154 0.4996 0.0850 1 1 0.4113 0.4992 0.0895 1 1 0.4055 0.4988 0.0957
chr7 142864293 C CCCT 0.500000 0.100 1 3 3 893 239 654 12 14 44 4 165 0 0 649 0 5 0.0502 0.0000 0.0076 4.432 0.17 3.21 -3.04 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 893 249 644 191 5 39 1 13 0 0 644 0 0 0.7671 0.0000 0.0000 5.359 2.69 3.31 -0.62 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 0 0.6274 0.3726 0.0000
chr7 143510991 CT C 0.500000 0.100 1 -1 3 1449 396 1053 380 1 0 0 15 0 0 1053 0 0 0.9596 0.0000 0.0000 396.000 1.24 2.53 -1.29 222 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9556 0.0444 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 2088 508 1580 0 0 16 0 492 0 0 1579 0 1 0.0000 0.0000 0.0006 30.750 1.36 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 678 131 547 3 0 4 0 124 0 0 540 0 7 0.0229 0.0000 0.0128 31.750 0.33 4.02 -3.69 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4975 0.5025 2 2 0.0000 0.0339 0.9661 2 2 0.0000 0.0118 0.9882
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 225 63 162 1 0 6 0 56 0 0 157 0 5 0.0159 0.0000 0.0309 9.500 1.00 4.48 -3.48 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2918 0.7082 2 2 0.0000 0.1211 0.8789 2 2 0.0000 0.0896 0.9104
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 702 180 522 162 0 1 0 17 0 0 522 0 0 0.9000 0.0000 0.0000 179.000 0.70 1.71 -1.01 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0456 0.9544 0.0000
chr7 149819749 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 443 128 315 120 0 1 0 7 0 0 315 0 0 0.9375 0.0000 0.0000 127.000 0.99 1.29 -0.29 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1901 0.8099 0.0000 0 0 0.7915 0.2085 0.0000
chr7 150372306 GCCGCCAGGGGCC G 0.500000 0.100 1 -12 2 699 196 503 115 0 2 1 78 0 0 496 0 7 0.5867 0.0000 0.0139 97.000 0.60 10.74 -10.14 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7659 0.2316 0.0024 1 0 0.7589 0.2381 0.0030 1 0 0.7485 0.2475 0.0040
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 599 87 512 0 1 4 14 68 1 0 484 9 18 0.0000 0.0020 0.0547 20.500 7.07 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0391 0.9609 2 2 0.0000 0.0150 0.9850 2 2 0.0000 0.0113 0.9887
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 604 86 518 0 0 7 8 71 0 0 490 8 20 0.0000 0.0000 0.0541 15.800 6.94 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0043 0.9957 2 2 0.0000 0.0051 0.9949
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 617 75 542 0 1 1 2 71 0 1 463 39 39 0.0000 0.0000 0.1458 74.000 7.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr7 158871383 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 382 88 294 49 1 4 0 34 0 0 292 0 2 0.5568 0.0000 0.0068 20.750 0.53 3.41 -2.88 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5439 0.4209 0.0351 1 0 0.5370 0.4245 0.0386 1 0 0.5272 0.4293 0.0435
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 793 190 603 80 1 26 0 83 1 0 601 0 1 0.4211 0.0017 0.0033 6.269 0.46 6.12 -5.66 30 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1114 0.6836 0.2049 1 1 0.1173 0.6707 0.2120 1 1 0.1249 0.6541 0.2209
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 249 89 160 79 0 2 0 8 0 0 160 0 0 0.8876 0.0000 0.0000 43.500 0.16 2.88 -2.71 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0123 0.9877 0.0000 0 1 0.2466 0.7534 0.0000
chr8 10610095 C CCTCTTCTTGCAGCCCTTCTATTACTTTAGTCCCCTCTAACTGCACCCT 0.000003 0.100 1 48 5 1076 309 767 45 5 16 3 240 0 0 765 0 2 0.1456 0.0000 0.0026 19.333 2.07 4.17 -2.10 5 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 516 245 271 0 0 30 1 214 0 0 271 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 7.167 5.88 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 338 124 214 80 0 1 0 43 0 0 211 0 3 0.6452 0.0000 0.0140 123.000 0.65 7.07 -6.42 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9259 0.0738 0.0003 1 0 0.9199 0.0797 0.0004 1 0 0.9112 0.0884 0.0005
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 246 104 142 96 0 2 0 6 0 0 142 0 0 0.9231 0.0000 0.0000 102.000 0.31 3.17 -2.85 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.3204 0.6796 0.0000 0 0 0.8367 0.1633 0.0000
chr8 27536817 A AGTC 0.053422 0.100 1 3 1 135 63 72 56 0 2 0 5 0 0 72 0 0 0.8889 0.0000 0.0000 30.500 0.07 3.20 -3.13 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0046 0.9954 0.0000 0 0 0.5862 0.4138 0.0000 0 0 0.9155 0.0845 0.0000
chr8 38404506 GGTGA G 0.000044 0.100 1 -4 1 154 48 106 23 0 2 0 23 0 0 106 0 0 0.4792 0.0000 0.0000 23.000 0.00 3.87 -3.87 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4438 0.5562 0.0000 1 1 0.4480 0.5519 0.0000 1 1 0.4534 0.5466 0.0000
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 561 186 375 156 0 6 0 24 0 0 375 0 0 0.8387 0.0000 0.0000 30.000 0.34 3.29 -2.95 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 218 93 125 90 0 1 0 2 0 0 125 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 92.000 0.49 2.50 -2.01 20 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.5359 0.4641 0.0000 0 0 0.9142 0.0858 0.0000 0 0 0.9562 0.0438 0.0000
chr8 61676164 T TTTC 0.000496 0.100 1 3 1 229 74 155 43 1 8 0 22 0 0 154 0 1 0.5811 0.0000 0.0065 8.250 0.05 2.86 -2.82 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8522 0.1478 0.0000 1 0 0.8451 0.1549 0.0000 1 0 0.8351 0.1649 0.0000
chr8 73009048 C CGAG 0.002257 0.100 1 3 5 315 67 248 29 2 10 1 25 0 0 248 0 0 0.4328 0.0000 0.0000 5.700 0.45 2.84 -2.39 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5542 0.4453 0.0005 1 0 0.5547 0.4448 0.0005 1 0 0.5549 0.4446 0.0005
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 655 198 457 82 0 3 1 112 0 0 456 0 1 0.4141 0.0000 0.0022 65.000 2.68 15.30 -12.62 14 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0014 0.1796 0.8190 1 2 0.0018 0.1870 0.8112 1 2 0.0025 0.1977 0.7998
chr8 137837732 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 346 162 184 89 0 1 0 72 0 0 179 0 5 0.5494 0.0000 0.0272 161.000 0.22 3.07 -2.84 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4054 0.5571 0.0376 1 1 0.4074 0.5512 0.0414 1 1 0.4090 0.5441 0.0469
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 504 147 357 0 0 31 11 105 0 0 349 1 7 0.0000 0.0000 0.0224 3.742 5.10 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr8 143859347 CGGGCCT C 0.500000 0.100 1 -6 3 1302 126 1176 99 2 9 5 11 0 0 1175 0 1 0.7857 0.0000 0.0009 13.000 0.97 5.27 -4.30 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0027 0.9973 0.0000
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 935 197 738 182 1 6 0 8 0 0 738 0 0 0.9239 0.0000 0.0000 31.833 0.38 2.75 -2.37 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 0 0.6506 0.3494 0.0000 0 0 0.9769 0.0231 0.0000
chr9 117366 C CCG 0.163682 0.100 1 2 3 911 153 758 69 7 2 1 74 0 1 755 1 1 0.4510 0.0000 0.0040 150.000 1.74 4.89 -3.15 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2525 0.6897 0.0578 1 1 0.2631 0.6770 0.0599 1 1 0.2768 0.6607 0.0625
chr9 117370 GCC G 0.163813 0.100 1 -2 4 913 156 757 4 75 4 5 68 0 0 754 0 3 0.0256 0.0000 0.0040 37.333 4.50 5.01 -0.51 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1284 0.7214 0.1503 1 1 0.1378 0.7117 0.1504 1 1 0.1508 0.6990 0.1502
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 1256 432 824 174 4 86 15 153 0 0 822 0 2 0.4028 0.0000 0.0024 4.023 0.18 3.26 -3.08 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2490 0.7421 0.0090 1 1 0.2676 0.7221 0.0103 1 1 0.2918 0.6961 0.0121
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 330 98 232 25 1 28 0 44 0 0 225 0 7 0.2551 0.0000 0.0302 2.500 0.52 7.91 -7.39 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0056 0.1955 0.7988 1 2 0.0067 0.2061 0.7872 1 2 0.0085 0.2208 0.7707
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 842 243 599 229 0 5 0 9 0 0 599 0 0 0.9424 0.0000 0.0000 47.600 0.18 1.67 -1.49 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.8663 0.1337 0.0000 0 0 0.9952 0.0048 0.0000
chr9 33796692 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 467 160 307 147 0 6 1 6 0 0 307 0 0 0.9187 0.0000 0.0000 25.667 0.92 3.17 -2.25 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.4812 0.5188 0.0000 0 0 0.9342 0.0658 0.0000
chr9 34893048 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 1015 260 755 252 1 1 0 6 0 0 755 0 0 0.9692 0.0000 0.0000 259.000 0.09 2.17 -2.08 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4041 0.5959 0.0000 0 0 0.9981 0.0019 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr9 35560263 TGGCCCG T 0.500000 0.100 1 -6 1 608 114 494 60 0 5 1 48 0 0 490 0 4 0.5263 0.0000 0.0081 21.800 0.78 6.25 -5.47 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3346 0.5819 0.0835 1 1 0.3360 0.5755 0.0885 1 1 0.3372 0.5675 0.0953
chr9 35562396 A ATAGT 0.500000 0.100 1 4 5 664 158 506 147 1 5 0 5 0 0 504 0 2 0.9304 0.0000 0.0040 30.600 0.50 5.60 -5.10 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4892 0.5108 0.0000 0 0 0.9374 0.0626 0.0000
chr9 35674193 CGGAGAGGAGGATCTACCT C 0.500000 0.100 1 -18 3 407 145 262 57 0 32 0 56 0 0 262 0 0 0.3931 0.0000 0.0000 3.531 0.11 13.21 -13.11 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2011 0.6340 0.1649 1 1 0.2057 0.6243 0.1700 1 1 0.2115 0.6119 0.1766
chr9 35811488 ACCAGGACCAGAG A 0.500000 0.100 1 -12 1 710 172 538 82 1 28 0 61 0 0 527 1 10 0.4767 0.0000 0.0204 5.143 0.40 10.41 -10.01 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3818 0.5714 0.0469 1 1 0.3839 0.5650 0.0511 1 1 0.3858 0.5571 0.0571
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 433 128 305 63 0 0 0 65 0 0 297 0 8 0.4922 0.0000 0.0262 128.000 0.17 13.22 -13.04 37 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0533 0.5597 0.3870 1 1 0.0577 0.5543 0.3880 1 1 0.0639 0.5477 0.3884
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 735 137 598 62 0 10 0 65 0 0 580 0 18 0.4526 0.0000 0.0301 12.700 0.21 10.71 -10.50 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0102 0.3334 0.6563 1 2 0.0119 0.3388 0.6493 1 2 0.0144 0.3465 0.6391
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 479 105 374 5 0 4 0 96 0 0 367 0 7 0.0476 0.0000 0.0187 25.250 0.00 3.42 -3.42 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9972 0.0028 2 1 0.0000 0.5447 0.4553 2 2 0.0000 0.1432 0.8568
chr9 88130024 A AAGG 0.500000 0.100 1 3 1 1178 300 878 190 0 8 1 101 0 0 875 0 3 0.6333 0.0000 0.0034 36.500 0.49 3.09 -2.60 82 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9982 0.0018 0.0000 1 0 0.9977 0.0023 0.0000 1 0 0.9970 0.0030 0.0000
chr9 88647428 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 1 190 70 120 1 0 2 0 67 0 0 118 0 2 0.0143 0.0000 0.0167 34.000 0.00 4.19 -4.19 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2151 0.7849 2 2 0.0000 0.0846 0.9154 2 2 0.0000 0.0626 0.9374
chr9 92474742 C CTCA 0.500000 0.100 1 3 2 298 79 219 8 4 19 0 48 0 0 215 0 4 0.1013 0.0000 0.0183 3.158 0.62 3.12 -2.50 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9567 0.0433 2 1 0.0000 0.9958 0.0042 2 1 0.0000 0.9937 0.0063
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 298 84 214 56 7 17 0 4 0 0 214 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 4.188 2.27 3.00 -0.73 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0035 0.9965 0.0000 0 1 0.2512 0.7488 0.0000 0 0 0.6244 0.3756 0.0000
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 415 150 265 10 1 2 0 137 0 0 264 0 1 0.0667 0.0000 0.0038 74.000 0.10 8.16 -8.06 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9917 0.0083 2 1 0.0000 0.5868 0.4132
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 844 309 535 94 0 1 1 213 0 0 533 0 2 0.3042 0.0000 0.0037 308.000 0.40 3.25 -2.85 12 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 419 107 312 43 1 14 1 48 0 0 312 0 0 0.4019 0.0000 0.0000 6.643 0.35 5.90 -5.55 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1115 0.5828 0.3057 1 1 0.1165 0.5765 0.3070 1 1 0.1231 0.5687 0.3082
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 858 148 710 0 0 33 2 113 0 1 700 0 9 0.0000 0.0000 0.0141 3.485 6.45 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr9 97904745 A AGACACCAAG 0.500000 0.100 1 9 1 245 89 156 76 0 11 0 2 0 0 155 0 1 0.8539 0.0000 0.0064 7.091 0.22 9.00 -8.78 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0576 0.9424 0.0000 0 0 0.6460 0.3540 0.0000 0 0 0.8535 0.1465 0.0000
chr9 104598487 GT G 0.500000 0.100 1 -1 2 441 93 348 18 0 0 1 74 0 0 348 0 0 0.1935 0.0000 0.0000 93.000 0.78 2.95 -2.17 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9490 0.0510 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr9 104605111 TGTTA T 0.500000 0.100 1 -4 1 909 228 681 133 0 1 0 94 0 0 679 0 2 0.5833 0.0000 0.0029 227.000 0.74 4.87 -4.13 41 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8638 0.1357 0.0006 1 0 0.8568 0.1424 0.0007 1 0 0.8465 0.1524 0.0011
chr9 104605383 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 823 192 631 21 0 4 4 163 0 0 627 1 3 0.1094 0.0000 0.0063 46.500 0.24 2.91 -2.68 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9945 0.0055
chr9 110138061 G GGAAGCT 0.500000 0.100 1 6 1 624 145 479 77 0 12 0 56 0 0 477 0 2 0.5310 0.0000 0.0042 11.083 0.32 5.34 -5.01 7 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6200 0.3657 0.0143 1 0 0.6135 0.3701 0.0164 1 0 0.6039 0.3765 0.0196
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 226 91 135 0 0 1 1 89 0 0 133 0 2 0.0000 0.0000 0.0148 90.000 3.99 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0091 0.9909 2 2 0.0000 0.0100 0.9900 2 2 0.0000 0.0114 0.9886
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 455 109 346 47 0 16 0 46 0 0 345 0 1 0.4312 0.0000 0.0029 5.812 0.38 6.76 -6.38 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1946 0.6133 0.1921 1 1 0.1988 0.6049 0.1963 1 1 0.2040 0.5944 0.2016
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 594 126 468 114 1 4 0 7 0 1 467 0 0 0.9048 0.0000 0.0021 30.250 0.45 6.14 -5.70 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1630 0.8370 0.0000 0 0 0.7611 0.2389 0.0000
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 541 134 407 69 1 9 1 54 0 0 407 0 0 0.5149 0.0000 0.0000 13.667 0.54 1.39 -0.85 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5315 0.4414 0.0271 1 0 0.5271 0.4428 0.0302 1 0 0.5204 0.4450 0.0346
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 570 183 387 95 4 20 1 63 0 2 380 2 3 0.5191 0.0000 0.0181 8.100 1.43 3.51 -2.08 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8336 0.1648 0.0015 1 0 0.8250 0.1730 0.0020 1 0 0.8126 0.1848 0.0027
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 546 177 369 69 0 5 0 103 0 0 366 0 3 0.3898 0.0000 0.0081 34.400 0.14 3.21 -3.07 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0006 0.1064 0.8931 1 2 0.0007 0.1139 0.8853 1 2 0.0011 0.1250 0.8740
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 693 211 482 112 0 21 1 77 0 0 477 0 5 0.5308 0.0000 0.0104 9.048 0.24 8.05 -7.81 78 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7724 0.2251 0.0024 1 0 0.7651 0.2319 0.0030 1 0 0.7543 0.2417 0.0040
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 462 128 334 43 6 35 2 42 1 0 331 0 2 0.3359 0.0030 0.0090 2.629 1.12 4.55 -3.43 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2856 0.5935 0.1209 1 1 0.2876 0.5865 0.1259 1 1 0.2898 0.5777 0.1325
chr9 133255669 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 631 144 487 71 0 3 0 70 0 0 486 0 1 0.4931 0.0000 0.0021 47.000 1.37 2.21 -0.85 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1663 0.6673 0.1664 1 1 0.1722 0.6555 0.1723 1 1 0.1798 0.6404 0.1798
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 306 116 190 63 0 0 0 53 0 0 189 0 1 0.5431 0.0000 0.0053 116.000 0.32 1.25 -0.93 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3813 0.5547 0.0640 1 1 0.3814 0.5499 0.0686 1 1 0.3809 0.5441 0.0750
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 306 116 190 63 0 0 0 53 0 0 189 0 1 0.5431 0.0000 0.0053 116.000 0.32 1.25 -0.93 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3813 0.5547 0.0640 1 1 0.3814 0.5499 0.0686 1 1 0.3809 0.5441 0.0750
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 287 124 163 65 0 8 0 51 0 0 162 0 1 0.5242 0.0000 0.0061 14.500 0.20 1.67 -1.47 3 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4867 0.4763 0.0370 1 0 0.4833 0.4761 0.0406 1 0 0.4781 0.4761 0.0458
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 428 117 311 71 1 1 0 44 0 0 311 0 0 0.6068 0.0000 0.0000 115.000 0.27 1.68 -1.41 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8140 0.1827 0.0033 1 0 0.8038 0.1922 0.0040 1 0 0.7891 0.2057 0.0052
chr9 136383542 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 1 577 170 407 0 0 19 7 144 0 0 402 1 4 0.0000 0.0000 0.0123 7.947 3.31 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 504 151 353 72 2 16 1 60 0 0 346 0 7 0.4768 0.0000 0.0198 8.438 1.29 12.73 -11.44 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2835 0.6296 0.0869 1 1 0.2876 0.6201 0.0923 1 1 0.2924 0.6080 0.0997
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 325 149 176 72 5 30 0 42 0 0 176 0 0 0.4832 0.0000 0.0000 3.967 0.38 2.93 -2.55 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8981 0.1010 0.0009 1 0 0.8894 0.1094 0.0011 1 0 0.8767 0.1217 0.0016
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 791 195 596 106 0 7 0 82 0 0 590 0 6 0.5436 0.0000 0.0101 26.857 0.27 8.45 -8.18 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6862 0.3129 0.0009 1 0 0.6867 0.3122 0.0011 1 0 0.6865 0.3122 0.0013
chr10 7563115 T TC 0.013494 0.100 1 1 1 320 88 232 51 0 0 0 37 0 0 231 1 0 0.5795 0.0000 0.0043 88.000 0.24 1.14 -0.90 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6979 0.3014 0.0007 1 0 0.6943 0.3049 0.0008 1 0 0.6891 0.3100 0.0009
chr10 18655037 AT A 0.002315 0.100 1 -1 3 62 24 38 12 0 1 0 11 0 0 38 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 23.000 0.08 1.00 -0.92 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4955 0.5035 0.0009 1 1 0.4967 0.5023 0.0010 1 1 0.4981 0.5009 0.0010
chr10 19352230 GC G 0.000697 0.100 1 -1 1 146 57 89 54 0 0 0 3 0 0 89 0 0 0.9474 0.0000 0.0000 57.000 1.57 1.33 0.24 4 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9666 0.0334 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 234 80 154 49 0 1 0 30 0 0 154 0 0 0.6125 0.0000 0.0000 79.000 0.29 3.83 -3.55 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7801 0.2156 0.0042 1 0 0.7722 0.2230 0.0048 1 0 0.7611 0.2331 0.0058
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 850 201 649 32 0 28 1 140 0 0 625 0 24 0.1592 0.0000 0.0370 6.179 0.12 5.51 -5.38 4 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 705 150 555 93 0 4 0 53 0 0 552 0 3 0.6200 0.0000 0.0054 36.500 0.26 3.94 -3.69 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9330 0.0668 0.0002 1 0 0.9273 0.0724 0.0003 1 0 0.9189 0.0807 0.0004
chr10 27147532 TGC T 0.011654 0.100 1 -2 1 312 131 181 84 0 1 0 46 0 0 181 0 0 0.6412 0.0000 0.0000 130.000 0.19 1.98 -1.79 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9576 0.0424 0.0000 1 0 0.9535 0.0465 0.0000 1 0 0.9473 0.0527 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 508 134 374 10 0 4 1 119 0 0 372 0 2 0.0746 0.0000 0.0053 32.500 0.50 1.26 -0.76 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9943 0.0057 2 1 0.0000 0.7568 0.2432
chr10 30027571 A ACTG 0.007813 0.100 1 3 1 892 191 701 94 4 26 1 66 0 0 698 0 3 0.4921 0.0000 0.0043 6.346 0.83 3.44 -2.61 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8700 0.1300 0.0000 1 0 0.8650 0.1349 0.0000 1 0 0.8578 0.1422 0.0000
chr10 46309137 T TTTGTGCCACTCCTGCTGC 0.003400 0.100 1 18 4 311 96 215 45 0 20 1 30 0 1 195 0 19 0.4688 0.0000 0.0930 3.800 0.16 12.47 -12.31 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2920 0.7057 0.0023 1 1 0.3028 0.6950 0.0023 1 1 0.3167 0.6810 0.0023
chr10 49679733 GC G 0.000246 0.100 1 -1 3 141 89 52 47 0 1 0 41 0 0 52 0 0 0.5281 0.0000 0.0000 88.000 0.45 1.17 -0.72 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5406 0.4593 0.0000 1 0 0.5430 0.4569 0.0000 1 0 0.5457 0.4543 0.0000
chr10 49988768 A AC 0.134835 0.100 1 1 1 668 229 439 219 0 0 0 10 0 0 439 0 0 0.9563 0.0000 0.0000 229.000 0.55 1.60 -1.05 111 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 0 0.8976 0.1024 0.0000 0 0 0.9977 0.0023 0.0000
chr10 49988921 AC A 0.048828 0.100 1 -1 1 721 211 510 122 3 5 1 80 0 0 510 0 0 0.5782 0.0000 0.0000 41.200 1.34 3.41 -2.08 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9642 0.0358 0.0000 1 0 0.9609 0.0391 0.0000 1 0 0.9559 0.0441 0.0000
chr10 50008914 CAA C 0.245598 0.100 1 -2 1 916 212 704 187 2 2 0 21 0 0 704 0 0 0.8821 0.0000 0.0000 105.000 0.18 2.48 -2.29 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0398 0.9602 0.0000
chr10 62217153 TAGCTTC T 0.152769 0.100 1 -6 3 100 52 48 33 0 0 0 19 0 0 48 0 0 0.6346 0.0000 0.0000 52.000 0.64 6.58 -5.94 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7187 0.2733 0.0081 1 0 0.7112 0.2799 0.0089 1 0 0.7010 0.2889 0.0101
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 384 108 276 37 0 25 3 43 0 0 275 0 1 0.3426 0.0000 0.0036 3.320 0.19 3.30 -3.11 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1379 0.6689 0.1933 1 1 0.1465 0.6632 0.1903 1 1 0.1584 0.6556 0.1860
chr10 80081665 C CA 0.104724 0.100 1 1 1 209 32 177 17 3 1 1 10 0 0 177 0 0 0.5312 0.0000 0.0000 28.000 0.24 1.20 -0.96 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6322 0.3539 0.0138 1 0 0.6269 0.3585 0.0146 1 0 0.6194 0.3649 0.0158
chr10 87234508 TCTC T 0.013816 0.100 1 -3 2 1023 403 620 371 12 9 0 11 0 0 620 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 43.778 0.42 2.82 -2.40 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3409 0.6591 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 660 136 524 86 0 3 0 47 0 0 523 0 1 0.6324 0.0000 0.0019 44.333 0.26 6.02 -5.77 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9433 0.0566 0.0002 1 0 0.9379 0.0619 0.0002 1 0 0.9298 0.0698 0.0003
chr10 97572621 TGGC T 0.015823 0.100 1 -3 3 468 139 329 92 0 1 0 46 0 0 326 0 3 0.6619 0.0000 0.0091 138.000 0.25 3.11 -2.86 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9722 0.0278 0.0000 1 0 0.9690 0.0310 0.0000 1 0 0.9641 0.0359 0.0000
chr10 101010536 T TGCTGCG 0.446080 0.100 1 6 1 595 184 411 144 0 24 1 15 0 0 411 0 0 0.7826 0.0000 0.0000 6.667 1.22 6.80 -5.58 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0451 0.9549 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 362 84 278 7 0 7 1 69 0 0 273 0 5 0.0833 0.0000 0.0180 10.857 1.00 6.20 -5.20 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9784 0.0216 2 1 0.0000 0.7233 0.2767
chr10 103473417 T TGGGGGCTCAGGCACTGCG 0.015096 0.100 1 18 1 397 131 266 64 0 18 1 48 0 0 261 0 5 0.4885 0.0000 0.0188 6.278 0.77 10.83 -10.07 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5974 0.4014 0.0013 1 0 0.5986 0.4000 0.0014 1 0 0.5996 0.3989 0.0015
chr10 104057110 CGCCACCAACACCGCCACCTCCTCCACT C 0.001817 0.100 1 -27 1 269 85 184 59 0 5 0 21 0 0 173 0 11 0.6941 0.0000 0.0598 16.000 0.49 20.71 -20.22 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9027 0.0972 0.0000 1 0 0.8964 0.1035 0.0000 1 0 0.8874 0.1126 0.0000
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 188 74 114 66 0 3 0 5 0 0 114 0 0 0.8919 0.0000 0.0000 23.667 0.48 3.40 -2.92 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0479 0.9521 0.0000 0 1 0.2752 0.7248 0.0000
chr10 116471844 GGC G 0.001719 0.100 1 -2 4 137 74 63 42 3 0 2 27 0 0 63 0 0 0.5676 0.0000 0.0000 73.000 3.24 4.78 -1.54 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7807 0.2193 0.0001 1 0 0.7744 0.2255 0.0001 1 0 0.7658 0.2341 0.0001
chr10 116471848 G GAA 0.001728 0.100 1 2 1 137 73 64 2 39 4 1 27 0 0 64 0 0 0.0274 0.0000 0.0000 10.667 3.50 4.78 -1.28 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4642 0.5351 0.0006 1 1 0.4679 0.5314 0.0007 1 1 0.4725 0.5268 0.0007
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 343 99 244 1 1 13 9 75 0 1 241 2 0 0.0101 0.0000 0.0123 5.923 0.00 2.07 -2.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7258 0.2742 2 2 0.0000 0.1824 0.8176 2 2 0.0000 0.0784 0.9216
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.100 1 21 2 634 155 479 128 0 10 0 17 1 0 475 0 3 0.8258 0.0021 0.0084 14.500 1.33 14.00 -12.67 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0095 0.9905 0.0000
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 495 154 341 82 0 5 0 67 0 0 341 0 0 0.5325 0.0000 0.0000 29.800 0.33 1.07 -0.75 24 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5025 0.4718 0.0257 1 0 0.5004 0.4709 0.0287 1 0 0.4966 0.4702 0.0332
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 759 163 596 75 0 16 0 72 0 0 593 0 3 0.4601 0.0000 0.0050 9.188 0.31 3.10 -2.79 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2108 0.6768 0.1123 1 1 0.2189 0.6645 0.1166 1 1 0.2294 0.6487 0.1220
chr11 608502 CGGACGCGCTCTG C 0.049275 0.100 1 -12 1 690 160 530 93 1 10 0 56 0 0 528 0 2 0.5813 0.0000 0.0038 15.000 0.40 11.43 -11.03 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9411 0.0589 0.0000 1 0 0.9364 0.0636 0.0001 1 0 0.9294 0.0705 0.0001
chr11 637361 CGCGGGGGCATCT C 0.071834 0.100 1 -12 2 326 125 201 110 1 5 0 9 0 0 199 0 2 0.8800 0.0000 0.0100 24.000 0.52 12.33 -11.82 56 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0262 0.9738 0.0000 0 0 0.7068 0.2932 0.0000
chr11 1094638 ACCAACCACCACTCCCAGCCCT A 0.029704 0.100 1 -21 2 1515 345 1170 108 12 142 13 70 6 3 1045 13 103 0.3130 0.0051 0.1068 1.423 2.57 12.49 -9.91 28 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.1570 0.8430 1 2 0.0001 0.1768 0.8232 1 2 0.0001 0.2069 0.7930
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 1062 235 827 136 2 85 2 10 0 0 827 0 0 0.5787 0.0000 0.0000 1.753 0.68 3.90 -3.22 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0054 0.9946 0.0000 0 1 0.3217 0.6783 0.0000
chr11 1630355 CCTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCTTA C 0.088777 0.100 1 -30 1 1072 226 846 18 0 92 1 115 0 0 806 0 40 0.0796 0.0000 0.0473 1.446 1.61 9.23 -7.61 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 995 288 707 52 2 121 2 111 0 1 706 0 0 0.1806 0.0000 0.0014 1.380 0.54 8.77 -8.23 14 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0119 0.9881 1 2 0.0000 0.0139 0.9861 1 2 0.0000 0.0172 0.9828
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 335 86 249 0 0 1 1 84 0 0 248 0 1 0.0000 0.0000 0.0040 85.000 3.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0123 0.9877 2 2 0.0000 0.0135 0.9865 2 2 0.0000 0.0152 0.9848
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 663 202 461 184 0 5 0 13 0 0 461 0 0 0.9109 0.0000 0.0000 39.400 0.18 1.23 -1.05 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0097 0.9903 0.0000 0 0 0.6444 0.3556 0.0000
chr11 4449480 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 530 150 380 85 0 1 1 63 0 0 377 0 3 0.5667 0.0000 0.0079 149.000 0.25 3.14 -2.90 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5761 0.4077 0.0162 1 0 0.5718 0.4097 0.0185 1 0 0.5650 0.4130 0.0219
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 244 106 138 67 0 1 0 38 0 0 136 0 2 0.6321 0.0000 0.0145 105.000 1.22 2.08 -0.86 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8082 0.1880 0.0038 1 0 0.7976 0.1978 0.0046 1 0 0.7825 0.2115 0.0060
chr11 4860474 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 1307 389 918 195 2 4 1 187 0 0 918 0 0 0.5013 0.0000 0.0000 96.250 0.26 1.27 -1.01 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1519 0.8225 0.0255 1 1 0.1656 0.8045 0.0298 1 1 0.1837 0.7801 0.0362
chr11 5151565 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 431 97 334 59 0 3 0 35 0 0 334 0 0 0.6082 0.0000 0.0000 31.333 0.59 2.09 -1.49 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7677 0.2257 0.0066 1 0 0.7567 0.2355 0.0078 1 0 0.7411 0.2491 0.0098
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 1643 424 1219 392 0 12 0 20 0 0 1219 0 0 0.9245 0.0000 0.0000 34.333 0.20 5.40 -5.20 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1532 0.8468 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 1135 280 855 248 0 12 0 20 0 0 855 0 0 0.8857 0.0000 0.0000 22.333 0.16 1.55 -1.39 82 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3117 0.6883 0.0000
chr11 5403157 T TTATC 0.500000 0.100 1 4 1 1585 373 1212 172 0 17 2 182 0 0 1200 0 12 0.4611 0.0000 0.0099 20.882 1.12 4.18 -3.06 52 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0042 0.5348 0.4610 1 1 0.0052 0.5230 0.4719 1 1 0.0067 0.5092 0.4840
chr11 5454410 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 398 89 309 52 0 1 0 36 0 0 309 0 0 0.5843 0.0000 0.0000 88.000 0.33 1.25 -0.92 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5979 0.3770 0.0251 1 0 0.5895 0.3825 0.0279 1 0 0.5778 0.3900 0.0322
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 720 131 589 0 0 20 1 110 0 0 570 0 19 0.0000 0.0000 0.0323 5.550 9.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0018 0.9982
chr11 6641514 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 5 577 151 426 116 3 28 0 4 1 1 424 0 0 0.7682 0.0023 0.0047 4.556 0.36 4.75 -4.39 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0639 0.9361 0.0000 0 0 0.8603 0.1397 0.0000 0 0 0.9656 0.0344 0.0000
chr11 6795057 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 1 773 144 629 74 0 9 0 61 0 0 629 0 0 0.5139 0.0000 0.0000 15.000 0.32 2.16 -1.84 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4662 0.4984 0.0354 1 1 0.4646 0.4964 0.0390 1 1 0.4614 0.4944 0.0442
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 245 118 127 8 0 10 6 94 0 0 127 0 0 0.0678 0.0000 0.0000 10.600 0.75 3.74 -2.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9711 0.0289 2 1 0.0000 0.5680 0.4320
chr11 12294797 G GCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 9 1 527 134 393 46 1 36 0 51 0 0 383 0 10 0.3433 0.0000 0.0254 2.722 1.33 10.80 -9.48 4 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0327 0.4441 0.5232 1 2 0.0360 0.4458 0.5182 1 2 0.0409 0.4484 0.5107
chr11 17372490 CTT C 0.500000 0.100 1 -2 2 940 252 688 237 1 7 0 7 0 0 688 0 0 0.9405 0.0000 0.0000 35.000 1.01 2.57 -1.56 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0321 0.9679 0.0000 0 0 0.9885 0.0115 0.0000 0 0 0.9992 0.0008 0.0000
chr11 20159199 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 3 194 97 97 56 0 1 0 40 0 0 96 0 1 0.5773 0.0000 0.0103 96.000 0.41 3.77 -3.36 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5622 0.4091 0.0287 1 0 0.5553 0.4128 0.0318 1 0 0.5455 0.4181 0.0364
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.100 1 -12 1 281 67 214 62 0 4 0 1 0 0 214 0 0 0.9254 0.0000 0.0000 15.750 0.21 12.00 -11.79 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7186 0.2814 0.0000 0 0 0.8841 0.1159 0.0000 0 0 0.9143 0.0857 0.0000
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 220 96 124 87 2 1 0 6 0 0 124 0 0 0.9062 0.0000 0.0000 95.000 0.76 6.50 -5.74 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1252 0.8748 0.0000 0 0 0.6147 0.3853 0.0000
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 788 233 555 129 0 9 0 95 0 0 555 0 0 0.5536 0.0000 0.0000 24.889 0.30 3.60 -3.30 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8282 0.1709 0.0010 1 0 0.8211 0.1776 0.0013 1 0 0.8108 0.1875 0.0018
chr11 49208393 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 231 85 146 45 0 1 0 39 0 0 146 0 0 0.5294 0.0000 0.0000 84.000 0.18 3.31 -3.13 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3367 0.5609 0.1025 1 1 0.3366 0.5561 0.1073 1 1 0.3360 0.5502 0.1138
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 1480 334 1146 0 0 9 0 325 0 0 1126 0 20 0.0000 0.0000 0.0175 36.111 2.64 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 80 34 46 15 0 0 0 19 0 0 46 0 0 0.4412 0.0000 0.0000 34.000 0.20 2.00 -1.80 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1487 0.5225 0.3287 1 1 0.1525 0.5208 0.3268 1 1 0.1574 0.5186 0.3240
chr11 62536083 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 240 78 162 37 1 10 0 30 0 0 161 0 1 0.4744 0.0000 0.0062 6.800 0.19 3.63 -3.44 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3771 0.5287 0.0942 1 1 0.3749 0.5263 0.0988 1 1 0.3716 0.5233 0.1051
chr11 65557854 C CCAGCAG 0.500000 0.100 1 6 3 276 82 194 61 2 11 0 8 0 0 193 0 1 0.7439 0.0000 0.0052 6.455 1.16 6.38 -5.21 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0016 0.9984 0.0000 0 1 0.0614 0.9386 0.0000
chr11 66744819 G GGGGGGC 0.500000 0.100 1 6 5 309 105 204 53 0 2 2 48 0 0 199 1 4 0.5048 0.0000 0.0245 102.000 0.79 5.00 -4.21 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1716 0.6284 0.1999 1 1 0.1765 0.6191 0.2044 1 1 0.1828 0.6072 0.2100
chr11 68050524 A AGGCCTG 0.500000 0.100 1 6 1 958 210 748 117 1 19 0 73 0 0 743 0 5 0.5571 0.0000 0.0067 10.053 0.39 6.05 -5.66 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9094 0.0902 0.0003 1 0 0.9025 0.0971 0.0004 1 0 0.8922 0.1072 0.0007
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 937 167 770 25 0 45 2 95 0 1 721 0 48 0.1497 0.0000 0.0636 2.711 0.36 5.92 -5.56 15 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 971 259 712 150 2 64 0 43 0 0 691 0 21 0.5792 0.0000 0.0295 3.031 0.27 13.86 -13.59 60 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9990 0.0010 0.0000 1 0 0.9988 0.0012 0.0000 1 0 0.9983 0.0017 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 1017 279 738 122 1 1 1 154 0 0 738 0 0 0.4373 0.0000 0.0000 277.000 0.39 2.17 -1.78 10 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0013 0.2422 0.7565 1 2 0.0016 0.2459 0.7525 1 2 0.0022 0.2519 0.7459
chr11 73309330 G GCTC 0.500000 0.100 1 3 1 688 145 543 18 1 13 0 113 0 0 539 0 4 0.1241 0.0000 0.0074 10.154 0.44 3.21 -2.77 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9981 0.0019
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 382 128 254 15 0 5 0 108 0 0 245 0 9 0.1172 0.0000 0.0354 24.600 0.13 15.31 -15.17 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9811 0.0189
chr11 83255888 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 159 68 91 44 0 3 1 20 0 0 91 0 0 0.6471 0.0000 0.0000 21.667 0.48 1.60 -1.12 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7771 0.2150 0.0079 1 0 0.7649 0.2258 0.0093 1 0 0.7478 0.2407 0.0115
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 648 179 469 92 0 10 0 77 0 0 466 0 3 0.5140 0.0000 0.0064 16.900 0.22 4.40 -4.19 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3987 0.5643 0.0369 1 1 0.4013 0.5579 0.0408 1 1 0.4036 0.5501 0.0463
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1302 374 928 122 1 85 2 164 0 0 926 1 1 0.3262 0.0000 0.0022 3.400 0.93 7.51 -6.59 2 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0871 0.9128 1 2 0.0002 0.0923 0.9075 1 2 0.0003 0.1003 0.8994
chr11 116858282 TTGCTGTTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 640 177 463 113 0 12 0 52 0 0 463 0 0 0.6384 0.0000 0.0000 13.750 0.26 8.98 -8.72 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9895 0.0105 0.0000 1 0 0.9875 0.0125 0.0000 1 0 0.9843 0.0157 0.0000
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 771 249 522 1 0 46 5 197 0 0 522 0 0 0.0040 0.0000 0.0000 4.413 13.00 9.66 3.34 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 260 110 150 62 0 3 0 45 0 0 147 0 3 0.5636 0.0000 0.0200 35.667 0.42 7.89 -7.47 12 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5162 0.4504 0.0334 1 0 0.5115 0.4517 0.0368 1 0 0.5045 0.4538 0.0417
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 362 105 257 9 0 11 1 84 0 0 257 0 0 0.0857 0.0000 0.0000 8.545 0.00 5.99 -5.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9952 0.0048 2 1 0.0000 0.8390 0.1610
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 369 106 263 41 0 19 2 44 0 0 262 0 1 0.3868 0.0000 0.0038 4.579 1.15 3.32 -2.17 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1011 0.5654 0.3335 1 1 0.1059 0.5604 0.3337 1 1 0.1125 0.5540 0.3335
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 516 132 384 12 0 17 2 101 0 0 378 0 6 0.0909 0.0000 0.0156 6.765 1.42 3.23 -1.81 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.9354 0.0646
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 392 143 249 1 0 21 10 111 0 0 248 0 1 0.0070 0.0000 0.0040 5.810 0.00 3.22 -3.22 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0145 0.9855 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr12 6778354 G GGAGCCC 0.001563 0.100 1 6 2 393 161 232 80 3 22 2 54 0 0 229 0 3 0.4969 0.0000 0.0129 6.318 1.15 5.48 -4.33 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8469 0.1531 0.0000 1 0 0.8416 0.1584 0.0000 1 0 0.8339 0.1661 0.0000
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 4480 1064 3416 982 4 7 0 71 0 0 3411 0 5 0.9229 0.0000 0.0015 150.857 1.26 4.11 -2.85 88 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1578 0.8422 0.0000
chr12 8843328 AAG A 0.001621 0.100 1 -2 1 243 83 160 48 0 0 1 34 0 0 160 0 0 0.5783 0.0000 0.0000 83.000 0.10 2.76 -2.66 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7103 0.2896 0.0001 1 0 0.7062 0.2937 0.0001 1 0 0.7004 0.2995 0.0001
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 247 97 150 54 1 4 1 37 0 0 145 0 5 0.5567 0.0000 0.0333 23.250 0.09 5.05 -4.96 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4796 0.4754 0.0450 1 1 0.4754 0.4757 0.0489 1 1 0.4691 0.4764 0.0545
chr12 10415650 T TAA 0.001347 0.100 1 2 4 140 56 84 38 0 0 0 18 0 0 82 0 2 0.6786 0.0000 0.0238 56.000 0.11 3.06 -2.95 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8173 0.1827 0.0000 1 0 0.8101 0.1899 0.0000 1 0 0.8001 0.1999 0.0000
chr12 10415652 TTA T 0.001349 0.100 1 -2 4 141 56 85 38 0 0 0 18 0 0 83 0 2 0.6786 0.0000 0.0235 56.000 0.11 3.06 -2.95 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8173 0.1827 0.0000 1 0 0.8101 0.1899 0.0000 1 0 0.8001 0.1998 0.0000
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 238 116 122 5 0 6 5 100 0 0 120 0 2 0.0431 0.0000 0.0164 18.333 2.60 4.28 -1.68 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9926 0.0074 2 2 0.0000 0.3156 0.6844 2 2 0.0000 0.0609 0.9391
chr12 26122638 G GGCCGCCGCCGCT 0.000016 0.100 1 12 3 342 64 278 51 0 11 0 2 0 0 277 0 1 0.7969 0.0000 0.0036 4.818 0.67 13.00 -12.33 15 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr12 40482887 AAGTGACAGGGACAACTGGACCATTAGCTGG A 0.182551 0.100 1 -30 1 4830 1692 3138 564 39 299 14 776 9 12 3110 2 5 0.3333 0.0029 0.0089 4.694 3.25 8.64 -5.40 114 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0002 0.9998 1 2 0.0000 0.0002 0.9998 1 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 1902 411 1491 115 1 185 2 108 1 3 1422 0 65 0.2798 0.0007 0.0463 1.211 4.67 4.63 0.04 11 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0333 0.9667 1 2 0.0000 0.0368 0.9632 1 2 0.0000 0.0421 0.9578
chr12 42144454 GGCCCGCGACGCCGGCGCCTCTCACGGCGCCGCGTCCGCC G 0.013087 0.100 1 -39 4 211 72 139 54 0 2 0 16 0 0 125 0 14 0.7500 0.0000 0.1007 35.000 3.52 31.81 -28.29 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8758 0.1241 0.0001 1 0 0.8690 0.1309 0.0001 1 0 0.8594 0.1405 0.0001
chr12 47751144 A ACGGGCT 0.000467 0.100 1 6 1 406 86 320 38 2 8 0 38 0 0 316 0 4 0.4419 0.0000 0.0125 9.750 1.58 6.18 -4.61 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3539 0.6458 0.0002 1 1 0.3627 0.6371 0.0002 1 1 0.3739 0.6258 0.0003
chr12 51329814 A AG 0.276619 0.100 1 1 2 176 56 120 53 0 0 0 3 0 0 120 0 0 0.9464 0.0000 0.0000 56.000 0.45 1.33 -0.88 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0506 0.9494 0.0000 0 0 0.6052 0.3948 0.0000 0 0 0.8337 0.1663 0.0000
chr12 51890755 T TGGCCCA 0.010615 0.100 1 6 1 664 196 468 149 0 38 0 9 0 0 466 0 2 0.7602 0.0000 0.0043 4.158 0.35 6.00 -5.65 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5665 0.4335 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 912 218 694 112 1 20 3 82 0 0 694 0 0 0.5138 0.0000 0.0000 9.850 0.75 13.73 -12.98 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7682 0.2293 0.0024 1 0 0.7616 0.2354 0.0030 1 0 0.7518 0.2443 0.0040
chr12 52790167 C CGCTGCCACCGCTGAAACCGCT 0.041809 0.100 1 21 2 423 98 325 48 0 21 0 29 0 0 310 0 15 0.4898 0.0000 0.0462 3.667 0.12 11.00 -10.88 22 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4712 0.5195 0.0093 1 1 0.4757 0.5146 0.0097 1 1 0.4811 0.5087 0.0102
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1102 291 811 231 1 51 0 8 0 0 811 0 0 0.7938 0.0000 0.0000 4.706 0.33 14.88 -14.55 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0487 0.9513 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 328 81 247 36 0 2 0 43 0 0 247 0 0 0.4444 0.0000 0.0000 39.500 0.33 1.84 -1.50 32 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1434 0.6066 0.2500 1 1 0.1503 0.6013 0.2484 1 1 0.1597 0.5944 0.2459
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 356 94 262 85 0 3 0 6 0 0 262 0 0 0.9043 0.0000 0.0000 30.333 0.38 1.17 -0.79 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1484 0.8516 0.0000 0 0 0.6601 0.3399 0.0000
chr12 55551800 CTCTT C 0.005776 0.100 1 -4 2 518 110 408 17 0 1 0 92 0 0 405 0 3 0.1545 0.0000 0.0074 109.000 0.12 4.10 -3.98 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 142 76 66 0 0 1 0 75 0 0 65 1 0 0.0000 0.0000 0.0152 75.000 2.07 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0125 0.9875 2 2 0.0000 0.0139 0.9861
chr12 58876497 CTGG C 0.000469 0.100 1 -3 3 174 67 107 44 1 1 0 21 0 0 107 0 0 0.6567 0.0000 0.0000 66.000 0.36 3.14 -2.78 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8864 0.1136 0.0000 1 0 0.8794 0.1206 0.0000 1 0 0.8695 0.1305 0.0000
chr12 64318766 A AGTT 0.404869 0.100 1 3 2 350 91 259 78 0 1 0 12 0 0 259 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 90.000 0.82 3.92 -3.10 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0284 0.9716 0.0000
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 132 47 85 42 0 1 0 4 0 0 85 0 0 0.8936 0.0000 0.0000 46.000 0.31 2.50 -2.19 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0019 0.9981 0.0000 0 1 0.1550 0.8450 0.0000 0 1 0.4839 0.5161 0.0000
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 955 282 673 0 0 30 2 250 0 0 671 0 2 0.0000 0.0000 0.0030 8.400 3.42 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 102958393 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 1 425 107 318 13 2 25 1 66 0 0 312 0 6 0.1215 0.0000 0.0189 3.280 0.85 3.11 -2.26 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9977 0.0023
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 580 149 431 121 1 17 0 10 0 0 431 0 0 0.8121 0.0000 0.0000 7.706 0.67 2.80 -2.13 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0104 0.9896 0.0000 0 1 0.3770 0.6230 0.0000
chr12 106247711 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 1 393 99 294 48 2 10 0 39 0 0 292 1 1 0.4848 0.0000 0.0068 8.900 1.29 3.49 -2.20 2 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4082 0.5230 0.0688 1 1 0.4060 0.5206 0.0734 1 1 0.4026 0.5178 0.0796
chr12 108623635 GAGTGGTCTGTGCCTCCATGGCTGCTGGTGGAGTGGTCTGTGCTTCCATGGCTGCTGGTGC G 0.500000 0.100 1 -60 3 1730 333 1397 42 0 88 9 194 1 1 1333 0 62 0.1261 0.0007 0.0458 2.773 0.74 4.43 -3.69 16 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 558 147 411 76 0 4 0 67 0 0 405 0 6 0.5170 0.0000 0.0146 35.750 0.41 8.67 -8.26 26 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2157 0.6653 0.1190 1 1 0.2214 0.6536 0.1250 1 1 0.2284 0.6387 0.1329
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 694 225 469 11 115 51 9 39 0 1 467 1 0 0.0489 0.0000 0.0043 3.440 5.00 4.21 0.79 1 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9971 0.0029 0.0000 1 0 0.9964 0.0036 0.0000 1 0 0.9951 0.0049 0.0000
chr12 111598963 C CTGCTGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 12 1 705 225 480 97 3 29 2 94 1 1 478 0 0 0.4311 0.0021 0.0042 7.760 3.03 10.30 -7.27 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2524 0.6813 0.0663 1 1 0.2597 0.6685 0.0718 1 1 0.2685 0.6520 0.0795
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 221 122 99 0 0 1 0 121 0 0 99 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 121.000 3.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0021 0.9979 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0028 0.9972
chr12 113180950 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 265 102 163 52 1 10 1 38 0 0 159 0 4 0.5098 0.0000 0.0245 9.200 0.38 3.00 -2.62 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4313 0.5099 0.0588 1 1 0.4286 0.5082 0.0632 1 1 0.4245 0.5063 0.0692
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 202 93 109 3 0 10 0 80 0 0 106 0 3 0.0323 0.0000 0.0275 8.300 0.00 5.92 -5.92 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9196 0.0804 2 2 0.0000 0.2786 0.7214 2 2 0.0000 0.1089 0.8911
chr12 121240524 C CTTT 0.500000 0.100 1 3 2 449 97 352 32 15 19 6 25 0 2 346 0 4 0.3299 0.0000 0.0170 4.167 0.62 6.04 -5.42 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5542 0.4115 0.0343 1 0 0.5468 0.4156 0.0377 1 0 0.5363 0.4211 0.0426
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 390 120 270 0 0 6 2 112 0 0 261 0 9 0.0000 0.0000 0.0333 18.833 5.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0022 0.9978 2 2 0.0000 0.0026 0.9974
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 322 88 234 21 0 8 0 59 0 0 225 0 9 0.2386 0.0000 0.0385 10.000 0.24 11.73 -11.49 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0292 0.9707 1 2 0.0001 0.0970 0.9028 2 1 0.0000 0.8319 0.1681
chr12 122266132 G GC 0.500000 0.100 1 1 3 678 215 463 104 2 24 9 76 0 0 462 0 1 0.4837 0.0000 0.0022 7.917 2.20 2.11 0.10 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6139 0.3770 0.0090 1 0 0.6103 0.3791 0.0106 1 0 0.6044 0.3826 0.0130
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 699 183 516 0 0 27 0 156 0 0 495 0 21 0.0000 0.0000 0.0407 5.778 8.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 224 82 142 26 0 26 1 29 0 0 139 0 3 0.3171 0.0000 0.0211 2.154 0.19 3.38 -3.19 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0981 0.5180 0.3839 1 1 0.1026 0.5164 0.3810 1 1 0.1088 0.5144 0.3768
chr12 124402512 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 3 224 82 142 27 0 53 0 2 0 0 141 0 1 0.3293 0.0000 0.0070 0.547 0.33 6.00 -5.67 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0050 0.9949 0.0000 0 1 0.1229 0.8771 0.0000 0 1 0.3251 0.6749 0.0000
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 174 53 121 2 0 9 3 39 0 1 120 0 0 0.0377 0.0000 0.0083 4.778 2.00 3.51 -1.51 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9333 0.0667 2 1 0.0000 0.5797 0.4203 2 2 0.0000 0.3746 0.6254
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 210 60 150 0 0 6 0 54 0 0 142 0 8 0.0000 0.0000 0.0533 9.000 8.98 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0407 0.9593 2 2 0.0000 0.0432 0.9568 2 2 0.0000 0.0470 0.9530
chr12 132062523 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 727 211 516 25 9 77 9 91 0 0 514 1 1 0.1185 0.0000 0.0039 1.760 4.08 4.90 -0.82 3 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0035 0.9965 1 2 0.0000 0.0483 0.9517 2 1 0.0000 0.9512 0.0488
chr12 132062548 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 711 216 495 3 12 78 9 114 0 0 491 1 3 0.0139 0.0000 0.0081 1.813 1.00 4.62 -3.62 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.9079 0.0921
chr13 20988343 C CGGGGCG 0.483296 0.100 1 6 2 654 162 492 69 0 24 0 69 0 0 489 0 3 0.4259 0.0000 0.0061 5.750 0.38 5.93 -5.55 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1266 0.6587 0.2146 1 1 0.1327 0.6475 0.2198 1 1 0.1407 0.6332 0.2261
chr13 42888298 T TTCAGG 0.039508 0.100 1 5 1 187 58 129 10 0 1 0 47 0 0 121 0 8 0.1724 0.0000 0.0620 57.000 1.60 4.72 -3.12 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010
chr13 45596584 CCCAGATACTCTTCCTCCT C 0.470699 0.100 1 -18 4 604 198 406 184 0 9 0 5 0 0 406 0 0 0.9293 0.0000 0.0000 21.000 0.43 12.40 -11.97 72 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1656 0.8344 0.0000 0 0 0.9817 0.0183 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 614 154 460 64 2 49 0 39 1 1 454 1 3 0.4156 0.0022 0.0130 2.143 1.16 6.46 -5.31 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8622 0.1371 0.0008 1 0 0.8553 0.1438 0.0009 1 0 0.8455 0.1534 0.0012
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 103 51 52 23 0 5 0 23 0 0 51 1 0 0.4510 0.0000 0.0192 9.200 0.43 5.17 -4.74 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4136 0.5754 0.0110 1 1 0.4185 0.5704 0.0111 1 1 0.4247 0.5641 0.0112
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 694 118 576 0 0 22 2 94 0 0 573 2 1 0.0000 0.0000 0.0052 4.364 5.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0016 0.9984 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 310 110 200 9 0 33 0 68 0 0 194 0 6 0.0818 0.0000 0.0300 2.333 0.44 9.63 -9.19 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9972 0.0028 2 1 0.0000 0.8990 0.1010
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 583 113 470 58 0 4 0 51 0 0 468 0 2 0.5133 0.0000 0.0043 27.250 0.36 3.31 -2.95 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2881 0.6050 0.1069 1 1 0.2907 0.5972 0.1121 1 1 0.2936 0.5873 0.1191
chr14 19868522 A AG 0.732384 0.100 1 1 2 1351 312 1039 21 0 8 3 280 0 0 1034 1 4 0.0673 0.0000 0.0048 37.750 0.00 2.37 -2.37 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 2 0.0000 0.1788 0.8212
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 1201 295 906 124 2 32 1 136 0 0 906 0 0 0.4203 0.0000 0.0000 8.219 0.19 1.20 -1.01 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0351 0.7007 0.2643 1 1 0.0396 0.6868 0.2736 1 1 0.0461 0.6691 0.2848
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 411 115 296 6 0 4 0 105 0 0 283 0 13 0.0522 0.0000 0.0439 27.750 1.33 19.15 -17.82 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.6874 0.3126 2 2 0.0000 0.1705 0.8295
chr14 20060441 AG A 0.001037 0.100 1 -1 1 416 97 319 57 0 6 1 33 0 0 318 0 1 0.5876 0.0000 0.0031 15.167 0.88 3.00 -2.12 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8493 0.1507 0.0000 1 0 0.8427 0.1572 0.0000 1 0 0.8335 0.1665 0.0000
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 395 94 301 43 0 9 1 41 0 0 298 0 3 0.4574 0.0000 0.0100 9.444 0.21 1.29 -1.08 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0951 0.5851 0.3199 1 1 0.0977 0.5781 0.3242 1 1 0.1012 0.5693 0.3296
chr14 21092593 GGAGGCT G 0.199659 0.100 1 -6 1 647 160 487 125 0 19 0 16 0 0 487 0 0 0.7812 0.0000 0.0000 7.421 0.42 6.50 -6.08 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0565 0.9435 0.0000
chr14 21155337 CAGA C 0.002975 0.100 1 -3 1 468 94 374 53 0 3 0 38 0 0 371 0 3 0.5638 0.0000 0.0080 30.333 1.17 4.11 -2.94 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6737 0.3261 0.0002 1 0 0.6712 0.3286 0.0002 1 0 0.6675 0.3322 0.0002
chr14 21670348 G GGT 0.221308 0.100 1 2 3 1674 445 1229 406 0 22 0 17 0 0 1229 0 0 0.9124 0.0000 0.0000 19.227 0.65 3.18 -2.53 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.9690 0.0310 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 499 142 357 123 2 11 0 6 0 0 357 0 0 0.8662 0.0000 0.0000 11.818 0.34 2.67 -2.33 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.4028 0.5972 0.0000 0 0 0.8771 0.1229 0.0000
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 461 114 347 5 1 5 0 103 0 0 347 0 0 0.0439 0.0000 0.0000 21.800 0.00 5.32 -5.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8967 0.1033 2 2 0.0000 0.4481 0.5519
chr14 23104903 CA C 0.653704 0.100 1 -1 1 878 235 643 17 30 3 177 8 0 0 643 0 0 0.0723 0.0000 0.0000 21.000 0.29 4.12 -3.83 5 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr14 23104905 GCA G 0.660524 0.100 1 -2 1 872 239 633 26 5 23 177 8 1 0 632 0 0 0.1088 0.0016 0.0016 10.600 0.69 4.12 -3.43 16 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 330 54 276 19 0 8 1 26 0 0 276 0 0 0.3519 0.0000 0.0000 5.750 2.89 3.19 -0.30 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1205 0.5304 0.3490 1 1 0.1262 0.5298 0.3440 1 1 0.1340 0.5289 0.3371
chr14 23275617 TTCC T 0.376038 0.100 1 -3 1 342 52 290 24 0 4 2 22 0 0 290 0 0 0.4615 0.0000 0.0000 12.000 2.46 3.64 -1.18 16 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2777 0.5578 0.1645 1 1 0.2803 0.5535 0.1662 1 1 0.2837 0.5480 0.1683
chr14 24208137 TACG T 0.003500 0.100 1 -3 2 399 104 295 7 0 6 1 90 0 0 294 0 1 0.0673 0.0000 0.0034 16.333 0.00 3.07 -3.07 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9966 0.0034
chr14 24300643 A AGAG 0.272949 0.100 1 3 1 380 102 278 75 5 11 0 11 0 0 278 0 0 0.7353 0.0000 0.0000 8.273 0.23 2.55 -2.32 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.1000 0.9000 0.0000
chr14 38210558 C CGCTCTGAGCCCGGGCCACGCAGGG 0.184930 0.100 1 24 1 278 52 226 16 1 27 1 7 0 0 225 0 1 0.3077 0.0000 0.0044 0.926 0.69 2.00 -1.31 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5962 0.3761 0.0277 1 0 0.5903 0.3805 0.0292 1 0 0.5813 0.3875 0.0311
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 642 151 491 0 1 26 0 124 0 0 479 0 12 0.0000 0.0000 0.0244 4.769 6.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr14 67198163 TGAA T 0.018726 0.100 1 -3 2 173 66 107 61 0 2 0 3 0 0 106 0 1 0.9242 0.0000 0.0093 32.000 0.11 3.00 -2.89 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1392 0.8608 0.0000 0 0 0.9397 0.0603 0.0000 0 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 621 157 464 0 0 35 3 119 0 1 459 0 4 0.0000 0.0000 0.0108 3.486 7.25 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr14 77027418 TTGCTGC T 0.394255 0.100 1 -6 1 446 119 327 49 0 21 2 47 0 0 325 0 2 0.4118 0.0000 0.0061 4.571 0.65 6.51 -5.86 15 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2071 0.6234 0.1695 1 1 0.2128 0.6146 0.1726 1 1 0.2201 0.6034 0.1764
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 438 110 328 54 35 4 10 7 0 3 325 0 0 0.4909 0.0000 0.0091 32.333 0.72 3.43 -2.71 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0018 0.9982 0.0000 0 1 0.0685 0.9315 0.0000
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 466 156 310 7 0 14 3 132 0 0 310 0 0 0.0449 0.0000 0.0000 10.143 0.57 3.42 -2.85 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.5298 0.4702 2 2 0.0000 0.0661 0.9339
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 452 132 320 119 0 1 0 12 0 0 319 0 1 0.9015 0.0000 0.0031 131.000 0.95 9.17 -8.22 83 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.1131 0.8869 0.0000
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 245 76 169 0 0 10 0 66 0 0 163 0 6 0.0000 0.0000 0.0355 6.600 8.35 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0320 0.9680 2 2 0.0000 0.0343 0.9657 2 2 0.0000 0.0379 0.9621
chr14 104707525 ACCCCAC A 0.082909 0.100 1 -6 2 503 88 415 33 0 23 2 30 0 0 413 0 2 0.3750 0.0000 0.0048 2.739 1.12 5.60 -4.48 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3742 0.5890 0.0368 1 1 0.3801 0.5827 0.0373 1 1 0.3875 0.5747 0.0378
chr14 105399471 G GA 0.001351 0.100 1 1 3 156 50 106 24 0 0 0 26 0 0 106 0 0 0.4800 0.0000 0.0000 50.000 0.17 1.00 -0.83 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3903 0.6089 0.0008 1 1 0.3966 0.6027 0.0008 1 1 0.4046 0.5946 0.0008
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 393 114 279 8 0 13 1 92 0 0 276 1 2 0.0702 0.0000 0.0108 7.769 0.62 3.62 -2.99 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9911 0.0089 2 1 0.0000 0.8131 0.1869
chr15 22786677 AGCG A 0.219888 0.100 1 -3 1 277 72 205 0 2 4 36 30 0 0 204 0 1 0.0000 0.0000 0.0049 16.500 5.50 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.1420 0.8580 2 2 0.0000 0.1464 0.8536 2 2 0.0000 0.1536 0.8464
chr15 22786677 AGCGGCG A 0.001053 0.100 1 -6 1 277 73 204 0 0 32 3 38 0 0 204 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 1.333 6.32 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9927 0.0073 2 1 0.0000 0.9929 0.0071 2 1 0.0000 0.9933 0.0067
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 1223 219 1004 0 0 6 2 211 0 5 923 52 24 0.0000 0.0000 0.0807 35.500 4.41 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 23440394 CT C 0.994113 0.100 1 -1 2 2893 728 2165 2 2 24 6 694 0 1 2065 26 73 0.0027 0.0000 0.0462 33.429 5.50 3.36 2.14 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 409 95 314 43 1 1 0 50 0 0 313 0 1 0.4526 0.0000 0.0032 94.000 0.40 2.02 -1.62 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1174 0.5998 0.2828 1 1 0.1237 0.5939 0.2824 1 1 0.1323 0.5864 0.2813
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 185 67 118 15 4 9 3 36 0 1 114 0 3 0.2239 0.0000 0.0339 6.444 1.73 2.08 -0.35 5 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0052 0.1840 0.8108 1 2 0.0061 0.1935 0.8005 1 2 0.0075 0.2067 0.7858
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 649 181 468 62 2 34 5 78 0 1 464 1 2 0.3425 0.0000 0.0085 4.324 1.29 3.96 -2.67 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0053 0.2771 0.7176 1 2 0.0062 0.2817 0.7121 1 2 0.0076 0.2885 0.7039
chr15 32798901 CCTT C 0.039558 0.100 1 -3 1 145 63 82 58 0 3 0 2 0 0 82 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 20.000 0.84 3.00 -2.16 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8456 0.1544 0.0000 0 0 0.9812 0.0188 0.0000 0 0 0.9912 0.0088 0.0000
chr15 39976797 G GGACGAC 0.109463 0.100 1 6 1 324 80 244 69 0 9 0 2 0 0 244 0 0 0.8625 0.0000 0.0000 7.889 0.77 4.00 -3.23 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7628 0.2372 0.0000 0 0 0.9681 0.0319 0.0000 0 0 0.9846 0.0154 0.0000
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 442 135 307 13 0 4 0 118 0 0 305 0 2 0.0963 0.0000 0.0065 32.750 1.69 2.13 -0.43 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9615 0.0385
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 448 111 337 7 0 7 0 97 0 0 335 0 2 0.0631 0.0000 0.0059 14.857 0.29 5.74 -5.46 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9565 0.0435 2 1 0.0000 0.5671 0.4329
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 158 70 88 66 0 2 0 2 0 0 88 0 0 0.9429 0.0000 0.0000 34.000 0.14 3.00 -2.86 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2751 0.7249 0.0000 0 0 0.7823 0.2177 0.0000 0 0 0.8840 0.1160 0.0000
chr15 72474873 T TGGC 0.069572 0.100 1 3 2 477 186 291 143 5 32 1 5 0 0 291 0 0 0.7688 0.0000 0.0000 4.781 0.73 3.60 -2.87 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2155 0.7845 0.0000 0 0 0.9877 0.0123 0.0000 0 0 0.9982 0.0018 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 465 116 349 40 1 9 6 60 0 0 348 0 1 0.3448 0.0000 0.0029 11.889 0.68 3.68 -3.01 14 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0033 0.1799 0.8167 1 2 0.0040 0.1887 0.8072 1 2 0.0051 0.2011 0.7937
chr15 79463264 TGAG T 0.000283 0.100 1 -3 2 282 99 183 53 1 1 0 44 0 0 183 0 0 0.5354 0.0000 0.0000 98.000 0.58 3.11 -2.53 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6248 0.3752 0.0000 1 0 0.6243 0.3756 0.0000 1 0 0.6232 0.3767 0.0000
chr15 83008518 C CA 0.185307 0.100 1 1 1 129 32 97 14 8 4 0 6 0 0 96 0 1 0.4375 0.0000 0.0103 5.000 1.07 2.00 -0.93 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7052 0.2838 0.0110 1 0 0.6375 0.3515 0.0110 1 1 0.4932 0.4980 0.0089
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 457 108 349 86 0 19 0 3 0 0 348 0 1 0.7963 0.0000 0.0029 4.684 0.41 18.33 -17.93 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0453 0.9547 0.0000 0 0 0.8170 0.1830 0.0000 0 0 0.9554 0.0446 0.0000
chr15 84895080 C CTTG 0.283663 0.100 1 3 3 352 135 217 119 2 0 0 14 0 0 217 0 0 0.8815 0.0000 0.0000 134.000 0.17 2.86 -2.69 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1004 0.8996 0.0000
chr15 89333596 T TTGC 0.100121 0.100 1 3 1 1388 384 1004 176 9 75 2 122 0 0 1002 0 2 0.4583 0.0000 0.0020 4.093 0.24 3.30 -3.05 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9856 0.0144 0.0000 1 0 0.9839 0.0161 0.0000 1 0 0.9813 0.0187 0.0000
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 687 190 497 80 6 79 2 23 0 1 495 0 1 0.4211 0.0000 0.0040 2.409 1.49 6.43 -4.95 0 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9747 0.0252 0.0001 1 0 0.9709 0.0290 0.0001 1 0 0.9640 0.0358 0.0001
chr15 89776903 AGGGCAGGGGCAG A 0.699006 0.100 1 -12 2 673 184 489 53 3 28 3 97 0 1 488 0 0 0.2880 0.0000 0.0020 5.923 1.45 6.21 -4.75 9 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0001 0.0468 0.9531 1 2 0.0001 0.0515 0.9483 1 2 0.0002 0.0587 0.9411
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 317 95 222 0 0 4 0 91 0 0 216 0 6 0.0000 0.0000 0.0270 22.750 6.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 312 100 212 52 0 2 0 46 0 0 212 0 0 0.5200 0.0000 0.0000 49.000 0.19 2.17 -1.98 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3138 0.5829 0.1034 1 1 0.3147 0.5768 0.1086 1 1 0.3153 0.5691 0.1156
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.100 1 -3 2 550 211 339 67 1 36 84 23 0 0 336 3 0 0.3175 0.0000 0.0088 4.861 0.49 3.83 -3.33 21 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0051 0.3577 0.6372 1 2 0.0064 0.3728 0.6208 1 2 0.0086 0.3936 0.5978
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 551 215 336 151 2 47 0 15 0 0 334 0 2 0.7023 0.0000 0.0060 3.652 1.89 6.40 -4.51 47 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0670 0.9330 0.0000
chr15 99712536 AGCC A 0.004065 0.100 1 -3 1 550 214 336 77 14 10 15 98 0 0 336 0 0 0.3598 0.0000 0.0000 18.600 0.64 3.10 -2.47 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0623 0.9291 0.0087 1 1 0.0709 0.9205 0.0086 1 1 0.0836 0.9079 0.0085
chr16 400140 C CAG 0.314665 0.100 1 2 2 351 111 240 56 1 1 0 53 0 0 240 0 0 0.5045 0.0000 0.0000 110.000 0.20 3.28 -3.09 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3458 0.5823 0.0719 1 1 0.3502 0.5748 0.0751 1 1 0.3553 0.5654 0.0793
chr16 813355 AGGACGCCGGACCGACAC A 0.089377 0.100 1 -17 2 261 67 194 0 0 1 0 66 0 0 189 0 5 0.0000 0.0000 0.0258 66.000 15.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2145 0.7855 2 2 0.0000 0.2271 0.7729 2 2 0.0000 0.2452 0.7548
chr16 1256558 AG A 0.210472 0.100 1 -1 1 879 190 689 16 0 1 0 173 0 0 688 0 1 0.0842 0.0000 0.0015 189.000 1.06 1.69 -0.63 12 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9582 0.0418
chr16 1792405 C CG 0.000218 0.100 1 1 1 615 150 465 62 1 10 0 77 0 0 464 0 1 0.4133 0.0000 0.0022 13.900 0.26 1.45 -1.20 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1003 0.8993 0.0004 1 1 0.1107 0.8889 0.0004 1 1 0.1254 0.8741 0.0004
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 576 96 480 0 0 0 2 94 0 0 479 0 1 0.0000 0.0000 0.0021 95.000 7.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 576 96 480 0 0 0 2 94 0 0 479 0 1 0.0000 0.0000 0.0021 95.000 7.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 389 102 287 0 0 7 0 95 0 0 279 0 8 0.0000 0.0000 0.0279 13.571 3.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0033 0.9967 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0042 0.9958
chr16 11927441 G GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA 0.000747 0.100 1 42 2 2050 379 1671 8 0 267 2 102 0 1 1653 0 17 0.0211 0.0000 0.0108 0.419 1.00 4.36 -3.36 6 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 2071 541 1530 269 2 136 1 133 0 0 1503 0 27 0.4972 0.0000 0.0176 2.971 1.92 4.50 -2.57 157 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr16 11927872 ATTCTGACCTGTAGGGCCAAAGGAGGGAATGTTTTCACACATAT A 0.011371 0.100 1 -43 2 1799 300 1499 203 0 0 1 96 0 0 1490 0 9 0.6767 0.0000 0.0060 300.000 0.31 29.95 -29.64 185 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 224 79 145 0 0 1 0 78 0 0 145 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 78.000 2.40 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr16 24777101 AGCAGCCACAGCC A 0.180179 0.100 1 -12 1 676 226 450 124 1 15 0 86 0 0 450 0 0 0.5487 0.0000 0.0000 14.067 0.20 10.00 -9.80 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9328 0.0671 0.0001 1 0 0.9282 0.0717 0.0001 1 0 0.9213 0.0785 0.0002
chr16 28496076 TGGGACAGCCTCAGGAGGGGAGGAGGCC T 0.319200 0.100 1 -27 1 883 212 671 7 1 63 1 140 0 0 671 0 0 0.0330 0.0000 0.0000 2.333 2.43 12.42 -9.99 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8104 0.1896 2 2 0.0000 0.2060 0.7940
chr16 31086367 G GC 0.500000 0.100 1 1 5 748 163 585 80 0 8 1 74 0 0 585 0 0 0.4908 0.0000 0.0000 19.375 0.38 2.45 -2.07 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2516 0.6551 0.0933 1 1 0.2570 0.6440 0.0991 1 1 0.2634 0.6298 0.1068
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 145 82 63 45 0 3 0 34 0 0 63 0 0 0.5488 0.0000 0.0000 26.333 0.27 2.29 -2.03 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4754 0.4709 0.0538 1 1 0.4703 0.4718 0.0579 1 1 0.4630 0.4733 0.0637
chr16 57813722 ATG A 0.500000 0.100 1 -2 1 296 127 169 63 59 1 0 4 0 0 169 0 0 0.4961 0.0000 0.0000 68.000 0.27 10.00 -9.73 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0397 0.9603 0.0000 0 0 0.7895 0.2105 0.0000 0 0 0.9450 0.0550 0.0000
chr16 57813725 CAGGTGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 296 131 165 124 0 2 0 5 0 0 165 0 0 0.9466 0.0000 0.0000 64.500 0.81 8.40 -7.59 68 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0083 0.9917 0.0000 0 0 0.7049 0.2951 0.0000 0 0 0.9431 0.0569 0.0000
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 514 96 418 58 13 14 1 10 0 0 417 1 0 0.6042 0.0000 0.0024 5.643 1.10 1.60 -0.50 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0240 0.9760 0.0000
chr16 67842920 ACAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 1155 383 772 172 4 59 15 133 0 0 772 0 0 0.4491 0.0000 0.0000 5.458 0.47 3.29 -2.83 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6155 0.3820 0.0025 1 0 0.6183 0.3786 0.0031 1 0 0.6201 0.3758 0.0041
chr16 69715020 ACACT A 0.500000 0.100 1 -4 2 68 37 31 18 0 0 0 19 0 0 29 0 2 0.4865 0.0000 0.0645 37.000 0.00 5.58 -5.58 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1647 0.5369 0.2985 1 1 0.1681 0.5341 0.2978 1 1 0.1727 0.5306 0.2968
chr16 71922608 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 262 96 166 32 2 22 0 40 1 0 159 0 6 0.3333 0.0060 0.0422 3.364 6.53 5.30 1.23 14 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0531 0.4722 0.4747 1 1 0.0572 0.4731 0.4698 1 1 0.0630 0.4744 0.4627
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 263 106 157 51 0 20 0 35 0 0 156 0 1 0.4811 0.0000 0.0064 4.300 4.43 5.83 -1.40 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5734 0.3973 0.0293 1 0 0.5657 0.4019 0.0324 1 0 0.5548 0.4082 0.0370
chr16 71947511 CTTTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 155 78 77 52 0 0 0 26 0 0 77 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 78.000 0.83 4.15 -3.33 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8140 0.1813 0.0047 1 0 0.8025 0.1919 0.0057 1 0 0.7861 0.2067 0.0072
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.100 1 -3 2 621 151 470 123 3 17 0 8 0 0 470 0 0 0.8146 0.0000 0.0000 7.824 0.79 3.12 -2.34 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0967 0.9033 0.0000 0 0 0.7249 0.2751 0.0000
chr16 72797458 C CTTGTTG 0.500000 0.100 1 6 1 682 158 524 79 0 36 0 43 0 0 517 0 7 0.5000 0.0000 0.0134 3.389 0.41 5.86 -5.46 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8201 0.1772 0.0027 1 0 0.8103 0.1864 0.0033 1 0 0.7962 0.1994 0.0044
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 327 94 233 50 0 7 0 37 0 0 226 0 7 0.5319 0.0000 0.0300 12.429 0.10 11.05 -10.95 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3274 0.5729 0.0997 1 1 0.3281 0.5673 0.1046 1 1 0.3285 0.5603 0.1112
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 258 113 145 104 0 1 0 8 0 0 145 0 0 0.9204 0.0000 0.0000 112.000 0.67 4.50 -3.83 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0348 0.9652 0.0000 0 1 0.4781 0.5219 0.0000
chr16 85656376 G GGAGCGCGAGCGCGAGCGCGAGCGC 0.500000 0.100 1 24 3 445 96 349 67 3 23 0 3 0 0 346 0 3 0.6979 0.0000 0.0086 3.227 3.01 16.33 -13.32 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0497 0.9503 0.0000 0 1 0.3754 0.6246 0.0000
chr16 85656376 GGAGCGC G 0.500000 0.100 1 -6 3 445 100 345 51 2 18 0 29 0 0 345 0 0 0.5100 0.0000 0.0000 4.444 1.86 5.10 -3.24 33 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7724 0.2205 0.0071 1 0 0.7609 0.2307 0.0084 1 0 0.7446 0.2450 0.0104
chr16 87604287 C CCTGCTG 0.500000 0.100 1 6 1 417 116 301 52 0 24 0 40 0 0 297 0 4 0.4483 0.0000 0.0133 3.833 1.12 5.28 -4.16 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3722 0.5489 0.0789 1 1 0.3715 0.5448 0.0837 1 1 0.3700 0.5398 0.0902
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 618 106 512 0 0 1 4 101 0 0 504 1 7 0.0000 0.0000 0.0156 104.000 7.66 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 617 99 518 0 0 3 5 91 0 0 509 4 5 0.0000 0.0000 0.0174 32.000 8.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0046 0.9954 2 2 0.0000 0.0051 0.9949 2 2 0.0000 0.0060 0.9940
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 620 100 520 0 0 1 2 97 0 0 506 8 6 0.0000 0.0000 0.0269 98.000 8.16 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0032 0.9968 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0042 0.9958
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 757 161 596 72 0 5 2 82 0 0 593 0 3 0.4472 0.0000 0.0050 31.200 6.57 7.05 -0.48 24 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0251 0.4844 0.4905 1 2 0.0281 0.4825 0.4894 1 2 0.0326 0.4806 0.4868
chr16 88714227 G GGTAT 0.500000 0.100 1 4 1 753 158 595 73 2 5 64 14 0 0 592 3 0 0.4620 0.0000 0.0050 76.000 7.42 9.43 -2.00 33 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1045 0.6642 0.2313 1 1 0.1105 0.6525 0.2370 1 1 0.1184 0.6376 0.2440
chr16 88714227 G GGTGT 0.500000 0.100 1 4 1 753 158 595 67 3 5 12 71 0 0 592 0 3 0.4241 0.0000 0.0050 30.400 7.22 6.01 1.21 31 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0234 0.4669 0.5097 1 2 0.0263 0.4660 0.5077 1 2 0.0305 0.4655 0.5040
chr16 88733964 GTCC G 0.500000 0.100 1 -3 1 773 233 540 82 1 40 9 101 0 0 538 0 2 0.3519 0.0000 0.0037 4.625 0.67 3.50 -2.83 14 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0033 0.2537 0.7430 1 2 0.0040 0.2599 0.7361 1 2 0.0052 0.2689 0.7258
chr16 88733987 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 759 221 538 98 3 12 89 19 0 0 538 0 0 0.4434 0.0000 0.0000 10.583 0.55 4.32 -3.76 2 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.6046 0.3832 0.0122 1 0 0.5998 0.3861 0.0141 1 0 0.5924 0.3906 0.0170
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 132 49 83 0 0 2 0 47 0 0 83 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 23.500 3.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0835 0.9165 2 2 0.0000 0.0873 0.9127 2 2 0.0000 0.0927 0.9073
chr17 1728046 TGAG T 0.225858 0.100 1 -3 1 967 248 719 216 4 15 0 13 0 0 719 0 0 0.8710 0.0000 0.0000 15.533 0.22 2.92 -2.70 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1645 0.8355 0.0000 0 0 0.9723 0.0277 0.0000
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 358 139 219 125 1 3 0 10 0 0 219 0 0 0.8993 0.0000 0.0000 45.333 0.46 2.00 -1.54 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0062 0.9938 0.0000 0 1 0.2582 0.7418 0.0000
chr17 4900004 G GC 0.000569 0.100 1 1 1 902 214 688 123 0 3 1 87 0 0 687 0 1 0.5748 0.0000 0.0015 70.333 0.31 1.17 -0.86 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9113 0.0887 0.0000 1 0 0.9071 0.0929 0.0000 1 0 0.9008 0.0992 0.0000
chr17 5183741 TATA T 0.006994 0.100 1 -3 1 821 162 659 1 84 3 1 73 0 0 658 0 1 0.0062 0.0000 0.0015 52.000 2.00 3.75 -1.75 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4420 0.5569 0.0011 1 1 0.4510 0.5479 0.0012 1 1 0.4619 0.5368 0.0013
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 634 160 474 53 5 38 1 63 0 0 466 0 8 0.3312 0.0000 0.0169 3.211 0.13 3.03 -2.90 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0189 0.4120 0.5692 1 2 0.0209 0.4124 0.5667 1 2 0.0239 0.4134 0.5627
chr17 7846859 T TACCACCACC 0.066744 0.100 1 9 2 1248 363 885 13 31 95 24 200 0 2 863 0 20 0.0358 0.0000 0.0249 2.860 7.38 5.54 1.85 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 7846859 TACCACC T 0.084745 0.100 1 -6 2 1254 401 853 305 9 72 0 15 0 1 852 0 0 0.7606 0.0000 0.0012 4.569 4.39 7.40 -3.01 67 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8951 0.1049 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.100 1 -6 1 1034 315 719 247 1 57 0 10 0 0 717 0 2 0.7841 0.0000 0.0028 4.589 0.87 6.40 -5.53 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.8605 0.1395 0.0000 0 0 0.9986 0.0014 0.0000
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 421 113 308 100 0 5 0 8 0 1 307 0 0 0.8850 0.0000 0.0032 21.600 1.05 8.62 -7.58 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0301 0.9699 0.0000 0 1 0.4417 0.5583 0.0000
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 480 173 307 70 1 36 3 63 0 1 305 1 0 0.4046 0.0000 0.0065 3.778 0.21 2.98 -2.77 40 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2606 0.6389 0.1005 1 1 0.2651 0.6288 0.1061 1 1 0.2704 0.6160 0.1136
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 936 246 690 133 3 10 95 5 0 0 689 0 1 0.5407 0.0000 0.0014 18.750 0.55 5.60 -5.05 43 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9916 0.0084 0.0000 1 0 0.9900 0.0100 0.0000 1 0 0.9873 0.0127 0.0000
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 937 242 695 133 7 95 2 5 0 1 693 1 0 0.5496 0.0000 0.0029 1.690 0.54 4.40 -3.86 43 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0071 0.9929 0.0000 0 0 0.7368 0.2632 0.0000 0 0 0.9615 0.0385 0.0000
chr17 18673034 G GCGCCGCCGC 0.500000 0.100 1 9 3 1005 274 731 121 4 56 0 93 9 2 705 2 13 0.4416 0.0123 0.0356 3.893 1.79 8.11 -6.31 53 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7068 0.2904 0.0028 1 0 0.7028 0.2938 0.0034 1 0 0.6963 0.2992 0.0045
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 675 150 525 0 0 7 0 143 0 0 515 0 10 0.0000 0.0000 0.0190 20.429 4.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr17 29761226 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 120 53 67 27 0 2 0 24 0 0 67 0 0 0.5094 0.0000 0.0000 25.500 0.56 1.21 -0.65 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2890 0.5515 0.1595 1 1 0.2891 0.5476 0.1633 1 1 0.2890 0.5427 0.1683
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 104 63 41 58 0 0 0 5 0 0 41 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 63.000 0.17 1.20 -1.03 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.0814 0.9186 0.0000 0 1 0.4029 0.5971 0.0000
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 916 232 684 190 5 31 0 6 1 2 680 1 0 0.8190 0.0015 0.0058 6.700 2.68 10.17 -7.48 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0044 0.9956 0.0000 0 0 0.9134 0.0866 0.0000 0 0 0.9935 0.0065 0.0000
chr17 41060050 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 777 192 585 106 0 4 1 81 0 0 584 0 1 0.5521 0.0000 0.0017 47.000 0.73 1.56 -0.83 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6547 0.3385 0.0069 1 0 0.6498 0.3421 0.0081 1 0 0.6422 0.3476 0.0101
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 481 125 356 48 0 6 1 70 0 0 356 0 0 0.3840 0.0000 0.0000 19.833 0.52 1.49 -0.96 38 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0076 0.2664 0.7260 1 2 0.0090 0.2747 0.7164 1 2 0.0111 0.2862 0.7027
chr17 41140276 TGACAGCAGCTGG T 0.500000 0.100 1 -12 1 806 132 674 54 3 24 0 51 3 1 661 1 8 0.4091 0.0045 0.0193 4.375 1.13 10.82 -9.69 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1826 0.6422 0.1752 1 1 0.1877 0.6320 0.1804 1 1 0.1941 0.6189 0.1869
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 518 118 400 0 0 19 1 98 0 1 377 1 21 0.0000 0.0000 0.0575 5.158 8.19 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0117 0.9883 2 2 0.0000 0.0062 0.9938 2 2 0.0000 0.0051 0.9949
chr17 41238458 AGACCACCTGCTGCAG A 0.500000 0.100 1 -15 1 247 82 165 69 0 8 0 5 0 0 161 2 2 0.8415 0.0000 0.0242 9.250 4.20 8.80 -4.60 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0060 0.9940 0.0000 0 1 0.1351 0.8649 0.0000
chr17 41315500 TGCCCCCGCAGCCAGA T 0.500000 0.100 1 -15 1 574 186 388 84 0 33 0 69 0 0 382 0 6 0.4516 0.0000 0.0155 4.636 0.30 13.54 -13.24 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3384 0.6048 0.0568 1 1 0.3420 0.5965 0.0615 1 1 0.3458 0.5861 0.0681
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1634 300 1334 32 0 6 0 262 0 0 1328 0 6 0.1067 0.0000 0.0045 49.000 0.28 3.27 -2.99 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 624 175 449 88 3 27 0 57 0 0 448 0 1 0.5029 0.0000 0.0022 5.481 0.49 3.33 -2.84 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8615 0.1373 0.0013 1 0 0.8526 0.1458 0.0016 1 0 0.8396 0.1581 0.0022
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 300 100 200 54 0 5 0 41 0 0 199 0 1 0.5400 0.0000 0.0050 19.000 0.24 3.78 -3.54 24 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4837 0.4715 0.0448 1 0 0.4793 0.4721 0.0487 1 1 0.4728 0.4730 0.0542
chr17 47836758 AAGGAGCTGGAGC A 0.500000 0.100 1 -12 1 684 164 520 93 0 7 1 63 0 0 517 0 3 0.5671 0.0000 0.0058 22.286 0.42 11.11 -10.69 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7559 0.2401 0.0040 1 0 0.7475 0.2476 0.0048 1 0 0.7353 0.2584 0.0062
chr17 50375617 A AAGC 0.500000 0.100 1 3 5 897 231 666 15 0 8 2 206 0 0 661 0 5 0.0649 0.0000 0.0075 27.875 0.27 3.05 -2.78 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9952 0.0048 2 2 0.0000 0.3306 0.6694
chr17 57979243 T TTGC 0.500000 0.100 1 3 1 373 179 194 75 4 47 2 51 0 0 194 0 0 0.4190 0.0000 0.0000 2.745 0.44 3.39 -2.95 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7681 0.2273 0.0047 1 0 0.7584 0.2360 0.0056 1 0 0.7447 0.2482 0.0072
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 393 128 265 43 0 25 2 58 0 0 265 0 0 0.3359 0.0000 0.0000 4.120 0.77 5.81 -5.04 23 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0210 0.3737 0.6053 1 2 0.0236 0.3789 0.5975 1 2 0.0275 0.3861 0.5864
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 345 141 204 67 0 18 0 56 0 0 204 0 0 0.4752 0.0000 0.0000 6.833 0.10 7.30 -7.20 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4270 0.5247 0.0482 1 1 0.4260 0.5216 0.0524 1 1 0.4238 0.5180 0.0582
chr17 69149049 TGA T 0.500000 0.100 1 -2 2 171 59 112 54 0 2 0 3 0 0 112 0 0 0.9153 0.0000 0.0000 28.500 0.13 3.33 -3.20 8 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0197 0.9803 0.0000 0 1 0.3785 0.6215 0.0000 0 0 0.6672 0.3328 0.0000
chr17 69154324 C CACCTGGAA 0.500000 0.100 1 8 2 284 63 221 33 1 5 0 24 0 0 220 0 1 0.5238 0.0000 0.0045 11.600 0.64 7.12 -6.49 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4419 0.4838 0.0743 1 1 0.4369 0.4844 0.0787 1 1 0.4299 0.4853 0.0848
chr17 69193976 AAT A 0.500000 0.100 1 -2 3 328 80 248 41 0 0 0 39 0 0 248 0 0 0.5125 0.0000 0.0000 80.000 0.17 2.21 -2.03 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2438 0.5921 0.1640 1 1 0.2464 0.5853 0.1683 1 1 0.2495 0.5767 0.1739
chr17 69194395 AACAG A 0.500000 0.100 1 -4 3 202 67 135 64 0 0 0 3 0 0 135 0 0 0.9552 0.0000 0.0000 67.000 1.06 4.00 -2.94 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0321 0.9679 0.0000 0 0 0.5006 0.4994 0.0000 0 0 0.7650 0.2350 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 543 103 440 60 0 8 0 35 0 0 434 0 6 0.5825 0.0000 0.0136 11.875 0.47 7.51 -7.05 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6569 0.3279 0.0152 1 0 0.6477 0.3349 0.0173 1 0 0.6348 0.3446 0.0206
chr17 75516562 T TGGAGCC 0.500000 0.100 1 6 1 448 96 352 51 0 2 1 42 0 0 349 0 3 0.5312 0.0000 0.0085 47.000 0.82 6.64 -5.82 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3002 0.5884 0.1113 1 1 0.3019 0.5818 0.1163 1 1 0.3036 0.5734 0.1230
chr17 75588737 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 1872 436 1436 231 4 16 9 176 1 0 1431 0 4 0.5298 0.0007 0.0035 27.800 0.80 2.40 -1.60 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8716 0.1283 0.0001 1 0 0.8689 0.1310 0.0001 1 0 0.8641 0.1358 0.0002
chr17 75589192 TGGCTGCGGCGGCGGCTGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2099 501 1598 272 3 48 2 176 2 2 1552 1 41 0.5429 0.0013 0.0288 9.417 0.77 17.27 -16.50 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9385 0.0615 0.0000 1 0 0.9360 0.0640 0.0000 1 0 0.9319 0.0680 0.0000
chr17 75589320 CAAGGGGCGGGGCCGCGGGAAAGCGGAT C 0.500000 0.100 1 -27 1 2232 446 1786 298 0 12 0 136 1 1 1735 2 47 0.6682 0.0006 0.0286 36.167 0.79 22.07 -21.28 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr17 75596487 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 2 971 289 682 152 1 8 0 128 0 0 679 0 3 0.5260 0.0000 0.0044 35.000 0.17 3.28 -3.11 44 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5134 0.4796 0.0069 1 0 0.5182 0.4735 0.0083 1 0 0.5227 0.4669 0.0104
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2269 522 1747 258 11 69 10 174 2 4 1730 3 8 0.4943 0.0011 0.0097 6.529 1.41 7.68 -6.28 72 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9931 0.0069 0.0000 1 0 0.9921 0.0079 0.0000 1 0 0.9905 0.0095 0.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2193 556 1637 267 6 32 4 247 5 3 1505 21 103 0.4802 0.0031 0.0806 16.839 1.70 4.79 -3.09 65 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0000 0.0048 0.9952 1 2 0.0000 0.0054 0.9946 1 2 0.0000 0.0063 0.9937
chr17 79834118 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 1089 199 890 104 0 14 1 80 0 0 890 0 0 0.5226 0.0000 0.0000 13.143 0.46 5.20 -4.74 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6640 0.3293 0.0067 1 0 0.6587 0.3334 0.0079 1 0 0.6505 0.3396 0.0099
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 517 140 377 117 0 6 0 17 0 0 376 0 1 0.8357 0.0000 0.0027 22.333 0.62 3.12 -2.49 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0028 0.9972 0.0000
chr17 81647906 T TTAAC 0.500000 0.100 1 4 3 524 126 398 116 0 5 0 5 0 0 398 0 0 0.9206 0.0000 0.0000 24.200 0.42 4.40 -3.98 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 0 0.6154 0.3846 0.0000 0 0 0.9183 0.0817 0.0000
chr18 11689670 C CGGCCCT 0.145960 0.100 1 6 4 374 91 283 40 0 8 1 42 0 0 283 0 0 0.4396 0.0000 0.0000 10.250 0.53 5.76 -5.24 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2766 0.6410 0.0823 1 1 0.2845 0.6326 0.0829 1 1 0.2948 0.6217 0.0835
chr18 21452083 GCGATGACCTAGA G 0.000946 0.100 1 -12 2 345 105 240 76 0 0 0 29 0 0 235 0 5 0.7238 0.0000 0.0208 105.000 0.39 10.83 -10.43 58 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9740 0.0260 0.0000 1 0 0.9708 0.0292 0.0000 1 0 0.9658 0.0342 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 285 125 160 0 0 8 0 117 0 0 157 0 3 0.0000 0.0000 0.0187 14.625 3.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 325 72 253 62 0 5 0 5 2 0 249 0 2 0.8611 0.0079 0.0158 13.400 0.81 10.20 -9.39 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0482 0.9518 0.0000 0 1 0.4717 0.5283 0.0000
chr18 24160067 CTG C 0.002292 0.100 1 -2 4 388 77 311 38 0 1 0 38 0 0 311 0 0 0.4935 0.0000 0.0000 76.000 0.21 2.21 -2.00 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4069 0.5921 0.0009 1 1 0.4138 0.5853 0.0010 1 1 0.4224 0.5767 0.0010
chr18 31760462 TC T 0.000470 0.100 1 -1 1 625 126 499 73 0 5 0 48 0 0 498 0 1 0.5794 0.0000 0.0020 24.200 0.55 1.42 -0.87 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8557 0.1443 0.0000 1 0 0.8498 0.1502 0.0000 1 0 0.8414 0.1586 0.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 158 72 86 1 0 2 0 69 0 0 86 0 0 0.0139 0.0000 0.0000 35.000 0.00 4.99 -4.99 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1849 0.8151 2 2 0.0000 0.0711 0.9289 2 2 0.0000 0.0524 0.9476
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 94 43 51 14 0 1 0 28 0 0 51 0 0 0.3256 0.0000 0.0000 42.000 0.07 3.04 -2.96 2 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0372 0.3661 0.5967 1 2 0.0407 0.3734 0.5859 1 2 0.0456 0.3833 0.5711
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 353 159 194 87 0 7 0 65 0 0 194 0 0 0.5472 0.0000 0.0000 21.714 0.24 3.68 -3.44 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6716 0.3198 0.0086 1 0 0.6646 0.3254 0.0100 1 0 0.6542 0.3334 0.0123
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 219 112 107 3 0 3 0 106 0 0 107 0 0 0.0268 0.0000 0.0000 36.333 0.00 2.97 -2.97 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.7780 0.2220 2 2 0.0000 0.1089 0.8911 2 2 0.0000 0.0385 0.9615
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 738 182 556 114 0 4 0 64 0 0 547 0 9 0.6264 0.0000 0.0162 44.500 0.18 13.72 -13.54 30 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9206 0.0791 0.0003 1 0 0.9139 0.0858 0.0004 1 0 0.9038 0.0956 0.0006
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 341 69 272 33 1 11 4 20 1 0 271 0 0 0.4783 0.0037 0.0037 5.091 2.61 4.70 -2.09 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4982 0.4454 0.0564 1 0 0.4912 0.4483 0.0605 1 0 0.4816 0.4522 0.0663
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 143 56 87 0 0 2 0 54 0 0 85 0 2 0.0000 0.0000 0.0230 27.000 3.31 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0544 0.9456 2 2 0.0000 0.0575 0.9425 2 2 0.0000 0.0619 0.9381
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 127 64 63 31 2 3 0 28 0 0 61 0 2 0.4844 0.0000 0.0317 20.333 0.42 3.11 -2.69 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2796 0.5660 0.1544 1 1 0.2805 0.5610 0.1585 1 1 0.2814 0.5548 0.1638
chr19 621458 G GGCAGGT 0.002400 0.100 1 6 1 590 150 440 75 1 5 0 69 0 0 432 0 8 0.5000 0.0000 0.0182 29.000 0.93 6.22 -5.28 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2987 0.7004 0.0009 1 1 0.3116 0.6875 0.0009 1 1 0.3282 0.6709 0.0009
chr19 971949 G GGCA 0.008030 0.100 1 3 1 213 89 124 5 1 39 2 42 0 0 124 0 0 0.0562 0.0000 0.0000 6.857 1.60 2.83 -1.23 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0310 0.9135 0.0556 2 1 0.0210 0.9485 0.0305 2 1 0.0117 0.9750 0.0134
chr19 1009186 GAGC G 0.092678 0.100 1 -3 2 508 123 385 103 1 13 1 5 0 0 385 0 0 0.8374 0.0000 0.0000 8.462 0.30 5.20 -4.90 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 0 0.7523 0.2477 0.0000 0 0 0.9702 0.0298 0.0000
chr19 1046907 GCTGCGGGACACCATGCGCGCCATGGGGCTCAGCCGCGCGGTGCT G 0.001648 0.100 1 -44 2 530 157 373 151 0 2 0 4 0 0 370 0 3 0.9618 0.0000 0.0080 77.500 1.00 11.00 -10.00 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1891 0.8109 0.0000 0 0 0.9985 0.0015 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 167 62 105 32 1 0 0 29 0 0 104 0 1 0.5161 0.0000 0.0095 62.000 1.56 4.21 -2.64 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4023 0.5304 0.0673 1 1 0.4042 0.5266 0.0692 1 1 0.4063 0.5220 0.0717
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 222 128 94 66 0 0 0 62 0 0 94 0 0 0.5156 0.0000 0.0000 128.000 0.38 3.15 -2.77 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3634 0.5894 0.0472 1 1 0.3698 0.5807 0.0495 1 1 0.3775 0.5699 0.0526
chr19 1827021 T TGGA 0.035075 0.100 1 3 2 358 94 264 37 7 24 1 25 0 0 263 0 1 0.3936 0.0000 0.0038 2.833 0.78 3.08 -2.30 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7769 0.2220 0.0011 1 0 0.7703 0.2285 0.0012 1 0 0.7612 0.2374 0.0014
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 289 102 187 46 0 18 34 4 0 0 184 3 0 0.4510 0.0000 0.0160 4.941 1.30 3.50 -2.20 24 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3231 0.5702 0.1066 1 1 0.3242 0.5646 0.1112 1 1 0.3252 0.5576 0.1173
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 289 104 185 48 0 20 1 35 0 0 181 0 4 0.4615 0.0000 0.0216 4.200 1.27 7.49 -6.21 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5403 0.4408 0.0189 1 0 0.5402 0.4398 0.0201 1 0 0.5394 0.4389 0.0217
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 289 111 178 59 1 43 0 8 0 0 177 0 1 0.5315 0.0000 0.0056 1.581 1.36 12.38 -11.02 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 1 0.2189 0.7811 0.0000
chr19 2248057 TCCCCCAGCTCCTGGCGTCCAC T 0.007266 0.100 1 -21 1 255 55 200 42 0 9 2 2 0 0 200 0 0 0.7636 0.0000 0.0000 5.111 0.95 12.00 -11.05 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2773 0.7227 0.0000 0 0 0.9506 0.0494 0.0000 0 0 0.9886 0.0114 0.0000
chr19 4529242 TGAG T 0.001023 0.100 1 -3 1 236 70 166 40 0 3 0 27 0 0 166 0 0 0.5714 0.0000 0.0000 22.333 0.93 2.81 -1.89 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7229 0.2771 0.0001 1 0 0.7178 0.2821 0.0001 1 0 0.7108 0.2891 0.0001
chr19 8325008 GTCC G 0.118610 0.100 1 -3 1 378 118 260 73 0 1 0 44 1 0 259 0 0 0.6186 0.0038 0.0038 117.000 1.16 2.98 -1.81 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9060 0.0937 0.0003 1 0 0.8997 0.0999 0.0004 1 0 0.8905 0.1089 0.0005
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 245 64 181 8 0 5 0 51 0 0 178 0 3 0.1250 0.0000 0.0166 11.800 0.88 5.51 -4.63 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9986 0.0014 2 1 0.0000 0.9634 0.0366
chr19 10871708 A AGCG 0.007655 0.100 1 3 1 304 109 195 49 2 4 2 52 1 0 190 1 3 0.4495 0.0051 0.0256 26.250 2.04 5.67 -3.63 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2490 0.7452 0.0058 1 1 0.2608 0.7334 0.0058 1 1 0.2763 0.7179 0.0058
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 833 282 551 111 2 45 23 101 0 0 548 0 3 0.3936 0.0000 0.0054 5.244 0.46 3.41 -2.95 47 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0332 0.6746 0.2921 1 1 0.0378 0.6645 0.2976 1 1 0.0446 0.6518 0.3036
chr19 11447525 AGAGGAG A 0.089394 0.100 1 -6 1 833 286 547 120 3 136 2 25 0 0 546 1 0 0.4196 0.0000 0.0018 1.129 0.50 6.44 -5.94 50 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr19 12430727 C CTG 0.053346 0.100 1 2 3 1397 316 1081 176 16 9 8 107 0 0 1071 3 7 0.5570 0.0000 0.0093 41.857 0.51 4.27 -3.77 40 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9909 0.0091 0.0000 1 0 0.9896 0.0104 0.0000 1 0 0.9877 0.0123 0.0000
chr19 12430728 CAA C 0.053324 0.100 1 -2 3 1398 323 1075 179 3 12 13 116 0 0 1066 0 9 0.5542 0.0000 0.0084 28.273 0.46 4.28 -3.82 45 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9441 0.0558 0.0000 1 0 0.9413 0.0587 0.0000 1 0 0.9368 0.0632 0.0000
chr19 13207858 CCTGCTG C 0.308136 0.100 1 -6 1 380 116 264 0 0 21 0 95 0 0 259 0 5 0.0000 0.0000 0.0189 4.524 10.18 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0134 0.9866 2 2 0.0000 0.0149 0.9851 2 2 0.0000 0.0171 0.9829
chr19 13207858 CCTGCTGCTGCTGCTGCTG C 0.085228 0.100 1 -18 1 381 121 260 65 0 18 1 37 0 0 254 0 6 0.5372 0.0000 0.0231 5.667 5.68 15.70 -10.03 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8192 0.1798 0.0011 1 0 0.8127 0.1861 0.0012 1 0 0.8035 0.1950 0.0015
chr19 14053768 TCGG T 0.001329 0.100 1 -3 2 469 117 352 57 1 5 0 54 0 0 350 0 2 0.4872 0.0000 0.0057 22.400 0.18 3.06 -2.88 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4088 0.5908 0.0004 1 1 0.4173 0.5823 0.0004 1 1 0.4279 0.5717 0.0004
chr19 14396381 GC G 0.000031 0.100 1 -1 4 481 217 264 169 0 2 0 46 0 0 264 0 0 0.7788 0.0000 0.0000 107.500 0.63 2.41 -1.78 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9919 0.0081 0.0000 0 1 0.0077 0.9923 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 14767068 AG A 0.000058 0.100 1 -1 1 248 48 200 28 0 0 0 20 0 0 199 0 1 0.5833 0.0000 0.0050 48.000 1.07 3.00 -1.93 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6115 0.3885 0.0000 1 0 0.6094 0.3906 0.0000 1 0 0.6064 0.3936 0.0000
chr19 14799825 GA G 0.002726 0.100 1 -1 1 805 198 607 95 2 18 0 83 0 0 607 0 0 0.4798 0.0000 0.0000 10.000 1.55 1.22 0.33 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6158 0.3841 0.0001 1 0 0.6192 0.3807 0.0001 1 0 0.6226 0.3772 0.0001
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 534 106 428 0 0 2 0 104 0 0 427 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 52.000 3.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 17286678 GTGTGTGTGTGTGTT G 0.125300 0.100 1 -14 1 309 75 234 29 8 12 5 21 0 0 234 0 0 0.3867 0.0000 0.0000 5.167 3.66 7.00 -3.34 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6473 0.3418 0.0109 1 0 0.6425 0.3457 0.0118 1 0 0.6358 0.3512 0.0130
chr19 17542226 CTGGCAGCACCGTT C 0.001442 0.100 1 -13 1 250 124 126 120 0 1 0 3 0 0 126 0 0 0.9677 0.0000 0.0000 123.000 0.26 8.67 -8.41 78 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9975 0.0025 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 18606579 GAGC G 0.207987 0.100 1 -3 1 111 43 68 35 0 4 0 4 0 0 67 0 1 0.8140 0.0000 0.0147 9.750 1.60 4.25 -2.65 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.0965 0.9035 0.0000 0 1 0.4567 0.5433 0.0000
chr19 19934801 AC A 0.001341 0.100 1 -1 1 1458 306 1152 176 0 8 2 120 3 0 1140 2 7 0.5752 0.0026 0.0104 37.250 1.01 2.03 -1.02 108 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9625 0.0375 0.0000 1 0 0.9599 0.0401 0.0000 1 0 0.9559 0.0441 0.0000
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 1490 333 1157 0 0 9 3 321 0 0 1075 13 69 0.0000 0.0000 0.0709 40.500 2.80 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr19 21116968 TATA T 0.087128 0.100 1 -3 2 1015 235 780 129 0 5 0 101 0 0 775 0 5 0.5489 0.0000 0.0064 46.000 0.13 3.01 -2.88 89 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7376 0.2617 0.0007 1 0 0.7373 0.2618 0.0009 1 0 0.7359 0.2630 0.0011
chr19 23745033 TA T 0.001746 0.100 1 -1 3 968 209 759 12 0 3 0 194 0 0 758 0 1 0.0574 0.0000 0.0013 68.667 0.42 1.28 -0.86 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9899 0.0101
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 302 83 219 38 0 9 4 32 0 0 218 0 1 0.4578 0.0000 0.0046 8.111 0.21 2.66 -2.45 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0793 0.6086 0.3121 1 1 0.0801 0.6013 0.3185 1 1 0.0812 0.5921 0.3267
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 563 156 407 74 0 3 1 78 0 0 406 0 1 0.4744 0.0000 0.0025 51.000 0.66 3.50 -2.84 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0403 0.5915 0.3682 1 1 0.0429 0.5820 0.3751 1 1 0.0465 0.5701 0.3834
chr19 35511459 ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG A 0.164843 0.100 1 -51 2 561 248 313 222 1 16 0 9 0 0 313 0 0 0.8952 0.0000 0.0000 14.500 5.60 17.56 -11.95 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 0 0.9600 0.0400 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr19 35511491 C CGCCACTGCTGCT 0.070267 0.100 1 12 2 554 200 354 60 2 57 3 78 0 0 353 0 1 0.3000 0.0000 0.0028 2.509 10.30 7.62 2.68 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0493 0.7620 0.1887 1 1 0.0559 0.7601 0.1840 1 1 0.0658 0.7569 0.1773
chr19 37388950 C CTGTG 0.140068 0.100 1 4 5 815 174 641 157 1 5 0 11 0 0 641 0 0 0.9023 0.0000 0.0000 33.600 0.17 4.45 -4.28 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1170 0.8830 0.0000 0 0 0.9174 0.0826 0.0000
chr19 37388952 AT A 0.140069 0.100 1 -1 2 817 173 644 160 0 3 0 10 0 0 644 0 0 0.9249 0.0000 0.0000 56.667 0.19 4.90 -4.71 46 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.3029 0.6971 0.0000 0 0 0.9594 0.0406 0.0000
chr19 38304906 TGAA T 0.163680 0.100 1 -3 1 388 100 288 91 1 4 0 4 0 0 288 0 0 0.9100 0.0000 0.0000 24.000 1.30 3.00 -1.70 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0697 0.9303 0.0000 0 0 0.8750 0.1250 0.0000 0 0 0.9709 0.0291 0.0000
chr19 39248513 CT C 0.306458 0.100 1 -1 2 443 109 334 11 0 2 2 94 0 1 322 3 8 0.1009 0.0000 0.0359 53.000 0.91 3.21 -2.30 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 0.9617 0.0383
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 237 30 207 0 0 2 25 3 0 0 207 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 11.500 5.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0674 0.9326 2 2 0.0000 0.0692 0.9308 2 2 0.0000 0.0718 0.9282
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 237 28 209 0 0 20 8 0 0 0 209 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.222 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1326 0.8674 2 2 0.0000 0.1342 0.8658 2 2 0.0001 0.1364 0.8636
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 421 123 298 5 0 5 2 111 0 0 298 0 0 0.0407 0.0000 0.0000 23.600 0.40 5.54 -5.14 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9943 0.0057 2 2 0.0000 0.3738 0.6262 2 2 0.0000 0.0780 0.9220
chr19 42763988 AG A 0.059186 0.100 1 -1 1 498 115 383 63 0 0 0 52 0 0 383 0 0 0.5478 0.0000 0.0000 115.000 0.17 3.81 -3.63 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6116 0.3840 0.0043 1 0 0.6115 0.3838 0.0047 1 0 0.6107 0.3840 0.0053
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 451 100 351 5 0 0 1 94 0 0 340 0 11 0.0500 0.0000 0.0313 100.000 0.00 6.71 -6.71 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 1 0.0000 0.5911 0.4089 2 2 0.0000 0.1686 0.8314
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 516 137 379 9 0 2 0 126 0 0 374 1 4 0.0657 0.0000 0.0132 67.500 0.11 3.10 -2.99 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9237 0.0763 2 2 0.0000 0.2447 0.7553
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 563 132 431 14 0 1 3 114 0 0 426 2 3 0.1061 0.0000 0.0116 130.000 0.14 2.24 -2.09 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9922 0.0078
chr19 44793589 A AC 0.013876 0.100 1 1 1 279 109 170 55 0 2 0 52 0 0 170 0 0 0.5046 0.0000 0.0000 53.500 0.09 2.15 -2.06 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4385 0.5581 0.0034 1 1 0.4454 0.5511 0.0035 1 1 0.4539 0.5424 0.0037
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 1429 470 959 210 1 82 0 177 0 0 934 0 25 0.4468 0.0000 0.0261 4.732 0.35 6.32 -5.96 82 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1397 0.8384 0.0219 1 1 0.1540 0.8202 0.0258 1 1 0.1730 0.7952 0.0318
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 322 100 222 49 0 23 0 28 0 0 212 0 10 0.4900 0.0000 0.0450 3.348 0.33 10.32 -9.99 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6294 0.3623 0.0084 1 0 0.6266 0.3643 0.0091 1 0 0.6226 0.3673 0.0101
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 199 88 111 79 0 5 0 4 0 1 110 0 0 0.8977 0.0000 0.0090 16.600 0.57 1.50 -0.93 45 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0409 0.9591 0.0000 0 0 0.7835 0.2165 0.0000 0 0 0.9453 0.0547 0.0000
chr19 49154453 ACAT A 0.377407 0.100 1 -3 1 1015 293 722 199 7 55 3 29 2 3 713 2 2 0.6792 0.0028 0.0125 4.327 0.82 3.66 -2.83 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 49154632 T TTCC 0.320050 0.100 1 3 1 1041 253 788 167 9 64 0 13 0 0 787 0 1 0.6601 0.0000 0.0013 2.953 0.33 3.38 -3.06 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 0 0.5787 0.4213 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTC G 0.363480 0.100 1 -6 2 574 124 450 0 0 29 0 95 0 0 441 0 9 0.0000 0.0000 0.0200 3.276 6.65 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0096 0.9904 2 2 0.0000 0.0111 0.9889
chr19 49908948 G GTGC 0.000984 0.100 1 3 2 789 199 590 112 0 14 4 69 0 0 590 0 0 0.5628 0.0000 0.0000 13.214 0.95 2.96 -2.01 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9511 0.0489 0.0000 1 0 0.9472 0.0528 0.0000 1 0 0.9413 0.0587 0.0000
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 659 151 508 4 1 4 72 70 0 0 503 2 3 0.0265 0.0000 0.0098 36.250 0.25 3.54 -3.29 0 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9668 0.0332 2 2 0.0000 0.1083 0.8917 2 2 0.0000 0.0181 0.9819
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 660 152 508 1 0 11 66 74 0 0 506 0 2 0.0066 0.0000 0.0039 12.818 1.00 4.00 -3.00 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0146 0.9854 2 2 0.0000 0.0053 0.9947 2 2 0.0000 0.0043 0.9957
chr19 50790456 CCTG C 0.001664 0.100 1 -3 1 487 184 303 88 1 18 2 75 0 0 303 0 0 0.4783 0.0000 0.0000 9.222 0.38 3.33 -2.96 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5923 0.4077 0.0001 1 0 0.5960 0.4039 0.0001 1 0 0.6001 0.3998 0.0001
chr19 51458362 G GGCA 0.000077 0.100 1 3 4 359 84 275 53 4 22 0 5 0 0 275 0 0 0.6310 0.0000 0.0000 2.818 0.70 3.20 -2.50 27 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7804 0.2196 0.0000 0 0 0.9991 0.0009 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 546 152 394 12 0 3 6 131 0 0 388 0 6 0.0789 0.0000 0.0152 49.667 0.83 2.80 -1.97 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9930 0.0070 2 1 0.0000 0.5272 0.4728
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 218 89 129 83 1 2 0 3 0 0 129 0 0 0.9326 0.0000 0.0000 43.500 0.10 2.33 -2.24 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0344 0.9656 0.0000 0 0 0.5120 0.4880 0.0000 0 0 0.7680 0.2320 0.0000
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 525 157 368 150 0 2 0 5 0 0 368 0 0 0.9554 0.0000 0.0000 77.500 0.15 2.40 -2.25 98 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0529 0.9471 0.0000 0 0 0.9349 0.0651 0.0000 0 0 0.9896 0.0104 0.0000
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 608 140 468 133 0 1 0 6 0 0 468 0 0 0.9500 0.0000 0.0000 139.000 0.16 3.50 -3.34 63 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0022 0.9978 0.0000 0 0 0.6707 0.3293 0.0000 0 0 0.9552 0.0448 0.0000
chr19 52613680 GCCACACTCATTACATTTGTAAGGTTTCTCTCCAGTGTGGATTCTCTGATGTTGTGCAAGGTGTGAAATATGATGGAAGACCTTT G 0.063910 0.100 1 -84 2 1197 419 778 390 0 17 0 12 10 2 765 0 1 0.9308 0.0129 0.0167 23.647 0.61 1.75 -1.14 104 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0037 0.9963 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 1416 302 1114 27 0 6 0 269 0 0 1106 1 7 0.0894 0.0000 0.0072 49.333 0.11 3.49 -3.38 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9864 0.0136
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 948 275 673 95 8 44 6 122 0 0 672 0 1 0.3455 0.0000 0.0015 8.179 0.26 2.55 -2.29 53 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0008 0.1729 0.8263 1 2 0.0010 0.1777 0.8213 1 2 0.0014 0.1849 0.8137
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 664 129 535 0 0 7 1 121 0 0 526 0 9 0.0000 0.0000 0.0168 17.429 3.58 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0021 0.9979
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.100 1 4 2 743 156 587 128 0 19 0 9 0 0 587 0 0 0.8205 0.0000 0.0000 7.211 0.61 4.11 -3.50 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5649 0.4351 0.0000 0 0 0.9799 0.0201 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 442 109 333 0 0 27 0 82 0 0 317 0 16 0.0000 0.0000 0.0480 3.037 7.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0086 0.9914
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 670 183 487 81 5 27 0 70 0 0 469 1 17 0.4426 0.0000 0.0370 6.375 2.17 19.23 -17.06 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0270 0.6462 0.3268 1 1 0.0286 0.6338 0.3377 1 1 0.0307 0.6180 0.3513
chr19 55518174 C CATCCCACCATGACTGCTG 0.004924 0.100 1 18 1 820 206 614 16 7 14 22 147 2 2 564 5 41 0.0777 0.0033 0.0814 26.286 5.88 9.93 -4.05 8 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 736 231 505 9 0 28 18 176 0 0 494 1 10 0.0390 0.0000 0.0218 7.960 0.22 5.39 -5.16 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.5429 0.4571 2 2 0.0000 0.0344 0.9656
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 545 104 441 5 0 2 1 96 0 0 437 0 4 0.0481 0.0000 0.0091 102.000 1.00 4.32 -3.32 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9969 0.0031 2 1 0.0000 0.5258 0.4742 2 2 0.0000 0.1339 0.8661
chr19 56088071 C CTCG 0.023520 0.100 1 3 2 346 65 281 56 1 1 0 7 0 0 281 0 0 0.8615 0.0000 0.0000 64.000 2.52 7.29 -4.77 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2911 0.7089 0.0000 0 0 0.8792 0.1208 0.0000
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.100 1 -48 1 120 61 59 35 1 13 0 12 0 0 54 0 5 0.5738 0.0000 0.0847 3.615 1.23 12.58 -11.35 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7935 0.2017 0.0047 1 0 0.7846 0.2100 0.0054 1 0 0.7720 0.2216 0.0064
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 314 110 204 59 0 1 0 50 0 0 201 0 3 0.5364 0.0000 0.0147 109.000 0.19 3.92 -3.73 37 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4582 0.5167 0.0251 1 1 0.4621 0.5114 0.0265 1 1 0.4665 0.5051 0.0284
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 317 105 212 0 0 1 2 102 0 0 211 0 1 0.0000 0.0000 0.0047 104.000 2.11 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0037 0.9963 2 2 0.0000 0.0042 0.9958 2 2 0.0000 0.0048 0.9952
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 88 45 43 3 0 1 0 41 0 0 43 0 0 0.0667 0.0000 0.0000 44.000 0.00 6.24 -6.24 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9844 0.0156 2 1 0.0000 0.6710 0.3290 2 2 0.0000 0.3781 0.6219
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 619 188 431 177 0 1 0 10 0 0 430 0 1 0.9415 0.0000 0.0023 187.000 0.23 8.10 -7.87 55 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0853 0.9147 0.0000 0 0 0.8830 0.1170 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 619 195 424 179 0 7 0 9 0 0 423 0 1 0.9179 0.0000 0.0024 26.857 0.22 8.11 -7.89 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2299 0.7701 0.0000 0 0 0.9408 0.0592 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 624 191 433 175 0 8 0 8 0 0 433 0 0 0.9162 0.0000 0.0000 22.875 0.12 9.25 -9.13 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.6893 0.3107 0.0000 0 0 0.9808 0.0192 0.0000
chr20 3045699 A AGCCCC 0.132912 0.100 1 5 1 322 138 184 124 0 11 0 3 0 1 182 1 0 0.8986 0.0000 0.0109 11.545 0.48 6.67 -6.18 58 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7852 0.2148 0.0000 0 0 0.9908 0.0092 0.0000 0 0 0.9970 0.0030 0.0000
chr20 3785200 T TTCC 0.003046 0.100 1 3 4 458 84 374 41 1 6 0 36 0 0 372 0 2 0.4881 0.0000 0.0053 13.000 0.66 3.53 -2.87 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4999 0.4994 0.0007 1 0 0.5035 0.4958 0.0007 1 0 0.5077 0.4915 0.0008
chr20 4699448 CCATGGTGGTGGCTGGGGACAGCCT C 0.009335 0.100 1 -24 4 822 257 565 133 1 27 1 95 0 0 565 0 0 0.5175 0.0000 0.0000 8.481 0.67 6.12 -5.45 15 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9341 0.0659 0.0000 1 0 0.9302 0.0698 0.0000 1 0 0.9244 0.0756 0.0000
chr20 5946423 CTCT C 0.007166 0.100 1 -3 3 137 72 65 66 0 2 0 4 0 0 65 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 35.000 0.52 3.00 -2.48 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.3556 0.6444 0.0000 0 0 0.9815 0.0185 0.0000 0 0 0.9962 0.0038 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 220 90 130 75 0 2 0 13 0 0 130 0 0 0.8333 0.0000 0.0000 44.000 0.48 1.08 -0.60 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0056 0.9944 0.0000
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 683 176 507 163 0 5 0 8 0 0 507 0 0 0.9261 0.0000 0.0000 34.200 0.31 6.25 -5.94 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4567 0.5433 0.0000 0 0 0.9516 0.0484 0.0000
chr20 32019232 A AGGCGGCGGC 0.000153 0.100 1 9 2 465 140 325 69 0 22 0 49 0 0 314 0 11 0.4929 0.0000 0.0338 5.364 0.39 8.04 -7.65 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5663 0.4337 0.0000 1 0 0.5695 0.4305 0.0000 1 0 0.5730 0.4269 0.0000
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 490 147 343 8 1 0 4 134 0 0 331 1 11 0.0544 0.0000 0.0350 146.000 0.12 3.54 -3.41 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.6540 0.3460 2 2 0.0000 0.0707 0.9293
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.100 1 -9 4 208 78 130 43 1 29 1 4 0 1 128 0 1 0.5513 0.0000 0.0154 1.655 2.74 7.50 -4.76 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0253 0.9747 0.0000 0 1 0.1713 0.8287 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 532 151 381 84 1 3 0 63 0 0 381 0 0 0.5563 0.0000 0.0000 49.333 0.25 3.24 -2.99 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6194 0.3683 0.0123 1 0 0.6114 0.3743 0.0143 1 0 0.5997 0.3828 0.0175
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 1032 306 726 0 0 58 14 234 0 0 722 0 4 0.0000 0.0000 0.0055 4.276 3.12 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr20 47651119 GCAA G 0.005778 0.100 1 -3 1 516 219 297 111 0 2 5 101 0 0 297 0 0 0.5068 0.0000 0.0000 106.000 0.32 3.19 -2.86 21 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4041 0.5953 0.0006 1 1 0.4170 0.5823 0.0007 1 1 0.4331 0.5662 0.0007
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.100 1 3 1 379 84 295 36 0 2 1 45 0 0 292 0 3 0.4286 0.0000 0.0102 41.000 0.28 3.31 -3.03 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0848 0.5977 0.3175 1 1 0.0919 0.5968 0.3114 1 1 0.1018 0.5954 0.3028
chr20 58854444 G GGCAGCCCCT 0.000770 0.100 1 9 3 678 161 517 79 0 20 0 62 0 0 504 0 13 0.4907 0.0000 0.0251 7.050 0.54 8.50 -7.96 1 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4110 0.5889 0.0001 1 1 0.4212 0.5787 0.0002 1 1 0.4338 0.5660 0.0002
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 185 40 145 0 0 4 1 35 0 0 139 0 6 0.0000 0.0000 0.0414 9.000 6.89 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 283 131 152 6 0 2 0 123 0 0 152 0 0 0.0458 0.0000 0.0000 64.500 0.83 1.96 -1.13 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9978 0.0022 2 2 0.0000 0.3372 0.6628 2 2 0.0000 0.0458 0.9542
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 711 175 536 108 1 2 0 64 0 0 533 0 3 0.6171 0.0000 0.0056 86.500 0.16 5.91 -5.75 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9294 0.0704 0.0002 1 0 0.9228 0.0769 0.0003 1 0 0.9130 0.0865 0.0005
chr21 33070402 CTCCTCCACT C 0.002225 0.100 1 -9 2 476 154 322 72 5 4 0 73 0 0 322 0 0 0.4675 0.0000 0.0000 37.250 0.56 7.99 -7.43 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4101 0.5894 0.0004 1 1 0.4201 0.5794 0.0005 1 1 0.4325 0.5670 0.0005
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 244 117 127 48 0 4 0 65 0 0 126 0 1 0.4103 0.0000 0.0079 28.250 0.23 2.89 -2.66 20 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0144 0.3406 0.6450 1 2 0.0163 0.3456 0.6381 1 2 0.0191 0.3527 0.6282
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 316 51 265 0 0 4 2 45 0 0 264 0 1 0.0000 0.0000 0.0038 11.750 2.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 1100 185 915 106 3 4 6 66 0 0 905 4 6 0.5730 0.0000 0.0109 89.000 1.59 3.56 -1.97 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6880 0.3071 0.0049 1 0 0.6792 0.3148 0.0060 1 0 0.6663 0.3258 0.0078
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 1100 193 907 113 1 6 6 67 0 0 896 4 7 0.5855 0.0000 0.0121 46.250 1.56 3.55 -1.99 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7401 0.2569 0.0030 1 0 0.7307 0.2656 0.0037 1 0 0.7171 0.2780 0.0050
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 649 159 490 132 3 19 0 5 21 6 462 0 1 0.8302 0.0429 0.0571 7.316 1.92 13.00 -11.08 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0246 0.9754 0.0000 0 0 0.9566 0.0434 0.0000 0 0 0.9955 0.0045 0.0000
chr21 44579846 AGG A 0.004815 0.100 1 -2 2 718 242 476 168 0 3 2 69 0 0 472 1 3 0.6942 0.0000 0.0084 119.000 1.70 8.62 -6.92 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr21 44579850 A ACG 0.004831 0.100 1 2 1 719 238 481 166 1 3 0 68 0 0 476 0 5 0.6975 0.0000 0.0104 117.500 1.70 8.68 -6.97 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9996 0.0004 0.0000 1 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr21 44637695 CCTGCTGTGTGCCTGT C 0.541271 0.100 1 -15 2 546 130 416 62 0 20 0 48 0 0 413 0 3 0.4769 0.0000 0.0072 5.500 2.55 12.58 -10.03 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4152 0.5294 0.0553 1 1 0.4132 0.5269 0.0599 1 1 0.4097 0.5239 0.0664
chr21 45504028 TTTC T 0.000493 0.100 1 -3 1 189 58 131 29 0 1 0 28 0 0 129 0 2 0.5000 0.0000 0.0153 57.000 0.07 3.29 -3.22 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4039 0.5959 0.0002 1 1 0.4101 0.5897 0.0002 1 1 0.4180 0.5818 0.0002
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 340 141 199 1 2 16 2 120 0 0 199 0 0 0.0071 0.0000 0.0000 7.688 1.00 8.55 -7.55 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr22 15698738 CAAATT C 0.000142 0.100 1 -5 1 413 249 164 240 2 1 0 6 5 1 158 0 0 0.9639 0.0305 0.0366 248.000 0.55 5.17 -4.62 116 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9997 0.0003 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 18608233 A ACACCTG 0.013847 0.100 1 6 1 3439 1073 2366 693 1 26 1 352 0 0 2347 0 19 0.6459 0.0000 0.0080 40.269 0.35 6.04 -5.69 103 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 20366617 A ATG 0.000432 0.100 1 2 3 344 111 233 67 0 1 0 43 0 0 233 0 0 0.6036 0.0000 0.0000 110.000 0.00 2.05 -2.05 67 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8628 0.1372 0.0000 1 0 0.8566 0.1434 0.0000 1 0 0.8479 0.1521 0.0000
chr22 20566526 ACAG A 0.027879 0.100 1 -3 2 746 238 508 170 5 47 0 16 0 0 508 0 0 0.7143 0.0000 0.0000 4.064 0.22 3.00 -2.78 54 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0086 0.9914 0.0000 0 0 0.8544 0.1456 0.0000
chr22 23617579 G GCAT 0.002056 0.100 1 3 3 218 95 123 50 0 5 0 40 0 0 122 0 1 0.5263 0.0000 0.0081 18.000 0.10 3.90 -3.80 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6090 0.3908 0.0002 1 0 0.6088 0.3909 0.0002 1 0 0.6081 0.3916 0.0002
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 191 91 100 82 0 3 0 6 0 0 100 0 0 0.9011 0.0000 0.0000 29.333 0.28 3.00 -2.72 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2423 0.7577 0.0000 0 0 0.7825 0.2175 0.0000
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 741 121 620 0 0 37 0 84 0 0 594 1 25 0.0000 0.0000 0.0419 2.333 14.83 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr22 27798924 T TTGC 0.004414 0.100 1 3 1 1508 456 1052 197 15 63 5 176 0 0 1050 0 2 0.4320 0.0000 0.0019 6.206 0.94 3.19 -2.24 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7288 0.2712 0.0000 1 0 0.7353 0.2647 0.0000 1 0 0.7420 0.2580 0.0000
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.100 1 3 1 1501 452 1049 294 26 105 7 20 1 0 1048 0 0 0.6504 0.0010 0.0010 3.288 1.84 3.35 -1.51 64 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.9044 0.0956 0.0000
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 772 224 548 212 0 4 0 8 0 0 548 0 0 0.9464 0.0000 0.0000 55.000 0.57 4.38 -3.81 142 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.9214 0.0786 0.0000 0 0 0.9961 0.0039 0.0000
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 619 190 429 95 0 9 0 86 0 0 427 0 2 0.5000 0.0000 0.0047 20.111 0.59 2.10 -1.52 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2764 0.6585 0.0651 1 1 0.2829 0.6468 0.0703 1 1 0.2906 0.6319 0.0775
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 577 124 453 107 2 4 0 11 0 0 453 0 0 0.8629 0.0000 0.0000 30.000 0.85 9.18 -8.33 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 1 0.1182 0.8818 0.0000
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 363 179 184 96 0 17 0 66 0 0 177 0 7 0.5363 0.0000 0.0380 9.529 0.32 7.83 -7.51 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7347 0.2613 0.0040 1 0 0.7292 0.2661 0.0047 1 0 0.7211 0.2731 0.0059
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 207 99 108 43 0 3 0 53 0 0 107 0 1 0.4343 0.0000 0.0093 32.000 0.86 3.68 -2.82 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0793 0.5695 0.3512 1 1 0.0854 0.5671 0.3476 1 1 0.0939 0.5640 0.3422
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 362 134 228 0 0 4 0 130 0 0 221 1 6 0.0000 0.0000 0.0307 32.500 3.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr22 40861830 T TA 0.018262 0.100 1 1 2 602 126 476 108 0 2 0 16 0 0 476 0 0 0.8571 0.0000 0.0000 62.000 0.17 2.00 -1.83 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.2620 0.7380 0.0000
chr22 46262985 ACGAGCG A 0.051474 0.100 1 -6 1 648 120 528 21 1 6 0 92 0 0 518 0 10 0.1750 0.0000 0.0189 19.000 1.76 6.98 -5.22 15 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr22 46363187 CCTGATGGTTCAAATTGAAGTTTCATTA C 0.006403 0.100 1 -27 3 231 90 141 7 0 23 0 60 0 0 133 0 8 0.0778 0.0000 0.0567 2.913 0.14 19.20 -19.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9980 0.0020
chr22 46537150 GGGC G 0.001229 0.100 1 -3 1 264 82 182 34 2 13 0 33 0 0 181 0 1 0.4146 0.0000 0.0055 5.231 1.21 4.61 -3.40 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4517 0.5479 0.0004 1 1 0.4566 0.5429 0.0004 1 1 0.4628 0.5368 0.0004
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 342 107 235 77 0 22 0 8 0 0 233 0 2 0.7196 0.0000 0.0085 3.864 0.27 16.00 -15.73 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0092 0.9908 0.0000 0 1 0.3648 0.6352 0.0000
809 rows