File Info

Filename
HG00621_x_HG00673_FF_10.features.tsv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/bb/c9566e74454fd22eff916ab9f33162/HG00621_x_HG00673_FF_10.features.tsv
Size
137.8 KB
Task
EMIT_ALPHA_FEATURES (HG00621_x_HG00673_FF_10)
Attempt

Content

View in new tab
chrom pos ref alt p_pop ff is_indel indel_len hp_len n_total n_span n_flank span_strong_ref span_weak_ref span_mid span_weak_alt span_strong_alt flank_strong_ref flank_weak_ref flank_mid flank_weak_alt flank_strong_alt frac_span_strong_ref frac_flank_strong_ref frac_flank_informative bimodality_ratio nm_strong_ref nm_strong_alt nm_elevation sr_strand_imbalance baseline_mat_gt baseline_fet_gt truth_mat_gt truth_fet_gt status a0.012_gm a0.012_gf a0.012_gf_post0 a0.012_gf_post1 a0.012_gf_post2 a0.05_gm a0.05_gf a0.05_gf_post0 a0.05_gf_post1 a0.05_gf_post2 a0.1_gm a0.1_gf a0.1_gf_post0 a0.1_gf_post1 a0.1_gf_post2
chr1 1919188 CAGCGGCAGG C 0.500000 0.100 1 -9 2 452 146 306 6 0 17 0 123 0 0 299 0 7 0.0411 0.0000 0.0229 7.588 0.33 8.48 -8.15 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 2 0.0000 0.4739 0.5261 2 2 0.0000 0.0789 0.9211
chr1 1968667 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 2 300 134 166 123 0 1 0 10 0 0 166 0 0 0.9179 0.0000 0.0000 133.000 0.12 4.60 -4.48 35 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0110 0.9890 0.0000 0 1 0.3899 0.6101 0.0000
chr1 3021843 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 552 144 408 127 0 10 0 7 0 0 408 0 0 0.8819 0.0000 0.0000 13.400 0.17 3.14 -2.97 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.2479 0.7521 0.0000 0 0 0.8416 0.1584 0.0000
chr1 11650722 C CGCG 0.500000 0.100 1 3 1 495 126 369 93 4 22 1 6 0 0 369 0 0 0.7381 0.0000 0.0000 4.682 0.39 3.00 -2.61 25 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1375 0.8625 0.0000 0 0 0.6488 0.3512 0.0000
chr1 13779899 A ACTC 0.500000 0.100 1 3 2 919 144 775 132 0 6 0 6 0 0 775 0 0 0.9167 0.0000 0.0000 23.000 0.39 3.00 -2.61 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 0 0.5510 0.4490 0.0000 0 0 0.9279 0.0721 0.0000
chr1 16539275 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 284 40 244 0 0 1 0 39 0 0 244 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 39.000 1.05 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1205 0.8795 2 2 0.0000 0.1248 0.8752 2 2 0.0000 0.1310 0.8690
chr1 31433042 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 1 359 142 217 9 0 8 1 124 0 0 216 0 1 0.0634 0.0000 0.0046 16.750 0.33 3.00 -2.67 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9641 0.0359 2 2 0.0000 0.4166 0.5834
chr1 40515335 CTG C 0.500000 0.100 1 -2 1 607 123 484 111 0 4 0 8 0 0 484 0 0 0.9024 0.0000 0.0000 29.750 0.44 1.88 -1.43 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0487 0.9513 0.0000 0 0 0.5628 0.4372 0.0000
chr1 47438996 T TCCGCAC 0.500000 0.100 1 6 1 661 171 490 1 1 15 1 153 0 0 489 0 1 0.0058 0.0000 0.0020 10.267 6.00 5.79 0.21 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr1 50419101 CCGGCGG C 0.500000 0.100 1 -6 6 726 122 604 53 1 12 0 56 0 1 600 0 3 0.4344 0.0000 0.0066 9.167 2.28 7.21 -4.93 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1149 0.6148 0.2703 1 1 0.1202 0.6063 0.2735 1 1 0.1272 0.5956 0.2772
chr1 51840391 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 244 96 148 0 0 12 2 82 0 0 148 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 6.917 2.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0137 0.9863 2 2 0.0000 0.0150 0.9850 2 2 0.0000 0.0168 0.9832
chr1 53459700 G GCCGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 634 168 466 141 1 21 0 5 0 0 465 0 1 0.8393 0.0000 0.0021 7.000 0.41 6.00 -5.59 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 0 0.6692 0.3308 0.0000 0 0 0.9543 0.0457 0.0000
chr1 74572173 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 4 653 141 512 87 0 5 2 47 0 0 511 0 1 0.6170 0.0000 0.0020 27.000 1.07 3.32 -2.25 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9104 0.0891 0.0006 1 0 0.9025 0.0968 0.0008 1 0 0.8908 0.1081 0.0011
chr1 77558660 C CTAT 0.500000 0.100 1 3 1 162 82 80 31 0 5 0 46 0 0 78 0 2 0.3780 0.0000 0.0250 15.400 0.16 3.61 -3.45 7 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0217 0.3456 0.6326 1 2 0.0244 0.3527 0.6229 1 2 0.0283 0.3623 0.6093
chr1 84574315 CGCAGCGCCA C 0.500000 0.100 1 -9 2 291 149 142 16 0 25 0 108 0 0 131 0 11 0.1074 0.0000 0.0775 4.960 1.12 10.07 -8.95 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9890 0.0110
chr1 86580213 TCCTACA T 0.500000 0.100 1 -6 1 510 183 327 91 1 8 0 83 0 0 324 0 3 0.4973 0.0000 0.0092 21.875 0.22 5.63 -5.41 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2534 0.6695 0.0772 1 1 0.2598 0.6574 0.0828 1 1 0.2674 0.6420 0.0906
chr1 109250113 A ACGC 0.500000 0.100 1 3 2 452 137 315 7 1 5 2 122 0 0 309 0 6 0.0511 0.0000 0.0190 26.200 0.43 3.18 -2.75 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.7826 0.2174 2 2 0.0000 0.1749 0.8251
chr1 111414879 CTCACAGACTGATGACTCACAGGGG C 0.500000 0.100 1 -24 3 819 183 636 112 0 22 9 40 0 0 629 4 3 0.6120 0.0000 0.0110 7.318 0.38 3.23 -2.84 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9826 0.0174 0.0000 1 0 0.9798 0.0202 0.0000 1 0 0.9753 0.0246 0.0000
chr1 111414925 GGGTCAGGGTCTTTTCCCCAGGGGTCACAGACTGATAACCCACAGA G 0.500000 0.100 1 -45 4 827 198 629 118 1 13 3 63 0 0 629 0 0 0.5960 0.0000 0.0000 14.154 0.56 3.67 -3.11 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9757 0.0243 0.0000 1 0 0.9722 0.0277 0.0000 1 0 0.9668 0.0331 0.0001
chr1 150226707 CTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -6 2 236 103 133 45 0 6 0 52 0 0 130 0 3 0.4369 0.0000 0.0226 16.167 0.16 5.48 -5.33 23 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0586 0.5158 0.4256 1 1 0.0629 0.5137 0.4233 1 1 0.0690 0.5112 0.4197
chr1 152111699 T TTGCTGCTCGCGCCTCTCC 0.500000 0.100 1 18 1 1260 368 892 206 12 120 3 27 15 3 856 7 11 0.5598 0.0168 0.0404 2.042 2.33 7.56 -5.23 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr1 152156589 GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA G 0.500000 0.100 1 -36 1 1074 265 809 210 0 44 0 11 0 0 809 0 0 0.7925 0.0000 0.0000 5.023 0.34 4.00 -3.66 22 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.2275 0.7725 0.0000 0 0 0.9581 0.0419 0.0000
chr1 152223252 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 257 85 172 4 1 11 7 62 0 0 172 0 0 0.0471 0.0000 0.0000 6.800 0.00 1.40 -1.40 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9965 0.0035 2 1 0.0000 0.7634 0.2366 2 2 0.0000 0.3860 0.6140
chr1 152515515 G GGGCTGCTGCGGCGACTCA 0.500000 0.100 1 18 4 228 90 138 62 0 24 0 4 0 0 138 0 0 0.6889 0.0000 0.0000 2.750 1.52 4.75 -3.23 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0032 0.9968 0.0000 0 1 0.2383 0.7617 0.0000 0 0 0.6086 0.3914 0.0000
chr1 152709204 C CAGCTCTGGGGGCTGCTGT 0.500000 0.100 1 18 2 269 85 184 0 0 8 0 77 0 0 163 0 21 0.0000 0.0000 0.1141 9.625 11.49 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0085 0.9915
chr1 152709213 G GGGCTGCTGTAGCTCTGGC 0.500000 0.100 1 18 5 269 109 160 7 0 4 0 98 0 0 159 0 1 0.0642 0.0000 0.0063 26.250 0.00 9.09 -9.09 5 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9242 0.0758 2 2 0.0000 0.4222 0.5778
chr1 152776532 C CCAGCTCTGGGGGCTGCTG 0.500000 0.100 1 18 1 792 287 505 138 1 66 0 82 0 0 489 0 16 0.4808 0.0000 0.0317 3.400 0.28 11.99 -11.71 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9036 0.0961 0.0002 1 0 0.8972 0.1024 0.0003 1 0 0.8877 0.1118 0.0005
chr1 152910982 C CCTGGTGCAGCAGGAGGGGCAGCTGAAGCAT 0.500000 0.100 1 30 1 1319 295 1024 140 5 135 3 12 11 3 1008 0 2 0.4746 0.0107 0.0156 1.170 1.25 5.25 -4.00 16 0/1 0/0 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0602 0.9398 0.0000
chr1 153261515 A ACTCTGGCGGCGG 0.500000 0.100 1 12 1 1160 287 873 135 0 54 1 97 3 1 843 2 24 0.4704 0.0034 0.0344 4.396 2.34 10.46 -8.12 9 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.3642 0.6160 0.0198 1 1 0.3726 0.6047 0.0227 1 1 0.3821 0.5909 0.0270
chr1 153615319 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 575 165 410 144 0 11 0 10 0 0 410 0 0 0.8727 0.0000 0.0000 14.000 0.35 3.30 -2.95 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0306 0.9694 0.0000 0 0 0.6386 0.3614 0.0000
chr1 153934802 CCTGCTGCTG C 0.500000 0.100 1 -9 1 574 265 309 143 0 16 1 105 0 0 309 0 0 0.5396 0.0000 0.0000 15.562 0.78 7.59 -6.81 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8518 0.1476 0.0006 1 0 0.8453 0.1539 0.0007 1 0 0.8357 0.1633 0.0011
chr1 153934829 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 567 268 299 148 97 8 2 13 0 0 299 0 0 0.5522 0.0000 0.0000 64.500 0.34 4.38 -4.04 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0570 0.9430 0.0000 0 0 0.9366 0.0634 0.0000
chr1 153934830 T TGC 0.500000 0.100 1 2 1 566 269 297 241 5 9 1 13 0 0 297 0 0 0.8959 0.0000 0.0000 32.375 3.44 4.38 -0.95 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1321 0.8679 0.0000 0 0 0.9652 0.0348 0.0000
chr1 156384556 T TC 0.500000 0.100 1 1 1 211 81 130 44 0 3 3 31 0 0 130 0 0 0.5432 0.0000 0.0000 26.000 1.59 2.06 -0.47 20 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4636 0.4784 0.0580 1 1 0.4588 0.4790 0.0622 1 1 0.4520 0.4799 0.0681
chr1 156595257 A AAC 0.500000 0.100 1 2 4 352 81 271 0 0 0 0 81 0 0 269 0 2 0.0000 0.0000 0.0074 81.000 2.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0143 0.9857 2 2 0.0000 0.0156 0.9844 2 2 0.0000 0.0175 0.9825
chr1 159432794 G GT 0.500000 0.100 1 1 1 844 155 689 0 0 1 0 154 0 0 686 0 3 0.0000 0.0000 0.0044 154.000 1.58 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr1 179534890 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 4 191 60 131 25 0 8 2 25 0 0 131 0 0 0.4167 0.0000 0.0000 6.375 0.24 4.56 -4.32 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1821 0.5591 0.2587 1 1 0.1854 0.5547 0.2599 1 1 0.1897 0.5491 0.2612
chr1 196958921 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 2 239 99 140 54 0 1 0 44 0 0 139 0 1 0.5455 0.0000 0.0071 98.000 0.13 1.95 -1.82 36 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4000 0.5328 0.0672 1 1 0.3986 0.5297 0.0717 1 1 0.3961 0.5259 0.0780
chr1 202214229 TG T 0.500000 0.100 1 -1 2 103 68 35 64 0 2 0 2 0 0 35 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 33.000 0.67 2.00 -1.33 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2360 0.7640 0.0000 0 0 0.7443 0.2557 0.0000 0 0 0.8609 0.1391 0.0000
chr1 203217822 C CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT 0.500000 0.100 1 24 3 484 184 300 0 0 39 1 144 0 0 253 0 47 0.0000 0.0000 0.1567 3.718 12.87 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr1 209432291 TAGCAGCAGCAGC T 0.500000 0.100 1 -12 1 451 215 236 0 0 31 0 184 0 0 219 0 17 0.0000 0.0000 0.0720 5.935 10.46 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr1 210094548 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 202 65 137 36 0 2 0 27 0 0 137 0 0 0.5538 0.0000 0.0000 31.500 0.17 3.22 -3.06 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4378 0.4887 0.0735 1 1 0.4331 0.4889 0.0779 1 1 0.4266 0.4893 0.0841
chr1 223363360 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 262 112 150 92 2 9 0 9 0 0 150 0 0 0.8214 0.0000 0.0000 11.444 0.13 3.22 -3.09 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0074 0.9926 0.0000 0 1 0.2264 0.7736 0.0000
chr1 225140736 G GAT 0.500000 0.100 1 2 1 314 89 225 82 0 2 1 4 0 0 225 0 0 0.9213 0.0000 0.0000 43.500 0.35 2.25 -1.90 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 1 0.2612 0.7388 0.0000 0 0 0.6993 0.3007 0.0000
chr1 235213963 TTCC T 0.500000 0.100 1 -3 1 186 55 131 26 0 8 1 20 0 0 131 0 0 0.4727 0.0000 0.0000 5.750 0.27 3.05 -2.78 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3495 0.5255 0.1250 1 1 0.3473 0.5235 0.1292 1 1 0.3441 0.5210 0.1349
chr1 236736599 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 265 136 129 50 1 3 0 82 0 0 128 1 0 0.3676 0.0000 0.0078 44.000 0.22 1.37 -1.15 8 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0015 0.1395 0.8590 1 2 0.0019 0.1484 0.8497 1 2 0.0026 0.1612 0.8361
chr1 240092268 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 598 176 422 92 3 18 2 61 1 0 419 0 2 0.5227 0.0024 0.0071 8.722 1.16 3.07 -1.90 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8265 0.1717 0.0018 1 0 0.8176 0.1801 0.0023 1 0 0.8048 0.1921 0.0031
chr1 247815239 AAGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 726 193 533 0 0 3 1 189 0 0 524 0 9 0.0000 0.0000 0.0169 63.333 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr1 248295573 CT C 0.500000 0.100 1 -1 1 554 113 441 51 0 3 0 59 0 0 441 0 0 0.4513 0.0000 0.0000 36.667 0.55 2.05 -1.50 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0743 0.5630 0.3627 1 1 0.0791 0.5579 0.3631 1 1 0.0857 0.5515 0.3629
chr1 248349637 AC A 0.500000 0.100 1 -1 3 480 135 345 124 0 3 0 8 0 0 345 0 0 0.9185 0.0000 0.0000 44.000 0.38 1.50 -1.12 12 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0896 0.9104 0.0000 0 0 0.7078 0.2922 0.0000
chr1 248361635 ATGGGACTCTTCAGACAATCCAAACATCCAATGGCCAATATCACCTGGATGGCCAACCACACTGGATGGTCGGATTTCATCCTGT A 0.500000 0.100 1 -84 1 730 219 511 142 1 23 1 52 0 0 511 0 0 0.6484 0.0000 0.0000 8.522 0.15 2.81 -2.65 78 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9993 0.0007 0.0000 1 0 0.9991 0.0009 0.0000 1 0 0.9987 0.0013 0.0000
chr1 248362336 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 981 249 732 134 2 4 0 109 0 0 731 0 1 0.5382 0.0000 0.0014 61.250 2.74 1.06 1.67 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6546 0.3414 0.0040 1 0 0.6524 0.3427 0.0049 1 0 0.6481 0.3456 0.0062
chr1 248441153 CAT C 0.500000 0.100 1 -2 1 509 189 320 89 0 4 0 96 0 0 320 0 0 0.4709 0.0000 0.0000 46.250 1.53 4.07 -2.54 53 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0670 0.6646 0.2684 1 1 0.0724 0.6527 0.2749 1 1 0.0799 0.6375 0.2826
chr1 248441258 T TTC 0.500000 0.100 1 2 1 659 61 598 0 1 3 3 54 0 0 590 0 8 0.0000 0.0000 0.0134 19.333 3.44 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0501 0.9499 2 2 0.0000 0.0506 0.9494 2 2 0.0000 0.0523 0.9477
chr1 248453429 CTCTA C 0.500000 0.100 1 -4 3 1197 264 933 161 0 3 1 99 0 1 929 0 3 0.6098 0.0000 0.0043 87.000 1.70 4.06 -2.36 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9793 0.0207 0.0000 1 0 0.9765 0.0235 0.0000 1 0 0.9722 0.0278 0.0000
chr1 248638643 TCAGCACG T 0.500000 0.100 1 -7 1 454 203 251 24 0 9 1 169 0 0 250 0 1 0.1182 0.0000 0.0040 24.250 1.08 6.67 -5.59 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009
chr1 248650349 CAGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 791 150 641 76 0 6 0 68 0 0 640 0 1 0.5067 0.0000 0.0016 28.800 0.41 3.84 -3.43 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3107 0.6158 0.0735 1 1 0.3144 0.6070 0.0786 1 1 0.3184 0.5959 0.0857
chr2 17781726 CAAGTT C 0.103121 0.100 1 -5 2 565 147 418 78 0 0 0 69 0 0 415 0 3 0.5306 0.0000 0.0072 147.000 0.32 5.00 -4.68 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4313 0.5536 0.0151 1 1 0.4388 0.5451 0.0161 1 1 0.4478 0.5347 0.0174
chr2 20667362 G GGGCGGCGGC 0.698820 0.100 1 9 5 506 152 354 0 1 18 2 131 0 0 324 0 30 0.0000 0.0000 0.0847 7.389 9.48 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr2 20667362 G GGGCGGCGGCGGCGGCGGC 0.159429 0.100 1 18 5 506 152 354 7 3 77 4 61 0 0 327 2 25 0.0461 0.0000 0.0763 0.909 5.86 9.98 -4.13 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9944 0.0056 2 1 0.0000 0.8763 0.1237
chr2 29065060 C CGCT 0.500000 0.100 1 3 1 387 114 273 90 1 9 0 14 0 0 273 0 0 0.7895 0.0000 0.0000 11.667 0.07 2.79 -2.72 14 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0103 0.9897 0.0000
chr2 46480673 G GGCAGCACGAGGTGGTGATGGAGCAGCTGCAGCGGGAGCA 0.500000 0.100 1 39 1 563 204 359 0 1 62 2 139 0 0 358 1 0 0.0000 0.0000 0.0028 2.290 1.91 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr2 54255566 GGGGCCC G 0.500000 0.100 1 -6 1 670 79 591 22 7 13 0 37 7 1 581 0 2 0.2785 0.0118 0.0169 4.923 3.36 6.14 -2.77 14 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1585 0.5841 0.2574 1 1 0.1627 0.5778 0.2594 1 1 0.1683 0.5699 0.2618
chr2 69514621 CTGT C 0.500000 0.100 1 -3 1 463 192 271 89 3 21 2 77 0 0 271 0 0 0.4635 0.0000 0.0000 8.048 0.38 3.19 -2.81 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4385 0.5311 0.0304 1 1 0.4398 0.5265 0.0338 1 1 0.4402 0.5211 0.0387
chr2 70833690 AGT A 0.500000 0.100 1 -2 2 412 109 303 105 0 0 0 4 0 0 303 0 0 0.9633 0.0000 0.0000 109.000 0.05 2.00 -1.95 49 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0283 0.9717 0.0000 0 0 0.7283 0.2717 0.0000 0 0 0.9261 0.0739 0.0000
chr2 73385903 T TGGA 0.500000 0.100 1 3 1 586 153 433 5 49 31 2 66 0 2 427 0 4 0.0327 0.0000 0.0139 3.935 0.20 3.80 -3.60 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0230 0.4224 0.5546 1 2 0.0258 0.4246 0.5496 1 2 0.0299 0.4279 0.5422
chr2 73385903 TGGAGGA T 0.500000 0.100 1 -6 1 594 163 431 83 2 26 0 52 0 0 429 0 2 0.5092 0.0000 0.0046 5.231 3.02 6.65 -3.63 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8389 0.1591 0.0019 1 0 0.8295 0.1681 0.0024 1 0 0.8159 0.1808 0.0033
chr2 73448097 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 434 111 323 61 0 3 0 47 0 0 319 0 4 0.5495 0.0000 0.0124 36.000 0.03 3.17 -3.14 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4126 0.5305 0.0568 1 1 0.4115 0.5273 0.0612 1 1 0.4092 0.5235 0.0673
chr2 85133705 GGGC G 0.500000 0.100 1 -3 5 429 156 273 71 2 14 3 66 0 0 271 1 1 0.4551 0.0000 0.0073 10.071 0.72 3.35 -2.63 13 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2148 0.6599 0.1253 1 1 0.2203 0.6485 0.1312 1 1 0.2270 0.6340 0.1390
chr2 88627211 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 4 552 143 409 59 0 18 1 65 0 0 407 0 2 0.4126 0.0000 0.0049 6.944 0.34 3.02 -2.68 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0623 0.5668 0.3709 1 1 0.0669 0.5611 0.3719 1 1 0.0734 0.5542 0.3724
chr2 96115238 CTCCTCCTCT C 0.500000 0.100 1 -9 2 784 223 561 9 0 11 0 203 0 0 560 0 1 0.0404 0.0000 0.0018 19.273 0.44 8.00 -7.56 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 2 0.0000 0.3529 0.6471 2 2 0.0000 0.0159 0.9841
chr2 112542424 TTCCGGCGTGTACCGAGAGACTGGCG T 0.500000 0.100 1 -25 1 410 92 318 61 0 8 0 23 0 1 306 0 11 0.6630 0.0000 0.0377 10.500 0.21 22.04 -21.83 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8303 0.1664 0.0033 1 0 0.8196 0.1765 0.0040 1 0 0.8042 0.1906 0.0052
chr2 119437075 A AGTGTGC 0.500000 0.100 1 6 1 599 138 461 9 0 0 0 129 0 0 455 0 6 0.0652 0.0000 0.0130 138.000 0.11 5.67 -5.56 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9447 0.0553 2 2 0.0000 0.3155 0.6845
chr2 130372355 AGACGGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 328 128 200 60 0 19 0 49 0 0 196 0 4 0.4688 0.0000 0.0200 5.737 0.28 6.06 -5.78 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3346 0.5819 0.0835 1 1 0.3359 0.5756 0.0885 1 1 0.3371 0.5676 0.0953
chr2 151379531 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 210 68 142 16 3 18 9 22 0 0 141 0 1 0.2353 0.0000 0.0070 2.333 0.50 1.50 -1.00 8 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0521 0.4187 0.5292 1 2 0.0560 0.4233 0.5207 1 2 0.0616 0.4294 0.5090
chr2 168247286 C CGCCGGG 0.500000 0.100 1 6 2 207 88 119 35 1 23 0 29 0 0 112 1 6 0.3977 0.0000 0.0588 2.826 0.77 6.62 -5.85 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2064 0.5873 0.2062 1 1 0.2097 0.5809 0.2095 1 1 0.2138 0.5727 0.2136
chr2 174427852 TTCAAATTTATCAG T 0.500000 0.100 1 -13 3 237 111 126 83 1 25 0 2 0 0 123 0 3 0.7477 0.0000 0.0238 3.400 0.06 6.50 -6.44 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 1 0.2434 0.7566 0.0000 0 0 0.7029 0.2971 0.0000
chr2 176123562 C CGCA 0.500000 0.100 1 3 2 441 122 319 103 0 12 0 7 0 0 319 0 0 0.8443 0.0000 0.0000 9.167 0.38 3.00 -2.62 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0905 0.9095 0.0000 0 0 0.6238 0.3762 0.0000
chr2 177617487 ATC A 0.500000 0.100 1 -2 1 1127 263 864 148 2 4 0 109 0 0 863 0 1 0.5627 0.0000 0.0012 64.750 0.25 2.37 -2.12 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8801 0.1196 0.0003 1 0 0.8739 0.1257 0.0004 1 0 0.8646 0.1348 0.0006
chr2 177629445 G GGGA 0.500000 0.100 1 3 4 306 142 164 7 0 2 0 133 0 0 158 0 6 0.0493 0.0000 0.0366 70.000 0.00 3.07 -3.07 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.6249 0.3751 2 2 0.0000 0.0951 0.9049
chr2 184937484 C CACA 0.500000 0.100 1 3 2 676 124 552 0 0 7 0 117 0 0 544 0 8 0.0000 0.0000 0.0145 16.714 3.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr2 186694302 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 311 126 185 20 1 16 81 8 0 0 184 1 0 0.1587 0.0000 0.0054 1.938 1.20 3.38 -2.17 12 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0001 0.0431 0.9569 2 1 0.0000 0.6167 0.3833 2 1 0.0000 0.9883 0.0117
chr2 186694320 G GCAA 0.500000 0.100 1 3 1 311 135 176 9 4 15 6 101 0 0 175 1 0 0.0667 0.0000 0.0057 7.400 1.11 3.10 -1.99 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9957 0.0043 2 1 0.0000 0.8264 0.1736
chr2 189805813 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 259 64 195 41 8 10 0 5 0 1 194 0 0 0.6406 0.0000 0.0051 4.600 0.24 1.20 -0.96 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0555 0.9445 0.0000 0 1 0.3060 0.6940 0.0000
chr2 210556728 A ATCT 0.500000 0.100 1 3 1 294 119 175 54 1 5 0 59 0 0 175 0 0 0.4538 0.0000 0.0000 22.800 0.04 3.19 -3.15 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1186 0.6181 0.2633 1 1 0.1239 0.6094 0.2667 1 1 0.1310 0.5984 0.2706
chr2 214780778 GTGGTGAAGAACATTCAGGCAA G 0.500000 0.100 1 -21 2 668 180 488 106 0 4 0 70 0 0 484 0 4 0.5889 0.0000 0.0082 44.000 0.68 17.07 -16.39 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8302 0.1683 0.0015 1 0 0.8220 0.1762 0.0018 1 0 0.8099 0.1876 0.0025
chr2 216633567 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 2 587 145 442 0 1 27 4 113 0 0 434 1 7 0.0000 0.0000 0.0181 4.296 7.87 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0029 0.9971
chr2 216633573 T TGCTGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 593 146 447 7 7 20 3 109 0 0 446 0 1 0.0479 0.0000 0.0022 6.579 0.43 7.84 -7.42 1 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9987 0.0013 2 1 0.0000 0.9125 0.0875
chr2 219496868 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 386 119 267 112 0 0 0 7 0 0 267 0 0 0.9412 0.0000 0.0000 119.000 0.64 1.86 -1.21 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1354 0.8646 0.0000 0 0 0.7199 0.2801 0.0000
chr2 230996317 TCAGCAGCCTAGCCCTGAATCCACACCA T 0.500000 0.100 1 -27 1 580 165 415 10 0 8 1 146 0 0 372 0 43 0.0606 0.0000 0.1036 19.625 0.00 15.47 -15.47 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.7607 0.2393 2 2 0.0000 0.0572 0.9428
chr2 231460703 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 1 608 126 482 67 1 8 0 50 0 0 480 0 2 0.5317 0.0000 0.0041 14.750 0.24 3.16 -2.92 39 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5615 0.4149 0.0236 1 0 0.5559 0.4176 0.0264 1 0 0.5477 0.4217 0.0306
chr2 232847516 CACA C 0.500000 0.100 1 -3 2 334 142 192 4 0 3 2 133 0 0 191 0 1 0.0282 0.0000 0.0052 46.000 2.50 3.49 -0.99 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8772 0.1228 2 2 0.0000 0.0741 0.9259 2 2 0.0000 0.0176 0.9824
chr2 233521093 T TTTC 0.500000 0.100 1 3 1 183 90 93 79 1 3 0 7 0 0 93 0 0 0.8778 0.0000 0.0000 28.667 0.08 3.00 -2.92 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0304 0.9696 0.0000 0 1 0.3506 0.6494 0.0000
chr2 240682382 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 694 155 539 16 0 0 0 139 0 0 538 0 1 0.1032 0.0000 0.0019 155.000 0.00 1.12 -1.12 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9699 0.0301
chr2 240757423 ATCC A 0.500000 0.100 1 -3 1 398 119 279 38 2 30 3 46 0 0 277 0 2 0.3193 0.0000 0.0072 3.000 0.16 3.02 -2.86 4 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0435 0.4576 0.4989 1 2 0.0473 0.4591 0.4936 1 2 0.0527 0.4613 0.4861
chr3 9810375 C CGAT 0.880171 0.100 1 3 1 529 130 399 60 0 4 0 66 0 0 394 0 5 0.4615 0.0000 0.0125 31.500 0.25 3.64 -3.39 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0088 0.4169 0.5743 1 2 0.0096 0.4150 0.5754 1 2 0.0108 0.4132 0.5761
chr3 27721936 G GCGGCGC 0.500000 0.100 1 6 2 471 104 367 0 0 2 12 90 0 0 367 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 51.000 4.86 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0057 0.9943 2 2 0.0000 0.0063 0.9937 2 2 0.0000 0.0073 0.9927
chr3 28253011 GA G 0.500000 0.100 1 -1 3 203 115 88 105 0 0 0 10 0 0 88 0 0 0.9130 0.0000 0.0000 115.000 0.20 1.50 -1.30 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 1 0.2111 0.7889 0.0000
chr3 37998943 A ACAC 0.500000 0.100 1 3 1 462 149 313 145 1 0 0 3 0 0 313 0 0 0.9732 0.0000 0.0000 149.000 0.33 3.00 -2.67 65 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6845 0.3155 0.0000 0 0 0.9837 0.0163 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000
chr3 40462029 A ACTGCTGCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 15 1 803 268 535 98 11 42 0 117 0 4 476 1 54 0.3657 0.0000 0.1103 5.381 3.24 12.07 -8.82 12 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0213 0.9787 1 2 0.0000 0.0240 0.9760 1 2 0.0000 0.0283 0.9717
chr3 42210085 C CGGA 0.500000 0.100 1 3 1 668 222 446 82 14 31 3 92 0 0 441 0 5 0.3694 0.0000 0.0112 6.161 0.18 3.30 -3.12 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0921 0.7084 0.1995 1 1 0.0985 0.6943 0.2072 1 1 0.1072 0.6761 0.2167
chr3 42210085 C CGGAGGA 0.500000 0.100 1 6 1 668 222 446 95 1 107 5 14 0 0 442 1 3 0.4279 0.0000 0.0090 1.057 0.58 5.07 -4.49 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0009 0.9991 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000
chr3 44499299 TTC T 0.500000 0.100 1 -2 5 434 140 294 0 0 11 0 129 0 0 290 1 3 0.0000 0.0000 0.0136 11.727 1.97 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr3 46459794 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 364 149 215 0 0 1 2 146 0 0 213 0 2 0.0000 0.0000 0.0093 148.000 3.47 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr3 46709583 TAAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 553 174 379 62 1 21 8 82 0 0 378 0 1 0.3563 0.0000 0.0026 7.286 0.44 3.29 -2.86 24 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0031 0.2099 0.7870 1 2 0.0038 0.2181 0.7781 1 2 0.0049 0.2299 0.7652
chr3 49358240 GGCCGCC G 0.500000 0.100 1 -6 3 393 101 292 0 1 10 0 90 0 0 288 0 4 0.0000 0.0000 0.0137 9.000 5.93 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0100 0.9900 2 2 0.0000 0.0108 0.9892 2 2 0.0000 0.0121 0.9879
chr3 51993837 TCCTTGG T 0.500000 0.100 1 -6 1 526 181 345 95 0 30 0 56 0 0 342 0 3 0.5249 0.0000 0.0087 5.033 0.12 5.70 -5.58 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8922 0.1071 0.0007 1 0 0.8840 0.1150 0.0009 1 0 0.8720 0.1266 0.0013
chr3 56557250 T TGGGGTAAGCA 0.500000 0.100 1 10 2 198 112 86 0 0 12 1 99 0 0 83 0 3 0.0000 0.0000 0.0349 8.333 6.53 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0052 0.9948 2 2 0.0000 0.0058 0.9942 2 2 0.0000 0.0067 0.9933
chr3 56616023 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 295 115 180 0 0 3 0 112 0 0 174 0 6 0.0000 0.0000 0.0333 37.333 3.34 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0027 0.9973 2 2 0.0000 0.0032 0.9968
chr3 63831135 C CACACT 0.500000 0.100 1 5 2 211 86 125 49 0 1 0 36 0 0 123 0 2 0.5698 0.0000 0.0160 85.000 0.33 5.08 -4.76 29 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4667 0.4806 0.0527 1 1 0.4623 0.4809 0.0568 1 1 0.4560 0.4814 0.0626
chr3 65439885 T TCTG 0.500000 0.100 1 3 1 308 135 173 10 0 15 4 106 0 0 165 0 8 0.0741 0.0000 0.0462 8.000 0.20 3.13 -2.93 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9915 0.0085 2 1 0.0000 0.6678 0.3322
chr3 73062330 C CA 0.500000 0.100 1 1 5 509 139 370 59 0 3 0 77 0 0 368 0 2 0.4245 0.0000 0.0054 45.333 0.12 1.39 -1.27 27 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0122 0.3472 0.6406 1 2 0.0140 0.3523 0.6337 1 2 0.0169 0.3596 0.6235
chr3 98168999 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 1060 301 759 260 1 20 0 20 0 0 759 0 0 0.8638 0.0000 0.0000 14.050 0.22 2.35 -2.13 112 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.4661 0.5339 0.0000
chr3 98264643 TTGTAACCAC T 0.500000 0.100 1 -9 3 694 196 498 171 0 12 0 13 0 0 497 0 1 0.8724 0.0000 0.0020 15.333 0.92 10.00 -9.08 59 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.3361 0.6639 0.0000
chr3 98354747 TA T 0.500000 0.100 1 -1 2 520 138 382 122 1 6 0 9 0 0 382 0 0 0.8841 0.0000 0.0000 22.000 0.32 1.22 -0.90 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0325 0.9675 0.0000 0 0 0.5518 0.4482 0.0000
chr3 98391562 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 404 124 280 111 1 6 1 5 0 0 280 0 0 0.8952 0.0000 0.0000 19.667 0.28 1.00 -0.72 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0036 0.9964 0.0000 0 1 0.4929 0.5071 0.0000 0 0 0.8775 0.1225 0.0000
chr3 112534211 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 126 57 69 29 1 0 3 24 0 0 68 0 1 0.5088 0.0000 0.0145 56.000 0.07 1.12 -1.06 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2682 0.5626 0.1692 1 1 0.2692 0.5579 0.1729 1 1 0.2703 0.5520 0.1778
chr3 113657263 TTGC T 0.500000 0.100 1 -3 1 1071 279 792 1 5 74 85 114 0 0 791 0 1 0.0036 0.0000 0.0013 2.716 0.00 3.00 -3.00 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr3 113657263 TTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -6 1 1073 286 787 7 4 175 1 99 0 0 787 0 0 0.0245 0.0000 0.0000 0.613 2.00 5.49 -3.49 3 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9798 0.0202 2 1 0.0000 0.7092 0.2908
chr3 119146279 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 607 188 419 159 1 18 0 10 0 0 417 0 2 0.8457 0.0000 0.0048 9.444 0.17 3.20 -3.03 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0083 0.9917 0.0000 0 0 0.5154 0.4846 0.0000
chr3 121632468 G GGGCTCAGGCTCA 0.500000 0.100 1 12 1 521 173 348 13 0 22 2 136 0 0 348 0 0 0.0751 0.0000 0.0000 6.818 0.31 6.17 -5.86 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.8354 0.1646
chr3 123700269 GTTC G 0.500000 0.100 1 -3 1 628 130 498 77 1 3 0 49 0 0 494 0 4 0.5923 0.0000 0.0080 42.333 0.22 3.10 -2.88 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7541 0.2406 0.0053 1 0 0.7446 0.2491 0.0064 1 0 0.7310 0.2610 0.0080
chr3 125013575 A AGAGGAGGAGGAGGAAGAG 0.500000 0.100 1 18 2 728 134 594 7 0 25 0 102 0 0 594 0 0 0.0522 0.0000 0.0000 4.360 0.00 7.89 -7.89 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9147 0.0853 2 2 0.0000 0.3909 0.6091
chr3 130096091 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 207 114 93 57 0 0 0 57 0 0 93 0 0 0.5000 0.0000 0.0000 114.000 0.33 2.58 -2.25 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1819 0.6362 0.1819 1 1 0.1868 0.6264 0.1868 1 1 0.1931 0.6138 0.1931
chr3 130471876 AT A 0.500000 0.100 1 -1 1 382 135 247 53 0 4 0 78 0 0 247 0 0 0.3926 0.0000 0.0000 32.750 1.06 2.09 -1.03 1 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0053 0.2406 0.7541 1 2 0.0064 0.2491 0.7446 1 2 0.0080 0.2610 0.7310
chr3 183775955 CGGA C 0.500000 0.100 1 -3 2 410 181 229 84 0 28 11 58 0 0 226 0 3 0.4641 0.0000 0.0131 5.464 0.33 3.14 -2.80 46 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4189 0.5430 0.0382 1 1 0.4200 0.5381 0.0420 1 1 0.4203 0.5322 0.0474
chr3 184711345 A ATCC 0.500000 0.100 1 3 1 564 151 413 59 1 20 0 71 0 0 411 0 2 0.3907 0.0000 0.0048 6.550 0.20 3.27 -3.06 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0366 0.5000 0.4635 1 1 0.0402 0.4980 0.4618 1 1 0.0454 0.4959 0.4587
chr3 195726146 GC G 0.500000 0.100 1 -1 4 1801 440 1361 253 2 10 5 170 0 0 1361 0 0 0.5750 0.0000 0.0000 42.600 2.28 2.40 -0.12 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9946 0.0054 0.0000 1 0 0.9937 0.0063 0.0000 1 0 0.9923 0.0077 0.0000
chr3 195785502 G GGAT 0.500000 0.100 1 3 1 1046 252 794 168 1 20 4 59 37 13 740 0 4 0.6667 0.0466 0.0680 12.105 2.26 5.36 -3.09 10 0/0 0/1 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9671 0.0329 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr3 195791241 T TGTCTCCTGCGTAACA 0.500000 0.100 1 15 1 693 139 554 0 1 15 0 123 0 0 531 0 23 0.0000 0.0000 0.0415 8.267 11.32 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr3 198153259 GGCAGCA G 0.500000 0.100 1 -6 1 245 119 126 42 0 26 0 51 0 0 124 0 2 0.3529 0.0000 0.0159 3.577 0.45 5.76 -5.31 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0525 0.4926 0.4549 1 1 0.0567 0.4920 0.4514 1 1 0.0625 0.4914 0.4461
chr4 1093539 G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 0.774228 0.100 1 21 1 553 103 450 9 0 1 0 93 0 0 369 3 78 0.0874 0.0000 0.1800 102.000 0.11 16.44 -16.33 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 2 0.0000 0.4163 0.5837 2 2 0.0000 0.0199 0.9801
chr4 1728037 ACAAAGCGGAGACTCCGCACGGAGCCGAGGAAGAATG A 0.021146 0.100 1 -36 1 724 190 534 103 0 49 0 38 0 0 511 0 23 0.5421 0.0000 0.0431 2.878 0.32 22.37 -22.05 7 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9657 0.0343 0.0000 1 0 0.9622 0.0378 0.0000 1 0 0.9570 0.0430 0.0000
chr4 3074876 CCAGCAG C 0.249314 0.100 1 -6 2 453 177 276 0 1 57 1 118 0 0 260 2 14 0.0000 0.0000 0.0580 2.143 6.60 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0087 0.9913 2 2 0.0000 0.0074 0.9926 2 2 0.0000 0.0072 0.9928
chr4 3074945 A ACCGCCGCCG 0.064236 0.100 1 9 2 453 212 241 153 4 28 0 27 1 1 238 1 0 0.7217 0.0041 0.0124 6.571 3.74 7.56 -3.82 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000
chr4 3767568 AGGGGGCGGGGCC A 0.069055 0.100 1 -12 1 621 163 458 141 1 10 0 11 0 0 458 0 0 0.8650 0.0000 0.0000 19.000 0.63 12.27 -11.64 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1099 0.8901 0.0000 0 0 0.9139 0.0861 0.0000
chr4 15003254 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 2 738 194 544 105 1 13 2 73 1 0 533 0 10 0.5412 0.0018 0.0202 13.692 1.00 7.77 -6.77 1 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6387 0.3538 0.0075 1 0 0.6344 0.3567 0.0089 1 0 0.6275 0.3614 0.0110
chr4 15003300 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 722 234 488 99 5 42 4 84 0 0 479 0 9 0.4231 0.0000 0.0184 4.524 1.03 6.31 -5.28 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2544 0.6814 0.0642 1 1 0.2617 0.6685 0.0697 1 1 0.2706 0.6521 0.0773
chr4 38926929 CCTTAGAGCA C 0.500000 0.100 1 -9 5 411 160 251 95 0 8 0 57 0 0 249 0 2 0.5938 0.0000 0.0080 19.000 0.56 7.63 -7.07 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8922 0.1071 0.0007 1 0 0.8840 0.1150 0.0009 1 0 0.8720 0.1266 0.0013
chr4 41745972 AGCTGCCGCCGCTGCC A 0.500000 0.100 1 -15 2 593 135 458 72 1 15 0 47 0 0 452 0 6 0.5333 0.0000 0.0131 8.000 0.68 11.51 -10.83 14 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.6535 0.3340 0.0124 1 0 0.6457 0.3400 0.0143 1 0 0.6344 0.3484 0.0172
chr4 76144165 C CTGT 0.500000 0.100 1 3 1 355 118 237 111 0 2 0 5 0 0 237 0 0 0.9407 0.0000 0.0000 58.000 0.28 3.60 -3.32 39 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0043 0.9957 0.0000 0 0 0.5549 0.4451 0.0000 0 0 0.8982 0.1018 0.0000
chr4 87615305 T TAGTAGTGAC 0.500000 0.100 1 9 1 2522 522 2000 222 15 22 8 255 28 37 1792 118 25 0.4253 0.0140 0.1040 23.381 2.19 7.96 -5.77 16 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0041 0.9959 1 2 0.0000 0.0046 0.9954 1 2 0.0000 0.0054 0.9946
chr4 87615716 TAGTGACAGCAGCAATAGC T 0.500000 0.100 1 -18 1 2695 785 1910 261 25 129 26 344 178 34 1679 10 9 0.3325 0.0932 0.1209 5.008 1.87 8.84 -6.96 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9974 0.0026 0.0000 1 0 0.9972 0.0028 0.0000 1 0 0.9967 0.0033 0.0000
chr4 100480004 TAAC T 0.500000 0.100 1 -3 1 173 78 95 4 1 4 0 69 0 0 94 0 1 0.0513 0.0000 0.0105 18.500 0.00 3.00 -3.00 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9989 0.0011 2 1 0.0000 0.8380 0.1620 2 2 0.0000 0.4354 0.5646
chr4 110011233 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 349 123 226 58 0 2 1 62 0 0 226 0 0 0.4715 0.0000 0.0000 60.500 0.19 1.24 -1.05 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1043 0.6169 0.2787 1 1 0.1097 0.6083 0.2820 1 1 0.1168 0.5974 0.2858
chr4 119026806 AAAG A 0.500000 0.100 1 -3 2 635 129 506 0 0 5 0 124 0 0 497 0 9 0.0000 0.0000 0.0178 24.800 3.55 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr4 139730430 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 4 540 241 299 0 0 32 4 205 0 0 291 1 7 0.0000 0.0000 0.0268 6.531 3.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr4 146639305 T TGGC 0.500000 0.100 1 3 2 512 193 319 69 8 52 4 60 2 0 314 1 2 0.3575 0.0063 0.0157 2.654 1.10 3.63 -2.53 11 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4340 0.5272 0.0388 1 1 0.4339 0.5235 0.0426 1 1 0.4329 0.5191 0.0480
chr4 151279866 G GCAGGT 0.500000 0.100 1 5 2 303 150 153 77 0 8 0 65 0 0 145 0 8 0.5133 0.0000 0.0523 17.750 0.05 5.00 -4.95 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2347 0.6591 0.1062 1 1 0.2401 0.6477 0.1121 1 1 0.2468 0.6333 0.1199
chr4 154323249 TTTTG T 0.500000 0.100 1 -4 1 230 100 130 55 0 18 0 27 0 0 128 0 2 0.5500 0.0000 0.0154 4.556 1.04 5.30 -4.26 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8096 0.1858 0.0047 1 0 0.7982 0.1961 0.0056 1 0 0.7821 0.2107 0.0072
chr4 183446405 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 2 825 166 659 152 0 4 0 10 0 0 659 0 0 0.9157 0.0000 0.0000 40.500 0.14 3.30 -3.16 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0450 0.9550 0.0000 0 0 0.7227 0.2773 0.0000
chr5 55233261 T TGGGCC 0.500000 0.100 1 5 1 384 99 285 49 1 13 1 35 0 0 284 0 1 0.4949 0.0000 0.0035 6.538 0.27 5.09 -4.82 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5264 0.4351 0.0384 1 0 0.5201 0.4379 0.0420 1 0 0.5111 0.4417 0.0472
chr5 56882021 TCAA T 0.500000 0.100 1 -3 2 800 180 620 77 0 23 2 78 0 0 615 0 5 0.4278 0.0000 0.0081 6.826 0.34 3.24 -2.91 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0639 0.6245 0.3116 1 1 0.0689 0.6150 0.3161 1 1 0.0758 0.6031 0.3211
chr5 61332747 CCGGCCGCAACCTCGG C 0.500000 0.100 1 -15 4 360 25 335 0 0 15 3 7 0 0 330 0 5 0.0000 0.0000 0.0149 0.533 8.14 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3242 0.6758 2 2 0.0000 0.3274 0.6725 2 2 0.0000 0.3319 0.6680
chr5 75195890 TTCA T 0.500000 0.100 1 -3 3 592 146 446 79 0 7 0 60 0 0 443 0 3 0.5411 0.0000 0.0067 19.857 0.14 3.05 -2.91 19 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5366 0.4409 0.0225 1 0 0.5330 0.4417 0.0253 1 0 0.5273 0.4434 0.0294
chr5 80654905 G GCCGCAGCGC 0.500000 0.100 1 9 2 291 85 206 38 5 12 2 28 0 0 205 1 0 0.4471 0.0000 0.0049 5.750 1.68 5.61 -3.92 16 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5034 0.4476 0.0490 1 0 0.4970 0.4501 0.0529 1 0 0.4881 0.4534 0.0585
chr5 109855234 TCTC T 0.500000 0.100 1 -3 2 181 81 100 2 0 5 0 74 0 0 100 0 0 0.0247 0.0000 0.0000 15.200 0.00 3.00 -3.00 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6622 0.3378 2 2 0.0000 0.1727 0.8273 2 2 0.0000 0.0905 0.9095
chr5 113488351 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 239 94 145 30 7 12 2 43 0 0 145 0 0 0.3191 0.0000 0.0000 6.833 1.33 5.33 -3.99 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0785 0.5252 0.3963 1 1 0.0831 0.5229 0.3940 1 1 0.0894 0.5200 0.3906
chr5 114362934 T TGCC 0.500000 0.100 1 3 1 671 201 470 2 1 21 2 175 0 0 464 2 4 0.0100 0.0000 0.0128 8.571 6.50 3.83 2.67 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0260 0.9740 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr5 122152940 AT A 0.500000 0.100 1 -1 2 605 141 464 78 0 2 0 61 0 0 464 0 0 0.5532 0.0000 0.0000 69.500 0.18 1.28 -1.10 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5657 0.4148 0.0195 1 0 0.5610 0.4170 0.0220 1 0 0.5539 0.4204 0.0258
chr5 128084239 T TGCG 0.500000 0.100 1 3 1 694 148 546 52 4 29 3 60 0 0 546 0 0 0.3514 0.0000 0.0000 4.103 0.54 3.85 -3.31 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0820 0.5886 0.3294 1 1 0.0871 0.5818 0.3312 1 1 0.0939 0.5732 0.3329
chr5 129461622 T TCCCGGC 0.500000 0.100 1 6 3 516 117 399 56 0 18 0 43 0 0 395 0 4 0.4786 0.0000 0.0100 5.500 0.12 6.35 -6.22 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3958 0.5377 0.0665 1 1 0.3948 0.5342 0.0710 1 1 0.3927 0.5300 0.0774
chr5 132813630 G GGCCGCCGCC 0.500000 0.100 1 9 1 370 98 272 41 1 3 2 51 0 0 258 0 14 0.4184 0.0000 0.0515 31.333 0.24 8.33 -8.09 27 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0059 0.2284 0.7657 1 2 0.0070 0.2378 0.7552 1 2 0.0088 0.2508 0.7403
chr5 135940512 AGTT A 0.500000 0.100 1 -3 1 219 97 122 7 0 2 1 87 0 0 117 0 5 0.0722 0.0000 0.0410 47.500 0.29 3.43 -3.14 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9437 0.0563 2 2 0.0000 0.4977 0.5023
chr5 140552043 A AGT 0.500000 0.100 1 2 1 229 92 137 48 0 3 1 40 0 0 134 0 3 0.5217 0.0000 0.0219 29.667 0.12 3.83 -3.70 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2806 0.5925 0.1269 1 1 0.2826 0.5856 0.1318 1 1 0.2848 0.5769 0.1383
chr5 140552044 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 229 91 138 49 0 1 2 39 0 0 135 0 3 0.5385 0.0000 0.0217 90.000 0.12 3.82 -3.70 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3046 0.5832 0.1122 1 1 0.3060 0.5769 0.1171 1 1 0.3072 0.5690 0.1237
chr5 141366622 G GC 0.500000 0.100 1 1 2 633 226 407 128 0 6 1 91 0 0 406 0 1 0.5664 0.0000 0.0025 36.500 0.15 1.23 -1.08 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8473 0.1519 0.0008 1 0 0.8401 0.1589 0.0010 1 0 0.8295 0.1690 0.0014
chr5 141393331 GC G 0.500000 0.100 1 -1 1 823 214 609 99 0 10 0 105 0 0 609 0 0 0.4626 0.0000 0.0000 20.400 0.16 1.29 -1.12 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0720 0.6987 0.2293 1 1 0.0779 0.6850 0.2371 1 1 0.0860 0.6674 0.2467
chr5 141945390 C CCTGCTGCTG 0.500000 0.100 1 9 1 374 111 263 10 1 2 0 98 0 0 248 0 15 0.0901 0.0000 0.0570 54.000 0.00 8.58 -8.58 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9945 0.0055 2 1 0.0000 0.7494 0.2506
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 12 1 427 164 263 10 0 39 1 114 0 0 252 0 11 0.0610 0.0000 0.0418 3.205 0.90 9.71 -8.81 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9872 0.0128 2 1 0.0000 0.5736 0.4264
chr5 146878727 A AGCTGCTGCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 18 1 427 164 263 11 0 43 1 109 0 0 252 0 11 0.0671 0.0000 0.0418 2.881 1.36 9.74 -8.38 5 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9967 0.0033 2 1 0.0000 0.7741 0.2259
chr5 149995316 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 588 146 442 87 2 1 1 55 0 0 442 0 0 0.5959 0.0000 0.0000 145.000 0.70 1.75 -1.04 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8644 0.1343 0.0013 1 0 0.8555 0.1429 0.0016 1 0 0.8425 0.1553 0.0022
chr5 157052432 CTTG C 0.500000 0.100 1 -3 1 383 162 221 146 3 8 0 5 0 0 221 0 0 0.9012 0.0000 0.0000 19.250 2.28 5.00 -2.72 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0290 0.9710 0.0000 0 0 0.8925 0.1075 0.0000 0 0 0.9823 0.0177 0.0000
chr5 157052546 GTTGGAACAGTCGTCA G 0.500000 0.100 1 -15 1 384 153 231 6 0 18 1 128 0 0 231 0 0 0.0392 0.0000 0.0000 7.500 3.83 11.75 -7.92 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9988 0.0012 2 2 0.0000 0.4863 0.5137 2 2 0.0000 0.0825 0.9175
chr5 157052557 C CGTT 0.500000 0.100 1 3 1 384 140 244 0 92 10 1 37 0 0 244 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 12.900 3.84 0 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9815 0.0184 0.0000 1 0 0.9785 0.0215 0.0000 1 0 0.9735 0.0264 0.0001
chr5 168454024 TGGA T 0.500000 0.100 1 -3 2 197 83 114 39 0 3 0 41 0 0 113 1 0 0.4699 0.0000 0.0088 26.667 0.08 3.68 -3.61 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1469 0.5876 0.2656 1 1 0.1514 0.5810 0.2676 1 1 0.1573 0.5728 0.2698
chr5 177503170 AGAG A 0.500000 0.100 1 -3 1 412 91 321 38 0 6 0 47 0 0 318 0 3 0.4176 0.0000 0.0093 14.167 0.92 3.79 -2.87 22 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0456 0.4618 0.4926 1 2 0.0495 0.4631 0.4874 1 2 0.0550 0.4650 0.4800
chr5 179345258 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 504 244 260 115 11 50 2 66 0 0 259 0 1 0.4713 0.0000 0.0038 3.939 1.25 3.14 -1.88 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9826 0.0174 0.0000 1 0 0.9798 0.0202 0.0000 1 0 0.9755 0.0245 0.0000
chr6 1390850 G GGGC 0.511246 0.100 1 3 5 557 156 401 8 0 28 4 116 0 0 399 0 2 0.0513 0.0000 0.0050 4.571 1.75 3.17 -1.42 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9155 0.0845 2 2 0.0000 0.3043 0.6957
chr6 1611567 G GGGC 0.201628 0.100 1 3 1 609 148 461 90 6 42 1 9 1 0 457 1 2 0.6081 0.0022 0.0087 2.789 1.68 3.56 -1.88 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0024 0.9976 0.0000 0 1 0.1958 0.8042 0.0000
chr6 7727289 G GAGC 0.018903 0.100 1 3 2 690 166 524 76 3 20 2 65 0 2 522 0 0 0.4578 0.0000 0.0038 7.300 0.21 3.11 -2.90 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6546 0.3446 0.0008 1 0 0.6548 0.3443 0.0009 1 0 0.6544 0.3446 0.0010
chr6 16327633 G GTGC 0.199384 0.100 1 3 2 919 190 729 15 30 51 3 91 0 0 720 0 9 0.0789 0.0000 0.0123 2.833 1.33 3.14 -1.81 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0295 0.9705 1 2 0.0001 0.0348 0.9651 1 2 0.0001 0.0433 0.9566
chr6 29417831 G GCTGGCCTGTGGGAACA 0.281779 0.100 1 16 3 672 132 540 80 0 6 0 46 0 0 532 0 8 0.6061 0.0000 0.0148 21.000 0.26 12.67 -12.41 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8325 0.1657 0.0018 1 0 0.8250 0.1728 0.0022 1 0 0.8143 0.1829 0.0028
chr6 30590700 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 336 107 229 10 0 4 0 93 0 0 229 0 0 0.0935 0.0000 0.0000 25.750 0.60 1.24 -0.64 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9975 0.0025 2 1 0.0000 0.8699 0.1301
chr6 30645943 T TG 0.500000 0.100 1 1 1 261 67 194 39 1 2 0 25 0 0 194 0 0 0.5821 0.0000 0.0000 32.000 0.36 1.36 -1.00 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5933 0.3752 0.0315 1 0 0.5838 0.3815 0.0347 1 0 0.5707 0.3899 0.0394
chr6 31027337 AC A 0.500000 0.100 1 -1 2 948 244 704 208 2 17 2 15 0 5 699 0 0 0.8525 0.0000 0.0071 13.294 1.31 2.20 -0.89 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 0 0.5186 0.4814 0.0000
chr6 31028710 GACC G 0.500000 0.100 1 -3 1 1801 406 1395 171 8 51 5 171 1 4 1369 3 18 0.4212 0.0007 0.0186 6.961 1.64 4.40 -2.76 35 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0137 0.7429 0.2434 1 1 0.0163 0.7250 0.2587 1 1 0.0203 0.7019 0.2778
chr6 31117165 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 1 826 223 603 206 0 5 0 12 0 0 603 0 0 0.9238 0.0000 0.0000 43.600 0.74 4.33 -3.59 26 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0767 0.9233 0.0000 0 0 0.9084 0.0916 0.0000
chr6 31412384 G GCT 0.500000 0.100 1 2 1 523 180 343 0 70 3 6 101 0 0 340 3 0 0.0000 0.0000 0.0087 58.000 2.95 0 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0002 0.0584 0.9414 1 2 0.0002 0.0644 0.9354 1 2 0.0004 0.0733 0.9263
chr6 31412384 G GCTGCTGCTGCT 0.500000 0.100 1 11 1 523 180 343 141 3 4 8 24 0 0 340 3 0 0.7833 0.0000 0.0087 58.000 3.33 5.17 -1.83 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 31627995 GCCTGCTGCCCCA G 0.500000 0.100 1 -12 1 542 163 379 91 0 12 0 60 0 0 377 0 2 0.5583 0.0000 0.0053 12.583 0.46 11.70 -11.24 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8050 0.1925 0.0026 1 0 0.7959 0.2009 0.0032 1 0 0.7828 0.2130 0.0042
chr6 32038437 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 443 116 327 48 0 12 1 55 0 0 327 0 0 0.4138 0.0000 0.0000 8.667 0.56 3.73 -3.16 8 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0758 0.5563 0.3678 1 1 0.0806 0.5517 0.3677 1 1 0.0872 0.5459 0.3669
chr6 32403192 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 265 86 179 80 0 3 0 3 0 0 179 0 0 0.9302 0.0000 0.0000 41.500 0.24 4.67 -4.43 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0694 0.9306 0.0000 0 0 0.6850 0.3150 0.0000 0 0 0.8734 0.1266 0.0000
chr6 32530180 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 119 76 43 2 54 10 6 4 0 0 43 0 0 0.0263 0.0000 0.0000 2.286 8.00 4.50 3.50 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0013 0.9987 0.0000 0 1 0.0045 0.9955 0.0000 0 1 0.0600 0.9400 0.0000
chr6 32581802 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 636 244 392 168 6 36 0 34 0 0 392 0 0 0.6885 0.0000 0.0000 5.943 6.90 7.91 -1.01 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32581807 C CT 0.500000 0.100 1 1 1 635 236 399 181 8 14 0 33 0 0 398 0 1 0.7669 0.0000 0.0025 15.786 7.67 7.97 -0.30 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 32666522 A ACC 0.500000 0.100 1 2 2 131 65 66 4 31 0 2 28 0 0 65 0 1 0.0615 0.0000 0.0152 35.000 6.50 9.21 -2.71 4 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.1508 0.5476 0.3016 1 1 0.1548 0.5440 0.3012 1 1 0.1600 0.5395 0.3005
chr6 34889525 G GGGCGGC 0.500000 0.100 1 6 5 501 219 282 190 1 24 0 4 1 0 279 0 2 0.8676 0.0035 0.0106 8.125 0.34 5.00 -4.66 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0278 0.9722 0.0000 0 0 0.9605 0.0395 0.0000 0 0 0.9958 0.0042 0.0000
chr6 35141212 TC T 0.500000 0.100 1 -1 2 218 67 151 35 0 3 0 29 0 0 151 0 0 0.5224 0.0000 0.0000 21.333 4.89 1.17 3.71 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3573 0.5355 0.1071 1 1 0.3556 0.5327 0.1117 1 1 0.3530 0.5292 0.1179
chr6 41786835 C CCTT 0.500000 0.100 1 3 1 584 137 447 5 78 5 0 49 0 0 445 0 2 0.0365 0.0000 0.0045 33.000 2.80 3.22 -0.42 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8394 0.1586 0.0021 1 0 0.8297 0.1677 0.0026 1 0 0.8159 0.1807 0.0034
chr6 43021675 CGCCGGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 304 135 169 116 1 14 0 4 0 0 169 0 0 0.8593 0.0000 0.0000 8.643 0.52 6.50 -5.98 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0508 0.9492 0.0000 0 0 0.8299 0.1701 0.0000 0 0 0.9573 0.0427 0.0000
chr6 43282987 GGAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 781 189 592 69 2 24 2 92 0 0 592 0 0 0.3651 0.0000 0.0000 6.833 0.52 4.24 -3.72 23 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0074 0.3164 0.6763 1 2 0.0087 0.3216 0.6697 1 2 0.0108 0.3293 0.6599
chr6 44002766 C CGCGGCG 0.500000 0.100 1 6 1 502 144 358 41 0 56 0 47 1 0 355 0 2 0.2847 0.0028 0.0084 1.630 1.83 5.19 -3.36 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0892 0.5565 0.3543 1 1 0.0940 0.5520 0.3540 1 1 0.1006 0.5464 0.3530
chr6 81752010 A ACCGCCGAAGTCGCCG 0.500000 0.100 1 15 2 591 157 434 29 3 73 2 50 0 0 412 1 21 0.1847 0.0000 0.0507 1.125 15.52 6.58 8.94 15 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0002 0.0454 0.9544 1 2 0.0003 0.0512 0.9486 1 2 0.0004 0.0600 0.9396
chr6 81752010 ACCGCCGAAGTCGCCG A 0.500000 0.100 1 -15 2 596 191 405 98 1 52 0 40 0 0 401 0 4 0.5131 0.0000 0.0099 2.673 3.86 11.50 -7.64 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9829 0.0171 0.0000 1 0 0.9800 0.0200 0.0000 1 0 0.9754 0.0245 0.0000
chr6 99613748 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 1 744 127 617 52 2 40 1 32 0 1 602 1 13 0.4094 0.0000 0.0243 2.175 1.46 3.31 -1.85 32 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3713 0.5529 0.0758 1 1 0.3709 0.5485 0.0805 1 1 0.3699 0.5431 0.0871
chr6 109585126 GCTT G 0.500000 0.100 1 -3 2 141 65 76 0 0 5 1 59 0 0 74 0 2 0.0000 0.0000 0.0263 15.000 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0394 0.9606 2 2 0.0000 0.0420 0.9580 2 2 0.0000 0.0457 0.9543
chr6 116279302 T TCAC 0.500000 0.100 1 3 2 757 179 578 0 0 9 2 168 0 0 568 0 10 0.0000 0.0000 0.0173 18.778 3.10 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr6 138218046 A AG 0.500000 0.100 1 1 1 388 102 286 94 0 5 0 3 0 0 285 0 1 0.9216 0.0000 0.0035 19.400 0.15 1.67 -1.52 48 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0174 0.9826 0.0000 0 0 0.6100 0.3900 0.0000 0 0 0.8806 0.1194 0.0000
chr6 138882869 AAGGTAAATG A 0.500000 0.100 1 -9 1 176 60 116 30 0 6 0 24 0 0 112 0 4 0.5000 0.0000 0.0345 10.800 0.17 12.17 -12.00 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2655 0.5647 0.1699 1 1 0.2666 0.5598 0.1736 1 1 0.2679 0.5537 0.1784
chr6 148343106 T TGAGCCC 0.500000 0.100 1 6 2 411 181 230 83 0 28 1 69 0 0 226 1 3 0.4586 0.0000 0.0174 5.464 0.30 5.33 -5.03 33 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3410 0.6020 0.0570 1 1 0.3445 0.5938 0.0617 1 1 0.3481 0.5837 0.0682
chr6 151352981 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 2 922 217 705 111 1 10 0 95 0 0 701 0 4 0.5115 0.0000 0.0057 20.700 0.08 3.17 -3.09 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3805 0.5906 0.0289 1 1 0.3857 0.5819 0.0324 1 1 0.3913 0.5712 0.0375
chr6 152697964 GAGAT G 0.500000 0.100 1 -4 3 228 120 108 111 0 5 0 4 0 0 108 0 0 0.9250 0.0000 0.0000 23.000 0.09 4.50 -4.41 33 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0379 0.9621 0.0000 0 0 0.7833 0.2167 0.0000 0 0 0.9437 0.0563 0.0000
chr6 159239747 GCCACCACCCGCCGCACGA G 0.500000 0.100 1 -18 1 594 219 375 13 0 42 0 164 0 0 364 0 11 0.0594 0.0000 0.0293 4.214 0.08 14.71 -14.63 9 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9939 0.0061 2 2 0.0000 0.4629 0.5371
chr6 159790613 GGTT G 0.500000 0.100 1 -3 5 429 135 294 68 0 7 0 60 0 0 291 0 3 0.5037 0.0000 0.0102 18.286 0.38 5.78 -5.40 26 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2712 0.6282 0.1007 1 1 0.2751 0.6188 0.1061 1 1 0.2797 0.6069 0.1134
chr6 160139865 CTGGTAAGT C 0.500000 0.100 1 -8 2 261 83 178 37 0 9 0 37 0 0 178 0 0 0.4458 0.0000 0.0000 8.222 0.46 7.68 -7.22 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2051 0.5898 0.2051 1 1 0.2085 0.5831 0.2085 1 1 0.2127 0.5747 0.2127
chr6 161098318 CCTG C 0.500000 0.100 1 -3 3 382 186 196 0 1 29 8 148 0 0 192 1 3 0.0000 0.0000 0.0204 5.414 3.05 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr6 170561925 A ACAG 0.500000 0.100 1 3 2 674 250 424 6 1 60 33 150 0 0 423 1 0 0.0240 0.0000 0.0024 3.167 3.17 4.13 -0.97 4 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9976 0.0024 2 2 0.0000 0.1482 0.8518 2 2 0.0000 0.0118 0.9882
chr6 170561949 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 682 240 442 28 34 11 87 80 0 0 442 0 0 0.1167 0.0000 0.0000 18.000 3.21 5.04 -1.82 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0017 0.9983 1 2 0.0000 0.0022 0.9978 1 2 0.0000 0.0030 0.9970
chr6 170561963 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 682 221 461 136 36 10 20 19 0 0 461 0 0 0.6154 0.0000 0.0000 24.143 3.60 9.11 -5.50 62 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr6 170561966 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 681 222 459 102 74 20 11 15 0 0 459 0 0 0.4595 0.0000 0.0000 11.111 2.97 7.33 -4.36 52 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0058 0.9942 0.0000
chr7 1547017 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 2 265 74 191 5 4 6 1 58 0 0 185 0 6 0.0676 0.0000 0.0314 11.333 0.20 4.07 -3.87 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9938 0.0062 2 1 0.0000 0.8909 0.1091
chr7 2513247 A AGATG 0.500000 0.100 1 4 1 237 108 129 38 3 19 0 48 0 0 128 0 1 0.3519 0.0000 0.0078 4.944 4.03 3.83 0.19 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0874 0.5524 0.3601 1 1 0.0922 0.5482 0.3596 1 1 0.0987 0.5430 0.3583
chr7 2513247 AGATG A 0.500000 0.100 1 -4 1 237 111 126 51 2 17 1 40 0 0 125 0 1 0.4595 0.0000 0.0079 5.529 3.65 3.95 -0.30 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4603 0.4886 0.0512 1 1 0.4566 0.4882 0.0553 1 1 0.4510 0.4879 0.0610
chr7 11831843 A AGCAGCG 0.500000 0.100 1 6 2 235 130 105 61 3 25 0 41 0 0 104 0 1 0.4692 0.0000 0.0095 4.160 0.48 5.80 -5.33 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7140 0.2765 0.0095 1 0 0.7040 0.2849 0.0111 1 0 0.6899 0.2966 0.0135
chr7 12351642 T TA 0.500000 0.100 1 1 3 220 94 126 3 1 1 1 88 0 0 126 0 0 0.0319 0.0000 0.0000 92.000 1.00 1.78 -0.78 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9023 0.0977 2 2 0.0000 0.2410 0.7590 2 2 0.0000 0.0914 0.9086
chr7 15686172 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 1 696 215 481 92 0 46 4 73 0 0 480 0 1 0.4279 0.0000 0.0021 3.674 0.25 3.19 -2.94 6 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4524 0.5195 0.0281 1 1 0.4531 0.5155 0.0314 1 1 0.4530 0.5109 0.0361
chr7 19145123 C CTCT 0.500000 0.100 1 3 2 484 109 375 59 0 10 0 40 0 0 375 0 0 0.5413 0.0000 0.0000 9.900 0.31 2.90 -2.59 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6590 0.3257 0.0152 1 0 0.6497 0.3329 0.0174 1 0 0.6366 0.3428 0.0206
chr7 25226950 TTAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 385 101 284 91 1 2 0 7 0 0 282 0 2 0.9010 0.0000 0.0070 49.500 0.30 2.57 -2.27 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0068 0.9932 0.0000 0 1 0.2120 0.7880 0.0000
chr7 31658299 C CT 0.500000 0.100 1 1 3 134 59 75 3 0 2 5 49 0 0 75 0 0 0.0508 0.0000 0.0000 28.000 0.00 1.43 -1.43 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9783 0.0217 2 1 0.0000 0.6228 0.3772 2 2 0.0000 0.3373 0.6627
chr7 33635227 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 451 119 332 56 0 1 0 62 0 0 332 0 0 0.4706 0.0000 0.0000 118.000 0.88 1.10 -0.22 38 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0930 0.6014 0.3056 1 1 0.0982 0.5938 0.3080 1 1 0.1052 0.5841 0.3107
chr7 36407740 A ACTT 0.500000 0.100 1 3 1 199 56 143 1 0 2 0 53 0 0 142 0 1 0.0179 0.0000 0.0070 27.000 0.00 3.45 -3.45 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3705 0.6295 2 2 0.0000 0.1635 0.8365 2 2 0.0000 0.1215 0.8785
chr7 45574559 C CGCGGCGGAGGCG 0.500000 0.100 1 12 1 278 45 233 39 0 4 0 2 1 0 231 0 1 0.8667 0.0043 0.0086 10.250 1.41 12.00 -10.59 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0097 0.9903 0.0000 0 1 0.2321 0.7679 0.0000 0 0 0.5039 0.4961 0.0000
chr7 51030870 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 262 132 130 122 1 5 0 4 0 1 129 0 0 0.9242 0.0000 0.0077 31.500 0.11 3.00 -2.89 0 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0724 0.9276 0.0000 0 0 0.8758 0.1242 0.0000 0 0 0.9697 0.0303 0.0000
chr7 64708639 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 230 85 145 14 2 43 1 25 0 0 144 0 1 0.1647 0.0000 0.0069 0.977 2.07 4.48 -2.41 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0902 0.4842 0.4256 1 1 0.0947 0.4850 0.4203 1 1 0.1007 0.4861 0.4132
chr7 64708641 G GAA 0.500000 0.100 1 2 1 229 84 145 15 42 0 1 26 0 0 144 0 1 0.1786 0.0000 0.0069 43.000 2.53 4.38 -1.85 9 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5307 0.4219 0.0474 1 0 0.5228 0.4260 0.0512 1 0 0.5119 0.4315 0.0566
chr7 70790590 GCCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 838 263 575 210 3 37 3 10 0 0 575 0 0 0.7985 0.0000 0.0000 6.108 0.29 3.20 -2.91 24 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0488 0.9512 0.0000 0 0 0.8890 0.1110 0.0000
chr7 76611468 CA C 0.500000 0.100 1 -1 1 450 141 309 66 0 1 1 73 0 0 309 0 0 0.4681 0.0000 0.0000 140.000 0.09 1.66 -1.57 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0682 0.5988 0.3329 1 1 0.0731 0.5911 0.3357 1 1 0.0800 0.5814 0.3386
chr7 82952172 T TTCA 0.500000 0.100 1 3 5 769 197 572 0 0 13 1 183 0 0 569 0 3 0.0000 0.0000 0.0052 14.154 3.20 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr7 92022864 A AAAC 0.500000 0.100 1 3 1 285 113 172 107 0 3 0 3 0 0 172 0 0 0.9469 0.0000 0.0000 36.667 0.23 3.33 -3.10 5 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2292 0.7708 0.0000 0 0 0.8957 0.1043 0.0000 0 0 0.9633 0.0367 0.0000
chr7 97006108 A AGCC 0.500000 0.100 1 3 1 487 207 280 80 5 62 5 55 0 0 280 0 0 0.3865 0.0000 0.0000 2.323 1.12 3.53 -2.40 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7546 0.2407 0.0047 1 0 0.7455 0.2488 0.0057 1 0 0.7326 0.2602 0.0072
chr7 100064888 GTAGT G 0.500000 0.100 1 -4 1 493 165 328 90 1 8 0 66 0 0 327 0 1 0.5455 0.0000 0.0030 19.625 0.16 3.95 -3.80 0 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7088 0.2851 0.0061 1 0 0.7011 0.2916 0.0072 1 0 0.6900 0.3009 0.0091
chr7 102496609 TGCCCTGG T 0.500000 0.100 1 -7 1 511 150 361 86 0 5 0 59 0 0 358 0 3 0.5733 0.0000 0.0083 29.000 0.34 7.02 -6.68 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7186 0.2752 0.0062 1 0 0.7104 0.2823 0.0073 1 0 0.6984 0.2924 0.0092
chr7 103989356 T TGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 396 147 249 0 0 43 5 99 0 0 239 1 9 0.0000 0.0000 0.0402 2.452 5.97 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0031 0.9969 2 2 0.0000 0.0035 0.9965 2 2 0.0000 0.0041 0.9959
chr7 105614354 AGAGGAG A 0.500000 0.100 1 -6 2 941 224 717 175 4 37 1 7 0 0 717 0 0 0.7812 0.0000 0.0000 5.000 0.35 5.29 -4.93 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0015 0.9985 0.0000 0 0 0.8066 0.1934 0.0000 0 0 0.9843 0.0157 0.0000
chr7 114629915 GCAA G 0.500000 0.100 1 -3 1 624 239 385 123 1 32 5 78 0 0 385 0 0 0.5146 0.0000 0.0000 6.645 0.20 3.13 -2.93 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9130 0.0867 0.0003 1 0 0.9064 0.0933 0.0004 1 0 0.8965 0.1030 0.0006
chr7 122013320 GTGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 718 186 532 150 2 25 0 9 0 0 532 0 0 0.8065 0.0000 0.0000 6.440 0.65 4.00 -3.35 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1200 0.8800 0.0000 0 0 0.8317 0.1683 0.0000
chr7 124032402 CGCT C 0.500000 0.100 1 -3 2 714 207 507 165 3 20 4 15 0 0 507 0 0 0.7971 0.0000 0.0000 9.350 0.43 3.33 -2.90 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0179 0.9821 0.0000
chr7 128947297 CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT C 0.500000 0.100 1 -30 3 715 265 450 220 1 27 0 17 0 0 449 0 1 0.8302 0.0000 0.0022 8.778 0.27 13.06 -12.79 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.3010 0.6990 0.0000
chr7 131556270 G GGGCGAC 0.500000 0.100 1 6 1 426 231 195 90 2 35 2 102 0 0 189 0 6 0.3896 0.0000 0.0308 5.735 0.49 5.34 -4.85 12 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0147 0.4683 0.5170 1 2 0.0169 0.4658 0.5173 1 2 0.0202 0.4634 0.5164
chr7 131556270 GGGCGAC G 0.500000 0.100 1 -6 1 426 248 178 217 2 26 0 3 0 0 178 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 8.538 2.62 7.00 -4.38 29 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9888 0.0112 0.0000 0 0 0.9996 0.0004 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr7 137928167 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 244 89 155 45 0 0 1 43 0 0 152 0 3 0.5056 0.0000 0.0194 88.000 0.09 2.98 -2.89 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1620 0.6067 0.2313 1 1 0.1665 0.5989 0.2346 1 1 0.1725 0.5889 0.2386
chr7 142864293 CCCT C 0.500000 0.100 1 -3 3 929 262 667 1 0 39 14 208 0 0 664 0 3 0.0038 0.0000 0.0045 5.718 0.00 3.06 -3.06 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr7 143511644 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 863 202 661 24 0 12 0 166 0 0 661 0 0 0.1188 0.0000 0.0000 15.833 0.42 1.25 -0.84 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr7 144129636 ACTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 653 154 499 77 0 4 0 73 0 0 498 0 1 0.5000 0.0000 0.0020 37.500 0.25 4.10 -3.85 5 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2143 0.6675 0.1182 1 1 0.2201 0.6557 0.1242 1 1 0.2272 0.6406 0.1322
chr7 149806828 GGATA G 0.500000 0.100 1 -4 3 233 61 172 34 0 2 0 25 0 0 168 0 4 0.5574 0.0000 0.0233 29.500 0.29 4.68 -4.39 6 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3300 0.5476 0.1225 1 1 0.3291 0.5439 0.1269 1 1 0.3277 0.5393 0.1329
chr7 149818100 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 706 178 528 160 0 3 0 15 1 0 527 0 0 0.8989 0.0019 0.0019 58.333 0.32 1.40 -1.08 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1389 0.8611 0.0000
chr7 149821443 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 636 189 447 101 1 2 0 85 0 0 445 0 2 0.5344 0.0000 0.0045 93.500 0.31 1.49 -1.19 45 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4558 0.5209 0.0233 1 1 0.4575 0.5162 0.0263 1 1 0.4585 0.5109 0.0306
chr7 151086813 C CG 0.500000 0.100 1 1 2 490 95 395 0 0 3 19 73 0 2 364 9 20 0.0000 0.0000 0.0785 30.333 7.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0025 0.9975 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0032 0.9968
chr7 151086821 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 491 93 398 0 0 6 14 73 0 1 364 15 18 0.0000 0.0000 0.0854 27.667 7.92 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0026 0.9974 2 2 0.0000 0.0030 0.9970
chr7 151086832 GTCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 494 92 402 0 1 9 6 76 0 2 319 32 49 0.0000 0.0000 0.2065 9.000 7.50 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0010 0.9990
chr7 151195597 TC T 0.500000 0.100 1 -1 3 379 159 220 78 0 0 1 80 0 0 219 0 1 0.4906 0.0000 0.0045 159.000 0.36 1.15 -0.79 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1048 0.6710 0.2242 1 1 0.1109 0.6589 0.2302 1 1 0.1189 0.6435 0.2376
chr8 544658 GGGCGGC G 0.425210 0.100 1 -6 1 291 148 143 135 1 9 0 3 0 0 143 0 0 0.9122 0.0000 0.0000 15.444 0.44 6.33 -5.90 3 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6420 0.3580 0.0000 0 0 0.9805 0.0195 0.0000 0 0 0.9933 0.0067 0.0000
chr8 8318865 CGGGGCG C 0.543000 0.100 1 -6 2 754 152 602 76 0 19 2 55 0 1 601 0 0 0.5000 0.0000 0.0017 6.947 0.53 5.58 -5.06 44 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6351 0.3519 0.0131 1 0 0.6272 0.3577 0.0151 1 0 0.6158 0.3659 0.0183
chr8 9030032 TAAC T 0.454100 0.100 1 -3 1 339 115 224 106 0 2 0 7 0 0 223 0 1 0.9217 0.0000 0.0045 56.500 0.13 3.00 -2.87 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0455 0.9545 0.0000 0 0 0.5472 0.4528 0.0000
chr8 10610119 T TTTC 0.070211 0.100 1 3 1 864 179 685 92 0 12 21 54 0 0 678 0 7 0.5140 0.0000 0.0102 17.111 1.79 5.72 -3.93 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5606 0.4352 0.0042 1 0 0.5648 0.4306 0.0046 1 0 0.5693 0.4255 0.0052
chr8 11808709 GTCCCAC G 0.938007 0.100 1 -6 1 587 270 317 0 0 37 1 232 0 0 316 0 1 0.0000 0.0000 0.0032 6.297 5.79 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr8 22404715 AGCTGCT A 0.199557 0.100 1 -6 2 354 150 204 93 0 8 0 49 0 0 200 0 4 0.6200 0.0000 0.0196 17.750 0.67 7.37 -6.70 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9543 0.0456 0.0001 1 0 0.9497 0.0502 0.0001 1 0 0.9429 0.0570 0.0002
chr8 22713394 GT G 0.311545 0.100 1 -1 2 281 126 155 58 0 3 0 65 0 0 152 1 2 0.4603 0.0000 0.0194 41.000 0.34 3.91 -3.56 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0866 0.6287 0.2847 1 1 0.0933 0.6224 0.2843 1 1 0.1028 0.6143 0.2829
chr8 41309118 GGCT G 0.380768 0.100 1 -3 3 619 214 405 11 0 7 1 195 0 0 402 0 3 0.0514 0.0000 0.0074 29.571 1.18 3.16 -1.98 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9054 0.0946 2 2 0.0000 0.1081 0.8919
chr8 60222337 CAG C 0.500000 0.100 1 -2 2 169 72 97 5 0 0 0 67 0 0 97 0 0 0.0694 0.0000 0.0000 72.000 0.00 2.28 -2.28 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9995 0.0005 2 1 0.0000 0.8783 0.1217 2 2 0.0000 0.4894 0.5106
chr8 64581463 G GGCA 0.072578 0.100 1 3 1 605 190 415 77 1 44 4 64 0 0 415 0 0 0.4053 0.0000 0.0000 3.395 0.49 3.20 -2.71 19 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5432 0.4508 0.0060 1 0 0.5469 0.4466 0.0065 1 0 0.5510 0.4417 0.0073
chr8 80486812 TGTC T 0.500000 0.100 1 -3 1 349 100 249 58 3 2 0 37 0 0 249 0 0 0.5800 0.0000 0.0000 49.000 1.95 4.16 -2.21 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7642 0.2293 0.0066 1 0 0.7533 0.2389 0.0078 1 0 0.7379 0.2523 0.0097
chr8 102560782 CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 0.500000 0.100 1 -27 4 717 253 464 146 0 5 0 102 0 0 463 0 1 0.5771 0.0000 0.0022 49.600 0.45 16.54 -16.09 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9126 0.0872 0.0002 1 0 0.9066 0.0931 0.0003 1 0 0.8976 0.1020 0.0004
chr8 143429783 ATGG A 0.500000 0.100 1 -3 2 507 144 363 2 1 33 9 99 0 0 357 0 6 0.0139 0.0000 0.0165 3.364 1.00 4.62 -3.62 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.6341 0.3659 2 2 0.0000 0.0717 0.9283 2 2 0.0000 0.0259 0.9741
chr8 143567371 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 315 81 234 40 0 5 0 36 0 0 231 0 3 0.4938 0.0000 0.0128 15.200 2.67 3.39 -0.71 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2228 0.5944 0.1827 1 1 0.2259 0.5874 0.1867 1 1 0.2297 0.5786 0.1917
chr8 144111962 TG T 0.500000 0.100 1 -1 1 844 178 666 150 0 0 0 28 0 0 665 1 0 0.8427 0.0000 0.0015 178.000 0.30 2.75 -2.45 2 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr8 144392334 T TGGGGGTGCAAGGTGA 0.500000 0.100 1 15 1 832 171 661 0 1 34 0 136 0 0 641 0 20 0.0000 0.0000 0.0303 4.000 10.42 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0007 0.9993
chr8 144774231 CTTT C 0.500000 0.100 1 -3 2 937 167 770 70 0 2 0 95 0 0 770 0 0 0.4192 0.0000 0.0000 82.500 0.26 3.07 -2.82 20 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0051 0.2724 0.7226 1 2 0.0061 0.2790 0.7149 1 2 0.0077 0.2885 0.7038
chr9 2039776 ACAG A 0.143274 0.100 1 -3 2 598 181 417 76 10 42 33 20 0 0 416 0 1 0.4199 0.0000 0.0024 3.262 0.13 3.30 -3.17 16 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.9118 0.0879 0.0003 1 0 0.9058 0.0938 0.0003 1 0 0.8971 0.1024 0.0005
chr9 12775862 T TGGCGGCGGC 0.500000 0.100 1 9 2 358 100 258 0 0 34 1 65 0 0 245 0 13 0.0000 0.0000 0.0504 1.912 7.72 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0176 0.9824 2 2 0.0000 0.0191 0.9809 2 2 0.0000 0.0213 0.9787
chr9 33575338 CA C 0.500000 0.100 1 -1 3 396 128 268 109 0 1 0 18 0 0 268 0 0 0.8516 0.0000 0.0000 127.000 0.16 1.61 -1.46 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0019 0.9981 0.0000
chr9 33796692 TGAG T 0.500000 0.100 1 -3 1 385 158 227 85 0 6 1 66 0 0 226 0 1 0.5380 0.0000 0.0044 25.333 0.27 3.06 -2.79 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5509 0.4304 0.0188 1 0 0.5474 0.4314 0.0212 1 0 0.5418 0.4332 0.0250
chr9 35562396 A ATAGT 0.500000 0.100 1 4 5 631 117 514 3 0 2 0 112 0 1 500 0 13 0.0256 0.0000 0.0272 57.500 0.33 4.87 -4.53 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9112 0.0888 2 2 0.0000 0.1170 0.8830 2 2 0.0000 0.0290 0.9710
chr9 65283162 AG A 0.500000 0.100 1 -1 3 369 53 316 28 0 0 0 25 0 0 316 0 0 0.5283 0.0000 0.0000 53.000 0.29 1.16 -0.87 28 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2875 0.5539 0.1586 1 1 0.2878 0.5498 0.1624 1 1 0.2878 0.5447 0.1675
chr9 70140212 TAAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 276 132 144 126 1 2 0 3 0 0 144 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 64.500 0.17 3.00 -2.83 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4500 0.5500 0.0000 0 0 0.9586 0.0414 0.0000 0 0 0.9857 0.0143 0.0000
chr9 76703459 GGTGACAGCCTGCAAC G 0.500000 0.100 1 -15 3 485 120 365 0 0 4 0 116 0 0 347 0 18 0.0000 0.0000 0.0493 29.000 14.22 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0011 0.9989 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0015 0.9985
chr9 76709219 A ATGACTGTTGCAG 0.500000 0.100 1 12 1 697 150 547 6 0 18 0 126 0 0 527 0 20 0.0400 0.0000 0.0366 7.333 0.17 11.16 -10.99 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9970 0.0030 2 2 0.0000 0.2846 0.7154 2 2 0.0000 0.0377 0.9623
chr9 86322936 ATTT A 0.500000 0.100 1 -3 2 450 117 333 10 0 0 0 107 0 0 327 0 6 0.0855 0.0000 0.0180 117.000 0.00 3.18 -3.18 8 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9933 0.0067 2 1 0.0000 0.7181 0.2819
chr9 92474742 CTCA C 0.500000 0.100 1 -3 2 313 106 207 2 1 30 8 65 0 0 205 1 1 0.0189 0.0000 0.0097 2.500 0.50 3.11 -2.61 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9295 0.0705 2 2 0.0000 0.3555 0.6445 2 2 0.0000 0.1513 0.8487
chr9 92474742 CTCATCA C 0.500000 0.100 1 -6 2 313 108 205 6 1 93 0 8 0 0 204 0 1 0.0556 0.0000 0.0049 0.156 1.83 5.75 -3.92 4 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2242 0.5191 0.2567 1 1 0.2255 0.5177 0.2568 1 1 0.2272 0.5160 0.2569
chr9 93676722 C CCCTGCCTCCACCACA 0.500000 0.100 1 15 4 427 151 276 74 1 3 0 73 0 0 276 0 0 0.4901 0.0000 0.0000 49.333 0.14 9.32 -9.18 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1975 0.6696 0.1329 1 1 0.2034 0.6577 0.1390 1 1 0.2107 0.6424 0.1469
chr9 94318662 GAGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 572 229 343 41 13 1 0 174 0 0 340 0 3 0.1790 0.0000 0.0087 228.000 8.85 3.18 5.68 3 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0637 0.9363 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr9 97330686 A AGAGGAG 0.500000 0.100 1 6 2 424 110 314 90 1 13 0 6 0 0 314 0 0 0.8182 0.0000 0.0000 7.462 0.53 4.83 -4.30 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.1363 0.8637 0.0000 0 0 0.6369 0.3631 0.0000
chr9 97854418 AGCCGCC A 0.500000 0.100 1 -6 1 870 123 747 0 0 30 1 92 0 0 740 2 5 0.0000 0.0000 0.0094 3.067 5.62 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0075 0.9925 2 2 0.0000 0.0086 0.9914
chr9 110138061 G GGAAGCT 0.500000 0.100 1 6 1 606 129 477 105 1 19 0 4 0 0 474 0 3 0.8140 0.0000 0.0063 5.737 0.24 3.25 -3.01 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1031 0.8969 0.0000 0 0 0.6563 0.3437 0.0000
chr9 112453942 GATTA G 0.500000 0.100 1 -4 1 315 128 187 0 0 3 0 125 0 0 181 1 5 0.0000 0.0000 0.0321 41.667 4.18 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0013 0.9987 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0017 0.9983
chr9 120714264 ACGGCGG A 0.500000 0.100 1 -6 1 435 95 340 35 2 11 0 47 0 0 340 0 0 0.3684 0.0000 0.0000 7.636 0.26 6.13 -5.87 31 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0609 0.4957 0.4434 1 1 0.0652 0.4951 0.4397 1 1 0.0712 0.4946 0.4342
chr9 122093051 G GTGGCCT 0.500000 0.100 1 6 1 674 150 524 140 1 3 1 5 0 0 524 0 0 0.9333 0.0000 0.0000 48.667 0.36 6.40 -6.04 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0169 0.9831 0.0000 0 0 0.8311 0.1689 0.0000 0 0 0.9713 0.0287 0.0000
chr9 122629491 C CA 0.500000 0.100 1 1 1 535 131 404 117 1 9 0 4 0 0 404 0 0 0.8931 0.0000 0.0000 13.444 0.45 1.00 -0.55 23 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0601 0.9399 0.0000 0 0 0.8391 0.1609 0.0000 0 0 0.9593 0.0407 0.0000
chr9 128258516 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 513 204 309 167 2 13 2 20 0 0 309 0 0 0.8186 0.0000 0.0000 14.692 0.31 3.75 -3.44 37 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0032 0.9968 0.0000
chr9 128275972 CACATCAG C 0.500000 0.100 1 -7 2 430 115 315 70 0 1 0 44 0 0 313 1 1 0.6087 0.0000 0.0063 114.000 0.37 7.80 -7.42 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7467 0.2468 0.0065 1 0 0.7367 0.2556 0.0077 1 0 0.7225 0.2679 0.0097
chr9 129868385 TGAC T 0.500000 0.100 1 -3 2 502 153 349 0 0 1 0 152 0 0 347 1 1 0.0000 0.0000 0.0057 152.000 2.95 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr9 130265925 CGGCAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 288 74 214 0 0 2 1 71 0 0 213 0 1 0.0000 0.0000 0.0047 36.000 7.49 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0236 0.9764 2 2 0.0000 0.0254 0.9746 2 2 0.0000 0.0281 0.9719
chr9 130681605 T TCGC 0.500000 0.100 1 3 1 549 165 384 9 7 40 4 105 0 0 372 1 11 0.0545 0.0000 0.0312 3.179 1.22 4.27 -3.04 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9876 0.0124
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 292 140 152 79 0 5 0 56 0 0 152 0 0 0.5643 0.0000 0.0000 27.000 0.20 2.71 -2.51 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7101 0.2824 0.0075 1 0 0.7014 0.2898 0.0088 1 0 0.6890 0.3001 0.0109
chr9 133257521 T TC 0.500000 0.100 1 1 4 292 140 152 79 0 5 0 56 0 0 152 0 0 0.5643 0.0000 0.0000 27.000 0.20 2.71 -2.51 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7101 0.2824 0.0075 1 0 0.7014 0.2898 0.0088 1 0 0.6890 0.3001 0.0109
chr9 135549839 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 222 87 135 52 1 0 0 34 0 0 134 0 1 0.5977 0.0000 0.0074 86.000 0.23 1.56 -1.33 22 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6413 0.3397 0.0190 1 0 0.6318 0.3467 0.0215 1 0 0.6185 0.3563 0.0252
chr9 135624500 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 415 115 300 55 0 4 0 56 0 0 300 0 0 0.4783 0.0000 0.0000 27.750 0.44 1.11 -0.67 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1660 0.6317 0.2023 1 1 0.1710 0.6221 0.2068 1 1 0.1775 0.6100 0.2125
chr9 135945095 GCCT G 0.500000 0.100 1 -3 2 305 126 179 113 0 3 0 10 0 0 178 0 1 0.8968 0.0000 0.0056 41.000 0.38 3.10 -2.72 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0023 0.9977 0.0000 0 1 0.1713 0.8287 0.0000
chr9 136341024 TC T 0.500000 0.100 1 -1 1 214 80 134 9 0 7 1 63 0 0 133 0 1 0.1125 0.0000 0.0075 10.429 0.00 1.83 -1.83 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018 2 1 0.0000 0.9317 0.0683
chr9 138023718 TGGAGAAGGAGACCAC T 0.500000 0.100 1 -15 1 469 140 329 80 1 13 3 43 0 0 321 0 8 0.5714 0.0000 0.0243 9.769 0.50 13.81 -13.31 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7865 0.2098 0.0037 1 0 0.7769 0.2186 0.0045 1 0 0.7632 0.2310 0.0058
chr9 138217086 G GGCA 0.500000 0.100 1 3 1 202 114 88 47 4 23 0 40 0 0 88 0 0 0.4123 0.0000 0.0000 3.957 0.19 3.08 -2.88 15 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4621 0.4857 0.0523 1 1 0.4581 0.4855 0.0564 1 1 0.4522 0.4856 0.0622
chr10 5748003 CCTGCCTCAG C 0.046274 0.100 1 -9 1 771 196 575 106 1 12 0 77 0 0 571 0 4 0.5408 0.0000 0.0070 15.250 0.16 8.06 -7.90 18 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8303 0.1694 0.0002 1 0 0.8261 0.1736 0.0003 1 0 0.8199 0.1797 0.0004
chr10 13657133 CCGCCCCCCG C 0.028316 0.100 1 -9 1 786 163 623 125 0 31 1 6 0 0 623 0 0 0.7669 0.0000 0.0000 4.258 0.39 7.83 -7.44 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0162 0.9838 0.0000 0 0 0.9465 0.0535 0.0000 0 0 0.9953 0.0047 0.0000
chr10 21146411 ACACT A 0.189476 0.100 1 -4 3 259 109 150 98 2 2 0 7 0 0 149 0 1 0.8991 0.0000 0.0067 53.500 0.10 4.29 -4.18 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1120 0.8880 0.0000 0 0 0.7633 0.2367 0.0000
chr10 21516537 C CCCTCCT 0.481720 0.100 1 6 6 812 190 622 162 1 20 0 7 0 0 621 0 1 0.8526 0.0000 0.0016 8.500 0.32 6.14 -5.82 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4253 0.5747 0.0000 0 0 0.9453 0.0547 0.0000
chr10 22209555 C CAGA 0.259534 0.100 1 3 1 723 162 561 144 0 5 0 13 1 0 560 0 0 0.8889 0.0018 0.0018 31.400 0.10 3.69 -3.59 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0039 0.9961 0.0000 0 1 0.4345 0.5655 0.0000
chr10 27413327 G GC 0.340501 0.100 1 1 1 534 152 382 67 0 9 0 76 0 1 381 0 0 0.4408 0.0000 0.0026 15.889 0.24 1.29 -1.05 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0943 0.6551 0.2506 1 1 0.1013 0.6462 0.2525 1 1 0.1109 0.6347 0.2544
chr10 35640327 CCCGCGCCCGCGCCCG C 0.000522 0.100 1 -15 1 730 185 545 147 2 28 0 8 1 2 542 0 0 0.7946 0.0018 0.0055 5.607 1.71 14.12 -12.42 11 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0776 0.9224 0.0000 0 0 0.9987 0.0013 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000
chr10 63208190 ACTAAAC A 0.035276 0.100 1 -6 1 795 179 616 106 0 5 0 68 0 0 614 0 2 0.5922 0.0000 0.0032 34.800 0.17 5.76 -5.59 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9352 0.0648 0.0000 1 0 0.9306 0.0694 0.0000 1 0 0.9239 0.0761 0.0001
chr10 73240978 AGCGGAG A 0.006364 0.100 1 -6 3 147 78 69 55 1 2 1 19 0 0 68 0 1 0.7051 0.0000 0.0145 38.000 1.56 12.74 -11.17 27 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9548 0.0452 0.0000 1 0 0.9500 0.0500 0.0000 1 0 0.9356 0.0644 0.0000
chr10 73240989 ACCAGTCTCT A 0.006454 0.100 1 -9 1 147 74 73 57 0 0 0 17 1 0 68 0 4 0.7703 0.0137 0.0685 74.000 1.53 13.18 -11.65 29 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9635 0.0365 0.0000 1 0 0.9590 0.0410 0.0000 1 0 0.9258 0.0742 0.0000
chr10 75022147 GGAA G 0.161983 0.100 1 -3 1 414 101 313 72 1 17 1 10 0 0 313 0 0 0.7129 0.0000 0.0000 4.941 0.42 4.10 -3.68 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.1340 0.8660 0.0000
chr10 87234508 TCTC T 0.013816 0.100 1 -3 2 585 237 348 168 4 6 1 58 0 0 348 0 0 0.7089 0.0000 0.0000 38.500 0.27 3.10 -2.83 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 1.0000 0.0000 0.0000 1 0 0.9999 0.0001 0.0000 1 0 0.9942 0.0058 0.0000
chr10 89738145 C CTAAAAG 0.255522 0.100 1 6 1 714 148 566 134 0 7 0 7 0 0 566 0 0 0.9054 0.0000 0.0000 20.143 1.42 6.86 -5.44 18 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 0 0.5766 0.4234 0.0000 0 0 0.9560 0.0440 0.0000
chr10 103350983 A AGGAGGC 0.474578 0.100 1 6 1 350 86 264 46 0 7 0 33 0 0 262 1 1 0.5349 0.0000 0.0076 11.286 0.30 6.24 -5.94 34 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4871 0.4633 0.0496 1 0 0.4823 0.4643 0.0535 1 0 0.4753 0.4658 0.0589
chr10 113679881 CTT C 0.228152 0.100 1 -2 1 328 143 185 78 0 9 0 56 0 0 184 0 1 0.5455 0.0000 0.0054 14.889 0.32 2.70 -2.38 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7587 0.2378 0.0035 1 0 0.7528 0.2432 0.0041 1 0 0.7441 0.2509 0.0050
chr10 114326025 C CCCG 0.723472 0.100 1 3 3 203 81 122 0 0 2 0 79 0 0 122 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 39.500 3.06 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0073 0.9927 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr10 124021236 CG C 0.538577 0.100 1 -1 1 360 78 282 15 2 7 13 41 0 5 271 3 3 0.1923 0.0000 0.0390 8.286 0.80 2.02 -1.22 13 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0007 0.0733 0.9260 1 2 0.0009 0.0813 0.9178 1 2 0.0012 0.1107 0.8881
chr10 125026590 A AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG 0.127285 0.100 1 21 2 553 104 449 52 0 8 0 44 0 0 441 0 8 0.5000 0.0000 0.0178 12.000 1.42 12.70 -11.28 2 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3274 0.6248 0.0478 1 1 0.3354 0.6157 0.0489 1 1 0.3455 0.6042 0.0504
chr10 127738728 G GGCC 0.003313 0.100 1 3 1 452 107 345 61 0 3 0 43 0 0 340 0 5 0.5701 0.0000 0.0145 34.667 0.20 3.23 -3.04 5 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6792 0.3206 0.0002 1 0 0.6772 0.3227 0.0002 1 0 0.6739 0.3259 0.0002
chr10 132329982 G GC 0.500000 0.100 1 1 1 338 100 238 56 0 6 0 38 0 0 237 0 1 0.5600 0.0000 0.0042 15.667 0.12 1.03 -0.90 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6152 0.3636 0.0212 1 0 0.6067 0.3695 0.0238 1 0 0.5948 0.3775 0.0277
chr10 133423454 CGCCGCCCCGGCT C 0.004943 0.100 1 -12 2 398 89 309 44 1 11 0 33 0 0 306 0 3 0.4944 0.0000 0.0097 7.091 1.89 13.42 -11.54 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6175 0.3820 0.0005 1 0 0.6165 0.3829 0.0006 1 0 0.6148 0.3846 0.0006
chr11 209894 ACCC A 0.342592 0.100 1 -3 2 540 126 414 8 0 8 0 110 0 0 412 0 2 0.0635 0.0000 0.0048 14.750 1.50 2.84 -1.34 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9727 0.0273 2 1 0.0000 0.5867 0.4133
chr11 704604 GA G 0.439706 0.100 1 -1 2 218 88 130 7 1 2 0 78 0 0 130 0 0 0.0795 0.0000 0.0000 43.000 2.00 2.12 -0.12 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9920 0.0080 2 1 0.0000 0.8288 0.1712
chr11 798222 T TCGC 0.001315 0.100 1 3 1 543 166 377 130 1 21 0 14 0 0 375 0 2 0.7831 0.0000 0.0053 6.905 0.32 4.29 -3.96 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0207 0.9793 0.0000 0 0 0.9383 0.0617 0.0000
chr11 1051657 A AC 0.136986 0.100 1 1 1 405 149 256 85 1 7 1 55 0 0 256 0 0 0.5705 0.0000 0.0000 20.143 0.33 1.75 -1.42 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8933 0.1064 0.0004 1 0 0.8871 0.1124 0.0005 1 0 0.8782 0.1212 0.0006
chr11 1597942 ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG A 0.542785 0.100 1 -30 2 883 147 736 44 0 64 1 38 0 0 736 0 0 0.2993 0.0000 0.0000 1.297 0.82 6.58 -5.76 18 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2911 0.5813 0.1277 1 1 0.2916 0.5755 0.1329 1 1 0.2918 0.5683 0.1399
chr11 1630383 TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC T 0.592794 0.100 1 -30 2 713 216 497 126 2 75 1 12 0 0 497 0 0 0.5833 0.0000 0.0000 1.880 0.29 6.33 -6.04 4 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.0762 0.9238 0.0000
chr11 3640355 A ATGG 0.500000 0.100 1 3 2 333 106 227 0 0 2 0 104 0 0 225 1 1 0.0000 0.0000 0.0088 52.000 2.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0045 0.9955 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0058 0.9942
chr11 4368174 AG A 0.500000 0.100 1 -1 2 686 226 460 14 0 5 0 207 0 0 460 0 0 0.0619 0.0000 0.0000 44.200 0.14 1.21 -1.07 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9894 0.0106 2 2 0.0000 0.2555 0.7445
chr11 4545229 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 311 81 230 38 0 0 0 43 0 0 230 0 0 0.4691 0.0000 0.0000 81.000 0.29 1.23 -0.94 20 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1166 0.5693 0.3141 1 1 0.1213 0.5641 0.3146 1 1 0.1277 0.5574 0.3148
chr11 4571476 T TAC 0.500000 0.100 1 2 1 185 88 97 0 0 3 81 4 0 0 95 2 0 0.0000 0.0000 0.0206 2.000 2.75 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0343 0.9657 2 2 0.0000 0.0371 0.9629 2 2 0.0000 0.0413 0.9587
chr11 4571478 C CAG 0.500000 0.100 1 2 1 185 90 95 0 0 4 1 85 0 0 93 0 2 0.0000 0.0000 0.0211 43.000 2.14 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0106 0.9894 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0132 0.9868
chr11 5070346 A AC 0.500000 0.100 1 1 1 586 148 438 135 0 3 0 10 0 0 438 0 0 0.9122 0.0000 0.0000 48.333 0.27 2.90 -2.63 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0202 0.9798 0.0000 0 0 0.5352 0.4648 0.0000
chr11 5178110 A AATGCCC 0.500000 0.100 1 6 1 679 153 526 0 0 2 0 151 0 0 516 1 9 0.0000 0.0000 0.0190 75.500 6.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr11 5178587 GC G 0.500000 0.100 1 -1 2 497 138 359 0 0 3 1 134 0 0 359 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 45.000 1.56 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0014 0.9986
chr11 5489193 ATCT A 0.500000 0.100 1 -3 1 678 125 553 63 0 4 0 58 0 0 553 0 0 0.5040 0.0000 0.0000 30.250 0.89 4.12 -3.23 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2796 0.6167 0.1038 1 1 0.2829 0.6080 0.1091 1 1 0.2866 0.5971 0.1162
chr11 5489310 G GGGCT 0.500000 0.100 1 4 1 641 145 496 135 0 0 0 10 0 0 496 0 0 0.9310 0.0000 0.0000 145.000 1.55 5.60 -4.05 13 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0198 0.9802 0.0000 0 0 0.5331 0.4669 0.0000
chr11 6546665 C CTGCCCTACTGCA 0.500000 0.100 1 12 2 741 124 617 0 0 7 0 117 0 0 593 0 24 0.0000 0.0000 0.0389 16.714 8.74 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0011 0.9989
chr11 6641514 C CCAG 0.500000 0.100 1 3 5 632 183 449 79 4 24 0 76 0 0 448 0 1 0.4317 0.0000 0.0022 6.625 0.34 3.16 -2.82 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2685 0.6497 0.0818 1 1 0.2738 0.6388 0.0874 1 1 0.2800 0.6250 0.0950
chr11 9091461 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 290 154 136 67 0 16 2 69 0 0 135 0 1 0.4351 0.0000 0.0074 8.562 0.48 4.46 -3.99 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1012 0.6394 0.2593 1 1 0.1068 0.6293 0.2639 1 1 0.1143 0.6164 0.2692
chr11 12294797 G GCTCCTCCTC 0.500000 0.100 1 9 1 522 141 381 1 1 51 0 88 0 0 371 0 10 0.0071 0.0000 0.0262 1.765 3.00 7.25 -4.25 1 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3035 0.6965 2 2 0.0000 0.0564 0.9436 2 2 0.0000 0.0296 0.9704
chr11 18105983 A ACCTCCT 0.500000 0.100 1 6 2 360 206 154 83 0 25 0 98 0 0 151 0 3 0.4029 0.0000 0.0195 7.240 0.19 5.65 -5.46 1 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0143 0.4371 0.5486 1 2 0.0164 0.4366 0.5469 1 2 0.0197 0.4369 0.5435
chr11 46703166 CAGTGGTGACAGA C 0.500000 0.100 1 -12 1 299 60 239 34 0 4 0 22 0 0 237 0 2 0.5667 0.0000 0.0084 14.000 0.85 10.68 -9.83 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4708 0.4644 0.0648 1 1 0.4647 0.4662 0.0691 1 1 0.4563 0.4686 0.0751
chr11 47767111 CGGTGGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 220 90 130 2 0 2 0 86 0 0 125 1 4 0.0222 0.0000 0.0385 44.000 0.00 5.86 -5.86 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4520 0.5480 2 2 0.0000 0.0820 0.9180 2 2 0.0000 0.0418 0.9582
chr11 48264429 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 856 279 577 258 0 10 0 11 0 0 576 0 1 0.9247 0.0000 0.0017 26.900 0.15 3.09 -2.94 36 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 0 0.5274 0.4726 0.0000 0 0 0.9920 0.0080 0.0000
chr11 56361197 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 465 86 379 41 0 5 0 40 0 0 379 0 0 0.4767 0.0000 0.0000 16.200 0.59 1.27 -0.69 3 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2215 0.5968 0.1817 1 1 0.2247 0.5896 0.1857 1 1 0.2286 0.5806 0.1908
chr11 56413160 A ACT 0.500000 0.100 1 2 4 780 161 619 0 0 3 0 158 0 0 613 0 6 0.0000 0.0000 0.0097 52.667 2.37 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr11 60397879 ATT A 0.500000 0.100 1 -2 1 94 53 41 51 0 0 0 2 0 0 41 0 0 0.9623 0.0000 0.0000 53.000 0.18 2.50 -2.32 15 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1365 0.8635 0.0000 0 0 0.6030 0.3970 0.0000 0 0 0.7670 0.2330 0.0000
chr11 66744819 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 5 299 117 182 78 6 21 0 12 0 0 182 0 0 0.6667 0.0000 0.0000 4.571 0.91 4.25 -3.34 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0002 0.9998 0.0000 0 1 0.0259 0.9741 0.0000
chr11 71538079 A AGGCTGTGGCTCCGGCTGTGGG 0.500000 0.100 1 21 2 667 164 503 91 0 36 1 36 1 0 476 0 26 0.5549 0.0020 0.0537 3.556 0.16 8.42 -8.25 49 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8035 0.1939 0.0026 1 0 0.7945 0.2023 0.0032 1 0 0.7815 0.2143 0.0042
chr11 71582738 TGGAGCCACAGCCCCCACAGCCAGAGCCACAGCCCCCACTGCC T 0.500000 0.100 1 -42 1 850 244 606 169 0 43 0 32 0 0 590 0 16 0.6926 0.0000 0.0264 4.674 0.24 12.34 -12.11 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 1 0.2335 0.7665 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr11 72139110 CTA C 0.500000 0.100 1 -2 1 868 227 641 0 0 7 1 219 0 0 640 0 1 0.0000 0.0000 0.0016 31.429 2.14 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 77184725 GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT G 0.500000 0.100 1 -22 2 232 91 141 55 0 6 0 30 0 0 140 0 1 0.6044 0.0000 0.0071 14.167 0.11 14.03 -13.92 1 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7743 0.2191 0.0067 1 0 0.7629 0.2292 0.0079 1 0 0.7469 0.2433 0.0098
chr11 77243743 T TA 0.500000 0.100 1 1 1 181 105 76 101 0 0 0 4 0 0 76 0 0 0.9619 0.0000 0.0000 105.000 0.25 2.75 -2.50 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0239 0.9761 0.0000 0 0 0.6881 0.3119 0.0000 0 0 0.9118 0.0882 0.0000
chr11 89490963 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 489 109 380 57 0 3 0 49 0 0 380 0 0 0.5229 0.0000 0.0000 35.333 0.30 4.22 -3.93 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3667 0.5582 0.0751 1 1 0.3668 0.5534 0.0798 1 1 0.3661 0.5474 0.0864
chr11 96092210 TTGCTGCTGC T 0.500000 0.100 1 -9 1 1269 340 929 1 3 73 6 257 1 0 926 1 1 0.0029 0.0011 0.0032 3.694 4.00 7.28 -3.28 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0012 0.9988 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr11 113983120 CG C 0.500000 0.100 1 -1 1 253 86 167 45 0 1 0 40 0 0 167 0 0 0.5233 0.0000 0.0000 85.000 0.24 1.10 -0.86 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3106 0.5741 0.1153 1 1 0.3114 0.5685 0.1201 1 1 0.3120 0.5615 0.1265
chr11 117918597 CGGGCTGGAGATGCCT C 0.500000 0.100 1 -15 3 780 216 564 15 1 29 2 169 0 0 561 1 2 0.0694 0.0000 0.0053 6.448 0.53 10.08 -9.55 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.8441 0.1559
chr11 118535613 CAGTGTGGA C 0.500000 0.100 1 -8 2 247 104 143 0 0 6 1 97 0 0 142 0 1 0.0000 0.0000 0.0070 16.167 7.67 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0064 0.9936 2 2 0.0000 0.0071 0.9929 2 2 0.0000 0.0082 0.9918
chr11 124880551 CCGGAGT C 0.500000 0.100 1 -6 1 333 127 206 69 0 6 0 52 0 0 206 0 0 0.5433 0.0000 0.0000 20.167 0.58 6.04 -5.46 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5863 0.3936 0.0202 1 0 0.5800 0.3973 0.0227 1 0 0.5708 0.4027 0.0265
chr11 130428222 GGCA G 0.500000 0.100 1 -3 1 455 158 297 67 1 13 1 76 0 0 295 1 1 0.4241 0.0000 0.0067 11.154 0.45 3.76 -3.32 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0450 0.5530 0.4020 1 1 0.0491 0.5477 0.4031 1 1 0.0550 0.5414 0.4036
chr12 139085 A AGAG 0.000224 0.100 1 3 2 507 106 401 87 0 12 0 7 0 0 401 0 0 0.8208 0.0000 0.0000 7.833 0.87 3.00 -2.13 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0608 0.9392 0.0000 0 0 0.9949 0.0051 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr12 865189 T TC 0.592141 0.100 1 1 1 389 142 247 70 0 2 0 70 1 0 243 0 3 0.4930 0.0040 0.0162 70.000 0.17 1.89 -1.71 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1089 0.6575 0.2335 1 1 0.1137 0.6460 0.2402 1 1 0.1201 0.6313 0.2486
chr12 1953157 T TTGC 0.435834 0.100 1 3 1 572 145 427 60 4 19 1 61 1 0 421 0 5 0.4138 0.0023 0.0141 6.632 0.13 3.03 -2.90 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1601 0.6577 0.1822 1 1 0.1665 0.6467 0.1868 1 1 0.1750 0.6326 0.1924
chr12 4626799 T TC 0.131925 0.100 1 1 1 581 129 452 18 0 1 0 110 0 0 445 0 7 0.1395 0.0000 0.0155 128.000 0.89 2.84 -1.95 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9996 0.0004
chr12 4626803 GA G 0.131932 0.100 1 -1 1 584 130 454 18 0 2 1 109 0 0 445 0 9 0.1385 0.0000 0.0198 63.500 0.89 2.87 -1.98 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9995 0.0005
chr12 6667903 TTGC T 0.555955 0.100 1 -3 1 430 135 295 8 0 34 9 84 0 0 293 0 2 0.0593 0.0000 0.0068 2.971 0.12 3.00 -2.88 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9720 0.0280 2 1 0.0000 0.5743 0.4257
chr12 8222185 C CACG 0.676520 0.100 1 3 1 1366 329 1037 101 1 2 0 225 0 0 1026 0 11 0.3070 0.0000 0.0106 163.500 2.01 3.97 -1.96 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000 1 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 8946399 G GAAC 0.112820 0.100 1 3 3 196 77 119 67 0 9 0 1 0 0 119 0 0 0.8701 0.0000 0.0000 7.556 0.36 3.00 -2.64 9 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9627 0.0373 0.0000 0 0 0.9871 0.0129 0.0000 0 0 0.9907 0.0093 0.0000
chr12 9733111 A ATAAGT 0.503415 0.100 1 5 1 271 111 160 61 0 3 0 47 0 0 158 0 2 0.5495 0.0000 0.0125 36.000 0.11 5.00 -4.89 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4661 0.4901 0.0438 1 1 0.4630 0.4893 0.0477 1 1 0.4581 0.4886 0.0533
chr12 12477741 GCACGC G 0.023257 0.100 1 -5 3 605 165 440 79 5 3 6 72 0 0 440 0 0 0.4788 0.0000 0.0000 53.333 0.35 8.47 -8.12 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4627 0.5344 0.0029 1 1 0.4710 0.5259 0.0031 1 1 0.4810 0.5156 0.0034
chr12 12477747 TGGGC T 0.023236 0.100 1 -4 1 602 163 439 76 5 8 3 71 0 0 439 0 0 0.4663 0.0000 0.0000 51.333 0.34 8.58 -8.24 16 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4783 0.5189 0.0028 1 1 0.4858 0.5112 0.0030 1 1 0.4947 0.5020 0.0033
chr12 14567620 GGCA G 0.679595 0.100 1 -3 1 327 169 158 74 1 10 3 81 0 0 158 0 0 0.4379 0.0000 0.0000 15.900 0.38 4.23 -3.86 10 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0326 0.5468 0.4206 1 1 0.0353 0.5396 0.4251 1 1 0.0392 0.5307 0.4301
chr12 18282464 GCCC G 0.396371 0.100 1 -3 2 488 111 377 105 0 1 0 5 0 0 377 0 0 0.9459 0.0000 0.0000 110.000 0.10 4.00 -3.90 31 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0048 0.9952 0.0000 0 0 0.5845 0.4155 0.0000 0 0 0.9094 0.0906 0.0000
chr12 40406131 C CGTCAGGATG 0.058262 0.100 1 9 2 154 73 81 39 0 6 0 28 0 0 74 1 6 0.5342 0.0000 0.0864 11.167 1.18 7.82 -6.64 5 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4867 0.4997 0.0136 1 1 0.4895 0.4964 0.0141 1 0 0.4927 0.4925 0.0148
chr12 40449704 CT C 0.008989 0.100 1 -1 1 133 69 64 40 0 0 0 29 0 0 64 0 0 0.5797 0.0000 0.0000 69.000 0.17 1.14 -0.96 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6772 0.3222 0.0007 1 0 0.6735 0.3258 0.0008 1 0 0.6683 0.3309 0.0008
chr12 40490898 C CACTATCAGCTGGAGTGACAGGGAAAAGTGG 0.517853 0.100 1 30 1 847 118 729 0 0 57 1 60 0 0 698 0 31 0.0000 0.0000 0.0425 1.053 4.52 0 0/1 0/0 . . OK 2 2 0.0000 0.0085 0.9915 2 2 0.0000 0.0094 0.9906 2 2 0.0000 0.0107 0.9893
chr12 52675438 CACCTCCGGAGCCGTAGCTGCT C 0.460720 0.100 1 -21 2 905 206 699 113 1 16 2 74 0 1 697 0 1 0.5485 0.0000 0.0029 11.750 0.60 13.70 -13.10 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9037 0.0959 0.0004 1 0 0.8968 0.1027 0.0005 1 0 0.8866 0.1126 0.0008
chr12 52795629 ACCAAAGCCACCAGCCCCT A 0.048305 0.100 1 -18 2 1085 283 802 206 1 69 0 7 0 0 802 0 0 0.7279 0.0000 0.0000 3.087 0.29 18.14 -17.86 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1158 0.8842 0.0000 0 0 0.9972 0.0028 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000
chr12 55129802 AT A 0.303312 0.100 1 -1 1 365 87 278 80 0 5 0 2 0 0 278 0 0 0.9195 0.0000 0.0000 16.400 0.23 1.50 -1.27 50 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6218 0.3782 0.0000 0 0 0.9372 0.0628 0.0000 0 0 0.9687 0.0313 0.0000
chr12 55320622 C CA 0.406066 0.100 1 1 2 357 103 254 97 0 0 0 6 0 0 254 0 0 0.9417 0.0000 0.0000 103.000 0.14 1.17 -1.02 65 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 1 0.2396 0.7604 0.0000 0 0 0.7754 0.2246 0.0000
chr12 56686880 CAT C 0.639374 0.100 1 -2 1 107 61 46 0 0 2 0 59 0 0 46 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 29.500 2.25 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0271 0.9729 2 2 0.0000 0.0288 0.9712 2 2 0.0000 0.0312 0.9688
chr12 70353913 TA T 0.224313 0.100 1 -1 1 248 87 161 12 15 36 14 10 0 0 158 3 0 0.1379 0.0000 0.0186 1.059 3.67 1.70 1.97 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3315 0.5615 0.1069 1 1 0.3352 0.5572 0.1077 1 1 0.3398 0.5517 0.1085
chr12 75423034 G GACA 0.385908 0.100 1 3 2 160 65 95 55 0 8 0 2 0 0 95 0 0 0.8462 0.0000 0.0000 7.125 0.18 3.00 -2.82 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.2356 0.7644 0.0000 0 0 0.7469 0.2531 0.0000 0 0 0.8641 0.1359 0.0000
chr12 76031157 TTGC T 0.989485 0.100 1 -3 1 937 253 684 0 0 28 2 223 0 0 681 0 3 0.0000 0.0000 0.0044 8.036 3.17 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr12 103947409 TGAA T 0.500000 0.100 1 -3 1 358 86 272 69 0 7 0 10 0 0 272 0 0 0.8023 0.0000 0.0000 11.286 0.45 3.10 -2.65 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.0444 0.9556 0.0000
chr12 108623874 GGAGTGGTCTGTGCCTCCGTGGGCACTGGTT G 0.500000 0.100 1 -30 1 1578 496 1082 386 4 73 1 32 1 11 1057 0 13 0.7782 0.0009 0.0231 5.767 0.81 20.25 -19.44 66 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000
chr12 111363022 TGCCACCCCC T 0.500000 0.100 1 -9 1 593 157 436 86 0 9 0 62 0 0 429 1 6 0.5478 0.0000 0.0161 18.500 0.26 8.52 -8.26 10 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5373 0.4428 0.0199 1 0 0.5344 0.4431 0.0225 1 0 0.5295 0.4441 0.0264
chr12 111598949 GGCT G 0.500000 0.100 1 -3 1 634 189 445 0 1 22 9 157 0 1 439 2 3 0.0000 0.0000 0.0135 7.500 3.51 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0014 0.9986 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr12 112931910 TA T 0.500000 0.100 1 -1 1 184 96 88 6 0 2 0 88 0 0 88 0 0 0.0625 0.0000 0.0000 94.000 0.33 2.35 -2.02 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.8830 0.1170 2 2 0.0000 0.4036 0.5964
chr12 118068522 TTCCTCC T 0.500000 0.100 1 -6 1 227 107 120 44 0 15 3 45 0 0 119 0 1 0.4112 0.0000 0.0083 7.077 0.14 6.02 -5.89 8 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1029 0.5754 0.3218 1 1 0.1078 0.5696 0.3226 1 1 0.1144 0.5624 0.3232
chr12 118068523 TCCTC T 0.500000 0.100 1 -4 2 227 104 123 49 4 3 2 46 0 0 120 0 3 0.4712 0.0000 0.0244 32.333 0.12 6.09 -5.96 9 0/0 0/1 . . OK 1 1 0.2186 0.6193 0.1621 1 1 0.2225 0.6105 0.1670 1 1 0.2273 0.5995 0.1732
chr12 121626865 GGCCCC G 0.500000 0.100 1 -5 5 378 116 262 0 0 10 1 105 0 1 253 0 8 0.0000 0.0000 0.0344 10.500 5.55 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0034 0.9966 2 2 0.0000 0.0038 0.9962 2 2 0.0000 0.0044 0.9956
chr12 121921491 G GGAGGAGGAGGAGAAA 0.500000 0.100 1 15 4 311 77 234 3 0 5 0 69 0 0 225 0 9 0.0390 0.0000 0.0385 14.400 0.00 11.88 -11.88 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9366 0.0634 2 2 0.0000 0.3315 0.6685 2 2 0.0000 0.1348 0.8652
chr12 124340175 C CGCCGCTGCT 0.500000 0.100 1 9 5 625 154 471 1 0 26 1 126 0 0 446 0 25 0.0065 0.0000 0.0531 4.923 0.00 8.27 -8.27 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0040 0.9960 2 2 0.0000 0.0015 0.9985 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr12 124402512 G GGCT 0.500000 0.100 1 3 3 251 98 153 24 3 24 2 45 0 1 143 0 9 0.2449 0.0000 0.0654 3.083 0.25 5.47 -5.22 10 0/0 0/1 . . OK 1 2 0.0031 0.1545 0.8424 1 2 0.0038 0.1647 0.8315 1 2 0.0050 0.1792 0.8158
chr12 124402512 G GGCTGCT 0.500000 0.100 1 6 3 251 98 153 27 0 28 0 43 0 1 144 0 8 0.2755 0.0000 0.0588 2.500 0.70 5.58 -4.88 9 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0073 0.2208 0.7719 1 2 0.0086 0.2311 0.7603 1 2 0.0107 0.2454 0.7439
chr12 124993835 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 196 76 120 8 1 10 0 57 0 0 116 1 3 0.1053 0.0000 0.0333 6.600 1.25 3.65 -2.40 6 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9985 0.0015 2 1 0.0000 0.9430 0.0570
chr12 131828553 G GGCTGCCGCT 0.500000 0.100 1 9 1 232 64 168 0 1 6 1 56 0 0 166 0 2 0.0000 0.0000 0.0119 9.500 8.79 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0633 0.9367 2 2 0.0000 0.0643 0.9357 2 2 0.0000 0.0666 0.9334
chr12 132143818 CGGCGCCTCCTCGCTGCTCCCTGCGCTGGGCTCCCCT C 0.500000 0.100 1 -36 5 519 161 358 111 2 41 0 7 0 0 358 0 0 0.6894 0.0000 0.0000 2.927 0.59 1.86 -1.27 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1409 0.8591 0.0000 0 0 0.7293 0.2707 0.0000
chr13 30461360 TTCA T 0.001253 0.100 1 -3 1 190 51 139 46 0 3 0 2 0 0 139 0 0 0.9020 0.0000 0.0000 16.000 0.61 3.50 -2.89 26 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9899 0.0101 0.0000 0 0 0.9989 0.0011 0.0000 0 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr13 71866526 T TGCCGCC 0.116857 0.100 1 6 1 656 132 524 4 1 36 0 91 0 0 516 2 6 0.0303 0.0000 0.0153 2.743 0.50 6.33 -5.83 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9192 0.0808 2 1 0.0000 0.6150 0.3850
chr13 72743602 G GGTGA 0.022257 0.100 1 4 1 159 79 80 70 0 6 0 3 0 0 80 0 0 0.8861 0.0000 0.0000 12.167 0.41 4.33 -3.92 24 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6643 0.3357 0.0000 0 0 0.9834 0.0166 0.0000 0 0 0.9948 0.0052 0.0000
chr13 78602188 G GGCC 0.815212 0.100 1 3 4 583 65 518 0 0 7 0 58 0 0 516 1 1 0.0000 0.0000 0.0039 8.286 4.31 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0105 0.9895 2 2 0.0000 0.0112 0.9888 2 2 0.0000 0.0122 0.9878
chr13 99970413 TGGC T 0.500000 0.100 1 -3 2 472 54 418 2 0 19 1 32 1 1 404 2 10 0.0370 0.0024 0.0335 1.842 0.50 5.34 -4.84 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9893 0.0107 2 1 0.0000 0.7515 0.2485 2 2 0.0000 0.4708 0.5292
chr13 107866367 CGCTGCTGCTGCT C 0.500000 0.100 1 -12 2 757 222 535 116 1 2 0 103 1 0 534 0 0 0.5225 0.0019 0.0019 109.500 0.40 9.68 -9.28 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4144 0.5636 0.0220 1 1 0.4192 0.5559 0.0249 1 1 0.4241 0.5466 0.0293
chr13 112068121 ATGGGCG A 0.500000 0.100 1 -6 2 649 161 488 138 1 13 0 9 3 1 484 0 0 0.8571 0.0061 0.0082 11.385 1.03 6.89 -5.86 10 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0808 0.9192 0.0000 0 0 0.7634 0.2366 0.0000
chr13 112068797 C CGGGCGT 0.500000 0.100 1 6 1 252 97 155 84 2 9 0 2 1 0 154 0 0 0.8660 0.0065 0.0065 9.778 0.50 7.00 -6.50 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4972 0.5028 0.0000 0 0 0.9016 0.0984 0.0000 0 0 0.9497 0.0503 0.0000
chr13 112547538 ATGGGAAAGTCGCGCG A 0.500000 0.100 1 -15 1 314 131 183 2 0 49 1 79 0 0 179 0 4 0.0153 0.0000 0.0219 1.673 0.00 10.03 -10.03 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.5418 0.4582 2 2 0.0000 0.1128 0.8872 2 2 0.0000 0.0579 0.9421
chr13 113325657 A ACACT 0.500000 0.100 1 4 1 425 97 328 52 0 2 1 42 0 0 324 0 4 0.5361 0.0000 0.0122 47.500 0.48 4.17 -3.69 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2986 0.5907 0.1106 1 1 0.3004 0.5839 0.1157 1 1 0.3022 0.5753 0.1224
chr13 113406670 C CAAG 0.500000 0.100 1 3 1 537 111 426 103 0 2 1 5 0 0 426 0 0 0.9279 0.0000 0.0000 54.500 0.53 3.20 -2.67 3 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 1 0.2518 0.7482 0.0000 0 0 0.7698 0.2302 0.0000
chr14 20002693 CT C 0.452728 0.100 1 -1 4 519 116 403 0 0 6 1 109 0 0 403 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 18.333 2.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0044 0.9956 2 2 0.0000 0.0050 0.9950 2 2 0.0000 0.0058 0.9942
chr14 20060289 TCATAGATTTGCTCACTGAC T 0.427196 0.100 1 -19 1 430 113 317 22 0 1 0 90 0 0 310 0 7 0.1947 0.0000 0.0221 112.000 0.27 18.81 -18.54 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9984 0.0016 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001
chr14 20198016 C CA 0.700403 0.100 1 1 1 426 97 329 55 0 6 1 35 0 0 327 0 2 0.5670 0.0000 0.0061 15.167 0.24 1.11 -0.88 17 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.4861 0.4748 0.0391 1 1 0.4765 0.4798 0.0437 1 1 0.4631 0.4865 0.0504
chr14 22902046 G GGGC 0.560337 0.100 1 3 1 475 112 363 48 0 7 0 57 0 0 362 0 1 0.4286 0.0000 0.0028 15.000 0.44 2.89 -2.46 12 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0486 0.5013 0.4501 1 1 0.0523 0.4991 0.4486 1 1 0.0575 0.4966 0.4459
chr14 23079574 A AGAACGT 0.278634 0.100 1 6 1 437 106 331 0 0 4 0 102 0 0 331 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 25.500 5.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0141 0.9859 2 2 0.0000 0.0156 0.9844 2 2 0.0000 0.0180 0.9820
chr14 23080669 TTCC T 0.061796 0.100 1 -3 1 601 193 408 102 0 13 2 76 0 0 408 0 0 0.5285 0.0000 0.0000 13.846 0.46 3.28 -2.82 56 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8070 0.1926 0.0005 1 0 0.8029 0.1965 0.0005 1 0 0.7969 0.2024 0.0007
chr14 23275591 ACAT A 0.375158 0.100 1 -3 1 298 43 255 39 0 2 0 2 0 0 255 0 0 0.9070 0.0000 0.0000 20.500 0.97 4.00 -3.03 27 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1265 0.8735 0.0000 0 0 0.5847 0.4153 0.0000 0 0 0.7561 0.2439 0.0000
chr14 24001481 T TA 0.049020 0.100 1 1 2 326 132 194 122 2 4 0 4 0 0 194 0 0 0.9242 0.0000 0.0000 32.000 0.16 1.25 -1.09 2 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.6014 0.3986 0.0000 0 0 0.9926 0.0074 0.0000 0 0 0.9984 0.0016 0.0000
chr14 24214060 CA C 0.080276 0.100 1 -1 1 263 77 186 44 0 1 0 32 0 0 185 0 1 0.5714 0.0000 0.0054 76.000 0.34 1.16 -0.82 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6471 0.3465 0.0064 1 0 0.6437 0.3493 0.0070 1 0 0.6389 0.3534 0.0077
chr14 24300643 A AGAGGAG 0.339983 0.100 1 6 1 389 112 277 43 0 25 1 43 0 0 274 0 3 0.3839 0.0000 0.0108 3.480 0.35 5.65 -5.30 1 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1745 0.6206 0.2048 1 1 0.1811 0.6130 0.2059 1 1 0.1898 0.6033 0.2069
chr14 53152762 T TGCCGCC 0.826994 0.100 1 6 1 684 116 568 0 0 22 1 93 0 0 549 1 18 0.0000 0.0000 0.0335 4.273 6.94 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0009 0.9991
chr14 67198163 TGAA T 0.018726 0.100 1 -3 2 158 59 99 34 0 4 0 21 0 0 96 0 3 0.5763 0.0000 0.0303 13.750 0.21 3.52 -3.32 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6643 0.3339 0.0017 1 0 0.6605 0.3376 0.0019 1 0 0.6551 0.3428 0.0021
chr14 69573086 CGCG C 0.132029 0.100 1 -3 2 643 165 478 0 4 39 118 4 0 0 472 6 0 0.0000 0.0000 0.0126 3.128 5.75 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0194 0.9806 2 2 0.0000 0.0207 0.9793 2 2 0.0000 0.0229 0.9771
chr14 69573086 CGCGGCG C 0.814084 0.100 1 -6 2 647 169 478 0 0 42 1 126 0 0 472 0 6 0.0000 0.0000 0.0126 3.024 7.16 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996
chr14 77027448 CTGT C 0.435919 0.100 1 -3 1 427 95 332 0 3 4 14 74 0 0 329 3 0 0.0000 0.0000 0.0090 27.000 4.57 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0532 0.9468 2 2 0.0000 0.0453 0.9547 2 2 0.0000 0.0406 0.9594
chr14 92688192 TGGC T 0.643421 0.100 1 -3 2 527 164 363 12 0 23 3 126 0 0 363 0 0 0.0732 0.0000 0.0000 6.130 0.08 3.17 -3.08 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9968 0.0032 2 1 0.0000 0.7009 0.2991
chr14 94115784 TGGCCATGGC T 0.375227 0.100 1 -9 1 219 76 143 8 1 2 1 64 0 1 139 0 3 0.1053 0.0000 0.0280 36.500 0.12 8.81 -8.69 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9609 0.0391
chr14 104588781 TGACGGGCAG T 0.435567 0.100 1 -9 1 235 63 172 0 0 9 0 54 0 0 168 0 4 0.0000 0.0000 0.0233 6.000 7.83 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0631 0.9369 2 2 0.0000 0.0668 0.9332 2 2 0.0000 0.0721 0.9279
chr14 104707525 ACCCCACCCCCAC A 0.157029 0.100 1 -12 2 502 84 418 62 4 12 1 5 0 0 418 0 0 0.7381 0.0000 0.0000 6.364 0.32 10.40 -10.08 60 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0017 0.9983 0.0000 0 1 0.3473 0.6527 0.0000 0 0 0.8062 0.1938 0.0000
chr14 105529712 TGCC T 0.270735 0.100 1 -3 2 432 134 298 6 0 10 0 118 0 0 294 0 4 0.0448 0.0000 0.0134 12.400 1.00 3.80 -2.80 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.7833 0.2167 2 2 0.0000 0.2538 0.7462
chr15 20534699 CCTCCTG C 0.091103 0.100 1 -6 1 630 110 520 6 0 12 0 92 7 15 463 22 13 0.0545 0.0135 0.1096 8.167 2.33 5.98 -3.64 2 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr15 22866845 TAAGA T 0.262722 0.100 1 -4 5 241 39 202 34 0 3 0 2 0 0 202 0 0 0.8718 0.0000 0.0000 12.000 0.97 4.00 -3.03 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1570 0.8430 0.0000 0 0 0.6458 0.3542 0.0000 0 0 0.8019 0.1981 0.0000
chr15 23439857 G GCAT 0.979303 0.100 1 3 1 240 54 186 0 0 3 1 50 0 3 166 16 1 0.0000 0.0000 0.1075 17.000 3.76 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0090 0.9910 2 2 0.0000 0.0039 0.9961 2 2 0.0000 0.0024 0.9976
chr15 30373077 TCA T 0.374666 0.100 1 -2 2 304 98 206 0 1 2 0 95 0 0 205 0 1 0.0000 0.0000 0.0049 48.000 1.85 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0227 0.9773 2 2 0.0000 0.0219 0.9781 2 2 0.0000 0.0223 0.9777
chr15 31229302 CG C 0.310739 0.100 1 -1 2 207 95 112 0 0 1 87 7 0 0 111 1 0 0.0000 0.0000 0.0089 9.000 1.43 0 0/0 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0277 0.9723 2 2 0.0000 0.0304 0.9696 2 2 0.0000 0.0345 0.9655
chr15 31229302 CGG C 0.653809 0.100 1 -2 2 207 95 112 0 0 8 2 85 0 0 111 0 1 0.0000 0.0000 0.0089 10.875 2.07 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0062 0.9938 2 2 0.0000 0.0068 0.9932 2 2 0.0000 0.0076 0.9924
chr15 31484007 TGGC T 0.683637 0.100 1 -3 1 672 135 537 0 0 32 5 98 0 0 530 0 7 0.0000 0.0000 0.0130 3.323 4.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0018 0.9982 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr15 40407805 GTT G 0.332169 0.100 1 -2 1 465 157 308 67 0 3 0 87 0 0 307 0 1 0.4268 0.0000 0.0032 51.333 1.46 2.18 -0.72 11 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0171 0.4378 0.5451 1 2 0.0198 0.4421 0.5381 1 2 0.0240 0.4484 0.5276
chr15 40807701 T TGGGGC 0.358646 0.100 1 5 1 476 153 323 127 0 14 0 12 0 0 323 0 0 0.8301 0.0000 0.0000 9.929 0.17 4.25 -4.08 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0029 0.9971 0.0000 0 1 0.2794 0.7206 0.0000
chr15 65964929 CA C 0.000030 0.100 1 -1 1 353 138 215 132 1 0 0 5 0 0 215 0 0 0.9565 0.0000 0.0000 138.000 0.63 1.80 -1.17 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9978 0.0022 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr15 70984141 GCAA G 0.472078 0.100 1 -3 2 170 95 75 8 0 0 0 87 0 0 73 0 2 0.0842 0.0000 0.0267 95.000 0.12 3.01 -2.89 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9850 0.0150 2 1 0.0000 0.7166 0.2834
chr15 72737574 TAA T 0.000073 0.100 1 -2 3 763 144 619 83 0 5 0 56 0 1 616 0 2 0.5764 0.0000 0.0048 27.800 0.23 2.09 -1.86 61 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8650 0.1350 0.0000 1 0 0.8595 0.1405 0.0000 1 0 0.8517 0.1483 0.0000
chr15 74244059 TAAG T 0.589043 0.100 1 -3 1 263 151 112 140 1 6 0 4 0 0 112 0 0 0.9272 0.0000 0.0000 24.167 0.23 3.00 -2.77 20 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1127 0.8873 0.0000 0 0 0.9186 0.0814 0.0000 0 0 0.9804 0.0196 0.0000
chr15 75208267 ATCCAGC A 0.000063 0.100 1 -6 3 685 146 539 61 0 35 0 50 0 0 535 0 4 0.4178 0.0000 0.0074 3.171 0.48 5.98 -5.50 17 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5324 0.4676 0.0000 1 0 0.5364 0.4636 0.0000 1 0 0.5409 0.4591 0.0000
chr15 78620725 ACAG A 0.589191 0.100 1 -3 1 435 110 325 47 1 6 2 54 0 0 324 0 1 0.4273 0.0000 0.0031 17.333 0.32 3.72 -3.40 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0510 0.5093 0.4397 1 1 0.0546 0.5063 0.4390 1 1 0.0596 0.5029 0.4375
chr15 84643645 ACTTGGCTCCGTGTTCCAT A 0.188520 0.100 1 -18 1 413 98 315 41 0 22 0 35 0 0 312 0 3 0.4184 0.0000 0.0095 3.455 0.46 12.69 -12.22 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4038 0.5445 0.0517 1 1 0.4072 0.5394 0.0534 1 1 0.4113 0.5331 0.0556
chr15 89776889 GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC G 0.425786 0.100 1 -24 2 772 171 601 0 1 27 0 143 0 0 582 0 19 0.0000 0.0000 0.0316 5.296 15.57 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr15 92655448 TTGGAGC T 0.998005 0.100 1 -6 1 403 134 269 0 0 4 0 130 0 0 258 0 11 0.0000 0.0000 0.0409 32.500 7.01 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr15 98968575 A AC 0.519727 0.100 1 1 1 320 127 193 116 1 5 0 5 0 0 193 0 0 0.9134 0.0000 0.0000 24.200 0.16 2.00 -1.84 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0055 0.9945 0.0000 0 0 0.6078 0.3922 0.0000 0 0 0.9154 0.0846 0.0000
chr15 99712504 CCAG C 0.144765 0.100 1 -3 2 580 230 350 104 0 38 12 76 0 0 347 0 3 0.4522 0.0000 0.0086 5.053 0.22 3.28 -3.06 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5357 0.4572 0.0071 1 0 0.5410 0.4511 0.0080 1 0 0.5468 0.4441 0.0091
chr15 99712504 CCAGCAG C 0.319707 0.100 1 -6 2 580 236 344 110 0 110 1 15 0 0 344 0 0 0.4661 0.0000 0.0000 1.178 0.21 5.40 -5.19 16 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0200 0.9800 0.0000
chr15 101746837 T TC 0.190418 0.100 1 1 2 23 15 8 9 0 0 0 6 0 0 7 0 1 0.6000 0.0000 0.1250 15.000 0.11 1.00 -0.89 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4436 0.4862 0.0702 1 1 0.4427 0.4861 0.0711 1 1 0.4413 0.4864 0.0723
chr16 805517 GGCAGCT G 0.053997 0.100 1 -6 4 374 110 264 105 0 2 0 3 0 0 264 0 0 0.9545 0.0000 0.0000 54.000 0.41 5.67 -5.26 63 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8259 0.1741 0.0000 0 0 0.9927 0.0073 0.0000 0 0 0.9976 0.0024 0.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 348 80 268 0 0 2 1 77 0 0 268 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 39.000 6.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 2009735 CG C 0.999815 0.100 1 -1 6 348 80 268 0 0 2 1 77 0 0 268 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 39.000 6.70 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr16 10430799 GGAC G 0.612863 0.100 1 -3 1 463 114 349 53 1 4 0 56 0 0 347 0 2 0.4649 0.0000 0.0057 27.500 0.19 2.96 -2.78 17 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0892 0.5959 0.3149 1 1 0.0932 0.5879 0.3189 1 1 0.0985 0.5779 0.3236
chr16 11927441 GTTCCACCTCAGCGGCCCTCCGCCTCTTGGGTTCGGGTGGTGA G 0.078615 0.100 1 -42 2 438 155 283 54 1 50 2 48 0 0 273 0 10 0.3484 0.0000 0.0353 2.080 1.33 4.79 -3.46 28 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2334 0.7151 0.0515 1 1 0.2442 0.7038 0.0520 1 1 0.2584 0.6892 0.0524
chr16 11933617 CAT C 0.996541 0.100 1 -2 1 144 54 90 0 0 1 0 53 0 0 90 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 53.000 2.19 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr16 15873504 T TCTA 0.057892 0.100 1 3 2 140 67 73 30 0 3 0 34 0 0 73 0 0 0.4478 0.0000 0.0000 21.333 0.00 2.88 -2.88 0 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3034 0.6554 0.0412 1 1 0.3117 0.6473 0.0410 1 1 0.3224 0.6369 0.0408
chr16 21984339 T TGAGGTAGAG 0.000117 0.100 1 9 1 398 155 243 115 1 33 0 6 0 0 243 0 0 0.7419 0.0000 0.0000 3.697 0.15 8.17 -8.02 71 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8368 0.1632 0.0000 0 0 0.9998 0.0002 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr16 22008325 AG A 0.081606 0.100 1 -1 1 306 184 122 97 0 0 0 87 0 0 122 0 0 0.5272 0.0000 0.0000 184.000 0.34 1.17 -0.83 51 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.4979 0.4961 0.0061 1 0 0.5050 0.4883 0.0067 1 0 0.5134 0.4791 0.0075
chr16 28320769 TTGCCCGTGCCGGTGCCGGTGCCAG T 0.000421 0.100 1 -24 3 503 119 384 71 1 11 0 36 1 0 375 0 8 0.5966 0.0026 0.0234 9.818 0.41 19.33 -18.92 21 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9088 0.0912 0.0000 1 0 0.9031 0.0969 0.0000 1 0 0.8947 0.1053 0.0000
chr16 31759375 G GA 0.500000 0.100 1 1 1 155 91 64 53 0 2 2 34 0 0 63 0 1 0.5824 0.0000 0.0156 44.500 0.36 1.91 -1.55 23 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5957 0.3793 0.0250 1 0 0.5875 0.3846 0.0279 1 0 0.5760 0.3920 0.0321
chr16 57813722 ATG A 0.500000 0.100 1 -2 1 339 150 189 82 62 0 0 6 0 0 189 0 0 0.5467 0.0000 0.0000 89.000 0.22 9.83 -9.61 40 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0014 0.9986 0.0000 0 0 0.5650 0.4350 0.0000 0 0 0.9308 0.0692 0.0000
chr16 57813725 CAGGTGG C 0.500000 0.100 1 -6 1 339 155 184 149 0 0 0 6 0 0 183 1 0 0.9613 0.0000 0.0054 155.000 0.59 9.83 -9.24 69 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0006 0.9994 0.0000 0 0 0.5271 0.4729 0.0000 0 0 0.9418 0.0582 0.0000
chr16 58543411 GA G 0.500000 0.100 1 -1 1 419 75 344 31 6 6 6 26 0 0 344 0 0 0.4133 0.0000 0.0000 12.600 0.94 2.08 -1.14 3 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3266 0.5511 0.1223 1 1 0.3260 0.5472 0.1268 1 1 0.3249 0.5423 0.1328
chr16 66579699 GTAAGGAGCCATCGGACAAACCTCAAAAGGCGGTGCAGGACCA G 0.500000 0.100 1 -42 2 523 166 357 128 1 34 0 3 0 0 355 0 2 0.7711 0.0000 0.0056 3.882 0.36 0.67 -0.31 76 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0106 0.9894 0.0000 0 0 0.7538 0.2462 0.0000 0 0 0.9548 0.0452 0.0000
chr16 71922608 AATGCCC A 0.500000 0.100 1 -6 2 299 145 154 71 0 20 1 53 0 0 154 0 0 0.4897 0.0000 0.0000 6.250 4.70 7.02 -2.31 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5863 0.3942 0.0195 1 0 0.5802 0.3978 0.0220 1 0 0.5712 0.4030 0.0258
chr16 72787694 A AGCCGCC 0.500000 0.100 1 6 1 601 105 496 82 1 20 0 2 0 0 494 0 2 0.7810 0.0000 0.0040 4.250 2.68 8.50 -5.82 38 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0094 0.9906 0.0000 0 1 0.4717 0.5283 0.0000 0 0 0.8116 0.1884 0.0000
chr16 72787719 ACCG A 0.500000 0.100 1 -3 2 612 119 493 46 1 16 1 55 0 0 493 0 0 0.3866 0.0000 0.0000 6.867 1.28 3.95 -2.66 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0691 0.5430 0.3879 1 1 0.0737 0.5391 0.3871 1 1 0.0801 0.5345 0.3854
chr16 81127868 G GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC 0.500000 0.100 1 22 2 346 90 256 40 0 12 0 38 0 0 243 0 13 0.4444 0.0000 0.0508 6.500 0.10 14.45 -14.35 22 0/1 1/1 . . OK 1 1 0.0520 0.4849 0.4631 1 1 0.0561 0.4848 0.4590 1 1 0.0619 0.4850 0.4531
chr16 81208543 GTT G 0.500000 0.100 1 -2 2 228 120 108 0 0 3 0 117 0 0 104 0 4 0.0000 0.0000 0.0370 39.000 4.54 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977 2 2 0.0000 0.0027 0.9973
chr16 87604287 C CCTG 0.500000 0.100 1 3 1 435 116 319 45 6 30 1 34 0 0 316 0 3 0.3879 0.0000 0.0094 2.867 0.00 3.00 -3.00 9 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5195 0.4413 0.0392 1 0 0.5135 0.4437 0.0428 1 0 0.5050 0.4470 0.0480
chr16 88533287 GGA G 0.500000 0.100 1 -2 1 637 140 497 0 0 8 11 121 0 0 491 1 5 0.0000 0.0000 0.0121 16.250 7.92 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0009 0.9991 2 2 0.0000 0.0010 0.9990 2 2 0.0000 0.0012 0.9988
chr16 88533292 CT C 0.500000 0.100 1 -1 2 633 128 505 0 0 10 12 106 0 1 494 5 5 0.0000 0.0000 0.0218 13.111 8.13 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0020 0.9980 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr16 88533294 CTGG C 0.500000 0.100 1 -3 1 632 123 509 0 0 3 2 118 0 1 498 5 5 0.0000 0.0000 0.0216 120.000 8.39 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0083 0.9917 2 2 0.0000 0.0041 0.9959 2 2 0.0000 0.0034 0.9966
chr16 88534246 CCCCCGCGCCCGAGTCGCCGCGGCCCGGAAGCGGAAGCGGAAGCGGCCCCGGCCTCGCCCCTGCGCGCTCGCCCGG C 0.500000 0.100 1 -75 1 622 223 399 207 1 12 0 3 1 0 398 0 0 0.9283 0.0025 0.0025 17.583 1.19 3.00 -1.81 19 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9817 0.0183 0.0000 0 0 0.9993 0.0007 0.0000 0 0 0.9997 0.0003 0.0000
chr16 88714226 AGGTGTG A 0.500000 0.100 1 -6 1 684 144 540 0 1 8 0 135 0 0 537 0 3 0.0000 0.0000 0.0056 17.000 6.86 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0067 0.9933 2 2 0.0000 0.0028 0.9972 2 2 0.0000 0.0023 0.9977
chr16 88721199 CCTT C 0.500000 0.100 1 -3 1 458 121 337 78 0 2 0 41 0 0 337 0 0 0.6446 0.0000 0.0000 59.500 0.85 5.59 -4.74 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9159 0.0835 0.0006 1 0 0.9079 0.0913 0.0008 1 0 0.8961 0.1028 0.0011
chr16 89224802 G GGTGA 0.500000 0.100 1 4 2 182 82 100 0 0 1 1 80 0 0 97 0 3 0.0000 0.0000 0.0300 81.000 4.09 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0136 0.9864 2 2 0.0000 0.0148 0.9852 2 2 0.0000 0.0167 0.9833
chr16 89850471 C CGAG 0.500000 0.100 1 3 3 511 138 373 74 3 12 2 47 0 0 368 0 5 0.5362 0.0000 0.0134 10.417 0.20 3.06 -2.86 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7229 0.2700 0.0070 1 0 0.7138 0.2779 0.0083 1 0 0.7008 0.2888 0.0103
chr17 3690982 TG T 0.682464 0.100 1 -1 2 338 135 203 55 1 4 0 75 0 0 203 0 0 0.4074 0.0000 0.0000 32.750 0.29 1.19 -0.90 5 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0075 0.2953 0.6972 1 2 0.0086 0.3000 0.6913 1 2 0.0103 0.3068 0.6829
chr17 7024700 C CCAG 0.654808 0.100 1 3 1 704 186 518 22 1 30 1 132 0 0 511 0 7 0.1183 0.0000 0.0135 5.200 0.18 3.05 -2.87 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9993 0.0007
chr17 7846859 TACC T 0.005966 0.100 1 -3 2 1247 401 846 160 12 95 8 126 0 0 842 2 2 0.3990 0.0000 0.0047 3.200 5.61 4.17 1.44 32 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8580 0.1420 0.0000 1 0 0.8563 0.1437 0.0000 1 0 0.8532 0.1468 0.0000
chr17 7848540 TCACCAC T 0.097683 0.100 1 -6 1 967 308 659 142 0 49 1 116 0 0 643 3 13 0.4610 0.0000 0.0243 5.396 0.99 6.52 -5.52 4 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4011 0.5936 0.0053 1 1 0.4155 0.5785 0.0059 1 1 0.4332 0.5600 0.0069
chr17 16353372 G GCGGAGGCCC 0.500000 0.100 1 9 2 424 121 303 1 0 3 1 116 0 0 303 0 0 0.0083 0.0000 0.0000 39.333 0.00 7.13 -7.13 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0230 0.9770 2 2 0.0000 0.0083 0.9917 2 2 0.0000 0.0065 0.9935
chr17 17136247 CCAG C 0.500000 0.100 1 -3 1 452 185 267 0 0 21 9 155 0 0 265 0 2 0.0000 0.0000 0.0075 7.810 3.11 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0003 0.9997
chr17 17793784 AGC A 0.500000 0.100 1 -2 1 882 253 629 1 1 41 5 205 0 0 628 1 0 0.0040 0.0000 0.0016 5.526 1.00 4.29 -3.29 1 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr17 17793787 AG A 0.500000 0.100 1 -1 1 885 248 637 1 31 11 20 185 0 0 637 0 0 0.0040 0.0000 0.0000 58.500 1.00 4.02 -3.02 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9821 0.0179 2 1 0.0000 0.7492 0.2508 2 2 0.0000 0.2664 0.7336
chr17 18971372 C CGGT 0.500000 0.100 1 3 1 750 154 596 10 0 6 0 138 0 0 590 0 6 0.0649 0.0000 0.0101 24.667 0.20 3.99 -3.79 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9693 0.0307 2 2 0.0000 0.3611 0.6389
chr17 40701882 CA C 0.500000 0.100 1 -1 2 165 115 50 2 0 1 0 112 0 0 49 0 1 0.0174 0.0000 0.0200 114.000 0.00 1.26 -1.26 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.2103 0.7897 2 2 0.0000 0.0289 0.9711 2 2 0.0000 0.0148 0.9852
chr17 40818999 GCCGCCGCCGGAGCTT G 0.500000 0.100 1 -15 1 839 201 638 80 0 60 1 60 1 1 624 3 9 0.3980 0.0016 0.0219 2.350 7.22 15.10 -7.88 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3587 0.5881 0.0532 1 1 0.3615 0.5808 0.0577 1 1 0.3642 0.5717 0.0641
chr17 40819055 TGCCGCCGTGGCC T 0.500000 0.100 1 -12 1 837 189 648 94 6 18 4 67 1 2 634 3 8 0.4974 0.0015 0.0216 11.200 8.13 11.66 -3.53 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6109 0.3793 0.0098 1 0 0.6071 0.3815 0.0115 1 0 0.6008 0.3852 0.0140
chr17 41041248 GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCACAGCAGCGTGGCTGGCAGGAGCTGGTCTCACAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGAGCCGCAGGTCCCACTGGTGGAGCAGCTGGGAAATCCACAGAAGCTGGTCTGA G 0.500000 0.100 1 -138 2 749 286 463 231 1 16 0 38 0 0 463 0 0 0.8077 0.0000 0.0000 16.875 1.02 2.97 -1.96 51 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr17 41098083 A AT 0.500000 0.100 1 1 2 314 95 219 0 0 8 0 87 0 0 219 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 10.875 1.64 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0116 0.9884 2 2 0.0000 0.0127 0.9873 2 2 0.0000 0.0144 0.9856
chr17 41105490 CTGCAGGACCACCTGCTGCCGCCCCAGCTGTTGTGTATCCAGCTGCTGCAGGCCCCAGTGCTGCCAGTCTGTGTGCTGCCAACCCACTTGTTCCCGCCCCAGCTGCTGTCAGACCACCTGT C 0.500000 0.100 1 -120 1 590 251 339 166 4 14 2 65 0 0 339 0 0 0.6614 0.0000 0.0000 16.929 1.58 3.12 -1.54 48 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9998 0.0002 0.0000 1 0 0.9997 0.0003 0.0000 1 0 0.9995 0.0005 0.0000
chr17 41105856 CTCCAGCTGCTGCCGCCCCTCTTGCTGTGAA C 0.500000 0.100 1 -30 1 566 201 365 118 0 31 0 52 0 0 355 0 10 0.5871 0.0000 0.0274 5.484 0.79 21.94 -21.15 38 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9816 0.0184 0.0000 1 0 0.9787 0.0213 0.0000 1 0 0.9741 0.0259 0.0000
chr17 41149523 T TGGCAGCAGCTGGGGC 0.500000 0.100 1 15 1 469 98 371 0 0 10 1 87 1 1 359 1 9 0.0000 0.0027 0.0323 8.700 7.24 0 0/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1054 0.8946 2 2 0.0000 0.0344 0.9656 2 2 0.0000 0.0233 0.9767
chr17 41238458 AGACCACCTGCTGCAG A 0.500000 0.100 1 -15 1 437 113 324 78 0 15 2 18 1 0 320 0 3 0.6903 0.0031 0.0123 6.533 3.82 15.50 -11.68 46 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9826 0.0174 0.0000 1 0 0.5962 0.4038 0.0000 0 1 0.0166 0.9834 0.0000
chr17 44903871 G GAGT 0.500000 0.100 1 3 5 1369 270 1099 135 0 2 0 133 0 0 1097 0 2 0.5000 0.0000 0.0018 134.000 0.41 3.28 -2.87 25 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1051 0.7899 0.1051 1 1 0.1136 0.7727 0.1136 1 1 0.1251 0.7499 0.1251
chr17 45242067 TCCG T 0.500000 0.100 1 -3 2 665 189 476 84 3 24 1 77 2 2 471 0 1 0.4444 0.0042 0.0105 6.875 0.68 3.42 -2.74 14 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3957 0.5660 0.0383 1 1 0.3982 0.5595 0.0422 1 1 0.4005 0.5517 0.0478
chr17 47361520 CAGTG C 0.500000 0.100 1 -4 1 202 71 131 59 0 5 0 7 0 0 130 0 1 0.8310 0.0000 0.0076 13.200 0.15 4.43 -4.28 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0038 0.9962 0.0000 0 1 0.0935 0.9065 0.0000
chr17 58756096 G GGAACCC 0.500000 0.100 1 6 2 471 179 292 75 1 42 0 61 0 0 292 0 0 0.4190 0.0000 0.0000 3.262 0.31 5.38 -5.07 29 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5159 0.4576 0.0265 1 0 0.5127 0.4578 0.0295 1 0 0.5076 0.4585 0.0340
chr17 67959642 T TCCTCCAGCC 0.500000 0.100 1 9 1 422 167 255 136 0 20 0 11 0 0 255 0 0 0.8144 0.0000 0.0000 7.350 0.41 7.00 -6.59 42 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0073 0.9927 0.0000 0 1 0.3868 0.6132 0.0000
chr17 74842991 A AGCTCCGGGG 0.500000 0.100 1 9 2 545 110 435 4 0 10 0 96 0 0 424 0 11 0.0364 0.0000 0.0253 10.000 0.25 8.21 -7.96 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9688 0.0312 2 2 0.0000 0.2525 0.7475 2 2 0.0000 0.0675 0.9325
chr17 75616380 C CAGG 0.500000 0.100 1 3 1 826 213 613 76 8 81 2 46 0 0 611 0 2 0.3568 0.0000 0.0033 1.617 0.82 3.76 -2.95 36 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8871 0.1120 0.0010 1 0 0.8783 0.1204 0.0012 1 0 0.8656 0.1327 0.0017
chr17 76292311 CACCAGGTTGCACCAAACCACGCTGAACTAT C 0.500000 0.100 1 -30 1 2148 493 1655 250 11 70 5 157 1 4 1639 3 8 0.5071 0.0006 0.0097 5.971 1.06 7.03 -5.97 28 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9984 0.0016 0.0000 1 0 0.9980 0.0020 0.0000 1 0 0.9974 0.0026 0.0000
chr17 76292483 CTGA C 0.500000 0.100 1 -3 1 2132 547 1585 250 9 27 6 255 1 3 1444 22 115 0.4570 0.0006 0.0890 19.148 1.26 4.65 -3.39 20 0/1 1/1 . . OK 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0001 0.9999 1 2 0.0000 0.0002 0.9998
chr17 78802466 TTTTTTC T 0.500000 0.100 1 -6 7 276 114 162 3 0 15 0 96 0 0 161 0 1 0.0263 0.0000 0.0062 6.600 0.00 5.66 -5.66 1 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.8486 0.1514 2 2 0.0000 0.1610 0.8390 2 2 0.0000 0.0583 0.9417
chr17 81245700 AATG A 0.500000 0.100 1 -3 2 579 158 421 141 0 3 0 14 0 0 421 0 0 0.8924 0.0000 0.0000 51.667 0.25 3.00 -2.75 53 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0004 0.9996 0.0000 0 1 0.1049 0.8951 0.0000
chr18 21520797 A ATCT 0.999706 0.100 1 3 1 150 79 71 1 0 3 0 75 0 1 69 0 1 0.0127 0.0000 0.0282 25.333 0.00 3.07 -3.07 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0000 1.0000 2 2 0.0000 0.0000 1.0000
chr18 23136050 GGGCGCCGGC G 0.218600 0.100 1 -9 2 397 77 320 65 3 5 0 4 0 0 320 0 0 0.8442 0.0000 0.0000 14.200 1.12 9.00 -7.88 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0154 0.9846 0.0000 0 0 0.5999 0.4001 0.0000 0 0 0.8808 0.1192 0.0000
chr18 31069031 GTCC G 0.000429 0.100 1 -3 1 309 144 165 127 0 8 0 9 0 0 164 0 1 0.8819 0.0000 0.0061 17.000 0.17 3.33 -3.16 9 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0003 0.9997 0.0000 0 0 0.9692 0.0308 0.0000 0 0 0.9994 0.0006 0.0000
chr18 44876705 C CTCTT 0.547041 0.100 1 4 1 233 118 115 66 0 4 0 48 0 0 115 0 0 0.5593 0.0000 0.0000 28.500 0.23 4.79 -4.56 24 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5943 0.3854 0.0202 1 0 0.5865 0.3906 0.0229 1 0 0.5752 0.3978 0.0270
chr18 46253735 TCTG T 0.500000 0.100 1 -3 1 139 79 60 46 0 0 0 33 0 0 59 0 1 0.5823 0.0000 0.0167 79.000 0.13 3.18 -3.05 2 0/1 0/1 . . OK 1 0 0.5015 0.4520 0.0465 1 0 0.4956 0.4540 0.0503 1 0 0.4873 0.4569 0.0559
chr18 49879055 T TGAG 0.500000 0.100 1 3 1 233 126 107 13 0 3 0 110 0 0 104 0 3 0.1032 0.0000 0.0280 41.000 0.00 3.83 -3.83 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9997 0.0003 2 1 0.0000 0.9464 0.0536
chr18 51196775 CGCCGCCGCG C 0.500000 0.100 1 -9 2 450 138 312 119 1 6 1 11 0 0 312 0 0 0.8623 0.0000 0.0000 22.000 1.29 11.55 -10.26 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0012 0.9988 0.0000 0 1 0.1347 0.8653 0.0000
chr18 54269587 GCGA G 0.500000 0.100 1 -3 2 245 143 102 73 0 5 0 65 0 0 102 0 0 0.5105 0.0000 0.0000 27.600 0.18 3.31 -3.13 21 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3350 0.5965 0.0686 1 1 0.3376 0.5889 0.0735 1 1 0.3403 0.5794 0.0803
chr18 58537155 ACAGTTGATGTGTCCT A 0.500000 0.100 1 -15 2 660 163 497 91 0 8 1 63 0 0 493 0 4 0.5583 0.0000 0.0080 19.375 0.22 13.79 -13.57 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6867 0.3061 0.0072 1 0 0.6796 0.3119 0.0085 1 0 0.6692 0.3203 0.0105
chr18 62523553 C CCCG 0.500000 0.100 1 3 6 379 81 298 7 1 19 3 51 0 1 295 0 2 0.0864 0.0000 0.0101 3.333 1.29 5.33 -4.05 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9940 0.0060 2 1 0.0000 0.8977 0.1023
chr18 70196614 T TCTC 0.500000 0.100 1 3 1 189 85 104 0 0 6 0 79 0 0 104 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 13.167 3.08 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0175 0.9825 2 2 0.0000 0.0190 0.9810 2 2 0.0000 0.0212 0.9788
chr18 74556356 G GTGC 0.500000 0.100 1 3 1 147 89 58 3 0 4 2 80 0 0 54 0 4 0.0337 0.0000 0.0690 21.250 0.00 3.11 -3.11 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9071 0.0929 2 2 0.0000 0.2488 0.7512 2 2 0.0000 0.0952 0.9048
chr18 76496529 C CG 0.500000 0.100 1 1 1 298 75 223 35 0 4 1 35 0 0 221 2 0 0.4667 0.0000 0.0090 17.750 0.26 2.26 -2.00 25 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1640 0.5824 0.2536 1 1 0.1681 0.5763 0.2556 1 1 0.1735 0.5685 0.2580
chr18 79863691 G GGGC 0.500000 0.100 1 3 4 415 155 260 73 2 17 0 63 0 0 259 0 1 0.4710 0.0000 0.0038 8.118 0.38 3.41 -3.03 27 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4093 0.5444 0.0463 1 1 0.4097 0.5398 0.0504 1 1 0.4094 0.5343 0.0563
chr18 79864067 CGCGCGGGGCCGA C 0.500000 0.100 1 -12 3 396 69 327 42 1 0 0 26 1 0 322 1 3 0.6087 0.0031 0.0153 69.000 0.60 10.15 -9.56 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5632 0.4021 0.0348 1 0 0.5550 0.4068 0.0382 1 0 0.5437 0.4133 0.0431
chr19 501701 G GACACCACCTCCCCGGAGCCTCCCA 0.223947 0.100 1 24 3 424 179 245 21 4 11 5 138 0 1 241 1 2 0.1173 0.0000 0.0163 18.444 2.57 4.78 -2.20 5 0/1 1/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr19 1535194 GCCC G 0.232630 0.100 1 -3 1 162 66 96 4 0 0 1 61 0 0 95 0 1 0.0606 0.0000 0.0104 65.000 0.00 4.62 -4.62 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9990 0.0010 2 1 0.0000 0.9098 0.0902 2 1 0.0000 0.6703 0.3297
chr19 1825928 TCTC T 0.223001 0.100 1 -3 2 267 173 94 96 0 1 0 76 0 1 93 0 0 0.5549 0.0000 0.0106 172.000 0.24 2.99 -2.75 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7239 0.2729 0.0033 1 0 0.7203 0.2759 0.0038 1 0 0.7146 0.2807 0.0047
chr19 2015541 GGGC G 0.470011 0.100 1 -3 4 430 131 299 4 0 22 100 5 0 0 293 6 0 0.0305 0.0000 0.0201 4.955 5.25 5.00 0.25 2 0/0 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9657 0.0343 2 2 0.0000 0.2364 0.7636 2 2 0.0000 0.0627 0.9373
chr19 2015541 GGGCGGC G 0.145769 0.100 1 -6 4 430 134 296 5 0 26 0 103 0 0 287 3 6 0.0373 0.0000 0.0304 4.320 4.20 9.54 -5.34 1 0/1 0/0 . . OK 2 1 0.0000 0.9992 0.0008 2 1 0.0000 0.8110 0.1890 2 2 0.0000 0.3786 0.6214
chr19 2015541 GGGCGGCGGCGGC G 0.199114 0.100 1 -12 4 430 143 287 22 0 73 2 46 0 0 277 0 10 0.1538 0.0000 0.0348 0.971 2.86 12.67 -9.81 10 0/1 0/0 . . OK 1 2 0.0046 0.2215 0.7739 1 2 0.0058 0.2383 0.7559 1 2 0.0078 0.2621 0.7301
chr19 8334065 CTCGCTGTCGCCA C 0.292264 0.100 1 -12 2 493 152 341 138 0 7 0 7 0 0 340 0 1 0.9079 0.0000 0.0029 20.714 0.79 9.14 -8.35 28 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.3232 0.6768 0.0000 0 0 0.9203 0.0797 0.0000
chr19 9126022 G GATGGT 0.319679 0.100 1 5 3 289 82 207 0 0 4 0 78 0 0 202 0 5 0.0000 0.0000 0.0242 19.500 5.21 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0302 0.9698 2 2 0.0000 0.0328 0.9672 2 2 0.0000 0.0367 0.9633
chr19 11447525 AGAG A 0.336648 0.100 1 -3 1 761 261 500 98 0 34 16 113 0 0 497 0 3 0.3755 0.0000 0.0060 6.676 0.44 3.25 -2.81 36 0/1 0/1 . . OK 1 2 0.0018 0.2418 0.7564 1 2 0.0023 0.2499 0.7478 1 2 0.0032 0.2618 0.7350
chr19 13207858 C CCTG 0.039345 0.100 1 3 1 407 127 280 44 61 18 0 4 0 2 278 0 0 0.3465 0.0000 0.0071 6.056 0.68 3.75 -3.07 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.4429 0.5571 0.0000 0 0 0.9864 0.0136 0.0000 0 0 0.9971 0.0029 0.0000
chr19 13207858 CCTG C 0.175850 0.100 1 -3 1 407 128 279 48 1 17 8 54 0 0 276 2 1 0.3750 0.0000 0.0108 6.529 0.83 3.22 -2.39 34 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0627 0.6330 0.3043 1 1 0.0694 0.6322 0.2984 1 1 0.0790 0.6310 0.2900
chr19 13207858 CCTGCTGCTGCTGCTGCTG C 0.085228 0.100 1 -18 1 407 138 269 125 0 9 0 4 0 0 266 0 3 0.9058 0.0000 0.0112 14.333 2.02 13.50 -11.48 93 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0011 0.9989 0.0000 0 0 0.7627 0.2373 0.0000 0 0 0.9811 0.0189 0.0000
chr19 14942171 T TATC 0.985769 0.100 1 3 1 541 100 441 0 1 1 1 97 0 0 440 0 1 0.0000 0.0000 0.0023 98.000 3.03 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr19 20624371 G GA 0.722794 0.100 1 1 1 186 46 140 0 0 1 1 44 0 0 134 0 6 0.0000 0.0000 0.0429 45.000 2.61 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0252 0.9748 2 2 0.0000 0.0266 0.9734 2 2 0.0000 0.0286 0.9714
chr19 21383385 TAATTCATGCTGGAGAGAAACACTACAAATGTGAAAAATGTGGCAAAGATTTTAAACAGTCCTCACACCTTACTAAACATAAGAC T 0.206936 0.100 1 -84 2 493 97 396 74 0 12 0 11 1 3 391 0 1 0.7629 0.0025 0.0126 7.083 0.74 2.73 -1.98 6 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0005 0.9995 0.0000 0 1 0.0717 0.9283 0.0000
chr19 23744939 CCA C 0.187747 0.100 1 -2 4 366 80 286 42 0 2 1 35 0 0 282 0 4 0.5250 0.0000 0.0140 39.000 0.17 2.26 -2.09 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3753 0.5664 0.0583 1 1 0.3798 0.5603 0.0599 1 1 0.3853 0.5526 0.0620
chr19 30009211 GTGA G 0.833397 0.100 1 -3 1 378 110 268 0 0 17 7 86 0 0 268 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.471 2.77 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0017 0.9983 2 2 0.0000 0.0019 0.9981 2 2 0.0000 0.0022 0.9978
chr19 35267372 G GGGA 0.741773 0.100 1 3 1 542 124 418 15 0 3 1 105 0 0 415 0 3 0.1210 0.0000 0.0072 40.333 0.33 3.17 -2.84 3 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9999 0.0001 2 1 0.0000 0.9638 0.0362
chr19 35511516 GCCA G 0.098140 0.100 1 -3 1 514 193 321 19 1 20 2 151 0 0 317 0 4 0.0984 0.0000 0.0125 8.550 7.05 3.51 3.54 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9991 0.0009
chr19 38385765 A AGCCGGGGATGGGGCCGGGGCCGGG 0.053863 0.100 1 24 2 555 132 423 107 1 17 0 7 0 0 422 0 1 0.8106 0.0000 0.0024 6.765 1.01 11.00 -9.99 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.4356 0.5644 0.0000 0 0 0.9512 0.0488 0.0000
chr19 38408861 C CAAG 0.029851 0.100 1 3 1 117 64 53 44 4 15 0 1 0 0 53 0 0 0.6875 0.0000 0.0000 3.267 0.14 4.00 -3.86 10 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9760 0.0240 0.0000 0 0 0.9919 0.0081 0.0000 0 0 0.9943 0.0057 0.0000
chr19 39906132 AGC A 0.783963 0.100 1 -2 1 213 21 192 0 0 3 17 1 0 0 192 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 5.333 4.00 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1015 0.8985 2 2 0.0000 0.1033 0.8967 2 2 0.0000 0.1057 0.8943
chr19 39906137 T TGC 0.795815 0.100 1 2 2 213 20 193 0 0 11 9 0 0 0 193 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.556 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0001 0.1386 0.8613 2 2 0.0001 0.1400 0.8599 2 2 0.0001 0.1420 0.8579
chr19 40667987 CTGCTGT C 0.548568 0.100 1 -6 1 419 128 291 59 2 6 0 61 0 0 291 0 0 0.4609 0.0000 0.0000 20.000 0.10 5.77 -5.67 9 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.1529 0.6430 0.2041 1 1 0.1576 0.6327 0.2097 1 1 0.1637 0.6195 0.2167
chr19 41116202 G GC 0.200742 0.100 1 1 2 429 134 295 77 0 6 0 51 0 0 294 0 1 0.5746 0.0000 0.0034 21.333 0.16 1.96 -1.80 37 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8337 0.1648 0.0015 1 0 0.8268 0.1715 0.0018 1 0 0.8168 0.1809 0.0023
chr19 41577387 A AGAC 0.041016 0.100 1 3 1 291 78 213 10 0 2 1 65 0 0 212 0 1 0.1282 0.0000 0.0047 38.000 0.10 4.22 -4.12 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9982 0.0018
chr19 42910638 AC A 0.000003 0.100 1 -1 1 607 276 331 264 0 1 0 11 0 0 331 0 0 0.9565 0.0000 0.0000 275.000 0.12 1.27 -1.15 72 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8544 0.1456 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 43847014 GGGAGAT G 0.416095 0.100 1 -6 1 308 83 225 7 0 0 0 76 0 0 221 0 4 0.0843 0.0000 0.0178 83.000 0.14 6.62 -6.48 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9780 0.0220 2 1 0.0000 0.7210 0.2790
chr19 44085846 TCTC T 0.633374 0.100 1 -3 2 515 166 349 102 0 4 1 59 0 0 347 0 2 0.6145 0.0000 0.0057 40.250 0.07 3.05 -2.98 12 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8987 0.1008 0.0005 1 0 0.8897 0.1096 0.0007 1 0 0.8764 0.1225 0.0011
chr19 44274642 CG C 0.147169 0.100 1 -1 2 479 149 330 139 1 3 0 6 0 0 330 0 0 0.9329 0.0000 0.0000 48.333 0.24 3.50 -3.26 1 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0128 0.9872 0.0000 0 0 0.9148 0.0852 0.0000 0 0 0.9910 0.0090 0.0000
chr19 45645376 A AGCCCGGGCCCGGTCCCC 0.000007 0.100 1 17 3 135 47 88 20 2 11 0 14 0 0 88 0 0 0.4255 0.0000 0.0000 3.273 0.25 11.93 -11.68 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6488 0.3512 0.0000 1 0 0.6448 0.3552 0.0000 1 0 0.6397 0.3603 0.0000
chr19 45761789 A ATCCAGC 0.479648 0.100 1 6 2 610 256 354 199 0 44 0 13 1 0 348 0 5 0.7773 0.0028 0.0169 4.818 0.20 6.23 -6.03 73 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.1461 0.8539 0.0000
chr19 45795880 T TCTCCTCGCCCTCCTCCTC 0.105365 0.100 1 18 1 370 133 237 104 0 25 0 4 0 0 237 0 0 0.7820 0.0000 0.0000 4.320 0.31 9.00 -8.69 32 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.1899 0.8101 0.0000 0 0 0.9558 0.0442 0.0000 0 0 0.9902 0.0098 0.0000
chr19 48939592 T TG 0.176847 0.100 1 1 1 240 96 144 84 2 8 0 2 0 0 144 0 0 0.8750 0.0000 0.0000 10.875 0.55 1.50 -0.95 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.8228 0.1772 0.0000 0 0 0.9761 0.0239 0.0000 0 0 0.9882 0.0118 0.0000
chr19 49652104 GCCGCTCCCGCTC G 0.005187 0.100 1 -12 2 593 160 433 82 0 24 1 53 0 0 428 2 3 0.5125 0.0000 0.0115 5.667 0.88 10.45 -9.57 14 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8309 0.1690 0.0000 1 0 0.8258 0.1742 0.0001 1 0 0.8183 0.1816 0.0001
chr19 50007714 CCTGGTCTTCTGAGGGCTACAG C 0.010131 0.100 1 -21 1 231 89 142 50 0 11 0 28 0 0 138 0 4 0.5618 0.0000 0.0282 7.091 0.74 16.11 -15.37 6 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.7975 0.2023 0.0002 1 0 0.7912 0.2086 0.0003 1 0 0.7823 0.2174 0.0003
chr19 50378563 A AAAC 0.592165 0.100 1 3 2 620 142 478 3 0 5 72 62 0 0 473 2 3 0.0211 0.0000 0.0105 45.667 0.00 3.35 -3.35 1 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.3690 0.6310 2 2 0.0000 0.0208 0.9792 2 2 0.0000 0.0073 0.9927
chr19 50378565 A ACAG 0.341817 0.100 1 3 3 617 147 470 2 0 5 64 76 0 0 468 0 2 0.0136 0.0000 0.0043 28.200 0.00 3.28 -3.28 2 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.1175 0.8825 2 2 0.0000 0.0152 0.9848 2 2 0.0000 0.0081 0.9919
chr19 51501537 G GC 0.655856 0.100 1 1 1 568 168 400 93 1 7 4 63 0 0 399 1 0 0.5536 0.0000 0.0025 22.857 0.66 2.73 -2.07 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6826 0.3108 0.0066 1 0 0.6725 0.3195 0.0080 1 0 0.6580 0.3318 0.0102
chr19 52300416 CTG C 0.721947 0.100 1 -2 1 151 74 77 4 0 1 1 68 0 0 75 1 1 0.0541 0.0000 0.0260 73.000 0.50 2.10 -1.60 4 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9867 0.0133 2 2 0.0000 0.4396 0.5604 2 2 0.0000 0.1379 0.8621
chr19 52383892 TA T 0.382581 0.100 1 -1 2 460 131 329 66 0 6 0 59 0 0 329 0 0 0.5038 0.0000 0.0000 20.833 0.24 1.80 -1.55 48 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3776 0.5640 0.0584 1 1 0.3805 0.5574 0.0621 1 1 0.3836 0.5492 0.0672
chr19 52383993 T TCAA 0.387747 0.100 1 3 1 549 136 413 69 0 6 0 61 0 0 412 0 1 0.5074 0.0000 0.0024 21.667 0.23 3.30 -3.06 39 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3690 0.5726 0.0583 1 1 0.3725 0.5654 0.0621 1 1 0.3762 0.5565 0.0673
chr19 52951222 C CACT 0.402666 0.100 1 3 2 668 162 506 0 0 1 0 161 0 0 506 0 0 0.0000 0.0000 0.0000 161.000 3.52 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995 2 2 0.0000 0.0006 0.9994
chr19 54171999 GCCC G 0.005239 0.100 1 -3 1 299 137 162 125 0 4 0 8 0 0 162 0 0 0.9124 0.0000 0.0000 33.250 0.30 3.00 -2.70 7 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0021 0.9979 0.0000 0 0 0.9513 0.0487 0.0000 0 0 0.9979 0.0021 0.0000
chr19 54250974 TG T 0.674930 0.100 1 -1 5 564 147 417 97 0 8 0 42 0 0 416 0 1 0.6599 0.0000 0.0024 17.375 0.29 2.50 -2.21 57 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9718 0.0282 0.0000 1 0 0.9672 0.0327 0.0001 1 0 0.9599 0.0400 0.0001
chr19 54462808 G GCCT 0.457433 0.100 1 3 1 683 130 553 17 0 6 0 107 0 0 543 1 9 0.1308 0.0000 0.0181 20.667 0.59 3.15 -2.56 7 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9955 0.0045
chr19 54574889 C CGT 0.000015 0.100 1 2 3 871 210 661 181 2 3 4 20 0 0 644 9 8 0.8619 0.0000 0.0257 69.000 1.27 11.60 -10.33 57 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0066 0.9934 0.0000
chr19 54574891 TGC T 0.000020 0.100 1 -2 1 871 210 661 182 0 4 4 20 0 1 641 7 12 0.8667 0.0000 0.0303 51.500 1.33 12.00 -10.67 58 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0001 0.9999 0.0000 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0006 0.9994 0.0000
chr19 54575935 GGC G 0.000047 0.100 1 -2 1 503 97 406 92 2 1 1 1 0 0 406 0 0 0.9485 0.0000 0.0000 96.000 0.28 11.00 -10.72 6 0/0 0/1 . . OK 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 54575938 C CTT 0.000047 0.100 1 2 2 499 96 403 91 0 2 2 1 0 0 402 0 1 0.9479 0.0000 0.0025 47.000 0.30 11.00 -10.70 7 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9994 0.0006 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr19 55014735 G GCAGA 0.030755 0.100 1 4 2 763 153 610 81 0 16 0 56 0 0 607 0 3 0.5294 0.0000 0.0049 8.562 0.12 3.93 -3.81 25 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8117 0.1880 0.0003 1 0 0.8067 0.1930 0.0004 1 0 0.7994 0.2001 0.0005
chr19 55014991 A AGCGGGAGGG 0.000023 0.100 1 9 1 698 160 538 71 5 36 0 48 0 0 525 0 13 0.4437 0.0000 0.0242 3.444 2.62 8.75 -6.13 3 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.6922 0.3078 0.0000 1 0 0.6908 0.3092 0.0000 1 0 0.6884 0.3116 0.0000
chr19 55279518 A AGCCGCCGCC 0.498757 0.100 1 9 2 450 108 342 50 0 16 0 42 0 0 337 0 5 0.4630 0.0000 0.0146 5.750 0.30 7.76 -7.46 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2539 0.6063 0.1398 1 1 0.2569 0.5985 0.1447 1 1 0.2603 0.5885 0.1511
chr19 55358511 GGCTCCTTCATCTCGCCCCATGGCT G 0.867196 0.100 1 -24 1 677 199 478 106 0 18 0 75 1 0 464 0 13 0.5327 0.0021 0.0293 10.056 0.29 20.44 -20.15 4 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2421 0.7214 0.0366 1 1 0.2406 0.7173 0.0420 1 1 0.2377 0.7120 0.0503
chr19 55518249 C CCCA 0.294252 0.100 1 3 4 846 198 648 9 0 41 1 147 0 1 631 3 13 0.0455 0.0000 0.0262 3.925 1.22 5.32 -4.10 5 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9627 0.0373 2 2 0.0000 0.3298 0.6702
chr19 55578542 C CCCG 0.537557 0.100 1 3 1 578 118 460 61 0 3 1 53 0 0 457 0 3 0.5169 0.0000 0.0065 38.333 1.02 3.68 -2.66 7 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2427 0.6297 0.1276 1 1 0.2461 0.6205 0.1334 1 1 0.2501 0.6088 0.1411
chr19 56088071 C CTCG 0.023520 0.100 1 3 2 333 55 278 24 1 1 1 28 0 0 277 0 1 0.4364 0.0000 0.0036 54.000 2.54 4.61 -2.07 0 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.3065 0.6737 0.0198 1 1 0.3149 0.6654 0.0196 1 1 0.3260 0.6547 0.0193
chr19 57477298 A AGCC 0.315092 0.100 1 3 1 142 81 61 10 1 4 1 65 0 0 59 0 2 0.1235 0.0000 0.0328 19.250 0.00 3.08 -3.08 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9998 0.0002 2 1 0.0000 0.9864 0.0136
chr19 57639970 TG T 0.349431 0.100 1 -1 1 179 80 99 36 1 0 0 43 0 0 99 0 0 0.4500 0.0000 0.0000 80.000 0.06 1.09 -1.04 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1451 0.5987 0.2562 1 1 0.1515 0.5930 0.2555 1 1 0.1601 0.5857 0.2541
chr19 58277216 GGGCCAGAAGGATCTGAGAGAGTGTGGCCAGCTTGAGCCCTCAGGAGTC G 0.191232 0.100 1 -48 1 171 103 68 80 0 21 0 2 0 0 68 0 0 0.7767 0.0000 0.0000 4.316 1.21 0.00 1.21 12 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.7540 0.2460 0.0000 0 0 0.9662 0.0338 0.0000 0 0 0.9834 0.0166 0.0000
chr20 145514 GCAAA G 0.152578 0.100 1 -4 2 318 98 220 88 0 3 0 7 0 0 219 0 1 0.8980 0.0000 0.0045 31.667 1.11 4.57 -3.46 44 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0833 0.9167 0.0000 0 0 0.7026 0.2974 0.0000
chr20 145669 ACC A 0.558572 0.100 1 -2 1 314 127 187 57 0 5 0 65 0 0 186 0 1 0.4488 0.0000 0.0053 24.400 0.09 3.23 -3.14 9 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0544 0.5442 0.4013 1 1 0.0584 0.5393 0.4023 1 1 0.0640 0.5332 0.4028
chr20 257794 CTGGTCT C 0.606741 0.100 1 -6 2 123 82 41 48 0 3 0 31 0 0 41 0 0 0.5854 0.0000 0.0000 26.333 0.02 6.71 -6.69 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.5722 0.3975 0.0304 1 0 0.5617 0.4044 0.0339 1 0 0.5471 0.4136 0.0393
chr20 1915303 A AGT 0.380246 0.100 1 2 1 442 147 295 103 0 2 1 41 0 0 292 0 3 0.7007 0.0000 0.0102 72.500 0.12 8.44 -8.32 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9895 0.0105 0.0000 1 0 0.9876 0.0124 0.0000 1 0 0.9845 0.0155 0.0000
chr20 1915304 CCT C 0.378293 0.100 1 -2 1 441 150 291 106 0 3 1 40 0 0 288 0 3 0.7067 0.0000 0.0103 49.000 0.11 8.47 -8.36 8 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9929 0.0071 0.0000 1 0 0.9915 0.0085 0.0000 1 0 0.9891 0.0109 0.0000
chr20 1915405 CCGA C 0.360324 0.100 1 -3 4 440 169 271 123 0 4 0 42 0 0 270 0 1 0.7278 0.0000 0.0037 41.250 0.07 8.19 -8.12 13 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9987 0.0013 0.0000 1 0 0.9984 0.0016 0.0000 1 0 0.9904 0.0096 0.0000
chr20 13759800 CCTT C 0.002105 0.100 1 -3 1 203 122 81 72 0 1 0 49 0 0 80 0 1 0.5902 0.0000 0.0123 121.000 0.19 3.02 -2.83 20 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8292 0.1708 0.0000 1 0 0.8236 0.1764 0.0000 1 0 0.8156 0.1843 0.0000
chr20 21126073 C CG 0.617502 0.100 1 1 2 248 90 158 2 0 5 0 83 0 0 158 0 0 0.0222 0.0000 0.0000 17.000 0.00 1.10 -1.10 2 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.4282 0.5718 2 2 0.0000 0.0759 0.9241 2 2 0.0000 0.0383 0.9617
chr20 25476413 GCTCCCA G 0.449443 0.100 1 -6 2 659 157 502 0 0 6 0 151 0 0 493 0 9 0.0000 0.0000 0.0179 25.167 5.74 0 1/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0003 0.9997 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0005 0.9995
chr20 34077058 C CCAG 0.656931 0.100 1 3 1 461 169 292 9 2 8 61 89 0 0 285 1 6 0.0533 0.0000 0.0240 22.571 0.22 2.79 -2.56 1 0/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.8314 0.1686 2 2 0.0000 0.1177 0.8823
chr20 34077071 CGGT C 0.001321 0.100 1 -3 2 458 181 277 98 1 13 1 68 0 0 277 0 0 0.5414 0.0000 0.0000 12.846 2.30 3.82 -1.53 2 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8938 0.1062 0.0000 1 0 0.8888 0.1112 0.0000 1 0 0.8815 0.1185 0.0000
chr20 35226773 GGCCGCCGCC G 0.585944 0.100 1 -9 4 310 101 209 2 2 30 4 63 0 1 203 1 4 0.0198 0.0000 0.0287 2.333 1.00 9.67 -8.67 0 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9499 0.0501 2 2 0.0000 0.4436 0.5564 2 2 0.0000 0.1888 0.8112
chr20 35277855 A AGGCTGG 0.014271 0.100 1 6 1 373 131 242 20 0 29 0 82 0 0 232 0 10 0.1527 0.0000 0.0413 3.517 1.60 5.56 -3.96 12 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9996 0.0004 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000
chr20 45375515 CATT C 0.606231 0.100 1 -3 2 476 138 338 127 1 4 0 6 0 0 338 0 0 0.9203 0.0000 0.0000 33.500 0.50 2.67 -2.16 71 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0007 0.9993 0.0000 0 1 0.3947 0.6053 0.0000 0 0 0.8730 0.1270 0.0000
chr20 45891598 CCTG C 0.607197 0.100 1 -3 2 945 326 619 27 0 38 6 255 0 0 613 1 5 0.0828 0.0000 0.0097 7.579 0.19 3.00 -2.81 13 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 1.0000 0.0000 2 1 0.0000 0.9809 0.0191
chr20 47651092 ACAG A 0.342693 0.100 1 -3 2 574 290 284 116 5 35 7 127 0 0 283 0 1 0.4000 0.0000 0.0035 7.171 0.25 3.09 -2.84 36 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.0270 0.6650 0.3080 1 1 0.0310 0.6550 0.3140 1 1 0.0370 0.6425 0.3204
chr20 58228620 C CCCG 0.223199 0.100 1 3 1 448 135 313 63 1 7 0 64 0 0 309 0 4 0.4667 0.0000 0.0128 18.143 0.41 3.19 -2.77 19 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1821 0.6921 0.1257 1 1 0.1914 0.6809 0.1277 1 1 0.2036 0.6664 0.1299
chr20 62065054 CGGGCGCGGG C 0.000869 0.100 1 -9 2 296 45 251 29 3 8 1 4 0 0 251 0 0 0.6444 0.0000 0.0000 4.500 2.14 1.25 0.89 17 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0969 0.9031 0.0000 0 0 0.9667 0.0333 0.0000 0 0 0.9956 0.0044 0.0000
chr20 62065249 TGCCAGG T 0.994314 0.100 1 -6 2 280 57 223 0 3 13 0 41 0 0 219 0 4 0.0000 0.0000 0.0179 3.231 4.44 0 0/1 0/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0065 0.9935 2 2 0.0000 0.0024 0.9976 2 2 0.0000 0.0016 0.9984
chr21 30541662 AG A 0.714353 0.100 1 -1 1 322 154 168 85 0 2 0 67 0 0 168 0 0 0.5519 0.0000 0.0000 76.000 0.31 2.06 -1.75 35 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.4330 0.5365 0.0305 1 1 0.4281 0.5372 0.0347 1 1 0.4207 0.5384 0.0409
chr21 32631618 A AAGTATT 0.509844 0.100 1 6 4 773 198 575 103 0 6 1 88 0 0 564 0 11 0.5202 0.0000 0.0191 31.833 0.23 5.66 -5.43 11 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.1826 0.7200 0.0974 1 1 0.1904 0.7054 0.1042 1 1 0.2002 0.6864 0.1134
chr21 39511744 G GAGA 0.574597 0.100 1 3 2 244 135 109 4 0 8 0 123 0 0 109 0 0 0.0296 0.0000 0.0000 15.875 0.25 2.98 -2.73 2 1/1 0/1 . . OK 2 1 0.0000 0.9104 0.0896 2 2 0.0000 0.1014 0.8986 2 2 0.0000 0.0242 0.9758
chr21 41878845 C CG 0.999218 0.100 1 1 2 343 37 306 0 0 2 1 34 0 0 304 1 1 0.0000 0.0000 0.0065 17.500 2.32 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr21 44539673 A ATG 0.649605 0.100 1 2 2 918 138 780 68 2 9 3 56 0 0 776 1 3 0.4928 0.0000 0.0051 21.333 0.82 3.02 -2.19 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2245 0.6567 0.1188 1 1 0.2268 0.6472 0.1260 1 1 0.2293 0.6349 0.1358
chr21 44539674 ATC A 0.649658 0.100 1 -2 2 921 139 782 66 4 8 4 57 0 0 779 0 3 0.4748 0.0000 0.0038 16.000 0.80 2.98 -2.18 12 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.2075 0.6610 0.1315 1 1 0.2102 0.6510 0.1388 1 1 0.2132 0.6381 0.1487
chr21 44550876 ACTTGCAGCAGACAGG A 0.204309 0.100 1 -15 2 550 119 431 97 0 14 0 8 27 3 399 0 2 0.8151 0.0626 0.0742 7.500 1.47 13.88 -12.40 29 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0509 0.9491 0.0000 0 0 0.7547 0.2453 0.0000
chr21 45504511 CGGCCCCCCA C 0.965477 0.100 1 -9 7 310 145 165 1 0 14 0 130 0 0 165 0 0 0.0069 0.0000 0.0000 9.357 1.00 7.83 -6.83 1 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0004 0.9996 2 2 0.0000 0.0002 0.9998 2 2 0.0000 0.0001 0.9999
chr22 17120968 GGCTGGT G 0.000079 0.100 1 -6 1 462 130 332 104 1 21 0 4 0 0 331 0 1 0.8000 0.0000 0.0030 5.190 0.56 7.75 -7.19 18 0/0 0/1 . . OK 0 0 0.9755 0.0245 0.0000 0 0 0.9999 0.0001 0.0000 0 0 1.0000 0.0000 0.0000
chr22 23622095 GCAT G 0.240155 0.100 1 -3 3 195 93 102 48 0 6 1 38 0 0 100 0 2 0.5161 0.0000 0.0196 14.500 0.15 2.87 -2.72 8 0/1 0/0 . . OK 1 1 0.4771 0.4853 0.0376 1 1 0.4775 0.4827 0.0397 1 1 0.4776 0.4798 0.0427
chr22 26483980 GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA G 0.877460 0.100 1 -21 3 527 101 426 0 0 19 0 82 0 0 402 0 24 0.0000 0.0000 0.0563 4.316 14.62 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr22 27798906 CTGCTGT C 0.030620 0.100 1 -6 1 798 188 610 100 1 23 2 62 0 0 610 0 0 0.5319 0.0000 0.0000 7.130 1.51 4.92 -3.41 26 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9430 0.0569 0.0000 1 0 0.9386 0.0614 0.0000 1 0 0.9320 0.0680 0.0000
chr22 27798945 T TTGC 0.161044 0.100 1 3 1 785 185 600 90 7 38 3 47 0 0 597 1 2 0.4865 0.0000 0.0050 3.973 2.59 3.11 -0.52 16 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9698 0.0302 0.0000 1 0 0.9663 0.0337 0.0000 1 0 0.9609 0.0390 0.0001
chr22 29441577 TTCC T 0.403493 0.100 1 -3 1 788 224 564 208 0 2 0 14 0 0 564 0 0 0.9286 0.0000 0.0000 111.000 0.22 3.71 -3.49 116 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.0159 0.9841 0.0000 0 0 0.8174 0.1826 0.0000
chr22 35265497 GAGC G 0.000012 0.100 1 -3 2 522 165 357 93 1 13 0 58 0 0 357 0 0 0.5636 0.0000 0.0000 11.692 0.32 3.17 -2.85 11 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9435 0.0565 0.0000 1 0 0.9391 0.0609 0.0000 1 0 0.9324 0.0676 0.0000
chr22 36191797 ACT A 0.485373 0.100 1 -2 3 654 208 446 103 1 6 0 98 0 0 444 0 2 0.4952 0.0000 0.0045 33.667 0.34 2.11 -1.77 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.2004 0.7137 0.0859 1 1 0.2086 0.6992 0.0921 1 1 0.2189 0.6805 0.1006
chr22 37510301 GCTCCTT G 0.237706 0.100 1 -6 2 409 211 198 97 0 40 3 71 0 0 190 2 6 0.4597 0.0000 0.0404 4.250 1.03 10.86 -9.83 27 0/0 0/1 . . OK 1 0 0.5983 0.3935 0.0082 1 0 0.5990 0.3917 0.0093 1 0 0.5988 0.3903 0.0109
chr22 37510301 GCTCCTTCTCCTT G 0.000613 0.100 1 -12 2 409 215 194 103 1 43 0 68 0 0 186 0 8 0.4791 0.0000 0.0412 3.977 1.00 10.59 -9.59 31 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.8768 0.1232 0.0000 1 0 0.8720 0.1280 0.0000 1 0 0.8651 0.1349 0.0000
chr22 37568401 CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT C 0.558599 0.100 1 -21 6 562 106 456 68 2 3 0 33 0 0 456 0 0 0.6415 0.0000 0.0000 34.333 0.44 10.61 -10.16 4 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9118 0.0875 0.0008 1 0 0.9029 0.0961 0.0010 1 0 0.8898 0.1088 0.0014
chr22 37723747 TCAA T 0.430493 0.100 1 -3 1 836 278 558 135 1 2 0 140 0 1 554 0 3 0.4856 0.0000 0.0072 138.000 1.03 3.58 -2.55 13 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.0616 0.7820 0.1563 1 1 0.0686 0.7656 0.1659 1 1 0.0783 0.7437 0.1780
chr22 38087148 T TTCATGGGTG 0.341262 0.100 1 9 4 365 190 175 165 1 14 0 10 0 0 175 0 0 0.8684 0.0000 0.0000 12.500 0.15 6.80 -6.65 19 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0000 1.0000 0.0000 0 1 0.1540 0.8460 0.0000 0 0 0.9080 0.0920 0.0000
chr22 39100317 TAAC T 0.333557 0.100 1 -3 3 216 115 101 105 0 6 0 4 0 0 101 0 0 0.9130 0.0000 0.0000 18.167 0.18 3.50 -3.32 41 0/0 0/1 . . OK 0 1 0.0549 0.9451 0.0000 0 0 0.8426 0.1574 0.0000 0 0 0.9616 0.0384 0.0000
chr22 39381817 C CCAA 0.707679 0.100 1 3 3 318 127 191 0 0 5 0 122 0 0 184 0 7 0.0000 0.0000 0.0366 24.400 3.02 0 1/1 1/1 . . OK 2 2 0.0000 0.0006 0.9994 2 2 0.0000 0.0007 0.9993 2 2 0.0000 0.0008 0.9992
chr22 42142513 T TC 0.297594 0.100 1 1 3 1023 226 797 145 0 1 0 80 0 0 792 0 5 0.6416 0.0000 0.0063 225.000 0.23 10.15 -9.92 57 0/1 0/0 . . OK 1 0 0.9886 0.0114 0.0000 1 0 0.9869 0.0131 0.0000 1 0 0.9841 0.0159 0.0000
chr22 50482719 AACACTCGGGCCCCCGAAG A 0.106467 0.100 1 -18 2 345 108 237 48 0 20 0 40 1 0 228 0 8 0.4444 0.0042 0.0380 4.400 0.19 14.80 -14.61 18 0/1 0/1 . . OK 1 1 0.3665 0.5977 0.0358 1 1 0.3734 0.5898 0.0368 1 1 0.3822 0.5798 0.0380
644 rows