File Info

Filename
cnv_call_summary.tsv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/platform-users/bding/CNV/FC13/CNV_Final_Mosaic_v4_11/cnv_call_summary.tsv
Size
35.8 KB
Workflow Run
bding-cnv-pipe-2026-06-08t22-59-41z
Published
Jun 08, 2026 4:23 PM

Content

View in new tab
Sample_ID Chrom Start End Genes Type Copy_Number Ploidy Z_Score Fold_Change Filter Zygosity Num_Probes Num_Exons Posterior_Prob SV_Length
3700663597_r13 chr1 196793300 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -32.58 0.55 PASS HET 19 3 0.99 33718
3700663597_r13 chr1 196828136 196914697 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -41.5 0.55 PASS HET 25 11 0.96 86561
471142234_r13 chr1 196774858 196788946 CFHR3 DEL 1 2 -32.14 0.54 PASS HET 13 4 1.0 14088
471142234_r13 chr1 196789186 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -35.07 0.56 PASS HET 25 3 0.97 37832
471142234_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.33 0.61 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700651519_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -59.97 0.49 PASS HET 50 10 0.99 57591
3700663361_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -60.95 0.5 PASS HET 50 10 0.99 57591
3700663345_r13 chr2 110123336 110204993 NPHP1 DUP 3 2 27.56 1.51 PASS HET 64 20 0.91 81657
3700650045_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -51.71 0.5 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700650045_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1182.02 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700650045_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -45.96 0.48 PASS HET 22 9 1.0 30771
3700650045_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DEL 1 2 -33.32 0.48 PASS HET 12 8 1.0 7409
3700650045_r13 chr11 14877389 14880768 CYP2R1 DUP 3 2 17.92 1.52 PASS HET 18 3 0.98 3379
3700650045_r13 chr19 3121064 3123814 GNA11 DUP 3 2 19.39 1.51 PASS HET 22 1 0.94 2750
3700650268_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -60.53 0.49 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700650997_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -62.73 0.49 PASS HET 50 10 0.99 57591
3700648978_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 7.22 1.52 PASS HET 4 2 0.96 1355
3700663405_r13 chr1 196793300 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -35.99 0.53 PASS HET 19 3 1.0 33718
3700663405_r13 chr1 196828136 196914697 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -42.85 0.54 PASS HET 25 11 0.96 86561
3700651378_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.49 1.49 PASS HET 4 2 0.97 1355
3700648921_r13 chr1 16021835 16023924 CLCNKA DUP 4 2 16.61 2.06 PASS HET 6 3 1.0 2089
3700648921_r13 chr1 16024827 16033272 CLCNKA DUP 3 2 17.84 1.45 PASS HET 22 15 0.9 8445
3700648921_r13 chr1 16044434 16045744 CLCNKB DEL 0 2 -594.19 0.0 PASS HOM 5 2 1.0 1310
3700648921_r13 chr1 16046475 16056524 CLCNKB DEL 1 2 -46.81 0.49 PASS HET 24 15 0.96 10049
3700648921_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.83 0.49 PASS HET 50 10 1.0 57591
3574258956_r13 chr1 196825430 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -57.98 0.47 PASS HET 37 14 1.0 93332
3700650069_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DEL 0 2 -1532.38 0.0 PASS HOM 29 17 1.0 12090
3700650069_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -51.15 0.53 PASS HET 40 7 0.99 52160
3700650069_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -20.37 0.67 PASS HET 8 3 0.87 4313
471142233_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.15 1.42 PASS HET 4 2 0.78 1355
3700663537_r13 chr2 110123336 110204993 NPHP1 DUP 3 2 31.15 1.55 PASS HET 64 20 0.95 81657
471140794_r13 chr1 196774858 196793762 CFHR3 DEL 1 2 -41.96 0.55 PASS HET 26 5 1.0 18904
471140794_r13 chr1 196794002 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -21.6 0.57 PASS HET 12 3 0.91 33016
471140794_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -21.82 0.63 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700650043_r13 chr16 2047901 2103952 TSC2,PKD1 DEL 1 2 -117.73 0.52 PASS HET 168 66 0.98 56051
3700650043_r13 chr16 2104252 2133652 PKD1 DEL 1 2 -99.52 0.53 PASS HET 169 21 0.98 29400
3700650043_r13 chr19 3121064 3123814 GNA11 DUP 3 2 19.95 1.55 PASS HET 22 1 0.9 2750
3700663169_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -61.07 0.5 PASS HET 50 10 0.99 57591
3700651382_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -60.7 0.48 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651382_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -25.97 0.57 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700652041_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -66.89 0.46 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700651459_r13 chr1 196793300 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -32.09 0.51 PASS HET 19 3 0.98 33718
3700651459_r13 chr1 196828136 196914697 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -34.22 0.57 PASS HET 25 11 0.96 86561
3700663565_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -63.33 0.5 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700651477_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -64.88 0.48 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700663373_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.29 0.51 PASS HET 50 10 0.99 57591
3700652192_r13 chr1 196793300 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -32.55 0.48 PASS HET 19 3 0.96 33718
3700652192_r13 chr1 196828136 196914697 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -33.97 0.52 PASS HET 25 11 0.95 86561
3700652046_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -53.45 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700652046_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.14 0.61 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700663213_r13 chr1 196793300 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -34.55 0.54 PASS HET 19 3 0.99 33718
3700663213_r13 chr1 196828136 196914697 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -43.27 0.54 PASS HET 25 11 0.96 86561
3700652025_r13 chr2 110123336 110204993 NPHP1 DUP 3 2 30.44 1.52 PASS HET 64 20 0.94 81657
3700651498_r13 chr2 110123336 110201564 NPHP1 DUP 3 2 27.82 1.49 PASS HET 63 19 0.92 78228
3700652096_r13 chr1 196793300 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -31.08 0.5 PASS HET 19 3 1.0 33718
3700652096_r13 chr1 196828136 196914697 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -36.42 0.51 PASS HET 25 11 0.96 86561
3601213916_r13 chr8 144051275 144060085 OPLAH DEL 1 2 -75.41 0.5 PASS HET 43 26 1.0 8810
3601213916_r13 chr9 133070428 133071106 CEL DUP 3 2 7.1 1.5 PASS HET 3 2 1.0 678
3700663553_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -60.74 0.5 PASS HET 50 10 0.99 57591
3700651326_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.88 1.5 PASS HET 4 2 0.94 1355
471201172_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -53.7 0.53 PASS HET 40 7 0.98 52160
471201172_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -25.53 0.59 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700663181_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.92 0.52 PASS HET 50 10 0.98 57591
3700663203_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -52.83 0.53 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700663203_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -18.7 0.7 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700651456_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -56.03 0.51 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651456_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -22.96 0.63 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700652157_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -62.79 0.49 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700663153_r13 chr2 110123336 110201564 NPHP1 DUP 3 2 30.28 1.51 PASS HET 63 19 0.95 78228
3700651434_r13 chr2 11787023 11791983 LPIN1 DUP 3 2 5.35 1.33 PASS HET 7 3 0.79 4960
471141754_r13 chr1 196774858 196788946 CFHR3 DEL 1 2 -27.88 0.55 PASS HET 13 4 0.99 14088
471141754_r13 chr1 196794482 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -22.65 0.54 PASS HET 10 3 0.99 32536
471141754_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -17.86 0.69 PASS HET 8 3 0.87 4313
3574103429_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DUP 3 2 13.7 1.57 PASS HET 12 8 0.95 7409
3574258833_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -66.31 0.48 PASS HET 50 10 1.0 57591
471141753_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.78 1.45 PASS HET 4 2 0.79 1355
3700650976_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.51 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700650976_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -21.38 0.66 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700651018_r13 chr2 110124896 110204993 NPHP1 DUP 3 2 27.12 1.5 PASS HET 53 19 0.94 80097
3700663395_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -56.39 0.52 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700663395_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -20.6 0.66 PASS HET 8 3 0.86 4313
471203993_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -62.4 0.48 PASS HET 40 7 1.0 52160
471203993_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.35 0.63 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700651328_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -56.26 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651328_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -22.18 0.64 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700651040_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -62.06 0.48 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700648982_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.44 0.49 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700648982_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -22.84 0.61 PASS HET 8 3 0.88 4313
471203350_r13 chr1 196825430 196827018 CFHR1 DEL 1 2 -26.16 0.42 PASS HET 5 2 1.0 1588
471203350_r13 chr1 196828136 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -50.23 0.5 PASS HET 30 12 0.97 90626
471203350_r13 chr11 119024551 119025275 SLC37A4 DUP 3 2 8.52 1.44 PASS HET 4 2 1.0 724
471203350_r13 chr11 119027001 119028433 SLC37A4 DUP 3 2 8.25 1.42 PASS HET 5 3 0.98 1432
471203350_r13 chr16 2115052 2119972 PKD1 DEL 1 2 -50.8 0.51 PASS HET 29 9 1.0 4920
471203350_r13 chr16 2121412 2133652 PKD1 DEL 1 2 -71.13 0.52 PASS HET 68 0 0.99 12240
3700663587_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -53.05 0.54 PASS HET 40 7 0.99 52160
3700663587_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -19.65 0.67 PASS HET 8 3 0.87 4313
471141431_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.06 0.51 PASS HET 50 10 0.94 57591
3700652107_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -65.25 0.45 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700650260_r13 chr22 18912710 18936584 PRODH DEL 1 2 -68.37 0.46 PASS HET 36 14 1.0 23874
3700651495_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 4 2 10.74 2.06 PASS HET 4 2 0.99 1355
3700651446_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2066.56 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700651446_r13 chr6 24171735 24178690 DCDC2 DUP 3 2 16.79 1.52 PASS HET 26 2 0.95 6955
3700651504_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DUP 3 2 22.87 1.49 PASS HET 29 17 0.98 12090
3700651504_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -52.5 0.51 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651504_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -20.59 0.65 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700651015_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 4 2 9.69 2.02 PASS HET 4 2 0.97 1355
3619659364_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -59.69 0.49 PASS HET 50 10 1.0 57591
3601213394_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1842.11 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3601213394_r13 chr15 53513708 53762945 WDR72 DEL 1 2 -80.8 0.51 PASS HET 84 20 0.99 249237
3700651433_r13 chr1 16044434 16056961 CLCNKB DUP 3 2 27.62 1.54 PASS HET 30 18 0.97 12527
3700651433_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -51.43 0.5 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700651433_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1272.24 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700651433_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -42.14 0.51 PASS HET 22 9 0.99 30771
3700663337_r13 chr1 16021835 16033272 CLCNKA DUP 3 2 21.93 1.47 PASS HET 30 18 0.95 11437
3700663232_r13 chr1 16044434 16056961 CLCNKB DUP 3 2 23.59 1.47 PASS HET 30 18 0.97 12527
3700663232_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -46.67 0.54 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700663232_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1180.39 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700663232_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -43.52 0.5 PASS HET 22 9 1.0 30771
3574260751_r13 chr1 196825430 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -56.73 0.47 PASS HET 37 14 1.0 93332
3574260751_r13 chr7 33155590 33155770 BBS9 DEL 0 2 -107.84 0.12 PASS HET 2 1 0.5 180
3574260751_r13 chr9 133064374 133070678 CEL DUP 3 2 15.48 1.56 PASS HET 10 7 1.0 6304
3700663424_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DUP 3 2 26.28 1.54 PASS HET 29 17 1.0 12090
3700663424_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -47.93 0.52 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700663424_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1061.6 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700663424_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -41.77 0.5 PASS HET 22 9 1.0 30771
3619658692_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -65.08 0.46 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700652089_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 4 2 12.3 2.15 PASS HET 4 2 1.0 1355
3700652059_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DUP 3 2 26.03 1.52 PASS HET 29 17 1.0 12090
3700652059_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -47.79 0.53 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700652059_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1137.48 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700652059_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -43.63 0.5 PASS HET 22 9 1.0 30771
3700652174_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DUP 3 2 26.15 1.52 PASS HET 29 17 0.99 12090
3700652174_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -53.72 0.53 PASS HET 40 7 0.99 52160
3700652174_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.75 0.6 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700652078_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DUP 3 2 25.23 1.51 PASS HET 29 17 0.99 12090
3700652078_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -53.24 0.52 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700652078_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -21.96 0.66 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700652054_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2328.82 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700652054_r13 chr6 24172095 24178690 DCDC2 DUP 3 2 13.67 1.5 PASS HET 23 2 0.93 6595
3619659356_r13 chr1 16044434 16056961 CLCNKB DUP 3 2 23.9 1.49 PASS HET 30 18 0.97 12527
3619659356_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -55.18 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
3619659356_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -19.04 0.67 PASS HET 8 3 0.78 4313
3579469123_r13 chr1 196825430 196827018 CFHR1 DUP 3 2 11.16 1.54 PASS HET 5 2 1.0 1588
3579469123_r13 chr1 196830482 196918406 CFHR1,CFHR4 DUP 3 2 19.75 1.5 PASS HET 27 11 0.97 87924
3599847854_r13 chr1 16021835 16033272 CLCNKA DUP 3 2 22.83 1.48 PASS HET 30 18 0.99 11437
3599847854_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -61.54 0.48 PASS HET 50 10 1.0 57591
3619658684_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DUP 3 2 23.25 1.47 PASS HET 29 17 0.99 12090
3619658684_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -45.51 0.57 PASS HET 40 7 0.98 52160
3619658684_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -17.55 0.7 PASS HET 8 3 0.82 4313
3601213337_r13 chr1 196747447 196827018 CFH,CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.28 0.49 PASS HET 41 8 0.97 79571
3601213337_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -24.35 0.6 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700652155_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DUP 3 2 27.37 1.54 PASS HET 29 17 1.0 12090
3700652155_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -48.27 0.52 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700652155_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1171.21 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700652155_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -44.89 0.49 PASS HET 22 9 1.0 30771
471141741_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2134.22 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700663157_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1795.11 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700663157_r13 chr6 24171735 24178690 DCDC2 DUP 3 2 17.64 1.61 PASS HET 26 2 0.95 6955
3700663616_r13 chr1 16044434 16056961 CLCNKB DUP 3 2 23.15 1.46 PASS HET 30 18 0.97 12527
3700663616_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -47.55 0.53 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700663616_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1189.3 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700663616_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -42.09 0.52 PASS HET 22 9 1.0 30771
3700651439_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -61.18 0.48 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700663529_r13 chr1 16021835 16033272 CLCNKA DUP 3 2 22.51 1.46 PASS HET 30 18 0.98 11437
471201190_2_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1951.66 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700663344_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 4 2 9.01 1.83 PASS HET 4 2 0.71 1355
3700663145_r13 chr1 16021835 16033272 CLCNKA DUP 3 2 22.89 1.49 PASS HET 30 18 0.99 11437
3574260342_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2010.4 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
471141423_r13 chr1 16045512 16056524 CLCNKB DUP 3 2 21.97 1.47 PASS HET 27 16 0.94 11012
471141423_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -49.38 0.54 PASS HET 40 7 1.0 52160
471141423_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.23 0.61 PASS HET 8 3 0.87 4313
471142221_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1738.73 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700650966_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2156.26 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700650966_r13 chr6 24171855 24178690 DCDC2 DUP 3 2 15.31 1.51 PASS HET 25 2 0.97 6835
3700650208_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DEL 0 2 -1648.69 0.0 PASS HOM 29 17 1.0 12090
3601213442_r13 chr7 33155590 33155770 BBS9 DEL 0 2 -109.37 0.13 PASS HET 2 1 0.5 180
3601213442_r13 chr8 142912647 142912905 CYP11B2 DEL 1 2 -15.0 0.56 PASS HET 2 2 1.0 258
471140781_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1855.41 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700651435_r13 chr1 16021835 16033272 CLCNKA DUP 3 2 25.44 1.52 PASS HET 30 18 0.99 11437
3700663349_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2252.41 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700663349_r13 chr6 24171735 24178690 DCDC2 DUP 3 2 17.8 1.63 PASS HET 26 2 0.94 6955
3700663541_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1887.07 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700663541_r13 chr6 24173295 24178690 DCDC2 DUP 3 2 12.96 1.54 PASS HET 16 2 0.89 5395
3700651369_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2025.75 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700651312_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1755.54 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700652011_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -67.72 0.45 PASS HET 50 10 1.0 57591
3700652019_r13 chr1 16021835 16033272 CLCNKA DUP 3 2 26.04 1.52 PASS HET 30 18 1.0 11437
3700663536_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 4 2 10.1 1.89 PASS HET 4 2 0.69 1355
3700648969_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1747.4 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700650955_r13 chr1 16021835 16033272 CLCNKA DUP 3 2 25.65 1.52 PASS HET 30 18 1.0 11437
3700648988_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -58.27 0.41 PASS HET 48 10 0.98 57351
3700663239_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -47.21 0.52 PASS HET 40 7 0.96 52160
3700663239_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -16.41 0.69 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700651505_r13 chr1 196774858 196788946 CFHR3 DEL 1 2 -29.49 0.52 PASS HET 13 4 1.0 14088
3700651505_r13 chr1 196789186 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -38.55 0.5 PASS HET 33 6 0.91 43023
3619659357_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -51.82 0.5 PASS HET 48 10 0.97 57351
3700651001_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -56.12 0.43 PASS HET 48 10 0.98 57351
3700663623_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -44.11 0.52 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700663623_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -14.89 0.75 PASS HET 6 3 0.83 4073
3700663391_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -43.64 0.54 PASS HET 40 7 0.98 52160
3700663391_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -18.35 0.64 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700652048_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -46.69 0.48 PASS HET 40 7 0.99 52160
3700652048_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.89 0.66 PASS HET 6 3 0.83 4073
471141764_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -54.15 0.48 PASS HET 48 10 0.97 57351
3619659355_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -45.51 0.54 PASS HET 48 10 0.93 57351
471141763_r13 chr1 196825430 196827018 CFHR1 DEL 1 2 -21.91 0.47 PASS HET 5 2 1.0 1588
471141763_r13 chr1 196828136 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -38.51 0.57 PASS HET 28 12 0.96 90626
471141424_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -52.1 0.51 PASS HET 48 10 0.97 57351
3700663583_r13 chr1 196774858 196789546 CFHR3 DEL 1 2 -27.64 0.56 PASS HET 18 4 0.95 14688
3700663583_r13 chr1 196793300 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -33.14 0.52 PASS HET 19 3 0.97 33718
3700663583_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -18.66 0.66 PASS HET 6 3 0.83 4073
3700652087_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -44.6 0.54 PASS HET 48 10 0.9 57351
3700663539_r13 chr20 62351692 62367262 LAMA5 DUP 3 2 12.99 1.5 PASS HET 10 6 0.99 15570
3579468541_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -51.81 0.5 PASS HET 48 10 0.96 57351
3579468541_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 7.32 1.58 PASS HET 4 2 0.97 1355
3700651020_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -54.53 0.46 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651020_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -15.72 0.7 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700651331_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -59.33 0.44 PASS HET 48 10 0.97 57351
471140804_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -54.29 0.48 PASS HET 48 10 0.97 57351
3700663347_r13 chr20 62351692 62367262 LAMA5 DUP 3 2 13.81 1.5 PASS HET 10 6 0.95 15570
3700652072_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DUP 3 2 12.52 1.49 PASS HET 12 8 0.98 7409
3700650033_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -52.64 0.47 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700650033_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.98 0.64 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700650033_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DEL 1 2 -29.16 0.54 PASS HET 12 8 0.93 7409
3700663559_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DUP 3 2 14.37 1.51 PASS HET 12 8 0.99 7409
3700663431_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -46.11 0.54 PASS HET 40 7 0.98 52160
3700663431_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -18.56 0.64 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700663155_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 5.78 1.44 PASS HET 4 2 0.98 1355
3700663155_r13 chr20 62351692 62367262 LAMA5 DUP 3 2 10.8 1.43 PASS HET 10 6 0.96 15570
471200525_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -50.25 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
471200525_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.28 0.69 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700663593_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -44.6 0.52 PASS HET 40 7 0.97 52160
3700663593_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -18.83 0.58 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700650952_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.73 1.51 PASS HET 4 2 0.99 1355
3700650952_r13 chr20 62351692 62367262 LAMA5 DUP 3 2 13.71 1.54 PASS HET 10 6 0.99 15570
3700651432_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 5.58 1.42 PASS HET 4 2 0.93 1355
3700651432_r13 chr20 62351692 62367262 LAMA5 DUP 3 2 12.46 1.49 PASS HET 10 6 0.9 15570
3700651025_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -52.77 0.5 PASS HET 48 10 0.95 57351
3700663367_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DUP 3 2 12.7 1.46 PASS HET 12 8 0.96 7409
3700652113_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -52.61 0.47 PASS HET 40 7 0.98 52160
3700652113_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -18.6 0.67 PASS HET 6 3 0.83 4073
3700663199_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -42.08 0.54 PASS HET 40 7 0.96 52160
3700663199_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.52 0.65 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700651481_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -56.51 0.46 PASS HET 48 10 0.98 57351
3700651484_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DUP 3 2 13.99 1.51 PASS HET 12 8 1.0 7409
3700650984_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -53.88 0.45 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700650984_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -19.31 0.61 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700652168_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DUP 3 2 14.28 1.53 PASS HET 12 8 0.95 7409
3700648890_r13 chr2 110123336 110204993 NPHP1 DEL 0 2 -1648.55 0.0 PASS HOM 64 20 1.0 81657
3700648890_r13 chr22 18912710 18936584 PRODH DEL 1 2 -63.77 0.5 PASS HET 36 14 1.0 23874
3700650199_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -44.32 0.54 PASS HET 40 7 0.94 52160
3700650199_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.04 0.68 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700650199_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DEL 1 2 -16.56 0.51 PASS HET 4 2 1.0 1355
3700652017_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -49.91 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700652017_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -16.54 0.69 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700652153_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -58.26 0.44 PASS HET 48 10 0.98 57351
3700651395_r13 chr1 196825430 196827018 CFHR1 DEL 1 2 -18.41 0.56 PASS HET 5 2 1.0 1588
3700651395_r13 chr1 196828136 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -41.74 0.55 PASS HET 28 12 0.96 90626
3599846892_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1941.0 0.0 PASS HOM 48 10 1.0 57351
3700651325_r13 chr1 196825430 196827018 CFHR1 DEL 1 2 -22.43 0.48 PASS HET 5 2 1.0 1588
3700651325_r13 chr1 196828136 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -44.69 0.53 PASS HET 28 12 0.96 90626
3700651500_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -49.18 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651500_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.16 0.67 PASS HET 6 3 0.84 4073
3601213931_r13 chr1 196747447 196832209 CFH,CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2212.92 0.01 PASS HOM 49 11 0.98 84762
3601213931_r13 chr22 18912710 18936584 PRODH DEL 1 2 -66.14 0.51 PASS HET 36 14 1.0 23874
3574259226_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -51.1 0.48 PASS HET 40 7 1.0 52160
3574259226_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.03 0.67 PASS HET 6 3 0.84 4073
471200531_r13 chr1 193122001 193142066 CDC73 DEL 1 2 -36.01 0.46 PASS HET 13 7 1.0 20065
471200531_r13 chr1 193150257 196715771 CDC73,CFH DEL 1 2 -76.06 0.51 PASS HET 95 20 0.97 3565514
471142243_r13 chr1 196825430 196827018 CFHR1 DEL 1 2 -18.12 0.57 PASS HET 5 2 1.0 1588
471142243_r13 chr1 196828136 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -44.22 0.53 PASS HET 28 12 0.96 90626
471142244_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -49.07 0.49 PASS HET 48 10 0.97 57351
3700651454_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -38.39 0.55 PASS HET 40 7 0.95 52160
3700651454_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.0 0.66 PASS HET 6 3 0.84 4073
3619658683_r13 chr1 196774858 196789426 CFHR3 DEL 1 2 -32.68 0.5 PASS HET 17 4 1.0 14568
3619658683_r13 chr1 196789786 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -33.41 0.54 PASS HET 28 6 0.86 42423
471141422_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -47.57 0.53 PASS HET 48 10 0.96 57351
3700652037_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -44.05 0.53 PASS HET 40 7 0.99 52160
3700652037_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -18.7 0.64 PASS HET 6 3 0.84 4073
471140803_r13 chr1 196825430 196827018 CFHR1 DEL 1 2 -25.02 0.41 PASS HET 5 2 1.0 1588
471140803_r13 chr1 196828136 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -43.95 0.53 PASS HET 28 12 0.96 90626
471204507_r13 chr16 1198582 1223668 CACNA1H DUP 3 2 39.35 1.51 PASS HET 69 30 0.98 25086
3700650063_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DEL 1 2 -51.17 0.51 PASS HET 29 17 0.96 12090
3700650063_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -42.09 0.51 PASS HET 35 5 0.99 20224
3700650063_r13 chr1 196825430 196832209 CFHR1 DEL 0 2 -1028.86 0.0 PASS HOM 13 5 1.0 6779
3700650063_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -40.27 0.49 PASS HET 22 9 1.0 30771
3700663401_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -48.49 0.5 PASS HET 40 7 0.98 52160
3700663401_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -15.54 0.69 PASS HET 6 3 0.84 4073
3700651388_r13 chr1 196747447 196832209 CFH,CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -58.87 0.44 PASS HET 49 11 0.96 84762
3700663209_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -42.26 0.54 PASS HET 40 7 0.92 52160
3700663209_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -17.64 0.66 PASS HET 6 3 0.84 4073
471204218_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -53.19 0.51 PASS HET 48 10 0.97 57351
471204218_r13 chr22 18912710 18936584 PRODH DUP 3 2 28.28 1.49 PASS HET 36 14 0.95 23874
3700650974_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -44.48 0.5 PASS HET 40 7 0.98 52160
3700650974_r13 chr1 196828136 196832209 CFHR1 DEL 1 2 -15.37 0.7 PASS HET 6 3 0.83 4073
3700663175_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DUP 3 2 13.33 1.46 PASS HET 12 8 0.97 7409
3700648923_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DEL 1 2 -29.44 0.56 PASS HET 12 8 1.0 7409
3619658685_r13 chr1 196774858 196832209 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -56.96 0.46 PASS HET 48 10 0.98 57351
3700648995_r13 chr1 196825430 196827018 CFHR1 DEL 1 2 -18.59 0.55 PASS HET 5 2 1.0 1588
3700648995_r13 chr1 196828136 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -44.63 0.52 PASS HET 28 12 0.96 90626
3700652106_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 7.06 1.53 PASS HET 4 2 0.98 1355
3700652106_r13 chr20 62351692 62367262 LAMA5 DUP 3 2 13.35 1.5 PASS HET 10 6 0.99 15570
3700652040_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.06 1.46 PASS HET 4 2 0.77 1355
3700651008_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -59.3 0.47 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651008_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -21.44 0.69 PASS HET 8 3 0.87 4313
3574258969_r13 chr9 133064374 133071783 CEL DUP 4 2 20.05 1.96 PASS HET 12 8 0.92 7409
3700652187_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -54.66 0.48 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700652187_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1281.7 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700652187_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -42.54 0.52 PASS HET 22 9 1.0 30771
3700650216_r13 chr1 16044434 16056524 CLCNKB DEL 1 2 -54.7 0.49 PASS HET 29 17 1.0 12090
3700651030_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -55.45 0.47 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700651030_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1273.97 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700651030_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -46.66 0.48 PASS HET 22 9 1.0 30771
3700651000_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 7.37 1.58 PASS HET 4 2 0.97 1355
3700651324_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -55.04 0.49 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651324_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -20.89 0.68 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700652145_r13 chr1 16044434 16056961 CLCNKB DUP 3 2 25.48 1.53 PASS HET 30 18 0.96 12527
3700652145_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.51 1.47 PASS HET 4 2 0.77 1355
3700651492_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -46.33 0.51 PASS HET 40 7 0.99 52160
3700651492_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -21.72 0.59 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700663606_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -55.95 0.47 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700663606_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1257.33 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700663606_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -47.84 0.46 PASS HET 22 9 1.0 30771
471142226_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -47.27 0.56 PASS HET 40 7 0.95 52160
471142226_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -25.64 0.58 PASS HET 8 3 0.88 4313
471201190_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2094.11 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3619659360_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -59.71 0.49 PASS HET 40 7 1.0 52160
3619659360_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -26.65 0.6 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700651480_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.22 1.49 PASS HET 4 2 0.85 1355
3700663400_r13 chr1 16044434 16057150 CLCNKB DUP 3 2 24.81 1.53 PASS HET 31 18 0.96 12716
3700663400_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.6 1.48 PASS HET 4 2 0.89 1355
3574259133_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.47 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
3574259133_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -25.23 0.61 PASS HET 8 3 0.88 4313
3619658691_r13 chr8 142876667 142877112 CYP11B1 DUP 3 2 7.7 1.43 PASS HET 3 2 0.99 445
3619658691_r13 chr8 142914690 142915137 CYP11B2 DEL 1 2 -15.44 0.62 PASS HET 3 2 1.0 447
3619658679_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 5.62 1.41 PASS HET 4 2 0.77 1355
471203204_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -1890.16 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3700648980_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -50.77 0.53 PASS HET 40 7 0.98 52160
3700648980_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -21.37 0.64 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700652105_r13 chr8 142914690 142915137 CYP11B2 DEL 1 2 -14.1 0.58 PASS HET 3 2 1.0 447
471141418_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.29 1.43 PASS HET 4 2 0.75 1355
3700663414_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -49.63 0.5 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700663414_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1026.16 0.0 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700663414_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -42.83 0.49 PASS HET 22 9 1.0 30771
471141427_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.34 0.49 PASS HET 40 7 1.0 52160
471141427_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.73 0.61 PASS HET 8 3 0.88 4313
3619658688_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -57.02 0.47 PASS HET 40 7 1.0 52160
3619658688_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -22.68 0.61 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700663592_r13 chr1 16044434 16057150 CLCNKB DUP 3 2 23.29 1.49 PASS HET 31 18 0.96 12716
3700663592_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 6.48 1.53 PASS HET 4 2 0.94 1355
471141746_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -50.91 0.53 PASS HET 40 7 0.98 52160
471141746_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -25.67 0.58 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700652186_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -56.52 0.5 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700652186_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.57 0.65 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700652094_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -48.05 0.53 PASS HET 40 7 0.99 52160
3700652094_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -21.37 0.64 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700651503_r13 chr1 16044434 16056961 CLCNKB DUP 3 2 24.9 1.51 PASS HET 30 18 0.96 12527
3700650972_r13 chr1 196825430 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -56.72 0.48 PASS HET 37 14 1.0 93332
3619658690_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -54.02 0.53 PASS HET 40 7 1.0 52160
3619658690_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -24.81 0.61 PASS HET 8 3 0.88 4313
3619659351_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 5.76 1.44 PASS HET 4 2 0.87 1355
3700663208_r13 chr1 16044434 16057150 CLCNKB DUP 3 2 25.95 1.54 PASS HET 31 18 0.94 12716
3700663208_r13 chr9 133070428 133071783 CEL DUP 3 2 7.71 1.57 PASS HET 4 2 0.85 1355
471140786_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -52.28 0.52 PASS HET 40 7 0.99 52160
471140786_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -22.9 0.61 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700651380_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -52.58 0.51 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651380_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -24.34 0.59 PASS HET 8 3 0.88 4313
3619659362_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -48.09 0.56 PASS HET 40 7 0.97 52160
3619659362_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -19.83 0.7 PASS HET 8 3 0.87 4313
471141429_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -51.22 0.52 PASS HET 40 7 0.98 52160
471141429_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.91 0.63 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700663222_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -52.48 0.49 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700663222_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1206.13 0.01 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700663222_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -43.05 0.51 PASS HET 22 9 1.0 30771
3619659363_r13 chr8 142876667 142877112 CYP11B1 DUP 3 2 8.07 1.46 PASS HET 3 2 1.0 445
3601213777_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -46.49 0.57 PASS HET 40 7 0.97 52160
3601213777_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.48 0.63 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700663566_r13 chr1 196825430 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -55.7 0.48 PASS HET 37 14 0.99 93332
3579447764_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 0 2 -2331.63 0.0 PASS HOM 50 10 1.0 57591
3579447764_r13 chr16 16149543 16221867 ABCC6 DUP 3 2 32.04 1.53 PASS HET 49 26 0.96 72324
3579447764_r13 chr22 18912710 18936584 PRODH DEL 1 2 -67.15 0.51 PASS HET 36 14 0.98 23874
471203424_r13 chr7 33155590 33155770 BBS9 DEL 0 2 -85.12 0.1 PASS HET 2 1 0.5 180
3700652049_r13 chr1 16044434 16057150 CLCNKB DUP 3 2 24.78 1.5 PASS HET 31 18 0.97 12716
471141430_r13 chr8 142876667 142877112 CYP11B1 DUP 3 2 7.99 1.44 PASS HET 3 2 1.0 445
471141430_r13 chr8 142914690 142915137 CYP11B2 DEL 1 2 -15.9 0.59 PASS HET 3 2 1.0 447
3700651488_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -59.6 0.46 PASS HET 40 7 1.0 52160
3700651488_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -23.04 0.64 PASS HET 8 3 0.87 4313
3700651510_r13 chr1 196774858 196795082 CFHR3 DEL 1 2 -57.76 0.44 PASS HET 35 5 1.0 20224
3700651510_r13 chr1 196825430 196832449 CFHR1 DEL 0 2 -1165.81 0.01 PASS HOM 15 5 1.0 7019
3700651510_r13 chr1 196887991 196918762 CFHR4 DEL 1 2 -44.09 0.49 PASS HET 22 9 1.0 30771
3700663374_r13 chr1 196825430 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -56.7 0.48 PASS HET 37 14 1.0 93332
3700652032_r13 chr1 196825430 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -59.07 0.5 PASS HET 37 14 1.0 93332
3574101803_r13 chr1 196774858 196832449 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -64.39 0.47 PASS HET 50 10 0.99 57591
3574101803_r13 chr18 36215868 36257096 MOCOS DUP 3 2 5.44 1.36 PASS HET 8 5 0.73 41228
3700651452_r13 chr1 196825430 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -57.73 0.49 PASS HET 37 14 1.0 93332
3700651012_r13 chr1 196774858 196827018 CFHR3,CFHR1 DEL 1 2 -43.78 0.52 PASS HET 40 7 0.98 52160
3700651012_r13 chr1 196828136 196832449 CFHR1 DEL 1 2 -19.97 0.6 PASS HET 8 3 0.88 4313
3700663182_r13 chr1 196825430 196918762 CFHR1,CFHR4 DEL 1 2 -55.41 0.5 PASS HET 37 14 1.0 93332
399 rows