## htsjdk.samtools.metrics.StringHeader
# CollectInsertSizeMetrics --Histogram_FILE V4_0001_RNA_0005_23H5VFLT4_s47_collectinsertsize.pdf --INPUT V4_0001_RNA_0005_23H5VFLT4_s47.Aligned.sortedByCoord.out.bam --OUTPUT V4_0001_RNA_0005_23H5VFLT4_s47_collectinsertsize.txt --DEVIATIONS 10.0 --MINIMUM_PCT 0.05 --METRIC_ACCUMULATION_LEVEL ALL_READS --INCLUDE_DUPLICATES false --ASSUME_SORTED true --STOP_AFTER 0 --VERBOSITY INFO --QUIET false --VALIDATION_STRINGENCY STRICT --COMPRESSION_LEVEL 5 --MAX_RECORDS_IN_RAM 500000 --CREATE_INDEX false --CREATE_MD5_FILE false --help false --version false --showHidden false --USE_JDK_DEFLATER false --USE_JDK_INFLATER false
## htsjdk.samtools.metrics.StringHeader
# Started on: Sat May 16 09:28:11 GMT 2026
## METRICS CLASS picard.analysis.InsertSizeMetrics
MEDIAN_INSERT_SIZE MODE_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_95_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT SAMPLE LIBRARY READ_GROUP
178 107 89 6 604469 213.129386 201.160168 287614213 FR 47 87 119 147 179 229 919 3011 8609 18589 77491
## HISTOGRAM java.lang.Integer
insert_size All_Reads.fr_count
6 4
7 2
8 22
9 29
10 61
11 17
12 208
13 206
14 1737
15 7310
16 15066
17 13978
18 13451
19 12927
20 12196
21 16224
22 17174
23 12693
24 12739
25 12652
26 16084
27 20299
28 23083
29 27136
30 28269
31 30829
32 36916
33 39256
34 42298
35 42408
36 44292
37 49926
38 56267
39 64943
40 73533
41 83773
42 96350
43 109347
44 120128
45 129466
46 136327
47 144958
48 153862
49 171861
50 187500
51 206833
52 233955
53 258365
54 275101
55 296623
56 311207
57 319642
58 336448
59 356563
60 378350
61 412676
62 453187
63 485892
64 525225
65 554989
66 581144
67 604989
68 626200
69 648143
70 691893
71 723354
72 760928
73 819176
74 866363
75 912781
76 956409
77 996637
78 1007189
79 1045705
80 1076068
81 1097888
82 1158527
83 1211547
84 1258344
85 1317341
86 1364499
87 1392166
88 1435417
89 1450353
90 1467243
91 1487271
92 1520528
93 1560499
94 1597198
95 1638017
96 1675089
97 1706891
98 1730557
99 1724477
100 1723148
101 1733445
102 1733547
103 1739668
104 1764600
105 1773197
106 1795052
107 1809247
108 1805334
109 1797752
110 1774426
111 1745752
112 1720510
113 1708058
114 1697453
115 1704391
116 1703778
117 1689080
118 1696350
119 1671843
120 1619677
121 1611396
122 1586767
123 1549319
124 1533622
125 1523551
126 1505069
127 1495978
128 1484253
129 1450319
130 1432099
131 1402530
132 1366070
133 1339714
134 1313704
135 1283425
136 1278581
137 1253059
138 1231798
139 1224416
140 1203988
141 1177134
142 1155678
143 1123873
144 1089247
145 1076608
146 1059296
147 1042759
148 1026964
149 1019466
150 996934
151 986996
152 968187
153 935678
154 922887
155 896901
156 875172
157 859829
158 846974
159 830911
160 820664
161 809302
162 791192
163 783373
164 766919
165 746527
166 738374
167 724474
168 710317
169 703387
170 697640
171 680621
172 669680
173 654787
174 637945
175 637143
176 623719
177 606363
178 599952
179 593331
180 581488
181 575679
182 563558
183 553037
184 548918
185 546588
186 526219
187 523441
188 519958
189 508937
190 502154
191 505116
192 491140
193 483454
194 479320
195 470801
196 467005
197 458036
198 451914
199 444225
200 435245
201 432587
202 429611
203 423425
204 415751
205 410867
206 406294
207 401450
208 395250
209 389834
210 382684
211 377737
212 372161
213 366306
214 365927
215 360824
216 354543
217 351532
218 347404
219 343255
220 340607
221 332400
222 327560
223 325198
224 323650
225 322429
226 313213
227 310058
228 306813
229 300602
230 296208
231 292834
232 290003
233 285869
234 283829
235 280683
236 282606
237 273242
238 266969
239 266771
240 261666
241 259860
242 255107
243 251912
244 247776
245 244759
246 241848
247 237508
248 235511
249 231021
250 228225
251 228030
252 222858
253 221755
254 216670
255 216365
256 212051
257 209430
258 206934
259 205850
260 203293
261 200749
262 200523
263 197081
264 193628
265 192304
266 189187
267 186476
268 184858
269 182094
270 177609
271 178834
272 176292
273 175146
274 173759
275 169752
276 171765
277 166342
278 165583
279 163051
280 162249
281 158308
282 157407
283 154667
284 153829
285 150713
286 148513
287 147013
288 147864
289 145301
290 143308
291 143123
292 142689
293 138341
294 141393
295 137146
296 137410
297 133648
298 133251
299 132373
300 129097
301 128619
302 127538
303 125094
304 125441
305 122619
306 122337
307 120195
308 121494
309 118742
310 119748
311 119460
312 116736
313 117576
314 114477
315 113217
316 114314
317 109277
318 112592
319 110270
320 108169
321 108439
322 108646
323 106079
324 107043
325 105275
326 101781
327 103516
328 102448
329 103143
330 101625
331 101707
332 99300
333 96946
334 97106
335 97324
336 96116
337 96014
338 95298
339 93673
340 93247
341 94140
342 92453
343 92011
344 90049
345 90284
346 90478
347 88755
348 88912
349 88729
350 87650
351 85834
352 87576
353 86170
354 84690
355 85829
356 84410
357 82956
358 81648
359 83088
360 82885
361 83648
362 82069
363 78995
364 81156
365 78616
366 81037
367 81036
368 79081
369 79571
370 77740
371 76844
372 77672
373 77649
374 75150
375 76135
376 79007
377 75538
378 75352
379 74767
380 73260
381 74000
382 74690
383 73230
384 73549
385 75181
386 73374
387 72153
388 73646
389 72282
390 72558
391 73956
392 73222
393 71574
394 73112
395 71669
396 72415
397 70753
398 69101
399 70329
400 68202
401 69173
402 69232
403 70809
404 69083
405 68836
406 67780
407 66563
408 68584
409 68570
410 67771
411 67998
412 69411
413 68546
414 66018
415 66918
416 69392
417 66809
418 68146
419 65754
420 64283
421 63478
422 66657
423 65910
424 65922
425 64987
426 63385
427 64234
428 63947
429 64341
430 63878
431 61979
432 60823
433 61052
434 61061
435 59827
436 59368
437 60875
438 62903
439 60155
440 59135
441 59538
442 59355
443 61019
444 59074
445 59301
446 58084
447 58665
448 60361
449 58829
450 59365
451 57929
452 57200
453 57186
454 57103
455 57640
456 58403
457 58340
458 56552
459 57171
460 57302
461 55885
462 54898
463 56178
464 55131
465 56064
466 55942
467 55750
468 54816
469 54203
470 53973
471 54843
472 53754
473 54545
474 52995
475 53596
476 53814
477 52374
478 52433
479 52207
480 52076
481 52982
482 50800
483 53004
484 51360
485 50580
486 53191
487 51511
488 50577
489 51049
490 51752
491 51578
492 51241
493 50429
494 51173
495 49724
496 50982
497 50603
498 49184
499 48608
500 49060
501 50806
502 49259
503 48996
504 47611
505 48821
506 48827
507 49237
508 48437
509 48967
510 47530
511 47511
512 49195
513 48144
514 46465
515 48128
516 48000
517 48255
518 47919
519 47224
520 48793
521 47698
522 46728
523 48714
524 47990
525 46768
526 46665
527 47728
528 46194
529 46600
530 45777
531 47090
532 47255
533 48704
534 47405
535 46047
536 47327
537 46997
538 46314
539 46613
540 46334
541 46474
542 47144
543 45323
544 46457
545 46114
546 45428
547 44800
548 45792
549 47106
550 44477
551 44659
552 45501
553 44640
554 45282
555 45814
556 45105
557 46595
558 45791
559 44603
560 44775
561 44627
562 45457
563 44333
564 44883
565 43661
566 44326
567 43711
568 44557
569 44037
570 42913
571 44332
572 44763
573 43792
574 43174
575 43568
576 41916
577 42729
578 43804
579 42460
580 43229
581 42669
582 42752
583 42372
584 43275
585 41967
586 43267
587 43053
588 43125
589 42450
590 43142
591 43393
592 42712
593 40891
594 41973
595 41898
596 42380
597 43345
598 41764
599 40905
600 41880
601 40741
602 41428
603 40463
604 40781
605 41323
606 40271
607 41085
608 40242
609 41365
610 41009
611 42393
612 40771
613 40252
614 40439
615 40241
616 40878
617 41040
618 40085
619 41549
620 40563
621 40981
622 40495
623 40118
624 40764
625 40940
626 39579
627 40332
628 40031
629 40338
630 41114
631 39731
632 40402
633 40239
634 40327
635 41298
636 39949
637 41105
638 41303
639 40852
640 41283
641 41797
642 40234
643 40852
644 40485
645 41317
646 40276
647 41275
648 42232
649 40799
650 40056
651 40939
652 41063
653 40208
654 41276
655 40105
656 40653
657 40979
658 39273
659 40255
660 41857
661 39445
662 40866
663 40098
664 40906
665 40567
666 40736
667 40161
668 40805
669 41200
670 41128
671 40591
672 41639
673 42163
674 41883
675 41441
676 40831
677 40340
678 41189
679 41761
680 41503
681 41450
682 40380
683 40573
684 40582
685 40726
686 40094
687 41153
688 41028
689 41272
690 39184
691 39778
692 40077
693 40361
694 40122
695 40258
696 39431
697 39339
698 39207
699 39543
700 40053
701 39491
702 39423
703 40649
704 38235
705 38485
706 38764
707 38891
708 38543
709 39057
710 39006
711 39848
712 39040
713 39124
714 39421
715 39399
716 38276
717 38654
718 39378
719 38857
720 38972
721 38598
722 39264
723 38704
724 38871
725 38155
726 39592
727 38177
728 38123
729 39384
730 38695
731 38575
732 38451
733 37631
734 37889
735 39168
736 38233
737 37187
738 37871
739 38288
740 38009
741 38199
742 36885
743 37496
744 36576
745 36999
746 37202
747 36836
748 36495
749 36770
750 36657
751 36226
752 38229
753 36337
754 37787
755 36371
756 35701
757 36526
758 36438
759 36262
760 36789
761 36208
762 35407
763 35695
764 35570
765 35129
766 36847
767 36333
768 35134
769 34918
770 35730
771 36614
772 35636
773 35177
774 35782
775 35885
776 35914
777 35138
778 35328
779 35577
780 34220
781 35923
782 34403
783 34264
784 34057
785 34885
786 34155
787 34706
788 34740
789 33654
790 33271
791 32994
792 33965
793 33760
794 34524
795 34826
796 35248
797 34155
798 34750
799 32640
800 33274
801 33879
802 33174
803 33720
804 33419
805 33622
806 34679
807 33678
808 34605
809 34374
810 32668
811 33830
812 33087
813 33143
814 33644
815 32876
816 34949
817 33581
818 32893
819 33208
820 32479
821 33373
822 33938
823 32810
824 31865
825 32689
826 32208
827 32747
828 32326
829 32630
830 32483
831 32863
832 31373
833 33253
834 32909
835 33135
836 33116
837 31407
838 32387
839 32819
840 32441
841 32803
842 32689
843 32763
844 33065
845 32096
846 31184
847 31601
848 32558
849 31663
850 32245
851 31404
852 31718
853 33046
854 32840
855 32522
856 33072
857 31482
858 33158
859 32305
860 33243
861 32363
862 32038
863 31347
864 32265
865 32341
866 32032
867 32925
868 33468
869 33193
870 33218
871 34065
872 32742
873 32515
874 32952
875 32196
876 32368
877 33402
878 32385
879 33197
880 33484
881 33130
882 31620
883 33205
884 32147
885 32451
886 33491
887 33493
888 33152
889 33385
890 32913
891 32236
892 33918
893 33115
894 32067
895 32352
896 32482
897 32387
898 32449
899 31850
900 32599
901 32068
902 33556
903 31057
904 32330
905 32438
906 32439
907 31702
908 31483
909 30970
910 31705
911 30384
912 32902
913 31948
914 31564
915 32221
916 31254
917 32971
918 31070
919 32654
920 31080
921 31162
922 32415
923 30905
924 31600
925 30980
926 31342
927 30865
928 30006
929 31080
930 32122
931 32818
932 31633
933 31149
934 31020
935 31375
936 31051
937 30024
938 29464
939 31107
940 30584
941 30904
942 30638
943 30809
944 30973
945 30382
946 31034
947 31344
948 31081
949 30975
950 31244
951 31129
952 30712
953 30045
954 31044
955 31295
956 31197
957 29560
958 30014
959 30635
960 29873
961 31209
962 29219
963 29691
964 29971
965 30127
966 29556
967 30668
968 30178
969 30109
970 31171
971 30797
972 30762
973 29791
974 30548
975 28165
976 29870
977 29627
978 29010
979 29438
980 29688
981 29211
982 28493
983 28288
984 29042
985 29370
986 29836
987 29448
988 29360
989 29406
990 30517
991 30170
992 29369
993 29557
994 29457
995 29916
996 29739
997 29492
998 29975
999 30634
1000 30289
1001 30803
1002 30055
1003 29038
1004 29673
1005 29690
1006 28946
1007 27452
1008 29206
1009 29456
1010 29153
1011 29333
1012 29181
1013 28181
1014 30046
1015 28822
1016 29257
1017 28456
1018 29622
1019 29766
1020 28871
1021 29150
1022 27840
1023 29232
1024 28014
1025 28879
1026 29292
1027 28650
1028 29079
1029 28913
1030 28575
1031 27728
1032 27927
1033 28798
1034 28920
1035 28731
1036 28900
1037 27728
1038 28241
1039 27684
1040 28184
1041 28844
1042 28053
1043 27987
1044 28379
1045 27194
1046 28447
1047 28694
1048 27785
1049 27478
1050 27796
1051 28415
1052 27928
1053 27827
1054 26592
1055 26651
1056 26121
1057 28456
1058 27306
1059 27772
1060 27015
1061 27289
1062 27136
1063 27081
1064 26828
1065 26702
1066 27793
1067 27003
1068 27369