## htsjdk.samtools.metrics.StringHeader
# CollectInsertSizeMetrics --Histogram_FILE V4_0001_RNA_0005_23H5VFLT4_s38_collectinsertsize.pdf --INPUT V4_0001_RNA_0005_23H5VFLT4_s38.Aligned.sortedByCoord.out.bam --OUTPUT V4_0001_RNA_0005_23H5VFLT4_s38_collectinsertsize.txt --DEVIATIONS 10.0 --MINIMUM_PCT 0.05 --METRIC_ACCUMULATION_LEVEL ALL_READS --INCLUDE_DUPLICATES false --ASSUME_SORTED true --STOP_AFTER 0 --VERBOSITY INFO --QUIET false --VALIDATION_STRINGENCY STRICT --COMPRESSION_LEVEL 5 --MAX_RECORDS_IN_RAM 500000 --CREATE_INDEX false --CREATE_MD5_FILE false --help false --version false --showHidden false --USE_JDK_DEFLATER false --USE_JDK_INFLATER false
## htsjdk.samtools.metrics.StringHeader
# Started on: Sat May 16 09:29:22 GMT 2026
## METRICS CLASS picard.analysis.InsertSizeMetrics
MEDIAN_INSERT_SIZE MODE_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_95_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT SAMPLE LIBRARY READ_GROUP
188 107 97 6 626970 228.612926 223.334441 260868038 FR 53 97 131 163 195 253 1045 3225 9035 19239 78653
## HISTOGRAM java.lang.Integer
insert_size All_Reads.fr_count
6 3
7 27
8 14
9 24
10 19
11 51
12 182
13 169
14 1678
15 6997
16 13241
17 13228
18 12391
19 11841
20 11544
21 16157
22 17331
23 12268
24 12480
25 12611
26 16834
27 21672
28 23944
29 27783
30 27488
31 29369
32 34142
33 36135
34 39178
35 40304
36 42650
37 46683
38 52158
39 59848
40 67660
41 77879
42 88015
43 97941
44 106405
45 114024
46 120190
47 126280
48 133586
49 146421
50 160266
51 177939
52 198792
53 218231
54 234199
55 248245
56 259704
57 264857
58 278417
59 293652
60 308411
61 338257
62 370874
63 399696
64 427259
65 456605
66 473028
67 495029
68 511536
69 526146
70 558000
71 586897
72 622863
73 665039
74 706654
75 743063
76 779309
77 809884
78 826732
79 852496
80 880555
81 905605
82 955528
83 995433
84 1037307
85 1087702
86 1135047
87 1150619
88 1188723
89 1203385
90 1224796
91 1238092
92 1272147
93 1300643
94 1340266
95 1382149
96 1403832
97 1435671
98 1468252
99 1459849
100 1473567
101 1472819
102 1474446
103 1488932
104 1512277
105 1517206
106 1545719
107 1560339
108 1548490
109 1559951
110 1545248
111 1514610
112 1500906
113 1498009
114 1484814
115 1486149
116 1493956
117 1479712
118 1488019
119 1465587
120 1442763
121 1414418
122 1403704
123 1371638
124 1358655
125 1357850
126 1336289
127 1330663
128 1316871
129 1296968
130 1279289
131 1251359
132 1214760
133 1195965
134 1169587
135 1148128
136 1144021
137 1131568
138 1112889
139 1096207
140 1080165
141 1062063
142 1039938
143 1017483
144 988617
145 972920
146 957652
147 939720
148 934495
149 923902
150 907028
151 893771
152 882055
153 859883
154 837087
155 819520
156 799340
157 795646
158 779339
159 765649
160 757352
161 743099
162 728923
163 715995
164 704985
165 688655
166 676619
167 666650
168 657703
169 651293
170 646660
171 634972
172 623161
173 604845
174 594500
175 586683
176 574059
177 565483
178 558197
179 549002
180 540058
181 535945
182 530523
183 520615
184 514780
185 512056
186 496957
187 492091
188 484233
189 478911
190 473485
191 465285
192 460387
193 456124
194 448459
195 441456
196 441945
197 430471
198 427014
199 420605
200 412183
201 406861
202 404826
203 398470
204 393964
205 388454
206 381183
207 379574
208 375561
209 370380
210 361171
211 360035
212 355480
213 353499
214 350146
215 346974
216 339387
217 334945
218 329991
219 327081
220 321026
221 318462
222 314426
223 313224
224 308766
225 303552
226 304446
227 298012
228 293047
229 288359
230 285078
231 280513
232 278811
233 275710
234 271230
235 268169
236 269233
237 263376
238 257149
239 253708
240 251451
241 248694
242 248645
243 243070
244 241218
245 235315
246 235078
247 231341
248 228974
249 225325
250 221533
251 220152
252 216686
253 214483
254 212236
255 209236
256 207682
257 204363
258 200799
259 200534
260 195857
261 196888
262 192464
263 190607
264 190695
265 185756
266 186783
267 182593
268 180872
269 179030
270 173802
271 173823
272 172000
273 171054
274 168525
275 166641
276 164424
277 162733
278 162097
279 158081
280 156164
281 155820
282 152748
283 151520
284 149714
285 147655
286 148039
287 143324
288 144003
289 141748
290 140512
291 137895
292 137498
293 138585
294 134669
295 134011
296 132943
297 130976
298 128801
299 128698
300 126324
301 127164
302 125083
303 124578
304 121526
305 120600
306 117737
307 119126
308 119110
309 118794
310 116096
311 112930
312 112830
313 113386
314 112502
315 111939
316 108866
317 107840
318 107546
319 107026
320 106131
321 104666
322 104408
323 104921
324 103248
325 101208
326 102139
327 99643
328 99774
329 98633
330 97256
331 97723
332 95885
333 96334
334 93485
335 94359
336 92663
337 93329
338 91013
339 93083
340 90644
341 90602
342 87603
343 88387
344 87955
345 86314
346 86503
347 85046
348 86114
349 84341
350 85370
351 83685
352 82740
353 83208
354 81816
355 81127
356 81761
357 82076
358 78726
359 79962
360 79658
361 77565
362 77619
363 77185
364 77756
365 77643
366 75765
367 76600
368 75327
369 75152
370 74630
371 74068
372 73833
373 74343
374 73243
375 73436
376 72906
377 72534
378 71797
379 72129
380 70249
381 70286
382 69974
383 69779
384 71545
385 70020
386 69998
387 69170
388 69376
389 67552
390 68551
391 68698
392 68519
393 67578
394 67516
395 66699
396 66418
397 66286
398 66836
399 66356
400 65377
401 67091
402 65771
403 65762
404 66015
405 65003
406 64704
407 64321
408 64994
409 63961
410 62438
411 65584
412 63809
413 62365
414 62804
415 64112
416 62567
417 63310
418 63144
419 62215
420 59962
421 59599
422 61650
423 60579
424 61131
425 60602
426 60320
427 59844
428 60423
429 58117
430 59038
431 59290
432 59503
433 57378
434 57600
435 55962
436 56535
437 57123
438 58083
439 56797
440 56278
441 55760
442 55782
443 55303
444 55703
445 55842
446 55380
447 55205
448 56564
449 54493
450 54885
451 54751
452 54562
453 53669
454 53794
455 53809
456 52725
457 53112
458 53142
459 53060
460 52756
461 51636
462 51243
463 52728
464 52326
465 52507
466 51552
467 51430
468 49906
469 50581
470 50746
471 51299
472 50295
473 49597
474 50139
475 49418
476 50357
477 49398
478 48991
479 47776
480 48266
481 48991
482 47671
483 48016
484 48751
485 47699
486 47499
487 48802
488 48686
489 47343
490 47941
491 47002
492 47132
493 46968
494 46602
495 47213
496 48966
497 46644
498 46464
499 45189
500 46263
501 46228
502 46186
503 45982
504 46295
505 44469
506 45693
507 44794
508 45559
509 45058
510 44483
511 44477
512 45026
513 44198
514 44034
515 44582
516 43338
517 43476
518 44035
519 44653
520 45281
521 43850
522 43346
523 44507
524 42524
525 43788
526 43397
527 43668
528 43084
529 43449
530 43133
531 42826
532 43121
533 43571
534 43689
535 44305
536 43341
537 43514
538 42539
539 43438
540 43620
541 43315
542 42601
543 42143
544 42549
545 42827
546 43357
547 43410
548 42242
549 42520
550 42297
551 41862
552 42354
553 42897
554 42558
555 43172
556 41928
557 41786
558 41927
559 41809
560 41473
561 41398
562 41947
563 40905
564 42067
565 42150
566 41196
567 41407
568 41444
569 41655
570 41818
571 41657
572 40117
573 40767
574 41060
575 39918
576 41001
577 39443
578 39670
579 40764
580 40362
581 40744
582 40861
583 39156
584 39332
585 39989
586 39813
587 39660
588 40282
589 40731
590 38773
591 39147
592 41104
593 39733
594 38765
595 39013
596 38756
597 38861
598 40275
599 38831
600 38079
601 38732
602 38799
603 38894
604 37457
605 38215
606 38586
607 37705
608 37608
609 38275
610 39675
611 37367
612 37611
613 38567
614 38361
615 37324
616 37259
617 38041
618 37327
619 37774
620 37349
621 37774
622 38846
623 37621
624 36612
625 36971
626 37168
627 37102
628 38166
629 37001
630 36789
631 38097
632 37435
633 37860
634 38179
635 37240
636 37703
637 38564
638 37259
639 38082
640 37227
641 37470
642 38018
643 37334
644 38090
645 37846
646 38397
647 38037
648 37961
649 38110
650 37089
651 37093
652 37308
653 38034
654 39056
655 36568
656 38637
657 37062
658 36943
659 36951
660 37357
661 37587
662 37750
663 38631
664 37380
665 38587
666 37960
667 37305
668 37102
669 36722
670 38645
671 37112
672 37686
673 38049
674 38366
675 36753
676 36577
677 38205
678 38217
679 38034
680 38574
681 37513
682 36757
683 37658
684 37263
685 37111
686 36738
687 37123
688 38111
689 37818
690 37056
691 37039
692 37324
693 35983
694 38245
695 37787
696 37670
697 36484
698 36502
699 37355
700 36976
701 36110
702 37061
703 36334
704 36410
705 36074
706 36937
707 35482
708 35422
709 36735
710 36639
711 35634
712 35325
713 34351
714 36288
715 36315
716 37314
717 36441
718 36399
719 36546
720 35996
721 34962
722 36265
723 36363
724 36082
725 35597
726 35528
727 35583
728 36182
729 35286
730 36147
731 35496
732 34784
733 34423
734 35310
735 34910
736 35332
737 35141
738 34853
739 34231
740 35318
741 34683
742 34766
743 34925
744 34210
745 33868
746 34262
747 35242
748 33928
749 34437
750 34451
751 33631
752 35616
753 34233
754 33803
755 33973
756 32889
757 34345
758 33857
759 34869
760 33788
761 34541
762 33791
763 33508
764 33438
765 33488
766 33619
767 33556
768 33403
769 32961
770 32669
771 33238
772 33599
773 33576
774 32323
775 32682
776 32971
777 32579
778 32305
779 32451
780 32812
781 31498
782 31226
783 32775
784 33070
785 31952
786 32648
787 32260
788 32327
789 32768
790 32044
791 32020
792 31249
793 31515
794 31909
795 32466
796 31783
797 31849
798 32002
799 31665
800 31346
801 30107
802 31415
803 31951
804 31830
805 31506
806 31333
807 31316
808 31913
809 30487
810 31696
811 30440
812 29631
813 31201
814 31663
815 30805
816 31422
817 31383
818 30733
819 30384
820 30266
821 30371
822 30973
823 29879
824 30056
825 30120
826 30849
827 31386
828 30759
829 30811
830 29963
831 30355
832 29971
833 30680
834 30895
835 30422
836 30196
837 30167
838 30230
839 30341
840 30058
841 31310
842 30656
843 29910
844 30677
845 30448
846 30279
847 29969
848 30030
849 30063
850 29794
851 29489
852 29379
853 30263
854 29557
855 29573
856 29536
857 29666
858 29882
859 31353
860 30049
861 30013
862 30716
863 29080
864 30458
865 30608
866 29602
867 29619
868 31189
869 30715
870 30867
871 30253
872 29381
873 29692
874 30138
875 30227
876 31345
877 30043
878 30829
879 30719
880 31335
881 30618
882 30324
883 30305
884 29894
885 30187
886 29738
887 30444
888 29781
889 30277
890 30623
891 30402
892 31018
893 30436
894 29614
895 29855
896 29632
897 29808
898 30777
899 30111
900 29302
901 29999
902 29995
903 28560
904 29301
905 29328
906 30033
907 28595
908 28516
909 29037
910 29642
911 29511
912 29446
913 30043
914 30406
915 29781
916 29424
917 30101
918 28521
919 29976
920 28750
921 28298
922 29485
923 29046
924 28946
925 29861
926 29529
927 29392
928 28959
929 29151
930 29455
931 29581
932 29057
933 29737
934 28816
935 29552
936 28413
937 28313
938 28642
939 29475
940 28376
941 28676
942 28257
943 28182
944 28287
945 29064
946 29516
947 28463
948 28025
949 28619
950 28728
951 28356
952 27864
953 28252
954 28053
955 28286
956 29286
957 28519
958 28706
959 29019
960 28187
961 28265
962 29350
963 27826
964 26911
965 28136
966 27737
967 28272
968 28339
969 27844
970 28871
971 27888
972 28114
973 28333
974 28099
975 27475
976 28026
977 28488
978 27410
979 27208
980 27828
981 28399
982 27137
983 27449
984 28324
985 27195
986 28075
987 27333
988 27475
989 27818
990 27299
991 27847
992 27762
993 27369
994 27944
995 28015
996 28147
997 28361
998 27475
999 27465
1000 27439
1001 27760
1002 27688
1003 27575
1004 27021
1005 27066
1006 26126
1007 25849
1008 25993
1009 26975
1010 27641
1011 27256
1012 28221
1013 27840
1014 26777
1015 26362
1016 26611
1017 27095
1018 26776
1019 27075
1020 27003
1021 27764
1022 27342
1023 26594
1024 26219
1025 26514
1026 26702
1027 26332
1028 26469
1029 26677
1030 26505
1031 26261
1032 26096
1033 26932
1034 27264
1035 26644
1036 26908
1037 26280
1038 26301
1039 26466
1040 26244
1041 26640
1042 26843
1043 26832
1044 26008
1045 26137
1046 26229
1047 25890
1048 26196
1049 26159
1050 25617
1051 25903
1052 25408
1053 25230
1054 25026
1055 25404
1056 25884
1057 25710
1058 25388
1059 25571
1060 25138
1061 25186
1062 25889
1063 25431
1064 24836
1065 24840
1066 25025
1067 25247
1068 25111
1069 25412
1070 25485
1071 24765
1072 25887
1073 24245
1074 25400
1075 25537
1076 25123
1077 25722
1078 25294
1079 24275
1080 24788
1081 24666
1082 24820
1083 24810
1084 24857
1085 24846
1086 24816
1087 25265
1088 24386
1089 23979
1090 24988
1091 24562
1092 24479
1093 24348
1094 23830
1095 24699
1096 24378
1097 24998
1098 25273
1099 25396
1100 23514
1101 24883
1102 24623
1103 24681
1104 24991
1105 23388
1106 24575
1107 23875
1108 23696
1109 24025
1110 23987
1111 25104
1112 24536
1113 24306
1114 24075
1115 24460
1116 24182
1117 23824
1118 24534
1119 24367
1120 24397
1121 24913
1122 24309
1123 24612
1124 24142
1125 24861
1126 23528
1127 24132
1128 23881
1129 23996
1130 24387
1131 24205
1132 23967
1133 24148
1134 24757
1135 24450
1136 24445
1137 24179
1138 24386
1139 24547
1140 23868
1141 24098
1142 23553
1143 24072
1144 24497
1145 24135
1146 24542
1147 24995
1148 25029
1149 24516
1150 24727
1151 24263
1152 24891
1153 25336
1154 25469
1155 26211
1156 24659
1157 25043
1158 24494