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UBE2F--SLC25A45	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	UBE2F^ENSG00000184182.19	chr2:237987992:+	SLC25A45^ENSG00000162241.12	chr11:65376060:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1415:51732:15307	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.5628	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr11]"]
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TBC1D13--ENDOG	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	TBC1D13^ENSG00000107021.16	chr9:128806311:+	ENDOG^ENSG00000167136.7	chr9:128820739:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1237:32454:11481	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.7232	["INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.01Mb]","NEIGHBORS[8070]"]
TBC1D10C--FBXO5	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	TBC1D10C^ENSG00000175463.12	chr11:67405921:+	FBXO5^ENSG00000112029.10	chr6:152982906:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1170:24291:25704	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.3383	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr6]"]
TARDBPP4--AC012485.1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	TARDBPP4^ENSG00000253555.1	chr8:63137813:-	AC012485.1^ENSG00000225057.2	chr2:238231867:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1194:31726:6969	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.3383	["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr2]"]
TAF9P1--TAF9	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	TAF9P1^ENSG00000226353.1	chrY:17628541:+	TAF9^ENSG00000273841.5	chr5:69365270:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1369:23434:19398	.	NO_LDAS	0.0017	GC	1.8295	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chrY--chr5]"]
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SRIP1--SRI	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SRIP1^ENSG00000248660.1	chr4:58103246:+	SRI^ENSG00000075142.14	chr7:88209439:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1431:39516:4293	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5219	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr7]"]
SRFBP1--AC010255.2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	SRFBP1^ENSG00000151304.6	chr5:122022407:+	AC010255.2^ENSG00000250803.6	chr5:122179550:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1481:14098:7936	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.05Mb]","NEIGHBORS[54052]"]
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SMIM10L1--LINC01252	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SMIM10L1^ENSG00000256537.5	chr12:11190111:+	LINC01252^ENSG00000247157.7	chr12:11549590:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1268:42752:13401	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.37Mb]"]
SMC6--ZBTB3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SMC6^ENSG00000163029.16	chr2:17695152:-	ZBTB3^ENSG00000185670.9	chr11:62753282:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1155:41636:11691	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.3996	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr11]"]
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SLC45A1--CDCP2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SLC45A1^ENSG00000162426.16	chr1:8324726:+	CDCP2^ENSG00000157211.11	chr1:54152885:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2474:29404:4125	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.7819	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:45.79Mb]"]
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SLC30A7--AC093157.1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	SLC30A7^ENSG00000162695.12	chr1:100974902:+	AC093157.1^ENSG00000233184.7	chr1:101086852:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1434:28288:24302	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9656	["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.04Mb]","NEIGHBORS[44087]"]
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SLC25A25--POLA1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SLC25A25^ENSG00000148339.12	chr9:128106257:+	POLA1^ENSG00000101868.13	chrX:24996215:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1239:42065:1112	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chrX]"]
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SLC25A13--ELAPOR2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	SLC25A13^ENSG00000004864.14	chr7:96321942:-	ELAPOR2^ENSG00000164659.15	chr7:86926916:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2142:36701:25704	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.8295	["INTRACHROMOSOMAL[chr7:9.06Mb]"]
SLC1A4--BPNT2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SLC1A4^ENSG00000115902.11	chr2:65018596:+	BPNT2^ENSG00000104331.9	chr8:56980185:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1179:26144:5428	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr8]"]
SLC18B1--MED23	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	SLC18B1^ENSG00000146409.12	chr6:132796982:-	MED23^ENSG00000112282.18	chr6:131618519:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1358:47518:6353	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.8062	["INTRACHROMOSOMAL[chr6:1.14Mb]"]
SLC17A9--AP3M1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SLC17A9^ENSG00000101194.18	chr20:62962722:+	AP3M1^ENSG00000185009.13	chr10:74138314:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1433:38125:5834	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.4295	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chr10]"]
SLC11A2--MYBL1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	SLC11A2^ENSG00000110911.17	chr12:51006174:-	MYBL1^ENSG00000185697.16	chr8:66599142:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1342:31127:4363	.	NO_LDAS	0.0034	GC	1.9329	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr8]"]
SLC10A7--ZGRF1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	SLC10A7^ENSG00000120519.15	chr4:146503849:-	ZGRF1^ENSG00000138658.16	chr4:112589874:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2445:6226:15909	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5301	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr4:33.62Mb]"]
SLAMF1--PRICKLE1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SLAMF1^ENSG00000117090.15	chr1:160608271:-	PRICKLE1^ENSG00000139174.12	chr12:42464608:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2126:43982:17661	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr12]"]
SKA3--CDRT4	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	SKA3^ENSG00000165480.16	chr13:21176375:-	CDRT4^ENSG00000239704.11	chr17:15440285:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1155:49176:16988	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.4295	AG	1.9899	["INTERCHROMOSOMAL[chr13--chr17]"]
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SIVA1--SNX30	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	SIVA1^ENSG00000184990.13	chr14:104753312:+	SNX30^ENSG00000148158.17	chr9:112874110:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2453:29291:14886	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr9]"]
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RAD51--DPH5	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	RAD51^ENSG00000051180.17	chr15:40731157:+	DPH5^ENSG00000117543.21	chr1:101001544:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1433:45487:21948	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr1]"]
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RABEPK--DNAJC8	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	RABEPK^ENSG00000136933.17	chr9:125232745:+	DNAJC8^ENSG00000126698.11	chr1:28220895:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2323:13281:6829	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.8256	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr1]"]
RABEPK--AP001042.1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	RABEPK^ENSG00000136933.17	chr9:125228059:+	AP001042.1^ENSG00000205622.11	chr21:38917400:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2442:42178:13163	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr21]"]
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RAB6B--FCHO2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	RAB6B^ENSG00000154917.11	chr3:133834575:-	FCHO2^ENSG00000157107.14	chr5:73087882:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1229:34072:22579	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.2310	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr5]"]
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RAB5A--AC092747.2	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	RAB5A^ENSG00000144566.11	chr3:19951061:+	AC092747.2^ENSG00000256625.1	chr12:27139966:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1280:30189:28604	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.8892	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr12]"]
RAB40B--ZDHHC11B	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	RAB40B^ENSG00000141542.11	chr17:82698455:-	ZDHHC11B^ENSG00000206077.14	chr5:766919:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2166:10748:15923	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.4295	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr5]"]
RAB38--AP000676.5	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	RAB38^ENSG00000123892.12	chr11:88149675:-	AP000676.5^ENSG00000285835.1	chr11:87964709:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1469:19567:17016	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6729	AG	1.8295	["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.07Mb]","NEIGHBORS[67643]"]
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RAB18--LINC02680	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	RAB18^ENSG00000099246.17	chr10:27509930:+	LINC02680^ENSG00000285737.1	chr10:27578371:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1420:29048:3592	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9219	AG	1.9329	["INTRACHROMOSOMAL[chr10:0.02Mb]","NEIGHBORS[22191]"]
QTRT1--KCNC1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	QTRT1^ENSG00000213339.9	chr19:10707382:+	KCNC1^ENSG00000129159.9	chr11:17736453:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1256:23927:22383	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr11]"]
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PXMP2--AACS	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PXMP2^ENSG00000176894.10	chr12:132701369:+	AACS^ENSG00000081760.17	chr12:125135791:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2396:41094:28296	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr12:7.54Mb]"]
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PUS7--CHMP4A	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PUS7^ENSG00000091127.14	chr7:105470688:-	CHMP4A^ENSG00000254505.11	chr14:24211491:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1231:29169:7137	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9219	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr14]"]
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PTPRN2--PTPRN	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PTPRN2^ENSG00000155093.19	chr7:157568902:-	PTPRN^ENSG00000054356.14	chr2:219296345:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2407:8540:8342	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7465	AG	1.6729	["HGNC_GENEFAM","INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr2]"]
PTPN9--SNUPN	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PTPN9^ENSG00000169410.10	chr15:75517259:-	SNUPN^ENSG00000169371.14	chr15:75621056:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1217:11355:15124	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.4295	["INTRACHROMOSOMAL[chr15:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[18768]"]
PTK6--RNF121	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PTK6^ENSG00000101213.7	chr20:63533551:-	RNF121^ENSG00000137522.18	chr11:71994719:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2347:10805:12854	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.9899	["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chr11]"]
PTGR2--FOXN2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PTGR2^ENSG00000140043.11	chr14:73879305:+	FOXN2^ENSG00000170802.16	chr2:48378856:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2246:5288:17338	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr2]"]
PTAR1--OR51G2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PTAR1^ENSG00000188647.13	chr9:69759853:-	OR51G2^ENSG00000176893.5	chr11:4915098:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1238:31240:20393	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"]
PSTPIP2--ITPKB	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PSTPIP2^ENSG00000152229.18	chr18:45991902:-	ITPKB^ENSG00000143772.9	chr1:226631838:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1338:3136:9211	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.4566	["INTERCHROMOSOMAL[chr18--chr1]"]
PSTK--LINC-PINT	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PSTK^ENSG00000179988.15	chr10:122983470:+	LINC-PINT^ENSG00000231721.7	chr7:130945835:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1149:5838:15853	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.5329	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr7]"]
PSORS1C1--DGKH	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PSORS1C1^ENSG00000204540.11	chr6:31114891:+	DGKH^ENSG00000102780.17	chr13:42129552:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1372:40706:25045	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr13]"]
PSMD7--PM20D2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PSMD7^ENSG00000103035.11	chr16:74301652:+	PM20D2^ENSG00000146281.6	chr6:89149265:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1249:24210:11439	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr6]"]
PSMD12--AC103764.1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PSMD12^ENSG00000197170.10	chr17:67366412:-	AC103764.1^ENSG00000251218.1	chr8:134851563:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2144:12480:21388	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr8]"]
PSMC1--KREMEN1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PSMC1^ENSG00000100764.14	chr14:90259193:+	KREMEN1^ENSG00000183762.13	chr22:29144956:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1435:42841:5176	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr22]"]
PSEN2--ABCB10	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PSEN2^ENSG00000143801.18	chr1:226889049:+	ABCB10^ENSG00000135776.5	chr1:229531731:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1352:19550:22257	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.7465	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:2.59Mb]"]
PRR5--HECW2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRR5^ENSG00000186654.21	chr22:44726634:+	HECW2^ENSG00000138411.13	chr2:196240494:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1111:34282:1869	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr2]"]
PRR14--HYAL2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRR14^ENSG00000156858.12	chr16:30656180:+	HYAL2^ENSG00000068001.14	chr3:50319942:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1304:6445:12476	.	YES_LDAS	0.0034	GC	1.6402	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr3]"]
PRPF4--OTULINL	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRPF4^ENSG00000136875.13	chr9:113282711:+	OTULINL^ENSG00000145569.6	chr5:14581799:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2450:37106:12616	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.3996	AG	1.4566	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr5]"]
PRPF39--MAP4K5	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRPF39^ENSG00000185246.18	chr14:45114950:+	MAP4K5^ENSG00000012983.11	chr14:50468771:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1364:36434:28240	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.9086	["INTRACHROMOSOMAL[chr14:5.30Mb]"]
PRPF38A--KDM4E	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRPF38A^ENSG00000134748.13	chr1:52412624:+	KDM4E^ENSG00000235268.2	chr11:95026625:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1275:39306:13429	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.2729	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr11]"]
PRKAR1B--ZNF18	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRKAR1B^ENSG00000188191.15	chr7:727590:-	ZNF18^ENSG00000154957.14	chr17:11992517:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1318:27875:11846	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5656	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr17]"]
PRKACB--KCNQ4	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PRKACB^ENSG00000142875.19	chr1:84078371:+	KCNQ4^ENSG00000117013.17	chr1:40817265:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1205:12811:23195	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5546	AG	1.5546	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:43.24Mb]"]
PRKAA1--AC113385.3	1	0	0.07	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PRKAA1^ENSG00000132356.11	chr5:40798063:-	AC113385.3^ENSG00000275374.1	chr5:100381398:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1192:39209:17268	.	YES_LDAS	0.0002	GT	1.8323	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr5:59.58Mb]"]
PRIM2--CMTM3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRIM2^ENSG00000146143.19	chr6:57318480:+	CMTM3^ENSG00000140931.20	chr16:66609883:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2474:3168:7754	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6402	AG	1.3383	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr16]"]
PRH1--ITPR2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PRH1^ENSG00000231887.7	chr12:10973655:-	ITPR2^ENSG00000123104.12	chr12:26387594:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1207:36159:25998	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.8323	["INTRACHROMOSOMAL[chr12:15.16Mb]"]
PRH1--ERGIC2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PRH1^ENSG00000231887.7	chr12:11171422:-	ERGIC2^ENSG00000087502.18	chr12:29371670:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2428:35973:23770	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr12:18.17Mb]"]
PRELID3A--COG7	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PRELID3A^ENSG00000141391.14	chr18:12422341:+	COG7^ENSG00000168434.13	chr16:23434718:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1204:43772:14998	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr18--chr16]"]
PRDX6-AS1--TNFSF4	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PRDX6-AS1^ENSG00000203739.4	chr1:173460378:-	TNFSF4^ENSG00000117586.11	chr1:173188569:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1267:46361:4153	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.21Mb]"]
PRDX6-AS1--TNFSF4	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRDX6-AS1^ENSG00000203739.4	chr1:173476632:-	TNFSF4^ENSG00000117586.11	chr1:173207185:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1180:39783:7726	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.5656	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.21Mb]"]
PRDM5--STXBP5L	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PRDM5^ENSG00000138738.11	chr4:120818349:-	STXBP5L^ENSG00000145087.13	chr3:121422522:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2389:38756:8721	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.7056	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr3]"]
PRCP--AASDHPPT	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PRCP^ENSG00000137509.12	chr11:82900235:-	AASDHPPT^ENSG00000149313.11	chr11:106079467:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2420:17528:16596	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.7819	["INTRACHROMOSOMAL[chr11:23.10Mb]"]
PPWD1--PLCB1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PPWD1^ENSG00000113593.12	chr5:65563421:+	PLCB1^ENSG00000182621.18	chr20:8628361:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1258:1793:9351	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr20]"]
PPT2--AL031595.3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PPT2^ENSG00000221988.13	chr6:32157924:+	AL031595.3^ENSG00000280434.1	chr22:44151887:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1309:43367:10682	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.4566	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr22]"]
PPP1R7--SLC44A4	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PPP1R7^ENSG00000115685.15	chr2:241182717:+	SLC44A4^ENSG00000204385.13	chr6:31863742:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2248:8443:4531	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.8256	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr6]"]
PPP1R14C--TSC22D4	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	PPP1R14C^ENSG00000198729.5	chr6:150143405:+	TSC22D4^ENSG00000166925.9	chr7:100478281:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2309:51182:10542	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.5301	AG	1.5656	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr7]"]
PPM1L--NMD3	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PPM1L^ENSG00000163590.14	chr3:160961910:+	NMD3^ENSG00000169251.13	chr3:161156971:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2346:45730:11495	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9329	["INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.03Mb]","NEIGHBORS[25794]"]
PPIP5K1--CATSPER2P1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PPIP5K1^ENSG00000168781.22	chr15:43564867:-	CATSPER2P1^ENSG00000205771.6	chr15:43745170:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1422:6339:5204	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr15:0.14Mb]"]
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PPARD--PCCA	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	PPARD^ENSG00000112033.14	chr6:35347150:+	PCCA^ENSG00000175198.17	chr13:100330561:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2498:19356:8160	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr13]"]
POLR3G--UPF3A	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	POLR3G^ENSG00000113356.13	chr5:90506674:+	UPF3A^ENSG00000169062.15	chr13:114298840:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2482:6056:15811	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.2729	AG	1.8062	["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr13]"]
POLE4--AC007681.1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	POLE4^ENSG00000115350.12	chr2:74960146:+	AC007681.1^ENSG00000270571.2	chr2:75186830:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2183:47728:4055	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.6402	["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.18Mb]"]
POLD3--RNF169	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	POLD3^ENSG00000077514.9	chr11:74640841:+	RNF169^ENSG00000166439.6	chr11:74789626:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1436:5409:4069	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5219	AG	1.8323	["ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.08Mb]","NEIGHBORS[79732]"]
POLA1--NDUFV2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	POLA1^ENSG00000101868.13	chrX:24699549:+	NDUFV2^ENSG00000178127.13	chr18:9126831:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1171:4721:13499	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.3383	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chrX--chr18]"]
POGLUT3--NPIPB10P	1	0	0.08	0.00	ONLY_REF_SPLICE	POGLUT3^ENSG00000178202.13	chr11:108478024:-	NPIPB10P^ENSG00000196796.5	chr16:29050502:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2463:47186:22313	.	NO_LDAS	0.0003	GT	1.9329	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr16]"]
POGK--TXNRD3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	POGK^ENSG00000143157.12	chr1:166850268:+	TXNRD3^ENSG00000197763.20	chr3:126646207:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1225:40795:5302	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr3]"]
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OR5AK2--AL136295.17	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	OR5AK2^ENSG00000181273.2	chr11:56988978:+	AL136295.17^ENSG00000287765.1	chr14:24189460:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2419:37203:13541	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	0.9183	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr14]"]
OR52D1--ATP6AP2	1	0	0.25	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	OR52D1^ENSG00000181609.5	chr11:5489697:+	ATP6AP2^ENSG00000182220.15	chrX:40589573:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2486:22422:7025	.	NO_LDAS	0.0008	GT	1.3383	AG	1.8256	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chrX]"]
OR51I2--MST1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	OR51I2^ENSG00000187918.5	chr11:5453927:+	MST1^ENSG00000173531.15	chr3:49688203:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1173:14915:19524	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.6402	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr3]"]
OPA1--AL162393.1	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	OPA1^ENSG00000198836.11	chr3:193643618:+	AL162393.1^ENSG00000232905.2	chr9:113850794:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1313:23781:13555	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.9329	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr9]"]
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NUDCD3--AUP1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NUDCD3^ENSG00000015676.18	chr7:44385334:-	AUP1^ENSG00000115307.17	chr2:74527757:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2346:40220:1252	.	NO_LDAS	0.0034	AT	1.7465	AC	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr2]"]
NTN1--AL121929.3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NTN1^ENSG00000065320.9	chr17:9179956:+	AL121929.3^ENSG00000287419.1	chr10:103583698:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1427:28029:18081	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr10]"]
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NT5DC3--AC024901.1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NT5DC3^ENSG00000111696.12	chr12:103806322:-	AC024901.1^ENSG00000255910.2	chr12:20009721:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2378:6809:12938	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr12:83.76Mb]"]
NSUN6--DCTD	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NSUN6^ENSG00000241058.4	chr10:18651129:-	DCTD^ENSG00000129187.15	chr4:182915575:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1314:7553:25858	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5656	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr4]"]
NSF--SEMA4C	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NSF^ENSG00000073969.18	chr17:46749862:+	SEMA4C^ENSG00000168758.11	chr2:96861019:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1261:14753:22831	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5329	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr2]"]
NSDHL--TICAM2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NSDHL^ENSG00000147383.11	chrX:152867673:+	TICAM2^ENSG00000243414.6	chr5:115579948:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2465:27195:23672	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.6729	["INTERCHROMOSOMAL[chrX--chr5]"]
NRIP1--LINC02246	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NRIP1^ENSG00000180530.11	chr21:15064745:-	LINC02246^ENSG00000281903.2	chr21:14857708:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1283:47040:27693	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.2729	AG	1.5546	["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.04Mb]","NEIGHBORS[42683]"]
NRIP1--LINC02246	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NRIP1^ENSG00000180530.11	chr21:15014344:-	LINC02246^ENSG00000281903.2	chr21:14857708:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1337:46563:12294	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.5546	["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.04Mb]","NEIGHBORS[42683]"]
NR2F1-AS1--SLC4A7	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NR2F1-AS1^ENSG00000237187.9	chr5:93544795:-	SLC4A7^ENSG00000033867.16	chr3:27437526:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1247:46126:21626	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.7056	["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr3]"]
NR2F1--BUB1B	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NR2F1^ENSG00000175745.14	chr5:93593749:+	BUB1B^ENSG00000156970.13	chr15:40185551:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1112:50470:24106	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.4566	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr15]"]
NR2E1--FAM177A1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NR2E1^ENSG00000112333.12	chr6:108166715:+	FAM177A1^ENSG00000151327.13	chr14:35046505:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2145:4446:11846	.	NO_LDAS	0.0034	GC	1.5329	AG	1.7968	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr14]"]
NPR2--UXS1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NPR2^ENSG00000159899.15	chr9:35800845:+	UXS1^ENSG00000115652.15	chr2:106096741:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2290:48763:26530	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.6402	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr2]"]
NPM1P35--EEF1A1P31	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NPM1P35^ENSG00000255213.1	chr11:62331240:+	EEF1A1P31^ENSG00000237859.2	chrX:154909640:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2410:17382:15307	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.6895	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chrX]"]
NPIPA2--SETD4	1	0	0.07	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NPIPA2^ENSG00000254852.8	chr16:14748185:+	SETD4^ENSG00000185917.14	chr21:36057204:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1492:34525:14676	.	YES_LDAS	0.0002	GT	1.8323	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr21]"]
NPC2--PGP	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NPC2^ENSG00000119655.11	chr14:74493212:-	PGP^ENSG00000184207.9	chr16:2214024:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1157:50988:22621	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5058	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr16]"]
NPAS3--RHOXF1P3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NPAS3^ENSG00000151322.20	chr14:33800866:+	RHOXF1P3^ENSG00000282933.2	chrX:119943286:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1401:45624:27651	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chrX]"]
NOXA1--GAMT	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NOXA1^ENSG00000188747.8	chr9:137426330:+	GAMT^ENSG00000130005.13	chr19:1397499:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1158:43206:28926	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr19]"]
NOL11--ABCA9	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NOL11^ENSG00000130935.10	chr17:67743586:+	ABCA9^ENSG00000154258.17	chr17:69051139:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2315:23725:10514	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.7232	["INTRACHROMOSOMAL[chr17:1.23Mb]"]
NLRP14--ZNF215	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NLRP14^ENSG00000158077.5	chr11:7049838:+	ZNF215^ENSG00000149054.16	chr11:6955690:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2174:28708:9421	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.7819	["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[19475]"]
NKX3-1--SCAND2P	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NKX3-1^ENSG00000167034.10	chr8:23679802:-	SCAND2P^ENSG00000176700.20	chr15:84646154:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1380:37729:16946	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.5656	["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr15]"]
NKD2--DPYS	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NKD2^ENSG00000145506.14	chr5:1009000:+	DPYS^ENSG00000147647.13	chr8:104466990:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1241:29194:2583	.	NO_LDAS	0.0011	GC	1.2729	AG	0.8366	["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr8]"]
NHLRC2--LHX2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NHLRC2^ENSG00000196865.4	chr10:113855004:+	LHX2^ENSG00000106689.11	chr9:124015276:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1244:49831:21290	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr9]"]
NHEJ1--CNPPD1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NHEJ1^ENSG00000187736.13	chr2:219157472:-	CNPPD1^ENSG00000115649.16	chr2:219176847:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1250:40342:25479	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.4716	["ChimerSeq","INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[11032]"]
NGDN--THTPA	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NGDN^ENSG00000129460.16	chr14:23477560:+	THTPA^ENSG00000259431.6	chr14:23558695:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1303:27616:18936	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5329	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr14:0.05Mb]","NEIGHBORS[46126]"]
NFKB1--TANC1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NFKB1^ENSG00000109320.13	chr4:102537956:+	TANC1^ENSG00000115183.15	chr2:159231741:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2324:42607:6395	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.8892	["HGNC_GENEFAM","INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr2]"]
NEPRO--C3orf52	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NEPRO^ENSG00000163608.15	chr3:113019542:-	C3orf52^ENSG00000114529.13	chr3:112102838:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1135:19203:27651	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.4295	AG	1.7465	["INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.87Mb]"]
NEK8--ADCK2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NEK8^ENSG00000160602.14	chr17:28737993:+	ADCK2^ENSG00000133597.11	chr7:140673740:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1314:32333:10206	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr7]"]
NEK2--GTF2F2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NEK2^ENSG00000117650.13	chr1:211667106:-	GTF2F2^ENSG00000188342.12	chr13:45283442:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2225:23628:11103	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr13]"]
NEK2--ABCA13	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NEK2^ENSG00000117650.13	chr1:211673682:-	ABCA13^ENSG00000179869.15	chr7:48524412:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2404:5223:21794	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.8062	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr7]"]
NEFM--CYP11A1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NEFM^ENSG00000104722.14	chr8:24918579:+	CYP11A1^ENSG00000140459.18	chr15:74361783:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2244:22714:1841	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr15]"]
NEBL--FGFR1OP2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NEBL^ENSG00000078114.19	chr10:20880794:-	FGFR1OP2^ENSG00000111790.14	chr12:26963342:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1283:40091:17731	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr12]"]
NDUFC2--KCTD14	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NDUFC2^ENSG00000151366.13	chr11:78079579:-	KCTD14^ENSG00000151364.17	chr11:78038758:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1243:49791:19426	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.8295	["ConjoinG","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.02Mb]","NEIGHBORS[22106]"]
NDUFC2--KCTD14	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NDUFC2^ENSG00000151366.13	chr11:78072998:-	KCTD14^ENSG00000151364.17	chr11:78038758:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1424:35779:6535	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.8295	["ConjoinG","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.02Mb]","NEIGHBORS[22106]"]
NDUFAF6--NPIPB10P	1	0	0.06	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NDUFAF6^ENSG00000156170.13	chr8:95044595:+	NPIPB10P^ENSG00000196796.5	chr16:29050502:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1308:25521:10963	.	NO_LDAS	0.0002	GT	1.9329	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr16]"]
NDUFAB1--C16orf70	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NDUFAB1^ENSG00000004779.10	chr16:23595429:-	C16orf70^ENSG00000125149.12	chr16:67139984:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2426:30650:3144	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.8062	["INTRACHROMOSOMAL[chr16:43.51Mb]"]
NDUFA6-DT--LINC01160	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NDUFA6-DT^ENSG00000237037.9	chr22:42121735:+	LINC01160^ENSG00000231346.5	chr1:111608601:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1146:9664:5162	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.8323	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr1]"]
NDUFA6-DT--AL359813.1	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NDUFA6-DT^ENSG00000237037.9	chr22:42121735:+	AL359813.1^ENSG00000287055.1	chr6:43424978:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1146:9664:5162	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.8323	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr6]"]
NDUFA5--IQUB	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NDUFA5^ENSG00000128609.16	chr7:123542103:-	IQUB^ENSG00000164675.11	chr7:123512344:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2468:20198:7656	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7465	AG	1.7968	["INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.00Mb]","NEIGHBORS[1920]"]
NDUFA4--SLC39A10	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NDUFA4^ENSG00000189043.10	chr7:10940016:-	SLC39A10^ENSG00000196950.14	chr2:195680032:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1304:31240:22383	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.2419	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr2]"]
NDUFA4--MGC4859	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NDUFA4^ENSG00000189043.10	chr7:10938090:-	MGC4859^ENSG00000283117.1	chr7:10561577:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2387:47768:15671	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.7465	["TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.15Mb]"]
NDST2--CAMK2G	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NDST2^ENSG00000166507.19	chr10:73805900:-	CAMK2G^ENSG00000148660.21	chr10:73873083:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2406:2982:7936	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.5058	["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr10:0.00Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[703]"]
NCAPG2--AC073636.1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NCAPG2^ENSG00000146918.20	chr7:158689856:-	AC073636.1^ENSG00000227098.2	chr2:176846342:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2122:28644:7460	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr2]"]
NCAPG2--AC002066.1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NCAPG2^ENSG00000146918.20	chr7:158671514:-	AC002066.1^ENSG00000237813.4	chr7:116243936:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1127:9826:14242	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.7819	["INTRACHROMOSOMAL[chr7:42.13Mb]"]
NCAPD3--ALDOA	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NCAPD3^ENSG00000151503.13	chr11:134192689:-	ALDOA^ENSG00000149925.22	chr16:30065788:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1361:11477:14634	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr16]"]
NBR2--DHX29	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NBR2^ENSG00000198496.12	chr17:43125770:+	DHX29^ENSG00000067248.10	chr5:55281515:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2113:1874:6269	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr5]"]
NBPF3--AC239859.1	1	0	0.33	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NBPF3^ENSG00000142794.19	chr1:21479400:+	AC239859.1^ENSG00000203825.4	chr1:143544151:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1394:26419:12070	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.8062	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:122.06Mb]"]
NBN--ZDHHC13	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NBN^ENSG00000104320.14	chr8:89982722:-	ZDHHC13^ENSG00000177054.14	chr11:19164301:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1314:18547:27469	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.5850	["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr11]"]
NBEAP2--C2orf27A	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NBEAP2^ENSG00000197927.13	chr2:131750830:+	C2orf27A^ENSG00000287151.1	chr2:131684709:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1360:11784:3816	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8062	["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.00Mb]","NEIGHBORS_OVERLAP:+:+:[628]"]
NARS2--GAB2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NARS2^ENSG00000137513.10	chr11:78441091:-	GAB2^ENSG00000033327.13	chr11:78280901:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1334:7383:23546	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9219	AG	1.8256	["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.02Mb]","NEIGHBORS[17620]"]
NAPSA--AC008655.2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NAPSA^ENSG00000131400.8	chr19:50365539:-	AC008655.2^ENSG00000269392.1	chr19:50366017:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2376:27268:2892	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.00Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[50]"]
NAP1L4--RMND1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	NAP1L4^ENSG00000205531.13	chr11:2976024:-	RMND1^ENSG00000155906.19	chr6:151433230:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2114:9834:10949	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr6]"]
NAA40--COX8A	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	NAA40^ENSG00000110583.13	chr11:63954450:+	COX8A^ENSG00000176340.4	chr11:63976225:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2406:25351:10332	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.7968	["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.02Mb]","NEIGHBORS[17301]"]
MYL6P5--DEDD	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	MYL6P5^ENSG00000228118.3	chr17:71621047:+	DEDD^ENSG00000158796.17	chr1:161130847:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1171:6987:29109	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.7056	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr1]"]
MYL5--MED23	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	MYL5^ENSG00000215375.6	chr4:680018:+	MED23^ENSG00000112282.18	chr6:131628173:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1296:37866:10879	.	NO_LDAS	0.0017	GT	1.6402	AG	1.5301	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr6]"]
MYH11--AL080243.1	1	0	0.25	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	MYH11^ENSG00000133392.18	chr16:15757893:-	AL080243.1^ENSG00000237214.3	chr22:41064387:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2492:13637:12602	.	YES_LDAS	0.0008	AT	1.7819	AC	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr22]"]
MYB--FAM83B	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	MYB^ENSG00000118513.19	chr6:135181536:+	FAM83B^ENSG00000168143.9	chr6:54870187:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1133:15950:17899	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5656	AG	1.5656	["INTRACHROMOSOMAL[chr6:80.24Mb]"]
MUTYH--TESK2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	MUTYH^ENSG00000132781.19	chr1:45340219:-	TESK2^ENSG00000070759.17	chr1:45355449:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1112:24065:18866	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.9899	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.00Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[2990]"]
MUTYH--SRD5A1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	MUTYH^ENSG00000132781.19	chr1:45334391:-	SRD5A1^ENSG00000145545.12	chr5:6656078:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1425:25950:20645	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.2729	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr5]"]
MTX2--LNPK	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	MTX2^ENSG00000128654.14	chr2:176269669:+	LNPK^ENSG00000144320.14	chr2:175979868:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1411:25820:21430	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.27Mb]"]
MTURN--ZNRF2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	MTURN^ENSG00000180354.16	chr7:30135298:+	ZNRF2^ENSG00000180233.11	chr7:30323642:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2128:22544:25816	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9656	["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.12Mb]"]
MTPAP--PLAA	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	MTPAP^ENSG00000107951.15	chr10:30315963:-	PLAA^ENSG00000137055.15	chr9:26935206:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1495:19308:17240	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr9]"]
MTND6P22--KCTD9	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	MTND6P22^ENSG00000270230.1	chr5:100046781:+	KCTD9^ENSG00000104756.16	chr8:25446250:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1395:50511:27231	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.5219	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr8]"]
MTMR14--LINC02280	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	MTMR14^ENSG00000163719.20	chr3:9688711:+	LINC02280^ENSG00000260792.1	chr14:104661909:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2217:18086:13555	.	NO_LDAS	0.0034	GC	1.9086	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr14]"]
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MCM9--CEP85L	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	MCM9^ENSG00000111877.18	chr6:118826147:-	CEP85L^ENSG00000111860.14	chr6:118632611:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1170:11663:15433	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7465	AG	1.9329	["INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.10Mb]"]
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LINC01376--LDAH	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LINC01376^ENSG00000236204.6	chr2:19125252:-	LDAH^ENSG00000118961.15	chr2:20790398:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1197:45713:2219	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9219	["INTRACHROMOSOMAL[chr2:1.34Mb]"]
LINC01145--SRGAP2B	1	0	0.33	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LINC01145^ENSG00000272419.6	chr1:145214677:-	SRGAP2B^ENSG00000196369.11	chr1:144995200:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1459:39371:20827	.	YES_LDAS	0.0011	GT	1.7819	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.07Mb]","NEIGHBORS[68571]"]
LINC01106--ZNF800	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LINC01106^ENSG00000175772.11	chr2:110384315:-	ZNF800^ENSG00000048405.10	chr7:127373479:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2418:42194:5036	.	YES_LDAS	0.0017	GC	1.9086	AG	1.8062	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr7]"]
LINC01031--AL138778.1	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LINC01031^ENSG00000232077.2	chr1:193304938:+	AL138778.1^ENSG00000286285.1	chr1:193457641:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1405:49548:1406	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.5329	AG	1.6402	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.09Mb]","NEIGHBORS[91469]"]
LINC00987--PALB2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LINC00987^ENSG00000237248.5	chr12:9240293:+	PALB2^ENSG00000083093.10	chr16:23635267:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2193:10304:29137	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr16]"]
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LINC00882--MED14	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LINC00882^ENSG00000242759.8	chr3:107114753:-	MED14^ENSG00000180182.11	chrX:40729345:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1232:9155:20589	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chrX]"]
LINC00707--GNA14	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LINC00707^ENSG00000238266.2	chr10:6789681:+	GNA14^ENSG00000156049.7	chr9:77431531:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1496:23903:22761	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr9]"]
LINC00552--TMEM43	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LINC00552^ENSG00000279770.1	chr13:113750025:-	TMEM43^ENSG00000170876.8	chr3:14129412:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2266:32591:10150	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr13--chr3]"]
LINC00115--AC240565.1	1	0	0.25	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LINC00115^ENSG00000225880.5	chr1:827484:-	AC240565.1^ENSG00000280136.2	chr17:106864:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1252:9891:9029	.	YES_LDAS	0.0008	GT	1.8323	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr17]"]
LINC-PINT--TSPAN9	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LINC-PINT^ENSG00000231721.7	chr7:130941413:-	TSPAN9^ENSG00000011105.14	chr12:3201177:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2227:32527:15419	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr12]"]
LINC-PINT--SUPT3H	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LINC-PINT^ENSG00000231721.7	chr7:130945720:-	SUPT3H^ENSG00000196284.17	chr6:45365301:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2101:26378:10963	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr6]"]
LINC-PINT--CHM	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LINC-PINT^ENSG00000231721.7	chr7:130945720:-	CHM^ENSG00000188419.14	chrX:85964052:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1491:28611:22649	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chrX]"]
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LIN52--TMEM135	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LIN52^ENSG00000205659.11	chr14:74101238:+	TMEM135^ENSG00000166575.17	chr11:87157341:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1164:5126:19412	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6402	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr11]"]
LIN52--NRIP1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LIN52^ENSG00000205659.11	chr14:74198973:+	NRIP1^ENSG00000180530.11	chr21:15065893:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2418:1356:23728	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.4566	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr21]"]
LIAS--LINC00674	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LIAS^ENSG00000121897.15	chr4:39466117:+	LINC00674^ENSG00000237854.3	chr17:68114422:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1137:22495:18810	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr17]"]
LIAS--KIF27	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LIAS^ENSG00000121897.15	chr4:39466117:+	KIF27^ENSG00000165115.15	chr9:83915678:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2223:23992:20477	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr9]"]
LFNG--ZNF821	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LFNG^ENSG00000106003.13	chr7:2527337:+	ZNF821^ENSG00000102984.15	chr16:71864940:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2223:27009:11803	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.5058	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr16]"]
LCMT1--FTLP10	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LCMT1^ENSG00000205629.12	chr16:25111996:+	FTLP10^ENSG00000250426.2	chr4:68212406:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1311:36159:5988	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr4]"]
LCA5--KIAA0753	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LCA5^ENSG00000135338.14	chr6:79518705:-	KIAA0753^ENSG00000198920.11	chr17:6620869:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1267:15659:7530	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.6729	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr17]"]
LAT2--ARHGAP1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LAT2^ENSG00000086730.17	chr7:74220619:+	ARHGAP1^ENSG00000175220.12	chr11:46688202:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2469:28231:9632	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.6402	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr11]"]
LARGE-AS1--TMTC2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LARGE-AS1^ENSG00000224973.6	chr22:33725101:+	TMTC2^ENSG00000179104.9	chr12:82687507:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2113:1324:10108	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.6402	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr12]"]
LAP3--SLC4A8	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LAP3^ENSG00000002549.13	chr4:17588977:+	SLC4A8^ENSG00000050438.17	chr12:51485787:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2388:5247:28646	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr12]"]
LAMTOR1--FBLN1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	LAMTOR1^ENSG00000149357.10	chr11:72097843:-	FBLN1^ENSG00000077942.19	chr22:45527876:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1217:15360:27049	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.4295	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr22]"]
LACTB--ZFAND6	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	LACTB^ENSG00000103642.12	chr15:63127689:+	ZFAND6^ENSG00000086666.19	chr15:80120328:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2349:5377:20575	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.8892	["INTRACHROMOSOMAL[chr15:16.92Mb]"]
KRTAP5-AS1--AP000867.5	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KRTAP5-AS1^ENSG00000233930.4	chr11:1598277:+	AP000867.5^ENSG00000286948.1	chr11:71563684:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2362:12415:17885	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6729	AG	1.8295	["INTRACHROMOSOMAL[chr11:69.96Mb]"]
KRTAP12-1--NSMAF	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KRTAP12-1^ENSG00000187175.5	chr21:44682032:-	NSMAF^ENSG00000035681.9	chr8:58599363:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1376:13159:15559	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.6895	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr21--chr8]"]
KRT42P--OGDHL	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KRT42P^ENSG00000214514.8	chr17:41634536:-	OGDHL^ENSG00000197444.10	chr10:49752740:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1212:41474:27357	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9329	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr10]"]
KRT18P55--IAH1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KRT18P55^ENSG00000265480.5	chr17:28307135:-	IAH1^ENSG00000134330.19	chr2:9474582:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1139:22552:17815	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5058	AG	1.2310	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr2]"]
KRR1--NIPA1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KRR1^ENSG00000111615.14	chr12:75511513:-	NIPA1^ENSG00000170113.16	chr15:22810749:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2497:51255:2177	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5656	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr15]"]
KLRC4--KLRK1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KLRC4^ENSG00000183542.5	chr12:10407636:-	KLRK1^ENSG00000213809.9	chr12:10388875:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1425:8677:16764	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.3996	AG	1.9219	["HGNC_GENEFAM","ChimerSeq","INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.02Mb]","NEIGHBORS[15508]"]
KIFBP--AL162430.1	1	0	0.14	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KIFBP^ENSG00000198954.9	chr10:68989105:+	AL162430.1^ENSG00000233406.5	chr1:51251340:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1348:37073:11495	.	YES_LDAS	0.0005	GT	1.7056	AG	1.5628	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr1]"]
KIF13A--NR3C2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KIF13A^ENSG00000137177.20	chr6:17898168:-	NR3C2^ENSG00000151623.15	chr4:148152613:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2336:45430:6157	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr4]"]
KIAA1328--ATP9B	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KIAA1328^ENSG00000150477.15	chr18:36835376:+	ATP9B^ENSG00000166377.20	chr18:79143802:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2106:41377:14830	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.8062	["INTRACHROMOSOMAL[chr18:41.84Mb]"]
KIAA0825--FAM172A	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KIAA0825^ENSG00000185261.14	chr5:94384368:-	FAM172A^ENSG00000113391.19	chr5:94074769:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2446:12334:9029	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9656	["ChimerSeq","INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.04Mb]","NEIGHBORS[41267]"]
KIAA0753--LPIN1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KIAA0753^ENSG00000198920.11	chr17:6596324:-	LPIN1^ENSG00000134324.12	chr2:11782393:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2393:52016:7109	.	NO_LDAS	0.0034	AT	1.7465	AC	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr2]"]
KIAA0586--TOMM20L	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KIAA0586^ENSG00000100578.18	chr14:58512627:+	TOMM20L^ENSG00000196860.8	chr14:58402680:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1257:23514:12056	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr14:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[18683]"]
KDELR2--IQCG	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KDELR2^ENSG00000136240.10	chr7:6463106:-	IQCG^ENSG00000114473.14	chr3:197958823:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2475:12350:27385	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.6402	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr3]"]
KCTD9P2--AC091185.1	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KCTD9P2^ENSG00000181819.14	chrX:105406795:+	AC091185.1^ENSG00000253476.1	chr8:25426327:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1393:38360:11061	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.8295	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chrX--chr8]"]
KCNT2--MIER2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KCNT2^ENSG00000162687.19	chr1:196342079:-	MIER2^ENSG00000105556.11	chr19:313511:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1139:38707:22761	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5329	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr19]"]
KCNQ1--AP001282.1	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KCNQ1^ENSG00000053918.18	chr11:2528018:+	AP001282.1^ENSG00000213252.3	chr11:106826778:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1409:46870:26530	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.8892	AG	1.9219	["INTRACHROMOSOMAL[chr11:103.98Mb]"]
KCNH2--NAGPA	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KCNH2^ENSG00000055118.16	chr7:150948444:-	NAGPA^ENSG00000103174.13	chr16:5025521:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1395:4867:4167	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5301	AG	1.5219	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr16]"]
KATNAL2--EPG5	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KATNAL2^ENSG00000167216.17	chr18:46946923:+	EPG5^ENSG00000152223.15	chr18:45855687:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2393:42615:28716	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.4566	AG	1.7819	["INTRACHROMOSOMAL[chr18:0.95Mb]"]
KASH5--C7orf50	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	KASH5^ENSG00000161609.10	chr19:49395146:+	C7orf50^ENSG00000146540.15	chr7:1010086:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2234:18175:18137	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr7]"]
KANK3--BTC	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KANK3^ENSG00000186994.11	chr19:8337795:-	BTC^ENSG00000174808.12	chr4:74748149:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1321:10651:19959	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9219	["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr4]"]
KANK1--IL17RE	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	KANK1^ENSG00000107104.20	chr9:473273:+	IL17RE^ENSG00000163701.19	chr3:9906364:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1311:22892:3522	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr3]"]
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JPH1--JPH3	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	JPH1^ENSG00000104369.5	chr8:74237208:-	JPH3^ENSG00000154118.13	chr16:87644258:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1437:23870:24555	.	NO_LDAS	0.0017	GT	1.5656	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr16]"]
JMJD7--YJEFN3	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	JMJD7^ENSG00000243789.11	chr15:41836551:+	YJEFN3^ENSG00000250067.12	chr19:19529364:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1204:34614:10346	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6895	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr19]"]
JAZF1--AL023775.1	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	JAZF1^ENSG00000153814.13	chr7:28180463:-	AL023775.1^ENSG00000235008.1	chr6:166702664:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2370:48755:15783	.	NO_LDAS	0.0017	GT	1.7819	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr6]"]
ITFG2--DDT	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	ITFG2^ENSG00000111203.13	chr12:2820225:+	DDT^ENSG00000099977.14	chr22:23971623:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1314:31645:4503	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr22]"]
ITFG1--PHKB	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	ITFG1^ENSG00000129636.13	chr16:47428804:-	PHKB^ENSG00000102893.16	chr16:47497399:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2180:12965:5974	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9656	["DEEPEST2019","ChimerSeq","TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr16:0.00Mb]","NEIGHBORS_OVERLAP:-:+:[3026]"]
ISY1--ACSS1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	ISY1^ENSG00000240682.10	chr3:129130550:-	ACSS1^ENSG00000154930.15	chr20:25012826:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2145:1534:27511	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.9899	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr20]"]
ISCA1--GOLM1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	ISCA1^ENSG00000135070.15	chr9:86272007:-	GOLM1^ENSG00000135052.16	chr9:86079341:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1160:28425:3746	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.9656	["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.16Mb]"]
IQCK--ZNF804B	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	IQCK^ENSG00000174628.16	chr16:19735450:+	ZNF804B^ENSG00000182348.7	chr7:89338518:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2177:24137:5708	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5656	AG	0.9183	["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr7]"]
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IPPK--ATG7	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	IPPK^ENSG00000127080.10	chr9:92652573:-	ATG7^ENSG00000197548.12	chr3:11298686:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2111:25763:3873	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.7968	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr3]"]
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HSDL2--EPB41L4A-AS1	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	HSDL2^ENSG00000119471.15	chr9:112470563:+	EPB41L4A-AS1^ENSG00000224032.7	chr5:112160997:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1150:22778:1532	.	NO_LDAS	0.0017	GT	0.5665	AG	1.7056	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr5]"]
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HPCAL4--VSNL1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	HPCAL4^ENSG00000116983.13	chr1:39683937:-	VSNL1^ENSG00000163032.12	chr2:17592070:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1103:6784:8693	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.6402	["HGNC_GENEFAM","INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr2]"]
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HNRNPCP2--PLCH2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	HNRNPCP2^ENSG00000204253.4	chr2:189923644:+	PLCH2^ENSG00000149527.18	chr1:2479814:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2201:13685:6465	.	YES_LDAS	0.0034	AT	1.8892	AC	1.7968	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr1]"]
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HLF--NPM1P21	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	HLF^ENSG00000108924.14	chr17:55265062:+	NPM1P21^ENSG00000248578.1	chr8:56101596:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1261:42089:2499	.	NO_LDAS	0.0034	GT	0.9056	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr8]"]
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HERC4--TUBD1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	HERC4^ENSG00000148634.16	chr10:67954595:-	TUBD1^ENSG00000108423.15	chr17:59860353:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2436:28781:13611	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7465	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr17]"]
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HAUS7--ECHDC2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	HAUS7^ENSG00000213397.11	chrX:153470828:-	ECHDC2^ENSG00000121310.17	chr1:52911790:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1127:8022:1084	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.2419	AG	1.9899	["INTERCHROMOSOMAL[chrX--chr1]"]
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H4C8--AC006122.1	1	0	0.25	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	H4C8^ENSG00000158406.5	chr6:26285448:-	AC006122.1^ENSG00000213970.4	chr12:4324635:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2380:3937:23069	.	YES_LDAS	0.0008	GT	1.6895	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr12]"]
H3P35--H3P16	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	H3P35^ENSG00000257287.1	chr12:72432001:-	H3P16^ENSG00000178458.5	chr4:139698481:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1496:42841:8735	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr4]"]
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GUCA1B--MRPS10	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	GUCA1B^ENSG00000112599.9	chr6:42188582:-	MRPS10^ENSG00000048544.6	chr6:42211917:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1305:4414:11733	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.9086	["INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[11851]"]
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GTF2IP20--GTF2IP1	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	GTF2IP20^ENSG00000272645.3	chr1:223988045:-	GTF2IP1^ENSG00000277053.4	chr7:75210599:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2421:41539:27581	.	NO_LDAS	0.0017	GT	1.9656	AG	1.5058	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr7]"]
GTF2H5--MILR1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	GTF2H5^ENSG00000272047.3	chr6:158170538:+	MILR1^ENSG00000271605.6	chr17:64468334:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1147:24809:13793	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr17]"]
GTF2E2--PCMTD2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	GTF2E2^ENSG00000197265.9	chr8:30658137:-	PCMTD2^ENSG00000203880.12	chr20:64255877:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2459:22236:22425	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.2419	AG	0.9183	["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr20]"]
GTDC1--PDP2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	GTDC1^ENSG00000121964.14	chr2:144145572:-	PDP2^ENSG00000172840.7	chr16:66889483:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1373:1526:7067	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr16]"]
GSDMB--AC105219.3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	GSDMB^ENSG00000073605.18	chr17:39912326:-	AC105219.3^ENSG00000254973.2	chr8:143758435:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1241:15141:26054	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr8]"]
GRIN2C--ANKRD33	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	GRIN2C^ENSG00000161509.14	chr17:74852640:-	ANKRD33^ENSG00000167612.13	chr12:51888044:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1224:17868:26236	.	NO_LDAS	0.0034	GC	1.3996	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr12]"]
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FSIP1--ARHGEF5	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	FSIP1^ENSG00000150667.8	chr15:39782628:-	ARHGEF5^ENSG00000050327.15	chr7:144362676:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1390:38432:16960	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.4566	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr7]"]
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FOXO1--LINC00598	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	FOXO1^ENSG00000150907.10	chr13:40665583:-	LINC00598^ENSG00000215483.11	chr13:40097967:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1304:32082:13387	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.9656	["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr13:0.02Mb]","NEIGHBORS[19860]"]
FOXN3--DCTD	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	FOXN3^ENSG00000053254.16	chr14:89411934:-	DCTD^ENSG00000129187.15	chr4:182915575:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2168:10926:21864	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5628	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr4]"]
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FNBP1L--PINX1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	FNBP1L^ENSG00000137942.18	chr1:93448305:+	PINX1^ENSG00000254093.9	chr8:10826244:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1405:29655:19945	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr8]"]
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FEN1--AC006122.1	1	0	0.25	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	FEN1^ENSG00000168496.4	chr11:61796333:+	AC006122.1^ENSG00000213970.4	chr12:4324623:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1408:6364:21276	.	YES_LDAS	0.0008	GT	1.8892	AG	1.5219	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr12]"]
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FEM1C--CCDC112	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	FEM1C^ENSG00000145780.8	chr5:115542950:-	CCDC112^ENSG00000164221.13	chr5:115284908:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2391:15004:19678	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6402	AG	1.6895	["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.22Mb]"]
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ELOVL2-AS1--SYCP2L	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	ELOVL2-AS1^ENSG00000230314.7	chr6:11047999:+	SYCP2L^ENSG00000153157.13	chr6:10956136:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1252:42308:3550	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.9086	["INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.06Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[64162]"]
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ELOA--ZNF165	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	ELOA^ENSG00000011007.12	chr1:23749077:+	ZNF165^ENSG00000197279.4	chr6:28085616:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1286:19769:18740	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr6]"]
ELAC1--SMAD4	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	ELAC1^ENSG00000141642.9	chr18:50974561:+	SMAD4^ENSG00000141646.14	chr18:51046920:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2365:22997:26937	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9086	["ChimerSeq","INTRACHROMOSOMAL[chr18:0.04Mb]","NEIGHBORS[40273]"]
EIF4E2--AC009075.2	1	0	0.25	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	EIF4E2^ENSG00000135930.14	chr2:232558018:+	AC009075.2^ENSG00000261774.1	chr16:72278298:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2145:12431:6591	.	NO_LDAS	0.0008	GT	1.7819	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr16]"]
EIF2AK3--SAMD3	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	EIF2AK3^ENSG00000172071.14	chr2:88613724:-	SAMD3^ENSG00000164483.17	chr6:130184623:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1244:5417:15517	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.5546	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr6]"]
EFR3B--H2AC4	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	EFR3B^ENSG00000084710.14	chr2:25146569:+	H2AC4^ENSG00000278463.2	chr6:26033576:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1365:2990:20533	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.8062	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr6]"]
EFCAB2--KIF26B	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	EFCAB2^ENSG00000203666.12	chr1:245083688:+	KIF26B^ENSG00000162849.16	chr1:245366834:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2455:21597:19328	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7465	AG	1.7819	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.03Mb]","NEIGHBORS[27821]"]
EEF1AKMT3--TSFM	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	EEF1AKMT3^ENSG00000123427.17	chr12:57773128:+	TSFM^ENSG00000123297.20	chr12:57783110:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1125:49613:23153	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.5656	["INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.00Mb]","NEIGHBORS[220]"]
EEF1AKMT2--AL121769.1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	EEF1AKMT2^ENSG00000203791.15	chr10:124789043:-	AL121769.1^ENSG00000242163.1	chr14:81332990:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1280:33837:5022	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr14]"]
EEF1AKMT1--INTS4	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	EEF1AKMT1^ENSG00000150456.11	chr13:20757455:-	INTS4^ENSG00000149262.17	chr11:77961138:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1229:28474:14116	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5058	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr13--chr11]"]
EEA1--TMEM258	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	EEA1^ENSG00000102189.17	chr12:92832512:-	TMEM258^ENSG00000134825.16	chr11:61790602:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1414:39241:6843	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6402	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr11]"]
EDRF1-DT--FRA10AC1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	EDRF1-DT^ENSG00000224023.10	chr10:125719422:-	FRA10AC1^ENSG00000148690.12	chr10:93700106:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2155:30205:4783	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.9329	["INTRACHROMOSOMAL[chr10:32.00Mb]"]
EAF1--PPP2R5E	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	EAF1^ENSG00000144597.14	chr3:15432195:+	PPP2R5E^ENSG00000154001.14	chr14:63374243:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2271:49758:2724	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9219	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr14]"]
DYNC1I2--ICE2	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DYNC1I2^ENSG00000077380.16	chr2:171692894:+	ICE2^ENSG00000128915.12	chr15:60478069:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1122:27859:23588	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.8892	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr15]"]
DVL2--POLD4	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DVL2^ENSG00000004975.12	chr17:7230316:-	POLD4^ENSG00000175482.9	chr11:67352709:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2141:7707:12588	.	NO_LDAS	0.0034	GC	1.5656	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr11]"]
DUS3L--AP001324.3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DUS3L^ENSG00000141994.16	chr19:5788357:-	AP001324.3^ENSG00000279353.1	chr11:74699256:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1114:49831:25381	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.4256	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr11]"]
DTX4--DTX2P1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DTX4^ENSG00000110042.8	chr11:59172806:+	DTX2P1^ENSG00000186704.9	chr7:76980621:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1103:33506:5484	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr7]"]
DTX2P1--TNFRSF11A	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DTX2P1^ENSG00000186704.9	chr7:77002321:+	TNFRSF11A^ENSG00000141655.17	chr18:62389144:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2432:4883:28744	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.8323	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr18]"]
DTWD2--TNFAIP8	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DTWD2^ENSG00000169570.10	chr5:118988294:-	TNFAIP8^ENSG00000145779.8	chr5:119392816:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2482:8588:20561	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.9899	["INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.28Mb]"]
DTWD2--TAB1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DTWD2^ENSG00000169570.10	chr5:118839037:-	TAB1^ENSG00000100324.14	chr22:39426703:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1140:44265:17815	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr22]"]
DTWD1--SEC62	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DTWD1^ENSG00000104047.15	chr15:49625431:+	SEC62^ENSG00000008952.17	chr3:169982707:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1337:14543:14144	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr3]"]
DTNB--DNMT3A	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DTNB^ENSG00000138101.19	chr2:25652594:-	DNMT3A^ENSG00000119772.17	chr2:25282711:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2445:19486:24499	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.7968	["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.03Mb]","NEIGHBORS[34608]"]
DTD2--G2E3	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DTD2^ENSG00000129480.13	chr14:31457283:-	G2E3^ENSG00000092140.16	chr14:30601770:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1330:3476:15993	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.5546	["INTRACHROMOSOMAL[chr14:0.83Mb]"]
DSTN--AC073840.1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DSTN^ENSG00000125868.16	chr20:17601042:+	AC073840.1^ENSG00000286035.1	chr4:83084051:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2161:2707:28142	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.0530	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chr4]"]
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DRAM1--AC079907.1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DRAM1^ENSG00000136048.14	chr12:101901433:+	AC079907.1^ENSG00000257222.1	chr12:102074408:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1412:19777:2752	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.7465	["INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.05Mb]","NEIGHBORS[51225]"]
DPM1--CERNA1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DPM1^ENSG00000000419.13	chr20:50945737:-	CERNA1^ENSG00000259577.2	chr15:52205277:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2463:20327:9113	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.4256	["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chr15]"]
DPH6--TRIM67	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DPH6^ENSG00000134146.12	chr15:35373517:-	TRIM67^ENSG00000119283.15	chr1:231197446:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2204:7715:14760	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7056	AG	1.9219	["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr1]"]
DPH5--LDHAL6EP	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DPH5^ENSG00000117543.21	chr1:100992637:-	LDHAL6EP^ENSG00000270098.1	chr4:71436985:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2426:34582:11719	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.4295	AG	1.1589	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr4]"]
DOK1--CRYBG3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DOK1^ENSG00000115325.14	chr2:74555324:+	CRYBG3^ENSG00000080200.10	chr3:97872545:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2281:23280:13387	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.6402	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr3]"]
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DDX27--AC008481.1	1	0	0.20	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DDX27^ENSG00000124228.15	chr20:49233342:+	AC008481.1^ENSG00000213303.3	chr19:11523731:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2181:8904:20799	.	YES_LDAS	0.0007	AT	1.5628	AC	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chr19]"]
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DDTL--MRPL45P2	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DDTL^ENSG00000099974.8	chr22:23967561:+	MRPL45P2^ENSG00000228782.7	chr17:47456793:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2212:13426:11369	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.7056	AG	1.9219	["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr17]"]
DDT--SPAG8	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DDT^ENSG00000099977.14	chr22:23973768:-	SPAG8^ENSG00000137098.14	chr9:35808306:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2204:46725:2065	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.7056	AG	1.9899	["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr9]"]
DDT--MRPL45P2	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DDT^ENSG00000099977.14	chr22:23973768:-	MRPL45P2^ENSG00000228782.7	chr17:47456793:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2212:13426:11369	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.7056	AG	1.9219	["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr17]"]
DDR2--RGS5	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DDR2^ENSG00000162733.19	chr1:162655374:+	RGS5^ENSG00000143248.13	chr1:163168368:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1292:21824:14592	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.8323	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.32Mb]"]
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DDAH1--BCL10	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	DDAH1^ENSG00000153904.21	chr1:85464743:-	BCL10^ENSG00000142867.14	chr1:85270906:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1478:48610:18277	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.3996	AG	1.8323	["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.04Mb]","NEIGHBORS[41853]"]
DCTD--TRPM6	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DCTD^ENSG00000129187.15	chr4:182891403:-	TRPM6^ENSG00000119121.22	chr9:74782476:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2321:1396:10626	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9219	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr9]"]
DCAKD--LINC02862	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DCAKD^ENSG00000172992.12	chr17:45013487:-	LINC02862^ENSG00000237571.1	chr2:215277608:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1282:8087:22271	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.9899	AG	1.8062	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr2]"]
DCAKD--ELP4	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DCAKD^ENSG00000172992.12	chr17:45013487:-	ELP4^ENSG00000109911.19	chr11:31580683:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1282:8087:22271	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.9899	AG	1.8062	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr11]"]
DCAKD--CCDC144NL	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DCAKD^ENSG00000172992.12	chr17:45013487:-	CCDC144NL^ENSG00000205212.5	chr17:20837111:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1282:8087:22271	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.9899	AG	1.8062	["INTRACHROMOSOMAL[chr17:24.13Mb]"]
DCAF11--PSTPIP2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DCAF11^ENSG00000100897.18	chr14:24118458:+	PSTPIP2^ENSG00000152229.18	chr18:45992202:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1257:33198:8763	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.9219	["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr18]"]
DAPK1--FPR2	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DAPK1^ENSG00000196730.13	chr9:87647403:+	FPR2^ENSG00000171049.9	chr19:51769618:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1138:11889:8987	.	NO_LDAS	0.0017	GT	1.6895	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr19]"]
DAPK1--FPR1	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DAPK1^ENSG00000196730.13	chr9:87647403:+	FPR1^ENSG00000171051.9	chr19:51746038:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1138:11889:8987	.	NO_LDAS	0.0017	GT	1.6895	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr19]"]
DAPK1--AC139491.6	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	DAPK1^ENSG00000196730.13	chr9:87640847:+	AC139491.6^ENSG00000283559.2	chr5:176155439:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2490:39541:29249	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.7232	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr5]"]
CYTOR--MRPS9	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CYTOR^ENSG00000222041.11	chr2:87455645:+	MRPS9^ENSG00000135972.9	chr2:105071313:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2283:9414:21094	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.7968	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr2:17.40Mb]"]
CYP2C23P--CLCN2	1	0	0.33	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CYP2C23P^ENSG00000283232.1	chr10:100122527:-	CLCN2^ENSG00000114859.16	chr3:184355460:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1235:44702:10921	.	NO_LDAS	0.0011	GT	1.6895	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr3]"]
CYP24A1--ATAD1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CYP24A1^ENSG00000019186.10	chr20:54157169:-	ATAD1^ENSG00000138138.14	chr10:87753498:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2196:21217:19202	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chr10]"]
CYP20A1--AC084838.1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CYP20A1^ENSG00000119004.16	chr2:203272748:+	AC084838.1^ENSG00000255076.2	chr8:14879300:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2427:46086:16343	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.6729	AG	1.5546	["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr8]"]
CYB5D1--MVD	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CYB5D1^ENSG00000182224.12	chr17:7858824:+	MVD^ENSG00000167508.12	chr16:88663115:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2309:18944:20589	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.6402	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr16]"]
CYB561D2--EIF1B	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CYB561D2^ENSG00000114395.11	chr3:50351560:+	EIF1B^ENSG00000114784.4	chr3:40309871:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1182:14769:21206	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7968	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr3:10.05Mb]"]
CYB561A3--LINC00279	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CYB561A3^ENSG00000162144.10	chr11:61356533:-	LINC00279^ENSG00000286217.2	chrY:8633049:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1326:43950:14214	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.6402	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chrY]"]
CXorf56--NDUFA1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CXorf56^ENSG00000018610.15	chrX:119539672:-	NDUFA1^ENSG00000125356.7	chrX:119876514:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1207:8661:24807	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6895	AG	1.8256	["INTRACHROMOSOMAL[chrX:0.31Mb]"]
CUTC--ELF4	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CUTC^ENSG00000119929.13	chr10:99736317:+	ELF4^ENSG00000102034.17	chrX:130081312:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1329:38918:12644	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5628	AG	1.9219	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chrX]"]
CUL2--FAM221B	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CUL2^ENSG00000108094.16	chr10:35062960:-	FAM221B^ENSG00000204930.10	chr9:35818016:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1147:51085:21332	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr9]"]
CU633906.5--RAB41	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CU633906.5^ENSG00000288187.1	chr21:6216499:-	RAB41^ENSG00000147127.8	chrX:70282261:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2290:45576:6353	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.2419	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr21--chrX]"]
CTTNBP2--ELAPOR2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CTTNBP2^ENSG00000077063.11	chr7:117861209:-	ELAPOR2^ENSG00000164659.15	chr7:86926916:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1119:20473:16988	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.8295	["INTRACHROMOSOMAL[chr7:30.65Mb]"]
CTSC--RAB38	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CTSC^ENSG00000109861.17	chr11:88296133:-	RAB38^ENSG00000123892.12	chr11:88149955:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1454:23620:25774	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9899	AG	1.8062	["GTEx_recurrent_StarF2019","Babiceanu_Normal","ChimerSeq","Greger_Normal","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.09Mb]","NEIGHBORS[89626]"]
CTSC--DCTN6	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CTSC^ENSG00000109861.17	chr11:88337556:-	DCTN6^ENSG00000104671.8	chr8:30164164:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2329:46927:12252	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr8]"]
CTDSPL2--PRPF38A	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CTDSPL2^ENSG00000137770.14	chr15:44459200:+	PRPF38A^ENSG00000134748.13	chr1:52408569:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1181:13208:7460	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr1]"]
CTAGE15--ARHGEF5	1	0	0.20	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CTAGE15^ENSG00000271079.1	chr7:143571949:+	ARHGEF5^ENSG00000050327.15	chr7:144371299:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1291:31087:8076	.	NO_LDAS	0.0007	GT	1.9656	AG	1.9219	["INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.78Mb]"]
CSTA--TPRG1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CSTA^ENSG00000121552.4	chr3:122325358:+	TPRG1^ENSG00000188001.10	chr3:189215292:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1283:34622:14872	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.5850	AG	1.7968	["INTRACHROMOSOMAL[chr3:66.61Mb]"]
CSNK1G1--EDC3	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CSNK1G1^ENSG00000169118.18	chr15:64300319:-	EDC3^ENSG00000179151.13	chr15:74675142:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2241:30423:11747	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.9086	["INTRACHROMOSOMAL[chr15:10.27Mb]"]
CSGALNACT2--MGME1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CSGALNACT2^ENSG00000169826.8	chr10:43138567:+	MGME1^ENSG00000125871.14	chr20:17988166:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2256:38724:28870	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.3383	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr20]"]
CS--TLR2	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CS^ENSG00000062485.19	chr12:56286595:-	TLR2^ENSG00000137462.9	chr4:153706248:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2446:8305:17661	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.7968	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr4]"]
CRYL1--RHBDL1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CRYL1^ENSG00000165475.15	chr13:20432102:-	RHBDL1^ENSG00000103269.14	chr16:676053:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1463:3880:7782	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.5546	["INTERCHROMOSOMAL[chr13--chr16]"]
CRYBG3--TMSB15B	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CRYBG3^ENSG00000080200.10	chr3:97822355:+	TMSB15B^ENSG00000158427.15	chrX:103931139:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2391:33934:19987	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.6895	AG	1.8062	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chrX]"]
CRY1--KLHDC2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CRY1^ENSG00000008405.12	chr12:106992787:-	KLHDC2^ENSG00000165516.11	chr14:49771594:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1126:7731:29053	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9219	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr14]"]
CRNDE--USH1C	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CRNDE^ENSG00000245694.10	chr16:54925212:-	USH1C^ENSG00000006611.17	chr11:17522926:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2383:6987:26642	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8323	AG	1.7465	["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr11]"]
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CR2--ZNF717	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CR2^ENSG00000117322.18	chr1:207477954:+	ZNF717^ENSG00000227124.11	chr3:75736919:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1230:29355:19090	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.6729	AG	1.9086	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr3]"]
COX6A1--BCLAF3	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	COX6A1^ENSG00000111775.3	chr12:120438521:+	BCLAF3^ENSG00000173681.16	chrX:19917334:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1459:24914:7670	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chrX]"]
COX18--SEC11C	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	COX18^ENSG00000163626.17	chr4:73061895:-	SEC11C^ENSG00000166562.9	chr18:59152565:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1279:19914:9127	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5546	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr18]"]
COX15--HERC4	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	COX15^ENSG00000014919.13	chr10:99727441:-	HERC4^ENSG00000148634.16	chr10:67955130:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1224:2925:8623	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6895	AG	1.9329	["INTRACHROMOSOMAL[chr10:31.64Mb]"]
COX11--COQ2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	COX11^ENSG00000166260.13	chr17:54963306:-	COQ2^ENSG00000173085.15	chr4:83279114:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1301:34145:7460	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.6402	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr4]"]
CORO2B--TEAD3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	CORO2B^ENSG00000103647.13	chr15:68645364:+	TEAD3^ENSG00000007866.22	chr6:35475981:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2394:28441:4923	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8892	AG	1.3996	["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr6]"]
COQ2--AC004847.1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	COQ2^ENSG00000173085.15	chr4:83273496:-	AC004847.1^ENSG00000260997.1	chr7:44959448:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1148:27632:13191	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.8295	["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr7]"]
COPS2--AC018638.8	1	0	0.13	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	COPS2^ENSG00000166200.15	chr15:49119045:-	AC018638.8^ENSG00000281896.1	chr7:128617868:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1121:48488:28100	.	YES_LDAS	0.0004	GT	1.9329	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr7]"]
COMMD2--ATP1B3	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	COMMD2^ENSG00000114744.9	chr3:149752406:-	ATP1B3^ENSG00000069849.11	chr3:141876881:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1409:51878:9365	.	YES_LDAS	0.0034	GC	1.8892	AG	1.9656	["INTRACHROMOSOMAL[chr3:7.81Mb]"]
COL4A3--COA5	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	COL4A3^ENSG00000169031.20	chr2:227310948:+	COA5^ENSG00000183513.9	chr2:98602645:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:2292:45964:19020	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7465	AG	1.9329	["INTRACHROMOSOMAL[chr2:128.56Mb]"]
COG3--FAHD2A	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	COG3^ENSG00000136152.15	chr13:45465137:+	FAHD2A^ENSG00000115042.10	chr2:95412476:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:4:1237:40722:6521	.	YES_LDAS	0.0034	GC	1.5219	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr13--chr2]"]
COA5--KIF5C	1	0	0.25	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	COA5^ENSG00000183513.9	chr2:98604111:-	KIF5C^ENSG00000168280.18	chr2:148978973:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1458:21039:16736	.	NO_LDAS	0.0008	GT	1.7465	AG	1.8256	["INTRACHROMOSOMAL[chr2:50.27Mb]"]
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CNTNAP3C--BX005040.4	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CNTNAP3C^ENSG00000283378.1	chr9:61331052:+	BX005040.4^ENSG00000283541.1	chr9:61082046:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1196:32074:17577	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8062	AG	1.9086	["INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.22Mb]"]
CNTLN--IVNS1ABP	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CNTLN^ENSG00000044459.15	chr9:17226287:+	IVNS1ABP^ENSG00000116679.16	chr1:185305643:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2473:16258:14984	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.8295	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr1]"]
CNOT10--TTC13	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	CNOT10^ENSG00000182973.19	chr3:32762863:+	TTC13^ENSG00000143643.13	chr1:230961303:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1176:23992:11313	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.7819	AG	1.8295	["HGNC_GENEFAM","INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr1]"]
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C20orf27--RFESD	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	C20orf27^ENSG00000101220.18	chr20:3754404:-	RFESD^ENSG00000175449.14	chr5:95656529:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1235:27746:22131	.	NO_LDAS	0.0017	GT	1.7056	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chr5]"]
C1QTNF6--ZFYVE1	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	C1QTNF6^ENSG00000133466.14	chr22:37182341:-	ZFYVE1^ENSG00000165861.14	chr14:73026977:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1370:14227:11663	.	YES_LDAS	0.0034	AT	1.8256	AC	1.4295	["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr14]"]
C1GALT1--MSRA	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	C1GALT1^ENSG00000106392.11	chr7:7182820:+	MSRA^ENSG00000175806.15	chr8:10207833:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2446:48496:7095	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9656	AG	1.7819	["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr8]"]
C16orf87--TENT2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	C16orf87^ENSG00000155330.10	chr16:46831084:-	TENT2^ENSG00000164329.13	chr5:79645123:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2472:29719:28380	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.8256	AG	1.9656	["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr5]"]
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ARL3--EIF4E2	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	ARL3^ENSG00000138175.9	chr10:102685816:-	EIF4E2^ENSG00000135930.14	chr2:232564247:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:1403:31507:1210	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.7232	AG	1.7968	["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr2]"]
ARL2--AP005264.4	1	0	0.50	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	ARL2^ENSG00000213465.8	chr11:65021742:+	AP005264.4^ENSG00000267733.5	chr18:12222889:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:3:1416:39792:20435	.	NO_LDAS	0.0017	GC	1.9219	AG	1.6895	["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr18]"]
ARL17A--RPS6KC1	1	0	0.50	0.00	ONLY_REF_SPLICE	ARL17A^ENSG00000185829.18	chr17:46570759:-	RPS6KC1^ENSG00000136643.12	chr1:213242569:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2387:3289:13933	.	YES_LDAS	0.0017	GT	1.6402	AG	1.8892	["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr1]"]
ARL13B--SRFBP1	1	0	1.00	0.00	ONLY_REF_SPLICE	ARL13B^ENSG00000169379.17	chr3:94003908:+	SRFBP1^ENSG00000151304.6	chr5:122019260:+	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2158:30690:24148	.	YES_LDAS	0.0034	GT	1.9086	AG	1.9329	["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr5]"]
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ANKRD13C--FAM106A	1	0	1.00	0.00	INCL_NON_REF_SPLICE	ANKRD13C^ENSG00000118454.13	chr1:70336058:-	FAM106A^ENSG00000273018.7	chr17:18524921:-	&FFPE_HD835_01_RNA_0001_23LGNLLT4_3@LH00166:237:23LGNLLT4:2:2145:31216:28786	.	NO_LDAS	0.0034	GT	1.5301	AG	1.9899	["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr17]"]
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