File Info
- Filename
- 1173_D6K_T1_RNA_SLD_01_A23T55JLT4_1.starfusion.starfusion.fusion_predictions.filtered_pass_only.tsv
- Full Path
- s3://natera-platform-sandbox/pipeline-outputs/cgp_runs/nextflow/dev_rna_exp0016/A23T55JLT4/nfcore_rnafusion__2cae617--20260515-145204/starfusion/1173_D6K_T1_RNA_SLD_01_A23T55JLT4_1.starfusion.starfusion.fusion_predictions.filtered_pass_only.tsv
- Size
- 32.2 KB
- Workflow Run
- dev_rna_exp0016-2cae617
- Published
- May 16, 2026 9:47 AM
Content
View in new tab| #FusionName | JunctionReadCount | SpanningFragCount | est_J | est_S | SpliceType | LeftGene | LeftBreakpoint | RightGene | RightBreakpoint | JunctionReads | SpanningFrags | LargeAnchorSupport | FFPM | LeftBreakDinuc | LeftBreakEntropy | RightBreakDinuc | RightBreakEntropy | annots | breakpoint_ID | blacklisted | blacklist_reasons | aih_curated_reason | CALL | filter_reason | FILTER | total_reads |
| MTAP--CDKN2B-AS1 | 77 | 2 | 77.0 | 2.0 | ONLY_REF_SPLICE | MTAP^ENSG00000099810.21 | chr9:21838010:+ | CDKN2B-AS1^ENSG00000240498.9 | chr9:22112320:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1124:48585:18599,LH00995:25:23T55JLT4:2:1152:22042:14830,LH00995:25:23T55JLT4:2:1175:7860:24008,LH00995:25:23T55JLT4:2:1179:30682:5274,LH00995:25:23T55JLT4:2:1191:14171:12630,LH00995:25:23T55JLT4:2:1197:48448:23125,LH00995:25:23T55JLT4:2:1228:49111:5190,LH00995:25:23T55JLT4:2:1282:49491:18123,LH00995:25:23T55JLT4:2:1304:48189:8441,LH00995:25:23T55JLT4:2:1331:49653:5596,LH00995:25:23T55JLT4:2:1337:33182:3915,LH00995:25:23T55JLT4:2:1414:19987:23125,LH00995:25:23T55JLT4:2:1444:6542:20267,LH00995:25:23T55JLT4:2:1447:32745:6829,LH00995:25:23T55JLT4:2:1475:40406:18473,LH00995:25:23T55JLT4:2:1476:50203:2233,LH00995:25:23T55JLT4:2:1478:11137:5806,LH00995:25:23T55JLT4:2:1478:40973:16371,LH00995:25:23T55JLT4:2:1491:51902:14172,LH00995:25:23T55JLT4:2:2106:32365:6647,LH00995:25:23T55JLT4:2:2126:26208:1420,LH00995:25:23T55JLT4:2:2153:6364:26264,LH00995:25:23T55JLT4:2:2172:2181:13947,LH00995:25:23T55JLT4:2:2239:14033:5974,LH00995:25:23T55JLT4:2:2286:14381:13807,LH00995:25:23T55JLT4:2:2321:40657:4111,LH00995:25:23T55JLT4:2:2362:45900:12378,LH00995:25:23T55JLT4:2:2368:5603:21500,LH00995:25:23T55JLT4:2:2423:26864:21892,LH00995:25:23T55JLT4:5:1150:45066:9842,LH00995:25:23T55JLT4:5:1248:19583:6339,LH00995:25:23T55JLT4:5:1270:9705:25157,LH00995:25:23T55JLT4:5:1292:24121:17871,LH00995:25:23T55JLT4:5:1298:9276:22397,LH00995:25:23T55JLT4:5:1337:42008:23266,LH00995:25:23T55JLT4:5:1339:20133:5806,LH00995:25:23T55JLT4:5:1349:1316:26965,LH00995:25:23T55JLT4:5:1403:45341:10514,LH00995:25:23T55JLT4:5:1414:10805:11453,LH00995:25:23T55JLT4:5:1438:18790:6002,LH00995:25:23T55JLT4:5:2143:45333:20533,LH00995:25:23T55JLT4:5:2207:39128:20323,LH00995:25:23T55JLT4:5:2211:16549:9127,LH00995:25:23T55JLT4:5:2283:3556:3214,LH00995:25:23T55JLT4:5:2374:51393:12196,LH00995:25:23T55JLT4:5:2470:42437:29697,LH00995:25:23T55JLT4:6:1103:14340:18137,LH00995:25:23T55JLT4:6:1108:31580:18936,LH00995:25:23T55JLT4:6:1112:43869:24891,LH00995:25:23T55JLT4:6:1156:11072:26068,LH00995:25:23T55JLT4:6:1162:51482:25578,LH00995:25:23T55JLT4:6:1295:50721:6829,LH00995:25:23T55JLT4:6:1350:5401:20477,LH00995:25:23T55JLT4:6:2180:10813:19959,LH00995:25:23T55JLT4:6:2184:42979:1294,LH00995:25:23T55JLT4:6:2296:41515:5568,LH00995:25:23T55JLT4:6:2323:45204:20505,LH00995:25:23T55JLT4:6:2332:19542:29389,LH00995:25:23T55JLT4:6:2421:38538:6577,LH00995:25:23T55JLT4:6:2426:26807:3550,LH00995:25:23T55JLT4:8:1139:50616:19258,LH00995:25:23T55JLT4:8:1238:1259:26278,LH00995:25:23T55JLT4:8:1317:19672:25045,LH00995:25:23T55JLT4:8:1371:47784:29459,LH00995:25:23T55JLT4:8:1446:3168:14592,LH00995:25:23T55JLT4:8:2126:10150:1546,LH00995:25:23T55JLT4:8:2147:43206:24667,LH00995:25:23T55JLT4:8:2150:50106:4223,LH00995:25:23T55JLT4:8:2214:30925:3480,LH00995:25:23T55JLT4:8:2270:40018:15531,LH00995:25:23T55JLT4:8:2308:47113:14928,LH00995:25:23T55JLT4:8:2318:15522:16848,LH00995:25:23T55JLT4:8:2409:15813:13485,LH00995:25:23T55JLT4:8:2409:51627:24008,LH00995:25:23T55JLT4:8:2415:50268:14900,LH00995:25:23T55JLT4:8:2473:51101:23041,LH00995:25:23T55JLT4:8:2477:7610:8609 | LH00995:25:23T55JLT4:2:1267:30909:19006,LH00995:25:23T55JLT4:6:1271:7699:24036 | YES_LDAS | 0.2675 | GT | 1.5301 | AG | 1.8323 | ["ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.06Mb]","NEIGHBORS[56488]"] | chr9:21838010-chr9:22112320 | False | 1 | PASS | 79 | |||
| TMEM65--ANXA13 | 45 | 1 | 45.0 | 0.58 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM65^ENSG00000164983.8 | chr8:124371854:- | ANXA13^ENSG00000104537.17 | chr8:123684722:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1106:23199:12826,LH00995:25:23T55JLT4:2:1116:37057:15587,LH00995:25:23T55JLT4:2:1131:7852:16596,LH00995:25:23T55JLT4:2:1134:26281:14914,LH00995:25:23T55JLT4:2:1384:19591:19636,LH00995:25:23T55JLT4:2:1430:16411:28506,LH00995:25:23T55JLT4:2:2315:2149:27315,LH00995:25:23T55JLT4:2:2374:9672:12406,LH00995:25:23T55JLT4:2:2401:47687:14242,LH00995:25:23T55JLT4:5:1221:39978:18571,LH00995:25:23T55JLT4:5:1242:19518:8188,LH00995:25:23T55JLT4:5:1326:11655:10907,LH00995:25:23T55JLT4:5:1367:1469:5624,LH00995:25:23T55JLT4:5:2162:36070:19987,LH00995:25:23T55JLT4:5:2175:20181:6927,LH00995:25:23T55JLT4:5:2253:1129:19833,LH00995:25:23T55JLT4:5:2303:6639:2359,LH00995:25:23T55JLT4:5:2312:28546:7039,LH00995:25:23T55JLT4:5:2370:34226:11439,LH00995:25:23T55JLT4:5:2403:8977:27147,LH00995:25:23T55JLT4:5:2462:13095:1883,LH00995:25:23T55JLT4:5:2476:18563:13009,LH00995:25:23T55JLT4:6:1116:22972:28941,LH00995:25:23T55JLT4:6:1176:14462:25297,LH00995:25:23T55JLT4:6:1295:46531:7278,LH00995:25:23T55JLT4:6:1329:24380:10640,LH00995:25:23T55JLT4:6:1391:43853:24919,LH00995:25:23T55JLT4:6:2160:38400:25760,LH00995:25:23T55JLT4:6:2192:26839:21738,LH00995:25:23T55JLT4:6:2337:2675:13681,LH00995:25:23T55JLT4:6:2344:40649:9253,LH00995:25:23T55JLT4:6:2433:8677:29039,LH00995:25:23T55JLT4:6:2485:5741:8931,LH00995:25:23T55JLT4:8:1130:49136:11593,LH00995:25:23T55JLT4:8:1226:32680:7810,LH00995:25:23T55JLT4:8:1348:28174:7432,LH00995:25:23T55JLT4:8:1411:41927:4517,LH00995:25:23T55JLT4:8:2106:13006:28520,LH00995:25:23T55JLT4:8:2187:14171:21710,LH00995:25:23T55JLT4:8:2194:47242:23840,LH00995:25:23T55JLT4:8:2222:50519:23938,LH00995:25:23T55JLT4:8:2251:15562:10584,LH00995:25:23T55JLT4:8:2280:49257:15615,LH00995:25:23T55JLT4:8:2311:1736:25367,LH00995:25:23T55JLT4:8:2340:51231:11355 | LH00995:25:23T55JLT4:5:1369:35779:8889 | YES_LDAS | 0.1544 | GT | 1.9656 | AG | 1.9219 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]"] | chr8:124371854-chr8:123684722 | False | 1 | PASS | 46 | |||
| RPSAP52--HMGA2 | 44 | 0 | 44.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | RPSAP52^ENSG00000241749.4 | chr12:65826843:- | HMGA2^ENSG00000149948.14 | chr12:65828001:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:35496:26671,LH00995:25:23T55JLT4:2:1171:45503:19678,LH00995:25:23T55JLT4:2:1177:6420:7558,LH00995:25:23T55JLT4:2:2172:31168:28338,LH00995:25:23T55JLT4:2:2196:11938:23700,LH00995:25:23T55JLT4:2:2216:24372:10851,LH00995:25:23T55JLT4:2:2257:7674:18081,LH00995:25:23T55JLT4:2:2295:10384:8903,LH00995:25:23T55JLT4:2:2330:42073:2864,LH00995:25:23T55JLT4:2:2360:5684:12252,LH00995:25:23T55JLT4:2:2409:36402:23532,LH00995:25:23T55JLT4:2:2421:41159:4279,LH00995:25:23T55JLT4:2:2444:42947:29683,LH00995:25:23T55JLT4:2:2455:7035:8875,LH00995:25:23T55JLT4:2:2458:51198:16596,LH00995:25:23T55JLT4:5:1214:6000:29613,LH00995:25:23T55JLT4:5:1237:15085:21108,LH00995:25:23T55JLT4:5:1251:3880:23896,LH00995:25:23T55JLT4:5:1270:26799:28394,LH00995:25:23T55JLT4:5:1309:27179:2121,LH00995:25:23T55JLT4:5:1359:38707:15475,LH00995:25:23T55JLT4:5:1410:24655:2541,LH00995:25:23T55JLT4:5:2197:28377:14704,LH00995:25:23T55JLT4:5:2281:22811:29501,LH00995:25:23T55JLT4:5:2325:21621:7292,LH00995:25:23T55JLT4:5:2330:1073:1322,LH00995:25:23T55JLT4:5:2378:42146:17535,LH00995:25:23T55JLT4:6:1109:34234:10753,LH00995:25:23T55JLT4:6:1114:2553:15180,LH00995:25:23T55JLT4:6:1182:34185:23139,LH00995:25:23T55JLT4:6:1238:45212:4349,LH00995:25:23T55JLT4:6:1464:44079:16231,LH00995:25:23T55JLT4:6:2201:33247:27175,LH00995:25:23T55JLT4:6:2276:4996:24344,LH00995:25:23T55JLT4:6:2371:48302:12756,LH00995:25:23T55JLT4:6:2412:18709:29543,LH00995:25:23T55JLT4:8:2128:30351:13947,LH00995:25:23T55JLT4:8:2148:8313:20225,LH00995:25:23T55JLT4:8:2184:6081:20113,LH00995:25:23T55JLT4:8:2214:30367:24485,LH00995:25:23T55JLT4:8:2287:16055:11495,LH00995:25:23T55JLT4:8:2308:30407:29599,LH00995:25:23T55JLT4:8:2317:22398:25536,LH00995:25:23T55JLT4:8:2444:40042:18908 | . | YES_LDAS | 0.149 | GT | 1.9329 | AG | 1.8256 | ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.00Mb]","NEIGHBORS_OVERLAP:-:+:[2537]"] | chr12:65826843-chr12:65828001 | False | 1 | PASS | 44 | |||
| B4GALT6--DSC3 | 44 | 0 | 44.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | B4GALT6^ENSG00000118276.11 | chr18:31684312:- | DSC3^ENSG00000134762.17 | chr18:30994372:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1126:29080:24330,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:40641:18487,LH00995:25:23T55JLT4:2:1152:13289:11775,LH00995:25:23T55JLT4:2:1209:18992:18684,LH00995:25:23T55JLT4:2:1209:23223:7936,LH00995:25:23T55JLT4:2:1422:13451:13121,LH00995:25:23T55JLT4:2:2105:48480:3312,LH00995:25:23T55JLT4:2:2176:32891:7614,LH00995:25:23T55JLT4:2:2191:8799:28969,LH00995:25:23T55JLT4:2:2204:29412:2513,LH00995:25:23T55JLT4:2:2241:34104:14144,LH00995:25:23T55JLT4:2:2321:22794:6465,LH00995:25:23T55JLT4:5:1103:35552:20771,LH00995:25:23T55JLT4:5:1261:6275:5848,LH00995:25:23T55JLT4:5:1328:51821:27119,LH00995:25:23T55JLT4:5:1436:26540:1490,LH00995:25:23T55JLT4:5:1457:40754:22915,LH00995:25:23T55JLT4:5:1458:33489:25970,LH00995:25:23T55JLT4:5:2168:47849:23714,LH00995:25:23T55JLT4:5:2221:50066:4545,LH00995:25:23T55JLT4:5:2390:24000:27918,LH00995:25:23T55JLT4:6:1110:42308:28884,LH00995:25:23T55JLT4:6:1142:20756:20141,LH00995:25:23T55JLT4:6:1143:11630:18375,LH00995:25:23T55JLT4:6:1156:15166:12784,LH00995:25:23T55JLT4:6:1251:21395:28422,LH00995:25:23T55JLT4:6:1404:31087:26713,LH00995:25:23T55JLT4:6:1409:34031:14017,LH00995:25:23T55JLT4:6:1488:6129:3018,LH00995:25:23T55JLT4:6:2156:48691:4461,LH00995:25:23T55JLT4:6:2295:1437:27119,LH00995:25:23T55JLT4:6:2344:19194:24863,LH00995:25:23T55JLT4:6:2351:32422:21010,LH00995:25:23T55JLT4:8:1161:7804:21808,LH00995:25:23T55JLT4:8:1183:44832:25381,LH00995:25:23T55JLT4:8:1256:37583:21290,LH00995:25:23T55JLT4:8:1268:39152:3690,LH00995:25:23T55JLT4:8:1278:49491:24120,LH00995:25:23T55JLT4:8:1364:21589:6255,LH00995:25:23T55JLT4:8:1384:26977:11719,LH00995:25:23T55JLT4:8:1423:4285:10809,LH00995:25:23T55JLT4:8:2302:51182:9590,LH00995:25:23T55JLT4:8:2337:13588:12070,LH00995:25:23T55JLT4:8:2339:4681:13149 | . | YES_LDAS | 0.149 | GT | 1.8323 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:0.58Mb]"] | chr18:31684312-chr18:30994372 | False | 1 | PASS | 44 | |||
| BIRC3--PDGFD | 43 | 0 | 43.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | BIRC3^ENSG00000023445.16 | chr11:102317571:+ | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000255:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1113:43189:15054,LH00995:25:23T55JLT4:2:1132:36572:13485,LH00995:25:23T55JLT4:2:1216:22341:7446,LH00995:25:23T55JLT4:2:1216:22358:7446,LH00995:25:23T55JLT4:2:1280:38157:27862,LH00995:25:23T55JLT4:2:1282:32672:22733,LH00995:25:23T55JLT4:2:1310:19469:16035,LH00995:25:23T55JLT4:2:1348:39436:16540,LH00995:25:23T55JLT4:2:1419:16201:1238,LH00995:25:23T55JLT4:2:1419:47898:27133,LH00995:25:23T55JLT4:2:2116:3726:20996,LH00995:25:23T55JLT4:2:2146:49702:17086,LH00995:25:23T55JLT4:2:2163:40649:3676,LH00995:25:23T55JLT4:2:2174:17334:20071,LH00995:25:23T55JLT4:2:2369:1947:23910,LH00995:25:23T55JLT4:2:2391:2537:4867,LH00995:25:23T55JLT4:2:2452:33789:13317,LH00995:25:23T55JLT4:5:1184:22479:17436,LH00995:25:23T55JLT4:5:1186:26233:16764,LH00995:25:23T55JLT4:5:1277:21079:6409,LH00995:25:23T55JLT4:5:1327:45511:2878,LH00995:25:23T55JLT4:5:1458:28498:10682,LH00995:25:23T55JLT4:5:2333:28449:26600,LH00995:25:23T55JLT4:5:2457:26435:1813,LH00995:25:23T55JLT4:6:1114:19130:12476,LH00995:25:23T55JLT4:6:1262:26694:28212,LH00995:25:23T55JLT4:6:1469:29825:10094,LH00995:25:23T55JLT4:6:1486:34679:23378,LH00995:25:23T55JLT4:6:1490:11614:22663,LH00995:25:23T55JLT4:6:2104:18248:3746,LH00995:25:23T55JLT4:6:2173:11776:11789,LH00995:25:23T55JLT4:6:2175:42057:3788,LH00995:25:23T55JLT4:6:2272:42291:23083,LH00995:25:23T55JLT4:6:2344:48343:22775,LH00995:25:23T55JLT4:8:1151:9503:25620,LH00995:25:23T55JLT4:8:1348:27430:18305,LH00995:25:23T55JLT4:8:1373:32818:27189,LH00995:25:23T55JLT4:8:1374:49443:2345,LH00995:25:23T55JLT4:8:1386:30140:17338,LH00995:25:23T55JLT4:8:2103:33198:18319,LH00995:25:23T55JLT4:8:2177:48173:24022,LH00995:25:23T55JLT4:8:2357:27284:14858,LH00995:25:23T55JLT4:8:2493:23061:4937 | . | YES_LDAS | 0.1456 | GT | 1.8323 | AG | 1.8323 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.57Mb]"] | chr11:102317571-chr11:104000255 | False | 1 | PASS | 43 | |||
| TMEM123--PDGFD | 42 | 0 | 42.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000255:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1113:8629:19566,LH00995:25:23T55JLT4:2:1291:43238:27946,LH00995:25:23T55JLT4:2:1301:36580:3971,LH00995:25:23T55JLT4:2:1366:42518:19636,LH00995:25:23T55JLT4:2:1450:34954:23041,LH00995:25:23T55JLT4:2:2134:4082:1883,LH00995:25:23T55JLT4:2:2180:27972:28520,LH00995:25:23T55JLT4:2:2202:12900:23882,LH00995:25:23T55JLT4:2:2260:48351:6002,LH00995:25:23T55JLT4:2:2374:14737:24737,LH00995:25:23T55JLT4:2:2431:41830:14634,LH00995:25:23T55JLT4:2:2451:23555:6997,LH00995:25:23T55JLT4:2:2458:41312:3957,LH00995:25:23T55JLT4:5:1142:38521:2205,LH00995:25:23T55JLT4:5:1182:51571:24863,LH00995:25:23T55JLT4:5:1193:52096:21682,LH00995:25:23T55JLT4:5:1315:24663:6507,LH00995:25:23T55JLT4:5:2146:26160:13051,LH00995:25:23T55JLT4:5:2333:21387:25970,LH00995:25:23T55JLT4:5:2378:25909:22173,LH00995:25:23T55JLT4:5:2476:45503:10262,LH00995:25:23T55JLT4:6:1174:51118:17072,LH00995:25:23T55JLT4:6:1251:33619:12210,LH00995:25:23T55JLT4:6:1487:3120:8623,LH00995:25:23T55JLT4:6:2192:29825:25479,LH00995:25:23T55JLT4:6:2275:38627:7348,LH00995:25:23T55JLT4:6:2367:20489:18137,LH00995:25:23T55JLT4:6:2370:6574:8945,LH00995:25:23T55JLT4:6:2484:37785:13457,LH00995:25:23T55JLT4:8:1179:14122:29389,LH00995:25:23T55JLT4:8:1236:32891:27315,LH00995:25:23T55JLT4:8:1248:39670:15012,LH00995:25:23T55JLT4:8:1272:8184:2709,LH00995:25:23T55JLT4:8:1311:45697:16596,LH00995:25:23T55JLT4:8:1361:8572:1532,LH00995:25:23T55JLT4:8:2101:19065:16540,LH00995:25:23T55JLT4:8:2114:9592:27988,LH00995:25:23T55JLT4:8:2139:8613:12364,LH00995:25:23T55JLT4:8:2188:36839:3158,LH00995:25:23T55JLT4:8:2242:24137:3018,LH00995:25:23T55JLT4:8:2252:1105:18950,LH00995:25:23T55JLT4:8:2256:28401:2780 | . | YES_LDAS | 0.1422 | GT | 1.9656 | AG | 1.8323 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]"] | chr11:102448812-chr11:104000255 | False | 1 | PASS | 42 | |||
| CLTC--VMP1 | 38 | 3 | 38.0 | 3.0 | ONLY_REF_SPLICE | CLTC^ENSG00000141367.12 | chr17:59690711:+ | VMP1^ENSG00000062716.13 | chr17:59838295:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1112:23725:12140,LH00995:25:23T55JLT4:2:1142:27543:22145,LH00995:25:23T55JLT4:2:1170:4932:21374,LH00995:25:23T55JLT4:2:1252:31750:18165,LH00995:25:23T55JLT4:2:1258:34760:14073,LH00995:25:23T55JLT4:2:2135:22875:18291,LH00995:25:23T55JLT4:2:2314:51781:25283,LH00995:25:23T55JLT4:5:1194:18782:13415,LH00995:25:23T55JLT4:5:1431:18604:3242,LH00995:25:23T55JLT4:5:2104:44985:14101,LH00995:25:23T55JLT4:5:2166:42251:7628,LH00995:25:23T55JLT4:5:2184:27867:17997,LH00995:25:23T55JLT4:5:2236:23579:14662,LH00995:25:23T55JLT4:5:2257:27058:7516,LH00995:25:23T55JLT4:5:2282:27479:5162,LH00995:25:23T55JLT4:5:2356:30100:5050,LH00995:25:23T55JLT4:5:2474:39605:13947,LH00995:25:23T55JLT4:6:1218:1396:19398,LH00995:25:23T55JLT4:6:1395:10012:13891,LH00995:25:23T55JLT4:6:1428:27026:8637,LH00995:25:23T55JLT4:6:1437:14357:1855,LH00995:25:23T55JLT4:6:1444:6517:4027,LH00995:25:23T55JLT4:6:2157:39686:20561,LH00995:25:23T55JLT4:6:2172:12253:24583,LH00995:25:23T55JLT4:6:2222:24178:12084,LH00995:25:23T55JLT4:6:2262:6121:4321,LH00995:25:23T55JLT4:6:2420:1008:11944,LH00995:25:23T55JLT4:6:2421:17253:20155,LH00995:25:23T55JLT4:8:1135:44063:28422,LH00995:25:23T55JLT4:8:1149:12480:18445,LH00995:25:23T55JLT4:8:1153:32486:7754,LH00995:25:23T55JLT4:8:1186:31038:5778,LH00995:25:23T55JLT4:8:1363:45082:6143,LH00995:25:23T55JLT4:8:2135:17326:22635,LH00995:25:23T55JLT4:8:2238:49726:5694,LH00995:25:23T55JLT4:8:2290:21573:28450,LH00995:25:23T55JLT4:8:2346:39792:12336,LH00995:25:23T55JLT4:8:2401:44565:15867 | LH00995:25:23T55JLT4:2:2409:47542:4405,LH00995:25:23T55JLT4:6:1256:44459:9463,LH00995:25:23T55JLT4:8:2260:36798:24919 | YES_LDAS | 0.1389 | GT | 1.8892 | AG | 1.8062 | ["Klijn_CellLines","Larsson_TCGA","ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.01Mb]","NEIGHBORS[10236]"] | chr17:59690711-chr17:59838295 | False | 1 | PASS | 41 | |||
| TBC1D13--AL442224.1 | 32 | 0 | 32.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TBC1D13^ENSG00000107021.16 | chr9:128792574:+ | AL442224.1^ENSG00000231990.2 | chr9:93825711:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1161:8305:3985,LH00995:25:23T55JLT4:2:1259:37996:10038,LH00995:25:23T55JLT4:2:1344:11323:8483,LH00995:25:23T55JLT4:2:1379:33239:7908,LH00995:25:23T55JLT4:2:1386:17795:19496,LH00995:25:23T55JLT4:2:1495:20982:10192,LH00995:25:23T55JLT4:2:2154:41555:3228,LH00995:25:23T55JLT4:2:2342:8783:29697,LH00995:25:23T55JLT4:2:2367:36143:8314,LH00995:25:23T55JLT4:2:2386:21516:29445,LH00995:25:23T55JLT4:5:1244:18847:23308,LH00995:25:23T55JLT4:5:1273:10045:3410,LH00995:25:23T55JLT4:5:1391:46539:18529,LH00995:25:23T55JLT4:5:2197:35043:4559,LH00995:25:23T55JLT4:5:2214:28199:4727,LH00995:25:23T55JLT4:5:2280:1947:21976,LH00995:25:23T55JLT4:5:2291:11307:4783,LH00995:25:23T55JLT4:5:2325:2836:11467,LH00995:25:23T55JLT4:5:2430:46134:5638,LH00995:25:23T55JLT4:6:1187:39363:22943,LH00995:25:23T55JLT4:6:1219:44840:18782,LH00995:25:23T55JLT4:6:1222:10190:21066,LH00995:25:23T55JLT4:6:1305:11962:15923,LH00995:25:23T55JLT4:6:1479:3298:5428,LH00995:25:23T55JLT4:6:2117:13548:20799,LH00995:25:23T55JLT4:6:2195:30626:12154,LH00995:25:23T55JLT4:6:2333:34509:10360,LH00995:25:23T55JLT4:6:2390:41709:1589,LH00995:25:23T55JLT4:8:1132:45980:23139,LH00995:25:23T55JLT4:8:1141:24688:29613,LH00995:25:23T55JLT4:8:1395:24599:8188,LH00995:25:23T55JLT4:8:2271:36386:29501 | . | YES_LDAS | 0.1084 | GT | 1.9329 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:34.93Mb]"] | chr9:128792574-chr9:93825711 | False | 1 | PASS | 32 | |||
| TMEM65--ANXA13 | 32 | 1 | 32.0 | 0.42 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM65^ENSG00000164983.8 | chr8:124371854:- | ANXA13^ENSG00000104537.17 | chr8:123688946:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1116:29186:12070,LH00995:25:23T55JLT4:2:1202:36305:14844,LH00995:25:23T55JLT4:2:2102:8661:25395,LH00995:25:23T55JLT4:2:2111:47420:7754,LH00995:25:23T55JLT4:2:2129:15683:27974,LH00995:25:23T55JLT4:2:2252:10910:19006,LH00995:25:23T55JLT4:2:2452:9681:19819,LH00995:25:23T55JLT4:2:2455:22155:27777,LH00995:25:23T55JLT4:5:1153:17083:1645,LH00995:25:23T55JLT4:5:1356:45074:9968,LH00995:25:23T55JLT4:5:1467:15497:13723,LH00995:25:23T55JLT4:5:1478:42469:13891,LH00995:25:23T55JLT4:5:2189:11703:11775,LH00995:25:23T55JLT4:5:2221:7245:16049,LH00995:25:23T55JLT4:5:2233:14243:19987,LH00995:25:23T55JLT4:5:2305:2893:19945,LH00995:25:23T55JLT4:5:2384:4721:7726,LH00995:25:23T55JLT4:5:2411:36402:5624,LH00995:25:23T55JLT4:5:2430:45131:1603,LH00995:25:23T55JLT4:5:2440:31629:24204,LH00995:25:23T55JLT4:6:1142:28045:7179,LH00995:25:23T55JLT4:6:1171:27244:19328,LH00995:25:23T55JLT4:6:1317:50624:22271,LH00995:25:23T55JLT4:6:1490:14713:8805,LH00995:25:23T55JLT4:6:2137:14001:9001,LH00995:25:23T55JLT4:6:2161:40212:7852,LH00995:25:23T55JLT4:6:2289:10902:9351,LH00995:25:23T55JLT4:6:2311:32413:3901,LH00995:25:23T55JLT4:6:2420:32543:8300,LH00995:25:23T55JLT4:8:1212:24696:4349,LH00995:25:23T55JLT4:8:1283:23466:24022,LH00995:25:23T55JLT4:8:2286:18385:21612 | LH00995:25:23T55JLT4:5:1369:35779:8889 | YES_LDAS | 0.1098 | GT | 1.9656 | AG | 1.9656 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]"] | chr8:124371854-chr8:123688946 | False | 1 | PASS | 33 | |||
| PDCD1LG2--DYNC2H1 | 31 | 2 | 31.0 | 1.41 | ONLY_REF_SPLICE | PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 | chr9:5535050:+ | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103114103:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1125:35463:13583,LH00995:25:23T55JLT4:2:1144:14090:12826,LH00995:25:23T55JLT4:2:1160:13483:19258,LH00995:25:23T55JLT4:2:1165:28660:21248,LH00995:25:23T55JLT4:2:1203:42105:7600,LH00995:25:23T55JLT4:2:1213:33805:19314,LH00995:25:23T55JLT4:2:1343:38246:11229,LH00995:25:23T55JLT4:2:1435:11121:10823,LH00995:25:23T55JLT4:2:2103:38157:20071,LH00995:25:23T55JLT4:2:2106:15837:13331,LH00995:25:23T55JLT4:2:2408:41369:10893,LH00995:25:23T55JLT4:5:1219:35884:25970,LH00995:25:23T55JLT4:5:1308:49063:23322,LH00995:25:23T55JLT4:5:1436:3427:21066,LH00995:25:23T55JLT4:5:2353:20974:17492,LH00995:25:23T55JLT4:5:2407:11679:25858,LH00995:25:23T55JLT4:6:1145:27009:23770,LH00995:25:23T55JLT4:6:1369:19227:4685,LH00995:25:23T55JLT4:6:1485:18571:21038,LH00995:25:23T55JLT4:6:2340:51409:24050,LH00995:25:23T55JLT4:8:1107:45535:11019,LH00995:25:23T55JLT4:8:1129:8338:10402,LH00995:25:23T55JLT4:8:1203:11622:2415,LH00995:25:23T55JLT4:8:1327:16411:6871,LH00995:25:23T55JLT4:8:2171:9211:3844,LH00995:25:23T55JLT4:8:2183:22050:8398,LH00995:25:23T55JLT4:8:2307:5992:3929,LH00995:25:23T55JLT4:8:2307:6768:3985,LH00995:25:23T55JLT4:8:2387:11533:20954,LH00995:25:23T55JLT4:8:2396:50414:23840,LH00995:25:23T55JLT4:8:2489:35407:2163 | LH00995:25:23T55JLT4:8:1496:15158:26166,LH00995:25:23T55JLT4:8:2334:1073:1743 | YES_LDAS | 0.1098 | GT | 1.9219 | AG | 1.8323 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"] | chr9:5535050-chr11:103114103 | False | 1 | PASS | 33 | |||
| SH3BP5--AC002074.1 | 27 | 0 | 27.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | SH3BP5^ENSG00000131370.16 | chr3:15304103:- | AC002074.1^ENSG00000285090.1 | chr7:94279390:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1230:17261:12798,LH00995:25:23T55JLT4:2:1262:5919:23952,LH00995:25:23T55JLT4:2:1327:27600:28492,LH00995:25:23T55JLT4:2:1395:29865:4055,LH00995:25:23T55JLT4:2:1402:33692:11467,LH00995:25:23T55JLT4:2:2144:19825:9085,LH00995:25:23T55JLT4:2:2173:46353:29473,LH00995:25:23T55JLT4:2:2214:33239:6283,LH00995:25:23T55JLT4:5:1137:26087:10262,LH00995:25:23T55JLT4:5:1318:36175:26867,LH00995:25:23T55JLT4:5:1319:1299:6199,LH00995:25:23T55JLT4:5:1452:44136:26558,LH00995:25:23T55JLT4:5:2178:4721:29445,LH00995:25:23T55JLT4:5:2225:27689:7768,LH00995:25:23T55JLT4:5:2293:15538:20435,LH00995:25:23T55JLT4:5:2442:50665:5722,LH00995:25:23T55JLT4:6:1421:34929:28072,LH00995:25:23T55JLT4:8:1206:39727:8637,LH00995:25:23T55JLT4:8:1280:44904:22621,LH00995:25:23T55JLT4:8:1341:14251:1168,LH00995:25:23T55JLT4:8:1430:4786:5288,LH00995:25:23T55JLT4:8:1447:8410:2485,LH00995:25:23T55JLT4:8:2102:11873:18235,LH00995:25:23T55JLT4:8:2154:10854:9407,LH00995:25:23T55JLT4:8:2253:1275:12938,LH00995:25:23T55JLT4:8:2397:48771:20015,LH00995:25:23T55JLT4:8:2498:5959:8889 | . | YES_LDAS | 0.0914 | GT | 1.5546 | AG | 1.5546 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr7]"] | chr3:15304103-chr7:94279390 | False | 1 | PASS | 27 | |||
| AL033504.1--SASH1 | 24 | 0 | 24.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | AL033504.1^ENSG00000227681.5 | chr6:147947519:+ | SASH1^ENSG00000111961.18 | chr6:148390134:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1124:38837:16484,LH00995:25:23T55JLT4:2:1160:47340:26390,LH00995:25:23T55JLT4:2:1453:38263:13667,LH00995:25:23T55JLT4:2:1456:7990:3606,LH00995:25:23T55JLT4:2:1483:11404:15545,LH00995:25:23T55JLT4:2:2319:40050:14326,LH00995:25:23T55JLT4:2:2362:20545:17338,LH00995:25:23T55JLT4:5:1347:22455:28044,LH00995:25:23T55JLT4:5:1402:11590:12728,LH00995:25:23T55JLT4:5:1489:45495:28856,LH00995:25:23T55JLT4:5:2280:27438:12070,LH00995:25:23T55JLT4:5:2369:46247:8749,LH00995:25:23T55JLT4:5:2440:51991:6367,LH00995:25:23T55JLT4:6:1179:42761:21542,LH00995:25:23T55JLT4:6:1430:27527:6899,LH00995:25:23T55JLT4:6:1454:9551:7908,LH00995:25:23T55JLT4:6:2235:21791:5232,LH00995:25:23T55JLT4:6:2371:2804:23434,LH00995:25:23T55JLT4:6:2479:15020:28506,LH00995:25:23T55JLT4:8:1108:43553:18936,LH00995:25:23T55JLT4:8:1150:37615:20757,LH00995:25:23T55JLT4:8:1487:50179:26769,LH00995:25:23T55JLT4:8:2211:37397:19566,LH00995:25:23T55JLT4:8:2409:38489:28324 | . | YES_LDAS | 0.0813 | GT | 1.5329 | AG | 1.9219 | ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.32Mb]"] | chr6:147947519-chr6:148390134 | False | 1 | PASS | 24 | |||
| TMEM123--PPP2R2C | 23 | 0 | 23.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PPP2R2C^ENSG00000074211.14 | chr4:6381094:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1252:23078:9842,LH00995:25:23T55JLT4:2:1271:36062:28380,LH00995:25:23T55JLT4:2:1412:34307:3004,LH00995:25:23T55JLT4:2:1414:23579:7628,LH00995:25:23T55JLT4:2:2277:31669:16540,LH00995:25:23T55JLT4:2:2284:13151:11902,LH00995:25:23T55JLT4:5:1246:25424:1518,LH00995:25:23T55JLT4:5:1323:3904:25395,LH00995:25:23T55JLT4:5:1461:35253:15825,LH00995:25:23T55JLT4:5:2180:38303:26769,LH00995:25:23T55JLT4:6:1449:2715:9351,LH00995:25:23T55JLT4:6:1486:2715:18908,LH00995:25:23T55JLT4:6:1498:10886:9407,LH00995:25:23T55JLT4:6:2294:30197:9533,LH00995:25:23T55JLT4:6:2386:22447:5946,LH00995:25:23T55JLT4:8:1245:13904:12056,LH00995:25:23T55JLT4:8:2136:37801:15699,LH00995:25:23T55JLT4:8:2146:36628:20141,LH00995:25:23T55JLT4:8:2206:32648:17899,LH00995:25:23T55JLT4:8:2326:31451:19524,LH00995:25:23T55JLT4:8:2342:14793:18557,LH00995:25:23T55JLT4:8:2374:27390:20897,LH00995:25:23T55JLT4:8:2388:35981:6241 | . | YES_LDAS | 0.0779 | GT | 1.9656 | AG | 1.8256 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr4]"] | chr11:102448812-chr4:6381094 | False | 1 | PASS | 23 | |||
| TMEM123--DYNC2H1 | 20 | 1 | 20.0 | 0.69 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103280348:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1311:16687:15587,LH00995:25:23T55JLT4:2:2145:28166:13975,LH00995:25:23T55JLT4:2:2193:24299:13387,LH00995:25:23T55JLT4:2:2193:2974:14312,LH00995:25:23T55JLT4:2:2247:47857:28941,LH00995:25:23T55JLT4:2:2291:16209:3494,LH00995:25:23T55JLT4:5:1185:36823:14760,LH00995:25:23T55JLT4:5:1376:50851:9463,LH00995:25:23T55JLT4:5:2107:36054:12532,LH00995:25:23T55JLT4:5:2422:43084:7642,LH00995:25:23T55JLT4:5:2466:31540:24190,LH00995:25:23T55JLT4:6:1142:10012:20197,LH00995:25:23T55JLT4:6:1325:34727:17661,LH00995:25:23T55JLT4:6:1392:18741:3424,LH00995:25:23T55JLT4:6:2137:43230:22383,LH00995:25:23T55JLT4:6:2247:34792:6871,LH00995:25:23T55JLT4:8:1343:17940:21878,LH00995:25:23T55JLT4:8:1478:20311:9533,LH00995:25:23T55JLT4:8:2159:26791:10697,LH00995:25:23T55JLT4:8:2449:7334:11579 | LH00995:25:23T55JLT4:8:1417:39290:13625 | YES_LDAS | 0.07 | GT | 1.9656 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.64Mb]"] | chr11:102448812-chr11:103280348 | False | 1 | PASS | 21 | |||
| SRGAP2--FCGR1B | 18 | 1 | 6.0 | 0.25 | ONLY_REF_SPLICE | SRGAP2^ENSG00000266028.7 | chr1:206343008:+ | FCGR1B^ENSG00000198019.13 | chr1:121092996:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1295:4940:26853,LH00995:25:23T55JLT4:2:1453:24243:21556,LH00995:25:23T55JLT4:2:2142:51514:1168,LH00995:25:23T55JLT4:2:2331:12714:17899,LH00995:25:23T55JLT4:2:2433:3395:13303,LH00995:25:23T55JLT4:5:2120:46223:28296,LH00995:25:23T55JLT4:5:2324:11744:4531,LH00995:25:23T55JLT4:5:2455:4592:16890,LH00995:25:23T55JLT4:5:2462:39177:3284,LH00995:25:23T55JLT4:6:1247:29088:1589,LH00995:25:23T55JLT4:6:1323:12973:9800,LH00995:25:23T55JLT4:6:1355:18555:21374,LH00995:25:23T55JLT4:6:2104:18693:6871,LH00995:25:23T55JLT4:6:2438:33878:1280,LH00995:25:23T55JLT4:8:1130:40584:20183,LH00995:25:23T55JLT4:8:1281:39646:14354,LH00995:25:23T55JLT4:8:1385:41846:7292,LH00995:25:23T55JLT4:8:1387:24979:14564 | LH00995:25:23T55JLT4:5:1342:4171:29417 | YES_LDAS | 0.0211 | GT | 1.7968 | AG | 1.9329 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:85.11Mb]"] | chr1:206343008-chr1:121092996 | False | 1 | PASS | 19 | |||
| TMEM123--PDGFD | 17 | 0 | 17.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000237:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1162:47695:18039,LH00995:25:23T55JLT4:2:1172:50187:21206,LH00995:25:23T55JLT4:2:2210:45244:9477,LH00995:25:23T55JLT4:5:1365:14526:6941,LH00995:25:23T55JLT4:5:2277:37381:9758,LH00995:25:23T55JLT4:6:1271:14462:13667,LH00995:25:23T55JLT4:6:1276:51967:18768,LH00995:25:23T55JLT4:6:1391:10967:14788,LH00995:25:23T55JLT4:6:1491:10732:10935,LH00995:25:23T55JLT4:6:2156:4576:13919,LH00995:25:23T55JLT4:6:2333:26354:24989,LH00995:25:23T55JLT4:6:2365:12706:13149,LH00995:25:23T55JLT4:6:2471:5053:13429,LH00995:25:23T55JLT4:8:1174:23781:23392,LH00995:25:23T55JLT4:8:2113:45390:26012,LH00995:25:23T55JLT4:8:2144:42324:7922,LH00995:25:23T55JLT4:8:2251:11331:28114 | . | YES_LDAS | 0.0576 | GT | 1.9656 | AG | 1.9656 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]"] | chr11:102448812-chr11:104000237 | False | 1 | PASS | 17 | |||
| PTPRM--TTC39C | 17 | 0 | 17.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | PTPRM^ENSG00000173482.17 | chr18:7567891:+ | TTC39C^ENSG00000168234.13 | chr18:24064140:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1193:6477:1659,LH00995:25:23T55JLT4:2:1275:33125:9113,LH00995:25:23T55JLT4:2:1309:10126:23167,LH00995:25:23T55JLT4:2:1327:4729:16203,LH00995:25:23T55JLT4:2:2239:34557:2401,LH00995:25:23T55JLT4:2:2309:37866:13037,LH00995:25:23T55JLT4:2:2349:42130:17198,LH00995:25:23T55JLT4:5:1236:39905:29263,LH00995:25:23T55JLT4:5:1473:30529:13275,LH00995:25:23T55JLT4:5:2148:24841:6030,LH00995:25:23T55JLT4:5:2148:50244:17661,LH00995:25:23T55JLT4:5:2281:50090:6100,LH00995:25:23T55JLT4:6:1265:13839:11747,LH00995:25:23T55JLT4:6:2142:19316:16414,LH00995:25:23T55JLT4:6:2398:28846:5960,LH00995:25:23T55JLT4:8:2314:42041:18277,LH00995:25:23T55JLT4:8:2434:4762:13317 | . | YES_LDAS | 0.0576 | GT | 1.9656 | AG | 1.7819 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:15.59Mb]"] | chr18:7567891-chr18:24064140 | False | 1 | PASS | 17 | |||
| PDCD1LG2--DYNC2H1 | 13 | 2 | 13.0 | 0.59 | ONLY_REF_SPLICE | PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 | chr9:5535050:+ | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103113537:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1204:8969:21416,LH00995:25:23T55JLT4:2:1452:10481:9295,LH00995:25:23T55JLT4:2:2133:29582:12252,LH00995:25:23T55JLT4:2:2154:23288:3760,LH00995:25:23T55JLT4:2:2290:4236:29109,LH00995:25:23T55JLT4:5:2271:42510:1294,LH00995:25:23T55JLT4:5:2445:45843:2611,LH00995:25:23T55JLT4:5:2489:1372:12350,LH00995:25:23T55JLT4:6:1323:21864:13121,LH00995:25:23T55JLT4:6:1412:39816:24148,LH00995:25:23T55JLT4:6:2242:45600:23322,LH00995:25:23T55JLT4:6:2469:9972:28310,LH00995:25:23T55JLT4:8:1159:18094:15026 | LH00995:25:23T55JLT4:8:1496:15158:26166,LH00995:25:23T55JLT4:8:2334:1073:1743 | YES_LDAS | 0.046 | GT | 1.9219 | AG | 1.7819 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"] | chr9:5535050-chr11:103113537 | False | 1 | PASS | 15 | |||
| TPTE--BAGE2 | 12 | 0 | 6.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TPTE^ENSG00000274391.5 | chr21:10527412:+ | BAGE2^ENSG00000187172.15 | chr21:10514122:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1119:12908:5764,LH00995:25:23T55JLT4:2:1319:24154:11173,LH00995:25:23T55JLT4:2:2104:32203:26432,LH00995:25:23T55JLT4:5:1137:3152:29053,LH00995:25:23T55JLT4:5:1210:13103:8090,LH00995:25:23T55JLT4:5:1451:42469:23588,LH00995:25:23T55JLT4:5:2276:18499:21052,LH00995:25:23T55JLT4:5:2291:24145:20379,LH00995:25:23T55JLT4:6:1420:11379:6563,LH00995:25:23T55JLT4:8:2412:27964:23546,LH00995:25:23T55JLT4:8:2446:40317:27679,LH00995:25:23T55JLT4:8:2467:3888:17997 | . | YES_LDAS | 0.0203 | GT | 1.9656 | AG | 1.7819 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]"] | chr21:10527412-chr21:10514122 | False | 1 | PASS | 12 | |||
| TMEFF2--TEX41 | 10 | 0 | 10.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEFF2^ENSG00000144339.12 | chr2:191998262:- | TEX41^ENSG00000226674.11 | chr2:144667969:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1431:45916:27567,LH00995:25:23T55JLT4:2:1492:35156:9379,LH00995:25:23T55JLT4:2:2104:15845:28254,LH00995:25:23T55JLT4:5:1240:32721:20043,LH00995:25:23T55JLT4:5:1459:6307:5876,LH00995:25:23T55JLT4:5:1486:42647:16470,LH00995:25:23T55JLT4:6:1455:15821:10388,LH00995:25:23T55JLT4:6:2137:7909:6857,LH00995:25:23T55JLT4:8:1384:4438:26404,LH00995:25:23T55JLT4:8:2385:7804:26404 | . | YES_LDAS | 0.0339 | GT | 1.8892 | AG | 1.8892 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:46.69Mb]"] | chr2:191998262-chr2:144667969 | False | 1 | PASS | 10 | |||
| SNU13--LLPH | 10 | 0 | 10.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | SNU13^ENSG00000100138.15 | chr22:41680244:- | LLPH^ENSG00000139233.7 | chr12:66129113:- | LH00995:25:23T55JLT4:5:1436:26880:2639,LH00995:25:23T55JLT4:5:1448:23676:21808,LH00995:25:23T55JLT4:5:2248:21306:15685,LH00995:25:23T55JLT4:6:2146:5199:18389,LH00995:25:23T55JLT4:6:2212:35188:1252,LH00995:25:23T55JLT4:8:1108:22220:18221,LH00995:25:23T55JLT4:8:1356:41070:3228,LH00995:25:23T55JLT4:8:2365:43610:27077,LH00995:25:23T55JLT4:8:2374:11485:26054,LH00995:25:23T55JLT4:8:2496:22390:28212 | . | YES_LDAS | 0.0339 | GT | 1.7056 | AG | 1.8295 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr12]"] | chr22:41680244-chr12:66129113 | False | 1 | PASS | 10 | |||
| MAP3K20--RAPGEF4 | 10 | 0 | 10.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | MAP3K20^ENSG00000091436.17 | chr2:173091190:+ | RAPGEF4^ENSG00000091428.18 | chr2:172917802:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1109:44023:12294,LH00995:25:23T55JLT4:2:1240:40148:15251,LH00995:25:23T55JLT4:2:2184:11598:16862,LH00995:25:23T55JLT4:6:1179:26176:18515,LH00995:25:23T55JLT4:6:2176:48343:28100,LH00995:25:23T55JLT4:6:2224:36014:14816,LH00995:25:23T55JLT4:6:2236:34476:11621,LH00995:25:23T55JLT4:8:1324:13289:13877,LH00995:25:23T55JLT4:8:1412:25966:7838,LH00995:25:23T55JLT4:8:1434:22131:25942 | . | YES_LDAS | 0.0339 | GT | 1.1589 | AG | 1.7968 | ["DEEPEST2019","TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[22542]"] | chr2:173091190-chr2:172917802 | False | 1 | PASS | 10 | |||
| FLG-AS1--ARHGAP32 | 10 | 0 | 10.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | FLG-AS1^ENSG00000237975.7 | chr1:152251758:+ | ARHGAP32^ENSG00000134909.18 | chr11:128998468:- | LH00995:25:23T55JLT4:2:1208:27511:20519,LH00995:25:23T55JLT4:2:2219:34298:14984,LH00995:25:23T55JLT4:5:1214:23328:7698,LH00995:25:23T55JLT4:5:1370:10441:1967,LH00995:25:23T55JLT4:5:2278:7626:1659,LH00995:25:23T55JLT4:5:2335:11201:16119,LH00995:25:23T55JLT4:6:1160:46304:26558,LH00995:25:23T55JLT4:6:2237:8241:25984,LH00995:25:23T55JLT4:6:2275:15238:10584,LH00995:25:23T55JLT4:8:1216:31588:19790 | . | YES_LDAS | 0.0339 | GT | 1.8256 | AG | 1.9219 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr11]"] | chr1:152251758-chr11:128998468 | False | 1 | PASS | 10 | |||
| TPTE--BAGE2 | 8 | 0 | 7.71 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TPTE^ENSG00000274391.5 | chr21:10527412:+ | BAGE2^ENSG00000187172.15 | chr21:10499475:+ | LH00995:25:23T55JLT4:2:1391:28886:24975,LH00995:25:23T55JLT4:5:1428:25731:15643,LH00995:25:23T55JLT4:5:2162:19510:26979,LH00995:25:23T55JLT4:5:2251:16136:11691,LH00995:25:23T55JLT4:6:1261:2594:6563,LH00995:25:23T55JLT4:6:2495:46878:28758,LH00995:25:23T55JLT4:8:1153:41183:8160,LH00995:25:23T55JLT4:8:2369:25278:6507 | . | YES_LDAS | 0.0261 | GT | 1.9656 | AG | 1.8323 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]"] | chr21:10527412-chr21:10499475 | False | 1 | PASS | 8 |
25 rows