#FusionName JunctionReadCount SpanningFragCount est_J est_S SpliceType LeftGene LeftBreakpoint RightGene RightBreakpoint JunctionReads SpanningFrags LargeAnchorSupport FFPM LeftBreakDinuc LeftBreakEntropy RightBreakDinuc RightBreakEntropy annots breakpoint_ID blacklisted blacklist_reasons aih_curated_reason CALL filter_reason FILTER total_reads MTAP--CDKN2B-AS1 76 1 76.0 1.0 ONLY_REF_SPLICE MTAP^ENSG00000099810.21 chr9:21838010:+ CDKN2B-AS1^ENSG00000240498.9 chr9:22112320:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1121:16735:20855,LH00995:25:23T55JLT4:2:1142:10012:19833,LH00995:25:23T55JLT4:5:1109:42930:9085,LH00995:25:23T55JLT4:5:1111:45956:19762,LH00995:25:23T55JLT4:5:1139:31613:16526,LH00995:25:23T55JLT4:5:1160:48602:25830,LH00995:25:23T55JLT4:5:1194:32753:24583,LH00995:25:23T55JLT4:5:1215:41337:16021,LH00995:25:23T55JLT4:5:1380:5118:1659,LH00995:25:23T55JLT4:5:1385:5401:19048,LH00995:25:23T55JLT4:5:1443:48860:19020,LH00995:25:23T55JLT4:5:1488:7965:15587,LH00995:25:23T55JLT4:5:1489:39921:27385,LH00995:25:23T55JLT4:5:2115:40730:24302,LH00995:25:23T55JLT4:5:2137:36547:5708,LH00995:25:23T55JLT4:5:2151:22293:3774,LH00995:25:23T55JLT4:5:2159:7593:29039,LH00995:25:23T55JLT4:5:2160:50980:11846,LH00995:25:23T55JLT4:5:2163:42275:22355,LH00995:25:23T55JLT4:5:2163:50584:10010,LH00995:25:23T55JLT4:5:2181:19599:23181,LH00995:25:23T55JLT4:5:2182:33514:10150,LH00995:25:23T55JLT4:5:2213:2869:27161,LH00995:25:23T55JLT4:5:2275:7601:3382,LH00995:25:23T55JLT4:5:2303:9778:4601,LH00995:25:23T55JLT4:5:2318:51862:8861,LH00995:25:23T55JLT4:5:2389:46207:13219,LH00995:25:23T55JLT4:6:1132:27438:27399,LH00995:25:23T55JLT4:6:1164:3613:11719,LH00995:25:23T55JLT4:6:1176:37049:20505,LH00995:25:23T55JLT4:6:1368:25537:26264,LH00995:25:23T55JLT4:6:1382:14761:16231,LH00995:25:23T55JLT4:6:1420:43642:17268,LH00995:25:23T55JLT4:6:1421:10975:19454,LH00995:25:23T55JLT4:6:1440:12771:15727,LH00995:25:23T55JLT4:6:1462:49775:26881,LH00995:25:23T55JLT4:6:1468:39889:21024,LH00995:25:23T55JLT4:6:2128:39767:9716,LH00995:25:23T55JLT4:6:2145:29663:12784,LH00995:25:23T55JLT4:6:2182:13159:28674,LH00995:25:23T55JLT4:6:2191:45398:21430,LH00995:25:23T55JLT4:6:2241:11695:3550,LH00995:25:23T55JLT4:6:2277:27147:6633,LH00995:25:23T55JLT4:6:2324:9381:14732,LH00995:25:23T55JLT4:6:2369:2497:22285,LH00995:25:23T55JLT4:6:2404:48998:14858,LH00995:25:23T55JLT4:6:2420:42291:1617,LH00995:25:23T55JLT4:6:2429:34768:29109,LH00995:25:23T55JLT4:6:2448:31305:12770,LH00995:25:23T55JLT4:6:2473:36111:7081,LH00995:25:23T55JLT4:8:1110:19599:29375,LH00995:25:23T55JLT4:8:1130:43926:15965,LH00995:25:23T55JLT4:8:1157:21209:4643,LH00995:25:23T55JLT4:8:1160:1421:13779,LH00995:25:23T55JLT4:8:1236:15044:4279,LH00995:25:23T55JLT4:8:1319:27810:28576,LH00995:25:23T55JLT4:8:1363:9041:9716,LH00995:25:23T55JLT4:8:1415:17665:13583,LH00995:25:23T55JLT4:8:1428:5781:1687,LH00995:25:23T55JLT4:8:1455:3362:17871,LH00995:25:23T55JLT4:8:2118:34857:21276,LH00995:25:23T55JLT4:8:2140:4827:22004,LH00995:25:23T55JLT4:8:2153:15182:22677,LH00995:25:23T55JLT4:8:2184:19728:14158,LH00995:25:23T55JLT4:8:2188:15554:20715,LH00995:25:23T55JLT4:8:2242:30084:19342,LH00995:25:23T55JLT4:8:2266:20311:13485,LH00995:25:23T55JLT4:8:2277:11744:8146,LH00995:25:23T55JLT4:8:2318:26742:13891,LH00995:25:23T55JLT4:8:2371:12140:25199,LH00995:25:23T55JLT4:8:2380:42372:24905,LH00995:25:23T55JLT4:8:2415:7585:23616,LH00995:25:23T55JLT4:8:2418:46013:20337,LH00995:25:23T55JLT4:8:2436:10886:25157,LH00995:25:23T55JLT4:8:2488:31693:22859,LH00995:25:23T55JLT4:8:2494:43157:18838 LH00995:25:23T55JLT4:5:1270:5547:12378 YES_LDAS 0.2614 GT 1.5301 AG 1.8323 "[""ChimerSeq"",""TCGA_StarF2019"",""CCLE_StarF2019"",""INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.06Mb]"",""NEIGHBORS[56488]""]" chr9:21838010-chr9:22112320 False 1 PASS 77 TMEM65--ANXA13 60 1 60.0 0.57 ONLY_REF_SPLICE TMEM65^ENSG00000164983.8 chr8:124371854:- ANXA13^ENSG00000104537.17 chr8:123684722:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1145:13693:13149,LH00995:25:23T55JLT4:5:1132:34751:2597,LH00995:25:23T55JLT4:5:1142:31410:24246,LH00995:25:23T55JLT4:5:1161:45091:20001,LH00995:25:23T55JLT4:5:1194:27851:20996,LH00995:25:23T55JLT4:5:1262:25019:22397,LH00995:25:23T55JLT4:5:1263:17884:19062,LH00995:25:23T55JLT4:5:1283:39371:21472,LH00995:25:23T55JLT4:5:1363:3476:21822,LH00995:25:23T55JLT4:5:1368:17811:20477,LH00995:25:23T55JLT4:5:1419:37785:3284,LH00995:25:23T55JLT4:5:1426:14526:15265,LH00995:25:23T55JLT4:5:1428:25561:5008,LH00995:25:23T55JLT4:5:1458:4632:13625,LH00995:25:23T55JLT4:5:2168:51999:24821,LH00995:25:23T55JLT4:5:2228:45034:18922,LH00995:25:23T55JLT4:5:2230:30893:12700,LH00995:25:23T55JLT4:5:2267:45811:14746,LH00995:25:23T55JLT4:5:2277:32923:25465,LH00995:25:23T55JLT4:5:2308:51287:5960,LH00995:25:23T55JLT4:5:2363:31815:3816,LH00995:25:23T55JLT4:5:2393:16792:9267,LH00995:25:23T55JLT4:5:2492:37793:10360,LH00995:25:23T55JLT4:6:1114:22964:4433,LH00995:25:23T55JLT4:6:1118:27495:29095,LH00995:25:23T55JLT4:6:1141:6016:13835,LH00995:25:23T55JLT4:6:1203:5765:23854,LH00995:25:23T55JLT4:6:1317:19720:26082,LH00995:25:23T55JLT4:6:1322:2683:27567,LH00995:25:23T55JLT4:6:1478:44120:18852,LH00995:25:23T55JLT4:6:2139:4851:1392,LH00995:25:23T55JLT4:6:2170:6849:11860,LH00995:25:23T55JLT4:6:2260:45301:12014,LH00995:25:23T55JLT4:6:2284:12674:1210,LH00995:25:23T55JLT4:6:2331:1421:1392,LH00995:25:23T55JLT4:6:2404:6744:28128,LH00995:25:23T55JLT4:6:2476:5296:3480,LH00995:25:23T55JLT4:8:1113:43966:13261,LH00995:25:23T55JLT4:8:1128:4705:12266,LH00995:25:23T55JLT4:8:1157:13523:22467,LH00995:25:23T55JLT4:8:1191:39816:23756,LH00995:25:23T55JLT4:8:1229:10926:26096,LH00995:25:23T55JLT4:8:1244:17673:13401,LH00995:25:23T55JLT4:8:1257:22188:1575,LH00995:25:23T55JLT4:8:1345:19502:23490,LH00995:25:23T55JLT4:8:1353:3095:28618,LH00995:25:23T55JLT4:8:1366:31216:12392,LH00995:25:23T55JLT4:8:1383:34485:27357,LH00995:25:23T55JLT4:8:1395:4301:2093,LH00995:25:23T55JLT4:8:1412:2804:1687,LH00995:25:23T55JLT4:8:1415:24356:8889,LH00995:25:23T55JLT4:8:2142:50478:18964,LH00995:25:23T55JLT4:8:2152:18887:18277,LH00995:25:23T55JLT4:8:2209:34072:29417,LH00995:25:23T55JLT4:8:2210:28627:6030,LH00995:25:23T55JLT4:8:2265:11072:11972,LH00995:25:23T55JLT4:8:2293:16298:2724,LH00995:25:23T55JLT4:8:2367:51716:1967,LH00995:25:23T55JLT4:8:2482:47841:9547,LH00995:25:23T55JLT4:8:2485:8872:14410 LH00995:25:23T55JLT4:6:1398:52153:25479 YES_LDAS 0.2055 GT 1.9656 AG 1.9219 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]""]" chr8:124371854-chr8:123684722 False 1 PASS 61 TBC1D13--AL442224.1 47 0 47.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE TBC1D13^ENSG00000107021.16 chr9:128792574:+ AL442224.1^ENSG00000231990.2 chr9:93825711:+ LH00995:25:23T55JLT4:5:1121:17795:17591,LH00995:25:23T55JLT4:5:1193:17714:7530,LH00995:25:23T55JLT4:5:1291:3888:10711,LH00995:25:23T55JLT4:5:1395:37696:23448,LH00995:25:23T55JLT4:5:1398:9575:27623,LH00995:25:23T55JLT4:5:1411:22147:25297,LH00995:25:23T55JLT4:5:1492:33651:27203,LH00995:25:23T55JLT4:5:2139:11679:18263,LH00995:25:23T55JLT4:5:2158:38983:3312,LH00995:25:23T55JLT4:5:2267:42235:5918,LH00995:25:23T55JLT4:5:2286:13774:20435,LH00995:25:23T55JLT4:5:2294:46927:7684,LH00995:25:23T55JLT4:5:2329:31475:13877,LH00995:25:23T55JLT4:5:2366:26338:14228,LH00995:25:23T55JLT4:5:2463:7699:6213,LH00995:25:23T55JLT4:6:1102:17042:17661,LH00995:25:23T55JLT4:6:1174:15424:4713,LH00995:25:23T55JLT4:6:1236:24631:22397,LH00995:25:23T55JLT4:6:1256:16112:25241,LH00995:25:23T55JLT4:6:1282:42486:25522,LH00995:25:23T55JLT4:6:1337:31556:4013,LH00995:25:23T55JLT4:6:1420:31524:12084,LH00995:25:23T55JLT4:6:1462:3063:28394,LH00995:25:23T55JLT4:6:1487:5352:22074,LH00995:25:23T55JLT4:6:2144:7165:10500,LH00995:25:23T55JLT4:6:2190:30011:24176,LH00995:25:23T55JLT4:6:2358:3103:20813,LH00995:25:23T55JLT4:6:2390:47728:10528,LH00995:25:23T55JLT4:6:2417:29137:23223,LH00995:25:23T55JLT4:6:2482:22172:28983,LH00995:25:23T55JLT4:8:1153:44945:9632,LH00995:25:23T55JLT4:8:1156:5207:11789,LH00995:25:23T55JLT4:8:1186:21209:5428,LH00995:25:23T55JLT4:8:1192:44338:7600,LH00995:25:23T55JLT4:8:1288:42704:27133,LH00995:25:23T55JLT4:8:1335:33303:13849,LH00995:25:23T55JLT4:8:1362:51465:5260,LH00995:25:23T55JLT4:8:1370:35051:22621,LH00995:25:23T55JLT4:8:1377:16120:10739,LH00995:25:23T55JLT4:8:1421:22681:2457,LH00995:25:23T55JLT4:8:2181:44799:6128,LH00995:25:23T55JLT4:8:2198:9211:27021,LH00995:25:23T55JLT4:8:2329:13920:24499,LH00995:25:23T55JLT4:8:2332:26200:18669,LH00995:25:23T55JLT4:8:2376:18620:24429,LH00995:25:23T55JLT4:8:2395:4891:4209,LH00995:25:23T55JLT4:8:2410:20400:2962 . YES_LDAS 0.1595 GT 1.9329 AG 1.9086 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr9:34.93Mb]""]" chr9:128792574-chr9:93825711 False 1 PASS 47 B4GALT6--DSC3 47 0 47.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE B4GALT6^ENSG00000118276.11 chr18:31684312:- DSC3^ENSG00000134762.17 chr18:30994372:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1124:36192:28156,LH00995:25:23T55JLT4:2:1131:8880:11173,LH00995:25:23T55JLT4:5:1119:44257:24947,LH00995:25:23T55JLT4:5:1132:2464:5442,LH00995:25:23T55JLT4:5:1207:30998:29641,LH00995:25:23T55JLT4:5:1257:39670:6044,LH00995:25:23T55JLT4:5:1311:19089:12882,LH00995:25:23T55JLT4:5:1318:30140:13499,LH00995:25:23T55JLT4:5:1345:25197:24134,LH00995:25:23T55JLT4:5:1391:36467:6549,LH00995:25:23T55JLT4:5:1403:36798:24134,LH00995:25:23T55JLT4:5:1458:26880:14158,LH00995:25:23T55JLT4:5:1461:10668:22397,LH00995:25:23T55JLT4:5:2139:7610:4629,LH00995:25:23T55JLT4:5:2205:15497:3382,LH00995:25:23T55JLT4:5:2230:37777:4643,LH00995:25:23T55JLT4:5:2247:42841:4475,LH00995:25:23T55JLT4:5:2255:46118:17016,LH00995:25:23T55JLT4:5:2334:10045:16414,LH00995:25:23T55JLT4:5:2379:21120:2499,LH00995:25:23T55JLT4:5:2388:40673:3802,LH00995:25:23T55JLT4:6:1175:10991:4405,LH00995:25:23T55JLT4:6:1177:21549:25998,LH00995:25:23T55JLT4:6:1226:26815:13457,LH00995:25:23T55JLT4:6:1332:12108:16736,LH00995:25:23T55JLT4:6:1377:28085:7978,LH00995:25:23T55JLT4:6:1395:32341:17955,LH00995:25:23T55JLT4:6:1398:22350:4433,LH00995:25:23T55JLT4:6:1482:33344:27259,LH00995:25:23T55JLT4:6:1483:50260:6507,LH00995:25:23T55JLT4:6:2106:15950:7950,LH00995:25:23T55JLT4:6:2421:31896:19482,LH00995:25:23T55JLT4:6:2494:30496:26979,LH00995:25:23T55JLT4:8:1208:39185:8511,LH00995:25:23T55JLT4:8:1241:37178:15180,LH00995:25:23T55JLT4:8:1260:5142:6437,LH00995:25:23T55JLT4:8:1264:42833:17969,LH00995:25:23T55JLT4:8:1314:17358:29361,LH00995:25:23T55JLT4:8:1323:17131:17002,LH00995:25:23T55JLT4:8:1394:37405:6213,LH00995:25:23T55JLT4:8:1456:18013:4601,LH00995:25:23T55JLT4:8:1487:37405:25017,LH00995:25:23T55JLT4:8:2164:1194:20589,LH00995:25:23T55JLT4:8:2181:9899:2121,LH00995:25:23T55JLT4:8:2265:28644:11439,LH00995:25:23T55JLT4:8:2341:11541:15307,LH00995:25:23T55JLT4:8:2415:24857:27525 . YES_LDAS 0.1595 GT 1.8323 AG 1.9086 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr18:0.58Mb]""]" chr18:31684312-chr18:30994372 False 1 PASS 47 TMEM65--ANXA13 45 1 45.0 0.43 ONLY_REF_SPLICE TMEM65^ENSG00000164983.8 chr8:124371854:- ANXA13^ENSG00000104537.17 chr8:123688946:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1108:9187:11565,LH00995:25:23T55JLT4:5:1137:25408:8441,LH00995:25:23T55JLT4:5:1217:4964:3774,LH00995:25:23T55JLT4:5:1274:13531:5610,LH00995:25:23T55JLT4:5:1277:43351:2275,LH00995:25:23T55JLT4:5:1295:11266:8497,LH00995:25:23T55JLT4:5:1450:30197:20015,LH00995:25:23T55JLT4:5:1494:24356:23322,LH00995:25:23T55JLT4:5:2232:23555:2289,LH00995:25:23T55JLT4:5:2260:39355:1434,LH00995:25:23T55JLT4:5:2273:19558:20141,LH00995:25:23T55JLT4:5:2363:5272:15545,LH00995:25:23T55JLT4:6:1131:28029:3929,LH00995:25:23T55JLT4:6:1233:24477:8006,LH00995:25:23T55JLT4:6:1250:26904:11005,LH00995:25:23T55JLT4:6:1270:14656:22663,LH00995:25:23T55JLT4:6:1293:11582:1056,LH00995:25:23T55JLT4:6:1330:11258:10697,LH00995:25:23T55JLT4:6:1368:3743:7207,LH00995:25:23T55JLT4:6:1370:27527:12028,LH00995:25:23T55JLT4:6:1381:15886:1701,LH00995:25:23T55JLT4:6:1454:14300:15909,LH00995:25:23T55JLT4:6:2146:13321:23630,LH00995:25:23T55JLT4:6:2150:10433:27848,LH00995:25:23T55JLT4:6:2276:45196:28254,LH00995:25:23T55JLT4:6:2335:18402:29711,LH00995:25:23T55JLT4:6:2346:27074:16315,LH00995:25:23T55JLT4:6:2376:5272:29529,LH00995:25:23T55JLT4:6:2402:19631:28114,LH00995:25:23T55JLT4:8:1251:43812:5820,LH00995:25:23T55JLT4:8:1268:25537:6507,LH00995:25:23T55JLT4:8:1286:8143:21500,LH00995:25:23T55JLT4:8:1337:43222:13933,LH00995:25:23T55JLT4:8:1419:51643:28464,LH00995:25:23T55JLT4:8:1431:28635:1701,LH00995:25:23T55JLT4:8:1478:36847:13681,LH00995:25:23T55JLT4:8:2109:48359:25830,LH00995:25:23T55JLT4:8:2198:30359:22313,LH00995:25:23T55JLT4:8:2271:1947:28226,LH00995:25:23T55JLT4:8:2271:3904:17520,LH00995:25:23T55JLT4:8:2286:29355:3368,LH00995:25:23T55JLT4:8:2294:29711:9393,LH00995:25:23T55JLT4:8:2311:14761:5554,LH00995:25:23T55JLT4:8:2351:29347:25185,LH00995:25:23T55JLT4:8:2381:1558:6143 LH00995:25:23T55JLT4:6:1398:52153:25479 YES_LDAS 0.1542 GT 1.9656 AG 1.9656 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]""]" chr8:124371854-chr8:123688946 False 1 PASS 46 CLTC--VMP1 44 1 44.0 1.0 ONLY_REF_SPLICE CLTC^ENSG00000141367.12 chr17:59690711:+ VMP1^ENSG00000062716.13 chr17:59838295:+ LH00995:25:23T55JLT4:5:1127:6509:20547,LH00995:25:23T55JLT4:5:1137:36086:18305,LH00995:25:23T55JLT4:5:1207:9551:26909,LH00995:25:23T55JLT4:5:1240:9033:12280,LH00995:25:23T55JLT4:5:1320:41159:13387,LH00995:25:23T55JLT4:5:1388:50794:21892,LH00995:25:23T55JLT4:5:1395:38133:7109,LH00995:25:23T55JLT4:5:1424:37939:4923,LH00995:25:23T55JLT4:5:2133:9802:15208,LH00995:25:23T55JLT4:5:2344:39921:1687,LH00995:25:23T55JLT4:5:2463:27381:10066,LH00995:25:23T55JLT4:5:2480:51660:17422,LH00995:25:23T55JLT4:6:1112:24412:21570,LH00995:25:23T55JLT4:6:1127:6679:6157,LH00995:25:23T55JLT4:6:1147:25941:18585,LH00995:25:23T55JLT4:6:1240:29153:22467,LH00995:25:23T55JLT4:6:1261:13540:4727,LH00995:25:23T55JLT4:6:1274:49961:28660,LH00995:25:23T55JLT4:6:1293:32648:20253,LH00995:25:23T55JLT4:6:1309:46466:17899,LH00995:25:23T55JLT4:6:1348:38449:27806,LH00995:25:23T55JLT4:6:1443:27309:7334,LH00995:25:23T55JLT4:6:1464:42356:2149,LH00995:25:23T55JLT4:6:2184:3904:3788,LH00995:25:23T55JLT4:6:2241:5409:9477,LH00995:25:23T55JLT4:6:2351:3039:7642,LH00995:25:23T55JLT4:6:2407:48933:21220,LH00995:25:23T55JLT4:6:2431:12633:19917,LH00995:25:23T55JLT4:6:2439:48804:4853,LH00995:25:23T55JLT4:8:1208:44184:24849,LH00995:25:23T55JLT4:8:1254:5037:10038,LH00995:25:23T55JLT4:8:1262:9511:16806,LH00995:25:23T55JLT4:8:1266:32163:9407,LH00995:25:23T55JLT4:8:1285:45713:25732,LH00995:25:23T55JLT4:8:1290:29404:6787,LH00995:25:23T55JLT4:8:1307:40859:19090,LH00995:25:23T55JLT4:8:1396:14842:3985,LH00995:25:23T55JLT4:8:1447:3160:10542,LH00995:25:23T55JLT4:8:1453:50770:3046,LH00995:25:23T55JLT4:8:2188:21403:2513,LH00995:25:23T55JLT4:8:2206:43359:10977,LH00995:25:23T55JLT4:8:2291:21937:25325,LH00995:25:23T55JLT4:8:2378:28959:1532,LH00995:25:23T55JLT4:8:2484:30302:1532 LH00995:25:23T55JLT4:8:2228:21330:24387 YES_LDAS 0.1527 GT 1.8892 AG 1.8062 "[""Klijn_CellLines"",""Larsson_TCGA"",""ChimerSeq"",""TCGA_StarF2019"",""CCLE_StarF2019"",""INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.01Mb]"",""NEIGHBORS[10236]""]" chr17:59690711-chr17:59838295 False 1 PASS 45 RPSAP52--HMGA2 34 0 34.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE RPSAP52^ENSG00000241749.4 chr12:65826843:- HMGA2^ENSG00000149948.14 chr12:65828001:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1153:19389:3929,LH00995:25:23T55JLT4:5:1108:49597:13681,LH00995:25:23T55JLT4:5:1276:17229:25942,LH00995:25:23T55JLT4:5:1280:13572:18319,LH00995:25:23T55JLT4:5:2201:24817:20925,LH00995:25:23T55JLT4:5:2231:13248:1224,LH00995:25:23T55JLT4:5:2279:48262:27539,LH00995:25:23T55JLT4:5:2319:27462:2331,LH00995:25:23T55JLT4:5:2403:46603:18389,LH00995:25:23T55JLT4:6:1121:42777:25157,LH00995:25:23T55JLT4:6:1151:2642:29599,LH00995:25:23T55JLT4:6:1191:49394:4055,LH00995:25:23T55JLT4:6:1235:12747:10220,LH00995:25:23T55JLT4:6:1286:49216:26586,LH00995:25:23T55JLT4:6:1384:29995:9015,LH00995:25:23T55JLT4:6:1391:43384:5106,LH00995:25:23T55JLT4:6:2117:40366:24681,LH00995:25:23T55JLT4:6:2163:4835:22439,LH00995:25:23T55JLT4:6:2220:42405:17282,LH00995:25:23T55JLT4:6:2308:32600:26699,LH00995:25:23T55JLT4:6:2321:21452:15208,LH00995:25:23T55JLT4:6:2427:23765:25718,LH00995:25:23T55JLT4:6:2442:26621:12560,LH00995:25:23T55JLT4:6:2479:7982:24807,LH00995:25:23T55JLT4:8:1141:11913:19847,LH00995:25:23T55JLT4:8:1256:8451:9814,LH00995:25:23T55JLT4:8:1277:27365:4237,LH00995:25:23T55JLT4:8:1387:28474:26390,LH00995:25:23T55JLT4:8:1460:7027:6955,LH00995:25:23T55JLT4:8:2114:35010:21794,LH00995:25:23T55JLT4:8:2133:13677:29095,LH00995:25:23T55JLT4:8:2216:11614:26334,LH00995:25:23T55JLT4:8:2228:43189:11663,LH00995:25:23T55JLT4:8:2311:51004:21528 . YES_LDAS 0.1154 GT 1.9329 AG 1.8256 "[""TCGA_StarF2019"",""CCLE_StarF2019"",""INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.00Mb]"",""NEIGHBORS_OVERLAP:-:+:[2537]""]" chr12:65826843-chr12:65828001 False 1 PASS 34 TMEM123--PDGFD 31 0 31.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- PDGFD^ENSG00000170962.13 chr11:104000255:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1117:42882:11972,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:2464:5134,LH00995:25:23T55JLT4:5:1107:13782:16750,LH00995:25:23T55JLT4:5:1107:13790:16764,LH00995:25:23T55JLT4:5:1110:14963:7249,LH00995:25:23T55JLT4:5:1142:6404:23700,LH00995:25:23T55JLT4:5:1149:19000:10038,LH00995:25:23T55JLT4:5:1163:22382:17913,LH00995:25:23T55JLT4:5:1218:29671:7221,LH00995:25:23T55JLT4:5:1227:16606:15503,LH00995:25:23T55JLT4:5:1277:49993:12154,LH00995:25:23T55JLT4:5:1358:10020:24555,LH00995:25:23T55JLT4:5:2203:47267:2303,LH00995:25:23T55JLT4:5:2473:42251:22425,LH00995:25:23T55JLT4:5:2475:43950:16652,LH00995:25:23T55JLT4:6:1182:17398:24555,LH00995:25:23T55JLT4:6:1348:50616:23097,LH00995:25:23T55JLT4:6:1468:32810:29725,LH00995:25:23T55JLT4:6:2364:39775:25171,LH00995:25:23T55JLT4:6:2473:4115:12252,LH00995:25:23T55JLT4:6:2488:9834:12910,LH00995:25:23T55JLT4:8:1170:12237:2135,LH00995:25:23T55JLT4:8:1202:39225:27273,LH00995:25:23T55JLT4:8:1335:23523:5400,LH00995:25:23T55JLT4:8:1379:33489:1981,LH00995:25:23T55JLT4:8:1451:4187:6269,LH00995:25:23T55JLT4:8:1475:19906:1070,LH00995:25:23T55JLT4:8:2233:41685:12952,LH00995:25:23T55JLT4:8:2234:43052:17422,LH00995:25:23T55JLT4:8:2257:30529:11201,LH00995:25:23T55JLT4:8:2314:19656:6997 . YES_LDAS 0.1052 GT 1.9656 AG 1.8323 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]""]" chr11:102448812-chr11:104000255 False 1 PASS 31 PTPRM--TTC39C 30 0 30.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE PTPRM^ENSG00000173482.17 chr18:7567891:+ TTC39C^ENSG00000168234.13 chr18:24064140:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1138:34557:6493,LH00995:25:23T55JLT4:5:1150:42121:4545,LH00995:25:23T55JLT4:5:1175:22544:17492,LH00995:25:23T55JLT4:5:1207:12221:29459,LH00995:25:23T55JLT4:5:1214:38246:9155,LH00995:25:23T55JLT4:5:2159:16331:27834,LH00995:25:23T55JLT4:5:2220:40123:18039,LH00995:25:23T55JLT4:5:2263:18305:22873,LH00995:25:23T55JLT4:5:2296:3540:21374,LH00995:25:23T55JLT4:5:2368:33198:9547,LH00995:25:23T55JLT4:5:2375:23159:5890,LH00995:25:23T55JLT4:5:2475:12237:16035,LH00995:25:23T55JLT4:6:1296:9753:14676,LH00995:25:23T55JLT4:6:1474:29283:22607,LH00995:25:23T55JLT4:6:2170:22293:21766,LH00995:25:23T55JLT4:6:2171:45940:1294,LH00995:25:23T55JLT4:6:2190:25626:13555,LH00995:25:23T55JLT4:6:2219:20505:28702,LH00995:25:23T55JLT4:6:2486:27050:8370,LH00995:25:23T55JLT4:8:1108:19348:8062,LH00995:25:23T55JLT4:8:1132:21015:7922,LH00995:25:23T55JLT4:8:1216:16646:5484,LH00995:25:23T55JLT4:8:1248:38505:4923,LH00995:25:23T55JLT4:8:1450:28951:25171,LH00995:25:23T55JLT4:8:1479:36280:26685,LH00995:25:23T55JLT4:8:2207:14429:15012,LH00995:25:23T55JLT4:8:2291:30407:28870,LH00995:25:23T55JLT4:8:2452:42267:21864,LH00995:25:23T55JLT4:8:2456:35779:15082,LH00995:25:23T55JLT4:8:2496:8313:5176 . YES_LDAS 0.1018 GT 1.9656 AG 1.7819 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr18:15.59Mb]""]" chr18:7567891-chr18:24064140 False 1 PASS 30 PDCD1LG2--DYNC2H1 30 0 30.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 chr9:5535050:+ DYNC2H1^ENSG00000187240.16 chr11:103114103:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1127:43295:15265,LH00995:25:23T55JLT4:5:1164:9470:16175,LH00995:25:23T55JLT4:5:1178:23620:20477,LH00995:25:23T55JLT4:5:1194:46943:2808,LH00995:25:23T55JLT4:5:1430:22948:27946,LH00995:25:23T55JLT4:5:1495:36434:15096,LH00995:25:23T55JLT4:5:2258:44435:20323,LH00995:25:23T55JLT4:5:2266:11493:2191,LH00995:25:23T55JLT4:5:2431:15344:19034,LH00995:25:23T55JLT4:6:1236:21427:28338,LH00995:25:23T55JLT4:6:1427:32850:29151,LH00995:25:23T55JLT4:6:2211:47315:8216,LH00995:25:23T55JLT4:6:2318:39225:27721,LH00995:25:23T55JLT4:6:2390:32591:6227,LH00995:25:23T55JLT4:6:2442:10983:17114,LH00995:25:23T55JLT4:8:1143:19380:5148,LH00995:25:23T55JLT4:8:1163:37065:12154,LH00995:25:23T55JLT4:8:1243:19469:7684,LH00995:25:23T55JLT4:8:1338:34832:5176,LH00995:25:23T55JLT4:8:1384:4196:27553,LH00995:25:23T55JLT4:8:1405:51166:10178,LH00995:25:23T55JLT4:8:1422:36806:25690,LH00995:25:23T55JLT4:8:1425:50074:4251,LH00995:25:23T55JLT4:8:2150:40673:17114,LH00995:25:23T55JLT4:8:2231:33053:3971,LH00995:25:23T55JLT4:8:2254:34266:25437,LH00995:25:23T55JLT4:8:2266:43521:12826,LH00995:25:23T55JLT4:8:2268:11517:7754,LH00995:25:23T55JLT4:8:2301:15457:11860,LH00995:25:23T55JLT4:8:2355:43513:8693 . YES_LDAS 0.1018 GT 1.9219 AG 1.8323 "[""INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]""]" chr9:5535050-chr11:103114103 False 1 PASS 30 TMEM123--DYNC2H1 28 1 28.0 1.0 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- DYNC2H1^ENSG00000187240.16 chr11:103280348:+ LH00995:25:23T55JLT4:5:1112:2060:6311,LH00995:25:23T55JLT4:5:1113:10821:22523,LH00995:25:23T55JLT4:5:1240:48504:6016,LH00995:25:23T55JLT4:5:1269:40164:24190,LH00995:25:23T55JLT4:5:1327:36928:6815,LH00995:25:23T55JLT4:5:2149:25505:6619,LH00995:25:23T55JLT4:5:2188:21087:19258,LH00995:25:23T55JLT4:5:2312:48513:22032,LH00995:25:23T55JLT4:5:2448:47008:28086,LH00995:25:23T55JLT4:6:1219:13839:6395,LH00995:25:23T55JLT4:6:1237:29485:20295,LH00995:25:23T55JLT4:6:1295:46757:22271,LH00995:25:23T55JLT4:6:1474:31378:21752,LH00995:25:23T55JLT4:6:2158:19097:27974,LH00995:25:23T55JLT4:6:2187:28975:17366,LH00995:25:23T55JLT4:6:2231:42332:14326,LH00995:25:23T55JLT4:6:2297:4511:17114,LH00995:25:23T55JLT4:6:2318:26864:16680,LH00995:25:23T55JLT4:6:2348:35132:4097,LH00995:25:23T55JLT4:6:2358:25173:17871,LH00995:25:23T55JLT4:6:2385:50964:19272,LH00995:25:23T55JLT4:8:1123:43812:17002,LH00995:25:23T55JLT4:8:1255:11339:29585,LH00995:25:23T55JLT4:8:1325:13993:29193,LH00995:25:23T55JLT4:8:1411:13224:12812,LH00995:25:23T55JLT4:8:2291:24121:4643,LH00995:25:23T55JLT4:8:2337:37267:20183,LH00995:25:23T55JLT4:8:2451:4074:28716 LH00995:25:23T55JLT4:6:2316:11533:17254 YES_LDAS 0.0984 GT 1.9656 AG 1.9086 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.64Mb]""]" chr11:102448812-chr11:103280348 False 1 PASS 29 SH3BP5--AC002074.1 24 0 24.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE SH3BP5^ENSG00000131370.16 chr3:15304103:- AC002074.1^ENSG00000285090.1 chr7:94279390:- LH00995:25:23T55JLT4:5:1109:10287:2289,LH00995:25:23T55JLT4:5:1124:5037:11916,LH00995:25:23T55JLT4:5:1201:28579:13625,LH00995:25:23T55JLT4:5:1345:4414:5204,LH00995:25:23T55JLT4:5:1383:28360:11341,LH00995:25:23T55JLT4:5:1385:15764:6955,LH00995:25:23T55JLT4:5:1387:41134:8300,LH00995:25:23T55JLT4:5:2467:10562:24176,LH00995:25:23T55JLT4:5:2478:47259:28660,LH00995:25:23T55JLT4:6:1124:47129:1308,LH00995:25:23T55JLT4:6:1151:39897:21066,LH00995:25:23T55JLT4:6:1195:20117:27497,LH00995:25:23T55JLT4:6:1286:16986:20841,LH00995:25:23T55JLT4:6:1431:19389:29711,LH00995:25:23T55JLT4:6:2393:28166:22131,LH00995:25:23T55JLT4:6:2433:51846:7095,LH00995:25:23T55JLT4:8:1194:12536:21682,LH00995:25:23T55JLT4:8:1298:47647:4391,LH00995:25:23T55JLT4:8:1405:25545:25550,LH00995:25:23T55JLT4:8:1461:10344:12588,LH00995:25:23T55JLT4:8:1497:2942:24513,LH00995:25:23T55JLT4:8:2268:32583:28324,LH00995:25:23T55JLT4:8:2290:23814:5316,LH00995:25:23T55JLT4:8:2423:25674:22915 . YES_LDAS 0.0815 GT 1.5546 AG 1.5546 "[""INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr7]""]" chr3:15304103-chr7:94279390 False 1 PASS 24 SRGAP2C--FCGR1B 20 0 20.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE SRGAP2C^ENSG00000171943.12 chr1:121324640:+ FCGR1B^ENSG00000198019.13 chr1:121092996:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1162:41976:18922,LH00995:25:23T55JLT4:5:1105:47995:21388,LH00995:25:23T55JLT4:5:1179:27430:9281,LH00995:25:23T55JLT4:5:1339:23353:16259,LH00995:25:23T55JLT4:5:2144:12318:9505,LH00995:25:23T55JLT4:5:2273:32583:4643,LH00995:25:23T55JLT4:5:2293:23086:25886,LH00995:25:23T55JLT4:5:2297:7189:15699,LH00995:25:23T55JLT4:5:2427:19397:24513,LH00995:25:23T55JLT4:5:2465:33384:1911,LH00995:25:23T55JLT4:6:1119:30504:10178,LH00995:25:23T55JLT4:6:1190:24218:14312,LH00995:25:23T55JLT4:6:1468:25529:11846,LH00995:25:23T55JLT4:6:2476:9195:22817,LH00995:25:23T55JLT4:8:1307:38538:16694,LH00995:25:23T55JLT4:8:1453:24679:6787,LH00995:25:23T55JLT4:8:2177:49548:14130,LH00995:25:23T55JLT4:8:2238:2262:2401,LH00995:25:23T55JLT4:8:2256:47064:26979,LH00995:25:23T55JLT4:8:2480:12973:9491 . YES_LDAS 0.0679 GT 1.7968 AG 1.9329 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.09Mb]"",""LOCAL_REARRANGEMENT:+:[87650]""]" chr1:121324640-chr1:121092996 False 1 PASS 20 TLK2--AC240565.1 19 0 5.41 0.0 ONLY_REF_SPLICE TLK2^ENSG00000146872.18 chr17:62560126:+ AC240565.1^ENSG00000280136.2 chr17:106864:- LH00995:25:23T55JLT4:5:1397:37162:19188,LH00995:25:23T55JLT4:5:2120:34533:2191,LH00995:25:23T55JLT4:5:2137:1930:12588,LH00995:25:23T55JLT4:6:1176:29760:9337,LH00995:25:23T55JLT4:6:1216:50632:26320,LH00995:25:23T55JLT4:6:1247:46142:3887,LH00995:25:23T55JLT4:6:1264:44654:23280,LH00995:25:23T55JLT4:6:1346:1898:21584,LH00995:25:23T55JLT4:6:1473:24817:26671,LH00995:25:23T55JLT4:6:2196:28053:5680,LH00995:25:23T55JLT4:6:2231:41086:29599,LH00995:25:23T55JLT4:6:2427:34638:22607,LH00995:25:23T55JLT4:6:2448:13151:20533,LH00995:25:23T55JLT4:8:1172:30982:25550,LH00995:25:23T55JLT4:8:1296:44977:20309,LH00995:25:23T55JLT4:8:1338:52129:15349,LH00995:25:23T55JLT4:8:2277:26993:20351,LH00995:25:23T55JLT4:8:2323:37826:25157,LH00995:25:23T55JLT4:8:2337:20529:3102 . YES_LDAS 0.0184 GT 1.8892 AG 1.8892 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr17:62.34Mb]""]" chr17:62560126-chr17:106864 False 1 PASS 19 FLG-AS1--ARHGAP32 19 0 19.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE FLG-AS1^ENSG00000237975.7 chr1:152251758:+ ARHGAP32^ENSG00000134909.18 chr11:128998468:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1122:14446:3410,LH00995:25:23T55JLT4:2:1129:7189:22481,LH00995:25:23T55JLT4:5:1258:27195:14256,LH00995:25:23T55JLT4:5:1395:6129:11089,LH00995:25:23T55JLT4:5:2178:36111:18067,LH00995:25:23T55JLT4:5:2383:3168:3915,LH00995:25:23T55JLT4:6:1260:38222:1182,LH00995:25:23T55JLT4:6:1417:4964:3466,LH00995:25:23T55JLT4:6:1417:4988:3452,LH00995:25:23T55JLT4:6:1451:35512:9183,LH00995:25:23T55JLT4:6:2127:46830:28534,LH00995:25:23T55JLT4:6:2146:39201:17198,LH00995:25:23T55JLT4:6:2430:15158:22747,LH00995:25:23T55JLT4:8:1330:9082:16428,LH00995:25:23T55JLT4:8:1351:23336:13905,LH00995:25:23T55JLT4:8:1405:19251:28212,LH00995:25:23T55JLT4:8:1443:8394:15208,LH00995:25:23T55JLT4:8:2197:33150:23700,LH00995:25:23T55JLT4:8:2345:40261:7348 . YES_LDAS 0.0645 GT 1.8256 AG 1.9219 "[""INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr11]""]" chr1:152251758-chr11:128998468 False 1 PASS 19 TMEM123--PDGFD 18 0 18.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- PDGFD^ENSG00000170962.13 chr11:104000237:- LH00995:25:23T55JLT4:5:1150:10392:2583,LH00995:25:23T55JLT4:5:1212:42186:10234,LH00995:25:23T55JLT4:5:1368:45446:13891,LH00995:25:23T55JLT4:5:2204:10304:28128,LH00995:25:23T55JLT4:5:2446:40317:20337,LH00995:25:23T55JLT4:6:1104:35221:21514,LH00995:25:23T55JLT4:6:1154:27293:24288,LH00995:25:23T55JLT4:6:1211:27260:19889,LH00995:25:23T55JLT4:6:2276:22835:4153,LH00995:25:23T55JLT4:6:2301:16678:27623,LH00995:25:23T55JLT4:6:2329:22317:8076,LH00995:25:23T55JLT4:6:2412:27559:20575,LH00995:25:23T55JLT4:6:2435:9931:16722,LH00995:25:23T55JLT4:8:1218:9583:11187,LH00995:25:23T55JLT4:8:1375:22293:1280,LH00995:25:23T55JLT4:8:1379:27147:26558,LH00995:25:23T55JLT4:8:2179:11493:10598,LH00995:25:23T55JLT4:8:2341:37413:29515 . YES_LDAS 0.0611 GT 1.9656 AG 1.9656 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]""]" chr11:102448812-chr11:104000237 False 1 PASS 18 BIRC3--PDGFD 18 0 18.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE BIRC3^ENSG00000023445.16 chr11:102317571:+ PDGFD^ENSG00000170962.13 chr11:104000255:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1116:29728:5666,LH00995:25:23T55JLT4:5:1195:49718:7586,LH00995:25:23T55JLT4:5:1420:27657:17549,LH00995:25:23T55JLT4:5:2178:13499:9421,LH00995:25:23T55JLT4:5:2193:6695:2345,LH00995:25:23T55JLT4:5:2435:8993:18768,LH00995:25:23T55JLT4:5:2440:9899:13807,LH00995:25:23T55JLT4:6:1235:47226:15236,LH00995:25:23T55JLT4:6:2208:2529:29291,LH00995:25:23T55JLT4:6:2427:37292:1084,LH00995:25:23T55JLT4:8:1227:44395:1140,LH00995:25:23T55JLT4:8:1303:31095:18684,LH00995:25:23T55JLT4:8:1432:29817:5596,LH00995:25:23T55JLT4:8:1435:43052:4195,LH00995:25:23T55JLT4:8:1496:25674:6997,LH00995:25:23T55JLT4:8:2138:28255:12084,LH00995:25:23T55JLT4:8:2322:30868:1897,LH00995:25:23T55JLT4:8:2379:5450:14284 . YES_LDAS 0.0611 GT 1.8323 AG 1.8323 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.57Mb]""]" chr11:102317571-chr11:104000255 False 1 PASS 18 PDCD1LG2--DYNC2H1 17 0 17.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 chr9:5535050:+ DYNC2H1^ENSG00000187240.16 chr11:103113537:+ LH00995:25:23T55JLT4:5:1129:8208:6591,LH00995:25:23T55JLT4:5:1350:30262:3480,LH00995:25:23T55JLT4:5:2304:32203:5638,LH00995:25:23T55JLT4:6:1292:52153:4769,LH00995:25:23T55JLT4:6:1337:31580:3634,LH00995:25:23T55JLT4:6:2293:6469:3270,LH00995:25:23T55JLT4:6:2310:18563:16960,LH00995:25:23T55JLT4:6:2473:1615:24597,LH00995:25:23T55JLT4:8:1133:19033:29431,LH00995:25:23T55JLT4:8:1293:30156:23420,LH00995:25:23T55JLT4:8:1332:3484:19090,LH00995:25:23T55JLT4:8:1333:13345:19552,LH00995:25:23T55JLT4:8:2140:44953:12588,LH00995:25:23T55JLT4:8:2165:20545:10949,LH00995:25:23T55JLT4:8:2216:37033:6605,LH00995:25:23T55JLT4:8:2470:23021:19945,LH00995:25:23T55JLT4:8:2470:23037:19945 . YES_LDAS 0.0577 GT 1.9219 AG 1.7819 "[""INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]""]" chr9:5535050-chr11:103113537 False 1 PASS 17 AL033504.1--SASH1 17 0 17.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE AL033504.1^ENSG00000227681.5 chr6:147947519:+ SASH1^ENSG00000111961.18 chr6:148390134:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1130:15077:11733,LH00995:25:23T55JLT4:5:1178:9778:2443,LH00995:25:23T55JLT4:5:1296:35010:14956,LH00995:25:23T55JLT4:5:1330:27220:24302,LH00995:25:23T55JLT4:5:1473:36280:17268,LH00995:25:23T55JLT4:5:2202:16436:2149,LH00995:25:23T55JLT4:5:2350:24688:19580,LH00995:25:23T55JLT4:5:2363:47105:5694,LH00995:25:23T55JLT4:6:1288:32883:3116,LH00995:25:23T55JLT4:6:2169:7699:9071,LH00995:25:23T55JLT4:6:2382:34290:23798,LH00995:25:23T55JLT4:8:1184:18224:15531,LH00995:25:23T55JLT4:8:1255:4948:15180,LH00995:25:23T55JLT4:8:1258:6792:27287,LH00995:25:23T55JLT4:8:1280:14373:6591,LH00995:25:23T55JLT4:8:2418:22341:7726,LH00995:25:23T55JLT4:8:2471:26055:6114 . YES_LDAS 0.0577 GT 1.5329 AG 1.9219 "[""TCGA_StarF2019"",""CCLE_StarF2019"",""INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.32Mb]""]" chr6:147947519-chr6:148390134 False 1 PASS 17 TRIO--TMEM123 12 0 12.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE TRIO^ENSG00000038382.20 chr5:14143882:+ TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448868:- LH00995:25:23T55JLT4:5:1277:12609:3088,LH00995:25:23T55JLT4:5:1279:42251:3648,LH00995:25:23T55JLT4:5:1478:1154:24779,LH00995:25:23T55JLT4:5:2107:27697:3410,LH00995:25:23T55JLT4:6:1141:4673:10192,LH00995:25:23T55JLT4:6:2214:38643:26180,LH00995:25:23T55JLT4:6:2228:50341:12308,LH00995:25:23T55JLT4:6:2261:15732:15279,LH00995:25:23T55JLT4:8:1152:33481:24330,LH00995:25:23T55JLT4:8:1342:12010:12392,LH00995:25:23T55JLT4:8:1447:36717:18249,LH00995:25:23T55JLT4:8:2185:17123:2527 . YES_LDAS 0.0407 GT 1.6895 AG 1.8892 "[""INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr11]""]" chr5:14143882-chr11:102448868 False 1 PASS 12 TPTE--BAGE2 11 0 11.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE TPTE^ENSG00000274391.5 chr21:10527412:+ BAGE2^ENSG00000187172.15 chr21:10514122:+ LH00995:25:23T55JLT4:5:1313:5975:28674,LH00995:25:23T55JLT4:5:1411:34072:21290,LH00995:25:23T55JLT4:5:2466:51385:25690,LH00995:25:23T55JLT4:6:1339:10085:21472,LH00995:25:23T55JLT4:6:1446:17698:11425,LH00995:25:23T55JLT4:6:2302:11242:23896,LH00995:25:23T55JLT4:6:2314:41110:27091,LH00995:25:23T55JLT4:8:1141:41766:11691,LH00995:25:23T55JLT4:8:1254:41668:9562,LH00995:25:23T55JLT4:8:1283:49152:13107,LH00995:25:23T55JLT4:8:2493:5741:27147 . YES_LDAS 0.0373 GT 1.9656 AG 1.7819 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]"",""LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]""]" chr21:10527412-chr21:10514122 False 1 PASS 11 TMEM123--PPP2R2C 11 0 11.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- PPP2R2C^ENSG00000074211.14 chr4:6381094:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1162:46684:8188,LH00995:25:23T55JLT4:5:1231:34145:14858,LH00995:25:23T55JLT4:5:2432:32543:20491,LH00995:25:23T55JLT4:6:2156:39832:12518,LH00995:25:23T55JLT4:6:2174:51918:18403,LH00995:25:23T55JLT4:6:2304:49767:3074,LH00995:25:23T55JLT4:6:2373:18927:12995,LH00995:25:23T55JLT4:8:1236:38060:21220,LH00995:25:23T55JLT4:8:1248:25772:9351,LH00995:25:23T55JLT4:8:1259:37801:9898,LH00995:25:23T55JLT4:8:2206:33061:25816 . YES_LDAS 0.0373 GT 1.9656 AG 1.8256 "[""INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr4]""]" chr11:102448812-chr4:6381094 False 1 PASS 11 C6orf62--ACOT13 11 0 11.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE C6orf62^ENSG00000112308.13 chr6:24714318:- ACOT13^ENSG00000112304.11 chr6:24701459:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1130:30059:4279,LH00995:25:23T55JLT4:2:1164:44718:13079,LH00995:25:23T55JLT4:5:1193:6275:13191,LH00995:25:23T55JLT4:5:1412:18976:22046,LH00995:25:23T55JLT4:5:2323:37526:1743,LH00995:25:23T55JLT4:5:2413:13305:17969,LH00995:25:23T55JLT4:6:1435:7108:2948,LH00995:25:23T55JLT4:6:1453:9308:10823,LH00995:25:23T55JLT4:8:1338:17916:21976,LH00995:25:23T55JLT4:8:1416:38036:16385,LH00995:25:23T55JLT4:8:2344:39759:3228 . YES_LDAS 0.0373 GT 1.8892 AG 1.9656 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.00Mb]"",""NEIGHBORS_OVERLAP:-:+:[204]""]" chr6:24714318-chr6:24701459 False 1 PASS 11 TMEM123--WTAPP1 9 0 9.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- WTAPP1^ENSG00000255282.6 chr11:102798024:+ LH00995:25:23T55JLT4:5:1132:23280:22046,LH00995:25:23T55JLT4:5:2228:47817:24863,LH00995:25:23T55JLT4:6:1120:31151:19090,LH00995:25:23T55JLT4:6:1208:7763:22495,LH00995:25:23T55JLT4:6:1223:41571:21164,LH00995:25:23T55JLT4:6:1484:22940:19468,LH00995:25:23T55JLT4:8:1388:17876:16442,LH00995:25:23T55JLT4:8:2436:16379:17184,LH00995:25:23T55JLT4:8:2482:10150:22537 . YES_LDAS 0.0305 GT 1.9656 AG 1.9219 "[""INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.28Mb]""]" chr11:102448812-chr11:102798024 False 1 PASS 9 MAP3K20--RAPGEF4 8 0 8.0 0.0 ONLY_REF_SPLICE MAP3K20^ENSG00000091436.17 chr2:173091190:+ RAPGEF4^ENSG00000091428.18 chr2:172917802:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1112:18280:27848,LH00995:25:23T55JLT4:5:2441:40342:7824,LH00995:25:23T55JLT4:5:2468:50487:15335,LH00995:25:23T55JLT4:6:1297:14793:29347,LH00995:25:23T55JLT4:6:1386:1574:27357,LH00995:25:23T55JLT4:6:2114:30205:3578,LH00995:25:23T55JLT4:6:2152:16881:5974,LH00995:25:23T55JLT4:8:1157:42720:9646 . YES_LDAS 0.0272 GT 1.1589 AG 1.7968 "[""DEEPEST2019"",""TCGA_StarF2019"",""INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.02Mb]"",""LOCAL_REARRANGEMENT:+:[22542]""]" chr2:173091190-chr2:172917802 False 1 PASS 8