File Info
- Filename
- 1173_D6K_T1_RNA_SLD_01_A23T55JLT4_2.starfusion.starfusion.fusion_predictions.filtered_pass_only.tsv
- Full Path
- s3://natera-platform-sandbox/pipeline-outputs/cgp_runs/nextflow/dev_rna_exp0016/A23T55JLT4/nfcore_rnafusion__73d51683--20260607-225254/starfusion/1173_D6K_T1_RNA_SLD_01_A23T55JLT4_2.starfusion.starfusion.fusion_predictions.filtered_pass_only.tsv
- Size
- 47.5 KB
- Workflow Run
- dev_rna_exp0016-73d51683
- Published
- Jun 08, 2026 8:45 AM
Content
View in new tab| #FusionName | JunctionReadCount | SpanningFragCount | est_J | est_S | SpliceType | LeftGene | LeftBreakpoint | RightGene | RightBreakpoint | JunctionReads | SpanningFrags | LargeAnchorSupport | FFPM | LeftBreakDinuc | LeftBreakEntropy | RightBreakDinuc | RightBreakEntropy | annots | breakpoint_ID | blacklisted | blacklist_reasons | aih_curated_reason | CALL | filter_reason | FILTER | total_reads |
| MTAP--CDKN2B-AS1 | 73 | 0 | 73.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | MTAP^ENSG00000099810.21 | chr9:21838010:+ | CDKN2B-AS1^ENSG00000240498.9 | chr9:22112320:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1149:17156:28758,LH00995:25:23T55JLT4:1:1167:39897:13947,LH00995:25:23T55JLT4:1:1211:14802:29501,LH00995:25:23T55JLT4:1:1255:8985:12224,LH00995:25:23T55JLT4:1:1263:3904:10094,LH00995:25:23T55JLT4:1:1268:12464:18754,LH00995:25:23T55JLT4:1:1275:37235:23125,LH00995:25:23T55JLT4:1:1320:41159:9576,LH00995:25:23T55JLT4:1:1334:37219:26825,LH00995:25:23T55JLT4:1:1339:11169:4181,LH00995:25:23T55JLT4:1:1344:2982:20996,LH00995:25:23T55JLT4:1:1348:14041:5960,LH00995:25:23T55JLT4:1:1376:9422:8721,LH00995:25:23T55JLT4:1:1431:48027:7235,LH00995:25:23T55JLT4:1:1463:32980:25283,LH00995:25:23T55JLT4:1:2104:49847:9996,LH00995:25:23T55JLT4:1:2112:18766:13835,LH00995:25:23T55JLT4:1:2123:49305:25367,LH00995:25:23T55JLT4:1:2138:29372:5442,LH00995:25:23T55JLT4:1:2150:27843:25129,LH00995:25:23T55JLT4:1:2243:30884:18067,LH00995:25:23T55JLT4:1:2258:4276:12252,LH00995:25:23T55JLT4:1:2283:21541:10542,LH00995:25:23T55JLT4:1:2294:32608:22901,LH00995:25:23T55JLT4:1:2301:29808:23266,LH00995:25:23T55JLT4:1:2322:42939:20505,LH00995:25:23T55JLT4:1:2333:6380:16708,LH00995:25:23T55JLT4:1:2350:32365:18669,LH00995:25:23T55JLT4:1:2358:24736:15461,LH00995:25:23T55JLT4:1:2412:23191:5414,LH00995:25:23T55JLT4:1:2426:21816:14746,LH00995:25:23T55JLT4:1:2438:43715:2289,LH00995:25:23T55JLT4:1:2439:13661:9814,LH00995:25:23T55JLT4:1:2441:40390:17969,LH00995:25:23T55JLT4:1:2479:4115:3340,LH00995:25:23T55JLT4:2:1121:16735:20855,LH00995:25:23T55JLT4:2:1142:10012:19833,LH00995:25:23T55JLT4:2:1228:4260:19286,LH00995:25:23T55JLT4:2:1264:28911:15012,LH00995:25:23T55JLT4:2:1279:51457:9421,LH00995:25:23T55JLT4:2:1341:36863:12644,LH00995:25:23T55JLT4:2:1396:19016:19482,LH00995:25:23T55JLT4:2:1404:25990:24078,LH00995:25:23T55JLT4:2:1404:25998:24064,LH00995:25:23T55JLT4:2:1440:3111:8581,LH00995:25:23T55JLT4:2:1468:48780:21346,LH00995:25:23T55JLT4:2:1496:44290:25704,LH00995:25:23T55JLT4:2:2103:1170:16400,LH00995:25:23T55JLT4:2:2144:39209:14017,LH00995:25:23T55JLT4:2:2267:11007:1687,LH00995:25:23T55JLT4:2:2326:49799:26250,LH00995:25:23T55JLT4:2:2417:38384:17212,LH00995:25:23T55JLT4:2:2448:5142:26951,LH00995:25:23T55JLT4:2:2476:27123:26657,LH00995:25:23T55JLT4:3:1250:16889:22887,LH00995:25:23T55JLT4:3:1318:30262:14970,LH00995:25:23T55JLT4:3:1321:6809:8202,LH00995:25:23T55JLT4:3:1352:32721:10234,LH00995:25:23T55JLT4:3:1384:40965:11986,LH00995:25:23T55JLT4:3:1471:25545:11874,LH00995:25:23T55JLT4:3:1477:18474:25185,LH00995:25:23T55JLT4:3:2147:22220:22789,LH00995:25:23T55JLT4:3:2198:32381:20547,LH00995:25:23T55JLT4:3:2210:32454:13415,LH00995:25:23T55JLT4:3:2248:8839:8693,LH00995:25:23T55JLT4:3:2263:2545:24695,LH00995:25:23T55JLT4:3:2290:33797:5456,LH00995:25:23T55JLT4:3:2324:37591:11467,LH00995:25:23T55JLT4:3:2331:49014:15895,LH00995:25:23T55JLT4:3:2372:49791:1182,LH00995:25:23T55JLT4:3:2404:49993:10472,LH00995:25:23T55JLT4:4:1132:24558:11846,LH00995:25:23T55JLT4:4:1152:37106:19903 | . | YES_LDAS | 0.2477 | GT | 1.5301 | AG | 1.8323 | ["ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.06Mb]","NEIGHBORS[56488]"] | chr9:21838010-chr9:22112320 | False | 1 | PASS | 73 | |||
| COL1A1--SLC45A4 | 70 | 0 | 70.0 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | COL1A1^ENSG00000108821.14 | chr17:50189867:- | SLC45A4^ENSG00000022567.10 | chr8:141254178:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1109:8685:9968,LH00995:25:23T55JLT4:1:1120:15635:29207,LH00995:25:23T55JLT4:1:1142:9228:1883,LH00995:25:23T55JLT4:1:1154:37745:7726,LH00995:25:23T55JLT4:1:1201:4511:9519,LH00995:25:23T55JLT4:1:1211:21031:1280,LH00995:25:23T55JLT4:1:1231:12714:1112,LH00995:25:23T55JLT4:1:1281:6833:24779,LH00995:25:23T55JLT4:1:1351:13313:25634,LH00995:25:23T55JLT4:1:1366:28522:20001,LH00995:25:23T55JLT4:1:1377:27535:21934,LH00995:25:23T55JLT4:1:1403:14648:11523,LH00995:25:23T55JLT4:1:1429:25343:19538,LH00995:25:23T55JLT4:1:1468:17067:20113,LH00995:25:23T55JLT4:1:1494:19380:17506,LH00995:25:23T55JLT4:1:1494:38885:26797,LH00995:25:23T55JLT4:1:1498:18086:13835,LH00995:25:23T55JLT4:1:2108:23555:24176,LH00995:25:23T55JLT4:1:2128:8944:12322,LH00995:25:23T55JLT4:1:2141:50883:5680,LH00995:25:23T55JLT4:1:2181:18118:25325,LH00995:25:23T55JLT4:1:2183:22269:27497,LH00995:25:23T55JLT4:1:2295:4196:26152,LH00995:25:23T55JLT4:1:2298:6153:8441,LH00995:25:23T55JLT4:1:2310:13305:12784,LH00995:25:23T55JLT4:1:2403:5142:11874,LH00995:25:23T55JLT4:1:2427:8823:10935,LH00995:25:23T55JLT4:1:2439:46450:19552,LH00995:25:23T55JLT4:1:2446:27309:8623,LH00995:25:23T55JLT4:1:2457:34938:7572,LH00995:25:23T55JLT4:1:2493:34218:1560,LH00995:25:23T55JLT4:2:1122:1316:22593,LH00995:25:23T55JLT4:2:1127:45535:8665,LH00995:25:23T55JLT4:2:1141:27236:3704,LH00995:25:23T55JLT4:2:1171:32559:17520,LH00995:25:23T55JLT4:2:1171:39177:9113,LH00995:25:23T55JLT4:2:1175:26775:5652,LH00995:25:23T55JLT4:2:1224:1194:27595,LH00995:25:23T55JLT4:2:1234:29946:5932,LH00995:25:23T55JLT4:2:1256:31524:12196,LH00995:25:23T55JLT4:2:1261:46700:8805,LH00995:25:23T55JLT4:2:1310:47461:29403,LH00995:25:23T55JLT4:2:1336:25432:22775,LH00995:25:23T55JLT4:2:1365:40681:26096,LH00995:25:23T55JLT4:2:1404:4454:26404,LH00995:25:23T55JLT4:2:2191:28029:17717,LH00995:25:23T55JLT4:2:2240:10498:8735,LH00995:25:23T55JLT4:2:2288:13839:10711,LH00995:25:23T55JLT4:2:2320:12431:15951,LH00995:25:23T55JLT4:2:2361:16177:2681,LH00995:25:23T55JLT4:2:2373:15190:19636,LH00995:25:23T55JLT4:2:2450:18167:3298,LH00995:25:23T55JLT4:2:2488:10045:8342,LH00995:25:23T55JLT4:3:1130:9608:7894,LH00995:25:23T55JLT4:3:1134:10392:2499,LH00995:25:23T55JLT4:3:1172:22633:8174,LH00995:25:23T55JLT4:3:1174:23587:24457,LH00995:25:23T55JLT4:3:1217:30949:1925,LH00995:25:23T55JLT4:3:1221:16185:10598,LH00995:25:23T55JLT4:3:1288:7593:11355,LH00995:25:23T55JLT4:3:1326:8831:19833,LH00995:25:23T55JLT4:3:1349:48238:21052,LH00995:25:23T55JLT4:3:1364:36353:12518,LH00995:25:23T55JLT4:3:1394:31006:13065,LH00995:25:23T55JLT4:3:1394:49694:22957,LH00995:25:23T55JLT4:3:1416:21104:7908,LH00995:25:23T55JLT4:3:1431:26807:25297,LH00995:25:23T55JLT4:3:2192:28360:25017,LH00995:25:23T55JLT4:3:2350:22333:27497,LH00995:25:23T55JLT4:4:1137:28110:10402 | . | YES_LDAS | 0.2376 | GT | 1.7056 | AG | 1.7819 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr8]"] | chr17:50189867-chr8:141254178 | False | 1 | PASS | 70 | |||
| B4GALT6--DSC3 | 56 | 0 | 56.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | B4GALT6^ENSG00000118276.11 | chr18:31684312:- | DSC3^ENSG00000134762.17 | chr18:30994372:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1177:42518:27567,LH00995:25:23T55JLT4:1:1195:38052:13527,LH00995:25:23T55JLT4:1:1205:50786:8707,LH00995:25:23T55JLT4:1:1221:36167:4321,LH00995:25:23T55JLT4:1:1243:10732:4209,LH00995:25:23T55JLT4:1:1304:34040:20813,LH00995:25:23T55JLT4:1:1350:11776:26110,LH00995:25:23T55JLT4:1:1397:16970:9688,LH00995:25:23T55JLT4:1:1424:32907:24597,LH00995:25:23T55JLT4:1:1447:5611:22131,LH00995:25:23T55JLT4:1:1480:23927:3466,LH00995:25:23T55JLT4:1:1488:8249:23448,LH00995:25:23T55JLT4:1:2130:26443:16147,LH00995:25:23T55JLT4:1:2130:37955:28380,LH00995:25:23T55JLT4:1:2136:29186:5036,LH00995:25:23T55JLT4:1:2150:23790:14130,LH00995:25:23T55JLT4:1:2276:1518:13191,LH00995:25:23T55JLT4:1:2405:16840:28016,LH00995:25:23T55JLT4:1:2413:10077:6577,LH00995:25:23T55JLT4:1:2422:36628:28997,LH00995:25:23T55JLT4:1:2461:38699:6829,LH00995:25:23T55JLT4:2:1124:36192:28156,LH00995:25:23T55JLT4:2:1131:8880:11173,LH00995:25:23T55JLT4:2:1196:38530:10542,LH00995:25:23T55JLT4:2:1198:44273:14073,LH00995:25:23T55JLT4:2:1316:50446:11145,LH00995:25:23T55JLT4:2:1379:33942:15573,LH00995:25:23T55JLT4:2:1437:32923:19328,LH00995:25:23T55JLT4:2:1445:11153:28226,LH00995:25:23T55JLT4:2:1470:27875:5904,LH00995:25:23T55JLT4:2:1478:37826:11005,LH00995:25:23T55JLT4:2:1483:33570:10500,LH00995:25:23T55JLT4:2:2206:19469:16400,LH00995:25:23T55JLT4:2:2250:40981:29501,LH00995:25:23T55JLT4:2:2323:17876:6521,LH00995:25:23T55JLT4:2:2345:32826:25718,LH00995:25:23T55JLT4:2:2384:35447:14228,LH00995:25:23T55JLT4:2:2461:11104:22285,LH00995:25:23T55JLT4:2:2472:46239:14368,LH00995:25:23T55JLT4:2:2478:31823:15629,LH00995:25:23T55JLT4:2:2489:21824:21710,LH00995:25:23T55JLT4:3:1111:10392:8637,LH00995:25:23T55JLT4:3:1149:31524:13457,LH00995:25:23T55JLT4:3:1276:26378:2275,LH00995:25:23T55JLT4:3:1313:45932:21822,LH00995:25:23T55JLT4:3:1320:34347:17310,LH00995:25:23T55JLT4:3:1327:41968:24288,LH00995:25:23T55JLT4:3:1337:35156:14396,LH00995:25:23T55JLT4:3:1441:34549:27441,LH00995:25:23T55JLT4:3:1493:23474:11453,LH00995:25:23T55JLT4:3:2139:34727:3592,LH00995:25:23T55JLT4:3:2233:39686:2009,LH00995:25:23T55JLT4:3:2328:10724:2850,LH00995:25:23T55JLT4:3:2347:3346:21206,LH00995:25:23T55JLT4:3:2424:22924:18599,LH00995:25:23T55JLT4:4:1132:30925:20715 | . | YES_LDAS | 0.1901 | GT | 1.8323 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:0.58Mb]"] | chr18:31684312-chr18:30994372 | False | 1 | PASS | 56 | |||
| TMEM65--ANXA13 | 53 | 0 | 53.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM65^ENSG00000164983.8 | chr8:124371854:- | ANXA13^ENSG00000104537.17 | chr8:123684722:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1135:33692:13373,LH00995:25:23T55JLT4:1:1175:39096:24555,LH00995:25:23T55JLT4:1:1184:37187:21444,LH00995:25:23T55JLT4:1:1337:26273:29417,LH00995:25:23T55JLT4:1:1367:19105:1280,LH00995:25:23T55JLT4:1:1376:23814:18011,LH00995:25:23T55JLT4:1:1382:5700:29431,LH00995:25:23T55JLT4:1:1394:20416:8819,LH00995:25:23T55JLT4:1:2154:42793:21682,LH00995:25:23T55JLT4:1:2229:34404:18866,LH00995:25:23T55JLT4:1:2233:7771:2443,LH00995:25:23T55JLT4:1:2325:36653:29095,LH00995:25:23T55JLT4:1:2347:6388:17647,LH00995:25:23T55JLT4:1:2362:25561:8735,LH00995:25:23T55JLT4:1:2362:45260:4125,LH00995:25:23T55JLT4:1:2366:46191:28464,LH00995:25:23T55JLT4:1:2380:37640:5386,LH00995:25:23T55JLT4:1:2476:23159:12952,LH00995:25:23T55JLT4:2:1145:13693:13149,LH00995:25:23T55JLT4:2:1168:9341:12756,LH00995:25:23T55JLT4:2:1378:19745:8188,LH00995:25:23T55JLT4:2:1404:7092:21724,LH00995:25:23T55JLT4:2:1441:10999:20841,LH00995:25:23T55JLT4:2:1469:27802:11747,LH00995:25:23T55JLT4:2:1476:38303:25479,LH00995:25:23T55JLT4:2:2111:2254:12028,LH00995:25:23T55JLT4:2:2174:37769:12981,LH00995:25:23T55JLT4:2:2194:21832:3172,LH00995:25:23T55JLT4:2:2342:34921:7123,LH00995:25:23T55JLT4:2:2348:31855:12294,LH00995:25:23T55JLT4:2:2401:7561:13681,LH00995:25:23T55JLT4:2:2462:17520:12126,LH00995:25:23T55JLT4:3:1134:45123:7334,LH00995:25:23T55JLT4:3:1227:7909:22943,LH00995:25:23T55JLT4:3:1233:45802:3046,LH00995:25:23T55JLT4:3:1241:1858:26446,LH00995:25:23T55JLT4:3:1241:5749:15503,LH00995:25:23T55JLT4:3:1274:18960:24373,LH00995:25:23T55JLT4:3:1294:10069:25479,LH00995:25:23T55JLT4:3:1367:32672:12056,LH00995:25:23T55JLT4:3:1375:3621:22271,LH00995:25:23T55JLT4:3:1381:23191:12336,LH00995:25:23T55JLT4:3:1436:26572:4713,LH00995:25:23T55JLT4:3:2159:14607:13527,LH00995:25:23T55JLT4:3:2190:18029:25311,LH00995:25:23T55JLT4:3:2279:19834:9435,LH00995:25:23T55JLT4:3:2340:2440:22411,LH00995:25:23T55JLT4:3:2354:32527:10178,LH00995:25:23T55JLT4:3:2394:45252:21038,LH00995:25:23T55JLT4:3:2411:13410:11397,LH00995:25:23T55JLT4:3:2422:15869:3438,LH00995:25:23T55JLT4:3:2432:39759:23518,LH00995:25:23T55JLT4:4:1121:23822:18361 | . | YES_LDAS | 0.1799 | GT | 1.9656 | AG | 1.9219 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]"] | chr8:124371854-chr8:123684722 | False | 1 | PASS | 53 | |||
| TMEM123--PDGFD | 41 | 0 | 41.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000255:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1189:32559:14886,LH00995:25:23T55JLT4:1:1255:35221:12126,LH00995:25:23T55JLT4:1:1286:30949:3606,LH00995:25:23T55JLT4:1:1339:20990:14158,LH00995:25:23T55JLT4:1:1446:1720:4937,LH00995:25:23T55JLT4:1:1472:48715:8174,LH00995:25:23T55JLT4:1:2172:37664:13135,LH00995:25:23T55JLT4:1:2215:12763:22467,LH00995:25:23T55JLT4:1:2237:27907:24457,LH00995:25:23T55JLT4:1:2258:30739:27763,LH00995:25:23T55JLT4:1:2315:31111:20393,LH00995:25:23T55JLT4:1:2459:32389:25746,LH00995:25:23T55JLT4:2:1117:42882:11972,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:2464:5134,LH00995:25:23T55JLT4:2:1194:3856:22537,LH00995:25:23T55JLT4:2:1216:14567:24947,LH00995:25:23T55JLT4:2:1231:28320:8300,LH00995:25:23T55JLT4:2:1274:16816:19482,LH00995:25:23T55JLT4:2:1355:28304:20547,LH00995:25:23T55JLT4:2:1425:45349:3130,LH00995:25:23T55JLT4:2:1455:22592:29347,LH00995:25:23T55JLT4:2:1458:17390:15096,LH00995:25:23T55JLT4:2:1478:44015:11355,LH00995:25:23T55JLT4:2:2149:15085:18473,LH00995:25:23T55JLT4:2:2227:29016:27301,LH00995:25:23T55JLT4:2:2227:35140:10753,LH00995:25:23T55JLT4:2:2278:37486:12182,LH00995:25:23T55JLT4:2:2324:40649:26152,LH00995:25:23T55JLT4:2:2393:7351:20323,LH00995:25:23T55JLT4:3:1140:5215:10598,LH00995:25:23T55JLT4:3:1277:48472:18235,LH00995:25:23T55JLT4:3:1284:26322:24849,LH00995:25:23T55JLT4:3:1323:42575:20491,LH00995:25:23T55JLT4:3:1385:39282:16470,LH00995:25:23T55JLT4:3:1463:37462:1939,LH00995:25:23T55JLT4:3:2130:4090:5904,LH00995:25:23T55JLT4:3:2247:3613:22873,LH00995:25:23T55JLT4:3:2328:16759:8707,LH00995:25:23T55JLT4:3:2384:24008:5904,LH00995:25:23T55JLT4:3:2455:23701:29501,LH00995:25:23T55JLT4:4:1118:19898:2709 | . | YES_LDAS | 0.1391 | GT | 1.9656 | AG | 1.8323 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]"] | chr11:102448812-chr11:104000255 | False | 1 | PASS | 41 | |||
| TMEM65--ANXA13 | 40 | 0 | 40.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM65^ENSG00000164983.8 | chr8:124371854:- | ANXA13^ENSG00000104537.17 | chr8:123688946:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1222:33894:8455,LH00995:25:23T55JLT4:1:1305:33352:21976,LH00995:25:23T55JLT4:1:1312:13815:8062,LH00995:25:23T55JLT4:1:1327:13588:11930,LH00995:25:23T55JLT4:1:1367:46450:25409,LH00995:25:23T55JLT4:1:1402:44532:15839,LH00995:25:23T55JLT4:1:2189:23401:18081,LH00995:25:23T55JLT4:1:2256:4932:2541,LH00995:25:23T55JLT4:1:2293:28741:6171,LH00995:25:23T55JLT4:1:2315:20529:19524,LH00995:25:23T55JLT4:1:2413:28660:20603,LH00995:25:23T55JLT4:1:2417:42801:7320,LH00995:25:23T55JLT4:1:2425:35989:12532,LH00995:25:23T55JLT4:1:2443:45511:25606,LH00995:25:23T55JLT4:1:2470:20780:2023,LH00995:25:23T55JLT4:2:1108:9187:11565,LH00995:25:23T55JLT4:2:1316:27179:15741,LH00995:25:23T55JLT4:2:1492:49985:16736,LH00995:25:23T55JLT4:2:2158:7059:23125,LH00995:25:23T55JLT4:2:2282:47073:28254,LH00995:25:23T55JLT4:2:2358:20562:13527,LH00995:25:23T55JLT4:2:2384:39872:18249,LH00995:25:23T55JLT4:2:2398:15141:9632,LH00995:25:23T55JLT4:2:2452:45592:3718,LH00995:25:23T55JLT4:3:1203:21751:27105,LH00995:25:23T55JLT4:3:1267:27503:11509,LH00995:25:23T55JLT4:3:1280:21096:7922,LH00995:25:23T55JLT4:3:1428:26443:28422,LH00995:25:23T55JLT4:3:2104:46369:24232,LH00995:25:23T55JLT4:3:2105:45624:8118,LH00995:25:23T55JLT4:3:2141:28846:27175,LH00995:25:23T55JLT4:3:2234:43998:17212,LH00995:25:23T55JLT4:3:2293:7415:17240,LH00995:25:23T55JLT4:3:2365:29946:27175,LH00995:25:23T55JLT4:3:2377:4552:27918,LH00995:25:23T55JLT4:3:2389:26063:24373,LH00995:25:23T55JLT4:3:2429:5466:16414,LH00995:25:23T55JLT4:3:2459:16331:8160,LH00995:25:23T55JLT4:4:1115:26111:18039,LH00995:25:23T55JLT4:4:1142:39516:16035 | . | YES_LDAS | 0.1358 | GT | 1.9656 | AG | 1.9656 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]"] | chr8:124371854-chr8:123688946 | False | 1 | PASS | 40 | |||
| PDCD1LG2--DYNC2H1 | 40 | 1 | 40.0 | 0.65 | ONLY_REF_SPLICE | PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 | chr9:5535050:+ | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103114103:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1107:13855:1294,LH00995:25:23T55JLT4:1:1193:2853:27217,LH00995:25:23T55JLT4:1:1195:7391:5652,LH00995:25:23T55JLT4:1:1255:21816:14073,LH00995:25:23T55JLT4:1:1303:49435:8945,LH00995:25:23T55JLT4:1:1328:13758:15839,LH00995:25:23T55JLT4:1:1355:44362:18039,LH00995:25:23T55JLT4:1:1403:32130:15573,LH00995:25:23T55JLT4:1:1493:41531:25634,LH00995:25:23T55JLT4:1:2103:32098:7390,LH00995:25:23T55JLT4:1:2129:40374:19650,LH00995:25:23T55JLT4:1:2198:34444:26558,LH00995:25:23T55JLT4:1:2220:15004:16932,LH00995:25:23T55JLT4:1:2226:48043:16400,LH00995:25:23T55JLT4:1:2294:52024:24022,LH00995:25:23T55JLT4:1:2369:28797:6100,LH00995:25:23T55JLT4:1:2383:33773:2191,LH00995:25:23T55JLT4:1:2420:30067:6591,LH00995:25:23T55JLT4:2:1127:43295:15265,LH00995:25:23T55JLT4:2:1350:5433:15293,LH00995:25:23T55JLT4:2:1409:1445:29431,LH00995:25:23T55JLT4:2:2143:28886:4041,LH00995:25:23T55JLT4:2:2222:39581:24947,LH00995:25:23T55JLT4:2:2238:43561:1911,LH00995:25:23T55JLT4:2:2349:18547:22509,LH00995:25:23T55JLT4:2:2378:22228:10668,LH00995:25:23T55JLT4:3:1206:13863:5484,LH00995:25:23T55JLT4:3:1372:30852:25914,LH00995:25:23T55JLT4:3:1406:35439:5274,LH00995:25:23T55JLT4:3:1420:48731:14508,LH00995:25:23T55JLT4:3:1439:6954:24681,LH00995:25:23T55JLT4:3:1443:22673:15895,LH00995:25:23T55JLT4:3:2129:33837:22397,LH00995:25:23T55JLT4:3:2188:50770:4307,LH00995:25:23T55JLT4:3:2217:16411:6395,LH00995:25:23T55JLT4:3:2289:21168:1911,LH00995:25:23T55JLT4:3:2347:6720:22201,LH00995:25:23T55JLT4:3:2444:17229:27399,LH00995:25:23T55JLT4:3:2460:38966:16175,LH00995:25:23T55JLT4:4:1154:12528:9618 | LH00995:25:23T55JLT4:3:2195:34541:29305 | YES_LDAS | 0.138 | GT | 1.9219 | AG | 1.8323 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"] | chr9:5535050-chr11:103114103 | False | 1 | PASS | 41 | |||
| RPSAP52--HMGA2 | 36 | 0 | 36.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | RPSAP52^ENSG00000241749.4 | chr12:65826843:- | HMGA2^ENSG00000149948.14 | chr12:65828001:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1210:23798:27763,LH00995:25:23T55JLT4:1:1226:42736:6731,LH00995:25:23T55JLT4:1:1313:50017:7432,LH00995:25:23T55JLT4:1:1322:15303:15012,LH00995:25:23T55JLT4:1:1376:18070:4839,LH00995:25:23T55JLT4:1:1430:21112:7978,LH00995:25:23T55JLT4:1:1477:33991:11285,LH00995:25:23T55JLT4:1:2106:39597:27441,LH00995:25:23T55JLT4:1:2112:40957:20603,LH00995:25:23T55JLT4:1:2255:14502:1238,LH00995:25:23T55JLT4:1:2398:14494:25269,LH00995:25:23T55JLT4:1:2492:5458:1827,LH00995:25:23T55JLT4:2:1221:38076:17492,LH00995:25:23T55JLT4:2:1281:4543:22018,LH00995:25:23T55JLT4:2:1282:4115:1210,LH00995:25:23T55JLT4:2:1424:2019:10949,LH00995:25:23T55JLT4:2:1442:28781:3802,LH00995:25:23T55JLT4:2:2154:8176:18866,LH00995:25:23T55JLT4:2:2155:12714:25409,LH00995:25:23T55JLT4:2:2171:4924:23882,LH00995:25:23T55JLT4:2:2289:22358:16189,LH00995:25:23T55JLT4:2:2386:30779:4321,LH00995:25:23T55JLT4:3:1218:28514:25423,LH00995:25:23T55JLT4:3:1376:18094:3620,LH00995:25:23T55JLT4:3:1401:51109:10248,LH00995:25:23T55JLT4:3:1420:11881:27581,LH00995:25:23T55JLT4:3:1441:7885:26320,LH00995:25:23T55JLT4:3:1448:6534:11481,LH00995:25:23T55JLT4:3:2307:21824:10332,LH00995:25:23T55JLT4:3:2311:44848:26614,LH00995:25:23T55JLT4:3:2370:35989:7095,LH00995:25:23T55JLT4:3:2411:43052:6689,LH00995:25:23T55JLT4:3:2416:51142:11677,LH00995:25:23T55JLT4:3:2421:42979:6395,LH00995:25:23T55JLT4:3:2453:15279:1911,LH00995:25:23T55JLT4:4:1156:33708:1715 | . | YES_LDAS | 0.1222 | GT | 1.9329 | AG | 1.8256 | ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.00Mb]","NEIGHBORS_OVERLAP:-:+:[2537]"] | chr12:65826843-chr12:65828001 | False | 1 | PASS | 36 | |||
| AP001021.1--YAP1 | 36 | 0 | 36.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | AP001021.1^ENSG00000264449.6 | chr18:5896086:+ | YAP1^ENSG00000137693.14 | chr11:102162456:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1145:34533:21416,LH00995:25:23T55JLT4:1:1187:24154:18936,LH00995:25:23T55JLT4:1:1232:29291:23574,LH00995:25:23T55JLT4:1:1258:15020:10514,LH00995:25:23T55JLT4:1:1357:40560:18824,LH00995:25:23T55JLT4:1:1379:44265:10865,LH00995:25:23T55JLT4:1:1379:6493:27217,LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:36086:18305,LH00995:25:23T55JLT4:1:1464:51012:29137,LH00995:25:23T55JLT4:1:2143:19008:14200,LH00995:25:23T55JLT4:1:2186:4778:14802,LH00995:25:23T55JLT4:1:2330:23676:11551,LH00995:25:23T55JLT4:1:2330:8152:11313,LH00995:25:23T55JLT4:1:2341:8386:2275,LH00995:25:23T55JLT4:1:2404:26945:21836,LH00995:25:23T55JLT4:2:1133:44824:9954,LH00995:25:23T55JLT4:2:1224:8580:18053,LH00995:25:23T55JLT4:2:1395:18847:21626,LH00995:25:23T55JLT4:2:1406:41596:16273,LH00995:25:23T55JLT4:2:1450:2416:25564,LH00995:25:23T55JLT4:2:2285:44557:23167,LH00995:25:23T55JLT4:2:2310:7690:24695,LH00995:25:23T55JLT4:2:2335:13483:13233,LH00995:25:23T55JLT4:2:2422:5668:16568,LH00995:25:23T55JLT4:2:2434:3184:19692,LH00995:25:23T55JLT4:3:1274:42308:14480,LH00995:25:23T55JLT4:3:1348:15352:2289,LH00995:25:23T55JLT4:3:1357:4899:4811,LH00995:25:23T55JLT4:3:1372:29687:11341,LH00995:25:23T55JLT4:3:1386:9721:19160,LH00995:25:23T55JLT4:3:1412:19380:19160,LH00995:25:23T55JLT4:3:2137:22948:4293,LH00995:25:23T55JLT4:3:2150:25836:18487,LH00995:25:23T55JLT4:3:2277:4446:16329,LH00995:25:23T55JLT4:3:2371:8936:5078,LH00995:25:23T55JLT4:3:2422:47752:9842 | . | YES_LDAS | 0.1222 | GT | 1.8062 | AG | 1.9086 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr18--chr11]"] | chr18:5896086-chr11:102162456 | False | 1 | PASS | 36 | |||
| YAP1--PDGFD | 35 | 1 | 35.0 | 0.8 | ONLY_REF_SPLICE | YAP1^ENSG00000137693.14 | chr11:102162571:+ | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000255:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1113:29711:29263,LH00995:25:23T55JLT4:1:1141:37211:16414,LH00995:25:23T55JLT4:1:1145:35641:1168,LH00995:25:23T55JLT4:1:1195:39161:24274,LH00995:25:23T55JLT4:1:1322:35156:14620,LH00995:25:23T55JLT4:1:1462:51918:25606,LH00995:25:23T55JLT4:1:2139:26467:13443,LH00995:25:23T55JLT4:1:2157:29121:27287,LH00995:25:23T55JLT4:1:2258:39889:7936,LH00995:25:23T55JLT4:1:2259:27875:21290,LH00995:25:23T55JLT4:1:2307:20909:24274,LH00995:25:23T55JLT4:1:2410:4980:25718,LH00995:25:23T55JLT4:2:1164:26168:7656,LH00995:25:23T55JLT4:2:1226:9519:7516,LH00995:25:23T55JLT4:2:1227:24065:29487,LH00995:25:23T55JLT4:2:1370:5765:28955,LH00995:25:23T55JLT4:2:1394:13086:5288,LH00995:25:23T55JLT4:2:1482:17140:16035,LH00995:25:23T55JLT4:2:2136:39872:13345,LH00995:25:23T55JLT4:2:2137:18644:29403,LH00995:25:23T55JLT4:2:2235:38295:4419,LH00995:25:23T55JLT4:2:2263:15950:8230,LH00995:25:23T55JLT4:3:1116:11404:2766,LH00995:25:23T55JLT4:3:1142:43909:2794,LH00995:25:23T55JLT4:3:1347:23951:17689,LH00995:25:23T55JLT4:3:1388:48189:20911,LH00995:25:23T55JLT4:3:1470:9859:3788,LH00995:25:23T55JLT4:3:2107:32292:29277,LH00995:25:23T55JLT4:3:2126:14381:20169,LH00995:25:23T55JLT4:3:2197:6784:13009,LH00995:25:23T55JLT4:3:2203:15797:9393,LH00995:25:23T55JLT4:3:2256:21735:28814,LH00995:25:23T55JLT4:3:2310:40414:8370,LH00995:25:23T55JLT4:3:2313:8580:15895,LH00995:25:23T55JLT4:3:2446:20909:24274 | LH00995:25:23T55JLT4:3:1261:7699:29305 | YES_LDAS | 0.1215 | GT | 1.9899 | AG | 1.8323 | ["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.67Mb]"] | chr11:102162571-chr11:104000255 | False | 1 | PASS | 36 | |||
| CLTC--VMP1 | 32 | 0 | 32.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | CLTC^ENSG00000141367.12 | chr17:59690711:+ | VMP1^ENSG00000062716.13 | chr17:59838295:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1103:28846:5092,LH00995:25:23T55JLT4:1:1154:37292:19776,LH00995:25:23T55JLT4:1:1330:31168:2976,LH00995:25:23T55JLT4:1:1407:44799:2401,LH00995:25:23T55JLT4:1:2131:48553:13639,LH00995:25:23T55JLT4:1:2172:30982:5484,LH00995:25:23T55JLT4:1:2218:33959:1308,LH00995:25:23T55JLT4:1:2240:45260:11579,LH00995:25:23T55JLT4:1:2274:20295:1687,LH00995:25:23T55JLT4:1:2287:28223:25984,LH00995:25:23T55JLT4:1:2431:11355:7418,LH00995:25:23T55JLT4:2:1176:4762:22509,LH00995:25:23T55JLT4:2:1228:26233:7796,LH00995:25:23T55JLT4:2:1266:49726:11944,LH00995:25:23T55JLT4:2:1406:12609:28254,LH00995:25:23T55JLT4:2:2105:48723:26432,LH00995:25:23T55JLT4:2:2150:5530:6773,LH00995:25:23T55JLT4:2:2194:6582:29305,LH00995:25:23T55JLT4:2:2230:37259:3298,LH00995:25:23T55JLT4:2:2280:4187:4531,LH00995:25:23T55JLT4:2:2320:11331:7460,LH00995:25:23T55JLT4:2:2366:31912:25704,LH00995:25:23T55JLT4:3:1114:47655:3172,LH00995:25:23T55JLT4:3:1391:26168:12112,LH00995:25:23T55JLT4:3:1396:9632:7067,LH00995:25:23T55JLT4:3:2156:12585:22411,LH00995:25:23T55JLT4:3:2163:10344:25592,LH00995:25:23T55JLT4:3:2248:19785:4587,LH00995:25:23T55JLT4:3:2253:7529:28282,LH00995:25:23T55JLT4:3:2256:32769:24639,LH00995:25:23T55JLT4:3:2359:3767:6745,LH00995:25:23T55JLT4:3:2427:7618:2261 | . | YES_LDAS | 0.1086 | GT | 1.8892 | AG | 1.8062 | ["Klijn_CellLines","Larsson_TCGA","ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.01Mb]","NEIGHBORS[10236]"] | chr17:59690711-chr17:59838295 | False | 1 | PASS | 32 | |||
| TBC1D13--AL442224.1 | 31 | 0 | 31.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TBC1D13^ENSG00000107021.16 | chr9:128792574:+ | AL442224.1^ENSG00000231990.2 | chr9:93825711:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1180:19300:4335,LH00995:25:23T55JLT4:1:1340:42720:23714,LH00995:25:23T55JLT4:1:2105:45374:21528,LH00995:25:23T55JLT4:1:2157:29533:28730,LH00995:25:23T55JLT4:1:2269:34226:13233,LH00995:25:23T55JLT4:1:2408:12237:25592,LH00995:25:23T55JLT4:2:1181:13030:24106,LH00995:25:23T55JLT4:2:1182:32842:27203,LH00995:25:23T55JLT4:2:1193:46110:8427,LH00995:25:23T55JLT4:2:1222:34582:22117,LH00995:25:23T55JLT4:2:1428:28773:26320,LH00995:25:23T55JLT4:2:1445:26524:6339,LH00995:25:23T55JLT4:2:2117:51328:19482,LH00995:25:23T55JLT4:2:2180:44209:10514,LH00995:25:23T55JLT4:2:2348:32956:25353,LH00995:25:23T55JLT4:2:2398:6105:9393,LH00995:25:23T55JLT4:2:2454:48286:25760,LH00995:25:23T55JLT4:3:1153:31734:22341,LH00995:25:23T55JLT4:3:1242:9050:16484,LH00995:25:23T55JLT4:3:1323:15433:24905,LH00995:25:23T55JLT4:3:1447:39096:19678,LH00995:25:23T55JLT4:3:1479:14154:22747,LH00995:25:23T55JLT4:3:1485:45212:27469,LH00995:25:23T55JLT4:3:2112:24073:27119,LH00995:25:23T55JLT4:3:2125:29080:6114,LH00995:25:23T55JLT4:3:2128:26839:4587,LH00995:25:23T55JLT4:3:2168:16614:24373,LH00995:25:23T55JLT4:3:2407:18790:9618,LH00995:25:23T55JLT4:3:2484:40471:15671,LH00995:25:23T55JLT4:3:2486:1599:21346,LH00995:25:23T55JLT4:4:1136:20845:6367 | . | YES_LDAS | 0.1052 | GT | 1.9329 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:34.93Mb]"] | chr9:128792574-chr9:93825711 | False | 1 | PASS | 31 | |||
| AL033504.1--SASH1 | 31 | 1 | 31.0 | 1.0 | ONLY_REF_SPLICE | AL033504.1^ENSG00000227681.5 | chr6:147947519:+ | SASH1^ENSG00000111961.18 | chr6:148390134:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1262:4066:19903,LH00995:25:23T55JLT4:1:1297:3492:25606,LH00995:25:23T55JLT4:1:1466:40123:21458,LH00995:25:23T55JLT4:1:2105:33789:1070,LH00995:25:23T55JLT4:1:2184:50438:4769,LH00995:25:23T55JLT4:1:2329:18588:11397,LH00995:25:23T55JLT4:2:1130:15077:11733,LH00995:25:23T55JLT4:2:1277:6987:24513,LH00995:25:23T55JLT4:2:1311:36022:10767,LH00995:25:23T55JLT4:2:1367:36200:22621,LH00995:25:23T55JLT4:2:2115:11638:28730,LH00995:25:23T55JLT4:2:2168:24016:13625,LH00995:25:23T55JLT4:2:2217:47348:27721,LH00995:25:23T55JLT4:2:2228:11994:26713,LH00995:25:23T55JLT4:2:2241:8653:29333,LH00995:25:23T55JLT4:2:2334:27301:27581,LH00995:25:23T55JLT4:2:2352:51740:6241,LH00995:25:23T55JLT4:2:2425:20812:24723,LH00995:25:23T55JLT4:2:2451:43893:9267,LH00995:25:23T55JLT4:3:1116:39557:19104,LH00995:25:23T55JLT4:3:1130:50988:6843,LH00995:25:23T55JLT4:3:1233:48496:10542,LH00995:25:23T55JLT4:3:1364:7707:13009,LH00995:25:23T55JLT4:3:1427:43262:25381,LH00995:25:23T55JLT4:3:2182:19332:16554,LH00995:25:23T55JLT4:3:2269:5619:26292,LH00995:25:23T55JLT4:3:2289:16339:23448,LH00995:25:23T55JLT4:3:2315:35067:27862,LH00995:25:23T55JLT4:3:2439:25650:21164,LH00995:25:23T55JLT4:4:1107:19000:23910,LH00995:25:23T55JLT4:4:1107:21007:15615 | LH00995:25:23T55JLT4:1:1448:3055:29277 | YES_LDAS | 0.1086 | GT | 1.5329 | AG | 1.9219 | ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.32Mb]"] | chr6:147947519-chr6:148390134 | False | 1 | PASS | 32 | |||
| CDV3--MT-RNR2 | 30 | 0 | 30.0 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | CDV3^ENSG00000091527.16 | chr3:133575115:+ | MT-RNR2^ENSG00000210082.2 | chrM:2449:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1170:39225:7460,LH00995:25:23T55JLT4:1:1259:26435:22691,LH00995:25:23T55JLT4:1:1350:23676:18277,LH00995:25:23T55JLT4:1:1388:31192:17563,LH00995:25:23T55JLT4:1:1426:32947:17324,LH00995:25:23T55JLT4:1:1430:34792:28198,LH00995:25:23T55JLT4:1:2226:6509:23882,LH00995:25:23T55JLT4:1:2398:3144:25592,LH00995:25:23T55JLT4:1:2414:22584:22495,LH00995:25:23T55JLT4:1:2454:21751:9590,LH00995:25:23T55JLT4:1:2483:11161:5568,LH00995:25:23T55JLT4:2:1117:34266:10472,LH00995:25:23T55JLT4:2:1383:7690:16231,LH00995:25:23T55JLT4:2:1414:25424:20603,LH00995:25:23T55JLT4:2:2149:22018:8511,LH00995:25:23T55JLT4:2:2168:28190:29543,LH00995:25:23T55JLT4:2:2244:45641:9267,LH00995:25:23T55JLT4:2:2376:14656:24316,LH00995:25:23T55JLT4:2:2429:5611:13779,LH00995:25:23T55JLT4:2:2476:48909:10893,LH00995:25:23T55JLT4:3:1295:7286:18613,LH00995:25:23T55JLT4:3:1350:23377:2037,LH00995:25:23T55JLT4:3:1439:27195:26671,LH00995:25:23T55JLT4:3:2103:45099:4629,LH00995:25:23T55JLT4:3:2107:20497:15881,LH00995:25:23T55JLT4:3:2128:34331:4839,LH00995:25:23T55JLT4:3:2134:40819:7249,LH00995:25:23T55JLT4:3:2202:24057:24429,LH00995:25:23T55JLT4:3:2332:49645:28618,LH00995:25:23T55JLT4:3:2366:15214:23854 | . | YES_LDAS | 0.1018 | GT | 1.7968 | AG | 1.2419 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chrM]"] | chr3:133575115-chrM:2449 | False | 1 | PASS | 30 | |||
| TMEM123--DYNC2H1 | 26 | 0 | 26.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103280348:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1110:44055:19664,LH00995:25:23T55JLT4:1:1132:24267:27707,LH00995:25:23T55JLT4:1:1143:20497:21626,LH00995:25:23T55JLT4:1:1167:2214:20617,LH00995:25:23T55JLT4:1:1271:14672:9856,LH00995:25:23T55JLT4:1:1311:22398:9926,LH00995:25:23T55JLT4:1:1348:44322:3760,LH00995:25:23T55JLT4:1:2113:21460:29403,LH00995:25:23T55JLT4:1:2214:1858:17310,LH00995:25:23T55JLT4:1:2242:10676:22551,LH00995:25:23T55JLT4:2:1281:16509:8497,LH00995:25:23T55JLT4:2:1344:25852:26110,LH00995:25:23T55JLT4:2:1430:45527:27735,LH00995:25:23T55JLT4:2:2124:9939:1378,LH00995:25:23T55JLT4:2:2274:10619:24499,LH00995:25:23T55JLT4:2:2357:28530:6535,LH00995:25:23T55JLT4:2:2434:44217:21150,LH00995:25:23T55JLT4:2:2435:44540:10921,LH00995:25:23T55JLT4:3:1191:2165:18431,LH00995:25:23T55JLT4:3:1333:3621:26586,LH00995:25:23T55JLT4:3:1365:28805:2695,LH00995:25:23T55JLT4:3:1478:10643:27904,LH00995:25:23T55JLT4:3:2269:49305:13429,LH00995:25:23T55JLT4:3:2441:28935:27637,LH00995:25:23T55JLT4:4:1120:28085:27876,LH00995:25:23T55JLT4:4:1148:29186:17142 | . | YES_LDAS | 0.0882 | GT | 1.9656 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.64Mb]"] | chr11:102448812-chr11:103280348 | False | 1 | PASS | 26 | |||
| SH3BP5--AC002074.1 | 26 | 0 | 26.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | SH3BP5^ENSG00000131370.16 | chr3:15304103:- | AC002074.1^ENSG00000285090.1 | chr7:94279390:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1107:34549:9169,LH00995:25:23T55JLT4:1:1168:33279:5876,LH00995:25:23T55JLT4:1:1262:17318:23266,LH00995:25:23T55JLT4:1:1265:19898:25073,LH00995:25:23T55JLT4:1:2158:15376:1238,LH00995:25:23T55JLT4:1:2163:27204:27441,LH00995:25:23T55JLT4:1:2326:35690:24989,LH00995:25:23T55JLT4:1:2421:36547:29697,LH00995:25:23T55JLT4:2:1193:30706:7558,LH00995:25:23T55JLT4:2:1222:22333:27777,LH00995:25:23T55JLT4:2:1288:15789:1280,LH00995:25:23T55JLT4:2:1350:44735:16946,LH00995:25:23T55JLT4:2:1394:18968:24078,LH00995:25:23T55JLT4:2:2163:39161:27525,LH00995:25:23T55JLT4:2:2423:39047:25788,LH00995:25:23T55JLT4:3:1114:50851:18880,LH00995:25:23T55JLT4:3:1276:17965:1350,LH00995:25:23T55JLT4:3:1326:12350:7376,LH00995:25:23T55JLT4:3:1433:50317:15825,LH00995:25:23T55JLT4:3:1460:8119:26250,LH00995:25:23T55JLT4:3:2129:4179:21528,LH00995:25:23T55JLT4:3:2139:14284:7726,LH00995:25:23T55JLT4:3:2186:39290:25620,LH00995:25:23T55JLT4:3:2380:50300:15265,LH00995:25:23T55JLT4:3:2443:21112:4307,LH00995:25:23T55JLT4:4:1139:29291:9618 | . | YES_LDAS | 0.0882 | GT | 1.5546 | AG | 1.5546 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr7]"] | chr3:15304103-chr7:94279390 | False | 1 | PASS | 26 | |||
| YAP1--MUC12 | 25 | 0 | 25.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | YAP1^ENSG00000137693.14 | chr11:102186131:+ | MUC12^ENSG00000205277.9 | chr7:101018595:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1187:38327:19496,LH00995:25:23T55JLT4:1:1294:44824:24190,LH00995:25:23T55JLT4:1:1337:27341:8202,LH00995:25:23T55JLT4:1:1358:10368:19636,LH00995:25:23T55JLT4:1:1416:1437:12462,LH00995:25:23T55JLT4:1:1486:30844:22453,LH00995:25:23T55JLT4:1:2190:9130:25143,LH00995:25:23T55JLT4:2:1103:27131:13023,LH00995:25:23T55JLT4:2:1185:49402:4881,LH00995:25:23T55JLT4:2:1342:39023:16442,LH00995:25:23T55JLT4:2:2146:7877:20982,LH00995:25:23T55JLT4:2:2243:10441:2079,LH00995:25:23T55JLT4:2:2280:39250:25073,LH00995:25:23T55JLT4:2:2362:13410:12322,LH00995:25:23T55JLT4:2:2476:46239:22131,LH00995:25:23T55JLT4:3:1297:6153:10711,LH00995:25:23T55JLT4:3:1473:43667:7978,LH00995:25:23T55JLT4:3:1492:2650:9884,LH00995:25:23T55JLT4:3:2177:25408:11299,LH00995:25:23T55JLT4:3:2319:35326:13933,LH00995:25:23T55JLT4:3:2368:42219:11271,LH00995:25:23T55JLT4:3:2470:40447:19216,LH00995:25:23T55JLT4:4:1126:1218:4405,LH00995:25:23T55JLT4:4:1145:9090:16021,LH00995:25:23T55JLT4:4:1147:19704:3130 | . | YES_LDAS | 0.0848 | GT | 1.7465 | AG | 1.8892 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr7]"] | chr11:102186131-chr7:101018595 | False | 1 | PASS | 25 | |||
| TMEM123--YAP1 | 23 | 0 | 23.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | YAP1^ENSG00000137693.14 | chr11:102114144:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1247:48270:17016,LH00995:25:23T55JLT4:1:1488:40059:22383,LH00995:25:23T55JLT4:1:2168:50559:9716,LH00995:25:23T55JLT4:1:2373:33222:21416,LH00995:25:23T55JLT4:1:2377:10943:13149,LH00995:25:23T55JLT4:2:1245:42882:2415,LH00995:25:23T55JLT4:2:1303:7488:25241,LH00995:25:23T55JLT4:2:1312:32527:17605,LH00995:25:23T55JLT4:2:1373:32041:14494,LH00995:25:23T55JLT4:2:1403:14114:29011,LH00995:25:23T55JLT4:2:1462:31014:16470,LH00995:25:23T55JLT4:2:2151:6784:11411,LH00995:25:23T55JLT4:2:2235:32025:21528,LH00995:25:23T55JLT4:3:1115:49961:22439,LH00995:25:23T55JLT4:3:1117:9317:9491,LH00995:25:23T55JLT4:3:1149:18240:3901,LH00995:25:23T55JLT4:3:1198:14769:9968,LH00995:25:23T55JLT4:3:1429:23539:18515,LH00995:25:23T55JLT4:3:2236:48642:16708,LH00995:25:23T55JLT4:3:2313:45932:8679,LH00995:25:23T55JLT4:3:2453:29485:6647,LH00995:25:23T55JLT4:3:2473:7901:15082,LH00995:25:23T55JLT4:3:2484:26896:25395 | . | YES_LDAS | 0.0781 | GT | 1.9656 | AG | 1.9899 | ["Klijn_CellLines","TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.16Mb]"] | chr11:102448812-chr11:102114144 | False | 1 | PASS | 23 | |||
| AC239859.5--AC013734.1 | 23 | 0 | 7.53 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | AC239859.5^ENSG00000277702.1 | chr1:143419625:- | AC013734.1^ENSG00000277146.1 | chrY:26453985:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1176:10101:14914,LH00995:25:23T55JLT4:1:1312:12415:5274,LH00995:25:23T55JLT4:1:1370:30326:21108,LH00995:25:23T55JLT4:1:1492:26540:2443,LH00995:25:23T55JLT4:1:2273:29970:4265,LH00995:25:23T55JLT4:1:2293:22932:12196,LH00995:25:23T55JLT4:2:1118:48869:1434,LH00995:25:23T55JLT4:2:1211:47348:26404,LH00995:25:23T55JLT4:2:1403:21751:22004,LH00995:25:23T55JLT4:2:1483:46903:26138,LH00995:25:23T55JLT4:2:2184:8831:21710,LH00995:25:23T55JLT4:2:2195:21985:26951,LH00995:25:23T55JLT4:2:2261:21662:9716,LH00995:25:23T55JLT4:2:2344:34031:21556,LH00995:25:23T55JLT4:3:1106:8896:15012,LH00995:25:23T55JLT4:3:1141:2788:3592,LH00995:25:23T55JLT4:3:1361:6558:16147,LH00995:25:23T55JLT4:3:2178:49669:2962,LH00995:25:23T55JLT4:3:2237:50187:24008,LH00995:25:23T55JLT4:3:2286:18749:2317,LH00995:25:23T55JLT4:3:2412:44047:28702,LH00995:25:23T55JLT4:3:2447:18523:23784,LH00995:25:23T55JLT4:3:2447:46749:16708 | . | YES_LDAS | 0.0256 | GT | 1.7465 | AG | 1.8892 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chrY]"] | chr1:143419625-chrY:26453985 | False | 1 | PASS | 23 | |||
| TMEM123--YAP1 | 22 | 0 | 22.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | YAP1^ENSG00000137693.14 | chr11:102162456:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1318:47364:25115,LH00995:25:23T55JLT4:1:1335:49621:3718,LH00995:25:23T55JLT4:1:1386:44387:11860,LH00995:25:23T55JLT4:1:1394:2845:10865,LH00995:25:23T55JLT4:1:1451:11962:7852,LH00995:25:23T55JLT4:1:1455:27155:8525,LH00995:25:23T55JLT4:1:1456:45819:9015,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:19478:10388,LH00995:25:23T55JLT4:2:1155:49030:22705,LH00995:25:23T55JLT4:2:2171:31006:7432,LH00995:25:23T55JLT4:2:2225:21047:8623,LH00995:25:23T55JLT4:2:2255:35083:29347,LH00995:25:23T55JLT4:3:1119:41668:13989,LH00995:25:23T55JLT4:3:1197:22074:22257,LH00995:25:23T55JLT4:3:1202:7650:21906,LH00995:25:23T55JLT4:3:1287:44217:22775,LH00995:25:23T55JLT4:3:1314:1089:14718,LH00995:25:23T55JLT4:3:1429:43473:1925,LH00995:25:23T55JLT4:3:2150:23620:6241,LH00995:25:23T55JLT4:3:2224:37502:8230,LH00995:25:23T55JLT4:3:2378:22285:26657,LH00995:25:23T55JLT4:3:2487:6323:14059 | . | YES_LDAS | 0.0747 | GT | 1.9656 | AG | 1.9086 | ["Klijn_CellLines","TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.16Mb]"] | chr11:102448812-chr11:102162456 | False | 1 | PASS | 22 | |||
| SRGAP2C--FCGR1B | 20 | 0 | 20.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | SRGAP2C^ENSG00000171943.12 | chr1:121324640:+ | FCGR1B^ENSG00000198019.13 | chr1:121092996:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1290:17585:1981,LH00995:25:23T55JLT4:1:1421:42097:7221,LH00995:25:23T55JLT4:1:1459:44548:26853,LH00995:25:23T55JLT4:1:2142:26306:5876,LH00995:25:23T55JLT4:1:2146:19429:11874,LH00995:25:23T55JLT4:1:2365:31572:18445,LH00995:25:23T55JLT4:1:2393:18159:27974,LH00995:25:23T55JLT4:1:2427:10247:5722,LH00995:25:23T55JLT4:1:2467:32130:28380,LH00995:25:23T55JLT4:1:2480:1170:19482,LH00995:25:23T55JLT4:2:1162:41976:18922,LH00995:25:23T55JLT4:2:2448:43125:14774,LH00995:25:23T55JLT4:2:2494:1405:3326,LH00995:25:23T55JLT4:3:1109:24688:8847,LH00995:25:23T55JLT4:3:1135:4867:11930,LH00995:25:23T55JLT4:3:1182:4835:16273,LH00995:25:23T55JLT4:3:1416:49224:26825,LH00995:25:23T55JLT4:3:1426:47809:6885,LH00995:25:23T55JLT4:3:2482:15408:22004,LH00995:25:23T55JLT4:3:2489:29590:27175 | . | YES_LDAS | 0.0679 | GT | 1.7968 | AG | 1.9329 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.09Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[87650]"] | chr1:121324640-chr1:121092996 | False | 1 | PASS | 20 | |||
| TMEM123--YAP1 | 19 | 0 | 19.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | YAP1^ENSG00000137693.14 | chr11:102186018:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1169:7699:26138,LH00995:25:23T55JLT4:1:1243:2311:13751,LH00995:25:23T55JLT4:1:1349:28773:11411,LH00995:25:23T55JLT4:1:2121:25901:1308,LH00995:25:23T55JLT4:1:2249:22034:17983,LH00995:25:23T55JLT4:1:2319:50179:5610,LH00995:25:23T55JLT4:1:2432:18135:29501,LH00995:25:23T55JLT4:2:1111:51587:14494,LH00995:25:23T55JLT4:2:1156:23968:9954,LH00995:25:23T55JLT4:2:1247:10166:11215,LH00995:25:23T55JLT4:2:1358:18474:11117,LH00995:25:23T55JLT4:2:2392:32931:21304,LH00995:25:23T55JLT4:3:1136:29574:24401,LH00995:25:23T55JLT4:3:1184:9130:12840,LH00995:25:23T55JLT4:3:1222:27090:19118,LH00995:25:23T55JLT4:3:1480:18968:15503,LH00995:25:23T55JLT4:3:2225:7650:17815,LH00995:25:23T55JLT4:3:2362:13564:28898,LH00995:25:23T55JLT4:3:2460:12747:6409 | . | YES_LDAS | 0.0645 | GT | 1.9656 | AG | 1.7819 | ["Klijn_CellLines","TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.16Mb]"] | chr11:102448812-chr11:102186018 | False | 1 | PASS | 19 | |||
| BIRC3--PDGFD | 19 | 0 | 19.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | BIRC3^ENSG00000023445.16 | chr11:102317571:+ | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000255:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1140:11541:22789,LH00995:25:23T55JLT4:1:2131:23676:26769,LH00995:25:23T55JLT4:1:2374:22560:5610,LH00995:25:23T55JLT4:2:1116:29728:5666,LH00995:25:23T55JLT4:2:1247:46692:25241,LH00995:25:23T55JLT4:2:1377:4422:7628,LH00995:25:23T55JLT4:2:1416:39290:24919,LH00995:25:23T55JLT4:2:1455:24388:19258,LH00995:25:23T55JLT4:2:2138:10053:18109,LH00995:25:23T55JLT4:2:2280:26524:23350,LH00995:25:23T55JLT4:2:2292:8305:29067,LH00995:25:23T55JLT4:2:2447:3993:25325,LH00995:25:23T55JLT4:2:2485:30593:24737,LH00995:25:23T55JLT4:3:1231:46733:12336,LH00995:25:23T55JLT4:3:1322:11331:16988,LH00995:25:23T55JLT4:3:2107:31289:2093,LH00995:25:23T55JLT4:3:2349:19251:24429,LH00995:25:23T55JLT4:3:2365:14551:7039,LH00995:25:23T55JLT4:3:2482:2302:24863 | . | YES_LDAS | 0.0645 | GT | 1.8323 | AG | 1.8323 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.57Mb]"] | chr11:102317571-chr11:104000255 | False | 1 | PASS | 19 | |||
| TLK2P1--AC110079.1 | 18 | 0 | 16.88 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | TLK2P1^ENSG00000226049.3 | chr17:34039043:- | AC110079.1^ENSG00000260404.3 | chr4:118595912:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1115:32891:27455,LH00995:25:23T55JLT4:1:1293:7666:20001,LH00995:25:23T55JLT4:1:1346:7383:15475,LH00995:25:23T55JLT4:1:1421:15869:17282,LH00995:25:23T55JLT4:1:2285:25909:9197,LH00995:25:23T55JLT4:1:2403:4042:24176,LH00995:25:23T55JLT4:1:2477:22430:13681,LH00995:25:23T55JLT4:2:1140:28166:28604,LH00995:25:23T55JLT4:2:1262:1825:2373,LH00995:25:23T55JLT4:2:2107:26912:6759,LH00995:25:23T55JLT4:2:2158:43181:23392,LH00995:25:23T55JLT4:2:2230:49953:10991,LH00995:25:23T55JLT4:2:2457:32438:9828,LH00995:25:23T55JLT4:3:1402:38295:14508,LH00995:25:23T55JLT4:3:2127:10676:19720,LH00995:25:23T55JLT4:3:2175:5166:5162,LH00995:25:23T55JLT4:3:2176:5021:23826,LH00995:25:23T55JLT4:3:2183:41102:9730 | . | YES_LDAS | 0.0573 | GT | 1.7465 | AG | 1.8892 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr4]"] | chr17:34039043-chr4:118595912 | False | 1 | PASS | 18 | |||
| PTPRM--TTC39C | 18 | 0 | 18.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | PTPRM^ENSG00000173482.17 | chr18:7567891:+ | TTC39C^ENSG00000168234.13 | chr18:24064140:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1225:9130:9870,LH00995:25:23T55JLT4:1:1301:44249:25493,LH00995:25:23T55JLT4:1:1395:10465:26166,LH00995:25:23T55JLT4:1:2293:10231:21696,LH00995:25:23T55JLT4:1:2343:15716:6927,LH00995:25:23T55JLT4:2:1138:34557:6493,LH00995:25:23T55JLT4:2:1169:37138:3564,LH00995:25:23T55JLT4:2:1190:30658:18627,LH00995:25:23T55JLT4:2:1347:29242:28450,LH00995:25:23T55JLT4:2:1359:28223:28870,LH00995:25:23T55JLT4:2:2144:17342:21122,LH00995:25:23T55JLT4:2:2266:51935:5764,LH00995:25:23T55JLT4:2:2316:43578:1911,LH00995:25:23T55JLT4:3:1426:32438:14284,LH00995:25:23T55JLT4:3:2172:32810:18235,LH00995:25:23T55JLT4:3:2376:42105:6311,LH00995:25:23T55JLT4:3:2416:7310:14116,LH00995:25:23T55JLT4:4:1115:14640:25886 | . | YES_LDAS | 0.0611 | GT | 1.9656 | AG | 1.7819 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:15.59Mb]"] | chr18:7567891-chr18:24064140 | False | 1 | PASS | 18 | |||
| PDCD1LG2--DYNC2H1 | 17 | 2 | 17.0 | 1.29 | ONLY_REF_SPLICE | PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 | chr9:5535050:+ | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103113537:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1102:37324:3214,LH00995:25:23T55JLT4:1:1125:25998:1645,LH00995:25:23T55JLT4:1:1312:50737:9435,LH00995:25:23T55JLT4:1:2244:51611:1813,LH00995:25:23T55JLT4:1:2412:13685:13135,LH00995:25:23T55JLT4:2:1202:19089:16946,LH00995:25:23T55JLT4:2:1233:4317:11677,LH00995:25:23T55JLT4:2:2115:49071:29165,LH00995:25:23T55JLT4:2:2137:23798:13835,LH00995:25:23T55JLT4:2:2271:8807:5722,LH00995:25:23T55JLT4:2:2473:32996:23854,LH00995:25:23T55JLT4:3:1262:38699:1252,LH00995:25:23T55JLT4:3:1342:12237:15419,LH00995:25:23T55JLT4:3:2290:47283:19454,LH00995:25:23T55JLT4:3:2366:5749:12112,LH00995:25:23T55JLT4:3:2409:49022:16750,LH00995:25:23T55JLT4:3:2449:14591:5176 | LH00995:25:23T55JLT4:1:1169:33829:28044,LH00995:25:23T55JLT4:3:2195:34541:29305 | YES_LDAS | 0.0621 | GT | 1.9219 | AG | 1.7819 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"] | chr9:5535050-chr11:103113537 | False | 1 | PASS | 19 | |||
| EIF4H--COL1A2 | 15 | 1 | 15.0 | 1.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | EIF4H^ENSG00000106682.16 | chr7:74195439:+ | COL1A2^ENSG00000164692.18 | chr7:94412068:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1140:36046:3606,LH00995:25:23T55JLT4:1:1266:41806:17394,LH00995:25:23T55JLT4:1:1272:38012:13961,LH00995:25:23T55JLT4:1:2103:1801:26236,LH00995:25:23T55JLT4:1:2174:9875:17941,LH00995:25:23T55JLT4:1:2226:37259:29361,LH00995:25:23T55JLT4:2:1113:28490:21430,LH00995:25:23T55JLT4:2:1335:40245:29123,LH00995:25:23T55JLT4:2:1352:4560:18515,LH00995:25:23T55JLT4:2:1495:25844:8861,LH00995:25:23T55JLT4:2:2259:9915:4475,LH00995:25:23T55JLT4:3:1293:39533:23602,LH00995:25:23T55JLT4:3:1487:29558:18403,LH00995:25:23T55JLT4:3:2416:40609:23476,LH00995:25:23T55JLT4:3:2431:6218:9646 | LH00995:25:23T55JLT4:2:2257:7512:28898 | YES_LDAS | 0.0543 | GT | 1.9329 | AG | 1.5656 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:20.20Mb]"] | chr7:74195439-chr7:94412068 | False | 1 | PASS | 16 | |||
| TMEM123--PDGFD | 14 | 0 | 14.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000237:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1129:42008:27105,LH00995:25:23T55JLT4:1:1492:37348:28170,LH00995:25:23T55JLT4:1:2122:38441:27707,LH00995:25:23T55JLT4:1:2150:9527:8034,LH00995:25:23T55JLT4:1:2484:48682:12798,LH00995:25:23T55JLT4:1:2496:27123:29095,LH00995:25:23T55JLT4:2:1308:31378:12952,LH00995:25:23T55JLT4:2:1331:10894:5470,LH00995:25:23T55JLT4:2:2349:28692:8721,LH00995:25:23T55JLT4:3:1340:48796:8931,LH00995:25:23T55JLT4:3:2123:40075:4083,LH00995:25:23T55JLT4:3:2176:8046:26460,LH00995:25:23T55JLT4:3:2215:9761:15755,LH00995:25:23T55JLT4:3:2265:45697:17829 | . | YES_LDAS | 0.0475 | GT | 1.9656 | AG | 1.9656 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]"] | chr11:102448812-chr11:104000237 | False | 1 | PASS | 14 | |||
| TPTE--BAGE2 | 12 | 0 | 5.96 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TPTE^ENSG00000274391.5 | chr21:10527412:+ | BAGE2^ENSG00000187172.15 | chr21:10514122:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1189:29372:17156,LH00995:25:23T55JLT4:1:1318:11695:11257,LH00995:25:23T55JLT4:1:2244:21783:9562,LH00995:25:23T55JLT4:1:2455:33926:5232,LH00995:25:23T55JLT4:2:1190:33829:17254,LH00995:25:23T55JLT4:2:1191:25100:12000,LH00995:25:23T55JLT4:2:1365:48739:4097,LH00995:25:23T55JLT4:2:2284:45738:26222,LH00995:25:23T55JLT4:2:2356:24874:16736,LH00995:25:23T55JLT4:3:1186:32470:14480,LH00995:25:23T55JLT4:3:1322:42631:11537,LH00995:25:23T55JLT4:3:1330:14575:1897 | . | YES_LDAS | 0.0202 | GT | 1.9656 | AG | 1.7819 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]"] | chr21:10527412-chr21:10514122 | False | 1 | PASS | 12 | |||
| TMEFF2--TEX41 | 11 | 0 | 11.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEFF2^ENSG00000144339.12 | chr2:191998262:- | TEX41^ENSG00000226674.11 | chr2:144667969:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1331:10295:17408,LH00995:25:23T55JLT4:1:2213:34331:20393,LH00995:25:23T55JLT4:2:1253:22600:3550,LH00995:25:23T55JLT4:2:1414:45576:16750,LH00995:25:23T55JLT4:2:2157:5530:11061,LH00995:25:23T55JLT4:3:1329:24404:12896,LH00995:25:23T55JLT4:3:2113:30844:26853,LH00995:25:23T55JLT4:3:2117:37421:25381,LH00995:25:23T55JLT4:3:2170:40301:23252,LH00995:25:23T55JLT4:4:1125:36750:23238,LH00995:25:23T55JLT4:4:1137:41232:17240 | . | YES_LDAS | 0.0373 | GT | 1.8892 | AG | 1.8892 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:46.69Mb]"] | chr2:191998262-chr2:144667969 | False | 1 | PASS | 11 | |||
| PDGFD--DYNC2H1 | 11 | 1 | 11.0 | 1.0 | ONLY_REF_SPLICE | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:103926912:- | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103468589:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:2194:48351:28955,LH00995:25:23T55JLT4:1:2194:48359:28969,LH00995:25:23T55JLT4:2:1480:11396:29151,LH00995:25:23T55JLT4:2:2109:41604:13457,LH00995:25:23T55JLT4:2:2417:4374:18333,LH00995:25:23T55JLT4:2:2447:44937:19230,LH00995:25:23T55JLT4:3:1176:45050:2191,LH00995:25:23T55JLT4:3:1252:32211:27343,LH00995:25:23T55JLT4:3:1409:30488:3929,LH00995:25:23T55JLT4:3:2325:43739:10402,LH00995:25:23T55JLT4:3:2440:9074:22579 | LH00995:25:23T55JLT4:2:2461:41984:8090 | YES_LDAS | 0.0407 | GT | 1.6729 | AG | 1.8892 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.43Mb]"] | chr11:103926912-chr11:103468589 | False | 1 | PASS | 12 | |||
| TMEM123--PPP2R2C | 10 | 0 | 10.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PPP2R2C^ENSG00000074211.14 | chr4:6381094:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:2325:50211:12280,LH00995:25:23T55JLT4:1:2336:12148:24344,LH00995:25:23T55JLT4:1:2392:1421:22046,LH00995:25:23T55JLT4:2:1162:46684:8188,LH00995:25:23T55JLT4:2:2358:34096:28030,LH00995:25:23T55JLT4:2:2469:39783:9968,LH00995:25:23T55JLT4:3:1150:18911:17899,LH00995:25:23T55JLT4:3:1182:16403:1897,LH00995:25:23T55JLT4:3:1241:26362:3368,LH00995:25:23T55JLT4:3:1358:28919:16456 | . | YES_LDAS | 0.0339 | GT | 1.9656 | AG | 1.8256 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr4]"] | chr11:102448812-chr4:6381094 | False | 1 | PASS | 10 | |||
| TMEFF2--TEX41 | 9 | 0 | 9.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEFF2^ENSG00000144339.12 | chr2:191998262:- | TEX41^ENSG00000226674.11 | chr2:144768098:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:2166:21508:9449,LH00995:25:23T55JLT4:1:2264:15109:13863,LH00995:25:23T55JLT4:1:2377:2489:25914,LH00995:25:23T55JLT4:2:1217:39428:21402,LH00995:25:23T55JLT4:2:1277:49378:1729,LH00995:25:23T55JLT4:2:2192:23102:16077,LH00995:25:23T55JLT4:2:2197:43464:10711,LH00995:25:23T55JLT4:3:1246:40325:5610,LH00995:25:23T55JLT4:3:2474:8710:23125 | . | YES_LDAS | 0.0305 | GT | 1.8892 | AG | 1.9219 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:46.69Mb]"] | chr2:191998262-chr2:144768098 | False | 1 | PASS | 9 | |||
| TLK2--AC240565.1 | 9 | 0 | 1.19 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TLK2^ENSG00000146872.18 | chr17:62560126:+ | AC240565.1^ENSG00000280136.2 | chr17:106864:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1115:37955:1224,LH00995:25:23T55JLT4:1:2349:5110:21066,LH00995:25:23T55JLT4:3:1281:47736:28562,LH00995:25:23T55JLT4:3:2175:5166:5162,LH00995:25:23T55JLT4:3:2176:5021:23826,LH00995:25:23T55JLT4:3:2183:41102:9730,LH00995:25:23T55JLT4:3:2230:31273:15208,LH00995:25:23T55JLT4:3:2435:26362:17885,LH00995:25:23T55JLT4:4:1132:47526:9702 | . | YES_LDAS | 0.004 | GT | 1.8892 | AG | 1.8892 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr17:62.34Mb]"] | chr17:62560126-chr17:106864 | False | 1 | PASS | 9 | |||
| FLG-AS1--ARHGAP32 | 9 | 0 | 9.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | FLG-AS1^ENSG00000237975.7 | chr1:152251758:+ | ARHGAP32^ENSG00000134909.18 | chr11:128998468:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:2148:49160:21136,LH00995:25:23T55JLT4:1:2392:49532:22425,LH00995:25:23T55JLT4:2:1122:14446:3410,LH00995:25:23T55JLT4:2:1129:7189:22481,LH00995:25:23T55JLT4:2:2330:23652:12322,LH00995:25:23T55JLT4:2:2483:9236:29305,LH00995:25:23T55JLT4:3:1106:50478:14116,LH00995:25:23T55JLT4:3:1142:51182:6815,LH00995:25:23T55JLT4:3:2113:40997:12350 | . | YES_LDAS | 0.0305 | GT | 1.8256 | AG | 1.9219 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr11]"] | chr1:152251758-chr11:128998468 | False | 1 | PASS | 9 | |||
| TVP23C--CDRT4 | 8 | 0 | 8.0 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | TVP23C^ENSG00000175106.17 | chr17:15503098:- | CDRT4^ENSG00000239704.11 | chr17:15438200:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:2287:39921:24134,LH00995:25:23T55JLT4:1:2359:15149:28562,LH00995:25:23T55JLT4:2:1156:40520:4769,LH00995:25:23T55JLT4:2:1261:28959:16582,LH00995:25:23T55JLT4:2:2168:44775:7460,LH00995:25:23T55JLT4:2:2253:37672:16624,LH00995:25:23T55JLT4:3:1476:24849:3214,LH00995:25:23T55JLT4:3:2476:18482:15643 | . | YES_LDAS | 0.0272 | GT | 1.9329 | AG | 1.6402 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.03Mb]","NEIGHBORS[26536]"] | chr17:15503098-chr17:15438200 | False | 1 | PASS | 8 |
37 rows