#FusionName JunctionReadCount SpanningFragCount est_J est_S SpliceType LeftGene LeftBreakpoint RightGene RightBreakpoint JunctionReads SpanningFrags LargeAnchorSupport FFPM LeftBreakDinuc LeftBreakEntropy RightBreakDinuc RightBreakEntropy annots HLA-C--MUC16 160 0 160.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE HLA-C^ENSG00000204525.17 chr6:31269489:- MUC16^ENSG00000181143.15 chr19:8848985:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1104:10659:27960,LH00995:25:23T55JLT4:1:1106:48537:7670,LH00995:25:23T55JLT4:1:1109:18847:8679,LH00995:25:23T55JLT4:1:1112:45406:9477,LH00995:25:23T55JLT4:1:1114:12504:14760,LH00995:25:23T55JLT4:1:1143:35205:18627,LH00995:25:23T55JLT4:1:1168:14405:4881,LH00995:25:23T55JLT4:1:1173:23498:22593,LH00995:25:23T55JLT4:1:1173:25586:18277,LH00995:25:23T55JLT4:1:1180:52072:3424,LH00995:25:23T55JLT4:1:1181:21541:10038,LH00995:25:23T55JLT4:1:1183:29404:11271,LH00995:25:23T55JLT4:1:1186:34493:7278,LH00995:25:23T55JLT4:1:1190:4228:26320,LH00995:25:23T55JLT4:1:1192:21727:9940,LH00995:25:23T55JLT4:1:1193:30634:18529,LH00995:25:23T55JLT4:1:1194:9414:26671,LH00995:25:23T55JLT4:1:1207:14268:6633,LH00995:25:23T55JLT4:1:1213:16881:6199,LH00995:25:23T55JLT4:1:1220:25577:25325,LH00995:25:23T55JLT4:1:1241:29647:5414,LH00995:25:23T55JLT4:1:1247:4956:22985,LH00995:25:23T55JLT4:1:1260:25626:9351,LH00995:25:23T55JLT4:1:1269:8702:4223,LH00995:25:23T55JLT4:1:1286:48917:5778,LH00995:25:23T55JLT4:1:1295:29315:9239,LH00995:25:23T55JLT4:1:1306:10821:28688,LH00995:25:23T55JLT4:1:1315:32883:20183,LH00995:25:23T55JLT4:1:1323:2982:16259,LH00995:25:23T55JLT4:1:1332:31524:27609,LH00995:25:23T55JLT4:1:1347:19664:8777,LH00995:25:23T55JLT4:1:1357:24785:3859,LH00995:25:23T55JLT4:1:1358:4446:17983,LH00995:25:23T55JLT4:1:1361:13637:28548,LH00995:25:23T55JLT4:1:1389:37267:28310,LH00995:25:23T55JLT4:1:1392:41652:1715,LH00995:25:23T55JLT4:1:1395:38076:18754,LH00995:25:23T55JLT4:1:1401:37001:17198,LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:27268:3256,LH00995:25:23T55JLT4:1:1418:37041:3256,LH00995:25:23T55JLT4:1:1419:38910:18992,LH00995:25:23T55JLT4:1:1421:28838:10318,LH00995:25:23T55JLT4:1:1490:24453:8356,LH00995:25:23T55JLT4:1:1493:46037:27777,LH00995:25:23T55JLT4:1:2105:18709:12756,LH00995:25:23T55JLT4:1:2124:10878:27273,LH00995:25:23T55JLT4:1:2124:24542:24148,LH00995:25:23T55JLT4:1:2127:32025:12616,LH00995:25:23T55JLT4:1:2130:48068:26222,LH00995:25:23T55JLT4:1:2136:36499:20337,LH00995:25:23T55JLT4:1:2137:1890:24905,LH00995:25:23T55JLT4:1:2141:9559:10080,LH00995:25:23T55JLT4:1:2163:15441:23518,LH00995:25:23T55JLT4:1:2184:44233:22915,LH00995:25:23T55JLT4:1:2205:24866:25914,LH00995:25:23T55JLT4:1:2234:37567:28436,LH00995:25:23T55JLT4:1:2249:29978:11313,LH00995:25:23T55JLT4:1:2251:34751:8118,LH00995:25:23T55JLT4:1:2269:8783:8931,LH00995:25:23T55JLT4:1:2273:6089:2948,LH00995:25:23T55JLT4:1:2307:14348:9155,LH00995:25:23T55JLT4:1:2308:4762:13737,LH00995:25:23T55JLT4:1:2315:34873:10570,LH00995:25:23T55JLT4:1:2327:20869:23504,LH00995:25:23T55JLT4:1:2338:13766:11593,LH00995:25:23T55JLT4:1:2347:34460:21262,LH00995:25:23T55JLT4:1:2372:39508:18039,LH00995:25:23T55JLT4:1:2386:47429:22649,LH00995:25:23T55JLT4:1:2390:33158:13261,LH00995:25:23T55JLT4:1:2392:9106:22439,LH00995:25:23T55JLT4:1:2396:25634:6339,LH00995:25:23T55JLT4:1:2427:13281:14116,LH00995:25:23T55JLT4:1:2429:25100:15671,LH00995:25:23T55JLT4:1:2447:35342:7740,LH00995:25:23T55JLT4:1:2465:50640:20813,LH00995:25:23T55JLT4:1:2485:24154:5232,LH00995:25:23T55JLT4:1:2490:6493:29599,LH00995:25:23T55JLT4:1:2496:3168:20785,LH00995:25:23T55JLT4:2:1102:46336:24569,LH00995:25:23T55JLT4:2:1111:28409:19861,LH00995:25:23T55JLT4:2:1114:3459:22887,LH00995:25:23T55JLT4:2:1114:35836:4783,LH00995:25:23T55JLT4:2:1125:9786:24120,LH00995:25:23T55JLT4:2:1139:20092:28324,LH00995:25:23T55JLT4:2:1139:21427:18557,LH00995:25:23T55JLT4:2:1159:39751:19440,LH00995:25:23T55JLT4:2:1168:34986:28590,LH00995:25:23T55JLT4:2:1191:51668:14690,LH00995:25:23T55JLT4:2:1208:27414:19594,LH00995:25:23T55JLT4:2:1238:23862:16442,LH00995:25:23T55JLT4:2:1256:25836:5484,LH00995:25:23T55JLT4:2:1256:29372:1911,LH00995:25:23T55JLT4:2:1260:35253:16582,LH00995:25:23T55JLT4:2:1281:19073:22187,LH00995:25:23T55JLT4:2:1301:30601:14858,LH00995:25:23T55JLT4:2:1315:37826:11902,LH00995:25:23T55JLT4:2:1346:2230:2261,LH00995:25:23T55JLT4:2:1363:17924:20954,LH00995:25:23T55JLT4:2:1367:15667:22957,LH00995:25:23T55JLT4:2:1419:30682:17380,LH00995:25:23T55JLT4:2:1439:3621:25802,LH00995:25:23T55JLT4:2:1440:12900:4573,LH00995:25:23T55JLT4:2:1452:1178:13303,LH00995:25:23T55JLT4:2:1456:37454:21878,LH00995:25:23T55JLT4:2:1485:22689:22929,LH00995:25:23T55JLT4:2:2117:9470:1603,LH00995:25:23T55JLT4:2:2127:23919:22201,LH00995:25:23T55JLT4:2:2149:42340:27848,LH00995:25:23T55JLT4:2:2163:33870:25283,LH00995:25:23T55JLT4:2:2166:28919:21360,LH00995:25:23T55JLT4:2:2166:41126:19692,LH00995:25:23T55JLT4:2:2191:33983:20463,LH00995:25:23T55JLT4:2:2257:24995:7642,LH00995:25:23T55JLT4:2:2257:38182:24737,LH00995:25:23T55JLT4:2:2265:13661:20939,LH00995:25:23T55JLT4:2:2327:17876:15713,LH00995:25:23T55JLT4:2:2357:43926:12658,LH00995:25:23T55JLT4:2:2370:39371:25423,LH00995:25:23T55JLT4:2:2454:51393:24835,LH00995:25:23T55JLT4:2:2477:1623:13401,LH00995:25:23T55JLT4:2:2497:50567:17212,LH00995:25:23T55JLT4:3:1132:12892:6941,LH00995:25:23T55JLT4:3:1188:13426:10725,LH00995:25:23T55JLT4:3:1188:30860:15194,LH00995:25:23T55JLT4:3:1258:16573:2359,LH00995:25:23T55JLT4:3:1321:8143:4013,LH00995:25:23T55JLT4:3:1344:10158:3999,LH00995:25:23T55JLT4:3:1355:41563:15545,LH00995:25:23T55JLT4:3:1393:46247:29403,LH00995:25:23T55JLT4:3:1396:26079:24849,LH00995:25:23T55JLT4:3:1452:26613:17563,LH00995:25:23T55JLT4:3:1464:15983:1869,LH00995:25:23T55JLT4:3:2112:9219:23644,LH00995:25:23T55JLT4:3:2128:19283:21122,LH00995:25:23T55JLT4:3:2182:36369:4615,LH00995:25:23T55JLT4:3:2240:9713:17492,LH00995:25:23T55JLT4:3:2298:3937:10150,LH00995:25:23T55JLT4:3:2328:41490:19678,LH00995:25:23T55JLT4:3:2333:10352:5596,LH00995:25:23T55JLT4:3:2347:26484:11201,LH00995:25:23T55JLT4:3:2350:37219:17436,LH00995:25:23T55JLT4:3:2415:10935:13723,LH00995:25:23T55JLT4:3:2422:22204:22004,LH00995:25:23T55JLT4:4:1110:27220:7123,LH00995:25:23T55JLT4:4:1191:1655:18361,LH00995:25:23T55JLT4:4:1205:29606:17535,LH00995:25:23T55JLT4:4:1242:42477:9646,LH00995:25:23T55JLT4:4:1366:28943:6969,LH00995:25:23T55JLT4:4:1369:40609:29053,LH00995:25:23T55JLT4:4:1370:21565:3774,LH00995:25:23T55JLT4:4:1380:32600:7362,LH00995:25:23T55JLT4:4:2101:24162:14270,LH00995:25:23T55JLT4:4:2167:26670:10374,LH00995:25:23T55JLT4:4:2288:24275:10122,LH00995:25:23T55JLT4:4:2294:14680:1238,LH00995:25:23T55JLT4:4:2327:44896:4027,LH00995:25:23T55JLT4:4:2351:8176:10626,LH00995:25:23T55JLT4:4:2384:27996:23350,LH00995:25:23T55JLT4:4:2435:13143:23434,LH00995:25:23T55JLT4:4:2476:3565:6787 . NO_LDAS 0.5418 GT 1.9656 AG 1.8062 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr19]"] HLA-A--C12orf40 137 0 135.49 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE HLA-A^ENSG00000206503.13 chr6:29942951:+ C12orf40^ENSG00000180116.15 chr12:39716794:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1105:23628:14017,LH00995:25:23T55JLT4:1:1136:32260:2906,LH00995:25:23T55JLT4:1:1137:3330:24204,LH00995:25:23T55JLT4:1:1141:29598:2583,LH00995:25:23T55JLT4:1:1157:46822:4195,LH00995:25:23T55JLT4:1:1169:49807:23013,LH00995:25:23T55JLT4:1:1173:4794:28786,LH00995:25:23T55JLT4:1:1177:9519:11019,LH00995:25:23T55JLT4:1:1180:1971:28296,LH00995:25:23T55JLT4:1:1193:47315:11047,LH00995:25:23T55JLT4:1:1193:5320:24513,LH00995:25:23T55JLT4:1:1198:45956:3312,LH00995:25:23T55JLT4:1:1207:18507:24961,LH00995:25:23T55JLT4:1:1207:7197:4727,LH00995:25:23T55JLT4:1:1249:51579:12490,LH00995:25:23T55JLT4:1:1251:1631:10388,LH00995:25:23T55JLT4:1:1253:39719:8483,LH00995:25:23T55JLT4:1:1258:48488:19328,LH00995:25:23T55JLT4:1:1270:45835:6325,LH00995:25:23T55JLT4:1:1294:13297:18964,LH00995:25:23T55JLT4:1:1301:3637:27511,LH00995:25:23T55JLT4:1:1303:21621:21332,LH00995:25:23T55JLT4:1:1314:33862:4895,LH00995:25:23T55JLT4:1:1331:42777:6409,LH00995:25:23T55JLT4:1:1354:49144:2191,LH00995:25:23T55JLT4:1:1362:3896:25241,LH00995:25:23T55JLT4:1:1381:15837:22691,LH00995:25:23T55JLT4:1:1393:25788:14144,LH00995:25:23T55JLT4:1:1410:15983:29585,LH00995:25:23T55JLT4:1:1427:51813:18417,LH00995:25:23T55JLT4:1:1442:19025:29473,LH00995:25:23T55JLT4:1:1468:28102:25634,LH00995:25:23T55JLT4:1:2111:14429:15965,LH00995:25:23T55JLT4:1:2131:33959:8174,LH00995:25:23T55JLT4:1:2151:27042:12420,LH00995:25:23T55JLT4:1:2162:19720:11902,LH00995:25:23T55JLT4:1:2162:51239:11201,LH00995:25:23T55JLT4:1:2185:31693:1869,LH00995:25:23T55JLT4:1:2204:8362:11986,LH00995:25:23T55JLT4:1:2207:45511:1645,LH00995:25:23T55JLT4:1:2226:9422:6030,LH00995:25:23T55JLT4:1:2227:26750:4181,LH00995:25:23T55JLT4:1:2234:36903:22327,LH00995:25:23T55JLT4:1:2235:31936:2429,LH00995:25:23T55JLT4:1:2238:29550:23013,LH00995:25:23T55JLT4:1:2244:42817:26628,LH00995:25:23T55JLT4:1:2252:36256:3746,LH00995:25:23T55JLT4:1:2260:52185:18249,LH00995:25:23T55JLT4:1:2260:8038:20729,LH00995:25:23T55JLT4:1:2266:47348:20743,LH00995:25:23T55JLT4:1:2266:51878:18529,LH00995:25:23T55JLT4:1:2321:44945:4811,LH00995:25:23T55JLT4:1:2337:25893:3957,LH00995:25:23T55JLT4:1:2339:6525:8441,LH00995:25:23T55JLT4:1:2371:20084:27497,LH00995:25:23T55JLT4:2:1112:13078:14858,LH00995:25:23T55JLT4:2:1112:46280:9758,LH00995:25:23T55JLT4:2:1145:13216:12546,LH00995:25:23T55JLT4:2:1155:51927:10598,LH00995:25:23T55JLT4:2:1161:26953:5456,LH00995:25:23T55JLT4:2:1164:6606:3004,LH00995:25:23T55JLT4:2:1168:45649:12756,LH00995:25:23T55JLT4:2:1171:37405:23784,LH00995:25:23T55JLT4:2:1205:26022:21668,LH00995:25:23T55JLT4:2:1258:46846:20911,LH00995:25:23T55JLT4:2:1270:12690:9253,LH00995:25:23T55JLT4:2:1275:21346:9758,LH00995:25:23T55JLT4:2:1279:36677:16918,LH00995:25:23T55JLT4:2:1287:13904:15531,LH00995:25:23T55JLT4:2:1289:38845:14676,LH00995:25:23T55JLT4:2:1336:13273:28310,LH00995:25:23T55JLT4:2:1364:44330:3606,LH00995:25:23T55JLT4:2:1413:20683:12084,LH00995:25:23T55JLT4:2:1416:6113:26026,LH00995:25:23T55JLT4:2:1445:38740:19790,LH00995:25:23T55JLT4:2:1476:33756:8244,LH00995:25:23T55JLT4:2:2129:22811:23812,LH00995:25:23T55JLT4:2:2132:2400:27665,LH00995:25:23T55JLT4:2:2141:39889:25648,LH00995:25:23T55JLT4:2:2262:46021:6423,LH00995:25:23T55JLT4:2:2277:27624:9085,LH00995:25:23T55JLT4:2:2280:14980:20001,LH00995:25:23T55JLT4:2:2293:2036:6689,LH00995:25:23T55JLT4:2:2294:25294:5050,LH00995:25:23T55JLT4:2:2322:30561:5960,LH00995:25:23T55JLT4:2:2380:8532:24162,LH00995:25:23T55JLT4:2:2407:7893:10164,LH00995:25:23T55JLT4:2:2450:31014:27035,LH00995:25:23T55JLT4:3:1122:38853:26376,LH00995:25:23T55JLT4:3:1148:9535:17689,LH00995:25:23T55JLT4:3:1179:43917:11832,LH00995:25:23T55JLT4:3:1329:11841:12322,LH00995:25:23T55JLT4:3:1368:18135:11958,LH00995:25:23T55JLT4:3:1390:49993:5736,LH00995:25:23T55JLT4:3:1405:47720:21472,LH00995:25:23T55JLT4:3:1439:17771:25087,LH00995:25:23T55JLT4:3:1458:51846:8020,LH00995:25:23T55JLT4:3:2119:43278:21878,LH00995:25:23T55JLT4:3:2124:9082:16119,LH00995:25:23T55JLT4:3:2136:32648:4559,LH00995:25:23T55JLT4:3:2140:30140:13527,LH00995:25:23T55JLT4:3:2146:38400:12476,LH00995:25:23T55JLT4:3:2189:18644:4321,LH00995:25:23T55JLT4:3:2190:40981:9463,LH00995:25:23T55JLT4:3:2282:37640:24274,LH00995:25:23T55JLT4:3:2360:33214:18347,LH00995:25:23T55JLT4:3:2388:46814:18529,LH00995:25:23T55JLT4:3:2394:42688:24106,LH00995:25:23T55JLT4:3:2443:16306:14956,LH00995:25:23T55JLT4:3:2446:18078:23209,LH00995:25:23T55JLT4:3:2491:15700:19678,LH00995:25:23T55JLT4:4:1102:49653:7362,LH00995:25:23T55JLT4:4:1129:16727:23588,LH00995:25:23T55JLT4:4:1143:1316:15923,LH00995:25:23T55JLT4:4:1144:33425:23952,LH00995:25:23T55JLT4:4:1250:35900:7670,LH00995:25:23T55JLT4:4:1304:49831:4811,LH00995:25:23T55JLT4:4:1312:9761:21192,LH00995:25:23T55JLT4:4:1313:45446:28884,LH00995:25:23T55JLT4:4:1356:19041:8763,LH00995:25:23T55JLT4:4:1370:8750:18684,LH00995:25:23T55JLT4:4:1413:49241:19594,LH00995:25:23T55JLT4:4:1444:43084:21822,LH00995:25:23T55JLT4:4:1447:14745:9477,LH00995:25:23T55JLT4:4:1482:44338:15447,LH00995:25:23T55JLT4:4:2184:10239:19524,LH00995:25:23T55JLT4:4:2195:52096:27595,LH00995:25:23T55JLT4:4:2206:48796:5260,LH00995:25:23T55JLT4:4:2212:10918:14031,LH00995:25:23T55JLT4:4:2220:46296:7852,LH00995:25:23T55JLT4:4:2248:46183:3620,LH00995:25:23T55JLT4:4:2271:49038:21514,LH00995:25:23T55JLT4:4:2295:35018:25087,LH00995:25:23T55JLT4:4:2311:17649:10164,LH00995:25:23T55JLT4:4:2369:19122:10921,LH00995:25:23T55JLT4:4:2389:29056:1140,LH00995:25:23T55JLT4:4:2457:39330:23392 . NO_LDAS 0.4588 AT 1.5656 AC 1.7056 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr12]"] HLA-C--NUMA1 124 0 124.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE HLA-C^ENSG00000204525.17 chr6:31269493:- NUMA1^ENSG00000137497.18 chr11:72013673:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1103:42526:20407,LH00995:25:23T55JLT4:1:1119:18847:4391,LH00995:25:23T55JLT4:1:1133:42987:28492,LH00995:25:23T55JLT4:1:1148:21055:27413,LH00995:25:23T55JLT4:1:1164:30561:23364,LH00995:25:23T55JLT4:1:1166:41774:27623,LH00995:25:23T55JLT4:1:1168:38570:3830,LH00995:25:23T55JLT4:1:1173:31459:17520,LH00995:25:23T55JLT4:1:1180:21217:23294,LH00995:25:23T55JLT4:1:1188:27438:11537,LH00995:25:23T55JLT4:1:1224:27762:24260,LH00995:25:23T55JLT4:1:1236:17876:7053,LH00995:25:23T55JLT4:1:1247:18612:25507,LH00995:25:23T55JLT4:1:1255:29590:2233,LH00995:25:23T55JLT4:1:1278:12561:27217,LH00995:25:23T55JLT4:1:1313:10676:26250,LH00995:25:23T55JLT4:1:1316:32794:28744,LH00995:25:23T55JLT4:1:1317:3516:13681,LH00995:25:23T55JLT4:1:1330:25545:7726,LH00995:25:23T55JLT4:1:1341:35439:9113,LH00995:25:23T55JLT4:1:1350:7019:11285,LH00995:25:23T55JLT4:1:1356:8079:6002,LH00995:25:23T55JLT4:1:1379:20133:14045,LH00995:25:23T55JLT4:1:1387:29533:13429,LH00995:25:23T55JLT4:1:1398:41175:19804,LH00995:25:23T55JLT4:1:1416:26225:21514,LH00995:25:23T55JLT4:1:1418:40366:16133,LH00995:25:23T55JLT4:1:1460:31782:3060,LH00995:25:23T55JLT4:1:1476:38028:10570,LH00995:25:23T55JLT4:1:1486:20246:18389,LH00995:25:23T55JLT4:1:2110:15230:17128,LH00995:25:23T55JLT4:1:2113:31313:2471,LH00995:25:23T55JLT4:1:2123:16953:10164,LH00995:25:23T55JLT4:1:2131:35908:25143,LH00995:25:23T55JLT4:1:2132:13507:12966,LH00995:25:23T55JLT4:1:2136:11282:26657,LH00995:25:23T55JLT4:1:2191:32543:27413,LH00995:25:23T55JLT4:1:2201:44589:1084,LH00995:25:23T55JLT4:1:2238:7262:20001,LH00995:25:23T55JLT4:1:2241:20901:8959,LH00995:25:23T55JLT4:1:2268:17188:10570,LH00995:25:23T55JLT4:1:2274:21872:11425,LH00995:25:23T55JLT4:1:2304:40253:6185,LH00995:25:23T55JLT4:1:2334:42769:9814,LH00995:25:23T55JLT4:1:2341:4414:3018,LH00995:25:23T55JLT4:1:2348:51546:9940,LH00995:25:23T55JLT4:1:2379:9406:23294,LH00995:25:23T55JLT4:1:2403:25262:21416,LH00995:25:23T55JLT4:1:2432:43481:28646,LH00995:25:23T55JLT4:1:2433:29129:18838,LH00995:25:23T55JLT4:1:2444:38489:19328,LH00995:25:23T55JLT4:2:1108:27608:25816,LH00995:25:23T55JLT4:2:1125:37421:24877,LH00995:25:23T55JLT4:2:1196:2125:13121,LH00995:25:23T55JLT4:2:1202:2594:4713,LH00995:25:23T55JLT4:2:1209:14373:24078,LH00995:25:23T55JLT4:2:1288:21565:24092,LH00995:25:23T55JLT4:2:1328:24817:16610,LH00995:25:23T55JLT4:2:1362:38594:26068,LH00995:25:23T55JLT4:2:1391:27907:22775,LH00995:25:23T55JLT4:2:1410:21500:2569,LH00995:25:23T55JLT4:2:1438:27754:8076,LH00995:25:23T55JLT4:2:1491:27220:25760,LH00995:25:23T55JLT4:2:1498:35965:22999,LH00995:25:23T55JLT4:2:2102:28409:1280,LH00995:25:23T55JLT4:2:2110:17544:25676,LH00995:25:23T55JLT4:2:2111:10004:20127,LH00995:25:23T55JLT4:2:2140:16460:7151,LH00995:25:23T55JLT4:2:2184:11614:20085,LH00995:25:23T55JLT4:2:2204:42057:20659,LH00995:25:23T55JLT4:2:2234:44193:20771,LH00995:25:23T55JLT4:2:2268:4390:15251,LH00995:25:23T55JLT4:2:2275:3508:9183,LH00995:25:23T55JLT4:2:2290:46320:28548,LH00995:25:23T55JLT4:2:2298:34185:24709,LH00995:25:23T55JLT4:2:2316:28676:29627,LH00995:25:23T55JLT4:2:2353:2925:5232,LH00995:25:23T55JLT4:2:2368:25674:21514,LH00995:25:23T55JLT4:2:2442:24024:25634,LH00995:25:23T55JLT4:2:2465:11363:9421,LH00995:25:23T55JLT4:2:2482:22819:24246,LH00995:25:23T55JLT4:3:1113:1413:21892,LH00995:25:23T55JLT4:3:1130:17649:15881,LH00995:25:23T55JLT4:3:1169:4042:19076,LH00995:25:23T55JLT4:3:1182:19882:28380,LH00995:25:23T55JLT4:3:1255:5272:29501,LH00995:25:23T55JLT4:3:1301:16962:12168,LH00995:25:23T55JLT4:3:1353:34727:22593,LH00995:25:23T55JLT4:3:1355:41766:26124,LH00995:25:23T55JLT4:3:1366:38570:5764,LH00995:25:23T55JLT4:3:1395:6356:4055,LH00995:25:23T55JLT4:3:1411:38303:28674,LH00995:25:23T55JLT4:3:1473:44557:12014,LH00995:25:23T55JLT4:3:1480:31249:28142,LH00995:25:23T55JLT4:3:1494:34112:22060,LH00995:25:23T55JLT4:3:2126:12310:26671,LH00995:25:23T55JLT4:3:2184:35156:25914,LH00995:25:23T55JLT4:3:2270:25181:4965,LH00995:25:23T55JLT4:3:2294:5045:4615,LH00995:25:23T55JLT4:3:2325:28166:26923,LH00995:25:23T55JLT4:3:2333:27422:27735,LH00995:25:23T55JLT4:3:2356:6364:19090,LH00995:25:23T55JLT4:3:2361:23183:15769,LH00995:25:23T55JLT4:3:2373:34501:29207,LH00995:25:23T55JLT4:3:2417:41741:27483,LH00995:25:23T55JLT4:4:1157:35358:8104,LH00995:25:23T55JLT4:4:1201:30278:5330,LH00995:25:23T55JLT4:4:1218:5328:16091,LH00995:25:23T55JLT4:4:1254:48157:26685,LH00995:25:23T55JLT4:4:1263:17730:11930,LH00995:25:23T55JLT4:4:1308:37963:8497,LH00995:25:23T55JLT4:4:1335:39565:25956,LH00995:25:23T55JLT4:4:1343:46166:11215,LH00995:25:23T55JLT4:4:1386:31750:13541,LH00995:25:23T55JLT4:4:1445:2861:5008,LH00995:25:23T55JLT4:4:1453:22641:10935,LH00995:25:23T55JLT4:4:2218:30456:2107,LH00995:25:23T55JLT4:4:2244:10918:26166,LH00995:25:23T55JLT4:4:2275:17811:4195,LH00995:25:23T55JLT4:4:2357:25537:20799,LH00995:25:23T55JLT4:4:2386:30351:2766,LH00995:25:23T55JLT4:4:2407:6420:14564,LH00995:25:23T55JLT4:4:2443:9017:7852,LH00995:25:23T55JLT4:4:2458:30852:16582 . NO_LDAS 0.4199 GT 1.8256 AG 1.7819 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr11]"] AC092807.3--DDAH1 96 1 96.00 1.00 ONLY_REF_SPLICE AC092807.3^ENSG00000282057.1 chr1:85577984:- DDAH1^ENSG00000153904.21 chr1:85358847:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1104:7747:26194,LH00995:25:23T55JLT4:1:1107:16258:25101,LH00995:25:23T55JLT4:1:1121:38343:5036,LH00995:25:23T55JLT4:1:1164:21298:12868,LH00995:25:23T55JLT4:1:1192:36248:16596,LH00995:25:23T55JLT4:1:1197:11994:26320,LH00995:25:23T55JLT4:1:1219:40940:27834,LH00995:25:23T55JLT4:1:1262:20918:5148,LH00995:25:23T55JLT4:1:1289:27074:12000,LH00995:25:23T55JLT4:1:1297:51158:24681,LH00995:25:23T55JLT4:1:1364:30027:10640,LH00995:25:23T55JLT4:1:1394:45147:21164,LH00995:25:23T55JLT4:1:1396:26969:20673,LH00995:25:23T55JLT4:1:1419:35471:17380,LH00995:25:23T55JLT4:1:1445:24453:10010,LH00995:25:23T55JLT4:1:1456:7003:29025,LH00995:25:23T55JLT4:1:1485:19688:6044,LH00995:25:23T55JLT4:1:2109:25294:20463,LH00995:25:23T55JLT4:1:2114:47898:11103,LH00995:25:23T55JLT4:1:2115:26419:27483,LH00995:25:23T55JLT4:1:2148:12091:19370,LH00995:25:23T55JLT4:1:2148:41539:19090,LH00995:25:23T55JLT4:1:2153:20497:25185,LH00995:25:23T55JLT4:1:2160:6032:27567,LH00995:25:23T55JLT4:1:2180:3880:24176,LH00995:25:23T55JLT4:1:2209:31410:25115,LH00995:25:23T55JLT4:1:2238:10142:21626,LH00995:25:23T55JLT4:1:2265:7359:28828,LH00995:25:23T55JLT4:1:2308:23409:15461,LH00995:25:23T55JLT4:1:2309:29347:9744,LH00995:25:23T55JLT4:1:2345:17544:4349,LH00995:25:23T55JLT4:1:2345:26548:4111,LH00995:25:23T55JLT4:1:2445:16444:28646,LH00995:25:23T55JLT4:2:1121:29469:27021,LH00995:25:23T55JLT4:2:1123:14251:19384,LH00995:25:23T55JLT4:2:1123:32761:14059,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:33465:8272,LH00995:25:23T55JLT4:2:1169:12682:2597,LH00995:25:23T55JLT4:2:1236:24243:20071,LH00995:25:23T55JLT4:2:1238:51061:20533,LH00995:25:23T55JLT4:2:1281:6752:26124,LH00995:25:23T55JLT4:2:1286:22786:25115,LH00995:25:23T55JLT4:2:1292:4875:2976,LH00995:25:23T55JLT4:2:1361:47615:18768,LH00995:25:23T55JLT4:2:1361:51838:10977,LH00995:25:23T55JLT4:2:1380:38691:3620,LH00995:25:23T55JLT4:2:1464:38724:14550,LH00995:25:23T55JLT4:2:2156:27365:14746,LH00995:25:23T55JLT4:2:2221:28927:1589,LH00995:25:23T55JLT4:2:2312:32203:26769,LH00995:25:23T55JLT4:2:2340:28886:7824,LH00995:25:23T55JLT4:2:2372:20238:28324,LH00995:25:23T55JLT4:2:2417:33174:10598,LH00995:25:23T55JLT4:2:2456:45997:21514,LH00995:25:23T55JLT4:2:2470:12197:18151,LH00995:25:23T55JLT4:3:1110:8872:17268,LH00995:25:23T55JLT4:3:1212:22657:25704,LH00995:25:23T55JLT4:3:1219:11792:10584,LH00995:25:23T55JLT4:3:1229:34921:15755,LH00995:25:23T55JLT4:3:1242:44395:14228,LH00995:25:23T55JLT4:3:1269:12059:17380,LH00995:25:23T55JLT4:3:1340:30092:23167,LH00995:25:23T55JLT4:3:1379:7011:13009,LH00995:25:23T55JLT4:3:1382:36248:10654,LH00995:25:23T55JLT4:3:1395:34347:25802,LH00995:25:23T55JLT4:3:1395:44929:8511,LH00995:25:23T55JLT4:3:1408:18159:24555,LH00995:25:23T55JLT4:3:1429:41118:15138,LH00995:25:23T55JLT4:3:1461:28846:13219,LH00995:25:23T55JLT4:3:2115:15465:3410,LH00995:25:23T55JLT4:3:2128:37227:7894,LH00995:25:23T55JLT4:3:2162:7480:17212,LH00995:25:23T55JLT4:3:2191:28142:19847,LH00995:25:23T55JLT4:3:2202:28757:14270,LH00995:25:23T55JLT4:3:2216:41377:18810,LH00995:25:23T55JLT4:3:2265:19753:19300,LH00995:25:23T55JLT4:3:2286:32381:18669,LH00995:25:23T55JLT4:3:2288:51142:29585,LH00995:25:23T55JLT4:3:2353:35399:28100,LH00995:25:23T55JLT4:3:2369:40811:20407,LH00995:25:23T55JLT4:3:2388:50794:9926,LH00995:25:23T55JLT4:3:2432:30982:2990,LH00995:25:23T55JLT4:3:2436:10805:19945,LH00995:25:23T55JLT4:4:1105:26362:21388,LH00995:25:23T55JLT4:4:1155:40803:17338,LH00995:25:23T55JLT4:4:1229:44646:12308,LH00995:25:23T55JLT4:4:1248:15077:27539,LH00995:25:23T55JLT4:4:1298:45301:14116,LH00995:25:23T55JLT4:4:1343:1534:20253,LH00995:25:23T55JLT4:4:1359:5870:24401,LH00995:25:23T55JLT4:4:1437:12860:24877,LH00995:25:23T55JLT4:4:1461:16266:10907,LH00995:25:23T55JLT4:4:2215:16500:7838,LH00995:25:23T55JLT4:4:2325:39735:2065,LH00995:25:23T55JLT4:4:2432:22892:16890,LH00995:25:23T55JLT4:4:2459:35285:1336 LH00995:25:23T55JLT4:4:2143:41976:3648 YES_LDAS 0.3285 GT 1.8062 AG 1.8062 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.02Mb]","NEIGHBORS[17122]"] LEPROT--LEPR 89 0 89.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LEPROT^ENSG00000213625.9 chr1:65425378:+ LEPR^ENSG00000116678.20 chr1:65565546:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1113:49726:2780,LH00995:25:23T55JLT4:1:1118:31208:15825,LH00995:25:23T55JLT4:1:1124:6744:2233,LH00995:25:23T55JLT4:1:1153:16420:3186,LH00995:25:23T55JLT4:1:1160:31491:2023,LH00995:25:23T55JLT4:1:1233:24461:18151,LH00995:25:23T55JLT4:1:1238:43448:19118,LH00995:25:23T55JLT4:1:1261:43036:10556,LH00995:25:23T55JLT4:1:1336:42461:22285,LH00995:25:23T55JLT4:1:1370:21953:21486,LH00995:25:23T55JLT4:1:1387:2464:7151,LH00995:25:23T55JLT4:1:1407:33020:10837,LH00995:25:23T55JLT4:1:1436:50810:25536,LH00995:25:23T55JLT4:1:1463:33870:27049,LH00995:25:23T55JLT4:1:1473:30059:2709,LH00995:25:23T55JLT4:1:1476:21071:22257,LH00995:25:23T55JLT4:1:1495:31022:3957,LH00995:25:23T55JLT4:1:2104:34832:7894,LH00995:25:23T55JLT4:1:2169:11477:18838,LH00995:25:23T55JLT4:1:2184:34185:7810,LH00995:25:23T55JLT4:1:2232:26467:28044,LH00995:25:23T55JLT4:1:2354:30318:18291,LH00995:25:23T55JLT4:1:2480:8783:12995,LH00995:25:23T55JLT4:2:1121:46304:12630,LH00995:25:23T55JLT4:2:1179:19639:23840,LH00995:25:23T55JLT4:2:1242:21314:17268,LH00995:25:23T55JLT4:2:1259:44330:13443,LH00995:25:23T55JLT4:2:1306:20732:10122,LH00995:25:23T55JLT4:2:1340:45131:9814,LH00995:25:23T55JLT4:2:1342:44953:2163,LH00995:25:23T55JLT4:2:1382:43359:7474,LH00995:25:23T55JLT4:2:1427:1105:21864,LH00995:25:23T55JLT4:2:1461:34986:25143,LH00995:25:23T55JLT4:2:1476:39557:17366,LH00995:25:23T55JLT4:2:2174:11104:24050,LH00995:25:23T55JLT4:2:2184:4818:3438,LH00995:25:23T55JLT4:2:2187:43699:22074,LH00995:25:23T55JLT4:2:2196:31030:1729,LH00995:25:23T55JLT4:2:2209:35560:1112,LH00995:25:23T55JLT4:2:2221:22981:21668,LH00995:25:23T55JLT4:2:2273:12868:15951,LH00995:25:23T55JLT4:2:2276:48820:23013,LH00995:25:23T55JLT4:2:2295:24040:28884,LH00995:25:23T55JLT4:2:2303:24817:25858,LH00995:25:23T55JLT4:2:2324:18143:3648,LH00995:25:23T55JLT4:2:2474:29469:17997,LH00995:25:23T55JLT4:2:2478:14090:21570,LH00995:25:23T55JLT4:3:1190:23870:5386,LH00995:25:23T55JLT4:3:1193:51757:18375,LH00995:25:23T55JLT4:3:1221:50826:23406,LH00995:25:23T55JLT4:3:1246:7715:19720,LH00995:25:23T55JLT4:3:1262:45527:1252,LH00995:25:23T55JLT4:3:1333:44241:12840,LH00995:25:23T55JLT4:3:1360:42785:10514,LH00995:25:23T55JLT4:3:1377:25375:16484,LH00995:25:23T55JLT4:3:1378:26338:4055,LH00995:25:23T55JLT4:3:2115:20222:27763,LH00995:25:23T55JLT4:3:2123:22325:13191,LH00995:25:23T55JLT4:3:2134:38012:23966,LH00995:25:23T55JLT4:3:2152:38028:26965,LH00995:25:23T55JLT4:3:2153:39217:21234,LH00995:25:23T55JLT4:3:2166:50907:28926,LH00995:25:23T55JLT4:3:2193:11412:9309,LH00995:25:23T55JLT4:3:2219:51304:22887,LH00995:25:23T55JLT4:3:2231:31160:14732,LH00995:25:23T55JLT4:3:2242:49564:14802,LH00995:25:23T55JLT4:3:2256:8936:5498,LH00995:25:23T55JLT4:3:2324:27381:19847,LH00995:25:23T55JLT4:3:2348:39484:10654,LH00995:25:23T55JLT4:3:2355:14138:21430,LH00995:25:23T55JLT4:3:2416:25933:1056,LH00995:25:23T55JLT4:3:2442:19445:28156,LH00995:25:23T55JLT4:3:2446:6356:19524,LH00995:25:23T55JLT4:3:2471:23660:27553,LH00995:25:23T55JLT4:3:2487:20327:28142,LH00995:25:23T55JLT4:3:2494:42008:7600,LH00995:25:23T55JLT4:4:1104:25027:4671,LH00995:25:23T55JLT4:4:1154:1566:14087,LH00995:25:23T55JLT4:4:1158:26815:4713,LH00995:25:23T55JLT4:4:1212:20691:9435,LH00995:25:23T55JLT4:4:1220:14874:2892,LH00995:25:23T55JLT4:4:1296:41911:23153,LH00995:25:23T55JLT4:4:1375:27697:8483,LH00995:25:23T55JLT4:4:1382:36127:10556,LH00995:25:23T55JLT4:4:1447:34687:5260,LH00995:25:23T55JLT4:4:2181:21905:16862,LH00995:25:23T55JLT4:4:2287:39241:7880,LH00995:25:23T55JLT4:4:2311:48432:27693,LH00995:25:23T55JLT4:4:2476:20869:26530 . YES_LDAS 0.3014 GT 1.8256 AG 1.9219 ["GTEx_recurrent_StarF2019","ChimerSeq","INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.09Mb]","NEIGHBORS[89682]"] MTAP--CDKN2B-AS1 85 1 85.00 1.00 ONLY_REF_SPLICE MTAP^ENSG00000099810.21 chr9:21838010:+ CDKN2B-AS1^ENSG00000240498.9 chr9:22112320:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1140:5781:15447,LH00995:25:23T55JLT4:1:1175:19672:22411,LH00995:25:23T55JLT4:1:1203:32049:26895,LH00995:25:23T55JLT4:1:1267:46255:25269,LH00995:25:23T55JLT4:1:1327:28377:13583,LH00995:25:23T55JLT4:1:1370:32244:10108,LH00995:25:23T55JLT4:1:1411:51554:24246,LH00995:25:23T55JLT4:1:1412:1186:16512,LH00995:25:23T55JLT4:1:1452:50422:12588,LH00995:25:23T55JLT4:1:1470:15109:25858,LH00995:25:23T55JLT4:1:1474:17860:24905,LH00995:25:23T55JLT4:1:1495:41240:14508,LH00995:25:23T55JLT4:1:2174:3136:27371,LH00995:25:23T55JLT4:1:2204:19251:8427,LH00995:25:23T55JLT4:1:2204:25254:10108,LH00995:25:23T55JLT4:1:2218:11792:12490,LH00995:25:23T55JLT4:1:2226:32462:2836,LH00995:25:23T55JLT4:1:2237:50851:23111,LH00995:25:23T55JLT4:1:2267:29121:10837,LH00995:25:23T55JLT4:1:2352:33578:13401,LH00995:25:23T55JLT4:1:2370:45277:8104,LH00995:25:23T55JLT4:1:2412:42841:13835,LH00995:25:23T55JLT4:1:2467:45179:10907,LH00995:25:23T55JLT4:2:1124:48585:18599,LH00995:25:23T55JLT4:2:1152:22042:14830,LH00995:25:23T55JLT4:2:1175:7860:24008,LH00995:25:23T55JLT4:2:1179:30682:5274,LH00995:25:23T55JLT4:2:1191:14171:12630,LH00995:25:23T55JLT4:2:1197:48448:23125,LH00995:25:23T55JLT4:2:1228:49111:5190,LH00995:25:23T55JLT4:2:1304:48189:8441,LH00995:25:23T55JLT4:2:1331:49653:5596,LH00995:25:23T55JLT4:2:1337:33182:3915,LH00995:25:23T55JLT4:2:1414:19987:23125,LH00995:25:23T55JLT4:2:1444:6542:20267,LH00995:25:23T55JLT4:2:1447:32745:6829,LH00995:25:23T55JLT4:2:1475:40406:18473,LH00995:25:23T55JLT4:2:1476:50203:2233,LH00995:25:23T55JLT4:2:1478:11137:5806,LH00995:25:23T55JLT4:2:1478:40973:16371,LH00995:25:23T55JLT4:2:1491:51902:14172,LH00995:25:23T55JLT4:2:2153:6364:26264,LH00995:25:23T55JLT4:2:2172:2181:13947,LH00995:25:23T55JLT4:2:2239:14033:5974,LH00995:25:23T55JLT4:2:2286:14381:13807,LH00995:25:23T55JLT4:2:2321:40657:4111,LH00995:25:23T55JLT4:2:2362:45900:12378,LH00995:25:23T55JLT4:2:2368:5603:21500,LH00995:25:23T55JLT4:2:2423:26864:21892,LH00995:25:23T55JLT4:2:2486:27009:2051,LH00995:25:23T55JLT4:3:1129:11323:7726,LH00995:25:23T55JLT4:3:1144:24639:25185,LH00995:25:23T55JLT4:3:1151:14874:9113,LH00995:25:23T55JLT4:3:1164:42251:1715,LH00995:25:23T55JLT4:3:1248:16444:22733,LH00995:25:23T55JLT4:3:1285:10215:14494,LH00995:25:23T55JLT4:3:1352:21783:16932,LH00995:25:23T55JLT4:3:1377:9406:6255,LH00995:25:23T55JLT4:3:1438:48092:7348,LH00995:25:23T55JLT4:3:1488:9794:15222,LH00995:25:23T55JLT4:3:2120:7488:12182,LH00995:25:23T55JLT4:3:2127:40981:2233,LH00995:25:23T55JLT4:3:2187:42210:26755,LH00995:25:23T55JLT4:3:2201:7011:9197,LH00995:25:23T55JLT4:3:2247:28102:22943,LH00995:25:23T55JLT4:3:2352:4131:9141,LH00995:25:23T55JLT4:3:2401:7941:14676,LH00995:25:23T55JLT4:3:2418:2294:11537,LH00995:25:23T55JLT4:4:1109:26006:24947,LH00995:25:23T55JLT4:4:1111:24372:5610,LH00995:25:23T55JLT4:4:1112:6501:8427,LH00995:25:23T55JLT4:4:1116:45851:12014,LH00995:25:23T55JLT4:4:1170:23733:14144,LH00995:25:23T55JLT4:4:1185:31111:7165,LH00995:25:23T55JLT4:4:1225:3152:29557,LH00995:25:23T55JLT4:4:1225:47396:23966,LH00995:25:23T55JLT4:4:1246:46013:18403,LH00995:25:23T55JLT4:4:1283:15958:6199,LH00995:25:23T55JLT4:4:1364:38352:14578,LH00995:25:23T55JLT4:4:1442:20020:12756,LH00995:25:23T55JLT4:4:2136:29631:23854,LH00995:25:23T55JLT4:4:2250:2448:6030,LH00995:25:23T55JLT4:4:2319:34897:15433,LH00995:25:23T55JLT4:4:2354:16767:13653,LH00995:25:23T55JLT4:4:2383:20481:14704 LH00995:25:23T55JLT4:2:1267:30909:19006 YES_LDAS 0.2912 GT 1.5301 AG 1.8323 ["ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.06Mb]","NEIGHBORS[56488]"] ABLIM3--PTPRB 66 0 66.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ABLIM3^ENSG00000173210.20 chr5:149251419:+ PTPRB^ENSG00000127329.16 chr12:70558894:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1135:26621:6423,LH00995:25:23T55JLT4:1:1142:1963:20996,LH00995:25:23T55JLT4:1:1168:38530:10486,LH00995:25:23T55JLT4:1:1227:23175:29711,LH00995:25:23T55JLT4:1:1230:27592:10542,LH00995:25:23T55JLT4:1:1267:21185:10654,LH00995:25:23T55JLT4:1:1362:43278:19748,LH00995:25:23T55JLT4:1:1368:42801:19398,LH00995:25:23T55JLT4:1:1401:49864:7081,LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:12455:5904,LH00995:25:23T55JLT4:1:1475:6356:20897,LH00995:25:23T55JLT4:1:2115:28142:12084,LH00995:25:23T55JLT4:1:2186:6137:10851,LH00995:25:23T55JLT4:1:2267:33910:26979,LH00995:25:23T55JLT4:1:2274:7068:8370,LH00995:25:23T55JLT4:1:2314:8588:26250,LH00995:25:23T55JLT4:1:2329:28312:8006,LH00995:25:23T55JLT4:1:2331:9179:22004,LH00995:25:23T55JLT4:1:2372:25319:27988,LH00995:25:23T55JLT4:2:1126:10077:25129,LH00995:25:23T55JLT4:2:1160:49807:25479,LH00995:25:23T55JLT4:2:1206:21621:20127,LH00995:25:23T55JLT4:2:1281:15489:17128,LH00995:25:23T55JLT4:2:1304:33870:2471,LH00995:25:23T55JLT4:2:1431:31629:7726,LH00995:25:23T55JLT4:2:2216:30504:14886,LH00995:25:23T55JLT4:2:2249:17617:4811,LH00995:25:23T55JLT4:2:2260:7407:7053,LH00995:25:23T55JLT4:2:2266:5773:2681,LH00995:25:23T55JLT4:2:2278:9462:8931,LH00995:25:23T55JLT4:2:2424:52048:23083,LH00995:25:23T55JLT4:2:2431:7456:13947,LH00995:25:23T55JLT4:2:2464:24849:18403,LH00995:25:23T55JLT4:2:2494:8629:9730,LH00995:25:23T55JLT4:3:1193:50697:9085,LH00995:25:23T55JLT4:3:1208:45236:9015,LH00995:25:23T55JLT4:3:1261:13531:5246,LH00995:25:23T55JLT4:3:1367:3281:12854,LH00995:25:23T55JLT4:3:1396:3330:29193,LH00995:25:23T55JLT4:3:1403:13709:21584,LH00995:25:23T55JLT4:3:1444:46927:16119,LH00995:25:23T55JLT4:3:2176:50066:15138,LH00995:25:23T55JLT4:3:2372:34832:21234,LH00995:25:23T55JLT4:3:2393:23862:24793,LH00995:25:23T55JLT4:3:2397:16743:9576,LH00995:25:23T55JLT4:3:2471:30075:16778,LH00995:25:23T55JLT4:3:2476:20990:21248,LH00995:25:23T55JLT4:3:2484:10263:28310,LH00995:25:23T55JLT4:4:1126:35480:14031,LH00995:25:23T55JLT4:4:1173:47712:27119,LH00995:25:23T55JLT4:4:1233:42170:8020,LH00995:25:23T55JLT4:4:1273:5975:2247,LH00995:25:23T55JLT4:4:1288:45204:11453,LH00995:25:23T55JLT4:4:1345:18539:8819,LH00995:25:23T55JLT4:4:1354:12480:27665,LH00995:25:23T55JLT4:4:1408:28045:25255,LH00995:25:23T55JLT4:4:1416:36992:9898,LH00995:25:23T55JLT4:4:1423:49540:25550,LH00995:25:23T55JLT4:4:1495:34072:4083,LH00995:25:23T55JLT4:4:2141:24550:3508,LH00995:25:23T55JLT4:4:2266:32430:20659,LH00995:25:23T55JLT4:4:2274:47267:10150,LH00995:25:23T55JLT4:4:2338:43416:2583,LH00995:25:23T55JLT4:4:2351:51619:27273,LH00995:25:23T55JLT4:4:2376:40997:28772,LH00995:25:23T55JLT4:4:2441:43497:27161 . NO_LDAS 0.2235 GT 1.8295 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr12]"] CDV3--MT-RNR2 55 0 55.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CDV3^ENSG00000091527.16 chr3:133575115:+ MT-RNR2^ENSG00000210082.2 chrM:2449:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1111:31977:29235,LH00995:25:23T55JLT4:1:1184:24445:13835,LH00995:25:23T55JLT4:1:1227:17528:16315,LH00995:25:23T55JLT4:1:1301:15562:24232,LH00995:25:23T55JLT4:1:1336:18741:22425,LH00995:25:23T55JLT4:1:1336:30124:21374,LH00995:25:23T55JLT4:1:1437:19607:11593,LH00995:25:23T55JLT4:1:2155:28045:18810,LH00995:25:23T55JLT4:1:2156:35099:24975,LH00995:25:23T55JLT4:1:2281:43189:20351,LH00995:25:23T55JLT4:1:2294:5369:22215,LH00995:25:23T55JLT4:1:2310:39217:28912,LH00995:25:23T55JLT4:1:2314:41798:18922,LH00995:25:23T55JLT4:1:2398:41005:18585,LH00995:25:23T55JLT4:1:2405:25901:22887,LH00995:25:23T55JLT4:1:2465:9333:5148,LH00995:25:23T55JLT4:2:1257:28708:7067,LH00995:25:23T55JLT4:2:1331:25804:21878,LH00995:25:23T55JLT4:2:1357:3071:5288,LH00995:25:23T55JLT4:2:1366:10870:25213,LH00995:25:23T55JLT4:2:1366:21767:14578,LH00995:25:23T55JLT4:2:1386:9737:22719,LH00995:25:23T55JLT4:2:1423:30965:20589,LH00995:25:23T55JLT4:2:1471:20586:9954,LH00995:25:23T55JLT4:2:2135:16331:16904,LH00995:25:23T55JLT4:2:2229:40681:1322,LH00995:25:23T55JLT4:2:2240:34031:11327,LH00995:25:23T55JLT4:2:2261:1178:8735,LH00995:25:23T55JLT4:2:2284:43917:7432,LH00995:25:23T55JLT4:2:2419:5352:25970,LH00995:25:23T55JLT4:2:2436:20634:15531,LH00995:25:23T55JLT4:3:1210:40277:17436,LH00995:25:23T55JLT4:3:1297:8597:27441,LH00995:25:23T55JLT4:3:1362:17754:18894,LH00995:25:23T55JLT4:3:1376:11436:11705,LH00995:25:23T55JLT4:3:1398:3500:2499,LH00995:25:23T55JLT4:3:2108:6461:2752,LH00995:25:23T55JLT4:3:2224:40075:3130,LH00995:25:23T55JLT4:3:2289:29412:21066,LH00995:25:23T55JLT4:3:2407:43270:21892,LH00995:25:23T55JLT4:3:2432:51449:26474,LH00995:25:23T55JLT4:3:2438:27123:13205,LH00995:25:23T55JLT4:3:2440:42607:4069,LH00995:25:23T55JLT4:3:2466:10692:3018,LH00995:25:23T55JLT4:4:1253:43238:5386,LH00995:25:23T55JLT4:4:1270:6598:9968,LH00995:25:23T55JLT4:4:1275:48124:24807,LH00995:25:23T55JLT4:4:1292:45236:29529,LH00995:25:23T55JLT4:4:1321:20481:10472,LH00995:25:23T55JLT4:4:1414:23806:27329,LH00995:25:23T55JLT4:4:2109:44783:15573,LH00995:25:23T55JLT4:4:2170:5134:28058,LH00995:25:23T55JLT4:4:2243:35439:5806,LH00995:25:23T55JLT4:4:2341:47129:2457,LH00995:25:23T55JLT4:4:2451:38877:2009 . YES_LDAS 0.1862 GT 1.7968 AG 1.2419 ["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chrM]"] B4GALT6--DSC3 55 0 55.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE B4GALT6^ENSG00000118276.11 chr18:31684312:- DSC3^ENSG00000134762.17 chr18:30994372:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1230:48739:2892,LH00995:25:23T55JLT4:1:1233:1356:6213,LH00995:25:23T55JLT4:1:1276:16217:4657,LH00995:25:23T55JLT4:1:1369:29606:8567,LH00995:25:23T55JLT4:1:2109:1170:14774,LH00995:25:23T55JLT4:1:2128:19542:9071,LH00995:25:23T55JLT4:1:2148:49071:25914,LH00995:25:23T55JLT4:1:2177:33020:17955,LH00995:25:23T55JLT4:1:2181:4001:24415,LH00995:25:23T55JLT4:1:2279:12609:27946,LH00995:25:23T55JLT4:1:2323:6687:10178,LH00995:25:23T55JLT4:1:2349:6614:19720,LH00995:25:23T55JLT4:1:2447:49993:17871,LH00995:25:23T55JLT4:1:2453:8152:24401,LH00995:25:23T55JLT4:1:2454:34145:4153,LH00995:25:23T55JLT4:1:2481:31499:8567,LH00995:25:23T55JLT4:2:1126:29080:24330,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:40641:18487,LH00995:25:23T55JLT4:2:1152:13289:11775,LH00995:25:23T55JLT4:2:1209:18992:18684,LH00995:25:23T55JLT4:2:1209:23223:7936,LH00995:25:23T55JLT4:2:1422:13451:13121,LH00995:25:23T55JLT4:2:2105:48480:3312,LH00995:25:23T55JLT4:2:2191:8799:28969,LH00995:25:23T55JLT4:2:2204:29412:2513,LH00995:25:23T55JLT4:2:2241:34104:14144,LH00995:25:23T55JLT4:2:2321:22794:6465,LH00995:25:23T55JLT4:3:1102:7577:15643,LH00995:25:23T55JLT4:3:1103:14850:26278,LH00995:25:23T55JLT4:3:1227:15764:4965,LH00995:25:23T55JLT4:3:1239:1356:5568,LH00995:25:23T55JLT4:3:1311:50567:16343,LH00995:25:23T55JLT4:3:1325:43206:26572,LH00995:25:23T55JLT4:3:1403:29493:15040,LH00995:25:23T55JLT4:3:2166:16355:7137,LH00995:25:23T55JLT4:3:2211:32591:18249,LH00995:25:23T55JLT4:3:2234:46903:16245,LH00995:25:23T55JLT4:3:2278:51611:14256,LH00995:25:23T55JLT4:3:2284:9276:1182,LH00995:25:23T55JLT4:3:2325:29485:12056,LH00995:25:23T55JLT4:4:1141:22746:28436,LH00995:25:23T55JLT4:4:1226:39023:14620,LH00995:25:23T55JLT4:4:1241:43772:4013,LH00995:25:23T55JLT4:4:1272:42930:5778,LH00995:25:23T55JLT4:4:1311:3880:6213,LH00995:25:23T55JLT4:4:1315:7901:8861,LH00995:25:23T55JLT4:4:1360:26208:8483,LH00995:25:23T55JLT4:4:1433:52185:5666,LH00995:25:23T55JLT4:4:1446:45325:16512,LH00995:25:23T55JLT4:4:1465:37470:27427,LH00995:25:23T55JLT4:4:2101:32980:16343,LH00995:25:23T55JLT4:4:2258:12423:26110,LH00995:25:23T55JLT4:4:2373:35196:2275,LH00995:25:23T55JLT4:4:2433:44201:16862,LH00995:25:23T55JLT4:4:2474:40592:19300 . YES_LDAS 0.1862 GT 1.8323 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:0.58Mb]"] TMEM65--ANXA13 50 0 50.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEM65^ENSG00000164983.8 chr8:124371854:- ANXA13^ENSG00000104537.17 chr8:123684722:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1227:20343:14578,LH00995:25:23T55JLT4:1:1339:19105:24849,LH00995:25:23T55JLT4:1:1397:27406:12714,LH00995:25:23T55JLT4:1:1481:32697:13247,LH00995:25:23T55JLT4:1:2231:21217:1939,LH00995:25:23T55JLT4:1:2249:3573:21066,LH00995:25:23T55JLT4:1:2307:42615:3354,LH00995:25:23T55JLT4:1:2349:31952:4447,LH00995:25:23T55JLT4:1:2401:32098:7053,LH00995:25:23T55JLT4:2:1106:23199:12826,LH00995:25:23T55JLT4:2:1116:37057:15587,LH00995:25:23T55JLT4:2:1131:7852:16596,LH00995:25:23T55JLT4:2:1134:26281:14914,LH00995:25:23T55JLT4:2:1384:19591:19636,LH00995:25:23T55JLT4:2:1430:16411:28506,LH00995:25:23T55JLT4:2:2315:2149:27315,LH00995:25:23T55JLT4:2:2374:9672:12406,LH00995:25:23T55JLT4:2:2401:47687:14242,LH00995:25:23T55JLT4:3:1214:12868:15839,LH00995:25:23T55JLT4:3:1311:9179:10907,LH00995:25:23T55JLT4:3:1320:15093:3690,LH00995:25:23T55JLT4:3:1331:34808:7768,LH00995:25:23T55JLT4:3:1369:23547:10514,LH00995:25:23T55JLT4:3:1478:7731:12742,LH00995:25:23T55JLT4:3:2223:21573:24891,LH00995:25:23T55JLT4:3:2225:8176:16624,LH00995:25:23T55JLT4:3:2245:41151:10851,LH00995:25:23T55JLT4:3:2273:41321:18543,LH00995:25:23T55JLT4:3:2298:41628:21374,LH00995:25:23T55JLT4:3:2380:49799:27203,LH00995:25:23T55JLT4:3:2421:22892:11313,LH00995:25:23T55JLT4:3:2435:20238:1084,LH00995:25:23T55JLT4:3:2439:10603:9954,LH00995:25:23T55JLT4:4:1220:28773:18866,LH00995:25:23T55JLT4:4:1222:6574:18782,LH00995:25:23T55JLT4:4:1351:29922:14158,LH00995:25:23T55JLT4:4:1441:5547:8174,LH00995:25:23T55JLT4:4:2148:28870:4013,LH00995:25:23T55JLT4:4:2173:44160:20463,LH00995:25:23T55JLT4:4:2208:20222:5764,LH00995:25:23T55JLT4:4:2227:6558:21192,LH00995:25:23T55JLT4:4:2242:14235:10809,LH00995:25:23T55JLT4:4:2271:35649:7067,LH00995:25:23T55JLT4:4:2296:12771:14045,LH00995:25:23T55JLT4:4:2308:27980:21556,LH00995:25:23T55JLT4:4:2317:48254:28674,LH00995:25:23T55JLT4:4:2339:19275:23686,LH00995:25:23T55JLT4:4:2354:25594:6493,LH00995:25:23T55JLT4:4:2413:42121:2051,LH00995:25:23T55JLT4:4:2448:19979:10725 . YES_LDAS 0.1693 GT 1.9656 AG 1.9219 ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]"] KCNH5--NCOA3 47 0 47.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE KCNH5^ENSG00000140015.20 chr14:62950140:- NCOA3^ENSG00000124151.19 chr20:47651081:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1147:45325:27665,LH00995:25:23T55JLT4:1:1188:15319:5064,LH00995:25:23T55JLT4:1:1219:30504:20463,LH00995:25:23T55JLT4:1:1303:5433:10304,LH00995:25:23T55JLT4:1:1376:47890:10668,LH00995:25:23T55JLT4:1:1380:15756:11397,LH00995:25:23T55JLT4:1:1396:46846:10851,LH00995:25:23T55JLT4:1:2123:3225:10654,LH00995:25:23T55JLT4:1:2166:9859:28955,LH00995:25:23T55JLT4:1:2207:27001:8987,LH00995:25:23T55JLT4:1:2263:39322:13037,LH00995:25:23T55JLT4:1:2279:11784:6815,LH00995:25:23T55JLT4:1:2338:31467:27147,LH00995:25:23T55JLT4:1:2418:51910:21024,LH00995:25:23T55JLT4:1:2431:36588:21500,LH00995:25:23T55JLT4:2:1133:17051:17170,LH00995:25:23T55JLT4:2:1171:6582:18571,LH00995:25:23T55JLT4:2:1264:31289:24877,LH00995:25:23T55JLT4:2:1281:46522:16119,LH00995:25:23T55JLT4:2:1456:38902:9814,LH00995:25:23T55JLT4:2:1471:33538:4643,LH00995:25:23T55JLT4:2:2112:30310:1631,LH00995:25:23T55JLT4:2:2151:1849:4713,LH00995:25:23T55JLT4:2:2207:25157:7614,LH00995:25:23T55JLT4:2:2238:43028:2135,LH00995:25:23T55JLT4:2:2246:21686:6058,LH00995:25:23T55JLT4:2:2282:18669:11537,LH00995:25:23T55JLT4:2:2286:28449:18417,LH00995:25:23T55JLT4:2:2437:15667:14970,LH00995:25:23T55JLT4:2:2458:31969:26474,LH00995:25:23T55JLT4:2:2470:49945:12490,LH00995:25:23T55JLT4:2:2480:21330:11215,LH00995:25:23T55JLT4:3:1134:46644:20085,LH00995:25:23T55JLT4:3:1153:29412:5372,LH00995:25:23T55JLT4:3:1226:13515:4377,LH00995:25:23T55JLT4:3:1245:3306:28282,LH00995:25:23T55JLT4:3:1325:27689:27329,LH00995:25:23T55JLT4:3:1406:2958:21794,LH00995:25:23T55JLT4:3:2192:7351:11383,LH00995:25:23T55JLT4:3:2208:25165:13177,LH00995:25:23T55JLT4:3:2279:34234:27343,LH00995:25:23T55JLT4:4:1389:25521:23938,LH00995:25:23T55JLT4:4:1460:10028:12714,LH00995:25:23T55JLT4:4:2139:31443:29207,LH00995:25:23T55JLT4:4:2225:16800:13849,LH00995:25:23T55JLT4:4:2238:37381:3676,LH00995:25:23T55JLT4:4:2381:49176:13037 . NO_LDAS 0.1591 GT 1.7819 AG 1.5656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr20]"] COL8A1--CMSS1 46 0 46.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE COL8A1^ENSG00000144810.16 chr3:99794382:+ CMSS1^ENSG00000184220.12 chr3:100146973:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1116:3476:5064,LH00995:25:23T55JLT4:1:1308:33522:3018,LH00995:25:23T55JLT4:1:1314:28498:12812,LH00995:25:23T55JLT4:1:1380:41547:27735,LH00995:25:23T55JLT4:1:2111:18345:20701,LH00995:25:23T55JLT4:1:2115:23296:23139,LH00995:25:23T55JLT4:1:2115:36507:22957,LH00995:25:23T55JLT4:1:2167:21443:17520,LH00995:25:23T55JLT4:1:2233:28902:17184,LH00995:25:23T55JLT4:1:2415:47259:3802,LH00995:25:23T55JLT4:1:2428:17568:22943,LH00995:25:23T55JLT4:1:2469:22487:23672,LH00995:25:23T55JLT4:2:1201:43739:19202,LH00995:25:23T55JLT4:2:1302:32786:13373,LH00995:25:23T55JLT4:2:1437:11274:17591,LH00995:25:23T55JLT4:2:2136:21055:18389,LH00995:25:23T55JLT4:2:2162:38263:12798,LH00995:25:23T55JLT4:2:2201:36402:18375,LH00995:25:23T55JLT4:2:2372:30973:6843,LH00995:25:23T55JLT4:3:1195:37219:15279,LH00995:25:23T55JLT4:3:1213:6404:14144,LH00995:25:23T55JLT4:3:1218:23045:22173,LH00995:25:23T55JLT4:3:1235:48488:21822,LH00995:25:23T55JLT4:3:1241:45843:9253,LH00995:25:23T55JLT4:3:2190:41369:2485,LH00995:25:23T55JLT4:3:2220:50284:29473,LH00995:25:23T55JLT4:3:2258:38651:7810,LH00995:25:23T55JLT4:3:2358:4131:8272,LH00995:25:23T55JLT4:3:2370:21824:29277,LH00995:25:23T55JLT4:3:2401:38724:17633,LH00995:25:23T55JLT4:3:2424:32600:14059,LH00995:25:23T55JLT4:4:1202:38740:9477,LH00995:25:23T55JLT4:4:1274:33441:16385,LH00995:25:23T55JLT4:4:1281:49127:23490,LH00995:25:23T55JLT4:4:1337:15246:23686,LH00995:25:23T55JLT4:4:1408:25149:29375,LH00995:25:23T55JLT4:4:1422:6024:19931,LH00995:25:23T55JLT4:4:1444:12585:3971,LH00995:25:23T55JLT4:4:1451:24315:27735,LH00995:25:23T55JLT4:4:2120:19154:8174,LH00995:25:23T55JLT4:4:2122:39759:23910,LH00995:25:23T55JLT4:4:2142:50851:24877,LH00995:25:23T55JLT4:4:2151:4131:1995,LH00995:25:23T55JLT4:4:2260:39832:2065,LH00995:25:23T55JLT4:4:2289:31265:8413,LH00995:25:23T55JLT4:4:2397:43909:8258 . YES_LDAS 0.1558 GT 1.8323 AG 1.9086 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.02Mb]","NEIGHBORS[18611]"] IGH@-ext--CREB3L2 45 0 45.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE IGH@-ext^IGH.g@-ext chr14:105760805:- CREB3L2^ENSG00000182158.15 chr7:137928171:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1146:11525:8889,LH00995:25:23T55JLT4:1:1151:19510:12966,LH00995:25:23T55JLT4:1:1166:12140:7600,LH00995:25:23T55JLT4:1:1256:7529:22705,LH00995:25:23T55JLT4:1:1283:25610:9155,LH00995:25:23T55JLT4:1:1338:47307:27595,LH00995:25:23T55JLT4:1:1348:38635:2429,LH00995:25:23T55JLT4:1:1498:12876:21850,LH00995:25:23T55JLT4:1:2109:3039:7754,LH00995:25:23T55JLT4:1:2122:14688:6913,LH00995:25:23T55JLT4:1:2214:46425:16035,LH00995:25:23T55JLT4:1:2242:41822:8286,LH00995:25:23T55JLT4:1:2324:8168:29277,LH00995:25:23T55JLT4:1:2349:25505:25760,LH00995:25:23T55JLT4:1:2369:16549:2121,LH00995:25:23T55JLT4:1:2427:1154:8244,LH00995:25:23T55JLT4:1:2432:36855:7137,LH00995:25:23T55JLT4:1:2438:10902:27595,LH00995:25:23T55JLT4:2:1108:24404:22229,LH00995:25:23T55JLT4:2:1188:24332:12406,LH00995:25:23T55JLT4:2:1190:22956:4727,LH00995:25:23T55JLT4:2:1201:27665:4643,LH00995:25:23T55JLT4:2:1222:9203:24316,LH00995:25:23T55JLT4:2:1281:13604:6297,LH00995:25:23T55JLT4:2:1332:8111:22537,LH00995:25:23T55JLT4:2:1429:15756:13415,LH00995:25:23T55JLT4:2:1443:47218:22929,LH00995:25:23T55JLT4:2:2225:4843:19931,LH00995:25:23T55JLT4:2:2353:9381:5400,LH00995:25:23T55JLT4:3:1128:46822:27399,LH00995:25:23T55JLT4:3:1237:4349:5652,LH00995:25:23T55JLT4:3:1281:12536:24344,LH00995:25:23T55JLT4:3:1372:6275:20309,LH00995:25:23T55JLT4:3:2188:7221:18529,LH00995:25:23T55JLT4:3:2242:20133:11607,LH00995:25:23T55JLT4:3:2348:9519:20099,LH00995:25:23T55JLT4:3:2397:28425:12518,LH00995:25:23T55JLT4:3:2476:28668:6157,LH00995:25:23T55JLT4:4:1478:14632:9393,LH00995:25:23T55JLT4:4:2171:5587:1883,LH00995:25:23T55JLT4:4:2191:17123:5442,LH00995:25:23T55JLT4:4:2191:38432:13905,LH00995:25:23T55JLT4:4:2267:22625:14746,LH00995:25:23T55JLT4:4:2293:27568:22495,LH00995:25:23T55JLT4:4:2427:17415:27525 . NO_LDAS 0.1524 CC 1.4566 CC 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr7]"] TMEM123--PDGFD 44 0 44.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- PDGFD^ENSG00000170962.13 chr11:104000255:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1145:10716:16512,LH00995:25:23T55JLT4:1:1253:40487:22369,LH00995:25:23T55JLT4:1:1312:39484:10879,LH00995:25:23T55JLT4:1:1331:9009:8735,LH00995:25:23T55JLT4:1:1424:28813:5372,LH00995:25:23T55JLT4:1:1431:9753:11145,LH00995:25:23T55JLT4:1:1497:2764:4195,LH00995:25:23T55JLT4:1:2121:17253:21836,LH00995:25:23T55JLT4:1:2283:17690:5050,LH00995:25:23T55JLT4:1:2346:51643:7221,LH00995:25:23T55JLT4:1:2396:35698:29571,LH00995:25:23T55JLT4:1:2432:39743:4041,LH00995:25:23T55JLT4:1:2476:48747:29221,LH00995:25:23T55JLT4:2:1113:8629:19566,LH00995:25:23T55JLT4:2:1291:43238:27946,LH00995:25:23T55JLT4:2:1301:36580:3971,LH00995:25:23T55JLT4:2:1366:42518:19636,LH00995:25:23T55JLT4:2:1450:34954:23041,LH00995:25:23T55JLT4:2:2134:4082:1883,LH00995:25:23T55JLT4:2:2180:27972:28520,LH00995:25:23T55JLT4:2:2202:12900:23882,LH00995:25:23T55JLT4:2:2260:48351:6002,LH00995:25:23T55JLT4:2:2374:14737:24737,LH00995:25:23T55JLT4:2:2451:23555:6997,LH00995:25:23T55JLT4:2:2458:41312:3957,LH00995:25:23T55JLT4:2:2496:25472:16287,LH00995:25:23T55JLT4:3:1132:48885:23294,LH00995:25:23T55JLT4:3:1187:27875:29221,LH00995:25:23T55JLT4:3:1273:34654:29557,LH00995:25:23T55JLT4:3:1334:34040:24541,LH00995:25:23T55JLT4:3:1348:9592:20533,LH00995:25:23T55JLT4:3:1412:31046:6829,LH00995:25:23T55JLT4:3:1451:14802:2962,LH00995:25:23T55JLT4:3:2444:40148:15615,LH00995:25:23T55JLT4:4:1120:40592:19272,LH00995:25:23T55JLT4:4:1212:22665:11061,LH00995:25:23T55JLT4:4:1377:23312:3382,LH00995:25:23T55JLT4:4:2114:6380:17128,LH00995:25:23T55JLT4:4:2152:49969:15615,LH00995:25:23T55JLT4:4:2186:14559:21598,LH00995:25:23T55JLT4:4:2236:5538:23630,LH00995:25:23T55JLT4:4:2268:34873:7992,LH00995:25:23T55JLT4:4:2323:33222:15419,LH00995:25:23T55JLT4:4:2381:19097:8553 . YES_LDAS 0.149 GT 1.9656 AG 1.8323 ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]"] PDCD1LG2--DYNC2H1 42 0 42.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 chr9:5535050:+ DYNC2H1^ENSG00000187240.16 chr11:103114103:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1169:28239:3929,LH00995:25:23T55JLT4:1:1195:33853:10542,LH00995:25:23T55JLT4:1:2188:2416:12280,LH00995:25:23T55JLT4:1:2273:19631:14354,LH00995:25:23T55JLT4:1:2324:27042:7600,LH00995:25:23T55JLT4:1:2401:16023:25872,LH00995:25:23T55JLT4:1:2434:10481:28212,LH00995:25:23T55JLT4:1:2436:34509:26755,LH00995:25:23T55JLT4:1:2439:31208:18740,LH00995:25:23T55JLT4:1:2465:3354:15951,LH00995:25:23T55JLT4:1:2496:20626:25830,LH00995:25:23T55JLT4:2:1125:35463:13583,LH00995:25:23T55JLT4:2:1144:14090:12826,LH00995:25:23T55JLT4:2:1160:13483:19258,LH00995:25:23T55JLT4:2:1165:28660:21248,LH00995:25:23T55JLT4:2:1203:42105:7600,LH00995:25:23T55JLT4:2:1213:33805:19314,LH00995:25:23T55JLT4:2:1343:38246:11229,LH00995:25:23T55JLT4:2:1435:11121:10823,LH00995:25:23T55JLT4:2:2103:38157:20071,LH00995:25:23T55JLT4:2:2106:15837:13331,LH00995:25:23T55JLT4:2:2408:41369:10893,LH00995:25:23T55JLT4:2:2493:24089:15321,LH00995:25:23T55JLT4:3:1427:30043:21598,LH00995:25:23T55JLT4:3:1450:44015:20715,LH00995:25:23T55JLT4:3:1488:44160:29151,LH00995:25:23T55JLT4:3:2102:23741:12028,LH00995:25:23T55JLT4:3:2154:1930:21080,LH00995:25:23T55JLT4:3:2381:51134:7488,LH00995:25:23T55JLT4:4:1223:48577:24863,LH00995:25:23T55JLT4:4:1263:5045:21486,LH00995:25:23T55JLT4:4:1294:47445:25227,LH00995:25:23T55JLT4:4:1296:13904:28955,LH00995:25:23T55JLT4:4:1307:27576:27721,LH00995:25:23T55JLT4:4:1362:42558:9197,LH00995:25:23T55JLT4:4:1404:44646:21276,LH00995:25:23T55JLT4:4:1432:8200:11509,LH00995:25:23T55JLT4:4:2104:43044:9618,LH00995:25:23T55JLT4:4:2150:5013:8258,LH00995:25:23T55JLT4:4:2166:43497:13289,LH00995:25:23T55JLT4:4:2380:43432:18529,LH00995:25:23T55JLT4:4:2417:42251:20295 . YES_LDAS 0.1422 GT 1.9219 AG 1.8323 ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"] TMEM65--ANXA13 39 0 39.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEM65^ENSG00000164983.8 chr8:124371854:- ANXA13^ENSG00000104537.17 chr8:123688946:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1141:2036:18796,LH00995:25:23T55JLT4:1:1259:31564:21122,LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:3063:26068,LH00995:25:23T55JLT4:1:2180:17512:14242,LH00995:25:23T55JLT4:1:2211:3678:12784,LH00995:25:23T55JLT4:1:2224:3694:9505,LH00995:25:23T55JLT4:1:2428:24437:22397,LH00995:25:23T55JLT4:1:2455:30156:26054,LH00995:25:23T55JLT4:2:1116:29186:12070,LH00995:25:23T55JLT4:2:1202:36305:14844,LH00995:25:23T55JLT4:2:2102:8661:25395,LH00995:25:23T55JLT4:2:2111:47420:7754,LH00995:25:23T55JLT4:2:2129:15683:27974,LH00995:25:23T55JLT4:2:2252:10910:19006,LH00995:25:23T55JLT4:2:2452:9681:19819,LH00995:25:23T55JLT4:2:2455:22155:27777,LH00995:25:23T55JLT4:3:1108:38554:1701,LH00995:25:23T55JLT4:3:1321:25351:27315,LH00995:25:23T55JLT4:3:1479:18046:4153,LH00995:25:23T55JLT4:3:1482:14251:24288,LH00995:25:23T55JLT4:3:2120:35059:1476,LH00995:25:23T55JLT4:3:2174:30755:18880,LH00995:25:23T55JLT4:3:2190:21799:26068,LH00995:25:23T55JLT4:3:2205:14049:22565,LH00995:25:23T55JLT4:3:2216:40536:21024,LH00995:25:23T55JLT4:3:2271:30706:3971,LH00995:25:23T55JLT4:3:2349:51190:12070,LH00995:25:23T55JLT4:3:2383:12059:1771,LH00995:25:23T55JLT4:3:2458:20909:13597,LH00995:25:23T55JLT4:4:1237:36208:11930,LH00995:25:23T55JLT4:4:1273:47558:2275,LH00995:25:23T55JLT4:4:1287:17754:23630,LH00995:25:23T55JLT4:4:1379:22188:21976,LH00995:25:23T55JLT4:4:1438:28045:9365,LH00995:25:23T55JLT4:4:2221:4948:12686,LH00995:25:23T55JLT4:4:2275:12836:16231,LH00995:25:23T55JLT4:4:2282:37923:7950,LH00995:25:23T55JLT4:4:2285:22107:10626,LH00995:25:23T55JLT4:4:2288:44443:28072 . YES_LDAS 0.1321 GT 1.9656 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]"] RPSAP52--HMGA2 39 0 39.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE RPSAP52^ENSG00000241749.4 chr12:65826843:- HMGA2^ENSG00000149948.14 chr12:65828001:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1146:45746:17969,LH00995:25:23T55JLT4:1:1175:29145:3732,LH00995:25:23T55JLT4:1:1279:48715:22803,LH00995:25:23T55JLT4:1:1290:51635:27749,LH00995:25:23T55JLT4:1:1310:36127:23280,LH00995:25:23T55JLT4:1:1312:36531:23167,LH00995:25:23T55JLT4:1:1477:11687:2079,LH00995:25:23T55JLT4:1:2194:21007:20939,LH00995:25:23T55JLT4:1:2244:31443:23546,LH00995:25:23T55JLT4:1:2402:42105:7516,LH00995:25:23T55JLT4:1:2458:15255:12126,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:35496:26671,LH00995:25:23T55JLT4:2:1171:45503:19678,LH00995:25:23T55JLT4:2:2172:31168:28338,LH00995:25:23T55JLT4:2:2196:11938:23700,LH00995:25:23T55JLT4:2:2216:24372:10851,LH00995:25:23T55JLT4:2:2257:7674:18081,LH00995:25:23T55JLT4:2:2295:10384:8903,LH00995:25:23T55JLT4:2:2330:42073:2864,LH00995:25:23T55JLT4:2:2360:5684:12252,LH00995:25:23T55JLT4:2:2409:36402:23532,LH00995:25:23T55JLT4:2:2421:41159:4279,LH00995:25:23T55JLT4:2:2444:42947:29683,LH00995:25:23T55JLT4:2:2455:7035:8875,LH00995:25:23T55JLT4:2:2458:51198:16596,LH00995:25:23T55JLT4:3:1122:36491:21248,LH00995:25:23T55JLT4:3:1236:20998:14900,LH00995:25:23T55JLT4:3:1284:15821:1532,LH00995:25:23T55JLT4:3:1332:3128:4769,LH00995:25:23T55JLT4:3:1348:21969:20869,LH00995:25:23T55JLT4:3:1350:8588:23420,LH00995:25:23T55JLT4:3:2174:48181:26054,LH00995:25:23T55JLT4:3:2207:43804:27217,LH00995:25:23T55JLT4:3:2273:9834:1589,LH00995:25:23T55JLT4:4:1227:46797:19370,LH00995:25:23T55JLT4:4:1361:35674:21150,LH00995:25:23T55JLT4:4:1393:32357:17731,LH00995:25:23T55JLT4:4:1460:23652:15965,LH00995:25:23T55JLT4:4:2102:39719:18403 . YES_LDAS 0.1321 GT 1.9329 AG 1.8256 ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.00Mb]","NEIGHBORS_OVERLAP:-:+:[2537]"] CLTC--VMP1 38 1 38.00 1.00 ONLY_REF_SPLICE CLTC^ENSG00000141367.12 chr17:59690711:+ VMP1^ENSG00000062716.13 chr17:59838295:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1161:36313:24190,LH00995:25:23T55JLT4:1:1277:41499:10164,LH00995:25:23T55JLT4:1:2209:18110:22229,LH00995:25:23T55JLT4:1:2261:48359:1617,LH00995:25:23T55JLT4:1:2316:6307:21962,LH00995:25:23T55JLT4:1:2391:5336:8791,LH00995:25:23T55JLT4:1:2427:16913:19230,LH00995:25:23T55JLT4:1:2492:16225:27651,LH00995:25:23T55JLT4:2:1112:23725:12140,LH00995:25:23T55JLT4:2:1142:27543:22145,LH00995:25:23T55JLT4:2:1170:4932:21374,LH00995:25:23T55JLT4:2:1252:31750:18165,LH00995:25:23T55JLT4:2:1258:34760:14073,LH00995:25:23T55JLT4:2:2135:22875:18291,LH00995:25:23T55JLT4:2:2314:51781:25283,LH00995:25:23T55JLT4:3:1137:26475:6479,LH00995:25:23T55JLT4:3:1207:4794:18053,LH00995:25:23T55JLT4:3:1384:41240:3802,LH00995:25:23T55JLT4:3:1409:14891:21836,LH00995:25:23T55JLT4:3:1458:29088:16666,LH00995:25:23T55JLT4:3:2143:38934:13373,LH00995:25:23T55JLT4:3:2186:34234:22691,LH00995:25:23T55JLT4:3:2217:2400:8553,LH00995:25:23T55JLT4:3:2317:22859:21514,LH00995:25:23T55JLT4:3:2452:50956:8861,LH00995:25:23T55JLT4:4:1223:27244:18936,LH00995:25:23T55JLT4:4:1238:47242:15881,LH00995:25:23T55JLT4:4:1265:33837:28955,LH00995:25:23T55JLT4:4:1345:22034:1897,LH00995:25:23T55JLT4:4:1357:3920:27637,LH00995:25:23T55JLT4:4:1377:7917:3844,LH00995:25:23T55JLT4:4:1383:39945:22131,LH00995:25:23T55JLT4:4:1446:2416:10486,LH00995:25:23T55JLT4:4:1472:15384:8735,LH00995:25:23T55JLT4:4:1489:8176:17352,LH00995:25:23T55JLT4:4:2151:17269:24527,LH00995:25:23T55JLT4:4:2393:43108:15811,LH00995:25:23T55JLT4:4:2424:39096:5694 LH00995:25:23T55JLT4:2:2409:47542:4405 YES_LDAS 0.1321 GT 1.8892 AG 1.8062 ["Klijn_CellLines","Larsson_TCGA","ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.01Mb]","NEIGHBORS[10236]"] UMAD1--GLCCI1 36 0 36.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE UMAD1^ENSG00000219545.11 chr7:7801743:+ GLCCI1^ENSG00000106415.13 chr7:8003908:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1213:50948:13891,LH00995:25:23T55JLT4:1:1214:10740:8427,LH00995:25:23T55JLT4:1:1295:32947:21752,LH00995:25:23T55JLT4:1:1308:40083:19230,LH00995:25:23T55JLT4:1:1477:23377:8875,LH00995:25:23T55JLT4:1:1496:6242:10108,LH00995:25:23T55JLT4:1:2136:19486:25732,LH00995:25:23T55JLT4:1:2165:11185:3844,LH00995:25:23T55JLT4:1:2410:23854:14634,LH00995:25:23T55JLT4:1:2488:26864:1967,LH00995:25:23T55JLT4:2:1262:50122:16582,LH00995:25:23T55JLT4:2:1342:8912:18235,LH00995:25:23T55JLT4:2:1451:47509:24106,LH00995:25:23T55JLT4:2:2103:8297:13023,LH00995:25:23T55JLT4:2:2141:43966:8945,LH00995:25:23T55JLT4:2:2187:22819:20771,LH00995:25:23T55JLT4:2:2216:39670:15124,LH00995:25:23T55JLT4:2:2347:48812:5568,LH00995:25:23T55JLT4:2:2496:21176:6016,LH00995:25:23T55JLT4:3:1254:4576:29445,LH00995:25:23T55JLT4:3:1326:3993:3046,LH00995:25:23T55JLT4:3:1464:15384:20029,LH00995:25:23T55JLT4:3:2351:43909:1196,LH00995:25:23T55JLT4:3:2489:48189:19230,LH00995:25:23T55JLT4:3:2492:46013:20449,LH00995:25:23T55JLT4:4:1250:48019:24737,LH00995:25:23T55JLT4:4:1269:42469:20029,LH00995:25:23T55JLT4:4:1287:33562:16512,LH00995:25:23T55JLT4:4:1377:4681:21584,LH00995:25:23T55JLT4:4:1392:16161:17983,LH00995:25:23T55JLT4:4:1464:3451:6058,LH00995:25:23T55JLT4:4:1483:16088:14690,LH00995:25:23T55JLT4:4:1495:21241:24401,LH00995:25:23T55JLT4:4:2343:26637:13177,LH00995:25:23T55JLT4:4:2459:29889:22004,LH00995:25:23T55JLT4:4:2471:2489:12714 . YES_LDAS 0.1219 GT 1.9656 AG 1.7465 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.00Mb]","NEIGHBORS[776]"] AL033504.1--SASH1 35 1 35.00 1.00 ONLY_REF_SPLICE AL033504.1^ENSG00000227681.5 chr6:147947519:+ SASH1^ENSG00000111961.18 chr6:148390134:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1334:35116:16259,LH00995:25:23T55JLT4:1:1342:9632:27749,LH00995:25:23T55JLT4:1:1382:1348:14690,LH00995:25:23T55JLT4:1:1418:33125:21276,LH00995:25:23T55JLT4:1:2134:20376:22173,LH00995:25:23T55JLT4:1:2224:12553:28100,LH00995:25:23T55JLT4:1:2248:20125:13135,LH00995:25:23T55JLT4:1:2443:34695:18221,LH00995:25:23T55JLT4:2:1124:38837:16484,LH00995:25:23T55JLT4:2:1160:47340:26390,LH00995:25:23T55JLT4:2:1453:38263:13667,LH00995:25:23T55JLT4:2:1456:7990:3606,LH00995:25:23T55JLT4:2:1483:11404:15545,LH00995:25:23T55JLT4:2:2319:40050:14326,LH00995:25:23T55JLT4:2:2362:20545:17338,LH00995:25:23T55JLT4:2:2495:35844:7880,LH00995:25:23T55JLT4:3:1169:33797:29613,LH00995:25:23T55JLT4:3:1191:35779:20743,LH00995:25:23T55JLT4:3:1252:32875:7221,LH00995:25:23T55JLT4:3:1336:36564:20505,LH00995:25:23T55JLT4:3:1350:15586:14970,LH00995:25:23T55JLT4:3:2180:50252:4951,LH00995:25:23T55JLT4:3:2187:21783:5302,LH00995:25:23T55JLT4:3:2422:47485:9856,LH00995:25:23T55JLT4:3:2462:8038:13667,LH00995:25:23T55JLT4:3:2477:8443:18543,LH00995:25:23T55JLT4:4:1155:10716:13737,LH00995:25:23T55JLT4:4:1231:43222:25311,LH00995:25:23T55JLT4:4:1421:19825:10346,LH00995:25:23T55JLT4:4:2201:16727:16582,LH00995:25:23T55JLT4:4:2215:13313:2457,LH00995:25:23T55JLT4:4:2225:10215:27105,LH00995:25:23T55JLT4:4:2235:21176:16414,LH00995:25:23T55JLT4:4:2268:20521:4321,LH00995:25:23T55JLT4:4:2436:19049:29263 LH00995:25:23T55JLT4:3:1278:16161:5092 YES_LDAS 0.1219 GT 1.5329 AG 1.9219 ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.32Mb]"] TBC1D13--AL442224.1 32 0 32.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TBC1D13^ENSG00000107021.16 chr9:128792574:+ AL442224.1^ENSG00000231990.2 chr9:93825711:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1178:15408:23294,LH00995:25:23T55JLT4:1:1257:12253:27413,LH00995:25:23T55JLT4:1:1269:5676:25465,LH00995:25:23T55JLT4:1:1331:2092:18333,LH00995:25:23T55JLT4:1:2166:10797:12280,LH00995:25:23T55JLT4:1:2265:9219:21766,LH00995:25:23T55JLT4:1:2356:1736:14410,LH00995:25:23T55JLT4:1:2382:3079:11607,LH00995:25:23T55JLT4:1:2449:22422:24429,LH00995:25:23T55JLT4:1:2449:42041:22341,LH00995:25:23T55JLT4:1:2458:14510:28688,LH00995:25:23T55JLT4:2:1161:8305:3985,LH00995:25:23T55JLT4:2:1259:37996:10038,LH00995:25:23T55JLT4:2:1344:11323:8483,LH00995:25:23T55JLT4:2:1379:33239:7908,LH00995:25:23T55JLT4:2:1386:17795:19496,LH00995:25:23T55JLT4:2:1495:20982:10192,LH00995:25:23T55JLT4:2:2154:41555:3228,LH00995:25:23T55JLT4:2:2342:8783:29697,LH00995:25:23T55JLT4:2:2367:36143:8314,LH00995:25:23T55JLT4:2:2386:21516:29445,LH00995:25:23T55JLT4:3:1197:29622:19300,LH00995:25:23T55JLT4:3:1263:32025:9786,LH00995:25:23T55JLT4:3:1397:50058:22691,LH00995:25:23T55JLT4:3:1428:7674:22593,LH00995:25:23T55JLT4:3:2178:13264:18824,LH00995:25:23T55JLT4:4:1452:23013:22537,LH00995:25:23T55JLT4:4:2205:17229:9155,LH00995:25:23T55JLT4:4:2207:24299:3887,LH00995:25:23T55JLT4:4:2215:34994:11733,LH00995:25:23T55JLT4:4:2350:6873:12854,LH00995:25:23T55JLT4:4:2415:40803:9351 . YES_LDAS 0.1084 GT 1.9329 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:34.93Mb]"] SAA4--SAA1 29 0 29.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE SAA4^ENSG00000148965.10 chr11:18232395:- SAA1^ENSG00000173432.12 chr11:18269717:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1198:19494:27539,LH00995:25:23T55JLT4:1:1263:13038:17478,LH00995:25:23T55JLT4:1:1421:39727:9365,LH00995:25:23T55JLT4:1:2198:22641:20239,LH00995:25:23T55JLT4:1:2206:3451:9337,LH00995:25:23T55JLT4:1:2214:36297:13429,LH00995:25:23T55JLT4:1:2456:14745:22677,LH00995:25:23T55JLT4:1:2468:32389:29529,LH00995:25:23T55JLT4:1:2488:28660:14494,LH00995:25:23T55JLT4:2:1127:20748:23658,LH00995:25:23T55JLT4:2:1298:23571:29613,LH00995:25:23T55JLT4:2:1479:41806:10500,LH00995:25:23T55JLT4:2:2151:33376:29361,LH00995:25:23T55JLT4:2:2339:40973:10038,LH00995:25:23T55JLT4:2:2366:42154:4853,LH00995:25:23T55JLT4:2:2419:14486:22088,LH00995:25:23T55JLT4:3:1174:4260:18361,LH00995:25:23T55JLT4:3:1343:33336:16960,LH00995:25:23T55JLT4:3:1463:25755:25437,LH00995:25:23T55JLT4:3:1480:31046:17927,LH00995:25:23T55JLT4:3:2412:28822:13877,LH00995:25:23T55JLT4:3:2431:33425:21262,LH00995:25:23T55JLT4:4:1233:27171:5862,LH00995:25:23T55JLT4:4:1412:47056:24106,LH00995:25:23T55JLT4:4:2262:40908:19903,LH00995:25:23T55JLT4:4:2298:18499:27721,LH00995:25:23T55JLT4:4:2346:16848:2107,LH00995:25:23T55JLT4:4:2410:40787:3186,LH00995:25:23T55JLT4:4:2439:26346:3256 . YES_LDAS 0.0982 GT 1.9329 AG 1.7819 ["DGD_PARALOGS","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.03Mb]","LOCAL_INVERSION:-:+:[29458]"] CPSF6--GRM8 25 0 25.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CPSF6^ENSG00000111605.18 chr12:69262562:+ GRM8^ENSG00000179603.18 chr7:126445313:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1176:23838:2079,LH00995:25:23T55JLT4:1:1183:28182:19720,LH00995:25:23T55JLT4:1:1364:51910:7011,LH00995:25:23T55JLT4:1:1389:11379:10739,LH00995:25:23T55JLT4:1:2130:32535:3382,LH00995:25:23T55JLT4:2:1130:35868:10164,LH00995:25:23T55JLT4:2:1142:16355:19272,LH00995:25:23T55JLT4:2:1363:20732:8272,LH00995:25:23T55JLT4:2:1405:3071:29277,LH00995:25:23T55JLT4:2:1426:28894:12462,LH00995:25:23T55JLT4:2:1475:15433:15741,LH00995:25:23T55JLT4:2:2126:18029:16624,LH00995:25:23T55JLT4:2:2164:16824:20449,LH00995:25:23T55JLT4:3:1121:24599:25283,LH00995:25:23T55JLT4:3:1295:28773:22313,LH00995:25:23T55JLT4:3:1307:50745:7964,LH00995:25:23T55JLT4:3:1325:42388:17759,LH00995:25:23T55JLT4:3:1348:32883:20743,LH00995:25:23T55JLT4:3:1484:42275:15825,LH00995:25:23T55JLT4:3:2459:49945:2289,LH00995:25:23T55JLT4:3:2487:14413:2093,LH00995:25:23T55JLT4:4:1178:37688:7712,LH00995:25:23T55JLT4:4:1187:38271:28786,LH00995:25:23T55JLT4:4:1360:16622:17184,LH00995:25:23T55JLT4:4:2350:37276:25802 . NO_LDAS 0.0846 GT 1.9899 AG 1.8256 ["DEEPEST2019","TumorFusionsNAR2018","ChimerSeq","TCGA_StarF2019","INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr7]"] BIRC3--PDGFD 25 0 25.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE BIRC3^ENSG00000023445.16 chr11:102317571:+ PDGFD^ENSG00000170962.13 chr11:104000255:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1352:45293:15615,LH00995:25:23T55JLT4:1:1378:45592:19272,LH00995:25:23T55JLT4:1:2194:47598:1617,LH00995:25:23T55JLT4:2:1113:43189:15054,LH00995:25:23T55JLT4:2:1132:36572:13485,LH00995:25:23T55JLT4:2:1216:22341:7446,LH00995:25:23T55JLT4:2:1216:22358:7446,LH00995:25:23T55JLT4:2:1280:38157:27862,LH00995:25:23T55JLT4:2:1282:32672:22733,LH00995:25:23T55JLT4:2:1310:19469:16035,LH00995:25:23T55JLT4:2:1348:39436:16540,LH00995:25:23T55JLT4:2:1419:16201:1238,LH00995:25:23T55JLT4:2:1419:47898:27133,LH00995:25:23T55JLT4:2:2116:3726:20996,LH00995:25:23T55JLT4:2:2146:49702:17086,LH00995:25:23T55JLT4:2:2163:40649:3676,LH00995:25:23T55JLT4:2:2174:17334:20071,LH00995:25:23T55JLT4:2:2369:1947:23910,LH00995:25:23T55JLT4:2:2391:2537:4867,LH00995:25:23T55JLT4:2:2452:33789:13317,LH00995:25:23T55JLT4:2:2474:12294:10024,LH00995:25:23T55JLT4:3:2459:26961:28226,LH00995:25:23T55JLT4:4:1252:35140:21010,LH00995:25:23T55JLT4:4:1422:40544:21150,LH00995:25:23T55JLT4:4:2171:51700:21976 . YES_LDAS 0.0846 GT 1.8323 AG 1.8323 ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.57Mb]"] LILRB1--AC245884.12 24 0 22.39 0.00 ONLY_REF_SPLICE LILRB1^ENSG00000104972.15 chr19:54633318:+ AC245884.12^ENSG00000276758.1 chr19:54296252:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1274:31200:8384,LH00995:25:23T55JLT4:1:1335:15044:12658,LH00995:25:23T55JLT4:1:1429:27818:25115,LH00995:25:23T55JLT4:1:2168:31451:6325,LH00995:25:23T55JLT4:1:2307:13483:27525,LH00995:25:23T55JLT4:2:1242:6388:5092,LH00995:25:23T55JLT4:2:1274:35374:17156,LH00995:25:23T55JLT4:2:1376:29970:28926,LH00995:25:23T55JLT4:2:2131:28692:4489,LH00995:25:23T55JLT4:2:2197:44354:26096,LH00995:25:23T55JLT4:2:2285:31710:12798,LH00995:25:23T55JLT4:2:2387:30545:4139,LH00995:25:23T55JLT4:2:2479:1324:17843,LH00995:25:23T55JLT4:3:1165:24008:23504,LH00995:25:23T55JLT4:3:2105:34315:5932,LH00995:25:23T55JLT4:4:1136:41523:6899,LH00995:25:23T55JLT4:4:1201:50818:23364,LH00995:25:23T55JLT4:4:1364:16589:17941,LH00995:25:23T55JLT4:4:1414:30787:28772,LH00995:25:23T55JLT4:4:1449:34363:18599,LH00995:25:23T55JLT4:4:2298:6534:16554,LH00995:25:23T55JLT4:4:2388:7739:12616,LH00995:25:23T55JLT4:4:2391:45633:7011,LH00995:25:23T55JLT4:4:2479:37332:16456 . YES_LDAS 0.0758 GT 1.9329 AG 1.8256 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.32Mb]"] TMEM123--DYNC2H1 23 0 23.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- DYNC2H1^ENSG00000187240.16 chr11:103280348:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1306:41757:3718,LH00995:25:23T55JLT4:1:1351:31079:28324,LH00995:25:23T55JLT4:1:2231:15837:13611,LH00995:25:23T55JLT4:1:2239:49807:22229,LH00995:25:23T55JLT4:1:2462:15133:15166,LH00995:25:23T55JLT4:2:1311:16687:15587,LH00995:25:23T55JLT4:2:2145:28166:13975,LH00995:25:23T55JLT4:2:2193:24299:13387,LH00995:25:23T55JLT4:2:2193:2974:14312,LH00995:25:23T55JLT4:2:2247:47857:28941,LH00995:25:23T55JLT4:2:2291:16209:3494,LH00995:25:23T55JLT4:3:1243:16112:10921,LH00995:25:23T55JLT4:3:2101:37454:27203,LH00995:25:23T55JLT4:3:2265:24809:1995,LH00995:25:23T55JLT4:3:2301:40471:25760,LH00995:25:23T55JLT4:3:2325:51506:2667,LH00995:25:23T55JLT4:4:1113:33732:19692,LH00995:25:23T55JLT4:4:1139:42267:29683,LH00995:25:23T55JLT4:4:1262:36806:2121,LH00995:25:23T55JLT4:4:1306:33748:7530,LH00995:25:23T55JLT4:4:2170:14874:24022,LH00995:25:23T55JLT4:4:2252:39703:14872,LH00995:25:23T55JLT4:4:2289:31685:6283 . YES_LDAS 0.0779 GT 1.9656 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.64Mb]"] CHST11--MME 23 0 23.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CHST11^ENSG00000171310.11 chr12:104601991:+ MME^ENSG00000196549.13 chr3:155183570:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1161:8119:21962,LH00995:25:23T55JLT4:1:1360:32608:19734,LH00995:25:23T55JLT4:1:2133:30739:1589,LH00995:25:23T55JLT4:2:1231:21468:5960,LH00995:25:23T55JLT4:2:1245:21816:5890,LH00995:25:23T55JLT4:2:1346:4883:28464,LH00995:25:23T55JLT4:2:1427:9543:2317,LH00995:25:23T55JLT4:2:1443:5280:15643,LH00995:25:23T55JLT4:2:2201:20481:6213,LH00995:25:23T55JLT4:2:2454:43909:25101,LH00995:25:23T55JLT4:2:2481:26192:12350,LH00995:25:23T55JLT4:3:1125:25391:7179,LH00995:25:23T55JLT4:3:1307:48521:28632,LH00995:25:23T55JLT4:3:1329:23660:25536,LH00995:25:23T55JLT4:3:1357:11768:12168,LH00995:25:23T55JLT4:3:1472:21840:25157,LH00995:25:23T55JLT4:3:2173:17576:22705,LH00995:25:23T55JLT4:3:2266:39500:12084,LH00995:25:23T55JLT4:3:2401:3767:27259,LH00995:25:23T55JLT4:4:1234:51684:19706,LH00995:25:23T55JLT4:4:1349:39306:5246,LH00995:25:23T55JLT4:4:2201:46102:29207,LH00995:25:23T55JLT4:4:2282:38117:19636 . NO_LDAS 0.0779 GT 1.7056 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr3]"] AC104123.1--CAST 23 0 23.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC104123.1^ENSG00000251314.2 chr5:96379652:+ CAST^ENSG00000153113.24 chr5:96675539:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1289:43157:19959,LH00995:25:23T55JLT4:1:1350:37405:22355,LH00995:25:23T55JLT4:1:1363:43222:24583,LH00995:25:23T55JLT4:1:1478:8224:1518,LH00995:25:23T55JLT4:1:2108:15441:25311,LH00995:25:23T55JLT4:1:2231:3476:18768,LH00995:25:23T55JLT4:1:2253:19769:15068,LH00995:25:23T55JLT4:1:2356:51603:18866,LH00995:25:23T55JLT4:2:1138:37688:1659,LH00995:25:23T55JLT4:2:1260:26168:18137,LH00995:25:23T55JLT4:2:2117:31685:9225,LH00995:25:23T55JLT4:2:2339:31370:25550,LH00995:25:23T55JLT4:2:2389:37259:19692,LH00995:25:23T55JLT4:2:2432:43901:24274,LH00995:25:23T55JLT4:2:2475:43497:12000,LH00995:25:23T55JLT4:3:1341:45252:14116,LH00995:25:23T55JLT4:3:1358:29622:21374,LH00995:25:23T55JLT4:3:1372:13410:15965,LH00995:25:23T55JLT4:3:1476:20060:16862,LH00995:25:23T55JLT4:3:2156:17803:9646,LH00995:25:23T55JLT4:3:2186:17754:18922,LH00995:25:23T55JLT4:3:2251:4649:3873,LH00995:25:23T55JLT4:4:1102:38950:23798 . YES_LDAS 0.0779 GT 1.7819 AG 1.8295 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.11Mb]"] TLR4--AL160272.1 22 0 22.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TLR4^ENSG00000136869.16 chr9:117704565:+ AL160272.1^ENSG00000284977.2 chr9:117848065:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1190:36806:16189,LH00995:25:23T55JLT4:1:1191:12310:14956,LH00995:25:23T55JLT4:1:1419:10158:28744,LH00995:25:23T55JLT4:1:2330:35617:12280,LH00995:25:23T55JLT4:1:2444:16177:17254,LH00995:25:23T55JLT4:2:1115:11938:9099,LH00995:25:23T55JLT4:2:1248:22471:8146,LH00995:25:23T55JLT4:2:2131:24186:4055,LH00995:25:23T55JLT4:2:2327:25270:29249,LH00995:25:23T55JLT4:2:2337:11234:13793,LH00995:25:23T55JLT4:3:2135:26395:20911,LH00995:25:23T55JLT4:3:2146:45366:6997,LH00995:25:23T55JLT4:3:2146:45374:7011,LH00995:25:23T55JLT4:3:2258:30310:7151,LH00995:25:23T55JLT4:3:2280:26807:1897,LH00995:25:23T55JLT4:3:2475:42130:14200,LH00995:25:23T55JLT4:4:1101:17892:6241,LH00995:25:23T55JLT4:4:1241:43853:17212,LH00995:25:23T55JLT4:4:1321:22058:21864,LH00995:25:23T55JLT4:4:1360:46967:28324,LH00995:25:23T55JLT4:4:1430:39800:5232,LH00995:25:23T55JLT4:4:2102:30334:17002 . YES_LDAS 0.0745 GT 1.7968 AG 1.8892 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.03Mb]","NEIGHBORS[34720]"] COL1A1--SLC45A4 22 0 22.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE COL1A1^ENSG00000108821.14 chr17:50189867:- SLC45A4^ENSG00000022567.10 chr8:141254178:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1321:24534:21724,LH00995:25:23T55JLT4:1:1368:19437:22257,LH00995:25:23T55JLT4:1:1477:41126:21878,LH00995:25:23T55JLT4:1:2189:49127:17240,LH00995:25:23T55JLT4:1:2206:25399:15797,LH00995:25:23T55JLT4:1:2307:49653:14564,LH00995:25:23T55JLT4:1:2334:12124:26685,LH00995:25:23T55JLT4:1:2406:12002:6185,LH00995:25:23T55JLT4:2:1138:27568:28800,LH00995:25:23T55JLT4:2:2175:24979:9295,LH00995:25:23T55JLT4:2:2263:40204:28352,LH00995:25:23T55JLT4:2:2377:17423:19300,LH00995:25:23T55JLT4:2:2425:8241:18333,LH00995:25:23T55JLT4:3:1227:23150:5568,LH00995:25:23T55JLT4:3:2136:48359:28324,LH00995:25:23T55JLT4:3:2161:18847:15124,LH00995:25:23T55JLT4:3:2406:42510:8777,LH00995:25:23T55JLT4:4:1239:42761:25802,LH00995:25:23T55JLT4:4:2274:8783:2597,LH00995:25:23T55JLT4:4:2304:36038:10318,LH00995:25:23T55JLT4:4:2307:26403:8763,LH00995:25:23T55JLT4:4:2352:41960:18613 . YES_LDAS 0.0745 GT 1.7056 AG 1.7819 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr8]"] SAMD5--SASH1 22 1 22.00 1.00 ONLY_REF_SPLICE SAMD5^ENSG00000203727.4 chr6:147509387:+ SASH1^ENSG00000111961.18 chr6:148390134:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1221:21233:11747,LH00995:25:23T55JLT4:1:1489:43990:12854,LH00995:25:23T55JLT4:1:2392:36806:23280,LH00995:25:23T55JLT4:1:2398:24793:6703,LH00995:25:23T55JLT4:2:1316:41604:17044,LH00995:25:23T55JLT4:2:2192:7593:4825,LH00995:25:23T55JLT4:2:2226:7237:9898,LH00995:25:23T55JLT4:2:2434:16339:26755,LH00995:25:23T55JLT4:3:1324:42744:8903,LH00995:25:23T55JLT4:3:1344:26314:3676,LH00995:25:23T55JLT4:3:1350:26597:4391,LH00995:25:23T55JLT4:3:1411:27996:27609,LH00995:25:23T55JLT4:3:1466:6275:17927,LH00995:25:23T55JLT4:3:2115:9867:12462,LH00995:25:23T55JLT4:3:2231:49864:5680,LH00995:25:23T55JLT4:3:2274:10554:6703,LH00995:25:23T55JLT4:3:2424:49993:19608,LH00995:25:23T55JLT4:4:1117:20578:23448,LH00995:25:23T55JLT4:4:1218:8572:6605,LH00995:25:23T55JLT4:4:2443:3823:17016,LH00995:25:23T55JLT4:4:2453:42502:19468,LH00995:25:23T55JLT4:4:2467:47801:2667 LH00995:25:23T55JLT4:1:1288:26281:21416 YES_LDAS 0.0779 GT 1.8295 AG 1.9219 ["HGNC_GENEFAM","INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.70Mb]"] NONO--KAT6A 21 0 21.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE NONO^ENSG00000147140.17 chrX:71290778:+ KAT6A^ENSG00000083168.11 chr8:41933275:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1102:36200:16147,LH00995:25:23T55JLT4:1:1118:15627:9884,LH00995:25:23T55JLT4:1:1418:29453:2135,LH00995:25:23T55JLT4:1:2235:2489:28156,LH00995:25:23T55JLT4:1:2320:44120:25802,LH00995:25:23T55JLT4:2:1264:2958:15265,LH00995:25:23T55JLT4:2:2168:22681:3046,LH00995:25:23T55JLT4:2:2174:51296:2639,LH00995:25:23T55JLT4:2:2242:38230:11817,LH00995:25:23T55JLT4:2:2252:33222:14298,LH00995:25:23T55JLT4:2:2475:36151:21976,LH00995:25:23T55JLT4:3:1143:18491:25746,LH00995:25:23T55JLT4:3:1372:6849:16147,LH00995:25:23T55JLT4:3:1480:23725:12084,LH00995:25:23T55JLT4:3:2316:37615:7474,LH00995:25:23T55JLT4:3:2336:37089:21080,LH00995:25:23T55JLT4:4:1408:13523:8230,LH00995:25:23T55JLT4:4:1491:49386:6339,LH00995:25:23T55JLT4:4:2135:19599:15783,LH00995:25:23T55JLT4:4:2156:21524:28422,LH00995:25:23T55JLT4:4:2435:43853:3116 . NO_LDAS 0.0711 GC 1.7819 AG 1.4566 ["INTERCHROMOSOMAL[chrX--chr8]"] SH3BP5--AC002074.1 20 0 20.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE SH3BP5^ENSG00000131370.16 chr3:15304103:- AC002074.1^ENSG00000285090.1 chr7:94279390:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1135:14899:12350,LH00995:25:23T55JLT4:1:1316:10999:23420,LH00995:25:23T55JLT4:1:2394:7917:16848,LH00995:25:23T55JLT4:2:1230:17261:12798,LH00995:25:23T55JLT4:2:1262:5919:23952,LH00995:25:23T55JLT4:2:1327:27600:28492,LH00995:25:23T55JLT4:2:1395:29865:4055,LH00995:25:23T55JLT4:2:1402:33692:11467,LH00995:25:23T55JLT4:2:2144:19825:9085,LH00995:25:23T55JLT4:2:2173:46353:29473,LH00995:25:23T55JLT4:2:2214:33239:6283,LH00995:25:23T55JLT4:3:1177:30876:20071,LH00995:25:23T55JLT4:3:1323:21557:22957,LH00995:25:23T55JLT4:3:1362:13758:2135,LH00995:25:23T55JLT4:3:1377:44686:10893,LH00995:25:23T55JLT4:3:2156:24024:21402,LH00995:25:23T55JLT4:3:2229:23976:14956,LH00995:25:23T55JLT4:3:2354:14478:4503,LH00995:25:23T55JLT4:4:1490:9195:3312,LH00995:25:23T55JLT4:4:2212:46336:7109 . YES_LDAS 0.0677 GT 1.5546 AG 1.5546 ["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr7]"] AC239859.5--AC013734.1 20 0 3.54 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC239859.5^ENSG00000277702.1 chr1:143419625:- AC013734.1^ENSG00000277146.1 chrY:26453985:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1111:27835:4013,LH00995:25:23T55JLT4:1:1253:33077:25620,LH00995:25:23T55JLT4:1:2421:4374:16175,LH00995:25:23T55JLT4:2:1184:16468:24765,LH00995:25:23T55JLT4:2:1430:15643:18964,LH00995:25:23T55JLT4:2:1495:23102:28184,LH00995:25:23T55JLT4:2:2246:4430:25353,LH00995:25:23T55JLT4:2:2285:7836:23097,LH00995:25:23T55JLT4:2:2319:4851:17871,LH00995:25:23T55JLT4:2:2402:12358:5120,LH00995:25:23T55JLT4:2:2402:45317:1953,LH00995:25:23T55JLT4:3:1219:19777:3144,LH00995:25:23T55JLT4:3:1339:39266:5736,LH00995:25:23T55JLT4:3:1423:13782:25914,LH00995:25:23T55JLT4:3:2185:7723:5806,LH00995:25:23T55JLT4:3:2228:47008:21808,LH00995:25:23T55JLT4:4:1315:3128:29459,LH00995:25:23T55JLT4:4:1496:48068:16610,LH00995:25:23T55JLT4:4:2194:48982:19090,LH00995:25:23T55JLT4:4:2273:9834:26951 . YES_LDAS 0.012 GT 1.7465 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chrY]"] SRGAP2C--FCGR1B 20 1 20.00 0.80 ONLY_REF_SPLICE SRGAP2C^ENSG00000171943.12 chr1:121324640:+ FCGR1B^ENSG00000198019.13 chr1:121092996:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2154:24647:24891,LH00995:25:23T55JLT4:1:2197:42971:27511,LH00995:25:23T55JLT4:1:2360:49346:2205,LH00995:25:23T55JLT4:1:2365:19380:17675,LH00995:25:23T55JLT4:2:1295:4940:26853,LH00995:25:23T55JLT4:2:1453:24243:21556,LH00995:25:23T55JLT4:2:2142:51514:1168,LH00995:25:23T55JLT4:2:2331:12714:17899,LH00995:25:23T55JLT4:2:2433:3395:13303,LH00995:25:23T55JLT4:3:1190:18507:6913,LH00995:25:23T55JLT4:3:1295:46320:19384,LH00995:25:23T55JLT4:3:2182:30504:9337,LH00995:25:23T55JLT4:3:2236:32187:14186,LH00995:25:23T55JLT4:3:2244:42947:20939,LH00995:25:23T55JLT4:3:2420:13499:14270,LH00995:25:23T55JLT4:3:2463:37866:12560,LH00995:25:23T55JLT4:4:1146:23846:28632,LH00995:25:23T55JLT4:4:1246:44492:24541,LH00995:25:23T55JLT4:4:2256:25836:17731,LH00995:25:23T55JLT4:4:2402:35245:22229 LH00995:25:23T55JLT4:4:1129:27090:5666 YES_LDAS 0.0704 GT 1.7968 AG 1.9329 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.09Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[87650]"] TLK2P1--AC110079.1 19 0 19.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TLK2P1^ENSG00000226049.3 chr17:34039043:- AC110079.1^ENSG00000260404.3 chr4:118595912:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1278:7116:7025,LH00995:25:23T55JLT4:1:2140:6849:27777,LH00995:25:23T55JLT4:1:2284:34420:3536,LH00995:25:23T55JLT4:1:2398:14583:2976,LH00995:25:23T55JLT4:2:1103:25343:20939,LH00995:25:23T55JLT4:2:1151:28166:29725,LH00995:25:23T55JLT4:2:1496:31839:14592,LH00995:25:23T55JLT4:2:2126:11412:25760,LH00995:25:23T55JLT4:2:2168:11509:15867,LH00995:25:23T55JLT4:2:2385:16808:15965,LH00995:25:23T55JLT4:2:2410:37898:3901,LH00995:25:23T55JLT4:3:1111:13596:10430,LH00995:25:23T55JLT4:3:1230:15635:23910,LH00995:25:23T55JLT4:4:1291:5757:29669,LH00995:25:23T55JLT4:4:2223:6493:24387,LH00995:25:23T55JLT4:4:2247:34727:12560,LH00995:25:23T55JLT4:4:2307:5894:4937,LH00995:25:23T55JLT4:4:2401:31200:6899,LH00995:25:23T55JLT4:4:2408:50762:18417 . YES_LDAS 0.0643 GT 1.7465 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr4]"] PKNOX2--MEIS3 19 0 19.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE PKNOX2^ENSG00000165495.16 chr11:125385722:+ MEIS3^ENSG00000105419.18 chr19:47417350:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1194:8063:22481,LH00995:25:23T55JLT4:1:1297:28061:29011,LH00995:25:23T55JLT4:1:1307:17034:20729,LH00995:25:23T55JLT4:1:1354:24607:7726,LH00995:25:23T55JLT4:1:1418:40091:7698,LH00995:25:23T55JLT4:1:2112:9721:14368,LH00995:25:23T55JLT4:1:2208:27826:14087,LH00995:25:23T55JLT4:2:1205:33311:21318,LH00995:25:23T55JLT4:2:2387:39881:27567,LH00995:25:23T55JLT4:2:2403:14931:15853,LH00995:25:23T55JLT4:2:2405:33724:13569,LH00995:25:23T55JLT4:3:1249:32543:18137,LH00995:25:23T55JLT4:3:2204:16573:5974,LH00995:25:23T55JLT4:3:2456:16784:4657,LH00995:25:23T55JLT4:4:1133:36968:25241,LH00995:25:23T55JLT4:4:1248:12172:8160,LH00995:25:23T55JLT4:4:1354:4891:11551,LH00995:25:23T55JLT4:4:1410:3411:27763,LH00995:25:23T55JLT4:4:2332:32931:22397 . NO_LDAS 0.0643 GT 1.9656 AG 1.9656 ["HGNC_GENEFAM","INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr19]"] PTPRM--TTC39C 18 0 18.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE PTPRM^ENSG00000173482.17 chr18:7567891:+ TTC39C^ENSG00000168234.13 chr18:24064140:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2364:37211:21234,LH00995:25:23T55JLT4:1:2492:24404:25255,LH00995:25:23T55JLT4:2:1193:6477:1659,LH00995:25:23T55JLT4:2:1275:33125:9113,LH00995:25:23T55JLT4:2:1309:10126:23167,LH00995:25:23T55JLT4:2:1327:4729:16203,LH00995:25:23T55JLT4:2:2239:34557:2401,LH00995:25:23T55JLT4:2:2309:37866:13037,LH00995:25:23T55JLT4:2:2349:42130:17198,LH00995:25:23T55JLT4:3:1340:6097:7502,LH00995:25:23T55JLT4:3:1404:27956:27679,LH00995:25:23T55JLT4:3:1422:31014:1168,LH00995:25:23T55JLT4:4:1245:13823:21640,LH00995:25:23T55JLT4:4:1361:27875:27988,LH00995:25:23T55JLT4:4:2151:12019:10809,LH00995:25:23T55JLT4:4:2191:36070:15643,LH00995:25:23T55JLT4:4:2273:20602:10318,LH00995:25:23T55JLT4:4:2353:8103:13415 . YES_LDAS 0.0609 GT 1.9656 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:15.59Mb]"] PDCD1LG2--DYNC2H1 18 1 18.00 1.00 ONLY_REF_SPLICE PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 chr9:5535050:+ DYNC2H1^ENSG00000187240.16 chr11:103113537:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1223:30771:11257,LH00995:25:23T55JLT4:1:2361:42380:29487,LH00995:25:23T55JLT4:2:1204:8969:21416,LH00995:25:23T55JLT4:2:1452:10481:9295,LH00995:25:23T55JLT4:2:2133:29582:12252,LH00995:25:23T55JLT4:2:2154:23288:3760,LH00995:25:23T55JLT4:2:2290:4236:29109,LH00995:25:23T55JLT4:2:2494:9495:6213,LH00995:25:23T55JLT4:3:1121:51797:15335,LH00995:25:23T55JLT4:3:1139:16678:3074,LH00995:25:23T55JLT4:3:1234:2594:1490,LH00995:25:23T55JLT4:3:1410:2545:18473,LH00995:25:23T55JLT4:3:2217:29784:2822,LH00995:25:23T55JLT4:3:2221:6372:18655,LH00995:25:23T55JLT4:3:2442:49152:10136,LH00995:25:23T55JLT4:3:2485:15837:20393,LH00995:25:23T55JLT4:4:1396:23191:13765,LH00995:25:23T55JLT4:4:2242:18046:1378 LH00995:25:23T55JLT4:4:1420:12302:25760 YES_LDAS 0.0643 GT 1.9219 AG 1.7819 ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"] RPS3AP11--SEPTIN7 17 0 5.67 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RPS3AP11^ENSG00000230116.1 chr1:42491744:+ SEPTIN7^ENSG00000122545.20 chr7:35832798:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1181:14073:1224,LH00995:25:23T55JLT4:2:1325:28943:15489,LH00995:25:23T55JLT4:2:2153:28514:24667,LH00995:25:23T55JLT4:2:2438:10684:21808,LH00995:25:23T55JLT4:3:1115:36547:8483,LH00995:25:23T55JLT4:3:1166:45843:27161,LH00995:25:23T55JLT4:3:1269:24202:25578,LH00995:25:23T55JLT4:3:1280:38974:29585,LH00995:25:23T55JLT4:3:1286:30634:28618,LH00995:25:23T55JLT4:3:1290:20853:9660,LH00995:25:23T55JLT4:3:2193:48707:27469,LH00995:25:23T55JLT4:3:2317:39589:22663,LH00995:25:23T55JLT4:3:2484:42486:7249,LH00995:25:23T55JLT4:4:1206:13507:4335,LH00995:25:23T55JLT4:4:1329:32988:5960,LH00995:25:23T55JLT4:4:2213:2634:3522,LH00995:25:23T55JLT4:4:2233:34104:29221 . NO_LDAS 0.0192 GT 1.9329 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr7]"] PRKCA--ZNF585A 17 0 17.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PRKCA^ENSG00000154229.12 chr17:66496283:+ ZNF585A^ENSG00000196967.11 chr19:37146612:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1133:13863:24513,LH00995:25:23T55JLT4:1:1190:38958:9940,LH00995:25:23T55JLT4:1:1284:26637:7544,LH00995:25:23T55JLT4:1:1378:12569:18459,LH00995:25:23T55JLT4:1:1445:26961:21668,LH00995:25:23T55JLT4:2:1103:48731:4279,LH00995:25:23T55JLT4:2:1135:29056:10360,LH00995:25:23T55JLT4:2:1272:44168:5736,LH00995:25:23T55JLT4:2:2344:14769:2485,LH00995:25:23T55JLT4:3:1163:32171:23770,LH00995:25:23T55JLT4:3:1291:19453:9786,LH00995:25:23T55JLT4:3:1317:35010:14620,LH00995:25:23T55JLT4:3:2194:41814:16932,LH00995:25:23T55JLT4:4:1365:23523:1336,LH00995:25:23T55JLT4:4:1367:15950:27007,LH00995:25:23T55JLT4:4:1377:21646:10472,LH00995:25:23T55JLT4:4:1384:40099:24162 . NO_LDAS 0.0576 GT 1.9329 AG 1.5656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr19]"] AP001347.1--ANKRD20A11P 16 0 16.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AP001347.1^ENSG00000224905.7 chr21:14027597:+ ANKRD20A11P^ENSG00000215559.8 chr21:13970110:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1193:18903:15587,LH00995:25:23T55JLT4:1:1365:14769:13107,LH00995:25:23T55JLT4:1:1488:18167:29109,LH00995:25:23T55JLT4:1:2272:38165:22579,LH00995:25:23T55JLT4:2:1158:48828:15265,LH00995:25:23T55JLT4:2:1256:30577:4391,LH00995:25:23T55JLT4:2:2175:43707:26993,LH00995:25:23T55JLT4:2:2386:50600:3396,LH00995:25:23T55JLT4:3:1230:21371:16750,LH00995:25:23T55JLT4:3:1235:30747:11159,LH00995:25:23T55JLT4:3:1401:43197:15096,LH00995:25:23T55JLT4:3:1468:34986:3816,LH00995:25:23T55JLT4:4:2112:37170:17016,LH00995:25:23T55JLT4:4:2144:45002:17212,LH00995:25:23T55JLT4:4:2246:4357:5218,LH00995:25:23T55JLT4:4:2323:19429:26250 . YES_LDAS 0.0542 GT 1.8323 AG 1.8892 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.05Mb]","LOCAL_INVERSION:+:-:[46982]"] PTPN2--NPIPB3 15 0 7.47 0.00 ONLY_REF_SPLICE PTPN2^ENSG00000175354.20 chr18:12869025:- NPIPB3^ENSG00000169246.16 chr16:21406859:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1106:27495:12560,LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:39298:16105,LH00995:25:23T55JLT4:1:1469:46110:25297,LH00995:25:23T55JLT4:2:1188:5110:25353,LH00995:25:23T55JLT4:2:1232:31402:9576,LH00995:25:23T55JLT4:2:1273:36467:22355,LH00995:25:23T55JLT4:2:1439:12763:4587,LH00995:25:23T55JLT4:3:1116:19445:13639,LH00995:25:23T55JLT4:3:1332:35188:6521,LH00995:25:23T55JLT4:3:2145:38619:29249,LH00995:25:23T55JLT4:3:2219:8880:23392,LH00995:25:23T55JLT4:3:2483:24696:25367,LH00995:25:23T55JLT4:4:1329:33983:1715,LH00995:25:23T55JLT4:4:1401:31257:12378,LH00995:25:23T55JLT4:4:1440:20311:11131 . YES_LDAS 0.0253 GT 1.9329 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr18--chr16]"] EWSR1--IGH@-ext 15 0 15.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE EWSR1^ENSG00000182944.18 chr22:29287118:+ IGH@-ext^IGH.g@-ext chr14:106679373:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1208:20133:13989,LH00995:25:23T55JLT4:1:2315:8912:20617,LH00995:25:23T55JLT4:1:2445:24073:29221,LH00995:25:23T55JLT4:2:1310:36208:26390,LH00995:25:23T55JLT4:2:1398:12237:20099,LH00995:25:23T55JLT4:2:1427:48318:19875,LH00995:25:23T55JLT4:2:1484:3039:3494,LH00995:25:23T55JLT4:2:2256:11517:2794,LH00995:25:23T55JLT4:2:2419:36920:23195,LH00995:25:23T55JLT4:4:1173:17552:25774,LH00995:25:23T55JLT4:4:1297:36539:14242,LH00995:25:23T55JLT4:4:1301:41830:23742,LH00995:25:23T55JLT4:4:2125:8613:1659,LH00995:25:23T55JLT4:4:2337:9753:20533,LH00995:25:23T55JLT4:4:2357:9875:11187 . NO_LDAS 0.0508 AG 1.5656 TC 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr14]"] CCDC198--NPIPB3 15 0 7.47 0.00 ONLY_REF_SPLICE CCDC198^ENSG00000100557.10 chr14:57475582:- NPIPB3^ENSG00000169246.16 chr16:21406859:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1106:27495:12560,LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:39298:16105,LH00995:25:23T55JLT4:1:1469:46110:25297,LH00995:25:23T55JLT4:2:1188:5110:25353,LH00995:25:23T55JLT4:2:1232:31402:9576,LH00995:25:23T55JLT4:2:1273:36467:22355,LH00995:25:23T55JLT4:2:1439:12763:4587,LH00995:25:23T55JLT4:3:1116:19445:13639,LH00995:25:23T55JLT4:3:1332:35188:6521,LH00995:25:23T55JLT4:3:2145:38619:29249,LH00995:25:23T55JLT4:3:2219:8880:23392,LH00995:25:23T55JLT4:3:2483:24696:25367,LH00995:25:23T55JLT4:4:1329:33983:1715,LH00995:25:23T55JLT4:4:1401:31257:12378,LH00995:25:23T55JLT4:4:1440:20311:11131 . YES_LDAS 0.0253 GT 1.9329 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr16]"] AC242842.1--SEC22B2P 14 0 2.33 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC242842.1^ENSG00000275557.1 chr1:149608516:+ SEC22B2P^ENSG00000274423.1 chr1:149351251:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2104:10611:8763,LH00995:25:23T55JLT4:2:1317:28150:11874,LH00995:25:23T55JLT4:2:2151:2885:15895,LH00995:25:23T55JLT4:2:2194:42995:18922,LH00995:25:23T55JLT4:2:2345:16589:14634,LH00995:25:23T55JLT4:2:2490:31087:15699,LH00995:25:23T55JLT4:3:1478:10716:15559,LH00995:25:23T55JLT4:4:1185:20893:14522,LH00995:25:23T55JLT4:4:1236:7990:22775,LH00995:25:23T55JLT4:4:1258:13014:18249,LH00995:25:23T55JLT4:4:1277:38538:19664,LH00995:25:23T55JLT4:4:2191:23142:13373,LH00995:25:23T55JLT4:4:2406:39120:14480,LH00995:25:23T55JLT4:4:2417:42267:16371 . YES_LDAS 0.0079 GT 1.7819 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.25Mb]"] TRIM58--OR2W3 13 0 13.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TRIM58^ENSG00000162722.9 chr1:247868063:+ OR2W3^ENSG00000238243.3 chr1:247895557:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1212:4600:2191,LH00995:25:23T55JLT4:1:1310:42906:24541,LH00995:25:23T55JLT4:1:2308:17633:28969,LH00995:25:23T55JLT4:1:2403:29161:24106,LH00995:25:23T55JLT4:2:1274:25238:10725,LH00995:25:23T55JLT4:2:1344:19275:14298,LH00995:25:23T55JLT4:2:1473:20667:8441,LH00995:25:23T55JLT4:2:2113:32753:22117,LH00995:25:23T55JLT4:2:2389:24008:21318,LH00995:25:23T55JLT4:3:2323:27479:27385,LH00995:25:23T55JLT4:4:2128:45997:20001,LH00995:25:23T55JLT4:4:2273:21363:19006,LH00995:25:23T55JLT4:4:2282:28846:11257 . YES_LDAS 0.044 GT 1.8892 AG 1.6729 ["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.02Mb]","NEIGHBORS[15449]"] TMEM123--PPP2R2C 13 0 13.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- PPP2R2C^ENSG00000074211.14 chr4:6381094:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1173:40520:6563,LH00995:25:23T55JLT4:1:1318:52056:28646,LH00995:25:23T55JLT4:1:1420:46377:28842,LH00995:25:23T55JLT4:2:1252:23078:9842,LH00995:25:23T55JLT4:2:1271:36062:28380,LH00995:25:23T55JLT4:2:1412:34307:3004,LH00995:25:23T55JLT4:2:1414:23579:7628,LH00995:25:23T55JLT4:2:2277:31669:16540,LH00995:25:23T55JLT4:3:1116:10061:6773,LH00995:25:23T55JLT4:3:2494:21363:12840,LH00995:25:23T55JLT4:4:1106:29881:6913,LH00995:25:23T55JLT4:4:1396:35528:26642,LH00995:25:23T55JLT4:4:2360:19114:7740 . YES_LDAS 0.044 GT 1.9656 AG 1.8256 ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr4]"] TMEM123--PDGFD 13 0 13.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- PDGFD^ENSG00000170962.13 chr11:104000237:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1178:39144:2976,LH00995:25:23T55JLT4:1:2161:30278:16203,LH00995:25:23T55JLT4:2:1162:47695:18039,LH00995:25:23T55JLT4:2:1172:50187:21206,LH00995:25:23T55JLT4:2:2210:45244:9477,LH00995:25:23T55JLT4:3:1123:21994:28478,LH00995:25:23T55JLT4:3:2308:1769:21248,LH00995:25:23T55JLT4:4:1158:18054:3046,LH00995:25:23T55JLT4:4:1264:5886:25157,LH00995:25:23T55JLT4:4:1386:28676:18361,LH00995:25:23T55JLT4:4:1406:17892:3887,LH00995:25:23T55JLT4:4:2406:20982:29557,LH00995:25:23T55JLT4:4:2476:1696:29557 . YES_LDAS 0.044 GT 1.9656 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]"] AC008740.1--CRYM-AS1 13 0 13.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC008740.1^ENSG00000257403.2 chr16:21352138:+ CRYM-AS1^ENSG00000189149.12 chr16:21338921:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1288:44459:8258,LH00995:25:23T55JLT4:1:2218:28312:21122,LH00995:25:23T55JLT4:1:2312:1728:27539,LH00995:25:23T55JLT4:1:2455:14737:7165,LH00995:25:23T55JLT4:2:2119:36863:4433,LH00995:25:23T55JLT4:2:2197:18660:29151,LH00995:25:23T55JLT4:2:2394:19162:7768,LH00995:25:23T55JLT4:3:1110:27859:11986,LH00995:25:23T55JLT4:3:1323:31410:8076,LH00995:25:23T55JLT4:3:1353:46935:6605,LH00995:25:23T55JLT4:4:1179:22463:16315,LH00995:25:23T55JLT4:4:1241:17374:2205,LH00995:25:23T55JLT4:4:2185:23717:12742 . YES_LDAS 0.044 GT 1.7232 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr16:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[8102]"] YAF2--RYBP 12 0 12.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE YAF2^ENSG00000015153.15 chr12:42238155:- RYBP^ENSG00000163602.11 chr3:72446621:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1176:6841:16974,LH00995:25:23T55JLT4:1:1229:18677:4237,LH00995:25:23T55JLT4:1:1326:41215:11523,LH00995:25:23T55JLT4:1:1396:28700:19272,LH00995:25:23T55JLT4:1:2279:17560:29095,LH00995:25:23T55JLT4:2:1182:15335:23840,LH00995:25:23T55JLT4:2:2106:46150:6507,LH00995:25:23T55JLT4:2:2404:43950:4321,LH00995:25:23T55JLT4:3:1128:23134:6381,LH00995:25:23T55JLT4:3:2367:20812:2695,LH00995:25:23T55JLT4:4:1162:1987:14984,LH00995:25:23T55JLT4:4:2398:47129:5792 . YES_LDAS 0.0406 GT 1.5656 AG 1.4566 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr3]"] FBXO25--SEPTIN14 12 0 12.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE FBXO25^ENSG00000147364.17 chr8:435707:+ SEPTIN14^ENSG00000154997.9 chr7:55796092:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1235:36782:15531,LH00995:25:23T55JLT4:2:1481:24089:8286,LH00995:25:23T55JLT4:2:2145:16379:17549,LH00995:25:23T55JLT4:2:2337:22770:20687,LH00995:25:23T55JLT4:3:1310:45616:25199,LH00995:25:23T55JLT4:3:1441:21120:27946,LH00995:25:23T55JLT4:3:2216:14891:23322,LH00995:25:23T55JLT4:3:2230:46611:22103,LH00995:25:23T55JLT4:3:2250:51287:8735,LH00995:25:23T55JLT4:4:1389:21718:29291,LH00995:25:23T55JLT4:4:1465:24162:21640,LH00995:25:23T55JLT4:4:2121:17374:15433 . YES_LDAS 0.0406 GT 1.7819 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr7]"] TPTE--BAGE2 11 0 5.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE TPTE^ENSG00000274391.5 chr21:10527412:+ BAGE2^ENSG00000187172.15 chr21:10514122:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1165:41846:3760,LH00995:25:23T55JLT4:1:2104:41604:24330,LH00995:25:23T55JLT4:1:2498:6970:27623,LH00995:25:23T55JLT4:2:1119:12908:5764,LH00995:25:23T55JLT4:2:1319:24154:11173,LH00995:25:23T55JLT4:2:2104:32203:26432,LH00995:25:23T55JLT4:3:1133:18701:18571,LH00995:25:23T55JLT4:3:1328:20974:16259,LH00995:25:23T55JLT4:3:2106:42947:11467,LH00995:25:23T55JLT4:3:2217:49038:14031,LH00995:25:23T55JLT4:4:1255:16711:12462 . YES_LDAS 0.0186 GT 1.9656 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]"] TMEFF2--TEX41 11 0 11.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEFF2^ENSG00000144339.12 chr2:191998262:- TEX41^ENSG00000226674.11 chr2:144667969:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1245:42032:8623,LH00995:25:23T55JLT4:1:1358:5725:2205,LH00995:25:23T55JLT4:2:1431:45916:27567,LH00995:25:23T55JLT4:2:1492:35156:9379,LH00995:25:23T55JLT4:2:2104:15845:28254,LH00995:25:23T55JLT4:3:1154:41579:22859,LH00995:25:23T55JLT4:3:2201:19445:5400,LH00995:25:23T55JLT4:3:2490:47534:8455,LH00995:25:23T55JLT4:4:1438:5045:9996,LH00995:25:23T55JLT4:4:1458:33320:16736,LH00995:25:23T55JLT4:4:2462:16937:11257 . YES_LDAS 0.0372 GT 1.8892 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:46.69Mb]"] EWSR1--IGH@-ext 11 0 11.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE EWSR1^ENSG00000182944.18 chr22:29287133:+ IGH@-ext^IGH.g@-ext chr14:106679374:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1198:40398:13583,LH00995:25:23T55JLT4:1:1296:4212:4265,LH00995:25:23T55JLT4:1:2182:25165:6395,LH00995:25:23T55JLT4:2:1413:24501:12056,LH00995:25:23T55JLT4:2:1440:20303:9127,LH00995:25:23T55JLT4:2:2234:1186:15503,LH00995:25:23T55JLT4:3:1172:13669:17619,LH00995:25:23T55JLT4:3:1363:44896:12322,LH00995:25:23T55JLT4:3:2414:48561:8244,LH00995:25:23T55JLT4:4:1401:35585:27890,LH00995:25:23T55JLT4:4:2253:34832:2177 . NO_LDAS 0.0372 AG 1.8062 CT 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr14]"] COL8A1--CMSS1 11 0 11.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE COL8A1^ENSG00000144810.16 chr3:99791010:+ CMSS1^ENSG00000184220.12 chr3:100146973:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1201:17463:16904,LH00995:25:23T55JLT4:1:1276:31467:25185,LH00995:25:23T55JLT4:1:1336:19227:2836,LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:46118:17913,LH00995:25:23T55JLT4:1:2462:38740:14326,LH00995:25:23T55JLT4:3:1189:4187:6633,LH00995:25:23T55JLT4:3:1213:32276:25774,LH00995:25:23T55JLT4:3:1231:27503:20365,LH00995:25:23T55JLT4:4:1219:40957:5022,LH00995:25:23T55JLT4:4:1323:19461:26418,LH00995:25:23T55JLT4:4:2326:47971:27427 . YES_LDAS 0.0372 GT 1.4566 AG 1.9086 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.02Mb]","NEIGHBORS[18611]"] CHCHD10--AC005064.1 11 0 11.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CHCHD10^ENSG00000250479.9 chr22:23767834:- AC005064.1^ENSG00000234715.2 chr7:103446122:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1430:40779:10430,LH00995:25:23T55JLT4:1:2323:14130:7796,LH00995:25:23T55JLT4:2:1220:26168:26881,LH00995:25:23T55JLT4:2:1382:41879:6030,LH00995:25:23T55JLT4:2:2427:43384:13513,LH00995:25:23T55JLT4:3:1108:13426:3999,LH00995:25:23T55JLT4:3:1290:8265:1392,LH00995:25:23T55JLT4:3:2386:50414:27763,LH00995:25:23T55JLT4:4:1209:15805:8455,LH00995:25:23T55JLT4:4:2105:25294:10851,LH00995:25:23T55JLT4:4:2201:49977:10388 . NO_LDAS 0.0372 GT 1.6402 AG 1.1589 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr7]"] APLP2--CERS3 11 0 11.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE APLP2^ENSG00000084234.18 chr11:130121799:+ CERS3^ENSG00000154227.14 chr15:100402823:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1429:31410:10262,LH00995:25:23T55JLT4:1:1481:29145:4153,LH00995:25:23T55JLT4:1:2267:26370:7782,LH00995:25:23T55JLT4:2:1254:25577:8202,LH00995:25:23T55JLT4:2:2210:50284:20673,LH00995:25:23T55JLT4:2:2358:50122:2906,LH00995:25:23T55JLT4:2:2409:4390:21696,LH00995:25:23T55JLT4:3:1445:34743:25788,LH00995:25:23T55JLT4:3:2243:22026:24106,LH00995:25:23T55JLT4:4:1190:23968:20071,LH00995:25:23T55JLT4:4:1429:44468:26152 . NO_LDAS 0.0372 GT 1.7819 AG 0.9968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr15]"] NDUFAF6--NPIPB3 10 0 1.67 0.00 ONLY_REF_SPLICE NDUFAF6^ENSG00000156170.13 chr8:95044595:+ NPIPB3^ENSG00000169246.16 chr16:21406859:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1271:27357:25690,LH00995:25:23T55JLT4:2:2156:46935:23308,LH00995:25:23T55JLT4:2:2322:6801:13233,LH00995:25:23T55JLT4:2:2484:46967:28184,LH00995:25:23T55JLT4:3:1215:45827:7292,LH00995:25:23T55JLT4:4:1129:51077:15012,LH00995:25:23T55JLT4:4:1478:21621:26572,LH00995:25:23T55JLT4:4:2127:37745:10248,LH00995:25:23T55JLT4:4:2320:5789:25606,LH00995:25:23T55JLT4:4:2477:34727:27497 . NO_LDAS 0.0057 GT 1.9329 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr16]"] LILRB1--LILRA5 10 0 9.78 0.00 ONLY_REF_SPLICE LILRB1^ENSG00000104972.15 chr19:54631107:+ LILRA5^ENSG00000187116.14 chr19:54312370:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1188:28482:10851,LH00995:25:23T55JLT4:1:1220:22649:26362,LH00995:25:23T55JLT4:1:2215:32996:3929,LH00995:25:23T55JLT4:1:2360:23223:20799,LH00995:25:23T55JLT4:2:1196:47606:13121,LH00995:25:23T55JLT4:2:1234:37551:20477,LH00995:25:23T55JLT4:3:2183:5935:20841,LH00995:25:23T55JLT4:3:2455:39694:12224,LH00995:25:23T55JLT4:4:2264:45956:18277,LH00995:25:23T55JLT4:4:2323:8079:4489 . YES_LDAS 0.0331 GT 1.7819 AG 1.7465 ["DGD_PARALOGS","HGNC_GENEFAM","INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.30Mb]"] LEPROTL1--SMG1P1 10 0 3.33 0.00 ONLY_REF_SPLICE LEPROTL1^ENSG00000104660.19 chr8:30104991:+ SMG1P1^ENSG00000237296.9 chr16:22451620:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1171:2675:11243,LH00995:25:23T55JLT4:1:1386:47064:11061,LH00995:25:23T55JLT4:1:2352:40665:13905,LH00995:25:23T55JLT4:2:1241:46903:19945,LH00995:25:23T55JLT4:2:1261:7763:11930,LH00995:25:23T55JLT4:4:1161:10004:7207,LH00995:25:23T55JLT4:4:1262:25464:7278,LH00995:25:23T55JLT4:4:1426:14963:2429,LH00995:25:23T55JLT4:4:2369:17293:27119,LH00995:25:23T55JLT4:4:2410:32211:25101 . YES_LDAS 0.0113 GC 1.8892 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr16]"] EIF4H--COL1A2 10 0 10.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE EIF4H^ENSG00000106682.16 chr7:74195439:+ COL1A2^ENSG00000164692.18 chr7:94412068:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1340:16670:18305,LH00995:25:23T55JLT4:1:2123:20707:15096,LH00995:25:23T55JLT4:2:1261:43489:11761,LH00995:25:23T55JLT4:2:1411:44929:7446,LH00995:25:23T55JLT4:2:2323:42825:25550,LH00995:25:23T55JLT4:2:2326:6032:2009,LH00995:25:23T55JLT4:3:1233:46450:29529,LH00995:25:23T55JLT4:3:1418:41968:17675,LH00995:25:23T55JLT4:3:2294:19567:6171,LH00995:25:23T55JLT4:4:2468:14664:1967 . YES_LDAS 0.0339 GT 1.9329 AG 1.5656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:20.20Mb]"] CMTM8--CMTM7 10 0 10.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE CMTM8^ENSG00000170293.9 chr3:32239119:+ CMTM7^ENSG00000153551.14 chr3:32441840:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1194:42599:21234,LH00995:25:23T55JLT4:1:1259:3144:9954,LH00995:25:23T55JLT4:1:2271:33967:16652,LH00995:25:23T55JLT4:2:1154:49775:10374,LH00995:25:23T55JLT4:3:1430:35836:17086,LH00995:25:23T55JLT4:3:1441:40228:16400,LH00995:25:23T55JLT4:3:2293:31483:5176,LH00995:25:23T55JLT4:4:1407:8119:2037,LH00995:25:23T55JLT4:4:2256:29719:18347,LH00995:25:23T55JLT4:4:2280:19672:26614 . YES_LDAS 0.0339 GT 1.9656 AG 1.9086 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.02Mb]","NEIGHBORS[21377]"] AL390860.1--TRIM58 10 0 10.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AL390860.1^ENSG00000235749.3 chr1:247640429:+ TRIM58^ENSG00000162722.9 chr1:247860617:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2178:20837:12966,LH00995:25:23T55JLT4:1:2274:12714:20029,LH00995:25:23T55JLT4:1:2333:33061:13597,LH00995:25:23T55JLT4:2:1145:6639:15559,LH00995:25:23T55JLT4:2:2438:22188:26965,LH00995:25:23T55JLT4:3:1332:18547:18389,LH00995:25:23T55JLT4:3:2301:21743:3943,LH00995:25:23T55JLT4:4:1132:34824:2247,LH00995:25:23T55JLT4:4:1274:46126:14536,LH00995:25:23T55JLT4:4:2153:34743:4237 . YES_LDAS 0.0339 GT 1.9219 AG 1.9656 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.10Mb]","NEIGHBORS[95932]"] AC112721.1--COL6A3 10 0 10.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC112721.1^ENSG00000222022.1 chr2:237422125:- COL6A3^ENSG00000163359.16 chr2:237396847:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2144:1445:5022,LH00995:25:23T55JLT4:1:2291:41636:26208,LH00995:25:23T55JLT4:1:2366:22932:25423,LH00995:25:23T55JLT4:2:2159:23514:21612,LH00995:25:23T55JLT4:2:2402:28716:11229,LH00995:25:23T55JLT4:2:2411:48310:28856,LH00995:25:23T55JLT4:3:1398:16630:21990,LH00995:25:23T55JLT4:3:2266:5741:5344,LH00995:25:23T55JLT4:3:2462:50786:18908,LH00995:25:23T55JLT4:4:2131:30577:2205 . YES_LDAS 0.0339 GT 1.8892 AG 1.7968 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.01Mb]","NEIGHBORS[7213]"] AC016597.1--NPIPB3 10 0 1.67 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC016597.1^ENSG00000261329.6 chr16:27685266:- NPIPB3^ENSG00000169246.16 chr16:21406859:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1271:27357:25690,LH00995:25:23T55JLT4:2:2156:46935:23308,LH00995:25:23T55JLT4:2:2322:6801:13233,LH00995:25:23T55JLT4:2:2484:46967:28184,LH00995:25:23T55JLT4:3:1215:45827:7292,LH00995:25:23T55JLT4:4:1129:51077:15012,LH00995:25:23T55JLT4:4:1478:21621:26572,LH00995:25:23T55JLT4:4:2127:37745:10248,LH00995:25:23T55JLT4:4:2320:5789:25606,LH00995:25:23T55JLT4:4:2477:34727:27497 . NO_LDAS 0.0057 GT 1.9329 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr16:6.23Mb]"] TLK2--AC018638.8 9 0 5.74 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TLK2^ENSG00000146872.18 chr17:62560126:+ AC018638.8^ENSG00000281896.1 chr7:128617868:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1148:10401:26054,LH00995:25:23T55JLT4:1:1190:24129:26628,LH00995:25:23T55JLT4:1:2167:23587:3802,LH00995:25:23T55JLT4:2:1158:16314:1266,LH00995:25:23T55JLT4:2:1385:1655:5050,LH00995:25:23T55JLT4:2:2284:44686:27904,LH00995:25:23T55JLT4:3:1243:37842:18011,LH00995:25:23T55JLT4:3:2229:45697:6535,LH00995:25:23T55JLT4:4:2165:40876:26685 . YES_LDAS 0.0194 GT 1.8892 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr7]"] TIGD5--NPM1 9 0 9.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TIGD5^ENSG00000179886.6 chr8:143601222:+ NPM1^ENSG00000181163.14 chr5:171400846:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1302:13410:16133,LH00995:25:23T55JLT4:1:1316:24898:3186,LH00995:25:23T55JLT4:1:1366:23701:22327,LH00995:25:23T55JLT4:2:1313:44330:27539,LH00995:25:23T55JLT4:2:1316:35552:19762,LH00995:25:23T55JLT4:3:1233:47615:21178,LH00995:25:23T55JLT4:4:1217:41264:29319,LH00995:25:23T55JLT4:4:2155:34177:14186,LH00995:25:23T55JLT4:4:2442:31896:6871 . NO_LDAS 0.0305 AT 1.6402 AC 1.9086 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr5]"] RBM14--RBM4 9 0 9.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE RBM14^ENSG00000239306.5 chr11:66617057:+ RBM4^ENSG00000173933.21 chr11:66639700:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2428:3225:12364,LH00995:25:23T55JLT4:2:1475:10522:14410,LH00995:25:23T55JLT4:2:2208:2642:2864,LH00995:25:23T55JLT4:3:1145:16792:11705,LH00995:25:23T55JLT4:3:1156:52048:14172,LH00995:25:23T55JLT4:3:1417:50195:6143,LH00995:25:23T55JLT4:3:2112:9996:16470,LH00995:25:23T55JLT4:4:1349:13086:3410,LH00995:25:23T55JLT4:4:2158:10595:18684 . YES_LDAS 0.0305 GT 1.7465 AG 1.9086 ["HGNC_GENEFAM","Greger_Normal","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.01Mb]","NEIGHBORS[8733]"] NSF--LRRC37A3 9 0 9.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE NSF^ENSG00000073969.18 chr17:46704854:+ LRRC37A3^ENSG00000176809.10 chr17:64892600:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1195:20222:8567,LH00995:25:23T55JLT4:2:1240:11218:20996,LH00995:25:23T55JLT4:2:2106:4802:4027,LH00995:25:23T55JLT4:2:2186:1922:13779,LH00995:25:23T55JLT4:2:2262:6170:6871,LH00995:25:23T55JLT4:2:2324:13895:18095,LH00995:25:23T55JLT4:4:1298:6202:24302,LH00995:25:23T55JLT4:4:2212:32244:23027,LH00995:25:23T55JLT4:4:2387:31936:11005 . YES_LDAS 0.0305 GT 1.6729 AG 1.7232 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr17:18.10Mb]"] HLA-B--HLA-V 9 0 4.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE HLA-B^ENSG00000234745.13 chr6:31357086:- HLA-V^ENSG00000181126.13 chr6:29792437:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1209:26629:4195,LH00995:25:23T55JLT4:2:1149:48367:27497,LH00995:25:23T55JLT4:2:1183:14243:17184,LH00995:25:23T55JLT4:2:2191:35051:14578,LH00995:25:23T55JLT4:2:2271:5684:22705,LH00995:25:23T55JLT4:3:1401:7173:14634,LH00995:25:23T55JLT4:3:2238:21816:20239,LH00995:25:23T55JLT4:3:2479:46838:22467,LH00995:25:23T55JLT4:4:1366:25594:4027 . YES_LDAS 0.0152 GT 1.7056 AG 1.8323 ["HGNC_GENEFAM","INTRACHROMOSOMAL[chr6:1.56Mb]"] C1QC--IGL-@-ext 9 0 3.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE C1QC^ENSG00000159189.12 chr1:22647462:+ IGL-@-ext^IGL-.g@-ext chr22:22661133:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2181:29428:13611,LH00995:25:23T55JLT4:1:2291:10312:23826,LH00995:25:23T55JLT4:1:2393:9033:20631,LH00995:25:23T55JLT4:2:1280:21055:6030,LH00995:25:23T55JLT4:2:2134:8524:6549,LH00995:25:23T55JLT4:3:1266:26047:27932,LH00995:25:23T55JLT4:3:2383:43586:11593,LH00995:25:23T55JLT4:4:1493:24930:26699,LH00995:25:23T55JLT4:4:2368:21832:17661 . NO_LDAS 0.0102 TT 1.8892 GC 1.4256 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr22]"] AC093895.1--SPARCL1 9 0 9.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC093895.1^ENSG00000249001.5 chr4:87672990:- SPARCL1^ENSG00000152583.13 chr4:87499585:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2166:40398:23504,LH00995:25:23T55JLT4:2:2348:27309:29361,LH00995:25:23T55JLT4:3:1262:40123:4755,LH00995:25:23T55JLT4:3:1459:42445:1490,LH00995:25:23T55JLT4:3:2310:45268:14480,LH00995:25:23T55JLT4:3:2440:20966:4503,LH00995:25:23T55JLT4:4:1318:8847:19552,LH00995:25:23T55JLT4:4:1447:4810:7740,LH00995:25:23T55JLT4:4:2203:50066:4461 . YES_LDAS 0.0305 GT 1.9656 AG 1.8892 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr4:0.04Mb]","NEIGHBORS[36974]"] MAP3K20--RAPGEF4 9 1 9.00 1.00 ONLY_REF_SPLICE MAP3K20^ENSG00000091436.17 chr2:173091190:+ RAPGEF4^ENSG00000091428.18 chr2:172917802:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1444:40277:26853,LH00995:25:23T55JLT4:1:2333:37753:5106,LH00995:25:23T55JLT4:2:1109:44023:12294,LH00995:25:23T55JLT4:2:1240:40148:15251,LH00995:25:23T55JLT4:2:2184:11598:16862,LH00995:25:23T55JLT4:3:1303:27770:5918,LH00995:25:23T55JLT4:4:1165:21905:6185,LH00995:25:23T55JLT4:4:1311:29364:17535,LH00995:25:23T55JLT4:4:2286:27721:8272 LH00995:25:23T55JLT4:1:1209:4333:25662 YES_LDAS 0.0339 GT 1.1589 AG 1.7968 ["DEEPEST2019","TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[22542]"] YWHAE--CRK 8 0 8.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE YWHAE^ENSG00000108953.17 chr17:1400047:- CRK^ENSG00000167193.8 chr17:1437155:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1221:2084:14620,LH00995:25:23T55JLT4:1:2135:23895:12882,LH00995:25:23T55JLT4:2:1252:40123:12322,LH00995:25:23T55JLT4:3:2175:44370:10795,LH00995:25:23T55JLT4:3:2469:1396:11832,LH00995:25:23T55JLT4:4:1141:14688:7306,LH00995:25:23T55JLT4:4:2233:21257:20841,LH00995:25:23T55JLT4:4:2369:15886:26110 . YES_LDAS 0.0271 GT 1.9329 AG 1.8323 ["DEEPEST2019","INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[20467]"] TMEFF2--TEX41 8 0 8.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEFF2^ENSG00000144339.12 chr2:191998262:- TEX41^ENSG00000226674.11 chr2:144768098:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1371:28757:13681,LH00995:25:23T55JLT4:1:2354:6089:24106,LH00995:25:23T55JLT4:2:1467:28652:25269,LH00995:25:23T55JLT4:2:2280:20578:24513,LH00995:25:23T55JLT4:3:2241:24332:8567,LH00995:25:23T55JLT4:4:1290:8079:25592,LH00995:25:23T55JLT4:4:2157:48650:6829,LH00995:25:23T55JLT4:4:2358:20812:23125 . YES_LDAS 0.0271 GT 1.8892 AG 1.9219 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:46.69Mb]"] LILRA5--LILRB1 8 0 8.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LILRA5^ENSG00000187116.14 chr19:54312335:- LILRB1^ENSG00000104972.15 chr19:54631500:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1135:27171:18473,LH00995:25:23T55JLT4:1:2116:19389:8777,LH00995:25:23T55JLT4:2:1431:6339:12154,LH00995:25:23T55JLT4:2:2267:19825:2415,LH00995:25:23T55JLT4:3:1109:7965:16119,LH00995:25:23T55JLT4:3:1191:26775:14956,LH00995:25:23T55JLT4:3:1298:14138:25942,LH00995:25:23T55JLT4:4:2320:19478:8539 . YES_LDAS 0.0271 GT 1.7819 AG 1.6729 ["DGD_PARALOGS","HGNC_GENEFAM","INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.30Mb]"] GRAMD1A--RAB11FIP3 8 0 0.55 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE GRAMD1A^ENSG00000089351.15 chr19:35000449:+ RAB11FIP3^ENSG00000090565.17 chr16:426178:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1424:33417:14466,LH00995:25:23T55JLT4:2:1303:14915:26222,LH00995:25:23T55JLT4:2:1468:19615:8469,LH00995:25:23T55JLT4:3:1108:40010:5064,LH00995:25:23T55JLT4:3:1113:51409:22985,LH00995:25:23T55JLT4:3:1135:21824:7474,LH00995:25:23T55JLT4:4:2107:27729:11817,LH00995:25:23T55JLT4:4:2162:20821:19664 . NO_LDAS 0.0019 GC 1.3710 AG 1.2729 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr16]"] DDX24--AL022099.1 8 0 8.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE DDX24^ENSG00000089737.17 chr14:94051188:- AL022099.1^ENSG00000271162.1 chr6:48952713:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1390:46547:24541,LH00995:25:23T55JLT4:2:1464:2302:9646,LH00995:25:23T55JLT4:2:2310:28773:21892,LH00995:25:23T55JLT4:3:1155:19761:26657,LH00995:25:23T55JLT4:3:1274:44710:11075,LH00995:25:23T55JLT4:3:2160:36556:22537,LH00995:25:23T55JLT4:4:1332:7755:12252,LH00995:25:23T55JLT4:4:2412:7537:13947 . NO_LDAS 0.0271 GT 1.8892 AG 1.8323 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr6]"] BOLA2B--SMG1P2 8 0 8.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE BOLA2B^ENSG00000169627.9 chr16:30193358:- SMG1P2^ENSG00000205534.6 chr16:29548658:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2123:47809:21178,LH00995:25:23T55JLT4:1:2183:7949:5610,LH00995:25:23T55JLT4:2:1214:37340:2653,LH00995:25:23T55JLT4:2:1262:30286:21430,LH00995:25:23T55JLT4:3:2191:50794:16147,LH00995:25:23T55JLT4:4:2154:50543:23139,LH00995:25:23T55JLT4:4:2393:3411:16666,LH00995:25:23T55JLT4:4:2432:6744:8987 . YES_LDAS 0.0271 GT 1.9329 AG 1.9656 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr16:0.60Mb]"] AP001347.1--ANKRD20A11P 8 0 8.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AP001347.1^ENSG00000224905.7 chr21:14027597:+ ANKRD20A11P^ENSG00000215559.8 chr21:13979932:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1134:23523:7670,LH00995:25:23T55JLT4:1:1357:20068:10094,LH00995:25:23T55JLT4:1:1463:35941:16960,LH00995:25:23T55JLT4:2:1374:30011:22523,LH00995:25:23T55JLT4:2:2337:32252:14718,LH00995:25:23T55JLT4:4:1197:4519:15727,LH00995:25:23T55JLT4:4:1234:39986:16371,LH00995:25:23T55JLT4:4:2174:16314:14326 . YES_LDAS 0.0271 GT 1.8323 AG 1.5628 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.05Mb]","LOCAL_INVERSION:+:-:[46982]"] TMEM123--BIRC2 8 1 8.00 0.73 ONLY_REF_SPLICE TMEM123^ENSG00000152558.15 chr11:102448812:- BIRC2^ENSG00000110330.8 chr11:102350844:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1137:21071:19903,LH00995:25:23T55JLT4:1:1326:29493:4419,LH00995:25:23T55JLT4:1:2168:34096:11719,LH00995:25:23T55JLT4:2:1115:39023:29585,LH00995:25:23T55JLT4:2:2369:24647:15727,LH00995:25:23T55JLT4:3:2377:26977:14718,LH00995:25:23T55JLT4:4:1145:33748:29333,LH00995:25:23T55JLT4:4:1169:31071:14101 LH00995:25:23T55JLT4:2:1271:24760:24134 YES_LDAS 0.0296 GT 1.9656 AG 1.9329 ["Klijn_CellLines","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.02Mb]","LOCAL_INVERSION:-:+:[17662]"] TPTE--BAGE2 7 0 7.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TPTE^ENSG00000274391.5 chr21:10527412:+ BAGE2^ENSG00000187172.15 chr21:10499475:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2249:10862:22845,LH00995:25:23T55JLT4:1:2259:50778:9954,LH00995:25:23T55JLT4:2:1391:28886:24975,LH00995:25:23T55JLT4:3:1283:43594:22313,LH00995:25:23T55JLT4:3:2230:47550:24905,LH00995:25:23T55JLT4:4:2275:13944:25409,LH00995:25:23T55JLT4:4:2459:31871:22943 . YES_LDAS 0.0237 GT 1.9656 AG 1.8323 ["INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]"] RIMKLA--CAMSAP1 7 0 7.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RIMKLA^ENSG00000177181.15 chr1:42419655:+ CAMSAP1^ENSG00000130559.19 chr9:135883078:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1367:10198:15054,LH00995:25:23T55JLT4:2:1419:30440:14101,LH00995:25:23T55JLT4:2:1431:26945:3088,LH00995:25:23T55JLT4:2:2118:30973:12504,LH00995:25:23T55JLT4:2:2395:14357:19762,LH00995:25:23T55JLT4:3:1263:8208:13709,LH00995:25:23T55JLT4:4:1101:36232:11860 . NO_LDAS 0.0237 GT 1.9899 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr9]"] HRH1--ATG7 7 0 7.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE HRH1^ENSG00000196639.7 chr3:11154554:+ ATG7^ENSG00000197548.12 chr3:11298686:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2321:49524:19272,LH00995:25:23T55JLT4:3:1343:14389:2359,LH00995:25:23T55JLT4:3:2335:26152:3564,LH00995:25:23T55JLT4:4:1308:35989:21332,LH00995:25:23T55JLT4:4:2132:12472:24681,LH00995:25:23T55JLT4:4:2132:13661:1406,LH00995:25:23T55JLT4:4:2409:10109:29557 . YES_LDAS 0.0237 GT 1.2867 AG 1.7968 ["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.01Mb]","NEIGHBORS[8752]"] ELAPOR2--TMEM243 7 0 7.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ELAPOR2^ENSG00000164659.15 chr7:86897506:- TMEM243^ENSG00000135185.12 chr7:87199057:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2301:51312:2808,LH00995:25:23T55JLT4:1:2304:21589:6731,LH00995:25:23T55JLT4:2:1178:29849:24232,LH00995:25:23T55JLT4:3:1121:46207:13051,LH00995:25:23T55JLT4:4:1155:20456:21808,LH00995:25:23T55JLT4:4:1169:47687:28618,LH00995:25:23T55JLT4:4:2102:20060:9660 . YES_LDAS 0.0237 GT 1.7819 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.14Mb]"] BNIP3L--DPYSL2 7 0 7.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE BNIP3L^ENSG00000104765.16 chr8:26408376:+ DPYSL2^ENSG00000092964.18 chr8:26581969:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1334:44354:26208,LH00995:25:23T55JLT4:1:2274:42833:24218,LH00995:25:23T55JLT4:2:1263:34120:25774,LH00995:25:23T55JLT4:2:2117:50389:3648,LH00995:25:23T55JLT4:3:1176:34460:13331,LH00995:25:23T55JLT4:3:2402:39120:11846,LH00995:25:23T55JLT4:4:1145:44370:4994 . YES_LDAS 0.0237 GT 1.6402 AG 1.9329 ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.01Mb]","NEIGHBORS[8395]"] AP001347.1--ANKRD20A11P 7 0 3.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AP001347.1^ENSG00000224905.7 chr21:14027597:+ ANKRD20A11P^ENSG00000215559.8 chr21:13954147:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1178:23118:8679,LH00995:25:23T55JLT4:2:2335:20149:3256,LH00995:25:23T55JLT4:2:2388:23320:4209,LH00995:25:23T55JLT4:3:1280:33012:27189,LH00995:25:23T55JLT4:4:1202:16347:24358,LH00995:25:23T55JLT4:4:1283:38230:28044,LH00995:25:23T55JLT4:4:2142:35261:7011 . YES_LDAS 0.0119 GT 1.8323 AG 1.9656 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.05Mb]","LOCAL_INVERSION:+:-:[46982]"] AL139042.1--CNR1 7 0 7.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AL139042.1^ENSG00000234426.3 chr6:88324000:- CNR1^ENSG00000118432.12 chr6:88145337:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1134:13556:4811,LH00995:25:23T55JLT4:1:1450:26856:9912,LH00995:25:23T55JLT4:2:1223:45293:1883,LH00995:25:23T55JLT4:2:1491:46620:12840,LH00995:25:23T55JLT4:3:1387:8370:18361,LH00995:25:23T55JLT4:3:1434:29752:24204,LH00995:25:23T55JLT4:4:2145:45010:4111 . YES_LDAS 0.0237 GT 1.9899 AG 1.8256 ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.01Mb]","NEIGHBORS[11445]"] AGAP5--AC022400.4 7 0 7.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AGAP5^ENSG00000172650.14 chr10:73692043:- AC022400.4^ENSG00000272140.2 chr10:73713332:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1417:12156:21052,LH00995:25:23T55JLT4:2:1151:1882:15475,LH00995:25:23T55JLT4:2:2153:34954:1378,LH00995:25:23T55JLT4:2:2225:28506:17254,LH00995:25:23T55JLT4:3:1481:2828:14144,LH00995:25:23T55JLT4:3:2393:15869:10725,LH00995:25:23T55JLT4:3:2393:15878:10711 . YES_LDAS 0.0237 GT 1.7465 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr10:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[5854]"] CCDC32--CBX3 7 1 7.00 0.58 INCL_NON_REF_SPLICE CCDC32^ENSG00000128891.16 chr15:40562772:- CBX3^ENSG00000122565.19 chr7:26201769:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2456:22350:29207,LH00995:25:23T55JLT4:2:1480:43125:1406,LH00995:25:23T55JLT4:2:2451:17665:27595,LH00995:25:23T55JLT4:3:2372:30820:28912,LH00995:25:23T55JLT4:4:1233:27794:13107,LH00995:25:23T55JLT4:4:1323:21872:14536,LH00995:25:23T55JLT4:4:1446:18313:9884 LH00995:25:23T55JLT4:3:1150:10028:21066 YES_LDAS 0.0257 GT 1.8892 AG 1.3383 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr7]"] TPTE--BAGE2 6 0 3.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TPTE^ENSG00000274391.5 chr21:10552716:+ BAGE2^ENSG00000187172.15 chr21:10514122:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1114:11290:4055,LH00995:25:23T55JLT4:1:1248:10829:20239,LH00995:25:23T55JLT4:1:2495:14745:24807,LH00995:25:23T55JLT4:2:1197:50705:14676,LH00995:25:23T55JLT4:2:2321:43400:1575,LH00995:25:23T55JLT4:4:1398:47170:9337 . YES_LDAS 0.0102 GT 1.8295 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]"] STEAP1--RAPGEF5 6 0 3.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE STEAP1^ENSG00000164647.9 chr7:90162078:+ RAPGEF5^ENSG00000136237.19 chr7:22318037:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2107:4835:7642,LH00995:25:23T55JLT4:2:2143:26645:17338,LH00995:25:23T55JLT4:3:1153:44880:9576,LH00995:25:23T55JLT4:3:2213:12415:24415,LH00995:25:23T55JLT4:4:2281:28296:13695,LH00995:25:23T55JLT4:4:2407:14583:13205 . YES_LDAS 0.0102 GT 1.7465 AG 1.8295 ["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr7:67.80Mb]"] SOBP--YWHAZ 6 0 6.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE SOBP^ENSG00000112320.12 chr6:107506427:+ YWHAZ^ENSG00000164924.18 chr8:100918879:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2198:21265:26180,LH00995:25:23T55JLT4:2:1308:32761:23560,LH00995:25:23T55JLT4:2:2148:41329:1154,LH00995:25:23T55JLT4:2:2468:42809:22999,LH00995:25:23T55JLT4:3:1139:13968:5694,LH00995:25:23T55JLT4:4:1169:43570:19160 . NO_LDAS 0.0203 GT 1.7819 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr8]"] SLC7A5P1--SMG1 6 0 6.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE SLC7A5P1^ENSG00000260727.2 chr16:29613103:- SMG1^ENSG00000157106.17 chr16:18900044:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2373:49419:15839,LH00995:25:23T55JLT4:1:2420:11185:13513,LH00995:25:23T55JLT4:2:1246:23806:7992,LH00995:25:23T55JLT4:3:1108:13353:16231,LH00995:25:23T55JLT4:3:1435:20092:11117,LH00995:25:23T55JLT4:3:2373:16201:28898 . YES_LDAS 0.0203 GT 1.7465 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr16:10.69Mb]"] LDLRAD3--PRR5L 6 0 6.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE LDLRAD3^ENSG00000179241.13 chr11:36098461:+ PRR5L^ENSG00000135362.14 chr11:36296290:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1101:48739:23770,LH00995:25:23T55JLT4:1:1128:47898:14774,LH00995:25:23T55JLT4:1:1253:28166:2149,LH00995:25:23T55JLT4:1:1433:40447:14900,LH00995:25:23T55JLT4:1:2286:1485:8903,LH00995:25:23T55JLT4:3:1387:9033:17408 . YES_LDAS 0.0203 GT 1.9329 AG 1.8892 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.06Mb]","NEIGHBORS[64152]"] IGL-@-ext--CTSB 6 0 6.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE IGL-@-ext^IGL-.g@-ext chr22:22093911:- CTSB^ENSG00000164733.22 chr8:11844379:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1459:2650:26362,LH00995:25:23T55JLT4:1:2203:35714:3368,LH00995:25:23T55JLT4:2:1482:31904:7193,LH00995:25:23T55JLT4:2:2160:35771:9099,LH00995:25:23T55JLT4:3:1230:17334:1883,LH00995:25:23T55JLT4:4:2392:29817:10192 . NO_LDAS 0.0203 CC 1.3996 AC 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr8]"] HIC2--PI4KA 6 0 6.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE HIC2^ENSG00000169635.10 chr22:21442857:+ PI4KA^ENSG00000241973.11 chr22:20733843:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2273:44063:1771,LH00995:25:23T55JLT4:1:2471:46514:29025,LH00995:25:23T55JLT4:1:2489:1647:19776,LH00995:25:23T55JLT4:2:1131:39525:10220,LH00995:25:23T55JLT4:2:1447:45066:9113,LH00995:25:23T55JLT4:4:2223:38570:9211 . YES_LDAS 0.0203 GT 1.7465 AG 1.7819 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr22:0.56Mb]"] FUS--CTNNA1 6 0 6.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE FUS^ENSG00000089280.19 chr16:31184352:+ CTNNA1^ENSG00000044115.21 chr5:138934073:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1281:13588:18207,LH00995:25:23T55JLT4:2:2366:30804:27371,LH00995:25:23T55JLT4:3:2286:12350:22117,LH00995:25:23T55JLT4:3:2426:51684:24499,LH00995:25:23T55JLT4:4:1467:22616:24401,LH00995:25:23T55JLT4:4:2311:44047:28590 . NO_LDAS 0.0203 GT 1.8062 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr5]"] FLG-AS1--ARHGAP32 6 0 6.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE FLG-AS1^ENSG00000237975.7 chr1:152251758:+ ARHGAP32^ENSG00000134909.18 chr11:128998468:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1417:38974:22018,LH00995:25:23T55JLT4:1:2285:17390:27763,LH00995:25:23T55JLT4:1:2465:25982:28464,LH00995:25:23T55JLT4:2:1208:27511:20519,LH00995:25:23T55JLT4:2:2219:34298:14984,LH00995:25:23T55JLT4:4:1164:12836:20799 . YES_LDAS 0.0203 GT 1.8256 AG 1.9219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr11]"] ERP44--DENND1A 6 0 6.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ERP44^ENSG00000023318.8 chr9:99984967:- DENND1A^ENSG00000119522.16 chr9:123652123:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2132:25909:20939,LH00995:25:23T55JLT4:1:2157:10417:24737,LH00995:25:23T55JLT4:2:2210:22091:9898,LH00995:25:23T55JLT4:3:2338:38141:19678,LH00995:25:23T55JLT4:3:2472:4932:12518,LH00995:25:23T55JLT4:4:1218:33020:25522 . YES_LDAS 0.0203 GT 1.5850 AG 1.7232 ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:23.28Mb]"] CEP170--RAD51B 6 0 3.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE CEP170^ENSG00000143702.16 chr1:243185779:- RAD51B^ENSG00000182185.18 chr14:68291884:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1268:41426:12364,LH00995:25:23T55JLT4:2:2236:11460:7263,LH00995:25:23T55JLT4:2:2241:39508:29053,LH00995:25:23T55JLT4:2:2465:20594:21654,LH00995:25:23T55JLT4:4:2117:4608:2009,LH00995:25:23T55JLT4:4:2476:33894:24961 . YES_LDAS 0.0102 GT 1.6729 AG 1.8892 ["GTEx_recurrent_StarF2019","ChimerSeq","INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr14]"] CA13--CA3 6 0 6.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CA13^ENSG00000185015.8 chr8:85281639:+ CA3^ENSG00000164879.7 chr8:85439712:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1131:39322:2135,LH00995:25:23T55JLT4:1:1246:36693:2205,LH00995:25:23T55JLT4:2:1146:33724:9842,LH00995:25:23T55JLT4:2:1350:30003:18389,LH00995:25:23T55JLT4:3:2335:39169:14592,LH00995:25:23T55JLT4:4:1368:24194:13037 . YES_LDAS 0.0203 GT 1.7968 AG 1.8892 ["DGD_PARALOGS","ConjoinG","GTEx_recurrent_StarF2019","HGNC_GENEFAM","INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.09Mb]","NEIGHBORS[89363]"] AC211476.4--CCDC146 6 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC211476.4^ENSG00000277125.1 chr7:73069531:+ CCDC146^ENSG00000135205.15 chr7:77236947:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1368:40156:8987,LH00995:25:23T55JLT4:1:2245:28538:10444,LH00995:25:23T55JLT4:2:1155:35334:20813,LH00995:25:23T55JLT4:2:2184:7181:29417,LH00995:25:23T55JLT4:3:2221:47930:11944,LH00995:25:23T55JLT4:3:2394:43998:29459 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.4566 AG 1.9329 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:4.05Mb]"] CTSC--RAB38 6 1 6.00 0.43 ONLY_REF_SPLICE CTSC^ENSG00000109861.17 chr11:88300530:- RAB38^ENSG00000123892.12 chr11:88149955:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1258:51118:21276,LH00995:25:23T55JLT4:1:1291:17876:1224,LH00995:25:23T55JLT4:1:1382:13483:11383,LH00995:25:23T55JLT4:1:2235:10020:25816,LH00995:25:23T55JLT4:4:1308:14818:23420,LH00995:25:23T55JLT4:4:2220:3387:5890 LH00995:25:23T55JLT4:1:2186:12067:26839 YES_LDAS 0.0218 GT 1.9656 AG 1.8062 ["GTEx_recurrent_StarF2019","Babiceanu_Normal","ChimerSeq","Greger_Normal","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.09Mb]","NEIGHBORS[89626]"] CTSC--RAB38 6 1 6.00 0.43 ONLY_REF_SPLICE CTSC^ENSG00000109861.17 chr11:88296133:- RAB38^ENSG00000123892.12 chr11:88149955:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1201:2214:24737,LH00995:25:23T55JLT4:1:1248:46814:1294,LH00995:25:23T55JLT4:3:1129:42939:26026,LH00995:25:23T55JLT4:3:2276:19356:16904,LH00995:25:23T55JLT4:3:2441:34485:7123,LH00995:25:23T55JLT4:4:1258:40625:20113 LH00995:25:23T55JLT4:1:2186:12067:26839 YES_LDAS 0.0218 GT 1.9899 AG 1.8062 ["GTEx_recurrent_StarF2019","Babiceanu_Normal","ChimerSeq","Greger_Normal","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.09Mb]","NEIGHBORS[89626]"] TVP23C--TVP23BP2 5 0 5.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TVP23C^ENSG00000175106.17 chr17:15540433:- TVP23BP2^ENSG00000108442.2 chr2:74628702:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2378:31435:15573,LH00995:25:23T55JLT4:2:2194:30836:17086,LH00995:25:23T55JLT4:3:1382:50600:12056,LH00995:25:23T55JLT4:4:1132:17795:7109,LH00995:25:23T55JLT4:4:2139:29752:27763 . YES_LDAS 0.0169 GT 1.8323 AG 1.8295 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr2]"] TPTE--BAGE2 5 0 0.83 0.00 ONLY_REF_SPLICE TPTE^ENSG00000274391.5 chr21:10552716:+ BAGE2^ENSG00000187172.15 chr21:10499475:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1337:16112:15797,LH00995:25:23T55JLT4:2:1329:39072:27876,LH00995:25:23T55JLT4:3:1146:23345:28800,LH00995:25:23T55JLT4:3:2371:7383:8973,LH00995:25:23T55JLT4:4:1336:1081:26390 . YES_LDAS 0.0028 GT 1.8295 AG 1.8323 ["INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]"] PRR16--AC114284.1 5 0 5.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE PRR16^ENSG00000184838.15 chr5:120464645:+ AC114284.1^ENSG00000248927.1 chr5:120789954:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1157:6210:12462,LH00995:25:23T55JLT4:2:1220:29461:10080,LH00995:25:23T55JLT4:2:2466:30658:4083,LH00995:25:23T55JLT4:3:1382:2586:17282,LH00995:25:23T55JLT4:4:2262:40601:8665 . YES_LDAS 0.0169 GT 1.6895 AG 1.9329 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.09Mb]","NEIGHBORS[93886]"] PRELID2--AC137770.1 5 0 5.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PRELID2^ENSG00000186314.11 chr5:145764931:- AC137770.1^ENSG00000250842.1 chr5:145381718:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1144:48682:11257,LH00995:25:23T55JLT4:2:1294:48642:15699,LH00995:25:23T55JLT4:2:1308:33748:16021,LH00995:25:23T55JLT4:3:1494:49273:7936,LH00995:25:23T55JLT4:3:2303:5085:13961 . YES_LDAS 0.0169 GT 1.5546 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.09Mb]","NEIGHBORS[90129]"] PARVB--DKKL1P1 5 0 5.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PARVB^ENSG00000188677.15 chr22:44094017:+ DKKL1P1^ENSG00000215546.2 chr20:31274402:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1110:6898:22845,LH00995:25:23T55JLT4:1:1407:25505:1659,LH00995:25:23T55JLT4:3:2279:40180:24302,LH00995:25:23T55JLT4:4:1260:13103:26755,LH00995:25:23T55JLT4:4:1349:34751:8006 . NO_LDAS 0.0169 GT 1.9086 AG 1.4295 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr20]"] IGL-@-ext--IRS1 5 0 1.67 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE IGL-@-ext^IGL-.g@-ext chr22:22621070:- IRS1^ENSG00000169047.6 chr2:226796699:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1134:38918:21276,LH00995:25:23T55JLT4:1:1478:22989:7446,LH00995:25:23T55JLT4:1:2335:15967:21290,LH00995:25:23T55JLT4:4:2271:39274:28114,LH00995:25:23T55JLT4:4:2296:29687:9604 . NO_LDAS 0.0057 AC 1.8295 AG 1.5850 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr2]"] TVP23C--CDRT4 5 1 5.00 1.00 INCL_NON_REF_SPLICE TVP23C^ENSG00000175106.17 chr17:15503098:- CDRT4^ENSG00000239704.11 chr17:15440285:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1445:34897:14564,LH00995:25:23T55JLT4:3:2218:50818:21458,LH00995:25:23T55JLT4:4:1305:18337:25956,LH00995:25:23T55JLT4:4:1373:47153:14382,LH00995:25:23T55JLT4:4:1460:48254:12420 LH00995:25:23T55JLT4:3:1185:52185:29487 YES_LDAS 0.0203 GT 1.9329 AG 1.9899 ["INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.03Mb]","NEIGHBORS[26536]"] SEPTIN14--AP006222.1 4 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE SEPTIN14^ENSG00000154997.9 chr7:55795924:- AP006222.1^ENSG00000228463.10 chr1:297502:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1171:39711:19819,LH00995:25:23T55JLT4:1:2342:51069:18193,LH00995:25:23T55JLT4:3:1221:20699:22481,LH00995:25:23T55JLT4:4:1481:5781:15222 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.5546 AG 1.9086 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr1]"] SEPTIN14--AP006222.1 4 0 4.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE SEPTIN14^ENSG00000154997.9 chr7:55795924:- AP006222.1^ENSG00000228463.10 chr1:289370:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2447:30893:7936,LH00995:25:23T55JLT4:3:1165:6372:10500,LH00995:25:23T55JLT4:3:2295:4729:15559,LH00995:25:23T55JLT4:4:1239:1437:9463 . YES_LDAS 0.0135 GT 1.5546 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr1]"] SEPTIN14--AL031259.1 4 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE SEPTIN14^ENSG00000154997.9 chr7:55795924:- AL031259.1^ENSG00000287411.1 chr6:170614324:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1171:39711:19819,LH00995:25:23T55JLT4:1:2342:51069:18193,LH00995:25:23T55JLT4:3:1221:20699:22481,LH00995:25:23T55JLT4:4:1481:5781:15222 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.5546 AG 1.9086 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr6]"] PCGF6--MNX1 4 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PCGF6^ENSG00000156374.16 chr10:103350983:- MNX1^ENSG00000130675.15 chr7:157005174:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2144:42615:5988,LH00995:25:23T55JLT4:2:2179:14907:2611,LH00995:25:23T55JLT4:3:1322:48068:19300,LH00995:25:23T55JLT4:3:1455:2747:17647 . NO_LDAS 0.0068 GT 1.2419 AG 1.2310 ["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr7]"] PCGF6--C10orf99 4 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PCGF6^ENSG00000156374.16 chr10:103350983:- C10orf99^ENSG00000188373.5 chr10:84184831:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2144:42615:5988,LH00995:25:23T55JLT4:2:2179:14907:2611,LH00995:25:23T55JLT4:3:1322:48068:19300,LH00995:25:23T55JLT4:3:1455:2747:17647 . NO_LDAS 0.0068 GT 1.2419 AG 1.2310 ["INTRACHROMOSOMAL[chr10:19.12Mb]"] COL1A2--KCNQ1-AS1 4 0 4.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE COL1A2^ENSG00000164692.18 chr7:94411154:+ KCNQ1-AS1^ENSG00000229414.2 chr11:2840442:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1432:47493:2752,LH00995:25:23T55JLT4:4:1235:1469:7418,LH00995:25:23T55JLT4:4:2102:22536:27203,LH00995:25:23T55JLT4:4:2361:44459:5372 . YES_LDAS 0.0135 GT 1.9329 AG 1.9219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr11]"] BOLA2B--SMG1P2 4 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE BOLA2B^ENSG00000169627.9 chr16:30193358:- SMG1P2^ENSG00000205534.6 chr16:29548762:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1489:29493:21150,LH00995:25:23T55JLT4:1:2107:30755:13639,LH00995:25:23T55JLT4:2:1466:28813:27203,LH00995:25:23T55JLT4:3:1231:29169:17563 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.9329 AG 1.9329 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr16:0.60Mb]"] BIRC2--AP000619.1 4 0 4.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE BIRC2^ENSG00000110330.8 chr11:102368548:+ AP000619.1^ENSG00000225678.2 chr11:102753855:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1448:38068:1196,LH00995:25:23T55JLT4:2:2248:25480:8651,LH00995:25:23T55JLT4:3:1145:1979:16007,LH00995:25:23T55JLT4:3:2207:5344:27806 . YES_LDAS 0.0135 GT 1.7968 AG 1.8295 ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.37Mb]"] AC092691.1--LSAMP 4 0 4.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC092691.1^ENSG00000239268.3 chr3:117997182:- LSAMP^ENSG00000185565.12 chr3:116444955:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2281:42752:7039,LH00995:25:23T55JLT4:2:1272:12035:12602,LH00995:25:23T55JLT4:2:2265:14939:2499,LH00995:25:23T55JLT4:3:1158:37575:3088 . YES_LDAS 0.0135 GT 1.8892 AG 1.9329 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.53Mb]"] ELAPOR2--TMEM243 4 1 4.00 1.00 INCL_NON_REF_SPLICE ELAPOR2^ENSG00000164659.15 chr7:86897506:- TMEM243^ENSG00000135185.12 chr7:87206742:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1253:6906:9295,LH00995:25:23T55JLT4:2:2154:25132:27834,LH00995:25:23T55JLT4:3:1107:6979:18613,LH00995:25:23T55JLT4:4:1181:29655:7502 LH00995:25:23T55JLT4:1:1494:8977:24008 YES_LDAS 0.0169 GT 1.7819 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.14Mb]"] NCOR1--AC108156.1 3 0 3.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE NCOR1^ENSG00000141027.21 chr17:16146495:- AC108156.1^ENSG00000249752.1 chr4:149062506:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2163:11776:11117,LH00995:25:23T55JLT4:2:2209:23272:12308,LH00995:25:23T55JLT4:4:2109:10328:9898 . NO_LDAS 0.0102 GT 1.5329 AG 1.6895 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr4]"] GPS2--MTRNR2L3 3 0 3.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE GPS2^ENSG00000132522.16 chr17:7314563:- MTRNR2L3^ENSG00000256222.3 chr20:57358555:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1404:43780:28128,LH00995:25:23T55JLT4:2:2196:6679:20365,LH00995:25:23T55JLT4:3:2408:14907:13093 . NO_LDAS 0.0102 AT 1.6895 AC 1.6402 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr20]"] FBN3--MAML2 3 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE FBN3^ENSG00000142449.13 chr19:8147387:- MAML2^ENSG00000184384.14 chr11:96092230:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1312:30787:6241,LH00995:25:23T55JLT4:1:1356:35471:24667,LH00995:25:23T55JLT4:4:2441:51627:13303 . NO_LDAS 0.0034 GC 1.7819 AG 1.5850 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr11]"] EWSR1--DOC2GP 3 0 3.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE EWSR1^ENSG00000182944.18 chr22:29299721:+ DOC2GP^ENSG00000231793.5 chr11:67613605:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1111:21209:2906,LH00995:25:23T55JLT4:2:1214:3605:29137,LH00995:25:23T55JLT4:3:2259:2416:27329 . NO_LDAS 0.0102 GT 1.7465 AG 1.6402 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr11]"] CA13--CA3 3 0 3.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE CA13^ENSG00000185015.8 chr8:85268627:+ CA3^ENSG00000164879.7 chr8:85439712:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1121:20764:13457,LH00995:25:23T55JLT4:2:2132:4495:21598,LH00995:25:23T55JLT4:4:2123:52007:28758 . YES_LDAS 0.0102 GT 1.9086 AG 1.8892 ["DGD_PARALOGS","ConjoinG","GTEx_recurrent_StarF2019","HGNC_GENEFAM","INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.09Mb]","NEIGHBORS[89363]"] BANP--SNX29P1 3 0 1.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE BANP^ENSG00000172530.20 chr16:88035394:+ SNX29P1^ENSG00000158482.10 chr16:21376648:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1290:6372:8595,LH00995:25:23T55JLT4:3:2253:32098:11229,LH00995:25:23T55JLT4:4:2224:16840:6689 . YES_LDAS 0.0051 GT 1.5656 AG 1.8256 ["INTRACHROMOSOMAL[chr16:66.56Mb]"] AP001347.1--ANKRD20A11P 3 0 3.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AP001347.1^ENSG00000224905.7 chr21:14027597:+ ANKRD20A11P^ENSG00000215559.8 chr21:13940978:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2355:13863:21178,LH00995:25:23T55JLT4:2:2268:48132:21850,LH00995:25:23T55JLT4:3:1338:30860:18277 . YES_LDAS 0.0102 GT 1.8323 AG 1.6402 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.05Mb]","LOCAL_INVERSION:+:-:[46982]"] AC211476.4--CCDC146 3 0 0.17 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC211476.4^ENSG00000277125.1 chr7:73069531:+ CCDC146^ENSG00000135205.15 chr7:77167658:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1185:30771:5848,LH00995:25:23T55JLT4:3:1410:46312:23742,LH00995:25:23T55JLT4:4:2477:14001:28198 . YES_LDAS 0.0006 GT 1.4566 AG 1.7465 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:4.05Mb]"] AC091132.4--AC091132.1 3 0 0.75 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC091132.4^ENSG00000267198.1 chr17:45545944:+ AC091132.1^ENSG00000131484.4 chr17:45534200:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1405:37098:22915,LH00995:25:23T55JLT4:2:2410:50252:21990,LH00995:25:23T55JLT4:3:2479:45495:29053 . YES_LDAS 0.0025 GT 1.5329 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[11094]"] AC005323.2--AC005323.1 3 0 3.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC005323.2^ENSG00000272736.5 chr17:10406238:+ AC005323.1^ENSG00000214970.8 chr17:10608354:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1389:6801:23574,LH00995:25:23T55JLT4:1:2393:25723:26979,LH00995:25:23T55JLT4:2:2190:43238:15082 . YES_LDAS 0.0102 GT 1.6895 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.04Mb]","NEIGHBORS[41178]"] ZNF77--AC119403.1 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZNF77^ENSG00000175691.9 chr19:2936524:- AC119403.1^ENSG00000253392.3 chr19:2919174:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2110:46789:9463,LH00995:25:23T55JLT4:2:1353:38052:12546 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.9086 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.01Mb]","NEIGHBORS[6401]"] TYW1--CALN1 2 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TYW1^ENSG00000198874.13 chr7:67195337:+ CALN1^ENSG00000183166.11 chr7:72278810:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1427:16573:3760,LH00995:25:23T55JLT4:2:2486:40139:16021 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6729 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:4.54Mb]"] TNFRSF1A--FAM50B 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TNFRSF1A^ENSG00000067182.8 chr12:6333380:- FAM50B^ENSG00000145945.7 chr6:3850097:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1478:34768:19132,LH00995:25:23T55JLT4:1:1478:34776:19118 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.9656 AG 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr6]"] SERF2--MED12 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE SERF2^ENSG00000140264.21 chr15:43793719:+ MED12^ENSG00000184634.16 chrX:71128622:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1402:34347:21122,LH00995:25:23T55JLT4:2:2310:18588:19945 . NO_LDAS 0.0068 AT 1.7819 AC 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chrX]"] RPL26P28--RPL26P36 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RPL26P28^ENSG00000223987.1 chr10:5304656:- RPL26P36^ENSG00000225912.1 chrX:92676740:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1139:9308:26825,LH00995:25:23T55JLT4:3:2364:4479:19804 . NO_LDAS 0.0068 GT 1.8295 AG 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chrX]"] RAD51B--CEP170P1 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE RAD51B^ENSG00000182185.18 chr14:67887204:+ CEP170P1^ENSG00000154608.14 chr4:118493552:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1188:6841:6044,LH00995:25:23T55JLT4:3:1205:49580:23153 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.9329 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr4]"] PPIB--PPIAP29 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PPIB^ENSG00000166794.6 chr15:64156740:- PPIAP29^ENSG00000214975.4 chr6:24976878:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1435:40892:4573,LH00995:25:23T55JLT4:4:1469:8556:14228 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.7819 AG 1.6895 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr6]"] PINX1--RP1L1 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE PINX1^ENSG00000254093.9 chr8:10826152:- RP1L1^ENSG00000183638.6 chr8:10623220:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1173:33975:18235,LH00995:25:23T55JLT4:2:2189:24097:6339 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.7232 AG 1.4566 ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.05Mb]","NEIGHBORS[52774]"] LANCL3--XK 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LANCL3^ENSG00000147036.12 chrX:37659659:+ XK^ENSG00000047597.7 chrX:37694286:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2288:11646:16806,LH00995:25:23T55JLT4:4:2350:36677:15208 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.8323 AG 1.6402 ["INTRACHROMOSOMAL[chrX:0.00Mb]","NEIGHBORS[1328]"] HSP90B1--VN2R1P 2 0 0.67 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE HSP90B1^ENSG00000166598.16 chr12:103942544:+ VN2R1P^ENSG00000174930.4 chr3:156019715:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2476:51401:18684,LH00995:25:23T55JLT4:3:1370:1065:15629 . NO_LDAS 0.0023 GT 1.8062 AG 1.3383 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr3]"] HSP90B1--KCNJ2 2 0 0.67 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE HSP90B1^ENSG00000166598.16 chr12:103942544:+ KCNJ2^ENSG00000123700.5 chr17:70175595:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2476:51401:18684,LH00995:25:23T55JLT4:3:1370:1065:15629 . NO_LDAS 0.0023 GT 1.8062 AG 1.3710 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr17]"] GCC2--RANBP2 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE GCC2^ENSG00000135968.21 chr2:108499754:+ RANBP2^ENSG00000153201.16 chr2:108746711:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1139:27907:28408,LH00995:25:23T55JLT4:3:2282:37591:26460 . NO_LDAS 0.0068 GT 1.9329 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.21Mb]"] FLG-AS1--ARHGAP32 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE FLG-AS1^ENSG00000237975.7 chr1:152189481:+ ARHGAP32^ENSG00000134909.18 chr11:128998468:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2240:6825:11986,LH00995:25:23T55JLT4:4:2187:10069:7292 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.8256 AG 1.9219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr11]"] DLGAP1--ANKRD30B 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE DLGAP1^ENSG00000170579.17 chr18:4151180:- ANKRD30B^ENSG00000180777.14 chr18:14791401:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2194:30739:22747,LH00995:25:23T55JLT4:3:2319:43375:21234 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.6402 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:10.27Mb]"] DDX12P--MIR4307HG 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE DDX12P^ENSG00000214826.5 chr12:9421755:- MIR4307HG^ENSG00000257612.2 chr14:26881418:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2158:17455:10388,LH00995:25:23T55JLT4:4:2274:42138:4629 . NO_LDAS 0.0068 GT 1.5656 AG 1.8323 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr14]"] CPVL-AS1--RBM39 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE CPVL-AS1^ENSG00000229452.1 chr7:29080328:+ RBM39^ENSG00000131051.24 chr20:35725155:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1461:24696:14438,LH00995:25:23T55JLT4:4:1369:41232:12420 . NO_LDAS 0.0068 GT 1.8892 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr20]"] AP001347.1--ANKRD20A11P 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AP001347.1^ENSG00000224905.7 chr21:14027597:+ ANKRD20A11P^ENSG00000215559.8 chr21:13972057:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1494:49394:3915,LH00995:25:23T55JLT4:2:2239:4123:10136 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.8323 AG 1.9656 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.05Mb]","LOCAL_INVERSION:+:-:[46982]"] AL670729.1--BEND6 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL670729.1^ENSG00000270094.1 chr1:228395806:+ BEND6^ENSG00000151917.18 chr6:56992380:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2327:20133:20407,LH00995:25:23T55JLT4:4:2248:7229:18067 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.8892 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr6]"] AL359771.1--NPM1P40 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL359771.1^ENSG00000237445.2 chr1:13657302:- NPM1P40^ENSG00000236523.2 chr1:203256068:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1173:9567:18585,LH00995:25:23T55JLT4:2:1485:10020:9954 . NO_LDAS 0.0068 GT 1.9656 AG 1.7056 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:189.60Mb]"] AL135910.1--AL009176.1 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AL135910.1^ENSG00000272848.2 chr6:169430641:- AL009176.1^ENSG00000285887.1 chr6:169421174:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2144:29355:8216,LH00995:25:23T55JLT4:4:2253:25836:13975 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.9086 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.00Mb]","NEIGHBORS[1264]"] AL022157.1--FAAH2 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL022157.1^ENSG00000226310.1 chrX:57127058:+ FAAH2^ENSG00000165591.7 chrX:57292498:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2336:51813:27217,LH00995:25:23T55JLT4:4:1496:11930:20351 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.9656 AG 1.5656 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chrX:0.16Mb]"] AC091042.1--AC018695.1 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC091042.1^ENSG00000265936.1 chr18:67375292:+ AC018695.1^ENSG00000214259.3 chr16:85815884:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1387:18571:22271,LH00995:25:23T55JLT4:1:1421:30949:1532 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.7819 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr18--chr16]"] AC016629.1--RPL23AP82 2 0 2.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC016629.1^ENSG00000269032.1 chr19:58586356:+ RPL23AP82^ENSG00000184319.16 chr22:50788750:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2480:44815:26755,LH00995:25:23T55JLT4:4:2240:8783:6437 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.7819 AG 1.6895 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr22]"] AC009093.9--AC009021.1 2 0 0.67 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC009093.9^ENSG00000284671.1 chr16:29099213:+ AC009021.1^ENSG00000260905.1 chr16:22613549:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1443:3605:26278,LH00995:25:23T55JLT4:1:2172:12472:12126 . YES_LDAS 0.0023 GT 1.8892 AG 1.8062 ["INTRACHROMOSOMAL[chr16:6.46Mb]"] AC007342.3--AC135983.2 2 0 2.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC007342.3^ENSG00000260078.3 chr16:53368437:- AC135983.2^ENSG00000223509.8 chr15:32533368:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1386:33174:12168,LH00995:25:23T55JLT4:4:1386:33182:12154 . YES_LDAS 0.0068 GT 1.9656 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr15]"] CTSC--RAB38 2 1 2.00 0.14 ONLY_REF_SPLICE CTSC^ENSG00000109861.17 chr11:88290402:- RAB38^ENSG00000123892.12 chr11:88149955:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1250:47914:4461,LH00995:25:23T55JLT4:4:2322:39484:5302 LH00995:25:23T55JLT4:1:2186:12067:26839 YES_LDAS 0.0073 GT 1.6402 AG 1.8062 ["GTEx_recurrent_StarF2019","Babiceanu_Normal","ChimerSeq","Greger_Normal","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.09Mb]","NEIGHBORS[89626]"] ZNF836--AP000851.1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ZNF836^ENSG00000196267.12 chr19:52156888:- AP000851.1^ENSG00000256916.1 chr11:102608065:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2373:40617:18641 . YES_LDAS 0.0034 AT 1.8062 AC 1.7232 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr11]"] ZNF75D--AC234771.4 1 0 0.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZNF75D^ENSG00000186376.15 chrX:135343261:- AC234771.4^ENSG00000236491.1 chrX:135193082:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1421:43392:25522 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.6895 AG 1.9899 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chrX:0.05Mb]","NEIGHBORS[54241]"] ZNF738--TMEM128 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZNF738^ENSG00000172687.13 chr19:21375964:+ TMEM128^ENSG00000132406.12 chr4:4246343:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2490:32891:4783 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6402 AG 1.8323 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr4]"] ZNF736P10Y--ZSCAN12 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ZNF736P10Y^ENSG00000216824.2 chrY:8419362:- ZSCAN12^ENSG00000158691.14 chr6:28391361:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2352:2408:18347 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.3996 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chrY--chr6]"] ZNF720--AC098826.1 1 0 0.17 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZNF720^ENSG00000197302.10 chr16:31723353:+ AC098826.1^ENSG00000225594.1 chr2:132087289:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1419:50786:3943 . NO_LDAS 0.0006 GT 1.8892 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr2]"] ZNF718--PRDX6-AS1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZNF718^ENSG00000250312.8 chr4:131505:+ PRDX6-AS1^ENSG00000203739.4 chr1:173440750:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1318:25367:22243 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.4566 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr1]"] ZNF717--RPL23AP49 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZNF717^ENSG00000227124.11 chr3:75783306:- RPL23AP49^ENSG00000243422.2 chr3:75630201:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1456:12949:18754 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.7968 AG 1.8256 ["TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.01Mb]","NEIGHBORS[8504]"] ZNF564--AC119403.1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ZNF564^ENSG00000249709.8 chr19:12527811:- AC119403.1^ENSG00000253392.3 chr19:2917106:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2102:11177:23336 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.5058 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr19:9.60Mb]"] ZNF486--MEFV 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ZNF486^ENSG00000256229.8 chr19:20186082:+ MEFV^ENSG00000103313.13 chr16:3247855:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2402:38408:16273 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.7968 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr16]"] ZNF43--TXNDC16 1 0 0.10 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZNF43^ENSG00000198521.12 chr19:21851905:- TXNDC16^ENSG00000087301.9 chr14:52440724:- LH00995:25:23T55JLT4:4:2216:45471:14438 . NO_LDAS 0.0003 GT 1.6895 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr14]"] ZNF382--AC100821.1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ZNF382^ENSG00000161298.18 chr19:36627546:+ AC100821.1^ENSG00000253667.2 chr8:53973147:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2146:1671:8356 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.8892 AG 1.2310 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr8]"] ZKSCAN7-AS1--ZNF852 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZKSCAN7-AS1^ENSG00000236869.1 chr3:44661262:- ZNF852^ENSG00000178917.17 chr3:44502668:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2412:29161:8244 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.05Mb]","NEIGHBORS[46721]"] ZFAND2A-DT--NEIL3 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZFAND2A-DT^ENSG00000229043.3 chr7:1162543:+ NEIL3^ENSG00000109674.4 chr4:177353308:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1487:45900:10949 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8256 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr4]"] ZBED3-AS1--PDE8B 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ZBED3-AS1^ENSG00000250802.7 chr5:77118521:+ PDE8B^ENSG00000113231.14 chr5:77311994:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2324:40285:19216 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.8256 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.04Mb]","NEIGHBORS[43540]"] UPK3BL2--BEGAIN 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE UPK3BL2^ENSG00000284981.1 chr7:102540015:- BEGAIN^ENSG00000183092.16 chr14:100538386:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1238:40350:1532 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.5656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr14]"] UNC45B--EFCAB5 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE UNC45B^ENSG00000141161.12 chr17:35150223:+ EFCAB5^ENSG00000176927.15 chr17:29968791:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2328:28967:6002 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8323 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr17:5.04Mb]"] ULK4P1--GOLGA8J 1 0 0.33 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ULK4P1^ENSG00000261279.5 chr15:32406998:- GOLGA8J^ENSG00000179938.12 chr15:30084771:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1469:22244:29697 . YES_LDAS 0.0011 GT 1.9656 AG 1.5058 ["INTRACHROMOSOMAL[chr15:2.31Mb]"] TRMT61B--AC007347.2 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TRMT61B^ENSG00000171103.11 chr2:28865017:- AC007347.2^ENSG00000280454.1 chr16:54114740:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1390:39508:13079 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr16]"] TPTE2P4--AC013734.1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TPTE2P4^ENSG00000215506.5 chrY:26515708:+ AC013734.1^ENSG00000277146.1 chrY:26436931:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1265:44508:28856 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8295 AG 1.9329 ["INTRACHROMOSOMAL[chrY:0.05Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[54121]"] TPTE2--MRPS31P2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TPTE2^ENSG00000132958.17 chr13:19475573:- MRPS31P2^ENSG00000232894.1 chr13:19570288:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1392:43157:1883 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8295 AG 1.9656 ["TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr13:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[15809]"] TMEM38B--FSD1L 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TMEM38B^ENSG00000095209.12 chr9:105694772:+ FSD1L^ENSG00000106701.13 chr9:105506399:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2258:5223:8258 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.7968 ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.14Mb]"] TBC1D21--AL590133.2 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TBC1D21^ENSG00000167139.9 chr15:73889220:+ AL590133.2^ENSG00000259357.2 chr1:150966152:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1287:35787:1364 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8062 AG 1.9219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr1]"] TAGLN2P1--AL136115.2 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE TAGLN2P1^ENSG00000253676.1 chr8:106697612:- AL136115.2^ENSG00000269967.1 chr1:31852025:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2174:12488:12126 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6729 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr1]"] TAFA1--SUCLG2-AS1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE TAFA1^ENSG00000183662.11 chr3:68006744:+ SUCLG2-AS1^ENSG00000241316.8 chr3:67840022:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1127:39589:4335 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7819 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.06Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[56534]"] SUSD3--AC211486.3 1 0 0.33 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE SUSD3^ENSG00000157303.11 chr9:93084651:+ AC211486.3^ENSG00000273598.1 chr7:75327758:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2498:17366:18978 . NO_LDAS 0.0011 GT 1.6402 AG 1.9086 ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr7]"] STXBP4--TOM1L1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE STXBP4^ENSG00000166263.13 chr17:54986266:+ TOM1L1^ENSG00000141198.16 chr17:54947261:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:1223:47210:14984 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.9899 ["ChimerSeq","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[6771]"] SPATA6L--CDC37L1-DT 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE SPATA6L^ENSG00000106686.16 chr9:4661899:- CDC37L1-DT^ENSG00000273061.1 chr9:4676749:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1208:27754:4125 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5301 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[9926]"] SPATA17--ROR1-AS1 1 0 0.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE SPATA17^ENSG00000162814.11 chr1:217651178:+ ROR1-AS1^ENSG00000223949.8 chr1:64108393:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1392:10012:13583 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.9656 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:153.46Mb]"] SPATA17--OSGEPL1-AS1 1 0 0.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE SPATA17^ENSG00000162814.11 chr1:217651178:+ OSGEPL1-AS1^ENSG00000253559.1 chr2:189764855:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1392:10012:13583 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.9656 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr2]"] SOX5--ZNF385D 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE SOX5^ENSG00000134532.19 chr12:23845983:- ZNF385D^ENSG00000151789.12 chr3:21665028:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1482:2052:1757 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5058 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr3]"] SOCS2--LRFN5 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE SOCS2^ENSG00000120833.14 chr12:93575173:+ LRFN5^ENSG00000165379.14 chr14:41898917:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2201:14996:15825 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7968 AG 1.9219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr14]"] SIGLEC6--AL451085.2 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE SIGLEC6^ENSG00000105492.16 chr19:51519254:- AL451085.2^ENSG00000271380.1 chr1:154961833:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2158:41547:25718 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.7232 AG 1.5656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr1]"] SDHAP3--AC026412.1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE SDHAP3^ENSG00000185986.12 chr5:1593113:- AC026412.1^ENSG00000188002.10 chr5:1599827:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2245:14494:15321 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr5:0.00Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[4300]"] SBF2-AS1--LRP2BP 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE SBF2-AS1^ENSG00000246273.8 chr11:9775765:+ LRP2BP^ENSG00000109771.16 chr4:185370814:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1166:11282:5218 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7465 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr4]"] SAMD12-AS1--COLEC10 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE SAMD12-AS1^ENSG00000281641.3 chr8:118905074:+ COLEC10^ENSG00000184374.3 chr8:119089680:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2443:34112:26040 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5058 AG 1.5219 ["CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.09Mb]","NEIGHBORS[89297]"] RTCA-AS1--FLACC1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE RTCA-AS1^ENSG00000224616.3 chr1:100265815:- FLACC1^ENSG00000155749.13 chr2:201344263:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1452:33732:20561 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8062 AG 1.8256 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr2]"] RPS27P26--AP006545.1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RPS27P26^ENSG00000240043.1 chr16:70444737:- AP006545.1^ENSG00000260949.1 chr8:38063083:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2245:49969:1687 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr8]"] RNFT1P3--AL358334.3 1 0 0.33 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RNFT1P3^ENSG00000187870.7 chr17:20754483:- AL358334.3^ENSG00000258745.1 chr14:50912285:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2297:21274:22271 . NO_LDAS 0.0011 GC 1.8892 AG 1.7819 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr14]"] RNF180--QDPR 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RNF180^ENSG00000164197.12 chr5:64214214:+ QDPR^ENSG00000151552.12 chr4:17490691:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2104:41976:27217 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr4]"] RN7SL337P--PLEKHS1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RN7SL337P^ENSG00000243488.3 chr19:14584267:+ PLEKHS1^ENSG00000148735.15 chr10:113774893:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:6170:17184 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9899 AG 1.8062 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr10]"] RMI1--CCR9 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RMI1^ENSG00000178966.17 chr9:84001300:+ CCR9^ENSG00000173585.16 chr3:45901978:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2217:1299:27161 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8323 AG 1.2310 ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr3]"] RLN1--PLGRKT 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RLN1^ENSG00000107018.8 chr9:5335468:- PLGRKT^ENSG00000107020.10 chr9:5361888:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1325:17957:1336 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7819 AG 1.9329 ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[18095]"] RGPD4--SORBS2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE RGPD4^ENSG00000196862.10 chr2:107882873:+ SORBS2^ENSG00000154556.18 chr4:185589785:- LH00995:25:23T55JLT4:4:2196:32486:22747 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr4]"] REREP1Y--OFD1P10Y 1 0 0.12 0.00 ONLY_REF_SPLICE REREP1Y^ENSG00000225189.1 chrY:23462535:+ OFD1P10Y^ENSG00000225466.1 chrY:23586700:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2156:29032:7292 . YES_LDAS 0.0004 GT 1.8892 AG 1.9899 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chrY:0.11Mb]"] RASA4B--AC025822.1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RASA4B^ENSG00000170667.15 chr7:102488463:- AC025822.1^ENSG00000227101.2 chr10:4025064:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1210:4681:17801 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.1589 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr10]"] RAB3A--AC008771.1 1 0 0.25 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE RAB3A^ENSG00000105649.10 chr19:18198765:- AC008771.1^ENSG00000249042.6 chr5:80488012:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1343:49071:10977 . NO_LDAS 0.0008 GT 1.5546 AG 1.2867 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr5]"] PRRG1--LANCL3 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE PRRG1^ENSG00000130962.18 chrX:37426000:+ LANCL3^ENSG00000147036.12 chrX:37655688:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1209:1121:13513 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.3753 AG 1.9656 ["ChimerSeq","INTRACHROMOSOMAL[chrX:0.11Mb]"] PRR20C--ZBP1 1 0 0.20 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PRR20C^ENSG00000229665.8 chr13:57154189:+ ZBP1^ENSG00000124256.15 chr20:57617299:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1486:25634:6619 . NO_LDAS 0.0007 GT 1.9899 AG 1.7819 ["INTERCHROMOSOMAL[chr13--chr20]"] PRR20A--ZBP1 1 0 0.20 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PRR20A^ENSG00000204919.1 chr13:57141046:+ ZBP1^ENSG00000124256.15 chr20:57617299:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1486:25634:6619 . NO_LDAS 0.0007 GT 1.9899 AG 1.7819 ["INTERCHROMOSOMAL[chr13--chr20]"] PRIM1--ZNF331 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE PRIM1^ENSG00000198056.15 chr12:56734147:- ZNF331^ENSG00000130844.19 chr19:53522617:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1288:31758:29725 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8256 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr19]"] PLGLB1--AL109933.1 1 0 0.25 0.00 ONLY_REF_SPLICE PLGLB1^ENSG00000183281.15 chr2:87016302:- AL109933.1^ENSG00000224477.5 chr6:160700554:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2135:31734:26068 . NO_LDAS 0.0008 GT 1.3996 AG 1.9219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr6]"] PHF7--AL442663.4 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PHF7^ENSG00000010318.21 chr3:52414587:+ AL442663.4^ENSG00000259015.1 chr14:72961851:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1203:51417:23532 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5546 AG 1.8295 ["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr14]"] PGR-AS1--AC002401.1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PGR-AS1^ENSG00000282728.1 chr11:101129239:+ AC002401.1^ENSG00000236472.1 chr17:50135592:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1323:1429:28142 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.3753 AG 1.7232 ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr17]"] PEX3--AC015660.1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PEX3^ENSG00000034693.15 chr6:143471611:+ AC015660.1^ENSG00000259341.2 chr15:99429961:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1357:5409:17296 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.5656 AG 1.8256 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr15]"] PDE5A--ACER1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE PDE5A^ENSG00000138735.16 chr4:119504536:- ACER1^ENSG00000167769.5 chr19:6312499:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2438:2116:5288 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.5058 ["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr19]"] PCDHA13--CCDC81 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE PCDHA13^ENSG00000239389.8 chr5:140884662:+ CCDC81^ENSG00000149201.10 chr11:86408200:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2160:46611:11425 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.7819 AG 1.3996 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr11]"] NUDCD2--DNM3 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE NUDCD2^ENSG00000170584.11 chr5:163453999:- DNM3^ENSG00000197959.14 chr1:172081832:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2132:39233:11453 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7232 AG 1.6729 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr1]"] NLRP14--ZNF215 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE NLRP14^ENSG00000158077.5 chr11:7070456:+ ZNF215^ENSG00000149054.16 chr11:6955690:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1436:11015:11229 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[19475]"] NLGN4Y--PIGP 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE NLGN4Y^ENSG00000165246.14 chrY:14751710:+ PIGP^ENSG00000185808.14 chr21:37072537:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2222:5927:1238 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chrY--chr21]"] NIPSNAP3B--STPG4 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE NIPSNAP3B^ENSG00000165028.12 chr9:104769021:+ STPG4^ENSG00000239605.11 chr2:47153016:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2473:44532:14802 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7465 AG 1.3996 ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr2]"] NBPF25P--NOTCH2NLB 1 0 0.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE NBPF25P^ENSG00000272150.5 chr1:145594451:- NOTCH2NLB^ENSG00000286019.1 chr1:148607159:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1446:8483:28226 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.7968 AG 1.5329 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:3.00Mb]"] NAA11--FLG 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE NAA11^ENSG00000156269.5 chr4:79294013:- FLG^ENSG00000143631.11 chr1:152304034:- LH00995:25:23T55JLT4:4:2142:14454:26657 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chr1]"] MINDY4--THSD1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE MINDY4^ENSG00000106125.14 chr7:30836721:+ THSD1^ENSG00000136114.17 chr13:52378492:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1223:18652:26054 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr13]"] MAGED4B--AL121935.2 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE MAGED4B^ENSG00000187243.16 chrX:52064043:- AL121935.2^ENSG00000284914.1 chr6:167126595:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1356:35827:28562 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.6895 AG 1.2729 ["INTERCHROMOSOMAL[chrX--chr6]"] LYPLAL1--C4orf47 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LYPLAL1^ENSG00000143353.12 chr1:219179246:+ C4orf47^ENSG00000205129.8 chr4:185440540:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2476:13580:14830 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7968 AG 1.5329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr4]"] LYPD6--MMADHC-DT 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LYPD6^ENSG00000187123.15 chr2:149449147:+ MMADHC-DT^ENSG00000231969.2 chr2:149593734:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:1287:42607:23013 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.7465 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.11Mb]"] LY96--AC087627.1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LY96^ENSG00000154589.7 chr8:74010129:+ AC087627.1^ENSG00000253983.3 chr8:74207721:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1372:6178:13947 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7968 AG 1.7968 ["TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.06Mb]","NEIGHBORS[64466]"] LRRN4--PIPOX 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE LRRN4^ENSG00000125872.8 chr20:6041464:- PIPOX^ENSG00000179761.12 chr17:28952302:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1356:33498:15475 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5850 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chr17]"] LRFN5--LINC02888 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LRFN5^ENSG00000165379.14 chr14:41608562:+ LINC02888^ENSG00000236318.2 chr7:17450995:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2365:18418:22761 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.6729 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr7]"] LPAR3--SSX2IP 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LPAR3^ENSG00000171517.6 chr1:84865385:- SSX2IP^ENSG00000117155.17 chr1:84670815:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2168:14729:12364 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.6729 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.12Mb]"] LINC02588--ZCWPW2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LINC02588^ENSG00000257842.6 chr14:26731156:+ ZCWPW2^ENSG00000206559.8 chr3:28435110:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1394:38214:22915 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr3]"] LINC01940--AC026427.1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE LINC01940^ENSG00000227744.4 chr2:238925516:- AC026427.1^ENSG00000249772.1 chr5:81113830:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2464:34994:18768 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr5]"] LINC01934--CCDC141 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LINC01934^ENSG00000234663.7 chr2:181362918:+ CCDC141^ENSG00000163492.15 chr2:178944651:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1380:6380:4153 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.4716 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:2.04Mb]"] LINC01903--NUDT6 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE LINC01903^ENSG00000265555.1 chr18:67809422:- NUDT6^ENSG00000170917.14 chr4:122893204:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2253:13895:25157 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.7232 AG 1.8062 ["INTERCHROMOSOMAL[chr18--chr4]"] LINC01563--IFTAP 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LINC01563^ENSG00000236819.2 chr17:21075957:+ IFTAP^ENSG00000166352.18 chr11:36648016:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2194:46806:13723 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7056 AG 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr11]"] LINC01018--TBCAP1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE LINC01018^ENSG00000250056.8 chr5:6592744:+ TBCAP1^ENSG00000226781.1 chrX:33041554:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2317:12480:16792 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.7232 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chrX]"] LINC00324--PMP2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LINC00324^ENSG00000178977.3 chr17:8222293:- PMP2^ENSG00000147588.7 chr8:81444989:- LH00995:25:23T55JLT4:4:2191:44694:25620 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr8]"] LINC00265--KIF24 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LINC00265^ENSG00000188185.13 chr7:39780624:+ KIF24^ENSG00000186638.16 chr9:34263172:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1329:46433:10220 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr9]"] LINC00032--LRRC19 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE LINC00032^ENSG00000283945.1 chr9:27258412:- LRRC19^ENSG00000184434.8 chr9:27037847:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2462:48739:8244 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5656 AG 1.4256 ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.24Mb]"] LIN52--NHLH2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE LIN52^ENSG00000205659.11 chr14:74101238:+ NHLH2^ENSG00000177551.5 chr1:115838380:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1376:6752:1995 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6402 AG 1.9086 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr1]"] KRTAP5-AS1--AP000867.5 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE KRTAP5-AS1^ENSG00000233930.4 chr11:1598289:+ AP000867.5^ENSG00000286948.1 chr11:71563684:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2123:48707:19931 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6895 AG 1.8295 ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:69.96Mb]"] KLRA1P--CHCHD2P2 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE KLRA1P^ENSG00000256667.6 chr12:10593964:- CHCHD2P2^ENSG00000215006.4 chr5:69334199:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1326:15683:6759 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8256 AG 1.8062 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr5]"] IRX4--SRRM1P3 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE IRX4^ENSG00000113430.10 chr5:1879598:- SRRM1P3^ENSG00000237307.2 chrX:136985671:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2427:23587:2009 . NO_LDAS 0.0034 GC 1.8256 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chrX]"] IL9R--RPL23AP24 1 0 0.04 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE IL9R^ENSG00000124334.17 chrX:156005479:+ RPL23AP24^ENSG00000236679.2 chr1:348430:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1235:14373:22397 . YES_LDAS 0.0001 GT 1.7819 AG 1.5850 ["INTERCHROMOSOMAL[chrY--chr1]"] IL7--AC068700.2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE IL7^ENSG00000104432.14 chr8:78798072:- AC068700.2^ENSG00000286675.1 chr8:78630426:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1203:2254:1687 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8323 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.01Mb]","NEIGHBORS[9761]"] IFNLR1--AL139093.1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE IFNLR1^ENSG00000185436.12 chr1:24180745:- AL139093.1^ENSG00000278128.2 chr6:23856771:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2361:2044:19819 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8295 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr6]"] HSPA14--TNFSF8 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE HSPA14^ENSG00000187522.16 chr10:14849454:+ TNFSF8^ENSG00000106952.8 chr9:114904254:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2463:33133:5316 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr9]"] HOXC10--LINC02381 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE HOXC10^ENSG00000180818.5 chr12:53986010:+ LINC02381^ENSG00000250742.4 chr12:54131990:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1253:4794:21668 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6402 AG 1.9086 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.14Mb]"] HLA-J--OR10S1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE HLA-J^ENSG00000204622.11 chr6:30009181:+ OR10S1^ENSG00000196248.5 chr11:123977426:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1186:7998:1266 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr11]"] H3-3A-DT--NSMCE4A 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE H3-3A-DT^ENSG00000272562.2 chr1:226060990:- NSMCE4A^ENSG00000107672.15 chr10:121961517:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2192:25836:17535 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8256 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr10]"] GSDMA--LINC01735 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE GSDMA^ENSG00000167914.12 chr17:39966437:+ LINC01735^ENSG00000261453.2 chr1:208612778:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1338:27527:18165 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.7465 AG 1.7056 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr1]"] GPRIN2--NPY4R 1 0 0.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE GPRIN2^ENSG00000204175.5 chr10:46554585:- NPY4R^ENSG00000204174.8 chr10:46462694:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1306:8427:20029 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.6402 AG 1.9219 ["INTRACHROMOSOMAL[chr10:0.08Mb]","NEIGHBORS[83086]"] GOLGA8IP--AC123768.1 1 0 0.10 0.00 ONLY_REF_SPLICE GOLGA8IP^ENSG00000277561.5 chr15:22607800:- AC123768.1^ENSG00000244952.2 chr15:32614109:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1390:2319:13233 . NO_LDAS 0.0003 GT 1.9086 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr15:10.00Mb]"] GLYATL2--GLYAT 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE GLYATL2^ENSG00000156689.7 chr11:58904156:- GLYAT^ENSG00000149124.11 chr11:58724511:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2246:19478:26390 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7465 AG 1.9656 ["DGD_PARALOGS","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.10Mb]"] GALNT8--KHDRBS3 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE GALNT8^ENSG00000130035.9 chr12:4765546:+ KHDRBS3^ENSG00000131773.14 chr8:135557448:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2486:46037:23434 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.5656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr8]"] FRG1GP--AC123769.1 1 0 0.25 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE FRG1GP^ENSG00000283023.1 chr22:12615534:+ AC123769.1^ENSG00000279674.1 chr17:34005194:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1426:38254:24330 . NO_LDAS 0.0008 GT 1.5329 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr17]"] FNDC11--STK26 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE FNDC11^ENSG00000125531.7 chr20:63548356:+ STK26^ENSG00000134602.16 chrX:132023553:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:1174:22908:26222 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.2419 AG 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr20--chrX]"] FLVCR1-DT--SPATA45 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE FLVCR1-DT^ENSG00000198468.9 chr1:212857766:- SPATA45^ENSG00000185523.6 chr1:212836187:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1155:42162:29361 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.7465 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.00Mb]","NEIGHBORS[4456]"] FBXO30-DT--GRM1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE FBXO30-DT^ENSG00000235652.9 chr6:145828456:+ GRM1^ENSG00000152822.14 chr6:146304611:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2127:44856:2303 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8323 AG 1.7465 ["INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.14Mb]"] FAM66D--ALG1L10P 1 0 0.33 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE FAM66D^ENSG00000255052.5 chr8:12177497:+ ALG1L10P^ENSG00000254016.3 chr12:8227735:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:1280:7569:13807 . YES_LDAS 0.0011 GT 1.9329 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr12]"] FAM53A--PAK3 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE FAM53A^ENSG00000174137.13 chr4:1654978:- PAK3^ENSG00000077264.16 chrX:111123077:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1369:12059:15307 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.8256 ["INTERCHROMOSOMAL[chr4--chrX]"] FAM222A--SOX5 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE FAM222A^ENSG00000139438.6 chr12:109714897:+ SOX5^ENSG00000134532.19 chr12:23665564:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2386:45058:28520 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7819 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr12:85.15Mb]"] EEF1A1P19--MC1R 1 0 0.33 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE EEF1A1P19^ENSG00000249855.1 chr5:43495631:- MC1R^ENSG00000258839.4 chr16:89919522:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2195:41393:12616 . YES_LDAS 0.0011 GT 1.9899 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr16]"] DRICH1--TMEM230P1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE DRICH1^ENSG00000189269.12 chr22:23614135:- TMEM230P1^ENSG00000225728.2 chrX:107939373:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1405:10692:10248 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.9656 AG 1.8256 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chrX]"] DNAL1--NEBL 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE DNAL1^ENSG00000119661.15 chr14:73671597:+ NEBL^ENSG00000078114.19 chr10:20868765:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1337:45026:18235 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.5546 ["INTERCHROMOSOMAL[chr14--chr10]"] DLEU1--PLA2G4A 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE DLEU1^ENSG00000176124.15 chr13:50715887:+ PLA2G4A^ENSG00000116711.10 chr1:186893011:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2267:43756:7320 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5329 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr13--chr1]"] DDX11L10--C20orf204 1 0 0.25 0.00 ONLY_REF_SPLICE DDX11L10^ENSG00000233614.6 chr16:11908:+ C20orf204^ENSG00000196421.8 chr20:64037927:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2264:26880:9870 . NO_LDAS 0.0008 GT 1.9086 AG 1.8295 ["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr20]"] CTC-338M12.4--AC114324.2 1 0 0.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE CTC-338M12.4^ENSG00000233937.7 chr5:181247386:+ AC114324.2^ENSG00000249444.2 chr5:99499070:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:1380:50195:7964 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.8256 AG 1.4295 ["INTRACHROMOSOMAL[chr5:81.75Mb]"] CRYBB2P1--SH2D4A 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CRYBB2P1^ENSG00000100058.12 chr22:25520733:+ SH2D4A^ENSG00000104611.12 chr8:19361203:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1374:31532:14760 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9329 AG 1.6729 ["INTERCHROMOSOMAL[chr22--chr8]"] CRISPLD1--HMGN2P26 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CRISPLD1^ENSG00000121005.9 chr8:75016703:+ HMGN2P26^ENSG00000241203.1 chr3:167958923:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1396:48747:8931 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.7465 AG 1.7819 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr3]"] CNTNAP3B--IGKV1OR-2 1 0 0.11 0.00 ONLY_REF_SPLICE CNTNAP3B^ENSG00000154529.15 chr9:42104629:- IGKV1OR-2^ENSG00000156755.10 chr9:64765351:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1196:36426:1350 . YES_LDAS 0.0004 GT 1.8062 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:22.64Mb]"] CMC4--SLIT3-AS2 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CMC4^ENSG00000182712.16 chrX:155061963:- SLIT3-AS2^ENSG00000254042.2 chr5:168709204:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1188:30092:19973 . YES_LDAS 0.0017 GC 1.8892 AG 1.6895 ["INTERCHROMOSOMAL[chrX--chr5]"] CICP14--FAM151A 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CICP14^ENSG00000281490.1 chr7:128658103:- FAM151A^ENSG00000162391.12 chr1:54609209:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1152:45228:10234 . YES_LDAS 0.0017 GC 1.9899 AG 1.6402 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr1]"] CDIN1--NUP35 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE CDIN1^ENSG00000186073.14 chr15:36579961:+ NUP35^ENSG00000163002.13 chr2:183128287:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:1370:20756:19356 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.9219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr2]"] CCDC122--ENOX1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE CCDC122^ENSG00000151773.13 chr13:43874842:- ENOX1^ENSG00000120658.13 chr13:43361452:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1131:6380:27862 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8256 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr13:0.04Mb]","NEIGHBORS[37001]"] CAVIN4--TMEFF1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE CAVIN4^ENSG00000170681.7 chr9:100586185:+ TMEFF1^ENSG00000241697.5 chr9:100550095:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2482:41952:1252 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8256 AG 1.8295 ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.00Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[443]"] C16orf74--MOCS3 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE C16orf74^ENSG00000154102.11 chr16:85750926:- MOCS3^ENSG00000124217.5 chr20:50962735:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1373:15772:26110 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5058 AG 1.8062 ["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr20]"] C16orf74--AF130359.1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE C16orf74^ENSG00000154102.11 chr16:85735190:- AF130359.1^ENSG00000237735.2 chr21:16755798:- LH00995:25:23T55JLT4:4:2348:7367:12056 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9899 AG 1.7232 ["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr21]"] BX679664.3--C3orf70 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE BX679664.3^ENSG00000244716.3 chr1:108992487:+ C3orf70^ENSG00000187068.3 chr3:185083125:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1276:1421:11089 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.6402 AG 1.9086 ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chr3]"] BTF3P10--RPLP0P2 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE BTF3P10^ENSG00000231120.3 chr6:149978257:+ RPLP0P2^ENSG00000243742.5 chr11:61636541:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1402:34565:14522 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9219 AG 1.9219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr11]"] B3GNT4--SLC22A11 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE B3GNT4^ENSG00000176383.9 chr12:122207099:+ SLC22A11^ENSG00000168065.16 chr11:64569724:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2143:46280:21024 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8062 AG 1.5546 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr11]"] ASB14--DNAH12 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ASB14^ENSG00000239388.9 chr3:57277767:- DNAH12^ENSG00000174844.14 chr3:57309854:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1181:16937:18151 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.3996 AG 1.5656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.00Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[1014]"] ARHGAP28--LINC02117 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ARHGAP28^ENSG00000088756.13 chr18:6729943:+ LINC02117^ENSG00000248539.1 chr5:37899668:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1310:47550:18992 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6729 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr18--chr5]"] AP002989.1--SLC1A1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AP002989.1^ENSG00000254987.1 chr11:103893875:- SLC1A1^ENSG00000106688.12 chr9:4566047:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1109:43586:10444 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr9]"] AP001160.3--STARD4-AS1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AP001160.3^ENSG00000269176.2 chr11:62786718:- STARD4-AS1^ENSG00000246859.3 chr5:111734418:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1313:34307:6395 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5058 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr5]"] AL928711.1--SYT14 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AL928711.1^ENSG00000259984.1 chr1:25337040:- SYT14^ENSG00000143469.20 chr1:210155721:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2113:15060:28744 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7968 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:184.56Mb]"] AL513550.1--AC011487.1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL513550.1^ENSG00000228506.2 chr6:99425898:+ AC011487.1^ENSG00000213777.5 chr19:53503656:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2466:26435:23420 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.7819 AG 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr19]"] AL513323.1--OR10J3 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL513323.1^ENSG00000228560.1 chr1:159468987:- OR10J3^ENSG00000196266.5 chr1:159314684:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2183:36936:1925 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.8256 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.03Mb]","NEIGHBORS[31507]"] AL139147.1--IL23R 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL139147.1^ENSG00000248458.2 chr1:66676976:- IL23R^ENSG00000162594.16 chr1:67160040:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2410:33619:22327 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.9656 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.46Mb]"] AL136164.3--ELL2P1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL136164.3^ENSG00000279289.1 chr6:71389449:- ELL2P1^ENSG00000227295.2 chr1:158176263:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1416:3209:28254 . YES_LDAS 0.0034 AT 1.7819 AC 1.8062 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr1]"] AL121749.2--AC232271.3 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL121749.2^ENSG00000287528.1 chr10:35641129:+ AC232271.3^ENSG00000286181.1 chrX:49263873:- LH00995:25:23T55JLT4:4:2164:6703:18389 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8256 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chrX]"] AL109615.1--RPL29P3 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AL109615.1^ENSG00000183239.5 chr6:44089338:- RPL29P3^ENSG00000243730.2 chr14:36577996:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1160:8985:15335 . YES_LDAS 0.0034 GC 1.5850 AG 1.5628 ["INTERCHROMOSOMAL[chr6--chr14]"] AGBL2--CCM2L 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AGBL2^ENSG00000165923.16 chr11:47690076:- CCM2L^ENSG00000101331.17 chr20:32031673:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:1333:22681:27063 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.7232 AG 1.9086 ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr20]"] AGAP5--AC022400.4 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AGAP5^ENSG00000172650.14 chr10:73692043:- AC022400.4^ENSG00000272140.2 chr10:73705078:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2338:21460:5638 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7465 AG 1.7056 ["INTRACHROMOSOMAL[chr10:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[5854]"] ADAMTSL3--SH3GL3 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE ADAMTSL3^ENSG00000156218.13 chr15:83704508:+ SH3GL3^ENSG00000140600.17 chr15:83586983:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2488:2100:27539 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9899 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr15:0.04Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[35345]"] ADAMTSL3--AC006547.1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ADAMTSL3^ENSG00000156218.13 chr15:83704508:+ AC006547.1^ENSG00000236540.7 chr22:20058476:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1342:40487:13933 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.9899 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr22]"] ACTR3C--AC092681.1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE ACTR3C^ENSG00000106526.10 chr7:150284753:- AC092681.1^ENSG00000224016.2 chr7:149909705:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2348:31168:23798 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9899 AG 1.9899 ["TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.33Mb]"] AC245041.2--CDKL3 1 0 0.33 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC245041.2^ENSG00000276850.5 chr10:47985856:- CDKL3^ENSG00000006837.12 chr5:134321903:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2304:20189:28436 . YES_LDAS 0.0011 GT 1.6402 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr10--chr5]"] AC244102.3--GABRA3 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC244102.3^ENSG00000287394.1 chrX:152635882:- GABRA3^ENSG00000011677.13 chrX:152364596:- LH00995:25:23T55JLT4:2:1375:23514:5610 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chrX:0.12Mb]"] AC244102.3--GABRA3 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC244102.3^ENSG00000287394.1 chrX:152635882:- GABRA3^ENSG00000011677.13 chrX:152486343:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2352:29817:6157 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chrX:0.12Mb]"] AC233968.1--H1-10-AS1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC233968.1^ENSG00000274615.1 chr17:38124630:+ H1-10-AS1^ENSG00000206417.8 chr3:129323425:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1355:21654:24022 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.9329 AG 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr3]"] AC215522.2--AL627309.5 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC215522.2^ENSG00000282572.2 chr7:20834:- AL627309.5^ENSG00000241860.7 chr1:173862:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1453:34938:25564 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6402 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr1]"] AC134407.3--PKN2-AS1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC134407.3^ENSG00000279880.1 chr17:67975958:+ PKN2-AS1^ENSG00000237505.8 chr1:88540052:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2404:39428:23308 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.2310 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr1]"] AC125257.1--AGMAT 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC125257.1^ENSG00000259623.1 chr17:41850945:- AGMAT^ENSG00000116771.6 chr1:15574824:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2220:46361:18137 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9086 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr1]"] AC107959.1--ITIH4 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC107959.1^ENSG00000245025.3 chr8:23007032:- ITIH4^ENSG00000055955.17 chr3:52826624:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1290:3378:8903 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.6895 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr3]"] AC105020.6--NIFK-AS1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC105020.6^ENSG00000275454.1 chr15:75640087:+ NIFK-AS1^ENSG00000236859.7 chr2:121651992:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2425:51878:23490 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8323 AG 1.7465 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr2]"] AC103564.3--TBC1D27P 1 0 0.14 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC103564.3^ENSG00000274353.1 chr2:131822800:- TBC1D27P^ENSG00000128438.10 chr17:16926963:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2420:17819:28198 . NO_LDAS 0.0005 GT 1.8323 AG 1.7819 ["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr17]"] AC097500.1--FSIP2-AS1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC097500.1^ENSG00000287129.1 chr2:185950644:- FSIP2-AS1^ENSG00000231646.6 chr2:185800148:- LH00995:25:23T55JLT4:3:2180:34638:11173 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9899 AG 1.8256 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.15Mb]"] AC096642.2--LYPLAL1 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC096642.2^ENSG00000287676.1 chr1:219295151:+ LYPLAL1^ENSG00000143353.12 chr1:219193130:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1180:45074:25746 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.3383 ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.08Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[82117]"] AC092032.2--PMS2CL 1 0 0.25 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC092032.2^ENSG00000288620.1 chr7:4985075:+ PMS2CL^ENSG00000187953.10 chr7:6731897:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1114:26289:25073 . YES_LDAS 0.0008 GT 1.7819 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:1.72Mb]"] AC092032.2--PMS2CL 1 0 0.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC092032.2^ENSG00000288620.1 chr7:4989177:+ PMS2CL^ENSG00000187953.10 chr7:6731897:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1325:5118:3172 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.8892 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:1.72Mb]"] AC091906.1--ADAM32 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC091906.1^ENSG00000248537.1 chr5:9367395:+ ADAM32^ENSG00000197140.15 chr8:39270876:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1309:24154:19384 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8323 AG 1.8892 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr8]"] AC090543.1--AL353748.1 1 0 0.25 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC090543.1^ENSG00000239465.1 chr15:64631395:- AL353748.1^ENSG00000231804.1 chr9:88485166:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1121:44006:6969 . NO_LDAS 0.0008 GT 1.9656 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr9]"] AC090543.1--AF305872.1 1 0 0.25 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC090543.1^ENSG00000239465.1 chr15:64631395:- AF305872.1^ENSG00000240237.1 chr8:133002913:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1121:44006:6969 . NO_LDAS 0.0008 GT 1.9656 AG 1.9899 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr8]"] AC084125.2--GUCA1B 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC084125.2^ENSG00000255182.2 chr8:144496648:- GUCA1B^ENSG00000112599.9 chr6:42185740:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1294:29655:10697 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.8295 ["INTERCHROMOSOMAL[chr8--chr6]"] AC079313.1--KEL 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC079313.1^ENSG00000258086.1 chr12:54409595:+ KEL^ENSG00000197993.9 chr7:142946572:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1195:37373:15881 . NO_LDAS 0.0017 GC 1.8256 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr12--chr7]"] AC048380.1--JPH1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC048380.1^ENSG00000267762.1 chr18:48688396:- JPH1^ENSG00000104369.5 chr8:74320993:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2110:51207:4867 . YES_LDAS 0.0034 GC 1.7465 AG 1.7232 ["INTERCHROMOSOMAL[chr18--chr8]"] AC044810.2--OVCH2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC044810.2^ENSG00000254951.7 chr11:7879007:- OVCH2^ENSG00000183378.12 chr11:7704674:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1398:36248:9225 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7056 AG 1.8256 ["GTEx_recurrent_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.05Mb]","NEIGHBORS[47972]"] AC037198.1--H3C3 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC037198.1^ENSG00000276107.1 chr15:39586914:+ H3C3^ENSG00000287080.2 chr6:26045576:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2484:11032:1953 . YES_LDAS 0.0034 AT 1.9899 AC 1.8256 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr6]"] AC026150.2--GOLGA2P9 1 0 0.08 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC026150.2^ENSG00000260784.1 chr15:30517819:+ GOLGA2P9^ENSG00000269332.5 chr19:22601360:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1133:39306:21724 . NO_LDAS 0.0003 GT 1.7056 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr19]"] AC025043.1--AL096869.3 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC025043.1^ENSG00000259595.1 chr15:44413334:- AL096869.3^ENSG00000259789.2 chr14:90490736:- LH00995:25:23T55JLT4:1:1297:2602:25241 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.6895 AG 1.7968 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr14]"] AC021851.1--NUP35 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC021851.1^ENSG00000272800.3 chr2:183182680:+ NUP35^ENSG00000163002.13 chr2:183151508:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2322:19825:24106 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8062 AG 1.8256 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[17126]"] AC018638.8--AL354836.1 1 0 0.08 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC018638.8^ENSG00000281896.1 chr7:128617977:+ AL354836.1^ENSG00000226332.2 chr20:62305773:- LH00995:25:23T55JLT4:4:2220:5571:7768 . NO_LDAS 0.0003 GT 1.9656 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr20]"] AC015712.1--HNRNPA3P10 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC015712.1^ENSG00000232386.9 chr15:100849600:+ HNRNPA3P10^ENSG00000257851.2 chr12:51712867:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2417:37170:4125 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.5628 AG 1.6402 ["INTERCHROMOSOMAL[chr15--chr12]"] AC011450.1--SLC6A16 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC011450.1^ENSG00000197813.6 chr19:49340172:- SLC6A16^ENSG00000063127.16 chr19:49294028:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1202:32268:13541 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.5656 AG 1.7819 ["INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.01Mb]","NEIGHBORS[6310]"] AC009315.1--FSIP2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC009315.1^ENSG00000286797.1 chr2:185434191:+ FSIP2^ENSG00000188738.15 chr2:185739346:+ LH00995:25:23T55JLT4:4:2174:36337:21402 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.8256 ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.23Mb]"] AC009093.8--ULK4 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC009093.8^ENSG00000284649.1 chr16:29116326:+ ULK4^ENSG00000168038.11 chr3:41819506:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2154:19558:15265 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 0.7219 ["INTERCHROMOSOMAL[chr16--chr3]"] AC008937.1--SPOCK3 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC008937.1^ENSG00000225230.1 chr5:56910176:- SPOCK3^ENSG00000196104.11 chr4:166754729:- LH00995:25:23T55JLT4:2:2211:8087:21458 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8295 AG 1.9656 ["INTERCHROMOSOMAL[chr5--chr4]"] AC008740.2--CRYM-AS1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC008740.2^ENSG00000276548.1 chr16:21401194:+ CRYM-AS1^ENSG00000189149.12 chr16:21315884:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:1409:32316:5386 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.8892 AG 1.8892 ["INTRACHROMOSOMAL[chr16:0.06Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[62052]"] AC008740.1--AC138512.1 1 0 0.50 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC008740.1^ENSG00000257403.2 chr16:21352138:+ AC138512.1^ENSG00000261273.1 chr16:88276474:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1387:31677:12014 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.7232 AG 1.9086 ["INTRACHROMOSOMAL[chr16:66.88Mb]"] AC007405.3--CERNA1 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC007405.3^ENSG00000239467.6 chr2:170771427:+ CERNA1^ENSG00000259577.2 chr15:52205277:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:2472:49305:4573 . NO_LDAS 0.0034 GT 1.7968 AG 1.4256 ["INTERCHROMOSOMAL[chr2--chr15]"] AC005944.1--PPP2R5CP 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC005944.1^ENSG00000267469.1 chr19:3053322:+ PPP2R5CP^ENSG00000239557.1 chr3:52374583:+ LH00995:25:23T55JLT4:2:1245:1008:7235 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8323 AG 1.8295 ["INTERCHROMOSOMAL[chr19--chr3]"] AC004980.2--AC008985.1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC004980.2^ENSG00000214243.3 chr7:76650398:- AC008985.1^ENSG00000278999.1 chr19:47662091:- LH00995:25:23T55JLT4:4:1389:24073:10697 . NO_LDAS 0.0017 GT 1.9656 AG 1.8295 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr19]"] AC004967.1--AC022494.1 1 0 0.50 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC004967.1^ENSG00000243554.1 chr7:97969012:- AC022494.1^ENSG00000240477.1 chr3:150051422:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2289:35577:3102 . YES_LDAS 0.0017 GT 1.9899 AG 1.9329 ["INTERCHROMOSOMAL[chr7--chr3]"] AC004951.3--POLR2J4 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC004951.3^ENSG00000241057.2 chr7:43965867:- POLR2J4^ENSG00000272655.2 chr7:44013679:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1124:20796:19987 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8256 AG 1.7465 ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:0.04Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[40239]"] AC004784.1--CD177 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC004784.1^ENSG00000282943.1 chr19:43101700:+ CD177^ENSG00000204936.10 chr19:43354207:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:2258:20408:15615 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.8062 ["TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.18Mb]"] AC004784.1--CD177 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AC004784.1^ENSG00000282943.1 chr19:43101700:+ CD177^ENSG00000204936.10 chr19:43353853:+ LH00995:25:23T55JLT4:3:2451:2553:1252 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.8892 AG 1.7968 ["TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.18Mb]"] AC004076.1--ZNF772 1 0 1.00 0.00 INCL_NON_REF_SPLICE AC004076.1^ENSG00000268163.1 chr19:57455653:- ZNF772^ENSG00000197128.12 chr19:57467085:- LH00995:25:23T55JLT4:4:2165:15732:3312 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.9656 AG 1.8062 ["INTRACHROMOSOMAL[chr19:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:-:[10424]"] AADAC--AC068647.2 1 0 1.00 0.00 ONLY_REF_SPLICE AADAC^ENSG00000114771.14 chr3:151817588:+ AC068647.2^ENSG00000250271.2 chr3:151803706:+ LH00995:25:23T55JLT4:1:1472:16153:29599 . YES_LDAS 0.0034 GT 1.7232 AG 1.9329 ["INTRACHROMOSOMAL[chr3:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5824]"] TVP23C--TEKT3 1 1 1.00 0.50 ONLY_REF_SPLICE TVP23C^ENSG00000175106.17 chr17:15540433:- TEKT3^ENSG00000125409.13 chr17:15340061:- LH00995:25:23T55JLT4:1:2271:35447:13163 LH00995:25:23T55JLT4:2:1338:9786:28436 YES_LDAS 0.0051 GT 1.8323 AG 1.7232 ["INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.16Mb]"] TVP23C--TEKT3 1 1 1.00 0.50 INCL_NON_REF_SPLICE TVP23C^ENSG00000175106.17 chr17:15503098:- TEKT3^ENSG00000125409.13 chr17:15331614:- LH00995:25:23T55JLT4:3:1446:24906:24499 LH00995:25:23T55JLT4:2:1338:9786:28436 YES_LDAS 0.0051 GT 1.9329 AG 1.7465 ["INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.16Mb]"]