File Info
- Filename
- 1173_D6K_T1_RNA_SLD_01_A23T55JLT4_1.starfusion.starfusion.fusion_predictions.filtered_pass_only.tsv
- Full Path
- s3://natera-platform-sandbox/pipeline-outputs/cgp_runs/nextflow/dev_rna_exp0016/A23T55JLT4/nfcore_rnafusion__73d51683--20260607-225254/starfusion/1173_D6K_T1_RNA_SLD_01_A23T55JLT4_1.starfusion.starfusion.fusion_predictions.filtered_pass_only.tsv
- Size
- 38.9 KB
- Workflow Run
- dev_rna_exp0016-73d51683
- Published
- Jun 08, 2026 9:37 AM
Content
View in new tab| #FusionName | JunctionReadCount | SpanningFragCount | est_J | est_S | SpliceType | LeftGene | LeftBreakpoint | RightGene | RightBreakpoint | JunctionReads | SpanningFrags | LargeAnchorSupport | FFPM | LeftBreakDinuc | LeftBreakEntropy | RightBreakDinuc | RightBreakEntropy | annots | breakpoint_ID | blacklisted | blacklist_reasons | aih_curated_reason | CALL | filter_reason | FILTER | total_reads |
| MTAP--CDKN2B-AS1 | 85 | 1 | 85.0 | 1.0 | ONLY_REF_SPLICE | MTAP^ENSG00000099810.21 | chr9:21838010:+ | CDKN2B-AS1^ENSG00000240498.9 | chr9:22112320:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1140:5781:15447,LH00995:25:23T55JLT4:1:1175:19672:22411,LH00995:25:23T55JLT4:1:1203:32049:26895,LH00995:25:23T55JLT4:1:1267:46255:25269,LH00995:25:23T55JLT4:1:1327:28377:13583,LH00995:25:23T55JLT4:1:1370:32244:10108,LH00995:25:23T55JLT4:1:1411:51554:24246,LH00995:25:23T55JLT4:1:1412:1186:16512,LH00995:25:23T55JLT4:1:1452:50422:12588,LH00995:25:23T55JLT4:1:1470:15109:25858,LH00995:25:23T55JLT4:1:1474:17860:24905,LH00995:25:23T55JLT4:1:1495:41240:14508,LH00995:25:23T55JLT4:1:2174:3136:27371,LH00995:25:23T55JLT4:1:2204:19251:8427,LH00995:25:23T55JLT4:1:2204:25254:10108,LH00995:25:23T55JLT4:1:2218:11792:12490,LH00995:25:23T55JLT4:1:2226:32462:2836,LH00995:25:23T55JLT4:1:2237:50851:23111,LH00995:25:23T55JLT4:1:2267:29121:10837,LH00995:25:23T55JLT4:1:2352:33578:13401,LH00995:25:23T55JLT4:1:2370:45277:8104,LH00995:25:23T55JLT4:1:2412:42841:13835,LH00995:25:23T55JLT4:1:2467:45179:10907,LH00995:25:23T55JLT4:2:1124:48585:18599,LH00995:25:23T55JLT4:2:1152:22042:14830,LH00995:25:23T55JLT4:2:1175:7860:24008,LH00995:25:23T55JLT4:2:1179:30682:5274,LH00995:25:23T55JLT4:2:1191:14171:12630,LH00995:25:23T55JLT4:2:1197:48448:23125,LH00995:25:23T55JLT4:2:1228:49111:5190,LH00995:25:23T55JLT4:2:1304:48189:8441,LH00995:25:23T55JLT4:2:1331:49653:5596,LH00995:25:23T55JLT4:2:1337:33182:3915,LH00995:25:23T55JLT4:2:1414:19987:23125,LH00995:25:23T55JLT4:2:1444:6542:20267,LH00995:25:23T55JLT4:2:1447:32745:6829,LH00995:25:23T55JLT4:2:1475:40406:18473,LH00995:25:23T55JLT4:2:1476:50203:2233,LH00995:25:23T55JLT4:2:1478:11137:5806,LH00995:25:23T55JLT4:2:1478:40973:16371,LH00995:25:23T55JLT4:2:1491:51902:14172,LH00995:25:23T55JLT4:2:2153:6364:26264,LH00995:25:23T55JLT4:2:2172:2181:13947,LH00995:25:23T55JLT4:2:2239:14033:5974,LH00995:25:23T55JLT4:2:2286:14381:13807,LH00995:25:23T55JLT4:2:2321:40657:4111,LH00995:25:23T55JLT4:2:2362:45900:12378,LH00995:25:23T55JLT4:2:2368:5603:21500,LH00995:25:23T55JLT4:2:2423:26864:21892,LH00995:25:23T55JLT4:2:2486:27009:2051,LH00995:25:23T55JLT4:3:1129:11323:7726,LH00995:25:23T55JLT4:3:1144:24639:25185,LH00995:25:23T55JLT4:3:1151:14874:9113,LH00995:25:23T55JLT4:3:1164:42251:1715,LH00995:25:23T55JLT4:3:1248:16444:22733,LH00995:25:23T55JLT4:3:1285:10215:14494,LH00995:25:23T55JLT4:3:1352:21783:16932,LH00995:25:23T55JLT4:3:1377:9406:6255,LH00995:25:23T55JLT4:3:1438:48092:7348,LH00995:25:23T55JLT4:3:1488:9794:15222,LH00995:25:23T55JLT4:3:2120:7488:12182,LH00995:25:23T55JLT4:3:2127:40981:2233,LH00995:25:23T55JLT4:3:2187:42210:26755,LH00995:25:23T55JLT4:3:2201:7011:9197,LH00995:25:23T55JLT4:3:2247:28102:22943,LH00995:25:23T55JLT4:3:2352:4131:9141,LH00995:25:23T55JLT4:3:2401:7941:14676,LH00995:25:23T55JLT4:3:2418:2294:11537,LH00995:25:23T55JLT4:4:1109:26006:24947,LH00995:25:23T55JLT4:4:1111:24372:5610,LH00995:25:23T55JLT4:4:1112:6501:8427,LH00995:25:23T55JLT4:4:1116:45851:12014,LH00995:25:23T55JLT4:4:1170:23733:14144,LH00995:25:23T55JLT4:4:1185:31111:7165,LH00995:25:23T55JLT4:4:1225:3152:29557,LH00995:25:23T55JLT4:4:1225:47396:23966,LH00995:25:23T55JLT4:4:1246:46013:18403,LH00995:25:23T55JLT4:4:1283:15958:6199,LH00995:25:23T55JLT4:4:1364:38352:14578,LH00995:25:23T55JLT4:4:1442:20020:12756,LH00995:25:23T55JLT4:4:2136:29631:23854,LH00995:25:23T55JLT4:4:2250:2448:6030,LH00995:25:23T55JLT4:4:2319:34897:15433,LH00995:25:23T55JLT4:4:2354:16767:13653,LH00995:25:23T55JLT4:4:2383:20481:14704 | LH00995:25:23T55JLT4:2:1267:30909:19006 | YES_LDAS | 0.2912 | GT | 1.5301 | AG | 1.8323 | ["ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr9:0.06Mb]","NEIGHBORS[56488]"] | chr9:21838010-chr9:22112320 | False | 1 | PASS | 86 | |||
| CDV3--MT-RNR2 | 55 | 0 | 55.0 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | CDV3^ENSG00000091527.16 | chr3:133575115:+ | MT-RNR2^ENSG00000210082.2 | chrM:2449:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1111:31977:29235,LH00995:25:23T55JLT4:1:1184:24445:13835,LH00995:25:23T55JLT4:1:1227:17528:16315,LH00995:25:23T55JLT4:1:1301:15562:24232,LH00995:25:23T55JLT4:1:1336:18741:22425,LH00995:25:23T55JLT4:1:1336:30124:21374,LH00995:25:23T55JLT4:1:1437:19607:11593,LH00995:25:23T55JLT4:1:2155:28045:18810,LH00995:25:23T55JLT4:1:2156:35099:24975,LH00995:25:23T55JLT4:1:2281:43189:20351,LH00995:25:23T55JLT4:1:2294:5369:22215,LH00995:25:23T55JLT4:1:2310:39217:28912,LH00995:25:23T55JLT4:1:2314:41798:18922,LH00995:25:23T55JLT4:1:2398:41005:18585,LH00995:25:23T55JLT4:1:2405:25901:22887,LH00995:25:23T55JLT4:1:2465:9333:5148,LH00995:25:23T55JLT4:2:1257:28708:7067,LH00995:25:23T55JLT4:2:1331:25804:21878,LH00995:25:23T55JLT4:2:1357:3071:5288,LH00995:25:23T55JLT4:2:1366:10870:25213,LH00995:25:23T55JLT4:2:1366:21767:14578,LH00995:25:23T55JLT4:2:1386:9737:22719,LH00995:25:23T55JLT4:2:1423:30965:20589,LH00995:25:23T55JLT4:2:1471:20586:9954,LH00995:25:23T55JLT4:2:2135:16331:16904,LH00995:25:23T55JLT4:2:2229:40681:1322,LH00995:25:23T55JLT4:2:2240:34031:11327,LH00995:25:23T55JLT4:2:2261:1178:8735,LH00995:25:23T55JLT4:2:2284:43917:7432,LH00995:25:23T55JLT4:2:2419:5352:25970,LH00995:25:23T55JLT4:2:2436:20634:15531,LH00995:25:23T55JLT4:3:1210:40277:17436,LH00995:25:23T55JLT4:3:1297:8597:27441,LH00995:25:23T55JLT4:3:1362:17754:18894,LH00995:25:23T55JLT4:3:1376:11436:11705,LH00995:25:23T55JLT4:3:1398:3500:2499,LH00995:25:23T55JLT4:3:2108:6461:2752,LH00995:25:23T55JLT4:3:2224:40075:3130,LH00995:25:23T55JLT4:3:2289:29412:21066,LH00995:25:23T55JLT4:3:2407:43270:21892,LH00995:25:23T55JLT4:3:2432:51449:26474,LH00995:25:23T55JLT4:3:2438:27123:13205,LH00995:25:23T55JLT4:3:2440:42607:4069,LH00995:25:23T55JLT4:3:2466:10692:3018,LH00995:25:23T55JLT4:4:1253:43238:5386,LH00995:25:23T55JLT4:4:1270:6598:9968,LH00995:25:23T55JLT4:4:1275:48124:24807,LH00995:25:23T55JLT4:4:1292:45236:29529,LH00995:25:23T55JLT4:4:1321:20481:10472,LH00995:25:23T55JLT4:4:1414:23806:27329,LH00995:25:23T55JLT4:4:2109:44783:15573,LH00995:25:23T55JLT4:4:2170:5134:28058,LH00995:25:23T55JLT4:4:2243:35439:5806,LH00995:25:23T55JLT4:4:2341:47129:2457,LH00995:25:23T55JLT4:4:2451:38877:2009 | . | YES_LDAS | 0.1862 | GT | 1.7968 | AG | 1.2419 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chrM]"] | chr3:133575115-chrM:2449 | False | 1 | PASS | 55 | |||
| B4GALT6--DSC3 | 55 | 0 | 55.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | B4GALT6^ENSG00000118276.11 | chr18:31684312:- | DSC3^ENSG00000134762.17 | chr18:30994372:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1230:48739:2892,LH00995:25:23T55JLT4:1:1233:1356:6213,LH00995:25:23T55JLT4:1:1276:16217:4657,LH00995:25:23T55JLT4:1:1369:29606:8567,LH00995:25:23T55JLT4:1:2109:1170:14774,LH00995:25:23T55JLT4:1:2128:19542:9071,LH00995:25:23T55JLT4:1:2148:49071:25914,LH00995:25:23T55JLT4:1:2177:33020:17955,LH00995:25:23T55JLT4:1:2181:4001:24415,LH00995:25:23T55JLT4:1:2279:12609:27946,LH00995:25:23T55JLT4:1:2323:6687:10178,LH00995:25:23T55JLT4:1:2349:6614:19720,LH00995:25:23T55JLT4:1:2447:49993:17871,LH00995:25:23T55JLT4:1:2453:8152:24401,LH00995:25:23T55JLT4:1:2454:34145:4153,LH00995:25:23T55JLT4:1:2481:31499:8567,LH00995:25:23T55JLT4:2:1126:29080:24330,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:40641:18487,LH00995:25:23T55JLT4:2:1152:13289:11775,LH00995:25:23T55JLT4:2:1209:18992:18684,LH00995:25:23T55JLT4:2:1209:23223:7936,LH00995:25:23T55JLT4:2:1422:13451:13121,LH00995:25:23T55JLT4:2:2105:48480:3312,LH00995:25:23T55JLT4:2:2191:8799:28969,LH00995:25:23T55JLT4:2:2204:29412:2513,LH00995:25:23T55JLT4:2:2241:34104:14144,LH00995:25:23T55JLT4:2:2321:22794:6465,LH00995:25:23T55JLT4:3:1102:7577:15643,LH00995:25:23T55JLT4:3:1103:14850:26278,LH00995:25:23T55JLT4:3:1227:15764:4965,LH00995:25:23T55JLT4:3:1239:1356:5568,LH00995:25:23T55JLT4:3:1311:50567:16343,LH00995:25:23T55JLT4:3:1325:43206:26572,LH00995:25:23T55JLT4:3:1403:29493:15040,LH00995:25:23T55JLT4:3:2166:16355:7137,LH00995:25:23T55JLT4:3:2211:32591:18249,LH00995:25:23T55JLT4:3:2234:46903:16245,LH00995:25:23T55JLT4:3:2278:51611:14256,LH00995:25:23T55JLT4:3:2284:9276:1182,LH00995:25:23T55JLT4:3:2325:29485:12056,LH00995:25:23T55JLT4:4:1141:22746:28436,LH00995:25:23T55JLT4:4:1226:39023:14620,LH00995:25:23T55JLT4:4:1241:43772:4013,LH00995:25:23T55JLT4:4:1272:42930:5778,LH00995:25:23T55JLT4:4:1311:3880:6213,LH00995:25:23T55JLT4:4:1315:7901:8861,LH00995:25:23T55JLT4:4:1360:26208:8483,LH00995:25:23T55JLT4:4:1433:52185:5666,LH00995:25:23T55JLT4:4:1446:45325:16512,LH00995:25:23T55JLT4:4:1465:37470:27427,LH00995:25:23T55JLT4:4:2101:32980:16343,LH00995:25:23T55JLT4:4:2258:12423:26110,LH00995:25:23T55JLT4:4:2373:35196:2275,LH00995:25:23T55JLT4:4:2433:44201:16862,LH00995:25:23T55JLT4:4:2474:40592:19300 | . | YES_LDAS | 0.1862 | GT | 1.8323 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:0.58Mb]"] | chr18:31684312-chr18:30994372 | False | 1 | PASS | 55 | |||
| TMEM65--ANXA13 | 50 | 0 | 50.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM65^ENSG00000164983.8 | chr8:124371854:- | ANXA13^ENSG00000104537.17 | chr8:123684722:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1227:20343:14578,LH00995:25:23T55JLT4:1:1339:19105:24849,LH00995:25:23T55JLT4:1:1397:27406:12714,LH00995:25:23T55JLT4:1:1481:32697:13247,LH00995:25:23T55JLT4:1:2231:21217:1939,LH00995:25:23T55JLT4:1:2249:3573:21066,LH00995:25:23T55JLT4:1:2307:42615:3354,LH00995:25:23T55JLT4:1:2349:31952:4447,LH00995:25:23T55JLT4:1:2401:32098:7053,LH00995:25:23T55JLT4:2:1106:23199:12826,LH00995:25:23T55JLT4:2:1116:37057:15587,LH00995:25:23T55JLT4:2:1131:7852:16596,LH00995:25:23T55JLT4:2:1134:26281:14914,LH00995:25:23T55JLT4:2:1384:19591:19636,LH00995:25:23T55JLT4:2:1430:16411:28506,LH00995:25:23T55JLT4:2:2315:2149:27315,LH00995:25:23T55JLT4:2:2374:9672:12406,LH00995:25:23T55JLT4:2:2401:47687:14242,LH00995:25:23T55JLT4:3:1214:12868:15839,LH00995:25:23T55JLT4:3:1311:9179:10907,LH00995:25:23T55JLT4:3:1320:15093:3690,LH00995:25:23T55JLT4:3:1331:34808:7768,LH00995:25:23T55JLT4:3:1369:23547:10514,LH00995:25:23T55JLT4:3:1478:7731:12742,LH00995:25:23T55JLT4:3:2223:21573:24891,LH00995:25:23T55JLT4:3:2225:8176:16624,LH00995:25:23T55JLT4:3:2245:41151:10851,LH00995:25:23T55JLT4:3:2273:41321:18543,LH00995:25:23T55JLT4:3:2298:41628:21374,LH00995:25:23T55JLT4:3:2380:49799:27203,LH00995:25:23T55JLT4:3:2421:22892:11313,LH00995:25:23T55JLT4:3:2435:20238:1084,LH00995:25:23T55JLT4:3:2439:10603:9954,LH00995:25:23T55JLT4:4:1220:28773:18866,LH00995:25:23T55JLT4:4:1222:6574:18782,LH00995:25:23T55JLT4:4:1351:29922:14158,LH00995:25:23T55JLT4:4:1441:5547:8174,LH00995:25:23T55JLT4:4:2148:28870:4013,LH00995:25:23T55JLT4:4:2173:44160:20463,LH00995:25:23T55JLT4:4:2208:20222:5764,LH00995:25:23T55JLT4:4:2227:6558:21192,LH00995:25:23T55JLT4:4:2242:14235:10809,LH00995:25:23T55JLT4:4:2271:35649:7067,LH00995:25:23T55JLT4:4:2296:12771:14045,LH00995:25:23T55JLT4:4:2308:27980:21556,LH00995:25:23T55JLT4:4:2317:48254:28674,LH00995:25:23T55JLT4:4:2339:19275:23686,LH00995:25:23T55JLT4:4:2354:25594:6493,LH00995:25:23T55JLT4:4:2413:42121:2051,LH00995:25:23T55JLT4:4:2448:19979:10725 | . | YES_LDAS | 0.1693 | GT | 1.9656 | AG | 1.9219 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]"] | chr8:124371854-chr8:123684722 | False | 1 | PASS | 50 | |||
| TMEM123--PDGFD | 44 | 0 | 44.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000255:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1145:10716:16512,LH00995:25:23T55JLT4:1:1253:40487:22369,LH00995:25:23T55JLT4:1:1312:39484:10879,LH00995:25:23T55JLT4:1:1331:9009:8735,LH00995:25:23T55JLT4:1:1424:28813:5372,LH00995:25:23T55JLT4:1:1431:9753:11145,LH00995:25:23T55JLT4:1:1497:2764:4195,LH00995:25:23T55JLT4:1:2121:17253:21836,LH00995:25:23T55JLT4:1:2283:17690:5050,LH00995:25:23T55JLT4:1:2346:51643:7221,LH00995:25:23T55JLT4:1:2396:35698:29571,LH00995:25:23T55JLT4:1:2432:39743:4041,LH00995:25:23T55JLT4:1:2476:48747:29221,LH00995:25:23T55JLT4:2:1113:8629:19566,LH00995:25:23T55JLT4:2:1291:43238:27946,LH00995:25:23T55JLT4:2:1301:36580:3971,LH00995:25:23T55JLT4:2:1366:42518:19636,LH00995:25:23T55JLT4:2:1450:34954:23041,LH00995:25:23T55JLT4:2:2134:4082:1883,LH00995:25:23T55JLT4:2:2180:27972:28520,LH00995:25:23T55JLT4:2:2202:12900:23882,LH00995:25:23T55JLT4:2:2260:48351:6002,LH00995:25:23T55JLT4:2:2374:14737:24737,LH00995:25:23T55JLT4:2:2451:23555:6997,LH00995:25:23T55JLT4:2:2458:41312:3957,LH00995:25:23T55JLT4:2:2496:25472:16287,LH00995:25:23T55JLT4:3:1132:48885:23294,LH00995:25:23T55JLT4:3:1187:27875:29221,LH00995:25:23T55JLT4:3:1273:34654:29557,LH00995:25:23T55JLT4:3:1334:34040:24541,LH00995:25:23T55JLT4:3:1348:9592:20533,LH00995:25:23T55JLT4:3:1412:31046:6829,LH00995:25:23T55JLT4:3:1451:14802:2962,LH00995:25:23T55JLT4:3:2444:40148:15615,LH00995:25:23T55JLT4:4:1120:40592:19272,LH00995:25:23T55JLT4:4:1212:22665:11061,LH00995:25:23T55JLT4:4:1377:23312:3382,LH00995:25:23T55JLT4:4:2114:6380:17128,LH00995:25:23T55JLT4:4:2152:49969:15615,LH00995:25:23T55JLT4:4:2186:14559:21598,LH00995:25:23T55JLT4:4:2236:5538:23630,LH00995:25:23T55JLT4:4:2268:34873:7992,LH00995:25:23T55JLT4:4:2323:33222:15419,LH00995:25:23T55JLT4:4:2381:19097:8553 | . | YES_LDAS | 0.149 | GT | 1.9656 | AG | 1.8323 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]"] | chr11:102448812-chr11:104000255 | False | 1 | PASS | 44 | |||
| PDCD1LG2--DYNC2H1 | 42 | 0 | 42.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 | chr9:5535050:+ | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103114103:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1169:28239:3929,LH00995:25:23T55JLT4:1:1195:33853:10542,LH00995:25:23T55JLT4:1:2188:2416:12280,LH00995:25:23T55JLT4:1:2273:19631:14354,LH00995:25:23T55JLT4:1:2324:27042:7600,LH00995:25:23T55JLT4:1:2401:16023:25872,LH00995:25:23T55JLT4:1:2434:10481:28212,LH00995:25:23T55JLT4:1:2436:34509:26755,LH00995:25:23T55JLT4:1:2439:31208:18740,LH00995:25:23T55JLT4:1:2465:3354:15951,LH00995:25:23T55JLT4:1:2496:20626:25830,LH00995:25:23T55JLT4:2:1125:35463:13583,LH00995:25:23T55JLT4:2:1144:14090:12826,LH00995:25:23T55JLT4:2:1160:13483:19258,LH00995:25:23T55JLT4:2:1165:28660:21248,LH00995:25:23T55JLT4:2:1203:42105:7600,LH00995:25:23T55JLT4:2:1213:33805:19314,LH00995:25:23T55JLT4:2:1343:38246:11229,LH00995:25:23T55JLT4:2:1435:11121:10823,LH00995:25:23T55JLT4:2:2103:38157:20071,LH00995:25:23T55JLT4:2:2106:15837:13331,LH00995:25:23T55JLT4:2:2408:41369:10893,LH00995:25:23T55JLT4:2:2493:24089:15321,LH00995:25:23T55JLT4:3:1427:30043:21598,LH00995:25:23T55JLT4:3:1450:44015:20715,LH00995:25:23T55JLT4:3:1488:44160:29151,LH00995:25:23T55JLT4:3:2102:23741:12028,LH00995:25:23T55JLT4:3:2154:1930:21080,LH00995:25:23T55JLT4:3:2381:51134:7488,LH00995:25:23T55JLT4:4:1223:48577:24863,LH00995:25:23T55JLT4:4:1263:5045:21486,LH00995:25:23T55JLT4:4:1294:47445:25227,LH00995:25:23T55JLT4:4:1296:13904:28955,LH00995:25:23T55JLT4:4:1307:27576:27721,LH00995:25:23T55JLT4:4:1362:42558:9197,LH00995:25:23T55JLT4:4:1404:44646:21276,LH00995:25:23T55JLT4:4:1432:8200:11509,LH00995:25:23T55JLT4:4:2104:43044:9618,LH00995:25:23T55JLT4:4:2150:5013:8258,LH00995:25:23T55JLT4:4:2166:43497:13289,LH00995:25:23T55JLT4:4:2380:43432:18529,LH00995:25:23T55JLT4:4:2417:42251:20295 | . | YES_LDAS | 0.1422 | GT | 1.9219 | AG | 1.8323 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"] | chr9:5535050-chr11:103114103 | False | 1 | PASS | 42 | |||
| TMEM65--ANXA13 | 39 | 0 | 39.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM65^ENSG00000164983.8 | chr8:124371854:- | ANXA13^ENSG00000104537.17 | chr8:123688946:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1141:2036:18796,LH00995:25:23T55JLT4:1:1259:31564:21122,LH00995:25:23T55JLT4:1:1406:3063:26068,LH00995:25:23T55JLT4:1:2180:17512:14242,LH00995:25:23T55JLT4:1:2211:3678:12784,LH00995:25:23T55JLT4:1:2224:3694:9505,LH00995:25:23T55JLT4:1:2428:24437:22397,LH00995:25:23T55JLT4:1:2455:30156:26054,LH00995:25:23T55JLT4:2:1116:29186:12070,LH00995:25:23T55JLT4:2:1202:36305:14844,LH00995:25:23T55JLT4:2:2102:8661:25395,LH00995:25:23T55JLT4:2:2111:47420:7754,LH00995:25:23T55JLT4:2:2129:15683:27974,LH00995:25:23T55JLT4:2:2252:10910:19006,LH00995:25:23T55JLT4:2:2452:9681:19819,LH00995:25:23T55JLT4:2:2455:22155:27777,LH00995:25:23T55JLT4:3:1108:38554:1701,LH00995:25:23T55JLT4:3:1321:25351:27315,LH00995:25:23T55JLT4:3:1479:18046:4153,LH00995:25:23T55JLT4:3:1482:14251:24288,LH00995:25:23T55JLT4:3:2120:35059:1476,LH00995:25:23T55JLT4:3:2174:30755:18880,LH00995:25:23T55JLT4:3:2190:21799:26068,LH00995:25:23T55JLT4:3:2205:14049:22565,LH00995:25:23T55JLT4:3:2216:40536:21024,LH00995:25:23T55JLT4:3:2271:30706:3971,LH00995:25:23T55JLT4:3:2349:51190:12070,LH00995:25:23T55JLT4:3:2383:12059:1771,LH00995:25:23T55JLT4:3:2458:20909:13597,LH00995:25:23T55JLT4:4:1237:36208:11930,LH00995:25:23T55JLT4:4:1273:47558:2275,LH00995:25:23T55JLT4:4:1287:17754:23630,LH00995:25:23T55JLT4:4:1379:22188:21976,LH00995:25:23T55JLT4:4:1438:28045:9365,LH00995:25:23T55JLT4:4:2221:4948:12686,LH00995:25:23T55JLT4:4:2275:12836:16231,LH00995:25:23T55JLT4:4:2282:37923:7950,LH00995:25:23T55JLT4:4:2285:22107:10626,LH00995:25:23T55JLT4:4:2288:44443:28072 | . | YES_LDAS | 0.1321 | GT | 1.9656 | AG | 1.9656 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr8:0.57Mb]"] | chr8:124371854-chr8:123688946 | False | 1 | PASS | 39 | |||
| RPSAP52--HMGA2 | 39 | 0 | 39.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | RPSAP52^ENSG00000241749.4 | chr12:65826843:- | HMGA2^ENSG00000149948.14 | chr12:65828001:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1146:45746:17969,LH00995:25:23T55JLT4:1:1175:29145:3732,LH00995:25:23T55JLT4:1:1279:48715:22803,LH00995:25:23T55JLT4:1:1290:51635:27749,LH00995:25:23T55JLT4:1:1310:36127:23280,LH00995:25:23T55JLT4:1:1312:36531:23167,LH00995:25:23T55JLT4:1:1477:11687:2079,LH00995:25:23T55JLT4:1:2194:21007:20939,LH00995:25:23T55JLT4:1:2244:31443:23546,LH00995:25:23T55JLT4:1:2402:42105:7516,LH00995:25:23T55JLT4:1:2458:15255:12126,LH00995:25:23T55JLT4:2:1148:35496:26671,LH00995:25:23T55JLT4:2:1171:45503:19678,LH00995:25:23T55JLT4:2:2172:31168:28338,LH00995:25:23T55JLT4:2:2196:11938:23700,LH00995:25:23T55JLT4:2:2216:24372:10851,LH00995:25:23T55JLT4:2:2257:7674:18081,LH00995:25:23T55JLT4:2:2295:10384:8903,LH00995:25:23T55JLT4:2:2330:42073:2864,LH00995:25:23T55JLT4:2:2360:5684:12252,LH00995:25:23T55JLT4:2:2409:36402:23532,LH00995:25:23T55JLT4:2:2421:41159:4279,LH00995:25:23T55JLT4:2:2444:42947:29683,LH00995:25:23T55JLT4:2:2455:7035:8875,LH00995:25:23T55JLT4:2:2458:51198:16596,LH00995:25:23T55JLT4:3:1122:36491:21248,LH00995:25:23T55JLT4:3:1236:20998:14900,LH00995:25:23T55JLT4:3:1284:15821:1532,LH00995:25:23T55JLT4:3:1332:3128:4769,LH00995:25:23T55JLT4:3:1348:21969:20869,LH00995:25:23T55JLT4:3:1350:8588:23420,LH00995:25:23T55JLT4:3:2174:48181:26054,LH00995:25:23T55JLT4:3:2207:43804:27217,LH00995:25:23T55JLT4:3:2273:9834:1589,LH00995:25:23T55JLT4:4:1227:46797:19370,LH00995:25:23T55JLT4:4:1361:35674:21150,LH00995:25:23T55JLT4:4:1393:32357:17731,LH00995:25:23T55JLT4:4:1460:23652:15965,LH00995:25:23T55JLT4:4:2102:39719:18403 | . | YES_LDAS | 0.1321 | GT | 1.9329 | AG | 1.8256 | ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr12:0.00Mb]","NEIGHBORS_OVERLAP:-:+:[2537]"] | chr12:65826843-chr12:65828001 | False | 1 | PASS | 39 | |||
| CLTC--VMP1 | 38 | 1 | 38.0 | 1.0 | ONLY_REF_SPLICE | CLTC^ENSG00000141367.12 | chr17:59690711:+ | VMP1^ENSG00000062716.13 | chr17:59838295:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1161:36313:24190,LH00995:25:23T55JLT4:1:1277:41499:10164,LH00995:25:23T55JLT4:1:2209:18110:22229,LH00995:25:23T55JLT4:1:2261:48359:1617,LH00995:25:23T55JLT4:1:2316:6307:21962,LH00995:25:23T55JLT4:1:2391:5336:8791,LH00995:25:23T55JLT4:1:2427:16913:19230,LH00995:25:23T55JLT4:1:2492:16225:27651,LH00995:25:23T55JLT4:2:1112:23725:12140,LH00995:25:23T55JLT4:2:1142:27543:22145,LH00995:25:23T55JLT4:2:1170:4932:21374,LH00995:25:23T55JLT4:2:1252:31750:18165,LH00995:25:23T55JLT4:2:1258:34760:14073,LH00995:25:23T55JLT4:2:2135:22875:18291,LH00995:25:23T55JLT4:2:2314:51781:25283,LH00995:25:23T55JLT4:3:1137:26475:6479,LH00995:25:23T55JLT4:3:1207:4794:18053,LH00995:25:23T55JLT4:3:1384:41240:3802,LH00995:25:23T55JLT4:3:1409:14891:21836,LH00995:25:23T55JLT4:3:1458:29088:16666,LH00995:25:23T55JLT4:3:2143:38934:13373,LH00995:25:23T55JLT4:3:2186:34234:22691,LH00995:25:23T55JLT4:3:2217:2400:8553,LH00995:25:23T55JLT4:3:2317:22859:21514,LH00995:25:23T55JLT4:3:2452:50956:8861,LH00995:25:23T55JLT4:4:1223:27244:18936,LH00995:25:23T55JLT4:4:1238:47242:15881,LH00995:25:23T55JLT4:4:1265:33837:28955,LH00995:25:23T55JLT4:4:1345:22034:1897,LH00995:25:23T55JLT4:4:1357:3920:27637,LH00995:25:23T55JLT4:4:1377:7917:3844,LH00995:25:23T55JLT4:4:1383:39945:22131,LH00995:25:23T55JLT4:4:1446:2416:10486,LH00995:25:23T55JLT4:4:1472:15384:8735,LH00995:25:23T55JLT4:4:1489:8176:17352,LH00995:25:23T55JLT4:4:2151:17269:24527,LH00995:25:23T55JLT4:4:2393:43108:15811,LH00995:25:23T55JLT4:4:2424:39096:5694 | LH00995:25:23T55JLT4:2:2409:47542:4405 | YES_LDAS | 0.1321 | GT | 1.8892 | AG | 1.8062 | ["Klijn_CellLines","Larsson_TCGA","ChimerSeq","TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr17:0.01Mb]","NEIGHBORS[10236]"] | chr17:59690711-chr17:59838295 | False | 1 | PASS | 39 | |||
| AL033504.1--SASH1 | 35 | 1 | 35.0 | 1.0 | ONLY_REF_SPLICE | AL033504.1^ENSG00000227681.5 | chr6:147947519:+ | SASH1^ENSG00000111961.18 | chr6:148390134:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1334:35116:16259,LH00995:25:23T55JLT4:1:1342:9632:27749,LH00995:25:23T55JLT4:1:1382:1348:14690,LH00995:25:23T55JLT4:1:1418:33125:21276,LH00995:25:23T55JLT4:1:2134:20376:22173,LH00995:25:23T55JLT4:1:2224:12553:28100,LH00995:25:23T55JLT4:1:2248:20125:13135,LH00995:25:23T55JLT4:1:2443:34695:18221,LH00995:25:23T55JLT4:2:1124:38837:16484,LH00995:25:23T55JLT4:2:1160:47340:26390,LH00995:25:23T55JLT4:2:1453:38263:13667,LH00995:25:23T55JLT4:2:1456:7990:3606,LH00995:25:23T55JLT4:2:1483:11404:15545,LH00995:25:23T55JLT4:2:2319:40050:14326,LH00995:25:23T55JLT4:2:2362:20545:17338,LH00995:25:23T55JLT4:2:2495:35844:7880,LH00995:25:23T55JLT4:3:1169:33797:29613,LH00995:25:23T55JLT4:3:1191:35779:20743,LH00995:25:23T55JLT4:3:1252:32875:7221,LH00995:25:23T55JLT4:3:1336:36564:20505,LH00995:25:23T55JLT4:3:1350:15586:14970,LH00995:25:23T55JLT4:3:2180:50252:4951,LH00995:25:23T55JLT4:3:2187:21783:5302,LH00995:25:23T55JLT4:3:2422:47485:9856,LH00995:25:23T55JLT4:3:2462:8038:13667,LH00995:25:23T55JLT4:3:2477:8443:18543,LH00995:25:23T55JLT4:4:1155:10716:13737,LH00995:25:23T55JLT4:4:1231:43222:25311,LH00995:25:23T55JLT4:4:1421:19825:10346,LH00995:25:23T55JLT4:4:2201:16727:16582,LH00995:25:23T55JLT4:4:2215:13313:2457,LH00995:25:23T55JLT4:4:2225:10215:27105,LH00995:25:23T55JLT4:4:2235:21176:16414,LH00995:25:23T55JLT4:4:2268:20521:4321,LH00995:25:23T55JLT4:4:2436:19049:29263 | LH00995:25:23T55JLT4:3:1278:16161:5092 | YES_LDAS | 0.1219 | GT | 1.5329 | AG | 1.9219 | ["TCGA_StarF2019","CCLE_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr6:0.32Mb]"] | chr6:147947519-chr6:148390134 | False | 1 | PASS | 36 | |||
| TBC1D13--AL442224.1 | 32 | 0 | 32.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TBC1D13^ENSG00000107021.16 | chr9:128792574:+ | AL442224.1^ENSG00000231990.2 | chr9:93825711:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1178:15408:23294,LH00995:25:23T55JLT4:1:1257:12253:27413,LH00995:25:23T55JLT4:1:1269:5676:25465,LH00995:25:23T55JLT4:1:1331:2092:18333,LH00995:25:23T55JLT4:1:2166:10797:12280,LH00995:25:23T55JLT4:1:2265:9219:21766,LH00995:25:23T55JLT4:1:2356:1736:14410,LH00995:25:23T55JLT4:1:2382:3079:11607,LH00995:25:23T55JLT4:1:2449:22422:24429,LH00995:25:23T55JLT4:1:2449:42041:22341,LH00995:25:23T55JLT4:1:2458:14510:28688,LH00995:25:23T55JLT4:2:1161:8305:3985,LH00995:25:23T55JLT4:2:1259:37996:10038,LH00995:25:23T55JLT4:2:1344:11323:8483,LH00995:25:23T55JLT4:2:1379:33239:7908,LH00995:25:23T55JLT4:2:1386:17795:19496,LH00995:25:23T55JLT4:2:1495:20982:10192,LH00995:25:23T55JLT4:2:2154:41555:3228,LH00995:25:23T55JLT4:2:2342:8783:29697,LH00995:25:23T55JLT4:2:2367:36143:8314,LH00995:25:23T55JLT4:2:2386:21516:29445,LH00995:25:23T55JLT4:3:1197:29622:19300,LH00995:25:23T55JLT4:3:1263:32025:9786,LH00995:25:23T55JLT4:3:1397:50058:22691,LH00995:25:23T55JLT4:3:1428:7674:22593,LH00995:25:23T55JLT4:3:2178:13264:18824,LH00995:25:23T55JLT4:4:1452:23013:22537,LH00995:25:23T55JLT4:4:2205:17229:9155,LH00995:25:23T55JLT4:4:2207:24299:3887,LH00995:25:23T55JLT4:4:2215:34994:11733,LH00995:25:23T55JLT4:4:2350:6873:12854,LH00995:25:23T55JLT4:4:2415:40803:9351 | . | YES_LDAS | 0.1084 | GT | 1.9329 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr9:34.93Mb]"] | chr9:128792574-chr9:93825711 | False | 1 | PASS | 32 | |||
| BIRC3--PDGFD | 25 | 0 | 25.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | BIRC3^ENSG00000023445.16 | chr11:102317571:+ | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000255:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1352:45293:15615,LH00995:25:23T55JLT4:1:1378:45592:19272,LH00995:25:23T55JLT4:1:2194:47598:1617,LH00995:25:23T55JLT4:2:1113:43189:15054,LH00995:25:23T55JLT4:2:1132:36572:13485,LH00995:25:23T55JLT4:2:1216:22341:7446,LH00995:25:23T55JLT4:2:1216:22358:7446,LH00995:25:23T55JLT4:2:1280:38157:27862,LH00995:25:23T55JLT4:2:1282:32672:22733,LH00995:25:23T55JLT4:2:1310:19469:16035,LH00995:25:23T55JLT4:2:1348:39436:16540,LH00995:25:23T55JLT4:2:1419:16201:1238,LH00995:25:23T55JLT4:2:1419:47898:27133,LH00995:25:23T55JLT4:2:2116:3726:20996,LH00995:25:23T55JLT4:2:2146:49702:17086,LH00995:25:23T55JLT4:2:2163:40649:3676,LH00995:25:23T55JLT4:2:2174:17334:20071,LH00995:25:23T55JLT4:2:2369:1947:23910,LH00995:25:23T55JLT4:2:2391:2537:4867,LH00995:25:23T55JLT4:2:2452:33789:13317,LH00995:25:23T55JLT4:2:2474:12294:10024,LH00995:25:23T55JLT4:3:2459:26961:28226,LH00995:25:23T55JLT4:4:1252:35140:21010,LH00995:25:23T55JLT4:4:1422:40544:21150,LH00995:25:23T55JLT4:4:2171:51700:21976 | . | YES_LDAS | 0.0846 | GT | 1.8323 | AG | 1.8323 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.57Mb]"] | chr11:102317571-chr11:104000255 | False | 1 | PASS | 25 | |||
| TMEM123--DYNC2H1 | 23 | 0 | 23.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103280348:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1306:41757:3718,LH00995:25:23T55JLT4:1:1351:31079:28324,LH00995:25:23T55JLT4:1:2231:15837:13611,LH00995:25:23T55JLT4:1:2239:49807:22229,LH00995:25:23T55JLT4:1:2462:15133:15166,LH00995:25:23T55JLT4:2:1311:16687:15587,LH00995:25:23T55JLT4:2:2145:28166:13975,LH00995:25:23T55JLT4:2:2193:24299:13387,LH00995:25:23T55JLT4:2:2193:2974:14312,LH00995:25:23T55JLT4:2:2247:47857:28941,LH00995:25:23T55JLT4:2:2291:16209:3494,LH00995:25:23T55JLT4:3:1243:16112:10921,LH00995:25:23T55JLT4:3:2101:37454:27203,LH00995:25:23T55JLT4:3:2265:24809:1995,LH00995:25:23T55JLT4:3:2301:40471:25760,LH00995:25:23T55JLT4:3:2325:51506:2667,LH00995:25:23T55JLT4:4:1113:33732:19692,LH00995:25:23T55JLT4:4:1139:42267:29683,LH00995:25:23T55JLT4:4:1262:36806:2121,LH00995:25:23T55JLT4:4:1306:33748:7530,LH00995:25:23T55JLT4:4:2170:14874:24022,LH00995:25:23T55JLT4:4:2252:39703:14872,LH00995:25:23T55JLT4:4:2289:31685:6283 | . | YES_LDAS | 0.0779 | GT | 1.9656 | AG | 1.9086 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.64Mb]"] | chr11:102448812-chr11:103280348 | False | 1 | PASS | 23 | |||
| COL1A1--SLC45A4 | 22 | 0 | 22.0 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | COL1A1^ENSG00000108821.14 | chr17:50189867:- | SLC45A4^ENSG00000022567.10 | chr8:141254178:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1321:24534:21724,LH00995:25:23T55JLT4:1:1368:19437:22257,LH00995:25:23T55JLT4:1:1477:41126:21878,LH00995:25:23T55JLT4:1:2189:49127:17240,LH00995:25:23T55JLT4:1:2206:25399:15797,LH00995:25:23T55JLT4:1:2307:49653:14564,LH00995:25:23T55JLT4:1:2334:12124:26685,LH00995:25:23T55JLT4:1:2406:12002:6185,LH00995:25:23T55JLT4:2:1138:27568:28800,LH00995:25:23T55JLT4:2:2175:24979:9295,LH00995:25:23T55JLT4:2:2263:40204:28352,LH00995:25:23T55JLT4:2:2377:17423:19300,LH00995:25:23T55JLT4:2:2425:8241:18333,LH00995:25:23T55JLT4:3:1227:23150:5568,LH00995:25:23T55JLT4:3:2136:48359:28324,LH00995:25:23T55JLT4:3:2161:18847:15124,LH00995:25:23T55JLT4:3:2406:42510:8777,LH00995:25:23T55JLT4:4:1239:42761:25802,LH00995:25:23T55JLT4:4:2274:8783:2597,LH00995:25:23T55JLT4:4:2304:36038:10318,LH00995:25:23T55JLT4:4:2307:26403:8763,LH00995:25:23T55JLT4:4:2352:41960:18613 | . | YES_LDAS | 0.0745 | GT | 1.7056 | AG | 1.7819 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr8]"] | chr17:50189867-chr8:141254178 | False | 1 | PASS | 22 | |||
| SH3BP5--AC002074.1 | 20 | 0 | 20.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | SH3BP5^ENSG00000131370.16 | chr3:15304103:- | AC002074.1^ENSG00000285090.1 | chr7:94279390:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1135:14899:12350,LH00995:25:23T55JLT4:1:1316:10999:23420,LH00995:25:23T55JLT4:1:2394:7917:16848,LH00995:25:23T55JLT4:2:1230:17261:12798,LH00995:25:23T55JLT4:2:1262:5919:23952,LH00995:25:23T55JLT4:2:1327:27600:28492,LH00995:25:23T55JLT4:2:1395:29865:4055,LH00995:25:23T55JLT4:2:1402:33692:11467,LH00995:25:23T55JLT4:2:2144:19825:9085,LH00995:25:23T55JLT4:2:2173:46353:29473,LH00995:25:23T55JLT4:2:2214:33239:6283,LH00995:25:23T55JLT4:3:1177:30876:20071,LH00995:25:23T55JLT4:3:1323:21557:22957,LH00995:25:23T55JLT4:3:1362:13758:2135,LH00995:25:23T55JLT4:3:1377:44686:10893,LH00995:25:23T55JLT4:3:2156:24024:21402,LH00995:25:23T55JLT4:3:2229:23976:14956,LH00995:25:23T55JLT4:3:2354:14478:4503,LH00995:25:23T55JLT4:4:1490:9195:3312,LH00995:25:23T55JLT4:4:2212:46336:7109 | . | YES_LDAS | 0.0677 | GT | 1.5546 | AG | 1.5546 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr3--chr7]"] | chr3:15304103-chr7:94279390 | False | 1 | PASS | 20 | |||
| AC239859.5--AC013734.1 | 20 | 0 | 3.54 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | AC239859.5^ENSG00000277702.1 | chr1:143419625:- | AC013734.1^ENSG00000277146.1 | chrY:26453985:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1111:27835:4013,LH00995:25:23T55JLT4:1:1253:33077:25620,LH00995:25:23T55JLT4:1:2421:4374:16175,LH00995:25:23T55JLT4:2:1184:16468:24765,LH00995:25:23T55JLT4:2:1430:15643:18964,LH00995:25:23T55JLT4:2:1495:23102:28184,LH00995:25:23T55JLT4:2:2246:4430:25353,LH00995:25:23T55JLT4:2:2285:7836:23097,LH00995:25:23T55JLT4:2:2319:4851:17871,LH00995:25:23T55JLT4:2:2402:12358:5120,LH00995:25:23T55JLT4:2:2402:45317:1953,LH00995:25:23T55JLT4:3:1219:19777:3144,LH00995:25:23T55JLT4:3:1339:39266:5736,LH00995:25:23T55JLT4:3:1423:13782:25914,LH00995:25:23T55JLT4:3:2185:7723:5806,LH00995:25:23T55JLT4:3:2228:47008:21808,LH00995:25:23T55JLT4:4:1315:3128:29459,LH00995:25:23T55JLT4:4:1496:48068:16610,LH00995:25:23T55JLT4:4:2194:48982:19090,LH00995:25:23T55JLT4:4:2273:9834:26951 | . | YES_LDAS | 0.012 | GT | 1.7465 | AG | 1.8892 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr1--chrY]"] | chr1:143419625-chrY:26453985 | False | 1 | PASS | 20 | |||
| SRGAP2C--FCGR1B | 20 | 1 | 20.0 | 0.8 | ONLY_REF_SPLICE | SRGAP2C^ENSG00000171943.12 | chr1:121324640:+ | FCGR1B^ENSG00000198019.13 | chr1:121092996:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:2154:24647:24891,LH00995:25:23T55JLT4:1:2197:42971:27511,LH00995:25:23T55JLT4:1:2360:49346:2205,LH00995:25:23T55JLT4:1:2365:19380:17675,LH00995:25:23T55JLT4:2:1295:4940:26853,LH00995:25:23T55JLT4:2:1453:24243:21556,LH00995:25:23T55JLT4:2:2142:51514:1168,LH00995:25:23T55JLT4:2:2331:12714:17899,LH00995:25:23T55JLT4:2:2433:3395:13303,LH00995:25:23T55JLT4:3:1190:18507:6913,LH00995:25:23T55JLT4:3:1295:46320:19384,LH00995:25:23T55JLT4:3:2182:30504:9337,LH00995:25:23T55JLT4:3:2236:32187:14186,LH00995:25:23T55JLT4:3:2244:42947:20939,LH00995:25:23T55JLT4:3:2420:13499:14270,LH00995:25:23T55JLT4:3:2463:37866:12560,LH00995:25:23T55JLT4:4:1146:23846:28632,LH00995:25:23T55JLT4:4:1246:44492:24541,LH00995:25:23T55JLT4:4:2256:25836:17731,LH00995:25:23T55JLT4:4:2402:35245:22229 | LH00995:25:23T55JLT4:4:1129:27090:5666 | YES_LDAS | 0.0704 | GT | 1.7968 | AG | 1.9329 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr1:0.09Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[87650]"] | chr1:121324640-chr1:121092996 | False | 1 | PASS | 21 | |||
| TLK2P1--AC110079.1 | 19 | 0 | 19.0 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | TLK2P1^ENSG00000226049.3 | chr17:34039043:- | AC110079.1^ENSG00000260404.3 | chr4:118595912:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1278:7116:7025,LH00995:25:23T55JLT4:1:2140:6849:27777,LH00995:25:23T55JLT4:1:2284:34420:3536,LH00995:25:23T55JLT4:1:2398:14583:2976,LH00995:25:23T55JLT4:2:1103:25343:20939,LH00995:25:23T55JLT4:2:1151:28166:29725,LH00995:25:23T55JLT4:2:1496:31839:14592,LH00995:25:23T55JLT4:2:2126:11412:25760,LH00995:25:23T55JLT4:2:2168:11509:15867,LH00995:25:23T55JLT4:2:2385:16808:15965,LH00995:25:23T55JLT4:2:2410:37898:3901,LH00995:25:23T55JLT4:3:1111:13596:10430,LH00995:25:23T55JLT4:3:1230:15635:23910,LH00995:25:23T55JLT4:4:1291:5757:29669,LH00995:25:23T55JLT4:4:2223:6493:24387,LH00995:25:23T55JLT4:4:2247:34727:12560,LH00995:25:23T55JLT4:4:2307:5894:4937,LH00995:25:23T55JLT4:4:2401:31200:6899,LH00995:25:23T55JLT4:4:2408:50762:18417 | . | YES_LDAS | 0.0643 | GT | 1.7465 | AG | 1.8892 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr4]"] | chr17:34039043-chr4:118595912 | False | 1 | PASS | 19 | |||
| PTPRM--TTC39C | 18 | 0 | 18.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | PTPRM^ENSG00000173482.17 | chr18:7567891:+ | TTC39C^ENSG00000168234.13 | chr18:24064140:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:2364:37211:21234,LH00995:25:23T55JLT4:1:2492:24404:25255,LH00995:25:23T55JLT4:2:1193:6477:1659,LH00995:25:23T55JLT4:2:1275:33125:9113,LH00995:25:23T55JLT4:2:1309:10126:23167,LH00995:25:23T55JLT4:2:1327:4729:16203,LH00995:25:23T55JLT4:2:2239:34557:2401,LH00995:25:23T55JLT4:2:2309:37866:13037,LH00995:25:23T55JLT4:2:2349:42130:17198,LH00995:25:23T55JLT4:3:1340:6097:7502,LH00995:25:23T55JLT4:3:1404:27956:27679,LH00995:25:23T55JLT4:3:1422:31014:1168,LH00995:25:23T55JLT4:4:1245:13823:21640,LH00995:25:23T55JLT4:4:1361:27875:27988,LH00995:25:23T55JLT4:4:2151:12019:10809,LH00995:25:23T55JLT4:4:2191:36070:15643,LH00995:25:23T55JLT4:4:2273:20602:10318,LH00995:25:23T55JLT4:4:2353:8103:13415 | . | YES_LDAS | 0.0609 | GT | 1.9656 | AG | 1.7819 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr18:15.59Mb]"] | chr18:7567891-chr18:24064140 | False | 1 | PASS | 18 | |||
| PDCD1LG2--DYNC2H1 | 18 | 1 | 18.0 | 1.0 | ONLY_REF_SPLICE | PDCD1LG2^ENSG00000197646.8 | chr9:5535050:+ | DYNC2H1^ENSG00000187240.16 | chr11:103113537:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1223:30771:11257,LH00995:25:23T55JLT4:1:2361:42380:29487,LH00995:25:23T55JLT4:2:1204:8969:21416,LH00995:25:23T55JLT4:2:1452:10481:9295,LH00995:25:23T55JLT4:2:2133:29582:12252,LH00995:25:23T55JLT4:2:2154:23288:3760,LH00995:25:23T55JLT4:2:2290:4236:29109,LH00995:25:23T55JLT4:2:2494:9495:6213,LH00995:25:23T55JLT4:3:1121:51797:15335,LH00995:25:23T55JLT4:3:1139:16678:3074,LH00995:25:23T55JLT4:3:1234:2594:1490,LH00995:25:23T55JLT4:3:1410:2545:18473,LH00995:25:23T55JLT4:3:2217:29784:2822,LH00995:25:23T55JLT4:3:2221:6372:18655,LH00995:25:23T55JLT4:3:2442:49152:10136,LH00995:25:23T55JLT4:3:2485:15837:20393,LH00995:25:23T55JLT4:4:1396:23191:13765,LH00995:25:23T55JLT4:4:2242:18046:1378 | LH00995:25:23T55JLT4:4:1420:12302:25760 | YES_LDAS | 0.0643 | GT | 1.9219 | AG | 1.7819 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr9--chr11]"] | chr9:5535050-chr11:103113537 | False | 1 | PASS | 19 | |||
| TMEM123--PPP2R2C | 13 | 0 | 13.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PPP2R2C^ENSG00000074211.14 | chr4:6381094:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1173:40520:6563,LH00995:25:23T55JLT4:1:1318:52056:28646,LH00995:25:23T55JLT4:1:1420:46377:28842,LH00995:25:23T55JLT4:2:1252:23078:9842,LH00995:25:23T55JLT4:2:1271:36062:28380,LH00995:25:23T55JLT4:2:1412:34307:3004,LH00995:25:23T55JLT4:2:1414:23579:7628,LH00995:25:23T55JLT4:2:2277:31669:16540,LH00995:25:23T55JLT4:3:1116:10061:6773,LH00995:25:23T55JLT4:3:2494:21363:12840,LH00995:25:23T55JLT4:4:1106:29881:6913,LH00995:25:23T55JLT4:4:1396:35528:26642,LH00995:25:23T55JLT4:4:2360:19114:7740 | . | YES_LDAS | 0.044 | GT | 1.9656 | AG | 1.8256 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr11--chr4]"] | chr11:102448812-chr4:6381094 | False | 1 | PASS | 13 | |||
| TMEM123--PDGFD | 13 | 0 | 13.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | PDGFD^ENSG00000170962.13 | chr11:104000237:- | LH00995:25:23T55JLT4:1:1178:39144:2976,LH00995:25:23T55JLT4:1:2161:30278:16203,LH00995:25:23T55JLT4:2:1162:47695:18039,LH00995:25:23T55JLT4:2:1172:50187:21206,LH00995:25:23T55JLT4:2:2210:45244:9477,LH00995:25:23T55JLT4:3:1123:21994:28478,LH00995:25:23T55JLT4:3:2308:1769:21248,LH00995:25:23T55JLT4:4:1158:18054:3046,LH00995:25:23T55JLT4:4:1264:5886:25157,LH00995:25:23T55JLT4:4:1386:28676:18361,LH00995:25:23T55JLT4:4:1406:17892:3887,LH00995:25:23T55JLT4:4:2406:20982:29557,LH00995:25:23T55JLT4:4:2476:1696:29557 | . | YES_LDAS | 0.044 | GT | 1.9656 | AG | 1.9656 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr11:1.44Mb]"] | chr11:102448812-chr11:104000237 | False | 1 | PASS | 13 | |||
| TPTE--BAGE2 | 11 | 0 | 5.5 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TPTE^ENSG00000274391.5 | chr21:10527412:+ | BAGE2^ENSG00000187172.15 | chr21:10514122:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1165:41846:3760,LH00995:25:23T55JLT4:1:2104:41604:24330,LH00995:25:23T55JLT4:1:2498:6970:27623,LH00995:25:23T55JLT4:2:1119:12908:5764,LH00995:25:23T55JLT4:2:1319:24154:11173,LH00995:25:23T55JLT4:2:2104:32203:26432,LH00995:25:23T55JLT4:3:1133:18701:18571,LH00995:25:23T55JLT4:3:1328:20974:16259,LH00995:25:23T55JLT4:3:2106:42947:11467,LH00995:25:23T55JLT4:3:2217:49038:14031,LH00995:25:23T55JLT4:4:1255:16711:12462 | . | YES_LDAS | 0.0186 | GT | 1.9656 | AG | 1.7819 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr21:0.01Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[5122]"] | chr21:10527412-chr21:10514122 | False | 1 | PASS | 11 | |||
| TMEFF2--TEX41 | 11 | 0 | 11.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEFF2^ENSG00000144339.12 | chr2:191998262:- | TEX41^ENSG00000226674.11 | chr2:144667969:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1245:42032:8623,LH00995:25:23T55JLT4:1:1358:5725:2205,LH00995:25:23T55JLT4:2:1431:45916:27567,LH00995:25:23T55JLT4:2:1492:35156:9379,LH00995:25:23T55JLT4:2:2104:15845:28254,LH00995:25:23T55JLT4:3:1154:41579:22859,LH00995:25:23T55JLT4:3:2201:19445:5400,LH00995:25:23T55JLT4:3:2490:47534:8455,LH00995:25:23T55JLT4:4:1438:5045:9996,LH00995:25:23T55JLT4:4:1458:33320:16736,LH00995:25:23T55JLT4:4:2462:16937:11257 | . | YES_LDAS | 0.0372 | GT | 1.8892 | AG | 1.8892 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:46.69Mb]"] | chr2:191998262-chr2:144667969 | False | 1 | PASS | 11 | |||
| EIF4H--COL1A2 | 10 | 0 | 10.0 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | EIF4H^ENSG00000106682.16 | chr7:74195439:+ | COL1A2^ENSG00000164692.18 | chr7:94412068:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1340:16670:18305,LH00995:25:23T55JLT4:1:2123:20707:15096,LH00995:25:23T55JLT4:2:1261:43489:11761,LH00995:25:23T55JLT4:2:1411:44929:7446,LH00995:25:23T55JLT4:2:2323:42825:25550,LH00995:25:23T55JLT4:2:2326:6032:2009,LH00995:25:23T55JLT4:3:1233:46450:29529,LH00995:25:23T55JLT4:3:1418:41968:17675,LH00995:25:23T55JLT4:3:2294:19567:6171,LH00995:25:23T55JLT4:4:2468:14664:1967 | . | YES_LDAS | 0.0339 | GT | 1.9329 | AG | 1.5656 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr7:20.20Mb]"] | chr7:74195439-chr7:94412068 | False | 1 | PASS | 10 | |||
| TLK2--AC018638.8 | 9 | 0 | 5.74 | 0.0 | INCL_NON_REF_SPLICE | TLK2^ENSG00000146872.18 | chr17:62560126:+ | AC018638.8^ENSG00000281896.1 | chr7:128617868:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1148:10401:26054,LH00995:25:23T55JLT4:1:1190:24129:26628,LH00995:25:23T55JLT4:1:2167:23587:3802,LH00995:25:23T55JLT4:2:1158:16314:1266,LH00995:25:23T55JLT4:2:1385:1655:5050,LH00995:25:23T55JLT4:2:2284:44686:27904,LH00995:25:23T55JLT4:3:1243:37842:18011,LH00995:25:23T55JLT4:3:2229:45697:6535,LH00995:25:23T55JLT4:4:2165:40876:26685 | . | YES_LDAS | 0.0194 | GT | 1.8892 | AG | 1.8892 | ["INTERCHROMOSOMAL[chr17--chr7]"] | chr17:62560126-chr7:128617868 | False | 1 | PASS | 9 | |||
| MAP3K20--RAPGEF4 | 9 | 1 | 9.0 | 1.0 | ONLY_REF_SPLICE | MAP3K20^ENSG00000091436.17 | chr2:173091190:+ | RAPGEF4^ENSG00000091428.18 | chr2:172917802:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1444:40277:26853,LH00995:25:23T55JLT4:1:2333:37753:5106,LH00995:25:23T55JLT4:2:1109:44023:12294,LH00995:25:23T55JLT4:2:1240:40148:15251,LH00995:25:23T55JLT4:2:2184:11598:16862,LH00995:25:23T55JLT4:3:1303:27770:5918,LH00995:25:23T55JLT4:4:1165:21905:6185,LH00995:25:23T55JLT4:4:1311:29364:17535,LH00995:25:23T55JLT4:4:2286:27721:8272 | LH00995:25:23T55JLT4:1:1209:4333:25662 | YES_LDAS | 0.0339 | GT | 1.1589 | AG | 1.7968 | ["DEEPEST2019","TCGA_StarF2019","INTRACHROMOSOMAL[chr2:0.02Mb]","LOCAL_REARRANGEMENT:+:[22542]"] | chr2:173091190-chr2:172917802 | False | 1 | PASS | 10 | |||
| TMEFF2--TEX41 | 8 | 0 | 8.0 | 0.0 | ONLY_REF_SPLICE | TMEFF2^ENSG00000144339.12 | chr2:191998262:- | TEX41^ENSG00000226674.11 | chr2:144768098:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1371:28757:13681,LH00995:25:23T55JLT4:1:2354:6089:24106,LH00995:25:23T55JLT4:2:1467:28652:25269,LH00995:25:23T55JLT4:2:2280:20578:24513,LH00995:25:23T55JLT4:3:2241:24332:8567,LH00995:25:23T55JLT4:4:1290:8079:25592,LH00995:25:23T55JLT4:4:2157:48650:6829,LH00995:25:23T55JLT4:4:2358:20812:23125 | . | YES_LDAS | 0.0271 | GT | 1.8892 | AG | 1.9219 | ["INTRACHROMOSOMAL[chr2:46.69Mb]"] | chr2:191998262-chr2:144768098 | False | 1 | PASS | 8 | |||
| TMEM123--BIRC2 | 8 | 1 | 8.0 | 0.73 | ONLY_REF_SPLICE | TMEM123^ENSG00000152558.15 | chr11:102448812:- | BIRC2^ENSG00000110330.8 | chr11:102350844:+ | LH00995:25:23T55JLT4:1:1137:21071:19903,LH00995:25:23T55JLT4:1:1326:29493:4419,LH00995:25:23T55JLT4:1:2168:34096:11719,LH00995:25:23T55JLT4:2:1115:39023:29585,LH00995:25:23T55JLT4:2:2369:24647:15727,LH00995:25:23T55JLT4:3:2377:26977:14718,LH00995:25:23T55JLT4:4:1145:33748:29333,LH00995:25:23T55JLT4:4:1169:31071:14101 | LH00995:25:23T55JLT4:2:1271:24760:24134 | YES_LDAS | 0.0296 | GT | 1.9656 | AG | 1.9329 | ["Klijn_CellLines","INTRACHROMOSOMAL[chr11:0.02Mb]","LOCAL_INVERSION:-:+:[17662]"] | chr11:102448812-chr11:102350844 | False | 1 | PASS | 9 |
30 rows