aih-tih-sc-7c6c07-R1_B23WHYVLT4_1.arriba.fusions.filtered_pass_only.tsv

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Filename: aih-tih-sc-7c6c07-R1_B23WHYVLT4_1.arriba.fusions.filtered_pass_only.tsv
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Size: 136.5 KB
Workflow Run: dev_rna_exp0018_2-73d51683
Published: Jun 08, 2026 2:39 AM

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gene2

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strand2(gene/fusion)

breakpoint1

breakpoint2

site1

site2

type

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split_reads2

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coverage2

confidence

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tags

retained_protein_domains

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closest_genomic_breakpoint2

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gene_id2

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transcript_id2

direction1

direction2

filters

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peptide_sequence

read_identifiers

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vaf2

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blacklisted

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FILTER

filter_reason

RBM39

BCL2L1

-/-

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CDS/splice-site

deletion

137

234

9998

20036

high

out-of-frame

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ENSG00000171552.14

ENST00000253363.11

ENST00000420488.6

upstream

downstream

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PASS

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PCDHAC1

+/+

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1598

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CDS/splice-site

deletion/read-through

1273

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high

in-frame

Cadherin-like(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

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651

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out-of-frame

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ENSG00000215440.12

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upstream

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Cadherin-like(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

ENSG00000204967.12

ENSG00000239389.8

ENST00000672575.1

ENST00000289272.3

downstream

upstream

duplicates(67),mismatches(2)

SYSQQRRPRVCSGEGPPKTDLMAFSPSLPDSRDREDQLQTTEESFAK|PRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTV

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0.018427518427518427

0.023526736312995854

False

PASS

UPK3B

PMS2P7

+/+

chr7:76514076

chr7:73016329

CDS/splice-site

exon/splice-site

duplication

2355

986

high

out-of-frame

ENSG00000243566.7

ENSG00000229018.5

ENST00000334348.8

ENST00000506558.2

downstream

upstream

duplicates(12)

TGTGCAGGGAAGACCCCCGGATCCATCGACACCTGGCCAGGGCGGCGAAGTGGCAGCATGATCGTCATTACCTCCATCCTCTCTTCTCTGGCCGGCCTCCTACTCTTGGCCTTCTTGGCAGCCTCTACCATGCGCTT|AAACGTGCCTGCTTCCCCTTCGCCTTCTGCCGTGATTGTCAGTTTCTTGAGGGCTCCCCAGCCATGCTTCCTGTAC

caGKTPGSIDTWPGRRSGSMIVITSILSSLAGLLLLAFLAASTMRl|nvpaspspsavivsflrapqpcfl

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0.005045408678102927

0.00715038629109185

False

PASS

TLK2P1

AC110079.1

-/-

+/+

chr17:34039043

chr4:118595912

exon

exon/splice-site

translocation

409

767

high

ENSG00000226049.3

ENSG00000260404.3

ENST00000530992.1

ENST00000567913.2

upstream

duplicates(26),mismatches(7)

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0.0013020833333333333

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False

PASS

CCDC169

SOHLH2

-/-

chr13:36248606

chr13:36202093

CDS/splice-site

deletion/read-through

154

high

out-of-frame

Domain_of_unknown_function_(DUF4600)(100%)|Helix-loop-helix_DNA-binding_domain(100%)

ENSG00000242715.8

ENSG00000120669.16

ENST00000379864.6

ENST00000379881.8

upstream

downstream

duplicates(9),mismappers(1),mismatches(1)

GCTTACCAGAAGATCAACAATGAACGCCGTACATACCTAGCTGAAATGTCTCAG___GGTTCTGGTTTACATCAAGTTTCTAAAAGGCAACAGGTGGATCAACTGCCTAGGATGCAAGAGAATCTAGTGAAAAC|GCAAAAATAGACATCTTATTAGTTGGAGATGTCACTGTGGGCTACCTGGCTGATACTGTACAGAAACTATTTGCAAACATAGCAGAAGTCACCATCACCATCAGTGACACGAAGGAGGCAGCAGCGCTTTTGGAT

AYQKINNERRTYLAEMSQGSGLHQVSKRQQVDQLPRMQENLVKt|qk*

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0.13512625551487845

False

PASS

ZNF559

ZNF177

+/+

chr19:9324780

chr19:9376316

CDS/splice-site

5'UTR/splice-site

deletion/read-through

787

126

high

out-of-frame

|C2H2-type_zinc_finger(100%),KRAB_box(100%),Zinc-finger_double_domain(100%),Zinc_finger__C2H2_type(100%)

ENSG00000188321.14

ENSG00000188629.13

ENST00000587557.5

ENST00000343499.8

downstream

upstream

duplicates(25),low_entropy(1),mismappers(17)

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PASS

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-/-

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5'UTR/splice-site

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180

high

out-of-frame

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PASS

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239

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ENSG00000242110.8

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+/+

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131

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0.05818826563507415

False

PASS

TLK2

FAM157A

+/+

chr17:62560126

chr3:198180755

CDS/splice-site

exon/splice-site

translocation

1810

1117

high

ENSG00000146872.18

ENSG00000236438.7

ENST00000578697.1

ENST00000634862.1

downstream

upstream

duplicates(15),mismatches(7),multimappers(13)

AGACAGACCCAG___GCCAACTGTGATTTGAGACGGCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACaATTAAATAGATGTGTGACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAG|ATGATGATTATTCCCCACCTTCTAAGAGACAAAGACCAACGAGCCACCACAGCCACCgGTCCCAGAACCCGCCAATGCTGGGGAACGGAAAATGAGGGAGTTCAACTCTG___GCCCTCACAATCCAGTGGAGGAGACGAAACTCAgCTGCCTCTGTCCCTCTGGGCACGCCTCATGCCAGGTGCATCTGTGGACAGGGGCCATGCTCCTGGGCTTCCAAAGTTGGAGAAAGCTGCCAGGCTCAG___GTCTGAAGGC

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False

PASS

PLRG1

RNU6-224P(86896),LINC02377(19473)

-/-

./+

chr4:154537969

chr4:131360244

CDS/splice-site

intergenic

inversion

408

high

out-of-frame

WD_domain__G-beta_repeat(94%)|

ENSG00000171566.12

ENST00000499023.7

upstream

duplicates(5)

TTTACATCCAAGACA___TTACACATTTGCATCTGGTTCTCCAGATAACATAAAGCAGTGGAAATTCCCTGATGGAAGTTTCATTCAAAATCTTTCCGGTCATAATGCTATTATTAACACATTGACGGTAAATTCTGATGGAGTGCTTGTATCTGGAG|AAATTCAATGCAGTCCAAATGAAAATTCTAGCAAGTTATAAGGTTTATATGGAAATTGATTTTCCCAGAAAAGCAAACACAACACTGAAGAAAAACAAAGAGAGGACTTACACTACCTGCTTTAAGACTGACTAAGAAGATAC

LHPRHYTFASGSPDNIKQWKFPDGSFIQNLSGHNAIINTLTVNSDGVLVSG|eiqcspnensskl*

LH00995:36:23WHYVLT4:7:1493:4471:22369,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1391:2513:1406,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2134:17932:24134,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2373:43489:22831,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2297:41660:15517,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1270:18086:25942,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1389:21023:20631,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1389:21031:20617,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1443:50058:6717,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2325:22948:25451,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2325:22956:25437,LH00995:36:23WHYVLT4:7:1481:46854:20169,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1364:31208:14368,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1364:31216:14354

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0.3333333333333333

0.1756919374247894

False

PASS

MB21D2

FGF12

-/-

chr3:192917630

chr3:192360538

CDS/splice-site

deletion

239

596

high

in-frame

|Fibroblast_growth_factor(98%)

ENSG00000180611.7

ENSG00000114279.14

ENST00000392452.3

ENST00000450716.5

upstream

downstream

duplicates(3)

GAGGAATTGAACAAACTCATCCAAGAATTTACGAAGCACGACCAGCGGGAATACGACGACCAGAGAGCGCTGGAGATTCACACAGCCAAGGATTTCATCTTTTCCATGCTGG|AACCCCAGCTCAAAGGGATTGTGACAAGGTTATTCAGCCAGCAGGGATACTTCCTGCAGATGCACCCAGATGGTACCATTGATGGGACCAAGGACGAAAACAGCGACTACA___CTCTCTTCAATCTAATTCCCGTGGGCCTGCGTGTAGTG

EELNKLIQEFTKHDQREYDDQRALEIHTAKDFIFSML|ePQLKGIVTRLFSQQGYFLQMHPDGTIDGTKDENSDYTLFNLIPVGLRV

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PASS

21 rows