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AC092807.3	DDAH1	-/-	-/-	chr1:85496166	chr1:85358847	exon/splice-site	CDS/splice-site	deletion/read-through	8	16	0	46	246	high	.	.	|Arginine_deiminase(65%)	.	.	ENSG00000282057.1	ENSG00000153904.21	ENST00000498304.5	ENST00000284031.13	upstream	downstream	duplicates(28)	GCGAAATGTGCAAATGTTTATGG___TTTCATCTGTATGGAAAAGGAGCTCTGGTAACTTTGGCCAAGACTTTTCAGTAGGAAATGCTTCAAAATACAAAGCAAGAGCTATTTTCAAGAAAGACCTTCTAAATTTATATTAG|GTTGACATGATGAAAGAAGCATTAGAAAAACTTCAGCTCAATATAGTAGAGATGAAAGATGAAAATGCAACTTTAGATGGCGGAGATGTTTTATTCACAG___GCAGAGAATTTTTTGT	.	LH00995:36:23WHYVLT4:1:1186:39185:17563,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1235:23191:3816,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1235:23207:3816,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1309:38505:28856,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1383:13078:18866,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1415:36709:9043,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2165:25456:28030,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2309:8847:8230,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2324:1162:20645,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1193:27074:13709,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1209:36709:24373,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1238:40633:25732,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1291:15886:9099,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2163:24016:6367,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2186:23506:17338,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2328:9381:22747,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2470:14785:28324,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1174:30334:15545,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1229:51207:28464,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2163:1429:18249,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2205:23377:15965,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2230:39152:15545,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2343:18968:15615,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2414:42591:7628,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2484:3500:10654,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1139:47776:28969,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1205:32899:13625,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1339:13693:27105,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1391:50106:7810,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1391:50114:7796,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1269:32422:13779,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1368:5296:17941,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1441:51643:1392,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2220:20723:26194,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1180:8079:20715,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1257:52024:10486,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1347:13386:26376,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2314:7982:24246,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2426:25416:12070,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1355:8459:17394,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2217:16743:4699,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1101:22940:22859,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1165:46150:25227,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1165:46158:25213,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1275:9559:8679,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1374:46377:26180,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1144:38772:25507,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1317:15206:5988,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2179:31103:13597,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1151:12019:11930,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1151:12027:11944,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1151:12035:11930	chr1:85496166-chr1:85358847	0.14814814814814814	0.061068702290076333	0.10460842521911223	24	False		PASS	
SPIB	POLD1	+/+	+/+	chr19:50423755	chr19:50413426	CDS/splice-site	CDS/splice-site	duplication	17	7	0	90	749	high	in-frame	.	|C4-type_zinc-finger_of_DNA_polymerase_delta(100%),DNA_polymerase_family_B(58%)	.	.	ENSG00000269404.7	ENSG00000062822.15	ENST00000595883.6	ENST00000643407.1	downstream	upstream	duplicates(26)	GGAGGAAGACTTACCGTTGGACAGCCCTGCCCTGGAGGTCTCGGACAGCGAGTCGGATGAGGCCCTCGTGGCTGGCCCCGAGGGGAAGGGATCCGAGGCAG|AGCGTCACGGGGTTCGGACGTCAGATGATCGAGAAAACCAAGCAGCTGGTGGAGTCTAAGTACACAGTGGAG	EEDLPLDSPALEVSDSESDEALVAGPEGKGSEA|eRHGVRTSDDRENQAAGGV*	LH00995:36:23WHYVLT4:2:1254:17706:20603,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1464:6493:22481,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2139:28231:16750,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1307:20998:25886,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2162:10247:27721,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1433:43610:23826,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2222:49322:22173,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2426:43804:2920,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1123:47121:29151,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1350:41482:9351,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1350:41490:9337,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1198:30569:9674,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1201:30626:18796,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1323:21460:4769,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1225:3500:1378,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1237:6089:2387,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1237:6097:2373,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1461:29339:7544,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1469:12989:15124,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2121:22382:10598,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2238:31265:1406,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2242:7844:7137,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2344:5409:10514,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2415:43003:14984,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2477:26063:14844,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1132:19866:26614,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2256:29776:11860,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2493:26435:12350,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1186:14154:19945,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1186:21007:15811,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1198:13572:15349,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2280:17673:8384,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2323:37575:14101,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2331:36709:1392,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2331:36717:1378,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2356:35682:10851,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1208:7027:18613,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1265:31103:24190,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1288:15780:22565,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1307:6259:2850,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1307:6267:2864,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1394:29186:1701,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1465:41215:5582,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2122:32640:1126,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2226:18499:3957,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2239:30609:15713,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1280:17585:11649,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1336:29105:4223,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1336:43011:13849,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1370:27390:14872	chr19:50423755-chr19:50413426	0.1588785046728972	0.009259259259259259	0.08406888196607823	24	False		PASS	
TASP1	MACROD2	-/-	+/-	chr20:13623446	chr20:14144593	CDS/splice-site	intron	duplication/5'-5'	19	3	1	1244	11	high	out-of-frame	.	Asparaginase(18%)|	.	.	ENSG00000089123.16	ENSG00000172264.17	ENST00000337743.9	.	upstream	downstream	duplicates(11)	GGCTTTGTGTTGGTGCATGCAG___GTGCAGGTTATCATTCTGAATCCAAAGCCAAGGAGTATAAACATGTATGCAAACGAGCTTGTCAGAAG___GCAATTGAAAAGCTGCAGGCCGGTGCTCTTGCAACTGACGCAGTCACTGCAGCACTGGTGGAACTTGAG|ACCATAAGTGCTGTAAGAACAGACAATAGGATCATACCTTCCTATGGCCAATATCTCACCCCAGTTCTGGACCAGG	GFVLVHAGAGYHSESKAKEYKHVCKRACQKAIEKLQAGALATDAVTAALVELE|tisavrtdnriipsygqyltpvldq	LH00995:36:23WHYVLT4:1:1481:7982:14242,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2147:35116:1911,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2153:6121:19931,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2222:51846:14858,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1195:17051:2121,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2268:24437:24162,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1172:7893:16750,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1385:37753:15559,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1434:41029:5064,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2338:37106:6451,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2338:37122:6451,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1349:30181:18109,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1420:16525:11916,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2123:22058:22257,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2195:17140:2920,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2316:21168:29375,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2363:50834:28912,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2373:5814:24779,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1189:37065:2990,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1254:16759:25802,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1339:19664:24078,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1355:28749:8427,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1404:7116:19776,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1410:43966:4041,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2139:30092:15321,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2140:30957:21164,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2214:50754:11313,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2226:41118:15951,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2444:17439:11453,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1316:35221:6745,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2477:22730:22187,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1472:46870:21178,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2329:3662:2780,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2329:3670:2794	chr20:13623446-chr20:14144593	0.015433320142461416	0.2413793103448276	0.12840631524364451	23	False		PASS	
PPP1R12A	PTPRQ	-/-	+/-	chr12:79828320	chr12:80580409	CDS/splice-site	intron	duplication/5'-5'	11	11	0	2344	19	high	out-of-frame	.	Ankyrin_repeats_(3_copies)(100%),Ankyrin_repeats_(many_copies)(100%)|	.	.	ENSG00000058272.19	ENSG00000139304.16	ENST00000261207.9	.	upstream	downstream	duplicates(13)	ACTTTTAATACAGGCAGGCTATGATGTTAATATTAAAGACTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGCATGTCGAATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGATGGTCAACAAAGTG|ATGGTACTAATTTGAACACATCATTCCATGCTTCCTGGAGTAATCACACAGCTTGCTTAGATTTTCTAAACATGACTGAACTGTGATGAAGCGATCAACATTAACTGCCAAG___ACTCCACATAGCAATGATGTGCTGGCCA	LLIQAGYDVNIKDYDGWTPLHAAAHWGKEEACRILVDNLCDMEMVNKV|mvli*	LH00995:36:23WHYVLT4:1:2251:7100:24373,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2366:44540:20505,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2366:44548:20491,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1277:28368:1883,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2138:18402:2611,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2155:11258:12966,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2196:39719:25381,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2196:39727:25395,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2318:48456:16385,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2384:18118:5176,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1205:14454:12196,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1419:37898:23013,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2204:8394:15377,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2204:8402:15391,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2491:49014:9337,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1157:40681:20351,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1157:40698:20351,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1157:40706:20365,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1248:30132:18529,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2244:8791:4657,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2344:20586:17408,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1160:8192:24050,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1160:8208:24050,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1434:4762:6171,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1108:45891:21836,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2440:30051:13597,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1201:34088:10248,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1219:37801:22733,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2250:36216:3396,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2250:36224:3382,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2488:17989:19440,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2489:23458:9968,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1191:37510:9618,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1319:15400:20813,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1332:20885:23027	chr12:79828320-chr12:80580409	0.004670912951167728	0.36666666666666664	0.18566878980891718	22	False		PASS	
NCOA3	EYA2	+/+	+/+	chr20:47502019	chr20:47169139	5'UTR/splice-site	CDS/splice-site	duplication	8	14	0	22	1074	high	.	.	|haloacid_dehalogenase-like_hydrolase(76%)	.	.	ENSG00000124151.19	ENSG00000064655.19	ENST00000371998.8	ENST00000357410.7	downstream	upstream	duplicates(10)	AGCGACGGCgGCGGCTGCGGCTTAGTCGGTGGCGGCCGGCGGCGGCTGCGGGCTGAGCGGCGAGTTTCCGATTTAAAGCTGAGCTGCGAGGAAAATGGCGGCGGGAG|GATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCCAAGATTTAAG___CACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGGAGCCAACCTGTGCCTGGGCTCTGGCGTGC	.	LH00995:36:23WHYVLT4:1:1475:10635:26516,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2125:45964:10164,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2129:7747:22859,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2263:4155:23728,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2361:4123:28576,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2428:32252:9365,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1301:5886:15208,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2105:16314:22313,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1155:26395:27665,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1189:10295:16876,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1385:37437:6493,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2207:29639:15377,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2412:35722:22187,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1104:23134:7362,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1157:32713:7782,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1192:34541:13135,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1450:45058:22355,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2107:47954:24513,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1101:38287:6703,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1246:26087:3060,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1309:5272:26474,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1315:38667:8314,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1379:4916:16245,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2167:1550:23840,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1396:38441:2766,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1339:38368:5302,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1361:15230:28590,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2331:22641:16568,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1126:21832:28983,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1334:25149:5946,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2241:33166:1504,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2440:23935:28730	chr20:47502019-chr20:47169139	0.26666666666666666	0.012867647058823529	0.1397671568627451	22	False		PASS	
SAMD11	CSMD2	+/+	-/+	chr1:935896	chr1:33647604	CDS/splice-site	intron	deletion/5'-5'	13	8	0	468	12	high	out-of-frame	.	SAND_domain(100%)|	.	.	ENSG00000187634.13	ENSG00000121904.17	ENST00000616016.5	.	downstream	upstream	duplicates(7),mismatches(1)	TGCAG___CCAGGACGGCAACCTTCCCACCCTCATATCCAGCGTCCACCGCAGCCGCCACCTCGTTATGCCCGAGCATCAGAGCCGCTGTGAATTCCAGAGAGGCAGCCTGGAGATTGGCCTGCGACCCGCCG|GATCTAATGTGAGGCATTAAGAAGGACAAGATATCAGCTTGAAAAAAGCCTCTATCAGAGCAACATGAATTCTGCTAAAATTGAAGCAAGGAAAAACATTAAATTTATGGTGAAGCTTGGGTAGAAGAATGGTGACATCACTGATGCTTTACAAAAA	CSQDGNLPTLISSVHRSRHLVMPEHQSRCEFQRGSLEIGLRPA|gsnvrh*	LH00995:36:23WHYVLT4:1:1322:3273:4937,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2148:11897:27525,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2294:8063:13457,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1125:12504:2261,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2139:34201:3774,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2485:5822:29305,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1418:8807:8469,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2148:14810:8637,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2338:16840:26586,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2346:23879:13947,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1277:27187:28478,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1459:43715:15180,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2472:45616:1406,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2179:36208:18011,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2179:36216:18025,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2213:1955:18011,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1218:9139:28828,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1282:2739:1799,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1265:40835:29109,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2108:41256:26110,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2108:41264:26096,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2129:2586:14704,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2451:1866:12168,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2260:28854:18613,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2260:28862:18599,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2416:52080:14984,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1130:51627:20141,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1302:20109:15349,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1302:20117:15335	chr1:935896-chr1:33647604	0.02702702702702703	0.4	0.21351351351351353	21	False		PASS	
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C22orf39	BNIP3P41(34867)	-/-	./+	chr22:19447378	chr4:14229	CDS/splice-site	intergenic	translocation	5	6	0	630	44	high	out-of-frame	.	Protein_of_unknown_function_(DUF3128)(68%)|	.	.	ENSG00000242259.9	.	ENST00000509549.5	.	upstream	upstream	duplicates(23),multimappers(37)	CAGCGCCAGGCACTTCCTACACCACTACTACGTCCACGGCGAGCGGCCGGCCTGCGAACAGTGGCAGCGCGACCTGGCCAGCTGCCGCGACTGGGAGGAGCGCCGGAACGCCGAGGCCCAG|ATATTATTTCCCCCTGATGCTTTCCTGAAAGCTCCTGCAATCAGCTACAGGTCAGAATGTTCATCTCCATCACGGGAtTCCCTCTGAGAC	SARHFLHHYYVHGERPACEQWQRDLASCRDWEERRNAEAQ|ilfppdaflkapaisyrsecsspsrdsl*	LH00995:36:23WHYVLT4:1:1220:11161:13415,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1244:9082:24891,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1397:43869:16147,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2402:33942:23952,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2402:7205:1070,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2484:20311:20379,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1334:49006:9015,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1495:9486:1406,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2149:26225:18123,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2213:11355:14676,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2243:21468:20393,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2345:15149:7656,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2364:13726:17240,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2401:37308:15909,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1157:1469:26586,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1297:51668:5666,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1343:51789:11537,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1365:39444:2401,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1493:33368:4545,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2152:36701:23434,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2152:36709:23420,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2347:17601:8735,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2413:6404:2766,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2419:45301:4671,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2439:30698:26685,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2439:30706:26699,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1252:17860:6969,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1336:9778:3901,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1410:36572:13709,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1422:25844:21360,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1469:2408:12294,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2161:27584:15909,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2307:2836:19678,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2465:25399:19692,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1125:6542:9169,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1130:16816:26404,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1280:28385:6283,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2131:51287:29725,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2167:41240:28044,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2287:47898:7852,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2290:32931:18361,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1125:26403:14312,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1213:19413:7390,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1310:26645:24653,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1209:5636:2639,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2165:50940:16652,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2186:45236:25914,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2249:38659:11579,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2398:23053:14648,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1177:40819:9800,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1230:17026:10262,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2174:6259:3270,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2248:8014:24246,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1167:8063:21164,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1302:44120:16890,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2346:24963:12574,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2409:3451:25255,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1119:24712:23266,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2149:45932:20337,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2435:9155:14704,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2481:15813:7488,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1114:29647:26068,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1141:17682:28997,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1143:18102:27988,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1165:51692:9547,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1289:9664:16203,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1364:35294:1995,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1446:31135:27273,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2306:40139:25325,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1175:13993:9576,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1381:32656:17801	chr22:19447378-chr4:14229	0.007874015748031496	0.12	0.06393700787401574	11	False		PASS	
TRPV6	TRBC2	-/+	+/+	chr7:142872531	chr7:142801041	intron	CDS/splice-site	duplication/3'-3'	4	6	0	45	445	high	.	.	.	.	.	ENSG00000165125.22	ENSG00000211772.11	.	ENST00000466254.1	downstream	upstream	duplicates(8),mismatches(5)	CCCGGAGCGAGGCCACAGGCAGCGAGGCAGCTTCCGCTCCAGCATCACcGTGGTGGCCACAATCTGCGTATGGGAACAAAAGGAGAAGTCAGAGATGAGGCTGGGCGCAGACAGAG|AGGACCTGAAAAACGTGTTCCCACCCgAGGTCGCTGTGTTTGAGCCATCAGAAGCAGAGATCTCCCACACCCAAAAGGCCACACTGGTGTGCCTGGCCACAGGCTTCTACCCCGACCACGTGGAGCTGAGCTGGTGGGTG	.	LH00995:36:23WHYVLT4:1:2107:47606:29403,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1177:36879:23938,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2166:32778:9632,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1223:26961:25171,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1223:26969:25157,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1223:26985:25157,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1451:4438:29655,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1277:44516:26600,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1428:13232:25465,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1428:13240:25479,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1450:29064:2079,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2351:32616:20841,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2351:32616:20869,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2351:32624:20855,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1369:22916:14410,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2369:12383:9477,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2388:30197:29459,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1291:41766:14774,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2291:47857:3606,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2376:25060:1560,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2204:7771:24863,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1216:8613:13905,LH00995:36:23WHYVLT4:6:1284:40309:20743	chr7:142872531-chr7:142801041	0.08163265306122448	0.013303769401330377	0.04746821123127743	10	False		PASS	
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