aih-tih-sc-6e7384-R1_B23WHYVLT4_1.arriba.fusions.filtered_pass_only.tsv

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Filename: aih-tih-sc-6e7384-R1_B23WHYVLT4_1.arriba.fusions.filtered_pass_only.tsv
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Size: 737.1 KB
Workflow Run: dev_rna_exp0018_2-73d51683
Published: Jun 08, 2026 2:40 AM

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#gene1

gene2

strand1(gene/fusion)

strand2(gene/fusion)

breakpoint1

breakpoint2

site1

site2

type

split_reads1

split_reads2

discordant_mates

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coverage2

confidence

reading_frame

tags

retained_protein_domains

closest_genomic_breakpoint1

closest_genomic_breakpoint2

gene_id1

gene_id2

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transcript_id2

direction1

direction2

filters

fusion_transcript

peptide_sequence

read_identifiers

breakpoint_ID

vaf1

vaf2

vaf_avg

total_reads

blacklisted

aih_curated_reason

FILTER

filter_reason

TVP23C

CDRT4

-/-

chr17:15503098

chr17:15440285

CDS

5'UTR/splice-site

deletion/read-through

123

1027

950

high

out-of-frame

Eukaryotic_protein_of_unknown_function_(DUF846)(100%)|CMT1A_duplicated_region_transcript_4_protein(100%)

ENSG00000175106.17

ENSG00000239704.11

ENST00000225576.7

ENST00000619038.5

upstream

downstream

duplicates(236),low_entropy(2),mismatches(3)

AGACGGTCTCGCCACATTGCCCAGACTGGTCTGAAAGTCTTGGGCTCAAGAGATCCTCCCGCTTCCGCCTTCCAAAGCGCTGGGATAACAGGCGTGAGCCGCTGCCCGGGCCATCCCTCGAGGAAGTTTCATCAG|GAATCTGAACCTGTGATGTTAAGAAATCAGTAAATATTAAAAAGAAGATGGATGCAAGAAGGATGAAGAAAGAAGAAG___GACTCACAGAAAACACTGGACTTCCCCGGAAGCTACTTGAAAAACATGACCCCTGGCCGGCC

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ENSG00000253305.2

ENST00000622527.1

ENST00000520790.1

downstream

upstream

duplicates(212),low_entropy(7),mismatches(3)

ASQSAKTEFNFLNITPELVPAQDLVCDNASWEQNTNHGAAGVPFASDTILK|QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQF

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212

False

PASS

PCDHGB2

PCDHGB7

+/+

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chr5:141494807

CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

164

771

10996

high

in-frame

Cadherin-like(100%),Cadherin_cytoplasmic_C-terminal(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

ENSG00000253910.2

ENSG00000254122.3

ENST00000622527.1

ENST00000398594.4

downstream

upstream

duplicates(212),low_entropy(7),mismatches(3)

ASQSAKTEFNFLNITPELVPAQDLVCDNASWEQNTNHGAAGVPFASDTILK|QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQF

chr5:141362556-chr5:141494807

0.1754010695187166

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212

False

PASS

PCDHGB2

PCDHGC3

+/+

chr5:141362556

chr5:141494807

CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

164

771

10996

high

in-frame

Cadherin-like(100%),Cadherin_cytoplasmic_C-terminal(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

ENSG00000253910.2

ENSG00000240184.7

ENST00000622527.1

ENST00000308177.5

downstream

upstream

duplicates(212),low_entropy(7),mismatches(3)

ASQSAKTEFNFLNITPELVPAQDLVCDNASWEQNTNHGAAGVPFASDTILK|QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQF

chr5:141362556-chr5:141494807

0.1754010695187166

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212

False

PASS

PCDHGB2

PCDHGA9

+/+

chr5:141362556

chr5:141494807

CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

164

771

10996

high

in-frame

Cadherin-like(100%),Cadherin_cytoplasmic_C-terminal(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

ENSG00000253910.2

ENSG00000261934.2

ENST00000622527.1

ENST00000573521.1

downstream

upstream

duplicates(212),low_entropy(7),mismatches(3)

ASQSAKTEFNFLNITPELVPAQDLVCDNASWEQNTNHGAAGVPFASDTILK|QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQF

chr5:141362556-chr5:141494807

0.1754010695187166

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212

False

PASS

PCDHGB2

PCDHGA12

+/+

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chr5:141494807

CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

164

771

10996

high

in-frame

Cadherin-like(100%),Cadherin_cytoplasmic_C-terminal(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

ENSG00000253910.2

ENSG00000253159.3

ENST00000622527.1

ENST00000252085.4

downstream

upstream

duplicates(212),low_entropy(7),mismatches(3)

ASQSAKTEFNFLNITPELVPAQDLVCDNASWEQNTNHGAAGVPFASDTILK|QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQF

chr5:141362556-chr5:141494807

0.1754010695187166

0.004346251358203549

0.08987366043846007

212

False

PASS

PCDHA10

PCDHAC2

+/+

chr5:140858436

chr5:140978949

CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

116

1259

3474

high

in-frame

Cadherin-like(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

ENSG00000250120.8

ENSG00000243232.6

ENST00000562220.2

ENST00000289269.7

downstream

upstream

duplicates(257),low_entropy(5),mismappers(3),mismatches(3)

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10996

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Cadherin-like(100%),Cadherin_cytoplasmic_C-terminal(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

ENSG00000253485.2

ENSG00000253159.3

ENST00000611914.1

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downstream

upstream

duplicates(251),low_entropy(6),mismappers(5),mismatches(2)

VSLTADSRKSHLIFPQPNYADTLLSEESCEKSEPLLMSDKVDANKEERRVQ|QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQAMILA

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ENSG00000248383.5

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ENST00000253807.3

downstream

upstream

duplicates(228),mismatches(6)

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117

False

PASS

PCDHA6

PCDHA13

+/+

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chr5:140978949

CDS

CDS/splice-site

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400

3474

high

in-frame

Cadherin-like(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

ENSG00000081842.18

ENSG00000239389.8

ENST00000378126.4

ENST00000289272.3

downstream

upstream

duplicates(228),mismatches(6)

RVCSGEGPPKMDLMAFSPSLSPCPIMMGKAENQDLNEDHDAK|PRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKY

chr5:140830485-chr5:140978949

0.04875148632580262

0.02702702702702703

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117

False

PASS

PCDHA4

PCDHAC2

+/+

chr5:140809572

chr5:140978949

CDS/splice-site

deletion/read-through

818

3474

high

in-frame

Cadherin-like(100%),Cadherin_domain(100%)|Cadherin_C-terminal_cytoplasmic_tail__catenin-binding_region(100%)

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ENSG00000243232.6

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downstream

upstream

duplicates(200),mismappers(1),mismatches(13)

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10996

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upstream

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10996

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544

10996

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duplicates(153),mismappers(7),mismatches(3)

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544

10996

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ENST00000398587.7

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PCDHGA2

PCDHGA10

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CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

544

10996

high

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ENST00000398610.2

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duplicates(153),mismappers(7),mismatches(3)

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PCDHGA2

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CDS

CDS/splice-site

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544

10996

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in-frame

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ENSG00000253305.2

ENST00000528330.2

ENST00000520790.1

downstream

upstream

duplicates(153),mismappers(7),mismatches(3)

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PCDHGA2

PCDHGB7

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CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

544

10996

high

in-frame

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ENSG00000081853.15

ENSG00000254122.3

ENST00000528330.2

ENST00000398594.4

downstream

upstream

duplicates(153),mismappers(7),mismatches(3)

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False

PASS

PCDHGA2

PCDHGC3

+/+

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CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

544

10996

high

in-frame

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ENSG00000081853.15

ENSG00000240184.7

ENST00000528330.2

ENST00000308177.5

downstream

upstream

duplicates(153),mismappers(7),mismatches(3)

VSLTADSRKSHLIFPQPNYADTLISQESCEKKDFLSAPQSLLEEEREETFSQ|QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEM

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False

PASS

PCDHGA2

PCDHGA9

+/+

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CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

544

10996

high

in-frame

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ENST00000573521.1

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False

PASS

PCDHGA2

PCDHGA12

+/+

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CDS

CDS/splice-site

deletion/read-through

544

10996

high

in-frame

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ENSG00000081853.15

ENSG00000253159.3

ENST00000528330.2

ENST00000252085.4

downstream

upstream

duplicates(153),mismappers(7),mismatches(3)

VSLTADSRKSHLIFPQPNYADTLISQESCEKKDFLSAPQSLLEEEREETFSQ|QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEM

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False

PASS

IRX5

DLG2

+/+

-/-

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CDS

CDS/splice-site

translocation

3936

592

high

out-of-frame

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ENSG00000176842.15

ENSG00000150672.18

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ENST00000376104.7

downstream

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+/+

-/-

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614

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out-of-frame

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downstream

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-/-

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5'UTR/splice-site

deletion

1875

146

high

out-of-frame

Glycosyl_hydrolase_family_47(100%),PA_domain(100%)|Protein_kinase_domain(100%)

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ENSG00000070759.17

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upstream

downstream

duplicates(14)

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False

PASS

GUSBP13

NAIP

+/+

-/-

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exon

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inversion

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1216

high

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ENSG00000249437.8

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downstream

duplicates(8),mismatches(6),multimappers(1)

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False

PASS

58 rows