#gene1 gene2 strand1(gene/fusion) strand2(gene/fusion) breakpoint1 breakpoint2 site1 site2 type split_reads1 split_reads2 discordant_mates coverage1 coverage2 confidence reading_frame tags retained_protein_domains closest_genomic_breakpoint1 closest_genomic_breakpoint2 gene_id1 gene_id2 transcript_id1 transcript_id2 direction1 direction2 filters fusion_transcript peptide_sequence read_identifiers breakpoint_ID vaf1 vaf2 vaf_avg total_reads blacklisted aih_curated_reason FILTER filter_reason TVP23C CDRT4 -/- -/- chr17:15503098 chr17:15440285 CDS 5'UTR/splice-site deletion/read-through 15 20 0 633 380 high out-of-frame . Eukaryotic_protein_of_unknown_function_(DUF846)(100%)|CMT1A_duplicated_region_transcript_4_protein(100%) . . ENSG00000175106.17 ENSG00000239704.11 ENST00000225576.7 ENST00000619038.5 upstream downstream duplicates(138),mismappers(1),mismatches(1) CTGGTCTGAAAGTCTTGGGCTCAAGAGATCCTCCCGCTTCCGCCTTCCAAAGCGCTGGGATAACAGGCGTGAGCCGCTGCCCGGGCCATCCCTCGAGGAAGTTTCATCAG|GAATCTGAACCTGTGATGTTAAGAAATCAGTAAATATTAAAAAGAAGATGGATGCAAGAAGGATGAAGAAAGAAGAAG___GACTCACAGAAAACACTGGACTTCCCCGGAAGCTACTTGAAAAACATGACCCCTGGCC GLKVLGSRDPPASAFQSAGITGVSRCPGHPSRKFHQ|esepvmlrnq* LH00995:36:23WHYVLT4:1:1113:25068:16680,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1151:14389:2892,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1156:33684:10921,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1347:9972:26657,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1379:1259:7053,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1379:1267:7067,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1484:43222:11747,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2119:50106:1701,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2161:51457:21304,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2216:41725:3550,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2268:26435:22467,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2276:37292:8987,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2278:22066:2373,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2334:4891:2275,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2383:27543:13765,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2422:44888:7656,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2440:47016:26614,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2459:51061:21486,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2488:18450:23770,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1130:41288:5120,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1141:14446:2121,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1141:14454:2135,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1152:17172:28226,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1152:17180:28240,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1225:15125:14536,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1257:3476:8455,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1287:29412:10640,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1342:47404:11565,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1379:15756:25522,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1390:22633:7278,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1390:22641:7292,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1390:22649:7278,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1425:47420:23364,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1425:47437:23364,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2177:10498:26699,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2217:2998:4377,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2222:35787:28576,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2275:3977:1869,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2296:8257:29683,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2302:23361:1813,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2319:8888:6451,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2319:8904:6451,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2342:12197:3802,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2350:10627:13191,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2415:42494:24415,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2435:38805:12784,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2453:5983:15321,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2454:4123:5680,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2464:17843:10612,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1124:20950:2794,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1145:1032:20253,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1145:32786:16119,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1219:36321:29025,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1245:38020:1308,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1276:32470:4951,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1313:16962:25255,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1372:1162:4699,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1375:25828:27329,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1416:51959:22509,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2102:28506:3943,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2166:1008:22621,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2178:17018:8174,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2190:21460:25956,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2202:45859:26152,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2220:35188:6185,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2220:35205:6185,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2248:17431:14017,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2309:38934:26376,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2365:9705:24877,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2414:15222:6689,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2432:41490:24190,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2432:41507:24190,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1160:32697:19328,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1279:40390:23938,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1363:6396:11299,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1384:20537:26096,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1474:20699:24751,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2129:10724:4839,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2151:10668:12784,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2160:27843:23644,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2175:6105:13513,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2225:7965:14578,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2244:26354:16778,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2271:44411:3859,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2355:17277:15713,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2396:28652:14984,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1215:1057:14438,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1279:22956:24344,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1280:37203:18333,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1298:19769:16554,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1298:19777:16540,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1454:12407:17703,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1454:12415:17717,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2110:17884:7600,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2155:25027:28436,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2166:37470:9379,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2175:45900:28436,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2206:37041:4153,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1118:25553:15307,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1214:8370:4181,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1415:43820:18866,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1420:28902:26236,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1467:8524:9632,LH00995:36:23WHYVLT4:1:1493:4471:27329,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2134:31685:7263,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2293:17350:2051,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2348:40673:14592,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2353:2642:8300,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2383:39832:12938,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2436:17552:3915,LH00995:36:23WHYVLT4:1:2498:36556:28955,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1135:11404:28072,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1194:29865:5120,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1227:49686:14200,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1287:2650:13359,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1316:27236:10851,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1379:8823:16624,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1426:18863:13303,LH00995:36:23WHYVLT4:2:1474:18434:1294,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2109:43108:9898,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2109:43125:9898,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2147:38877:26250,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2222:15190:24288,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2239:35868:12294,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2239:35876:12280,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2239:35884:12266,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2302:4414:21570,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2426:32850:16876,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2426:45891:17324,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2426:50527:16554,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2446:36507:29235,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2456:45972:7712,LH00995:36:23WHYVLT4:2:2495:39751:27091,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1166:3031:29543,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1372:15352:28016,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1372:15360:28002,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1381:49305:23462,LH00995:36:23WHYVLT4:3:1448:43748:15405,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2241:14858:26208,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2245:47372:27820,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2280:46555:22004,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2282:38012:6787,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2282:38012:6815,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2366:3451:23574,LH00995:36:23WHYVLT4:3:2386:22479:19202,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1120:33417:28618,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1136:41749:4769,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1180:14591:16442,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1204:11137:1462,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1234:15093:13919,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1292:16023:15839,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1346:18070:10472,LH00995:36:23WHYVLT4:4:1431:50203:27539,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2113:19389:16932,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2115:19761:29487,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2122:21541:1687,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2202:47153:9477,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2310:28336:15363,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2323:37745:2794,LH00995:36:23WHYVLT4:4:2484:42340:12714,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1142:12375:27259,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1142:12391:27259,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1281:29598:4994,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1303:6817:4545,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1342:19599:11215,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1350:41782:12924,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1432:45592:12126,LH00995:36:23WHYVLT4:5:1434:24833:16189,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2151:27066:14592,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2177:35617:18361,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2203:29784:12378,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2218:13952:26264,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2233:2335:11495,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2233:2343:11481,LH00995:36:23WHYVLT4:5:2236:29889:5386 chr17:15503098-chr17:15440285 0.023148148148148147 0.05 0.03657407407407408 35 False PASS