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Filename
659_bCu-T1-TRNA-1_B23WHTKLT4_1.arriba.fusions.tsv
Full Path
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Size
131.3 KB
Task
NFCORE_RNAFUSION:RNAFUSION:ARRIBA_WORKFLOW:ARRIBA (659_bCu-T1-TRNA-1_B23WHTKLT4_1)
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TNS1 ALK -/- -/- chr2:217880898 chr2:29223528 CDS/splice-site CDS/splice-site deletion 5 4 0 6488 30615 high in-frame . C2_domain_of_PTEN_tumour-suppressor_protein(100%)|Protein_kinase_domain(100%) . . 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CCDC82 ARRB1 -/- -/- chr11:96389844 chr11:75287375 5'UTR/splice-site CDS/splice-site deletion 0 2 0 0 1119 medium . . |Arrestin_(or_S-antigen)__C-terminal_domain(100%),Arrestin_(or_S-antigen)__N-terminal_domain(100%) . . ENSG00000149231.16 ENSG00000137486.17 ENST00000679696.1 ENST00000420843.7 upstream downstream duplicates(26) CCGGGGCAGGGGCGGAGGCGGAGGCAGAGGTGGAGGCGCTTTGAAAG|CTCACCGTCTAtCTGGGAAAGCGGGACTTTGTGGACCACATCGACCTCGTGGACCCTGTGG___ATGGTGTGGTCCTGGTGGATCCTGAGTATCTCAAAGAGCGGAGAG___TCTATGTGACGCTGACCTGCGCCTTCCGCTATGGCCGGGAGGACCTGGATGTCCTGGGCCTGACCTTTCGCAAGGACCTGTTTGTGGCCAACGTACAGTCGTTCCCACCGGCCCCCG . LH00995:42:23WHTKLT4:2:1275:26848:21444,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1275:26856:21430,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1424:29752:15965,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2269:40779:4321,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2308:32964:9898,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1369:17002:23532,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2271:27891:12014,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2319:41207:25241,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2330:40965:10332,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2416:27665:14003,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2437:34468:18025,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1249:19138:13835,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1251:42405:15068,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2414:22390:19861,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1292:45293:20351,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1172:49734:20085,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1340:23142:24779,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1340:23150:24765,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2218:22050:12574,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2392:16258:20561,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1114:45244:8104,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1167:42987:7558,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1167:42995:7572,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1441:31726:29473,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2130:6736:18249,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2365:43060:29431,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1433:27511:13905,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2211:49475:6885
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