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Filename
659_bua-T1-TRNA-1_B23WHTKLT4_1.arriba.fusions.tsv
Full Path
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Size
256.5 KB
Task
NFCORE_RNAFUSION:RNAFUSION:ARRIBA_WORKFLOW:ARRIBA (659_bua-T1-TRNA-1_B23WHTKLT4_1)
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TPM3 NTRK1 -/- +/+ chr1:154169305 chr1:156874571 CDS/splice-site CDS/splice-site inversion 7 4 5 3792 11054 high out-of-frame . Tropomyosin(85%)|Protein_kinase_domain(100%),Tyrosine_kinase_receptor_A_trans-membrane_domain(100%) . . 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AVL9 SEPTIN7(3831),RNU6-1085P(19222) +/+ ./+ chr7:32559464 chr7:35910936 CDS/splice-site intergenic deletion 43 27 9 894 61 high out-of-frame . Transport_protein_Avl9(77%)| . . ENSG00000105778.19 . ENST00000318709.9 . downstream upstream duplicates(190),mismatches(37) TGGGAAACTTTGGATCCTAGTGTCTTAGAGGACCCCAACTTGAAAGAAAGGGAACAGCTGGGATCAGACCAGACAAATTTGTTTCCAAAGGACTCTGTCCCCTCAGAGAGTCTTCCAATTACTGTACAACCTCAAGCTAATACGGGACAGGTAGTCCTGATACCAGGGCTCATTTCGGGTTTGGAAGAGGATCAGTATGGCATGCCCCTGGCCATCTTCACAAAG|GCCAGAACCAGCAGTCGATTTGcATACCATCAAGACACCTGAAACCTTATCATGAACCAGATGCCAAGGAAGAGATTCTGaAAGGATCCTGAGGACCCCCCTGGTTGCAGCCATGTCAAGACTtATGCTGAGGAGGACCCCAACTGTCACGAGCAACACC WETLDPSVLEDPNLKEREQLGSDQTNLFPKDSVPSESLPITVQPQANTGQVVLIPGLISGLEEDQYGMPLAIFTK|artssrfayhqdt* 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PKD1P3 AC138969.3 +/+ -/+ chr16:14932796 chr16:16351593 intron exon deletion/5'-5' 1 4 0 351 154 medium . . . . . ENSG00000183458.14 ENSG00000277920.1 ENST00000534164.6 . downstream upstream duplicates(28),mismappers(5),mismatches(3),multimappers(1) CGTGGGCATCATGCTGTATGGGGTGGACAGCCGGAGCGGCCACCGGCACCTGGACGGCGACAGAGCCTTCCACCGCAACAGTCTGGACATCTTCCAGATCGCCACCCCGCACAGCCTGGGTAGCGTGTGGAAGATCCGAGTGTGGCACGACAACAAAGGTCTGTATGGACCCTGCCAAGCTCTGCCCCTCTGCCCCTGCATTGGGGCGCCCTG|TCTTGGGGCTGCAGCCGGCCTCCTCAGCTCGAGTGTAACAACAGTCGTGGCCATGGCAGCACCTGCGGATGTCACATGGGCAGGACAGCAG___AGACGTCTCCCACAACCTGCTCCGGGCGCTGGACGTTGGGCTCCTG . LH00995:42:23WHTKLT4:1:1392:20610:19188,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2138:22212:17955,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2456:34638:7362,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2412:14235:16638,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1457:41976:19146,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1457:41992:19146,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2315:9284:25157,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1468:6428:22173,LH00995:42:23WHTKLT4:1:1371:46547:29053,LH00995:42:23WHTKLT4:1:1398:47962:28702,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2417:17673:17492,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1102:22989:4671,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1119:2820:10991,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1179:38562:15447,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1219:14324:7320,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1219:14324:7320,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1450:10109:6128,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1340:31103:10010,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1358:15967:20701,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2293:37170:10542,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2308:47032:29389,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2350:24882:27820,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2358:17204:28590,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2131:16096:1757,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1488:9009:11902,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2123:35698:19622,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2394:36272:7474,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2396:23167:27539,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2487:28377:5848,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2487:28377:5848,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1436:13062:4545,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1436:13070:4559,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2259:36054:7067,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1244:42510:11047,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1406:10336:12490,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1406:10336:12490,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2147:6267:15082,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2147:6267:15082,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2355:19558:17450,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1129:13232:24204,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1129:13240:24190,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1129:13248:24204
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TLK2P1 AC110079.1 -/- +/+ chr17:34039043 chr4:118595912 exon exon/splice-site translocation 4 0 0 497 155 medium . . . . . ENSG00000226049.3 ENSG00000260404.3 ENST00000530992.1 ENST00000567913.2 upstream upstream duplicates(26),mismatches(3) ATTAAGAGCCAaCTGTGATTTGAGACGGCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACaATTAAATAGATGTGTGACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAA|GATGATGATTATTCCCCACCTTCTAAGAGACAAAGACCAACGAGCCACCACAGCCACCgGTCCCAGAACCCGCCAATGCTGGGGAAcGGAAAATGAGGGAGTTCAACTCTG___GCCCTCACAATCCAGTGGAGGAG . LH00995:42:23WHTKLT4:2:1398:35326:10318,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1424:39597:26460,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1395:51991:16119,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2363:1599:21766,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2354:39638:4671,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1370:40512:14368,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1120:9883:10949,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2266:7699:14452,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2126:31621:13485,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2359:2286:3396,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1168:6501:25718,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1180:41062:5540,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1330:17673:15727,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1398:39945:2822,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1476:46433:10500,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2110:25165:11243,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1202:42599:17310,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1210:1591:24218,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1347:17439:26671,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2226:43311:20645,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1485:44953:12252,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1485:44969:12252,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2121:1113:1673,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2124:34201:22495,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2391:45616:21220,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1174:50203:16890,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1265:7998:8497,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2151:30658:22579,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2203:39986:11579,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2428:27988:28969,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1169:15967:18712,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1323:2092:15335,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1445:38085:2485
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AC242842.2 SEC22B2P +/+ +/+ chr1:149607554 chr1:149351251 exon/splice-site exon/splice-site duplication 0 4 0 1041 134 medium . . . . . ENSG00000284964.1 ENSG00000274423.1 ENST00000643225.1 ENST00000618702.1 downstream upstream duplicates(4) GTTCAAGGCAAGACCGAATTCAGAAGGATATCGACGTCGTGATCCAGAAGTCCAGAGCTGAGGACTGCCTGTTTGCAG|CTACATTATTGAGCAGGGGGTGTGTGATTTGGTTTTATGTGAAGCTGCCTTCCCTAAGACGTTGGCTTTTGCCTACCTAGAAGATTTGCACTCAGAATTTGATGAACAGCATGGAAAGAAGGTGCCCACTGTGTCCCGACCCTATTCCTTTATTGAATTTG___ATACTTTCATTCAGAAAACCAAGAAGCTCTACATTGACAGTTGTGCTCGAAGAAACCTAGGCTCCA . LH00995:42:23WHTKLT4:2:1345:24145:9365,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2295:41046:18627,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1402:24065:19678,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1182:18936:11663,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1184:15772:13527,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2276:18733:12630,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1276:24429:10080,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2405:35245:1462
ROPN1B(6968),SLC41A3(15935) ROPN1B ./- +/+ chr3:125990422 chr3:125972043 intergenic 5'UTR/splice-site inversion 1 3 0 10 23 medium . . . . . . ENSG00000114547.10 . ENST00000251776.8 upstream upstream duplicates(22) CTCCTGCTCTAGGCCCAGCGCCTTGGACGTGCACAGTAGATCCCTCCCGGCTTCCCGGCTTCCCGTCTCGTCACCCTCTG|GTCAACCAATCAATGGCTCAGACAGATAAGCCAACATGCATCCCGCCGGAGCTGCCGAAAATGCTGAAGGAGTTTGCCA...GTGGGGGGCCGA___TTATTTTGAGGCCCTGTCCCGTGGAGAGACGCCTCCGGTGAGAGAGCGGTCTGAGCGAGTCGCTTTGTGTAACTGGGCAGAGCTAACACCTGAGCTGTTAAAGATCCTGCATTCTCAG___GTTGCTGGCAGACTGATCATC . LH00995:42:23WHTKLT4:1:2346:2278:10725,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1216:16347:11495,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1444:3354:13877,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1435:14696:14970,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2165:17795:8230,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2176:11970:24625,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2203:20740:28856,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2346:33409:20925,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2335:31071:28534,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2445:10384:2401,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1207:22236:2415,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1253:43149:5120,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1350:15481:4279,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1276:47890:8455,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1222:18871:4629,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1478:35407:25732,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1363:33489:1532,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2107:40698:10851,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2213:13167:1981,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2241:40633:1518,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2411:50365:27175,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1488:16468:4503,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2331:41159:24120,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2446:49030:8300,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2458:27260:13891,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1313:37397:21192
GSK3B RANBP1 -/- +/+ chr3:119967777 chr22:20126952 intron CDS/splice-site translocation 0 3 0 0 3215 medium . . Protein_kinase_domain(13%)| . . ENSG00000082701.17 ENSG00000099901.17 . ENST00000430524.6 upstream upstream duplicates(5) GGGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAAAG|CAGGATCAGGCAAAAATGATCATGCCGAAAAAGTGGCGGAAAAGCTAGAAGCTCTCTCGGTGAAGGAGGAGACCAAGGAGG . LH00995:42:23WHTKLT4:1:2274:19534:5694,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2313:41312:12756,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1443:8232:28268,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1202:21403:2485,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1417:15724:2345,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2139:37543:18193,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1187:10215:26320,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1448:11695:28688
AC026371.1(84110),IPO8(52576) NCL ./+ -/- chr12:30576412 chr2:231460562 intergenic CDS/splice-site translocation 0 2 0 0 4831 medium . . |RNA_recognition_motif._(a.k.a._RRM__RBD__or_RNP_domain)(100%) . . . ENSG00000115053.17 . ENST00000322723.9 downstream downstream duplicates(1),mismappers(1) AGAGAGAGAGAGAGAGGAGGAAGAG|CCTGTCAAAGAAGCACCTGGAAAACGAAAGAAGGAAATGGCCAAACAGAAAGCAGCTCCTGAAGCCAAGAAACAGAAAGTGGAAG___GCACAGAACC . LH00995:42:23WHTKLT4:1:1124:32316:20968,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1412:10336:26895,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1268:38853:7964,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2419:8572:5820
ANOS1 ANOS1 -/- -/- chrX:8699698 chrX:8699745 CDS/splice-site CDS/splice-site duplication/non-canonical_splicing 18 38 0 706 666 low in-frame . Anosmin_cysteine_rich_domain(51%)|Anosmin_cysteine_rich_domain(68%),Fibronectin_type_III_domain(100%),WAP-type_(Whey_Acidic_Protein)_'four-disulfide_core'(100%) . . 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PCNX2 MAP3K21 -/+ +/+ chr1:233295703 chr1:233346442 5'UTR CDS/splice-site deletion/read-through/3'-3' 1 3 0 35 43 low . . |Protein_kinase_domain(47%) . . ENSG00000135749.19 ENSG00000143674.11 . ENST00000366624.8 downstream upstream duplicates(9) CCCCGCCGTCGCCGCCGCCGTCGCCCCCGCCGCCTCCTTCCACCCCACGTTTGAAGCTGGAGCTGCTCTTCCGCCCGGACCCGCGAACCGCGGCGCCGGAGCCGGCTGCTGCGGCCGGGCAG|TTTTGCTACTTGAGAAGATAGAACATGATGACATCTGCAATAAAACTTTGAAGATTACAGATTTTGGGTTGGCGAGGGAATGGCACAGGACCACCAAAATGAGCACAGCAGGCACCTATGCCTGGATGGCCCCCGAAGTGATCAAGTCTTCCTTGTTTTCTAAGGGAAGCGACATCTGGAG___CTATGGAGTGCTGCTGTGGGAACTGCTCACCGG . LH00995:42:23WHTKLT4:2:1213:9559:4979,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1372:14122:16610,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2140:39581:28114,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2471:42833:27413,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1494:16282:21472,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1340:16500:17535,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1255:17722:22453,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1281:20125:5036,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2411:32041:14270,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2457:9575:4895,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2491:51724:7558,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1335:39735:1589,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1418:44370:25620
AL133380.1 MAP3K21 -/+ +/+ chr1:233295703 chr1:233346442 exon CDS/splice-site deletion/read-through/3'-3' 1 3 0 35 43 low . . |Protein_kinase_domain(47%) . . ENSG00000251508.1 ENSG00000143674.11 . ENST00000366624.8 downstream upstream duplicates(9) CCCCGCCGTCGCCGCCGCCGTCGCCCCCGCCGCCTCCTTCCACCCCACGTTTGAAGCTGGAGCTGCTCTTCCGCCCGGACCCGCGAACCGCGGCGCCGGAGCCGGCTGCTGCGGCCGGGCAG|TTTTGCTACTTGAGAAGATAGAACATGATGACATCTGCAATAAAACTTTGAAGATTACAGATTTTGGGTTGGCGAGGGAATGGCACAGGACCACCAAAATGAGCACAGCAGGCACCTATGCCTGGATGGCCCCCGAAGTGATCAAGTCTTCCTTGTTTTCTAAGGGAAGCGACATCTGGAG___CTATGGAGTGCTGCTGTGGGAACTGCTCACCGG . LH00995:42:23WHTKLT4:2:1213:9559:4979,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1372:14122:16610,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2140:39581:28114,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2471:42833:27413,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1494:16282:21472,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1340:16500:17535,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1255:17722:22453,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1281:20125:5036,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2411:32041:14270,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2457:9575:4895,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2491:51724:7558,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1335:39735:1589,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1418:44370:25620
SREBF1 SIM1 -/- -/+ chr17:17836736 chr6:100457997 CDS intron translocation/5'-5' 3 0 0 3061 3 low out-of-frame . . . . ENSG00000072310.17 ENSG00000112246.10 ENST00000261646.10 . upstream upstream duplicates(4) ATGGACGAGCCACCCTTCAGCGAGGCGGCTTTGGAGCAGGCGCTGGGCGAGCCGTGCGATCTGGACGCGGCGCTGCTGACCG|TCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC MDEPPFSEAALEQALGEPCDLDAALLT|vslflslslslslslslsls LH00995:42:23WHTKLT4:1:1238:25755:25045,LH00995:42:23WHTKLT4:1:1464:16840:3270,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2220:32470:23195,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2459:12860:24373,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1402:42316:4181,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2143:35075:12266,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1337:38594:28142
SPATA13 SPATA13 +/+ +/+ chr13:23983933 chr13:24222819 exon/splice-site 5'UTR/splice-site deletion/read-through 0 3 0 2 187 low . . |PH_domain(100%),RhoGEF_domain(100%),SH3_domain(100%) . . ENSG00000228741.2 ENSG00000182957.16 ENST00000439928.2 ENST00000382108.8 downstream upstream duplicates(3) ATTCGCTGCCTGTGCAGCACCACAGGCCTGATGAAAATGAAATGGCAACACCGTGCAGATGGCAAAGCGTAGGCCTCACAAACATCCTGGCCGTGAAG|CCCGTGGCCACCCAGGAGCCCGATGTGCAAGGCAGGTGTGAGTGCCAGGACGGCATTCCTGGAGATGAAGGCCTGGAGCTGCGGTCTGCGGACTCGGCAGTGCCCGTGGCCATGACCCAGGCTGCCGTGCGGCCCTGGGCACCCTGCCTGGAGAACATGACCACTGCCCCAAACGGCCTCGGGCCAGGCCCCGCAGCCCCCTGTGCAGGCTCGGACCTGAAAGACGCCAAGATGGTGACCTCCCTTGCGTGTGGAAATGGAGTCTGTGGCTGCAGCCCTGGTGGCGACAC . LH00995:42:23WHTKLT4:2:1282:28692:19875,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2462:16921:18964,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2321:16225:13387,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1132:31071:20491,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1188:13426:10136,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2393:26969:6885
SPATA13 SPATA13 +/+ +/+ chr13:24017701 chr13:24249477 exon/splice-site CDS/splice-site deletion/read-through 0 1 0 0 530 low . . |PH_domain(100%),RhoGEF_domain(100%),SH3_domain(100%) . . ENSG00000228741.2 ENSG00000182957.16 ENST00000439928.2 ENST00000382108.8 downstream upstream duplicates(3) AGAGCTTGTCTTCAAGAGTAGCTGGTGCAGAAACTCG|GTCGTCCCTGATGGCCCCTGGAGGCGAAGCTCATCACAGGATGAGGAAAGGACAGAGGCACAGAGAACCC . LH00995:42:23WHTKLT4:1:2207:33667:14172,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2444:5377:8945,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1384:35625:17927,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1365:32235:29319
HOXC6 HOXC4 +/+ +/+ chr12:54017414 chr12:54053160 5'UTR/splice-site exon/splice-site deletion/read-through 0 3 0 288 11 low . . |Homeodomain(100%) . . ENSG00000197757.8 ENSG00000198353.8 ENST00000394331.3 ENST00000507650.1 downstream upstream duplicates(5) GGGAAGACGAGAAAGAGAGTGGGAGAGAGAGAGGCAGAGAGGGAGAGAGGGAGAGTGACAGCAGCGCTCG|CGGGGGCTCAACCCCCAGACCTCCAGAAATGACGTCAGAATCATTTGCATCCCGCTGCCTCTACCTGCCTGGTCCAGCTGGGACCCTGCCTCGCCGGCCGCATGGCCAGAGGGTTGG___AATATTCGCAAAATAGCTACATCCCTGAACACAGTCCGGAATATTACGGCCGGACCAGGGAATCGGGATTCCAGCATCACCACCAGGAGCTGTACCCACCACCGCCTCCGCGC . LH00995:42:23WHTKLT4:3:1486:20877:1266,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2496:27754:17464,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1311:25683:11635,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1454:26281:16343,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2409:41102:20771,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1224:50211:25395,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2457:38368:21752,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2132:32365:26348
STX16 NPEPL1 +/+ +/+ chr20:58673711 chr20:58691724 CDS/splice-site 5'UTR/splice-site deletion/read-through 2 1 0 1510 315 low . . SNARE_domain(49%),Syntaxin(100%)|Cytosol_aminopeptidase_family__catalytic_domain(100%),M17_aminopeptidase_N-terminal_domain_2(100%) . . ENSG00000124222.22 ENSG00000215440.12 ENST00000438253.1 ENST00000525967.5 downstream upstream duplicates(5) AACACTCTTTACCATCGG___GGTACAGTCCTTGACAGAATTGACTATAACGTTGAACAGTCCTGTATCAAAACTGAAGATGGTTTGAAACAGCTTCACAAG|GCTGGTTATGAAGAAGAAACTCAAAATAACAGGAGTGGCTTATGGAACTACATGGAGGTAACAGAGGAG . LH00995:42:23WHTKLT4:1:1253:20359:22285,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1410:49702:1168,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1465:5336:24737,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2216:24793:1406,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2319:15635:23490,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1282:31685:5498,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1147:6736:7460,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2219:36879:11523
STX16 NPEPL1 +/+ +/+ chr20:58671297 chr20:58691724 CDS/splice-site 5'UTR/splice-site deletion/read-through 1 0 0 1839 315 low stop-codon . Syntaxin(99%)|Cytosol_aminopeptidase_family__catalytic_domain(100%),M17_aminopeptidase_N-terminal_domain_2(100%) . . ENSG00000124222.22 ENSG00000215440.12 ENST00000361830.7 ENST00000525967.5 downstream upstream duplicates(1) GTTCTGGTGGAGCAGAACACACTGATGGT-GAAGAGCGGGAACGAGAGATTCGCCAGATTGTACAGTCCATTTCTGACCTGAATGAAATATTCAGGGACTTAGGGGCGATGATTGTAGAACAG|GCTGGTTATGAAGAAGAAACTCAAAATAACAGGAGTGGCTTATGGAACTACATGGAGG . LH00995:42:23WHTKLT4:3:2224:43327:11341,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2224:43335:11327
RBM14 RBM4 +/+ +/+ chr11:66617057 chr11:66646027 CDS/splice-site CDS/splice-site deletion/read-through 1 2 0 2938 3659 low in-frame . RNA_recognition_motif._(a.k.a._RRM__RBD__or_RNP_domain)(72%)|RNA_recognition_motif._(a.k.a._RRM__RBD__or_RNP_domain)(2%) . . ENSG00000239306.5 ENSG00000173933.21 ENST00000310137.5 ENST00000398692.8 downstream upstream duplicates(29) GTGGGCAATGTGTCGGCTGCATGCACGAGCCAGGAACTGCGCAGCCTCTTCGAGCGCCGCGGACGCGTCATCGAGTGTGACGTGGTGAAAG|GTGGGATGTGTGTGGGCTGAAATTCCGAGCTGCGGTTGTGCATGAGAATACACCCTTCGTGGTACCCCATCTCCGGGACGTTCTCGGCTCTGTGCGTTCAGTCCCTCAGGAACCGTGGACCTTAATTTACCTTGCTAAGTTCAGACCTTCTCTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTCTCCTGCCCATTTTCCTGTTCTTC VGNVSAACTSQELRSLFERRGRVIECDVVK|gGMCVG* LH00995:42:23WHTKLT4:1:2333:41531:23924,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1241:44880:15433,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1250:25391:4713,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2194:2149:25942,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2425:18693:6283,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2448:50414:1757,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2473:43958:21374,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1239:10570:12981,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2386:28004:1448,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2481:6493:11495,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2490:13337:3676,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1314:30585:11075,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2396:25715:19566,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1229:14437:6058,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1264:40309:13121,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2102:50681:19678,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1446:24841:23238,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2190:12059:24387,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1162:4131:16932,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1305:4220:24373,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2317:44759:20211,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2370:26208:18459,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2427:20376:21584,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2271:33368:29571,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1293:6291:19664,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1305:44532:4685,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1466:28733:12966,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2115:11477:7067,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1410:42494:19146,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2442:50195:8132,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1232:52169:28618,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1280:32454:6128
RBM14 RBM4 +/+ +/+ chr11:66617057 chr11:66665856 CDS/splice-site CDS/splice-site deletion/read-through 1 0 0 2938 893 low in-frame . RNA_recognition_motif._(a.k.a._RRM__RBD__or_RNP_domain)(72%)|RNA_recognition_motif._(a.k.a._RRM__RBD__or_RNP_domain)(1%) . . ENSG00000239306.5 ENSG00000173933.21 ENST00000310137.5 ENST00000396053.9 downstream upstream duplicates(10) GCACGAGCCAGGAACTGCGCAGCCTCTTCGAGCGCCGCGGACGCGTCATCGAGTGTGACGTGGTGAAAG|GCAAGATAACCCCTGTGACAGAAGGCTACTGTTGCTGTAACAAAGGGC TSQELRSLFERRGRVIECDVVK|gKITPVTEGYCCCNKG LH00995:42:23WHTKLT4:1:1325:20966:10080,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2450:49330:29389,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1229:1340:13975,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1275:31006:9477,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1449:19478:3859,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1179:27940:12238,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2472:38238:28590,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2121:25974:14942,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1161:24963:24316,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1161:24971:24302,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1171:25836:19580
RBM14 RBM4 +/+ +/+ chr11:66617057 chr11:66639700 CDS/splice-site 5'UTR/splice-site deletion/read-through 0 0 0 2938 3170 low out-of-frame . RNA_recognition_motif._(a.k.a._RRM__RBD__or_RNP_domain)(72%)|RNA_recognition_motif._(a.k.a._RRM__RBD__or_RNP_domain)(100%),Zinc_knuckle(100%) . . 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FIGNL2-DT ANKRD33 +/+ +/+ chr12:51850310 chr12:51888568 exon/splice-site CDS/splice-site deletion/read-through 1 2 0 13 497 low . . |Ankyrin_repeats_(3_copies)(100%) . . ENSG00000259887.1 ENSG00000167612.13 ENST00000562996.1 ENST00000301190.11 downstream upstream duplicates(1) CCGCCCGCGGCCCCGTACCTtGGCATCACGGCCGGGTCCTAG___CCCACATTTGGAAGCAACCGGCACCCACGCAGGTTCTGGAACTTGCCAAG|ATGCCAGCTGCATGAGAAAAGGGACTCACCTTCTGGTTCCCTGCCTGGAAGAGGAAGAGCTGGCATTGCACAGGAGACGGCTGGACATGTCTGAGGCACTGCCCTG . LH00995:42:23WHTKLT4:5:1305:45633:22088,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1338:42712:18571,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1291:20068:8132,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2204:20473:12616
FIGNL2-DT ANKRD33 +/+ +/+ chr12:51850310 chr12:51890584 exon/splice-site CDS/splice-site deletion/read-through 2 0 0 13 706 low . . |Ankyrin_repeats_(3_copies)(5%) . . ENSG00000259887.1 ENSG00000167612.13 ENST00000562996.1 ENST00000301190.11 downstream upstream duplicates(7) CCCGGGCCGGCGGACAAAGCTCCGGACACCCTGACCGAACGGTCACCTCCCCCCGCCCCATCCCGGCCCGCCCGCGGCCCCGTACCTCGGCATCACGGCCGGGTCCTAG___CCCACATTTGGAAGCAACCGGCACCCACGCAGGTTCTGGAACTTGCCAAG|GTGCTGACCTGACAGCAGTGGACCCTGTTCGGGGCAAGACGGCCCTGGAATGGGCAGTGCTGACC . LH00995:42:23WHTKLT4:1:2370:9996:4727,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1449:20351:15405,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2115:20181:12168,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2326:13879:26446,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1381:41458:14746,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1150:17827:2738,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1170:8653:19496,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2151:49079:7207,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2390:26540:8973
DNAJB11 ASXL1 +/+ +/+ chr3:186577800 chr20:32428128 CDS/splice-site CDS/splice-site translocation 1 1 0 3989 1933 low in-frame . DnaJ_C_terminal_domain(9%),DnaJ_domain(100%)|Asx_homology_domain(100%),PHD_domain_of_transcriptional_enhancer__Asx(100%) . . ENSG00000090520.12 ENSG00000171456.20 ENST00000439351.5 ENST00000375687.10 downstream upstream duplicates(12) TGGGGATTTTGGTTTCATGTTTGGAGGAACCCCTCGTCAGCAAGACAGAAATATTCCAAGAGGAAGTGATATTATTGTAGATCTAGAAGTCACTTTGGAAGAAGTATATGCAGGAAATTTTGTGGAA|AAGGATGCCCTGCAGTGGTCTCGCCATCCAGCTACAGTGGAGGGAGAGGAGCCAGAGGACACGGCTGATGTGGAGAGCTGTGGGTCTAATGAAGCCAGCACTGTGAGTGGTGAAAACGATG___TATCTCTTGATGAAACATCTTCGAACGCATCCTGTTCTACAGAATCTCAGAGTCGACCTCTTTCCAATCCC GDFGFMFGGTPRQQDRNIPRGSDIIVDLEVTLEEVYAGNFVE|KDALQWSRHPATVEGEEPEDTADVESCGSNEASTVSGENDVSLDETSSNASCSTESQSRPLSN LH00995:42:23WHTKLT4:2:1195:2756:27357,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1389:1097:20057,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1106:32980:21052,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1111:11064:21962,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1481:6016:29361,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1446:38392:26642,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2259:32753:21864,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2259:32761:21878,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1447:19745:20071,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2260:4179:2163,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1170:13677:18557,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1215:33489:11789,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1367:8677:4797,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1484:36159:27063
ELMO1 HSPH1 -/- -/- chr7:37096619 chr13:31158863 CDS/splice-site CDS/splice-site translocation 1 0 1 868 5433 low out-of-frame . ELMO/CED-12_family(73%),ELMO__armadillo-like_helical_domain(100%)|Hsp70_protein(95%) . . ENSG00000155849.16 ENSG00000120694.20 ENST00000310758.9 ENST00000445273.6 upstream downstream duplicates(12) GGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTACATCCGG___ATTGTGCTTGAGAACAGTAGTCGAGAAGACAAGCATGAATGTCCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGCTGACCAAGATGCTATGTGAGATCTTGAAAGTGGGCGAGTTGC|GTCAGTCATATCATTTGGATCAAAAAATAGAACAATCGGAGTTGCA DNMLYFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGEL|rqsyhldqkieqsel LH00995:42:23WHTKLT4:2:2191:41960:13401,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2209:24032:7151,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1161:17868:13233,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1161:17876:13219,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1102:6048:23476,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1429:42558:12308,LH00995:42:23WHTKLT4:1:1159:12706:5218,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2125:14203:18824,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1102:10538:4041,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2133:33198:12406,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2413:13240:4433,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2413:13248:4447,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2135:17301:5470,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2135:17318:5470
SEC24D MXD1 -/- +/+ chr4:118751996 chr2:69916121 CDS/splice-site CDS/splice-site translocation 0 2 0 2501 1485 low out-of-frame . Sec23/Sec24_trunk_domain(54%),Sec23/Sec24_zinc_finger(100%)|Helix-loop-helix_DNA-binding_domain(100%) . . ENSG00000150961.15 ENSG00000059728.11 ENST00000280551.11 ENST00000540449.5 upstream upstream duplicates(4) GGCTGGCATGGAAGCACTAAAG|AAGCTGAACATGGTTATGCCTCCATGTTACCATACAATAACAAGGACAGAGATGCCTTAAAACGGAGGAACAAATCCAAA AGMEALK|klnmvmppcyhtitrtemp* LH00995:42:23WHTKLT4:2:1179:35447:3550,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1221:30763:20323,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2190:38295:13583,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2317:48359:14368,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2363:45673:22943,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2391:13006:13331
PRKAA1 SPIDR -/- +/+ chr5:40798063 chr8:47396376 CDS/splice-site CDS/splice-site translocation 0 2 0 1260 1028 low in-frame . Protein_kinase_domain(5%)|Domain_of_unknown_function_(DUF4502)(54%),Domain_of_unknown_function_(DUF4503)(100%) . . ENSG00000132356.11 ENSG00000164808.17 ENST00000397128.6 ENST00000517824.5 upstream upstream duplicates(9) ACAGCCGAGAAGCAGAAACACGACGGGCGGGTGAAGATCGGCCACTACATTCTGGGTGACACGCTGGGGGTCGGCACCTTCGGCAAAGTGAAGG|CCAAGTTCTATAGAAATTTTAGAGTATTCATCAGATAGTGAAAAAGAAGATGATTTGGAAAATGTCCTACTCATTGATTCAGAATCCCCTCACAAATACCACGTGCAGTTTGCATCGGATGCAAGACAGATTATGGAGAGACTGATAGATCCAAGGACAAAATCAACAGAGACCATTTTGCATACACCTCAGAAACCCACAGCTAAGTTTCCCAGGACTCCAGAAAATTCAG TAEKQKHDGRVKIGHYILGDTLGVGTFGKVK|aKFYRNFRVFIR* LH00995:42:23WHTKLT4:1:2265:44548:20911,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1312:9430:11846,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1312:9438:11832,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1145:17350:4489,LH00995:42:23WHTKLT4:3:1427:17649:12182,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2332:36645:27679,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1368:51296:4433,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1465:40342:20687,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2350:28571:22859,LH00995:42:23WHTKLT4:7:1181:28069:27203,LH00995:42:23WHTKLT4:8:2406:42275:24176
KLHL2 TBC1D31 +/+ +/+ chr4:165207902 chr8:123077111 CDS/splice-site CDS/splice-site translocation 1 1 0 994 246 low in-frame . |Rab-GTPase-TBC_domain(100%) . . ENSG00000109466.14 ENSG00000156787.17 ENST00000226725.11 ENST00000287380.6 downstream upstream duplicates(18) CGGCTGGAATGGTGCTGGCTGTGTTGGTCGGTGCCTGCGTTCTGAAGCCCGAGAGGAGCCACAATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGC|AATTATAGTGAACATTATTCACAACACTTCCGATTACCATCCAAAAGTTTTGCGATTTTTGAATGTGGCTTTTGATaGCACAGGCGACTGCTTAATTGCTGGGGACCACCAAGG METPPLPPa|IIVNIIHNTSDYHPKVLRFLNVAFDsTGDCLIAGDHQ LH00995:42:23WHTKLT4:1:1115:30820:2794,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2224:12868:18501,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2226:27737:16259,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1210:30383:21514,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2426:33158:6871,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1361:35593:19552,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1493:19025:28576,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2290:24170:29529,LH00995:42:23WHTKLT4:6:1425:9519:6451,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2326:33732:29417,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2419:43254:26068,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1454:33109:21892,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2208:39614:22229,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1320:26807:24737,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2229:6202:6255,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1219:29331:10220,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1356:20141:7530,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2284:17762:24933,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1118:27584:22383,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2238:36976:9758
OSBPL8 MON2 -/- +/+ chr12:76487510 chr12:62508286 CDS/splice-site CDS/splice-site inversion 0 2 0 3538 2450 low in-frame . |C-terminal_region_of_Mon2_protein(100%),Domain_of_unknown_function_(DUF1981)(100%),Guanine_nucleotide_exchange_factor_in_Golgi_transport_N-terminal(70%) . . ENSG00000091039.17 ENSG00000061987.16 ENST00000261183.8 ENST00000393630.8 upstream upstream duplicates(14) GTTTGGCAGATGGAGAACCTGATCGAACTTCG|CACCAAGAATTTAGTTTCCTCCTCAAAGAAAGGGTATGTCCTCTTGTGATAAAGCTCTTTTCTCCAAATATAAAGTTCAGACAAGGTTCCAGCACCTCATCTTCTCCAGCACCAGTTGAAA LADGEPDRTS|HQEFSFLLKERVCPLVIKLFSPNIKFRQGSSTSSSPAPVE LH00995:42:23WHTKLT4:1:1207:33611:21948,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2193:42186:7207,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2397:30181:28534,LH00995:42:23WHTKLT4:2:1132:8014:15727,LH00995:42:23WHTKLT4:3:2160:22358:8174,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1481:1866:29599,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2116:8685:3382,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2128:29485:22229,LH00995:42:23WHTKLT4:4:2217:43036:11958,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1275:44443:7586,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1305:31006:25283,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1323:9745:26993,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1323:9761:26993,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2216:12027:17605,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2412:8119:22971,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2374:41312:10038
SPAG9 ZNF207 -/- +/+ chr17:50984923 chr17:32369295 CDS/splice-site CDS/splice-site inversion 1 1 0 1777 3272 low out-of-frame . JNK-interacting_protein_leucine_zipper_II(100%),JNK_SAPK-associated_protein-1(100%),WD40_repeated_domain(33%)| . . ENSG00000008294.21 ENSG00000010244.19 ENST00000262013.12 ENST00000394670.9 upstream upstream duplicates(8) CTCAAAATGGCTG___TTTGTATGTCCATTCATCTGTAGCCCAGTGGAGGAAATGTCTCCATTCCATTAAACTTAAAGATTCGATTCTCAGTATTGT___ACACGTGAAGGGAATCGTGTTAGTAGCCCTGGCTGACGGCACCCTTGCAATCTTTCACAGAGGAGTGG|GAAGAGAGAAGGGCACAGTTACCTAAGTATCAACGTAATCTTCCTCGGCCAGGACAGGCCCCCATCGGTAATCCACCAGTTGGACCAATTGGAGGTATGATGCCACCACAGCCAGGCATCCCACAGCAACAAGGAATGAGACCCCCAATGCCACCTCATG___GTCAGTATGGTGGTCATCATCAAGGCATGCCAGGATACCTTCCTGGTGCTATGCCCCCGTATGGGCAGGGACCGCCAATGGTGCCCCC QNGCLYVHSSVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGV|grekgtvt* LH00995:42:23WHTKLT4:2:1448:5288:24989,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1347:42267:23910,LH00995:42:23WHTKLT4:5:1425:18936:17268,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2222:40576:27960,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1265:6833:13625,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1265:6841:13639,LH00995:42:23WHTKLT4:8:1265:6849:13625,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2295:13006:21318,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2334:34614:25536,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2435:16015:29501
EIF3H TRPS1 -/- -/- chr8:116755666 chr8:115620060 CDS/splice-site CDS/splice-site deletion 2 0 0 5415 4764 low out-of-frame . JAB1/Mov34/MPN/PAD-1_ubiquitin_protease(9%)|GATA_zinc_finger(100%) . . ENSG00000147677.11 ENSG00000104447.13 ENST00000276682.8 ENST00000395715.8 upstream downstream duplicates(7) GCGTCCCGCAAGGAAGGTACCGGCTCTACTGCCACCTCTTCCAGCTCCACCGCCGGCGCAGCAGGGAAAGGCAAAGGCAAAGGCGGCTCGGGAGATTCAGCCGTGAAGCAAGTGCAGATAGATGGCCTT|ATATGGTCCGGAAAAAGAACCCCCCTCTGAGAAACGTTGCAAGTGAAGGCGAGGGCCAGATCCTGGAGCCTATAGGTACAGAAAGC ASRKEGTGSTATSSSSTAGAAGKGKGKGGSGDSAVKQVQIDGL|iwsgkrtpl* LH00995:42:23WHTKLT4:1:1170:32405:16329,LH00995:42:23WHTKLT4:1:1464:22196:29333,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2277:35091:6297,LH00995:42:23WHTKLT4:1:2478:9365:17619,LH00995:42:23WHTKLT4:2:2135:8451:7488,LH00995:42:23WHTKLT4:4:1275:20246:28198,LH00995:42:23WHTKLT4:5:2137:42405:28212,LH00995:42:23WHTKLT4:6:2122:39250:12966,LH00995:42:23WHTKLT4:7:2105:6509:2639
LINC00486 ORAI3 +/+ +/+ chr2:32916478 chr16:30954039 intron CDS/splice-site translocation 0 0 0 65535 1077 low . . . . . ENSG00000230876.8 ENSG00000175938.7 . ENST00000566237.1 downstream upstream inconsistently_clipped(1) GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAaGGGG|ATTTTCCCCATCAGTCTGTCCCTTGGGTTTTGCAAGCTACTCTGCACCTGGGCTGGCCTCAGTTGAAGGATCATGCAGTAGATAGAGGGGAGGCAGGGAGAGCTTGTGGGACCTTCAGTGCTGACTTTAGCC . LH00995:42:23WHTKLT4:4:1470:24121:19300
68 rows