## htsjdk.samtools.metrics.StringHeader # CollectInsertSizeMetrics --Histogram_FILE aih-tih-sc-f7ac14-R1_A23YTGFLT4_1_collectinsertsize.pdf --INPUT aih-tih-sc-f7ac14-R1_A23YTGFLT4_1.Aligned.sortedByCoord.out.bam --OUTPUT aih-tih-sc-f7ac14-R1_A23YTGFLT4_1_collectinsertsize.txt --DEVIATIONS 10.0 --MINIMUM_PCT 0.05 --METRIC_ACCUMULATION_LEVEL ALL_READS --INCLUDE_DUPLICATES false --ASSUME_SORTED true --STOP_AFTER 0 --VERBOSITY INFO --QUIET false --VALIDATION_STRINGENCY STRICT --COMPRESSION_LEVEL 5 --MAX_RECORDS_IN_RAM 500000 --CREATE_INDEX false --CREATE_MD5_FILE false --help false --version false --showHidden false --USE_JDK_DEFLATER false --USE_JDK_INFLATER false ## htsjdk.samtools.metrics.StringHeader # Started on: Wed Jun 03 22:36:33 GMT 2026 ## METRICS CLASS picard.analysis.InsertSizeMetrics MEDIAN_INSERT_SIZE MODE_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_95_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT SAMPLE LIBRARY READ_GROUP 128 88 53 6 632754 146.364031 111.876672 287724165 FR 23 45 65 85 107 137 321 1489 5093 11575 56311 ## HISTOGRAM java.lang.Integer insert_size All_Reads.fr_count 6 5 7 2 8 16 9 9 10 7 11 25 12 87 13 41 14 539 15 1777 16 2709 17 2949 18 2951 19 2612 20 2885 21 3712 22 4190 23 3769 24 3979 25 5022 26 7197 27 10337 28 12824 29 18114 30 23897 31 32544 32 42605 33 48984 34 60902 35 75365 36 91693 37 112611 38 136573 39 160598 40 193922 41 225669 42 258448 43 292524 44 322803 45 353171 46 389293 47 425639 48 464526 49 512290 50 558746 51 606264 52 663401 53 721422 54 766750 55 824987 56 858036 57 897977 58 951341 59 996362 60 1056164 61 1127474 62 1200998 63 1267185 64 1343417 65 1416805 66 1459093 67 1513256 68 1557183 69 1593754 70 1664323 71 1716805 72 1776998 73 1877544 74 1944167 75 2009188 76 2077504 77 2099473 78 2123704 79 2143049 80 2168409 81 2185953 82 2237295 83 2282720 84 2326088 85 2386409 86 2418557 87 2435713 88 2445184 89 2420822 90 2399030 91 2380099 92 2364222 93 2356711 94 2379190 95 2395299 96 2397269 97 2403475 98 2386646 99 2337792 100 2303222 101 2252611 102 2197039 103 2173359 104 2132696 105 2125684 106 2105431 107 2089169 108 2064668 109 2043964 110 1975498 111 1908782 112 1857616 113 1807849 114 1760513 115 1738118 116 1703556 117 1681743 118 1657533 119 1627575 120 1581560 121 1531614 122 1486890 123 1425880 124 1387920 125 1363795 126 1320366 127 1301109 128 1270004 129 1240231 130 1211289 131 1180275 132 1142251 133 1103743 134 1058825 135 1027860 136 1005398 137 980894 138 954128 139 941832 140 910848 141 891789 142 869012 143 846193 144 815364 145 786783 146 761828 147 746315 148 725967 149 710150 150 695447 151 685143 152 669367 153 651295 154 628626 155 614195 156 595028 157 580976 158 565816 159 550644 160 543375 161 535799 162 523819 163 514224 164 504854 165 489702 166 476932 167 463525 168 457944 169 450114 170 444759 171 437177 172 431887 173 420160 174 414567 175 408638 176 404390 177 395416 178 386083 179 381387 180 374233 181 371864 182 368119 183 363102 184 356246 185 351746 186 350198 187 341542 188 337337 189 330240 190 328368 191 319202 192 315200 193 313526 194 307634 195 302661 196 302549 197 301257 198 297695 199 291973 200 293157 201 284346 202 280077 203 278120 204 277962 205 279869 206 271524 207 264725 208 262648 209 261036 210 253793 211 252181 212 245354 213 240334 214 241399 215 243909 216 237871 217 235287 218 229332 219 222614 220 222622 221 221160 222 217930 223 213608 224 210639 225 208296 226 206699 227 204785 228 200594 229 200765 230 196387 231 192049 232 190936 233 190327 234 187249 235 183909 236 180845 237 176981 238 177657 239 173626 240 172052 241 170465 242 168995 243 163514 244 162804 245 162286 246 157180 247 156705 248 155491 249 150627 250 147939 251 148364 252 145364 253 143838 254 140248 255 141517 256 138541 257 137780 258 137282 259 136430 260 135278 261 131397 262 130424 263 128934 264 127116 265 125715 266 126609 267 122041 268 123016 269 120901 270 120921 271 117775 272 121713 273 114515 274 117357 275 115938 276 113914 277 111883 278 111714 279 109362 280 110177 281 109106 282 106901 283 106353 284 106028 285 105684 286 104654 287 104190 288 103386 289 102688 290 101042 291 102203 292 100992 293 99081 294 98236 295 99877 296 99306 297 98117 298 98437 299 97295 300 97147 301 96416 302 95047 303 94202 304 93516 305 94489 306 93862 307 93476 308 92721 309 92099 310 92657 311 92102 312 91757 313 91337 314 92086 315 90166 316 88918 317 88979 318 90535 319 89965 320 87973 321 86901 322 86414 323 86105 324 84991 325 86665 326 85147 327 86740 328 85728 329 87019 330 84561 331 84250 332 85620 333 82426 334 82867 335 83327 336 82815 337 84624 338 81800 339 82431 340 80582 341 79551 342 80789 343 80694 344 80939 345 80361 346 79603 347 78357 348 77787 349 78619 350 75926 351 76294 352 76627 353 77152 354 76934 355 74681 356 77106 357 74986 358 74278 359 73385 360 73774 361 72162 362 72459 363 72632 364 71084 365 71936 366 71708 367 71562 368 71394 369 69422 370 70180 371 69432 372 69776 373 69139 374 68857 375 68822 376 69962 377 69570 378 68530 379 67441 380 68515 381 67699 382 65864 383 66129 384 65705 385 65934 386 67103 387 66487 388 66348 389 67156 390 66697 391 65836 392 66590 393 65730 394 66227 395 65102 396 65107 397 65842 398 64863 399 64283 400 64098 401 63903 402 63836 403 65133 404 64279 405 64414 406 63341 407 63381 408 64008 409 64933 410 63359 411 63882 412 62631 413 61674 414 61914 415 62477 416 62047 417 64631 418 63674 419 62626 420 61588 421 61311 422 63158 423 62148 424 61485 425 60192 426 59524 427 58971 428 60324 429 60348 430 59805 431 58223 432 59034 433 59637 434 60039 435 58577 436 58630 437 60000 438 58042 439 57680 440 58762 441 58452 442 58087 443 57388 444 56854 445 57728 446 58149 447 57370 448 56766 449 55742 450 56967 451 56334 452 56303 453 55352 454 54943 455 55466 456 54677 457 55569 458 53884 459 54683 460 53742 461 54138 462 54252 463 53468 464 53157 465 54363 466 52949 467 52874 468 52390 469 52739 470 51995 471 51234 472 51188 473 52371 474 50300 475 51388 476 50308 477 48711 478 48489 479 49119 480 48705 481 49598 482 49430 483 50052 484 48152 485 48271 486 48026 487 48036 488 48234 489 47839 490 48421 491 48831 492 47745 493 48047 494 47735 495 49347 496 48757 497 46930 498 47225 499 46721 500 48434 501 48028 502 46829 503 48983 504 45695 505 46893 506 47011 507 47181 508 47253 509 46575 510 48344 511 47369 512 47228 513 47231 514 46504 515 47087 516 46637 517 46893 518 46409 519 47134 520 46423 521 47788 522 46611 523 46971 524 46616 525 45354 526 45571 527 45932 528 47881 529 46483 530 47433 531 47109 532 46596 533 46845 534 46381 535 46574 536 47373 537 47756 538 46334 539 45491 540 46830 541 46380 542 44985 543 45551 544 45762 545 45582 546 46445 547 45594 548 45015 549 44571 550 45766 551 44814 552 45731 553 46158 554 46088 555 46298 556 44386 557 43975 558 44102 559 43901 560 44606 561 44222 562 43427 563 43824 564 43651 565 44064 566 43339 567 44262 568 44054 569 43965 570 44055 571 44522 572 42157 573 42633 574 43425 575 42345 576 43777 577 44105 578 43655 579 42216 580 43117 581 42217 582 43370 583 42512 584 41536 585 43692 586 43325 587 42385 588 43912 589 41650 590 42602 591 41337 592 41094 593 41565 594 42440 595 41092 596 41517 597 40805 598 41123 599 40694 600 40429 601 41121 602 40760 603 40324 604 40606 605 38972 606 38366 607 39530 608 39501 609 40239 610 39312 611 37969 612 39030 613 39181 614 38485 615 38457 616 39260 617 38012 618 39494 619 37787 620 38207 621 39142 622 38785 623 38620 624 37991 625 37565 626 38268 627 38266 628 38210 629 38443 630 37261 631 37858 632 38451 633 38439 634 39542 635 38858 636 38969 637 38805 638 38690 639 39337 640 38654 641 39046 642 38656 643 37590 644 38343 645 38303 646 38740 647 38899 648 39095 649 39022 650 37743 651 39279 652 38768 653 38678 654 39157 655 38433 656 39509 657 38115 658 38694