Sample chr1 chr9 chrX chr21
HCC1395_BL.deconflicted_germline_custom.ann_snpEff_VEP.ann nan nan nan 355.0
HCC1395_BL_custom.ann_snpEff_VEP.ann 1.0 1.0 1.0 nan
HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.strelka.somatic_indels_custom.ann_snpEff_VEP.ann nan nan nan 35.0
HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.strelka.somatic_snvs_custom.ann_snpEff_VEP.ann nan nan nan 369.0
Sig_18_Blood.deconflicted_germline_custom.ann_snpEff_VEP.ann nan nan nan 395.0
Sig_18_Blood_custom.ann_snpEff_VEP.ann 1.0 1.0 1.0 nan
custom_Sig_18_tumor_normal.manta.diploid_sv_custom.ann_snpEff_VEP.ann nan nan nan 1.0
custom_Sig_18_tumor_normal.strelka.somatic_indels_custom.ann_snpEff_VEP.ann nan nan nan 66.0
custom_Sig_18_tumor_normal.strelka.somatic_snvs_custom.ann_snpEff_VEP.ann nan nan nan 265.0