File Info
- Filename
- Sig_18_Blood.deconflicted_germline_custom.ann_snpEff.csv
- Full Path
- s3://natera-rnd-pltf-dev-s3-gitlab-results/sarek/build2797383/regression-run/63548394/reports/raw_qc/snpeff/sentieon_haplotyper_rf/Sig_18_Blood/Sig_18_Blood.deconflicted_germline_custom.ann_snpEff.csv
- Size
- 28.8 KB
- Workflow Run
- gitlab-sarek-build2797383-regression-run-63548394
- Published
- Jun 04, 2026 7:30 PM
Content
View in new tab| # | Summary | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name | , | Value | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome | , | GRCh38.105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Date | , | 2026-06-05 | 02:29 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SnpEff_version | , | SnpEff | 5.1d | (build | 2022-04-19 | 15:49), | by | Pablo | Cingolani | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Command_line_arguments | , | SnpEff | GRCh38.105 | -csvStats | Sig_18_Blood.deconflicted_germline_custom.ann_snpEff.csv | Sig_18_Blood.deconflicted_germline_custom.ann.vcf.gz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Warnings | , | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_lines_in_input_file, | 395 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_variants_before_filter, | 395 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_not_variants | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_variants_processed | , | 395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_known_variants | (i.e. | non-empty | ID) | , | 391, | 98.987342% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_effects | , | 605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome_total_length | ,63147197748 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome_effective_length | ,46709983 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Change_rate | , | 118253 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Change | rate | by | chromosome | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | , | Length | , | Changes | , | Change_rate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21 | , | 46709983 | , | 395 | , | 118253 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Variantss | by | type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DEL | , | 14 | , | 3.544304% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| INS | , | 12 | , | 3.037975% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP | , | 369 | , | 93.417722% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Effects | by | impact | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HIGH | , | 9 | , | 1.487603% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOW | , | 139 | , | 22.975207% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MODERATE | , | 156 | , | 25.785124% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MODIFIER | , | 301 | , | 49.752066% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Effects | by | functional | class | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MISSENSE | , | 149 | , | 52.280702% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NONSENSE | , | 2 | , | 0.701754% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SILENT | , | 134 | , | 47.017544% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Missense_Silent_ratio, | 1.11194 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Count | by | effects | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3_prime_UTR_variant | , | 7 | , | 1.145663% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant | , | 1 | , | 0.163666% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5_prime_UTR_variant | , | 7 | , | 1.145663% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| conservative_inframe_insertion | , | 1 | , | 0.163666% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| disruptive_inframe_deletion | , | 3 | , | 0.490998% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| disruptive_inframe_insertion | , | 3 | , | 0.490998% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| downstream_gene_variant | , | 47 | , | 7.692308% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| frameshift_variant | , | 7 | , | 1.145663% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| intragenic_variant | , | 31 | , | 5.07365% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| intron_variant | , | 142 | , | 23.240589% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| missense_variant | , | 149 | , | 24.386252% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| non_coding_transcript_exon_variant | , | 24 | , | 3.927987% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| splice_region_variant | , | 8 | , | 1.309329% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| stop_gained | , | 2 | , | 0.327332% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| synonymous_variant | , | 134 | , | 21.93126% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| upstream_gene_variant | , | 45 | , | 7.364975% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Count | by | genomic | region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DOWNSTREAM | , | 47 | , | 7.768595% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EXON | , | 319 | , | 52.727273% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| INTRON | , | 142 | , | 23.471074% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SPLICE_SITE_REGION | , | 6 | , | 0.991736% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRANSCRIPT | , | 31 | , | 5.123967% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UPSTREAM | , | 45 | , | 7.438017% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UTR_3_PRIME | , | 7 | , | 1.157025% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UTR_5_PRIME | , | 8 | , | 1.322314% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Quality | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 48,148,193,226,434,466,469,506,701,755,765,786,830,1122,1133,1139,1206,1216,1266,1298,1312,1315,1316,1372,1404,1430,1437,1560,1585,1588,1599,1610,1632,1640,1675,1676,1695,1696,1728,1750,1790,1802,1803,1827,1847,1867,1872,1925,1931,1945,1948,1959,1961,1965,1973,1978,2050,2053,2074,2076,2097,2109,2148,2152,2179,2190,2234,2252,2290,2310,2322,2332,2335,2336,2367,2415,2422,2427,2460,2472,2490,2495,2499,2518,2540,2557,2572,2594,2606,2612,2641,2654,2664,2697,2725,2735,2745,2771,2776,2816,2828,2832,2848,2885,2907,2963,2986,2990,3003,3004,3010,3063,3071,3123,3138,3151,3177,3243,3322,3328,3355,3375,3389,3404,3431,3449,3451,3457,3465,3466,3509,3534,3537,3542,3543,3586,3619,3627,3632,3653,3658,3667,3674,3738,3801,3823,3851,3872,3891,3907,3911,3941,3942,3949,4020,4056,4083,4102,4123,4168,4208,4310,4316,4366,4373,4384,4420,4440,4474,4594,4655,4659,4727,4747,4761,4787,4804,4806,4836,4838,4880,4914,4921,4979,5008,5038,5040,5048,5099,5144,5205,5218,5219,5303,5321,5377,5398,5405,5484,5515,5586,5606,5649,5716,5750,5763,5829,5831,5858,5902,5917,5986,5991,6012,6090,6104,6173,6292,6424,6527,6563,6578,6637,6687,6737,6750,6785,6808,6846,6888,6989,7029,7159,7195,7197,7214,7608,7612,7636,7657,7724,7729,7743,7756,7758,7765,7824,7896,7897,7907,8005,8039,8156,8196,8206,8275,8297,8364,8377,8399,8512,8709,8728,8814,8868,8886,8974,8986,8995,9003,9077,9080,9100,9200,9252,9295,9360,9428,9430,9471,9510,9801,9836,9845,9953,10215,10218,10624,10648,10996,11042,11044,11093,11123,11157,11160,11239,11258,11415,11498,11534,11986,12052,12252,12504,12651,12967,13108,13256,13678,13924,13974,14299,14494,14737,14970,15014,15114,15212,15685,16266,16891,17731,19080,19368,19596,19614,19672,19747,19972,20130,20370,20856,22260,22326,22364,22627,22950,23289,23431,23530,23724,24058,24190,24212,24214,24220,24361,24370,24435,24545,24814,24960,25129,25442,25852,26201,26357,26652,27417,28525,29525,29882,29980,32910,33062,33640,33938,34069,34328,35796,36259,37204,47751,47882,52466,53968,54930,55183,56418,56908,61335,61723,64326,71283,73424,75217,78637 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | InDel | lengths | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 0,1,2,4,5,38,39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 4,17,1,1,1,1,1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Base | changes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| base | , | A | , | C | , | G | , | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A | , | 0 | , | 13 | , | 64 | , | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| C | , | 10 | , | 0 | , | 13 | , | 75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| G | , | 71 | , | 24 | , | 0 | , | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| T | , | 7 | , | 65 | , | 10 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | summary | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transitions | , | 381 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transversions | , | 133 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ts_Tv_ratio | , | 2.864662 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | : | All | variants | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample | ,Sig_18_Blood,Total | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transitions | ,381,381 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transversions | ,133,133 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ts/Tv | ,2.865,2.865 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | : | Known | variants | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample | ,Sig_18_Blood,Total | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transitions | ,379,379 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transversions | ,132,132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ts/Tv | ,2.871,2.871 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | frequency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | frequency | : | All | variants | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 50,100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 241,154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | Count | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 1,2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 241,154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Hom/Het | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample_names | , | Sig_18_Blood | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Het | , | 241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Hom | , | 154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Missing | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Codon | change | table | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| codons | , | - | , | AAA | , | AAC | , | AAG | , | AAT | , | ACA | , | ACC | , | ACG | , | ACT | , | AGA | , | AGC | , | AGG | , | AGT | , | ATA | , | ATC | , | ATG | , | ATT | , | CAA | , | CAC | , | CAG | , | CAT | , | CCA | , | CCC | , | CCG | , | CCT | , | CGA | , | CGC | , | CGG | , | CGT | , | CTA | , | CTC | , | CTG | , | CTT | , | GAA | , | GAC | , | GAG | , | GAT | , | GCA | , | GCC | , | GCG | , | GCT | , | GGA | , | GGC | , | GGG | , | GGT | , | GTA | , | GTC | , | GTG | , | GTT | , | TAC | , | TAT | , | TCA | , | TCC | , | TCG | , | TCT | , | TGA | , | TGC | , | TGG | , | TGT | , | TTA | , | TTC | , | TTG | , | TTT |
| - | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 |
| AAA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAG | , | 0 | , | 3 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAT | , | 1 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGA | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGC | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGG | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CCA | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 6 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CCC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CCG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 6 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CCT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CGA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CGC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CGG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CGT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CTA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CTC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CTG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 |
| CTT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GAA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GAC | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GAG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GAT | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GCA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GCC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GCG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 9 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GCT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GGA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GGC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GGG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GGT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GTA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GTC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GTG | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GTT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TAC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TAT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TCA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TCC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TCG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 |
| TCT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 |
| TGA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TGC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 |
| TGG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TGT | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 |
| TTC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 |
| # | Amino | acid | change | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| aa | , | * | , | - | , | ? | , | A | , | C | , | D | , | E | , | F | , | G | , | H | , | I | , | K | , | L | , | M | , | N | , | P | , | Q | , | R | , | S | , | T | , | V | , | W | , | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| * | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 1 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 1 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ? | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 17 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 3 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| C | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 8 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| E | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| F | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| G | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 14 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 6 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| I | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| K | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 1 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 12 | , | 2 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| N | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| P | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 21 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| R | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 6 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| S | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 2 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 13 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| T | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| V | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 6 | , | 0 | , | 2 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 9 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| W | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Y | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Chromosome | change | table | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21, | Position,0,1000000,2000000,3000000,4000000,5000000,6000000,7000000,8000000,9000000,10000000,11000000,12000000,13000000,14000000,15000000,16000000,17000000,18000000,19000000,20000000,21000000,22000000,23000000,24000000,25000000,26000000,27000000,28000000,29000000,30000000,31000000,32000000,33000000,34000000,35000000,36000000,37000000,38000000,39000000,40000000,41000000,42000000,43000000,44000000,45000000,46000000 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21,Count,0,0,0,0,0,0,0,1,0,0,17,0,0,0,10,1,0,0,3,0,0,1,0,0,0,4,8,0,5,2,15,4,13,11,6,5,7,7,12,14,0,96,25,9,74,9,36 |
238 rows