File Info
- Filename
- HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.tnseq.filtered_custom.ann_snpEff.csv
- Full Path
- s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-data-01/users/mipeters/semiproductionize/sarek/698115e9/test_regression_dev_b0193075/reports/raw_qc/snpeff/tnseq/HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL/HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.tnseq.filtered_custom.ann_snpEff.csv
- Size
- 26.7 KB
- Workflow Run
- mipeters-regression-dev-698115e9
- Published
- Feb 02, 2026 1:39 PM
Content
View in new tab| # | Summary | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name | , | Value | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome | , | GRCh38.105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Date | , | 2026-02-02 | 21:39 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SnpEff_version | , | SnpEff | 5.1d | (build | 2022-04-19 | 15:49), | by | Pablo | Cingolani | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Command_line_arguments | , | SnpEff | GRCh38.105 | -csvStats | HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.tnseq.filtered_custom.ann_snpEff.csv | HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.tnseq.filtered_custom.ann.vcf.gz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Warnings | , | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_lines_in_input_file, | 305 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_variants_before_filter, | 329 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_not_variants | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_variants_processed | , | 329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_known_variants | (i.e. | non-empty | ID) | , | 0, | 0% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_effects | , | 497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome_total_length | ,63147197748 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome_effective_length | ,46709983 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Change_rate | , | 141975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Change | rate | by | chromosome | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | , | Length | , | Changes | , | Change_rate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21 | , | 46709983 | , | 329 | , | 141975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Variantss | by | type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DEL | , | 31 | , | 9.422492% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| INS | , | 17 | , | 5.167173% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MNP | , | 6 | , | 1.823708% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP | , | 275 | , | 83.586626% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Effects | by | impact | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HIGH | , | 7 | , | 1.408451% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOW | , | 121 | , | 24.346076% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MODERATE | , | 124 | , | 24.949698% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MODIFIER | , | 245 | , | 49.295775% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Effects | by | functional | class | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MISSENSE | , | 107 | , | 46.929825% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NONSENSE | , | 2 | , | 0.877193% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SILENT | , | 119 | , | 52.192982% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Missense_Silent_ratio, | 0.89916 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Count | by | effects | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3_prime_UTR_variant | , | 6 | , | 1.192843% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5_prime_UTR_variant | , | 9 | , | 1.789264% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| conservative_inframe_deletion | , | 4 | , | 0.795229% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| conservative_inframe_insertion | , | 2 | , | 0.397614% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| disruptive_inframe_deletion | , | 4 | , | 0.795229% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| disruptive_inframe_insertion | , | 2 | , | 0.397614% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| downstream_gene_variant | , | 49 | , | 9.741551% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| frameshift_variant | , | 5 | , | 0.994036% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| intragenic_variant | , | 23 | , | 4.572565% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| intron_variant | , | 105 | , | 20.874751% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| missense_variant | , | 112 | , | 22.266402% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| non_coding_transcript_exon_variant | , | 18 | , | 3.578529% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| splice_region_variant | , | 6 | , | 1.192843% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| stop_gained | , | 2 | , | 0.397614% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| synonymous_variant | , | 119 | , | 23.658052% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| upstream_gene_variant | , | 37 | , | 7.355865% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Count | by | genomic | region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DOWNSTREAM | , | 49 | , | 9.859155% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EXON | , | 264 | , | 53.118712% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| INTRON | , | 105 | , | 21.126761% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SPLICE_SITE_REGION | , | 4 | , | 0.804829% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRANSCRIPT | , | 23 | , | 4.627767% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UPSTREAM | , | 37 | , | 7.444668% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UTR_3_PRIME | , | 6 | , | 1.207243% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UTR_5_PRIME | , | 9 | , | 1.810865% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Quality | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | InDel | lengths | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 0,1,2,3,5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 6,38,2,1,1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Base | changes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| base | , | A | , | C | , | G | , | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A | , | 0 | , | 5 | , | 48 | , | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| C | , | 9 | , | 0 | , | 10 | , | 55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| G | , | 59 | , | 18 | , | 0 | , | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| T | , | 1 | , | 51 | , | 5 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | summary | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transitions | , | 213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transversions | , | 61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ts_Tv_ratio | , | 3.491803 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | : | All | variants | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample | ,HCC1395_HCC1395_BL,HCC1395_HCC1395_tumor,Total | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transitions | ,0,213,213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transversions | ,0,61,61 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ts/Tv | ,NaN,3.492,3.492 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | : | Known | variants | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| No | results | available | (empty | input?) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | frequency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | frequency | : | All | variants | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 25,50,75,125,150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 296,4,1,2,2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | Count | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 1,2,3,5,6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 296,4,1,2,2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Hom/Het | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample_names | , | HCC1395_HCC1395_BL, | HCC1395_HCC1395_tumor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference | , | 305, | 0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Het | , | 0, | 296 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Hom | , | 0, | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Missing | , | 0, | 0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Codon | change | table | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| codons | , | - | , | AAA | , | AAC | , | AAG | , | AAT | , | ACA | , | ACC | , | ACG | , | ACT | , | AGA | , | AGC | , | AGG | , | AGT | , | ATA | , | ATC | , | ATG | , | ATT | , | CAA | , | CAC | , | CAG | , | CAT | , | CCA | , | CCC | , | CCG | , | CCT | , | CGA | , | CGC | , | CGG | , | CGT | , | CTA | , | CTC | , | CTG | , | CTT | , | GAA | , | GAC | , | GAG | , | GAT | , | GCA | , | GCC | , | GCG | , | GCT | , | GGA | , | GGC | , | GGG | , | GGT | , | GTA | , | GTC | , | GTG | , | GTT | , | TAA | , | TAC | , | TAT | , | TCA | , | TCC | , | TCG | , | TCT | , | TGA | , | TGC | , | TGG | , | TGT | , | TTA | , | TTC | , | TTG | , | TTT |
| - | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAC | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAG | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAT | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACA | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACC | , | 2 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGA | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGC | , | 11 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGG | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGT | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAC | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAG | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
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| CCC | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
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| TCT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 |
| TGA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TGC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TGG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TGT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 |
| TTC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| # | Amino | acid | change | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| aa | , | * | , | - | , | ? | , | A | , | C | , | D | , | E | , | F | , | G | , | H | , | I | , | K | , | L | , | M | , | N | , | P | , | Q | , | R | , | S | , | T | , | V | , | W | , | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| * | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ? | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 14 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| C | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 8 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 6 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| E | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| F | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| G | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 14 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 6 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| I | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| K | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 11 | , | 1 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| N | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 6 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| P | , | 0 | , | 7 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 15 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q | , | 0 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| R | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 4 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| S | , | 0 | , | 13 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 1 | , | 7 | , | 0 | , | 2 | , | 12 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| T | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 8 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| V | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 1 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| W | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Y | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Chromosome | change | table | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21, | Position,0,1000000,2000000,3000000,4000000,5000000,6000000,7000000,8000000,9000000,10000000,11000000,12000000,13000000,14000000,15000000,16000000,17000000,18000000,19000000,20000000,21000000,22000000,23000000,24000000,25000000,26000000,27000000,28000000,29000000,30000000,31000000,32000000,33000000,34000000,35000000,36000000,37000000,38000000,39000000,40000000,41000000,42000000,43000000,44000000,45000000,46000000 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21,Count,0,0,0,0,0,1,0,0,0,0,18,0,0,0,8,0,0,2,2,0,0,1,0,0,0,4,4,0,3,2,18,7,9,16,9,8,4,3,5,18,1,69,15,8,46,15,33 |
234 rows