File Info
- Filename
- Sig_18_Blood.entropy.entropy_custom.ann_snpEff.csv
- Full Path
- s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-data-01/users/mipeters/semiproductionize/sarek/698115e9/test_regression_dev_b0193075/reports/raw_qc/snpeff/haplotypecaller/Sig_18_Blood/Sig_18_Blood.entropy.entropy_custom.ann_snpEff.csv
- Size
- 28.8 KB
- Workflow Run
- mipeters-regression-dev-698115e9
- Published
- Feb 02, 2026 1:42 PM
Content
View in new tab| # | Summary | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name | , | Value | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome | , | GRCh38.105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Date | , | 2026-02-02 | 21:42 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SnpEff_version | , | SnpEff | 5.1d | (build | 2022-04-19 | 15:49), | by | Pablo | Cingolani | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Command_line_arguments | , | SnpEff | GRCh38.105 | -csvStats | Sig_18_Blood.entropy.entropy_custom.ann_snpEff.csv | Sig_18_Blood.entropy.entropy_custom.ann.vcf.gz | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Warnings | , | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_lines_in_input_file, | 397 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_variants_before_filter, | 397 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_not_variants | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_variants_processed | , | 397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_known_variants | (i.e. | non-empty | ID) | , | 393, | 98.992443% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Number_of_effects | , | 607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome_total_length | ,63147197748 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome_effective_length | ,46709983 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Change_rate | , | 117657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Change | rate | by | chromosome | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | , | Length | , | Changes | , | Change_rate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21 | , | 46709983 | , | 397 | , | 117657 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Variantss | by | type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DEL | , | 14 | , | 3.526448% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| INS | , | 12 | , | 3.02267% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP | , | 371 | , | 93.450882% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Effects | by | impact | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HIGH | , | 9 | , | 1.482702% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| LOW | , | 139 | , | 22.899506% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MODERATE | , | 156 | , | 25.700165% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MODIFIER | , | 303 | , | 49.917628% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Effects | by | functional | class | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MISSENSE | , | 149 | , | 52.280702% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NONSENSE | , | 2 | , | 0.701754% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SILENT | , | 134 | , | 47.017544% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Missense_Silent_ratio, | 1.11194 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Count | by | effects | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3_prime_UTR_variant | , | 7 | , | 1.141925% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant | , | 1 | , | 0.163132% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5_prime_UTR_variant | , | 7 | , | 1.141925% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| conservative_inframe_insertion | , | 1 | , | 0.163132% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| disruptive_inframe_deletion | , | 3 | , | 0.489396% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| disruptive_inframe_insertion | , | 3 | , | 0.489396% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| downstream_gene_variant | , | 47 | , | 7.66721% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| frameshift_variant | , | 7 | , | 1.141925% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| intragenic_variant | , | 33 | , | 5.383361% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| intron_variant | , | 142 | , | 23.164763% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| missense_variant | , | 149 | , | 24.306688% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| non_coding_transcript_exon_variant | , | 24 | , | 3.915171% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| splice_region_variant | , | 8 | , | 1.305057% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| stop_gained | , | 2 | , | 0.326264% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| synonymous_variant | , | 134 | , | 21.859706% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| upstream_gene_variant | , | 45 | , | 7.340946% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Count | by | genomic | region | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Type | , | Count | , | Percent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DOWNSTREAM | , | 47 | , | 7.742998% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EXON | , | 319 | , | 52.553542% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| INTRON | , | 142 | , | 23.39374% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SPLICE_SITE_REGION | , | 6 | , | 0.988468% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TRANSCRIPT | , | 33 | , | 5.436573% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UPSTREAM | , | 45 | , | 7.413509% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UTR_3_PRIME | , | 7 | , | 1.153213% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UTR_5_PRIME | , | 8 | , | 1.317957% | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Quality | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 47,111,184,187,257,338,491,494,515,571,801,846,894,1195,1250,1289,1308,1337,1386,1390,1396,1417,1437,1488,1527,1535,1564,1634,1668,1674,1742,1761,1764,1771,1800,1809,1810,1838,1841,1865,1906,1943,1975,1986,1991,2001,2005,2046,2067,2083,2095,2096,2117,2135,2144,2176,2184,2193,2212,2228,2254,2285,2319,2330,2354,2375,2388,2410,2468,2473,2484,2507,2509,2552,2566,2577,2579,2587,2592,2599,2626,2628,2641,2656,2661,2668,2736,2775,2829,2833,2852,2873,2885,2888,2918,2953,2957,2973,2975,3023,3041,3071,3082,3095,3106,3111,3161,3181,3190,3219,3233,3264,3276,3277,3286,3359,3397,3421,3470,3472,3508,3517,3530,3543,3568,3580,3593,3622,3653,3669,3680,3694,3727,3731,3739,3786,3787,3801,3812,3843,3888,3916,3926,3945,3948,3953,4052,4059,4085,4093,4155,4183,4190,4195,4197,4228,4292,4294,4317,4336,4358,4391,4509,4552,4591,4618,4670,4733,4746,4881,4908,4929,4942,4988,5070,5119,5136,5140,5147,5244,5262,5272,5281,5314,5316,5434,5460,5482,5520,5521,5530,5538,5546,5663,5674,5702,5725,5795,5831,5837,5848,5854,5920,6011,6112,6198,6199,6200,6241,6314,6349,6416,6421,6428,6464,6477,6493,6508,6522,6863,6942,6990,7067,7103,7110,7143,7221,7250,7303,7314,7384,7516,7538,7589,7642,7686,7716,7727,7858,7859,7874,7936,7952,8014,8048,8054,8058,8118,8163,8177,8213,8217,8287,8367,8456,8489,8522,8604,8703,8713,8735,8913,9034,9053,9125,9268,9380,9424,9428,9487,9492,9507,9526,9597,9608,9611,9663,9854,10074,10131,10243,10249,10315,10425,10718,10731,10832,10850,10894,11064,11249,11394,11532,11706,11709,11722,11729,11840,11982,12031,12074,12091,12206,12655,12673,12688,13046,13406,14001,14003,14113,14575,14648,14896,15453,15467,15815,15969,16055,16174,16496,16607,16922,17480,17630,19796,20630,20902,20934,21224,21910,22166,22167,22189,22219,23100,23620,23914,24428,24498,25138,25404,25436,25555,25646,25807,25874,25985,26158,26478,26666,26670,27375,27377,27409,27459,27729,28176,28309,28441,28975,29025,30099,31110,31390,32172,32440,32503,34608,34632,35595,35997,36592,37219,39172,45488,46018,48845,49401,55339,59774,60673,62241,63051,63943,68840,71441,76677,78119,80748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,2,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | InDel | lengths | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 0,1,2,4,5,38,39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 4,17,1,1,1,1,1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Base | changes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| base | , | A | , | C | , | G | , | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A | , | 0 | , | 13 | , | 64 | , | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| C | , | 10 | , | 0 | , | 13 | , | 75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| G | , | 71 | , | 24 | , | 0 | , | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| T | , | 7 | , | 67 | , | 10 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | summary | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transitions | , | 383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transversions | , | 133 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ts_Tv_ratio | , | 2.879699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | : | All | variants | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample | ,Sig_18_Sig_18_Blood,Total | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transitions | ,383,383 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transversions | ,133,133 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ts/Tv | ,2.880,2.880 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Ts/Tv | : | Known | variants | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample | ,Sig_18_Sig_18_Blood,Total | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transitions | ,381,381 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transversions | ,132,132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ts/Tv | ,2.886,2.886 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | frequency | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | frequency | : | All | variants | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 50,100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 243,154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Allele | Count | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Values | , | 1,2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Count | , | 243,154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Hom/Het | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sample_names | , | Sig_18_Sig_18_Blood | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Het | , | 243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Hom | , | 154 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Missing | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Codon | change | table | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| codons | , | - | , | AAA | , | AAC | , | AAG | , | AAT | , | ACA | , | ACC | , | ACG | , | ACT | , | AGA | , | AGC | , | AGG | , | AGT | , | ATA | , | ATC | , | ATG | , | ATT | , | CAA | , | CAC | , | CAG | , | CAT | , | CCA | , | CCC | , | CCG | , | CCT | , | CGA | , | CGC | , | CGG | , | CGT | , | CTA | , | CTC | , | CTG | , | CTT | , | GAA | , | GAC | , | GAG | , | GAT | , | GCA | , | GCC | , | GCG | , | GCT | , | GGA | , | GGC | , | GGG | , | GGT | , | GTA | , | GTC | , | GTG | , | GTT | , | TAC | , | TAT | , | TCA | , | TCC | , | TCG | , | TCT | , | TGA | , | TGC | , | TGG | , | TGT | , | TTA | , | TTC | , | TTG | , | TTT |
| - | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 |
| AAA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAG | , | 0 | , | 3 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AAT | , | 1 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ACT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGA | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGC | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGG | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| AGT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| ATT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CAT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CCA | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 6 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CCC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CCG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 6 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CCT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CGA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CGC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CGG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CGT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CTA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CTC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| CTG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 |
| CTT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GAA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GAC | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GAG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GAT | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GCA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GCC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GCG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 9 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GCT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GGA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GGC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GGG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GGT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GTA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GTC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GTG | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| GTT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TAC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TAT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TCA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TCC | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TCG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 |
| TCT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 |
| TGA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TGC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 |
| TGG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TGT | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTA | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 |
| TTC | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTG | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 |
| TTT | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 |
| # | Amino | acid | change | table | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| aa | , | * | , | - | , | ? | , | A | , | C | , | D | , | E | , | F | , | G | , | H | , | I | , | K | , | L | , | M | , | N | , | P | , | Q | , | R | , | S | , | T | , | V | , | W | , | Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| * | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| - | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 1 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 1 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ? | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 17 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 3 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| C | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 8 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| E | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| F | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| G | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 14 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 6 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| I | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| K | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 1 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 12 | , | 2 | , | 0 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| N | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| P | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 21 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 3 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| R | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 5 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 4 | , | 6 | , | 1 | , | 1 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| S | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 2 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 13 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| T | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 0 | , | 1 | , | 7 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| V | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 3 | , | 0 | , | 1 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 6 | , | 0 | , | 2 | , | 4 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 9 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| W | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Y | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | , | 0 | , | 0 | , | 0 | , | 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| # | Chromosome | change | table | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21, | Position,0,1000000,2000000,3000000,4000000,5000000,6000000,7000000,8000000,9000000,10000000,11000000,12000000,13000000,14000000,15000000,16000000,17000000,18000000,19000000,20000000,21000000,22000000,23000000,24000000,25000000,26000000,27000000,28000000,29000000,30000000,31000000,32000000,33000000,34000000,35000000,36000000,37000000,38000000,39000000,40000000,41000000,42000000,43000000,44000000,45000000,46000000 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 21,Count,0,0,0,0,0,0,0,1,0,0,19,0,0,0,10,1,0,0,3,0,0,1,0,0,0,4,8,0,5,2,15,4,13,11,6,5,7,7,12,14,0,96,25,9,74,9,36 |
238 rows