File Info

Filename
1029_BBS1-T1-TDNA-1_23FC2GLT4_s23_vs_1029_BBS1-N1-BDNA-1_2375WFLT3_s23.segments.csv
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-data-01/users/mipeters/semiproductionize/sarek/69814f07/std_run_largest2_smallest2_8a99ba01/variant_calling/facets/1029_BBS1-T1-TDNA-1_23FC2GLT4_s23_vs_1029_BBS1-N1-BDNA-1_2375WFLT3_s23/1029_BBS1-T1-TDNA-1_23FC2GLT4_s23_vs_1029_BBS1-N1-BDNA-1_2375WFLT3_s23.segments.csv
Size
19.0 KB
Workflow Run
mipeters-std-largest2-smallest2-69814f07
Published
Feb 02, 2026 7:06 PM

Content

View in new tab
chrom seg num.mark nhet cnlr.median mafR segclust cnlr.median.clust mafR.clust start end cf.em tcn.em lcn.em
1 1 1 3046 354 0.270727037010749 0.225842699524796 51 0.276821100672535 0.225842699524796 14574 10623215 0.278280938500826 4 1
2 1 2 1067 121 0.233889913269948 0.132814947125636 48 0.221934986931194 0.131915181634348 10624282 12776047 0.219044421051089 4 1
3 1 3 241 35 -0.158493513938563 0.0765475414782914 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 12776187 13418492 1 2 1
4 1 4 1622 330 0.174140390568455 0.102403365032566 47 0.163277799812538 0.118280946381208 13418760 18854336 0.278280938500826 3 1
5 1 5 16225 1713 0.281182857599838 0.161234520829578 50 0.276821100672535 0.16080586210379 18854680 97047884 0.246817015498781 4 1
6 1 6 4484 395 -0.101274649429991 0.00355531687213131 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 97077557 125179852 1 2 1
7 1 7 12104 1154 0.323664879393949 0.145415932680375 53 0.323664879393949 0.145415932680375 125180120 191947348 0.276755404097886 4 1
8 1 8 928 33 -0.519535360168486 0.395258033534087 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 192150206 200618830 0.270816523590447 0 0
9 1 9 1220 134 0.167692358351527 0.108537753454052 47 0.163277799812538 0.118280946381208 200641019 203594575 0.278280938500826 3 1
10 1 10 5508 621 -0.49904162971019 0.440357063736423 11 -0.497768343554731 0.440357063736423 203626267 230765269 0.266262113867838 0 0
11 1 11 3039 447 -0.100154161062447 -0.0015658436432959 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 230767552 248936648 1 2 1
12 2 12 12999 1352 -0.0774467908494644 -0.00155166942622106 35 -0.059276130723806 0.000947290339952167 41366 86470630 1 2 1
13 2 13 8253 908 -0.191252969552747 0.00566404183063326 25 -0.18979388274626 0.00182594690360528 86474490 142723963 1 2 1
14 2 14 11224 889 -0.103421063322625 -0.00430044990627588 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 142885432 215037050 1 2 1
15 2 15 6084 727 -0.511944544973898 0.398237420031758 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 215045813 242122433 0.270816523590447 0 0
16 3 16 7238 695 -0.0859025651811361 -0.001069603462174 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 51439 45091334 1 2 1
17 3 17 4535 260 -0.486810554492384 0.374174120138598 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 45091684 54503660 0.270816523590447 0 0
18 3 18 19163 1943 -0.0966478854147557 0.00222132421357245 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 54562788 198170016 1 2 1
19 4 19 6279 848 -0.159252134067415 -0.00331398905081644 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 15066 49622409 1 2 1
20 4 20 5500 537 0.209128271934872 0.134791961369945 48 0.221934986931194 0.131915181634348 49709444 89927825 0.219044421051089 4 1
21 4 21 3266 400 0.0630449482042725 0.0427709612803929 42 0.0563599028600642 0.03422839106468 89928049 121681879 0.206719594906145 3 1
22 4 22 4041 391 0.244853906141438 0.158681984732643 48 0.221934986931194 0.131915181634348 121683401 163854204 0.219044421051089 4 1
23 4 23 2013 267 0.0880202218934227 0.0347352913618262 42 0.0563599028600642 0.03422839106468 163932826 186589528 0.206719594906145 3 1
24 4 24 12 1 0.606505299209598 0.183325358421172 54 0.606505299209598 NA 186590163 186597155 0.278280938500826 7 NA
25 4 25 256 49 0.0598926189696175 0.0387626839727532 42 0.0563599028600642 0.03422839106468 186597412 190117227 0.206719594906145 3 1
26 5 26 795 168 -0.269154591054032 -0.00209920136939005 21 -0.261359924621413 0.00464544845549633 23627 3382190 0.153410288071474 0 0
27 5 27 22544 2353 -0.0582514060406183 0.00248023877990075 35 -0.059276130723806 0.000947290339952167 3440419 180550163 1 2 1
28 5 28 283 54 -0.324721922300354 -0.00060693616114499 19 -0.336979360496636 0.00576491204493655 180553378 181404211 0.185138192720058 0 0
29 6 29 25783 3211 -0.0462582309955071 0.00457344440604607 34 -0.059276130723806 0.00423841060222063 106396 170700652 1 2 1
30 7 30 7942 1019 -0.109612083265127 -0.00255520353878944 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 19640 54923588 1 2 1
31 7 31 927 191 -0.370058131163845 0.00543430370689779 17 -0.385361046868446 0.00410796358489614 54925613 65185723 0.222507009480073 0 0
32 7 32 16364 1683 -0.0921206092219616 0.00402480857164081 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 65186559 159328596 1 2 1
33 8 33 631 98 -0.140361445141622 0.0253911341187303 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 166096 7143830 1 2 1
34 8 34 198 43 -0.838994597057509 0.0687688661388983 3 -0.838994597057509 0.0687688661388983 7196714 8237303 0.278280938500826 0 0
35 8 35 3582 599 -0.135997428032342 0.00740547952168358 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 8238158 30794151 1 2 1
36 8 36 883 39 -0.504738542869367 0.00331859103036706 15 -0.497768343554731 0.00809662205447625 30794297 33227041 0.24412994242782 0 0
37 8 37 879 45 -0.254287864602617 0.000703918153055364 23 -0.261359924621413 0.000703918153055364 33372553 38469256 0.179996000511723 1 0
38 8 38 10651 947 -0.1060170946014 0.00070337152412199 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 38512375 141192757 1 2 1
39 8 39 1631 213 -0.224490154408835 0.0077413415115024 21 -0.261359924621413 0.00464544845549633 141193905 145054464 0.153410288071474 0 0
40 9 40 6399 799 -0.229160090237858 0.0209508689863505 20 -0.261359924621413 0.0256419198317758 14665 68387379 0.278280938500826 1 0
41 9 41 1446 165 0.0236103834483994 0.00423010437403491 43 0.0563599028600642 0.00423010437403491 68387579 81652441 0.0525865687064266 4 2
42 9 42 1345 137 -0.205201526926842 0.00391198234683428 25 -0.18979388274626 0.00182594690360528 81653963 88411592 1 2 1
43 9 43 2982 237 0.268355631747321 0.0951181726675477 52 0.276821100672535 0.104278139412645 88426574 105523275 0.221822472125383 4 1
44 9 44 61 3 -0.0957615493763065 0.0851254494329041 33 -0.0994532903771977 NA 105523569 105705679 NA 2 NA
45 9 45 1774 195 -0.382988907213318 0.548252197056853 16 -0.385361046868446 0.558874795997135 105705900 114905915 0.278280938500826 1 0
46 9 46 3010 260 -0.00585872604102151 -0.00282926412965732 39 -0.0128052922796688 0.00378447423820661 114918114 128966168 1 2 1
47 9 47 798 112 -0.517883648135124 0.371593932620705 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 128968568 130929696 0.270816523590447 0 0
48 9 48 389 31 -0.0372674624060605 -0.00192860408334678 35 -0.059276130723806 0.000947290339952167 130929988 132198510 1 2 1
49 9 49 1995 308 -0.586413544669009 0.32492113132422 7 -0.579554114627485 0.321611990751745 132198772 136677801 0.278280938500826 0 0
50 9 50 899 103 -0.142366511277706 -0.000920906202988617 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 136687220 137717172 1 2 1
51 9 51 200 17 -0.590213474328727 0.241729725003471 7 -0.579554114627485 0.321611990751745 137717324 138233830 0.278280938500826 0 0
52 10 52 4685 520 -0.0775831969841754 0.00468735778902931 36 -0.059276130723806 0.00648761228150118 47165 37147398 1 2 1
53 10 53 1435 209 -0.332655348084518 0.00101220478190214 19 -0.336979360496636 0.00576491204493655 37147645 48201039 0.185138192720058 0 0
54 10 54 14785 1672 -0.0962619279588216 -0.00123110270278856 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 48201463 133626949 1 2 1
55 11 55 700 74 -0.146826007629472 0.00247774934011932 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 86832 993842 1 2 1
56 11 56 864 172 -0.402096644524668 0.00180030987928655 17 -0.385361046868446 0.00410796358489614 994095 2588717 0.222507009480073 0 0
57 11 57 5212 643 -0.0957830506736341 0.00356561358547536 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 2588877 32104309 1 2 1
58 11 58 58 18 -0.964222800851789 0.353543507551406 2 -0.965618921706037 0.353543507551406 32104490 32433659 0.278280938500826 0 0
59 11 59 2453 240 -0.0289664051754537 -0.00140190126191365 39 -0.0128052922796688 0.00378447423820661 32433981 48366367 1 2 1
60 11 60 643 105 -0.459555387362042 0.0280434623189543 14 -0.497768343554731 0.029250360211864 48366648 56347022 0.270700715955418 0 0
61 11 61 5355 438 -0.0443412095625001 0.00283403448455615 34 -0.059276130723806 0.00423841060222063 56357567 67612260 1 2 1
62 11 62 10923 1070 -0.181714913012072 9.09158128262267e-08 25 -0.18979388274626 0.00182594690360528 67612581 128819742 1 2 1
63 11 63 778 60 -0.0905270329297321 -0.012505336216513 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 128839161 134868517 1 2 1
64 12 64 15 1 -0.136915823441068 -0.0302804369158546 31 -0.143253100306965 NA 14780 67521 NA 2 NA
65 12 65 1412 201 -0.514535048088889 0.372254522794452 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 67634 6072442 0.270816523590447 0 0
66 12 66 1150 130 0.0447333267525599 0.839113034247719 44 0.0563599028600642 0.834954980642853 6073583 8093091 0.278280938500826 3 0
67 12 67 3477 446 -0.195837332733313 1.10695357802488 27 -0.18979388274626 1.10695357802488 8095771 25564088 0.278280938500826 2 0
68 12 68 652 59 0.0826009961841438 0.683426967329132 44 0.0563599028600642 0.834954980642853 25564193 30169927 0.278280938500826 3 0
69 12 69 521 63 0.214245709841674 0.161291192178524 48 0.221934986931194 0.131915181634348 30201547 34022776 0.219044421051089 4 1
70 12 70 4132 445 -0.16277743836137 0.000161512782930094 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 34023019 52953095 1 2 1
71 12 71 14326 1197 -0.074122574678383 0.000591088180325521 35 -0.059276130723806 0.000947290339952167 53006455 127658651 1 2 1
72 12 72 1076 175 -0.192584129830697 -0.00838783322926811 25 -0.18979388274626 0.00182594690360528 127697827 133246862 1 2 1
73 13 73 1896 226 -0.173864365570663 -0.000229980449446235 25 -0.18979388274626 0.00182594690360528 18173420 28329621 1 2 1
74 13 74 782 79 -0.639451795816934 0.281556763752521 6 -0.639451795816934 0.281556763752521 28329949 32537164 0.278280938500826 0 0
75 13 75 1101 118 -0.0104378634621312 0.00238534383582716 39 -0.0128052922796688 0.00378447423820661 32605387 41458449 1 2 1
76 13 76 1251 147 -0.558958249443127 0.500357263956976 8 -0.579554114627485 0.500357263956976 41466708 49567209 0.278280938500826 0 0
77 13 77 4931 599 -0.190302279108434 0.0140340210817166 26 -0.18979388274626 0.0280453075283459 49567302 114326392 1 2 1
78 14 78 237 67 -0.75263831160472 0.0220448595857957 4 -0.75263831160472 0.0104732267374996 16047840 19828499 0.278280938500826 0 0
79 14 79 13563 1391 -0.284553236224412 0.0301980738392069 20 -0.261359924621413 0.0256419198317758 19868281 104085829 0.278280938500826 1 0
80 14 80 657 108 -0.535779014022467 0.0172862469627978 14 -0.497768343554731 0.029250360211864 104085986 106876127 0.270700715955418 0 0
81 15 81 8108 808 -0.122924772830729 0.00147817587543603 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 17079372 55497979 1 2 1
82 15 82 1922 161 0.058168557506887 0.00624041328358628 42 0.0563599028600642 0.03422839106468 55498100 65329769 0.206719594906145 3 1
83 15 83 4927 510 -0.0579906935323973 0.00264528361422096 34 -0.059276130723806 0.00423841060222063 65329958 87854734 1 2 1
84 15 84 869 152 -0.474138487449181 0.00174123140336081 13 -0.497768343554731 0.00174123140336081 87854956 88146413 0.245599821824169 0 0
85 15 85 2286 308 -0.0438999454070873 0.00846716428314684 36 -0.059276130723806 0.00648761228150118 88146609 101976511 1 2 1
86 16 86 103 17 0.132248018923752 0.182592014768932 47 0.163277799812538 0.118280946381208 14472 154184 0.278280938500826 3 1
87 16 87 2731 292 -0.0155155718366538 0.0323643813923843 40 -0.0128052922796688 0.0323643813923843 154524 3745120 1 2 1
88 16 88 693 93 0.281213635117781 0.151261595647217 50 0.276821100672535 0.16080586210379 3745361 5750128 0.246817015498781 4 1
89 16 89 6183 607 -0.198969410857108 0.0396914163734698 26 -0.18979388274626 0.0280453075283459 5750336 31900909 1 2 1
90 16 90 1575 136 -0.50499614800433 0.383939310836996 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 31906040 54920198 0.270816523590447 0 0
91 16 91 38 6 -0.0744218661014957 -0.0212892451958723 38 -0.059276130723806 NA 54920464 55479914 NA 2 NA
92 16 92 1499 226 0.22218515718687 0.125683315385677 48 0.221934986931194 0.131915181634348 55481787 59619857 0.219044421051089 4 1
93 16 93 4578 479 -0.468976802044323 0.360751303313409 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 59754418 83217219 0.270816523590447 0 0
94 16 94 2017 356 -0.152178679309457 0.00584663143425411 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 83217605 90197286 1 2 1
95 17 95 674 65 0.0265516264834072 0.914213169940335 44 0.0563599028600642 0.834954980642853 116312 1853057 0.278280938500826 3 0
96 17 96 1050 153 0.209951293219876 0.193660072010959 49 0.221934986931194 0.191360736487737 1853277 4289260 0.274374866423197 4 1
97 17 97 654 107 -0.0446472804427277 0.871781288683915 37 -0.059276130723806 0.920876404350822 4289514 5227350 0.278280938500826 2 0
98 17 98 681 83 0.178659959268542 0.209039967099809 47 0.163277799812538 0.118280946381208 5234641 7251314 0.278280938500826 3 1
99 17 99 436 57 0.00444076975130603 0.877515319913607 41 -0.0128052922796688 0.877515319913607 7251400 7588446 0.278280938500826 3 0
100 17 100 314 32 -0.965618921706037 -0.0189237600477764 1 -0.965618921706037 -0.0189237600477764 7588910 7833640 0.278280938500826 0 0
101 17 101 389 37 0.0277597076299112 0.599459451760032 46 0.0563599028600642 0.599459451760032 7845723 8210521 0.278280938500826 3 0
102 17 102 353 19 -0.407626073073037 0.327350555935151 16 -0.385361046868446 0.558874795997135 8210791 8893693 0.278280938500826 1 0
103 17 103 3141 412 0.197741404133342 0.118538864475867 48 0.221934986931194 0.131915181634348 8904722 20321546 0.219044421051089 4 1
104 17 104 414 87 -0.229911266221287 0.0814501002450236 22 -0.261359924621413 0.101755127824111 20321807 27249582 0.273140079443287 1 0
105 17 105 975 54 0.235205624268557 0.0980761124230554 48 0.221934986931194 0.131915181634348 27250676 29294124 0.219044421051089 4 1
106 17 106 343 38 -0.364447911045158 0.736470514923725 16 -0.385361046868446 0.558874795997135 29451507 30432017 0.278280938500826 1 0
107 17 107 2427 224 0.163631500868708 0.149942036485726 47 0.163277799812538 0.118280946381208 30438981 38632509 0.278280938500826 3 1
108 17 108 455 37 -0.0590073373533799 1.08614688626031 37 -0.059276130723806 0.920876404350822 38673204 39573671 0.278280938500826 2 0
109 17 109 13862 1554 0.228627736825002 0.134193037336176 48 0.221934986931194 0.131915181634348 39605384 80947317 0.219044421051089 4 1
110 17 110 314 68 0.0462003314896533 0.143346425133816 45 0.0563599028600642 0.143346425133816 80947524 81463827 0.133011910485004 3 0
111 17 111 548 40 -0.499715776435858 0.330238014643237 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 81464030 82096469 0.270816523590447 0 0
112 17 112 381 76 -0.058272202445613 0.00105244415083664 35 -0.059276130723806 0.000947290339952167 82101456 83094601 1 2 1
113 18 113 1971 214 -0.0209810542232296 -0.00381748868476297 39 -0.0128052922796688 0.00378447423820661 47530 13885072 1 2 1
114 18 114 279 54 -0.579044352787495 -0.00736910634504487 9 -0.579554114627485 -0.00736910634504487 13885528 20951491 0.278280938500826 0 0
115 18 115 2979 295 -0.0973364546448354 -0.00132338552691667 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 20953681 47630070 1 2 1
116 18 116 156 26 -0.700836048541663 -0.00134238763226366 5 -0.700836048541663 -0.00134238763226366 47630486 47879342 0.278280938500826 0 0
117 18 117 52 2 -0.194428723876404 -0.0155535892726702 29 -0.18979388274626 NA 47879619 48636884 0.128154613413577 1 0
118 18 118 2096 235 -0.0677513207831085 -0.00257987267137585 35 -0.059276130723806 0.000947290339952167 48651064 68846512 1 2 1
119 18 119 839 110 -0.278916226472648 0.121996894677359 22 -0.261359924621413 0.101755127824111 68874769 80247399 0.273140079443287 1 0
120 19 120 1882 289 -0.513932346141519 0.2705683378992 12 -0.497768343554731 0.262817298761263 110522 3158111 0.278280938500826 0 0
121 19 121 2979 419 0.218303388347148 0.125208397902835 48 0.221934986931194 0.131915181634348 3162844 8774374 0.219044421051089 4 1
122 19 122 557 100 -0.174296920857997 0.121645980152111 28 -0.18979388274626 0.121645980152111 8790542 9759730 0.172642352862205 2 0
123 19 123 1376 163 0.265606720237159 0.124371425877886 52 0.276821100672535 0.104278139412645 9759989 11667211 0.221822472125383 4 1
124 19 124 305 11 -0.401434533689654 0.22110138753284 18 -0.385361046868446 NA 11667364 12582911 0.278280938500826 1 0
125 19 125 5042 608 0.218550595825928 0.126241486300608 48 0.221934986931194 0.131915181634348 12583424 33144804 0.219044421051089 4 1
126 19 126 30 6 -0.244241000724025 0.0660907940001604 24 -0.261359924621413 NA 33145066 33205672 0.259815278767904 1 0
127 19 127 1291 149 -0.13916298867373 0.00460797273930397 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 33205991 36194414 1 2 1
128 19 128 388 24 -0.486739568836057 0.102963504232964 12 -0.497768343554731 0.262817298761263 36194851 37889437 0.278280938500826 0 0
129 19 129 2824 319 0.214788438546104 0.19051566189458 49 0.221934986931194 0.191360736487737 37889675 42593915 0.274374866423197 4 1
130 19 130 1255 192 -0.344990753602106 0.0137881343326546 19 -0.336979360496636 0.00576491204493655 42593999 45368348 0.185138192720058 0 0
131 19 131 2799 342 -0.112949011946558 -9.13216042491937e-06 32 -0.0994532903771977 0.000596746842174162 45368778 50047002 1 2 1
132 19 132 1025 150 -0.255121357985963 0.00542536510046805 21 -0.261359924621413 0.00464544845549633 50075202 52064523 0.153410288071474 0 0
133 19 133 534 81 -0.754689738104343 -0.00454562174435896 4 -0.75263831160472 0.0104732267374996 52065130 53569432 0.278280938500826 0 0
134 19 134 2669 415 -0.246572313366273 0.00579552558646749 21 -0.261359924621413 0.00464544845549633 53571534 58599150 0.153410288071474 0 0
135 20 135 3911 429 -0.495744768768937 0.374388748369017 10 -0.497768343554731 0.379168393622527 87755 31259408 0.270816523590447 0 0
136 20 136 6354 574 -0.0143143192346381 -0.000844510321515874 39 -0.0128052922796688 0.00378447423820661 31259815 59196250 1 2 1
137 20 137 1595 229 0.145019860198526 0.109378149610654 47 0.163277799812538 0.118280946381208 59206976 64328100 0.278280938500826 3 1
138 21 138 551 129 -0.528540960347221 0.0392704427169298 14 -0.497768343554731 0.029250360211864 5030628 14243206 0.270700715955418 0 0
139 21 139 4893 703 -0.0617030261993259 0.00232717874388518 35 -0.059276130723806 0.000947290339952167 14254116 46664533 1 2 1
140 22 140 2305 336 -0.141765097905706 0.00870600029365872 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 10678996 22589314 1 2 1
141 22 141 340 96 -0.480604916419455 0.00881114596251309 15 -0.497768343554731 0.00809662205447625 22627776 23318412 0.24412994242782 0 0
142 22 142 1968 289 -0.146709411650086 0.00930019294063545 30 -0.143253100306965 0.00485296722400354 23359617 29738248 1 2 1
143 22 143 5344 594 -0.00254270058269516 0.0148464016198175 39 -0.0128052922796688 0.00378447423820661 29738406 47037221 1 2 1
144 22 144 865 138 -0.289600744267757 0.0164009390439324 20 -0.261359924621413 0.0256419198317758 47111550 50798749 0.278280938500826 1 0
145 23 145 6417 13 -0.111304448831726 0.0515032431940637 33 -0.0994532903771977 NA 284080 66616044 1 1 NA
146 23 146 7677 15 -0.258594877951203 0.0653921925220234 24 -0.261359924621413 NA 66685368 153873133 0.259815278767904 0 NA
147 23 147 682 0 -0.0877154928511701 0 33 -0.0994532903771977 NA 153875682 155680180 1 1 NA
148 rows